View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8124_low_2 (Length: 514)

Name: NF8124_low_2
Description: NF8124
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8124_low_2
NF8124_low_2
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (5-502)||(37261294-37261789)
chr5 (5-502)||(25542526-25543033)
chr5 (5-502)||(14192545-14193052)
chr5 (5-502)||(39883162-39883669)
chr5 (5-497)||(3689961-3690463)
chr5 (5-497)||(3876324-3876826)
chr5 (9-493)||(17871375-17871868)
chr5 (5-502)||(27881063-27881570)
chr5 (5-502)||(37372915-37373422)
chr5 (5-502)||(8428318-8428814)
chr5 (5-280)||(30346362-30346637)
chr5 (5-270)||(10025199-10025464)
chr5 (5-280)||(24629686-24629954)
chr5 (355-502)||(24629954-24630101)
chr5 (355-502)||(10025042-10025189)
chr5 (355-502)||(30346637-30346784)
chr5 (459-492)||(6089199-6089232)
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (5-498)||(10038623-10039116)
chr3 (5-502)||(10110579-10111086)
chr3 (5-502)||(10000386-10000893)
chr3 (5-502)||(10968515-10969021)
chr3 (5-502)||(13530018-13530525)
chr3 (5-502)||(50410151-50410654)
chr3 (5-502)||(32750-33257)
chr3 (5-502)||(10237535-10238040)
chr3 (5-502)||(11368625-11369125)
chr3 (71-500)||(11362239-11362681)
chr3 (226-502)||(52918045-52918330)
chr3 (314-502)||(46913050-46913238)
chr3 (335-502)||(47692948-47693115)
chr3 (5-185)||(52918332-52918512)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (5-502)||(186534-187040)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (5-502)||(2201912-2202419)
chr6 (5-502)||(18344104-18344611)
chr6 (50-502)||(10187523-10187985)
chr6 (9-493)||(30881315-30881808)
chr6 (115-502)||(15333622-15334019)
chr6 (191-500)||(29639947-29640266)
chr6 (191-500)||(31510118-31510437)
chr6 (5-245)||(12517520-12517760)
chr6 (347-502)||(12517367-12517522)
chr6 (38-183)||(18814054-18814199)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (5-502)||(1860656-1861163)
chr4 (5-502)||(35855886-35856393)
chr4 (5-502)||(49710152-49710658)
chr4 (14-502)||(38518075-38518573)
chr4 (73-502)||(49786640-49787068)
chr4 (5-396)||(13337320-13337721)
chr4 (5-314)||(617957-618266)
chr4 (5-280)||(55558856-55559131)
chr4 (355-502)||(55559131-55559278)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (5-502)||(24268803-24269310)
chr2 (5-502)||(27509353-27509860)
chr2 (14-494)||(24245812-24246302)
chr2 (5-502)||(27192468-27192975)
chr2 (5-502)||(27842282-27842789)
chr2 (5-502)||(21395349-21395856)
chr2 (40-502)||(17683597-17684069)
chr2 (73-502)||(28665984-28666412)
chr2 (73-502)||(37824818-37825246)
chr2 (74-502)||(41919986-41920413)
chr2 (5-277)||(35609867-35610139)
chr2 (314-502)||(35609664-35609852)
chr2 (12-163)||(3642920-3643071)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (5-502)||(2452850-2453357)
chr1 (5-502)||(16042004-16042511)
chr1 (5-502)||(36207194-36207701)
chr1 (16-502)||(2329148-2329641)
chr1 (5-499)||(37389885-37390389)
chr1 (5-502)||(48775068-48775575)
chr1 (9-502)||(6310731-6311235)
chr1 (105-502)||(18148667-18149074)
chr1 (5-361)||(48233498-48233864)
chr1 (5-280)||(52500795-52501063)
chr1 (314-502)||(48238529-48238717)
chr1 (355-502)||(52500648-52500795)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (5-502)||(5828288-5828795)
chr7 (5-502)||(21069795-21070302)
chr7 (5-502)||(9000878-9001385)
chr7 (5-502)||(7036699-7037206)
chr7 (9-493)||(22843792-22844285)
chr7 (5-502)||(12780881-12781389)
chr7 (73-502)||(12785790-12786218)
chr7 (5-280)||(42232210-42232486)
chr7 (355-502)||(42232063-42232210)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (5-499)||(18988-19491)
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (5-502)||(21113477-21113984)
chr8 (5-502)||(25218298-25218805)
chr8 (5-502)||(25208780-25209272)
chr8 (5-502)||(7821817-7822324)
chr8 (93-502)||(30307156-30307575)
chr8 (314-502)||(31978579-31978767)
chr8 (5-89)||(30325877-30325961)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (5-502)||(17610-18109)
[»] scaffold0073 (3 HSPs)
scaffold0073 (5-502)||(31912-32418)
scaffold0073 (278-502)||(19436-19670)
scaffold0073 (5-241)||(1-237)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (14-502)||(314-812)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (5-502)||(4993-5499)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (5-502)||(321069-321576)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (5-498)||(182794-183297)
scaffold0003 (5-500)||(165511-166019)
[»] scaffold1139 (1 HSPs)
scaffold1139 (73-498)||(983-1418)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (73-502)||(48748-49176)
[»] scaffold0118 (2 HSPs)
scaffold0118 (5-280)||(28452-28727)
scaffold0118 (355-502)||(28727-28874)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (72-310)||(39937-40175)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (286-502)||(16663-16889)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (5-157)||(14010-14162)
[»] scaffold0888 (1 HSPs)
scaffold0888 (384-502)||(24-142)
[»] scaffold1424 (1 HSPs)
scaffold1424 (426-502)||(1627-1703)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 407; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 37261789 - 37261294
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  37261789 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcctgttgtctgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgtctcgatcaattcatcaaa 37261690  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  37261689 gatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaagaagaaattgctaattttggcaag 37261590  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |    
T  37261589 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgcttatattggacacaacaa--c 37261492  T
Q  305 cgttgatgtctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgag 404  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  37261491 cgttgatgtctttgtgtatcccaatttgaatgataaccttaatgacccgttattttttcaagaaaggggaatacttgcgccaacacttgattcagttgag 37261392  T
Q  405 catattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37261391 catattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtcca 37261294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Original strand, 25542526 - 25543033
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25542526 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgtggcagaatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 25542625  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  25542626 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcaaagcagaaagaaattgctaactttggcaag 25542725  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||     
T  25542726 tggatactctcaattggagacggcaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagattttctcatatcggacacaacaaata 25542825  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
     ||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542826 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 25542925  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25542926 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattat 25543025  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  25543026 gatgtcca 25543033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Original strand, 14192545 - 14193052
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||||||  |||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  14192545 gaatgacagttgttttaggtggtgatttcaggcatatattgcatgttgcccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgccccaattaattcattaaa 14192644  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  14192645 gatatgggcttattataatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgtagagtaggaagaaattgctaattttgacaag 14192744  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14192745 tggatactctcaattggagacggcaacgaagtttcggatcagaatggtgaaatgaaggtagaaatttctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 14192844  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
     ||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14192845 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgatccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttaa 14192944  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14192945 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 14193044  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  14193045 gatgtcca 14193052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 39883669 - 39883162
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |  |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  39883669 gaatgacagtagttttacgtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtcctaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcagtcaattcgtcaaa 39883570  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  39883569 gatattggcttattgtaatatgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcagcttcggtacatgcagagcatgaagaaattgctaattttggcaag 39883470  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39883469 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagatattcctaaagatttgctgatatcggacacaacaaatc 39883370  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39883369 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgcccagctattttgccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 39883270  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  39883269 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaagtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgacaattat 39883170  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  39883169 gatgtcca 39883162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 5 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 3690463 - 3689961
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3690463 gaatgatagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 3690364  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  3690363 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttacagttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgcagagcaggaagaaactgctaattttggcaag 3690264  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||| || |||||||||     
T  3690263 tggatactctcaattggagacggcaacgacacttcgaatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcccaaagatttgctcatatccgatacaacaaatt 3690164  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||||          |||||| |||||  |||||||||||||| || ||||||| || ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3690163 cgttgatgtcactaatggactttgtatatcccgatttgaatgataacattggtgacccactcttttttcaagaaaagtgaatactcgcaccaacgcttga 3690064  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3690063 ttcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaagtggagagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaattct 3689964  T
Q  495 gat 497  Q
    |||    
T  3689963 gat 3689961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 5 - 497
Target Start/End: Original strand, 3876324 - 3876826
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3876324 gaatgatagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 3876423  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  3876424 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttacagttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgcagagcaggaagaaactgctaattttggcaag 3876523  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||| || |||||||||     
T  3876524 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcgaatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcccaaagatttgctcatatccgatacaacaaatt 3876623  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||||          |||||| |||||  |||||||||||||| || | ||||| || ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3876624 cgttgatgtcactaatggactttgtatatcccgatttgaatgataacattggggacccactcttttttcaagaaaagtgaatactcgcaccaacgcttga 3876723  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3876724 ttcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaagtggagagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaattct 3876823  T
Q  495 gat 497  Q
    |||    
T  3876824 gat 3876826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 493
Target Start/End: Original strand, 17871375 - 17871868
Alignment:
Q  9 gacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagata 108  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17871375 gacaaaagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcatgtcatccgaaaaggaacgaggcatgatattgttgatgcctcaatcagttcatcaaagata 17871474  T
Q  109 tgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtgga 208  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  17871475 tgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgggattgggtgcatctttggtacctgcagagcaggaataaattgctaattttggcaaatgga 17871574  T
Q  209 tactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgtt 308  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17871575 tactctcaattagagaaggcaacggcgcttcggatgag-atggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgtt 17871673  T
Q  309 gatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattca 398  Q
    |||||          | |||||||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  17871674 gatgtcacttatagacattgtgtatctcgatttaaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaagggaaatactcgcaccaacgcttgattct 17871773  T
Q  399 gttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 493  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17871774 gttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctggttctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 17871868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 27881570 - 27881063
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27881570 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcatgttgtccgaggaggaacaaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcatcaaa 27881471  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27881470 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttaccgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacatgcagagcaggtagaaattgctaattttggcaag 27881371  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| | | ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27881370 tggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcggatgacaatggtgaaataaaggtagaaactcctgaagatttgctgatatcggacccaacaaatc 27881271  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27881270 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 27881171  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  27881170 ttcagctgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaagtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttgtagatcgggtgaaaattat 27881071  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  27881070 gatgtcca 27881063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 37373422 - 37372915
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  37373422 gaatcacagtagttttaggtggtgattttaagcagatattgcctgttgtctgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcgtcggtcaattcgtcaaa 37373323  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  37373322 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 37373223  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  37373222 tggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacataacaaatc 37373123  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37373122 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttcgaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 37373023  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  37373022 ttcagttgagcatgttaaccaatttatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggtgataattct 37372923  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  37372922 gatgtcca 37372915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Original strand, 8428318 - 8428814
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||   |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  8428318 gaatggcagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccagatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 8428417  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  8428418 gatatgggcttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 8428506  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8428507 tggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatc 8428606  T
Q  305 cgttgatgtc----------tttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    ||||||||||          |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8428607 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttga 8428706  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    |||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  8428707 ttcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaatattct 8428806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Original strand, 30346362 - 30346637
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30346362 gaatgacaatagttttaggtggtgatgtcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 30346461  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  30346462 gatatgtgcttattttaatgtgttaagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 30346561  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatt 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  30346562 tggatactctgaattggagacggcaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 30346637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10025464 - 10025199
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| | |||| |||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10025464 gaatgacaatagttttaggtggtgatattaggcagatattgcctgctgtccgaaaaggaacgaggcaatatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 10025365  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  10025364 gatatgtgcttattttgatgtgttgagacttactgttaatatgagactgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 10025265  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatt 270  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10025264 tggatactctgaattagagacggtaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaatt 10025199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Original strand, 24629686 - 24629954
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24629686 gaatgacaatagttttaggtggtgatatcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 24629785  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||       ||||| |||| |    
T  24629786 gatatgtgcttattttaatgtgttgagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaaga-------aatttcggcaag 24629878  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatt 280  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  24629879 tggatactctgaattggagacgacaacaacgcttcggatgagaatggttaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 24629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 355 - 502
Target Start/End: Original strand, 24629954 - 24630101
Alignment:
Q  355 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagta 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24629954 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 24630053  T
Q  455 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24630054 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtcca 24630101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 355 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 10025189 - 10025042
Alignment:
Q  355 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagta 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  10025189 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcattgattccaagtgaagagaaagagta 10025090  T
Q  455 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10025089 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtcca 10025042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 355 - 502
Target Start/End: Original strand, 30346637 - 30346784
Alignment:
Q  355 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagta 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30346637 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacacttgattaagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 30346736  T
Q  455 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30346737 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtcca 30346784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 459 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 6089232 - 6089199
Alignment:
Q  459 agctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaatt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6089232 agctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaatt 6089199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 402; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 10039116 - 10038623
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10039116 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaagaagatattgcatgttgtctgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 10039017  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  10039016 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttattgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaagaagaaattgctaattttggcaag 10038917  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10038916 tggatactctcaattgaagacggcaacgacgctttagatgagaatggtgaaacgaaggtataaattttcgaagatttgcttatatcagacacaacaaatc 10038817  T
Q  305 cgttgatgtctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgag 404  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  10038816 tgttgatgtctttgtgtatcccaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcaattgag 10038717  T
Q  405 catattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatg 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10038716 catattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatattatttaagctctcattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatg 10038623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 10111086 - 10110579
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10111086 gaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 10110987  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  10110986 gatatgagcttattttaatgtgttaatgcttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctacagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 10110887  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10110886 tggatactatgaattggagacggcaacaacgcttcggaggagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcagacgcaacaaatc 10110787  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
     ||||||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10110786 tgttgatgtcacttacagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 10110687  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10110686 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattatgtttgttgatcgggtgaaaattct 10110587  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  10110586 gatgtcca 10110579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 10000893 - 10000386
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10000893 gaatgacaatagttttaggtggggatttcaggcagatgttgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 10000794  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| |    
T  10000793 gatatgggcttattttaatgtgttaaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagtagaaagaaattgttaattttggcaag 10000694  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  10000693 tggatactatgaattggagacggcaacaacgcttcggaggagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcagatgcaacaaatc 10000594  T
Q  305 cgttgat----------gtctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
     ||||||          | |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10000593 tgttgatatcacttacagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaagaggaatactcgcaccaacgcttga 10000494  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10000493 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattatgtttgttgatcgggtgaaaattct 10000394  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  10000393 gatgtcca 10000386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Original strand, 10968515 - 10969021
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| | || ||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968515 gaatgacagtagttttagatggtgatttcaggcagatattgtctgtagtccgaaacggatcgagggaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 10968614  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10968615 gatatgggtttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcagtacctatagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 10968714  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10968715 tggacactctcaattggagatggcaacgacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaatttctg-agatttgctgatatcggacacaacaaatc 10968813  T
Q  305 cgttgat----------gtctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||          | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10968814 cgttgatgccacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaacttcgtgacctgctatttttctaagcaaggggaatactcgcaccaacgcttga 10968913  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10968914 ttcagtttagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctcttattttgtttgtcgatcgggtgaaaattct 10969013  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  10969014 gatgtcca 10969021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 13530525 - 13530018
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13530525 gaatgacagtagttttagctggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccaaaaaggaacgaggcacgatattgttgatgcctcaatcaattcatcaca 13530426  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  13530425 gatatgggcttattgtaatgtgtagaggcttactgttaatatgagattgagtgcatcttcggtacctgtagagcaggaataaattgctaattttggcaag 13530326  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  13530325 tatatactctcaattggagacggcaacgacgcatcaggtgagaatggtgaaatgaaggtagaaattctagaagatttggtcatatcagacacaacaaatc 13530226  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  13530225 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacacttca 13530126  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  13530125 ttcagttgagcattttaacgaatatatgatgtcactgagtccaggtgaagagaaagagtatttaagctctggttctgcttgtcgatcaggtgaaaatttt 13530026  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    | ||||||    
T  13530025 ggtgtcca 13530018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 50410654 - 50410151
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| | |||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50410654 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggcagatactgcctgttgtccgtaaagcaacgaggcacgatatttttgatgcctcaatcaattcatcaaa 50410555  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  50410554 gatattggcttattctaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgagtgcatcttcggtacctgtagagcaggaataaattgctaattttggcaag 50410455  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50410454 tggatactctcaattagagacggtaacgacgctttggatgagaatggtgaaatgaag----aaattcctgaagattttctcatatcggacacaacaaatc 50410359  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    || ||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50410358 cgctgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggcgacccactattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 50410259  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50410258 ttcagtcgagcatgttaacaaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctctttgtcgatcgggtgaaaattct 50410159  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  50410158 gatgtcca 50410151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 33257 - 32750
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||  |||||| | |  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  33257 gaatgacaatagttttaggtggtgattttaggcagatattgcatgttgtccgaggaggaacgacgccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 33158  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  33157 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 33058  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  33057 tggatactctcaattagagacggcaacaatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatc 32958  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32957 cgttgatgtcacttatggactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 32858  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  32857 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaagtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattct 32758  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  32757 gatgtcca 32750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 10238040 - 10237535
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10238040 gaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcttgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 10237941  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  10237940 gatatgggcttattttaatgtgttaaggcttactgttaatataagattggatgcatctttggtacctgctgagcagaaagaaattgctaattttggcaag 10237841  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||  | |||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  10237840 tggatactctgaattggagacggcaacaacgcttcgga-gggaatggtgaaataacggtagaaattcctgaagaattgctcatatcagacgcaacaaatc 10237742  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
     ||||||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10237741 tgttgatgtcacttacagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 10237642  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10237641 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgttactgattccaggtgaagagaaagagta-ttaagctttgattatgtttgttgatcgggtgaaaattct 10237543  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  10237542 gatgtcca 10237535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 11369125 - 11368625
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11369125 gaatgacagtagttttaagtggtgatttcaggcatatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 11369026  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||| |    
T  11369025 gatatggacttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgcagagaaggaagaaactgataattttggcaag 11368926  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||         |||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11368925 tggataccctcaattggagaggacaac---------gatgagaatggtgaaatgaatgtagaaattcccgaagatttgctcatatccgacacaacaaatc 11368835  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgct-atttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttg 393  Q
    |||||||||          |||||| |||||  |||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11368834 cgttgatgtcactcatagactttgtatatcccgatttgaatgataacattggtgacccgctcttttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttg 11368735  T
Q  394 attcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtg-aaaatt 492  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| |    
T  11368734 attcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattcaatttgtcgattgggtgaaaaagt 11368635  T
Q  493 ctgatgtcca 502  Q
    ||||||||||    
T  11368634 ctgatgtcca 11368625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 71 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 11362681 - 11362239
Alignment:
Q  71 aggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacg 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  11362681 aggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttacagttaatatgagattgggtgcatcttcgggacc 11362582  T
Q  171 tgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtgg--atactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaa 268  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   |||    
T  11362581 tgcagagcaagaataaactgctaattttggcaagtggatatactctcaattggagacgacaacgacgcttcgaatgagaatggtgaaatgaagggggaaa 11362482  T
Q  269 tttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatt 358  Q
    || |||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||          |||||| |||||  |||| ||||||||| || ||||||| |||||    
T  11362481 ttcccgaagatttactcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatagactttgtatatcccgatttaaatgataacattggtgacccactatt 11362382  T
Q  359 tttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaata-gtattt 457  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  | |||    
T  11362381 tttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaggtgaagagaaagattttttt 11362282  T
Q  458 aagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtc 500  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11362281 aagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaagtctgatgtc 11362239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 226 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 52918330 - 52918045
Alignment:
Q  226 ggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtc----------t 315  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||   || ||||||||||||||| ||||||| |          |    
T  52918330 ggcaacgacgcttcggatgggaatggtgaaatgaaggtagaaattcctga-gatttgccgttaccggacacaacaaatctgttgatgccacttatagact 52918232  T
Q  316 ttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaatga 415  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  52918231 tcgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgactcgctatttttccaagaaaggggaatacccgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacga 52918132  T
Q  416 atatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52918131 atatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattttgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 52918045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 314 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 46913238 - 46913050
Alignment:
Q  314 ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaat 413  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  46913238 ctttgtgtatcccgatttgaatgataactttggcgacccgctatttttccaagaaaggagaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaac 46913139  T
Q  414 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  46913138 gaatatatgatgtcaccaattccaggtgaagaaaaatagtatttaagctttgattatgtttgtcgatcggggggaaattctgatgtcca 46913050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 335 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 47693115 - 47692948
Alignment:
Q  335 tgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgatt 434  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||    
T  47693115 tgataaccttggtgacccacaattttcccaagaaaggggaatcctcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatacatgatgtcactaatt 47693016  T
Q  435 ccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  47693015 ccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctgtttgtcgatcggacgaaaattctgatgtcca 47692948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 52918512 - 52918332
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52918512 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcatgtagtccgaaaaggatcgagggaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 52918413  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaaga 185  Q
    |||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  52918412 gatacgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgtagagtaggaaga 52918332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 187040 - 186534
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  187040 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaagcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcaccaatcaattcatcaaa 186941  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||||| |||  || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  186940 gatatgggcttattgtaatgttttaaggcctactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacttgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 186841  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  186840 tggatactctcaattggagacggcaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcgtacacaacaaatc 186741  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
     ||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  186740 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaataaaggggaatactcgcaccaacgcttga 186641  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  186640 ttcagctgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtg-aaattct 186542  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  186541 gatgtcca 186534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Original strand, 2201912 - 2202419
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2201912 gaatgacagtagttttaggtggtgacttcaggcagatattgcccattgtccgaaaaggatcgaggcaggatattgttgatgcctcgatcaattcatcaaa 2202011  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    ||||| ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  2202012 gatataggcatattgtaatgtgtcgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacttgcagagcatgaagaaattgctaattttggcaag 2202111  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2202112 tggatactctcaattggagaaggcaacgacgcttcaaatgagaatggtgaaatgaatgtagaaattcccgaagatttgctcatatcgaacacaataaatc 2202211  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2202212 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttaa 2202311  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    |||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2202312 ttcagtagaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttgtcgatcgggtgaaaattct 2202411  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  2202412 gatgtcca 2202419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 18344611 - 18344104
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18344611 gaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaatttatcaaa 18344512  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  18344511 gatatgggcttattgtaatttgttgaggcttactgttaatatgagattgagtgcatctttggtatctacagagcaggaagaaattcctaattttgacaag 18344412  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18344411 tgaatactctcaattggagacgacaacgaagcttcagatgagaatagtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 18344312  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||| ||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18344311 cgttcatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgaccatctatttttccaagaaaggggaatacttgcaccaacgcttga 18344212  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18344211 ttcagttgagcatgttgacgaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaagctttgattctatttgtcgatcgggtgaaaatttt 18344112  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  18344111 gatgtcca 18344104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 50 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 10187985 - 10187523
Alignment:
Q  50 ttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgag 149  Q
    ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10187985 ttgtccgaaaaggaacgagacaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttattgttaatatgag 10187886  T
Q  150 attaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaat 249  Q
    ||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10187885 attgggtgcatcttcgatacctgtagagcaggaagaaattgctaattttcgcacgtggatgctctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaat 10187786  T
Q  250 ggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgata 339  Q
    ||| ||| ||||||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||    
T  10187785 ggtaaaatgaaggtagaaattcctgaatatttgctcatattggacacaaaaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgata 10187686  T
Q  340 accttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccagg 439  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10187685 accttggtgacccgctatttttccaagaaaagggaatactcgctccaacacttgattcaattgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccagg 10187586  T
Q  440 tgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10187585 tgaagagaaagagtatttaagctatgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtcca 10187523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 30881808 - 30881315
Alignment:
Q  9 gacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagata 108  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30881808 gacaaaagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcatgtcatccgaaaaggaacgaggcatgatattgttgatgcctcaatcagttcatcaaagata 30881709  T
Q  109 tgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtgga 208  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  30881708 tgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgggattgggtgcatctttggtacctgcagagcaggaataaattgctaattttggcaaatgga 30881609  T
Q  209 tactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgtt 308  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30881608 tactctcaattagagaaggcaacggcgcttcggatgag-atggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgtt 30881510  T
Q  309 gatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattca 398  Q
    |||||          | |||||||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  30881509 gatgtcacttatagacattgtgtatctcgatttaaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaagggaaatactcgcaccaacgcttgattct 30881410  T
Q  399 gttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 493  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30881409 gttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctggttctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 30881315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 115 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 15334019 - 15333622
Alignment:
Q  115 tattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactct 214  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15334019 tattgtaatgtgttgaagcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcgatacctgcagagcaagaagaaattgctaattttggcaagtggatactct 15333920  T
Q  215 caattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt- 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||     
T  15333919 caattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatagtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgttgatatcgtacgtaacaaatccgttgatgtc 15333820  T
Q  314 ---------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgag 404  Q
             ||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15333819 actaatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaacaaatgggaatactcgcaccaacacttgattcagttgag 15333720  T
Q  405 catattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  15333719 catgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaggctctgattctgtttgtagatcaggtgaaaattctgatgtcca 15333622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 191 - 500
Target Start/End: Original strand, 29639947 - 29640266
Alignment:
Q  191 ctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatc 290  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||    
T  29639947 ctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatc 29640046  T
Q  291 ggacacaacaaatccgttgatgtc----------tttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactc 380  Q
       ||||||||||| |||||||||          |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  29640047 aaccacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcctgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactc 29640146  T
Q  381 gcaccaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgat 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| | |||    
T  29640147 gcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctaattctatttttagat 29640246  T
Q  481 cgggtgaaaattctgatgtc 500  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29640247 cgggtgaaaattctgatgtc 29640266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 191 - 500
Target Start/End: Original strand, 31510118 - 31510437
Alignment:
Q  191 ctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatc 290  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||| |||||    
T  31510118 ctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgtttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaatttcttaagatttgctgatatc 31510217  T
Q  291 ggacacaacaaatccgttgatgtc----------tttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactc 380  Q
       ||||||||||| |||||||||          ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31510218 aaccacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcctaatctgaatgataaccttggtgaccaactattttttcaagaaaggggaatactc 31510317  T
Q  381 gcaccaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgat 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| | |||    
T  31510318 gcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctaattctatttttagat 31510417  T
Q  481 cgggtgaaaattctgatgtc 500  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31510418 cgggtgaaaattctgatgtc 31510437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12517760 - 12517520
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  12517760 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcagttaattcgtcaaa 12517661  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12517660 gatatgggcttattgtaatgtgttgaagcttactgttaatatgagattgggtgcatcttctgttcctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 12517561  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatga 245  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12517560 tggatactctcaattggagacgacaacgacacttcggatga 12517520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 347 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 12517522 - 12517367
Alignment:
Q  347 tgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagag 446  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12517522 tgaccagctatttttccaagaaaggggaatatttgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagag 12517423  T
Q  447 aaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  12517422 aaagagtatttaagctctgattctgtttgatgatggggtgaaaattctgatgtcca 12517367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18814199 - 18814054
Alignment:
Q  38 agatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttac 137  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||| ||  | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18814199 agatattgcatgttgtccgaaaaggaacgagacatgatattgttgatcccttaatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttac 18814100  T
Q  138 tgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaa 183  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||| || ||||||||||    
T  18814099 tgttaatatgagattgggtgcatcgttggtacctgtagagcaggaa 18814054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 1861163 - 1860656
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  1861163 gaatgacaatagtgtaaggtggtgatttcaggcaaatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcattaaa 1861064  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  1861063 gatatgggcttattttaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 1860964  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1860963 tggatactctgaattggagacgacaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 1860864  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
     ||||||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1860863 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 1860764  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1860763 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattctgggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgttgatcgggtgaaaattct 1860664  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  1860663 gatgtcca 1860656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 35856393 - 35855886
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  35856393 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 35856294  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  35856293 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 35856194  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35856193 tggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatc 35856094  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35856093 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 35855994  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  35855993 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattct 35855894  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  35855893 gatgtcca 35855886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 49710658 - 49710152
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||  |||||| |||   |||||||||||||||||  ||||||| | |||    
T  49710658 gaatgacaatagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgttcgaggaggaacgaggccagatattgttgatgcctccgtcaattcgttaaa 49710559  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  49710558 gatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagaacagaaagaaattgctaattttggcaag 49710459  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49710458 tggatactctcaattggacacggcaacgatgcttcggatgaaaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatc 49710359  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    | |||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49710358 c-ttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 49710260  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49710259 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattct 49710160  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  49710159 gatgtcca 49710152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 14 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 38518573 - 38518075
Alignment:
Q  14 tagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggc 113  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||  | |||||||||  |||||| ||   |||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  38518573 tagttttaggtggtgattttaggcagatattaactgttgtctgaggaggaacgagaccggatattgttaatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgggc 38518474  T
Q  114 ttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactc 213  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38518473 ttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactc 38518374  T
Q  214 tcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38518373 tcaattggagacggcaacgatgctttgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgt 38518274  T
Q  314 ----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttga 403  Q
              ||||||||||||  || | |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38518273 cacttatagactttgtgtatcccgatctaaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcaattga 38518174  T
Q  404 gcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  38518173 gcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtcca 38518075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 73 - 502
Target Start/End: Original strand, 49786640 - 49787068
Alignment:
Q  73 gatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtg 172  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||||||||| |     
T  49786640 gatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtaccta 49786728  T
Q  173 cagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttc 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| |    
T  49786729 cagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcc 49786828  T
Q  273 cgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtc----------tttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttc 362  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||          | |||||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  49786829 tgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttc 49786928  T
Q  363 caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagct 462  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  49786929 caagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatattaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacct 49787028  T
Q  463 ctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  49787029 ctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtcca 49787068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 13337721 - 13337320
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  13337721 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 13337622  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    ||||||   ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  13337621 gatatgatattattgtaatgtgttgaggtttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 13337522  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13337521 tggatactctcaattggagacgacaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcatgaagatttgctgatatcggacacaacaaatc 13337422  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||| ||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13337421 cgtttatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcatcaacgcttga 13337322  T
Q  395 tt 396  Q
    ||    
T  13337321 tt 13337320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 314
Target Start/End: Original strand, 617957 - 618266
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617957 gaatgacaatagctttaggtggtgatttcaagcagatattgcatgttgtctgaaaaggaacgaggcatgatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 618056  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    ||||| |||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  || |    
T  618057 gatataggcttattgtaatttgttgaggctaactgttaatatgagattgagtgcatctttggtatctgcagagcaggaagaaattcctaattttaacaag 618156  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  618157 tgaatactctcaattggagacgacaacgaagcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 618256  T
Q  305 cgttgatgtc 314  Q
    |||| |||||    
T  618257 cgttcatgtc 618266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Original strand, 55558856 - 55559131
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55558856 gaatgacaatagttttaggtggtgatatcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcagtatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 55558955  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  55558956 gatatgtgcttattttaatgtgttgagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 55559055  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatt 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  55559056 tggatactctgaattggagacggcaacaacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 55559131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 355 - 502
Target Start/End: Original strand, 55559131 - 55559278
Alignment:
Q  355 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagta 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55559131 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 55559230  T
Q  455 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55559231 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtcca 55559278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Original strand, 24268803 - 24269310
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  24268803 gaatgacaatagttttaggtggtgatatcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaca 24268902  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  24268903 gatatgtgcttattttaatgtgttgacgcttattgttaatatgcgattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 24269002  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24269003 tggatactctgaattggagacggcaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 24269102  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
     ||||||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24269103 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 24269202  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24269203 ttcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattct 24269302  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  24269303 gatgtcca 24269310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 27509860 - 27509353
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27509860 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccaaaaaggaacgagacaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 27509761  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27509760 gatatgggcttattgtaatgtattgaggcttactgttaatataagattgggtgcatctttgctacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 27509661  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  27509660 tagatactctcaattggagacagcaacgacgcttcagatgagaatggtgagatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatgtcggacacaacaaatt 27509561  T
Q  305 cgttgat----------gtctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||          | ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27509560 cgttgatatcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacctgctatttttccaagaaaggggaatactcgcatcaacgcttga 27509461  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27509460 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 27509361  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
     |||||||    
T  27509360 aatgtcca 27509353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 14 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 24246302 - 24245812
Alignment:
Q  14 tagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaa-ggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggg 112  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||||| ||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24246302 tagttttaggtggtgatttaaggcagatattgcatgttgtccgaaaaaggaatgatgcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggg 24246203  T
Q  113 cttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatact 212  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  24246202 cttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagatt-ggtgaatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatgttggcatgtggattct 24246104  T
Q  213 ctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24246103 ctcaattggagacggcaacgacgctttggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcataacggacacaacaaatccgtggatg 24246004  T
Q  313 t----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttg 402  Q
    |          | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24246003 tcacttatagaccttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttg 24245904  T
Q  403 agcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24245903 agcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagatctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 24245812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 27192975 - 27192468
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27192975 gaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 27192876  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||  |||||||| || |    
T  27192875 gatatgggcttattgtaatttgttgaggctgattgttaatatgagattgggtgcatctttgatacctgtagagcaggaagaaattcataattttgacaag 27192776  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27192775 tggatactctcaactggtgacggcaacgacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 27192676  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
     ||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27192675 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgaccctctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 27192576  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  27192575 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttgtcgatcgggtgaaattttt 27192476  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  27192475 gatgtcca 27192468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 27842789 - 27842282
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27842789 gaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 27842690  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||  |||||||| || |    
T  27842689 gatatgggcttattgtaatttgttgaggctgattgttaatatgagattgggtgcatctttgatacctgtagagcaggaagaaattcataattttgacaag 27842590  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27842589 tggatactctcaactggtgacggcaacgacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 27842490  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
     ||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27842489 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgaccctctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 27842390  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  27842389 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttgtcgatcgggtgaaattttt 27842290  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  27842289 gatgtcca 27842282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 21395856 - 21395349
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  21395856 gaatgaccgtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctccgtcaattcgtcaaa 21395757  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |    
T  21395756 gttatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagatcaggaagaaattgctaatttcggcaag 21395657  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21395656 tggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatc 21395557  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||||          |||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395556 cgttgatgtcgcttatagactttgtatatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 21395457  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21395456 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattct 21395357  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  21395356 gatgtcca 21395349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 40 - 502
Target Start/End: Original strand, 17683597 - 17684069
Alignment:
Q  40 atattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactg 139  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||| ||    
T  17683597 atattgcttgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgttaaggcttattg 17683696  T
Q  140 ttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttc 239  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17683697 ttaatatgagattgggtgcatcttcgatacctgtagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttc 17683796  T
Q  240 ggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaat 329  Q
     |||||||||||| ||| ||||||| ||||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||          ||||||||||||  ||    
T  17683797 agatgagaatggtaaaatgaaggtagaaattcctgaatattcgctcatattggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgat 17683896  T
Q  330 ttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcac 429  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17683897 ttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgctccaacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatatatgatgtcac 17683996  T
Q  430 tgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17683997 tgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctatgattttgtttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtcca 17684069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 73 - 502
Target Start/End: Original strand, 28665984 - 28666412
Alignment:
Q  73 gatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtg 172  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||||||||| |     
T  28665984 gatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtaccta 28666072  T
Q  173 cagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttc 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| |    
T  28666073 cagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcc 28666172  T
Q  273 cgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtc----------tttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttc 362  Q
     ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||          | |||||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  28666173 tgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttc 28666272  T
Q  363 caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagct 462  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  28666273 caagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaacct 28666372  T
Q  463 ctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  28666373 ctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtcca 28666412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 73 - 502
Target Start/End: Original strand, 37824818 - 37825246
Alignment:
Q  73 gatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtg 172  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||||||||| |     
T  37824818 gatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtaccta 37824906  T
Q  173 cagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttc 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| |    
T  37824907 cagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcc 37825006  T
Q  273 cgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtc----------tttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttc 362  Q
     ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||          | |||||||||  || | |||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  37825007 tgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctaaatgataaccttggtgaccaactatttttc 37825106  T
Q  363 caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagct 462  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  37825107 caagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaacct 37825206  T
Q  463 ctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  37825207 ctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtcca 37825246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 74 - 502
Target Start/End: Original strand, 41919986 - 41920413
Alignment:
Q  74 atattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgc 173  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||| ||||| ||     
T  41919986 atattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatctttggtacctgt 41920074  T
Q  174 agagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttcc 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| |     
T  41920075 agagcaggaagaaattgataatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcct 41920174  T
Q  274 gaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtc----------tttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttcc 363  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||          |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  41920175 gaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttcc 41920274  T
Q  364 aagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctc 463  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  41920275 aagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattaagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagataaagagtatttaacctc 41920374  T
Q  464 tgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  41920375 tgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtcca 41920413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 35610139 - 35609867
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  35610139 gaatgacagttgttttaggtggtgatttcaggcatatattgcctgttgcccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgccccaatcaattcattaaa 35610040  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35610039 gatatggacttattataatgtgttgaggcttactgttaatatgacattgggtgcatcttcggtacctttagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 35609940  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaag 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  35609939 tggatactctcaattggagacggcaacgaagtttcggatcagaatggtgaaatgaaggtagaaatttctgaag 35609867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 314 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 35609852 - 35609664
Alignment:
Q  314 ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaat 413  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  35609852 ctttgtgtattccgatttgaatgataacattggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagtatgttaac 35609753  T
Q  414 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35609752 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattatgtttgtcgatcgagtgaaaattctgatgtcca 35609664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3643071 - 3642920
Alignment:
Q  12 aatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgg 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3643071 aatagttttaggtggtgatttcaggtagatattgcctgttgcccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgg 3642972  T
Q  112 gcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatctt 163  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3642971 gcttattgtaatttgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctt 3642920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Original strand, 2452850 - 2453357
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2452850 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggaagatattgcccattgtccgaaaaggatcgaggcaggatattgttgatgcttcaatcaattcatcaaa 2452949  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    ||||| ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  2452950 gatataggcatattgtaatgtgtcgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcatgaagaaattgctaattttgacaag 2453049  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2453050 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcaaatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcgaacacaacaaatc 2453149  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||||          ||||||| || |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2453150 cgttgatgtcacttatagactttgtgaattccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttta 2453249  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    || |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2453250 ttgagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactaattccaggtgaagagaaagagtatttaggctctgattctatttgtcgatcgggtgaaaattct 2453349  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  2453350 gatgtcca 2453357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 16042511 - 16042004
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |  |||||| |||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  16042511 gaatgacagtagttttacgtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtcctaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcagttaattcgtcaaa 16042412  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16042411 gatattggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcagcttcggtacatgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 16042312  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16042311 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatc 16042212  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||||          |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16042211 cgttgatgtcgcttatagactttgtgtatcccaatctgaatgataaccttggtgcccagctattttgccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 16042112  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16042111 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaagtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattct 16042012  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  16042011 gatgtcca 16042004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 36207701 - 36207194
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36207701 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcagacagatattgcctgttgtctgaaaaggaaagaggcaggatattattgatgcctcaatcaattcatcaaa 36207602  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  36207601 gatatgagtttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggttcatcttcggtacctgcaaagcaggaagaaattgataattttggcaag 36207502  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  36207501 tggatactctcaattgaagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaattgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccgacacaacaaatc 36207402  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  36207401 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcgccccaacaattga 36207302  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  36207301 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattatgtttgtcgatcgggtgaaaattat 36207202  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  36207201 gatgtcca 36207194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 16 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 2329641 - 2329148
Alignment:
Q  16 gttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggctt 115  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| | || |||||| |  ||| ||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2329641 gttttaggtggtgatttcaggcagatactacctgttgtccgtgaagcaacgaggcacgatattgttaatgccttaatcaattcatcaaagatatgggctt 2329542  T
Q  116 attgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctc 215  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2329541 attgtaatatgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcctcttcgttacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctc 2329442  T
Q  216 aattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtct 315  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2329441 aattagagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtaaaatgaaggtagaaattcctgaagattttctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtca 2329342  T
Q  316 tt-------gtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcata 408  Q
     |       ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  2329341 cttatagacgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgatccactattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagtcgagcatg 2329242  T
Q  409 ttaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2329241 ttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctctttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 2329148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 5 - 499
Target Start/End: Original strand, 37389885 - 37390389
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  37389885 gaatgacaatagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggctggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 37389984  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  37389985 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactattaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 37390084  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37390085 tggatattctcaattggagacggcaaagatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatc 37390184  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37390185 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 37390284  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  37390285 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattct 37390384  T
Q  495 gatgt 499  Q
    |||||    
T  37390385 gatgt 37390389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Original strand, 48775068 - 48775575
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||  | ||||||   |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48775068 gaatgacggtagttttaggtggtgatttcagacaaatattgtatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 48775167  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
     ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  48775168 tatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatcagattgggtgcatcttcgggacctacagagcagaaagaaactgctaattttggcaag 48775267  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  48775268 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcgaatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcccgaagatttgctcatatccgacacaacaaatt 48775367  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    | |||||||          |||||| |||||  ||| |||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48775368 ctttgatgtcactaatacactttgtatatcccgattagaatgataacattggtgacctgctctttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttga 48775467  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||    
T  48775468 ttcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtaaatgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcaaaaagtct 48775567  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  48775568 gatgtcca 48775575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 9 - 502
Target Start/End: Original strand, 6310731 - 6311235
Alignment:
Q  9 gacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagata 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| | |||||| ||  |||||  |||   |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  6310731 gacaatagttttaggtggtgattttaggcagatattgtctgttgtccgaggaggaatgaggcctgatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagata 6310830  T
Q  109 tgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtgga 208  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  6310831 tgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtgga 6310930  T
Q  209 tactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgtt 308  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6310931 tagtctccattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagattcgctgatatcagacacaacaaatccgtt 6311030  T
Q  309 gatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattca 398  Q
    |||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311031 gatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattca 6311130  T
Q  399 gttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgt-cgatcgggtgaaaattctgat 497  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  6311131 gttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttgagatcgggtgaaaattctgat 6311230  T
Q  498 gtcca 502  Q
    |||||    
T  6311231 gtcca 6311235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 105 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 18149074 - 18148667
Alignment:
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18149074 gatatggacttattttaatgtgttaaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 18148975  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18148974 tggatactctgaattggagacggcaataacgcttcgaaggagaatggtgaaatgaaggtagaaatttatgaagattttctcatatcggacacaacaaatc 18148875  T
Q  305 cgttgatgtc----------tttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
     |||||||||          ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18148874 tgttgatgtcacttatcgactttgtgtatctcaatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 18148775  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18148774 ttcatttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctcttattctgtttgtcgatcggatgaaaattct 18148675  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
     |||||||    
T  18148674 tatgtcca 18148667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 48233864 - 48233498
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48233864 gaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgagacaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 48233765  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||| | ||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  48233764 gatatgtgtttattgtaatttgttgaggcttactgttgatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcaggaagaaattcctaattttgacaag 48233665  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    || |||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  48233664 tgaatactctcaacttgagacgacaacgacgcttcagatgagaatggggaaatgaaggtagaaattcctgaagatttactcatatcgaacacaacaaatc 48233565  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctattttt 361  Q
    || ||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  48233564 cgctgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggcgaccctctattttt 48233498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 52501063 - 52500795
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52501063 gaatgacaatagttttaggtggtgatatcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 52500964  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||       ||||| |||| |    
T  52500963 gatatgtgcttattttaatgtgttgagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaaga-------aatttcggcaag 52500871  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatt 280  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  52500870 tggatactctgaattggagacgacaacaacgcttcggatgagaatggttaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 52500795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 314 - 502
Target Start/End: Original strand, 48238529 - 48238717
Alignment:
Q  314 ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaat 413  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  48238529 ctttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggcgaccctctatttttccaagaaagaggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaac 48238628  T
Q  414 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  48238629 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtcca 48238717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 355 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 52500795 - 52500648
Alignment:
Q  355 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagta 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52500795 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 52500696  T
Q  455 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52500695 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtcca 52500648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Original strand, 5828288 - 5828795
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5828288 gaatgatattagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 5828387  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5828388 gatatgggtttattttaatgtgttgaggcttactattaatatgagattgagtgcatcttcggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 5828487  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5828488 tggatactctgaattggagacggcaacaacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 5828587  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
      |||||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5828588 ttttgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacacttga 5828687  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
     |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  5828688 ctcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattat 5828787  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  5828788 gatgtcca 5828795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Original strand, 21069795 - 21070302
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  21069795 gaatcacagtagttttaggtggtgatttcaggtagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcattaaa 21069894  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  21069895 gatatgggtttattgtaatgtatcgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttgacaag 21069994  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21069995 tggatactctcaattggagacggcaacgacgtttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcagacacaacaaatc 21070094  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21070095 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtaacctgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 21070194  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  21070195 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattcctggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgttgatcgggtgaaaattta 21070294  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  21070295 gatgtcca 21070302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Original strand, 9000878 - 9001385
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9000878 gaatgacagtagttttaggttgtgattttaggcagatattgcctattgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcagtcaattcgtcaaa 9000977  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9000978 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcatagcaggaagaaattgctaattttggcaag 9001077  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9001078 tggatactctcaattggatacggcaacgatgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcttgaagatttgttgatatcggacacaacaaatc 9001177  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||||          |||||| |||||  || ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9001178 cgttgatgtctcttatagactttgtttatcccgatctgattgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcactaacgcttga 9001277  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9001278 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattct 9001377  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  9001378 gatgtcca 9001385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 7037206 - 7036699
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  7037206 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 7037107  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  7037106 gatataggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaagaagaaattgctaatttttgcaag 7037007  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  7037006 tggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagattcgctgatatcagacacaacaaatc 7036907  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7036906 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactacttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 7036807  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  7036806 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattct 7036707  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  7036706 gatgtcca 7036699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 9 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 22844285 - 22843792
Alignment:
Q  9 gacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagata 108  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||  ||  || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22844285 gacaaaagttttaggtggtgatttcatgcagatattgcatgtcatccgaaaaggaacgaggcatgatattgttgatgcctcaatcagttcatcaaagata 22844186  T
Q  109 tgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtgga 208  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  22844185 tgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgggattgggtgcatctttggtacctgtagagcaggaataaattgctaattttggcaattgga 22844086  T
Q  209 tactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgtt 308  Q
    |||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  22844085 tactcttaattagagaaggcaacgtcgcttcggatgag-atggtgaaatgaaggtagaaattcttgaagatttgctcatatctgacacaacaaatctgtt 22843987  T
Q  309 gatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattca 398  Q
    |||||          | |||||||||   |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22843986 gatgtcacttatagacattgtgtatctcgatttaaatgataaccttggtgacctgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattct 22843887  T
Q  399 gttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 493  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22843886 gttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagttctgtttctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 22843792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Original strand, 12780881 - 12781389
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| || |||  |  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  12780881 gaatgacaatagttttaggtggtgattttaggcagatgttgcctgtagtccaaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 12780980  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  12780981 gatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgtagagcaagaagaaattgctaatttttgcaag 12781080  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12781081 tggatactctcaattggagacgacaatgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatataagacacaacaaatc 12781180  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12781181 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 12781280  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgt-cgatcgggtgaaaattc 493  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  12781281 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttgagatcgggtgaaaattc 12781380  T
Q  494 tgatgtcca 502  Q
    |||||||||    
T  12781381 tgatgtcca 12781389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 73 - 502
Target Start/End: Original strand, 12785790 - 12786218
Alignment:
Q  73 gatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtg 172  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||||||||| |     
T  12785790 gatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtaccta 12785878  T
Q  173 cagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttc 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| |    
T  12785879 cagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcc 12785978  T
Q  273 cgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtc----------tttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttc 362  Q
     ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||          | |||||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  12785979 tgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttc 12786078  T
Q  363 caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagct 462  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  12786079 caagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaacct 12786178  T
Q  463 ctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  12786179 ctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtcca 12786218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 42232486 - 42232210
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagtttt-atgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaa 103  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42232486 gaatgacaatagtttttaggtggtgatatcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcagtatattgttgatgcatcaatcaattcatcaa 42232387  T
Q  104 agatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcat 203  Q
    ||||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||     
T  42232386 agatatgtgcttattttaatgtgttgagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagtagaaagaaattgctaattttggcaa 42232287  T
Q  204 gtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatt 280  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  42232286 gtggatactctgaattggagacggcaacaacggttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 42232210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 355 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 42232210 - 42232063
Alignment:
Q  355 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagta 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42232210 tatttttccaagaaaggggaatactctcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 42232111  T
Q  455 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42232110 tttaaactctgattttgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtcca 42232063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 5 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 19491 - 18988
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19491 gaatgacaatagttttaggtggtaatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 19392  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  19391 gatatgggcttattttaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttgatacctgcagagcagaaagaaattgctaa-tttggcaag 19293  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
     ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19292 gggatactttgaattggagacggcaacaacgcttcggatgagaatgatgaaatgaaggtagaaatttctgaagatttgctcatatcggacacaacaaata 19193  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
     ||||||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19192 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatcttgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaaaaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 19093  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19092 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgagtgaaaattct 18993  T
Q  495 gatgt 499  Q
    |||||    
T  18992 gatgt 18988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Original strand, 21113477 - 21113984
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  21113477 gaatgacaatagttttaggtggtgatatcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaca 21113576  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  21113577 gatatgtgcttattttaatgtgttgacgcttactgttaatatgcgattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 21113676  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21113677 tggatactctgaattggagacggcaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgcttatatcggacacaacaaatc 21113776  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
     ||||||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21113777 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatcttgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaaaaaaggggaatacttgcaccaacgcttga 21113876  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21113877 ttcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattct 21113976  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  21113977 gatgtcca 21113984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Original strand, 25218298 - 25218805
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  25218298 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 25218397  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  25218398 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 25218497  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25218498 tggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatc 25218597  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25218598 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 25218697  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25218698 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattct 25218797  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  25218798 gatgtcca 25218805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Original strand, 25208780 - 25209272
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| || ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  25208780 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttttccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 25208879  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||| |    
T  25208880 gatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttaatgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggacgaaattactaatttttgcaag 25208979  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  25208980 tggatactctcaattggagacgacaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatgtcagacacaacaaatc 25209079  T
Q  305 cgttgatgtctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgag 404  Q
    ||||||||||  |   |||  | | || |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25209080 cgttgatgtcact---tat--agactttaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgag 25209174  T
Q  405 catattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  25209175 catgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggcgaaaattctgatgtcca 25209272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 7822324 - 7821817
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||  |||||| |||  |  |||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  7822324 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctattgtccgaggaggaacgaggccgattattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 7822225  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| | | |    
T  7822224 gatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgagtgcatcttcggtacctgtagagcaggaagaaattgcgaatttttgtaag 7822125  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  7822124 tggatactctcaattggagacgacaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatc 7822025  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||||          |||||||||| |  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822024 cgttgatgtcacttatagactttgtgtattccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 7821925  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  7821924 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgatttcaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggtgaaaattct 7821825  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  7821824 gatgtcca 7821817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 93 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 30307575 - 30307156
Alignment:
Q  93 caattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgct 192  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  30307575 caattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagtgggaagaaattgct 30307476  T
Q  193 aattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcgg 292  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| ||| ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  30307475 aatttttgcaagtagatactctcaattggagacgacaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaatgtagaaattcctgaagatttgctgatatcgg 30307376  T
Q  293 acacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgc 382  Q
    |||||||||||||||||||||          ||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30307375 acacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaacgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgc 30307276  T
Q  383 accaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcg 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | |||||    
T  30307275 accaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctccgattctatttttagatcg 30307176  T
Q  483 ggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30307175 ggtgaaaattctgatgtcca 30307156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 314 - 502
Target Start/End: Original strand, 31978579 - 31978767
Alignment:
Q  314 ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaat 413  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||     
T  31978579 ctttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaagaaaggggaatactcgcatcaacgcttgattcagttgagcatgtcaac 31978678  T
Q  414 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  31978679 aaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggggaaaattcagatgtcca 31978767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 30325961 - 30325877
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctc 89  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  30325961 gaatgacagtagttttaggttgtgattttaggcagatattgcctattgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctc 30325877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Original strand, 17610 - 18109
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17610 gaatgacaagagttttatgtggtgatttcaggcagctattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 17709  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17710 gatatgggctt-ttgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttagcaag 17808  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17809 tggatactctcaattggagacagcaacgaagcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 17908  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17909 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgatccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 18001  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  18002 tttagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgccgatcgggtgaaaattat 18101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 3)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 32418 - 31912
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  32418 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgacgaggaacgaggccagatattgttgatgcctcagtcaattcgtcaaa 32319  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32318 gatatgtgcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 32219  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32218 tggatactctcaattggatacggcaacgatgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatc 32119  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32118 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaagaaagggg-atacttgcaccaacgcttga 32020  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32019 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgttgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattct 31920  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  31919 gatgtcca 31912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 278 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 19670 - 19436
Alignment:
Q  278 atttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtc----------tttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaaga 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||          |||||||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19670 atttgctgatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttataaactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaaga 19571  T
Q  368 aaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgat 467  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19570 aaggggaatactcgcatcaacgcttgattcagttgagcatgtcaacaaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgat 19471  T
Q  468 tctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19470 tctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtcca 19436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 237 - 1
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  || || ||  |||||| |||  |||||||||||||| |||  ||||||| |||||    
T  237 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgccttttttccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgtctcggtcaattcgtcaaa 138  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
     |||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  137 tatattggcttattgtaatgttttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaagaagaaattgctaatttttgcaag 38  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcgg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37 tggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 14 - 502
Target Start/End: Original strand, 314 - 812
Alignment:
Q  14 tagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggc 113  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  314 tagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaggaggaacaaggccggatattgttgatgcctcaatcaattcgtcaaagatatgggc 413  T
Q  114 ttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactc 213  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  414 ttattgtaatgtgttgaggcttactattaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactc 513  T
Q  214 tcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  514 tcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatgatgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaacccgttgatgt 613  T
Q  314 ----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttga 403  Q
              ||||||||||||  || | |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  614 cacttataaactttgtgtatcccgatctaaatgataaccttggtgaccagctatttttccaataaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttga 713  T
Q  404 gcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  714 gcatgttaatgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaaaagaaagagtatttaacctctgattctgtttgtagattgggtgaaaattctgatgtcca 812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Original strand, 4993 - 5499
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||  ||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  4993 gaatgacaatagttttagatggtgattttaggcagatattgcctattgttcgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcataaaa 5092  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5093 gatatgtgcttattttaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttgatacctgcaaagcagaaagaaattgctaattttggcaag 5192  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5193 tggatactctgacttggagacgacaacagcgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 5292  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
      |||||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5293 tattgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgcta-ttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 5391  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5392 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgatttcaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 5491  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  5492 gatgtcca 5499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 5 - 502
Target Start/End: Original strand, 321069 - 321576
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  321069 gaatgacaagagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgccttaatcaattcatcaac 321168  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  321169 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttacttttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 321268  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  321269 tggatattctcaatttgagacggcaattatgcttcggttgataatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacaaaacaaatc 321368  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||||          |||| |||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  321369 cgttgatgtcacttatagactttttgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaatgcttga 321468  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  321469 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatatcgctgatttcaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattct 321568  T
Q  495 gatgtcca 502  Q
    ||||||||    
T  321569 gatgtcca 321576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 5 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 183297 - 182794
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  183297 gaatgatagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaatgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 183198  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  183197 gatatggccttattgtaatgtgttgaggcttacagttaatatgatattgggtgcatcttcgggacctgcagagcaggaagaaactgctaattttggcaag 183098  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  183097 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcgaatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcccgaagatttgctcatatccgatacaacaaatt 182998  T
Q  305 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 394  Q
    |||||||||          |||||| |||||  |||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  182997 cgttgatgtcactaatagactttgtatatcccgatttgaatgatatcattggtgacccactctttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttga 182898  T
Q  395 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 494  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  182897 ttcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaagtgaagagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaaatct 182798  T
Q  495 gatg 498  Q
    ||||    
T  182797 gatg 182794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 5 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 166019 - 165511
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166019 gaatgatagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 165920  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |    
T  165919 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttacagttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgcagagcaagaataaactgctaattttggcaag 165820  T
Q  205 tgg--atactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaa 302  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  165819 tggatatactctcaattggagacgacaacgacgcttcgaatgagaatggtgaaatgaagggggaaattcccgaagatttactcatatccgatacaacaaa 165720  T
Q  303 tccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgctt 392  Q
    | |||||||||          |||||| |||||  |||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  165719 ttcgttgatgtcactaatagactttgtatatcccgatttaaatgataacattggtgacccactatttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgctt 165620  T
Q  393 gattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaata-gtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaat 491  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  165619 gattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaggtgaagagaaagatttttttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaag 165520  T
Q  492 tctgatgtc 500  Q
    |||||||||    
T  165519 tctgatgtc 165511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1139 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold1139
Description:

Target: scaffold1139; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 73 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 1418 - 983
Alignment:
Q  73 gatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtg 172  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||    
T  1418 gatattatttatgcatcaatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgggattgggtgcatcttaggtacatg 1319  T
Q  173 cagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttc 272  Q
     | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  1318 tatagcaggaagaaatttctaattttggcaagtggatactctcaattggagacgacaacgactcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcc 1219  T
Q  273 cgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttc 362  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1218 tgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttc 1119  T
Q  363 caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagct 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1118 caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttaattcagtcgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaagtgaagagaaagagtatttaagct 1019  T
Q  463 ctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatg 498  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  1018 ctgattttgtttgtcaatcgggcgaaaattctgatg 983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 73 - 502
Target Start/End: Original strand, 48748 - 49176
Alignment:
Q  73 gatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtg 172  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||||||||| |     
T  48748 gatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtaccta 48836  T
Q  173 cagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttc 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| |    
T  48837 cagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcc 48936  T
Q  273 cgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtc----------tttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttc 362  Q
     ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||          | |||||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  48937 tgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttc 49036  T
Q  363 caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagct 462  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  49037 caagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaacct 49136  T
Q  463 ctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  49137 ctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtcca 49176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Original strand, 28452 - 28727
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28452 gaatgacaatagtttaaggtggtgatatcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 28551  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 204  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  28552 gatatgtgcttattttaatgagttgagacttactgttaatatgagattggatgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 28651  T
Q  205 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatt 280  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  28652 tggatactctgaattgaagacagcaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 28727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 355 - 502
Target Start/End: Original strand, 28727 - 28874
Alignment:
Q  355 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagta 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28727 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaaaagta 28826  T
Q  455 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  28827 tttaaactctgattctgtttgtcgcttgggtgaaaattttgatgtcca 28874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 72 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 40175 - 39937
Alignment:
Q  72 ggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgt 171  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  40175 ggatattgttgatgcctcagtcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgtgtgcatcttcggtacct 40076  T
Q  172 gcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaattt 271  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||     
T  40075 acagagcaggaagaaattgctaactttggcaagtgaatactctcaattggagatggcaacgatgcttcggatgagaatggtgaaataaaggtagaaattc 39976  T
Q  272 ccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttga 310  Q
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39975 ttgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttga 39937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 286 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 16889 - 16663
Alignment:
Q  286 atatcggacacaacaaatccgttgatgtc----------tttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaa 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16889 atatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataactttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaa 16790  T
Q  376 tactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttg 475  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| || |||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||     
T  16789 tactcgcaccaacgcttaatttagtggagtatgttaacgcatatatgatttcactgattctaggtgaagagaaagagtttttaagctatgattctgtttt 16690  T
Q  476 tcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    || |||| | |||||||||||||||||    
T  16689 tcaatcgagcgaaaattctgatgtcca 16663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 157
Target Start/End: Original strand, 14010 - 14162
Alignment:
Q  5 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 104  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14010 gaatgataatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaagatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 14109  T
Q  105 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtg 157  Q
     ||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14110 tatatgggcttattttaatatgttgaggcttactattaatatgagattgggtg 14162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0888 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0888
Description:

Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 384 - 502
Target Start/End: Original strand, 24 - 142
Alignment:
Q  384 ccaacgcttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgg 483  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24 ccaaggcttgattcagttgagcatgttaacgaatatacgatgtcactgatttcaggtggcgagaaagagtatttaagctctgattttgtatgtcgatcgg 123  T
Q  484 gtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  124 gtgaaaattctgatttcca 142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1424
Description:

Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 426 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 1703 - 1627
Alignment:
Q  426 tcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1703 tcactgattccaggtgaagagaaagcgtatttaaactctgattatgtttatcgatcgggtgaaaattttgatgtcca 1627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University