View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8199_low_66 (Length: 220)

Name: NF8199_low_66
Description: NF8199
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8199_low_66
NF8199_low_66
[»] chr7 (96 HSPs)
chr7 (3-186)||(33423276-33423459)
chr7 (2-187)||(47740331-47740516)
chr7 (2-187)||(25893917-25894102)
chr7 (2-186)||(33839715-33839899)
chr7 (2-187)||(22979647-22979832)
chr7 (2-187)||(33695821-33696006)
chr7 (2-186)||(17855427-17855611)
chr7 (2-186)||(35355887-35356071)
chr7 (2-187)||(46913107-46913294)
chr7 (2-185)||(47066977-47067160)
chr7 (1-187)||(45690096-45690282)
chr7 (2-183)||(23393051-23393232)
chr7 (2-183)||(49171362-49171543)
chr7 (2-186)||(27018115-27018299)
chr7 (2-186)||(45482657-45482841)
chr7 (2-188)||(2341661-2341848)
chr7 (2-185)||(35328069-35328252)
chr7 (2-183)||(20165814-20165995)
chr7 (2-186)||(33411259-33411443)
chr7 (2-185)||(40670563-40670746)
chr7 (2-188)||(48609677-48609863)
chr7 (2-185)||(26579717-26579900)
chr7 (2-185)||(31586848-31587031)
chr7 (2-185)||(37846016-37846199)
chr7 (2-185)||(10028488-10028673)
chr7 (2-188)||(33332786-33332971)
chr7 (2-164)||(36389377-36389539)
chr7 (2-187)||(5712166-5712351)
chr7 (2-187)||(19563445-19563630)
chr7 (11-182)||(15877553-15877724)
chr7 (2-168)||(5183825-5183991)
chr7 (2-185)||(35757020-35757203)
chr7 (2-185)||(35767481-35767657)
chr7 (2-188)||(45063357-45063541)
chr7 (2-183)||(31625706-31625886)
chr7 (2-186)||(43499484-43499668)
chr7 (2-185)||(31429475-31429658)
chr7 (3-186)||(33870244-33870424)
chr7 (14-183)||(41990870-41991039)
chr7 (2-160)||(29446863-29447020)
chr7 (2-193)||(10618290-10618474)
chr7 (2-133)||(30076527-30076658)
chr7 (36-186)||(33720070-33720220)
chr7 (2-185)||(35752034-35752206)
chr7 (2-134)||(28233936-28234068)
chr7 (2-185)||(43489218-43489390)
chr7 (2-187)||(46817421-46817595)
chr7 (2-186)||(36816845-36817018)
chr7 (2-185)||(24923024-24923196)
chr7 (2-183)||(37127939-37128109)
chr7 (2-185)||(48085858-48086030)
chr7 (2-186)||(7876328-7876501)
chr7 (2-186)||(24228540-24228713)
chr7 (2-186)||(46898016-46898189)
chr7 (2-185)||(21718117-21718288)
chr7 (2-185)||(29610635-29610807)
chr7 (11-185)||(26941541-26941704)
chr7 (10-187)||(25037516-25037682)
chr7 (2-121)||(44405412-44405531)
chr7 (26-167)||(44564356-44564497)
chr7 (2-118)||(41904272-41904388)
chr7 (2-183)||(26371051-26371221)
chr7 (3-184)||(45502817-45502987)
chr7 (3-185)||(33393328-33393499)
chr7 (2-188)||(44003370-44003545)
chr7 (2-183)||(45237533-45237703)
chr7 (2-186)||(7257380-7257553)
chr7 (2-185)||(498188-498360)
chr7 (2-185)||(2332019-2332191)
chr7 (4-188)||(35484633-35484807)
chr7 (4-185)||(39453484-39453647)
chr7 (2-185)||(47906758-47906931)
chr7 (77-186)||(16482847-16482956)
chr7 (6-184)||(29098752-29098915)
chr7 (36-186)||(32556640-32556779)
chr7 (2-186)||(44659843-44660015)
chr7 (87-183)||(39866667-39866763)
chr7 (6-183)||(41855061-41855228)
chr7 (3-179)||(46103127-46103291)
chr7 (4-187)||(15643948-15644120)
chr7 (2-185)||(39323616-39323779)
chr7 (2-183)||(47460772-47460942)
chr7 (73-173)||(38448508-38448608)
chr7 (87-183)||(33455098-33455194)
chr7 (88-183)||(29863017-29863112)
chr7 (120-185)||(30077043-30077108)
chr7 (88-184)||(7720578-7720674)
chr7 (117-185)||(35557730-35557798)
chr7 (77-186)||(21649442-21649552)
chr7 (2-145)||(37443602-37443734)
chr7 (2-67)||(42272180-42272244)
chr7 (122-186)||(35823289-35823353)
chr7 (2-60)||(33455201-33455259)
chr7 (16-60)||(39866762-39866806)
chr7 (92-135)||(26456159-26456202)
chr7 (148-187)||(42272149-42272188)
[»] chr5 (75 HSPs)
chr5 (2-188)||(24253378-24253564)
chr5 (2-188)||(43262183-43262369)
chr5 (2-188)||(27501055-27501241)
chr5 (1-187)||(43326378-43326564)
chr5 (2-187)||(739704-739889)
chr5 (3-183)||(15398483-15398663)
chr5 (4-187)||(6901796-6901979)
chr5 (2-185)||(35626037-35626220)
chr5 (2-186)||(3466681-3466865)
chr5 (1-185)||(5184971-5185155)
chr5 (2-186)||(7722047-7722231)
chr5 (1-187)||(27938894-27939081)
chr5 (2-185)||(39932578-39932761)
chr5 (2-185)||(40886028-40886210)
chr5 (2-184)||(15683791-15683973)
chr5 (2-183)||(18479668-18479849)
chr5 (1-184)||(12648797-12648980)
chr5 (2-188)||(25831517-25831702)
chr5 (2-183)||(2484292-2484473)
chr5 (3-185)||(27278474-27278660)
chr5 (2-186)||(28424795-28424977)
chr5 (2-186)||(5137713-5137897)
chr5 (2-190)||(31938892-31939079)
chr5 (2-188)||(40278858-40279043)
chr5 (2-147)||(29789295-29789440)
chr5 (2-188)||(890902-891087)
chr5 (2-182)||(13504742-13504922)
chr5 (2-176)||(38756487-38756662)
chr5 (2-184)||(763723-763905)
chr5 (4-188)||(40110230-40110413)
chr5 (2-135)||(34451299-34451432)
chr5 (2-188)||(19295726-19295901)
chr5 (2-187)||(27503376-27503550)
chr5 (2-185)||(33617584-33617756)
chr5 (2-183)||(38015514-38015684)
chr5 (2-185)||(23195248-23195420)
chr5 (3-185)||(9424593-9424764)
chr5 (21-187)||(4149691-4149847)
chr5 (2-186)||(5497271-5497444)
chr5 (2-186)||(13957668-13957841)
chr5 (11-187)||(42658671-42658836)
chr5 (2-184)||(6973063-6973234)
chr5 (2-183)||(31293989-31294170)
chr5 (2-183)||(9374502-9374672)
chr5 (2-185)||(36365445-36365617)
chr5 (40-185)||(40632498-40632634)
chr5 (2-183)||(14971979-14972149)
chr5 (2-155)||(3656568-3656710)
chr5 (73-188)||(12558090-12558204)
chr5 (1-185)||(2585461-2585634)
chr5 (2-185)||(24167784-24167956)
chr5 (25-185)||(6206883-6207032)
chr5 (2-150)||(38492647-38492783)
chr5 (2-186)||(38637910-38638083)
chr5 (87-186)||(42247856-42247955)
chr5 (2-186)||(1402505-1402678)
chr5 (2-186)||(18327173-18327346)
chr5 (77-187)||(36472348-36472458)
chr5 (2-185)||(27390596-27390768)
chr5 (76-173)||(5120036-5120132)
chr5 (4-151)||(36948492-36948626)
chr5 (3-179)||(33623940-33624105)
chr5 (2-183)||(40686900-40687069)
chr5 (2-74)||(612757-612830)
chr5 (99-181)||(9171111-9171193)
chr5 (117-183)||(9527124-9527190)
chr5 (117-173)||(15300977-15301033)
chr5 (2-60)||(42247791-42247849)
chr5 (2-65)||(3940336-3940399)
chr5 (93-160)||(3940411-3940478)
chr5 (2-76)||(9171035-9171108)
chr5 (2-39)||(21785995-21786032)
chr5 (114-181)||(33316320-33316387)
chr5 (87-155)||(612830-612897)
chr5 (124-180)||(28756082-28756138)
[»] chr4 (123 HSPs)
chr4 (2-188)||(31532135-31532321)
chr4 (2-184)||(34276547-34276729)
chr4 (2-187)||(21366609-21366794)
chr4 (2-186)||(237475-237659)
chr4 (2-186)||(23437590-23437774)
chr4 (2-185)||(9798464-9798647)
chr4 (2-184)||(18462013-18462195)
chr4 (2-187)||(42085204-42085389)
chr4 (3-183)||(6019929-6020109)
chr4 (2-186)||(39077543-39077727)
chr4 (3-186)||(32366661-32366844)
chr4 (2-185)||(53854430-53854612)
chr4 (2-188)||(41632007-41632192)
chr4 (2-188)||(44984757-44984943)
chr4 (2-188)||(51363003-51363188)
chr4 (2-187)||(2826682-2826866)
chr4 (2-187)||(53461816-53462001)
chr4 (2-187)||(54574940-54575125)
chr4 (2-186)||(19387688-19387872)
chr4 (4-187)||(41702461-41702644)
chr4 (2-188)||(26091258-26091444)
chr4 (2-187)||(3170623-3170808)
chr4 (2-187)||(29478357-29478542)
chr4 (2-187)||(47344653-47344838)
chr4 (2-186)||(31914196-31914379)
chr4 (2-186)||(45797477-45797661)
chr4 (2-181)||(31972336-31972515)
chr4 (2-185)||(42765842-42766024)
chr4 (2-185)||(43471695-43471878)
chr4 (2-185)||(54607961-54608144)
chr4 (2-185)||(55056259-55056442)
chr4 (2-184)||(146429-146611)
chr4 (2-185)||(41949381-41949566)
chr4 (4-185)||(397401-397582)
chr4 (2-183)||(22618514-22618693)
chr4 (4-185)||(50457812-50457993)
chr4 (2-186)||(55776043-55776226)
chr4 (2-186)||(55840221-55840404)
chr4 (2-185)||(407753-407934)
chr4 (5-184)||(6285307-6285486)
chr4 (2-185)||(23609086-23609269)
chr4 (2-185)||(27373075-27373257)
chr4 (2-185)||(56022998-56023181)
chr4 (6-183)||(50534632-50534809)
chr4 (2-185)||(2243457-2243640)
chr4 (2-185)||(29777257-29777440)
chr4 (2-185)||(41560327-41560510)
chr4 (2-186)||(49881059-49881247)
chr4 (6-184)||(35446506-35446683)
chr4 (2-183)||(42222292-42222473)
chr4 (2-187)||(50233997-50234182)
chr4 (2-187)||(54086407-54086590)
chr4 (3-183)||(53834055-53834235)
chr4 (2-185)||(3692210-3692393)
chr4 (2-185)||(31070074-31070256)
chr4 (2-185)||(55519826-55520009)
chr4 (2-185)||(38591667-38591846)
chr4 (2-188)||(47662102-47662288)
chr4 (2-187)||(42033172-42033357)
chr4 (1-194)||(54805613-54805810)
chr4 (2-185)||(48313556-48313737)
chr4 (2-186)||(14017376-14017558)
chr4 (2-185)||(1932762-1932945)
chr4 (1-188)||(50536623-50536810)
chr4 (19-185)||(39587796-39587962)
chr4 (2-182)||(48657826-48658000)
chr4 (2-186)||(54424980-54425163)
chr4 (4-190)||(51951676-51951861)
chr4 (20-183)||(22468788-22468951)
chr4 (11-188)||(33897504-33897680)
chr4 (2-185)||(36532830-36533003)
chr4 (2-187)||(45633779-45633953)
chr4 (2-185)||(15060289-15060461)
chr4 (2-183)||(48259512-48259691)
chr4 (2-183)||(48654815-48655002)
chr4 (1-144)||(52728306-52728448)
chr4 (2-185)||(9997931-9998103)
chr4 (2-188)||(37239090-37239265)
chr4 (2-187)||(22620590-22620764)
chr4 (2-184)||(5117438-5117609)
chr4 (2-184)||(47811906-47812077)
chr4 (2-185)||(34552318-34552490)
chr4 (2-185)||(46708741-46708913)
chr4 (2-185)||(52688348-52688520)
chr4 (2-184)||(54715035-54715206)
chr4 (2-183)||(20351842-20352012)
chr4 (2-183)||(43890929-43891099)
chr4 (2-185)||(27873550-27873720)
chr4 (4-188)||(54216309-54216482)
chr4 (2-185)||(31881314-31881486)
chr4 (2-99)||(35595772-35595869)
chr4 (2-185)||(4486581-4486753)
chr4 (2-188)||(49014094-49014269)
chr4 (2-187)||(34835174-34835348)
chr4 (2-186)||(54216736-54216909)
chr4 (2-185)||(33289702-33289873)
chr4 (2-185)||(38547601-38547773)
chr4 (2-129)||(42509351-42509478)
chr4 (2-185)||(52461365-52461534)
chr4 (87-188)||(3293097-3293198)
chr4 (6-185)||(27398607-27398775)
chr4 (6-185)||(46720024-46720195)
chr4 (3-75)||(33048990-33049062)
chr4 (2-185)||(1662261-1662431)
chr4 (2-183)||(14335101-14335271)
chr4 (2-183)||(27580120-27580290)
chr4 (46-135)||(52396775-52396865)
chr4 (3-104)||(35344868-35344968)
chr4 (87-188)||(11972203-11972304)
chr4 (20-183)||(33557960-33558112)
chr4 (88-185)||(43231502-43231598)
chr4 (2-184)||(6371249-6371420)
chr4 (100-183)||(42557583-42557666)
chr4 (2-185)||(573802-573974)
chr4 (2-79)||(48259704-48259780)
chr4 (2-77)||(51981479-51981554)
chr4 (2-70)||(3291805-3291873)
chr4 (2-151)||(27872612-27872750)
chr4 (2-173)||(18206512-18206682)
chr4 (2-107)||(42558270-42558367)
chr4 (141-186)||(17555625-17555670)
chr4 (78-183)||(49057933-49058038)
chr4 (96-185)||(43478059-43478147)
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (2-187)||(32984077-32984262)
chr8 (1-186)||(41862218-41862403)
chr8 (2-185)||(24079901-24080084)
chr8 (2-185)||(37956420-37956603)
chr8 (2-184)||(9303574-9303756)
chr8 (2-185)||(43328706-43328889)
chr8 (2-188)||(5946043-5946229)
chr8 (2-184)||(40435153-40435335)
chr8 (2-183)||(10646124-10646305)
chr8 (2-185)||(33730641-33730824)
chr8 (2-184)||(9734255-9734435)
chr8 (2-188)||(13356120-13356306)
chr8 (6-183)||(31830959-31831136)
chr8 (2-187)||(41653892-41654077)
chr8 (2-185)||(6365985-6366168)
chr8 (2-185)||(33981663-33981846)
chr8 (2-188)||(17718722-17718908)
chr8 (3-185)||(37301326-37301508)
chr8 (2-188)||(37419936-37420122)
chr8 (2-183)||(2714550-2714730)
chr8 (2-186)||(45236565-45236749)
chr8 (4-179)||(32114254-32114429)
chr8 (2-184)||(2275913-2276094)
chr8 (2-186)||(25185897-25186081)
chr8 (2-185)||(41231945-41232128)
chr8 (2-184)||(9013684-9013865)
chr8 (1-185)||(35628776-35628960)
chr8 (2-185)||(13760646-13760831)
chr8 (2-184)||(45066592-45066774)
chr8 (3-186)||(22878389-22878572)
chr8 (1-187)||(25248036-25248216)
chr8 (5-183)||(44088446-44088624)
chr8 (25-186)||(29048426-29048587)
chr8 (3-187)||(41639911-41640095)
chr8 (2-128)||(12032986-12033112)
chr8 (2-184)||(45258510-45258691)
chr8 (2-135)||(3904126-3904258)
chr8 (2-118)||(41981534-41981650)
chr8 (2-185)||(4447295-4447467)
chr8 (14-183)||(42701301-42701471)
chr8 (1-189)||(10378304-10378481)
chr8 (2-185)||(31940314-31940485)
chr8 (2-188)||(117329-117504)
chr8 (2-185)||(41843252-41843424)
chr8 (2-185)||(9713688-9713857)
chr8 (2-115)||(31336163-31336276)
chr8 (2-183)||(3211207-3211376)
chr8 (2-186)||(2379138-2379311)
chr8 (2-184)||(40458772-40458943)
chr8 (8-172)||(40649837-40649990)
chr8 (7-182)||(4975412-4975576)
chr8 (77-184)||(39915887-39915994)
chr8 (2-185)||(9509400-9509572)
chr8 (2-188)||(33896843-33897017)
chr8 (87-188)||(27243213-27243314)
chr8 (87-188)||(27254788-27254889)
chr8 (8-179)||(32373733-32373892)
chr8 (2-186)||(3490399-3490572)
chr8 (2-188)||(33622467-33622640)
chr8 (19-184)||(38631652-38631806)
chr8 (82-163)||(41981454-41981535)
chr8 (2-188)||(26196317-26196491)
chr8 (75-186)||(31148953-31149063)
chr8 (2-77)||(41425429-41425503)
chr8 (115-178)||(164728-164791)
chr8 (2-67)||(39901674-39901739)
chr8 (148-185)||(12032951-12032988)
chr8 (141-183)||(39901574-39901616)
[»] chr2 (83 HSPs)
chr2 (2-187)||(17600832-17601017)
chr2 (2-185)||(746464-746647)
chr2 (2-187)||(6594458-6594643)
chr2 (2-187)||(23901775-23901960)
chr2 (2-185)||(4034590-4034773)
chr2 (1-184)||(38997100-38997283)
chr2 (2-185)||(45370988-45371171)
chr2 (2-188)||(26710340-26710526)
chr2 (1-185)||(11184970-11185154)
chr2 (2-186)||(13815218-13815402)
chr2 (2-185)||(2324889-2325072)
chr2 (2-185)||(27651034-27651217)
chr2 (2-185)||(40635216-40635399)
chr2 (2-184)||(14660445-14660627)
chr2 (2-184)||(34518366-34518548)
chr2 (8-185)||(6430471-6430648)
chr2 (5-186)||(10424592-10424773)
chr2 (2-187)||(27400399-27400584)
chr2 (2-185)||(10244582-10244765)
chr2 (2-188)||(40735459-40735645)
chr2 (2-183)||(32327361-32327542)
chr2 (2-185)||(27024413-27024596)
chr2 (2-183)||(33427647-33427828)
chr2 (2-185)||(1091951-1092134)
chr2 (2-184)||(5726128-5726310)
chr2 (2-184)||(32948445-32948626)
chr2 (2-183)||(4609626-4609807)
chr2 (2-185)||(40037141-40037323)
chr2 (2-184)||(7892688-7892870)
chr2 (2-186)||(14697537-14697721)
chr2 (2-186)||(37255337-37255516)
chr2 (2-183)||(2914138-2914319)
chr2 (2-186)||(37620867-37621054)
chr2 (8-188)||(15925075-15925255)
chr2 (36-187)||(32608376-32608527)
chr2 (2-183)||(9444683-9444874)
chr2 (1-180)||(11159625-11159803)
chr2 (2-169)||(32856436-32856603)
chr2 (5-132)||(25294886-25295013)
chr2 (28-187)||(8432942-8433101)
chr2 (36-183)||(12842103-12842250)
chr2 (2-183)||(35158050-35158220)
chr2 (3-188)||(39103042-39103216)
chr2 (36-193)||(41172449-41172605)
chr2 (2-185)||(28641292-28641464)
chr2 (2-188)||(1229630-1229809)
chr2 (59-185)||(42899913-42900039)
chr2 (2-185)||(12730059-12730231)
chr2 (2-185)||(29687039-29687211)
chr2 (2-183)||(27331298-27331472)
chr2 (4-184)||(145281-145450)
chr2 (2-186)||(21734900-21735073)
chr2 (2-185)||(4258488-4258659)
chr2 (2-109)||(447633-447740)
chr2 (2-187)||(2688729-2688903)
chr2 (2-187)||(12333497-12333669)
chr2 (2-184)||(19428426-19428598)
chr2 (1-183)||(39301196-39301367)
chr2 (2-187)||(13543624-13543798)
chr2 (1-186)||(27764862-27765035)
chr2 (2-185)||(43898971-43899142)
chr2 (2-185)||(44481826-44481998)
chr2 (7-187)||(28566703-28566872)
chr2 (2-152)||(3711664-3711803)
chr2 (2-183)||(34249265-34249435)
chr2 (2-185)||(43356097-43356266)
chr2 (1-110)||(12827136-12827244)
chr2 (104-188)||(12814609-12814693)
chr2 (1-188)||(2000338-2000512)
chr2 (40-109)||(28014856-28014925)
chr2 (7-185)||(35126778-35126945)
chr2 (87-187)||(40544150-40544250)
chr2 (4-183)||(3266296-3266455)
chr2 (19-184)||(8056625-8056779)
chr2 (2-187)||(30545817-30545991)
chr2 (141-186)||(28019960-28020005)
chr2 (117-184)||(10176558-10176625)
chr2 (2-60)||(40544085-40544143)
chr2 (2-79)||(10176637-10176714)
chr2 (77-152)||(38985342-38985416)
chr2 (2-57)||(42900781-42900835)
chr2 (141-187)||(36216305-36216351)
chr2 (141-185)||(8264532-8264576)
[»] chr1 (108 HSPs)
chr1 (2-186)||(31307999-31308183)
chr1 (2-186)||(45538151-45538335)
chr1 (2-188)||(3611132-3611318)
chr1 (2-187)||(44661967-44662152)
chr1 (2-187)||(23984752-23984937)
chr1 (2-185)||(17994951-17995134)
chr1 (2-184)||(21139412-21139594)
chr1 (2-188)||(47671582-47671768)
chr1 (2-187)||(25058685-25058870)
chr1 (8-188)||(4068689-4068869)
chr1 (2-185)||(5981169-5981352)
chr1 (2-185)||(25678259-25678442)
chr1 (2-185)||(46967041-46967224)
chr1 (2-188)||(6327548-6327733)
chr1 (2-188)||(24245025-24245211)
chr1 (2-188)||(26277173-26277359)
chr1 (4-182)||(43251713-43251891)
chr1 (2-187)||(46616546-46616731)
chr1 (2-186)||(41999813-41999997)
chr1 (2-185)||(31040708-31040891)
chr1 (2-185)||(35273595-35273778)
chr1 (2-185)||(36566329-36566512)
chr1 (2-188)||(26085398-26085583)
chr1 (2-188)||(38331859-38332045)
chr1 (1-186)||(33112817-33113001)
chr1 (2-183)||(38790197-38790378)
chr1 (1-185)||(37620191-37620375)
chr1 (2-185)||(23932509-23932692)
chr1 (2-185)||(39646567-39646750)
chr1 (2-185)||(49253975-49254158)
chr1 (2-184)||(33884088-33884270)
chr1 (2-184)||(33959982-33960164)
chr1 (2-183)||(47317316-47317497)
chr1 (2-187)||(51057068-51057253)
chr1 (1-185)||(5980067-5980251)
chr1 (6-186)||(26794302-26794482)
chr1 (2-185)||(24885500-24885683)
chr1 (2-189)||(46784418-46784605)
chr1 (2-184)||(26524889-26525071)
chr1 (2-188)||(47187101-47187287)
chr1 (2-184)||(47383732-47383914)
chr1 (2-186)||(35692663-35692848)
chr1 (2-183)||(50774218-50774399)
chr1 (6-185)||(23220939-23221112)
chr1 (3-186)||(3285400-3285582)
chr1 (2-185)||(49398988-49399171)
chr1 (2-183)||(36003131-36003315)
chr1 (33-186)||(31844374-31844527)
chr1 (15-182)||(42863867-42864034)
chr1 (5-183)||(28888582-28888760)
chr1 (2-188)||(48373500-48373677)
chr1 (2-185)||(42313361-42313548)
chr1 (46-183)||(25518815-25518952)
chr1 (2-185)||(41467632-41467804)
chr1 (2-187)||(27983603-27983772)
chr1 (2-149)||(2450529-2450676)
chr1 (2-187)||(2657300-2657474)
chr1 (2-188)||(33073207-33073382)
chr1 (2-130)||(4808699-4808827)
chr1 (3-184)||(6626025-6626195)
chr1 (2-187)||(10928064-10928238)
chr1 (8-187)||(26472185-26472353)
chr1 (2-188)||(29770666-29770841)
chr1 (5-182)||(45475848-45476014)
chr1 (2-135)||(51045596-51045729)
chr1 (19-184)||(51403034-51403189)
chr1 (2-188)||(42234836-42235010)
chr1 (2-183)||(4953053-4953223)
chr1 (2-185)||(2954854-2955026)
chr1 (65-182)||(31979998-31980115)
chr1 (1-186)||(4243489-4243663)
chr1 (2-185)||(26685855-26686027)
chr1 (2-133)||(4156438-4156576)
chr1 (8-184)||(34752320-34752485)
chr1 (2-187)||(39475783-39475956)
chr1 (65-187)||(2556909-2557031)
chr1 (2-186)||(30289910-30290083)
chr1 (2-182)||(41895164-41895333)
chr1 (2-95)||(13312531-13312624)
chr1 (2-187)||(33187337-33187505)
chr1 (2-187)||(5961267-5961441)
chr1 (1-185)||(38716246-38716419)
chr1 (2-181)||(1388476-1388644)
chr1 (8-183)||(44544052-44544216)
chr1 (2-185)||(51155590-51155761)
chr1 (2-134)||(47772172-47772304)
chr1 (5-182)||(32448650-32448807)
chr1 (28-184)||(13281588-13281733)
chr1 (87-188)||(13313248-13313351)
chr1 (2-188)||(44293455-44293630)
chr1 (2-186)||(10920198-10920371)
chr1 (2-183)||(7561528-7561712)
chr1 (93-187)||(24649802-24649896)
chr1 (87-193)||(46428327-46428433)
chr1 (2-186)||(52323936-52324110)
chr1 (2-185)||(52367882-52368054)
chr1 (77-185)||(27924722-27924830)
chr1 (19-188)||(35991616-35991773)
chr1 (94-185)||(39637899-39637986)
chr1 (1-172)||(48683329-48683489)
chr1 (125-185)||(4156188-4156248)
chr1 (2-77)||(38718167-38718242)
chr1 (25-135)||(24215812-24215911)
chr1 (2-61)||(31286504-31286563)
chr1 (132-186)||(10919313-10919367)
chr1 (2-39)||(31844818-31844855)
chr1 (157-187)||(23994845-23994875)
chr1 (33-63)||(39359502-39359532)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (2-185)||(39556-39739)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (2-185)||(5882505-5882688)
chr6 (2-187)||(8615237-8615422)
chr6 (2-188)||(22551061-22551247)
chr6 (6-186)||(14891383-14891563)
chr6 (2-181)||(18101495-18101674)
chr6 (2-185)||(24168090-24168273)
chr6 (2-185)||(26377204-26377387)
chr6 (2-186)||(19415533-19415717)
chr6 (4-183)||(2892189-2892368)
chr6 (2-185)||(34527862-34528045)
chr6 (2-187)||(1970708-1970893)
chr6 (2-187)||(7393586-7393771)
chr6 (11-187)||(16703363-16703539)
chr6 (2-186)||(28947085-28947269)
chr6 (2-184)||(959904-960086)
chr6 (2-191)||(2593852-2594041)
chr6 (4-185)||(7345114-7345295)
chr6 (2-171)||(11988974-11989143)
chr6 (3-185)||(19281056-19281238)
chr6 (2-186)||(599890-600074)
chr6 (2-171)||(22341788-22341959)
chr6 (2-185)||(10507908-10508091)
chr6 (2-183)||(33452572-33452753)
chr6 (2-184)||(24224070-24224253)
chr6 (2-188)||(5294801-5294987)
chr6 (2-188)||(5299353-5299539)
chr6 (2-183)||(30743448-30743629)
chr6 (55-185)||(30467656-30467786)
chr6 (2-187)||(28948845-28949019)
chr6 (2-152)||(23261929-23262079)
chr6 (9-187)||(13329378-13329545)
chr6 (2-185)||(15965432-15965604)
chr6 (1-186)||(7167580-7167754)
chr6 (2-183)||(4487528-4487698)
chr6 (2-184)||(3786749-3786920)
chr6 (1-186)||(1398551-1398725)
chr6 (2-183)||(3291009-3291179)
chr6 (102-186)||(929657-929741)
chr6 (2-77)||(18661830-18661905)
chr6 (2-77)||(24913096-24913171)
chr6 (128-188)||(11743070-11743130)
chr6 (87-178)||(1939578-1939669)
chr6 (96-187)||(375807-375898)
chr6 (2-61)||(34262342-34262401)
chr6 (4-61)||(375729-375786)
[»] chr3 (113 HSPs)
chr3 (2-186)||(49330035-49330219)
chr3 (2-185)||(40419834-40420017)
chr3 (2-185)||(47257792-47257975)
chr3 (2-184)||(27066978-27067160)
chr3 (2-188)||(37313395-37313581)
chr3 (2-187)||(40130959-40131144)
chr3 (2-187)||(41464349-41464534)
chr3 (2-186)||(43612047-43612231)
chr3 (2-188)||(7855114-7855300)
chr3 (2-188)||(24100279-24100464)
chr3 (2-183)||(38416724-38416905)
chr3 (2-186)||(22399095-22399278)
chr3 (2-186)||(28048392-28048576)
chr3 (2-185)||(47809596-47809780)
chr3 (2-186)||(48739233-48739417)
chr3 (3-187)||(51170034-51170218)
chr3 (3-187)||(55453245-55453429)
chr3 (2-185)||(40643799-40643982)
chr3 (2-188)||(32234398-32234583)
chr3 (2-188)||(40804510-40804696)
chr3 (2-188)||(51102378-51102564)
chr3 (2-187)||(29625827-29626012)
chr3 (2-186)||(42291840-42292024)
chr3 (2-187)||(41732525-41732710)
chr3 (6-186)||(35594119-35594299)
chr3 (2-186)||(44222827-44223011)
chr3 (2-185)||(2665999-2666182)
chr3 (2-185)||(7755307-7755489)
chr3 (2-185)||(20754393-20754576)
chr3 (2-185)||(35748311-35748494)
chr3 (2-185)||(52628953-52629135)
chr3 (2-184)||(39634572-39634753)
chr3 (2-184)||(51452751-51452932)
chr3 (2-187)||(43125828-43126012)
chr3 (2-185)||(39053393-39053576)
chr3 (2-188)||(37324537-37324723)
chr3 (4-187)||(48609719-48609903)
chr3 (2-185)||(44806683-44806866)
chr3 (2-185)||(51146215-51146398)
chr3 (17-183)||(52215077-52215243)
chr3 (2-183)||(46134357-46134538)
chr3 (2-185)||(53943588-53943770)
chr3 (27-185)||(24376572-24376730)
chr3 (3-183)||(43021715-43021896)
chr3 (2-187)||(52638839-52639024)
chr3 (2-182)||(41293319-41293498)
chr3 (4-179)||(43183917-43184092)
chr3 (2-198)||(36368925-36369120)
chr3 (4-184)||(53832486-53832666)
chr3 (1-188)||(5560024-5560218)
chr3 (2-185)||(41216454-41216637)
chr3 (2-161)||(46126010-46126168)
chr3 (2-183)||(18946904-18947085)
chr3 (4-185)||(47894822-47895003)
chr3 (35-184)||(53637841-53637990)
chr3 (4-187)||(48546842-48547014)
chr3 (2-186)||(25641644-25641817)
chr3 (2-185)||(42589829-42590001)
chr3 (2-188)||(34279721-34279896)
chr3 (2-187)||(51415966-51416140)
chr3 (4-187)||(54159000-54159173)
chr3 (2-187)||(54707220-54707394)
chr3 (2-185)||(55000178-55000350)
chr3 (2-184)||(38156632-38156803)
chr3 (38-188)||(37758925-37759075)
chr3 (2-185)||(54401186-54401358)
chr3 (5-187)||(49130575-49130746)
chr3 (2-185)||(39141125-39141298)
chr3 (2-186)||(47510940-47511113)
chr3 (2-185)||(41635800-41635972)
chr3 (19-180)||(46949379-46949538)
chr3 (2-183)||(31286793-31286963)
chr3 (2-185)||(55379984-55380156)
chr3 (2-188)||(25353550-25353725)
chr3 (2-117)||(33550467-33550582)
chr3 (2-187)||(37028720-37028894)
chr3 (7-183)||(40022075-40022240)
chr3 (2-124)||(52864550-52864671)
chr3 (1-188)||(51224037-51224212)
chr3 (2-185)||(53115446-53115618)
chr3 (4-185)||(45058882-45059052)
chr3 (27-187)||(17665549-17665698)
chr3 (1-184)||(24688114-24688286)
chr3 (88-188)||(28576187-28576287)
chr3 (73-188)||(2227995-2228110)
chr3 (2-187)||(30251501-30251675)
chr3 (53-138)||(47182046-47182131)
chr3 (3-183)||(51143818-51143987)
chr3 (73-175)||(47402810-47402911)
chr3 (88-185)||(48726073-48726170)
chr3 (3-185)||(42998790-42998960)
chr3 (1-183)||(43176737-43176908)
chr3 (88-183)||(41882066-41882161)
chr3 (2-185)||(44945935-44946101)
chr3 (2-77)||(48534007-48534082)
chr3 (88-188)||(21597223-21597323)
chr3 (2-187)||(50731914-50732087)
chr3 (2-187)||(50780769-50780942)
chr3 (2-155)||(52756067-52756213)
chr3 (2-183)||(40165653-40165822)
chr3 (2-86)||(30429227-30429311)
chr3 (111-185)||(52434138-52434213)
chr3 (111-184)||(48752085-48752158)
chr3 (2-54)||(40688431-40688483)
chr3 (141-185)||(51942544-51942588)
chr3 (132-186)||(37741433-37741487)
chr3 (2-153)||(41609098-41609238)
chr3 (88-183)||(177162-177257)
chr3 (73-188)||(8847718-8847832)
chr3 (2-44)||(41882011-41882053)
chr3 (8-61)||(52434291-52434344)
chr3 (157-185)||(33550581-33550609)
chr3 (3-43)||(37760346-37760386)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (2-185)||(13762-13945)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (2-185)||(2432-2615)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (2-187)||(11133-11317)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (2-182)||(1871-2051)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (2-185)||(75244-75427)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (2-185)||(18854-19037)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (2-185)||(278005-278190)
scaffold0007 (2-172)||(176666-176836)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (33-185)||(32560-32712)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (2-183)||(3089-3261)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (2-193)||(4596-4781)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (2-185)||(7089-7262)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-184)||(20476-20648)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (2-188)||(14740-14915)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (2-188)||(98-272)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (2-187)||(4554-4729)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (2-187)||(3389-3564)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (36-190)||(17900-18043)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (78-173)||(19228-19327)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 164; Significance: 8e-88; HSPs: 96)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Original strand, 33423276 - 33423459
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33423276 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 33423375  T
Q  103 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33423376 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 33423459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 47740331 - 47740516
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47740331 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaactat 47740430  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47740431 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 47740516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 25893917 - 25894102
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25893917 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 25894016  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25894017 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 25894102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 33839715 - 33839899
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33839715 ggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 33839814  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839815 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 33839899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 22979647 - 22979832
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22979647 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 22979746  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22979747 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 22979832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 33695821 - 33696006
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33695821 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 33695920  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33695921 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 33696006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17855611 - 17855427
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17855611 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtagtatccatgaactat 17855512  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17855511 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacct 17855427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 35356071 - 35355887
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  35356071 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 35355972  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35355971 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacct 35355887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 46913294 - 46913107
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca--tttttaagtgatatccatgaact 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  46913294 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacacatttttaagtggtatccatgaact 46913195  T
Q  100 atcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46913194 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 46913107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 47066977 - 47067160
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47066977 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 47067076  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47067077 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacc 47067160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 45690096 - 45690282
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45690096 gggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 45690195  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  45690196 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaccctt 45690282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 23393051 - 23393232
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23393051 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 23393150  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23393151 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 23393232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 49171362 - 49171543
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  49171362 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 49171461  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49171462 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 49171543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27018299 - 27018115
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27018299 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 27018200  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27018199 cttgaccacaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 27018115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 45482841 - 45482657
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45482841 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacatcagtcacataagcatatttttaagtgatatccatgaactat 45482742  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45482741 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 45482657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 2341661 - 2341848
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtaccc-atggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2341661 ggtgacaactagggtaccccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagttgtatccatgaacta 2341760  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2341761 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctta 2341848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 35328069 - 35328252
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35328069 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 35328168  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35328169 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttacccaccattcttcataggtaatttagaaaaaacc 35328252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 20165814 - 20165995
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20165814 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttacctcaacctatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactat 20165913  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20165914 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 20165995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 33411443 - 33411259
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33411443 ggtgacaactagggtacttatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 33411344  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33411343 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcaagaaaaaacct 33411259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40670746 - 40670563
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40670746 ggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 40670647  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40670646 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggttggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 40670563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 48609677 - 48609863
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  48609677 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgtataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaattat 48609776  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48609777 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 48609863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 26579717 - 26579900
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26579717 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatacatgaactat 26579816  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26579817 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattgatttgtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 26579900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 31587031 - 31586848
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31587031 ggtgagaactagggtacttatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 31586932  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31586931 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttagtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 31586848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 37846016 - 37846199
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  37846016 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccataaattat 37846115  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37846116 cttgatcccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacc 37846199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10028673 - 10028488
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggta--cccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaact 99  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10028673 ggtgacaactagggtatacccatggaagaatagtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccataaact 10028574  T
Q  100 atcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10028573 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 10028488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33332971 - 33332786
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  33332971 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttacctcaatcaatacacattagccgcataagcatatttttaagtggtatc-atgaactat 33332873  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33332872 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 33332786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 36389539 - 36389377
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  36389539 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 36389440  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttc 164  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  36389439 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttc 36389377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5712351 - 5712166
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5712351 ggtgacaactagggtacccatgaaaaaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccataaactat 5712252  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| || || |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5712251 cttgaccccactaataaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 5712166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19563630 - 19563445
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19563630 ggtgacaattagagtacccatggaagaatggtgggtaatttaccttaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaactat 19563531  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19563530 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 19563445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15877724 - 15877553
Alignment:
Q  11 tagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgaccca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  15877724 tagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgacccc 15877625  T
Q  111 accaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15877624 accaacaaattgctcattttcatttgttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 15877553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Original strand, 5183825 - 5183991
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5183825 ggtgataactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgttatccatgaactat 5183924  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaag 168  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  5183925 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaag 5183991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 35757020 - 35757203
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35757020 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttacccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatc-atgaacta 35757118  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35757119 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcgttggttggtggataaattatccaccattcttcaaagttaatctagaaaaaacc 35757203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 35767657 - 35767481
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35767657 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccatataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 35767558  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35767557 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattg--ggg-----tacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 35767481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 45063357 - 45063541
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45063357 ggtgacaactagagtaccaatgaaagaatggtggataatttacctcaac--atacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45063454  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45063455 cttgactccatcaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 45063541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 31625886 - 31625706
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31625886 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgg-taatttactccaaccaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 31625788  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31625787 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcgaaggtaatctagaaaaaa 31625706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 43499668 - 43499484
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  43499668 ggtgagaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaactaatatacattggccacataagtatatttttaagtggtatccatgaactat 43499569  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  43499568 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattctttaaaggtaatctaaaaaaaacct 43499484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 31429475 - 31429658
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31429475 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatgatgagtaatttacttcaaccaatacacattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgtactat 31429574  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31429575 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaatcacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 31429658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 33870424 - 33870244
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 102  Q
    ||||||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  33870424 gtgacaactagagtacccat---agaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtattcatgaactatc 33870328  T
Q  103 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  33870327 ttgaccccaccaacaaattgctcatttacattggttggtgggtaaattatccaccattctttaaaggtgatctagaaaaaacct 33870244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 183
Target Start/End: Original strand, 41990870 - 41991039
Alignment:
Q  14 ggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaacc 113  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  41990870 ggtacccatggaagaatggtgagtaatttatccaaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactatcttgaccccacc 41990969  T
Q  114 aacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  41990970 aacaaattgctcattttcattggttggtgtgtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaa 41991039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 29447020 - 29446863
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29447020 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatt-actccaaccaatacacattagtcacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 29446922  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcatt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  29446921 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatt 29446863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10618474 - 10618290
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10618474 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtggtattcatgaactat 10618375  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttagtttt 193  Q
           | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10618374 -------ccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaatgtaatctagaaaaaaccatagtttt 10618290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Original strand, 30076527 - 30076658
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30076527 ggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttacgccaactaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 30076626  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcat 133  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  30076627 cttgaccccaccaacaaattgatcattttcat 30076658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 186
Target Start/End: Original strand, 33720070 - 33720220
Alignment:
Q  36 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattg 135  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||    
T  33720070 gtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactatcttgactccatcaacaaattgctcatttttattg 33720169  T
Q  136 attgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33720170 gttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacct 33720220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 35752034 - 35752206
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  35752034 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 35752122  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35752123 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 35752206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Original strand, 28233936 - 28234068
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28233936 ggtgacaactagggtacccatgaaagaaaggtgggtagtttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 28234035  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcatt 134  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28234036 cttaaccccaccaacaaattgctcattttcatt 28234068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 43489390 - 43489218
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  43489390 ggtgacaactagactacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 43489302  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  43489301 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattattcaaaggtaatttagaaaaaacc 43489218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 46817421 - 46817595
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  46817421 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 46817509  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46817510 cttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 46817595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 36816845 - 36817018
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  36816845 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 36816933  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36816934 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 36817018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 24923024 - 24923196
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||| |||    
T  24923024 ggtgacaactaggctacccatgaaagaaggatgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaattat 24923112  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24923113 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 24923196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 37128109 - 37127939
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||           |||||||||    
T  37128109 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagctacataagcacatattt-----------atgaactat 37128021  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  37128020 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttaaaaaaaa 37127939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 48086030 - 48085858
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| || |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  48086030 ggtgataattaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 48085942  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||| || || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48085941 cttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 48085858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 7876328 - 7876501
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||| ||||||||||    
T  7876328 ggtgacaactaggctaccaatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtac-----------atattcatgaactat 7876416  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    ||||| || || || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7876417 cttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaacaacct 7876501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24228713 - 24228540
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||||    
T  24228713 ggtgacaattaggctacccatgaaagaatgatggataatttacccaaaccaatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaactat 24228625  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24228624 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggttggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 24228540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 46898016 - 46898189
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  46898016 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 46898104  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
     ||||||| | ||| ||||||||||| || |||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  46898105 tttgaccccatcaataaattgctcatatttattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 46898189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21718288 - 21718117
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  21718288 ggtgacaactaggctacccatgaaa-aataatgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 21718201  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||    
T  21718200 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccgttattcaaaggtaatttagaaaaaacc 21718117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 29610807 - 29610635
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  29610807 ggtggcaactatgctacccatgaaagaatgatgagtaatttactccaatcaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 29610719  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29610718 cttaaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 29610635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Original strand, 26941541 - 26941704
Alignment:
Q  11 tagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgaccca 110  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||||||||||     
T  26941541 taggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgacccc 26941629  T
Q  111 accaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26941630 acaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttataaaaaacc 26941704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 187
Target Start/End: Original strand, 25037516 - 25037682
Alignment:
Q  10 ctagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgaccc 109  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||           ||||||||||||||||||    
T  25037516 ctaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaatcaatacacatcagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgaccc 25037604  T
Q  110 aaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
     ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25037605 caccaataaattgatcattttaattgattggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 25037682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 44405531 - 44405412
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44405531 ggtgacaactagaatacccatggaagaatggtaggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 44405432  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaatt 121  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  44405431 cttgaccctaccaataaatt 44405412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44564497 - 44564356
Alignment:
Q  26 agaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctc 125  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | || || ||||||||     
T  44564497 agaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcatatttttaagtggtatctatgaactatcttgacaccactaataaattgctt 44564398  T
Q  126 attttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaa 167  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  44564397 atttttattgattggtgggtaaattatccaccattcttcaaa 44564356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 41904388 - 41904272
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41904388 ggtgacaactaggatacttatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41904289  T
Q  102 cttgacccaaccaacaa 118  Q
    |||||||  ||||||||    
T  41904288 cttgacctcaccaacaa 41904272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 26371221 - 26371051
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||           |||| ||||||||||    
T  26371221 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcac-----------atattcatgaactat 26371133  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
     ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||    
T  26371132 tttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatggataaattacccaccattcttcaaagataatttaaaaaaaa 26371051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Original strand, 45502817 - 45502987
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 102  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || ||||               
T  45502817 gtgacaactaaggtatccatggaagaacggtgggtaatttacctcaaccaatatacattagctacataagcatatttttaaatggtatc----------- 45502905  T
Q  103 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  45502906 ttgacccaactaacaaattgctcattttcattgattggtaggtaaattactcaccattcttcaaagttaatctagaaaaaac 45502987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 33393499 - 33393328
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||           |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  33393499 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatgaacattaacc-----------tttttaggtggtatccataaactatc 33393411  T
Q  103 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  33393410 ttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccactattttttaaaggtaatctagaaaaaacc 33393328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 44003370 - 44003545
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  44003370 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 44003458  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  44003459 cttgactccaccaataaattgctcattatgattagttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 44003545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 45237533 - 45237703
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||           |||||| |||    
T  45237533 ggtgacaactaagctacccataaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatatt-----------catgaattat 45237621  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||  || || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45237622 cttgacctcacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacctatcattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 45237703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7257553 - 7257380
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||           ||| |||||| ||| ||| ||| ||||||    
T  7257553 ggtgacaactagggtacccatagaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataatcatt-----------cacctttttaggtggtattcataaactat 7257465  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7257464 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccatcatttttcgaaggtaatctagaaaaaacct 7257380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 498188 - 498360
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  498188 ggtggcaactaggctagccatgaaagaatgatggataatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 498276  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  498277 cttgaccccacaaataaattactcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttataaaaaacc 498360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 2332191 - 2332019
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  2332191 ggtgacaacttgggtacccatggaaaaatggtggataatttaccccaaccaatacacagtaaccacataagcac-----------atattcatgaactat 2332103  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  2332102 cttgatcccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattactcaccatttttcaaagataatttagaaaaaacc 2332019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 35484807 - 35484633
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 103  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||           ||||||||||||    
T  35484807 tgacaattaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttacctcaaataatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactatct 35484719  T
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaa-ttacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||| |  || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35484718 tgaccccataaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaatttacccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacctta 35484633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Original strand, 39453484 - 39453647
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 103  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||                  ||||||||    
T  39453484 tgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccattacacattagtcacataaacacat------------------aactatct 39453565  T
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39453566 tgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatttagaaaaaacc 39453647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 47906758 - 47906931
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaattt-accccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    |||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||||||    
T  47906758 ggtggcaactaggctatccatgaaaaaatgatgggtaattttaccctaatcaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 47906846  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||| || || || ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47906847 tcttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtaggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 47906931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 186
Target Start/End: Original strand, 16482847 - 16482956
Alignment:
Q  77 tttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatcta 176  Q
    |||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  16482847 tttttaggtggtatccataaaccatcttgaccccaccaataaattgctcattatcattgattggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 16482946  T
Q  177 gaaaaaacct 186  Q
    ||||||||||    
T  16482947 gaaaaaacct 16482956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 29098915 - 29098752
Alignment:
Q  6 acaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 105  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||               |||||||||||||    
T  29098915 acaactaggctatccatgaaaaaatgatgagtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatat---------------atgaactatcttg 29098831  T
Q  106 acccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29098830 accccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaatttagaaaaaac 29098752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 186
Target Start/End: Original strand, 32556640 - 32556779
Alignment:
Q  36 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattg 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||           |||||||||||||| ||| || || |||||| ||||||||||||    
T  32556640 gtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactatcttgtccccacaaataaattgttcattttcattg 32556728  T
Q  136 attgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32556729 gttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 32556779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 44660015 - 44659843
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||||    
T  44660015 ggtggcaactaggctacccataaaagaatgatggataatttactccaaccgatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaactat 44659927  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44659926 cttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtggataaatta-ccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 44659843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 39866763 - 39866667
Alignment:
Q  87 atatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  39866763 atattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgagtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 39866667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41855228 - 41855061
Alignment:
Q  6 acaactagg-gtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatctt 104  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||           |||||||||||    
T  41855228 acaactaggagtatccatggaagaatgatgggtaatttatccaaactaatacacattagccacataagcatatattta-----------tgaactatctt 41855140  T
Q  105 gacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    ||| | ||||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  41855139 gactccaccaataaattgctcacattcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaa 41855061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 46103291 - 46103127
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 102  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||     
T  46103291 gtgacaactagactacccatgaaagaatgatgagtaatttactccaactaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactatt 46103203  T
Q  103 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaa 179  Q
    ||||||| || || |||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  46103202 ttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggt-ggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaa 46103127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 187
Target Start/End: Original strand, 15643948 - 15644120
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 103  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| |||||| |    
T  15643948 tgacaactagtgtacccatgaaaaaatggtgggtaatttaccccaatcaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactattt 15644036  T
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  15644037 tgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccattttttaaagataatctagaaaaaacctt 15644120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 39323779 - 39323616
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||                   | ||||||||||    
T  39323779 ggtgacaactaggctactcatgaaagaatgatgggtaatttaccc-aaccaatacacattagccacata-------------------ttcatgaactat 39323700  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39323699 cttgaccccacaaataaattgttcattttaattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 39323616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 47460772 - 47460942
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||           ||  |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  47460772 ggtgacaactagggtacccatgaaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaataaacatt-----------catctttttaggtggtatccataaactat 47460860  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| ||| |||| || ||| |||||||| ||||||    
T  47460861 cttgaccccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattatccaccattttttaaaagtaatctaaaaaaaa 47460942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 173
Target Start/End: Original strand, 38448508 - 38448608
Alignment:
Q  73 cacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaa 172  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||||    
T  38448508 cacatttttaggtgatattcataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattgattggtgggtaaattatccacaatttttcaaaggtaa 38448607  T
Q  173 t 173  Q
    |    
T  38448608 t 38448608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 33455194 - 33455098
Alignment:
Q  87 atatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||| |||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33455194 atattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgttcatttttattggttggtgggtaaattatccaccattcttcataggtaatttagaaaaaa 33455098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29863112 - 29863017
Alignment:
Q  88 tatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||||||||| ||||  | ||||| |||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29863112 tatccatgaactattttgattccaccaataaattattcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctaaaaaaaa 29863017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 185
Target Start/End: Original strand, 30077043 - 30077108
Alignment:
Q  120 ttgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30077043 ttgcccattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacc 30077108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 184
Target Start/End: Original strand, 7720578 - 7720674
Alignment:
Q  88 tatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | | |||||||| ||||| |||| ||  ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  7720578 tatccatgaactatcttaacccaatctataaattgcttatttttattggttagtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatcaagaaaaaac 7720674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 35557798 - 35557730
Alignment:
Q  117 aaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  35557798 aaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtattctaaaaaaaacc 35557730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 186
Target Start/End: Original strand, 21649442 - 21649552
Alignment:
Q  77 tttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatca-ttcttcaaaggtaatct 175  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||| |  | || || ||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21649442 tttttaggtggtatccataaactatcttaaatctactaataaattgctcattttcattggttaataagtaaattacccatcattttttcaaaggtaatct 21649541  T
Q  176 agaaaaaacct 186  Q
    | |||||||||    
T  21649542 aaaaaaaacct 21649552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Original strand, 37443602 - 37443734
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| |||| || ||||||    
T  37443602 ggtgacaactagggtacccataaaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatctataaactat 37443690  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggt 145  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| |||||    
T  37443691 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggt 37443734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 42272244 - 42272180
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccac 67  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  42272244 ggtgacaactagggtatc-atggaagaattatgggtaatttacctcaatcaatacacattagccac 42272180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 35823353 - 35823289
Alignment:
Q  122 gctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  35823353 gctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttctaaggtaatttagaaaaaacct 35823289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 33455259 - 33455201
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacat 60  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  33455259 ggtgacaactaggctacctatgaaagaatgatggacaatttacccaaaccaatacacat 33455201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 39866806 - 39866762
Alignment:
Q  16 tacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacat 60  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39866806 tacccatgaaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacat 39866762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 26456202 - 26456159
Alignment:
Q  92 catgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattg 135  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  26456202 catgaactatcttgatcccaccaataaattgctcattttcattg 26456159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 42272188 - 42272149
Alignment:
Q  148 attacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42272188 attagccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 42272149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 75)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24253564 - 24253378
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24253564 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 24253465  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24253464 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 24253378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 43262183 - 43262369
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43262183 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 43262282  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43262283 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtaggttaattacccaccattcttcaaaggtaatatagaaaaaacctta 43262369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 27501055 - 27501241
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27501055 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaacaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 27501154  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27501155 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctta 27501241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 43326378 - 43326564
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43326378 gggtgccaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataggcacatttttaagtggtatccatgaacta 43326477  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43326478 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 43326564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 739704 - 739889
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  739704 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 739803  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  739804 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 739889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 183
Target Start/End: Original strand, 15398483 - 15398663
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 102  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15398483 gtgacaactagagtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 15398582  T
Q  103 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15398583 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 15398663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6901979 - 6901796
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  6901979 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactatct 6901880  T
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6901879 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacctt 6901796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 35626220 - 35626037
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35626220 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 35626121  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35626120 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 35626037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 3466681 - 3466865
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3466681 ggtgacaactagggtacccataaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 3466780  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3466781 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 3466865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 5185155 - 5184971
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5185155 gggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgagtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaacta 5185056  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5185055 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 5184971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7722231 - 7722047
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7722231 ggtgacaattagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccaaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 7722132  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7722131 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaaggcaatctagaaaaaacct 7722047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27939081 - 27938894
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggta-cccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaact 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27939081 gggtgacaactagggtaacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 27938982  T
Q  100 atcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27938981 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaaataatctagaaaaaacctt 27938894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 39932761 - 39932578
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39932761 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggttggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 39932662  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39932661 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 39932578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 40886028 - 40886210
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40886028 ggtgaaaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccatgaactat 40886126  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40886127 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 40886210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15683973 - 15683791
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15683973 ggtgacaactagggtacttatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccatataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 15683874  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15683873 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacacatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 15683791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 18479668 - 18479849
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18479668 ggtgactactagggtatccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 18479767  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18479768 tttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 18479849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 12648980 - 12648797
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12648980 gggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 12648881  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12648880 tcttaaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaagataatctagaaaaaac 12648797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25831702 - 25831517
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25831702 ggtgacaaataaggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaattggtatccatgaactat 25831603  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
     ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25831602 -ttgaccccaccaacaaattgcttattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 25831517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 2484292 - 2484473
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2484292 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtagtatccatgaactat 2484391  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  2484392 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaagataatctagaaaaaa 2484473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 185
Target Start/End: Original strand, 27278474 - 27278660
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaa----c 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    |    
T  27278474 gtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacgtaagcacatttttaagtggtatccatgaattatc 27278573  T
Q  99 tatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27278574 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 27278660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 28424795 - 28424977
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28424795 ggtgacaactagagtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 28424894  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28424895 cttgaccccaccaacaaattg--cattttcattggttgatggataaattacccactatccttcaaaggtaatctagaaaaaacct 28424977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 5137897 - 5137713
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5137897 ggtgacaactagggtattaatggaagaatggtggataatttactcaaatcaatacatattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 5137798  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5137797 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 5137713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 31939079 - 31938892
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31939079 ggtgacaattagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcatataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 31938980  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttagt 190  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  31938979 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaat-aaaaaaaaaccttagt 31938892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 40278858 - 40279043
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  40278858 ggtgacaactagggtattcatggaagaatgatgggtaatttatctcaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 40278957  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  40278958 gttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaat-taaaaaaaacctta 40279043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Original strand, 29789295 - 29789440
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29789295 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 29789394  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaa 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  29789395 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaa 29789440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 891087 - 890902
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  891087 ggtgacaattaggatacccatggaagaatggtaggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccatgaactat 890989  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  890988 cttgactcgaccaacaaattgctcattttcattagttggtggataaattatccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacctta 890902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 182
Target Start/End: Original strand, 13504742 - 13504922
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13504742 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtggataatttatcccaactaatacatattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 13504841  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaa 182  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  13504842 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcgatggtaatctagaaaaa 13504922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 38756487 - 38756662
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatgg-aagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  38756487 ggtgacaactagggtacctatgggaagaattgtgggtaatttatctcaactaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 38756586  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatcta 176  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38756587 tcttgatcccaccaacaaattgctcattttcatttattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcta 38756662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 763905 - 763723
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  763905 ggtgacaactagagtatccatcaaagaatgatgggtaatttaccccaactaatacatattagccacataagtacatttttaagtgatatccatgaactat 763806  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    ||| || | ||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  763805 cttaactccaccaacaaattactcatttttattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaaaataatctagaaaaaac 763723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 40110413 - 40110230
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 103  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||| | | |||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  40110413 tgacaattaggatactcatggaagaatggtagataatttaccctaactaatatacattaaccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactatct 40110314  T
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40110313 tgaccc-accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaatatagaaaaaacctta 40110230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 34451432 - 34451299
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34451432 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 34451333  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattg 135  Q
     ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  34451332 attgaccccaccaataaattgctcattttcattg 34451299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 19295901 - 19295726
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  19295901 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atatacatgaactat 19295813  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    ||| |||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19295812 cttaaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 19295726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27503550 - 27503376
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  27503550 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 27503462  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27503461 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 27503376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 33617756 - 33617584
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  33617756 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 33617668  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  33617667 cttgaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 33617584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 38015514 - 38015684
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  38015514 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 38015602  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  38015603 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 38015684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 23195248 - 23195420
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  23195248 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgacgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 23195336  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23195337 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatttagaaaaaacc 23195420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 185
Target Start/End: Original strand, 9424593 - 9424764
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 102  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||||||    
T  9424593 gtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaactatc 9424681  T
Q  103 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9424682 ttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 9424764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4149847 - 4149691
Alignment:
Q  21 atggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaat 120  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||          | |||| ||||||||||    
T  4149847 atggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcca----------taaccccaccaacaaat 4149758  T
Q  121 tgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4149757 tgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatatagaaaaaacctt 4149691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 5497444 - 5497271
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  5497444 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 5497356  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
     ||||||| || || |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  5497355 tttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacct 5497271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13957841 - 13957668
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||           ||||||||||    
T  13957841 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcgcatatt-----------catgaactat 13957753  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13957752 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 13957668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 42658671 - 42658836
Alignment:
Q  11 tagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgaccca 110  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||           ||||||||||||||||||     
T  42658671 taggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatatt-----------catgaactatcttgacccc 42658759  T
Q  111 accaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42658760 acaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaattttgaaaaaacctt 42658836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6973234 - 6973063
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  6973234 ggtgtcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacatattagtcacataagcacatatt-----------catgaactat 6973146  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| || || |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6973145 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 6973063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 31293989 - 31294170
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |  ||| |||||| ||||||||||| ||| |||| ||||     
T  31293989 ggtgacaactagggtacccatgtaagaatggtgggtaatttactccaaccaataaccatcaatcacgtaagcatatttttaagtggtattcatggactac 31294088  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |  ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  31294089 ccggaccctaccaataatttgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaa 31294170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 9374502 - 9374672
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||           ||||||||||    
T  9374502 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacctaaacacatatt-----------catgaactat 9374590  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  9374591 cttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaa 9374672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 36365445 - 36365617
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  36365445 ggtggcaactagactatccatgaaagaatgatggctaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 36365533  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36365534 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 36365617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40632634 - 40632498
Alignment:
Q  40 tttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40632634 tttaccccaaccaatacacattagccacataagcacc---------ggtatccatgaactatcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttg 40632544  T
Q  140 atgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40632543 gtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 40632498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14972149 - 14971979
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| ||           ||| ||||||    
T  14972149 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcctaatcaatacacattagtcacataagcacatatt-----------cataaactat 14972061  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||    
T  14972060 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagttaatttaaaaaaaa 14971979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 155
Target Start/End: Original strand, 3656568 - 3656710
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  3656568 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 3656656  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattaccca 155  Q
    |||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3656657 cttgaccccaaaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattaccca 3656710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 188
Target Start/End: Original strand, 12558090 - 12558204
Alignment:
Q  73 cacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaa 172  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12558090 cacatttttaagtggtatc-atgaactatcttgaccacatcaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaa 12558188  T
Q  173 tctagaaaaaacctta 188  Q
    ||||||||||||||||    
T  12558189 tctagaaaaaacctta 12558204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 2585634 - 2585461
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||  ||||||  || ||||||| |||||    
T  2585634 gggtgacaattagggtatccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------caactttttagatggtatccataaacta 2585546  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2585545 tcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 2585461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 24167784 - 24167956
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  24167784 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatgttgagtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 24167872  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||| |||||| | ||| | |||| ||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24167873 cttgaccccaccaataaattgtttattatgattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 24167956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 6207032 - 6206883
Alignment:
Q  25 aagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgct 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||||||| |||||||  | || ||||||||    
T  6207032 aagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactattttgaccccccaaataaattgct 6206944  T
Q  125 cattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| || ||||||||    
T  6206943 cattttaattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaagtaatttaaaaaaaacc 6206883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 38492783 - 38492647
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||           |||| ||||||||||    
T  38492783 ggtggcaactaggctacc-atgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcac-----------atattcatgaactat 38492696  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaatt 150  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38492695 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaatt 38492647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 38637910 - 38638083
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| |||||           ||| ||||||  || ||||||| ||||||    
T  38637910 ggtgacaactagggtacccatggaaaaattgtgggtaatttaccccaactaataaacatt-----------cacctttttagttggtatccataaactat 38637998  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38637999 cttgaccccaccaataaattactcattatgattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacct 38638083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 186
Target Start/End: Original strand, 42247856 - 42247955
Alignment:
Q  87 atatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42247856 atattcataaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 42247955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 1402505 - 1402678
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||           ||| |||||  ||| ||||||| ||||||    
T  1402505 ggtgataactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaactaataaacatt-----------cacctttttgggtggtatccataaactat 1402593  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||| | |||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1402594 cttgatcccaccaataaattactcattatgattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacct 1402678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 18327173 - 18327346
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  18327173 ggtgataactaaggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 18327261  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18327262 cttgactccaccaataaattgcgcattataattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaagataatctagaaaaaacct 18327346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 187
Target Start/End: Original strand, 36472348 - 36472458
Alignment:
Q  77 tttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatcta 176  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  36472348 ttttaaagtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 36472447  T
Q  177 gaaaaaacctt 187  Q
    |||||||||||    
T  36472448 gaaaaaacctt 36472458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27390768 - 27390596
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  27390768 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatgaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 27390680  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  27390679 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaactatccaccatttttcaaaggtaatctaaaaataacc 27390596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 5120132 - 5120036
Alignment:
Q  76 atttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaat 173  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5120132 atttttaagtggtatc-atgaactatcttgaccctaccaataaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcatcaaaggtaat 5120036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Original strand, 36948492 - 36948626
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 103  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||    
T  36948492 tgacagctagggtactcatgcaagaatggtgggtaatttacccta-ccaatacacattagccacataagcac-----------atatccatgaactatct 36948579  T
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaatta 151  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  36948580 t-accctaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 36948626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 179
Target Start/End: Original strand, 33623940 - 33624105
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 102  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           ||| ||||||| |||     
T  33623940 gtgacaattagggtatccattgaaaaatggtggataatttaccccaaccgatacacattagccacataagcac-----------atacccatgaattatt 33624028  T
Q  103 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaa 179  Q
    |||| || || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||    
T  33624029 ttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatctaccattattcaaaggtaatttagaa 33624105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 40687069 - 40686900
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| ||||||  || ||| ||| ||||||    
T  40687069 ggtgacaattagggtacctatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cac-tttttagatggtattcataaactat 40686982  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||| ||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  40686981 cttgaccccaccaataaattactcattatgattggttggtggataaattacccaccatttctcaaaggtaatctagaaaaaa 40686900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 74
Target Start/End: Original strand, 612757 - 612830
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttac-cccaaccaatacacattagccacataagca 74  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  612757 ggtgacaactaggatacccatggaagaatactgagtaatttactcccaaccaatacacattagccacataagca 612830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 181
Target Start/End: Original strand, 9171111 - 9171193
Alignment:
Q  99 tatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaa 181  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9171111 tatcttgaccccacaaataaattgctcattttcatttgttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaa 9171193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 183
Target Start/End: Original strand, 9527124 - 9527190
Alignment:
Q  117 aaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  9527124 aaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaa 9527190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 173
Target Start/End: Original strand, 15300977 - 15301033
Alignment:
Q  117 aaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaat 173  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15300977 aaattgctcattttcattggttgatgtgtaaattaccaatcattcttcaaaggtaat 15301033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 42247791 - 42247849
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacat 60  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42247791 ggtgtcaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaatcaatacacat 42247849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Original strand, 3940336 - 3940399
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagcc 65  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  3940336 ggtgacaactaaggtatctatggaagaatgatgagtaatttattcgaaccaatacacattagcc 3940399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 160
Target Start/End: Original strand, 3940411 - 3940478
Alignment:
Q  93 atgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcatt 160  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  3940411 atgaattatcttgaccgcaccaataaattgctcattttcatttgttggtgggtaaattacccaccatt 3940478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 76
Target Start/End: Original strand, 9171035 - 9171108
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca 76  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||   ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  9171035 ggtgacaactaggctacctatgaaagaatgacaagtaatttaccc-aatcaatacacattaaccacataagcaca 9171108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 21786032 - 21785995
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaa 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21786032 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgataggtaa 21785995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 181
Target Start/End: Original strand, 33316320 - 33316387
Alignment:
Q  114 aacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaa 181  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||    
T  33316320 aacaaattgcttattttcattggttgataagtaaattacttgtcattctttaaaagtaatctagaaaa 33316387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 155
Target Start/End: Original strand, 612830 - 612897
Alignment:
Q  87 atatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattaccca 155  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| || ||| ||| |||||||||||    
T  612830 atatcaataaactatcttgaccccaccaataaattgttcattttca-tggttggtggttaaattaccca 612897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28756138 - 28756082
Alignment:
Q  124 tcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaa 180  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||    
T  28756138 tcattttcattgcttggtgggtaaattatccacctttctttaaaggtgatctagaaa 28756082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 123)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 31532135 - 31532321
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31532135 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 31532234  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31532235 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 31532321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 34276729 - 34276547
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34276729 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 34276630  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34276629 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 34276547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 21366609 - 21366794
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21366609 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 21366708  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21366709 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaccctt 21366794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 237659 - 237475
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  237659 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgttatccatgaactat 237560  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  237559 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacct 237475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23437774 - 23437590
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23437774 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 23437675  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23437674 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 23437590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9798647 - 9798464
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9798647 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 9798548  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9798547 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 9798464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 18462013 - 18462195
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18462013 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtgatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 18462112  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18462113 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 18462195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 42085389 - 42085204
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42085389 ggtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 42085290  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42085289 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacctt 42085204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 6020109 - 6019929
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  6020109 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatt 6020010  T
Q  103 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6020009 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 6019929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 39077727 - 39077543
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39077727 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgttgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 39077628  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39077627 cttaaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 39077543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Original strand, 32366661 - 32366844
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32366661 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccacaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 32366760  T
Q  103 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32366761 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacct 32366844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 53854430 - 53854612
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53854430 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 53854528  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53854529 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 53854612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 41632007 - 41632192
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41632007 ggtgacaactaggatacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacatattagccatataagtacatttttaagcgatatccatgaactat 41632106  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41632107 cttgaccc-accaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 41632192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 44984943 - 44984757
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44984943 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 44984844  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  44984843 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaccctta 44984757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 51363188 - 51363003
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51363188 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 51363090  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51363089 cttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 51363003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 2826682 - 2826866
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2826682 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 2826780  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2826781 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagggaatctagaaaaaacctt 2826866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 53461816 - 53462001
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53461816 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 53461915  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  53461916 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttacccaccattcttcataggtaatttagaaaaaacctt 53462001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 54574940 - 54575125
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54574940 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 54575039  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  54575040 cttgaccccaccaccaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttctaagataatctagaaaaaacctt 54575125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 19387688 - 19387872
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19387688 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacaat 19387787  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19387788 cttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaacgtaatctagaaaaaacct 19387872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 187
Target Start/End: Original strand, 41702461 - 41702644
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41702461 tgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 41702560  T
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41702561 taaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaagttacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 41702644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 26091258 - 26091444
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26091258 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 26091357  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  26091358 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttccaagataatttagaaaaaacctta 26091444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 3170808 - 3170623
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3170808 ggtgacaactagagtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaactat 3170709  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3170708 cttgaccccaccaacaaattgttcatttttattggttggtgggtaaattacacaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 3170623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29478542 - 29478357
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29478542 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaactaatacacattagccatataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 29478443  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29478442 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 29478357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 47344838 - 47344653
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  47344838 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgaataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtggtatccatgaactat 47344739  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47344738 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 47344653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 31914379 - 31914196
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31914379 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagcc-cataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 31914281  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31914280 cttgaccccaccaacaaattgctcagtttcattggttggtgggtaaattatccacaattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacct 31914196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 45797661 - 45797477
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45797661 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtaggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactat 45797562  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  45797561 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctaaaaaaaacct 45797477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 181
Target Start/End: Original strand, 31972336 - 31972515
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31972336 ggtgacaattagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 31972435  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaa 181  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  31972436 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaa 31972515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 42765842 - 42766024
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42765842 ggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacattagcacatttttaagtggtat-catgaactat 42765940  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42765941 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 42766024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 43471695 - 43471878
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43471695 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataatcacatttttaagtggtatccatgaactat 43471794  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43471795 cttgaccacaccaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 43471878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 54608144 - 54607961
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  54608144 ggtgactactagggtatccatggaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatacatgaactat 54608045  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54608044 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacc 54607961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 55056259 - 55056442
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  55056259 ggtgacaacaagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagttgtatccatgaactat 55056358  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55056359 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 55056442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 146429 - 146611
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  146429 ggtgacaactagagtacgcatagaagaatggtgggtaatttaccacaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 146528  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  146529 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 146611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 41949566 - 41949381
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacata--agcacatttttaagtgatatccatgaact 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41949566 ggtgacaactagggtacctatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacatataagcacatttttaagtggtatccatgaact 41949467  T
Q  100 atcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41949466 atcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 41949381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 397582 - 397401
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  397582 tgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatct 397483  T
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  397482 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 397401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 22618514 - 22618693
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22618514 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacct-aaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 22618612  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22618613 cttgaccca-ccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 22618693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Original strand, 50457812 - 50457993
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50457812 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgtataatttacctcaaccaatacacattagcaacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 50457911  T
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50457912 tgatcccaccaacaaattgctcattttcattgattggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 50457993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 55776226 - 55776043
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55776226 ggtgacaactagggtacttatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 55776127  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  55776126 cttgaccc-accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctaaaaaaaacct 55776043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 55840404 - 55840221
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55840404 ggtgacaactagggtacttatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 55840305  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  55840304 cttgaccc-accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctaaaaaaaacct 55840221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 407934 - 407753
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  407934 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtggataatt-accccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtg-tatccatgaactat 407837  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  407836 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 407753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6285486 - 6285307
Alignment:
Q  5 gacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatctt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  6285486 gacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatttt 6285387  T
Q  105 gacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6285386 gaccccaccaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatatagaaaaaac 6285307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23609269 - 23609086
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23609269 ggtgacaaatagggtacccatggaagaatggtgagtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccgtgaactat 23609170  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23609169 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcgttgattggtgggtaaattacccactattcttcaaagataatctagaaaaaacc 23609086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27373257 - 27373075
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27373257 ggtgacaattagagtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 27373159  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27373158 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacc 27373075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 56022998 - 56023181
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  56022998 ggtgacaactagggtacccatgaaaaaatgatggataatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 56023097  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  56023098 cttgaccccactaacaaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 56023181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 50534809 - 50534632
Alignment:
Q  6 acaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 105  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50534809 acaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 50534710  T
Q  106 acccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  50534709 accccaccaataaattgctcatttttattgattggtgggtaagttacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaa 50534632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 2243640 - 2243457
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2243640 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttactccaactaatacacataagccacataaatacatttttaagtggtatccatgaactat 2243541  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2243540 cttgacccgaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 2243457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 29777257 - 29777440
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  29777257 ggtgacaattagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccgtaaactat 29777356  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29777357 ctcgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 29777440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 41560510 - 41560327
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41560510 ggtgacagctagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41560411  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41560410 cttgatcccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatttaaaaaaaacc 41560327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 49881059 - 49881247
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaattta----ccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaa 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  49881059 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccgcccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaa 49881158  T
Q  98 ctatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49881159 ctatcttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 49881247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 35446683 - 35446506
Alignment:
Q  6 acaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35446683 acaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccaaataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 35446584  T
Q  106 acccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35446583 accccatcaacaaattgctcattttcattggtcggt-ggtaaattacccaccattcttaaaaggtaatctagaaaaaac 35446506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 42222473 - 42222292
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  42222473 ggtgacaactagggtacccataaaagaatggtgtgtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcaatgaactat 42222374  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42222373 cttgaccccaccaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 42222292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 50234182 - 50233997
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  50234182 ggtgacaactagggtatccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccattaactat 50234083  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50234082 cttgatcccaccaacaaatttctcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 50233997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 54086590 - 54086407
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  54086590 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatgcacattagccacataagcacatttttaagcggtatccatgaactat 54086491  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54086490 cttgaccc-accaacaaattactcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaa-gtaatctagaaaaaacctt 54086407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 183
Target Start/End: Original strand, 53834055 - 53834235
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53834055 gtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttacttcaatcaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 53834154  T
Q  103 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  53834155 ttgaccgcaccaacaaattgctcattttcattgattgttgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaa 53834235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 3692210 - 3692393
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||    
T  3692210 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatcaataaactat 3692309  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||| | || ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3692310 cttaatcccaccaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattattcaaaggtaatctagaaaaaacc 3692393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 31070074 - 31070256
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31070074 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacatgagcacatttttaagtggtat-catgaactat 31070172  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31070173 cttgactccaccagcaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 31070256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 55520009 - 55519826
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55520009 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttaccacaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 55519910  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55519909 cttgatcccaccaaaaaattgctcattttcattagttggtggataaattatccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacc 55519826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 38591846 - 38591667
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    | || ||||||||||||||    
T  38591846 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatt----aatggtatccatgaactat 38591751  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38591750 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaatgtaatctagaaaaaacc 38591667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 47662102 - 47662288
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  47662102 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccattaactat 47662201  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
     ||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47662202 attgacaccactaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattattcaaaggtaatctagaaaaaacctta 47662288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 42033357 - 42033172
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42033357 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatctcaaccaatatacattagctacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 42033258  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42033257 cttgactccaccaacaaattgctcattttaattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctt 42033172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 54805613 - 54805810
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataag----cacatttttaagtgatatccatga 96  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| |||| ||||    
T  54805613 gggtgacatctagggtacccatggaacaatgatgagtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaataaacacatttttaagtggtatctatga 54805712  T
Q  97 actatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttagttttg 194  Q
    |||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54805713 actatcttaatcccaccaacaaattgttcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttggttttg 54805810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 48313737 - 48313556
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  48313737 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccctaaccaatatatattagctacataagcatatttt-aagtggtatccatgaactat 48313639  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48313638 cttgaccca-ccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 48313556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 14017376 - 14017558
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  14017376 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggcaggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacacactt--aagtggtatccatgaactat 14017473  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14017474 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcgttggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 14017558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 1932945 - 1932762
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1932945 ggtgataactagggtacccatgaaaaaatgatggataatttatcccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 1932846  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1932845 cttgaccccactaacaaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacctactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 1932762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 50536623 - 50536810
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||    
T  50536623 gggtaacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaactaatacacattagtcacataaacatatttttaagtggtatccattaacta 50536722  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50536723 tcttgaccccaccaacaaatttctcattttcatcggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctta 50536810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 39587796 - 39587962
Alignment:
Q  19 ccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaa 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39587796 ccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatatacattagttatataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa 39587895  T
Q  119 attgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39587896 attgctcatattcattggttggtaggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 39587962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 48658000 - 48657826
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48658000 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 48657901  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaa 182  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||      ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  48657900 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtggg------acccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaa 48657826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 54425163 - 54424980
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  54425163 ggtgacaactagtgtacc-atggaagaatcgtgggtaatttaccccaaccaatagacattagtcacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 54425065  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  54425064 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggtcggtgggtaaattacccaccattcttcatagggaatctagataaaacct 54424980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 51951861 - 51951676
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51951861 tgacaattagggtatccatggaagaatggtgggtaatttacac-aaccaatatacattagccacataagcacatttttaactgatatccatgaactatct 51951763  T
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttagt 190  Q
    |||| | |  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  51951762 tgactccattaacaaattgttcattttcattgattggtggataaattactcatcattcttcaaaagtaatctagaaaaaatcttagt 51951676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 183
Target Start/End: Original strand, 22468788 - 22468951
Alignment:
Q  20 catggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaa 119  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  22468788 catggaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtggtatctatgaactatcttgatcccaccaacaaa 22468887  T
Q  120 ttgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22468888 ttgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 22468951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 188
Target Start/End: Original strand, 33897504 - 33897680
Alignment:
Q  11 tagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgaccca 110  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  33897504 tagggtacctatagaagaatggtgggtaatttattccaattaatacacattagccatataatcatatttttaagtggtatccatgaactatcttgacccc 33897603  T
Q  111 accaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33897604 accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcta-aaaaaacctta 33897680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 36532830 - 36533003
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36532830 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttaccataaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 36532929  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| |||||||||||||||          ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36532930 cttgaccccaccaacaaattgctc----------attgtggtgtaaattacccatcattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 36533003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 45633779 - 45633953
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  45633779 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 45633867  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  45633868 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttaaaaaaaacctt 45633953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 15060289 - 15060461
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  15060289 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattggccacataagcacatatt-----------catgaactat 15060377  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15060378 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 15060461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 48259512 - 48259691
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  48259512 ggtgataagtagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacatattagccacataagcacatttt-aagtggtattcatgaactat 48259609  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  48259610 cttgactccaccaactaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaagggtaatctagaaaaaa 48259691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 48655002 - 48654815
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacat------tagccacataagcacatttttaagtgatatccatg 95  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||     
T  48655002 ggtgacaattagggtagccatggaagaatggtaggtaatttaccccaaccaatacacatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatctatc 48654903  T
Q  96 aactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  48654902 aactatcttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaa 48654815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 52728306 - 52728448
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  52728306 gggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacgcattagtcacataagcacatttttaagtggtattcatgaacta 52728404  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatggg 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  52728405 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggg 52728448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 9997931 - 9998103
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  9997931 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 9998019  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9998020 cttgatcccaccaataaattactcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 9998103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 37239090 - 37239265
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  37239090 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 37239178  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37239179 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 37239265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22620764 - 22620590
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  22620764 ggtggcaactaggctacccataaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 22620676  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22620675 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccatcattcttcaaagataatttagaaaaaacctt 22620590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 5117438 - 5117609
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  5117438 ggtgacaactagactatccattaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 5117526  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5117527 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 5117609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 47812077 - 47811906
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  47812077 ggtgacaattagggtatccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 47811989  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  47811988 cttgactcaatcaataaattgctcatattcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaac 47811906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 34552490 - 34552318
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||           |||| ||||||||||    
T  34552490 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagccgcataagcac-----------atattcatgaactat 34552402  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||| | |  || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34552401 cttgacaccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 34552318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 46708741 - 46708913
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  46708741 ggtgacaactaggctatcaatgaaagaatgatgggtgatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactat 46708829  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  46708830 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaataacc 46708913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 52688520 - 52688348
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||| ||||||||||    
T  52688520 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagca-----------tatattcatgaactat 52688432  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
     |||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  52688431 tttgatcccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttctaaggtaatttagaaaaaacc 52688348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 54715206 - 54715035
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  54715206 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaactaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 54715118  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
     ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  54715117 gttgaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaac 54715035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 20351842 - 20352012
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  20351842 ggtgacaactagactacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 20351930  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    ||||| || || || |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20351931 cttgatcccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 20352012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 43891099 - 43890929
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  43891099 ggtgacaactatggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 43891011  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
     ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  43891010 attgactccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaa 43890929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 27873550 - 27873720
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  27873550 ggtgacaactaggctacccaa--aagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 27873636  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27873637 cttaaccccacaaataaattactcattttcattgattggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 27873720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 54216482 - 54216309
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 103  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||           ||||||||||||    
T  54216482 tgacaactaggttacccatgaaagaatgatcgataatttaccccaaccaatacacattagcaacataagcacatatt-----------catgaactatct 54216394  T
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    ||| || || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54216393 tgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 54216309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 31881314 - 31881486
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  31881314 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgaataatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 31881402  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31881403 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcataggtaatttagaaaaaacc 31881486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 35595869 - 35595772
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaact 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35595869 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 35595772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 4486581 - 4486753
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||  || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||| |||    
T  4486581 ggtgacaactagactatctatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaattat 4486669  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||    
T  4486670 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccgttcttcaaagataatttagaaaaaacc 4486753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 49014269 - 49014094
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||           ||||||||||    
T  49014269 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttacctcaatcaatacacattagccacataagtacatatt-----------catgaactat 49014181  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||    
T  49014180 cttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtgatttaaaaaaaacctta 49014094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 34835348 - 34835174
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| ||||||  || ||| ||| ||||||    
T  34835348 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttagatggtattcataaactat 34835260  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34835259 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 34835174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 54216736 - 54216909
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  54216736 ggtgataactagggtatccatggaagaatggagggtaatttatcccaaccaatacacattaatcacataagcacatatt-----------catgaactat 54216824  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  54216825 cttgaccccaccaataaattgttcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 54216909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 33289873 - 33289702
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||| ||||||||||    
T  33289873 ggtgacaa-taggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------gtattcatgaactat 33289786  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||| || || || ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33289785 cttgatcctacaaataaattgctcattttcattagttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 33289702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 38547601 - 38547773
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  38547601 ggtgacaactagggtacccatagaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 38547689  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  38547690 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 38547773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 42509478 - 42509351
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42509478 ggtgataactagggtactcatggaagaatggtggataatttatcctaaccaatacacattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 42509379  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattt 129  Q
     ||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  42509378 tttgaccccaccaataaattggtcattt 42509351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 52461534 - 52461365
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  52461534 ggtggcaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 52461446  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||   |||||||||||| |||||||||||    
T  52461445 cttgaccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacacacca---ttcaaaggtaatttagaaaaaacc 52461365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 188
Target Start/End: Original strand, 3293097 - 3293198
Alignment:
Q  87 atatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3293097 atattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 3293196  T
Q  187 ta 188  Q
    ||    
T  3293197 ta 3293198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Original strand, 27398607 - 27398775
Alignment:
Q  6 acaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 105  Q
    |||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||            ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27398607 acaactagggtaccaatgaaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacattt-----------acatttttaagtggtatccataaactatcttg 27398695  T
Q  106 acccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27398696 accccaccaataaattgcgcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaagtaatctagaaaaaacc 27398775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 46720195 - 46720024
Alignment:
Q  6 acaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||       |||  ||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  46720195 acaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaataaacat-------atat-cacctttttaggtggtatccataaactatcttg 46720104  T
Q  106 acccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||| | ||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  46720103 accccatcaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaagttaatctagaaaaaacc 46720024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 33049062 - 33048990
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33049062 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac 33048990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 1662261 - 1662431
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||             |  |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  1662261 ggtgacaactagggtacctatggaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatgaacat-------------atctttttaggtggtatccataaactat 1662347  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1662348 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtaggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 1662431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 14335101 - 14335271
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||   ||||           ||| |||||| ||| |||| |||||||||    
T  14335101 ggtgacaactagagtacccatgaaagaatggtgggtaatttacctcaaacaatgagcatt-----------cacctttttaggtggtatctatgaactat 14335189  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14335190 cttgaccctaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacctaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 14335271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 27580290 - 27580120
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| || | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||           ||  |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  27580290 ggtgacaaataagatacccatggaaaaatgatggataatttaccccaaccaataaacatt-----------catctttttaggtggtatccataaactat 27580202  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27580201 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 27580120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 52396865 - 52396775
Alignment:
Q  46 ccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc-ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattg 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52396865 ccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactatctttaaccccaccaacaaattgctcattttcattg 52396775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 35344968 - 35344868
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 102  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  35344968 gtgacaactaggatacctatggaagaatggtggataatttacca-aaccaatacacattagccacataagcacattttcaagtggtatccatgaactatc 35344870  T
Q  103 tt 104  Q
    ||    
T  35344869 tt 35344868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 188
Target Start/End: Original strand, 11972203 - 11972304
Alignment:
Q  87 atatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||| |||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11972203 atattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 11972302  T
Q  187 ta 188  Q
    ||    
T  11972303 ta 11972304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 183
Target Start/End: Original strand, 33557960 - 33558112
Alignment:
Q  20 catggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaa 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||           |||||||||||||||||| || || |||    
T  33557960 catgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataaatacatatt-----------catgaactatcttgaccctacaaataaa 33558048  T
Q  120 ttgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    || ||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  33558049 ttcctcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaagataatttagaaaaaa 33558112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 88 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 43231598 - 43231502
Alignment:
Q  88 tatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43231598 tatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcatttttattggttgatggataaattacccaccattcttcaaa-gtaatctagaaaaaacc 43231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 6371249 - 6371420
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| || || | || |||    
T  6371249 ggtgacaactagggtacctatgaaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtaaccctaaattat 6371337  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  6371338 cttgaccccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattacccactatttttcaaaggtaatctagaaaaaac 6371420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 42557666 - 42557583
Alignment:
Q  100 atcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42557666 atcttgaccccaccaacaaattactcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 42557583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 573974 - 573802
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  573974 ggtgacaactagtgtactcatggaaaaatagtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacttttttaggtggtatccataaactat 573886  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| | |||| ||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||    
T  573885 cttgaccccaccaataaattgttcattatgattggttggtaggtaaattacccaccattttttaaaggtaatctagaaacaacc 573802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Original strand, 48259704 - 48259780
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacattt 79  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48259704 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacatattagccacataagcacattt 48259780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 77
Target Start/End: Original strand, 51981479 - 51981554
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat 77  Q
    ||||| ||||||  |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51981479 ggtgataactagtctaccaatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat 51981554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 70
Target Start/End: Original strand, 3291805 - 3291873
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacata 70  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3291805 ggtgacaattaggctatccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacata 3291873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 27872750 - 27872612
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  27872750 ggtgacaactacggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 27872662  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaatta 151  Q
    ||||| || || || |||||||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  27872661 cttgatcccactaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaatta 27872612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Original strand, 18206512 - 18206682
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  |||||   |||||    |   ||||| ||| ||||||||||||||    
T  18206512 ggtgacaactaaggtacccatggaaaaatgatgggtaatttatttcaaccaatgaacatt---cacatttttaa--ttttaggtggtatccatgaactat 18206606  T
Q  102 ----cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaat 173  Q
        |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  18206607 atatcttgaccccaccaataaattgttcattttcattgattgagaggtaaattacccaccgttcttcaaaagtaat 18206682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 42558367 - 42558270
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||        ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  42558367 ggtgacaactaagatacccatggaagaatggtggataatttaccctaatcaatacacattagcc--------acatttttaagtggtatctatgaactat 42558276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 186
Target Start/End: Original strand, 17555625 - 17555670
Alignment:
Q  141 tgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17555625 tgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 17555670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 183
Target Start/End: Original strand, 49057933 - 49058038
Alignment:
Q  78 ttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctag 177  Q
    |||||| || |||| ||||||||| || |||  | ||| |||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  49057933 ttttaaatggtatctatgaactattttaacctcatcaataaattattcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattctttaaaggtaatctag 49058032  T
Q  178 aaaaaa 183  Q
    ||||||    
T  49058033 aaaaaa 49058038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 43478147 - 43478059
Alignment:
Q  96 aactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||||||||  || || ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||  |||||  || |||||||||||||||||    
T  43478147 aactatcttgaccacactaataaattgctcattt-cattggttgatcgataaattacccatggttctttgaaagtaatctagaaaaaacc 43478059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 32984077 - 32984262
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32984077 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 32984176  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32984177 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 32984262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 41862403 - 41862218
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41862403 gggtgacaattaggatacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 41862304  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41862303 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 41862218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 24079901 - 24080084
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24079901 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 24080000  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24080001 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctacaaaaaacc 24080084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 37956603 - 37956420
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37956603 ggtgacaactagggtatccatgaaataatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 37956504  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37956503 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 37956420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 9303574 - 9303756
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9303574 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccgaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 9303673  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  9303674 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaac 9303756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 43328889 - 43328706
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43328889 ggtgacaattagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 43328790  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43328789 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 43328706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5946229 - 5946043
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5946229 ggtgacaactagggtacctatgaaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 5946130  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5946129 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 5946043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 40435153 - 40435335
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40435153 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 40435252  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40435253 cttgacctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaagttacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 40435335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 10646305 - 10646124
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10646305 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagaacatttttaagtggtatccatgaactat 10646206  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10646205 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccactatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 10646124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 33730641 - 33730824
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33730641 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 33730740  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33730741 cttgaccccaccaacaaattgctcatattaattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 33730824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 9734435 - 9734255
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9734435 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatt-accccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtg-tatccatgaactat 9734338  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9734337 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 9734255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 13356120 - 13356306
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13356120 ggtgacaactagagtacccatggaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 13356219  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13356220 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacctttcttcaaatgtaatctaaaaaaaacctta 13356306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 183
Target Start/End: Original strand, 31830959 - 31831136
Alignment:
Q  6 acaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31830959 acaactagggtacccatggaagaatggtaggtaatttacccaaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 31831058  T
Q  106 acccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31831059 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 31831136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41654077 - 41653892
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  41654077 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 41653978  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
     ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41653977 tttgaccccatcaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 41653892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 6366168 - 6365985
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6366168 ggtgacaactagggtatccatgaaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 6366069  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
     ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6366068 attgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 6365985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 33981663 - 33981846
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33981663 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccgcataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 33981762  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33981763 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaagataatctaaaaaaaacc 33981846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 17718722 - 17718908
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17718722 ggtgacagctagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 17718821  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| | ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17718822 cttgaccccatcaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaatctta 17718908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 185
Target Start/End: Original strand, 37301326 - 37301508
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  37301326 gtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatt 37301425  T
Q  103 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37301426 ttggccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 37301508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37420122 - 37419936
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  37420122 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccttaatcaatacacattagtcacataagcacatttttaagtagtatccatgaactat 37420023  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37420022 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 37419936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 2714730 - 2714550
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2714730 ggtgacaactaaagtacc-atggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 2714632  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2714631 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 2714550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 45236565 - 45236749
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45236565 ggtgacaactaggatacccataaaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45236664  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45236665 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 45236749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 32114429 - 32114254
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  32114429 tgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactattt 32114330  T
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaa 179  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32114329 tgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaa 32114254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2276094 - 2275913
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2276094 ggtgacaactagtctacccatggaagaatgatgggtaatttaccctaatcaatacacattagccacataagcatatttt-aagtggtatccatgaactat 2275996  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2275995 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 2275913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 25186081 - 25185897
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  25186081 ggtgacgattagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 25185982  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25185981 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaatacct 25185897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 41232128 - 41231945
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41232128 ggtgacaactagggtatccatggaggaatagtgggtaatttaccccaaccaatacacattggtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41232029  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41232028 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 41231945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 9013865 - 9013684
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9013865 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacct-aaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactat 9013767  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9013766 cttgactccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacctaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 9013684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 35628960 - 35628776
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  35628960 gggtgacaactagggtactcatagaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtattcttgaacta 35628861  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35628860 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagttaatctaaaaaaaacc 35628776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 13760646 - 13760831
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtac--ccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaact 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13760646 ggtgacaactagggtacacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacagaagcacatttttaaatggtatccatgaact 13760745  T
Q  100 atcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13760746 atcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtaggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcttgaaaaaacc 13760831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 45066592 - 45066774
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45066592 ggtgagaattagggtacccatggaagaatgatgggtaatttattataatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45066691  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  45066692 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccattattcttcaaaggtaatctataaaaaac 45066774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22878572 - 22878389
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22878572 gtgacaactagggtacccatagaagaattgtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 22878473  T
Q  103 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||   | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22878472 ttgaccccaacaaaaaattgatcattttcattggaaggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 22878389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25248216 - 25248036
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25248216 gggtgacaattagggtatccatggaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagcaacataagcacattttaaagtggtatccatgaacta 25248117  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||      ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248116 tcttgaccccaccaacaaattgctcatttt------ttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 25248036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 183
Target Start/End: Original strand, 44088446 - 44088624
Alignment:
Q  5 gacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatctt 104  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44088446 gacaattagagtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatctt 44088545  T
Q  105 gacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44088546 gatcccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgagtaaattattcatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 44088624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Original strand, 29048426 - 29048587
Alignment:
Q  25 aagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgct 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29048426 aagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgct 29048525  T
Q  125 cattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29048526 cattttcattggttagtgggtaaattatccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacct 29048587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41640095 - 41639911
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 102  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| ||||||||||    
T  41640095 gtgacaactagggtatctatggaagaatggtgggtaatttatcccaactaatacacattagccacataaacatatttttaagcggtatctatgaactatc 41639996  T
Q  103 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41639995 ttgaccccaccaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattactcatcattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctt 41639911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12033112 - 12032986
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12033112 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 12033013  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcatt 128  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||    
T  12033012 cttgaccgcaccaacaaattgctcatt 12032986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 45258691 - 45258510
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  45258691 ggtgataactagagtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagttacataaacacatttttaaatggtatccatgaactat 45258593  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  45258592 cttgacccctccaacaaattgctcatttacattggttggtgggtaaattaccgaccattcttcaaaagtaatctaaaaaaaac 45258510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 3904258 - 3904126
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3904258 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacaatagccacataagcacatttttaagtggtat-catgaactat 3904160  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattg 135  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3904159 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattg 3904126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 41981650 - 41981534
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41981650 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41981551  T
Q  102 cttgacccaaccaacaa 118  Q
    |||||||| ||||||||    
T  41981550 cttgaccccaccaacaa 41981534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 4447295 - 4447467
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  4447295 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 4447383  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4447384 cttgaccccacctataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 4447467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 183
Target Start/End: Original strand, 42701301 - 42701471
Alignment:
Q  14 ggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacattttt---aagtgatatccatgaactatcttgaccca 110  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  42701301 ggtacccatggaaggatggtggataatttaccccaaccaatacacattagtcaca--agcacattttttttaagtggtattcatgaactatcttgacccc 42701398  T
Q  111 accaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    || ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  42701399 actaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattattcaaaggtaatctagaaaaaa 42701471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10378481 - 10378304
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||           |||||||||    
T  10378481 gggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacatattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 10378393  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttag 189  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10378392 tcttgaccccacctataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaaccttag 10378304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 31940485 - 31940314
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  31940485 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccc-aaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 31940398  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31940397 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 31940314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 117329 - 117504
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  117329 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgaataatttacccgaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 117417  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  117418 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaatctta 117504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 41843424 - 41843252
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  41843424 ggtgataactaagctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 41843336  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    || ||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  41843335 ctggaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 41843252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9713857 - 9713688
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  9713857 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 9713769  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||| || || || |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9713768 cttgatcccacaaataaattgctcattttcattg---gttgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 9713688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 31336276 - 31336163
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31336276 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttgccccaaccaatacacattagccatataaacatatttttaagtggtatccatgaactat 31336177  T
Q  102 cttgacccaaccaa 115  Q
    |||||||| |||||    
T  31336176 cttgaccccaccaa 31336163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3211376 - 3211207
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  3211376 ggtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaacgaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 3211288  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  3211287 cttaaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatt-ttcaaaggtaatttagaaaaaa 3211207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 2379311 - 2379138
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||           |||| ||||||||||    
T  2379311 ggtgacaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcac-----------atattcatgaactat 2379223  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
     |||| || || || |||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2379222 tttgatcccacaaataaattgttcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 2379138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 40458772 - 40458943
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||           ||||||||||    
T  40458772 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacatattagccacaaaaacacatatt-----------catgaactat 40458860  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  40458861 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaattgagaaaaaac 40458943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Original strand, 40649837 - 40649990
Alignment:
Q  8 aactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgac 107  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||| ||| ||||     
T  40649837 aactaggctacccatgaaagaatgatgggtagtttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaattattttgat 40649925  T
Q  108 ccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaa 172  Q
    || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40649926 cccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccatcattctttaaaggtaa 40649990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 182
Target Start/End: Original strand, 4975412 - 4975576
Alignment:
Q  7 caactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttga 106  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||           |||||||||||||||    
T  4975412 caactaggctacccatgaaagaatgatggataatttacccaaaccaatacacattagccatataagcacatatt-----------catgaactatcttga 4975500  T
Q  107 cccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaa 182  Q
    ||| || || |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  4975501 ccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttaaaaaaa 4975576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 184
Target Start/End: Original strand, 39915887 - 39915994
Alignment:
Q  77 tttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatcta 176  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  39915887 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataattta 39915986  T
Q  177 gaaaaaac 184  Q
    ||||||||    
T  39915987 gaaaaaac 39915994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 9509400 - 9509572
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  9509400 ggtgaaaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaataaaaatttgccacataaacacatatt-----------catgaactat 9509488  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||| |||| || || |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9509489 cttaaccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacacaccattctttaaaggtaatttagaaaaaacc 9509572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 33896843 - 33897017
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| |||||           ||  |||||| ||| |||| || ||||||    
T  33896843 ggtgacaactagggtacccatgaaaaaatggtgggtaatttactccaaccaataaacatt-----------catctttttaggtggtatctataaactat 33896931  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33896932 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatt-ttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 33897017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 188
Target Start/End: Original strand, 27243213 - 27243314
Alignment:
Q  87 atatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27243213 atattcatgaactatcttggccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 27243312  T
Q  187 ta 188  Q
    ||    
T  27243313 ta 27243314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 188
Target Start/End: Original strand, 27254788 - 27254889
Alignment:
Q  87 atatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27254788 atattcatgaactatcttggccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 27254887  T
Q  187 ta 188  Q
    ||    
T  27254888 ta 27254889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Original strand, 32373733 - 32373892
Alignment:
Q  8 aactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgac 107  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||           ||||||||||||||||    
T  32373733 aactaggttatccatggaagaatggtgg-taatttaccccaaccaatacacattaatcacataagcacatatt-----------catgaactatcttgac 32373820  T
Q  108 ccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaa 179  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||    
T  32373821 cccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccattttttaaaggtaatttagaa 32373892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 3490399 - 3490572
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| || |||| || |||    
T  3490399 ggtgacaactagggtacctatgaaaaaatggtgggtagtttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtaaccataaattat 3490487  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3490488 cttgaccccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 3490572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 33622467 - 33622640
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  33622467 ggtgacaactaggctacc-atgaaaaaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagtcacataaccacatatt-----------catgaactat 33622554  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
     ||||||||   || | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  33622555 tttgacccata-aatatattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttaaaaaaaagctta 33622640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 38631806 - 38631652
Alignment:
Q  19 ccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaa 118  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||           |||||||||||||||||  ||||| ||    
T  38631806 ccattgaagaatggtggataatttatcccaaccaatacatattaaccacataagcatatatt-----------catgaactatcttgaccacaccaataa 38631718  T
Q  119 attgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38631717 attgctcatattcattggttgatgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaac 38631652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 41981535 - 41981454
Alignment:
Q  82 aagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattctt 163  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  41981535 aagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacctaccattctt 41981454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 26196317 - 26196491
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  26196317 ggtgacaactaggatattcatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 26196405  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
     ||||||| ||||| |||||| | ||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  26196406 tttgaccccaccaataaattgtt-attatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaacctta 26196491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 186
Target Start/End: Original strand, 31148953 - 31149063
Alignment:
Q  75 catttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatc 174  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| |||| | ||| |||| |||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31148953 catttttaagtggtatc-atgaactatcttaaccccatcaataaatagctcattttcattggttagtgaataaattacccaccatttttcaaaggtaatc 31149051  T
Q  175 tagaaaaaacct 186  Q
    ||||||||||||    
T  31149052 tagaaaaaacct 31149063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 77
Target Start/End: Original strand, 41425429 - 41425503
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat 77  Q
    |||| |||||||| |||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41425429 ggtggcaactaggctacccataaaagaattatggataatttaccc-aaccaatacacattagccacataagcacat 41425503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 164791 - 164728
Alignment:
Q  115 acaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctaga 178  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  164791 acaaattgctcatttttattggttggtggataaattacccatcattccttaaaggtaatctaga 164728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 39901739 - 39901674
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccac 67  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  39901739 ggtgacaactaaggtatccattgaagaatggtggataatttacctcaaccaataaacattagccac 39901674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12032988 - 12032951
Alignment:
Q  148 attacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12032988 attacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 12032951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 39901616 - 39901574
Alignment:
Q  141 tgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  39901616 tgggtaagttacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaa 39901574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 83)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17601017 - 17600832
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17601017 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 17600918  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17600917 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 17600832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 746647 - 746464
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  746647 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 746548  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  746547 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 746464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 6594458 - 6594643
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6594458 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 6594557  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594558 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 6594643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23901960 - 23901775
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23901960 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 23901861  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23901860 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaccctt 23901775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4034773 - 4034590
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4034773 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 4034674  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4034673 cttaaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 4034590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 38997283 - 38997100
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38997283 gggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatagacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 38997184  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38997183 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 38997100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 45371171 - 45370988
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45371171 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45371072  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45371071 cttgaccccgccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 45370988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26710526 - 26710340
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26710526 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacatcagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 26710427  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26710426 cttgaccccaccaacaaaatgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 26710340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11185154 - 11184970
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11185154 gggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcatataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 11185055  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185054 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacctaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 11184970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 13815218 - 13815402
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13815218 ggtgacaactagggtacccatgaaagaaaggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 13815317  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13815318 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 13815402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 2324889 - 2325072
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2324889 ggtgacaactagggtattcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 2324988  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2324989 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 2325072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 27651034 - 27651217
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27651034 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 27651133  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27651134 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgggcggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 27651217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40635399 - 40635216
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40635399 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 40635300  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40635299 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 40635216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14660627 - 14660445
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14660627 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacaccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 14660528  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14660527 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggcaatctagaaaaaac 14660445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 34518548 - 34518366
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34518548 ggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 34518449  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  34518448 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaac 34518366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 6430648 - 6430471
Alignment:
Q  8 aactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgac 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6430648 aactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgac 6430549  T
Q  108 ccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6430548 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcgaaggtaatctagaaaaaacc 6430471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10424773 - 10424592
Alignment:
Q  5 gacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatctt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10424773 gacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatctt 10424674  T
Q  105 gacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10424673 gaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 10424592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27400584 - 27400399
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27400584 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagtacatttttaagtggtatccatgaactat 27400485  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27400484 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 27400399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 10244582 - 10244765
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10244582 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 10244681  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10244682 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 10244765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 40735645 - 40735459
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40735645 ggtgacaattagggtactcatggaagaatgatgggtaatttacctcaatcaatacacattagccgcataagtacatttttaagtggtatccataaactat 40735546  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40735545 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 40735459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 32327542 - 32327361
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  32327542 ggtgacaactagggtacctatggaagaatgatggataatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 32327443  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32327442 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggctggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 32327361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27024596 - 27024413
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27024596 ggtgacaactagggtacccatggaagaataatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataatcatatttttaagtggtatccatgaactat 27024497  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27024496 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggtttgtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 27024413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 33427647 - 33427828
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  33427647 ggtgataactagggtacccatgaaagaatggtgtgtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 33427746  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  33427747 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatggataaattacccaccattattcaaaggtaatctagaaaaaa 33427828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 1091951 - 1092134
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1091951 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 1092050  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1092051 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 1092134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 5726310 - 5726128
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  5726310 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccatataaacacatttttaagtggtaaccatgaactat 5726211  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5726210 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 5726128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 32948626 - 32948445
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  32948626 ggtgacaactagagtacccatagaagaatgatgggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaact-t 32948528  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32948527 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaac 32948445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4609807 - 4609626
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4609807 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgttggataatttaccccaaccaatacacattaggcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 4609708  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4609707 cttgaccccaccaacaaattacttattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaa 4609626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40037323 - 40037141
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40037323 ggtgacaactagggtacccatgaaa-aatgatgggtaatttacctcaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 40037225  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40037224 cttgaccccaccaacaaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 40037141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 7892688 - 7892870
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7892688 ggtgacaactagggtatctatggaagaatggtgggtaatttacccaaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 7892787  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7892788 attgaccccgccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 7892870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 14697537 - 14697721
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14697537 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccgaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 14697636  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14697637 cttgatcacaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctaaaaaaaacct 14697721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 37255337 - 37255516
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37255337 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 37255436  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37255437 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaatt-----ccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 37255516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 2914138 - 2914319
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2914138 ggtgacaactaggatatccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccgatacacatcagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 2914237  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  2914238 cttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaa 2914319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 37620867 - 37621054
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37620867 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttatccaaaccaatacacataagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 37620966  T
Q  102 cttg---acccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37620967 cttgagtaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacct 37621054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15925255 - 15925075
Alignment:
Q  8 aactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgac 107  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15925255 aactagggtatctatgaaagaatgatggataatttacctcaaccaatacacattagctacataagcatatttttaagtggtatccatgaactatcttgac 15925156  T
Q  108 ccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15925155 cccaccaataaattactcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttgaaaggtaatctagaaaaaacctta 15925075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 32608527 - 32608376
Alignment:
Q  36 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattg 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  32608527 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaactatcttgacaccaccaacaaattgctcattttcattg 32608428  T
Q  136 attgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
     ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32608427 gttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 32608376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 9444874 - 9444683
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgg---gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaac 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9444874 ggtgacaactagggtatccatggaagaataatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 9444775  T
Q  99 tatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattg-------atgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||       || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9444774 tatcttgaccccaccagcaaattgctcattttcattggttggtgggtaattggtaaattacccaccattcttcaaatgtaatctagaaaaaa 9444683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 11159803 - 11159625
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11159803 gggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccatccaatacacaatagccacataaacacatttttaagtggcatccatgaacta 11159704  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaa 180  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  11159703 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaatta-ccaccatttttcaaaggtaatcaagaaa 11159625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 169
Target Start/End: Original strand, 32856436 - 32856603
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  32856436 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatatacattagccacataagcacatttgtaagtggtatccatgaactat 32856535  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaagg 169  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  32856536 cttgatcccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaagg 32856603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25295013 - 25294886
Alignment:
Q  5 gacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatctt 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25295013 gacaactagggtactcatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatctt 25294914  T
Q  105 gacccaaccaacaaattgctcattttca 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25294913 gaccccaccaacaaattgctcattttca 25294886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Original strand, 8432942 - 8433101
Alignment:
Q  28 aatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcat 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8432942 aatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtatattttaaagtggtatccatgaactatcttgaccacaccaacaaattgctcat 8433041  T
Q  128 tttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| |||   ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8433042 tttcattggttggcaggtaaattatccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacctt 8433101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 12842250 - 12842103
Alignment:
Q  36 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattg 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  12842250 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaattggtatccaagaactatcttgactccaccaacaaattactcattttcattg 12842151  T
Q  136 attgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
     ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12842150 gttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatcaagaaaaaa 12842103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 35158050 - 35158220
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  35158050 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactat 35158138  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35158139 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 35158220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 39103216 - 39103042
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||     
T  39103216 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactatt 39103128  T
Q  103 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  39103127 ttgaccccatcaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 39103042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 41172605 - 41172449
Alignment:
Q  36 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattg 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||    
T  41172605 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtacctttgaactatcttgacctcaccaataaattactcattttcattg 41172506  T
Q  136 attgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttagtttt 193  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  41172505 gttggtgggtaaattacccatcattcttcaaatgtaattta-aaaaaaccttaatttt 41172449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 28641292 - 28641464
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||         |||| ||||||||||    
T  28641292 ggtgacaactaggctacccatgaaagaataatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataa--acat---------atattcatgaactat 28641380  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28641381 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 28641464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1229809 - 1229630
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggta-cccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1229809 ggtgacaacttgggtaacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatatatattagccagataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 1229710  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||         |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1229709 tcttgaccccatcaacaaattgttcattttcattga--------caaattacctaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacctta 1229630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 42900039 - 42899913
Alignment:
Q  59 attagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatca 158  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||    
T  42900039 attagccacataagcgcatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattaccaacca 42899940  T
Q  159 ttcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  42899939 ttcttcgaaggtaatctagaaaaaacc 42899913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12730231 - 12730059
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||           ||||||||    
T  12730231 ggtggcaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccataaccaatacacattagtcacataagcacatattta-----------tgaactat 12730143  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12730142 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 12730059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 29687211 - 29687039
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  29687211 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccataaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 29687123  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  29687122 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacc 29687039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 27331472 - 27331298
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |       |||| ||||||||||    
T  27331472 ggtgacaattaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaactaatacatattagccacataagcacatat-------atattcatgaactat 27331380  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27331379 cttgaccctacaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 27331298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 145450 - 145281
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 103  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||           ||||||||||||    
T  145450 tgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacgtatt-----------catgaactatct 145362  T
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  145361 tgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 145281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 21734900 - 21735073
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  21734900 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatatacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 21734988  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21734989 cttgacccccccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 21735073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4258659 - 4258488
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  4258659 ggtgacaactaggctacccatgaacgaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 4258571  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  4258570 cttgaccc-acaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacc 4258488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 109
Target Start/End: Original strand, 447633 - 447740
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  447633 ggtgacaactagggtacccatggatgaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaactat 447732  T
Q  102 cttgaccc 109  Q
    ||||||||    
T  447733 cttgaccc 447740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 2688729 - 2688903
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  2688729 ggtgacaactaggctatccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 2688817  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2688818 cttgaccctacaaataaattgctaattttcattaatcggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 2688903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 12333497 - 12333669
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||           || ||||||||||    
T  12333497 ggtgacaactaggctacc-atgaaagaatgatgggtaatttaccc-aaccaatacacattagccacataagcacat-----------atacatgaactat 12333583  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| || || |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12333584 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 12333669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 19428426 - 19428598
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  19428426 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 19428514  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaa-ggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| || |  ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19428515 cttgaccccacaagtaaattgctcattttcattggtcggtgggtaaattacccaccattcttcaaagggtaatttagaaaaaac 19428598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 39301196 - 39301367
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||           |||||||||    
T  39301196 gggtgacaactaggctatccatgaaagaatgatggataatttaccctaaccaatacacattagtcatataagcacatatt-----------catgaacta 39301284  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  39301285 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 39301367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 13543624 - 13543798
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  13543624 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 13543712  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| || || |||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||    
T  13543713 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtaggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatttaaaaagaacctt 13543798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 27764862 - 27765035
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||||||    
T  27764862 gggtggcaactaggctacccatgaaaga-tgatggttaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaacta 27764949  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    | ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27764950 ttttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaatttagaaaaaacct 27765035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 43898971 - 43899142
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  43898971 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaattta-cccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 43899058  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  43899059 cttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 43899142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 44481998 - 44481826
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  44481998 ggtgacaaccagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacttt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 44481910  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44481909 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 44481826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 28566703 - 28566872
Alignment:
Q  7 caactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttga 106  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||           |||||||||||||||    
T  28566703 caactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcacatatt-----------catgaactatcttga 28566791  T
Q  107 cccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    ||| |  || ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28566792 ccccagaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaagtaatttagaaaaaacctt 28566872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 3711803 - 3711664
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||           |||| ||||||||||    
T  3711803 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccgcataagcac-----------atattcatgaactat 3711715  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattac 152  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3711714 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtaggtaaattac 3711664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 34249435 - 34249265
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||           |||| ||| ||||||    
T  34249435 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaatcaatacacattagtcacataagcac-----------atattcataaactat 34249347  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| || |||||||||||| |||| || ||||||    
T  34249346 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtaggtaaattactcaccattcttcaaagataatttaaaaaaaa 34249265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 43356266 - 43356097
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  43356266 ggtgacaactaggctaaccatgaaagaatcatgggtaatttactcaaaccaatacaaattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 43356178  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| |||||   ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43356177 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggt---ttacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 43356097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 12827244 - 12827136
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    ||||||||||||| | |||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12827244 gggtgacaactagagcacctgtggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtat-catgaacta 12827146  T
Q  101 tcttgaccca 110  Q
    |||| |||||    
T  12827145 tcttaaccca 12827136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 12814693 - 12814609
Alignment:
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12814693 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 12814609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 2000338 - 2000512
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||| ||||           |||||||    
T  2000338 gggtgacaactaggctacc-atgaaagaatgatgagtaatttaccccaac-aatacatatgagccacgtaagcacatattta-----------tgaacta 2000424  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    | |||| || || || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2000425 ttttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 2000512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 109
Target Start/End: Original strand, 28014856 - 28014925
Alignment:
Q  40 tttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgaccc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28014856 tttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccc 28014925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 35126945 - 35126778
Alignment:
Q  7 caactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttga 106  Q
    ||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  35126945 caactagggtatctatggaaaaatggtgggtaatttatcccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactatcttga 35126857  T
Q  107 cccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  35126856 ccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccgtttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 35126778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 87 - 187
Target Start/End: Original strand, 40544150 - 40544250
Alignment:
Q  87 atatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40544150 atattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaactatccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 40544249  T
Q  187 t 187  Q
    |    
T  40544250 t 40544250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3266455 - 3266296
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 103  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||         |||||||| ||           ||||||||||||    
T  3266455 tgacaactaggttacccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaaccaatacacat---------aagcacatatt-----------catgaactatct 3266376  T
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||| |  || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3266375 tgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaatttagaaaaaa 3266296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8056779 - 8056625
Alignment:
Q  19 ccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaa 118  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||           ||||||||||||| || | || || ||    
T  8056779 ccatgaaagaatgatgagtaatttactccaaccaatacacattagctacataagcgcatatt-----------catgaactatcttcactccacaaataa 8056691  T
Q  119 attgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    || | |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8056690 atagttcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 8056625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30545991 - 30545817
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||  |||||||  |||||           || |||||||  |  |||||| |||||||    
T  30545991 ggtgacaactagggtatctatggaggaatgatgggtaatttacctgaaccaatgaacatt-----------catatttttagattgtatccacgaactat 30545903  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||| | ||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  30545902 cttgaccccaccaataagttgctcatttttattgtttggtaggtaaattatccaccattcttcaaaaataatctaaaaaaaacctt 30545817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 186
Target Start/End: Original strand, 28019960 - 28020005
Alignment:
Q  141 tgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28019960 tgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 28020005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 10176625 - 10176558
Alignment:
Q  117 aaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10176625 aaattgctcattttcattaattggtgaataagttacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaac 10176558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 40544085 - 40544143
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacat 60  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  40544085 ggtgacaactagactacccatgaaagaatgatgtgtaatttacctcaaccaatacacat 40544143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 10176714 - 10176637
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacattt 79  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||||  |||||| |||||||    
T  10176714 ggtgataactagggtgtccatggaagaataatggttaatttacttcaaccaataaacattagttacataaacacattt 10176637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 152
Target Start/End: Original strand, 38985342 - 38985416
Alignment:
Q  77 tttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattac 152  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||  | | || ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  38985342 tttttaggtggtatccatgaactatcttgacatatc-aataaattgctcattttcattggttggtgagtaaattac 38985416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 42900835 - 42900781
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaataca 57  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  42900835 ggtgacaactagg-tacacatggaagaatggtgggtaatttatctcaaccaataca 42900781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 187
Target Start/End: Original strand, 36216305 - 36216351
Alignment:
Q  141 tgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  36216305 tgggtaaattacccatgagttttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 36216351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8264576 - 8264532
Alignment:
Q  141 tgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||    
T  8264576 tgggtaaattacccatgaattttcaaaggtaatttagaaaaaacc 8264532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 108)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 31308183 - 31307999
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31308183 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 31308084  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31308083 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 31307999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 45538335 - 45538151
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45538335 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45538236  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45538235 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 45538151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 3611318 - 3611132
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3611318 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 3611219  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3611218 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 3611132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44662152 - 44661967
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  44662152 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 44662053  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44662052 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 44661967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23984937 - 23984752
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23984937 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 23984838  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23984837 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 23984752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 17994951 - 17995134
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  17994951 ggtgccaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 17995050  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17995051 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 17995134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 21139412 - 21139594
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21139412 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 21139511  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21139512 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatacttcaaaggtaatctagaaaaaac 21139594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 47671768 - 47671582
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47671768 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 47671669  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47671668 cttgacccctccaacaaatagctcattttcattggttggtcggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 47671582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25058870 - 25058685
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25058870 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 25058771  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
     |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058770 tttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 25058685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Original strand, 4068689 - 4068869
Alignment:
Q  8 aactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgac 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4068689 aactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgac 4068788  T
Q  108 ccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4068789 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaagcctta 4068869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 5981352 - 5981169
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5981352 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 5981253  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5981252 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 5981169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 25678259 - 25678442
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25678259 ggtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 25678358  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25678359 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 25678442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 46967041 - 46967224
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46967041 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatgatgggtaatttatcctaacaaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 46967140  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46967141 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 46967224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 6327548 - 6327733
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6327548 ggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtca-ataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 6327646  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6327647 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 6327733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 24245025 - 24245211
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24245025 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaactaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 24245124  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24245125 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 24245211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26277359 - 26277173
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26277359 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacaaatttttaagtggtatccatgaactat 26277260  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26277259 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 26277173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 43251891 - 43251713
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43251891 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 43251792  T
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaa 182  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  43251791 tgacctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 43251713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 46616731 - 46616546
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46616731 ggtgacacctagagtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtgatattcatgaactat 46616632  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46616631 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 46616546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 41999997 - 41999813
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  41999997 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacaat 41999898  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41999897 cttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacct 41999813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 31040891 - 31040708
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31040891 ggtgacaactagggtacccatggaataatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 31040792  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31040791 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 31040708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 35273778 - 35273595
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35273778 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgtgtaatttacctcaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 35273679  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  35273678 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattatccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacc 35273595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 36566512 - 36566329
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36566512 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccgaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 36566413  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36566412 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgaatatattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 36566329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 26085398 - 26085583
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26085398 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 26085497  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26085498 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttc-aaggtaatctagtaaaaacctta 26085583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 38331859 - 38332045
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  38331859 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatattcatgaactat 38331958  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38331959 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 38332045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 33112817 - 33113001
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  33112817 gggtgacaactagggtacc-atgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 33112915  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33112916 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 33113001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 38790197 - 38790378
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  38790197 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccataaactat 38790296  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  38790297 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattaccaaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 38790378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 37620191 - 37620375
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  37620191 gggtgacaactagggtacacatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaggacatttttaagtggtatccatgaacta 37620290  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37620291 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 37620375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 23932509 - 23932692
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  23932509 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctgatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtgtccatgaactat 23932608  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23932609 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcaagaaaaaacc 23932692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 39646750 - 39646567
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  39646750 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagttacataagcacatttttaagtggtatccatgacctat 39646651  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39646650 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggcaatctagaaaaaacc 39646567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 49253975 - 49254158
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  49253975 ggtgataattagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccatataagcacatttttaagtggtatccataaactat 49254074  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49254075 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 49254158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33884270 - 33884088
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  33884270 ggtgacaattagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtatctatgaactat 33884171  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33884170 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaac 33884088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 33959982 - 33960164
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  33959982 ggtgacaattagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtatctatgaactat 33960081  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33960082 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaac 33960164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 47317497 - 47317316
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  47317497 ggtgacaactagggtacccatagaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaactat 47317398  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  47317397 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgaataaattacccaccattcttcaaaggtaatataaaaaaaa 47317316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 51057253 - 51057068
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  51057253 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttacctcaactaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgatctat 51057154  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51057153 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggttggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 51057068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 5980251 - 5980067
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||    
T  5980251 gggtgacagctagggtacctatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagctaatttttaagtggtatccattaacta 5980152  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5980151 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 5980067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26794482 - 26794302
Alignment:
Q  6 acaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  26794482 acaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactattttg 26794383  T
Q  106 acccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  26794382 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatttaaaaaaaacct 26794302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24885683 - 24885500
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24885683 ggtgacaactagggtattcatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattatccacataaacatatttttaagtggtatccatgaactat 24885584  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24885583 cttgaccccaccaacaaattgatcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 24885500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 46784605 - 46784418
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46784605 ggtgacaattagggtacccatggaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 46784506  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttag 189  Q
    ||| ||    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  46784505 ctttacttctccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcctcaaaggtaatctagaaaaaactttag 46784418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 26524889 - 26525071
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||    
T  26524889 ggtgacaactagggtatccatggaagaatagtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatctataaactat 26524988  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26524989 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 26525071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 47187287 - 47187101
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  47187287 ggtgacaactacggtacccatgaaagaatggtggataatttaccataaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccataaactat 47187188  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47187187 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattactcatcaatcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 47187101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 47383732 - 47383914
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47383732 ggtgacaactagggtaccaatgaaagaatggtgggtaatttatcccaatcaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 47383831  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47383832 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatatagaaaaaac 47383914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 35692663 - 35692848
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  35692663 ggtgacaactagagtatccatggaagaacggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagcggtatccatgaactat 35692762  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatggg-taaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35692763 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 35692848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 50774399 - 50774218
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  50774399 ggtgacaactagggtacccatggaagaaaggtgggtaatttatcccaaccaatacacattggtcacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 50774300  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  50774299 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggttaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 50774218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Original strand, 23220939 - 23221112
Alignment:
Q  6 acaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23220939 acaactagggtacccatggaagaatggtggata------cccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 23221032  T
Q  106 acccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23221033 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 23221112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3285582 - 3285400
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3285582 gtgacaattagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccatgaactatc 3285484  T
Q  103 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3285483 ttgaccccaccaacaaattactcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 3285400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 49398988 - 49399171
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  49398988 ggtgacaactaggatacccatggaagaatagtgggtaatttaccccaaccaatagacattagccacataaacacatttttaagtggtatccataaactat 49399087  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49399088 cttaactccaccaacaaattgctcattttcattgattggtggataaattacctaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 49399171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 36003315 - 36003131
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatg---gaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaac 98  Q
    |||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36003315 ggtgacaactagggtacctatgaaagaagaatggtgggtaatttatccgaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 36003216  T
Q  99 tatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  36003215 tatcttgaccccaccagtaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 36003131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 33 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 31844527 - 31844374
Alignment:
Q  33 tgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttca 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31844527 tgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgacctcaccaacaaattgctcattttca 31844428  T
Q  133 ttgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31844427 ttggttggtgggtaaattatccaccattcctcaaaggtaatctagaaaaaacct 31844374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 42864034 - 42863867
Alignment:
Q  15 gtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaacca 114  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  42864034 gtactcatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtagtatccatgaactatcttgaccccacca 42863935  T
Q  115 acaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaa 182  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  42863934 acaaatagctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtagtctagaaaaa 42863867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 28888760 - 28888582
Alignment:
Q  5 gacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatctt 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28888760 gacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttatctcaatcaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatctt 28888661  T
Q  105 gacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    || || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28888660 gatcccaccaacaaattgatcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagttaatctagaaaaaa 28888582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 48373677 - 48373500
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48373677 ggtgacaactaaggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacat---------aagcacatttttaagtggtatccatgaactat 48373587  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48373586 cttgaccccaccaataaactgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 48373500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 42313361 - 42313548
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  42313361 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtattaatgaactat 42313460  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattac----ccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42313461 cttgactccaccaataaatttctcattttcattggttggtgggtaaattatatatccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 42313548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 25518952 - 25518815
Alignment:
Q  46 ccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  25518952 ccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggt 25518853  T
Q  146 aaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  25518852 aaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 25518815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 41467632 - 41467804
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  41467632 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 41467720  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41467721 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 41467804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 27983603 - 27983772
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||               
T  27983603 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtat----------- 27983691  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
         ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27983692 -----ccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 27983772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 2450676 - 2450529
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2450676 ggtgacaactaggatacccatggaagaatgataggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 2450577  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaat 149  Q
    |||||  | || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2450576 cttgattccactaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaat 2450529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2657474 - 2657300
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  2657474 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 2657386  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2657385 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttaaaaaaaacctt 2657300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33073382 - 33073207
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  33073382 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 33073294  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  33073293 cttgaccccacctataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 33073207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 4808827 - 4808699
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4808827 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 4808728  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcatttt 130  Q
    |||||||| | ||| |||||| |||||||    
T  4808727 cttgaccctatcaataaattgttcatttt 4808699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Original strand, 6626025 - 6626195
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 102  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||||||||    
T  6626025 gtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactatc 6626113  T
Q  103 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6626114 ttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 6626195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10928238 - 10928064
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  10928238 ggtgacaactagggtattcatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 10928150  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  10928149 cttgaccccaccaataaattgttcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 10928064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 187
Target Start/End: Original strand, 26472185 - 26472353
Alignment:
Q  8 aactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgac 107  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||||||||    
T  26472185 aactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaagacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttgac 26472273  T
Q  108 ccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    || || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26472274 cccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 26472353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 29770841 - 29770666
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  29770841 ggtggcaactaggctacccatgaaaaaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 29770753  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29770752 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattagttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 29770666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Original strand, 45475848 - 45476014
Alignment:
Q  5 gacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatctt 104  Q
    |||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  45475848 gacaactagggtacca--gaaagaatggtgggtaatttaccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttgtaagtggtatccatcaactatctt 45475944  T
Q  105 gacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaa 182  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||        | ||||||||||||||||||||||||||    
T  45475945 gaccccaccaataaattgctcattttcattgattggtgggta--------accattcttcaaaggtaatctagaaaaa 45476014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Original strand, 51045596 - 51045729
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  51045596 ggtgacaactaggatacccgtagaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcataaactat 51045695  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattg 135  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  51045696 cttgaccccaccaacaaattactcattttcattg 51045729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Original strand, 51403034 - 51403189
Alignment:
Q  19 ccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaa 118  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||         ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51403034 ccatggaagaatggtgagtaatttatcccaaccaatacatat---------aagcacatttt-aagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa 51403123  T
Q  119 attgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51403124 attgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 51403189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 42235010 - 42234836
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  42235010 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccc-aaccaatacacattaaccacataagcacatatt-----------catgaactat 42234923  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42234922 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 42234836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4953223 - 4953053
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  4953223 ggtgacaattaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatatt-----------catgaactat 4953135  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4953134 cttgatcccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagagaaaa 4953053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 2955026 - 2954854
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |           ||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  2955026 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacaat-----------cacctttttaagtggtatccattaactat 2954938  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2954937 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattgattggtgggtaaattacccaccatttgtcaaaggtaatctagaaaaaacc 2954854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 182
Target Start/End: Original strand, 31979998 - 31980115
Alignment:
Q  65 cacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttc 164  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31979998 cacataaggacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccctaacaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttc 31980097  T
Q  165 aaaggtaatctagaaaaa 182  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31980098 aaaggtaatctagaaaaa 31980115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 4243489 - 4243663
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||           |||| ||| |||||    
T  4243489 gggtgacaactagactacccatgaaagaattatgggtaatttaccccatccaatacacattagccacataagcac-----------atattcataaacta 4243577  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  4243578 tcttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattattcaaaggtaatttagaaaaaacct 4243663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26686027 - 26685855
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  26686027 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaataaacatt-----------cacttttttaggtggtatccataaactat 26685939  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26685938 cttgaccctaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 26685855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 4156576 - 4156438
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta- 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||     
T  4156576 ggtgacaactagagtacccatggaaaaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaatacatttttaagtggtatccataaactat 4156477  T
Q  101 ------tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcat 133  Q
          ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4156476 attgagtcttgaccccaccaacaaattggtcattttcat 4156438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Original strand, 34752320 - 34752485
Alignment:
Q  8 aactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgac 107  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||||| |     
T  34752320 aactaggttacccatgaaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactatcttaag 34752408  T
Q  108 ccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    || || || ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34752409 cccacaaataaattgctcattttatttggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 34752485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 39475783 - 39475956
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| || ||           |||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  39475783 ggtgacaactagggtacccatgaaaaaatgatgggttatttatcccaaccaataaacgtt-----------cacatttttaggtggtatccataaactat 39475871  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  39475872 cttgaccca-ccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccatcatttttcaaaggtactctagaaaaaacctt 39475956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 187
Target Start/End: Original strand, 2556909 - 2557031
Alignment:
Q  65 cacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttc 164  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||  ||| ||||||| ||| ||||||||    
T  2556909 cacataaacacatttttaagtggtattcatgaactatcttgaccccaccaacagattgctcattttcattagttagtggataaattatccaccattcttc 2557008  T
Q  165 aaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2557009 aaaggtaatctagaaaaaacctt 2557031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 30289910 - 30290083
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  30289910 ggtgacaactaaggtactcatggaagaatggtggataatttacctcaaccaatacacattaaccacataagcac-----------atattcatgaactat 30289998  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  30289999 cttgactccaccaataaattgctcatattcactggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaacacct 30290083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 182
Target Start/End: Original strand, 41895164 - 41895333
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  41895164 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacaccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 41895252  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaa 182  Q
    |||||||  || || |||||||| ||| | |||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||    
T  41895253 cttgacctcacaaataaattgctaattgttattggttggtgggtaaattacccacaattctttaaaggtaatttagaaaaa 41895333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 95
Target Start/End: Original strand, 13312531 - 13312624
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatg 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13312531 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatatttaagtggtatccatg 13312624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 33187505 - 33187337
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||                 |||||||| |||| || ||||||    
T  33187505 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatatt-----------------tttaagtggtatctataaactat 33187423  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  33187422 cttgatccaaccaataaattgctcattttcattggttggtgtgtaaattatccaccattctttaaagataatctagaaaaaacctt 33187337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 5961267 - 5961441
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  5961267 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatgatgggtaatttacctcaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 5961355  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| | |||  ||| ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5961356 cttgatcccaccaataaattgctcattatgatttgttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaagtaatctagaaaaaacctt 5961441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 38716246 - 38716419
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| || ||    
T  38716246 gggtgacaacaagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaatta 38716334  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  38716335 tcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccattttttaaagataatctagaaaaaacc 38716419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 1388644 - 1388476
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  1388644 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttacctcaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 1388556  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaa 181  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||  | |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  1388555 cttgaccctaccaataaattgctcatcatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaatgtaatctagaaaa 1388476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Original strand, 44544052 - 44544216
Alignment:
Q  8 aactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgac 107  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||  ||||||| |||| ||           ||||||||||||||||    
T  44544052 aactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccctaactaatatacattagttacataagtacatatt-----------catgaactatcttgac 44544140  T
Q  108 ccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  44544141 cccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 44544216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 51155590 - 51155761
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||           ||||||||||    
T  51155590 ggtgacagctaaggtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacacattagtcacataaacacatatt-----------catgaactat 51155677  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||| | ||||| |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  51155678 cttgactccaccaataaattgttcatattcattggttggtgggtaaattacccatcatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 51155761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Original strand, 47772172 - 47772304
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| || |||  || ||||||    
T  47772172 ggtgacaattaaggtacccatggaagaatggtgtgtaatttactccaaccaatatacattagtcacataaacacatttttaaatggtatatataaactat 47772271  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcatt 134  Q
     ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  47772272 tttgaccctaccaacaaattgcttattttcatt 47772304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 32448807 - 32448650
Alignment:
Q  5 gacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatctt 104  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||||           |||| |||||||||||||    
T  32448807 gacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaata---------cacttaagcac-----------atattcatgaactatctt 32448728  T
Q  105 gacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaa 182  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  32448727 gaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaa 32448650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 184
Target Start/End: Original strand, 13281588 - 13281733
Alignment:
Q  28 aatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcat 127  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||||||| ||||||| || || |||||| ||||    
T  13281588 aatgatggataatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactattttgaccccacaaataaattgttcat 13281676  T
Q  128 tttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13281677 tgtcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 13281733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 188
Target Start/End: Original strand, 13313248 - 13313351
Alignment:
Q  87 atatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaagg--taatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13313248 atatccatgaactatcttaaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccacaattcttcaaaggtataatctagaaaaaac 13313347  T
Q  185 ctta 188  Q
    ||||    
T  13313348 ctta 13313351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 44293455 - 44293630
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||| ||           ||||||||||    
T  44293455 ggtggcaactaggctatccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaactaatatatattagccacataagtacatatt-----------catgaactat 44293543  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| || || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  44293544 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttgatgggtaaattacctactattcttcaaaggtaattttaaaaaaacctta 44293630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10920371 - 10920198
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  10920371 ggtgacaactaaggtatccatggaaaaatggtcggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 10920283  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||| ||||||  |||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10920282 cttgaccccaccaataaattgtgcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaagataatctagaaaaaacct 10920198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 7561528 - 7561712
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattag--ccacataagcacatttttaagtgatatccatgaact 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||| || | |   |||  || |       
T  7561528 ggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccccacgtaagcacatattcatgaactataaattatgg 7561627  T
Q  100 at-cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
     |  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||    
T  7561628 gtaattgaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacctaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaa 7561712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 187
Target Start/End: Original strand, 24649802 - 24649896
Alignment:
Q  93 atgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24649802 atgaactatcttgaccccaccaataaataactcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 24649896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 193
Target Start/End: Original strand, 46428327 - 46428433
Alignment:
Q  87 atatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  46428327 atattcatgaactatcttgaccccatcaataaattgctcatattcattggttgctgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacat 46428426  T
Q  187 tagtttt 193  Q
    || ||||    
T  46428427 tattttt 46428433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 52324110 - 52323936
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||  |||||           ||| |||||| ||| ||| ||| || |||    
T  52324110 ggtgacaactagggtacccatggaagattggtgggtaatttactccaatcaatgaacattt----------cacctttttaggtggtattcataaattat 52324021  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  52324020 cttgaccccaccaataaattgttcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaacct 52323936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 52368054 - 52367882
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |  || ||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  52368054 ggtgacaactagggtacctatggaaaaatgatgggtaatttatctaaatcaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 52367966  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||    
T  52367965 cttgaccctaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccacaattttttaaaggtaatccagaaaaaacc 52367882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 185
Target Start/End: Original strand, 27924722 - 27924830
Alignment:
Q  77 tttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatcta 176  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  27924722 tttttaggtggtatccataaactatcttgatcccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaagtaatcta 27924821  T
Q  177 gaaaaaacc 185  Q
    |||||||||    
T  27924822 gaaaaaacc 27924830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Original strand, 35991616 - 35991773
Alignment:
Q  19 ccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaa 118  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||           |||||||||||||||||| || || ||    
T  35991616 ccatgaaagaatgatagctaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcatatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaataa 35991704  T
Q  119 attgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||||||||| |  ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  35991705 attgctcattttcaattgttggtggataaattacccacaattcttcaaaggtaattta-aaaaaacctta 35991773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 39637986 - 39637899
Alignment:
Q  94 tgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39637986 tgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggt----gggtaaattacccaccattcttcataggtaatctagaaaaaacc 39637899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 48683329 - 48683489
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||           ||  |||||| ||| ||||||| |||||    
T  48683329 gggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttatcccaaccaataaacatt-----------catctttttaggtggtatccataaacta 48683417  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaa 172  Q
    ||||||| | ||||| |||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  48683418 tcttgactccaccaataaattgttcattatgattggttggtgggtaaattacccaccattttttaaaggtaa 48683489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 185
Target Start/End: Original strand, 4156188 - 4156248
Alignment:
Q  125 cattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4156188 cattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 4156248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 77
Target Start/End: Original strand, 38718167 - 38718242
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttac-cccaaccaatacacattagccacataagcacat 77  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  38718167 ggtgacaactaggctacc-atgaaagaatgatgggtaatttactcccaaccgatatacattagccacataagcacat 38718242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 24215911 - 24215812
Alignment:
Q  25 aagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgct 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||         |||| ||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  24215911 aagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataa--acat---------atattcatgaactatcttgatcctacaaataaattgct 24215823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 61
Target Start/End: Original strand, 31286504 - 31286563
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacatt 61  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  31286504 ggtgacaactagggtacccatagaaaaatggtggataatttaccccaaccaataaacatt 31286563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 186
Target Start/End: Original strand, 10919313 - 10919367
Alignment:
Q  132 attgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10919313 attggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaagataatctagaaaaaacct 10919367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 31844855 - 31844818
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaa 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31844855 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaa 31844818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23994875 - 23994845
Alignment:
Q  157 cattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23994875 cattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 23994845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 39359532 - 39359502
Alignment:
Q  33 tgggtaatttaccccaaccaatacacattag 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39359532 tgggtaatttaccccaaccaatacacattag 39359502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 39556 - 39739
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39556 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 39655  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39656 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 39739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 5882688 - 5882505
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5882688 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 5882589  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5882588 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 5882505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8615422 - 8615237
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8615422 ggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 8615323  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8615322 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 8615237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 22551061 - 22551247
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22551061 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaggtggtatccatgaactat 22551160  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22551161 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 22551247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 186
Target Start/End: Original strand, 14891383 - 14891563
Alignment:
Q  6 acaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14891383 acaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 14891482  T
Q  106 acccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14891483 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggcaatctagaaaaaacct 14891563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 181
Target Start/End: Original strand, 18101495 - 18101674
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18101495 ggtgacaactaggatacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 18101594  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaa 181  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18101595 tttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaa 18101674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24168273 - 24168090
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24168273 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 24168174  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24168173 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 24168090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 26377204 - 26377387
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26377204 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 26377303  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26377304 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacc 26377387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 19415533 - 19415717
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19415533 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgagctat 19415632  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19415633 cttgaccccaccaacaaattggtcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 19415717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 2892368 - 2892189
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2892368 tgacaactagggtacccatagaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 2892269  T
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2892268 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 2892189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 34527862 - 34528045
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  34527862 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 34527961  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  34527962 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 34528045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1970893 - 1970708
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1970893 ggtgacaactaaagtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtgatattcatgaactat 1970794  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1970793 cttgaccccaccaacaaattgtttattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 1970708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 7393586 - 7393771
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7393586 ggtgacaattatggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 7393685  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7393686 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacctt 7393771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16703539 - 16703363
Alignment:
Q  11 tagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgaccca 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  16703539 taggatacccatggaagaatgatgcgtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccataaactatcttgacccc 16703440  T
Q  111 accaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16703439 accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 16703363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28947269 - 28947085
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  28947269 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatacatgaattat 28947170  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28947169 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 28947085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 959904 - 960086
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  959904 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatctatgaattat 960003  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  960004 cttgaccccaccaacaaattgctcatttccattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 960086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 191
Target Start/End: Original strand, 2593852 - 2594041
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2593852 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtggataatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 2593951  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttagtt 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2593952 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccacaattcttcaaagataatctagaaaaaacctaagtt 2594041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Original strand, 7345114 - 7345295
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 103  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  7345114 tgacaactaaggtagacatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactattt 7345213  T
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7345214 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 7345295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 171
Target Start/End: Original strand, 11988974 - 11989143
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11988974 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 11989073  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggta 171  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11989074 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggta 11989143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 185
Target Start/End: Original strand, 19281056 - 19281238
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 102  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19281056 gtgacaactaggctacctatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatattcatgaactatc 19281155  T
Q  103 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19281156 ttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggcaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 19281238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 600074 - 599890
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  600074 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtggataatttatcccaaccaatacaaattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 599975  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  599974 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 599890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 171
Target Start/End: Original strand, 22341788 - 22341959
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22341788 ggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 22341887  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgat--tgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggta 171  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22341888 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgtgttgggtaaattacccaccattcttcaaaggta 22341959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 10507908 - 10508091
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10507908 ggtgacaactagggtagccatcgaagaatggtgggtagtttaccccaaccaatacacattagccacgtaagcacatttttaagtggtatccatgaactat 10508007  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10508008 cttgaccccaccaacaaattgctcattatcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 10508091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 33452572 - 33452753
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33452572 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactat 33452671  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| | |||||||||  |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  33452672 cttgaccccaacaacaaattattcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaa 33452753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 24224070 - 24224253
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24224070 ggtgacaactaggatactcatgaaagaatagtaggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 24224169  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggt-aatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24224170 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaaatctagaaaaaac 24224253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 5294801 - 5294987
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5294801 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgagtaatttacctcaatcaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 5294900  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5294901 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccactattcttcaaaagtaatctagaaaaaatctta 5294987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 5299353 - 5299539
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5299353 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgagtaatttacctcaatcaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 5299452  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5299453 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccactattcttcaaaagtaatctagaaaaaatctta 5299539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 30743448 - 30743629
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| || ||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  30743448 ggtgataattagggtatccatgaaagaatggtaggtaatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccataaactat 30743547  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30743548 cttgatctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 30743629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 55 - 185
Target Start/End: Original strand, 30467656 - 30467786
Alignment:
Q  55 acacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattaccc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  30467656 acacattagccacataagcacatgtttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgtttggtgggtaaattaccc 30467755  T
Q  155 atcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30467756 accattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 30467786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 28948845 - 28949019
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||| |||||| |||    
T  28948845 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagca-----------tatattcatgaattat 28948933  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28948934 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 28949019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 152
Target Start/End: Original strand, 23261929 - 23262079
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23261929 ggtgacaactagggtacctatgaaagaacggtggataatttaccccaaccaatacatattaacctcataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 23262028  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattac 152  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23262029 cttaaccccatcaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattac 23262079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13329545 - 13329378
Alignment:
Q  9 actagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacc 108  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||           |||||||||||| |||    
T  13329545 actaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatattt-----------atgaactatcttaacc 13329457  T
Q  109 caaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    | || || |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13329456 ccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 13329378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15965604 - 15965432
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||           |||| |||||| |||    
T  15965604 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacac-----------atattcatgaagtat 15965516  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||| |||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15965515 cttaaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacc 15965432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7167754 - 7167580
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| |||||    
T  7167754 gggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaacta 7167666  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    ||||||||| || || |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7167665 tcttgaccccactaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacct 7167580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4487698 - 4487528
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||| ||||||||||    
T  4487698 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacatgagtac-----------atattcatgaactat 4487610  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| || ||||||    
T  4487609 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcataggaaatttaaaaaaaa 4487528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3786920 - 3786749
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  3786920 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaactaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 3786832  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
     ||||||| || || |||||  |||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3786831 attgaccccacaaataaattcttcattttcattgattggtaggtaaattatccaccattcttcaaaagtaatttagaaaaaac 3786749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 1398725 - 1398551
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||           |||| ||| |||||    
T  1398725 gggtgacaactaggctacctatgaaagaatgacgggtaatttactccaaccaatacatattagccacataagcac-----------atattcatcaacta 1398637  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    ||||||||  || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  1398636 tcttgacctcacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaagataatttagaaaaaacct 1398551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3291179 - 3291009
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||           ||||||||    
T  3291179 ggtgacaattaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaatcaatacatattagccacataagcacatattta-----------tgaactat 3291091  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    ||| |||| || || |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3291090 cttaaccccacaaataaattgttcattttaattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 3291009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 929741 - 929657
Alignment:
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  929741 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 929657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 18661905 - 18661830
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat 77  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18661905 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacat 18661830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 77
Target Start/End: Original strand, 24913096 - 24913171
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat 77  Q
    ||||||||||| | ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24913096 ggtgacaactaagctactcatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacat 24913171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 188
Target Start/End: Original strand, 11743070 - 11743130
Alignment:
Q  128 tttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11743070 tttcattgattgatggataaattacccaccattcttcaagggtaatctagaaaaaacctta 11743130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 178
Target Start/End: Original strand, 1939578 - 1939669
Alignment:
Q  87 atatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctaga 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  1939578 atatccatgaattatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggtttataggtaaattatccaccattcttcaaagataatttaga 1939669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 187
Target Start/End: Original strand, 375807 - 375898
Alignment:
Q  96 aactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | |||  ||| | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  375807 aactatcttgaccccaccaataaattgcgcattatgattagttggtaggtaaattacccaccatttttcaaaagtaatctaaaaaaaacctt 375898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 34262401 - 34262342
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacatt 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  34262401 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttatcacaaccaataaacatt 34262342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 375729 - 375786
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacatt 61  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  375729 tgacaattaaggtacccatggaaaaatggtggataatttaccccaaccaataaacatt 375786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 113)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 49330219 - 49330035
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49330219 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 49330120  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49330119 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 49330035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40420017 - 40419834
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40420017 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgagtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 40419918  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40419917 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 40419834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 47257975 - 47257792
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  47257975 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 47257876  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47257875 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 47257792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 27066978 - 27067160
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27066978 ggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaactat 27067077  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27067078 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggttggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 27067160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37313581 - 37313395
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37313581 ggtgacacctagagtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtgatattcatgaactat 37313482  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37313481 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 37313395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 40130959 - 40131144
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40130959 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 40131058  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40131059 cttgaccccacagacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 40131144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41464534 - 41464349
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41464534 ggtgacaactagagtacccatggaagaatgctgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41464435  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41464434 cttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 41464349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 43612047 - 43612231
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43612047 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 43612146  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43612147 cttgaccacgccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaatctagaaaaaacct 43612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 7855114 - 7855300
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7855114 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccttgaactat 7855213  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7855214 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacctta 7855300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24100464 - 24100279
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  24100464 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatc-atgaactat 24100366  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24100365 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 24100279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 38416724 - 38416905
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38416724 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacgtaagcacatttttaagtggtatccatgaactat 38416823  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  38416824 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 38416905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22399278 - 22399095
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  22399278 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagcacatttt-aagtggtttccatgaactat 22399180  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22399179 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 22399095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 28048392 - 28048576
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28048392 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccaaattaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 28048491  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28048492 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 28048576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 47809596 - 47809780
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttacccc-aaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  47809596 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 47809695  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47809696 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 47809780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 48739233 - 48739417
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  48739233 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacaat 48739332  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  48739333 cttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaagtaatctagaaaaaacct 48739417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 187
Target Start/End: Original strand, 51170034 - 51170218
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51170034 gtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 51170133  T
Q  103 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51170134 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctt 51170218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 187
Target Start/End: Original strand, 55453245 - 55453429
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55453245 gtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 55453344  T
Q  103 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55453345 ttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttgatgagtaaattacccaccattcttcaaaggtaacctagaaaaaacctt 55453429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40643982 - 40643799
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  40643982 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatgatatccataaactat 40643883  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  40643882 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacc 40643799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 32234398 - 32234583
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32234398 ggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcatatttt-aagtggtatccatgaactat 32234496  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32234497 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 32234583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 40804510 - 40804696
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40804510 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccctaactaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 40804609  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40804610 cttgatcctaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaatctta 40804696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 51102378 - 51102564
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51102378 ggtgacaactagggtaccaacggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaatacatttttaagtgatatccatgaactat 51102477  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51102478 cttgaccccaccaacaaattactcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 51102564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 29625827 - 29626012
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29625827 ggtgataattagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 29625926  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29625927 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 29626012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 42292024 - 42291840
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  42292024 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacattttcaagtggtatctatgaactat 42291925  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42291924 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 42291840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41732710 - 41732525
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41732710 ggtgacaactggggtatccatggaaggatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41732611  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41732610 cttgaccccactaacaaattgctcattttcattgattgatggataaattatccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 41732525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 35594299 - 35594119
Alignment:
Q  6 acaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35594299 acaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaactaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactatcttg 35594200  T
Q  106 acccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  35594199 accccatcaacaaattgctcatttttattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctaaaaaaaacct 35594119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 44223011 - 44222827
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  44223011 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtattcatgaacaat 44222912  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  44222911 cttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattacccactatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 44222827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 2666182 - 2665999
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2666182 ggtgacaactagagtacccatgaaagaatagtgggtaatttaccataaccaatacacattagccacataagcacagttttaagtggtatccatgaactat 2666083  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2666082 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 2665999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 7755307 - 7755489
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||    
T  7755307 ggtgacaagtagggtacccatggaagaatgatgggttatttaccccaagcaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccataatctat 7755405  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7755406 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 7755489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 20754393 - 20754576
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20754393 ggtgacaactagggtactcatggaataatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtgatatccatgaactat 20754492  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20754493 cttgactctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 20754576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 35748311 - 35748494
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35748311 ggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 35748410  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35748411 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccactattcttcaaagctaatctaaaaaaaacc 35748494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 52629135 - 52628953
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  52629135 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 52629037  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52629036 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaataaacc 52628953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 39634572 - 39634753
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39634572 ggtgacaactagggtacccatggaagaattgtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 39634671  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39634672 -ttgaccccaccaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaaatacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaac 39634753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 51452751 - 51452932
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  51452751 ggtgacaattagggtacc-atggaagaatgatgggtaatttaccctaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccataaactat 51452849  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51452850 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 51452932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 43126012 - 43125828
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43126012 ggtgacaactagg-tacctataaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 43125914  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43125913 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattgattagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 43125828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 39053576 - 39053393
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||| ||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39053576 ggtgacaactagagtatccataaaaaaatgatgggtaatttaccccaacgaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 39053477  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39053476 cttgaccccatcaacaaattgatcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 39053393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37324723 - 37324537
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  37324723 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaatatatttttaagtggtatacatgaactat 37324624  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37324623 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacctaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 37324537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 48609903 - 48609719
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48609903 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 48609804  T
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatc-tagaaaaaacctt 187  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  48609803 taaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcgaaggtaatcttaaaaaaaacctt 48609719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 44806866 - 44806683
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44806866 ggtgacaactagggtacccatgaaagaattgtggataatttacttcaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 44806767  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44806766 cttgattccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 44806683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 51146215 - 51146398
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  51146215 ggtggcaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttacctcaatcaatacacattagccacataagcaaatttttaagtggtatccatgaactat 51146314  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51146315 cttgaccccaccaataaattgttcattttcattgattgatgtgtaaattacctaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 51146398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 52215243 - 52215077
Alignment:
Q  17 acccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaac 116  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  52215243 acccatagaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgactccaccaac 52215144  T
Q  117 aaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52215143 aaattgctcatgttcattagttggtgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 52215077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 46134538 - 46134357
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46134538 ggtgacaattagggtatccatgaaagaatggtgaataatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 46134439  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  46134438 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 46134357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 53943588 - 53943770
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  53943588 ggtgacaactagagtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagtatatttttaagtggtatccatgaactat 53943686  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53943687 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 53943770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24376730 - 24376572
Alignment:
Q  27 gaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctca 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24376730 gaatggtgggtaatttaccccaacaaatacacataagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgatcccaccaacaaattgctca 24376631  T
Q  127 ttttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24376630 ttttcattggttggtgcgtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 24376572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 43021896 - 43021715
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 102  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  43021896 gtgacaactagggtacctatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagctacataagcacatttttaagtggtattcatgaactatc 43021797  T
Q  103 ttga-cccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  43021796 ttgacccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaa 43021715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 52639024 - 52638839
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  52639024 ggtgacaactagggtacccatagaataatggtgggtaatttacctcaatcaatacacattagccacagaagcacatttttaagtggtatccatgaattat 52638925  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52638924 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttcgttggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacctt 52638839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 182
Target Start/End: Original strand, 41293319 - 41293498
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||    
T  41293319 ggtgacaattagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtattcatgaattat 41293417  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaa 182  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41293418 cttgatcccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 41293498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 43184092 - 43183917
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43184092 tgacaactagggtacctatggaagaatggtgagtaatttacctcaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 43183993  T
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaa 179  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  43183992 tgatctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaa 43183917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 36369120 - 36368925
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36369120 ggtgataactagagcacccatggaaga-tggtgggtaatttaccctaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 36369022  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttagttttgatat 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  36369021 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattagttggtgggtaaattatcgaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccatattttttatat 36368925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Original strand, 53832486 - 53832666
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 103  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||    
T  53832486 tgacaactagggaacacatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacatattagccacataagcccctttttaattggtatccataaactatct 53832585  T
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53832586 tgacaccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaac 53832666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 5560024 - 5560218
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacatta--gccacataagcacatttttaagtgatatccatgaac 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5560024 gggtgacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatagacattatagtcacataagcatatttttaagtggtatccatgaac 5560123  T
Q  99 tatcttgacccaaccaacaaattgctcattt-----tcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||     |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5560124 tatcttgaccccacaaacaaattgctcatttaattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 5560218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 41216637 - 41216454
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41216637 ggtgacaactagagtacctatggaagaatagtgggtaatttatcccaattaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41216538  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
     || |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  41216537 attaaccccaccaacaaattgcttattttcattggttgatggataaattacccaccatcctttaaaggtaatctagaaaaaacc 41216454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 46126168 - 46126010
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  46126168 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtatccatgaactat 46126070  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattc 161  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||||    
T  46126069 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattatccaccattc 46126010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18947085 - 18946904
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18947085 ggtgacaagtagggtacccatggaagaatggtgggtaatttgtctcaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaactggtatccatgaactat 18946986  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18946985 cttgaccccacaaacaaattgttcattttcattggttggtaggtaaattacgcaccattcttcaaagataatctagaaaaaa 18946904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Original strand, 47894822 - 47895003
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47894822 tgacaactagggtacccatggaagaatggtggatgatttacctcaactaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 47894921  T
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||| | ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  47894922 tgaccccaccaacaaattgttcattttcattagttggtaggtaaattatccaccattctttaaaggtaatctaaaaaaaacc 47895003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 53637990 - 53637841
Alignment:
Q  35 ggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcatt 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  53637990 ggtaatttacctcaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattatcctgaccccactaacaaattgctcattttcatt 53637891  T
Q  135 gattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    | ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53637890 ggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 53637841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 187
Target Start/End: Original strand, 48546842 - 48547014
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||         ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  48546842 tgacaactagggtatccatggaagaatggtggataatttaccccaatcaatacacat---------aagcacatttttaagtggtatccatgaactat-t 48546931  T
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48546932 tgaccca-ccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacctt 48547014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 25641817 - 25641644
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||||||||    
T  25641817 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatattta-----------tgaactat 25641729  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25641728 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 25641644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 42590001 - 42589829
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  42590001 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 42589913  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42589912 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 42589829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Original strand, 34279721 - 34279896
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  34279721 ggtggcaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 34279809  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34279810 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 34279896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 51416140 - 51415966
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           || ||||||||||    
T  51416140 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------atacatgaactat 51416052  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51416051 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 51415966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 187
Target Start/End: Original strand, 54159000 - 54159173
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  54159000 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatt-accccaaccaatacaca---------taagcacatttttaagtggtatctatgaactatct 54159089  T
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54159090 tgactccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacctt 54159173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 54707220 - 54707394
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  54707220 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 54707308  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| || || |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54707309 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 54707394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 55000178 - 55000350
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  55000178 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 55000266  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  55000267 cttgaccctacaaataaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttctaaggtaatttagaaaaaacc 55000350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 38156632 - 38156803
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||    
T  38156632 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactat 38156720  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38156721 cttgaccccacaaataaattgttcattttaattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaac 38156803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37759075 - 37758925
Alignment:
Q  38 aatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |    
T  37759075 aatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatctatgaactatcttgacttcatcaacaaattgctcattttcattggt 37758976  T
Q  138 tgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  37758975 tgatggataaattattcaccattcttcaaaagcaatctagaaaaaacctta 37758925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 54401358 - 54401186
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  54401358 ggtggcaattaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 54401270  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  54401269 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttaaaaaaaacc 54401186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 49130746 - 49130575
Alignment:
Q  5 gacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatctt 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||||||||||    
T  49130746 gacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------atattcatgaactatctt 49130658  T
Q  105 gacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    ||||  | ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  49130657 gacctcatcaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 49130575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 39141125 - 39141298
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||         |||| ||||||||||    
T  39141125 ggtgataactaggttacc-atgaaagaatgatgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacat---------atattcatgaactat 39141214  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39141215 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatttagaaaaaacc 39141298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 47510940 - 47511113
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  47510940 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttactccaatcaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 47511028  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  47511029 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 47511113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 41635800 - 41635972
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  41635800 ggtgacaactagattacccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaatcaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 41635888  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41635889 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 41635972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 46949538 - 46949379
Alignment:
Q  19 ccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaa 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  46949538 ccatggaagaatggtgggtaatttatcc-aaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatcttgatcccgccaacaa 46949440  T
Q  119 attgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaa 180  Q
    |||| |||||||||||| | | |||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||    
T  46949439 attgttcattttcattggtcggtgggtaaattacacacca-tcttcaaagataatctagaaa 46949379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 31286793 - 31286963
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  31286793 ggtgacaactaggctactcatgaaagaatgatgagtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactat 31286881  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31286882 cttgaccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 31286963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 55380156 - 55379984
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  55380156 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 55380068  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55380067 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 55379984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25353725 - 25353550
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  25353725 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatgaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 25353637  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25353636 cttgaccccaccaataaattgcttattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 25353550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Original strand, 33550467 - 33550582
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  33550467 ggtgacaactagggtattcatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 33550566  T
Q  102 cttgacccaaccaaca 117  Q
    ||| |||| |||||||    
T  33550567 cttaaccccaccaaca 33550582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37028894 - 37028720
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||           |||| ||||||||||    
T  37028894 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacac-----------atattcatgaactat 37028806  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||| | || || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  37028805 cttgactccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattctttaaaggtaatttaaaaaaaacctt 37028720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 40022240 - 40022075
Alignment:
Q  7 caactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttga 106  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||           |||||||||||||||    
T  40022240 caactacgctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------catgaactatcttga 40022152  T
Q  107 cccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    ||| || || |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40022151 ccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattatccatcattcttcaaaggtaatttagaaaaaa 40022075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 52864671 - 52864550
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  52864671 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactc-aaccaatatacattagctacataaacacatttttaaatggtatccatgaactat 52864573  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgct 124  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  52864572 cttgaccccaccaacaaattgct 52864550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 51224037 - 51224212
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||           |||||||||    
T  51224037 gggtggcaactaggctacccataaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatatatattagtcacataagcacatatt-----------catgaacta 51224125  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51224126 tcttgaccccacaaataaattgctcatttttattg-ttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 51224212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 53115618 - 53115446
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  53115618 ggtgacaactagggtacctatggaaaaatggtggataatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaagtggtatccataaactat 53115530  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53115529 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 53115446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 45059052 - 45058882
Alignment:
Q  4 tgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatct 103  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||           ||||||||||||    
T  45059052 tgacaactaggctgcccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaatcaatatacattagcaacataagcacatatt-----------catgaactatct 45058964  T
Q  104 tgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||    
T  45058963 tgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttaaaaaaaacc 45058882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 187
Target Start/End: Original strand, 17665549 - 17665698
Alignment:
Q  27 gaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctca 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||           |||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  17665549 gaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcatatatt-----------catgaactatcttgaccccacaaataaattgctca 17665637  T
Q  127 ttttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17665638 ttttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcataggtaatttagaaaaaacctt 17665698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24688286 - 24688114
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||           |||||||||    
T  24688286 gggtgacaactaggttacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccagtagacattagccacataaacacatatt-----------catgaacta 24688198  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    | ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24688197 ttttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacaatttttcaaaggtaatttagaaaaaac 24688114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 88 - 188
Target Start/End: Original strand, 28576187 - 28576287
Alignment:
Q  88 tatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28576187 tatccataaactatcttgaccccaccaataaattgttcattttcatcggttgatgggtaaattacccatcatacttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 28576286  T
Q  188 a 188  Q
    |    
T  28576287 a 28576287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 188
Target Start/End: Original strand, 2227995 - 2228110
Alignment:
Q  73 cacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaa 172  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  2227995 cacattttgaagtgatatctatgaactatcttgacctcaccaataaattgcttattttcattggttgatcggtaaatttcccaccatttttcaaaggtaa 2228094  T
Q  173 tctagaaaaaacctta 188  Q
    ||||||||||||||||    
T  2228095 tctagaaaaaacctta 2228110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 30251501 - 30251675
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  30251501 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttagcccaaccaatgaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 30251589  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| || |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  30251590 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgagtaaattacccaccatttttcaaaggtagtctagaaaaaacctt 30251675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 47182131 - 47182046
Alignment:
Q  53 atacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgatt 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47182131 atacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccataaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgatt 47182046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 51143987 - 51143818
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 102  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||     
T  51143987 gtgacaactagggtacccatgaaaaaatggtgggtaatttactccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactata 51143899  T
Q  103 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  51143898 ttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaa 51143818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 175
Target Start/End: Original strand, 47402810 - 47402911
Alignment:
Q  73 cacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaa 172  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47402810 cacatttttaaatggtatc-atgaactatcttgaccctaccaataaattgttcattttcattgattgatggataaattacccaccattctttaaaggtaa 47402908  T
Q  173 tct 175  Q
    |||    
T  47402909 tct 47402911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 88 - 185
Target Start/End: Original strand, 48726073 - 48726170
Alignment:
Q  88 tatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  48726073 tatccatgaactgtcttgactctaccaataaattgcttattttcattgattggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatttagaaaaaacc 48726170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 185
Target Start/End: Original strand, 42998790 - 42998960
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatc 102  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||           ||| |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  42998790 gtgacaactaaggtactcatggaaaaatggtgggtaatttatcccaaccaataagcatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactatc 42998878  T
Q  103 ttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42998879 ttgaccccaccaataaattgatcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatt-ttcaaaggtaatctagaaaaaacc 42998960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 43176737 - 43176908
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||            ||| |||||| ||| ||||||| |||||    
T  43176737 gggtgacaactagggtacccatggaaaaatgatgggtaatttatcccaaccaataaacat-----------ccacctttttaggtggtatccataaacta 43176825  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||||   ||||| |||||| ||||| | |||| ||| ||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  43176826 tcttgacatcaccaataaattgttcattatgattggttggtggataaattatccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 43176908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 183
Target Start/End: Original strand, 41882066 - 41882161
Alignment:
Q  88 tatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  41882066 tatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 41882161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 44945935 - 44946101
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||                 ||||    
T  44945935 ggtgacaactaggctacgcatgaaagaatgatgaataatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatatt-----------------ctat 44946017  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||    
T  44946018 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaagataatttaaaaaaaacc 44946101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 77
Target Start/End: Original strand, 48534007 - 48534082
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat 77  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48534007 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccgatacacattagccacataagcacat 48534082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 188
Target Start/End: Original strand, 21597223 - 21597323
Alignment:
Q  88 tatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21597223 tatccataaactatcttgatcccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattactcaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 21597322  T
Q  188 a 188  Q
    |    
T  21597323 a 21597323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 50731914 - 50732087
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||   |||||           |||  |||||  || ||||||| |||||     
T  50731914 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggaaatttactccaaccaacgaacatt-----------caccgttttagatggtatccataaactac 50732002  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  50732003 cttgaccccaccaacaaattgctcattaagattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta-aaaaaacctt 50732087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 50780942 - 50780769
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||   |||||           |||  |||||  || ||||||| |||||     
T  50780942 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggaaatttactccaaccaacgaacatt-----------caccgttttagatggtatccataaactac 50780854  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  50780853 cttgaccccaccaacaaattgctcattaagattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta-aaaaaacctt 50780769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 155
Target Start/End: Original strand, 52756067 - 52756213
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacac----attagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaa 97  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||           |||| ||||||    
T  52756067 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacccaaaccaatacacattaattagccacataagcac-----------atattcatgaa 52756155  T
Q  98 ctatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattaccca 155  Q
    |||||||||||| || || |||||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  52756156 ctatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttagtgggtaaataaccca 52756213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 40165822 - 40165653
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  40165822 ggtgacaaccagggtacccatggaaaaatggtggataatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaactat 40165734  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    |||||| | ||||| ||||| |||||| | |||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  40165733 cttgactccaccaataaattactcattatgattgcttggtgggtaaatta-ccattatttttcaaagataatttagaaaaaa 40165653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 86
Target Start/End: Original strand, 30429227 - 30429311
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtg 86  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  30429227 ggtgacaactagggtacctacggaagaatggtggataatttatcccaattaatacatattagtcacataaacacatttttaagtg 30429311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 52434213 - 52434138
Alignment:
Q  111 accaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaa-ttacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52434213 accaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 52434138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 48752158 - 48752085
Alignment:
Q  111 accaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  48752158 accaataaattgcacattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaac 48752085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 40688483 - 40688431
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaat 54  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40688483 ggtgacaattaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaat 40688431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 185
Target Start/End: Original strand, 51942544 - 51942588
Alignment:
Q  141 tgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51942544 tgggtaaattacctaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 51942588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 37741487 - 37741433
Alignment:
Q  132 attgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 186  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  37741487 attggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctaaaaaaaacct 37741433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 41609238 - 41609098
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||  |||||           |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  41609238 ggtgacaactaatgtacccatggaagaatgacggataatttacctcaaccaatgaacatt-----------cacatttttaggtagtatccatgaactat 41609150  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacc 153  Q
     || || | || || ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||    
T  41609149 tttaactccactaataaattgctcattttcattagttggtaggtaaattacc 41609098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 177257 - 177162
Alignment:
Q  88 tatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||| || | |||| ||| ||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  177257 tatccataaagtatcttgatcccaccaataaattactcgttatgattggttggtgactaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaa 177162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 188
Target Start/End: Original strand, 8847718 - 8847832
Alignment:
Q  73 cacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaa 172  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| || ||||| |||||| ||||||| |||  ||| |  ||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  8847718 cacatttttaagtggtattcgtgaactattttgatcccaccaataaattgttcatttttattagttggtatgtaaattatacactattcttcaaaggtaa 8847817  T
Q  173 tctagaaaaaacctta 188  Q
    | || |||||||||||    
T  8847818 ttta-aaaaaacctta 8847832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 44
Target Start/End: Original strand, 41882011 - 41882053
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttac 44  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  41882011 ggtgacaactagggtacccgtggaagaatggtggataatttac 41882053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 52434344 - 52434291
Alignment:
Q  8 aactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacatt 61  Q
    |||||||||||| || ||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  52434344 aactagggtacctatagaaaaatggtgggtaatttactccaaccaataaacatt 52434291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 185
Target Start/End: Original strand, 33550581 - 33550609
Alignment:
Q  157 cattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33550581 cattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 33550609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 37760386 - 37760346
Alignment:
Q  3 gtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaattta 43  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  37760386 gtgataactagggtacctatggaagaatggtgggtaattta 37760346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 13762 - 13945
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13762 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 13861  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13862 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 13945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 2432 - 2615
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2432 ggtgataactagggtacccatggaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 2531  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2532 cttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataatttacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 2615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 146; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 11133 - 11317
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11133 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 11232  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  11233 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctt-aaaggtaatctagaaaaaccctt 11317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 2051 - 1871
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2051 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 1952  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaa 182  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  1951 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaa 1871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 75244 - 75427
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  75244 ggtgacaactaggttaccaatggaagaatggtgaataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatgcatgaactat 75343  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  75344 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 75427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Original strand, 18854 - 19037
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18854 ggtgacaactagggtacccatggaagaattgtggataatttattccaactaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 18953  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18954 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 19037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 278190 - 278005
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagt--gatatccatgaact 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  278190 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggggtatccatgaact 278091  T
Q  100 atcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  278090 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaatttacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 278005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 176836 - 176666
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  176836 ggtgacaactaggatacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacattttcaagtggtatccatgaactat 176737  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaa 172  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  176736 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtcggtaaattacccaccattcttcaaaggtaa 176666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 33 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 32712 - 32560
Alignment:
Q  33 tgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttca 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32712 tgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataaacacatttttaaatggtatccatgaactatcttgatcccaccaacaaattgctcattttca 32613  T
Q  133 ttgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32612 ttggttggtgggttaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 32560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3261 - 3089
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3261 ggtgacaactaaggtatccatagaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 3162  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 183  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||          ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3161 cttgatcccaccaacaaattgctcatttt---------gtgaataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 3089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 193
Target Start/End: Original strand, 4596 - 4781
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4596 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccataaactat 4695  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttagtttt 193  Q
    ||| |||| |||||||||||| ||||||| |||  ||| ||      ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4696 ctttaccccaccaacaaattgttcatttttattagttggtg------ttacccaccattattcaaagttaatctagaaaaaatcttagtttt 4781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 7262 - 7089
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||           ||||||||||    
T  7262 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattggccacataagcacatatt-----------catgaactat 7174  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcatttt-cattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 185  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7173 cttgaccccacaaataaattgctcatttttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 7089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 20476 - 20648
Alignment:
Q  1 gggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||||||| || ||    
T  20476 gggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtatccataaatta 20564  T
Q  101 tcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 184  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20565 tcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaac 20648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14915 - 14740
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||| ||| ||| ||| ||||||    
T  14915 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtaggtaatttaccccaaccaataaacatt-----------cacctttttaggtggtattcataaactat 14827  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14826 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagacaaaacctta 14740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 272 - 98
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||  |||||           ||| |||||| ||| ||| ||| ||||||    
T  272 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtggg-aatttacctcaaccaattaacatt-----------cacctttttaggtggtattcataaactat 185  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 188  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  184 cttgactccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 98  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 4554 - 4729
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||  |||||           ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  4554 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggtggataatttacttcaaccaatgaacatt-----------cacctttttaaatggtatccatgaactat 4642  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcatttt-cattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4643 cttgacctcaccaataaattactcatttttcattggttggtggataaattacccaccatttttgaaaggtaatctagaaaaaacctt 4729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 3564 - 3389
Alignment:
Q  2 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||  |||||           ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  3564 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggtggataatttacttcaaccaatgaacatt-----------cacctttttaaatggtatccatgaactat 3476  T
Q  102 cttgacccaaccaacaaattgctcatttt-cattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 187  Q
    |||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3475 cttgacctcaccaataaattactcatttttcattggttggtggataaattacccaccatttttgaaaggtaatctagaaaaaacctt 3389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18043 - 17900
Alignment:
Q  36 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattg 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||           ||| || ||| ||||| | | ||| |||||| |||| |||||||    
T  18043 gtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacgtatt-----------cataaaatattttgactccatcaataaattgatcatattcattg 17955  T
Q  136 attgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttagt 190  Q
     ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17954 gttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaaccgtagt 17900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19327 - 19228
Alignment:
Q  78 ttttaagtgatatccatgaac----tatcttgacccaaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaat 173  Q
    ||||| ||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  19327 ttttaggtggtatccatgaactatatatcttgaccccaccaataaattgttcattttcattgattgagaggtaaattacccaccgttcttcaaaagtaat 19228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University