View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8160_low_12 (Length: 304)

Name: NF8160_low_12
Description: NF8160
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8160_low_12
NF8160_low_12
[»] chr1 (42 HSPs)
chr1 (25-275)||(42134485-42134736)
chr1 (24-235)||(45380853-45381065)
chr1 (24-275)||(44157436-44157687)
chr1 (48-275)||(33685143-33685369)
chr1 (24-275)||(36895379-36895631)
chr1 (24-275)||(46638676-46638928)
chr1 (29-280)||(18183818-18184069)
chr1 (29-275)||(35479850-35480096)
chr1 (24-222)||(31801689-31801888)
chr1 (24-280)||(27940606-27940863)
chr1 (54-209)||(6575261-6575414)
chr1 (24-275)||(47269325-47269577)
chr1 (60-222)||(15104497-15104659)
chr1 (60-222)||(31238401-31238563)
chr1 (60-222)||(34778045-34778206)
chr1 (60-213)||(6818584-6818737)
chr1 (60-268)||(50556003-50556211)
chr1 (60-222)||(4855873-4856034)
chr1 (68-222)||(27087339-27087492)
chr1 (60-268)||(2869589-2869797)
chr1 (60-268)||(25278274-25278482)
chr1 (60-268)||(37344352-37344560)
chr1 (66-222)||(51121961-51122117)
chr1 (60-268)||(3013376-3013590)
chr1 (155-222)||(51896153-51896220)
chr1 (60-214)||(33602550-33602704)
chr1 (173-225)||(42136230-42136282)
chr1 (60-180)||(43868712-43868832)
chr1 (173-280)||(5784853-5784960)
chr1 (173-275)||(31803686-31803788)
chr1 (173-275)||(33679262-33679364)
chr1 (60-222)||(46583462-46583624)
chr1 (60-123)||(26225460-26225523)
chr1 (187-222)||(27952500-27952535)
chr1 (173-224)||(45379139-45379190)
chr1 (189-268)||(52643650-52643729)
chr1 (173-235)||(18180543-18180605)
chr1 (173-275)||(44159280-44159382)
chr1 (189-222)||(6577107-6577140)
chr1 (173-222)||(11152601-11152650)
chr1 (60-116)||(5783505-5783561)
chr1 (155-215)||(9121669-9121729)
[»] chr3 (50 HSPs)
chr3 (32-275)||(18430148-18430392)
chr3 (24-275)||(45257089-45257341)
chr3 (24-275)||(24382762-24383014)
chr3 (24-275)||(48633880-48634138)
chr3 (24-275)||(31887320-31887573)
chr3 (48-275)||(33852564-33852791)
chr3 (24-275)||(23774155-23774406)
chr3 (24-280)||(23888641-23888898)
chr3 (24-275)||(2977198-2977450)
chr3 (29-275)||(33113055-33113301)
chr3 (24-275)||(41020872-41021124)
chr3 (61-222)||(1845840-1846001)
chr3 (48-275)||(51454140-51454371)
chr3 (97-275)||(40508854-40509032)
chr3 (60-222)||(53190686-53190847)
chr3 (85-275)||(39641770-39641960)
chr3 (60-268)||(27899007-27899215)
chr3 (60-268)||(54898447-54898654)
chr3 (60-222)||(2226079-2226240)
chr3 (60-222)||(35905639-35905800)
chr3 (141-275)||(45898335-45898469)
chr3 (60-268)||(51684620-51684828)
chr3 (60-222)||(30599844-30600006)
chr3 (60-216)||(41977812-41977967)
chr3 (60-222)||(23293096-23293258)
chr3 (60-222)||(42279563-42279725)
chr3 (60-200)||(7884800-7884939)
chr3 (60-235)||(21348766-21348941)
chr3 (24-100)||(45898246-45898323)
chr3 (60-235)||(17515353-17515528)
chr3 (60-215)||(48830732-48830887)
chr3 (60-222)||(43765193-43765355)
chr3 (60-205)||(2377102-2377247)
chr3 (187-267)||(2975471-2975551)
chr3 (188-265)||(31885531-31885608)
chr3 (66-181)||(600806-600921)
chr3 (173-275)||(1847631-1847733)
chr3 (173-275)||(33111844-33111946)
chr3 (60-222)||(44794263-44794425)
chr3 (173-275)||(45897053-45897155)
chr3 (60-222)||(46112543-46112705)
chr3 (60-181)||(5125898-5126019)
chr3 (187-275)||(23887201-23887289)
chr3 (187-275)||(48635373-48635461)
chr3 (173-280)||(40508491-40508598)
chr3 (60-222)||(3152144-3152306)
chr3 (173-222)||(37865440-37865489)
chr3 (60-119)||(41944712-41944771)
chr3 (60-114)||(41623816-41623870)
chr3 (173-278)||(45255483-45255588)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (24-275)||(15432331-15432583)
chr2 (24-275)||(37417276-37417528)
chr2 (31-275)||(25619663-25619908)
chr2 (24-222)||(39266-39465)
chr2 (29-222)||(29909534-29909728)
chr2 (74-274)||(42879360-42879559)
chr2 (24-222)||(92216-92415)
chr2 (48-275)||(42001613-42001839)
chr2 (24-275)||(41706542-41706794)
chr2 (24-222)||(15372555-15372754)
chr2 (114-274)||(39560-39720)
chr2 (60-222)||(19908172-19908334)
chr2 (60-268)||(16763086-16763293)
chr2 (60-215)||(39664674-39664829)
chr2 (60-222)||(14389010-14389172)
chr2 (60-222)||(44709671-44709833)
chr2 (60-213)||(42519131-42519284)
chr2 (60-222)||(40560279-40560441)
chr2 (60-222)||(17946150-17946312)
chr2 (30-123)||(10716777-10716872)
chr2 (60-222)||(6797563-6797725)
chr2 (60-222)||(7744099-7744261)
chr2 (60-213)||(17696271-17696424)
chr2 (60-268)||(2766944-2767152)
chr2 (56-177)||(862214-862335)
chr2 (60-121)||(11315263-11315324)
chr2 (155-215)||(11315336-11315396)
chr2 (187-275)||(42880811-42880899)
chr2 (173-275)||(28248161-28248263)
chr2 (173-222)||(11021589-11021638)
chr2 (60-119)||(11022940-11022999)
chr2 (143-222)||(16377206-16377285)
chr2 (155-222)||(24208063-24208130)
chr2 (60-119)||(28246801-28246860)
chr2 (60-115)||(40097711-40097766)
chr2 (187-222)||(41708430-41708465)
chr2 (173-275)||(33196-33298)
chr2 (189-275)||(41144-41230)
chr2 (173-275)||(37418755-37418857)
chr2 (155-224)||(6786002-6786071)
chr2 (173-222)||(42003476-42003525)
[»] chr7 (53 HSPs)
chr7 (32-275)||(47341559-47341807)
chr7 (29-275)||(46812456-46812703)
chr7 (31-275)||(33038673-33038918)
chr7 (29-275)||(23953808-23954056)
chr7 (24-275)||(46996571-46996823)
chr7 (24-275)||(40784349-40784601)
chr7 (60-275)||(2167482-2167697)
chr7 (24-275)||(8423150-8423402)
chr7 (24-275)||(35344159-35344411)
chr7 (60-275)||(27955373-27955588)
chr7 (60-273)||(2492332-2492544)
chr7 (60-222)||(6602391-6602553)
chr7 (60-222)||(39859135-39859297)
chr7 (138-275)||(38614896-38615032)
chr7 (60-235)||(13168163-13168341)
chr7 (60-222)||(34776821-34776983)
chr7 (60-222)||(45359392-45359554)
chr7 (138-275)||(38613465-38613602)
chr7 (31-131)||(38613610-38613712)
chr7 (77-222)||(37796104-37796249)
chr7 (60-235)||(30940331-30940506)
chr7 (60-222)||(1546343-1546505)
chr7 (68-222)||(38474057-38474211)
chr7 (60-268)||(47386115-47386323)
chr7 (60-203)||(35693276-35693419)
chr7 (60-222)||(24228315-24228477)
chr7 (173-275)||(45465170-45465272)
chr7 (56-181)||(31913566-31913691)
chr7 (173-275)||(2168820-2168922)
chr7 (173-275)||(40785534-40785636)
chr7 (60-181)||(6056863-6056984)
chr7 (56-205)||(23962377-23962526)
chr7 (173-224)||(4321092-4321143)
chr7 (173-280)||(30108563-30108670)
chr7 (189-268)||(33775418-33775497)
chr7 (29-121)||(48704337-48704431)
chr7 (173-275)||(46994663-46994765)
chr7 (31-222)||(48852222-48852415)
chr7 (173-222)||(46810761-46810810)
chr7 (60-116)||(34691136-34691192)
chr7 (187-222)||(8421472-8421507)
chr7 (187-222)||(35342481-35342516)
chr7 (143-222)||(37115515-37115594)
chr7 (60-123)||(46439436-46439499)
chr7 (60-163)||(46867841-46867943)
chr7 (60-119)||(48303576-48303635)
chr7 (173-275)||(3690153-3690255)
chr7 (173-275)||(38614778-38614880)
chr7 (173-222)||(56386-56435)
chr7 (63-131)||(13034820-13034888)
chr7 (155-223)||(19712264-19712332)
chr7 (155-215)||(20478105-20478165)
chr7 (60-116)||(45463811-45463867)
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (31-275)||(1320620-1320865)
chr8 (24-275)||(42897643-42897895)
chr8 (30-275)||(37525898-37526144)
chr8 (24-275)||(38882666-38882918)
chr8 (24-222)||(8654556-8654754)
chr8 (29-273)||(33160022-33160267)
chr8 (24-275)||(462241-462491)
chr8 (31-275)||(32822364-32822608)
chr8 (24-222)||(33750253-33750452)
chr8 (24-275)||(31201012-31201264)
chr8 (24-275)||(31821421-31821663)
chr8 (60-222)||(8609714-8609875)
chr8 (60-222)||(13108263-13108424)
chr8 (60-222)||(38547284-38547445)
chr8 (60-268)||(41825570-41825778)
chr8 (60-216)||(9184445-9184601)
chr8 (60-214)||(9673091-9673245)
chr8 (95-222)||(13282534-13282660)
chr8 (60-222)||(26242240-26242402)
chr8 (60-214)||(41042510-41042664)
chr8 (60-217)||(13486025-13486182)
chr8 (60-268)||(7745038-7745246)
chr8 (60-214)||(5036509-5036667)
chr8 (66-222)||(40339612-40339768)
chr8 (60-268)||(42941784-42941992)
chr8 (187-275)||(33158659-33158747)
chr8 (173-275)||(33368762-33368864)
chr8 (173-263)||(37524873-37524963)
chr8 (173-270)||(42894784-42894881)
chr8 (56-114)||(15145664-15145722)
chr8 (60-222)||(27691210-27691372)
chr8 (173-275)||(40019159-40019261)
chr8 (173-270)||(461184-461281)
chr8 (60-116)||(28433643-28433699)
chr8 (77-132)||(11722732-11722787)
chr8 (173-280)||(33748330-33748437)
chr8 (173-235)||(25707287-25707349)
chr8 (173-222)||(9186631-9186680)
chr8 (189-266)||(9671989-9672066)
chr8 (173-222)||(11031485-11031534)
chr8 (173-222)||(24526952-24527001)
chr8 (173-222)||(25373608-25373657)
chr8 (187-224)||(31199539-31199576)
chr8 (173-222)||(31823462-31823511)
chr8 (173-222)||(32824257-32824306)
chr8 (173-237)||(9876548-9876612)
[»] chr4 (46 HSPs)
chr4 (24-222)||(35996119-35996318)
chr4 (30-275)||(44558368-44558614)
chr4 (24-275)||(51041800-51042051)
chr4 (54-268)||(27624816-27625030)
chr4 (24-275)||(47941814-47942066)
chr4 (48-222)||(2350398-2350575)
chr4 (24-275)||(44794629-44794881)
chr4 (24-222)||(2827460-2827659)
chr4 (60-275)||(4519379-4519594)
chr4 (24-275)||(10762584-10762836)
chr4 (59-275)||(10372611-10372827)
chr4 (60-268)||(51011936-51012143)
chr4 (60-222)||(2693159-2693320)
chr4 (66-222)||(41761658-41761814)
chr4 (60-259)||(48646653-48646852)
chr4 (60-236)||(35404351-35404527)
chr4 (173-275)||(39922993-39923095)
chr4 (60-121)||(11255846-11255907)
chr4 (29-121)||(25993653-25993747)
chr4 (60-215)||(42980698-42980853)
chr4 (60-222)||(41781595-41781757)
chr4 (173-275)||(43778392-43778494)
chr4 (60-222)||(49523180-49523342)
chr4 (60-200)||(26296800-26296940)
chr4 (60-111)||(27382284-27382335)
chr4 (173-275)||(39085138-39085240)
chr4 (60-114)||(50131326-50131380)
chr4 (173-235)||(51040778-51040840)
chr4 (97-235)||(52868092-52868230)
chr4 (29-203)||(11601745-11601921)
chr4 (173-222)||(27626714-27626763)
chr4 (60-119)||(5484678-5484737)
chr4 (144-215)||(13450970-13451041)
chr4 (60-119)||(32652237-32652296)
chr4 (60-119)||(42880688-42880747)
chr4 (60-119)||(43779794-43779853)
chr4 (187-222)||(44792990-44793025)
chr4 (173-275)||(42879278-42879380)
chr4 (173-275)||(44992811-44992913)
chr4 (173-222)||(230492-230541)
chr4 (173-222)||(2828397-2828446)
chr4 (173-222)||(39190805-39190854)
chr4 (173-222)||(44556676-44556725)
chr4 (187-235)||(34460268-34460316)
chr4 (60-116)||(39083780-39083836)
chr4 (60-116)||(39189523-39189579)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (24-275)||(18728471-18728723)
chr5 (24-275)||(32087517-32087769)
chr5 (24-275)||(38177962-38178214)
chr5 (24-275)||(38205186-38205438)
chr5 (29-275)||(43317934-43318181)
chr5 (24-275)||(33256403-33256655)
chr5 (48-275)||(35395336-35395561)
chr5 (29-275)||(35292256-35292502)
chr5 (66-211)||(38597012-38597157)
chr5 (60-222)||(17574374-17574535)
chr5 (48-218)||(32838394-32838567)
chr5 (60-235)||(30468186-30468361)
chr5 (60-222)||(7267899-7268060)
chr5 (141-275)||(38596871-38597005)
chr5 (60-268)||(18624914-18625122)
chr5 (60-214)||(2179851-2180005)
chr5 (60-268)||(8539685-8539893)
chr5 (63-222)||(24496799-24496958)
chr5 (60-222)||(34327691-34327853)
chr5 (67-222)||(36057526-36057681)
chr5 (189-275)||(32835879-32835965)
chr5 (173-270)||(33257746-33257843)
chr5 (173-275)||(32089911-32090013)
chr5 (173-235)||(43316823-43316885)
chr5 (173-222)||(18726621-18726670)
chr5 (187-224)||(38176686-38176723)
chr5 (187-224)||(38203910-38203947)
chr5 (187-222)||(40330515-40330550)
chr5 (172-222)||(24541230-24541280)
chr5 (173-275)||(42619292-42619394)
chr5 (173-222)||(24498053-24498102)
chr5 (155-215)||(29621782-29621842)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (24-275)||(29077331-29077583)
chr6 (48-222)||(2968195-2968369)
chr6 (24-222)||(29112356-29112555)
chr6 (24-275)||(4641358-4641610)
chr6 (60-222)||(3018338-3018500)
chr6 (60-235)||(20523409-20523584)
chr6 (60-270)||(10568407-10568617)
chr6 (77-222)||(32439015-32439159)
chr6 (60-268)||(6899495-6899703)
chr6 (60-214)||(11355286-11355440)
chr6 (60-200)||(7049835-7049975)
chr6 (60-222)||(9398716-9398878)
chr6 (60-199)||(14338381-14338520)
chr6 (60-235)||(30891167-30891342)
chr6 (29-121)||(24662615-24662709)
chr6 (173-275)||(17950564-17950666)
chr6 (187-275)||(4646216-4646304)
chr6 (48-96)||(30641223-30641271)
chr6 (155-222)||(7372959-7373026)
chr6 (189-268)||(9400035-9400114)
chr6 (155-222)||(13613583-13613650)
chr6 (60-119)||(17951969-17952028)
chr6 (60-199)||(25172015-25172154)
chr6 (60-119)||(35175790-35175849)
chr6 (60-181)||(32516974-32517095)
chr6 (155-215)||(3456811-3456871)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (48-275)||(6528-6755)
[»] scaffold1454 (1 HSPs)
scaffold1454 (60-214)||(1327-1480)
[»] scaffold0564 (1 HSPs)
scaffold0564 (60-222)||(8318-8478)
[»] scaffold0129 (1 HSPs)
scaffold0129 (56-181)||(4556-4681)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (155-222)||(3350-3417)
scaffold0058 (155-222)||(4522-4589)
[»] scaffold1041 (2 HSPs)
scaffold1041 (173-235)||(2141-2203)
scaffold1041 (179-228)||(2883-2932)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (60-116)||(37366-37422)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 42)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 42134736 - 42134485
Alignment:
Q  25 aaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42134736 aaagtgaaaagtgaaaactggactttttccaattcaatcaaattagtccttgaacatgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgca 42134637  T
Q  124 gggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatta 223  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  42134636 gggtgacatgtcaacatggctaacggagcacttggacggagggacctttttgatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataattg 42134537  T
Q  224 aaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    |  ||||| |||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42134536 agggatgattttggccgacccgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 42134485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 45380853 - 45381065
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45380853 taaagtgaaaagtgaaaattggactttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 45380952  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  45380953 agggcgacatgtcaccatggctaacggagcacttggacggaggaacctttttgatggacgtctgacaaattcatgaactaagttgatatttcgcataatt 45381052  T
Q  223 aaaagatgaattt 235  Q
     |  |||||||||    
T  45381053 gagggatgaattt 45381065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 44157687 - 44157436
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44157687 taaagtgaaaagtgaaaactgaactttttccaattcaatcaaattagtc-ttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacaacatgc 44157589  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  44157588 agggcgacatgtcactatggctgacggagcacttagacggaaggactttttttatggacgtctaacaaattcagggactaagttgatattttgcataatt 44157489  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     |  |||||||||    |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  44157488 gagggatgaatttggccgacccgtgaaaatttaaggacgagtttgatggttca 44157436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 48 - 275
Target Start/End: Original strand, 33685143 - 33685369
Alignment:
Q  48 ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaac 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  33685143 ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaactcaacatgcagggcgacacatcggcatggctaac 33685242  T
Q  148 ggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgta 247  Q
    |||||||||||| ||| ||| | |||||||||| || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |  |||| |||    
T  33685243 ggagcacttggatggagggatc-ttttgatggagatgtgacaaattcaatgattaaattgatatttcgcataattgagggatgaatttgaccgacccgta 33685341  T
Q  248 aaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  33685342 aaaattcagggacgaatttgatggttca 33685369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Original strand, 36895379 - 36895631
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  36895379 taaattgaaaagtgaaaactcaacattttccaattcaatcaaattcgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacacaacatgc 36895478  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | | |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36895479 aagacgacagatcagcatggctaacggagcacttggacgaagggacctttttgatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataatt 36895578  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     |  || ||| || |  |||  || |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  36895579 gatggacgaagttgaccgacgcgtgaaaattcagggacaaatttgatggttca 36895631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Original strand, 46638676 - 46638928
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  46638676 taaactgaaaagtgaaaactcaacattttccaattcaatcaaattcgtccctgaacacgtggcttcctttttgccacgcgtacaagacaacacaacatgc 46638775  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  46638776 aaggcgacagatcagcatggctaacggagcacttggacggagggacctttttggtggacgtctgacaaattcaaggactaagttgatatttcgcataatt 46638875  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     |  |||||| ||    |||  || |||||||| | |||||||||||||||||    
T  46638876 gagggatgaagttggccgacgcgtgaaaattcaggaacgaatttgatggttca 46638928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 280
Target Start/End: Original strand, 18183818 - 18184069
Alignment:
Q  29 tgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggc 127  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  18183818 tgaaaagtgaaaactggaatttttccacttccatcaaattagtccttgaacacgtggcttcttttttgccacgtgtacaagacaacacaacatgctggac 18183917  T
Q  128 gacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaag 227  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||| || | | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |    
T  18183918 gacaaatcagcatggctaacggagcactt-gatgaagggacatttttgatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgaggg 18184016  T
Q  228 atgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttcaatcgt 280  Q
    |||| |||    || | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18184017 atgattttggccgaaccgtaaaaattcaaagacgaatttgatggttcactcgt 18184069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 275
Target Start/End: Original strand, 35479850 - 35480096
Alignment:
Q  29 tgaaaagtgaaaactggacttttccaa-ttcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggc 127  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||    
T  35479850 tgaaaagtgaaaattgaactttttcaaattcaatcaaattagtccctgaacacgtggcttctttcttgccacgcgtacaagacaacaaagcatgcatggc 35479949  T
Q  128 gacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaag 227  Q
    ||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| |  |    
T  35479950 gacagatcagcat-gctaacagagcacttggacggaaggacctttttgatggacgtctgacaaattcatagattaagttgatatttcgcataattgaggg 35480048  T
Q  228 atgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    ||||||||   ||| | || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  35480049 atgaatttggctgatccgtgaaaattcaaggacgaagttgatggttca 35480096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31801888 - 31801689
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  31801888 taaactgaaaagtgaaaactcaacattttccaattcaatcaaattcgtccctgaacacgtgacttccttcttgccacgcgtacaagacaacacaacatgc 31801789  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | | |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  31801788 aagacgacaaatcagcatggctaacggagcacttggacggagggacctttttgatggacgtctcacaaatttaaggactaagttgatatttcgcataatt 31801689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27940863 - 27940606
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  27940863 taaattgaaaaatgaaaagtgaactttttccaaatcaatcaaattcgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacagcacatcatgc 27940764  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | ||  |||||||| ||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27940763 aaggttacatgtcagcatggctaacggagcccgttaacggagggacctttttgatggacgtctgataaattcaaggattaaattgatatttcgcataatt 27940664  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttcaatcgt 280  Q
     |  || |||||| |   |||||| |||||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  27940663 gagggacgaatttgaccaacctgtgaaaattcagggactaaattgatggttcactcgt 27940606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6575414 - 6575261
Alignment:
Q  54 aattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| ||||||  || |||||    
T  6575414 aattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacaaagcatgcatgacgacatatcagcatggc--acagagca 6575317  T
Q  154 cttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgat 209  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6575316 ctttgacggaaggacctttttgatagatgtctgacaaattcagggactaagttgat 6575261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Original strand, 47269325 - 47269577
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||    
T  47269325 taaattgaaaaatgaaaagtgaactttttccaaatcaatcaaattcgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaggacagcacaccatgc 47269424  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
      | |||||||||| ||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||    
T  47269425 cagacgacatgtcagcatggctaacggagcccgttaacggagggacctttttgatggacgtttgacaaattcagggatgaaattgaaatttcgtataatt 47269524  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     |  ||  |||||    |||  || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  47269525 gagggactaatttggccgacgcgtgaaaattcagggacgaatttgatggttca 47269577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15104659 - 15104497
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||  ||||||   |||| |||||  |||||    
T  15104659 atcaaattagtccttgtacacgtggctgccttattgacacgtgtacaagacaacacagcatgcaagaagacacatcatcaccactaatggagcttttgga 15104560  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15104559 cggaaggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 15104497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 31238401 - 31238563
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||| | |  |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  31238401 atcaaattagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacagcatggaagaggacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 31238500  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31238501 cagatggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 31238563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 34778045 - 34778206
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| || |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  34778045 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacaatatgcaagg-gacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 34778143  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  34778144 cggagggaccattttgatggacatctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 34778206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 213
Target Start/End: Original strand, 6818584 - 6818737
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||||||||   ||||||||||  |||||    
T  6818584 atcaaattagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacatgtcatcaccactaacggagcttttgga 6818683  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatattt 213  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  6818684 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatattt 6818737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Original strand, 50556003 - 50556211
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| | |||||   ||||||||||  |||||    
T  50556003 atcaaattagtccttgtacacgtgactcccttgttgacacgtgtacatgacaacacagcatgcaagatgacacgccatcaccactaacggagcttttgga 50556102  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 259  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||| |||||| | |||  | | ||||||||| ||    
T  50556103 cggagggaccattttgatagacgtctgtaaaatttagggactaaatagatatttcgcaaaattcagagacgaatttgactgattttttaaaattcaaaga 50556202  T
Q  260 cgaatttga 268  Q
    |||||||||    
T  50556203 cgaatttga 50556211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 4855873 - 4856034
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||    |||||||||  |||||    
T  4855873 atcaatttagtccttgtacacgtgactgccttgttgacacgtgtacaagacaacacaacatgcaagg-gacacgtcatcaccattaacggagcttttgga 4855971  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  4855972 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 4856034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 68 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27087492 - 27087339
Alignment:
Q  68 agtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatgga 167  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||   ||||||||||  ||||||||||||     
T  27087492 agtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacagcatgcaagg-gacacatcatcaccactaacggagcttttggacggatggg 27087394  T
Q  168 cctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    || ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27087393 ccattttgatggacgtttgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 27087339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2869797 - 2869589
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   ||||| ||||  |||||    
T  2869797 atcaatttagtccttgtacatgtggctgccttgttgacacgtgtacaggacaacacatcatgcaagatgacacatcatcaccactaacagagcttttgga 2869698  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 259  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||| |  || |||||| |  ||  | | ||||||||||||    
T  2869697 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaatttagagactaaatagatatttcgcaaaattcagggacgaatttgaccgatttttgaaaattcaagga 2869598  T
Q  260 cgaatttga 268  Q
    |||||||||    
T  2869597 cgaatttga 2869589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Original strand, 25278274 - 25278482
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||| |||||| |  |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  25278274 atcaatttagtccttatacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacagcacatcatgcaagaggacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 25278373  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 259  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |  || |||||| |  ||  | | ||||||||||||    
T  25278374 cggagggaccattttgatggacgtatgtaaaattcaaggactaaataggtatttcgcaaaattcagggacgaatttgaccgattttttaaaattcaagga 25278473  T
Q  260 cgaatttga 268  Q
    |||||||||    
T  25278474 cgaatttga 25278482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37344560 - 37344352
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  37344560 atcaatttagtccttatacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacatcatgcaagaggacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 37344461  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 259  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | ||  |||||||  |||||||| | ||||||||| |||| |  || |||||| |  ||  | | ||||||||||||    
T  37344460 cggagggaccattttgatggacgtatgtaaaattcaaagactaaataggtatttcgcaaaattcagggacgaatttgaccgattttttaaaattcaagga 37344361  T
Q  260 cgaatttga 268  Q
    |||||||||    
T  37344360 cgaatttga 37344352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 51122117 - 51121961
Alignment:
Q  66 ttagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatg 165  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||  ||| |||  ||||| || |  ||||||||| |    
T  51122117 ttagtccttgtacacgtgacttcctttttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcagggagccagctcaacatcactaacagaccttttggacggagg 51122018  T
Q  166 gacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||||||||| |  || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  51122017 gaccattttgatggacgtgagagaaattcagggacgaaattgatattttgcaaaatt 51121961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Original strand, 3013376 - 3013590
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||| |  || |  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  3013376 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacggcatgcaagaggatacatcatcaccactaacggagcttttgga 3013475  T
Q  160 cggatggacctttttgatg------gacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaatt 253  Q
    |||| ||||  ||||||||      ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  || |||||| | |||  | | ||||||    
T  3013476 cggagggactattttgatgtccatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaattcatggacgaatttgactgatgttttaaaatt 3013575  T
Q  254 caaggacgaatttga 268  Q
    |||||||||||||||    
T  3013576 caaggacgaatttga 3013590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 222
Target Start/End: Original strand, 51896153 - 51896220
Alignment:
Q  155 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  51896153 ttggacggagggactattttgatggacatctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 51896220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 214
Target Start/End: Original strand, 33602550 - 33602704
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||  |||  || |||||||||||||||||||| |||||| |  | ||  |||||||  |||||||| |  |||||    
T  33602550 atcaatttagtccttgtacacatggctgacttgctgacacgtgtacaagacaacacaacatgcaagaagccacatcatcattactaacggaccttttgga 33602649  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttc 214  Q
    |||| ||||   ||||| |||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33602650 cggagggactaatttgacggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttc 33602704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 225
Target Start/End: Original strand, 42136230 - 42136282
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaa 225  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42136230 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattaaa 42136282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 43868832 - 43868712
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||   |||||| | |||||  ||| ||   ||||||||||| |||||    
T  43868832 atcaaattggtccttgtacacgtgacttccttgtagacacgtgtacaagacaacatgacatgcatgacgacaactcagcagcactaacggagcatttgga 43868733  T
Q  160 cggatggacctttttgatgga 180  Q
    |||| ||||  ||||||||||    
T  43868732 cggaaggactattttgatgga 43868712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 280
Target Start/End: Original strand, 5784853 - 5784960
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| || |  |||| || |||||||| ||||||| |||||| |    
T  5784853 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttgaccgacccgtgaaaattcagggacgaagttgatgat 5784952  T
Q  273 tcaatcgt 280  Q
    ||| ||||    
T  5784953 tcactcgt 5784960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Original strand, 31803686 - 31803788
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| ||    |||| || |||||||| ||||||| |||||| |    
T  31803686 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgaaggacgaagttggccgacccgtgaaaattcagggacgaagttgatgat 31803785  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  31803786 tca 31803788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33679364 - 33679262
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |  || ||||||   ||||| ||||||||||| |||| || |||||| |    
T  33679364 ttgattgacatttaacaaattcaaggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaatttggctgacccgtaaaaattcatggacaaaattgatgat 33679265  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  33679264 tca 33679262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 46583462 - 46583624
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  |||  || |||||||||| ||||| | |||||||| |  | ||  ||||||    ||||||| |  |||||    
T  46583462 atcaatttagtccttgtacacgtggctgacttgctgacacgtgtacatgacaagaaagcatgcaagaagccacatcatcaccattaacggaccttttgga 46583561  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  46583562 cggagggacaaatttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 46583624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 123
Target Start/End: Original strand, 26225460 - 26225523
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgca 123  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| | || ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26225460 atcaatttagtccttgtacatgtggctgctttgttgacacgtgtacaagacaacacatcatgca 26225523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 222
Target Start/End: Original strand, 27952500 - 27952535
Alignment:
Q  187 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27952500 acaaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 27952535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45379190 - 45379139
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaa 224  Q
    ||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45379190 ttgattgacatttaacaaatttagggattaaattgatatttcgcataattaa 45379139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 268
Target Start/End: Original strand, 52643650 - 52643729
Alignment:
Q  189 aaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttga 268  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||| |  || |||||||| |||  | |||||||| ||||||||||||||    
T  52643650 aaattcagggactaaataaatatttcgcaaaattcagggacgaatttaactgatttttaaaaatttaaggacgaatttga 52643729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18180605 - 18180543
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 235  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  18180605 ttgattgacatttaacaaattcaggaattaaattgatatttcgcataattgagggatgaattt 18180543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Original strand, 44159280 - 44159382
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  || ||| || |  || |||| |||||||| ||||||| |||||| |    
T  44159280 ttgattgacatttaacaaattcaggaattaaattgatattttgcataattaagggacgaaattgaccgatctgtgaaaattcagggacgaagttgatgat 44159379  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  44159380 tca 44159382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 222
Target Start/End: Original strand, 6577107 - 6577140
Alignment:
Q  189 aaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6577107 aaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 6577140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11152650 - 11152601
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11152650 ttgattgacatttaacaaattctgggattaaattgatatttcgcataatt 11152601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 5783561 - 5783505
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacaca 116  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||    
T  5783561 atcaatttagtccctgtacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagccaacaca 5783505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 215
Target Start/End: Original strand, 9121669 - 9121729
Alignment:
Q  155 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcg 215  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  9121669 ttggacggagggactgatttgatggacgtctgcaaaattcagggactaatttgatatttcg 9121729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 50)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 275
Target Start/End: Original strand, 18430148 - 18430392
Alignment:
Q  32 aaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgac 130  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18430148 aaagtgaaaattggactttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggtttccttcttgccacgtgtacaagacaacacggcatgcagggcgac 18430247  T
Q  131 atgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatg 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||    
T  18430248 atgtcaccatggctaacggagcacttggacggagggacctttttattggacgtctgacatattcagggactaagttgatatttcgcataattgagggatg 18430347  T
Q  231 aatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    |||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430348 aatttggctgacccgttaaaattcaaggacgaatttgatggttca 18430392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Original strand, 45257089 - 45257341
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45257089 taaagtgaaaagtgaaaactggactttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttcattcttgccacgtgtacaagacaacacaacatgc 45257188  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||    
T  45257189 agggcggcatgtcagcatgactaacggagcacttggacggagggacattttttatggacgtctgacaaattcaggaactaagttgatattttacataatt 45257288  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     |  |||||||||    |||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  45257289 gagggatgaatttggccgacccgtgaaaattcaagaacgaatttgatggttca 45257341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Original strand, 24382762 - 24383014
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||    
T  24382762 taaactgaaaagtgaaaactgaactttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttcctttttgccccgtatataagacaacacaacatgc 24382861  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||    
T  24382862 agggcgacatatcagcatggctaacggatgacttggacggagggacctttttgatggacgtctgacaaatccatggactaagttgatatttctcataatt 24382961  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     || |||||||||    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24382962 gaaggatgaatttggccgacccgtaaaaattcaaggaccaatttgatggttca 24383014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 48634138 - 48633880
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggacttttc---caattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaa----caca 116  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||    
T  48634138 taaactgaaaagtgaaaattagacttttttttcaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttcctttttgccacgtgtacaagacaaacaacaca 48634039  T
Q  117 gcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgc 216  Q
     ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48634038 tcatgcagggcgacagatcaacatggctaacggagcacttggacggagggacctttttgatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgc 48633939  T
Q  217 ataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    |||||| |  || |||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48633938 ataattgatggacgaatttgaccgacccgtgaaaattcaaggacgaatttgatggttca 48633880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Original strand, 31887320 - 31887573
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaat-tcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatg 121  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31887320 taaactgaaaagtgaaaactggaatttttccactatccatcaaattagtccttgaacatatggcttcctttttgccacgtgtacaagacaacacagcatg 31887419  T
Q  122 cagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataat 221  Q
    || |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31887420 caaggcgacaaatcagcatggctaacggagcacttggacggagggacctttttgatagacatctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataat 31887519  T
Q  222 taaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    | |  | ||||||| |  || | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31887520 tgatggttgaatttgaccgatccgtgaaaattcaaggacgaatttgatggttca 31887573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 48 - 275
Target Start/End: Original strand, 33852564 - 33852791
Alignment:
Q  48 ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaac 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33852564 ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtctacaagacaacacaacatgcagggcgacatgtcaccatggctaac 33852663  T
Q  148 ggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgta 247  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||| |   ||| |||    
T  33852664 ggagcacttggacagagggacctttttgatggacgtctgataaattcagaaattaaattgatatttcgcataattgagggataaatttgaccaacccgta 33852763  T
Q  248 aaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  33852764 aaaattcaaggacaaatttaatgattca 33852791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23774406 - 23774155
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23774406 taaactgaaaagtgaaaattggactttttccaaatcaatcgaattagtccttgaacacgtggcttccttattgccacgtgtacaagacaacacatcatgc 23774307  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23774306 agggcgacagatcaacatggctaacagagcacttagac-gagggacttttttgatggacgtctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 23774208  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     |  || ||||||    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23774207 gagggacgaatttggccgactcgtgaaaattcaaggacgaatttgatggttca 23774155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 280
Target Start/End: Original strand, 23888641 - 23888898
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23888641 taaactgaaaagtgaaaactcaacattttccaattcaatcaaattagtccctgaacatgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacacagtatgc 23888740  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | |||||||  ||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23888741 aaggcgacagatcagcaaggctaacggaggatttggacggagggacctttttgatggacgtttgacaaattcagggactaagctgatatttcgcataatt 23888840  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttcaatcgt 280  Q
     |  || ||| ||    ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23888841 gagggacgaagttggccgacgtgtgaaaattcagggacgaatttgatggttcactcgt 23888898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Original strand, 2977198 - 2977450
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggacttttc-caattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||||| |||| |||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  2977198 taaactgaaaagtcaaaattggaattttttcacttccatcaaattagtccttgaacatgtggtttccttcttgccacgtgtattagacaacatagcatgc 2977297  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2977298 agggcgacaaatcagcatcgctaacggagcacttgggcggatggacctttttgatggacgtatgacaaatttagggactgaattgatatttcgcataatt 2977397  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    ||  |||||||||    ||   |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2977398 aagggatgaatttggccgattcgtaaaaattcaaggacgaatttgatgattca 2977450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 275
Target Start/End: Original strand, 33113055 - 33113301
Alignment:
Q  29 tgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggc 127  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||| ||||    
T  33113055 tgaaaagtgaaaagtggaatttttccacttccatcaaattagtccttgaacacgtggcttcctttttgccacgtgtacaagacagcgcaacatgctgggc 33113154  T
Q  128 gacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaag 227  Q
    ||||  ||  ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |  |    
T  33113155 gacagatcggcatggctaacggatcactt-gacggagggacctttttgatggacgtctgacaaatttagggactaagttgatatttcgcataattgaggg 33113253  T
Q  228 atgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    |||| |||    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33113254 atgattttggccgacccgtaaaaattcaaggactaatttgatggttca 33113301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Original strand, 41020872 - 41021124
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  41020872 taaattgaaaaatgaaaagtgaactttttccaaatcaatcaaattcgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaggacagcacagcatgc 41020971  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  41020972 caggcgacatgtcagcatggctaacggagcccgttaacggagggacctttttgatggacgtctgacaaattcagggatgaaattgaaatttcgcataatt 41021071  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     |  ||  |||||    |||  || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  41021072 gagggactaatttggccgacgcgtgaaaattcagggacgaatttgatggttca 41021124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 61 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1846001 - 1845840
Alignment:
Q  61 tcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1846001 tcaaattagtccttgaacacgtggcttcctttttgccacgtgtataggacatcacatcatgcagggcgacatatcaacatggttaacggagcacttggac 1845902  T
Q  161 ggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||    
T  1845901 ggagggacgtttttgatggacgtctgtcaaattcaaagactaagttgatattttgcataatt 1845840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 275
Target Start/End: Original strand, 51454140 - 51454371
Alignment:
Q  48 ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgac----atgtcatcatggc 143  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    || | | ||||||    
T  51454140 tttttcaatttaatctaattagtccttgaacacgtggcctccttcttgccacgtgtataagacaacacatcatgcagggggacatatatatgaacatggc 51454239  T
Q  144 taacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacc 243  Q
    ||||||| ||||||||| || |||| ||||| |||||  | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |   ||||||||    || |    
T  51454240 taacggatcacttggacagagggacattttttatggatgtttgacaaattcaaagactaatttgatatttcgcataattgaggaatgaatttggccgatc 51454339  T
Q  244 tgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51454340 cgtgaaaattcaaggacgaatttgatggttca 51454371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Original strand, 40508854 - 40509032
Alignment:
Q  97 cacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcag 196  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||| || | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  40508854 cacgtgtacatgacaacacaacatgcagggcgacagatcagcacgactaacggaacacttggacggagggacatttttgatggacgtctgacaaattcaa 40508953  T
Q  197 ggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| |  || ||||||    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40508954 ggattaagttgatatttcgcataattgagggacgaatttggccgacccgtgaaaattcaaggacgaatttgatggttca 40509032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 53190686 - 53190847
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  53190686 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacaacatgcaagg-gacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 53190784  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  53190785 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 53190847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 275
Target Start/End: Original strand, 39641770 - 39641960
Alignment:
Q  85 cttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatc 184  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||  |  ||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || ||    
T  39641770 cttccttcttaccacatgtataagacaacacaacatgcaggacggtagatcaacatggctaacggagtacttgaacggagggaccttttttatgaacgtc 39641869  T
Q  185 tgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| || | |||||| | ||||||||||    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39641870 tgacaaatttaaggactaagttgatactttgaataattgagagatgaatttggccgacccgtaaaaattcaaggacaaatttgatggttca 39641960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Original strand, 27899007 - 27899215
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  27899007 atcaaattagtccttgtacacatggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 27899106  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 259  Q
    |||| ||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||    ||  | | ||||||||||||    
T  27899107 cggagggaccatttttatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaattcaaggacgaatttggccgattttttaaaattcaagga 27899206  T
Q  260 cgaatttga 268  Q
    |||||||||    
T  27899207 cgaatttga 27899215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 54898654 - 54898447
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| || |||| |||||| |  ||||||||||  |||||    
T  54898654 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacgcaacatgcaagg-gacacgtcatcgtcactaacggagcttttgga 54898556  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 259  Q
    ||||  |||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  || |||||| |  ||  | | ||||||||||||    
T  54898555 cggagagaccattttgatgaacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaattcagggacgaatttgaccgattttttaaaattcaagga 54898456  T
Q  260 cgaatttga 268  Q
    |||||||||    
T  54898455 cgaatttga 54898447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 2226079 - 2226240
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||   ||||| |||   |||||    
T  2226079 atcaatttagtccttgtacacgtggctaccttgttgacacgtgtacaagacaacacagcatgcaagg-gacacgtcatcaccactaacagagtttttgga 2226177  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||| | |||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2226178 cggagggaacattttgatgaacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 2226240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 35905639 - 35905800
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| || |||| |||||||   ||| ||||||  |||||    
T  35905639 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacccatcatgcaagg-gacacgtcatcaccactaccggagcttttgga 35905737  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  35905738 cggagggaccattttgatgaacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 35905800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 141 - 275
Target Start/End: Original strand, 45898335 - 45898469
Alignment:
Q  141 ggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattg 240  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  ||  || ||  | |    
T  45898335 ggctaacggaggacttggacggagggacctttttgatagacgtctgacaaattcaaggactaagttgatatttcgcataattcagggacaaagttggtcg 45898434  T
Q  241 acctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  45898435 acgtgtgaaaattcagggacgaatttgatggttca 45898469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 51684828 - 51684620
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||| ||||||||| || ||| |  ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  51684828 atcaaattagtccttgtacacgtgtctgccttgttgacacgtgtacaggacaacacaacacgcaagaggacacatcatcaccactaacggagcttttgga 51684729  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 259  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| |  |||||||||   |||  | | ||||||||||||    
T  51684728 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcaaggactaaatagatattttgcaaaattcagggatgaatttggctgatttttgaaaattcaagga 51684629  T
Q  260 cgaatttga 268  Q
    |||||||||    
T  51684628 cgaatttga 51684620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 30599844 - 30600006
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |  ||||  ||||||   ||||| ||||  |||||    
T  30599844 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttattgacatgtgtacaagacaacacagcatgcaagaggacacatcatcaccactaacagagcttttgga 30599943  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| |||   ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30599944 cggagggaccattttgatcgacgtctctaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 30600006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41977967 - 41977812
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||    ||||| |||  |||||    
T  41977967 atcaatttagtccttgtacacgtgactgccttgttgacacgtgtacaagacaacacaacatgcaagg-gacacgtcatcaccattaacgaagcttttgga 41977869  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgc 216  Q
    |||| ||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41977868 cggagggaccattttgacggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgc 41977812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 23293096 - 23293258
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  23293096 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacacatcatcaccactaacggagcttttgga 23293195  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||  ||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23293196 cggagggactattttgatggacgtttgtaaaattcatggactaaatagatatttcgcaaaatt 23293258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 42279725 - 42279563
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   ||||| ||||  |||||    
T  42279725 atcaaattagtccttgtacacgtgtctgccttgttgacacgtgtataagacaacacaacatgcaagaggacacatcatcaccactaacagagcttttgga 42279626  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  42279625 cggagggaccattttgatagacgtctgtaaaattcagggactaaatagatattttgcaaaatt 42279563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 200
Target Start/End: Original strand, 7884800 - 7884939
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||  ||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||   |||||||| |  |||||    
T  7884800 atcaatttagtccttatacatgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacaacatgcaagg-gacatgtcatcaccactaacggaacttttgga 7884898  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggac 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  7884899 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggac 7884939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21348941 - 21348766
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||  |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||  | ||||   ||||| ||||  |||||    
T  21348941 atcaatttagtctttgtacacgtggccgccttattgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacacattatcaccactaacagagcttttgga 21348842  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 235  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||    
T  21348841 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaattcaaggacgaattt 21348766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 100
Target Start/End: Original strand, 45898246 - 45898323
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacg 100  Q
    |||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  45898246 taaactgaaaagtgaaaactcaacattttccaattcaatcaaattagtccctaaacacgtggcttccttcttgccacg 45898323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17515528 - 17515353
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||    ||||  ||||||   ||||||| |   |||||    
T  17515528 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttattgacaagtgtacaagacaacacaacatgcaaaaggacacatcatcaccactaacggtgattttgga 17515429  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 235  Q
    | || ||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||    
T  17515428 cagagggaccattttgatggacgtttgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaattcagcgatgaattt 17515353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 215
Target Start/End: Original strand, 48830732 - 48830887
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   ||||| ||||  |||||    
T  48830732 atcaaattagtccttgtacacgtggttgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacacatcatcaccactaacagagcttttgga 48830831  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcg 215  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |  |||||||  |||||||| |||||||||    
T  48830832 cggagggaccattttgatggacgtccgtaaaattcaaagactaaatagatatttcg 48830887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 43765355 - 43765193
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||| | |  ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  43765355 atcaatttagtcattgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgtaagaggacacatcatcaccactaacggagcttttgga 43765256  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
     ||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  43765255 tggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagaaactaaatagatatttcgcaaaatt 43765193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 2377247 - 2377102
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  |||| |||||||   ||||||||||  || ||    
T  2377247 atcaaattagtcctattacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacatcatgcaagaggacacgtcatcaccactaacggagcttttaga 2377148  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaat 205  Q
    |||| | ||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||    
T  2377147 cggaggaaccattttgatggacgtctgtaaaattcagagactaaat 2377102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 2975551 - 2975471
Alignment:
Q  187 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttg 267  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2975551 acaaattcagggattaaattgatatttcgcatcattgagggatgaatttagctgatccgtaaaaattcaaggacgaatttg 2975471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31885608 - 31885531
Alignment:
Q  188 caaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatt 265  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  31885608 caaattcaagtactaaattgatatttcgcataattaagggatgaatttgaccgacccgtaaaaatccaaggacgaatt 31885531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 600921 - 600806
Alignment:
Q  66 ttagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatg 165  Q
    |||||||||| |||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  |||| |||||||   ||||||||||  || |||||| |    
T  600921 ttagtccttgtacacgtggctgctttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacacgtcatcaccactaacggagcttttagacggagg 600822  T
Q  166 gacctttttgatggac 181  Q
    |||| |||||||||||    
T  600821 gaccattttgatggac 600806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Original strand, 1847631 - 1847733
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||||||    |||| || ||||||||||||| ||||||||| |    
T  1847631 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatattttgcataattgagggatgaatttggccgacccgtgaaaattcaaggacaaatttgatgat 1847730  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  1847731 tca 1847733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33111946 - 33111844
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |  || | || |||||||| ||||||| |||||| |    
T  33111946 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggatgaatttgaccgagccgtgaaaattcagggacgaagttgatgat 33111847  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  33111846 tca 33111844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44794425 - 44794263
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  |||  || |||||||||| ||||||| |||||||| |  | ||  ||||||    ||||||| |  |||||    
T  44794425 atcaatttagtccttgtacacgtggctgacttgctgacacgtgtacaggacaacaaagcatgcaagaagccacatcatcactattaacggaccttttgga 44794326  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  44794325 cggagggacgaatttgatggacttctgcaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 44794263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 45897155 - 45897053
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  45897155 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttggccgacccgtaaaaattcaaggacgaagttgatgat 45897056  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  45897055 tca 45897053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 46112705 - 46112543
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||| ||  ||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  |||| |||||||   |||||  |||  ||| |    
T  46112705 atcaatttagtctttgtacacgtgactgacttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacacgtcatcaccactaacatagcttttgaa 46112606  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  46112605 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcatggactaaatagatattttgcaaaatt 46112543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5126019 - 5125898
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||   |||||||| |||||  ||| ||   ||||||||||| |||||    
T  5126019 atcaaattggtccttgtacacgtggcttctttgtagacacgtgtacaagacaacaggacatgcaggacgacaactcagcagcactaacggagcatttgga 5125920  T
Q  160 cggatggacctttttgatggac 181  Q
    | || ||||  |||||||||||    
T  5125919 ccgaaggactattttgatggac 5125898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23887289 - 23887201
Alignment:
Q  187 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| |||   ||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23887289 acaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttagccgacccataaaaattcaaggacgaagttgatgattca 23887201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 275
Target Start/End: Original strand, 48635373 - 48635461
Alignment:
Q  187 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||| |  || | || |||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  48635373 acaaattcagggattaaattgatatttcgcataattaagggacgaatttgaccgatccgtgaaaattcagggacgaaattgatgattca 48635461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 40508598 - 40508491
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || ||||||    |||| || |||||||| ||||||| |||||| |    
T  40508598 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgagatttcgcataattaagggacgaatttgtccgacccgtgaaaattcagggacgaagttgatgat 40508499  T
Q  273 tcaatcgt 280  Q
    ||| ||||    
T  40508498 tcactcgt 40508491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 3152144 - 3152306
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  |||  || |||||||||| ||||||| |||||| | |  | ||  ||||||    ||||||| |  |||||    
T  3152144 atcaatttagtccttgtacacgtggctgacttgctgacacgtgtacatgacaacaaagcatgtaagaagccacatcatcactattaacggaccttttgga 3152243  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3152244 cggagggacggatttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 3152306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37865489 - 37865440
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37865489 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 37865440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 41944771 - 41944712
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagca 119  Q
    ||||| ||||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  41944771 atcaatttagtccctgtacacgcggcttcctttttcccacgtgtacaagccaacacagca 41944712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 41623870 - 41623816
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaaca 114  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||    
T  41623870 atcaaattggtccttgtacacgtggcttccttgtagacacgtatacaagacaaca 41623816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 45255588 - 45255483
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||| | |||||| |||||||| |  |||||| || |  || | ||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  45255588 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaagtaatattttgcataattgagtgatgaagttgaccgatccgtaaaaattcagggacgaagttgatgat 45255489  T
Q  273 tcaatc 278  Q
    ||||||    
T  45255488 tcaatc 45255483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15432583 - 15432331
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15432583 taaactgaaaagtgaaaactgaactttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacatgacttccttcttgccacgtgtacaagacaacacaacatgc 15432484  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15432483 agggcgacatgtcagcatgactaatagagcacttggacgaatgaacctttttgatggacgtctgacaaattcagagactaaattgatatttcgcataatt 15432384  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     |  ||||||||| |  ||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15432383 gagggatgaatttgaccgacccataaaaattcaaggataaatttgatggttca 15432331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 37417528 - 37417276
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37417528 taaactgaaaattgaaaattggactttttccaaatcaattaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 37417429  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37417428 agggcaacagatcagcatggctaacggagcacttggacgaagggacctttttgatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataatt 37417329  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     |  |||||||||    ||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37417328 gagggatgaatttggccgacccatgaaaattcaaggacgaatatgatggttca 37417276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25619908 - 25619663
Alignment:
Q  31 aaaagtgaaaactggacttttc-caattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcga 129  Q
    |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  25619908 aaaagtgaaaactaaacttttttcaattcaatcaaattagtccttgaacatgtggcttctttcttgccacgtgtataagacaacgcaacatgcagagcga 25619809  T
Q  130 catgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagat 229  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |  |||    
T  25619808 cagatcaacatggctaacggagcacttggatggagggacctttttgatggacatatgacaaattcagggactaagttgatattttgcataattgagggat 25619709  T
Q  230 gaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    |||||| |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25619708 gaatttgaccgacccataaaaattcaaggacgaatttgatggttca 25619663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Original strand, 39266 - 39465
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39266 taaactgaaaagtgaaaactcaacattttccaattcaatcaaatttgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacacagcatgc 39365  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39366 aagacgacatatcagcatggctaacggaacacttggacggggggacctttttgatgaacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataatt 39465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 222
Target Start/End: Original strand, 29909534 - 29909728
Alignment:
Q  29 tgaaaagtgaaaactggacttttccaa-ttcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggc 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||    
T  29909534 tgaaaagtgaaaactcaactttttcaaattcaatcaaattagtcccttaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacacaacatgcaacgc 29909633  T
Q  128 gacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29909634 gacagatcaacatggctaacagagcacttggacggagggacctttttgatggacgtctgacaaattaagggactaaattgatatttcgcataatt 29909728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 74 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 42879559 - 42879360
Alignment:
Q  74 tgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttt 173  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  42879559 tgaacacgtgacttccttcttgtcacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatatcagcatgactaacggaacacttggacggagggacctttt 42879460  T
Q  174 tgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggtt 273  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42879459 tgatggacgtctgacaaattcatagactaagttgat-tttcgcataattaagggatgaatttgaccgacccgtaaaaatttaaggacgaatttgatggtt 42879361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Original strand, 92216 - 92415
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  92216 taaactgaaaagtgaaaactcaacattttccaattcaatcaaatttgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacacgtacaagacaacacagcatgc 92315  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  92316 aagacgacatatcagcatggctaacggagcacttggactgagggacctttttgatgaacgtctgacaaattcaaagactaagttgatatttcgcataatt 92415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 42001839 - 42001613
Alignment:
Q  48 ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaac 147  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  42001839 ttttccaattcaatcaaatcagtccttgaacacgtgacttccttcttgtcacgtgtacaagacaactcaacatgcagggcgacacatcaacatggctaac 42001740  T
Q  148 ggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgta 247  Q
    | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |  ||| |||||     ||| |||    
T  42001739 gaagcacttggatggatgaacctttttgat-gatgtctgacaaattcaaggattaaattgatatttcgcataatagagggataaatttggacaacccgta 42001641  T
Q  248 aaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42001640 aaaattcaaggacgaatttgatggttca 42001613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 41706794 - 41706542
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  41706794 taaattgaaaaatgaaaagtgaactttttccaaatcaatcaaattcgtccctgaacacgtgacttccttcttgccacgcgtacaagacagcacagcatgc 41706695  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41706694 aaggcgacatgtcagcatggctaacggagcccgttaacggagggacctttttgatggacgttcgataaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 41706595  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     |  || |||||| |  |||| || |||||||| | || || |||||||||||    
T  41706594 gagggacgaatttgaccgacccgtgaaaattcaggaactaaattgatggttca 41706542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15372754 - 15372555
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  15372754 taaattgaaaaatgaaaagtgaactttttccaaatcaatcaaattcgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacagcacaacatgc 15372655  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15372654 aaggcgacatgttagcatggctaacggagcccgttaacggagggacctttttgatggacgtctgataaattcagggattaaattgatattttgcataatt 15372555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 39720 - 39560
Alignment:
Q  114 acagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatattt 213  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||  |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  39720 acagcacgcatggcgacatgtcagcatggctaacgaagcacttggacggagggacctttttaatcgacgcctgataaattcagggattaaattgatattt 39621  T
Q  214 cgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttc 274  Q
    ||||||||| |  || ||||||    |||| ||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  39620 cgcataattgagggacgaatttggccgacccgtaaaaattcagggactaaattgatggttc 39560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 19908172 - 19908334
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  19908172 atcaaattagtccttgtacacgtggctgtcttgttgacacgtgtacatgacaacacagcatgcaagaggacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 19908271  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||| |||||| |||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19908272 cggagggaccattttgacggacgtctgtaaaattcaaggactaaatagatatttcgcaaaatt 19908334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16763293 - 16763086
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||    ||||| |||   |||||    
T  16763293 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaaaacaacatgcaagg-gacacgtcatcgccactaacagagattttgga 16763195  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 259  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  || |||||| |  ||  | ||||||||||||||    
T  16763194 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaattcagggacgaatttgaccgatttttaaaaattcaagga 16763095  T
Q  260 cgaatttga 268  Q
    |||||||||    
T  16763094 cgaatttga 16763086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 215
Target Start/End: Original strand, 39664674 - 39664829
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||| |  ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  39664674 atcaaattagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacagctagcaagaggacacatcatcaccactaacggagcttttgga 39664773  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcg 215  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  39664774 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcg 39664829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 14389010 - 14389172
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   |||||| | |  |||||    
T  14389010 atcaagttagtccttgtacacgtggctgccttattgacacgtgtacaagacaacacaacatgcaagaggacacatcatcactactaacgaaacttttgga 14389109  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14389110 cggagggaccattttgatggacatttggaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 14389172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 44709671 - 44709833
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||   |||||| |||  |||||    
T  44709671 atcaatttagtccttgtacacgtggatgtcttgttgacacgtgtacaagacaacacaacatgcaagaggacatatcatcaccactaacgaagcttttgga 44709770  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  44709771 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagttatttcgcaaaatt 44709833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 213
Target Start/End: Original strand, 42519131 - 42519284
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  42519131 atcaatttagtccttgtacacgtgactgccttgttgacacgtgtacaggacaacacagcatgcaagaggacacatcatcaccactaacggagcttttgga 42519230  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatattt 213  Q
     ||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  42519231 tggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatattt 42519284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40560441 - 40560279
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||||||   ||||| || |  |||||    
T  40560441 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgcgtacatgacaacacagcatgcaagaggacacatcatcaccactaacagaacttttgga 40560342  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  40560341 cggagggactattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 40560279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17946312 - 17946150
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||  | | |||  |||||||| |  |||||    
T  17946312 atcaatttagtccttgtacacgtgacttcctttttgacatgtgtacatgacaacacaacatacagggagccagcttagcatcactaacggaccttttgga 17946213  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  17946212 cggagggaccattttgatggacatgagagaaattcagggacaaaattgatattttgcaaaatt 17946150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 123
Target Start/End: Original strand, 10716777 - 10716872
Alignment:
Q  30 gaaaagtgaaaactggacttttc--caattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgca 123  Q
    ||||||||||||||| | |||||  || ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  10716777 gaaaagtgaaaactgaaattttcatcatttccatcaaattggtccttgtacacgtggcttccttgttgacacgtgtacaagacaacacaacatgca 10716872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6797725 - 6797563
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |  || |  ||||||    |||| ||||  |||||    
T  6797725 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacatcatgcaagaggatacatcatcacccgtaacagagcttttgga 6797626  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| | ||| ||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6797625 cggaggaaccattttgatagacgtctgtaaaattaagggactaaatagatatttcgcaaaatt 6797563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7744261 - 7744099
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||| ||| ||| | |  |  ||| |||  |||||||| |  |||||    
T  7744261 atcaatttagtcattgtacacgtggcttcctttttgacatgtgtacatgacaacacaacatacagagagctaactcagcatcactaacggaccttttgga 7744162  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
     ||| ||||| |||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  7744161 tggagggaccattttgatggacatgagagaaattcagggacgaaattgatatttcgcaaaatt 7744099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17696424 - 17696271
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  17696424 atcaatttagtccttgtacacatggctgccttgttgacacgtgtacaggacaacacaacatgcaagatgacacatcatcaccactaacggagcttttgga 17696325  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatattt 213  Q
    ||||  |||| ||||||| ||| | ||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  17696324 cggagtgaccattttgattgacgtttgtaaaattcagggactaaatagatattt 17696271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2767152 - 2766944
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| ||| ||| || ||||||| || |||| ||  |||||||||| ||||||||| ||| || |  ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  2767152 atcaatttaatccatgtacacgtgactgccttgttaacacgtgtacaggacaacacaacatacaagaggacacatcatcaccactaacggagcttttgga 2767053  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 259  Q
    | || ||||| ||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || || || ||| |  ||  | ||||||||||||||    
T  2767052 cagagggaccattttgatagacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaattcaaggacgagtttgaccgatttttaaaaattcaagga 2766953  T
Q  260 cgaatttga 268  Q
    |||||||||    
T  2766952 cgaatttga 2766944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 177
Target Start/End: Original strand, 862214 - 862335
Alignment:
Q  56 ttcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcact 155  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||   ||||||||  ||||  ||| ||   ||||||||||| |    
T  862214 ttcaatcaaattggtccttgtacacatggcttccttgtagacacgtgtacaagacaacaagccatgcaggaagacaactcaacagcactaacggagcatt 862313  T
Q  156 tggacggatggacctttttgat 177  Q
    |||||||| ||||  |||||||    
T  862314 tggacggaaggactattttgat 862335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 121
Target Start/End: Original strand, 11315263 - 11315324
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatg 121  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11315263 atcaaattggtccttgtacatgtggcttccttgttgacacgtgtacaagacaacacaacatg 11315324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 215
Target Start/End: Original strand, 11315336 - 11315396
Alignment:
Q  155 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcg 215  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11315336 ttggacggagggaccattttgatggacgtctgacaaattcaggaactattttgatatttcg 11315396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 275
Target Start/End: Original strand, 42880811 - 42880899
Alignment:
Q  187 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||| |  |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  42880811 acaaatttatggattaaattgatatttcgcataattaagggacgaatttgaccgacccgtaaaaattcagggacgaagttgatgattca 42880899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Original strand, 28248161 - 28248263
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  28248161 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttggccgacccgtaaaaattcagggacgaagttgatgat 28248260  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  28248261 tca 28248263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11021638 - 11021589
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11021638 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 11021589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 119
Target Start/End: Original strand, 11022940 - 11022999
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagca 119  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  11022940 atcaatttagtccctgtacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagccaacacagca 11022999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 222
Target Start/End: Original strand, 16377206 - 16377285
Alignment:
Q  143 ctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  16377206 ctaacggagcttttggacggagggaccattttgatggacgtatgtaaaattcaaggactaaatagatattttgcaaaatt 16377285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 222
Target Start/End: Original strand, 24208063 - 24208130
Alignment:
Q  155 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24208063 ttggacggagggactgatttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgaataatt 24208130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 28246860 - 28246801
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagca 119  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  28246860 atcaatttagtccctgtacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagccaacacagca 28246801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 40097766 - 40097711
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacac 115  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  40097766 atcaaattagttcttgtacacgtggcttccttgttgacacgtatataagacaacac 40097711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 222
Target Start/End: Original strand, 41708430 - 41708465
Alignment:
Q  187 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41708430 acaaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 41708465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33298 - 33196
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || || ||| ||    |||| || |||||||| ||||||| |||||| |    
T  33298 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcacataattgaaggacgaagttggccgacccgtgaaaattcagggacgaagttgatgat 33199  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  33198 tca 33196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 275
Target Start/End: Original strand, 41144 - 41230
Alignment:
Q  189 aaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||||||    |||| || |||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  41144 aaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaatttggccgacccgtgaaaattcagggacgaagttgatgattca 41230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Original strand, 37418755 - 37418857
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| || ||||||    |||| || |||||||||| ||||| |||||| |    
T  37418755 ttgattgacatttaacaaatttagggattagattgatattttgcataattaaaggacgaatttggccgacccgtgaaaattcaagtacgaagttgatgat 37418854  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  37418855 tca 37418857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 224
Target Start/End: Original strand, 6786002 - 6786071
Alignment:
Q  155 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaa 224  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  6786002 ttggacggagggactgatttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcaaataattaa 6786071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Original strand, 42003476 - 42003525
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  42003476 ttgattgacatttaacaaattcagagattaaattgatatttcgcataatt 42003525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 53)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 275
Target Start/End: Original strand, 47341559 - 47341807
Alignment:
Q  32 aaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacaca----gcatgcaggg 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  47341559 aaagtgaaaactggactttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcatgcaggg 47341658  T
Q  127 cgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaa 226  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |      
T  47341659 cgacatgtccccatggctaacggagcacttggacggagatacctttttgattaacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgagg 47341758  T
Q  227 gatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    |||||||||    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47341759 gatgaatttggccgacccgtgaaaattcaaggacgaatttgatggttca 47341807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 29 - 275
Target Start/End: Original strand, 46812456 - 46812703
Alignment:
Q  29 tgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggc 127  Q
    ||||||||||||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  46812456 tgaaaagtgaaaattgaaccttttcaaattcaatcaaagtagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacacgtacaagacaacacagcatgcagggc 46812555  T
Q  128 gacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaag 227  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |  |    
T  46812556 gacatatcagcatggctaacagagcacttggacggaatgacctttttgatggacgtctgacaaatttagggactaaattgatatttcacgtaattgaggg 46812655  T
Q  228 atgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    ||||||||    |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46812656 atgaatttggccgactcgtaaaaattcaaggacgaagttgatggttca 46812703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Original strand, 33038673 - 33038918
Alignment:
Q  31 aaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcga 129  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  33038673 aaaagtgaaaactagacattttccaattcaatcaaatcagtccttgaacacatggcttccttcttgacacgtgtataagacaacacaacatgcaggacga 33038772  T
Q  130 catgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagat 229  Q
    ||  ||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||    
T  33038773 cagatcaacatgcctaacagagcacttggacggagggacctttttgatggacgtctgaaaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgagggat 33038872  T
Q  230 gaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    |||||| |  ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33038873 gaatttgaccgacccataaaaattcaaggacgaatttgatgattca 33038918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23954056 - 23953808
Alignment:
Q  29 tgaaaagtgaaaactggactttt-ccaat-tcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcaggg 126  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23954056 tgaaaagtgaaaattggaatttttccactatccatcaaattagtcctggaacacgtggcttcctttttgccacgtgtacaagacaacacaacatgcatgg 23953957  T
Q  127 cgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaa 226  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |      
T  23953956 cgacatatcagcatggctaacggagcacttggacggagggacctttttgattgacgtctgacaaattcacggactaagttgatatttcgcataattgatg 23953857  T
Q  227 gatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    || |||||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23953856 gacgaattttaccgacccgtaaaaatttaaggacgaatttgatggttca 23953808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Original strand, 46996571 - 46996823
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46996571 taaactgaaaagtgaaaactcaacattttccaattcaatcaaattcgtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacacagcatgc 46996670  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  46996671 aaggcgacagatcagcatcgctaacggagcacttggacggagggacctttttgatggacgtctgacaaattcagtgactaagttgatatttcgcataatt 46996770  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     |  || ||| ||    |||  || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  46996771 gagggacgaagttggccgacgcgtgaaaattcagggacgaatttgatggttca 46996823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 40784601 - 40784349
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40784601 taaactgaaaagtgaaaatttgaccttttccaattcaatcaaattagtccttgaacatgtggcttccttcttgccacgtgtataagacaacacaacatgc 40784502  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||| |||||  ||| ||||  |||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  40784501 aggacgacagatcagcatgattaacagcgcatttggacggagggacctttttgatggatgtctgacaaattcaaagactaagttgatatttcgcataatt 40784402  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     || ||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40784401 gaaggatgaatttagctgacgcgtaaaaattcaagaacgaatttgatggttca 40784349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 60 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2167697 - 2167482
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2167697 atcaaattagtccttgaacgcgtggctttctttttgccacgtgtacaagacaacacatcatgcagggtgacacgtcagcatggctaatggagcacttgga 2167598  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 259  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||| |  |||| |||  ||||||||||    
T  2167597 cggagggacctttttgatgggcgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgagggatgaatttgaccgacccgtactaattcaagga 2167498  T
Q  260 cgaatttgatggttca 275  Q
    |  |||||||||||||    
T  2167497 catatttgatggttca 2167482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Original strand, 8423150 - 8423402
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8423150 taaattgaaaaatgaaaagtgaactttttccaaatcaatcaaattcgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacagcacagcatgc 8423249  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8423250 aaggcgacatgtcagcatggctaacggagcccgttaacggagggacctttttgattgacgtctgataaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 8423349  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     |  ||  |||||   ||||| || |||||||| |||| || |||||||||||    
T  8423350 gagggacaaatttggctgacccgtgaaaattcagggactaaattgatggttca 8423402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Original strand, 35344159 - 35344411
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  35344159 taaattgaaaaatgaaaagtgaactttttccaaatcaatcaaattcgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacagcacagcatgc 35344258  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35344259 aaggcaacatgtcagcatggctaacggagcccgttaacggagggacctttttgatggacgtcttataaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 35344358  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     |  || ||||||   ||||| || |||||||  |||| || |||||||||||    
T  35344359 gagggacgaatttggctgacccgtgaaaattcggggactaaattgatggttca 35344411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 60 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27955588 - 27955373
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  27955588 atcaaattggtccttgaacacatggcttccttgttgccaagtgtacaagacaacacaacatgcagcacgacacatcagcatgactaacggagcacttgga 27955489  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 259  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||| | |||| |  ||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  27955488 cggagggacctctttgatggacgtctgacaaattcagaaattaagttgatatttcgtaaaattgagggatgaatttagctgatccgtaaaaattcaagga 27955389  T
Q  260 cgaatttgatggttca 275  Q
    ||||||||||| ||||    
T  27955388 cgaatttgatgattca 27955373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2492544 - 2492332
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||  |||||| |  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  2492544 atcaaattagtccttgaacacgtgacttcctttttgccacgtgtacaagacagcagagcatgttgggcgatagatcaacatggctaacggagcacttgaa 2492445  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 259  Q
    |||| ||| |||||| |||||| | ||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||||| || ||| | ||| |  |||| |||||||||| ||||    
T  2492444 cgga-ggaacttttttatggacgtttgaaaaattcaagtattaagttgatatttcgcataattgaaggataattttgaccgacccgtaaaaattcgagga 2492346  T
Q  260 cgaatttgatggtt 273  Q
    ||||||||||||||    
T  2492345 cgaatttgatggtt 2492332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6602553 - 6602391
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||   ||||||||||  |||||    
T  6602553 atcaaattagtccttgtacacgtggctgcctggttgacacgtgtacatgacaacacagcatgcaaaaggacatgtcatcaccactaacggagcttttgga 6602454  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6602453 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 6602391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 39859135 - 39859297
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  39859135 atcaaattagtccttgtacacgtggctgtcttgttgacacgtgtacatgacaacacagcatgcaagaggacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 39859234  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||| |||||| |||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  39859235 cggagggaccattttgacggacgtctgtaaaattcaaggactaaatagatatttcgcaaaatt 39859297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 138 - 275
Target Start/End: Original strand, 38614896 - 38615032
Alignment:
Q  138 catggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaa 237  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |  ||||||||| |    
T  38614896 catggctaacagagcacttagacggagggacattttt-atggacgtctgacaaattcagggactaagttaatatttcgcataattgagggatgaatttga 38614994  T
Q  238 ttgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    | |||| || |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  38614995 tcgacccgtgaaaatttaaggacgaatttgatgtttca 38615032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13168341 - 13168163
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  13168341 atcaaattagtccttgtacacgtgtctgtcttgttgacacgtgtacatgacaacacagcatgcaagatgacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 13168242  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattc---agggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 235  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||   ||||||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||    
T  13168241 cggatggaccattttgatggacgtctgtaaaattcaggagggactaaatagatatttcgcaaaattcaaggacgaattt 13168163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 34776821 - 34776983
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||| | |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  |||| ||||||||  |||||||||   |||||    
T  34776821 atcaaattagttcttgtacatgtggttgccttgttggcacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacacgtcatcatcactaacggagtttttgga 34776920  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  34776921 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 34776983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 45359554 - 45359392
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  45359554 atcaaattagtccttgtacacgtgactgcctttttgaaacgtgtacatgacaacacagcatgcaagaggacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 45359455  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
     ||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  45359454 tggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcaaggactaaatagatatttcgcaaaatt 45359392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 275
Target Start/End: Original strand, 38613465 - 38613602
Alignment:
Q  138 catggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaa 237  Q
    ||||||||||  | ||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||      
T  38613465 catggctaacataacacttagacgaatggacattttttatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgagggatgaatttgg 38613564  T
Q  238 ttgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
      |||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  38613565 ccgacccgtgaaaattgaaggacgaatttgatggttca 38613602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38613712 - 38613610
Alignment:
Q  31 aaaagtgaaaactggac-ttttccaat-tcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcg 128  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38613712 aaaagtgaaaactggaaattttccactatccatcaagttagtccttgaacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagacaacacaccatgcagggcg 38613613  T
Q  129 aca 131  Q
    |||    
T  38613612 aca 38613610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 222
Target Start/End: Original strand, 37796104 - 37796249
Alignment:
Q  77 acacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttga 176  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |  ||||  ||| ||| |||||||||||   |||||||| ||||  ||||||    
T  37796104 acacgtggctgccttcttgacacgtgtagaagacaacacaacatgcaagaggacacatcagcatcgctaacggagcttatggacggagggactattttga 37796203  T
Q  177 tggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||| || |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37796204 tggacgtccgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 37796249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 235
Target Start/End: Original strand, 30940331 - 30940506
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||    ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  30940331 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacatgtgtacaggacaacacagcatgcaataggacacatcatcaccactaacggagcttttgga 30940430  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 235  Q
    ||||  |||| |||||||| || | ||  ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||| ||||||    
T  30940431 cggagagaccattttgatgaacgtttgtaaaattcagggactaaatagatatttcgtaaaattaagagacgaattt 30940506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1546505 - 1546343
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| | ||  ||| |||  |||||||| |  |||||    
T  1546505 atcaatttagtccttgtacacgtgacttcctttttgacacgtatataagacaacacaacatgcagggagccagctcagcatcactaacggaccttttgga 1546406  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |  || ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||    
T  1546405 cggagggaccattttgatggacgtgagagaaattcaaggacgcaattgatatttcgcaaaatt 1546343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 222
Target Start/End: Original strand, 38474057 - 38474211
Alignment:
Q  68 agtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatgga 167  Q
    |||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||||| || |  ||||  ||||||   ||||||||||  |||||||||||||    
T  38474057 agtccttgcacacgtggctgtcttgttgacacgtgtacaggacaacacagcatacaagaggacacatcatcaccactaacggagcttttggacggatgga 38474156  T
Q  168 cctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    || ||||||| | | ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38474157 ccattttgataggcgtctgtaaaattcaaggactaaatagatatttcgcaaaatt 38474211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Original strand, 47386115 - 47386323
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||||| |   |||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  47386115 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacttgtacaggacaacacatcatgcaagagaacacatcatcaccactaacggagcttttgga 47386214  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 259  Q
    ||||  |||| ||||||||||| ||||  ||||| || ||||||||  |||||||||| |||| || || |||||| | |||  | | |||||| |||||    
T  47386215 cggaatgaccattttgatggacgtctgtaaaatttagagactaaataaatatttcgcaaaattcaaggacgaatttgactgattttttaaaattaaagga 47386314  T
Q  260 cgaatttga 268  Q
    |||||||||    
T  47386315 cgaatttga 47386323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 203
Target Start/End: Original strand, 35693276 - 35693419
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  |||||| |  ||||  ||||||   ||||| || |  |||||    
T  35693276 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacactacatgcaagaggacacatcatcaccactaacagaacttttgga 35693375  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaa 203  Q
     ||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  35693376 tggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaa 35693419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 24228315 - 24228477
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||| | | |||||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   |||| |||||  |||||    
T  24228315 atcaatttagtcttcgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtatatgacaacacaacatgcaagaggacacatcatcaccactaatggagcttttgga 24228414  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    || | ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  24228415 cgaagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagagactaaatagatatttcgcaaaatt 24228477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Original strand, 45465170 - 45465272
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| || |  |||| ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  45465170 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttgaccgacccgtaaaaattcaaggacgaagttgatgat 45465269  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  45465270 tca 45465272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 31913691 - 31913566
Alignment:
Q  56 ttcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcact 155  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||   |||||||| |||||  ||| ||   ||||||||||| |    
T  31913691 ttcaatcaaattggtccttgtacacgtggcttccttgtagacacgtgtgcaagacaacaagccatgcaggacgacaactcagcaacactaacggagcatt 31913592  T
Q  156 tggacggatggacctttttgatggac 181  Q
    |||||||| | ||  |||||||||||    
T  31913591 tggacggaagaactattttgatggac 31913566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Original strand, 2168820 - 2168922
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||  |||||||||    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  2168820 ttgattgacatttaacaaattcaaggactaaattgatatttttcttaattaagggatgaatttggacgaccagtaaaaattcaaggacgaagttgatgat 2168919  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  2168920 tca 2168922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Original strand, 40785534 - 40785636
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||||||    |||| || |||||||||||||||| |||||| |    
T  40785534 ttgattgacatttaacaaattcagggattagattgatatttcacataattgagagatgaatttggccgacccgtgaaaattcaaggacgaaattgatgat 40785633  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  40785634 tca 40785636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 6056984 - 6056863
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||   |||||||| |||||  ||| ||   ||||||||||| |||||    
T  6056984 atcaaattggtccttgtagacgtggcttccttgtagacacgtgtacaatacaacaggacatgcaggacgacagctcagcagcactaacggagcatttgga 6056885  T
Q  160 cggatggacctttttgatggac 181  Q
    |||| ||||  |||||||||||    
T  6056884 cggaaggactattttgatggac 6056863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23962526 - 23962377
Alignment:
Q  56 ttcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcact 155  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||   ||||||||  ||||  ||| ||   ||||||||||| |    
T  23962526 ttcaatcaaattggtccttgtacatgtggcttccttgtaggcacgtgtacaagacaacaagccatgcaggaagacaactcagcagcactaacggagcatt 23962427  T
Q  156 tggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaat 205  Q
    | |||||| ||||  ||||||| ||| | ||  |||||||||||| ||||    
T  23962426 ttgacggaaggactattttgattgacgtttgttaaattcagggacaaaat 23962377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4321143 - 4321092
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaa 224  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4321143 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattaa 4321092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 30108670 - 30108563
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  30108670 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttggccgacccgtaaaaattcagggacgaagttgatgat 30108571  T
Q  273 tcaatcgt 280  Q
    ||| ||||    
T  30108570 tcactcgt 30108563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33775497 - 33775418
Alignment:
Q  189 aaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttga 268  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| || |  |||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  33775497 aaattcagggattaaattgatatttcgcataattgaaggacgaagttgaccgacccgtaaaaattcagggacgaagttga 33775418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 48704431 - 48704337
Alignment:
Q  29 tgaaaagtgaaaactggacttttc--caattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatg 121  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |  ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  48704431 tgaaaagtgaaaactgaaattttcatcgtttccatcaaattggtccttgtacacgtgacttccttgttgacacgtgtacacgacaacacaacatg 48704337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 46994765 - 46994663
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| ||    |||| || |||||||| ||||||| |||||| |    
T  46994765 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgaaggacgaagttggccgacccgtgaaaattcagggacgaagttgatgat 46994666  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  46994665 tca 46994663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 222
Target Start/End: Original strand, 48852222 - 48852415
Alignment:
Q  31 aaaagtgaaaactggactttt--ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcg 128  Q
    |||||| ||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| |||| | |  |    
T  48852222 aaaagttaaaactggaatttttaccatttccatcaaattagttcttgtacacgtgactgtcttgttgacacatgtacaagacaacacatcatgtaagagg 48852321  T
Q  129 acatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||  ||||||   ||||| ||||  |||||| ||  |||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  48852322 acacatcatcaccactaacagagcttttggaccgagagaccattttgatggacgtctgtaaaattcaaggattaaatagatattttgcaaaatt 48852415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 46810810 - 46810761
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46810810 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 46810761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 34691192 - 34691136
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacaca 116  Q
    ||||| ||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34691192 atcaatttaatccctgtacacgtggcttccttgttgccacgtgtacaagccaacaca 34691136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8421507 - 8421472
Alignment:
Q  187 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8421507 acaaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 8421472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 35342516 - 35342481
Alignment:
Q  187 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35342516 acaaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 35342481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 222
Target Start/End: Original strand, 37115515 - 37115594
Alignment:
Q  143 ctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  37115515 ctaacggagcttttggacggagggactattttgatggacgtctgtaaaattcaggtactaaatagatattttgcaaaatt 37115594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 123
Target Start/End: Original strand, 46439436 - 46439499
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgca 123  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  46439436 atcaatttagtccatgtacacgtggctgccctgttgacacgtgtacaagacaacacaacatgca 46439499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 163
Target Start/End: Original strand, 46867841 - 46867943
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  ||| ||   ||||||||||| |||||    
T  46867841 atcaaattggtccttgtacatgtggcttccttgaagacacgtgtacaagacaaca-tgcatgcaggacgacagctcagcagcactaacggagcatttgga 46867939  T
Q  160 cgga 163  Q
    ||||    
T  46867940 cgga 46867943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 119
Target Start/End: Original strand, 48303576 - 48303635
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagca 119  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  48303576 atcaatttagtccctgtacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagccaacacagca 48303635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3690255 - 3690153
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |   | ||| ||    || ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3690255 ttgattgacatttaacaaattcaaggattaaattgatatttcgcataattgaggaacgaagttggccgaactgtaaaaattcaaggacgaagttgatgat 3690156  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  3690155 tca 3690153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Original strand, 38614778 - 38614880
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||| |  ||||  |||||||||||||||| | |||||| |    
T  38614778 ttgattgacatttaacaaactcaaggactaagttgatattttgcataattgagggatgaatttgaccgacccataaaaattcaaggacgtagttgatgat 38614877  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  38614878 tca 38614880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 56435 - 56386
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  56435 ttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 56386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 13034888 - 13034820
Alignment:
Q  63 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgaca 131  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  ||   || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13034888 aaattggtccttgtacacgtggctgactagatgacacgtgtacaggacaacacagcatgcaggacgaca 13034820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 223
Target Start/End: Original strand, 19712264 - 19712332
Alignment:
Q  155 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatta 223  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  19712264 ttggacggtgggaccattttgatggacgtctaataaattcagagactaatgtgatatttcacataatta 19712332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20478165 - 20478105
Alignment:
Q  155 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcg 215  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20478165 ttggacggagggactgatttgatggacgtctgcaaaattcagggactaatttgatatttcg 20478105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 45463867 - 45463811
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacaca 116  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||    
T  45463867 atcaatttagtccctgtacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagccaacaca 45463811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1320865 - 1320620
Alignment:
Q  31 aaaagtgaaaactggacttttc-caattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcga 129  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1320865 aaaagtgaaaactgaacttttttcaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacatagcatgcagggcga 1320766  T
Q  130 catgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagat 229  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |  |||    
T  1320765 catgtcaccatggctgacggaacacttggacggaaggaccttatttatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatattttgcataattgagggat 1320666  T
Q  230 gaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    |||||||   |||| || |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1320665 gaatttagccgacccgtgaaaatttaaggacaaatttgatggttca 1320620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Original strand, 42897643 - 42897895
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42897643 taaattgaaaagtgataattggactttttccaaataaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 42897742  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  42897743 aggacgacagatcagcatggctaacagagcacttggacggagggacctttttgatggacgtctgacaaattcaaggactaagttgatatttcacataatt 42897842  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     |  || ||||||    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42897843 gagggacgaatttggccgacccgtaaaaattcaaggacggatttgatggttca 42897895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 275
Target Start/End: Original strand, 37525898 - 37526144
Alignment:
Q  30 gaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcg 128  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||    
T  37525898 gaaaagtgaaaatttgactttttccaattgaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtataagacaacacaacatacaggacg 37525997  T
Q  129 acatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaaga 228  Q
    |||  ||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |    
T  37525998 acagatcaacatgactaacagcgcacttggacggagggacctttttgatggatgtctgaaaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgaagaa 37526097  T
Q  229 tgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    ||||||| |  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37526098 tgaatttgaccgacgcgtgaaaattcaaggacgaatttgatggttca 37526144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Original strand, 38882666 - 38882918
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||| ||| ||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38882666 taaactgaaaagtgaaaactgtaatttttccacttccattaaattggtccttgaacacgtgacttccttgttgccacgagtacaagacaacacagcatgc 38882765  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  38882766 aggacgacagatcaacatggctaacggagcacttggacggagggacattttttatggacgtctgacaaattcagggattaaattgatatctcgcatagtt 38882865  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     || ||||||||| |  || | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882866 gaaggatgaatttgaccgatccgtgaaaattcaaggacgaatttgatggttca 38882918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8654754 - 8654556
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  8654754 taaattgaaaagtgaaaagtgaactttttccaattcaatcaaattagtccttgaacatgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacattgcatgc 8654655  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||||    
T  8654654 agggcgacatgtcagcatggctaacggagcacttggacggagggacccttttgatggacgtctgataaattcaagaattaaa-tgatatttcgcataatt 8654556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 273
Target Start/End: Original strand, 33160022 - 33160267
Alignment:
Q  29 tgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtg-gcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcaggg 126  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  33160022 tgaaaagtgaaaacttgaatttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtgagctt-cttcttgccacgtgtataagacaacacaacatgcaggg 33160120  T
Q  127 cgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaa 226  Q
    |||||  ||| |||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |      
T  33160121 cgacagatcagcatggctaacagagcacttaggtggagggacctttttgatgggcgtctgacaaattcagagactaagttgatatttcacataattgagg 33160220  T
Q  227 gatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggtt 273  Q
    |||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33160221 gatgaatttggccgacctgtgaaaattcaaggacgaatttgatggtt 33160267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Original strand, 462241 - 462491
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggacttttccaa-ttcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  462241 taaactgaagagtgaaaactgaactttttcaaattcaatcaaattagtccttgaacact--gcttccttcttgccacgtgtataagataacacaacatgc 462338  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | |||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  462339 acggcgacaaatcagcatggctaacagagcacttggatggagggatctttttgatggacgtttgacaaattcaaggactaagttgatatttcgcataatt 462438  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     |  |||||||||    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  462439 gacggatgaatttggccgatctgtaaaaattcaatgacgaatttgatggttca 462491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 32822608 - 32822364
Alignment:
Q  31 aaaagtgaaaactggacttttccaa-ttcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcga 129  Q
    ||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  32822608 aaaagtgaaaattgaactttttcaaattcaatcaaattagtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacaaagcatgcatggcga 32822509  T
Q  130 catgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagat 229  Q
    ||  ||| ||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||| |  |||    
T  32822508 cagatcagcat-gctaacaaagcacttggacggaaggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaagttgatattttaaataattgagggat 32822410  T
Q  230 gaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    ||||||    || |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32822409 gaatttggccgatccataaaaattcaaggacgaagttgatggttca 32822364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Original strand, 33750253 - 33750452
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33750253 taaactgaaaagtgaaaactcaacattttccaattcaatcaaattcgtccctgaacacatggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacacaacatgc 33750352  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | | |||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33750353 aagacgacagatcaacatcgctaacagagcacttggacggagggacctttttgatgaatgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataatt 33750452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Original strand, 31201012 - 31201264
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  31201012 taaattgaaaaatgaaaagtgaactttttccaaatcaatcaaattcgtccctgaacacatgacttccttcttgccacgcatacaagacaacacatcatgc 31201111  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31201112 aaggcgacatgtcagcatggctaacggagcccgttaacggagggacctttttgatggacgtctgataaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 31201211  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     |  || ||||||    |||| || |||||||| |||| || |||||||||||    
T  31201212 gatggacgaatttggccgacccgtgaaaattcagggactaaattgatggttca 31201264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31821663 - 31821421
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggacttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgca 123  Q
    |||| ||||| |||||||||  | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||         ||||||||||||| ||||||    
T  31821663 taaactgaaatgtgaaaactcaaatttttcaattcaatcaaattagtccctgaacacgtggcttccttctt---------acaagacaacacatcatgca 31821573  T
Q  124 gggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatta 223  Q
     | |||||  ||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||     
T  31821572 agacgacagatcagcaaggctaacagaggacttggacggagggacctttttgatggacgtctgataaattctgggactaagttgatatttcgcataattg 31821473  T
Q  224 aaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    |  || ||| || |  ||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31821472 agggacgaagttgaccgacgtgtgaaaattcagggacgaatttgattgttca 31821421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 8609714 - 8609875
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  8609714 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgtcgacacgtgtacaagacaacacagcatgcaagg-gacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 8609812  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8609813 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 8609875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 13108263 - 13108424
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||   |||||| |||  |||||    
T  13108263 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacagcatgcaagg-gacacgtcatcaccactaacgaagcttttgga 13108361  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13108362 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 13108424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38547445 - 38547284
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  38547445 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacagcatgcaagg-gacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 38547347  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
     ||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  38547346 tggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 38547284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Original strand, 41825570 - 41825778
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| || ||||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||||||   ||||| ||||  |||||    
T  41825570 atcaaattagtccttgtacacgtgactgccttgttgacatgtgtacaggacaacacagcatgcaagaagacacatcatcactactaacagagcttttgga 41825669  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 259  Q
    ||||  |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||| ||||  | | ||||||||||||    
T  41825670 cggagtgaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaattcaaggacgaatttatttgatttttgaaaattcaagga 41825769  T
Q  260 cgaatttga 268  Q
    |||||||||    
T  41825770 cgaatttga 41825778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9184601 - 9184445
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||   |||| | |||| |||||    
T  9184601 atcaaattggtctttgtacacgtggattccttgttgacacatgtacaagacaacacatcatgcagggcgacagatcagcagcactaatgaagcatttgga 9184502  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgc 216  Q
    |||| ||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9184501 cggagggaccatttcgatcgacgtctgacaaattcagggactaatttgatatttcgc 9184445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 214
Target Start/End: Original strand, 9673091 - 9673245
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   |||||| |||  || ||    
T  9673091 atcaaattagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaagacacatcatcaccactaacgaagcttttaga 9673190  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttc 214  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9673191 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggattaaatagatatttc 9673245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13282660 - 13282534
Alignment:
Q  95 gccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattc 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||||   ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||  ||||||    
T  13282660 gccacgtgtacaagacaacagagcatgcaagg-gacacatcatcaccactaacggagcttttggacggagggaccattttgatggacgtttgtaaaattc 13282562  T
Q  195 agggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13282561 agggactaaatagatatttcgcaaaatt 13282534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 26242240 - 26242402
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||  ||| |||| ||| | |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||  |||||    ||||||||||  |||||    
T  26242240 atcaaattagttattgtacacatggttgccttgttgacacgtgtacaagacaacacaacatgcaagaggacacatcatcgccactaacggagcttttgga 26242339  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  26242340 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagagactaaatagatatttcgcaaaatt 26242402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 214
Target Start/End: Original strand, 41042510 - 41042664
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| |||| ||| ||| ||| || |||||||||||||||| |  ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  41042510 atcaatttagtccttgtacccgtggctgccttgttgacacatgtgcaggacaacacagcatgcaagaggacacatcatcaccactaacggagcttttgga 41042609  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttc 214  Q
    |||| ||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41042610 cggagggaccattttgatggacgcctgtaaaattcagggactaaatagatatttc 41042664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 217
Target Start/End: Original strand, 13486025 - 13486182
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||| | ||||||| |||||| |  ||||  ||||||   |||| |||||  |||||    
T  13486025 atcaatttagtccttgtacacgtgactgccttgttgacacgtgtacagggcaacacaacatgcaagaggacacatcatcactactaatggagcttttgga 13486124  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgca 217  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13486125 cagagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgca 13486182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Original strand, 7745038 - 7745246
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| |||  || || |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  7745038 atcaaattagtccttgtacatatgactgccttgttgacacgtgtacaagacaacacatcatgcaagaggacacatcatcaccactaacggagcttttgga 7745137  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 259  Q
     ||| ||||| ||||||||||  ||||  |||| ||||||||||||  |||||||||| |||| | ||| ||||||   |||  | | ||||||||| ||    
T  7745138 tggagggaccattttgatggatgtctgtaaaatacagggactaaataaatatttcgcaaaattcagagacgaatttggctgatttttgaaaattcaaaga 7745237  T
Q  260 cgaatttga 268  Q
    |||||||||    
T  7745238 cgaatttga 7745246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5036667 - 5036509
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagc----act 155  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||  |||||||  ||||| ||||    | |    
T  5036667 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacaacatgcaagaggacacatcatcatcactaacagagctttaatt 5036568  T
Q  156 tggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttc 214  Q
    ||||||||  |||| ||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5036567 tggacggagagaccattttgatagacgtctgtaaaattcaaggactaaatagatatttc 5036509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 222
Target Start/End: Original strand, 40339612 - 40339768
Alignment:
Q  66 ttagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatg 165  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| || ||||||| ||||||||| ||||||    || |  ||||||   ||||||||||  ||||| | | |    
T  40339612 ttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacaggtgtacatgacaacacaacatgcaaaaggatacatcatcactactaacggagcttttggatgaagg 40339711  T
Q  166 gacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  40339712 gaccattttgatggacatctgtaaaattcatggactaaatagatatttcacataatt 40339768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 42941992 - 42941784
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||| |  ||||  |||||    |||||||||   |||||    
T  42941992 atcaatttagtccttgtacatgtggctgccttgttgacacgtgtacctgacaacacaacatgcaagaggacacatcatctccactaacggagattttgga 42941893  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 259  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| || |||| |  || ||||||   |||  | | ||||||||||||    
T  42941892 cggagggactattttgatggacatctgtaaaattcagggactaaataaatatttctcaaaattcagggacgaatttggctgattttttaaaattcaagga 42941793  T
Q  260 cgaatttga 268  Q
    |||||||||    
T  42941792 cgaatttga 42941784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33158747 - 33158659
Alignment:
Q  187 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |   |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33158747 acaaattcaaggattaaattgatatttcgcataattgaataatgaatttgagccacctataaaaattcaaggacgaagttgatgattca 33158659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33368864 - 33368762
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  |  ||   |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  33368864 ttgattgacatttaacaaattcaaggattaaattgatatttcgcataattgagagatgaattcgaccgattcgtaaaaattcaaagacgaatttgatgat 33368765  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  33368764 tca 33368762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 37524963 - 37524873
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaa 263  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| || || ||||||||||| |||||||||  ||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||    
T  37524963 ttgattgacatttaacaaattcagagattagattgatatttcacataattaagggatgaatttgaccgacccgtaaaaattcaaggacgaa 37524873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 42894881 - 42894784
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatg 270  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||  | |||| || ||||||||| ||| || ||||||    
T  42894881 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattaagggacgaatttggtcgacccgtgaaaattcaaagacaaagttgatg 42894784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 114
Target Start/End: Original strand, 15145664 - 15145722
Alignment:
Q  56 ttcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaaca 114  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  15145664 ttcaatcaaattggtccttgtacatgtggcttccttgtcgacacgtgtacaagacaaca 15145722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27691372 - 27691210
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  |||  || |||||||||| ||||||| |||||||| |  | ||  ||||||    | ||||| |  |||||    
T  27691372 atcaatttagtccttgtacacgtggctgacttgctgacacgtgtacaggacaacaaagcatgcaagaagccacatcatcactattgacggaccttttgga 27691273  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27691272 cggagggacggatttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 27691210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 40019261 - 40019159
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||    |||| |||||||||||| |||||| |||||| |    
T  40019261 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttggccgacccgtaaaaattcaaagacgaagttgatgat 40019162  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  40019161 tca 40019159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 461281 - 461184
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatg 270  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |  |||||||||    |||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  461281 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgttatttcacataattgagggatgaatttggccgacccgtgaaaattcaaggacgaagttgatg 461184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 116
Target Start/End: Original strand, 28433643 - 28433699
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacaca 116  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  28433643 atcaatttagtccatgtacacgtggcttcctttttcccacgtgtacaagccaacaca 28433699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 132
Target Start/End: Original strand, 11722732 - 11722787
Alignment:
Q  77 acacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacat 132  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||    
T  11722732 acacgtggcttccttgttgacacgtgtacaacacaacacaacatgcaagacgacat 11722787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 33748437 - 33748330
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || || ||| ||    |||| || |||||||| ||||||| |||||| |    
T  33748437 ttgattgacatttaacaaattcaggaattaaattgatatttcgcataattgaaggacgaagttggccgacccgtgaaaattcagggacgaagttgatgat 33748338  T
Q  273 tcaatcgt 280  Q
    ||| ||||    
T  33748337 tcactcgt 33748330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 235
Target Start/End: Original strand, 25707287 - 25707349
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 235  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  25707287 ttgattgacgtctcacaaattcagggattaagttgatatttcgcataattgagggatgaattt 25707349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Original strand, 9186631 - 9186680
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||| ||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9186631 ttgattgacatatgccaaatttagggactaatttgatatttcgcataatt 9186680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9672066 - 9671989
Alignment:
Q  189 aaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaattt 266  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |  || |||||| |||||   || |||||||||||||||||||    
T  9672066 aaattcggggactaaatagatatttcgcaaaattcatggacgaatttgattgattggtgaaaattcaaggacgaattt 9671989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11031534 - 11031485
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  11031534 ttgattgacatatgacaaactcaggaactaatttgatatttcgcataatt 11031485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24527001 - 24526952
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24527001 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcacataatt 24526952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Original strand, 25373608 - 25373657
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  25373608 ttgattgacgtctgacaaattcaggaattaagttgatatttcgcataatt 25373657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31199576 - 31199539
Alignment:
Q  187 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaa 224  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31199576 acaaattcagggattaaattgatatttctcataattaa 31199539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Original strand, 31823462 - 31823511
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31823462 ttgattgacatttaacaaatttagggattaaattgatatttcgcataatt 31823511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Original strand, 32824257 - 32824306
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32824257 ttgattgacatttaacaaattcagtgattaaattgatatttcgcataatt 32824306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Original strand, 9876548 - 9876612
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaa 237  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||    
T  9876548 ttgattgacatttaacaaattcaggtattaaattgatattttgcataattaagggatgaagttaa 9876612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 46)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 35996318 - 35996119
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35996318 taaattgaaaagtgaaaagtgatctttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacaacatgc 35996219  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  35996218 atggcgacatgtcagcatggctaacggagcacttggacggagggacctttttgatggacgtctgataaattcagggattaaattgatattttgcacaatt 35996119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 275
Target Start/End: Original strand, 44558368 - 44558614
Alignment:
Q  30 gaaaagtgaaaactggacttttccaa-ttcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcg 128  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |    
T  44558368 gaaaagtgaaaactgaactttttcaaattcaatcaaatgagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacagagcatgcatggtg 44558467  T
Q  129 acatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaaga 228  Q
    |||  ||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||    
T  44558468 acagatcagcatggctaacatagcacttggacggaaggacctttttgatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgaggga 44558567  T
Q  229 tgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    |||||||    |||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  44558568 tgaatttggccgacccgtgaaaattcaaggacgaagttgatggttca 44558614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Original strand, 51041800 - 51042051
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  51041800 taaactgaaaagtgaaagctagactttttccaattcaatcaaattagtccttgaacatgtggcttccttcttgccacgtgtataagacaacacaacatgc 51041899  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  51041900 agggcgacagatcagcatggctaacaaagcacttggatggagggacctttttgat-gacgtctgacaaattcatggactaagttgatatttcacataatt 51041998  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     |  ||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  51041999 gagggatgaatttgaccgacctgtaaaaatttaaggacgaatttgacggttca 51042051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27625030 - 27624816
Alignment:
Q  54 aattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  27625030 aattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacacgtacaagacaacaaagcatgcatggcgacagatcaacatggctaacagagca 27624931  T
Q  154 cttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaatt 253  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||| |||||||||    
T  27624930 ctttgacggaatgacctttttgatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgaaagatgaatttgaccaacccgtaaaaatt 27624831  T
Q  254 caaggacgaatttga 268  Q
    ||||| |||| ||||    
T  27624830 caagggcgaagttga 27624816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 47942066 - 47941814
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  47942066 taaattgaaaaatgaaaagtgaactttttccaaatcaatcaaattcgtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacagcacaacatgc 47941967  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47941966 aaggcgacatgtcagcatggctaacggagcccgttaacggagggacctttttgatggacgtctgataaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 47941867  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     | ||| |||||| |  |||| ||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  47941866 gagagacgaatttgaccgacccgtaaaaattcagggactaaattgatggttca 47941814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 48 - 222
Target Start/End: Original strand, 2350398 - 2350575
Alignment:
Q  48 ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaaga---caacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggct 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  2350398 ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagagtacaacacagcatgcagagcgacatgtcagcatggct 2350497  T
Q  145 aacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  2350498 aacggagcacttggacagagggacctttttgatgaacgtctgataaattcagagattaaattgatatttcgcataatt 2350575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Original strand, 44794629 - 44794881
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  44794629 taaattgaaaaatgaaaagtgaactttttccaaatcaatcaaattcgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacatcacagcatgc 44794728  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44794729 aaggcgacatgtcagcatggctaacggagcccgttaacggagggacctttttgatggacgtctgataaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 44794828  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     |  || |||||| |  ||| ||| |||||||| |||| || |||||||||||    
T  44794829 gagggacgaatttgaccgacgtgtgaaaattcagggactaaattgatggttca 44794881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2827659 - 2827460
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2827659 taaactgaaaagtgaaaactcaacatttttcaattcaatcaaattagtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacacatcatgc 2827560  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | | |||||  ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  2827559 aagacgacagatcagcaaggctaacggaggacttggacggagggacctttttgatggacgtctgacaaattcaaggactaagttgatatttcacataatt 2827460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 60 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4519594 - 4519379
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||    
T  4519594 atcaaattagtccttgaacacgtgactttctttttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacagatcagcatggctaacggagcatttgga 4519495  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 259  Q
    |||| |||||||||||||| |  ||| |||||||||  | ||||  ||||||||||||||||| |  |||||||||     ||| |||||||||||||||    
T  4519494 cggagggacctttttgatgaatgtctaacaaattcaaaggctaagctgatatttcgcataattgagggatgaatttggccaaccggtaaaaattcaagga 4519395  T
Q  260 cgaatttgatggttca 275  Q
    |||||||||| |||||    
T  4519394 cgaatttgattgttca 4519379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10762836 - 10762584
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  10762836 taaattgaaaaatgaaaagtgaactttttccaaatcaatcaaattcgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaggacagcacagcatgc 10762737  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  10762736 caggcgacatgtcagcatggctaacggagcccgttaacggagggacctttttgatggacgtctgacaaattcagggatgaaattgaaatttcgcataatt 10762637  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     |  ||  |||||    |||  || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  10762636 gagggactaatttggccgacgcgtgaaaattcagggacgaatttgatggttca 10762584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 59 - 275
Target Start/End: Original strand, 10372611 - 10372827
Alignment:
Q  59 aatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgg 158  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  | |      
T  10372611 aatcaaattcgtccctgaacacgtggcttctttcttgccacgcgtacaagacagcacagcatgcaaggcgacatgtcagcatggctaacggagtccgtta 10372710  T
Q  159 acggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagg 258  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||  |||||    |||  || |||||||| ||    
T  10372711 acggagggacctttttgatggacgtctgacaaattcagggatgaaattgatatttcgcataattgagggactaatttggccgacgcgtgaaaattcaggg 10372810  T
Q  259 acgaatttgatggttca 275  Q
    |||||||||||||||||    
T  10372811 acgaatttgatggttca 10372827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 51012143 - 51011936
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||   ||||| ||||  |||||    
T  51012143 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacatcatgcaagg-gacacgtcatcactactaacagagcttttgga 51012045  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 259  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||  | |||||| |  ||  | | ||||||||||||    
T  51012044 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagagactaaatagatatttcgcaaaattcaagaaagaatttgaccgattttttaaaattcaagga 51011945  T
Q  260 cgaatttga 268  Q
    |||||||||    
T  51011944 cgaatttga 51011936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 2693159 - 2693320
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |  ||||  |||||||  |||| ||| |   ||||    
T  2693159 atcaaattagtccttgtacacgtggctgccttcttgacacgtgtacaggacaacacagcatgcaagatgacacatcatcatcactaatggaacttatgga 2693258  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | | |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  2693259 cggatggaccattttgatggacatttta-aaattcaaagactaaatagatatttcgcaaaatt 2693320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 222
Target Start/End: Original strand, 41761658 - 41761814
Alignment:
Q  66 ttagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatg 165  Q
    |||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |  ||||  ||||||   |||||| |||  ||||||||| |    
T  41761658 ttagtccttgtacacgtgactgccttgttgacacgtgtacatgagaacacagcatgcaagaggacacatcatcaccactaacgaagcttttggacggagg 41761757  T
Q  166 gacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  41761758 gaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 41761814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 259
Target Start/End: Original strand, 48646653 - 48646852
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||| | ||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   |||||| |||  |||||    
T  48646653 atcaaattagtccttgtacacgtggttgccttgttgacacgtgtaaatgacaacacaacatgcaagaggacacatcatcaccactaacgaagcttttgga 48646752  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 259  Q
    |||| ||||| |||||||| |  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || || |||||||  |||| | | ||||||||||||    
T  48646753 cggaaggaccattttgatgaaggtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgctaaattcaaggacgaatttagctgacttttgaaaattcaagga 48646852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Original strand, 35404351 - 35404527
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||| | |  |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  35404351 atcaatttagtcattgtacacgtggctgtcttgttgacacatgtacatgacaacacaacatggaagaggacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 35404450  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattta 236  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||| |||| || || |||||||    
T  35404451 cggatggaccattttgttggacgtctgtaaaattcagggattaaataaatatttcgcaaaattgaaggacgaattta 35404527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Original strand, 39922993 - 39923095
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  39922993 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttggccgacctgtaaaaattcagggacgaaattgatggt 39923092  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  39923093 tca 39923095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 121
Target Start/End: Original strand, 11255846 - 11255907
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatg 121  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11255846 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacagcatg 11255907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 25993747 - 25993653
Alignment:
Q  29 tgaaaagtgaaaactggacttttc--caattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatg 121  Q
    |||||||||||||||| | |||||  || ||| |||||||| |||| || |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  25993747 tgaaaagtgaaaactgcaattttcatcatttccatcaaattggtccatgtacacgtggcttcattgttgacacgtgtacaagacaacacatcatg 25993653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42980853 - 42980698
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||| ||  ||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   ||||| ||||  |||||    
T  42980853 atcaatttagtctttgtacacgtgactgtcttgttgacacgtgtacaggacaacacaacatgcaagaggacacatcatcaccactaacagagcttttgga 42980754  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcg 215  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  42980753 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattaagggactaaatagaaatttcg 42980698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41781757 - 41781595
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| ||||| |||| |||| ||||| | || ||| |||  ||||| ||||||||| |||||| |  ||||  |||||||  ||||||||||  |||||    
T  41781757 atcaatttagttcttgtacacatggctgctttgttgacacacgtacatgacaacacatcatgcaagaggacacatcatcatcactaacggagcttttgga 41781658  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||    
T  41781657 cggagggaccattttgatggatgtctgtaaaattcagggactaaataaatattttgcaaaatt 41781595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 43778494 - 43778392
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| || |  |||| ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  43778494 ttgattgacatttaacaaatttagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttgaccgacccgtaaaaattcaaggacgaagttgatgat 43778395  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  43778394 tca 43778392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 49523342 - 49523180
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| || |  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |  | ||  ||||||   ||||||||    |||||    
T  49523342 atcaatttagtctttgtacacgcggttgtcttgttgacacgtgtacaagacaacacaacatgcaagaaggcacatcatcaccactaacggattttttgga 49523243  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  49523242 cggagggaccattttgatgaacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 49523180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 200
Target Start/End: Original strand, 26296800 - 26296940
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||   |||||| | |||||  ||||||   ||||| || || |||||    
T  26296800 atcaaattggtccttgtatacgtggcttccttgtagacacgtgtacaagacaacatgacatgcaagacgacagctcatcaacactaacagatcatttgga 26296899  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggac 200  Q
     |||  |||  ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26296900 tggaatgactattttgatggacgtttgacaaattcagggac 26296940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 27382335 - 27382284
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagaca 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  27382335 atcaaattagtccttgtacacgtggctttcttgttgacacgtgtacaagaca 27382284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Original strand, 39085138 - 39085240
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| || |  |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  39085138 ttgattgacatttaacaaattcatggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttgaccgacccgtaaaaattcagggacgaagttgatgat 39085237  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  39085238 tca 39085240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 50131380 - 50131326
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaaca 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  50131380 atcaaattagtccttgtacacgtgacttccttgtagacacgtgtacaagacaaca 50131326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 51040840 - 51040778
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 235  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  51040840 ttgattgacatttaacaaattcagggattgaattgatatttcgcataattgaaggatgaattt 51040778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 235
Target Start/End: Original strand, 52868092 - 52868230
Alignment:
Q  97 cacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcag 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||    ||||||||||  ||||||| |  |||| ||||||| | | ||||  ||||||||    
T  52868092 cacgtgtacatgacaacacagcatgcaagaggacacgtcatcgccactaacggagcttttggacgaagtgaccattttgataggcgtctgttaaattcag 52868191  T
Q  197 ggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 235  Q
     |||||||| ||||||||||| |||| | ||| ||||||    
T  52868192 agactaaatagatatttcgcaaaatttatagacgaattt 52868230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11601921 - 11601745
Alignment:
Q  29 tgaaaagtgaaaactggactttt--ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcaggg 126  Q
    |||||||| ||||||| | ||||  ||| ||| |||||||||||||||  |||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||| |     
T  11601921 tgaaaagttaaaactgcaatttttaccatttccatcaaattagtccttatacacgtgattgccttcttgacacgtgtacatgacaacacaacacgcaaga 11601822  T
Q  127 cgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaa 203  Q
     ||||  ||| |||  |||||| |||   ||||| || ||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  11601821 ggacacatcagcatcactaacgaagcttgtggacagagggactattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaa 11601745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Original strand, 27626714 - 27626763
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27626714 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 27626763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 5484737 - 5484678
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagca 119  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  5484737 atcaatttagtccctgtacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagccaacacagca 5484678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 215
Target Start/End: Original strand, 13450970 - 13451041
Alignment:
Q  144 taacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcg 215  Q
    |||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  13450970 taacagagcatttggatggagggaccattttgatggacgtctgataaattcaaggactattttgatatttcg 13451041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 32652296 - 32652237
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagca 119  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||    
T  32652296 atcaatttagtccatgtacacgtggcttcctttttcccacgtgtataagccaacacagca 32652237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 119
Target Start/End: Original strand, 42880688 - 42880747
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagca 119  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  42880688 atcaatttagtccctgtacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagtcaacacagca 42880747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 119
Target Start/End: Original strand, 43779794 - 43779853
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagca 119  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  43779794 atcaatttagtccctgtacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagccaacacagca 43779853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44793025 - 44792990
Alignment:
Q  187 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44793025 acaaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 44792990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 42879380 - 42879278
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  42879380 ttgattgacatttaacaaattcatggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttggccgacccgtaaaaattcagggacgaagttgatgat 42879281  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  42879280 tca 42879278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 44992913 - 44992811
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  44992913 ttgattgacatttaacaaactcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttggccgacccgtaaaaattcagggacgaagttgatgat 44992814  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  44992813 tca 44992811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 230541 - 230492
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  230541 ttgatcgacatatgccaaattcagagactaatttgatatttcgcataatt 230492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Original strand, 2828397 - 2828446
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2828397 ttgattgacatttaacaaattcaaggattaaattgatatttcgcataatt 2828446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Original strand, 39190805 - 39190854
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  39190805 ttgattgacatttaacaaattcacggattaaattgatatttcgcataatt 39190854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44556725 - 44556676
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  44556725 ttgattgacatttaacaaattcatggactaaattgatatttcacataatt 44556676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34460316 - 34460268
Alignment:
Q  187 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 235  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  34460316 acaaatttagggattaaattgatattttgcataattaagagacgaattt 34460268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 39083836 - 39083780
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacaca 116  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||    
T  39083836 atcaatttagtccctgtacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagccaacaca 39083780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 39189579 - 39189523
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacaca 116  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||    
T  39189579 atcaatttagtccctgtacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagccaacaca 39189523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Original strand, 18728471 - 18728723
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18728471 taaactgaaaagtgaaaactcaacattttccaattcaatcaaattagtcccttaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 18728570  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | || ||||  ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18728571 aaggtgacagatcagcaaggctaacagagcacttggacggagggacctttttgatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataatt 18728670  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    ||  || ||| ||    |||  || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18728671 aagggacgaagttggccgacaagtgaaaattcagggacgaatttgatggttca 18728723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 32087769 - 32087517
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32087769 taaactgaaaagtgaaaactcaacattttccaattcaatcaaattagtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacacagcatgc 32087670  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | ||||| |  ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32087669 aaggcgatagatcagcaaggctaacagagcacttggacggagggacctttttgatggacgtctgaaaaattaagggactaagttgatatttcgcataatt 32087570  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    ||  || ||| || || |||  || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  32087569 aagggacgaagttgatcgacgcgtgaaaattcagggacgaatttgatggttca 32087517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Original strand, 38177962 - 38178214
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggacttttc-caattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38177962 taaactgaaaagtgaaaattgaacttttttcaaatcaatcaagttagtccttgaacacgtgacttcctttttgctacgtgtacaagacaacacagcatgc 38178061  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38178062 aggacgacatatcagcatggctaacggagcacatggacgaagggacctttttgatggacgtctgacaaattcagatactaaattgatatttcgcataatt 38178161  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     |  ||||||||| |  |||| || |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  38178162 gagggatgaatttgaccgacccgtgaaaatttaaggacgaatttgatagttca 38178214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Original strand, 38205186 - 38205438
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggacttttc-caattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38205186 taaactgaaaagtgaaaattgaacttttttcaaatcaatcaagttagtccttgaacacgtgacttcctttttgctacgtgtacaagacaacacagcatgc 38205285  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38205286 aggacgacatatcagcatggctaacggagcacatggacgaagggacctttttgatggacgtctgacaaattcagatactaaattgatatttcgcataatt 38205385  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     |  ||||||||| |  |||| || |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  38205386 gagggatgaatttgaccgacccgtgaaaatttaaggacgaatttgatagttca 38205438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 29 - 275
Target Start/End: Original strand, 43317934 - 43318181
Alignment:
Q  29 tgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggc 127  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  43317934 tgaaaagtgaaaactgaaatttttccactttcatcaaattagtccttgaacacgtggcttcctttttgccacatgtacaagacagcacaacatgctgggc 43318033  T
Q  128 gacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaag 227  Q
    ||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |    
T  43318034 gacatatcggcatggctaacagagcacttggacggagggaccttttttatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgaggg 43318133  T
Q  228 atgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    |||| |||    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43318134 atgattttggccgacccataaaaattcaaggacgaatttgatggttca 43318181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33256655 - 33256403
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33256655 taaactgaaaagtgaaaactcaacatttttcaattcaatcaaattagtccctgaacacgtggcttccttcttgccactcgtacaagacaacacagcatgc 33256556  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | || ||||  ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||    
T  33256555 aaggtgacagatcagcaaggctaacggaggacttggacggagggacttttttgatggacgtctgacaaattcaaagattaagttgatatttcgcataatt 33256456  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     || |||||| ||    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33256455 gaaggatgaagttggccgacgtgtaaaaattcagggacgaatttgatggttca 33256403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35395561 - 35395336
Alignment:
Q  48 ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaac 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  35395561 ttttccaattcaatcaaattagtccctgaacatgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacac--catgcaaggcgacatatcagcatggctaac 35395464  T
Q  148 ggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgta 247  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  || ||| ||    ||| |||     
T  35395463 agagcacttggacggagggacctttttgatggacgtctaacaaattcaggaactaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttggccgacgtgtg 35395364  T
Q  248 aaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  35395363 aaaattcagggatgaatttgatggttca 35395336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 275
Target Start/End: Original strand, 35292256 - 35292502
Alignment:
Q  29 tgaaaagtgaaaactggacttttc-caattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggc 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||  || ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||    
T  35292256 tgaaaagtgaaaactggaattttttcactttcatcaaattagtccttgaacacgtagcttcctttttgccacgtgtacaagacagcacaacatgttgggc 35292355  T
Q  128 gacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaag 227  Q
    ||||  |||  || |||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  35292356 gacagatcagaatagctaacggagcatttggacggaggaaccttttttatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgaagg 35292455  T
Q  228 atgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    ||| ||||     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35292456 atg-attttggccacccataaaaattcaaggacgaatttgatggttca 35292502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 38597157 - 38597012
Alignment:
Q  66 ttagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatg 165  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||| || |    
T  38597157 ttagtccttgaacacgcggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacagatcagcacggctaacggaacacttggacagagg 38597058  T
Q  166 gacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatat 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  38597057 gacctttttgatggacgtctgacaaattaagggactaagttgatat 38597012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17574535 - 17574374
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  17574535 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacagcatgcaagg-gacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 17574437  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17574436 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 17574374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 218
Target Start/End: Original strand, 32838394 - 32838567
Alignment:
Q  48 ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaac 147  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| |||||    
T  32838394 ttttccaaatcattcaaattattccttgaacacgtggcttccttcttgctatgtgtacaagacaacacagcatgtaggacgacatatcaacatgactaac 32838493  T
Q  148 ggagcacttggacggatggaccttt---ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcat 218  Q
    ||||||||| ||| ||  |||||||   || |||| | ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  32838494 ggagcactttgacagaaagaccttttaattaatggtcgtctgacaaattcagaaattaagttgatatttcgcat 32838567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 235
Target Start/End: Original strand, 30468186 - 30468361
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  30468186 atcaaattagtccttgtacacgtggttgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 30468285  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 235  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | ||| ||||||    
T  30468286 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcaaggactaaatagatatttcgcaaaattgagagacgaattt 30468361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7268060 - 7267899
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  || |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  7268060 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacatcatgcgagg-gacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 7267962  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7267961 cggagggatcattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 7267899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 38597005 - 38596871
Alignment:
Q  141 ggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattg 240  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || ||||||    |    
T  38597005 ggctaacggaacacttggacagaaagacctttttgatggacgtctaacaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgagggacgaatttggccg 38596906  T
Q  241 acctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38596905 acccataaaaattcaaggacgaatttgatggttca 38596871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Original strand, 18624914 - 18625122
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  18624914 atcaaattagtccttgtacacgtggttgccttgttgacacgtgtataagacaacacaacatgcaagaagacacatcatcactactaacggagcttttgga 18625013  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 259  Q
    |||| ||||| |||||||||||   ||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||| |  || |||||||  ||| | || ||||||||||||    
T  18625014 cggaaggaccattttgatggacgagtgtaaaattcagggactaaatagatatttcacaaaattcagggacgaatttagctgatcagtgaaaattcaagga 18625113  T
Q  260 cgaatttga 268  Q
    |||||||||    
T  18625114 cgaatttga 18625122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2180005 - 2179851
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||||||||   |||| |||||  |||||    
T  2180005 atcaaattagtccttgtacatgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacatgtcatcaccactaatggagcttttgga 2179906  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttc 214  Q
    |||| ||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2179905 cggagggaccattttgatggatgtctgtaaaattcagggattaaatagatatttc 2179851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8539893 - 8539685
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||   |||||   ||||||||||  |||||    
T  8539893 atcaatttagtccttgcacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacacaccatcaacactaacggagcttttgga 8539794  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 259  Q
     |||  |||  ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  | |||||| |||||  | | ||||||||||||    
T  8539793 tggagcgactattttgatggacgtttgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaattcaagaacgaatttgattgatttttcaaaattcaagga 8539694  T
Q  260 cgaatttga 268  Q
    |||||||||    
T  8539693 cgaatttga 8539685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24496958 - 24496799
Alignment:
Q  63 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgg 162  Q
    ||||| ||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  ||| ||    |||| || || ||||||||    
T  24496958 aaattggtccttgtacacatgacttccttgttgacacgtgtacgagacaacatagcatgcaggacgacagatcagcaatagtaacagaacatttggacgg 24496859  T
Q  163 atggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  24496858 atggaccattttgatgaacgtctcacaaattcagggattaatttgatatttcacataatt 24496799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34327853 - 34327691
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| || |||||| |  ||||  ||||||   ||||| ||||  |||||    
T  34327853 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacgcaacatgcaagaggacacatcatcaccactaacagagcttttgga 34327754  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||  |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  34327753 cggagagaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 34327691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 222
Target Start/End: Original strand, 36057526 - 36057681
Alignment:
Q  67 tagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatgg 166  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||  ||||||    |||||||||  ||||||||| ||    
T  36057526 tagtccttgtacatgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagatgacacatcatcaccattaacggagcttttggacggaggg 36057625  T
Q  167 acctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||| ||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  36057626 accattttgatggacgtctgtaaaattcagggtctaaatagatatttcgcaaaatt 36057681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 32835965 - 32835879
Alignment:
Q  189 aaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||| |  |||| || |||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  32835965 aaattcagggattaaattgatatttcgcataattaagggacgaatttgaccgacccgtgaaaattcagggacgaagttgatgattca 32835879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 270
Target Start/End: Original strand, 33257746 - 33257843
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatg 270  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33257746 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattaagggacgaagttggccgacccgtaaaaattcagggacgaagttgatg 33257843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Original strand, 32089911 - 32090013
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  32089911 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttggccgacccgtaaaaattcagggacgaagttgatgat 32090010  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  32090011 tca 32090013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43316885 - 43316823
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 235  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  43316885 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcatagttgaaggatgaattt 43316823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18726670 - 18726621
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18726670 ttgattgacatttaacaaattaagggactaaattgatatttcgcataatt 18726621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 38176723 - 38176686
Alignment:
Q  187 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaa 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38176723 acaaattcagggattaaattgatatttcgcataattaa 38176686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 38203947 - 38203910
Alignment:
Q  187 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaa 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38203947 acaaattcagggattaaattgatatttcgcataattaa 38203910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 222
Target Start/End: Original strand, 40330515 - 40330550
Alignment:
Q  187 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40330515 acaaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 40330550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Original strand, 24541230 - 24541280
Alignment:
Q  172 tttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24541230 tttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 24541280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 42619394 - 42619292
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| || |  |||| || |||||||| ||||||| |||||| |    
T  42619394 ttgattgacatttaacaaattctgggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaaattgaccgacccgtgaaaattcagggacgaagttgatgat 42619295  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  42619294 tca 42619292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Original strand, 24498053 - 24498102
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  24498053 ttgattgacatatgacaaattcagggactaatttgatttatcgcataatt 24498102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 215
Target Start/End: Original strand, 29621782 - 29621842
Alignment:
Q  155 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcg 215  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29621782 ttggacggagggactgatttgatggacgtctgcaaaattcagggactaatttgatatttcg 29621842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29077583 - 29077331
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29077583 taaattgaaaaatgaaaagtgaactttttccaaatcaatcaaattcgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacacagcatgc 29077484  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  29077483 aaggcgacatgtcagcatggctaacggagcccgttaacggagggacctttttgatggacgtctgacaaattcagggatgaaattgaaatttcgcataatt 29077384  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     |  ||  |||||    |||  || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29077383 gagggactaatttggccgacgcgtgaaaattcagggacgaatttgatggttca 29077331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2968369 - 2968195
Alignment:
Q  48 ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaac 147  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||| || |||||||    
T  2968369 ttttccaaatcaatcaaattcgtctctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacagcacaacatgcaaggcgacatgtcagcacggctaac 2968270  T
Q  148 ggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||| | |  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2968269 ggagcccgttaacggatggacctttttgatggacgtctgataaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 2968195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29112555 - 29112356
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  29112555 taaattgaaaaatgaaaagtgaactttttccaaatcaatcaaattcgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaggacagcacagcatgc 29112456  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  29112455 caggcgacatgtcagcatggctaacggagcccgttaacggagggacctttttgatggacgtctgacaaattcagggatgaaattgaaatttcgcataatt 29112356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4641610 - 4641358
Alignment:
Q  24 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 122  Q
    |||| |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4641610 taaattgaaaaatgaaaagtgaactttttccaaatcaatcaaattcgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacagcacagcatgc 4641511  T
Q  123 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    | ||  |||||||| ||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4641510 aaggaaacatgtcagcatggctaacggagcccgttaacggagggacctttttgatggaggtctgataaattcagggattaaattgatatttcacataatt 4641411  T
Q  223 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
     |  || ||||||    |||| || |||||||| |||| || |||||||||||    
T  4641410 gagggacgaatttggccgacccgtgaaaattcagggactaaattgatggttca 4641358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 3018338 - 3018500
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3018338 atcaaattcgtccctgaacatgtggcttccgtcttgccacgcgtacaagacaacacatcatgcaagacgatagatcaacatggctaacggagcacttgga 3018437  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
     ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3018438 tggagggacctttttgatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataatt 3018500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20523584 - 20523409
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||  ||||||   ||||| || |  |||||    
T  20523584 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaggacaacacggcatgcaagaagacacatcatcaccactaacagaacttttgga 20523485  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 235  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||    
T  20523484 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaattcaaggacgaattt 20523409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10568617 - 10568407
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||    ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  10568617 atcaaattagtccttgtacatgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaaaaggacacatcatcaccactaacggagcttttgga 10568518  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 259  Q
    |||| ||||  ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||  |||| || || |||||| | |||  | | ||||||||||||    
T  10568517 cggagggactattttgatagacgtctgtaaaattcagggactaaataaatatttcgctaaattcaaggacgaatttgactgatttttgaaaattcaagga 10568418  T
Q  260 cgaatttgatg 270  Q
    |||||||||||    
T  10568417 cgaatttgatg 10568407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 222
Target Start/End: Original strand, 32439015 - 32439159
Alignment:
Q  77 acacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttga 176  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||   ||||| || |  ||||||||| ||||| ||||||    
T  32439015 acacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacatcatgcaagg-gacacgtcatcactactaacagatcttttggacggagggaccattttga 32439113  T
Q  177 tggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32439114 tggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 32439159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6899703 - 6899495
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||| || |||||| |||||| |  ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  6899703 atcaaattagtccttgtacacgtggttgccttgttgacacgtgtacatgataacacaacatgcaagaggacacatcatcaacactaacggagcttttgga 6899604  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 259  Q
    || | ||||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||| |||||||| || |||| | ||| |||||| | |||  | | ||||||||||||    
T  6899603 cgaagggaccattttgatggatgtctgtaaaatttagggactaaatagatatttcacaaaatttagagacgaatttgactgatttttgaaaattcaagga 6899504  T
Q  260 cgaatttga 268  Q
    | |||||||    
T  6899503 caaatttga 6899495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11355440 - 11355286
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  |||| |||||||   ||| ||||||  |||||    
T  11355440 atcaaattagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacacgtcatcaccactaccggagcttttgga 11355341  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttc 214  Q
    |||| ||||| ||||| ||| | ||||  ||||||||||| | ||| ||||||||    
T  11355340 cggagggaccattttggtggccgtctgtaaaattcagggagttaatagatatttc 11355286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7049975 - 7049835
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   | ||||||||  |||||    
T  7049975 atcaaattagtccttgtacacgtggatgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacacatcatcaccacgaacggagcttttgga 7049876  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggac 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  7049875 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggac 7049835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9398878 - 9398716
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||    ||||  ||||||   |||||||| |  |||||    
T  9398878 atcaatttagtccttgtacacgtggctgtcttgttgacacgtgtacaggacaacacaacatgcaaaatgacacatcatcaccactaacggaacttttgga 9398779  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||| ||||| |||||||| || |||   ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9398778 cggagggaccattttgatgaacgtctataaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 9398716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 199
Target Start/End: Original strand, 14338381 - 14338520
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||    || |  |||||||   |||||||||  ||| |    
T  14338381 atcaaattggtccttgtacacgtggcttccttgttgacacgtgtacaggacaacacatcatgcaacaggatacatcatcatcagtaacggagcttttgaa 14338480  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcaggga 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  14338481 cggagggaccattttgatggacgtctgtgaaattcaggga 14338520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30891342 - 30891167
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||  | || |   ||||  ||||| |||||    
T  30891342 atcaaattggtccttgtacacgtggcttgtttgttgacacgtgtacaagacaagactacatgcagggtgacaaattataagcactaatagagcatttgga 30891243  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 235  Q
    |||| ||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| || ||| |||||    
T  30891242 cggagggactactttgttggacgtctgacaaattcagggactaaacgtatattttgcataatttaaggataaattt 30891167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 24662709 - 24662615
Alignment:
Q  29 tgaaaagtgaaaactggacttttc--caattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatg 121  Q
    |||||||||||||||| | |||||  || ||| |||||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24662709 tgaaaagtgaaaactgaaattttcatcatttccatcaaattggcccttgtacacgtgtcttccttgttgacacgtgtacaagacaacacaacatg 24662615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17950666 - 17950564
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 272  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  17950666 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttggccgacccgtaaaaattcagggatgaaattgatggt 17950567  T
Q  273 tca 275  Q
    |||    
T  17950566 tca 17950564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 275
Target Start/End: Original strand, 4646216 - 4646304
Alignment:
Q  187 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||||||||  || | ||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  4646216 acaaatttagggattaaattgatatttcgcataattgatggacgaatttaaccgatccgtaaaaattcagggattaagttgatggttca 4646304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 96
Target Start/End: Original strand, 30641223 - 30641271
Alignment:
Q  48 ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgc 96  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  30641223 ttttcaaattcaatcaaattagtcctcgaacatgtggctttcttcttgc 30641271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 222
Target Start/End: Original strand, 7372959 - 7373026
Alignment:
Q  155 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  |||  |||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  7372959 ttggacggagggaccattttgatggacgcctgtaaaattcagggactaaataaatatttcgcaaaatt 7373026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 268
Target Start/End: Original strand, 9400035 - 9400114
Alignment:
Q  189 aaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttga 268  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||| |||| || ||||||||| | |||  | | |||||||||||||||||||||    
T  9400035 aaattcggggactaattagatatttcgcaaaattcaaggatgaatttgactgatttttcaaaattcaaggacgaatttga 9400114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 222
Target Start/End: Original strand, 13613583 - 13613650
Alignment:
Q  155 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13613583 ttggacggagggactaatttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 13613650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 119
Target Start/End: Original strand, 17951969 - 17952028
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagca 119  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  17951969 atcaatttagtccctgtacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagccaacacagca 17952028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 199
Target Start/End: Original strand, 25172015 - 25172154
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||   |||||||| | |||  ||| ||   |||| |||||| |||||    
T  25172015 atcaaattggtccttgtacatgtgacttccttgttgacacgtgtacaagacaacatgacatgcaggacaacaactcaacaatactaatggagcatttgga 25172114  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcaggga 199  Q
    |||| ||||  |||| |||||| | ||  |||||||||||    
T  25172115 cggaaggactatttttatggacgtttgttaaattcaggga 25172154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 119
Target Start/End: Original strand, 35175790 - 35175849
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagca 119  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  35175790 atcaatttagtccctgtacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagccaacacagca 35175849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 32517095 - 32516974
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||| |||| ||  |||||||||| |||| |||| |||||| |   ||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  32517095 atcaatttagtccttatacacgtggctgccttgttaacacgtgtacatgacagcacatcatgcaagagaacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 32516996  T
Q  160 cggatggacctttttgatggac 181  Q
    |||| ||||  |||||||||||    
T  32516995 cggagggacaattttgatggac 32516974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3456871 - 3456811
Alignment:
Q  155 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcg 215  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3456871 ttggacggagggactgatttgatggacgtctgcaaaattcagggactaatttgatatttcg 3456811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 275
Target Start/End: Original strand, 6528 - 6755
Alignment:
Q  48 ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaac 147  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  6528 ttttccaaatcaatcaaattcgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacagcacagcatgcaaggtgacatgtcagcatggctaac 6627  T
Q  148 ggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgta 247  Q
    ||||| | |  ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |  || ||||||    |||| ||     
T  6628 ggagcccgttaacggagggacctttttgatggaggtctgataaattcagggattaaattgatatttcacataattgagggacgaatttggccgacccgtg 6727  T
Q  248 aaaattcaaggacgaatttgatggttca 275  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||    
T  6728 aaaattcagggactaaattgatggttca 6755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1454 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1454
Description:

Target: scaffold1454; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1480 - 1327
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||   ||||||||||  |||||    
T  1480 atcaatttagtccttgtacacgtggttgccttgttgacacgtgtacaagacaacacagcatgcaagg-gatacgtcatcaccactaacggagcttttgga 1382  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttc 214  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1381 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttc 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8478 - 8318
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 159  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||| |  |||| |||||||   |||||| |||  |||||    
T  8478 atcaatttagtacttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacatcttgcaagaggacacgtcatcaccactaacgaagcttttgga 8379  T
Q  160 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | |   ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  8378 cggatgtaccattttgatggacgtat--aaaattcagggactaaatagatattttgcaaaatt 8318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0129 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0129
Description:

Target: scaffold0129; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 4681 - 4556
Alignment:
Q  56 ttcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcact 155  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||   |||||||| |||||  ||| ||   ||||| || || |    
T  4681 ttcaatcaaattggtccttgtacacgtggcttccttgtagacacgtgtacaagacaacaagccatgcaggacgacaactcagcaacactaacagaacatt 4582  T
Q  156 tggacggatggacctttttgatggac 181  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||    
T  4581 tggacggaaggactattttgatggac 4556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3417 - 3350
Alignment:
Q  155 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3417 ttggacggagggacgaatttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 3350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4589 - 4522
Alignment:
Q  155 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 222  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  4589 ttggacggagggacgaatttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 4522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1041 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold1041
Description:

Target: scaffold1041; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2203 - 2141
Alignment:
Q  173 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 235  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  2203 ttgattgacgtctgacaaatttagggattaagttgatatttcgcataattgagggatgaattt 2141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1041; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 228
Target Start/End: Original strand, 2883 - 2932
Alignment:
Q  179 gacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaaga 228  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2883 gacatttgacaaattcaaggattaaattgttatttctcataattaaaaga 2932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 37422 - 37366
Alignment:
Q  60 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacaca 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||| | |||||||||    
T  37422 atcaaattagtccttgtacacgtggttgccttgttgacacgtgtaaaggacaacaca 37366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University