View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8180A_low_171 (Length: 260)

Name: NF8180A_low_171
Description: NF8180A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8180A_low_171
NF8180A_low_171
[»] chr5 (37 HSPs)
chr5 (15-260)||(31447512-31447763)
chr5 (74-260)||(27604535-27604722)
chr5 (74-260)||(5291657-5291843)
chr5 (74-260)||(40399995-40400180)
chr5 (93-260)||(39361276-39361443)
chr5 (89-260)||(15768368-15768539)
chr5 (89-260)||(37731057-37731228)
chr5 (89-260)||(6985326-6985497)
chr5 (89-260)||(9345568-9345739)
chr5 (89-260)||(14039625-14039796)
chr5 (89-260)||(14448131-14448302)
chr5 (89-260)||(14559163-14559334)
chr5 (89-260)||(17616647-17616818)
chr5 (89-260)||(17728504-17728675)
chr5 (89-260)||(22685031-22685202)
chr5 (89-260)||(23305874-23306045)
chr5 (89-260)||(23371537-23371708)
chr5 (89-260)||(23706384-23706555)
chr5 (89-260)||(27043314-27043485)
chr5 (89-260)||(27469589-27469760)
chr5 (89-260)||(31358121-31358292)
chr5 (89-260)||(36583604-36583775)
chr5 (89-260)||(42052396-42052567)
chr5 (89-258)||(30228551-30228720)
chr5 (89-260)||(24589159-24589330)
chr5 (89-260)||(39491992-39492163)
chr5 (89-256)||(24817946-24818113)
chr5 (96-260)||(22156080-22156244)
chr5 (89-260)||(35225090-35225261)
chr5 (90-257)||(15994389-15994556)
chr5 (90-260)||(31842993-31843163)
chr5 (91-259)||(20796650-20796818)
chr5 (91-237)||(1110295-1110441)
chr5 (89-180)||(36697303-36697394)
chr5 (150-260)||(36697202-36697312)
chr5 (95-154)||(19477001-19477060)
chr5 (94-256)||(23405403-23405565)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (14-260)||(19992970-19993221)
chr7 (74-260)||(21001962-21002148)
chr7 (74-260)||(9434409-9434595)
chr7 (74-260)||(5686704-5686891)
chr7 (74-260)||(6876797-6876982)
chr7 (89-260)||(1988726-1988897)
chr7 (89-260)||(8011641-8011812)
chr7 (94-260)||(22090372-22090538)
chr7 (89-260)||(24735911-24736082)
chr7 (90-260)||(2715191-2715361)
chr7 (96-260)||(4213219-4213383)
chr7 (96-260)||(17959629-17959793)
chr7 (89-260)||(9086415-9086586)
chr7 (89-260)||(26399650-26399821)
chr7 (89-260)||(40051658-40051829)
chr7 (89-260)||(11097198-11097370)
chr7 (89-260)||(11006375-11006546)
chr7 (89-260)||(26698683-26698854)
chr7 (89-260)||(42867016-42867187)
chr7 (98-260)||(8618587-8618749)
chr7 (96-260)||(168090-168254)
chr7 (89-257)||(466550-466718)
chr7 (95-257)||(15887203-15887365)
[»] chr3 (33 HSPs)
chr3 (15-260)||(16390431-16390682)
chr3 (74-260)||(37867645-37867832)
chr3 (74-260)||(37876163-37876350)
chr3 (93-260)||(19779600-19779767)
chr3 (23-260)||(6499870-6500113)
chr3 (94-260)||(6219544-6219710)
chr3 (15-260)||(9992800-9993052)
chr3 (96-260)||(20682623-20682787)
chr3 (90-260)||(13382159-13382329)
chr3 (90-260)||(13392753-13392923)
chr3 (89-260)||(4744897-4745068)
chr3 (89-260)||(5511853-5512024)
chr3 (89-260)||(5546511-5546682)
chr3 (89-260)||(24661074-24661245)
chr3 (89-260)||(5626867-5627038)
chr3 (89-260)||(5875152-5875323)
chr3 (89-260)||(12295710-12295881)
chr3 (89-260)||(16477438-16477609)
chr3 (89-260)||(24392962-24393133)
chr3 (89-260)||(41684833-41685004)
chr3 (96-260)||(14466815-14466979)
chr3 (89-260)||(8775863-8776034)
chr3 (89-260)||(18485196-18485367)
chr3 (89-260)||(38195930-38196101)
chr3 (89-260)||(39373260-39373431)
chr3 (90-260)||(23758440-23758610)
chr3 (96-260)||(13122889-13123053)
chr3 (89-260)||(28323707-28323878)
chr3 (91-259)||(29470675-29470843)
chr3 (90-260)||(12248335-12248505)
chr3 (172-260)||(10635926-10636014)
chr3 (89-176)||(10654248-10654335)
chr3 (94-154)||(13072979-13073039)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (31-260)||(27373866-27374101)
chr6 (31-260)||(27464219-27464454)
chr6 (74-260)||(9122019-9122205)
chr6 (9-260)||(25590271-25590528)
chr6 (90-260)||(12856097-12856267)
chr6 (90-260)||(26865940-26866110)
chr6 (89-260)||(3662491-3662662)
chr6 (89-260)||(12726323-12726494)
chr6 (89-260)||(17983624-17983795)
chr6 (89-260)||(25788875-25789046)
chr6 (89-260)||(26026566-26026737)
chr6 (89-260)||(27342874-27343045)
chr6 (89-260)||(27403614-27403785)
chr6 (89-260)||(16931541-16931712)
chr6 (96-260)||(34816661-34816825)
chr6 (98-260)||(32971364-32971526)
chr6 (92-183)||(7669375-7669466)
chr6 (95-257)||(12359298-12359460)
chr6 (89-180)||(4632036-4632127)
chr6 (89-180)||(27385562-27385653)
chr6 (89-180)||(27475975-27476066)
chr6 (89-180)||(32310650-32310741)
chr6 (150-260)||(27385644-27385754)
chr6 (150-260)||(27476057-27476167)
chr6 (150-260)||(4632118-4632228)
chr6 (150-260)||(32310549-32310659)
chr6 (94-259)||(32780124-32780289)
[»] scaffold1216 (1 HSPs)
scaffold1216 (15-259)||(185-434)
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (74-260)||(43083816-43084003)
chr2 (24-260)||(29245316-29245561)
chr2 (74-260)||(24337270-24337454)
chr2 (90-260)||(40223475-40223645)
chr2 (89-260)||(11404351-11404522)
chr2 (89-260)||(43346540-43346711)
chr2 (97-260)||(4211085-4211248)
chr2 (89-260)||(10268123-10268294)
chr2 (89-260)||(10278700-10278871)
chr2 (89-260)||(27222561-27222732)
chr2 (89-260)||(35254174-35254345)
chr2 (89-260)||(35264783-35264954)
chr2 (96-260)||(22959209-22959373)
chr2 (15-260)||(9907066-9907308)
chr2 (90-260)||(9772237-9772407)
chr2 (90-236)||(34803301-34803447)
chr2 (94-259)||(21171305-21171470)
chr2 (94-259)||(28730751-28730916)
chr2 (232-260)||(34799698-34799726)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (74-260)||(4168384-4168569)
chr1 (74-260)||(19180067-19180253)
chr1 (74-260)||(5649263-5649448)
chr1 (94-260)||(21864824-21864990)
chr1 (89-260)||(38096206-38096377)
chr1 (89-260)||(51655381-51655552)
chr1 (89-260)||(7508420-7508591)
chr1 (89-260)||(36245937-36246108)
chr1 (89-260)||(35400049-35400220)
chr1 (89-260)||(35647574-35647745)
chr1 (89-260)||(47617443-47617614)
chr1 (96-260)||(12622683-12622847)
chr1 (89-260)||(5834347-5834518)
chr1 (91-259)||(153158-153326)
chr1 (89-260)||(3172743-3172914)
chr1 (90-257)||(12731631-12731798)
chr1 (90-257)||(12742224-12742391)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (92-260)||(19129938-19130106)
chr8 (74-260)||(26112451-26112636)
chr8 (89-260)||(15766087-15766258)
chr8 (89-260)||(15790224-15790395)
chr8 (89-260)||(36294108-36294279)
chr8 (89-260)||(209093-209264)
chr8 (89-260)||(242991-243162)
chr8 (89-260)||(722716-722887)
chr8 (89-260)||(796361-796532)
chr8 (89-260)||(3358145-3358316)
chr8 (89-260)||(9342313-9342484)
chr8 (89-260)||(29077889-29078060)
chr8 (89-260)||(32087209-32087380)
chr8 (89-260)||(13687504-13687675)
chr8 (89-260)||(36079113-36079284)
chr8 (96-260)||(6152292-6152456)
chr8 (95-257)||(19226134-19226296)
chr8 (95-257)||(30324171-30324333)
chr8 (89-180)||(44482305-44482396)
chr8 (150-260)||(44482387-44482497)
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (15-259)||(40469487-40469736)
chr4 (92-260)||(24026932-24027100)
chr4 (94-260)||(17919294-17919460)
chr4 (74-260)||(19953849-19954036)
chr4 (89-260)||(55754722-55754893)
chr4 (89-260)||(10750062-10750233)
chr4 (89-260)||(10963831-10964002)
chr4 (89-260)||(18761975-18762146)
chr4 (89-260)||(24641490-24641661)
chr4 (89-260)||(36019510-36019681)
chr4 (96-260)||(16257112-16257276)
chr4 (90-257)||(21997592-21997759)
chr4 (90-257)||(451752-451919)
chr4 (89-260)||(27657823-27657994)
chr4 (90-257)||(30935988-30936155)
chr4 (94-154)||(16306388-16306448)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (89-260)||(32312-32483)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (89-260)||(46488-46659)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (91-259)||(52481-52649)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (91-260)||(3430-3599)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (191-260)||(3556-3625)
[»] scaffold0398 (2 HSPs)
scaffold0398 (91-257)||(3250-3416)
scaffold0398 (91-169)||(11593-11671)
[»] scaffold1002 (2 HSPs)
scaffold1002 (91-180)||(2863-2952)
scaffold1002 (152-259)||(2763-2870)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (95-162)||(23758-23825)
[»] scaffold0454 (2 HSPs)
scaffold0454 (89-180)||(2444-2535)
scaffold0454 (150-260)||(2526-2636)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 37)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31447763 - 31447512
Alignment:
Q  15 gataatatttatatagataagtcaagatacaaaggcaaagctactaacaacttagaacaaaaa------caagcaaagaaagttgggtgtgcaactaagg 108  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31447763 gataacatttatatagataagttaagatacaaaggcaaagctactaacaacttagaacaaaaattaaaacaagcaaagaatgttgggtgtgcaactaagg 31447664  T
Q  109 ttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaaca 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31447663 ttgggcttgcttatacatctgttccaaaatatacttaatttgctcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccagca 31447564  T
Q  209 tgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31447563 tgaattctagcagcccttgtaatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 31447512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 74 - 260
Target Start/End: Original strand, 27604535 - 27604722
Alignment:
Q  74 aaaacaagcaaagaa-agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagc 172  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27604535 aaaacaagcaaagaataaatgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagc 27604634  T
Q  173 tcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27604635 tcatccttttctctcattcttcttttaaacccagcatgaattcttgcagtccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 27604722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 74 - 260
Target Start/End: Original strand, 5291657 - 5291843
Alignment:
Q  74 aaaacaagcaaagaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 173  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5291657 aaaacaagcaaagaaaactgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctattccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 5291756  T
Q  174 catccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5291757 catccttttctctcattcttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttataatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 5291843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 74 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 40400180 - 40399995
Alignment:
Q  74 aaaacaagcaaagaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 173  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40400180 aaaacaagcaaaaaaaattgg-tgtgcaactagggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 40400082  T
Q  174 catccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40400081 catccttttctctcattcttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtaatgtattcttcttctggatagaaaggagtga 40399995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 39361443 - 39361276
Alignment:
Q  93 gggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  39361443 gggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatcattcttcttgagtagctcatccttttccctcattct 39361344  T
Q  193 tcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39361343 tcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctgggtagaaaggagtga 39361276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15768539 - 15768368
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15768539 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctca 15768440  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15768439 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 15768368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 37731057 - 37731228
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37731057 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctca 37731156  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37731157 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 37731228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6985497 - 6985326
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6985497 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 6985398  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6985397 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 6985326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9345739 - 9345568
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9345739 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctaaagtagctcatccttttccctca 9345640  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9345639 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 9345568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14039796 - 14039625
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14039796 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 14039697  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14039696 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 14039625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 14448131 - 14448302
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14448131 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 14448230  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14448231 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 14448302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 14559163 - 14559334
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14559163 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 14559262  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14559263 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 14559334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17616818 - 17616647
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17616818 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctca 17616719  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||  | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17616718 ttcttcttttgtatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 17616647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17728675 - 17728504
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17728675 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctca 17728576  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||  | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17728575 ttcttcttttgtatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 17728504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22685202 - 22685031
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22685202 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 22685103  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22685102 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 22685031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23306045 - 23305874
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23306045 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 23305946  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23305945 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 23305874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23371708 - 23371537
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23371708 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 23371609  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23371608 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 23371537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23706555 - 23706384
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23706555 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 23706456  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23706455 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 23706384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 27043314 - 27043485
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27043314 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 27043413  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27043414 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 27043485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27469760 - 27469589
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27469760 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 27469661  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27469660 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 27469589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31358292 - 31358121
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31358292 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctca 31358193  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||  | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31358192 ttcttcttttgtatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 31358121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 36583604 - 36583775
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  36583604 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 36583703  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36583704 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 36583775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 42052567 - 42052396
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  42052567 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 42052468  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42052467 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 42052396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 258
Target Start/End: Original strand, 30228551 - 30228720
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  30228551 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 30228650  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagt 258  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30228651 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagt 30228720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 24589159 - 24589330
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  24589159 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttacctca 24589258  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589259 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 24589330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 39491992 - 39492163
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  39491992 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatcctttttcctca 39492091  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39492092 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 39492163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 256
Target Start/End: Original strand, 24817946 - 24818113
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24817946 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 24818045  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagga 256  Q
    |||||| |||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24818046 ttcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaagga 24818113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22156244 - 22156080
Alignment:
Q  96 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttct 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  22156244 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatctttttccctcaatcttct 22156145  T
Q  196 tttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||  ||||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22156144 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 22156080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 35225261 - 35225090
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35225261 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 35225162  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||  |  |||| |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35225161 ttcttcttacatgcccagcatgaatccttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 35225090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 257
Target Start/End: Original strand, 15994389 - 15994556
Alignment:
Q  90 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || |     
T  15994389 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatcattttcccttaa 15994488  T
Q  190 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggag 257  Q
    | | ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15994489 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggag 15994556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31843163 - 31842993
Alignment:
Q  90 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |  ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |     
T  31843163 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactattctaagaaatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 31843064  T
Q  190 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    | | ||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31843063 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagtga 31842993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 91 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20796818 - 20796650
Alignment:
Q  91 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcatt 190  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| |    
T  20796818 ttgggtgtgcaactaaggtttggctagcttatacatctgttccaaaagatatttaatctgctcatccttcttctgaagttgttcatcctttgctctcagt 20796719  T
Q  191 cttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtg 259  Q
    |||||||| |||||  | || |||||  |||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20796718 cttcttttcaacccggcttgaattctaacagttcttgaaatgtactcatcttctggatagaaaggagtg 20796650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 237
Target Start/End: Original strand, 1110295 - 1110441
Alignment:
Q  91 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcatt 190  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| |    
T  1110295 ttgggtgtgcaactaaggtttggcttgcttatacaactgttccaatagatacttaatttgctcatccttcttctgaagttgttcatcctttgctctcagt 1110394  T
Q  191 cttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactc 237  Q
    || ||||| |||||| |||| ||||| |||| |||||  ||||||||    
T  1110395 ctacttttcaacccagcatgaattctagcagtccttgaaatgtactc 1110441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 36697394 - 36697303
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatcctt 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||     |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36697394 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcaactgttctaagagaagtctaatctgttcatccttcttctgaagtagctcatcctt 36697303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 36697312 - 36697202
Alignment:
Q  150 gctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggata 249  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |   | || |||  |||| |||  ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  36697312 gctcatccttcttctgaagtagttcttccttctctcttaacttcctcttatgcccagcataaattcttgcagctcttgtgatgtattctgcctctggata 36697213  T
Q  250 gaaaggagtga 260  Q
    |||||||||||    
T  36697212 gaaaggagtga 36697202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19477060 - 19477001
Alignment:
Q  95 gtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctca 154  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || ||| ||||| ||||||    
T  19477060 gtgtgcaactaaggtttggctagcttagacatctgttccataaagtatttaatctgctca 19477001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23405565 - 23405403
Alignment:
Q  94 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattctt 193  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||  |||||||| | ||| ||||| ||||||  || ||||| ||||   ||||||||  |||||| ||||    
T  23405565 ggtgtgcaactaaggtttggatagcttagacacttgttccaataagtatttaatctgctcagactgcttctgaagttcttcatccttggctctcagtctt 23405466  T
Q  194 cttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaagga 256  Q
    ||| | | |||  | || |||||  ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||    
T  23405465 cttctcagcccttcttgaattctatcagcccttgagatgtaatcagcttctggatagaaagga 23405403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19993221 - 19992970
Alignment:
Q  14 agataatatttatatagataagtcaagatacaaaggcaaagctactaacaacttagaacaaaaa-----caagcaaagaaagttgggtgtgcaactaagg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19993221 agataatatttatatagataagataagatacaaaggcaaagctactaacaacttagaacaaaaattaaacaagcaaagagtgttgggtgtgcaactaagg 19993122  T
Q  109 ttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaaca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  19993121 ttgggcttgcttatacatctgttccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtaactcatccttttctctcattcttcttttgaatccagca 19993022  T
Q  209 tgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19993021 tgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 19992970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 74 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21002148 - 21001962
Alignment:
Q  74 aaaacaagcaaagaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 173  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21002148 aaaacaagcaaagaaaattgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 21002049  T
Q  174 catccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21002048 catccttttctctcattcttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 21001962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 74 - 260
Target Start/End: Original strand, 9434409 - 9434595
Alignment:
Q  74 aaaacaagcaaagaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 173  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9434409 aaaacaagcaaagaaaaatgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 9434508  T
Q  174 catccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9434509 catccttttctctcattcttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 9434595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 74 - 260
Target Start/End: Original strand, 5686704 - 5686891
Alignment:
Q  74 aaaacaagcaaagaaagt-tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagc 172  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5686704 aaaacaagcaaagaaaaaatgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagc 5686803  T
Q  173 tcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5686804 tcatccttttctctcattcttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 5686891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 74 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6876982 - 6876797
Alignment:
Q  74 aaaacaagcaaagaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 173  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6876982 aaaacaagcaaaaaaaat-gggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 6876884  T
Q  174 catccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6876883 catccttttctctcattcttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 6876797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 1988726 - 1988897
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1988726 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctca 1988825  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988826 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 1988897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8011812 - 8011641
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8011812 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctca 8011713  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8011712 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 8011641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 260
Target Start/End: Original strand, 22090372 - 22090538
Alignment:
Q  94 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattctt 193  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22090372 ggtgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttccctcattctt 22090471  T
Q  194 cttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22090472 cttttatacccagcatgaattctggttgcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 22090538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 24735911 - 24736082
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24735911 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 24736010  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24736011 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 24736082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 2715361 - 2715191
Alignment:
Q  90 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  2715361 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttttgaagtagctcatccttttccctcat 2715262  T
Q  190 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2715261 tcttcttttatacccagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagtga 2715191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 96 - 260
Target Start/End: Original strand, 4213219 - 4213383
Alignment:
Q  96 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttct 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4213219 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgattttctcatccttcttcttgagtagctcatcattttccctcattcttct 4213318  T
Q  196 tttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||| ||||| |||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4213319 tttatacccagcatgaattcttgatgcccttgtaatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 4213383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 96 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17959793 - 17959629
Alignment:
Q  96 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttct 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17959793 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttccctcattcttct 17959694  T
Q  196 tttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||  ||||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17959693 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 17959629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 9086415 - 9086586
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9086415 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 9086514  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9086515 ttcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 9086586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26399821 - 26399650
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26399821 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaacagttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 26399722  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26399721 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 26399650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 40051829 - 40051658
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  40051829 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 40051730  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    || |||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40051729 ttattcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 40051658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 11097198 - 11097370
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  11097198 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 11097297  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcc-cttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11097298 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccactagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 11097370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 11006375 - 11006546
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11006375 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 11006474  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11006475 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 11006546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26698854 - 26698683
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26698854 agttggatgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactattctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 26698755  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26698754 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 26698683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 42867016 - 42867187
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42867016 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 42867115  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42867116 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 42867187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 98 - 260
Target Start/End: Original strand, 8618587 - 8618749
Alignment:
Q  98 tgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  8618587 tgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttccctcattcttattt 8618686  T
Q  198 taaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |  ||||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8618687 tgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 8618749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 260
Target Start/End: Original strand, 168090 - 168254
Alignment:
Q  96 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttct 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  168090 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatctttttccctcaatcttct 168189  T
Q  196 tttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||  ||||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  168190 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 168254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 466718 - 466550
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  466718 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttccctta 466619  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggag 257  Q
     | | ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  466618 atttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggag 466550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15887365 - 15887203
Alignment:
Q  95 gtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttc 194  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| || || ||||  |||||||| ||||||| |||| | || | || | |||||| |||||    
T  15887365 gtgtgcaactaaggtttggctagcttagacatctgttccaatagatatttaacctgctcatcattcttctgaagttgttctttctgtgctctcagtcttc 15887266  T
Q  195 ttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggag 257  Q
    |||| | |||| | || |||||  |||||||||   |||| || ||||||||||| |||||||    
T  15887265 ttttcagcccagcttgaattctatcagcccttgaagtgtaatcatcttctggataaaaaggag 15887203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 33)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16390682 - 16390431
Alignment:
Q  15 gataatatttatatagataagtcaagatacaaaggcaaagctactaacaacttagaacaaaaa------caagcaaagaaagttgggtgtgcaactaagg 108  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16390682 gataacatttatatagataagttaagatacaaaggcaaagctactaacaacttagagcaaaaattaaaacaagcaaagaatgtcgggtgtgcaactaagg 16390583  T
Q  109 ttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaaca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16390582 ttgggcttgcttatacatctgttccaagagatacttaatttgctcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccagca 16390483  T
Q  209 tgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16390482 tgaattctggctgcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 16390431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 74 - 260
Target Start/End: Original strand, 37867645 - 37867832
Alignment:
Q  74 aaaacaagcaaagaa-agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagc 172  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37867645 aaaacaagcaaagaataaatgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctattccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagc 37867744  T
Q  173 tcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37867745 tcatccttttctctcattcttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 37867832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 74 - 260
Target Start/End: Original strand, 37876163 - 37876350
Alignment:
Q  74 aaaacaagcaaagaa-agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagc 172  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37876163 aaaacaagcaaagaataaatgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctattccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagc 37876262  T
Q  173 tcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37876263 tcatccttttctctcattcttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 37876350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 19779600 - 19779767
Alignment:
Q  93 gggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19779600 gggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattct 19779699  T
Q  193 tcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19779700 tcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttatgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 19779767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6500113 - 6499870
Alignment:
Q  23 ttatatagataagtcaagatacaaaggcaaagctactaacaacttagaaca------aaaacaagcaaagaaagttgggtgtgcaactaaggttgggctt 116  Q
    |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||| | || ||||||||      ||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  6500113 ttatattgacaagttaagatacaaaggaaaagctactgataatttagaacacaagtaaaaacaagctaaaagtgttgggtgtgcaactaaggttgggctt 6500014  T
Q  117 gcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattct 216  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  6500013 gcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaagcccagcatgaattct 6499914  T
Q  217 tgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6499913 tgcagcccttgtgatgtactcttcttcttgatagaaaggagtga 6499870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 94 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6219710 - 6219544
Alignment:
Q  94 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattctt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6219710 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaagagatacttaatttgttcatccttctgcttaagtagctcatccttttctctcattctt 6219611  T
Q  194 cttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6219610 cttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 6219544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9993052 - 9992800
Alignment:
Q  15 gataatatttatatagataagtcaagatacaaaggcaaagctactaacaactt-agaac------aaaaacaagcaaagaaagttgggtgtgcaactaag 107  Q
    |||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||| | || || |||||      |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  9993052 gataatatttatattgacaaattaagatacagaggcaaagctactgataaatttagaaccaaagtaaaaacaagctaagagtgttgggtgtgcaactaag 9992953  T
Q  108 gttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaac 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  9992952 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatatgatcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttatgcccagc 9992853  T
Q  208 atgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9992852 atgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttcgggatagaaaggagtga 9992800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 96 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20682787 - 20682623
Alignment:
Q  96 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttct 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20682787 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttcttcttgagtagctcatccttttccctcattcttct 20682688  T
Q  196 tttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||| ||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20682687 tttatacccagcatgaattcttgatgcccttgtgatgtactcttcttctgtatagaaaggagtga 20682623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 90 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13382329 - 13382159
Alignment:
Q  90 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13382329 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcat 13382230  T
Q  190 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13382229 tcttcttttatacccagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcctctggatagaaaggagtga 13382159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 90 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13392923 - 13392753
Alignment:
Q  90 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13392923 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcat 13392824  T
Q  190 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13392823 tcttcttttatacccagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcctctggatagaaaggagtga 13392753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 4744897 - 4745068
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  4744897 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 4744996  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4744997 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 4745068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 5511853 - 5512024
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5511853 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 5511952  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5511953 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 5512024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5546682 - 5546511
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5546682 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 5546583  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5546582 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 5546511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 24661074 - 24661245
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24661074 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 24661173  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661174 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 24661245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5627038 - 5626867
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5627038 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 5626939  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5626938 ttcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 5626867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5875323 - 5875152
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5875323 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 5875224  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||  |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5875223 ttctttgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 5875152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12295881 - 12295710
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12295881 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 12295782  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12295781 ttcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 12295710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 16477438 - 16477609
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16477438 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 16477537  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16477538 ttcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 16477609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24393133 - 24392962
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24393133 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 24393034  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24393033 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctgaatagaaaggagtga 24392962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 41684833 - 41685004
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  41684833 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 41684932  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41684933 ttcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 41685004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 260
Target Start/End: Original strand, 14466815 - 14466979
Alignment:
Q  96 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttct 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14466815 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttccctcaatcttct 14466914  T
Q  196 tttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||  ||||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14466915 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 14466979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 8775863 - 8776034
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8775863 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 8775962  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8775963 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 8776034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 18485196 - 18485367
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18485196 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 18485295  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18485296 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 18485367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 38195930 - 38196101
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38195930 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 38196029  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38196030 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 38196101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 39373260 - 39373431
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39373260 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 39373359  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39373360 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 39373431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 90 - 260
Target Start/End: Original strand, 23758440 - 23758610
Alignment:
Q  90 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |     
T  23758440 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 23758539  T
Q  190 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    | | ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23758540 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagtga 23758610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 260
Target Start/End: Original strand, 13122889 - 13123053
Alignment:
Q  96 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttct 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13122889 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttccctcaatcttct 13122988  T
Q  196 tttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||  |||||  ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13122989 tttgtacccagaatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 13123053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28323878 - 28323707
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28323878 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 28323779  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28323778 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgagatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 28323707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 91 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29470843 - 29470675
Alignment:
Q  91 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcatt 190  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| |    
T  29470843 ttgggtgtgcaactaaggtttggcttgcttatacaactgttccaatagatacttaatttgctcatccttcttctgaagttgttcatcctttgctctcagt 29470744  T
Q  191 cttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtg 259  Q
    || ||||| |||||| |||| ||||| |||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  29470743 ctacttttcaacccagcatgaattctagcagtccttgaaatgtcctcatcttctggatagaaaggagtg 29470675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12248505 - 12248335
Alignment:
Q  90 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || | ||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |     
T  12248505 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttaaacaactgttctaagagatgcttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 12248406  T
Q  190 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    | | ||||||  |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  12248405 tttccttttatgcccagcatgaattctagcagcccttgtgatgtattcttcttctggatagtaaggagtga 12248335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 172 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10636014 - 10635926
Alignment:
Q  172 ctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10636014 ctcatccttttctctcattttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagtga 10635926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 89 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10654335 - 10654248
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcat 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  10654335 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactattctaagagatacttgatttgatcatctttcttctgaagtagctcat 10654248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 154
Target Start/End: Original strand, 13072979 - 13073039
Alignment:
Q  94 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctca 154  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||  |||||||  ||||||||||| ||||||    
T  13072979 ggtgtgcaactaaggtttggctagcttagacacttgttccattaggtacttaatctgctca 13073039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 260
Target Start/End: Original strand, 27373866 - 27374101
Alignment:
Q  31 ataagtcaagatacaaaggcaaagctactaacaacttagaacaaaaa------caagcaaagaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatac 124  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373866 ataagttaagatacaaaggcaaaactactaacaacttagaacaaaaattaaaacaagcaaagagtgttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatac 27373965  T
Q  125 atctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagccc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  27373966 atctgttccaaaaggtacttaatttgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttatacccagcatgaattcttgcagccc 27374065  T
Q  225 ttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  27374066 ttgtgatatactcttcttctagatagaaaggagtga 27374101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 260
Target Start/End: Original strand, 27464219 - 27464454
Alignment:
Q  31 ataagtcaagatacaaaggcaaagctactaacaacttagaacaaaaa------caagcaaagaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatac 124  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27464219 ataagttaagatacaaaggcaaaactactaacaacttagaacaaaaattaaaacaagcaaagagtgttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatac 27464318  T
Q  125 atctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagccc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  27464319 atctgttccaaaaggtacttaatttgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttatacccagcatgaattcttgcagccc 27464418  T
Q  225 ttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  27464419 ttgtgatatactcttcttctagatagaaaggagtga 27464454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 74 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9122205 - 9122019
Alignment:
Q  74 aaaacaagcaaagaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 173  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9122205 aaaacaagcaaagaaaattgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 9122106  T
Q  174 catccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9122105 catccttttctctcattcttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 9122019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 260
Target Start/End: Original strand, 25590271 - 25590528
Alignment:
Q  9 agcagagataatatttatatagataagtcaagatacaaaggcaaagctactaaca-acttagaacaaa------aacaagcaaagaaagttgggtgtgca 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | | |||   ||||||||||||      ||| ||||| ||||  ||||||||||    
T  25590271 agcaaagataatatttatatagataagttaagatacaaaagcaaatcaattaaagtacttagaacaaagattaaaactagcaa-gaaaaatgggtgtgca 25590369  T
Q  102 actaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25590370 actaaggttgggcttgcttatacatctgttctaagaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagaagttcatccttctctctcatccttcttttaaa 25590469  T
Q  202 cccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25590470 cccagcatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 25590528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 90 - 260
Target Start/End: Original strand, 12856097 - 12856267
Alignment:
Q  90 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  12856097 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcat 12856196  T
Q  190 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12856197 tcttcttttatacccagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 12856267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 90 - 260
Target Start/End: Original strand, 26865940 - 26866110
Alignment:
Q  90 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26865940 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcat 26866039  T
Q  190 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||||||| | ||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26866040 tcttcttttatatccagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 26866110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 3662491 - 3662662
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3662491 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 3662590  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3662591 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 3662662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12726494 - 12726323
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12726494 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 12726395  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12726394 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 12726323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17983795 - 17983624
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  17983795 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 17983696  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17983695 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 17983624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 25788875 - 25789046
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25788875 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 25788974  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25788975 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 25789046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 26026566 - 26026737
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26026566 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 26026665  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26026666 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 26026737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 27342874 - 27343045
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27342874 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 27342973  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27342974 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 27343045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 27403614 - 27403785
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27403614 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 27403713  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27403714 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 27403785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 16931541 - 16931712
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16931541 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacnactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 16931640  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931641 ttcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 16931712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34816825 - 34816661
Alignment:
Q  96 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttct 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  34816825 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatctttttccctcaatcttct 34816726  T
Q  196 tttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||  ||||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34816725 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 34816661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 98 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 32971526 - 32971364
Alignment:
Q  98 tgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  32971526 tgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatcattttccctcaatcttcttt 32971427  T
Q  198 taaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |  ||||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32971426 tgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 32971364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 92 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 7669466 - 7669375
Alignment:
Q  92 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttc 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7669466 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttgatttgctcatccttcttcttgagtagctcatccttttc 7669375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 257
Target Start/End: Original strand, 12359298 - 12359460
Alignment:
Q  95 gtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttc 194  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||| ||||   |||| |||| |||||| ||| |    
T  12359298 gtgtgcaactaaggtttggctagcttagacatctgttccaatagatatttaatctgatcatccttcttctgaagttcttcattctttgctctcaatctgc 12359397  T
Q  195 ttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggag 257  Q
    |||| | |||  | || |||||  |||||||||   |||| || |||||||||||||||||||    
T  12359398 ttttcagccctgcttgaattctatcagcccttgaagtgtaatcatcttctggatagaaaggag 12359460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 180
Target Start/End: Original strand, 4632036 - 4632127
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatcctt 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||     |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4632036 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcaactgttctaagagaagtctaatctgttcatccttcttctgaagtagctcatcctt 4632127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 180
Target Start/End: Original strand, 27385562 - 27385653
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatcctt 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||     |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27385562 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcaactgttctaagagaagtctaatctgttcatccttcttctgaagtagctcatcctt 27385653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 180
Target Start/End: Original strand, 27475975 - 27476066
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatcctt 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||     |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27475975 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcaactgttctaagagaagtctaatctgttcatccttcttctgaagtagctcatcctt 27476066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 32310741 - 32310650
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatcctt 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||     |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32310741 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcaactgttctaagagaagtctaatctgttcatccttcttctgaagtagctcatcctt 32310650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 260
Target Start/End: Original strand, 27385644 - 27385754
Alignment:
Q  150 gctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggata 249  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |   | || |||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  27385644 gctcatccttcttctgaagtagttcttccttctctcttaacttcctcttatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatgtattctgcctctggata 27385743  T
Q  250 gaaaggagtga 260  Q
    |||||||||||    
T  27385744 gaaaggagtga 27385754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 260
Target Start/End: Original strand, 27476057 - 27476167
Alignment:
Q  150 gctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggata 249  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |   | || |||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  27476057 gctcatccttcttctgaagtagttcttccttctctcttaacttcctcttatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatgtattctgcctctggata 27476156  T
Q  250 gaaaggagtga 260  Q
    |||||||||||    
T  27476157 gaaaggagtga 27476167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 260
Target Start/End: Original strand, 4632118 - 4632228
Alignment:
Q  150 gctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggata 249  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |   | || |||  |||| |||  ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  4632118 gctcatccttcttctgaagtagttcttccttctctcttaacttcctcttatgcccagcataaattcttgcagctcttgtgatgtattctgcctctggata 4632217  T
Q  250 gaaaggagtga 260  Q
    |||||||||||    
T  4632218 gaaaggagtga 4632228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 32310659 - 32310549
Alignment:
Q  150 gctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggata 249  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |   | || |||  |||| |||  ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  32310659 gctcatccttcttctgaagtagttcttccttctctcttaacttcctcttatgcccagcataaattcttgcagctcttgtgatgtattctgcctctggata 32310560  T
Q  250 gaaaggagtga 260  Q
    |||||||||||    
T  32310559 gaaaggagtga 32310549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 94 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 32780289 - 32780124
Alignment:
Q  94 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattctt 193  Q
    |||||| |||||||||| || | ||||| |||  |||||||| | ||| ||||| ||||||  || ||||| ||||   ||||||||  |||||| ||||    
T  32780289 ggtgtgaaactaaggtttggatagcttagacacttgttccaataagtatttaatctgctcagactgcttctgaagttcttcatccttggctctcagtctt 32780190  T
Q  194 cttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtg 259  Q
    ||| | | |||  | || |||||  ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  32780189 cttctcagcccttcttgaattctatcagcccttgagatgtaatcagcttctggatagaaaggagtg 32780124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1216 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold1216
Description:

Target: scaffold1216; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Original strand, 185 - 434
Alignment:
Q  15 gataatatttatatagataagtcaagatacaaaggcaaagctactaaca-acttagaacaaaaa-----caagcaaagaaagttgggtgtgcaactaagg 108  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||     ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  185 gataacatttataaagataagtcaagatacaaaggcaaagctactaaaatacttagaacaaaaattaaacaagcaaagaa-gatgggtgtgcaactaagg 283  T
Q  109 ttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaaca 208  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  284 tttggcttgcttatacatttgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaatccagca 383  T
Q  209 tgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtg 259  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  384 tgaattctagcagcccttgtaatgtactcttcttatggatagaaaggagtg 434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 74 - 260
Target Start/End: Original strand, 43083816 - 43084003
Alignment:
Q  74 aaaacaagcaaagaa-agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagc 172  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43083816 aaaacaagcaaagaataaatgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagc 43083915  T
Q  173 tcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43083916 tcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 43084003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 260
Target Start/End: Original strand, 29245316 - 29245561
Alignment:
Q  24 tatatagataagtcaagatacaaaggcaaagctactaaca-acttagaaca------aaaacaagcaaagaaagt--tgggtgtgcaactaaggttgggc 114  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||| || ||||| | ||||||||||      ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  29245316 tatatagaaaagttaagatacaaatgcaaggcaactaaaatacttagaacagagattaaaacaagcaaagaaaaaaatgggtgtgcaactaaggttgggc 29245415  T
Q  115 ttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtatt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  29245416 ttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccagcatgaatt 29245515  T
Q  215 cttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29245516 cttgcagcccttgtaatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 29245561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 74 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24337454 - 24337270
Alignment:
Q  74 aaaacaagcaaagaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 173  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24337454 aaaacaagcaaaaaaatt--ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttgagtagct 24337357  T
Q  174 catccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24337356 catccttttctctcattcttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 24337270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 90 - 260
Target Start/End: Original strand, 40223475 - 40223645
Alignment:
Q  90 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  40223475 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcat 40223574  T
Q  190 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40223575 tcttcttttatacccagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 40223645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11404522 - 11404351
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  11404522 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 11404423  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11404422 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 11404351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 43346540 - 43346711
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  43346540 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 43346639  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346640 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 43346711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 97 - 260
Target Start/End: Original strand, 4211085 - 4211248
Alignment:
Q  97 gtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttctt 196  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4211085 gtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttctctcattcttctt 4211184  T
Q  197 ttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||  | ||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4211185 ttgtatccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 4211248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 10268123 - 10268294
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10268123 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatcctttttctgaagtagctcatccttttccctca 10268222  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10268223 ttcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 10268294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 10278700 - 10278871
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10278700 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatcctttttctgaagtagctcatccttttccctca 10278799  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10278800 ttcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 10278871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 27222561 - 27222732
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27222561 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 27222660  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27222661 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 27222732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 35254174 - 35254345
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35254174 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 35254273  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35254274 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 35254345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 35264783 - 35264954
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35264783 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 35264882  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35264883 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 35264954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22959373 - 22959209
Alignment:
Q  96 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttct 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  22959373 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatctttttccctcaatcttct 22959274  T
Q  196 tttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||  ||||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959273 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 22959209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9907308 - 9907066
Alignment:
Q  15 gataatatttatatagataagtcaagatacaaaggcaaagctactaacaacttagaacaaaaacaagcaaagaaagttgggtgtgcaactaaggttgggc 114  Q
    ||||||||||||| ||| | || ||||||||||| |||||||||||| |||  |    |||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||    
T  9907308 gataatatttataaagaaaggttaagatacaaagacaaagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagt---gttgggtgtgcaactaaggttgggc 9907212  T
Q  115 ttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtatt 214  Q
    || |||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| || | | | ||||||  |||| |||| |||    
T  9907211 ttacttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttcccttaatttccttttatgcccagcatgaatt 9907112  T
Q  215 cttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9907111 cttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagtga 9907066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 90 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9772407 - 9772237
Alignment:
Q  90 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |     
T  9772407 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 9772308  T
Q  190 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    | | ||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9772307 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagtga 9772237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34803447 - 34803301
Alignment:
Q  90 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  34803447 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagttcatccttttccctcat 34803348  T
Q  190 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtact 236  Q
    |||||||||| ||||| | || ||||| ||| |||||||||||||||    
T  34803347 tcttcttttatacccagcctgaattctagcaacccttgtgatgtact 34803301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21171470 - 21171305
Alignment:
Q  94 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattctt 193  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||  |||||||| | ||| ||||| ||||||  || ||||| ||||   ||||||||  |||||| ||||    
T  21171470 ggtgtgcaactaaggtttggatagcttagacacttgttccaataagtatttaatctgctcagactgcttctgaagttcttcatccttggctctcagtctt 21171371  T
Q  194 cttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtg 259  Q
    ||| | | |||  | || |||||  ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  21171370 cttctcagcccttcttgaattctatcagcccttgagatgtaatcagcttctggatagaaaggagtg 21171305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28730916 - 28730751
Alignment:
Q  94 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattctt 193  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||  |||||||| | ||| ||||| ||||||  || ||||| ||||   ||||||||  |||||| ||||    
T  28730916 ggtgtgcaactaaggtttggatagcttagacacttgttccaataagtatttaatctgctcagactacttctgaagttcttcatccttggctctcagtctt 28730817  T
Q  194 cttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtg 259  Q
    ||| | | |||  | || |||||  ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  28730816 cttctcagcccttcttgaattctatcagcccttgagatgtaatcagcttctggatagaaaggagtg 28730751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34799726 - 34799698
Alignment:
Q  232 gtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34799726 gtactcttcttctggatagaaaggagtga 34799698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 74 - 260
Target Start/End: Original strand, 4168384 - 4168569
Alignment:
Q  74 aaaacaagcaaagaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 173  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4168384 aaaacaagcaaaaaaaat-gggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 4168482  T
Q  174 catccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4168483 catccttttctctcattcttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 4168569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 74 - 260
Target Start/End: Original strand, 19180067 - 19180253
Alignment:
Q  74 aaaacaagcaaagaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 173  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19180067 aaaacaagcaaagaaaactgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 19180166  T
Q  174 catccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  19180167 catccttttctctcattcttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtaatatactcttcttctagatagaaaggagtga 19180253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 74 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5649448 - 5649263
Alignment:
Q  74 aaaacaagcaaagaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 173  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  5649448 aaaacaagcaaaaaaaattgg-tgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatctgctcatccttcttattgagtagct 5649350  T
Q  174 catccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5649349 catccttttctctcattcttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctgggtagaaaggagtga 5649263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 260
Target Start/End: Original strand, 21864824 - 21864990
Alignment:
Q  94 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattctt 193  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21864824 ggtgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttccctcattctt 21864923  T
Q  194 cttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21864924 cttttatacccagcatgaattcttgttgcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 21864990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 38096206 - 38096377
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  38096206 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttttgaagtagctcatccttttctctca 38096305  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38096306 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 38096377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 51655552 - 51655381
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  51655552 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 51655453  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51655452 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 51655381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 7508420 - 7508591
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7508420 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 7508519  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7508520 ttcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 7508591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 36246108 - 36245937
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  36246108 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 36246009  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36246008 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttatggatagaaaggagtga 36245937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 35400220 - 35400049
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35400220 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 35400121  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35400120 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 35400049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 35647745 - 35647574
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35647745 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 35647646  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35647645 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 35647574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 47617614 - 47617443
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47617614 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 47617515  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47617514 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 47617443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12622847 - 12622683
Alignment:
Q  96 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttct 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12622847 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcgtccttctttttgagtagctcatccttttccctcattcttct 12622748  T
Q  196 tttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||  | ||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12622747 tttgtatccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 12622683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 5834347 - 5834518
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5834347 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 5834446  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||  |  |||| |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5834447 ttcttcttacatgcccagcatgaatccttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 5834518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 91 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 153326 - 153158
Alignment:
Q  91 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcatt 190  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| |||||| |    
T  153326 ttgggtgtgcaactaaggtttggcttgcttatacaactgttccaatagatacttaatttgctcatccttcttctgaagttgttcattctttgctctcagt 153227  T
Q  191 cttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtg 259  Q
    || ||||| |||||| |||| ||||| |||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  153226 ctacttttcaacccagcatgaattctagcagtccttgaaatgtactcatcttctggatagaaaggagtg 153158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 3172743 - 3172914
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3172743 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttctttttaagtagctcatccttttccctca 3172842  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||  |  |||| |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3172843 ttcttcttacatgcccagcatgaatccttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 3172914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 257
Target Start/End: Original strand, 12731631 - 12731798
Alignment:
Q  90 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |     
T  12731631 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 12731730  T
Q  190 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggag 257  Q
    | | ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12731731 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggag 12731798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 257
Target Start/End: Original strand, 12742224 - 12742391
Alignment:
Q  90 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |     
T  12742224 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 12742323  T
Q  190 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggag 257  Q
    | | ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12742324 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggag 12742391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 92 - 260
Target Start/End: Original strand, 19129938 - 19130106
Alignment:
Q  92 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19129938 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctgatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 19130037  T
Q  192 ttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19130038 ttcttttaaacccaacatgaattcttgcagcccttgtaatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 19130106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 74 - 260
Target Start/End: Original strand, 26112451 - 26112636
Alignment:
Q  74 aaaacaagcaaagaaagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 173  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26112451 aaaacaagcaaaaaaaat-gggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgttcatccttctgcttaagtagct 26112549  T
Q  174 catccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26112550 catccttttctctcattcttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 26112636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15766258 - 15766087
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  15766258 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctaaagtagctcattcttttccctca 15766159  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15766158 ttcttcttttatacccagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 15766087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15790395 - 15790224
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| ||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15790395 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatccgatcatccttcttctaaagtagctcatccttttccctca 15790296  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15790295 ttcttcttttatacccagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 15790224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 36294108 - 36294279
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36294108 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctca 36294207  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36294208 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 36294279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 209264 - 209093
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  209264 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 209165  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  209164 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 209093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 242991 - 243162
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  242991 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 243090  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  243091 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 243162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 722887 - 722716
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  722887 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 722788  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  722787 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 722716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 796361 - 796532
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  796361 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 796460  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  796461 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 796532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3358316 - 3358145
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3358316 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 3358217  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3358216 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 3358145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 9342313 - 9342484
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9342313 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 9342412  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9342413 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 9342484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 29077889 - 29078060
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  29077889 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 29077988  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29077989 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 29078060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 32087380 - 32087209
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  32087380 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 32087281  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32087280 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 32087209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13687675 - 13687504
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13687675 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 13687576  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13687575 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 13687504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 36079113 - 36079284
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36079113 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 36079212  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36079213 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 36079284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 260
Target Start/End: Original strand, 6152292 - 6152456
Alignment:
Q  96 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttct 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  6152292 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcattcttctttttgagtagctcatccttttccctcaatcttct 6152391  T
Q  196 tttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||  ||||| |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6152392 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctcgatagaaaggagtga 6152456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 257
Target Start/End: Original strand, 19226134 - 19226296
Alignment:
Q  95 gtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttc 194  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||| |||| | || | || | |||||| |||||    
T  19226134 gtgtgcaactaaggtttggctagcttagacatctgttccaatagatatttaatctgctcatccttcttctgaagttgttctttctgtgctctcagtcttc 19226233  T
Q  195 ttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggag 257  Q
    |||| | |||| | || |||||  |||||||||   |||| || |||||||||||||||||||    
T  19226234 ttttcagcccagcttgaattctatcagcccttgaagtgtaatcatcttctggatagaaaggag 19226296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 30324333 - 30324171
Alignment:
Q  95 gtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttc 194  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||| | |||  || | |||||| |||||    
T  30324333 gtgtgcaactaaggtttggctagcttagacatctgttccaaaagatatttaatctgctcatccttcttctgaagttgttcagtctgtgctctcactcttc 30324234  T
Q  195 ttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggag 257  Q
    |||| | |||| | || |||||  |||||||||   |||| || ||||||||||| |||||||    
T  30324233 ttttcagcccagcttgaattctatcagcccttgaagtgtaatcatcttctggataaaaaggag 30324171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 180
Target Start/End: Original strand, 44482305 - 44482396
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatcctt 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||     |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44482305 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcagctgttctaagagaagtctaatctgttcatccttcttctgaagtagctcatcctt 44482396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 260
Target Start/End: Original strand, 44482387 - 44482497
Alignment:
Q  150 gctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggata 249  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |   | || |||  |||| |||  ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  44482387 gctcatccttcttctgaagtagttcttccttctctcttaacttcctcttatgcccagcataaattcttgcagctcttgtgatgtattctgcctctggata 44482486  T
Q  250 gaaaggagtga 260  Q
    |||||||||||    
T  44482487 gaaaggagtga 44482497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40469736 - 40469487
Alignment:
Q  15 gataatatttatatagataagtcaagatacaaaggcaaagctactaaca-acttagaacaaaaa-----caagcaaagaaagttgggtgtgcaactaagg 108  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||     |||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  40469736 gataacatttataaagacaagtcaagatacaaaggcaaagctactaaaatatttagaacaaaaattaaacaagcaaaaaaaat-gggtgtgcaactaagg 40469638  T
Q  109 ttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaaca 208  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  40469637 tttggcttgcttatacatttgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaatccagca 40469538  T
Q  209 tgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtg 259  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40469537 tgaattctagcagcccttgtaatgtactcttcttctagatagaagggagtg 40469487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 92 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24027100 - 24026932
Alignment:
Q  92 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24027100 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttgatttgctcatccttcttcttgagtagctcatccttttccctcattc 24027001  T
Q  192 ttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24027000 ttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 24026932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 94 - 260
Target Start/End: Original strand, 17919294 - 17919460
Alignment:
Q  94 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattctt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17919294 ggtgtgcaactaaggttgggctttcttgtacatctgttccaaaagatacttgatttgctcatccttcttcttgagtagctcatccttttccctcattctt 17919393  T
Q  194 cttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17919394 cttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 17919460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 74 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19954036 - 19953849
Alignment:
Q  74 aaaacaagcaaagaa-agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagc 172  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19954036 aaaacaagcaaagaataaatgggtgtgcaactaaggttggacttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttgagtagc 19953937  T
Q  173 tcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19953936 tcatccttttcccttattcttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactattcttctgggtagaaaggagtga 19953849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 55754893 - 55754722
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55754893 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctca 55754794  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55754793 ttcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 55754722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10750233 - 10750062
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10750233 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttagacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 10750134  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10750133 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 10750062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10964002 - 10963831
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10964002 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttagacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 10963903  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10963902 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 10963831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18762146 - 18761975
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18762146 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatttgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 18762047  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18762046 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagcccatgtgatgtattcctcttctggatagaaaggagtga 18761975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 24641490 - 24641661
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24641490 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 24641589  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24641590 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 24641661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 36019510 - 36019681
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  36019510 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaattgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctca 36019609  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||| | ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36019610 ttcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 36019681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 260
Target Start/End: Original strand, 16257112 - 16257276
Alignment:
Q  96 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttct 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  16257112 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatctttttccctcaatcttct 16257211  T
Q  196 tttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||  ||||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16257212 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 16257276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 90 - 257
Target Start/End: Original strand, 21997592 - 21997759
Alignment:
Q  90 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |     
T  21997592 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 21997691  T
Q  190 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggag 257  Q
    | | ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21997692 tttccttttatgcccaacatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggag 21997759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 257
Target Start/End: Original strand, 451752 - 451919
Alignment:
Q  90 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |     
T  451752 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 451851  T
Q  190 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggag 257  Q
    | | ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  451852 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggag 451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 27657823 - 27657994
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27657823 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttctttttaagtagctcatccttttccctca 27657922  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||  |  |||| |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27657923 ttcttcttacatgcccagcatgaatccttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 27657994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 30936155 - 30935988
Alignment:
Q  90 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |     
T  30936155 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 30936056  T
Q  190 tcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggag 257  Q
    | | ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30936055 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggag 30935988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 154
Target Start/End: Original strand, 16306388 - 16306448
Alignment:
Q  94 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctca 154  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||  |||||||  ||||||||||| ||||||    
T  16306388 ggtgtgcaactaaggtttggctagcttagacacttgttccattaggtacttaatctgctca 16306448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 32312 - 32483
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  32312 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttttgaagtagctcatccttttccctca 32411  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    |||||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32412 ttcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 32483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 46659 - 46488
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46659 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctca 46560  T
Q  189 ttcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||  |  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46559 ttcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 46488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 91 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 52649 - 52481
Alignment:
Q  91 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcatt 190  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| |    
T  52649 ttgggtgtgcaactaaggtttgacttgcttatacatctgttccaatagatacttaatttgctcatccttcttctgaagttgttcatcctttgctctcagt 52550  T
Q  191 cttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtg 259  Q
    || ||||| |||||| |||| ||||| |||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52549 ctacttttcaacccagcatgaattctagcagtccttgaaatgtactcatcttctggatagaaaggagtg 52481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3599 - 3430
Alignment:
Q  91 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcatt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || || ||  | || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |    
T  3599 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgctctaagagatatctgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttcccttaat 3500  T
Q  191 cttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
     |||| |||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  3499 tttctcttatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatgtattcttcctctgggtagaagggagtga 3430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Original strand, 3556 - 3625
Alignment:
Q  191 cttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 260  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3556 cttcttttaaacccagcatgtattcttgcagctcttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 3625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0398
Description:

Target: scaffold0398; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 3416 - 3250
Alignment:
Q  91 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcatt 190  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||| |||| | |||| || | |||| | |    
T  3416 ttgggtgtgcaactaaggtttggctagcttatacatctgttccaatagatatttaatctgctcatccttcttctgaagttgttcattctgtgctcttagt 3317  T
Q  191 cttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggag 257  Q
    |||||||| | |||| | || |||||  |||| ||||  ||||| || ||||||||||| |||||||    
T  3316 cttcttttcagcccagcttgaattctatcagctcttgaaatgtaatcatcttctggataaaaaggag 3250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11671 - 11593
Alignment:
Q  91 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagt 169  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  11671 ttgggtgtgcaactaaggtttggctagcttatacatctgttccaatagatatttaatctgctcatccttcttctgaagt 11593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1002 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold1002
Description:

Target: scaffold1002; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2952 - 2863
Alignment:
Q  91 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatcctt 180  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||  || || ||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  2952 ttgggtgtgcaactaaggtttggctagcttagacatctgttccagtagatatttaatctgctcatccttcttctgaagttgttcatcctt 2863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1002; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2870 - 2763
Alignment:
Q  152 tcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggataga 251  Q
    ||||||||||||| |||| | |||| |||| || ||| ||||||||| | |||| | || |||||  |||||||||   |||| || |||||||||||||    
T  2870 tcatccttcttctgaagttgatcattctttgctttcagtcttcttttcagcccagcttgaattctatcagcccttgaagtgtaatcatcttctggataga 2771  T
Q  252 aaggagtg 259  Q
    ||||||||    
T  2770 aaggagtg 2763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 162
Target Start/End: Original strand, 23758 - 23825
Alignment:
Q  95 gtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttctt 162  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  23758 gtgtgcaactaaggtttggctagcttagacatctgttccaaaagatatttaatctgctcatccttctt 23825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 180
Target Start/End: Original strand, 2444 - 2535
Alignment:
Q  89 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatcctt 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||     |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2444 agttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcaactgttctaagagaagtctaatctgttcatccttcttctgaagtagctcatcctt 2535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 260
Target Start/End: Original strand, 2526 - 2636
Alignment:
Q  150 gctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccaacatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggata 249  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |   | || |||  |||| |||  ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  2526 gctcatccttcttctgaagtagttcttccttctctcttaacttcctcttatgcccagcataaattcttgcagctcttgtgatgtattctgcctctggata 2625  T
Q  250 gaaaggagtga 260  Q
    |||||||||||    
T  2626 gaaaggagtga 2636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University