View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8180A_low_7 (Length: 522)

Name: NF8180A_low_7
Description: NF8180A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8180A_low_7
NF8180A_low_7
[»] chr2 (47 HSPs)
chr2 (1-512)||(19456511-19457022)
chr2 (1-512)||(21703254-21703765)
chr2 (1-325)||(27118515-27118839)
chr2 (29-325)||(31891446-31891742)
chr2 (1-325)||(34303393-34303717)
chr2 (1-325)||(34156838-34157162)
chr2 (1-325)||(3784481-3784805)
chr2 (1-325)||(16163426-16163750)
chr2 (1-512)||(27392630-27393120)
chr2 (1-500)||(27434534-27435036)
chr2 (29-511)||(23128684-23129169)
chr2 (29-511)||(28881852-28882337)
chr2 (29-511)||(12655180-12655665)
chr2 (29-511)||(20837556-20838041)
chr2 (8-511)||(34279087-34279593)
chr2 (29-427)||(21677300-21677701)
chr2 (8-511)||(11635283-11635792)
chr2 (51-460)||(13936684-13937096)
chr2 (8-511)||(11641472-11641981)
chr2 (8-460)||(34286043-34286498)
chr2 (8-460)||(34291103-34291558)
chr2 (8-511)||(37374799-37375305)
chr2 (29-460)||(37925182-37925616)
chr2 (29-428)||(34861401-34861803)
chr2 (29-428)||(37686027-37686429)
chr2 (29-428)||(37701292-37701694)
chr2 (207-460)||(261064-261317)
chr2 (29-421)||(32049526-32049921)
chr2 (8-427)||(22926125-22926547)
chr2 (29-428)||(31876002-31876404)
chr2 (51-428)||(12716742-12717125)
chr2 (29-428)||(16829456-16829858)
chr2 (29-428)||(16891623-16892025)
chr2 (1-460)||(40233188-40233662)
chr2 (246-428)||(39889783-39889965)
chr2 (207-460)||(12586490-12586743)
chr2 (207-460)||(27803381-27803634)
chr2 (207-460)||(9350293-9350546)
chr2 (246-451)||(19416837-19417042)
chr2 (207-460)||(27776896-27777149)
chr2 (207-460)||(27816663-27816916)
chr2 (213-460)||(39052133-39052380)
chr2 (51-172)||(27803687-27803808)
chr2 (29-163)||(39890063-39890197)
chr2 (51-172)||(27777202-27777323)
chr2 (51-148)||(27816984-27817081)
chr2 (51-148)||(39051962-39052059)
[»] chr3 (72 HSPs)
chr3 (1-512)||(16626648-16627158)
chr3 (1-512)||(18529999-18530504)
chr3 (1-325)||(17993926-17994250)
chr3 (1-325)||(4625736-4626060)
chr3 (1-325)||(5652179-5652503)
chr3 (29-500)||(15892876-15893350)
chr3 (29-511)||(8301437-8301919)
chr3 (29-511)||(18050865-18051350)
chr3 (29-511)||(8295578-8296060)
chr3 (29-511)||(4796823-4797308)
chr3 (29-511)||(35880369-35880854)
chr3 (29-511)||(18330277-18330757)
chr3 (29-511)||(15741264-15741737)
chr3 (8-511)||(4721234-4721740)
chr3 (8-511)||(29148904-29149410)
chr3 (8-511)||(6191919-6192425)
chr3 (8-511)||(18277201-18277707)
chr3 (8-511)||(18292502-18293008)
chr3 (8-511)||(18307803-18308309)
chr3 (8-511)||(8211344-8211847)
chr3 (8-511)||(28116103-28116612)
chr3 (8-511)||(7072815-7073321)
chr3 (8-500)||(10395750-10396242)
chr3 (1-172)||(32292697-32292868)
chr3 (29-511)||(47023056-47023541)
chr3 (51-421)||(20065739-20066109)
chr3 (29-463)||(7996213-7996650)
chr3 (29-463)||(10642721-10643158)
chr3 (1-172)||(31034259-31034430)
chr3 (8-350)||(22387727-22388069)
chr3 (29-325)||(5713016-5713315)
chr3 (29-325)||(5723926-5724225)
chr3 (29-325)||(5757252-5757551)
chr3 (29-325)||(5768143-5768442)
chr3 (8-428)||(4346836-4347256)
chr3 (29-428)||(17985126-17985528)
chr3 (8-428)||(28020964-28021384)
chr3 (8-511)||(21674296-21674802)
chr3 (29-428)||(18224877-18225279)
chr3 (29-427)||(5466672-5467073)
chr3 (195-451)||(5596705-5596961)
chr3 (9-500)||(32438771-32439262)
chr3 (9-350)||(4892977-4893318)
chr3 (8-427)||(28338989-28339411)
chr3 (8-427)||(31964622-31965044)
chr3 (8-427)||(50134220-50134642)
chr3 (29-499)||(6542632-6543117)
chr3 (8-427)||(4416603-4417028)
chr3 (246-460)||(22871264-22871478)
chr3 (246-460)||(22886323-22886537)
chr3 (8-424)||(5609471-5609890)
chr3 (207-451)||(36997440-36997684)
chr3 (29-511)||(5013315-5013800)
chr3 (207-460)||(11110712-11110965)
chr3 (207-460)||(20577213-20577466)
chr3 (207-451)||(51781674-51781918)
chr3 (207-397)||(29665336-29665526)
chr3 (29-451)||(24327822-24328247)
chr3 (207-460)||(48465569-48465822)
chr3 (207-451)||(51796762-51797007)
chr3 (246-460)||(18242381-18242595)
chr3 (29-148)||(36997247-36997366)
chr3 (29-150)||(5596527-5596648)
chr3 (8-88)||(11110498-11110578)
chr3 (29-88)||(51782052-51782111)
chr3 (29-150)||(18242706-18242827)
chr3 (51-172)||(29665162-29665283)
chr3 (8-172)||(22871005-22871169)
chr3 (8-172)||(22886064-22886228)
chr3 (8-148)||(48465896-48466036)
chr3 (37-88)||(51797141-51797192)
chr3 (51-172)||(20577039-20577163)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (1-510)||(15285029-15285538)
chr4 (1-512)||(15227529-15228040)
chr4 (1-512)||(1899916-1900427)
chr4 (1-512)||(14235626-14236140)
chr4 (1-512)||(15391439-15391948)
chr4 (1-325)||(24460706-24461030)
chr4 (8-511)||(17013657-17014163)
chr4 (29-511)||(14664675-14665160)
chr4 (29-511)||(24592443-24592925)
chr4 (8-511)||(14763412-14763918)
chr4 (8-511)||(36344623-36345126)
chr4 (8-511)||(6569510-6570016)
chr4 (29-511)||(27163446-27163931)
chr4 (29-511)||(14098198-14098683)
chr4 (8-460)||(54833098-54833550)
chr4 (8-511)||(5005527-5006036)
chr4 (29-428)||(31126647-31127049)
chr4 (227-511)||(19372918-19373202)
chr4 (9-350)||(24112483-24112824)
chr4 (207-428)||(30753482-30753703)
chr4 (9-350)||(34189069-34189410)
chr4 (29-451)||(18800742-18801176)
chr4 (29-499)||(40105767-40106240)
chr4 (207-451)||(33674120-33674364)
chr4 (114-428)||(21969441-21969758)
chr4 (207-460)||(39850331-39850584)
chr4 (29-148)||(30753777-30753896)
chr4 (8-148)||(33673906-33674046)
chr4 (51-172)||(39850637-39850758)
[»] chr7 (39 HSPs)
chr7 (1-500)||(16040980-16041479)
chr7 (1-512)||(16449985-16450496)
chr7 (1-325)||(31088451-31088775)
chr7 (29-511)||(16518431-16518916)
chr7 (1-325)||(45733292-45733616)
chr7 (29-511)||(16503395-16503880)
chr7 (29-511)||(10916883-10917365)
chr7 (29-511)||(11424791-11425276)
chr7 (8-511)||(5127635-5128141)
chr7 (29-511)||(2154216-2154701)
chr7 (8-511)||(5147334-5147840)
chr7 (29-463)||(45387034-45387471)
chr7 (1-172)||(2108992-2109163)
chr7 (1-172)||(26484679-26484850)
chr7 (8-511)||(16736454-16736960)
chr7 (8-511)||(16751508-16752014)
chr7 (8-511)||(17523175-17523681)
chr7 (8-511)||(17529534-17530040)
chr7 (1-172)||(39211010-39211181)
chr7 (1-172)||(2775344-2775515)
chr7 (29-427)||(4145138-4145539)
chr7 (8-511)||(26434900-26435406)
chr7 (29-426)||(26319884-26320284)
chr7 (29-460)||(9618345-9618779)
chr7 (29-428)||(26275109-26275511)
chr7 (9-350)||(5159326-5159667)
chr7 (9-172)||(18540784-18540947)
chr7 (207-451)||(11441263-11441507)
chr7 (246-511)||(31124554-31124819)
chr7 (29-460)||(26669929-26670363)
chr7 (29-511)||(24592556-24593041)
chr7 (29-460)||(26537885-26538322)
chr7 (207-428)||(3445020-3445241)
chr7 (207-428)||(26485940-26486161)
chr7 (207-428)||(31564595-31564816)
chr7 (29-148)||(3445315-3445434)
chr7 (29-150)||(31564405-31564526)
chr7 (29-100)||(11441629-11441700)
chr7 (29-150)||(31124927-31125048)
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (1-512)||(25198682-25199193)
chr5 (1-513)||(23891855-23892370)
chr5 (1-348)||(22888287-22888634)
chr5 (1-325)||(13184646-13184970)
chr5 (1-325)||(33877087-33877411)
chr5 (1-325)||(13440492-13440816)
chr5 (1-325)||(11325634-11325958)
chr5 (29-511)||(24688183-24688668)
chr5 (8-511)||(23752455-23752961)
chr5 (29-511)||(30934287-30934769)
chr5 (29-511)||(23718014-23718500)
chr5 (29-511)||(11549005-11549490)
chr5 (8-511)||(33777138-33777644)
chr5 (8-510)||(22999119-22999624)
chr5 (1-183)||(29889080-29889262)
chr5 (8-460)||(9548548-9549003)
chr5 (8-511)||(15658765-15659271)
chr5 (29-427)||(8665501-8665902)
chr5 (29-310)||(24969876-24970154)
chr5 (8-451)||(41674420-41674866)
chr5 (29-460)||(34616223-34616654)
chr5 (317-511)||(24951761-24951955)
chr5 (29-460)||(2510753-2511187)
chr5 (29-460)||(30168171-30168605)
chr5 (8-428)||(32599477-32599897)
chr5 (29-463)||(15758883-15759320)
chr5 (29-460)||(9317153-9317587)
chr5 (29-428)||(12131889-12132291)
chr5 (8-460)||(6874004-6874462)
chr5 (29-511)||(18375438-18375923)
chr5 (29-460)||(26480094-26480528)
chr5 (29-511)||(5637561-5638046)
chr5 (29-511)||(30151669-30152154)
chr5 (8-511)||(43077900-43078409)
chr5 (207-460)||(31431130-31431383)
chr5 (9-350)||(33292340-33292681)
chr5 (29-428)||(33516090-33516492)
chr5 (207-460)||(18500955-18501208)
chr5 (207-511)||(3789177-3789481)
chr5 (51-428)||(24681171-24681554)
chr5 (51-428)||(24723698-24724081)
chr5 (207-499)||(37358862-37359154)
chr5 (8-428)||(37671488-37671920)
chr5 (246-428)||(37771245-37771427)
chr5 (246-499)||(40473798-40474051)
chr5 (246-428)||(31826665-31826847)
chr5 (8-451)||(28648937-28649392)
chr5 (29-451)||(29967092-29967517)
chr5 (29-451)||(30029126-30029551)
chr5 (246-460)||(37754670-37754884)
chr5 (29-428)||(28959812-28960226)
chr5 (207-460)||(13325051-13325304)
chr5 (8-150)||(18500735-18500877)
chr5 (29-139)||(31431466-31431576)
chr5 (29-148)||(31826433-31826552)
chr5 (8-150)||(37770992-37771134)
chr5 (29-150)||(37358669-37358790)
chr5 (29-172)||(3789534-3789677)
chr5 (29-150)||(37754995-37755116)
chr5 (51-148)||(40473597-40473694)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (1-512)||(16208132-16208640)
chr1 (185-512)||(20460748-20461075)
chr1 (1-325)||(20340436-20340760)
chr1 (8-166)||(20461070-20461228)
chr1 (8-511)||(41793416-41793922)
chr1 (1-172)||(28151845-28152016)
chr1 (29-460)||(10962362-10962796)
chr1 (29-451)||(28584682-28585107)
chr1 (246-460)||(51637910-51638124)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-512)||(20053-20543)
scaffold0124 (29-511)||(30095-30579)
[»] chr6 (60 HSPs)
chr6 (3-512)||(20160345-20160851)
chr6 (3-512)||(22171980-22172486)
chr6 (1-354)||(22477317-22477673)
chr6 (1-325)||(28162485-28162809)
chr6 (1-325)||(13522117-13522441)
chr6 (1-325)||(33374300-33374624)
chr6 (1-325)||(8892354-8892678)
chr6 (1-325)||(8903589-8903913)
chr6 (29-511)||(13299023-13299508)
chr6 (1-511)||(22934924-22935434)
chr6 (1-511)||(23857369-23857879)
chr6 (29-511)||(15424389-15424874)
chr6 (29-511)||(26988640-26989125)
chr6 (29-460)||(24304690-24305124)
chr6 (29-511)||(24863356-24863841)
chr6 (29-511)||(26999712-27000197)
chr6 (8-460)||(26918070-26918525)
chr6 (8-511)||(16749493-16749999)
chr6 (8-511)||(29549117-29549620)
chr6 (1-183)||(27290414-27290596)
chr6 (1-196)||(22456978-22457176)
chr6 (29-428)||(4525011-4525410)
chr6 (1-172)||(14143329-14143500)
chr6 (1-172)||(26787925-26788096)
chr6 (8-511)||(27044029-27044532)
chr6 (1-172)||(27196298-27196469)
chr6 (1-172)||(27252771-27252942)
chr6 (29-428)||(29572735-29573137)
chr6 (207-511)||(3695702-3696006)
chr6 (29-428)||(30558088-30558490)
chr6 (29-460)||(29501096-29501539)
chr6 (1-499)||(27272624-27273128)
chr6 (207-511)||(17024901-17025205)
chr6 (29-428)||(4757483-4757888)
chr6 (207-460)||(34463614-34463867)
chr6 (246-460)||(27484807-27485021)
chr6 (207-460)||(27007402-27007655)
chr6 (207-511)||(4546037-4546341)
chr6 (207-427)||(26777880-26778100)
chr6 (207-511)||(28207081-28207385)
chr6 (207-460)||(16673817-16674070)
chr6 (246-451)||(16944319-16944524)
chr6 (29-460)||(4772687-4773130)
chr6 (207-428)||(27360263-27360484)
chr6 (207-428)||(27450606-27450827)
chr6 (207-499)||(4724396-4724688)
chr6 (152-499)||(27629907-27630254)
chr6 (207-428)||(26116672-26116893)
chr6 (29-172)||(3696062-3696205)
chr6 (29-163)||(26777687-26777821)
chr6 (8-172)||(34463397-34463561)
chr6 (29-139)||(4545847-4545957)
chr6 (29-139)||(4724206-4724316)
chr6 (29-139)||(28207468-28207578)
chr6 (8-148)||(16674144-16674284)
chr6 (8-172)||(27007708-27007872)
chr6 (29-172)||(27360064-27360207)
chr6 (29-172)||(27450407-27450550)
chr6 (29-150)||(27485132-27485253)
chr6 (29-70)||(26116482-26116523)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-512)||(21208-21716)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (1-325)||(2759-3083)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (1-511)||(16283091-16283604)
chr8 (1-325)||(44562932-44563256)
chr8 (1-512)||(22080938-22081446)
chr8 (1-325)||(9354453-9354777)
chr8 (1-325)||(19659099-19659423)
chr8 (29-511)||(16277196-16277681)
chr8 (29-511)||(2137347-2137832)
chr8 (29-511)||(14557269-14557751)
chr8 (29-511)||(19687740-19688225)
chr8 (29-511)||(27608993-27609478)
chr8 (8-511)||(18710228-18710734)
chr8 (8-511)||(19674080-19674589)
chr8 (8-427)||(31354250-31354672)
chr8 (29-451)||(31489838-31490263)
chr8 (8-460)||(19286158-19286610)
chr8 (1-172)||(33244649-33244820)
chr8 (29-428)||(19208448-19208850)
chr8 (29-460)||(28362043-28362477)
chr8 (207-499)||(3329788-3330080)
chr8 (207-499)||(29828967-29829259)
chr8 (207-460)||(19518412-19518665)
chr8 (29-451)||(33258425-33258850)
chr8 (246-511)||(12093041-12093306)
chr8 (29-150)||(3329595-3329716)
chr8 (29-150)||(12092812-12092933)
chr8 (28-88)||(29829390-29829450)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (29-511)||(29405-29890)
scaffold0089 (29-511)||(40198-40683)
scaffold0089 (29-511)||(47114-47599)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (29-511)||(26934-27419)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (29-511)||(258-744)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (1-183)||(129-311)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (29-428)||(7368-7770)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (29-511)||(15059-15544)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (202-511)||(7874-8183)
scaffold0336 (8-180)||(9542-9714)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (36-511)||(26338-26816)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (29-424)||(9195-9593)
scaffold0159 (29-361)||(19807-20142)
[»] scaffold0415 (3 HSPs)
scaffold0415 (1-86)||(2018-2103)
scaffold0415 (207-460)||(5682-5936)
scaffold0415 (8-88)||(6080-6160)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (207-511)||(7579-7883)
scaffold0038 (29-139)||(7966-8076)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (317-511)||(48568-48769)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (246-364)||(82-200)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 444; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 512
Target Start/End: Original strand, 19456511 - 19457022
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19456511 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctatgagaagtagagt 19456610  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19456611 cgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaa 19456710  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19456711 acgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaaagtattgcgcatatgggt 19456810  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456811 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatg 19456910  T
Q  401 atgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  19456911 atgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctaggcgagtccccatg 19457010  T
Q  501 atgtccatctca 512  Q
     || ||||||||    
T  19457011 gtgaccatctca 19457022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 512
Target Start/End: Original strand, 21703254 - 21703765
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703254 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgtcctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 21703353  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  21703354 cgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgttga 21703453  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21703454 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggt 21703553  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatg 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703554 acgacggaggtaactaggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatg 21703653  T
Q  401 atgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 500  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21703654 atgaccgttaccgtatctctttgatgcatttacagaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacgagtccccatg 21703753  T
Q  501 atgtccatctca 512  Q
     || ||||||||    
T  21703754 gtgaccatctca 21703765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27118839 - 27118515
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27118839 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 27118740  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    ||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  27118739 cgggagtaattcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctga 27118640  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  27118639 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatgcgggt 27118540  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  27118539 acgacggaggtagctgagcagcatt 27118515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 29 - 325
Target Start/End: Original strand, 31891446 - 31891742
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  31891446 gaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggt 31891545  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggtt 228  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31891546 atcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggtt 31891645  T
Q  229 gacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  31891646 gtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 31891742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 34303393 - 34303717
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34303393 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 34303492  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||     
T  34303493 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 34303592  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34303593 acgacgacattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 34303692  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  34303693 acgacggaggtagctgagcagcatt 34303717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34157162 - 34156838
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34157162 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 34157063  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||     
T  34157062 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 34156963  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34156962 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 34156863  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  34156862 acgacggaggtagctgagcagcatt 34156838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3784805 - 3784481
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3784805 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 3784706  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||     
T  3784705 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctactgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 3784606  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3784605 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 3784506  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  3784505 acgacggaggtagctgagcagcatt 3784481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16163750 - 16163426
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16163750 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 16163651  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||     
T  16163650 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 16163551  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16163550 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 16163451  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  16163450 acgacggaggtagctgagcagcatt 16163426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 27393120 - 27392630
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  27393120 gatggaaatcgcacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagt 27393021  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    |||||| | ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||                     |||||||||||||    
T  27393020 cgggagcagctcggcatacatcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgttgctgttg---------------------ttgcatttgctga 27392942  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| |||    
T  27392941 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggcggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactggt 27392842  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatg 400  Q
    |||  ||||||| ||| |||||||  || ||||||||||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27392841 acggtggaggtagctgagcagcatcgatgggggcaacagtagccacagattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctttcttcttatg 27392742  T
Q  401 atgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 500  Q
    |||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  || || ||||||    
T  27392741 atgaccattaccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacctttctcaaacacaataatgccgtctctgacagcctcttctaagcgggttcccatg 27392642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 27434534 - 27435036
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||   |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||     
T  27434534 gatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacttgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagc 27434633  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgc 197  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||  ||||||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| ||     
T  27434634 cggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgt 27434733  T
Q  198 tgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacg 297  Q
    ||| | || |||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  27434734 tgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatg 27434833  T
Q  298 ggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 397  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27434834 ggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttctt 27434933  T
Q  398 atgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtcccc 497  Q
     || || |||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||    
T  27434934 gtggtgtccgttaccatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttccc 27435033  T
Q  498 atg 500  Q
    |||    
T  27435034 atg 27435036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Original strand, 23128684 - 23129169
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||  |||    
T  23128684 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 23128783  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  23128784 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 23128883  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  23128884 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcatt 23128983  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  23128984 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttaccatacctctttgat 23129083  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  23129084 gcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 23129169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 28882337 - 28881852
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  28882337 gaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 28882238  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  28882237 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 28882138  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  28882137 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcatt 28882038  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  28882037 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgat 28881938  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || |||| ||||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  28881937 gcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacagcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 28881852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 12655665 - 12655180
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  12655665 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 12655566  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  12655565 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 12655466  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  12655465 gttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggaggcatttgggctgcatt 12655366  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  12655365 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacaccattcctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgat 12655266  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | |||| |||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  12655265 gcattcacagagggttcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 12655180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 20838041 - 20837556
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  20838041 gaacctgggaggcaacagatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 20837942  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  20837941 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 20837842  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| | |  ||||| |||||    
T  20837841 gttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggatgcatttgggctgcatt 20837742  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  20837741 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacaccattcctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgat 20837642  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | | ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||||    
T  20837641 gcattcacagtggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatctc 20837556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 34279593 - 34279087
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  34279593 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 34279494  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||| | |    
T  34279493 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 34279394  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||    
T  34279393 ttgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatga 34279294  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  34279293 cggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgt 34279194  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| |||||||| || | |||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  34279193 ccattaccatacctcttcgacgtattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtga 34279094  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  34279093 ccatctc 34279087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 427
Target Start/End: Original strand, 21677300 - 21677701
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  21677300 gaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 21677399  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  21677400 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 21677499  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | |||||| |  || || |||||    
T  21677500 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcatt 21677599  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||    
T  21677600 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgat 21677699  T
Q  426 gc 427  Q
    ||    
T  21677700 gc 21677701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Original strand, 11635283 - 11635792
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  11635283 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 11635382  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaa 201  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||      ||| || |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||      
T  11635383 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttggg 11635482  T
Q  202 cgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 301  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  11635483 caattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggta 11635582  T
Q  302 cgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 401  Q
     |||||||| |  || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||||||||| ||     
T  11635583 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgcttctttcttcttgtgg 11635682  T
Q  402 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 501  Q
    || || ||||| ||||||||  | ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  11635683 tgtccattaccatacctcttcaacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 11635782  T
Q  502 tgtccatctc 511  Q
    || |||||||    
T  11635783 tgaccatctc 11635792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 51 - 460
Target Start/End: Original strand, 13936684 - 13937096
Alignment:
Q  51 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctag 150  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||| |    
T  13936684 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctgg 13936783  T
Q  151 cttgttgc---tgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggata 247  Q
    |||| ||    ||||||||||||||| | ||  ||| ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  13936784 cttgctgactttgctgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggta 13936883  T
Q  248 ctgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatg 347  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  13936884 ctgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatg 13936983  T
Q  348 gattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactt 447  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |||    
T  13936984 gattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctt 13937083  T
Q  448 tctcgaatacaat 460  Q
    |||| || |||||    
T  13937084 tctcaaacacaat 13937096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Original strand, 11641472 - 11641981
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  11641472 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 11641571  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaa 201  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||||| || ||||||||||||||      ||| || |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||      
T  11641572 aactcagcatataacatctgtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttggg 11641671  T
Q  202 cgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 301  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  11641672 caattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggta 11641771  T
Q  302 cgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 401  Q
     |||||||| |  || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||||||||| ||     
T  11641772 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgcttctttcttcttgtgg 11641871  T
Q  402 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 501  Q
    || || ||||| ||||||||  | ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  11641872 tgtccattaccatacctcttcaacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 11641971  T
Q  502 tgtccatctc 511  Q
    || |||||||    
T  11641972 tgaccatctc 11641981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 34286498 - 34286043
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  34286498 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 34286399  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||| | |    
T  34286398 aactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaa 34286299  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
      ||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||  ||  ||| ||||| ||    
T  34286298 ctgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggtatga 34286199  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||     
T  34286198 cggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgt 34286099  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
    || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34286098 ccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34286043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 34291558 - 34291103
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  34291558 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 34291459  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||| | |    
T  34291458 aactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaa 34291359  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
      ||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||  ||  ||| ||||| ||    
T  34291358 ctgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggtatga 34291259  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||     
T  34291258 cggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgt 34291159  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
    || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34291158 ccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34291103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 37375305 - 37374799
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  37375305 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 37375206  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagc---ttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    | ||| ||||| ||||  ||||| |||||||| || |||||||    ||| |||||||| || |||||| | || || |  ||||| |  || ||| |||    
T  37375205 agctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgctgttgaacgggcggttgatgttgtacctgttgagcga 37375106  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    || |||| || || ||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||    
T  37375105 tgacattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggcgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatga 37375006  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || |  || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  37375005 cggaggcatttgagttgcgttgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgt 37374906  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  37374905 ccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtga 37374806  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  37374805 ccatctc 37374799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 37925616 - 37925182
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||| ||||    
T  37925616 gaaccttggaggcaacgggtcgggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacattggt 37925517  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  37925516 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 37925417  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  37925416 gttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 37925317  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||    
T  37925316 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgat 37925217  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
    ||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  37925216 gcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 37925182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 34861803 - 34861401
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  34861803 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 34861704  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  34861703 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 34861604  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  34861603 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 34861504  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  34861503 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgat 34861404  T
Q  426 gca 428  Q
    |||    
T  34861403 gca 34861401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 428
Target Start/End: Original strand, 37686027 - 37686429
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  37686027 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 37686126  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  37686127 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 37686226  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  37686227 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 37686326  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  37686327 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgat 37686426  T
Q  426 gca 428  Q
    |||    
T  37686427 gca 37686429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 428
Target Start/End: Original strand, 37701292 - 37701694
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  37701292 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 37701391  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  37701392 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 37701491  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  37701492 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 37701591  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  37701592 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgat 37701691  T
Q  426 gca 428  Q
    |||    
T  37701692 gca 37701694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 207 - 460
Target Start/End: Original strand, 261064 - 261317
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||    
T  261064 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacg 261163  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || |  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  261164 gaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 261263  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
     ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  261264 attaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 261317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 32049921 - 32049526
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||| |  ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  32049921 gaaccttggaggcaacgggtccggtgggggtttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 32049822  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||| | || ||||| ||||| || ||||    
T  32049821 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgag 32049722  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | |||||| |  || || |||||    
T  32049721 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcatt 32049622  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctt 421  Q
     || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||    
T  32049621 gatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttcttttttcttgtggtgtccattaccatacctctt 32049526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 427
Target Start/End: Original strand, 22926125 - 22926547
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  22926125 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 22926224  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | |    
T  22926225 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 22926324  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | ||||| ||||| || ||||| || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||    
T  22926325 ttgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatga 22926424  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  22926425 cggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgt 22926524  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgc 427  Q
    || ||||| |||||||| |||||    
T  22926525 ccattaccatacctcttcgatgc 22926547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 31876404 - 31876002
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || || |||| ||||    
T  31876404 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgtacaacattggt 31876305  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  31876304 ataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 31876205  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  31876204 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 31876105  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  31876104 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgat 31876005  T
Q  426 gca 428  Q
    |||    
T  31876004 gca 31876002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 51 - 428
Target Start/End: Original strand, 12716742 - 12717125
Alignment:
Q  51 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctag 150  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || ||||| |    
T  12716742 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctgg 12716841  T
Q  151 cttgttgctgctgttgttgttg------agctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagagg 244  Q
      | ||||||||||||||||||      | | ||   || ||||| ||| || ||  | || || || ||||| || ||||| || |||| ||| | |||    
T  12716842 tatattgctgctgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagg 12716941  T
Q  245 atactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 344  Q
     ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  12716942 gtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcc 12717041  T
Q  345 atggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 428  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  12717042 atggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 12717125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 428
Target Start/End: Original strand, 16829456 - 16829858
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| |||| ||||    
T  16829456 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggt 16829555  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  16829556 ataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 16829655  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  || |  |||||    
T  16829656 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcatt 16829755  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||    
T  16829756 gatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgat 16829855  T
Q  426 gca 428  Q
    |||    
T  16829856 gca 16829858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 16892025 - 16891623
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| |||| ||||    
T  16892025 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggt 16891926  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  16891925 ataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 16891826  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  || |  |||||    
T  16891825 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcatt 16891726  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||    
T  16891725 gatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgat 16891626  T
Q  426 gca 428  Q
    |||    
T  16891625 gca 16891623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 40233662 - 40233188
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| |||    
T  40233662 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagt 40233563  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctg---------------ttgttgttgagctggtggctat 185  Q
     || || | ||| ||||| |||| |||||| |||||||| || ||||| |  | |||||||||               |||||||||| | ||   || |    
T  40233562 tggaagaagctcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttgttgttgttgttgttgaaccggcaactgt 40233463  T
Q  186 tgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagt 285  Q
    |||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  40233462 tgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagt 40233363  T
Q  286 attgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgt 385  Q
    |  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  40233362 acggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgt 40233263  T
Q  386 ttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
    |||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  40233262 ttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 40233188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 246 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 39889965 - 39889783
Alignment:
Q  246 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 345  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  39889965 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggcca 39889866  T
Q  346 tggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 428  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  39889865 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 39889783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 12586743 - 12586490
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || || || ||||    
T  12586743 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatggatatgacg 12586644  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || |  ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  12586643 gaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 12586544  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
     ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  12586543 attaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 12586490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 27803634 - 27803381
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||    
T  27803634 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacg 27803535  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || |  ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  27803534 gaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 27803435  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
     ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27803434 attaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27803381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 460
Target Start/End: Original strand, 9350293 - 9350546
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| | | || || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||    
T  9350293 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtagcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacg 9350392  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || |  ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  9350393 gaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 9350492  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
     ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  9350493 attaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 9350546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 246 - 451
Target Start/End: Original strand, 19416837 - 19417042
Alignment:
Q  246 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 345  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  19416837 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtagcca 19416936  T
Q  346 tggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 445  Q
    | ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  19416937 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 19417036  T
Q  446 tttctc 451  Q
    ||||||    
T  19417037 tttctc 19417042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 27777149 - 27776896
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| | ||| || || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||    
T  27777149 gcattgacgggcacttgaggttgacctggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacg 27777050  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || |  ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  27777049 gaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 27776950  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
     ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27776949 attaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27776896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 27816916 - 27816663
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| | ||| || || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||    
T  27816916 gcattgacgggcacttgaggttgacctggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacg 27816817  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || |  ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  27816816 gaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 27816717  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
     ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27816716 attaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27816663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 460
Target Start/End: Original strand, 39052133 - 39052380
Alignment:
Q  213 acgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggta 312  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| |||||||| |    
T  39052133 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 39052232  T
Q  313 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 412  Q
      || || |||||  |||| ||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  39052233 tttgagctgcattggtaggagcaacggttgctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 39052332  T
Q  413 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  39052333 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 39052380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 27803808 - 27803687
Alignment:
Q  51 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctag 150  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || ||||| |    
T  27803808 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctgg 27803709  T
Q  151 cttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
      | ||||||||| ||||||||    
T  27803708 tatattgctgctgntgttgttg 27803687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 39890197 - 39890063
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| |||| ||||    
T  39890197 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggt 39890098  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctg 163  Q
    || |||||||| || |||||||| | |||||||||    
T  39890097 ataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctg 39890063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 27777323 - 27777202
Alignment:
Q  51 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctag 150  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || ||||| |    
T  27777323 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctgg 27777224  T
Q  151 cttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
      | ||||||||| ||||||||    
T  27777223 tatattgctgctgctgttgttg 27777202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 27817081 - 27816984
Alignment:
Q  51 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtct 148  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || |||||    
T  27817081 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27816984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 148
Target Start/End: Original strand, 39051962 - 39052059
Alignment:
Q  51 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtct 148  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || |||||    
T  39051962 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39052059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 436; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 512
Target Start/End: Original strand, 16626648 - 16627158
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16626648 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctaagaagtagagt 16626747  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
     |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16626748 agggagtaactcgacatatatcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctga 16626847  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16626848 acgatggcattaacgggtaccggaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaacggtggaaagaagggatgctgagagtattgtgcatacgggt 16626947  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16626948 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttc-ttcttcttatg 16627046  T
Q  401 atgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16627047 atgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctaggcgagtccccatg 16627146  T
Q  501 atgtccatctca 512  Q
     || ||||||||    
T  16627147 gtgaccatctca 16627158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 18530504 - 18529999
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530504 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 18530405  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    | |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18530404 caggagtaactcagcatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttg------agctggtggctgttgttgcatttgctga 18530311  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530310 acgacggcattaacgggcacttgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 18530211  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatg 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530210 acgatggaggtaactgggcagcattaataggggtaacagtagccatggattgactagttccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatg 18530111  T
Q  401 atgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 500  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18530110 atgaccgttaccgtatctctttgatgcatttacagaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacgagtccccatg 18530011  T
Q  501 atgtccatctca 512  Q
     || ||||||||    
T  18530010 gtgaccatctca 18529999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 17993926 - 17994250
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17993926 gatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 17994025  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||     
T  17994026 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 17994125  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17994126 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 17994225  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  17994226 acgacggaggtagctgagcagcatt 17994250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4626060 - 4625736
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4626060 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 4625961  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||     
T  4625960 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 4625861  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4625860 acgacgacattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 4625761  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  4625760 acgacggaggtagctgagcagcatt 4625736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5652503 - 5652179
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5652503 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcaggtgaaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagt 5652404  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||     
T  5652403 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 5652304  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5652303 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgattgcaaacgatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 5652204  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  5652203 acgacggaggtagctgagcagcatt 5652179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 500
Target Start/End: Original strand, 15892876 - 15893350
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| |||| ||||    
T  15892876 gaacctgggaggcaaaggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacattggt 15892975  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg---agctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||   | | ||   || ||||| ||| || ||| | || |||||||||||||| ||||    
T  15892976 atcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgag 15893075  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  15893076 gttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaagggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcatt 15893175  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||  ||||||||||||    
T  15893176 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttactatacctctttgat 15893275  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 500  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  15893276 gcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacagcttcttccagacgagttcccatg 15893350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Original strand, 8301437 - 8301919
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||  |||    
T  8301437 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 8301536  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggtt 228  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |  |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| | || |||||||||||||| |||||||    
T  8301537 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggtt 8301636  T
Q  229 gacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaat 328  Q
    |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  8301637 gacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgagtacgacggaggcatttgggcagcattgat 8301736  T
Q  329 aggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 428  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||    
T  8301737 aggagcaacaatagccatggattgaccggctccggcagacaccatccatacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgacgca 8301836  T
Q  429 tttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    ||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  8301837 ttcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 8301919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 18051350 - 18050865
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||  |||    
T  18051350 gaacctgggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 18051251  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  18051250 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 18051151  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  18051150 gttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcatt 18051051  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  18051050 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgat 18050951  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  18050950 gcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 18050865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 8296060 - 8295578
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||  |||    
T  8296060 gaacctgggaggcaacagatcaggtaggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctgtggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 8295961  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggtt 228  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |  ||||||||||||  |||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||| ||||| |||||||    
T  8295960 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaattggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggtt 8295861  T
Q  229 gacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaat 328  Q
    |||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  8295860 gacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgat 8295761  T
Q  329 aggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 428  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||    
T  8295760 aggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgca 8295661  T
Q  429 tttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    ||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || ||  |||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  8295660 ttcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccttgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 8295578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Original strand, 4796823 - 4797308
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||  |||    
T  4796823 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggt 4796922  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||| | || |||||||||||||| ||||    
T  4796923 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgag 4797022  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  4797023 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcatt 4797122  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  4797123 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgat 4797222  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  4797223 gcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 4797308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 35880854 - 35880369
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  35880854 gaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtttggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 35880755  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  35880754 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 35880655  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  35880654 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 35880555  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||    
T  35880554 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgat 35880455  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  35880454 gcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 35880369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 18330757 - 18330277
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||  ||||| || ||||| ||||||||||  |||    
T  18330757 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaggtcggaagcaactcagcatataacatcggt 18330658  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  18330657 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 18330558  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| |||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  18330557 gttgacccggtggcagagg-----gatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 18330463  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||    
T  18330462 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgat 18330363  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||  ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  18330362 gcattcacagaggattcagctttctcgagcacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 18330277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Original strand, 15741264 - 15741737
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  15741264 gaaccttggaggcaacgaatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 15741363  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggtt 228  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |  |||||||||||      |||| | |||||         | |||| |||||||||||||| |||||||    
T  15741364 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg---------agcgattgcattaacgggtacttgaggtt 15741454  T
Q  229 gacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaat 328  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  15741455 gacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgat 15741554  T
Q  329 aggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 428  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||||||||||    
T  15741555 aggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattgccatacctctttgatgca 15741654  T
Q  429 tttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    ||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  15741655 ttcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 15741737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 4721740 - 4721234
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| |||||||| ||   |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  4721740 atcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagc 4721641  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || |||||  || || ||| | |    
T  4721640 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgttttatctgttgagcaa 4721541  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||  || |||| ||||| ||    
T  4721540 ttgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaagatgctgagaatacggcacatatgggtatga 4721441  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||     
T  4721440 cggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgt 4721341  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  4721340 ccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtga 4721241  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  4721240 ccatctc 4721234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Original strand, 29148904 - 29149410
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  29148904 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagc 29149003  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||| |||    
T  29149004 aactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcga 29149103  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||    
T  29149104 ttgcattaacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatga 29149203  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||     
T  29149204 cggaggcatttgggctgcattgataggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgt 29149303  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  29149304 ccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtga 29149403  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  29149404 ccatctc 29149410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 6192425 - 6191919
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| |||||||| ||   |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  6192425 atcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcagatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagc 6192326  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| | |    
T  6192325 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 6192226  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||    
T  6192225 ttgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactaatgataaaatggcgaaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatga 6192126  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| || ||     
T  6192125 cggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccaactgacaccatccatacttccgtttctttcttcttgtggtgt 6192026  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  6192025 ccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtga 6191926  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  6191925 ccatctc 6191919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Original strand, 18277201 - 18277707
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  18277201 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 18277300  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||  | |  |||||||  || ||| |||    
T  18277301 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcga 18277400  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||    
T  18277401 tggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatga 18277500  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  18277501 cggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgt 18277600  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  18277601 ccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtga 18277700  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  18277701 ccatctc 18277707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Original strand, 18292502 - 18293008
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  18292502 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 18292601  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||  | |  |||||||  || ||| |||    
T  18292602 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcga 18292701  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||    
T  18292702 tggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatga 18292801  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  18292802 cggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgt 18292901  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  18292902 ccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtga 18293001  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  18293002 ccatctc 18293008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Original strand, 18307803 - 18308309
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  18307803 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 18307902  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||  | |  |||||||  || ||| |||    
T  18307903 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcga 18308002  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||    
T  18308003 tggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatga 18308102  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  18308103 cggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgt 18308202  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  18308203 ccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtga 18308302  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  18308303 ccatctc 18308309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 8211847 - 8211344
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  8211847 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 8211748  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatgg 207  Q
    |  || ||||| |||| |||||| |||||||| ||  ||||||  | ||||||||| || |||||| |||| || |  ||||| |  || ||| ||||||    
T  8211747 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttagtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatgg 8211648  T
Q  208 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 307  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||    
T  8211647 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacgg 8211548  T
Q  308 aggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccg 407  Q
    ||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||     
T  8211547 aggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 8211448  T
Q  408 ttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtcca 507  Q
    ||||| |||||||| |||||| | || ||||| ||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||    
T  8211447 ttaccatacctcttcgatgcactcgcagaggactcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgacca 8211348  T
Q  508 tctc 511  Q
    ||||    
T  8211347 tctc 8211344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Original strand, 28116103 - 28116612
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  28116103 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaagtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 28116202  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaa 201  Q
    || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||      ||| || |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||      
T  28116203 aattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttggg 28116302  T
Q  202 cgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 301  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  28116303 caattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggta 28116402  T
Q  302 cgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 401  Q
     |||||||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  28116403 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 28116502  T
Q  402 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 501  Q
    || || ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  28116503 tgtccattaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaataattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 28116602  T
Q  502 tgtccatctc 511  Q
    || |||||||    
T  28116603 tgaccatctc 28116612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 7073321 - 7072815
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  7073321 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgggggcttaccttgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 7073222  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||| | |    
T  7073221 aactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 7073122  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||    
T  7073121 ttgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatga 7073022  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  7073021 cggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgactggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgt 7072922  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| |||||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  7072921 ccattaccatacctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtga 7072822  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  7072821 ccatctc 7072815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 10396242 - 10395750
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  10396242 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 10396143  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatgg 207  Q
    | ||| ||||| ||||  ||||||||||| || |||||||||||||| || |  |||||||||||      |||| | ||||| |  || ||| ||||||    
T  10396142 agctctgcatacaacataggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtacctgttgagcgatgg 10396043  T
Q  208 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 307  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||  ||  ||| ||||| |||||    
T  10396042 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacgg 10395943  T
Q  308 aggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccg 407  Q
    ||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||     
T  10395942 aggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 10395843  T
Q  408 ttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 500  Q
    ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||    
T  10395842 ttaccatatctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaataattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatg 10395750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 32292868 - 32292697
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32292868 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggagacttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagt 32292769  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
    |||||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32292768 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 32292697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 47023541 - 47023056
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  47023541 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 47023442  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| |||||||    
T  47023441 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacctgag 47023342  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| |||||||| |  || |  |||||    
T  47023341 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcatt 47023242  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||    
T  47023241 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgat 47023142  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||  ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  47023141 gcattcacagaggattcggctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 47023056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 51 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 20066109 - 20065739
Alignment:
Q  51 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctag 150  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||    
T  20066109 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 20066010  T
Q  151 cttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactg 250  Q
      | ||||||||| || |||||| |||| || |  ||||| |  || ||| |||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| | ||| |||||    
T  20066009 tatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactg 20065910  T
Q  251 atgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 350  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  20065909 atgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtggccatggat 20065810  T
Q  351 tgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctt 421  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  20065809 tgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtatctttcttcttgtgatgtccattaccatacctctt 20065739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 7996650 - 7996213
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  7996650 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 7996551  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||| | || ||||| ||||| || ||||    
T  7996550 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgag 7996451  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | |||||| |  || || |||||    
T  7996450 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcatt 7996351  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||     
T  7996350 gatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgag 7996251  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 463  Q
    ||| | || || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  7996250 gcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 7996213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 10643158 - 10642721
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  10643158 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 10643059  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||| | || ||||| ||||| || ||||    
T  10643058 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgag 10642959  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | |||||| |  || || |||||    
T  10642958 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcatt 10642859  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||     
T  10642858 gatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgag 10642759  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 463  Q
    ||| | || || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  10642758 gcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 10642721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 31034259 - 31034430
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31034259 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagt 31034358  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
    |||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  31034359 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 31034430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 350
Target Start/End: Original strand, 22387727 - 22388069
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  22387727 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagc 22387826  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatgg 207  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || |||||| |||| || |  |||||||  || ||| ||||||    
T  22387827 aactctgcatacaacattggtataggaggaaaagtcggtctagcatattgttgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatgg 22387926  T
Q  208 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 307  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||    
T  22387927 cattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgcataagggtaggacgg 22388026  T
Q  308 aggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 350  Q
     || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22388027 gggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 22388069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5713315 - 5713016
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  5713315 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 5713216  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  |||| ||||| ||||| || ||||    
T  5713215 atcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgag 5713116  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  5713115 gttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 5713016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5724225 - 5723926
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  5724225 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 5724126  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  |||| ||||| ||||| || ||||    
T  5724125 atcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgag 5724026  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  5724025 gttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 5723926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 325
Target Start/End: Original strand, 5757252 - 5757551
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  5757252 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 5757351  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  |||| ||||| ||||| || ||||    
T  5757352 atcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgag 5757451  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  5757452 gttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 5757551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 325
Target Start/End: Original strand, 5768143 - 5768442
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  5768143 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 5768242  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  |||| ||||| ||||| || ||||    
T  5768243 atcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgag 5768342  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  5768343 gttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 5768442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 428
Target Start/End: Original strand, 4346836 - 4347256
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  4346836 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 4346935  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatgg 207  Q
    |  || ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||| || |||||| |||| || |  ||||| |  || ||| ||||||    
T  4346936 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatgg 4347035  T
Q  208 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 307  Q
    |||| || || ||||||||||| || | ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  | | ||||| |||||    
T  4347036 cattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatacatgggtatgacgg 4347135  T
Q  308 aggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccg 407  Q
    ||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||     
T  4347136 aggcatttgggctgcgttgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 4347235  T
Q  408 ttaccgtacctctttgatgca 428  Q
    ||||| |||||||| ||||||    
T  4347236 ttaccatacctcttcgatgca 4347256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 428
Target Start/End: Original strand, 17985126 - 17985528
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| |||| ||||    
T  17985126 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggt 17985225  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  17985226 ataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 17985325  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  17985326 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 17985425  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||    
T  17985426 gatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctttttgat 17985525  T
Q  426 gca 428  Q
    |||    
T  17985526 gca 17985528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 28021384 - 28020964
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  28021384 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaatggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtatagttggaaga 28021285  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatgg 207  Q
    |  || ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||| || |||||| |||| || |  ||||| |  || ||| ||||||    
T  28021284 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatgg 28021185  T
Q  208 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 307  Q
    |||| || || ||||||||||| || | ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||    
T  28021184 cattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 28021085  T
Q  308 aggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccg 407  Q
    ||| |  ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||    
T  28021084 aggcatttgggctgtattgataggagcaacagtagccatggattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtccg 28020985  T
Q  408 ttaccgtacctctttgatgca 428  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  28020984 ttaccatacctctttgatgca 28020964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 21674802 - 21674296
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  21674802 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtagagttggaaga 21674703  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    |  || ||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||  | |    
T  21674702 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 21674603  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | || || | ||| || ||||||||||||| ||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||    
T  21674602 ttgcgttgatgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaatggcggaaagaacggatgctgagaatacggcacatatgggtatga 21674503  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || || ||||| ||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  21674502 cggaggcatttgagctgcattgataggagccacggtagccatgggttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgt 21674403  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  21674402 ccattaccatatctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtga 21674303  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  21674302 ccatctc 21674296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 18225279 - 18224877
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| |||| ||||    
T  18225279 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 18225180  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||| |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  18225179 ataggagggaaggtaggcctagcttgttgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 18225080  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  18225079 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 18224980  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  18224979 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgat 18224880  T
Q  426 gca 428  Q
    |||    
T  18224879 gca 18224877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 5467073 - 5466672
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||  |||    
T  5467073 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaaggagttctgcatacaacataggt 5466974  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagc---ttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    ||  ||||||| || |||||| |   ||| |||||||| || |||||| |||| || |   |||| |  || ||| |||||||||| || || |||||||    
T  5466973 ataagaggaaaagttggtctatcatattgctgctgctgctgctgttgaactggcggttgacgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgag 5466874  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||| || | ||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  5466873 gttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaatggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 5466774  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  5466773 gataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgat 5466674  T
Q  426 gc 427  Q
    ||    
T  5466673 gc 5466672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 451
Target Start/End: Original strand, 5596705 - 5596961
Alignment:
Q  195 tgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcat 294  Q
    |||||| |||||||||| || || ||||||||||| || | ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||    
T  5596705 tgctgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatat 5596804  T
Q  295 acgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttctt 394  Q
    | |||||||||||||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  5596805 atgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttctt 5596904  T
Q  395 cttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 451  Q
    ||| || || || ||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||||||||    
T  5596905 cttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggattcaactttctc 5596961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 32439262 - 32438771
Alignment:
Q  9 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 108  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  32439262 tcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 32439163  T
Q  109 actcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggc 208  Q
      || ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||| || |||||| |||| || |  |||||||  || ||| |||||||    
T  32439162 gttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggc 32439063  T
Q  209 attaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgga 308  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||     
T  32439062 attgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacggg 32438963  T
Q  309 ggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgt 408  Q
    || ||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||   | |||||| | || ||| || || || || ||||||||||| ||||| || |    
T  32438962 ggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttcttcttgtgatgtccat 32438863  T
Q  409 taccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 500  Q
    ||||||| ||||| |  |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| |||||||| |  | ||||||||| ||||| || ||||||    
T  32438862 taccgtatctcttcgcagcatttgcagatgactcaatcttctcaaacacaatgatgccttcccgaacagcttcttccagacgtgttcccatg 32438771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4893318 - 4892977
Alignment:
Q  9 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 108  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |  |||||||| |||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  4893318 tcacacttaagatcagagtggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggtttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 4893219  T
Q  109 actcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggc 208  Q
     ||| ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||| || |||||| |||| || |  |||||||  || ||| |||||||    
T  4893218 gctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggc 4893119  T
Q  209 attaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgga 308  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||     
T  4893118 attgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacggg 4893019  T
Q  309 ggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 350  Q
    || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  4893018 ggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttggat 4892977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 28339411 - 28338989
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  28339411 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 28339312  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | |    
T  28339311 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 28339212  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | ||||| ||||| || ||||| || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||    
T  28339211 ttgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatga 28339112  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  28339111 cggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgt 28339012  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgc 427  Q
    || ||||| |||||||| |||||    
T  28339011 ccattaccatacctcttcgatgc 28338989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 427
Target Start/End: Original strand, 31964622 - 31965044
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  31964622 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 31964721  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | |    
T  31964722 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 31964821  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | ||||| ||||| || ||||| || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||    
T  31964822 ttgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatga 31964921  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  31964922 cggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgt 31965021  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgc 427  Q
    || ||||| |||||||| |||||    
T  31965022 ccattaccatacctcttcgatgc 31965044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 427
Target Start/End: Original strand, 50134220 - 50134642
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  50134220 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 50134319  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | |    
T  50134320 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 50134419  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | ||||| ||||| || ||||| || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||    
T  50134420 ttgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatga 50134519  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  50134520 cggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgt 50134619  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgc 427  Q
    || ||||| |||||||| |||||    
T  50134620 ccattaccatacctcttcgatgc 50134642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 499
Target Start/End: Original strand, 6542632 - 6543117
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| |||| ||||    
T  6542632 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 6542731  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagc---------------ttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaa 213  Q
    || |||||||| || |||||||                |||||| || |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| |    
T  6542732 ataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattga 6542831  T
Q  214 cgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaa 313  Q
    |||| || ||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |     
T  6542832 cgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcat 6542931  T
Q  314 ctgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccg 413  Q
     || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||     
T  6542932 ttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacca 6543031  T
Q  414 tacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 499  Q
    |||||||| |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  6543032 tacctcttcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccat 6543117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 4417028 - 4416603
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  4417028 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 4416929  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaa 201  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||      ||| || |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||      
T  4416928 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttggg 4416829  T
Q  202 cgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 301  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| || |||| ||| | ||| | ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  4416828 caattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtgctgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 4416729  T
Q  302 cgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 401  Q
     |||||||| |  || |  ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  4416728 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 4416629  T
Q  402 tgaccgttaccgtacctctttgatgc 427  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  4416628 tgtccattaccatacctcttcgatgc 4416603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 246 - 460
Target Start/End: Original strand, 22871264 - 22871478
Alignment:
Q  246 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 345  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22871264 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 22871363  T
Q  346 tggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 445  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | || ||||||||| |    
T  22871364 tagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggattcagc 22871463  T
Q  446 tttctcgaatacaat 460  Q
    |||||| || |||||    
T  22871464 tttctcaaacacaat 22871478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 246 - 460
Target Start/End: Original strand, 22886323 - 22886537
Alignment:
Q  246 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 345  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22886323 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 22886422  T
Q  346 tggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 445  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | || ||||||||| |    
T  22886423 tagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggattcagc 22886522  T
Q  446 tttctcgaatacaat 460  Q
    |||||| || |||||    
T  22886523 tttctcaaacacaat 22886537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 424
Target Start/End: Original strand, 5609471 - 5609890
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  5609471 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 5609570  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||| ||    || |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | |    
T  5609571 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 5609670  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | ||||| ||||| || ||||| || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||   |  ||| ||||| ||    
T  5609671 ttgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgtcatatatgggtatga 5609770  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  5609771 cggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgt 5609870  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttga 424  Q
    || ||||| || ||||||||    
T  5609871 ccattaccatatctctttga 5609890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 207 - 451
Target Start/End: Original strand, 36997440 - 36997684
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||    
T  36997440 gcattgacgggcacctgaggttggccgggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacg 36997539  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  36997540 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 36997639  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 451  Q
     ||||| || ||||| || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  36997640 attaccatatctcttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 36997684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 5013800 - 5013315
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || || |||| ||||    
T  5013800 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgtacaacattggt 5013701  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    || |||||||| || || || ||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  5013700 ataggaggaaaagttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 5013601  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  5013600 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 5013501  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  5013500 gatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgat 5013401  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    ||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5013400 gcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5013315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 207 - 460
Target Start/End: Original strand, 11110712 - 11110965
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||    
T  11110712 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacg 11110811  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||    
T  11110812 gaggcatttgagttgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtcc 11110911  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
     ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  11110912 attaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 11110965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 460
Target Start/End: Original strand, 20577213 - 20577466
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||    
T  20577213 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacg 20577312  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || |  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  20577313 gaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 20577412  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
     ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  20577413 attaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 20577466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 207 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 51781918 - 51781674
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||  || || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||   || ||||| ||||    
T  51781918 gcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacg 51781819  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  51781818 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 51781719  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 451  Q
     ||||| || ||||| || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  51781718 attaccatatctcttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 51781674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 397
Target Start/End: Original strand, 29665336 - 29665526
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||   || ||||| ||||    
T  29665336 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacg 29665435  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 397  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29665436 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 29665526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 24328247 - 24327822
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||  |||    
T  24328247 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggt 24328148  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    || ||||| ||||| || || ||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  24328147 ataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 24328048  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  24328047 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 24327948  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||     
T  24327947 gataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgac 24327848  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctc 451  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||    
T  24327847 gcattcacagaggattcagctttctc 24327822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 48465822 - 48465569
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| |||  | || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||    
T  48465822 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcggggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacg 48465723  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  48465722 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 48465623  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
     ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  48465622 attaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 48465569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 51797007 - 51796762
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||  || || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||   || ||||| ||||    
T  51797007 gcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacg 51796908  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg-ac 405  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||  |    
T  51796907 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtgc 51796808  T
Q  406 cgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 451  Q
    | ||||| || ||||| || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  51796807 cattaccatatctcttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 51796762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 246 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 18242595 - 18242381
Alignment:
Q  246 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 345  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  18242595 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 18242496  T
Q  346 tggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 445  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  18242495 ttgattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 18242396  T
Q  446 tttctcgaatacaat 460  Q
    |||||| || |||||    
T  18242395 tttctcaaacacaat 18242381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 148
Target Start/End: Original strand, 36997247 - 36997366
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| |||| ||||    
T  36997247 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggt 36997346  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtct 148  Q
    || |||||||| || |||||    
T  36997347 ataggaggaaaagttggtct 36997366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 150
Target Start/End: Original strand, 5596527 - 5596648
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| |||| ||||    
T  5596527 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 5596626  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctag 150  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  5596627 ataggagggaaggttggtctag 5596648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 88
Target Start/End: Original strand, 11110498 - 11110578
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 88  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  11110498 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 11110578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 51782111 - 51782052
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 88  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51782111 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51782052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 18242827 - 18242706
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| |||| ||||    
T  18242827 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggt 18242728  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctag 150  Q
    || |||||||| || |||||||    
T  18242727 ataggaggaaaagttggtctag 18242706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 172
Target Start/End: Original strand, 29665162 - 29665283
Alignment:
Q  51 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctag 150  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || ||||| |    
T  29665162 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctgg 29665261  T
Q  151 cttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
      | ||||||||| ||||||||    
T  29665262 tatattgctgctgctgttgttg 29665283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Original strand, 22871005 - 22871169
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  22871005 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 22871104  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
    |  || ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| |  |||||||| || |||||    
T  22871105 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatactgctgctgctgctgttg 22871169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Original strand, 22886064 - 22886228
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  22886064 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 22886163  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
    |  || ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| |  |||||||| || |||||    
T  22886164 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatactgctgctgctgctgttg 22886228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 48466036 - 48465896
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  48466036 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctttggagtaaagttggaaga 48465937  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtct 148  Q
    |  || ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||    
T  48465936 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 48465896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 51797192 - 51797141
Alignment:
Q  37 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 88  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51797192 gaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51797141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 172
Target Start/End: Original strand, 20577039 - 20577163
Alignment:
Q  51 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctag 150  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || ||||| |    
T  20577039 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctgg 20577138  T
Q  151 c---ttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
        ||| |||||||||||||||||    
T  20577139 tatattgatgctgctgttgttgttg 20577163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 422; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Original strand, 15285029 - 15285538
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15285029 gatggaaatcacacttgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 15285128  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  15285129 cgggagtaactcgaaatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagttggtggctgttgttgcatttgctga 15285228  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15285229 acgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatatgggt 15285328  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatg 400  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15285329 acaatggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccatacttctgtttctttcttcttatg 15285428  T
Q  401 atgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 500  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15285429 atgaccgttaccgttcctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctaggcgagtccccatg 15285528  T
Q  501 atgtccatct 510  Q
     || ||||||    
T  15285529 gtgaccatct 15285538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 15228040 - 15227529
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15228040 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaatggatcaggtggaggcttaccctgtctggttgtacagtgccctctgagaagtagagt 15227941  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15227940 cgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctga 15227841  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227840 acgacagcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 15227741  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227740 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatg 15227641  T
Q  401 atgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 500  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15227640 atgaccgttaccatgcctctttgatgcatttgcggaggattcatctttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacgagtccccatg 15227541  T
Q  501 atgtccatctca 512  Q
     || ||||||||    
T  15227540 gtgaccatctca 15227529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 1900427 - 1899916
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900427 gatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgagaagcaacggatcaggtggaggcttaccatgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 1900328  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1900327 cgggagtaactcggcatacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgctgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 1900228  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1900227 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggt 1900128  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900127 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatg 1900028  T
Q  401 atgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 500  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  1900027 atgatcgttaccgtacctctttgatgcatttacagaggattcaactttctcaaatacaataatgccttctctgacagcttcttccaaacgagtccccatg 1899928  T
Q  501 atgtccatctca 512  Q
     || ||||||||    
T  1899927 gtgaccatctca 1899916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 512
Target Start/End: Original strand, 14235626 - 14236140
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||    
T  14235626 gatggaaatcacatttgaggtcgaaatggaacctgggaggcaaagggttaggtggaggcttgccctgtctggttgtacagtgccctttaagaagcagagt 14235725  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgt---tgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgc 197  Q
    |||||| | ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||    
T  14235726 cgggagcagctcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgttgctgctgttgttgctgagccggcggctgttgttgcatttgc 14235825  T
Q  198 tgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacg 297  Q
    ||| | |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  14235826 tgagcaatggcattaacgggtacctatgggtgacccgatggtagagggtactgatgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatatact 14235925  T
Q  298 ggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 397  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14235926 ggtacggcagaggtaactgagcagcattaataggggtaacagtggccatggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctttcttctt 14236025  T
Q  398 atgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtcccc 497  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||   |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  || || |||    
T  14236026 atgatgaccattaccgtacttctttgatgtgcttgcagaggattcccctttctcgaacacaataatgtcttctctgacagcctcttctaagcgggttccc 14236125  T
Q  498 atgatgtccatctca 512  Q
    ||| || ||||||||    
T  14236126 atggtgaccatctca 14236140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 512
Target Start/End: Original strand, 15391439 - 15391948
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  15391439 gatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttcccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagt 15391538  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    |||||| |||||||| || | || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||   |||  | |||| ||| ||||||||||||    
T  15391539 cgggagcaactcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgctgctgttgttg---agccagcggctgttgctgcatttgctga 15391635  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
     | |||||||| | ||||||||||||||||||||  | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| | |    
T  15391636 gcaatggcattgatgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 15391735  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaa-cagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttat 399  Q
    ||| |||||||| ||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15391736 acggcggaggtagctgagcaacattgatgggggcaaacagtagccatggattgactggttccagcagataccatccctacttctgtctctttcttcttat 15391835  T
Q  400 gatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 499  Q
    ||||||| || || ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  || || |||||    
T  15391836 gatgaccattgccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacctttcccaaacacaataatgccatctctgacagcctcttctaagcgggttcccat 15391935  T
Q  500 gatgtccatctca 512  Q
    | || ||||||||    
T  15391936 ggtgaccatctca 15391948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 24460706 - 24461030
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24460706 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 24460805  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||     
T  24460806 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 24460905  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24460906 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 24461005  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  24461006 acgacggaggtagctgagcagcatt 24461030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 17014163 - 17013657
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| ||     
T  17014163 atcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctttggagtaaagtcggaagc 17014064  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| | |    
T  17014063 aactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 17013964  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||    
T  17013963 ttgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatga 17013864  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
     ||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||     
T  17013863 aggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgt 17013764  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  17013763 ccattaccatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtga 17013664  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  17013663 ccatctc 17013657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 14665160 - 14664675
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||  |||    
T  14665160 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggt 14665061  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  14665060 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 14664961  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  14664960 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggtgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcatt 14664861  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  14664860 gataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgat 14664761  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || |  ||||| || |||||||| |||||| || |||||||    
T  14664760 gcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctaacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatctc 14664675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Original strand, 24592443 - 24592925
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||  |||    
T  24592443 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggt 24592542  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggtt 228  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |  |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  24592543 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggtt 24592642  T
Q  229 gacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaat 328  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  || || ||||| ||    
T  24592643 gacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 24592742  T
Q  329 aggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 428  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  24592743 aggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 24592842  T
Q  429 tttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    ||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||||    
T  24592843 ttcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatctc 24592925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Original strand, 14763412 - 14763918
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  14763412 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 14763511  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||  | |  |||||||  || ||| |||    
T  14763512 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcga 14763611  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||    
T  14763612 tggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatga 14763711  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  14763712 cggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgt 14763811  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  14763812 ccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtga 14763911  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  14763912 ccatctc 14763918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Original strand, 36344623 - 36345126
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  36344623 atcacatttgagatcagacctgaacctcggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 36344722  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatgg 207  Q
    | ||| ||||| ||||  ||||| |||||||| || |||||||  | ||||||||| || |||||| |||| || |  |||||||  || ||| ||||||    
T  36344723 agctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatgg 36344822  T
Q  208 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 307  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| |||||    
T  36344823 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggatactgatgataaaacggtaggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacgg 36344922  T
Q  308 aggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccg 407  Q
    ||| |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||     
T  36344923 aggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 36345022  T
Q  408 ttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtcca 507  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||    
T  36345023 ttaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgacca 36345122  T
Q  508 tctc 511  Q
    ||||    
T  36345123 tctc 36345126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 6570016 - 6569510
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  6570016 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 6569917  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttg---ttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    |  || ||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||| || |  ||||||||   |||| ||||   || ||||| ||| || ||  | |    
T  6569916 agttctgcatacaacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgctgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 6569817  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||    
T  6569816 ttgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatga 6569717  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  6569716 cggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgt 6569617  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  6569616 ccattaccatatctcttcgatgcattcgcagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtga 6569517  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  6569516 ccatctc 6569510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Original strand, 27163446 - 27163931
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  27163446 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 27163545  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||| | || ||||| ||||| || ||||    
T  27163546 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgag 27163645  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  27163646 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 27163745  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  27163746 gatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgat 27163845  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    ||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  27163846 gcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 27163931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 14098683 - 14098198
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| |||| ||||    
T  14098683 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 14098584  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  14098583 ataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 14098484  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  14098483 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 14098384  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||     
T  14098383 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgac 14098284  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  14098283 gcatttacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 14098198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 54833550 - 54833098
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  54833550 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaaga 54833451  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatgg 207  Q
    | ||| ||||| ||||  ||||| |||||||| || |||||||  | ||||||||| || |||||| |||| || |  ||||| |  || ||| | ||||    
T  54833450 agctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcaatgg 54833351  T
Q  208 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 307  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| |||||    
T  54833350 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacgg 54833251  T
Q  308 aggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccg 407  Q
    ||| |  || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||     
T  54833250 aggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 54833151  T
Q  408 ttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
    ||||| |||||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || |||||    
T  54833150 ttaccatacctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaat 54833098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 5006036 - 5005527
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  5006036 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccttgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 5005937  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaa 201  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||      ||| || |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||      
T  5005936 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttggg 5005837  T
Q  202 cgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 301  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  5005836 caattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggta 5005737  T
Q  302 cgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 401  Q
     |||||||| |  || || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  5005736 tgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 5005637  T
Q  402 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 501  Q
    || || ||||| |||||||| || | | | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  5005636 tgtccattaccatacctcttcgacgtactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 5005537  T
Q  502 tgtccatctc 511  Q
    || |||||||    
T  5005536 tgaccatctc 5005527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 428
Target Start/End: Original strand, 31126647 - 31127049
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| |||| ||||    
T  31126647 gaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggt 31126746  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  31126747 ataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 31126846  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  31126847 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 31126946  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||    
T  31126947 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgat 31127046  T
Q  426 gca 428  Q
    |||    
T  31127047 gca 31127049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 227 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 19373202 - 19372918
Alignment:
Q  227 ttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatta 326  Q
    |||||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| |||||||| |  || || |||||     
T  19373202 ttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattg 19373103  T
Q  327 ataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatg 426  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||    
T  19373102 ataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatg 19373003  T
Q  427 catttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    ||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  19373002 cattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 19372918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24112824 - 24112483
Alignment:
Q  9 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 108  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  24112824 tcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 24112725  T
Q  109 actcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggc 208  Q
     ||| ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||| || |||||| |||| || |  |||||||  || ||| |||||||    
T  24112724 gctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggc 24112625  T
Q  209 attaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgga 308  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||     
T  24112624 attgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacggg 24112525  T
Q  309 ggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 350  Q
    || ||||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||    
T  24112524 ggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggat 24112483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 207 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 30753703 - 30753482
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||    
T  30753703 gcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 30753604  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  30753603 gaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacatcatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 30753504  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgca 428  Q
     ||||| |||||||| ||||||    
T  30753503 attaccatacctcttcgatgca 30753482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 350
Target Start/End: Original strand, 34189069 - 34189410
Alignment:
Q  9 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 108  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  34189069 tcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 34189168  T
Q  109 actcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggc 208  Q
     ||| ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||| || |||||| |||| || |  |||||||  || ||| |||||||    
T  34189169 gctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggc 34189268  T
Q  209 attaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgga 308  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||     
T  34189269 attgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacggg 34189368  T
Q  309 ggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 350  Q
    || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||    
T  34189369 ggaaactgagcagcattgataggagcgacagtagccttggat 34189410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 451
Target Start/End: Original strand, 18800742 - 18801176
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| |||| ||||    
T  18800742 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 18800841  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctag----------ct--tgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgg 216  Q
    || |||||||| || |||||||          ||  || ||||| |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||    
T  18800842 ataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgctgctgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgg 18800941  T
Q  217 gtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactg 316  Q
    | || ||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  ||    
T  18800942 gcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttg 18801041  T
Q  317 ggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtac 416  Q
     || ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||     
T  18801042 agctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttctgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatat 18801141  T
Q  417 ctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 451  Q
    ||||| || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  18801142 ctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctc 18801176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 499
Target Start/End: Original strand, 40105767 - 40106240
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||||||||  |||    
T  40105767 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttcagcatataacatcggt 40105866  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   ||  |||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  40105867 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgctgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 40105966  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  40105967 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 40106066  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |  ||||||||||| || |||    
T  40106067 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtctattaccgtaccttttcgat 40106166  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 499  Q
    ||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| ||||||||    
T  40106167 gcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgactgcttcctcaagacgggtccccat 40106240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 207 - 451
Target Start/End: Original strand, 33674120 - 33674364
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||  || || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||   || ||||| ||||    
T  33674120 gcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaatggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacg 33674219  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  33674220 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 33674319  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 451  Q
     ||||| || ||||| || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  33674320 attaccatatctcttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 33674364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 21969758 - 21969441
Alignment:
Q  114 gcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcat 210  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||| | || ||||    
T  21969758 gcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcat 21969659  T
Q  211 taacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 310  Q
    | ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||||    
T  21969658 tgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggagg 21969559  T
Q  311 taactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtta 410  Q
     |  || || ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||    
T  21969558 catttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttcttttttcttgtggtgtccatta 21969459  T
Q  411 ccgtacctctttgatgca 428  Q
    || |||||||| ||||||    
T  21969458 ccatacctcttcgatgca 21969441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 39850584 - 39850331
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||  || || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||   || ||||| ||||    
T  39850584 gcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacg 39850485  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  39850484 gaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 39850385  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
     ||||| || ||||| || | |||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  39850384 attaccatatctcttcgacgtattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 39850331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 30753896 - 30753777
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| |||| ||||    
T  30753896 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 30753797  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtct 148  Q
    || |||||||| || |||||    
T  30753796 ataggaggaaaagttggtct 30753777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 148
Target Start/End: Original strand, 33673906 - 33674046
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  33673906 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagc 33674005  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtct 148  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||    
T  33674006 aactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 33674046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 39850758 - 39850637
Alignment:
Q  51 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctag 150  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || ||||| |    
T  39850758 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctgg 39850659  T
Q  151 cttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
      | ||||||||| ||||||||    
T  39850658 tatattgctgctgctgttgttg 39850637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 408; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 16041479 - 16040980
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041479 gatggaaatcacactttaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 16041380  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16041379 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 16041280  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16041279 acgacggaattaacgggtacctgaggttgacccgatgacaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggt 16041180  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041179 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatg 16041080  T
Q  401 atgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 500  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  16041079 atgaccgttaccatacctctttgatgcatttacggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacgagttcccatg 16040980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 512
Target Start/End: Original strand, 16449985 - 16450496
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449985 gatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 16450084  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16450085 cgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgctgttgagctggtggctgttgttgcacttgctga 16450184  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16450185 acgacggcattaatgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgataaaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcgtacgggt 16450284  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16450285 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagctatggattgaccggctccggcagataccatccctacttttgtttctttcttcttatg 16450384  T
Q  401 atgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 500  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16450385 atgaccgttaccgtatctttttgatgcatttacagaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacgagtccccatg 16450484  T
Q  501 atgtccatctca 512  Q
     || ||||||||    
T  16450485 gtgaccatctca 16450496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 31088451 - 31088775
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31088451 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 31088550  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||     
T  31088551 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 31088650  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31088651 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 31088750  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  31088751 acgacggaggtagctgagcagcatt 31088775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Original strand, 16518431 - 16518916
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||  |||    
T  16518431 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 16518530  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||  ||| ||||| ||| || ||| | || |||||||||||||||||||    
T  16518531 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgag 16518630  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  16518631 gttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcatt 16518730  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  16518731 aataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttaccatacctctttgat 16518830  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||| | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  16518831 gcatttacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 16518916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 45733616 - 45733292
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45733616 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 45733517  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
       |||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||     
T  45733516 taagagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 45733417  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45733416 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 45733317  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  45733316 acgacggaggtagctgagcagcatt 45733292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Original strand, 16503395 - 16503880
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||  |||    
T  16503395 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 16503494  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||  ||| ||||| ||| || ||| | || |||||||||||||||||||    
T  16503495 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgag 16503594  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  16503595 gttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcatt 16503694  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  16503695 aataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttaccatacctctttgat 16503794  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  16503795 gcattcacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 16503880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Original strand, 10916883 - 10917365
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||  |||    
T  10916883 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 10916982  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggtt 228  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |  |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||| ||||| |||||||    
T  10916983 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggtt 10917082  T
Q  229 gacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaat 328  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| |||| ||| |  ||||| ||||| ||    
T  10917083 gacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacgaaggcatttgggctgcattgat 10917182  T
Q  329 aggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 428  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||    
T  10917183 aggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgca 10917282  T
Q  429 tttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    ||  | ||||||||| ||||||| || ||||| ||  | || || |  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  10917283 ttcacagaggattcagctttctcaaacacaatgatttcatccctaacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 10917365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Original strand, 11424791 - 11425276
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  11424791 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtgcaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 11424890  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  11424891 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 11424990  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  |||||  ||||    
T  11424991 gttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctacatt 11425090  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||    
T  11425091 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgat 11425190  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  11425191 gcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 11425276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 5128141 - 5127635
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  5128141 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggattaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagc 5128042  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||| | |    
T  5128041 aactcagcatacaacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 5127942  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||    
T  5127941 ttgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatga 5127842  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||     
T  5127841 cggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgt 5127742  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||| ||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  5127741 ccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggactcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtga 5127642  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  5127641 ccatctc 5127635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 2154701 - 2154216
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||  |||    
T  2154701 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggt 2154602  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||| |||||||||| || |   | |||||||||||| |  |   || |||||  || || ||| | || |||||||||| ||| ||||    
T  2154601 atcggagggaaagtatgtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccagcaactgttgttttatctgttgagcaattgcattaacggatacttgag 2154502  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  2154501 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcatt 2154402  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  2154401 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgat 2154302  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| ||  | || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  2154301 gcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgatttcatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 2154216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Original strand, 5147334 - 5147840
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  5147334 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 5147433  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |   | ||||||||||||   ||   || ||||| ||| || ||  | |    
T  5147434 aactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgttgattttgttgttgttgttgaatcggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 5147533  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| || || ||    
T  5147534 ttgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatggatatga 5147633  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || || ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  5147634 cggaggcatttgagctgcattgataggagcaatggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgt 5147733  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  5147734 ccattaccatacctcttcgatgcattcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtga 5147833  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  5147834 ccatctc 5147840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 45387471 - 45387034
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  45387471 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 45387372  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  45387371 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 45387272  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  45387271 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 45387172  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||     
T  45387171 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgac 45387072  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 463  Q
    ||| |||| || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  45387071 gcacttgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 45387034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 2108992 - 2109163
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2108992 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagt 2109091  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
    |||||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2109092 cgggagcaactcagcatatatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 2109163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 26484850 - 26484679
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484850 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagt 26484751  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
    |||||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26484750 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 26484679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Original strand, 16736454 - 16736960
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  16736454 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 16736553  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | |    
T  16736554 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 16736653  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||    
T  16736654 ttgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatga 16736753  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||  |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  16736754 cggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgt 16736853  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  16736854 ccattaccatatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtga 16736953  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  16736954 ccatctc 16736960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Original strand, 16751508 - 16752014
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  16751508 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 16751607  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | |    
T  16751608 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 16751707  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||    
T  16751708 ttgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatga 16751807  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||  |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  16751808 cggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgt 16751907  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  16751908 ccattaccatatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtga 16752007  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  16752008 ccatctc 16752014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 17523681 - 17523175
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  17523681 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 17523582  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | |    
T  17523581 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 17523482  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||    
T  17523481 ttgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatga 17523382  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||  |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  17523381 cggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgt 17523282  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  17523281 ccattaccatatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtga 17523182  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  17523181 ccatctc 17523175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Original strand, 17529534 - 17530040
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  17529534 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 17529633  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | |    
T  17529634 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 17529733  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||    
T  17529734 ttgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatga 17529833  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||  |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  17529834 cggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgt 17529933  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  17529934 ccattaccatatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtga 17530033  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  17530034 ccatctc 17530040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 39211010 - 39211181
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39211010 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaagcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagt 39211109  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
    |||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  39211110 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgcggtcgttgttg 39211181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 2775515 - 2775344
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2775515 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagt 2775416  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
    ||||||  |||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  2775415 cgggagctactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctactgtcgttgttg 2775344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 427
Target Start/End: Original strand, 4145138 - 4145539
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  4145138 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 4145237  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||  | |  ||||| |  || ||| |||||||||| || || |||||||    
T  4145238 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgag 4145337  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  4145338 gttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 4145437  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||    
T  4145438 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgat 4145537  T
Q  426 gc 427  Q
    ||    
T  4145538 gc 4145539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 26435406 - 26434900
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  26435406 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 26435307  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    |  || ||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||  | |    
T  26435306 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaa 26435207  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||    
T  26435206 ttgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatga 26435107  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || || ||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  26435106 cggaggcatttgagctgcactgataggagcaacagtggccatggactgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgt 26435007  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| || ||||| | |||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  26435006 ccattaccatatctcttcggtgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtga 26434907  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  26434906 ccatctc 26434900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 426
Target Start/End: Original strand, 26319884 - 26320284
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  26319884 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 26319983  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | || | || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  26319984 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 26320083  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  26320084 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 26320183  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||    
T  26320184 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctcttcgat 26320283  T
Q  426 g 426  Q
    |    
T  26320284 g 26320284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 9618779 - 9618345
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  9618779 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 9618680  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  9618679 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 9618580  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  9618579 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 9618480  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||    
T  9618479 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgat 9618380  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
    ||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  9618379 gcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 9618345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 428
Target Start/End: Original strand, 26275109 - 26275511
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  26275109 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 26275208  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  26275209 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 26275308  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  26275309 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 26275408  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||    
T  26275409 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctcttcgat 26275508  T
Q  426 gca 428  Q
    |||    
T  26275509 gca 26275511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5159667 - 5159326
Alignment:
Q  9 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 108  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  5159667 tcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 5159568  T
Q  109 actcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggc 208  Q
     ||| ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||| || |||||| |||| || |  |||||||  || ||| |||||||    
T  5159567 gctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggc 5159468  T
Q  209 attaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgga 308  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||     
T  5159467 attgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacggg 5159368  T
Q  309 ggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 350  Q
    || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5159367 ggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 5159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 18540947 - 18540784
Alignment:
Q  9 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 108  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18540947 tcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagca 18540848  T
Q  109 actcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
    |||| ||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18540847 actcagcatatagcattggtatcagaggaaaagtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 18540784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 207 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 11441507 - 11441263
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||    
T  11441507 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacg 11441408  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  11441407 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 11441308  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 451  Q
     ||||| || ||||| || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  11441307 attaccatatctcttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 11441263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 246 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 31124819 - 31124554
Alignment:
Q  246 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 345  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  31124819 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 31124720  T
Q  346 tggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 445  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||| |    
T  31124719 ttgattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcattcgcagaggattcagc 31124620  T
Q  446 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  31124619 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 31124554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 460
Target Start/End: Original strand, 26669929 - 26670363
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  26669929 gaaccttgggggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 26670028  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  26670029 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 26670128  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  26670129 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 26670228  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||    
T  26670229 gataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgat 26670328  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
    ||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  26670329 gcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 26670363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Original strand, 24592556 - 24593041
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||  |||    
T  24592556 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggt 24592655  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    || ||||| ||||| || || ||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  24592656 ataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 24592755  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  24592756 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 24592855  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||     
T  24592856 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgac 24592955  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  24592956 gcatttacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 24593041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 460
Target Start/End: Original strand, 26537885 - 26538322
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |  || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  26537885 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgcacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 26537984  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctg------ttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacct 222  Q
    || |||||||| || ||||| |  | |||||||||      |||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || |    
T  26537985 ataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcactt 26538084  T
Q  223 gaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagc 322  Q
    |||||||||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || ||    
T  26538085 gaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgc 26538184  T
Q  323 attaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctcttt 422  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||     
T  26538185 attgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttc 26538284  T
Q  423 gatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
    || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  26538285 gacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 26538322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 3445241 - 3445020
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||  || || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||   || ||||| ||||    
T  3445241 gcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacg 3445142  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  3445141 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 3445042  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgca 428  Q
     ||||| |||||||| ||||||    
T  3445041 attaccatacctcttcgatgca 3445020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 428
Target Start/End: Original strand, 26485940 - 26486161
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||    
T  26485940 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacg 26486039  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  26486040 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 26486139  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgca 428  Q
     ||||| |||||||| ||||||    
T  26486140 attaccatacctcttcgatgca 26486161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 207 - 428
Target Start/End: Original strand, 31564595 - 31564816
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||  ||| ||||| ||||    
T  31564595 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacg 31564694  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  31564695 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 31564794  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgca 428  Q
     ||||| || ||||| ||||||    
T  31564795 attaccatatctcttcgatgca 31564816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 3445434 - 3445315
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| |||| ||||    
T  3445434 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 3445335  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtct 148  Q
    || |||||||| || |||||    
T  3445334 ataggaggaaaagttggtct 3445315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 150
Target Start/End: Original strand, 31564405 - 31564526
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| |||| ||||    
T  31564405 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 31564504  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctag 150  Q
    || |||||||| || |||||||    
T  31564505 ataggaggaaaagttggtctag 31564526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 11441700 - 11441629
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||    
T  11441700 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagt 11441629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 31125048 - 31124927
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| |||| ||||    
T  31125048 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggt 31124949  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctag 150  Q
    || |||||||| || |||||||    
T  31124948 ataggaggaaaagttggtctag 31124927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 25199193 - 25198682
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199193 gatggaaatcacacttgagatcagaacggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 25199094  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  25199093 cgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagaaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 25198994  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  25198993 acgacggcgttaacgagtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggt 25198894  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatg 400  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25198893 acgacggaggcaattgggaagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcggataccatccctacttctgtttccttcttcttatg 25198794  T
Q  401 atgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 500  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  25198793 atgtccgttaccgtacctctttgatgcattcacggaggattcaactttctcgaatacaataattccttctctgacagcttcttccagatgagtccccatg 25198694  T
Q  501 atgtccatctca 512  Q
     || ||||||||    
T  25198693 gtgaccatctca 25198682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 23892370 - 23891855
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892370 gatggaaatcacatttgaggtcggaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 23892271  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg---agctggtggctattgttgcatttgc 197  Q
    ||| || ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   | | ||||||| |||||||||||||    
T  23892270 cggaagcaactcggcatacatgattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggtggctgttgttgcatttgc 23892171  T
Q  198 tgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacg 297  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  23892170 tgaacgatggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgttggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatg 23892071  T
Q  298 ggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 397  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892070 ggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgatcggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 23891971  T
Q  398 atgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtcccc 497  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23891970 atgatgtccgttaccatacctctttgatgcattcacggaggattcaactttctcgaatacaataattccttctctgacagcttcttccagacgagtcccc 23891871  T
Q  498 atgatgtccatctcat 513  Q
    ||| || |||||||||    
T  23891870 atggtgaccatctcat 23891855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22888634 - 22888287
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22888634 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaaatagagt 22888535  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22888534 cgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 22888435  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22888434 acgacggcattaacggttacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggt 22888335  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatgg 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888334 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatgg 22888287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 13184646 - 13184970
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13184646 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 13184745  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||     
T  13184746 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 13184845  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13184846 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13184945  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  13184946 acgacggaggtagctgagcagcatt 13184970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33877411 - 33877087
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33877411 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 33877312  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||     
T  33877311 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 33877212  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33877211 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 33877112  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  33877111 acgacggaggtagctgagcagcatt 33877087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 13440492 - 13440816
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13440492 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 13440591  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    ||||||||| |  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||     
T  13440592 cgggagtaatttagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 13440691  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13440692 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13440791  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  13440792 acgacggaggtagctgagcagcatt 13440816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11325958 - 11325634
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11325958 gatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 11325859  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  11325858 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctga 11325759  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11325758 acgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccaatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 11325659  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  11325658 acgacggaggtagctgagcagcatt 11325634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Original strand, 24688183 - 24688668
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| || |  |||    
T  24688183 gaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaatatcggt 24688282  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| | || | |||||||||||| ||||    
T  24688283 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgtattaacgggtacttgag 24688382  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  24688383 gttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcatt 24688482  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  24688483 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgat 24688582  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  24688583 gcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 24688668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Original strand, 23752455 - 23752961
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| |||||||| ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| ||     
T  23752455 atcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagc 23752554  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||    
T  23752555 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcga 23752654  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||    
T  23752655 ttgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatga 23752754  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||     
T  23752755 cggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgt 23752854  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| ||     
T  23752855 ccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtga 23752954  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  23752955 ccatctc 23752961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 30934769 - 30934287
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||  |||    
T  30934769 gaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggt 30934670  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggtt 228  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |  |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  30934669 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggtt 30934570  T
Q  229 gacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaat 328  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  30934569 gacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgat 30934470  T
Q  329 aggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 428  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||    
T  30934469 aggagcaacagtagtcatggattggccggctccggtagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgca 30934370  T
Q  429 tttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    ||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  30934369 ttcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 30934287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Original strand, 23718014 - 23718500
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||  |||    
T  23718014 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggt 23718113  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  23718114 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 23718213  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  23718214 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcatt 23718313  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||    
T  23718314 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgat 23718413  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagctt-cttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||| |||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  23718414 gcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttccttccagacgagttcccatggtgaccatctc 23718500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 11549490 - 11549005
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||  |||    
T  11549490 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggt 11549391  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  11549390 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 11549291  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  11549290 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgtgaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcatt 11549191  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||    
T  11549190 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgat 11549091  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  11549090 gcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 11549005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 33777644 - 33777138
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| |||||||| ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  33777644 atcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagc 33777545  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||| |||    
T  33777544 aactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcga 33777445  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||    
T  33777444 ttgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatga 33777345  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||     
T  33777344 cggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgt 33777245  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  33777244 ccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtga 33777145  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  33777144 ccatctc 33777138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 510
Target Start/End: Original strand, 22999119 - 22999624
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||| || ||     
T  22999119 atcacacttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagc 22999218  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||    
T  22999219 aactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcga 22999318  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||    
T  22999319 ttgcattaacgggtacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatga 22999418  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||     
T  22999419 cggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgt 22999518  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  22999519 ccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtga 22999618  T
Q  505 ccatct 510  Q
    ||||||    
T  22999619 ccatct 22999624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 29889080 - 29889262
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29889080 gatggaaatcacatatgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtggtgcagtgccctctgagaagtagagt 29889179  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggct 183  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  29889180 tgggagtagctcagcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggct 29889262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 460
Target Start/End: Original strand, 9548548 - 9549003
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  9548548 atcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 9548647  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    || || ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| || |   | ||||||||||||   ||   || ||||| ||| || ||| | |    
T  9548648 aattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaatcggcatctgttgtttcatctgttgagcaa 9548747  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||    
T  9548748 ttgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatga 9548847  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  ||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  9548848 cggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgt 9548947  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
    || ||||| |||||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  9548948 ccattaccatacctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 9549003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Original strand, 15658765 - 15659271
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  15658765 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 15658864  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||| | |    
T  15658865 aactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 15658964  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||  || |||| || || ||    
T  15658965 ttgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaacggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatggatatga 15659064  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || |  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  15659065 cggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgt 15659164  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  15659165 ccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtga 15659264  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  15659265 ccatctc 15659271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 427
Target Start/End: Original strand, 8665501 - 8665902
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  8665501 gaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 8665600  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  8665601 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 8665700  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | |||||| |  || || |||||    
T  8665701 gttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcatt 8665800  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||    
T  8665801 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgat 8665900  T
Q  426 gc 427  Q
    ||    
T  8665901 gc 8665902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24970154 - 24969876
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||  |||    
T  24970154 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 24970055  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggtt 228  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||   |||||||||| | ||  ||| ||||| ||| || ||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  24970054 atcggagggaaagtaggtctagcttgttgatg---ttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggtt 24969958  T
Q  229 gacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 310  Q
    |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||    
T  24969957 gacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacgacggagg 24969876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 41674866 - 41674420
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  41674866 atcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 41674767  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    || || ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | |    
T  41674766 aattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaa 41674667  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | ||||| |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  ||  || |||| ||||| ||    
T  41674666 ttgcattgacgggtacttgaggtggacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagcatacggcacatatgggtatga 41674567  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  41674566 cggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgt 41674467  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 451  Q
    || ||||| |||||||| || |||||  | ||||||||  |||||||    
T  41674466 ccattaccatacctcttcgacgcattcacagaggattcggctttctc 41674420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 34616654 - 34616223
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || ||||| ||||| |||| ||||    
T  34616654 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggt 34616555  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggtt 228  Q
    || |||||||| || |||||||| | ||||||||| || |||||| |||| || |  ||||| |  || ||| |||||||||| || || ||||||||||    
T  34616554 ataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggtt 34616455  T
Q  229 gacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaat 328  Q
      || | ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  34616454 agccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgat 34616355  T
Q  329 aggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 428  Q
    ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||||    
T  34616354 aggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgca 34616255  T
Q  429 tttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
     |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34616254 ctcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34616223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 317 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 24951955 - 24951761
Alignment:
Q  317 ggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtac 416  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||    
T  24951955 ggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttaccatac 24951856  T
Q  417 ctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  24951855 ctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 24951761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 2511187 - 2510753
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  2511187 gaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 2511088  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||  || ||||    
T  2511087 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacggacacttgag 2510988  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  2510987 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcatt 2510888  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  2510887 gataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgat 2510788  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
    ||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  2510787 gcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 2510753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 30168605 - 30168171
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  30168605 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 30168506  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  30168505 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 30168406  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  30168405 gttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 30168306  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     || || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||    
T  30168305 gatgggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgat 30168206  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
    ||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  30168205 gcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 30168171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 428
Target Start/End: Original strand, 32599477 - 32599897
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  32599477 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 32599576  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatgg 207  Q
    |  || ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||| || |||||| |||| || |  ||||| |  |||||| ||||||    
T  32599577 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgctgagcgatgg 32599676  T
Q  208 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 307  Q
    |||| || || ||||||||||| || | ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||    
T  32599677 cattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 32599776  T
Q  308 aggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccg 407  Q
    ||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||     
T  32599777 aggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtcca 32599876  T
Q  408 ttaccgtacctctttgatgca 428  Q
    ||||| |||||||| ||||||    
T  32599877 ttaccatacctcttcgatgca 32599897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 463
Target Start/End: Original strand, 15758883 - 15759320
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  15758883 gaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 15758982  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  15758983 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 15759082  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  15759083 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 15759182  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||     
T  15759183 gataggagcaacagtagccattgattgacctgctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgac 15759282  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 463  Q
    ||| |||| || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  15759283 gcacttgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 15759320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 9317587 - 9317153
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  9317587 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 9317488  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  9317487 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 9317388  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  9317387 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 9317288  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  9317287 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgat 9317188  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
    ||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  9317187 gcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 9317153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 12132291 - 12131889
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  12132291 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 12132192  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | || | || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  12132191 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 12132092  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  12132091 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 12131992  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||    
T  12131991 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctcttcgat 12131892  T
Q  426 gca 428  Q
    |||    
T  12131891 gca 12131889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 6874462 - 6874004
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  6874462 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 6874363  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaa 201  Q
    | ||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||      ||| || |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||      
T  6874362 agctcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttggg 6874263  T
Q  202 cgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 301  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  6874262 caattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 6874163  T
Q  302 cgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 401  Q
     |||||||| |  || |  ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  6874162 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 6874063  T
Q  402 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
    || || ||||| ||||||||||||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  6874062 tgtccattaccatacctctttgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 6874004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Original strand, 18375438 - 18375923
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||| |||| ||||    
T  18375438 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggt 18375537  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  18375538 ataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 18375637  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  18375638 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 18375737  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  18375738 gatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgat 18375837  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    ||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  18375838 gcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 18375923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 26480528 - 26480094
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  26480528 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 26480429  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  26480428 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 26480329  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  26480328 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 26480229  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||    
T  26480228 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgat 26480129  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
    ||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  26480128 gcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 26480094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 5638046 - 5637561
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  5638046 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 5637947  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  5637946 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 5637847  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  5637846 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 5637747  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||    
T  5637746 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgat 5637647  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    ||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5637646 gcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5637561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 30152154 - 30151669
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  30152154 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 30152055  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  30152054 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 30151955  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  30151954 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 30151855  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  30151854 gatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgat 30151755  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    ||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  30151754 gcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 30151669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 43078409 - 43077900
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  43078409 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 43078310  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctg------ttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaa 201  Q
    |  || ||||| |||| |||||| |||||||| || ||||| |  | |||||||||      |||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||      
T  43078309 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttggg 43078210  T
Q  202 cgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 301  Q
    | || ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || |||||    
T  43078209 caattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggta 43078110  T
Q  302 cgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 401  Q
    ||||||||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  43078109 cgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagttgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 43078010  T
Q  402 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 501  Q
    || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  43078009 tgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcgagacgggttcccatgg 43077910  T
Q  502 tgtccatctc 511  Q
    || |||||||    
T  43077909 tgaccatctc 43077900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 207 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 31431383 - 31431130
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||    
T  31431383 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 31431284  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  31431283 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 31431184  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
     ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  31431183 attaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 31431130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 33292681 - 33292340
Alignment:
Q  9 tcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagta 108  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |    
T  33292681 tcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaa 33292582  T
Q  109 actcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggc 208  Q
     ||| ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| | ||| ||||| || |||||| |||| || |  |||||||  || ||| |||||||    
T  33292581 gctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgttgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggc 33292482  T
Q  209 attaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgga 308  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||     
T  33292481 attgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacggg 33292382  T
Q  309 ggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 350  Q
    || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  33292381 ggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttggat 33292340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 33516492 - 33516090
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| |||| ||||    
T  33516492 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggt 33516393  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  33516392 ataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 33516293  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  33516292 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcatt 33516193  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||    
T  33516192 gatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgat 33516093  T
Q  426 gca 428  Q
    |||    
T  33516092 gca 33516090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 207 - 460
Target Start/End: Original strand, 18500955 - 18501208
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||    
T  18500955 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacg 18501054  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || |  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  18501055 gaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 18501154  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
     ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  18501155 attaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 18501208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 207 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 3789481 - 3789177
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||    
T  3789481 gcattgacgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacg 3789382  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  3789381 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 3789282  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtcc 506  Q
     ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || ||    
T  3789281 attaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgacc 3789182  T
Q  507 atctc 511  Q
    |||||    
T  3789181 atctc 3789177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 51 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 24681554 - 24681171
Alignment:
Q  51 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctag 150  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || ||||| |    
T  24681554 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctgg 24681455  T
Q  151 cttgttgctgctg------ttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagagg 244  Q
      | |||||||||      |||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || || || ||||| || ||||| || |||| ||| | |||    
T  24681454 tatattgctgctgctgctgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagg 24681355  T
Q  245 atactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 344  Q
     ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  24681354 gtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcc 24681255  T
Q  345 atggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 428  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  24681254 atggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 24681171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 51 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 24724081 - 24723698
Alignment:
Q  51 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctag 150  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || ||||| |    
T  24724081 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctgg 24723982  T
Q  151 cttgttgctgctg------ttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagagg 244  Q
      | |||||||||      |||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || || || ||||| || ||||| || |||| ||| | |||    
T  24723981 tatattgctgctgctgctgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagg 24723882  T
Q  245 atactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 344  Q
     ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  24723881 gtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcc 24723782  T
Q  345 atggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 428  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  24723781 atggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 24723698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 207 - 499
Target Start/End: Original strand, 37358862 - 37359154
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||    
T  37358862 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 37358961  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  37358962 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 37359061  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 499  Q
     ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| ||||||| |||||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  37359062 attaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaatacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccat 37359154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 428
Target Start/End: Original strand, 37671488 - 37671920
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  37671488 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagc 37671587  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctag----------ct--tgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcattt 195  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||          ||  ||||| || |||||||||||| | ||   || ||||| ||| |    
T  37671588 aactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatct 37671687  T
Q  196 gctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcata 295  Q
    | ||  | || ||||| ||||| || ||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  |||    
T  37671688 gttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatata 37671787  T
Q  296 cgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttc 395  Q
     ||||| |||||||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  37671788 tgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttc 37671887  T
Q  396 ttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 428  Q
    || || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  37671888 ttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 37671920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 246 - 428
Target Start/End: Original strand, 37771245 - 37771427
Alignment:
Q  246 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 345  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| || ||||||||||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  37771245 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatggatacgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 37771344  T
Q  346 tggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 428  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  37771345 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 37771427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 246 - 499
Target Start/End: Original strand, 40473798 - 40474051
Alignment:
Q  246 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 345  Q
    |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||   |  ||||| |||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  40473798 tactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtgtgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggggcaacagtagcca 40473897  T
Q  346 tggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 445  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  40473898 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 40473997  T
Q  446 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 499  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||    
T  40473998 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcttcaagacgggttcccat 40474051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 246 - 428
Target Start/End: Original strand, 31826665 - 31826847
Alignment:
Q  246 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 345  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  31826665 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 31826764  T
Q  346 tggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 428  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  31826765 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 31826847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 28649392 - 28648937
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  28649392 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 28649293  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctag----ct--tgttgctgctgttgttgttg------agctggtggctattgttgcattt 195  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||    ||  || |||||||||||||||||      | | ||   || ||||| ||| |    
T  28649292 aactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgctgttgttgttgttgttgaaccggaaactgttgtttcatct 28649193  T
Q  196 gctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcata 295  Q
    | ||  | || ||||| ||||| || ||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  |||    
T  28649192 gttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatata 28649093  T
Q  296 cgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttc 395  Q
     ||||| |||||||| |  || || | ||| ||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28649092 tgggtatgacggaggcatttgagctgtattgatagttgcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttc 28648993  T
Q  396 ttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 451  Q
    || || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  28648992 ttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctc 28648937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 451
Target Start/End: Original strand, 29967092 - 29967517
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| |||| ||||    
T  29967092 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 29967191  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    || ||||| ||||| || || ||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  29967192 ataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 29967291  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  29967292 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 29967391  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| ||     
T  29967392 gataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttctttttgtggtgtccattaccatatctcttcgac 29967491  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctc 451  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||    
T  29967492 gcattcacagaggattcagctttctc 29967517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 30029551 - 30029126
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| |||| ||||    
T  30029551 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 30029452  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    || ||||| ||||| || || ||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  30029451 ataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 30029352  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  30029351 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 30029252  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| ||     
T  30029251 gataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttctttttgtggtgtccattaccatatctcttcgac 30029152  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctc 451  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||    
T  30029151 gcattcacagaggattcagctttctc 30029126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 246 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 37754884 - 37754670
Alignment:
Q  246 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 345  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| || || |||||||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  37754884 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 37754785  T
Q  346 tggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 445  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || ||| |||| || |||||| |    
T  37754784 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcacttgcagaagattcagc 37754685  T
Q  446 tttctcgaatacaat 460  Q
    |||||| || |||||    
T  37754684 tttctcaaacacaat 37754670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 428
Target Start/End: Original strand, 28959812 - 28960226
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| |||| ||||    
T  28959812 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 28959911  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctg---------------ttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaa 213  Q
    || |||||||| || |||||||| | |||||||||               |||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| |    
T  28959912 ataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattga 28960011  T
Q  214 cgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaa 313  Q
    |||| || ||||| || |||  ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |     
T  28960012 cgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcat 28960111  T
Q  314 ctgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccg 413  Q
     |||||  |||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||     
T  28960112 ttgggctacattgataggtgcaacagtagccgttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacca 28960211  T
Q  414 tacctctttgatgca 428  Q
    |||||||| ||||||    
T  28960212 tacctcttcgatgca 28960226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 207 - 460
Target Start/End: Original strand, 13325051 - 13325304
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||  ||| ||||| ||||    
T  13325051 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacg 13325150  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  13325151 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccagctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 13325250  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
     ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  13325251 attaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 13325304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Original strand, 18500735 - 18500877
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  18500735 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 18500834  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctag 150  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||    
T  18500835 aactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctag 18500877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 31431576 - 31431466
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||| |||| ||||    
T  31431576 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggt 31431477  T
Q  129 atcggaggaaa 139  Q
    || ||||||||    
T  31431476 ataggaggaaa 31431466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 148
Target Start/End: Original strand, 31826433 - 31826552
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| |||| ||||    
T  31826433 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 31826532  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtct 148  Q
    || |||||||| || |||||    
T  31826533 ataggaggaaaagttggtct 31826552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 150
Target Start/End: Original strand, 37770992 - 37771134
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || || |||||  | |||| ||| || ||     
T  37770992 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagc 37771091  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctag 150  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||    
T  37771092 aactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37771134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 150
Target Start/End: Original strand, 37358669 - 37358790
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| |||| ||||    
T  37358669 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttccgcatacaacattggt 37358768  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctag 150  Q
    || |||||||| || |||||||    
T  37358769 ataggaggaaaagttggtctag 37358790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 3789677 - 3789534
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| |||| ||||    
T  3789677 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggt 3789578  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
    || |||||||| || |||||||  |  |||||||| ||||||||    
T  3789577 ataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgttgttg 3789534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 37755116 - 37754995
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| |||| ||||    
T  37755116 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 37755017  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctag 150  Q
    || |||||||| || |||||||    
T  37755016 ataggaggaaaagttggtctag 37754995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 148
Target Start/End: Original strand, 40473597 - 40473694
Alignment:
Q  51 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtct 148  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || |||||    
T  40473597 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 40473694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 512
Target Start/End: Original strand, 16208132 - 16208640
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16208132 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggttttccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 16208231  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16208232 cgggagtaactcggtatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatg---ttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctga 16208328  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| | |    
T  16208329 acgatggcattaatgggtacctgaggctgacccgatggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 16208428  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatg 400  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16208429 acggcggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatctctacttctgtttctttcttcttatg 16208528  T
Q  401 atgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 500  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16208529 atgaccgttaccgtaactctttgatgcatttacagaggattcaactttctcaaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacgagtccccatg 16208628  T
Q  501 atgtccatctca 512  Q
     || ||||||||    
T  16208629 gtgaccatctca 16208640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 185 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20461075 - 20460748
Alignment:
Q  185 ttgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagag 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461075 ttgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagag 20460976  T
Q  285 tattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctg 384  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  20460975 tattgcgcatacgggtacggcggaggtaactgggcagcattaataggggcaatagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttcta 20460876  T
Q  385 tttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttc 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20460875 tttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcattggcggaggattcaactttctcgaatataataatgccttctctgacagcttcttc 20460776  T
Q  485 tagacgagtccccatgatgtccatctca 512  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||||    
T  20460775 taggcgagtccccatggtgaccatctca 20460748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 20340436 - 20340760
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20340436 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagt 20340535  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
     ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  20340536 tgggagtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgctgatgctgttgttgttgagctggaggctgttgttgcatttgttga 20340635  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20340636 acgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcgtacgggt 20340735  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  20340736 acgacggaggtagctgagcagcatt 20340760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 20461228 - 20461070
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461228 atcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 20461129  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttg 166  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20461128 aactcggcatatagcattagtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgttg 20461070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Original strand, 41793416 - 41793922
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  41793416 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 41793515  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| ||  || | |    
T  41793516 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgtggagcaa 41793615  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||  ||| ||||| ||    
T  41793616 ttgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgttgagaatacggcatatatgggtatga 41793715  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  41793716 cggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgt 41793815  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| ||||||||||||||| |  | |||| |||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  41793816 ccattaccatacctctttgatgcactcacagaggtttcagctttctcaaacacaatgatcccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtga 41793915  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  41793916 ccatctc 41793922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 28152016 - 28151845
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28152016 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggagcctgggaggtaacagatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagt 28151917  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
    |||||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28151916 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 28151845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 10962796 - 10962362
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | || | ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  10962796 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagcaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 10962697  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  10962696 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 10962597  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  10962596 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 10962497  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||    
T  10962496 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgat 10962397  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
    |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  10962396 gcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 10962362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 28585107 - 28584682
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  28585107 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 28585008  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  28585007 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 28584908  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||||||||| |||||||| |  || || |||||    
T  28584907 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatacgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 28584808  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||     
T  28584807 gataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgac 28584708  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctc 451  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||    
T  28584707 gcattcacagaggattcagctttctc 28584682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 246 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 51638124 - 51637910
Alignment:
Q  246 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 345  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  51638124 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 51638025  T
Q  346 tggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 445  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||| |||| || |||||| |    
T  51638024 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgacgcacttgcagaagattcagc 51637925  T
Q  446 tttctcgaatacaat 460  Q
    |||||| || |||||    
T  51637924 tttctcaaacacaat 51637910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20543 - 20053
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20543 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 20444  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                     |||||||||||||    
T  20443 cgggagtaactcagcatacaacattggtatcgggggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttg---------------------ttgcatttgctga 20365  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  20364 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggt 20265  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20264 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatg 20165  T
Q  401 atgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20164 atgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaacacaataatgccttctctgacagcttcttctaggcgagtccccatg 20065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 30579 - 30095
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| |||| ||||    
T  30579 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggt 30480  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    || ||||||||| ||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  30479 ataggaggaaag-taggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 30381  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  30380 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcatt 30281  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||| | |||    
T  30280 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcctcgat 30181  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  30180 gcattcacagaggattcggctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 30095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 60)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 3 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20160851 - 20160345
Alignment:
Q  3 tggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcg 102  Q
    |||| |||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |    
T  20160851 tggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttg 20160752  T
Q  103 ggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaac 202  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| |    
T  20160751 ggagtaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgttgagctggtggctgttgctgtttttgctgagc 20160652  T
Q  203 gatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtac 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| || ||||     
T  20160651 aatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaacaggtat 20160552  T
Q  303 gacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgat 402  Q
    |  |||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20160551 ggtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagccatggattgaccgg---cagcaaattccatccctacttctgtttccttcttcttatgat 20160455  T
Q  403 gaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgat 502  Q
    |||||||||||||||| |||| |||  |  ||||||||||| |||| || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| |    
T  20160454 gaccgttaccgtacctttttggtgcgctcacggaggattcacctttatcaaacacaatgattccttccctgacagcttcttctagacgggttcccatggt 20160355  T
Q  503 gtccatctca 512  Q
    | ||||||||    
T  20160354 gaccatctca 20160345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 3 - 512
Target Start/End: Original strand, 22171980 - 22172486
Alignment:
Q  3 tggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcg 102  Q
    |||| |||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |    
T  22171980 tggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttg 22172079  T
Q  103 ggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaac 202  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| |    
T  22172080 ggagtaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgttgagctggtggctgttgctgtttttgctgagc 22172179  T
Q  203 gatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtac 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| || ||||     
T  22172180 aatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaacaggtat 22172279  T
Q  303 gacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgat 402  Q
    |  |||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22172280 ggtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagccatggattgaccgg---cagcaaattccatccctacttctgtttccttcttcttatgat 22172376  T
Q  403 gaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgat 502  Q
    |||||||||||||||| |||| |||  |  ||||||||||| |||| || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| |    
T  22172377 gaccgttaccgtacctttttggtgcgctcacggaggattcacctttatcaaacacaatgattccttccctgacagcttcttctagacgggttcccatggt 22172476  T
Q  503 gtccatctca 512  Q
    | ||||||||    
T  22172477 gaccatctca 22172486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 22477317 - 22477673
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22477317 gatggaaatcacacttgaggttagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccatatgagaagtagagt 22477416  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgt---tgttgttgagctggtggctattgttgcatttgc 197  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||| | |||| || ||||||||||||     
T  22477417 cgggagtaactcggcatacatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttgttgaaccggtgactgttgttgcatttgt 22477516  T
Q  198 tgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacg 297  Q
    ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22477517 tgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactaatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcatacg 22477616  T
Q  298 ggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgac 354  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22477617 ggtacgacagaggtaattgggcagcattaattggggcaacagtagccatggattgac 22477673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28162809 - 28162485
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28162809 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaagtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 28162710  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  28162709 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctga 28162610  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28162609 acgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 28162510  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||    
T  28162509 acgatggaggtagctgagcagcatt 28162485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 13522117 - 13522441
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13522117 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 13522216  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||     
T  13522217 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 13522316  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13522317 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13522416  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  13522417 acgacggaggtagctgagcagcatt 13522441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 33374300 - 33374624
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33374300 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 33374399  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||     
T  33374400 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 33374499  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33374500 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 33374599  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  33374600 acgacggaggtagctgagcagcatt 33374624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 8892354 - 8892678
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8892354 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 8892453  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  8892454 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctga 8892553  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8892554 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 8892653  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  8892654 acgacggaggtagctgagcagcatt 8892678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 8903589 - 8903913
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8903589 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 8903688  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  8903689 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctga 8903788  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  8903789 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagagatgctgagagtattgcgcatacgtgt 8903888  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  8903889 acgacggaggtagctgagcagcatt 8903913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Original strand, 13299023 - 13299508
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  13299023 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 13299122  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  13299123 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 13299222  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  13299223 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcatt 13299322  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||||    
T  13299323 gataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctctttgat 13299422  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  13299423 gcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 13299508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Original strand, 22934924 - 22935434
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||    
T  22934924 gatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagt 22935023  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    ||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| || |  |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || |||    
T  22935024 cggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttga 22935123  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| ||||    
T  22935124 gcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggt 22935223  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatg 400  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || || || |||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  22935224 atgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtg 22935323  T
Q  401 atgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 500  Q
     || |||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  22935324 gtgtccgttaccatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatg 22935423  T
Q  501 atgtccatctc 511  Q
     || |||||||    
T  22935424 gtgaccatctc 22935434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Original strand, 23857369 - 23857879
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||    
T  23857369 gatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagt 23857468  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    ||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| || |  |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || |||    
T  23857469 cggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttga 23857568  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
     | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| ||||    
T  23857569 gcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggt 23857668  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatg 400  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || || || |||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  23857669 atgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtg 23857768  T
Q  401 atgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 500  Q
     || |||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  23857769 gtgtccgttaccatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatg 23857868  T
Q  501 atgtccatctc 511  Q
     || |||||||    
T  23857869 gtgaccatctc 23857879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Original strand, 15424389 - 15424874
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||  |||    
T  15424389 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 15424488  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg---agctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |  |||||||||||   | ||||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  15424489 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttcaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 15424588  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  15424589 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcatt 15424688  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  15424689 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgat 15424788  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | || |||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||||    
T  15424789 gcattcacagaagattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatctc 15424874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 26989125 - 26988640
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||  |||    
T  26989125 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggt 26989026  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttg---ttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |  |||||   ||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  26989025 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgatgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 26988926  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  26988925 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcatt 26988826  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||    
T  26988825 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgat 26988726  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  26988725 gcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 26988640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 460
Target Start/End: Original strand, 24304690 - 24305124
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  24304690 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 24304789  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  24304790 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggaaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 24304889  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  24304890 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggcagcatt 24304989  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  24304990 gataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgat 24305089  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||| |||||    
T  24305090 gcattcacagaggattcagctttctcgaacacaat 24305124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 24863841 - 24863356
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||  |||    
T  24863841 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggt 24863742  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||| | || |||||||||||||| || |    
T  24863741 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttggg 24863642  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  24863641 gttgactcggtggtagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggaggcatttgggctgcatt 24863542  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  24863541 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgat 24863442  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| | |||| || |||||||    
T  24863441 gcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttctcatggtgaccatctc 24863356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 27000197 - 26999712
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| ||||  |||    
T  27000197 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggt 27000098  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||| | || |||||||||||||| ||||    
T  27000097 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgag 26999998  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  26999997 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcatt 26999898  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  26999897 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgat 26999798  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  26999797 gcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 26999712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 26918525 - 26918070
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| ||     
T  26918525 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagc 26918426  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| | | || ||| | |    
T  26918425 aactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcgtctgttgagcaa 26918326  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||    
T  26918325 ttgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatga 26918226  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||     
T  26918225 cggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgt 26918126  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||    
T  26918125 ccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaat 26918070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 16749999 - 16749493
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  16749999 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagc 16749900  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||| |||    
T  16749899 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcga 16749800  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||    
T  16749799 ttgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatga 16749700  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||  |  || || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||     
T  16749699 cggagacatttgagctgcgttgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgt 16749600  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| |||||||| |||||| |  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  16749599 ccattaccatacctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcgaacacaatgatcccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtga 16749500  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  16749499 ccatctc 16749493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 29549620 - 29549117
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  29549620 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 29549521  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatgg 207  Q
    | ||| ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| || |  |||||||  || ||| ||||||    
T  29549520 agctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcgtattgctgctgctgttgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatgg 29549421  T
Q  208 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 307  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| |||||    
T  29549420 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacgg 29549321  T
Q  308 aggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccg 407  Q
    ||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  29549320 aggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtcca 29549221  T
Q  408 ttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtcca 507  Q
    ||||| |||||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||    
T  29549220 ttaccatacctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgacca 29549121  T
Q  508 tctc 511  Q
    ||||    
T  29549120 tctc 29549117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 27290414 - 27290596
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27290414 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacttgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagt 27290513  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggct 183  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27290514 cgggagcaactcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttattgctgctgtcgttgttgagccggtggct 27290596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 22456978 - 22457176
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22456978 gatggaaatcacacttgaggtaagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccttatgagaagtagagt 22457077  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgct---gttgttgttgagctggtggctattgttgcatttg 196  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| | |||| || ||||||||||||    
T  22457078 cgggagtaactcggcatacatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttgttgaaccggtgactgttgttgcatttg 22457176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 4525410 - 4525011
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| |||| ||||    
T  4525410 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 4525311  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggtt 228  Q
    || |||||||| || |||||||  |  |||||||| || |||||| |||| || |  ||||| |  || ||| |||||||||| || || ||||||||||    
T  4525310 ataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggtt 4525211  T
Q  229 gacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaat 328  Q
    | || | ||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || ||||| ||    
T  4525210 ggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 4525111  T
Q  329 aggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 428  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  4525110 aggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 4525011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 14143329 - 14143500
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14143329 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagt 14143428  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
    |||||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14143429 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 14143500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 26788096 - 26787925
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26788096 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagt 26787997  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
    |||||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26787996 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 26787925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 27044532 - 27044029
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  27044532 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaaga 27044433  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatgg 207  Q
    | ||| ||||| ||||  ||||| |||||||| || |||||||  | ||||||||| || |||||| |||| || |  ||||| |  || ||| ||||||    
T  27044432 agctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatgg 27044333  T
Q  208 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 307  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||    
T  27044332 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacgg 27044233  T
Q  308 aggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccg 407  Q
    ||| |  ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||     
T  27044232 aggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 27044133  T
Q  408 ttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtcca 507  Q
    ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||    
T  27044132 ttaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgacca 27044033  T
Q  508 tctc 511  Q
    ||||    
T  27044032 tctc 27044029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 27196469 - 27196298
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27196469 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagt 27196370  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
    |||||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27196369 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 27196298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 27252771 - 27252942
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27252771 gatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagt 27252870  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
    |||||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27252871 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 27252942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 29573137 - 29572735
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| |||| ||||    
T  29573137 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 29573038  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    || |||||||| || ||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  29573037 ataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 29572938  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  29572937 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 29572838  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  29572837 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgat 29572738  T
Q  426 gca 428  Q
    |||    
T  29572737 gca 29572735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 207 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 3696006 - 3695702
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||    
T  3696006 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacg 3695907  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  3695906 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 3695807  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtcc 506  Q
     ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || ||    
T  3695806 attaccatatctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgacc 3695707  T
Q  507 atctc 511  Q
    |||||    
T  3695706 atctc 3695702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 428
Target Start/End: Original strand, 30558088 - 30558490
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| |||| ||||    
T  30558088 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggt 30558187  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  30558188 ataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 30558287  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  30558288 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 30558387  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||    
T  30558388 gatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgat 30558487  T
Q  426 gca 428  Q
    |||    
T  30558488 gca 30558490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 29501539 - 29501096
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| |||| ||||    
T  29501539 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggt 29501440  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctag----ct--------tgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgg 216  Q
    || ||||| ||||| |||||||    ||        ||||| || ||||||||||||  ||| || |  |||||    |||||| |||||||||| || |    
T  29501439 ataggagggaaggttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttgttgttgttgaattggcggttgatgttgtgcctgctgagcgatggcattgacag 29501340  T
Q  217 gtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactg 316  Q
    | ||||||||||| || | ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||||||||||| |  ||    
T  29501339 gaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttg 29501240  T
Q  317 ggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtac 416  Q
     || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||     
T  29501239 agctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatat 29501140  T
Q  417 ctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
    ||||| || |||||  |  |||||||| ||||||| || |||||    
T  29501139 ctcttcgacgcattcacaaaggattcagctttctcaaacacaat 29501096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 499
Target Start/End: Original strand, 27272624 - 27273128
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||   ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||    
T  27272624 gatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcgacggatcaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctctggagtagagt 27272723  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgt------tgagctggtggctattgttgcatt 194  Q
    ||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||  |||| || | ||||||||||      ||| ||||||| | |||| || |     
T  27272724 cggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctgacttgctgattctgttgttgttgttgctgaactggtggttgttgtggcttc 27272823  T
Q  195 tgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcat 294  Q
    ||||| || || ||||| || ||||| |||||| | || ||||| | |||||||| ||  || ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||  |  |||    
T  27272824 tgctgcacaatagcattcacaggtacttgaggtggtcctgatggcaaaggatactaatagtaaaatggcgggtagaatggatgttgagaatacggtacat 27272923  T
Q  295 acgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttctt 394  Q
    | | ||| |  ||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||  | |  ||||| |||||||  |||||||| || || |||||||| |||||    
T  27272924 aggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagctgtagtctgacctgctccagaggataccattccaacctctgtttccttctt 27273023  T
Q  395 cttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtc 494  Q
    ||| || || || || || ||||||||  |  ||||||  || || ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||  ||||| ||||||||||||    
T  27273024 cttgtggtggccattgccatacctcttcaacccatttgtagaagactcacccttctcaaatacaatgataccttccctgacggcttcctctagacgagtc 27273123  T
Q  495 cccat 499  Q
    |||||    
T  27273124 cccat 27273128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 207 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 17025205 - 17024901
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||    
T  17025205 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 17025106  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  17025105 gaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 17025006  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtcc 506  Q
     ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||  ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || ||    
T  17025005 attaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcggctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgacc 17024906  T
Q  507 atctc 511  Q
    |||||    
T  17024905 atctc 17024901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 4757888 - 4757483
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| |||| ||||    
T  4757888 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 4757789  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctag----ct--tgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacct 222  Q
    || |||||||| || |||||||    ||  || ||||| |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || |    
T  4757788 ataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcactt 4757689  T
Q  223 gaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagc 322  Q
    |||| || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || ||    
T  4757688 gaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgc 4757589  T
Q  323 attaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctcttt 422  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||     
T  4757588 attgataggagcgacagtagccattgattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttc 4757489  T
Q  423 gatgca 428  Q
    ||||||    
T  4757488 gatgca 4757483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 460
Target Start/End: Original strand, 34463614 - 34463867
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||    
T  34463614 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacg 34463713  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  34463714 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 34463813  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
     ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34463814 attaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34463867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 246 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 27485021 - 27484807
Alignment:
Q  246 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 345  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  27485021 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 27484922  T
Q  346 tggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 445  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  27484921 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 27484822  T
Q  446 tttctcgaatacaat 460  Q
    |||||| || |||||    
T  27484821 tttctcaaacacaat 27484807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 27007655 - 27007402
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  |||  |||| ||||    
T  27007655 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatataggtatgacg 27007556  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  27007555 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 27007456  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
     ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27007455 attaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27007402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 207 - 511
Target Start/End: Original strand, 4546037 - 4546341
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||    
T  4546037 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 4546136  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  4546137 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 4546236  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtcc 506  Q
     ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || ||    
T  4546237 attaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgacc 4546336  T
Q  507 atctc 511  Q
    |||||    
T  4546337 atctc 4546341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 207 - 427
Target Start/End: Original strand, 26777880 - 26778100
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||    
T  26777880 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacg 26777979  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  ||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  26777980 gaggcatttgggctgtattgataggtgcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 26778079  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgc 427  Q
     ||||| |||||||| |||||    
T  26778080 attaccatacctcttcgatgc 26778100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 207 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 28207385 - 28207081
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||    
T  28207385 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 28207286  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  28207285 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 28207186  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtcc 506  Q
     ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || ||    
T  28207185 attaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgacc 28207086  T
Q  507 atctc 511  Q
    |||||    
T  28207085 atctc 28207081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 16674070 - 16673817
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| || || ||||    
T  16674070 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatggatatgacg 16673971  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  16673970 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 16673871  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
     ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  16673870 attaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 16673817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 246 - 451
Target Start/End: Original strand, 16944319 - 16944524
Alignment:
Q  246 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 345  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  16944319 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 16944418  T
Q  346 tggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 445  Q
    | ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  16944419 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 16944518  T
Q  446 tttctc 451  Q
    ||||||    
T  16944519 tttctc 16944524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 4773130 - 4772687
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| |||| ||||    
T  4773130 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 4773031  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctag----ct--tgttgctgctgttgttgttg------agctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgg 216  Q
    || |||||||| || |||||||    ||  || |||||||||||||||||      | | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||    
T  4773030 ataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgctgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgg 4772931  T
Q  217 gtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactg 316  Q
    | || ||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  ||    
T  4772930 gcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttg 4772831  T
Q  317 ggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtac 416  Q
     || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||     
T  4772830 agctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatat 4772731  T
Q  417 ctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
    ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  4772730 ctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 4772687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 207 - 428
Target Start/End: Original strand, 27360263 - 27360484
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||  ||| ||||| ||||    
T  27360263 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacg 27360362  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  27360363 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 27360462  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgca 428  Q
     ||||| || ||||| ||||||    
T  27360463 attaccatatctcttcgatgca 27360484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 207 - 428
Target Start/End: Original strand, 27450606 - 27450827
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||  ||| ||||| ||||    
T  27450606 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacg 27450705  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  27450706 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 27450805  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgca 428  Q
     ||||| || ||||| ||||||    
T  27450806 attaccatatctcttcgatgca 27450827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 207 - 499
Target Start/End: Original strand, 4724396 - 4724688
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||    
T  4724396 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 4724495  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  4724496 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 4724595  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 499  Q
     ||||| ||||| || |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  4724596 attaccataccttttcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccat 4724688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 499
Target Start/End: Original strand, 27629907 - 27630254
Alignment:
Q  152 ttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactga 251  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||| | |||| || | || || || || ||||| ||||||||||||||| | || ||||| | |||||| |||    
T  27629907 ttgttgctgttgttgttgctgaactggtggttgttgtggcttctgttgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattga 27630006  T
Q  252 tgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggatt 351  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||| ||| | | | | ||||| |  ||||||| ||| ||| |||||| |||||| ||||||||| | || |    
T  27630007 tggtaaaacggtgggaagaatggatgctgagaatatggtgtacaggggtatggtggaggtagctgagcaacattaacaggggcgacagtagccgtagact 27630106  T
Q  352 gaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 451  Q
    |||| ||||| |  |||||||| || || |||||||| |||||||| || || || || || |||||||| ||  || |||  || || ||| | |||||    
T  27630107 gacctgctcccgaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtggtggccattgccatacctcttcgacccacttgtagaagactcacccttctc 27630206  T
Q  452 gaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 499  Q
     |||||||| || || |||||||  || || |||||||||||||||||    
T  27630207 aaatacaatgataccctctctgacggcctcctctagacgagtccccat 27630254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 428
Target Start/End: Original strand, 26116672 - 26116893
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||    
T  26116672 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacgaatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 26116771  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || | ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  26116772 gaggcatttgagctgtattgataggagcaacggtagctatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 26116871  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgca 428  Q
     ||||| || ||||| ||||||    
T  26116872 attaccatatctcttcgatgca 26116893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 3696205 - 3696062
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| |||| ||||    
T  3696205 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 3696106  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
    || |||||||| || ||||| |  | ||||||||| ||||||||    
T  3696105 ataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttg 3696062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 163
Target Start/End: Original strand, 26777687 - 26777821
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  |||||||| ||||  |||    
T  26777687 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttcggcatacaacatcggt 26777786  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctg 163  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |||||||||    
T  26777787 ataggagggaaggttggtctagcatattgctgctg 26777821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Original strand, 34463397 - 34463561
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  34463397 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggctttccttgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagc 34463496  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || ||||| |  | ||||||||| ||||||||    
T  34463497 aactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttg 34463561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 139
Target Start/End: Original strand, 4545847 - 4545957
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || ||||| ||||| |||| ||||    
T  4545847 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggt 4545946  T
Q  129 atcggaggaaa 139  Q
    || ||||||||    
T  4545947 ataggaggaaa 4545957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 139
Target Start/End: Original strand, 4724206 - 4724316
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||| |||| ||||    
T  4724206 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggt 4724305  T
Q  129 atcggaggaaa 139  Q
    || ||||||||    
T  4724306 ataggaggaaa 4724316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 28207578 - 28207468
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||| |||| ||||    
T  28207578 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggt 28207479  T
Q  129 atcggaggaaa 139  Q
    || ||||||||    
T  28207478 ataggaggaaa 28207468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16674284 - 16674144
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  16674284 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 16674185  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtct 148  Q
    | ||| ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||    
T  16674184 agctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 16674144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 27007872 - 27007708
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  27007872 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 27007773  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
    |  || ||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||  |  |||||||| ||||||||    
T  27007772 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgttgttg 27007708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 172
Target Start/End: Original strand, 27360064 - 27360207
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||  |||    
T  27360064 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggt 27360163  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
    || |||||||| || |||||||  |  |||||||||||||||||    
T  27360164 ataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 27360207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 172
Target Start/End: Original strand, 27450407 - 27450550
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||  |||    
T  27450407 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggt 27450506  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
    || |||||||| || |||||||  |  |||||||||||||||||    
T  27450507 ataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttg 27450550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 27485253 - 27485132
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| |||| ||||    
T  27485253 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggt 27485154  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctag 150  Q
    || |||||||| || |||||||    
T  27485153 ataggaggaaaagttggtctag 27485132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 70
Target Start/End: Original strand, 26116482 - 26116523
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtct 70  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26116482 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtct 26116523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 21716 - 21208
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | |||    
T  21716 gatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacaggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgtcctttgagaagcaaagt 21617  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    |||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||    |||  |  ||| ||||||||||||||||    
T  21616 cgggagcagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgttgctgctgtta---agccagcagctgttgttgcatttgctga 21520  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| |||    
T  21519 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactggt 21420  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatg 400  Q
    ||| |||||||| ||| | |||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21419 acggcggaggtagctgagaagcattgatgggggcaacagtagccacggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctttcttcttatg 21320  T
Q  401 atgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 500  Q
    |||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||| ||| |||||||  || || ||||||    
T  21319 atgaccattaccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacctttctcaaacacaataattccgtctctgacagcctcttctaagcgggttcccatg 21220  T
Q  501 atgtccatctca 512  Q
     || ||||||||    
T  21219 gtgaccatctca 21208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 2759 - 3083
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2759 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagt 2858  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
     ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  2859 tgggagtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgctgatgctgttgttgttgagctggaggctgttgttgcatttgttga 2958  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2959 acgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcgtacgggt 3058  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  3059 acgacggaggtagctgagcagcatt 3083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 16283604 - 16283091
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||    
T  16283604 gatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctaaggagtaaagt 16283505  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg---agctggtggctattgttgcatttgc 197  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||   | | ||   || ||||| ||| ||     
T  16283504 cggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgt 16283405  T
Q  198 tgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacg 297  Q
    ||| | || ||||||| |||||||||||||||||| | ||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  16283404 tgagcaattgcattaatgggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatg 16283305  T
Q  298 ggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 397  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16283304 ggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttctt 16283205  T
Q  398 atgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtcccc 497  Q
     || || |||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||    
T  16283204 gtggtgtccgttaccatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaatacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttccc 16283105  T
Q  498 atgatgtccatctc 511  Q
    ||| || |||||||    
T  16283104 atggtgaccatctc 16283091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 44563256 - 44562932
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44563256 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagt 44563157  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    |||||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  44563156 cgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctga 44563057  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563056 acggcggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 44562957  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  44562956 acgacggaggtagctgagcagcatt 44562932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 512
Target Start/End: Original strand, 22080938 - 22081446
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  22080938 gatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggctttccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagt 22081037  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    |||||| | |||||| || | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||   |||    |||| ||| ||||||||||||    
T  22081038 cgggagcagctcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgctgctgctgttg---agccaacggctgttgctgcatttgctga 22081134  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||||||  | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| | |    
T  22081135 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 22081234  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatg 400  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22081235 acggcggaggtagctgagcagcattgatgggggcaacagtagccatggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctttcttcttatg 22081334  T
Q  401 atgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 500  Q
    |||||| || || ||| || ||||||||||||| |||||||||  ||| || || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  || || ||||||    
T  22081335 atgaccattgccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacatttttcaaacacaataatgccatctctgacagcctcttctaagcgggttcccatg 22081434  T
Q  501 atgtccatctca 512  Q
     || ||||||||    
T  22081435 gtgaccatctca 22081446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9354777 - 9354453
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9354777 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagt 9354678  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||     
T  9354677 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgg 9354578  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9354577 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 9354478  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  9354477 acgacggaggtagctgagcagcatt 9354453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 19659099 - 19659423
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19659099 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagt 19659198  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctga 200  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||| ||||     
T  19659199 cgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggttgttgttgcattcgctgg 19659298  T
Q  201 acgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19659299 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 19659398  T
Q  301 acgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  19659399 acgacggaggtagctgagcagcatt 19659423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 16277681 - 16277196
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  16277681 gaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 16277582  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  16277581 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 16277482  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  16277481 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcatt 16277382  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  16277381 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgat 16277282  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  16277281 gcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 16277196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Original strand, 2137347 - 2137832
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||  |||    
T  2137347 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 2137446  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  2137447 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 2137546  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  2137547 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgacggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcatt 2137646  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  2137647 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgat 2137746  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || | ||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  2137747 gcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattcattccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 2137832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 14557751 - 14557269
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| |||||||||| ||||    
T  14557751 gaaccttggaggcaacggatcaggcgagggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacattggt 14557652  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggtt 228  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |  |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||| ||||| |||||||    
T  14557651 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggtt 14557552  T
Q  229 gacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaat 328  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||| ||    
T  14557551 gacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgat 14557452  T
Q  329 aggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 428  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||    
T  14557451 aggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgca 14557352  T
Q  429 tttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    ||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  14557351 ttcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 14557269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 19688225 - 19687740
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||  |||    
T  19688225 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 19688126  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | |    || ||||| ||| || ||| | || |||||||||||||| ||||    
T  19688125 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccgacaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgag 19688026  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  19688025 gttgacccggtggcagagggtactggtgatagaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcatt 19687926  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  19687925 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgat 19687826  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||||    
T  19687825 gcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatctc 19687740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Original strand, 27608993 - 27609478
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||  |||    
T  27608993 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 27609092  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  27609093 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 27609192  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||   | |||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  27609193 gttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgacacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcatt 27609292  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  27609293 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgat 27609392  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||||    
T  27609393 gcattcacagaggattcggctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatctc 27609478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 18710734 - 18710228
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||||||||| |||||   |||||| ||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  18710734 atcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgagggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagc 18710635  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagc---ttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||   ||| |||||||| ||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||| | |    
T  18710634 aactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaa 18710535  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
      ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||    
T  18710534 ctgcattgacgggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatga 18710435  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  18710434 cggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgt 18710335  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgt 504  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| ||     
T  18710334 ccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtga 18710235  T
Q  505 ccatctc 511  Q
    |||||||    
T  18710234 ccatctc 18710228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 19674589 - 19674080
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  19674589 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 19674490  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaa 201  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||      ||| || |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||      
T  19674489 aactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttggg 19674390  T
Q  202 cgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 301  Q
    | || ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  19674389 caattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggta 19674290  T
Q  302 cgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 401  Q
     |||||||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||| |||    
T  19674289 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgactggctccagctgacaccatccccacgtccgtttctttcttcttgtga 19674190  T
Q  402 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 501  Q
    || || ||||| |||||||| || ||| | || || |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  19674189 tgtccattaccatacctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcgaacacaataattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 19674090  T
Q  502 tgtccatctc 511  Q
    || |||||||    
T  19674089 tgaccatctc 19674080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 31354672 - 31354250
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  31354672 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagc 31354573  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacga 204  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||  | |  ||||| |  || ||| |||    
T  31354572 aactcggcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgtacctgttgagcga 31354473  T
Q  205 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacga 304  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||    
T  31354472 tggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatga 31354373  T
Q  305 cggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    |||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  31354372 cggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtggccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgt 31354273  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgc 427  Q
    || ||||| |||||||| |||||    
T  31354272 ccattaccatacctcttcgatgc 31354250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 451
Target Start/End: Original strand, 31489838 - 31490263
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  31489838 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 31489937  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   ||  |||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  31489938 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgctgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgag 31490037  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  31490038 gttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 31490137  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||     
T  31490138 gataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgac 31490237  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctc 451  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||    
T  31490238 gcattcacagaggattcagctttctc 31490263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 19286610 - 19286158
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||     
T  19286610 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaaga 19286511  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatgg 207  Q
    | ||| ||||| ||||  ||||| |||||||| || |||||||  | ||||||||| || |||||| |||| || |  ||||| |  || ||| | ||||    
T  19286510 agctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcaatgg 19286411  T
Q  208 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgg 307  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| |||||    
T  19286410 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacgg 19286311  T
Q  308 aggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccg 407  Q
    ||| |  || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||     
T  19286310 aggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcca 19286211  T
Q  408 ttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
    ||||| |||||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || |||||    
T  19286210 ttaccatacctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaat 19286158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 33244820 - 33244649
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33244820 gatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttaggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagt 33244721  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg 172  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  33244720 cgggagtaattcaacatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 33244649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 428
Target Start/End: Original strand, 19208448 - 19208850
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  19208448 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 19208547  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  19208548 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 19208647  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  19208648 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 19208747  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||| |||| |||    
T  19208748 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacttcttcgat 19208847  T
Q  426 gca 428  Q
    |||    
T  19208848 gca 19208850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 460
Target Start/End: Original strand, 28362043 - 28362477
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  28362043 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 28362142  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  28362143 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 28362242  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  28362243 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 28362342  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||    
T  28362343 gatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgat 28362442  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
    ||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  28362443 gcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 28362477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 207 - 499
Target Start/End: Original strand, 3329788 - 3330080
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||    
T  3329788 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 3329887  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  3329888 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacgatagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 3329987  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 499  Q
     ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || |||||||| |||||    
T  3329988 attaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgagttcccat 3330080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 207 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 29829259 - 29828967
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||    
T  29829259 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 29829160  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  29829159 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 29829060  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 499  Q
     ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  29829059 attaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatctctgacggcttcctcaagacgggttcccat 29828967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 460
Target Start/End: Original strand, 19518412 - 19518665
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||    
T  19518412 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 19518511  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || |  ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  19518512 gaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 19518611  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
     ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  19518612 attaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 19518665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 33258850 - 33258425
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| ||||  |||    
T  33258850 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggt 33258751  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    || ||||| ||||| || || ||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  33258750 ataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 33258651  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  33258650 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 33258551  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||     
T  33258550 gataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgcccattaccatatctcttcgac 33258451  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctc 451  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||    
T  33258450 gcattcacagaggattcagctttctc 33258425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 511
Target Start/End: Original strand, 12093041 - 12093306
Alignment:
Q  246 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 345  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || ||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12093041 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcacttgagctgcattgataggagcaatagtagcca 12093140  T
Q  346 tggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 445  Q
    | ||||| |||||| |||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  12093141 tagattggccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 12093240  T
Q  446 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  12093241 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 12093306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 150
Target Start/End: Original strand, 3329595 - 3329716
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| |||| ||||    
T  3329595 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggt 3329694  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctag 150  Q
    || |||||||| || |||||||    
T  3329695 ataggaggaaaagttggtctag 3329716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 150
Target Start/End: Original strand, 12092812 - 12092933
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| |||| ||||    
T  12092812 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttccgcatacaacattggt 12092911  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctag 150  Q
    || |||||||| || |||||||    
T  12092912 ataggaggaaaagttggtctag 12092933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 29829450 - 29829390
Alignment:
Q  28 ggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 88  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  29829450 ggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctggtggtacaatgccctct 29829390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 29890 - 29405
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||  |||    
T  29890 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 29791  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttg---agctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||   | | ||   || ||||| ||| || ||| | || |||||||||||||| ||||    
T  29790 atcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagctattgcattaacgggtacttgag 29691  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  29690 gttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatacgggtacgatggaggcatttgggcagcatt 29591  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  29590 aataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttaccatacctctttgat 29491  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  29490 gcattcacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 29405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Original strand, 40198 - 40683
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||  |||    
T  40198 gaacctggggggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 40297  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||| | || ||||| |||||||||||||    
T  40298 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcatttacgggtacctgag 40397  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||| |  ||||| |||||    
T  40398 gttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacggcggaggcatttgggctgcatt 40497  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  40498 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttaccatacctctttgat 40597  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||||    
T  40598 gcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatctc 40683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Original strand, 47114 - 47599
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| ||||  |||    
T  47114 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggt 47213  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  47214 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 47313  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| || ||||| |  ||||| |||||    
T  47314 gttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgatggaggcatttgggctgcatt 47413  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  47414 gataagagcaacagtagccatgggttgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgat 47513  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||||    
T  47514 gcattcacggaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatctc 47599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 27419 - 26934
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||||||  |||    
T  27419 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggt 27320  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| ||||   || ||||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  27319 atcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgag 27220  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||    
T  27219 gttgacccggtggtagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcatt 27120  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  27119 gataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgat 27020  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  27019 gcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 26934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Original strand, 258 - 744
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcg-gcatataacaatgg 127  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||   ||||||||||  ||    
T  258 gaacttgggaggcaacggatccggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactaaagcatataacatcgg 357  T
Q  128 tatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctga 224  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||| | || |||||||||||||| |||    
T  358 tatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttga 457  T
Q  225 ggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcat 324  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  || || ||||    
T  458 ggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcat 557  T
Q  325 taataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttga 424  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||    
T  558 tgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagttgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcga 657  T
Q  425 tgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    ||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||||    
T  658 tgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatctc 744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 129 - 311
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  129 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctggaaggcaacggatcaggtggaggcttgccatgtctggttgagcagtgccctctgagaagtagagt 228  T
Q  101 cgggagtaactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggct 183  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  229 cgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgctgttgagctggtggct 311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 428
Target Start/End: Original strand, 7368 - 7770
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  7368 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 7467  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | || | || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  7468 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 7567  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  7568 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 7667  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||    
T  7668 gataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctcttcgat 7767  T
Q  426 gca 428  Q
    |||    
T  7768 gca 7770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 511
Target Start/End: Original strand, 15059 - 15544
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||| |||| ||||    
T  15059 gaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggt 15158  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    || |||||||| |||||||||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  15159 ataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 15258  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  15259 gctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 15358  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgat 425  Q
     || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  15359 gatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgat 15458  T
Q  426 gcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    ||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  15459 gcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 15544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 202 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 8183 - 7874
Alignment:
Q  202 cgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 301  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| || | ||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  8183 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 8084  T
Q  302 cgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 401  Q
     |||||||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  8083 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 7984  T
Q  402 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 501  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  7983 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 7884  T
Q  502 tgtccatctc 511  Q
    || |||||||    
T  7883 tgaccatctc 7874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9714 - 9542
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 107  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  9714 atcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 9615  T
Q  108 aactcggcatataacaatggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtg 180  Q
    |  || ||||| ||||  ||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||| || |||||| ||||||    
T  9614 agttctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggtg 9542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 511
Target Start/End: Original strand, 26338 - 26816
Alignment:
Q  36 ggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggtatcggag 135  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  26338 ggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggag 26437  T
Q  136 gaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacc 232  Q
    |||| ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| | | || ||  | || ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  26438 gaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcctctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcc 26537  T
Q  233 cgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggg 332  Q
    ||  || |  || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || ||||| |||||     
T  26538 cggcggcaacgggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatagga 26637  T
Q  333 gcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttg 432  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || ||||||     
T  26638 gcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattta 26737  T
Q  433 cggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 511  Q
    | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  26738 cagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 26816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 424
Target Start/End: Original strand, 9195 - 9593
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  9195 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 9294  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgct---gctgttgttgttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |   | |||||||||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  9295 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 9394  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  9395 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 9494  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttga 424  Q
     ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  9495 gataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctctttga 9593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20142 - 19807
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||||||  |||    
T  20142 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggt 20043  T
Q  129 atcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgtt---gttgagctggtggctattgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgag 225  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |  |||||||   ||||| | ||   || ||||| ||| || ||  | || ||||| ||||| || ||||    
T  20042 atcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgag 19943  T
Q  226 gttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 325  Q
    | || ||||  || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||||| |  || || |||||    
T  19942 gctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcatt 19843  T
Q  326 aataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 361  Q
     ||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  19842 gataggagcgacggtagccatggattgaccggctcc 19807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 2018 - 2103
Alignment:
Q  1 gatggacatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 86  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2018 gatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 207 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 5936 - 5682
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaat-ggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgac 305  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| |||    
T  5936 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgac 5837  T
Q  306 ggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatg-gattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatga 404  Q
    ||||| |  || |  ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  5836 ggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccatttgattgaccggctccagctgacaccatccc-acttccgtttctttcttcttgtggtgt 5738  T
Q  405 ccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 460  Q
    || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  5737 ccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 5682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 6160 - 6080
Alignment:
Q  8 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 88  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  6160 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctct 6080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 207 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 7883 - 7579
Alignment:
Q  207 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 306  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||    
T  7883 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 7784  T
Q  307 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccagcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 406  Q
    |||| |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  7783 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 7684  T
Q  407 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtcc 506  Q
     ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || ||    
T  7683 attaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgacc 7584  T
Q  507 atctc 511  Q
    |||||    
T  7583 atctc 7579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 8076 - 7966
Alignment:
Q  29 gaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatataacaatggt 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||| |||| ||||    
T  8076 gaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggt 7977  T
Q  129 atcggaggaaa 139  Q
    || ||||||||    
T  7976 ataggaggaaa 7966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 317 - 511
Target Start/End: Original strand, 48568 - 48769
Alignment:
Q  317 ggcagcattaataggggcaacag-tagccatggattga--ccggctccagca-gataccatccc-tacttctgtttctttcttcttatgatgacc-gtta 410  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||   |||||||| ||| || |||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  48568 ggcagcattgataggagcaacaggtagccatggattggacccggctccggcaagacaccatcccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcccgtta 48667  T
Q  411 ccgtacctcttt-gatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 509  Q
    || ||||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  48668 ccatacctcttttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 48767  T
Q  510 tc 511  Q
    ||    
T  48768 tc 48769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 364
Target Start/End: Original strand, 82 - 200
Alignment:
Q  246 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 345  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| || || |||||||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  82 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 181  T
Q  346 tggattgaccggctccagc 364  Q
    | |||||||||||||||||    
T  182 ttgattgaccggctccagc 200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University