View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8206A_low_59 (Length: 309)

Name: NF8206A_low_59
Description: NF8206A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8206A_low_59
NF8206A_low_59
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (1-309)||(29123435-29123744)
chr4 (1-309)||(22340496-22340804)
chr4 (1-309)||(4303199-4303507)
chr4 (6-309)||(18116384-18116687)
chr4 (1-309)||(8110835-8111143)
chr4 (6-309)||(36279205-36279508)
chr4 (1-173)||(17826778-17826950)
chr4 (6-309)||(23158152-23158455)
chr4 (78-309)||(15705634-15705865)
chr4 (1-308)||(3621420-3621727)
chr4 (6-309)||(51872602-51872905)
chr4 (6-304)||(12915713-12916011)
chr4 (184-307)||(17838714-17838837)
chr4 (3-309)||(15649066-15649372)
chr4 (22-103)||(50693772-50693853)
chr4 (22-103)||(36951324-36951405)
chr4 (167-309)||(6614197-6614339)
chr4 (22-103)||(17469142-17469223)
chr4 (38-109)||(24059760-24059831)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (3-309)||(23603180-23603485)
chr3 (9-309)||(42462637-42462937)
chr3 (1-308)||(8595175-8595482)
chr3 (1-309)||(48547471-48547779)
chr3 (6-309)||(23571623-23571926)
chr3 (6-309)||(3514601-3514904)
chr3 (3-309)||(17153806-17154112)
chr3 (6-298)||(9818988-9819280)
chr3 (51-309)||(53152132-53152390)
chr3 (6-304)||(42459305-42459592)
chr3 (22-103)||(16664099-16664180)
chr3 (22-103)||(52196409-52196490)
chr3 (30-103)||(39632858-39632931)
chr3 (39-103)||(10754186-10754250)
chr3 (161-256)||(39632989-39633084)
chr3 (219-309)||(30737405-30737495)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (2-309)||(49369684-49369991)
chr1 (6-309)||(41342810-41343113)
chr1 (6-298)||(10003859-10004151)
chr1 (6-298)||(27029880-27030172)
chr1 (163-309)||(5557184-5557330)
chr1 (38-127)||(24545091-24545180)
chr1 (14-106)||(28520847-28520939)
chr1 (44-103)||(37668976-37669035)
chr1 (39-106)||(26996083-26996150)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-309)||(58393-58701)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (6-304)||(74220-74518)
[»] chr7 (20 HSPs)
chr7 (6-304)||(40891766-40892064)
chr7 (6-309)||(586701-587004)
chr7 (3-306)||(37075589-37075892)
chr7 (6-298)||(24819625-24819917)
chr7 (18-298)||(36575396-36575676)
chr7 (6-304)||(12121508-12121806)
chr7 (3-309)||(9403131-9403430)
chr7 (1-309)||(20705489-20705797)
chr7 (1-309)||(20873533-20873841)
chr7 (3-309)||(34981764-34982070)
chr7 (22-103)||(22865766-22865847)
chr7 (22-103)||(47548969-47549050)
chr7 (22-103)||(47553412-47553493)
chr7 (22-106)||(27987585-27987669)
chr7 (27-106)||(27869020-27869099)
chr7 (22-127)||(18815411-18815516)
chr7 (33-106)||(8457213-8457286)
chr7 (209-306)||(27278522-27278619)
chr7 (235-309)||(5196550-5196624)
chr7 (25-106)||(5196753-5196834)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (14-305)||(38938393-38938684)
chr2 (6-304)||(30275811-30276109)
chr2 (3-309)||(23384760-23385066)
chr2 (3-309)||(32349791-32350097)
chr2 (7-307)||(21963327-21963627)
chr2 (7-179)||(21964640-21964812)
chr2 (56-309)||(27914653-27914906)
chr2 (22-103)||(1258584-1258665)
chr2 (23-131)||(22300858-22300966)
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (6-309)||(11265942-11266245)
chr5 (1-309)||(27891615-27891923)
chr5 (7-307)||(5824972-5825272)
chr5 (3-309)||(6678577-6678881)
chr5 (26-304)||(29150227-29150504)
chr5 (22-103)||(29322916-29322997)
chr5 (18-106)||(31962686-31962774)
chr5 (111-309)||(10462244-10462442)
chr5 (22-103)||(38931892-38931973)
chr5 (25-103)||(8896369-8896447)
[»] chr6 (8 HSPs)
chr6 (1-309)||(28604884-28605192)
chr6 (6-309)||(18295398-18295701)
chr6 (1-309)||(667180-667490)
chr6 (6-304)||(2894159-2894457)
chr6 (22-302)||(7218368-7218648)
chr6 (6-131)||(17228031-17228156)
chr6 (22-103)||(5391535-5391616)
chr6 (79-202)||(9759578-9759701)
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (6-309)||(26077728-26078031)
chr8 (1-179)||(31423238-31423416)
chr8 (22-276)||(29532307-29532561)
chr8 (22-271)||(26390260-26390508)
chr8 (22-103)||(10801698-10801779)
chr8 (219-309)||(31423430-31423520)
chr8 (162-309)||(2959748-2959895)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (22-232)||(224744-224954)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (22-127)||(11164-11269)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 29123435 - 29123744
Alignment:
Q  1 tcaatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggtt-cccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgcta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29123435 tcaatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggtttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgcta 29123534  T
Q  100 caaaggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  29123535 caaaggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaagagaccatttgttttttca 29123634  T
Q  200 atgtgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgt 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29123635 atgtgatttttatggtcgattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcaaggcaatttatatcctcatgctaatcagttttgt 29123734  T
Q  300 gctcttggag 309  Q
    ||||||||||    
T  29123735 gctcttggag 29123744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22340804 - 22340496
Alignment:
Q  1 tcaatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22340804 tcaatatcactgcagtgtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctaaatagacttgctac 22340705  T
Q  101 aaaggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22340704 aaaggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgtggccttgtgtggtaaggaggaggaaagagatcatttgttttttcaa 22340605  T
Q  201 tgtgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtg 300  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22340604 tgtgattattatggtcgattatggctcttggtttcgaattggtttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctaatcagttttgtg 22340505  T
Q  301 ctcttggag 309  Q
    |||||||||    
T  22340504 ctcttggag 22340496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 4303199 - 4303507
Alignment:
Q  1 tcaatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4303199 tcaatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaatatttttgtttggcgtctttttctgaatagacttgctac 4303298  T
Q  101 aaaggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaa 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  4303299 aaaggacaatcttcgcaagaggaatatccttcatgctacagattcttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaagggaccatttgttttttcaa 4303398  T
Q  201 tgtgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtg 300  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  4303399 tgtgattattatggtcgattatgactcttgatatcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatacccatgctaatcaattttgtg 4303498  T
Q  301 ctcttggag 309  Q
    | |||||||    
T  4303499 cccttggag 4303507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 309
Target Start/End: Original strand, 18116384 - 18116687
Alignment:
Q  6 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18116384 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcctttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagatttgctacaaagg 18116483  T
Q  106 acaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtga 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||    
T  18116484 acaatcttcgcaagaggaatgtccttgaggctaccaatgtttcttgtggagccttatgtggtaaggaggaggaaagggatcatttgtttttccaatgtga 18116583  T
Q  206 tttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctctt 305  Q
    || ||||||||  |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||    
T  18116584 ttattatggtcggttatggcttttgctatcggattggcttggttttgttacggtttttaatggcaatttatatacaaatgctaatcagttttgcgctctt 18116683  T
Q  306 ggag 309  Q
    ||||    
T  18116684 ggag 18116687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8111143 - 8110835
Alignment:
Q  1 tcaatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctac 100  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8111143 tcaacatcactgcagagtttaatcaatttttatggcttaaagcggttccattaaaggttaatatttttgtatggcgtctctttctgaatagacttgcaac 8111044  T
Q  101 aaaggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaa 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| || ||| | |  ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| |||||||||    
T  8111043 aaaggacaacctgcgcaagaggaacgtctttgaggtttccaatgtgtcttgcgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaagggaccatttcttttttcaa 8110944  T
Q  201 tgtgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtg 300  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||| ||||||||||||    
T  8110943 tgtgatcattatggtcgattatggctcttgatatcgaattggtttggtattgttaaggtgtttcatggcaatatattttcacatgctaatcagttttgtg 8110844  T
Q  301 ctcttggag 309  Q
    |||||||||    
T  8110843 ctcttggag 8110835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 309
Target Start/End: Original strand, 36279205 - 36279508
Alignment:
Q  6 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  36279205 atcactgcagattttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaatatttttgtttggcggttctttctgaatagacttgctacaaagg 36279304  T
Q  106 acaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtga 205  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||  ||||||||  || || ||||||||||||||| || |  ||||||||||||| |||||||     
T  36279305 ataatcttcgtaagaggaatgttcttgaggctaccaatgtttcttgtggtgctttatgtggtaaggaggagaaaagggatcatttgtttttccaatgtgc 36279404  T
Q  206 tttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctctt 305  Q
    || |||||||| |||||||||  || | ||| ||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  36279405 ttattatggtcgattatggcttatgctatcggattggttaggttttgttacggttttcaatggcaatttatatactcatgctaatcagttttgcgctctt 36279504  T
Q  306 ggag 309  Q
    ||||    
T  36279505 ggag 36279508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 17826778 - 17826950
Alignment:
Q  1 tcaatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctac 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17826778 tcaatatcactgtagagtttgatcaatttttatggcttaaagtggtttccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctac 17826877  T
Q  101 aaaggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggag 173  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17826878 aaaggagaatcttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatgcttcttgtgcggccttgtgtggtaaggag 17826950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 309
Target Start/End: Original strand, 23158152 - 23158455
Alignment:
Q  6 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 105  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23158152 atcactgcatattttgatcaatttttatggcttaaagcagtccccttaaaagttaatatttttgtttggcggctctttctgaatagacttgctacaaagg 23158251  T
Q  106 acaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtga 205  Q
    | || ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  ||||||||  || || |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||| |||    
T  23158252 ataatcttcgcaagaggaatgttcttgaggctaccaatgtttcttgtggtgctttatgtggtaaggaggaggaaagggatcatttgtttttccaatatga 23158351  T
Q  206 tttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctctt 305  Q
    || |||||||| |||||||||  || | ||| ||||| | ||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  23158352 ttattatggtcgattatggcttatgctatcggattggttaggttttgttacggttctcaatggcaatttatatactcatgctaatcagttttgcgctctt 23158451  T
Q  306 ggag 309  Q
    ||||    
T  23158452 ggag 23158455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 78 - 309
Target Start/End: Original strand, 15705634 - 15705865
Alignment:
Q  78 ctctttctgaatagacttgctacaaaggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggagg 177  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15705634 ctctctctgaatggacttgctacaaatgacaatcttcgcaagaggaatatccttcaggctacagatgcttcttgtgcggccttgtgtgataaggaggagg 15705733  T
Q  178 aaggatatcatttgttttttcaatgtgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttata 277  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15705734 aaagggatcatttgttttttcaatgtgattattatggtcgattatggctcttgatatcgaattgacttggttttgttacggtgcttcatggcaatttata 15705833  T
Q  278 tcctcatgctcatcagttttgtgctcttggag 309  Q
    | | |||||| | || |||||||| |||||||    
T  15705834 tacccatgctaaccaattttgtgcccttggag 15705865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3621727 - 3621420
Alignment:
Q  1 tcaatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  3621727 tcaatatcactgcagagtttaatcaatttttatggcttaaaccggtcccattaaaggttaatatttttgtatggcgtctttttctgaatagacttgcaac 3621628  T
Q  101 aaaggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaa 200  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||| ||| | |  ||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||| |||    
T  3621627 aaaggacaacctgcgtaagaggaacgttcttgaggtttccaatgtgtcttgcgcgaccttgtgtggtaaggaggaggaaagagaccatttttttttccaa 3621528  T
Q  201 tgtgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtg 300  Q
    ||||||  ||||||||  |||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||    
T  3621527 tgtgatcattatggtcggttatggctcttgttaacgaattggtttggtattgttactgtgtttcatggcaatctattttcacatgctcatcagttttgtg 3621428  T
Q  301 ctcttgga 308  Q
    ||||||||    
T  3621427 ctcttgga 3621420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 51872905 - 51872602
Alignment:
Q  6 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 105  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51872905 atcactgcagattttgttcaatttttatggcttaaagcggtacccttaaaagttaatatttttgtttggcggctctttctgaatagacttgctacaaagg 51872806  T
Q  106 acaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtga 205  Q
    | || ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  ||| | ||  || || | |||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||    
T  51872805 ataatcttcgcaagaggaatgttcttgaggctaccaatgtttcctatggtgctttatttggtaaggaggaggaaagggatcatttgtttttccaatgcga 51872706  T
Q  206 tttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctctt 305  Q
    || |||||||| |||||||||  || | ||| ||||| | ||||| ||||| ||  || ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||     
T  51872705 ttattatggtcgattatggcttatgctatcggattggttaggtttggttacagttcttaatggcaattcatatactcatgctaatcagttttgtggtcta 51872606  T
Q  306 ggag 309  Q
    ||||    
T  51872605 ggag 51872602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 12916011 - 12915713
Alignment:
Q  6 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 105  Q
    ||||||| ||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  12916011 atcactgaagattttaaccaattcttgtggcttaaggcggttccgttaaaggttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagaattgctacaaaga 12915912  T
Q  106 acaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtga 205  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||||  |||||   ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||    
T  12915911 acaacttgcgcaaaaggaatgtccttgcggctaacaatgtttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaagagacaatttattttttcaatgtga 12915812  T
Q  206 tttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctct 304  Q
       |||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| || |||||||| |||| |||||||||||    
T  12915811 ccattatgggcggttatggctcttggtatcgcagtggcttggtattgttacggttttacatggtaatttacatactcatgctaatcatttttgtgctct 12915713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 184 - 307
Target Start/End: Original strand, 17838714 - 17838837
Alignment:
Q  184 atcatttgttttttcaatgtgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctca 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  17838714 atcatttgttttttcaatgtgattattatggtcgattatggctcttgatatcgaattgacttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatacaca 17838813  T
Q  284 tgctcatcagttttgtgctcttgg 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  17838814 tgctaatcagttttgtgctcttgg 17838837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Original strand, 15649066 - 15649372
Alignment:
Q  3 aatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaa 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||    
T  15649066 aatatcaatgcagagtttgatcatttattatggcttaaagcagtccctttaaaggttaatatttttgtttggaggctctttctgaatcgccttgctacaa 15649165  T
Q  103 aggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatg 202  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||||  |||||||  |   || |||||   | || |||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||    
T  15649166 aggataatcttcgcaagcggaatgtcctcgaggctaccaacgttttttgtggtactttatgtggtaaggaggaggaaagagaccatttattttttcaatg 15649265  T
Q  203 tgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgct 302  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||  || | ||  ||||| | |||||||| |||| | |  |||| || |||||| | |||||| |||||||||||||     
T  15649266 tgattattatggtcggttatggcttatgctatcagattggttaggttttgtcacggcgctcaatggaaacttatattcacatgctaatcagttttgtgca 15649365  T
Q  303 cttggag 309  Q
    |||||||    
T  15649366 cttggag 15649372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 103
Target Start/End: Original strand, 50693772 - 50693853
Alignment:
Q  22 atcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 103  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50693772 atcaatttttatggttgaaagcggttccgttgaaggttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 50693853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 36951405 - 36951324
Alignment:
Q  22 atcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 103  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36951405 atcaatttttatggttgaaagcggttccgttgaaggttaacatttttgtatggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 36951324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 167 - 309
Target Start/End: Original strand, 6614197 - 6614339
Alignment:
Q  167 taaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcat 266  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||  || | ||| ||||| | ||||||||||||||  |  ||    
T  6614197 taaggaggaggaaagggatcatttgtttttccaatgtgattattatggtcggttatggcttatgctatcggattggttaggttttgttacggttctcaat 6614296  T
Q  267 ggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctcttggag 309  Q
    |||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||    
T  6614297 ggcaatttatattcacatgcaaatcagttttgtgctcttggag 6614339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 103
Target Start/End: Original strand, 17469142 - 17469223
Alignment:
Q  22 atcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 103  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17469142 atcattttttatggttgaaagcggttccgttgaaggttaacatttttgtttggcatctctttctgaatagacttgctacaaa 17469223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 24059831 - 24059760
Alignment:
Q  38 taaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaaggacaa 109  Q
    |||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24059831 taaaacggtttcgttaaaagttaatatttttgtttgacgtctctttatgagtagacttgctacaaaggacaa 24059760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23603485 - 23603180
Alignment:
Q  3 aatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaa 102  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  23603485 aatatcattgcggagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcctttaaaagttaacatttttgtttggcgactctttctgaatagacttgctacta 23603386  T
Q  103 aggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  23603385 aggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcag-ctacaaatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaagagatcatctgttttttcaatg 23603287  T
Q  203 tgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgct 302  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23603286 tgatttttatggtcgactatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctattcagttttgtgct 23603187  T
Q  303 cttggag 309  Q
    |||||||    
T  23603186 cttggag 23603180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 42462937 - 42462637
Alignment:
Q  9 actgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaaggaca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42462937 actgcagagtttgatcaatttttatggcttaaaacggctcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtttctttctgaatagacttgctacaaaggaca 42462838  T
Q  109 accttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtgattt 208  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     
T  42462837 atcttcgcaagaggaatgtccttcaggctacaaatgcatcttgtgcgaccttgtatgataaggaggaggaaagagatcatttgttttttcaatgtgatta 42462738  T
Q  209 ttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctcttgga 308  Q
    ||||||||  |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  42462737 ttatggtcggttatggcttttgatatcaaattgacttggttttgttacgatgtttcatggcaatttatatacacatgctaatcagttttgtgctcttgga 42462638  T
Q  309 g 309  Q
    |    
T  42462637 g 42462637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8595482 - 8595175
Alignment:
Q  1 tcaatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctac 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8595482 tcaatatcattgcagagtttgatcaatttctatggcttaaagcggttcctttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctac 8595383  T
Q  101 aaaggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaa 200  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  8595382 aaaggacaatcttcgtaagaggaatatccttcaggctacagatgcttcttgtgcggccttgtgtgctaaggaggaggaaagggaccatttgttttttcaa 8595283  T
Q  201 tgtgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtg 300  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||| | || |||||||    
T  8595282 tgtgattattatggtcgtttatggctcttgatatcaaattcgcttggttttgttacggtgtttcatgtcaatttacatacccatgctaaccaattttgtg 8595183  T
Q  301 ctcttgga 308  Q
    | ||||||    
T  8595182 cccttgga 8595175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 48547779 - 48547471
Alignment:
Q  1 tcaatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctac 100  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48547779 tcaacatcactgcagagtttaatcaatttttatggcttaaagcagttccattaaaggttaatatttttgtctggcgtctctttctgaatagacttgcaac 48547680  T
Q  101 aaaggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaa 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| | |  ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  48547679 aaaggacaacctgcgcaagaggaacgtccttgaggtttccaatgtttcttgcgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaagggaccatttgttttttcaa 48547580  T
Q  201 tgtgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtg 300  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||  | | |||||| ||||||||||||    
T  48547579 tgtgatcattatggtcgattatggctcttgatatcgaattggtttggtattgttacggtgtctcaaggcaatttaatttcacatgctaatcagttttgtg 48547480  T
Q  301 ctcttggag 309  Q
    |||||||||    
T  48547479 ctcttggag 48547471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 309
Target Start/End: Original strand, 23571623 - 23571926
Alignment:
Q  6 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23571623 atcactgtagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtatgacgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 23571722  T
Q  106 acaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtga 205  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||||  ||  ||||||||  || || |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||    
T  23571723 acaatcttcgcaagacgaatgtccttgaggctaccaatgtttcttgtggtgctttatgtggtaaggaggaggaaagggatcatttgtttttccaatgcga 23571822  T
Q  206 tttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctctt 305  Q
    || ||||||||  |||||||| ||| | ||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||    
T  23571823 ttattatggtcggttatggcttttgctatcggattggttaggttttgctacggtttttaatggcaatttatatacacatgctaatcagttttgtgctttt 23571922  T
Q  306 ggag 309  Q
    ||||    
T  23571923 ggag 23571926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3514904 - 3514601
Alignment:
Q  6 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3514904 atcactgcagattttgatcaatttttatggcttaaagcggtacccttaaaagttaatatttttgtttggcggttctttctgaatagacttgctacaaagg 3514805  T
Q  106 acaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtga 205  Q
    | || ||||||||||||||||| ||| ||||||   ||  ||||||||  || || |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||    
T  3514804 ataatcttcgcaagaggaatgttcttgaggctatcaatgtttcttgtggtgctttatgtggtaaggaggaggaaagggatcatttgtttttccaatgcga 3514705  T
Q  206 tttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctctt 305  Q
    || ||||||||  ||||||||  || | ||  ||||| | ||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||     
T  3514704 ttattatggtcgcttatggcttatgctatccgattggttaggttttgttacggttctcaatggcaatttatatactcatgctaatcagttttgcgctcta 3514605  T
Q  306 ggag 309  Q
    ||||    
T  3514604 ggag 3514601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Original strand, 17153806 - 17154112
Alignment:
Q  3 aatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaa 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  17153806 aatatcaatgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttccattaaaagttaatatttttatttggcggctctttatgaatagacttgctacaa 17153905  T
Q  103 aggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatg 202  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||  |||||||  ||  || |||||  || || |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| |||||    
T  17153906 aggataatcttcgcaagaggaatgtcctcgaggctaccaatgttttttgtggtgctttatgtggtaaagaggaggaaagggatcatttgtttttccaatg 17154005  T
Q  203 tgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgct 302  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||  || | | | ||||| | ||||||||||||||  |  ||| |||||||||| | |||||  |||||||||| |||    
T  17154006 tgattattatggtcggttatggcttatgctattggattggttaggttttgttacggttctcaatgacaatttatattcacatgcaaatcagttttgcgct 17154105  T
Q  303 cttggag 309  Q
    |||||||    
T  17154106 cttggag 17154112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9819280 - 9818988
Alignment:
Q  6 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9819280 atcactgcagattttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagtcaatatttatgtttggcggctttttctgaatagacttgctacaaagg 9819181  T
Q  106 acaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtga 205  Q
    | || ||||| ||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||  || || |||||||||||||||||     ||||||||||||| ||||| ||    
T  9819180 ataatcttcgtaagaggaatgtccttgaggctaccaatgtttcttgtggtgctttatgtggtaaggaggaggacaaggatcatttgtttttccaatgcga 9819081  T
Q  206 tttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttg 298  Q
     ||||||||||  ||||||||  || | ||| ||||| | |||||||||| |||  |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  9819080 cttttatggtcgtttatggcttatgctatcggattggttaggttttgttatggttctcaatggcaatttatattctcatgctaatcagttttg 9818988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 309
Target Start/End: Original strand, 53152132 - 53152390
Alignment:
Q  51 ttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaaggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttctt 150  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||  ||  || ||    
T  53152132 ttaaaagttaatatttttgtttggaggctctttcagaatcgacttgctacaaaggataatcttcgcaagaggaatgtcctcgaggctaccaatgtttttt 53152231  T
Q  151 gtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttt 250  Q
    |||  || || ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||  || | ||| ||||| | ||| |    
T  53152232 gtggtgctttatgtggcaaggaggaggaaagagatcatttgttttttcaatgtgattattatggtcggttatggcttatgctatcggattggttaggtat 53152331  T
Q  251 tgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctcttggag 309  Q
    |||||||||  |  ||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  53152332 tgttacggttctcaatgacaatttatattcacatgctaatcagttttgtgcacttggag 53152390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Original strand, 42459305 - 42459592
Alignment:
Q  6 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 105  Q
    ||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  42459305 atcactgaagattttaaccaattcttatggcttaaggaggttccgttaaaggttaacatttttgtttgacgtctttttctgaatagaattgctacaaagg 42459404  T
Q  106 acaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatact-tcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtg 204  Q
    ||||| | | ||| |||||||||||| |||||| | | | | ||||||||| |||||||||||||           || | ||||| |||||||||||||    
T  42459405 acaacttgcacaaaaggaatgtccttgaggcta-acaaagtatcttgtgcgaccttgtgtggtaa-----------gagaccatttattttttcaatgtg 42459492  T
Q  205 atttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctct 304  Q
    |   |||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  42459493 accattatggacggttatggctcttggtatcgcagtggcttggtattgttacggttttacatggtaatttacattctcatgctaatcagttttgtgctct 42459592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 16664180 - 16664099
Alignment:
Q  22 atcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 103  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16664180 atcaatttttatggttgaaagcggttccgttgaaggttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 16664099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 52196490 - 52196409
Alignment:
Q  22 atcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 103  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52196490 atcaatttttatggttgaaagcggttccgttgaaggttaacatttttgtttggcgcctctttctgaatagacttgctacaaa 52196409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 103
Target Start/End: Original strand, 39632858 - 39632931
Alignment:
Q  30 ttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 103  Q
    |||||| | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39632858 ttatggttgaaagcggttccgttgaaggttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 39632931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 10754250 - 10754186
Alignment:
Q  39 aaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 103  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10754250 aaagcggttccgttgaaggttaacatctttgtttggcgtctctttatgaatagacttgctacaaa 10754186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 256
Target Start/End: Original strand, 39632989 - 39633084
Alignment:
Q  161 gtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttac 256  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||||| |||||   |||||||| | | ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  39632989 gtgtggtaaggaagaggaaagggatcatctgttttttcattgtgaccattatggtcgactttggctcttgatttctcattggcttggtattgttac 39633084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 30737495 - 30737405
Alignment:
Q  219 ttatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctcttggag 309  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| | || |||||| ||||| || | |||||  ||||||||||| |||||||||    
T  30737495 ttatggctcttgatctcgcattggcttagtattgttacgattttacatggcgatttacatacacatgcgaatcagttttgtactcttggag 30737405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 2 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 49369991 - 49369684
Alignment:
Q  2 caatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctaca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49369991 caatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttttttggcgtctctttctgaatagacttgctaca 49369892  T
Q  102 aaggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaat 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  49369891 aaggacaatcttcgcaagaggaatgtcctttaggctgcagatgcttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaagggatcatttgttttttcaat 49369792  T
Q  202 gtgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgc 301  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||| |||    
T  49369791 gtgattattatggtcgattatggctcttgatatcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatgacaatttatatactcatgctaaccagttttatgc 49369692  T
Q  302 tcttggag 309  Q
     |||||||    
T  49369691 ccttggag 49369684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 309
Target Start/End: Original strand, 41342810 - 41343113
Alignment:
Q  6 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41342810 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcctttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagatttgctacaaagg 41342909  T
Q  106 acaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtga 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||    
T  41342910 acaatcttcgcaagaggaatgtccttgaggctaccaatgtttcttgtggagccttatgtggtaaggaggaggaaagggatcatttgtttttccaatgtga 41343009  T
Q  206 tttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctctt 305  Q
    || ||||||||  |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||    
T  41343010 ttattatggtcggttatggcttttgctatcggattggcttggttttgttacggtttttaatggcaatttatatacaaatgctaatcagttttgcgctctt 41343109  T
Q  306 ggag 309  Q
    ||||    
T  41343110 ggag 41343113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10004151 - 10003859
Alignment:
Q  6 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10004151 atcactgcagattttgatcaatttttatggcttaaagcggttcctttaaaagtcaatatttttgcttggcggctctttctgaatagacttgctacaaagg 10004052  T
Q  106 acaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtga 205  Q
    | || ||||| |||| ||||||| || |||||||  ||  ||||||||  ||  | |||||||||||||||||| |  |||||||||||||  |||| ||    
T  10004051 ataatcttcgtaagaagaatgtctttgaggctaccaatgtttcttgtggtgctctttgtggtaaggaggaggaaagggatcatttgtttttcgaatgcga 10003952  T
Q  206 tttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttg 298  Q
     ||||||||||  |||||||| ||| | ||| ||||| | ||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  10003951 cttttatggtcggttatggcttttgctatcggattggttaggttttgttacggttctcaatggcaatttatattctcatgctaatcagttttg 10003859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27030172 - 27029880
Alignment:
Q  6 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  27030172 atcactgcagattttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagtcaatatttttgtttggcggctttttttgaatagacttgctataaagg 27030073  T
Q  106 acaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtga 205  Q
    | || ||||| ||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||  ||  | |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||  |    
T  27030072 ataatcttcgtaagaggaatgtccttgaggctaccaatgtttcttgtggtgctctatgtggtaaggaggaggaaagagatcatttgtttttccaatgcaa 27029973  T
Q  206 tttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttg 298  Q
      ||||||| |  ||||||||  || | ||| ||||| | ||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27029972 agtttatggacgtttatggcttatgctctcggattggttaggttttgttacggttctcaatggcaatttatattctcatgctaatcagttttg 27029880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 5557330 - 5557184
Alignment:
Q  163 gtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtt 262  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5557330 gtggtaaggaggaggaaagggaccatttgtttttttaatgtgatcattatggtcgattatgactcttgatatcgaattggtttggtattgttacggtgtt 5557231  T
Q  263 tcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctcttggag 309  Q
    ||| |  ||||||  | | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5557230 tcaagataatttaatttcacatgctaatcagttttgtgctcttggag 5557184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 127
Target Start/End: Original strand, 24545091 - 24545180
Alignment:
Q  38 taaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaaggacaaccttcgcaagaggaatgt 127  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  24545091 taaagtggttccgttaaaagttaatatttttgtctggcgtctctttctgaacagacttgctacaaaggataatcttcgaaagagaaatgt 24545180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Original strand, 28520847 - 28520939
Alignment:
Q  14 agagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagga 106  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28520847 agagtttcatcaatttttgtggcttaaagcggtttcgttaaaggtgaatatatttgtatggcgtctcttcctgaatagacttgctacagagga 28520939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 37669035 - 37668976
Alignment:
Q  44 ggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 103  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37669035 ggttccgttgaaggttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgatacaaa 37668976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 26996150 - 26996083
Alignment:
Q  39 aaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagga 106  Q
    |||||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26996150 aaagcgattccgttaaaggttaatatttttgtctggcgtctctttctgaatagacttggtgcaaagga 26996083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 58393 - 58701
Alignment:
Q  1 tcaatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctac 100  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58393 tcaacatcactgcagagtttaatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaggttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctac 58492  T
Q  101 aaaggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||    
T  58493 aaaggacaaccttcgcaagaggaatgtccttgaggctaccaatatttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaagggaccgtttgttttttcaa 58592  T
Q  201 tgtgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtg 300  Q
    |||||   ||||||||  |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || | |||||| ||||||||||||    
T  58593 tgtgacaattatggtcggttatggctcttgatatcaaattggcttggttttgttacggtgtttcacgacaatttaaatacacatgctaatcagttttgtg 58692  T
Q  301 ctcttggag 309  Q
    |||||||||    
T  58693 ctcttggag 58701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 74518 - 74220
Alignment:
Q  6 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74518 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 74419  T
Q  106 acaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||| ||||||||    
T  74418 acaaccttcgcaagaggaatgtccttgaggctacctatgtttcttgtggggccttgtgtggtaaggaggaggaaatggaccatttgtttttccaatgtga 74319  T
Q  206 tttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctct 304  Q
    || ||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| |||||    
T  74318 ttattatggtcagttatggcttttgatatcaaattggcttggttttgttacagtgtttcatggcaatttatatacacatgataatcagttttgcgctct 74220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Original strand, 40891766 - 40892064
Alignment:
Q  6 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40891766 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 40891865  T
Q  106 acaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||| ||||||||    
T  40891866 acaaccttcgcaagaggaatgtccttgaggctacctatgtttcttgtggggccttgtgtggtaaggaggaggaaatggaccatttgtttttccaatgtga 40891965  T
Q  206 tttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctct 304  Q
    || ||||||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| |||||    
T  40891966 ttattatggtcagttatggcttttgatatcaaattggcttggttttgttacagtgtttcatggcaatttatatacacatgataatcagttttgcgctct 40892064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 587004 - 586701
Alignment:
Q  6 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 105  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  587004 atcactgcagagtttgatcgttttttatggcttaaagcggttcccttaaaggttaatatttttgtttggcgtctctttttgaatagacttgctacaaagg 586905  T
Q  106 acaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtga 205  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||||||  ||  |||  ||| |||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  586904 acaatcttcgtaaaaggaatgtccttgaggctaccaatgtttcaagtggggccttatgtggtaaggaggaggaaagggatcatttgttttttcaatgtga 586805  T
Q  206 tttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctctt 305  Q
    || |||||||| |||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||    
T  586804 ttattatggtcgattatggcttctgatatcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatgacaatttatatacacatgctaatcagttttgcgctctt 586705  T
Q  306 ggag 309  Q
    ||||    
T  586704 ggag 586701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 306
Target Start/End: Original strand, 37075589 - 37075892
Alignment:
Q  3 aatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  37075589 aatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcctttaaaagttaatatttttgtttggaggctctttcagaatcgacttgctacaa 37075688  T
Q  103 aggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatg 202  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||  |||||||  ||  || |||||  || || ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  37075689 aggataatcttcgcaagaggaatgtcctcgaggctaccaatgttttttgtggtgctttatgtggcaaggaggaggaaagggatcatttgttttttcaatg 37075788  T
Q  203 tgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgct 302  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||  || | ||| ||||| | ||| ||||||||||  |  ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||     
T  37075789 tgattattatggtcggttatggcttatgctatcggattggttaggtattgttacggttctcaatgacaatttatattcacatgctaatcagttttgtgca 37075888  T
Q  303 cttg 306  Q
    ||||    
T  37075889 cttg 37075892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24819917 - 24819625
Alignment:
Q  6 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24819917 atcactgcagattttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagtcaatatttttgtttggcggctttttctgaatagacttgctacaaagg 24819818  T
Q  106 acaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtga 205  Q
    | || ||||| |||||||| |||||| |||||||  |   ||||||||  || || |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||    
T  24819817 ataatcttcgtaagaggaacgtccttgaggctaccaacgtttcttgtggtgctttatgtggtaaggaggaggaaagggatcatttgtttttccaatgcga 24819718  T
Q  206 tttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttg 298  Q
     | ||||||||  ||||||||  || | ||| ||||| | ||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24819717 ctattatggtcgtttatggcttatgctatcggattggttaggttttgttacggttctcaatggcaatttatattctcatgctaatcagttttg 24819625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 298
Target Start/End: Original strand, 36575396 - 36575676
Alignment:
Q  18 tttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaaggacaaccttcgca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  36575396 tttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagtcaatatttttgtttggcggctttttctgaatagacttgctacaaaggataatcttcgta 36575495  T
Q  118 agaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtgatttttatggtca 217  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||  ||  | |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||||     
T  36575496 agaggaatgtccttgaggctaccaatgtttcttgtggtgctctatgtggtaaggaggaggaaagggatcatttgtttttccaatgcgacttttatggtcg 36575595  T
Q  218 attatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttg 298  Q
     ||||||||  || | ||| ||||| | ||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  36575596 tttatggcttatgctatcggattggttaggttttgttacggttctcaatggcaatttatattctcatgctaatcagttttg 36575676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 12121806 - 12121508
Alignment:
Q  6 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 105  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12121806 atcactgcaaattttgatcaatttttatggcttaaagcggtacccttaaaagttaatatttttgtttggcggctctttctgaatagacttgctacaaagg 12121707  T
Q  106 acaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtga 205  Q
    | || ||||||||||||||||| ||  ||| |||  ||  ||||||||  || || ||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| ||    
T  12121706 ataatcttcgcaagaggaatgttctagaggataccaatgtttcttgtggtgctttatgtggtaaggaggaggaaatggatcatttgtttttccaatgcga 12121607  T
Q  206 tttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctct 304  Q
    || |||||||| |||||||||  || | ||| ||||| | ||||| ||||||||  |  ||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  12121606 ttattatggtcgattatggcttatgctatcggattggttaggtttggttacggttctcaatgacaatttatatactcatgctaatcagttttgcgctct 12121508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Original strand, 9403131 - 9403430
Alignment:
Q  3 aatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||         |||||| ||||||||||||    
T  9403131 aatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcctttaaaagttaatatttttgtttggac-------ctgaatcgacttgctacaa 9403223  T
Q  103 aggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatg 202  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||  |||||||  ||  || |||||  || || |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||    
T  9403224 aggataatcttcgcaagaggaatgtcctcgaggctaccaatgttttttgtggtgctttatgtggtaaggaggaggaaagggatcatttgtttttccaatg 9403323  T
Q  203 tgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgct 302  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||  || | ||| ||||| | ||||||||||||||  |  |||||||||||||| | |||||  |||||||||||||     
T  9403324 tgattattatggtcggttatggcttatgctatcggattggttaggttttgttacggttctcaatggcaatttatattcacatgcaaatcagttttgtgca 9403423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 20705489 - 20705797
Alignment:
Q  1 tcaatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | || || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20705489 tcaatatcactgcagagtttactcaatttttatggcttaaaccagtcccattgaaggttaatatttttgtatggcgtctttttctgaatagacttgcaac 20705588  T
Q  101 aaaggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaa 200  Q
    |||||| || || |||||||| || || ||| ||| | |  ||    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||    
T  20705589 aaaggataatctgcgcaagagaaacgttcttgaggtttctaatgtggcttgtgcggctttgtgtggtaaggaggaggaaagagaccatttgtttttccaa 20705688  T
Q  201 tgtgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtg 300  Q
    ||||||  |||||| |  |||||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||    
T  20705689 tgtgatcattatggccggttatggcttttgatatcgaattggtttggtattgttactgtgtttcatggcactttattttcacatactcatcagttttgtg 20705788  T
Q  301 ctcttggag 309  Q
    | |||||||    
T  20705789 cacttggag 20705797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 20873533 - 20873841
Alignment:
Q  1 tcaatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | || || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  20873533 tcaatatcactgcagagtttactcaatttttatggcttaaaccagtcccattgaaggttaatatttttgtatggcgtctttttctgaatagacttgcaac 20873632  T
Q  101 aaaggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaa 200  Q
    |||||| || || |||||||| || || ||| ||| | |  ||    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||    
T  20873633 aaaggataatctgcgcaagagaaacgttcttgaggtttctaatgtggcttgtgcggctttgtgtggtaaggaggaggaaagagaccatttgtttttccaa 20873732  T
Q  201 tgtgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtg 300  Q
    ||||||  |||||| |  |||||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||    
T  20873733 tgtgatcattatggccggttatggcttttgatatcgaattggtttggtattgttactgtgtttcatggcactttattttcacatactcatcagttttgtg 20873832  T
Q  301 ctcttggag 309  Q
    | |||||||    
T  20873833 cacttggag 20873841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 34982070 - 34981764
Alignment:
Q  3 aatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaa 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||    
T  34982070 aatatcaatgcagagtttgatcagtttttatggcttaaagcggtccctttaaaggttaatatttttgtttggaggctctttctgaatcgccttgctacaa 34981971  T
Q  103 aggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatg 202  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||  |||||||  |   ||  ||||  || || |||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||||    
T  34981970 aggataatcttcgcaagaggaatgtcctcgaggctaccaacgttttctgtggtgctttatgtggtaaggaggaggaaagagaccatttattctttcaatg 34981871  T
Q  203 tgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgct 302  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||  || | ||  ||||| | |||||||| |||| | |  |||| || |||||| | |||||| |||||||||||||     
T  34981870 tgattattatggtcggttatggcttatgctatcagattggttaggttttgtcacggcgctcaatggaaacttatattcacatgctaatcagttttgtgca 34981771  T
Q  303 cttggag 309  Q
    |||||||    
T  34981770 cttggag 34981764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 103
Target Start/End: Original strand, 22865766 - 22865847
Alignment:
Q  22 atcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 103  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22865766 atcaatttttatggttgaaagcagttccgttgaaggttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 22865847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 47549050 - 47548969
Alignment:
Q  22 atcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 103  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47549050 atcaatttttatggttgaaagcagttccgttgaaggttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 47548969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 47553493 - 47553412
Alignment:
Q  22 atcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 103  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47553493 atcaatttttatggttgaaagcagttccgttgaaggttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 47553412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 106
Target Start/End: Original strand, 27987585 - 27987669
Alignment:
Q  22 atcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagga 106  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27987585 atcattttttgtggcataaagcggttccgttaaaggttaatatttttgtatggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagga 27987669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 27869099 - 27869020
Alignment:
Q  27 tttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagga 106  Q
    ||||||||||| |||||||||   ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27869099 tttttatggctaaaagcggttatgttaaaggttaacatatttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagga 27869020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 127
Target Start/End: Original strand, 18815411 - 18815516
Alignment:
Q  22 atcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaaggacaaccttcgcaagag 121  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||    
T  18815411 atcattttttgtggcataaagcggttccgttaaaggttaatatatttgtctagcgtctctttctgaatagacttgctacaaaggataatctgaggaagag 18815510  T
Q  122 gaatgt 127  Q
    ||||||    
T  18815511 gaatgt 18815516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 106
Target Start/End: Original strand, 8457213 - 8457286
Alignment:
Q  33 tggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagga 106  Q
    |||| |||||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8457213 tggcataaagcggtttcgttaaaggttaatatttttgtctggcgtctctttctgaatagacttgatacaaagga 8457286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27278619 - 27278522
Alignment:
Q  209 ttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctcttg 306  Q
    ||||||||  |||||||||||| | | | ||||| ||||| |||||||| | || |||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  27278619 ttatggtcggttatggctcttgatattgcattggtttggtattgttacgattttacatggcaatttaaatacacatgctaatcagttttgtgctcttg 27278522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 5196624 - 5196550
Alignment:
Q  235 cgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctcttggag 309  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| ||  |||| |  | |||||||||||||||||||    
T  5196624 cgaattggcttggtattgttacggtttttcatggcgacttaaatattcattcaaaacagttttgtgctcttggag 5196550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 5196834 - 5196753
Alignment:
Q  25 aatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagga 106  Q
    ||||||| |||||||| ||| || | |||||||| || || ||| | || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5196834 aatttttgtggcttaaggcgatttcgttaaaagtgaatatctttatctgacgactctttctaaatagacttgctacaaagga 5196753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 38938684 - 38938393
Alignment:
Q  14 agagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaaggacaacctt 113  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  38938684 agagtttgatcagtttttatggcttaaagcggttcccttaaaaattaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttactacaaaggacaatctt 38938585  T
Q  114 cgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtgatttttatg 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  38938584 cgcaagaggaatgtctttcaggctacatatgcttcttgtgcggccttatgtggtaaggaggaggaaagggaccatttattttttcaatgtgattattatg 38938485  T
Q  214 gtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctctt 305  Q
    ||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||    
T  38938484 gtcgattatgactcttgatatcgaattggcttggttttgttatggtgtttaatggcaatttatatacacatgctaatcatttttgtgctctt 38938393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 30276109 - 30275811
Alignment:
Q  6 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30276109 atcactgcagattttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaatatttttgtttggaggctctttctgaatagactcgctacaaagg 30276010  T
Q  106 acaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtga 205  Q
    | || ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  ||||||||  || || |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  30276009 ataatcttcgcaagaggaatgttcttgaggctaccaatgtttcttgtggtgctttatgtggtaaggaggaggaaagagatcatttgtttttccaatgtga 30275910  T
Q  206 tttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctct 304  Q
    || |||||||| |||||| ||  || | ||| ||||| | ||||||||||||||  |  | |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  30275909 ttattatggtcgattatgacttatgttatcggattggttaggttttgttacggttctcaacggcaatttatatactcatgctaatcagttttgcgctct 30275811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23385066 - 23384760
Alignment:
Q  3 aatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  23385066 aatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcctttaaaagttaatatttttgtttggcggctctttctgaatagacatgctacaa 23384967  T
Q  103 aggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatg 202  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||  |||||||  ||  || |||||  || || |||||||| ||||||||| |  |||||||||| || |||||    
T  23384966 aggataatcttcgcaagaggaatgtcctcgaggctaccaatgttttttgtggtgctttatgtggtaaagaggaggaaagtgatcatttgttcttccaatg 23384867  T
Q  203 tgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgct 302  Q
    ||||| |||||||   ||||||||  || | ||||||||| | ||||||||||||||  |  |||||||||||||| | |||||  ||||||||||| ||    
T  23384866 tgattattatggttggttatggcttatgctatcgaattggttaggttttgttacggttctcaatggcaatttatattcacatgcaaatcagttttgtact 23384767  T
Q  303 cttggag 309  Q
    |||||||    
T  23384766 cttggag 23384760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 32350097 - 32349791
Alignment:
Q  3 aatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaa 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  32350097 aatatcactgcagattttgatcaatttttatggcttaaagcgattcccttaaaagttaatatttttgtttcgtggctctttctgaatagacttgctacaa 32349998  T
Q  103 aggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatg 202  Q
    |||| |  ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  ||||||||  || || |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||    
T  32349997 aggatattcttcgcaagaggaatgttcttgaggctaccaatgtttcttgtggtgctttatgtggtaaggaggaggaaagggatcatttgtttttccaatg 32349898  T
Q  203 tgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgct 302  Q
     |||| |||||||| |||||||||  || | ||| ||||| | || |||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  32349897 cgattattatggtcgattatggcttatgctatcggattggttaggatttgttacggttctcaatggcaatttatatactcatgctaatcagttttgcgct 32349798  T
Q  303 cttggag 309  Q
    || ||||    
T  32349797 ctaggag 32349791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21963627 - 21963327
Alignment:
Q  7 tcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21963627 tcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggtccctttaaaagttaatatttttgtttggaggctctttctgaatcgacttgctacaaagga 21963528  T
Q  107 caaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtgat 206  Q
     || ||||||||||||||||||||  |||||||  ||  || |||||  || || ||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||    
T  21963527 taatcttcgcaagaggaatgtcctcgaggctaccaatgttttttgtggtgctttatgtggtaaggaggaggaaaaggatcatttgttttttcgatgtgat 21963428  T
Q  207 ttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctcttg 306  Q
    | |||||||   ||||||||  || | ||  ||||| | |||||||| |||||  || |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  21963427 tattatggtaggttatggcttatgctatcagattggttaggttttgtgacggttcttaatggcaatttatattcacatgctaatcagttttgtgcacttg 21963328  T
Q  307 g 307  Q
    |    
T  21963327 g 21963327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21964812 - 21964640
Alignment:
Q  7 tcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21964812 tcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggtccctttaaaagttaatatttttgtttggaggctctttctgaatcgacttgctacaaagga 21964713  T
Q  107 caaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaa 179  Q
     || ||||||||||||||||||||  |||||||  ||  || |||||  || || ||||||||||||||||||    
T  21964712 taatcttcgcaagaggaatgtcctcgaggctaccaatgttttttgtggtgctttatgtggtaaggaggaggaa 21964640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 56 - 309
Target Start/End: Original strand, 27914653 - 27914906
Alignment:
Q  56 agttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaaggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcg 155  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||  ||  || || ||      
T  27914653 agttaatatttttgtttgacggttctttctgaatagacttgctacaaaggataatcttcgcaagaggaatgtcctcgaggctaccaatgttttttatggt 27914752  T
Q  156 gccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgtta 255  Q
    ||  | |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||  || | ||  ||||| | ||||||||||    
T  27914753 gctatatgtggtaaggaggaggaaagggatcatttgtttttccaatgtgattattatggtcggttatggcttatgatatcagattggttaggttttgtta 27914852  T
Q  256 cggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctcttggag 309  Q
    ||||  |  |||||||||||||| | |||||  | |||||||||||||||||||    
T  27914853 cggttctcaatggcaatttatattcacatgcaaaccagttttgtgctcttggag 27914906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 1258665 - 1258584
Alignment:
Q  22 atcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 103  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1258665 atcaatttttatggttaaaagcggttccgttgaaggttaacatatttgttttgcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 1258584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22300966 - 22300858
Alignment:
Q  23 tcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaaggacaaccttcgcaagagg 122  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||| || || |||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  | ||||| ||     
T  22300966 tcaatttttatggttaaaagtggttccgttgaaggttaacatatttgtaagacgtctctttctgaatagacctgctacaaaggataatttgcgcaaaaga 22300867  T
Q  123 aatgtcctt 131  Q
    |||||||||    
T  22300866 aatgtcctt 22300858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 11266245 - 11265942
Alignment:
Q  6 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11266245 atcactgcagagtttggtcaatttttatggcttaaagcggttcctttaaaagttaatatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 11266146  T
Q  106 acaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtga 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||    
T  11266145 acaaccttcgcaagaggaatgtccttgaggctactaatgtttcttgcgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaagggaccatttgttttttcaatgtga 11266046  T
Q  206 tttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctctt 305  Q
     | ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||    | |||||| |||||||||||||||||    
T  11266045 ctattatggtcggttatggctcttgatttcgaattggcttggttttgttacggtgctacacggaaatttaacaacacatgctaatcagttttgtgctctt 11265946  T
Q  306 ggag 309  Q
    ||||    
T  11265945 ggag 11265942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27891923 - 27891615
Alignment:
Q  1 tcaatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctac 100  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  27891923 tcaacatcactgcagagtttaatcaatttttatggcttaaagcggttccattaaaggttaatatttttgtctggcatctctttctgaatagacttgcaac 27891824  T
Q  101 aaaggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaa 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |  ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  27891823 aaaggacaacctgcgcaagaggaacgtccttcaggtttccaatgtgtcttgcgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaagggaccatttgttttttcaa 27891724  T
Q  201 tgtgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtg 300  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||| ||||||||||||    
T  27891723 tgtgatcattatggtcgattatggctcttgatatcgaattggtttggtattgttacggtgtttcatggcaatatattttcacatgctaatcagttttgtg 27891624  T
Q  301 ctcttggag 309  Q
    |||||||||    
T  27891623 ctcttggag 27891615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 307
Target Start/End: Original strand, 5824972 - 5825272
Alignment:
Q  7 tcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5824972 tcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggtccctttaaaagttaatatttttgtttggaggctctttctgaatcgacttgctacaaagga 5825071  T
Q  107 caaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtgat 206  Q
     || ||||||||||||||||||||  |||||||  ||  || |||||  || || |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  5825072 taatcttcgcaagaggaatgtcctcgaggctaccaatgttttttgtggtgctttatgtggtaaggaggaggaaagggatcatttgttttttcgatgtgat 5825171  T
Q  207 ttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctcttg 306  Q
    | |||||||   ||||||||  || | ||| ||||| | ||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  5825172 tattatggtaggttatggcttatgctatcggattggttaggttttgttacggttcttaatggcaatttatattcacatgctaatcagttttgtgcacttg 5825271  T
Q  307 g 307  Q
    |    
T  5825272 g 5825272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Original strand, 6678577 - 6678881
Alignment:
Q  3 aatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  6678577 aatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcctttagaag--aatatttttgtttggaggctctttctgaatcgacttgctacaa 6678674  T
Q  103 aggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatg 202  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||  |||||||  ||  || |||||  || || | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  6678675 aggataatcttcgcaagaggaatgtcctcgaggctaccaatgttttttgtggtgctttatatggtaaggaggaggaaagtgatcatttgttttttcaatg 6678774  T
Q  203 tgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgct 302  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||  || | ||| ||||| | ||| ||||||||||  |  ||| |||||| ||| | |||||| |||||||||||||     
T  6678775 tgattattatggtcggttatggcttatgctatcggattggttaggtattgttacggttctcaatgacaatttttattcacatgctaatcagttttgtgca 6678874  T
Q  303 cttggag 309  Q
    |||||||    
T  6678875 cttggag 6678881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29150504 - 29150227
Alignment:
Q  26 atttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaaggacaaccttcgcaagaggaat 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  29150504 atttttatggcttaaggcggttccgttaaaggttaatatttttgtttggtgtcttttcctgaatagacttgctacaaaggacaacttgcgcaaaaggaat 29150405  T
Q  126 gtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtgatttttatggtcaattatggc 225  Q
    |||| | ||||||   ||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||||| ||||||||||||||   |||||| |  |||||||    
T  29150404 gtcc-tgaggctaacaatgtatcttgtgcggccttctgtggtaaggacgaggaaagagaccatttattttttcaatgtgaccattatggccggttatggc 29150306  T
Q  226 tcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctct 304  Q
    ||||| | ||  |||| ||  || |||||||||| || |||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  29150305 tcttgatatcacattgactctgtattgttacggttttacatgacaatttaaatactcatgctaatcagttttgtgctct 29150227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 29322997 - 29322916
Alignment:
Q  22 atcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 103  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29322997 atcaatttttatggttgaaagcagttccgttgaaggttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 29322916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 106
Target Start/End: Original strand, 31962686 - 31962774
Alignment:
Q  18 tttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagga 106  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31962686 tttgctcaatttttatggctaaaagtggttccgttaaaggttaacatatttgtttggcatctctatctgaatagacttgctacaaagga 31962774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 309
Target Start/End: Original strand, 10462244 - 10462442
Alignment:
Q  111 cttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtgattttt 210  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||  || |||||  || || ||| |||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  10462244 cttcgcaagaggaatgtcctcgaggctaccaatgttttttgtggtgctttatgtagtaaggaggaggaaagggatcatttgtttttccaatgtgattatt 10462343  T
Q  211 atggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctcttggag 309  Q
    ||||||  ||||||||  || | ||| ||||| | ||||||||||||||  |  |||||||||||||| | |||||  | ||| |||||||||||||||    
T  10462344 atggtcggttatggcttatgatatcggattggttaggttttgttacggttctcaatggcaatttatattcacatgcaaaccagatttgtgctcttggag 10462442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 38931973 - 38931892
Alignment:
Q  22 atcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 103  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||  | || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38931973 atcaatttttatggttgaaagcggttccgctgaaggttaacatatttgtttggcatctctttctgaatagacttgctacaaa 38931892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 8896447 - 8896369
Alignment:
Q  25 aatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 103  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  || || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8896447 aatttttatggttgaaagcggttctgttgaaggttaacatagttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 8896369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 8)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 28604884 - 28605192
Alignment:
Q  1 tcaatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  28604884 tcaatatcactgcagagtttaatcaatttttatggcttaaaccggtcccattaaaggttaatatttttgtatggcgtctttttctgaatagacttgcaac 28604983  T
Q  101 aaaggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaa 200  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||| ||| | |  ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||    
T  28604984 aaaggacaacctgcgtaagaggaacgttcttgaggtttccaatgtgtcttgcgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaagagaccatttgtttttccaa 28605083  T
Q  201 tgtgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtg 300  Q
    ||||||  ||||||||  |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||    
T  28605084 tgtgatcattatggtcggttatggctcttgatatcgaattggtttggtattgttactgtgtttcatggcaatctattttcacatgctcatcagttttgtg 28605183  T
Q  301 ctcttggag 309  Q
    |||||||||    
T  28605184 ctcttggag 28605192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 309
Target Start/End: Original strand, 18295398 - 18295701
Alignment:
Q  6 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 105  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18295398 atcactgcatattttgatcaatttttatggcttaaagcggtacccttaaaagttaatatttttgtttggcggctctttctgaatagacttgctacaaagg 18295497  T
Q  106 acaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtga 205  Q
    | || ||||||||||||||||| ||  ||| |||  ||  ||||||||  || || |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||    
T  18295498 ataatcttcgcaagaggaatgttctagaggttaccaatgtttcttgtggtgctttatgtggtaaggaggaggaaagggatcatttgtttttccaatgcga 18295597  T
Q  206 tttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctctt 305  Q
    || |||||||| |||||||||  || | ||  ||||| | |||||||||| |||  |  |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||     
T  18295598 ttattatggtcgattatggcttatgctatcagattggttaggttttgttatggttctcaatggcaatttatatactaatgctaatcagttttgcgctcta 18295697  T
Q  306 ggag 309  Q
    ||||    
T  18295698 ggag 18295701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 667490 - 667180
Alignment:
Q  1 tcaatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctac 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  667490 tcaacatcactgcagagtttaatcaatttttatggcttaaagtggttcccttaaaggttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctac 667391  T
Q  101 aaaggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  |||||||||          ||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||    
T  667390 aaaggacaaccttcgcaagaggaatgtacttgaggctacaaatgtttcttgtgc----------ggtaaggaggaggaaagggactatttgttttttcaa 667301  T
Q  201 tgtgatttttatggt---caattatgg----------ctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgct 287  Q
    ||||| | |||||||   | |||||||          |||||| | || ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || | ||||||    
T  667300 tgtgactattatggtcgactattatggtcggctatgactcttgatatcaaattggcttggtttt-taacggtgtttcacggcaatttaaatacacatgct 667202  T
Q  288 catcagttttgtgctcttggag 309  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  667201 aatcagttttgtgctcttggag 667180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2894457 - 2894159
Alignment:
Q  6 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  2894457 atcactgcagattttgatcaatttctatggcttaaagcggttcccttaaaagttaatatttttgtttggcggctttttctgaatagacttgctacaaagg 2894358  T
Q  106 acaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtga 205  Q
    | || ||||| ||||||||| ||||| |||| ||  ||  ||||||||  || || |||||||| ||||||||     ||||||||||||| |||||  |    
T  2894357 ataatcttcgtaagaggaatatccttgaggcaaccaatgtttcttgtggtgctttatgtggtaacgaggaggacatggatcatttgtttttccaatgcaa 2894258  T
Q  206 tttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctct 304  Q
     | ||||||||  ||||||||  || ||||| ||||| | ||||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  2894257 ctattatggtcgtttatggcttatgatttcggattggttaggttttgttacggttctcaatggcaatttatattctcatgctcatcagttttgcgctct 2894159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 302
Target Start/End: Original strand, 7218368 - 7218648
Alignment:
Q  22 atcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaaggacaaccttcgcaagag 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | || || ||    
T  7218368 atcaatttttatggcttaaggcggttccgttaaaggttaacatttttgtttggcgtctttttctgaatagacttgctacaaaggataatttgcgtaaaag 7218467  T
Q  122 gaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtgatttttatggtcaatta 221  Q
    ||||||| || ||||||   ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||| |||||||||  ||| ||    |||    
T  7218468 gaatgtctttgaggctaacaatgtatattgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaagagaccatttatttttccaatgtgatcattacgggtggtta 7218567  T
Q  222 tggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgct 302  Q
    ||||||||||| |||   ||||||||| || ||||||  || ||||| |  ||| || ||||||||  |||||||||||||    
T  7218568 tggctcttggtatcgcggtggcttggtatttttacggccttacatggtagcttacatactcatgctactcagttttgtgct 7218648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17228156 - 17228031
Alignment:
Q  6 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 105  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17228156 atcactgaagagtttcatcattttttgtggcttaaagcagttccgttaaatgtgaacatatttgtctggcgtctctttctaaatagacttgctacaaagg 17228057  T
Q  106 acaaccttcgcaagaggaatgtcctt 131  Q
    ||||  | ||||| ||||||||||||    
T  17228056 acaatttgcgcaaaaggaatgtcctt 17228031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 103
Target Start/End: Original strand, 5391535 - 5391616
Alignment:
Q  22 atcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 103  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||    
T  5391535 atcaatttttatggttgaaagcggctccgttgaaggttaacatttttgtttggcgcttatttctgaatagacttgcaacaaa 5391616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 202
Target Start/End: Original strand, 9759578 - 9759701
Alignment:
Q  79 tctttctgaatagacttgctacaaaggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggagga 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||| || |||| ||   |   | ||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  9759578 tctttccgaatagacttgctacaaaggataatctgcgcaaaaggaatgtctttgaggccacttttgtgtattgtgcggctttgcgtggtaaggaggatga 9759677  T
Q  179 aggatatcatttgttttttcaatg 202  Q
    | |  | ||| |||||||||||||    
T  9759678 aagggaccatctgttttttcaatg 9759701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 309
Target Start/End: Original strand, 26077728 - 26078031
Alignment:
Q  6 atcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaagg 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26077728 atcactgcagattttgatcaatttttatggcttaaagcggtacccttaaaagttaatatttttgtttggcggctctttctgaatagacttgctacaaagg 26077827  T
Q  106 acaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtga 205  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||| |||||||  ||  ||||||||  || || |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||    
T  26077828 acaatcttcgcaaaaggaatgttcttgaggctaccaatgtttcttgtggtgctttatgtggtaaggaggaggaaagggatcatttgtttttccaatgcga 26077927  T
Q  206 tttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctctt 305  Q
     | ||||||||  ||||||||  || | ||  ||||| | ||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||     
T  26077928 atattatggtcgcttatggcttatgttatccgattggttaggttttgttacggttctcaatggcaatttatatactcatgctaatcagttttgcgctcta 26078027  T
Q  306 ggag 309  Q
    ||||    
T  26078028 ggag 26078031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 31423238 - 31423416
Alignment:
Q  1 tcaatatcactgcagagtttgatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctac 100  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  31423238 tcaacatcactgcagagtttaatcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaggttaatatttttgtctgacgtctctttctgaatagacttgcaac 31423337  T
Q  101 aaaggacaaccttcgcaagaggaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaa 179  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| | | |||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31423338 aaagaacaaccttcgcaagaggaacgtccttgaaggtaccaatgtttcttgcgcggccttgtgtggtaaggaggaggaa 31423416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 29532561 - 29532307
Alignment:
Q  22 atcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaaggacaaccttcgcaagag 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| ||    
T  29532561 atcaatttttatggcttaaagcggtaccattaaatgttaacatttttgtctggcgtctctttctgaatagacttgctacaaaggacaatttaagcaaaag 29532462  T
Q  122 gaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtgatttttatggtcaatta 221  Q
    |||||||||||  ||||   |||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||||||| |||  ||||| || | |     
T  29532461 gaatgtccttccagctaataatatatcttgtgtggccttgtgtgataaggaggaggaaagggatcatttgttctttcaatgcgatcattatgatcgactt 29532362  T
Q  222 tggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttat 276  Q
    ||||||||| | ||| | |||||| || |||||||||| || |||||||||||||    
T  29532361 tggctcttgatatcgcactggcttagtattgttacggttttacatggcaatttat 29532307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Original strand, 26390260 - 26390508
Alignment:
Q  22 atcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaaggacaaccttcgcaagag 121  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |||  ||    
T  26390260 atcaatttttatggcttacggcggtaccattaaaggttaacatttttgtctggcgtctctttctgaatagacttgctacaacggacaatttaagcataag 26390359  T
Q  122 gaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtgatttttatggtcaatta 221  Q
    ||||||||||| |||||   |||  |||| |  ||||||||||||||||||||| ||| |    |||||||| |||||||| |||  |||||||| | |     
T  26390360 gaatgtccttccggctaataatatgtcttatatggccttgtgtggtaaggaggacgaaaggggccatttgttctttcaatgcgatcattatggtcgact- 26390458  T
Q  222 tggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaa 271  Q
    | ||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||| || ||||||||    
T  26390459 ttgctcttgatatcgcattgacttggtattgttacggttttacatggcaa 26390508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 103
Target Start/End: Original strand, 10801698 - 10801779
Alignment:
Q  22 atcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 103  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10801698 atcaatttttatggttgaaagcagttccgttgaaggttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaa 10801779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 309
Target Start/End: Original strand, 31423430 - 31423520
Alignment:
Q  219 ttatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgtttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctcttggag 309  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  31423430 ttatggctcttgatatcgaattggtttggtattgttacggtgtttcacgacaatttaaattcacatgctaatcagttttgtgctcttggag 31423520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 309
Target Start/End: Original strand, 2959748 - 2959895
Alignment:
Q  162 tgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtgatttttatggtcaattatggctcttggtttcgaattggcttggttttgttacggtgt 261  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||||||  || | ||  ||||| | |||||||| |||| |     
T  2959748 tgtggtaaggaggaggacagagaccatttattctttcaatgtgattattatggtcggttatggcttatgctatcagattggttaggttttgtcacggcgc 2959847  T
Q  262 ttcatggcaatttatatcctcatgctcatcagttttgtgctcttggag 309  Q
    |  |||| || |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2959848 tcaatggaaacttatattcacatgctaatcagttttgtgcacttggag 2959895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 232
Target Start/End: Original strand, 224744 - 224954
Alignment:
Q  22 atcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaaggacaaccttcgcaagag 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | || || ||    
T  224744 atcaatttttatggcttaaggcggttccgttaaaggttaacatttttgtttggcgtctttttctgaatagacttgctacaaaggacaatttgcgtaaaag 224843  T
Q  122 gaatgtccttcaggctacagatacttcttgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaggatatcatttgttttttcaatgtgatttttatggtcaatta 221  Q
    |||||||||| ||||||   ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||| |||||||||  ||||||    |||    
T  224844 gaatgtccttgaggctaacaatgtatattgtgcggccttgtgtggtaaggaggaggaaagagaccatttatttttccaatgtgatcattatgggtggtta 224943  T
Q  222 tggctcttggt 232  Q
    |||||||||||    
T  224944 tggctcttggt 224954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 11269 - 11164
Alignment:
Q  22 atcaatttttatggcttaaagcggttcccttaaaagttaacatttttgtttggcgtctctttctgaatagacttgctacaaaggacaaccttcgcaagag 121  Q
    |||| ||||| ||||  |||| |||||| ||||| ||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| || || || |||||    
T  11269 atcattttttgtggcacaaagaggttccgttaaaggttaatatatttgtatgatgtctcttcctgaatagactttctacaaaggataatctgcggaagag 11170  T
Q  122 gaatgt 127  Q
     |||||    
T  11169 aaatgt 11164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University