View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8181_low_13 (Length: 267)

Name: NF8181_low_13
Description: NF8181
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8181_low_13
NF8181_low_13
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (1-257)||(113727-113983)
scaffold0029 (21-152)||(108713-108844)
scaffold0029 (165-253)||(95048-95136)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (1-257)||(19880299-19880555)
chr6 (1-246)||(34644610-34644855)
chr6 (1-257)||(18795691-18795947)
chr6 (18-257)||(21563173-21563412)
chr6 (18-257)||(21569032-21569271)
chr6 (1-256)||(19454422-19454677)
chr6 (1-257)||(15460337-15460593)
chr6 (3-247)||(5296232-5296476)
chr6 (1-239)||(8761957-8762195)
chr6 (18-241)||(21472618-21472841)
chr6 (1-241)||(14378941-14379181)
chr6 (1-241)||(14380491-14380731)
chr6 (18-256)||(15897096-15897334)
chr6 (1-244)||(10467873-10468116)
chr6 (18-244)||(22434883-22435109)
chr6 (18-244)||(22443281-22443507)
chr6 (21-245)||(27188449-27188673)
chr6 (21-245)||(27260567-27260791)
chr6 (18-256)||(22761496-22761734)
chr6 (19-256)||(20636343-20636580)
chr6 (1-241)||(24365429-24365669)
chr6 (21-152)||(16926684-16926815)
chr6 (18-241)||(19488313-19488536)
chr6 (5-241)||(19436019-19436255)
chr6 (18-154)||(23079573-23079709)
chr6 (18-118)||(29590961-29591061)
chr6 (21-152)||(16962489-16962620)
chr6 (18-152)||(16625758-16625892)
chr6 (3-152)||(25113658-25113807)
chr6 (21-257)||(5838263-5838499)
chr6 (21-151)||(28281857-28281987)
chr6 (16-169)||(19865776-19865929)
chr6 (21-257)||(1542128-1542364)
chr6 (24-171)||(25608908-25609055)
chr6 (21-152)||(28262241-28262372)
chr6 (21-152)||(28340990-28341121)
chr6 (19-188)||(27564863-27565032)
chr6 (18-118)||(2873844-2873944)
chr6 (24-154)||(18406991-18407121)
chr6 (18-105)||(18196774-18196861)
chr6 (99-241)||(25769208-25769350)
chr6 (21-118)||(18449650-18449747)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (1-257)||(6567-6823)
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (1-257)||(19613802-19614058)
chr7 (16-257)||(11387309-11387550)
chr7 (18-257)||(14263127-14263366)
chr7 (18-257)||(19148338-19148577)
chr7 (18-257)||(20747737-20747976)
chr7 (3-257)||(15101471-15101725)
chr7 (18-243)||(16071178-16071403)
chr7 (1-241)||(13022500-13022740)
chr7 (18-256)||(12205683-12205921)
chr7 (6-241)||(16949343-16949578)
chr7 (1-241)||(11305129-11305369)
chr7 (1-241)||(26117471-26117711)
chr7 (3-241)||(274-513)
chr7 (1-256)||(13666665-13666920)
chr7 (1-241)||(12457783-12458023)
chr7 (1-244)||(14285242-14285485)
chr7 (18-152)||(14955785-14955919)
chr7 (24-256)||(320948-321180)
chr7 (1-241)||(49153444-49153684)
chr7 (29-188)||(15147801-15147960)
chr7 (18-152)||(8708836-8708970)
chr7 (18-188)||(11771146-11771316)
chr7 (18-152)||(18550663-18550797)
chr7 (18-152)||(44790256-44790390)
chr7 (18-188)||(10872190-10872360)
chr7 (18-244)||(14333535-14333761)
chr7 (1-151)||(23504736-23504886)
chr7 (18-118)||(8199893-8199993)
chr7 (18-234)||(11236118-11236334)
chr7 (18-118)||(15159962-15160062)
chr7 (19-118)||(18179007-18179106)
chr7 (18-184)||(16223-16389)
chr7 (1-151)||(18052819-18052969)
chr7 (19-152)||(23202519-23202652)
chr7 (19-152)||(23508646-23508779)
chr7 (18-118)||(13687329-13687429)
chr7 (1-241)||(13967534-13967774)
chr7 (19-151)||(15204851-15204983)
chr7 (142-241)||(12456845-12456944)
chr7 (18-152)||(12688731-12688866)
chr7 (24-242)||(15341573-15341791)
chr7 (3-188)||(9597252-9597437)
chr7 (19-118)||(11552008-11552107)
chr7 (19-171)||(14212886-14213038)
chr7 (18-157)||(14040921-14041060)
chr7 (18-157)||(14350951-14351090)
chr7 (39-193)||(15625744-15625898)
chr7 (45-109)||(40078-40142)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (1-257)||(32559-32815)
scaffold0076 (1-241)||(55782-56022)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (1-257)||(49396-49652)
scaffold0028 (21-257)||(44319-44555)
scaffold0028 (19-118)||(9781-9880)
scaffold0028 (19-86)||(16275-16342)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (1-257)||(21679839-21680095)
chr5 (1-256)||(22463003-22463258)
chr5 (1-256)||(20822505-20822760)
chr5 (3-241)||(24619358-24619596)
chr5 (3-241)||(24715589-24715827)
chr5 (3-241)||(24748617-24748855)
chr5 (1-256)||(28894003-28894258)
chr5 (1-256)||(28915474-28915729)
chr5 (1-256)||(28922829-28923084)
chr5 (1-247)||(23079150-23079396)
chr5 (31-256)||(20774811-20775036)
chr5 (1-241)||(14886052-14886292)
chr5 (1-256)||(22234981-22235236)
chr5 (1-241)||(24797458-24797698)
chr5 (1-205)||(28930742-28930946)
chr5 (18-244)||(21563051-21563277)
chr5 (114-257)||(21889933-21890076)
chr5 (18-154)||(23472400-23472536)
chr5 (1-241)||(37542442-37542682)
chr5 (18-244)||(27667568-27667794)
chr5 (18-118)||(16357710-16357810)
chr5 (1-241)||(25849142-25849382)
chr5 (18-118)||(27519614-27519714)
chr5 (18-118)||(34567702-34567802)
chr5 (18-118)||(40709988-40710088)
chr5 (3-241)||(22503746-22503984)
chr5 (19-245)||(23574810-23575036)
chr5 (21-118)||(41772050-41772147)
chr5 (18-118)||(27611562-27611662)
chr5 (21-152)||(19771134-19771265)
chr5 (18-257)||(23441279-23441518)
chr5 (18-116)||(21872128-21872226)
chr5 (18-116)||(21876408-21876506)
chr5 (18-244)||(22331965-22332191)
chr5 (24-154)||(25427605-25427735)
chr5 (18-118)||(14998817-14998917)
chr5 (1-241)||(20343349-20343589)
chr5 (18-118)||(22135876-22135976)
chr5 (18-118)||(27684478-27684578)
chr5 (18-118)||(29475151-29475251)
chr5 (18-205)||(26737805-26737992)
chr5 (22-100)||(21497150-21497228)
chr5 (18-152)||(37290574-37290708)
chr5 (19-257)||(21882018-21882256)
chr5 (18-79)||(20467176-20467237)
chr5 (57-226)||(21830878-21831047)
chr5 (19-171)||(18776951-18777103)
chr5 (27-118)||(21338384-21338475)
chr5 (25-151)||(17268419-17268545)
chr5 (21-234)||(21408230-21408443)
chr5 (24-74)||(873-923)
[»] chr3 (50 HSPs)
chr3 (1-257)||(13971227-13971483)
chr3 (1-257)||(14087439-14087695)
chr3 (1-257)||(10419152-10419408)
chr3 (3-256)||(12359636-12359889)
chr3 (1-233)||(17187164-17187396)
chr3 (21-257)||(14574689-14574925)
chr3 (3-257)||(17493396-17493650)
chr3 (1-244)||(31694293-31694536)
chr3 (1-244)||(31939682-31939925)
chr3 (1-241)||(47124726-47124966)
chr3 (18-257)||(16827327-16827566)
chr3 (1-256)||(13319609-13319864)
chr3 (1-250)||(16337619-16337868)
chr3 (18-256)||(15228416-15228654)
chr3 (18-256)||(15234284-15234522)
chr3 (24-257)||(16835640-16835873)
chr3 (1-241)||(11960276-11960516)
chr3 (21-188)||(15347383-15347550)
chr3 (24-257)||(14580083-14580316)
chr3 (3-127)||(12179234-12179358)
chr3 (1-241)||(18133453-18133693)
chr3 (19-154)||(16491317-16491452)
chr3 (18-244)||(5424065-5424291)
chr3 (21-118)||(6601631-6601728)
chr3 (18-118)||(15588527-15588627)
chr3 (1-241)||(16328767-16329007)
chr3 (18-118)||(16636668-16636768)
chr3 (18-118)||(20061189-20061289)
chr3 (18-118)||(43163992-43164092)
chr3 (18-118)||(48426342-48426442)
chr3 (21-188)||(53384156-53384323)
chr3 (24-170)||(17490693-17490839)
chr3 (1-151)||(44778119-44778269)
chr3 (18-118)||(10006495-10006595)
chr3 (18-118)||(10907105-10907205)
chr3 (112-244)||(11302991-11303123)
chr3 (18-118)||(13253585-13253685)
chr3 (18-154)||(15260489-15260625)
chr3 (18-244)||(15401652-15401878)
chr3 (1-151)||(41178394-41178544)
chr3 (18-244)||(15340038-15340264)
chr3 (19-188)||(14125730-14125899)
chr3 (18-118)||(15724069-15724169)
chr3 (16-152)||(12499109-12499245)
chr3 (19-254)||(14875635-14875870)
chr3 (1-151)||(13942896-13943046)
chr3 (18-151)||(16693026-16693159)
chr3 (19-118)||(16411418-16411517)
chr3 (55-118)||(16755757-16755820)
chr3 (19-188)||(16806083-16806252)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (1-257)||(24179-24435)
scaffold0090 (1-257)||(20017-20273)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (16-257)||(20060918-20061159)
chr1 (1-256)||(19855458-19855713)
chr1 (1-244)||(19662088-19662331)
chr1 (3-244)||(23197199-23197440)
chr1 (1-256)||(20855711-20855966)
chr1 (1-256)||(20939014-20939269)
chr1 (1-246)||(20834851-20835096)
chr1 (3-241)||(24098556-24098794)
chr1 (1-241)||(31538948-31539188)
chr1 (18-232)||(16373707-16373921)
chr1 (27-256)||(21750093-21750322)
chr1 (1-205)||(21952113-21952317)
chr1 (19-154)||(431085-431220)
chr1 (18-125)||(21744520-21744627)
chr1 (18-244)||(51332461-51332687)
chr1 (24-188)||(41352636-41352800)
chr1 (3-241)||(20295580-20295818)
chr1 (18-118)||(16349564-16349664)
chr1 (21-188)||(33390000-33390167)
chr1 (18-118)||(21838241-21838341)
chr1 (18-154)||(22110277-22110413)
chr1 (18-154)||(22114126-22114262)
chr1 (18-152)||(19107625-19107759)
chr1 (18-244)||(21831468-21831694)
chr1 (24-188)||(16077630-16077794)
chr1 (18-244)||(19759841-19760067)
chr1 (18-188)||(21025394-21025564)
chr1 (19-171)||(21234700-21234852)
chr1 (19-256)||(22361213-22361450)
chr1 (18-97)||(24793585-24793664)
chr1 (18-94)||(17043983-17044059)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (19-257)||(23099455-23099693)
chr2 (1-257)||(27209591-27209847)
chr2 (1-241)||(23277560-23277800)
chr2 (1-244)||(24949371-24949614)
chr2 (18-244)||(23111517-23111743)
chr2 (1-241)||(1064535-1064775)
chr2 (3-241)||(20829043-20829281)
chr2 (1-233)||(31831450-31831682)
chr2 (1-241)||(23294719-23294959)
chr2 (1-241)||(19651469-19651709)
chr2 (18-256)||(24710803-24711041)
chr2 (18-118)||(16923796-16923896)
chr2 (18-118)||(16926267-16926367)
chr2 (18-118)||(16983059-16983159)
chr2 (18-118)||(16999907-17000007)
chr2 (18-118)||(17064624-17064724)
chr2 (18-118)||(22324292-22324392)
chr2 (18-118)||(27218923-27219023)
chr2 (25-188)||(24676326-24676489)
chr2 (24-154)||(23067262-23067391)
chr2 (18-152)||(27372142-27372276)
chr2 (18-118)||(44385005-44385105)
chr2 (19-154)||(23107167-23107302)
chr2 (1-151)||(12575227-12575377)
chr2 (19-152)||(21144478-21144611)
chr2 (18-118)||(10869757-10869857)
chr2 (18-118)||(41607821-41607921)
chr2 (1-151)||(27788615-27788764)
chr2 (19-118)||(24876186-24876285)
chr2 (18-116)||(24263279-24263377)
chr2 (21-256)||(45533113-45533349)
chr2 (27-152)||(21324711-21324836)
chr2 (16-188)||(24706916-24707088)
chr2 (216-257)||(27364713-27364754)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (24-257)||(1051-1284)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (1-255)||(68540-68794)
scaffold0034 (1-246)||(3835-4080)
scaffold0034 (1-257)||(12790-13039)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (1-257)||(2212-2468)
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (18-257)||(20984886-20985125)
chr8 (18-257)||(21841620-21841859)
chr8 (18-241)||(19852630-19852853)
chr8 (18-241)||(19858666-19858889)
chr8 (21-257)||(23656130-23656366)
chr8 (16-241)||(22372150-22372375)
chr8 (1-256)||(20974978-20975228)
chr8 (1-241)||(14566361-14566601)
chr8 (18-232)||(20395471-20395685)
chr8 (3-241)||(31415795-31416036)
chr8 (19-257)||(19979170-19979408)
chr8 (16-241)||(22376791-22377016)
chr8 (16-241)||(22382966-22383191)
chr8 (1-241)||(29302748-29302988)
chr8 (18-241)||(20009260-20009482)
chr8 (3-241)||(6604877-6605115)
chr8 (24-205)||(21324614-21324794)
chr8 (18-242)||(20389317-20389541)
chr8 (25-124)||(21921082-21921181)
chr8 (24-241)||(6680330-6680547)
chr8 (24-188)||(19483409-19483573)
chr8 (24-188)||(23651313-23651477)
chr8 (19-154)||(21252250-21252385)
chr8 (1-241)||(16270546-16270786)
chr8 (18-152)||(17673362-17673496)
chr8 (18-244)||(20017602-20017828)
chr8 (19-257)||(21165878-21166116)
chr8 (18-232)||(23886252-23886466)
chr8 (1-151)||(31570164-31570314)
chr8 (18-118)||(19114032-19114132)
chr8 (18-106)||(22247772-22247860)
chr8 (70-241)||(803064-803235)
chr8 (19-154)||(21393205-21393340)
chr8 (19-154)||(21787699-21787834)
chr8 (18-188)||(22041131-22041301)
chr8 (19-152)||(21043753-21043886)
chr8 (1-241)||(12305977-12306217)
chr8 (18-118)||(18857919-18858019)
chr8 (19-171)||(30312484-30312636)
chr8 (24-154)||(1267544-1267674)
chr8 (24-257)||(22052066-22052299)
chr8 (3-72)||(27355924-27355993)
chr8 (19-154)||(15534689-15534824)
chr8 (18-171)||(32601433-32601586)
chr8 (1-109)||(19869044-19869152)
chr8 (129-257)||(16407495-16407623)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (1-257)||(434-690)
scaffold0120 (19-244)||(13239-13464)
scaffold0120 (19-154)||(7291-7426)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (18-244)||(10974-11200)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (1-255)||(27901525-27901779)
chr4 (18-257)||(15002260-15002499)
chr4 (3-244)||(15358001-15358242)
chr4 (18-254)||(15413922-15414158)
chr4 (1-241)||(29452416-29452656)
chr4 (6-241)||(33224076-33224311)
chr4 (1-241)||(3263673-3263913)
chr4 (21-257)||(15247061-15247297)
chr4 (18-213)||(15320317-15320512)
chr4 (1-232)||(16148873-16149104)
chr4 (1-232)||(16153019-16153250)
chr4 (111-244)||(15078785-15078918)
chr4 (18-226)||(8707088-8707296)
chr4 (1-241)||(11206110-11206350)
chr4 (16-188)||(16354079-16354251)
chr4 (18-241)||(14695266-14695489)
chr4 (16-151)||(15071602-15071737)
chr4 (18-169)||(15146521-15146672)
chr4 (18-118)||(8387688-8387788)
chr4 (18-118)||(12477876-12477976)
chr4 (18-118)||(18298481-18298581)
chr4 (18-118)||(19777429-19777529)
chr4 (18-118)||(29038040-29038140)
chr4 (1-256)||(1648156-1648411)
chr4 (21-188)||(23956953-23957120)
chr4 (18-244)||(8052259-8052485)
chr4 (19-154)||(14160710-14160845)
chr4 (21-152)||(27712578-27712709)
chr4 (1-151)||(51605671-51605821)
chr4 (19-152)||(12524918-12525051)
chr4 (27-152)||(14850011-14850136)
chr4 (18-94)||(14681867-14681943)
chr4 (1-205)||(20892171-20892375)
chr4 (19-152)||(40474282-40474415)
chr4 (18-234)||(14302614-14302830)
chr4 (1-241)||(44660745-44660985)
chr4 (18-205)||(18226082-18226269)
chr4 (3-154)||(18614445-18614596)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (18-257)||(5598-5837)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (1-256)||(115-370)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (18-257)||(29225-29464)
scaffold0026 (24-154)||(30216-30346)
scaffold0026 (18-67)||(50168-50217)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (1-247)||(323882-324128)
scaffold0004 (18-226)||(202367-202575)
scaffold0004 (18-174)||(118477-118633)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (1-257)||(1736-1992)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (18-241)||(27708-27931)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (18-257)||(47933-48172)
scaffold0053 (1-256)||(56729-56984)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (3-244)||(24760-25001)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (1-257)||(28385-28641)
scaffold0139 (1-257)||(34638-34894)
scaffold0139 (56-133)||(95-172)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (21-257)||(48272-48508)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (18-257)||(4944-5183)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (3-246)||(13379-13622)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (21-244)||(40879-41102)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (1-244)||(46281-46524)
scaffold0010 (1-241)||(41215-41455)
scaffold0010 (25-241)||(3098-3314)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (18-257)||(89344-89583)
scaffold0001 (18-257)||(90022-90261)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (18-247)||(15290-15519)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (21-257)||(5918-6154)
[»] scaffold2112 (1 HSPs)
scaffold2112 (18-257)||(146-385)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (18-257)||(50774-51013)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (3-241)||(43967-44205)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (1-246)||(149749-149993)
scaffold0011 (1-256)||(194586-194841)
scaffold0011 (25-154)||(25439-25568)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (21-257)||(1037-1273)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (1-244)||(182-425)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (18-234)||(5988-6206)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (3-241)||(10941-11179)
scaffold0298 (3-241)||(14711-14949)
scaffold0298 (3-257)||(21151-21405)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (3-241)||(249797-250035)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (3-244)||(2769-3010)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (1-241)||(42101-42341)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (3-242)||(6122-6361)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (3-257)||(32579-32833)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (1-256)||(2237-2492)
scaffold0222 (1-241)||(8244-8484)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (6-241)||(20578-20813)
scaffold0104 (6-241)||(23398-23633)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (21-255)||(3346-3580)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (18-244)||(872-1098)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (3-257)||(27793-28046)
scaffold0067 (24-256)||(51085-51317)
scaffold0067 (24-256)||(60119-60351)
scaffold0067 (24-256)||(66507-66739)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (3-244)||(2369-2610)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (73-257)||(16448-16632)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (1-257)||(570-824)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (53-257)||(6264-6468)
scaffold0149 (53-257)||(10695-10899)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-241)||(100444-100684)
scaffold0020 (69-188)||(181436-181555)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (18-256)||(9707-9945)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (39-256)||(11902-12119)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (1-256)||(13181-13436)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (58-244)||(1-187)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (18-256)||(16876-17114)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (18-234)||(18114-18330)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (1-241)||(10339-10579)
scaffold0235 (1-241)||(20553-20793)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (24-256)||(20289-20521)
scaffold0058 (21-74)||(58093-58146)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (3-244)||(3932-4171)
scaffold0035 (24-211)||(43012-43199)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (24-233)||(516-725)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (24-241)||(4357-4574)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (16-257)||(79391-79632)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (18-241)||(218316-218539)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (18-256)||(177161-177399)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (16-241)||(15379-15604)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (3-196)||(108859-109052)
scaffold0031 (18-169)||(62930-63081)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (18-234)||(3171-3387)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (1-241)||(7027-7267)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (21-257)||(18517-18753)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (1-205)||(12409-12613)
scaffold0180 (18-154)||(31652-31788)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (18-234)||(30184-30400)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (3-238)||(32203-32438)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (3-116)||(35422-35535)
scaffold0156 (123-257)||(28393-28527)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (24-241)||(45701-45918)
scaffold0114 (19-118)||(19241-19340)
scaffold0114 (24-174)||(21138-21288)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (45-254)||(39685-39894)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (18-154)||(16925-17061)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (18-154)||(16148-16284)
scaffold0040 (27-154)||(112396-112523)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (18-241)||(13652-13875)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (18-241)||(10621-10844)
scaffold0089 (1-241)||(15595-15835)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (18-154)||(10240-10376)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (27-154)||(7561-7688)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (18-257)||(7182-7421)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (18-169)||(29470-29621)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (18-241)||(23084-23307)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (18-152)||(8670-8804)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (18-188)||(102470-102640)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (36-241)||(5215-5420)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (16-205)||(5091-5280)
scaffold0270 (16-205)||(12221-12410)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (24-241)||(5241-5458)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (25-188)||(3431-3594)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (19-154)||(7643-7778)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (19-118)||(7356-7455)
scaffold0358 (44-130)||(3534-3620)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (19-154)||(14111-14246)
[»] scaffold0319 (2 HSPs)
scaffold0319 (19-154)||(37-172)
scaffold0319 (19-154)||(2540-2675)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (19-154)||(25845-25979)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (16-151)||(277727-277862)
scaffold0005 (24-242)||(261491-261709)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (19-169)||(50688-50838)
scaffold0081 (19-244)||(19783-20008)
scaffold0081 (19-244)||(35207-35432)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (3-208)||(28150-28355)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (19-154)||(7231-7366)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (18-169)||(26230-26381)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (18-244)||(2089-2315)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (18-244)||(8120-8346)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (18-226)||(23978-24179)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (19-257)||(4253-4491)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (19-152)||(8639-8772)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (27-188)||(7995-8156)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (24-153)||(38853-38982)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (24-257)||(80737-80970)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (18-154)||(966-1102)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (3-151)||(14184-14331)
scaffold0261 (3-151)||(22363-22510)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (18-154)||(4383-4519)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (1-241)||(142-386)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (19-118)||(2200-2299)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (18-169)||(24723-24874)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (18-241)||(9915-10138)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (24-257)||(6381-6614)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (19-188)||(1655-1824)
scaffold0044 (19-188)||(15395-15564)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (21-241)||(85421-85641)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (18-241)||(6790-7013)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (19-106)||(32473-32560)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (1-151)||(96438-96588)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (19-152)||(38720-38853)
scaffold0042 (19-85)||(66745-66811)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (27-94)||(12900-12967)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (19-118)||(28268-28367)
scaffold0023 (18-154)||(3355-3491)
scaffold0023 (54-154)||(131377-131477)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (24-154)||(39828-39958)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (44-154)||(6492-6602)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (19-85)||(18967-19033)
scaffold0017 (18-94)||(196377-196453)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (1-85)||(1716-1800)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (18-94)||(23972-24048)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (24-151)||(11691-11818)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (18-193)||(115804-115979)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (18-88)||(13980-14050)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (21-79)||(343-401)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (21-146)||(16466-16591)


Alignment Details
Target: scaffold0029 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 113983 - 113727
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  113983 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaacgccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttaca 113884  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  113883 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagccttgtttgtgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggcatg 113784  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  113783 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 113727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 152
Target Start/End: Original strand, 108713 - 108844
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  108713 aaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtctgctatgatggtca 108812  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
      || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  108813 gagagttcgagttacttgaacagttcagagat 108844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 253
Target Start/End: Original strand, 95048 - 95136
Alignment:
Q  165 tgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttga 253  Q
    |||||||||| | | || ||||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  95048 tgtgaattgtcatcgcaaagtgtacagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagcatcagagaagcacaacaagttga 95136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19880555 - 19880299
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  19880555 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaacgtagttgcagatgctttgagtagaaagacgttgca 19880456  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19880455 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggcatg 19880356  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19880355 ttgaaaatcaataatgaattcttgagtagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 19880299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 34644610 - 34644855
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34644610 ggagatggctagagttattgaaggattatgagtttgggttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 34644709  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  34644710 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagccttgtttgcgagttgtcaccccagagtgtgcagttgggtatg 34644809  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaac 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  34644810 ttgaaaatcaatagtgaattcttggatagtattagagaagcgcaac 34644855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18795947 - 18795691
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18795947 ggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttaca 18795848  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||||||  | ||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  18795847 catgtcggctttaatggtaaaggaatttgagttgcttgaatagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagttgggtatg 18795748  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18795747 ttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 18795691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Original strand, 21563173 - 21563412
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21563173 ttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatgg 21563272  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  21563273 taaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtga 21563372  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21563373 tttcttgaaaagtatcagagaagcgcaacaagttgatgtc 21563412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Original strand, 21569032 - 21569271
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21569032 ttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatgg 21569131  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  21569132 taaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtga 21569231  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21569232 tttcttgaaaagtatcagagaagcgcaacaagttgatgtc 21569271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19454677 - 19454422
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || ||    
T  19454677 ggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacattgca 19454578  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||    
T  19454577 tatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcaatttagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtgcagttggggatg 19454478  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
     |||| || || | ||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  19454477 ctgaagattaacagtgatttcttgaataatatcagagaagcacaacaagtggatgt 19454422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15460593 - 15460337
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  15460593 ggagatggctagaattattaaaggattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgca 15460494  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| || || || || |||||||||| | | || |||||||| ||||| |||    
T  15460493 catgtcggccttgatggtaaaggagttcgaattgcttgaacagtttagagacttgagtctagtgtgtgaattgtcatcgcaaagtgtgcatttgggtatg 15460394  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  15460393 ctgaagatcaatagtgatttcttgagtagtatccgagaagcacaacgagttgatgtc 15460337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 247
Target Start/End: Original strand, 5296232 - 5296476
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  5296232 agatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgttgatgcgttgagcaggaagacgttgcaca 5296331  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||| |||||| | || ||||| ||| |    
T  5296332 tgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagccttgtttgtgagttatcacctcagagtatacaattggggatgct 5296431  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 247  Q
    || ||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5296432 gagaattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcgcaaca 5296476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 8761957 - 8762195
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | ||    
T  8761957 ggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgctgca 8762056  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  | |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||    
T  8762057 tatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggggatg 8762156  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaa 239  Q
     ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  8762157 ctgaaaattaatagtgatttcctgaatagtatccgagaa 8762195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21472841 - 21472618
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  21472841 ttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 21472742  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || || |||||||| || || || |||||||| || || |||||||| || |||  ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  21472741 taaaagagtttgagttccttgaacaatttagagacttgagtcttgtttgcgagttgccacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtga 21472642  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     |||||||| ||||| || |||||    
T  21472641 tttcttgaacagtattagggaagc 21472618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 14378941 - 14379181
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| | ||    
T  14378941 ggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgctgca 14379040  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||| | |||||||| ||||| || || || ||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| || ||||| |||    
T  14379041 tatgtctgccttaatggtgaaagaattcgatttgctagagtagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattggggatg 14379140  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     | || || |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14379141 ctaaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagc 14379181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 14380491 - 14380731
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| | ||    
T  14380491 ggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgctgca 14380590  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||| | |||||||| ||||| || || || ||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| || ||||| |||    
T  14380591 tatgtctgccttaatggtgaaagaattcgatttgctagagtagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattggggatg 14380690  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     | || || |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14380691 ctaaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagc 14380731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15897334 - 15897096
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || ||||||     
T  15897334 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgcgatgatga 15897235  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || ||||||||||| || || |||||||||||||| ||| | || |||||| ||| ||| ||||||||| |||| || ||| |||| ||  ||| |||    
T  15897234 tcaaagaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtga 15897135  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||    
T  15897134 attcttgaacagtattaaagaagcacaaaaagttgatgt 15897096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 10467873 - 10468116
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||    
T  10467873 ggagatggttagagttactgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcagaaaaacattgca 10467972  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  ||||| | || ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| || ||||||| ||| |||||| | |||||||| |||    
T  10467973 tatgtctgctttgatgataaaagaatttgagttgctggagcaatttagagacttgagtcttgtctgagaattgtcacctcagagtatacagttggggatg 10468072  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
     |||| ||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10468073 ctgaagattgatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 10468116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22435109 - 22434883
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  22435109 ttgaaagattatgactttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatag 22435010  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | |  || || ||||| || || |||||||||||||| ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  22435009 ttagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtga 22434910  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    |||  |||| ||||||| |||||||||    
T  22434909 atttctgaagagtatcaaagaagcaca 22434883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22443507 - 22443281
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  22443507 ttgaaagattatgactttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatag 22443408  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | |  || || ||||| || || |||||||||||||| ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  22443407 ttagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 22443308  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    |||  |||| ||||||| |||||||||    
T  22443307 atttctgaagagtatcaaagaagcaca 22443281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27188673 - 27188449
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  27188673 aaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatggtca 27188574  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 220  Q
      || |||||| |||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| ||||||    
T  27188573 gagagtttgagctacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaatt 27188474  T
Q  221 cttgaatagtatcagagaagcacaa 245  Q
      |||| || |||| ||||||||||    
T  27188473 tctgaaaagcatcaaagaagcacaa 27188449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 27260567 - 27260791
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  27260567 aaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatggtca 27260666  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 220  Q
      || |||||| |||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| ||||||    
T  27260667 gagagtttgagctacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaatt 27260766  T
Q  221 cttgaatagtatcagagaagcacaa 245  Q
      |||| || |||| ||||||||||    
T  27260767 tctgaaaagcatcaaagaagcacaa 27260791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Original strand, 22761496 - 22761734
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  22761496 ttgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgccatgatgg 22761595  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | ||||| || ||||| || || || || |||||||| ||  | ||||||||| ||||| |  | |||||| || | || ||| |||| ||  |||||||    
T  22761596 taaaggagttcgagttgcttgaacaattcagagatttgagtttagtttgtgaaatgttatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatga 22761695  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
    |||| |||| ||||| | |||||| ||| | ||||||||    
T  22761696 attcctgaagagtattaaagaagcgcaaaaagttgatgt 22761734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Original strand, 20636343 - 20636580
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||  || ||||||||    
T  20636343 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttacatatgttcgctatgatggt 20636442  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 218  Q
     ||||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||  | ||||||||| ||| | |  | |||||| || | || ||| |||| ||  ||||||||    
T  20636443 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaa 20636542  T
Q  219 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
    ||  |||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||    
T  20636543 tttctgaagagtattaaagaagcgcaaaaggttgatgt 20636580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24365669 - 24365429
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || || || ||    
T  24365669 ggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaacgttgttgctgatgctttgagcaggaaaaccttgca 24365570  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||| ||  | ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| | |||||||| |||    
T  24365569 catgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacattagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttgggaatg 24365470  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  24365469 ttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 24365429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 152
Target Start/End: Original strand, 16926684 - 16926815
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||| || |||||||| |    
T  16926684 aaggattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcattgagtaggaagtcattgcacatgtccgctatgatggtaa 16926783  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
    | || || |||||||| || ||||||||||||    
T  16926784 aagagttcgagttactggaacagtttagagat 16926815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Original strand, 19488313 - 19488536
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| || |||||||    
T  19488313 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgaatatgtctgctatgatgg 19488412  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||||||| ||||  || || |||||| |||| || |||||||| ||||  |  ||    
T  19488413 ttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcaaagtgtgaagttaggtatgttgaagatcagcagaga 19488512  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     |||||||||||||| | ||||||    
T  19488513 gttcttgaatagtattaaagaagc 19488536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19436255 - 19436019
Alignment:
Q  5 atggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatg 104  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||  |||| |||||  | ||||| || || |||    
T  19436255 atggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctagtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagccggaagacattgcatatg 19436156  T
Q  105 tcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttga 204  Q
    || ||  |||||||| ||||||| || || || |||||||| | |||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| || ||  | ||| |||    
T  19436155 tctgctttgatggtggaggaattcgatttgctagagcagttcaaagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattcaggatgctga 19436056  T
Q  205 aaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19436055 aaattcatagtgatttcttgaatagtatctgagaagc 19436019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23079709 - 23079573
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  23079709 ttgaaggattatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 23079610  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
    | || || ||| | || || || ||||||||||||||    
T  23079609 taaaagagtttaattttctggaacagtttagagattt 23079573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 29590961 - 29591061
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  29590961 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 29591060  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  29591061 t 29591061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 152
Target Start/End: Original strand, 16962489 - 16962620
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||| | || |||||||| || |||||||| |    
T  16962489 aaggattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttggagatgcattgagtaggaagtcattgcacatgtccgctatgatggtaa 16962588  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
    | || || |||||||| || ||||||||||||    
T  16962589 aagagttcgagttactggaacagtttagagat 16962620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 152
Target Start/End: Original strand, 16625758 - 16625892
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16625758 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16625857  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
    | |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  16625858 tcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 16625892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 25113807 - 25113658
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  25113807 agatggctagagttgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 25113708  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
    |||| || |||||||| |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  25113707 tgtccgctatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 25113658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 257
Target Start/End: Original strand, 5838263 - 5838499
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    ||||| |||||||| |  |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  5838263 aaggactatgatttcgaattgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtta 5838362  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 220  Q
      || || |||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| || |||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||| ||    
T  5838363 gagagttcgagttacttgagcagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcatagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgattt 5838462  T
Q  221 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
      ||||||||||||  ||||||||  | |||||||||    
T  5838463 tctgaatagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 5838499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 151
Target Start/End: Original strand, 28281857 - 28281987
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | || ||||| || |||||| |||    
T  28281857 aaggattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagcaaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagacactccatatgtctgctatgatgatga 28281956  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagaga 151  Q
    | |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  28281957 aagaatttgatttattggaacagtttagaga 28281987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19865929 - 19865776
Alignment:
Q  16 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 115  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||    
T  19865929 tattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgctgatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgtctgctatgat 19865830  T
Q  116 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 169  Q
    ||| || || || ||| | || || |||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  19865829 ggttaaagagttcgagctgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtga 19865776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 257
Target Start/End: Original strand, 1542128 - 1542364
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  1542128 aaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtcggaagacattgcatatgtccgctatgatggtta 1542227  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 220  Q
      || || |||||||| || |||||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||| ||    
T  1542228 gagagttcgagttacttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgagtt 1542327  T
Q  221 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    | |||| |||||||  ||||||||  | |||||||||    
T  1542328 cctgaagagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 1542364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 171
Target Start/End: Original strand, 25608908 - 25609055
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |  |    
T  25608908 gattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagacgccttgagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttagag 25609007  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 171  Q
    | || |||||  | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  25609008 agttcgagttgttggaacagtttagagatttgagtttagtttgtgaat 25609055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 152
Target Start/End: Original strand, 28262241 - 28262372
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  28262241 aaggattatgactttggtttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtctgccatgatggtca 28262340  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
      || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  28262341 gagagttcgagttacttgaacagttcagagat 28262372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 152
Target Start/End: Original strand, 28340990 - 28341121
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  28340990 aaggattatgactttggtttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtctgccatgatggtca 28341089  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
      || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  28341090 gagagttcgagttacttgaacagttcagagat 28341121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Original strand, 27564863 - 27565032
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  27564863 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 27564962  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
     |   | || || ||||| || |||||||||||| | ||| | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  27564963 tagaaagttcgaattacttgaacagtttagagatatgagcttggtttgtgaatagtcacctcagagtgtg 27565032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 2873844 - 2873944
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  2873844 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 2873943  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  2873944 t 2873944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 154
Target Start/End: Original strand, 18406991 - 18407121
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  18406991 gattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaacgttgttgtagacgctttgagcaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagg 18407090  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
    | || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  18407091 agttcgagttgcttgaacagttcagagattt 18407121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 105
Target Start/End: Original strand, 18196774 - 18196861
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgt 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||  ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  18196774 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttatagatgccttaagtaggaagactttacatatgt 18196861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25769350 - 25769208
Alignment:
Q  99 cacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggca 198  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || || |||||||| || || ||| ||||||| || | ||| ||||||||||||| ||| |    
T  25769350 cacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttctttgtgagttatcacctcagagtgtgcagtagggta 25769251  T
Q  199 tgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||| || | |||||| |||||    
T  25769250 tgttgaagatcaatagtgatttcttaaacaatatcagggaagc 25769208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 18449747 - 18449650
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    ||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||| || ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  18449747 aaggattataatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcatatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggt 18449650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 6567 - 6823
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  6567 ggagatggttggagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcggatgctttgagtaggaagacgttaca 6666  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  6667 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtcttgtttgtgagttgtcgccccagagtgtgcagttgggtatg 6766  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6767 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 6823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19614058 - 19613802
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19614058 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttaca 19613959  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  19613958 catgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatg 19613859  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19613858 atgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 19613802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 257
Target Start/End: Original strand, 11387309 - 11387550
Alignment:
Q  16 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  11387309 tattgaaggattatgattttggattgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgtagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgat 11387408  T
Q  116 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 215  Q
    ||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |    
T  11387409 ggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaatagt 11387508  T
Q  216 gaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11387509 gatttcttgaatagtatcagagaagcgcaacaagttgatgtc 11387550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Original strand, 14263127 - 14263366
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  | || ||||    
T  14263127 ttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtctactataatgg 14263226  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| | |||||||| ||| |||| || |||| |||    
T  14263227 taaaggagtttgagttacttgaacagtttagagacttaagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtttacagttgggtatgctgaagattaatagtga 14263326  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14263327 tttcttgagtagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 14263366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19148577 - 19148338
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  19148577 ttgaaggactatgattttggattgaattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 19148478  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||| ||| ||||||| |||| |||    
T  19148477 taaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgggtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagatgggtatgctgaaaattaatagtga 19148378  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19148377 tttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagttgatgtc 19148338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20747976 - 20747737
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  20747976 ttgaaggactatgattttggattgaattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 20747877  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||| ||| ||||||| |||| |||    
T  20747876 taaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgggtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagatgggtatgctgaaaattaatagtga 20747777  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20747776 tttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagttgatgtc 20747737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Original strand, 15101471 - 15101725
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| || |||||||| || |    
T  15101471 agatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctctgagcaggaagacgttgcata 15101570  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  15101571 tgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgtt 15101670  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    ||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  15101671 gaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 15101725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 243
Target Start/End: Original strand, 16071178 - 16071403
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| || ||||| || |||||||| || |||||||    
T  16071178 ttgaaggattatgattttggtttgaattaccattctggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaagacattgcacatgtctgctatgatgg 16071277  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| | |    
T  16071278 taaaggagtttgagttactagaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtaa 16071377  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcac 243  Q
     ||||||||||||||| |||||||||    
T  16071378 tttcttgaatagtatccgagaagcac 16071403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13022740 - 13022500
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||    
T  13022740 ggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccaccctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaaaacattaca 13022641  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  ||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | || ||||| |||    
T  13022640 tatgtctgctttgatggtaagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacaattggggatg 13022541  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     |||| || |||| | | ||||||||||||||| |||||||    
T  13022540 ctgaagattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagc 13022500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Original strand, 12205683 - 12205921
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || |||||||    
T  12205683 ttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatatcagctatgatgg 12205782  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || ||||||||||| || |  ||||||||||| || || || |||||||| |||| ||| || |||||| | ||||| |||||||| ||||| | |||    
T  12205783 ttaaagaatttgagttgcttggtcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtga 12205882  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
     || ||||||||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  12205883 gtttttgaatagtattaaagaagcacaggaggttgatgt 12205921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Original strand, 16949343 - 16949578
Alignment:
Q  6 tggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgt 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||    
T  16949343 tggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaaaccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacattgcatatgt 16949442  T
Q  106 cggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 205  Q
    | ||  ||||||||||||||||||| || || || |||||||| || || || ||||| |||||||||  ||| |||||| | |||||||| ||| |||     
T  16949443 ctgctctgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagggacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttggggatgctgag 16949542  T
Q  206 aatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     || |||| ||| |||| |||||||||| |||||||    
T  16949543 gattaatagtgacttctagaatagtatctgagaagc 16949578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 11305129 - 11305369
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || || ||    
T  11305129 ggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggctaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgca 11305228  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||    
T  11305229 catgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatg 11305328  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  11305329 ttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 11305369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 26117471 - 26117711
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| || || ||||| ||||| || || || || ||    
T  26117471 ggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggttaagccaatgttgtggctgatgctttgagcaggaaaactttgca 26117570  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || || || |||||  | || ||||| |||||||||| |  ||||||| | || ||||| |||    
T  26117571 catgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacatttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcattccagagtatacatttgggaatg 26117670  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  26117671 ttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 26117711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Original strand, 274 - 513
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgc-agatgccttgagtagaaagacgttacac 101  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| | |||| ||| | || ||||| || ||     
T  274 agatggttagaactgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgttgttgctaaatgcgttgcgcaggaagacattgcat 373  T
Q  102 atgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgt 201  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| | ||| |||  ||| |||||| | |||||||| |||     
T  374 atgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctatgagttgacacctcagagtattcagttggggatgc 473  T
Q  202 tgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  474 tgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13666920 - 13666665
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || |||||  |||||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||| ||    
T  13666920 ggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttagtttgaattaccatcctagtaaagccaacgtggttgcaaatgccttgagtaggaaaacgttgca 13666821  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  ||||||| ||  ||||||| ||  | |||||||||||||| || ||| |||| |||||||||  ||| || ||||| |||||||| |||    
T  13666820 tatgtctgctttgatggtaaaataatttgatttgttagagcagtttagagacttgagctttgtctgtgaattgacacctcaaagtgttcagttggggatg 13666721  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
     |||| || || | | | ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  13666720 ctgaagattaacagttatttcttgaatagcatccgagaagcacaacaagtagatgt 13666665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12458023 - 12457783
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||    
T  12458023 ggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtagttgctgatgctttgagcagaaaaacattgca 12457924  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  ||||| | || ||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||  ||||||||| ||| |||||| |  ||||||| |||    
T  12457923 tatgtctgctttgatgataaaagaatttgagttgctggagcaatttagagacttgagtcttgtccgtgaattgtcacctcagagtatatagttggggatg 12457824  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     |||| ||  ||| ||| |||||||| |||||  |||||||    
T  12457823 ctgaagattgatagtgatttcttgaacagtattcgagaagc 12457783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 14285242 - 14285485
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||  | ||    
T  14285242 ggagatggttagagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaggaagacactgca 14285341  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| || |||||||| || |||||||| || || || |||||||||||  | ||||| || ||||| ||||  || |||||| | ||||||||||||    
T  14285342 tatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagcctggtatgtgagttgtcgcctcagagtatacagttgggcatg 14285441  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
     |||| || |||| ||| ||||||  ||||||  ||||||||||    
T  14285442 ctgaagattaatagtgatttcttgggtagtattcgagaagcaca 14285485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 14955919 - 14955785
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  14955919 ttgaaggattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 14955820  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
    | |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  14955819 ttagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 14955785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 256
Target Start/End: Original strand, 320948 - 321180
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||    
T  320948 gattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtgaagg 321047  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 223  Q
    | || ||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| |||||| | |  |||||||| |||| || ||| |||| ||  ||| ||| |||||    
T  321048 agttcgagttgctggagtagttcagagatttgagtttggtatgttaattgtcatctaagagtgtgaagttagggatgctgaagattgatagtgatttctt 321147  T
Q  224 gaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
    ||| ||||| | |||||||||| | ||||||||    
T  321148 gaagagtattaaagaagcacaaaaagttgatgt 321180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 49153684 - 49153444
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || || ||    
T  49153684 ggaggtggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgcggacgctttgagtaggaaaactttgca 49153585  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||| ||  ||||||||||||| || || || || || ||||| |||||  | |||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||||| |||    
T  49153584 catgtctgctttgatggtgaaggagttcgaattgctagaacagttcagagacatgagccttgtctgtgaatggtcaccccagagtattcagttgggaatg 49153485  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||||  ||| | | || ||||| |||||| |||||||    
T  49153484 ttgaaaattgatagtaactttttgaacagtatccgagaagc 49153444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 188
Target Start/End: Original strand, 15147801 - 15147960
Alignment:
Q  29 tgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaattt 128  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| | ||| ||     
T  15147801 tgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttagggagttc 15147900  T
Q  129 gagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||| | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  15147901 gagttgcttgaacagtttagtgatttgagcttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 15147960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 8708970 - 8708836
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  8708970 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatgg 8708871  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
    | |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  8708870 tcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 8708836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Original strand, 11771146 - 11771316
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||| || |||||||    
T  11771146 ttgaaagactatgattttgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagatgttgcatatgtccgctatgatgg 11771245  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
    | || ||| |||| || || || || ||||||||||| ||| | || || || |||| ||| |||||||||    
T  11771246 taaaagaaattgaattgcttgaacaatttagagatttgagcttagtctgcgagttgtcacctcagagtgtg 11771316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 152
Target Start/End: Original strand, 18550663 - 18550797
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  18550663 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatgg 18550762  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
    | |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  18550763 tcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 18550797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 152
Target Start/End: Original strand, 44790256 - 44790390
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  44790256 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 44790355  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
    | || || || || || || || ||||||||||||    
T  44790356 tcaaagagttcgaattgcttgaacagtttagagat 44790390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 10872360 - 10872190
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  10872360 ttgaaagattatgactttgggttggattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 10872261  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||| |||||||||    
T  10872260 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtg 10872190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14333761 - 14333535
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  14333761 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 14333662  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  14333661 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 14333562  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    |||  |||| |||||||  ||||||||    
T  14333561 atttctgaaaagtatcaaggaagcaca 14333535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 23504736 - 23504886
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | ||    
T  23504736 ggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacgctgca 23504835  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 151  Q
     ||||| || |||||| | || |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  23504836 tatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttactggaacagtttagaga 23504886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 8199993 - 8199893
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  8199993 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 8199894  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  8199893 t 8199893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 11236118 - 11236334
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  11236118 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 11236217  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||||||  ||| |||    
T  11236218 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaaaattgatagtga 11236317  T
Q  218 attcttgaatagtatca 234  Q
    |||| |||| |||||||    
T  11236318 attcctgaaaagtatca 11236334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 15159962 - 15160062
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  15159962 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 15160061  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  15160062 t 15160062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 18179106 - 18179007
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  18179106 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 18179007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Original strand, 16223 - 16389
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||||    
T  16223 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatgg 16322  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagag 184  Q
    | |  || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||    
T  16323 ttagagagtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagag 16389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 18052819 - 18052969
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | ||    
T  18052819 ggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgcggatgctttgagtaggaagacactcca 18052918  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 151  Q
     ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  18052919 tatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 18052969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 152
Target Start/End: Original strand, 23202519 - 23202652
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  23202519 tgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgggtaaagctaatgatgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 23202618  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
     |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  23202619 cagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 23202652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 152
Target Start/End: Original strand, 23508646 - 23508779
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  23508646 tgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgggtaaagctaatgatgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 23508745  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
     |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  23508746 cagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 23508779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 13687429 - 13687329
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  13687429 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcatatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 13687330  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  13687329 t 13687329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 13967534 - 13967774
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |   | || || || ||    
T  13967534 ggaggtggttagagttattgaaggattatgattttggcttaaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttaacccggaaaactttgca 13967633  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||| ||  |||||||||| |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||  ||||| | |||||||| |||    
T  13967634 catgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccttagagtatacagttggggatg 13967733  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     |||| ||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  13967734 ctgaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 13967774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15204983 - 15204851
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  15204983 tgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttacatatgtctgctatgatggt 15204884  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 151  Q
     || || || ||| | |||||  ||||||||||    
T  15204883 taaagagttggagctgctcgaatagtttagaga 15204851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12456944 - 12456845
Alignment:
Q  142 agtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12456944 agtttagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaataatgatttcttgaatagtatccgagaagc 12456845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 12688866 - 12688731
Alignment:
Q  18 ttgaaggatt-atgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatg 116  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||    
T  12688866 ttgaaggatttatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 12688767  T
Q  117 gtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
    || |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  12688766 gttagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 12688731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15341791 - 15341573
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||| | || ||||| || |||||| | || |    
T  15341791 gattattattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaatgtagttgctgatgcattgagcaggaagacgctgcatatgtctgctatgatgataaaag 15341692  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 223  Q
    ||||||| || || || |||||||| ||  | || || || ||||| ||||   | |||||| | |||||||||||| |||| || |||| ||| |||||    
T  15341691 aatttgatttgctggaacagtttagggacatgagtctggtatgtgagttgtcgactcagagtatacagttgggcatgctgaagattaatagtgatttctt 15341592  T
Q  224 gaatagtatcagagaagca 242  Q
    || ||||||| ||||||||    
T  15341591 gagtagtatccgagaagca 15341573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9597437 - 9597252
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||| || || |    
T  9597437 agatggctagaactactgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcatgaagacattgcata 9597338  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
    |||| ||  ||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  9597337 tgtccgctttgatggttagagagttcgaattacttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 9597252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Original strand, 11552008 - 11552107
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || ||||||||    
T  11552008 tgaaggattataactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaaaaagacattgcatatgtccgctatgatggt 11552107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 14213038 - 14212886
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  14213038 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 14212939  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 171  Q
     |  || ||||||||||| || || || |||||||| ||| | ||||||||||    
T  14212938 tagagagtttgagttacttgaacaattcagagatttgagcttggtttgtgaat 14212886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14041060 - 14040921
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | || |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || || ||| | || |||||||    
T  14041060 ttgaaagattatgattttgagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacattgcatatgcccgctatgatgg 14040961  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaag 157  Q
    | || || || |||||  | || ||||||| |||||||||    
T  14040960 taaaagagttcgagttgttggaacagtttacagatttaag 14040921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14351090 - 14350951
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | || |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || || ||| | || |||||||    
T  14351090 ttgaaagattatgattttgagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacattgcatatgcccgctatgatgg 14350991  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaag 157  Q
    | || || || |||||  | || ||||||| |||||||||    
T  14350990 taaaagagttcgagttgttggaacagtttacagatttaag 14350951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15625898 - 15625744
Alignment:
Q  39 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcg 138  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || |||||||| || || || ||| | ||||    
T  15625898 ttgaattatcatccaggtaaagataatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtctgctatgatggttaaagagttggagctgctcg 15625799  T
Q  139 agcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 193  Q
    | |||||||||||| | || || || |||||||||| ||| |||| |||| ||||    
T  15625798 aacagtttagagatctgagtctagtctgtgaattgtcacctcagattgtgaagtt 15625744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 109
Target Start/End: Original strand, 40078 - 40142
Alignment:
Q  45 tatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggc 109  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| ||| | || |||||||||||    
T  40078 tatcatccaggaaaggccaatgtagtagctgatgccttgagtaggaagtccttgcacatgtcggc 40142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 32559 - 32815
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  32559 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttaca 32658  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  32659 catgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatg 32758  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32759 atgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 32815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 55782 - 56022
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || ||    
T  55782 ggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttcaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacattgca 55881  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||| | |||||||| |||    
T  55882 tatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagttggggatg 55981  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     ||||||| |||| | | ||||||||||||||| |||||||    
T  55982 ctgaaaattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagc 56022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 49396 - 49652
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  49396 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcattcgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttaca 49495  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  49496 catgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatg 49595  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49596 tagaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 49652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 44555 - 44319
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  44555 aaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtcggaagacattgcatatgtccgctatgatggtta 44456  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 220  Q
      || || ||||||||||| ||||| |||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||| ||    
T  44455 gagagttcgagttactcgaacagttcagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgagtt 44356  T
Q  221 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    | |||| |||||||  ||||||||  | |||||||||    
T  44355 cctgaagagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 44319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 9880 - 9781
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  9880 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctagtgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 9781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16342 - 16275
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagt 86  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16342 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagt 16275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 21679839 - 21680095
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21679839 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttaca 21679938  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  21679939 catgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatg 21680038  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21680039 atgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 21680095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22463258 - 22463003
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  22463258 ggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagttaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgca 22463159  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||| | | || |||||||||||||| |||    
T  22463158 catgtcggccttaatggtaaaggagtttgaattgctcgaacagtttagggatttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatg 22463059  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
     |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22463058 ctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgt 22463003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20822760 - 20822505
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  20822760 ggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgca 20822661  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||||| || | | | || |||||||||||||| |||    
T  20822660 catgtcggccttgatggtaaaggaattcgaattgcttgaacagtttagagacttaagtctagtgtgtgagttatcatctcaaagtgtgcagttgggtatg 20822561  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
    ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20822560 ttgaagatcaatagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgt 20822505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Original strand, 24619358 - 24619596
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  24619358 agatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacaca 24619457  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| || |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||| |||  ||| |||||||| |||||||| ||| |    
T  24619458 tgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagtttagagacttgagccttggttgtgagttggcacctcagagtgttcagttggggatgct 24619557  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24619558 gaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24619596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Original strand, 24715589 - 24715827
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  24715589 agatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacaca 24715688  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| || |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||| |||  ||| |||||||| |||||||| ||| |    
T  24715689 tgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagtttagagacttgagccttggttgtgagttggcacctcagagtgttcagttggggatgct 24715788  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24715789 gaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24715827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Original strand, 24748617 - 24748855
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  24748617 agatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacaca 24748716  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| || |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||| |||  ||| |||||||| |||||||| ||| |    
T  24748717 tgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagtttagagacttgagccttggttgtgagttggcacctcagagtgttcagttggggatgct 24748816  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24748817 gaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24748855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 28894003 - 28894258
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  28894003 ggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacattgca 28894102  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || ||||| |||||||| |||    
T  28894103 catgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttgggtatg 28894202  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
    ||||| ||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28894203 ttgaagatcaatagtggtttcttggatagtgtcagagaagcacaacaagttgatgt 28894258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 28915474 - 28915729
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  28915474 ggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacattgca 28915573  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || ||||| |||||||| |||    
T  28915574 catgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttgggtatg 28915673  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
    ||||| ||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28915674 ttgaagatcaatagtggtttcttggatagtgtcagagaagcacaacaagttgatgt 28915729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 28922829 - 28923084
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  28922829 ggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacattgca 28922928  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || ||||| |||||||| |||    
T  28922929 catgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttgggtatg 28923028  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
    ||||| ||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28923029 ttgaagatcaatagtggtttcttggatagtgtcagagaagcacaacaagttgatgt 28923084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 23079150 - 23079396
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||||| || || || |||||    
T  23079150 ggagatggttagagctgttgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagcaggaaaacattaca 23079249  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||  |||||| |  ||||||| |||    
T  23079250 tatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacttcagagtatatagttggggatg 23079349  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 247  Q
    ||||| || || | | | ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23079350 ttgaagattaacagtaatttcttgaatagtatctgagaagctcaaca 23079396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20775036 - 20774811
Alignment:
Q  31 attttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttga 130  Q
    ||||||| |||||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  20775036 attttggcttgaactaccatccagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcga 20774937  T
Q  131 gttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagt 230  Q
    ||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||  ||||    
T  20774936 gttgcttgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgggtagt 20774837  T
Q  231 atcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20774836 atcagagaagcacaacaagttgatgt 20774811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 14886052 - 14886292
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||    
T  14886052 ggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgca 14886151  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||    
T  14886152 catgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatg 14886251  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  14886252 ttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 14886292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 22234981 - 22235236
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  22234981 ggagatggttggagctgttgaaggactatgaatttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgttgca 22235080  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| | |||||||| |||    
T  22235081 tatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtattcagttggggatg 22235180  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
     | || || || | ||| |||||||||| |||| ||||||| || ||||| |||||    
T  22235181 ctaaagattaacagtgatttcttgaataatatccgagaagcgcagcaggtagatgt 22235236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 24797458 - 24797698
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  24797458 ggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggtagctgatgctttgagtaggaagactttgca 24797557  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||    
T  24797558 catgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatg 24797657  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||||  |||  || |||||||| |||||| |||||||    
T  24797658 ttgaaaattgatagggatttcttgaacagtatccgagaagc 24797698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 28930742 - 28930946
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  28930742 ggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacattgca 28930841  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || ||||| |||||||| |||    
T  28930842 catgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttgggtatg 28930941  T
Q  201 ttgaa 205  Q
    |||||    
T  28930942 ttgaa 28930946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Original strand, 21563051 - 21563277
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  || |||||||    
T  21563051 ttgaaggactatgattttagtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtatgctatgatgg 21563150  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || || |||||||| || || |||||||||||  | || || |||||||| ||||  ||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  21563151 ttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctgagtctcgtttgtgagttgtcgccttagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtga 21563250  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||    
T  21563251 gttcttgaacagtatcaaagaagcaca 21563277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 257
Target Start/End: Original strand, 21889933 - 21890076
Alignment:
Q  114 atggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaata 213  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||| || || ||||||| ||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  21889933 atggtaaaggagtttgagttgctagagaagtttagagacttgagtcttgtttatgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagatcaata 21890032  T
Q  214 atgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21890033 gtgatttcttgaacagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 21890076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23472536 - 23472400
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  23472536 ttgaaggattatgattttgggttaaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 23472437  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
    | || || || ||||| || || ||||||||||||||    
T  23472436 taaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagattt 23472400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 37542442 - 37542682
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| || || || ||    
T  37542442 ggaggtggttagagttattgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgacgctttaagtaggaaaactttgca 37542541  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    | |||| ||  ||||||||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||    
T  37542542 cgtgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatg 37542641  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||||  ||| | | ||||| || |||||| |||||||    
T  37542642 ttgaaaattgatagtaacttcttaaacagtatccgagaagc 37542682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Original strand, 27667568 - 27667794
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27667568 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27667667  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  27667668 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 27667767  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    |||  |||| || |||| |||||||||    
T  27667768 atttctgaaaagcatcaaagaagcaca 27667794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 16357810 - 16357710
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16357810 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16357711  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  16357710 t 16357710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25849382 - 25849142
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || ||    
T  25849382 ggagatggttagagttactgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcaggaaaactttgca 25849283  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||| ||  |||||||||| |||||||| || || ||  |||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| | |||||||| |||    
T  25849282 catgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgctagaatagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttggggatg 25849183  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     | || ||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  25849182 ctaaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 25849142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 27519714 - 27519614
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27519714 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27519615  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  27519614 t 27519614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 34567802 - 34567702
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  34567802 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 34567703  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  34567702 t 34567702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 40710088 - 40709988
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  40710088 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 40709989  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  40709988 t 40709988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22503984 - 22503746
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || || |    
T  22503984 agatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcata 22503885  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| ||  | ||||| || ||||| |||||  | || ||||||||||| || || || || ||||| |||| ||| |||||| | |||||||| ||| |    
T  22503884 tgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtctagtctgtgagttgtcacctcagagtatacagttggggatgct 22503785  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||| ||  ||| | | |||||||| |||||| |||||||    
T  22503784 gaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 22503746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23575036 - 23574810
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| | || || ||||| || ||||||||    
T  23575036 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaggcattgcatatgtccgctatgatggt 23574937  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 218  Q
     |  || || || || || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||||    
T  23574936 tagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaa 23574837  T
Q  219 ttcttgaatagtatcagagaagcacaa 245  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  23574836 ttcctgaagagtatcaaagaagcacaa 23574810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 41772147 - 41772050
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  41772147 aaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 41772050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 27611662 - 27611562
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27611662 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27611563  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  27611562 t 27611562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19771265 - 19771134
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  19771265 aaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtca 19771166  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
      || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  19771165 gagagttcgagttacttgaacagttcagagat 19771134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23441518 - 23441279
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  23441518 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 23441419  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | |  || || || ||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  23441418 ttagagagttcgaattacttgaacagtttagagatttgagtttagtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaagtgggaatgctgaagattgatagtga 23441319  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    |||  |||| ||||| | ||| |||||| | |||||||||    
T  23441318 atttatgaagagtattaaagaggcacaaaaagttgatgtc 23441279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 116
Target Start/End: Original strand, 21872128 - 21872226
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatg 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||||||    
T  21872128 ttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagctgaaagacgttgcacatgtctgctatgatg 21872226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 116
Target Start/End: Original strand, 21876408 - 21876506
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatg 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||||||    
T  21876408 ttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagctgaaagacgttgcacatgtctgctatgatg 21876506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Original strand, 22331965 - 22332191
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  22331965 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 22332064  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  22332065 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 22332164  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  22332165 attcctgaaaagtatcaaggaagcaca 22332191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 25427735 - 25427605
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  25427735 gattatgattttgagttgagctatcatccgtgtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagg 25427636  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| ||||    
T  25427635 agttcgagttgcttgaacagttcagaaattt 25427605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 14998817 - 14998917
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  14998817 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 14998916  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  14998917 t 14998917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20343589 - 20343349
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || ||    
T  20343589 ggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcaggaaaactttgca 20343490  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||| ||  ||||| |||| |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| | |||||||| | | |||||| | |||||||| |||    
T  20343489 catgtctgctttgatgatgaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctatgaattgtcatctcagagtatacagttggggatg 20343390  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     |||| ||  ||| ||| |||||||| |||||  |||||||    
T  20343389 ctgaagattgatagtgatttcttgaacagtattcgagaagc 20343349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 22135976 - 22135876
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  22135976 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 22135877  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  22135876 t 22135876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 27684478 - 27684578
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  27684478 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 27684577  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  27684578 t 27684578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 29475151 - 29475251
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  29475151 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 29475250  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  29475251 t 29475251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 205
Target Start/End: Original strand, 26737805 - 26737992
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  26737805 ttgaaagactatgattttagtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 26737904  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 205  Q
    | || || || |||||  | ||||||||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| ||||    
T  26737905 taaaagagttcgagttgttggagcagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaa 26737992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 21497228 - 21497150
Alignment:
Q  22 aggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  21497228 aggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgttaca 21497150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 152
Target Start/End: Original strand, 37290574 - 37290708
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  37290574 ttgaaggattacgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 37290673  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
    | |  ||||| || || || || ||||||||||||    
T  37290674 tcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagat 37290708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21882256 - 21882018
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||  | ||||| || ||||||||    
T  21882256 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagtaggaagacattgaatatgtccgctatgatggt 21882157  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 218  Q
     |  || |||||||| || || ||||||| |||| | ||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |  || | ||| |||| ||  ||| ||||    
T  21882156 tagagagtttgagttgcttgaacagtttacagatatgagcctagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgtgaatgctgaagattgatagtgaa 21882057  T
Q  219 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    ||  |||| ||||||| |||||||||  | |||||||||    
T  21882056 tttctgaagagtatcaaagaagcacagaaagttgatgtc 21882018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 79
Target Start/End: Original strand, 20467176 - 20467237
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgc 79  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  20467176 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgc 20467237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 226
Target Start/End: Original strand, 21830878 - 21831047
Alignment:
Q  57 aaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaa 156  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||  | |    
T  21830878 aaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtttgctatgatggttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctga 21830977  T
Q  157 gccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaa 226  Q
    | || |||||||| ||||  ||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  21830978 gtctcgtttgtgagttgtcgcctaagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaa 21831047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 18777103 - 18776951
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  18777103 tgaaagattatgattttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggt 18777004  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 171  Q
     |  || || |||||||| || ||||| |||||||| ||  | ||||||||||    
T  18777003 cagagagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaat 18776951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 118
Target Start/End: Original strand, 21338384 - 21338475
Alignment:
Q  27 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||| || |||| | | || ||||| || ||||||||    
T  21338384 tatgattttgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaaatgctttgagcaggaagatgctgcatatgtcagctatgatggt 21338475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 151
Target Start/End: Original strand, 17268419 - 17268545
Alignment:
Q  25 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 124  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | || ||||| || |||||| | || ||    
T  17268419 attatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacactgcatatgtctgctatgatgataaaaga 17268518  T
Q  125 atttgagttactcgagcagtttagaga 151  Q
    ||| || || || || |||||||||||    
T  17268519 attcgatttgctggaacagtttagaga 17268545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21408443 - 21408230
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||| | || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  21408443 aaggattatgaattcggattgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatactttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggtta 21408344  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 220  Q
    | || || ||||| || || ||||| ||||| || ||  | ||||||||| |||  || |||||| |  | ||||| ||||| || ||||| | ||||||    
T  21408343 aagagttggagttgcttgaacagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccgcagagtctaaaattgggaatgtttaatatcaacattgaatt 21408244  T
Q  221 cttgaatagtatca 234  Q
     || ||||||||||    
T  21408243 ttttaatagtatca 21408230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Original strand, 873 - 923
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgca 74  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  873 gattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgca 923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 50)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 13971227 - 13971483
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13971227 ggagatggttagagctattgaaggattatgactttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtaggaagacgttaca 13971326  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  13971327 catgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatg 13971426  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  13971427 ttaaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcaaataagcgcaacaggttgatgtc 13971483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14087695 - 14087439
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  14087695 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttaaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacattaca 14087596  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||    
T  14087595 catgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgagaagttgggtatg 14087496  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14087495 atgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 14087439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 10419152 - 10419408
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  10419152 ggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgca 10419251  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || |||||||||||||| |||    
T  10419252 catgtcggccttgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttgggtatg 10419351  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  10419352 ttgaagatcaatagtgacttcttgaatagtatcagagaagcacaacgagttgatgtc 10419408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 256
Target Start/End: Original strand, 12359636 - 12359889
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  12359636 agatggatagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagattccttgagtagaaagacgttgcata 12359735  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| ||  ||||||||||  ||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||| ||| |    
T  12359736 tgtctgctttgatggtgaaataatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggggatgct 12359835  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
    ||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  12359836 gaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtagatgt 12359889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17187396 - 17187164
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | || ||    
T  17187396 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttagtttgaactatcacccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaggcattgca 17187297  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || || || |||||||||||   ||| ||||||||||||||||| |||    
T  17187296 tatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagttcagagacttgagtctggtttgtgaattaacacctcagagtgtgcagttgggtatg 17187197  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatc 233  Q
    |||||||| || | ||| ||||||| |||||||    
T  17187196 ttgaaaattaacagtgatttcttgagtagtatc 17187164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14574925 - 14574689
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  14574925 aaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaa 14574826  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 220  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||| ||    
T  14574825 atgaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgcgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgctgaagattaatagtgattt 14574726  T
Q  221 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  14574725 cttgagtagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 14574689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17493650 - 17493396
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || |    
T  17493650 agatggttaaagctgttgaaggattatgattttggtttgagttaccatccgggtaaagccaacgtggttgcagatgccttgaggaggaagacgttgcata 17493551  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| || ||||||||||  |||||||| || || || ||||||||||| || || | ||| |||||||||  ||| |||||||| || ||||| ||| |    
T  17493550 tgtctgctatgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcgtgtctgtgaattgacacctcagagtgtacatttggggatgct 17493451  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    ||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  17493450 gaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 17493396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 31694293 - 31694536
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||    
T  31694293 ggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaacatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaaacgctgca 31694392  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| || | |||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||    
T  31694393 tatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgaaccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggggatg 31694492  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
     |||| || |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  31694493 ctgaagattaatagtgatttcttgaatagtattcgagaagcaca 31694536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31939925 - 31939682
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||    
T  31939925 ggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaaacgctgca 31939826  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |  |||||||  |||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||    
T  31939825 tatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagaacagtttagagactcgagccttgcctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggggatg 31939726  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
     |||| || |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  31939725 ctgaagattaatagtgatttcttgaatagtattcgagaagcaca 31939682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 47124966 - 47124726
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||    
T  47124966 ggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgca 47124867  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||    
T  47124866 catgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatg 47124767  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  47124766 ttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 47124726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Original strand, 16827327 - 16827566
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  16827327 ttgaaggattatgattttagtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtgtttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 16827426  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || || |||||||| || || || |||||||| || || ||| | ||||| |||| ||| ||| |||| |||||||| ||| |||| || |||| |||    
T  16827427 taaaagagtttgagttgctagaccattttagagacttgagtcttatctgtgagttgtcacctcagggtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtga 16827526  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16827527 tttcttgaacagtatcagagaagcacatcaagttgatgtc 16827566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 13319609 - 13319864
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||||| || ||||| |||||    
T  13319609 ggagatggttagagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcgaatgcgttgagcaggaagaccttaca 13319708  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  ||||||| |  |||||||| || || || ||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||| || ||| | |||| ||| |||    
T  13319709 tatgtctgcactgatggtaagagaatttgatttgctagaacagtttaaagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcaaagtattcagtcggggatg 13319808  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
    ||||| || || | ||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||    
T  13319809 ttgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgtgaagctcagcaggtagatgt 13319864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 16337619 - 16337868
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||    
T  16337619 ggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccgatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattaca 16337718  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  |||||||||||||||| || ||  | || ||||||||||| || || || || |||||||||| ||| |||||| | |||||||| |||    
T  16337719 tatgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgttagaacagtttagagacttgagtctggtatgtgaattgtcacctcagagtatacagttgggaatg 16337818  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggt 250  Q
    ||||  ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  16337819 ttgaggattgatagtgatttcttgaacagtatcagagaagctcagcaggt 16337868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15228654 - 15228416
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||||| |    
T  15228654 ttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttcagcaggaagactttgcatatgtcagctatgatag 15228555  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || || |||||||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| |||| | | || |||||| | ||||| |||||||| ||||| | |||    
T  15228554 ttaaagattttgagttgcttgagcaatttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcaactcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtga 15228455  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
     |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  15228454 gttcttgaatagtattaaagaagcacagaaggttgatgt 15228416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15234522 - 15234284
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||||| |    
T  15234522 ttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttcagcaggaagactttgcatatgtcagctatgatag 15234423  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || || |||||||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| |||| | | || |||||| | ||||| |||||||| ||||| | |||    
T  15234422 ttaaagattttgagttgcttgagcaatttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcaactcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtga 15234323  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
     |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  15234322 gttcttgaatagtattaaagaagcacagaaggttgatgt 15234284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 257
Target Start/End: Original strand, 16835640 - 16835873
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||  | ||||| |  |    
T  16835640 gattatgattttggtttgaattaccatcctgataaagccaatgtagttgcggatgcgttgagcagaaagactttgcacatgtctgcattaatggtaagag 16835739  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 223  Q
    ||||||| || || || |||||||||||  | || ||||| ||||| |||  |||  ||||||| |||||||| ||||||||||| || | ||| |||||    
T  16835740 aatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtcttgtgtgtgagttgacaccgaagagtgttcagttgggtatgttgaaaattaacagtgatttctt 16835839  T
Q  224 gaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    || ||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  16835840 gagtagtatccgagaagcacagcaggtggatgtc 16835873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 11960276 - 11960516
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || ||    
T  11960276 ggagattgttagaactactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctagtaaggccaatgtggttgctgatgcattgaggaggaaaacattgca 11960375  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||||| ||| |||||| | |||||||| |||    
T  11960376 tatgtctgctttgatggtaaaggaatttgagttgctagagcagtttagggacttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggggatg 11960475  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     |||  ||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  11960476 atgaggattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 11960516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 188
Target Start/End: Original strand, 15347383 - 15347550
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||| ||||||||||| |    
T  15347383 aaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagaaattgcatatgtccgccatgatggtca 15347482  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
      || || |||||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  15347483 gagagttcgagttacttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 15347550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 257
Target Start/End: Original strand, 14580083 - 14580316
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| || |||||||| || |    
T  14580083 gattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagaatttacacatgtccgctatgatggtaaaag 14580182  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 223  Q
    | || ||||| || || ||||| |||||||| ||  | || |||||| ||| | | ||||||||  || | || |||||||| ||  |||||||||| ||    
T  14580183 agttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtctgtgaaatgtcatctcagagtgttaagctaggaatgttgaagattgataatgaattttt 14580282  T
Q  224 gaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    ||| ||||| |  ||||||||  | |||||||||    
T  14580283 gaaaagtattaaggaagcacagaaagttgatgtc 14580316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 12179358 - 12179234
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |    
T  12179358 agatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccagccgggcaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaaacgttgcata 12179259  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatt 127  Q
    |||| || ||||||||||| |||||    
T  12179258 tgtctgctatgatggtgaaagaatt 12179234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 18133453 - 18133693
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||| || ||||| ||    
T  18133453 ggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggcatgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcatataccttaagtaggaaaacgttgca 18133552  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||  | |||| ||||||||| || ||||| || |||||||||  ||| || ||||| |||||||  |||    
T  18133553 tatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttagagccgtttagagacttgagcctcgtctgtgaattgacacctcatagtgttcagttggcgatg 18133652  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     | || || || | ||| |||||||||| |||| |||||||    
T  18133653 ctaaagattaacagtgatttcttgaataatatccgagaagc 18133693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Original strand, 16491317 - 16491452
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  16491317 tgaaggattatgattttgggttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgaagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 16491416  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  16491417 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 16491452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Original strand, 5424065 - 5424291
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  5424065 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 5424164  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  5424165 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 5424264  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    |||  |||| |||||||  ||||||||    
T  5424265 atttctgaaaagtatcaaggaagcaca 5424291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 6601728 - 6601631
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  6601728 aaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 6601631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 15588527 - 15588627
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  15588527 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 15588626  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  15588627 t 15588627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 16328767 - 16329007
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||    
T  16328767 ggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattaca 16328866  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  | ||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||| ||| | | |||||| | |||||||| ||     
T  16328867 tatgtctgctttaatggtaaaagaatttgagttgttggaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcatctcagagtatacagttggggata 16328966  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     |||| ||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  16328967 atgaagattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 16329007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 16636768 - 16636668
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16636768 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16636669  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  16636668 t 16636668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 20061189 - 20061289
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  20061189 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 20061288  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  20061289 t 20061289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 43164092 - 43163992
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  43164092 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 43163993  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  43163992 t 43163992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 48426442 - 48426342
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  48426442 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 48426343  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  48426342 t 48426342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 188
Target Start/End: Original strand, 53384156 - 53384323
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  53384156 aaggattatgactttggtttgaattaacatccgggtaaagctaatgttattgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtca 53384255  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
      || ||||||||||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  53384256 gagagtttgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 53384323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17490839 - 17490693
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||     
T  17490839 gattatgattttgagttgagctatcatcctggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagt 17490740  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaa 170  Q
    | || ||||| || || ||||| |||||||| ||| | |||||||||    
T  17490739 agttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtttgtgaa 17490693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 44778269 - 44778119
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | ||    
T  44778269 ggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacactgca 44778170  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 151  Q
     ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  44778169 tatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttactggaacagtttagaga 44778119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 10006595 - 10006495
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  10006595 ttgaaggattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 10006496  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  10006495 t 10006495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 10907205 - 10907105
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  10907205 ttgaaggattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 10907106  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  10907105 t 10907105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Original strand, 11302991 - 11303123
Alignment:
Q  112 tgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaa 211  Q
    |||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || ||    
T  11302991 tgatggtgaaagaatttgatctgctagagcagtttagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaa 11303090  T
Q  212 taatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
     | ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11303091 cagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 11303123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 13253685 - 13253585
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  13253685 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 13253586  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  13253585 t 13253585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 15260625 - 15260489
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| || |||||||    
T  15260625 ttgaaagattatgattttgagttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatatgtccgctatgatgg 15260526  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
    | || || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  15260525 taaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagattt 15260489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Original strand, 15401652 - 15401878
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  15401652 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 15401751  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  15401752 tcagagagttcgaatttcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 15401851  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  15401852 attcctgaaaagtatcaaggaagcaca 15401878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 41178544 - 41178394
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | ||    
T  41178544 ggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacactcca 41178445  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 151  Q
     ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  41178444 tatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 41178394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15340264 - 15340038
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  15340264 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgctgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 15340165  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  15340164 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 15340065  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  15340064 attcctgaaaagtatcaaggaagcaca 15340038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Original strand, 14125730 - 14125899
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  14125730 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 14125829  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
     |  || || || ||||| || | |||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  14125830 tagagagttcgaattacttgaaccgtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 14125899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 15724069 - 15724169
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  15724069 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 15724168  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  15724169 t 15724169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 12499245 - 12499109
Alignment:
Q  16 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 115  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||| || || ||||| || |||||    
T  12499245 tattgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaacgtcgttgcagatggcttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgat 12499146  T
Q  116 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
    ||| |  || || || ||||| || ||||||||||||    
T  12499145 ggttagagagttcgatttacttgaacagtttagagat 12499109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 254
Target Start/End: Original strand, 14875635 - 14875870
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||  | ||||| ||    
T  14875635 tgaaagattatgactttgatttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccactatgatagt 14875734  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 218  Q
     |  || || ||||| || ||  ||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||||||  ||| ||||    
T  14875735 tagagagttcgagttgcttgaatagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaaaattgatagtgaa 14875834  T
Q  219 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgat 254  Q
    || ||||| ||||| | ||| |||||| | ||||||    
T  14875835 tttttgaaaagtattaaagaggcacaaaaagttgat 14875870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 13943046 - 13942896
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||  | ||    
T  13943046 ggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagcaggaagacactgca 13942947  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 151  Q
     ||||| || |||||| | || ||||| || || || || |||||||||||    
T  13942946 tatgtctgctatgatgataaaagaattcgatttgctggaacagtttagaga 13942896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 16693159 - 16693026
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||||    
T  16693159 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgccttgatgg 16693060  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 151  Q
    | |  || || |||||||| || ||||| |||||    
T  16693059 ttagagagttcgagttacttgaacagttcagaga 16693026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Original strand, 16411418 - 16411517
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  16411418 tgaaagattacgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 16411517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 118
Target Start/End: Original strand, 16755757 - 16755820
Alignment:
Q  55 gtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  16755757 gtaaagcgaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 16755820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Original strand, 16806083 - 16806252
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  16806083 tgaaagattatgactttgctttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 16806182  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
     |  || || |||||||| || ||||| || ||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  16806183 tagagagttcgagttacttgaacagttcagggatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 16806252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24435 - 24179
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  24435 ggagatggttagagctgttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttacagatgctttgagcaggaagacgttaca 24336  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  24335 catgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatg 24236  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24235 ttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 24179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20273 - 20017
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  20273 ggagatggttagagctgttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttacagatgctttgagcaggaagacgttaca 20174  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  20173 catgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctggtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatg 20074  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20073 ctgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 20017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 257
Target Start/End: Original strand, 20060918 - 20061159
Alignment:
Q  16 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 115  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20060918 tattaaaggattatgattttggcttgaactaccattcgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgat 20061017  T
Q  116 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 215  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  20061018 ggtgaaggaatttgagttgcttgagcattttagagatttgagccttgtttgtgatttgttaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagt 20061117  T
Q  216 gaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20061118 gaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacagattgatgtc 20061159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19855713 - 19855458
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || ||    
T  19855713 ggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacattgca 19855614  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||    
T  19855613 tatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttactagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggggatg 19855514  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
     |||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  19855513 ctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgt 19855458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 19662088 - 19662331
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  19662088 ggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacattgca 19662187  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||    
T  19662188 tatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagatttgagtcttgtttgtgaattgacaccccagagtgtacagttggggatg 19662287  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
     |||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19662288 ctgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 19662331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 244
Target Start/End: Original strand, 23197199 - 23197440
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  23197199 agatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacgttgcaca 23197298  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||| ||| |    
T  23197299 tgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggggatgct 23197398  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    ||| || |||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  23197399 gaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgtgaagcaca 23197440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 20855711 - 20855966
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  20855711 ggagatggcttgagttattaaatgattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagttaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgca 20855810  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||||||| | ||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||| | | || |||||||||||||| |||    
T  20855811 catgtcggccttaatggtaaaggagttttaattgctcgaacagtttagggatttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatg 20855910  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
     |||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20855911 ctgaagatcaatagtgatttcttggatagtatcagagaagcgcaacaagttgatgt 20855966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 20939014 - 20939269
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||| ||    
T  20939014 ggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttaaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaatgttgca 20939113  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||  |  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| || ||||| |||    
T  20939114 tatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttatagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacaattggggatg 20939213  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
     ||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  20939214 ctgaaaattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgt 20939269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 20834851 - 20835096
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | ||    
T  20834851 ggagatggttggagttgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgctgca 20834950  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  | |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||   ||| |||||||| |||||||| |||    
T  20834951 tatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattaacacctcagagtgttcagttggggatg 20835050  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaac 246  Q
     |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20835051 ctgaagattaataatgatttcttgaatagtatccgagaagcacaac 20835096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Original strand, 24098556 - 24098794
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || || |    
T  24098556 agatggttagatcttttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacattgcata 24098655  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||  ||| |||||||| |||||||| ||| |    
T  24098656 tgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgct 24098755  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24098756 gaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24098794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 31538948 - 31539188
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||    
T  31538948 ggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgca 31539047  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    | |||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| ||| |||||| | |||||||| |||    
T  31539048 cgtgtcagctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttgggaatg 31539147  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  31539148 ttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 31539188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16373921 - 16373707
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  16373921 ttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatgg 16373822  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | ||||| || ||||| || || |||||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| || |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  16373821 ttaaggagttcgagttgcttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaagattgatagtga 16373722  T
Q  218 attcttgaatagtat 232  Q
    ||||||||| |||||    
T  16373721 attcttgaaaagtat 16373707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21750322 - 21750093
Alignment:
Q  27 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 126  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || |    
T  21750322 tatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagt 21750223  T
Q  127 ttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaa 226  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||| ||  | || |||||| ||| | |  |||||||| |||| || ||| |||| ||  ||||||||||  ||||    
T  21750222 tcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtatgtgaaatgtcatctgagagtgtgaagttagggatgctgaagattgataatgaatttctgaa 21750123  T
Q  227 tagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
     ||||| | |||||||||| | ||||||||    
T  21750122 gagtattaaagaagcacaaaaagttgatgt 21750093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21952317 - 21952113
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  21952317 ggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacattgca 21952218  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| || |||||||| |||||| ||| | | |||||| | |||||||| |||    
T  21952217 tatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaactgtcatctcagagtatacagttggggatg 21952118  T
Q  201 ttgaa 205  Q
     ||||    
T  21952117 ctgaa 21952113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Original strand, 431085 - 431220
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  431085 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 431184  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
     || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||    
T  431185 aaaagaattcgagttgcttgaacagttcagagattt 431220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 125
Target Start/End: Original strand, 21744520 - 21744627
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||    
T  21744520 ttgaaggattatgattttgggttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 21744619  T
Q  118 tgaaggaa 125  Q
    | ||||||    
T  21744620 taaaggaa 21744627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Original strand, 51332461 - 51332687
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  51332461 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgattaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 51332560  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || || || || || || || |||||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  51332561 tcaaagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 51332660  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  51332661 attcctgaaaagtatcaaggaagcaca 51332687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 188
Target Start/End: Original strand, 41352636 - 41352800
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |  |    
T  41352636 gattatgactttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagag 41352735  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
    | ||||||||||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  41352736 agtttgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 41352800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20295818 - 20295580
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || || || ||||    
T  20295818 agatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccaccctggtaaggccaatgtagttgctgatgctttgagcaggaaaactttgcaca 20295719  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| ||  |||||| ||| |||||||| ||  | ||  |||||||||| || ||  | || |||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||| |    
T  20295718 tgtctgctttgatggcgaaagaatttgaattgttagaatagtttagagacttgagtttggtctgtgaattgtcacctcagagtattcagttggggatgct 20295619  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||| ||  ||| | | |||||||| |||||| |||||||    
T  20295618 gaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 20295580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 16349564 - 16349664
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16349564 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16349663  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  16349664 t 16349664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 188
Target Start/End: Original strand, 33390000 - 33390167
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  33390000 aaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtca 33390099  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
      || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  33390100 gagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 33390167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 21838341 - 21838241
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  21838341 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 21838242  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  21838241 t 21838241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 22110413 - 22110277
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||||    
T  22110413 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtcctctatgatgg 22110314  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
    | || || |||||||| || ||  |||||||||||||    
T  22110313 taaaagagtttgagttgcttgaatagtttagagattt 22110277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 22114262 - 22114126
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||||    
T  22114262 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtcctctatgatgg 22114163  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
    | || || |||||||| || ||  |||||||||||||    
T  22114162 taaaagagtttgagttgcttgaatagtttagagattt 22114126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19107759 - 19107625
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||    
T  19107759 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgtatatgtccgctatgatgg 19107660  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
    | |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  19107659 ttagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 19107625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21831694 - 21831468
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  21831694 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 21831595  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  21831594 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 21831495  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  21831494 attcctgaaaagtatcaaggaagcaca 21831468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 188
Target Start/End: Original strand, 16077630 - 16077794
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||||| |  |    
T  16077630 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccttgaggaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagag 16077729  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
    | ||||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  16077730 agtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 16077794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Original strand, 19759841 - 19760067
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || ||||||     
T  19759841 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggaaaagctaatgttgttgcagatgcgttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatga 19759940  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    |  | ||||| ||| | || || |||||||||||||| ||  | || |||||| ||| ||| ||||||||| |||| |  ||| |||| ||  ||| |||    
T  19759941 tctaagaattggagctgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttagaaatgctgaagattgatagtga 19760040  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    |||  |||||||||| | |||||||||    
T  19760041 atttatgaatagtataaaagaagcaca 19760067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21025564 - 21025394
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  21025564 ttgaaagattatgaatttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatggtgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 21025465  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  21025464 ttagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 21025394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 171
Target Start/End: Original strand, 21234700 - 21234852
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||  |||||||    
T  21234700 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtccgctttgatggt 21234799  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 171  Q
     |  || || |||||||| || ||||| |||||||| ||  | ||||||||||    
T  21234800 cagagagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaat 21234852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Original strand, 22361213 - 22361450
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    ||||||| |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||||||    
T  22361213 tgaaggactatgattttgagttaagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatatctgctatgatggt 22361312  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 218  Q
     ||  | || ||||| || || ||||| |||||||| ||  | ||||||||| ||| | |  | |||||| || | || ||| |||| ||  ||||||||    
T  22361313 aaaatagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatcttaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaa 22361412  T
Q  219 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
    || ||||| ||||| | ||||||| || | ||||||||    
T  22361413 tttttgaagagtattaaagaagcataaaaagttgatgt 22361450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 97
Target Start/End: Original strand, 24793585 - 24793664
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 97  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  24793585 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaaaacgtt 24793664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Original strand, 17043983 - 17044059
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 94  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  17043983 ttgaaggattacgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgccttgagcaggaagac 17044059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 257
Target Start/End: Original strand, 23099455 - 23099693
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23099455 tgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggt 23099554  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 218  Q
     |||||||||||||| || || ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||     
T  23099555 aaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctggtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtgat 23099654  T
Q  219 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23099655 ttcttgaaaagtatcagagaagcgcaacaagttgatgtc 23099693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 27209591 - 27209847
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||    
T  27209591 ggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagtcgcagatgcgttgagtagaaagacattgca 27209690  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||| || || |||||  |||||||||| || || || || |||||||| | | | || |||||||||||||| |||    
T  27209691 catgtccgccttgatggtaaaggaattcgaattgctcgaatagtttagagacttgagtctcgtatgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttgggtatg 27209790  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27209791 ctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 27209847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23277800 - 23277560
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  23277800 ggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgca 23277701  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||||  | ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| |||||||| ||     
T  23277700 catgtctgctatgatggtaaaagaatttgatctgctatagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatt 23277601  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     |||| || || | ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23277600 ctgaagattaacagtgacttcttgaatagtatccgagaagc 23277560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24949614 - 24949371
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  24949614 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttggtttgaattaccattctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgttgca 24949515  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||| ||  |||||||||| |||||||| ||  | || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||  |||||||| |||||||| |||    
T  24949514 catgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgttagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacttcagagtgttcagttggggatg 24949415  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
     |||| || |  | ||| |||||  |||||||| ||||||||||    
T  24949414 ctgaagattatcagtgatttcttagatagtatccgagaagcaca 24949371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23111743 - 23111517
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  23111743 ttgaaggactatgattttagtttgaattatcatccaagtaaagccaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 23111644  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || || ||| |||| || ||  ||||||||||| | || ||||||||||| |||| ||| |||| |||| ||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  23111643 taaaagagttttagttgcttgaagagtttagagatctgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagattgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtga 23111544  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  23111543 attcttgaacagtattaaagaagcaca 23111517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1064775 - 1064535
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||    
T  1064775 ggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgca 1064676  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||    
T  1064675 catgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatg 1064576  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||| |||||  |||||||    
T  1064575 ttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtattcgagaagc 1064535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20829281 - 20829043
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  20829281 agatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtgaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcaca 20829182  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||    
T  20829181 tgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatgtt 20829082  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  20829081 gaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 20829043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31831682 - 31831450
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||    
T  31831682 ggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttaca 31831583  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||    
T  31831582 catgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatg 31831483  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatc 233  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||| ||||||    
T  31831482 ttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatc 31831450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23294959 - 23294719
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  23294959 ggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatttggtggcagatgcgttgagcaggaagacgttgca 23294860  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||  |  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| |  ||||||| |||    
T  23294859 tatgtctgctttaatggtaaaagaatttgatttgttatagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtattaagttggggatg 23294760  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     |||| || || | ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23294759 ctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 23294719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 19651469 - 19651709
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||| | ||    
T  19651469 ggagatggttagagctgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcctaggaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgctgca 19651568  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||    |||||||| ||||| || || ||  ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| || ||||| |||    
T  19651569 tatgtctgcttcaatggtgaaagaattcgatttgctatagcagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattggggatg 19651668  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19651669 ctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 19651709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24711041 - 24710803
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  24711041 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 24710942  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  24710941 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 24710842  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
    |||  |||| |||||||  ||||||||| | ||||||||    
T  24710841 atttctgaaaagtatcaaggaagcacaaaaagttgatgt 24710803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 16923896 - 16923796
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16923896 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16923797  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  16923796 t 16923796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 16926367 - 16926267
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16926367 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16926268  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  16926267 t 16926267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 16983159 - 16983059
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16983159 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16983060  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  16983059 t 16983059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 17000007 - 16999907
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  17000007 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16999908  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  16999907 t 16999907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 17064724 - 17064624
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  17064724 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 17064625  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  17064624 t 17064624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 22324292 - 22324392
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  22324292 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 22324391  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  22324392 t 22324392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 27219023 - 27218923
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27219023 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27218924  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  27218923 t 27218923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24676489 - 24676326
Alignment:
Q  25 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 124  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |  ||    
T  24676489 attatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagaga 24676390  T
Q  125 atttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
     || |||||||| || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  24676389 gttcgagttacttgaacagtttagagatatgagcttggtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 24676326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23067391 - 23067262
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  23067391 gattatgattttgagttga-ctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtagaaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagg 23067293  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
    | || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  23067292 agttcgagttgcttgaacagttcagagattt 23067262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 27372276 - 27372142
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27372276 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27372177  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
    | |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  27372176 tcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 27372142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 44385005 - 44385105
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  44385005 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 44385104  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  44385105 t 44385105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Original strand, 23107167 - 23107302
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  23107167 tgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgcgtaaagctaatgttgttacagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 23107266  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
     || || || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  23107267 aaaagagttcgagttacttgaacagttcagagattt 23107302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 12575377 - 12575227
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | ||    
T  12575377 ggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagacactgca 12575278  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 151  Q
     ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  12575277 tatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 12575227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 152
Target Start/End: Original strand, 21144478 - 21144611
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21144478 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 21144577  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
     |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  21144578 cagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 21144611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 10869857 - 10869757
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  10869857 ttgaaggattatgactttggtctgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 10869758  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  10869757 t 10869757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 41607821 - 41607921
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  41607821 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 41607920  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  41607921 t 41607921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 27788764 - 27788615
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | ||    
T  27788764 ggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacact-ca 27788666  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 151  Q
     ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  27788665 tatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 27788615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Original strand, 24876186 - 24876285
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  24876186 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 24876285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 24263377 - 24263279
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatg 116  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||    
T  24263377 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 24263279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 45533349 - 45533113
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||| | ||||| || |||||||| |    
T  45533349 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaacattaaatatgtctgctatgatggtta 45533250  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa-t 219  Q
      || || ||||| || ||  |||| ||||| || ||  | ||||||||| |||  || ||||||||| | ||||| |||||||| ||||| || ||| |    
T  45533249 gagagttggagttgcttgaatagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccacagagtgtgaaattggggatgttgaagatcaacaacgaatt 45533150  T
Q  220 tcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
    | ||| ||||||||| ||| || ||| |||| |||||    
T  45533149 ttttggatagtatcaaagaggctcaaaaggtggatgt 45533113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 152
Target Start/End: Original strand, 21324711 - 21324836
Alignment:
Q  27 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 126  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |  || |    
T  21324711 tatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgttgttgtagacgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggttagagagt 21324810  T
Q  127 ttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
    | |||||||| || ||||||||||||    
T  21324811 tcgagttacttgaacagtttagagat 21324836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 188
Target Start/End: Original strand, 24706916 - 24707088
Alignment:
Q  16 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 115  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||  |||| || |||||  |||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||    
T  24706916 tattgaaagattatgactttggtttgaattattatccaagtaaggctaatgtttttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgcattgat 24707015  T
Q  116 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
    ||| |  || || |||||||| || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  24707016 ggttagagagttcgagttacttgaacagtttagagatatgagcttggtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 24707088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 257
Target Start/End: Original strand, 27364713 - 27364754
Alignment:
Q  216 gaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27364713 gaattcttgaatagtatcaaagaagcgcaacaggttgatgtc 27364754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1284 - 1051
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1284 gattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtagaaagacattgcacatgtcggccatgatggtgaagg 1185  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 223  Q
    |||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||    
T  1184 aattcgaattgcttgaacagtttagagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcaaagtgtgcagttgggtatattgaagatcaatagtgatttctt 1085  T
Q  224 gaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1084 gaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 68794 - 68540
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  68794 ggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgca 68695  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||    
T  68694 catgtcggccatgatggtaaaggaattcgaatttcttgaacagtttagagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcagagtgtacagttgggtatg 68595  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatg 255  Q
     |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  68594 ctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatg 68540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 3835 - 4080
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  3835 ggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccacccgggtaaagctaatgtggttgcagatgccttgagtagcaagacgttgca 3934  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||  |||  ||||||| |||||||| |||    
T  3935 tatgtctgctttgatggtgaaagaatttgagttgctagagcattttagagacttgagtcttgtttgtgaattgacaccttagagtgtacagttggggatg 4034  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaac 246  Q
     |||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4035 ctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaac 4080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 12790 - 13039
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || ||    
T  12790 ggagatggttggagctattgaaggattatgattttggcttgaattaccatcatggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacattgca 12889  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     |||||  |  ||||||||||| ||||||| || || || | ||||||       || ||||| ||||| |||| ||| |||||| | |||||||| |||    
T  12890 tatgtctcctttgatggtgaagcaatttgaattgctagaactgtttag-------agtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtatacagttgggtatg 12982  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||| || |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||    
T  12983 ctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatacgagaagcacaacaagtggatgtc 13039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 2212 - 2468
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | || ||    
T  2212 ggagatggttagagctgttgaaggattatgattttagtttgaactatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaggcattgca 2311  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||    
T  2312 tatgtcggcgttgatggtgaaagaatttgagttgcttgagcagttcagagacttgagtctggtttgtgaattgacacctcagagtgtgcagttgggtatg 2411  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    |||||||| || | ||||||||||| ||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  2412 ttgaaaattaacagtgaattcttgagtagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 2468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Original strand, 20984886 - 20985125
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  20984886 ttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcagaaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 20984985  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | ||||| |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  20984986 taaaggagtttgagttgctatagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtga 20985085  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||    
T  20985086 tttcttgaacagtatcagagaagcacagaaagttgatgtc 20985125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21841859 - 21841620
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  21841859 ttgaaggattatgatttctgtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttaaacatgtctgctatgatgg 21841760  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| |||    
T  21841759 taaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttaagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtga 21841660  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21841659 tttcttgaacagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 21841620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19852853 - 19852630
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  19852853 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 19852754  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || || |||||||| |||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||| |||    
T  19852753 taaaggagtttgagttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtacaattgggtatgttgaagattaatagtga 19852654  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  19852653 tttcttgaatagtatcagagaagc 19852630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19858889 - 19858666
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  19858889 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 19858790  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||| |||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||| |||    
T  19858789 taaaggagtttgagttgcttgagcagttcagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtacaattgggtatgttgaagattaatagtga 19858690  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  19858689 tttcttgaatagtatcagagaagc 19858666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23656366 - 23656130
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  23656366 aaggattatgattttggtttgaattactatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaa 23656267  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 220  Q
    | |||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||| | |||||||| ||| |||| || |||| ||| ||    
T  23656266 aagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtatacagttgggtatgctgaagattaatagtgattt 23656167  T
Q  221 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  23656166 cttgagtagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 23656130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22372375 - 22372150
Alignment:
Q  16 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 115  Q
    |||||||||| ||||||||| | || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  22372375 tattgaaggactatgattttagtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgat 22372276  T
Q  116 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 215  Q
    ||| || || |||||||| || || |||||||||||  | || |||||||||   |||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  22372275 ggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctgagtcttgtttgtttgttgtcatctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagt 22372176  T
Q  216 gaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    || ||||| || ||||||||||||||    
T  22372175 gatttcttaaacagtatcagagaagc 22372150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 20974978 - 20975228
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | ||    
T  20974978 ggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgctgca 20975077  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     |||||     || ||||||| |||||  | || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||    
T  20975078 tatgtc-----tgctggtgaaagaattccattttctagaacagtttagagagttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggggatg 20975172  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
     |||| || || | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  20975173 ctgaagattaaaagtgatttcttgaatagtataagagaagcaaaacaagtggatgt 20975228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14566601 - 14566361
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || ||    
T  14566601 ggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgca 14566502  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||    
T  14566501 catgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatg 14566402  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  14566401 ttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 14566361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Original strand, 20395471 - 20395685
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| |  |||||||    
T  20395471 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactttacatatgtcagttatgatgg 20395570  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || || || ||| | ||||| |||||||||||  | ||  | ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||| |||    
T  20395571 ttaaagagttggagctgctcgaacagtttagagacctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgttgaagattaatagtga 20395670  T
Q  218 attcttgaatagtat 232  Q
    ||| |||||||||||    
T  20395671 atttttgaatagtat 20395685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Original strand, 31415795 - 31416036
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || || |    
T  31415795 agatggttagaactgttgaaggattatgattttggcttgaattaccattctggtaaagccaatgtggttgctgacgcgttgagcaggaagacattgcata 31415894  T
Q  103 tgtcggcca---tgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcat 199  Q
    |||| ||     ||||||||||||||||||| || || || |||||||| || || || |||||  |||| |||  ||| ||||||||||||||||| ||    
T  31415895 tgtctgctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagggacttgagtcttgtcagtgagttgacacctcagagtgtgcagttggggat 31415994  T
Q  200 gttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    | |||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  31415995 gctgaagattaatagtgaattcttgaatagtatccgagaagc 31416036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19979408 - 19979170
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || ||||||||    
T  19979408 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtataaagacattgcatatgtccgctatgatggt 19979309  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 218  Q
     |  || |||||||| || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||||||  ||| ||||    
T  19979308 tagagagtttgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaaaattgatagtgaa 19979209  T
Q  219 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    || ||||| ||||||| |||||||||  | |||||||||    
T  19979208 tttttgaagagtatcaaagaagcacagaaagttgatgtc 19979170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 241
Target Start/End: Original strand, 22376791 - 22377016
Alignment:
Q  16 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| || |||||    
T  22376791 tattgaaagattatgattttgggttgaattattatctaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcatatgtccgctatgat 22376890  T
Q  116 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 215  Q
    ||| || || |||||||| || || |||||||||||| | ||  | ||||||||||||| ||| ||||||||| || || | ||| | || ||  ||| |    
T  22376891 ggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgtgaatgctaaagattgatagt 22376990  T
Q  216 gaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22376991 gaattcttgaacagtatcaaagaagc 22377016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 241
Target Start/End: Original strand, 22382966 - 22383191
Alignment:
Q  16 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| || |||||    
T  22382966 tattgaaagattatgattttgggttgaattattatctaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcatatgtccgctatgat 22383065  T
Q  116 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 215  Q
    ||| || || |||||||| || || |||||||||||| | ||  | ||||||||||||| ||| ||||||||| || || | ||| | || ||  ||| |    
T  22383066 ggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgtgaatgctaaagattgatagt 22383165  T
Q  216 gaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22383166 gaattcttgaacagtatcaaagaagc 22383191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 29302748 - 29302988
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || || || || || ||    
T  29302748 ggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaggctaatgtggttgcagatgcgttaagcaggaaaacattgca 29302847  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||||| ||| |||||| | | |||||| |||    
T  29302848 tatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttggaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacggttggggatg 29302947  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     |||| ||  ||| ||| ||||| || |||||| |||||||    
T  29302948 ctgaagattgatagtgatttcttaaacagtatccgagaagc 29302988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Original strand, 20009260 - 20009482
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  20009260 ttgaaggactgtgattttggtttgaattatcaccccggtaaa-ctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 20009358  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || || |||||||| || || ||||| ||||| || || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||| |||    
T  20009359 taaaagagtttgagttgcttgaacagttcagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcaattgggtatgttgaagattaatagtga 20009458  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     |||||||| | ||||| ||||||    
T  20009459 tttcttgaacaatatcatagaagc 20009482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6605115 - 6604877
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || ||||    
T  6605115 agatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcaca 6605016  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| ||  |||||||||| || || |||||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||    
T  6605015 tgtctgctttgatggtgaaagagttcgagttgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatgtt 6604916  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||| ||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  6604915 gaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 6604877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 205
Target Start/End: Original strand, 21324614 - 21324794
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| | | |||||||||| |    
T  21324614 gattacgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgttgcatgtgtctg-cttgatggtgaaag 21324712  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 205  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  21324713 aatttgatttgctagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtttagttggggatgctgaa 21324794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20389541 - 20389317
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  20389541 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagattctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 20389442  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || || ||| | || || || |||||||| || || ||||| |||||||| ||||  || ||||||||| ||||| | |||||||| ||||| | |||    
T  20389441 ttaaagagttttatttgcttgaacagtttagggacttgagcctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgagtatgttgaagatcaacagtga 20389342  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagca 242  Q
     |||||||| | ||||| |||||||    
T  20389341 gttcttgaacaatatcaaagaagca 20389317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 124
Target Start/End: Original strand, 21921082 - 21921181
Alignment:
Q  25 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  21921082 attatgattttgagttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacttttcacatgtctgccatgatggtaaagga 21921181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6680547 - 6680330
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||||||| ||  |||||||||| |    
T  6680547 gattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaag 6680448  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 223  Q
    | || |||||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||    
T  6680447 agttcgagttgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttctt 6680348  T
Q  224 gaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  6680347 gaacagtatccgagaagc 6680330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 188
Target Start/End: Original strand, 19483409 - 19483573
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |  |    
T  19483409 gattatgactttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagag 19483508  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
    | ||||||||||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  19483509 agtttgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 19483573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23651477 - 23651313
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| | ||    
T  23651477 gattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttaggg 23651378  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
    | || |||||  | || |||||||||||||| ||| | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  23651377 agttcgagttgttggaacagtttagagatttgagcttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 23651313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 21252385 - 21252250
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21252385 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21252286  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  21252285 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 21252250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 16270546 - 16270786
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || ||    
T  16270546 ggagatggttagagttactaaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgca 16270645  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||| ||  | ||||| || ||||| |||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||| ||| ||| |||||| | |||||||| |||    
T  16270646 catgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcacctcagagtatacagttggggatg 16270745  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     |||| ||  ||| | | |||||||| |||||| |||||||    
T  16270746 ctgaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 16270786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 152
Target Start/End: Original strand, 17673362 - 17673496
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  17673362 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 17673461  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
    | |  || || || ||||| || ||||||||||||    
T  17673462 tcagagagttcgaattacttgaacagtttagagat 17673496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Original strand, 20017602 - 20017828
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  20017602 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 20017701  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  20017702 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 20017801  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    |||  |||| |||||||  ||||||||    
T  20017802 atttctgaaaagtatcaaggaagcaca 20017828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 257
Target Start/End: Original strand, 21165878 - 21166116
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  21165878 tgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 21165977  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 218  Q
     |  || || ||||| || || |||||||||||| | ||| | || ||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||||    
T  21165978 tagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtgtgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaa 21166077  T
Q  219 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    ||  |||| ||||||| |||||||||  | |||||||||    
T  21166078 tttctgaagagtatcaaagaagcacataaagttgatgtc 21166116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23886466 - 23886252
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||     
T  23886466 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatcctggtaaaactaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacacatgtccgccatgatga 23886367  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || || || ||| | || || || ||||||||||| ||  | || |||||||||| ||| ||||||||| |||| || ||| |||| ||  ||| |||    
T  23886366 tcaaagagttggagctgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtga 23886267  T
Q  218 attcttgaatagtat 232  Q
    |||  ||||||||||    
T  23886266 atttctgaatagtat 23886252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 31570164 - 31570314
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | ||    
T  31570164 ggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacacttca 31570263  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 151  Q
     ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  31570264 tatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttactggaacagtttagaga 31570314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 19114132 - 19114032
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  19114132 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 19114033  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  19114032 t 19114032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 106
Target Start/End: Original strand, 22247772 - 22247860
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  22247772 ttgaaggattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtc 22247860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 803064 - 803235
Alignment:
Q  70 ttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 169  Q
    |||| ||||| |||||||| || || || |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||    
T  803064 ttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtga 803163  T
Q  170 attgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  803164 attgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 803235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Original strand, 21393205 - 21393340
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21393205 tgaaagattctgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21393304  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
     ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  21393305 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 21393340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Original strand, 21787699 - 21787834
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21787699 tgaaagattctgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21787798  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
     ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  21787799 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 21787834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22041301 - 22041131
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||||    
T  22041301 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagccaatgttgttgcggatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatgg 22041202  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
    | |  || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  22041201 ttagagagtttgagttacttgaacagttcagtgatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 22041131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 21043886 - 21043753
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21043886 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctctgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21043787  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
    ||| || || ||||| || || ||||| ||||||    
T  21043786 gaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagat 21043753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12306217 - 12305977
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    ||||||||||| || || | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  | || || || ||    
T  12306217 ggagatggttatagttactaaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagctgtaaaacattgca 12306118  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  | ||||| || ||||| |||||  | || ||||||||||| || || || || |||||||||| ||| |||||| | |||||||| |||    
T  12306117 tatgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtctagtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggggatg 12306018  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||| ||  ||| | | |||||||| |||||| |||||||    
T  12306017 ttgaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 12305977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 18858019 - 18857919
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  18858019 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatgg 18857920  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  18857919 t 18857919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 171
Target Start/End: Original strand, 30312484 - 30312636
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  30312484 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 30312583  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 171  Q
     |  || || |||||||| || ||||| |||||||| ||  | ||||||||||    
T  30312584 tagagagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaat 30312636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 1267674 - 1267544
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||  | || || || || |||||| | || |    
T  1267674 gattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagtcaatgtggttgcagatgcgttgaggaggaagacactgcatatatctgctatgatgataaaag 1267575  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||    
T  1267574 aatttgatttgctagagcagtttagagattt 1267544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22052299 - 22052066
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||  | || ||||| || |||||||| || |    
T  22052299 gattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaag 22052200  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 223  Q
    ||||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||| ||||  || || ||  |  ||||||||||| |||| || |||| ||| |||||    
T  22052199 aatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtctggtatgtgagttgtcgcctcaaagcatatagttgggcatgctgaagattaatagtgatttctt 22052100  T
Q  224 gaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    |  ||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  22052099 gggtagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 22052066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 27355993 - 27355924
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttg 72  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  27355993 agatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 27355924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 15534824 - 15534689
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||  |||||||    
T  15534824 tgaaagattatgactttggtttgaattatgatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcacatgtccgctttgatggt 15534725  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
     |  || || |||||||| || || |||||||||||    
T  15534724 tagagagttcgagttacttgaacaatttagagattt 15534689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 32601586 - 32601433
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||||    
T  32601586 ttgaaggattacgactttggtttgaatcatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatgg 32601487  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 171  Q
    | |  || || |||||||| || || || |||||||| ||  | ||||||||||    
T  32601486 ttatagagttcgagttacttgaacaattcagagatttgagtttggtttgtgaat 32601433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 19869152 - 19869044
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||   |||  |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| ||| | || ||    
T  19869152 ggagatggttggagttcttaaaggactatgattttgaactgagttatcatccagggaaggccaatgtagtagctgatgccttgagtaggaagtccttgca 19869053  T
Q  101 catgtcggc 109  Q
    |||||||||    
T  19869052 catgtcggc 19869044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 257
Target Start/End: Original strand, 16407495 - 16407623
Alignment:
Q  129 gagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaata 228  Q
    |||||| | ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || | | ||||||||| |  |||| ||| |||| || |||| ||||||  |||| |    
T  16407495 gagttaattgagcagtttagagatatgagcttggtttgtgaatggtcatctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattaatagtgaatttctgaaga 16407594  T
Q  229 gtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    |||| | |||||||||| | |||||||||    
T  16407595 gtattaaagaagcacaaaaagttgatgtc 16407623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 434 - 690
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  434 ggagatgcttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgttgca 533  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||    
T  534 catgtctgctatgatggtgaaagaatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggggatg 633  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||| || || | ||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  634 ctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgggaagcacaacaagtggatgtc 690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13464 - 13239
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || | ||| |||||||||||    
T  13464 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtcaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcataagtctgccatgatggt 13365  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 218  Q
     ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||| | || |||||| ||| | |  |||||||| || | || ||| |||| ||  ||||||||    
T  13364 aaaggagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaa 13265  T
Q  219 ttcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||||    
T  13264 tttctgaagagtattaaagaagcaca 13239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 7426 - 7291
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  7426 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggt 7327  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  7326 aaatgagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 7291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 11200 - 10974
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  11200 ttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 11101  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||    
T  11100 taaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagattaatagtga 11001  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  11000 tttcttgaatagtatcagagaagcaca 10974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27901779 - 27901525
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  27901779 ggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgca 27901680  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| |||    
T  27901679 catgtcggccatgatggtaaaggaattcgaattacttgaacagtttagagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcaaagtgtaaagttgggtatg 27901580  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatg 255  Q
     |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27901579 ctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtataagagaagcacaacaagttgatg 27901525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Original strand, 15002260 - 15002499
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15002260 ttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtcggctatgatgg 15002359  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || || |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| |||    
T  15002360 taaaagagtttgagttgctatagcagtttagagactttagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtga 15002459  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15002460 tttcttgaacagtatcagagaagcacaacaagatgatgtc 15002499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 244
Target Start/End: Original strand, 15358001 - 15358242
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  15358001 agatggtgagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacgttgcata 15358100  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||| ||| |  ||||| ||||||| || || ||||| |||||||||  ||| || ||||| ||||| || ||| |    
T  15358101 tgtctgctatgatggtaaaggaatttgatttaatatagcagcttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcatagtgtacagttagggatgct 15358200  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    ||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15358201 gaagattaatagtgacttcttgaatagtatccgagaagcaca 15358242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 254
Target Start/End: Original strand, 15413922 - 15414158
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || |||||||    
T  15413922 ttgaaagactatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatatgtcagctatgatgg 15414021  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || ||||||||||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| |||| ||| || |||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  15414022 ttaaagaatttgagttgctggagcattttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaatagtga 15414121  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgat 254  Q
     |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||    
T  15414122 gttcttgaatagtattaaagaagcacagaaggttgat 15414158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 29452416 - 29452656
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||    
T  29452416 ggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgca 29452515  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||    
T  29452516 catgtctgctttgatggtgaaggagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatg 29452615  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  29452616 ttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 29452656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33224311 - 33224076
Alignment:
Q  6 tggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgt 105  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||    
T  33224311 tggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacattacatatgt 33224212  T
Q  106 cggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 205  Q
    | ||  ||||||||||||||||||| ||  | || |||||||| || || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||| ||| |||     
T  33224211 ctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagggacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgctgag 33224112  T
Q  206 aatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     || |||| ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  33224111 gattaatagtgatttcttgaatagtacccgagaagc 33224076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 3263673 - 3263913
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || ||    
T  3263673 ggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgca 3263772  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||    
T  3263773 catgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatg 3263872  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  3263873 ttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 3263913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15247297 - 15247061
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  15247297 aaggattatgactttggtttgaattaccattcgggtaaagctaatgtggttgcagatgttttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaa 15247198  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 220  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| | ||| |||  ||  |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| ||| ||    
T  15247197 aagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctatgagttgacacttcagagtgtacagttggggatgctgaagattaatagtgattt 15247098  T
Q  221 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  15247097 cttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 15247061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15320512 - 15320317
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||| |||||  |||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||  ||||||    
T  15320512 ttgaaggattatgattttggtatgaattatcacccaggtaaagctaatgtgattgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctttgatgg 15320413  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaata 213  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || || |||| ||| |||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  15320412 taaaggattttgagttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttatgagttgtcacctcagagtgtgtagttgggtatgttgaagatcaata 15320317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16149104 - 16148873
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||| || ||    
T  16149104 ggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatacgttgagcaggaagacattgca 16149005  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||| ||||||| || ||||| || ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| | |||||||| |||    
T  16149004 tatgtccgccttgatggtaaaagaattcgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttggggatg 16148905  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 232  Q
     |||| || |||| ||| |||||||| |||||    
T  16148904 ctgaagattaatagtgatttcttgaacagtat 16148873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16153250 - 16153019
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||| || ||    
T  16153250 ggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatacgttgagcaggaagacattgca 16153151  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||| ||||||| || ||||| || ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| | |||||||| |||    
T  16153150 tatgtccgccttgatggtaaaagaattcgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttggggatg 16153051  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 232  Q
     |||| || |||| ||| |||||||| |||||    
T  16153050 ctgaagattaatagtgatttcttgaacagtat 16153019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15078918 - 15078785
Alignment:
Q  111 atgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatca 210  Q
    |||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15078918 atgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaagatca 15078819  T
Q  211 ataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15078818 atagtgaattcttgaatagtatcagggaagcaca 15078785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8707296 - 8707088
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  8707296 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 8707197  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | |  || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||||||| ||||  || || |||||| ||||||| ||| |||| ||||| | |||    
T  8707196 ttagagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcatagtgtgaagttgggtatgctgaagatcaacagtga 8707097  T
Q  218 attcttgaa 226  Q
     ||||||||    
T  8707096 gttcttgaa 8707088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 11206110 - 11206350
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || ||    
T  11206110 ggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttgagcaggaaaactttgca 11206209  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||| ||  |||||||||| |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| | |||||||| |||    
T  11206210 catgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttggggatg 11206309  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  11206310 ttgaagattgatagtgatttcttgaacagtatctgagaagc 11206350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 188
Target Start/End: Original strand, 16354079 - 16354251
Alignment:
Q  16 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 115  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||    
T  16354079 tattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgat 16354178  T
Q  116 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
    ||| |  || || ||||||||  |||||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  16354179 ggttagagagttcgagttacttaagcagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 16354251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14695489 - 14695266
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||| || ||||||     
T  14695489 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagaagttgcatatgtccgctatgatgt 14695390  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || || |||||||| ||  |  | ||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| | || ||  ||| |||    
T  14695389 taaaagagtttgagttgcttaaaaaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgatagtga 14695290  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  14695289 attcttgaacagtatcaaagaagc 14695266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15071737 - 15071602
Alignment:
Q  16 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 115  Q
    |||||||||| ||||||||| | || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  15071737 tattgaaggactatgattttagtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgat 15071638  T
Q  116 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 151  Q
    ||| || || |||||||| || || |||||||||||    
T  15071637 ggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagaga 15071602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Original strand, 15146521 - 15146672
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  15146521 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgcctcgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 15146620  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 169  Q
    | || || |||||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  15146621 ttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtga 15146672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 8387788 - 8387688
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  8387788 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 8387689  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  8387688 t 8387688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 12477976 - 12477876
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  12477976 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 12477877  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  12477876 t 12477876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 18298581 - 18298481
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  18298581 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 18298482  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  18298481 t 18298481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 19777429 - 19777529
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  19777429 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 19777528  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  19777529 t 19777529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 29038040 - 29038140
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  29038040 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 29038139  T
Q  118 t 118  Q
    |    
T  29038140 t 29038140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 1648156 - 1648411
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||   ||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  1648156 ggagatggttagagctgttgaaagactatgactttggtttgaattaccaccctaataaggctaatgttgtggcggatgcgttgagtaggaagacattgca 1648255  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||| ||||||| |||||  | |||||||| |||| ||| || ||| |  | || || |||    
T  1648256 catgtcggccatgatggtaaaggaattcgaattgcttgaacagcttagagacttaagtttagtttgtgagttgtcacctcaaagtattaaatttgggatg 1648355  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
     |||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  1648356 ctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagctcaacaggtggatgt 1648411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23957120 - 23956953
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  23957120 aaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtca 23957021  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
      || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  23957020 gagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 23956953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Original strand, 8052259 - 8052485
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  8052259 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 8052358  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  8052359 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 8052458  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    |||  |||| |||||||  ||||||||    
T  8052459 atttctgaaaagtatcaaggaagcaca 8052485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 14160845 - 14160710
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  14160845 tgaaggattttgattttggcttgaattatcatccgggtaaagcgaatgtcgtagctgatgccttaagtagaaagaccttgcatatgtccgctatgatggt 14160746  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
     ||||| ||||| || || ||  | |||||||||||    
T  14160745 taaggagtttgaattgctagaataatttagagattt 14160710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 27712709 - 27712578
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  27712709 aaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtca 27712610  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
      || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  27712609 gagagttcgagttacttgaacagttcagagat 27712578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 51605671 - 51605821
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | ||    
T  51605671 ggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacactcca 51605770  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 151  Q
     ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  51605771 tatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 51605821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 12525051 - 12524918
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||||||    
T  12525051 tgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatggt 12524952  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
     |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  12524951 tagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 12524918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 152
Target Start/End: Original strand, 14850011 - 14850136
Alignment:
Q  27 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 126  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||||| || || |    
T  14850011 tatgattttgggtttaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgctttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctgtgatggtaaaagagt 14850110  T
Q  127 ttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
    ||||||| || |||||||||||||||    
T  14850111 ttgagttgcttgagcagtttagagat 14850136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 14681943 - 14681867
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 94  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  14681943 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 14681867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20892375 - 20892171
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || ||    
T  20892375 ggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgca 20892276  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||  | || ||||||||||| || || || || |||||||||| ||| |||||| | |||||||| |||    
T  20892275 tatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttggaacagtttagagacttgagtctggtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggggatg 20892176  T
Q  201 ttgaa 205  Q
     ||||    
T  20892175 ctgaa 20892171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 40474415 - 40474282
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  40474415 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 40474316  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
     || || || || || || || ||||||||||||    
T  40474315 caaagagttcgaattgcttgaacagtttagagat 40474282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 14302614 - 14302830
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||| || |||||||    
T  14302614 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagatattgcatatgtccgctatgatgg 14302713  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  14302714 tcagagagttcgaatttcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 14302813  T
Q  218 attcttgaatagtatca 234  Q
    |||| |||| |||||||    
T  14302814 attcctgaaaagtatca 14302830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 44660745 - 44660985
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |  || || || ||    
T  44660745 ggaggtggttagagttactgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaacgttgttgctgatgctttgagcaagaaaactttgca 44660844  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| | |||||||| |||    
T  44660845 tatgtctgctttaatggtaaaggaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttgggaatg 44660944  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||||  |||  || |||||||| |||||| |||||||    
T  44660945 ttgaaaattgatagcgacttcttgaacagtatccgagaagc 44660985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 205
Target Start/End: Original strand, 18226082 - 18226269
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||||    
T  18226082 ttgaaagattatgactatggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtcagctttgatgg 18226181  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 205  Q
    | |   | ||||||||||| || | ||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  18226182 ttagaaagtttgagttacttgaacggttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggaatgctgaa 18226269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 154
Target Start/End: Original strand, 18614445 - 18614596
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || || |    
T  18614445 agatggatagaactgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgctgatgccttgagcatgaagacattgcata 18614544  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
    |||| ||  ||||||| |  || ||||||||||| || || || ||||||||    
T  18614545 tgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacaattcagagattt 18614596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 5837 - 5598
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  5837 ttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagaaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 5738  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| |||    
T  5737 taaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtga 5638  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5637 tttcttgaacagtatcagagaagcacaaaaagttgatgtc 5598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 115 - 370
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  115 ggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaaataccatccagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgca 214  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||| | | ||||||||||||||||| |||    
T  215 catgtcggccttgatggtaaaggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcagagtgtgcagttgggtatg 314  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
     |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  315 ctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgt 370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29464 - 29225
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  29464 ttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 29365  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | ||| | |||||||| || |||||||||||||| || |  ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||| |||    
T  29364 taaagaagtttgagttgctagagcagtttagagagttgattcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagattaatagtga 29265  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  29264 tttcttgaataatatcagagaagcacagcaagttgatgtc 29225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 30346 - 30216
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  30346 gattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgtttttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtctgctatgatggtaaagg 30247  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
    | || |||||  | || ||||| ||||||||    
T  30246 agttcgagttggttgaacagttcagagattt 30216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 50217 - 50168
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgt 67  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  50217 ttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgt 50168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 324128 - 323882
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  324128 ggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgttgca 324029  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||| ||  | ||||||||  ||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||    
T  324028 catgtctgctttaatggtgaaataatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgacacctcagagtgttcagttggggatg 323929  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 247  Q
     |||| || || ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  323928 ctgaagattaacaatgatttcttgaagagtatccgagaagcacaaca 323882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 202367 - 202575
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||    
T  202367 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagcaaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtcagctatgatgg 202466  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || || |||||||| || || || |||||||| || || || |||||||| ||||  || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  202467 ttaaagagtttgagttgcttgaacattttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtga 202566  T
Q  218 attcttgaa 226  Q
     ||||||||    
T  202567 gttcttgaa 202575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 118633 - 118477
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| |  ||||||     
T  118633 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgttatgatga 118534  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgt 174  Q
    | || || || ||| | ||||| ||||||||||| || ||  || ||||||||||||    
T  118533 tcaaagagttggagctgctcgaacagtttagagacttgagttttatttgtgaattgt 118477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 1736 - 1992
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  1736 ggagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagcaaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgttgca 1835  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    ||||||  | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| ||||||||  ||||||| |||    
T  1836 catgtctactatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgtaaagttggggatg 1935  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||| || |||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1936 ctgaagattaatagtgatttcttgaacaatatcagagaagcacaacaagttgatgtc 1992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27931 - 27708
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  27931 ttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgtttcacatgtctgctatgatgg 27832  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || || |||||| |||| || || |||||||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  27831 taaaagagtttgagctacttgaacaatttagagacttcagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtga 27732  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     |||||||| ||||||||||||||    
T  27731 tttcttgaacagtatcagagaagc 27708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Original strand, 47933 - 48172
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  47933 ttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggtcgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 48032  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | ||||| ||||||||  | |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  48033 taaaggagtttgagttgttagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtatagttgggtatgttgaaaatcaatagtga 48132  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||    
T  48133 tttcttgaacattatcagagaagcacagcaagttgatgtc 48172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 56729 - 56984
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |  |||||| | ||    
T  56729 ggagatggttagagctgttaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaagaagacgctgca 56828  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||| || ||||||||  |||||  ||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||| | |||||||| |||    
T  56829 catgtctgctatgatggtataggaacatgatttgctagaacagtttagagagttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagttgggaatg 56928  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
     ||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||    
T  56929 ctgagaattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcgcaacaagtggatgt 56984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 244
Target Start/End: Original strand, 24760 - 25001
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |    
T  24760 agatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcagaaagacgttgcata 24859  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||  ||  |||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  | ||||| |||||||||  |||  ||||||| |||||||| |||||    
T  24860 tgtttgctttgatggtgaaagaattcgatttgctagagcagtttagagatttgtgtcttgtctgtgaattgacacctgagagtgtacagttggggatgtt 24959  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    ||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24960 gaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 25001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28641 - 28385
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||  | ||    
T  28641 ggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacactgca 28542  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     || |  ||  ||||||||||  ||||||| || || ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||    
T  28541 tatatgtgctttgatggtgaaataatttgatttgctagagtagtttagagatttgagtcttgtttgtgaattgacacctcagagtgtacagttggggatg 28442  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  28441 ctgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 28385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 34894 - 34638
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||  | ||    
T  34894 ggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacactgca 34795  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     || |  ||  ||||||||||  ||||||| || || ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||    
T  34794 tatatgtgctttgatggtgaaataatttgatttgctagagtagtttagagatttgagtcttgtttgtgaattgacacctcagagtgtacagttggggatg 34695  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  34694 ctgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 34638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 133
Target Start/End: Original strand, 95 - 172
Alignment:
Q  56 taaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagtt 133  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||||  || |||||||| ||||| ||||||||    
T  95 taaagctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaagacgttgcacatgtttgctatgatggtaaaggagtttgagtt 172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 48508 - 48272
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  48508 aaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaa 48409  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 220  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| ||| ||    
T  48408 aggattttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtgattt 48309  T
Q  221 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48308 cttgagtagtatcagagaagcacatcaggttgatgtc 48272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 5183 - 4944
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||    
T  5183 ttgaaggattatgattttggtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaagaagacgttgcacatttctgctatgatgg 5084  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||| | ||| |||| || |||| |||    
T  5083 taaaggagtttgagttgctggagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcaaagtgtacagttgagtatgctgaagattaatagtga 4984  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4983 tttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 4944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13622 - 13379
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  13622 agatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcaca 13523  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| || | ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  |||  ||||||| |||||||| ||| |    
T  13522 tgtctgctacgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacaccttagagtgtacagttggggatgct 13423  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaac 246  Q
    ||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13422 gaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaac 13379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 41102 - 40879
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  41102 aaggattatgattttggttttgattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaa 41003  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 220  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||| ||| ||    
T  41002 aagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagattaatagtgattt 40903  T
Q  221 cttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  40902 cttgaatagtatccgagaagcaca 40879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 46281 - 46524
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||    
T  46281 ggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcacatgccttgagtaggaaaacgttgca 46380  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||| || | |||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||    
T  46381 tatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttagagcagtttagagacttgatccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggggatg 46480  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
     |||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  46481 ctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 46524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 41215 - 41455
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||    
T  41215 ggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgca 41314  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
    |||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||    
T  41315 catgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatg 41414  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  41415 ttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 41455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3314 - 3098
Alignment:
Q  25 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 124  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||||| || ||    
T  3314 attatgattgtgggttgaattattatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgcattgatggtaaaaga 3215  T
Q  125 atttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttg 224  Q
     |||||||| || || || ||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | || ||  ||| |||||||||     
T  3214 gtttgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgctaaagattgatagtgaattctta 3115  T
Q  225 aatagtatcagagaagc 241  Q
    |||||||||| ||||||    
T  3114 aatagtatcaaagaagc 3098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Original strand, 89344 - 89583
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  89344 ttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 89443  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||| |||    
T  89444 taaacgaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagattaatagtga 89543  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  89544 tttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 89583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Original strand, 90022 - 90261
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  90022 ttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 90121  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||| |||    
T  90122 taaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagattaatagtga 90221  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  90222 tttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 90261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15519 - 15290
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||| || ||||| || |||||||    
T  15519 ttgaaggattatgattttgggttgaattaccatctgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagaggttgcatatgtctgctatgatgg 15420  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| |||    
T  15419 taaaggagtttgagttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtga 15320  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaaca 247  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15319 tttcttgaatagtatcagagaagcacaaca 15290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6154 - 5918
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||  |  |||||||| |    
T  6154 aaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttgcacatgtttgttatgatggtaa 6055  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 220  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| | ||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||| ||| ||    
T  6054 aggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctatgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagattaatagtgattt 5955  T
Q  221 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5954 cttgaatagtatccgagaagcacaacaagttgatgtc 5918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2112 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold2112
Description:

Target: scaffold2112; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 385 - 146
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  385 ttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatatggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 286  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | ||||| |||| ||| || ||  |||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| |||    
T  285 taaaggagtttgtgttgcttgaatagttcagagacttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtga 186  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  185 tttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagttgatgtc 146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Original strand, 50774 - 51013
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| || || ||||| |||||||| || |||||||    
T  50774 ttgaaggattatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaaaacgttgcacatgtctgctatgatgg 50873  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||  ||| |||| || |||| |||    
T  50874 taaaggagtttgagttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggctatgctgaagattaatagtga 50973  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  50974 tttcttgaatagtattagagaagcacatcaagttgatgtc 51013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 44205 - 43967
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| || || |    
T  44205 agatggttagagcttttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagtaggaagacattgcata 44106  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||| || || || || |||||||| || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||| ||| |    
T  44105 tgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacattttagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgct 44006  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  44005 gaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 43967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 149993 - 149749
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||  |    
T  149993 ggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagc-aatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacattgaa 149895  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| |||||||| |||    
T  149894 tatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatg 149795  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaac 246  Q
     |||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  149794 ctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaac 149749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 194586 - 194841
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||| ||    
T  194586 ggagatggttggaggtgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttattgatgccttgagtaggaagacgttgca 194685  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| | || || |||||||| ||||||  ||| | |||||| |||||||| |||    
T  194686 tatgtctgctttgatggtgaaagaatttgagttgctagagtagtttagatacttgagtcttgtttgcgaattgacacctctgagtgtacagttggggatg 194785  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
     |||| || || | ||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  194786 ctgaagattaacagtgatttcttgaatagtattcgagaagcacaacaagtggatgt 194841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 154
Target Start/End: Original strand, 25439 - 25568
Alignment:
Q  25 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||    
T  25439 attatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccctaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtaaaaga 25538  T
Q  125 atttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
     |||||||| || || ||||||||||||||    
T  25539 gtttgagttgcttgaacagtttagagattt 25568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1273 - 1037
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  | |||||||| |    
T  1273 aaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtctactatgatggtaa 1174  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 220  Q
    |||| |||||||| || ||  |||  ||||| || || ||||||||||| ||||  ||  ||||||| || ||||| |||||||| || |||| ||| ||    
T  1173 aggagtttgagtttctagaatagtaaagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcgccttagagtgtacaattgggtatgttgaagattaatagtgattt 1074  T
Q  221 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1073 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 1037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 425 - 182
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  425 ggagatggttagagctgttgaaggattatgatttttgtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggtagcagatgcgttgagcaggaagacgttgca 326  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| || |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||| || |||    
T  325 tatgtctgctatgatggttaaagaattcgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagtttgggatg 226  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  225 ttgaaaattaatagtgatttcctgaatagtatccgagaagcaca 182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 5988 - 6206
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgta--gttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 115  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  5988 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtacggttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctatgat 6087  T
Q  116 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 215  Q
    ||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  6088 ggtaaaggagttggagttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagt 6187  T
Q  216 gaattcttgaatagtatca 234  Q
    || |||||||| |||||||    
T  6188 gatttcttgaacagtatca 6206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Original strand, 10941 - 11179
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  10941 agatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcaca 11040  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| || | |||||| || |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| |||||||| ||| |    
T  11041 tgtctgctacgatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttgggaatgct 11140  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||| || || | ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  11141 gaagattaacattgatttcttgaatagtattcgagaagc 11179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Original strand, 14711 - 14949
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  14711 agatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcaca 14810  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| || | |||||| || |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| |||||||| ||| |    
T  14811 tgtctgctaagatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttgggaatgct 14910  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||| || || | ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  14911 gaagattaacattgatttcttgaatagtattcgagaagc 14949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21405 - 21151
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||  ||| |||||||| || ||  || ||||  |||| |  | |||||| || |    
T  21405 agatggttagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatttggggaaagccaacgtggtgtcaaatgcgatgagcaagaggacgttgcata 21306  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||  |||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| |||||||| ||| |    
T  21305 tgtctgctatgatggtgaaagaatttgatttgctagagccatttagagaattgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttgggaatgct 21206  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    ||| || || | ||| ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  21205 gaagattaacattgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 21151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 250035 - 249797
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||| |    
T  250035 agatggttagagctgctgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaaaacattacata 249936  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||| | ||| |    
T  249935 tgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttgcggatgct 249836  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  249835 gaagattaataatgatttcttgaatagcatccgagaagc 249797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3010 - 2769
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||| || |||| ||| || |    
T  3010 agatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagccaatatggttgcagatgcgctgagcaggaagatgttgcata 2911  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| || ||||||||||| ||||| || || || ||| |||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||| ||| |    
T  2910 tgtctgctatgatggtgaaagaattcgatttgctagagtagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggggatgct 2811  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    ||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2810 gaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 2769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 42341 - 42101
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | ||    
T  42341 ggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgctgca 42242  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  | |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| | |||||||| |||    
T  42241 tatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttggggatg 42142  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42141 ctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 42101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Original strand, 6122 - 6361
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||| || |    
T  6122 agatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaatgttgcata 6221  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| ||  | |||||||| |||||| | ||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||| |||||||| ||| |    
T  6222 tgtctgctttaatggtgaaagaattttatttgttagagcagtttagagacttaagccttgtatgtgaattgacacctctgagtgtacagttggggatgct 6321  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagca 242  Q
    ||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  6322 gaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagca 6361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 32833 - 32579
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |  |||| || || ||||| || |    
T  32833 agatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcggatactctgagcaggaaaacgttgcata 32734  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| || |||||||| || ||||||||||| || | || |||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| |    
T  32733 tgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagcgcggtttagagatttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtgtacagttgggtatgct 32634  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    ||| || |||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||    
T  32633 gaagattaatagtgatttcttgaatagtatccaagaagcgcaacaagtggatgtc 32579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 2237 - 2492
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  2237 ggagatggttagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgcgtaggaaaacgttgca 2336  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     |||||  | |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| |||||||| |||    
T  2337 tatgtctactatgatggtaaaagaattcgatttgctagagcaatttagagacttgagtcttgtgtgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatg 2436  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
     |||| || || | ||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||    
T  2437 ctgaagattaacagtgatttcttgaacagtatccgagaagcgcaacaagtagatgt 2492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8484 - 8244
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||    
T  8484 ggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcagatgtcttgaataggaagacgttgca 8385  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     |||||  |  | |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||    
T  8384 tatgtctactttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggggatg 8285  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     |||| || || | ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  8284 ctgaagattaacagtgacttcttgaatagtattcgagaagc 8244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20813 - 20578
Alignment:
Q  6 tggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgt 105  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||    
T  20813 tggttcgagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgttgatgcgttgagcaggaagacattacatatgt 20714  T
Q  106 cggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 205  Q
    | ||  ||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||| ||| |||     
T  20713 ctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagagacttaagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgctgag 20614  T
Q  206 aatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20613 gattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 20578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23633 - 23398
Alignment:
Q  6 tggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgt 105  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||    
T  23633 tggttcgagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgatgatgcgttgagcaggaagacattacatatgt 23534  T
Q  106 cggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 205  Q
    | ||  ||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||| ||| |||     
T  23533 ctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagagacttaagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgctgag 23434  T
Q  206 aatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23433 gattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 23398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3580 - 3346
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  3580 aaggattatgattttggtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctattatggtaa 3481  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 220  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||| |||  |||||||  ||||||| ||| |||| || |||| ||| ||    
T  3480 aggagtttgagttgctagagcattttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctaagagtgtatagttgggtatgctgaagattaatagtgattt 3381  T
Q  221 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatg 255  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  3380 cttgaacagtatcagagaagcacagcaagttgatg 3346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Original strand, 872 - 1098
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||||||||| || || || ||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||| ||| || |||||||    
T  872 ttgaaggattatgattttggtttaaattaccattcggttaaagctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaagacgttgcacaagtctgctatgatgg 971  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || || |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| |||    
T  972 taaatgactttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgaaacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtga 1071  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  1072 tttcttgaatagtatcagagaagcaca 1098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28046 - 27793
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||  |||| |||| ||||||  | |    
T  28046 agatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgtggttgtagatgctctgagcagaa-gacgttggata 27948  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||| || || |||||||| || |||| |||  ||||||| |||||||| |||||    
T  27947 tgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttaaagacttgagtcttgtttgcgagttgtcaccttagagtgtacagttgggtatgtt 27848  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  27847 gaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 27793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 256
Target Start/End: Original strand, 51085 - 51317
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||| |||||| | ||| ||||| ||||  || ||||| ||||| ||||| ||  |||||||||  |    
T  51085 gattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaagaccttacatatgtctgcgttgatggtgagag 51184  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 223  Q
    ||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||| |    
T  51185 aatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggggatgttgagaattaatagtgatttcct 51284  T
Q  224 gaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
    ||||| |||| | ||||||||||| || |||||    
T  51285 gaataatatccgtgaagcacaacaagtggatgt 51317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 256
Target Start/End: Original strand, 60119 - 60351
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||| |||||| | ||| ||||| ||||  || ||||| ||||| ||||| ||  |||||||||  |    
T  60119 gattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaagaccttacatatgtctgcgttgatggtgagag 60218  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 223  Q
    ||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||| |    
T  60219 aatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggggatgttgagaattaatagtgatttcct 60318  T
Q  224 gaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
    ||||| |||| | ||||||||||| || |||||    
T  60319 gaataatatccgtgaagcacaacaagtggatgt 60351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 256
Target Start/End: Original strand, 66507 - 66739
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||| |||||| | ||| ||||| ||||  || ||||| ||||| ||||| ||  |||||||||  |    
T  66507 gattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaagaccttacatatgtctgcgttgatggtgagag 66606  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 223  Q
    ||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||| |    
T  66607 aatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggggatgttgagaattaatagtgatttcct 66706  T
Q  224 gaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
    ||||| |||| | ||||||||||| || |||||    
T  66707 gaataatatccgtgaagcacaacaagtggatgt 66739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 244
Target Start/End: Original strand, 2369 - 2610
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  2369 agatggctagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtgaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcata 2468  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || | |||  ||||||| |||||||| |||||    
T  2469 tgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttctcaccttagagtgtacagttgggtatgtt 2568  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    ||| || |||  | | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2569 gaagattaattgtaatttcttgaatagtatccgagaagcaca 2610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16632 - 16448
Alignment:
Q  73 cagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaatt 172  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| | |||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||    
T  16632 cagatgccttgagtagaaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggaattggaattgctcgaacagtttagagacttgagtctcgtgtgtgaatt 16533  T
Q  173 gttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    || | | || |||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16532 gtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtctcagagaagcacaacaagttgatgtc 16448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 570 - 824
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| ||    
T  570 ggagatggctagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatc-gggtaaagcaaatgtggttgcagatgccataagtaggaagacgttgca 668  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| || |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||| ||| |||||||| |||    
T  669 tatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagactgtacagttggggatg 768  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
     |||| || |||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  769 atgaagattaat-gtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 257
Target Start/End: Original strand, 6264 - 6468
Alignment:
Q  53 gggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||     
T  6264 gggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttcctagaacagtttagagac 6363  T
Q  153 ttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttg 252  Q
    || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6364 ttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtccagttgggtatgttgaagaataatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagttg 6463  T
Q  253 atgtc 257  Q
    |||||    
T  6464 atgtc 6468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 257
Target Start/End: Original strand, 10695 - 10899
Alignment:
Q  53 gggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||     
T  10695 gggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttcctagaacagtttagagac 10794  T
Q  153 ttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttg 252  Q
    || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  10795 ttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtccagttgggtatgttgaagaataatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagttg 10894  T
Q  253 atgtc 257  Q
    |||||    
T  10895 atgtc 10899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 100444 - 100684
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || ||    
T  100444 ggagatggttagagctattgaaggactacaattttggtttgaattaccatcatggtaaagccaatgtggttgcagatgcattgagcaggaagacattgca 100543  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  |||||||||||||||| || || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||  |||  ||||| | || ||||| |||    
T  100544 tatgtctgctttgatggtgaaggaattcgatttgctagagcagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacaccttagagtattcaattggggatg 100643  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  100644 ctgaaaattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 100684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 181555 - 181436
Alignment:
Q  69 gttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtg 168  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || || || ||||| || || ||||| |||||||| ||| | |||||||    
T  181555 gttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaagagttcgagttgcttgaacagttgagagatttgagcttagtttgtg 181456  T
Q  169 aattgttaccccagagtgtg 188  Q
    ||| || | | |||||||||    
T  181455 aatggtcatctcagagtgtg 181436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Original strand, 9707 - 9945
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||| ||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||  |||| || |||||||    
T  9707 ttgaaggattgtgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatttgtcagctatgatgg 9806  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || ||||||||||| || |||||||||| ||| || || || |||||||| |||| ||| || |||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  9807 ttaaagaatttgagttgcttgagcagtttaaagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtga 9906  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
     |||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  9907 gttcttggatagtattagagaagcacagaaggttgatgt 9945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12119 - 11902
Alignment:
Q  39 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcg 138  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |  ||||||| || |||||||| || || |    
T  12119 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagaccttacatatgtctacgttgatggtaaaagaatttgatttgctag 12020  T
Q  139 agcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagaga 238  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  12019 aacagtttagtgacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggggatgttgagaattaatagtgatttcttgaatagtatccgaga 11920  T
Q  239 agcacaacaggttgatgt 256  Q
    ||| ||||| || |||||    
T  11919 agcgcaacaagtggatgt 11902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 13181 - 13436
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | ||    
T  13181 ggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctgataaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgctgca 13280  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||  ||  | |||||||| ||||| || || || || || |||||||| || |||||||| |||||||||  |||  ||||||| |||||||| |||    
T  13281 tatgtttgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacaatttagagacttgagccttgtctgtgaattgacaccttagagtgttcagttggggatg 13380  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
     ||||||| || | | | ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  13381 ctgaaaattaaaagtaatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgt 13436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 244
Target Start/End: Original strand, 1 - 187
Alignment:
Q  58 aagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaag 157  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  | |     
T  1 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgagcagtttagagacgtgac 100  T
Q  158 ccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
     || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  101 tctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacaatatcagagaagcaca 187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Original strand, 16876 - 17114
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || |||||||    
T  16876 ttgaaagattatgattttgagttgaattatcaaccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatgg 16975  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | || |||||| ||| ||| ||||||||| |||| || ||| |||| ||  |||||||    
T  16976 tcaaggaatttgagttacttgaacagtttagagatttgagcttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgataatga 17075  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
    ||||||||| | ||| | |||||| ||| | ||||||||    
T  17076 attcttgaacaatattaaagaagcgcaaaaagttgatgt 17114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 18114 - 18330
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  18114 ttgaaggattgtgattttgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 18213  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || || |||||||| || || |||||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| | || ||  ||| |||    
T  18214 taaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgatagtga 18313  T
Q  218 attcttgaatagtatca 234  Q
    |||||||||||||||||    
T  18314 attcttgaatagtatca 18330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 10339 - 10579
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| | ||    
T  10339 ggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttacagatgccttgagtaggaaaacgctgca 10438  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  |  ||||||| |||||  | || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||| ||| || ||||| |||    
T  10439 tatgtccgctttagtggtgaaagaattcaatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagattgttcaattggggatg 10538  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     |||| || |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  10539 ctgaagattaatagtgatttcttaaatagtatccgagaagc 10579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 20553 - 20793
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| | ||    
T  20553 ggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttacagatgccttgagtaggaaaacgctgca 20652  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  |  ||||||| |||||  | || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||| ||| || ||||| |||    
T  20653 tatgtccgctttagtggtgaaagaattcaatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagattgttcaattggggatg 20752  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     |||| || |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  20753 ctgaagattaatagtgatttcttaaatagtatccgagaagc 20793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20521 - 20289
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||||||||||    
T  20521 gattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgcgttgatggtgaagg 20422  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 223  Q
    |||| || ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||  ||| |||||| | |||||||| ||| |||| || |||| ||| |||||    
T  20421 aattcgatttactagaacaatttagagacttgagtcttgtttgtgaattgacacctcagagtattcagttggggatgctgaagattaatagtgatttctt 20322  T
Q  224 gaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||| || |||||    
T  20321 gaacagtatccgagaagcgcaacaagtggatgt 20289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 74
Target Start/End: Original strand, 58093 - 58146
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgca 74  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  58093 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgca 58146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4171 - 3932
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||| |||| || |    
T  4171 agatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcatgaaggcgttgcata 4072  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| || |||||||| || |||||  | || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| ||||  || |||||||| ||| |    
T  4071 tgtctgctatgatggtaaaagaattcaatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcaga--gtacagttgggaatgct 3974  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    ||| || |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  3973 gaagattaatagtgatttcttgaatagtatccaagaagcaca 3932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 211
Target Start/End: Original strand, 43012 - 43199
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| |  |||||||| || |    
T  43012 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgttatgatggttaaag 43111  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaa 211  Q
    | || ||||| || || ||||| ||||| || ||  | ||||||||| | | ||| || |||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  43112 agttggagtttcttgaacagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtatcaccacaaagtgtgaaattgggaatgttgaagatcaa 43199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 725 - 516
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||  ||||||| || |    
T  725 gattatgattttggtttgaattaccaccctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagaccttacatatgtctgcgttgatggtaaaag 626  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 223  Q
    ||||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||| | |||||||| ||| ||| ||| |||| ||| |||||    
T  625 aatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagttggggatgctgagaattaatagtgatttctt 526  T
Q  224 gaatagtatc 233  Q
    ||||||||||    
T  525 gaatagtatc 516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Original strand, 4357 - 4574
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||  ||||||| || |    
T  4357 gattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagaccttacatatgtctgcattgatggtaaaag 4456  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 223  Q
    ||||||| ||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||| | |||||||| ||| ||| ||| |||| ||| |||||    
T  4457 aatttgatttactagaatagtttagagacttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagttggggatgctgagaattaatagtgatttctt 4556  T
Q  224 gaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||| |||  |||||||    
T  4557 gaataatattcgagaagc 4574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 257
Target Start/End: Original strand, 79391 - 79632
Alignment:
Q  16 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 115  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  79391 tattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagaaagacattgcatatgtccgccatgat 79490  T
Q  116 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 215  Q
    ||| |  || || |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  | || |||||||| ||  ||| |    
T  79491 ggttagagagttcgagttacttgagcagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactaggaatgttgaagattgatagt 79590  T
Q  216 gaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    |||||  |||| ||||| | ||| |||||| | |||||||||    
T  79591 gaatttctgaagagtattaaagaggcacaaaaagttgatgtc 79632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Original strand, 218316 - 218539
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||||    
T  218316 ttgaaagattatgattttgggttgaactataatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgatgg 218415  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || || |||||||| || ||||||||||||||||| ||  | || |  ||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | || ||  ||| |||    
T  218416 taaaagagtttgagttgcttgagcagtttagagatttgagtttagtctacgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgctaaagattgatagtga 218515  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||    
T  218516 attcttgaacaatatcaaagaagc 218539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Original strand, 177161 - 177399
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  177161 ttgaaagactatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgtcgttgcagaagctttaagcaggaagacgttacatatgtctgctatgatgg 177260  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || ||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||||| ||||  || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  177261 ttaaagaattagaattgctagaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaatagtga 177360  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 256  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||| || | ||||||||    
T  177361 attcttgaacagtattaaagaagcataaaaagttgatgt 177399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 241
Target Start/End: Original strand, 15379 - 15604
Alignment:
Q  16 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||    
T  15379 tattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccatgtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgat 15478  T
Q  116 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 215  Q
    ||| || || ||||||||||| || | |||||||||||| ||  | ||||| || ||||  || ||||||||| ||||||| ||| | |  ||  ||| |    
T  15479 ggtaaaagagtttgagttacttgaacggtttagagatttgagtttagtttgcgatttgtcccctcagagtgtgaagttgggaatgctaaggattgatagt 15578  T
Q  216 gaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15579 gaattcttgaacagtatcaaagaagc 15604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 109052 - 108859
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  109052 agatggcttgagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaacatccgggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaagacgttgcaca 108953  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 196  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| || ||  |||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||||||||    
T  108952 tgtctgctatgatggtaaatgattttgagtttctagattagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagcgtacagttggg 108859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Original strand, 62930 - 63081
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  62930 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgtcttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 63029  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 169  Q
    | || |  || ||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  63030 ttaaagtgttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtga 63081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 3171 - 3387
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||  |||||| | |||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||  |||| |    
T  3171 ttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcttggtaaaactaatgtagtcgcggatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctttgatag 3270  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    |||| || |||||||| || || || |||||||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||    
T  3271 tgaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcaattgggtatgttgaagatcaatagtga 3370  T
Q  218 attcttgaatagtatca 234  Q
     |||||||| |||||||    
T  3371 tttcttgaacagtatca 3387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 7027 - 7267
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || ||    
T  7027 ggagatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgca 7126  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  | ||||| |  ||||| || || || || |||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| |||    
T  7127 tatgtctgctttaatggtaagagaattggatttgctagaacagtttagagacctgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggggatg 7226  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||| || || | | | || |||||||||||| |||||||    
T  7227 ttgaagattaacagtaattttttgaatagtatccgagaagc 7267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18753 - 18517
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |    
T  18753 aaggattatgattttggttttaattaccatccgggtaaagctaatgtcgttgtagatgctttgagcaggaagacatttcacatctctgctatgatggtaa 18654  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 220  Q
    | || |||||||| || ||  | |||||||| || || ||||| ||||| |||| ||  || ||||| |||||||| ||| ||||  | |||| ||| ||    
T  18653 aagagtttgagttgctagaatattttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacttcaaagtgtacagttgggtatgctgaaggttaatagtgattt 18554  T
Q  221 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18553 cttgaatagtatcagagaagcacagcaagttgatgtc 18517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 12409 - 12613
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  12409 ggagatggttagaactgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgctgca 12508  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||    |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| |||||| | |||||||| |||    
T  12509 tatgtctgcttgaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtattcagttggggatg 12608  T
Q  201 ttgaa 205  Q
     ||||    
T  12609 ctgaa 12613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 154
Target Start/End: Original strand, 31652 - 31788
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  31652 ttgaaagattatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 31751  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
    | || || || ||||| || || ||||||||||||||    
T  31752 taaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagattt 31788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 30184 - 30400
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||  |||||| | |||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||  |||| |    
T  30184 ttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcttggtaaaactaatgtagtcgcggatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctttgatag 30283  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    |||| || |||||||| || || || |||||||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||    
T  30284 tgaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcaattgggtatgttgaagatcaatagtga 30383  T
Q  218 attcttgaatagtatca 234  Q
     |||||||| |||||||    
T  30384 tttcttgaacagtatca 30400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 238
Target Start/End: Original strand, 32203 - 32438
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||| |    
T  32203 agatggttagagctgctgaaggattatgattttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcagcaaaacattacata 32302  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| ||  |||||||||||||||| || ||  | ||  ||| |||||| || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  32303 tgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgttagaatagtctagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgtt 32402  T
Q  203 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagaga 238  Q
    |   || |||| ||| |||||||| |||||| ||||    
T  32403 gcggattaatagtgatttcttgaacagtatccgaga 32438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 35535 - 35422
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  35535 agatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagatgttgcaca 35436  T
Q  103 tgtcggccatgatg 116  Q
    |||| || ||||||    
T  35435 tgtctgctatgatg 35422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28527 - 28393
Alignment:
Q  123 gaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattct 222  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| ||| ||||    
T  28527 gaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaatagtgatttct 28428  T
Q  223 tgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  28427 tgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 28393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 45918 - 45701
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||  |||| ||||| ||  ||||||| |  |    
T  45918 gattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttaagcaggaagaccctacatatgtctgcgttgatggtaagag 45819  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 223  Q
    ||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||| |||| || || | | | |||||    
T  45818 aatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttgggaatgctgaagattaacagtaatttctt 45719  T
Q  224 gaatagtatcagagaagc 241  Q
    |||||||||| |||||||    
T  45718 gaatagtatccgagaagc 45701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Original strand, 19241 - 19340
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  19241 tgaaggactatgattttgtgttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 19340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21288 - 21138
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||  ||||||| |  |    
T  21288 gattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagctaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagaccttacatatgtctgcgttgatggtaagag 21189  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgt 174  Q
    |||||||  | || || ||||||||||| || |||||||||| ||| ||||    
T  21188 aatttgatcttctagaacagtttagagacttgagccttgtttctgagttgt 21138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 254
Target Start/End: Original strand, 39685 - 39894
Alignment:
Q  45 tatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagt 144  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || || |    
T  39685 tatcatcaaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcatgaagacgttgcatatgtctgctatgatggttaaggagtttgagttgcttgaacaat 39784  T
Q  145 ttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    ||||||| || || || |||||||| ||||  || |||||| || ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  39785 ttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtatgaagttgggtatgttgaagatcaacaatgagttcttgaacagtatcaaagaagcaca 39884  T
Q  245 acaggttgat 254  Q
    | | ||||||    
T  39885 aaaagttgat 39894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 17061 - 16925
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  17061 ttgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatgg 16962  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
    | || || ||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  16961 taaaagagtttgaattattggaacagtttagagattt 16925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16284 - 16148
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  16284 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatgg 16185  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
    | ||||| |||||| | || || ||||||||||||||    
T  16184 ttaaggagtttgagctgcttgaacagtttagagattt 16148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 154
Target Start/End: Original strand, 112396 - 112523
Alignment:
Q  27 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 126  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||| |||||||||| || || |    
T  112396 tatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttaagtaggaagacattgcatatgtcgaccatgatggtaaaagagt 112495  T
Q  127 ttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
    | |||||  | || ||||||||||||||    
T  112496 tcgagttgttggaacagtttagagattt 112523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13875 - 13652
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||| || || || || || || ||||| ||||||||||    
T  13875 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgtcgcagatgccttaagcaggaaaactttgcatatgtccgccatgatgg 13776  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || || |||||||| || || |||||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || | || ||| | || ||| ||| |||    
T  13775 taaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctaggaatgctaaagatcgatagtga 13676  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  13675 attcttgaacagtatcaaagaagc 13652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10844 - 10621
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||   |||||  | ||||| || || ||||| || |||||||    
T  10844 ttgaaggactgtgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatattttgagcgggaagacattgcatatgtcagctatgatgg 10745  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || || |||||||| ||||  || ||||||||| ||||| | |||||||| ||||| | |||    
T  10744 ttaaagaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgtgtatgttgaagatcaacagtga 10645  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||    
T  10644 attcttgaacagtattaaagaagc 10621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 15595 - 15835
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||    
T  15595 ggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttgagcaggaagactttgca 15694  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 200  Q
     ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| |  ||||||| | |    
T  15695 tatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatatagttgggaagg 15794  T
Q  201 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15795 ttgaaaattgataatgacttcttgaatagtatccgagaagc 15835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 10376 - 10240
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  10376 ttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttacatatgtctgctatgatgg 10277  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
    | ||||| || ||||| || || || |||||||||||    
T  10276 ttaaggagttcgagttgcttgaacaatttagagattt 10240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 154
Target Start/End: Original strand, 7561 - 7688
Alignment:
Q  27 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 126  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || |    
T  7561 tatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagt 7660  T
Q  127 ttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
    | ||||| || || ||||| ||||||||    
T  7661 tcgagttgcttgaacagttcagagattt 7688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7421 - 7182
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||    
T  7421 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagtaagacattgcatatgtcctctatgatgg 7322  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | |  || || |||||||| || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||| || |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  7321 ttagagagttcgagttacttgatcagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtctgaaactgggaatgctgaagattgatagtga 7222  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    ||| ||||| ||||| | ||| |||||| | |||||||||    
T  7221 atttttgaaaagtattaaagaggcacaaaaagttgatgtc 7182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Original strand, 29470 - 29621
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  29470 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 29569  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 169  Q
    | || || || ||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  29570 ttaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtga 29621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Original strand, 23084 - 23307
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| || |  ||||| |||||  | |||||||    
T  23084 ttgaaagactatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaattttacatatgtctcctatgatgg 23183  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || || || ||| | |||||  |||||||| | || ||  | ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||| |||    
T  23184 ttaaagagttggagctgctcgaatagtttagacacttgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgttgaagattaatagtga 23283  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||| || |||||||| | ||||||    
T  23284 attttttaatagtattaaagaagc 23307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 8804 - 8670
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  8804 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 8705  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
    |||  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  8704 tgagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 8670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 102640 - 102470
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||| | ||||||||||    
T  102640 ttgaaagattatgattttggtttgaactatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgcattgagtaggaagactttgcatatgcccgccatgatgg 102541  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
    | || || || ||||| || || ||||||| |||||| ||| | || |||||||||| | | |||||||||    
T  102540 taaaagagttcgagttgcttgaacagtttatagatttgagcttagtctgtgaattgtcatctcagagtgtg 102470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5420 - 5215
Alignment:
Q  36 gggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttac 135  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |  || |||||||| |    
T  5420 gggttgaattatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttacatatgtccgctatgatggtaagagagtttgagttgc 5321  T
Q  136 tcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcag 235  Q
    | || |||||||| ||||| ||  | || |||||||||| ||| ||||||||| || || | ||| | || ||  ||| |||||||||||| |||||||     
T  5320 ttgaacagtttagggatttgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgagaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacagtatcaa 5221  T
Q  236 agaagc 241  Q
    ||||||    
T  5220 agaagc 5215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5280 - 5091
Alignment:
Q  16 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||    
T  5280 tattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgat 5181  T
Q  116 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 205  Q
    ||| ||  | |||||||| || || || ||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| ||||    
T  5180 ggtaaaaaagtttgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgatgaa 5091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12410 - 12221
Alignment:
Q  16 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||    
T  12410 tattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgat 12311  T
Q  116 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 205  Q
    ||| ||  | |||||||| || || || ||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| ||||    
T  12310 ggtaaaaaagtttgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgatgaa 12221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Original strand, 5241 - 5458
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||||||||||||| ||| | || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||   ||||||    |    
T  5241 gattatgattttggtttggattaccatcttggtaaagccaatgtagttgcggatgcgttgaggaggaagaccttacatatgtctgcgtagatggtatgag 5340  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 223  Q
    ||||||| || || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||| |||| || || | | | |||||    
T  5341 aatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggggatgctgaagattaacagtaatttctt 5440  T
Q  224 gaatagtatcagagaagc 241  Q
    |||||||||| |||||||    
T  5441 gaatagtatccgagaagc 5458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 3594 - 3431
Alignment:
Q  25 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 124  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||    
T  3594 attatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttacagatgcctcgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaaga 3495  T
Q  125 atttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
     || ||||| || || |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | | |||||||||    
T  3494 gttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagttgtcatctcagagtgtg 3431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 7778 - 7643
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  7778 tgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 7679  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  7678 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 7643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 7455 - 7356
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  7455 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 7356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 130
Target Start/End: Original strand, 3534 - 3620
Alignment:
Q  44 ctatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttga 130  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  3534 ctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagtttga 3620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Original strand, 14111 - 14246
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  | || ||||| || ||||||||    
T  14111 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccatgcatatgtctgctatgatggt 14210  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  14211 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 14246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 172 - 37
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  172 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 73  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
     ||||| || ||||| || ||  |||| ||||||||    
T  72 aaaggagttcgagttgcttgaatagttcagagattt 37  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 2675 - 2540
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  2675 tgaatgattttgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 2576  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
     ||||| || ||||| || ||  |||| ||||||||    
T  2575 aaaggagttcgagttgcttgaatagttcagagattt 2540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Original strand, 25845 - 25979
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  25845 tgaaggatta-gattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggt 25943  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
     || || || |||||  | || ||||||||||||||    
T  25944 aaaagagttcgagttgttggaacagtttagagattt 25979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 151
Target Start/End: Original strand, 277727 - 277862
Alignment:
Q  16 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 115  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||    
T  277727 tattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgat 277826  T
Q  116 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 151  Q
    ||| |  || || |||||||| || |||||||||||    
T  277827 ggttagagagttcgagttacttgaacagtttagaga 277862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 261709 - 261491
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||  | || ||||| || |||||||| || |    
T  261709 gattatgatttttgtttgaattaccatccaggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaag 261610  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 223  Q
    ||||||| || || || |||||||| ||  | || || || ||||| ||||   | |||||| | |||||||||||| |||| || |||| ||| |||||    
T  261609 aatttgatttgctggaacagtttagggacatgagtctggtatgtgagttgtcgactcagagtatacagttgggcatgctgaagattaatagtgatttctt 261510  T
Q  224 gaatagtatcagagaagca 242  Q
    |  ||||||| ||||||||    
T  261509 gggtagtatccgagaagca 261491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 50838 - 50688
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  50838 tgaaggactacgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagactttgcacatgtccgctatgatggt 50739  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 169  Q
     ||||| || ||||| || || ||||| | |||||| ||| | ||||||||    
T  50738 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcaaagatttgagcttagtttgtga 50688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20008 - 19783
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  20008 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 19909  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 218  Q
     |  || || ||||| || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||| |||| |||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||||    
T  19908 tagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggttacctcagaatgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaa 19809  T
Q  219 ttcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    ||  |||| ||||||| |||||||||    
T  19808 tttctgaagagtatcaaagaagcaca 19783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 35432 - 35207
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  35432 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 35333  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 218  Q
     |  || || ||||| || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||| |||| |||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||||    
T  35332 tagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggttacctcagaatgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaa 35233  T
Q  219 ttcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    ||  |||| ||||||| |||||||||    
T  35232 tttctgaagagtatcaaagaagcaca 35207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 28355 - 28150
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| || || || || || |    
T  28355 agatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcatggtaaggccaatgtggttgttgatgcattgagcaggaaaacattgcata 28256  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 202  Q
    |||| ||  | |||||||| |||||||| ||  | ||  |||||||||| || || ||||| |||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||| |    
T  28255 tgtctgctttaatggtgaaagaatttgaattgttagaaaagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggggatgct 28156  T
Q  203 gaaaat 208  Q
    ||||||    
T  28155 gaaaat 28150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Original strand, 7231 - 7366
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||  |||| || ||||||||    
T  7231 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagaccttgcatttgtctgctatgatggt 7330  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  7331 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 7366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26381 - 26230
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  26381 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 26282  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 169  Q
    | |  || || ||||||||  | |||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  26281 ttagagagttcgagttactttatcagtttagagatatgagttttgtttgtga 26230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2315 - 2089
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||    
T  2315 ttgaaagattatgatttcgggctgaattatcatccaggtaaagctaatgttcttgcagatgctttaagtaggaaaactttacatatgtctgctatgatgg 2216  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | ||  | || ||| | | ||| |||||||  ||  | ||  ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| |||||||| || |||| |||    
T  2215 ttaaaaagttggagctgcacgaacagtttattgacctgagttttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtcaagttgggaatgttgaagattaatagtga 2116  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  2115 atttttgaacagtattaaagaagcaca 2089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8346 - 8120
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  8346 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 8247  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  8246 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 8147  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagcaca 244  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  8146 attcctgaaaagtatcaaggaagcaca 8120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 23978 - 24179
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||       ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  23978 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgca-------tgagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 24070  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || || |||||||| || || ||||||||||| || || || ||||||||  |||  || ||||||||| ||||| | |||||||| ||||| | |||    
T  24071 ttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagatgtagcctcagagtgtgaagttgagtatgttgaagatcaacagtga 24170  T
Q  218 attcttgaa 226  Q
     ||||||||    
T  24171 gttcttgaa 24179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 257
Target Start/End: Original strand, 4253 - 4491
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||  |||||||    
T  4253 tgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgaatatgtccgctttgatggt 4352  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 218  Q
     |  || || ||||| ||  | |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| || |||| ||| |||| ||  ||| ||||    
T  4353 tagagagttcgagttgcttaaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaagattgatagtgaa 4452  T
Q  219 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    ||  | || ||||||| |||||||||  | |||||||||    
T  4453 tttctaaagagtatcaaagaagcacagaaagttgatgtc 4491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 8772 - 8639
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  8772 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 8673  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
     |  || || || ||||| || ||||||||||||    
T  8672 cagagagttcgaattacttgaacagtttagagat 8639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 188
Target Start/End: Original strand, 7995 - 8156
Alignment:
Q  27 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 126  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || || ||||||||||||||||| |  || |    
T  7995 tatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaacattgcatatgtcggccatgatggtaagagagt 8094  T
Q  127 ttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
    | |||||  | || |||||||||||||| ||  | || |||||||||| | | |||||||||    
T  8095 tcgagttgtttgaacagtttagagatttgagtttagtatgtgaattgtcatctcagagtgtg 8156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 153
Target Start/End: Original strand, 38853 - 38982
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||    
T  38853 gattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagaccttggatatgtctgctatgatggtaaagg 38952  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatt 153  Q
    | || ||||| || || ||||| |||||||    
T  38953 agttcgagttgcttgaacagttcagagatt 38982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 257
Target Start/End: Original strand, 80737 - 80970
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||| || |||||||| || |    
T  80737 gattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacactacatatgtctgctatgatggtaaaag 80836  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 223  Q
    ||||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||| ||||  || || ||  |  ||||||||||| |||| || |||| ||| |||||    
T  80837 aatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtctggtatgtgagttgtagcctcaaagaataaagttgggcatgctgaagattaatagtgatttctt 80936  T
Q  224 gaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    |  ||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  80937 gggtagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 80970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 154
Target Start/End: Original strand, 966 - 1102
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  966 ttgaaagactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatcttgtagcagatgccttgaataggaagacattgcatatgtcggccatgatgg 1065  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
    | || || || || ||  |||| ||||||||||||||    
T  1066 taaaagagttcgaattgttcgaacagtttagagattt 1102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 151
Target Start/End: Original strand, 14184 - 14331
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  14184 agatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccag-taaagacaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcata 14282  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 151  Q
    |||| ||  ||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||    
T  14283 tgtctgctctgatggtaaaagaatttgagttgctagaccattttagaga 14331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 151
Target Start/End: Original strand, 22363 - 22510
Alignment:
Q  3 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 102  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  22363 agatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccag-taaagacaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcata 22461  T
Q  103 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 151  Q
    |||| ||  ||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||    
T  22462 tgtctgctctgatggtaaaagaatttgagttgctagaccattttagaga 22510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 4519 - 4383
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  4519 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcaaacggttaaagctaatgttgttgcggataccttaagtaggaagactttacatatgtctgctatgatgg 4420  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
    | ||||| |||||||| || || || ||||| |||||    
T  4419 ttaaggagtttgagtttcttgaacaatttagggattt 4383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 386 - 142
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt---- 96  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |        
T  386 ggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgca 287  T
Q  97 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 196  Q
    || | ||||| ||  |||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||| || || ||||| |||||| ||| ||| |||||| | ||||||||    
T  286 tatatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgctataacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcacctcagagtatacagttggg 187  T
Q  197 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     ||| |||| ||  ||  ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  186 gatgctgaagatttattgtgatttcttgaacagtatccgagaagc 142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 2299 - 2200
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  2299 tgaaagattatgattttgagttgagctatcatctaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggt 2200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 24874 - 24723
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||  |||| ||||| ||  ||||||    
T  24874 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaagactctacatatgtccgctttgatgg 24775  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 169  Q
    | || || || ||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  24774 ttaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtga 24723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Original strand, 9915 - 10138
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||  || ||||| || ||  |||| ||||| || ||||||     
T  9915 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtatagccaatgttgttgcagatgaattaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatga 10014  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || ||||| ||| | || || |||||| ||||||| ||  | || |||||| ||| |||| |||||||| |||| || ||| |||| ||  ||| |||    
T  10015 tcaaagaattggagctgcttgaacagttttgagatttgagtttagtctgtgaagtgtcaccctagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtga 10114  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    |||  |||||||||| | ||||||    
T  10115 atttctgaatagtattaaagaagc 10138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6614 - 6381
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||  | || ||||  || |||||||| || |    
T  6614 gattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacacttcatatgtatgctatgatggtaaaag 6515  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 223  Q
    ||||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||| ||||  || |||||  | |||||||||||| |||| || |||| ||| |||||    
T  6514 aatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtctggtatgtgagttgtcgcctcagagcatacagttgggcatgctgaagattaatagtgatttctt 6415  T
Q  224 gaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 257  Q
    |  ||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  6414 gggtagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 6381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1824 - 1655
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  1824 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 1725  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
     |  || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  1724 tagagagtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 1655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15564 - 15395
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  15564 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 15465  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 188  Q
     |  || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  15464 tagagagtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 15395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Original strand, 85421 - 85641
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  | |||||  |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  85421 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaagactaatgttattgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggtta 85520  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 220  Q
      || |||||||| || || ||||||||||| || ||  | ||||||||| |||  || ||||||||| | || || |||||||| |||||  |||||||    
T  85521 gagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccgcagagtgtgaaattaggaatgttgaagatcaacgatgaatt 85620  T
Q  221 cttgaatagtatcagagaagc 241  Q
     || || | ||||| ||||||    
T  85621 ttttaacactatcaaagaagc 85641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Original strand, 6790 - 7013
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||     
T  6790 ttgaaagactatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcattaagtaggaagactctacatatgtccgctatgatga 6889  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 217  Q
    | || || || ||| | || || ||||||||||| || ||| | || || ||| ||| |||  |||||||| |||| || ||| |||| ||   || |||    
T  6890 tcaaagagttggagctgcttgaacagtttagagacttgagcttagtctgcgaagtgtcaccttagagtgtgaagttaggaatgatgaagattgttagtga 6989  T
Q  218 attcttgaatagtatcagagaagc 241  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||    
T  6990 attcttgaacagtattaaagaagc 7013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 106
Target Start/End: Original strand, 32473 - 32560
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtc 106  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  32473 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcagaaagacgttgcatatgtc 32560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 96588 - 96438
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 100  Q
    |||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||  | ||    
T  96588 ggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagcaggaagacactgca 96489  T
Q  101 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 151  Q
     ||||| || |||||| | || |||||||| || || || |||||||||||    
T  96488 tatgtctgctatgatgataaaagaatttgattttctggaacagtttagaga 96438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 152
Target Start/End: Original strand, 38720 - 38853
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  38720 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgtgtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 38819  T
Q  119 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 152  Q
     |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  38820 tagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 38853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 66811 - 66745
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgag 85  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  66811 tgaaagattatgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgag 66745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 94
Target Start/End: Original strand, 12900 - 12967
Alignment:
Q  27 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 94  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  12900 tatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 12967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Original strand, 28268 - 28367
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 118  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  28268 tgaaggattatgactttggtttcaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagattccttgagttggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 28367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 154
Target Start/End: Original strand, 3355 - 3491
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || || |||||  | |||||||    
T  3355 ttgaaagattacgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatatgtcttctatgatgg 3454  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
    | || || ||| | || || || ||||||||||||||    
T  3455 ttaaagagttttaattgcttgaacagtttagagattt 3491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 131477 - 131377
Alignment:
Q  54 ggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatt 153  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  131477 ggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgccatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagatt 131378  T
Q  154 t 154  Q
    |    
T  131377 t 131377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 39958 - 39828
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  |  ||||| | ||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  39958 gattatgattttgagttgagctatcatccggttaaagctaatgttgttgcagacactctgagtgggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagg 39859  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 154  Q
    | || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  39858 agttcgagttgcttgaacagttcagagattt 39828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 6602 - 6492
Alignment:
Q  44 ctatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcag 143  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || |||    
T  6602 ctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacag 6503  T
Q  144 tttagagattt 154  Q
    || ||||||||    
T  6502 ttcagagattt 6492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Original strand, 18967 - 19033
Alignment:
Q  19 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgag 85  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18967 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgag 19033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Original strand, 196377 - 196453
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 94  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||    
T  196377 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcggacgccttgagtaggaagac 196453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 1716 - 1800
Alignment:
Q  1 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgag 85  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  1716 ggagatggttatagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgag 1800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Original strand, 23972 - 24048
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 94  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  23972 ttgaaagattatgactttaggttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagac 24048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 151
Target Start/End: Original strand, 11691 - 11818
Alignment:
Q  24 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 123  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||  | || ||||| || |||||||| || |    
T  11691 gattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaag 11790  T
Q  124 aatttgagttactcgagcagtttagaga 151  Q
    |||||||  | || || |||||||||||    
T  11791 aatttgatatgctggaacagtttagaga 11818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 115804 - 115979
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 117  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || ||||||     
T  115804 ttgaaagattatgattttggattgaattatcatccaggtaaggctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatga 115903  T
Q  118 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 193  Q
    | || ||  | ||| | ||||| |||||||||||  | ||  | || |||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  115904 tcaaagagctggagctgctcgaacagtttagagacctgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagtt 115979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 88
Target Start/End: Original strand, 13980 - 14050
Alignment:
Q  18 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtag 88  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||||||| || |||||    
T  13980 ttgaaagattatggttttgggttgaattatcatcctagtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtag 14050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 401 - 343
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgc 79  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  401 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaagactaatgttgttgcagatgc 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 146
Target Start/End: Original strand, 16466 - 16591
Alignment:
Q  21 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 120  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  16466 aaggattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 16565  T
Q  121 aggaatttgagttactcgagcagttt 146  Q
    | || ||||||||  | |||||||||    
T  16566 aagagtttgagttgattgagcagttt 16591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University