View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8159_low_1 (Length: 547)

Name: NF8159_low_1
Description: NF8159
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8159_low_1
NF8159_low_1
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (41-258)||(7767380-7767596)
chr3 (161-326)||(33803250-33803414)
chr3 (161-326)||(12114560-12114724)
chr3 (162-322)||(15772851-15773010)
chr3 (163-313)||(21832356-21832503)
chr3 (161-323)||(37990978-37991139)
chr3 (161-325)||(37990638-37990801)
chr3 (161-326)||(29644900-29645064)
chr3 (161-322)||(43346793-43346953)
chr3 (161-332)||(25739417-25739587)
chr3 (190-313)||(41359776-41359898)
chr3 (161-309)||(33175674-33175826)
chr3 (161-420)||(53577360-53577609)
chr3 (161-326)||(35946518-35946682)
chr3 (165-313)||(22304569-22304716)
chr3 (161-325)||(42342387-42342550)
chr3 (161-313)||(54017827-54017978)
chr3 (161-326)||(53117973-53118136)
chr3 (161-326)||(29644579-29644743)
chr3 (161-313)||(39914248-39914399)
chr3 (174-313)||(39934966-39935104)
chr3 (161-325)||(1634314-1634477)
chr3 (161-313)||(32462911-32463063)
chr3 (161-322)||(42342092-42342252)
chr3 (161-313)||(52634672-52634822)
chr3 (161-325)||(32589700-32589862)
chr3 (161-313)||(45395664-45395815)
chr3 (163-313)||(54018209-54018358)
chr3 (165-326)||(44160545-44160702)
chr3 (165-282)||(39389070-39389186)
chr3 (161-298)||(47964544-47964680)
chr3 (161-313)||(25755390-25755541)
chr3 (161-313)||(15773188-15773341)
chr3 (161-284)||(49336727-49336849)
chr3 (161-440)||(22303848-22304110)
chr3 (161-313)||(9240145-9240296)
chr3 (161-324)||(45901709-45901872)
chr3 (165-280)||(4823655-4823769)
chr3 (161-313)||(8327900-8328055)
chr3 (161-311)||(31190013-31190154)
chr3 (165-325)||(37726504-37726655)
chr3 (156-313)||(47964926-47965082)
chr3 (168-323)||(11661954-11662108)
chr3 (161-332)||(39336224-39336391)
chr3 (226-313)||(22303670-22303756)
chr3 (161-325)||(3135453-3135623)
chr3 (173-298)||(3135099-3135223)
chr3 (161-313)||(32462569-32462721)
chr3 (165-250)||(51886561-51886645)
chr3 (175-282)||(42584864-42584970)
chr3 (13-54)||(7767596-7767637)
chr3 (165-325)||(50612446-50612610)
chr3 (348-420)||(22304367-22304438)
chr3 (250-326)||(41359489-41359565)
chr3 (168-285)||(33362334-33362451)
chr3 (168-298)||(25317161-25317290)
chr3 (246-313)||(43978876-43978947)
chr3 (237-294)||(39336000-39336057)
chr3 (236-313)||(54017559-54017636)
chr3 (161-221)||(43346646-43346706)
chr3 (215-271)||(52634990-52635045)
chr3 (165-220)||(22304246-22304301)
chr3 (248-313)||(7766794-7766857)
chr3 (447-509)||(8328161-8328223)
chr3 (158-232)||(11661528-11661602)
chr3 (161-271)||(46546378-46546487)
chr3 (162-271)||(3384319-3384427)
chr3 (345-413)||(53577653-53577721)
chr3 (235-297)||(2300026-2300089)
chr3 (161-204)||(12747871-12747914)
chr3 (357-411)||(33803175-33803229)
chr3 (235-271)||(16871012-16871048)
chr3 (235-271)||(17735044-17735080)
chr3 (235-271)||(19036313-19036349)
chr3 (277-325)||(22304304-22304352)
[»] chr1 (71 HSPs)
chr1 (161-437)||(22077392-22077657)
chr1 (161-524)||(66282-66634)
chr1 (161-440)||(22077723-22077990)
chr1 (161-439)||(41156987-41157257)
chr1 (161-325)||(26661521-26661684)
chr1 (163-325)||(41142370-41142532)
chr1 (161-326)||(39066199-39066362)
chr1 (161-313)||(24600325-24600476)
chr1 (161-322)||(3875333-3875493)
chr1 (173-313)||(24131999-24132135)
chr1 (165-325)||(44290823-44290983)
chr1 (161-439)||(34364503-34364771)
chr1 (165-325)||(44290457-44290616)
chr1 (165-324)||(5319965-5320123)
chr1 (175-324)||(3537599-3537747)
chr1 (173-396)||(9955915-9956129)
chr1 (167-440)||(34649440-34649703)
chr1 (190-326)||(22077108-22077243)
chr1 (161-313)||(41157371-41157522)
chr1 (165-324)||(41759483-41759641)
chr1 (161-313)||(37556107-37556258)
chr1 (161-313)||(17294573-17294725)
chr1 (161-326)||(31767159-31767323)
chr1 (161-313)||(40082403-40082553)
chr1 (165-326)||(48588486-48588646)
chr1 (161-313)||(34364921-34365072)
chr1 (161-313)||(66100-66251)
chr1 (161-313)||(19283466-19283617)
chr1 (161-440)||(26661792-26662060)
chr1 (163-326)||(30630636-30630798)
chr1 (165-292)||(32594748-32594874)
chr1 (161-313)||(44685452-44685604)
chr1 (165-326)||(29798199-29798359)
chr1 (173-325)||(14318875-14319026)
chr1 (155-298)||(1188614-1188756)
chr1 (161-324)||(37850600-37850762)
chr1 (161-258)||(41184491-41184587)
chr1 (161-308)||(22793274-22793421)
chr1 (166-284)||(3550721-3550838)
chr1 (175-313)||(5528765-5528902)
chr1 (167-309)||(38804370-38804511)
chr1 (161-325)||(11977276-11977439)
chr1 (192-313)||(32168709-32168823)
chr1 (161-326)||(45084378-45084536)
chr1 (177-313)||(5575116-5575249)
chr1 (165-326)||(45493972-45494137)
chr1 (348-524)||(47379977-47380152)
chr1 (168-313)||(37555733-37555876)
chr1 (168-313)||(50052035-50052178)
chr1 (165-243)||(3537228-3537305)
chr1 (161-313)||(45839623-45839778)
chr1 (192-250)||(4956218-4956275)
chr1 (161-243)||(21378122-21378203)
chr1 (194-291)||(10351189-10351285)
chr1 (161-289)||(1187399-1187526)
chr1 (237-313)||(47380178-47380254)
chr1 (202-284)||(44043812-44043893)
chr1 (261-323)||(44091989-44092051)
chr1 (348-402)||(44290755-44290809)
chr1 (248-325)||(11977026-11977103)
chr1 (357-401)||(3537452-3537496)
chr1 (451-531)||(30630824-30630904)
chr1 (161-224)||(50469180-50469243)
chr1 (348-402)||(31767094-31767147)
chr1 (352-402)||(48588418-48588468)
chr1 (355-440)||(11977126-11977210)
chr1 (174-234)||(30630911-30630972)
chr1 (383-471)||(1188475-1188562)
chr1 (237-301)||(24448348-24448412)
chr1 (281-325)||(41184407-41184451)
chr1 (165-217)||(47379891-47379943)
[»] chr6 (52 HSPs)
chr6 (161-440)||(10074257-10074525)
chr6 (165-440)||(29518503-29518767)
chr6 (165-313)||(3409259-3409406)
chr6 (161-531)||(16107674-16108032)
chr6 (165-325)||(29518920-29519079)
chr6 (165-325)||(32741179-32741338)
chr6 (161-322)||(10073618-10073776)
chr6 (165-396)||(35210204-35210423)
chr6 (173-325)||(2843562-2843714)
chr6 (161-324)||(10073991-10074153)
chr6 (165-325)||(14748341-14748496)
chr6 (161-438)||(16454571-16454838)
chr6 (163-471)||(12071555-12071851)
chr6 (165-325)||(2378126-2378285)
chr6 (161-438)||(2578730-2578996)
chr6 (161-313)||(2579883-2580034)
chr6 (173-325)||(16454915-16455066)
chr6 (173-518)||(2579310-2579642)
chr6 (167-313)||(2377756-2377901)
chr6 (165-325)||(1846748-1846907)
chr6 (161-325)||(2578442-2578604)
chr6 (165-326)||(3058226-3058386)
chr6 (168-313)||(6999807-6999951)
chr6 (173-313)||(1127368-1127507)
chr6 (165-325)||(3409660-3409819)
chr6 (168-309)||(1950200-1950340)
chr6 (175-324)||(5832027-5832174)
chr6 (161-298)||(6071128-6071264)
chr6 (164-325)||(593706-593868)
chr6 (173-326)||(3415466-3415620)
chr6 (161-313)||(12092493-12092644)
chr6 (165-313)||(26544049-26544196)
chr6 (173-290)||(32460614-32460730)
chr6 (249-321)||(12085037-12085109)
chr6 (165-313)||(10911565-10911713)
chr6 (161-284)||(8481923-8482044)
chr6 (161-324)||(2579109-2579267)
chr6 (162-313)||(5958618-5958764)
chr6 (173-291)||(9062383-9062499)
chr6 (161-257)||(16108059-16108154)
chr6 (173-326)||(17135067-17135219)
chr6 (190-326)||(31714695-31714828)
chr6 (379-427)||(2975373-2975421)
chr6 (347-439)||(3409458-3409549)
chr6 (347-398)||(2377925-2377976)
chr6 (161-224)||(33605650-33605713)
chr6 (378-440)||(33605843-33605905)
chr6 (357-458)||(12084911-12085012)
chr6 (350-402)||(2579805-2579857)
chr6 (348-402)||(2579042-2579096)
chr6 (476-530)||(10074178-10074232)
chr6 (260-302)||(10902452-10902494)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (161-408)||(1085542-1085778)
chr7 (161-313)||(7517576-7517727)
chr7 (167-524)||(47129097-47129438)
chr7 (161-313)||(30244266-30244417)
chr7 (161-438)||(8128336-8128603)
chr7 (165-440)||(37532905-37533168)
chr7 (202-440)||(37533258-37533485)
chr7 (161-313)||(40094785-40094936)
chr7 (161-325)||(45434632-45434795)
chr7 (175-325)||(6054570-6054719)
chr7 (161-295)||(7554021-7554154)
chr7 (173-322)||(34218036-34218184)
chr7 (161-325)||(23376-23539)
chr7 (161-313)||(30245073-30245220)
chr7 (161-324)||(118299-118463)
chr7 (161-326)||(24177431-24177595)
chr7 (173-325)||(11845199-11845350)
chr7 (165-313)||(22567050-22567196)
chr7 (173-313)||(19122740-19122878)
chr7 (161-313)||(45754712-45754862)
chr7 (165-284)||(16569196-16569314)
chr7 (165-284)||(16596348-16596466)
chr7 (163-313)||(36939744-36939893)
chr7 (161-313)||(45433237-45433388)
chr7 (165-284)||(22566703-22566820)
chr7 (161-254)||(28301613-28301705)
chr7 (165-326)||(29157565-29157725)
chr7 (175-301)||(24838724-24838850)
chr7 (161-323)||(36622956-36623117)
chr7 (168-309)||(9901648-9901786)
chr7 (165-313)||(14681510-14681655)
chr7 (168-321)||(20599317-20599471)
chr7 (173-325)||(30032575-30032726)
chr7 (161-325)||(41854631-41854793)
chr7 (161-284)||(40230331-40230453)
chr7 (207-313)||(30253534-30253635)
chr7 (161-313)||(36534797-36534946)
chr7 (161-284)||(1085288-1085411)
chr7 (211-322)||(28300255-28300366)
chr7 (161-234)||(36109006-36109079)
chr7 (161-256)||(41910662-41910756)
chr7 (161-284)||(43241491-43241613)
chr7 (237-440)||(37345652-37345845)
chr7 (161-233)||(30244697-30244769)
chr7 (376-531)||(48243266-48243419)
chr7 (161-232)||(30245490-30245561)
chr7 (161-232)||(30255335-30255406)
chr7 (247-324)||(47129450-47129527)
chr7 (226-322)||(37167842-37167937)
chr7 (235-313)||(40094424-40094502)
chr7 (267-328)||(30245256-30245317)
chr7 (161-291)||(37345912-37346043)
chr7 (161-313)||(37393060-37393205)
chr7 (267-323)||(30244453-30244509)
chr7 (267-326)||(30253671-30253730)
chr7 (277-311)||(7517768-7517802)
chr7 (277-311)||(7518034-7518068)
chr7 (162-224)||(10341829-10341891)
chr7 (447-524)||(1085447-1085524)
chr7 (359-440)||(28300472-28300552)
chr7 (249-313)||(28300579-28300644)
chr7 (357-437)||(40094664-40094744)
chr7 (161-217)||(36967335-36967391)
chr7 (254-322)||(37532753-37532821)
chr7 (373-439)||(45433435-45433502)
chr7 (235-285)||(21416180-21416230)
chr7 (173-271)||(44361517-44361613)
chr7 (161-298)||(4124114-4124250)
chr7 (458-531)||(37345815-37345888)
chr7 (447-529)||(45434521-45434605)
chr7 (235-271)||(23569055-23569091)
[»] chr4 (84 HSPs)
chr4 (161-328)||(36629233-36629399)
chr4 (161-313)||(3244460-3244611)
chr4 (161-313)||(25483332-25483483)
chr4 (161-307)||(4955332-4955477)
chr4 (161-326)||(36608657-36608821)
chr4 (161-322)||(39792860-39793020)
chr4 (165-313)||(32941132-32941279)
chr4 (161-326)||(22183260-22183424)
chr4 (161-438)||(3340803-3341069)
chr4 (165-313)||(50002426-50002573)
chr4 (161-311)||(2740696-2740843)
chr4 (161-307)||(34646664-34646809)
chr4 (166-323)||(16889535-16889691)
chr4 (165-326)||(55933120-55933280)
chr4 (161-325)||(39404014-39404177)
chr4 (165-325)||(41370357-41370516)
chr4 (161-313)||(52884883-52885037)
chr4 (161-440)||(10245916-10246184)
chr4 (161-324)||(36572015-36572177)
chr4 (161-323)||(1731646-1731807)
chr4 (161-323)||(39404394-39404555)
chr4 (173-524)||(20825844-20826182)
chr4 (161-524)||(22028179-22028531)
chr4 (161-313)||(52884691-52884843)
chr4 (180-524)||(54108551-54108880)
chr4 (161-321)||(34004586-34004743)
chr4 (173-313)||(50630764-50630903)
chr4 (190-325)||(18932746-18932880)
chr4 (162-313)||(54017604-54017754)
chr4 (161-313)||(22027970-22028121)
chr4 (161-308)||(54741194-54741338)
chr4 (202-313)||(54936233-54936342)
chr4 (174-324)||(44620362-44620511)
chr4 (180-313)||(54108928-54109059)
chr4 (166-324)||(16888814-16888971)
chr4 (190-324)||(44621027-44621160)
chr4 (219-332)||(23817671-23817783)
chr4 (161-326)||(44620656-44620819)
chr4 (175-313)||(54343017-54343147)
chr4 (163-279)||(2741069-2741184)
chr4 (161-312)||(4390111-4390261)
chr4 (168-323)||(50459724-50459878)
chr4 (161-298)||(28034225-28034361)
chr4 (163-313)||(49302902-49303053)
chr4 (161-326)||(51768056-51768220)
chr4 (179-307)||(15841383-15841510)
chr4 (161-297)||(41707490-41707624)
chr4 (205-325)||(43827480-43827598)
chr4 (161-313)||(49076840-49076990)
chr4 (161-332)||(19504701-19504861)
chr4 (163-298)||(23556890-23557024)
chr4 (180-295)||(45496820-45496934)
chr4 (165-284)||(49880160-49880278)
chr4 (161-325)||(49076448-49076608)
chr4 (161-313)||(3700361-3700504)
chr4 (161-326)||(3341124-3341288)
chr4 (161-313)||(43174502-43174654)
chr4 (216-313)||(31691203-31691301)
chr4 (178-291)||(34544119-34544232)
chr4 (173-298)||(760197-760320)
chr4 (173-313)||(20826225-20826364)
chr4 (173-284)||(6975494-6975604)
chr4 (161-255)||(10246343-10246436)
chr4 (260-325)||(43174235-43174300)
chr4 (211-322)||(18879852-18879962)
chr4 (161-231)||(45489421-45489491)
chr4 (353-531)||(2740868-2741043)
chr4 (348-429)||(45496723-45496804)
chr4 (447-524)||(49076644-49076721)
chr4 (190-271)||(54017753-54017833)
chr4 (183-313)||(3271802-3271936)
chr4 (173-231)||(44620304-44620362)
chr4 (161-231)||(44621422-44621492)
chr4 (191-325)||(48111695-48111828)
chr4 (352-489)||(44621175-44621309)
chr4 (238-282)||(11706584-11706628)
chr4 (235-285)||(11197295-11197345)
chr4 (177-291)||(15841016-15841128)
chr4 (347-440)||(41370528-41370620)
chr4 (252-313)||(45489723-45489784)
chr4 (431-487)||(5882033-5882088)
chr4 (374-402)||(44620543-44620571)
chr4 (161-213)||(45050597-45050649)
chr4 (165-217)||(50788087-50788139)
[»] chr2 (69 HSPs)
chr2 (165-328)||(41283471-41283633)
chr2 (162-440)||(7598225-7598492)
chr2 (165-325)||(42514649-42514808)
chr2 (165-313)||(36178616-36178763)
chr2 (161-313)||(40679640-40679791)
chr2 (165-313)||(962598-962745)
chr2 (165-313)||(14745678-14745825)
chr2 (161-313)||(15880259-15880410)
chr2 (161-313)||(28531325-28531476)
chr2 (161-313)||(36005891-36006041)
chr2 (165-388)||(37105924-37106136)
chr2 (167-325)||(6421387-6421544)
chr2 (161-305)||(28254258-28254399)
chr2 (173-322)||(33731656-33731804)
chr2 (161-325)||(35580723-35580885)
chr2 (165-322)||(37106188-37106344)
chr2 (165-325)||(5542624-5542783)
chr2 (161-307)||(30313174-30313318)
chr2 (161-323)||(38796619-38796782)
chr2 (161-313)||(15511506-15511655)
chr2 (165-313)||(5543009-5543156)
chr2 (181-313)||(6422126-6422257)
chr2 (190-325)||(36178170-36178304)
chr2 (167-325)||(6712978-6713136)
chr2 (162-313)||(7598606-7598748)
chr2 (161-291)||(16542445-16542574)
chr2 (162-318)||(1769889-1770044)
chr2 (161-313)||(40733513-40733664)
chr2 (178-313)||(23346250-23346383)
chr2 (176-313)||(40163383-40163520)
chr2 (161-310)||(5367451-5367599)
chr2 (235-325)||(6421800-6421890)
chr2 (161-283)||(30323460-30323581)
chr2 (155-313)||(37632608-37632765)
chr2 (173-313)||(14745304-14745444)
chr2 (161-298)||(29873563-29873699)
chr2 (161-298)||(29874049-29874185)
chr2 (161-271)||(31468803-31468908)
chr2 (161-313)||(9231245-9231396)
chr2 (161-289)||(33561486-33561613)
chr2 (219-325)||(3673122-3673227)
chr2 (181-274)||(28254162-28254254)
chr2 (161-254)||(31899496-31899588)
chr2 (161-325)||(40733879-40734041)
chr2 (161-313)||(29676899-29677055)
chr2 (165-271)||(36178322-36178427)
chr2 (161-271)||(37895114-37895223)
chr2 (238-531)||(3672773-3673054)
chr2 (173-324)||(29676543-29676687)
chr2 (161-233)||(38796308-38796380)
chr2 (161-313)||(16590884-16591030)
chr2 (161-296)||(41678396-41678531)
chr2 (161-222)||(36785664-36785725)
chr2 (235-326)||(6421695-6421786)
chr2 (166-297)||(31385738-31385868)
chr2 (156-307)||(33954279-33954428)
chr2 (235-313)||(35580450-35580529)
chr2 (161-271)||(31259669-31259781)
chr2 (165-255)||(12529097-12529186)
chr2 (161-271)||(12910224-12910333)
chr2 (161-298)||(33953797-33953933)
chr2 (161-285)||(37894731-37894854)
chr2 (452-524)||(38796415-38796487)
chr2 (180-224)||(42515031-42515075)
chr2 (207-286)||(30312831-30312909)
chr2 (348-429)||(35580628-35580710)
chr2 (348-401)||(6421903-6421956)
chr2 (347-388)||(36178552-36178593)
chr2 (232-296)||(15689427-15689491)
[»] chr8 (80 HSPs)
chr8 (161-313)||(45122068-45122219)
chr8 (161-325)||(9309351-9309513)
chr8 (161-313)||(9608741-9608892)
chr8 (161-322)||(3038292-3038452)
chr8 (165-313)||(3669687-3669834)
chr8 (161-411)||(34834872-34835109)
chr8 (161-322)||(40518578-40518738)
chr8 (173-325)||(34835217-34835368)
chr8 (190-437)||(45122649-45122890)
chr8 (161-325)||(6876861-6877025)
chr8 (202-438)||(18371889-18372115)
chr8 (168-468)||(147454-147740)
chr8 (165-313)||(3670060-3670207)
chr8 (177-313)||(5420663-5420798)
chr8 (161-308)||(41972154-41972303)
chr8 (167-313)||(25561826-25561972)
chr8 (161-325)||(40518065-40518230)
chr8 (161-313)||(30359267-30359418)
chr8 (165-440)||(1014139-1014403)
chr8 (165-313)||(30441081-30441232)
chr8 (161-304)||(33113387-33113529)
chr8 (202-325)||(34835512-34835634)
chr8 (202-325)||(34835778-34835900)
chr8 (173-313)||(43398079-43398221)
chr8 (163-326)||(45121908-45122070)
chr8 (161-326)||(1513913-1514077)
chr8 (161-324)||(8918764-8918926)
chr8 (190-313)||(9483198-9483320)
chr8 (161-324)||(5915868-5916025)
chr8 (167-313)||(37544501-37544646)
chr8 (167-313)||(40579517-40579662)
chr8 (161-313)||(4154679-4154828)
chr8 (161-440)||(9308973-9309245)
chr8 (161-313)||(30359605-30359756)
chr8 (173-308)||(70290-70424)
chr8 (161-325)||(9620677-9620838)
chr8 (165-313)||(1013882-1014029)
chr8 (173-313)||(9482615-9482754)
chr8 (202-313)||(9507819-9507929)
chr8 (168-322)||(32640534-32640682)
chr8 (194-303)||(9609114-9609222)
chr8 (161-322)||(147825-147976)
chr8 (202-303)||(20870594-20870694)
chr8 (161-313)||(45121667-45121817)
chr8 (161-325)||(45123002-45123165)
chr8 (161-313)||(4154292-4154442)
chr8 (173-313)||(6651511-6651641)
chr8 (161-313)||(12283869-12284019)
chr8 (173-313)||(18371672-18371806)
chr8 (163-230)||(18372349-18372416)
chr8 (173-236)||(41416258-41416321)
chr8 (163-233)||(18372789-18372859)
chr8 (191-325)||(32305503-32305636)
chr8 (245-326)||(41129067-41129148)
chr8 (165-313)||(6731904-6732042)
chr8 (177-270)||(18372988-18373077)
chr8 (248-326)||(8919142-8919220)
chr8 (245-307)||(20995433-20995495)
chr8 (446-531)||(40518469-40518554)
chr8 (273-325)||(3037968-3038020)
chr8 (161-233)||(8794107-8794179)
chr8 (348-427)||(18372190-18372269)
chr8 (175-231)||(25561736-25561792)
chr8 (245-313)||(40579280-40579348)
chr8 (168-271)||(43274832-43274934)
chr8 (173-313)||(2467510-2467647)
chr8 (202-259)||(18373235-18373291)
chr8 (161-222)||(20995502-20995563)
chr8 (379-438)||(9483084-9483144)
chr8 (154-198)||(18645712-18645756)
chr8 (161-233)||(33831974-33832046)
chr8 (167-271)||(18372659-18372758)
chr8 (173-271)||(18380070-18380167)
chr8 (173-271)||(20130457-20130553)
chr8 (161-298)||(5274771-5274907)
chr8 (247-304)||(16524446-16524503)
chr8 (260-325)||(43274634-43274699)
chr8 (369-472)||(9608946-9609045)
chr8 (348-411)||(30359445-30359505)
chr8 (261-313)||(34629712-34629764)
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (158-326)||(40296313-40296480)
chr5 (161-325)||(1028516-1028679)
chr5 (161-313)||(26074608-26074759)
chr5 (165-326)||(6500823-6500982)
chr5 (161-326)||(41632778-41632942)
chr5 (161-313)||(26074157-26074308)
chr5 (165-440)||(6500451-6500714)
chr5 (167-313)||(18603131-18603276)
chr5 (161-310)||(13415774-13415922)
chr5 (161-313)||(36568580-36568729)
chr5 (165-313)||(26590921-26591068)
chr5 (175-313)||(34753036-34753173)
chr5 (165-323)||(36492218-36492375)
chr5 (165-326)||(32487394-32487553)
chr5 (173-325)||(41170642-41170793)
chr5 (161-313)||(26075172-26075324)
chr5 (161-313)||(299485-299636)
chr5 (165-325)||(623818-623977)
chr5 (165-313)||(624196-624343)
chr5 (161-325)||(15370095-15370258)
chr5 (160-313)||(3295026-3295177)
chr5 (161-313)||(35150003-35150153)
chr5 (161-325)||(3295344-3295505)
chr5 (165-325)||(27502035-27502194)
chr5 (173-284)||(9498694-9498804)
chr5 (168-325)||(25327938-25328094)
chr5 (173-313)||(38427556-38427694)
chr5 (202-328)||(15370439-15370564)
chr5 (161-313)||(24489217-24489366)
chr5 (161-326)||(6224192-6224356)
chr5 (161-313)||(11416988-11417137)
chr5 (161-325)||(42405597-42405758)
chr5 (165-301)||(29549278-29549413)
chr5 (177-313)||(33747783-33747918)
chr5 (161-298)||(36521922-36522058)
chr5 (161-313)||(12662663-12662814)
chr5 (161-258)||(31509619-31509715)
chr5 (161-284)||(26074821-26074944)
chr5 (161-313)||(35167849-35168000)
chr5 (168-292)||(36522269-36522392)
chr5 (168-326)||(2411010-2411167)
chr5 (347-520)||(13415959-13416128)
chr5 (161-258)||(42508608-42508704)
chr5 (167-243)||(26074320-26074395)
chr5 (165-304)||(5723811-5723949)
chr5 (161-322)||(300955-301107)
chr5 (179-291)||(31509745-31509857)
chr5 (179-291)||(19275543-19275653)
chr5 (352-434)||(26075058-26075140)
chr5 (252-326)||(26900015-26900089)
chr5 (236-302)||(36527117-36527183)
chr5 (167-233)||(42524719-42524784)
chr5 (260-313)||(38427313-38427366)
chr5 (161-233)||(39309680-39309752)
chr5 (168-236)||(41635278-41635346)
chr5 (359-467)||(35150188-35150299)
chr5 (448-506)||(3295229-3295287)
chr5 (235-285)||(13042608-13042658)
chr5 (168-230)||(35914852-35914914)
chr5 (168-224)||(6225047-6225103)
[»] scaffold0702 (3 HSPs)
scaffold0702 (167-313)||(525-670)
scaffold0702 (165-325)||(146-300)
scaffold0702 (347-398)||(450-501)
[»] scaffold0391 (5 HSPs)
scaffold0391 (161-326)||(1104-1268)
scaffold0391 (358-522)||(1304-1465)
scaffold0391 (212-411)||(1607-1802)
scaffold0391 (452-531)||(3174-3254)
scaffold0391 (161-216)||(3092-3147)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (161-313)||(4978-5129)
scaffold0078 (161-284)||(5353-5475)
scaffold0078 (347-440)||(5154-5245)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (161-313)||(5392-5544)
scaffold0734 (161-256)||(5773-5867)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (161-325)||(47356-47519)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (161-282)||(17496-17618)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (167-243)||(10192-10267)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (161-298)||(39453-39588)
scaffold0113 (334-388)||(39612-39666)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 170; Significance: 6e-91; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 7767596 - 7767380
Alignment:
Q  41 agggagagtctttaagtaatgtttgatagaatgtcataagattttactcagatattggatcaatggagtgtcataagatttataaataattatgaataga 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7767596 agggagagtctttaagtaatgtttgatagaatgtcataagattttactctgatattggatcaatggagtgtcataagatttataaataattatgaataga 7767497  T
Q  141 gataaatttcacagaactggtgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccata 240  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||    
T  7767496 gacaaatttcacagaactggtgtgtgtaagtctgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttggacactttataactaagagga-ctcata 7767398  T
Q  241 aactcattgccttaaggt 258  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  7767397 aacccattgtcttaaggt 7767380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 161 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33803414 - 33803250
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |    
T  33803414 tgtgtgcaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagagga-cccataaacccattgcattaaggtat 33803316  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33803315 tgggtaagagtgtggcgtctccctctcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccca 33803250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 161 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 12114724 - 12114560
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| | |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |    
T  12114724 tgtgtgcaagtgtaagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgtcttaaggttt 12114626  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  12114625 tgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagccacgatgtggtcggtccccca 12114560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 162 - 322
Target Start/End: Original strand, 15772851 - 15773010
Alignment:
Q  162 gtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgtt 261  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15772851 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagagga-cccataaactcattgctttaaggtttt 15772949  T
Q  262 gggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcc 322  Q
    || ||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  15772950 ggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacggtcc 15773010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21832503 - 21832356
Alignment:
Q  163 tgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttg 262  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||    
T  21832503 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ctcataaactcatagccttaaggttttg 21832405  T
Q  263 ggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21832404 ggtaagag--tggcgtctctcttgcttgtctggttgttctagcctcgatgt 21832356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 37991139 - 37990978
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||| |    
T  37991139 tgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cctataaactcatcgccttaaggttt 37991041  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccc 323  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37991040 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 37990978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 37990801 - 37990638
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  || |||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  37990801 tgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagagga-ctcataaactcattgccttaaggttt 37990703  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37990702 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtgattgttctagcctcgatgtggacggtccccc 37990638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 161 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 29645064 - 29644900
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |    
T  29645064 tgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttaaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgtcttaaggttt 29644966  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| || ||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  29644965 tgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcctcgatgtggacggtccccca 29644900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 161 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 43346953 - 43346793
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  43346953 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaa-cccataaactcattgccttaaggttt 43346855  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcc 322  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  43346854 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctctatgtggacggtcc 43346793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 161 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25739587 - 25739417
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||| |||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||| |    
T  25739587 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacatcatataagtaagagga-cccataaactcattgcttttaggttt 25739489  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctc 332  Q
    ||||||||||| || |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  25739488 tgggtaagagtgtgacgtctctctagcttgtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccccaaggctc 25739417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 190 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41359898 - 41359776
Alignment:
Q  190 atcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcactt 289  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  41359898 atcggatacaatagtaaaggttgaataccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggcgtctctctcgctt 41359800  T
Q  290 gtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  41359799 gtgtggttgttctagcctcgatgt 41359776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 161 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 33175826 - 33175674
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcc--cataaactcattgccttaaggt 258  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||   |||||||||| ||||||||||    
T  33175826 tgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataataaactcatagccttaaggt 33175727  T
Q  259 gttgggtaaga--gtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcg 309  Q
     ||||||||||  || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33175726 tttgggtaagagtgtgtgacgtctctctcacttgtgtgattgttctagcctcg 33175674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 161 - 420
Target Start/End: Original strand, 53577360 - 53577609
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||| |||| || |||| |||| ||||||||  ||||||||||||| |    
T  53577360 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttaaaaataagtggat-ccataaacatattgccttaaggtct 53577458  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtg 360  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||| |||  | ||||||||   |  |||      ||| ||||||||||| ||||    
T  53577459 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcggtgtggatggtccccc---gaactc------ctctttgtgacccaacagtg 53577549  T
Q  361 gtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaa 420  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||| |||||    
T  53577550 gtatcagagtcccggttcgacgaagggtacgaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaa 53577609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 161 - 326
Target Start/End: Original strand, 35946518 - 35946682
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |    
T  35946518 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccgttgccttaaggttt 35946616  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  35946617 tgggtaaaagtgtggtgtctctcttgcttgtgcaattgttctagcctcgatgtggacggtccccca 35946682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Original strand, 22304569 - 22304716
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| |||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22304569 tgcaagtgtgagctatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataagtaagagga-cccataaacacattgccttaaggttttggg 22304667  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22304668 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgt 22304716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 42342550 - 42342387
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||| |    
T  42342550 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagagga-cccataaatccattgtcttaaggttt 42342452  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  42342451 tgggtaagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtccccc 42342387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 54017978 - 54017827
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |  |||||||||| |    
T  54017978 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ctcataaacctaacgccttaaggttt 54017880  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  54017879 tgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcttcgatgt 54017827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 53118136 - 53117973
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |  ||| |||||||||||| | |    
T  53118136 tgtgggcaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggattcaa--aacccattgccttaagattt 53118039  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  53118038 tgggtaagagtgtagtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcatcgatgtgaacggtccccca 53117973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 29644743 - 29644579
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    
T  29644743 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggattaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga-gaacccataaacccattgtcttaaggttt 29644645  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| || ||||||| |||| |||||||  | |||||||||    
T  29644644 tgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcttcgatgtggatggtccccca 29644579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 39914248 - 39914399
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | ||||||||  | |    
T  39914248 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaacagtagaggttgaacaccttataaataagagga-cccataaacctaatgccttaatattt 39914346  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  39914347 tggataagagtgtggtgtctctctcacttatgcggttgttctagcctcgatgt 39914399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 174 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 39935104 - 39934966
Alignment:
Q  174 gagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtct 273  Q
    ||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  39935104 gagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcc-ataaacccattgccttaaagttttgagtaagagtgt 39935006  T
Q  274 ggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  39935005 gatgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 39934966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1634477 - 1634314
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagt-aaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtg 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||     
T  1634477 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaaggttaaacacattataagtaagagga-cccataaacccattggcttaaggtt 1634379  T
Q  260 ttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||||||||  ||  |||||||||| | | |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1634378 ttgggtaagagtgcggtatctctctcac-tatatggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 1634314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 32463063 - 32462911
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaa-ggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtg 259  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||||||     
T  32463063 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaagagtaaaaggttgaataccttataagtaagaaga-ctcataaacccattgccttaaggtt 32462965  T
Q  260 ttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  32462964 ttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 32462911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 42342252 - 42342092
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||  || |||||||| || |||||| ||| ||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  42342252 tgtgtgcaagtgtgattcatatgttccacatcggataaaagagtaaatgttcaatgccttataagtaagagga-ctcataaactcattgccttaaggttt 42342154  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcc 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  42342153 tgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 42342092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 52634672 - 52634822
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||| |    
T  52634672 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacgccttataagtaagaga--cccataaacccattgccttaaggttt 52634769  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| || |||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  52634770 tgggtaagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagccttgatgt 52634822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Original strand, 32589700 - 32589862
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| || ||  |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  32589700 tgtgtgcaagtgtgagt-atatgtcccacataagataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggttt 32589797  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    |||||||||||  |  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  32589798 tgggtaagagtgcgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctaggctcgatgtggacggtccccc 32589862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45395815 - 45395664
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| | |||||||| || || |||| ||| || |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| || |    
T  45395815 tgtgtgcaagtgtaagttatatatcccacatcgaataaaagagtaaaggttaaacacgttataagtaagaggatcc-ataaacccattgtcttaatgttt 45395717  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45395716 tgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgctctagcctcgatgt 45395664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 54018358 - 54018209
Alignment:
Q  163 tgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttg 262  Q
    ||||||||| |||||||||||||    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |  |||||||||| |||    
T  54018358 tgtgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcggataaaagagtaaagattgaacaccttataagtaagagga-cccataaacctaacgccttaaggttttg 54018260  T
Q  263 ggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  54018259 ggtaagagtgtggtgtctctcatgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 54018209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 44160702 - 44160545
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||    
T  44160702 tgcaagtgtcagttatatgtttcatattggataaaacaataaaggttgaacaccttataaataagaggat-ccataaacccattgtcttaaggt-tttgg 44160605  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||| | |||||||||||| |||  || | ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  44160604 taagaatgtggcgtctctcttact--tgcgattgttctagcctcgatgtggacggtccccca 44160545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 282
Target Start/End: Original strand, 39389070 - 39389186
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| |||||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  39389070 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttaaaactaagagga-cccataaacccattgtcttaaggttttggg 39389168  T
Q  265 taagagtctggcgtctct 282  Q
    ||||||| ||| ||||||    
T  39389169 taagagtgtggtgtctct 39389186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 47964680 - 47964544
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |  |||||||||||| ||  ||||||||| |  ||||| | |||||| |||||||||  ||||||||||||| |    
T  47964680 tgtgtgcaagtgtgagttgtatgtcccgcatcggatagaaatgtggaggttgaacgctatataagtgagagga-cccataaacctattgccttaaggttt 47964582  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttg 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47964581 tgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttg 47964544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 25755390 - 25755541
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||  ||||| | ||| ||      
T  25755390 tgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaggttgaataccttataagtaagagga-ctcataaatccattgtcctaaagttg 25755488  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25755489 tgggtaaaagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 25755541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 15773188 - 15773341
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||| || |    
T  15773188 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaaagttgaacatcttataagtaagagga-ctcataagctcattgccttaaagttt 15773286  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctct--ctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||  ||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15773287 tgggtaagagtgtgatgtctcttgcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgt 15773341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 49336849 - 49336727
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||| ||      
T  49336849 tgtgtacaagtgtgagttacatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaccaccttataagtaagagga-cccataaacccatagtcttaaagttc 49336751  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctct 284  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||    
T  49336750 tgggtaagagtgtggtgtctctct 49336727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22304110 - 22303848
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||| || |||||||||       ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  22304110 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggt-------cttataagtaagcgga-cccataaacccattgccttaaggttt 22304019  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtg 360  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||          ||||| ||  |||||| || ||||    
T  22304018 tggataagagtgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggattgtccccca---------aggctcccccagtgacctaacagtg 22303928  T
Q  361 gtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagc 440  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| | || ||||| || |||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  22303927 gtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgacagaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagc 22303848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 9240145 - 9240296
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||||| | |    
T  9240145 tgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagagaagtaaaagctgaacaccttataagtaagagga-cccataaatccattaccttaagattt 9240243  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
     || ||||| | ||| |||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||    
T  9240244 cggataagaatgtggtgtctctctcaatagtgcggttattctagcctcgatgt 9240296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 324
Target Start/End: Original strand, 45901709 - 45901872
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaa-aagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtg 259  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||| ||     
T  45901709 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagaaaaaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cgcataaactcatggccttaaagtt 45901807  T
Q  260 ttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccc 324  Q
    || ||||||||| ||| |||||||| |||| |  |||||||||| | |||||||  |||||||||    
T  45901808 tttggtaagagtgtggtgtctctcttacttatagggttgttctaacttcgatgtggacggtcccc 45901872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 280
Target Start/End: Original strand, 4823655 - 4823769
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| || |||||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  4823655 tgcaagtgtgagttataagtctcacatcggataaaatagtaaaagttaaacaccttataagtaggagga-cccataaactcattgccttaagattttggg 4823753  T
Q  265 taagagtctggcgtct 280  Q
    ||||||| ||| ||||    
T  4823754 taagagtgtggtgtct 4823769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 8327900 - 8328055
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||| | ||||||| ||||| || |||||||||  | ||||||||||| |    
T  8327900 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggatgaatatcttataagtaaga-gaacccataaacgtaatgccttaaggttt 8327998  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtg----gttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  ||| |    |||||||||||||||||||    
T  8327999 tgggtaagagtgtggtgtctctctcacaagtgagtgcagttgttctagcctcgatgt 8328055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 311
Target Start/End: Original strand, 31190013 - 31190154
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||        |||||||||| |    
T  31190013 tgtgtgcaagtgtgagtgatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagttagagga-cccata--------gccttaaggttt 31190103  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgat 311  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  31190104 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtcgggttgttctagcctcgat 31190154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Original strand, 37726504 - 37726655
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||         ||||||||| |||| ||||     
T  37726504 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaataccttataagtaagaggatc---------cattgcctttaggttttgga 37726594  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||| || ||| | ||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37726595 taagagtgtgacgtttatcttacttgtatagttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 37726655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 47965082 - 47964926
Alignment:
Q  156 actggtgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaa 255  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||  ||||| ||||   ||||| | |||||  | ||||| | |||||||||||    
T  47965082 actgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttttacatcggatagaaaagtggaggttaaacattatataagtgagaggg-ctcataagcccattgccttaa 47964984  T
Q  256 ggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||| |||| |||||    
T  47964983 gattttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttatatgattgttctggcctagatgt 47964926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 168 - 323
Target Start/End: Original strand, 11661954 - 11662108
Alignment:
Q  168 aagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgtt-gggta 266  Q
    |||| ||||||| ||| | || || ||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||  | |||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  11661954 aagtgtgagttaaatgccccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttaaaagtgagaggc-ctcataaaccaattgccttaaggtttttgggta 11662052  T
Q  267 agagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccc 323  Q
    |||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  11662053 agagtgaggtgtctctctca-ttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacagtccc 11662108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39336391 - 39336224
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||  |  ||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  39336391 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaagttggaggttgaacactttataagtgagaggat-ccataaactcattgctttaaggttt 39336293  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctc 332  Q
    ||| ||| ||| | ||  ||||||| || ||||||||| ||| |||| |||||  | |||||||| ||||||    
T  39336292 tggataatagtgttgc--ctctctcgctcgtgtggttgctct-gcctggatgtggatggtcccccttggctc 39336224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22303756 - 22303670
Alignment:
Q  226 taagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  22303756 taagagga-cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttacttgtgcgattgttctagcctcgatgt 22303670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3135623 - 3135453
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataac-----taagaggatccc-ataaactcattgcctta 254  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||  || |||| || |||||| |||||||||||||| |      |||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  3135623 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacctcagataaaagagtaaaagttgaacaccttattatattagtaagaggacccccataaacccattgcctta 3135524  T
Q  255 aggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    |||| || | ||||||| ||| |||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3135523 aggttttagataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 3135453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3135223 - 3135099
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||| | || ||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||     
T  3135223 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaa-aagaacccataaacccactgccataaggttttgagtaagagtg 3135125  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttg 298  Q
    ||| ||||||||  |||||| |||||    
T  3135124 tggtgtctctcttgcttgtgcggttg 3135099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 32462721 - 32462569
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaa-ggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtg 259  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||  || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||     
T  32462721 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaatgaaagagtaaaaggttgaacaccttataagtaagatgatcc-ataaacctattgctttaaggtt 32462623  T
Q  260 ttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||   ||||| | ||||| ||||||||||||    
T  32462622 ttggataagagtgtggggtctctcttgtttgtgggattgttttagcctcgatgt 32462569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 250
Target Start/End: Original strand, 51886561 - 51886645
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgc 250  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  51886561 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcatataagtaagagga-cccataaactcattgc 51886645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 42584970 - 42584864
Alignment:
Q  175 agttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctg 274  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||| | ||| | |||||| ||    
T  42584970 agttatatgtcccacatcggatagaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggat-ccataaaccaattgtcttaagattttgagaaagagtgtg 42584872  T
Q  275 gcgtctct 282  Q
    | ||||||    
T  42584871 gtgtctct 42584864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 7767637 - 7767596
Alignment:
Q  13 ataatacttcagtcaagtggttgtgagcagggagagtcttta 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7767637 ataatacttcagtcaagtggttgtgagcagggagagtcttta 7767596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 50612610 - 50612446
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccata-----aactcattgccttaaggtg 259  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||     |||  |||  ||||||||     
T  50612610 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagattgaacaccttataagtaagagga-ctcataaatctaacatattatcttaaggtt 50612512  T
Q  260 ttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||  |||| |||||||||| | |||||| ||  ||||||||||    
T  50612511 ttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgagtggttgttccatcctcgacgtggacggtccccc 50612446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 348 - 420
Target Start/End: Original strand, 22304367 - 22304438
Alignment:
Q  348 tgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaa 420  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  22304367 tgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggt-cgttgcgcagaaa 22304438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 41359565 - 41359489
Alignment:
Q  250 ccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  41359565 ccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtccccca 41359489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33362451 - 33362334
Alignment:
Q  168 aagtctgagttatatg---tctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    |||| |||||||||||   |||||| ||||||| || | ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |||||    
T  33362451 aagtgtgagttatatgatatctcatgtcggataaaataataaaggttgaataccttataagtaagagga-cccataaacccatttccttaagattttggg 33362353  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctc 285  Q
    ||  ||| |||||||||||||    
T  33362352 ta--agtgtggcgtctctctc 33362334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 298
Target Start/End: Original strand, 25317161 - 25317290
Alignment:
Q  168 aagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaa 267  Q
    |||| |||||||| |||| || | | ||| |||||||  ||||||| ||| || ||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  25317161 aagtgtgagttatgtgtcccacaccagatggaaaagtggaggttgagcactttgtaactgagagga-cccataaacttgttgccttaaggttttgggtaa 25317259  T
Q  268 gagtctggcgtctctctcacttgtgtggttg 298  Q
     ||| | | || |||||||||||||||||||    
T  25317260 aagtgtagtgtgtctctcacttgtgtggttg 25317290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 43978947 - 43978876
Alignment:
Q  246 attgccttaaggtgttgggtaag----agtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  43978947 attgccttaaggttttgggtaagctagagtgtggcgtctctctcacttgtgtgtttgttctaacctcgatgt 43978876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39336057 - 39336000
Alignment:
Q  237 cataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtg 294  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  39336057 cataaaatcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtg 39336000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 54017636 - 54017559
Alignment:
Q  236 ccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | |||| |||| ||||| | ||||||||||    
T  54017636 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctattacttatgtgattgttttggcctcgatgt 54017559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 221
Target Start/End: Original strand, 43346646 - 43346706
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacacctta 221  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  43346646 tgtgtgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 43346706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 271
Target Start/End: Original strand, 52634990 - 52635045
Alignment:
Q  215 caccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagt 271  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  52634990 caccttataaataagagga-cccataaactcattgccttaagattttgggtaagagt 52635045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 220
Target Start/End: Original strand, 22304246 - 22304301
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacacctt 220  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22304246 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 22304301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7766857 - 7766794
Alignment:
Q  248 tgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| || ||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  7766857 tgccttaaggttttaggtaagattgtggcgtctctc--acttgtatggttgttctagcctcgatgt 7766794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 509
Target Start/End: Original strand, 8328161 - 8328223
Alignment:
Q  447 tgtcggtccgtttgcggagaaagcagtagcggcaatacaagtaagtaataggttccgcttgaa 509  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||| || |||||||||||    
T  8328161 tgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacggcgatacaagcaagtaagagcttccgcttgaa 8328223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 232
Target Start/End: Original strand, 11661528 - 11661602
Alignment:
Q  158 tggtgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagagg 232  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||| |||| ||||||| |||||||    
T  11661528 tggtgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaacggttaaacatcttataagtaagagg 11661602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 46546487 - 46546378
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    |||||| |||| |||||||||||||  | || |||| |||| ||  ||||||||||| |||||| | |||| |||| |||||| |||||||||||||| |    
T  46546487 tgtgtgtaagtgtgagttatatgtcctacattggattgaaatgtggaggttgaacactttataagttagagaatcc-ataaacccattgccttaaggttt 46546389  T
Q  261 tgggtaagagt 271  Q
    || ||||||||    
T  46546388 tgtgtaagagt 46546378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 162 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3384427 - 3384319
Alignment:
Q  162 gtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgtt 261  Q
    |||||||||  ||||||||||||| || ||  |||| || |||| ||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||||| | |||||||| || ||    
T  3384427 gtgtgcaagcgtgagttatatgtcccacatatgataaaacagtataggttaaacactttataaggaagagga-cccataaacttaatgccttaaagtttt 3384329  T
Q  262 gggtaagagt 271  Q
    ||||||||||    
T  3384328 gggtaagagt 3384319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 413
Target Start/End: Original strand, 53577653 - 53577721
Alignment:
Q  345 ttgtgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgc 413  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||| |||||||| || |||| |||||    
T  53577653 ttgtgacccaacagtggtatcagagtcccggttcgaagaagggtacgaccgaggccgccggtcagttgc 53577721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 297
Target Start/End: Original strand, 2300026 - 2300089
Alignment:
Q  235 cccataaactcattgcctt-aaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggtt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  2300026 cccataaactcattgcctttaaggttatgggtaaaaatgcggcgtctctctcacttgtgtggtt 2300089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12747914 - 12747871
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagt 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12747914 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagt 12747871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 357 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 33803229 - 33803175
Alignment:
Q  357 agtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgtt 411  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||  |||||||    
T  33803229 agtggtatcagagcctcgattcgacgaagggtacgactgaggcagccagtccgtt 33803175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16871048 - 16871012
Alignment:
Q  235 cccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16871048 cccataaactcattgccttaaggttttaggtaagagt 16871012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17735080 - 17735044
Alignment:
Q  235 cccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagt 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17735080 cccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagt 17735044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19036349 - 19036313
Alignment:
Q  235 cccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagt 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19036349 cccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagt 19036313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 325
Target Start/End: Original strand, 22304304 - 22304352
Alignment:
Q  277 gtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22304304 gtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 22304352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 71)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 161 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22077657 - 22077392
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||| |    
T  22077657 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaactcgtagccttaaggttt 22077559  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtg 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||| |  |||||||||||          ||||| ||||||||||||| ||||    
T  22077558 tgggtaagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgttcaagcatcgatatggacggtccccca----------ggctccccttgtgacccaacagtg 22077469  T
Q  361 gtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtaca 437  Q
    | ||| |||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22077468 gcatcagagcccaggttcgacgaagggtacgaccaaggcagccggtccgttgcggagaaaccagcaacgacggtaca 22077392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 161 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 66634 - 66282
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  || |||||||||| |    
T  66634 tgtgtgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggat-ccataaacatatggccttaaggttt 66536  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtg 360  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||          | |||  |||| |||  |||||||| ||||    
T  66535 tgggtaagagtatagcgtctctctcgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggt----------tatccaagctcccctcatgacccaacagtg 66446  T
Q  361 gtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagctccttatgtcggtccgtttg 460  Q
     |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||  |||    
T  66445 atatcagagtcccggttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtataagctcattgtgtcagtcc-cttg 66347  T
Q  461 cggagaaagcagtagcggcaatacaagtaag-taataggttccgcttgaaaggggagcatgatga 524  Q
     ||||||  ||| | |||| ||||||| ||| ||| || ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  66346 tggagaagccagcaacggcgatacaagcaagataagagcttccgcttgatgggggaacatgatga 66282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 161 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22077990 - 22077723
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |    
T  22077990 tgtgtgcaagtgtgagttatatgttttaaatcggatagaaaaataaaggttgaacatcttataagtaagagga-cccataaactcatagcc-taaggttt 22077893  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtg 360  Q
     |||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| ||| |||||||  ||||||          |||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  22077892 ggggtaagagtgtggcgtctctttcacttatgcggttgttcaagcatcgatgtggacggtc----------ctccaggctccccttgtgacccaacagtg 22077803  T
Q  361 gtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagc 440  Q
    | ||| |||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||    
T  22077802 gcatcagagcccaggttcgacgaagggtatgaccaaggcagccggtccgttgcggagaaaccagtaacgacgatacaagc 22077723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 161 - 439
Target Start/End: Original strand, 41156987 - 41157257
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  41156987 tgtgtgcaagtgtgaattatatgtcccataacggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaactcattgctttaaggttt 41157085  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtg 360  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||   ||     ||||||||| | ||    
T  41157086 tgggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccccaaggctcccct---tc----agtgacccaacaatg 41157178  T
Q  361 gtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccg-ttgcggagaaaccaacaacggcggtacaag 439  Q
    ||||| ||||| | ||||||| |||||||| ||| ||||||  |||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||    
T  41157179 gtatcagagcc-ccgttcgacaaagggtacgaccaaggcagtcggtccgtttgcgcataaagcaacaacgacggtacaag 41157257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26661684 - 26661521
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  26661684 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagagga-cccataaactcattgccttaaggttt 26661586  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||    
T  26661585 tgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggttgttcaagcctcgatatggacggtccccc 26661521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 163 - 325
Target Start/End: Original strand, 41142370 - 41142532
Alignment:
Q  163 tgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttg 262  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||     
T  41142370 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaaaagga-cccataaacccattgccttaaggttttt 41142468  T
Q  263 ggt-aagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41142469 ggtaaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 41142532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 39066362 - 39066199
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||| |    
T  39066362 tgtgtgcaagtgtgagttatatattccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagatga-cccataaaatcattgtcttaaggttt 39066264  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  39066263 tggataagagtgtggtgtctctcttacttatgtggttgttctagccttgatgt-gacggtccccca 39066199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24600476 - 24600325
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||| |    
T  24600476 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacatattataagtaaga-gaactcataaactcattgtcttaaggttt 24600378  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    || |||||||| ||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  24600377 tgtgtaagagtgtggtgtctctctcgctagtatggttgttctagcctcgatgt 24600325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 161 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 3875493 - 3875333
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||| |    
T  3875493 tgtgtgcaagagtcagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgtacaccttataagtaagagga-ctcataaacccattgccttaaggttt 3875395  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcc 322  Q
    | ||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3875394 taggtaagaatgtggagtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3875333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 173 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24132135 - 24131999
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||     
T  24132135 tgagttatatgtccctcatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataaggggat-ccataaactcattgccttaaggt-ttgggta--agtg 24132040  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24132039 tggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgt 24131999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 44290983 - 44290823
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  44290983 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggttttggg 44290885  T
Q  265 t-aagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    | |||||| ||| || |||||  |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44290884 taaagagtgtggtgtatctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 44290823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 161 - 439
Target Start/End: Original strand, 34364503 - 34364771
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||||| |    
T  34364503 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccg-taaacccatagccttaaggttt 34364601  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctg-gctctccttgtgacccaaaagt 359  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||    ||      |||| || |||| |||| ||  ||||||||| |||    
T  34364602 tgggtaagagtgtgatgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgt----gg------atggttc-cctgagctcccccagtgacccaacagt 34364690  T
Q  360 ggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccg-ttgcggagaaaccaacaacggcggtacaag 439  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || |||| |||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||||    
T  34364691 ggtatcagagccccggttcgacgaagggtacgacccagacagccggtccgtttgtgcagaaagcagcaacggcgatacaag 34364771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 44290616 - 44290457
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  44290616 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggttttggg 44290518  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||| ||| |||| |||  |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44290517 taagagtatggtgtctttcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 44290457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 165 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5320123 - 5319965
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  5320123 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagagga-cccataaactcatagccttaaggttttggg 5320025  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccc 324  Q
    ||||||| | | ||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  5320024 taagagtgtagtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 5319965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 175 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3537747 - 3537599
Alignment:
Q  175 agttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctg 274  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  3537747 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttatgagtaagagga-cctataaacccattggcttaaggttttgggtaagagtgtg 3537649  T
Q  275 gcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccc 324  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3537648 gcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3537599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 173 - 396
Target Start/End: Original strand, 9955915 - 9956129
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaa-gtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagt 271  Q
    ||||||||||||| || ||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9955915 tgagttatatgtcccacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccattaaaccaattgccttaaggttttgggtaagagt 9956014  T
Q  272 ctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtggtatcggagcc 371  Q
     ||  ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| |          ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  9956015 gtgatgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgagcggtccccta----------ggctctcctcgtgacccaacagtggtatcagagcc 9956104  T
Q  372 tcggttcgacgaagggtacaaccga 396  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  9956105 tcggttcgacgaagggtacgaccga 9956129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 167 - 440
Target Start/End: Original strand, 34649440 - 34649703
Alignment:
Q  167 caagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggta 266  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |   || | |||||||||  | ||||||||||| |||||||    
T  34649440 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgcaagaa-cccataaacctaatgccttaaggttttgggta 34649538  T
Q  267 agagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtggtatcg 366  Q
    |||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||        |||  ||| ||||||||| |||||||||     
T  34649539 agagtgaggcgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc--gg-------agcttccctagtgacccaacagtggtatca 34649629  T
Q  367 gagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccg-ttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagc 440  Q
    ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  34649630 gagcc-ccgttcgatgaagggtacgaccgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagcaacaacgacggtacaagc 34649703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 190 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22077243 - 22077108
Alignment:
Q  190 atcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcactt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || |||||| |||||||    
T  22077243 atcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagagga-cccataaactcattgccctaaggttttggataagagtgtgacgtctccctcactt 22077145  T
Q  290 gtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
     || |||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  22077144 atgcggttgttcaagcctcgatgtggacggtccccca 22077108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 41157371 - 41157522
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |    
T  41157371 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgcctttaggttt 41157469  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    || |||||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  41157470 tgagtaagagtgtggtgtctgtcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 41157522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 165 - 324
Target Start/End: Original strand, 41759483 - 41759641
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||||    
T  41759483 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagatgatcc-ataaatccattgccttaaggttttggg 41759581  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccc 324  Q
    ||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  41759582 taagagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 41759641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 37556107 - 37556258
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaa-agtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtg 259  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||     
T  37556107 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagagga--ccataaacccatagccttaaggtt 37556204  T
Q  260 ttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  37556205 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgt 37556258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 17294573 - 17294725
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  17294573 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggttt 17294671  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtg-tggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  17294672 tgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttatgcaggttgctctagcctcgatgt 17294725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 31767323 - 31767159
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| || |||||||||  || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  | ||||||||||| |    
T  31767323 tgtgtgcaagtgtgggttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccattaacctaatgccttaaggttt 31767225  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||||||| || ||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  31767224 tgggtaagagtgtgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctagactcgatgtggacggtccccca 31767159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 40082403 - 40082553
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||| |    
T  40082403 tgtgcgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggat--cataaattcattgccttaaggttt 40082500  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| |||  |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  40082501 tgggtaagagtgtggtatctctcttgcttgtgcgtttgttctagcctcgatgt 40082553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 48588646 - 48588486
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| |||||| ||||||  | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  48588646 tgcaagtgtgagttctatgtccgacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaga-cccgtaaattcattgccttaaggttttggg 48588548  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    |||||||  || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  48588547 taagagtgcggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcgccca 48588486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 34364921 - 34365072
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |    
T  34364921 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccatagccttaaggttt 34365019  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||  |||| |||| |||||||||    
T  34365020 tgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttatgcagttgctctaacctcgatgt 34365072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 66251 - 66100
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttat-atgtctcatatcggatagaaaagtaaagg-ttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggt 258  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  66251 tgtgtgcaagtgtgagtaatcatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggtttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacctatggccttaaggt 66153  T
Q  259 gttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
     |||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  66152 tttgggtaagagtgtggcg--cctctcacttgtatggttgttctggcctcgatgt 66100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19283617 - 19283466
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||  ||||||| ||| || ||| | |||||| | ||||||||||| |||||||||| |    
T  19283617 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggatagaaaagtggaggttgagcactttgtaaatgagagga-cacataaactcatcgccttaaggttt 19283519  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  19283518 tggataagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctggatgt 19283466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 26662060 - 26661792
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| |||||||||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||  ||||||||||||| |    
T  26662060 tgtgtacaagtgtgagttatatatcccatatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaaga-cccataaaccgattgccttaaggttt 26661962  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtg 360  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||   | |||| |          ||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  26661961 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaatccttgatgcggatggtctc----------cctagctcccctcgtgacccaaaagtg 26661872  T
Q  361 gtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagc 440  Q
    ||||  || ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |||  ||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  26661871 gtattagaacctcgattcgacgaagggtacgaccgaggccgccagtcaattgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagc 26661792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 30630798 - 30630636
Alignment:
Q  163 tgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttg 262  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||    
T  30630798 tgtgcaagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaaaattaaaggtttgacactttataagtaagagaa-cccataaacacattgccttaaagttttg 30630700  T
Q  263 ggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    |||||||||  |||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||| | | ||||||||    
T  30630699 ggtaagagtggggcgtccctatcacttatgtggttgttctggcctcgatgtgagcagtccccca 30630636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 165 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 32594874 - 32594748
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| |||||||||||||  | ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  32594874 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaactcattgtcttaaggttttggg 32594776  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtg 292  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  32594775 taagagtgtggtgtctctcttacttgtg 32594748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 44685452 - 44685604
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaagg-ttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtg 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||     
T  44685452 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggtttgaaaaccttataagtaagagga-ccaataaactcattgccttaatgt- 44685549  T
Q  260 ttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgt-gtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |||||||| ||| || ||||| |||| ||||| | ||| |||||| |||||||||    
T  44685550 ttgggtaacagtgtgacgtctttctctcttgtgggggtagttctaacctcgatgt 44685604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 326
Target Start/End: Original strand, 29798199 - 29798359
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| |||||||||||||  | || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||     
T  29798199 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ctcataaacccattgccttaaggtcttgga 29798297  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |  |||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||    
T  29798298 taagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctaacctcgatatagacggtccccca 29798359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 325
Target Start/End: Original strand, 14318875 - 14319026
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    ||||||||||||  ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||     
T  14318875 tgagttatatgttccacgtcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaga-cccataaatctattgccttaaggttttgggtaagagtg 14318973  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  14318974 tggtgtctctcttatttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtccccc 14319026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 155 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 1188756 - 1188614
Alignment:
Q  155 aactggtgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgcctta 254  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||| |  |||||| | ||| || | |||||||||||||| |||    
T  1188756 aactgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtggaggttgaatattttataagtgagaaga-ctcataaactcattgcttta 1188658  T
Q  255 aggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttg 298  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1188657 aggttttgggtaaaagtgtggcgtctctctcacttatgtggttg 1188614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 37850762 - 37850600
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||  | ||  ||||||| |    
T  37850762 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaaga-gaacccataaacctaatgttttaaggttt 37850664  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccc 324  Q
     || ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  37850663 cggataagagtgtggtgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtcccc 37850600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 41184587 - 41184491
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggt 258  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  41184587 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggt 41184491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 308
Target Start/End: Original strand, 22793274 - 22793421
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactca-ttgccttaaggtg 259  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||| |||||||| || |||||||| |||     
T  22793274 tgtgagcaagtgtgagttatatgtcccacatcgtatagaaaagtagaggttgaaaactttataagtgagaggat-ccataaacccatttgccttacggtt 22793372  T
Q  260 ttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctc 308  Q
    ||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22793373 ttgagtaagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttgttctggcctc 22793421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 166 - 284
Target Start/End: Original strand, 3550721 - 3550838
Alignment:
Q  166 gcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggt 265  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  3550721 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ctcataaacccattgccttaaagttttgggt 3550819  T
Q  266 aagagtctggcgtctctct 284  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  3550820 aagagtgtggtgtctctct 3550838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5528902 - 5528765
Alignment:
Q  175 agttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctg 274  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||| ||||||||  || ||    
T  5528902 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataaataagagga-ctcataaactcattttcttaaggttttgggtaaatgtgtg 5528804  T
Q  275 gcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||   || || |||||||||| |||||||||    
T  5528803 gcgtctctcttctttatgcggttgttctatcctcgatgt 5528765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 38804511 - 38804370
Alignment:
Q  167 caagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggta 266  Q
    ||||| ||||||||| ||| || |||| ||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||| |||||||    
T  38804511 caagtgtgagttatacgtcccacatcgaataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggatcc-ataaacccataaccttaaggttttgggta 38804413  T
Q  267 agagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcg 309  Q
    ||||| | | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  38804412 agagtgtagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 38804370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Original strand, 11977276 - 11977439
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || ||||| || || |||||| |||||||||||||||| |||||| | | |||||||  | ||||||||||| |    
T  11977276 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagagca-ctcataaacctaatgccttaaggttt 11977374  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||  |  ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11977375 tgggtaagagtgtgatgtctctcttgcaagtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 11977439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 32168823 - 32168709
Alignment:
Q  192 cggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgt 291  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||      |||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  32168823 cggataaaatagtaaaggttgaacacctta------agagga-cccataaacccattgccttgaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgt 32168731  T
Q  292 gtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  32168730 gcggttgttctagcctcgatgt 32168709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 326
Target Start/End: Original strand, 45084378 - 45084536
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||       | |||||||| |    
T  45084378 tgtgtgcaagtgtgagttatatctcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataa------cgtcttaaggttt 45084470  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  45084471 tgggtaagagagtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgcggacggtccccca 45084536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 313
Target Start/End: Original strand, 5575116 - 5575249
Alignment:
Q  177 ttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggc 276  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||  ||| || ||||||| |||| ||||||| ||||    
T  5575116 ttatatgtcccacgtcggatagaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cctataaatccatagctttaaggttttggataagagtgtggc 5575214  T
Q  277 gtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||  ||| || ||| ||||||||||||||||    
T  5575215 gtctctct--cttatgaggtagttctagcctcgatgt 5575249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 45494137 - 45493972
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagtt-atatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacacc----ttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtg 259  Q
    ||||||| |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||     ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||     
T  45494137 tgcaagtgtgagtttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatatatataagtaagatgat-ccataaacccattgccttaaagtt 45494039  T
Q  260 ttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  45494038 ttggataagagtgtggtgtctctcttccttatgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccccca 45493972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 348 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 47380152 - 47379977
Alignment:
Q  348 tgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagctccttat 447  Q
    |||||||| | ||||||| ||||| || || || |||| |||| || |||||| | |||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  47380152 tgacccaacaatggtatcagagccccgatttgatgaagagtacgactgaggcaaccggtcagttgcagagaaaccagcaatggcggtacaagctccttgt 47380053  T
Q  448 gtcggtccgtttgcggagaaagcagtagcggcaatacaagtaagtaataggttccgcttgaaaggggagcatgatga 524  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| | || | ||||||| |||||| |  ||||||||||  |||||||| |||||    
T  47380052 gtcggtctg-ttgcggagaaagcagcaacgacgatacaagcaagtaagaacttccgcttgaggggggagcacgatga 47379977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 313
Target Start/End: Original strand, 37555733 - 37555876
Alignment:
Q  168 aagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaa 267  Q
    |||| ||||||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||| || |||||| ||||||||  || ||||  | | |||||||||| ||||||||    
T  37555733 aagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtgaaggttgaatacattataagtaagagga--ccttaaatccttagccttaaggttttgggtaa 37555830  T
Q  268 gagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  37555831 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgt 37555876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 168 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 50052178 - 50052035
Alignment:
Q  168 aagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaa 267  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||  |||  ||||| || ||||||||    
T  50052178 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagagga-cccataaacctattttcttaaagttttgggtaa 50052080  T
Q  268 gagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |||| ||| ||||||||   || ||| ||||||||| |||||||||    
T  50052079 gagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctaacctcgatgt 50052035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3537305 - 3537228
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaac 243  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3537305 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaac 3537228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 45839623 - 45839778
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaa-----caccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaa 255  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||     |||||||||| ||||| || ||||||||   | ||||||||    
T  45839623 tgtgtacaagtatgagttatatgtcccacatcggatagaaaa-taaaggttgaatcgaacaccttataagtaagaaga-cccataaatgtaatgccttaa 45839720  T
Q  256 ggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||| |||||||||| | ||| ||||||||  |||||| | ||||||| ||||||||||    
T  45839721 ggttttgggtaagattgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctggcctcgatgt 45839778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 250
Target Start/End: Original strand, 4956218 - 4956275
Alignment:
Q  192 cggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  4956218 cggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggat-ccataaactcattgc 4956275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21378203 - 21378122
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaac 243  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||    
T  21378203 tgtgtgcaagtgtcagttatatgtcccagatcggatagaacagtaaaggttgaatatcttataagtaagagga-cccataaac 21378122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 291
Target Start/End: Original strand, 10351189 - 10351285
Alignment:
Q  194 gatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgt 291  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||| | |||| | ||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10351189 gatagaaaaatagaggttgaacactttataagtgagagaa-cccataaacacattactttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgt 10351285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1187526 - 1187399
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| ||||||  ||||| ||||  |||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||| | |    
T  1187526 tgtgtgcaagtgtgaattatatgtctcacatcgaatataaaagtggaggttaaacattttataagtgagaaga-cccataaactcattaccttaagattt 1187428  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcactt 289  Q
    || |||| ||| || ||||||||||||||    
T  1187427 tgagtaaaagtgtgacgtctctctcactt 1187399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 47380254 - 47380178
Alignment:
Q  237 cataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| || | |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||    
T  47380254 cataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtgacatctctctcacttgtctggttgctcaagcctagatgt 47380178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 202 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 44043893 - 44043812
Alignment:
Q  202 agtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctct 284  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  44043893 agtaaatgttgaacaccttataagtaagatga-cccataaacccattgtcttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctct 44043812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 323
Target Start/End: Original strand, 44091989 - 44092051
Alignment:
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccc 323  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  44091989 tgggtaagagtgtggcgtctttctcacttgttttgttgttctggcctcgatgtagacggtccc 44092051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 44290809 - 44290755
Alignment:
Q  348 tgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagc 402  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  44290809 tgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggcagc 44290755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 325
Target Start/End: Original strand, 11977026 - 11977103
Alignment:
Q  248 tgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  |  ||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11977026 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtccccc 11977103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3537496 - 3537452
Alignment:
Q  357 agtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcag 401  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3537496 agtggtatcagagccacggttcgacgaagggtacgaccgaggcag 3537452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 451 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 30630904 - 30630824
Alignment:
Q  451 ggtccgtttgcggagaaagcagtagcggcaatacaagtaagtaataggttccgcttgaaaggggagcatgatgagttgatg 531  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |  | ||||||| ||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30630904 ggtccgtttgcggagaaagtagtaacaacgatacaagcaagtaagtgcttcctcttgaagggggagcatgatgaattgatg 30630824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 50469243 - 50469180
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataa 224  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  | ||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  50469243 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataataaagtaaaggttgaacactttataa 50469180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 348 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 31767147 - 31767094
Alignment:
Q  348 tgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagc 402  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31767147 tgacccaacagtggtatcagagccccg-ttcgacgaagggtacgaccgaggcagc 31767094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 352 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 48588468 - 48588418
Alignment:
Q  352 ccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagc 402  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  48588468 ccaaaagtggtatcagagtcccggttcaacgaagggtgcaaccgaggcagc 48588418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 440
Target Start/End: Original strand, 11977126 - 11977210
Alignment:
Q  355 aaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagc 440  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |  |||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  11977126 aaagtggcatcagagcc-cggtttgacgaagggtacgaccgaggccgtcggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagc 11977210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30630972 - 30630911
Alignment:
Q  174 gagttatatgtctcatatcggatagaaaagt-aaaggttgaacaccttataactaagaggat 234  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30630972 gagttatatgtcttacatcggataaaaaaattaaaggctgaacaccttataagtaagaggat 30630911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 383 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 1188562 - 1188475
Alignment:
Q  383 aagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagctccttatgtcggtccgtttgcggagaaagca 471  Q
    |||||||  |||||| |||||| |  |||||||||||| || ||||| || |||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||    
T  1188562 aagggtatgaccgagacagctgatttgttgcggagaaagcagcaacgacgatacaagctccttgtgtcggcccg-tagcggagaaagca 1188475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 237 - 301
Target Start/End: Original strand, 24448348 - 24448412
Alignment:
Q  237 cataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttc 301  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||| ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||    
T  24448348 cataaactcattgtcttaagattttggataaaagtgtggcgtgtctctcacttatgaggttgttc 24448412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 281 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 41184451 - 41184407
Alignment:
Q  281 ctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41184451 ctcttacttgtgcggttgttccagcctcgatgtcgacggtccccc 41184407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 47379943 - 47379891
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacac 217  Q
    ||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||  |||||||||||    
T  47379943 tgcaagtgtgagttatatatcccacatcggatagaaaagtggaggttgaacac 47379891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 52)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 161 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10074525 - 10074257
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  10074525 tgtgtgcaagtgtgagttagaggtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaactcattgccttaaggttt 10074427  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtg 360  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||          ||||| |||||||||||||   |     
T  10074426 tgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggatagtccccca----------ggctccccttgtgacccaactctt 10074337  T
Q  361 gtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagc 440  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || |||| |||||| |||||  | ||||| ||||||||||    
T  10074336 gtatcagagccccggttcgaagaagggtacgaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagtagcaacgacggtacaagc 10074257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 165 - 440
Target Start/End: Original strand, 29518503 - 29518767
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  29518503 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattaccttaaggttttggg 29518601  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtggtat 364  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||   || |||||       ||  | |||||| ||||||||    
T  29518602 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc---gcgctcct-------ctcataacccaacagtggtat 29518691  T
Q  365 cggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagc 440  Q
    | ||||| |||||||||||||||| | |||||| | || |||  |||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  29518692 cagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagc 29518767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Original strand, 3409259 - 3409406
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3409259 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaactcattgccttaaggttttggg 3409357  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3409358 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 3409406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 531
Target Start/End: Original strand, 16107674 - 16108032
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||| |    
T  16107674 tgtgtacaagtgtgagttatatgtgtcacatcggataaaaaagtaaaggttaaacaccttataagtaagagga-ctcataaacccattgccttaaggttt 16107772  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtg 360  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    ||| |||| |  ||| |||   ||     ||||||||| ||||    
T  16107773 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgggtggtacccc-taactcccct---tc----agtgacccaacagtg 16107864  T
Q  361 gtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtcc-gttgcggagaaaccaacaacggcggtac-aagctccttatgtcggtccgtt 458  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||  ||| | ||||| || |||||||||||| ||||      |||||||| |||    
T  16107865 gtatcagagccccggttcgacgaagggtatgaccgaggcagccggtccatttgtgcagaaagcagcaacggcggtacaaagc----agtgtcggtctgtt 16107960  T
Q  459 tgcggagaaagcagtagcggcaatacaagtaagtaataggttccgcttgaaaggggagcatgatgagttgatg 531  Q
    |||| ||||| ||| | |||| || |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16107961 tgcgaagaaaccagcaacggcgatgcaagaaagtaagagcttccgcttg-aaggggagcatgatgaattgatg 16108032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Original strand, 29518920 - 29519079
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  29518920 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattaccttaaggttttggg 29519018  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29519019 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 29519079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Original strand, 32741179 - 32741338
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  32741179 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattaccttaaggttttggg 32741277  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32741278 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 32741338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 10073776 - 10073618
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | |    
T  10073776 tgtgtgcaagtgttagttatatgtcccacatcgga--gaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcc-ataaactcattggcttaagattt 10073680  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcc 322  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  10073679 tgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtcc 10073618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 396
Target Start/End: Original strand, 35210204 - 35210423
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  35210204 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaaaccattgccttaaggttttggg 35210302  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtggtat 364  Q
    ||||||| ||| || ||| |  |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||           |||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  35210303 taagagtgtggtgtttcttttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtcc-----------cctggctcccccagtgacccaacagtggtat 35210391  T
Q  365 cggagcctcggttcgacgaagggtacaaccga 396  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35210392 caaagcctcggttcgacgaagggtacgaccga 35210423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 173 - 325
Target Start/End: Original strand, 2843562 - 2843714
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  2843562 tgagttatatgtttcacatcggataaaataataaaagttgaacaccttataagtaagaggaccccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtg 2843661  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    |||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2843662 tggtatctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 2843714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10074153 - 10073991
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  10074153 tgtgtgcaagggtgagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaacgttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggttt 10074055  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccc 324  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  10074054 tgggtaaaagtgtggtgtctctctcgcttatttggttgttctagcctcgacgtggacggtcccc 10073991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14748496 - 14748341
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14748496 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagagga-cccataaactcattgcgttaaggttttggg 14748398  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||| |||    |||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14748397 taagagtgtgg----tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 14748341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 438
Target Start/End: Original strand, 16454571 - 16454838
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||| || ||| |||| || | |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |    
T  16454571 tgtgtacaagtgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagaataaaagttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaagattt 16454669  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtg 360  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||          ||  |||| ||| ||||||||| ||||    
T  16454670 tggataagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccc----------ccgagctcccctcgtgacccaacagtg 16454759  T
Q  361 gtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccg-ttgcggagaaaccaacaacggcggtacaa 438  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||| | | |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  16454760 gtatcagagcccaggttcgacgaagggtacgaccgaggtaaccggtccgtttgcgcagaaagcaacaacgacggtacaa 16454838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 12071851 - 12071555
Alignment:
Q  163 tgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttg 262  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| |  || |||||||| ||||||   | |||| | |||||||  ||  ||||||||| |||    
T  12071851 tgtgcaagtgtgagttatatgtctcgcatcagatagaaaaatggagtttgaacactttataatagaaagga-ctcataaacctatgaccttaaggttttg 12071753  T
Q  263 ggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtggt 362  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |           |||| |||  ||||| || ||||||    
T  12071752 ggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtccccta----------agctcccctcatgacctaacagtggt 12071663  T
Q  363 atcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagctccttatgtcggtccgtttgcg 462  Q
    ||| ||| | || ||||| |||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||| | ||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  12071662 atcagagtcccgattcgatgaagagtacgaccaaggcagctgatccgttgcggagaaactagcaacagtggtgcaagctccttgtgtcggtccg-ttgcg 12071564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Original strand, 2378126 - 2378285
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||    
T  2378126 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattaccttaaggttttagg 2378224  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||| | ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2378225 taagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 2378285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 161 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 2578996 - 2578730
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||| |  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  2578996 tgtgagcaagtgtgatttatatgtccctcatcggata-aaaagtaaatgttgaataccttataaataagaggatcc-ataaactcattaccttaaggttt 2578899  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtg 360  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||          ||||| |||  |||  ||| ||||    
T  2578898 tgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctgacctcgatgtggacggtccccca----------ggctcccctcatgaatcaacagtg 2578809  T
Q  361 gtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccg-ttgcggagaaaccaacaacggcggtacaa 438  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||    
T  2578808 gtatcagagccccggttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccgcttgggcagaaagcagcaacggcgttacaa 2578730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2580034 - 2579883
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||  |||||||||| |    
T  2580034 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagagga-cccataaacccacagccttaaggttt 2579936  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2579935 tgggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 2579883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 173 - 325
Target Start/End: Original strand, 16454915 - 16455066
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    |||||||| |||| || ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||     
T  16454915 tgagttatgtgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaatagga-cccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtg 16455013  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16455014 tggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 16455066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 173 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 2579642 - 2579310
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    ||||||||||||| || |||||| | |||||||||||| | | ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  2579642 tgagttatatgtcccacatcggacaaaaaagtaaaggtcggataccttataagtaagaggg-cccataaactcattgccttaaggttttgggtaaaagta 2579544  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtggtatcggagcct 372  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  | ||| || ||          ||||| |||   ||  ||| ||||||||| |||||     
T  2579543 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggatggttccaca----------ggctcccctcacgaatcaacagtggtatcagagccc 2579454  T
Q  373 cggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtcc-gttgcggagaaaccaacaacggcggtac-aagctccttatgtcggtccgtttgcggagaaagc 470  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  ||||| ||||| || |||||||||||| ||||      |||||||| |||||| |||||| |    
T  2579453 cggttcgacgaacggtacgaccgaggcagccggtccacttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaaagc----ggtgtcggtctgtttgcagagaaacc 2579358  T
Q  471 agtagcggcaatacaagtaagtaataggttccgcttgaaaggggagca 518  Q
    || | |||| ||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2579357 agcaacggcgatacaaacaagtaagagcttccgcttgaaaggggagca 2579310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 167 - 313
Target Start/End: Original strand, 2377756 - 2377901
Alignment:
Q  167 caagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggta 266  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2377756 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggttttgggta 2377854  T
Q  267 agagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||| ||| |||| |||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  2377855 agagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgt 2377901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Original strand, 1846748 - 1846907
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||  |||||||||||||| ||||     
T  1846748 tgcaagtgtgaattctatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagca-cccataaatccattgccttaaggttttgga 1846846  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||| ||| |||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1846847 taagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 1846907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 2578604 - 2578442
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || | |||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |    
T  2578604 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccaca-cggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagagga-cccataaacccatagccttaaggttt 2578507  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2578506 tgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 2578442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 326
Target Start/End: Original strand, 3058226 - 3058386
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| | ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3058226 tgcaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtatgaggat-ccataaacccattgccttaaggttttggg 3058324  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||||  ||| |||||| |||||||||  || ||||||||    
T  3058325 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtagggtggttctaacctcgatgtggaccgtccccca 3058386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 168 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6999951 - 6999807
Alignment:
Q  168 aagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaa 267  Q
    |||| |||||||||||||  | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  6999951 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaaaagtaaaagttgaacaccttatatgtaagaggatcc-ataaactcactgccttaaggttttggataa 6999853  T
Q  268 gagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  6999852 gagtgtggcgtctctcttgctaatgtggttgttctagtctcgatgt 6999807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 173 - 313
Target Start/End: Original strand, 1127368 - 1127507
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    |||||||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||     
T  1127368 tgagttatatatcccacatcgggtaaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ctcataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtg 1127466  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||    
T  1127467 tggcgtctctcttacttatgtggttgctctaacctcgatgt 1127507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Original strand, 3409660 - 3409819
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||  || ||| |||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |  | |||||    
T  3409660 tgcaagtgtgagttatatgtaccacatcagataaaatagtaaaagttgaacatcttataagtaagagga-cccataaacccattgcctttattttttggg 3409758  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3409759 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 3409819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 168 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 1950340 - 1950200
Alignment:
Q  168 aagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaa 267  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||   | ||||||||||| ||| ||||    
T  1950340 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggagcc-ataaatctaatgccttaaggttttgagtaa 1950242  T
Q  268 gagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcg 309  Q
    |||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1950241 gagtgtgacgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcg 1950200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5832174 - 5832027
Alignment:
Q  175 agttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctg 274  Q
    ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||| ||    
T  5832174 agttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaagccacc-ccttaagattttgggtaaaagtgtg 5832077  T
Q  275 gcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccc 324  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5832076 gtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtagacggtcccc 5832027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 298
Target Start/End: Original strand, 6071128 - 6071264
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || || | ||||||||||  ||||||||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  6071128 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagatgatcc-ataaactcattgccttaagattt 6071226  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttg 298  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6071227 tggataagagtgtggcgtctctctcgcttgtatggttg 6071264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 593868 - 593706
Alignment:
Q  164 gtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgg 263  Q
    |||||||| |||||| |||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  | ||||||||||| ||||    
T  593868 gtgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ctcataaaccgactgccttaaggttttgg 593770  T
Q  264 gtaagagtctggcgtctctctc--acttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    |||| ||| |||  ||||||||  ||||||  ||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  593769 gtaatagtgtggtatctctctcttacttgtacggttgttctaggctcgatgttgacggtccccc 593706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Original strand, 3415466 - 3415620
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    ||||||||||||| || |||  ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  3415466 tgagttatatgtcccacatcacataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtg 3415564  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgt--tctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||| ||||||||  |||||| ||||||  ||||||||||||||  | |||||||||    
T  3415565 tggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctctagcctcgatgtggaaggtccccca 3415620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12092644 - 12092493
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||  || |||| ||||| || |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  12092644 tgtgtgcaagggtgtgttagatgtcccacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggatcc-ataaactcattgccttaaggttt 12092546  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    || |||||| | ||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||    
T  12092545 tgagtaagactgtggtgtctctctcacttgtgaggttgctctggcctggatgt 12092493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Original strand, 26544049 - 26544196
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||| |    
T  26544049 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagagga-cccataaacccaccgccttaaggttttgag 26544147  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||| ||  ||||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  26544148 taagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcgattgttctagcctcaatgt 26544196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 173 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 32460730 - 32460614
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  32460730 tgagttatatgtcccacatcgtataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ctcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 32460632  T
Q  273 tggcgtctctctcacttg 290  Q
    || | ||| |||||||||    
T  32460631 tgacatctttctcacttg 32460614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 249 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12085109 - 12085037
Alignment:
Q  249 gccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtc 321  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12085109 gccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgcgaacggtc 12085037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Original strand, 10911565 - 10911713
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaa-gtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgg 263  Q
    ||||||| |||||||||||||  | ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || |||     
T  10911565 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ctcataaactcattgccttaaagttttga 10911663  T
Q  264 gtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
     ||||||| ||  |||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||||    
T  10911664 ataagagtgtgatgtctctcttactaatgttgttgttcaagcctcgatgt 10911713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 284
Target Start/End: Original strand, 8481923 - 8482044
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||  ||||||||||| |||||| | ||| || | |||||||||||||||||||| | |    
T  8481923 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtc-cacatcagatataaaagtggaggttgaacactttataaatgagatga-ctcataaactcattgccttaagattt 8482020  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctct 284  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||    
T  8482021 tgggtaagagtgtggtgtctctct 8482044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2579267 - 2579109
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||||||||    ||||| || |||||| |||  | ||||||  |    
T  2579267 tgtgtacaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataa----gaggaacc-ataaacccataactttaaggctt 2579173  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccc 324  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  2579172 tggctaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtcccc 2579109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5958764 - 5958618
Alignment:
Q  162 gtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgtt 261  Q
    |||||||| | |||||||||||| | | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||| ||||| || ||    
T  5958764 gtgtgcaattgtgagttatatgtgttacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataaga-gaactcataaactcattgtcttaaagtttt 5958666  T
Q  262 gggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |||  ||||| ||  ||||||    |||||||| |||||||| |||||||||    
T  5958665 gggatagagtgtgatgtctct----cttgtgtgattgttctaacctcgatgt 5958618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9062499 - 9062383
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||| || |||||||| |||     
T  9062499 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagagga-ctcataaactcattgtcttaa-gttttgggtaaaagtg 9062402  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgt 291  Q
    |||  ||||||| ||||||    
T  9062401 tggtatctctcttacttgt 9062383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 257
Target Start/End: Original strand, 16108059 - 16108154
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaagg 257  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  || ||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16108059 tgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaagg 16108154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 17135219 - 17135067
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||||  ||||||||  |||||||||||||    || || |||| |||||||     
T  17135219 tgagttatatgtctcacatcggatagagaagtaaatgtttaataccttataagcaagaggat-tcataaactcattgttagaaagttttggataagagtg 17135121  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    || || |||| || |||||| ||||||||  |||| |||||  |||||||||||    
T  17135120 tgacggctctttcgcttgtgcggttgttccggccttgatgtggacggtccccca 17135067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 326
Target Start/End: Original strand, 31714695 - 31714828
Alignment:
Q  190 atcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcactt 289  Q
    |||||||||||||||  |||||||||    ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| | | || |||    
T  31714695 atcggatagaaaagtggaggttgaacgttatataa-tgagagga-cccattaactcattgccttaaggttttgagtaagagtgtggcgt-tttttcgctt 31714791  T
Q  290 gtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  31714792 gtgtggttgctctagcctcgatgtggacggtctccca 31714828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 427
Target Start/End: Original strand, 2975373 - 2975421
Alignment:
Q  379 gacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaa 427  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2975373 gacgaagggtattaccgaggcagctggtctgttgcggagaaaccaacaa 2975421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 439
Target Start/End: Original strand, 3409458 - 3409549
Alignment:
Q  347 gtgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaag 439  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||| ||| ||||||| | ||| || |||||||||||||||    
T  3409458 gtgacccaatagtggtatcagagccccggttcgacgaagtatatgaccgaggcagccggt-cgttgcgtaaaaagcagcaacggcggtacaag 3409549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 347 - 398
Target Start/End: Original strand, 2377925 - 2377976
Alignment:
Q  347 gtgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgagg 398  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  2377925 gtgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgagg 2377976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 224
Target Start/End: Original strand, 33605650 - 33605713
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataa 224  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  33605650 tgtgtgcaagtgtgagctatatgtctcacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataa 33605713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 440
Target Start/End: Original strand, 33605843 - 33605905
Alignment:
Q  378 cgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagc 440  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  33605843 cgacgaagggtaggaccgaggcagccgatccgttgcggagaaaccagcaacgacgatacaagc 33605905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 357 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 12085012 - 12084911
Alignment:
Q  357 agtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagctccttatgtcggtccg 456  Q
    ||||||||| ||| | ||||| || |||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||   |||| | ||| |||||||||| ||||||||||    
T  12085012 agtggtatcagagtcccggtttgatgaagagtacgactgaggcagccgatccgttgcggagaaacttgcaacagtggtgcaagctccttgtgtcggtccg 12084913  T
Q  457 tt 458  Q
    ||    
T  12084912 tt 12084911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 350 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 2579857 - 2579805
Alignment:
Q  350 acccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagc 402  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2579857 acccaacagtggtatcagagccccggttccacgaagggtacgaccgaggcagc 2579805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 348 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 2579096 - 2579042
Alignment:
Q  348 tgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagc 402  Q
    |||||||| |||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2579096 tgacccaacagtgatatcagagtcccggttcgacgaagggtacgaccgaggcagc 2579042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 476 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 10074232 - 10074178
Alignment:
Q  476 cggcaatacaagtaagtaataggttccgcttgaaaggggagcatgatgagttgat 530  Q
    |||| ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10074232 cggcgatacaagcaagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgat 10074178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 10902494 - 10902452
Alignment:
Q  260 ttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttct 302  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10902494 ttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtatggttgttct 10902452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 161 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 1085778 - 1085542
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  1085778 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggttt 1085680  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtg 360  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||          |||||||| |||  |||||||| ||||    
T  1085679 tgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc----------cctggctcccctcatgacccaacagtg 1085590  T
Q  361 gtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtcc 408  Q
    |||||  |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  1085589 gtatcatagccccggttcgatgaagggtatgaccgaggcagccggtcc 1085542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 7517576 - 7517727
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  7517576 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggttt 7517674  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517675 tgggtaagagtgtggtgtctgtctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 7517727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 167 - 524
Target Start/End: Original strand, 47129097 - 47129438
Alignment:
Q  167 caagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggta 266  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| ||| || ||||||| |||||||    
T  47129097 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacctcttataagtaagagga-cccataaacccatcgctttaaggttttgggta 47129195  T
Q  267 agagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtggtatcg 366  Q
     |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |           |||| |||  ||| |||| |||||||||     
T  47129196 ggagtgtggtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcctcaatgtagacggtccccga-----------gctcccctcatgatccaacagtggtatca 47129284  T
Q  367 gagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccg-ttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagctccttatgtcggtccgtttgcggag 465  Q
    ||||| | |||||| ||| ||| | | ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||      |||||||||||||||||||    
T  47129285 gagcc-ccgttcgatgaatggtgcgatcgaggcagccggtccgtttgcgtagaaagcaacaacggcggtgcaagc----agtgtcggtccgtttgcggag 47129379  T
Q  466 aaagcagtagcggcaatacaagtaagtaataggttccgcttgaaaggggagcatgatga 524  Q
    ||| ||| | || ||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  47129380 aaaccagcaacgacaatacaagcaagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatga 47129438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 30244266 - 30244417
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||| |    
T  30244266 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaagaccttataagtaagagga-ctcataaacccattgccttaaggttt 30244364  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30244365 tgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgt 30244417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 8128603 - 8128336
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||  ||||||||| |    
T  8128603 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaaataaaggttgaacaccttatatgtaagagga-cccataaacccataaccttaaggttt 8128505  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtg 360  Q
    ||| ||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||   || ||||   ||| |    | |||||| ||||    
T  8128504 tggttaagagtgtggtgtcactctcgcttatgtggttgttctagcatcgatgtgaacagtccccc---gcactcc--cctcac----taacccaacagtg 8128414  T
Q  361 gtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaa 438  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  8128413 gtatcaaagccctggttcgacgaagggtacgatcgaagcagccgttccgttgcggagaaaccagcaacgacgatacaa 8128336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 165 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 37533168 - 37532905
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37533168 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaactcattgccttaaggttttggg 37533070  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtggtat 364  Q
    ||| ||| ||| ||||||||  |||||| | |||||||| |||||||||  ||||||||||   ||       |||| | | ||||||||| ||||||||    
T  37533069 taa-agtgtggtgtctctcttgcttgtgcgcttgttctaacctcgatgtggacggtccccc---gc-------gctcccatcgtgacccaacagtggtat 37532981  T
Q  365 cggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagc 440  Q
    | ||||| |||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||| ||||| || ||||| | ||||||||    
T  37532980 cagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgactgtacaagc 37532905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 202 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 37533485 - 37533258
Alignment:
Q  202 agtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |  |||||| ||||||||    
T  37533485 agtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttc 37533387  T
Q  302 tagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcag 401  Q
    ||||||||||||  ||||||||||   ||       |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||| |    
T  37533386 tagcctcgatgtggacggtccccc---gc-------gctcccctcgtgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggccg 37533297  T
Q  402 ctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagc 440  Q
    | |||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  37533296 ccggtcagttgcgtagaaagcagcaacgacggtacaagc 37533258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40094936 - 40094785
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||| |    
T  40094936 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagagga-cccataaacccatcgtcttaaggttt 40094838  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  40094837 tgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgt 40094785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Original strand, 45434632 - 45434795
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||| |    
T  45434632 tgtgtacaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacttactgccttaaggttt 45434730  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||||||| ||  |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  45434731 tgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtggagttgttctagcctcgatgtgatcggtccccc 45434795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 175 - 325
Target Start/End: Original strand, 6054570 - 6054719
Alignment:
Q  175 agttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctg 274  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  6054570 agttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 6054668  T
Q  275 gcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    | |||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  6054669 gtgtctctcctacttgtatggttgttctagccttgatgtggacggtccccc 6054719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 161 - 295
Target Start/End: Original strand, 7554021 - 7554154
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |    
T  7554021 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggat-ccataaacccatagccttaaggttt 7554119  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtgg 295  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  7554120 tgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtgg 7554154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 173 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 34218184 - 34218036
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| | ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||     
T  34218184 tgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtgagagga-ctcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtg 34218086  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcc 322  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  34218085 tggtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 34218036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23539 - 23376
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||| | ||||||||||||  || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||| |    
T  23539 tgtgtgcaattgtgagttatatgttccacatcggatacaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacctattgccttaaggttt 23441  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  23440 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcatgtgcggttgttctagcctcgatttggacggtccccc 23376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 30245073 - 30245220
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |    
T  30245073 tgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagacga-cccataaactcattgccttaaggttt 30245171  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||| ||||||    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  30245172 tgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcctcgatgt 30245220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 118463 - 118299
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| || |||||| |    
T  118463 tgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacacctaataagtaagaggat-ccataaacccattaccgtaaggttt 118365  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtc--tctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccc 324  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||  ||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||    
T  118364 tgggtaagagtgtggcgtctatctcttgcttgtgtggttgttctagctttgatgtggacggtcccc 118299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 326
Target Start/End: Original strand, 24177431 - 24177595
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||| || |    
T  24177431 tgtgtgcaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggctgaacaccttataagtaagcgga-cccataaacccattgccttaaagttt 24177529  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    | ||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||  ||||||||| ||  |||||||||||    
T  24177530 ttggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgtcttagcctcgacgtggacggtccccca 24177595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 173 - 325
Target Start/End: Original strand, 11845199 - 11845350
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    ||||||||||||  || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||     
T  11845199 tgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaatccattgccttaaggttttggataagagtg 11845297  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||| ||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11845298 tggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgtagacggtccccc 11845350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22567196 - 22567050
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  22567196 tgcaagtgtgagtaatatgtc-cacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaactcattgccttaaggtttttgg 22567099  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||    
T  22567098 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcgggcctcgatgt 22567050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 173 - 313
Target Start/End: Original strand, 19122740 - 19122878
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||     
T  19122740 tgagttatatgtc-cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ctcataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtg 19122837  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19122838 tggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgt 19122878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 45754712 - 45754862
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||| |||||||||| |    
T  45754712 tgtgtacaagtgtgagttatatgtc-cacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatga-ctcataaacccatagccttaaggttt 45754809  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  45754810 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgt 45754862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 165 - 284
Target Start/End: Original strand, 16569196 - 16569314
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  16569196 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggtttttgg 16569294  T
Q  265 taagagtctggcgtctctct 284  Q
    |||||||  || ||||||||    
T  16569295 taagagtgcggtgtctctct 16569314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 165 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16596466 - 16596348
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  16596466 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggtttttgg 16596368  T
Q  265 taagagtctggcgtctctct 284  Q
    |||||||  || ||||||||    
T  16596367 taagagtgcggtgtctctct 16596348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 36939893 - 36939744
Alignment:
Q  163 tgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttg 262  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||    
T  36939893 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcgtataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagagga-cccataaatccattgccttaaggttttg 36939795  T
Q  263 ggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||| ||| ||| || |||||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  36939794 ggtaaaagtgtggtgtttctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgt 36939744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 45433237 - 45433388
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| |||||||||||   || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||  ||||||||||| | |    
T  45433237 tgtgtacaagtgtgagttatatgatccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaa-ctcataaacctattgccttaagattt 45433335  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45433336 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgt 45433388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22566820 - 22566703
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22566820 tgcaagtgtgagtaatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggttttggg 22566722  T
Q  265 taagagtctggcgtctctct 284  Q
    ||||||| ||| ||||||||    
T  22566721 taagagtgtgg-gtctctct 22566703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28301705 - 28301613
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgcctta 254  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28301705 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaagctgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgcctta 28301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 326
Target Start/End: Original strand, 29157565 - 29157725
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || | |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  29157565 tgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagacga-cccataaatccattgccttaaggttttggg 29157663  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||| ||| ||||||||  || |||| |||| ||||| || |||||  |||||| ||||    
T  29157664 taagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtagttgctctagtcttgatgtggacggtctccca 29157725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24838850 - 24838724
Alignment:
Q  175 agttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaaga-ggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtct 273  Q
    |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||||||| |||||||||||| |    
T  24838850 agttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaggatcc-ataaacccgttgtcttaaggttttgggtaagagtgt 24838752  T
Q  274 ggcgtctctctcacttgtgtggttgttc 301  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||    
T  24838751 gacgtctctcttgcttgtgtggttgttc 24838724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 323
Target Start/End: Original strand, 36622956 - 36623117
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||| ||||  |||||| || |||||| |||||||  |||||||||||||| |    
T  36622956 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacattttataagtaggaggat-ccataaatccattgccttaaggttt 36623054  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccc 323  Q
    |||||| |||| ||| | |||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||  ||||||||    
T  36623055 tgggtaggagtatggtgcctctcttacttgtgtgattgttctgaccttgatgtggacggtccc 36623117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 168 - 309
Target Start/End: Original strand, 9901648 - 9901786
Alignment:
Q  168 aagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaa 267  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  9901648 aagtgtgagttatatgtc-cacatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttatacgta-gaggatcc-ataaactcattgtcttaaggttttgggtaa 9901744  T
Q  268 gagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcg 309  Q
    |||| ||| ||||||||  || ||| ||||||||||||||||    
T  9901745 gagtgtggtgtctctcttgctagtgcggttgttctagcctcg 9901786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Original strand, 14681510 - 14681655
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| | ||||||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  14681510 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagagg-gcccataaacccattgtcttaaggttttggg 14681608  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||| ||  || ||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  14681609 taagagtgtg--gtgtctctcacaagtgtggttgttctagccttgatgt 14681655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 168 - 321
Target Start/End: Original strand, 20599317 - 20599471
Alignment:
Q  168 aagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggta- 266  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| || |||||||     
T  20599317 aagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaaaagtaaaggataaacactttataaataagagga-catataaactcattgccttaacgttttgggtaa 20599415  T
Q  267 -agagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtc 321  Q
     ||||| ||| ||||||||  ||||| |||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  20599416 gagagtgtggtgtctctcttgcttgtatggttgttttaaccttgatgtgaacggtc 20599471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 173 - 325
Target Start/End: Original strand, 30032575 - 30032726
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| || |||||  |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  || |||||||||| ||||||||||||     
T  30032575 tgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaagtgttgaacaccttataagtaagagtatcc-ataaacctatagccttaaggttttgggtaagagtg 30032673  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    || | |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  30032674 tgacatctctcttgcttgtgcggttgttctatcctcgatgtggacggtccccc 30032726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Original strand, 41854631 - 41854793
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||| | || || |||||||||||||||||||||||  |||| || || |||||   | ||||||||||| |    
T  41854631 tgtgtgcaagtatgagttatatgtcccacatcag-taaaagagtaaaggttgaacaccttataagcaagatga-cctataaatataatgccttaaggttt 41854728  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  41854729 tgggtaagagtgtgacgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcaatgtagacggtccccc 41854793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 40230453 - 40230331
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| || |||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||| |    
T  40230453 tgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcgaataaaaaagtaaaagttgaacatcttataagtaagagga-cccataaacccatagtcttaaggttt 40230355  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctct 284  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||    
T  40230354 tgggtaaaagtctggtgtctctct 40230331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 313
Target Start/End: Original strand, 30253534 - 30253635
Alignment:
Q  207 aggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcc 306  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    ||||||||||||||| ||||    
T  30253534 aggttgaagaccttataagtaagagaa-cccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcc 30253628  T
Q  307 tcgatgt 313  Q
    |||||||    
T  30253629 tcgatgt 30253635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 36534946 - 36534797
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| | | ||||||||| ||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |  | |||||||| |    
T  36534946 tgtgtgcaagtgtaacttatatgtcccacctcggataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacctaaagtcttaaggttt 36534848  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  36534847 tgggtaagagtgtggcg--tctctcacaagtgtggttgttccagcctcgatgt 36534797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1085411 - 1085288
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttat-atgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtg 259  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| || |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||     
T  1085411 tgtgtgcaagtgtgagtttttatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacaactcataagtaagagaa-cccataaactcattgccttaaggtt 1085313  T
Q  260 ttgggtaagagtctggcgtctctct 284  Q
    |||||||||||| ||| || |||||    
T  1085312 ttgggtaagagtgtggtgtttctct 1085288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 211 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 28300366 - 28300255
Alignment:
Q  211 tgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcga 310  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||  |||||||    
T  28300366 tgaacaccttataagtaagagaaccccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttcgggcctcga 28300267  T
Q  311 tgtcaacggtcc 322  Q
    |||  |||||||    
T  28300266 tgtggacggtcc 28300255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36109079 - 36109006
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggat 234  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36109079 tgtgtgcaagtgtgagttatatttctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggat 36109006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41910756 - 41910662
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaag 256  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  41910756 tgtgtgtaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaataccttataactgagagga-cccataaacccattggcttaag 41910662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 284
Target Start/End: Original strand, 43241491 - 43241613
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||| |||| |||||||| |    
T  43241491 tgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaaaaataaaggttgaacaccttataagtaaaagga-ctcataaacttattgacttaaggttt 43241589  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctct 284  Q
    | ||||| ||| ||  ||||||||    
T  43241590 taggtaaaagtatgatgtctctct 43241613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 440
Target Start/End: Original strand, 37345652 - 37345845
Alignment:
Q  237 cataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcct 336  Q
    |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||| |  ||||| ||  ||||| ||     
T  37345652 cataaacatattgccttaaggtttttggtaagagtctgacgtctctctcacttgtacggttgctct-gcctggatgtgagtggtccgccg-ggctcccc- 37345748  T
Q  337 ggctctccttgtgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtac 436  Q
      ||||     |||||||| ||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  37345749 --ctct-----tgacccaacagtggtatcagagccccggttcagtgaagggtacaatcgaggcagccgatccgttgcggagaaagcagcaacggcgatac 37345841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 30244697 - 30244769
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagagga 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30244697 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagagga 30244769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 376 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 48243419 - 48243266
Alignment:
Q  376 ttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccg-ttgcggagaaaccaacaacggcggtac-aagctccttatgtcggtccgtttgcggagaaagcagt 473  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||||| ||||      ||||||| |||| ||||||||| |||     
T  48243419 ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaaagc----agtgtcggttcgttggcggagaaaccagc 48243324  T
Q  474 agcggcaatacaagtaagtaataggttccgcttgaaaggggagcatgatgagttgatg 531  Q
    | |||| ||||||| |||||| |  |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  48243323 aacggcgatacaagcaagtaagaacttccacttgaagggggagcatgatgaattgatg 48243266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 232
Target Start/End: Original strand, 30245490 - 30245561
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagagg 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30245490 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 30245561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 232
Target Start/End: Original strand, 30255335 - 30255406
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagagg 232  Q
    ||||||||||| || |||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30255335 tgtgtgcaagtgtgcgttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 30255406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 324
Target Start/End: Original strand, 47129450 - 47129527
Alignment:
Q  247 ttgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccc 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  47129450 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtggacggtcccc 47129527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 322
Target Start/End: Original strand, 37167842 - 37167937
Alignment:
Q  226 taagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcc 322  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  37167842 taagaggatcc-ataaatccattgacttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37167937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40094502 - 40094424
Alignment:
Q  235 cccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |||||||||||||| | |||| || |||||||||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40094502 cccataaactcattactttaaagttttgggtaagagtgtgacgtctttcttacttatgtggttgttctagccccgatgt 40094424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 328
Target Start/End: Original strand, 30245256 - 30245317
Alignment:
Q  267 agagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatg 328  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||    
T  30245256 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcaatgtggacggtcccccatg 30245317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 291
Target Start/End: Original strand, 37345912 - 37346043
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatat--cggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggt 258  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||  | |||||||||||  ||||| ||||  |||||| | ||| || |||||||||  |||||||||| ||    
T  37345912 tgtgtgcaagtgtgagttatatatgtcatatatctgatagaaaagtggaggttaaacattttataagtgagaaga-cccataaacatattgccttaaagt 37346010  T
Q  259 gttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgt 291  Q
     ||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  37346011 tttgagtaagagtgtgacgtctctctcacttgt 37346043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 37393060 - 37393205
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||  |||||||||||||  || |||     ||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||| |||| |    
T  37393060 tgtgtgcaagtttgagttatatgttccatattagatagaaaagtaaccgtcgaa-----tataagtaagatga--ccataaactcaatgccttgaggttt 37393152  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    || |||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  37393153 tgagtaaaagtgtggcgtctcttccacttatgtggttgctctaacctcgatgt 37393205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 323
Target Start/End: Original strand, 30244453 - 30244509
Alignment:
Q  267 agagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccc 323  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  30244453 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccc 30244509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 326
Target Start/End: Original strand, 30253671 - 30253730
Alignment:
Q  267 agagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||    
T  30253671 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggactgtccccca 30253730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 311
Target Start/End: Original strand, 7517768 - 7517802
Alignment:
Q  277 gtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgat 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517768 gtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgat 7517802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 311
Target Start/End: Original strand, 7518034 - 7518068
Alignment:
Q  277 gtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgat 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7518034 gtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgat 7518068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 224
Target Start/End: Original strand, 10341829 - 10341891
Alignment:
Q  162 gtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataa 224  Q
    |||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  10341829 gtgtgcaaatataagttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgaacactttataa 10341891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 447 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 1085524 - 1085447
Alignment:
Q  447 tgtcggtccgtttgcggagaaagcagtagcggcaatacaagtaagtaataggttccgcttgaaaggggagcatgatga 524  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||| |||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||    
T  1085524 tgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacagcgatacaagcaagtaagagcttccccttgaaggggtagcatgatga 1085447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 359 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 28300552 - 28300472
Alignment:
Q  359 tggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagc 440  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  28300552 tggtatcagagcct-gattcgacgaagggtacgaccgaggcagtcggtccattgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagc 28300472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28300644 - 28300579
Alignment:
Q  249 gccttaaggtgttggg-taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28300644 gccttaaggttttggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgt 28300579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 357 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 40094744 - 40094664
Alignment:
Q  357 agtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccg-ttgcggagaaaccaacaacggcggtaca 437  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||  | |||||||||||||    
T  40094744 agtggtatcagagcc-ctgttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagtagcaacggcggtaca 40094664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36967391 - 36967335
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacac 217  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||    
T  36967391 tgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaagattaaacac 36967335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 37532821 - 37532753
Alignment:
Q  254 aaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcc 322  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||  |||||||    
T  37532821 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctagcttgtgctgttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37532753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 439
Target Start/End: Original strand, 45433435 - 45433502
Alignment:
Q  373 cggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccg-ttgcggagaaaccaacaacggcggtacaag 439  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| || |||||||||| ||||    
T  45433435 cggttcgacaaagggtacgaccgaggcagctggtccgtttgcgcataaagcagcaacggcggttcaag 45433502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21416230 - 21416180
Alignment:
Q  235 cccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctc 285  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  21416230 cccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctctc 21416180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 44361613 - 44361517
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagt 271  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||| |||  ||||| ||| || |||||||||    
T  44361613 tgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgat-ccataaacccataaccttacggttttaggtaagagt 44361517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4124250 - 4124114
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||| | ||| ||| |||||  | ||||| ||||||| |  |||||  |||| |||||| | |||||| || ||||||||||||| ||||||| |    
T  4124250 tgtgtgcaactgtgaattacatgtcctacatcggttagaaaatttgaggtttgacactttataagtgagagga-ccaataaactcattgcattaaggttt 4124152  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttg 298  Q
    ||| ||| ||| ||| ||||||||||||| | ||||||    
T  4124151 tggataaaagtgtggtgtctctctcacttttttggttg 4124114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 458 - 531
Target Start/End: Original strand, 37345815 - 37345888
Alignment:
Q  458 ttgcggagaaagcagtagcggcaatacaagtaagtaataggttccgcttgaaaggggagcatgatgagttgatg 531  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| || |||| |||||  |||||||| ||||| ||||||    
T  37345815 ttgcggagaaagcagcaacggcgatacaagcaagtaaaagcttccacttgacgggggagcacgatgaattgatg 37345888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 529
Target Start/End: Original strand, 45434521 - 45434605
Alignment:
Q  447 tgtcggtccgtttgcggagaaagcagtagcggcaatacaagtaagtaata--ggttccgcttgaaaggggagcatgatgagttga 529  Q
    |||||||| |||||||||||||  || | |||| ||||||| |||||| |  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  45434521 tgtcggtctgtttgcggagaaactagcaacggcgatacaagcaagtaaaaaagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattga 45434605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 23569091 - 23569055
Alignment:
Q  235 cccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagt 271  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23569091 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 23569055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 84)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 161 - 328
Target Start/End: Original strand, 36629233 - 36629399
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  36629233 tgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttaaacaccttataagtaagagga-cccataaactcattgccttaaggttt 36629331  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatg 328  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  36629332 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccacatg 36629399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3244611 - 3244460
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  3244611 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagagga-cccataaactcattgtcttaaagttt 3244513  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3244512 tgggtaagaatgtgtcgtctctctcacttgtatggttgttccagcctcgatgt 3244460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 25483332 - 25483483
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  25483332 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatcc-ataaacccattgccttaaggttt 25483430  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  25483431 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 25483483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4955477 - 4955332
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||| |    
T  4955477 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcatatcggataaaatagttaaggttgaacaccttataagtaagagga-ctcataaacccattgccttaaggttt 4955379  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcct 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  4955378 tgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtgcggttgctctagcct 4955332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 36608821 - 36608657
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| || |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||| |    
T  36608821 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctcataagtaagaggatcc-ataaatccattgtcttaaggttt 36608723  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  36608722 tgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccca 36608657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 39793020 - 39792860
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||| |    
T  39793020 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagaaagaggaaccg-taaactcattgccttaaggttt 39792922  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcc 322  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  39792921 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 39792860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 32941279 - 32941132
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  32941279 tgcaagtgtgagttatatgtcttacatcggaaagaacagtaaaggttgaacaccttataaataagaggg-ctcataaactcattgccttaaggttttggg 32941181  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  32941180 taagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 32941132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 161 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22183424 - 22183260
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||| || || |||||||| || |||||| ||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  22183424 tgtgtgcaagtgtgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaatttataagtaaaagga-cccataaacccattgccttaaggttt 22183326  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22183325 tggataagagtgtggcgtctctctcacttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtccccca 22183260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 161 - 438
Target Start/End: Original strand, 3340803 - 3341069
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||  || |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||| |    
T  3340803 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccgcatcagatgaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagagga-cccataaacccactgccttaaggttt 3340901  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctg-gctctccttgtgacccaaaagt 359  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||  ||||           ||||||| |||| ||  ||||||||| |||    
T  3340902 tgggtaagagtgtggtgtctttcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggacgg-----------tctcctgagctcccccagtgacccaacagt 3340990  T
Q  360 ggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaa 438  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  3340991 ggtatcagagccccggttcgacgaacggtacgaccgaggtcgctggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaa 3341069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Original strand, 50002426 - 50002573
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  50002426 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttttaagtaagagga-cccataaatccattgtcttaaggttttggg 50002524  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50002525 taagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgt 50002573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 161 - 311
Target Start/End: Original strand, 2740696 - 2740843
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||  |||||||||| |    
T  2740696 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cctataaacccagagccttaaggttt 2740794  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgat 311  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2740795 tacgtaagagtgtggcgtctctctcact--tgtggttgttctagcctcgat 2740843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 34646809 - 34646664
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  34646809 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataactaagagga-ctcataaactcattgccttaaggttt 34646711  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcct 307  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||    |||||||||||||||||||    
T  34646710 tgggtaagagtgtggtgtctctctggtctgtgtggttgttctagcct 34646664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 16889691 - 16889535
Alignment:
Q  166 gcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggt 265  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||  | |||||||| || ||||||    
T  16889691 gcaagtgtgagttatatgtctcaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggat-tcataaacctactgccttaaagttttgggt 16889593  T
Q  266 aagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccc 323  Q
    |||||| ||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||    
T  16889592 aagagtatggtgtctctcttccttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacggtccc 16889535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 165 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 55933280 - 55933120
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| |||||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  55933280 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaagggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaagttttggg 55933182  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||   |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  55933181 taagagtgtggtgtctctcttacttgtacagttgttctagcctcgatgtggacggtccccca 55933120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Original strand, 39404014 - 39404177
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  | || | ||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| || ||||||| |    
T  39404014 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcctacattgaataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagagga-ctcataaactcatagcattaaggttt 39404112  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  39404113 tgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 39404177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Original strand, 41370357 - 41370516
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  41370357 tgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaatagtaaatgttgaaaaccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaagttttggg 41370455  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||| | | ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41370456 taagagtgtagtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 41370516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 52884883 - 52885037
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  52884883 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggat-ccataaacccattgccttaaggttt 52884981  T
Q  261 t-gggtaagagtctggcgtctctctc--acttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    | |||||||| | ||| |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  52884982 tggggtaagaatgtggtgtctctctcttatttgtgtggttgatctagcctcgatgt 52885037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 440
Target Start/End: Original strand, 10245916 - 10246184
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||  |||||||||| |    
T  10245916 tgtgtgcaagtgtgagttatatgccccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga--ccataaacccaaagccttaaggttt 10246013  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtg 360  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||  |||| ||| ||        |||||||| ||||    
T  10246014 tgggtaagagtgtggtgtctcccttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacgctccccca-agctcccctcgc--------tgacccaacagtg 10246104  T
Q  361 gtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagc 440  Q
    ||||| || || |||||||| ||||||||| || ||||| ||  ||| |||| | ||||| || ||||| ||||||||||    
T  10246105 gtatcagaaccccggttcgatgaagggtacgactgaggccgcctgtcagttgtgcagaaagcagcaacgacggtacaagc 10246184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 324
Target Start/End: Original strand, 36572015 - 36572177
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||| |    
T  36572015 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaaga-cccataaatccattgccttaaggttt 36572113  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccc 324  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36572114 tgggttagagtatggtgtctctctcgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccc 36572177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 1731807 - 1731646
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||| |    
T  1731807 tgtgtgcaaatgtgagttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaacatcttataaataagagga-cccataaaccaattgccttaaggttt 1731709  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccc 323  Q
    ||||||||||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  1731708 tgggtaagagtgtggtgtttctcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtccc 1731646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 323
Target Start/End: Original strand, 39404394 - 39404555
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||  || |||||||||| |    
T  39404394 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggtggaacaccttataagtaagagga-cccataaacctatagccttaaggttt 39404492  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccc 323  Q
    |||| |||| | ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39404493 tgggcaagaatgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtccc 39404555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 173 - 524
Target Start/End: Original strand, 20825844 - 20826182
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    ||||||||||||  || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||   | |||||||||| ||||||||||||     
T  20825844 tgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagagca-cccataaacctttagccttaaggttttgggtaagagtg 20825942  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtggtatcggagcct 372  Q
    ||| || |||||  ||| || |||||||||||||| |||||  || ||||||||||   ||||     || |   ||| |||| ||||| ||| |||||     
T  20825943 tggtgtttctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacagtcccccatg---ctcc-----cttc-aatgatccaacagtggcatcagagccc 20826033  T
Q  373 cggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtcc-gttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagctccttatgtcggtccgtttgcggagaaagca 471  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| ||||| || ||||||||||||||||      ||| | |||||||||||||||| ||    
T  20826034 caattcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccatttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaagc----agtgttgatccgtttgcggagaaacca 20826129  T
Q  472 gtagcggcaatacaagtaagtaataggttccgcttgaaaggggagcatgatga 524  Q
    | | |||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  20826130 gcaacggcgatacaagcaagtaatagcgtccgcttgaagggggagcatgatga 20826182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 22028531 - 22028179
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaag--taaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggt 258  Q
    ||||||||||| | | |||||||||  | |||||||| ||||   ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  22028531 tgtgtgcaagtgttacttatatgtcctacatcggataaaaaaaaataaaggttgaacaccttattagtaagagga-cccataaactcattgtcttaatgt 22028433  T
Q  259 gttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaag 358  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||  |        |||||||| ||    
T  22028432 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccaaagctcccctcac--------tgacccaacag 22028341  T
Q  359 tggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccg-ttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagctccttatgtcggtccgt 457  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||| |||   ||||| ||| | | ||| |||||||| |||||||||    |  |||||||||||    
T  22028340 tggtatcggagcc-ccgttcgacgaagggtatgaccgagacagtcagtccgtttgtgcataaagcaacaacgacggtacaag----tagtgtcggtccgt 22028246  T
Q  458 ttgcggagaaagcagtagcggcaatacaagtaagtaataggttccgcttgaaaggggagcatgatga 524  Q
    ||||||||||| ||| | || | || |||| |||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  22028245 ttgcggagaaaccagcaacgacgattcaagcaagtaagagctttcgcttgaagggggagcacgatga 22028179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 52884691 - 52884843
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||| |||||||||||||| |    
T  52884691 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgat-cgataaacccattgccttaaggttt 52884789  T
Q  261 t-gggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  52884790 tggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgt 52884843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 180 - 524
Target Start/End: Original strand, 54108551 - 54108880
Alignment:
Q  180 tatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccat-aaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgt 278  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||    
T  54108551 tatgtcccatataggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaagga-cccataaaattcattgccttaaggttttggctaagagtgtggtgt 54108649  T
Q  279 ctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtggtatcggagcctcggttc 378  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||         | |||| ||  ||||||||| || |||||| ||||| | ||||    
T  54108650 ctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgt-ggcggtccccca---------tagctcccccagtgacccaacagcggtatcagagccac-gttc 54108738  T
Q  379 gacgaagggtacaaccgaggcagctggtccg-ttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagctccttatgtcggtccgtttgcggagaaagcagtagcg 477  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| | ||| || ||| |||||||||||    |  ||||||| |||||| ||||||| ||| | ||    
T  54108739 gacgaagggtacga-cgaggcagccggtccgtttgcgcataaagcagcaatggcggtacaag----tagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacg 54108833  T
Q  478 gcaatacaagtaagtaataggttccgcttgaaaggggagcatgatga 524  Q
    || ||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  54108834 gcgatacaagcaagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatga 54108880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 34004743 - 34004586
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  34004743 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatatgata-aaaactaaaggttgaacaacttataagtaagagga-cccataaactcatt-ccttaaggttt 34004647  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtc 321  Q
    | | ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  34004646 tcgataagagtgtgccgtctctctcccttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacggtc 34004586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 173 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 50630903 - 50630764
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    |||||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  50630903 tgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 50630805  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||| ||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  50630804 tggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgt 50630764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18932880 - 18932746
Alignment:
Q  190 atcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcactt 289  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  18932880 atcggataaaatagtaaaggttgaataccttataaataagagga-cccataaacccattgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttactt 18932782  T
Q  290 gtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  18932781 gagtggttgttatagcctcgatgtgtacggtccccc 18932746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 162 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 54017754 - 54017604
Alignment:
Q  162 gtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgtt 261  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  || |||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  54017754 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacgtcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggtttt 54017656  T
Q  262 gggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
     ||||||||| ||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  54017655 aggtaagagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgt 54017604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22028121 - 22027970
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||| |    
T  22028121 tgtgtgcaagtgtgacttatatgtcccacatcggataaaatacgaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacatattgccttaaggttt 22028023  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  22028022 tgggtaagaatgtggtgtctctctcgcttatgtggttgttttagtctcgatgt 22027970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 54741338 - 54741194
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||  |||| |||||||| |    
T  54741338 tgtgtgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccatacacagattgtcttaaggttt 54741240  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctc 308  Q
    ||| ||||||| | |  ||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  54741239 tggataagagtgtagtctctctctcac--gtgttgttgttctagcctc 54741194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 202 - 313
Target Start/End: Original strand, 54936233 - 54936342
Alignment:
Q  202 agtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttc 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  54936233 agtaaaggttgaacaccttgtaagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcac-tatgtggttgttc 54936330  T
Q  302 tagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||||    
T  54936331 tagcctcgatgt 54936342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 174 - 324
Target Start/End: Original strand, 44620362 - 44620511
Alignment:
Q  174 gagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtct 273  Q
    |||||||||||  || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  44620362 gagttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagag-agcccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 44620460  T
Q  274 ggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccc 324  Q
    |  || |||||  ||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||    
T  44620461 gatgtttctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatgtggacggtcccc 44620511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 180 - 313
Target Start/End: Original strand, 54108928 - 54109059
Alignment:
Q  180 tatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtc 279  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| |||    
T  54108928 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaa-gttttgggtaagagtgtggtgtc 54109025  T
Q  280 tctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  54109026 tctcttgcttgtgcggttgttctagcttcgatgt 54109059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 166 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16888971 - 16888814
Alignment:
Q  166 gcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggt 265  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  16888971 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaaga-gaacctataaactcattgtcttacggttttgggt 16888873  T
Q  266 aagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccc 324  Q
    |||||| ||  ||||||||   ||||| | |||||||||  |||||||  |||||||||    
T  16888872 aagagtgtgatgtctctcttgtttgtgcgattgttctagtttcgatgtagacggtcccc 16888814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 324
Target Start/End: Original strand, 44621027 - 44621160
Alignment:
Q  190 atcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcactt 289  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| || |||||  |||    
T  44621027 atcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggg-cacataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgctt 44621125  T
Q  290 gtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccc 324  Q
    ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  44621126 gtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcccc 44621160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 219 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23817783 - 23817671
Alignment:
Q  219 ttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacg 318  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  23817783 ttataagtaagaggattc-ataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 23817685  T
Q  319 gtcccccatggctc 332  Q
    ||||||||| ||||    
T  23817684 gtcccccatagctc 23817671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 326
Target Start/End: Original strand, 44620656 - 44620819
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||  || |||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||||| |    
T  44620656 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatgaaatagtagaggttgaacactttataagtaagagga-cccataaac-cataaccttaaggttt 44620753  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||||||| |||  |||||||  |||||| ||||||| || |||||||||  |||||||||||    
T  44620754 tgggtaagagtgtggtttctctcttgcttgtgcggttgttatatcctcgatgtggacggtccccca 44620819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 54343147 - 54343017
Alignment:
Q  175 agttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctg 274  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||        ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  54343147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccccat--------tgccttaaggttttgggtaagagtgtg 54343056  T
Q  275 gcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    | ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  54343055 gtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgt 54343017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 279
Target Start/End: Original strand, 2741069 - 2741184
Alignment:
Q  163 tgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttg 262  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||| |||    
T  2741069 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaatagtaaaggttgaataccttataagtaagagga-cccataactccattgccttaaggttttg 2741167  T
Q  263 ggtaagagtctggcgtc 279  Q
    ||||||||| |||||||    
T  2741168 ggtaagagtgtggcgtc 2741184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4390261 - 4390111
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||| || || || ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||  | |||||| ||||||| |    
T  4390261 tgtgtgcaagtgtgagttacatatcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcctttag-cacattgcgttaaggttt 4390163  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatg 312  Q
    ||||||||||| || |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  4390162 tgggtaagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatg 4390111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 168 - 323
Target Start/End: Original strand, 50459724 - 50459878
Alignment:
Q  168 aagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaa 267  Q
    |||| ||||||||||||  || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||||  |||||||| || |||||    
T  50459724 aagtgtgagttatatgttccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacatcttataagtaagagga-ctcataaacccattatcttaaggttttaggtaa 50459822  T
Q  268 gagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccc 323  Q
    |||  ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  50459823 gagcgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccc 50459878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 298
Target Start/End: Original strand, 28034225 - 28034361
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||| | |||||||||| ||||| ||||||| |    
T  28034225 tgtgtgcaagtgtgaattatatgtcccgcatcggatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagagaa-cccataaacttattgctttaaggttt 28034323  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttg 298  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  28034324 taggtaagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttg 28034361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Original strand, 49302902 - 49303053
Alignment:
Q  163 tgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataac--taagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || |||  ||| |||||||||||||||||| |||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  49302902 tgtgtaagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaagtaaaggttgaacatcttataaaagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggttt 49303000  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| |||| || | |||||||| |||||||||    
T  49303001 tgggtaagagtgtggtgtatctcttacttatgcgattgttctatcctcgatgt 49303053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 51768220 - 51768056
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||| | |||||||||||||  |||||| ||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||| |    
T  51768220 tgtgtgcaaatgtgagttatatgtcctatatcgaatataagagtaaatgttgaacaccttataaataagagga-ctcataaactcattgtcttaaggttt 51768122  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||| |||  |  |||||||| |||| || | |||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  51768121 tgggtaaaagtacgatgtctctcttacttatgggattgttctaacctcgatgtggacggtctccca 51768056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 15841510 - 15841383
Alignment:
Q  179 atatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgt 278  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||| || ||| | ||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||  ||    
T  15841510 atatgtctcacatcaaatagaaaagtggaggttgaacactttgtaagtgagaggattc-ataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgt 15841412  T
Q  279 ctctctcacttgtgtggttgttctagcct 307  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15841411 ctctctcacttgtgtggttgctctagcct 15841383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41707624 - 41707490
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||| |||||||| |    
T  41707624 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaa-aagaacccataaactcattgtcttaaggt-t 41707527  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggtt 297  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||    
T  41707526 ttggtaagagtgtggtgtctctctcactagcgtggtt 41707490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 325
Target Start/End: Original strand, 43827480 - 43827598
Alignment:
Q  205 aaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctag 304  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||     
T  43827480 aaagattgaactccttataaataagagga-cccataaattcattgccttaaggt-ttggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctaa 43827577  T
Q  305 cctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    |||||||||  ||||||||||    
T  43827578 cctcgatgtggacggtccccc 43827598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 49076990 - 49076840
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||| || || || ||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||| |||  ||||||||| |    
T  49076990 tgtgtgcaagtgtgagttatatgttccatattggctaaaatagtaaaggttgaacaccttatag-taagagaa-cccataaacccataaccttaaggttt 49076893  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||| ||||| ||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  49076892 tgggttagagtgtggtgtctttcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 49076840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 332
Target Start/End: Original strand, 19504701 - 19504861
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||         ||||||| ||||||||   |||||||||| || |    
T  19504701 tgtgtacaagtatgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacac---------aagagga-cccataaatctattgccttaaagttt 19504790  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctc 332  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  19504791 tgggtaagagtgtggcgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg-cagcggtcccccatagctc 19504861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23557024 - 23556890
Alignment:
Q  163 tgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttg 262  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | | |||||||||||||||  ||||||||||  |||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| || |||    
T  23557024 tgtgcaagtgtgagttaaatgttttacatcggatagaaaagtggaggttgaacattttataaataagagaatcc-ataaaatcattgccttaaagttttg 23556926  T
Q  263 ggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttg 298  Q
    | ||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  23556925 gataagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttg 23556890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 295
Target Start/End: Original strand, 45496820 - 45496934
Alignment:
Q  180 tatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtc 279  Q
    |||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  45496820 tatgtcccacatcggataaaatcgtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cctataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc 45496918  T
Q  280 tctctcacttgtgtgg 295  Q
    |||||  |||||||||    
T  45496919 tctcttgcttgtgtgg 45496934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 284
Target Start/End: Original strand, 49880160 - 49880278
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || || | ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  49880160 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccactgccttaaggttttggg 49880258  T
Q  265 taagagtctggcgtctctct 284  Q
    ||||||  ||| ||||||||    
T  49880259 taagagcgtggtgtctctct 49880278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 49076608 - 49076448
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| ||||| || |    
T  49076608 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtaccatatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cctataaacccattgtcttaaagt-t 49076511  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    |||||||| |   || |||| |||| ||| || | ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  49076510 tgggtaaggg--cggtgtctgtctcgcttatgcgattgttatagcctcgatgtggacggtccccc 49076448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 3700361 - 3700504
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||| ||||         |||||||||||||||| |    
T  3700361 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagga---------ctcattgccttaaggttt 3700451  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||| ||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  3700452 tggataagagtatgatgtctctctcatttgtgtggttattcaagcctcgatgt 3700504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 326
Target Start/End: Original strand, 3341124 - 3341288
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| || |||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||  ||||| | |    
T  3341124 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttaaacactttataagtaagagga-cccataacatcattgttttaagattt 3341222  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||||||| ||  |||| ||| | || ||||||| || || |||||||||  |||||||||||    
T  3341223 tgggtaagagtgtgatgtctttcttaattatgtggttattttaacctcgatgtagacggtccccca 3341288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 43174502 - 43174654
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaa-agtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtg 259  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| | || ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  ||  |||||| |||    
T  43174502 tgtgtacaagtgtgagttatatgccacacatcagataaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cacataaacctatgaccttaaagtg 43174600  T
Q  260 ttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |||||||||||| ||||||||||||   || | |||||||| |||||| |||||    
T  43174601 ttgggtaagagtgtggcgtctctcttgtttatatggttgttgtagccttgatgt 43174654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 313
Target Start/End: Original strand, 31691203 - 31691301
Alignment:
Q  216 accttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtc--tctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||  |||||  | ||||||||||||||||||    
T  31691203 accttataagtaagagga-cccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctatctcttgcttgtacgattgttctagcctcgatgt 31691301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 291
Target Start/End: Original strand, 34544119 - 34544232
Alignment:
Q  178 tatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaagg-tgttgggtaagagtctggc 276  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||     
T  34544119 tatatatctcacatcgaatagaaaagtggaggttgatcactttataaatgagagga-cccataaactcattgccttaaggtttttgggtaagagtgtggt 34544217  T
Q  277 gtctctctcacttgt 291  Q
     ||||||||||||||    
T  34544218 atctctctcacttgt 34544232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Original strand, 760197 - 760320
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||| | ||||||||  || |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||     
T  760197 tgagttatatgtcccacatcgaatagaaaaatgaaggttgagaactttataagtgagagga-cccataaactcattgccttaagat-tttggtaaaagtg 760294  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttg 298  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||    
T  760295 tggtgtctctctcatttgtgtggttg 760320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 313
Target Start/End: Original strand, 20826225 - 20826364
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || |||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||| ||| |||||||  | || |||||||||     
T  20826225 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacacgttataagtaaga-gaacccataaacccatagccttaacattttaggtaagagtg 20826323  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||  ||||||||  ||| || | ||||||||||||||||||    
T  20826324 tgatgtctctcttccttatgcgattgttctagcctcgatgt 20826364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6975604 - 6975494
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||  ||||  |||||| | ||||||||||||     
T  6975604 tgagttatatgtctcacatccgataaaatagtaaaggttgaatatcttataagtaagagga-ctcataaatccattatcttaagattttgggtaagagtg 6975506  T
Q  273 tggcgtctctct 284  Q
    ||||||||||||    
T  6975505 tggcgtctctct 6975494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 255
Target Start/End: Original strand, 10246343 - 10246436
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaa 255  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  10246343 tgtgtgcaagtgtctgttatatgtctcaaatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataagttagagga-cccataaacccatagccttaa 10246436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 325
Target Start/End: Original strand, 43174235 - 43174300
Alignment:
Q  260 ttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||    
T  43174235 ttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagccttgatgtggacggtccccc 43174300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 322
Target Start/End: Original strand, 18879852 - 18879962
Alignment:
Q  211 tgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcga 310  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||| |   |||||||||||||||||| ||||    
T  18879852 tgaacaccttataagtaagatga-cctataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctcttttggttgtgtggttgttctagcttcga 18879950  T
Q  311 tgtcaacggtcc 322  Q
    |||  |||||||    
T  18879951 tgtggacggtcc 18879962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45489491 - 45489421
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagag 231  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  45489491 tgtgtacaagtgtgaattatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaagag 45489421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 353 - 531
Target Start/End: Original strand, 2740868 - 2741043
Alignment:
Q  353 caaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccg-ttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagctccttatgtcg 451  Q
    ||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||| ||||| || |||| |||||||||     |  |||||    
T  2740868 caacagtggtatcagagccccg-ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccgatccgtttgcgcagaaagcagcaacagcggtacaa-----tcgtgtcg 2740961  T
Q  452 gtccgtttgcggagaaagcagtagcggcaatacaag-taagtaataggttccgcttgaaaggg-gagcatgatgagttgatg 531  Q
    |||||||||| |||||| ||| | |||| |||| ||  |||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  2740962 gtccgtttgcagagaaaccagcaacggcgatacgagcaaagtaagagcttccgcttgaaggggagagcatgatgaattgatg 2741043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 429
Target Start/End: Original strand, 45496723 - 45496804
Alignment:
Q  348 tgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacg 429  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||| ||||| || |||||    
T  45496723 tgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggccgccggtcagttgcgtagaaagcagcaacg 45496804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 447 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 49076721 - 49076644
Alignment:
Q  447 tgtcggtccgtttgcggagaaagcagtagcggcaatacaagtaagtaataggttccgcttgaaaggggagcatgatga 524  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| | || ||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  49076721 tgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacgacaatacaagcaagtaagagtttccgcttgaagggggaacatgatga 49076644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 54017833 - 54017753
Alignment:
Q  190 atcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagt 271  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | ||||| |||||||| || |||||||||    
T  54017833 atcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccatattcccattgtcttaaggttttaggtaagagt 54017753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 313
Target Start/End: Original strand, 3271802 - 3271936
Alignment:
Q  183 gtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttat---aactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtc 279  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||   || |||||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | | |||    
T  3271802 gtctcacatcagatagaaaagtaaaagttaaacaccttattataagtaagagaa-cccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgt-gtgtc 3271899  T
Q  280 tctctc---acttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||     || |||||||||||||||||||||||    
T  3271900 tctctcgtttattatgtggttgttctagcctcgatgt 3271936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 231
Target Start/End: Original strand, 44620304 - 44620362
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagag 231  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44620304 tgagttatatgtcccacatgggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 231
Target Start/End: Original strand, 44621422 - 44621492
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagag 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  | || ||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  44621422 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatgggataaaacagtaaaggttaaacaccttataagtaagag 44621492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 48111828 - 48111695
Alignment:
Q  191 tcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttg 290  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||| |||| |  |||||  |||| ||||||||| || |||| |||| ||| |||||||||||       
T  48111828 tcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaaaagga-cttataaatccattaccttaaggttttaggtatgagtgtggtgtctctctcacaaa 48111730  T
Q  291 tgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||  ||||||||||    
T  48111729 tgtggtttttctaacctcaatgtggacggtccccc 48111695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 352 - 489
Target Start/End: Original strand, 44621175 - 44621309
Alignment:
Q  352 ccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccg-ttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagctccttatgtc 450  Q
    |||| ||||||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||| |||| |||||| || || ||||| || |||||||| ||||||    |  ||||    
T  44621175 ccaacagtggtatcagagccctggtttgacgaagggtacgaccgagacagccggtccgttttcgcagaaagcagcaacggcgatacaag----tagtgtc 44621270  T
Q  451 ggtccgtttgcggagaaagcagtagcggcaatacaagta 489  Q
    ||||||||| || ||||||||| | |||| |||||||||    
T  44621271 ggtccgttttcgcagaaagcagcaacggcgatacaagta 44621309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11706628 - 11706584
Alignment:
Q  238 ataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctct 282  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11706628 ataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctct 11706584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 285
Target Start/End: Original strand, 11197295 - 11197345
Alignment:
Q  235 cccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctc 285  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  11197295 cccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctctc 11197345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15841128 - 15841016
Alignment:
Q  177 ttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggc 276  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||  ||| ||||||  |||||| | ||||||| | |||||| |||||| |||| || |||||||||||| |       
T  15841128 ttatatgtcccatatcagatagaaaagtggaggctgaacattttataagtgagaggat-ctataaacccattgctttaa-gttttgggtaagagtgtatt 15841031  T
Q  277 gtctctctcacttgt 291  Q
    |||||||||||||||    
T  15841030 gtctctctcacttgt 15841016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 440
Target Start/End: Original strand, 41370528 - 41370620
Alignment:
Q  347 gtgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagc 440  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  41370528 gtgacccaacagtgatatcagagcccccattcgacgaagggtgcgaccgaggcagccggt-cgttgcacagaaagccgcaacggcggtacaagc 41370620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45489784 - 45489723
Alignment:
Q  252 ttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||    
T  45489784 ttaaggttttgggtaatagtgtggtgtctctctcgcttgcatggttgttctagtctcgatgt 45489723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 431 - 487
Target Start/End: Original strand, 5882033 - 5882088
Alignment:
Q  431 cggtacaagctccttatgtcggtccgtttgcggagaaagcagtagcggcaatacaag 487  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||||||    
T  5882033 cggtacaagctccttgtgtcggtccg-ttgtggagaaagcagaaacggcgatacaag 5882088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 374 - 402
Target Start/End: Original strand, 44620543 - 44620571
Alignment:
Q  374 ggttcgacgaagggtacaaccgaggcagc 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620543 ggttcgacgaagggtacaaccgaggcagc 44620571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 213
Target Start/End: Original strand, 45050597 - 45050649
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttga 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||| || ||||||||||||    
T  45050597 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcaaataaaagagtaaaggttga 45050649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 50788139 - 50788087
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacac 217  Q
    ||||||| | ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||    
T  50788139 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 50788087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 69)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 165 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 41283633 - 41283471
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  41283633 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaactcattgccttaaggttttagg 41283535  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatg 328  Q
    ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  41283534 taagagtgtggcgtctctcttgtttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccccatg 41283471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 162 - 440
Target Start/End: Original strand, 7598225 - 7598492
Alignment:
Q  162 gtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgtt 261  Q
    |||||||||| ||| ||||||||   | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  7598225 gtgtgcaagtgtgaattatatgttctacatcgaatagaaaagtaaaggttcaacaccttataaataagagga-cccataaactcatagccttaaggtttt 7598323  T
Q  262 gggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtgg 361  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    | |||||       ||| ||||||||| | |||    
T  7598324 gggtaagaatatggtgtctctctcacttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccc---tgatctcc-------cctcgtgacccaacactgg 7598413  T
Q  362 tatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagc 440  Q
    ||||  ||||  ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  7598414 tatcaaagcccaggttcgacgaagggtacgactgaggtagccggtccgttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagc 7598492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Original strand, 42514649 - 42514808
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||| | |||||    
T  42514649 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccatcgccttaagattttggg 42514747  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42514748 taagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 42514808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 36178763 - 36178616
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  36178763 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggttttggg 36178665  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  36178664 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctctatgt 36178616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40679791 - 40679640
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| |||||||| | |    
T  40679791 tgtgtgcaaatgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaagggttgaacaccttataagtaaga-gaacccataaacccatcgccttaagattt 40679693  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  40679692 tgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagtctcgatgt 40679640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Original strand, 962598 - 962745
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  962598 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgagagga-cccataaacccattgtcttaaggttttggg 962696  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||| ||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  962697 taagagtgtgttgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 962745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14745825 - 14745678
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  14745825 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggttttggg 14745727  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  14745726 taagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcgatgt 14745678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 15880259 - 15880410
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  15880259 tgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggttt 15880357  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15880358 tgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgt 15880410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28531476 - 28531325
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |    
T  28531476 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagcaaaggttgaacaccttataagtaagagg-tcccataaactcattgccttaagattt 28531378  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| || ||  |||| ||||||||||||||    
T  28531377 tgggtaagagtgtggtgactctctcagttatgcagttgctctagcctcgatgt 28531325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 36006041 - 36005891
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  36006041 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaa-gtaaaagttgaacaccttataagtaagagga-cccataaactcattgccttaaggttt 36005944  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36005943 tgggtaaaagtgtggcgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgt 36005891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 165 - 388
Target Start/End: Original strand, 37105924 - 37106136
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  37105924 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggga-cccataaactcattgccttaagattttggg 37106022  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtggtat 364  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||          ||  |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37106023 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtccc----------ccgagctccccttgtgacccaacagtggtat 37106112  T
Q  365 cggagcctcggttcgacgaagggt 388  Q
    | ||||| ||||||||||||||||    
T  37106113 cagagccccggttcgacgaagggt 37106136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 167 - 325
Target Start/End: Original strand, 6421387 - 6421544
Alignment:
Q  167 caagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggta 266  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  6421387 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ctcataaactcattgccttgaggttttgggta 6421485  T
Q  267 agagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  6421486 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacggtccccc 6421544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 161 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 28254399 - 28254258
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  28254399 tgtgtgccagtgtgacttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagagga-cccataaactcattgccttaaggttt 28254301  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagc 305  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  28254300 tgggtaagagtgtggtgtctctct--cttgtggggttgttctagc 28254258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 173 - 322
Target Start/End: Original strand, 33731656 - 33731804
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||     
T  33731656 tgagttatatatctcacatcggataaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggatcc-ataaacctattgccttaaggttttgggtaagagta 33731754  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcc 322  Q
    ||| ||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33731755 tggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtaaacggtcc 33731804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 35580885 - 35580723
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || | |||| |||||||||||||||| | ||||||  |||||||| |||||||||||||| |    
T  35580885 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacaataaatgttgaacaccttataagtgagagga--ccataaacccattgccttaaggttt 35580788  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    |||||||||||  |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  35580787 tgggtaagagtgcggcgtctctcttgtttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 35580723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 165 - 322
Target Start/End: Original strand, 37106188 - 37106344
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  37106188 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccatttccttaaggttttggg 37106286  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcc 322  Q
    ||||||| ||| || |||||  |||||| | ||||||||||||||||||  |||||||    
T  37106287 taagagtgtggtgtttctcttgcttgtgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcc 37106344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5542783 - 5542624
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||| || ||    
T  5542783 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacctattgccttaaggtttttgg 5542685  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||    
T  5542684 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcaagtctcgatgtggacggtccccc 5542624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Original strand, 30313174 - 30313318
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||| | |    
T  30313174 tgtgtgcaagcgtgtgttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgaacac-ttataagtgagagga-cccaaaaactcattgccttaagattt 30313271  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcct 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30313272 tgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgctctggcct 30313318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 38796782 - 38796619
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | ||||||||||| |    
T  38796782 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaacaataaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacctaatgccttaaggttt 38796684  T
Q  261 tgggtaagag--tctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccc 323  Q
    ||||||||||  | |||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  38796683 tgggtaagagtatgtggcgtctctattgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtcgacggtccc 38796619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15511655 - 15511506
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || | |||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||| | |    
T  15511655 tgtgtgcaagt--gagttatatgtcacacaacggataaaagagtaaaggttgaacacgttataagtaagagga-cccataaacccattgtcttaagattt 15511559  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15511558 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgt 15511506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5543156 - 5543009
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||    
T  5543156 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggat-ccataaacctattgccttaagattttggg 5543058  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||| ||| |||||| |  |||||| |||||||| |||||||||||    
T  5543057 taagagtgtggtgtctctattgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgt 5543009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 313
Target Start/End: Original strand, 6422126 - 6422257
Alignment:
Q  181 atgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtct 280  Q
    ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| ||| ||||    
T  6422126 atgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacacattataattaagagga-cccataaacccatagccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtct 6422224  T
Q  281 ctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  6422225 ctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 6422257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 36178304 - 36178170
Alignment:
Q  190 atcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcactt 289  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||| | ||||||  |||    
T  36178304 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag-ggaacccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgcctctcttgctt 36178206  T
Q  290 gtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  36178205 gtgtggttgttatagcctcgatgtagacggtccccc 36178170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 167 - 325
Target Start/End: Original strand, 6712978 - 6713136
Alignment:
Q  167 caagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaagg-tgttgggt 265  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||||| | ||||||    
T  6712978 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacctattgctttaaggtttttgggt 6713076  T
Q  266 aagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    |||||| ||  ||||||||  ||| || | ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6713077 aagagtgtgatgtctctcttgcttatgggattgttctagcctcgatgtggacggtccccc 6713136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 162 - 313
Target Start/End: Original strand, 7598606 - 7598748
Alignment:
Q  162 gtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgtt 261  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||        |||||| || ||    
T  7598606 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataa--------ccttaacgtttt 7598696  T
Q  262 gggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  7598697 tggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcatcgatgt 7598748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 291
Target Start/End: Original strand, 16542445 - 16542574
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| | |    
T  16542445 tgtgtgcaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagagga-cttataaactcattgccttaagattt 16542543  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgt 291  Q
    || |||||||| | || ||||||||||||||    
T  16542544 tgagtaagagtgtagcatctctctcacttgt 16542574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 318
Target Start/End: Original strand, 1769889 - 1770044
Alignment:
Q  162 gtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgtt 261  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| || || | |  ||    
T  1769889 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagagga-ctcataaactcatagctttgaagcttt 1769987  T
Q  262 gggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacg 318  Q
    |  ||||||| ||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  1769988 gaataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtgaacg 1770044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 40733513 - 40733664
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |   |||||| || |    
T  40733513 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacctacaaccttaaagttt 40733611  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||    
T  40733612 tgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggtagttcaagtctcgatgt 40733664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 178 - 313
Target Start/End: Original strand, 23346250 - 23346383
Alignment:
Q  178 tatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcg 277  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| ||  |    
T  23346250 tatatgtctcacatcgtatagaaaagtaaaggttaaacaccttataa-taagagg-gcccataaacccatagccttaaggttttcggtaagagtgtgatg 23346347  T
Q  278 tctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||| |||||    
T  23346348 tctctcttgcttgtgcggttgttctagcctagatgt 23346383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 176 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40163520 - 40163383
Alignment:
Q  176 gttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattg-ccttaaggtgttgggtaagagtctg 274  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||  | || | ||||||| |||||||| ||| ||    
T  40163520 gttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatga-cccattaacctagtgtctttaaggttttgggtaaaagtgtg 40163422  T
Q  275 gcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  40163421 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgt 40163383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 310
Target Start/End: Original strand, 5367451 - 5367599
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||  ||||||||| |    
T  5367451 tgtgtacaagtgtgatatatatgtcccagatcggataaaagagcaaaggttgaacaccttataagtaagatgatcc-atgaacacataaccttaaggttt 5367549  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcga 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||    
T  5367550 tgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcga 5367599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 325
Target Start/End: Original strand, 6421800 - 6421890
Alignment:
Q  235 cccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  6421800 cccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttctggcctcgatgtggacggtccccc 6421890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 283
Target Start/End: Original strand, 30323460 - 30323581
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| || |||||||||| || ||| ||||||||| |  ||||||||||| ||| || | |||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  30323460 tgtgtgcaagtgtgtgttatatgtcccaaatcagatagaaaattggaggttgaacactttagaagtgagagga-cctataaactcattgccttaaggttt 30323558  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctc 283  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  30323559 tgggtaagagtgtggcgtctctc 30323581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 155 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 37632765 - 37632608
Alignment:
Q  155 aactggtgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgcctta 254  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||  |||  |||||| |||||||| ||||||||| |||  | |||    
T  37632765 aactgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggtttgacattttataagtaagagga-cccataaacccataacttta 37632667  T
Q  255 aggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |||| |||||||||||| ||| || ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  37632666 aggttttgggtaagagtgtggtgtatctcttacaagtgtgattgttctagcctcgatgt 37632608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14745444 - 14745304
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| || ||||| ||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  14745444 tgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatggttgaacatcttgtaagtatgagga-cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 14745346  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgt-gtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||||     || ||||||||||||||||||||||    
T  14745345 tggcgtctctcttgtaagtggtggttgttctagcctcgatgt 14745304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29873699 - 29873563
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||  || |||| ||||| || ||| |||||||||||  ||||||||||  |||||| |  ||||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  29873699 tgtgtgcaagggtgtgttacatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacattttataagtgggagga-ctcataaactcattgccttaaggttt 29873601  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttg 298  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  29873600 tgagtaagagtgtgacgtctctctcacttgtgtggttg 29873563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29874185 - 29874049
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| || |||||||||| || ||| |||||||||||  ||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  29874185 tgtgtacaagtgtgtgttatatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataattgggagga-cccataaacccattgccttaaggttt 29874087  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttg 298  Q
    ||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  29874086 tggataagagtgtggcgtctatcccacttgtgcggttg 29874049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31468908 - 31468803
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| | ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  31468908 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaatatctta----taagagga-cccataaactcattgccttaaggttt 31468814  T
Q  261 tgggtaagagt 271  Q
    |||||||||||    
T  31468813 tgggtaagagt 31468803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 9231245 - 9231396
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||| ||  ||||||| || |    
T  9231245 tgtgtgtaagtatgagttatatgtctcatatcagatagaaaagtaaaggttgaacatattataaataagaggat-ccatcaacccaccgccttaaagttt 9231343  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||| ||||||| | |  ||||||| |||| || |||| ||||| ||| |||||    
T  9231344 tggttaagagtgtagtatctctctaacttatgcggttattctaaccttgatgt 9231396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 33561613 - 33561486
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  || ||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||| |    
T  33561613 tgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcagatagaaaagtggaggttaaacactttataagtgagagga-cccataaactcattgtcttaaggttt 33561515  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcactt 289  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  33561514 tgggtaagagtgtgatatctctctcactt 33561486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 325
Target Start/End: Original strand, 3673122 - 3673227
Alignment:
Q  219 ttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacg 318  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||| ||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  3673122 ttataagtaagaggatcc-ataaactcattgctttaagattttggctaagagtgtgatgtctctcttactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 3673220  T
Q  319 gtccccc 325  Q
    |||||||    
T  3673221 gtccccc 3673227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28254254 - 28254162
Alignment:
Q  181 atgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctg 274  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| | ||||||||| || | |||||||||||||    
T  28254254 atgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacactttataagtaagagga-ctcataaacactttgccttaaagtttagggtaagagtctg 28254162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31899588 - 31899496
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgcctta 254  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  || |||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31899588 tgtgtgaaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagagga-cccataaactcattgcctta 31899496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Original strand, 40733879 - 40734041
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||| || ||||||| || |||||||||||| |||||||  | ||||| || |  ||||||| || |    
T  40733879 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaagatttaacaccttataagtaagaggg-ctcataacct-acagccttaaagttt 40733976  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||    
T  40733977 tgggtaagagtgtggtgtctgtctcgcttgtgtggttgttcaagtctcgatgtggacggtccccc 40734041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 29676899 - 29677055
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagagga----tcccataaactcattgccttaag 256  Q
    |||||||| || ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||| |||||||||||  | ||||||     ||||||||| ||||||||||||    
T  29676899 tgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggtttaacaccttataggtgagaggagaagacccataaacccattgccttaag 29676998  T
Q  257 gtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |  ||  |||||||| ||| |||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||    
T  29676999 gctttaagtaagagtgtggtgtctctcttaattgtggggttgttccaacctcgatgt 29677055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 36178427 - 36178322
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  36178427 tgcaagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggtggaacaccttataagtaagggga-ctcataaacccattgtcttaaggttttggg 36178329  T
Q  265 taagagt 271  Q
    |||||||    
T  36178328 taagagt 36178322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 37895223 - 37895114
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||| |||||| || ||| | || | ||||||| |||||||||||||| |    
T  37895223 tgtgtgcgagtttgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaagttgaaaaccttaaaagtaa-aagaacacataaacccattgccttaaggttt 37895125  T
Q  261 tgggtaagagt 271  Q
    |||||||||||    
T  37895124 tgggtaagagt 37895114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 531
Target Start/End: Original strand, 3672773 - 3673054
Alignment:
Q  238 ataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctg 337  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||         
T  3672773 ataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttaattgtgtggttgttctagtctcgatgtggacggttcccc-tggctc----- 3672866  T
Q  338 gctctccttgtgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccg-ttgcggagaaaccaacaacggcggtac 436  Q
       | ||| |||||||||   || |||| ||||| | ||||||||||||||   | ||||||||| |||||| ||||| ||||| || |  ||||||| |    
T  3672867 ---cccctagtgacccaacgctgttatcagagcc-ccgttcgacgaagggtgtgatcgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagcagcggcggcggtgc 3672962  T
Q  437 aagctccttatgtcggtccgtttgcggagaaagcagtagcggcaatacaag-taagtaataggttccgcttgaaaggggagcatgatgagttgatg 531  Q
    ||||      |||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||| |  |||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  3672963 aagc----agtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacaatacatgcaaagtaaaagcttccgcttgaagagggagcatgatgaattgatg 3673054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 324
Target Start/End: Original strand, 29676543 - 29676687
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || ||||||| |||||||| |||||| | ||| || |||||||||||||||||||      ||||||||||||     
T  29676543 tgagttatatgtctcacattggataaaagagtaaagattgaacacattataagtgaga-gaacccataaactcattgcctt------ttgggtaagagtg 29676635  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccc 324  Q
    ||| ||||||||  |||||| |||| ||| | |||||||||  |||||||||    
T  29676636 tggtgtctctcttgcttgtggggttattcaaacctcgatgtggacggtcccc 29676687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38796380 - 38796308
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagagga 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  38796380 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagagga 38796308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 16590884 - 16591030
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaa-gtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtg 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||| |||| ||||||||||||||      || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  16590884 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaaagtaaaggttgaaca------aagtaagagga-cccataaacacattgccttaaggtt 16590976  T
Q  260 ttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||  |||||| |||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16590977 ttaagtaagaatctaatgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcaatgt 16591030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 41678531 - 41678396
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatat--gtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggt 258  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||   ||||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  41678531 tgtgtgcaagtgtgagttatatatgtctcacatcagatagaaaaggggaggttaaacactttataagtgagagga-cccataaac-ctttgccttaaggt 41678434  T
Q  259 gttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggt 296  Q
     ||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  41678433 tttgagtaagagtgtaacgtctctctcacttgtatggt 41678396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 36785725 - 36785664
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttat 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  36785725 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 36785664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 326
Target Start/End: Original strand, 6421695 - 6421786
Alignment:
Q  235 cccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    |||||||||  |||| || ||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||    
T  6421695 cccataaacctattgactaaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttccggcctcgatgtggacggtacccca 6421786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 297
Target Start/End: Original strand, 31385738 - 31385868
Alignment:
Q  166 gcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggt 265  Q
    |||||| ||||||| | |||| | ||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||| | | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  31385738 gcaagtgtgagttagaagtctgacatcggttagaaaaatggaggttgagcaccttataagtgaaagga-cccataaacccattgccttaaggttttggga 31385836  T
Q  266 aagagtctggcgtctctctcacttgtgtggtt 297  Q
    |  ||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  31385837 ataagtgtggtgtctctttcacttgtgtggtt 31385868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 33954428 - 33954279
Alignment:
Q  156 actggtgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaa 255  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||  ||||| ||||   ||||||| | | || | |||||| ||  |||||||     
T  33954428 actgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttaaacattatataacttaaatga-ctcataaa-tctatgccttac 33954331  T
Q  256 ggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcct 307  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  33954330 gattttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttatatggttgttctggcct 33954279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 35580529 - 35580450
Alignment:
Q  235 cccataaactcattgccttaaggtgttgggta--agagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| | | |||| ||||| ||||||||||||    
T  35580529 cccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagagtgtggcgtctctctc-cctatgtgattgttttagcctcgatgt 35580450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31259781 - 31259669
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatc---ggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaagg 257  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||| |||   ||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||  ||||||||    
T  31259781 tgtgtgtaagtgcgagttatatgtctcacatcatcggataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagatga-cccataaacctatcaccttaagg 31259683  T
Q  258 tgttgggtaagagt 271  Q
    | ||||||||||||    
T  31259682 ttttgggtaagagt 31259669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12529186 - 12529097
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaa 255  Q
    ||||||| |||||||||||||  | |||  ||| || ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12529186 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcaaataaaacagtaaagattgaacaccgtataagtaagagga-ctcataaactcattgccttaa 12529097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 271
Target Start/End: Original strand, 12910224 - 12910333
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| | | | || |  ||||| |||||| |||||||| |    
T  12910224 tgtgtgtaagtttgagttatatgttccacatcggatggaaaagtacaggttgaaccccttataagtgaaatga-cttataaattcattgtcttaaggttt 12910322  T
Q  261 tgggtaagagt 271  Q
    |||||||||||    
T  12910323 tgggtaagagt 12910333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 33953933 - 33953797
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||| || ||| |||||||||||  |||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||   |||||||||  | |    
T  33953933 tgtgtgcaaatgtgagttataagtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactatataagtgagagga-cccataaacctgttgccttaaaattt 33953835  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttg 298  Q
    ||||||||||| || |||| |||| |||| | ||||||    
T  33953834 tgggtaagagtgtgacgtccctcttacttttatggttg 33953797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 37894854 - 37894731
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| || || | ||||||||||||||| | || ||||||||| ||||| || | ||||||  |||||||||||| | |    
T  37894854 tgtgtgcaaatgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtaaaggctaaaaaccttataagtaagaaga-ctcataaatccattgccttaagattt 37894756  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctc 285  Q
    ||| ||| ||| ||| || ||||||    
T  37894755 tggttaaaagtgtggtgtgtctctc 37894731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 452 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 38796487 - 38796415
Alignment:
Q  452 gtccgtttgcggagaaagcagtagcggcaatacaagtaagtaataggttccgcttgaaaggggagcatgatga 524  Q
    ||||||||||||||||| ||| | || | ||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38796487 gtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatacaagcaagtaagatcttccgcttgaagggggagcatgatga 38796415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 224
Target Start/End: Original strand, 42515031 - 42515075
Alignment:
Q  180 tatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataa 224  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42515031 tatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacaccttataa 42515075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 286
Target Start/End: Original strand, 30312831 - 30312909
Alignment:
Q  207 aggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctca 286  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  30312831 aggttgaacactttataacttagatga-cccataaacttatttccttaaggttttgggtaaaagtgtgtagtctctctca 30312909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 348 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 35580710 - 35580628
Alignment:
Q  348 tgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcag-ctggtccgttgcggagaaaccaacaacg 429  Q
    |||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | | | ||  ||||||||||||||||||||    
T  35580710 tgacccaataatggtatcagagccccggttcgacgaagggtatgaccgaggctgtcggctcgtttgcggagaaaccaacaacg 35580628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 401
Target Start/End: Original strand, 6421903 - 6421956
Alignment:
Q  348 tgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcag 401  Q
    ||||||||  |||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  6421903 tgacccaacggtggtattagagcctcggttcgacaaagggtacgaccgaggcag 6421956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 36178593 - 36178552
Alignment:
Q  347 gtgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggt 388  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36178593 gtgacccaatagtggtatcagagccccggttcgacgaagggt 36178552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15689491 - 15689427
Alignment:
Q  232 gatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggt 296  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | | ||| |||||| ||||| |||||||    
T  15689491 gatcccgtaaactcattgtcttaaggttttgggtaaaaatgtggtgtctctatcactagtgtggt 15689427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 80)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45122219 - 45122068
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||  |||||||| |    
T  45122219 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaa-cccataaactcattttcttaaggttt 45122121  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45122120 tgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgt 45122068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Original strand, 9309351 - 9309513
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9309351 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagagga-cccttaaactcattgccttaaggtgt 9309449  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9309450 cgggtaagagtgtggtgtctctctca-gtatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 9309513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 9608741 - 9608892
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||  ||||||||| |    
T  9608741 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatga-cccataaacccatcaccttaaggttt 9608839  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  9608840 tgggtatgagtgtggcgtctctcttgctagtgaggttgttctagcctcgatgt 9608892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 3038452 - 3038292
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  3038452 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaaaagga-cccataaacccattgccttaaggttt 3038354  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcc 322  Q
    ||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3038353 tgggtaagagtgtggcatctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3038292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Original strand, 3669687 - 3669834
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  3669687 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ctcataaactcattgccttaaggttttggg 3669785  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3669786 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 3669834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 411
Target Start/End: Original strand, 34834872 - 34835109
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || || ||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||| |    
T  34834872 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagatga-ctcataaactcattgccttaaggttt 34834970  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtg 360  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  | | ||||   | || |||        ||| ||||||||| ||||    
T  34834971 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggatgatccc---ttgcgctc--------cctagtgacccaacagtg 34835059  T
Q  361 gtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgtt 411  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34835060 gtatcagagcc-cggttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccgtt 34835109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 161 - 322
Target Start/End: Original strand, 40518578 - 40518738
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||| |    
T  40518578 tgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagagga-cccataaacccaatgacttaaggttt 40518676  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcc 322  Q
    ||||||||||| || |||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  40518677 tgggtaagagtgtgacgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 40518738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 173 - 325
Target Start/End: Original strand, 34835217 - 34835368
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    ||||||||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  34835217 tgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtg 34835315  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||| ||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  34835316 tggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccc 34835368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 190 - 437
Target Start/End: Original strand, 45122649 - 45122890
Alignment:
Q  190 atcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcactt 289  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||  |||    
T  45122649 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaactcattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggcgtctctcttgctt 45122747  T
Q  290 gtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggta 389  Q
    |||||||||||| |||||||||||  | |||||||| |||    || | ||| ||   ||||| || ||||| ||| ||||||  |||||||||||||||    
T  45122748 gtgtggttgttcaagcctcgatgtggaaggtccccc-tgg----cccgactccccccatgaccaaacagtggcatcagagcct-agttcgacgaagggta 45122841  T
Q  390 caaccgaggcagctggtccg-ttgcggagaaaccaacaacggcggtaca 437  Q
    | |||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  45122842 cgaccgaggcagccagtccgtttgcgcagaaagcaacaacggtggtaca 45122890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6877025 - 6876861
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatat-gtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtg 259  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||| |||| |||     
T  6877025 tgtgtgcaagtgtgagttatatagtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagatga-cccatacactcattgtcttagggtt 6876927  T
Q  260 ttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    |||||||||||| ||| || |||||   ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6876926 ttgggtaagagtgtggtgtttctcttgtttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 6876861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 202 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 18372115 - 18371889
Alignment:
Q  202 agtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || |||||| |||||| ||||| ||    
T  18372115 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcc-ataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctctcgcttgtgcggttgctc 18372017  T
Q  302 tagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcag 401  Q
    ||||||| |||| |||||| |||         ||  |||| |||  |||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18372016 tagcctcaatgtgaacggttccc---------ccgagctcccctcatgacccaacagtggtatcagagcct-ggttcgacaaagggtacgaccgaggcag 18371927  T
Q  402 ctggtccg-ttgcggagaaaccaacaacggcggtacaa 438  Q
    | ||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  18371926 ccggttcgtttgcggagaaaccagcagcggcgatacaa 18371889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 168 - 468
Target Start/End: Original strand, 147454 - 147740
Alignment:
Q  168 aagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaa 267  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||| || ||||||||    
T  147454 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagagga-cccataaacctattgccttaaagttttgggtaa 147552  T
Q  268 gagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtggtatcgg 367  Q
    |||| ||||||||||||  |||||| ||| |||||||| | |||||    |||||||||| ||||          ||   |||||||| |||| |||| |    
T  147553 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggtagttctagcattgatgtgggtggtcccccatagctc----------ccccatgacccaacagtgatatcag 147642  T
Q  368 agcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccg-ttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagctccttatgtcggtccgtttgcggaga 466  Q
    |||| ||||||||| |||||||| | |||||||||  ||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||||      ||||||||||||||||||||    
T  147643 agccccggttcgacaaagggtacgatcgaggcagccagtccgtttgcgcagaaagcagcaacagcggtacaagc----agtgtcggtccgtttgcggaga 147738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Original strand, 3670060 - 3670207
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  3670060 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtatgagga-cccataaacctatttccttaaggttttggg 3670158  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3670159 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 3670207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 177 - 313
Target Start/End: Original strand, 5420663 - 5420798
Alignment:
Q  177 ttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggc 276  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| || |    
T  5420663 ttatatgtcccacatcggatagaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagagga-ctcataaacccattgccttaaggttttttgtaagagtgtgac 5420761  T
Q  277 gtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5420762 gtctccctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgt 5420798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 308
Target Start/End: Original strand, 41972154 - 41972303
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaagg--- 257  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| ||||||| ||| |       
T  41972154 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgatagga-cccataaacccattgccataaagttt 41972252  T
Q  258 tgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctc 308  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  41972253 tgttgggtaagagtgtggcgtcactcttgcttgtgtggttgttccagcctc 41972303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 167 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25561972 - 25561826
Alignment:
Q  167 caagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgtt-gggt 265  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  25561972 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaacgttgaacaccttataagtaagagga-cccataaactcattgtcttaaggttttggggt 25561874  T
Q  266 aagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |||||| || | |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25561873 aagagtgtgacatctctcttgcttgtgtggttgctctagcctcgatgt 25561826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Original strand, 40518065 - 40518230
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaa--gtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggt 258  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  || || ||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| || |||||||||||    
T  40518065 tgtgttcaagtgtgagttatatgttccacattggataaaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaatgga-cccataaacccaatgccttaaggt 40518163  T
Q  259 gttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
     |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  40518164 tttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtccccc 40518230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 30359267 - 30359418
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |    
T  30359267 tgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagcaagagga-cccataaacccatagccttaaggttt 30359365  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||  |||||| ||||||| ||||    
T  30359366 tgggtaagagtgtggtgtctctctttcttgtgatgttgttttagcctcaatgt 30359418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 165 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 1014403 - 1014139
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| |||||||||||||  | ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| || |||||| || |||||    
T  1014403 tgcaagtgtgagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccgtaaactcgttaccttaaagttttggg 1014305  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtggtat 364  Q
    ||||||| ||| |||||||   |||||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||         ||  |||| ||  ||||  ||| ||||||||    
T  1014304 taagagtgtggtgtctctcctgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggttccc---------ccgagctcccccagtgatacaacagtggtat 1014214  T
Q  365 cggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagc 440  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||    
T  1014213 cagagccccggttcgacgaagggtacgactgaggcagccggt-cgttgcgcagaaagccgcaacggcggtacaagc 1014139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Original strand, 30441081 - 30441232
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacacctta----taactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||    ||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| |    
T  30441081 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggctaaaatagtaaaggttgaacaccttaattataagtaagaggg-cccataaacccattgccttaaggttt 30441179  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30441180 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 30441232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 33113529 - 33113387
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  33113529 tgtgtacaagtttgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacgtcttataagtaagagga-cccataaactcattgccttaagattt 33113431  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctag 304  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  || |||||||||||||||    
T  33113430 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctag 33113387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 202 - 325
Target Start/End: Original strand, 34835512 - 34835634
Alignment:
Q  202 agtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttc 301  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||||||| |||    
T  34835512 agtaaaggtttaacaccttataagtaagagga-cccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattc 34835610  T
Q  302 tagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||||||||  ||||||||||    
T  34835611 tagcctcgatgtagacggtccccc 34835634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 202 - 325
Target Start/End: Original strand, 34835778 - 34835900
Alignment:
Q  202 agtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttc 301  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||||||| |||    
T  34835778 agtaaaggtttaacaccttataagtaagagga-cccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattc 34835876  T
Q  302 tagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||||||||  ||||||||||    
T  34835877 tagcctcgatgtagacggtccccc 34835900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 173 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 43398221 - 43398079
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagagga--tcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagag 270  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||| |||||||||||| || |||| |||||     
T  43398221 tgagttatatatctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggaggacccataaattcattgccttaaagttttggataagaa 43398122  T
Q  271 tctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    | |||||| ||| | ||| ||| ||||| |||| |||||||||    
T  43398121 tgtggcgtttcttttactagtgcggttgctctaacctcgatgt 43398079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 45122070 - 45121908
Alignment:
Q  163 tgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttg 262  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | |||    
T  45122070 tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagagga-ctcataaactcattgccttaagattttg 45121972  T
Q  263 ggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||| ||| |||||||||| |  || |||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||    
T  45121971 ggtaacagtgtggcgtctcttttgctcgtgtggttattcaagcctcgatgtggaaggtccccca 45121908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1514077 - 1513913
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| |||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||  ||||||||| |    
T  1514077 tgtgtacaagtatgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccttaaacccataaccttaaggttt 1513979  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||| ||| |||  ||||||| || |||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  1513978 tgggtaaaagtgtggtatctctcttacatgtggggttattctagcctcgatgtggacggtccccca 1513913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8918926 - 8918764
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||  |||| |||||||| |    
T  8918926 tgtgtgcaagtgtgagttacatgtcccacatcagatagcagagtaaaggttgaacactttataagtaagagga-cccataaacctattgacttaaggttt 8918828  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccc 324  Q
    ||||||||||| || ||||| |||  | |||||||||||| || |||||||||  |||||||||    
T  8918827 tgggtaagagtgtgacgtctttcttgcgtgtgtggttgttttaacctcgatgtggacggtcccc 8918764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9483320 - 9483198
Alignment:
Q  190 atcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcactt 289  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |  ||     
T  9483320 atcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgctc 9483222  T
Q  290 gtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  9483221 gtgcggttgttctagcctcgatgt 9483198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 324
Target Start/End: Original strand, 5915868 - 5916025
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  | || ||||| ||| |||||| || ||||| ||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  5915868 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaaatgtaaagttt-aacactttataa----gagga-cccataaactcattgccttaaggttt 5915961  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccc 324  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5915962 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 5916025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 167 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 37544646 - 37544501
Alignment:
Q  167 caagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggta 266  Q
    ||||| ||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||  |||| | ||||||| |||||||    
T  37544646 caagtgtgagttataagtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagaaagagga-cccataaatccattactttaaggttttgggta 37544548  T
Q  267 agagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37544547 agagtgtggtgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgt 37544501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 167 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40579662 - 40579517
Alignment:
Q  167 caagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggta 266  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||    
T  40579662 caagtgtgaattatatgtttcatattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacttattgctttaaggttttaggta 40579564  T
Q  267 agagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||| ||| |||||| |  |||||  |||||||||| |||||||||    
T  40579563 agagtgtggtgtctctattgcttgtacggttgttctatcctcgatgt 40579517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4154828 - 4154679
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||  ||||||||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||  ||||| |    
T  4154828 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgaaagga-cccataaactcattgccccaaggttt 4154730  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||| ||| |||| |||||    
T  4154729 tgggtaagagtgtggcg--tctctcgcttgtgtggttgctctggcctagatgt 4154679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 440
Target Start/End: Original strand, 9308973 - 9309245
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtct--catatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggt 258  Q
    ||||||||||| |||||||||||||   || ||| |||| || |||||| ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  9308973 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacacatcagataaaagagtaaaagttgaacatgttataagtaagagga-cccataaacccattgcctaaaggt 9309071  T
Q  259 gttgggtaagagtc---tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaa 355  Q
     ||||| ||||||    ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||          ||  |||| ||  |||||||||    
T  9309072 tttgggcaagagtagtgtggtgtctctctcacta-tgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc----------ccgagctcccccagtgacccaa 9309160  T
Q  356 aagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagc 440  Q
    |||||||||| || || | |||||||| ||||||| |||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||    
T  9309161 aagtggtatcagaaccccagttcgacggagggtacgaccgaggccgccggtcagttgcgtagaaagcaacaacgacggcacaagc 9309245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 30359605 - 30359756
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||  ||||||| | |    
T  30359605 tgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagagga-ctcataaacccataaccttaagattt 30359703  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| || |||||||||| | |||||||    
T  30359704 tgggtaagagtgtggtgtctctcttacttatgcggttgttctaacttcgatgt 30359756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 70424 - 70290
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||||||||     
T  70424 tgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacatcttataagtaagagga-cccataaacccactgccttaaggttttaggtaagagtg 70326  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctc 308  Q
    || ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  70325 tgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctaacctc 70290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9620838 - 9620677
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||| | ||||| ||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  9620838 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacaacagatagaaaagtagaagttgatcactttataagtgagagga-cccataaactcattgccttaagattt 9620740  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    |   ||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||  ||||||||||    
T  9620739 t--ataagagtttgatgtctctctcacttgtgtggttgctcaggcctggatgtggacggtccccc 9620677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1014029 - 1013882
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||  || |||||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||  || ||| |    
T  1014029 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccctataagtaagagga-ccaataaacccattgccttagagttttgag 1013931  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||| ||  |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1013930 taagagtgtgttgtctcttttacttgtgcggttgttctagcctcgatgt 1013882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 173 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9482754 - 9482615
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    ||||||||||||  || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |||  |||||||     
T  9482754 tgagttatatgttccacatgggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgcctaaagattttgtataagagtg 9482656  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |||  |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9482655 tggtatctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 9482615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 313
Target Start/End: Original strand, 9507819 - 9507929
Alignment:
Q  202 agtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttc 301  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| | |||||||||    
T  9507819 agtaaaggttgaataccttataagtaagagga-ctcataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctatctcttatatggttgttc 9507917  T
Q  302 tagcctcgatgt 313  Q
     |||||||||||    
T  9507918 aagcctcgatgt 9507929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 168 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 32640682 - 32640534
Alignment:
Q  168 aagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaa 267  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||     ||  |||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32640682 aagtgtgagttatctgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaaca-----taggtaagagga-ccgataaacccattgccttaaggttttgggtaa 32640589  T
Q  268 gagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcc 322  Q
    |||| | ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  32640588 gagtgttgcgtctctcttgcttttgtgattgttctagcctcgatgtgagcggtcc 32640534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 194 - 303
Target Start/End: Original strand, 9609114 - 9609222
Alignment:
Q  194 gatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||| ||||||||||||  || ||||    
T  9609114 gatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagatga-cccataaacccatcgccttaatgttttcggtaagagtgtggcgtctctcttgctagtgt 9609212  T
Q  294 ggttgttcta 303  Q
    ||||||||||    
T  9609213 ggttgttcta 9609222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 322
Target Start/End: Original strand, 147825 - 147976
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| |||||||| | ||||||          ||||||||  ||||||||||||| |    
T  147825 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaaaagtaaatgttgaacaacatataac----------ccataaacctattgccttaaggttt 147914  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcc 322  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||| | ||||||    
T  147915 tgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcagttgttctagcctcaatgtgagcggtcc 147976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 202 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20870694 - 20870594
Alignment:
Q  202 agtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttc 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  20870694 agtaaaggttgaacatcttataagtaagagga-cccataaacccactgccttaagattttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 20870596  T
Q  302 ta 303  Q
    ||    
T  20870595 ta 20870594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45121817 - 45121667
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| |||||| | |||| || |||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||  |  |||||||||| |    
T  45121817 tgtgtacaagtgtgagttgt-tgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgatcaccttataagtaagaggat-ccataaacctacagccttaaggttt 45121720  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    || |||||||| ||   ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  45121719 tgagtaagagtgtgatatctctcttacttatggggttgttctagcctcgatgt 45121667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Original strand, 45123002 - 45123165
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||| |||||||  ||| ||||| || |||||||||  |||  |||||||| |    
T  45123002 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacacct--taagtaagatga-cccataaacctattttcttaaggttt 45123098  T
Q  261 tgggta--agagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||  ||||| ||| |||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||    
T  45123099 tgggtaagagagtgtggtgtctctcttatttgtggggttgttctaatctcgatgtggacggtccccc 45123165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4154442 - 4154292
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||| | |||||||||||||  | ||| |||||||||||  ||||||||||| |||||| | ||||   |||||||||||||||||||||  | |    
T  4154442 tgtgtgcaaatgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagaga--cccataaactcattgccttaatattt 4154345  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |||||||| || ||  |||||||||| |||| |||||| ||| |||| |||||    
T  4154344 tgggtaagtgtgtgatgtctctctcaattgtttggttgctctggcctagatgt 4154292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 313
Target Start/End: Original strand, 6651511 - 6651641
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |         |||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  6651511 tgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaaaa---------taagagaa-cccataaattcattgccttaaggttttgggtaagagtg 6651600  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||| ||||||||  |||||| | |||||||| |||||||||    
T  6651601 tggtgtctctcttgcttgtgcgattgttctaacctcgatgt 6651641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 12283869 - 12284019
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||  || |||| ||||||||| |||||| | |||| || ||| | || | ||||||||||  | |||||||| |    
T  12283869 tgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacgtcagataaaaaagtaaatgttgaatatcttaaaagtaaaatga-cacataaactcaa-gtcttaaggttt 12283966  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12283967 tggataagagtgtagtgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctctatgt 12284019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18371806 - 18371672
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||     ||| ||||| || ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||     
T  18371806 tgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaacat----taagtaagaaga-cccataaacccat-gccttaaggttttgggtaagagtg 18371713  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||| || ||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  18371712 tggtgtgtctctcatttgtgcggttgctctagcttcgatgt 18371672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18372416 - 18372349
Alignment:
Q  163 tgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaaga 230  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18372416 tgtgaaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 18372349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41416321 - 41416258
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcc 236  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41416321 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcc 41416258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18372859 - 18372789
Alignment:
Q  163 tgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagagga 233  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18372859 tgtgaaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 18372789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 325
Target Start/End: Original strand, 32305503 - 32305636
Alignment:
Q  191 tcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttg 290  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||| |||| ||||||| | |||| ||||||| |||||||| | | ||||     
T  32305503 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaga-cctataaacccattaccttaagattttggataagagtgtggcgtctttattactta 32305601  T
Q  291 tgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||  ||||||||| ||| |||||  ||||||||||    
T  32305602 tgcagttgttctaaccttgatgtggacggtccccc 32305636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 41129067 - 41129148
Alignment:
Q  245 cattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||    
T  41129067 cattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttcaaacctcgatgtggacggtccccca 41129148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Original strand, 6731904 - 6732042
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||         | |||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  6731904 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaa---------agtaagagaa-cccataaattcattgccttaaggttttgag 6731993  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||| ||| ||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||    
T  6731994 taagagtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctaacctcgatgt 6732042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18373077 - 18372988
Alignment:
Q  177 ttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagag 270  Q
    ||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||   |||| |||||||||||    
T  18373077 ttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagagga-ctcataaactcattgcc---aggttttgggtaagag 18372988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 8919220 - 8919142
Alignment:
Q  248 tgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  8919220 tgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtggacggtccccca 8919142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20995495 - 20995433
Alignment:
Q  245 cattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcct 307  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  20995495 cattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcacttgtgtggttgctctggcct 20995433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 446 - 531
Target Start/End: Original strand, 40518469 - 40518554
Alignment:
Q  446 atgtcggtccgtttgcggagaaagcagtagcggcaatacaagtaagtaataggttccgcttgaaaggggagcatgatgagttgatg 531  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || | ||||||| |||||| || |||| |||||  |||||||||||||| ||||||    
T  40518469 atgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatacaagcaagtaagagcttccacttgaggggggagcatgatgaattgatg 40518554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3038020 - 3037968
Alignment:
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3038020 tggcgtctctctatcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 3037968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 8794107 - 8794179
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagagga 233  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  8794107 tgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagaataaatgttgaacatcttataagtaagagga 8794179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 18372269 - 18372190
Alignment:
Q  348 tgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccg-ttgcggagaaaccaacaa 427  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| || |||||||||||||||    
T  18372269 tgacccaatagtggtatcagagcct-ggttcgacaaagggtacgaccgaggcagccgatccgttttcggagaaaccaacaa 18372190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25561792 - 25561736
Alignment:
Q  175 agttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagag 231  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25561792 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 25561736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40579348 - 40579280
Alignment:
Q  245 cattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |||||||||| | | |||||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  40579348 cattgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 40579280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 43274934 - 43274832
Alignment:
Q  168 aagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaa 267  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||  |||| |||||||| ||| ||||    
T  43274934 aagtgtgagttatatgtttcacatcagataaaagagtaaaggttgaatatattataagtaagagga-cccataaacctattgtcttaaggttttgagtaa 43274836  T
Q  268 gagt 271  Q
    ||||    
T  43274835 gagt 43274832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 313
Target Start/End: Original strand, 2467510 - 2467647
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||  ||||  | |||| | | ||||||||| ||| ||||| || || ||||| |||     
T  2467510 tgagttatatgtctcacgtcggatagaaaattagaagttgaacac--tatatgtgagag-agcacataaactcgttgtcttaaagtttttggtaaaagtg 2467606  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    || |||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||    
T  2467607 tgacgtctctctcacttgtatggttgctttagcctagatgt 2467647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 202 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18373291 - 18373235
Alignment:
Q  202 agtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||    
T  18373291 agtaaaggttgaacaccttataaataagaggat-ccattaacccattgtcttaaggtg 18373235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20995563 - 20995502
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttat 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||| ||||    
T  20995563 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaaaagtggaggttgaacactttat 20995502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 379 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 9483144 - 9483084
Alignment:
Q  379 gacgaagggtacaaccgaggcagctggtccg-ttgcggagaaaccaacaacggcggtacaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  9483144 gacgaagggtacaaccgaggcagtcggtccgtttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaa 9483084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18645756 - 18645712
Alignment:
Q  154 gaactggtgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatag 198  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18645756 gaactgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatag 18645712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 33831974 - 33832046
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagagga 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  | | | ||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||    
T  33831974 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacgttgaagagaaaagtagaagttgaacactttataagtaagagga 33832046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18372758 - 18372659
Alignment:
Q  167 caagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggta 266  Q
    ||||| ||| ||||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| |||||||   |||| |||||||    
T  18372758 caagtgtgatttatatgttccatttcggataaaatagtaaaggttgaaca-cttataagtaagagga-ctcataaacccattgcc---aggttttgggta 18372664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18380167 - 18380070
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagt 271  Q
    |||||||||| || || |||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||  || |||||| || | ||||||||| ||| ||||||||    
T  18380167 tgagttatatatcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag-ggggcctataaacccactaccttaaggttttgagtaagagt 18380070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 271
Target Start/End: Original strand, 20130457 - 20130553
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagt 271  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||| |||  ||||| ||| || |||||||||    
T  20130457 tgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgat-ccataaacccataaccttacggttttaggtaagagt 20130553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 298
Target Start/End: Original strand, 5274771 - 5274907
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   | || | ||| ||||| | ||||||||||| |||||| |  || || |||||||| ||||||||||||| | |    
T  5274771 tgtgtgcaagtatgagttatatgttctacattgaataaaaaaggagaggttgaacactttataaatgggaaga-cccataaaatcattgccttaagattt 5274869  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttg 298  Q
    || |||||||| ||  |||||| || ||||||| ||||    
T  5274870 tgagtaagagtgtgatgtctctatcgcttgtgttgttg 5274907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 304
Target Start/End: Original strand, 16524446 - 16524503
Alignment:
Q  247 ttgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctag 304  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16524446 ttgctttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgctctag 16524503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 43274699 - 43274634
Alignment:
Q  260 ttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||| |||| || |||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  43274699 ttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttatggggttgttccagcctcgatgtggacggtccccc 43274634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 369 - 472
Target Start/End: Original strand, 9608946 - 9609045
Alignment:
Q  369 gcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgtt-gcggagaaaccaacaacggcggtacaagctccttatgtcggtccgtttgcggagaa 467  Q
    ||| ||||||||| |||||||| ||||||| | | |||||||| ||| | ||| || ||||||||||||||||      |||||||||||||||| ||||    
T  9608946 gccccggttcgacaaagggtacgaccgaggaaaccggtccgtttgcgcataaagcagcaacggcggtacaagc-----gtgtcggtccgtttgcgcagaa 9609040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 348 - 411
Target Start/End: Original strand, 30359445 - 30359505
Alignment:
Q  348 tgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgtt 411  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  30359445 tgacccaacagtggtatcagagcct--gttcgacgaaggg-acgaccgaggcagccggtccgtt 30359505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 261 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 34629764 - 34629712
Alignment:
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| |||||    
T  34629764 tgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggtagttatggccttgatgt 34629712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 158 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 40296480 - 40296313
Alignment:
Q  158 tggtgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaagg 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  40296480 tggtgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagaaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttgagg 40296382  T
Q  258 tgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  40296381 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccca 40296313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1028679 - 1028516
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||  ||  ||||||||| |    
T  1028679 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggatgaacactttataagtaagagga-cccataaacctataaccttaaggttt 1028581  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1028580 ttggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 1028516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 26074608 - 26074759
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  26074608 tgtgtacaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggttt 26074706  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  26074707 tgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgt 26074759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 326
Target Start/End: Original strand, 6500823 - 6500982
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  6500823 tgcaagtgtgagttatatgtc-cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataaaagga-cccataaactcattgccttaaggttttgga 6500920  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  6500921 taagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtccccca 6500982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 326
Target Start/End: Original strand, 41632778 - 41632942
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||| ||||| | |    
T  41632778 tgtgtgcaagtgtaagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccaatgctttaagattt 41632876  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||||||  |||||||||||    
T  41632877 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagtctcgatgtggacggtccccca 41632942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26074308 - 26074157
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |    
T  26074308 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgaacacctcatatgtaagagga-cccatgaacccattgccttaaggttt 26074210  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  26074209 tgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgt 26074157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 165 - 440
Target Start/End: Original strand, 6500451 - 6500714
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||| |||||    
T  6500451 tgcaagtgtgagttatatgtc-cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cctttaaacccattgccttaaggttttggg 6500548  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtggtat 364  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||  |        | |||||| ||||||||    
T  6500549 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccca-ggctcccctcac--------ttacccaacagtggtat 6500639  T
Q  365 cggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagc 440  Q
    | |||   |||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||    
T  6500640 cagagttccggttcgacgaagggtgcaaccgaggcagccagt-cgttgcgcagaaagccgcaacggcggtataagc 6500714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 167 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18603276 - 18603131
Alignment:
Q  167 caagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggta 266  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18603276 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggttttgggta 18603178  T
Q  267 agagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18603177 agagtgtggcatctctcttgcttgtgtggtagttctagcctcgatgt 18603131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 161 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13415922 - 13415774
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |    
T  13415922 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaattagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacctattaccttaaggttt 13415824  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcga 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  13415823 tgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcga 13415774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 36568729 - 36568580
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| || ||| ||||| |||||||||||||| |    
T  36568729 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagatga-cccgtaaacccattgccttaaggttt 36568631  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  36568630 ttggtaagagtgtggcgtctctct--cttgtgtggttgttctatcctcgatgt 36568580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26591068 - 26590921
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||| ||| ||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||| |    
T  26591068 tgcaagtgtgatttaaatgttccatatcgaatcgaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcc-ataaattcaatgccttaaggttttgag 26590970  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  26590969 taagagtgtggcgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcgatgt 26590921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 175 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 34753173 - 34753036
Alignment:
Q  175 agttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctg 274  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  34753173 agttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtaagaaga-cccataaaccgattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 34753075  T
Q  275 gcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  34753074 gcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 34753036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 165 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 36492375 - 36492218
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| |||| |||| ||||     
T  36492375 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ccaataaacacattacctttaggttttgga 36492277  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccc 323  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  36492276 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 36492218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 165 - 326
Target Start/End: Original strand, 32487394 - 32487553
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  32487394 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct-ataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggttttggg 32487491  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||| || ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  32487492 taagagtgtgacgtatctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggatggtccccca 32487553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 173 - 325
Target Start/End: Original strand, 41170642 - 41170793
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  41170642 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 41170740  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||| || | |||  ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  41170741 tggtgtttttcttgcttgtgtggttgttctagcctcggtgtagacggtccccc 41170793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26075324 - 26075172
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  26075324 tgtgtacaagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggttt 26075226  T
Q  261 tgggt-aagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||| |||||| || |||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  26075225 tgggtaaagagtgtgtcgtctctcttgcaagtgtggttgttttagcctcgatgt 26075172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 299485 - 299636
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||| |    
T  299485 tgtgcgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagatga-cccataaactcatagccttaaggttt 299583  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    || |||||||| |||||||||| |  |||||  |||||||||||| |||||||    
T  299584 tgtgtaagagtgtggcgtctctattgcttgtacggttgttctagcatcgatgt 299636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Original strand, 623818 - 623977
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||| || ||||  || || ||||||| || |||||||||| ||| |    
T  623818 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatataatagtaaaggttgaacactttacaagtaagttgagcc-ataaacttatagccttaaggttttgag 623916  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  623917 taagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcaatgtagacggtccccc 623977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Original strand, 624196 - 624343
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || || | ||| || |||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||| |||| |||||    
T  624196 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattgtataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagatga-cccataaacccatagccttgaggttttggg 624294  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  624295 taagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcgatgt 624343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Original strand, 15370095 - 15370258
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  ||  |||||||||| |    
T  15370095 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagagga-cccataaatccacagccttaaggttt 15370193  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15370194 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctagcctcgatgtggacggtccccc 15370258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 160 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3295177 - 3295026
Alignment:
Q  160 gtgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtg 259  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||| ||||     
T  3295177 gtgtgtgcaagtgtgagt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaga-cccataaacccattgccttgaggtt 3295080  T
Q  260 ttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3295079 ttgggtatgagtgtggtgtctctcttggttgtgtggttgttgtagcctcgatgt 3295026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 35150003 - 35150153
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||  ||||| |||||||| |    
T  35150003 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtcaaggttgaacaccttataagtaagag--acccataaatccattgtcttaaggttt 35150100  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  35150101 tgggtaaaagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcaatgt 35150153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3295505 - 3295344
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||  || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||| |    
T  3295505 tgtgtggaagtgtgagt-atatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaaccaattgccttaaggttt 3295408  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||| ||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3295407 tgg-taagagtgtgttgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 3295344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27502194 - 27502035
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || || ||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| | || ||    
T  27502194 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagagga-cccataaacctattgccttaagatttttgg 27502096  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  27502095 taaaagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctatcctcgatgtggacggtccccc 27502035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 173 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9498804 - 9498694
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||     
T  9498804 tgagttatatgtctcacatcagatagaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtg 9498706  T
Q  273 tggcgtctctct 284  Q
    ||| ||||||||    
T  9498705 tggtgtctctct 9498694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 168 - 325
Target Start/End: Original strand, 25327938 - 25328094
Alignment:
Q  168 aagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaa 267  Q
    |||| |||||||||||||  | |||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  25327938 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaacagtaaaagttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 25328036  T
Q  268 gagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    |||| ||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  25328037 gagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtccccc 25328094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 313
Target Start/End: Original strand, 38427556 - 38427694
Alignment:
Q  173 tgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtc 272  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| ||  ||||| |||||||| ||| ||||||||     
T  38427556 tgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagta-gagga-cccattaatccattgtcttaaggttttgtgtaagagtg 38427653  T
Q  273 tggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38427654 tgacgtctctctcacttgtgcggttgttctaacctcgatgt 38427694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 202 - 328
Target Start/End: Original strand, 15370439 - 15370564
Alignment:
Q  202 agtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttc 301  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||    
T  15370439 agtaaatgttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccatagccttaaggttttgcgtaagagtgtggcgtctctcttgtttgtggggttgttc 15370537  T
Q  302 tagcctcgatgtcaacggtcccccatg 328  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  15370538 tagcctcgatgtggacggtcctccatg 15370564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24489366 - 24489217
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||    ||||||||| |||||||||||| | |    
T  24489366 tgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagaaaaggttaaacaccttattagtaagaa---cccataaacccattgccttaagattt 24489270  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    || |||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24489269 tgcgtaagagtgtggcgtctcttttacttgtgcggttgttctagtctcgatgt 24489217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 326
Target Start/End: Original strand, 6224192 - 6224356
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  6224192 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaactcatcgccttaaggttt 6224290  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    | ||||||||| ||| | |||  |  |||||| ||||| ||||||||| || |  |||||||||||    
T  6224291 ttggtaagagtgtggtgcctcagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatatggacggtccccca 6224356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11417137 - 11416988
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    |||||||||||  |||||||||||  || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  11417137 tgtgtgcaagt--gagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggat-ccataaacccattgccttaaggttt 11417041  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    || |||||||| ||   |||||||  |||||| | |||||||||| |||||||    
T  11417040 tgtgtaagagtgtgatctctctcttgcttgtgggattgttctagcttcgatgt 11416988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 42405758 - 42405597
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||| |||| | |||||||  | ||||||||||| |    
T  42405758 tgtgtacaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttacaagtaaaagga-ctcataaacctaatgccttaaggttt 42405660  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||||||| ||  || |||||  |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42405659 tgggtaagagtgtg--gtgtctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 42405597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 29549413 - 29549278
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||     
T  29549413 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcagataaaatagtaaaggatgaacaccatataagtaagaaga-cccataaacacattaccttaaggttttgga 29549315  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttc 301  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  29549314 taagagtgtggcgtctctcttgcttatgtggttgttc 29549278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 313
Target Start/End: Original strand, 33747783 - 33747918
Alignment:
Q  177 ttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggc 276  Q
    ||||||||| || |||||||| || |||||||||| || || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||     
T  33747783 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaatactttataagtaagaggatcc-ataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggt 33747881  T
Q  277 gtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||  ||| || |||||||||||||| |||||    
T  33747882 gtctctcttccttatgcggttgttctagccttgatgt 33747918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 36522058 - 36521922
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||  |||||||||||  | ||| | |||||| |||||||||  ||||||||||||| |    
T  36522058 tgtgcgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttgaacactctttaaatgagagga-cccataaaccaattgccttaaggttt 36521960  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttg 298  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||    
T  36521959 tgggtaagagtgtgtcatctctctcatttgtgtggttg 36521922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12662814 - 12662663
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||  |||||| |||||  | ||||||||  ||||| |||||| | |    
T  12662814 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacattttataagtaaga-aaacccataaatccattgtcttaagtttt 12662716  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||| | || |||  |||||| |||| |||||||||||||||    
T  12662715 tgggtaagagtgtggtgcctttcttgcttgtggggttcttctagcctcgatgt 12662663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 258
Target Start/End: Original strand, 31509619 - 31509715
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggt 258  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||| | |||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  31509619 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagagga-ctcataaactcattgccttgaggt 31509715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26074944 - 26074821
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||  |||| |||||||| |    
T  26074944 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacaatataagtaggagga-cccataaacctattgtcttaaggttt 26074846  T
Q  261 tgggt-aagagtctggcgtctctct 284  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||    
T  26074845 tgggtaaagagtgtggcgtctctct 26074821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 35168000 - 35167849
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||   |||||||| | || |    
T  35168000 tgtgtacaagtatgagttatgtatctcacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaggatga-cccataaatctattgccttgatgttt 35167902  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    | ||||||||| ||  ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  35167901 ttggtaagagtgtgatgtctctcacactagtgtggttgttctagcatcgatgt 35167849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 36522392 - 36522269
Alignment:
Q  168 aagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaa 267  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||| |  | ||||||||  |||||| | |||||| || |||||| ||||  |||||||| ||||||||    
T  36522392 aagtgtgagttatatgtctcacattggatagaaaaatggaagttgaacattttataagtgagagga-ccaataaacccattatcttaaggttttgggtaa 36522294  T
Q  268 gagtctggcgtctctctcacttgtg 292  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||    
T  36522293 gagtgtggtgtctctctcacttgtg 36522269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 326
Target Start/End: Original strand, 2411010 - 2411167
Alignment:
Q  168 aagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaa 267  Q
    |||| |||||||||||||  | || ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  2411010 aagtgtgagttatatgtcctacattggatagagaagtaaaagttgaacatcttgtaagtaagagaa-cccataaacttattgccttaaggttttgagtaa 2411108  T
Q  268 gagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    |||| | |  ||||| | |||||  || |||||||| ||||||| |  |||||||||||    
T  2411109 gagtgtagtttctctattacttgaatgattgttctaacctcgatatggacggtccccca 2411167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 13416128 - 13415959
Alignment:
Q  347 gtgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgtt-gcggagaaaccaacaacggcggtacaagctcctt 445  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| | || |||| |||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||||| || |||||||||| |||||         
T  13416128 gtgacccaacagtggtatcagagtcccg-ttcgtcgaagggtacgaccgaggcaaccggtccgtttgcgcagaaagcagcaacggcggtgcaagcag--- 13416033  T
Q  446 atgtcggtccgtttgcggagaaagcagtagcggcaatacaagtaagtaataggttccgcttgaaaggggagcatg 520  Q
     | |||||||||||||||||||| ||  | | || ||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  13416032 -tctcggtccgtttgcggagaaaccatcaacagcgatacaagcaagtaagagcttccgcttgaagggggagcatg 13415959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 258
Target Start/End: Original strand, 42508608 - 42508704
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggt 258  Q
    ||||| ||||| ||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  42508608 tgtgtacaagtgtgaattatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacatctaataagtaagagga-ctcataaacccattgccttaaggt 42508704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Original strand, 26074320 - 26074395
Alignment:
Q  167 caagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaac 243  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  26074320 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaactaaagattgaacaccttataagtaagagga-cccataaac 26074395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5723949 - 5723811
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || | |||| ||||||||| |||||  ||||| || ||||| || | |||| |||||||| |||||    
T  5723949 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaataataaaagttgaacacattatatgtaaga-gaacccattaatttattgtcttaaggttttggg 5723851  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctag 304  Q
     |||||| | | ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  5723850 aaagagtatagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 5723811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 322
Target Start/End: Original strand, 300955 - 301107
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| || |||||||||| || ||| |||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||         |||||||||||| | |    
T  300955 tgtgtacaagtgtgggttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaataccttataagtaagagaatc---------cattgccttaagattt 301045  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtcc 322  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||    
T  301046 ttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggctgttcaagtctcgacgtgaacggtcc 301107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 291
Target Start/End: Original strand, 31509745 - 31509857
Alignment:
Q  179 atatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaagg-tgttgggtaagagtctggcg 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||| | |||||| | ||||||||||||||||| ||| | || ||||||| | ||| |    
T  31509745 atatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagagga-ctcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtggtg 31509843  T
Q  278 tctctctcacttgt 291  Q
    |||||||| |||||    
T  31509844 tctctctcgcttgt 31509857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 291
Target Start/End: Original strand, 19275543 - 19275653
Alignment:
Q  179 atatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgt 278  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||  |||| || |||||||| |||||| |||||| | |||||||||| | ||||||    
T  19275543 atatgtcttaaatcagatagaaaagtagaggttgaaca-cttataaggaagaaga-cccataaattcattgtcttaagattttgggtaagattgtggcgt 19275640  T
Q  279 ctctctcacttgt 291  Q
    || |||| |||||    
T  19275641 ctgtctcgcttgt 19275653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 352 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 26075140 - 26075058
Alignment:
Q  352 ccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccg-ttgcggagaaaccaacaacggcggt 434  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||| || ||||||||||    
T  26075140 ccaacagtggtatcagagcctcg-ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtctgtttgcgcagaaagcagcaacggcggt 26075058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 26900089 - 26900015
Alignment:
Q  252 ttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  |||||| | |||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  26900089 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggtttgttctagccttgatgtggacggtccccca 26900015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 36527183 - 36527117
Alignment:
Q  236 ccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttct 302  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36527183 ccataaacgcattgccttaagattttggataagagtgtgctgtctctctcacttgtgtggctgttct 36527117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 233
Target Start/End: Original strand, 42524719 - 42524784
Alignment:
Q  167 caagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagagga 233  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  42524719 caagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaa-gttgaacatcttatgaataagagga 42524784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 313
Target Start/End: Original strand, 38427313 - 38427366
Alignment:
Q  260 ttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||    
T  38427313 ttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgt 38427366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 39309680 - 39309752
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagagga 233  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  39309680 tgtgtacaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagggtaaatgttgaacacattataaataagagga 39309752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41635346 - 41635278
Alignment:
Q  168 aagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcc 236  Q
    |||| |||||||||||| ||  ||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41635346 aagtatgagttatatgtttcccatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggatcc 41635278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 467
Target Start/End: Original strand, 35150188 - 35150299
Alignment:
Q  359 tggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaacc----gaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagctccttatgtcggtc 454  Q
    ||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||     ||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||||    
T  35150188 tggtatcagagtcgcagttcgacgaagggtacgaccaaggcaggcagccggtctgttgtggagaaaccagcaacgacggtataaactccttgtgtcggtc 35150287  T
Q  455 cgtttgcggagaa 467  Q
    | |||||||||||    
T  35150288 c-tttgcggagaa 35150299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 448 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 3295287 - 3295229
Alignment:
Q  448 gtcggtccgtttgcggagaaagcagtagcggcaatacaagtaagtaataggttccgctt 506  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| || ||||||||    
T  3295287 gtcggtccgtttgcgcagaaagcagcaacggcgatacaagcaagtaagagcttccgctt 3295229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 285
Target Start/End: Original strand, 13042608 - 13042658
Alignment:
Q  235 cccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctc 285  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||    
T  13042608 cccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctctc 13042658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 230
Target Start/End: Original strand, 35914852 - 35914914
Alignment:
Q  168 aagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaaga 230  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||  |||||| |||||    
T  35914852 aagtatgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaggttgaacattttataagtaaga 35914914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 6225047 - 6225103
Alignment:
Q  168 aagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataa 224  Q
    ||||||||||||||| || || ||| |||| || | |||||||||||||||||||||    
T  6225047 aagtctgagttatatatcccacatcagataaaagaataaaggttgaacaccttataa 6225103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 167 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 670 - 525
Alignment:
Q  167 caagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggta 266  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  670 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaaggttttgggta 572  T
Q  267 agagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||| ||| |||| |||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  571 agagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgt 525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 300 - 146
Alignment:
Q  165 tgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttggg 264  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||   ||| |||| || ||    
T  300 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga--ccataaac-cat--actttaggt-ttagg 207  T
Q  265 taagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||| | ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  206 taagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 347 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 501 - 450
Alignment:
Q  347 gtgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgagg 398  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  501 gtgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgagg 450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 5)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1268 - 1104
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||  || |||| | ||||||| |||||||||||||| |    
T  1268 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagaaaaagga-ctcataaacccattgccttaaggttt 1170  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccca 326  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  1169 tgggtaagagtatggtgtctctcttgtttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggttcccca 1104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 358 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 1465 - 1304
Alignment:
Q  358 gtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccg-ttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagctccttatgtcggtccg 456  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||    |  ||||||||||    
T  1465 gtggtatcagagccccggttcgacgaagggtatgaccgaggcagccggtccgtttgtgcagaaagcagcaacggcggtacaag----tagtgtcggtccg 1370  T
Q  457 tttgcggagaaagcagtagcggcaatacaagtaagtaataggttccgcttgaaaggggagcatgat 522  Q
    |||||||||||| ||| | || | ||||||| |||||| || ||||||| ||| ||||||||||||    
T  1369 tttgcggagaaaccagcaacgacgatacaagcaagtaagagcttccgctcgaagggggagcatgat 1304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 1802 - 1607
Alignment:
Q  212 gaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgttgggtaagagtctggcgtctctctcactt--------gtgtggttgttcta 303  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||         ||||||||||||||    
T  1802 gaacaccttataagtgagagga-cccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctctctctctcacacaagtgtggttgttcta 1704  T
Q  304 gcctcgatgtcaacggtcccccatggctctcctggctctccttgtgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagct 403  Q
    ||||||||||   | |||||||          | |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1703 gcctcgatgtgggcagtccccc----------tagctcccctcgtgacccaacagtggtatcagagcctcg-ttcgacaaagggtacaaccgaggcagct 1615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 452 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 3254 - 3174
Alignment:
Q  452 gtccgtttgcggagaaagcagtagcggcaatacaagt-aagtaataggttccgcttgaaaggggagcatgatgagttgatg 531  Q
    ||||||||||||||||  ||  | |||| |||||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3254 gtccgtttgcggagaacccaacaacggcgatacaaatcaagtaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgagttgatg 3174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3147 - 3092
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaaca 216  Q
    |||||||| || ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  3147 tgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaaca 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 4978 - 5129
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||| || | ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| ||| |    
T  4978 tgtgtgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggagagaacagtaaaggtttaatatcttataagtaaaaaga-cccataaactcattgccttatggttt 5076  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||    
T  5077 tgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgt 5129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 284
Target Start/End: Original strand, 5353 - 5475
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |    
T  5353 tgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaagattt 5451  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctct 284  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||    
T  5452 tggataagagtgtggtgtctctct 5475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 347 - 440
Target Start/End: Original strand, 5154 - 5245
Alignment:
Q  347 gtgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggtacaaccgaggcagctggtccgttgcggagaaaccaacaacggcggtacaagc 440  Q
    ||||||||| ||||| |||  |||| || ||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  5154 gtgacccaacagtggcatcacagccccg-ttcgacgaaaggtacgatcgaggcagctggt-cgttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaagc 5245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 313
Target Start/End: Original strand, 5392 - 5544
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgcctt-aaggtg 259  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  |||| ||| ||| |     
T  5392 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg-gcccataaacatattgtcttaaagttt 5490  T
Q  260 ttgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgt 313  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||    
T  5491 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcaagcctcgatgt 5544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 256
Target Start/End: Original strand, 5773 - 5867
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaag 256  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  5773 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-cccataaacccattgccttaag 5867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Original strand, 47356 - 47519
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| |||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| || |    
T  47356 tgtgtgcaagtgtgaattaaatgtctcacatccgataaaatagtaaagtttgaacaccttataagtaagagaat-ccataaacccattgccttaaagttt 47454  T
Q  261 tgggtaagagtctggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtcaacggtccccc 325  Q
    ||||||| | | ||| ||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  47455 tgggtaaaaatgtggtgtctctcttgcttgcgcggttgttctaacctcgatgtggacggtccccc 47519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17618 - 17496
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaagg--t 258  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||  |    
T  17618 tgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagagga-cccataaacccatagccttaaggttt 17520  T
Q  259 gttgggtaagagtctggcgtctct 282  Q
     |||||||||||| ||| ||||||    
T  17519 tttgggtaagagtatggtgtctct 17496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10267 - 10192
Alignment:
Q  167 caagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaac 243  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  10267 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatggtaaaagttgaacaccttataagtaagagga-cccataaac 10192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 298
Target Start/End: Original strand, 39453 - 39588
Alignment:
Q  161 tgtgtgcaagtctgagttatatgtctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagaggatcccataaactcattgccttaaggtgt 260  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||||  | ||||||   ||||||||| || |    
T  39453 tgtgttcaagtgtgagttatatgtctcaca-cgcatagaaaagtggaggttgaactccttataagtgagagga-actataaacatgttgccttaa-gttt 39549  T
Q  261 tgggtaagagt-ctggcgtctctctcacttgtgtggttg 298  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||    
T  39550 tgggtaaaagtgttggcgtctctcttgcttgtgtggttg 39588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 388
Target Start/End: Original strand, 39612 - 39666
Alignment:
Q  334 cctggctctccttgtgacccaaaagtggtatcggagcctcggttcgacgaagggt 388  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  39612 cctggctcccctagtgacccaacagtggtatcagagccgaggttcgacgaagggt 39666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University