View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8184_high_6 (Length: 298)

Name: NF8184_high_6
Description: NF8184
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8184_high_6
NF8184_high_6
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (1-283)||(18654786-18655068)
chr4 (1-283)||(18730813-18731095)
chr4 (1-283)||(18723394-18723676)
chr4 (1-283)||(18698709-18698991)
chr4 (1-283)||(18678869-18679151)
chr4 (5-273)||(18074352-18074620)
chr4 (165-264)||(5090285-5090384)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (1-283)||(28786825-28787107)
chr6 (1-283)||(28792946-28793228)
chr6 (2-283)||(27717812-27718093)
chr6 (2-283)||(27610433-27610714)
chr6 (5-283)||(27604017-27604295)
chr6 (5-282)||(27592335-27592612)
chr6 (5-282)||(27676934-27677211)
chr6 (1-283)||(28781688-28781970)
chr6 (5-273)||(27426935-27427203)
chr6 (5-264)||(27705736-27705995)
chr6 (5-264)||(27679541-27679800)
chr6 (1-264)||(26803033-26803296)
chr6 (1-255)||(27697927-27698181)
chr6 (4-264)||(26623861-26624121)
chr6 (4-264)||(26729838-26730098)
chr6 (2-256)||(27530641-27530895)
chr6 (4-264)||(31285149-31285409)
chr6 (55-264)||(26656606-26656815)
chr6 (55-264)||(26762577-26762786)
chr6 (56-228)||(27337463-27337635)
chr6 (56-228)||(27398203-27398375)
chr6 (55-264)||(26824460-26824669)
chr6 (1-228)||(26647066-26647293)
chr6 (1-228)||(26753034-26753261)
chr6 (70-228)||(26862236-26862394)
chr6 (55-264)||(25492651-25492860)
chr6 (70-257)||(25580378-25580565)
chr6 (70-264)||(25483715-25483909)
chr6 (70-264)||(26143524-26143718)
chr6 (55-230)||(26884711-26884886)
chr6 (70-264)||(26056578-26056772)
chr6 (70-264)||(26076548-26076742)
chr6 (70-228)||(25539199-25539357)
chr6 (95-283)||(27215133-27215321)
chr6 (167-264)||(25511645-25511742)
chr6 (182-264)||(28140303-28140385)
chr6 (135-264)||(26950464-26950593)
chr6 (5-261)||(26937620-26937876)
chr6 (165-264)||(26849463-26849562)
chr6 (182-264)||(28097775-28097857)
chr6 (172-264)||(28243553-28243645)
chr6 (219-263)||(29674432-29674476)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (1-283)||(8074-8356)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (1-283)||(12988-13270)
scaffold0277 (1-283)||(4025-4307)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (2-283)||(2852-3133)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (5-273)||(60160-60428)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (1-264)||(267672-267935)
chr1 (55-264)||(28163707-28163916)
chr1 (54-257)||(28127014-28127217)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (1-264)||(29273170-29273433)
chr8 (235-264)||(31905872-31905901)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (158-267)||(16691611-16691720)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (164-264)||(3280409-3280509)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (172-264)||(43715-43807)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18655068 - 18654786
Alignment:
Q  1 aagtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18655068 aagtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgctgccagttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaac 18654969  T
Q  101 aagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18654968 aagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaat 18654869  T
Q  201 ttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaac 283  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18654868 taataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaac 18654786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18731095 - 18730813
Alignment:
Q  1 aagtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaac 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18731095 aagtttattgaaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaac 18730996  T
Q  101 aagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  18730995 aagtgaaatcgcttcttgataaaggatcttatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgctaaagtaat 18730896  T
Q  201 ttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaac 283  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18730895 ttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaac 18730813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18723676 - 18723394
Alignment:
Q  1 aagtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18723676 aagtttattggaaagatagtcaaatatgtcaacaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccacttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaac 18723577  T
Q  101 aagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  18723576 aagtgaaatcgcttcttgataaaggatctaatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaaggaat 18723477  T
Q  201 ttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaac 283  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18723476 ttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaacgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaac 18723394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18698991 - 18698709
Alignment:
Q  1 aagtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaac 100  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18698991 aagtttattggagatatagtcaaatacgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaac 18698892  T
Q  101 aagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaat 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  18698891 aagtgaaagcgcttcttgataaaggatctgatgatggagtccgcatgttaggactttatggcattggaggcatgggtaaatcaacacttgcgaaagcaat 18698792  T
Q  201 ttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaac 283  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18698791 ttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaac 18698709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18679151 - 18678869
Alignment:
Q  1 aagtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaac 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18679151 aagtttattggagagatagtcaaatacgtctctaacaagatcagtcggcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaac 18679052  T
Q  101 aagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaat 200  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  18679051 aagtgaaatcgcttcttgatgaatgatcttatgatggagtccgcatggtaggactttatggcattggaggcatgggtaaattaacacttgcaaaagcaat 18678952  T
Q  201 ttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaac 283  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18678951 ttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaatcaattgaaac 18678869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 273
Target Start/End: Original strand, 18074352 - 18074620
Alignment:
Q  5 ttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18074352 ttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagtccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagt 18074451  T
Q  105 gaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttat 204  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||  ||| | ||| ||||||| |||||||||   || |||||||||||||||| | |||| |||    
T  18074452 gaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctat 18074551  T
Q  205 aattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaat 273  Q
    |||| | ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| | || ||||| |||||| ||||||||    
T  18074552 aattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtcagagagaattcagcttcaaat 18074620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 165 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5090384 - 5090285
Alignment:
Q  165 tggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattca 264  Q
    |||||| ||||| ||| | ||||||| |||| ||||||| ||||  |||||| |||||||||||||    |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  5090384 tggaggaatgggtaaaaccacacttggaaaagcaatttacaatttcattgctcatcaatttgaatgtctttgttttcttcccaatgtgagagaaaattca 5090285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 28786825 - 28787107
Alignment:
Q  1 aagtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaac 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28786825 aagtttattggagatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaac 28786924  T
Q  101 aagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaat 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  28786925 aagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccgcatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaat 28787024  T
Q  201 ttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaac 283  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  28787025 ttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaac 28787107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 28792946 - 28793228
Alignment:
Q  1 aagtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaac 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28792946 aagtttattggagatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaac 28793045  T
Q  101 aagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaat 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  28793046 aagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccgcatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaat 28793145  T
Q  201 ttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaac 283  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||    
T  28793146 ttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagagttcagcttcaaatagattgaaac 28793228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27718093 - 27717812
Alignment:
Q  2 agtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaaca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27718093 agtttattggagagatagtcaaatacatctccaacaagaccagtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaaca 27717994  T
Q  102 agtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27717993 agtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatt 27717894  T
Q  202 tataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaac 283  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  27717893 tataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcaacttcaaataaattgaaac 27717812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27610714 - 27610433
Alignment:
Q  2 agtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaaca 101  Q
    |||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  27610714 agtttactggagagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcaagtacaaga 27610615  T
Q  102 agtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27610614 agtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatt 27610515  T
Q  202 tataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaac 283  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  27610514 tataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcaacttcaaataaattgaaac 27610433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27604295 - 27604017
Alignment:
Q  5 ttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagt 104  Q
    |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27604295 ttattggaaagatagtgaaagaaatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattatcctattggattgcagtctcgagtacaacaagt 27604196  T
Q  105 gaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttat 204  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27604195 gaaatctcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttat 27604096  T
Q  205 aattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaac 283  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  27604095 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaac 27604017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27592612 - 27592335
Alignment:
Q  5 ttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27592612 ttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagcccttaaatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagt 27592513  T
Q  105 gaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttat 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||  ||| | ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27592512 gaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcgaaagcaatttat 27592413  T
Q  205 aattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaa 282  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||| | ||||||    
T  27592412 aactttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaa 27592335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27677211 - 27676934
Alignment:
Q  5 ttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  27677211 ttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcaacaacccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaaat 27677112  T
Q  105 gaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttat 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||  ||| | ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27677111 gaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcgaaagcaatttat 27677012  T
Q  205 aattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaa 282  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||| | ||||||    
T  27677011 aattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgaaagagagttcagcttcaaataacttgaaa 27676934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 28781688 - 28781970
Alignment:
Q  1 aagtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaac 100  Q
    |||||||||||  | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  28781688 aagtttattggcgatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcacttacatgttgccaattaccctgttggattacagtcccgagtacaac 28781787  T
Q  101 aagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaat 200  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||| || |    
T  28781788 aagtgaaatcgcttcttggtgaaggatatgataatggagtcaggatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgtaaaagcagt 28781887  T
Q  201 ttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaac 283  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  28781888 ttataacttaattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaac 28781970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27427203 - 27426935
Alignment:
Q  5 ttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27427203 ttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagtccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagt 27427104  T
Q  105 gaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttat 204  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||  ||| | ||| ||||||| |||||||||   || |||||||||||||||| | |||| |||    
T  27427103 gaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctat 27427004  T
Q  205 aattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaat 273  Q
    |||| | ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| | || ||||| |||||| ||||||||    
T  27427003 aattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtcagagagaattcagcttcaaat 27426935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27705995 - 27705736
Alignment:
Q  5 ttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27705995 ttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacatcccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagt 27705896  T
Q  105 gaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttat 204  Q
    |||||| ||||||||| | ||| |||||| ||| ||||  ||| | ||| ||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  27705895 gaaatcacttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttttggcattggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatttat 27705796  T
Q  205 aattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattca 264  Q
    |||| | ||||||||||||||||| | | |||||||||| |  |||||||||| ||||||    
T  27705795 aattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattca 27705736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 27679541 - 27679800
Alignment:
Q  5 ttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27679541 ttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagcccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagt 27679640  T
Q  105 gaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttat 204  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||  ||| | ||| ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| |  ||| |||    
T  27679641 gaaatcgcttcttgatgagggatccgatgatggggtccatatggttggaatttatggcattggaggtttggggaaatcaacacttgcaagacaaatctat 27679740  T
Q  205 aattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattca 264  Q
    |||| | |||| |||||||| ||| | |||||||||||| |  |||||||||| ||||||    
T  27679741 aattttgttgcagatcaattcgaaggttcatgttttcttcatgatgtgagagagaattca 27679800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 26803033 - 26803296
Alignment:
Q  1 aagtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaac 100  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  26803033 aagttgattggagagatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtcagcccttacatgttgctaattaccctgttggattgcactctcgagtacaag 26803132  T
Q  101 aagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaat 200  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||  ||| | ||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||| | ||||    
T  26803133 aagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcagcacttgcaagagcaat 26803232  T
Q  201 ttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattca 264  Q
     ||||||| | ||||||||||||||||| | | |||||||||| |  |||||||||| ||||||    
T  26803233 ctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattca 26803296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27698181 - 27697927
Alignment:
Q  1 aagtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaac 100  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||     
T  27698181 aagtttattgaagagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcaagtacaaa 27698082  T
Q  101 aagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaat 200  Q
     |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||| | ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  27698081 gagtgaaatcaattcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatttttgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcaagagcaat 27697982  T
Q  201 ttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgaga 255  Q
     |||||||   ||||||||||||||||| | | |||||||||| | |||||||||    
T  27697981 ctataatttggttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcataatgtgaga 27697927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 264
Target Start/End: Original strand, 26623861 - 26624121
Alignment:
Q  4 tttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaag 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||| | |||||||||    
T  26623861 tttattgaaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtgtgcccttacatgttgctaaataccctgttggattacagtctcaactacaacaag 26623960  T
Q  104 tgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaattta 203  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||| | ||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||| ||    
T  26623961 tgaaatcacttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatgtatgggattggaggcttgggcaaatcaacacttgcaagagcaatcta 26624060  T
Q  204 taattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattca 264  Q
    ||| | | ||||||||||||||||| | | |||||||||| |  |||||||||| ||||||    
T  26624061 taactttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattca 26624121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 264
Target Start/End: Original strand, 26729838 - 26730098
Alignment:
Q  4 tttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaag 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||| | |||||||||    
T  26729838 tttattgaaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtgtgcccttacatgttgctaaataccctgttggattacagtctcaactacaacaag 26729937  T
Q  104 tgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaattta 203  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||| | ||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||| ||    
T  26729938 tgaaatcacttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatgtatgggattggaggcttgggcaaatcaacacttgcaagagcaatcta 26730037  T
Q  204 taattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattca 264  Q
    ||| | | ||||||||||||||||| | | |||||||||| |  |||||||||| ||||||    
T  26730038 taactttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattca 26730098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27530895 - 27530641
Alignment:
Q  2 agtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaaca 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |  | ||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||  || |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  27530895 agtttattggaaagatagtcgaagacatttccaacaggattagtcgtgagcccttagatgttgccaaatatcctgttggattacagtcccgagtacaaca 27530796  T
Q  102 agtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatt 201  Q
     ||||||  || ||||||| ||  |||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  27530795 tgtgaaagggcatcttgatgaaaaatctgatgatgaggtccacatggtaggactttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttgcaaaagcaatt 27530696  T
Q  202 tataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagag 256  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||||||    
T  27530695 tataatttcattgctgatcaatttgaagttttatgttttctagaaaatgtgagag 27530641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 264
Target Start/End: Original strand, 31285149 - 31285409
Alignment:
Q  4 tttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaag 103  Q
    ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||    
T  31285149 tttattggagacatagtcaaatacatctccaacaagatcaatcgtgtgcccttacatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaag 31285248  T
Q  104 tgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaattta 203  Q
    |||||| |||||||||||| | | || ||   || || | |||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||| | |||| ||    
T  31285249 tgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtacacatggtaggactttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatcta 31285348  T
Q  204 taattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattca 264  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  | | |||||||||| |  |||||||||| ||||||    
T  31285349 taattttattggtgatcaatttgacggattatgttttcttcatgatgtgagagagaattca 31285409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 264
Target Start/End: Original strand, 26656606 - 26656815
Alignment:
Q  55 ttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggac 154  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | | ||  || | |||| ||||||    
T  26656606 ttacatgttgccaaataccctgttggattagagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatctaaggatgaggttctcatggtaggac 26656705  T
Q  155 tttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgag 254  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||    
T  26656706 tttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgccaaagcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcacaatgtcag 26656805  T
Q  255 agaaaattca 264  Q
    ||| ||||||    
T  26656806 agagaattca 26656815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 264
Target Start/End: Original strand, 26762577 - 26762786
Alignment:
Q  55 ttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggac 154  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | | ||  || | |||| ||||||    
T  26762577 ttacatgttgccaaataccctgttggattagagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatctaaggatgaggttctcatggtaggac 26762676  T
Q  155 tttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgag 254  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||    
T  26762677 tttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgccaaagcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcacaatgtcag 26762776  T
Q  255 agaaaattca 264  Q
    ||| ||||||    
T  26762777 agagaattca 26762786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 56 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27337635 - 27337463
Alignment:
Q  56 tacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggact 155  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||||  || |||  |||| |||||||    
T  27337635 tacacgttgccaaataccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggact 27337536  T
Q  156 ttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaa 228  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27337535 ttatggtactagaggcttgggaaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaa 27337463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 56 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27398375 - 27398203
Alignment:
Q  56 tacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggact 155  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||||  || |||  |||| |||||||    
T  27398375 tacacgttgccaaataccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggact 27398276  T
Q  156 ttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaa 228  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27398275 ttatggtactagaggcttgggaaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaa 27398203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 264
Target Start/End: Original strand, 26824460 - 26824669
Alignment:
Q  55 ttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggac 154  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||  ||||  ||| ||||||    
T  26824460 ttacatgttgccaaatacccggttggattacagtcccgagtacaacaagtgaaatctcttcttgataacgaatctgatgatgtggtccatatggtaggac 26824559  T
Q  155 tttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgag 254  Q
    |||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||||   |  ||||||||||| || |||||    
T  26824560 tttacggtattggaggtttaggtaaatcaacacttgcaaaagcaacttttaattctattgctgataaatttgaagttttttgttttcttgagaacgtgag 26824659  T
Q  255 agaaaattca 264  Q
    ||| ||||||    
T  26824660 agagaattca 26824669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 26647066 - 26647293
Alignment:
Q  1 aagtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |  ||||||||||||||| ||||      |||||||| ||||  ||||||||||| ||  |||| ||| || |||    
T  26647066 aagtttattgggaagatagtcgaagacatctccaacaagatcaatcgtgtcattttacatgtagccaaataccctgttggattagagtcccgattagaac 26647165  T
Q  101 aagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||  ||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||| ||| | ||    
T  26647166 aagtgaaattgcttcttgataaagaatctgatgaaggggtccatatggtaggactttatggtactggaggtttgggtaaatcaacacttgccaaagcgat 26647265  T
Q  201 ttataattgtattgctgatcaatttgaa 228  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||    
T  26647266 ttataattttgttgctgatcaatttgaa 26647293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 26753034 - 26753261
Alignment:
Q  1 aagtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaac 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |  ||||||||||||||| ||||      |||||||| ||||  ||||||||||| ||  |||| ||| || |||    
T  26753034 aagtttattgggaagatagtcgaagacatctccaacaagatcaatcgtgtcattttacatgtagccaaataccctgttggattagagtcccgattagaac 26753133  T
Q  101 aagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||  ||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||| ||| | ||    
T  26753134 aagtgaaattgcttcttgataaagaatctgatgaaggggtccatatggtaggactttatggtactggaggtttgggtaaatcaacacttgccaaagcgat 26753233  T
Q  201 ttataattgtattgctgatcaatttgaa 228  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||    
T  26753234 ttataattttgttgctgatcaatttgaa 26753261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 228
Target Start/End: Original strand, 26862236 - 26862394
Alignment:
Q  70 taccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggag 169  Q
    ||||||||||| ||  |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||  | ||||||||  || || | |||| ||||||||||||||| |||||    
T  26862236 taccctgttggattaaagtcccgagtagaacaagtgaaattgcttcttgatatggaatctgatgaaggggtacacatggtaggactttatggtactggag 26862335  T
Q  170 gcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaa 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  26862336 gcatggggaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttgttgccgatcaatttgaa 26862394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25492860 - 25492651
Alignment:
Q  55 ttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggac 154  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||| |||||| ||| | | |||||| | ||   ||| |||| ||||||    
T  25492860 ttacatgttgccaaataccctgttggattacaatcccgagtacaacacgtgaaattgcttctagatgaggtatctgaggatgagttccacatggtaggac 25492761  T
Q  155 tttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgag 254  Q
    ||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||| | | ||||||||| | | |||||||    
T  25492760 tttatggtactggaggcttaggtaaatcaacacttgcaaaatcaatctataacttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctaggagatgtgag 25492661  T
Q  255 agaaaattca 264  Q
    ||| ||||||    
T  25492660 agagaattca 25492651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 257
Target Start/End: Original strand, 25580378 - 25580565
Alignment:
Q  70 taccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggag 169  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |  || ||||| | ||  |||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  25580378 taccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgtggtccacatggtaggactttatggtactggag 25580477  T
Q  170 gcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagaga 257  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |||||    
T  25580478 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagaga 25580565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 264
Target Start/End: Original strand, 25483715 - 25483909
Alignment:
Q  70 taccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggag 169  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |  || ||||| | ||  ||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  25483715 taccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttttggtactggag 25483814  T
Q  170 gcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattca 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| | ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||| ||||||    
T  25483815 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattttcttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 25483909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 264
Target Start/End: Original strand, 26143524 - 26143718
Alignment:
Q  70 taccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggag 169  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| || || ||||||||| ||||||||| |  || ||||| | ||  ||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  26143524 taccctgttggattacagtcccgaatagaagaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttttggtactggag 26143623  T
Q  170 gcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattca 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||| ||||||    
T  26143624 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 26143718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 230
Target Start/End: Original strand, 26884711 - 26884886
Alignment:
Q  55 ttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggac 154  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||| || ||||  |||||||||||| | |||| |||||||||||| | |||| | |  || || | |||| |||||     
T  26884711 ttacatgtagccaaataccctgttggattacagtaccgagtacaacaattaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaaggggtacacatggtaggaa 26884810  T
Q  155 tttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaatg 230  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26884811 tttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattatgttgctgatcaatttgaatg 26884886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 264
Target Start/End: Original strand, 26056578 - 26056772
Alignment:
Q  70 taccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggag 169  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |  || |||||   ||  ||||||||| ||||| ||| |||||  ||||    
T  26056578 taccctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgagaatgaggtccgcatggtaggaatttttggtaccggag 26056677  T
Q  170 gcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattca 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||| ||||||    
T  26056678 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 26056772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 264
Target Start/End: Original strand, 26076548 - 26076742
Alignment:
Q  70 taccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggag 169  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |  || |||||   ||  ||||||||| ||||| ||| |||||  ||||    
T  26076548 taccctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggctctgagaatgaggtccgcatggtaggaatttttggtaccggag 26076647  T
Q  170 gcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattca 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||| ||||||    
T  26076648 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 26076742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 228
Target Start/End: Original strand, 25539199 - 25539357
Alignment:
Q  70 taccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggag 169  Q
    ||||||||||| || ||||| | | || |||||||||||| |||||||||    || ||||| | ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25539199 taccctgttggattacagtccccaatagaacaagtgaaattgcttcttgacttgggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggag 25539298  T
Q  170 gcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaa 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  25539299 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattttgttgctgatcaatttgaa 25539357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 283
Target Start/End: Original strand, 27215133 - 27215321
Alignment:
Q  95 tacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaa 194  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| || |||||| | |  |  |||| |||| |||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27215133 tacaacaagtaaaattgcttcttgacaagggatctaaggaagaggtccacatggtaggacttcatggagctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaa 27215232  T
Q  195 atcaatttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaac 283  Q
    | |||||| |||||  ||||||||||| |||||| | |||| |||||| ||| |||||| ||| |||||| ||| |||| | |||||||    
T  27215233 agcaatttttaatttcattgctgatcagtttgaaggttcatattttctagaagatgtgaaagagaattcaactttaaataacttgaaac 27215321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 264
Target Start/End: Original strand, 25511645 - 25511742
Alignment:
Q  167 gaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattca 264  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||| ||||||    
T  25511645 gaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 25511742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 264
Target Start/End: Original strand, 28140303 - 28140385
Alignment:
Q  182 caacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattca 264  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  28140303 caacacttgcacaagcaatttataattttattgccgatcaatttgaatgtttgtgttttcttcataatgtgagagaaatttca 28140385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 264
Target Start/End: Original strand, 26950464 - 26950593
Alignment:
Q  135 tggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaatgctca 234  Q
    ||||||| ||||||||||| |   ||| | ||| || ||||||||  ||||||||||  || || ||||||| |  |||||| ||||||||||||||  |    
T  26950464 tggagtctgcatgataggaatccttggaactgggggaatgggaaagacaacacttgctcaagcagtttataacttgattgctaatcaatttgaatgcaaa 26950563  T
Q  235 tgttttcttgaaaatgtgagagaaaattca 264  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26950564 tgttttcttcacaatgtgagagaaaattca 26950593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 261
Target Start/End: Original strand, 26937620 - 26937876
Alignment:
Q  5 ttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagt 104  Q
    ||||||||||||| ||  || | || || |||||||||| |||||  || |||||||||||   |||||| |||||  ||||||||||| | | ||||||    
T  26937620 ttattggaaagatggttcaagaggtgtctaacaagatcaatcgtcctcctttacatgttgcggattaccccgttggactgcagtctcgattgctacaagt 26937719  T
Q  105 gaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttat 204  Q
     || || |||||  |||  |||| ||||| ||||||  | ||| ||||  | ||||| ||||| || || || |||||||||||||||  | ||||||||    
T  26937720 aaattctcttctgaatattggatatgatgatggagtatgtatggtagggatctatgggattggcggaattggtaaatcaacacttgcacgagcaatttat 26937819  T
Q  205 aattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaat 261  Q
    ||||  |||| ||||||||||||| | |  ||||||||| | |||||  ||||||||    
T  26937820 aatttgattggtgatcaatttgaaagtttgtgttttcttcataatgtacgagaaaat 26937876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 264
Target Start/End: Original strand, 26849463 - 26849562
Alignment:
Q  165 tggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattca 264  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||  || || |||||||||  ||||||||||||||||||||    ||||| ||| |  |||||||||||||||||    
T  26849463 tggaggaatgggaaaaacaacacttgctcaagcagtttataattcgattgctgatcaatttgaatgtaagtgtttccttcacgatgtgagagaaaattca 26849562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28097857 - 28097775
Alignment:
Q  182 caacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattca 264  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||  ||||||| ||||||||||||    ||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  28097857 caacacttgcaaaagcggtttataatttcattgctggtcaatttgaatgtgtctgtttccttcacaatgtgagagaaaattca 28097775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 264
Target Start/End: Original strand, 28243553 - 28243645
Alignment:
Q  172 atgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattca 264  Q
    ||||||||  |||||||||||| | || |||||||||  || |||||||||||||| || | |||||||||| |  |||| || |||||||||    
T  28243553 atgggaaagacaacacttgcaagagcagtttataattccatagctgatcaatttgattgtttatgttttcttcacgatgtaagggaaaattca 28243645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29674476 - 29674432
Alignment:
Q  219 tcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattc 263  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  29674476 tcaatttgaatgttcctgttttcttgaaaaagttagagaaaattc 29674432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 8074 - 8356
Alignment:
Q  1 aagtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaac 100  Q
    |||||||||||  | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8074 aagtttattggcgatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaac 8173  T
Q  101 aagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaat 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  8174 atgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaat 8273  T
Q  201 ttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaac 283  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  8274 ttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaac 8356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13270 - 12988
Alignment:
Q  1 aagtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaac 100  Q
    |||||||||||  | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13270 aagtttattggcgatatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaac 13171  T
Q  101 aagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaat 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  13170 atgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaat 13071  T
Q  201 ttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaac 283  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  13070 ttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaac 12988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4307 - 4025
Alignment:
Q  1 aagtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaac 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4307 aagtttattggagagatagtcaagaacatctccaacaagatcagtcatcagcccttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaac 4208  T
Q  101 aagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaat 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  4207 atgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggagcccacatggtaggactttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaat 4108  T
Q  201 ttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaac 283  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  4107 ttataattttattgctgatgaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaac 4025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3133 - 2852
Alignment:
Q  2 agtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaaca 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  3133 agtttattggagagatagtcaaatacatctccaacaagaccagtcgtcaacccttacatgttgccaattaccctgttggaatgaagtctcgagtacaaca 3034  T
Q  102 agtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatt 201  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  3033 agtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtaggactttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatt 2934  T
Q  202 tataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaatcaattgaaac 283  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  2933 tataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttcaaataaattgaaac 2852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 273
Target Start/End: Original strand, 60160 - 60428
Alignment:
Q  5 ttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  60160 ttattggaaagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgacagtccttacatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagt 60259  T
Q  105 gaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttat 204  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||  ||| | ||| ||||||| |||||||||   || |||||||||||||||| | |||| |||    
T  60260 gaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctat 60359  T
Q  205 aattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttcaaat 273  Q
    |||| | ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| | || ||||| |||||| ||||||||    
T  60360 aattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtcagagagaattcagcttcaaat 60428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 267935 - 267672
Alignment:
Q  1 aagtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaac 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||||| ||||||||    
T  267935 aagtttattggagagatagtcaaatacatctccaacaagatcagtcgtgagcccttacatgttgccaattaccctgttggattatggtctcaagtacaac 267836  T
Q  101 aagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaat 200  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||| | ||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||| | ||||    
T  267835 aagtgaaattgcttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaat 267736  T
Q  201 ttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattca 264  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  267735 ctataattttattgctgatcaatttgaaggattatgttttcttcatgatgtgagagaaaattca 267672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28163916 - 28163707
Alignment:
Q  55 ttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggac 154  Q
    ||||||||||| |  || |||||||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||  |||| |||| ||||||    
T  28163916 ttacatgttgcaaaatatcctgttggattacaatctcaagtacaacaagtgaaattgcttctcgataagggatatgatgatgaggtccacatggtaggac 28163817  T
Q  155 tttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgag 254  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| |||||||    
T  28163816 tttatgatactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctagaagatgtgag 28163717  T
Q  255 agaaaattca 264  Q
    ||| ||||||    
T  28163716 agagaattca 28163707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28127217 - 28127014
Alignment:
Q  54 cttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgatagga 153  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| || |||   | ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||| ||  |||| |||| |||||    
T  28127217 cttacatgttgccaaatatcctgttggattacaggaccaagtacaacaagtgaatttgcttctcgataagggatatgatgatgaggtccacatggtagga 28127118  T
Q  154 ctttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtga 253  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| ||||||    
T  28127117 ctttatggtattggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttttctagaagatgtga 28127018  T
Q  254 gaga 257  Q
    ||||    
T  28127017 gaga 28127014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 29273433 - 29273170
Alignment:
Q  1 aagtttattggaaagatagtcaaatatgtctccaacaagatcagtcgtcagcccttacatgttgccatttaccctgttgggttgcagtctcgagtacaac 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  29273433 aagtttatcggagagatagtcaaatacatctccaacaagatcagccgcgtgcccttacatgttgccaaataccctgttggattacagtctcaagtacaac 29273334  T
Q  101 aagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaat 200  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||  ||| | ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||| | ||||    
T  29273333 aagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttggaatttatgggattggtggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaat 29273234  T
Q  201 ttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattca 264  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||   | |||||||||| |  |||||||||| ||||||    
T  29273233 ctataatttttttgctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtgagagagaattca 29273170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 264
Target Start/End: Original strand, 31905872 - 31905901
Alignment:
Q  235 tgttttcttgaaaatgtgagagaaaattca 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31905872 tgttttcttgaaaatgtgagagaaaattca 31905901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 267
Target Start/End: Original strand, 16691611 - 16691720
Alignment:
Q  158 atggtattggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagaga 257  Q
    |||| |||||||| || || ||| ||||||||||   | ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |  ||||||||| |  | ||||||||    
T  16691611 atggaattggaggaatcggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatttgattgctgatcaatttgaatgtttgtgttttcttcatgacgtgagaga 16691710  T
Q  258 aaattcatct 267  Q
    ||||||||||    
T  16691711 aaattcatct 16691720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 264
Target Start/End: Original strand, 3280409 - 3280509
Alignment:
Q  164 ttggaggcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattc 263  Q
    ||||||| ||||| ||  |||| ||||||| | || |||||||||  |||||| |||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  3280409 ttggaggaatgggtaagacaactcttgcaagagcagtttataatttcattgctaatcaatttgaatgtgtatgttttcttcacaatgtgagagaaaattc 3280508  T
Q  264 a 264  Q
    |    
T  3280509 a 3280509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 264
Target Start/End: Original strand, 43715 - 43807
Alignment:
Q  172 atgggaaaatcaacacttgcaaaatcaatttataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattca 264  Q
    ||||||||  |||||||||||| | || |||||||||  || |||||||||||||| || | |||||||||| |  |||| || |||||||||    
T  43715 atgggaaagacaacacttgcaagagcagtttataattccatagctgatcaatttgattgtttatgttttcttcacgatgtaagggaaaattca 43807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University