View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8180A_low_111 (Length: 294)

Name: NF8180A_low_111
Description: NF8180A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8180A_low_111
NF8180A_low_111
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (31-275)||(43960-44204)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (31-275)||(38550167-38550411)
chr8 (31-275)||(20982801-20983045)
chr8 (31-275)||(27472472-27472708)
chr8 (32-233)||(39833687-39833887)
chr8 (76-275)||(6102544-6102738)
chr8 (18-274)||(21580001-21580242)
chr8 (18-275)||(39936856-39937095)
chr8 (31-165)||(13428328-13428462)
chr8 (18-207)||(24713188-24713371)
chr8 (163-275)||(18760481-18760593)
chr8 (31-160)||(1323366-1323495)
chr8 (41-275)||(41680916-41681133)
chr8 (176-275)||(1327201-1327300)
chr8 (78-186)||(29763740-29763846)
chr8 (176-275)||(42560321-42560419)
chr8 (18-120)||(19127977-19128073)
chr8 (111-275)||(21415256-21415421)
chr8 (163-276)||(19128061-19128161)
chr8 (18-120)||(18760397-18760493)
chr8 (76-174)||(2418971-2419066)
chr8 (126-174)||(35026960-35027008)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (31-275)||(25956797-25957041)
chr6 (37-275)||(27850884-27851113)
chr6 (18-275)||(18708467-18708706)
chr6 (22-275)||(20734241-20734477)
chr6 (18-209)||(17318969-17319155)
chr6 (146-275)||(19399687-19399816)
chr6 (169-275)||(31630703-31630809)
chr6 (95-275)||(23151112-23151279)
chr6 (76-181)||(27323545-27323649)
chr6 (18-103)||(19444250-19444331)
chr6 (132-275)||(28708550-28708680)
chr6 (81-178)||(31733740-31733836)
chr6 (18-103)||(16133640-16133721)
chr6 (176-275)||(34297063-34297161)
chr6 (18-104)||(23017094-23017175)
chr6 (216-275)||(18927823-18927882)
chr6 (124-207)||(31733829-31733911)
chr6 (18-55)||(27326767-27326804)
chr6 (18-55)||(27387507-27387544)
chr6 (37-68)||(18822102-18822133)
chr6 (76-174)||(20136594-20136691)
chr6 (76-174)||(22196178-22196275)
chr6 (76-174)||(23528201-23528298)
chr6 (236-275)||(27322264-27322303)
chr6 (31-68)||(18822053-18822090)
chr6 (137-206)||(19829807-19829875)
chr6 (18-47)||(31733715-31733744)
chr6 (37-77)||(18456587-18456627)
chr6 (37-77)||(18461747-18461787)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (31-275)||(15099050-15099293)
chr4 (31-275)||(361956-362191)
chr4 (18-275)||(19609291-19609530)
chr4 (31-177)||(19857283-19857429)
chr4 (18-275)||(35812283-35812522)
chr4 (18-177)||(15042058-15042213)
chr4 (18-177)||(15112211-15112366)
chr4 (37-178)||(15869019-15869163)
chr4 (18-131)||(46642579-46642691)
chr4 (18-275)||(33185919-33186160)
chr4 (124-275)||(15868875-15869026)
chr4 (39-176)||(32851052-32851192)
chr4 (31-120)||(13844304-13844393)
chr4 (124-275)||(630940-631091)
chr4 (76-186)||(10357362-10357471)
chr4 (18-111)||(3484988-3485077)
chr4 (175-274)||(13844384-13844483)
chr4 (101-207)||(10357285-10357391)
chr4 (37-139)||(3514880-3514985)
chr4 (124-229)||(14185097-14185201)
chr4 (162-275)||(32851218-32851331)
chr4 (175-275)||(46642679-46642779)
chr4 (216-275)||(9923296-9923355)
chr4 (223-275)||(11479504-11479556)
chr4 (18-73)||(10357535-10357589)
chr4 (37-114)||(21815788-21815868)
chr4 (37-77)||(21815877-21815917)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (31-275)||(9389873-9390116)
chr7 (31-271)||(6170283-6170522)
chr7 (31-275)||(17232330-17232566)
chr7 (31-275)||(37727721-37727957)
chr7 (31-275)||(45847816-45848043)
chr7 (62-275)||(14270220-14270428)
chr7 (59-275)||(8468173-8468372)
chr7 (18-275)||(8852011-8852250)
chr7 (18-275)||(36686044-36686285)
chr7 (18-271)||(11066435-11066670)
chr7 (18-275)||(30821050-30821291)
chr7 (18-273)||(59239-59477)
chr7 (18-198)||(32434499-32434674)
chr7 (18-275)||(38480054-38480295)
chr7 (15-173)||(48811865-48812018)
chr7 (76-275)||(12371299-12371484)
chr7 (18-195)||(13150458-13150621)
chr7 (18-173)||(46386997-46387147)
chr7 (76-275)||(12128010-12128195)
chr7 (176-275)||(15213659-15213757)
chr7 (18-120)||(18875861-18875957)
chr7 (178-275)||(18302016-18302113)
chr7 (132-204)||(11392030-11392102)
chr7 (18-111)||(20619252-20619340)
chr7 (216-275)||(13148318-13148377)
chr7 (76-173)||(18075463-18075559)
chr7 (80-177)||(14183560-14183653)
chr7 (18-73)||(20253594-20253649)
chr7 (238-275)||(11391972-11392009)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (31-275)||(1465587-1465830)
chr3 (31-275)||(49389846-49390090)
chr3 (37-275)||(18440023-18440261)
chr3 (18-275)||(12269266-12269515)
chr3 (31-275)||(20630273-20630509)
chr3 (18-275)||(40806963-40807202)
chr3 (18-275)||(22307429-22307668)
chr3 (19-275)||(30175360-30175598)
chr3 (18-275)||(15447791-15448032)
chr3 (18-275)||(17538074-17538313)
chr3 (18-275)||(31224748-31224989)
chr3 (15-275)||(31415223-31415462)
chr3 (146-275)||(49970046-49970175)
chr3 (18-207)||(41173220-41173404)
chr3 (15-207)||(5214882-5215068)
chr3 (18-186)||(17519827-17519990)
chr3 (18-186)||(17534689-17534852)
chr3 (84-275)||(14500888-14501079)
chr3 (25-192)||(13516368-13516529)
chr3 (18-173)||(40811778-40811928)
chr3 (18-207)||(5206503-5206688)
chr3 (18-207)||(14507871-14508054)
chr3 (39-178)||(23413557-23413699)
chr3 (39-178)||(45796838-45796980)
chr3 (22-192)||(15932371-15932535)
chr3 (179-275)||(12852535-12852631)
chr3 (18-107)||(13026636-13026721)
chr3 (129-275)||(45796978-45797123)
chr3 (18-107)||(13031725-13031810)
chr3 (82-192)||(17693155-17693264)
chr3 (37-112)||(19485261-19485335)
chr3 (132-275)||(5841857-5841987)
chr3 (20-103)||(17548519-17548598)
chr3 (18-103)||(17044063-17044143)
chr3 (176-274)||(11912881-11912978)
chr3 (124-235)||(23413454-23413564)
chr3 (119-173)||(17519784-17519838)
chr3 (119-173)||(17534646-17534700)
chr3 (127-184)||(52466418-52466475)
chr3 (224-275)||(40811993-40812044)
chr3 (37-114)||(53070856-53070936)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (31-275)||(2746-2990)
[»] chr1 (21 HSPs)
chr1 (31-275)||(28194625-28194869)
chr1 (31-275)||(46382731-46382975)
chr1 (31-275)||(43697075-43697318)
chr1 (31-275)||(35981864-35982099)
chr1 (31-275)||(43542819-43543055)
chr1 (31-233)||(41305814-41306007)
chr1 (18-274)||(48300830-48301068)
chr1 (18-186)||(51274461-51274623)
chr1 (18-192)||(20587697-20587866)
chr1 (18-192)||(20592235-20592404)
chr1 (18-174)||(20634508-20634659)
chr1 (31-130)||(20636606-20636705)
chr1 (175-275)||(20636694-20636793)
chr1 (18-120)||(35088484-35088580)
chr1 (18-111)||(14238498-14238587)
chr1 (20-103)||(13528762-13528841)
chr1 (76-180)||(41227622-41227725)
chr1 (112-214)||(11809380-11809482)
chr1 (112-214)||(23073052-23073154)
chr1 (76-174)||(16381109-16381203)
chr1 (222-275)||(41227550-41227603)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (18-275)||(6576180-6576432)
chr2 (18-275)||(5032170-5032409)
chr2 (18-275)||(24781686-24781925)
chr2 (18-200)||(22689647-22689824)
chr2 (18-200)||(22694243-22694420)
chr2 (18-270)||(24436020-24436245)
chr2 (18-186)||(9974892-9975055)
chr2 (18-275)||(24883429-24883659)
chr2 (76-186)||(22500860-22500968)
chr2 (76-186)||(22508794-22508902)
chr2 (76-275)||(24865564-24865751)
chr2 (18-107)||(26896277-26896362)
chr2 (18-134)||(7672421-7672532)
chr2 (124-260)||(21367914-21368050)
chr2 (20-103)||(6478254-6478333)
chr2 (76-173)||(20915126-20915222)
chr2 (18-91)||(356982-357051)
chr2 (18-73)||(24865791-24865846)
chr2 (101-192)||(9975026-9975116)
chr2 (18-73)||(19202169-19202224)
chr2 (18-57)||(20913058-20913097)
chr2 (18-73)||(23969686-23969741)
chr2 (124-214)||(5985197-5985286)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (70-275)||(2468-2672)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (31-221)||(106266-106456)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (73-275)||(84991-85193)
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (31-275)||(21741709-21741961)
chr5 (31-275)||(5889351-5889579)
chr5 (59-275)||(29915249-29915457)
chr5 (18-275)||(12122315-12122556)
chr5 (18-275)||(21555173-21555415)
chr5 (18-275)||(21557839-21558080)
chr5 (18-275)||(17875031-17875272)
chr5 (18-275)||(31454895-31455135)
chr5 (18-275)||(31455508-31455748)
chr5 (176-275)||(36460130-36460228)
chr5 (18-120)||(19920682-19920778)
chr5 (18-73)||(21309019-21309074)
chr5 (76-214)||(25250739-25250875)
chr5 (76-214)||(25314524-25314660)
chr5 (117-175)||(30615667-30615725)
chr5 (76-174)||(25743647-25743744)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (31-204)||(46923-47095)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (18-207)||(145754-145938)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (18-275)||(14157-14398)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (112-275)||(362787-362950)
[»] scaffold1792 (2 HSPs)
scaffold1792 (37-178)||(103-243)
scaffold1792 (124-275)||(236-386)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (18-275)||(9148-9387)
[»] scaffold0230 (3 HSPs)
scaffold0230 (37-178)||(23657-23797)
scaffold0230 (37-134)||(20770-20867)
scaffold0230 (124-275)||(23514-23664)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (18-275)||(1383-1624)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (18-275)||(10072-10311)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (18-275)||(59399-59638)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (19-193)||(9673-9842)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (18-207)||(57767-57951)
[»] scaffold0737 (4 HSPs)
scaffold0737 (18-275)||(6472-6712)
scaffold0737 (101-207)||(5562-5667)
scaffold0737 (119-185)||(5639-5705)
scaffold0737 (119-182)||(5751-5814)
[»] scaffold0061 (3 HSPs)
scaffold0061 (29-182)||(19320-19469)
scaffold0061 (200-267)||(15529-15595)
scaffold0061 (200-267)||(24587-24653)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (18-275)||(76718-76948)
[»] scaffold0235 (4 HSPs)
scaffold0235 (39-178)||(13233-13375)
scaffold0235 (45-178)||(24940-25076)
scaffold0235 (129-275)||(13373-13519)
scaffold0235 (129-235)||(25074-25180)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (22-176)||(2768-2917)
scaffold0507 (22-66)||(2942-2986)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (39-178)||(8605-8747)
scaffold0075 (124-275)||(8460-8612)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (39-168)||(34820-34952)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (18-275)||(2892-3122)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (129-275)||(8232-8365)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (179-275)||(24820-24916)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (18-111)||(33427-33516)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (37-139)||(4567-4672)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (18-111)||(285-374)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (18-111)||(10872-10961)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (76-275)||(10766-10953)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (18-111)||(863-952)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (15-120)||(78299-78398)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (18-103)||(605-686)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (179-275)||(7815-7911)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (18-255)||(95298-95531)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (132-275)||(2523-2653)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (111-275)||(1780-1945)
[»] scaffold0599 (2 HSPs)
scaffold0599 (176-274)||(157-254)
scaffold0599 (176-274)||(4575-4672)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (39-178)||(74522-74656)
[»] scaffold0632 (1 HSPs)
scaffold0632 (99-207)||(263-368)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (23-103)||(41193-41269)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (18-111)||(78053-78141)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (124-177)||(7585-7638)
[»] scaffold0815 (1 HSPs)
scaffold0815 (196-275)||(463-542)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (216-275)||(5550-5609)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (216-275)||(6853-6912)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (224-275)||(812-863)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (18-73)||(15943-15998)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (37-77)||(9752-9792)


Alignment Details
Target: scaffold0116 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 44204 - 43960
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44204 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacaacttagac 44105  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaagg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44104 atctcttatgactccaataatttggaccaacatcttataacttaaacaacttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatcagcaagg 44005  T
Q  231 caacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  44004 caacatcatcaaataatttacagcaagtcatcatcaacaataatc 43960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 38550411 - 38550167
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38550411 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaataagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacaacttagac 38550312  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaagg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  38550311 atctcttatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatcagcaaga 38550212  T
Q  231 caacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  38550211 caacaccatcaaataatttacagcaagtcaacatcaacaataatc 38550167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20983045 - 20982801
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20983045 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagctttcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacaacttagac 20982946  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaagg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20982945 atctcttatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaatttaaacaaacattaacatcttaatgatattaatacatcacatcagcaagg 20982846  T
Q  231 caacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||| ||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||    
T  20982845 caacaccatcaaataatttacagcaaatcaacatcaacaataatc 20982801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27472708 - 27472472
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||    
T  27472708 acatattatgtataaatatatattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatagactcaacatcttaacaactta--------gac 27472617  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaagg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27472616 atctcttatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatcagcaagg 27472517  T
Q  231 caacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  27472516 caacaccatcaaataatttacagcaagtcaacatcaacaataatc 27472472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 32 - 233
Target Start/End: Original strand, 39833687 - 39833887
Alignment:
Q  32 cataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagaca 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  39833687 catattatgtataaatatacattacagagcatcaagccatcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactcaacaacttagaca 39833786  T
Q  132 tctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggc 231  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39833787 tctcttatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagatcaacattag-atcttcatgatattaatacatcacatcagcaaggc 39833885  T
Q  232 aa 233  Q
    ||    
T  39833886 aa 39833887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 76 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6102738 - 6102544
Alignment:
Q  76 caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaa 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||    |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6102738 caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatctta-cgacttaagaact----catctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaa 6102644  T
Q  176 acaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  6102643 acaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatggagcaagtcaacatcaacaacaatc 6102544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21580242 - 21580001
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  21580242 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatctt-acgact 21580148  T
Q  118 taacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatctt-aatgatattaataca 216  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||          |||||| |||| ||||||| ||    
T  21580147 taacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactt-aacaacttaga----------catcttaaatggtattaattca 21580059  T
Q  217 tcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataat 274  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||  ||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  21580058 tcacaacagcaagacaacatcatttaaacatatgcagcaagtcaccatcaataataat 21580001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 39937095 - 39936856
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  39937095 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattagagggcatcaagccctca----acttaaataagtatgca-tggactcaacatctta-caact 39937002  T
Q  118 taa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaataca 216  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||             |    
T  39937001 taaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacgacttaaacaacttagaccaacattagcatccta-------------a 39936915  T
Q  217 tcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  39936914 tcacgatagcaaggcagcaccattaaataatatgcagcaagtcaacattaacaataatc 39936856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13428462 - 13428328
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13428462 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaaaccctcacccaacgtaaatgagtatgtaatggactcaacatcttaacaacttaacaacttagac 13428363  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatct 165  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  13428362 atctcttatgactccaataatttggatcaacatct 13428328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 207
Target Start/End: Original strand, 24713188 - 24713371
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||    
T  24713188 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagagcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-agggactcaacgtctt-acaact 24713281  T
Q  118 t-aacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgat 207  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||    
T  24713282 taaacagcttagacatctcatatgacttcaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaactt-gaccaacatatgcaacttaatgat 24713371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 163 - 275
Target Start/End: Original strand, 18760481 - 18760593
Alignment:
Q  163 tcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatc 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  18760481 tcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaatagcaaggcatcaccattaaataatatgcagcaagtcaac 18760580  T
Q  263 atcaacaataatc 275  Q
    |||||||||||||    
T  18760581 atcaacaataatc 18760593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 1323495 - 1323366
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1323495 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccgacgtaaatgaatatgcaatgtacttaacatcttaacaacttaacaacttagac 1323396  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaa 160  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1323395 atctcttatgactccaataatttggatcaa 1323366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 41681133 - 41680916
Alignment:
Q  41 tataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctcttatg 140  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||    
T  41681133 tataaatatacattacagggcatcaagccctcg----acttaaatgagtatgcaatggactcaacatctta-cgacttaacaacttagatatctcatatg 41681039  T
Q  141 actctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccatt 240  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||          |||||||||| ||||||| |||||||||| |||| || |||||||    
T  41681038 actccaataatttggatcaacatcttacaactt-aacaactt-ga----------catcttaatggtattaattcatcacaacaacaagacatcaccatt 41680951  T
Q  241 aaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
     ||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  41680950 taaacatatgcagcaagtcaccatcaataataatc 41680916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1327300 - 1327201
Alignment:
Q  176 acaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  1327300 acaacttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatcagcaaggcaacaccatcaaataatttacagcaagtcaacatcaacaataatc 1327201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29763846 - 29763740
Alignment:
Q  78 acttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaac 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  29763846 acttaaatgagtatgcaatggactcaacatctta-cgacttaacaacttaaacatctcatatgacttcaataatttggatcaacatcttacaactt-aac 29763749  T
Q  178 aacttagac 186  Q
    |||||||||    
T  29763748 aacttagac 29763740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 42560419 - 42560321
Alignment:
Q  176 acaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  42560419 acaacttataccaacattag-atcttcatgatattaatacgtcacaaccgcaaggtaacaccattaaataatatgcagcaagtcaacatcaataataatc 42560321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 120
Target Start/End: Original strand, 19127977 - 19128073
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  19127977 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaact 19128070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21415421 - 21415256
Alignment:
Q  111 aacaacttaacagcttagacatctctt-atgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcat-cttaatgata 208  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||| ||| |||| ||||||| |||| || |||||||| |    
T  21415421 aacatcttaacgacttagacatctctttatgactccaataacttggatcaacatcttacgacttgaacgactttgaccaac-ttagaattcttaatgaca 21415323  T
Q  209 ttaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||||| || ||| |||||||    
T  21415322 ttattacttcacaacagcaaggcaacatcatataataataagcagcaagtcaacaacaataataatc 21415256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 276
Target Start/End: Original strand, 19128061 - 19128161
Alignment:
Q  163 tcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatc 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||             ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  19128061 tcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcctaat-------------caggacagcaaggcagcaccattaaataatatgcagcaagtcaac 19128147  T
Q  263 atcaacaataatct 276  Q
    ||||||||||||||    
T  19128148 atcaacaataatct 19128161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 120
Target Start/End: Original strand, 18760397 - 18760493
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  18760397 catcaagcccccaacataacatgtataaatatacattacaggacatcaagccct----caacttaaatgagtatg-tatggactcaacgtctt-acaact 18760490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2419066 - 2418971
Alignment:
Q  76 caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaactta 174  Q
    |||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| || | ||||||| |   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2419066 caacttgaatgagtatgcatgagactcaacatctta-caacttaaacaacgtagacatat---atgactccaataatttggatcaacatcttacaactta 2418971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 35027008 - 35026960
Alignment:
Q  126 tagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaactta 174  Q
    |||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35027008 tagacatcttatacgactccaataatttggatcaacatcttacaactta 35026960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25957041 - 25956797
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25957041 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacaacttagac 25956942  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaagg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25956941 atctcttatgactccaataatttggaccaacatcttataacttaaacaacttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatcagcaagg 25956842  T
Q  231 caacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  25956841 caacatcatcaaataatttacagcaagtcatcatcaacaataatc 25956797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 275
Target Start/End: Original strand, 27850884 - 27851113
Alignment:
Q  37 tatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctct 136  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  27850884 tatgtacaaatatacattatagagcatcaagccctcacccaatgtaaacgagtatgcaattgactcaacatcttaacaacttaacaacttagacatctcg 27850983  T
Q  137 tatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacac 236  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27850984 tatgactccaataatttggaccaacatcttacaacttaa---------accaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatcagtaaggcaacac 27851074  T
Q  237 cattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||| ||||||| || ||||||||| |||| |||||||||    
T  27851075 catcaaataatttgcagcaagtcaacatcgacaataatc 27851113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 18708467 - 18708706
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  18708467 catcaagccctcaacataatatgtataaatgtacattacagggcatcaagccctca----acttaaatgagtatgca-tggactcaacgtctta-caact 18708560  T
Q  118 taa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaataca 216  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||             |    
T  18708561 taaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatccta-------------a 18708647  T
Q  217 tcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  18708648 tcacgacagcaaggcatcaccattaaataatatgcagcaagtcaacataaacaataatc 18708706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20734477 - 20734241
Alignment:
Q  22 aagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  20734477 aagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaaaccctca----acttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttatga-cttaac 20734383  T
Q  122 agcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcaca 221  Q
    | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||          |||||||||| ||||||| |||||||    
T  20734382 aacttagatatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactt-aacaactt-ga----------catcttaatggtattaattcatcaca 20734295  T
Q  222 acagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  20734294 acagcaagacaacaccatttaaacatatgcagcaagtcaccatcaataataatc 20734241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17319155 - 17318969
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    |||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||    
T  17319155 catcaagccctcaacataatatatataaatatacattacattgcatcaagccctca----acttaaatgagtataca-tggactcaacgtctta-caact 17319062  T
Q  118 taa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatat 209  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  17319061 taaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacatatgctacttaatgatat 17318969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 146 - 275
Target Start/End: Original strand, 19399687 - 19399816
Alignment:
Q  146 aataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaata 245  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  19399687 aatactttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgataataatacatcacaaaagcaaggcagaaccattaaata 19399786  T
Q  246 atatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19399787 atatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 19399816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31630809 - 31630703
Alignment:
Q  169 aacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaac 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  31630809 aacttaaacaacttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatcaacaagacaacaccatcaaataatttacagcaagtcaacatcaac 31630710  T
Q  269 aataatc 275  Q
    |||||||    
T  31630709 aataatc 31630703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 95 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23151279 - 23151112
Alignment:
Q  95 atggactcaacatcttaacaacttaa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacatt 193  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23151279 atggactcaacgtctta-caacataaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacgacttaaacaacttagaccaacatt 23151181  T
Q  194 agcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||||| ||             ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  23151180 agcatccta-------------atcacgatagcaaggcagcaccattaaataatatgcagcaagtcaacattaacaataatc 23151112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27323649 - 27323545
Alignment:
Q  76 caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaactta 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27323649 caacttaaatgagtatgca-tggactcaacatctta-caacttaaacaacttagacatctcatatgacgccaataatttggatcaacatcttacaactta 27323552  T
Q  175 aacaact 181  Q
    |||||||    
T  27323551 aacaact 27323545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 19444331 - 19444250
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactca 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19444331 catcaaaccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgcaatggactca 19444250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 275
Target Start/End: Original strand, 28708550 - 28708680
Alignment:
Q  132 tctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggc 231  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||             ||||| |||||||  |    
T  28708550 tctcatatgactccaataatttggatcaaaatcttacaatttaaacaacttagaccaacattagcatccta-------------atcacgacagcaaaac 28708636  T
Q  232 aacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28708637 aacactattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 28708680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 178
Target Start/End: Original strand, 31733740 - 31733836
Alignment:
Q  81 taaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaaca 178  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31733740 taaatgagtatgca-tggactcaacgtctta-caacttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaaca 31733836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 16133721 - 16133640
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactca 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16133721 catcaaaccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgcaatgaactca 16133640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 34297161 - 34297063
Alignment:
Q  176 acaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||    
T  34297161 acaacttatcccaacattag-atcttcatgatattaatacgtcacaaccgcaaggaaacaccattaaataatatgcagcaagtcaacattaataataatc 34297063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 23017175 - 23017094
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaa 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23017175 catcaaaccctcaacataatatgtataaatatacattacatggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaa 23017094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 275
Target Start/End: Original strand, 18927823 - 18927882
Alignment:
Q  216 atcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18927823 atcacgacagcaaggcagcaccattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 18927882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 207
Target Start/End: Original strand, 31733829 - 31733911
Alignment:
Q  124 cttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgat 207  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| |||||||||    
T  31733829 cttaaacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactttaacaactt-gaccaacatatgcaacttaatgat 31733911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 27326804 - 27326767
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacatta 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27326804 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacatta 27326767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 27387544 - 27387507
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacatta 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27387544 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacatta 27387507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 18822133 - 18822102
Alignment:
Q  37 tatgtataaatatacattacaaagcatcaagc 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18822133 tatgtataaatatacattacaaagcatcaagc 18822102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 174
Target Start/End: Original strand, 20136594 - 20136691
Alignment:
Q  76 caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactta-acagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaactta 174  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | | |||||||  |||||||| || | |||||| ||| |||||||| ||||    
T  20136594 caacttaaatgagtatgc-atggactcaacatctt-acaacttagacaacatcgacatcttatatgactccaacattttggaacaacatcttacatctta 20136691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22196275 - 22196178
Alignment:
Q  76 caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactta-acagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaactta 174  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | | |||||||  |||||||| || | |||||| ||| |||||||| ||||    
T  22196275 caacttaaatgagtatgc-atggactcaacatctt-acaacttagacaacatcgacatcttatatgactccaacattttggaacaacatcttacatctta 22196178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23528298 - 23528201
Alignment:
Q  76 caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactta-acagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaactta 174  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||| | |  ||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23528298 caacttaaatgagtatgc-atgaactcaacatctt-acaacttagacatcatgaacatcttatatgactccaatagtttggatcaacatcttacatctta 23528201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27322303 - 27322264
Alignment:
Q  236 ccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  27322303 ccattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 27322264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 18822090 - 18822053
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagc 68  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18822090 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagc 18822053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19829875 - 19829807
Alignment:
Q  137 tatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatga 206  Q
    |||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  19829875 tatgactccaatactttggaacaacatcttacaactt-tacaacttagaccaacacttgcaacttaatga 19829807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 47
Target Start/End: Original strand, 31733715 - 31733744
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaat 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31733715 catcaagccctcaacataatatgtataaat 31733744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 77
Target Start/End: Original strand, 18456587 - 18456627
Alignment:
Q  37 tatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcaccca 77  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  18456587 tatgtataaatatacattacagagcatcaagctctctccca 18456627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 77
Target Start/End: Original strand, 18461747 - 18461787
Alignment:
Q  37 tatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcaccca 77  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  18461747 tatgtataaatatacattacagagcatcaagctctctccca 18461787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Original strand, 15099050 - 15099293
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15099050 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacattttaacaacttaacaacttagac 15099149  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaagg 230  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15099150 agctcttatgactctaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattag-atcttcatgatattaatacgtcacaaccgcaagg 15099248  T
Q  231 caacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15099249 caacaccattaaatagtatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 15099293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Original strand, 361956 - 362191
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  361956 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaatatcttaacaacttaacagcttagac 362055  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaagg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  362056 atctcttatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaa---------accaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatcagcaagg 362146  T
Q  231 caacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  362147 caacaccatcaaataatttacagcaagtcaacatcaacaataatc 362191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 19609291 - 19609530
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||    
T  19609291 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagtcctca----acttaaatgagtatgca-tggactcaacgtctta-cagct 19609384  T
Q  118 taa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaataca 216  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||             |    
T  19609385 taaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatccta-------------a 19609471  T
Q  217 tcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19609472 tcacgacagcaaggcagcaccattaaataatatgtaacaagtcaacatcaacaataatc 19609530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 177
Target Start/End: Original strand, 19857283 - 19857429
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19857283 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggcctcaacatcttaactacttaacaacttagac 19857382  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaac 177  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19857383 atctcttatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaac 19857429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35812522 - 35812283
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  35812522 catcaagccctcaacatgatatgtataaatatatattacagggcatcaagccctca----acttaaatgagtatgca-tggagtcaacgtctta-caact 35812429  T
Q  118 taa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaataca 216  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||             |    
T  35812428 taaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaatatctttcaacttaaacaacttagaccaacattagcatccta-------------a 35812342  T
Q  217 tcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  35812341 tcacaacagcaagacaacatcattagataatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 35812283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15042213 - 15042058
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  15042213 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaact 15042120  T
Q  118 t--aacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaac 177  Q
    |  |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15042119 taaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaac 15042058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 177
Target Start/End: Original strand, 15112211 - 15112366
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  15112211 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaact 15112304  T
Q  118 t--aacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaac 177  Q
    |  |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15112305 taaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaac 15112366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15869163 - 15869019
Alignment:
Q  37 tatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcaccca--acttaa-atgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatc 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15869163 tatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcccccatcacgtattatgagtatgcaatggactcaacatcctaacaacttaacaacttagacatc 15869064  T
Q  134 tcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaaca 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15869063 tcttatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaaca 15869019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Original strand, 46642579 - 46642691
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  46642579 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagagcatcaaaccctcacccaacttaaatgagtatgcaat-gattcaacatcttaacaact 46642677  T
Q  118 taacagcttagaca 131  Q
    ||||| ||||||||    
T  46642678 taacaacttagaca 46642691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 33185919 - 33186160
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  33185919 catcaagccttcaatataatatgtataaatatacattacaggacatcaagccct----caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatctt-acgact 33186013  T
Q  118 taacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacat 217  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||          |||||||||| ||||||| |||    
T  33186014 taacaacttagacatctcatatgataccaatgatttggatcaacatcttacaactt-aacaacttaga----------catcttaatggtattaattcat 33186102  T
Q  218 cacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||| |||| || || |||| ||  | ||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  33186103 cacaacaacaagacatcatcatttaaacaaatgcagcaagtcaccatcaataataatc 33186160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15869026 - 15868875
Alignment:
Q  124 cttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaac 223  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||| ||||  ||| |||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15869026 cttaaacatctcatatgactccaataaattgggccaacatcttataactcaagcgacttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatc 15868927  T
Q  224 agcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  15868926 agcaaggcaacaacatcaaataatttgcagcaagtcaacatcaacaataatc 15868875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 176
Target Start/End: Original strand, 32851052 - 32851192
Alignment:
Q  39 tgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaat---gagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctc 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || | ||   || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  32851052 tgtataaatatacattacagagcatcaagccctcccccatctcatattatgaatatgcaatggactcaacatcctaacaacctaacaacttagacatctc 32851151  T
Q  136 ttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaa 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32851152 ttatgactccaataatttggatcaacatcttacaaattaaa 32851192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 120
Target Start/End: Original strand, 13844304 - 13844393
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13844304 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaa 13844393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 631091 - 630940
Alignment:
Q  124 cttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaac 223  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||| |||| || | |||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  631091 cttaaacatctcatatgactccaataaattgggtcgatatcttataactcaaacgacttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatc 630992  T
Q  224 agcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||||||  || ||||||| || ||||||||| |||||| |||||||    
T  630991 agcaaggcaacaaaatcaaataatttgcagcaagtcaacatcaataataatc 630940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10357471 - 10357362
Alignment:
Q  76 caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaactta 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10357471 caacttaaatgagtatgca-tggactcaacatctta-caacttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactta 10357374  T
Q  175 aacaacttagac 186  Q
    ||||||||||||    
T  10357373 aacaacttagac 10357362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 111
Target Start/End: Original strand, 3484988 - 3485077
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatctta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3484988 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaggcatcaaaccct----caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatctta 3485077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 175 - 274
Target Start/End: Original strand, 13844384 - 13844483
Alignment:
Q  175 aacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataat 274  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13844384 aacaacttaaaccaatattaacatcttaatgatattaatacatcacatcaacaaggcaacaccatcaaataatttatagcaagtcatcatcaacaataat 13844483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10357391 - 10357285
Alignment:
Q  101 tcaacatcttaacaacttaa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatc 199  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  10357391 tcaacatctta-caacttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacatatgcaac 10357293  T
Q  200 ttaatgat 207  Q
    ||||||||    
T  10357292 ttaatgat 10357285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 139
Target Start/End: Original strand, 3514880 - 3514985
Alignment:
Q  37 tatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaact--taa-atgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatc 133  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3514880 tatgtataaatatacattacagatcatcaagccctctcccatctcgtattatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacaacttagacatc 3514979  T
Q  134 tcttat 139  Q
    ||||||    
T  3514980 tcttat 3514985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 229
Target Start/End: Original strand, 14185097 - 14185201
Alignment:
Q  124 cttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaac 223  Q
    |||| ||||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14185097 cttaaacatctcatatgactcga-tagtttggatcaacatcttacaacttaagcaacttagaccaacattagcaccttaatgatattaatacgtcacaac 14185195  T
Q  224 agcaag 229  Q
    | ||||    
T  14185196 aacaag 14185201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 162 - 275
Target Start/End: Original strand, 32851218 - 32851331
Alignment:
Q  162 atcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcat 261  Q
    |||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | ||||| || | |||||||     
T  32851218 atcttataactcaaacgacttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatatatcacatcagcaaggcaacaacatcatataatttgcaacaagtcaa 32851317  T
Q  262 catcaacaataatc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  32851318 catcaacaataatc 32851331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 275
Target Start/End: Original strand, 46642679 - 46642779
Alignment:
Q  175 aacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataat 274  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  46642679 aacaacttagacaaacattagcaccttaatgatattaatacaccacgacggcaaggcaacactattaactaatatgcagcacgtcaacatcaacaataat 46642778  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  46642779 c 46642779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 275
Target Start/End: Original strand, 9923296 - 9923355
Alignment:
Q  216 atcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  9923296 atcacgacagcaaggcagcaccattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 9923355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11479556 - 11479504
Alignment:
Q  223 cagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  11479556 cagcaaggcagcgccattaagtaatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 11479504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 10357589 - 10357535
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctca 73  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  10357589 catcaaaccctcaacattatatgtataa-tatacattacagggcatcaagccctca 10357535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 21815868 - 21815788
Alignment:
Q  37 tatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaact--ta-aatgagtatgcaatggactcaacatcttaaca 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||  ||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21815868 tatgtataaatatacattacagagcatcaagctctctcccatctcgtattatgcgtatgtaatggactcaacttcttaaca 21815788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 21815917 - 21815877
Alignment:
Q  37 tatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcaccca 77  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  21815917 tatgtataaatatacattacagagcatcaagctctctccca 21815877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9390116 - 9389873
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  9390116 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaatatcttaacagcttaacaacttagac 9390017  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaagg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9390016 atctcttatgactccaataatttggatcaacattttacaacttaaacaacttagacccacattag-atcttcatgatattaatacgtcacaaccgcaagg 9389918  T
Q  231 caacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9389917 caacaccattaaataatatgtagcaagtcaacatcaacaataatc 9389873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6170522 - 6170283
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6170522 acatattatgtataaatatacattatagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacaacttagac 6170423  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaagg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6170422 atctcttatgactccaataatttggaccaacatcatataacttaaacaactta-accaacattagcaacttaatgatattaatacatcacatcagcaagg 6170324  T
Q  231 caacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaat 271  Q
    ||||||||| ||||||| |  || | |||||||||||||||    
T  6170323 caacaccatcaaataatttacagtaggtcatcatcaacaat 6170283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Original strand, 17232330 - 17232566
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||    
T  17232330 acatattatgtataaatatacattacatagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactta--------gac 17232421  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaagg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17232422 atctcttatgactccaataatttggatcaacaccttacaacttaaacaactcaaaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatcagcaagg 17232521  T
Q  231 caacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||| || |||||||||||    
T  17232522 caacaccatcaaataatatacagcaagtcaacagcaacaataatc 17232566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 37727957 - 37727721
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||    
T  37727957 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagctctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactta--------gac 37727866  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaagg 230  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37727865 atctcatatgactccaataatttggaccaacatcttataacttaaacaacttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatcagcaagg 37727766  T
Q  231 caacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  37727765 caacaccatcaaataatttacagcaagtcaacatcaacaataatc 37727721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 45848043 - 45847816
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||        |||||||    
T  45848043 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcagcatcttaacaa--------cttagac 45847952  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaagg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45847951 atctcttatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaa---------accaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatcagcaagg 45847861  T
Q  231 caacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  45847860 caacaccatcaaataatttacagcaagtcaacatcaacaataatc 45847816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 62 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14270428 - 14270220
Alignment:
Q  62 atcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaa----cttaacagcttagacatctcttatgactctaataatttggat 157  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14270428 atcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaattgacttaacaacttagacatctcttatgactccaataatttggat 14270329  T
Q  158 caagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaag 257  Q
    ||| ||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||    
T  14270328 caacatcttacaacttaa---------accaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatcagcaaggcaacaccatcaaataatttacagcaag 14270238  T
Q  258 tcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  14270237 tcaacatcaacaataatc 14270220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 59 - 275
Target Start/End: Original strand, 8468173 - 8468372
Alignment:
Q  59 agcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatc 158  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8468173 agcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactta--------gacatctcttatgacttcaataatttggatc 8468264  T
Q  159 aagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagt 258  Q
    || ||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  8468265 aacatcttacaacttaaac---------caacattagcatcttaatgatattaatacatcacatcagcaaggcaacaccattaaataatttacagcaagt 8468355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8852250 - 8852011
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  8852250 catcaagccctcaaaataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctca----acttaaatgagtatgca-tggactcaatgtctta-caact 8852157  T
Q  118 taa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaataca 216  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||             |    
T  8852156 taaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatccta-------------a 8852070  T
Q  217 tcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  8852069 tcacgacagcaaggcaacaccattaaataatatgcagtaagtcaacatcaacaataatc 8852011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 36686285 - 36686044
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  36686285 catcaaaccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctca----acttaaatgagtatgcaatggactcaacatctta-cgact 36686191  T
Q  118 taacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacat 217  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||          |||||||||| ||||||| |||    
T  36686190 taacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactt-aacaacttaga----------catcttaatggtattaattcat 36686102  T
Q  218 cacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  36686101 cacaacagcaagacaacatcatttaaacatatgcagcaagtcaccatcaataataatc 36686044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Original strand, 11066435 - 11066670
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  11066435 catcaaaccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaaaccctca----acttaaaagagtatgca-tggactcaacgtctta-caact 11066528  T
Q  118 taa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaataca 216  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||             |    
T  11066529 taaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatccta-------------a 11066615  T
Q  217 tcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaat 271  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  11066616 tcacgacagcaaggcagcaccattaaataatatgcagcaagtcaacaacaacaat 11066670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 30821291 - 30821050
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  30821291 catcaagccctcaacataatatgtaaaaatatacattacatgacatcaagccctca----acttaaatgagtatgcaatggactcaacatctta-cgact 30821197  T
Q  118 taacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacat 217  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||          |||||||||| ||||||| |||    
T  30821196 taacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactt-aacaacttaga----------catcttaatggtattaattcat 30821108  T
Q  218 cacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||| |||| ||||| |||| ||  ||||| ||||||| | |||||| |||||||    
T  30821107 cacaacaacaagacaacatcatttaaacatatgcagcaagttaccatcaataataatc 30821050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 59477 - 59239
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  59477 catcaatcccacaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctca----acttaaatgagcatgca-tggactcaacgtctta-caact 59384  T
Q  118 taa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaataca 216  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||  ||       |    
T  59383 taaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagc-----aatccta-------a 59296  T
Q  217 tcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataa 273  Q
    | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  59295 ttacgacagcaaggcaacaacattaaataatatggagcaagtcaacatcaacaataa 59239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32434674 - 32434499
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||     ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  32434674 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattaaagaacatcaagacct----aaacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaact 32434581  T
Q  118 t-aacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcat 198  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32434580 taaacaacttagacatctcatatgactcaaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcat 32434499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 38480054 - 38480295
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||    
T  38480054 catcaagcccccaacataatatgtataaatatatattacatggcatcaaaccctca----acttaaatgagtatgcaatagactctacatctta-cgact 38480148  T
Q  118 taacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacat 217  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||           ||||||||| ||||||| |||    
T  38480149 taacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactt-aacaacttaga----------tatcttaatggtattaattcat 38480237  T
Q  218 cacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  38480238 cacaacagcaagacaacatcatttaaatatatgcagcaagtcaccatcaataataatc 38480295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 173
Target Start/End: Original strand, 48811865 - 48812018
Alignment:
Q  15 ggacatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaaca 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||| | ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  48811865 ggacatcaagccctcaacatgatatttataaatatacattacagggcatcaaactct----caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatctt-acg 48811959  T
Q  115 acttaacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaactt 173  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48811960 acttaacaacttagatatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactt 48812018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 275
Target Start/End: Original strand, 12371299 - 12371484
Alignment:
Q  76 caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaactta 174  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12371299 caacttgaatgagtatgca-tggactcaatgtctta-caacttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactta 12371396  T
Q  175 aacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataat 274  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12371397 aacaacttagactaacattagcatccta-------------atcacgacagcaaggcaacaccattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaataat 12371483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13150621 - 13150458
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||           
T  13150621 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt------- 13150534  T
Q  118 taacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattag 195  Q
      ||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13150533 --acaacttagaaatctcatatgactcaaataatttagatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattag 13150458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 46387147 - 46386997
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  46387147 catcaaaccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaact 46387054  T
Q  118 t-aacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaactt 173  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46387053 taaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactt 46386997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12128195 - 12128010
Alignment:
Q  76 caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaactta 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12128195 caacttaaatgagtatgca-tggactcaacgtctta-caacttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactta 12128098  T
Q  175 aacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataat 274  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||             ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  12128097 aacaacttcgaccaacattagcatccta-------------atcacgacagcaaggcagcaccattaactaatatgcagtaagtcaacatcaacaataat 12128011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Original strand, 15213659 - 15213757
Alignment:
Q  176 acaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  15213659 acaacttataccaacattag-atcttcatgatattaatacgtcacaaccgcaaggcaacaccattaaataatatgcagcaagtcaacatcaataataatc 15213757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 18875957 - 18875861
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  18875957 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaact 18875864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 178 - 275
Target Start/End: Original strand, 18302016 - 18302113
Alignment:
Q  178 aacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |  | |||| || ||||||||||||||    
T  18302016 aacttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatcagcaaggcaacaacatcaaataatttacaacaagccaacatcaacaataatc 18302113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11392102 - 11392030
Alignment:
Q  132 tctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaat 204  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11392102 tctcatatgactccaataatttggatcaaaatcttacaatttaaacaacttagaccaacattagcatcctaat 11392030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 111
Target Start/End: Original strand, 20619252 - 20619340
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatctta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20619252 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttgaatgagtatgc-atggactcaacgtctta 20619340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13148377 - 13148318
Alignment:
Q  216 atcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  13148377 atcacgacagcaaggcagcaccattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 13148318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18075559 - 18075463
Alignment:
Q  76 caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaactt 173  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||  |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18075559 caacttaaatgagtatgca-tggactcaacgtctta-caacttaaacaacttagatatcttatatgactcaaataatttgaatcaacatcttacaactt 18075463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14183653 - 14183560
Alignment:
Q  80 ttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaac 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||   |  ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14183653 ttaaatgagtatgca-tggactcaacgtctta-caacttaaa--caaagacatctcatataactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaac 14183560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 20253649 - 20253594
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctca 73  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||    
T  20253649 catcaaaccctcaacttaatatgtataattatacatttcagagcatcaagctctca 20253594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11392009 - 11391972
Alignment:
Q  238 attaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  11392009 attaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 11391972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1465830 - 1465587
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1465830 acatattatgtttaaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacaacttagac 1465731  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaagg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||  |||||    
T  1465730 atctcttatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattag-atcttcatgatattaatacgccacaaccacaagg 1465632  T
Q  231 caacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1465631 caacaccattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 1465587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 49390090 - 49389846
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49390090 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagctgtcacccaacgtaaatgagtatgcaatgaactcaacatcttaacaacttaacaacttagac 49389991  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaagg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  49389990 atctcttatgactccaataatttggaccaacatcttataacttaaacaacttaaaccaacattaacatcttaatgatattaacacatcacatcagcaagg 49389891  T
Q  231 caacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  49389890 caacaccatcaaataatttacagcaagtcaacatcaacaataatc 49389846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 37 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18440261 - 18440023
Alignment:
Q  37 tatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacat-ctc 135  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  18440261 tatgtataaatatacattacagagcatcaa-ccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacaacttagacattctc 18440163  T
Q  136 ttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaaca 235  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  18440162 ttatgactccaataatttggaccaacatcttataacttaaacaacttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacctcagcaagacaaca 18440063  T
Q  236 ccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||||||    
T  18440062 ccatcaaataatttacagcaggtcatcatcaacaataatc 18440023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 12269266 - 12269515
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12269266 catcaagccctcaacataatatgtataaatgtacattacagagcatcaagccctcacccaacttaaataagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 12269365  T
Q  118 taacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacat 217  Q
    ||        |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |     
T  12269366 ta--------gacatctcatatgactccaataatttggatcaacaccttacaacttaaacaacttatactaacattagcaccttaatgatattaatagac 12269457  T
Q  218 cacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||| || |||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  12269458 cacgactgcaaggcaacactattaactaatatgcagcacgtcaacatcaacaataatc 12269515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20630509 - 20630273
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||    
T  20630509 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacctaatgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaccaactta--------gac 20630418  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaagg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20630417 atctcttatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttaaacaaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatcagcaagg 20630318  T
Q  231 caacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||| ||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  20630317 caacaacatcaaataatttacagcaagtcaacatcaacaataatc 20630273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 40806963 - 40807202
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  40806963 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctca----acttaaatgagtatgca-tggactcaacgtctta-caact 40807056  T
Q  118 taa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaataca 216  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||             |    
T  40807057 taaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatccta-------------a 40807143  T
Q  217 tcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  40807144 tcacgacagcaaggcagcaccattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 40807202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22307668 - 22307429
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  22307668 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctca----acttgaatgagtatgca-tggactcaacgtctta-caact 22307575  T
Q  118 taa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaataca 216  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |             ||    
T  22307574 taaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcct-------------ca 22307488  T
Q  217 tcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22307487 tcacgacagcaaggcagcaccattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 22307429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 30175598 - 30175360
Alignment:
Q  19 atcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactt 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  30175598 atcaagccctcaacataatatggataaatatacattacagggcatcaagccctca----acttaaatgagtaagca-tggactcaaaatctta-caactt 30175505  T
Q  119 aa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacat 217  Q
    || || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||             ||    
T  30175504 aaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatccta-------------at 30175418  T
Q  218 cacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  30175417 cacgacagcaaggcaacaccattaaataatatgaagcaagtcaacatcaacaataatc 30175360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15448032 - 15447791
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  15448032 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacatggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatctt-acgact 15447938  T
Q  118 taacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacat 217  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||          |||||||||| ||||||| |||    
T  15447937 taacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaatatcttacaactt-aacaacttaga----------catcttaatggtattaattcat 15447849  T
Q  218 cacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||  ||||| | ||||||| |||||| |||||||    
T  15447848 cacaacagcaagacaacatcatttaaacatatgcatcaagtcaccatcaataataatc 15447791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 17538074 - 17538313
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  17538074 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctca----acttaaatgagtatgca-tggagtcaacgtctta-caact 17538167  T
Q  118 taa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaataca 216  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||             |    
T  17538168 taaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatctttcaacttaaacaacttagaccaacattagcatccta-------------a 17538254  T
Q  217 tcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17538255 tcacgacagcaaggcagcaccattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 17538313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31224989 - 31224748
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  31224989 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcattaagccctca----acttaaatgagtatgcaatggactcaacatctta-cgact 31224895  T
Q  118 taacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacat 217  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||          | |||||||||| ||||||| |||    
T  31224894 taacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactt-aacaactta----------aacatcttaatggtattaattcat 31224806  T
Q  218 cacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  31224805 cacaacagcaagacaacatcatttaaacatatgcagcaagtcaccatcaataataatc 31224748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 275
Target Start/End: Original strand, 31415223 - 31415462
Alignment:
Q  15 ggacatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaaca 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  31415223 ggacattaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctca---------aatgagtatgcaatggactcaacatctta-cg 31415312  T
Q  115 acttaacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaata 214  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||          |||||||||| |||||||     
T  31415313 acttaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactt-aacaacttaga----------catcttaatggtattaatt 31415401  T
Q  215 catcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  31415402 catcacaacagcaagacaacatcatttaaacatatgcagcaagtcaccatcaataataatc 31415462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 146 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 49970175 - 49970046
Alignment:
Q  146 aataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaata 245  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  49970175 aatactttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgataataatacatcacaacagcaaggcagtaccattaaata 49970076  T
Q  246 atatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  49970075 atatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 49970046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 41173404 - 41173220
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    || |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  41173404 catcaagccctcaacataatgtgtataaatatacattacatggcatctagccctca----acgtaaatgagtatgca-tggactcaacgtctta-caact 41173311  T
Q  118 taa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgat 207  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  41173310 taaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacatatgcaacttaatgat 41173220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 5214882 - 5215068
Alignment:
Q  15 ggacatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaaca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||    
T  5214882 ggacatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgactt-aca 5214975  T
Q  115 actt-aacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgat 207  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| |||||||||    
T  5214976 acttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactttaacaactt-gaccaacatatgcaacttaatgat 5215068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17519990 - 17519827
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  17519990 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctca----acttaaatgagtatgca-tggactcaacgtctta-caact 17519897  T
Q  118 taa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagac 186  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  17519896 taaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttataacttaaacaacttagac 17519827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17534852 - 17534689
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  17534852 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctca----acttaaatgagtatgca-tggactcaacgtctta-caact 17534759  T
Q  118 taa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagac 186  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  17534758 taaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttataacttaaacaacttagac 17534689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 275
Target Start/End: Original strand, 14500888 - 14501079
Alignment:
Q  84 atgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaactta 183  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  | | |||||| |||| |||| |||||    
T  14500888 atgaatatgcaatggactcaacatcctaaaaacttaacaacttagacatctcttatgactccaataaattgggccgacatcttataactcaaacgactta 14500987  T
Q  184 gaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| | ||||| || | ||||||| ||||||||||||||    
T  14500988 aaccaacattagcatcttaatgatattaatatatcacattagcaaggcaacaacatcatataatttgcaacaagtcaacatcaacaataatc 14501079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 192
Target Start/End: Original strand, 13516368 - 13516529
Alignment:
Q  25 ccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagc 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  13516368 ccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaataagtatgcaatggactcaacatctt-acgacttaacaac 13516462  T
Q  125 ttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacat 192  Q
    || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  13516463 ttggacatctcatatgactccaataatttggatcaaaatcttacaactt-gacaactttgaccaacat 13516529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 173
Target Start/End: Original strand, 40811778 - 40811928
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  40811778 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaact 40811871  T
Q  118 t-aacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaactt 173  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40811872 taaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactt 40811928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5206688 - 5206503
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||    
T  5206688 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacatggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggacttaacgtctt-acaact 5206595  T
Q  118 t-aacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttac-aacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgat 207  Q
    | || | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  5206594 taaaaaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaaatttaaacaacttagaccaatatatgcaacttaatgat 5206503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 207
Target Start/End: Original strand, 14507871 - 14508054
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  14507871 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaact 14507964  T
Q  118 t-aacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgat 207  Q
    | |||| |||| | ||||  |||||||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| |||||||||    
T  14507965 taaacaacttaaatatcttatatgactccaataatttgattcaacatcttacaactttaacaactt-gaccaacatatgcaacttaatgat 14508054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23413699 - 23413557
Alignment:
Q  39 tgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaat---gagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctc 135  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| || | ||   || |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  23413699 tgtataaatatacattatagagcatcaagccctcccccatctcagattatgaatatgcaatggactcaacatcctagcaacttaacaacttagacatctc 23413600  T
Q  136 ttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaaca 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23413599 ttatgactccaataatttggatcaacatcatacaacttaaaca 23413557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 178
Target Start/End: Original strand, 45796838 - 45796980
Alignment:
Q  39 tgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaat---gagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctc 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || | ||   || ||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  45796838 tgtataaatatacattacagagcatcaagccctcccccatctcagattatgaatatgcaatggacttaacatcctaacaactaaacaacttagacatctc 45796937  T
Q  136 ttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaaca 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  45796938 ttatgactccaataatttggatcaacatcttacaaattaaaca 45796980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15932535 - 15932371
Alignment:
Q  22 aagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaa- 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    ||||||||||||||||| || ||||||| | ||| ||||||||     
T  15932535 aagccctcaatataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctca----acttaaatgagtatgcattg-actcaacgtgtta-caacttaaa 15932442  T
Q  121 cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacat 192  Q
    || |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15932441 caacttaaacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaatttaaacaactt-gaccaacat 15932371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 179 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12852631 - 12852535
Alignment:
Q  179 acttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  12852631 acttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatcagcaaggcaacaacatcaaataatttacagcaagtcaacatcaacaataatc 12852535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 13026721 - 13026636
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13026721 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgcaatggactcaacat 13026636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 129 - 275
Target Start/End: Original strand, 45796978 - 45797123
Alignment:
Q  129 acatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaa 228  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||  | | |||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  45796978 acatctcatatgactccaataaattgggccgacatcttataactcaaacgacttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatatatcacatcagcaa 45797077  T
Q  229 ggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||| ||| | ||||| || | ||||||| ||||||||||||||    
T  45797078 ggcaacaacatcatataat-tgcaacaagtcaacatcaacaataatc 45797123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 13031810 - 13031725
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacat 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13031810 catcaagccctcaacataacatgtataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgcaatggactcaacat 13031725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 192
Target Start/End: Original strand, 17693155 - 17693264
Alignment:
Q  82 aaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaac 180  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17693155 aaatgagtgtgca-tggactcaacaactta-caacttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggattaacatcttacaacttaaacaac 17693252  T
Q  181 ttagaccaacat 192  Q
    ||||||||||||    
T  17693253 ttagaccaacat 17693264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 19485335 - 19485261
Alignment:
Q  37 tatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485335 tatgtataaatatacattacagagcatcaa-ccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaa 19485261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 275
Target Start/End: Original strand, 5841857 - 5841987
Alignment:
Q  132 tctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggc 231  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||             ||||| |||||||  |    
T  5841857 tctcatatgactccaataatttggatcaaaatcttacaatttaaacaacttagaccaacattagcatccta-------------atcacgacagcaaaac 5841943  T
Q  232 aacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5841944 aacactattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 5841987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 17548598 - 17548519
Alignment:
Q  20 tcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17548598 tcaagccctcaacataatatgtataaatatagattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgcaatggactca 17548519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 103
Target Start/End: Original strand, 17044063 - 17044143
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  17044063 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactca 17044143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 176 - 274
Target Start/End: Original strand, 11912881 - 11912978
Alignment:
Q  176 acaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataat 274  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||    
T  11912881 acaacttataccaacattag-atcttcatgaaattaatatgtcacaaccgcaaggcaacaccattaaataatatgcatcaagtcaacatcaataataat 11912978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23413564 - 23413454
Alignment:
Q  124 cttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaac 223  Q
    |||| |||||||  ||||||| ||||||||||  | | |||||| |||| |||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23413564 cttaaacatctcaaatgactccaataatttgggccgacatcttataactcaaatgacttaaac-aacattagcatcttaatgatattaatacatcacatc 23413466  T
Q  224 agcaaggcaaca 235  Q
    |||||| |||||    
T  23413465 agcaagacaaca 23413454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 17519838 - 17519784
Alignment:
Q  119 aacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaactt 173  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17519838 aacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactt 17519784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 17534700 - 17534646
Alignment:
Q  119 aacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaactt 173  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17534700 aacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactt 17534646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 52466475 - 52466418
Alignment:
Q  127 agacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttag 184  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  52466475 agacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttgaacagcttag 52466418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 275
Target Start/End: Original strand, 40811993 - 40812044
Alignment:
Q  224 agcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  40811993 agcaaagcagcaccattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 40812044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 53070936 - 53070856
Alignment:
Q  37 tatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaact--ta-aatgagtatgcaatggactcaacatcttaaca 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||  ||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  53070936 tatgtataaatatacattacagagcatcaagctctctcccatctcgtattatgcgtatgcaatggactcaacttcttaaca 53070856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Original strand, 2746 - 2990
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  2746 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatgcactcaacatcttaaaaacttaacaacttagac 2845  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaagg 230  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2846 atctcttatgactccaataatttagaccaacatcttataacttaaaaaacttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatcagcaagg 2945  T
Q  231 caacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  2946 caacaccatcatataatttacagcaagtcatcatcaacaataatc 2990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 21)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 28194869 - 28194625
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  28194869 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatctaaacaacttaacaacttagac 28194770  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaagg 230  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28194769 atctcttatgactccaataatttagaccaacatcttataacttaaacaacttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacctcagcaagg 28194670  T
Q  231 caacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||| ||||||| |  |||| || ||||||||||||||||    
T  28194669 caacaccatcaaataatttacagcaggttatcatcaacaataatc 28194625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 46382975 - 46382731
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  46382975 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaaaccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatagactcaatatcttaacaacttaacaacttagac 46382876  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaagg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  46382875 atctcttatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaaaaacttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatacattacatcagcatgg 46382776  T
Q  231 caacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  46382775 caacaccatcaaataatttacagcaagtcaacatcaacaataatc 46382731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Original strand, 43697075 - 43697318
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43697075 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaaaccctcacccaacgtaaatgagtatgcaataaactcaacatcttaacaacttaaaaacttagac 43697174  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaagg 230  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  43697175 atcacttatgactccaataatttggaccaacatcttataacttaaacaactta-accaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatcaacaagg 43697273  T
Q  231 caacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
     |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  43697274 taacaccatcaaataatttacagcaagtcatcatcaacaataatc 43697318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35982099 - 35981864
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |    
T  35982099 acatattatgtataaataaacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactta--------ggc 35982008  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaagg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35982007 atctcttatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattag-atcttcatgatattaatacgtcacaaccgcaagg 35981909  T
Q  231 caacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  35981908 caacaccattaaataatatgcaacaagtcaacatcaacaataatc 35981864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Original strand, 43542819 - 43543055
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||    
T  43542819 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagctctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactta--------gac 43542910  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaagg 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  43542911 atctcttatgactccaataatttggttcaacatcttacaacttaaacaacttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatacatgacatcagcaagg 43543010  T
Q  231 caacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  43543011 caacaccatcaaataatttacagcaagtcaacatcaacaataatc 43543055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41306007 - 41305814
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41306007 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacaacttagac 41305908  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaagg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41305907 atctcttatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaa---------accaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatcagcaagg 41305817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 274
Target Start/End: Original strand, 48300830 - 48301068
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  48300830 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaggcatcaagccct----aaacttaaatgagtatgc-atggactcaaaatctt-acaact 48300923  T
Q  118 t-aacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaataca 216  Q
    | || | |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||             |    
T  48300924 taaaaaacttaaacaactcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattaacatccta-------------a 48301010  T
Q  217 tcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataat 274  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  48301011 tcacgacaacaagacaacaccattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaataat 48301068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 51274623 - 51274461
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  51274623 catcaaaccctcaacataatatgtataaatatacattgcagggcatcaagccctca----acttaaatgagtatgcaatagactcaacatctta-cgact 51274529  T
Q  118 taacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagac 186  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  51274528 taacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactt-aacaacttagac 51274461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Original strand, 20587697 - 20587866
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  20587697 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattatatggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaact 20587790  T
Q  118 t-aacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacat 192  Q
    | |||| ||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20587791 taaacaacttagacatttaatatgactcctataatttggatcaacatcttacagcttaaacaacttagaccaacat 20587866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Original strand, 20592235 - 20592404
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  20592235 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattatatggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaact 20592328  T
Q  118 t-aacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacat 192  Q
    | |||| ||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20592329 taaacaacttagacatttaatatgactcctataatttggatcaacatcttacagcttaaacaacttagaccaacat 20592404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20634659 - 20634508
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  20634659 catcaaaccctcaacataatttgtataaatatacattatagggcatcaagccctca----acttaaatgagtatgca-tgtactcaacatctta-caact 20634566  T
Q  118 taa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaactta 174  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20634565 taaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactta 20634508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 130
Target Start/End: Original strand, 20636606 - 20636705
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20636606 acatattatggataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacgacttaacaacttagac 20636705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 175 - 275
Target Start/End: Original strand, 20636694 - 20636793
Alignment:
Q  175 aacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataat 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20636694 aacaacttagaccaacattag-atcttcatgatattaatacatcacaacaacagggcaacaccattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaataat 20636792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 120
Target Start/End: Original strand, 35088484 - 35088580
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  35088484 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagagcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaact 35088577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 14238587 - 14238498
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatctta 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14238587 catcaagctctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaaaccct----caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatctta 14238498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 13528841 - 13528762
Alignment:
Q  20 tcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13528841 tcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgcaatggactca 13528762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 41227725 - 41227622
Alignment:
Q  76 caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaactta 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||  |||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41227725 caacttaaatgagtatgca-tggactcaacgtgttg-caacttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactta 41227628  T
Q  175 aacaac 180  Q
     |||||    
T  41227627 gacaac 41227622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11809482 - 11809380
Alignment:
Q  112 acaactta-acagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatatt 210  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  11809482 acaacttagacaacttacacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactt-cgtaacttagaccaacacttgcaacttaatgatatt 11809384  T
Q  211 aata 214  Q
    ||||    
T  11809383 aata 11809380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 214
Target Start/End: Original strand, 23073052 - 23073154
Alignment:
Q  112 acaactta-acagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatatt 210  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  23073052 acaacttagacaacttaaacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttagaactt-tgtaacttagaccaacacttgcaacttaatgatatt 23073150  T
Q  211 aata 214  Q
    ||||    
T  23073151 aata 23073154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 174
Target Start/End: Original strand, 16381109 - 16381203
Alignment:
Q  76 caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaactta 174  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  | | | ||||  |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16381109 caacataaatgagtatgca-tggactcaacatctt-acaacttagaaacatcgaca--tcttatgattccaataatttggatcaacatcttacatctta 16381203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 41227603 - 41227550
Alignment:
Q  222 acagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  41227603 acagcaaggcagcacaattaaatattatgcagcaagtcaacattaacaataatc 41227550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 6576180 - 6576432
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  6576180 catcaagcccccaacataatatttataaatatacattacagggcatcaagccctca----acttaaatgagtatgca-tggactcaacgtctta-caact 6576273  T
Q  118 taa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaataca 216  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6576274 taaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattattaca 6576373  T
Q  217 tcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6576374 tcacaatagcaaggcagcaccattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 6576432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5032409 - 5032170
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  5032409 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacatggcatcaagccctca----acttaaatgagtatgca-tggactcaacgtctta-caact 5032316  T
Q  118 taac-agcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaataca 216  Q
    |||  | |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||             |    
T  5032315 taaataacttaaacacctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatccta-------------a 5032229  T
Q  217 tcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5032228 tcacgacagcaaggcaacaacattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 5032170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24781925 - 24781686
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    || |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  24781925 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctca----acataaatgagtatgca-tggactcaacgtctta-caact 24781832  T
Q  118 taa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaataca 216  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||             |    
T  24781831 taaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatccta-------------a 24781745  T
Q  217 tcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||| ||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24781744 tcacgacatcaaggcagcatcattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 24781686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Original strand, 22689647 - 22689824
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  22689647 catcaaactctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctca----acttaaatgagtatgca-tggactcaacgtctta-caact 22689740  T
Q  118 taa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatct 200  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22689741 taaacaacttagacatctcatatgactcaaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatct 22689824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Original strand, 22694243 - 22694420
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  22694243 catcaaactctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctca----acttaaatgagtatgca-tggactcaacgtctta-caact 22694336  T
Q  118 taa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatct 200  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22694337 taaacaacttagacatctcatatgactcaaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatct 22694420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Original strand, 24436020 - 24436245
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||          
T  24436020 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcattaagccttca----acttaaatgagtatgca-tggactcaacatctta------ 24436108  T
Q  118 taacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacat 217  Q
       || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||             ||    
T  24436109 ---caacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatccta-------------at 24436192  T
Q  218 cacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaa 270  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24436193 tacgacagcaaggcagcaccattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaa 24436245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Original strand, 9974892 - 9975055
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  9974892 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattccagggcatcaagccct----caacttaaatgggtatgc-atggactcaacgtctt-acaact 9974985  T
Q  118 t-aacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagac 186  Q
    | |||| |||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9974986 taaacaacttagacatcttatatgacttcaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagac 9975055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 24883429 - 24883659
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  24883429 catcaagccctcaacataatatgtaaaaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaattagtatgc-atggactcaacgtctt-acaact 24883522  T
Q  118 t-aacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaataca 216  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||| ||             |    
T  24883523 taaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatctt---------acaacttagaccaacattagcatccta-------------a 24883600  T
Q  217 tcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24883601 tcacgacaccaaggcagcaccattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 24883659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 186
Target Start/End: Original strand, 22500860 - 22500968
Alignment:
Q  76 caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaa 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22500860 caacttaaatgagtatgcaatagactcaacatctta-cgacttaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaatatcttacaactt-a 22500957  T
Q  176 acaacttagac 186  Q
    |||||||||||    
T  22500958 acaacttagac 22500968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 186
Target Start/End: Original strand, 22508794 - 22508902
Alignment:
Q  76 caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaa 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22508794 caacttaaatgagtatgcaatagactcaacatctta-cgacttaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaatatcttacaactt-a 22508891  T
Q  176 acaacttagac 186  Q
    |||||||||||    
T  22508892 acaacttagac 22508902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 76 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24865751 - 24865564
Alignment:
Q  76 caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaa 175  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  24865751 caacttacatgagtatgcaacggactcgacatctta-cgacttaacaacttagacatctcatataactccaataatttggatcaacatcttacaactt-a 24865654  T
Q  176 acaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||||          |||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||| |||| ||  ||||| | ||||||| |||||| |||||||    
T  24865653 acaacttaga----------catcttaatggtattaattcatcacaatagcaagacaacatcatttaaacatatgcatcaagtcaccatcaataataatc 24865564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 107
Target Start/End: Original strand, 26896277 - 26896362
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26896277 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaatccct----caacttaaatgagtatgcaatggactcaacat 26896362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 7672532 - 7672421
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  7672532 catcaagccctcaacgtaatatgtataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttccatgagtatgcaatggactcgacatctt-acgact 7672438  T
Q  118 taacagcttagacatct 134  Q
    ||||| |||||||||||    
T  7672437 taacaacttagacatct 7672421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 260
Target Start/End: Original strand, 21367914 - 21368050
Alignment:
Q  124 cttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaac 223  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | |  ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21367914 cttagacaactcatatgactccaataatttggaacaacatcttacaacttta-cttcttagaccaacgtttgcatcttaatgatattaataaatcacaac 21368012  T
Q  224 agca-aggcaacaccattaaataatatgtagcaagtca 260  Q
     ||| ||||| || |||||||||| ||| | |||||||    
T  21368013 cgcagaggcagcaacattaaataacatgcaacaagtca 21368050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 6478333 - 6478254
Alignment:
Q  20 tcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactca 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6478333 tcaagccctcaacataatatgcataaatatacattacagggcatcaaaccct----caacttaaatgagtatgcaatggactca 6478254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 173
Target Start/End: Original strand, 20915126 - 20915222
Alignment:
Q  76 caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaactt 173  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||| ||||||||||||    
T  20915126 caacttaaatgagcatgcaatggattcaacatctta-cgacttaacaacttagacatctcatatgactccaatactttagaacaacatcttacaactt 20915222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 91
Target Start/End: Original strand, 356982 - 357051
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtat 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  356982 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtat 357051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 24865846 - 24865791
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctca 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24865846 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctca 24865791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 192
Target Start/End: Original strand, 9975026 - 9975116
Alignment:
Q  101 tcaacatcttaacaacttaa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacat 192  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  9975026 tcaacatctta-caacttaaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactttaacaa-tttgaccaacat 9975116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 19202224 - 19202169
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctca 73  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19202224 catcaagccctcaacataatatatataaatatacattacagggcatcaagccctca 19202169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 20913097 - 20913058
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattaca 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20913097 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattaca 20913058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 23969741 - 23969686
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctca 73  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23969741 catcaagccctacacataatttgtataaatatacattacagggcatcaagccctca 23969686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 214
Target Start/End: Original strand, 5985197 - 5985286
Alignment:
Q  124 cttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaata 214  Q
    |||||||| ||  |||||||| ||||  ||||| ||| | |||||||||| | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  5985197 cttagacaacttatatgactccaatatcttggaacaacaacttacaacttta-caacttagaccaacacttgcaacttaatgatattaata 5985286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2672 - 2468
Alignment:
Q  70 ctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttaca 169  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  2672 ctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacaacttagacatctcttatgactccaataatttggatcaacatcttaca 2573  T
Q  170 acttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaaca 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  2572 acttaaacaacttagaccaacattag-atcttcatgatattaatacgtcacaaccgcaaggcaacaccattaaataaaatgcagcaagtcaacatcaaca 2474  T
Q  270 ataatc 275  Q
    ||||||    
T  2473 ataatc 2468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 221
Target Start/End: Original strand, 106266 - 106456
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  106266 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaaactctcacctaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacaacttagac 106365  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcaca 221  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106366 atctcttatgactccaataacttggatcaacatcttacaacttaaacaacttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcaca 106456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 73 - 275
Target Start/End: Original strand, 84991 - 85193
Alignment:
Q  73 acccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaact 172  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  84991 acccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacaacttagacatctcttatgactccaataatttggatcaacatcttaaaact 85090  T
Q  173 taaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaata 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||| || ||||||||| |||||||||||    
T  85091 taaacaacttaaaccaacattagcatattaatgatattaatacatcaaatcagcaaggcaacaccatcaattaatttgcagcaagtcaacatcaacaata 85190  T
Q  273 atc 275  Q
    |||    
T  85191 atc 85193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21741961 - 21741709
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21741961 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaatttaacaacttagac 21741862  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaa---------cttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcaca 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||| |||||||||||         |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  21741861 atctcttatgactccaataatttgggccaacatcttataacttaaacaacttaaacaacttaaaccaacattag-atcttcatgatattaatacgtcaca 21741763  T
Q  222 acagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21741762 accgtaaggcaacaccattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 21741709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5889579 - 5889351
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5889579 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacaacttagac 5889480  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaagg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |                |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5889479 atctcttatgactccaataatttggacc----------------aacatcttaaatcaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatcagcaagg 5889396  T
Q  231 caacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  5889395 caacaccatcaaataatttacagcaagtcatcatcaacaataatc 5889351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 59 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29915457 - 29915249
Alignment:
Q  59 agcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatc 158  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29915457 agcatcaagccctcgcccatcgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactta--------gacatctcttatgactccaataatttggatc 29915366  T
Q  159 aagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagt 258  Q
    || |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |  |||||||    
T  29915365 aacatcttacaacttaaacaacttaaataaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatcagcaaggcaacgccattcaataatttacagcaagt 29915266  T
Q  259 catcatcaacaataatc 275  Q
    || ||||||||||||||    
T  29915265 caacatcaacaataatc 29915249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12122556 - 12122315
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12122556 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccctca----acttaaatgagtatgcaatggactcaacatctta-caact 12122462  T
Q  118 taacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacat 217  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||          | ||||| |||| ||||||| |||    
T  12122461 taacaacttagacatctcatatgactcaaataatttggatcaacatcttacaactt-aacaactta----------aacatctcaatggtattaattcat 12122373  T
Q  218 cacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||||||||||| || || |||| ||  |||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  12122372 cacaacagcaagacatcatcatttaaacatatgccgcaagtcaccatcaataataatc 12122315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21555415 - 21555173
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  21555415 catcaagccctcaacataatatatataaatatacattacagggtatcaagccctca----acttaaatgagtatgcaatggactcaacatctta-cgact 21555321  T
Q  118 taacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatctt-aatgatattaataca 216  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||          |||||| |||| ||||||| ||    
T  21555320 taacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactt-aacaacttaga----------catcttaaatggtattaattca 21555232  T
Q  217 tcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  21555231 tcacaacagcaagacaacatcatttaaacatatgcagcaagtcaccatcaataataatc 21555173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21558080 - 21557839
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  21558080 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatc-taacgact 21557986  T
Q  118 taacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacat 217  Q
    |||||  || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||          |||||||||| ||||||| |||    
T  21557985 taacaagttggacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactt-aacaacttaga----------catcttaatggtattaattcat 21557897  T
Q  218 cacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    || ||||||||| ||||| |||| ||  ||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  21557896 cataacagcaagacaacatcatttaaacatatgcagcaagtcactatcaataataatc 21557839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 17875031 - 17875272
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  17875031 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgcaatggactcagcatctt-acgact 17875125  T
Q  118 taacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacat 217  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||          |||||||||| ||||||| | |    
T  17875126 taacaacttagacatcttatatgactccaataatttggatcaatatcttacaactt-aacaacttaga----------catcttaatggtattaattctt 17875214  T
Q  218 cacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||||||  || | |||| ||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  17875215 cacaacagcaagataatatcatttaaacatatgcagcaagtcaccatcaataataatc 17875272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 31454895 - 31455135
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||    
T  31454895 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atgaactcaacatctt-acgact 31454988  T
Q  118 taacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacat 217  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||          |||||||||| ||||| | |||    
T  31454989 taacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactt-aacaacttaga----------catcttaatggtattacttcat 31455077  T
Q  218 cacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||  ||||| | ||||||| |||||| |||||||    
T  31455078 cacaacagcaagacaacatcatttaaacatatgcatcaagtcaccatcaataataatc 31455135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 31455508 - 31455748
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||    
T  31455508 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atgaactcaacatctt-acgact 31455601  T
Q  118 taacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacat 217  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||          |||||||||| ||||| | |||    
T  31455602 taacaacttagacatctcatatgactccaataatttgtatcaacatcttacaactt-aacaacttaga----------catcttaatggtattacttcat 31455690  T
Q  218 cacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  31455691 cacaacagcaagacaacatcatttaaacatatgcagcaagtcaccatcaataataatc 31455748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Original strand, 36460130 - 36460228
Alignment:
Q  176 acaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||    
T  36460130 acaacttataccaacattag-atcttcatgatattaatatgtcacaaccgcaagacaacaccattaaataatatgcagcaagtcaacattaataataatc 36460228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 120
Target Start/End: Original strand, 19920682 - 19920778
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  19920682 catcaagccctcaaaataatatgtataaatatacattacatgacatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-acaact 19920775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 21309074 - 21309019
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctca 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  21309074 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacatttcagggcatcaaaccctca 21309019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25250875 - 25250739
Alignment:
Q  76 caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactta-acagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaactta 174  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| |||  ||| ||  |||||||| ||||  ||||| ||| | ||||||||||     
T  25250875 caacttatatgagtatgca-tggactcaacaactta-caacttagacaacttcaacaacttatatgactccaatatcttggaacaacaacttacaacttt 25250778  T
Q  175 aacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaata 214  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25250777 a-caacttagaccaacatttgcaacttaatgatattaata 25250739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25314660 - 25314524
Alignment:
Q  76 caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactta-acagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaactta 174  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| |||  ||| ||  |||||||| ||||  ||||| ||| | ||||||||||     
T  25314660 caacttatatgagtatgca-tggactcaacaactta-caacttagacaacttcaacaacttatatgactccaatatcttggaacaacaacttacaacttt 25314563  T
Q  175 aacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaata 214  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25314562 a-caacttagaccaacatttgcaacttaatgatattaata 25314524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 175
Target Start/End: Original strand, 30615667 - 30615725
Alignment:
Q  117 ttaacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaa 175  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30615667 ttaacaacttagacatctcatacgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaa 30615725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 174
Target Start/End: Original strand, 25743647 - 25743744
Alignment:
Q  76 caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaactta 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || | |  ||||||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||||    
T  25743647 caacttaaatgagtatgca-tggactcaacttctta-caacttaaacaacgtgaacatctcatatgactccaataatttggattgacatcttacatctta 25743744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 47095 - 46923
Alignment:
Q  31 acataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  47095 acatattatgtataaatatacattacagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatttta-caacttaacaacttagac 46997  T
Q  131 atctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaat 204  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46996 atctcatatgactccaacaatttggatcaacatcttataacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaat 46923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 207
Target Start/End: Original strand, 145754 - 145938
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  145754 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaaaccctca----acttaaatgagtatgcaatggactcaacatctta-caatt 145848  T
Q  118 taacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgat 207  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  145849 taacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacatatgcaacttaatgat 145938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 14157 - 14398
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  14157 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacatggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatctt-acgact 14251  T
Q  118 taacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacat 217  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||          |||||||||| ||||||| |||    
T  14252 taacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaaaatcttacaactt-aacaacttaga----------catcttaatggtattaattcat 14340  T
Q  218 cacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||  ||||| | ||||||| |||||| |||||||    
T  14341 cacaacagcaagacaacatcatttaaacatatgcatcaagtcaccatcaataataatc 14398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 112 - 275
Target Start/End: Original strand, 362787 - 362950
Alignment:
Q  112 acaacttaacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatatta 211  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  362787 acaactttacaacttagacatctcttatgaatccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttaaaccaacattagcatcttaatgatatta 362886  T
Q  212 atacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  362887 atacatcacatcagcaaggcaacaccatcaattaatttacagcaagtcaacatcaacaataatc 362950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 178
Target Start/End: Original strand, 103 - 243
Alignment:
Q  37 tatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctct 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  103 tatgtataaatatacattacagagcgtcaagcc-tcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacaacttagacatctct 201  T
Q  137 tatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaaca 178  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  202 tatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaaca 243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 275
Target Start/End: Original strand, 236 - 386
Alignment:
Q  124 cttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaac 223  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  236 cttaaacatctcatatgactccaataaattggaccaacatcttataactcaaacgacttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatc 335  T
Q  224 agcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||| ||||||||||||  |||||| |  | ||||||| ||||||||||||||    
T  336 agc-aggcaacaccatcgaataatttacaacaagtcaacatcaacaataatc 386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9387 - 9148
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  9387 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacatggcatcaagccctca----acttaaatgagtatgca-tggactcaacgtctta-caact 9294  T
Q  118 taac-agcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaataca 216  Q
    |||  | |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||             |    
T  9293 taaataacttaaacacctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatccta-------------a 9207  T
Q  217 tcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  9206 tcacgacatcaaggcagcaccattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 9148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23797 - 23657
Alignment:
Q  37 tatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctct 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23797 tatgtataaatatacattacagagcgtcaagcc-tcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacaacttagacatctct 23699  T
Q  137 tatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaaca 178  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23698 tatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaaca 23657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 20867 - 20770
Alignment:
Q  37 tatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatct 134  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20867 tatgtataaatatacattatagagcatcaagccctcacccaacgtaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacaactttgacatct 20770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23664 - 23514
Alignment:
Q  124 cttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaac 223  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23664 cttaaacatctcatatgactccaataaattggaccaacatcttataactcaaacgacttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatc 23565  T
Q  224 agcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||| ||||||||||||  |||||| |  | ||||||| ||||||||||||||    
T  23564 agc-aggcaacaccatcgaataatttacaacaagtcaacatcaacaataatc 23514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 1383 - 1624
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||    
T  1383 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagagcatcaagccct----caacttacatgagtatgcaatagactcgacatctt-acgact 1477  T
Q  118 taacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacat 217  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||          |||||||||| ||||||| |||    
T  1478 taacaacttagacatctcatataactccaataatttggatcaacatcttacaactt-aacaacttaga----------catcttaatggtattaattcat 1566  T
Q  218 cacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||| |||| ||||| |||| ||  ||||| | ||||||| |||||| |||||||    
T  1567 cacaacaacaagacaacatcatttaaacatatgcatcaagtcaccatcaataataatc 1624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10311 - 10072
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  10311 catcaagccttcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagctctta----acttaaatgagtatgca-tggactcaacgtctta-caact 10218  T
Q  118 taa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaataca 216  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||             |    
T  10217 taaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacgtcttacgacttaaacaacttaggccaacattagcatccta-------------a 10131  T
Q  217 tcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  10130 tcacgacagcaaggcagcaccattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 10072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 59638 - 59399
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||    | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  59638 catcaagtcctcaacatgatatgtataaatatatattacagggcatcaagtcctca----aattaaatgagtatgca-tggactcaacatctta-caact 59545  T
Q  118 taa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaataca 216  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||             |    
T  59544 taaacaacttagacatctcatatgacttcaataatttggatcaacatcttgcaacttaaacaacttagaccaacattagcatccta-------------a 59458  T
Q  217 tcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  59457 tcacgacagcaaggcaacaccattaaaaaatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 59399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9842 - 9673
Alignment:
Q  19 atcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaactt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  9842 atcaagccctcaacataatatgtataaatatacattataggccatcaagccctca----acttaaatgagtatgca-tggactcaacgtctta-caactt 9749  T
Q  119 aa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacatt 193  Q
    || || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9748 aaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacatt 9673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 207
Target Start/End: Original strand, 57767 - 57951
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  57767 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccct----taacttaaatgagtatgc-atggactcaatgtctt-acaact 57860  T
Q  118 t-aacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgat 207  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  57861 taaacaacttagacatctcatatgactccagtaatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacatatgcaacttaatgat 57951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6712 - 6472
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||    
T  6712 catcaagccctcaacataatatgtataaatatatattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atgaactcaacgtctt-acaact 6619  T
Q  118 t-aacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaataca 216  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||          |||||||||| ||||||| ||    
T  6618 taaacaacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactt-aacaactt-ga----------catcttaatggtattaattca 6531  T
Q  217 tcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  6530 tcacaatagcaagacaacaccatttaaacatatgcagcaagtcaccatcaataataatc 6472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5667 - 5562
Alignment:
Q  101 tcaacatcttaacaacttaa-cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatc 199  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |    
T  5667 tcaacatctta-caacttaaacaacttagagatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaactt-gaccaacatatgcaac 5570  T
Q  200 ttaatgat 207  Q
    ||||||||    
T  5569 ttaatgat 5562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 5705 - 5639
Alignment:
Q  119 aacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttaga 185  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5705 aacaacttagacatctcatatgactgcaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttaga 5639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 5814 - 5751
Alignment:
Q  119 aacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaactt 182  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5814 aacaacttagacatctcatatgactgcaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaactt 5751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 19469 - 19320
Alignment:
Q  29 caacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttag 128  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| ||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19469 caacataatatgtataactatacattatagggcaacaaaccct----caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacaacttag 19374  T
Q  129 acatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaactt 182  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  19373 acatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacgacttgaacaactt 19320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15595 - 15529
Alignment:
Q  200 ttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaa 267  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  15595 ttaatgatattaatgcatcacaacaacaaggcatcaacattaaat-atatgcagcaaatcaacatcaa 15529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24653 - 24587
Alignment:
Q  200 ttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaa 267  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  24653 ttaatgatattaatgcatcacaacaacaaggcatcaacattaaat-atatgcagcaaatcaacatcaa 24587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 76718 - 76948
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||    
T  76718 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagagcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atgcactcaacgtctt-acaact 76811  T
Q  118 t-aacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaataca 216  Q
    | |||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||| ||             |    
T  76812 taaacaactttgacatctcatatgactccaataatttggatcaacatctt---------acaacttagaccaacattagcatccta-------------a 76889  T
Q  217 tcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  76890 tcacgacagcaaggcagcaccattaaataatatgtagcaaatcaaaatcaacaataatc 76948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 178
Target Start/End: Original strand, 13233 - 13375
Alignment:
Q  39 tgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaat---gagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctc 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || | ||   || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  13233 tgtataaatatacattacagagcatcaagccctcccccatctcatattatgaatatgcaatggactcaacatcctaacaacttaacaacttagacatctc 13332  T
Q  136 ttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaaca 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  13333 ttatgactccaataatttggatcaacatcttacaaattaaaca 13375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 178
Target Start/End: Original strand, 24940 - 25076
Alignment:
Q  45 aatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaat---gagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctcttatga 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| || | ||   || | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24940 aatatacattacagagcatcaagccgtcccccatctcagattatgaatgtgcaatggactcaacatcctaacaacttaacaacttagacatctcttatga 25039  T
Q  142 ctctaataatttggatcaagatcttacaacttaaaca 178  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  25040 ctccaataatttggatcaacatcttacaaattaaaca 25076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 129 - 275
Target Start/End: Original strand, 13373 - 13519
Alignment:
Q  129 acatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaa 228  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||  | | |||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  13373 acatctcatatgactccaataaattgggccgacatcttataactcaaacgacttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatatatcagatcagcaa 13472  T
Q  229 ggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||| ||| | ||||| || | ||||||| ||||||||||||||    
T  13473 ggcaacaacatcatataatttgcaacaagtcaacatcaacaataatc 13519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 235
Target Start/End: Original strand, 25074 - 25180
Alignment:
Q  129 acatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaa 228  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||  | | |||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  25074 acatctcatatgactccaataaattgggccgacatcttataactcaaacgacttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatatatcagatcagcaa 25173  T
Q  229 ggcaaca 235  Q
    |||||||    
T  25174 ggcaaca 25180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2917 - 2768
Alignment:
Q  22 aagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaa- 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||     
T  2917 aagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaaaccctca----acttaaatgagtatgca-tggactcaacgtctta-caacttaaa 2824  T
Q  121 cagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaa 176  Q
    || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2823 caacttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaa 2768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 2986 - 2942
Alignment:
Q  22 aagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaa 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2986 aagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaa 2942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8747 - 8605
Alignment:
Q  39 tgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaact--taa-atgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctc 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||    
T  8747 tgtataaatatacattacagagcatcaagccctcccccatctcgtattatgagtatgcaatggactcaacatcctaacaacttaataatttagacatctc 8648  T
Q  136 ttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaaca 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8647 ttatgactccaataatttggatcaacatattacaacttaaaca 8605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8612 - 8460
Alignment:
Q  124 cttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaa-cttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaa 222  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| ||||  | | |||||| || || |||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8612 cttaaacatctcatatgactctaataaattgggccgacatcttataaactcaaatgacttaaatcaacattagcatcttaatgatattaatacatcacat 8513  T
Q  223 cagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || | ||||||| ||||||||||||||    
T  8512 cagcaaggcaacaacatcaaataatttgcaacaagtcaacatcaacaataatc 8460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 168
Target Start/End: Original strand, 34820 - 34952
Alignment:
Q  39 tgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaact--taa-atgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctc 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  34820 tgtataaatatacattacagagcatcaagccctcccccatctcgtattatgaatatgcaatggactcaacatcctaacaacttaacaacttagacatctc 34919  T
Q  136 ttatgactctaataatttggatcaagatcttac 168  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  34920 ttatgactccaataatttggatcaacatcttac 34952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 2892 - 3122
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  2892 catcaaaccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcaggaagccctca----acttaaattagtatgca-tggactcaacgtctta-caact 2985  T
Q  118 taacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacat 217  Q
    ||| |        ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||             ||    
T  2986 taaaa--------atctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagacaaacattagcatccta-------------at 3064  T
Q  218 cacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
     || ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3065 aacgacaacaaggcaacaacattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 3122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8365 - 8232
Alignment:
Q  129 acatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaa 228  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||             ||||| |||||||    
T  8365 acatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatccta-------------atcacgacagcaa 8279  T
Q  229 ggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  8278 ggcagcaccattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaacaatc 8232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 179 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24916 - 24820
Alignment:
Q  179 acttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  24916 acttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatcagcaaggcaacaacatcaaataatttacagcaagtcaacatcaacaataatc 24820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 111
Target Start/End: Original strand, 33427 - 33516
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatctta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33427 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaatccct----caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatctta 33516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 139
Target Start/End: Original strand, 4567 - 4672
Alignment:
Q  37 tatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaact--taa-atgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatc 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4567 tatgtataaatatacattacagagcatcaagccctctcccatctcgtattatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaataacttagacatc 4666  T
Q  134 tcttat 139  Q
    ||||||    
T  4667 tcttat 4672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 111
Target Start/End: Original strand, 285 - 374
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatctta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  285 catcaagccctcaacataatatgtataattatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgcaatggacttaacatctta 374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 111
Target Start/End: Original strand, 10872 - 10961
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatctta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10872 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcattaaaccct----caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatctta 10961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 275
Target Start/End: Original strand, 10766 - 10953
Alignment:
Q  76 caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaa 175  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||| ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  10766 caacctaaatgagtatgcaatggactcaacatctt-acgacttaataacttatacacctcatataactccaataatttggatcaacatcttacaactt-a 10863  T
Q  176 acaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||||          |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| ||  ||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  10864 acaacttaga----------catcttaatggtattaattcatcaaaacagcaagacaacatcatttaaacatatgcagcaagtcacaatcaataataatc 10953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 952 - 863
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatctta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  952 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcattaaaccct----caacttaaatgagtatgcaatggactcaacatctta 863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 78398 - 78299
Alignment:
Q  15 ggacatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaaca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  78398 ggacatcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgc-atggactcaacgtctt-aca 78305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 686 - 605
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactca 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  686 catctagccctcaacataatatgtataaatatacattacatggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgcaatggactca 605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 179 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7911 - 7815
Alignment:
Q  179 acttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    ||||||||| | ||||||||||||    
T  7911 acttaaaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacatcagcaaggcaacaacatcaaataattcacagcaagtcaacgtcaacaataatc 7815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 255
Target Start/End: Original strand, 95298 - 95531
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatcttaacaact 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  95298 catcaagccctcaacgtaatatgtatgaatatacattctagagcatcaagccct----caactttaatgagtatgc-atggactcaacaactt-acaact 95391  T
Q  118 ta-ac-agcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatg-atattaata 214  Q
    || || | |||  ||| ||  |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  95392 tagacaaacttgaacaacttatatgactccaataacttggaacaacatcttacgactt-tgcaacttagaccaacatttgcatcttaatgaatattaata 95490  T
Q  215 catcacaacagca-aggcaacaccattaaataatatgtagca 255  Q
     |||||||||||| || || || |||||||||| ||| ||||    
T  95491 -atcacaacagcagagacatcaacattaaataacatgcagca 95531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2653 - 2523
Alignment:
Q  132 tctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggc 231  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||             ||||| |||||||  |    
T  2653 tctcatatgactccaataatttggatcaaaatcttacaatttaaacaacttagaccaacattagcatccta-------------atcacgacagcaaaac 2567  T
Q  232 aacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2566 aacactattaaataatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 2523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Original strand, 1780 - 1945
Alignment:
Q  111 aacaacttaacagcttagacatctctt-atgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcat-cttaatgata 208  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||| ||| |||| ||||||| |||| || |||||||| |    
T  1780 aacatcttaacaacttagacaactctttatgactccaataacttggatcaacatcttacgacttgaacgactttgaccaac-ttagaattcttaatgaca 1878  T
Q  209 ttaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||||| || ||| |||||||    
T  1879 ttattacttcacaacagcaaggcaacatcatctaataataagcagcaagtcaacaacaataataatc 1945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 176 - 274
Target Start/End: Original strand, 157 - 254
Alignment:
Q  176 acaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataat 274  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||    
T  157 acaacttataccaacattag-atcttcatgaaattaatatgtcacaaccgcaaggcaacaccattaaataatatgcatcaagtcaacatcaataataat 254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 176 - 274
Target Start/End: Original strand, 4575 - 4672
Alignment:
Q  176 acaacttagaccaacattagcatcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataat 274  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||    
T  4575 acaacttataccaacattag-atcttcatgaaattaatatgtcacaaccgcaaggcaacaccattaaataatatgcatcaagtcaacatcaataataat 4672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 178
Target Start/End: Original strand, 74522 - 74656
Alignment:
Q  39 tgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaact--taa-atgagtatgcaatggactcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctc 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||  ||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||    
T  74522 tgtataaatatacattacagagcatcaaaccctcccccatctcgtattatgaatatgcaatggactcaacatcctaacaactta--------gacatctc 74613  T
Q  136 ttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaaca 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  74614 ttatgactccaataatttggatcaacatcttacgaattaaaca 74656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0632 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0632
Description:

Target: scaffold0632; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 207
Target Start/End: Original strand, 263 - 368
Alignment:
Q  99 actcaacatcttaacaacttaacagcttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaacaacttagaccaacattagcat 198  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||  |||     
T  263 actcaacatctta-cgacttaacaacttagatatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaactt-aacaactt-gaccaacatatgcaa 359  T
Q  199 cttaatgat 207  Q
    |||||||||    
T  360 cttaatgat 368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 41269 - 41193
Alignment:
Q  23 agccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactca 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41269 agcccttaacataatatgtataaatatacattatagggcatcaagccct----caacttaaatgagtatgcaatggactca 41193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 111
Target Start/End: Original strand, 78053 - 78141
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcacccaacttaaatgagtatgcaatggactcaacatctta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||    ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  78053 catcaagccctcaacataatatgtataaatatagattacagggcattaagccct----caacttaaatgaggatgc-atggactcaacaactta 78141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 124 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7638 - 7585
Alignment:
Q  124 cttagacatctcttatgactctaataatttggatcaagatcttacaacttaaac 177  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7638 cttagacatctcatatgactccaataatttggatcaacatcttacaacttaaac 7585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0815 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0815
Description:

Target: scaffold0815; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 275
Target Start/End: Original strand, 463 - 542
Alignment:
Q  196 catcttaatgatattaatacatcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |  ||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  463 catcttaatgatattaattcatcacaacagcaagacaacatcattttaacatatgcagcaagtcaccatcaataataatc 542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5609 - 5550
Alignment:
Q  216 atcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  5609 atcacgacagcaaggcagcaccattaaataatatgcagcaagttaacatcaacaataatc 5550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6912 - 6853
Alignment:
Q  216 atcacaacagcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  6912 atcacgacagtaaggcagcaccattaaataatatgcagcaagtcaacatgaacaataatc 6853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 275
Target Start/End: Original strand, 812 - 863
Alignment:
Q  224 agcaaggcaacaccattaaataatatgtagcaagtcatcatcaacaataatc 275  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  812 agcaaggcagcacgattagataatatgcagcaagtcaacatcaacaataatc 863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 73
Target Start/End: Original strand, 15943 - 15998
Alignment:
Q  18 catcaagccctcaacataatatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctca 73  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || | |||||||| || |||||||||||||||    
T  15943 catcaagccctcaacttaatatgaatgattatacattccagagcatcaagccctca 15998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 77
Target Start/End: Original strand, 9752 - 9792
Alignment:
Q  37 tatgtataaatatacattacaaagcatcaagccctcaccca 77  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9752 tatgtataaatattcattacagagcatcaagccctctccca 9792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University