View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8206A_low_168 (Length: 230)

Name: NF8206A_low_168
Description: NF8206A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8206A_low_168
NF8206A_low_168
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (1-227)||(24854391-24854617)
chr5 (1-227)||(6431109-6431335)
chr5 (1-215)||(5342554-5342769)
chr5 (3-227)||(41614837-41615062)
chr5 (41-215)||(31470687-31470861)
chr5 (1-227)||(27949928-27950153)
chr5 (61-213)||(8241589-8241741)
chr5 (68-201)||(27688870-27689003)
chr5 (134-213)||(10133539-10133618)
chr5 (61-201)||(22416198-22416338)
chr5 (59-187)||(28335811-28335939)
chr5 (61-213)||(28443698-28443850)
chr5 (7-58)||(1709770-1709821)
chr5 (59-158)||(23248945-23249043)
chr5 (70-180)||(22909929-22910038)
chr5 (59-147)||(27496580-27496668)
[»] chr3 (20 HSPs)
chr3 (1-227)||(3939923-3940149)
chr3 (1-227)||(41973104-41973330)
chr3 (1-227)||(44206185-44206411)
chr3 (1-227)||(47373244-47373469)
chr3 (1-227)||(49325790-49326016)
chr3 (1-227)||(21449137-21449362)
chr3 (1-227)||(8484901-8485127)
chr3 (1-227)||(21978362-21978590)
chr3 (1-227)||(22000793-22001021)
chr3 (88-227)||(48063651-48063790)
chr3 (48-227)||(9331957-9332136)
chr3 (1-181)||(18877496-18877678)
chr3 (1-127)||(22162976-22163104)
chr3 (4-93)||(48064910-48064999)
chr3 (59-213)||(23333455-23333609)
chr3 (61-195)||(25213228-25213363)
chr3 (59-180)||(24628814-24628934)
chr3 (59-148)||(27025283-27025371)
chr3 (1-47)||(16478655-16478701)
chr3 (71-180)||(51327445-51327553)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (1-227)||(13721929-13722155)
chr4 (1-227)||(52917965-52918191)
chr4 (12-211)||(40760880-40761079)
chr4 (1-227)||(45657994-45658221)
chr4 (1-227)||(38989176-38989402)
chr4 (1-227)||(55610167-55610386)
chr4 (1-227)||(40691453-40691680)
chr4 (137-227)||(11649115-11649205)
chr4 (1-51)||(53270869-53270919)
[»] chr7 (13 HSPs)
chr7 (1-227)||(33851499-33851725)
chr7 (5-227)||(29330755-29330977)
chr7 (1-227)||(110121-110348)
chr7 (1-227)||(35583536-35583763)
chr7 (1-227)||(15031079-15031305)
chr7 (5-227)||(38000058-38000280)
chr7 (1-209)||(41792594-41792801)
chr7 (1-180)||(7253746-7253924)
chr7 (169-227)||(43747858-43747916)
chr7 (59-199)||(1380250-1380390)
chr7 (59-199)||(1386354-1386494)
chr7 (59-147)||(1853837-1853925)
chr7 (61-195)||(1905589-1905725)
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (1-227)||(24832177-24832403)
chr8 (82-227)||(10290-10435)
chr8 (137-227)||(41836104-41836194)
chr8 (61-230)||(16795989-16796158)
chr8 (61-213)||(12191384-12191535)
chr8 (61-213)||(12435812-12435963)
chr8 (61-129)||(14194245-14194313)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (1-227)||(5462857-5463083)
chr2 (1-230)||(15111824-15112053)
chr2 (3-214)||(18964774-18964984)
chr2 (1-214)||(34949940-34950153)
chr2 (86-195)||(5936899-5937008)
chr2 (60-195)||(25630519-25630654)
chr2 (59-191)||(2734633-2734765)
chr2 (59-190)||(37126475-37126605)
chr2 (60-199)||(33946281-33946419)
chr2 (1-82)||(5936303-5936385)
chr2 (84-213)||(42014668-42014797)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (1-227)||(4852792-4853018)
chr1 (1-227)||(10221718-10221944)
chr1 (1-227)||(10311171-10311398)
chr1 (1-230)||(5748329-5748558)
chr1 (1-227)||(18277948-18278175)
chr1 (1-227)||(7198510-7198735)
chr1 (1-227)||(39599643-39599869)
chr1 (1-227)||(50890440-50890665)
chr1 (44-227)||(17384421-17384604)
chr1 (1-227)||(30516813-30517039)
chr1 (104-227)||(7563139-7563262)
chr1 (59-148)||(41368066-41368154)
chr1 (154-213)||(15499960-15500019)
chr1 (61-208)||(48181095-48181242)
chr1 (165-201)||(11355591-11355627)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (7-227)||(16925-17145)
[»] chr6 (6 HSPs)
chr6 (1-227)||(29436346-29436573)
chr6 (1-227)||(13038343-13038569)
chr6 (37-227)||(34950307-34950497)
chr6 (22-195)||(12303850-12304023)
chr6 (61-193)||(20386618-20386749)
chr6 (63-199)||(17521172-17521307)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (69-159)||(425832-425922)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (59-158)||(36830-36929)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 24854391 - 24854617
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  24854391 ggtccctgttttcattacaagtaaactacatcagacaaaaaaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagctagcggcagtctactacaacgg 24854490  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  24854491 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagacgatgtcaccctctccgagctgaaggatgagctggatcaaatcaaccgtcaactcaaccacaaagac 24854590  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  24854591 acgaggagggtggtcggagttgaatat 24854617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 6431109 - 6431335
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6431109 ggtccctgttttcattacaattaaactacatcagacaaaaaaacatggaattccctggctttgatctgaacaccaagctagcggcagtctactacaacgg 6431208  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  6431209 tggaacaccaccccatctatttaggattcgagacgatgtcaccctctccgggctgaaggatgagctggatcaaatcaaccgtcaactcaaccacaaagac 6431308  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||    
T  6431309 acgaggagggtggtcgaagttgaatat 6431335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 5342554 - 5342769
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagac-aaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacg 99  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  5342554 ggtccctgttttcattacaattaaactacatcagaagaaaaaaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagctagcggcaatctactacaacg 5342653  T
Q  100 gtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaaga 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  5342654 gtggaacaccaccccctctgtttaggattcgagacgatgtcaccctctccgggttgaaggatgaactggatcaaatcaactgtcaactcaaccacaaaga 5342753  T
Q  200 tatgaggagggtggtc 215  Q
     | |||||||||||||    
T  5342754 cacgaggagggtggtc 5342769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 227
Target Start/End: Original strand, 41614837 - 41615062
Alignment:
Q  3 tccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaa-catggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggt 101  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  41614837 tccctgttttcattacaattaaactacaccaggaaaaaaaatcatggaattccctggccttgatccgaataccaagctagcggcaatctactacaacggt 41614936  T
Q  102 ggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  41614937 ggaacaccaccccatctgtttaggattcacaacgatgtcaccctctccgggatgaaggatgagctggatcaaatcaaccgtcaactcaaccacaaagaca 41615036  T
Q  202 tgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
      |||||||||||| | |||||||||    
T  41615037 caaggagggtggtcggtgttgaatat 41615062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 215
Target Start/End: Original strand, 31470687 - 31470861
Alignment:
Q  41 caacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtc 140  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||    
T  31470687 caacatggaattcactggctttgatctgaaccccaagctatcggcagtcttctacaacggtggaacaccaccccaactgtttaggattcgcaacgatgtc 31470786  T
Q  141 accctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagatatgaggagggtggtc 215  Q
    |||||||||  ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  31470787 accctctccgagctgaaggatgatgtggatcaaatcaaccgtcaactcaaccgcaaagacacgaggagggtggtc 31470861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27950153 - 27949928
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    ||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||| | |||||||||| ||  ||||||||||||||| ||  ||||  || ||||||||||||     
T  27950153 ggtccatgttttcattacaagtaaactacaccagaaaaaa-atcatggaattctctaactttgatccgaacacgaaactagcgacaatctactacaacga 27950055  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  27950054 gggaaaaccaccccatctgtttaggattcgcaacgatgtcaccctttccgtgctgaaggatcagctggatcaaatcaaccgtcaactcaactacagagac 27949955  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | ||||| || |||| | |||||||||    
T  27949954 acgaggatggcggtcggtgttgaatat 27949928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 213
Target Start/End: Original strand, 8241589 - 8241741
Alignment:
Q  61 ttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaagga 160  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| | | || |||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||| |||| |||||||    
T  8241589 ttgatccgaacaccaagttagctgcattttactacaacagggaaaaaccaccccacatgtttaggattcacactgatgtcaccctctacaggttgaagga 8241688  T
Q  161 tgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagatatgaggagggtgg 213  Q
    | | ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||||| |||||    
T  8241689 tcatctggatcaaatcaaccgtcaactcaatcacagagacacgaggatggtgg 8241741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 201
Target Start/End: Original strand, 27688870 - 27689003
Alignment:
Q  68 gaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctg 167  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||| |   | ||||||||||||||||  |||||||| ||||     
T  27688870 gaacaccaagctagctgcagtttactacaacgggggaaaaccatcccacctgtttaggatttgcactcatgtcaccctctccagattgaaggatcagctc 27688969  T
Q  168 gatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagata 201  Q
    |||||||| ||||  |||||||| |||| |||||    
T  27688970 gatcaaataaaccaccaactcaagcacatagata 27689003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 213
Target Start/End: Original strand, 10133539 - 10133618
Alignment:
Q  134 tgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagatatgaggagggtgg 213  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  10133539 tgatgtcaccatctccaggttgaaggatcagctggatcaaatcaaccgccaactcaaccacaaagacacgcggagggtgg 10133618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 201
Target Start/End: Original strand, 22416198 - 22416338
Alignment:
Q  61 ttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaagga 160  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||  | |||| |||||  |||||||| | ||||| |  ||||||||| |||| | || ||||||     
T  22416198 ttgatccgaacaccaagctagctgcaatttactacaataggggaaaaccacttcatctgttcatgattcaaactgatgtcacgctcttcgggttgaaggg 22416297  T
Q  161 tgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagata 201  Q
    ||| || |||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  22416298 tgaactagatcaaatcaaccatcaattcaaccacaaagata 22416338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28335939 - 28335811
Alignment:
Q  59 ctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaag 158  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||     | |||||||||||||| || ||||     
T  28335939 ctttgatctaaacaccaagctagctacagtttactacaacgggggaaaaccaccccatctgttcaggatttccactaatgtcaccctctccgggttgaaa 28335840  T
Q  159 gatgagctggatcaaattaaccgtcaact 187  Q
    | | || |||||||||| |||||||||||    
T  28335839 ggttagttggatcaaatcaaccgtcaact 28335811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28443850 - 28443698
Alignment:
Q  61 ttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaagga 160  Q
    |||||| ||| |||||| |||| ||| | |||| |||| | |||| |||||||| | | || |||||||    |||||||||| ||||  || |||||||    
T  28443850 ttgatctgaataccaagctagctgcaatttactgcaacaggggaaaaccacccctttttttcaggattcacactgatgtcaccttctctgggttgaagga 28443751  T
Q  161 tgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagatatgaggagggtgg 213  Q
    | ||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||| | | |||||||||    
T  28443750 tcagctggatcaaatcaaccaccaactcaaccacagagacacgcggagggtgg 28443698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 58
Target Start/End: Original strand, 1709770 - 1709821
Alignment:
Q  7 tgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctgg 58  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  1709770 tgttttcattacaattaaactacatcagacaaaaaatcatggaattccctgg 1709821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 23249043 - 23248945
Alignment:
Q  59 ctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaag 158  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || || | ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    |||||||||| ||||| || |||||    
T  23249043 ctttgatccaaacaccaagctagctgcggttttctacaacgggggaa-accaccccatctgttcaggattcccactgatgtcaccttctccgggttgaag 23248945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 180
Target Start/End: Original strand, 22909929 - 22910038
Alignment:
Q  70 acaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctgga 169  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||| || |||| |||||||||| | || |||||||   ||||||||||||||||| || |||||  | ||||| |    
T  22909929 acaccaagctagctgcagtttactacaatgg-ggaaaaccaccccatttcttcaggattcacaatgatgtcaccctctccgggttgaagagtcagctgaa 22910027  T
Q  170 tcaaattaacc 180  Q
    |||||| ||||    
T  22910028 tcaaatcaacc 22910038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27496668 - 27496580
Alignment:
Q  59 ctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctct 147  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||| | || |||||||| || | |||||||||| |||| || ||||   |||||||||||||||    
T  27496668 ctttgatccgaacgccaagctagctgcaatttattacaacggggggaaaccaccccatatgttcagaattcacaatgatgtcaccctct 27496580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 20)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 3939923 - 3940149
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3939923 ggtccctgttttcattacaattaaattacatcagacaaaaaaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcggcagtctactacaacgg 3940022  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  3940023 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagacgatatcaccctctccggactgaaggatgagctggatcaaatcaaccgtcaacacaaccacaaagac 3940122  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  3940123 acgaggagggtggtcagagttgaatat 3940149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 41973104 - 41973330
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  41973104 ggtccctgttttcattacaattaaactacatcagacaaaaaaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagctaactgcagtctactacaacgg 41973203  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  41973204 tggaacaccatctcatctgtttaagattcgagacgatgtcgccctctccgggttgaaggatgagctggatcaaatcaaccgtcaactcaaccacaaagac 41973303  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||    
T  41973304 atgaggagggtggttggagttgaatat 41973330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 44206185 - 44206411
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  44206185 ggtccctgttttcattacaagtaaactacatcagacaaaaaaacatggaattccctggctttgatcagaacaccaagctagcggcagtctactacaacgg 44206284  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||     
T  44206285 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagacgatgtcaccctctccgagctgaaggatgagctggatcaaatcaacaatcaactaaaccacaaagac 44206384  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  44206385 acgaggagggtggtcggagttgaatat 44206411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 47373244 - 47373469
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  47373244 ggtccctgttttcattacaattaaactacatcagacaaaaaaacatagaattccctgtctttgatctgaacaccaagctagcggcagtctactacaacgg 47373343  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  47373344 tggaacaccaccc-atctgtttaggattcgagacgatgtcaccctctccgggttgaaggatgagctggatcaaatcaaccgtcaactcaaccacaaagac 47373442  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  47373443 acgaggagggtggtcggagttgaatat 47373469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 49325790 - 49326016
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    ||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  49325790 ggtccttgttttcattacaagtaaactacatcagacaaaaaagcgtgaaattccctggctttgatccgaacaccaagctagcggcagtatactacaacgg 49325889  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  49325890 tggaacaccaccccatctgtttaggattcaagacgatgtcaccctctccgagcttaaggatgagctggatcaaatcaaccgtcaactcaaccacaaagac 49325989  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  49325990 acgaggagggtggtcggagttgaatat 49326016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 21449137 - 21449362
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    ||||||| || |||||| ||  |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21449137 ggtccctattttcattacaagcaaactacatcagacaaaaaaacaaggaattccctggctttgatctgaacaccaagttagcggcagtctactacaacgg 21449236  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  21449237 tgga-caccaccccatctgtttaggattcgagacgatgtcaccctctctgagctgaaggatgagatggatcaaatcaaccgacaactcaaccacaaagac 21449335  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  21449336 acgaggagggtggtcggagttgaatat 21449362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 8484901 - 8485127
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagac--aaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaac 98  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  8484901 ggtccctgttttcattacaagtaaactacatcagacctaaaaca-catggaatcccctggctttgatccgaacaccaagctagcggcagtctactacaac 8484999  T
Q  99 ggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaag 198  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  8485000 ggtggaacacaacca-atctgtttaggattcgagacgatgttaccctctctaggctgaaggatgagctggatcaagtcaaccgtcaactcaaccacaaag 8485098  T
Q  199 atatgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | | ||||||||||||| || ||||||||    
T  8485099 acacgaggagggtggtcggacttgaatat 8485127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 21978362 - 21978590
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctgg-ctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacg 99  Q
    |||||||||| |||||| || |||| ||||||||| |||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  21978362 ggtccctgttttcattacaagtaaagtacaccagaaaaaaaatcatggatttccctgggctttgatccgaacaccaagctagcggcagtcttctacaacg 21978461  T
Q  100 gtggaacaccaccccatctgtttaggat-tcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaag 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || | |  | ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  21978462 gtggaacaccaccctatctgtttagaatattgcaacgatgtcaccctctcccgactaaaggatgagctggatcaaatcaaccgtcaactcaaccgcagag 21978561  T
Q  199 atatgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | | ||||||||||||| | |||||||||    
T  21978562 acacgaggagggtggtcggtgttgaatat 21978590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 22000793 - 22001021
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctgg-ctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacg 99  Q
    |||||||||| |||||| || |||| ||||||||| |||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  22000793 ggtccctgttttcattacaagtaaagtacaccagaaaaaaaatcatggatttccctgggctttgatccgaacaccaagctagcggcagtcttctacaacg 22000892  T
Q  100 gtggaacaccaccccatctgtttaggat-tcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaag 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || | |  | ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  22000893 gtggaacaccaccctatctgtttagaatattgcaacgatgtcaccctctcccgactaaaggatgagctggatcaaatcaaccgtcaactcaaccgcagag 22000992  T
Q  199 atatgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | | ||||||||||||| | |||||||||    
T  22000993 acacgaggagggtggtcggtgttgaatat 22001021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 88 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 48063790 - 48063651
Alignment:
Q  88 tctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaact 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48063790 tctactacaacggtggaacaccatcccatctgtttaggattcgagacgatgtcaccctctccgagctgaaggatgagctggatcaaatcaaccgtcaact 48063691  T
Q  188 caaccacaaagatatgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    |||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  48063690 caaccacaaagacacgaggagggtgatcggagttgaatat 48063651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9332136 - 9331957
Alignment:
Q  48 gaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctct 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||    
T  9332136 gaattccctgactttgattcgaacaccaagctagcggaagtctactacaacggtggagaaccaccccatttgtttaggattcgcaacgatgtcaccctct 9332037  T
Q  148 ccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagatatgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||    
T  9332036 ccgggctgaaggaccagctggatcaaatcaaccgtcaactcaactacagagacacgaggagggtggtcggtgttgaatat 9331957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18877678 - 18877496
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaa-catggaattccctgg-ctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaac 98  Q
    ||||||| || |||||| || |||| ||||| ||| |||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18877678 ggtccctattttcattacaagtaaagtacactagaaaaaaaaatcatcgaattccctgggctttgatccgaacaccaagctagcggcagtctactacaac 18877579  T
Q  99 ggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccg 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  | ||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18877578 ggtggaacatcaccccatctgtttaggatttgcaacgatatcatcctctcccggctaaaggatgagctggatcaaatcaaccg 18877496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 22162976 - 22163104
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaa-catggaattccctgg-ctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaac 98  Q
    |||||||||| |||||| || |||| ||||| ||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  22162976 ggtccctgttttcattacaagtaaagtacacgagaaaaaaaaatcatggatttccctgggctttgatccgaacaccaagctagcggcagtctactacaat 22163075  T
Q  99 ggtggaacaccaccccatctgtttaggat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22163076 ggtggaacaccaccccatctgtttaggat 22163104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 48064999 - 48064910
Alignment:
Q  4 ccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctact 93  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  48064999 ccctgttttcattacaagtaaactacatcagacaaaaaaacatggaattccctagctttgatccgaacaccaagctagcggcagtctact 48064910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 213
Target Start/End: Original strand, 23333455 - 23333609
Alignment:
Q  59 ctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaag 158  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |  | |||||||||| ||||  |||| |    ||||||||||||||| ||| |||||    
T  23333455 ctttgatccaaacaccaaggtagctgcagtttactacaacggggagaaaccaccccatttgttcgggatgcccactgatgtcaccctctctaggttgaag 23333554  T
Q  159 gatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagatatgaggagggtgg 213  Q
      ||||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  23333555 agtgagctgaatcaaattaacctcgaactcaactacaaagatacgtggagggtgg 23333609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 195
Target Start/End: Original strand, 25213228 - 25213363
Alignment:
Q  61 ttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacg-gtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaagg 159  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| || | ||||| | || | |||||||||| |||| ||||||||    ||||||||||||||| |||||||||    
T  25213228 ttgatccgaacaccaagctagctgcagtttaattcaacgtgggggaaaccaccccatatgttcaggattcgcacggatgtcaccctctccgggctgaagg 25213327  T
Q  160 atgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccaca 195  Q
     | ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||    
T  25213328 gtcagctaaatcaaatcaaccaccaactcaaccaca 25213363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 180
Target Start/End: Original strand, 24628814 - 24628934
Alignment:
Q  59 ctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaag 158  Q
    ||||||||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||| | || |||||||||| |||||||   ||||||||||||||| | || |||||    
T  24628814 ctttgatccaaacaccaagctagttgcagtttactacaacgggggaaaatca-cccatctgttcaggattcacaatgatgtcaccctcttcgggttgaag 24628912  T
Q  159 gatgagctggatcaaattaacc 180  Q
      | ||||| ||||||| ||||    
T  24628913 agtcagctgaatcaaatcaacc 24628934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 27025371 - 27025283
Alignment:
Q  59 ctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctc 148  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  | |||| | ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  27025371 ctttgatccaaacaccaagttagctgcagtttaatacaataggggaa-atcaccccatctgttcaggattcgcactgatgtcaccctctc 27025283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 16478701 - 16478655
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatg 47  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16478701 ggtccctgttttcattacaattaaactacatcagacaaaaaaacatg 16478655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 180
Target Start/End: Original strand, 51327445 - 51327553
Alignment:
Q  71 caccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggat 170  Q
    ||||||| |||| || || ||||||||||| |||| |||| ||||| |||| |||||| |  ||||||||||||||||| || |||||  | ||||| ||    
T  51327445 caccaagctagctgcggtttactacaacgg-ggaaaaccatcccatatgttcaggatttgcaatgatgtcaccctctccgggttgaagagtcagctgaat 51327543  T
Q  171 caaattaacc 180  Q
    ||||| ||||    
T  51327544 caaatcaacc 51327553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13722155 - 13721929
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  13722155 ggtccctgttttcattacaagtaaactacatcagacaaaaaaacatggaattccctgactttgatccgaacaccaaactagcagcaatctactacaacgg 13722056  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  13722055 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccgagctgaaggataagctggatcaaatcaaccgtcaactcaaccacaaagac 13721956  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  13721955 acgaggagggtggtcggagttgaatat 13721929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 52917965 - 52918191
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    ||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  52917965 ggtccttgttttcattacaagtaaactacatcagacaaaaaaacatggaattccctggctttgattcgaacaccaagatagcgacagtctactacaacgg 52918064  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  52918065 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagaggatgtcaccctctccgggctgaaggatgagctggatcaaatcaaccgtcaactcaaccacaaagac 52918164  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  52918165 acgaggagggtggtcggagttgaatat 52918191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 211
Target Start/End: Original strand, 40760880 - 40761079
Alignment:
Q  12 tcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccac 111  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40760880 tcattacaagtaaactacatcagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagctagcggcagtctactacaacggtggaacaccac 40760979  T
Q  112 cccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagatatgaggagggt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  40760980 cccatctgtttaggattcgagacaatgtcaccctctccgggctgaaggatgatttggatcaaatcaaccgtcaactcaaccacaaagacacgaggagggt 40761079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 45657994 - 45658221
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    |||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  45657994 ggtccctgtgttcattacaagtaaactacatcagacaaaaaaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagctagcggcagtctactacaacgg 45658093  T
Q  101 tggaacacca-ccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaaga 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  45658094 tggaacaccacccccatctgtttaggattcgagacgatgtcaccctctcctggctgaaggatgagctggatcaaatcaaccgtcaactcaaccacagaga 45658193  T
Q  200 tatgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
     |    |||||||||| |||||||||||    
T  45658194 cacatagagggtggtcggagttgaatat 45658221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 38989176 - 38989402
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    ||||||| || |||||  || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  38989176 ggtccctattttcattgcaagtaaactacatcagacaaaaaaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagctagcggcagtctactacaacgg 38989275  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||   || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  38989276 tggaacaccaccccatctatctaggattaacgacgatgtaaccctctccgggctgaaggatgagctggatcaaatcaaccgtcaactcaaccacaaagac 38989375  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  38989376 acgaggagggtggtcggagttgaatat 38989402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 55610167 - 55610386
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  55610167 ggtccctgttttcattacaattaaactacatcagacaaaaaaacatggaattccctgtctttgatccgaacaccaagctagcggcagtctactacaacgg 55610266  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||       ||||||||||||||||||     
T  55610267 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagacgatgtcaccctctccgggttaaaggatgagctgaatcaaa-------tcaactcaaccacaaagac 55610359  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  55610360 acgaggagggtggtcggagttgaatat 55610386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 40691453 - 40691680
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaa-catggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacg 99  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||    
T  40691453 ggtctctgttttcattacaagtaaactacatcagacaaaaaaaacatggaattccttggctttgatccgaacaccaagctagcgacaatctactacaacg 40691552  T
Q  100 gtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaaga 199  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40691553 gtgtaacatcaccccatctgtttaggattcgagacgatgtcaccctctccaagctgaaggatgagctgaatcaaatcaaccgtcaactcaaccacaaaga 40691652  T
Q  200 tatgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||    
T  40691653 cacgaggagggtggtcggagttgaatat 40691680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11649205 - 11649115
Alignment:
Q  137 tgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagatatgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  11649205 tgtcaccctcttcgggctgaaggatgagctggatcaaatcaactgtcaactcaaccacagagacatgaggagggtggtcggtgttgaatat 11649115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 53270919 - 53270869
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaat 51  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  53270919 ggtccctgttttcattacaagtaaactacaccagacaaaaaatcatggaat 53270869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 13)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33851725 - 33851499
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  33851725 ggtccttgttttcattacaattaaactacatcagacaaaaaaacatggaataccctggccttgatcctaacaccaagctagcggcagtctactacaacgg 33851626  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  33851625 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagacgatgtcaccctctccgagctgaaggatgagctggatcaaatcaaccgtcaactcaaccacaaagac 33851526  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  33851525 acgaggagggtggtcggagttgaatat 33851499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Original strand, 29330755 - 29330977
Alignment:
Q  5 cctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtgga 104  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  29330755 cctgttttcattacaattaaactacatcagacaaaaaaacatggaattctctagctttgatccgaacaccaagctagcagcagtctactacagcggtgga 29330854  T
Q  105 acaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagatatga 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| | ||    
T  29330855 acaccaccccatctgtttaggattcgagacgatgccaccctctccgggctgaaggatgagctggatcaaatcaaccatcaactcaatcacaaagacacga 29330954  T
Q  205 ggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  29330955 ggagggtggtcggagttgaatat 29330977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 110348 - 110121
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaaca-tggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacg 99  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||| | ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||    
T  110348 ggtccctgttttcattataagtaaactagatcagacaaaaaaaaaatggaattccctggctttgatccgaacaccaagctagcggcggtctattacaacg 110249  T
Q  100 gtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaaga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  110248 gtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagacgatgtcaccctctccgggctgaaggatgagctggatcaaatcaaccgtcaactcaaccacaaaga 110149  T
Q  200 tatgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||    
T  110148 cacgaggagggtggtcggagttgaatat 110121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 35583536 - 35583763
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaa-catggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacg 99  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  35583536 ggtccctgatttcattataattaaactacatcagacaaaaaaaacatggaattccctagctttgatccgaacaccaagctagcggcagtctactacaacg 35583635  T
Q  100 gtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaaga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35583636 gtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagacgatgtcaccctctccggactgaaggatgagttggatcaaatcaactgtcaactcaaccacaaaga 35583735  T
Q  200 tatgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||    
T  35583736 caagaggagggtggtcggagttgaatat 35583763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 15031079 - 15031305
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    ||||||| || |||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  15031079 ggtccctattttcattacaagtaaactacatcagacaaaaaaacatggaattccctggctttgatctgaacaccaagctagcggcagtctactacaacgg 15031178  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  15031179 tggaacaccaacccatctgtttaggattcgagacgatgtcaccctctccgagatgaaggatgagctgaatcaaatcaactgtcaactcaaccacaaagac 15031278  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  15031279 acgaggagggtggtcagagttgaatat 15031305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38000280 - 38000058
Alignment:
Q  5 cctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtgga 104  Q
    |||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  38000280 cctgttttcattactagtaaactacatcagacaaaaaaatatggaattccctggctttgatctgaacaccaagctagcggcaatctactacaacggtgga 38000181  T
Q  105 acaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagatatga 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| | ||    
T  38000180 acaccaccccatttgtttaggattcgagacgatgtcaccctctccgggctgaaggatgagctggatcaaatcaaccgtcaactcgaacacaaagacacga 38000081  T
Q  205 ggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | ||||||||  |||||||||||    
T  38000080 gcagggtggttggagttgaatat 38000058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41792801 - 41792594
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    ||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||     
T  41792801 ggtccatgttttcattacaagtaaactacatcagacaaaaaaacatgaaattccctg-ctttgatccgaacaccaagctagcggcaatctactacaacga 41792703  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  41792702 tggaacaccaccccatatgtttaggattcgagacgatgtcaccctcttcgggctgaaggatgagctagatcaaatcaaccgtcaactcaaccacaaagac 41792603  T
Q  201 atgaggagg 209  Q
    | |||||||    
T  41792602 acgaggagg 41792594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 7253746 - 7253924
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  7253746 ggtccctgttttcattacaagtaaactacatcagacaaaaatac-tggaattccctggctttgattcgaacaccaagctagcggcagtctactacaacgg 7253844  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaacc 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7253845 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagacgatgtcaccctcttcgggctgaaggatgagttggatcaaattaacc 7253924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 227
Target Start/End: Original strand, 43747858 - 43747916
Alignment:
Q  169 atcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagatatgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||    
T  43747858 atcaaatcaaccgtcaactcaaccacaaagacacgaggagggtggtcggggttgaatat 43747916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1380390 - 1380250
Alignment:
Q  59 ctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaag 158  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||  || | |||| ||||| |||| | |||||    |||| ||||||||||| || |||||    
T  1380390 ctttgatccgaacaccaagctagccgtagtttactacaacgaggggaaaccatcccatttgttcaagattcccactgatctcaccctctccgggttgaag 1380291  T
Q  159 gatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaaga 199  Q
      |  |||| ||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  1380290 agtcggctgaatcaaattaacctcaaactcaactacaaaga 1380250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1386494 - 1386354
Alignment:
Q  59 ctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaag 158  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||  || | |||| ||||| |||| | |||||    |||| ||||||||||| || |||||    
T  1386494 ctttgatccgaacaccaagctagccgtagtttactacaacgaggggaaaccatcccatttgttcaagattcccactgatctcaccctctccgggttgaag 1386395  T
Q  159 gatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaaga 199  Q
      |  |||| ||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  1386394 agtcggctgaatcaaattaacctcaaactcaactacaaaga 1386354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 1853925 - 1853837
Alignment:
Q  59 ctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctct 147  Q
    ||||||| | ||||||||| || | ||||| |||| ||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||    
T  1853925 ctttgattcaaacaccaagctacctgcagtttactgcaacgggagaaaaccaccccatctgttcaggattcccactgatgtcaccctct 1853837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 195
Target Start/End: Original strand, 1905589 - 1905725
Alignment:
Q  61 ttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaac-ggtggaacacca-ccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaag 158  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| || |||| |||| |||||||| ||| ||||||    | ||||||||||||   || |||||    
T  1905589 ttgatccgaaaaccaagctagctgcagtttactacaacggggggaaaaccacccccatctatttgggattcacactaatgtcaccctctttgggttgaag 1905688  T
Q  159 gatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccaca 195  Q
    | | |||||||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  1905689 ggtcagctggatcaaatataccgccaacacaaccaca 1905725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24832403 - 24832177
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||  | ||||||||||||| |    
T  24832403 ggtccctgttttcattacaattaaactacattagacaaaacaacatggaattccctggctttgatctaaacaccaagctagaggtagtctactacaacag 24832304  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  24832303 tggaacagcaccccatctgtttaggattcgagacaatgtcaccctctccgggctgaaggatgagctggatcaaatcaaccgtcaactcaaccacaaagac 24832204  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24832203 atgaggagggtggtcggagttgaatat 24832177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 82 - 227
Target Start/End: Original strand, 10290 - 10435
Alignment:
Q  82 cagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  10290 cagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctattttggattcgagacgatgtcaccctctccgagctgaaggatgagctggatcaaatcaacca 10389  T
Q  182 tcaactcaaccacaaagatatgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  10390 tcaactcaaccacaaagacacgaggagggtggtcggagttgaatat 10435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41836194 - 41836104
Alignment:
Q  137 tgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagatatgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  41836194 tgtcaccctcttcgggctgaaggatgagctggatcaaatcaactgtcaactcaaccacagagacatgaggagggtggtcggtgttgaatat 41836104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 230
Target Start/End: Original strand, 16795989 - 16796158
Alignment:
Q  61 ttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaagga 160  Q
    |||||||||| |||||| |||   |||| ||||| ||| | |||| || | ||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||  | |||||||    
T  16795989 ttgatccgaataccaagctagttacagtttactataacaggggaaaactatcccatctattcaggattcgcattgatgtcaccctctccgagttgaagga 16796088  T
Q  161 tgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagatatgaggagggtggtcagagttgaatattga 230  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||    
T  16796089 ttagctggatcaaatcaactgtcaactcaaccacagagacatgaggagggtggacggtgttgagtattga 16796158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12191535 - 12191384
Alignment:
Q  61 ttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaagga 160  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||  | |||| |||||  ||| |||| ||||||||   |||||||||| ||||| || | || ||    
T  12191535 ttgatccgaacaccaagctagctgcagtttactacaatag-ggaaaaccacttcatatgttcaggattcgcactgatgtcaccttctccgggttaaatga 12191437  T
Q  161 tgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagatatgaggagggtgg 213  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  12191436 tcagctggatcaaatcaaccgtcaattcaaccacaaagacacaaggagggtgg 12191384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12435963 - 12435812
Alignment:
Q  61 ttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaagga 160  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||  | |||| |||||  ||| |||| ||||||||   |||||||||| ||||| || | || ||    
T  12435963 ttgatccgaacaccaagctagctgcagtttactacaatag-ggaaaaccacttcatatgttcaggattcgcactgatgtcaccttctccgggttaaatga 12435865  T
Q  161 tgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagatatgaggagggtgg 213  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  12435864 tcagctggatcaaatcaaccgtcaattcaaccacaaagacacaaggagggtgg 12435812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 14194313 - 14194245
Alignment:
Q  61 ttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattc 129  Q
    ||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14194313 ttgattcgaacaccaagctagttgcagtttactacaacgggggaaaaccaccccatctgttcaggattc 14194245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 5462857 - 5463083
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  5462857 ggtccctgttttcattacaagtaaactacatcagacaaaaaaacatggaattccttggctttgatccaaacaccaaactagcggcagtctactacaacgg 5462956  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  5462957 tggaacaccaccccatctgtttaggattctagacgatgtcaccctctccgggctgaaggatgagctggatcgaattaaccgtcaactcaaccacaaagac 5463056  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | ||||||||||||| |||| ||||||    
T  5463057 acgaggagggtggtcggagtggaatat 5463083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 15111824 - 15112053
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||  |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  15111824 ggtccctgttttcattacaagtaaactacattagacaaaaaatcatggaattcccaggctttgatccgaacaccaagctagcggtagtctactacaacgg 15111923  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  15111924 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagacgatgtcaccctctccgggctgaaggatgagttagatcaaatcaactgtcaactcaaccacagagac 15112023  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatattga 230  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15112024 acgaggagggtggtcagagtttaatattga 15112053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18964984 - 18964774
Alignment:
Q  3 tccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtg 102  Q
    |||||||| |||||| || ||| |||||||| |  ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  18964984 tccctgttttcattacaagtaa-ctacaccataataaaaatcatggaattccctgactttgatccgaacaccaagatagctgcagtctactacaacgggg 18964886  T
Q  103 gaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagatat 202  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  18964885 gaaaaccacccaatctgtttaggatttgcgacgatgtcaccctctccgggatgaaggatgagttggatcaaatcaaccgtcaactcaaccacaaagacag 18964786  T
Q  203 gaggagggtggt 214  Q
    ||||||||||||    
T  18964785 gaggagggtggt 18964774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34950153 - 34949940
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaa-catggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacg 99  Q
    |||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  34950153 ggtccctgttttcattc-aagtaaactacaccagaaaaaaaaaacatggaattctatggctttgatccgaacaccaagctagcgacagtctactacaacg 34950055  T
Q  100 gtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaaga 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |  | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  34950054 gtggaacatcaccccatctgtttaggatttgcaacgatctcaccttctccgggctgaaggatgagctggatcaaatcaatcgtcaactcaaccacataga 34949955  T
Q  200 tatgaggagggtggt 214  Q
     | ||| ||||||||    
T  34949954 cacgagtagggtggt 34949940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 195
Target Start/End: Original strand, 5936899 - 5937008
Alignment:
Q  86 agtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  5936899 agtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcacaacgatgtcaccctctccgggctgaaggatgagctggatcaaatcaatcgtcaa 5936998  T
Q  186 ctcaaccaca 195  Q
    ||||||||||    
T  5936999 ctcaaccaca 5937008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 195
Target Start/End: Original strand, 25630519 - 25630654
Alignment:
Q  60 tttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaagg 159  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||| || |||| | |||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25630519 tttgatccgaacaccaagctagctgcagtttgctacaatggaggaatatcaccccatttgtctaggattcgcgctgatgtcaccctctccaggttgaagg 25630618  T
Q  160 atgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccaca 195  Q
     |  |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25630619 gtcggctggatcaaatcaactgtcaactcaaccaca 25630654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 59 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2734765 - 2734633
Alignment:
Q  59 ctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg-tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaa 157  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| || ||||| || |  ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  2734765 ctttgatccgaaaaccaaggtagctgcagtttactacaatgggtggaaaac-ataccatctgttcaggattcgtactgatgtcaccctctccaggttgaa 2734667  T
Q  158 ggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaac 191  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2734666 gggtcagctggatcaaatcaaccgtcaactcaac 2734633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 190
Target Start/End: Original strand, 37126475 - 37126605
Alignment:
Q  59 ctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaag 158  Q
    ||||||||||||||||||| | || | | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| || |||||    
T  37126475 ctttgatccgaacaccaagcttgctgaaatttactacaacgg-ggaaaaccaccccatctgttcaggattcgtactgatgtcaccctctccgggttgaag 37126573  T
Q  159 gatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaa 190  Q
    | | || | |||||||| || |||||||||||    
T  37126574 ggtcagatagatcaaatcaatcgtcaactcaa 37126605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33946419 - 33946281
Alignment:
Q  60 tttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaagg 159  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||| | |||| |||| | || | |||||||||| |||| |||||| |   ||||||||||||||||||  ||||||    
T  33946419 tttgatccgaacatcaagctagctgcaatttactgcaacaggggga-accaccccatatgttcaggattggcattgatgtcaccctctccagattgaagg 33946321  T
Q  160 atgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaaga 199  Q
     | ||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||    
T  33946320 gtcagctggatcaaatcaaccgccaattcaactacaaaga 33946281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 5936303 - 5936385
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaa-catggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagc 82  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5936303 ggtccctgttttcattacaagtaaactacaccagaaaaaaaaatcatggaattcattggctttgatccaaacaccaagctagc 5936385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Original strand, 42014668 - 42014797
Alignment:
Q  84 gcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtc 183  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||  ||| |||| || ||| || | ||||||||||| ||||||||  |||| ||| |  |||||||||| |||||||    
T  42014668 gcagtttactacaacggaggaatactgccctatcttttcagggtttgggatgatgtcacgctctccagtttgaaagataaattggatcaaatcaaccgtc 42014767  T
Q  184 aactcaaccacaaagatatgaggagggtgg 213  Q
    |||||| ||||| ||| |  ||||||||||    
T  42014768 aactcacccacagagacacaaggagggtgg 42014797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4853018 - 4852792
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  4853018 ggtccctgttttcattacaagtaaactacatcagacaaaaaaacatggaattccctggctttgacccgaacaccaagctagcggcagtctactagaacgg 4852919  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||     
T  4852918 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagacgatgtcaccctctccgagctgaaggatgagctggatcaaatcaactgtcaactcaaccacagagac 4852819  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||    
T  4852818 acgaggagggtggttagagttgaatat 4852792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 10221718 - 10221944
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||  |    
T  10221718 ggtccctgttttcattacaattaaactacatcagacaaaaaaacatgaaattccctggctttgatccgaacaccaagctagcggctgtctattacaattg 10221817  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  10221818 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagacgatgtcaccctctccgggctgaaggatgagctggatcaaatcaaccgtcaactcaaccacaaagac 10221917  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||    
T  10221918 acgaggagggtggtcggggttgaatat 10221944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 10311171 - 10311398
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaa-catggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacg 99  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||| |  |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  10311171 ggtccctgttttcattacaagtaaactatattagacaaaaaaaacatggaattccctagctttgatccgaacaccaagctagcggcagtctactacaact 10311270  T
Q  100 gtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaaga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10311271 gtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccgagctgaaggatgagctggatcaaatcaaccgtcaactcaaccacaaaga 10311370  T
Q  200 tatgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||    
T  10311371 cacgaggagggtggtcggagttgaatat 10311398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 5748329 - 5748558
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    ||||||| || |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  5748329 ggtccctattttcattacaagtaaactacatcagagaaaaaaacatggaattacctgactttgatccgaacaccaagctagtggcagtctactacaacgg 5748428  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  5748429 tggaacaccaccgcatctgtttaggattcgagacgatgtcaccctcttcgagctgaaggaggagctggatcaaatcaaccgtcaattcaaccacaaagac 5748528  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatattga 230  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5748529 acgaggagggtggttagagttgaatattga 5748558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18278175 - 18277948
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagac-aaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacg 99  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18278175 ggtccctgttttcattacaagtaaactacatcagaccaaaaaaaaatggaattccctggctttgatccgaacaccaagatagcggcagtctactacaacg 18278076  T
Q  100 gtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaaga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  | |||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18278075 gtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagactatgtcaccctctccgtgttgaaggattattttgatcaaatcaaccgtcaactcaaccacaaaga 18277976  T
Q  200 tatgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||    
T  18277975 cacgaggagggtggtcggagttgaatat 18277948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 7198510 - 7198735
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  7198510 ggtccctgttttcattacaagtaaactacatcagacgaaaaaacatggaattcc-tggctttgatccgaacaccaagctagcggcagtatactacaacgg 7198608  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  7198609 tggaacactaccccatctgtttaggattggagacgatgtcaccatctccgagctgaaggacgagagggatcaaatcaaccgtcaactcaactacaaagac 7198708  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  7198709 acgaggagggtggtcagagttgaatat 7198735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 39599869 - 39599643
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  39599869 ggtcactgttttcattacaagtaaactacatcgaacaaaaaaacatggaattccctggctttgatatgaacaccaagctagcggcagtctactacaacgg 39599770  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  39599769 tggaacaccaccccgtttgtttaggatttgagacaatgtcaccctctccgagctgaaggatgagctggatcaaatcaaccgtcaactcaaccacagagac 39599670  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  39599669 acgaggagggtggtcggagttgaatat 39599643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 50890665 - 50890440
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    |||| ||||| |||||| || |||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||    
T  50890665 ggtcactgttttcattacaagtaaactacaccagaaaaaa-atcatggaattccctgactttgatccgaacaccaagctagcagcagtatactaaaatgg 50890567  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  50890566 gggaaaaccaccccatatgtttaggattcgcaacgatgtcaccctcactgggctgaaggatgatctggatcaaatcaaccgtcaactcaaccacagagac 50890467  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||    
T  50890466 acgaggagggtggtctgtgttgaatat 50890440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 227
Target Start/End: Original strand, 17384421 - 17384604
Alignment:
Q  44 catggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcacc 143  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||    
T  17384421 catggaattccctggctttgacccgaacaccaagctagtgggagtctactacaacggtgaaacaccaccccatctgtttaggatttgcaacgatgtcacc 17384520  T
Q  144 ctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagatatgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||    
T  17384521 ctctcagggctgaagggtgagctggatcaaatcaatcgtcaaatcaaccacagagacacgaggagggtggtcggtgttgaatat 17384604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 30516813 - 30517039
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    |||||||||| | || | || ||||||||||  || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||    
T  30516813 ggtccctgttttaatcacaagtaaactacacttgaaaaaaaatcatggaattccctggctttgatccgaacaccaagctagcggcagtctactacactgg 30516912  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
     || | || ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||     
T  30516913 ggggaaacaaccccatctgtttaggattcacaacgatgtcaccctctccaggctaaaggatcagctggatcaaatcaactgccaactcaaccacagagac 30517012  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | ||||||||||||  | |||||||||    
T  30517013 acgaggagggtggtatgtgttgaatat 30517039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 227
Target Start/End: Original strand, 7563139 - 7563262
Alignment:
Q  104 aacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagatatg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |    
T  7563139 aacatcaccccatctgtttaggattcacaacgatgtcaccctctccgggctgaaggatgagctggatcaaatcaaccgtcaactcaaccacagagacacg 7563238  T
Q  204 aggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    |||||||||||| | |||||||||    
T  7563239 aggagggtggtcggtgttgaatat 7563262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 41368154 - 41368066
Alignment:
Q  59 ctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctc 148  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| | |||| |||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||    
T  41368154 ctttgatccgaacaccaagctagccgtagtttactacaacaggggaa-accaccccatctattcatgattcgcaatgatgtcaccctctc 41368066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15500019 - 15499960
Alignment:
Q  154 tgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagatatgaggagggtgg 213  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  15500019 tgaaggattagctgcatcaaatcaaccgtcaactcaaccacaaagacactaggagggtgg 15499960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 208
Target Start/End: Original strand, 48181095 - 48181242
Alignment:
Q  61 ttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaagga 160  Q
    ||||||| |||||||||  ||| ||| | ||||||||||| | || |||||||||| |||| | |||| |   ||||||||  ||||| ||| |||||||    
T  48181095 ttgatccaaacaccaagccagctgcaatttactacaacggggaaaaaccaccccatttgttcaagatttgcactgatgtcatgctctctaggttgaagga 48181194  T
Q  161 tgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagatatgaggag 208  Q
    | || ||||||||||  |||||||||||||| || |||| || |||||    
T  48181195 tcagttggatcaaatctaccgtcaactcaacaacgaagacataaggag 48181242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11355627 - 11355591
Alignment:
Q  165 ctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagata 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11355627 ctggatcaaatcaaccgtcaactcaaccacagagata 11355591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17145 - 16925
Alignment:
Q  7 tgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaac 106  Q
    |||| |||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17145 tgttttcattacaagtaaactacatcagacaaaaaaacatggaatttcttggctttgatccgaacaccaagctagcggcagtctactacaacggtggaac 17046  T
Q  107 accaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagatatgagg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  17045 accaccccatctgtttaggattcgagacgatgtcaccctctccgggctaaaggatgagctggatcaaatcaaccttcaactcaaccacaaagacacgagg 16946  T
Q  207 agggtggtcagagttgaatat 227  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  16945 agggtggtcggagttgaatat 16925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29436573 - 29436346
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccc-tggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacg 99  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||| |||  |||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29436573 ggtccctgttttcattacaagtaaactacatcaggaaaaaaaatatggaattcccctggctttgatccaaacaccaagctagcggcagtctactacaacg 29436474  T
Q  100 gtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaaga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  29436473 gtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagacgatgtcaccctctccgagctgaaggatgagttggatcaaagcaaccgtcaactcaaccacaaaca 29436374  T
Q  200 tatgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||    
T  29436373 cacgaggagggtggtcggagttgaatat 29436346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13038569 - 13038343
Alignment:
Q  1 ggtccctgttctcattagaattaaactacaccagacaaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacgg 100  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  13038569 ggtccttgttttcattacaattaaactacattagataaaaagacatggaattccccgactttgatccgaacaccaagctagcggcagtatactacaacgg 13038470  T
Q  101 tggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagat 200  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  13038469 tggaacatcaccctgtctgtttaggattcgagacgatgtcaccctctccgggctgaaggatgagctggatcaattcaaccgtcaactcaaccacaaagac 13038370  T
Q  201 atgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||    
T  13038369 acgaggagggtggtcggagttgaatat 13038343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34950497 - 34950307
Alignment:
Q  37 aaaacaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatga 136  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  34950497 aaaaaaacatggaattccctggctttgatccgaacaccaagctagcggaagtctactacaacggtggaacaccaccccatctatttaggattcgagacga 34950398  T
Q  137 tgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaagatatgaggagggtggtcagagttgaatat 227  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  34950397 tgtcaccctctccgagctaaatgatgagctggatcaaatcaaccgtcaactcaaccacaaagacacgaggagggtggtcggagttgaatat 34950307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 195
Target Start/End: Original strand, 12303850 - 12304023
Alignment:
Q  22 taaactacaccagacaaaacaa-catggaattccctggctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgt 120  Q
    |||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| | ||| | |||| ||||||||||||||    
T  12303850 taaactacaccagaaaaaaaaatcatgaaattccctggctttgatccaaacaccaatctagcggcagtctacaataacaggggaaaaccaccccatctgt 12303949  T
Q  121 ttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatgagctggatcaaattaaccgtcaactcaaccaca 195  Q
    ||||||||||  | || |||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12303950 ttaggattcgcaacgacgtcactttct-cgggctgaaggatgagctggatcaaatcaaccgtcaactcaaccaca 12304023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 193
Target Start/End: Original strand, 20386618 - 20386749
Alignment:
Q  61 ttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaagga 160  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||  |||||||||  ||| ||||||||||| | || |||| ||    ||||||||| |||||| || |||||||    
T  20386618 ttgatctgaacaccaagctagctgcagtgcactacaacgaggga-caccaccccatgtattcaggactctcactgatgtcacgctctccgggttgaagga 20386716  T
Q  161 tgagctggatcaaattaaccgtcaactcaacca 193  Q
    | |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20386717 tcagctagatcaaatcaaccgtcaactcaacca 20386749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17521307 - 17521172
Alignment:
Q  63 gatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaaggatg 162  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||| |||| | | |||| |     
T  17521307 gatccaaacaccaagctagctgcaatttactacaacgggggaa-accaccccatctgttcaggatttgcattgatgtcaccctatccaagttaaagggtc 17521209  T
Q  163 agctggatcaaattaaccgtcaactcaaccacaaaga 199  Q
    ||||||| ||  | || || ||||||||| |||||||    
T  17521208 agctggaacatgtcaatcgccaactcaactacaaaga 17521172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 159
Target Start/End: Original strand, 425832 - 425922
Alignment:
Q  69 aacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacaccaccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaagg 159  Q
    ||||||||| |||| | ||| || |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||| || ||||||    
T  425832 aacaccaagctagctgtagtttaatacaacgggggaaaaccaccccatctgttcaggattcccactgatgtcaccctctccgggttgaagg 425922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 158
Target Start/End: Original strand, 36830 - 36929
Alignment:
Q  59 ctttgatccgaacaccaagttagcagcagtctactacaacggtggaacacca-ccccatctgtttaggattcgagatgatgtcaccctctccaggctgaa 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||  | |||| |||| |||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||| || ||||    
T  36830 ctttgatccgaacaccaagctagccgtagtttactacaataggggaa-accatccccatctattcatgattcgcaatgatgtcaccctctccgggttgaa 36928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University