View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8170_low_3 (Length: 544)

Name: NF8170_low_3
Description: NF8170
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8170_low_3
NF8170_low_3
[»] chr7 (61 HSPs)
chr7 (17-543)||(41764981-41765503)
chr7 (258-543)||(21991610-21991894)
chr7 (259-543)||(5657384-5657667)
chr7 (259-543)||(8861260-8861543)
chr7 (254-537)||(48928473-48928754)
chr7 (254-543)||(18797299-18797585)
chr7 (259-543)||(15612662-15612944)
chr7 (275-543)||(48928200-48928466)
chr7 (257-543)||(30055499-30055785)
chr7 (257-543)||(32820956-32821241)
chr7 (275-543)||(38258536-38258803)
chr7 (257-543)||(9355729-9356014)
chr7 (258-543)||(32432431-32432710)
chr7 (259-543)||(6546494-6546777)
chr7 (259-543)||(27283719-27284002)
chr7 (260-539)||(24211717-24211995)
chr7 (259-533)||(4582894-4583167)
chr7 (285-543)||(12165753-12166001)
chr7 (275-543)||(37347013-37347279)
chr7 (275-544)||(23111181-23111451)
chr7 (275-502)||(22687230-22687456)
chr7 (275-533)||(25691457-25691715)
chr7 (259-543)||(37109847-37110132)
chr7 (258-533)||(43686015-43686288)
chr7 (256-543)||(17842487-17842775)
chr7 (258-543)||(31578967-31579256)
chr7 (259-543)||(10359117-10359400)
chr7 (275-544)||(7334785-7335052)
chr7 (341-543)||(11071263-11071461)
chr7 (261-513)||(27421313-27421563)
chr7 (284-543)||(29173540-29173780)
chr7 (275-543)||(33688165-33688431)
chr7 (339-536)||(10481660-10481856)
chr7 (286-543)||(26980325-26980564)
chr7 (275-543)||(31520644-31520893)
chr7 (355-543)||(44598737-44598924)
chr7 (377-533)||(15672675-15672830)
chr7 (368-515)||(37704241-37704387)
chr7 (257-453)||(12390622-12390818)
chr7 (296-537)||(35353120-35353360)
chr7 (392-543)||(37703401-37703551)
chr7 (261-472)||(44413353-44413564)
chr7 (307-453)||(32593181-32593326)
chr7 (255-408)||(26524364-26524517)
chr7 (359-533)||(43925177-43925349)
chr7 (403-502)||(26588028-26588126)
chr7 (392-543)||(46481032-46481182)
chr7 (259-389)||(34362205-34362334)
chr7 (28-139)||(41757298-41757409)
chr7 (464-543)||(38053640-38053719)
chr7 (477-543)||(44411443-44411509)
chr7 (481-543)||(12390552-12390614)
chr7 (474-543)||(32593109-32593178)
chr7 (338-430)||(38053540-38053624)
chr7 (261-323)||(8299192-8299254)
chr7 (356-397)||(34362150-34362191)
chr7 (490-543)||(37704387-37704440)
chr7 (253-304)||(40381934-40381985)
chr7 (488-543)||(34362081-34362138)
chr7 (275-304)||(3953747-3953776)
chr7 (275-304)||(23402374-23402403)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (259-543)||(28002914-28003197)
chr4 (257-543)||(35020963-35021248)
chr4 (257-536)||(25700991-25701270)
chr4 (257-543)||(38011852-38012137)
chr4 (259-543)||(55241033-55241315)
chr4 (256-537)||(55477825-55478109)
chr4 (275-543)||(34948023-34948292)
chr4 (275-543)||(7703533-7703792)
chr4 (261-543)||(36493617-36493897)
chr4 (258-543)||(37663669-37663951)
chr4 (259-543)||(19089381-19089664)
chr4 (285-543)||(17173316-17173573)
chr4 (275-543)||(5047894-5048160)
chr4 (261-543)||(33341397-33341681)
chr4 (285-543)||(17167739-17167996)
chr4 (276-539)||(23761089-23761350)
chr4 (261-537)||(47253751-47254017)
chr4 (258-537)||(35025530-35025800)
chr4 (275-544)||(46888085-46888352)
chr4 (275-535)||(33816452-33816728)
chr4 (367-544)||(1815409-1815585)
chr4 (258-543)||(25184112-25184396)
chr4 (275-543)||(49375982-49376250)
chr4 (275-543)||(19440576-19440843)
chr4 (256-539)||(27396613-27396895)
chr4 (257-543)||(29584128-29584411)
chr4 (313-539)||(4934134-4934360)
chr4 (258-543)||(37287732-37288011)
chr4 (275-543)||(879476-879743)
chr4 (257-543)||(32912508-32912793)
chr4 (275-543)||(37775685-37775941)
chr4 (281-543)||(32579466-32579729)
chr4 (275-533)||(4598009-4598255)
chr4 (257-539)||(34361424-34361704)
chr4 (277-533)||(6864053-6864308)
chr4 (257-537)||(30002575-30002837)
chr4 (337-543)||(50697320-50697525)
chr4 (269-543)||(32592103-32592367)
chr4 (253-539)||(42199723-42200008)
chr4 (284-544)||(54499165-54499425)
chr4 (275-543)||(50764748-50765003)
chr4 (381-543)||(3042741-3042902)
chr4 (253-477)||(9139241-9139462)
chr4 (259-456)||(39397918-39398106)
chr4 (359-543)||(17272068-17272247)
chr4 (445-543)||(7152132-7152230)
chr4 (488-539)||(39400236-39400287)
chr4 (401-536)||(46884045-46884177)
chr4 (255-304)||(38812263-38812312)
chr4 (257-353)||(4205114-4205210)
chr4 (495-543)||(4205219-4205267)
chr4 (256-325)||(17272008-17272077)
chr4 (458-543)||(26896285-26896369)
chr4 (261-304)||(20097494-20097537)
chr4 (255-304)||(2704508-2704557)
chr4 (257-334)||(7152242-7152319)
chr4 (259-304)||(38811813-38811858)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (252-543)||(7234936-7235225)
chr6 (258-543)||(3879840-3880124)
chr6 (253-543)||(29182157-29182447)
chr6 (258-543)||(8513232-8513511)
chr6 (275-529)||(15491631-15491884)
chr6 (257-537)||(4318729-4319009)
chr6 (275-537)||(21017019-21017280)
chr6 (256-543)||(1945830-1946117)
chr6 (261-543)||(30353259-30353540)
chr6 (260-543)||(20768087-20768365)
chr6 (261-543)||(6088910-6089186)
chr6 (257-543)||(5627389-5627674)
chr6 (320-543)||(6091083-6091306)
chr6 (275-543)||(33618850-33619113)
chr6 (259-543)||(33892913-33893186)
chr6 (258-518)||(7055141-7055400)
chr6 (257-390)||(18498431-18498565)
chr6 (257-304)||(19631747-19631794)
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (258-543)||(27082746-27083030)
chr8 (253-544)||(36694873-36695163)
chr8 (275-536)||(11727039-11727299)
chr8 (259-543)||(5299854-5300137)
chr8 (275-543)||(37970427-37970694)
chr8 (259-533)||(6098436-6098709)
chr8 (258-543)||(16446783-16447067)
chr8 (275-543)||(1204942-1205209)
chr8 (257-543)||(9864145-9864430)
chr8 (259-543)||(12876108-12876392)
chr8 (259-543)||(13307622-13307904)
chr8 (257-543)||(34894964-34895244)
chr8 (257-543)||(38643975-38644260)
chr8 (275-543)||(10555112-10555377)
chr8 (257-543)||(16222860-16223145)
chr8 (340-543)||(1149540-1149742)
chr8 (259-543)||(33906223-33906494)
chr8 (257-543)||(43643503-43643788)
chr8 (337-544)||(1953895-1954103)
chr8 (275-543)||(23854339-23854606)
chr8 (341-543)||(7890865-7891066)
chr8 (275-543)||(465857-466114)
chr8 (257-543)||(40862416-40862701)
chr8 (286-543)||(41910897-41911153)
chr8 (311-531)||(43025753-43025972)
chr8 (385-543)||(4132594-4132750)
chr8 (258-543)||(30654491-30654775)
chr8 (254-543)||(31933794-31934082)
chr8 (258-453)||(34952028-34952223)
chr8 (337-536)||(39099034-39099232)
chr8 (248-456)||(1150099-1150306)
chr8 (339-538)||(44869576-44869774)
chr8 (286-543)||(8803725-8803974)
chr8 (342-543)||(35459619-35459819)
chr8 (259-452)||(41362517-41362707)
chr8 (367-453)||(7998401-7998488)
chr8 (455-543)||(1149828-1149912)
chr8 (464-538)||(7998481-7998555)
chr8 (259-383)||(4133077-4133199)
chr8 (488-543)||(34951965-34952020)
chr8 (358-448)||(33197947-33198029)
chr8 (487-543)||(35859160-35859216)
chr8 (256-327)||(24823395-24823466)
chr8 (421-543)||(18259244-18259361)
chr8 (495-543)||(12587816-12587864)
chr8 (258-299)||(7998361-7998402)
chr8 (441-498)||(12585297-12585353)
chr8 (261-305)||(6446708-6446752)
chr8 (259-323)||(15009241-15009305)
chr8 (257-297)||(39099262-39099302)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (257-543)||(16415639-16415925)
chr1 (259-543)||(38823210-38823493)
chr1 (258-543)||(2959743-2960027)
chr1 (275-543)||(47279201-47279468)
chr1 (257-543)||(15168083-15168375)
chr1 (275-543)||(4330291-4330560)
chr1 (261-543)||(15752027-15752308)
chr1 (261-543)||(33725497-33725778)
chr1 (258-539)||(10181909-10182189)
chr1 (275-543)||(14758053-14758311)
chr1 (275-543)||(27532878-27533144)
chr1 (278-543)||(9902951-9903215)
chr1 (275-543)||(27267097-27267361)
chr1 (257-544)||(15382927-15383213)
chr1 (275-536)||(7078967-7079238)
chr1 (337-543)||(27227382-27227587)
chr1 (291-543)||(40884841-40885092)
chr1 (257-536)||(34012286-34012559)
chr1 (275-543)||(31621446-31621717)
chr1 (296-533)||(32216088-32216324)
chr1 (259-543)||(3309144-3309432)
chr1 (255-543)||(8222123-8222407)
chr1 (261-543)||(28769651-28769932)
chr1 (258-531)||(18422646-18422918)
chr1 (257-542)||(32267028-32267312)
chr1 (275-544)||(47682390-47682657)
chr1 (261-543)||(238410-238690)
chr1 (258-543)||(19899666-19899950)
chr1 (257-542)||(48620631-48620906)
chr1 (275-543)||(37451298-37451564)
chr1 (341-543)||(25160710-25160911)
chr1 (259-533)||(30326859-30327132)
chr1 (259-543)||(42721035-42721315)
chr1 (278-543)||(10922742-10923006)
chr1 (257-544)||(39393377-39393664)
chr1 (288-543)||(51128884-51129138)
chr1 (258-543)||(30254419-30254702)
chr1 (257-543)||(1547281-1547550)
chr1 (257-539)||(3534926-3535198)
chr1 (275-543)||(28564680-28564945)
chr1 (275-543)||(23999359-23999626)
chr1 (257-452)||(11742338-11742532)
chr1 (261-543)||(41926161-41926436)
chr1 (298-543)||(46931446-46931688)
chr1 (327-536)||(27563809-27564017)
chr1 (359-543)||(27763208-27763391)
chr1 (359-533)||(22170807-22170980)
chr1 (257-543)||(37618798-37619078)
chr1 (344-533)||(38759610-38759802)
chr1 (259-407)||(21289661-21289816)
chr1 (456-543)||(1359832-1359919)
chr1 (456-543)||(48353735-48353821)
chr1 (474-543)||(11742265-11742334)
chr1 (257-305)||(4150489-4150537)
chr1 (478-533)||(21289817-21289869)
chr1 (259-304)||(43579242-43579287)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (253-543)||(36641980-36642271)
chr2 (255-543)||(29242058-29242345)
chr2 (258-537)||(4264002-4264281)
chr2 (258-544)||(17071656-17071941)
chr2 (256-533)||(4166919-4167195)
chr2 (258-519)||(19424572-19424832)
chr2 (253-537)||(33550913-33551195)
chr2 (257-544)||(2325297-2325575)
chr2 (257-543)||(31570654-31570939)
chr2 (275-543)||(4763644-4763914)
chr2 (258-544)||(17054015-17054300)
chr2 (285-543)||(3176965-3177222)
chr2 (259-543)||(44913662-44913947)
chr2 (261-534)||(41463779-41464051)
chr2 (275-536)||(26357593-26357853)
chr2 (359-543)||(41960940-41961123)
chr2 (275-543)||(44285965-44286232)
chr2 (261-543)||(33660297-33660569)
chr2 (259-536)||(4478368-4478641)
chr2 (259-537)||(19313852-19314121)
chr2 (260-543)||(13711465-13711742)
chr2 (291-533)||(37905740-37905983)
chr2 (259-543)||(41465509-41465784)
chr2 (291-544)||(33709151-33709403)
chr2 (296-543)||(43648165-43648411)
chr2 (340-543)||(45327801-45328003)
chr2 (291-543)||(27349868-27350109)
chr2 (257-543)||(39167289-39167568)
chr2 (261-536)||(43770775-43771039)
chr2 (257-543)||(18494201-18494473)
chr2 (285-543)||(19289243-19289500)
chr2 (258-543)||(11366301-11366585)
chr2 (283-513)||(33902092-33902319)
chr2 (360-543)||(31861953-31862135)
chr2 (400-536)||(18258214-18258349)
chr2 (258-543)||(5881533-5881812)
chr2 (275-537)||(35958925-35959173)
chr2 (340-543)||(7006858-7007043)
chr2 (455-543)||(19500835-19500923)
chr2 (286-404)||(41051263-41051382)
chr2 (362-434)||(19501768-19501839)
chr2 (275-304)||(6177791-6177820)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (258-537)||(133-411)
scaffold0002 (360-543)||(408331-408512)
scaffold0002 (280-493)||(94335-94547)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (257-539)||(19119857-19120138)
chr5 (275-536)||(22980809-22981069)
chr5 (259-544)||(31786537-31786821)
chr5 (275-543)||(699166-699433)
chr5 (275-543)||(33908249-33908516)
chr5 (275-537)||(27318385-27318646)
chr5 (257-543)||(8741777-8742064)
chr5 (278-540)||(5837574-5837835)
chr5 (259-543)||(23116114-23116397)
chr5 (275-536)||(30969223-30969483)
chr5 (275-518)||(26268090-26268332)
chr5 (257-543)||(12910348-12910638)
chr5 (261-543)||(25500818-25501099)
chr5 (257-543)||(38528129-38528413)
chr5 (256-533)||(36860420-36860697)
chr5 (259-533)||(36866762-36867035)
chr5 (259-533)||(40133385-40133658)
chr5 (252-543)||(27330299-27330587)
chr5 (275-543)||(35511374-35511636)
chr5 (327-533)||(23954692-23954897)
chr5 (258-536)||(9200232-9200500)
chr5 (259-543)||(14409233-14409501)
chr5 (260-537)||(31705510-31705785)
chr5 (259-543)||(7693230-7693504)
chr5 (257-532)||(14919431-14919706)
chr5 (283-543)||(22019656-22019906)
chr5 (258-502)||(39572818-39573061)
chr5 (260-543)||(32563150-32563423)
chr5 (338-543)||(15992432-15992636)
chr5 (313-533)||(21088668-21088887)
chr5 (258-543)||(1429054-1429321)
chr5 (257-502)||(5112247-5112490)
chr5 (337-543)||(7208756-7208960)
chr5 (257-543)||(22973974-22974259)
chr5 (275-543)||(22255197-22255465)
chr5 (259-543)||(15724490-15724771)
chr5 (258-543)||(35933901-35934179)
chr5 (257-543)||(24886100-24886370)
chr5 (337-543)||(35504443-35504648)
chr5 (258-543)||(8436965-8437248)
chr5 (317-518)||(6824397-6824598)
chr5 (257-543)||(35826378-35826660)
chr5 (253-453)||(8466739-8466938)
chr5 (320-543)||(5829962-5830175)
chr5 (298-537)||(17157929-17158166)
chr5 (298-472)||(28416490-28416663)
chr5 (340-543)||(43308552-43308746)
chr5 (381-541)||(13956256-13956415)
chr5 (317-414)||(25668707-25668804)
chr5 (407-543)||(2888337-2888472)
chr5 (379-543)||(42342851-42343004)
chr5 (474-544)||(25889584-25889654)
chr5 (275-396)||(11898018-11898139)
chr5 (252-353)||(13956426-13956527)
chr5 (410-543)||(25669737-25669859)
chr5 (259-334)||(16004476-16004552)
chr5 (257-304)||(22616492-22616539)
chr5 (260-304)||(10237415-10237459)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (254-543)||(22450954-22451242)
chr3 (258-540)||(11466814-11467095)
chr3 (275-543)||(52040824-52041092)
chr3 (261-536)||(46297671-46297945)
chr3 (257-543)||(34132924-34133209)
chr3 (259-543)||(37203058-37203342)
chr3 (257-543)||(33378687-33378969)
chr3 (257-543)||(48354930-48355215)
chr3 (275-543)||(53229054-53229322)
chr3 (275-543)||(11357283-11357534)
chr3 (259-543)||(37157699-37157982)
chr3 (259-543)||(4015451-4015733)
chr3 (307-543)||(42505977-42506212)
chr3 (257-539)||(4761554-4761838)
chr3 (256-536)||(21193594-21193874)
chr3 (258-543)||(26941162-26941446)
chr3 (256-544)||(39282641-39282927)
chr3 (258-543)||(7327384-7327669)
chr3 (291-537)||(3362276-3362523)
chr3 (275-543)||(32373479-32373744)
chr3 (307-543)||(2007972-2008206)
chr3 (258-543)||(40552161-40552445)
chr3 (275-539)||(44891514-44891767)
chr3 (275-539)||(29099362-29099616)
chr3 (258-533)||(3655114-3655388)
chr3 (257-518)||(35844315-35844575)
chr3 (275-544)||(25579746-25580014)
chr3 (380-543)||(33698265-33698427)
chr3 (281-536)||(45174516-45174773)
chr3 (359-543)||(46994563-46994746)
chr3 (275-539)||(22445971-22446234)
chr3 (317-543)||(24708017-24708242)
chr3 (337-543)||(43348327-43348531)
chr3 (257-543)||(47481511-47481796)
chr3 (282-539)||(44186423-44186663)
chr3 (259-471)||(51212955-51213166)
chr3 (275-543)||(27480264-27480548)
chr3 (275-535)||(24488872-24489131)
chr3 (306-543)||(21009704-21009940)
chr3 (275-543)||(43975794-43976054)
chr3 (362-543)||(29163912-29164083)
chr3 (270-537)||(40935993-40936241)
chr3 (341-501)||(53176127-53176286)
chr3 (359-543)||(54828603-54828786)
chr3 (386-537)||(1089811-1089962)
chr3 (382-543)||(22622620-22622780)
chr3 (275-437)||(20373303-20373465)
chr3 (356-536)||(38591786-38591965)
chr3 (375-538)||(36012244-36012408)
chr3 (283-536)||(54505823-54506074)
chr3 (318-537)||(14586587-14586796)
chr3 (370-510)||(11835562-11835702)
chr3 (425-537)||(20373152-20373263)
chr3 (455-536)||(11357059-11357140)
chr3 (478-543)||(51212673-51212738)
chr3 (474-533)||(53811646-53811701)
chr3 (345-411)||(53811695-53811767)
chr3 (257-304)||(40640637-40640684)
chr3 (257-323)||(55343405-55343471)
chr3 (260-353)||(11835702-11835790)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (261-543)||(7889-8170)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (261-543)||(11908-12192)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (261-543)||(43959-44239)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (261-543)||(154548-154828)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (307-543)||(267331-267568)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (275-535)||(145926-146185)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (258-350)||(42347-42439)
scaffold0009 (481-527)||(100948-100994)
scaffold0009 (403-444)||(100894-100935)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 61)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 41765503 - 41764981
Alignment:
Q  17 catcaattatgccggttcgaacattgatttctggaatagatacatcttttactggcttgaattcctctgaggtgttggcattgcaaaacgcacgaatcga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41765503 catcaattatgccggttcgaacattgatttctggaatagatacatcttttactggcttgaatccctctgaggtgttggcattgcaaaacgcacgaatcga 41765404  T
Q  117 attcttgtacaagtttggaactgcattcgagacctctggcccctgaaaatagaagcagcacaaaaattgtataccacagtgtaggtcacaacattttaaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41765403 attcttgtacaagtttggaactgcattcgagacctctggcccctgaaaatagaag-----caaaaattgtataccacaatgtaggtcacaacattttaaa 41765309  T
Q  217 aaagcgtttgtgtaacat---caatattgcaatgttaataattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactat 313  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||    
T  41765308 aaagcttttgtgtaacatgtgcaatattgcaatgtt-ataattaaggaaaattccatggtgaagtcatgagaatgacttttctgataaagtcaatactat 41765210  T
Q  314 agtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactaca 413  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  41765209 agcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgca 41765110  T
Q  414 ctcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgtta 513  Q
    || ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  41765109 cttaatctaattttactctaccttgttttaagtgtaaca-ccccagaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgtta 41765011  T
Q  514 aagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  41765010 aagatgccaacgatgaaatagtacatgtaa 41764981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 258 - 543
Target Start/End: Original strand, 21991610 - 21991894
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| ||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||| |||    
T  21991610 aggaaaattctagggtgaagtcatgagaatgatttttatggtgaagttaacactatagcatcaaaattgttgcgagtaacaccccactgtttgtacagtg 21991709  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21991710 tcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-cccc 21991808  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21991809 acaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 21991894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 5657667 - 5657384
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  5657667 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 5657568  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||    
T  5657567 catcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcatattaacaaaaatacacttaatttaattttatcctactttgttttaagtgtaaca-gccca 5657469  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  5657468 caaagtgtaatacttaagactatcgcatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaa 5657384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Original strand, 8861260 - 8861543
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||| ||||    
T  8861260 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctcgcgaagttaacactatagcatcaaaagtgttatgaataacaccccactgtttgtacagtgg 8861359  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  8861360 catcaaaagttaagtccccatagtatcatcaattaatcagattaacaacaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaaca-ccccg 8861458  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8861459 caaagtgtaacactcaagaccatcacatgatatcagcaactctctttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaa 8861543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 254 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 48928754 - 48928473
Alignment:
Q  254 attaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtac 353  Q
    ||||| |||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  48928754 attaaagaaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactatttgtac 48928655  T
Q  354 ggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacac 453  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  48928654 ggtgccatcaaaagttcagtcc-catagtattatcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattattttaagtgtaaca- 48928557  T
Q  454 ccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtac 537  Q
    || || ||| |||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  48928556 cctcagaaagtgtaatgcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgataaaatagtac 48928473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 254 - 543
Target Start/End: Original strand, 18797299 - 18797585
Alignment:
Q  254 attaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtac 353  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||   ||  |||| |||| |||||  |||||||||||||||||    
T  18797299 attaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactaacata--aaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtac 18797396  T
Q  354 ggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacac 453  Q
      || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  18797397 aatgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaaca- 18797495  T
Q  454 ccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  18797496 cctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaa 18797585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 15612944 - 15612662
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||||||||  |||||| ||||  |||||  ||||||| ||||||||  ||||    
T  15612944 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaataacgtttcttgtgaagttaacactataacatcaaa-gtgttatgagtaacaccccagtgtttgtagagtgg 15612846  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15612845 catcaaaagttcagtccctataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-cccca 15612747  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  15612746 caaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgtaa 15612662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 48928466 - 48928200
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48928466 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactatttgtacggtgccatcaaaagttcagtc 48928367  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||| |||||  || |    
T  48928366 c-catagtattatcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca-cctcagaaagtgtaatgctta 48928269  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||    
T  48928268 agactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgatgaaatagtacatgtaa 48928200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Original strand, 30055499 - 30055785
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctgg-tgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacgg 355  Q
    ||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| | | ||||||  |||||||| |||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||      
T  30055499 aaggaaaattctatggtgaagtcataagaatgactttttttgatgaagttaacactataatatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaa 30055598  T
Q  356 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccc 455  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||| |||||| ||    
T  30055599 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcattaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaaca-cc 30055697  T
Q  456 ccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30055698 ctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaa 30055785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 32821241 - 32820956
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||| ||||  ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||  |    
T  32821241 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgatttttttggtgaagttaacaatataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaat 32821142  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  32821141 ggcatcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcaattcattagattaacaagactacagttaatttagttttatcctaccttgttttaagcgtaaca-ccc 32821043  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  32821042 cataaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaa 32820956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Original strand, 38258536 - 38258803
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||| | ||||| |||| |||||||||  ||||||||  || |||| |||| |||||  |||| ||| ||||||||  || ||||||||||||| ||    
T  38258536 aagtcataaaaatgatttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccacaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatc 38258635  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  38258636 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaaca-ccccacaaagtgtaacactta 38258734  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38258735 agactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaa 38258803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 9356014 - 9355729
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||  || || ||||||||||||||||  || ||||||| |  ||||||||| || |||| |||||||||    |||||||||||||||| ||    
T  9356014 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaatgaccattttggtgaatttaacactatagcataaaaaatgtagtgagcaataccccactgtttgtacagt 9355915  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    | ||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  9355914 gacatcaaaagtttagttctcatattatcgttaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttcatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccc 9355816  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  9355815 cacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaa 9355729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 258 - 543
Target Start/End: Original strand, 32432431 - 32432710
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| || || |||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||     |||||||| ||| ||||||  ||||||| |||||||||  ||    
T  32432431 aggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgatttttctggtgaagttaacac-----tatcaaaaatgttgtgagtaacaccccattgtttgtacaatg 32432525  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32432526 acatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacagttaatataattttatcctaccttattttaagtgtaaca-cccc 32432624  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  32432625 acaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacactgtttgcatattaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaa 32432710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Original strand, 6546494 - 6546777
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || ||||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||  ||||||||| ||||||| ||      
T  6546494 ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgatttttctagtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacaccccactatttgtacagtaa 6546593  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    ||||||||||| | |   ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6546594 catcaaaagtttactatccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-cccca 6546692  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| | ||||||| || | |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6546693 caaagtataacacttaatattatcacatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaa 6546777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Original strand, 27283719 - 27284002
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || |||| || | ||||| |||| |||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  |||||||| ||||||||  ||     
T  27283719 ggaaaattctatggtgaagttataaaaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatga 27283818  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  27283819 aatcaaaagttcagtcctcatagtattatcaatttatcagattaacaagactatacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaaca-cccca 27283917  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27283918 caaagtgtaacacttaaaactatcacataatattatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaa 27284002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 260 - 539
Target Start/End: Original strand, 24211717 - 24211995
Alignment:
Q  260 gaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggc 359  Q
    |||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||| ||   ||||    
T  24211717 gaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccctactgtttatagaatggc 24211816  T
Q  360 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccac 459  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || |||||||||||  || ||    
T  24211817 atcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaaca-tcctac 24211915  T
Q  460 aaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacct 539  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24211916 aaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacct 24211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 259 - 533
Target Start/End: Original strand, 4582894 - 4583167
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || |||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||  ||     
T  4582894 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaatactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatga 4582993  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  4582994 catcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaaca-cccca 4583092  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaata 533  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||  ||||||| |||||    
T  4583093 caaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgatcaaata 4583167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 285 - 543
Target Start/End: Original strand, 12165753 - 12166001
Alignment:
Q  285 aatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtat 384  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    |||||    
T  12165753 aatgacttttctggtgaagttaacactatagcatccaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttaagtcccttaagtat 12165852  T
Q  385 catcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcac 484  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||         ||||    
T  12165853 catcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacac---------tcac 12165942  T
Q  485 ataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  12165943 ataatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtatctgtaa 12166001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Original strand, 37347013 - 37347279
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||  | ||||||  ||||||| | || |||||  ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  37347013 aagtcatgaaaatgatttttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatataatgagtaacaccccattgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtc 37347112  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||  | | ||||||| ||||||||| |    
T  37347113 ctcatagtatcatcaatttattaaattaacaggactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgta--aactccacaaagtgtaacactta 37347210  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  37347211 agactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtatctgtaa 37347279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 275 - 544
Target Start/End: Original strand, 23111181 - 23111451
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||| | | ||||||  ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||  |    
T  23111181 aagtcatgaaaatgatttttctggtgaagttaacactataacatcaaaaatattgtgagtaacacaccactatttgtacaatggcatcaaaagttcaacc 23111280  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattt--tatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacact 472  Q
     || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  23111281 atcgtagtatcatcaattcattagattaacaagactacacttaatctaattttatatcatactttgttttaagcgtaaca-ccccacaaagtgtaacact 23111379  T
Q  473 gaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaaa 544  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23111380 taagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgtaaa 23111451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 275 - 502
Target Start/End: Original strand, 22687230 - 22687456
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  22687230 aagtcatgagaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgcagtggtatcaaaagttcagtc 22687329  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  22687330 cccatagtatcatcaattcatcagattaacaataatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacactca 22687428  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctg 502  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  22687429 agactatctcatgatatcaacaactctg 22687456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 275 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 25691715 - 25691457
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggc-accccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagt 373  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||| | ||||||    ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25691715 aagtcatgagaatgacttttctcgtgaagttaacactataacatcaaaagtattgtgagtaattacctcactgtttgtacagtggcatcaacagttcagt 25691616  T
Q  374 cctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactg 473  Q
     || ||||||| |||||||||||| |||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||     
T  25691615 tcttatagtattatcaattcatcatattaacaaaaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtcacactt 25691517  T
Q  474 aagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaata 533  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||    
T  25691516 aagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagatgttaacgataaaata 25691457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Original strand, 37109847 - 37110132
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || ||||||| | |||||||||| |||||||||  ||||||||  || |||| |||| |||||  |||||||| ||||||||  ||     
T  37109847 ggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatga 37109946  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcc--taccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||| || |||| |||||| |||    
T  37109947 catcaaaagttcagtcattataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaaca-ccc 37110045  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  37110046 cacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaa 37110132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 258 - 533
Target Start/End: Original strand, 43686015 - 43686288
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| || || |||||| || ||||||||||  ||||||||  |||||||| |||||||| ||| ||||||  ||||| |||||||||||  ||    
T  43686015 aggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgactttttgggtgaagttaacactataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccc-actgtttgtacaatg 43686113  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  43686114 gcatcaaaagttcagtccctatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-cccc 43686212  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaata 533  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  43686213 acaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaata 43686288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 256 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 17842775 - 17842487
Alignment:
Q  256 taaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacgg 355  Q
    |||||||||||| || || ||||||| | |||||||||| |||||||||  ||||||||  || |||| |||| |||||  |||||||| ||||||||      
T  17842775 taaggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaa 17842676  T
Q  356 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcc--taccttattttaagtgtaacac 453  Q
    || ||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||| || |||| ||||||     
T  17842675 tgacatcaaaagctcagtcattataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaaca- 17842577  T
Q  454 ccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  17842576 tcccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaa 17842487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 258 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 31579256 - 31578967
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttg-----ta 352  Q
    |||||||||| || || ||||||| ||||| | |||| |||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  |||||||||||||      ||    
T  31579256 aggaaaattctatggtgaagtcataagaataatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttaatttata 31579157  T
Q  353 cggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaaca 452  Q
    |  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  31579156 caatgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataaca 31579057  T
Q  453 cccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
     ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  31579056 -ccctataaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaa 31578967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 10359400 - 10359117
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||| || |  |   ||||| ||||||||||||||||||  || || ||| ||| ||| |||     
T  10359400 ggaaaattctatggtgaagtcatgataatgacttttctggtaaaattaatcttatagcatcaaaagtgtagtgagtaacatcctactatttatacagtga 10359301  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaa-tctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  10359300 catcaaaagttcagtc-tgatagtatcatcaattcatcagatcaacaagactacacttaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacacccc- 10359203  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  10359202 acaaagtgtaacacttaagactatcacataacaacatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaattagtacttgtaa 10359117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 275 - 544
Target Start/End: Original strand, 7334785 - 7335052
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||  ||||||||  || |||  |||| |||||  |||||||||||||||||  || |||||||||||||||     
T  7334785 aagtcgtgagaatgacttttttgatgaagttaacactataacataaaatatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtt 7334884  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |    
T  7334885 ctcatagtatcatcaactcatcagcttaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaaca-ccccacagagtgtaacactta 7334983  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaaa 544  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||||  | ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  7334984 agattatcagataatatcatcaact-agtttgaatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaaa 7335052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 341 - 543
Target Start/End: Original strand, 11071263 - 11071461
Alignment:
Q  341 ccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttatt 440  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||    
T  11071263 ccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcagattaacaacactacgcttaatctaattttatcctaccttgtt 11071362  T
Q  441 ttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctg 540  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||    
T  11071363 ttaagtgtaata-ccccacaaagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactttgttcgcatgttaaaga---caacgataaaataatacctg 11071458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 27421563 - 27421313
Alignment:
Q  261 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 360  Q
    ||||||| || || ||||| ||| ||||| |||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||  || ||    
T  27421563 aaaattctatggtgaagtcgtgataatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatgaca 27421464  T
Q  361 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccaca 460  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  27421463 tcaaaagttcagtcct-ataatatcataaatttatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaaca-tcccaca 27421366  T
Q  461 aaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgtta 513  Q
    || ||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27421365 aagtgtaacacttaagactatcgtatgatatcagcaactctgtttgcatgtta 27421313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 284 - 543
Target Start/End: Original strand, 29173540 - 29173780
Alignment:
Q  284 gaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagta 383  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  29173540 gaatgacttttctggtgaagttaacactgtagtatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagta 29173639  T
Q  384 tcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatca 483  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||                  ||| ||||| ||||||||||    
T  29173640 tcatcaattcatcaaactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaag------------------tgttacacttaagactatca 29173721  T
Q  484 cataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  29173722 cataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa-atgccaacgataaaatagtatctgtaa 29173780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 33688431 - 33688165
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||  |||||  || || ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33688431 aagttatgagaatgacttttctggt-aagttaacactataacatcaaaagtgttatgagtaacatcctactgtttgtccagtggcatcaaaagttcagtc 33688333  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
       |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||| | ||| ||| ||||||| | |    
T  33688332 tctatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcatactttgttttaagtgtaaca-ctccataaagtgtaacattca 33688234  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  33688233 agactatcatatgatatcagcaactctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaa 33688165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 339 - 536
Target Start/End: Original strand, 10481660 - 10481856
Alignment:
Q  339 ccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctacctta 438  Q
    |||||||||||||||  || |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||     
T  10481660 ccccactgtttgtacaatgacatcaaaaattcagtctttatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacgcttaatctaattttatcttaccttg 10481759  T
Q  439 ttttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagta 536  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  10481760 ttataagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctctttgcatgtcaaagattccaacaataaaatagta 10481856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 286 - 543
Target Start/End: Original strand, 26980325 - 26980564
Alignment:
Q  286 atgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatc 385  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26980325 atgacttttatggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacggtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccccataatatc 26980424  T
Q  386 atcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcaca 485  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||                  ||||||||| ||||||||||||    
T  26980425 atcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaag------------------tgtaacacttaagactatcaca 26980506  T
Q  486 taatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  26980507 tgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaa 26980564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 31520893 - 31520644
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||||| | ||||||||  ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31520893 aagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatatagtgagtaacactccattgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtc 31520794  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||                  ||||| |    
T  31520793 c-catagtatcatcaattcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgta------------------acactta 31520713  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31520712 agactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaa 31520644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 355 - 543
Target Start/End: Original strand, 44598737 - 44598924
Alignment:
Q  355 gtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacc 454  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  44598737 gtggcatcaaaaattcaatccccatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaaca-c 44598835  T
Q  455 cccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  44598836 cccacaaagtgtaacacctaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaataatacatgtaa 44598924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 377 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 15672830 - 15672675
Alignment:
Q  377 catagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaag 476  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||    
T  15672830 catagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ctccacaaagtgtaacacttaag 15672732  T
Q  477 actatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaata 533  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15672731 actatcacataatatcatcaactctatttgaatgttaaagatgccaacgataaaata 15672675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 368 - 515
Target Start/End: Original strand, 37704241 - 37704387
Alignment:
Q  368 ttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgta 467  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37704241 ttcagtccccatagtatcatcaatttatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgta 37704339  T
Q  468 acactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaa 515  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  37704340 acacttaagactatcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 257 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 12390818 - 12390622
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| || || ||||||| |||  ||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||||||| |||||  || |||||||||||| | ||    
T  12390818 aaggaaaattctatggtgaagtcatcagatcgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgtaatgagtaacatcccactgtttgtgcagt 12390719  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacac 453  Q
    | |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12390718 gacatcaaaagttatgtccccatagtattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttcttttaagtgtaacac 12390622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 296 - 537
Target Start/End: Original strand, 35353120 - 35353360
Alignment:
Q  296 tggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaag-ttcagtcctcatagtatcatcaattca 394  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||    
T  35353120 tggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccattgtttgtacgatggaatcaaaagtttctgtccccatagtatcaccaattca 35353219  T
Q  395 tcaaattaacaagactacactcaatctaatttta--tcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatc 492  Q
    ||| |||||||||||| || |    |||  | ||   | |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  35353220 tcagattaacaagactgcatt---actagatgtaacacttaccttgttttaagtgtaaca-ccccagaaaatgtaacacttaagactatctcataatatc 35353315  T
Q  493 agcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtac 537  Q
    | ||||| |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  35353316 atcaactatatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtac 35353360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 392 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 37703551 - 37703401
Alignment:
Q  392 tcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatat 491  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  37703551 tcatcagattaataagactacacttaatctaattttatcatatcttattttaagtgtaacatccc-acaaagtgtaccacttaagactatcacataatat 37703453  T
Q  492 cagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    || ||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  37703452 catcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaa 37703401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 261 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 44413564 - 44413353
Alignment:
Q  261 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctgg-tgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggc 359  Q
    ||||||| || || ||||||||| |||||||||| |   ||||||  ||||||||  ||||||| | ||||||||  ||||||| |||||||||  ||      
T  44413564 aaaattctatggtaaagtcatgaaaatgactttttttaatgaagttaacactataacatcaaaaatatagtgagtaacaccccaatgtttgtacactgaa 44413465  T
Q  360 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccac 459  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44413464 atcaaaagttcggtctccatagtatcttcaattcatcaaattaacaaggctacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaaca-ccccac 44413366  T
Q  460 aaaatgtaacact 472  Q
    ||| |||||||||    
T  44413365 aaagtgtaacact 44413353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 307 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 32593326 - 32593181
Alignment:
Q  307 acactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaa 406  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  32593326 acactatagcattaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttatatggtggtatcaaaagttcagt-ctcacagtatcatcaattcatcagattatcaa 32593228  T
Q  407 gactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacac 453  Q
     ||| || | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  32593227 aactgcatttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacac 32593181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 255 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 26524517 - 26524364
Alignment:
Q  255 ttaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacg 354  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||| ||| |||| |  ||| ||| ||||||| |     
T  26524517 ttaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgatgttaacactataacatcaaaaatgttgtgactaacactccattgtttgtgca 26524418  T
Q  355 gtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaaga 408  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26524417 gtggcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaatttatcatattaacaaga 26524364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 359 - 533
Target Start/End: Original strand, 43925177 - 43925349
Alignment:
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||| | |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| | |    
T  43925177 catcaaaagttcagtctacatagtatcatcaact-atcagactaacaataatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgcaacacctc-a 43925274  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaata 533  Q
    |||  | ||| ||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43925275 caacgtttaatacttaatacaatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaata 43925349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 403 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 26588126 - 26588028
Alignment:
Q  403 acaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctg 502  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  26588126 acaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacactcaagactatcacatgatatcaacaactctg 26588028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 392 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 46481182 - 46481032
Alignment:
Q  392 tcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatat 491  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||| |||| || |||||||||||||| | | | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46481182 tcatcagattaacaagactatacttgatgtaattttattctacattgttttaagtgtaacatctc-ataaagtgtaacacttaagactatcacataatat 46481084  T
Q  492 cagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||  |||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  46481083 cattaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaa 46481032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 34362334 - 34362205
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || || | ||||||||||||||||| |  ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  34362334 ggaaaattctatggtgaaattatgagaatgacttttctaggaaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 34362235  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatca 389  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  34362234 catc-aaagttcagttctcatagtatcatca 34362205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 41757409 - 41757298
Alignment:
Q  28 ccggttcgaacattgatttctggaatagatacatcttttactggcttgaattcctctgaggtgttggcattgcaaaacgcacgaatcgaattcttgtaca 127  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| || || ||||| |||||||    
T  41757409 ccggtttgaagattggtttctggaatagatacatcctttgcaggcttgaatccctctgatgtgttcgcattgcaaagcgctcggattgaatttttgtaca 41757310  T
Q  128 agtttggaactg 139  Q
    ||||||||||||    
T  41757309 agtttggaactg 41757298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 464 - 543
Target Start/End: Original strand, 38053640 - 38053719
Alignment:
Q  464 tgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  38053640 tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttggatgttaaagattccaacaataaaatagtacctgtaa 38053719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 477 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 44411509 - 44411443
Alignment:
Q  477 actatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  44411509 actatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatattatctgtaa 44411443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 481 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 12390614 - 12390552
Alignment:
Q  481 tcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  12390614 tcacataatatcatcaactcagcttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaa 12390552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 474 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 32593178 - 32593109
Alignment:
Q  474 aagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  32593178 aagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgttaaaatagtacatgtaa 32593109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 430
Target Start/End: Original strand, 38053540 - 38053624
Alignment:
Q  338 accccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatc 430  Q
    |||| |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||| ||||        |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38053540 accctactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagttctcatagtgtcat--------caaattaacaagactacacttaatctaattttatc 38053624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 323
Target Start/End: Original strand, 8299192 - 8299254
Alignment:
Q  261 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaa 323  Q
    ||||||| || || |||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8299192 aaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaacactatagtatcaaaa 8299254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 356 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 34362191 - 34362150
Alignment:
Q  356 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatca 397  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  34362191 tggcatcaaaagttcagttcttatagtatcatcaattcatca 34362150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 490 - 543
Target Start/End: Original strand, 37704387 - 37704440
Alignment:
Q  490 atcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37704387 atcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaa 37704440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 304
Target Start/End: Original strand, 40381934 - 40381985
Alignment:
Q  253 aattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 304  Q
    ||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40381934 aattaaggaaaattctacggtgaagttatgagaatgacttttctggtgaagt 40381985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 488 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 34362138 - 34362081
Alignment:
Q  488 atatcagcaactct--ggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  34362138 atatcagcaactctctgtttgcatgttaaaaatatcaacgataaaatagtatctgtaa 34362081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 304
Target Start/End: Original strand, 3953747 - 3953776
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3953747 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 3953776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 23402403 - 23402374
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23402403 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 23402374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 28003197 - 28002914
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | || ||||||||||||| |||     
T  28003197 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtcagtagtactccactgtttgtacagtga 28003098  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28003097 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcggattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-cccca 28002999  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
     ||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  28002998 gaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaa 28002914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 35021248 - 35020963
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||  |    
T  35021248 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaacattataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacatt 35021149  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  35021148 ggcgtcaaaagtttcgtcctcgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaaca-ccc 35021050  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  35021049 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaa 35020963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 257 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 25701270 - 25700991
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||  || || ||||||||| |||||||||| |||| ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||    
T  25701270 aaggaaaattttatggtgaagtcatgataatgacttttttggtaaagttaacattataacatcaaaagtgtagtgagtaacaccctactgtttgtacagt 25701171  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  25701170 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaggactacactaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatccc 25701071  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagta 536  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  25701070 cacaaagtgtaacacttaagattatcacataacatcatcaactttgtttgcatgttaaagaagtcaacgataaaatagta 25700991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Original strand, 38011852 - 38012137
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  38011852 aaggaaaattctatggtgaaatcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgaatagcaccccactgtttgtacggt 38011951  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    | ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||    
T  38011952 gccatcaaaagttcagtccccataatattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatttaattttattataccttgttttaagtgtaaca-tcc 38012050  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    || ||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||    
T  38012051 cagaaagtgtaacgcttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcacgttaaaaatgccaacaataaaatagtacatgtaa 38012137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 55241315 - 55241033
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  55241315 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagttaatactatattatcaaaattgttgcgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 55241216  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||    
T  55241215 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaatttatcaga-taagaagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaaca-cctca 55241118  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  55241117 caaagtgtaacacttaagactatcacatgatgtcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaa 55241033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 256 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 55478109 - 55477825
Alignment:
Q  256 taaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgt---- 351  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||  ||||||| ||||  ||||  ||| |||||||||||        
T  55478109 taaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacactccactgtttgtttgt 55478010  T
Q  352 acggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaac 451  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  55478009 acaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgttataagtgtaac 55477910  T
Q  452 acccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtac 537  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55477909 a-ccccacaacgtgtaacactgaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtac 55477825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 34948292 - 34948023
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34948292 aagtcatgagaatgacttttctggcgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtaaagtggcatcaaaagttcagtc 34948193  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaac--act 472  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||    
T  34948192 ctcataatatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgtttaaagtgcaaca-ccccacaaagtgtaacgtact 34948094  T
Q  473 gaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
     ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  34948093 taagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaa 34948023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Original strand, 7703533 - 7703792
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7703533 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtcagtaacaccccactgtttgtacggtgacatcaaaagttcagtc 7703632  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    | |||||||||||||         |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| |    
T  7703633 cccatagtatcatcag--------attaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacactcc-acaaagtgtcacactta 7703723  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7703724 agactatcacatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaa 7703792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 261 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 36493897 - 36493617
Alignment:
Q  261 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 360  Q
    ||||||| || || ||||||||| ||| |||||| |||||||||  | ||||||  ||||||| | ||||||||  ||||||| ||||||||| ||| ||    
T  36493897 aaaattctatggtgaagtcatgaaaataacttttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatatagtgagtaacaccccattgtttgtacagtgaca 36493798  T
Q  361 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccaca 460  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||  | | |||||    
T  36493797 tcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgta--aactccaca 36493700  T
Q  461 aaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    || ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  36493699 aagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaa 36493617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 258 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 37663951 - 37663669
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| || || ||||||| |||||||||||| || ||||||  ||||||    || |||| |||| |||||  |||||||||||||||||  ||    
T  37663951 aggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttgatgaagttaacactaac--attaaaactgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatg 37663854  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||| |||||| ||||    
T  37663853 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaaca-cccc 37663755  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37663754 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaa 37663669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 19089664 - 19089381
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || ||||||| ||||| |||||| || ||||||  |||||||| |||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||   ||     
T  19089664 ggaaaattctatggtgaagtcataagaataacttttttgatgaagttaacactataatatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtataatga 19089565  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || | |||||| ||| |    
T  19089564 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctatatgcgtaaca-cccta 19089466  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19089465 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaa 19089381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 285 - 543
Target Start/End: Original strand, 17173316 - 17173573
Alignment:
Q  285 aatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtat 384  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  17173316 aatgacttttctgatgaagttaacattataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatctccatagtat 17173415  T
Q  385 catcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcac 484  Q
    ||| ||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  17173416 cattaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacacttaagactatcac 17173514  T
Q  485 ataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17173515 ataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaa 17173573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 5048160 - 5047894
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||     
T  5048160 aagttatgagaatgatttttctggtgaagtcaactctataacatcaaaagtgtagtgagtaggaccacactgtttgtacgatgatatcaaaagttcagtt 5048061  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||| |||||||||||||| |    
T  5048060 cccatagtatcatcaattcatgagattaacaagactgcatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaata--cccgcaaaatgtaacactta 5047963  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  5047962 agactatcacatgatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgtaa 5047894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 261 - 543
Target Start/End: Original strand, 33341397 - 33341681
Alignment:
Q  261 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtg----tagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||  ||||||| ||    | | |||   ||||||||||||||||| ||    
T  33341397 aaaattctatagtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaaattaacactatatcatcaaaattgattgttgcgaggaacaccccactgtttgtacagt 33341496  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  33341497 ggcatcaaaagttcagtcc-catagtatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctc 33341595  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  33341596 -acaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaa 33341681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 285 - 543
Target Start/End: Original strand, 17167739 - 17167996
Alignment:
Q  285 aatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtat 384  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  17167739 aatgacttttctgatgaagttaacattataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcattctccatagtat 17167838  T
Q  385 catcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcac 484  Q
    ||| ||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  17167839 cattaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacacttaagactatcac 17167937  T
Q  485 ataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17167938 ataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaa 17167996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 276 - 539
Target Start/End: Original strand, 23761089 - 23761350
Alignment:
Q  276 agtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcc 375  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  23761089 agtcatgagaatgactattcttgtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtatagtgacatcaaaagttcagtcc 23761188  T
Q  376 tcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaa 475  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || || ||| ||| ||| | ||    
T  23761189 ccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttat-ctaccttgttttaagtgtaaca-cctcataaagtgtcacatttaa 23761286  T
Q  476 gactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacct 539  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23761287 gactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagataccaacgataaaattgtacct 23761350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 261 - 537
Target Start/End: Original strand, 47253751 - 47254017
Alignment:
Q  261 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 360  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||| | ||||| ||| ||| ||    
T  47253751 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactatatcatcaaaagtgttgtgagtaacaccc-attgtttatacagtgaca 47253849  T
Q  361 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccaca 460  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  47253850 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag--------attaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc-aca 47253940  T
Q  461 aaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtac 537  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  47253941 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtac 47254017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 258 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 35025800 - 35025530
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  35025800 aggaaaattctatgctgaagtcatgaaaatgatttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttatacgttg 35025701  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||        |||| |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||    
T  35025700 acatcaaaagttcagtcctcgtagtatc--------atcagattaacaagactgcatttaatataattttatcctatcttgttttaagtgtcaca-cccc 35025610  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtac 537  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35025609 agaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtac 35025530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 275 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 46888352 - 46888085
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    |||||| || ||| ||||||||| ||||||  | ||||||  ||||||| ||||||||||   |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  46888352 aagtcaagaaaataacttttctgatgaagttaatactataacatcaaaattgtagtgagtaataccccactatttgtacagcggcatcaaaagttcagtc 46888253  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    | |||| |||| | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||      
T  46888252 cccatactatcgttaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaaca-ccccacaaaacgtaacact-t 46888155  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaaa 544  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46888154 agactatcacataatatcatcaaatcggtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaaa 46888085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 275 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 33816728 - 33816452
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33816728 aagtcatgagaatgatttttctggtgaagtcaacattgtagcatcaaaagtgtagtgagtagcacctcactatttatacggtggcatcaaaagttcagtc 33816629  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacac----------------cccca 458  Q
      |||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||                |||||    
T  33816628 tccatagtatcatcaatttatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaatacccca 33816529  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagt 535  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33816528 caaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagt 33816452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 367 - 544
Target Start/End: Original strand, 1815409 - 1815585
Alignment:
Q  367 gttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgt 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  1815409 gttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacatttactctaattttatcctaccttgttttaagggtaacacccc-acaaagtgt 1815507  T
Q  467 aacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaaa 544  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1815508 aacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaa 1815585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 258 - 543
Target Start/End: Original strand, 25184112 - 25184396
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  ||| | |||||||||||  ||    
T  25184112 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgactattttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactctactgtttgtacaatg 25184211  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
     |||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |    
T  25184212 acatccaaagttcaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaaca-cctc 25184310  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| || || || |||||||||||| |||||    
T  25184311 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgtaa 25184396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Original strand, 49375982 - 49376250
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgactttt-ctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagt 373  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  49375982 aagtcatgagaatgactttttctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgtcgtgagtaacaccccactgcttgtacagtggcatcaaaagttcagt 49376081  T
Q  374 cctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactg 473  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||  |||||||||||| || ||||  |||||||   ||| ||||||||  |||||||||     
T  49376082 cttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacgcttgatctaattttattctgccttgatttaagttataca-ccccacaatgtgtaacactt 49376180  T
Q  474 aagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  49376181 aagattatcacataatatcatcaactttgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaa 49376250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 19440843 - 19440576
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||  ||||||| |||| ||| |  ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19440843 aagtcatgagaatgacttttttggtgatgttaacactataacatcaaaaatgtaatgattaacactccaccgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtc 19440744  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| || |||| |||||| ||||||||  |||||| || |    
T  19440743 ctcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcttagcttgttataagcgtaaca-ccccacaacgtgtaaccctta 19440645  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  19440644 agtttataacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaatagtacatgtaa 19440576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 256 - 539
Target Start/End: Original strand, 27396613 - 27396895
Alignment:
Q  256 taaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacgg 355  Q
    |||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||  |||||  ||||| |||||||||||      
T  27396613 taagaaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacattatagcattaaaagtgttatgagtaacaccctactgtttgtacaa 27396712  T
Q  356 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccc 455  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |    
T  27396713 tgacatcaaaagtttcgtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaagtgtaaca-tc 27396811  T
Q  456 ccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacct 539  Q
    ||| ||| ||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||    
T  27396812 ccataaagtgtcacacttaagaccatcgcatgatatcagcaacgctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaagtggtacct 27396895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 29584411 - 29584128
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||  |||||  |||| ||||||||||||  |    
T  29584411 aaggaaaattctatggtgaagtcgtgggaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgt--tgagtaacacctcactgtttgtacaat 29584314  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||    
T  29584313 ggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgttaca-ccc 29584215  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||  || ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| ||||||| |||| |||||    
T  29584214 catgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgtaa 29584128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 313 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 4934360 - 4934134
Alignment:
Q  313 tagtatcaaaagtgtagtgagtggcacccc-actgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagacta 411  Q
    |||||| |||| ||||||||||  |||||| | |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  4934360 tagtataaaaaatgtagtgagtaacacccccattgtttgtacactggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcatttcatcagattaacaagacta 4934261  T
Q  412 cactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgt 511  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||    
T  4934260 cacttaatctaattttattctaccttgttttaagtccaaca-cctcacaaagtgtaacacttaagactatcatataatatcatcaactatgtttgcatgt 4934162  T
Q  512 taaagataccaacgataaaatagtacct 539  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||    
T  4934161 taaagatgacaacgataaaatagtacct 4934134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 258 - 543
Target Start/End: Original strand, 37287732 - 37288011
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttct-ggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    |||||||||| || || |||| ||||||||||||||| | ||| ||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  37287732 aggaaaattctatggtgaagtaatgagaatgactttttttggtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagt 37287831  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaatttt-atcctaccttattttaagtgtaacaccc 455  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| |         |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| |||    
T  37287832 ggcatcaaaagttcaatcctcataatatcataag--------attaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaagtgtaacgccc 37287923  T
Q  456 ccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  37287924 ccacaaaatgtaacacttaagactagcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttgaagatgccaacgataaaatagtacatgtaa 37288011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 879743 - 879476
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  |||| || |||||||||  || ||||||||||| | ||    
T  879743 aagtcatgagaataatttttttggtgaagtaaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcattgtttgtacaatgacatcaaaagtttaatc 879644  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
     ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||||| ||||||| | |    
T  879643 ttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacataatctaattttatcctaccttgttataagcgtaaca-cctcacaaagtgtaacattta 879545  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||    
T  879544 agactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtacctgtaa 879476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 32912793 - 32912508
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  ||||| | | ||||||   |    
T  32912793 aaggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccctagtatttgtagaat 32912694  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    |  |||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || |||| |||||||||     
T  32912693 gatatcaaaagttcagcactcataatatcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccct 32912594  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32912593 -acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgtatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaa 32912508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Original strand, 37775685 - 37775941
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||| | ||||| |||| |||||||||   ||||||| ||| |||| ||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  37775685 aagtcattaaaatgatttttttggtgaagttagcactataatattaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttccccc 37775784  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||       
T  37775785 ct--tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacac--- 37775878  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
          |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37775879 ------tcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaa 37775941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 281 - 543
Target Start/End: Original strand, 32579466 - 32579729
Alignment:
Q  281 tgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgt---acggtggcatcaaaagttcagtcctc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||   |||||| ||||||||||| |||| ||    
T  32579466 tgagaatgacttttctggtgaagtcaacattataacatcaaaagtgcagtgagtagcaccccagtgtttgttgtacggtgccatcaaaagtttagtc-tc 32579564  T
Q  378 atagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaaga 477  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || || ||| |||||| || ||||    
T  32579565 atagtattatcagttcatcagattaacatgactgtacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaga-cctcagaaagtgtaactcttaaga 32579663  T
Q  478 ctatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||  ||||||||| ||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  32579664 ctatcttataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaa 32579729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 275 - 533
Target Start/End: Original strand, 4598009 - 4598255
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4598009 aagtcattagaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaa-gtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtc 4598107  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    | | |||  |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||       
T  4598108 cccttagactcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatttaattttatcct-gcttgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacac--- 4598202  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaata 533  Q
          |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4598203 ------tcacatgatatcagcaactctgttttcatgttaaagatgccaacgataaaata 4598255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 257 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 34361704 - 34361424
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||  || |||| |||| |||||  ||||||||||||||||   |    
T  34361704 aaggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtagaat 34361605  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    | ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||| || |||| |||||||||     
T  34361604 gacattaaaagttcag-cctcataatatcatcaattcatccggttaacaaaattacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccct 34361506  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacct 539  Q
     ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34361505 -acaaagtgtaacacttaaagctatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacct 34361424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 277 - 533
Target Start/End: Original strand, 6864053 - 6864308
Alignment:
Q  277 gtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcct 376  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   |||||||  ||||||| | || ||| |  || || ||| |||||||  | ||||||||||| |||||||    
T  6864053 gtcatgagaatgacttttttggtgaagttatcactataacatcaaaaatttaatgaataacatccaactttttgtacaatagcatcaaaagtccagtcct 6864152  T
Q  377 catagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaag 476  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| || |||| |||||| ||||||||| ||||| ||| |||    
T  6864153 catagtatcatcaatttatcagattaacaagactacatttaatttaattttatcataccttgttataagcgtaaca-ccccacaaagtgtaatacttaag 6864251  T
Q  477 actatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaata 533  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6864252 actatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaata 6864308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 257 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 30002837 - 30002575
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    |||||||| || || || ||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||    
T  30002837 aaggaaaactctatggtgaagtcattaaaatgatttttctggtgaagttaacactgtagcatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtacagt 30002738  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||         |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30002737 gacatcaaaagttcagtcttcttagtatcatcag--------attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaaca-ccc 30002647  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtac 537  Q
    |||||| ||||||||         |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30002646 cacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtac 30002575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 337 - 543
Target Start/End: Original strand, 50697320 - 50697525
Alignment:
Q  337 caccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctacct 436  Q
    ||||| || ||||||||  || ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  50697320 caccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcaattctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctacct 50697418  T
Q  437 tattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgc-atgttaaagataccaacgataaaatagt 535  Q
    | || |||| |||||| || |||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50697419 tgttataagcgtaaca-ccacacaaagtgcaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcaatgttaaagattccaacgataaaatagt 50697517  T
Q  536 acctgtaa 543  Q
    ||||||||    
T  50697518 acctgtaa 50697525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 269 - 543
Target Start/End: Original strand, 32592103 - 32592367
Alignment:
Q  269 attgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagt 368  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||| || ||||||  |||||| |||||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  32592103 attgtgaagtcattataatgacttttttgatgaagttaacactacagtatcaaaagtgttgagagtaacactccactgtttgtatagtgacatcaaaagt 32592202  T
Q  369 tcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaa 468  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32592203 tcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaa 32592301  T
Q  469 cactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||         ||| || || ||||||||| || |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  32592302 cac---------tcatatgatttcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtctacgataaaatagtacctgtaa 32592367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 253 - 539
Target Start/End: Original strand, 42199723 - 42200008
Alignment:
Q  253 aattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgta 352  Q
    |||| ||||||| || || || || |||| ||||||| |||| |||||||||  | ||||||  ||||||| |||| |||||   |||||| | ||||||    
T  42199723 aatttaggaaaaatctatggtgaaatcataagaatgatttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaatgagtaataccccattatttgta 42199822  T
Q  353 cggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaaca 452  Q
       || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || ||||  |||||    
T  42199823 gaatgacataaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataaca 42199922  T
Q  453 cccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacct 539  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  42199923 -ccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacct 42200008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 284 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 54499425 - 54499165
Alignment:
Q  284 gaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtac-ggtggcatcaaaagttcagtcctcatagt 382  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||   || ||||||||||||||||   |||||    
T  54499425 gaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccaccgtttgtactaatgacatcaaaagttcagtctctatagt 54499326  T
Q  383 atcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaa-ttttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactat 481  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||  | ||||||||    
T  54499325 atcatcaattcatcatattaacaagaatatacttaatctaatttttatcataccttgttttaagtgtaaca-ccctacaaagtgtaacttttaagactat 54499227  T
Q  482 cacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaaa 544  Q
    ||||| |||| || ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||    
T  54499226 cacatgatattagtaactctgtttccatgttaaa-atgccaacgataaaatggtaccggtaaa 54499165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Original strand, 50764748 - 50765003
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||  ||||||    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  50764748 aagtcatgagaataacttttttgatgaagttaacactaac--atcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacggtgacatcaaaagttcaatc 50764845  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||          |||||||| ||||||||| || |||||| |    
T  50764846 ctcatagtatcatcaattcattagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctac----------gtgtaaca-ccccacaaagtgaaacactca 50764934  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    | | |||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  50764935 atattatcacatgatatcagcaactatgtttgcaagttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaa 50765003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 3042741 - 3042902
Alignment:
Q  381 gtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagacta 480  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  3042741 gtatcatcaattcatcatattaacaagattacacttaatataattttatcataccttattataagcgtaacacccc-acaaagtgtaacacttaagacta 3042839  T
Q  481 tcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  3042840 tcacataatatcatcaactttgtttgcttgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaa 3042902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 253 - 477
Target Start/End: Original strand, 9139241 - 9139462
Alignment:
Q  253 aattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgta 352  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| | |||||||| |||||||||  ||  ||||| || |||| |  |||||||  |||||||| |||||||    
T  9139241 aattaaggaaaattctatggtgaagtcatgaaattgacttttttggtgaagttaacgttatagcataaaaaat--agtgagtaacaccccaccgtttgta 9139338  T
Q  353 cggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaaca 452  Q
    | ||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  9139339 cagtgacataaaaagttcaatccccatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaactgtaaca 9139438  T
Q  453 cccccacaaaatgtaacactgaaga 477  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||    
T  9139439 -ccctacaaagtgtaacacttaaga 9139462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 259 - 456
Target Start/End: Original strand, 39397918 - 39398106
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||  || |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||     
T  39397918 ggaaaattctatggtgaagtcattagaatgacttttatggtgaagttaacactataacattaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttgtacagtga 39398017  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||         ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39398018 catcaaaagttcagtcttctcagtatcatc---------aattaacaagaatacacttaatctaattttatcctgccttattttaagtgtaacacccc 39398106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 359 - 543
Target Start/End: Original strand, 17272068 - 17272247
Alignment:
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17272068 catcaaaagttcagtc----tagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaaca-cccca 17272162  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
      || ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||  |||| |||||||||||| |||||    
T  17272163 tgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatattaaagatttcaacaataaaatagtacatgtaa 17272247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 445 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7152230 - 7152132
Alignment:
Q  445 gtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||| || |||||| | ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  7152230 gtgtaacatcctcacaaagtataacacttaatactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 7152132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 488 - 539
Target Start/End: Original strand, 39400236 - 39400287
Alignment:
Q  488 atatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacct 539  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  39400236 atatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatggtacct 39400287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 46884177 - 46884045
Alignment:
Q  401 taacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactc 500  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| || ||| || ||||  ||||| | | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||  || |     
T  46884177 taacgagactacacttaatctaattttatcatatcttgttataagc-taacatctc-acaaaatgtaacacttaa-actatcacataatatcataaattt 46884081  T
Q  501 tggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagta 536  Q
    || |||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  46884080 tgtttgcatgttaaaaattccaaagataaaatagta 46884045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 38812312 - 38812263
Alignment:
Q  255 ttaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 304  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38812312 ttaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 38812263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 353
Target Start/End: Original strand, 4205114 - 4205210
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtac 353  Q
    ||||||||||| || || |||||| || ||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||  ||| |  |||||||||||||||||    
T  4205114 aaggaaaattctatggtgaagtcaggaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatatcaaaaatgttctgaataacaccccactgtttgtac 4205210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 495 - 543
Target Start/End: Original strand, 4205219 - 4205267
Alignment:
Q  495 caactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  4205219 caactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaa 4205267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 325
Target Start/End: Original strand, 17272008 - 17272077
Alignment:
Q  256 taaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagt 325  Q
    |||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||    
T  17272008 taaggaaaattctatggtgaagtcgtgggaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagt 17272077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 458 - 543
Target Start/End: Original strand, 26896285 - 26896369
Alignment:
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| |||  |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  26896285 acaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatgatcaagtctatttgcatgttaaa-atttcaacgataaaatagtacttgtaa 26896369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20097537 - 20097494
Alignment:
Q  261 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 304  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20097537 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 20097494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 304
Target Start/End: Original strand, 2704508 - 2704557
Alignment:
Q  255 ttaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 304  Q
    ||||||||||||  || || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2704508 ttaaggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagt 2704557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7152319 - 7152242
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagt 334  Q
    ||||||||||| || || ||||||||  ||||||||||||||| ||||  ||| ||||  ||||||||| ||||||||    
T  7152319 aaggaaaattctatggtgaagtcatgctaatgacttttctggtaaagttaacattataacatcaaaagtatagtgagt 7152242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 304
Target Start/End: Original strand, 38811813 - 38811858
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 304  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38811813 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagt 38811858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 168; Significance: 9e-90; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 252 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7235225 - 7234936
Alignment:
Q  252 taattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgt 351  Q
    |||||| ||||||||| || || |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7235225 taattatggaaaattctatggtgaagttatgagaatgacttttccggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgt 7235126  T
Q  352 acggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaac 451  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7235125 acggtgccatcaaaagttcagt-ctcatagtattatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaac 7235027  T
Q  452 acccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    | ||||| ||| |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  7235026 a-ccccagaaagtgtaacgcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgataaaatagtacatgtaa 7234936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 258 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 3880124 - 3879840
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||  ||    
T  3880124 aggaaaattctatggtgaagtcacgagaatgacttttctggtgaagttaacattatagtatcaaaagtgttgtgagtaacaccctactgtttgtacaatg 3880025  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  3880024 acatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatatacttattctaattttatcctaccttgttttaaatgtaaca-cccc 3879926  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  3879925 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaa 3879840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 253 - 543
Target Start/End: Original strand, 29182157 - 29182447
Alignment:
Q  253 aattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgta 352  Q
    ||||||| ||||||  || || ||||||||||||||| |||  || ||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||    
T  29182157 aattaagaaaaattttatggtgaagtcatgagaatgattttattgatgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttata 29182256  T
Q  353 cggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaaca 452  Q
    | ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29182257 cagtgtcatcaaaagttcagtctccatattatcatcaattcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccatattttaagtgtaaca 29182356  T
Q  453 cccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  29182357 cccccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctatttgcaggttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaa 29182447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 258 - 543
Target Start/End: Original strand, 8513232 - 8513511
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  8513232 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataatatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtg 8513331  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaa-ttttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
     ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| |||      ||||| |||    
T  8513332 acatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttgatctaatttttatcctaccttgttt------taaca-ccc 8513424  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  8513425 tacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggtaa 8513511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 275 - 529
Target Start/End: Original strand, 15491631 - 15491884
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| | ||  ||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  15491631 aagttatgagaatgacttttctcgtgaagttaacattgtaacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttgtacagtggcatcaaaagttcagcc 15491730  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  15491731 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatgcacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaaca-ccccacaaaatgtaacactta 15491829  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataa 529  Q
    | | |||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  15491830 aaaatatcacatgatatcagcaattctgtttggatgttaaagatgctaacgataa 15491884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 257 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 4319009 - 4318729
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||||||  |||||  ||||||||||||||||| ||    
T  4319009 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttatgagtaacaccccactgtttgtacagt 4318910  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaa-ttttatcctaccttattttaagtgtaacaccc 455  Q
    | |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4318909 gacatcaaaagttcaacccccatagtatcatcaattcattagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaaca-cc 4318811  T
Q  456 ccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtac 537  Q
    | | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  4318810 ctataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgttttcatgttaaagatgtcaacgatgaaatagtac 4318729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 275 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 21017280 - 21017019
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||  ||| | |||||| |||| ||| ||||||  ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||    
T  21017280 aagtcacgaaaatgacttttttggtgaagttaacattgtagtataaaaaatgttgtgagtaacaccccattatttgtacaatggcatcaaaagttcagtc 21017181  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  21017180 cccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaataaacttaatctaattttatcctacgttattttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacactta 21017082  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtac 537  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  21017081 agactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtac 21017019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 256 - 543
Target Start/End: Original strand, 1945830 - 1946117
Alignment:
Q  256 taaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttct-ggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacg 354  Q
    |||||||||||| |  || ||||||| |||||||||||| | ||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||      
T  1945830 taaggaaaattctacggtgaagtcataagaatgactttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtaga 1945929  T
Q  355 gtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacc 454  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || |||| |||||| |    
T  1945930 atgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatgaattcatcaagttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaaca-c 1946028  T
Q  455 cccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1946029 cctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaa 1946117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 261 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 30353540 - 30353259
Alignment:
Q  261 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 360  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||| | ||||   | | |||||||||||| ||||||    
T  30353540 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacattataacatcaaaagtgttgcgagtaatatctcactgtttgtacagtggca 30353441  T
Q  361 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccaca 460  Q
    || | |||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  ||||||    
T  30353440 tcgatagttcagtctccatagtatcatcaattcatcatataaacaagaatacacttaatctaattttatcatgccttgttttaagtgtaaca-tcccaca 30353342  T
Q  461 aaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  30353341 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaa 30353259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 260 - 543
Target Start/End: Original strand, 20768087 - 20768365
Alignment:
Q  260 gaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggc 359  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||   |||||    
T  20768087 gaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagca-tccattgtttgt-tagtggc 20768184  T
Q  360 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccac 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||     
T  20768185 atcaaaagttcagtcctcatagtatcattaattcatcagattaacaagatt--acttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaaca-tcccat 20768281  T
Q  460 aaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||| ||| | || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  20768282 aaagtgtaacacttaagatcatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaa 20768365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 261 - 543
Target Start/End: Original strand, 6088910 - 6089186
Alignment:
Q  261 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 360  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||  ||||||    
T  6088910 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactatagtatcaaaagtgttgtgagtaacgccccactgtttgtaaagtggca 6089009  T
Q  361 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaa-ttttatcctaccttattttaagtgtaacacccccac 459  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||  |||||| |||||||||||||| |||      ||||| | | ||    
T  6089010 tcaaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatatccttgatctaatttttatcctaccttgttt------taaca-ctctac 6089102  T
Q  460 aaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||  | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  6089103 aaggtataacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccagtaa 6089186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Original strand, 5627389 - 5627674
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| |  || ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||  || |||| | || |||||  ||||||||| ||||||   |    
T  5627389 aaggaaaattctaaggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatataatgagtaacaccccactatttgtagaat 5627488  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || ||||  ||||| |||    
T  5627489 gacatcaaaagttcagccctcatagtattatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataaca-ccc 5627587  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
     ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5627588 tacaaagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaa 5627674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 320 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 6091306 - 6091083
Alignment:
Q  320 aaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaat 419  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||    
T  6091306 aaaaatgtagtgagtaacacaccattgtttgtacaatgccatcaaaagttcagtactcgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaat 6091207  T
Q  420 ctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacac-tgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagat 518  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  6091206 ctaattttatcataccttgttttaagcgtaaca-cccaacaaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatattaaagat 6091108  T
Q  519 accaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
     | ||||||||||||||||||||||    
T  6091107 tcaaacgataaaatagtacctgtaa 6091083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Original strand, 33618850 - 33619113
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  33618850 aagtcatgggaaatacttttctggtgaagtcaacactatcgcatcaaaagtgtagtgagtagcaacccattatttgtacggtggcatcaaaagttcagtt 33618949  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||        |||||||||  |||   || ||| ||||| |    
T  33618950 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacc--------agtgtaaca--ccctagaagtgtgacactta 33619039  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcat-----gttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||     ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  33619040 agagtatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaa 33619113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 33893186 - 33892913
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || ||||||| ||||| | |||| | |||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||  ||     
T  33893186 ggaaaattctatggtaaagtcattagaataatttttttagtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatga 33893087  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
     || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  33893086 tattaaaagttcagtcc-cttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttatgtataaca-cccca 33892989  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| ||||||||         |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  33892988 caaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactcagtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgtaa 33892913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 258 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 7055400 - 7055141
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||  || || ||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||||||||  || |||| | || | |||  |||| |||| ||||||   ||    
T  7055400 aggaaaattttatggtgaagtcataagaatgatttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatataattagtaacacctcactatttgtagaatg 7055301  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || ||||||||||| | |     
T  7055300 acatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaaca-cgct 7055202  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagat 518  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||    
T  7055201 acaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctatttggatgttaaagat 7055141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 257 - 390
Target Start/End: Original strand, 18498431 - 18498565
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcacccc-actgtttgtacgg 355  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||   |||||| || |||||||| |    
T  18498431 aaggaaaaatctatagtgaagtcatgagaatgactttcctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgtagtgagcaacacccccacagtttgtacag 18498530  T
Q  356 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18498531 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 18498565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 304
Target Start/End: Original strand, 19631747 - 19631794
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 304  Q
    ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19631747 aaggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttctggtgaagt 19631794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 258 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 27083030 - 27082746
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||    
T  27083030 aggaaaattctatggtgaagtcatcagactgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacaccccactgtttgtgcagtg 27082931  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||||    
T  27082930 gcattaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttaccatgttttaagtctaaca-cccc 27082832  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  27082831 gcaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaa 27082746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 253 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 36695163 - 36694873
Alignment:
Q  253 aattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgta 352  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| || ||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  36695163 aattaaggaaaattctatggtgaagtcaggaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgta 36695064  T
Q  353 cggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaaca 452  Q
    |  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  36695063 caatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca 36694964  T
Q  453 cccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaaa 544  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  36694963 -ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaaa 36694873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 275 - 536
Target Start/End: Original strand, 11727039 - 11727299
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11727039 aagttatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtaagtaacaccccactatttgtatagtggcatcaaaagttcagtc 11727138  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  11727139 ctcataatatcatcaattcatcaaattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaaca-ccccacaaaatgtaacactta 11727237  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagta 536  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11727238 agactatcacatgatatcaacaactttgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagta 11727299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 5300137 - 5299854
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||| |  ||||||  ||||||||| ||||||||||| || ||| |||| | ||||||||||| ||||    
T  5300137 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttaatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtaagtagcactctactgtttgtacagtgg 5300038  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  5300037 catcaaaagttcagtccttatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaaca-cccca 5299939  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5299938 caaagtgtaacacttaagattatcaaatgatatcagcaattttgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgtaa 5299854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 37970694 - 37970427
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||  || |||||||||||||| |    
T  37970694 aagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgccatcaaaagttcagcc 37970595  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  37970594 ctcatagtatcatcaattcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacactta 37970496  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||    
T  37970495 agactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatccttacaataaaatagtacctgtaa 37970427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 259 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 6098709 - 6098436
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || ||||||||| ||| |||||| |||||||||  | ||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| |||     
T  6098709 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaataacttttttggtgaagttaatactatagcatcaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 6098610  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  6098609 catcaaaagttcagtccccatagtatcgtcaattcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaaca-cccca 6098511  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaata 533  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  6098510 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgatacaata 6098436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 258 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 16447067 - 16446783
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||   ||    
T  16447067 aggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgataaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtataatg 16446968  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  16446967 gcatcaaaagtttagtccccatactatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgtttcaagtgtaaca-cccc 16446869  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16446868 acaaagcgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgtaa 16446783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Original strand, 1204942 - 1205209
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || |||| ||||||||||  |||  ||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  1204942 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataacataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtc 1205041  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  1205042 ctcatagtatcatcagttcatcatattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagcgtaaca-ccccacaaagtgtaacactta 1205140  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  1205141 agactatcgcataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaa 1205209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Original strand, 9864145 - 9864430
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| ||  | |||||| || |||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||  |    
T  9864145 aaggaaaattctataatgaagtcacgaaaatgacttttttggtgaaattaacactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaat 9864244  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  9864245 gacatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccc 9864343  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9864344 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaa 9864430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Original strand, 12876108 - 12876392
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || |||||| || ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| |||| ||| ||||||  ||||| |||||||||||  ||     
T  12876108 ggaaaattctatggttaagtcacgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatataaaaaatgttgtgagtaacacccaactgtttgtacaatga 12876207  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12876208 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaagaaggatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaaca-cccca 12876306  T
Q  459 caaaatgtaacac-tgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  12876307 caaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaa 12876392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Original strand, 13307622 - 13307904
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||| |||     
T  13307622 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactatttgtacagtga 13307721  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  13307722 catcaaaagttcagtccccatagtattatcaattcatcagattagcaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaaatgtaaca-cccca 13307820  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  13307821 caaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaa-atgtcaacgataaaatagtacccgtaa 13307904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Original strand, 34894964 - 34895244
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||  ||    
T  34894964 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaagt 34895063  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||    
T  34895064 ggcatcaaaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaaca-ccc 34895162  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||||||||||     ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  34895163 cacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgaaaaaatagtacatgtaa 34895244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Original strand, 38643975 - 38644260
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||   ||    
T  38643975 aaggaaaattctatggtgaaatcatgagaatgacttttttggtcaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtctagt 38644074  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  38644075 ggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ctc 38644173  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    || ||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  38644174 cataaagtgtaacactcaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaa 38644260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 10555377 - 10555112
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  || |||| |||| |||||  ||| |||||||||||||  || ||||||||||||| ||    
T  10555377 aagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatc 10555278  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| | |||| || ||||||| ||||||||      
T  10555277 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgcaaca-cctcacaaaacgtaacact-- 10555181  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
     |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  10555180 tgactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaa 10555112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Original strand, 16222860 - 16223145
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||| | |||||||| |  |||||| ||||||||  |    
T  16222860 aaggaaaattctacggtgaaatcatgagaatgacttttctggtgaatttaacactataacataaaaaatatagtgagtagttccccacagtttgtacaat 16222959  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||| |||    
T  16222960 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatccttccttgttttaaacgtaaca-ccc 16223058  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    || ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  16223059 caaaaagtgtaacacttaagagtatcacataatatcatcaactttgtttgcattttaaagattccaatgataaaatagtacatgtaa 16223145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 340 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 1149742 - 1149540
Alignment:
Q  340 cccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttat 439  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  1149742 cccactgtttgtacaatgacatcaaaagttctgtcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcttaccttgt 1149643  T
Q  440 tttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacct 539  Q
    | |||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1149642 tataagcgtaaca-ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacct 1149544  T
Q  540 gtaa 543  Q
    ||||    
T  1149543 gtaa 1149540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Original strand, 33906223 - 33906494
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||          
T  33906223 ggaaaattctatggtgaaattatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactatagtattaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttata------ 33906316  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
          |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||   |||    
T  33906317 ------aagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaagggtaaca-ttcca 33906409  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
     ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  33906410 aaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaa 33906494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 43643788 - 43643503
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  ||| | |||||||||||  |    
T  43643788 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgactattttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactctactgtttgtacaat 43643689  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    | |||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||     
T  43643688 gacatccaaagttcaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaaca-cct 43643590  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| || || || |||||||||||| |||||    
T  43643589 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgtaa 43643503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 337 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 1954103 - 1953895
Alignment:
Q  337 caccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatc-atcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctacc 435  Q
    ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1954103 caccctactatttggacagtggcatcaaaagttcagccctcatagtatctatcaattcatcagattaatatgactacactaaatctaattttatcatacc 1954004  T
Q  436 ttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagt 535  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  1954003 ttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaagttgtcaacgataaaatagt 1953904  T
Q  536 acctgtaaa 544  Q
    |||||||||    
T  1953903 acctgtaaa 1953895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 23854606 - 23854339
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  || |||| |||| |||||  ||||| ||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  23854606 aagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacacccaactgtttgtgcaatgacatcaaaagttcagtc 23854507  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||  || ||||||||||| || || ||| ||||||||| |    
T  23854506 ctcatagtatcatcaactcattagattaacaatactacaattaatctaattttatcttacctagttataagtgtaaca-ccgcataaagtgtaacactta 23854408  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  23854407 agacaatcacataatatcatcaactctgcttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaa 23854339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 341 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7891066 - 7890865
Alignment:
Q  341 ccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttatt 440  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||    
T  7891066 ccaccgtttgtacaatggcatcaaaagttcggtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacactcaatctagttttatcttactttgtt 7890967  T
Q  441 ttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctg 540  Q
     |||| |||||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  7890966 ataagcgtaaca-ccccacaacgtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactctggttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatg 7890868  T
Q  541 taa 543  Q
    |||    
T  7890867 taa 7890865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Original strand, 465857 - 466114
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||  |||| |||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  465857 aagtcattaaaatgacttttgtggtgaagttaacacgataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaaattcagtc 465956  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    | | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||       
T  465957 cccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacac--- 466052  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
          |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  466053 ------tcacat-atatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaataatacctgtaa 466114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Original strand, 40862416 - 40862701
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaag-tgtagtgagtggcaccccactgtttgtacgg 355  Q
    ||||||||||| || || |||||| || ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||||      
T  40862416 aaggaaaattctatagtgaagtcacgaaaataacttttctggtgaagttaacactataatatcaaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaa 40862515  T
Q  356 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccc 455  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | |||||| | |||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||| |    
T  40862516 tggcatcaaaagttcagtc-tcatggtatcatcaatttttcatactaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttctaagtgtaacactc 40862614  T
Q  456 ccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  40862615 c-acaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaa 40862701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 286 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 41911153 - 41910897
Alignment:
Q  286 atgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcacccc-actgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtat 384  Q
    |||| |||| |||||||||  | ||||||  ||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||   || || ||||||||| |||||||  ||||||||    
T  41911153 atgatttttttggtgaagttaatactatatcatcaaaagtgtcgtgagtaacacccccactattataacagtagcatcaaaaattcagtcaacatagtat 41911054  T
Q  385 catcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcac 484  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  41911053 catcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacacttaatactatcac 41910955  T
Q  485 ataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    || |||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  41910954 atgatatcaccaactctgtttgcatgttaaagat-gcaacgataaaatattacctgtaa 41910897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 311 - 531
Target Start/End: Original strand, 43025753 - 43025972
Alignment:
Q  311 tatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagact 410  Q
    ||||||||||||||||| |||| |   |||||||| |||||||  ||| || ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| | ||| |||| |    
T  43025753 tatagtatcaaaagtgttgtgattaataccccactctttgtacaatggtattaaaagttcagttcatataatatcatcaattcatcagactaagaagaat 43025852  T
Q  411 acactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatg 510  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  43025853 acatttaatctaattttatcctaccttattttaactgtaaca-ccccacaaaatgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgattgcatg 43025951  T
Q  511 ttaaagataccaacgataaaa 531  Q
    ||||||||  |||||||||||    
T  43025952 ttaaagatgtcaacgataaaa 43025972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 385 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 4132750 - 4132594
Alignment:
Q  385 catcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcac 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  4132750 catcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgttt-aagtgtaacacccc-acaaagtgtaacacataagactatcac 4132653  T
Q  485 ataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4132652 ataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaa 4132594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 258 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 30654775 - 30654491
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||  || || ||||||| ||| ||| |||| |||||||||  ||||||||  || |||| |||| |||||  |||||||||||||||    ||    
T  30654775 aggaaaattttatggtgaagtcataagagtgatttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgttgaatg 30654676  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| || ||||||| |||||||||      
T  30654675 acatcaaaagttcagccttcatagtatcatcacttcatcaggttaacaagactacacttaatttaattttaccatacattgttttaagcgtaacaccct- 30654577  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  30654576 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatgttaaaaatttcaacgataaaatagtacctgtaa 30654491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 254 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 31934082 - 31933794
Alignment:
Q  254 attaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtac 353  Q
    ||||| |||||||| |  || |||| |||||||||| |||| |||||||||  |||||||  |||||||| | || |||||  ||||||||| ||| |||    
T  31934082 attaaagaaaattctaacgtgaagttatgagaatgatttttttggtgaagttaacactatgatatcaaaaatataatgagtaacaccccactctttatac 31933983  T
Q  354 ggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacac 453  Q
      || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||  ||| |     
T  31933982 aatgacatcaaaagttcagtcattatagtatcatcaattcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcataata- 31933884  T
Q  454 ccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    || |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  31933883 ccgcacaaagtgtaacacttaaaattatcacataatatcatcaagtctgtttgcatgttaaggattccaacaataaaatagtacttgtaa 31933794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 258 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 34952223 - 34952028
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| || || ||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||| |||    
T  34952223 aggaaaattctatagtaaagtcattaaaatgacttttctggtcaagttaacactatatcatcaaaagtgttgtgagtaacagcccactgtttgtacagtg 34952124  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacac 453  Q
     |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34952123 acatcaaaagttcagtccctttagtatcatcaattcatcaaattaataagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacac 34952028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 337 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 39099232 - 39099034
Alignment:
Q  337 caccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctacct 436  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||     
T  39099232 caccccactctttgtacactagcatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcttaccc 39099133  T
Q  437 tattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagta 536  Q
    | ||||||||||||||  |||||||| | | ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  39099132 tgttttaagtgtaaca-tcccacaaagtatcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagta 39099034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 248 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 1150306 - 1150099
Alignment:
Q  248 ttaataattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgt 347  Q
    |||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||||||  || |||||  ||||||| |||| |||||  || ||||||||    
T  1150306 ttaataatta-ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacgctataacatcaaaaatgtaatgagtaacatcccactgt 1150208  T
Q  348 ttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtg 447  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  1150207 ttgtacaacgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcg 1150108  T
Q  448 taacacccc 456  Q
    |||||||||    
T  1150107 taacacccc 1150099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 339 - 538
Target Start/End: Original strand, 44869576 - 44869774
Alignment:
Q  339 ccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaa-ttttatcctacctt 437  Q
    |||||||||||| ||  || ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44869576 ccccactgtttgcacaatgacatcaaaagttcaatcgtcatagtatcatcaatttatcagattaacaataatacacttaatctaatttttatcctacctt 44869675  T
Q  438 attttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtac 537  Q
     ||||||||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44869676 gttttaagtgt--tgtccccacaaagtgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaacgataaaatagtac 44869773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 286 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 8803974 - 8803725
Alignment:
Q  286 atgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatc 385  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  ||| ||||| ||||||   || |||||||||||||| |       ||||    
T  8803974 atgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactccactatttgtagaatgacatcaaaagttcagcc-------tatc 8803882  T
Q  386 atcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcaca 485  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || |||| |||||||||  | ||| ||||||||| || |||||||||    
T  8803881 atcaatttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctaa-aaagtgtaacacttaatactatcaca 8803783  T
Q  486 taatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  8803782 taatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaa 8803725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 342 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 35459819 - 35459619
Alignment:
Q  342 cactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattt 441  Q
    ||||| ||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||     
T  35459819 cactgattgtacaatgacattaaaagttcagtcctcataatatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctactttgtta 35459720  T
Q  442 taagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgt 541  Q
    ||| |||||||  |||||| | | ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||  | || ||||||||||| ||||    
T  35459719 taaatgtaaca-tcccacagattataacacttaagactattacataatatcatcaattctgtttgtatgttaaagatttcgacaataaaatagtatctgt 35459621  T
Q  542 aa 543  Q
    ||    
T  35459620 aa 35459619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 259 - 452
Target Start/End: Original strand, 41362517 - 41362707
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || |||| |||| |||||||||| |||||||||  ||||||  | || |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||  |||     
T  41362517 ggaaaattctatggtgaagttatgaaaatgacttttttggtgaagttaacacta--gcataaaaa-tgtagtgagtaacaccccactatttgtatagtga 41362613  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaaca 452  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  41362614 catcaaaagttcagacctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactaaacttgatataattttatcataccttgttttaagtgtaaca 41362707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 367 - 453
Target Start/End: Original strand, 7998401 - 7998488
Alignment:
Q  367 gttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaa-ttttatcctaccttattttaagtgtaacac 453  Q
    |||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7998401 gttcggtccccataatatcatcaatacatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacac 7998488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 455 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 1149912 - 1149828
Alignment:
Q  455 cccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||| ||||||||| |||||    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1149912 cccacaaagtgtaacacttaagac----acataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacttgtaa 1149828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 464 - 538
Target Start/End: Original strand, 7998481 - 7998555
Alignment:
Q  464 tgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacc 538  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||  || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  7998481 tgtaacacttaatactatcacataatatcaacaactctgtttctatattaaagatgccaacgataaaatagtacc 7998555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 4133199 - 4133077
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||  || |||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||  | || ||||   ||||||||   |||  ||||||||||| ||||    
T  4133199 ggaaaattttatggtcaagtcatcagaatgacttttttggtgaagttaacacta--gcataaaaaagatagtgagtaatacctgactgtttgtacagtgg 4133102  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagta 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4133101 catcaaaagttcagtcctcatagta 4133077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 488 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 34952020 - 34951965
Alignment:
Q  488 atatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  34952020 atatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaa 34951965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 448
Target Start/End: Original strand, 33197947 - 33198029
Alignment:
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgt 448  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||        ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33197947 gcatcaaaagttcagtctccataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacac--------attttatcctaccttgttttaagtgt 33198029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 487 - 543
Target Start/End: Original strand, 35859160 - 35859216
Alignment:
Q  487 aatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  35859160 aatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaa 35859216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24823466 - 24823395
Alignment:
Q  256 taaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgt 327  Q
    |||||||||| | || || |||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  24823466 taaggaaaatactatggtaaagttatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataatatcaaaagtgt 24823395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 421 - 543
Target Start/End: Original strand, 18259244 - 18259361
Alignment:
Q  421 taattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagatac 520  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||    |||||  |||||||||| |    |||||||||||| ||      
T  18259244 taattttatcataccttattttaagtgtaaca-tcccacaaagtgtaacacctaag----tcacaagatatcagcaatttaatttgcatgttaaaaatgt 18259338  T
Q  521 caacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  18259339 caacgataaaatagtacatgtaa 18259361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 495 - 543
Target Start/End: Original strand, 12587816 - 12587864
Alignment:
Q  495 caactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12587816 caactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 12587864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 299
Target Start/End: Original strand, 7998361 - 7998402
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggt 299  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  7998361 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggt 7998402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 498
Target Start/End: Original strand, 12585297 - 12585353
Alignment:
Q  441 ttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaac 498  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  12585297 ttaagtgtaacacccc-acaaaatctaacacttaatactatcacataacatcatcaac 12585353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 261 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6446752 - 6446708
Alignment:
Q  261 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtc 305  Q
    ||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6446752 aaaattctatggtgaagtcatgataatgacttttctggtgaagtc 6446708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 323
Target Start/End: Original strand, 15009241 - 15009305
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaa 323  Q
    ||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||    
T  15009241 ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaa 15009305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 257 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 39099302 - 39099262
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctg 297  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  39099302 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctg 39099262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Original strand, 16415639 - 16415925
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccac-tgtttgtacgg 355  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||| |    
T  16415639 aaggaaaattctaaggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacaccctaaatgtttgtacag 16415738  T
Q  356 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccc 455  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  16415739 tggcatcaaaagttcagccatcatagtatcatcaattcattagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaata-cc 16415837  T
Q  456 ccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16415838 ccacatattgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaa 16415925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Original strand, 38823210 - 38823493
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| ||| | ||||  ||||||||| ||||||| |||     
T  38823210 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggttaagttaacactatagcatcaaaattgttgcgagtaacaccccactatttgtacagtgt 38823309  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  38823310 catcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaagtgtaaca-cccaa 38823408  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  38823409 caaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttagagatgccaacgataaaataatacctgtaa 38823493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 258 - 543
Target Start/End: Original strand, 2959743 - 2960027
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||| |||||| |||  || |||||||||||||| |||    
T  2959743 aggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtaagtaacatcccactgtttgtacagtg 2959842  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||    
T  2959843 acatcaaaagttcagtcctcatagtgtcatcaattcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaaca-tccc 2959941  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  2959942 acaaattgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaa 2960027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Original strand, 47279201 - 47279468
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  47279201 aagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacattatactatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcgaaagttcagtc 47279300  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||| ||||||||| |    
T  47279301 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaattgtaaca-tcccataaagtgtaacactta 47279399  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  47279400 agactatcacatgatatcaacaactatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtatctgtaa 47279468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Original strand, 15168083 - 15168375
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgt----- 351  Q
    ||||||||||| || || |||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||         
T  15168083 aaggaaaattctatcgtgaagtgatgagaatgctttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacgtt 15168182  T
Q  352 --acggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgta 449  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15168183 gtacggtggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcagttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgta 15168282  T
Q  450 acacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||| || || ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  15168283 aca-cctcagaaagtgtaacacttaaggctatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaa 15168375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Original strand, 4330291 - 4330560
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaag-tcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcacccc-actgtttgtacggtggcatcaaaagttcag 372  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4330291 aagttatgagaatgacttttctgatgaagataaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacacccccaatgtttgtacagtgggatcaaaagttcag 4330390  T
Q  373 tcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacact 472  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4330391 tcatcatagtatcatcaatttatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccccacaaaatgtaacact 4330489  T
Q  473 gaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  4330490 taagactatcacataatatcatcaactctttttgcatgttaaagatgtcaaagataaaatagtacttgtaa 4330560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 261 - 543
Target Start/End: Original strand, 15752027 - 15752308
Alignment:
Q  261 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 360  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  || |||| | ||||||||  |||| ||||||||||||  |||||    
T  15752027 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatatagtgagtaacacctcactgtttgtacaatggca 15752126  T
Q  361 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccaca 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  15752127 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaaca-ccccata 15752225  T
Q  461 aaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    || ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||| ||| |||||    
T  15752226 aagtgtaacacttaagagtatcacataatatcattaactctgtttgcatgttaaaaattccaacgacaaaataatacatgtaa 15752308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 261 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 33725778 - 33725497
Alignment:
Q  261 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 360  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| |  |||||||    
T  33725778 aaaattctatggtaaagtcaagagaatgacttttctagtgaagtcaacgctatatcatcaaaagtgtattgagtagcagcccactatttctttggtggca 33725679  T
Q  361 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccaca 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  33725678 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca-ccccaga 33725580  T
Q  461 aaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    || ||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  33725579 aagtgtaacatttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaa 33725497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 258 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 10182189 - 10181909
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| || || ||||||||| |||||||||| |||||||||  | ||| ||  || |||| | ||||| ||  ||| ||||||||||||| |||    
T  10182189 aggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaaaactgtaacataaaaaatatagtgcgtaacacgccactgtttgtacagtg 10182090  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10182089 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-cccc 10181991  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacct 539  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||||||||||    
T  10181990 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgacaacaatacaatagtacct 10181909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Original strand, 14758053 - 14758311
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14758053 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcacacaactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 14758152  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    | |||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||         | |    
T  14758153 cccatagtttcatcaattcattagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccccagaaa---------tta 14758242  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  14758243 agactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaa 14758311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 27533144 - 27532878
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| | ||| ||  || |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  27533144 aagttatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtattgtgggtaacaacccactctttgtacagtggcatcaaaagttcaatc 27533045  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| |    
T  27533044 cccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatc-aattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-cctcacaaagtgtaacactca 27532947  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27532946 agactatcacatgatatcagcaattctgtttgcaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaa 27532878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 278 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 9903215 - 9902951
Alignment:
Q  278 tcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctc 377  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |    
T  9903215 tcatgaaaatgacttttttgatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacaccccgctgtttgtacagtgacatcaaaagttcaatccac 9903116  T
Q  378 atagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaaga 477  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9903115 atactatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttacattgtttcaagtgtaaca-ccccacaaaatgtaacacttaaga 9903017  T
Q  478 ctatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  9903016 ctatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtaccagtaa 9902951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 27267361 - 27267097
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||  | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27267361 aagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacacta--gcataaaaaatgtagtgagtgacaccccactgtttgtacagtggcattaaaagttcagtc 27267264  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || |||||| |    
T  27267263 tccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttaat-ctaccttgttttgagtgtaaca-ccccacaaagtgcaacactta 27267166  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  27267165 agactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaa 27267097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 257 - 544
Target Start/End: Original strand, 15382927 - 15383213
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| || || |||| || | |||||||||| ||||||| |  ||||||||  ||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||  |    
T  15382927 aaggaaaattctatggtgaagttataaaaatgacttttttggtgaaattaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacatcccaccgtttgtacaat 15383026  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||    
T  15383027 gtcatcaaaagttcagtcatcgtagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaaca-ccc 15383125  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaaa 544  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15383126 cacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtatgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaa 15383213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 275 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 7079238 - 7078967
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccact-----------gtttgtacggtggcatca 363  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||           ||||||||  || |||||    
T  7079238 aagtcatgataatgacttttttggtgaagttaacactataatatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactaacacctcactgtttgtacaatgacatca 7079139  T
Q  364 aaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaa 463  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  7079138 aaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccccacaaag 7079040  T
Q  464 tgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagta 536  Q
    | ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7079039 tataagacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagta 7078967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 337 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 27227587 - 27227382
Alignment:
Q  337 caccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctacct 436  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27227587 cacctcactgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctacct 27227488  T
Q  437 tattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagta 536  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27227487 tgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgcaacacttaagactatcacatgatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagta 27227389  T
Q  537 cctgtaa 543  Q
     ||||||    
T  27227388 tctgtaa 27227382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 291 - 543
Target Start/End: Original strand, 40884841 - 40885092
Alignment:
Q  291 ttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 390  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  40884841 ttttctggtgaagtcaacaccataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtccctatagtatcttcaa 40884940  T
Q  391 ttcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataata 490  Q
    ||||||| |||||||||| | |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||  || | ||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  40884941 ttcatcagattaacaagattgcacttaatctagttttatcctatcttgttttaagtgtaacattccga-aaagtgtaacacttaagactatcgcataata 40885039  T
Q  491 tcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||    
T  40885040 tcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccgatgataaaatagtacatgtaa 40885092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 257 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 34012559 - 34012286
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| |||||| ||| || ||||||  ||||||||  ||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||  ||    
T  34012559 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacgtttatgatgaagttaacactataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaagt 34012460  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||    
T  34012459 ggcatcaaaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaaca-ccc 34012361  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagta 536  Q
    |||||||||||||||     ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34012360 cacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagta 34012286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 31621717 - 31621446
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  31621717 aagtcatgagaatgacttttctagtgaagtcaacactataacatcaaaggtgtattgagtagcaccccgctatttgtacggtggcatcaaaaattcagtc 31621618  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    || ||| ||||| |    
T  31621617 cccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgcaatacccc--agaagtgtgacactta 31621520  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcat-----gttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||     ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  31621519 agactatcgcataatatcaacaactatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaa 31621446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 296 - 533
Target Start/End: Original strand, 32216088 - 32216324
Alignment:
Q  296 tggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcat 395  Q
    |||||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32216088 tggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaatggcgtcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcaattcat 32216187  T
Q  396 caaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagc 495  Q
     | |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  32216188 tagattaacaaaactaaacttaatcaaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcata 32216286  T
Q  496 aactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaata 533  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32216287 aactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaata 32216324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Original strand, 3309144 - 3309432
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||||    
T  3309144 ggaaaattctatggtaaagtcatgagaatgacttttctggtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccc-actgtttgtacagtgg 3309242  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaa-ttttatcctaccttattttaagtgtaacacccc- 456  Q
     |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||||| |     
T  3309243 tatcaaaagttcaatcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaaatgtaacacctca 3309342  T
Q  457 ---cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
       ||| || ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3309343 ctacactaagtgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacccgtaa 3309432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 255 - 543
Target Start/End: Original strand, 8222123 - 8222407
Alignment:
Q  255 ttaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacg 354  Q
    ||||||||||||| |  || ||||||| | |||||| ||| | |||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  |||| ||| |||   ||     
T  8222123 ttaaggaaaattctacggtgaagtcataaaaatgacctttttagtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccacaccgtt---aca 8222219  T
Q  355 gtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacc 454  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||| |    
T  8222220 atggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaaca-c 8222318  T
Q  455 cccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  8222319 cccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaa 8222407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 261 - 543
Target Start/End: Original strand, 28769651 - 28769932
Alignment:
Q  261 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 360  Q
    ||||||| || || ||||||| | ||| |||||| | |||||||  |||||||   ||||||| |||| |||||  ||||| || ||||||||  |||||    
T  28769651 aaaattctatggtgaagtcataaaaataactttttttgtgaagttaacactatgacatcaaaaatgtaatgagtaacaccc-accgtttgtacaatggca 28769749  T
Q  361 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccaca 460  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||  ||||||||||||||    
T  28769750 tcaaaggttcggtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataaacgtaacacccccaca 28769849  T
Q  461 aaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    || |||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28769850 aagtgtaacgcttaagactatcacataatatcatcacctctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaa 28769932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 258 - 531
Target Start/End: Original strand, 18422646 - 18422918
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| || || ||||||| | |||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||| | ||  ||||  |||||||| ||||||||  ||    
T  18422646 aggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatataacgagtaacaccccaccgtttgtacaatg 18422745  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||    
T  18422746 acatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttatatgcgtaaca-cccc 18422844  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaa 531  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18422845 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcacctccgtttgcatgttaaagattccaacgataaaa 18422918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 257 - 542
Target Start/End: Original strand, 32267028 - 32267312
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||  || || ||||||| |||||||||||| | |||||||  ||| ||||  ||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||  |    
T  32267028 aaggaaaattttatggtgaagtcataagaatgactttttttgtgaagttaacaatataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaat 32267127  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||| | |    
T  32267128 gacatcaaaagttcactcctcatattatcatcaacccatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaaca-ctc 32267226  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgta 542  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  32267227 cacaaagtgtaacactcaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaatattccaactataaaatagtacctgta 32267312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 275 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 47682657 - 47682390
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcac-cccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagt 373  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||  | || |||| ||| ||||||  ||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||| |    
T  47682657 aagtcatgagagtgacttttttggtgaagttaacacta--gcataaaaaatgttgtgagtaacactcccactgcttgtacagtggtatcaaaagttcatt 47682560  T
Q  374 cctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactg 473  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||| || |||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||     
T  47682559 cctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacatttaaactaattttattctgccttgttttaagtgtaaca-cctcacaaagtgtaacactt 47682461  T
Q  474 aagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaaa 544  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  47682460 aagactatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaaa 47682390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 261 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 238690 - 238410
Alignment:
Q  261 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 360  Q
    ||||||| || || |||||| || ||| |||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||| ||||||  || || |||||||||||  || ||    
T  238690 aaaattctatagtgaagtcacgaaaataacttttttggtgaagttaacactatagtattaaaaatgttgtgagtaacatcc-actgtttgtacaatgaca 238592  T
Q  361 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccaca 460  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  238591 tcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattaatcagactaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaaca-ccccaca 238493  T
Q  461 aaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  238492 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataatatctgtaa 238410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 258 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 19899950 - 19899666
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| || || ||||||| | ||||| |||| |||||||||  ||||||||  ||||||| ||||  ||||  |||| |||||||||||   ||    
T  19899950 aggaaaattctatggtgaagtcataataatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacacctcactgtttgtagaatg 19899851  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| || || |||| |||||| |||     
T  19899850 gcatcaaaagttcaaccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcatacattgttctaagcgtaaca-ccct 19899752  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19899751 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcaccaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaa 19899666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 257 - 542
Target Start/End: Original strand, 48620631 - 48620906
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| ||  | |||| || | |||||||||||| |||||||  ||| ||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  48620631 aaggaaaattctatgttgaagttattaaaatgacttttcttgtgaagttaacaatataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagt 48620730  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  48620731 gacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaaca-ccc 48620829  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgta 542  Q
    |||||| ||||||||         |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  48620830 cacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgaataaatagtacctgta 48620906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Original strand, 37451298 - 37451564
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| ||||  ||||||||  ||||||| |||| | |||  ||||| || ||||||||  || ||||||||||||||||    
T  37451298 aagtcataaaaatgacttttttggtaaagttaacactataacatcaaaaatgtaataagtaacaccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtc 37451397  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| | | ||| ||||||||| |    
T  37451398 ctc-tagtatcatcaatttatcatattaacaagactacacttaatctaattttatctgaccttgttataagtgtaacacctcaa-aaagtgtaacactta 37451495  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37451496 agactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaa 37451564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 341 - 543
Target Start/End: Original strand, 25160710 - 25160911
Alignment:
Q  341 ccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttatt 440  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  25160710 ccaccgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcattagattaataagactacacttaatctcattttatcctaccttgtt 25160809  T
Q  441 ttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctg 540  Q
     ||||||||||| ||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  25160810 ataagtgtaaca-ccccacaaagtataacacttaaaactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatg 25160908  T
Q  541 taa 543  Q
    |||    
T  25160909 taa 25160911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 259 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 30327132 - 30326859
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || ||||||| | |||||||||| | ||||| |  ||||||||  ||||||| |||| |||||   |||| || ||||||||  | |    
T  30327132 ggaaaattctatagtgaagtcataaaaatgactttttttgtgaatttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaatacccaaccgtttgtacaatag 30327033  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||| |||||    
T  30327032 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaaca-cccca 30326934  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaata 533  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30326933 caaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaata 30326859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Original strand, 42721035 - 42721315
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || ||||||||| ||||| |||| |||||||||   | |||||  || |||| | ||||||||  ||||||||||||||||| ||      
T  42721035 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgatttttttggtgaagttagccctatatcataaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagtaa 42721134  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  42721135 catcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaata-cccca 42721233  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| | ||||||| |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||| ||| |||||    
T  42721234 caaagtataacacttaagattatcacgtaatatcatcaactttgtttgcatgttaaaga---caacgataaaatattacatgtaa 42721315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 278 - 543
Target Start/End: Original strand, 10922742 - 10923006
Alignment:
Q  278 tcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctc 377  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||  || |||| |||| |||||   ||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||    
T  10922742 tcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaagaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcaatcctc 10922841  T
Q  378 atagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaaga 477  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || |||| |||||| || |||||| ||||||||| ||||    
T  10922842 atagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatcttattttatcataccttgttataagggtaaca-cctcacaaagtgtaacacttaaga 10922940  T
Q  478 ctatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||||    
T  10922941 ctgtcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtatctgtaa 10923006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 257 - 544
Target Start/End: Original strand, 39393377 - 39393664
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||   ||  || ||||||||| ||    
T  39393377 aaggaaaattctacggtgaagttatgagaatgacttttctaatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaatacttcattgtttgtacagt 39393476  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaa-ttttatcctaccttattttaagtgtaacaccc 455  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  39393477 ggcatcaaaagtttaatccccatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacacttcatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaaca-tc 39393575  T
Q  456 ccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaaa 544  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  39393576 ctacaaagtgtaacacttaagactatcatatgatattagcaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggtaaa 39393664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 288 - 543
Target Start/End: Original strand, 51128884 - 51129138
Alignment:
Q  288 gacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcat 387  Q
    ||||||| | |||||||  ||||||||  || |||| |||| |||||  ||| |||| ||||||||  || |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  51128884 gacttttttagtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcattatagtatcat 51128983  T
Q  388 caattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacata 487  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||    
T  51128984 caattcatcatattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttataagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacaattaaaactatcacata 51129082  T
Q  488 atatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  51129083 atatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaa 51129138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 258 - 543
Target Start/End: Original strand, 30254419 - 30254702
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| || || |||| || |||||||||||| || ||||||  ||| ||||  ||||||| |||| |||||   || | |||||||||||  ||    
T  30254419 aggaaaattctatggtgaagttataagaatgacttttttgttgaagttaacaatataacatcaaaaatgtaatgagtaatacac-actgtttgtacaatg 30254517  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||     
T  30254518 acatcaaaagttcagtcctcaaagtatcatcaattcatcagattaacaagactagacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataaca-ccct 30254616  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    | ||| ||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  30254617 ataaagtgtaacacttaagactgtcacataataacatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaa 30254702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Original strand, 1547281 - 1547550
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || |||| ||| ||||||  ||| ||||||||||| | ||    
T  1547281 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataacataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgcagt 1547380  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||        |||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  1547381 ggcatcaaaagttcagttctcatagta--------tcatcagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaaca-ccc 1547471  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1547472 cacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaactc--------tgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaa 1547550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 257 - 539
Target Start/End: Original strand, 3534926 - 3535198
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| ||||| | |||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||  ||||||||| | ||    
T  3534926 aaggaaaattctattatgaagtcattagaattaattttctagtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccttactgtttgtgcagt 3535025  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    | ||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  3535026 gacatcaaaagttcagtccccttaatattatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctgccttgttttaagtgtaaca-ccc 3535124  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacct 539  Q
    |||||| ||||||||         | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3535125 cacaaagtgtaacac---------ttacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacct 3535198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 28564945 - 28564680
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    |||| |||| ||||| |||| || ||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  ||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  28564945 aagttatgaaaatgatttttttgatgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccttactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtc 28564846  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| || ||||  ||||| ||||  ||| ||||||||| |    
T  28564845 ctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcatgccttgttataagcataaca-ccccgtaaagtgtaacactta 28564747  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
      ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  28564746 --actatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaataatacatgtaa 28564680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Original strand, 23999359 - 23999626
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||| |  || |||| | ||  ||||  ||||||||| ||||||   || |||||||||||||| |    
T  23999359 aagtcataagaatgatttttttggtgaagttaacactacaacataaaaaatataacgagtaacaccccactatttgtagaatgacatcaaaagttcagcc 23999458  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || ||||  ||||||||  ||||| ||||||||| |    
T  23999459 ctcatagtattatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccct-acaaagtgtaacactta 23999557  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23999558 agactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaa 23999626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 257 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 11742532 - 11742338
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||  || || |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || |||  ||||||||||||||||| ||    
T  11742532 aaggaaaattttatcgtgaagttatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatattatcaaaagtgttgtaagtaacaccccactgtttgtacagt 11742433  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaaca 452  Q
    | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  11742432 gacatcaaaagttcagtcc-cataatatcatcaattcatcggattaacaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaaca 11742338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 543
Target Start/End: Original strand, 41926161 - 41926436
Alignment:
Q  261 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 360  Q
    ||||||| || || |||| |||| ||||| |||| || ||||||  | ||||||  ||||||| | ||||||||   | |||||||||||||| ||||||    
T  41926161 aaaattctatggtgaagttatgaaaatgatttttttgatgaagttaatactataacatcaaaaatatagtgagtaatatcccactgtttgtacagtggca 41926260  T
Q  361 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccaca 460  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||    
T  41926261 tcacaagttcagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaaca-ctccaca 41926359  T
Q  461 aaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    || |||||||||      ||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  41926360 aagtgtaacact------tattaaataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacttgtaa 41926436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 298 - 543
Target Start/End: Original strand, 46931446 - 46931688
Alignment:
Q  298 gtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatca 397  Q
    |||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||   |||||||||||||||    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  46931446 gtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaataccccactgtttgtagaacggcatcaaaaattcagccctcataatatcatcaattcatca 46931545  T
Q  398 aattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaa 497  Q
      |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||   || |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  46931546 ggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttc--agcgtaacaccct-acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaa 46931642  T
Q  498 ctctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  46931643 ctctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaa 46931688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 327 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 27564017 - 27563809
Alignment:
Q  327 tagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattt 426  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27564017 tagtgagtaacactccactgtttgtatagtgacatcaaaagttcagttccgataatattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattt 27563918  T
Q  427 tatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacga 526  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  27563917 tatcctaccttgttttaagtataata-ccccacaaagaggaacacttaagactatcatataatttcatcaactctgtttgcatgttaaagatgcaaacga 27563819  T
Q  527 taaaatagta 536  Q
    ||||||||||    
T  27563818 taaaatagta 27563809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 359 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 27763391 - 27763208
Alignment:
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  || |||| |||||| ||| |    
T  27763391 catcaaaagtccagccctcatagtatcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatctaattttatcatacctagttctaagcgtaaca-cccta 27763293  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27763292 caaagtgtaatacttaagactatcacataatataatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaa 27763208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 359 - 533
Target Start/End: Original strand, 22170807 - 22170980
Alignment:
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| |    
T  22170807 catcaaaagttcagtctacataatatcatcaattcattagattaataacactacacttaatctaatttcatcctaccttgtttcaaatgtaacacccc-a 22170905  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaata 533  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22170906 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaata 22170980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 37619078 - 37618798
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtgg--caccccactgtttgtacg 354  Q
    ||||||||||| || || |||| || |||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||| | || |||||    ||||||||||||||||      
T  37619078 aaggaaaattctatggtgaagttataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatttaatgagtaaaacaccccactgtttgtaaa 37618979  T
Q  355 gtggcatcaaaagttcagtcctcatagtat--catcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaaca 452  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||    
T  37618978 atgacatcaaaagttcagttctcatagtatatcatcaattcatcagattaacaatactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataaca 37618879  T
Q  453 cccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
      |||| ||| ||||||||         ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  37618878 -tcccataaagtgtaacac---------tcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaa 37618798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 344 - 533
Target Start/End: Original strand, 38759610 - 38759802
Alignment:
Q  344 ctgtttgtacggtggcatcaaaagttcag----tcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttat 439  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||    || || || |||||||||||||||| ||||| || |||||| | ||| |||||||||| || |||||    
T  38759610 ctgtttgtacagtgacatcaaaagttcagccagtcttcgtaatatcatcaattcatcatattaataaaactacatttaatttaattttatcatatcttat 38759709  T
Q  440 tttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaata 533  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||| |  |||| ||||||||    
T  38759710 tttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacacttgagactatcagataatatcaccaactatgtttgcatgttaaaggtgtcaactataaaata 38759802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 259 - 407
Target Start/End: Original strand, 21289661 - 21289816
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaa-------aagtgtagtgagtggcaccccactgtttgt 351  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || ||       || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  21289661 ggaaaaatctattgtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatatcataaataataaaaaatgtagtgagtaacaccccactgtttgt 21289760  T
Q  352 acggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaag 407  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21289761 acagtggcatcaaaagttcagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaag 21289816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 456 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 1359919 - 1359832
Alignment:
Q  456 ccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1359919 ccacaaagtgtaacacttaagattatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaa 1359832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 456 - 543
Target Start/End: Original strand, 48353735 - 48353821
Alignment:
Q  456 ccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  48353735 ccacaaagtgtaacact-aagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaa 48353821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 474 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 11742334 - 11742265
Alignment:
Q  474 aagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  11742334 aagactatcacatgatatcagcaactctctttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaa 11742265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4150537 - 4150489
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtc 305  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4150537 aaggaaaattctatggtgaagtcatgataatgacttttctggtgaagtc 4150489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 478 - 533
Target Start/End: Original strand, 21289817 - 21289869
Alignment:
Q  478 ctatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaata 533  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21289817 ctatcacataatatca---actctgtttgcatattaaagatgccaacgataaaata 21289869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 304
Target Start/End: Original strand, 43579242 - 43579287
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 304  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43579242 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagt 43579287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 253 - 543
Target Start/End: Original strand, 36641980 - 36642271
Alignment:
Q  253 aattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgta 352  Q
    ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||    
T  36641980 aattaagaaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaaattaatactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacacctcactgtttgta 36642079  T
Q  353 cggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaa--ttttatcctaccttattttaagtgtaa 450  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  36642080 cagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttttatcctaccttgttttaagtgtaa 36642179  T
Q  451 cacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    || ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  36642180 ca-ccctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgataccagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccggtaa 36642271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 255 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 29242345 - 29242058
Alignment:
Q  255 ttaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacg 354  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| ||||  |||| |||||||||  | ||||||  || |||| | ||||| ||  |||||||||||||||||     
T  29242345 ttaaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatggtttttttggtgaagttaaaactataacataaaaaatatagtgcgtaacaccccactgtttgtaca 29242246  T
Q  355 gtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacc 454  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  29242245 gtggtatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-c 29242147  T
Q  455 cccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  29242146 cccacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgtcaacgatacaatagtacctgtaa 29242058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 258 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 4264281 - 4264002
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| || || ||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||| |||    
T  4264281 aggaaaattctatggtgaagtcatcataatgacttttctggtaaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgtttgtacagtg 4264182  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
     ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  4264181 acatcaaaagttcagtctccatagtattatcaattcatcatattaagaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtttaaca-cccc 4264083  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatc-acataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtac 537  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4264082 acaaagtgtaacacttaagactatcaacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtac 4264002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 258 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 17071941 - 17071656
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||  | ||||| |||||| |||  || | || | |||||||  ||    
T  17071941 aggaaaattctatggtgaagtcatgcgaatgacttttttggtgaagttaacactataacaacaaaaatgtagtaagtaacatctcattatttgtacaatg 17071842  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
     |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17071841 acatcaaaagttcggtattcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaaca-cccc 17071743  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaaa 544  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17071742 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaa 17071656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 256 - 533
Target Start/End: Original strand, 4166919 - 4167195
Alignment:
Q  256 taaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacgg 355  Q
    |||||||||||| || || |||||| || ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | | ||||||  |||||||||||||||||      
T  4166919 taaggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaacattatagtatcaaaaatattgtgagtaacaccccactgtttgtacaa 4167018  T
Q  356 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccc 455  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4167019 tggcatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-cc 4167117  T
Q  456 ccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaata 533  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  4167118 ccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaata 4167195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 258 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 19424832 - 19424572
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||  || || |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||  |||    
T  19424832 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaatggcttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttatatagtg 19424733  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  19424732 gcatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaaca-cccc 19424634  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagata 519  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19424633 acaaagtgtaacatttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagata 19424572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 253 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 33551195 - 33550913
Alignment:
Q  253 aattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgta 352  Q
    ||||| ||||||||| |  || |||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33551195 aattatggaaaattctacggtgaagtcatgagaatgacttttttagtgaagttaacactataacatcaaaaatgtagtgagtaacaccccactgtttgta 33551096  T
Q  353 cggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaaca 452  Q
    |  || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  33551095 caatgacatcaaaagttcggtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctacgttgttttaagcgtaaca 33550996  T
Q  453 cccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtac 537  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33550995 -ccccacaaagtgtaacacttaagacta-cgtataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtac 33550913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 257 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 2325575 - 2325297
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||| |||||||  ||| ||||  |||| || |||| |||||  ||||||| |||||||||  |    
T  2325575 aaggaaaattctatggtgaagttatgtgaatgacttttctcgtgaagttaacaatataacatcataaatgtattgagtaacaccccattgtttgtacact 2325476  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2325475 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa--------attaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacacccc 2325384  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaaa 544  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2325383 -acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaatagtacctgtaaa 2325297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 31570939 - 31570654
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| || || |||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||  || |||||||| || |||  ||||||||| ||| ||  ||    
T  31570939 aaggaaaattctatggtgaagttatgagaataacttttctggtgaaattaacactataacattaaaagtgttgtaagtaacaccccactatttttatagt 31570840  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||    
T  31570839 gacatcaaaagttcagtccacatagtatcatgaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaaca-ccc 31570741  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  31570740 cacaaaatgtaacacttaagactgtcacatgatatcaacaactctgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaa 31570654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Original strand, 4763644 - 4763914
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagt---cgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttca 371  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||   | ||||||||  | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4763644 aagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacaacactatatcaacaaaactgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttca 4763743  T
Q  372 gtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacac 471  Q
    || | |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  4763744 gttcccatagtataatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttattctaccttgtttcaagtgtagca-ccccacaaagtgtaacac 4763842  T
Q  472 tgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4763843 ttaagactatcacataatatcatcaattctttttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacctgtaa 4763914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 258 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 17054300 - 17054015
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||||| |||||| |||  || | || |||||||||  ||    
T  17054300 aggaaaattctatggtgaagtcatgcgaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtagtaagtaacatctcattgtttgtacaatg 17054201  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
     |||||||||| | ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17054200 acatcaaaagtncggtattcataatatcatcaattcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaaca-cccc 17054102  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaaa 544  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  17054101 acaaagtgtaacacttaanactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaaggttccaacgataaaatagtacctgtaaa 17054015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 285 - 543
Target Start/End: Original strand, 3176965 - 3177222
Alignment:
Q  285 aatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtat 384  Q
    ||||||||||||| ||||||  | |||||| |||||||| |||  |||||  ||| | |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3176965 aatgacttttctgatgaagttaatactataatatcaaaaatgttttgagtaacacgcaactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtat 3177064  T
Q  385 catcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcac 484  Q
    ||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3177065 catcaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacacttaagactatcac 3177163  T
Q  485 ataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||    
T  3177164 ataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaactataaaatagtacatgtaa 3177222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Original strand, 44913662 - 44913947
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccact-gtttgtacggtg 357  Q
    ||||||||| || || |||||| || |||||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||  |||| |||| |||||||   ||    
T  44913662 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttatg-tgaagttaacactgtagtatcaaaaatgttgtgagtaacacctcacttgtttgtaaaatg 44913760  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctc-atagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
     ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  44913761 acataaaaagttcaatcccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaacacccc 44913860  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  44913861 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaa 44913947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 261 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 41464051 - 41463779
Alignment:
Q  261 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 360  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||||| ||| |||||||||  | ||||||  ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||    
T  41464051 aaaattctatggtgaagtcgtgagaatgacatttttggtgaagttaatactataaaatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtacagtggca 41463952  T
Q  361 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccaca 460  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| |||||||||| ||| || |||||| ||||||| || ||||    
T  41463951 tcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacttttaatataattttatcatactttgttttaattgtaaca-cctcaca 41463853  T
Q  461 aaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatag 534  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41463852 aaatgtaacatttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatag 41463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 275 - 536
Target Start/End: Original strand, 26357593 - 26357853
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  26357593 aagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacatcccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtt 26357692  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    || ||||  | |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| |    
T  26357693 cttatagagttatcaattcatcatattaacaagatcacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaaca-tcccacaaattgtaacactta 26357791  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagta 536  Q
    | ||||||||||||||| | ||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26357792 aaactatcacataatattatcaaatgtgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagta 26357853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 359 - 543
Target Start/End: Original strand, 41960940 - 41961123
Alignment:
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  41960940 catcaaaagttcagtccacatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaaca-cccca 41961038  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  41961039 caaagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaaatcggtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacctgtaa 41961123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Original strand, 44285965 - 44286232
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| | |||    | | |||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  44285965 aagtcatgcgaatgatttttctgatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagcaatatctcactgtttgtatagtggcatcaaaagtttagtc 44286064  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  44286065 cacatagtatcataaattcatcagattaacaataatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacactta 44286163  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||    
T  44286164 agactatcacatgatatcaacaactttgtttgcatgttaaatatgctaacgataaaatagtatctgtaa 44286232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 261 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 33660569 - 33660297
Alignment:
Q  261 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 360  Q
    ||||||| || || ||||||| | |||||||||||| || ||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  33660569 aaaattctatggtgaagtcattaaaatgacttttctagttaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccaactgtttgtacagtggca 33660470  T
Q  361 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccaca 460  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33660469 tcaaaagttcagtcctcttagtatcatcaattcattagattaacaggaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccccaca 33660371  T
Q  461 aaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    || ||||||||          ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  33660370 aagtgtaacac---------ccacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaa 33660297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 259 - 536
Target Start/End: Original strand, 4478368 - 4478641
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcat-gagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    ||||||||| || || ||||||| || |||||  ||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||||||| |||    
T  4478368 ggaaaattctatagtgaagtcatagaaaatgatatttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccattgtttgtacagtg 4478467  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaa-ttttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||          
T  4478468 gcatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaa------ 4478561  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagta 536  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4478562 cacaaagtgtaacacttaagtctatcacatgatatcaccaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagta 4478641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 259 - 537
Target Start/End: Original strand, 19313852 - 19314121
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||  ||||  ||| ||| ||| |||     
T  19313852 ggaaaattctatggtgaagtcattagaatgacttttctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccttactatttatacagtga 19313951  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19313952 catcaaaagttcagtcct-atagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatcgaattttaccctaccttgttttaagtgtaaca-cccca 19314049  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtac 537  Q
    |||| ||||||       |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  19314050 caaagtgtaac-------actatcacatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagatgtcagcgataaaatagtac 19314121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 260 - 543
Target Start/End: Original strand, 13711465 - 13711742
Alignment:
Q  260 gaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggc 359  Q
    |||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| ||| |    
T  13711465 gaaaattctatggtgaagtcatcagaatgacttttctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacagtttgtacagtgac 13711564  T
Q  360 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccac 459  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||     | | |||||||||||||| |||||     
T  13711565 atcaaaagtttagtccacatggtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttat-----catgttttaagtgtaaca-ccccat 13711658  T
Q  460 aaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||| | ||| | | |||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  13711659 aaagtataatagttaagactatgacatgatatcagcaactctgtatgcatgttaaagatgccagcgataaaatagtacctgtaa 13711742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 291 - 533
Target Start/End: Original strand, 37905740 - 37905983
Alignment:
Q  291 ttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 390  Q
    |||| |||||||||  ||||||||  || |||| ||||  ||||  |||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37905740 ttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaacgagtaacaccccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 37905839  T
Q  391 ttcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaaca-cccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataat 489  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||    
T  37905840 ttcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccccacaaagtgtaacacttaaaactatcgcataat 37905939  T
Q  490 atcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaata 533  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  37905940 atcattaactctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaata 37905983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Original strand, 41465509 - 41465784
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |        ||| |||    
T  41465509 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaggtgtagtgagtagcacccta--------acgctgg 41465600  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
     ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||    
T  41465601 tatcaaaagttcagtccctataatatcatcaattcattagattcacaagactgaacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaaca-cctca 41465699  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
     ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  41465700 gaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaa 41465784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 291 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 33709403 - 33709151
Alignment:
Q  291 ttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 390  Q
    |||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||| | ||||  ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33709403 ttttatggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgcgagtaacactccactgttagtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaa 33709304  T
Q  391 ttcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataata 490  Q
     |  ||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||| ||| |||    
T  33709303 atattcagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccctacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgata 33709205  T
Q  491 tcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaaa 544  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  33709204 tcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacttgtaaa 33709151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 296 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 43648411 - 43648165
Alignment:
Q  296 tggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcat 395  Q
    |||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||   || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  43648411 tggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcactgtttgtataatgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaactcat 43648312  T
Q  396 caaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagc 495  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  43648311 cagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagtgtaaca-ccacacaaagtataacacttaagactatcacataatatcatc 43648213  T
Q  496 aactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| || || ||||||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  43648212 aactttgtttccatgttaaagatttcaacgataaaatagcacttgtaa 43648165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 340 - 543
Target Start/End: Original strand, 45327801 - 45328003
Alignment:
Q  340 cccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttat 439  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  45327801 cccattgtttatacggtgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgt 45327900  T
Q  440 tttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacct 539  Q
    ||||||||||||| || || ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  45327901 tttaagtgtaaca-cctcagaaagtgtaacacataagactatcgcataatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacat 45327999  T
Q  540 gtaa 543  Q
    ||||    
T  45328000 gtaa 45328003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 291 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 27350109 - 27349868
Alignment:
Q  291 ttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 390  Q
    |||| |||||||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27350109 ttttttggtgaagttaacactatagcatcaaaaatgttgtgagtaacaccacactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcc-cttagtatcatcaa 27350011  T
Q  391 ttcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataata 490  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||         |||||| |||    
T  27350010 ttcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacac---------tcacatgata 27349921  T
Q  491 tcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27349920 tcaggaactctgtttgcaagttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaa 27349868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 39167568 - 39167289
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||  || || |||||| |||||||| |||| || ||||||  |||  |||||||||||||| | ||||||  |||| ||||||||||||  |    
T  39167568 aaggaaaattttatggtgaagtcacgagaatgatttttttgatgaagttaacagaatagtatcaaaagtattgtgagtaacacctcactgtttgtacaat 39167469  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | |||||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||    
T  39167468 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcattagagtaacaagaatacacttattctaattttattataccttgttttaagtgtaaca-tcc 39167370  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||| |||||||      ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  39167369 cacaaagtgtaaca------actatcacataatatcatcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaa 39167289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 43771039 - 43770775
Alignment:
Q  261 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 360  Q
    ||||||| || || ||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  43771039 aaaattctatggtgaagtcattagaatgattttt-tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttatacagtggca 43770941  T
Q  361 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccaca 460  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||    
T  43770940 tcaaaagttcagtccccttaatatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatttaattttatcctgccttgttttaagtgtaaca-cctcaca 43770842  T
Q  461 aaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagta 536  Q
    || ||||||||         |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  43770841 aagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagta 43770775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 18494473 - 18494201
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    |||||||||||  | || ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||                
T  18494473 aaggaaaattctgtggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccac------------ 18494386  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||  | ||     
T  18494385 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattcactagaatacacttgatctaattttatcctaccttgtattaagtgta--aacct 18494288  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18494287 cacaaagagtcacacttaagactatcacatgatatcaacgactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaa 18494201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 285 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 19289500 - 19289243
Alignment:
Q  285 aatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtat 384  Q
    |||||||||| || ||||||  ||||||||  ||||||| | || |||||  ||||||| |||||||||  || ||||||||||| ||| |||| |||||    
T  19289500 aatgacttttttgatgaagttaacactataacatcaaaaatataatgagtaacaccccattgtttgtacaatgacatcaaaagttaagttctcacagtat 19289401  T
Q  385 catcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcac 484  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||| |||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19289400 catcaactcatcagattaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttataaatgtaaca-tcccacaaagtgtaacacttaagactatcac 19289302  T
Q  485 ataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  19289301 ataatatcatcaactctgtgtgcatgttaaagattccgacaataaaataatacctgtaa 19289243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 258 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 11366585 - 11366301
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| || || || |||| |||||||||||| ||||||| |  ||||||||  ||||||| |||| |||||  || | |||| ||||||   ||    
T  11366585 aggaaaattctatggtgaaatcataagaatgacttttttggtgaaattaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacatctcactatttgtataatg 11366486  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||| || |||   ||||||||      
T  11366485 acatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacatttaatataattttatcatatcttgttctaaacataacaccct- 11366387  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11366386 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaa 11366301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 283 - 513
Target Start/End: Original strand, 33902092 - 33902319
Alignment:
Q  283 agaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagt 382  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||   ||  |||| ||||||||||   |||||||||||||||   || |||||||||||||||||||| |||    
T  33902092 agaatgacttttctggtgaagttaacactaacata--aaaaatgtagtgagtaataccccactgtttgtaaaatgacatcaaaagttcagtcctcaaagt 33902189  T
Q  383 atcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatc 482  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| || | ||||    
T  33902190 atcatcagttcatcagattaacaagactatatttaatcgaattttatcctaccttgttttaagggtagca-ccccacaaagtgtaacacttaatagtatc 33902288  T
Q  483 acataatatcagcaactctggttgcatgtta 513  Q
    |||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  33902289 acataatatcattaactctgtttccatgtta 33902319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 360 - 543
Target Start/End: Original strand, 31861953 - 31862135
Alignment:
Q  360 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccac 459  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| || || |||| |||||| ||||||    
T  31861953 atcaaaatttcagtcattatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttaacatacattgttataagcgtaaca-ccccac 31862051  T
Q  460 aaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||| ||||||||| || | ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| || || |||||||||||| |||||    
T  31862052 aaagtgtaacacttaaaattatcacataatatcatcaagtctgtttgcatgttaaggattccgacaataaaatagtacttgtaa 31862135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 400 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 18258349 - 18258214
Alignment:
Q  400 ttaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaact 499  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18258349 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctacatttttttaagtgtaacacccc-ataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaact 18258251  T
Q  500 ctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagta 536  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18258250 ctctttgcatgttaaagatcccaacgataaaatagta 18258214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 258 - 543
Target Start/End: Original strand, 5881533 - 5881812
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaa-----gtgtagtgagtggcaccccactgtttgta 352  Q
    |||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| || | ||||  |||||||     |||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  5881533 aggaaaattttattgtgaagtcattaaaatgacttttctggtgaagttgatattataacatcaaaacaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgta 5881632  T
Q  353 cggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaaca 452  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |    
T  5881633 cagtgacatcaaaagttgagtccccttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacatttaatctaa-tttatcataccttgttttaagtgtaata 5881731  T
Q  453 cccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
     || |||||| ||||||||         |||||| |||||| ||| | || |||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||    
T  5881732 -cctcacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcaacaattttgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtacatgtaa 5881812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 275 - 537
Target Start/End: Original strand, 35958925 - 35959173
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||| | |||||||  || |||| |||| ||||   |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||      
T  35958925 aagtcataaaaatgacttttttggtgaagttgccactataacataaaaaatgtaatgagcaacaccccactgtttgtacaatgacattaaaagttcag-- 35959022  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
              ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||| || |||| |||||||||| ||||| ||||||| | |    
T  35959023 ----------catcaattcatcatattaacaagactgcacttaatataattt-atcctaccttgttataagcgtaacacccc-acaaagtgtaacagtta 35959110  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtac 537  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  35959111 agactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtac 35959173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 340 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7007043 - 7006858
Alignment:
Q  340 cccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttat 439  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  7007043 cccactgtttgtacagtagcatcaaaagtttagttcccatagtatcatcaatttataagattaacaagaatacacttaatctaattttatcataccttgt 7006944  T
Q  440 tttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacct 539  Q
    ||||||||||                  ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  7006943 tttaagtgta------------------acacttaagaatatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtactt 7006862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 455 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 19500923 - 19500835
Alignment:
Q  455 cccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||   |||||||||||||||| |||||    
T  19500923 cccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctatttacatgttaaagatgttaacgataaaatagtacatgtaa 19500835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 286 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 41051382 - 41051263
Alignment:
Q  286 atgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacg-gtggcatcaaaagttcagtcctcatagtat 384  Q
    |||||||||||| |||||   | ||||||| ||||||||||| |||  |  |||  |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41051382 atgacttttctgatgaagctaatactatagcatcaaaagtgttgtgtataacacttcactatttgtaccagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtat 41051283  T
Q  385 catcaattcatcaaattaac 404  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  41051282 catcaattcatcagattaac 41051263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 19501839 - 19501768
Alignment:
Q  362 caaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctac 434  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  19501839 caaaagttcagtctctatagtatcatcaattcatcagattaacaa-actacatttaatctaattttattctac 19501768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 304
Target Start/End: Original strand, 6177791 - 6177820
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6177791 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 6177820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 258 - 537
Target Start/End: Original strand, 133 - 411
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| || || |||||| || ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||| ||||||  ||| |||||||||||||  ||    
T  133 aggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaacactgtagtataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatg 232  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  233 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctatcttattttaagtgtaaca-cccc 331  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtac 537  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  332 ataaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtac 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 360 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 408512 - 408331
Alignment:
Q  360 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccac 459  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||| || |||    
T  408512 atcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaaca-cctcac 408415  T
Q  460 aaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||| || |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  408414 aaagtggaacacttaagactatcacacaatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaa 408331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 280 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 94547 - 94335
Alignment:
Q  280 atgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcat 379  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||    
T  94547 atgaaaatgacttttctgatgaagttaacattataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagtttggtccccat 94448  T
Q  380 agtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagact 479  Q
    | |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  94447 actatcatcaattcatgagattaacaagactacacttaatttaattttattctagcttgtttcaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacacttaagact 94349  T
Q  480 atcacataatatca 493  Q
    || |||||||||||    
T  94348 attacataatatca 94335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 257 - 539
Target Start/End: Original strand, 19119857 - 19120138
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||| ||    
T  19119857 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttgtggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgctagtaacaccccactgtttgtacagt 19119956  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  19119957 gacatcaaaagttcagtccccatagtgtcatcaattcatcagattaacaagaataaacttactctaattttatcctaccttgttttaagtataaca-ccc 19120055  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacct 539  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19120056 cacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactccgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacct 19120138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 275 - 536
Target Start/End: Original strand, 22980809 - 22981069
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||   |||||||||||||  |  || ||||||||||||||||    
T  22980809 aagttatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagtatcaaaaatacagtgagtaataccccactgtttgagcaatgacatcaaaagttcagtc 22980908  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  22980909 cccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-cctcacaaaatgtaacactta 22981007  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagta 536  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22981008 agactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagta 22981069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 259 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 31786821 - 31786537
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || ||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||||||| || |||| |||||||||     ||||||||||||||| ||||    
T  31786821 ggaaaattctatagtgaagtagtgagaatgacttttttggtgaagttaacactatagcatgaaaaatgtagtgagcactgccccactgtttgtacagtgg 31786722  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |    
T  31786721 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaaca-cccta 31786623  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaaa 544  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31786622 caaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgattgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaaa 31786537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Original strand, 699166 - 699433
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| || |||| | ||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  699166 aagttatgagaatgacttttctgatgaagttaacactatagcataaaaaatctagtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtc 699265  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
     ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| |    
T  699266 atcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttattttaagtgtaaca-ctccacaaagtgtaatactta 699364  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  699365 agactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaa 699433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Original strand, 33908249 - 33908516
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33908249 aagtcatgagaatgaactttctggtgaagtcaacactatatcatcaaaagtgtagtgagtagcactccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 33908348  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| |    
T  33908349 ctcatagtatcatcaattattcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaaca-ccccagaaagtgtaacactta 33908447  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||| |||||||||  ||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  33908448 agactatcgcataatatcgtcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaa 33908516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 275 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 27318646 - 27318385
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |  || |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||  || ||||||||||| |||     
T  27318646 aagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactaaaacataaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaatgacatcaaaagtttagtt 27318547  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  27318546 ctcacagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaaca-ccccacaaagtgtaacactta 27318448  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtac 537  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27318447 agactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtac 27318385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 8742064 - 8741777
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcacccc-actgtttgtacgg 355  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||||      
T  8742064 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacccccattgtttgtacaa 8741965  T
Q  356 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccc 455  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||    
T  8741964 tggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacaattaatctaattttgtcataccttgttttaagtgtaaca-cc 8741866  T
Q  456 ccacaaaatgtaacactgaagactatcacat-aatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  8741865 ctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgattatgagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaa 8741777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 278 - 540
Target Start/End: Original strand, 5837574 - 5837835
Alignment:
Q  278 tcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctc 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  |    
T  5837574 tcatgagaatgacttttctggtgaaggtaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaatttcagtctcc 5837673  T
Q  378 atagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaaga 477  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
T  5837674 atagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaatttaatcctacattgttttaagtgtaata-ccccacaaagtgtaacacttaaga 5837772  T
Q  478 ctatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctg 540  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  5837773 ctatcacatgatatcagcaactctctttgcatgttaaagatgacaacgacaaaatagtacctg 5837835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 23116397 - 23116114
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || | ||||||| |||||||||| |  ||||||  ||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23116397 ggaaaattctatggtgacgtcatgaaaatgactttttttatgaagttaacattataacatcaaaactgtagtgagtagcaccccactgtttgtacagtgg 23116298  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
     ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  23116297 aatcaaaagttcagtttacatagtatcatcaattcatcagattaacaatattacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaaca-cccca 23116199  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23116198 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 23116114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 275 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 30969483 - 30969223
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||    
T  30969483 aagtcatgagaatgatttatctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttatacaatgacatcaaaagttcagtc 30969384  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||| ||||||||| |    
T  30969383 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaaca-cctcacaaagtgtaacactta 30969285  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagta 536  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  30969284 agactatcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagta 30969223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 275 - 518
Target Start/End: Original strand, 26268090 - 26268332
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26268090 aagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttttgagtaacaccccactgtttgtacggtgacatcaaaagtttagtc 26268189  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| |    
T  26268190 cacatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacaattaatcaaattttatcataccttgttttaagtgtaaca-ccgcacaaagtgtaacactta 26268288  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagat 518  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  26268289 agactatcacatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagat 26268332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Original strand, 12910348 - 12910638
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||||| | ||||| ||  ||||||||||||||||| ||    
T  12910348 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaaaactataacatcaaaaatatagtgcgtaacaccccactgtttgtacagt 12910447  T
Q  357 -----ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaac 451  Q
         | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12910448 acagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacatgactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaac 12910547  T
Q  452 acccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    | ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||| |||||    
T  12910548 a-ccccacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgccaacaatacaataatacatgtaa 12910638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 261 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 25501099 - 25500818
Alignment:
Q  261 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 360  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||| |||| |  |||| ||||||||||||  || ||    
T  25501099 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtaaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgaataacacctcactgtttgtacactgcca 25501000  T
Q  361 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccaca 460  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25500999 tcaaaagttaagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaagaataaacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccccaca 25500901  T
Q  461 aaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    || ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25500900 aagtgtaacacttaagatcatcacatgatatcagcaactttctttagatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaa 25500818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 38528413 - 38528129
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| ||||  ||||||| ||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  ||||||| ||||| ||| ||    
T  38528413 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatggtttttctgatgaagttaacactataacatcaaaattgtaatgagtaacaccccattgtttatacagt 38528314  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||    
T  38528313 gacatcaaaagttcagtc-tcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcttaccttgtttcaagtgtaaca-ccc 38528216  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38528215 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctatttacatgttaaagatatcaacgataaaatagtacttgtaa 38528129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 256 - 533
Target Start/End: Original strand, 36860420 - 36860697
Alignment:
Q  256 taaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacgg 355  Q
    |||||||||||| || || |||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||||||||||      
T  36860420 taaggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgatttttctggtgaagttaacactatagtataaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaa 36860519  T
Q  356 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctacc-ttattttaagtgtaacacc 454  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  36860520 tgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcatactaacaagagtacatttaatctaattttatcctaccttttttttaagtgtaaca-c 36860618  T
Q  455 cccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaata 533  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  36860619 cccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaata 36860697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 259 - 533
Target Start/End: Original strand, 36866762 - 36867035
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || |||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| | | ||||||  |||||||||||||||||  |||    
T  36866762 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgatttttctggtgaagttaacactataatatcaaaaatattgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgg 36866861  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  36866862 catcaaaagttcagtcccgatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-cccca 36866960  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaata 533  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  36866961 caaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaata 36867035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 259 - 533
Target Start/End: Original strand, 40133385 - 40133658
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || |||||| || |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||  |||    
T  40133385 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttgtggtgaagttaacattatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatgg 40133484  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  40133485 catcaaaagttcagtccccataatatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-cccca 40133583  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaata 533  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  40133584 caaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaata 40133658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 252 - 543
Target Start/End: Original strand, 27330299 - 27330587
Alignment:
Q  252 taattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgt 351  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||  |||||  ||||  |||||||||    
T  27330299 taattaaggaaaattctatggtgaagtcgtgggaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgt--tgagtaacaccttactgtttgt 27330396  T
Q  352 acggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaac 451  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27330397 acaatggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaac 27330496  T
Q  452 acccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    | |||||  || ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| ||||||| |||| |||||    
T  27330497 a-ccccatgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgtaa 27330587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 35511636 - 35511374
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||  ||| ||||  ||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  35511636 aagtcatgaaaatgacgtttctgatgaagttaacattataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaagtgacatcaaaagttcagtc 35511537  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
     ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||       
T  35511536 atcatactatcaccaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaaca-ccccacaaaatgtaacac--- 35511441  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
      ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  35511440 --actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaa 35511374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 327 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 23954897 - 23954692
Alignment:
Q  327 tagtgagtggcaccccactgtttgtacg-gtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaatt 425  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23954897 tagtgagtaacaccccactgtttttactagtggcatcaaaagttcagtttccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaatt 23954798  T
Q  426 ttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacg 525  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  23954797 ttatcctaccttgttttaagtgtaaca-cctcacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa-atgccaacg 23954700  T
Q  526 ataaaata 533  Q
    ||||||||    
T  23954699 ataaaata 23954692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 258 - 536
Target Start/End: Original strand, 9200232 - 9200500
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||  || || ||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||    
T  9200232 aggaaaattttatggtgaagtcattaaaataacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacagtttgtacagtg 9200331  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||    
T  9200332 acatcaaaagtttagtcctcttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ttcc 9200430  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagta 536  Q
    ||||| ||||||||         |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9200431 acaaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagta 9200500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 14409501 - 14409233
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||  ||||||||    
T  14409501 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaaatgtagtgagtagcaccccactcttaatacggtgg 14409402  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||           
T  14409401 catcaaaagttcagt-ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaac------- 14409310  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
             || || ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  14409309 --------tactcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaa 14409233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 260 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 31705785 - 31705510
Alignment:
Q  260 gaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggc 359  Q
    |||||||| || || ||||||| | ||||| |||| |||||||||  ||||||||  ||||||| ||||  ||||  ||||| || ||||||||  || |    
T  31705785 gaaaattctatggtgaagtcataaaaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacaccctaccgtttgtacaatgac 31705686  T
Q  360 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccac 459  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||| |||||| | | ||    
T  31705685 atcaaaagtccagtcctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcgtaacatctc-ac 31705588  T
Q  460 aaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtac 537  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31705587 aaaatgtaacacttaagaccatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaaagataaaatagtac 31705510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Original strand, 7693230 - 7693504
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || ||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||| ||||    
T  7693230 ggaaaattctatggtgaagtcattaaaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgtttgtacagtgg 7693329  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||| || ||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  7693330 catcaaaagttcaatcctcttagtatcatcaattcattagattaacatgaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaaca-cccca 7693428  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| ||||||||         |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  7693429 caaagtgtaacac---------tcacatgatattagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataatacttgtaa 7693504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 257 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 14919706 - 14919431
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctgg-tgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacgg 355  Q
    ||||||||||  || || ||||||||||||| | |||| | | ||||||  ||| ||||  ||||||| |||| |||||  |||| |||||||| ||       
T  14919706 aaggaaaattatatggtgaagtcatgagaattattttttttgatgaagttaacattataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcactgtttatataa 14919607  T
Q  356 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccc 455  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14919606 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcatattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaaca-cc 14919508  T
Q  456 ccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaat 532  Q
     |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14919507 tcacaaattgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacaataaaat 14919431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 283 - 543
Target Start/End: Original strand, 22019656 - 22019906
Alignment:
Q  283 agaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagt 382  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||    
T  22019656 agaatgacttttctggtgaagttaaaactatagaatcaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttgtatagtgacatcaaaagttaagtccccttagt 22019755  T
Q  383 atcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatc 482  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||         ||    
T  22019756 atcatcacttcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaaca-ccccacaaagtataacac---------tc 22019845  T
Q  483 acataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  22019846 acatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacttgtaa 22019906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 258 - 502
Target Start/End: Original strand, 39572818 - 39573061
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||| || ||||  | |||||| ||| |||| ||| ||||||  ||| ||||||||||| | |||    
T  39572818 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagttaagttaatactataatataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgcagtg 39572917  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  39572918 acatcaaaagttcagttctcatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-tccc 39573016  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctg 502  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  39573017 acaaagtgtaacactcgagactatcacatgatatcaacaactctg 39573061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 260 - 543
Target Start/End: Original strand, 32563150 - 32563423
Alignment:
Q  260 gaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggc 359  Q
    |||||||| || || ||||||| | ||||| ||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||| ||| |    
T  32563150 gaaaattctatggtgaagtcattaaaatgatttttctgatgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtctgtacagtgac 32563249  T
Q  360 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccac 459  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  32563250 atcaaaagttcagtccccttaatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-gcccac 32563348  T
Q  460 aaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||| ||||||||         |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  32563349 aaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttatagatgccaacgataaaatagtacatgtaa 32563423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 338 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 15992636 - 15992432
Alignment:
Q  338 accccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctacctt 437  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||    
T  15992636 accccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttgatctaattttattctacctt 15992537  T
Q  438 attttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtac 537  Q
      ||| |||| |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15992536 gatttgagtgcaaca-ccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcaggaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtac 15992438  T
Q  538 ctgtaa 543  Q
    | ||||    
T  15992437 cggtaa 15992432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 313 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 21088887 - 21088668
Alignment:
Q  313 tagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactac 412  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||    
T  21088887 tagtataaaaaatgttgtgagtgacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcatactaacaagaatac 21088788  T
Q  413 actcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgtt 512  Q
    | | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||    
T  21088787 atttaatctaactttatcctaccttgttttaagtgtaaca-tcccacaaagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactatgtttgtatgtt 21088689  T
Q  513 aaagataccaacgataaaata 533  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  21088688 aaagatgccaacgataaaata 21088668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 258 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 1429321 - 1429054
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    ||||||| || || || ||||||||| ||||||| || |||||||||  ||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||  ||    
T  1429321 aggaaaaatctatggtgaagtcatgaaaatgactcttttggtgaagttaacactatagcatcaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacactg 1429222  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||            
T  1429221 gcatcaaaaattcagtctccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgta-------- 1429130  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
              ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1429129 ----------acacttaagactatcacataatatcataaactttatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaa 1429054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 257 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 5112490 - 5112247
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||  || || ||||||||| |||||||||| |||||||||  | ||||||  || |||| | ||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  5112490 aaggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacataaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagt 5112391  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||  | |||    
T  5112390 ggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcattaaattaacaagactatacttaatctaattttatcataccatgttttaagtgta--aaccc 5112293  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctg 502  Q
    |||||| |  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5112292 cacaaagtacaacacttaagactttcacataatatcatcaactctg 5112247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 337 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7208960 - 7208756
Alignment:
Q  337 caccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctacct 436  Q
    ||||| || ||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7208960 caccctaccgtttgtacattgacatcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctacct 7208862  T
Q  437 tattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagta 536  Q
    | || |||  |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7208861 tgttataaacgtaacacctc-acaaagtgtaacacttaagactatcacataatattttcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagta 7208763  T
Q  537 cctgtaa 543  Q
    | |||||    
T  7208762 catgtaa 7208756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 22974259 - 22973974
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| || || |||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||||||  |||||||  ||| |||||  || ||||||||||||||  |    
T  22974259 aaggaaaattctatggtgaagttatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaaagtaatgagtaacatcccactgtttgtacaat 22974160  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
      ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||| |||||| ||     
T  22974159 aacatcaaaagttcaattctcatattatcatcaactcatcagaataacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgttataagcgtaaca-cct 22974061  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||  | || |||||||||||| |||||    
T  22974060 cacaaaatgtaacacttaagactattacataatattatcaactctgtttgcatgttaaagatttcgacaataaaatagtacatgtaa 22973974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Original strand, 22255197 - 22255465
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaag-tgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagt 373  Q
    ||||||| | ||| |||||| |||||||||  ||| ||||  |||||||  |||| |||||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22255197 aagtcataaaaataacttttttggtgaagttaacattataacatcaaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatggcatcaaaagttcagt 22255296  T
Q  374 cctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactg 473  Q
     |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  || || |||| |||||| || |||||| |||||||||     
T  22255297 tctcatattatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttagcctattttgttataagcgtaaca-ccacacaaagtgtaacactt 22255395  T
Q  474 aagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22255396 aaaactattacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaatattccaacgataaaatagtacctgtaa 22255465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Original strand, 15724490 - 15724771
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||| | ||||||  ||||||||||||| |||  ||     
T  15724490 ggaaaattctatggtgaagttatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagttttgtgagtaacaccccactgtttatacaatga 15724589  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||     
T  15724590 catcaaa-gttcagtcc-cataatatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttattttaagtataacacgccc- 15724686  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| |||| || | |||||||||| || |||||| ||||| || || ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||    
T  15724687 caaagtgtatcaattaagactatcatatgatatcaacaactttgtttacatgttaaagatgtcaactataaaatagtacttgtaa 15724771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 258 - 543
Target Start/End: Original strand, 35933901 - 35934179
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||  || || ||||||||||||||| |||| || ||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||     ||  |||    
T  35933901 aggaaaattgtatggtgaagtcatgagaatgatttttttgatgaagttaacactatagaatcaaaagtgttgtgagtaacacctcact-----ta--gtg 35933993  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaatttt-atcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  35933994 gcatcaaaagtccagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctagtttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccct 35934093  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||    
T  35934094 -acaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaacaataaaatagtaccggtaa 35934179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Original strand, 24886100 - 24886370
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttct--ggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacg 354  Q
    ||||||||||  || || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  | ||||||  ||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||     
T  24886100 aaggaaaattttatggtgaaatcatgagaatgacttttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtaca 24886199  T
Q  355 gtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacc 454  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||             
T  24886200 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataag--------- 24886290  T
Q  455 cccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
             ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  24886291 ---------tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacaataaaatagtacatgtaa 24886370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 337 - 543
Target Start/End: Original strand, 35504443 - 35504648
Alignment:
Q  337 caccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctacct 436  Q
    |||| ||| ||||||| | || ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  35504443 cacctcaccgtttgtatgatgacatcaaaagttcaatcattatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatataattttatcctacca 35504542  T
Q  437 tattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagta 536  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35504543 tattataagcgtaaca-ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaaatctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagta 35504641  T
Q  537 cctgtaa 543  Q
    | |||||    
T  35504642 catgtaa 35504648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 258 - 543
Target Start/End: Original strand, 8436965 - 8437248
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||| ||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||  || ||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||    
T  8436965 aggacaattctaatgtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaaattaacactatagcttccaaagtgtagtgagtaacatcccattgtttgtacagtg 8437064  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
     |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||| |||| ||||  || |||||||||||||||| |||| ||||||||   |||||||     
T  8437065 acatcaaaagttcagtcctcattatatcatcaac-catcagatttacaaaactatgcttaatctaattttatcctgccttgttttaagttatacacccc- 8437162  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8437163 acaatgtgtaacacttaagattatcacataatatgatcaactctgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaa 8437248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 317 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 6824598 - 6824397
Alignment:
Q  317 atcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagt--tcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacac 414  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  6824598 atcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacagtgacatcaaaagtgttcagtcttcatagtatcatcaatttatcagattaacaagaatacac 6824499  T
Q  415 tcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaa 514  Q
    | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  6824498 ttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaaca-ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacaagatat-agcaactctgtttgcatgttaa 6824401  T
Q  515 agat 518  Q
    ||||    
T  6824400 agat 6824397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 35826660 - 35826378
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||| | |||||||  | ||||||  ||||||| |||| |||||  |||  || ||||||||| ||    
T  35826660 aaggaaaattctatggtgaagtcatgataatgactttttttgtgaagttaatactataacatcaaaaatgtactgagtaacacttcattgtttgtacagt 35826561  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| || ||| | ||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| | |    
T  35826560 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat-agattaacaataccacatttaatctaattttattctacattgttttaagcgtaaca-ctc 35826463  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||| |||||| || |||| |||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  35826462 cacaaagtgtaacccttaagattat--cataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaa 35826378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 253 - 453
Target Start/End: Original strand, 8466739 - 8466938
Alignment:
Q  253 aattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgta 352  Q
    ||||||||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||| |||| |  |||||| || ||||||    
T  8466739 aattaaggaaaattctatgatgaggtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactgtaacatcaaaagtgttgtgaataacacccc-ctctttgta 8466837  T
Q  353 cggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaaca 452  Q
    | |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  8466838 cagtggtatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaaatgtaaca 8466937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 320 - 543
Target Start/End: Original strand, 5829962 - 5830175
Alignment:
Q  320 aaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaat 419  Q
    |||| |||| |||||  ||||| || ||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||         |||||||||||||| |||    
T  5829962 aaaaatgtaatgagtaacaccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaatt---------aacaagactacacttaat 5830052  T
Q  420 ctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagata 519  Q
    || |||||||| |||||| || |||| |||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  5830053 ctcattttatcttaccttgttataagcgtaacacccc-acaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatt 5830151  T
Q  520 ccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  5830152 ccaacgataaaatagtacatgtaa 5830175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 298 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 17158166 - 17157929
Alignment:
Q  298 gtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatca 397  Q
    |||||||  ||||||||  || |||| |||| |||||  ||| |||| ||||||||  || |||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||    
T  17158166 gtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttc-gtcattatagtatcattaattcatca 17158068  T
Q  398 aattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaa 497  Q
     ||||||||||||||||| | | ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| | |||    
T  17158067 gattaacaagactacacttagtataattgtatcttaccttattataagtgtaacacccc-acaaagtgtaacacttaagaccatcacataatattatcaa 17157969  T
Q  498 ctctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtac 537  Q
    ||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  17157968 ctctgtttgcatgataaagatttcaacgataaaatagtac 17157929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 298 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 28416663 - 28416490
Alignment:
Q  298 gtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatca 397  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||| | ||||||  || |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||    
T  28416663 gtgaagttaacactataatatcaaaagtattgtgagtaacatcccactgtttgtacagtggaatcaaaagttcaatctccttaatatcatcaattcatca 28416564  T
Q  398 aattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacact 472  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  28416563 gattaacaagaatacacttaatctaattttattctgccttattttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacact 28416490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 340 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 43308746 - 43308552
Alignment:
Q  340 cccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttat 439  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||| |    
T  43308746 cccactgttcgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcagcttaacaaaactatacttaatctaattttatcttaccttgt 43308647  T
Q  440 tttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacct 539  Q
    | ||||||||||||||  | ||| ||||||||| ||||||        |||||| |||||||  ||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  43308646 tataagtgtaacaccctga-aaagtgtaacacttaagact--------atatcatcaactcttcttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacct 43308556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 381 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 13956415 - 13956256
Alignment:
Q  381 gtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagacta 480  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||  || ||| ||| |||||||||||||  |||||  |||||||| |||||||    
T  13956415 gtatcatcaattcatcagattaacaaaacttcacttaatctaattttattttatcttgtttcaagtgtaacaccct-acaaagcgtaacacttaagacta 13956317  T
Q  481 tcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgt 541  Q
    ||| ||||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13956316 tcatataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgt 13956256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 317 - 414
Target Start/End: Original strand, 25668707 - 25668804
Alignment:
Q  317 atcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacac 414  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  25668707 atcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgaacagtggcatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcattagattaacaagaatacac 25668804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 407 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 2888472 - 2888337
Alignment:
Q  407 gactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttg 506  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||  || | ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | || |||    
T  2888472 gactacacttaatctaattttattttaccttgtttcaagtttaacattcc-ataaagtgtaacacttaagactatcagataatatcatcaaatatgtttg 2888374  T
Q  507 catgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2888373 catgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaa 2888337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 379 - 543
Target Start/End: Original strand, 42342851 - 42343004
Alignment:
Q  379 tagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagac 478  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||| | | ||||||| ||||||||           
T  42342851 tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatctta-cttgttttaagtgtaata-caccacaaagtgtaacac------- 42342941  T
Q  479 tatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
      |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  42342942 --tcacatgatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataggacatgtaa 42343004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 474 - 544
Target Start/End: Original strand, 25889584 - 25889654
Alignment:
Q  474 aagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaaa 544  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25889584 aagattatgacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataccaacaataaaatagtacctgtaaa 25889654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 396
Target Start/End: Original strand, 11898018 - 11898139
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||  | | ||||| |||||||||| | |||||  ||||| |||  |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  11898018 aagtcatgataataacttttctggtaaagttaatattatagcatcaaaagtgcactgagtaacaccctactagttgtacagtgacatcaaaagtttagtc 11898117  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatc 396  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11898118 ctcatagtatcatcaattcatc 11898139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 13956527 - 13956426
Alignment:
Q  252 taattaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgt 351  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||    
T  13956527 taattaaggaaaattctacggtgaagtcatgaaaatgacttttctcatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacacctcactgtttgt 13956428  T
Q  352 ac 353  Q
    ||    
T  13956427 ac 13956426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 543
Target Start/End: Original strand, 25669737 - 25669859
Alignment:
Q  410 tacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcat 509  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||  |||||||||         ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  25669737 tacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactcc-acaag-tgtaacact---------cacatgatatcatcaactctgtttgcat 25669825  T
Q  510 gttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  25669826 gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaa 25669859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16004552 - 16004476
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaat-gacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagt 334  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||| ||||||    
T  16004552 ggaaaattctatggtaaagtcatgagaattgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaaatgttgtgagt 16004476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 304
Target Start/End: Original strand, 22616492 - 22616539
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 304  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22616492 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagt 22616539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 304
Target Start/End: Original strand, 10237415 - 10237459
Alignment:
Q  260 gaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 304  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10237415 gaaaattctattgtgaagtcatgaaaatgacttttctagtgaagt 10237459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 158; Significance: 8e-84; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 254 - 543
Target Start/End: Original strand, 22450954 - 22451242
Alignment:
Q  254 attaaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtac 353  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  22450954 attaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcacctcactgtttgtat 22451053  T
Q  354 ggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacac 453  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||     
T  22451054 ggtggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccttaccttgttttaagtgtaaca- 22451152  T
Q  454 ccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||  || ||||||| | || ||||||  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||    
T  22451153 ccccagtaagtgtaacatttaacactatcgtataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtacatgtaa 22451242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 258 - 540
Target Start/End: Original strand, 11466814 - 11467095
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||  | ||||||  |||  |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  11466814 aggaaaattctatggtgaagtcttgagaatgacttttctgatgaagttaagactataacatcgcaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtg 11466913  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  11466914 gcatcaaaagtttagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaata-cccc 11467012  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctg 540  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11467013 acaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgtttaagataccaacgacaaaatagtacctg 11467095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 52041092 - 52040824
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccac-tgtttgtacggtggcatcaaaagttcagt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||||||||||||  | |||||  ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  52041092 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaatactataacatcaaaagtgtagtgagtaactccccaaatgtttgtatagtggcatcaaaagttcagt 52040993  T
Q  374 cctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactg 473  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| | |||||||||     
T  52040992 catcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaata-ccccacatagtgtaacactt 52040894  T
Q  474 aagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  52040893 aagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaa 52040824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 261 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 46297945 - 46297671
Alignment:
Q  261 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 360  Q
    ||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| | ||||||||  ||| |||||||||||||  ||||     
T  46297945 aaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaaatatagtgagtaacacaccactgtttgtacaatggcg 46297846  T
Q  361 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccaca 460  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  46297845 tcaaaagttcagtccccgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatcaaactttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccccaca 46297747  T
Q  461 aaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagta 536  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46297746 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagta 46297671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Original strand, 34132924 - 34133209
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| ||  | |||||| || |||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||  |    
T  34132924 aaggaaaattctataatgaagtcacgaaaatgacttttttggtgaaattaacactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaat 34133023  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  34133024 gacatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccc 34133122  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34133123 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaa 34133209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Original strand, 37203058 - 37203342
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || ||||||| | ||||| |||| || ||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  37203058 ggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgatttttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 37203157  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  37203158 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttttagtgtatca-cccca 37203256  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaact-ctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  || ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  37203257 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatattgtttgtatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacctgtaa 37203342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 33378969 - 33378687
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| || |  |||| |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  33378969 aaggaaaattctatggcaaagttatgagaatgactttt---gtgaagtcaacactatagtatcaaaagtgtagtgagtagtaccccaatatttgtacggt 33378873  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  33378872 gacatcaaaagttcagtccccatagtattatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccc 33378774  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||  || ||||| ||| ||||||||| |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  33378773 caagaagtgtaatacttaagactatcgcataatctcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaa 33378687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Original strand, 48354930 - 48355215
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| ||| |||| |||| |||||  ||||||| |||||||||  |    
T  48354930 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttatggtgaagttaacactataatattaaaaatgtaatgagtaacaccccattgtttgtacaat 48355029  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| |||||||   |    
T  48355030 ggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttagtctaattttatcctaccttgttataaatgtaaca-tac 48355128  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  48355129 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtatctgtaa 48355215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 53229322 - 53229054
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccc-cactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagt 373  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||   ||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  53229322 aagtcatgaaaattatttttctggtgaaattaacactatagcatcaaaagtgtagtgagcaacaccctcaatgtttgtacagttgcatcaaaagttcagt 53229223  T
Q  374 cctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactg 473  Q
    | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||     
T  53229222 catcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacagttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaac-tccccacaaagtgtaacactt 53229124  T
Q  474 aagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  53229123 aagactatcacatagtatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaa 53229054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 11357534 - 11357283
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcacccc-actgtttgtacggtggcatcaaaagttcagt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11357534 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtatagtgagtaacacccccactgtttgtacagttgcatcaaaagttcagt 11357435  T
Q  374 cctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactg 473  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||                  |||||     
T  11357434 catcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgta------------------acactt 11357353  T
Q  474 aagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11357352 aagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacttgtaa 11357283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Original strand, 37157699 - 37157982
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || ||||||||| |||| ||||| || ||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  37157699 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatggcttttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtt-gtacagtgg 37157797  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  37157798 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaatttataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttcaagtgtaaca-cccca 37157896  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaact-ctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  37157897 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatattgtttgtatgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaa 37157982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 259 - 543
Target Start/End: Original strand, 4015451 - 4015733
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||  |||     
T  4015451 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctgatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacccaactgtttgtagagtga 4015550  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | | | |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  4015551 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatataattagtctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca-cccca 4015649  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| |||  ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  4015650 caaagtgtcacacttaagactatcgcattgtatcaacaact-tgtttgcatgttaaagatgccaacggtaaaatagtacatgtaa 4015733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 307 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 42506212 - 42505977
Alignment:
Q  307 acactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaa 406  Q
    ||||||||  ||||||| |||| |||||   ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42506212 acactataacatcaaaattgtaatgagtaataccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaa 42506113  T
Q  407 gactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttg 506  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || | |    
T  42506112 gactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaaca-ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcg 42506014  T
Q  507 catgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42506013 catgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaa 42505977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 257 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 4761838 - 4761554
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttct--ggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacg 354  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  | |||||| |||||||| |||| |||||  |||  ||||||||||||     
T  4761838 aaggaaaattctatggtgaattcatgagattgacttttttttggtgaagttaatactataatatcaaaaatgtaatgagtaacacttcactgtttgtaca 4761739  T
Q  355 gtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacc 454  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  4761738 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatctgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataacacc 4761639  T
Q  455 cccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacct 539  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  4761638 cccacaaagtataacacttaagactatcacataatatcatcaactatatttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacct 4761554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 256 - 536
Target Start/End: Original strand, 21193594 - 21193874
Alignment:
Q  256 taaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacgg 355  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  |    
T  21193594 taaggaaaattctatggtaaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactgttgaatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtagag 21193693  T
Q  356 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccc 455  Q
    || ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  21193694 tgacatcaaaagttcagtccccatggtatcattaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ct 21193792  T
Q  456 ccacaaaatgtaacac-tgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagta 536  Q
    ||| |||   |||||| | |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  21193793 ccataaaggataacacttaaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagattctcacgataaaatagta 21193874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 258 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 26941446 - 26941162
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| || || ||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||||||||  ||||||| | || |||||  ||||||||||||||||   ||    
T  26941446 aggaaaattctatggtgaagtcataagaatgatttttttggtgaagttaacactataaaatcaaaattataatgagtaacaccccactgtttgtataatg 26941347  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | || |    
T  26941346 acatcaaaagttcagtcctcatggtatcattaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaata-cctc 26941248  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    | ||| ||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26941247 ataaagtgtaacacttaaaactatcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaa 26941162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 256 - 544
Target Start/End: Original strand, 39282641 - 39282927
Alignment:
Q  256 taaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacgg 355  Q
    |||||||||||| || || ||||||||| ||||| ||||||| | || |  ||||||||  ||||||| ||| ||||||   |||||||||||| ||| |    
T  39282641 taaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgatttttctgataaaattaacactataacatcaaaactgt-gtgagtaataccccactgtttatacag 39282739  T
Q  356 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccc 455  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  39282740 tggcatcaaaagttcagttctcatattatcatccattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaaca-cc 39282838  T
Q  456 ccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaaa 544  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | || |||| ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||    
T  39282839 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatatgtttgcctgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctgtaaa 39282927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 258 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7327669 - 7327384
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcga-cactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    |||||||||| || || |||| ||||||||||||||| | |||||||  | |||||||  ||||||||||| ||||||  ||| ||| | ||||||| ||    
T  7327669 aggaaaattctatggtgaagttatgagaatgacttttttagtgaagttaaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccattatttgtacagt 7327570  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||| |||  ||||||||| |||    
T  7327569 gacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcggattaacaagaatacacttaatttatttttatcctaccttctttctagtgtaaca-ccc 7327471  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  7327470 cacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaa 7327384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 291 - 537
Target Start/End: Original strand, 3362276 - 3362523
Alignment:
Q  291 ttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 390  Q
    |||| |||||||||  ||||||||| |||| || | ||||||||  || |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3362276 ttttttggtgaagttaacactatagcatcagaaatatagtgagtaacatcccactatttgtacagtggcatcaaaagttcactcctcatggtatcatcaa 3362375  T
Q  391 ttcatcaaattaacaagactacac--tcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataa 488  Q
    |||||||  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3362376 ttcatcatgttaacaagactacactattaatctaattttatcctaccttattttaagtgaaaca-ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataa 3362474  T
Q  489 tatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtac 537  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  3362475 catcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaattgtac 3362523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Original strand, 32373479 - 32373744
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    |||||||||||||||||||||   | ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||   || ||||||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  32373479 aagtcatgagaatgacttttccaataaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagta--actccactgtttgtacagtggcatcaaaagttccacc 32373576  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    |  || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| |    
T  32373577 ccaatggtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-tcccacaaagtgtgacactta 32373675  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  32373676 agactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatattaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaa 32373744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 307 - 543
Target Start/End: Original strand, 2007972 - 2008206
Alignment:
Q  307 acactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaa 406  Q
    |||||||||  | |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  2007972 acactatagcgttaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatccccatagcatcatcaattcatcagattaacaa 2008071  T
Q  407 gactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttg 506  Q
    || || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  2008072 gaatatacttaatctaattttatcctacctcgttttaagtgt-aca-ctccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttg 2008169  T
Q  507 catgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  2008170 catgttaaagatgacaacgataaaatagtacttgtaa 2008206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 258 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 40552445 - 40552161
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  ||| |||| ||||||||  ||    
T  40552445 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggagaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatg 40552346  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||| || |||| ||||||  |||    
T  40552345 acatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaacactacacttaatttaattttatcttagcttgttataagcgtaaca-tccc 40552247  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||  ||||||||| | || | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  40552246 acaacgtgtaacacttaggattgtcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaa 40552161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 275 - 539
Target Start/End: Original strand, 44891514 - 44891767
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  || ||||||||         ||||||||||||| ||||    
T  44891514 aagtcatgaaaatgactttt-tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgt---------ggcatcaaaagtttagtc 44891603  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    | |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |    
T  44891604 cacatagtatcatcaattaatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ctccacaaagtgtaacactta 44891702  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacct 539  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44891703 agactatcacatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacct 44891767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 275 - 539
Target Start/End: Original strand, 29099362 - 29099616
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  || |||| ||| ||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  29099362 aagtcattagaatgacttttctggtgaagttaacactataacataaaaaatgtcgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatctaaagttcagtc 29099461  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    | | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||           
T  29099462 cccttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatttaattttatcgtgccttattttaagtgtaaca-ccccacaaagtgta------- 29099553  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacct 539  Q
      ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  29099554 --actttcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacct 29099616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 258 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 3655388 - 3655114
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtg 357  Q
    |||||||||  || || ||||||| | |||||||||| || | ||||  ||||||||  || |||| |||| |||||  |||||||| ||||||||  ||    
T  3655388 aggaaaattttatggtgaagtcataaaaatgacttttttgataaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatg 3655289  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| | ||    
T  3655288 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttagaagcgtaaca-cacc 3655190  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaata 533  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3655189 acaaaatgtaacacttaaaactatcacatgatatcatcagctctgtttgcatgttaaagattccatcgataaaata 3655114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 257 - 518
Target Start/End: Original strand, 35844315 - 35844575
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||| ||    
T  35844315 aaggaaaattctatggtgaagtcatgataatgacttttctggtgaagttaacactataacaacaaaaatgttgtgagtaacacctcactgtttgtacagt 35844414  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaa-ttttatcctaccttattttaagtgtaacaccc 455  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  35844415 gacatcaaaagtttagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctacctagttttaagtgtaaca-cc 35844513  T
Q  456 ccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagat 518  Q
    | ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| || || ||||||||||||    
T  35844514 ctacaaagtgtaacacttaaga-tatcacatgatatcagtaactttgtttccatgttaaagat 35844575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 275 - 544
Target Start/End: Original strand, 25579746 - 25580014
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||| |  ||  | ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  25579746 aagttatgagaatgatttttctggtgaagttaatactatagcatcaaaagtgttgtgaataacattctactatttatacagtgacatcaaaagttcagtc 25579845  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    | |||| |||||||| || || | |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  25579846 cccatattatcatcagtttattagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgtttttagtgtaacacccc-acaaagtgtaacactta 25579944  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaaa 544  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||    
T  25579945 agactattacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaactgtacctataaa 25580014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 380 - 543
Target Start/End: Original strand, 33698265 - 33698427
Alignment:
Q  380 agtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagact 479  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  33698265 agtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc-acaaagtgtaacacttaagact 33698363  T
Q  480 atcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33698364 atcgcatgatatcggcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaa 33698427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 281 - 536
Target Start/End: Original strand, 45174516 - 45174773
Alignment:
Q  281 tgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtg--agtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctca 378  Q
    ||||||| |||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||  |||  |||  |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||    
T  45174516 tgagaataacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgtgagtaacacttcactgtttgtacagtagcatcaaaagttcagtcccca 45174615  T
Q  379 tagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaa-ttttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaaga 477  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||||    
T  45174616 tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatttaatttttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ctctacaaagtgtaacacttaaga 45174714  T
Q  478 ctatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagta 536  Q
    |||| | || ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45174715 ctataatatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagta 45174773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 359 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 46994746 - 46994563
Alignment:
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  46994746 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaac-gcccca 46994648  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | || ||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  46994647 caaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattatgtttgcatgctaaagattccgacaataaaatagtacctgtaa 46994563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 275 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 22446234 - 22445971
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttct-ggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagt 373  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||  ||| ||||  ||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||      
T  22446234 aagtcatgaaaatgactttttttggtgaagttaacattatatcatcaaaaatatagtgagtaacaccccact-tttgtacagtggcatcaaaagttcaaa 22446136  T
Q  374 cc-tcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacact 472  Q
    || |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | |||||  | |||||||    
T  22446135 ccctcatagtatcatcaattcatcatataaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca--ctcacaatgtataacact 22446038  T
Q  473 gaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacct 539  Q
     |||||||||| ||||||||| ||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22446037 caagactatcatataatatcatcaactatttttgcatattaaagataccaacgataaaatagtacct 22445971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 317 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 24708242 - 24708017
Alignment:
Q  317 atcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacac-- 414  Q
    ||||||| || |||||||  |||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  24708242 atcaaaactgcagtgagtaacacctcactgt--gtacagtgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacactt 24708145  T
Q  415 tcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaa 514  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||| ||| | || |||||||||||    
T  24708144 ttgatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacacttaaaacaatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaa 24708046  T
Q  515 agataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  24708045 agatgccaacgataaaatagtacatgtaa 24708017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 337 - 543
Target Start/End: Original strand, 43348327 - 43348531
Alignment:
Q  337 caccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctacct 436  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  43348327 caccccactgtttgtttagtggcatcaaaagttcagtcttt-tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctacct 43348425  T
Q  437 tattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagta 536  Q
    | ||||||||||||||  |||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43348426 tgttttaagtgtaaca-tcccataaagtgtgacacttaagactatcacatgatatcaacaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagta 43348524  T
Q  537 cctgtaa 543  Q
    | |||||    
T  43348525 cttgtaa 43348531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 257 - 543
Target Start/End: Original strand, 47481511 - 47481796
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggt 356  Q
    ||||||||||  || || |||||||  ||||||  ||| |||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||   |    
T  47481511 aaggaaaattttatggtgaagtcataggaatgatgtttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtagaat 47481610  T
Q  357 ggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccc 456  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||| ||||  ||||| |||    
T  47481611 gacatcaaaagtttagccctcatagtatcatcaattcatcatgttaacaagactacacttaatataattttattataccttattctaagcataaca-ccc 47481709  T
Q  457 cacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  47481710 tacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatattaaagatttcaacgataaaatagtacttgtaa 47481796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 282 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 44186663 - 44186423
Alignment:
Q  282 gagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatag 381  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  44186663 gagaatgatttttttggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccgctgtttatacagtgacatcaaaagttcagtccccatag 44186564  T
Q  382 tatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactat 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||                |||||    
T  44186563 tatcatcaattcatcaaattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaaca-ccccaca----------------actat 44186481  T
Q  482 cacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacct 539  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  44186480 cacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacct 44186423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 259 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 51213166 - 51212955
Alignment:
Q  259 ggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtgg 358  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||  || |||| |||| ||||   |||||||||||||||||  |||    
T  51213166 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactgtaacataaaaaatgtaatgagcaacaccccactgtttgtacaatgg 51213067  T
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  51213066 catcaaaagttgagtcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagtgtaaca-cccca 51212968  T
Q  459 caaaatgtaacac 471  Q
    |||| ||||||||    
T  51212967 caaagtgtaacac 51212955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 27480548 - 27480264
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||  ||||||||| || ||||| ||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27480548 aagtcatgagaatgatatttttggtaaagtcaacactataacatcaaaagtataatgagtagcatccaattgtttgtacggtgacatcaaaagttcagtc 27480449  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccc------------ccacaaa 462  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||            ||   ||    
T  27480448 cccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacccagaagtgtaacacccagaa 27480349  T
Q  463 atgtaacactgaagactatcacataatatcagcaac----tctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27480348 gtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatatatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaa 27480264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 275 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 24489131 - 24488872
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    |||||| || ||||| |||| | |||||||  | |||||||||| |||| ||| ||||||  ||  |||||||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  24489131 aagtcacgaaaatgattttttttgtgaagttaagactatagtattaaaaatgttgtgagtaacattccactgtttgcacaatgacatcaaaagttcagtc 24489032  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    | |||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||| || |||||  ||||||||| |    
T  24489031 cccatattatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaaca-cctcacaaggtgtaacactta 24488933  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagt 535  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24488932 agactatcacacaatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagt 24488872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 306 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 21009940 - 21009704
Alignment:
Q  306 gacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaaca 405  Q
    |||||||||  ||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||   || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  21009940 gacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactatttgtagaatgacatcaaaagttcagccctcatattatcatcaattcatcaggttaaca 21009841  T
Q  406 agactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggtt 505  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| || ||| || ||||  ||||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |  ||    
T  21009840 agactacacttaatataattttatcataacttgttctaagcataaca-ctctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacaatattt 21009742  T
Q  506 gcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21009741 gcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaa 21009704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 275 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 43976054 - 43975794
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||    
T  43976054 aagtcatgagaatgacttttttg---aagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcactccactatttgtacgatgacatcaaaagtttaatc 43975958  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||         
T  43975957 ctcataatatcatcaattcatcagattaacaaaattgcacttaatctaattttatcttatcttgttttaagtgtaaca-ccccagaaagtgtaac----- 43975864  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaact---ctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
      |||||| |||||||||| |||||    || || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  43975863 --actatcgcataatatcatcaactatgttgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaa 43975794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 362 - 543
Target Start/End: Original strand, 29163912 - 29164083
Alignment:
Q  362 caaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaa 461  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29163912 caaaagttcagtcctcttagtatcatcaattcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccccacaa 29164010  T
Q  462 aatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    | ||||||||         |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  29164011 agtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacttgtaa 29164083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 270 - 537
Target Start/End: Original strand, 40935993 - 40936241
Alignment:
Q  270 ttgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagtt 369  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||  |||| || ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  40935993 ttgtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacacctcattgtttatacagtgacatcaaaagtt 40936092  T
Q  370 cagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaac 469  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||                  ||||||    
T  40936093 cagtcctcatagtatcatctattcatcagattaacaagaatacacttaatataattttatcc-aactttttttaag------------------tgtaac 40936173  T
Q  470 actgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtac 537  Q
    ||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40936174 acttaagactatcacatgatattagcaactccgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtac 40936241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 341 - 501
Target Start/End: Original strand, 53176127 - 53176286
Alignment:
Q  341 ccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttatt 440  Q
    |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  53176127 ccactgtttgtacaataacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaacctcatt 53176226  T
Q  441 ttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactct 501  Q
    |||| | ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53176227 ttaaatataaca-ctccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactct 53176286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 359 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 54828786 - 54828603
Alignment:
Q  359 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccca 458  Q
    |||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  54828786 catcaaaaattcattcttcatagcatcatcaattcatcatatgaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaaca-tccca 54828688  T
Q  459 caaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||| ||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||| |||||||| || ||||| |||||||||||| |||||    
T  54828687 caaagtgtaacacttaaaactatcaaataatatcatcaactatgtttgtatgttaaaaattccaactataaaatagtacatgtaa 54828603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 386 - 537
Target Start/End: Original strand, 1089811 - 1089962
Alignment:
Q  386 atcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcaca 485  Q
    ||||||| |||| || |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1089811 atcaatttatcagatcaacaggactacattaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 1089910  T
Q  486 taatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtac 537  Q
    ||| |||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1089911 taacatcaacaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtac 1089962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 382 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 22622780 - 22622620
Alignment:
Q  382 tatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactat 481  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||    
T  22622780 tatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgtttcaagtgtaaca-ccccacaaagcgtaacacttaagactat 22622682  T
Q  482 cacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  22622681 cacataatatcatcaaatctgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaa 22622620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20373465 - 20373303
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||  | ||||||  ||||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||  || |||||||||||||||     
T  20373465 aagtcataagaatgatttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaacgagtaacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtt 20373366  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctacctt 437  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20373365 ctcatggtatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcctacctt 20373303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 356 - 536
Target Start/End: Original strand, 38591786 - 38591965
Alignment:
Q  356 tggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccc 455  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||    
T  38591786 tggcatcaaaagttaagtccacatattattatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgtttcaagtgtaata-cc 38591884  T
Q  456 ccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagta 536  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||  ||||||||||| ||||    
T  38591885 ccacaaaacgtgacacttaagactatcacataatatcatcaaatctatttgcatgtcaaagatgacaacgataaaaaagta 38591965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 375 - 538
Target Start/End: Original strand, 36012244 - 36012408
Alignment:
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaatttt-atcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactg 473  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  36012244 ctcataatatcatcaattcatcagatgaacaagaatacacctaatctaatttttatcctaccttgttttcagtgtaacatccc-acaaaatgtaacactt 36012342  T
Q  474 aagactatcacataatatcagcaactc-tggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacc 538  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36012343 aagactatcaaatgatatcagcaactcttgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtacc 36012408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 283 - 536
Target Start/End: Original strand, 54505823 - 54506074
Alignment:
Q  283 agaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagt 382  Q
    |||||||||||| || ||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  ||||||| | ||| ||   || |||||||| ||||| |||||||||    
T  54505823 agaatgacttttttgttgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccattatttatagaatgacatcaaaaattcag-cctcatagt 54505921  T
Q  383 atcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatc 482  Q
    ||||| ||| ||||   |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || ||||  |||||| |  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  54505922 atcataaatacatcgggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacactct-acaaagtgtaacacttaagactatc 54506020  T
Q  483 acataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagta 536  Q
    ||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54506021 acataatatcatctactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagta 54506074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 318 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 14586796 - 14586587
Alignment:
Q  318 tcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactca 417  Q
    |||||||||| ||||||  |||| |||| ||| ||| |||  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  14586796 tcaaaagtgttgtgagtaacacctcactatttatacagtgatatcaaaagttttgtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacactta 14586697  T
Q  418 atctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaaga 517  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||         ||  || |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  14586696 atctaactttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacac---------tcgtatgatatcaacaactatgtttgcatgttaaaga 14586607  T
Q  518 taccaacgataaaatagtac 537  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  14586606 tgccaacgataaaatagtac 14586587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 370 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 11835702 - 11835562
Alignment:
Q  370 cagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaat-tttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaa 468  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| |||||    
T  11835702 cagtccccatagtatcatcaatttatcatattaacaaaaatacacttaatctaatatttatcctaccttgttttaagtgtaaca-acctacaaagtgtaa 11835604  T
Q  469 cactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatg 510  Q
    || | ||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||    
T  11835603 caattaagactatcacatgatatcatcaactctatttgcatg 11835562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 425 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 20373263 - 20373152
Alignment:
Q  425 tttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaac 524  Q
    ||||||||||||| || |||| |||| | ||| | ||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20373263 tttatcctaccttgttataagcgtaatatccc-ataaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaac 20373165  T
Q  525 gataaaatagtac 537  Q
    |||||||||||||    
T  20373164 gataaaatagtac 20373152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 455 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 11357140 - 11357059
Alignment:
Q  455 cccacaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagta 536  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||    
T  11357140 cccacaaagtgtaacactcaagactatcatataatatcatcaactctggttgtatgttaaatatgccaatgataaaatagta 11357059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 478 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 51212738 - 51212673
Alignment:
Q  478 ctatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  51212738 ctatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaa 51212673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 474 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 53811701 - 53811646
Alignment:
Q  474 aagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaata 533  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53811701 aagactatcacataatatcatcaact----ttgcatgttaaagataccaacgataaaata 53811646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 53811767 - 53811695
Alignment:
Q  345 tgtttgtacggtggcatcaaaagttcagt------cctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagacta 411  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||      || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53811767 tgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtatataaccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagacta 53811695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 40640684 - 40640637
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 304  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40640684 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagt 40640637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 55343471 - 55343405
Alignment:
Q  257 aaggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaa 323  Q
    ||||||||||| || || |||||| || ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||    
T  55343471 aaggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatatcaaaa 55343405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 11835790 - 11835702
Alignment:
Q  260 gaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtac 353  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||     |||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||    
T  11835790 gaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacac-----tatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtac 11835702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 261 - 543
Target Start/End: Original strand, 7889 - 8170
Alignment:
Q  261 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 360  Q
    ||||||| || || |||| || |||||||||||| || ||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||  || ||    
T  7889 aaaattctatggtgaagttataagaatgacttttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgaca 7988  T
Q  361 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccaca 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  | |||| |||||| |||||||    
T  7989 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgctataagcgtaaca-ccccaca 8087  T
Q  461 aaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  8088 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaa 8170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 261 - 543
Target Start/End: Original strand, 11908 - 12192
Alignment:
Q  261 aaaattccattgtcaagtcatgagaa-tgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcacccc-actgtttgta-cggtg 357  Q
    ||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||  || |||||||| ||||||  |||||| | |||||||| | |||    
T  11908 aaaattctatggtgaagtcatgagaaatgacttttctggtgaaattaacaccataacattaaaagtgttgtgagtaacacccccattgtttgtatcagtg 12007  T
Q  358 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccc 457  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  12008 gtatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaaca-cccc 12106  T
Q  458 acaaaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  12107 acaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaa 12192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 111; Significance: 9e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 261 - 543
Target Start/End: Original strand, 43959 - 44239
Alignment:
Q  261 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 360  Q
    ||||||| || || ||||| | |||| ||||||| |||||||||  || ||||| |||||||| |||| |||||  ||||||  |||||||||  |||||    
T  43959 aaaattctatggtgaagtcgtaagaaagacttttttggtgaagttaacgctataatatcaaaaatgtaatgagtaacaccccgttgtttgtacaatggca 44058  T
Q  361 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccaca 460  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||| || ||| || ||||  ||||| |||||||    
T  44059 taaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaaca-ccccaca 44157  T
Q  461 aaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  44158 aagtgtaacacttaag-ctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaa 44239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 111; Significance: 9e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 261 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 154828 - 154548
Alignment:
Q  261 aaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggca 360  Q
    ||||||| || || ||||| | |||| ||||||| |||||||||  || ||||| |||||||| |||| |||||  ||||||  |||||||||  |||||    
T  154828 aaaattctatggtgaagtcgtaagaaagacttttttggtgaagttaacgctataatatcaaaaatgtaatgagtaacaccccgttgtttgtacaatggca 154729  T
Q  361 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccaca 460  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||| || ||| || ||||  ||||| |||||||    
T  154728 taaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaaca-ccccaca 154630  T
Q  461 aaatgtaacactgaagactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  154629 aagtgtaacacttaag-ctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaa 154548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 307 - 543
Target Start/End: Original strand, 267331 - 267568
Alignment:
Q  307 acactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgttt-gtacggtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaaca 405  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||  || || ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  267331 acactatagcatcaaaaatatagtgagtaacatccaactgttttgtacagtgtcatcaaaagttcagtctctataatatcatcaattcattagattagca 267430  T
Q  406 agactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacac-tgaagactatcacataatatcagcaactctggt 504  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  267431 agactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaaca-tcccacaaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactttgtt 267529  T
Q  505 tgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacctgtaa 543  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  267530 tgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaa 267568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 101; Significance: 8e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 275 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 146185 - 145926
Alignment:
Q  275 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtc 374  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||| ||||  ||| ||||  || |||| |||| |||||  ||||||| | ||||||   || |||||||||||||| |    
T  146185 aagtcataagaatgatttttttggttaagttaacattataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccattatttgtagaatgacatcaaaagttcagcc 146086  T
Q  375 ctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacacccccacaaaatgtaacactga 474  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || ||||  ||||| ||| ||||| ||||||||| |    
T  146085 ttcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataaca-ccctacaaagtgtaacactta 145987  T
Q  475 agactatcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgataaaatagt 535  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  145986 agactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagt 145926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 350
Target Start/End: Original strand, 42347 - 42439
Alignment:
Q  258 aggaaaattccattgtcaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcgacactatagtatcaaaagtgtagtgagtggcaccccactgtttg 350  Q
    |||||||||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||    
T  42347 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaataatttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttg 42439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 527
Target Start/End: Original strand, 100948 - 100994
Alignment:
Q  481 tcacataatatcagcaactctggttgcatgttaaagataccaacgat 527  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  100948 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgat 100994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 444
Target Start/End: Original strand, 100894 - 100935
Alignment:
Q  403 acaagactacactcaatctaattttatcctaccttattttaa 444  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  100894 acaagactacacttaatttaattttatcctaccttgttttaa 100935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University