View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8159_low_3 (Length: 378)

Name: NF8159_low_3
Description: NF8159
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8159_low_3
NF8159_low_3
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (13-366)||(15229269-15229622)
chr4 (13-366)||(1901657-1902010)
chr4 (13-366)||(15283446-15283799)
chr4 (13-366)||(15389896-15390249)
chr4 (12-375)||(6571252-6571615)
chr4 (12-375)||(34187469-34187832)
chr4 (12-375)||(5007272-5007635)
chr4 (12-375)||(31125027-31125390)
chr4 (13-375)||(24590864-24591226)
chr4 (12-375)||(36343024-36343387)
chr4 (28-375)||(14666433-14666780)
chr4 (12-375)||(39852037-39852400)
chr4 (12-327)||(18799170-18799485)
chr4 (12-375)||(30755153-30755516)
chr4 (12-375)||(33672307-33672670)
chr4 (12-375)||(54834786-54835149)
chr4 (12-375)||(14099940-14100303)
chr4 (12-375)||(14761813-14762176)
chr4 (12-375)||(21971100-21971463)
chr4 (12-375)||(27161825-27162188)
chr4 (12-327)||(40104195-40104510)
chr4 (13-375)||(24114062-24114424)
chr4 (121-375)||(17014551-17014805)
chr4 (298-366)||(24460281-24460349)
chr4 (49-112)||(14731187-14731250)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (13-366)||(19454929-19455281)
chr2 (13-366)||(21701671-21702024)
chr2 (12-375)||(27805087-27805450)
chr2 (12-375)||(27778602-27778965)
chr2 (12-375)||(12588190-12588553)
chr2 (12-375)||(37376541-37376904)
chr2 (12-366)||(9348489-9348843)
chr2 (12-327)||(27818360-27818675)
chr2 (12-375)||(34287734-34288097)
chr2 (12-375)||(34292794-34293157)
chr2 (12-366)||(13935051-13935405)
chr2 (12-375)||(16827836-16828199)
chr2 (12-375)||(16893282-16893645)
chr2 (12-375)||(32051178-32051541)
chr2 (12-375)||(39050320-39050683)
chr2 (12-375)||(40234891-40235254)
chr2 (12-375)||(259251-259614)
chr2 (43-375)||(19414997-19415329)
chr2 (12-375)||(11633683-11634046)
chr2 (12-375)||(12715100-12715463)
chr2 (28-375)||(28883610-28883957)
chr2 (12-375)||(21675680-21676043)
chr2 (13-365)||(23127074-23127426)
chr2 (12-375)||(31877661-31878024)
chr2 (13-365)||(27432952-27433304)
chr2 (13-365)||(12656923-12657275)
chr2 (121-375)||(20839390-20839644)
chr2 (12-375)||(39891454-39891817)
chr2 (44-375)||(34863092-34863423)
chr2 (12-375)||(37949820-37950183)
chr2 (298-366)||(34302968-34303036)
chr2 (44-375)||(37684407-37684738)
chr2 (44-375)||(37699672-37700003)
chr2 (298-366)||(3785162-3785230)
chr2 (298-366)||(27119196-27119264)
chr2 (298-366)||(31890993-31891061)
chr2 (298-366)||(34157518-34157586)
chr2 (12-131)||(11640117-11640236)
chr2 (254-375)||(37926992-37927113)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (13-366)||(16625160-16625513)
chr3 (13-366)||(18531734-18532087)
chr3 (12-375)||(20575397-20575760)
chr3 (13-375)||(8297318-8297680)
chr3 (12-375)||(29663520-29663883)
chr3 (12-375)||(7074557-7074920)
chr3 (28-375)||(18052623-18052970)
chr3 (12-375)||(18226536-18226899)
chr3 (12-375)||(28114504-28114867)
chr3 (12-365)||(20067388-20067741)
chr3 (13-365)||(15891266-15891618)
chr3 (12-375)||(10397478-10397841)
chr3 (13-375)||(22386128-22386490)
chr3 (12-366)||(5607881-5608235)
chr3 (13-335)||(6193661-6193983)
chr3 (12-366)||(11108908-11109262)
chr3 (12-375)||(4345237-4345600)
chr3 (12-375)||(5015057-5015420)
chr3 (12-366)||(5594916-5595270)
chr3 (12-375)||(18290903-18291266)
chr3 (12-375)||(18306204-18306567)
chr3 (13-375)||(15739644-15740006)
chr3 (13-375)||(29147305-29147667)
chr3 (13-375)||(35882112-35882474)
chr3 (13-365)||(4722977-4723329)
chr3 (12-375)||(31963023-31963386)
chr3 (12-375)||(4418264-4418627)
chr3 (12-327)||(18244084-18244399)
chr3 (12-375)||(18275602-18275965)
chr3 (13-375)||(22869406-22869768)
chr3 (13-375)||(22884465-22884827)
chr3 (44-366)||(5468362-5468684)
chr3 (13-375)||(8288021-8288383)
chr3 (12-365)||(32440499-32440852)
chr3 (12-275)||(48467272-48467535)
chr3 (12-375)||(10644415-10644778)
chr3 (12-375)||(17983506-17983869)
chr3 (12-375)||(24329504-24329867)
chr3 (12-375)||(51783368-51783731)
chr3 (28-275)||(4795303-4795550)
chr3 (36-375)||(18331997-18332336)
chr3 (12-375)||(21676038-21676401)
chr3 (12-366)||(8213083-8213437)
chr3 (12-375)||(6541012-6541375)
chr3 (43-375)||(7997938-7998270)
chr3 (12-375)||(47024798-47025161)
chr3 (13-326)||(28022621-28022934)
chr3 (298-366)||(5652860-5652928)
chr3 (298-366)||(4626417-4626485)
chr3 (298-366)||(5713700-5713768)
chr3 (298-366)||(5724610-5724678)
chr3 (298-366)||(5767690-5767758)
chr3 (298-366)||(17993501-17993569)
chr3 (12-125)||(20441462-20441575)
chr3 (254-375)||(28340766-28340887)
chr3 (254-375)||(36995750-36995871)
chr3 (12-125)||(41438588-41438701)
chr3 (49-112)||(7090873-7090936)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (13-366)||(22889863-22890216)
chr5 (17-366)||(25200427-25200776)
chr5 (121-366)||(25264686-25264931)
chr5 (13-365)||(23893600-23893952)
chr5 (12-365)||(15657176-15657529)
chr5 (12-375)||(9318844-9319207)
chr5 (12-375)||(40471955-40472318)
chr5 (12-365)||(41676102-41676455)
chr5 (12-375)||(12133548-12133911)
chr5 (12-375)||(26481784-26482147)
chr5 (13-365)||(11550748-11551100)
chr5 (13-365)||(30936027-30936379)
chr5 (12-364)||(33517749-33518101)
chr5 (12-375)||(3790934-3791297)
chr5 (12-375)||(28650628-28650991)
chr5 (12-375)||(43079645-43080008)
chr5 (13-375)||(33778881-33779243)
chr5 (12-365)||(33293918-33294271)
chr5 (13-365)||(24686573-24686925)
chr5 (13-365)||(24971412-24971764)
chr5 (12-375)||(24682833-24683196)
chr5 (12-375)||(24725360-24725723)
chr5 (13-375)||(23750856-23751218)
chr5 (12-375)||(15757263-15757626)
chr5 (12-375)||(18499136-18499499)
chr5 (13-375)||(22997520-22997882)
chr5 (13-375)||(23716394-23716756)
chr5 (12-375)||(8663881-8664244)
chr5 (12-375)||(13323235-13323598)
chr5 (12-375)||(28958192-28958555)
chr5 (12-375)||(30169862-30170225)
chr5 (12-375)||(37357049-37357412)
chr5 (12-327)||(37669937-37670252)
chr5 (12-375)||(30030808-30031171)
chr5 (12-375)||(30153411-30153774)
chr5 (12-375)||(37756373-37756736)
chr5 (12-365)||(18125811-18126164)
chr5 (12-375)||(6875698-6876061)
chr5 (12-375)||(31824813-31825176)
chr5 (12-375)||(34617911-34618274)
chr5 (13-375)||(31432834-31433196)
chr5 (43-327)||(37769441-37769725)
chr5 (12-375)||(2512444-2512807)
chr5 (298-366)||(13440067-13440135)
chr5 (254-375)||(18373941-18374062)
chr5 (298-366)||(9548116-9548184)
chr5 (298-366)||(11326315-11326383)
chr5 (298-366)||(13184222-13184290)
chr5 (254-375)||(5639422-5639543)
chr5 (254-366)||(32594689-32594801)
chr5 (50-125)||(34467047-34467122)
chr5 (296-365)||(20390438-20390507)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (13-366)||(16042709-16043062)
chr7 (13-366)||(16448402-16448755)
chr7 (12-375)||(5145735-5146098)
chr7 (13-375)||(5129378-5129740)
chr7 (12-375)||(26318264-26318627)
chr7 (12-366)||(26536274-26536628)
chr7 (13-365)||(5160905-5161257)
chr7 (12-327)||(26436642-26436957)
chr7 (13-375)||(10915263-10915625)
chr7 (28-375)||(16501796-16502143)
chr7 (12-375)||(26514166-26514529)
chr7 (12-375)||(31126305-31126668)
chr7 (13-375)||(11423172-11423534)
chr7 (12-375)||(31562785-31563148)
chr7 (13-365)||(2155959-2156311)
chr7 (12-375)||(3446691-3447054)
chr7 (12-375)||(9620036-9620399)
chr7 (28-375)||(16516832-16517179)
chr7 (12-375)||(11442264-11442627)
chr7 (12-375)||(26273489-26273852)
chr7 (12-375)||(16734855-16735218)
chr7 (12-375)||(16749909-16750272)
chr7 (12-375)||(17524917-17525280)
chr7 (12-375)||(17527935-17528298)
chr7 (12-375)||(24590936-24591299)
chr7 (44-375)||(26668309-26668640)
chr7 (298-366)||(2108567-2108635)
chr7 (196-375)||(45388789-45388968)
chr7 (298-366)||(45733973-45734041)
chr7 (12-119)||(18542184-18542291)
chr7 (298-375)||(4201060-4201137)
chr7 (298-359)||(31088033-31088094)
chr7 (50-125)||(800159-800234)
chr7 (254-375)||(4143641-4143762)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (13-366)||(16206549-16206902)
chr1 (13-199)||(20462469-20462655)
chr1 (12-375)||(10964053-10964416)
chr1 (12-375)||(51639601-51639964)
chr1 (12-375)||(28586364-28586727)
chr1 (12-375)||(41791817-41792180)
chr1 (12-375)||(10946462-10946825)
chr1 (304-375)||(20462656-20462727)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (13-366)||(22079379-22079732)
chr8 (13-365)||(16284834-16285186)
chr8 (13-375)||(27607373-27607735)
chr8 (13-375)||(18792092-18792454)
chr8 (12-375)||(19675825-19676188)
chr8 (13-375)||(19206828-19207190)
chr8 (28-375)||(19689498-19689845)
chr8 (12-375)||(9356007-9356370)
chr8 (12-375)||(3327975-3328338)
chr8 (13-375)||(14559009-14559371)
chr8 (13-375)||(2135727-2136089)
chr8 (13-365)||(16278939-16279290)
chr8 (13-375)||(29830707-29831069)
chr8 (12-327)||(12091240-12091555)
chr8 (12-375)||(31355909-31356272)
chr8 (12-375)||(33260107-33260470)
chr8 (12-327)||(28360471-28360786)
chr8 (298-366)||(33245177-33245245)
chr8 (196-375)||(31488341-31488520)
chr8 (298-366)||(19658675-19658743)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (13-366)||(17090907-17091260)
chr6 (13-327)||(27628206-27628520)
chr6 (12-375)||(16675520-16675883)
chr6 (12-375)||(29550856-29551219)
chr6 (12-366)||(3697462-3697816)
chr6 (12-375)||(26776062-26776425)
chr6 (13-375)||(24303070-24303432)
chr6 (13-365)||(22933342-22933694)
chr6 (13-365)||(23855787-23856139)
chr6 (13-365)||(15422779-15423131)
chr6 (13-329)||(27271078-27271394)
chr6 (12-375)||(29502796-29503159)
chr6 (13-375)||(27020520-27020883)
chr6 (12-375)||(27045769-27046132)
chr6 (13-119)||(20162073-20162179)
chr6 (13-119)||(22170652-22170758)
chr6 (13-375)||(24865099-24865461)
chr6 (13-365)||(13297413-13297765)
chr6 (13-365)||(26919762-26920114)
chr6 (13-375)||(16751236-16751598)
chr6 (13-375)||(27288822-27289184)
chr6 (191-375)||(20162176-20162360)
chr6 (191-375)||(22170471-22170655)
chr6 (12-327)||(26114910-26115225)
chr6 (12-375)||(27009111-27009474)
chr6 (12-375)||(30556468-30556831)
chr6 (12-375)||(4759145-4759508)
chr6 (12-327)||(27486510-27486825)
chr6 (12-327)||(28208835-28209150)
chr6 (12-375)||(4526667-4527030)
chr6 (12-366)||(4544236-4544590)
chr6 (12-375)||(16942479-16942842)
chr6 (13-206)||(26990271-26990464)
chr6 (12-327)||(4722634-4722949)
chr6 (12-375)||(29574394-29574757)
chr6 (121-353)||(34913563-34913795)
chr6 (254-375)||(4774506-4774627)
chr6 (298-366)||(8891930-8891998)
chr6 (298-366)||(8903165-8903233)
chr6 (298-366)||(28163166-28163234)
chr6 (298-366)||(33373875-33373943)
[»] scaffold1697 (1 HSPs)
scaffold1697 (12-375)||(949-1312)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (13-375)||(5746-6108)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (268-366)||(46134-46232)
scaffold0124 (13-365)||(31838-32190)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (13-365)||(31142-31494)
scaffold0089 (28-365)||(45504-45841)
scaffold0089 (13-353)||(38600-38940)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (12-327)||(10950-11265)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (28-365)||(28693-29030)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (12-375)||(7399-7762)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (12-327)||(9333-9648)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (12-375)||(13439-13802)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (12-375)||(24710-25073)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (298-366)||(22073-22141)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (298-366)||(119574-119642)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (254-366)||(7707-7819)
scaffold0159 (254-366)||(21260-21372)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (134-327)||(27711-27904)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Original strand, 15229269 - 15229622
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15229269 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaa 15229368  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15229369 agaatggaaaacttgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 15229468  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15229469 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagcctaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 15229568  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15229569 gccggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 15229622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Original strand, 1901657 - 1902010
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1901657 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcataagaaattgaagtttgtaa 1901756  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  1901757 agaatggaaagcttgttacagtccatggagaggaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgccgaaggaactgc 1901856  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1901857 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 1901956  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1901957 gccggctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaggaaggtctc 1902010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15283799 - 15283446
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15283799 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggacacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 15283700  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15283699 agaatgggaagcttgttacaatccatggagaagagacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 15283600  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  15283599 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagcctaagaaggctggggctgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgtccaagaaggacaggct 15283500  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15283499 gtcggctagggcaagttaatacaactccgcgggaataagcacaaagaaggtctc 15283446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15390249 - 15389896
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15390249 atggacatcaatgcctcttatagctgtctcctagaaagaccgtggatacatgacgctggggcagtgacctctaccctgcaccagaagttaaagtttgtaa 15390150  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| || ||||| ||    
T  15390149 agaatggaaagctcgttacaatccatggagaggaggcatatttggttagccagctatcatctttctcttgcattgaagcagggtctgcagaaggaaccgc 15390050  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     ||||  ||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||  |||||||||| ||||| || || ||||||| |||||| |||||||| ||  ||    
T  15390049 ttttcagggtttgactatcgaaggtacggagcccaagagggctggagctgctatggcctctttgaaggatgctcagagggctgtccaagaaggtcaagct 15389950  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||| ||||||    
T  15389949 accggctggggcaagttaatacaactccttaagaataagcacagagagggtctc 15389896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 6571252 - 6571615
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  6571252 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 6571351  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| || || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  6571352 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 6571451  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  6571452 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 6571551  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  6571552 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 6571615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34187832 - 34187469
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  34187832 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 34187733  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  || ||||| ||||| ||||    
T  34187732 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcctgcatagaagcagggtctgcagaggggactg 34187633  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | |||| |||  ||||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  34187632 cttttcaaggattgactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 34187533  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  34187532 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 34187469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 5007272 - 5007635
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  5007272 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 5007371  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| ||||||||||| || ||||| |||||  |||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |  || |||||||| || ||||    
T  5007372 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggggaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaggcagggtctgctgaagggactg 5007471  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||| ||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||    
T  5007472 ctttccaaggtttgaccattgagggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggaaggtcagac 5007571  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  5007572 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 5007635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31125390 - 31125027
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||    
T  31125390 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 31125291  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  31125290 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 31125191  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  31125190 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 31125091  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31125090 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31125027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24591226 - 24590864
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  24591226 atggacattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24591127  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  24591126 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 24591027  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  24591026 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 24590927  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||||| |||| || || ||||| || || || ||||||||  ||||||||    
T  24590926 gccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaaacataaggaaggtcttggcttctcc 24590864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36343387 - 36343024
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  36343387 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 36343288  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |  | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  36343287 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 36343188  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  36343187 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 36343088  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| || || || ||||||||  ||||||||    
T  36343087 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaaacataaggaaggtcttggcttctcc 36343024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 375
Target Start/End: Original strand, 14666433 - 14666780
Alignment:
Q  28 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 127  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  14666433 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtaacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 14666532  T
Q  128 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 227  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  14666533 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 14666632  T
Q  228 tattgaaggtacggagctcaaga-agactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaa 326  Q
    | | ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||| |||||||     
T  14666633 tgtcgaaggtacggagcccaagagaga-tggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggatggggcag 14666731  T
Q  327 gttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  14666732 gttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 14666780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 39852037 - 39852400
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  39852037 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagttcata 39852136  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| ||||||||||| || || || |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  39852137 aggaatggaaagcttgttaccgttcacggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 39852236  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  39852237 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 39852336  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  39852337 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 39852400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18799485 - 18799170
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  18799485 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggttacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 18799386  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||  || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  18799385 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgttgtccttttcttgtattgaagcggggtctgctgaagggactg 18799286  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || |||||    
T  18799285 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagac 18799186  T
Q  312 tgccggctggggcaag 327  Q
    ||||||||||||||||    
T  18799185 tgccggctggggcaag 18799170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 30755153 - 30755516
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  30755153 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 30755252  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| ||||| |||||  | ||||| |||||  |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  30755253 aagaatggaaagctcgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 30755352  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  30755353 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 30755452  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  30755453 tgccggatggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 30755516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 33672670 - 33672307
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  33672670 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 33672571  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  33672570 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 33672471  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  33672470 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 33672371  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  33672370 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 33672307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 54834786 - 54835149
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  54834786 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 54834885  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  54834886 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 54834985  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||  ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| |||||    
T  54834986 ctttccaaggtttgatcattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 54835085  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  54835086 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 54835149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 14099940 - 14100303
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  14099940 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 14100039  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  14100040 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 14100139  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| |||||||||||||||| || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  14100140 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttctttgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 14100238  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  14100239 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 14100303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14762176 - 14761813
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  14762176 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 14762077  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |  | ||| |||||||||||  | ||||||||  |  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  14762076 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagagaaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 14761977  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | |||| |||  | ||| ||||||| ||||| |  ||||||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  14761976 cttttcaaggattaactgttgaaggaacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 14761877  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  14761876 tgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 14761813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 21971100 - 21971463
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  21971100 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccatggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 21971199  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  21971200 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 21971299  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || |  ||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  21971300 cgttccagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 21971398  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  21971399 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 21971463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27162188 - 27161825
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  27162188 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 27162089  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  27162088 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27161989  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  27161988 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 27161890  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27161889 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27161825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 40104510 - 40104195
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  40104510 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 40104411  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  40104410 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 40104311  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  40104310 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 40104211  T
Q  312 tgccggctggggcaag 327  Q
    |||||| |||||||||    
T  40104210 tgccggttggggcaag 40104195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 24114062 - 24114424
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  24114062 atggatattaatgcctcttacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24114161  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||  ||||| || ||    
T  24114162 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgtagaggggaccgc 24114261  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||| | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  24114262 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaaaagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 24114361  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  24114362 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 24114424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 121 - 375
Target Start/End: Original strand, 17014551 - 17014805
Alignment:
Q  121 aagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgag 220  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || ||||| || || |||| ||    
T  17014551 aagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgcttttcaag 17014650  T
Q  221 gcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctg 320  Q
    |  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||    
T  17014651 gattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctg 17014750  T
Q  321 gggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  17014751 gggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 17014805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24460349 - 24460281
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  24460349 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 24460281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14731250 - 14731187
Alignment:
Q  49 agaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  14731250 agaccatggattcatgacgctggggcagtgacatctactctccatcagaaattgaagtttgtaa 14731187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19455281 - 19454929
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19455281 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgttggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 19455182  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19455181 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagagacatatttggttagccagctgtcatcttt-tcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 19455083  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  19455082 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagcctaagaaggctggggctgctatggcttctttaaaagacgcttagaaggctgtccaagaaggacaggct 19454983  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19454982 gccggatggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 19454929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21702024 - 21701671
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  21702024 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaattttaagtttgtaa 21701925  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21701924 agaatggaaagcttgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagttgtcgtctttctcttgtattgaagctggatctgctgaaggaactgc 21701825  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21701824 ctttcaaggtttgactattgaaggtatggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 21701725  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21701724 gccggccggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaagaaggtctc 21701671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 27805087 - 27805450
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||  ||    
T  27805087 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccctacatcagaagttgaagttcata 27805186  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  27805187 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27805286  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  27805287 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 27805386  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27805387 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27805450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 27778602 - 27778965
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  27778602 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 27778701  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  27778702 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27778801  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| |||| |||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  27778802 ctttccaaggtttgaccattggaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 27778901  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27778902 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27778965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 12588190 - 12588553
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  12588190 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 12588289  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || || |||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  12588290 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagtcagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 12588389  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  12588390 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 12588489  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  12588490 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 12588553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 37376541 - 37376904
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  37376541 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 37376640  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    || | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  37376641 aaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 37376740  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  37376741 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 37376840  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  37376841 tgccggctggggcaagttagtacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 37376904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 9348843 - 9348489
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  9348843 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 9348744  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | ||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  9348743 aggaacggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 9348644  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  9348643 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 9348544  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  9348543 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 9348489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 327
Target Start/End: Original strand, 27818360 - 27818675
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  27818360 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 27818459  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||  | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  27818460 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctcacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27818559  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| |||| |||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  27818560 ctttccaaggtttgaccattggaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 27818659  T
Q  312 tgccggctggggcaag 327  Q
    |||||| |||||||||    
T  27818660 tgccggttggggcaag 27818675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 34287734 - 34288097
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||     
T  34287734 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 34287833  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || |||     
T  34287834 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggacta 34287933  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| |||||    
T  34287934 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 34288033  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  34288034 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 34288097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 34292794 - 34293157
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||     
T  34292794 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 34292893  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || |||     
T  34292894 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggacta 34292993  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| |||||    
T  34292994 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 34293093  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  34293094 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 34293157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13935405 - 13935051
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  13935405 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 13935306  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  13935305 aggaatggaaagcttgttacaatccatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 13935206  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || |||||    
T  13935205 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagac 13935106  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  13935105 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 13935051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16828199 - 16827836
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||    
T  16828199 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 16828100  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  16828099 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16828000  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  16827999 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 16827900  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16827899 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16827836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 16893282 - 16893645
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||    
T  16893282 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 16893381  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  16893382 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16893481  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  16893482 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 16893581  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16893582 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16893645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 32051178 - 32051541
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||    
T  32051178 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 32051277  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  32051278 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 32051377  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  32051378 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 32051477  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  32051478 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 32051541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39050683 - 39050320
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  39050683 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagttcata 39050584  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || || |    
T  39050583 aggaatgaaaagcttgttacaatccatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 39050484  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||||||||||||| | || |  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  39050483 ctttccaaggtttgactattgaaggtgcagaacctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 39050384  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  39050383 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 39050320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 40234891 - 40235254
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| |||||||||||     
T  40234891 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 40234990  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| || | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  40234991 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 40235090  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  40235091 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 40235190  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  40235191 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 40235254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 259614 - 259251
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  259614 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 259515  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  259514 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 259415  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  259414 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 259315  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  259314 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 259251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19415329 - 19414997
Alignment:
Q  43 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 142  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  19415329 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 19415230  T
Q  143 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 242  Q
    ||||| | || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  19415229 aagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 19415130  T
Q  243 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 341  Q
    | || | |||| ||||| |||||||||||||||| || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||| |    
T  19415129 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttctttgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtaatacagctctg 19415031  T
Q  342 cgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
     ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  19415030 tgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 19414997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11634046 - 11633683
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||  | || ||||| ||||||||  ||    
T  11634046 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccactttacatcagaagttgaagttcata 11633947  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| ||||||||||| || ||||| |||||  ||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  11633946 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 11633847  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  || ||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  11633846 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcctaaaaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 11633747  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  11633746 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 11633683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12715463 - 12715100
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  12715463 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 12715364  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  12715363 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 12715264  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  12715263 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 12715164  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  12715163 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 12715100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 375
Target Start/End: Original strand, 28883610 - 28883957
Alignment:
Q  28 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 127  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  28883610 tcttacagctgtctcttgggtagaccttggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 28883709  T
Q  128 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 227  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||||||| |||  | ||    
T  28883710 ttaccattcatggagaggaagcatacctggctagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcctttcaaggattaac 28883809  T
Q  228 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 327  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  28883810 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 28883909  T
Q  328 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  28883910 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 28883957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21676043 - 21675680
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  21676043 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 21675944  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  21675943 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 21675844  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || |||||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  21675843 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaagaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 21675745  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    | ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  21675744 ccgccggctggggcaaggtgatacagctctgcgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 21675680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23127426 - 23127074
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  23127426 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 23127327  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |  |||||||| ||||| || ||    
T  23127326 aaagtggaaagcttgttaccatacatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcataggggcaggatctgcagaggggaccgc 23127227  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  23127226 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 23127127  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||  | ||||| ||||| || ||||||||    
T  23127126 gccggctggggcaggttaatacagctttgtgagaacaagcataaggaaggtct 23127074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 31877661 - 31878024
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  31877661 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31877760  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| | || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  31877761 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactg 31877860  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||    
T  31877861 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 31877960  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    || ||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31877961 tgtcggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31878024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27433304 - 27432952
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  | || || |||| |||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  27433304 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgagagcggtgacctttactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 27433205  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  27433204 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 27433105  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  27433104 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 27433005  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  27433004 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 27432952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Original strand, 12656923 - 12657275
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||| | || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  12656923 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccgtggatacataacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 12657022  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||| | ||||| || ||    
T  12657023 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctacagaggggaccgc 12657122  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
    ||||| |||  | ||| | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  12657123 ctttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 12657222  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  12657223 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 12657275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 375
Target Start/End: Original strand, 20839390 - 20839644
Alignment:
Q  121 aagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgag 220  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| ||    
T  20839390 aagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaag 20839489  T
Q  221 gcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctg 320  Q
    |  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||    
T  20839490 gattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctg 20839589  T
Q  321 gggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  20839590 gggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 20839644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 39891454 - 39891817
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||  | || ||||| ||||| |||||     
T  39891454 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtg 39891553  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  39891554 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 39891653  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||  |||||| || | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  39891654 ctttccaaggtttgatcattgaaagtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 39891752  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  39891753 ctgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 39891817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 375
Target Start/End: Original strand, 34863092 - 34863423
Alignment:
Q  44 tgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggaga 143  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  34863092 tgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtga 34863191  T
Q  144 agaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggag 243  Q
    |||| | || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | |||    
T  34863192 agaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagag 34863291  T
Q  244 ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcg 343  Q
       ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | |    
T  34863292 tcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtg 34863391  T
Q  344 agaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  34863392 agaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 34863423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37950183 - 37949820
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| |||||||||||     
T  37950183 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 37950084  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || || ||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || ||||||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  37950083 aagaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 37949984  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||| | | ||||  |||||  | ||| ||||| ||||||| || ||||| |||||||  ||  | || || || |||||    
T  37949983 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagccggggctgctgtggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaggagggtcagac 37949884  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  37949883 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 37949820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 34303036 - 34302968
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34303036 caagaaggacaggctgccggctggggtaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagagggtctc 34302968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37684738 - 37684407
Alignment:
Q  44 tgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggaga 143  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  37684738 tgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtga 37684639  T
Q  144 agaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggag 243  Q
    |||| | || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || |  ||  |||| ||||||||| | |||    
T  37684638 agaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccagggtttgaccattgaaggtgcagag 37684539  T
Q  244 -ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 342  Q
     || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||| ||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  37684538 tctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcggagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 37684440  T
Q  343 gagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  37684439 gagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 37684407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37700003 - 37699672
Alignment:
Q  44 tgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggaga 143  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  37700003 tgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtga 37699904  T
Q  144 agaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggag 243  Q
    |||| | || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || |  ||  |||| ||||||||| | |||    
T  37699903 agaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccagggtttgaccattgaaggtgcagag 37699804  T
Q  244 -ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 342  Q
     || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||| ||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  37699803 tctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcggagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 37699705  T
Q  343 gagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  37699704 gagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 37699672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Original strand, 3785162 - 3785230
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  3785162 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 3785230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Original strand, 27119196 - 27119264
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  27119196 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 27119264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31891061 - 31890993
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  31891061 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 31890993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Original strand, 34157518 - 34157586
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  34157518 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 34157586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 11640236 - 11640117
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||  | || ||||| ||||||||  ||    
T  11640236 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccactttacatcagaagttgaagttcata 11640137  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttac 131  Q
    | |||||| |||||||||||    
T  11640136 aggaatggaaagcttgttac 11640117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 375
Target Start/End: Original strand, 37926992 - 37927113
Alignment:
Q  254 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 353  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  37926992 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 37927091  T
Q  354 caaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
     |||||||||||| | ||||||    
T  37927092 taaagaaggtctcgggttctcc 37927113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16625513 - 16625160
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16625513 atggacatcaatgcttcttatagctgtatcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 16625414  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16625413 agaatgggaagcttgttatagtccatggataagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 16625314  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  16625313 ctttcaaggtttgactattgaaggtacagagcctaagaaggctggggctgctgtggcttctttaaaagacgctcagaaggctgtccaagaaggacaggct 16625214  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16625213 gccggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 16625160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Original strand, 18531734 - 18532087
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18531734 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaa 18531833  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||    
T  18531834 agaatggaaagcttgttacaatccatggagaagagacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctaccgaaggaactgc 18531933  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18531934 ctttcaaggtttgactattgaaggtatggagcctaagaagactggggctgccatggcatctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 18532033  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532034 gccggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 18532087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20575760 - 20575397
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  20575760 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 20575661  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  20575660 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 20575561  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| |||||    
T  20575560 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 20575461  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  20575460 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 20575397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 8297318 - 8297680
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||    
T  8297318 atggacattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaa 8297417  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  8297418 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 8297517  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaaga-agactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  8297518 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagaga-tggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 8297616  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  8297617 tgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 8297680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 29663883 - 29663520
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  29663883 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 29663784  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||  ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  29663783 aggaatgaaaagcttgttaccgttcatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 29663684  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  29663683 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 29663584  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  29663583 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 29663520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 7074557 - 7074920
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  7074557 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 7074656  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  7074657 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagtcagctgtcgtctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 7074756  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  7074757 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 7074856  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  7074857 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 7074920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 375
Target Start/End: Original strand, 18052623 - 18052970
Alignment:
Q  28 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 127  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  18052623 tcttacagctgtctcctggggagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 18052722  T
Q  128 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 227  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  18052723 ttaccattcatggagaggaagcatatctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 18052822  T
Q  228 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 327  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  18052823 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaagatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 18052922  T
Q  328 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18052923 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 18052970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 18226536 - 18226899
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||    
T  18226536 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 18226635  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  18226636 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 18226735  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  18226736 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 18226835  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  18226836 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 18226899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28114867 - 28114504
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||      
T  28114867 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgag 28114768  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| ||||||||||| || ||||| |||||  |||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |  || |||||||| || ||||    
T  28114767 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaggcagggtctgctgaagggactg 28114668  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||| ||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  28114667 ctttccaaggtttgaccattgagggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 28114568  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  28114567 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 28114504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 365
Target Start/End: Original strand, 20067388 - 20067741
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  20067388 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 20067487  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |  | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  20067488 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 20067587  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  20067588 cttttcaaggtttaactctcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 20067687  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  20067688 tgccggccggggcaagttaatacagcttcgtgagaataagcataaggaaggtct 20067741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15891618 - 15891266
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  15891618 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 15891519  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  15891518 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatatctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 15891419  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  || |||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  15891418 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 15891319  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  15891318 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 15891266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 10397478 - 10397841
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||     
T  10397478 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 10397577  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  10397578 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 10397677  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||| | | ||||  |||||  ||||| |||||||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  10397678 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 10397777  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  10397778 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 10397841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22386490 - 22386128
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  22386490 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgatgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 22386391  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || ||||| || ||    
T  22386390 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgc 22386291  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| |||||||||||||| ||  | ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  22386290 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcgatggcttctttaaaggatacacagagagccgtccaagagggtcaagct 22386191  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  22386190 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 22386128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 5608235 - 5607881
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  5608235 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 5608136  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  5608135 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 5608036  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | ||| ||||| ||||||||| | ||| || |||||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  5608035 ctttccaaggtctgaccattgaaggtgcagagtctaaagaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 5607937  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  5607936 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 5607881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 335
Target Start/End: Original strand, 6193661 - 6193983
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  6193661 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttgggaagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 6193760  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  6193761 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcgtctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 6193860  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | |||   ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||  ||    
T  6193861 ttttcaaggattaactgccgaaggtacggagcccaagagggatggaactgctatggcttctttgaaggatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagct 6193960  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtaca 335  Q
    ||||||||||||| |||| ||||    
T  6193961 gccggctggggcaggttaataca 6193983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 11109262 - 11108908
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  11109262 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 11109163  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  11109162 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 11109063  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || |||||    
T  11109062 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagac 11108963  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  11108962 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 11108908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4345600 - 4345237
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    |||||||||||| || || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  4345600 gatggacatcaacgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 4345501  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    ||| |||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  4345500 aagcatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagttagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 4345401  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  | || ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  4345400 ctttccaaggtttaaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagacgctcagagagccatccaagaaggtcagac 4345301  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  4345300 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4345237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 5015057 - 5015420
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  5015057 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 5015156  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| | || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  5015157 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactg 5015256  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||    
T  5015257 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 5015356  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  5015357 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 5015420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 5595270 - 5594916
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  5595270 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccatggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 5595171  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  5595170 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 5595071  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  5595070 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 5594972  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  5594971 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 5594916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18291266 - 18290903
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  18291266 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 18291167  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |  | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  18291166 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 18291067  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | |||| |||  | ||| ||||||| ||||| |  ||||||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  18291066 cttttcaaggattaactgttgaaggaacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 18290967  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18290966 tgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 18290903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18306567 - 18306204
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  18306567 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 18306468  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |  | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  18306467 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 18306368  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | |||| |||  | ||| ||||||| ||||| |  ||||||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  18306367 cttttcaaggattaactgttgaaggaacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 18306268  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18306267 tgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 18306204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15740006 - 15739644
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||    
T  15740006 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttagggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaa 15739907  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  15739906 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 15739807  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||| | ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || ||  |||  || || ||||| || ||  ||    
T  15739806 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggaacccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcatagagagccgtccaagagggtcaagct 15739707  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  15739706 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 15739644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 29147667 - 29147305
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  29147667 atggacattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 29147568  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  29147567 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccaactatcatctttctcttgcatagaggcggggtctgcagaggggaccgc 29147468  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||  ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||   |    
T  29147467 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagtccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagtt 29147368  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  29147367 gccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 29147305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 35882112 - 35882474
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  35882112 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 35882211  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  35882212 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 35882311  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||| || || || || |  || || | ||| || ||  ||    
T  35882312 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacatagagccgtccgagagggtcaagct 35882411  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  35882412 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 35882474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Original strand, 4722977 - 4723329
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  4722977 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccgtggatacatgatgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 4723076  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||  ||||| || ||    
T  4723077 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgtagaggggaccgc 4723176  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  4723177 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 4723276  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  4723277 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 4723329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31963386 - 31963023
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  31963386 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31963287  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| |||||||    
T  31963286 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaaggaactg 31963187  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  31963186 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 31963088  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31963087 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31963023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 4418264 - 4418627
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||    
T  4418264 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 4418363  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | ||| || |||||||||||  | ||||| |||||  ||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  4418364 aggaagggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 4418463  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || |  ||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  4418464 ctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 4418563  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  4418564 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4418627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 327
Target Start/End: Original strand, 18244084 - 18244399
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  18244084 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 18244183  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  ||||||||||| || ||||    
T  18244184 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcaggatctgctgaagggactg 18244283  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  18244284 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 18244383  T
Q  312 tgccggctggggcaag 327  Q
    ||||||||||||||||    
T  18244384 tgccggctggggcaag 18244399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18275965 - 18275602
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  18275965 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 18275866  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |  | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  18275865 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 18275766  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | |||| |||  | ||| ||||||| ||||| |  ||||||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  18275765 cttttcaaggattaactgttgaaggaacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 18275666  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||| ||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18275665 tgccggctggagcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttagcttctcc 18275602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22869768 - 22869406
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |    
T  22869768 atggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 22869669  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || |||||    
T  22869668 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 22869569  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
     || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  22869568 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 22869470  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  22869469 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 22869406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22884827 - 22884465
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |    
T  22884827 atggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 22884728  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || |||||    
T  22884727 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 22884628  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
     || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  22884627 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 22884529  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  22884528 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 22884465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 366
Target Start/End: Original strand, 5468362 - 5468684
Alignment:
Q  44 tgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggaga 143  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  5468362 tgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtaaagaatggaaaactcgttacaatccatggtga 5468461  T
Q  144 agaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggag 243  Q
    |||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  ||||  |||||||| | |||    
T  5468462 agaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccgttgaaggtgcagag 5468561  T
Q  244 ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcg 343  Q
    |  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | |    
T  5468562 cctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaagatgatacagctctgtg 5468661  T
Q  344 agaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||| ||||  ||||||||||||    
T  5468662 agaacaagcgtaaagaaggtctc 5468684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8288383 - 8288021
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  8288383 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 8288284  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || ||||| || ||    
T  8288283 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtcggcggaggggaccgc 8288184  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  8288183 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 8288084  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    || |||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  8288083 gctggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 8288021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 365
Target Start/End: Original strand, 32440499 - 32440852
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  32440499 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgtggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 32440598  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |  | ||| |||||||||||  | |||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || || || ||||| || |    
T  32440599 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaagaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtcggcagaggggaccg 32440698  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  32440699 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 32440798  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  32440799 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 32440852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 48467272 - 48467535
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| |||||||||||     
T  48467272 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 48467371  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || || ||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  48467372 aagaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 48467471  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttcttt 275  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  48467472 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctgggactgctatggcttcttt 48467535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 10644415 - 10644778
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  10644415 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagatcgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 10644514  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  10644515 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 10644614  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || |  ||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  10644615 ctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 10644713  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  10644714 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 10644778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 17983869 - 17983506
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  17983869 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 17983770  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  17983769 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 17983670  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || |  ||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  17983669 ctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 17983571  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  17983570 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 17983506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 24329504 - 24329867
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  24329504 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 24329603  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  24329604 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 24329703  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  24329704 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 24329802  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  24329803 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 24329867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 51783368 - 51783731
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  51783368 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 51783467  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  51783468 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 51783567  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  51783568 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 51783666  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  51783667 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 51783731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4795550 - 4795303
Alignment:
Q  28 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 127  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  4795550 tcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcaggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 4795451  T
Q  128 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 227  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  4795450 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 4795351  T
Q  228 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttcttt 275  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| |||||||||||    
T  4795350 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttcttt 4795303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 375
Target Start/End: Original strand, 18331997 - 18332336
Alignment:
Q  36 ctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtc 135  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| || || ||  |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||||||  |     
T  18331997 ctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggaacagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccatt 18332096  T
Q  136 catggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaag 235  Q
    | |||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||| | ||||    
T  18332097 cgtggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaag 18332196  T
Q  236 gtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtaca 335  Q
    ||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||| ||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  18332197 gtacggagcccaagagggatggaactgcaatgacttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaataca 18332296  T
Q  336 actccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
     || |  ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18332297 gcttcttgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 18332336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 21676038 - 21676401
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| |||||||||||     
T  21676038 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 21676137  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| ||  | || ||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  21676138 aagaatggaaaaatcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 21676237  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||| | | ||||  |||||  ||||| |||||||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||  |    
T  21676238 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaggatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagc 21676337  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  21676338 tgccggttggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 21676401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 366
Target Start/End: Original strand, 8213083 - 8213437
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  8213083 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 8213182  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  8213183 acgaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 8213282  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| |||||| || | ||||  |||||  ||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||  |    
T  8213283 ctttccaaggtttgaccattgaaagtgcagagcctaagaaagctggagctgctatggcttctttgaaggatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagc 8213382  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  8213383 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 8213437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 6541375 - 6541012
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  6541375 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 6541276  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  6541275 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 6541176  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| |||||| || | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| | |||||  ||  | |||||||| ||||    
T  6541175 ctttccaaggtttgaccattgaaagtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgttcagagagccatccaagaaggtcaga 6541077  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  6541076 ctgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 6541012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 375
Target Start/End: Original strand, 7997938 - 7998270
Alignment:
Q  43 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 142  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  7997938 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 7998037  T
Q  143 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 242  Q
    ||||| | || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  7998038 aagaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgcgttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 7998137  T
Q  243 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 341  Q
    | || | |||| ||||| | ||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  7998138 gtctaaggaag-ctggggccgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 7998236  T
Q  342 cgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
     ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  7998237 tgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 7998270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 47024798 - 47025161
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || || || ||||| |||||     
T  47024798 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcaaaagttgaaatttgtg 47024897  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| |||||||    
T  47024898 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaaggaactg 47024997  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| |||||| || | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  47024998 ctttccaaggtttgaccattgaaagtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 47025096  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  47025097 ctgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 47025161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 326
Target Start/End: Original strand, 28022621 - 28022934
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |    
T  28022621 atggacattaatgcgtcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 28022720  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    ||||||| || || |||||| ||| ||| |||||| |||| || || |||||| |||| || ||||||||  |||| |  || |||||||| || |||||    
T  28022721 agaatggaaaactcgttacaatccgtggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtgttgaggcagggtctgctgaagggactgc 28022820  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
     || | |||  |||| ||||||| | | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || |||||    
T  28022821 tttccaaggtttgaccattgaagatgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagac 28022919  T
Q  312 tgccggctggggcaa 326  Q
     ||||||||||||||    
T  28022920 cgccggctggggcaa 28022934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Original strand, 5652860 - 5652928
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  5652860 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 5652928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Original strand, 4626417 - 4626485
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  4626417 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 4626485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Original strand, 5713700 - 5713768
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  5713700 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 5713768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Original strand, 5724610 - 5724678
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  5724610 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 5724678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 5767758 - 5767690
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  5767758 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 5767690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 17993569 - 17993501
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  17993569 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 17993501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Original strand, 20441462 - 20441575
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    |||||||||| | || || || |||||||| || ||  |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||     
T  20441462 gatggacatccaagcatcctacagctgtctactaggccgaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtg 20441561  T
Q  112 aagaatgggaagct 125  Q
    ||||||||||||||    
T  20441562 aagaatgggaagct 20441575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 375
Target Start/End: Original strand, 28340766 - 28340887
Alignment:
Q  254 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 353  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  28340766 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctgggggaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 28340865  T
Q  354 caaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
     |||||||||||| | ||||||    
T  28340866 taaagaaggtctcgggttctcc 28340887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36995871 - 36995750
Alignment:
Q  254 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 353  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  36995871 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 36995772  T
Q  354 caaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
     |||||||||||| | ||||||    
T  36995771 taaagaaggtctcgggttctcc 36995750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Original strand, 41438588 - 41438701
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    |||||||||| | || || || |||||||| || ||  |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||     
T  41438588 gatggacatccaagcatcctacagctgtctactaggccgaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtg 41438687  T
Q  112 aagaatgggaagct 125  Q
    ||||||||||||||    
T  41438688 aagaatgggaagct 41438701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 7090936 - 7090873
Alignment:
Q  49 agaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  7090936 agaccatggattcatgacgctggggcagtgacatctactctccatcagaaattgaagtttgtaa 7090873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Original strand, 22889863 - 22890216
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22889863 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggtgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaa 22889962  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| |    
T  22889963 agaatggaaagcttgttacaatccatggagaagaagcatatttggttagccagctatcgtctttctcctgcattgaagcaggatctgctgaaggaactac 22890062  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22890063 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaagct 22890162  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22890163 gtcggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 22890216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 17 - 366
Target Start/End: Original strand, 25200427 - 25200776
Alignment:
Q  17 acatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25200427 acatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaaagaa 25200526  T
Q  117 tgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25200527 tggaaagcttgttacagtccatggagaagaagcatatttggttagccagctatcgtctttctcctgcattgaagctggatctgctgaaggaactgccttt 25200626  T
Q  217 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 316  Q
    | |||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  25200627 caaggtttgactattgaaggtacggaacctaagaagactgggactgctatggcttcttttaaagacgctcagaaggctattcaggaaggacaggctgccg 25200726  T
Q  317 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25200727 gctggggcaagttaatccaactccgtgagaataagcacaaggaaggtctc 25200776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 121 - 366
Target Start/End: Original strand, 25264686 - 25264931
Alignment:
Q  121 aagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgag 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  25264686 aagcttgttacagtccatggagaagaagcatatttggttagccagctatcgtctttctcctgcattgaagctggatctgctgaaggaactgcctttcaag 25264785  T
Q  221 gcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctg 320  Q
    |  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  25264786 gtttgactattgaaggtacggaacctaagaagactgggactgctatggcttcttttaaagacgctcagaaggctattcaggaaggacaggctgccggctg 25264885  T
Q  321 gggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25264886 gggcaagttaatccaactccgtgagaataagcacaaggaaggtctc 25264931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Original strand, 23893600 - 23893952
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  23893600 atggacatcaatgcctcttatagctgtctcttaggaagaccgtggatacatgacgctggggcggtgacctctaccctgcaccagaagttaaagtttgcaa 23893699  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    ||| ||| ||||| |||||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| || ||||| ||    
T  23893700 agagtggaaagctcgttacaattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaaggaaccgc 23893799  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||| | |  | |  |||||||||||||||| || || || || | ||| || |||||||| ||  |     
T  23893800 ttttcaaggtttaactgtcgaaggtacggagcccaaaagggattgagctgctatggcttctttgaaggatgcacatagggccgtccaagaaggtcaagcc 23893899  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  23893900 gccggctggggcagattaatacaactccgtgagaacaagcataaggaaggtct 23893952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15657529 - 15657176
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  15657529 gatggacattaatgcatcttacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 15657430  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |  | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  15657429 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 15657330  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  15657329 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 15657230  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  15657229 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaataagcataaggaaggtct 15657176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 9318844 - 9319207
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| || |||    
T  9318844 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgta 9318943  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | ||| || |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  9318944 aggaagggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 9319043  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  9319044 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 9319143  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  9319144 tgccggttggggcaaggtggtacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 9319207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40472318 - 40471955
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  40472318 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 40472219  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | ||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  40472218 aggaacggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 40472119  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| | ||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  40472118 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggccgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 40472019  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  40472018 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 40471955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 365
Target Start/End: Original strand, 41676102 - 41676455
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  41676102 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 41676201  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  41676202 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaagaagcatacttggtcagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 41676301  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | |||| |||  | ||| ||||| ||||||||  ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  41676302 cttttcaaggattaactgttgaatgtacggagtccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 41676401  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  41676402 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 41676455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 12133548 - 12133911
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| || |||    
T  12133548 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgta 12133647  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | ||| || |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  12133648 aggaagggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 12133747  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  12133748 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 12133847  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  12133848 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 12133911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 26481784 - 26482147
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||    
T  26481784 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 26481883  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || || |||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  26481884 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26481983  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  26481984 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcttaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 26482083  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  26482084 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 26482147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Original strand, 11550748 - 11551100
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||| ||    
T  11550748 atggatattaatgcctcttacagctgtctcgtggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaagtttgcaa 11550847  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  11550848 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 11550947  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  11550948 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcctctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 11551047  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  11551048 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 11551100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Original strand, 30936027 - 30936379
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  30936027 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 30936126  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  30936127 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 30936226  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  30936227 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 30936326  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  30936327 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 30936379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Original strand, 33517749 - 33518101
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||    
T  33517749 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 33517848  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  33517849 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 33517948  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  33517949 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 33518048  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtc 364  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||    
T  33518049 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtc 33518101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 3790934 - 3791297
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  3790934 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 3791033  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  3791034 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 3791133  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||| ||| | ||||  |||||  |||||  ||||||| |||| || ||||| |||| ||||| | | || ||||| |||||    
T  3791134 ctttccaaggtttgaccattgagggtgcagagcctaagaaagctggggttgctatgacttcattgaaagatgctcggaaggttatccaggaaggtcagac 3791233  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  3791234 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 3791297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 28650628 - 28650991
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  28650628 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtcacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 28650727  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || || |    
T  28650728 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagttagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 28650827  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  28650828 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagccaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 28650927  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  28650928 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 28650991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 43079645 - 43080008
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  43079645 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtcacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 43079744  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || || |    
T  43079745 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagttagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 43079844  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  43079845 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagccaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 43079944  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  43079945 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 43080008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 33778881 - 33779243
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  33778881 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 33778980  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  33778981 aaagtggaaagcttgttactattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcgtctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 33779080  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  33779081 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 33779180  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  33779181 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 33779243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 365
Target Start/End: Original strand, 33293918 - 33294271
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||| | ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  33293918 gatggacgttaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 33294017  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  33294018 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 33294117  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  33294118 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 33294217  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  33294218 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 33294271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24686925 - 24686573
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  24686925 atggatattaatgcctcttacagctgtctcctggggagaccatggatacataacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24686826  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  || ||||| ||||| || ||    
T  24686825 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatataagcagggtctgcagaggggaccgc 24686726  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||| | ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  24686725 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggaacccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaagatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 24686626  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    | |||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  24686625 gtcggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 24686573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Original strand, 24971412 - 24971764
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  24971412 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24971511  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  24971512 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttttcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 24971611  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  24971612 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 24971711  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  24971712 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 24971764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 24682833 - 24683196
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  24682833 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 24682932  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  24682933 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 24683032  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  24683033 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 24683132  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  24683133 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 24683196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 24725360 - 24725723
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  24725360 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 24725459  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  24725460 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 24725559  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  24725560 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 24725659  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  24725660 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 24725723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23751218 - 23750856
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  23751218 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 23751119  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  23751118 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 23751019  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  23751018 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 23750919  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  23750918 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 23750856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15757626 - 15757263
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  15757626 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 15757527  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| |||||||    
T  15757526 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaaggaactg 15757427  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  15757426 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 15757328  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  15757327 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 15757263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18499499 - 18499136
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  18499499 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagttcata 18499400  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  18499399 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 18499300  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||| | | ||||  |||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || ||  |    
T  18499299 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaagatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagc 18499200  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  18499199 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 18499136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22997882 - 22997520
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  22997882 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 22997783  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  22997782 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 22997683  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | |||   ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  22997682 ttttcaaggattaactgccgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcctctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 22997583  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  22997582 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 22997520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23716756 - 23716394
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||    
T  23716756 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaa 23716657  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  23716656 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 23716557  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  |  || | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  23716556 ttttcaaggattagctgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 23716457  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  23716456 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 23716394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8664244 - 8663881
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  8664244 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 8664145  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  8664144 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 8664045  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | ||||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  8664044 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ttggggctgctatggcttcattaaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 8663946  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  8663945 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgcgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 8663881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13323598 - 13323235
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||| |     
T  13323598 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttatg 13323499  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  13323498 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 13323399  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  13323398 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 13323300  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  13323299 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 13323235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28958555 - 28958192
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  28958555 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 28958456  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || ||||||||  |||| |  || |||||||| || ||||    
T  28958455 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtgttgaggcagggtctgctgaagggactg 28958356  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||| | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  28958355 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 28958256  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  28958255 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 28958192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 30169862 - 30170225
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  30169862 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 30169961  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  30169962 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 30170061  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||    
T  30170062 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 30170161  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  30170162 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgcaaagaaggtctcgggttctcc 30170225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37357412 - 37357049
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  37357412 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 37357313  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  37357312 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 37357213  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  37357212 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 37357113  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  37357112 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 37357049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 37670252 - 37669937
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  37670252 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 37670153  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  37670152 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 37670053  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  37670052 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 37669953  T
Q  312 tgccggctggggcaag 327  Q
    ||||||||||||||||    
T  37669952 tgccggctggggcaag 37669937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 30030808 - 30031171
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  30030808 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 30030907  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  30030908 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 30031007  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  30031008 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattaaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 30031106  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  30031107 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 30031171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 30153411 - 30153774
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  30153411 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 30153510  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  30153511 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 30153610  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  30153611 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 30153709  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  30153710 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 30153774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 37756373 - 37756736
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  37756373 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 37756472  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  37756473 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 37756572  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  37756573 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 37756672  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  37756673 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 37756736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18126164 - 18125811
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  18126164 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 18126065  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||| ||||  ||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| || |  || || || ||||| || |    
T  18126064 aggaatggaaagcttgttaccattcatggaaaagaggcatacctggtcagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtcggcagaggggaccg 18125965  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | ||||  ||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| || || ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  18125964 cttttcagggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaaccgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 18125865  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  18125864 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 18125811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 6875698 - 6876061
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  6875698 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 6875797  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||| |||| || ||||    
T  6875798 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctactgaagggactg 6875897  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  6875898 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 6875996  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  6875997 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 6876061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31825176 - 31824813
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  31825176 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31825077  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  31825076 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 31824977  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  31824976 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 31824878  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31824877 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31824813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 34617911 - 34618274
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  34617911 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 34618010  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  34618011 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 34618110  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  34618111 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 34618209  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  34618210 ctgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 34618274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 31432834 - 31433196
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    |||||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |    
T  31432834 atggacattaatgcatcctacagttgcctgctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 31432933  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| | || ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || |||||    
T  31432934 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttatcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 31433033  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
     || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  31433034 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 31433132  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31433133 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31433196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 37769725 - 37769441
Alignment:
Q  43 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 142  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  37769725 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 37769626  T
Q  143 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 242  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  37769625 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 37769526  T
Q  243 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 327  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||| ||  ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37769525 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcggagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaag 37769441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 2512444 - 2512807
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  2512444 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 2512543  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| || | || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||| |||| || ||||    
T  2512544 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcacacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctactgaagggactg 2512643  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  | || ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  2512644 ctttccaaggtttaaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 2512742  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  2512743 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 2512807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13440135 - 13440067
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  13440135 caagaaggacaagctgccggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 13440067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18374062 - 18373941
Alignment:
Q  254 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 353  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  18374062 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 18373963  T
Q  354 caaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
     |||||||||||| | ||||||    
T  18373962 taaagaaggtctcgggttctcc 18373941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 9548184 - 9548116
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  9548184 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 9548116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Original strand, 11326315 - 11326383
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  11326315 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 11326383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13184290 - 13184222
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  13184290 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 13184222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 375
Target Start/End: Original strand, 5639422 - 5639543
Alignment:
Q  254 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 353  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  5639422 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 5639521  T
Q  354 caaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
     |||||||||||| | ||||||    
T  5639522 taaagaaggtctcgggttctcc 5639543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 32594801 - 32594689
Alignment:
Q  254 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 353  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  32594801 ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 32594702  T
Q  354 caaagaaggtctc 366  Q
     ||||||||||||    
T  32594701 taaagaaggtctc 32594689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 50 - 125
Target Start/End: Original strand, 34467047 - 34467122
Alignment:
Q  50 gaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 125  Q
    |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  34467047 gaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtgaagaatgggaagct 34467122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 20390507 - 20390438
Alignment:
Q  296 ttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||||||||||| |  |||  |||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||    
T  20390507 ttcaagaaggaaaagctgaaggctgggggaagttagtacagctgcccgagaacaagcacaaagaaggtct 20390438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Original strand, 16042709 - 16043062
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16042709 atggacatcaacgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcaataacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtga 16042808  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16042809 agaatggaaagctcgttacggtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 16042908  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  16042909 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagcctaagaagactggggctactatggcttcttttaaagatgctcagaaggttgttcaagaaggacaggct 16043008  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16043009 gccggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 16043062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16448755 - 16448402
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16448755 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaa 16448656  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | |||| |    
T  16448655 agaatggaaagcttgttacggtccatggagaagaagcatatttggttagccagctgtcatctttctctagcattgaatctggatctgctgaagaaactac 16448556  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
    ||| | |||  |||||||||||||||| ||||  |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16448555 cttccaaggtttgactattgaaggtacagagcctaagaaagctggggctgctatggtttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 16448456  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16448455 gccggctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaagaaggtctc 16448402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5146098 - 5145735
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  5146098 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 5145999  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| || || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  5145998 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 5145899  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||| ||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  5145898 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctttggcttcgttgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 5145799  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  5145798 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 5145735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 5129378 - 5129740
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||    
T  5129378 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaa 5129477  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  5129478 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 5129577  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  5129578 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 5129677  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  5129678 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 5129740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26318627 - 26318264
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || |||||||||||| | || ||||| ||||| || |||    
T  26318627 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgacgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgta 26318528  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | ||| || |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  26318527 aggaagggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26318428  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  26318427 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 26318328  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  26318327 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcggtttctcc 26318264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 26536628 - 26536274
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  26536628 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggttacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 26536529  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  26536528 aagaatggaaaactcgttacaatccatggcgaagaagcatacttagtcagccagctgtcgtccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26536429  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || |||||    
T  26536428 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagac 26536329  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  26536328 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 26536274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Original strand, 5160905 - 5161257
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  5160905 atggatattaatgcctcttacagctgtctcctggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 5161004  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  || |||||||||| ||||||||||||||||| | ||  || ||||| ||||| || ||    
T  5161005 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctgattagccagctatcatctttctcttgcatagtagcagggtctgcagaggggaccgc 5161104  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  ||||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  ||  | ||||| || ||  ||    
T  5161105 ttttcaaggattgactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccatccaagagggccaagct 5161204  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  5161205 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 5161257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 327
Target Start/End: Original strand, 26436642 - 26436957
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| |||||||||||     
T  26436642 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 26436741  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || || ||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  26436742 aagaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26436841  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  26436842 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 26436941  T
Q  312 tgccggctggggcaag 327  Q
    |||||| |||||||||    
T  26436942 tgccggttggggcaag 26436957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10915625 - 10915263
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||    
T  10915625 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaa 10915526  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | |  || |||||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  10915525 aaagcggaaagcttgttacaattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcaggttctgcagaggggaccgc 10915426  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  10915425 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 10915326  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||  ||| |||| || || ||||| ||| | || ||||||||  ||||||||    
T  10915325 gccggctggggcagattaatacagcttcgtgagaacaagtataaggaaggtcttggcttctcc 10915263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16502143 - 16501796
Alignment:
Q  28 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 127  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || |  || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  16502143 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggtggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 16502044  T
Q  128 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 227  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  16502043 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 16501944  T
Q  228 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 327  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  16501943 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 16501844  T
Q  328 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  16501843 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 16501796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 26514166 - 26514529
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  26514166 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 26514265  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  26514266 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26514365  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  26514366 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 26514465  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  26514466 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 26514529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 31126305 - 31126668
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||| |     
T  31126305 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttatg 31126404  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  31126405 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 31126504  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  31126505 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 31126604  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31126605 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31126668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11423534 - 11423172
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  11423534 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 11423435  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  11423434 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 11423335  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||| ||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |     
T  11423334 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacgaagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagcc 11423235  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    || |||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  11423234 gctggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 11423172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31563148 - 31562785
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  31563148 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31563049  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  31563048 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 31562949  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  31562948 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 31562849  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31562848 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31562785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Original strand, 2155959 - 2156311
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  2155959 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 2156058  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  2156059 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggtagggtctgcagaggggaccgc 2156158  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||| |  |||| |  ||| ||||  ||||||||||| || || || ||||  || |||||||| || ||  ||    
T  2156159 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggaacctaagagggatggaactgacatggcttctttgaaggatgcacagagagccgttcaagagggtcaagct 2156258  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| || || || ||||||||    
T  2156259 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaaacataaggaaggtct 2156311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 3446691 - 3447054
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  3446691 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 3446790  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  3446791 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 3446890  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  3446891 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 3446989  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  3446990 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 3447054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 9620036 - 9620399
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  9620036 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 9620135  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  9620136 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 9620235  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  9620236 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 9620334  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  9620335 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 9620399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16517179 - 16516832
Alignment:
Q  28 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 127  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || |  || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  16517179 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggtggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 16517080  T
Q  128 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 227  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  16517079 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 16516980  T
Q  228 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 327  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||| ||||||||| |    
T  16516979 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccagctggggcagg 16516880  T
Q  328 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||| || | || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  16516879 ttaataaagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 16516832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 11442264 - 11442627
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  11442264 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 11442363  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  11442364 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 11442463  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| | ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  11442464 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ccggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 11442562  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  11442563 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 11442627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26273852 - 26273489
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  26273852 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 26273753  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  26273752 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26273653  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  26273652 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 26273554  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  26273553 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 26273489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16735218 - 16734855
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  16735218 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 16735119  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||  ||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  16735118 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16735019  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  16735018 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 16734919  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16734918 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16734855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16750272 - 16749909
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  16750272 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 16750173  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||  ||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  16750172 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16750073  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  16750072 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 16749973  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16749972 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16749909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 17524917 - 17525280
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  17524917 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 17525016  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||  ||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  17525017 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 17525116  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  17525117 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 17525216  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  17525217 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 17525280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 17528298 - 17527935
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  17528298 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 17528199  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||  ||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  17528198 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 17528099  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  17528098 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 17527999  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  17527998 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 17527935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24591299 - 24590936
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  24591299 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 24591200  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  24591199 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 24591100  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  24591099 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 24591000  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
     ||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  24590999 cgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 24590936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26668640 - 26668309
Alignment:
Q  44 tgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggaga 143  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  26668640 tgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaaaaatggaaaactcgttacaatccatggtga 26668541  T
Q  144 agaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggag 243  Q
    |||| | || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || |  ||  |||| ||||||||| | |||    
T  26668540 agaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccagggtttgaccattgaaggtgcagag 26668441  T
Q  244 -ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 342  Q
     || | |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |||| ||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  26668440 tctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattaaaggatgctcggagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 26668342  T
Q  343 gagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  26668341 gagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 26668309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2108635 - 2108567
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  2108635 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 2108567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 375
Target Start/End: Original strand, 45388789 - 45388968
Alignment:
Q  196 tctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctg 295  Q
    ||||||||||||||||| || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||      
T  45388789 tctgctgagggaactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagcca 45388888  T
Q  296 ttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  45388889 ttcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 45388968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Original strand, 45733973 - 45734041
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  45733973 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 45734041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 119
Target Start/End: Original strand, 18542184 - 18542291
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  18542184 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 18542283  T
Q  112 aagaatgg 119  Q
    ||||||||    
T  18542284 aagaatgg 18542291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Original strand, 4201060 - 4201137
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  4201060 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4201137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31088094 - 31088033
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaaga 359  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||    
T  31088094 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaaga 31088033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 50 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 800234 - 800159
Alignment:
Q  50 gaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 125  Q
    |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  800234 gaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtgaagaatgggaagct 800159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4143762 - 4143641
Alignment:
Q  254 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 353  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  4143762 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 4143663  T
Q  354 caaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
     |||||||||||| | ||||||    
T  4143662 taaagaaggtctcgggttctcc 4143641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16206902 - 16206549
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16206902 atggacatcaatgcctattatagctgtctcttgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtga 16206803  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  16206802 agaatggaaagcttgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagccggatctgctgaaggaactgc 16206703  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16206702 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagctcaaaaagactggggctactatggcttcttttaaagacgctcagaaggctgttcaggaaggacaggct 16206603  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  16206602 gccggctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcataaggaaggtctc 16206549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Original strand, 20462469 - 20462655
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20462469 atggatatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccaacaattgaagtttgtaa 20462568  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20462569 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctg 20462655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 10964053 - 10964416
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  10964053 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 10964152  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  10964153 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 10964252  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  10964253 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 10964351  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  10964352 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 10964416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 51639601 - 51639964
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||  | || ||||| ||||| |||||     
T  51639601 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtg 51639700  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  51639701 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 51639800  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  51639801 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 51639899  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  51639900 ctgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 51639964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 28586364 - 28586727
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  28586364 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 28586463  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| | || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  28586464 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactg 28586563  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||    
T  28586564 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 28586663  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  28586664 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 28586727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41792180 - 41791817
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  41792180 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 41792081  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||| |||| || ||||    
T  41792080 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctactgaagggactg 41791981  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  41791980 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 41791882  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  41791881 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 41791817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 10946462 - 10946825
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  10946462 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 10946561  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| | || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  10946562 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 10946661  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || |  ||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||| ||  ||  | |||||||| ||||    
T  10946662 ctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcggagagccatccaagaaggtcaga 10946760  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  10946761 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 10946825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 304 - 375
Target Start/End: Original strand, 20462656 - 20462727
Alignment:
Q  304 ggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20462656 ggacaggctgccggatggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctcgggttctcc 20462727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22079732 - 22079379
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  22079732 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctaggaagaccgtggatacatgacgctggggcagtgacctctaccctgcaccaaaagttaaagtttgtaa 22079633  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| || ||||| ||    
T  22079632 agaatggaaagctcgttacagtccatggagaggaggcatatttggttagccagctatcatctttctcttgcattgaagcagggtctgcagaaggaaccgc 22079533  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     ||||  ||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||  |||||||||| ||||| || || ||||||| |||||| | |||||| ||  ||    
T  22079532 ttttcagggtttgactatcgaaggtacggagcccaagagggctggagctgctatggcctctttgaaggatgctcagagggctgtcctagaaggtcaagct 22079433  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  22079432 accggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacagagagggtctc 22079379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Original strand, 16284834 - 16285186
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  16284834 atggatatcaatgcctcttatatctgtctcttgggaagaccgtggatacatgacgctggggcggtgacctctaccttgcaccagaagttgaagtttgcaa 16284933  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | |  || |||||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| |||||||| ||    
T  16284934 aaagcggaaagcttgttacaattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagagggaaccgc 16285033  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||| | |  ||| ||||||||||||||||| || || || ||||  || ||  ||||||| ||  ||    
T  16285034 ttttcaaggtttaactgtcgaaggtacggagcccaaaagggatggaactgctatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtctaagaaggtcaagct 16285133  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  16285134 gccggctggggcaggttaatacaacttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 16285186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27607735 - 27607373
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  | ||||| || ||||| |||| ||    
T  27607735 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttacaccaaaagttgaaatttgcaa 27607636  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | ||||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  27607635 aaaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 27607536  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| ||| || ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  27607535 ttttcaaggactaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 27607436  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  27607435 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 27607373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 18792092 - 18792454
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  18792092 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 18792191  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  18792192 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 18792291  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  18792292 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 18792391  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  18792392 gccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 18792454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 19675825 - 19676188
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| |||||||| || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  19675825 gatggacattaatgcctcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgctggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 19675924  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  19675925 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagtagggtctgctgaagggactg 19676024  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  19676025 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 19676124  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  19676125 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 19676188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19207190 - 19206828
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |    
T  19207190 atggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 19207091  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| |||||  |||| || || |||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || |||||    
T  19207090 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacttagtcagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 19206991  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     || | |||  |||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||    
T  19206990 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcttaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagact 19206891  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  19206890 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 19206828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 375
Target Start/End: Original strand, 19689498 - 19689845
Alignment:
Q  28 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 127  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  19689498 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 19689597  T
Q  128 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 227  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  19689598 ttaccattcatggagaggaagcatatctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 19689697  T
Q  228 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 327  Q
    | | ||||||||||| |  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  19689698 tgtcgaaggtacggaacctaagagggatggaactgcgatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 19689797  T
Q  328 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  19689798 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 19689845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 9356007 - 9356370
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||||    
T  9356007 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgta 9356106  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  9356107 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 9356206  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  9356207 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 9356305  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  9356306 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 9356370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3328338 - 3327975
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  3328338 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 3328239  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  3328238 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 3328139  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  3328138 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 3328039  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  3328038 tgccggctggggcaagatgatacaactctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 3327975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 14559009 - 14559371
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||  |    
T  14559009 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcca 14559108  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | |  || |||||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  14559109 aaagcggaaagcttgttacaattcatggagaggaagcatacctggttaaccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 14559208  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |   || ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  14559209 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggagggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 14559308  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||| | || ||||||||  ||||||||    
T  14559309 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagtataaggaaggtcttagcttctcc 14559371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2136089 - 2135727
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  2136089 atggatattaatgcctcttacagttgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 2135990  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  2135989 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacccggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 2135890  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  2135889 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 2135790  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  2135789 gccggttggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 2135727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Original strand, 16278939 - 16279290
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  16278939 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 16279038  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |     
T  16279039 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg- 16279137  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaaga-agactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    ||||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  16279138 ctttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagaga-tggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 16279236  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    |||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  16279237 tgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 16279290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 29830707 - 29831069
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |    
T  29830707 atggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 29830806  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||  ||||||| || |||||    
T  29830807 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggcctgctgaagggactgc 29830906  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
     || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  29830907 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 29831005  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  29831006 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 29831069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12091555 - 12091240
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  12091555 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 12091456  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  12091455 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 12091356  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  12091355 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 12091256  T
Q  312 tgccggctggggcaag 327  Q
    | ||||||||||||||    
T  12091255 taccggctggggcaag 12091240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 31355909 - 31356272
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  31355909 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31356008  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  31356009 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 31356108  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  31356109 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 31356207  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31356208 ctgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31356272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 33260107 - 33260470
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  33260107 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 33260206  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| | || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  33260207 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactg 33260306  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  | || ||||||||| | ||||  |||||  ||||| |||||||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  33260307 ctttccaaggtttaaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 33260406  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  33260407 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 33260470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28360786 - 28360471
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  28360786 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 28360687  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  28360686 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 28360587  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacgga-gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | || ||| | |||| ||||| | ||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  28360586 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagaggctaaggaag-ctggggccgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 28360488  T
Q  311 ctgccggctggggcaag 327  Q
    |||||||||||||||||    
T  28360487 ctgccggctggggcaag 28360471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Original strand, 33245177 - 33245245
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  33245177 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 33245245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31488520 - 31488341
Alignment:
Q  196 tctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctg 295  Q
    ||||||||||||||||| || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||      
T  31488520 tctgctgagggaactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagcca 31488421  T
Q  296 ttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31488420 ttcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 31488341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19658743 - 19658675
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  19658743 caagaaggacaagctgctggctggggcaagataatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 19658675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 17091260 - 17090907
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  17091260 atggatatcaacgcttcttatagctgtcttctgggaaggccgtggatacatgacgcgggcgcagtaacctccaccctgcaccagaagttaaagtttgtga 17091161  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
     |||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  ||||||||||| || |||||    
T  17091160 ggaatggaaagctcgtcacagtccatggtgaagaagcatacttagttagccaactgtcatccttctcctgtattgaagcaggatctgctgaagggactgc 17091061  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  |||| |||||||||||||||| |||||||  | || |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17091060 ttttcaaggattgaccattgaaggtacggagcccaagaaggttagggctgctatggcttctttgaaggacgctcagaaggctattcaagaaggacaggct 17090961  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    ||||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||| |||||||||||||||    
T  17090960 gccggttggggtaagttgatacaactctatgagaataaacacaaagaaggtctc 17090907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 27628520 - 27628206
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| ||| ||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| |    
T  27628520 atggatattaatgcttcatacagctgcctcttgggaaggccttggatacatgacgcgggcgcggtaacctccaccttgcatcagaagttaaagtttgtga 27628421  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || |||||    
T  27628420 agaatggaaaactcgttacagtccatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 27628321  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     || | |||  |||| ||||||||  ||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | |||||||||| ||||||    
T  27628320 tttccaaggtttgaccattgaaggcgcggagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaagaaggtcagact 27628221  T
Q  313 gccggctggggcaag 327  Q
    |||||||||||||||    
T  27628220 gccggctggggcaag 27628206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 16675520 - 16675883
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  16675520 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 16675619  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  16675620 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16675719  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  16675720 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 16675819  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16675820 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16675883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 29550856 - 29551219
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  29550856 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccatggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 29550955  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  29550956 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 29551055  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  29551056 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 29551155  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  29551156 tgccggctggggcaagttagtacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 29551219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 366
Target Start/End: Original strand, 3697462 - 3697816
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | |||||||| ||||| |||||     
T  3697462 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacaccagaagttgaaatttgtg 3697561  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || || ||| ||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  3697562 aagaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 3697661  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  3697662 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 3697761  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  3697762 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 3697816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26776425 - 26776062
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| || |||    
T  26776425 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgta 26776326  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    | |||||  ||||| |||||  | ||||| |||||  |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  26776325 aggaatgaaaagctcgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26776226  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  26776225 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcttaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 26776126  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  26776125 tgccggatggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 26776062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24303432 - 24303070
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  24303432 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24303333  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  24303332 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 24303233  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || ||  |||  || || ||||| || ||  ||    
T  24303232 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcatagagagccgtccaagagggtcaagct 24303133  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  24303132 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 24303070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22933694 - 22933342
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | ||||| || ||||| |||| ||    
T  22933694 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttacaccaaaagttgaaatttgcaa 22933595  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||| |||||| || ||    
T  22933594 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgttgaggggaccgc 22933495  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  22933494 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 22933395  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  22933394 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 22933342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23856139 - 23855787
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | ||||| || ||||| |||| ||    
T  23856139 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttacaccaaaagttgaaatttgcaa 23856040  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||| |||||| || ||    
T  23856039 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgttgaggggaccgc 23855940  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  23855939 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 23855840  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  23855839 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 23855787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15423131 - 15422779
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  15423131 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcaggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 15423032  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  15423031 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 15422932  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||| || || ||  |||  || || ||||| || ||  ||    
T  15422931 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcatagagagccgtccaagagggtcaagct 15422832  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  15422831 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 15422779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27271394 - 27271078
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || |||||||| || || || ||| ||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |    
T  27271394 atggatattaatgcttcatacagttgcctcttgggaaggccttggatacatgacgcgggcgcggtaacctccaccttgcatcagaaattaaagtttgtga 27271295  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    ||||||| || || || ||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || |||||    
T  27271294 agaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 27271195  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     || |  ||  |||| |||||||||   ||||  |||| |  |||  |||| |||||||| |||||||| ||||||| || | |||| ||||| ||||||    
T  27271194 tttccagggtttgaccattgaaggtgtagagcctaagagggatggagctgccatggcttcattaaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 27271095  T
Q  313 gccggctggggcaagtt 329  Q
    ||||| |||||||||||    
T  27271094 gccggttggggcaagtt 27271078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 29502796 - 29503159
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  29502796 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccatggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 29502895  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  29502896 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 29502995  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  29502996 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 29503094  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  29503095 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 29503159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 27020520 - 27020883
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  27020520 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 27020619  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  27020620 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 27020719  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||| || | || |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  27020720 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaggagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 27020819  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  27020820 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 27020883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 27045769 - 27046132
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  27045769 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 27045868  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  27045869 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27045968  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||| | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| |||||    
T  27045969 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 27046068  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27046069 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27046132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Original strand, 20162073 - 20162179
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  20162073 atggatatcaatgcttcgtatagctgtctcctgggaagaccttggatacatgacgctggcgcggtaacctctaccctacaccagaagttgaaatttgtga 20162172  T
Q  113 agaatgg 119  Q
    |||||||    
T  20162173 agaatgg 20162179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 22170758 - 22170652
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  22170758 atggatatcaatgcttcgtatagctgtctcctgggaagaccttggatacatgacgctggcgcggtaacctctaccctacaccagaagttgaaatttgtga 22170659  T
Q  113 agaatgg 119  Q
    |||||||    
T  22170658 agaatgg 22170652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 24865099 - 24865461
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  24865099 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24865198  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  24865199 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagccgggtctgcagaggggaccgc 24865298  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||| |||||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  24865299 ttttcaaggattaactgtcgaaggaacggagcctaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 24865398  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    | ||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  24865399 gtcggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 24865461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13297765 - 13297413
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  | ||  | ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  13297765 atggacattaacgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgagagcgatgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 13297666  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || ||||| || ||    
T  13297665 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgc 13297566  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || |||||||| || ||  ||    
T  13297565 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgttcaagagggtcaagct 13297466  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || |||||||| ||||| || ||||||||    
T  13297465 gccggctggggcaggttaatacagcttcgcgagaacaagcataaggaaggtct 13297413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Original strand, 26919762 - 26920114
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||| |||| | |||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  26919762 atggatattaatgcctcttacagttgcctcttggggaaaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 26919861  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | ||||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  26919862 aaaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagtcagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 26919961  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  26919962 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 26920061  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  26920062 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 26920114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 16751236 - 16751598
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  16751236 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 16751335  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  16751336 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 16751435  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||| ||| |  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  ||||| ||||| || ||  ||    
T  16751436 ttttcaaggattaactgtcgaaggtatggaacctaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagctgtccaagagggtcaagct 16751535  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||    
T  16751536 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtcttggcttctcc 16751598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27289184 - 27288822
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  27289184 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 27289085  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||  || ||||| |||||||| ||    
T  27289084 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccaactatcatctttctcctgcatagaagcagggtctgcagagggaaccgc 27288985  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||| ||||  || | |  |||  |||| ||||||||||| ||||| || ||||  || || ||||| || ||||||    
T  27288984 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacagagcctaaaagggatggagctgccatggcttctttgaaagatgcgcagagagccgtccaagagggtcagact 27288885  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    || || ||||||||| |  |||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27288884 gctgggtggggcaaggtgatacagctccgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27288822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 191 - 375
Target Start/End: Original strand, 20162176 - 20162360
Alignment:
Q  191 atggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||  || |||| |||||| | |||| |||||||  |||  |||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  20162176 atggatctgctgagggaactgcttttcaagggttgtctatggaaggtgcagagcccaagaaggttggagctgcaatggcttctttgaaggacgcccagaa 20162275  T
Q  291 ggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||| | ||||||||||  || ||||||||| | ||||||    
T  20162276 ggctgttcaggagggacaggctgccgactggggcaagttaatccaactctgtgagaataagcgaaaggaaggtctcagattctcc 20162360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 191 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22170655 - 22170471
Alignment:
Q  191 atggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||  || |||| |||||| | |||| |||||||  |||  |||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  22170655 atggatctgctgagggaactgcttttcaagggttgtctatggaaggtgcagagcccaagaaggttggagctgcaatggcttctttgaaggacgcccagaa 22170556  T
Q  291 ggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||| | ||||||||||  || ||||||||| | ||||||    
T  22170555 ggctgttcaggagggacaggctgccgactggggcaagttaatccaactctgtgagaataagcgaaaggaaggtctcagattctcc 22170471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 26115225 - 26114910
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  26115225 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 26115126  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || |||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||    
T  26115125 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcaggatctgctgaagggactg 26115026  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  26115025 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 26114927  T
Q  311 ctgccggctggggcaag 327  Q
    |||||||||||||||||    
T  26114926 ctgccggctggggcaag 26114910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 27009111 - 27009474
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||| |     
T  27009111 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttatg 27009210  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  27009211 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27009310  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  27009311 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 27009409  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27009410 ctgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 27009474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30556831 - 30556468
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  30556831 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 30556732  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || || |    
T  30556731 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 30556632  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  30556631 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 30556533  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  30556532 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 30556468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 4759145 - 4759508
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||| ||||| |||||     
T  4759145 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtg 4759244  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  4759245 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 4759344  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  4759345 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 4759444  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  4759445 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4759508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 327
Target Start/End: Original strand, 27486510 - 27486825
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  27486510 gatggacattaatgcatcctacagttgcctactgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 27486609  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  |||||||| || || ||||    
T  27486610 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcaggatctgccgaagggactg 27486709  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  27486710 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 27486809  T
Q  312 tgccggctggggcaag 327  Q
    ||||||||||||||||    
T  27486810 tgccggctggggcaag 27486825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 327
Target Start/End: Original strand, 28208835 - 28209150
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  28208835 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 28208934  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  28208935 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 28209034  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  28209035 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 28209134  T
Q  312 tgccggctggggcaag 327  Q
    ||||||||||||||||    
T  28209135 tgccggctggggcaag 28209150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 4526667 - 4527030
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||| ||||| |||||     
T  4526667 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtg 4526766  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  4526767 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 4526866  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||  | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  4526867 ctttccaaggtttgaccattgaaggcgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 4526966  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  4526967 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 4527030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 4544590 - 4544236
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  4544590 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 4544491  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  4544490 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 4544391  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| || |||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  4544390 ctttccaaggtttgaccatcgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 4544292  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  4544291 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 4544236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16942842 - 16942479
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  16942842 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 16942743  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  16942742 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16942643  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  ||||  |||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  16942642 ctttccaaggtttgaccgttgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 16942543  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16942542 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 16942479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Original strand, 26990271 - 26990464
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  26990271 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 26990370  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgaggg 206  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||    
T  26990371 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcaggatctgcagaggg 26990464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4722949 - 4722634
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  4722949 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 4722850  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  4722849 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 4722750  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| || |||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  4722749 ctttccaaggtttgaccatcgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 4722651  T
Q  311 ctgccggctggggcaag 327  Q
    |||||||||||||||||    
T  4722650 ctgccggctggggcaag 4722634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 29574394 - 29574757
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  29574394 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 29574493  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| | || || |||||  |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  29574494 aagaatggaaaactcgttacaattcacggtgaagaggcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 29574593  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  29574594 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 29574692  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  29574693 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 29574757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 34913795 - 34913563
Alignment:
Q  121 aagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgag 220  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| ||    
T  34913795 aagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctgattagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaag 34913696  T
Q  221 gcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctg 320  Q
    |  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || |||||  | ||  ||||||||||    
T  34913695 gattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagagtcaagctgccggctg 34913596  T
Q  321 gggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 353  Q
    ||||| |||| |||| || || ||||| |||||    
T  34913595 gggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagca 34913563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 375
Target Start/End: Original strand, 4774506 - 4774627
Alignment:
Q  254 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 353  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| |||||    
T  4774506 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagca 4774605  T
Q  354 caaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
     |||||||||||| | ||||||    
T  4774606 taaagaaggtctcgggttctcc 4774627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 8891998 - 8891930
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  8891998 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 8891930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 8903233 - 8903165
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  8903233 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 8903165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Original strand, 28163166 - 28163234
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  28163166 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 28163234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 33373943 - 33373875
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  33373943 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 33373875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1697 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1697
Description:

Target: scaffold1697; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1312 - 949
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || |||||||| ||| |||| ||||| || ||||||||     
T  1312 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgacgcgggtgcggtaacctccaccttgcatcagaagttaaagtttgtg 1213  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  1212 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatatttggtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 1113  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  ||||  |||| ||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| | | |||| ||||| |||||    
T  1112 ctttccaaggtttgacctttgagggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaagttattcaggaaggtcagac 1013  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| || || ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  1012 tgccggttggggcaaggtgatacagcttcgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 6108 - 5746
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    |||||||| ||||| || || || ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  |||    
T  6108 atggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccatggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataa 6009  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
     |||||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || |||||    
T  6008 ggaatggaaaacttgttaccattcatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 5909  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | ||||| || ||||||    
T  5908 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaagagggtcagact 5809  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  5808 gccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 5746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 268 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 46232 - 46134
Alignment:
Q  268 gcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46232 gcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggctgccggctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaagaaggtctc 46134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Original strand, 31838 - 32190
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  31838 atggacattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 31937  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  31938 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 32037  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || |||||||| ||  ||    
T  32038 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagaaggtcaagct 32137  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    |||||||||||||||||| |||| || || ||||  ||||| || ||||||||    
T  32138 gccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagagcaagcataaggaaggtct 32190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 365
Target Start/End: Original strand, 31142 - 31494
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||    
T  31142 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccagaagttgaaatttgcaa 31241  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  31242 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 31341  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  31342 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 31441  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  31442 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 31494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 45841 - 45504
Alignment:
Q  28 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 127  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  45841 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtgggaagcttg 45742  T
Q  128 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 227  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || ||||| || || |||| |||  | ||    
T  45741 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 45642  T
Q  228 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 327  Q
    | | |||||||||||||  || | |  ||||||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  45641 tgtcgaaggtacggagcctaaaagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 45542  T
Q  328 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  45541 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 45504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 38940 - 38600
Alignment:
Q  13 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 112  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  38940 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 38841  T
Q  113 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 212  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  38840 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 38741  T
Q  213 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 312  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  38740 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 38641  T
Q  313 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 353  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| |||||    
T  38640 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagca 38600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 327
Target Start/End: Original strand, 10950 - 11265
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||  || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  10950 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgtgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 11049  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||| ||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  11050 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagctagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 11149  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  11150 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 11249  T
Q  312 tgccggctggggcaag 327  Q
    ||||||||||||||||    
T  11250 tgccggctggggcaag 11265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 365
Target Start/End: Original strand, 28693 - 29030
Alignment:
Q  28 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 127  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || || ||| ||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  28693 tcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcgggggcggtgacccctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 28792  T
Q  128 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 227  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  28793 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 28892  T
Q  228 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 327  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  28893 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 28992  T
Q  328 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 365  Q
    ||| || | || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  28993 ttaatatagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 29030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 7399 - 7762
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  7399 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 7498  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || || |    
T  7499 aagaatggaaagctcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 7598  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||| ||  ||  |||||||||| ||||    
T  7599 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcggagagccattcaagaaggtcaga 7697  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  7698 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 7762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 327
Target Start/End: Original strand, 9333 - 9648
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  9333 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 9432  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  9433 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 9532  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  9533 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 9632  T
Q  312 tgccggctggggcaag 327  Q
    ||||||||||||||||    
T  9633 tgccggctggggcaag 9648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13802 - 13439
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  13802 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 13703  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  13702 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 13603  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 310  Q
    | || |  ||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  13602 ctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 13504  T
Q  311 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  13503 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 13439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25073 - 24710
Alignment:
Q  12 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 111  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  25073 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 24974  T
Q  112 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 211  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || || |    
T  24973 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 24874  T
Q  212 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 311  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  24873 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 24774  T
Q  312 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctctgcttctcc 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  24773 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctcgggttctcc 24710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Original strand, 22073 - 22141
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  22073 caagaaggacaagctgccggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 22141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 119642 - 119574
Alignment:
Q  298 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 366  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  119642 caagaaggacaagctgccggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 119574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 254 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 7819 - 7707
Alignment:
Q  254 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 353  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  7819 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 7720  T
Q  354 caaagaaggtctc 366  Q
     ||||||||||||    
T  7719 taaagaaggtctc 7707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 254 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21372 - 21260
Alignment:
Q  254 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 353  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  21372 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 21273  T
Q  354 caaagaaggtctc 366  Q
     ||||||||||||    
T  21272 taaagaaggtctc 21260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Original strand, 27711 - 27904
Alignment:
Q  134 tccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattga 233  Q
    ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  |||| |||||| || ||||| || | |||  ||||  ||||    
T  27711 tccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcaggatttgctgaagggactgctttccaaggtttgaccgttga 27810  T
Q  234 aggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 327  Q
    |||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27811 aggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaag 27904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University