View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8122_low_3 (Length: 452)

Name: NF8122_low_3
Description: NF8122
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8122_low_3
NF8122_low_3
[»] chr2 (60 HSPs)
chr2 (1-435)||(34528003-34528438)
chr2 (1-435)||(34541977-34542412)
chr2 (1-435)||(6856114-6856544)
chr2 (1-435)||(44374824-44375255)
chr2 (1-435)||(44390405-44390836)
chr2 (4-435)||(25495624-25496050)
chr2 (1-435)||(26717657-26718085)
chr2 (1-435)||(26731790-26732218)
chr2 (1-435)||(41232472-41232904)
chr2 (1-435)||(35039726-35040155)
chr2 (1-435)||(20364686-20365122)
chr2 (1-435)||(17685092-17685525)
chr2 (1-435)||(24293214-24293645)
chr2 (1-435)||(35147983-35148415)
chr2 (1-435)||(24286646-24287077)
chr2 (34-435)||(26896685-26897083)
chr2 (1-435)||(42564533-42564966)
chr2 (1-435)||(42573157-42573590)
chr2 (1-435)||(35139642-35140074)
chr2 (1-435)||(15943145-15943579)
chr2 (1-435)||(15951655-15952090)
chr2 (1-323)||(20623373-20623692)
chr2 (189-435)||(42247632-42247880)
chr2 (1-435)||(20920493-20920935)
chr2 (189-413)||(16274631-16274852)
chr2 (189-413)||(16283807-16284028)
chr2 (1-376)||(17095634-17095997)
chr2 (189-435)||(28481201-28481446)
chr2 (189-435)||(34068828-34069069)
chr2 (129-435)||(30524675-30524972)
chr2 (189-435)||(21151291-21151535)
chr2 (189-413)||(10681504-10681728)
chr2 (189-435)||(15600587-15600834)
chr2 (189-435)||(29855198-29855443)
chr2 (189-413)||(21850302-21850527)
chr2 (189-413)||(21858737-21858962)
chr2 (189-413)||(34685555-34685778)
chr2 (284-435)||(35304648-35304801)
chr2 (129-427)||(42385921-42386211)
chr2 (129-427)||(42400805-42401095)
chr2 (129-423)||(42245347-42245637)
chr2 (120-413)||(27681103-27681394)
chr2 (1-304)||(17069159-17069454)
chr2 (189-413)||(22187188-22187413)
chr2 (189-435)||(34436946-34437190)
chr2 (189-413)||(31354892-31355115)
chr2 (189-413)||(34707978-34708200)
chr2 (1-304)||(17075152-17075447)
chr2 (189-435)||(33306712-33306957)
chr2 (189-435)||(3755042-3755285)
chr2 (189-435)||(3765093-3765336)
chr2 (189-413)||(11622221-11622446)
chr2 (1-435)||(21111031-21111461)
chr2 (189-435)||(2652889-2653132)
chr2 (1-59)||(44374494-44374551)
chr2 (382-435)||(30683261-30683314)
chr2 (322-376)||(17069063-17069117)
chr2 (364-435)||(21320773-21320845)
chr2 (364-435)||(14630437-14630509)
chr2 (364-435)||(19655717-19655789)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (4-435)||(28459601-28460026)
chr1 (1-435)||(32135266-32135696)
chr1 (4-435)||(41744659-41745083)
chr1 (1-435)||(28991263-28991699)
chr1 (1-435)||(3431558-3431991)
chr1 (1-435)||(31540974-31541406)
chr1 (1-435)||(31549543-31549975)
chr1 (1-435)||(13804012-13804440)
chr1 (1-435)||(13451846-13452280)
chr1 (1-435)||(2384986-2385417)
chr1 (1-431)||(43455854-43456288)
chr1 (1-435)||(23355567-23356005)
chr1 (35-435)||(51055269-51055668)
chr1 (189-435)||(21497038-21497286)
chr1 (227-435)||(13477078-13477285)
chr1 (189-427)||(31553360-31553596)
chr1 (189-427)||(31562494-31562730)
chr1 (227-435)||(8241020-8241229)
chr1 (189-435)||(32608594-32608837)
chr1 (291-435)||(23952221-23952365)
chr1 (189-435)||(22479631-22479876)
chr1 (189-435)||(20502117-20502362)
chr1 (284-435)||(52101236-52101389)
chr1 (189-435)||(38123583-38123827)
chr1 (210-435)||(21054901-21055126)
chr1 (129-413)||(22472503-22472781)
chr1 (129-413)||(16135066-16135343)
chr1 (189-413)||(34336791-34337016)
chr1 (1-372)||(36848721-36849090)
chr1 (189-411)||(3350707-3350927)
chr1 (189-413)||(12464224-12464449)
chr1 (1-252)||(11950135-11950385)
chr1 (189-410)||(18702459-18702676)
chr1 (228-423)||(4282676-4282866)
chr1 (356-435)||(35097535-35097615)
chr1 (382-435)||(21245028-21245081)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (10-435)||(4661841-4662267)
chr7 (1-435)||(24186084-24186512)
chr7 (1-435)||(13832526-13832956)
chr7 (1-435)||(13840556-13840986)
chr7 (1-435)||(1886889-1887314)
chr7 (1-435)||(1900990-1901415)
chr7 (1-435)||(18303018-18303450)
chr7 (1-365)||(10441987-10442350)
chr7 (1-435)||(17739338-17739776)
chr7 (189-435)||(5199136-5199380)
chr7 (189-435)||(5208253-5208497)
chr7 (220-435)||(10449323-10449539)
chr7 (129-435)||(17211194-17211493)
chr7 (1-423)||(43600363-43600781)
chr7 (189-435)||(16545414-16545659)
chr7 (189-435)||(16620003-16620248)
chr7 (1-294)||(33533462-33533749)
chr7 (189-435)||(29081931-29082176)
chr7 (189-435)||(29096690-29096935)
chr7 (283-435)||(4940249-4940401)
chr7 (190-435)||(16909791-16910034)
chr7 (129-413)||(16227657-16227936)
chr7 (129-413)||(16244535-16244814)
chr7 (189-413)||(16120674-16120898)
chr7 (189-413)||(16147414-16147638)
chr7 (189-435)||(27965914-27966158)
chr7 (189-435)||(27975367-27975611)
chr7 (189-435)||(17514305-17514549)
chr7 (189-435)||(17538665-17538909)
chr7 (189-413)||(40679923-40680146)
chr7 (129-413)||(29023320-29023599)
chr7 (129-435)||(16889707-16890005)
chr7 (129-411)||(29031758-29032035)
chr7 (189-435)||(15185501-15185745)
chr7 (189-435)||(15200121-15200365)
chr7 (1-376)||(4323575-4323946)
chr7 (189-435)||(44075171-44075415)
chr7 (189-413)||(558434-558656)
chr7 (189-413)||(568344-568566)
chr7 (189-413)||(27435207-27435433)
chr7 (189-413)||(27444237-27444463)
chr7 (189-413)||(2548907-2549129)
chr7 (189-413)||(2562793-2563015)
chr7 (315-435)||(19384067-19384187)
chr7 (284-411)||(36476755-36476884)
chr7 (364-435)||(13492034-13492106)
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (1-435)||(1875501-1875936)
chr4 (1-435)||(1889616-1890051)
chr4 (1-435)||(772968-773396)
chr4 (1-435)||(12425373-12425805)
chr4 (1-435)||(10640162-10640593)
chr4 (1-435)||(8092893-8093323)
chr4 (1-435)||(27341669-27342097)
chr4 (4-435)||(12998349-12998778)
chr4 (1-435)||(8101698-8102128)
chr4 (1-435)||(21530262-21530700)
chr4 (68-435)||(52297571-52297937)
chr4 (229-435)||(20865816-20866021)
chr4 (189-435)||(4747558-4747803)
chr4 (189-435)||(55584314-55584559)
chr4 (261-435)||(4522371-4522545)
chr4 (189-435)||(26210537-26210782)
chr4 (189-435)||(26219297-26219542)
chr4 (129-435)||(18009988-18010288)
chr4 (283-435)||(26034118-26034271)
chr4 (129-413)||(21398999-21399278)
chr4 (189-413)||(25247334-25247559)
chr4 (1-170)||(20866046-20866210)
chr4 (189-413)||(10786621-10786844)
chr4 (189-413)||(19759787-19760011)
chr4 (189-413)||(19774543-19774767)
chr4 (129-413)||(19645042-19645320)
chr4 (189-413)||(34842659-34842883)
chr4 (129-413)||(14718676-14718963)
chr4 (287-435)||(25652603-25652753)
chr4 (293-413)||(21811045-21811167)
chr4 (312-413)||(14736961-14737064)
chr4 (189-242)||(24924585-24924638)
chr4 (129-251)||(14737083-14737205)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (1-435)||(16775049-16775484)
chr8 (1-435)||(17662425-17662856)
chr8 (1-435)||(17681554-17681985)
chr8 (1-435)||(16760612-16761047)
chr8 (1-434)||(25585009-25585437)
chr8 (4-435)||(4837519-4837952)
chr8 (1-435)||(30939303-30939735)
chr8 (1-435)||(17528847-17529278)
chr8 (1-435)||(26871369-26871818)
chr8 (13-435)||(17975460-17975885)
chr8 (1-428)||(39836174-39836600)
chr8 (1-435)||(39844209-39844642)
chr8 (1-435)||(23923009-23923446)
chr8 (189-435)||(36248708-36248955)
chr8 (189-435)||(22103581-22103830)
chr8 (189-423)||(19850778-19851015)
chr8 (189-423)||(19856814-19857051)
chr8 (189-435)||(36252450-36252697)
chr8 (189-435)||(36576700-36576943)
chr8 (223-435)||(4583602-4583813)
chr8 (279-435)||(4842964-4843121)
chr8 (1-435)||(26912682-26913119)
chr8 (284-435)||(15832007-15832158)
chr8 (189-413)||(14204497-14204721)
chr8 (189-413)||(14219138-14219362)
chr8 (189-413)||(16190569-16190793)
chr8 (129-413)||(23092654-23092932)
chr8 (189-434)||(25719020-25719263)
chr8 (189-413)||(31000785-31001009)
chr8 (189-413)||(31207676-31207901)
chr8 (189-411)||(6582856-6583076)
chr8 (284-413)||(22418206-22418338)
chr8 (299-413)||(17129388-17129505)
chr8 (227-413)||(22366905-22367093)
chr8 (349-435)||(25796693-25796779)
chr8 (189-251)||(17129260-17129322)
chr8 (359-435)||(1388249-1388326)
chr8 (192-314)||(22023032-22023149)
chr8 (364-435)||(14335896-14335968)
chr8 (367-435)||(23601013-23601082)
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (1-435)||(50826329-50826756)
chr3 (1-435)||(50849097-50849531)
chr3 (4-435)||(30062785-30063213)
chr3 (1-435)||(27550801-27551237)
chr3 (4-435)||(4435399-4435826)
chr3 (1-435)||(18949598-18950030)
chr3 (1-435)||(39706818-39707245)
chr3 (4-435)||(4456190-4456617)
chr3 (1-435)||(18900488-18900921)
chr3 (1-435)||(17364684-17365118)
chr3 (1-435)||(2256396-2256825)
chr3 (1-435)||(41016361-41016793)
chr3 (1-435)||(17360042-17360476)
chr3 (1-431)||(27339020-27339440)
chr3 (1-435)||(8196374-8196807)
chr3 (1-435)||(13507397-13507833)
chr3 (1-435)||(51922217-51922650)
chr3 (1-414)||(16814560-16814968)
chr3 (1-435)||(17935036-17935474)
chr3 (1-400)||(18890340-18890738)
chr3 (1-435)||(3711569-3711995)
chr3 (1-435)||(8153285-8153717)
chr3 (1-435)||(18040867-18041304)
chr3 (1-342)||(41007582-41007920)
chr3 (44-435)||(43468227-43468620)
chr3 (189-435)||(15696883-15697131)
chr3 (189-435)||(15711173-15711421)
chr3 (189-435)||(15694570-15694818)
chr3 (189-435)||(14425782-14426031)
chr3 (189-435)||(2215074-2215319)
chr3 (190-435)||(8204185-8204432)
chr3 (129-435)||(6293672-6293970)
chr3 (189-435)||(6563757-6564002)
chr3 (189-435)||(6577426-6577671)
chr3 (1-282)||(9183894-9184169)
chr3 (189-435)||(18351184-18351431)
chr3 (129-435)||(10720857-10721157)
chr3 (191-413)||(1004289-1004510)
chr3 (189-405)||(16290847-16291062)
chr3 (189-435)||(5144421-5144666)
chr3 (129-435)||(27978685-27978985)
chr3 (1-352)||(27958025-27958366)
chr3 (93-435)||(21185571-21185907)
chr3 (189-413)||(11918377-11918601)
chr3 (189-413)||(11932947-11933171)
chr3 (1-161)||(8223112-8223275)
chr3 (189-413)||(1480034-1480258)
chr3 (189-413)||(13274853-13275079)
chr3 (189-423)||(17562857-17563091)
chr3 (287-435)||(17630358-17630507)
chr3 (12-422)||(27884561-27884959)
chr3 (4-124)||(14536879-14536997)
chr3 (1-151)||(18886343-18886495)
chr3 (129-413)||(31278579-31278856)
chr3 (189-435)||(22951850-22952095)
chr3 (189-435)||(22965824-22966069)
chr3 (284-435)||(13847824-13847977)
chr3 (189-413)||(7063800-7064025)
chr3 (189-435)||(15675227-15675470)
chr3 (129-435)||(25264700-25264998)
chr3 (129-435)||(25274194-25274492)
chr3 (189-435)||(15683769-15684012)
chr3 (189-413)||(4503535-4503760)
chr3 (190-413)||(17616653-17616877)
chr3 (189-413)||(7096647-7096872)
chr3 (306-435)||(27957329-27957459)
chr3 (189-405)||(30102067-30102286)
chr3 (129-427)||(24216150-24216430)
chr3 (34-423)||(9567441-9567823)
chr3 (22-169)||(27880175-27880326)
chr3 (210-303)||(27957882-27957974)
chr3 (283-423)||(27880426-27880565)
chr3 (362-435)||(29730570-29730643)
chr3 (349-435)||(10713583-10713670)
chr3 (348-413)||(12468968-12469036)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (1-435)||(19225645-19226073)
chr5 (1-435)||(43596663-43597096)
chr5 (1-435)||(43629457-43629890)
chr5 (1-435)||(1726776-1727208)
chr5 (1-435)||(28844962-28845395)
chr5 (1-435)||(28853572-28854005)
chr5 (1-435)||(31412629-31413062)
chr5 (1-435)||(31423533-31423968)
chr5 (1-435)||(24955451-24955882)
chr5 (1-435)||(24963911-24964342)
chr5 (1-361)||(20370777-20371130)
chr5 (1-361)||(20396480-20396833)
chr5 (1-307)||(21931240-21931546)
chr5 (189-435)||(41093707-41093956)
chr5 (189-435)||(20377709-20377955)
chr5 (189-435)||(20386498-20386744)
chr5 (189-435)||(33835287-33835531)
chr5 (189-435)||(33843986-33844230)
chr5 (284-435)||(23348699-23348851)
chr5 (189-435)||(11812580-11812824)
chr5 (189-435)||(26078514-26078759)
chr5 (189-435)||(26088493-26088738)
chr5 (189-435)||(11802504-11802748)
chr5 (189-413)||(23039050-23039273)
chr5 (189-435)||(12170286-12170530)
chr5 (189-435)||(12179715-12179959)
chr5 (190-413)||(23984696-23984920)
chr5 (189-413)||(27064026-27064248)
chr5 (189-413)||(23637282-23637506)
chr5 (189-413)||(23827926-23828150)
chr5 (189-413)||(23835384-23835608)
chr5 (129-413)||(17642366-17642643)
chr5 (129-413)||(21850816-21851093)
chr5 (189-413)||(21986346-21986570)
chr5 (189-413)||(21994994-21995218)
chr5 (189-413)||(26177025-26177248)
chr5 (189-427)||(27223314-27223551)
chr5 (189-427)||(27232785-27233022)
chr5 (189-413)||(31548224-31548447)
chr5 (189-435)||(3476922-3477167)
chr5 (189-435)||(3491692-3491937)
chr5 (129-435)||(36458526-36458824)
chr5 (284-413)||(21856977-21857108)
chr5 (189-427)||(27220307-27220546)
chr5 (284-413)||(21858730-21858861)
chr5 (189-411)||(23762462-23762684)
chr5 (367-435)||(21931541-21931609)
chr5 (364-435)||(29190253-29190325)
chr5 (129-251)||(23025830-23025946)
chr5 (364-435)||(345033-345105)
chr5 (364-435)||(359672-359744)
chr5 (392-435)||(20370721-20370764)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (35-435)||(109202-109599)
scaffold0002 (1-237)||(122966-123197)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (1-435)||(23927365-23927794)
chr6 (1-435)||(19826538-19826964)
chr6 (1-435)||(33299897-33300328)
chr6 (1-435)||(20530656-20531089)
chr6 (1-435)||(27537192-27537619)
chr6 (1-435)||(27551401-27551828)
chr6 (1-435)||(15389372-15389805)
chr6 (1-435)||(5996431-5996862)
chr6 (4-398)||(13827540-13827927)
chr6 (1-435)||(5487080-5487509)
chr6 (1-435)||(14475359-14475793)
chr6 (1-435)||(30823138-30823568)
chr6 (1-435)||(25993354-25993787)
chr6 (1-435)||(35090295-35090727)
chr6 (1-435)||(25552188-25552620)
chr6 (1-435)||(25713520-25713955)
chr6 (1-435)||(13491806-13492237)
chr6 (1-347)||(25692785-25693131)
chr6 (1-347)||(25699426-25699772)
chr6 (189-434)||(16302925-16303170)
chr6 (80-435)||(12451475-12451826)
chr6 (189-435)||(21708524-21708769)
chr6 (191-435)||(27047206-27047449)
chr6 (191-435)||(27057450-27057693)
chr6 (189-435)||(18205095-18205341)
chr6 (189-435)||(18220094-18220340)
chr6 (129-435)||(16588922-16589220)
chr6 (129-435)||(16606160-16606458)
chr6 (189-435)||(16635375-16635618)
chr6 (189-435)||(16645332-16645575)
chr6 (189-435)||(24920437-24920681)
chr6 (189-435)||(27960235-27960481)
chr6 (189-435)||(24485400-24485646)
chr6 (129-413)||(25653891-25654168)
chr6 (189-435)||(30995484-30995729)
chr6 (189-435)||(18111887-18112133)
chr6 (189-435)||(18126432-18126678)
chr6 (129-413)||(23982686-23982965)
chr6 (189-413)||(21358594-21358819)
chr6 (189-413)||(23962576-23962801)
chr6 (189-428)||(28304189-28304427)
chr6 (189-435)||(28266476-28266720)
chr6 (189-435)||(28345225-28345469)
chr6 (359-435)||(13827922-13827998)
chr6 (3-168)||(18753591-18753755)
chr6 (364-435)||(28267750-28267822)
chr6 (364-435)||(28346499-28346571)
chr6 (379-435)||(11063825-11063881)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (1-435)||(4170-4602)
[»] scaffold0015 (3 HSPs)
scaffold0015 (1-435)||(188342-188774)
scaffold0015 (189-435)||(194718-194964)
scaffold0015 (284-435)||(159154-159305)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (1-435)||(19575-20013)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (1-434)||(10197-10627)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (73-435)||(29774-30131)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (1-352)||(38672-39019)
[»] scaffold1804 (1 HSPs)
scaffold1804 (234-435)||(1-201)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (189-435)||(9956-10202)
[»] scaffold0545 (1 HSPs)
scaffold0545 (1-273)||(8011-8283)
[»] scaffold0257 (1 HSPs)
scaffold0257 (189-435)||(10139-10388)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (260-435)||(4297-4473)
[»] scaffold1120 (1 HSPs)
scaffold1120 (1-163)||(1268-1428)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (1-252)||(12504-12753)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (189-435)||(97-340)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (189-435)||(4495-4742)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (129-435)||(63135-63434)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (116-412)||(32325-32622)
[»] scaffold0007 (3 HSPs)
scaffold0007 (1-272)||(19404-19667)
scaffold0007 (1-239)||(26354-26588)
scaffold0007 (364-435)||(63287-63359)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (189-435)||(46606-46852)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (284-435)||(450-603)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (284-435)||(80495-80648)
scaffold0044 (284-435)||(64093-64246)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (189-435)||(14832-15079)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-154)||(25397-25550)
[»] scaffold1481 (1 HSPs)
scaffold1481 (189-413)||(1457-1681)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (284-435)||(145437-145591)
scaffold0023 (296-435)||(136475-136617)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (129-413)||(83332-83612)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (284-435)||(21608-21760)
[»] scaffold0455 (1 HSPs)
scaffold0455 (189-413)||(3750-3974)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (358-435)||(29726-29803)
scaffold0156 (41-157)||(33159-33276)
[»] scaffold1199 (1 HSPs)
scaffold1199 (362-435)||(2366-2439)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (322-413)||(22888-22980)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (362-435)||(22087-22160)
[»] scaffold1547 (1 HSPs)
scaffold1547 (189-313)||(1542-1662)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 60)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 34528438 - 34528003
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgtttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34528438 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt 34528339  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||    
T  34528338 gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacctttttttt--caaaattgttaaaatcaac 34528241  T
Q  200 ctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34528240 ctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 34528142  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||     
T  34528141 ataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttaggtattaattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataaa 34528042  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  34528041 ttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 34528003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 34542412 - 34541977
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgtttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34542412 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt 34542313  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||    
T  34542312 gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacctttttttt--caaaattgttaaaatcaac 34542215  T
Q  200 ctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34542214 ctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 34542116  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||     
T  34542115 ataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttaggtattaattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataaa 34542016  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  34542015 ttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 34541977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 6856544 - 6856114
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6856544 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttc-ctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttcttg 6856446  T
Q  101 taattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||| |  |||||||||||    
T  6856445 taattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccatttt-----caaaaatcataaaatcaacc 6856351  T
Q  201 taacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaa 298  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6856350 taacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaa 6856252  T
Q  299 taaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||     
T  6856251 taaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataatc 6856152  T
Q  398 taggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6856151 taggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 6856114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 44374824 - 44375255
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44374824 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttcttg 44374922  T
Q  101 taattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||          ||||| | ||||||||||||    
T  44374923 taattaaaatctgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcctttcttaaaaccatttt-----caaaaatcttaaaatcaacc 44375017  T
Q  201 taacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaa 298  Q
    |||||||| |||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44375018 taacccacaaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcatatgatttttatccttccaaatcaaa 44375116  T
Q  299 taaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttaga--tttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44375117 taaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttttaggtaacagttttcaaataagcaatgaatttagcacaagataat 44375216  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  44375217 ttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 44375255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 44390405 - 44390836
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44390405 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttcttg 44390503  T
Q  101 taattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||          ||||| | ||||||||||||    
T  44390504 taattaaaatctgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcctttcttaaaaccatttt-----caaaaatcttaaaatcaacc 44390598  T
Q  201 taacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaa 298  Q
    |||||||| |||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44390599 taacccacaaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcatatgatttttatccttccaaatcaaa 44390697  T
Q  299 taaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttaga--tttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44390698 taaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttttaggtaacagttttcaaataagcaatgaatttagcacaagataat 44390797  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  44390798 ttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 44390836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 4 - 435
Target Start/End: Original strand, 25495624 - 25496050
Alignment:
Q  4 ttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgtttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-cttgt 101  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25495624 ttaataaaccttggcttgtaacccaagtgtttttttccttttatttccttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgattttcttgt 25495723  T
Q  102 aattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||          |||||   |||||||||||||    
T  25495724 aattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcttcttatctcttcttaaaaccatttt-----caaaaaa-ttaaaatcaacct 25495817  T
Q  202 aacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataa 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25495818 aacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatctttccaaatcaaataa 25495916  T
Q  302 aaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttag 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  25495917 aaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttc-agtaagcaaatgaatttagcacaagataatctag 25496015  T
Q  401 gtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25496016 gtaagaggttcctatgtaataccatagacgcttag 25496050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26718085 - 26717657
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt- 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  26718085 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttc-ctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgacttcttt 26717987  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||           ||||| |  ||||||||||    
T  26717986 gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaac-----tattttcaaaaat--taaaatcaac 26717894  T
Q  200 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26717893 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaagt 26717795  T
Q  300 aaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagat-ttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcac-aatataatt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  26717794 aaaaataaccaaaaacatacttcttcttcccccattctttcacttagattttttaggtaataaatttcaaataagcaatgaatttagcacaaagataaat 26717695  T
Q  398 taggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  26717694 taggtaagaggttcctacgggataccgtagacgcttag 26717657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26732218 - 26731790
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt- 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  26732218 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttc-ctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgacttcttt 26732120  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||           ||||| |  ||||||||||    
T  26732119 gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaac-----tattttcaaaaat--taaaatcaac 26732027  T
Q  200 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26732026 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaagt 26731928  T
Q  300 aaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagat-ttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcac-aatataatt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  26731927 aaaaataaccaaaaacatacttcttcttcccccattctttcacttagattttttaggtaataaatttcaaataagcaatgaatttagcacaaagataaat 26731828  T
Q  398 taggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  26731827 taggtaagaggttcctacgggataccgtagacgcttag 26731790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 41232904 - 41232472
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  41232904 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttctt 41232805  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt--ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||| | |||||||||    
T  41232804 gtaattaaaatgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctt-tcttttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatca 41232710  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41232709 acctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 41232611  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||     
T  41232610 ataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataaa 41232511  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  41232510 ttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 41232472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 35039726 - 35040155
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt- 99  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  35039726 ttcttaataaaccttgatttgtaacccaagtgttttc-ctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttcttt 35039824  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||          ||||| | |||||||||||    
T  35039825 gtaattaaaatccgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttctaaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatcaac 35039919  T
Q  200 ctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    |||||||||||||  |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35039920 ctaacccaccaaaaagaaactttttagatgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 35040018  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatt 397  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  35040019 ataaaaataaccaaaaa-atgcttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataaat 35040117  T
Q  398 taggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  35040118 taggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 35040155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20365122 - 20364686
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgt---tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttc 97  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  20365122 ttcttaataaaccttggctggtaacccaagtgtccctttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttt 20365023  T
Q  98 tt-gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatc 196  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||           |||| | ||||||||    
T  20365022 tttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttta---aaaaatcttaaaatc 20364927  T
Q  197 aacctaacccaccaaaga--aattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaat 294  Q
    |||||||||||||||| |  || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20364926 aacctaacccaccaaaaagtaacttttttggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaat 20364828  T
Q  295 caaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagat-ttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatat 393  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20364827 caaataaaaatgaccaaaaacatacttcttctcctcccattctttcacttagattttttaggtaataattttcaaataaccaatgaatttagcacaagat 20364728  T
Q  394 aatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20364727 aaattaggtaagaggttcctatggaataccgtagacgcttag 20364686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 17685525 - 17685092
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt- 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  17685525 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttc-ctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttcttt 17685427  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||            |||| | |||||||||||    
T  17685426 gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttctaaaaactcattttcaa--aaaaatcttaaaatcaac 17685330  T
Q  200 ctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17685329 ctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaattcaa 17685231  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||     
T  17685230 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaaggtaaa 17685131  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17685130 ttaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 17685092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 24293214 - 24293645
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagt-gttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ct 98  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  24293214 ttcttaataaaacttggtttgtaacccaagttgctttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatactagacttgattttct 24293313  T
Q  99 tgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||  |||||||||    
T  24293314 tgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccattttct----aaaatt--taaaatcaa 24293407  T
Q  199 cctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 296  Q
    || |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  24293408 cc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcagaggattgttatcctttcaaatca 24293505  T
Q  297 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataa 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  24293506 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctctctccgttctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataa 24293605  T
Q  396 tttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  24293606 tttaggtaagaggttcttacggaataccgtagacgcttag 24293645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 35147983 - 35148415
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  35147983 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttctt 35148082  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt--ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||| | |||||||||    
T  35148083 gtaattaaaacgtgaacaatctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctt-tcttttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatca 35148177  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35148178 acctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 35148276  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||     
T  35148277 ataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataaa 35148376  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  35148377 ttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 35148415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 24286646 - 24287077
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagt-gttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ct 98  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  24286646 ttcttaataaaacttggtttgtaacccaagttgctttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatactagacttgattttct 24286745  T
Q  99 tgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||  |||||||||    
T  24286746 tgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccattttct----aaaatt--taaaatcaa 24286839  T
Q  199 cctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 296  Q
    || |||||||||||  |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  24286840 cc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactatattggttttgatccctttt-ctttaaaggtatgtaggcagaggattgttatcctttcaaatca 24286937  T
Q  297 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataa 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  24286938 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccgttctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataa 24287037  T
Q  396 tttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  24287038 tttaggtaagaggttcttacggaataccgtagacgcttag 24287077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 34 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26897083 - 26896685
Alignment:
Q  34 tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-cttgtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26897083 tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatactagacttgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttatttt 26896984  T
Q  133 ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaac 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||  ||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||||    
T  26896983 ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccattttct----aaaatt--taaaatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 26896891  T
Q  231 tacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcccc 330  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26896890 tacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcagaggacttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 26896792  T
Q  331 ccattctttcacttagatttttaggtaat-aattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccataga 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26896791 ccattctttcacttagatttttaggtaataaattttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatgggataccataga 26896692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 42564966 - 42564533
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  42564966 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttctt 42564867  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt--ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||| | |||||||||    
T  42564866 gtaattaaaacgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctt-tcttttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatca 42564772  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggattttt-atccttccaaatca 296  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42564771 acctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggattttttatccttccaaatca 42564673  T
Q  297 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataa 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||    
T  42564672 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaagtaagcaaatcaatttagcacaaggtaa 42564573  T
Q  396 tttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  42564572 attaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 42564533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 42573590 - 42573157
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  42573590 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttctt 42573491  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt--ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||| | |||||||||    
T  42573490 gtaattaaaacgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctt-tcttttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatca 42573396  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggattttt-atccttccaaatca 296  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42573395 acctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggattttttatccttccaaatca 42573297  T
Q  297 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataa 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||    
T  42573296 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaagtaagcaaatcaatttagcacaaggtaa 42573197  T
Q  396 tttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  42573196 attaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 42573157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 35139642 - 35140074
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  35139642 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttctt 35139741  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt--ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||| |  ||||||||    
T  35139742 gtaattaaaacgtgaacaatctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctt-tcttttcttaaaacccatttt----caaaaatcgtaaaatca 35139836  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35139837 acctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 35139935  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||     
T  35139936 ataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataaa 35140035  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  35140036 ttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 35140074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15943579 - 15943145
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  15943579 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttctt 15943480  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt--ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||| | |||||||||    
T  15943479 gtaattaaaacgtgaacaatctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctt-tcttttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatca 15943385  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggattttt--atccttccaaatc 295  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  15943384 acctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttttatccttccaagtc 15943286  T
Q  296 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatata 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||    
T  15943285 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaagtaagcaaatcaatttagcacaagata 15943186  T
Q  395 atttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15943185 aattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 15943145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15952090 - 15951655
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  15952090 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttctt 15951991  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt--ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||| | |||||||||    
T  15951990 gtaattaaaacgtgaacaatctcaccttattttttctctcataccttgaggcctctt-tcttttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatca 15951896  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggattttt---atccttccaaat 294  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  15951895 acctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggattttttttatccttccaaat 15951797  T
Q  295 caaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||    
T  15951796 caaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaagtaagcaaatcaatttagcacaagat 15951697  T
Q  394 aatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15951696 aaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 15951655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 20623373 - 20623692
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttga-tttctt 99  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  20623373 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatagtagacttgattttctt 20623472  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||          ||||| | |||||||||||    
T  20623473 gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcacgccttgaggcctctt-tcccttctaaaaacc----cattttcaaaaatcttaaaatcaac 20623567  T
Q  200 ctaacccacc--aaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    ||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20623568 ctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccc-ttttctttaagggtatgtaggcatgggatttttatccttccaaatcaa 20623666  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttct 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  20623667 ataaaaataaccaaaaacatacttct 20623692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 42247880 - 42247632
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42247880 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtatgcataggatttttatcc 42247782  T
Q  287 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  42247781 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttag 42247682  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42247681 cacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccgtagacgcttag 42247632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 20920493 - 20920935
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttga-tttctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||| | ||||||    
T  20920493 ttcttaataaaccttggtttgcagc--aagtgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaatcaatttaacatccatattagacttaaatttctt 20920589  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcac------tttattttctctcatgccttgaggcctcttatcc------cttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaatt 187  Q
    |||||||||||||||||||| |||       ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |      ||||||||||||           |||| |    
T  20920590 gtaattaaaatttgaccaacatcatctttttttttttttctcttatgccttgaggcctcttattcttatctcttcttaaaaccttttttca---aaaaat 20920686  T
Q  188 gttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatc 285  Q
     |||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  20920687 attaaaatcaatctaacccaccaaaaagaaattttttaggcgaactacattggttttgatcccttt--ctttaagggtatgtagggaaaggatttttgtc 20920784  T
Q  286 cttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaattta 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||  |||||    
T  20920785 cttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatgtttaggcaataattttcaaataagcaaattgattta 20920884  T
Q  385 gcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  20920885 gcacaagataaattaggcaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttag 20920935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Original strand, 16274631 - 16274852
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16274631 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 16274729  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16274730 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttct----ccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagc 16274825  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  16274826 acaagataatctaggtaagcggttcct 16274852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Original strand, 16283807 - 16284028
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16283807 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 16283905  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  16283906 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttct----ccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaattttgc 16284001  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  16284002 acaagataatctaggtaagcggttcct 16284028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 17095997 - 17095634
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttga-tttctt 99  Q
    |||||||| |||||| | || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| |||| ||||||||  ||||||    
T  17095997 ttcttaataaaccttcgattttaacccaaatgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgtttaatcaatttaacatccatattagacttgggtttctt 17095899  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
     |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||           ||||| | ||||||||||     
T  17095898 ataattaaaatttgatcaacctcatcttattttctctcatgtcttgaggcctcttatcccttcttaaaac-----aattttcaaaaat-ttaaaatcaat 17095805  T
Q  200 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaat 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  || |||||||||||||||||    
T  17095804 ccaacccaccaaagaaattctttacaggaactacattggttttgatccc-ttttctttaagggtatgtaggcaaaaga-gttaatccttccaaatcaaat 17095707  T
Q  300 aaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaa 376  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||   |||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  17095706 aaaaacaacaaaagacatacttctt---cccccattctttcacttagactctta-gcaataattttcaaataagcaa 17095634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 28481201 - 28481446
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  28481201 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 28481297  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28481298 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagc 28481397  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28481398 acaagataatctaggtaagaggttcctatgggataccatagacgcttag 28481446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 34069069 - 34068828
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||  ||| |   ||||    
T  34069069 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttt--ctttaagggtatataggcaggggagtca-atcc 34068973  T
Q  287 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |  || |||||||||||    
T  34068972 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttt----tttgcaaatgaatttag 34068878  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34068877 cacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 34068828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 129 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 30524972 - 30524675
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||    
T  30524972 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaaccatttt-----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtgga 30524879  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataa-ccaaaaacatacttcttctc 327  Q
    ||||| | ||||||||||||||   |   ||||||| ||||||| |||  || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30524878 actacgtcggttttgatcccttc--ccaaaagggtacgtaggcagagggcttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaaccaaaaacatacttcttctc 30524783  T
Q  328 cccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatag 427  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  30524782 cctccattcttttacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatgtagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtag 30524683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 21151291 - 21151535
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtg-aactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcct 287  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| | | |||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||    
T  21151291 ttaaaatcaacctaacccaccatagaaatt-tttgggtggaactacgtcgattttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--cct 21151386  T
Q  288 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttag 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  21151387 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttag 21151485  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21151486 cacaatataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 21151535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 10681728 - 10681504
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  10681728 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 10681631  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10681630 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtgataatttttcaagtaagcaaatgaatttagc 10681531  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  10681530 acaagataatctaggtaagcggttcct 10681504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 15600587 - 15600834
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  15600587 ttaaaatcaacctaacccaccaaggaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 15600684  T
Q  289 ccaaatcaaataaaa-ataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||    
T  15600685 ccaaatcaaataaaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaataaatttag 15600784  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15600785 cacaagataatctaggtaagcggttcctacggaataccgtagatgcttag 15600834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 29855198 - 29855443
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |  ||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  29855198 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcagttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 29855295  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa--ttttcaaataagcaatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||  ||||||||||| |||  | ||||||    
T  29855296 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataattttttcaaataaacaagtagtttagc 29855394  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29855395 acaaaataatttaggtaagaggttcctatggaataccatggacgcttag 29855443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21850527 - 21850302
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  21850527 ttaaaatcagcctaacccactaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 21850430  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  21850429 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttag 21850330  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  21850329 cacaagataatttaagtaagcggttcct 21850302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21858962 - 21858737
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  21858962 ttaaaatcagcctaacccactaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 21858865  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  21858864 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttag 21858765  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  21858764 cacaagataatttaagtaagcggttcct 21858737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Original strand, 34685555 - 34685778
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  34685555 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 34685651  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  34685652 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttag 34685750  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  34685751 cacaagataatttaggtaagcggttcct 34685778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 284 - 435
Target Start/End: Original strand, 35304648 - 35304801
Alignment:
Q  284 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaat-aattttcaaataagc-aatgaat 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  35304648 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaaatttttaggtaataaattttcaagtaagcaaatgaat 35304747  T
Q  382 ttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  35304748 ttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 35304801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 129 - 427
Target Start/End: Original strand, 42385921 - 42386211
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||    
T  42385921 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaaccatttt-----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtgga 42386014  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42386015 actacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 42386112  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatag 427  Q
    | |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42386113 ctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagtagtttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatag 42386211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 129 - 427
Target Start/End: Original strand, 42400805 - 42401095
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||    
T  42400805 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaaccatttt-----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtgga 42400898  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42400899 actacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 42400996  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatag 427  Q
    | |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42400997 ctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagtagtttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatag 42401095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 129 - 423
Target Start/End: Original strand, 42245347 - 42245637
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  42245347 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaaccatttt-----caaaaatcttaaaaccaacctaacccaccaaagaaattttttagtgga 42245440  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaa---gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttc 325  Q
    ||||| | ||||||||||||||| ||   ||   ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245441 actacgtcggttttgatccctttctcaaaaaaaggggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttc 42245538  T
Q  326 tccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaatacc 423  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||    
T  42245539 tccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggaatacc 42245637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 120 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 27681394 - 27681103
Alignment:
Q  120 ctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattc 219  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27681394 ctcatttttttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattt 27681300  T
Q  220 tttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatac 319  Q
    |||||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27681299 tttagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatac 27681202  T
Q  320 ttcttctccccccattctttcacttagat-ttttaggtaataa--ttttcaaataagc--aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| |||||  || ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  27681201 ttcttctccctccattctttcacttagatttttttggtaataattttttcaagtaagccaaacgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttcct 27681103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 17069454 - 17069159
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttga-tttctt 99  Q
    |||||||| |||||| |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| |||| ||||||||  ||||||    
T  17069454 ttcttaataaaccttcgagtttaacccaagtgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgtttaatcaatttaacatccatattagacttgggtttctt 17069356  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
     |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||          ||||| | ||||||||||     
T  17069355 ataattaaaatttgatcaacctcatcttattttctcccatgtcttgaggcctcatatctcttcttaaaacc-----attttcaaaaat-ttaaaatcaat 17069262  T
Q  200 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaat 299  Q
    | |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||  || |||||||||||||||||    
T  17069261 ccaacccaccaaagaaattcttcacgagaactacattggttttgatccc-ttttctttaagggtatgtagggaaaaga-gttaatccttccaaatcaaat 17069164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Original strand, 22187188 - 22187413
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| |  ||||||||||||||  |   ||||||| ||||| | |||| || |  ||||    
T  22187188 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcagttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggtagaggacttgt--cctt 22187285  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttag 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  22187286 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatactcctgctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttag 22187385  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22187386 cacaagataatttaggtaagcggttcct 22187413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 34436946 - 34437190
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  34436946 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 34437043  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||  |  ||||||    
T  34437044 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagtagcttagca 34437142  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  34437143 caagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 34437190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 31355115 - 31354892
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  31355115 ttaaaatcaacttaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 31355019  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31355018 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattcttttacatagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagc 31354919  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  31354918 acaagataatctaggtaagcggttcct 31354892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Original strand, 34707978 - 34708200
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||||||||   |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  34707978 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatcccttc--ccaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 34708073  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  | |||||||||    
T  34708074 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagccaagtgaatttag 34708172  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  34708173 cacaagataatttaggtaagcggttcct 34708200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 17075447 - 17075152
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttga-tttctt 99  Q
    |||||||| |||||| |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| |||| ||||||||  ||||||    
T  17075447 ttcttaataaaccttcgagtttaacccaagtgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgtttaatcaatttaacatccatattagacttgggtttctt 17075349  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
     |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||          ||||| | ||||||||||     
T  17075348 ataattaaaatttgatcaacctcatcttattttctcccatgtcttgaggcctcatatctcttcttaaaacc-----attttcaaaaat-ttaaaatcaat 17075255  T
Q  200 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaat 299  Q
    | |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | ||  || |||||||||||||||||    
T  17075254 ccaacccaccaaagaaattcttcacgagaactacattggttttgatccc-ttttcttgaagggtatgtagggaaaaga-gttaatccttccaaatcaaat 17075157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 33306957 - 33306712
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||      ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  33306957 ttaaaatcaacctaacccactaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcctaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 33306860  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaa-tgaatttagc 386  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||    
T  33306859 ccaaatcaaataaaaataactaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-gttcaggtaataatttttcaaataagcaattttttttagc 33306761  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  33306760 acaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 33306712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 3755285 - 3755042
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | ||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  3755285 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttctcaa-aagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 3755189  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||| ||||||||||| |||  || ||||||    
T  3755188 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatgcttcttctccctccattctttcatttaga-cattaggcgataatttttcaaataaacaagtaacttagca 3755090  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  3755089 caagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 3755042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 3765336 - 3765093
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | ||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  3765336 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttctcaa-aagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 3765240  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||| ||||||||||| |||  || ||||||    
T  3765239 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatgcttcttctccctccattctttcatttaga-cattaggcgataatttttcaaataaacaagtaacttagca 3765141  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  3765140 caagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 3765093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 11622446 - 11622221
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaag-ggtatgtaggcataggatttttatcct 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||  |||| ||||||| |||| || |  |||    
T  11622446 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaaatggtacgtaggcagaggacttgt--cct 11622349  T
Q  288 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttag 385  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  11622348 cccaaatcaaataaaaacaaccaaaaacatacttcttctccctccattcttttacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttag 11622249  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  11622248 cacaagataatctaagtaagcggttcct 11622221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 21111031 - 21111461
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttga-tttctt 99  Q
    |||||| | ||| |||| || |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  | |||| ||  ||| |||| |||  ||||||    
T  21111031 ttcttattaaactttggattttaacccaattgttttt-cctttt-ttttcttaatcaaatgtttaatcaatttaatatctatattagatttgggtttctt 21111128  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
     |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||           ||||| ||||||||||||     
T  21111129 ataattaaaatttgaccaacctcatcttattttctctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaac--attttttttcaaaaatgttaaaatcaat 21111226  T
Q  200 ctaacccaccaaaga-aattctttag---gtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaa-t 294  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| |   | ||||||| ||| ||||||||||| ||      || ||| ||||||| | |||||  |||||| |||| |    
T  21111227 ctaacccaccaaaaataatttttttgagagagaactac-ttgattttgatccctcttg-----agagtacgtaggcaaatgattt--atccttacaaaat 21111318  T
Q  295 caaataaaaataaccaaaaa--catacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatg-aatttagcacaat 391  Q
    ||||||| || ||| |||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||     
T  21111319 caaataacaacaacaaaaaaaacatatttcttctacccccattcttccacctagactcttagc-aataattttcaaataagcaaaataatttagcacaag 21111417  T
Q  392 ataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21111418 ataatttaggcaagaggttcctacggaataccatagacgcttag 21111461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 2652889 - 2653132
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | ||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  2652889 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttctcaa-aagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 2652985  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||   |||||  |||| ||||||||||| |||  || ||||||    
T  2652986 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatgcttcttctccctccatcctttcatttaga-cattaggcgataatttttcaaataaacaagtaacttagca 2653084  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  2653085 caagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 2653132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 44374494 - 44374551
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaa 59  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44374494 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtg-tttttccttttattttcttaatcaaa 44374551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 30683314 - 30683261
Alignment:
Q  382 ttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30683314 ttagcacaagataatctaagtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 30683261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 17069117 - 17069063
Alignment:
Q  322 cttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaa 376  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17069117 cttcttcccccattctttcacttagactcttaggcaataattttcaaataagcaa 17069063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21320845 - 21320773
Alignment:
Q  364 ttcaaataagcaatg-aatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  21320845 ttcaaataagcaaagcaatttagcacaagataaattaggtaaaaggttcctacggagtaccgtagacgcttag 21320773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 435
Target Start/End: Original strand, 14630437 - 14630509
Alignment:
Q  364 ttcaaataagcaatg-aatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  14630437 ttcaaataagcaaagcaatttagcacaagataaattaagtaaaaggttcctacggagtaccgtagacgcttag 14630509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 19655789 - 19655717
Alignment:
Q  364 ttcaaataagcaatg-aatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  19655789 ttcaaataagcaaagcaatttagcacaagataaattatgtaaaaggttcctacggagtaccgtagacgcttag 19655717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 4 - 435
Target Start/End: Original strand, 28459601 - 28460026
Alignment:
Q  4 ttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttgtaa 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28459601 ttaataaaccttggtttgtaacctaagtgtttt--ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttgtaa 28459698  T
Q  104 ttaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||    
T  28459699 ttaaaatttgaccaacctcactttattttctc--atgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccttttttt---caaaattgttaaaatcaacctaa 28459793  T
Q  204 cccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28459794 cccaccaaagaaattctttaggtgaactacattgattttgatccctttt-ctttaagggtatgtagacataggatttttatccttccaaatcaaataaaa 28459892  T
Q  304 ataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttagg 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28459893 ataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaacaatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatttagg 28459992  T
Q  402 taagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||| ||||    
T  28459993 taagaggttcctgcggaataccgtagacgtttag 28460026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 32135696 - 32135266
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  32135696 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttctt 32135598  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||          ||||||||||||||| |||    
T  32135597 gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctctaatctcttcttaaaacctttttc----caaaattgttaaaattaac 32135502  T
Q  200 ctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    | |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32135501 c-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 32135404  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatt 397  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  32135403 ataaaaataaccaaaaatatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataaat 32135304  T
Q  398 taggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  32135303 taggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 32135266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 4 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 41745083 - 41744659
Alignment:
Q  4 ttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttgtaa 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41745083 ttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttt--ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttgtaa 41744986  T
Q  104 ttaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaa 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||           ||||||  ||||||||||| ||    
T  41744985 ttaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaaccatttttct---aaaatt--taaaatcaacc-aa 41744892  T
Q  204 cccaccaaa-gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaa 302  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41744891 cccaccaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaa 41744793  T
Q  303 aataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagat-ttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttagg 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  41744792 aataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagattttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaggataaattagg 41744693  T
Q  402 taagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  41744692 taagaggttcctacggaataccgtagacgtttag 41744659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 28991699 - 28991263
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgt-------tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttga 93  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  28991699 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgtctttttttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacctga 28991600  T
Q  94 ttt-cttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaa 192  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||   |||    
T  28991599 ttttcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccattttct----aaaatc--taa 28991506  T
Q  193 aatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 290  Q
    |||||||| |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28991505 aatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 28991408  T
Q  291 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaa 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28991407 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaa 28991308  T
Q  391 tataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28991307 gataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 28991263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 3431991 - 3431558
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttatttt-cttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt 99  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3431991 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagttgcttttccttttatttttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttctt 3431892  T
Q  100 -gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaa 198  Q
     |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||           |||| | ||||||||||    
T  3431891 tgtaattaaaattcgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttca---aaaaatcttaaaatcaa 3431796  T
Q  199 cctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 296  Q
    ||||||||| ||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3431795 cctaacccaacaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 3431697  T
Q  297 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  3431696 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataaccaatgaatttagcacaagataaa 3431597  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3431596 ttaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 3431558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 31540974 - 31541406
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||    
T  31540974 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattaaacttgattttctt 31541073  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt--ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||| | |||||||||    
T  31541074 gtaattaaaatgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctt-tcttttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatca 31541168  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31541169 acctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 31541267  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||     
T  31541268 ataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataaa 31541367  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  31541368 ttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 31541406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 31549543 - 31549975
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||    
T  31549543 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattaaacttgattttctt 31549642  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt--ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||| | |||||||||    
T  31549643 gtaattaaaatgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctt-tcttttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatca 31549737  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31549738 acctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 31549836  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||     
T  31549837 ataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataaa 31549936  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  31549937 ttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 31549975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 13804440 - 13804012
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13804440 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagggttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgattttctt 13804342  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||           ||||    ||||||||||    
T  13804341 gtaattaaaatttgaccaacctcatcttattttatctcatgccttgaggcctctt-tcccttcttaaaaccattttct----aaaacc--taaaatcaac 13804249  T
Q  200 ctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    | |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13804248 c-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaagcataggatttttatccttccaaatcaa 13804151  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataat 396  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  13804150 ataaaaataacaaaaaacatatttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtagtaattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataat 13804051  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  13804050 ttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 13804012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 13451846 - 13452280
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgtttttt--ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-c 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  13451846 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttttttccttttattttattaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagactcgattttc 13451945  T
Q  98 ttgtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt-ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatc 196  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||  |||||||    
T  13451946 ttgtaattaaaatttgaccaagctcatcttatttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccattttct----aaaatt--taaaatc 13452039  T
Q  197 aacctaacccaccaaaga--aattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaat 294  Q
    |||| |||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13452040 aacc-aacccaccaaagagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaaa 13452137  T
Q  295 caaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagcacaata 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  13452138 caaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccatgctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaaga 13452237  T
Q  393 taatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13452238 taaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 13452280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 2384986 - 2385417
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttc--cttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-c 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  2384986 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtttttttttttcttttattctcttaatcaaatgcttatttgaattaatattcatattagacttgattttc 2385085  T
Q  98 ttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||  ||||||||    
T  2385086 ttgtaattaaaatttgatcaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccattttct----aaaatt--taaaatca 2385179  T
Q  198 acctaacccacc--aaagaaa-ttctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaat 294  Q
    ||| ||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||    
T  2385180 acc-aacccacccaaaagaaacttttttaggtgaactacattggttttgatccctttc-ctttaagggtatgtaggcaaagg--tttaatccttccaaat 2385275  T
Q  295 caaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  2385276 caaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagat 2385375  T
Q  394 aatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2385376 aatttagataagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 2385417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Original strand, 43455854 - 43456288
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgtttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ct 98  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  43455854 ttcttaataaaccttggttggtaacccaagtgtttttttccttttactttcttaatcaaatgcttaattgacttaatattcatattagacttgattttct 43455953  T
Q  99 tgtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt-ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |          |||||||||||||||||    
T  43455954 tgtaattaaaatttgaccaacctcatcttatttttctctcatgccttgaggcctctaatctcttcttaaaatcttttttta--caaaattgttaaaatca 43456051  T
Q  198 acctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatc 295  Q
    | | |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |||||    
T  43456052 atccaacccaccaaaaagaaattttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatataggcaaaggagtta-atccttcaaaatc 43456149  T
Q  296 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttaga--tttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaata 392  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  43456150 aaataaaaataaccaaaaatatacttcttctccctccattctttcacttagatttttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaaga 43456249  T
Q  393 taatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43456250 taatttaggtaagaggttcctatgaaataccatagacgc 43456288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23356005 - 23355567
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||    
T  23356005 ttcttgataaaccttggtttgtaatccaagtgttttc-ctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagatttgattttctt 23355907  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcac----tttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaat 195  Q
    | ||||||||||  |||||||||||    ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          ||||| | |||||||    
T  23355906 gcaattaaaatta-accaacctcaccttgttttttttttctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaaccatttt-----caaaaatattaaaat 23355813  T
Q  196 caacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaa 293  Q
    ||| |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23355812 caatctaacccaccaaaaagaatttttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaa 23355714  T
Q  294 tcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttag----atttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcac 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||     ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23355713 tcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccgcccattctttcgcatagtagattttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagcac 23355614  T
Q  389 aatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    || |||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  23355613 aagataaattaggtaagaggttcatatgaaatatcatagacgcttag 23355567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 35 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 51055668 - 51055269
Alignment:
Q  35 ttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttga-tttcttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttc 133  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  51055668 ttttccttttattttctcaatcaaatgcttaatcaatttaatatccatattagacttgagtttcttgtaattaaaatttgaccaacctcatcttattttc 51055569  T
Q  134 tctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaact 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||          |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  | ||||||||||||    
T  51055568 tctcatgccttgaggcctctaatctcttcttaaaacctgttttc---caaaattgttaaaatcaatctaacccaccaaaaagaacctttttaggtgaact 51055472  T
Q  232 acattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccc 331  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || || | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51055471 acattggttttgatccctttct-tttaagggtatgtagccaaagaagtta-atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccc 51055374  T
Q  332 cattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 430  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  51055373 cattctttcacttagacttttaggcaataatttttaaataagcaaattaatttagcacaagataaattaggcaagaggttcctatggagtaccgtagacg 51055274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21497286 - 21497038
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21497286 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 21497188  T
Q  287 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21497187 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttag 21497088  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  21497087 cacaagataagttaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgattag 21497038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 227 - 435
Target Start/End: Original strand, 13477078 - 13477285
Alignment:
Q  227 gaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttct 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13477078 gaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttct 13477176  T
Q  327 ccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccata 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  13477177 ccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataatttaggtaagaggttcctacgggataccgta 13477276  T
Q  427 gacgcttag 435  Q
    || ||||||    
T  13477277 gatgcttag 13477285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 189 - 427
Target Start/End: Original strand, 31553360 - 31553596
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31553360 ttaaaaccaacctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttt--ctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 31553457  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||  | |||||||    
T  31553458 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagtagtttagca 31553556  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatag 427  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31553557 caagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatag 31553596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 189 - 427
Target Start/End: Original strand, 31562494 - 31562730
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31562494 ttaaaaccaacctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttt--ctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 31562591  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||  | |||||||    
T  31562592 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagtagtttagca 31562690  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatag 427  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31562691 caagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatag 31562730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 227 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8241229 - 8241020
Alignment:
Q  227 gaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataacca-aaaacatacttcttc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  8241229 gaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcaaaggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaaacttacttcttc 8241131  T
Q  326 tccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaatacca 424  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||     
T  8241130 tccccccattctttcacttagacttttaggcaataattttcaaataagcaaattaatttagcacaagataaattaggcaagagattcctacggagtaccg 8241031  T
Q  425 tagacgcttag 435  Q
    |||| ||||||    
T  8241030 tagatgcttag 8241020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 32608594 - 32608837
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | ||||||||||||||   |   ||||||| ||||||| |||  || |  ||||    
T  32608594 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatcccttc--ccaaaagggtacgtaggcagagggcttgt--cctt 32608689  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataa-ccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32608690 ccaaatcaaataaaaataaaccaaaaacatacttcttctccctccattcttttacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatgtagca 32608789  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  32608790 caagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 32608837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 291 - 435
Target Start/End: Original strand, 23952221 - 23952365
Alignment:
Q  291 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaa 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23952221 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaa 23952320  T
Q  391 tataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23952321 gataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 23952365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 22479631 - 22479876
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  22479631 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 22479728  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  22479729 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaataattttagc 22479828  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  22479829 acaagataa-ttaggtaagaggttcctacgggataccgtagacgcttag 22479876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 20502117 - 20502362
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||| | |||| || |  ||||    
T  20502117 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggtagaggacttgt--cctt 20502213  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20502214 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattcttccacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagc 20502313  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  20502314 acaagacaatctaggtaagaggttcctacgggataccgtagacgcttag 20502362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 284 - 435
Target Start/End: Original strand, 52101236 - 52101389
Alignment:
Q  284 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaat 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  52101236 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatatttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaaataagcaaatgaat 52101335  T
Q  382 ttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52101336 ttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaatatcatagacgcttag 52101389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 38123827 - 38123583
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  38123827 ttaaaatcaacctaacccactaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 38123730  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||  | |||||||    
T  38123729 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagtagtttagca 38123631  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38123630 caagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 38123583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 210 - 435
Target Start/End: Original strand, 21054901 - 21055126
Alignment:
Q  210 aaagaaattcttt-aggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataac 308  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21054901 aaagaaattttttcaggggaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggaaaaggcgtta-atcattccaaatcaaataaaaataac 21054998  T
Q  309 caaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagag 407  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||| ||||| |||||    
T  21054999 caaaaacatacttcttctccctccattcttttacttagatttttaggcaataattttcaaataagcgaattaatttagcacaggataaattaggcaagag 21055098  T
Q  408 gttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||  || |||| |||||||||||    
T  21055099 gttcctacagagtaccgtagacgcttag 21055126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 129 - 413
Target Start/End: Original strand, 22472503 - 22472781
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  22472503 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaaccatttt-----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattttttagtgga 22472596  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22472597 actacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatactccttctcc 22472693  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  22472694 ctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttcct 22472781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 129 - 413
Target Start/End: Original strand, 16135066 - 16135343
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||    
T  16135066 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaaccatttt-----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtgga 16135159  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16135160 actacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 16135257  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  16135258 ctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttcct 16135343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 34337016 - 34336791
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  34337016 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaattt-tttagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 34336920  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa--ttttcaaataagc--aatgaattta 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  || |||||||    
T  34336919 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttttcaagtaagccaaacgaattta 34336820  T
Q  385 gcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  34336819 gcacaagataatctaggtaagcggttcct 34336791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 36849090 - 36848721
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgtttttt----ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttg-att 95  Q
    |||||||  |||||||| || |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  | |||| |||||||| |||    
T  36849090 ttcttaagaaaccttggattttaacccaagtgttttttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaatcaatttaatctccatattagacttggatt 36848991  T
Q  96 tcttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaat 195  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||           ||||| | |||||||    
T  36848990 tcttataattaaaatttgaccaacctcatcttattttctctcatgccttgaggcctcttatctcttctaaaaac----tttttttcaaaaattttaaaat 36848895  T
Q  196 caacctaacccaccaaaga-aattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaat 294  Q
    ||| | ||||||||||| | || | || ||  || ||||   ||||||||||||  || | || |||||| ||||||| || |  |||||| ||||||||    
T  36848894 caatccaacccaccaaaaagaacttttgagtggatctacgacggttttgatccc--ttccgtttagggtacgtaggcaaagaa--tttatcattccaaat 36848799  T
Q  295 caaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataa 372  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||    
T  36848798 caaataaaaacaacaaaaaacatacttcttctccctccattctttcacctagactcttaggcaataattttcatataa 36848721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 189 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 3350927 - 3350707
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||||||||||   |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  3350927 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgttggttttgatcccttc--ccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 3350832  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3350831 ccaaatcaaataaaaacaaccaaaaacatacttcttctccctccattcttttacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagc 3350732  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttc 411  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||    
T  3350731 acaagataatctaagtaagcggttc 3350707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 12464449 - 12464224
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaa--gggtatgtaggcataggatttttatcc 286  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||  ||||| ||||| | |||| || |  ||    
T  12464449 ttaaaatcaatctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaaaagggtacgtaggtagaggacttgt--cc 12464352  T
Q  287 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaattta 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  12464351 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaa-catacttattctccctccattcttttacatagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaattta 12464253  T
Q  385 gcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  12464252 gcacaagataatctaggtaagcggttcct 12464224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 11950135 - 11950385
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagac-ttgatttctt 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11950135 ttcttaataaaccttggtttgtaacataagcgtttt--ccttttattttcttaatcaaatgtttaatcaacttaacattcatactagactttgatttctt 11950232  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctca-ctttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaa 198  Q
    | |||||||| || | |||||||| |||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||           |||||||||||||||||    
T  11950233 gcaattaaaa-ttaatcaacctcatcttatttttctcttatgccttgaggtctctaatctcttcttaaaaccttttttaca--aaaattgttaaaatcaa 11950329  T
Q  199 cctaacccacc--aaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttt 252  Q
     | ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11950330 tccaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatacctttt 11950385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 189 - 410
Target Start/End: Original strand, 18702459 - 18702676
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| |||||||  ||| || |  ||||    
T  18702459 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagggaaactacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcaagggacttgt--cctt 18702555  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||| | |||  || ||||||    
T  18702556 ccaaatcaataaaaaata-ccaaaaacatactttttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaatgaacaagtaacttagca 18702653  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggtt 410  Q
    ||| |||||||||||||| ||||    
T  18702654 caagataatttaggtaagcggtt 18702676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 4282866 - 4282676
Alignment:
Q  228 aactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctc 327  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  4282866 aactacaatggttttgatcccttttt-----agggtatgtaggcaaatgattt--atccttccaaatcaaataaaaacaacaaaaaacatgtttcttctc 4282774  T
Q  328 cccccattctttcacttagatttttaggtaataattttc--aaataagcaatgaatttagcac-aatataatttaggtaagaggttcctatggaatacc 423  Q
    || |||||| ||||||||  ||| ||   ||| ||||||  ||||| ||||| |||||||||| |||  || ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4282773 cctccattc-ttcacttaattttgtaaacaattattttcgaaaataggcaattaatttagcacaaattaaagttaggtaggaggttcctacggaatacc 4282676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 356 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 35097615 - 35097535
Alignment:
Q  356 taataattttcaaataagcaa-tgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  35097615 taataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 35097535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21245081 - 21245028
Alignment:
Q  382 ttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  21245081 ttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 21245028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 10 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 4662267 - 4661841
Alignment:
Q  10 aaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttgtaattaaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4662267 aaccttggtttgtaacccaagtgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttgtaattaaaa 4662169  T
Q  110 tttgaccaacctcactttatttt-ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccac 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||          ||||||||||||||| || | |||||||    
T  4662168 tttgaccaacctcactttatttttctcttatgccttgaggcctctaatctcttcttaaaacctttttttttacaaaattgttaaaattaatccaacccac 4662069  T
Q  209 caaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaata 306  Q
    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4662068 caaaaagaaattttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcatagaatttttatccttccaaatcaaataaaaata 4661970  T
Q  307 accaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaaga 406  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4661969 acaaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataatttaggtaaga 4661870  T
Q  407 ggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4661869 ggttcctacggaataccgtagacgcttag 4661841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 24186512 - 24186084
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt- 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  24186512 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttc-ctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgacttcttt 24186414  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||           ||||| |  ||||||||||    
T  24186413 gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaac-----tattttcaaaaat--taaaatcaac 24186321  T
Q  200 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24186320 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaagt 24186222  T
Q  300 aaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagat-ttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcac-aatataatt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  24186221 aaaaataaccaaaaacatacttcttcttcccccattctttcacttagattttttaggtaataaatttcaaataagcaatgaatttagcacaaagataaat 24186122  T
Q  398 taggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  24186121 taggtaagaggttcctacgggataccgtagacgcttag 24186084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 13832526 - 13832956
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  13832526 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttctt 13832625  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt--ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||| | |||||||||    
T  13832626 gtaattaaaatgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctt-tcttttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatca 13832720  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13832721 acctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-cttaaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 13832819  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatt 397  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13832820 ataaaa-taaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataatt 13832918  T
Q  398 taggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  13832919 taggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 13832956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 13840556 - 13840986
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  13840556 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttctt 13840655  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt--ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||| | |||||||||    
T  13840656 gtaattaaaatgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctt-tcttttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatca 13840750  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13840751 acctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-cttaaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 13840849  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatt 397  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13840850 ataaaa-taaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataatt 13840948  T
Q  398 taggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  13840949 taggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 13840986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 1887314 - 1886889
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt- 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  1887314 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttc-ctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgacttcttt 1887216  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||           ||||| |  ||||||||||    
T  1887215 gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaac-----tattttcaaaaat--taaaatcaac 1887123  T
Q  200 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1887122 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaagt 1887024  T
Q  300 aaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttaga-tttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcac-aatataatt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  1887023 aaaaataaccaaaaacatacttctt---cccccattctttcacttagattttttaggtaataaatttcaaataagcaatgaatttagcacaaagataaat 1886927  T
Q  398 taggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  1886926 taggtaagaggttcctacgggataccgtagacgcttag 1886889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 1901415 - 1900990
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt- 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  1901415 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttc-ctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgacttcttt 1901317  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||           ||||| |  ||||||||||    
T  1901316 gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaac-----tattttcaaaaat--taaaatcaac 1901224  T
Q  200 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1901223 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaagt 1901125  T
Q  300 aaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttaga-tttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcac-aatataatt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  1901124 aaaaataaccaaaaacatacttctt---cccccattctttcacttagattttttaggtaataaatttcaaataagcaatgaatttagcacaaagataaat 1901028  T
Q  398 taggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  1901027 taggtaagaggttcctacgggataccgtagacgcttag 1900990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18303450 - 18303018
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt- 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  18303450 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttc-ctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttcttt 18303352  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||           |||||| |||||||||||    
T  18303351 gtaattaaaattcgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaa--aaaatt-ttaaaatcaac 18303256  T
Q  200 ctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18303255 ctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 18303157  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||     
T  18303156 ataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataaa 18303057  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  18303056 ttaggtaagaggttcctactgaataccgtagacgcttag 18303018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Original strand, 10441987 - 10442350
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgtttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10441987 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt 10442086  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt-ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||            ||||||||||||||||    
T  10442087 gtaattaaaatttgaccaacctcatcttatttttctctcatgccttgaggcctctaatctcttcttaaaaccttttttttt---aaattgttaaaatcaa 10442183  T
Q  199 cctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 296  Q
    || |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10442184 cc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 10442281  T
Q  297 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataatttt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10442282 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt 10442350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 17739776 - 17739338
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttc--t 98  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||| ||||   |    
T  17739776 ttcttaataaaccttgctttgtaacccaattgttttttc-ttttattttcttaatcaaatgcttaatcaatttaacatccatattagacttaattttctt 17739678  T
Q  99 tgtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt-ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||          ||||||| |||||||||    
T  17739677 tttaattaaaatttgaccaacctcatcttatttttctctcatgccttgaggcctctaatctcttcttaaaaccttttttttttcaaaattattaaaatca 17739578  T
Q  198 acctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatc 295  Q
    | |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||    
T  17739577 atctaacccaccaaaaagaacttttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggaaaaggagtta-atccttccaaatc 17739480  T
Q  296 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagat-ttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  17739479 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagattttttaggcaataattttcaaataagcaaatgaatttagcacaagat 17739380  T
Q  394 aatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    || ||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  17739379 aaattaggcaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttag 17739338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 5199380 - 5199136
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5199380 ttaaaaccaacctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttt--ctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 5199283  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||  | |||||||    
T  5199282 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagtagtttagca 5199184  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5199183 caagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 5199136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 5208497 - 5208253
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5208497 ttaaaaccaacctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttt--ctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 5208400  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||  | |||||||    
T  5208399 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagtagtttagca 5208301  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5208300 caagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 5208253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 220 - 435
Target Start/End: Original strand, 10449323 - 10449539
Alignment:
Q  220 tttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10449323 tttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatac 10449421  T
Q  320 ttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatgg 417  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  10449422 ttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaatcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagagattcctatgg 10449521  T
Q  418 aataccatagacgcttag 435  Q
     |||||||||||||||||    
T  10449522 gataccatagacgcttag 10449539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 129 - 435
Target Start/End: Original strand, 17211194 - 17211493
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  17211194 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaaccatttt-----caaaaatcttaaaatcaacctaatccaccaaagaaatttttgaggtga 17211287  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||  ||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17211288 actacatgggttttgatccgttt--cttcaagggtatgtaggcaggggaatcat-tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 17211384  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccata 426  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  17211385 ctccattcttttacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaggataatctaggtaagagggttttatggaataccata 17211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Original strand, 43600363 - 43600781
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagactt-gatttctt 99  Q
    |||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  43600363 ttcttaagaaaccttggattttaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaatcaatttaacctccatattagacttggatttctt 43600462  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
     ||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||           ||||| ||||||||||||     
T  43600463 ataattaaaatttagccaatctcatcttattttctctcatgccttgaggcctcttagctcttcttaaaac----tttttttcaaaaatgttaaaatcaat 43600558  T
Q  200 ctaacccaccaaaga-aattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaa 298  Q
    | ||||||||||| | || | || ||  |||||||   ||||||||||||  || | || |||||| |||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  43600559 ccaacccaccaaaaagaacttttgagtggaactacgacggttttgatccc--ttccctttagggtacgtagtcaaagga--tttatccttccaaatcaaa 43600654  T
Q  299 taaaaataac-caaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataat 396  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||     
T  43600655 taaaaacaacaaaaaaacatacttcttctccctccattctttcacctagactcttaggcaataattttcaaataagcaaaataatttagcacaagataag 43600754  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaatacc 423  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  43600755 ttaggcaataggttcctacggaatacc 43600781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 16545414 - 16545659
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  16545414 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 16545510  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16545511 ccaaatcaaataaaaataatcagaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagc 16545610  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16545611 acaagataatataggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 16545659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16620248 - 16620003
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  16620248 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 16620152  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16620151 ccaaatcaaataaaaataatcagaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagc 16620052  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16620051 acaagataatataggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 16620003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 33533749 - 33533462
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttga-tttctt 99  Q
    |||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||| || |||| ||||||||| ||||||    
T  33533749 ttcttagtaaaccttggattttaacccaagtgctttttccttttattttcttaatcaaatgtttaatcaatttaatatccatattagacttgaatttctt 33533650  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||          ||||| |  |||||||||     
T  33533649 gtaattaaaatttgaccaacctcatcttattttctctcatgccttgaagcctcttatctcttcttcaaacc-----attttcaaaacttctaaaatcaat 33533555  T
Q  200 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaat 294  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||    
T  33533554 ccaacccaccaaagaaattccttaggggaactacattggttttgatccc-ttttctttaagggtatgtaggcaaagga-gttaatccttccaaat 33533462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 29081931 - 29082176
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  29081931 ttaaaatcaacctaacccactaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 29082028  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa--ttttcaaataagcaatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  || |||||    
T  29082029 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataattttttcaaataagcaacaaagttagc 29082127  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29082128 acaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 29082176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 29096690 - 29096935
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  29096690 ttaaaatcaacctaacccactaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 29096787  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa--ttttcaaataagcaatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  || |||||    
T  29096788 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataattttttcaaataagcaacaaagttagc 29096886  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29096887 acaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 29096935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 283 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 4940401 - 4940249
Alignment:
Q  283 atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatt 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4940401 atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaatgaact 4940302  T
Q  383 tagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  4940301 tagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagaagcttag 4940249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 190 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16910034 - 16909791
Alignment:
Q  190 taaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttc 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||    
T  16910034 taaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgaggggaactacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcaaaggacttgt--ccttc 16909938  T
Q  290 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcac 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16909937 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttccccctccactctttcacttagatttttagctaacaattttcaagtaagcaaatgattttagcac 16909838  T
Q  389 aatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    || |||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  16909837 aagataagttaggtaagaggttcctacgggataccgtagacgcttag 16909791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 129 - 413
Target Start/End: Original strand, 16227657 - 16227936
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  16227657 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaaccatttt-----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattttttagtgga 16227750  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16227751 actacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatactccttctcc 16227848  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  16227849 ctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttcct 16227936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 129 - 413
Target Start/End: Original strand, 16244535 - 16244814
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  16244535 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaaccatttt-----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattttttagtgga 16244628  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16244629 actacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatactccttctcc 16244726  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  16244727 ctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttcct 16244814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16120898 - 16120674
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  16120898 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 16120801  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  16120800 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttag 16120702  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16120701 cacaagataatttaggtaagcggttcct 16120674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16147638 - 16147414
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  16147638 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 16147541  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  16147540 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttag 16147442  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16147441 cacaagataatttaggtaagcggttcct 16147414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27966158 - 27965914
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  27966158 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 27966061  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||  | |||||||    
T  27966060 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagtagtttagca 27965962  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27965961 caaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 27965914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27975611 - 27975367
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  27975611 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 27975514  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||  | |||||||    
T  27975513 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagtagtttagca 27975415  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27975414 caaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 27975367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 17514549 - 17514305
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  17514549 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 17514452  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||  | |||||||    
T  17514451 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaccatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagtagtttagca 17514353  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17514352 caaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgtttag 17514305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 17538665 - 17538909
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  17538665 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 17538762  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||  | |||||||    
T  17538763 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaccatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagtagtttagca 17538861  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17538862 caaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgtttag 17538909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Original strand, 40679923 - 40680146
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  40679923 ttaaaatcaacctagcccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 40680019  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40680020 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagc 40680119  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  40680120 acaagataatctaggtaagcggttcct 40680146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 129 - 413
Target Start/End: Original strand, 29023320 - 29023599
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||    
T  29023320 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgtgtgga 29023414  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29023415 actacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactt--atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 29023512  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  29023513 ctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttcct 29023599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 129 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16890005 - 16889707
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||    
T  16890005 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaaccatttt-----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtgga 16889912  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16889911 actacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 16889814  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatag 427  Q
    | |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||| ||| |||  |  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16889813 ctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaagtaaacaagtagcttagcacaaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccatag 16889715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 129 - 411
Target Start/End: Original strand, 29031758 - 29032035
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||    
T  29031758 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgtgtgga 29031852  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29031853 actacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactt--atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 29031950  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttc 411  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  29031951 ctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttc 29032035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 15185501 - 15185745
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||||||||   |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  15185501 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatcccttcc-caaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 15185597  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaata--attttcaaataagcaatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||   ||||||||||| |||  | ||||||    
T  15185598 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaatatttttttcaaataaacaagtagtttagc 15185696  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15185697 acaaaataatttaggtaagaggttcctatggaataccatggacgcttag 15185745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 15200121 - 15200365
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||||||||   |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  15200121 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatcccttcc-caaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 15200217  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaata--attttcaaataagcaatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||   |||||||||||  ||  | ||||||    
T  15200218 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaatatttttttcaaataaagaagtagtttagc 15200316  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15200317 acaaaataatttaggtaagaggttcctatggaataccatggacgcttag 15200365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 4323575 - 4323946
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagactt-gatttctt 99  Q
    |||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||| || |||| ||| ||| ||||||||    
T  4323575 ttcttattaaaccttggattttaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgtttaatcaatttaatatccatattaggcttggatttctt 4323674  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctca-ctttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaa 198  Q
    | |||||||| || |||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          ||||| ||||||||||||    
T  4323675 gcaattaaaa-ttaaccaacttcatcttatttttctctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaacc---tttttttcaaaaatgttaaaatcaa 4323770  T
Q  199 cctaacccaccaaagaaattctttag-gtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcca----aa 293  Q
     |||||||||||||  |||| || || | |||||||| || ||||||| ||      |||  || |||||||||| |||||||   ||||||||    ||    
T  4323771 tctaacccaccaaa-taatttttgagagagaactacaatgattttgattcc-----atttgtggatatgtaggcaaaggatttcattccttccaaatcaa 4323864  T
Q  294 tcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaa 376  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4323865 tcaaataaaaacaa-caaaaacatacttcttctcccccctttctttcatctagactcttaggcaataattttcaaataagcaa 4323946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 44075415 - 44075171
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||     
T  44075415 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctc 44075318  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||| ||||| ||||||||||| |||  |  ||||||    
T  44075317 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcactcaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagtagcttagca 44075219  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||    
T  44075218 caagataatctaggtaagaggttcctacgaaataccgtagatgcttag 44075171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 558656 - 558434
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  558656 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 558559  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||  | |||||||    
T  558558 ccaaatcaaataaaaataaccaaaagcatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagtagtttagca 558460  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||    
T  558459 caagataatctaggtaagcggttcct 558434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 568566 - 568344
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  568566 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 568469  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||  | |||||||    
T  568468 ccaaatcaaataaaaataaccaaaagcatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagtagtttagca 568370  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||    
T  568369 caagataatctaggtaagcggttcct 568344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Original strand, 27435207 - 27435433
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  27435207 ttaaaatcaacctaacccactaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 27435304  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttaga-tttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaattta 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||    
T  27435305 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacataattcttctctctccattcttttacttagattttttaggtaataatttttcgagtaagcaaaatgaattta 27435404  T
Q  385 gcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  27435405 gcacaagataatctaggtaagcggttcct 27435433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Original strand, 27444237 - 27444463
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  27444237 ttaaaatcaacctaacccactaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 27444334  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttaga-tttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaattta 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||    
T  27444335 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacataattcttctctctccattcttttacttagattttttaggtaataatttttcgagtaagcaaaatgaattta 27444434  T
Q  385 gcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  27444435 gcacaagataatctaggtaagcggttcct 27444463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Original strand, 2548907 - 2549129
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  2548907 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 2549004  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||  | |||||||    
T  2549005 ccaaatcaaataaaaataaccaaaagcatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagtagtttagca 2549103  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||    
T  2549104 caagataatctaggtaagcggttcct 2549129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Original strand, 2562793 - 2563015
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  2562793 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 2562890  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||  | |||||||    
T  2562891 ccaaatcaaataaaaataaccaaaagcatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagtagtttagca 2562989  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||    
T  2562990 caagataatctaggtaagcggttcct 2563015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 19384187 - 19384067
Alignment:
Q  315 catacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19384187 catacttcttctccctccattctttcacttagacatt-aggcaataatttttcaaataaacaagtagtttagcacaagataatctaggtaagaggttcct 19384089  T
Q  414 atggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19384088 atggaataccatagacgcttag 19384067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 36476884 - 36476755
Alignment:
Q  284 tccttccaaatcaaataaaaa-taacca-aaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   || || ||||| ||||||||| | |||  ||    
T  36476884 tccttccaaatcaaataaaaaataacaacaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattgggcaataatttttcaaatgaacaagtaa 36476786  T
Q  381 tttagcacaatataatttaggtaagaggttc 411  Q
    ||||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  36476785 tttagcaaatgataatttaggtaagcggttc 36476755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 13492106 - 13492034
Alignment:
Q  364 ttcaaataagcaatg-aatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  13492106 ttcaaataagcaaagcaatttagcacaagatgaattaggtaaaaggttcctacggagtaccgtagacgcttag 13492034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 1875936 - 1875501
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgt--tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttct 98  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1875936 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgtcctttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttct 1875837  T
Q  99 tgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||    
T  1875836 tgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccttttttt---caaaattgttaaaatcaa 1875740  T
Q  199 cctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 296  Q
    ||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1875739 cctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttct-cttcaagggtatgtaggcatgggatttgtatccttccaaatca 1875641  T
Q  297 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggta-ataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataa 395  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1875640 aataaaaataaccaaaaacatgcttcttcttcccccattctttcacttagatttttaggtagttaattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataa 1875541  T
Q  396 tttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  1875540 tttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 1875501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 1890051 - 1889616
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgt--tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-c 97  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  1890051 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgtcctttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgattttc 1889952  T
Q  98 ttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||    
T  1889951 ttgtaattaaaatt-gaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccttttttt---caaaattgttaaaatca 1889856  T
Q  198 acctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatc 295  Q
    |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1889855 acctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttct-cttcaagggtatgtaggcatgggatttgtatccttccaaatc 1889757  T
Q  296 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggta-ataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatata 394  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1889756 aaataaaaataaccaaaaacatgcttcttcttcccccattctttcacttagatttttaggtagttaattttcaaataagcaatgaatttagcacaagata 1889657  T
Q  395 atttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  1889656 atttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 1889616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 772968 - 773396
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  772968 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagggttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgattttctt 773066  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||   ||||||||||    
T  773067 gtaattaaaatttgactaacctcaccttattttatctcgtgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccattttct----aaaatc--taaaatcaac 773160  T
Q  200 ctaacccaccaaaga--aattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    | ||||||||||| |  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  773161 c-aacccaccaaaaataaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-cttaaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 773258  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  773259 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataatt 773358  T
Q  398 taggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  773359 taggtaagaggttcctatggaataccgtagatgcttag 773396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12425805 - 12425373
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagt-gttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ct 98  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  12425805 ttcttaataaaccgtggttcgtaacccaagttgctttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttct 12425706  T
Q  99 tgtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt-ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||           |||||| |||||||||    
T  12425705 tgtaattaaaatttgaccaacctcatcttatttttctctcatgacttgaggcctctt-tcttttcttaaaaccattttca----aaaattcttaaaatca 12425611  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12425610 acctaacccatcaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 12425512  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagat-ttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12425511 ataaaaataaccaaaaacatactttttctccccccattctttcacttagattttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataat 12425412  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12425411 ttaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 12425373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 10640162 - 10640593
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttc--cttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-c 97  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  10640162 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgtttttttttcttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgattttc 10640261  T
Q  98 ttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||   |||| |||    
T  10640262 ttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccattttct----aaaatc--taaagtca 10640355  T
Q  198 acctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatc 295  Q
    ||| |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10640356 acc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatc 10640453  T
Q  296 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataa 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10640454 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaagtaataattttcaaataagcaatgaatgtagcacaagataa 10640553  T
Q  396 tttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10640554 attaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 10640593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8093323 - 8092893
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttatttt-cttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt 99  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8093323 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagttgcttttccttttatttttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttctt 8093224  T
Q  100 -gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaa 198  Q
     |||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||   |||||||||    
T  8093223 tgtaattaaaattcgac-aacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccattttcta---aaaatc--taaaatcaa 8093130  T
Q  199 cctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 296  Q
    || |||||||||||  |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8093129 cc-aacccaccaaaaagaaacttttcaggtgaactacattggttttgatccctttt-cttaaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 8093032  T
Q  297 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  8093031 aataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataaa 8092932  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8092931 ttaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 8092893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27342097 - 27341669
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt- 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  27342097 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttc-ctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttcttt 27341999  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |           ||||||  ||||| ||||    
T  27341998 gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctt-tcccttcttaaaaaccattttct---aaaatt--taaaagcaac 27341905  T
Q  200 ctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    | |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27341904 c-aacccaccaaaaagaaattttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-cttaaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 27341807  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27341806 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataattttc-agtaagcaaatgaatttagcacaagataat 27341708  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27341707 ctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 27341669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 4 - 435
Target Start/End: Original strand, 12998349 - 12998778
Alignment:
Q  4 ttaatgaaccttggtttgtaacccaagtg---ttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt- 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  12998349 ttaataaaccttggtttgtaacccaagttgctttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatactagacttgatttcttt 12998448  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||           ||||||  ||||||||||    
T  12998449 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttatctcatgccttgaggcttcttatcccttcttaaaaccattttct----aaaatt--taaaatcaac 12998542  T
Q  200 ctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    | |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  12998543 c-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcaaaagaattttatccttccaaatcaa 12998640  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  12998641 ataaaaataaccaaaaacatacttcttatccctccattctttcacttagacttttaggtaataatttttaaataagcaatgaatttagcacaagataaat 12998740  T
Q  398 taggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  12998741 taggtaagaggttcctacggaatacagtagacgcttag 12998778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8102128 - 8101698
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttatttt-cttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt 99  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8102128 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagttgcttttccttttatttttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttctt 8102029  T
Q  100 -gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaa 198  Q
     |||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           |||||   |||||||||    
T  8102028 tgtaattaaaattcgac-aacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttgaaaccattttcta---aaaatc--taaaatcaa 8101935  T
Q  199 cctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 296  Q
    || |||||||||||  |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8101934 cc-aacccaccaaaaagaaacttttcaggtgaactacattggttttgatccctttt-cttaaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 8101837  T
Q  297 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  8101836 aataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataaa 8101737  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8101736 ttaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 8101698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21530700 - 21530262
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgt----tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt 96  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21530700 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgtcctttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgattt 21530601  T
Q  97 -cttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaat 195  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||           |||| | |||||||    
T  21530600 tcttgtaattaaaatttgaccaacctcatcttattttctctcatgcctcgaggcctcttatcctttcttaaaaccattttca----aaaaatcttaaaat 21530505  T
Q  196 caacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaa 293  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21530504 caacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttct-cttcaagggtatgtaggcatgggatttgtatccttccaaa 21530406  T
Q  294 tcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggta-ataattttcaaataagcaatgaatttagcacaata 392  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21530405 tcaaataaaaataaccaaaaacatgcttcttcttcccccattctttcacttagatttttaggtagttaattttcaaataagcaatgaatttagcacaaga 21530306  T
Q  393 taattta-ggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  21530305 taatttagggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 21530262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 68 - 435
Target Start/End: Original strand, 52297571 - 52297937
Alignment:
Q  68 tgaattaacattcataatagacttgatttcttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaa 167  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  52297571 tgaattaatattcataatagacttgatttattgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttctaaaa 52297669  T
Q  168 accnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtat 265  Q
     ||           |||| | ||||||||||| ||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  52297670 ccccattttcaa--aaaaatcttaaaatcaacttaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-cttaaaaggtat 52297766  T
Q  266 gtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataatttt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52297767 gtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt 52297866  T
Q  366 caaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52297867 caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 52297937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 229 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20866021 - 20865816
Alignment:
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20866021 actacattgattttgatccctttt-cttaaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatactttttctcc 20865923  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccataga 428  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20865922 ctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtaga 20865823  T
Q  429 cgcttag 435  Q
     ||||||    
T  20865822 tgcttag 20865816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 4747803 - 4747558
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4747803 ttaaaaccaacctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttt--ctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 4747706  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa--ttttcaaataagcaatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||  ||||||||||| |||  || |||||    
T  4747705 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttctcctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataattttttcaaataaacaagtaacttagc 4747607  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4747606 acaagataatttaggcaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 4747558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 55584559 - 55584314
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |   ||||||    
T  55584559 ttaaaatcaacctaaccaaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttt--ctttaagggtatgtaggcaagggagtca-atcctt 55584463  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  55584462 cgaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcctctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttccaagtaagcaaatgaatttagc 55584363  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55584362 acaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 55584314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 261 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 4522545 - 4522371
Alignment:
Q  261 ggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaata 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4522545 ggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaata 4522446  T
Q  361 attttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4522445 attttcaaataaccaatgaatgtagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 4522371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26210782 - 26210537
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatcct 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||  |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||    
T  26210782 ttaaaaccaacctaacccaccaaagaaattttttagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cct 26210685  T
Q  288 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26210684 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataaacaatgaatttagca 26210585  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26210584 caagataatctaggtaagaggttcctatgggataccatagacgcttag 26210537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26219542 - 26219297
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatcct 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||  |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||    
T  26219542 ttaaaaccaacctaacccaccaaagaaattttttagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cct 26219445  T
Q  288 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26219444 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataaacaatgaatttagca 26219345  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26219344 caagataatctaggtaagaggttcctatgggataccatagacgcttag 26219297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 129 - 435
Target Start/End: Original strand, 18009988 - 18010288
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||    
T  18009988 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtgga 18010082  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18010083 actacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 18010179  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccata 426  Q
    |  |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18010180 cttcattctttcatttatatttttaggtaataatttttcaagtaatcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccata 18010279  T
Q  427 gacgcttag 435  Q
    |||||||||    
T  18010280 gacgcttag 18010288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 283 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26034271 - 26034118
Alignment:
Q  283 atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaat 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  26034271 atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacattcttcttcttcctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaagtaagcaaatcaat 26034172  T
Q  382 ttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26034171 ttagcacaagataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 26034118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 129 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21399278 - 21398999
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||           |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  21399278 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tcccttcttaaaaccattttcaa---aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattttttagtgga 21399183  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21399182 actacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatatttcttctcc 21399086  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  21399085 ctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatctagcacaagataatctaggtaagcggttcct 21398999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 25247559 - 25247334
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  25247559 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaatttttttagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 25247462  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttag 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  25247461 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatactccttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttag 25247362  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  25247361 cacaagataatctaggtaagcggttcct 25247334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20866210 - 20866046
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     |||||||    
T  20866210 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagggttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataattga----ttttcttg 20866116  T
Q  101 taattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacc 170  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20866115 taattaaaatttgactaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttattccttcttaaaacc 20866046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Original strand, 10786621 - 10786844
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  10786621 ttaaaatcaacctaacccactaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttc-caaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 10786717  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  10786718 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttag 10786816  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10786817 cacaagataatttaggtaagcggttcct 10786844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Original strand, 19759787 - 19760011
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  19759787 ttaaaatcaacttaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 19759884  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  | |||||||||    
T  19759885 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagccaattgaatttag 19759983  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19759984 cacaagataatttaggtaagcggttcct 19760011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Original strand, 19774543 - 19774767
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  19774543 ttaaaatcaacttaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 19774640  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  | |||||||||    
T  19774641 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagccaattgaatttag 19774739  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19774740 cacaagataatttaggtaagcggttcct 19774767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 129 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 19645320 - 19645042
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||    
T  19645320 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgtgtgga 19645226  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19645225 actacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 19645129  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  19645128 ctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttcct 19645042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Original strand, 34842659 - 34842883
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  34842659 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaatttttttagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 34842755  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttag 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  34842756 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatactccttcttcctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttag 34842855  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  34842856 cacaagataatctatgtaagcggttcct 34842883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 129 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 14718963 - 14718676
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtg- 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||           |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||     
T  14718963 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaacctttttttcaaaaaaaatcttaaaaccaacctaacccaccaaagaaatttttttagtgg 14718865  T
Q  228 aactacattggttttgatccctttttctttaa---gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttctt 324  Q
    |||||| | |||||||||||||||  |   ||   ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14718864 aactacgtcggttttgatccctttcccaaaaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttctt 14718767  T
Q  325 ctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  14718766 ctccctccattcttttacatagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttcct 14718676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 287 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 25652753 - 25652603
Alignment:
Q  287 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaattta 384  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||    
T  25652753 ttccaaatcaaataaaaataatcaaaaacatatttcttttctctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtacccaaatgaattta 25652654  T
Q  385 gcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  25652653 gcacaagataatctaggtaagaggtttctacggaataccgtagacgcttag 25652603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 293 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21811167 - 21811045
Alignment:
Q  293 atcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttagcaca 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  21811167 atcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcaca 21811069  T
Q  390 atataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  21811068 agataatttaggtaagcggttcct 21811045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 312 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 14737064 - 14736961
Alignment:
Q  312 aaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggt 409  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  14737064 aaacatacttcttctccctccattcttttacatagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggt 14736965  T
Q  410 tcct 413  Q
    ||||    
T  14736964 tcct 14736961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 242
Target Start/End: Original strand, 24924585 - 24924638
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggtttt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  24924585 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggtttt 24924638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14737205 - 14737083
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaa-ttctttaggtg 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||           |||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  14737205 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaacctttttttcaaaaaaaatcttaaaaccaacctaacccaccaaagaaatttttttagtgg 14737107  T
Q  228 aactacattggttttgatcccttt 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||    
T  14737106 aactacgtcggttttgatcccttt 14737083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 16775049 - 16775484
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgt--tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttct 98  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16775049 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgtcctttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttct 16775148  T
Q  99 tgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||    
T  16775149 tgtaattaaaatttgaccaaccgcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccttttttt---caaaattgttaaaatcaa 16775245  T
Q  199 cctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 296  Q
    ||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16775246 cctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttct-cttcaagggtatgtaggcatgggatttgtatccttccaaatca 16775344  T
Q  297 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggta-ataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataa 395  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16775345 aataaaaataaccaaaaacatgcttcttcttcccccattctttcacttagatttttaggtagttaattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataa 16775444  T
Q  396 tttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16775445 tttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 16775484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 17662856 - 17662425
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttg 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662856 ttcttaataaaccttggtttataacccaagtgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttg 17662758  T
Q  101 taattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaat-tgttaaaatcaac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||           ||||| | |||||||||||    
T  17662757 taattaaaatttgaccaacctcactttattttctttcatgccttgaggcctctt-tcccctctaaaaacccattttca---aaaatatcttaaaatcaac 17662662  T
Q  200 ctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17662661 ctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggttttttatccttccaaatcaa 17662563  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  17662562 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataaccaatgaatttagcacaagataaat 17662463  T
Q  398 taggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  17662462 taggtaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttag 17662425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 17681985 - 17681554
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttg 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17681985 ttcttaataaaccttggtttataacccaagtgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttg 17681887  T
Q  101 taattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaat-tgttaaaatcaac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||           ||||| | |||||||||||    
T  17681886 taattaaaatttgaccaacctcactttattttctttcatgccttgaggcctctt-tcccctctaaaaacccattttca---aaaatatcttaaaatcaac 17681791  T
Q  200 ctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17681790 ctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatcattccaaatcaa 17681692  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  17681691 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataaccaatgaatttagcacaagataaat 17681592  T
Q  398 taggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  17681591 taggtaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttag 17681554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 16760612 - 16761047
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgt--tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttct 98  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16760612 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgtcctttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttct 16760711  T
Q  99 tgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||    
T  16760712 tgtaattaaaatttgaccaaccgcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccttttttt---caaaattgttaaaatcaa 16760808  T
Q  199 cctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 296  Q
    ||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16760809 cctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttct-cttcaagggtatataggcatgggatttgtatccttccaaatca 16760907  T
Q  297 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggta-ataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataa 395  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16760908 aataaaaataaccaaaaacatgcttcttcttcccccattctttcacttagatttttaggtagttaattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataa 16761007  T
Q  396 tttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16761008 tttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 16761047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 25585437 - 25585009
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt- 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  25585437 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttcttt 25585339  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||            ||||   |||||||||||    
T  25585338 gtaattaaaattcgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaactatttaaa----aaaaaaattaaaatcaac 25585243  T
Q  200 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaat 299  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25585242 ctaacccgccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaat 25585144  T
Q  300 aaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataattta 399  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25585143 aaaaataaccaaaaatatacttcttctccctccactctttcatttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaaggtaattta 25585044  T
Q  400 ggtaagaggttcctatggaataccatagacgctta 434  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  25585043 ggtaagaggttcctacggaataccgtagatgctta 25585009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 4 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 4837952 - 4837519
Alignment:
Q  4 ttaatgaaccttggtttgtaacccaagtg---ttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt- 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  4837952 ttaataaaccttggtttgtaacccaagttgcttttttttcttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttcttt 4837853  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||           |||| | |||||||||||    
T  4837852 gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttca---aaaaatcttaaaatcaac 4837757  T
Q  200 ctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4837756 ctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctgtaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 4837658  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagat-ttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  4837657 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagattttttaggtgataattttcaaataagcaatgaaattagcacaagataaa 4837558  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4837557 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 4837519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 30939303 - 30939735
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  30939303 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttctt 30939402  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt--ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||| | |||||||||    
T  30939403 gtaattaaaatgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctt-tcttttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatca 30939497  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30939498 acctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 30939596  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||     
T  30939597 ataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataaa 30939696  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  30939697 ttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 30939735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 17528847 - 17529278
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgtttttt----ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt 96  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17528847 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgttttttttttccttttattttcttaatctaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgattt 17528946  T
Q  97 -cttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaat 195  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||           |||||   ||||||    
T  17528947 tcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctctttttc-ttcttaaaaccattttct----aaaatc--taaaat 17529039  T
Q  196 caacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaa 293  Q
    ||||| |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17529040 caacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgcaggcataggatttttatccttccaaa 17529137  T
Q  294 tcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatat 393  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17529138 tcaaataaaaataaccaaaaatatacttcttctcccc-cattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagat 17529236  T
Q  394 aatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17529237 aaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 17529278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26871818 - 26871369
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttc-cttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ct 98  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||    
T  26871818 ttcttaataaaccttggttagtaacccaagtgttttttttcttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattatacttgattttct 26871719  T
Q  99 tgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttct--------------ctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaa 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |              ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||           |||    
T  26871718 tgtaattaaaatttgaccaacctcactttgttttttttgtttttttttttctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaaccattttcaaa--aaa 26871621  T
Q  185 attgttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggattttt 282  Q
    | | |||||||||| | |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26871620 aatattaaaatcaatccaacccaccaaaaagaaattttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggattttt 26871522  T
Q  283 atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatt 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26871521 atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatt 26871422  T
Q  383 tagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26871421 tagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 26871369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 435
Target Start/End: Original strand, 17975460 - 17975885
Alignment:
Q  13 cttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-cttgtaattaaaatt 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17975460 cttggttcgtaacccaagtgttttc-ctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgatttgcttgtaattaaaatt 17975558  T
Q  112 tgaccaacctcactttatttt---ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccac 208  Q
    ||| ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17975559 tgaacaacctcaccttatttttttctctcatgccttgaggcctctaatctcttcttaaaacctttttttt--caaaattgttaaaatcaacctaacccac 17975656  T
Q  209 caaa--gaaattcttt-aggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaat 305  Q
    ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17975657 caaaaagaaatttttttaggtgaactacattggttttgatccctatt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaat 17975755  T
Q  306 aaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17975756 aaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataactttcagataagcaatgaatttagcacaagataaattaggtaag 17975855  T
Q  406 aggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  17975856 aggttcctacggagtaccgtagacgcttag 17975885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 39836600 - 39836174
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  39836600 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttctt 39836501  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt--ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||| | |||||||||    
T  39836500 gtaattaaaacgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctt-tcttttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatca 39836406  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggattttt-atccttccaaatca 296  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39836405 acctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggattttttatccttccaaatca 39836307  T
Q  297 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataa 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||    
T  39836306 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaagtaagcaaatcaatttagcacaaggtaa 39836207  T
Q  396 tttaggtaagaggttcctatggaataccataga 428  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  39836206 attaggtaagaggttcctacggaataccgtaga 39836174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 39844642 - 39844209
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  39844642 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttctt 39844543  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt--ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||| | |||||||||    
T  39844542 gtaattaaaacgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctt-tcttttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatca 39844448  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggattttt-atccttccaaatca 296  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39844447 acctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggattttttatccttccaaatca 39844349  T
Q  297 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataa 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||    
T  39844348 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaagtaagcaaatcaatttagcacaaggtaa 39844249  T
Q  396 tttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||    
T  39844248 attaggtaagaggttcctacagaataccgtagatgcttag 39844209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23923446 - 23923009
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttg-atttctt 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  ||| |||||||| |||||||    
T  23923446 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaatcaatttaacatcaatattagacttggatttctt 23923347  T
Q  100 -gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt-ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||          |||| ||||||||||||    
T  23923346 tgtaattaaaatttgaccaacctcatcttatttttctctcatgccttgaggtctctaatctcttcttaaaaccttttttc---caaacttgttaaaatca 23923250  T
Q  198 acctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatc 295  Q
    | ||| |||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23923249 atctagcccaccaaaaagatattttttagatgaactacattggttttgatccctttct-tttaacggtatgtaggcaaagaatttttatccttccaaatc 23923151  T
Q  296 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttaga-tttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  23923150 aaataaaaataaccaaaaacatatttctcctccctccattctttcacttagaccttttaggcaataattttcaaataagcaaattaatttagcacaagat 23923051  T
Q  394 aatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23923050 aaattaggcaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 23923009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 36248708 - 36248955
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 286  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36248708 ttaaaatcaacttaacccaccaaaaagaaattttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-cttcaagggtatgtaggcataggatttttatcc 36248806  T
Q  287 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagc 386  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36248807 ttccaaatcaaataaaaataacaaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagc 36248906  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  36248907 acaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 36248955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22103830 - 22103581
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 286  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22103830 ttaaaatcaacttaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 22103732  T
Q  287 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaattta 384  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||    
T  22103731 ttccaaatcaaataaaactaaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatcta 22103632  T
Q  385 gcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22103631 gcacaagataatctatgtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 22103581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 189 - 423
Target Start/End: Original strand, 19850778 - 19851015
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 286  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19850778 ttaaaagcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-cttaaagggtatgtaggcataggatttttatcc 19850876  T
Q  287 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaattta 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  19850877 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctctctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaattta 19850976  T
Q  385 gcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaatacc 423  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  19850977 gcacaagataatctaggtaagcggttcctttggagtacc 19851015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 189 - 423
Target Start/End: Original strand, 19856814 - 19857051
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 286  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19856814 ttaaaagcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-cttaaagggtatgtaggcataggatttttatcc 19856912  T
Q  287 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaattta 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  19856913 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctctctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaattta 19857012  T
Q  385 gcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaatacc 423  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  19857013 gcacaagataatctaggtaagcggttcctttggagtacc 19857051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 36252697 - 36252450
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |   ||||||    
T  36252697 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcaagggagtca-atcctt 36252600  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa--ttttcaaataagc-aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||    
T  36252599 ccaaatcaaataaaaataaccaaaagcatactacttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttttcaagtaagcaaatgaatttag 36252500  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  36252499 cacaagataatctaggtaagaggttcctacgggataccgtagacgcttag 36252450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 36576943 - 36576700
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  36576943 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgttggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 36576847  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataat-tttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36576846 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacatt-aggcaataatctttcaaataagcaatgaatttagca 36576748  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36576747 caagataaattaggcaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 36576700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 223 - 435
Target Start/End: Original strand, 4583602 - 4583813
Alignment:
Q  223 aggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4583602 aggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcaggggagtca-atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttc 4583699  T
Q  323 ttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaata 421  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4583700 ttcttcctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcatgtaagcaaatcaatttagcacaggataatttaggtaagaggttcctacggaata 4583799  T
Q  422 ccatagacgcttag 435  Q
    || ||||| |||||    
T  4583800 ccgtagacacttag 4583813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 279 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 4843121 - 4842964
Alignment:
Q  279 ttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagat-ttttaggtaataattttcaaataagcaat 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4843121 ttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagattttttaggtgataattttcaaataagcaat 4843022  T
Q  378 gaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4843021 gaaattagcacaagataaattaggtaagaggttcctaaggaataccatagacgcttag 4842964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26913119 - 26912682
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttga-tttctt 99  Q
    |||||||| |||||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  | |||| || |||| |||| |||| |||| |    
T  26913119 ttcttaataaacctttgattttaatccaagtgttttttctttttattttcttaatcaaatgtttaatcaatttaatatccatattagagttgagtttcgt 26913020  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnn---caaaattgttaaaatc 196  Q
     |||||||||||||||||||||||  |||||  || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||             ||||| ||||||||||    
T  26913019 ataattaaaatttgaccaacctcatcttatt--ctttcatgtcttgaggcctcttatctcttcttaaaaccttttttttcttttcaaaaatgttaaaatc 26912922  T
Q  197 aacctaacccaccaaaga--aattctttaggt---gaactacattgg-ttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 290  Q
    || ||||||||||||| |  | |||||| |     ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  26912921 aatctaacccaccaaaaatcatttcttttgagaacgaactacgttgggttttgatccctttt-ctttaagagtatgtaggcaaaggattt--atccttcc 26912825  T
Q  291 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcaca 389  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  26912824 aaatcaaataaaaacaac-aaaaacatacttcttctccccc-attctttcacctagactcttaggcaataattttcaaataagcaaaataatttagcaca 26912727  T
Q  390 atataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    | |||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  26912726 agataa-ttaggcaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttag 26912682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 284 - 435
Target Start/End: Original strand, 15832007 - 15832158
Alignment:
Q  284 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaattt 383  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15832007 tccttccaaatcaaataaaaaaaaccaaaaacatatttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaatgaattt 15832106  T
Q  384 agcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15832107 agcacaagataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 15832158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Original strand, 14204497 - 14204721
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  14204497 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 14204594  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14204595 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagc 14204694  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  14204695 acaaaataatctaggtaagcggttcct 14204721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Original strand, 14219138 - 14219362
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  14219138 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 14219235  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14219236 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagc 14219335  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  14219336 acaaaataatctaggtaagcggttcct 14219362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16190793 - 16190569
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||| |||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  16190793 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgattcctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 16190696  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  16190695 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttag 16190597  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16190596 cacaagataatttaggtaagcggttcct 16190569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 129 - 413
Target Start/End: Original strand, 23092654 - 23092932
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||    
T  23092654 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgtgtgga 23092748  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23092749 actacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 23092845  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  23092846 ctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttcct 23092932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 189 - 434
Target Start/End: Original strand, 25719020 - 25719263
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||| | ||||||||| |||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  25719020 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgattggaactacgtcggttttgattcctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 25719116  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||    
T  25719117 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcgagtaagcaaatgaatttagc 25719215  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgctta 434  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25719216 acaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgctta 25719263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 31001009 - 31000785
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  ||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  31001009 ttaaaatcaacctaacccaccaaataaattcttgagtggaactacgtcagttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 31000912  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  31000911 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttag 31000813  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31000812 cacaagataatttaggtaagcggttcct 31000785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 31207901 - 31207676
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatcct 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||  |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||    
T  31207901 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattttttagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cct 31207804  T
Q  288 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttag 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  31207803 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttccccctccattcttttacatagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttag 31207704  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  31207703 cacaagataatctaggtaagcggttcct 31207676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 6583076 - 6582856
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||  ||||||| | | |||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  6583076 ttaaaatcaacctaacccac--aagaaattttttagtggaactacgtcgattttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 6582982  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa--ttttcaaataagc-aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||    
T  6582981 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttttcaagtaagcaaatgaatttag 6582882  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttc 411  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  6582881 cacaagataatctaggtaagcggttc 6582856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 284 - 413
Target Start/End: Original strand, 22418206 - 22418338
Alignment:
Q  284 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaa 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  22418206 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatactccttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaa 22418305  T
Q  381 tttagcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  22418306 tttagcacaagataatctaggtaagcggttcct 22418338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 299 - 413
Target Start/End: Original strand, 17129388 - 17129505
Alignment:
Q  299 taaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttagcacaatataa 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||    
T  17129388 taaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataa 17129487  T
Q  396 tttaggtaagaggttcct 413  Q
    | |||||||| |||||||    
T  17129488 tctaggtaagcggttcct 17129505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 227 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 22367093 - 22366905
Alignment:
Q  227 gaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttct 326  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22367093 gaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacataattcttct 22366996  T
Q  327 ccccccattctttcacttagat-ttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    | | ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  22366995 ctctccattcttttacttagattttttaggtaataatttttcgagtaagcaaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttcct 22366905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 349 - 435
Target Start/End: Original strand, 25796693 - 25796779
Alignment:
Q  349 ttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  25796693 ttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggattaccgtagacgcttag 25796779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 251
Target Start/End: Original strand, 17129260 - 17129322
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatcccttt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||    
T  17129260 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatcccttt 17129322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 1388326 - 1388249
Alignment:
Q  359 taattttcaaataagcaa-tgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  1388326 taattttcaagtaagcaaatcaatttagcacaaggtaaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 1388249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22023149 - 22023032
Alignment:
Q  192 aaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcca 291  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||   || |||||||||| | || || ||||||||||    
T  22023149 aaatcaatccaacccaccaaataaatttttgaggtgaactacattgattttgatccattttcctt---ggatatgtaggca-aagaattctatccttcca 22023054  T
Q  292 aatcaaataaaaataaccaaaaa 314  Q
    |||| |||||||| ||| |||||    
T  22023053 aatc-aataaaaacaacaaaaaa 22023032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 14335968 - 14335896
Alignment:
Q  364 ttcaaataagcaatg-aatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  14335968 ttcaaataagcaaagcaatttagcacaagataagttaagtaaaaggttcctacggagtaccgtagacgcttag 14335896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23601082 - 23601013
Alignment:
Q  367 aaataagcaatg-aatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  23601082 aaataagcaaagcaatttagcacaagataaattaagtaaaaggttcctacggagtaccgtagacgcttag 23601013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 50826329 - 50826756
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50826329 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttg 50826427  T
Q  101 taattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||   |||||||||||    
T  50826428 taattaaaatttgaccaacctcatcttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccattttct----aaaatc--taaaatcaacc 50826521  T
Q  201 taacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaa 298  Q
     |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50826522 -aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaagtcaaa 50826619  T
Q  299 taaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataattt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  50826620 taaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaacgaatttagcacaagataaatt 50826719  T
Q  399 aggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  50826720 aggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 50826756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 50849531 - 50849097
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgtttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50849531 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt 50849432  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||   ||||||||||    
T  50849431 gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccattttctaaa-aaaatc--taaaatcaac 50849335  T
Q  200 ctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggattttt--atccttccaaatc 295  Q
    | |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  50849334 c-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttcaatccttccaaatc 50849237  T
Q  296 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataa 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  50849236 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaacgaatttagcacaagataa 50849137  T
Q  396 tttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  50849136 attaggtaagaggttcctacggaataccaaagacgcttag 50849097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 4 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 30063213 - 30062785
Alignment:
Q  4 ttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttgtaa 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30063213 ttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttt--ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagatttgatttcttgtaa 30063116  T
Q  104 ttaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaat-tgttaaaatcaaccta 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||           ||||| | ||||||||||||||    
T  30063115 ttaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctt-tcccttctaaaaacccattttca---aaaatatcttaaaatcaaccta 30063020  T
Q  203 acccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaata 300  Q
    ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30063019 acccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcatgggatttttatccttccaaatcaaata 30062921  T
Q  301 aaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagat-ttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataattta 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  30062920 aaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataaatta 30062821  T
Q  400 ggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30062820 ggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 30062785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27551237 - 27550801
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgt-----tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatt 95  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27551237 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgtccttttttttcctttcattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatt 27551138  T
Q  96 tcttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaat 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||          ||||| | |||||||    
T  27551137 tcttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcctttcttaaaaccatttt-----caaaaatcttaaaat 27551043  T
Q  196 caacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaa 293  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27551042 caacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaa 27550944  T
Q  294 tcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaata 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  27550943 tcaagtaaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttagatattaattttcaaataagcaaatcaatttagcacaaga 27550844  T
Q  393 taatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  27550843 taaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 27550801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 4 - 435
Target Start/End: Original strand, 4435399 - 4435826
Alignment:
Q  4 ttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttgtaa 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4435399 ttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttt--ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagatttgatttcttgtaa 4435496  T
Q  104 ttaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaat-tgttaaaatcaaccta 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||           ||||| | ||||||||||||||    
T  4435497 ttaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctt-tcccttctaaaaacccattttca---aaaatatcttaaaatcaaccta 4435592  T
Q  203 acccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaata 300  Q
    ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4435593 acccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggattttcatccttccaaatcaaata 4435691  T
Q  301 aaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttag 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  4435692 aaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatgtagcacaagataaattag 4435791  T
Q  401 gtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4435792 gtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 4435826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18950030 - 18949598
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtg-ttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ct 98  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  18950030 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgcttttttccttttatttccttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgattttct 18949931  T
Q  99 tgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||           |||||   |||||||||    
T  18949930 tgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttctcaaaaccattttcta---aaaatc--taaaatcaa 18949836  T
Q  199 cctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 296  Q
    || |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18949835 cc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaagtca 18949738  T
Q  297 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagat-ttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataa 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18949737 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccctattctttcacttagattttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagatag 18949638  T
Q  396 tttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18949637 attaggtaagaggttcctatggaataccgtagacgcttag 18949598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 39706818 - 39707245
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt- 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  39706818 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttc-ctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgacttcttt 39706916  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||           ||||| |  ||||||||||    
T  39706917 gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaac-----tattttcaaaaat--taaaatcaac 39707009  T
Q  200 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39707010 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggattttcatccttccaaatcaaat 39707108  T
Q  300 aaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataattt 398  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  39707109 aaaaataatcaaaaacatacttcctcttcctccattctttcacttagatttttaggtattaattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataattt 39707208  T
Q  399 aggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  39707209 aggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 39707245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 4 - 435
Target Start/End: Original strand, 4456190 - 4456617
Alignment:
Q  4 ttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttgtaa 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4456190 ttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttt--ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagatttgatttcttgtaa 4456287  T
Q  104 ttaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaat-tgttaaaatcaaccta 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||           ||||| | ||||||||||||||    
T  4456288 ttaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctt-tcccttctaaaaacccattttca---aaaatatcttaaaatcaaccta 4456383  T
Q  203 acccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaata 300  Q
    ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4456384 acccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggattttcatccttccaaatcaaata 4456482  T
Q  301 aaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttag 400  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  4456483 aaaataaccaaaaatatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatgtagcacaagataaattag 4456582  T
Q  401 gtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||| | |||| | |||||||||||    
T  4456583 gtaagaggttcctacgaaatagcgtagacgcttag 4456617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18900921 - 18900488
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtg--ttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttct 98  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||    
T  18900921 ttcttaataaaacttggtttgtaatccaagttgcttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatactagacttattttct 18900822  T
Q  99 tgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||          ||||| | ||||||||||    
T  18900821 tgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttctctcatgcctcgaggcctttt-tcccttctaaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatcaa 18900727  T
Q  199 cctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 296  Q
    ||||||||| ||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18900726 cctaacccatcaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 18900628  T
Q  297 aataaaaataaccaaaaa-catacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataa 395  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18900627 aataaaaataaccaaaaaacatactccttctccccccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataa 18900528  T
Q  396 tttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18900527 tttaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 18900488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 17364684 - 17365118
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgtttttt--ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-c 97  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  17364684 ttcttaataaaccttggttagtaacccaagtgttttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgattttc 17364783  T
Q  98 ttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||           |||| | |||||||||    
T  17364784 ttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaaccattttcaaa--aaaaatattaaaatca 17364881  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17364882 acctaacccactaaataaatttttgaggtgagctacaatggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 17364980  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataat 396  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||     
T  17364981 ataaaaaaaac-aaaaacatacttcttctccctccattatttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataaa 17365079  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  17365080 ttaggtaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttag 17365118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 2256396 - 2256825
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  2256396 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagttgcttttccttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttctt 2256494  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
     ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||    
T  2256495 ctaattaaaacttgaccaacctcacctcattttctctcatgccttgaggcttcctttctcttcttaaaacctatttt----caaaaatcttaaaatcaac 2256590  T
Q  200 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaat 299  Q
     |||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2256591 ttaactcgccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcagaggatttttatccttccaaatcaaat 2256689  T
Q  300 aaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataattta 399  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2256690 aaaaataaccaaaaatatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataattta 2256789  T
Q  400 ggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  2256790 ggtaagaggttcctacagaataccgtagacgcttag 2256825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 41016361 - 41016793
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  41016361 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttctt 41016460  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt--ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||| | |||||||||    
T  41016461 gtaattaaaatgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctt-tcttttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatca 41016555  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41016556 acctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 41016654  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||     
T  41016655 ataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataaa 41016754  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  41016755 ttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 41016793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 17360042 - 17360476
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgtttttt--ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-c 97  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  17360042 ttcttaataaaccttggttagtaacccaagtgttttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagtcttgattttc 17360141  T
Q  98 ttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||           |||| | |||||||||    
T  17360142 ttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaaccattttcaaa--aaaaatattaaaatca 17360239  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17360240 acctaacccactaaataaatttttgaggtgagctacaatggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 17360338  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataat 396  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||     
T  17360339 ataaaaaaaac-aaaaacatacttcttctccctccattatttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataaa 17360437  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  17360438 ttaggtaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttag 17360476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27339440 - 27339020
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt- 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  27339440 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttt--cctttt------ttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttcttt 27339349  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||           |||| | |||||||||||    
T  27339348 gtaattaaaattagaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttca---aaaaatcttaaaatcaac 27339253  T
Q  200 ctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    |||||||||||||  |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339252 ctaacccaccaaaaagaaacttttttggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 27339154  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27339153 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataatt 27339054  T
Q  398 taggtaagaggttcctatggaataccatagacgc 431  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27339053 taggtaagaggttcctacggaataccgtagacgc 27339020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8196807 - 8196374
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgt--tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-c 97  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  8196807 ttcttaataaaacttggtttgtaacccaagtttgctttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatactagacttgattttc 8196708  T
Q  98 ttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||           |||||   ||||||||    
T  8196707 ttgaaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaaccattttct----aaaatc--taaaatca 8196614  T
Q  198 acctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggattttta-tccttccaaat 294  Q
    ||| |||| ||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  8196613 accaaacc-accaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggattttcaatccttccaaat 8196516  T
Q  295 caaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataag-caatgaatttagcacaatat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||    
T  8196515 caaataaaaataaccaaaaacatacttcttctctctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagaaaatcaatttagcacaagat 8196416  T
Q  394 aatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  8196415 aatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 8196374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 13507833 - 13507397
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgtttttt------ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgat 94  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13507833 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgttttttttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgat 13507734  T
Q  95 tt-cttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaa 193  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||           |||||   ||||    
T  13507733 tttcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcattccttgaggcctcttatcctctcttaaaaccattttct----aaaatc--taaa 13507640  T
Q  194 atcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggattttta-tccttcc 290  Q
    ||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13507639 atcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactgcattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggattttcaatccttcc 13507542  T
Q  291 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaa 390  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13507541 aaatcgaataaaaataaccaaaaacatacctcttctccccccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaa 13507442  T
Q  391 tataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13507441 gataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 13507397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 51922650 - 51922217
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgt--tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-c 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  51922650 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtttgctttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatactagacttgattttc 51922551  T
Q  98 ttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||           ||||||  ||||||||    
T  51922550 ttgtaattaaaatttgactaacctcaccttattttctctcatgccttaaggcctcttatcccttcttaaaaccattttcta---aaaatt--taaaatca 51922456  T
Q  198 acctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatc 295  Q
    ||| |||||||||||  |||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51922455 acc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacgttggttttgatccccttt-ctttaaaggtatgtaggcagaggatttttatccttccaaatc 51922358  T
Q  296 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatata 394  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||    
T  51922357 aaagaaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataaacaaatcaatttagcacaagata 51922258  T
Q  395 atttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    || |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  51922257 atctaggtaagaggttcttacggaataccgtagacgcttag 51922217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 16814968 - 16814560
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  16814968 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttctt 16814869  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||           ||||||  ||||||||||    
T  16814868 gtaattaaaacttgaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctcttatctcttctcaaaaccattttct----aaaatt--taaaatcaac 16814775  T
Q  200 ctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    | |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || | ||  |||||||||||||||    
T  16814774 caaacccatcaaaaagaaattatttaggtgaactacattggttttgatcccttt--ctttaagggtatgtaggcaaagaagtta-atccttccaaatcaa 16814678  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||     
T  16814677 ataaaaataaccaaaaacatactttttctcccttcattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataaa 16814578  T
Q  397 ttaggtaagaggttccta 414  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16814577 ttaggtaagaggttccta 16814560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 17935036 - 17935474
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgtttttt-----------ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagac 89  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  17935036 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttttttttttttttccttttattttcttaatcaaatgctttattgaattaatattcatattagac 17935135  T
Q  90 ttgattt-cttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattg 188  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||           ||||||     
T  17935136 ttgattttcttgtaattaaaacttgaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaaccattttct----aaaatt- 17935230  T
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||    
T  17935231 -taaaatcaaccaaacccaccaaaaaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttt--ctttaagggtatgtaggcaaaggagtta-atcctt 17935326  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17935327 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagca 17935426  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  17935427 caagataaattaggtaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttag 17935474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 18890738 - 18890340
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtg--ttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttct 98  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||    
T  18890738 ttcttaataaaacttggtttgtaatccaagttgcttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatactagacttattttct 18890639  T
Q  99 tgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||          ||||| | ||||||||||    
T  18890638 tgtaattaaaatttgaccaacctcatcttattttctctcatgcctcgaggcctctt-tcccttctaaaatcccatttt----caaaaatcttaaaatcaa 18890544  T
Q  199 cctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 296  Q
    ||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18890543 cctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 18890445  T
Q  297 aataaaaataaccaaaaa-catacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataa 395  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18890444 aataaaaataaccaaaaaacatactccttctcctcccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataa 18890345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 3711569 - 3711995
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgtttttt--ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttct 98  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  | |         ||||    
T  3711569 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgttttttttccttttatttttttaatcaaatgcttaattgaattaatattccgatt---------ttct 3711659  T
Q  99 tgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||  |||||||||    
T  3711660 tgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacctttttttttctaaaatt--taaaatcaa 3711757  T
Q  199 cctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 296  Q
    || |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3711758 cc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcacaggatttttatccttccaaatca 3711855  T
Q  297 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataa 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  3711856 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaaatgaatttagcacaagataa 3711955  T
Q  396 tttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
     ||||||||||||| | || |||||||| |||| ||||||    
T  3711956 attaggtaagaggtccatacggaataccgtagatgcttag 3711995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8153717 - 8153285
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttatttt-cttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt 99  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8153717 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagttgcttttccttttatttttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttctt 8153618  T
Q  100 -gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaa 198  Q
     |||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||   |||||||||    
T  8153617 tgtaattaaaattcgac-aacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccattttcta---aaaatc--taaaatcaa 8153524  T
Q  199 cctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggattttta-tccttccaaatc 295  Q
    || |||||||||||  |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  8153523 cc-aacccaccaaaaagaaacttttcaggtgaactacattggttttgatcccttttg-tttaagggtatgtaggcataggattttcaatccttccaaatc 8153426  T
Q  296 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatata 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||    
T  8153425 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaaggta 8153326  T
Q  395 atttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  8153325 aattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 8153285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 18040867 - 18041304
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt--ct 98  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||    
T  18040867 ttcttaataaaccttggttcgtaacccaaatgttttc-ctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgatttttct 18040965  T
Q  99 tgtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt---ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaat 195  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||   || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||          |||||||||||||||    
T  18040966 tgtaattaaaatttgaacaacctcaccttatttttctctgtcatgccttgaggcctctaatctcttcttaaaacctttttttta-caaaattgttaaaat 18041064  T
Q  196 caacctaacccaccaaagaaattcttt--aggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaa 293  Q
    ||| | ||||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||    
T  18041065 caatccaacccaccaaaaaaaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttt--ctttaagggtatgtaggcaagggagtta-atccttccaaa 18041161  T
Q  294 tcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaata 392  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  18041162 tcaaatataaataaccaagaacatgcttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatattcaaataagcaaatcaatttagcacaaga 18041261  T
Q  393 taatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18041262 taatttagttaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 18041304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 41007582 - 41007920
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  41007582 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttctt 41007681  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt--ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||| | |||||||||    
T  41007682 gtaattaaaatgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctt-tcttttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatca 41007776  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41007777 acctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 41007875  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  41007876 ataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcac 41007920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 44 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 43468620 - 43468227
Alignment:
Q  44 tattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttg-atttcttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgcc 142  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | |||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||    
T  43468620 tattttcttaatcaaatgtttaatcaacttaatattcatattagacttggatttcttgcaattaaaatta-atcaacctcatcttattttctctcatgcc 43468522  T
Q  143 ttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnn--caaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattgg 238  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||    
T  43468521 ttgaggcctctaatctcttcttaaaacctttttttttcttcaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattgg 43468422  T
Q  239 ttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctt 338  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  43468421 ttttgatccctttct-tttaagggtatgtaggcaaaggagtta-atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaa-catactttttctcccccctttctt 43468325  T
Q  339 tcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43468324 tcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttaacacaagataatttaggtaagaggttcatatggaataccatagacgcttag 43468227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 15696883 - 15697131
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 286  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15696883 ttaaaatcaacccaacccaccaaaaagaaattttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 15696981  T
Q  287 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggt-aataattttcaaataagcaatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15696982 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaccatacttcttcttcccccattctttcacttagatttttaggtaaataactttcaaataagcaatgaatttag 15697081  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15697082 cacaagataaattaggcaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 15697131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 15711173 - 15711421
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 286  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15711173 ttaaaatcaacccaacccaccaaaaagaaattttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 15711271  T
Q  287 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggt-aataattttcaaataagcaatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15711272 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaccatacttcttcttcccccattctttcacttagatttttaggtaaataactttcaaataagcaatgaatttag 15711371  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15711372 cacaagataaattaggcaagaggttccaatggaataccatagacgcttag 15711421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 15694570 - 15694818
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 286  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15694570 ttaaaatcaacccaacccaccaaaaagaaattttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 15694668  T
Q  287 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggt-aataattttcaaataagcaatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15694669 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaccatacttcttcttcccccattctttcacttagatttttaggtaaataactttcaaataagcaatgaatttag 15694768  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15694769 cacaagataaattaggcaagaggttcctatataataccatagacgcttag 15694818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 14425782 - 14426031
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 286  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14425782 ttaaaatcaacttaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 14425880  T
Q  287 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaattta 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||    
T  14425881 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatcta 14425980  T
Q  385 gcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14425981 gcacaagataatctatgtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 14426031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 2215319 - 2215074
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |   ||||||    
T  2215319 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttt--ctttaagggtatgtaggcaagggagtca-atcctt 2215223  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2215222 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttattctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagc 2215123  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2215122 acaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 2215074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 190 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8204432 - 8204185
Alignment:
Q  190 taaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggattttta-tcc 286  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  8204432 taaaatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggattttcaatcc 8204335  T
Q  287 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  8204334 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctctctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttag 8204235  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  8204234 cacaagataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 8204185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 129 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 6293970 - 6293672
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  6293970 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaaccatctt-----caaaaatcttaaaatcaacctaacccatcaaagaaatttttgaggtga 6293877  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6293876 actacattggttttgatcccttt--ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 6293779  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatag 427  Q
    | |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| | |  || ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  6293778 ctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacgagtaacttagcacaaaataatctaagtaagaggttcctatggaataccatag 6293680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 6563757 - 6564002
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6563757 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttt--ctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 6563854  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataacc-aaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||| ||||| ||||||||||| |||  |  |||||    
T  6563855 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaaacatacttcttctccctccattctttcactta-aacattaggcaataatttttcaaataaacaagtagcttagc 6563953  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6563954 acaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 6564002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 6577426 - 6577671
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6577426 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttt--ctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 6577523  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataacc-aaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||| ||||| ||||||||||| |||  |  |||||    
T  6577524 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaaacatacttcttctccctccattctttcactta-aacattaggcaataatttttcaaataaacaagtagcttagc 6577622  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6577623 acaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 6577671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9184169 - 9183894
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9184169 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgattttctt 9184071  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           |||||  |||||||||||    
T  9184070 gtaattaaaatttgaccaacctcaccttatattctctcatgccttgaagcctcttatcccttcttaaaaccattttct----aaaat--ttaaaatcaac 9183977  T
Q  200 ctaacccacc--aaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggattttt 282  Q
    | ||||||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9183976 c-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgatctacattggttttgatccc-ttttcttaaagggtatgtaggcataggattttt 9183894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 18351184 - 18351431
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |   ||||    
T  18351184 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttt--ctttaagggtatgtaggcaggggagtca-atcc 18351280  T
Q  287 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaattta 384  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  18351281 ttccaatttaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaattta 18351380  T
Q  385 gcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18351381 gcacaagataatctaggtaagaggttcctatgggataccatagacgcttag 18351431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 129 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 10721157 - 10720857
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||    
T  10721157 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaaccatttt-----caaaaatcttaaaatcaatctaaaccaccaaagaaatttttgaggtga 10721064  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaat-aaccaaaaacatacttcttctc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10721063 actacattggttttgatccctttt-cttaaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaaccaaaaacatacttcttctc 10720965  T
Q  328 cccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccata 426  Q
    || |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||| | |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  10720964 cctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaatgaacaagtattttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgta 10720866  T
Q  427 gacgcttag 435  Q
    || ||||||    
T  10720865 gatgcttag 10720857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 191 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 1004510 - 1004289
Alignment:
Q  191 aaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1004510 aaaatcaatctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-cttaaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 1004412  T
Q  291 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagcaca 389  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||  | |||||||||    
T  1004411 aaatcaaataaaaataaccaaaagcatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagtagtttagcaca 1004313  T
Q  390 atataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    | ||||| |||||||| |||||||    
T  1004312 agataatctaggtaagcggttcct 1004289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 189 - 405
Target Start/End: Original strand, 16290847 - 16291062
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |   ||||||    
T  16290847 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaaattttgaggtgaactacattggttttgatcccttt--ctttaagggtatgtaggcaggggagtca-atcctt 16290943  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | ||||||||||||    
T  16290944 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggttataatttttcaagtaaacaaatgaatttagc 16291043  T
Q  387 acaatataatttaggtaag 405  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  16291044 acaagataatctaggtaag 16291062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 5144666 - 5144421
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  5144666 ttaaaatcaacctaacccactaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 5144569  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa--ttttcaaataagcaatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  || |||||    
T  5144568 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataattttttcaaataagcaacaaagttagc 5144470  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5144469 acaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 5144421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 129 - 435
Target Start/End: Original strand, 27978685 - 27978985
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||    
T  27978685 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtgga 27978779  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27978780 actacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 27978876  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccata 426  Q
    |  |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27978877 cttcattctttcatttatatttttaggtaataatttttcaagtaatcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccata 27978976  T
Q  427 gacgcttag 435  Q
    |||||||||    
T  27978977 gacgcttag 27978985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 27958366 - 27958025
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttga-tttctt 99  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| | ||||||    
T  27958366 ttcttaataaaccttggttggtaacccaagtgtttt--ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcacattagactttattttctt 27958269  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttat--tttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||          ||||| | |||||||||    
T  27958268 gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattcttttttccatgctttgaggcctcttatctcttcttagaacc-----attttcaaaaat-ttaaaatca 27958175  T
Q  198 acctaacccac--caaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatc 295  Q
    |   |||||||   ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||  ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27958174 attcaacccactaaaaagaaattttttaggtgaacgacattgattttgatccc-tttcatttaaaggtatgtaggcaaaggatttttatcattccaaatc 27958076  T
Q  296 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagattttt 352  Q
    ||||||    ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27958075 aaataa----aaccaaaaacatgtttcttct--ccccattctttcacttagattttt 27958025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 93 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21185907 - 21185571
Alignment:
Q  93 atttcttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttct-ctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgtta 191  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          |||||   |||    
T  21185907 atttcttgtaattaaaatttgatcaacctcatcttatttttttctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaaccatttt-----caaaaaattta 21185813  T
Q  192 aaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcca 291  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   |  |||  || |||||||||| |||| ||  |||||||||    
T  21185812 aaatcaatccaactcaccaaagaaattctttaggggaactgcattggttttgatcccaaatctttt--ggatatgtaggcaaaggagtta-atccttcca 21185716  T
Q  292 aatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaa 390  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  21185715 aatcaaataaaaacaacaaaaaacatacttcttctcccttcattctttcacttagacctttaggcaataattttcaaataagcaaattaatttaacacaa 21185616  T
Q  391 tataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
     |||| ||||| |||||||||||| | | |||| |||||||||||    
T  21185615 gataaattaggcaagaggttcctacgaagtaccgtagacgcttag 21185571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 11918601 - 11918377
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | ||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  11918601 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttctcaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 11918504  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11918503 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagc 11918404  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  11918403 acaagataatctaggtaagcggttcct 11918377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 11933171 - 11932947
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | ||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  11933171 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttctcaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 11933074  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11933073 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagc 11932974  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  11932973 acaagataatctaggtaagcggttcct 11932947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8223275 - 8223112
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgt--tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-c 97  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  8223275 ttcttaataaaacttggtttgtaacccaagtttgctttttccttttattttcttaatcaaatgcataattgaattaatattcatactagacttgattttc 8223176  T
Q  98 ttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatccctt 161  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8223175 ttgaaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatccctt 8223112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Original strand, 1480034 - 1480258
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  1480034 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 1480131  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  1480132 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttag 1480230  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1480231 cacaagataatttaggtaagcggttcct 1480258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Original strand, 13274853 - 13275079
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaa-attctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcct 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||    
T  13274853 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaatattttttagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cct 13274950  T
Q  288 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaattta 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||    
T  13274951 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatactccttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaattta 13275050  T
Q  385 gcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  13275051 gcacaagataatctaggtaagcggttcct 13275079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 189 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 17563091 - 17562857
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  17563091 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatcccttttccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 17562995  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaa-taaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaattta 384  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||    
T  17562994 ccaaatcaaataaaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaattta 17562896  T
Q  385 gcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaatacc 423  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  17562895 gcacaagataatttaggtaagcggttccttcggaatacc 17562857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 287 - 435
Target Start/End: Original strand, 17630358 - 17630507
Alignment:
Q  287 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttag 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17630358 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcaatttag 17630457  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  17630458 cacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 17630507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 422
Target Start/End: Original strand, 27884561 - 27884959
Alignment:
Q  12 ccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttg-atttcttgtaattaaaat 110  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||| || |||| |||||||| |||| ||||||||||||     
T  27884561 ccttggattttaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgtttaatcaatttaatatccatattagacttgtattttttgtaattaaaa- 27884659  T
Q  111 ttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccacca 210  Q
    || |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          ||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  27884660 ttaaccaacttcatcttattttctctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaacc-----atttccaaaacttttaaaatcaatccaacccacca 27884754  T
Q  211 aagaaattctttag-gtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataacc 309  Q
    ||  | || || || | |||||||| |||||||||| ||       ||  || |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||| || |    
T  27884755 aa-tactttttgagagagaactacaatggttttgattcc-----gcttgtggatatgtaggcaaagga-tctaatccttccaaatcaaataaaaacaa-c 27884846  T
Q  310 aaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttc-aaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagagg 408  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||  || ||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  27884847 aaaaacatacttcttctccatccattctttcacttagacttttaagtaagcattttcaaaataagcaaataa-ttagcacaagataaagtaggcaagagg 27884945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14536997 - 14536879
Alignment:
Q  4 ttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttgtaa 103  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14536997 ttaataaaccttggttcgtaacccaagtgtttt--ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttgtaa 14536900  T
Q  104 ttaaaatttgaccaacctcac 124  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14536899 ttaaaatttgaccaacctcac 14536879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 18886495 - 18886343
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtg--ttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttct 98  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||    
T  18886495 ttcttaataaaacttggtttgtaatccaagttgcttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatactagacttattttct 18886396  T
Q  99 tgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcct 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  18886395 tgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttctctcatgcctcgaggcct 18886343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 129 - 413
Target Start/End: Original strand, 31278579 - 31278856
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||    
T  31278579 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaaccatttt-----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtgga 31278672  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||| | | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31278673 actgcgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 31278769  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  31278770 cttcattctttcacttagatttttaggaaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttcct 31278856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 22951850 - 22952095
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  22951850 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 22951947  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa--ttttcaaataagcaatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||   ||||| |||||  ||||||| ||| |||  || |||||    
T  22951948 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctctcatttaga-cattaggcaataattttttcaagtaaacaagtaacttagc 22952046  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22952047 acaagataatctaagtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 22952095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 22965824 - 22966069
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  22965824 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 22965921  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa--ttttcaaataagcaatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||   ||||| |||||  ||||||| ||| |||  || |||||    
T  22965922 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctctcatttaga-cattaggcaataattttttcaagtaaacaagtaacttagc 22966020  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22966021 acaagataatctaagtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 22966069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 284 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 13847977 - 13847824
Alignment:
Q  284 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaa-catacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaat 381  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  13847977 tccttccaaatcaaataaaaataatcaaaaaacatacttcttctccctccattctttcatttagattcttaagtaataattttcaaataagcaaatcaat 13847878  T
Q  382 ttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13847877 ttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 13847824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 7064025 - 7063800
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatcct 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||| | |||||||||||||||  |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||    
T  7064025 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgattggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cct 7063928  T
Q  288 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttag 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  7063927 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttattctccctccattcttttatatagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttag 7063828  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  7063827 cacaagataatctaggtaagcggttcct 7063800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15675470 - 15675227
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |   |||    
T  15675470 ttaaaatcaacctaatccactaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgtt--ctt 15675374  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||| | |||  | |||||||    
T  15675373 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaatgaacaagtagtttagca 15675275  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15675274 caagataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 15675227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 129 - 435
Target Start/End: Original strand, 25264700 - 25264998
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||    
T  25264700 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaaccatctt-----caaaaatcttaaaatcaacctaacccactaaagaaatttttgagtgga 25264793  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25264794 actacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataactaaaaacatacttcttctcc 25264891  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccataga 428  Q
    | |||||||||||||||||  || ||  |  | ||||||||| | |||  | |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  25264892 ctccattctttcacttagacattaagcaatgatttttcaaatgaacaagtattttagcacaagataatctagataagaggttcctacggaataccgtaga 25264991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 129 - 435
Target Start/End: Original strand, 25274194 - 25274492
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||    
T  25274194 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaaccatctt-----caaaaatcttaaaatcaacctaacccactaaagaaatttttgagtgga 25274287  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25274288 actacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataactaaaaacatacttcttctcc 25274385  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccataga 428  Q
    | |||||||||||||||||  || ||  |  | ||||||||| | |||  | |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  25274386 ctccattctttcacttagacattaagcaatgatttttcaaatgaacaagtattttagcacaagataatctagataagaggttcctacggaataccgtaga 25274485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15684012 - 15683769
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |   |||    
T  15684012 ttaaaatcaacctaatccactaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgtt--ctt 15683916  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||| | |||  | |||||||    
T  15683915 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaatgaacaagtagtttagca 15683817  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||    
T  15683816 caagataatttaggtaagaggttcctacggaatatcgtagatgcttag 15683769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 4503760 - 4503535
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatcct 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   || ||||| ||||| | |||| || |  |||    
T  4503760 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaaagggtacgtaggtagaggacttgt--cct 4503663  T
Q  288 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaattta 384  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||    
T  4503662 tccaaatcaaataaaaaaaaccaaaaacatatttcttctccctccattctttcacttaga-ttttagataataatttttcaagtaagccaaatgaattta 4503564  T
Q  385 gcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  4503563 gcacaagataatctaggtaagcggttcct 4503535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 190 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 17616877 - 17616653
Alignment:
Q  190 taaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaa--gggtatgtaggcataggatttttatcct 287  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||  ||||| ||||| | |||| || |  |||    
T  17616877 taaaatcaatctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaaaagggtacgtaggtagaggacttgt--cct 17616780  T
Q  288 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttag 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  17616779 tccaaatcaaataaaaataaccaaaa-catacttattctccctccattcttttacatagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttag 17616681  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  17616680 cacaagataatctaggtaagcggttcct 17616653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 7096872 - 7096647
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatcct 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||| | |||||||||||||||  |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||    
T  7096872 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgattggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cct 7096775  T
Q  288 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttag 385  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  7096774 tccaaatcaaataaaattaaccaaaaacatacttattctccgtccattcttttatatagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttag 7096675  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  7096674 cacaagataatctaggtaagcggttcct 7096647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 306 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27957459 - 27957329
Alignment:
Q  306 aaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagattttt-aggtaataattttcaaataagcaa-tgaatttagcacaatataatttaggta 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  27957459 aaccaaaaacatacttcttctccccc-attctttcacttatattttttaggcaataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataatttaggta 27957361  T
Q  404 agaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27957360 agaggttcctacggaataccgtagacgcttag 27957329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 189 - 405
Target Start/End: Original strand, 30102067 - 30102286
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaa--gggtatgtaggcataggatttttatcc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||| | ||||||||||| |||  |   ||  ||||| ||||||| |||| || |  ||    
T  30102067 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaattt--ttagtggaactacgtcggttttgatccttttcccaaaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cc 30102162  T
Q  287 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttaga-tttttaggtaataa--ttttcaaataagc--aatgaat 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||  || ||||    
T  30102163 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttttaggtaataattttttcaagtaagccaaacgaat 30102262  T
Q  382 ttagcacaatataatttaggtaag 405  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||    
T  30102263 ttagcacaagataatctaggtaag 30102286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 129 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 24216430 - 24216150
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||    
T  24216430 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaaccatttt-----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtgga 24216337  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||          ||||||||||||    
T  24216336 actacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaata----------tacttcttctcc 24216249  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatag 427  Q
    | |||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24216248 ctccattctttcacttagacatt-aggcaataatttttcaaataaacaagtagtttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatag 24216150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 9567823 - 9567441
Alignment:
Q  34 tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttga-tttcttgtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt 132  Q
    |||||| || |||||||||||||||||  |||||  | |||| || |||| |||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9567823 tttttctttatattttcttaatcaaatctttaatcaatttaatatccatattagatttgggtttcttataattaaaatttgaccaacctcatcttatttt 9567724  T
Q  133 ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttag-gtgaact 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||           ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| || || | |||||    
T  9567723 ctctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaac---tttattttcaaaaatgttaaaatcaatctaacccaccaaataaatttttaagagagaact 9567627  T
Q  232 acattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataac-caaaaacatacttcttctcccc 330  Q
    |||  | ||||||| ||       ||  || |||||||||| | || |   ||||||||||||| |||||||  |||  ||||||||||||||||| ||     
T  9567626 acaacgattttgattcc-----acttgtggatatgtaggcaaacga-tccaatccttccaaatc-aataaaagaaacaaaaaaacatacttcttcttcct 9567534  T
Q  331 ccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaatacc 423  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |  || |||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||    
T  9567533 ccattctttcacttagactctta-gacattattttcaaataagcaaattaatttaacacaagataaagtaggcaagaggttcctatgggatacc 9567441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 169
Target Start/End: Original strand, 27880175 - 27880326
Alignment:
Q  22 taacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagactt-gatttcttgtaattaaaatttgaccaacc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||| || |||| ||||||| | |||||||||||||||| || ||||||     
T  27880175 taacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgtttaatcaatttaatatccatattagacttgggtttcttgtaattaaaa-ttaaccaact 27880273  T
Q  121 tca-ctt---tattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaac 169  Q
    ||| |||   |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27880274 tcatcttatatattttctctcatgccctgaggcctcttatctcttcttaaaac 27880326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 210 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27957974 - 27957882
Alignment:
Q  210 aaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaa 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27957974 aaagaaattttttaggtgaactacattggttttgatccctttca-tttaagggtatgtaggcaaaggatttttatcattccaaatcaaataaaa 27957882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 283 - 423
Target Start/End: Original strand, 27880426 - 27880565
Alignment:
Q  283 atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttc-aaataagcaatgaat 381  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||  ||     
T  27880426 atccttccaaatcaaataaaaacaac-aaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagacttttaagtaagcattttcaaaataagcaaataa- 27880523  T
Q  382 ttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaatacc 423  Q
    ||||||||| ||||  |||| |||||||||||| ||||||||    
T  27880524 ttagcacaagataaagtaggcaagaggttcctacggaatacc 27880565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 362 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 29730643 - 29730570
Alignment:
Q  362 ttttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29730643 ttttcaaataaacaagtagtttagcacaaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 29730570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 10713670 - 10713583
Alignment:
Q  349 ttttaggtaataatttt-caaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| | |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  10713670 ttttaggcaataatttttcaaatgaacaagtattttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 10713583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 348 - 413
Target Start/End: Original strand, 12468968 - 12469036
Alignment:
Q  348 tttttaggtaataatttt-caaataagc--aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  12468968 tttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttcct 12469036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 19225645 - 19226073
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  19225645 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtattttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttctt 19225743  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt-ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          ||||| |  |||||||||    
T  19225744 gtaattaaaatttgaccaacctcatcttatttttctctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaaccatttt-----caaaaat--taaaatcaa 19225836  T
Q  199 cctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaa 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19225837 cctaacccaccgaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctttcaaatcaaa 19225935  T
Q  299 taaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttaga-tttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  19225936 taaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagattttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataaat 19226035  T
Q  398 taggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19226036 taggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 19226073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 43597096 - 43596663
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt- 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  43597096 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttc-ctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttcttt 43596998  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||           |||| | |||||||||||    
T  43596997 gtaattaaaattcgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctt-tcccttctaaaaacccattttca---aaaaatcttaaaatcaac 43596902  T
Q  200 ctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43596901 ctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 43596803  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataa 395  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  43596802 ataaaaataaacaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagacttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataa 43596703  T
Q  396 tttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43596702 tttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 43596663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 43629890 - 43629457
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt- 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  43629890 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttc-ctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttcttt 43629792  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||           |||| | |||||||||||    
T  43629791 gtaattaaaattcgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctt-tcccttctaaaaacccattttca---aaaaatcttaaaatcaac 43629696  T
Q  200 ctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43629695 ctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 43629597  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataa 395  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  43629596 ataaaaataaacaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagacttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataa 43629497  T
Q  396 tttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43629496 tttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 43629457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 1727208 - 1726776
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttatttt-cttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ct 98  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  1727208 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagttgcttttccttttatttttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacctgattttct 1727109  T
Q  99 tgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||   |||||||||    
T  1727108 tgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccattttct----aaaatc--taaaatcaa 1727015  T
Q  199 cctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 296  Q
    || |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1727014 cc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 1726917  T
Q  297 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagat--ttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatata 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1726916 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagata 1726817  T
Q  395 atttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  1726816 aattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 1726776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 28844962 - 28845395
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  28844962 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttctt 28845061  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt--ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||| | |||||||||    
T  28845062 gtaattaaaacgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctt-tcttttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatca 28845156  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttt-tatccttccaaatca 296  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28845157 acctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggattttttatccttccaaatca 28845255  T
Q  297 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataa 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||    
T  28845256 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaagtaagcaaatcaatttagcacaaggtaa 28845355  T
Q  396 tttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  28845356 attaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 28845395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 28853572 - 28854005
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  28853572 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttctt 28853671  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt--ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||| | |||||||||    
T  28853672 gtaattaaaacgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctt-tcttttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatca 28853766  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttt-tatccttccaaatca 296  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28853767 acctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggattttttatccttccaaatca 28853865  T
Q  297 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataa 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||    
T  28853866 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaagtaagcaaatcaatttagcacaaggtaa 28853965  T
Q  396 tttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  28853966 attaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 28854005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 31412629 - 31413062
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaa-tgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31412629 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagttgcttttccttttattttcttaatcaaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttctt 31412728  T
Q  100 -gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctc-atgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| |           |||| | |||||||||    
T  31412729 tgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctctatgccttgaggcctctt-tctcttctaaaaatccattttca---aaaaatcttaaaatca 31412824  T
Q  198 acctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatc 295  Q
    |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31412825 acctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatc 31412923  T
Q  296 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttt-taggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatata 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  31412924 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttct--ccccattctttcacttagattttctaggtaataattttcaaataagcaatgaacttagcacaagata 31413021  T
Q  395 atttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  31413022 agttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 31413062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 31423533 - 31423968
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtg---ttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttc 97  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31423533 ttcttaataaaacttggtttgtaatccaagtcactttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttc 31423632  T
Q  98 tt-gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatc 196  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||           |||| | ||||||||    
T  31423633 tttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctt-tcccttctaaaaacccattttca---aaaaatcttaaaatc 31423728  T
Q  197 aacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaat 294  Q
    ||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31423729 aacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgcaggcataggatttttatccttccaaat 31423827  T
Q  295 caaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatata 394  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  31423828 caaataaaaataaccaaaaacacactttttctccctccattctttcatttagacttttaggtaataattttcaaataagcaatgaattaaacacaagata 31423927  T
Q  395 atttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  31423928 aattagataagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 31423968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 24955882 - 24955451
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||    
T  24955882 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattaaacttgattttctt 24955783  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt--ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||| | |||||||||    
T  24955782 gtaattaaaatgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctt-tcttttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatca 24955688  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24955687 acctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 24955589  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||     
T  24955588 ataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcagtttagcacaa-gtaaa 24955490  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  24955489 ttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 24955451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 24964342 - 24963911
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||    
T  24964342 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattaaacttgattttctt 24964243  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt--ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||| | |||||||||    
T  24964242 gtaattaaaatgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctt-tcttttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatca 24964148  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24964147 acctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 24964049  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||     
T  24964048 ataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcagtttagcacaa-gtaaa 24963950  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  24963949 ttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 24963911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20371130 - 20370777
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20371130 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttc-ctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttcttg 20371032  T
Q  101 taattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||           |||||  ||||||||||||    
T  20371031 taattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctgatgccttgaggcttcttatcccttcttaaaaccattttct----aaaat--ttaaaatcaacc 20370938  T
Q  201 taacccacc--aaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaa 298  Q
     ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20370937 -aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccc-ttttctttaagggtatgtaggcataggattttcatccttccaaatcaaa 20370840  T
Q  299 taaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20370839 taaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataa 20370777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20396833 - 20396480
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20396833 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttc-ctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttcttg 20396735  T
Q  101 taattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||           |||||  ||||||||||||    
T  20396734 taattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctgatgccttgaggcttcttatcccttcttaaaaccattttct----aaaat--ttaaaatcaacc 20396641  T
Q  201 taacccacc--aaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaa 298  Q
     ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20396640 -aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccc-ttttctttaagggtatgtaggcataggattttcatccttccaaatcaaa 20396543  T
Q  299 taaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20396542 taaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataa 20396480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 21931240 - 21931546
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttga-tttctt 99  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  21931240 ttcttaataaaccttggttagtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttctt 21931339  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcac--tttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | | |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||           |||  | |||||||||    
T  21931340 gtaattaaaatttgaccaacctcaccttgttttttttctcatgccttgaggcctcttatttcttcttaaaaccattttca----aaacatattaaaatca 21931435  T
Q  198 acctaacccacc--aaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatc 295  Q
    | | ||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21931436 atccaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactgcattggttttgatccc-ttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatc 21931534  T
Q  296 aaataaaaataa 307  Q
    ||||||||||||    
T  21931535 aaataaaaataa 21931546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 41093956 - 41093707
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41093956 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 41093858  T
Q  287 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaattta 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  41093857 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcaattatacttttaggtaataatttttcaaataagcaaatcaattta 41093758  T
Q  385 gcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  41093757 gcacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 41093707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 20377709 - 20377955
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20377709 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 20377808  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||  |  ||||||    
T  20377809 ccaaatcaaataaaaataactaaaagcatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagtagcttagca 20377907  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  20377908 caagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 20377955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 20386498 - 20386744
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20386498 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 20386597  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||  |  ||||||    
T  20386598 ccaaatcaaataaaaataactaaaagcatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagtagcttagca 20386696  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  20386697 caagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 20386744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 33835531 - 33835287
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33835531 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttt--ctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 33835434  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||  |  ||||||    
T  33835433 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagtagcttagca 33835335  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  33835334 caagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 33835287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 33844230 - 33843986
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33844230 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttt--ctttaagggtatgtaggcatatgatttttatcctt 33844133  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||  |  ||||||    
T  33844132 ccaaatcaaataaaagtaaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagtagcttagca 33844034  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  33844033 caagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 33843986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 284 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23348851 - 23348699
Alignment:
Q  284 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatt 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  23348851 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtagtaattttcaaataagcaaatcaatt 23348752  T
Q  383 tagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23348751 tagcacaagataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 23348699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 11812824 - 11812580
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  11812824 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatccctttctcaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 11812727  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaata-attttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||  ||||||||||| |||  | |||||||    
T  11812726 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cgttaggcaatattttttcaaataaacaagtagtttagca 11812628  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11812627 caaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 11812580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26078759 - 26078514
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  26078759 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatccctttc-caaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 26078663  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataat-tttcaaa-taag-caatgaatttag 385  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||  | |||||    
T  26078662 ccaaatcaaataaaaatagccaaaaacatacttcttctccctccattttttcacttaga-ttttaggtaataatctttcaaagtaagccaagtagtttag 26078564  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26078563 cacaaaataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 26078514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26088738 - 26088493
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  26088738 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatccctttc-caaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 26088642  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataat-tttcaaa-taag-caatgaatttag 385  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||  | |||||    
T  26088641 ccaaatcaaataaaaatagccaaaaacatacttcttctccctccattttttcacttaga-ttttaggtaataatctttcaaagtaagccaagtagtttag 26088543  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26088542 cacaaaataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 26088493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 11802748 - 11802504
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||||| ||| ||   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  11802748 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatccatttctcaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 11802651  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaata-attttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||  ||||||||||| |||  | |||||||    
T  11802650 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cgttaggcaatattttttcaaataaacaagtagtttagca 11802552  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11802551 caaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 11802504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Original strand, 23039050 - 23039273
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||  |   || |||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  23039050 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattttttagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaa-aatggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 23039146  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23039147 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagc 23039246  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  23039247 acaagataatctaggtaagcggttcct 23039273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12170530 - 12170286
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  12170530 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 12170433  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaata-attttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||  ||||||||||| |||  | |||||||    
T  12170432 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cgttaggcaatattttttcaaataaacaagtagtttagca 12170334  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12170333 caaaataatctaggtaagaggttcctatgaaataccatagacgcttag 12170286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12179959 - 12179715
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  12179959 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 12179862  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaata-attttcaaataagcaatgaatttagca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||  ||||||||||| |||  | |||||||    
T  12179861 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cgttaggcaatattttttcaaataaacaagtagtttagca 12179763  T
Q  388 caatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12179762 caaaataatctaggtaagaggttcctatgaaataccatagacgcttag 12179715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 190 - 413
Target Start/End: Original strand, 23984696 - 23984920
Alignment:
Q  190 taaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttc 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| ||||  | |  |||||    
T  23984696 taaaatcaacctaacccaccaaagaaattttttagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacctgt--ccttc 23984793  T
Q  290 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  23984794 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatactccttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagc 23984893  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  23984894 acaagataatctaggtaagcggttcct 23984920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Original strand, 27064026 - 27064248
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||||||||   |   ||||||||||||||| |||| |  |  ||||    
T  27064026 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatcccttc--ccaaaagggtatgtaggcagaggactcgt--cctt 27064121  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  27064122 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttag 27064220  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27064221 cacaagataatttaggtaagcggttcct 27064248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Original strand, 23637282 - 23637506
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  23637282 ttaaaaccaacctaacccaccaaagaaattttttagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 23637379  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||  |||||||||||    
T  23637380 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataattttttaagtaagccaaatgaatttag 23637478  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  23637479 cacaagataatttaggtaagcggttcct 23637506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 23828150 - 23827926
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  23828150 ttaaaaccaacctaacccaccaaagaaattttttagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 23828053  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||  |||||||||||    
T  23828052 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataattttttaagtaagccaaatgaatttag 23827954  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  23827953 cacaagataatttaggtaagcggttcct 23827926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 23835608 - 23835384
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  23835608 ttaaaaccaacctaacccaccaaagaaattttttagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 23835511  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||  |||||||||||    
T  23835510 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataattttttaagtaagccaaatgaatttag 23835412  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  23835411 cacaagataatttaggtaagcggttcct 23835384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 129 - 413
Target Start/End: Original strand, 17642366 - 17642643
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||    
T  17642366 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaaccatttt-----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtgga 17642459  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17642460 actacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 17642556  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||    
T  17642557 ttccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcgaatgaatttagcacaagataatctaggtaaacggttcct 17642643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 129 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21851093 - 21850816
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||    
T  21851093 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaaccatttt-----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaataaatttttgagtgga 21851000  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850999 actacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 21850903  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  21850902 ttccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttcct 21850816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21986570 - 21986346
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  21986570 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 21986473  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||  | |||||||||    
T  21986472 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaagtaataatttttcaagtaagccaagtgaatttag 21986374  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21986373 cacaagataatttaggtaagcggttcct 21986346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21995218 - 21994994
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  21995218 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 21995121  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||  | |||||||||    
T  21995120 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaagtaataatttttcaagtaagccaagtgaatttag 21995022  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21995021 cacaagataatttaggtaagcggttcct 21994994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Original strand, 26177025 - 26177248
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  26177025 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 26177121  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26177122 ccaaatcaaataaaaataacccaaaacatacttattctccctccattcttttacatagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagc 26177221  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  26177222 acaagataatctaggtaagcggttcct 26177248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 189 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27223551 - 27223314
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  27223551 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 27223454  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggta--ataattttcaaataagcaatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||| |  ||| ||||||||||| |||  |  |||||    
T  27223453 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccatactttcacttaga-cattaggcaatatatttttcaaataaacaagtagcttagc 27223355  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatag 427  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27223354 acaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatag 27223314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 189 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27233022 - 27232785
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  27233022 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 27232925  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggta--ataattttcaaataagcaatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||| |  ||| ||||||||||| |||  |  |||||    
T  27232924 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccatactttcacttaga-cattaggcaatatatttttcaaataaacaagtagcttagc 27232826  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatag 427  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27232825 acaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatag 27232785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 31548447 - 31548224
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | ||||||||||||| |  |   ||||||| || |||| |||| || |  | ||    
T  31548447 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctgtcccaa-aagggtacgtgggcagaggacttgt--catt 31548351  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31548350 ccaaatcaaataaaaacaaccaaaaacatacttcttctccctccattcttttacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagc 31548251  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  31548250 acaagataatctaggtaagcggttcct 31548224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 3477167 - 3476922
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | ||||||||||||||   |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  3477167 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatcccttccccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 3477070  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa--ttttcaaataagcaatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||  ||||||||||| |||  |  |||||    
T  3477069 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataattttttcaaataaacaagtagcttagc 3476971  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  3476970 acaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 3476922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 3491937 - 3491692
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | ||||||||||||||   |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  3491937 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatcccttccccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 3491840  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa--ttttcaaataagcaatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||  ||||||||||| |||  |  |||||    
T  3491839 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataattttttcaaataaacaagtagcttagc 3491741  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  3491740 acaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 3491692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 129 - 435
Target Start/End: Original strand, 36458526 - 36458824
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||    
T  36458526 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaaccatttt-----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtgga 36458619  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataa-ccaaaaacatacttcttctc 327  Q
    ||||| | ||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36458620 actacgtcggttttgatccctttctcaa-aagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaaccaaaaacatacttcttctc 36458716  T
Q  328 cccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccata 426  Q
    || |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||| | |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  36458717 cctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaatgaacaagtattttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgta 36458815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 284 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21857108 - 21856977
Alignment:
Q  284 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaat 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  21857108 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccttccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaat 21857009  T
Q  382 ttagcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  21857008 ttagcacaagataatctaggtaagcggttcct 21856977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 189 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27220546 - 27220307
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaa--gggtatgtaggcataggatttttatcc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||  ||||| ||||||| |||| || |  ||    
T  27220546 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cc 27220449  T
Q  287 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggta--ataattttcaaataagcaatgaattta 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||| |  ||| ||||||||||| |||  |  |||    
T  27220448 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccatactttcacttaga-cattaggcaatatatttttcaaataaacaagtagctta 27220350  T
Q  385 gcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatag 427  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27220349 gcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatag 27220307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 284 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21858861 - 21858730
Alignment:
Q  284 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaat 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  21858861 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccttccattctttcacttaaatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaat 21858762  T
Q  382 ttagcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  21858761 ttagcacaagataatctaggtaagcggttcct 21858730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 23762684 - 23762462
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| ||| |||||  ||| ||  | |||||| ||||||||  |   ||||||||||||||| |||| || |   |||    
T  23762684 ttaaaaccaacctatccctccaaagatattttttagtggaaatatgtcggtttttatccctttcccaaaaagggtatgtaggcagaggacttgtt--ctt 23762587  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttag 385  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||  |||||||||||    
T  23762586 tcaaatcaaataaaaataaccaaaaacatatttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataattttttaagtaagccaaatgaatttag 23762488  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttc 411  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||    
T  23762487 cacaagataatttagataagcggttc 23762462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 367 - 435
Target Start/End: Original strand, 21931541 - 21931609
Alignment:
Q  367 aaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21931541 aaataagcaatgaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 21931609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 435
Target Start/End: Original strand, 29190253 - 29190325
Alignment:
Q  364 ttcaaataagcaatg-aatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  29190253 ttcaaataagcaaagcaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttag 29190325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23025946 - 23025830
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  23025946 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaaccatttt-----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattttttagtgga 23025853  T
Q  229 actacattggttttgatcccttt 251  Q
    ||||| | |||||| ||||||||    
T  23025852 actacgtcggttttaatcccttt 23025830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 345105 - 345033
Alignment:
Q  364 ttcaaataagcaatg-aatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  345105 ttcaaataagcaaagcaatttagcacaagataaattaagtaaaaggttcctacggagtaccgtagacgcttag 345033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 359744 - 359672
Alignment:
Q  364 ttcaaataagcaatg-aatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  359744 ttcaaataagcaaagcaatttagcacaagataaattaagtaaaaggttcctacggagtaccgtagacgcttag 359672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20370764 - 20370721
Alignment:
Q  392 ataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20370764 ataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 20370721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 35 - 435
Target Start/End: Original strand, 109202 - 109599
Alignment:
Q  35 ttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttct 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109202 ttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttcttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttct 109301  T
Q  135 ctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactaca 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109302 ctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccttttttt---caaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactaca 109398  T
Q  235 ttggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttt-tatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcccccca 333  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  109399 ttggttttgatccctttt-cttaaagggtatgtaggcatatgattttttatccttcaaaaccaaataaaaataacaaaaaaaatgcttcttctccctcca 109497  T
Q  334 ttctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgctt 433  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  109498 ttctttcactcagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgctt 109597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 122966 - 123197
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  122966 ttcttaataaaccttggtttgtaaaccaagtgtttt--ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttg 123063  T
Q  101 taattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||    
T  123064 taattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacc---tttttttcaaaattgttaaaatcaacc 123160  T
Q  201 taacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123161 taacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattg 123197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 23927365 - 23927794
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23927365 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt-ctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttcttg 23927463  T
Q  101 taattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||           ||||||  |||||||||||    
T  23927464 taattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcttcttatcccttcttaaaaccattttct----aaaatt--taaaatcaacc 23927557  T
Q  201 taacccaccaaa---gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
     |||||||||||   |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23927558 -aacccaccaaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-cttaaagggtatgtaggcatgggatttgtatccttccaaatcaa 23927655  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaa-taattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  23927656 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaattaattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataaa 23927755  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23927756 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 23927794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 19826964 - 19826538
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt- 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  19826964 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttc-ctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttcttt 19826866  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||           ||||| |  ||||||||||    
T  19826865 gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaac-----tattttcaaaaat--taaaatcaac 19826773  T
Q  200 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19826772 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttt-cttaaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaat 19826674  T
Q  300 aaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataattta 399  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  19826673 aaaaatgaccaaaaacatacttcttttccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaagtaagcaatgaatgtagcacaagataagtta 19826574  T
Q  400 ggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19826573 ggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 19826538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 33299897 - 33300328
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgtttttt--ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-c 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  33299897 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgattttc 33299996  T
Q  98 ttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||  ||||||||    
T  33299997 ttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccattttct----aaaatt--taaaatca 33300090  T
Q  198 acctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatc 295  Q
    ||| |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33300091 acc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcatgagatttttatccttccaaatc 33300188  T
Q  296 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatata 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  33300189 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttct-cccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagata 33300287  T
Q  395 atttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33300288 aattaggtaagaggttcatatggaataccatagacgcttag 33300328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20531089 - 20530656
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgt---tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt- 96  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  20531089 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgtctttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttt 20530990  T
Q  97 cttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatc 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||   |||||||    
T  20530989 cttgtaattaaaattttaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccattttct----aaaatc--taaaatc 20530896  T
Q  197 aacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaat 294  Q
    |||| |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20530895 aacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaat 20530798  T
Q  295 caaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagat-ttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatat 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20530797 caaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatcttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagat 20530698  T
Q  394 aatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20530697 aaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 20530656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 27537192 - 27537619
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt- 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  27537192 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttc-ctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgacttcttt 27537290  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||           ||||| |  ||||||||||    
T  27537291 gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaac-----tattttcaaaaat--taaaatcaac 27537383  T
Q  200 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27537384 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaat 27537482  T
Q  300 aaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataattt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||    
T  27537483 aaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataaatt 27537582  T
Q  399 aggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  27537583 aggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 27537619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 27551401 - 27551828
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt- 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  27551401 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttc-ctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgacttcttt 27551499  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||           ||||| |  ||||||||||    
T  27551500 gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaac-----tattttcaaaaat--taaaatcaac 27551592  T
Q  200 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27551593 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaat 27551691  T
Q  300 aaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataattt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||    
T  27551692 aaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataaatt 27551791  T
Q  399 aggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  27551792 aggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 27551828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15389805 - 15389372
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt- 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  15389805 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatgatagacttgatttcttt 15389707  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||           |||| | |||||||||||    
T  15389706 gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaa--aaaaatcttaaaatcaac 15389610  T
Q  200 ctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    |||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15389609 ctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaattacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 15389511  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  15389510 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatgaatttagcacaagataaa 15389411  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15389410 ttaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 15389372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 5996431 - 5996862
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtg-ttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ct 98  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  5996431 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgcttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgattttct 5996530  T
Q  99 tgtaattaaaatttgaccaacctcac-tttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||           ||||||  ||||||||    
T  5996531 tgtaattaaaatttgaccaacctcacctttattttatctcatgccttgaggcttcttttcccttcttaaaaccattttct----aaaatt--taaaatca 5996624  T
Q  198 acctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatc 295  Q
    || ||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5996625 ac-taacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatc 5996722  T
Q  296 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataa 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5996723 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcccctcattctttcacttagatttttaggtaaaatttttcaaataagcaatgaatttagcacaagataa 5996822  T
Q  396 tttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5996823 attaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 5996862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 4 - 398
Target Start/End: Original strand, 13827540 - 13827927
Alignment:
Q  4 ttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttgtaa 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13827540 ttaataaaccttggtttgtaacccaagtgcttt--ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttgtaa 13827637  T
Q  104 ttaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaa 203  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| |||||||||||||||    
T  13827638 ttaaa-tttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaac----tttttttcaaaattattaaaatcaacctaa 13827732  T
Q  204 cccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaa 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13827733 cccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcatgagatttttatacttccaaatcaaataaaa 13827831  T
Q  304 ataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaat-aattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataattt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  13827832 ataaccaaaaacatacttcttctcccgtcattctttcacttagatttttaggtaataaatgttcaaataagcaatgaatttagcacaagntaattt 13827927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 5487509 - 5487080
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  5487509 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatagtagacttgattttctt 5487410  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||   ||||||||||    
T  5487409 gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccattttct----aaaatc--taaaatcaac 5487316  T
Q  200 ctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    | |||||||||||  |||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5487315 c-aacccaccaaaaagaaacttttgaggtgaactacagtggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 5487218  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  5487217 ataaaaataaccaaaaacatacttcttccccctccattctttcatttagacttttaggtaataattttcaaataagcaatgattttagcacaagataaat 5487118  T
Q  398 taggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  5487117 taggtaagaggttcctacggaataccgtagacgtttag 5487080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 14475359 - 14475793
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgt--tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttct 98  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  14475359 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgtcctttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgattttt 14475458  T
Q  99 t--gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatc 196  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||   |||||||    
T  14475459 tttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccattttctg----aaatc--taaaatc 14475552  T
Q  197 aacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaat 294  Q
    |||| |||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14475553 aacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccatttta-tttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaat 14475650  T
Q  295 caaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttaga-tttttaggtaa-taattttcaaataagcaatgaatttagcacaata 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14475651 caaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttttaggtaattaattttcaaataagcaatgaatttagcacaaga 14475750  T
Q  393 taatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  14475751 taatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 14475793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 30823568 - 30823138
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttatttt-cttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttctt 99  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30823568 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagttgcttttccttttatttttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttctt 30823469  T
Q  100 -gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaa 198  Q
     |||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           |||||   |||||||||    
T  30823468 tgtaattaaaattcgac-aacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttgaaaccattttcta---aaaatc--taaaatcaa 30823375  T
Q  199 cctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 296  Q
    || |||||||||||  |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30823374 cc-aacccaccaaaaagaaacttttcaggtgaactacattggttttgatccctttt-cttaaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 30823277  T
Q  297 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  30823276 aataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataaa 30823177  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30823176 ttaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 30823138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 25993354 - 25993787
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  25993354 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttc-ctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttctt 25993452  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt--ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||            ||||||||||||||||    
T  25993453 gtaattaaaatttgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctaatctcttcgtaaaacttttttct----aaaattgttaaaatca 25993548  T
Q  198 acctaacccaccaaa-gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 296  Q
    | | |||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25993549 atccaacccatcaaaagattttttttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcagaggatttttatccttccaaatca 25993647  T
Q  297 aataaaaataaccaaaa-acatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataa 395  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25993648 aataaaaataatcaaaaaacatacttcttctcccccaattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataa 25993747  T
Q  396 tttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25993748 attaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 25993787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 35090727 - 35090295
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  35090727 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgtttaattgaattaatattcatattagacttgattttctt 35090628  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt--ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||          ||||| | |||||||||    
T  35090627 gtaattaaaatgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctt-tcttttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatca 35090533  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35090532 acctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttt-tttaaagatatgtaggcataaaatttttatccttccaaatcaa 35090434  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||     
T  35090433 ataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataaa 35090334  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  35090333 ttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 35090295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 25552188 - 25552620
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  25552188 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttctt 25552287  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt--ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    | ||||||||||||| ||||   || |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||              ||||||||||||||||    
T  25552288 gcaattaaaatttgaacaacgcaaccttattttttctctcatgccttgaggcctctaatctcttcttaaa-----tttttttttaaaattgttaaaatca 25552382  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    |   ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  25552383 attcaacccaccaaaaaaaaaatttaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcagagcatttttatccttccaaatcaa 25552481  T
Q  298 ataaaaataaccaaaa-acatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataat 396  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  25552482 ataaaaataatcaaaaaacatacttcttctcccccaattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataaacaatgaatttagcacaagataaa 25552581  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25552582 ttaggtaagaggttcctaaggaataccatagacgcttag 25552620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 25713520 - 25713955
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaa-ttgaattaacattcataatagacttgattt-ct 98  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| |||||| ||    
T  25713520 ttcttaataaatcttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaaattgaattaatattcatattggacctgattttct 25713619  T
Q  99 tgtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt-ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||           |||||||  |||||||    
T  25713620 tgtaattaaaatttgaccaacctcatcttatttttctctcatgccttgaggacaattatcccttcttaaaaccattttct----aaaattg--aaaatca 25713713  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattcttt--aggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatc 295  Q
    ||| ||||||||||| |||  ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25713714 acc-aacccaccaaaaaaaaactttttaggtgaactacattgattttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatc 25713811  T
Q  296 aaataaaaataa----ccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaat 391  Q
    ||||||||| ||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  25713812 aaataaaaaaaaaaaaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataactttcagataagcaatgaatttagcacaag 25713911  T
Q  392 ataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  25713912 ataaattaggtaagaggttcctacggaataccaaagacgcttag 25713955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 13491806 - 13492237
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttga-tttctt 99  Q
    |||||| | |||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  13491806 ttcttagtaaaccttggattttaacccaagtgccttttccttttattttcttaatcaaatgtttaatcaatttaacatccatattagacttgaatttctt 13491905  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctc-tcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaa 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||           ||||| | ||||||||||    
T  13491906 gtaat-aaaatttgaccaacctcatctcattttttcctcatgccttggggcctcttatctcttcttaaaac------attttcaaaaatattaaaatcaa 13491998  T
Q  199 cctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 296  Q
     |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||    
T  13491999 tctaacccaccaaaaagaaattttttaggtgaactacattggttttgatccctttca-tttaagggtatgtaggcaaaggagtca-atccttccaaatca 13492096  T
Q  297 aataaaa-ataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatata 394  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  13492097 aataaaaaataaccaaacacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagata 13492196  T
Q  395 atttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13492197 aattaggcaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 13492237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 25692785 - 25693131
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgctt-aattgaattaacattcataatagacttga-tttct 98  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||    
T  25692785 ttcttaataaatcttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaaattgaattaatattcatattggacctgattttct 25692884  T
Q  99 tgtaattaaaatttgaccaacctca-ctttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||  |||||||||    
T  25692885 tgtaattaaaatttgaccaacctcatcttatttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccattttct----aaaat--ttaaaatca 25692978  T
Q  198 acctaacccacc--aaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatc 295  Q
    ||| ||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25692979 acc-aacccaccaaaaaaaaactttttaggtgaactacattgattttgatccc-ttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatc 25693076  T
Q  296 aaat---aaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttaga 347  Q
    ||||   ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25693077 aaataaaaaaaaaaaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga 25693131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 25699426 - 25699772
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgctt-aattgaattaacattcataatagacttga-tttct 98  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||    
T  25699426 ttcttaataaatcttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaaattgaattaatattcatattggacctgattttct 25699525  T
Q  99 tgtaattaaaatttgaccaacctca-ctttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||  |||||||||    
T  25699526 tgtaattaaaatttgaccaacctcatcttatttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccattttct----aaaat--ttaaaatca 25699619  T
Q  198 acctaacccacc--aaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatc 295  Q
    ||| ||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25699620 acc-aacccaccaaaaaaaaactttttaggtgaactacattgattttgatccc-ttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatc 25699717  T
Q  296 aaat---aaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttaga 347  Q
    ||||   ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25699718 aaataaaaaaaaaaaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga 25699772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 189 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 16303170 - 16302925
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  ||| |   ||||||    
T  16303170 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttt--ctttaagggtatgtaggtaggggagtcaaatcctt 16303073  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16303072 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagc 16302973  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgctta 434  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16302972 acaagataatctagataagaggttcctatggaataccaaagacgctta 16302925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 80 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12451826 - 12451475
Alignment:
Q  80 cataatagacttga-tttcttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnn 178  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||             
T  12451826 catattagacttgaatttcttgtaattaaaatttgaccaacctcatcttatttt-tctcatgccttgaggcttcttatctcttctcaaaac-----tatt 12451733  T
Q  179 nncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggat 278  Q
      || ||   |||||||||| | |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  12451732 ttcataaactttaaaatcaatccaacccaccaaagaatttttttaggggaactacattggttttgatccatttt-ctttaagggtatgtaggcaaaggag 12451634  T
Q  279 ttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcactt--agatttttaggtaataattttcaaataagc-a 375  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  12451633 tca-atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctctcacttaaatatttctaggtaataattttcaaataagcaa 12451535  T
Q  376 atgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12451534 attgatttagcacaaaataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 12451475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21708769 - 21708524
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |   ||||||    
T  21708769 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttt--ctttaagggtatgtaggcaagggagtca-atcctt 21708673  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21708672 ccaaatcaaataaaagtaaccaaaaacatacttgttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagc 21708573  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21708572 acaagataatctaggtaagaggtttctatggaataccatagacgcttag 21708524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 191 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27047449 - 27047206
Alignment:
Q  191 aaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27047449 aaaatcaatctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-cttaaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 27047351  T
Q  291 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagcaca 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||| ||| |||  || ||||||||    
T  27047350 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaagtaaacaagtaacttagcaca 27047252  T
Q  390 atataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27047251 agataatctaagtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 27047206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 191 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27057693 - 27057450
Alignment:
Q  191 aaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 290  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27057693 aaaatcaatctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-cttaaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 27057595  T
Q  291 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatttagcaca 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||| ||| |||  || ||||||||    
T  27057594 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaagtaaacaagtaacttagcaca 27057496  T
Q  390 atataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27057495 agataatctaagtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 27057450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18205341 - 18205095
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  18205341 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 18205244  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18205243 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagctttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagc 18205144  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18205143 acaaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 18205095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18220340 - 18220094
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  18220340 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 18220243  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18220242 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagctttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagc 18220143  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18220142 acaaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 18220094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 129 - 435
Target Start/End: Original strand, 16588922 - 16589220
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  ||    
T  16588922 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatcaatctaacccaccaaagaaatttttgagtgga 16589016  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16589017 actacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 16589113  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccataga 428  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  16589114 ctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacgggataccgtaga 16589213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 129 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16606458 - 16606160
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  ||    
T  16606458 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatcaatctaacccaccaaagaaatttttgagtgga 16606364  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16606363 actacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 16606267  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccataga 428  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  16606266 ctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacgggataccgtaga 16606167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 16635375 - 16635618
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  16635375 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 16635471  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcac 388  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16635472 ccaaatcaataaaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataaacaatgaatttagcac 16635571  T
Q  389 aatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16635572 aaaataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 16635618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 16645332 - 16645575
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  16645332 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 16645428  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcac 388  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16645429 ccaaatcaataaaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataaacaatgaatttagcac 16645528  T
Q  389 aatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16645529 aaaataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 16645575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 24920437 - 24920681
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  24920437 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatcccttt--ccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 24920532  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |    
T  24920533 ccaaatcaaataaaaatgaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaagtaataatttttcaagtaagcaaataaatttaac 24920632  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24920633 acaagataatctaggtaagaggttcctatgggataccatagacgcttag 24920681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 27960235 - 27960481
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  27960235 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttc-caaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 27960331  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaa-taagcaa--tgaattta 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |  ||||||||    
T  27960332 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttt-aggaaataatttttcaaagtaagccaagtgaattta 27960430  T
Q  385 gcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27960431 gcataagataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 27960481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 24485646 - 24485400
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||| | ||||||| ||||||  |  ||||    
T  24485646 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggcacgtaggcagaggattcgt--cctt 24485550  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| |||||    
T  24485549 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaaatgattttag 24485450  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  24485449 cacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 24485400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 129 - 413
Target Start/End: Original strand, 25653891 - 25654168
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||    
T  25653891 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaaccatttt-----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaagaatttttttagtgga 25653984  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25653985 actacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 25654081  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25654082 ctccattctttcacttaaatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcct 25654168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 30995729 - 30995484
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  30995729 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 30995632  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggta--ataattttcaaataagcaatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |  ||| ||||||||||| |||  |  |||||    
T  30995631 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ctttaggcaatatatttttcaaataaacaagtagcttagc 30995533  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30995532 acaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 30995484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 18111887 - 18112133
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtg-aactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcct 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||| |||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||    
T  18111887 ttaaaatcaacctaacccactaaagaaattttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cct 18111984  T
Q  288 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa--ttttcaaataagcaatgaatttag 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||  ||||||||||| |||  | |||||    
T  18111985 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataattttttcaaataaacaagtagtttag 18112083  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18112084 cacaaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 18112133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 18126432 - 18126678
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtg-aactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcct 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||| |||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||    
T  18126432 ttaaaatcaacctaacccactaaagaaattttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cct 18126529  T
Q  288 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa--ttttcaaataagcaatgaatttag 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||  ||||||||||| |||  | |||||    
T  18126530 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataattttttcaaataaacaagtagtttag 18126628  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18126629 cacaaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 18126678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 129 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 23982965 - 23982686
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  23982965 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaaccatttt-----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattttttagtgga 23982872  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctc 327  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23982871 actacgtcggttttgatccctttcccaaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctc 23982774  T
Q  328 cccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  23982773 cctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttcct 23982686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21358819 - 21358594
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatcct 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||  |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||    
T  21358819 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattttttagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cct 21358722  T
Q  288 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaattta 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||    
T  21358721 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaattta 21358623  T
Q  385 gcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  21358622 gcacaagataatctaggtaagcggttcct 21358594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 23962801 - 23962576
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatcct 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||  |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||    
T  23962801 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattttttagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cct 23962704  T
Q  288 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaattta 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||    
T  23962703 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaattta 23962605  T
Q  385 gcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  23962604 gcacaagataatctaggtaagcggttcct 23962576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 189 - 428
Target Start/End: Original strand, 28304189 - 28304427
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |   |||    
T  28304189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgtt--ctt 28304285  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataacca-aaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa--ttttcaaataagcaatgaatttag 385  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||  ||||||||| | |||  | |||||    
T  28304286 ccaaatcaaataaaaataacaagaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataattttttcaaatgaacaagtattttag 28304384  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccataga 428  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28304385 cacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtaga 28304427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 28266476 - 28266720
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| | |||||||||||||||  |   | ||||| ||||||| |||| || |   |||    
T  28266476 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtgtaactacgtcggttttgatccctttcccaaca-gggtacgtaggcagaggacttgtt--ctt 28266572  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa--ttttcaaataagcaatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||  ||||||||| | |||  | ||||||    
T  28266573 ccaaatcaaataaaaataacagaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataattttttcaaatgaacaagtattttagc 28266671  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  28266672 acaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 28266720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 28345225 - 28345469
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| | |||||||||||||||  |   | ||||| ||||||| |||| || |   |||    
T  28345225 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtgtaactacgtcggttttgatccctttcccaaca-gggtacgtaggcagaggacttgtt--ctt 28345321  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa--ttttcaaataagcaatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||  ||||||||| | |||  | ||||||    
T  28345322 ccaaatcaaataaaaataacagaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataattttttcaaatgaacaagtattttagc 28345420  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  28345421 acaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 28345469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 359 - 435
Target Start/End: Original strand, 13827922 - 13827998
Alignment:
Q  359 taattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13827922 taattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 13827998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18753755 - 18753591
Alignment:
Q  3 cttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttga-tttcttgt 101  Q
    |||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||| || ||||   ||||||  |||||| |    
T  18753755 cttaataaaccttggattttaactcaaatgttttttccttttatttctttaatcaaatgtttaatcaatttaatatccatat--gacttgggtttcttat 18753658  T
Q  102 aattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaa 168  Q
    |||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  18753657 aattaaaatttgaaaaacttcatcttattttctctcatgtcttgatgcctcttatctctttttaaaa 18753591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 28267822 - 28267750
Alignment:
Q  364 ttcaaataagcaatg-aatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  28267822 ttcaaataagcaaagcaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttag 28267750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 28346571 - 28346499
Alignment:
Q  364 ttcaaataagcaatg-aatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  28346571 ttcaaataagcaaagcaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttag 28346499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 379 - 435
Target Start/End: Original strand, 11063825 - 11063881
Alignment:
Q  379 aatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  11063825 aatttagcacaagataaattaagtaaaaggttcctacggagtaccgtagacgcttag 11063881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 4170 - 4602
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagt-gttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ct 98  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  4170 ttcttaataaaccgtggttcgtaacccaagttgctttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttct 4269  T
Q  99 tgtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt-ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||           |||||| |||||||||    
T  4270 tgtaattaaaatttgaccaacctcatcttatttttctctcatgacttgaggcctctt-tcttttcttaaaaccattttca----aaaattcttaaaatca 4364  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 297  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4365 acctaacccatcaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaa 4463  T
Q  298 ataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttaga-tttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4464 ataaaaataaccaaaaacatactttttctccccccattctttcacttagattttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataat 4563  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4564 ttaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag 4602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 3)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 188342 - 188774
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagt-gttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ct 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  188342 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagttgctttttctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatactagacttgattttct 188441  T
Q  99 tgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||            ||||||  |||||||||    
T  188442 tgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcatcttatcccttcttaaaactattttct----aaaatt--taaaatcaa 188535  T
Q  199 cctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 296  Q
    |  |||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  188536 cg-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccatttt-ctttaagggtatgtaggcaagggatttttatctttccaaaaca 188633  T
Q  297 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttaga-tttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatata 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||    
T  188634 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttttaggtaataattttcaagttagcaaatgaatttagcacaagata 188733  T
Q  395 atttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  188734 atttaggtaagaggatcatatggaataccatagacgcttag 188774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 194718 - 194964
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  194718 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--cctt 194815  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  194816 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagc 194915  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  194916 acaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagatgcttag 194964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 284 - 435
Target Start/End: Original strand, 159154 - 159305
Alignment:
Q  284 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaatgaatt 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| |||  | ||    
T  159154 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaagcatacttcttctccctccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagtagtt 159252  T
Q  383 tagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  159253 tagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 159305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Original strand, 19575 - 20013
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttc--cttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-c 97  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19575 ttcttaataaaccttggtctgtaacccaagtgtttttttttcttttattttcttaatcaaatgctaaattgaattaacattcatattagacttgatttgc 19674  T
Q  98 ttgtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt-ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatc 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||          ||||||||||||||||    
T  19675 ttgtaattaaaatttgaacaacctcatcttatttttctcttatgccttgaggcctctaatctcttcttaaaaccttttttta--caaaattgttaaaatc 19772  T
Q  197 aacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaat 294  Q
    |||| ||| |||||||  ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |   ||||||||||||    
T  19773 aacccaactcaccaaaaagaatttttttaggtgaactacattggtgttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcaagggagtca-atccttccaaat 19870  T
Q  295 caaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagcacaata 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  19871 caaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaaga 19970  T
Q  393 taatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19971 taatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 20013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 434
Target Start/End: Original strand, 10197 - 10627
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ctt 99  Q
    |||||||| ||||||||  | |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||    
T  10197 ttcttaataaaccttggactttaacccaagtgtttt--ccttttattttcttaattaaatgcttaattgaattaatgttcatattagacttgattttctt 10294  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt-ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||           ||||||||||||||||||    
T  10295 gtaattaaaatttgaccaacctcatcttatttttctctcatgccttgaggcctctaatctcttcttaaaac--tttttttttcaaaattgttaaaatcaa 10392  T
Q  199 cctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaa 298  Q
     |  ||||| |||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  10393 tcctacccaacaaagaaactttttaggtaagctacattggttttgatcccttt--ccttaagggtatgtaggcaaaggagtta-atccttccaaatcaaa 10489  T
Q  299 taaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| |||||    
T  10490 taaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtatgcaaatgaatttagcacaagataat 10589  T
Q  397 ttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgctta 434  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10590 ctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgctta 10627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 73 - 435
Target Start/End: Original strand, 29774 - 30131
Alignment:
Q  73 taacattcataatagacttgatttcttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnn 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  29774 taacattcataatagacttgatttcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccat 29873  T
Q  173 nnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtagg 270  Q
             |||||   ||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29874 tttct----aaaata--taaaatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacctcattggttttgatcccttt--ctttaagggtatgtagg 29964  T
Q  271 cataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttaga--tttttaggtaataattttcaa 368  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  29965 cagaggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcccccattctttcacttagatttttttaggtaataattttcaa 30064  T
Q  369 ataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  30065 ataagcaatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagacacttag 30131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 39019 - 38672
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttc-cttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt-ct 98  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  39019 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgttttttttcttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaagattcataatagacttgattttct 38920  T
Q  99 tgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||   |||| ||||    
T  38919 tgtaattaaaatttgaccaacctaaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaac----tattttctaaaat--ctaaagtcaa 38826  T
Q  199 cctaacccacc--aaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 296  Q
    || ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38825 cc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccc-ttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatca 38728  T
Q  297 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagattttt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  38727 aataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagactttt 38672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1804 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1804
Description:

Target: scaffold1804; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 234 - 435
Target Start/End: Original strand, 1 - 201
Alignment:
Q  234 attggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcccccca 333  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1 attggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 99  T
Q  334 ttctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgctt 433  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  100 ttcattcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacagaataccgtagacgctt 199  T
Q  434 ag 435  Q
    ||    
T  200 ag 201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 10202 - 9956
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |   ||||||    
T  10202 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcc-tttttctttaagggtatgtaggcaagggagtca-atcctt 10105  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10104 ccaaatcaaataaaaatagccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagc 10005  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10004 acaagataatctaggtaagaggtttctatggaataccatagacgcttag 9956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0545 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0545
Description:

Target: scaffold0545; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8283 - 8011
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgt----tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgattt 96  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8283 ttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgtcctttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgattt 8184  T
Q  97 cttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||          ||||| | ||||||||    
T  8183 cttgtaattaaaatttgaccaacctcatcttattttctctcatgcctcgaggcctcttatcctttcttaaaacc-----attttcaaaaatcttaaaatc 8089  T
Q  197 aacctaacccacc--aaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcat 273  Q
    |||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8088 aacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccc-ttttctttaagggtatgtaggcat 8011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0257 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0257
Description:

Target: scaffold0257; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 10139 - 10388
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10139 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttct-cttcaagggtatgtaggcatgggatttgtatcc 10237  T
Q  287 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggta-ataattttcaaataagcaatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10238 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatgcttcttcttcccccattctttcacttagatttttaggtagttaattttcaaataagcaatgaatttag 10337  T
Q  386 cacaatataattta-ggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  10338 cacaagataatttagggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 10388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 260 - 435
Target Start/End: Original strand, 4297 - 4473
Alignment:
Q  260 gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaat 359  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4297 gggtacgtaggcaaaggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaat 4396  T
Q  360 aattttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4397 aatttttaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 4473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1120 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold1120
Description:

Target: scaffold1120; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 1268 - 1428
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1268 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttt--ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttg 1365  T
Q  101 taattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttct 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1366 taattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgtcttgaggcctcttatcccttct 1428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 12504 - 12753
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12504 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagttgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttcttg 12603  T
Q  101 taattaaaatttgaccaacctcacttta--ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||          |||||   ||||||||||    
T  12604 taattaaaatttgaccaacctcatcttattttttctcccatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaacc-----attttcaaaa-aattaaaatcaa 12697  T
Q  199 cctaacccacc--aaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttt 252  Q
    |||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698 cctaacccaccaaaaaaaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt 12753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 340 - 97
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  340 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 244  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaatgaatttagcac 388  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  243 ccaaatcaataaaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataaacaatgaatttagcac 144  T
Q  389 aatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  143 aaaataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 97  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 4495 - 4742
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  4495 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 4592  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcccc-ccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttag 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  4593 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttag 4692  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  4693 cacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 4742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 129 - 435
Target Start/End: Original strand, 63135 - 63434
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||    
T  63135 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaaccatttt-----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtgga 63228  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 328  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63229 actacgtcggttttgatccctttcccaa-aagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 63325  T
Q  329 ccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccata 426  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  63326 ctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatgggataccata 63425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 116 - 412
Target Start/End: Original strand, 32325 - 32622
Alignment:
Q  116 caacctcactttatttt-ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaa-- 212  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||          |||||||||||||||||| | |||||||||||      
T  32325 caacctcaccttatttttctctcatgccttgaggcctctaatctcttcttaaaacctttttttta-caaaattgttaaaatcaatccaacccaccaaaaa 32423  T
Q  213 gaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaa 312  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32424 gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttt--ctttaagggtatgtaggcaagggagtca-atccttccaaatcaaataaaaataaccaaa 32520  T
Q  313 aacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggtt 410  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||    
T  32521 aacatacttattctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaatcaaatgaatttagcataagataatctaagtaagaggtt 32620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19667 - 19404
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttg-atttctt 99  Q
    |||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  | |||| || |||| |||||||| |||||||    
T  19667 ttcttagtaaaccttggatt-taacccaagtgttttttccttttatttccttaatcaaatgtttaatcaatttaatatccatattagacttgaatttctt 19569  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaac 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          ||||| | ||||||||||     
T  19568 gtaattaaaatttgaccaaccttaacttatttt-tctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaacc-----aatttcaaaaat-ttaaaatcaat 19476  T
Q  200 ctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggca 272  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19475 ccaacccaccaaagaaattctttaggggaactacattggttttgatccc-ttttctttaagggtatgtaggca 19404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26588 - 26354
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttg-atttctt 99  Q
    |||||| | |||||||| || ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    |||| || |||| |||||||| |||||||    
T  26588 ttcttagtaaaccttggatt-taacccaagtacttttttcttttatttccttaatcaaatgtttaatcattttaatatccatattagacttggatttctt 26490  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcac--tttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatca 197  Q
    | ||||||||||||||||| ||||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          ||||| | |||||||||    
T  26489 gcaattaaaatttgaccaatctcatctttttttttttctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaacc-----attttcaaaaat-ttaaaatca 26396  T
Q  198 acctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggt 239  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26395 atccaacccaccaaagaaattctttaggggaactacattggt 26354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 435
Target Start/End: Original strand, 63287 - 63359
Alignment:
Q  364 ttcaaataagcaatg-aatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  63287 ttcaaataagcaaagcaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttag 63359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 46852 - 46606
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  46852 ttaaaatcaacctaacctgccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 46755  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataa-gcaatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||   ||||||||||||    
T  46754 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagcaattaaatgaatttagc 46655  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46654 acaagataatctaggtaagaggttcctatggtataccatagacgcttag 46606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 284 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 603 - 450
Alignment:
Q  284 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaat 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  603 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattcattcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaat 504  T
Q  382 ttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  503 ttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 284 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 80648 - 80495
Alignment:
Q  284 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaat 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  80648 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaat 80549  T
Q  382 ttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  80548 ttagaacaagataatctaggtaagaggttcctatgggataccatagacgcttag 80495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 284 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 64246 - 64093
Alignment:
Q  284 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaat 381  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||    
T  64246 tcctaccaaatcaaataaaaataaccaaaaatatacttcttcttcctccattctttcagttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaaggaat 64147  T
Q  382 ttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  64146 ttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatgggataccatagacgcttag 64093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 189 - 435
Target Start/End: Original strand, 14832 - 15079
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||     
T  14832 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattcttgagtggaaatacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctc 14929  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaat-aaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttag 385  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  14930 ccaaatcaaataaaaaacaaccaaaaacatacttcttctccctccattcttttacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttag 15029  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15030 cacaagataatctaagtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttag 15079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 25397 - 25550
Alignment:
Q  1 ttcttaatgaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttgatttc-tt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  25397 ttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttc-ctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttcttt 25495  T
Q  100 gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctctt 154  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25496 gtaattaaaattcgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctt 25550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1481 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1481
Description:

Target: scaffold1481; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Original strand, 1457 - 1681
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||      ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||    
T  1457 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcaaaaaaagggtacgtaggcagaggactagt--cctt 1554  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||||    
T  1555 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtattaatttttcaagtaaccaaatgaatttagc 1654  T
Q  387 acaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  1655 acaagataacttaggtaagcggttcct 1681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 284 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 145591 - 145437
Alignment:
Q  284 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttag-atttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaa 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||    
T  145591 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagcttttttaggtaataatttttcatgtaagcaaatgaa 145492  T
Q  381 tttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  145491 tttagcacaagataatctaggtaagaggttcctttggaataccatagacgcttag 145437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 296 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 136617 - 136475
Alignment:
Q  296 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagattttt-aggtaataatttt-caaataagcaa-tgaatttagcacaata 392  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  136617 aaataaatataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaaga 136518  T
Q  393 taatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  136517 taatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacacttag 136475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 129 - 413
Target Start/End: Original strand, 83332 - 83612
Alignment:
Q  129 ttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccnnnnnnnnnncaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||          ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |  ||    
T  83332 ttttatctcatgccttgaggcctctt-tctcttcttaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatcaacctaactcaccaaagaaatttttgtgtgga 83426  T
Q  229 actacattggttttgatccctttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctc 327  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  83427 actacgtcggttttgatccctttcccaaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctc 83524  T
Q  328 cccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  83525 cctccatttttttacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttcct 83612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 284 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21760 - 21608
Alignment:
Q  284 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatt 382  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  21760 tcctcccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatgcttcttcttcctccattctttcatttagatttttaggtaataattttcaagtaagcaaatcaatt 21661  T
Q  383 tagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  21660 tagcacaagataatttaggtaagaggttcctacggaatattgtagacgcttag 21608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0455 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0455
Description:

Target: scaffold0455; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 189 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 3974 - 3750
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |  ||||||| | |||||||||||||||  |   |||| || ||||||| |||| || |  ||||    
T  3974 ttaaaatcaacctaacccatcaaagaaatttttgtgtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagg-tacgtaggcagaggacttgt--cctt 3878  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc--aatgaatttag 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  3877 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatactccttctccctccattctttcatttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttag 3778  T
Q  386 cacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||||    
T  3777 cacaagataatccaggtaagcggttcct 3750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 29803 - 29726
Alignment:
Q  358 ataattttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  29803 ataattttcaaataagcaatgaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtcgacgcttag 29726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 33276 - 33159
Alignment:
Q  41 ttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagacttg-atttcttgtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt-ctctca 138  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||| || |||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33276 tttttttttctttatcaaatgtttaatcgatttaatatccatattagacttggatttcttgtaattaaaacta-accaacctcaccttatttttctctca 33178  T
Q  139 tgccttgaggcctcttatc 157  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33177 tgccttgaggcctcttatc 33159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1199 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1199
Description:

Target: scaffold1199; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 362 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 2439 - 2366
Alignment:
Q  362 ttttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2439 ttttcaaataagcaacaaagttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 2366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 322 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 22980 - 22888
Alignment:
Q  322 cttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcct 413  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  22980 cttctccctccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttcct 22888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 362 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22160 - 22087
Alignment:
Q  362 ttttcaaataagcaatgaatttagcacaatataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 435  Q
    ||||||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22160 ttttcaaataaacaagtagtttagcacaaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 22087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1547 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1547
Description:

Target: scaffold1547; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 313
Target Start/End: Original strand, 1542 - 1662
Alignment:
Q  189 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||  |||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||    
T  1542 ttaaaatcaacctaacccaccaaagaattttttgtgg--aactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctt 1637  T
Q  289 ccaaatcaaataaaaataaccaaaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1638 ccaaatcaaataaaaataaccaaaa 1662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University