View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8170_low_10 (Length: 357)

Name: NF8170_low_10
Description: NF8170
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8170_low_10
NF8170_low_10
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (1-337)||(16041155-16041491)
chr7 (5-346)||(31088443-31088784)
chr7 (1-337)||(16449973-16450309)
chr7 (5-346)||(45733283-45733624)
chr7 (1-184)||(2108980-2109163)
chr7 (1-184)||(26484679-26484862)
chr7 (9-322)||(16503363-16503679)
chr7 (9-322)||(16518399-16518715)
chr7 (1-184)||(2775344-2775527)
chr7 (5-184)||(39211002-39211181)
chr7 (9-295)||(10916851-10917137)
chr7 (6-340)||(5127818-5128155)
chr7 (9-295)||(11424759-11425048)
chr7 (9-184)||(18540784-18540959)
chr7 (9-340)||(5159348-5159679)
chr7 (6-298)||(5147320-5147615)
chr7 (6-298)||(26435125-26435420)
chr7 (9-295)||(2154444-2154733)
chr7 (6-295)||(16736440-16736732)
chr7 (6-295)||(16751494-16751786)
chr7 (6-295)||(17529520-17529812)
chr7 (6-295)||(4145103-4145395)
chr7 (6-295)||(17523403-17523695)
chr7 (6-295)||(26319849-26320141)
chr7 (6-295)||(26275074-26275366)
chr7 (6-295)||(45387214-45387506)
chr7 (6-184)||(9618636-9618814)
chr7 (6-160)||(3445315-3445469)
chr7 (6-295)||(26669894-26670186)
chr7 (5-162)||(31564369-31564526)
chr7 (6-295)||(24592521-24592813)
chr7 (6-184)||(31124905-31125083)
chr7 (6-151)||(11441590-11441735)
chr7 (6-298)||(26537850-26538148)
chr7 (219-295)||(11441431-11441507)
chr7 (1-34)||(4200682-4200715)
chr7 (1-34)||(26682975-26683008)
[»] chr5 (57 HSPs)
chr5 (1-337)||(22888310-22888646)
chr5 (1-346)||(33877078-33877423)
chr5 (5-346)||(13184638-13184979)
chr5 (1-346)||(11325625-11325970)
chr5 (5-346)||(13440484-13440825)
chr5 (1-322)||(25198884-25199205)
chr5 (1-322)||(23892058-23892382)
chr5 (1-196)||(29889068-29889263)
chr5 (9-322)||(24969876-24970186)
chr5 (9-295)||(30934515-30934801)
chr5 (6-295)||(23752441-23752733)
chr5 (1-322)||(24688143-24688467)
chr5 (9-340)||(33777321-33777655)
chr5 (9-295)||(23717982-23718271)
chr5 (6-295)||(22999105-22999397)
chr5 (9-292)||(11549236-11549522)
chr5 (9-340)||(33292362-33292693)
chr5 (6-295)||(32599463-32599752)
chr5 (6-295)||(9548534-9548826)
chr5 (6-295)||(34616400-34616689)
chr5 (6-295)||(8665466-8665758)
chr5 (6-295)||(15658751-15659043)
chr5 (6-341)||(18375403-18375741)
chr5 (6-341)||(30168302-30168640)
chr5 (6-295)||(15758848-15759140)
chr5 (6-294)||(41674589-41674880)
chr5 (6-295)||(6874181-6874476)
chr5 (6-184)||(2511044-2511222)
chr5 (6-295)||(12132034-12132326)
chr5 (6-162)||(37671474-37671630)
chr5 (6-184)||(26480385-26480563)
chr5 (6-162)||(28649250-28649406)
chr5 (6-341)||(33516189-33516527)
chr5 (6-184)||(5637903-5638081)
chr5 (6-184)||(9317444-9317622)
chr5 (6-151)||(31431466-31431611)
chr5 (6-162)||(37770978-37771134)
chr5 (6-295)||(43078128-43078423)
chr5 (6-184)||(28959777-28959955)
chr5 (6-295)||(29967057-29967349)
chr5 (6-184)||(30152011-30152189)
chr5 (6-160)||(31826398-31826552)
chr5 (6-184)||(37358634-37358812)
chr5 (6-162)||(18500721-18500877)
chr5 (6-184)||(30029408-30029586)
chr5 (6-162)||(3789556-3789712)
chr5 (6-162)||(37754995-37755151)
chr5 (5-162)||(13324819-13324976)
chr5 (219-295)||(31431307-31431383)
chr5 (219-298)||(3789402-3789481)
chr5 (6-160)||(24681457-24681611)
chr5 (6-160)||(24723984-24724138)
chr5 (6-160)||(40473540-40473694)
chr5 (219-295)||(18500955-18501031)
chr5 (219-295)||(28649105-28649181)
chr5 (219-295)||(37358862-37358938)
chr5 (219-295)||(37671699-37671775)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (1-337)||(15227716-15228052)
chr4 (1-337)||(1900103-1900439)
chr4 (5-346)||(24460698-24461039)
chr4 (1-337)||(15285017-15285353)
chr4 (1-337)||(14235614-14235953)
chr4 (1-341)||(15391427-15391764)
chr4 (9-313)||(17013867-17014174)
chr4 (9-340)||(24592411-24592742)
chr4 (9-340)||(14664858-14665192)
chr4 (5-340)||(34189053-34189388)
chr4 (6-298)||(14763398-14763693)
chr4 (5-295)||(6569738-6570031)
chr4 (9-339)||(24112506-24112836)
chr4 (6-298)||(36344609-36344901)
chr4 (6-340)||(14098381-14098718)
chr4 (6-340)||(54833230-54833564)
chr4 (6-340)||(31126612-31126949)
chr4 (6-295)||(27163411-27163703)
chr4 (6-295)||(5005755-5006050)
chr4 (6-162)||(18800707-18800863)
chr4 (6-295)||(21969586-21969878)
chr4 (6-160)||(30753777-30753931)
chr4 (6-160)||(33673892-33674046)
chr4 (6-184)||(40105732-40105910)
chr4 (5-160)||(39850661-39850816)
chr4 (239-340)||(19373101-19373202)
chr4 (219-295)||(18800932-18801008)
chr4 (219-295)||(30753627-30753703)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (1-337)||(21703242-21703578)
chr2 (1-346)||(27118506-27118851)
chr2 (5-346)||(34303385-34303726)
chr2 (5-346)||(34156829-34157170)
chr2 (5-346)||(3784472-3784813)
chr2 (5-346)||(16163417-16163758)
chr2 (1-337)||(19456499-19456835)
chr2 (9-345)||(31891414-31891750)
chr2 (9-322)||(27434530-27434846)
chr2 (1-341)||(27392813-27393132)
chr2 (1-322)||(23128644-23128968)
chr2 (9-295)||(28882080-28882369)
chr2 (9-322)||(12655381-12655697)
chr2 (9-313)||(20837766-20838073)
chr2 (6-295)||(21677265-21677557)
chr2 (6-295)||(34279315-34279607)
chr2 (6-292)||(34286223-34286512)
chr2 (6-292)||(34291283-34291572)
chr2 (6-295)||(11635269-11635564)
chr2 (6-295)||(11641458-11641753)
chr2 (1-160)||(40233515-40233674)
chr2 (6-295)||(13936627-13936919)
chr2 (6-295)||(22926111-22926403)
chr2 (6-295)||(37925359-37925651)
chr2 (6-298)||(37375024-37375319)
chr2 (6-295)||(31876147-31876439)
chr2 (6-295)||(16829421-16829713)
chr2 (6-295)||(16891768-16892060)
chr2 (6-295)||(32049664-32049956)
chr2 (6-295)||(37685992-37686284)
chr2 (6-295)||(37701257-37701549)
chr2 (6-184)||(34861660-34861838)
chr2 (6-151)||(260836-260981)
chr2 (6-184)||(12716685-12716863)
chr2 (6-295)||(19416582-19416874)
chr2 (6-184)||(39890054-39890232)
chr2 (164-295)||(261009-261140)
chr2 (6-184)||(27803687-27803865)
chr2 (6-160)||(27777226-27777380)
chr2 (6-160)||(27816984-27817138)
chr2 (6-160)||(39051905-39052059)
chr2 (6-160)||(9350065-9350219)
chr2 (6-100)||(12586874-12586968)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (1-346)||(2747-3092)
[»] chr6 (55 HSPs)
chr6 (1-346)||(13522105-13522450)
chr6 (5-346)||(33374292-33374633)
chr6 (5-346)||(8892346-8892687)
chr6 (5-346)||(8903581-8903922)
chr6 (5-345)||(28162477-28162817)
chr6 (1-337)||(22477305-22477644)
chr6 (1-208)||(22456966-22457176)
chr6 (1-196)||(27290402-27290597)
chr6 (6-298)||(20160568-20160860)
chr6 (6-298)||(22171971-22172263)
chr6 (1-184)||(14143317-14143500)
chr6 (1-184)||(26787925-26788108)
chr6 (1-184)||(27196298-27196481)
chr6 (1-184)||(27252759-27252942)
chr6 (9-322)||(22934920-22935233)
chr6 (9-322)||(23857365-23857678)
chr6 (1-340)||(24304650-24304992)
chr6 (9-322)||(13298991-13299307)
chr6 (9-322)||(15424357-15424673)
chr6 (6-340)||(29549300-29549634)
chr6 (9-295)||(16749721-16750010)
chr6 (9-295)||(26988868-26989157)
chr6 (9-295)||(26999940-27000229)
chr6 (9-340)||(26918202-26918536)
chr6 (9-322)||(24863557-24863873)
chr6 (6-295)||(4525156-4525445)
chr6 (6-295)||(27044257-27044546)
chr6 (1-259)||(27272612-27272876)
chr6 (6-184)||(29572994-29573172)
chr6 (6-341)||(30558053-30558391)
chr6 (5-162)||(4773009-4773166)
chr6 (6-340)||(29501228-29501574)
chr6 (6-160)||(3696086-3696240)
chr6 (5-151)||(4545811-4545957)
chr6 (6-160)||(16674144-16674298)
chr6 (6-184)||(26777652-26777830)
chr6 (6-151)||(4724171-4724316)
chr6 (6-151)||(28207468-28207613)
chr6 (6-162)||(4757767-4757923)
chr6 (6-162)||(27007730-27007886)
chr6 (164-295)||(27629907-27630038)
chr6 (6-184)||(27485110-27485288)
chr6 (6-295)||(16944064-16944356)
chr6 (6-184)||(27360029-27360207)
chr6 (6-184)||(27450372-27450550)
chr6 (6-160)||(34463383-34463537)
chr6 (6-162)||(17025280-17025436)
chr6 (6-162)||(26116447-26116603)
chr6 (219-295)||(3695930-3696006)
chr6 (219-295)||(4546037-4546113)
chr6 (219-295)||(4724396-4724472)
chr6 (219-295)||(17025129-17025205)
chr6 (219-295)||(26777880-26777956)
chr6 (219-295)||(27007579-27007655)
chr6 (219-295)||(28207309-28207385)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (1-346)||(20340424-20340769)
chr1 (1-302)||(16208120-16208418)
chr1 (3-337)||(20460935-20461245)
chr1 (1-184)||(28151845-28152028)
chr1 (6-295)||(41793402-41793694)
chr1 (1-295)||(10962539-10962836)
chr1 (6-340)||(28584805-28585142)
chr1 (6-184)||(51638201-51638379)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (5-346)||(9354444-9354785)
chr8 (5-346)||(19659091-19659432)
chr8 (5-346)||(44562923-44563264)
chr8 (9-322)||(16283292-16283608)
chr8 (1-341)||(22080926-22081263)
chr8 (1-184)||(33244649-33244832)
chr8 (9-295)||(27608961-27609250)
chr8 (9-322)||(2137315-2137631)
chr8 (9-295)||(14557497-14557783)
chr8 (9-322)||(16277397-16277713)
chr8 (1-340)||(19687923-19688265)
chr8 (6-340)||(18710411-18710748)
chr8 (6-295)||(31354394-31354686)
chr8 (6-340)||(31489803-31490140)
chr8 (6-340)||(19286290-19286624)
chr8 (6-295)||(19674308-19674603)
chr8 (6-295)||(19208413-19208705)
chr8 (6-295)||(28362008-28362300)
chr8 (5-162)||(3329559-3329716)
chr8 (5-162)||(12092776-12092933)
chr8 (6-162)||(29829328-29829484)
chr8 (6-184)||(33258707-33258885)
chr8 (219-295)||(3329788-3329864)
chr8 (219-295)||(19518412-19518488)
chr8 (219-295)||(29829183-29829259)
[»] chr3 (65 HSPs)
chr3 (5-346)||(17993918-17994259)
chr3 (5-346)||(4625727-4626068)
chr3 (1-346)||(5652170-5652515)
chr3 (1-337)||(16626636-16626972)
chr3 (1-337)||(18530186-18530516)
chr3 (6-346)||(5713007-5713350)
chr3 (6-346)||(5723917-5724260)
chr3 (6-346)||(5757217-5757560)
chr3 (6-346)||(5768108-5768451)
chr3 (9-340)||(15892844-15893178)
chr3 (9-340)||(8301405-8301736)
chr3 (1-184)||(32292697-32292880)
chr3 (1-184)||(31034247-31034430)
chr3 (1-322)||(8295779-8296100)
chr3 (9-340)||(22387716-22388047)
chr3 (9-322)||(18051066-18051382)
chr3 (6-295)||(29148890-29149182)
chr3 (9-295)||(4796791-4797080)
chr3 (9-340)||(35880552-35880886)
chr3 (9-340)||(18330460-18330789)
chr3 (6-298)||(18277187-18277482)
chr3 (6-298)||(18292488-18292783)
chr3 (6-298)||(18307789-18308084)
chr3 (6-340)||(6192102-6192439)
chr3 (9-339)||(32438944-32439274)
chr3 (9-340)||(4721417-4721751)
chr3 (9-340)||(4892999-4893330)
chr3 (6-340)||(8211527-8211861)
chr3 (6-295)||(4346822-4347111)
chr3 (6-292)||(10395970-10396256)
chr3 (6-341)||(17985091-17985429)
chr3 (6-295)||(28021109-28021398)
chr3 (6-295)||(5466816-5467108)
chr3 (6-295)||(7073043-7073335)
chr3 (1-295)||(15741224-15741509)
chr3 (9-295)||(20065877-20066163)
chr3 (5-295)||(28116088-28116384)
chr3 (6-295)||(5609457-5609749)
chr3 (6-295)||(7996393-7996685)
chr3 (6-295)||(10642901-10643193)
chr3 (6-295)||(31964608-31964900)
chr3 (6-295)||(50134206-50134498)
chr3 (6-340)||(21674479-21674816)
chr3 (5-184)||(28339247-28339426)
chr3 (6-295)||(47023284-47023576)
chr3 (6-162)||(6542597-6542753)
chr3 (6-340)||(18224977-18225314)
chr3 (6-184)||(4416864-4417042)
chr3 (6-160)||(36997212-36997366)
chr3 (6-340)||(5596492-5596838)
chr3 (6-160)||(11110484-11110638)
chr3 (6-295)||(5013543-5013835)
chr3 (6-184)||(18242684-18242862)
chr3 (6-160)||(48465896-48466050)
chr3 (6-163)||(22870991-22871148)
chr3 (6-163)||(22886050-22886207)
chr3 (6-100)||(51782052-51782146)
chr3 (219-298)||(29665336-29665415)
chr3 (6-100)||(51797141-51797236)
chr3 (6-184)||(20576982-20577160)
chr3 (6-184)||(24328104-24328282)
chr3 (5-160)||(29665104-29665259)
chr3 (219-295)||(11110712-11110788)
chr3 (219-295)||(6542825-6542901)
chr3 (219-295)||(36997440-36997516)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-337)||(20240-20555)
scaffold0124 (6-322)||(30296-30614)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (1-196)||(117-312)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-341)||(21391-21728)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (9-314)||(29614-29922)
scaffold0089 (9-314)||(40166-40474)
scaffold0089 (9-295)||(47082-47371)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (9-322)||(27135-27451)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (1-98)||(2006-2103)
scaffold0415 (6-100)||(6080-6175)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (9-340)||(226-561)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (6-341)||(15024-15362)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (6-295)||(7333-7625)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (6-184)||(26295-26474)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (6-192)||(9542-9728)
scaffold0336 (185-295)||(8102-8212)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (6-295)||(9160-9452)
scaffold0159 (6-184)||(19999-20177)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (6-151)||(7966-8111)
scaffold0038 (219-295)||(7807-7883)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16041491 - 16041155
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041491 ccagagcaccttgatggaaatcacactttaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 16041392  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041391 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 16041292  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16041291 tgcatttgctgaacgacggaattaacgggtacctgaggttgacccgatgacaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatg 16041192  T
Q  301 gcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcatt 337  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  16041191 gcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 16041155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 5 - 346
Target Start/End: Original strand, 31088443 - 31088784
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31088443 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaga 31088542  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 204  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  31088543 agtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgca 31088642  T
Q  205 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 304  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31088643 ttcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 31088742  T
Q  305 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31088743 atacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 31088784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 16449973 - 16450309
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449973 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 16450072  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16450073 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgctgttgagctggtggctgttgt 16450172  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16450173 tgcacttgctgaacgacggcattaatgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgataaaatggtggaaagaagggatgctgagagtact 16450272  T
Q  301 gcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcatt 337  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  16450273 gcgcgtacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 16450309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 5 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 45733624 - 45733283
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45733624 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaga 45733525  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 204  Q
    ||||||||   |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  45733524 agtagagttaagagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgca 45733425  T
Q  205 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 304  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45733424 ttcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 45733325  T
Q  305 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45733324 atacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 45733283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 2108980 - 2109163
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2108980 ccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctct 2109079  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2109080 gagaagtagagtcgggagcaactcagcatatatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 2109163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26484862 - 26484679
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26484862 ccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctct 26484763  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  26484762 gagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 26484679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 16503363 - 16503679
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  16503363 ccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 16503462  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||  ||||||||| |||    
T  16503463 aagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcat 16503562  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  16503563 ctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgca 16503662  T
Q  306 tacgggtacaacggagg 322  Q
    || |||||  |||||||    
T  16503663 tatgggtatgacggagg 16503679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 16518399 - 16518715
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  16518399 ccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 16518498  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||  ||||||||| |||    
T  16518499 aagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcat 16518598  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  16518599 ctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgca 16518698  T
Q  306 tacgggtacaacggagg 322  Q
    || |||||  |||||||    
T  16518699 tatgggtatgacggagg 16518715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2775527 - 2775344
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2775527 ccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctct 2775428  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||    
T  2775427 gagaagtagagtcgggagctactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctactgtcgttgttg 2775344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 184
Target Start/End: Original strand, 39211002 - 39211181
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39211002 agcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaagcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgaga 39211101  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  39211102 agtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgcggtcgttgttg 39211181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Original strand, 10916851 - 10917137
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  10916851 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 10916950  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttg 208  Q
     |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   |||||||| ||| ||    
T  10916951 aagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctg 10917050  T
Q  209 ctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
     ||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10917051 ttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgaga 10917137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5128155 - 5127818
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |    
T  5128155 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggattaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctatgga 5128056  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  5128055 gtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgttt 5127956  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 302  Q
    ||| || ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  5127955 catctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggc 5127856  T
Q  303 gcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
     |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  5127855 acatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 5127818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Original strand, 11424759 - 11425048
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||    
T  11424759 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtgcaatgccctctatggagta 11424858  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| |||    
T  11424859 aagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcat 11424958  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
     || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11424959 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 11425048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18540959 - 18540784
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18540959 ccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagta 18540860  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18540859 gagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaagtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 18540784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5159679 - 5159348
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | ||||    
T  5159679 ccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagta 5159580  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttg 208  Q
     ||| || || | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  ||    
T  5159579 aagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctg 5159480  T
Q  209 ctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatac 308  Q
     ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||     
T  5159479 ttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataa 5159380  T
Q  309 gggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
    |||||  |||| || | |||||||||||||||    
T  5159379 gggtaggacgggggaaactgagcagcattgat 5159348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 298
Target Start/End: Original strand, 5147320 - 5147615
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  5147320 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttgga 5147419  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||||  ||   ||||||||     
T  5147420 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgttgattttgttgttgttgttgaatcggcatctgttgttt 5147519  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 298  Q
    ||| || ||  | |  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5147520 catctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 5147615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26435420 - 26435125
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  26435420 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 26435321  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||||||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   ||||||||     
T  26435320 gtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcatctgttgttt 26435221  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 298  Q
    ||| || ||  | |  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26435220 catctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 26435125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2154733 - 2154444
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  2154733 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 2154634  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     ||| || || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||| |||||||||| ||||  |||||||   |||||||  |   ||||||||  ||    
T  2154633 aagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtatgtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccagcaactgttgttttat 2154534  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
     || ||| | |  |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  2154533 ctgttgagcaattgcattaacggatacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 2154444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 16736440 - 16736732
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  16736440 gcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttgga 16736539  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  16736540 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 16736639  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16736640 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 16736732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 16751494 - 16751786
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  16751494 gcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttgga 16751593  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  16751594 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 16751693  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16751694 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 16751786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 17529520 - 17529812
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  17529520 gcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttgga 17529619  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  17529620 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 17529719  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17529720 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 17529812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 4145103 - 4145395
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  4145103 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 4145202  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  | || |||||    
T  4145203 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttg 4145302  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
     |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  4145303 tacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 4145395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17523695 - 17523403
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  17523695 gcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttgga 17523596  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   ||||||||     
T  17523595 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 17523496  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17523495 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 17523403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 26319849 - 26320141
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  26319849 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 26319948  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| || | ||||||||     
T  26319949 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgttt 26320048  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  26320049 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 26320141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 26275074 - 26275366
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  26275074 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 26275173  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  26275174 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 26275273  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  26275274 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 26275366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 45387506 - 45387214
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  45387506 gcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 45387407  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   ||||||||     
T  45387406 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 45387307  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  45387306 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 45387214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 9618814 - 9618636
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  9618814 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 9618715  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  9618714 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 9618636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3445469 - 3445315
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  3445469 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 3445370  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 160  Q
    ||||||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  3445369 gtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 3445315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 26669894 - 26670186
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||| | | |||| | || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  26669894 gcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttgggggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 26669993  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  26669994 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 26670093  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  26670094 catctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 26670186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Original strand, 31564369 - 31564526
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  |     
T  31564369 agcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctgg 31564468  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 162  Q
    |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  31564469 agtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 31564526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 24592521 - 24592813
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  24592521 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctgga 24592620  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||||||| || || |  || ||||||||||| |||||  |||| ||||| || || ||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  24592621 gtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 24592720  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  24592721 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 24592813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 31125083 - 31124905
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  31125083 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctgga 31124984  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  31124983 gtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 31124905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 11441735 - 11441590
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  11441735 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 11441636  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaa 151  Q
    ||||||| || || |  || || ||||||||||||||  |||||||    
T  11441635 gtagagttggaagaagttctgcgtacaacattggtataggaggaaa 11441590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 298
Target Start/End: Original strand, 26537850 - 26538148
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  || ||||||||  | |    
T  26537850 gcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgcacaatgccctctctgga 26537949  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgc------tgttgttgttgaactggtggctgttg 199  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| || ||||| |  | ||| |||      |||||||||||||| ||   ||||||    
T  26537950 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttgttgttgaaccggcaactgttg 26538049  T
Q  200 ttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 298  Q
    || ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || || ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26538050 tttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 26538148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11441507 - 11441431
Alignment:
Q  219 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  11441507 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 11441431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 4200715 - 4200682
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4200715 ccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 4200682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 26682975 - 26683008
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26682975 ccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 26683008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 22888646 - 22888310
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888646 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 22888547  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888546 gagaaatagagtcgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 22888447  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22888446 tgcatttgctgaacgacggcattaacggttacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatg 22888347  T
Q  301 gcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcatt 337  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  22888346 gcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 22888310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 33877423 - 33877078
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33877423 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcccttt 33877324  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  33877323 gagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgt 33877224  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 300  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877223 tgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 33877124  T
Q  301 gcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877123 gcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 33877078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 5 - 346
Target Start/End: Original strand, 13184638 - 13184979
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13184638 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaga 13184737  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 204  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  13184738 agtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgca 13184837  T
Q  205 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 304  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184838 ttcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 13184937  T
Q  305 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184938 atacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 13184979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 11325970 - 11325625
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11325970 ccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcccttt 11325871  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  11325870 gagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgt 11325771  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11325770 tgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccaatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 11325671  T
Q  301 gcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11325670 gcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 11325625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 5 - 346
Target Start/End: Original strand, 13440484 - 13440825
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13440484 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaga 13440583  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 204  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  13440584 agtagagtcgggagtaatttagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgca 13440683  T
Q  205 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 304  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440684 ttcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 13440783  T
Q  305 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440784 atacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 13440825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25199205 - 25198884
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199205 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgagatcagaacggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 25199106  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199105 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagaaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 25199006  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  25199005 tgcatttgctgaacgacggcgttaacgagtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacg 25198906  T
Q  301 gcgcatacgggtacaacggagg 322  Q
    ||||||| |||||| |||||||    
T  25198905 gcgcatatgggtacgacggagg 25198884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23892382 - 23892058
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892382 ccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcggaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 23892283  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgt 197  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||    
T  23892282 gagaagtagagtcggaagcaactcggcatacatgattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggtggctgt 23892183  T
Q  198 tgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagt 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  23892182 tgttgcatttgctgaacgatggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgttggaaagaaaggatgctgagagt 23892083  T
Q  298 attgcgcatacgggtacaacggagg 322  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||    
T  23892082 acggcgcatatgggtacgacggagg 23892058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 29889068 - 29889263
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29889068 ccagagcaccttgatggaaatcacatatgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtggtgcagtgccctct 29889167  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctg 196  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||    
T  29889168 gagaagtagagttgggagtagctcagcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctg 29889263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24970186 - 24969876
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  24970186 ccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 24970087  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttg 208  Q
     |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||    
T  24970086 aagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgttga---tgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctg 24969990  T
Q  209 ctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatac 308  Q
     ||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||     
T  24969989 ttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatat 24969890  T
Q  309 gggtacaacggagg 322  Q
    |||||| |||||||    
T  24969889 gggtacgacggagg 24969876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 30934801 - 30934515
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | ||||    
T  30934801 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagta 30934702  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttg 208  Q
     |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   |||||||| ||| ||    
T  30934701 aagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctg 30934602  T
Q  209 ctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
     ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30934601 ttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgaga 30934515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 23752441 - 23752733
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |    
T  23752441 gcaccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatgga 23752540  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   ||||||||     
T  23752541 gtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgttt 23752640  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  23752641 catctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 23752733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 24688143 - 24688467
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  | | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24688143 ccagagcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 24688242  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgt 197  Q
      | |||| |||||| || ||||| |||||||| || |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   ||||    
T  24688243 atggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaatatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgt 24688342  T
Q  198 tgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagt 297  Q
    |||| ||| || ||| | |  | |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  24688343 tgtttcatctgttgagcaattgtattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaat 24688442  T
Q  298 attgcgcatacgggtacaacggagg 322  Q
    |  ||||||| |||||  |||||||    
T  24688443 acggcgcatatgggtatgacggagg 24688467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33777655 - 33777321
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  33777655 ccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 33777556  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     ||| || || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| |||    
T  33777555 aagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcat 33777456  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || ||    
T  33777455 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 33777356  T
Q  306 tacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
    || |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  33777355 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 33777321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Original strand, 23717982 - 23718271
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  23717982 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 23718081  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| |||    
T  23718082 aagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcat 23718181  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
     || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  23718182 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 23718271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 22999105 - 22999397
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |    
T  22999105 gcaccttgatgaaaatcacacttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatgga 22999204  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   ||||||||     
T  22999205 gtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgttt 22999304  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22999305 catctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 22999397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11549522 - 11549236
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  11549522 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 11549423  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| |||    
T  11549422 aagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcat 11549323  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 292  Q
     || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11549322 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggtggaaagaaaggatgctg 11549236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33292693 - 33292362
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | ||||    
T  33292693 ccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagta 33292594  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttg 208  Q
     ||| || || | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  ||    
T  33292593 aagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgttgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctg 33292494  T
Q  209 ctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatac 308  Q
     ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||     
T  33292493 ttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataa 33292394  T
Q  309 gggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
    |||||  |||| || | |||||||||||||||    
T  33292393 gggtaggacgggggaaactgagcagcattgat 33292362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 32599463 - 32599752
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |    
T  32599463 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctgga 32599562  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
    ||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |     
T  32599563 gtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtac 32599662  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
     |||||| ||| |||||| || || ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  32599663 ctgctgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 32599752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 9548534 - 9548826
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  9548534 gcaccttgatgaaaatcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttgga 9548633  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || || || ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||  ||   ||||||||     
T  9548634 gtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaatcggcatctgttgttt 9548733  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||| | |  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  9548734 catctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 9548826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34616689 - 34616400
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  34616689 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctgga 34616590  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |     
T  34616589 gtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtac 34616490  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
     || ||| ||| |||||| || || ||||||||||  || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  34616489 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttagccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 34616400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 8665466 - 8665758
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  8665466 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 8665565  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  8665566 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 8665665  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| || || ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  8665666 catctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 8665758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 15658751 - 15659043
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  15658751 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttgga 15658850  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  15658851 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgttt 15658950  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||| | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  15658951 catctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaacggcggaaagaaaggatgctgaga 15659043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 18375403 - 18375741
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  18375403 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 18375502  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  18375503 gtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgttt 18375602  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 302  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  18375603 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggc 18375702  T
Q  303 gcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatg 341  Q
      ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||    
T  18375703 atatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatg 18375741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 30168640 - 30168302
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |    
T  30168640 gcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctgga 30168541  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   ||||||||     
T  30168540 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgttt 30168441  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 302  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  30168440 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggc 30168341  T
Q  303 gcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatg 341  Q
      ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||    
T  30168340 atatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatg 30168302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 15758848 - 15759140
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  15758848 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 15758947  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  15758948 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 15759047  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  15759048 catctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 15759140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41674880 - 41674589
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  41674880 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttgga 41674781  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || || || ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   ||||||||     
T  41674780 gtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgttt 41674681  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgag 294  Q
    ||| || ||  | |  ||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  41674680 catctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggtggacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgag 41674589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6874476 - 6874181
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  6874476 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 6874377  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat------gctgttgttgttgaactggtggctgttg 199  Q
    ||| ||| || || | ||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||      | |||||||||||||| ||   ||||||    
T  6874376 gtaaagttggaagcagctcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttg 6874277  T
Q  200 ttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    || ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  6874276 tttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 6874181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2511222 - 2511044
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  2511222 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 2511123  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  2511122 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 2511044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12132326 - 12132034
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  12132326 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 12132227  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| || | ||||||||     
T  12132226 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgttt 12132127  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  12132126 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 12132034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 37671474 - 37671630
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||  | |    
T  37671474 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctgga 37671573  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 162  Q
    ||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  37671574 gtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37671630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26480563 - 26480385
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  26480563 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 26480464  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  26480463 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 26480385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 28649406 - 28649250
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |    
T  28649406 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctgga 28649307  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 162  Q
    ||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  28649306 gtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 28649250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 33516527 - 33516189
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  33516527 gcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctgga 33516428  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    |||  || || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  33516427 gtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgttt 33516328  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 302  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  33516327 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggc 33516228  T
Q  303 gcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatg 341  Q
      ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||    
T  33516227 atatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgatg 33516189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 5638081 - 5637903
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  5638081 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 5637982  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  5637981 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 5637903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 9317622 - 9317444
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  9317622 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 9317523  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  9317522 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 9317444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 31431611 - 31431466
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |    
T  31431611 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctgga 31431512  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaa 151  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  31431511 gtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaa 31431466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 37770978 - 37771134
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || || |||||  | |    
T  37770978 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctgga 37771077  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 162  Q
    ||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  37771078 gtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37771134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 43078423 - 43078128
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||  | |    
T  43078423 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtacaatgccctctctgga 43078324  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgc------tgttgttgttgaactggtggctgttg 199  Q
    ||||||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || ||||| |  | ||| |||      |||||||||||||| ||   ||||||    
T  43078323 gtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttgttgttgaaccggcaactgttg 43078224  T
Q  200 ttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    || ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  43078223 tttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 43078128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Original strand, 28959777 - 28959955
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  28959777 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctgga 28959876  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||||||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || |||||    
T  28959877 gtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttg 28959955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 29967057 - 29967349
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  29967057 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctgga 29967156  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||||||| || || |  || |||||||||||||||||  |||| ||||| || || ||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  29967157 gtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 29967256  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  29967257 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 29967349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 30152189 - 30152011
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  30152189 gcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 30152090  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  30152089 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 30152011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 31826398 - 31826552
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  31826398 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 31826497  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 160  Q
    ||||||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  31826498 gtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 31826552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Original strand, 37358634 - 37358812
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  37358634 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctgga 37358733  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||||||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  37358734 gtagagttggaagaagttccgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 37358812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 18500721 - 18500877
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |    
T  18500721 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttgga 18500820  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 162  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||||    
T  18500821 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctag 18500877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 30029586 - 30029408
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  30029586 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctgga 30029487  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||||||| || || |  || |||||||||||||||||  |||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||||||    
T  30029486 gtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttg 30029408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3789712 - 3789556
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |    
T  3789712 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctgga 3789613  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 162  Q
    ||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  3789612 gtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 3789556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 37755151 - 37754995
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || || || |||||  | |    
T  37755151 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgacctctctgga 37755052  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 162  Q
    ||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  37755051 gtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37754995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Original strand, 13324819 - 13324976
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  |     
T  13324819 agcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctgg 13324918  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 162  Q
    |||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  13324919 agtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 13324976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31431383 - 31431307
Alignment:
Q  219 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  31431383 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 31431307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3789481 - 3789402
Alignment:
Q  219 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 298  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3789481 gcattgacgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 3789402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24681611 - 24681457
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |    
T  24681611 gcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctgga 24681512  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 160  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||    
T  24681511 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 24681457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24724138 - 24723984
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |    
T  24724138 gcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctgga 24724039  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 160  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||    
T  24724038 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 24723984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 40473540 - 40473694
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |    
T  40473540 gcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctgga 40473639  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 160  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||    
T  40473640 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 40473694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Original strand, 18500955 - 18501031
Alignment:
Q  219 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  18500955 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 18501031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28649181 - 28649105
Alignment:
Q  219 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  28649181 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 28649105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Original strand, 37358862 - 37358938
Alignment:
Q  219 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  37358862 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 37358938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Original strand, 37671699 - 37671775
Alignment:
Q  219 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  37671699 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 37671775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15228052 - 15227716
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15228052 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaatggatcaggtggaggcttaccctgtctggttgtacagtgccctct 15227953  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15227952 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgt 15227853  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227852 tgcatttgctgaacgacagcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 15227753  T
Q  301 gcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcatt 337  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  15227752 gcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 15227716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 1900439 - 1900103
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1900439 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgagaagcaacggatcaggtggaggcttaccatgtctggttgtgcagtgccctct 1900340  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1900339 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgctgttgaactggtggctgttgt 1900240  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1900239 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatg 1900140  T
Q  301 gcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcatt 337  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  1900139 gcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 1900103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 5 - 346
Target Start/End: Original strand, 24460698 - 24461039
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24460698 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaga 24460797  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 204  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  24460798 agtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgca 24460897  T
Q  205 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 304  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24460898 ttcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 24460997  T
Q  305 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24460998 atacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 24461039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 15285017 - 15285353
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15285017 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 15285116  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15285117 gagaagtagagtcgggagtaactcgaaatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagttggtggctgttgt 15285216  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15285217 tgcatttgctgaacgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtatt 15285316  T
Q  301 gcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcatt 337  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  15285317 gcgcatatgggtacaatggaggtaactgggcagcatt 15285353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 14235614 - 14235953
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  14235614 ccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcgaaatggaacctgggaggcaaagggttaggtggaggcttgccctgtctggttgtacagtgcccttt 14235713  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttgttgaactggtggctgt 197  Q
     ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||| | || ||||||    
T  14235714 aagaagcagagtcgggagcagctcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgttgctgctgttgttgctgagccggcggctgt 14235813  T
Q  198 tgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagt 297  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  || ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14235814 tgttgcatttgctgagcaatggcattaacgggtacctatgggtgacccgatggtagagggtactgatgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagt 14235913  T
Q  298 attgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcatt 337  Q
    |||||  |||| |||||  | |||||| ||||||||||||    
T  14235914 attgcatatactggtacggcagaggtaactgagcagcatt 14235953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 15391427 - 15391764
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  15391427 ccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttcccctgcctggttgtgcagtgcccttt 15391526  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||   | |  | ||||||||     
T  15391527 gagaagcaaagtcgggagcaactcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgctgctgttgttg---agccagcggctgttgc 15391623  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagt 297  Q
    |||||||||||| | | |||||| | ||||||||||||||||||||   |||||   ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15391624 tgcatttgctgagcaatggcattgatgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagt 15391720  T
Q  298 attgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatg 341  Q
    |||||   ||| | |||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  15391721 attgcatgtactgatacggcggaggtagctgagcaacattgatg 15391764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17014174 - 17013867
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||  | | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  17014174 ccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctttggagta 17014075  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| |||    
T  17014074 aagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcat 17013975  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||    
T  17013974 ctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 17013875  T
Q  306 tacgggta 313  Q
    || |||||    
T  17013874 tatgggta 17013867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Original strand, 24592411 - 24592742
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  24592411 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 24592510  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttg 208  Q
     ||| || || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||   |||||||| ||| ||    
T  24592511 aagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctg 24592610  T
Q  209 ctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatac 308  Q
     ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || ||||     
T  24592611 ttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatat 24592710  T
Q  309 gggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
    |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  24592711 gggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 24592742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14665192 - 14664858
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | ||||    
T  14665192 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagta 14665093  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     ||| || || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| |||    
T  14665092 aagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcat 14664993  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||    
T  14664992 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggtgca 14664893  T
Q  306 tacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
    || |||||  ||||||| |  || |||||||||||    
T  14664892 tatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgat 14664858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 340
Target Start/End: Original strand, 34189053 - 34189388
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  |     
T  34189053 agcaccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctgg 34189152  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 204  Q
    |||| ||| || || | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||    
T  34189153 agtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgca 34189252  T
Q  205 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 304  Q
      || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||    
T  34189253 cctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgc 34189352  T
Q  305 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
    ||| |||||  |||| || | |||||||||||||||    
T  34189353 ataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgat 34189388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 298
Target Start/End: Original strand, 14763398 - 14763693
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  14763398 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttgga 14763497  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||  | || |||||    
T  14763498 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttg 14763597  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 298  Q
    ||  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14763598 cacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 14763693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6570031 - 6569738
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |     
T  6570031 agcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgg 6569932  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgtt 201  Q
    |||||||| || || |  || |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||   || ||||| |||||||||||   ||||||||    
T  6569931 agtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgctgttgaactggcatctgttgtt 6569832  T
Q  202 gcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
     ||| || ||  | |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  6569831 tcatctgttgggcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 6569738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24112836 - 24112506
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | ||||    
T  24112836 ccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagta 24112737  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttg 208  Q
     ||| || || | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  ||    
T  24112736 aagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctg 24112637  T
Q  209 ctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatac 308  Q
     ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||     
T  24112636 ttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataa 24112537  T
Q  309 gggtacaacggaggtagctgagcagcattga 339  Q
    |||||  |||| || | ||||||||||||||    
T  24112536 gggtaggacgggggaaactgagcagcattga 24112506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 298
Target Start/End: Original strand, 36344609 - 36344901
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |    
T  36344609 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaacctcggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctgga 36344708  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
    ||| ||| || || | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||     
T  36344709 gtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcac 36344808  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 298  Q
     || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||    
T  36344809 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggatactgatgataaaacggtaggaagaacggatgctgagagta 36344901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14098718 - 14098381
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||   | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  14098718 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagtcctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 14098619  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||||||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   ||||||||     
T  14098618 gtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgttt 14098519  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 302  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  14098518 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggc 14098419  T
Q  303 gcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
      ||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  14098418 atatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 14098381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 54833564 - 54833230
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  | |    
T  54833564 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttgga 54833465  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
    ||| ||| || || | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |     
T  54833464 gtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtac 54833365  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| | | |||||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || ||    
T  54833364 ctgttgagcaatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 54833265  T
Q  306 tacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
    || |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  54833264 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 54833230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 340
Target Start/End: Original strand, 31126612 - 31126949
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  31126612 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 31126711  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||||||| || || | ||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  31126712 gtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgttt 31126811  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 302  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  31126812 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggc 31126911  T
Q  303 gcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
      ||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  31126912 atatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 31126949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 27163411 - 27163703
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  27163411 gcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 27163510  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  27163511 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 27163610  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||| | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  27163611 catctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 27163703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5006050 - 5005755
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  5006050 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccttgtctagttgtacaatgccctctctgga 5005951  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt------gttgaactggtggctgttg 199  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||      ||||||| ||   ||||||    
T  5005950 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttg 5005851  T
Q  200 ttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    || ||| || ||  | |  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  5005850 tttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 5005755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 18800707 - 18800863
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |    
T  18800707 gcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctgga 18800806  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 162  Q
    ||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  18800807 gtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 18800863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21969878 - 21969586
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||| | ||||| || || || |||||||||||||| || || || || || || |||||  | |    
T  21969878 gcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccttgcctagtcgtacaatgtcctctctgga 21969779  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||||||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  21969778 gtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgttt 21969679  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||| | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  21969678 catctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggcgggaagaaaggatgctgaga 21969586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 30753931 - 30753777
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  30753931 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 30753832  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 160  Q
    ||||||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  30753831 gtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 30753777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 33673892 - 33674046
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |    
T  33673892 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctgga 33673991  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 160  Q
    ||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  33673992 gtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 33674046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Original strand, 40105732 - 40105910
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |    
T  40105732 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctgga 40105831  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||| ||| || || |  || ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  40105832 gtaaagttggaagaagttcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 40105910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 39850816 - 39850661
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  |     
T  39850816 agcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctgg 39850717  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 160  Q
    |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||    
T  39850716 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39850661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19373202 - 19373101
Alignment:
Q  239 ttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattg 338  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||    
T  19373202 ttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattg 19373103  T
Q  339 at 340  Q
    ||    
T  19373102 at 19373101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Original strand, 18800932 - 18801008
Alignment:
Q  219 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  18800932 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 18801008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 30753703 - 30753627
Alignment:
Q  219 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||  |||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  30753703 gcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 30753627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 21703242 - 21703578
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21703242 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgtcctgtctggttgtgcagtgccctct 21703341  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703342 gagaagtagagtcgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 21703441  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21703442 tgcatttgttgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatg 21703541  T
Q  301 gcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcatt 337  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||  ||||||||    
T  21703542 gcgcatatgggtacgacggaggtaactaggcagcatt 21703578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27118851 - 27118506
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27118851 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcccttt 27118752  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  27118751 gagaagtagagtcgggagtaattcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgt 27118652  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27118651 tgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 27118552  T
Q  301 gcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27118551 gcgcatgcgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 27118506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 5 - 346
Target Start/End: Original strand, 34303385 - 34303726
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34303385 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaga 34303484  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 204  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  34303485 agtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgca 34303584  T
Q  205 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 304  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303585 ttcgctggacgacgacattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 34303684  T
Q  305 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303685 atacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 34303726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 5 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 34157170 - 34156829
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34157170 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaga 34157071  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 204  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  34157070 agtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgca 34156971  T
Q  205 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 304  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34156970 ttcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 34156871  T
Q  305 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34156870 atacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 34156829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 5 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 3784813 - 3784472
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3784813 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaga 3784714  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 204  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  3784713 agtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctactgtcgttgttgagctggaggctgttgttgca 3784614  T
Q  205 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 304  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3784613 ttcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 3784514  T
Q  305 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3784513 atacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 3784472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 5 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16163758 - 16163417
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16163758 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaga 16163659  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 204  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  16163658 agtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgca 16163559  T
Q  205 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 304  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16163558 ttcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 16163459  T
Q  305 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16163458 atacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 16163417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 19456499 - 19456835
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19456499 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctat 19456598  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19456599 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgt 19456698  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 300  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19456699 tgcatttgctaaacgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaaagtatt 19456798  T
Q  301 gcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcatt 337  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  19456799 gcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 19456835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 345
Target Start/End: Original strand, 31891414 - 31891750
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31891414 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagta 31891513  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttg 208  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  31891514 gagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcg 31891613  T
Q  209 ctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31891614 ctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatac 31891713  T
Q  309 gggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtcca 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891714 gggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtcca 31891750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 27434530 - 27434846
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  27434530 ccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacttgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 27434629  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     || ||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| |||    
T  27434630 aagccggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcat 27434729  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  27434730 ctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgca 27434829  T
Q  306 tacgggtacaacggagg 322  Q
    || |||||| |||||||    
T  27434830 tatgggtacgacggagg 27434846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27393132 - 27392813
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  27393132 ccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgcccttt 27393033  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
    |||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||                     |    
T  27393032 gagaagcaaagtcgggagcagctcggcatacatcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgttgctgttg---------------------t 27392954  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 300  Q
    |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||  ||    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27392953 tgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggcggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtatt 27392854  T
Q  301 gcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatg 341  Q
    ||   ||| |||||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  27392853 gcatgtactggtacggtggaggtagctgagcagcatcgatg 27392813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 23128644 - 23128968
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23128644 ccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 23128743  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgt 197  Q
      | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   ||||    
T  23128744 atggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgt 23128843  T
Q  198 tgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagt 297  Q
    |||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  23128844 tgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaat 23128943  T
Q  298 attgcgcatacgggtacaacggagg 322  Q
    |  ||||||| |||||  |||||||    
T  23128944 acggcgcatatgggtatgacggagg 23128968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28882369 - 28882080
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  28882369 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 28882270  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| |||    
T  28882269 aagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcat 28882170  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
     || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  28882169 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 28882080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12655697 - 12655381
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  12655697 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 12655598  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| |||    
T  12655597 aagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcat 12655498  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||    
T  12655497 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 12655398  T
Q  306 tacgggtacaacggagg 322  Q
    || |||||  |||||||    
T  12655397 tatgggtaggacggagg 12655381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20838073 - 20837766
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  | | |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||    
T  20838073 ccttgatggaaatcacatttaaggtcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagta 20837974  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| |||    
T  20837973 aagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcat 20837874  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||    
T  20837873 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 20837774  T
Q  306 tacgggta 313  Q
    || |||||    
T  20837773 tatgggta 20837766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 21677265 - 21677557
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  21677265 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 21677364  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  21677365 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 21677464  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21677465 catctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 21677557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34279607 - 34279315
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  34279607 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttgga 34279508  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  34279507 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgttt 34279408  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||| | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  34279407 catctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 34279315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 34286512 - 34286223
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  34286512 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttgga 34286413  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  34286412 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 34286313  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 292  Q
    ||| || ||| | || ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  34286312 catctgttgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctg 34286223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 34291572 - 34291283
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  34291572 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttgga 34291473  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  34291472 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 34291373  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 292  Q
    ||| || ||| | || ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  34291372 catctgttgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctg 34291283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 11635269 - 11635564
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  11635269 gcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 11635368  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg------ttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttg 199  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||||||||||||      ||| || |||||||||||||| ||   ||||||    
T  11635369 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttg 11635468  T
Q  200 ttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    || ||| || ||  | |  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  11635469 tttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 11635564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 11641458 - 11641753
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  11641458 gcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 11641557  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg------ttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttg 199  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| |||||  ||||| |||| || ||||||||||||||      ||| || |||||||||||||| ||   ||||||    
T  11641558 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatctgtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttg 11641657  T
Q  200 ttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    || ||| || ||  | |  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  11641658 tttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 11641753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 40233674 - 40233515
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  40233674 ccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 40233575  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 160  Q
      | |||| ||| || || | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  40233574 ctggagtaaagttggaagaagctcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 40233515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 13936627 - 13936919
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |    
T  13936627 gcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctgga 13936726  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||| ||||| |||   ||||||||||||||||| ||  |||||||||     
T  13936727 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgactttgctgttgttgttgaaccggcagctgttgttt 13936826  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  13936827 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 13936919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 22926111 - 22926403
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  22926111 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 22926210  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  22926211 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 22926310  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  22926311 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 22926403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37925651 - 37925359
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||| | | |||| | ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  37925651 gcaccttgatggaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcgggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 37925552  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   ||||||||     
T  37925551 gtaaagttggaagcaactcagcatataacattggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 37925452  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  37925451 catctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 37925359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 37375319 - 37375024
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |    
T  37375319 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctgga 37375220  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag---cttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||    ||| || ||||| || |||||||| || || || |||||    
T  37375219 gtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgctgttgaacgggcggttgatgttg 37375120  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 298  Q
     |  || ||| ||| | |||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  37375119 tacctgttgagcgatgacattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggcgggaagaacggatgctgagagta 37375024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31876439 - 31876147
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  31876439 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 31876340  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||||||| || || |  || || ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  31876339 gtagagttggaagaagttccgcgtacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 31876240  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  31876239 catctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 31876147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 16829421 - 16829713
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  16829421 gcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctgga 16829520  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    |||  || || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  16829521 gtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgttt 16829620  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  16829621 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 16829713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16892060 - 16891768
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  16892060 gcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctgga 16891961  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    |||  || || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  16891960 gtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgttt 16891861  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  16891860 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 16891768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32049956 - 32049664
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||| | | |||| | ||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  32049956 gcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtgggggtttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 32049857  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  32049856 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 32049757  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||| | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  32049756 catctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 32049664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 37685992 - 37686284
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  37685992 gcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 37686091  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  37686092 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 37686191  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  37686192 catctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 37686284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 37701257 - 37701549
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  37701257 gcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 37701356  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  37701357 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 37701456  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  37701457 catctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 37701549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 34861838 - 34861660
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  34861838 gcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 34861739  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  34861738 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 34861660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 151
Target Start/End: Original strand, 260836 - 260981
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |    
T  260836 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacagatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctgga 260935  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaa 151  Q
    ||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  |||||||    
T  260936 gtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaa 260981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Original strand, 12716685 - 12716863
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |    
T  12716685 gcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctgga 12716784  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| || ||||| |  | ||| ||||||||||||||    
T  12716785 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgttgttgttg 12716863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 19416582 - 19416874
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  19416582 gcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctgga 19416681  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||||||| || || |  || ||||||||||| |||||  |||| || || || || ||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  19416682 gtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaaagttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 19416781  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19416782 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 19416874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 39890232 - 39890054
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||   | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  39890232 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagccctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctgga 39890133  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    |||  || || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || |||||    
T  39890132 gtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttg 39890054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 295
Target Start/End: Original strand, 261009 - 261140
Alignment:
Q  164 ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattga 263  Q
    |||||| || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||    
T  261009 ttgttgttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactga 261108  T
Q  264 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  261109 tgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 261140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27803865 - 27803687
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |    
T  27803865 gcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctgga 27803766  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| || ||||| |  | ||| ||||| ||||||||    
T  27803765 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgntgttgttg 27803687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27777380 - 27777226
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |    
T  27777380 gcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctgga 27777281  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 160  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||    
T  27777280 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27817138 - 27816984
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |    
T  27817138 gcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctgga 27817039  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 160  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||    
T  27817038 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27816984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 39051905 - 39052059
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |    
T  39051905 gcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctgga 39052004  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 160  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||    
T  39052005 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39052059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 9350065 - 9350219
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||| | ||||| || || || |||||||||||||| || || || |||||||| |||||  | |    
T  9350065 gcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccttgcctagtcgtgcagtgtcctctctgga 9350164  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 160  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||    
T  9350165 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 9350219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 12586968 - 12586874
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  12586968 gcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 12586874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 2747 - 3092
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2747 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctct 2846  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2847 gagaagtagagttgggagtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgctgatgctgttgttgttgagctggaggctgttgt 2946  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2947 tgcatttgttgaacgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 3046  T
Q  301 gcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3047 gcgcgtacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 55)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 13522105 - 13522450
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13522105 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcccttt 13522204  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  13522205 gagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgt 13522304  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 300  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522305 tgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 13522404  T
Q  301 gcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522405 gcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 13522450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 5 - 346
Target Start/End: Original strand, 33374292 - 33374633
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33374292 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaga 33374391  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 204  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  33374392 agtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgca 33374491  T
Q  205 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 304  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33374492 ttcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 33374591  T
Q  305 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33374592 atacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 33374633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 5 - 346
Target Start/End: Original strand, 8892346 - 8892687
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8892346 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaga 8892445  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 204  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  8892446 agtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgca 8892545  T
Q  205 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 304  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8892546 ttcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 8892645  T
Q  305 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8892646 atacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 8892687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 5 - 346
Target Start/End: Original strand, 8903581 - 8903922
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8903581 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaga 8903680  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 204  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  8903681 agtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgca 8903780  T
Q  205 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 304  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8903781 ttcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagagatgctgagagtattgcgc 8903880  T
Q  305 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8903881 atacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 8903922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 5 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28162817 - 28162477
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28162817 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaagtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaga 28162718  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 204  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  28162717 agtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgca 28162618  T
Q  205 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 304  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28162617 ttcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgc 28162518  T
Q  305 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtcca 345  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28162517 atacgggtacgatggaggtagctgagcagcattgatgtcca 28162477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 22477305 - 22477644
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  22477305 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggttagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccatat 22477404  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttgttgaactggtggctgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| |||| ||||    
T  22477405 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttgttgaaccggtgactgt 22477504  T
Q  198 tgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagt 297  Q
    ||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22477505 tgttgcatttgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactaatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagt 22477604  T
Q  298 attgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcatt 337  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||  || ||||||||    
T  22477605 actgcgcatacgggtacgacagaggtaattgggcagcatt 22477644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 22456966 - 22457176
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  22456966 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtaagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccttat 22457065  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttgttgaactggtggctgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| |||| ||||    
T  22457066 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttgttgaaccggtgactgt 22457165  T
Q  198 tgttgcatttg 208  Q
    |||||||||||    
T  22457166 tgttgcatttg 22457176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 27290402 - 27290597
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27290402 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacttgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctct 27290501  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctg 196  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||    
T  27290502 gagaagtagagtcgggagcaactcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttattgctgctgtcgttgttgagccggtggctg 27290597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20160860 - 20160568
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||    
T  20160860 gcaccttggtggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaa 20160761  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||  |    
T  20160760 gtaaagttgggagtaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgttgagctggtggctgttgctgttt 20160661  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 298  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  20160660 ttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagta 20160568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 298
Target Start/End: Original strand, 22171971 - 22172263
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||    
T  22171971 gcaccttggtggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaa 22172070  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||  |    
T  22172071 gtaaagttgggagtaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgttgagctggtggctgttgctgttt 22172170  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 298  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  22172171 ttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagta 22172263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 14143317 - 14143500
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14143317 ccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctct 14143416  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14143417 gagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 14143500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26788108 - 26787925
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26788108 ccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctct 26788009  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  26788008 gagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 26787925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27196481 - 27196298
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27196481 ccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctct 27196382  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27196381 gagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 27196298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 27252759 - 27252942
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27252759 ccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctct 27252858  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27252859 gagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 27252942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 22934920 - 22935233
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | ||||    
T  22934920 ccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagta 22935019  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttg 208  Q
     |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||   |||||||| ||| ||    
T  22935020 aagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctg 22935119  T
Q  209 ctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatac 308  Q
     ||| | |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  |||||||     
T  22935120 ttgagcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatat 22935219  T
Q  309 gggtacaacggagg 322  Q
    |||||  |||||||    
T  22935220 gggtatgacggagg 22935233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 23857365 - 23857678
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | ||||    
T  23857365 ccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagta 23857464  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttg 208  Q
     |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||   |||||||| ||| ||    
T  23857465 aagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctg 23857564  T
Q  209 ctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatac 308  Q
     ||| | |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  |||||||     
T  23857565 ttgagcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatat 23857664  T
Q  309 gggtacaacggagg 322  Q
    |||||  |||||||    
T  23857665 gggtatgacggagg 23857678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 24304650 - 24304992
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24304650 ccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 24304749  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgt 197  Q
      | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   ||||    
T  24304750 atggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggaaactgt 24304849  T
Q  198 tgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagt 297  Q
    |||| ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  24304850 tgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaat 24304949  T
Q  298 attgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
    |  || |||| |||||  ||||||| |  || |||||||||||    
T  24304950 acggcacatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgat 24304992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 13298991 - 13299307
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  13298991 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 13299090  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| |||    
T  13299091 aagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcat 13299190  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||    
T  13299191 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 13299290  T
Q  306 tacgggtacaacggagg 322  Q
    || |||||  |||||||    
T  13299291 tatgggtatgacggagg 13299307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 15424357 - 15424673
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||    
T  15424357 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagta 15424456  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||| ||||||   |||||||| |||    
T  15424457 aagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttcaactggcaactgttgtttcat 15424556  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||    
T  15424557 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 15424656  T
Q  306 tacgggtacaacggagg 322  Q
    || |||||  |||||||    
T  15424657 tatgggtatgacggagg 15424673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29549634 - 29549300
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  29549634 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 29549535  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
    ||||||| || || | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||     
T  29549534 gtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcgtattgctgctgctgttgttgaactggcggttgatgttgcac 29549435  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || ||    
T  29549434 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 29549335  T
Q  306 tacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
    || |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  29549334 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 29549300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16750010 - 16749721
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||    
T  16750010 ccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagta 16749911  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| |||    
T  16749910 aagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcat 16749811  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
     || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16749810 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 16749721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26989157 - 26988868
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | ||||    
T  26989157 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagta 26989058  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || || ||||||||||||||   |||||||| |||    
T  26989057 aagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgatgttgttgaactggcaactgttgtttcat 26988958  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
     || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  26988957 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 26988868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27000229 - 26999940
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  27000229 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 27000130  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     ||| || || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| |||    
T  27000129 aagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcat 27000030  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
     || ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  27000029 ctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 26999940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26918536 - 26918202
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  26918536 ccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 26918437  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| | |    
T  26918436 aagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcgt 26918337  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| | |  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || ||    
T  26918336 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 26918237  T
Q  306 tacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
    || |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  26918236 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 26918202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24863873 - 24863557
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  24863873 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 24863774  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     ||| || || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| |||    
T  24863773 aagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcat 24863674  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| | |  |||||||||||||| || ||||||| || ||| | ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||    
T  24863673 ctgttgagcaattgcattaacgggtacttggggttgactcggtggtagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 24863574  T
Q  306 tacgggtacaacggagg 322  Q
    || |||||  |||||||    
T  24863573 tatgggtaggacggagg 24863557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 4525445 - 4525156
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| | ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  | |    
T  4525445 gcaccttgatgaaagtcacatttgggatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcaatgtcctctctgga 4525346  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
    ||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||  |  || ||||| || ||||||||||| || || ||||| |     
T  4525345 gtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtac 4525246  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
     || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  4525245 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 4525156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27044546 - 27044257
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  27044546 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttgga 27044447  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
    ||| ||| || || | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |     
T  27044446 gtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtac 27044347  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
     || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  27044346 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 27044257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 27272612 - 27272876
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | | |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  27272612 ccagagcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcgacggatcaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctct 27272711  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgt------tgaactggtggc 194  Q
      | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||||||  |||| |||| ||||||||||      |||||||||||     
T  27272712 ctggagtagagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctgacttgctgattctgttgttgttgttgctgaactggtggt 27272811  T
Q  195 tgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggata 259  Q
    |||||| || | ||||| || |  ||||| || ||||| |||||| | || ||||||||||||||    
T  27272812 tgttgtggcttctgctgcacaatagcattcacaggtacttgaggtggtcctgatggcaaaggata 27272876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 29573172 - 29572994
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||  | |    
T  29573172 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctgga 29573073  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  29573072 gtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttg 29572994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 30558053 - 30558391
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  30558053 gcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctgga 30558152  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    |||  || || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  30558153 gtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgttt 30558252  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 302  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  30558253 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggc 30558352  T
Q  303 gcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatg 341  Q
      ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||    
T  30558353 atatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatg 30558391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 4773166 - 4773009
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  |     
T  4773166 agcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctgg 4773067  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 162  Q
    |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  4773066 agtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 4773009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29501574 - 29501228
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  29501574 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctgga 29501475  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag----ct--------tgttgatgctgttgttgttgaactggtgg 193  Q
    ||||||| || || |  || |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||    ||        ||||| || ||||||||||||| ||| ||    
T  29501474 gtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttgttgttgttgaattggcgg 29501375  T
Q  194 ctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctga 293  Q
     || |||||    |||||| ||| |||||| || || ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  29501374 ttgatgttgtgcctgctgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctga 29501275  T
Q  294 gagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
    || ||  ||  ||| |||||| ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  29501274 gaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgat 29501228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3696240 - 3696086
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |    
T  3696240 gcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctgga 3696141  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 160  Q
    ||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  3696140 gtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 3696086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 151
Target Start/End: Original strand, 4545811 - 4545957
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  |     
T  4545811 agcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctgg 4545910  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaa 151  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  4545911 agtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaa 4545957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16674298 - 16674144
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |    
T  16674298 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctgga 16674199  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 160  Q
    ||| ||| || || | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  16674198 gtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 16674144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Original strand, 26777652 - 26777830
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  26777652 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctgga 26777751  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||||||| || || |  |||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||    
T  26777752 gtagagttggaagaagttcggcatacaacatcggtataggagggaaggttggtctagcatattgctgctgctgctgttg 26777830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 151
Target Start/End: Original strand, 4724171 - 4724316
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |    
T  4724171 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctgga 4724270  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaa 151  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  4724271 gtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaa 4724316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 28207613 - 28207468
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |    
T  28207613 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctgga 28207514  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaa 151  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  28207513 gtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaa 28207468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 4757923 - 4757767
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  4757923 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctgga 4757824  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 162  Q
    ||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  4757823 gtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 4757767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 27007886 - 27007730
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |    
T  27007886 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctgga 27007787  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 162  Q
    ||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  27007786 gtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 27007730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 295
Target Start/End: Original strand, 27629907 - 27630038
Alignment:
Q  164 ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattga 263  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| || | || || || |  ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  27629907 ttgttgctgttgttgttgctgaactggtggttgttgtggcttctgttgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattga 27630006  T
Q  264 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    || || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  27630007 tggtaaaacggtgggaagaatggatgctgaga 27630038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27485288 - 27485110
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  27485288 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctgga 27485189  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  27485188 gtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 27485110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 16944064 - 16944356
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  16944064 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctgga 16944163  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||||||| || || |  || ||||||||||| |||||  |||| ||||| || || ||||| |||   || ||||| |||||||| ||   ||||||||     
T  16944164 gtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgctgttgaaccggcatctgttgttt 16944263  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  16944264 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 16944356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Original strand, 27360029 - 27360207
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  27360029 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctgga 27360128  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||||||| || || |  || ||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  27360129 gtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 27360207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Original strand, 27450372 - 27450550
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  27450372 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctgga 27450471  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||||||| || || |  || ||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  27450472 gtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 27450550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 34463383 - 34463537
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||  | |    
T  34463383 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggctttccttgtctagtcgtgcagtgtcctctctgga 34463482  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 160  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||    
T  34463483 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 34463537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17025436 - 17025280
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |    
T  17025436 gcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctgga 17025337  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 162  Q
    ||||||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  17025336 gtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 17025280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 26116447 - 26116603
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || || |||||  | |    
T  26116447 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctgga 26116546  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 162  Q
    ||| |||||| || |  || ||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||    
T  26116547 gtaaagtcggaagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtctag 26116603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3696006 - 3695930
Alignment:
Q  219 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  3696006 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 3695930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Original strand, 4546037 - 4546113
Alignment:
Q  219 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  4546037 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 4546113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Original strand, 4724396 - 4724472
Alignment:
Q  219 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  4724396 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 4724472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17025205 - 17025129
Alignment:
Q  219 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  17025205 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 17025129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Original strand, 26777880 - 26777956
Alignment:
Q  219 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  26777880 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 26777956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27007655 - 27007579
Alignment:
Q  219 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  27007655 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgaga 27007579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28207385 - 28207309
Alignment:
Q  219 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  28207385 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 28207309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 20340424 - 20340769
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20340424 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctct 20340523  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20340524 gagaagtagagttgggagtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgctgatgctgttgttgttgagctggaggctgttgt 20340623  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 300  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340624 tgcatttgttgaacgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 20340723  T
Q  301 gcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340724 gcgcgtacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 20340769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 16208120 - 16208418
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16208120 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggttttccctgtctggttgtgcagtgccctct 16208219  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  16208220 gagaagtagagtcgggagtaactcggtatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgttgttgttgaactggtggctgttgt 16208316  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16208317 tgcatttgctgaacgatggcattaatgggtacctgaggctgacccgatggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtatt 16208416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20461245 - 20460935
Alignment:
Q  3 agagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctga 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461245 agagcaccttgatgaaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctga 20461146  T
Q  103 gaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||                         
T  20461145 gaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattagtatcggaggaaaggtaggtctagcttgt---tgctgttgttg--------------------- 20461070  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 302  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20461069 catttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 20460970  T
Q  303 gcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcatt 337  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||    
T  20460969 gcatacgggtacggcggaggtaactgggcagcatt 20460935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28152028 - 28151845
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28152028 ccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggagcctgggaggtaacagatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctct 28151929  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28151928 gagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 28151845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 41793402 - 41793694
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  41793402 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 41793501  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  41793502 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 41793601  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| ||  || | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  41793602 catctgtggagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgttgaga 41793694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10962836 - 10962539
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  10962836 ccagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 10962737  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgt 197  Q
      | || | ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||    
T  10962736 ctggagcaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgt 10962637  T
Q  198 tgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    |||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  10962636 tgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 10962539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28585142 - 28584805
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  28585142 gcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 28585043  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   ||||||||     
T  28585042 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 28584943  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 302  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||    
T  28584942 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggc 28584843  T
Q  303 gcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
      |||||||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  28584842 atatacgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 28584805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 51638379 - 51638201
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |    
T  51638379 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctgga 51638280  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||||||| || || |  || ||||||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  51638279 gtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtatcgaagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 51638201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 5 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9354785 - 9354444
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  9354785 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagg 9354686  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 204  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  9354685 agtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgca 9354586  T
Q  205 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 304  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9354585 ttcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 9354486  T
Q  305 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9354485 atacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 9354444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 5 - 346
Target Start/End: Original strand, 19659091 - 19659432
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19659091 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgaga 19659190  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 204  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| || ||||||||||    
T  19659191 agtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggttgttgttgca 19659290  T
Q  205 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 304  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19659291 ttcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 19659390  T
Q  305 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19659391 atacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 19659432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 5 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 44563264 - 44562923
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44563264 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaga 44563165  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 204  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  44563164 agtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgca 44563065  T
Q  205 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 304  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44563064 ttcgctgaacggcggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgc 44562965  T
Q  305 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44562964 atacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 44562923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16283608 - 16283292
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||    
T  16283608 ccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctaaggagta 16283509  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg---aactggtggctgttgttgcat 205  Q
     |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||   |||||||| |||    
T  16283508 aagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcat 16283409  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| | |  ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  16283408 ctgttgagcaattgcattaatgggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgca 16283309  T
Q  306 tacgggtacaacggagg 322  Q
    || |||||| |||||||    
T  16283308 tatgggtacgacggagg 16283292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 22080926 - 22081263
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  22080926 ccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggctttccctgcctggttgtgcagtgcccttt 22081025  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
    |||||| | ||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||   ||||| || |||||| |    ||||||||     
T  22081026 gagaagcaaagtcgggagcagctcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgt---tgctgctgctgttgagccaacggctgttgc 22081122  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacc---cgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagt 297  Q
    |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||   |||||||   ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22081123 tgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagt 22081219  T
Q  298 attgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatg 341  Q
    |||||   ||| | |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22081220 attgcatgtactgatacggcggaggtagctgagcagcattgatg 22081263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33244832 - 33244649
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  33244832 ccagcgcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttaggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgcccttt 33244733  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  33244732 gagaagtagagtcgggagtaattcaacatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 33244649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Original strand, 27608961 - 27609250
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  27608961 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 27609060  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| |||    
T  27609061 aagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcat 27609160  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
     || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  27609161 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 27609250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 2137315 - 2137631
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  2137315 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 2137414  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| |||    
T  2137415 aagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcat 2137514  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||  |||||    
T  2137515 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgacggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 2137614  T
Q  306 tacgggtacaacggagg 322  Q
    || |||||  |||||||    
T  2137615 tatgggtatgacggagg 2137631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14557783 - 14557497
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  14557783 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgagggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 14557684  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttg 208  Q
     ||| || || ||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   |||||||| ||| ||    
T  14557683 aagttggaagcaactcagcatataacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctg 14557584  T
Q  209 ctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
     ||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14557583 ttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgaga 14557497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16277713 - 16277397
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  16277713 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 16277614  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| |||    
T  16277613 aagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcat 16277514  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||    
T  16277513 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 16277414  T
Q  306 tacgggtacaacggagg 322  Q
    || |||||  |||||||    
T  16277413 tatgggtatgacggagg 16277397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19688265 - 19687923
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19688265 ccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 19688166  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgt 197  Q
      | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||| |    ||||    
T  19688165 atggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccgacaactgt 19688066  T
Q  198 tgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagt 297  Q
    |||| ||| || ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  19688065 tgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactggtgatagaatggcggaaagaaaggatgctgggaat 19687966  T
Q  298 attgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
    |  ||||||| |||||  ||||||| |  || |||||||||||    
T  19687965 acggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgat 19687923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18710748 - 18710411
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | | |||| | ||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  18710748 gcaccctgatgaaaatcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgagggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttgga 18710649  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||   ||| || ||||| ||||||||||| ||   ||||||||     
T  18710648 gtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgttgaaccggcaactgttgttt 18710549  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 302  Q
    ||| || ||| | || ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||    
T  18710548 catctgttgagcaactgcattgacgggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggc 18710449  T
Q  303 gcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
     |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  18710448 acatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 18710411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31354686 - 31354394
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  31354686 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 31354587  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  | || |||||    
T  31354586 gtaaagttggaagcaactcggcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttg 31354487  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
     |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  31354486 tacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 31354394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 340
Target Start/End: Original strand, 31489803 - 31490140
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  31489803 gcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 31489902  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||| ||||     
T  31489903 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgctgttt 31490002  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 302  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  31490003 catctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggc 31490102  T
Q  303 gcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
      ||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  31490103 atatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 31490140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19286624 - 19286290
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  | |    
T  19286624 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttgga 19286525  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
    ||| ||| || || | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |     
T  19286524 gtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtac 19286425  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| | | |||||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || ||    
T  19286424 ctgttgagcaatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 19286325  T
Q  306 tacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
    || |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  19286324 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 19286290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19674603 - 19674308
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  19674603 gcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 19674504  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt------gttgaactggtggctgttg 199  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||      ||||||| ||   ||||||    
T  19674503 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttg 19674404  T
Q  200 ttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    || ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  19674403 tttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 19674308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 19208413 - 19208705
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  19208413 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 19208512  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  19208513 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 19208612  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19208613 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 19208705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 28362008 - 28362300
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  28362008 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 28362107  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  28362108 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 28362207  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  28362208 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 28362300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Original strand, 3329559 - 3329716
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  |     
T  3329559 agcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctgg 3329658  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 162  Q
    |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  3329659 agtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 3329716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Original strand, 12092776 - 12092933
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  |     
T  12092776 agcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctgg 12092875  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 162  Q
    |||||||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  12092876 agtagagttggaagaagttccgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 12092933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29829484 - 29829328
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||  | |    
T  29829484 gcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctggtggtacaatgccctctctgga 29829385  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 162  Q
    ||| ||| || || |  || || ||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  29829384 gtaaagttggaagaagttctgcgtacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 29829328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33258885 - 33258707
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  33258885 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctgga 33258786  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||||||| || || |  || ||||||||||| |||||  |||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||||||    
T  33258785 gtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttg 33258707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Original strand, 3329788 - 3329864
Alignment:
Q  219 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  3329788 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgaga 3329864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Original strand, 19518412 - 19518488
Alignment:
Q  219 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  19518412 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 19518488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29829259 - 29829183
Alignment:
Q  219 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  29829259 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 29829183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 65)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 5 - 346
Target Start/End: Original strand, 17993918 - 17994259
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17993918 agcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaga 17994017  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 204  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  17994018 agtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgca 17994117  T
Q  205 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 304  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17994118 ttcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 17994217  T
Q  305 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17994218 atacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 17994259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 5 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 4626068 - 4625727
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4626068 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaga 4625969  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 204  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  4625968 agtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgca 4625869  T
Q  205 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 304  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4625868 ttcgctggacgacgacattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 4625769  T
Q  305 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4625768 atacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 4625727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5652515 - 5652170
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5652515 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcaggtgaaggcttgccctgtctggttgtgcagtgcccttt 5652416  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  5652415 gaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgt 5652316  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 300  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5652315 tgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgattgcaaacgatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 5652216  T
Q  301 gcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5652215 gcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 5652170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 16626636 - 16626972
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626636 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 16626735  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16626736 aagaagtagagtagggagtaactcgacatatatcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgt 16626835  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626836 tgcatttgctgaacgatggcattaacgggtaccggaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaacggtggaaagaagggatgctgagagtatt 16626935  T
Q  301 gcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcatt 337  Q
    | |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  16626936 gtgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 16626972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18530516 - 18530186
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530516 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 18530417  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||      |||||| ||||||||||||||    
T  18530416 gagaagtagagtcaggagtaactcagcatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgc------tgttgagctggtggctgttgt 18530323  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18530322 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggcacttgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtatt 18530223  T
Q  301 gcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcatt 337  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||    
T  18530222 gcgcatacgggtacgatggaggtaactgggcagcatt 18530186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5713350 - 5713007
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  5713350 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttgga 5713251  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  5713250 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgttt 5713151  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 302  Q
    ||| || ||  |||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713150 catctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 5713051  T
Q  303 gcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713050 gcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 5713007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5724260 - 5723917
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  5724260 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttgga 5724161  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  5724160 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgttt 5724061  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 302  Q
    ||| || ||  |||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5724060 catctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 5723961  T
Q  303 gcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5723960 gcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 5723917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 346
Target Start/End: Original strand, 5757217 - 5757560
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  5757217 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttgga 5757316  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  5757317 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgttt 5757416  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 302  Q
    ||| || ||  |||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757417 catctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 5757516  T
Q  303 gcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757517 gcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 5757560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 346
Target Start/End: Original strand, 5768108 - 5768451
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  5768108 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttgga 5768207  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  5768208 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgttt 5768307  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 302  Q
    ||| || ||  |||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5768308 catctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 5768407  T
Q  303 gcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 346  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5768408 gcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 5768451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Original strand, 15892844 - 15893178
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  | | |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  15892844 ccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaaaggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 15892943  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg---aactggtggctgttgttgcat 205  Q
     |||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||   |||||||| |||    
T  15892944 aagtcggaagcaactcagcatacaacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcat 15893043  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  15893044 ctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaagggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgca 15893143  T
Q  306 tacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
    || |||||| ||||||| |  || |||||||||||    
T  15893144 tatgggtacgacggaggcatttgggcagcattgat 15893178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Original strand, 8301405 - 8301736
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  8301405 ccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 8301504  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttg 208  Q
     |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   |||||||| ||| ||    
T  8301505 aagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctg 8301604  T
Q  209 ctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatac 308  Q
     ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||     
T  8301605 ttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatat 8301704  T
Q  309 gggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
    | |||| ||||||| |  || |||||||||||    
T  8301705 gagtacgacggaggcatttgggcagcattgat 8301736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 32292880 - 32292697
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32292880 ccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggagacttcccctgtctgattgtgcagtgccctct 32292781  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32292780 gagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 32292697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 31034247 - 31034430
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31034247 ccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctct 31034346  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  31034347 gagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 31034430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 8296100 - 8295779
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  8296100 ccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtaggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 8296001  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
    | | |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||   |||||||    
T  8296000 gtggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaattggcaactgttgt 8295901  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 300  Q
    | ||| || ||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||| || || ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||      
T  8295900 ttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacg 8295801  T
Q  301 gcgcatacgggtacaacggagg 322  Q
    ||||||| |||||  |||||||    
T  8295800 gcgcatatgggtatgacggagg 8295779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Original strand, 22387716 - 22388047
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  22387716 ccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 22387815  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttg 208  Q
     ||| || || ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  ||    
T  22387816 aagttggaagcaactctgcatacaacattggtataggaggaaaagtcggtctagcatattgttgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctg 22387915  T
Q  209 ctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatac 308  Q
     ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||| | |||||     
T  22387916 ttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgcataa 22388015  T
Q  309 gggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
    |||||  |||| || | |||||||||||||||    
T  22388016 gggtaggacgggggaaactgagcagcattgat 22388047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 18051382 - 18051066
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||  | | |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | ||||    
T  18051382 ccttgatagaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagta 18051283  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| |||    
T  18051282 aagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcat 18051183  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  |||||    
T  18051182 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgca 18051083  T
Q  306 tacgggtacaacggagg 322  Q
    || |||||  |||||||    
T  18051082 tatgggtatgacggagg 18051066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 29148890 - 29149182
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  29148890 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatgga 29148989  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  29148990 gtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgttt 29149089  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||| |||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  29149090 catctgttgagcgattgcattaacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 29149182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Original strand, 4796791 - 4797080
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  4796791 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 4796890  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     ||| || || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| |||    
T  4796891 aagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcat 4796990  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
     || ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  4796991 ctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 4797080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 35880886 - 35880552
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||  | ||||    
T  35880886 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtttggttgtacaatgccctctatggagta 35880787  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| |||    
T  35880786 aagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcat 35880687  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || ||    
T  35880686 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 35880587  T
Q  306 tacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
    || |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  35880586 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 35880552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18330789 - 18330460
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  18330789 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 18330690  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
      ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| |||    
T  18330689 aggtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcat 18330590  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  || ||    
T  18330589 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagg-----gatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 18330495  T
Q  306 tacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
    || |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  18330494 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 18330460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 298
Target Start/End: Original strand, 18277187 - 18277482
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  18277187 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttgga 18277286  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||  | || |||||    
T  18277287 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttg 18277386  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 298  Q
    ||  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18277387 cacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 18277482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 298
Target Start/End: Original strand, 18292488 - 18292783
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  18292488 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttgga 18292587  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||  | || |||||    
T  18292588 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttg 18292687  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 298  Q
    ||  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18292688 cacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 18292783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 298
Target Start/End: Original strand, 18307789 - 18308084
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  18307789 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttgga 18307888  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||  | || |||||    
T  18307889 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttg 18307988  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 298  Q
    ||  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18307989 cacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 18308084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6192439 - 6192102
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||  | | |||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |    
T  6192439 gcaccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcagatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatgga 6192340  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||     
T  6192339 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgttt 6192240  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 302  Q
    ||| || ||| | |  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || | |||||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||  ||    
T  6192239 catctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactaatgataaaatggcgaaaagaaaggatgctgagaatacggc 6192140  T
Q  303 gcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
     |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  6192139 acatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 6192102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 32439274 - 32438944
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | ||||    
T  32439274 ccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagta 32439175  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttg 208  Q
     ||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  ||    
T  32439174 aagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctg 32439075  T
Q  209 ctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatac 308  Q
     ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||     
T  32439074 ttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataa 32438975  T
Q  309 gggtacaacggaggtagctgagcagcattga 339  Q
    |||||  |||| || | ||||||||||||||    
T  32438974 gggtaggacgggggaaactgagcagcattga 32438944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4721751 - 4721417
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||  | | |||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  4721751 ccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 4721652  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   ||||||||  ||    
T  4721651 aagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgttttat 4721552  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| | |  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||  || ||    
T  4721551 ctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaagatgctgagaatacggcaca 4721452  T
Q  306 tacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
    || |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  4721451 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 4721417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4893330 - 4892999
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |  ||||| | ||||| || || || |||||||| |||||||| || || |||||||| |||||  | ||||    
T  4893330 ccttgatggaagtcacacttaagatcagagtggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggtttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagta 4893231  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttg 208  Q
     ||| || || | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  ||    
T  4893230 aagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctg 4893131  T
Q  209 ctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatac 308  Q
     ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||     
T  4893130 ttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataa 4893031  T
Q  309 gggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
    |||||  |||| || | |||||||||||||||    
T  4893030 gggtaggacgggggaaactgagcagcattgat 4892999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8211861 - 8211527
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |    
T  8211861 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctgga 8211762  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
    ||||||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |     
T  8211761 gtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttagtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtac 8211662  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||    
T  8211661 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgca 8211562  T
Q  306 tacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
    || |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  8211561 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 8211527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 4346822 - 4347111
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |    
T  4346822 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctgga 4346921  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
    ||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |     
T  4346922 gtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtac 4347021  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
     || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  4347022 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 4347111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 10396256 - 10395970
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||  | |    
T  10396256 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtgcagtgtcctctctgga 10396157  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || | ||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||      
T  10396156 gtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgt-- 10396059  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 292  Q
     |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  10396058 -acctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctg 10395970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 17985091 - 17985429
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  17985091 gcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 17985190  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||||||| || || | ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  17985191 gtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgttt 17985290  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 302  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  17985291 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggc 17985390  T
Q  303 gcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatg 341  Q
      ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||    
T  17985391 atatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatg 17985429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28021398 - 28021109
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  28021398 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaatggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 28021299  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
    ||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |     
T  28021298 gtatagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtac 28021199  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
     || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  28021198 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 28021109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5467108 - 5466816
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  5467108 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 5467009  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||||||| || || |  || ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| |   ||| || ||||| || ||||||||||| || ||  ||||    
T  5467008 gtagagttggaaggagttctgcatacaacataggtataagaggaaaagttggtctatcatattgctgctgctgctgctgttgaactggcggttgacgttg 5466909  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
     |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  5466908 tacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaatggtgggaagaacggatgctgaga 5466816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7073335 - 7073043
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||  | |    
T  7073335 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgggggcttaccttgtctagtcgtacaatgccctctttgga 7073236  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  7073235 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgttt 7073136  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||| | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  7073135 catctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 7073043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 15741224 - 15741509
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15741224 ccagagcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgaatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctct 15741323  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgt 197  Q
      | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || ||||||||||||||||            
T  15741324 atggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactg-------- 15741415  T
Q  198 tgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
        |||  || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15741416 ----gcaactgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 15741509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20066163 - 20065877
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| | |||||| | ||||| || ||  | ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | ||||    
T  20066163 ccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggcccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagta 20066064  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttg 208  Q
     ||| || || | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  ||    
T  20066063 aagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctg 20065964  T
Q  209 ctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
     ||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20065963 ttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 20065877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 295
Target Start/End: Original strand, 28116088 - 28116384
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  |     
T  28116088 agcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaagtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgg 28116187  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg------ttgatgctgttgttgttgaactggtggctgtt 198  Q
    |||| ||| || || || || ||||| ||||| |||||| |||| || ||||||||||||||      ||| || |||||||||||||| ||   |||||    
T  28116188 agtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgtt 28116287  T
Q  199 gttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| ||| || ||  | |  ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  28116288 gtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 28116384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 5609457 - 5609749
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  5609457 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 5609556  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  5609557 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 5609656  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  5609657 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 5609749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7996685 - 7996393
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  7996685 gcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 7996586  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  7996585 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 7996486  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||| | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  7996485 catctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 7996393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10643193 - 10642901
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  10643193 gcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 10643094  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  10643093 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 10642994  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||| | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  10642993 catctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 10642901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 31964608 - 31964900
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  31964608 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 31964707  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  31964708 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 31964807  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  31964808 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 31964900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 50134206 - 50134498
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  50134206 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 50134305  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  50134306 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 50134405  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  50134406 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 50134498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21674816 - 21674479
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |    
T  21674816 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttgga 21674717  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||||||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   ||||||||     
T  21674716 gtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcatctgttgttt 21674617  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 302  Q
    ||| || ||  | |  || || | ||| || ||||||||||||| |||||  || || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  21674616 catctgttgggcaattgcgttgatgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaatggcggaaagaacggatgctgagaatacggc 21674517  T
Q  303 gcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
     |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  21674516 acatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 21674479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28339426 - 28339247
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  |     
T  28339426 agcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgg 28339327  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  28339326 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 28339247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 47023576 - 47023284
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  47023576 gcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 47023477  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||   ||||||| ||   ||||||||     
T  47023476 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 47023377  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  47023376 catctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 47023284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 6542597 - 6542753
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  | |    
T  6542597 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcagtgtcctctctgga 6542696  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag 162  Q
    ||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  6542697 gtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 6542753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18225314 - 18224977
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  18225314 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctgga 18225215  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||||||| || || |  || |||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||   ||||||| ||   ||||||||     
T  18225214 gtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggtaggcctagcttgttgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 18225115  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 302  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  18225114 catctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggc 18225015  T
Q  303 gcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
      ||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  18225014 atatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 18224977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 4417042 - 4416864
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  4417042 gcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 4416943  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  4416942 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 4416864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 36997212 - 36997366
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  36997212 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 36997311  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 160  Q
    ||||||| || || | ||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  36997312 gtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 36997366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 340
Target Start/End: Original strand, 5596492 - 5596838
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  5596492 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctgga 5596591  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctag----ct--------tgttgatgctgttgttgttgaactggtgg 193  Q
    ||||||| || || |  || |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||    ||        ||||| || ||||||||||||| ||| ||    
T  5596592 gtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttgttgttgttgaattggcgg 5596691  T
Q  194 ctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctga 293  Q
     || |||||    |||||| ||| |||||| || || ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  5596692 ttggtgttgtgcctgctgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctga 5596791  T
Q  294 gagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
    || ||  ||  ||| |||||| ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  5596792 gaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgat 5596838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 11110484 - 11110638
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |    
T  11110484 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctgga 11110583  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 160  Q
    ||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  11110584 gtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 11110638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5013835 - 5013543
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  5013835 gcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 5013736  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||||||| || || |  || || ||||||||||||||  ||||||| || || || ||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  5013735 gtagagttggaagaagttccgcgtacaacattggtataggaggaaaagttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 5013636  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  5013635 catctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 5013543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18242862 - 18242684
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  18242862 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctgga 18242763  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||  |  || ||||||||||||||    
T  18242762 gtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 18242684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 48466050 - 48465896
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |    
T  48466050 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctttgga 48465951  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 160  Q
    ||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  48465950 gtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 48465896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 22870991 - 22871148
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |    
T  22870991 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctgga 22871090  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 163  Q
    ||||||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  22871091 gtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22871148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 22886050 - 22886207
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |    
T  22886050 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctgga 22886149  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 163  Q
    ||||||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  22886150 gtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22886207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 51782146 - 51782052
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51782146 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51782052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 298
Target Start/End: Original strand, 29665336 - 29665415
Alignment:
Q  219 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 298  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29665336 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 29665415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 51797236 - 51797141
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaac-ttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51797236 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttgtgaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51797141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Original strand, 20576982 - 20577160
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |    
T  20576982 gcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctgga 20577081  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| || ||||| |  | ||||||||| ||||||||    
T  20577082 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctggtatattgatgctgctgttgttg 20577160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24328282 - 24328104
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  24328282 gcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctgga 24328183  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||||||| || || |  || ||||||||||| |||||  |||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||||||    
T  24328182 gtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttg 24328104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 29665104 - 29665259
Alignment:
Q  5 agcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||| | ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  |     
T  29665104 agcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctgg 29665203  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 160  Q
    |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||    
T  29665204 agtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 29665259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Original strand, 11110712 - 11110788
Alignment:
Q  219 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  11110712 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 11110788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Original strand, 6542825 - 6542901
Alignment:
Q  219 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  6542825 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 6542901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Original strand, 36997440 - 36997516
Alignment:
Q  219 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  36997440 gcattgacgggcacctgaggttggccgggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 36997516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20555 - 20240
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20555 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 20456  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||                     |    
T  20455 gagaagtagagtcgggagtaactcagcatacaacattggtatcgggggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttg---------------------t 20377  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  20376 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatgctgagagtatg 20277  T
Q  301 gcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcatt 337  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  20276 gcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 20240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 30614 - 30296
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |    
T  30614 gcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctgga 30515  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    |||  || || || |  || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||     
T  30514 gtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaag-taggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgttt 30416  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 302  Q
    ||| || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||    
T  30415 catctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggc 30316  T
Q  303 gcatacgggtacaacggagg 322  Q
    ||||| |||||  |||||||    
T  30315 gcatatgggtatgacggagg 30296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 117 - 312
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  117 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctggaaggcaacggatcaggtggaggcttgccatgtctggttgagcagtgccctct 216  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  217 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgctgttgagctggtggctg 312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21728 - 21391
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  21728 ccagagccccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacaggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgtccttt 21629  T
Q  101 gagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgt 200  Q
    |||||| | ||||||||| | ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||   || |||| | |  |  ||||||||    
T  21628 gagaagcaaagtcgggagcagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgttgc---tgctgttaagccagcagctgttgt 21532  T
Q  201 tgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatt 300  Q
    |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||  ||    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21531 tgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtatt 21432  T
Q  301 gcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatg 341  Q
    ||   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  21431 gcatgtactggtacggcggaggtagctgagaagcattgatg 21391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29922 - 29614
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  29922 ccttggtggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 29823  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg---aactggtggctgttgttgcat 205  Q
     |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||   |||||||| |||    
T  29822 aagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcat 29723  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||    
T  29722 ctgttgagctattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 29623  T
Q  306 tacgggtac 314  Q
    |||||||||    
T  29622 tacgggtac 29614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 314
Target Start/End: Original strand, 40166 - 40474
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  | | |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  40166 ccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctggggggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 40265  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| |||    
T  40266 aagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcat 40365  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| | |  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||  |||||    
T  40366 ctgttgagcaattgcatttacgggtacctgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 40465  T
Q  306 tacgggtac 314  Q
    || ||||||    
T  40466 tatgggtac 40474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Original strand, 47082 - 47371
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | ||||    
T  47082 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagta 47181  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||   |||||||| |||    
T  47182 aagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcat 47281  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
     || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  47282 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 47371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 27451 - 27135
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  27451 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 27352  T
Q  109 gagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcat 205  Q
     |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||   |||||||| |||    
T  27351 aagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcat 27252  T
Q  206 ttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgca 305  Q
     || ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||    
T  27251 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggtagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgca 27152  T
Q  306 tacgggtacaacggagg 322  Q
    || |||||  |||||||    
T  27151 tatgggtatgacggagg 27135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 2006 - 2103
Alignment:
Q  1 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2006 ccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 6175 - 6080
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaa-tcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 100  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  6175 gcaccttgatgaaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctct 6080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Original strand, 226 - 561
Alignment:
Q  9 ccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  | | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||    
T  226 ccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacttgggaggcaacggatccggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 325  T
Q  109 gagtcgggagtaactcg-gcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgca 204  Q
     |||||| || ||||   ||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||    
T  326 aagtcggaagcaactaaagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttca 425  T
Q  205 tttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgc 304  Q
    | || ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |    
T  426 tctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcac 525  T
Q  305 atacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 340  Q
    ||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  526 atatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 15024 - 15362
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  15024 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 15123  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || |  || |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  15124 gtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgttt 15223  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 302  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  15224 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggc 15323  T
Q  303 gcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatg 341  Q
      ||| |||||  ||||||| |  ||||| |||||||||    
T  15324 atatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatg 15362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 7333 - 7625
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  7333 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 7432  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| || | ||||||||     
T  7433 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgttt 7532  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  7533 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 7625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Original strand, 26295 - 26474
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaac-ttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgaga 104  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |     
T  26295 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaacctttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctgg 26394  T
Q  105 agtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    |||||||| || || | ||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  26395 agtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 26474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9728 - 9542
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |    
T  9728 gcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctgga 9629  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtg 192  Q
    ||||||| || || |  || ||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || |||||||||||||    
T  9628 gtagagttggaagaagttctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggtg 9542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8212 - 8102
Alignment:
Q  185 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 284  Q
    |||||| ||||| ||||| |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||| || ||||| |||||     
T  8212 aactggcggctgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaac 8113  T
Q  285 ggatgctgaga 295  Q
    |||||||||||    
T  8112 ggatgctgaga 8102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 9160 - 9452
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  9160 gcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 9259  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttg 202  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| ||   ||||||||     
T  9260 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgttt 9359  T
Q  203 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  9360 catctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 9452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20177 - 19999
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  20177 gcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctgga 20078  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 184  Q
    ||| ||| || || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  20077 gtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 19999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 8111 - 7966
Alignment:
Q  6 gcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaaaacggaacttgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaa 105  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |    
T  8111 gcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctgga 8012  T
Q  106 gtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcagaggaaa 151  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  8011 gtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaa 7966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7883 - 7807
Alignment:
Q  219 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 295  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  7883 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 7807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University