View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8207_low_1 (Length: 719)

Name: NF8207_low_1
Description: NF8207
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8207_low_1
NF8207_low_1
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (11-705)||(50009-50703)
[»] chr3 (90 HSPs)
chr3 (11-705)||(16825210-16825906)
chr3 (11-705)||(14290463-14291157)
chr3 (20-708)||(12180857-12181545)
chr3 (20-705)||(17494159-17494848)
chr3 (20-708)||(12357455-12358143)
chr3 (20-708)||(31692113-31692801)
chr3 (20-708)||(31941416-31942104)
chr3 (20-698)||(12857434-12858111)
chr3 (24-708)||(18131275-18131958)
chr3 (165-705)||(35982839-35983379)
chr3 (21-705)||(11958112-11958796)
chr3 (58-702)||(16326641-16327287)
chr3 (20-680)||(16831484-16832144)
chr3 (20-703)||(17188887-17189570)
chr3 (21-708)||(10408482-10409169)
chr3 (20-705)||(24189817-24190501)
chr3 (21-708)||(28756833-28757520)
chr3 (21-708)||(47126458-47127145)
chr3 (20-693)||(15230116-15230789)
chr3 (20-693)||(15235984-15236657)
chr3 (61-454)||(11949107-11949500)
chr3 (20-648)||(8744378-8745006)
chr3 (20-648)||(13944537-13945165)
chr3 (11-216)||(12272842-12273047)
chr3 (26-314)||(10417367-10417655)
chr3 (20-252)||(16378318-16378550)
chr3 (21-252)||(12509867-12510098)
chr3 (84-306)||(13317864-13318086)
chr3 (20-158)||(14575499-14575637)
chr3 (368-666)||(16384342-16384640)
chr3 (20-237)||(15262133-15262350)
chr3 (33-237)||(12843513-12843717)
chr3 (31-237)||(15345655-15345861)
chr3 (31-237)||(16638287-16638493)
chr3 (31-237)||(24185704-24185910)
chr3 (31-237)||(43165189-43165395)
chr3 (31-237)||(48427961-48428167)
chr3 (31-218)||(15065585-15065772)
chr3 (31-237)||(10008114-10008320)
chr3 (31-237)||(10908724-10908930)
chr3 (31-237)||(12889223-12889429)
chr3 (31-237)||(13255204-13255410)
chr3 (31-237)||(15358597-15358803)
chr3 (31-237)||(15713466-15713672)
chr3 (365-705)||(13317500-13317840)
chr3 (31-237)||(3688457-3688663)
chr3 (31-237)||(15586802-15587008)
chr3 (65-290)||(15013115-15013340)
chr3 (33-237)||(14578818-14579022)
chr3 (31-237)||(15399927-15400133)
chr3 (31-237)||(20059464-20059670)
chr3 (65-218)||(14873997-14874150)
chr3 (65-237)||(16754111-16754283)
chr3 (31-218)||(5422359-5422546)
chr3 (31-237)||(6603249-6603455)
chr3 (31-237)||(16694678-16694884)
chr3 (31-237)||(26790823-26791029)
chr3 (31-237)||(53382428-53382634)
chr3 (65-237)||(16804357-16804529)
chr3 (596-698)||(2245610-2245712)
chr3 (443-705)||(12508496-12508758)
chr3 (437-536)||(15008684-15008783)
chr3 (436-705)||(12843045-12843314)
chr3 (412-531)||(2037017-2037136)
chr3 (412-531)||(2040758-2040877)
chr3 (412-531)||(14039651-14039770)
chr3 (33-145)||(17492367-17492479)
chr3 (176-237)||(11861033-11861094)
chr3 (149-237)||(23079427-23079515)
chr3 (436-642)||(16803952-16804158)
chr3 (436-693)||(15262549-15262806)
chr3 (542-648)||(6603757-6603863)
chr3 (436-498)||(23079166-23079228)
chr3 (536-645)||(3688959-3689068)
chr3 (545-645)||(10008625-10008725)
chr3 (545-645)||(10909235-10909335)
chr3 (545-645)||(15713061-15713161)
chr3 (542-645)||(6597077-6597180)
chr3 (436-567)||(11861272-11861403)
chr3 (610-705)||(14578363-14578458)
chr3 (542-645)||(16638795-16638898)
chr3 (436-567)||(23414870-23415001)
chr3 (542-645)||(43165697-43165800)
chr3 (436-498)||(15065990-15066052)
chr3 (610-652)||(23079012-23079054)
chr3 (171-216)||(8271830-8271875)
chr3 (602-687)||(10416994-10417079)
chr3 (171-216)||(13964786-13964831)
chr3 (610-659)||(15459410-15459459)
chr3 (171-216)||(30150021-30150066)
[»] chr7 (59 HSPs)
chr7 (11-705)||(12798194-12798885)
chr7 (11-705)||(19149876-19150570)
chr7 (11-705)||(20749275-20749969)
chr7 (20-633)||(15099365-15099978)
chr7 (26-705)||(14260936-14261615)
chr7 (21-693)||(16947174-16947846)
chr7 (20-708)||(13676325-13677007)
chr7 (29-705)||(13024228-13024903)
chr7 (21-705)||(12459503-12460187)
chr7 (20-705)||(11385119-11385804)
chr7 (20-666)||(14283103-14283749)
chr7 (21-708)||(26091485-26092172)
chr7 (26-708)||(21755292-21755974)
chr7 (21-708)||(26115277-26115964)
chr7 (21-708)||(49155176-49155863)
chr7 (56-708)||(40924504-40925156)
chr7 (21-709)||(13965354-13966042)
chr7 (20-698)||(12203497-12204175)
chr7 (20-648)||(18050700-18051328)
chr7 (20-312)||(14140553-14140845)
chr7 (20-282)||(15343305-15343567)
chr7 (402-650)||(14144917-14145165)
chr7 (213-705)||(12712353-12712845)
chr7 (31-237)||(11550282-11550488)
chr7 (31-237)||(14957438-14957644)
chr7 (20-282)||(15627397-15627659)
chr7 (31-237)||(44788531-44788737)
chr7 (31-237)||(8710489-8710695)
chr7 (31-237)||(13688925-13689131)
chr7 (31-237)||(14335280-14335486)
chr7 (65-207)||(15146133-15146275)
chr7 (464-705)||(13004783-13005024)
chr7 (31-237)||(11234393-11234599)
chr7 (31-237)||(18180627-18180833)
chr7 (31-237)||(18587351-18587557)
chr7 (31-237)||(15158237-15158443)
chr7 (31-237)||(17703635-17703841)
chr7 (33-237)||(14042581-14042785)
chr7 (33-237)||(14352611-14352815)
chr7 (31-237)||(9591248-9591454)
chr7 (443-693)||(15627820-15628070)
chr7 (31-237)||(12690386-12690591)
chr7 (31-141)||(8200932-8201042)
chr7 (436-648)||(17703224-17703436)
chr7 (536-705)||(14043084-14043253)
chr7 (536-705)||(14353114-14353283)
chr7 (436-648)||(16726210-16726422)
chr7 (150-237)||(16726621-16726708)
chr7 (148-233)||(38330-38415)
chr7 (436-665)||(11984281-11984510)
chr7 (31-119)||(10873574-10873662)
chr7 (545-645)||(15157832-15157932)
chr7 (436-567)||(9591653-9591784)
chr7 (545-645)||(13689436-13689536)
chr7 (171-216)||(4442951-4442996)
chr7 (171-216)||(7826924-7826969)
chr7 (171-216)||(13459057-13459102)
chr7 (171-216)||(27104975-27105020)
chr7 (171-216)||(27173305-27173350)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (20-687)||(14993088-14993755)
chr4 (96-708)||(15266736-15267348)
chr4 (20-698)||(15073243-15073921)
chr4 (58-702)||(20892953-20893597)
chr4 (27-708)||(16150527-16151208)
chr4 (27-708)||(16154673-16155354)
chr4 (21-708)||(3261494-3262181)
chr4 (21-708)||(29450237-29450924)
chr4 (21-708)||(44658566-44659253)
chr4 (56-708)||(11203932-11204584)
chr4 (327-705)||(18259632-18260010)
chr4 (20-687)||(27903269-27903936)
chr4 (149-708)||(7357280-7357839)
chr4 (20-648)||(51603552-51604180)
chr4 (63-648)||(53750230-53750815)
chr4 (22-158)||(15354290-15354426)
chr4 (20-282)||(14696985-14697247)
chr4 (36-237)||(14162370-14162571)
chr4 (412-698)||(8708953-8709239)
chr4 (33-237)||(15946-16150)
chr4 (440-669)||(13879413-13879642)
chr4 (31-237)||(14683462-14683668)
chr4 (31-237)||(17092060-17092266)
chr4 (31-237)||(12479495-12479701)
chr4 (31-237)||(16233903-16234109)
chr4 (31-237)||(23958642-23958848)
chr4 (31-237)||(27714231-27714437)
chr4 (65-237)||(8050534-8050706)
chr4 (65-237)||(14300890-14301062)
chr4 (65-237)||(19635065-19635237)
chr4 (31-237)||(8389307-8389513)
chr4 (31-237)||(16350465-16350671)
chr4 (31-215)||(15144825-15145009)
chr4 (65-237)||(19775704-19775876)
chr4 (31-218)||(18224376-18224563)
chr4 (31-237)||(40475935-40476141)
chr4 (21-100)||(15258812-15258891)
chr4 (31-218)||(16250780-16250967)
chr4 (71-237)||(13513285-13513451)
chr4 (436-634)||(14697401-14697599)
chr4 (193-250)||(15354234-15354291)
chr4 (134-237)||(16219186-16219289)
chr4 (134-237)||(16222506-16222609)
chr4 (608-705)||(14162942-14163039)
chr4 (545-645)||(14300485-14300585)
chr4 (170-234)||(18604733-18604797)
chr4 (436-567)||(13513650-13513781)
chr4 (31-90)||(16219125-16219184)
chr4 (31-90)||(16222445-16222504)
chr4 (150-233)||(18546794-18546877)
chr4 (436-670)||(8336-8570)
chr4 (436-498)||(18224123-18224185)
chr4 (436-665)||(18604302-18604531)
chr4 (65-145)||(14188435-14188515)
chr4 (436-498)||(16248326-16248388)
chr4 (545-651)||(19635542-19635648)
chr4 (171-216)||(14999681-14999726)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (11-705)||(63245-63919)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (11-705)||(5085-5778)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (20-705)||(22015520-22016205)
chr1 (11-705)||(21738811-21739505)
chr1 (11-705)||(21742327-21743021)
chr1 (20-708)||(19857204-19857892)
chr1 (21-705)||(24096390-24097074)
chr1 (20-708)||(20832673-20833360)
chr1 (21-708)||(38909598-38910285)
chr1 (21-708)||(48425804-48426491)
chr1 (21-708)||(52988672-52989358)
chr1 (21-708)||(31536769-31537456)
chr1 (63-708)||(20074481-20075126)
chr1 (21-708)||(37679980-37680667)
chr1 (56-669)||(20297347-20297962)
chr1 (198-694)||(21961135-21961631)
chr1 (20-291)||(18710315-18710586)
chr1 (20-708)||(20853532-20854220)
chr1 (31-282)||(16379004-16379255)
chr1 (437-669)||(18273114-18273346)
chr1 (31-237)||(22496499-22496705)
chr1 (31-279)||(24785058-24785306)
chr1 (31-237)||(16347838-16348044)
chr1 (31-237)||(20081619-20081825)
chr1 (31-237)||(51330735-51330941)
chr1 (62-237)||(21751988-21752163)
chr1 (31-218)||(33388291-33388478)
chr1 (31-237)||(17042258-17042464)
chr1 (65-237)||(21833246-21833418)
chr1 (31-279)||(21842122-21842370)
chr1 (21-128)||(12200449-12200556)
chr1 (31-237)||(19109278-19109484)
chr1 (80-237)||(41350911-41351068)
chr1 (436-702)||(16379409-16379675)
chr1 (89-237)||(21228799-21228947)
chr1 (176-282)||(21045322-21045428)
chr1 (436-567)||(21228469-21228600)
chr1 (160-237)||(22401631-22401708)
chr1 (182-237)||(22435976-22436031)
chr1 (611-705)||(20921929-20922023)
chr1 (536-645)||(16347433-16347542)
chr1 (536-645)||(16354081-16354190)
chr1 (516-693)||(21044941-21045118)
chr1 (545-645)||(51330330-51330430)
chr1 (545-591)||(19109791-19109837)
chr1 (436-498)||(24784839-24784901)
chr1 (438-567)||(17041929-17042057)
chr1 (171-216)||(20828656-20828701)
chr1 (171-216)||(20928104-20928149)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (20-705)||(29537-30222)
scaffold0067 (20-708)||(64305-64993)
scaffold0067 (20-708)||(48883-49571)
scaffold0067 (20-708)||(57917-58605)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (20-705)||(42611-43296)
scaffold0102 (65-237)||(50519-50691)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (11-705)||(1017-1711)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (11-705)||(7648-8342)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (20-705)||(34250-34935)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (20-708)||(518-1206)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (20-708)||(36852-37540)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (20-708)||(586-1274)
[»] scaffold0046 (3 HSPs)
scaffold0046 (78-705)||(70079-70706)
scaffold0046 (11-225)||(60643-60857)
scaffold0046 (611-705)||(433-527)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (65-705)||(4010-4650)
[»] chr2 (58 HSPs)
chr2 (20-705)||(23274108-23274793)
chr2 (20-705)||(19716260-19716945)
chr2 (21-708)||(20848105-20848789)
chr2 (21-705)||(23097261-23097945)
chr2 (163-705)||(19720823-19721365)
chr2 (20-669)||(12576868-12577517)
chr2 (20-311)||(23113238-23113528)
chr2 (300-698)||(28350670-28351068)
chr2 (33-237)||(22733485-22733689)
chr2 (33-237)||(23074391-23074595)
chr2 (354-698)||(21901386-21901730)
chr2 (20-211)||(24817577-24817768)
chr2 (33-215)||(23105461-23105643)
chr2 (31-254)||(45673706-45673929)
chr2 (31-237)||(9338108-9338314)
chr2 (31-237)||(9486742-9486948)
chr2 (31-237)||(11351422-11351628)
chr2 (31-237)||(16983766-16983972)
chr2 (31-237)||(17001526-17001732)
chr2 (31-237)||(21322977-21323183)
chr2 (65-237)||(22742677-22742849)
chr2 (65-237)||(23064973-23065145)
chr2 (31-279)||(24705151-24705399)
chr2 (31-237)||(22323053-22323259)
chr2 (31-237)||(24712560-24712766)
chr2 (31-237)||(44383281-44383487)
chr2 (31-218)||(23029191-23029378)
chr2 (31-234)||(27220542-27220745)
chr2 (31-218)||(27373795-27373982)
chr2 (31-237)||(10871376-10871582)
chr2 (31-237)||(24678013-24678219)
chr2 (31-237)||(24657369-24657575)
chr2 (31-237)||(24874461-24874667)
chr2 (65-237)||(24264930-24265102)
chr2 (31-218)||(21142771-21142958)
chr2 (80-237)||(30208631-30208788)
chr2 (65-237)||(23204874-23205046)
chr2 (436-498)||(22462931-22462993)
chr2 (20-72)||(23279291-23279343)
chr2 (150-237)||(19817492-19817579)
chr2 (436-567)||(23116440-23116571)
chr2 (436-567)||(24817221-24817352)
chr2 (436-497)||(23205245-23205306)
chr2 (436-497)||(23676849-23676910)
chr2 (170-237)||(23676583-23676650)
chr2 (436-498)||(11351161-11351223)
chr2 (608-705)||(22742209-22742306)
chr2 (609-694)||(24817094-24817179)
chr2 (545-645)||(10871887-10871987)
chr2 (171-239)||(22739363-22739431)
chr2 (545-645)||(24265407-24265507)
chr2 (542-645)||(9338616-9338719)
chr2 (542-645)||(9487250-9487353)
chr2 (542-645)||(44382876-44382979)
chr2 (436-478)||(24657128-24657170)
chr2 (436-498)||(24704932-24704994)
chr2 (171-240)||(22280771-22280840)
chr2 (65-126)||(41606209-41606269)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (20-705)||(43125-43810)
scaffold0104 (20-107)||(25129-25216)
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (11-705)||(19985121-19985815)
chr8 (11-705)||(21928369-21929063)
chr8 (20-681)||(22373819-22374480)
chr8 (20-708)||(22027423-22028111)
chr8 (21-705)||(31413678-31414362)
chr8 (21-708)||(29300569-29301256)
chr8 (21-650)||(22053814-22054443)
chr8 (21-708)||(28983862-28984549)
chr8 (26-708)||(16268367-16269049)
chr8 (20-698)||(20391036-20391714)
chr8 (21-252)||(28989081-28989312)
chr8 (21-199)||(27357487-27357665)
chr8 (272-669)||(6606651-6607048)
chr8 (33-279)||(21253908-21254154)
chr8 (33-237)||(21391475-21391679)
chr8 (33-237)||(21780801-21781005)
chr8 (33-237)||(22421506-22421710)
chr8 (31-237)||(19980928-19981134)
chr8 (33-207)||(21785999-21786173)
chr8 (20-234)||(22375071-22375284)
chr8 (31-237)||(17671636-17671842)
chr8 (31-207)||(22523507-22523683)
chr8 (31-279)||(22990006-22990254)
chr8 (31-237)||(19115361-19115567)
chr8 (31-237)||(20015877-20016083)
chr8 (31-237)||(21164152-21164358)
chr8 (20-282)||(22245584-22245846)
chr8 (20-282)||(22246002-22246264)
chr8 (31-237)||(32603106-32603312)
chr8 (31-279)||(22126531-22126779)
chr8 (31-237)||(18859538-18859744)
chr8 (31-237)||(22031064-22031270)
chr8 (31-237)||(22117789-22117995)
chr8 (31-237)||(22042788-22042994)
chr8 (31-237)||(30310758-30310964)
chr8 (31-237)||(15536344-15536550)
chr8 (31-237)||(22129231-22129437)
chr8 (80-237)||(19481686-19481843)
chr8 (609-708)||(21970694-21970793)
chr8 (609-707)||(22004225-22004323)
chr8 (436-645)||(22043193-22043402)
chr8 (436-693)||(22523876-22524133)
chr8 (436-498)||(30310497-30310559)
chr8 (436-567)||(32603511-32603642)
chr8 (536-705)||(21671981-21672150)
chr8 (545-648)||(18860049-18860152)
chr8 (545-645)||(22126168-22126268)
chr8 (545-693)||(22990520-22990668)
chr8 (436-567)||(15536749-15536880)
chr8 (150-233)||(19870773-19870856)
chr8 (610-705)||(22421039-22421134)
chr8 (436-498)||(21391214-21391276)
chr8 (436-498)||(21780540-21780602)
chr8 (609-707)||(21982098-21982196)
chr8 (609-707)||(21998584-21998682)
chr8 (611-672)||(3274646-3274707)
chr8 (171-216)||(20649990-20650035)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (20-708)||(5718-6405)
scaffold0035 (67-237)||(41282-41452)
[»] chr5 (71 HSPs)
chr5 (20-708)||(23563050-23563738)
chr5 (21-705)||(23077790-23078474)
chr5 (56-708)||(20345116-20345768)
chr5 (56-708)||(22505513-22506165)
chr5 (21-708)||(14883873-14884560)
chr5 (20-693)||(21983074-21983747)
chr5 (21-708)||(25850871-25851558)
chr5 (20-698)||(21560917-21561595)
chr5 (20-708)||(17266216-17266904)
chr5 (430-705)||(21870163-21870438)
chr5 (430-705)||(21874443-21874718)
chr5 (26-497)||(20824257-20824728)
chr5 (20-252)||(28892280-28892512)
chr5 (20-252)||(20778711-20778943)
chr5 (20-242)||(22464748-22464970)
chr5 (65-352)||(21631637-21631924)
chr5 (33-237)||(25429250-25429454)
chr5 (272-698)||(43122517-43122943)
chr5 (412-681)||(23669822-23670091)
chr5 (31-237)||(21882601-21882807)
chr5 (31-237)||(16359329-16359535)
chr5 (31-237)||(29473426-29473632)
chr5 (31-237)||(34569321-34569527)
chr5 (31-237)||(40711607-40711813)
chr5 (33-237)||(26736080-26736284)
chr5 (31-237)||(14997092-14997298)
chr5 (31-237)||(18781941-18782147)
chr5 (31-237)||(22330240-22330446)
chr5 (31-237)||(27521233-27521439)
chr5 (65-237)||(37288849-37289021)
chr5 (65-237)||(41773703-41773875)
chr5 (20-207)||(23474011-23474198)
chr5 (31-237)||(19772787-19772993)
chr5 (31-237)||(27613183-27613389)
chr5 (31-237)||(27682753-27682959)
chr5 (31-237)||(22350746-22350952)
chr5 (31-237)||(27665843-27666049)
chr5 (65-237)||(23460832-23461004)
chr5 (31-218)||(20803424-20803611)
chr5 (65-237)||(22137529-22137701)
chr5 (436-705)||(23474426-23474695)
chr5 (105-237)||(23525952-23526084)
chr5 (412-531)||(16258095-16258214)
chr5 (412-531)||(22591814-22591933)
chr5 (412-531)||(22595369-22595488)
chr5 (65-287)||(21409995-21410217)
chr5 (136-237)||(21332339-21332440)
chr5 (31-122)||(21336762-21336853)
chr5 (65-126)||(21342878-21342939)
chr5 (436-498)||(18782346-18782408)
chr5 (398-708)||(22465126-22465436)
chr5 (612-705)||(21331874-21331967)
chr5 (545-645)||(22329835-22329935)
chr5 (602-687)||(20770518-20770603)
chr5 (602-687)||(20779293-20779378)
chr5 (598-687)||(28891845-28891934)
chr5 (545-645)||(14996687-14996787)
chr5 (545-645)||(19773298-19773398)
chr5 (436-639)||(23461203-23461406)
chr5 (545-645)||(27682348-27682448)
chr5 (542-645)||(16359837-16359940)
chr5 (443-642)||(21410373-21410572)
chr5 (610-669)||(25429826-25429885)
chr5 (542-645)||(27521741-27521844)
chr5 (545-636)||(27613694-27613785)
chr5 (542-645)||(34569829-34569932)
chr5 (436-498)||(23526283-23526345)
chr5 (437-498)||(20803830-20803891)
chr5 (608-693)||(21631296-21631381)
chr5 (171-216)||(23508633-23508678)
chr5 (171-216)||(24584159-24584204)
[»] chr6 (55 HSPs)
chr6 (20-705)||(19455771-19456456)
chr6 (75-705)||(19465971-19466601)
chr6 (20-708)||(19437750-19438438)
chr6 (20-698)||(25770592-25771270)
chr6 (23-708)||(14376761-14377446)
chr6 (20-698)||(21474348-21475010)
chr6 (58-708)||(18797476-18798126)
chr6 (11-630)||(24515337-24515956)
chr6 (21-705)||(10465696-10466380)
chr6 (20-698)||(19486149-19486827)
chr6 (21-705)||(21566839-21567523)
chr6 (56-708)||(24367184-24367836)
chr6 (20-708)||(34642430-34643119)
chr6 (20-708)||(15462084-15462772)
chr6 (20-282)||(23085096-23085358)
chr6 (412-705)||(8720553-8720846)
chr6 (33-237)||(18405260-18405464)
chr6 (30-186)||(20010821-20010977)
chr6 (33-237)||(23081184-23081388)
chr6 (20-280)||(30678297-30678557)
chr6 (71-237)||(5836544-5836710)
chr6 (20-234)||(18182686-18182900)
chr6 (412-705)||(16813780-16814073)
chr6 (31-237)||(29589755-29589961)
chr6 (65-237)||(22436662-22436834)
chr6 (31-237)||(2872118-2872324)
chr6 (31-237)||(16574649-16574855)
chr6 (31-237)||(16620525-16620731)
chr6 (31-237)||(16924956-16925162)
chr6 (31-237)||(27559285-27559491)
chr6 (31-237)||(24293098-24293304)
chr6 (31-215)||(19867446-19867630)
chr6 (31-237)||(28260513-28260719)
chr6 (31-237)||(28285197-28285403)
chr6 (31-237)||(28339262-28339468)
chr6 (464-705)||(19881588-19881829)
chr6 (65-237)||(28312423-28312595)
chr6 (65-234)||(27190229-27190398)
chr6 (65-234)||(27258842-27259011)
chr6 (436-705)||(30677872-30678141)
chr6 (31-237)||(25115311-25115517)
chr6 (436-705)||(23081587-23081856)
chr6 (410-708)||(20010346-20010645)
chr6 (436-705)||(18660083-18660352)
chr6 (545-645)||(5836139-5836239)
chr6 (442-670)||(25958636-25958864)
chr6 (170-237)||(22829702-22829769)
chr6 (436-498)||(21764976-21765038)
chr6 (609-698)||(23084680-23084769)
chr6 (545-645)||(2871713-2871813)
chr6 (610-652)||(22437207-22437249)
chr6 (545-591)||(22829351-22829397)
chr6 (436-478)||(27559044-27559086)
chr6 (171-216)||(16379710-16379755)
chr6 (171-216)||(16647306-16647351)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (11-705)||(1625-2317)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (20-708)||(98286-98974)
scaffold0020 (11-698)||(175892-176578)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (20-666)||(29440-30086)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (20-708)||(1655-2343)
scaffold0034 (20-693)||(70285-70958)
scaffold0034 (322-708)||(11609-11995)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (20-459)||(12640-13079)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (20-708)||(8527-9215)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (20-693)||(20727-21400)
scaffold0222 (20-705)||(193-878)
[»] scaffold0010 (7 HSPs)
scaffold0010 (21-708)||(39038-39723)
scaffold0010 (20-182)||(44656-44818)
scaffold0010 (31-275)||(4839-5083)
scaffold0010 (65-237)||(14382-14554)
scaffold0010 (436-567)||(14753-14884)
scaffold0010 (436-705)||(5244-5513)
scaffold0010 (602-687)||(180563-180648)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (20-693)||(990-1663)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (20-693)||(28003-28676)
[»] scaffold0243 (3 HSPs)
scaffold0243 (20-708)||(9477-10163)
scaffold0243 (33-237)||(24119-24323)
scaffold0243 (614-670)||(23686-23742)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (22-708)||(4912-5598)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (11-708)||(8165-8862)
scaffold0235 (11-708)||(18379-19076)
[»] scaffold0664 (2 HSPs)
scaffold0664 (22-687)||(6953-7618)
scaffold0664 (653-708)||(3-58)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (11-705)||(5506-6200)
[»] scaffold0053 (3 HSPs)
scaffold0053 (233-705)||(62478-62950)
scaffold0053 (20-498)||(65211-65689)
scaffold0053 (519-705)||(65028-65214)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (21-660)||(30077-30716)
[»] scaffold2062 (1 HSPs)
scaffold2062 (163-708)||(575-1125)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (21-694)||(10891-11564)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (20-708)||(22035-22723)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (22-705)||(164107-164790)
scaffold0023 (65-215)||(30770-30920)
scaffold0023 (33-239)||(47155-47360)
scaffold0023 (33-145)||(152007-152119)
scaffold0023 (436-498)||(30487-30549)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (22-708)||(53962-54648)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (21-705)||(251536-252217)
scaffold0009 (170-237)||(230026-230093)
scaffold0009 (436-498)||(229765-229827)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (20-448)||(11873-12301)
scaffold0165 (485-584)||(12322-12421)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (21-696)||(514068-514743)
scaffold0001 (26-211)||(441572-441757)
scaffold0001 (26-279)||(495939-496192)
scaffold0001 (609-693)||(442154-442238)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (20-552)||(325620-326151)
scaffold0004 (20-550)||(200338-200859)
scaffold0004 (371-708)||(319507-319844)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (21-708)||(375-1062)
[»] scaffold0523 (3 HSPs)
scaffold0523 (229-705)||(5562-6035)
scaffold0523 (11-234)||(2775-2998)
scaffold0523 (186-670)||(11484-11968)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (21-558)||(4998-5535)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (172-705)||(51716-52249)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (20-666)||(263139-263785)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (231-705)||(16761-17235)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (20-666)||(203294-203940)
scaffold0003 (65-237)||(424266-424438)
scaffold0003 (545-639)||(424746-424840)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (20-501)||(764-1245)
scaffold0203 (542-708)||(3754-3920)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (99-708)||(8724-9333)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (21-660)||(39972-40611)
scaffold0114 (33-237)||(17523-17726)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (21-639)||(4621-5239)
scaffold0348 (21-680)||(17215-17874)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (20-660)||(9538-10177)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (56-708)||(41684-42336)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (20-705)||(251-936)
scaffold0476 (31-237)||(10710-10916)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (62-666)||(6002-6606)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (20-708)||(53126-53814)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (21-702)||(66817-67498)
[»] scaffold0011 (7 HSPs)
scaffold0011 (314-708)||(153699-154093)
scaffold0011 (20-306)||(151480-151766)
scaffold0011 (20-237)||(23707-23924)
scaffold0011 (167-216)||(73792-73841)
scaffold0011 (167-216)||(78173-78222)
scaffold0011 (164-216)||(175708-175760)
scaffold0011 (171-216)||(182054-182099)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (368-705)||(4160-4496)
scaffold0017 (31-237)||(17240-17446)
scaffold0017 (32-215)||(195034-195217)
scaffold0017 (21-234)||(24220-24433)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (191-705)||(1193-1707)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (254-624)||(71-441)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (21-483)||(29848-30310)
scaffold0088 (533-708)||(30336-30511)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (127-704)||(1555-2132)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (425-705)||(5608-5888)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (20-252)||(14-246)
[»] scaffold1530 (2 HSPs)
scaffold1530 (20-320)||(496-796)
scaffold1530 (401-708)||(798-1105)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (20-257)||(20682-20919)
scaffold0261 (20-257)||(12502-12739)
scaffold0261 (317-705)||(12120-12506)
scaffold0261 (317-705)||(20300-20686)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (417-705)||(115934-116222)
scaffold0031 (20-224)||(110523-110727)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (21-483)||(11723-12173)
[»] scaffold0167 (2 HSPs)
scaffold0167 (20-240)||(1033-1253)
scaffold0167 (259-708)||(5205-5654)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (186-708)||(1310-1832)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (58-567)||(115513-116022)
scaffold0029 (20-309)||(93996-94285)
scaffold0029 (602-687)||(93618-93703)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (20-493)||(11743-12214)
[»] scaffold0585 (2 HSPs)
scaffold0585 (20-501)||(3999-4480)
scaffold0585 (496-698)||(574-775)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (384-708)||(245-569)
[»] scaffold0074 (3 HSPs)
scaffold0074 (20-252)||(15036-15268)
scaffold0074 (327-708)||(15292-15673)
scaffold0074 (26-282)||(6032-6288)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (464-705)||(3222-3463)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (26-567)||(3736-4274)
scaffold0130 (65-218)||(7972-8125)
scaffold0130 (436-486)||(7704-7754)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (25-242)||(9396-9613)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (11-202)||(49086-49277)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (259-708)||(2783-3226)
[»] scaffold2165 (1 HSPs)
scaffold2165 (194-696)||(518-1020)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (58-242)||(3-187)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (118-357)||(19023-19262)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (446-705)||(33078-33337)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (327-708)||(23626-24007)
[»] scaffold1845 (1 HSPs)
scaffold1845 (410-708)||(1007-1305)
[»] scaffold0529 (2 HSPs)
scaffold0529 (20-282)||(5001-5263)
scaffold0529 (608-705)||(5589-5686)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (20-234)||(17791-18005)
scaffold0040 (53-237)||(111081-111265)
scaffold0040 (436-705)||(18174-18443)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (20-705)||(6786-7471)
scaffold0270 (20-705)||(13916-14601)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (58-202)||(21802-21946)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (20-153)||(26025-26158)
[»] scaffold0282 (3 HSPs)
scaffold0282 (26-282)||(13608-13864)
scaffold0282 (436-672)||(13213-13449)
scaffold0282 (611-705)||(9828-9922)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (33-282)||(8336-8585)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (20-279)||(14398-14657)
[»] scaffold0018 (4 HSPs)
scaffold0018 (20-279)||(23430-23689)
scaffold0018 (20-211)||(9551-9742)
scaffold0018 (436-567)||(9195-9326)
scaffold0018 (609-694)||(9068-9153)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (31-237)||(36422-36628)
scaffold0079 (436-567)||(36827-36958)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (20-153)||(1132-1257)
[»] scaffold1423 (2 HSPs)
scaffold1423 (33-237)||(552-756)
scaffold1423 (610-659)||(130-179)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (33-237)||(4360-4564)
scaffold0621 (91-237)||(1-147)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (33-237)||(2437-2641)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (20-282)||(26265-26527)
scaffold0042 (31-237)||(36994-37200)
scaffold0042 (608-705)||(26853-26950)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (33-237)||(11054-11258)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (28-279)||(15111-15362)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (20-279)||(57746-58005)
scaffold0077 (436-705)||(57320-57589)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (20-279)||(15335-15582)
scaffold0293 (436-693)||(15739-15996)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (26-279)||(216552-216805)
scaffold0012 (436-705)||(216126-216395)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (33-237)||(1915-2119)
scaffold0324 (545-693)||(2427-2575)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (33-237)||(55644-55848)
scaffold0075 (436-670)||(48059-48293)
[»] scaffold0550 (2 HSPs)
scaffold0550 (31-237)||(10332-10538)
scaffold0550 (436-498)||(10071-10133)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (31-237)||(29102-29308)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (67-237)||(1959-2129)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (31-237)||(22171-22377)
[»] scaffold0100 (3 HSPs)
scaffold0100 (436-669)||(16351-16584)
scaffold0100 (180-282)||(16738-16840)
scaffold0100 (20-183)||(21413-21576)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (69-237)||(14873-15041)
scaffold0403 (545-659)||(15349-15463)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (20-216)||(13997-14193)
scaffold0120 (134-237)||(11291-11394)
scaffold0120 (171-216)||(25242-25287)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (33-237)||(8149-8353)
[»] scaffold0080 (7 HSPs)
scaffold0080 (33-237)||(54563-54767)
scaffold0080 (31-236)||(31807-32012)
scaffold0080 (65-236)||(37307-37478)
scaffold0080 (65-237)||(10412-10584)
scaffold0080 (65-237)||(13067-13239)
scaffold0080 (436-498)||(10152-10214)
scaffold0080 (436-498)||(12807-12869)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (65-237)||(7194-7366)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (62-237)||(40681-40856)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (33-237)||(8876-9077)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (474-639)||(2198-2363)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (33-234)||(104153-104354)
scaffold0006 (442-705)||(104561-104824)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (33-213)||(24910-25090)
scaffold0218 (171-216)||(1147-1192)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (33-237)||(7913-8117)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (31-235)||(17861-18065)
scaffold0028 (31-237)||(11393-11599)
scaffold0028 (161-237)||(55058-55134)
scaffold0028 (31-99)||(53651-53719)
[»] scaffold0273 (3 HSPs)
scaffold0273 (68-215)||(1-148)
scaffold0273 (436-498)||(369-431)
scaffold0273 (608-666)||(541-599)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (31-237)||(10292-10498)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (31-237)||(8182-8388)
[»] scaffold0044 (4 HSPs)
scaffold0044 (31-237)||(3348-3554)
scaffold0044 (65-237)||(17118-17290)
scaffold0044 (436-567)||(17489-17620)
scaffold0044 (545-639)||(3859-3953)
[»] scaffold0609 (2 HSPs)
scaffold0609 (461-669)||(7911-8119)
scaffold0609 (412-536)||(1244-1368)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (31-215)||(34911-35095)
scaffold0022 (33-237)||(41558-41762)
scaffold0022 (33-237)||(75278-75482)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (67-218)||(942-1093)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (20-131)||(3450-3561)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (80-237)||(3524-3681)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (33-237)||(18576-18780)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (65-237)||(13298-13470)
scaffold0109 (31-237)||(41079-41285)
scaffold0109 (436-498)||(13037-13099)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (31-237)||(1206-1412)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (596-698)||(748-850)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (33-207)||(4509-4683)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (596-698)||(25949-26051)
[»] scaffold2059 (2 HSPs)
scaffold2059 (65-237)||(943-1115)
scaffold2059 (436-567)||(613-744)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (69-237)||(21566-21734)
scaffold0081 (69-237)||(36990-37158)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (31-234)||(65-268)
[»] scaffold1914 (1 HSPs)
scaffold1914 (404-645)||(996-1237)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (542-708)||(1-167)
[»] scaffold0177 (3 HSPs)
scaffold0177 (69-234)||(11533-11698)
scaffold0177 (436-498)||(11269-11331)
scaffold0177 (436-498)||(14954-15016)
[»] scaffold1881 (2 HSPs)
scaffold1881 (65-217)||(674-826)
scaffold1881 (436-651)||(240-455)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (151-282)||(11072-11203)
scaffold0507 (545-705)||(11466-11626)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (96-237)||(15753-15894)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (596-698)||(30741-30843)
scaffold0180 (413-529)||(30895-31011)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (436-705)||(1128-1397)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (33-126)||(3527-3620)
[»] scaffold1274 (1 HSPs)
scaffold1274 (509-705)||(20-215)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (161-237)||(48719-48795)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (150-237)||(2907-2994)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (571-702)||(17703-17834)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (440-524)||(36161-36245)
[»] scaffold0605 (2 HSPs)
scaffold0605 (191-242)||(1364-1415)
scaffold0605 (410-663)||(1583-1836)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (31-122)||(12587-12678)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (533-708)||(13757-13932)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (436-498)||(208-270)
[»] scaffold1600 (1 HSPs)
scaffold1600 (509-705)||(468-664)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (436-567)||(117-248)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (436-630)||(139391-139585)
scaffold0008 (436-474)||(179-217)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (171-216)||(2635-2680)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (608-669)||(2252-2313)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (171-240)||(13502-13571)
scaffold0467 (171-216)||(816-861)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (171-216)||(5000-5045)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (177-218)||(171188-171229)
scaffold0019 (436-478)||(171447-171489)
[»] scaffold0947 (1 HSPs)
scaffold0947 (653-708)||(1252-1307)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (438-497)||(445-504)
[»] scaffold0789 (1 HSPs)
scaffold0789 (170-237)||(1-68)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (436-639)||(5327-5530)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (436-498)||(13945-14007)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (628-702)||(16232-16306)
[»] scaffold0848 (1 HSPs)
scaffold0848 (443-536)||(4874-4967)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (171-216)||(5499-5544)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (171-216)||(26460-26505)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (171-216)||(35149-35194)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (171-216)||(24027-24072)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (610-659)||(2732-2781)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (171-216)||(8221-8266)
scaffold0021 (171-216)||(90566-90611)


Alignment Details
Target: scaffold0108 (Bit Score: 559; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 559; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 705
Target Start/End: Original strand, 50009 - 50703
Alignment:
Q  11 agatggacatcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50009 agatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaacaattt 50108  T
Q  111 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 210  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50109 ctcctttcatatcagatacaactagccccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 50208  T
Q  211 attattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggc 310  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50209 actattaaagaaacaagtacctctaataagtcggtcctcattcactgtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggc 50308  T
Q  311 tgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacc 410  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  50309 tgggtacactacgaactgatatgaccttcctcattgcagttgtagcaaacaatatccccacgcttacaatcagctaaggtgtgtcctttctgaccacacc 50408  T
Q  411 tgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttggg 510  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50409 tgaaacacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggtctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttggg 50508  T
Q  511 cctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcacc 610  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50509 cctcctctcatcattccatctatgcttacccttgtcagcaggggcactatacggcttcggaccactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcacc 50608  T
Q  611 ttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50609 ttgtaatgagctttcgtatcttcttcatagatcctacagctgcttaccaactcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 50703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 530; Significance: 0; HSPs: 90)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 530; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 16825906 - 16825210
Alignment:
Q  11 agatggacatcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825906 agatcgacttcaaagtctctaccaattatagacaacggacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 16825807  T
Q  111 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16825806 atcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcactagtatctataatagcaattaaaggagt 16825707  T
Q  211 attat--taaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttag 308  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825706 actatattaaagaaacaagtacctctgataagtcagtcctcattcaccgtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttag 16825607  T
Q  309 gctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccaca 408  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||    
T  16825606 gctgcgtacactgcaaactgatatgaccttcctcattgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcagctaaagtgtgtccttttttaccaca 16825507  T
Q  409 cctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttg 508  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16825506 cctgaagcacttcttctcatcacggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcatcttg 16825407  T
Q  509 ggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatca 608  Q
    |||||| ||||||| |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16825406 ggcctcctctcatctttcaatctctacttacccttgtcaggaggggcactatacggcttcggacgactcagctgtcccttgcctctgcgctcactcatca 16825307  T
Q  609 ccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825306 ccttgtaatgagctttcgtatcttcttcatagatcctacagctgcttaccaactcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 16825210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 14291157 - 14290463
Alignment:
Q  11 agatggacatcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291157 agatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 14291058  T
Q  111 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14291057 ctcctttcatatcagatataaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcactagtgtctataatagcaattaaatgagt 14290958  T
Q  211 attattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggc 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14290957 actattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcacggtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgtccgaaccttcttaggc 14290858  T
Q  311 tgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacc 410  Q
    | | | |||| |||  | ||||| || || || |   | || ||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  14290857 ttcttgcactgcgagctaatatgtccctcttcatcacaattatagcaaataacatccccacgcttacaatcagctaaagtgtgtcctttctgtccacacc 14290758  T
Q  411 tgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttggg 510  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  14290757 taaagcacttcttctcatctcaatcacacacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaataatctcagtaggagcatctctcctcttagg 14290658  T
Q  511 cctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcacc 610  Q
    |||| ||||||||||||  || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  14290657 cctcctctcatcattcagcctctgtttacctttgtcagcaggagcactatacggtttcggacgactctgctgtcccttacctctgcgctcactcatcact 14290558  T
Q  611 ttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14290557 ttataatgagctttggtatcctcttcatagattctacaactgctttccaattcagaaaaatttcttatcttttgataaccaatagccctcttgat 14290463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Original strand, 12180857 - 12181545
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12180857 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacatcttggacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtgtcaacaaccatttctcctttca 12180956  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12180957 tattagatacaaacagacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaactaaaggagtactattaaa 12181056  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |    | || ||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  12181057 gaaacaagtacctctgataagtcggtcctcactagtggtttacgtaccagtcaaagcaaacactttaccaccggtcctaaccttcttcggttgcgtacac 12181156  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| | || || ||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12181157 tacgaactgatatgaccttccttgttgcaattataacaaacaatgtccccaagcttacaatcagctagtgtgtgtcctttccgaccacaactgaagcact 12181256  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12181257 tcttctcatctctatcacagactttactcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaaaaatgtcagtaggagcatctctcctcttggtcctcctctc 12181356  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||| || || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12181357 atcatttaacctctacttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcagacgactctgttgtcccttgcctcttcgttcactcatcaccttgtaatga 12181456  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  12181457 gctttcgtgtcctcctcataaatcctacagccgcttaccaattcagagaagttccttattttctgatagccaatggttctcttgatgtc 12181545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 705
Target Start/End: Original strand, 17494159 - 17494848
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagttt-caacaaccatttctcctttc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17494159 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacatcttagacaaacaagagaattagttactgaacccttagctggagttttcaacaaccatttctcctttc 17494258  T
Q  119 atatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17494259 atatcagatacaaccagacccaatttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaa 17494358  T
Q  219 agaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtaca 318  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||| | |  | |||||||| ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  17494359 agaaacaagtacctctgataagcatgtcctcactaatggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggtcctaaccttcttcggttgagtaca 17494458  T
Q  319 ctacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcac 418  Q
    || |||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||| ||| |||  |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17494459 ctgcgaactaatatgaccttcctcgttgcagttatagcaaacaatgtctccacacttacagtcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctg-agcac 17494557  T
Q  419 ttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttct 518  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17494558 ttcttctcatctctatcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacatttgaagcaaacaatctcagtatgagcatctctcctcttgggcctcctct 17494657  T
Q  519 catcattcaatctatgcttaccgtt----gtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgt 614  Q
    ||||||| || || |||||||| ||    | ||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17494658 catcatttaacctctgcttacccttctcagccagcaggagcactatatggcttcgaacgactttgttgtcccttggctctgcgctcactcatcaccttgt 17494757  T
Q  615 aatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17494758 aatgagctttggtatcctcctcatagattctacagctgcttaccaactcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatggctctcttgat 17494848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 12358143 - 12357455
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12358143 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttttcctttca 12358044  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  12358043 tatcagatacaaccagacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcactagtgtctataatagcaattaaaggtgtactattaaa 12357944  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |    | |||||||| ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  12357943 gaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggtcctaaccttcttcggttgtgtacac 12357844  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12357843 tgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttatagcaaacaacgtctccccgcttacaatcagctaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcact 12357744  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12357743 tcttctcatctttatcacagacattactcttgtggcctttttcgccacacttgtagcaaacaatctcagcaggagtatctctcctcttgggcctcctctc 12357644  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    ||||||||  || | ||| || ||||||||||| |||||||| || ||   ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12357643 atcattcagcctctactttcccttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgatgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaatga 12357544  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||  |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||    
T  12357543 gctttagtgtcttcttcatatatcctgcagctactcaccaaatcagagaaaattcttatcttctgatacctaatggctctcttgatgtc 12357455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 31692801 - 31692113
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31692801 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacacaagagaagtagttactgaacccttagctgaagtttcaacaaccatttctcctttca 31692702  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31692701 tatcagatacaaccagacccgacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccaatatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 31692602  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |    | |||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31692601 gaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggctgcgtacac 31692502  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| ||||||| || ||||| ||| |||| || |||||||  || |||| ||| || ||| ||| ||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  31692501 tgtgaactgatatggccctcctcattgcagttataacaaacaacatcaccactcttgcagtcagctagagtgtgtcccttctaaccacacctgaaacact 31692402  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||| || ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  31692401 tcttctcatctttggtacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacgatctcagcagaagcatttctcctattgggcctcctctc 31692302  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||  || || |||||||||||||| ||||||    
T  31692301 atcattcaacttctgcttccctttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgctccttcgatcactcatcaccttataatga 31692202  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  31692201 gctttcgtgtcctcctcatagattctgcagctacttaccaattcagagaagtttctgatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 31692113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Original strand, 31941416 - 31942104
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31941416 tcaaagtctctgccaaacatagacaacgggcaccttagacacacaagagaagtagttactagacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 31941515  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31941516 tatcagatacaaccagacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaaaaatgagtagcatcagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 31941615  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |    | |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31941616 gaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggctgcgtacac 31941715  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    || ||| ||||||| || ||||| ||| | || || |||||||  || |||||||| || ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  31941716 tatgaactgatatggccctcctcattgcaattataacaaacaacatcaccacgcttgcagtcagctagagtgtgtcccttctgaccacacctgaaacact 31941815  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  31941816 tcttctcatctttggtacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaacgatctcagcaggagcatttctcctattgggcctcctctc 31941915  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||||||  | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | ||| ||||  || || |||||||||||||| ||||||    
T  31941916 atcattcaacttctgcttccctttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctatcctttgctccttcgatcactcatcaccttataatga 31942015  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  31942016 gctttcgtgtcctcctcatagattctgcagctacttaccaattcagagaagtttctgatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 31942104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 12858111 - 12857434
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12858111 tcaaagtcactaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccgtttctccattca 12858012  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12858011 tatcagatataaccagaaccaacttatatgcacaaaccacagcaatgaaacaataactagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 12857912  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | | |||    
T  12857911 gaaacaagtacctctgataagt-cgtcctcattaacagtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcagagccttcttaggcttcctgcac 12857813  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |||||  | ||||||||||| || |   | |||||||||||||| || | |||||| || ||| |||   |||||||||||   ||||| | ||| ||||    
T  12857812 tacgagctaatatgaccttcttcatcacaattgtagcaaacaatatcacgacgcttgcactcagctattatgtgtcctttctttccacatcggaaacact 12857713  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  12857712 tcttctcatcacagtcacatacattactcatgtggcccttttcaccacacttgaaacagacaatctcagtaggagcatctctccttttaggcctcctctc 12857613  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||||| ||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12857612 atcattcagtccttgtttacctttgtcagcaggagcactatacggttttggacgactctactgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttataatga 12857513  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccc 698  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||  |||||||||| || || ||||| ||||    
T  12857512 gcttttgtatcctcctcatagattctacagctactcaccaaatcaaaaaaaattcttatcttttggtagccaatggccc 12857434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 18131958 - 18131275
Alignment:
Q  24 agtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatc 123  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18131958 agtctctaccaaacatagacaacagacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccgtttcccctttcatatc 18131859  T
Q  124 agatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18131858 agatacaaccagacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccag-gtctataatagcaattaaaggagtactattaaagaaa 18131760  T
Q  224 caagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacg 323  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |    | |||||||| ||||| || |||||| || ||||| || |||||||||||  | || ||||||| ||    
T  18131759 caagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagtaaacactttaccaccggttctaaccttcttcagttgagtacactgcg 18131660  T
Q  324 aattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttctt 423  Q
    || | ||||||| |||||| ||| |||| ||||| || |  |||||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18131659 aactaatatgactttcctcattgcagttatagcacactacatccccacgcttacaattagctaatgcgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttctt 18131560  T
Q  424 ctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatca 523  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  18131559 ctcatctttatcacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtagcaatcaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatta 18131460  T
Q  524 ttcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctt 623  Q
    |||| ||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||   ||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  18131459 ttcagtctctgttttcctttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgctgtcctttacctctccgttcactcatcactttgtaatgagctt 18131360  T
Q  624 ttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    | || || |||||||| |||||||| || || ||||  ||||| ||  |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  18131359 tagtgtcttcttcatatatcctacagctactcaccatatcagagaaaattcttatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 18131275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 165 - 705
Target Start/End: Original strand, 35982839 - 35983379
Alignment:
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgt 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  35982839 tgaaacaatgagtagtaccagtatctataatagcaattaaaagagtactattaaagaaacaagtatctctgataagtcggtcctcattcaccgtttgcgt 35982938  T
Q  265 acgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatg 364  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||     
T  35982939 aacagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacaatgcgaactaatatgtccttcctcattacagttgtagcaaacaata 35983038  T
Q  365 tccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcac 464  Q
    ||||||||||| |||||| | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  35983039 tccccacgcttgcaatcagccaatgtgtgtcctttctgtccacatctgaaacacttcttctcatctcggtcacacacattactcttgtggcctttctcac 35983138  T
Q  465 cacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacgg 564  Q
    |||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  35983139 cacacttgaagcaaataatcacagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcagcctctgtttacctttgtcagcaggagcactatacgg 35983238  T
Q  565 cttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattca 664  Q
     |||  || |||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  35983239 tttcggacaactctgctgtcccttacctctgcactcactcatcactttataatgagctttggtatcctcttcatagattctacaactgcttaccaattca 35983338  T
Q  665 gaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35983339 gaaaaatttcttatcttatgataaccaatagccctcttgat 35983379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 21 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 11958796 - 11958112
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |   |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11958796 caaagtctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 11958697  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11958696 atcagatacaatcaaacccaacttatatgcactttctaaagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggattactattaaag 11958597  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  11958596 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggtcctagccttcttcggctgagtacact 11958497  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
    | ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||  || ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11958496 atgaactgatatgactttcttcgttgcagttgtagcagacaatgtcctcacgcttacattcagctagtgtatgtcctttctgaccacacctgaaacactt 11958397  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | |||||||||   ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||| | |||    
T  11958396 cctctcatctctaccacaagcattgcttttgtggcctttttcaccacacttataacaaacaatttcagcaggagcatctctcctcttaagcctcctatca 11958297  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    ||||||| ||| || || || ||||||||||| ||||| || || ||   |||| |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||     
T  11958296 tcattcattctctgtttccctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgctgtcccttacctctcctctcactcatcaccttgtaatgaa 11958197  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||||||| || || ||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||   ||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  11958196 cttttgtgtcttcctcataaatcccgcagctgcttaccaactcagagaaaactctaatcttctgatacccaatagctcttttgat 11958112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 58 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 16327287 - 16326641
Alignment:
Q  58 acaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatca 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||     
T  16327287 acaaacaagagaagtagttactgaacccttagttggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaatcaaacccaacttatatgcactttct 16327188  T
Q  158 acagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactg 257  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    |    
T  16327187 aaagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctaataagtcggtcctcattggtag 16327088  T
Q  258 attgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagca 357  Q
      ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||  ||||||| |||| |||||||||| ||  | ||| ||||||||||    
T  16327087 tctgcgtaccagtcaatgcaaacacctttccaccagttctaaccttcttcggcttagtacactgcgaactgatatgaccctctccattgcagttgtagca 16326988  T
Q  358 aacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcct 457  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || ||| |||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  16326987 gacaatgtccccacgcttacattcagctaaattgtgtcccttctgaccacacctgaaacatttcctctcatctctaccacaaacattgctcttgtggcct 16326888  T
Q  458 ttttcaccacacttgaaacaaacaa-tatcagtaggagca-tctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggc 555  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||   | ||||| || ||||||||||| ||    
T  16326887 ttttcaccacacttataacaaacaagtctcagcaggagcagtctctcctcttgggtctcctatcatcattcaccttttgctttcctttgtcagcaggagc 16326788  T
Q  556 actatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgctt 655  Q
    ||| |  |||||   ||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| ||    
T  16326787 actgtcaggcttaggacgactctgctgtcccttgcccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaatcctgcaactgttt 16326688  T
Q  656 accaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctctt 702  Q
    ||||| ||||| |||  ||| |||| |||||| |||||||| |||||    
T  16326687 accaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctctctt 16326641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 20 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 16832144 - 16831484
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |   |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16832144 tcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcttctttca 16832045  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16832044 tatcagatacaatcaaacccaacttatatgcactttctaaagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 16831945  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    |  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |||    
T  16831944 gaaacaagtacctctgataagacggtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccagttctaaccttcttcggctgtgtgcac 16831845  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  | | ||||||| || || |||||| |||| || || ||||  || |||||||| || ||  ||||   ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  16831844 tgtgtactgatatggccctcttcgttgcagttataacatacaacatcaccacgcttgcagtccgctaacacgtgacccttctgaccacacctgaagcact 16831745  T
Q  420 tcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttct 518  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||| |||    
T  16831744 tcttctcatccttggt-acaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacaaactatctcagcaggagcatctctcctattcggcctcctct 16831646  T
Q  519 catcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatg 618  Q
    ||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||   | ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16831645 catcattaagtctctgcttacccttatcagcaggggcactatacggcttaggatgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatg 16831546  T
Q  619 agcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatct 680  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  16831545 agctttggtgtcctcctcatagatcctgcaacgacttaccaaatcagagaaaattcttatct 16831484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 20 - 703
Target Start/End: Original strand, 17188887 - 17189570
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |   |||| || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  17188887 tcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacgagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcaacaaccatctctccctcca 17188986  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17188987 tatcagatacaatcaaacccaatttatatgcacattctaaagcaatgaaacaatgagtagcacccgtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 17189086  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    | |||||||| |||||| |||||||| || ||||| || |||| |||||| ||||| ||||||    
T  17189087 gaaacaagtacctctgataagcctgtcctcattagtagtttgcgtaccagtcaacgcaaacactttcccaccggttctaatcttctttggctgagtacac 17189186  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| |||| || || ||||| |   | || || |||||||  || || | ||| || | | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17189187 tgtgaactgatgtggccctcctcatcacaattataacaaacaacatcaccccacttgcagttagccaacgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcact 17189286  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||||  |  |||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17189287 tcttctcatctttggtacaaacgttacttttgtggcctttctcgccacacttaaaacaaacaatatcaacaggagcatctctcctcttggacctcctctc 17189386  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||| |||||| ||||| |||||||||  ||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17189387 atcattaaatctctgctttcccttgttagcaggagcactgtacggcttcggacgactctgctggcccttgcctctgcggtcactcatcaccttgtaatga 17189486  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttg 703  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  17189487 gcttttgtgtcctcttcatagattctacagctacttaccaactcaaagaagtttctgatcttctggtatccaatagccctcttg 17189570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 21 - 708
Target Start/End: Original strand, 10408482 - 10409169
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10408482 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcacacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 10408581  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10408582 atcagatacatccaaacccaacttatatgcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaag 10408681  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||    |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||  | |||  |||||| ||||  | |||||    
T  10408682 aaacaagtacctctgataagttggtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacact 10408781  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| |||||||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  10408782 gtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcactt 10408881  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  10408882 cctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacatttgtaacaaacaatctcagctggagcatctctcctcttgggcctcctatca 10408981  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||  ||   | || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||   ||||||||| |||||||| || || | ||||||||| | |||||||||||    
T  10408982 tcacccatcttctgtttacccttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctggtgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgag 10409081  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||| || || |||||||| || || || ||  | ||||| ||||||||   ||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  10409082 ctttggtgtcttcttcatagattctgcacctattaaccaactcagaaaaaactctgatctgctgatatccaatagctcttttgatgtc 10409169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 705
Target Start/End: Original strand, 24189817 - 24190501
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |   |||| || | |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  24189817 tcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacgagaaaagtagtcactgaacccttagctggagtctcaacaaccatctctcccttca 24189916  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24189917 tatcagatacaatcaaacccaatttatatgcacattctaaagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 24190016  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||    |  ||||||| |||||| |||||| | || ||||| || |||| |||||| ||||| ||||||    
T  24190017 gaaacaagtacctctgataagcctgtcctcgttagtagtctgcgtaccagtcaacgcaaactctttcccaccggttctaatcttctttggctgagtacac 24190116  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| |||| || || ||||| |   | || || |||||||  || || | ||| || | | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24190117 tgtgaactgatgtggccctcctcatcacaattataacaaacaacatcaccccacttgcagttagccaacgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcact 24190216  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||||  |  |||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  24190217 tcttctcatctttggtacaaacgttacttttgtggcctttctcgccacacttaaaacaaacaatatcaacaggagcatctctcctcttgtacctcctctc 24190316  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| ||  |||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  24190317 atcattcaatctctgctttcccttgtcagcaggagcactgtacggcttcggacgactctgctg-gccttgcctctgcggtcagtcatcaccttgtaatga 24190415  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  24190416 gctttcgtgtcctcttcatagattctacagctacttaccaaatcagagaagtttctgatcttctggtatccaatagccctcttgat 24190501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 21 - 708
Target Start/End: Original strand, 28756833 - 28757520
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28756833 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccgtagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 28756932  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28756933 atcagatacatccaaacccaacttatatgcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaag 28757032  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| |||||||||||||||||| || ||  | |||  |||||| ||||  | |||||    
T  28757033 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttcccccaattctagtcttcttcggctcaggacact 28757132  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| | |||||||||||  | ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  28757133 gtgaactaatatgaccttctccattgcaattgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcactt 28757232  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28757233 cctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatca 28757332  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||  ||   | ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||   |||| ||||||||||||| || || | ||||||||| | |||||||||||    
T  28757333 tcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgag 28757432  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||| || || |||||||| || || || ||  | ||||| ||||| |||  ||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  28757433 ctttggtgtcttcttcatagattctgcacctattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 28757520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 21 - 708
Target Start/End: Original strand, 47126458 - 47127145
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47126458 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 47126557  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47126558 atcagatatatccaaacccaacttataagcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaag 47126657  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||    |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||  | |||  |||||| ||||  | |||||    
T  47126658 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcgttaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttaccaccaattctagtcttcttcggctcaggacact 47126757  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| |||||||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  47126758 gtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcactt 47126857  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  47126858 cctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatca 47126957  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||  ||  || ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||   |||| ||||||||||||| || || | ||||||||| | ||| |||||||    
T  47126958 tcacccatcctctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgag 47127057  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||| || || |||||||| || || || ||  | ||||| ||||| |||  ||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  47127058 ctttggtgtcttcttcatagattctgcacctattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 47127145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 693
Target Start/End: Original strand, 15230116 - 15230789
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  15230116 tcaaaatctctacaaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttaatgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccactca 15230215  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||   || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15230216 tacttgacataaccagacccaacttatatgcaaaatcaacagcaatgaaacaatgtgtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 15230315  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||| || |   | ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| | | ||     
T  15230316 gaaacaagtacctatgataagtcaatcctcattaaccgtccgtgtaccggtcaatgcaaacacctttccacctgtctgatccttcttaggcttcctgcat 15230415  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||  | | ||||||||| || |   | ||| |||||||||| || |||||||| || ||| |||  || || ||||||   ||||| | ||| ||||    
T  15230416 tgcgagctaagatgaccttcttcatcacaattgaagcaaacaatatcaccacgcttgcattcagctatcgtatgccctttcttcccacatcagaaacact 15230515  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    | |||||||| |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||| | ||||| |||||| ||||    
T  15230516 ttttctcatcaccattacaaacattactcttgtggcccttttcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggaacatcttttctcttaggcctcctctc 15230615  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||   |||||  ||||| || |||   ||   ||||||||| ||||| ||||||    
T  15230616 atcatttaatctttgcttccctttgtcagcaggagcactatagggcttaggacgaccttgttggcctttgttcctcttctcactcataaccttataatga 15230715  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaat 693  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||  |||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  15230716 gctttggtatcctcctcatagattctacagctactccccaactcagaaaattgtctgatcttctgataaccaat 15230789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 693
Target Start/End: Original strand, 15235984 - 15236657
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  15235984 tcaaaatctctacaaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttaatgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccactca 15236083  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||   || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15236084 tacttgacataaccagacccaacttatatgcaaaatcaacagcaatgaaacaatgtgtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 15236183  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||| || |   | ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| | | ||     
T  15236184 gaaacaagtacctatgataagtcaatcctcattaaccgtccgtgtaccggtcaatgcaaacacctttccacctgtctgatccttcttaggcttcctgcat 15236283  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||  | | ||||||||| || |   | ||| |||||||||| || |||||||| || ||| |||  || || ||||||   ||||| | ||| ||||    
T  15236284 tgcgagctaagatgaccttcttcatcacaattgaagcaaacaatatcaccacgcttgcattcagctatcgtatgccctttcttcccacatcagaaacact 15236383  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    | |||||||| |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||| | ||||| |||||| ||||    
T  15236384 ttttctcatcaccattacaaacattactcttgtggcccttttcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggaacatcttttctcttaggcctcctctc 15236483  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||   |||||  ||||| || |||   ||   ||||||||| ||||| ||||||    
T  15236484 atcatttaatctttgcttccctttgtcagcaggagcactatagggcttaggacgaccttgttggcctttgttcctcttctcactcataaccttataatga 15236583  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaat 693  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||  |||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  15236584 gctttggtatcctcctcatagattctacagctactccccaactcagaaaattgtctgatcttctgataaccaat 15236657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 61 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 11949500 - 11949107
Alignment:
Q  61 aacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaaca 160  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  11949500 aacaagaaaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcatatcagatacaaccagacccaacttataaccacattcaata 11949401  T
Q  161 gcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgatt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |    | ||    
T  11949400 gcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagttgatcctcactagtggttt 11949301  T
Q  261 gcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaac 360  Q
    |||||| ||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||| | || |||||||| | || |||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  11949300 gcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccgatcctaaccttcttcgtctacgtacactgcaaactgatgtgaccttcctcattgcagttatagcaaac 11949201  T
Q  361 aatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtgg 454  Q
    ||  || || |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||    
T  11949200 aacatctccccgcttacaatcagctaatatgtgtcctttctgaccacatctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtgg 11949107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 8745006 - 8744378
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | | |||| || |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8745006 tcaaaatctctaccaaacatagaaattggacacctcaagcaaacaagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 8744907  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||| |||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8744906 tatcagacacaatcaaacccaacctatatgcactttctaaagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 8744807  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||  | |  || |||| |||||||||||| || || |||||    ||||||||||| || || || |||    
T  8744806 gaaacaagtacctctgatgagacggtcctcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggttgtgtgcac 8744707  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  | | |||| || || || || ||  | || ||||| ||||  || || ||||| |||||  |||   |||| || ||| | ||||| ||||| ||||    
T  8744706 tgagtactgatgtggccctcttcattacaattatagcatacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacatctgaaacact 8744607  T
Q  420 tcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttct 518  Q
    ||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || || || || |||| ||||||||| ||| |  | |||||| |||    
T  8744606 tcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtgacctttctcgccacacttaaagcacactatctcagcaggagcatccctcttactcggcctcctct 8744508  T
Q  519 catcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatg 618  Q
    ||||||| | ||| |||||||| || ||||  |||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  8744507 catcattaagtctctgcttacccttatcagtcggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcactttataatg 8744408  T
Q  619 agcttttgtatcctcttcataaatcctaca 648  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||    
T  8744407 agctttggtgtcctcctcgtagatcctaca 8744378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 648
Target Start/End: Original strand, 13944537 - 13945165
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | | |||| || |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13944537 tcaaaatctctaccaaacatagaaattggacacctcaagcaaactagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccttcca 13944636  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||| |||| || |||||  ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13944637 tatcagacacaatcaaacccagtttataagcacattctaaagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 13944736  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||  | |  || |||| |||||||||||| || || |||||    ||||||||||| ||||| || |||    
T  13944737 gaaacaagtacctctgatgagacggtcctcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcac 13944836  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  | | |||| || || || || ||  | || ||||| ||||  || || ||||| |||||  |||   |||| || ||| | ||||| ||||| ||||    
T  13944837 tgagtactgatgtggccctcttcattacaattatagcatacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacatctgaaacact 13944936  T
Q  420 tcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttct 518  Q
    ||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || || || || |||| ||||||||| ||| |  | |||||| |||    
T  13944937 tcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtgacctttctcgccacacttaaagcacactatctcagcaggagcatccctcttactcggcctcctct 13945035  T
Q  519 catcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatg 618  Q
    ||||||| | ||| |||||||| || ||||  |||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13945036 catcattaagtctctgcttacccttatcagtcggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatg 13945135  T
Q  619 agcttttgtatcctcttcataaatcctaca 648  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||    
T  13945136 agctttggtgtcctcctcgtagatcctaca 13945165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 216
Target Start/End: Original strand, 12272842 - 12273047
Alignment:
Q  11 agatggacatcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12272842 agatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 12272941  T
Q  111 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12272942 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttaaatgcatagtcaacaacaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 12273041  T
Q  211 attatt 216  Q
    | ||||    
T  12273042 actatt 12273047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10417655 - 10417367
Alignment:
Q  26 tctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcag 125  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10417655 tctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacaccagagaagtagtcactgaacccttggctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcag 10417556  T
Q  126 atacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaaca 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10417555 atacaatcagacccaacttatatgcacactctaaagcaatgaaacaatgtgtagcaccggtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaagaaaca 10417456  T
Q  226 agtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcg 314  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||    |  ||||||| |||||||||||| || || || || || || ||||||||||| ||||    
T  10417455 agtacctctgataagtcgatcctcattggtagtctgcgtaccagtcaaagcaaatacttttcctccagttctgaccttcttaggttgcg 10417367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16378550 - 16378318
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | | |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16378550 tcaaaatctctaccaaacatagatattggacacctcaagcaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttaa 16378451  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  16378450 tatcagatacaatcaaacccaacttatatgcactttctaaagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctatgatagcaattaaaggagtactattaaa 16378351  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcatt 252  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  16378350 gaaacaagcacctctgataagacggtcctcatt 16378318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12510098 - 12509867
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  ||||| |  | |||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12510098 caaaatctctaccaaacatagatataagacaccccaaacaaaccagagaagtggttgctgaaatcttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 12509999  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12509998 atcagatacatccaaacccaacttataggcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaag 12509899  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcatt 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12509898 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcatt 12509867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 84 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13318086 - 13317864
Alignment:
Q  84 ccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcacc 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  13318086 ccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaatcaagcccaacttatatgcacattctaaagcaatgaaacaatgagtagcacc 13317987  T
Q  184 agtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacacc 283  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    |  ||||||| |||||||||||||||     
T  13317986 agtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagacggtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacact 13317887  T
Q  284 ttgccacctgtcctaaccttctt 306  Q
    || ||||| || || ||||||||    
T  13317886 tttccaccagttctgaccttctt 13317864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 158
Target Start/End: Original strand, 14575499 - 14575637
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14575499 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 14575598  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaa 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14575599 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaa 14575637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 368 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 16384640 - 16384342
Alignment:
Q  368 ccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatc-tcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcacca 466  Q
    |||||||| |||||| | ||  |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||| |||| || |||    
T  16384640 ccacgcttgcaatcagccaacatgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtggactttctcgcca 16384542  T
Q  467 cacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggct 566  Q
    ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  16384541 cacttaaaacaaactatctcagcaggagcatctctcctattcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactgtatggct 16384442  T
Q  567 tctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcaga 666  Q
    |   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||| |  |||||||| |||||    
T  16384441 taggacgactctgttgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttgctgtcctcctcatagatcctacagcaacttaccaaatcaga 16384342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 237
Target Start/End: Original strand, 15262133 - 15262350
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  15262133 tcaaaatctcgaccaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccattagctggagtttcgacaaccatctctccattca 15262232  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||  || | | | |||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||    
T  15262233 tatttgacatagcaagacccaacttagaagcacaatcaatagcaataaaacaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtactatcaaa 15262332  T
Q  220 gaaacaagtacctctgat 237  Q
      |||| |||||||||||    
T  15262333 ataacatgtacctctgat 15262350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12843717 - 12843513
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||| ||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||  || | | |    
T  12843717 caaacataaacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcactgaaccattagctggagtttcaacaatcatctctccattcatatttgacatagc 12843618  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||| |||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  || ||| |||  |||||||||||    
T  12843617 aagatccaacttagaagcacaatcaatagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtatactatcaaaataacaagtacct 12843518  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  12843517 ctgat 12843513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15345861 - 15345655
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  15345861 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 15345762  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  15345761 acaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 15345662  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  15345661 ctctgat 15345655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 16638287 - 16638493
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  16638287 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 16638386  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||   | |  ||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  16638387 acaagacccaaagcagaaacacaatcaaaagcaataaagcaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 16638486  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  16638487 ctctgat 16638493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 24185704 - 24185910
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||||  | ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  24185704 accaaacatagacaaaggacaacgcaaacatacgagagaagtagtcaccaaacccttagctggagtttcaacgaccatctctccattcatatcagacaaa 24185803  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||  || |  ||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  24185804 tcaagacccaaagtagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgagtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 24185903  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  24185904 ctctgat 24185910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 43165189 - 43165395
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  43165189 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 43165288  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  43165289 acaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 43165388  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  43165389 ctctgat 43165395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 48427961 - 48428167
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  48427961 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 48428060  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  48428061 acaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 48428160  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  48428161 ctctgat 48428167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 218
Target Start/End: Original strand, 15065585 - 15065772
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  15065585 accaaacatagacaaaggacatttcaaacaaacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagattcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 15065684  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaa 218  Q
    || ||||||||   | | |||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15065685 acaagacccaaagaagaagcacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaatgagtattattaa 15065772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 10008114 - 10008320
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  10008114 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 10008213  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  10008214 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 10008313  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  10008314 ctctgat 10008320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 10908724 - 10908930
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  10908724 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 10908823  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  10908824 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 10908923  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  10908924 ctctgat 10908930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 12889223 - 12889429
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  12889223 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 12889322  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  12889323 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 12889422  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  12889423 ctctgat 12889429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 13255204 - 13255410
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  13255204 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 13255303  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  13255304 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 13255403  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  13255404 ctctgat 13255410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 15358597 - 15358803
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  15358597 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 15358696  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  15358697 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 15358796  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  15358797 ctctgat 15358803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15713672 - 15713466
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  15713672 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 15713573  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  15713572 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 15713473  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  15713472 ctctgat 15713466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 365 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 13317840 - 13317500
Alignment:
Q  365 tccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcac 464  Q
    ||||||||||| |||||  |||||   || |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||  |   ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  13317840 tccccacgcttgcaatccgctaaaacatgacctttttgaccacatctgaaacacttcttctcatctttggtgcaaacattacttttgtggccttttgcac 13317741  T
Q  465 cacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacgg 564  Q
    |||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| | | |||||| |||||||||| ||| | || || || ||||||||||| ||||| || ||    
T  13317740 cacacttgtaacaaacaacatcaacaggagcatctctccccctaggcctcctctcatcatttaatatttgttttcctttgtcagcaggagcactgtaggg 13317641  T
Q  565 cttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattca 664  Q
    ||||   |||||    || |||||    ||   ||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  13317640 cttcgggcgactactctggcccttattcctcttctcgctcatcgccttatagtgagcctttgtatcctcctcatatatcctacaactgctcaccaactcc 13317541  T
Q  665 gaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    || || ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  13317540 gagaaatttatgatcttctgatatccaatggctctcttgat 13317500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 3688457 - 3688663
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  3688457 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagccggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 3688556  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||   | |  |||||||   |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  3688557 acaagacccaaagcagaaacacaatcggaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 3688656  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  3688657 ctctgat 3688663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15587008 - 15586802
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  15587008 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagccggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 15586909  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  15586908 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 15586809  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  15586808 ctctgat 15586802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15013340 - 15013115
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||   || | ||| ||||||||||||   ||||||||| || |||    
T  15013340 agagaagtagtcaccgaacccttagctggggtttcgacaaccatttccccattcatagacgacataacaagacccaacttagtagcacaatcagcaacaa 15013241  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgt 264  Q
    | ||| |||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| || |  ||||||||| |||  || ||    
T  15013240 taaaaaaatgtgtaacactagtatctataatagtaattaaaggagtgctattaatgaaacatgtacctctgattagacgatcctcattcgctgtctgagt 15013141  T
Q  265 acgagtcaaagcaaacaccttgccac 290  Q
    || ||  |||||||||||||| ||||    
T  15013140 accagctaaagcaaacaccttcccac 15013115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14579022 - 14578818
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  || |        
T  14579022 caaacatagacaaaggacatcttaaacatactatagaagtagttactgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatttgacatggg 14578923  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     |||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| || ||| ||||||| || |||||| ||||||| ||  ||||| ||| ||    
T  14578922 aagacccaacttagaagcacaatcaatagcaataaaacaatgtgtagcactaggatcaataatagtaactaaaggtgtattatcaataaaacatgtagct 14578823  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  14578822 ctgat 14578818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15400133 - 15399927
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  15400133 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaaccctaagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 15400034  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||   | |||||||    
T  15400033 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaaccaaaggagtattattaatatagcaagtac 15399934  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  15399933 ctctgat 15399927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20059670 - 20059464
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |      
T  20059670 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatactagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaac 20059571  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  20059570 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 20059471  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  20059470 ctctgat 20059464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14874150 - 14873997
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| | | | ||||||||  || | |||||||| | |||||    
T  14874150 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatattagacatatcaagacccaaagtagaagcacaatcgaaagcaa 14874051  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaa 218  Q
    | |||||||| || |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  14874050 taaaacaatgtgttgcaccaatatcaataatagcaactaaaggagtattattaa 14873997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16754283 - 16754111
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |   | ||||||||   | |  ||||||| | |||||    
T  16754283 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaactcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaa 16754184  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  16754183 taaagcaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 16754111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5422546 - 5422359
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    ||||||||||||||| |||||  | | ||| || ||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  5422546 accaaacatagacaaaagacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagtcggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 5422447  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaa 218  Q
     | ||||||||   | |  | ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5422446 tcaagacccaaagcagaaacgcaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaa 5422359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 6603249 - 6603455
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| |      
T  6603249 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagttttgacaaccatctctccattcatatcagacaac 6603348  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  6603349 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgggtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 6603448  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  6603449 ctctgat 6603455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 16694678 - 16694884
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  |||| |  | ||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  16694678 accaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcacagaacccttagctggagtctcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 16694777  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | |||||||||  | |  ||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||   | |||||||    
T  16694778 tcaagacccaacgcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgcgtagcaccagtatcaataataacaactaagggagtattattaatatagcaagtac 16694877  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  16694878 ctctgat 16694884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26791029 - 26790823
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  26791029 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagccggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 26790930  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||     |  ||||||| | | |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  26790929 tcaagacccaaagcggaaacacaatcgaaaacaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 26790830  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  26790829 ctctgat 26790823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 53382634 - 53382428
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |      
T  53382634 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaatcatctctccattcatatcagacaac 53382535  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  53382534 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 53382435  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  53382434 ctctgat 53382428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16804529 - 16804357
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | | | | ||||||||   | |  ||||||| | |||||    
T  16804529 agagaagtagtcaccaaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcaaacaaatcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaa 16804430  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  16804429 taaagcaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatataacaagtacatctgat 16804357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 596 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 2245712 - 2245610
Alignment:
Q  596 cgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatag 695  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  2245712 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtatcatcctcataaatcctaaagctactcaccaactcagaaaagtttctaatcttctgataaccaatgg 2245613  T
Q  696 ccc 698  Q
    |||    
T  2245612 ccc 2245610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 443 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 12508758 - 12508496
Alignment:
Q  443 ttactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgt 542  Q
    |||||||| || |||||||| |||||   | |||||||||  |||||||||| |||  || |  |||||||||||||||||||||  || |||| ||| |    
T  12508758 ttactcttatgacctttttctccacatcggtaacaaacaacttcagtaggagtatccttctttatgggcctcttctcatcattcaccctctgctcaccct 12508659  T
Q  543 tgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaat 642  Q
    | ||||| || ||||| || |||||   |||||| || || | ||| ||| | | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||    
T  12508658 tatcagccggagcactgtaaggctttggacgactttgctgactcttacctttcctctcactcatagccttgtaatgagctttcgtatccttctcatagat 12508559  T
Q  643 cctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
     || |||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12508558 tctgcaactgctcaccagttcagaaaagttacagatcttctgatatccaatggccctcttgat 12508496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 437 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 15008783 - 15008684
Alignment:
Q  437 caaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgct 536  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||    
T  15008783 caaacattactcttgtggcctctctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggaacatctctcctcttaggtctcctctcatcattcaatctttgct 15008684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 436 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 12843314 - 12843045
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |  | || ||||| |||  |||||||||| || || | |||| | |||||||| ||| ||| ||     
T  12843314 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttcttcctaggccgcctctcatcaatcattctctgt 12843215  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    || || || |||||||| ||||||||  ||||   ||||||||| || || ||| || | |||||| |||  | |||||||||||| || |||||||| |    
T  12843214 ttgcccttatcagcaggagcactataaagctttggacgactctgctgacctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcct 12843115  T
Q  636 cataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |  |||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  12843114 cataaatcctgcaactgctcaccagctcggaaaagttacgaatcttctggtaaccaattgcccgcttgat 12843045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 2037136 - 2037017
Alignment:
Q  412 gaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggc 511  Q
    ||||||||||||||| || |  |  |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||     
T  2037136 gaagcacttcttctcctcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggatcatctctcctcttaggt 2037037  T
Q  512 ctcttctcatcattcaatct 531  Q
    ||| |||||||| |||||||    
T  2037036 ctcctctcatcagtcaatct 2037017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 2040877 - 2040758
Alignment:
Q  412 gaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggc 511  Q
    ||||||||||||||| || |  |  |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||     
T  2040877 gaagcacttcttctcctcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggatcatctctcctcttaggt 2040778  T
Q  512 ctcttctcatcattcaatct 531  Q
    ||| |||||||| |||||||    
T  2040777 ctcctctcatcagtcaatct 2040758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 531
Target Start/End: Original strand, 14039651 - 14039770
Alignment:
Q  412 gaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggc 511  Q
    ||||||||||||||| || |  |  |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||     
T  14039651 gaagcacttcttctcctcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggatcatctctcctcttaggt 14039750  T
Q  512 ctcttctcatcattcaatct 531  Q
    ||| |||||||| |||||||    
T  14039751 ctcctctcatcagtcaatct 14039770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 145
Target Start/End: Original strand, 17492367 - 17492479
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||| ||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||    
T  17492367 caaacataaacaagggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaactcttcgctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacataac 17492466  T
Q  133 cagacccaactta 145  Q
     ||||||||||||    
T  17492467 aagacccaactta 17492479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 237
Target Start/End: Original strand, 11861033 - 11861094
Alignment:
Q  176 gtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  11861033 gtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatataacaagtacctctgat 11861094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23079515 - 23079427
Alignment:
Q  149 gcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    |||||||| | |||||| |||||||| || |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  23079515 gcacaatcgaaagcaataaaacaatgtgttgcacaagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 23079427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 16804158 - 16803952
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| ||||  ||||||||  || |||| |||| | | |||||   || ||| ||     
T  16804158 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 16804059  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    || || || ||||||||||||||||| |||||    |||||||| || ||||||    | |||||| |||  |||||||||||||| || |||||||| |    
T  16804058 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcct 16803959  T
Q  636 cataaat 642  Q
    |||||||    
T  16803958 cataaat 16803952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 693
Target Start/End: Original strand, 15262549 - 15262806
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||| |||||||||| | |||||| ||||||||  |  | || ||||| |||  |||||||||| ||||  |  ||||| |||||||||||| ||| ||     
T  15262549 acaagcattactcttatagcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttccttctacgcctcctctcatcattcattctttgt 15262648  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    ||||| || |||||||| ||  | || |||||   |||||| |||||  | |||||| | |||||| |||  |||||||||||||| || |||||||| |    
T  15262649 ttacccttatcagcaggagcgttgtaaggctttggacgactttgttgatctttgcctttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcct 15262748  T
Q  636 cataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaat 693  Q
    |||| || || |||||||| ||||  ||||||||||| |  |||||||  ||||||||    
T  15262749 catagattctgcaactgctcaccagctcagaaaagttacggatcttctagtaaccaat 15262806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 542 - 648
Target Start/End: Original strand, 6603757 - 6603863
Alignment:
Q  542 ttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaa 641  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  6603757 ttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcataga 6603856  T
Q  642 tcctaca 648  Q
    |||||||    
T  6603857 tcctaca 6603863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 23079228 - 23079166
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  ||| |||||||||    
T  23079228 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacaaacaatcacagcaggagcatc 23079166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 536 - 645
Target Start/End: Original strand, 3688959 - 3689068
Alignment:
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  3688959 ttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctctt 3689058  T
Q  636 cataaatcct 645  Q
    | || |||||    
T  3689059 cgtagatcct 3689068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 645
Target Start/End: Original strand, 10008625 - 10008725
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcc 644  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  10008625 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 10008724  T
Q  645 t 645  Q
    |    
T  10008725 t 10008725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 645
Target Start/End: Original strand, 10909235 - 10909335
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcc 644  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  10909235 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 10909334  T
Q  645 t 645  Q
    |    
T  10909335 t 10909335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 15713161 - 15713061
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcc 644  Q
    ||||| |||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  15713161 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 15713062  T
Q  645 t 645  Q
    |    
T  15713061 t 15713061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 645
Target Start/End: Original strand, 6597077 - 6597180
Alignment:
Q  542 ttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaa 641  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  6597077 ttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcataga 6597176  T
Q  642 tcct 645  Q
    ||||    
T  6597177 tcct 6597180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 567
Target Start/End: Original strand, 11861272 - 11861403
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| || | |||||||||  || |||| |||| | | |||||   || ||| ||     
T  11861272 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaatagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 11861371  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggctt 567  Q
    || || || ||||||||||||||||| |||||    
T  11861372 ttgcctttatcagcaggggcactatagggctt 11861403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 610 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 14578458 - 14578363
Alignment:
Q  610 cttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||  | ||||||||  |  |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  14578458 cttgtaatgagccttggtatcatcctcataaatcctgcaactgctcaccagcttagaaaagtcacggatcttctggtaaccaattgctctcttgat 14578363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 645
Target Start/End: Original strand, 16638795 - 16638898
Alignment:
Q  542 ttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaa 641  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  16638795 ttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcataga 16638894  T
Q  642 tcct 645  Q
    ||||    
T  16638895 tcct 16638898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 23415001 - 23414870
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||| || | |||||||||  || |||| |||| | | |||||   || ||| ||     
T  23415001 acaaacattactcttgtggcctttctcgccatagttgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 23414902  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggctt 567  Q
    || || || ||||||||||||||||| |||||    
T  23414901 ttgcccttatcagcaggggcactataaggctt 23414870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 645
Target Start/End: Original strand, 43165697 - 43165800
Alignment:
Q  542 ttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaa 641  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  43165697 ttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcataga 43165796  T
Q  642 tcct 645  Q
    ||||    
T  43165797 tcct 43165800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Original strand, 15065990 - 15066052
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||  ||| |||||||||    
T  15065990 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatcgcagcaggagcatc 15066052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 610 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 23079054 - 23079012
Alignment:
Q  610 cttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactg 652  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23079054 cttgtaatgagccttggtatcctcttcataaatcctgcaactg 23079012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8271875 - 8271830
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  8271875 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 8271830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 10417079 - 10416994
Alignment:
Q  602 ctcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgata 687  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || || || || |||| ||| || ||  |||| |||||||||||    
T  10417079 ctcatcaccttgtaatgagccttcgtatcctcctcataaattctgcagctactcaccagttctgagaaaattctgatcttctgata 10416994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13964831 - 13964786
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  13964831 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 13964786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 610 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 15459459 - 15459410
Alignment:
Q  610 cttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttacca 659  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  15459459 cttgtaatgagtctttgtatcctcctcataaatcctgcaactgctcacca 15459410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 30150021 - 30150066
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  30150021 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 30150066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 521; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 521; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 12798885 - 12798194
Alignment:
Q  11 agatggacatcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 110  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12798885 agatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacagacaacttagacaaataagagaagtagttactgaacccttagcttgagtttcaacaaccattt 12798786  T
Q  111 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12798785 ttcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacaacaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 12798686  T
Q  211 attattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggc 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12798685 actattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcactgtttgcgtaccagtcaacgcaaaaaccttgccacctgtcctagccttcttaggc 12798586  T
Q  311 tgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacc 410  Q
    || ||||||| |||| ||||||||||||| || ||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12798585 tgtgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccccacgctcacaatcagctaaagtgtgtcctttctgaccacacc 12798486  T
Q  411 tgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttggg 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  12798485 tgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttt---ccacacttgaaacaaacaatatcagtatgagcatctctcctcttgag 12798389  T
Q  511 cctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcacc 610  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12798388 cctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctgcgctcactcatcacc 12798289  T
Q  611 ttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12798288 ttgtaaagagctttcgtatcctcttcataaatcctacagctgcttaccaactcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 12798194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 705
Target Start/End: Original strand, 19149876 - 19150570
Alignment:
Q  11 agatggacatcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19149876 agattgacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 19149975  T
Q  111 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19149976 ctccattcatatcagatacaaccagacctaacttatatgcacaatcaacaacaatgaaacaatgagtagaaccagtatctataatagcaattaaaggagt 19150075  T
Q  211 attattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggc 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| || || |||||| ||||| ||||||||||     
T  19150076 actattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcacagtttgcgtaccagtcaacgcaaatactttaccacctatcctagccttcttaggt 19150175  T
Q  311 tgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacc 410  Q
    |||||||||| |||| | ||||| ||||| || ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | || |||||||||||| |||||||||    
T  19150176 tgcgtacactgcgaactaatatgtccttcttcattacagttgtagcaaacaatatctccacgcttgcaatcagccaatgtgtgtcctttctgaccacacc 19150275  T
Q  411 tgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttggg 510  Q
    | ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19150276 taaagcacttcttctgatctcgatcacacacattactgttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttagg 19150375  T
Q  511 cctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcacc 610  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  19150376 cctcctctcatcattcaacctctgcttacccttgtcagcaggggcactaaacggcttcggacgactctgctgtcccttacctatgcgctcactcatcacc 19150475  T
Q  611 ttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19150476 ttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcctgcagctactcaccaattcggaaaagtttcttatcttttgataaccaatagcccttttgat 19150570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 705
Target Start/End: Original strand, 20749275 - 20749969
Alignment:
Q  11 agatggacatcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20749275 agattgacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 20749374  T
Q  111 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20749375 ctccattcatatcagatacaaccagacctaacttatatgcacaatcaacaacaatgaaacaatgagtagaaccagtatctataatagcaattaaaggagt 20749474  T
Q  211 attattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggc 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| || || |||||| ||||| ||||||||||     
T  20749475 actattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcacagtttgcgtaccagtcaacgcaaatactttaccacctatcctagccttcttaggt 20749574  T
Q  311 tgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacc 410  Q
    |||||||||| |||| | ||||| ||||| || ||  |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | || |||||||||||| |||||||||    
T  20749575 tgcgtacactgcgaactaatatgtccttcttcattacagttgtagcaaacaatatctccacgcttgcaatcagccaatgtgtgtcctttctgaccacacc 20749674  T
Q  411 tgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttggg 510  Q
    | ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20749675 taaagcacttcttctgatctcgatcacacacattactgttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttagg 20749774  T
Q  511 cctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcacc 610  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  20749775 cctcctctcatcattcaacctctgcttacccttgtcagcaggggcactaaacggcttcggacgactctgctgtcccttacctatgcgctcactcatcacc 20749874  T
Q  611 ttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20749875 ttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcctgcagctactcaccaattcggaaaagtttcttatcttttgataaccaatagcccttttgat 20749969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 15099978 - 15099365
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15099978 tcaaagtctctaccaaacatagacaacagacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 15099879  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15099878 tatcagatacaactagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtatcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 15099779  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15099778 gaaacaagtacatctgataagtcggtcctcattaactgtctgcataccagttaaagcaaacaccttaccacctgtcctaaccttcttcggctgcgtacac 15099679  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15099678 tgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttataacaaacgatgtccccacgcttacaatcatctagagtgtgtcccttctgaccacacctgaagcact 15099579  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  15099578 tcttctcatctctatcacaaacgttactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaactatgtcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctccc 15099479  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15099478 atcatttaacctctgcttacccttgtcagcaggagcactatacggcgtcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 15099379  T
Q  620 gcttttgtatcctc 633  Q
    ||||| || |||||    
T  15099378 gctttcgtgtcctc 15099365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 14261615 - 14260936
Alignment:
Q  26 tctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcag 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14261615 tctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactaaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccattcatatcag 14261516  T
Q  126 atacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  14261515 atacaaccagacccaacttatatgctcaatcaacaacaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaagaaata 14261416  T
Q  226 agtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaa 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  14261415 agtacctctgataagtcggtcctcattcatagtttgcgtaccagtcaacgcaaataccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcataaactgcgaa 14261316  T
Q  326 ttgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttct 425  Q
     | ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||    
T  14261315 ctaatatgtccttcctcattacagttgtagcaaacaatatccccacgcttgcaatcagccaatgtgtgtcctttctgactacacctaaagtacttcttct 14261216  T
Q  426 catctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcatt 525  Q
    ||||||| | ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  14261215 catctcgatgacgcacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaataatctcagtaggagcatatctccccttaggcctcctctcatcatt 14261116  T
Q  526 caatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttt 625  Q
    || ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  14261115 cagtctctacttacccttgtcagcaggggcactatacggcttcggacgactctactgtcccttacctttgcgctcactgatcaccttgtaatgagctttc 14261016  T
Q  626 gtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14261015 gtatcctcttcatatatcctgcagctactcaccaactcagagaaattccttatcttttgatagccaatagccctcttgat 14260936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 16947846 - 16947174
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16947846 caaagtctctaccaaacatagacaatggacatctcaagcaaactagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 16947747  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16947746 atcagatacatccaaacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaatgagtactattaaag 16947647  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| | |||| |||||||| || ||||| || ||| |||||||  ||||  ||||||    
T  16947646 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcattagtagtctgcgtaccattcaatgcaaacactttcccaccggttctagccttcttcagctgaatacact 16947547  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||| |  |||||    
T  16947546 gtgaactgatatgaccctcttcgttgcagttgtagcaaacaatgtctccacgcttacattcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctaacacactt 16947447  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16947446 cctctcatctctaccacaagcattactcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatttcaactggagcatctctcctcttgggccttctctca 16947347  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   ||||||||| |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||    
T  16947346 tcattcattctctgctttcccttgtcagcaggggcactgtatggtttaggacgactctgctgtcccttaccccttctctcactcatcaccttgtaatgag 16947247  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaat 693  Q
    |||| |||||||||||||| || || || || || ||||||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||    
T  16947246 ctttcgtatcctcttcatagattctgcagctactcaccaattcagagaaaattctaatcttctgatacccaat 16947174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Original strand, 13676325 - 13677007
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13676325 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 13676424  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13676425 tatcagatacaaccagacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagcgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 13676524  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |    | |||||||| ||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || | ||||    
T  13676525 gaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggttctaaccttcttcggttgtgcacac 13676624  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| ||||||| || ||||| ||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||| |||    
T  13676625 tgtgaactgatatggccctcctcattgcagttatagcaaactatgtctccccgcttacaatcagctaatgtgtgtcccttctgtccacacctgaagtact 13676724  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13676725 tcttctcatctttatcacaaacattactcttgtggcctttcttaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctc 13676824  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||| ||||||||||| ||   | ||||||| ||||  || |||||      || ||||||||||||||||    
T  13676825 atcattcaacctctgttttcctttgtcagcaggagcactatacggtttaggatgactctgctgtcatttacctct------acacatcaccttgtaatga 13676918  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  13676919 gctttagtatcttcttcatatatcctgcagctactcaccaaatcagagaaaattcttatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 13677007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 29 - 705
Target Start/End: Original strand, 13024228 - 13024903
Alignment:
Q  29 ctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagata 128  Q
    |||||||||||||||||  |||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13024228 ctaccaaacatagacaacggacacctcaagcaaactagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagata 13024327  T
Q  129 caaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagt 228  Q
    || ||| |||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13024328 catccaaacccaacttataagcactttctaaagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtct-attaaagaaacaagt 13024426  T
Q  229 acctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattg 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||  ||| ||    
T  13024427 acctctgataagtcggtcctcatttgtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggtcctagccttcttcggctgagtacactgagaactg 13024526  T
Q  329 atatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcat 428  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||||||  |||||||||||| || ||| ||||||    
T  13024527 atatgaccttcttcgttgcagttgtagcagacaatgtctccacgcttacattcagctagggtgtgtcctttctaaccacacctgaaacatttcctctcat 13024626  T
Q  429 ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaa 528  Q
     ||   || || |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||     
T  13024627 atctaccataagcattgcttttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatttcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcat 13024726  T
Q  529 tctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgta 628  Q
     || ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||   |||| |||  |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  13024727 cctctgcttccctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctactgtcccttacccctcctctcactcatcaccttgtaatgagctttggtg 13024826  T
Q  629 tcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||   ||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  13024827 tcttcctcatatatcctgcagctgcttaccaactcagagaaaactctaatcttctgatacccaatagctcttttgat 13024903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 21 - 705
Target Start/End: Original strand, 12459503 - 12460187
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12459503 caaagtctctaccaaacatagataacggacaccttaaacagacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 12459602  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12459603 atcagatacatccaaacccaacttataggcacattcaatagcaataaaacaattagtagcatcagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaag 12459702  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  |||||||   ||||  ||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  12459703 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcatttgtagtctgcgtacctttcaattcaaacactttccctccggtcctgaccttcttcggctgagtacact 12459802  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| | ||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||| |||||||||| || || ||    
T  12459803 gtgaactaatatgaccttcttcattgcagttatagcagacaatgtccccacgcttacattcagctagggtgtgtcccttctgaccacacctaaaacattt 12459902  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | |||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  12459903 cctctcatctctaccacaagcattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcaggaacatctctcctcttgggcctcctatca 12460002  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    ||||||| | | ||||| || ||||||||| | ||| | || |||||   ||||||||| |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||    
T  12460003 tcattcattttctgctttcccttgtcagcaagagcattgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacccctcctctcactcatcaccttgtaatgag 12460102  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||   ||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  12460103 cttttgtgtcttcctcatatatcctgcagctgctcaccaactcagagaaaactctaatcttctgataccctatagccctcttgat 12460187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 20 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 11385804 - 11385119
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |   |||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11385804 tcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttcctgaacccttagctggagtttcaacaaccatctctcctttca 11385705  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11385704 tatcaaatacaatcagacccaacttatatgcacattctaaagcaatgaaacaatgagtagcatcagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 11385605  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||| || || || |||    
T  11385604 gaaacaagtacctctgataagtctgtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttcccaccagttctaatcttctttggttgagtgcac 11385505  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| |||| || || ||||| |   | || || |||||||  || || | ||| || | | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11385504 tgtgaactgatgtggccctcctcatcacaattataacaaacaacatcacccctcttgcagttagccaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcact 11385405  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||||  |  |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||  | ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  11385404 tcttctcatctttggtacaaacattacttttgtggcctttctcgccacacttatagcaaactatctcagcaggagcatctctcctcttgggccttctctc 11385305  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||    
T  11385304 atcattcagtcgttgctttcccttgtcagcaggggcactgtacggcttaggatgactctgttgtcccttacccctccgctcactcatcatcttgtaatga 11385205  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||||||| ||| || ||||| || || || ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11385204 gcttttgaatcttcctcatagattctgcagctgcttaccaactcagaaaaagttctgatcttctgatagccaatggccctcttgat 11385119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 14283749 - 14283103
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |   |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14283749 tcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttggctagagtttcaacaaccatttctcctttca 14283650  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14283649 tatcagatacaatcaaacccaacttatatgcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccaatgtctataatagcaatgaaaggagtactattaaa 14283550  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    |  ||||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| |  |||    
T  14283549 gaaacaagtacctctgataagacagtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggctgtgggcac 14283450  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  |   |||||||||| || |||||| |||| || || ||||  || |||||||| |||||| |||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  14283449 tgtgtgctgatatgaccctcttcgttgcagttataacatacaacatcaccacgcttgcaatcagctaatgtgtgacccttctgaccacacctgaagcact 14283350  T
Q  420 tcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttct 518  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||   ||||||| |||    
T  14283349 tcttctcatccttggt-acaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaacaacctcagcaggagcatctctcctaacgggcctcctct 14283251  T
Q  519 catcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatg 618  Q
    ||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||    || | |||||||||||||||||||||    
T  14283250 catcattgagtctctgcttacccttatcagcaggggcactatacggcttcgggcgactctgctgtcccttattccttctctcactcatcaccttgtaatg 14283151  T
Q  619 agcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcaga 666  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||    
T  14283150 agctttagtgtcctcctcatagatcctgcaacgacttaccaaatcaga 14283103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 21 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 26092172 - 26091485
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26092172 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 26092073  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26092072 atcagatacatccaaacccaacttatatgcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaag 26091973  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||  | |||  |||||| ||||  | |||||    
T  26091972 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacact 26091873  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| |||||||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  26091872 gtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcactt 26091773  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26091772 cctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatca 26091673  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||  ||   | ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||   |||| |||| |||||||| || || | ||||||||| | |||||||||||    
T  26091672 tcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgag 26091573  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||| || || |||||||| || || || ||  | ||||| ||||| |||  ||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  26091572 ctttggtgtcttcttcatagattctgcacctattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 26091485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 26 - 708
Target Start/End: Original strand, 21755292 - 21755974
Alignment:
Q  26 tctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcag 125  Q
    ||||||||||||||||| |   |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21755292 tctctaccaaacatagatataggacacctcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttccccttccatatcag 21755391  T
Q  126 atacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaaca 225  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21755392 atacatccaaacccaacttataagcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccaatatcaataatagcaattaaaggagtactattaaagaaaca 21755491  T
Q  226 agtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaa 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||  | |||||  ||     
T  21755492 agtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacaccttgcccccagttctaaccttcttcggctcaggacactgtgag 21755591  T
Q  326 ttgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttct 425  Q
     | |||||||| ||  | ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  21755592 ctaatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaatatccccacgcttacattcagctaaagtgtgacccttctgaccacacctgaaacacttcctct 21755691  T
Q  426 catctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcatt 525  Q
    |||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||||| |    
T  21755692 catctttaccacaaacattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagagggagcatctctcctcttaggcctcatgtcatcact 21755791  T
Q  526 caatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttt 625  Q
    ||   | ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||   |||| | ||||||||||| || || | ||||||||| | |||||||||||||||     
T  21755792 catattctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattttgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttg 21755891  T
Q  626 gtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
     | || ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||  ||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  21755892 atgtcttcttcataaattctacacctgttaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 21755974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 21 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 26115964 - 26115277
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26115964 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 26115865  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26115864 atcagatacatccaaacccaacttatatgcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccaatatcaataatagcaattaaaggagtactattaaag 26115765  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||    |  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||  |||||| || |  | |||||    
T  26115764 aaacaagtacctctgatgagtcggtcctcattaggagtgtgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccagttctagtcttcttcggttcaggacact 26115665  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      | | | |||||||||||  | ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  26115664 gtgtactaatatgaccttctccattgcaattgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcactt 26115565  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26115564 cctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagccggagcatctctcctcttgggcctcctatca 26115465  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    ||| |||   | ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||   |||| |||||| |||||| || || | ||||||||| | |||||||||||    
T  26115464 tcactcatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttatcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgag 26115365  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||| || || |||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |||  ||| |||| |||||| ||||| || |||||||||||    
T  26115364 ctttggtgtcttcttcatagattctacacctgttaaccaactcagagaagactctgatctgctgatatccaatggctctcttgatgtc 26115277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 21 - 708
Target Start/End: Original strand, 49155176 - 49155863
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49155176 caaaatctctaccaaacatagatatgggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 49155275  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49155276 atcagatatatccaaacccaacttatatgcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaag 49155375  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||  | |||  |||||| ||||  | |||||    
T  49155376 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacact 49155475  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| |||||||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||| | || || ||| |||||||||||||||||||    
T  49155476 gtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactatgacccttctgaccacacctgaagcactt 49155575  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  49155576 cctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcc 49155675  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||  ||  || ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||   |||| ||||||||||||| || || | ||||||||| | ||| |||||||    
T  49155676 tcacccatcctctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgag 49155775  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||| || || |||||||| || || || ||  | || || ||||| |||  ||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  49155776 ctttggtgtcttcttcatagattctgcatctattaactaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 49155863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 56 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 40925156 - 40924504
Alignment:
Q  56 agacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaat 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |    
T  40925156 agacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcatatcagatatatccaaacccaacttataagcacatt 40925057  T
Q  156 caacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcac 255  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       
T  40925056 caatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattagg 40924957  T
Q  256 tgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtag 355  Q
     |  ||||||| |||||||||||||||||| || ||  | |||  |||||| ||||  | |||||  ||| |||||||||||||| | ||| |||||||     
T  40924956 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttcccccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaa 40924857  T
Q  356 caaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggc 455  Q
    || ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||    
T  40924856 cagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattactcttgtggc 40924757  T
Q  456 ctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggc 555  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||   | ||||| || ||||||||||| ||    
T  40924756 ctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagc 40924657  T
Q  556 actatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgctt 655  Q
    ||| || |||||   |||| ||||||||||||| || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || || |||||||| || || || ||  |     
T  40924656 actgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcatagattctgcacctatta 40924557  T
Q  656 accaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||| ||||| |||  | | |||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  40924556 accaactcagagaagactttgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 40924504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 21 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 13966042 - 13965354
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13966042 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccccagacaaacaagagaagtggttattgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 13965943  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13965942 atcagatacatccaaacccaacttataggcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaag 13965843  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||  | |||||    
T  13965842 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacaccttcccaccagttctagccttcttcggctcaggacact 13965743  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| |||||||||| ||  | ||| | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||| | |||| || ||| |||||||||||||||| ||    
T  13965742 gtgaactgatatgaccctctccattgcaattgtagcagacaatatccccacgcttgcattcagctagactgtgacccttctgaccacacctgaagcattt 13965643  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
      | ||||||    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  13965642 tctatcatctttaccacaaacattactcttgtggtctttctcaccacacttgtagcaatcaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatca 13965543  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||  ||   | ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||   |||| | ||||||||||| || || | ||||||||| | || ||||||||    
T  13965542 tcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattatgttgtcccttacccctcctctcactcattatctggtaatgag 13965443  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtcc 709  Q
    |||| || || ||||||||||||| ||| ||| | ||||| |||||||||  ||| |||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  13965442 ctttggtgtcttcttcataaatccaacacctgttaaccaactcagaaaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtcc 13965354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 12204175 - 12203497
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  12204175 tcaaaatctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttattgaacccttagctagagtttcaacaaccatttctccactca 12204076  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||   || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  12204075 tacttgacataaccagacccaacttatatgcacaatcaacaacaatgaaacaatgtgtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggattactattaaa 12203976  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| || |  |  ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| | | ||     
T  12203975 gaaacaagtacctctgataagtcgatcctcattaaccgtctatgtaccggtcaatgcaaacacctttccacctgtctgagccttcttaggcttcctgcat 12203876  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||  | | ||||||||| || |   | ||| |||||||||| ||  ||||||| || ||| |||  || || ||||||   ||||| | ||||||||    
T  12203875 tgcgagctaagatgaccttcttcatcacaattgaagcaaacaatatcatcacgcttgcattcagctatcgtatgccctttcttcccacatcagaagcact 12203776  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    | |||||||| |  | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||  ||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||    
T  12203775 ttttctcatcaccattacaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatcacagcaggaacatctctcctcttaggtctcctctc 12203676  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || |||||   |||||  || || ||  ||   ||   ||||||||| ||||| ||||||    
T  12203675 atcattcaatctttgtttccctttgtcagcaggagcactgtagggcttaggacgaccttgctggcctctgttcctcttctcactcataaccttataatga 12203576  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccc 698  Q
     |||| |||||||| ||||| || ||||| || || || || |||||||| | | | ||||||||||||||||| ||||    
T  12203575 actttggtatcctcctcatagattctacagctactcactaactcagaaaattgtttgatcttctgataaccaatggccc 12203497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 18051328 - 18050700
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | | |||| || |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18051328 tcaaaatctctaccaaacatagaaattggacacctcaagcaaaccagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcccttca 18051229  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||| |||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18051228 tatcagacacaatcaaacccaacctatatgcactttctaaagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 18051129  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||  | |  || |||| |||||||||||| || || |||||    ||||||||||| ||||| || |||    
T  18051128 gaaacaagtacctctgatgagacggtcctcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcac 18051029  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  | | |||| ||||| || || ||  | || || || ||||  || || ||||| |||||  |||   |||| || ||| | ||||| ||||| ||||    
T  18051028 tgagtactgatgtgaccctcttcattacaattataacatacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacatctgaaacact 18050929  T
Q  420 tcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttct 518  Q
    ||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || || || || |||| ||||||||| ||| |  | |||||| |||    
T  18050928 tcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtgacctttctcgccacacttaaagcacactatctcagcaggagcatccctcttactcggcctcctct 18050830  T
Q  519 catcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatg 618  Q
    ||||||| | ||| |||||||| || ||||  || ||||||||||| ||   |||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18050829 catcattaagtctctgcttacccttatcagtcggagcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatg 18050730  T
Q  619 agcttttgtatcctcttcataaatcctaca 648  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||    
T  18050729 agctttggtgtcctcctcgtagatcctaca 18050700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 312
Target Start/End: Original strand, 14140553 - 14140845
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |   |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14140553 tcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcccttca 14140652  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14140653 tatcagatacactcaaacccaacttatatgcactttctaaagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 14140752  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||    |  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||    
T  14140753 gaaacaagtacctctgataagtctttcctcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaataccttcccaccagttctaaccttcttcggctg 14140845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Original strand, 15343305 - 15343567
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |   |||| || | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15343305 tcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactttacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 15343404  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15343405 tatcagatacaatcaaacccaacttatatgcactttctaaagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 15343504  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacac 282  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    |  ||||||| |||||||||||||||    
T  15343505 gaaacaagtacctctgataagcctgtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacac 15343567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 402 - 650
Target Start/End: Original strand, 14144917 - 14145165
Alignment:
Q  402 gaccacacctgaagcacttcttctcatc-tcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctc 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| || |||| |||||||||||    
T  14144917 gaccacacctgaagcacttcttctcctccttggt-acaaacgttactcttgtggcctttctcgccatacttaaaacaaactatctcagcaggagcatctc 14145015  T
Q  501 tcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctc 600  Q
    |||| |  |||||| |||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  14145016 tcctatatggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctc 14145115  T
Q  601 actcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaac 650  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||    
T  14145116 actcatcaccttataatgagctttggtgccctcctcatagatcctgcaac 14145165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 213 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 12712845 - 12712353
Alignment:
Q  213 tattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||    | ||||||||  | ||| |||||||| || || |  ||||||||||||||  | ||    
T  12712845 tattaaagaaacaagtacctctgataagtctatcttgatttgtggtttgcgtacccgccaaggcaaacactttcccgctggtcctaaccttcttccgttg 12712746  T
Q  313 cgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctg 412  Q
     || ||||  |||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| ||||| || ||||| || |||||| ||||   ||| || ||| | |||||||||    
T  12712745 agtgcactgagaattgatatgaccctccccattgcagttatagcatacaatatcaccacgtttgcaatcagctaacacgtgacccttctgtccacacctg 12712646  T
Q  413 aagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcc 512  Q
    ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||  |||||  ||||| | |||||| |    
T  12712645 aagcacttcttctcatctttggtacaaacattacttttgtggcctttctcgccacacttaaagcaaactatctcaacaggagtgtctcttcccttgggtc 12712546  T
Q  513 tcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcacctt 612  Q
    |  |||||||||||| ||  ||||| || ||  ||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  12712545 ttctctcatcattcagtcgttgctttcccttaccagcaggagcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccctccgttcactcatcacctt 12712446  T
Q  613 gtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    | ||||||| |||| ||| || ||||| || || || || |||| ||| ||| |||   |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12712445 ggaatgagcctttgaatcttcctcatagattctgcagctacttatcaactcataaagagttctaatcttctgatagccaatggccctcttgat 12712353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11550488 - 11550282
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||||  | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  11550488 accaaacatagacaaaggacaacgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 11550389  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | || ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  11550388 tcaagacccaaggcagatacacaatcaaaagcaataaagcaatgagtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 11550289  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  11550288 ctctgat 11550282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 14957438 - 14957644
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||||  | ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  14957438 accaaacatagacaaaggacaacgcaaacatacgagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcaacgaccatctctccattcatatcagacaaa 14957537  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  14957538 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgagtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 14957637  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  14957638 ctctgat 14957644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Original strand, 15627397 - 15627659
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||   ||| |||||||| || | ||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||  | ||||    
T  15627397 tcaaagtctcgaccaaacatcggcaaagaacaccttagacacactaaagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgaaaaccatttcctcattca 15627496  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||   || | | | ||||||||| ||   ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  15627497 tactcgacatatcaagacccaacataggagcacaatcaacggcaataaaacaatgcgtatcaccagtatcaataatagtaattaaaggagtactatcaaa 15627596  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacac 282  Q
    ||| || |||||| | || |  | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15627597 gaagcatgtacctataatcaaccggtcctcattcactgtttgcgtaccagtcaaagcaaacac 15627659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44788737 - 44788531
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  44788737 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagataaa 44788638  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  44788637 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 44788538  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  44788537 ctctgat 44788531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 8710489 - 8710695
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  8710489 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 8710588  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  8710589 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 8710688  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  8710689 ctctgat 8710695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 13688925 - 13689131
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  13688925 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 13689024  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  13689025 tcaagacccaaagcagacacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 13689124  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  13689125 ctctgat 13689131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 14335280 - 14335486
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  14335280 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 14335379  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  14335380 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 14335479  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  14335480 ctctgat 14335486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15146275 - 15146133
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || | | | |||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  15146275 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatccgacaaagcaagacccaacttagaagcacaatcaagagcaa 15146176  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaagg 207  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15146175 taaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaagg 15146133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 464 - 705
Target Start/End: Original strand, 13004783 - 13005024
Alignment:
Q  464 ccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacg 563  Q
    |||||||| || ||||| || |||| |||||  ||||| | |||||| ||  |||||||||||| ||  ||||| || ||| |||||||||| || ||||    
T  13004783 ccacacttaaagcaaactatctcagcaggagtgtctcttcccttgggtcttctctcatcattcagtcgttgctttcccttgccagcaggggcgctgtacg 13004882  T
Q  564 gcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattc 663  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || || || || |||| ||| ||    
T  13004883 gcttaggacgactctgttgtcccttgcccctccgttcactcatcaccttgtaatgagcctttgaatcttcttcatagattctgcagctacttatcaactc 13004982  T
Q  664 agaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||   | || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13004983 agaaagaatcctgatcttctgataaccaatggccctcttgat 13005024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11234599 - 11234393
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  11234599 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagaaaaa 11234500  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  11234499 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtattaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 11234400  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  11234399 ctctgat 11234393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 18180627 - 18180833
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||      
T  18180627 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagataac 18180726  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  18180727 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgcgtagcaccagtatcaataataacaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 18180826  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  18180827 ctctgat 18180833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18587557 - 18587351
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  18587557 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 18587458  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  18587457 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataataacaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 18587358  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  18587357 ctctgat 18587351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15158443 - 15158237
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  15158443 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagccggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 15158344  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  15158343 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 15158244  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  15158243 ctctgat 15158237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17703841 - 17703635
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  |||| |  | ||| || ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  17703841 accaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttaactggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 17703742  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||    
T  17703741 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgtgtagcactagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatataacaagtac 17703642  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  17703641 ctctgat 17703635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Original strand, 14042581 - 14042785
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||  ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||  || | | |    
T  14042581 caaacatagacaaaggacatcttgaacacacaagagaagtagtcacaaaacccttagcttgagtttcgacaaccatctctccatttatatttgacatagc 14042680  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||| ||| |||  |||| ||||||    
T  14042681 aagacccaacttaatagcacaatcaatagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataataacaactaaaggtgtactatcaaaataacatgtacct 14042780  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  14042781 ctgat 14042785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Original strand, 14352611 - 14352815
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||  ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||  || | | |    
T  14352611 caaacatagacaaaggacatcttgaacacacaagagaagtagtcacaaaacccttagcttgagtttcgacaaccatctctccatttatatttgacatagc 14352710  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||| ||| |||  |||| ||||||    
T  14352711 aagacccaacttaatagcacaatcaatagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataataacaactaaaggtgtactatcaaaataacatgtacct 14352810  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  14352811 ctgat 14352815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 9591248 - 9591454
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||| ||  |||| || | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  9591248 accaaacatagataaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 9591347  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | |||||| |   | |  ||||||  | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  9591348 tcaagacccgaagcagaaacacaattgaaagcaataaagcaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 9591447  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  9591448 ctctgat 9591454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 443 - 693
Target Start/End: Original strand, 15627820 - 15628070
Alignment:
Q  443 ttactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgt 542  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||  |||| ||||| |||| || |  | |||||||||||||||||||  || || ||||| |    
T  15627820 ttactcttgtggcctttctcaccacagttgtagcaaacaacttcagcaggagtatctttctttctaggcctcttctcatcattcaccctttgtttaccct 15627919  T
Q  543 tgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaat 642  Q
    | |||||||| ||||| || |||||   |||||| ||||| | ||| | | | | |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15627920 tatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgttgactcttacttttcctctcattcataaccttgtaatgagctttcgtatcctcctcatagat 15628019  T
Q  643 cctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaat 693  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||  |||   ||||||||||| |||||    
T  15628020 ccggcaactacttaccaattcagaaattttttggatcttctgatatccaat 15628070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 12690386 - 12690591
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||||  | ||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||| | |    
T  12690386 accaaacatagacaaaggacaacgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcaacgaccatctctcaactcatatcagacaaa 12690485  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  12690486 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgagtagcactagtat-aataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 12690584  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  12690585 ctctgat 12690591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 141
Target Start/End: Original strand, 8200932 - 8201042
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  8200932 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 8201031  T
Q  131 accagacccaa 141  Q
    || ||||||||    
T  8201032 acaagacccaa 8201042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 436 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 17703436 - 17703224
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||  || |||| |||| | | |||||   || ||| ||     
T  17703436 acaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgt 17703337  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    || || || |||| |||||||||||| || ||    |||||||| || ||||||    | |||||| |||  ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17703336 ttgcccttatcagtaggggcactataaggtttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagctctggtatcctctt 17703237  T
Q  636 cataaatcctaca 648  Q
    |||| ||||||||    
T  17703236 catagatcctaca 17703224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 536 - 705
Target Start/End: Original strand, 14043084 - 14043253
Alignment:
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||   || ||||||||| || ||| || | |||||| |||  | |||||||||||| || |||||||| |    
T  14043084 ttacccttatcagcaggagcactataaggctttggacaactctgttgacctttgactttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcct 14043183  T
Q  636 cataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||| |||||||| ||||  ||||||||  | |  |||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  14043184 cataaatcctgcaactgctcaccagatcagaaaaagtacggatcttctggtaaccaattgcccgcttgat 14043253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 536 - 705
Target Start/End: Original strand, 14353114 - 14353283
Alignment:
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||   || ||||||||| || ||| || | |||||| |||  | |||||||||||| || |||||||| |    
T  14353114 ttacccttatcagcaggagcactataaggctttggacaactctgttgacctttgactttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcct 14353213  T
Q  636 cataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||| |||||||| ||||  ||||||||  | |  |||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  14353214 cataaatcctgcaactgctcaccagatcagaaaaagtacggatcttctggtaaccaattgcccgcttgat 14353283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 436 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 16726422 - 16726210
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||  || |||| |||| | | |||||   || ||| ||     
T  16726422 acaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgt 16726323  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    || || || |||| ||||||||| || || ||    |||||||| || ||||||    | |||||| |||  ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16726322 ttgcccttatcagtaggggcactttaaggtttagggcgactctgctggcccttggtctttcgctcattcacaaccttgtaatgagctctggtatcctctt 16726223  T
Q  636 cataaatcctaca 648  Q
    |||| ||||||||    
T  16726222 catagatcctaca 16726210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16726708 - 16726621
Alignment:
Q  150 cacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    ||||||| | |||||| || ||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  16726708 cacaatcgaaagcaataaagcaatgtgtagcactagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatatcaagtacctctgat 16726621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38415 - 38330
Alignment:
Q  148 tgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctc 233  Q
    ||||||||||| || ||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| || | ||||||||||||||    
T  38415 tgcacaatcaagagaaataaaagaatgcgtagctccagtatctataatagcaattaaagggaaattgttgatgaaacaagtacctc 38330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 665
Target Start/End: Original strand, 11984281 - 11984510
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| ||||  ||||||||  || |||| ||||   | |||||   || ||| ||     
T  11984281 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccattctctgt 11984380  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    || || || ||||||||||||||||| |||||    |||||||| || ||||||    | |||||| |||  |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  11984381 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcttctt 11984480  T
Q  636 cataaatcctacaactgcttaccaattcag 665  Q
    | || |||||||||||| | ||||| ||||    
T  11984481 cgtagatcctacaactgttaaccaaatcag 11984510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 119
Target Start/End: Original strand, 10873574 - 10873662
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  10873574 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattca 10873662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 545 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 15157932 - 15157832
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcc 644  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  15157932 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 15157833  T
Q  645 t 645  Q
    |    
T  15157832 t 15157832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 436 - 567
Target Start/End: Original strand, 9591653 - 9591784
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || | |||||||||  || |||| |||| | | ||||||  || ||| |||    
T  9591653 acaaacattgctcttgtggcctttctcgccacagttgaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcaaccattctctgc 9591752  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggctt 567  Q
    || || || ||| ||||||||||||| |||||    
T  9591753 ttgcccttatcaacaggggcactataaggctt 9591784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 645
Target Start/End: Original strand, 13689436 - 13689536
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcc 644  Q
    |||| ||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  13689436 tcagtaggggcactgtacggcttaggacgactctggtgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 13689535  T
Q  645 t 645  Q
    |    
T  13689536 t 13689536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 4442951 - 4442996
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  4442951 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 4442996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 7826924 - 7826969
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  7826924 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 7826969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 13459057 - 13459102
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  13459057 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 13459102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27105020 - 27104975
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  27105020 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 27104975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 27173305 - 27173350
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  27173305 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 27173350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 508; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 508; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 14993755 - 14993088
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14993755 tcaaagcctccaccaaacatagacaacggacaacttagacaaacaagagaagtagttagtgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 14993656  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14993655 tatcagatacaactagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaataatgaagagcactagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 14993556  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14993555 gaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcactgtttgcgtaccattcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggttgcgtacac 14993456  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14993455 tgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttgtagcaaacaacatccccatgcttgcaatcagctaaagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcact 14993356  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14993355 tcttcttctcacggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctc 14993256  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14993255 atcattcaatctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggcttcagacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 14993156  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgata 687  Q
    |||||  |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14993155 gctttcatatcctcttcataaattctgcaactacttaccaaatcagaaaagtttcttatcttctgata 14993088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 96 - 708
Target Start/End: Original strand, 15266736 - 15267348
Alignment:
Q  96 tttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataat 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  15266736 tttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttataagcacaatcaacatcaatgaaacaatgagtagtaccagtgtctataat 15266835  T
Q  196 agcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtc 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |   || ||||||||  || |||||||||||||||||||| |||    
T  15266836 agcaattaaaggagtactattaaagaaacaactacctctgataagtctgtcttcactagttgtttgcgtactggttaaagcaaacaccttgccaccggtc 15266935  T
Q  296 ctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtc 395  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  15266936 ctaaccttcttcggctgcgtacactacgaactgatatgaccttcttcgttgcagttatagcaaacaatgtctccatgcttacaatcagctagagtgtgtc 15267035  T
Q  396 ctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagc 495  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  15267036 ctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctgtcacaaacattactcttatggcccttctcatcacacttgaagcaaacaatattcgtaggagc 15267135  T
Q  496 atctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctcta 595  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  15267136 atctctcctcttgggcctcctctcatcatttaacctctgcttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcctctg 15267235  T
Q  596 cgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatag 695  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  15267236 cgttcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataaatcctgcagctacttatcaaatcagagaagtttcttattttctgataaccaatgg 15267335  T
Q  696 ccctcttgatgtc 708  Q
    | |||||||||||    
T  15267336 ctctcttgatgtc 15267348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 698
Target Start/End: Original strand, 15073243 - 15073921
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15073243 tcaaagtctctaccaaacatagacaaaggacaactcaaactgacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccattca 15073342  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15073343 tatcagatataaccagagccaacttatgtgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 15073442  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||| | | |||    
T  15073443 gaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaacagtttgtgtaccagtcaaagaaaacaccttgccacctgtcagagccttcttaggcttcctgcac 15073542  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||  | ||||||||||| || |   | || ||||||||||  || | | |||| |||||| |||| ||||||||||||   |||||||| || ||||    
T  15073543 tgtgagcttatatgaccttcttcatcacaattatagcaaacaacatcacaaagcttgcaatcagctaatgtgtgtcctttctttccacacctaaaacact 15073642  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  15073643 tcttctcatcacggtcacatacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacagacaatctcagtaggagcatctctcctcctaggcctcctctc 15073742  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||||| ||| || ||| | ||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15073743 atcattcagtctctgtttaactttgtcagcaggagcactatacggtttcggacgactcagctgtcccttacctctacgctcactcatcaccttataatga 15073842  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccc 698  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| || || || |||||||    
T  15073843 gcttttgtatcctcttcatagatcctacagctactcaccaaatcagaaaaattccttatcttttggtagccgatagccc 15073921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 58 - 702
Target Start/End: Original strand, 20892953 - 20893597
Alignment:
Q  58 acaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatca 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||     
T  20892953 acaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaatcaaacccaacttatatgcactttct 20893052  T
Q  158 acagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactg 257  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |    
T  20893053 aaagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtag 20893152  T
Q  258 attgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagca 357  Q
      ||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||| || || || ||| |||||||| |    
T  20893153 tctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccagttctaaccttcttcggctcagtacactgcgaactgatatgcccctcttcattgcagttgtagta 20893252  T
Q  358 aacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcct 457  Q
     ||||| ||||||||||| || ||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||| ||||||| ||||    
T  20893253 gacaatatccccacgcttgcattcagctaaattgtgtcccttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctctaccacaaacattgctcttgttgcct 20893352  T
Q  458 ttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcac 557  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||   | ||||| || ||||||||||| ||||    
T  20893353 ttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctttgtcagcaggagcac 20893452  T
Q  558 tatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttac 657  Q
    | || |||||   ||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||  |||||||| |||||| ||||    
T  20893453 tttaaggcttaggacgactctgctgtcccttgcccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttctttgtaaatcctgcaactgtttac 20893552  T
Q  658 caattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctctt 702  Q
    ||| |||||||||  ||| |||| |||||| |||||||| |||||    
T  20893553 caactcagaaaagactctgatctgctgatacccaatagctctctt 20893597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 27 - 708
Target Start/End: Original strand, 16150527 - 16151208
Alignment:
Q  27 ctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcaga 126  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16150527 ctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcatatcaga 16150626  T
Q  127 tacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaa 226  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16150627 aacaaccaaacccaacttatatgcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaactaaaggagtactattaaagaaacaa 16150726  T
Q  227 gtacctctgataagtccgtcctcattcactgat-tgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaa 325  Q
    |||| |||||||||||  |||||| | | || | | ||||| |||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || | | | || | |||     
T  16150727 gtacatctgataagtcgatcctcact-agtggtctacgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggtttcttgcattgcgag 16150825  T
Q  326 ttgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttct 425  Q
     | ||||| || || || |   |||| ||||||||||  || |||||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16150826 ctaatatgcccctcttcatcacagttatagcaaacaacatcaccacgcttgcaatcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttct 16150925  T
Q  426 catctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcatt 525  Q
    |||||     |||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16150926 catctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttatagcaaacaatatcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcatt 16151025  T
Q  526 caatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttt 625  Q
    |||  | ||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16151026 caacttctgctttcctttgtcagtaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgccccttcgatcactcatcaccttgtaatgagctttt 16151125  T
Q  626 gtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    || ||||| ||||| || || || || |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  16151126 gtgtcctcctcatagattctgcagctacttaccaattcagagaagttcatgatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 16151208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 27 - 708
Target Start/End: Original strand, 16154673 - 16155354
Alignment:
Q  27 ctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcaga 126  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16154673 ctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcatatcaga 16154772  T
Q  127 tacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaa 226  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16154773 cacaaccaaacccaacttatatgcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaactaaaggagtactattaaagaaacaa 16154872  T
Q  227 gtacctctgataagtccgtcctcattcactgat-tgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaa 325  Q
    |||| |||||||||||  |||||| | | || | | ||||| |||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || | | | || | |||     
T  16154873 gtacatctgataagtcgatcctcact-agtggtctacgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggtttcttgcattgcgag 16154971  T
Q  326 ttgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttct 425  Q
     | ||||| || || || |   |||| ||||||||||  || |||||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16154972 ctaatatgcccctcttcatcacagttatagcaaacaacatcaccacgcttgcaatcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttct 16155071  T
Q  426 catctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcatt 525  Q
    |||||     |||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16155072 catctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttatagcaaacaatatcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcatt 16155171  T
Q  526 caatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttt 625  Q
    |||  | ||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16155172 caacttctgctttcctttgtcagtaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgccccttcgatcactcatcaccttgtaatgagctttt 16155271  T
Q  626 gtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    || ||||| ||||| || || || || |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  16155272 gtgtcctcctcatagattctgcagctacttaccaattcagagaagttcatgatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 16155354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 21 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 3262181 - 3261494
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3262181 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 3262082  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3262081 atcagatacatccaaacccaacttatatgcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaag 3261982  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||  | |||  |||||| ||||  | |||||    
T  3261981 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacact 3261882  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| |||||||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  3261881 gtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcactt 3261782  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  3261781 cctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatca 3261682  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||  ||   | ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||   |||| |||| |||||||| || || | ||||||||| | |||||||||||    
T  3261681 tcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgag 3261582  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||| || || |||||||| || || || ||  | ||||| ||||| |||  ||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  3261581 ctttggtgtcttcttcatagattctgcacctattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 3261494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 21 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 29450924 - 29450237
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29450924 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 29450825  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29450824 atcagatacatccaaacccaacttatatgcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaag 29450725  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| |||||||||||||||||| || ||  | |||  |||||| ||||  | |||||    
T  29450724 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttcccccaattctagtcttcttcggctcaggacact 29450625  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| |||| ||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| || ||| ||||||||||||| |||||    
T  29450624 gtgaactgatgtgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaaacactt 29450525  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  29450524 cctatcatctcctccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttaggcctcctatca 29450425  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||  ||   | ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||   |||| ||||||||||||| || || | ||||||||| | ||| |||||||    
T  29450424 tcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgag 29450325  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||| || || |||||||||||  | || ||  | ||||| ||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29450324 ctttggtgtcttcttcataaattttgcacctattaaccaactcagaaaagattctgatctgttgatatccaatagcccttttgatgtc 29450237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 21 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 44659253 - 44658566
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44659253 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 44659154  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44659153 atcagatacatccaaacccaacttatatgcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaag 44659054  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| | |||||||||||||||| ||||| || |||  |||||| || |  | |||||    
T  44659053 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgcgtaccattcaaagcaaacacctttccaccagttctagtcttcttcggttcaggacact 44658954  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| | ||||||| |||  | ||| | ||||| || ||||| ||||||||||| || ||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  44658953 gtgaactaatatgacattctccattgcaattgtaacagacaatatccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcactt 44658854  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  44658853 cctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatca 44658754  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    | |  ||   | ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||   |||| ||||||||||||| || || | ||||||||| | |||||||||||    
T  44658753 tgacccatcttctgctttcctttgtccgcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgag 44658654  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||| || || |||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |||  ||| |||| |||||| ||||| || |||||||||||    
T  44658653 ctttggtgtcttcttcatagattctacacctgttaaccaactcagagaagactctgatctgctgatatccaatggctctcttgatgtc 44658566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 56 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 11204584 - 11203932
Alignment:
Q  56 agacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaat 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |    
T  11204584 agacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcataccagatacatccaaacctaacttataggcacatt 11204485  T
Q  156 caacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcac 255  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       
T  11204484 caatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggt 11204385  T
Q  256 tgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtag 355  Q
     |  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| || ||||  | |||||  ||| |||||||||| ||  | ||| | ||||||    
T  11204384 agtntgcgtaccagtcaaagcaaacaccttcccaccagttctagcctttttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccctctccattgcaattgtag 11204285  T
Q  356 caaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggc 455  Q
    || ||||| ||||||||||| || | | ||| | |||| || ||| |||||||||||||||| ||  | |||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  11204284 cagacaatatccccacgcttgcattaagctagactgtgacccttctgaccacacctgaagcattttctatcatctctaccacaaacattgctcttgtggc 11204185  T
Q  456 ctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggc 555  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||   | | ||| || ||||||||||| ||    
T  11204184 ctttctcaccacacttataacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcttctactttcctttgtcagcaggagc 11204085  T
Q  556 actatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgctt 655  Q
    |||||| |||||   |||| |||| |||||||| || || | ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||    
T  11204084 actataaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattctacatctgttt 11203985  T
Q  656 accaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||| ||||| |||  ||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  11203984 accaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 11203932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 327 - 705
Target Start/End: Original strand, 18259632 - 18260010
Alignment:
Q  327 tgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctc 426  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18259632 tgatatgaccttcctcattgcagttatagcaaacaatgtccccacgcttacaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctc 18259731  T
Q  427 atctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattc 526  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  18259732 atctctatcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttaaagcaaacaatattagtaggagcatctgtcctcttgggcctcctctcatcattt 18259831  T
Q  527 aatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttg 626  Q
    || || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18259832 aacctctgcttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggatgactctgctgtcccttgcccctacgctcactcatcaccttgtaatgagattttg 18259931  T
Q  627 tatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||| |||||||| |||||  | || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  18259932 tatcttcttcatagatcctgtagctacttactaaatcagagaagtttcttattttctagtaaccaatagccctcttgat 18260010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 687
Target Start/End: Original strand, 27903269 - 27903936
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27903269 tcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacaaactagagaagtagttactgaacccttggctggagtttcaacgaccatttctcctttca 27903368  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27903369 tatcagatataatcagacccaacttatatgcacattctaaagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 27903468  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||    |  ||||||| |||||||||||| || || || |  || || ||||||||||| ||||| |||    
T  27903469 gaaacatgtacctctgataagtcgatcctcattggtagtctgcgtaccagtcaaagcaaatacttttcctcaagttctgaccttcttaggttgcgtgcac 27903568  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| | || |  || ||||| ||  |||| || |||||||| || |||||||| || ||| | ||    || |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  27903569 tgtgaactaatgttgccctcctcattacagttataacaaacaatatctccacgcttgcattcagccaacacatgacctttctgaccacatctgaaacact 27903668  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||||  |   || ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| | | |||| | ||||    
T  27903669 tcttctcatctttggtgcagacattactcttgtggcctttcgcaccacacttgtaacaaacaacatcaacaggagcatctctccccctaggccgcctctc 27903768  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||||||||| || || || |||||||||||  || | || ||||||   |||||    || |||||    ||   ||| ||||||||||| || |||    
T  27903769 atcattcaatctttgttttcctttgtcagcaggaacattgtagggcttcgggcgactactctggcccttattcctcttctcgctcatcaccttatagtga 27903868  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgata 687  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  27903869 gcctttgtatcctcctcataaatcttacagctactcaccaattcagagaaatttctgatcttctgata 27903936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 149 - 708
Target Start/End: Original strand, 7357280 - 7357839
Alignment:
Q  149 gcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcct 248  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7357280 gcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcct 7357379  T
Q  249 cattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaa 348  Q
    ||||    |  || |||| |||||| ||||||||||| ||||  || ||| ||||||| ||||  | |||||  ||| | |||||||| ||  | ||| |    
T  7357380 cattggtagtctgtgtaccagtcaatgcaaacaccttcccactagttctagccttcttcggctcaggacactgtgaactaatatgaccctctccattgca 7357479  T
Q  349 gttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactc 448  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    || ||||||| |||    
T  7357480 gttgtagcagacaatgtctccacgcttgcattcagctaaattgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctttaccataaacattgctc 7357579  T
Q  449 ttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcag 548  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||   | ||||| || |||||||    
T  7357580 ttgtggcctttctcaccactcttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcag 7357679  T
Q  549 caggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctaca 648  Q
    |||| ||| | || |||||   |||| ||||||||||||| || || | ||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||||||||||||    
T  7357680 caggagcaatgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagccttggtgtcttcttcataaatcctaca 7357779  T
Q  649 actgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
     ||| | ||||| |||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||| || ||||||||    
T  7357780 cctgttaaccaactcagaaaagactctgatctgttgatacccaatagctcttttgatgtc 7357839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 51604180 - 51603552
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | | |||| || |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51604180 tcaaaatctctaccaaacatagaaattggacacctcaagcaaacaagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 51604081  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||| |||| || |||||  ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51604080 tatcagacacaatcaaacccagtttataagcacattctaaagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 51603981  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||  | |  || |||| |||||||||||| || || |||||    ||||||||||| ||||| || |||    
T  51603980 gaaacaagtacctctgatgagacggtcctcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcac 51603881  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  | | |||| || || || || ||  | || ||||| ||||  || || ||||| |||||  |||   |||| || ||| | ||||| ||||| ||||    
T  51603880 tgagtactgatgtggccctcttcattacaattatagcacacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacatctgaaacact 51603781  T
Q  420 tcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttct 518  Q
    ||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || || || || |||| ||||||||| ||| |  | |||||| |||    
T  51603780 tcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtgacctttctcgccacacttaaagcacactatctcagcaggagcatccctcttactcggcctcctct 51603682  T
Q  519 catcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatg 618  Q
    ||||||| | ||| |||||||| || ||||  |||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  51603681 catcattaagtctctgcttacccttatcagtcggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcactttataatg 51603582  T
Q  619 agcttttgtatcctcttcataaatcctaca 648  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||    
T  51603581 agctttggtgtcctcctcgtagatcctaca 51603552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 63 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 53750815 - 53750230
Alignment:
Q  63 caagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagc 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||| ||||| || | |||    
T  53750815 caagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagacacaatcaaacccagtttataagcacattctaaagc 53750716  T
Q  163 aatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgc 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  | |  ||     
T  53750715 aatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgatgagacggtcctcattagcagtctgt 53750616  T
Q  263 gtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaa 362  Q
    |||| |||||||||||| || || |||||    ||||||||||| ||||| || ||||  | | |||| || || || || ||  | || ||||| ||||    
T  53750615 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtggccctcttcattacaattatagcatacaa 53750516  T
Q  363 tgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggccttttt 461  Q
      || || ||||| |||||  |||   |||| || ||| | ||||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| ||||| |    
T  53750515 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacatctgaaacacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtgacctttct 53750417  T
Q  462 caccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactata 561  Q
    | |||||||| || || || || |||| ||||||||| ||| |  | |||||| |||||||||| | ||| |||||||| || ||||  |||||||||||    
T  53750416 cgccacacttaaagcacactatctcagcaggagcatccctcttactcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttatcagtcggggcactata 53750317  T
Q  562 cggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctaca 648  Q
    ||| ||   |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||    
T  53750316 cggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcactttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaca 53750230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 15354426 - 15354290
Alignment:
Q  22 aaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcata 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15354426 aaagtctctaccaaacatagacaacagacatcttagacaaacaagagaagtagttactgaacccgtagctggagtttcaacaaccatttcccctttcata 15354327  T
Q  122 tcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaa 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15354326 tcagatacaaccagacccaacttatatacacaatcaa 15354290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Original strand, 14696985 - 14697247
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||  |||| ||||  || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  14696985 tcaaaatctcgaccaaacatagacaagggacatcttaagcacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattca 14697084  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||  || | | | |||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  14697085 tattcgacatagcaagacccaacttagaagcacaatcaatagcaataaaacaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatcaaa 14697184  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacac 282  Q
    | |||| |||||| | || |  |  ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14697185 gtaacatgtacctataatcaaacgatcctcattctctgtttgcgtaccagtcaaagcaaacac 14697247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 237
Target Start/End: Original strand, 14162370 - 14162571
Alignment:
Q  36 acatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccag 135  Q
    ||||||||||  |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | | | ||    
T  14162370 acatagacaaaggacaccttaaacacacaagagaagtagttaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattcatatcagacatagcaag 14162469  T
Q  136 acccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctg 235  Q
    | |||||||| | |||||||||| |||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||    
T  14162470 atccaacttagaagcacaatcaagagcaataaaactatgcgtagcaccggtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctg 14162569  T
Q  236 at 237  Q
    ||    
T  14162570 at 14162571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 412 - 698
Target Start/End: Original strand, 8708953 - 8709239
Alignment:
Q  412 gaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggc 511  Q
    |||||||||||| ||||| |  |  |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||| | ||||| ||     
T  8708953 gaagcacttcttttcatcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggaacatctattctcttaggt 8709052  T
Q  512 ctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcacct 611  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||  |||||  |||||  || || || |||   || ||||||||||| ||||    
T  8709053 ctcctctcatcattcaatctttgcttccctttgtcagcaggagcactatagagcttcggacgaccttgctgacctttgttcctccgctcactcataacct 8709152  T
Q  612 tgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccc 698  Q
    |||||||||||||  |||||||||| || || ||||||||||| ||||||||| |||| |  || ||||||||||||||||| ||||    
T  8709153 tgtaatgagctttgatatcctcttcgtagattctacaactgctcaccaattcaaaaaattgcctaatcttctgataaccaatggccc 8709239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16150 - 15946
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| | |      
T  16150 caaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatattagacatagt 16051  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||||||||   |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||||    
T  16050 aagacccaacttagtagcacaatcaatagcaataaaaaaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtactatcaaaataacaagtacct 15951  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  15950 ctgat 15946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 440 - 669
Target Start/End: Original strand, 13879413 - 13879642
Alignment:
Q  440 acattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttac 539  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| ||||  |    
T  13879413 acattactcttgtggcccttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagtagaaacatctcttctcttaggtctcctctcatcattcaatctttgctacc 13879512  T
Q  540 cgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcata 639  Q
    | |||||| |||| ||||| || ||||||  |||||  || || ||||||   || ||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  13879513 ctttgtcatcaggagcactgtagggcttcggacgaccttgctgacccttgttcctccgctcactcctaaccttataatgagccttcgtatcctcctcata 13879612  T
Q  640 aatcctacaactgcttaccaattcagaaaa 669  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  13879613 aattctacaactactcaccaattcagaaaa 13879642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 14683462 - 14683668
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||||  | ||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  14683462 accaaacatagacaaaggacaacgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcaacgaccatctctccattcatatcagacaaa 14683561  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  14683562 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgagtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 14683661  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  14683662 ctctgat 14683668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17092266 - 17092060
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  17092266 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 17092167  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  17092166 acaagacccaaggcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 17092067  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  17092066 ctctgat 17092060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 12479495 - 12479701
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  12479495 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 12479594  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  12479595 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 12479694  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  12479695 ctctgat 12479701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16234109 - 16233903
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  16234109 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 16234010  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  16234009 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 16233910  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  16233909 ctctgat 16233903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 23958642 - 23958848
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  23958642 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 23958741  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  23958742 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 23958841  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  23958842 ctctgat 23958848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 27714231 - 27714437
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    ||||||||||||||| |||||  | | ||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  27714231 accaaacatagacaaaagacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagccggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 27714330  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  27714331 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 27714430  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  27714431 ctctgat 27714437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8050706 - 8050534
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | | ||||||||   | |  ||||||| | |||||    
T  8050706 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaatcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaa 8050607  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  8050606 taaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 8050534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14301062 - 14300890
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | | ||||||||   | |  ||||||| | |||||    
T  14301062 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaatcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaa 14300963  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  14300962 taaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 14300890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Original strand, 19635065 - 19635237
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | | ||||||||   | |  ||||||| | |||||    
T  19635065 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaatcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaa 19635164  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  19635165 taaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 19635237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 8389307 - 8389513
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || || |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  8389307 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagtgaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 8389406  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  8389407 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 8389506  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  8389507 ctctgat 8389513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16350671 - 16350465
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||| ||||||||||  |||| || | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || | |    
T  16350671 accagacatagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatccgacaaa 16350572  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||  || |  ||||||| | |||||| ||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||    
T  16350571 tcaagacccaaagtagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcatagcactagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatataacaagtac 16350472  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  16350471 ctctgat 16350465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15145009 - 15144825
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  15145009 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagacgtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacata 15144910  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattat 215  Q
    || ||||||||  || | |||||||| | | |||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15144909 acaagacccaaagtagaagcacaatcgaaaacaataaaacaatgcttagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattat 15144825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19775876 - 19775704
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | | ||||||||   | |  ||||||| | |||||    
T  19775876 agagaagtagtcaccgaacccttagccggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaatcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaa 19775777  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  19775776 taaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 19775704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18224563 - 18224376
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  |||| |  | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  18224563 accaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 18224464  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaa 218  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  18224463 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaa 18224376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 40475935 - 40476141
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  40475935 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgaccaccatctctccattcatatcagacaaa 40476034  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  40476035 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 40476134  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  40476135 ctctgat 40476141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 100
Target Start/End: Original strand, 15258812 - 15258891
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15258812 caaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaactcttagctggagtttca 15258891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16250967 - 16250780
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  |||| |  | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  16250967 accaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 16250868  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaa 218  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||| ||||||  |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16250867 tcaagacccaaggcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgcgtagcattagtatcaataatagcaactaaatgagtattattaa 16250780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 237
Target Start/End: Original strand, 13513285 - 13513451
Alignment:
Q  71 gtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaac 170  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | | |||||| |   | |  ||||||  | |||||| || |    
T  13513285 gtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaatcaagacccgaagcagaaacacaattgaaagcaataaagc 13513384  T
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  13513385 aatgtgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 13513451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 436 - 634
Target Start/End: Original strand, 14697401 - 14697599
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||  |  | |||||||| |||| || ||||||| || |  | |||||| |||||||||||||||| |||    
T  14697401 acaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtatagcaaacaatctcagcagtagcatctttctttctaggcctcctctcatcattcaatctttgc 14697500  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctct 634  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || |||||   |||||| || || ||||||||| | | |||| |||  || |||||||||||||| |||||||||    
T  14697501 ttacccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaactttgtaatgagctttggtatcctct 14697599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15354291 - 15354234
Alignment:
Q  193 aatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctca 250  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15354291 aatatcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctca 15354234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Original strand, 16219186 - 16219289
Alignment:
Q  134 agacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctc 233  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||  |||| |||||||    
T  16219186 agacccaacttagaagcacaatcaatagcaataaaacagtgtgtagcaccaatatcaataatagcaactaaaggtgtactatcaaaataacatgtacctc 16219285  T
Q  234 tgat 237  Q
    ||||    
T  16219286 tgat 16219289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Original strand, 16222506 - 16222609
Alignment:
Q  134 agacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctc 233  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||  |||| |||||||    
T  16222506 agacccaacttagaagcacaatcaatagcaataaaacagtgtgtagcaccaatatcaataatagcaactaaaggtgtactatcaaaataacatgtacctc 16222605  T
Q  234 tgat 237  Q
    ||||    
T  16222606 tgat 16222609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 608 - 705
Target Start/End: Original strand, 14162942 - 14163039
Alignment:
Q  608 accttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14162942 accttgtagtgagccttagtatccttttcataaatcctgcaactgctcaccagctctgaaaaatttcggatcttctggtaaccaattgccctcttgat 14163039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 545 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 14300585 - 14300485
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcc 644  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  14300585 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 14300486  T
Q  645 t 645  Q
    |    
T  14300485 t 14300485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18604797 - 18604733
Alignment:
Q  170 caatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctct 234  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||||||    
T  18604797 caatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctct 18604733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 436 - 567
Target Start/End: Original strand, 13513650 - 13513781
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || | |||||||||  || |||| |||| | | ||||||  || ||| |||    
T  13513650 acaaacattgctcttgtggcctttctcgccacagttgaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcaaccattctctgc 13513749  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggctt 567  Q
    || || || ||| ||||||||||||| |||||    
T  13513750 ttgcccttatcaacaggggcactataaggctt 13513781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 90
Target Start/End: Original strand, 16219125 - 16219184
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagc 90  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16219125 accaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagttattgaacccttagc 16219184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 90
Target Start/End: Original strand, 16222445 - 16222504
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagc 90  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16222445 accaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagttattgaacccttagc 16222504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 150 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18546877 - 18546794
Alignment:
Q  150 cacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctc 233  Q
    ||||||||| || ||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| || | ||||||||||||||    
T  18546877 cacaatcaagagaaataaaagaatgcgtagctccagtatctataatagcaattaaagggaaattgttgacgaaacaagtacctc 18546794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 670
Target Start/End: Original strand, 8336 - 8570
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |  | || ||||| |||  |||||||||| || |  | || | | ||||||||  || ||| ||     
T  8336 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttatagggcgcctctcatcaaccattctctgt 8435  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || |||||   ||||||||| || || ||| || | |||||| |||  | |||||||||||  || |||||||| |    
T  8436 ttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcct 8535  T
Q  636 cataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaag 670  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  8536 cataaattctgcaactgctcaccaactcagaaaag 8570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 18224185 - 18224123
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || | |||||||||    
T  18224185 acaaacattacacttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatc 18224123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 18604531 - 18604302
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||| || | |||||||||  || |||| |||| | | |||||   || ||| |||    
T  18604531 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttaaaacaaataatctccgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgc 18604432  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtccctt-gcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctct 634  Q
    || || || |||||||||||| |||| |||||    |||||||| || ||||| | || | | |||| | |  ||||||||||||||| | |||||||||    
T  18604431 ttgcccttatcagcaggggcattataaggcttagggcgactctgctggcccttagtct-tcctctcattaacaaccttgtaatgagctatggtatcctct 18604333  T
Q  635 tcataaatcctacaactgcttaccaattcag 665  Q
    ||||| |||||||| ||| | ||||| ||||    
T  18604332 tcatagatcctacagctgttcaccaaatcag 18604302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 145
Target Start/End: Original strand, 14188435 - 14188515
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaactta 145  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||| ||| | | | ||||||||||||    
T  14188435 agagaagtagtaaccgaacctttagctggagtttcgacaaccatctctccattaatattagacatagcaagacccaactta 14188515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16248388 - 16248326
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||   ||| ||||| ||||||||    
T  16248388 acaaacattactcttgtggcctttctcaccataattgaaacatgtaatctcagttggagcatc 16248326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 545 - 651
Target Start/End: Original strand, 19635542 - 19635648
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcc 644  Q
    ||||| |||||||| ||||||||   || |||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  19635542 tcagcgggggcactgtacggcttaggacaactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 19635641  T
Q  645 tacaact 651  Q
    | |||||    
T  19635642 tgcaact 19635648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 14999681 - 14999726
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  14999681 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 14999726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 494; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 63919 - 63245
Alignment:
Q  11 agatggacatcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63919 agatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 63820  T
Q  111 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  63819 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacaacaatgaaacaatgagtaacaccagtatctataatagcaattaaaagagt 63720  T
Q  211 attattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggc 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  63719 actattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcactgtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacttgtcctaaccttcttaggc 63620  T
Q  311 tgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacc 410  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  63619 tgcgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattatagttgtagcaaacaatatccccatgcttacaatcagctaaagtgtgtcctttctgaccacacc 63520  T
Q  411 tgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttggg 510  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63519 tgaaacacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttatcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttggg 63420  T
Q  511 cctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcacc 610  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||                    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  63419 cctcctctcatcattcaatctttgcttacccttgtcagcagg--------------------gactctgctgtaccttgcctctacgctcactcatcacc 63340  T
Q  611 ttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  63339 ttgtaatgagctttcgtatcctcttcataaatcctacagctacttaccaattcagaaaagtttcttatcttctcataaccaatagccctcttgat 63245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 491; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 705
Target Start/End: Original strand, 5085 - 5778
Alignment:
Q  11 agatggacatcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 110  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5085 agatcgacttcaaagtctctaccaaacattgacaacggacaacttagacaaacaagagaaatagttactgaaacctcagctggagtttcaacaaccattt 5184  T
Q  111 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 210  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5185 ctcctttcatatcagacataaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaatgagt 5284  T
Q  211 attattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggc 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  5285 actattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcactgtttgcgtaccagtcaacgcaaaaaccttgccacctgacctagacttcttaggc 5384  T
Q  311 tgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacc 410  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| || ||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5385 tgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccccacgcttacaatcagctaaagtgtgtcctttctgaccacacc 5484  T
Q  411 tgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttggg 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5485 tgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctctt-gg 5583  T
Q  511 cctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcacc 610  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  5584 cctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcagtaggggcactgtacggcttccgatgactctgctgtcccttgactctatgctcactcatcact 5683  T
Q  611 ttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |  | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5684 ttgtaatgagctttggtatcctcttcataaatcttgtagctacttaccaattcagaaaagttccttatcttctgataaccaatagccctcttgat 5778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 470; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 22016205 - 22015520
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22016205 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 22016106  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22016105 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacatcaatgaaacaatgagtatcaccagtatctataatagcaattaaatgagtactattaaa 22016006  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22016005 gaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcactgtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttcggctgcgtacac 22015906  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | | || | |||||| ||||||||||| |||| || |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22015905 tgcaaactaatatgatcttcctcgttgcagttataacaaacaacatccccacgcttgcaatcagctaaagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcact 22015806  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  22015805 tcttctcatctctatcacaaacattacttttttggcctttttctccacacttgaatcaaacaatatttgtaggagcatctctcttctttggcctcctctc 22015706  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||| | ||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22015705 atcatttattctcttcttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtccctttcccctacgctcactcatcaccttgtaatga 22015606  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22015605 gctttcgtaacttcttcatagatcctacagctgcttaccaaatcagagaagtttcttattttctgataaccaatagccctcttgat 22015520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 21739505 - 21738811
Alignment:
Q  11 agatggacatcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21739505 agatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagaaaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 21739406  T
Q  111 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 210  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21739405 ctcctttcatatcagataaaacaagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagaaattaaaggagt 21739306  T
Q  211 attattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggc 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21739305 actattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaaccgtttgcgtaccagtcaaagaaaacagcttgccacctgtcctaaccttcttaggc 21739206  T
Q  311 tgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacc 410  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||| || ||  |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  21739205 tccgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattatagttgtagcaaaaaacatccccacgcttacaatcaactaaggtgtgtcctttctgaccacacc 21739106  T
Q  411 tgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttggg 510  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  21739105 taaagcacttcttctcatctcgatcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaataatctcagtaggagcacctctcctcttagg 21739006  T
Q  511 cctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcacc 610  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  21739005 cctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcagcatgggcgctatatggcttcggacgactctgttgtcccttacctctgcggtcactcatcacc 21738906  T
Q  611 ttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21738905 ttgtaatgagctttcgtatcctcttcatatatcctgcagctacttaccaattcagaaaaattccttaccttttgatagccaatagccctcttgat 21738811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 21743021 - 21742327
Alignment:
Q  11 agatggacatcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 110  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21743021 agatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacagacaactcaaacaaacaagagacgtagttaccgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 21742922  T
Q  111 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 210  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21742921 ctccattcatatcagatacaatcagacccaacttatatgcacaatcaacaacaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaatgagt 21742822  T
Q  211 attattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggc 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21742821 actattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcactgtttgcgtaccagtcaacgcaaataccttgccacctgtcctaaccttcttaggc 21742722  T
Q  311 tgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacc 410  Q
    |||||||||| |||| | ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | || |||||||||||| |||||||||    
T  21742721 tgcgtacactgcgaactaatatgtccttcctcattacagttgtagcaaacaacatccccacgcttgcaatcagccaatgtgtgtcctttctgaccacacc 21742622  T
Q  411 tgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttggg 510  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21742621 taaagcacttcttctcatctcggtcacatacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaataatctcagtaggagcatctctcctcttagg 21742522  T
Q  511 cctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcacc 610  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21742521 cctcctctcatcattcagtctctgcttacccttgtcagtaggagcactatacggtttcggacgactctactgtcccttacctctgcgctcactcatcacc 21742422  T
Q  611 ttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21742421 ttgtaatgagctttcgtatcctcttcatatatcctgcagctactcaccaactcagagaaaattcttatcttctcataaccaatagccctcttgat 21742327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Original strand, 19857204 - 19857892
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857204 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttaggcaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 19857303  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19857304 tatcagatacaaccatacccaacttataagcacattcaataacaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcagttaaaggagtactattaaa 19857403  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||| |    | |||||||| ||||| ||||||||| || ||||  ||| |||||||||| || || ||||||    
T  19857404 gaaacaagtacctctaataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccactggtcataaccttcttcggttgagtacac 19857503  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||| | |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| || |||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  19857504 tgcgaactaatatgaccttcctcattgtagttataacaaacaatgtctccccgcttacaatcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcatt 19857603  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19857604 tcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaacaatctcggtagaagcatctctcctcttaggcctcctctc 19857703  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||   |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19857704 atcattcaacctctgcttacccttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttacctctgcgttcactcatcaccttgtaatga 19857803  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    || || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  19857804 gccttagtatcctcttcatagatcttacagctgcttaccaactcagaaaagtttctaatcttctgatagccaatggctctcttgatgtc 19857892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 24097074 - 24096390
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24097074 caaagtctctaccaaacatagacaatggacatctcaagcaaacaagagaagtaattactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 24096975  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24096974 attagatacatccaaacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcactagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 24096875  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| |||||| |||||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  24096874 aaacaagtacctctgataagtcagtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctagccttcttcggctgagtacact 24096775  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  24096774 gtgaactgatatgaccttcttcgttgcagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacattcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctaaaacactt 24096675  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24096674 cctctcatctctaccacaagcattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctca 24096575  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||||||  || || || || ||||||||||| |||||||| || ||   |||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  24096574 tcattcatcctctgttttcctttgtcagcaggagcactataaggtttaggacgactctgttgtcccttacttcttcgctcactcgtcaccttgtaatgag 24096475  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  24096474 ctttggtgtcttcctcatatatcctgcagctgctcaccaactcagagaaaattctaatcttctgatacccaatagctcttttgat 24096390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 20833360 - 20832673
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20833360 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttaatgaacccttatctggagtttcaacaaccatttcccctttca 20833261  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20833260 tatcagatacaaccagacccaacttataagaacattcaataacaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggaataatattaaa 20833161  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |    | |||||||| ||||| ||||||||| || | ||| |||||||||||| | || |||||||||    
T  20833160 gaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttactaccggtcctaaccttcctcggttgcgtacac 20833061  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||| |||| ||||||||||| ||| |||| || |||||||  || || | ||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  20833060 tgcgaactgatgtgaccttcctcattgcagttataacaaacaacatctcccctcttgcaatcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctgaaacaat 20832961  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||||     |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  20832960 tcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtagcaaacaatatcaacaggagcatctctcctcttgggtctcctctc 20832861  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    ||||||||  || ||||| || ||||||||||| ||||||||  | ||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20832860 atcattcagcctctgctttcccttgtcagcaggagcactata-tgtttaggacgactctgctgtcccttgcctctacggtcactcatcaccttgtaatga 20832762  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||| ||||| | |||||| || ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20832761 gctttcgtatcttattcatagattctacagctgctcaccaacttcgaaaagtttctaattttctggtatccaatagccctcttgatgtc 20832673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 21 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 38910285 - 38909598
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  38910285 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattttccctttcat 38910186  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38910185 atcagatacatccaaacccaacttatatgcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaag 38910086  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||  | |||  |||||| ||||  | |||||    
T  38910085 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaggcaaaaacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacact 38909986  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| |||||||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  38909985 gtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcactt 38909886  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  38909885 cctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatca 38909786  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||  ||  || ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||   |||| ||||||||||||| || || | | ||||||| | |||||||||||    
T  38909785 tcacccatcctctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgttgtcccttacccctcctcccactcattatcttgtaatgag 38909686  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||  ||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  38909685 ctttggtgtcttcttcataaattctacatctgtttaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 38909598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 21 - 708
Target Start/End: Original strand, 48425804 - 48426491
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48425804 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 48425903  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48425904 atcagatacatccaaacccaacttatatgcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaag 48426003  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||  | |||  |||||| ||||  | |||||    
T  48426004 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacact 48426103  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| |||||||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  48426104 gtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcactt 48426203  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  48426204 cctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatca 48426303  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||  ||   | ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||   |||| ||||||||||||| || || | ||||||||| | |||||||||||    
T  48426304 tcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgag 48426403  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||| || || |||||||| || || || ||  | ||||| ||||| |||  ||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  48426404 ctttggtgtcttcttcatagattctgcacctattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 48426491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 21 - 708
Target Start/End: Original strand, 52988672 - 52989358
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52988672 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 52988771  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52988772 atcagatacatccaaacccaacttataagcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaag 52988871  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || |  | ||| |    
T  52988872 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacaccttgcccccagttctaaccttcttcggttcaggacatt 52988971  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| |||||||||| ||  | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| || ||| ||||||||||||| |||||    
T  52988972 gtgaactgatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaatgtccccacgcttacattcagctaaattgtgacccttctgaccacacctgaaacactt 52989071  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | ||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  52989072 cctctcatctttaccacaaacattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatca 52989171  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||||||   | ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||   |||| | || |||||||| || || | ||||||||| |  ||||||||||    
T  52989172 tcattcatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattttgctgtcccttacccctcctctcactcatta-tttgtaatgag 52989270  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||| || || ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||  ||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  52989271 ctttggtgtcttcttcataaattctacacctgttaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 52989358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 21 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 31537456 - 31536769
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31537456 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 31537357  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31537356 atcagacacatccaaacccaacttatatgcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaag 31537257  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||    |  ||||||| ||||| |||||||||||| |||||  | |||  |||||| ||||  | |||||    
T  31537256 aaacaagtacctctgataagtcggtcttcattaggagtctgcgtaccagtcagagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacact 31537157  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| | ||||| |||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||| ||    
T  31537156 gtgaactaatatggccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcattt 31537057  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
      | |||||||   |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  31537056 tctatcatctctaccacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacacttataacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttgggtctcctatca 31536957  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||||||  || ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||   |||| |||| |||||||| || || | ||||||||| | |||||||||||    
T  31536956 tcattcatcctctgctttcctttgtcagcaggagcactataaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgag 31536857  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||  ||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  31536856 ctttggtgtcttcttcataaattctacatctgtttaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 31536769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 63 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 20075126 - 20074481
Alignment:
Q  63 caagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagc 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||    
T  20075126 caagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcatatcagatacatccaaacccaacttataggcacattcaatagc 20075027  T
Q  163 aatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgc 262  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |  |||    
T  20075026 aataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgc 20074927  T
Q  263 gtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaa 362  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||| ||||    
T  20074926 gtaccagtcaatgcaaacatcttgcccccagttctaaccttcttcggctcaggacactgcgaattgatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaa 20074827  T
Q  363 tgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttc 462  Q
    | ||||||||||| || ||| | ||  |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  20074826 tatccccacgcttgcattcagccaagctgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctttactacaaacattgctcttgtggcctttctc 20074727  T
Q  463 accacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatac 562  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||| | |||||| |||   | ||||| || ||||||||||  ||||| ||     
T  20074726 accacacttgtaacacacaatctcagtgggagcatctctcctcttaagcctcctgtcatcactcatcttctgctttcctttgtcagcagaagcactgtaa 20074627  T
Q  563 ggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaatt 662  Q
    |||||   |||| |||| |||||||| || || | ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||  || | ||||| |    
T  20074626 ggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattctacacatgttaaccaact 20074527  T
Q  663 cagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||| |||  ||| |||| || ||| |||||||| || ||||||||    
T  20074526 cagagaagaatctgatctgctaatacccaatagctcttttgatgtc 20074481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 21 - 708
Target Start/End: Original strand, 37679980 - 37680667
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37679980 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 37680079  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37680080 atcagatatatccaaacccaacttatatgcacattcaatagcaataaaacaatgaatagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaag 37680179  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||  | |||  |||| | ||||  | |||||    
T  37680180 aaacaagtacctctgataagtctgtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttcccaccaattctagtcttcctcggctcaggacact 37680279  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| | |||||||||||  | ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  37680280 gtgaactaatatgaccttctccattgcaattgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcactt 37680379  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  37680380 cctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagtatctctcctcttgggcctcctatca 37680479  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||  ||   | ||||| || ||||||| ||| ||||| || |||||   |||| ||||||||||||| || || | ||||||||| | |||||||||||    
T  37680480 tcacccatcttctgctttcctttgtcagtaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgag 37680579  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||| || || |||||||| || || || ||  | ||||| ||| | |||  ||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  37680580 ctttggtgtcttcttcatagattctgcacctattaaccaactcaaagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 37680667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 56 - 669
Target Start/End: Original strand, 20297347 - 20297962
Alignment:
Q  56 agacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaat 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |    
T  20297347 agacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcatatcagatacatccaaacccaacttataagcacatt 20297446  T
Q  156 caacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcatt--c 253  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||       
T  20297447 caatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaagaaaccagtacctctgataagtcggtcctcattggt 20297546  T
Q  254 actgattgcgtacgag-tcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttg 352  Q
    | ||  |    || || ||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||  | |||||| ||| | |||||||||||  | ||| |||||    
T  20297547 agtg-gtaataaccagctcaaaccaaacaccttcccaccagttctaaccttcttcgactcaggacactatgaactaatatgaccttctccattgcagttg 20297645  T
Q  353 tagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgt 452  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||| |||   |||| || |||  ||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||    
T  20297646 tagcagacaatgtccccacgcttgcattcagctaggctgtgacccttctaaccacacctgaagcacttcctctcatctttaccacaaacattactcttgt 20297745  T
Q  453 ggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcagg 552  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||   | || || || ||||||| |||    
T  20297746 ggcatttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctgtcatcacccatcttctgttttcccttgtcagtagg 20297845  T
Q  553 ggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactg 652  Q
     ||||| || |||||   |||| |||| |||||||| || || | ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  20297846 agcactgtaaggcttaggacgattctgatgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattctacacctg 20297945  T
Q  653 cttaccaattcagaaaa 669  Q
     | ||||| ||||||||    
T  20297946 ttaaccaactcagaaaa 20297962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 198 - 694
Target Start/End: Original strand, 21961135 - 21961631
Alignment:
Q  198 caattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcct 297  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  21961135 caattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaaagcaaatacctttccaccagttct 21961234  T
Q  298 aaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcct 397  Q
    ||||||||| ||||  |  |||| |||| |||||||||| ||  | ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||     
T  21961235 aaccttcttcggctcagggcactgcgaactgatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaatatccccacgcttacattcagctaaactgtgtccc 21961334  T
Q  398 ttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcat 497  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  21961335 ttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctttaccacaaacattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcat 21961434  T
Q  498 ctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacg 597  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||   | ||||| || ||||||| ||| ||||| || |||||   |||| |||| |||||||| ||||| |     
T  21961435 ctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcttctgctttcctttgtcagaaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacctctcct 21961534  T
Q  598 ctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaata 694  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||  | || ||| ||||||||||||| |||  ||| |||| |||||| ||||||    
T  21961535 ctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattatgcatctgtttaccaattcagagaagactctgatctgctgatacccaata 21961631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 291
Target Start/End: Original strand, 18710315 - 18710586
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  18710315 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctctca 18710414  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18710415 tatcagatacaaccagacgcaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtttataatagcaattaaaggagtactattaaa 18710514  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacc 291  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |    | |||||||| ||||| ||||||||| || |||||    
T  18710515 gaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccacc 18710586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 20854220 - 20853532
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20854220 tcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacacacaagagaagtagttactgaacccttggctggagtttcaacaaccatttcccctttca 20854121  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20854120 tatcagatacaattaggcccaacttatatgcacattctaaagcaatgaaacaatgcgtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 20854021  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||    |  || |||| ||||||||| || ||||| || |  || || ||||||||||| ||||| |||    
T  20854020 gaaacaagtacctctgataagtcgatcctcgttggtagtctgggtaccagtcaaagcgaaaaccttccctcaagttctgaccttcttaggttgcgtgcac 20853921  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||  | || || || || |||    | ||  | ||||| || || |||||||| || ||| | ||  | || || ||| |||| || ||||| || |    
T  20853920 tgcgagctaatgtggccctcatcgccacaattaaaacaaacgatatctccacgcttgcattcagccaacatatgacccttctgaccgcatctgaaacatt 20853821  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    ||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||| |||  | ||||    
T  20853820 tcttctcatcttgggtgcaagcattactcttgtggcccttcacaccacatttgtaacaaacaacatcaacaggagcatttctccccttaggctgcctctc 20853721  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||||||||| || || || |||| || ||| ||||| || ||||||   |||||    || |||||    ||   ||| ||||||||||| ||||||    
T  20853720 atcattcaatctttgtttgcctttgttagtaggagcactgtagggcttcgggcgactactctgacccttattccttttctcgctcatcaccttataatga 20853621  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || ||  |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  20853620 gcctttgtatcctcctcataaattctacagctactcaccaattctgagaaaattctgatcttctgatatccaatggctctcttgatgtc 20853532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 282
Target Start/End: Original strand, 16379004 - 16379255
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  || | |    
T  16379004 accaaacatagacaaaggacatcttaaacaaacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatttgacata 16379103  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     |  ||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  || |||| |||| ||||    
T  16379104 gcatgacccaacttagaagcacaatcaatagcaataaaacaatgcgtagcaccaatatcaataatagcaattaaaggagtaccatcaaagtaacatgtac 16379203  T
Q  231 ctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacac 282  Q
    ||||||| |  |  ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16379204 ctctgatcaaacgatcctcgttctctgtttgcgtaccagtcaaagcaaacac 16379255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 437 - 669
Target Start/End: Original strand, 18273114 - 18273346
Alignment:
Q  437 caaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgct 536  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| ||||    
T  18273114 caaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagtaggaacatctcttctcttaggtctcctctcatcattcaatctttgct 18273213  T
Q  537 taccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttc 636  Q
      || |||||| |||| ||||| || ||||||  |||||  || || ||||||   || ||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  18273214 cccctttgtcaacaggagcactgtagggcttcggacgaccttgctgacccttgttcctccgctcactcctaaccttataatgagccttcgtatcctcctc 18273313  T
Q  637 ataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaa 669  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  18273314 ataaattctacagctactcaccaattcagaaaa 18273346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22496705 - 22496499
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  22496705 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacata 22496606  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||  || | |||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||   |||| ||||    
T  22496605 acaagacccaatgtagaagcacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattatcaatataacatgtac 22496506  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  22496505 ctctgat 22496499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24785306 - 24785058
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  24785306 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggaatttcaacgaccatctctccattcatatcagataaa 24785207  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||   | | |||||||| | |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  24785206 acaagacccaaagcagaagcacaatcgaaagcaataaaacaatgtgtagcacaagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 24785107  T
Q  231 ctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaa 279  Q
    ||||||| |  |  ||||||||| |||  || |||| ||||||||||||    
T  24785106 ctctgatcaaacgatcctcattctctgtctgagtaccagtcaaagcaaa 24785058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16348044 - 16347838
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  16348044 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 16347945  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  16347944 acaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 16347845  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  16347844 ctctgat 16347838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20081825 - 20081619
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  20081825 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacata 20081726  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||  || | |||||||| | |||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||   |||| ||||    
T  20081725 acaagacccaaagtagaagcacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagtaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattatcaatataacatgtac 20081626  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  20081625 ctctgat 20081619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 51330941 - 51330735
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  51330941 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 51330842  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  51330841 acaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 51330742  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  51330741 ctctgat 51330735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 237
Target Start/End: Original strand, 21751988 - 21752163
Alignment:
Q  62 acaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacag 161  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| ||| | | | ||||||||||||   |||||||||| ||    
T  21751988 acaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctcttcattcatattagacatagcaagacccaacttagtagcacaatcaatag 21752087  T
Q  162 caatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||    
T  21752088 caataaaacaatgcgtagcaccaatatcaataatagcaactaaaggtgtactatcaaaataacaagtacctctgat 21752163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33388478 - 33388291
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  33388478 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 33388379  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaa 218  Q
    || ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  33388378 acaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaa 33388291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17042464 - 17042258
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  |||| |  | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  17042464 accaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 17042365  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | || |||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||    
T  17042364 tcaaggcccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatataacaagtac 17042265  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  17042264 ctctgat 17042258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Original strand, 21833246 - 21833418
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | | ||||||||   | |  ||||||| | ||| |    
T  21833246 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaatcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcca 21833345  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  21833346 taaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 21833418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 279
Target Start/End: Original strand, 21842122 - 21842370
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| | |    
T  21842122 accaaacatagacaaatgacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaacaatctctccattcatatcagacaaa 21842221  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||| ||   | |  ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  21842222 tcaagacctaaagcagaaacacaatcaaaagcaataaaacaatgcgtagcaccaatatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 21842321  T
Q  231 ctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaa 279  Q
    ||||||| |  |  ||||| ||| |||  ||||||| ||||||||||||    
T  21842322 ctctgatcaagcgatcctcgttctctgtctgcgtaccagtcaaagcaaa 21842370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 128
Target Start/End: Original strand, 12200449 - 12200556
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12200449 caaaatctctaccaaacatagatatgggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 12200548  T
Q  121 atcagata 128  Q
    ||||||||    
T  12200549 atcagata 12200556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 19109278 - 19109484
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  19109278 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatactagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 19109377  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | |||| |||   | | |||||||||   ||||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  19109378 tcaagactcaaagcagaagcacaatcataggcaataaaacaatgcatagcaccagtgtcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 19109477  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  19109478 ctctgat 19109484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41351068 - 41350911
Alignment:
Q  80 gaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtag 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |   | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||| ||||    
T  41351068 gaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccgttcatatcagacaactcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgcgtag 41350969  T
Q  180 caccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  41350968 caccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 41350911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 436 - 702
Target Start/End: Original strand, 16379409 - 16379675
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||     | |||||||| |||| |  | ||||| || |  | |||||| |||||||||| | ||| ||     
T  16379409 acaaacattacttttgtggcctttctcaccacaagcatagcaaacaatctcagcaacaacatctttctttctcggcctcctctcatcattaactctctgt 16379508  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    || || || ||||||| |||||| || |||||   |||||||||||| ||||||||| | |||||| |||  |||||||||||||| || |||||||| |    
T  16379509 ttgcccttatcagcagaggcactgtaaggcttaggacgactctgttgacccttgcctttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcct 16379608  T
Q  636 cataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctctt 702  Q
    |||||||||| || ||||| ||||  |||||||| || |  |||||||  |||||||| ||||||||    
T  16379609 cataaatcctgcatctgctcaccagctcagaaaaattacggatcttctagtaaccaattgccctctt 16379675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21228947 - 21228799
Alignment:
Q  89 gctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtat 188  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||    
T  21228947 gctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaatcaagacccaaaccagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgcgtagcaccagtat 21228848  T
Q  189 ctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||||||   | ||||||||||||||    
T  21228847 caataatagcaactaaaggagtaatattaatatagcaagtacctctgat 21228799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21045428 - 21045322
Alignment:
Q  176 gtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaag 275  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||| | || |  |  ||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  21045428 gtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatcaaagtaacatgtacctataatcaaacgatcctcattctctgtttgcgtaccagtcaaag 21045329  T
Q  276 caaacac 282  Q
    |||||||    
T  21045328 caaacac 21045322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 21228600 - 21228469
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || | |||||||||  || |||| |||| | | |||||   || ||| ||     
T  21228600 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 21228501  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggctt 567  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  21228500 ttacccttatcagcaggggcactatagggctt 21228469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 237
Target Start/End: Original strand, 22401631 - 22401708
Alignment:
Q  160 agcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||   |||||||| |||||||    
T  22401631 agcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtattatcaatataacaagtatctctgat 22401708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 182 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22436031 - 22435976
Alignment:
Q  182 ccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  22436031 ccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatataacaagtacctctgat 22435976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 611 - 705
Target Start/End: Original strand, 20921929 - 20922023
Alignment:
Q  611 ttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| || | ||||| |||||| |  ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  20921929 ttgtaatgtgctttggtatcctcttcatagattctgcaactgctcactagttcagtaaagttacggatcttctgatatccaattgcccgcttgat 20922023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 536 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 16347542 - 16347433
Alignment:
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  16347542 ttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctctt 16347443  T
Q  636 cataaatcct 645  Q
    | || |||||    
T  16347442 cgtagatcct 16347433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 536 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 16354190 - 16354081
Alignment:
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  16354190 ttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctctt 16354091  T
Q  636 cataaatcct 645  Q
    | || |||||    
T  16354090 cgtagatcct 16354081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 516 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 21045118 - 21044941
Alignment:
Q  516 tctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgta 615  Q
    |||||||||| | ||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||   |||||| || || ||||||||| | | || | |||  ||||||||    
T  21045118 tctcatcattaactctttgcttgcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctcttattcacaaccttgta 21045019  T
Q  616 atgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaat 693  Q
    |||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| ||||  ||||||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  21045018 atgagccttagtatcttcctcatatattctgcaactgctcaccagctcagaaaagttacggatcttctgttaaccaat 21044941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 51330430 - 51330330
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcc 644  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  51330430 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 51330331  T
Q  645 t 645  Q
    |    
T  51330330 t 51330330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 545 - 591
Target Start/End: Original strand, 19109791 - 19109837
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcc 591  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  19109791 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgcc 19109837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 24784901 - 24784839
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| || | |||||||||    
T  24784901 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccataattgaaacagacaatctccgcaggagcatc 24784839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 438 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 17042057 - 17041929
Alignment:
Q  438 aaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgctt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||| || | |||||||||  || |||| |||| | | |||||   || ||| |||||    
T  17042057 aaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaa-aatctccgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgctt 17041959  T
Q  538 accgttgtcagcaggggcactatacggctt 567  Q
     || || ||||||||||||||||| |||||    
T  17041958 gcccttatcagcaggggcactataaggctt 17041929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20828701 - 20828656
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  20828701 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 20828656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 20928104 - 20928149
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  20928104 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 20928149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 466; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 705
Target Start/End: Original strand, 29537 - 30222
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29537 tcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 29636  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29637 tatcagatacaactagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatcaaacattgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 29736  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  29737 gaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaactgtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttaccacctgtcctaaccttcttcggttgcgtacac 29836  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||| |  | || ||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  29837 tgcgaactgatatgaccttcctcattgcaaatataacaaacgatgtccccacacttacaatcagctagagtgtgtcccttttgaccacacctgaagcact 29936  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  29937 tcttctcatctctatcacaaacgttactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaactatgtcagtaggaacatctctcctcttgggcctcctctc 30036  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30037 atcatttaaactctgcttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 30136  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  30137 gctttcgtgtcctcctcataaatcctacagctgcttaccaaatcagagaagtttcttattttctgataaccaatggctctcttgat 30222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 64993 - 64305
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  64993 tcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacaaacaagagaagtagttactgaaccctttgctggagtttcaacagccatttctcctttca 64894  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||| || |  ||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  64893 tatcagatacaatcaaattcaacttatacgcacattctaaagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 64794  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    |  ||||||| || |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| || || || |||    
T  64793 gaaacaagtacctctgataagacggtcctcattagtagtctgcgtaccagccaaagcaaacactttcctaccagttctaaccttcttcggttgtgtgcac 64694  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| | ||||| || || || |   | || |||||||| |  || |||||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  64693 tgtgaactaatatggccctcttcatcacaattatagcaaactacatcaccacgcttgcaattagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctgaaacatt 64594  T
Q  420 tcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttct 518  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || |||| ||||||||| ||||| || |||||| | |    
T  64593 tcttctcatccttggt-acaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaactatctcagcaggagcatccctcctattcggcctccttt 64495  T
Q  519 catcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatg 618  Q
    ||||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  64494 catcattcagtctctgctttcccttgtcagccggggcactatacggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatg 64395  T
Q  619 agcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| ||  |||| ||||  ||||| || || || |||||||||||    
T  64394 agcttttgagtcctcctcatatatcctgcaacgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttgataccctatggctctcttgatgtc 64305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 49571 - 48883
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49571 tcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttggctggagtttcaacagccatttctcctttca 49472  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||| || |  ||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49471 tatcagatacaatcaaattcaacttatacgcacattctaaagcaatgaaacaatgagtagctccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 49372  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    |  ||||||| || |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| || || || |||    
T  49371 gaaacaagtacctctgataagacggtcctcattagtagtctgcgtaccagccaaagcaaacactttcctaccagttctaaccttcttcggttgtgtgcac 49272  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| | ||||| || || || |   | || |||||||| |  || |||||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  49271 tgtgaactaatatggccctcttcatcacaattatagcaaactacatcaccacgcttgcaattagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctgaaacatt 49172  T
Q  420 tcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttct 518  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| || |||| ||||||||| ||||| || |||||| | |    
T  49171 tcttctcatccttggt-acaaacattactcttgtggcccttctcgccacacttgtaacaaactatctcagcaggagcatccctcctattcggcctccttt 49073  T
Q  519 catcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatg 618  Q
    ||||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  49072 catcattcagtctctgctttcccttgtcagccggggcactatacggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatg 48973  T
Q  619 agcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| ||  |||| |||| |||||| || || || |||||||||||    
T  48972 agcttttgagtcctcctcatatatcctgcaacgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgctgataccctatggctctcttgatgtc 48883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 58605 - 57917
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  58605 tcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttggctggagtttcaacagccatttctcctttca 58506  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||| || |  ||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  58505 tatcagatacaatcaaattcaacttatacgcacattctaaagcaatgaaacaatgagtagctccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 58406  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    |  ||||||| || |||||||||||| || | ||| || ||||||||||| || || || |||    
T  58405 gaaacaagtacctctgataagacggtcctcattagtagtctgcgtaccagccaaagcaaacactttcctaccagttctaaccttcttcggttgtgtgcac 58306  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| | ||||| || || || |   | || |||||||| |  || |||||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  58305 tgtgaactaatatggccctcttcatcacaattatagcaaactacatcaccacgcttgcaattagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctgaaacatt 58206  T
Q  420 tcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttct 518  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| || |||| ||||||||| ||||| || |||||| | |    
T  58205 tcttctcatccttggt-acaaacattactcttgtggcccttctcgccacacttgtaacaaactatctcagcaggagcatccctcctattcggcctccttt 58107  T
Q  519 catcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatg 618  Q
    ||||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  58106 catcattcagtctctgctttcccttgtcagccggggcactatacggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatg 58007  T
Q  619 agcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| ||  |||| |||| |||||| || || || |||||||||||    
T  58006 agcttttgagtcctcctcatatatcctgcaacgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgctgataccctatggctctcttgatgtc 57917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 454; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 705
Target Start/End: Original strand, 42611 - 43296
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42611 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttattgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 42710  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42711 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaactacaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaaataaaggagtactattaaa 42810  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  42811 gaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaactgtttgcgcaccagtgaaagcaaacaccttgccacctgtcctaatcttcttaggttgcgtacac 42910  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||| | |||||||||||  | ||  | |||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  42911 tgcgaactaatatgaccttctgcattacaattgtagcaaacaacatccccacgcttaaaatccgctaaagtgtgtcctttctgactacacctaaagcact 43010  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  43011 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcacaacacttgaaacaaattatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctc 43110  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    ||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  43111 atcattcaacctctgtttacccttgtcagcaggggcactatacggcttcggacgactctactgtcccttgcctcggcgcttactcatcaccttgtaatga 43210  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43211 gcttttgtatcctcatcatagatcttacagctgcttaccaaatcagagaagtttcttattttctgataaccaatagccctcttgat 43296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 50691 - 50519
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||  || | |||||||| | |||||    
T  50691 agagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacataacaagacccaaggtagaagcacaatcgaaagcaa 50592  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||   |||| |||||||||||    
T  50591 taaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattatcaatataacatgtacctctgat 50519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 447; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 1711 - 1017
Alignment:
Q  11 agatggacatcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1711 agatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtaattaccgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 1612  T
Q  111 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611 ctcctttcgtatcagatacaaccagacccaacttatatgcacagtcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 1512  T
Q  211 attattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggc 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    |  ||| | | |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  1511 actattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcactagtagtctgcatgccagtcaacgcgaacactttaccacctgtcctaaccttcttaggc 1412  T
Q  311 tgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacc 410  Q
    || ||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1411 tgagtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcaagtgtagcaaacaatatccccacgcttacattcagctaaagtgtgtcctttctgaccacacc 1312  T
Q  411 tgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttggg 510  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1311 tgaagcacttcttctcatctctatcacaagcattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaattatctcagtaggagcatctctcctcttggg 1212  T
Q  511 cctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcacc 610  Q
    |||| ||||||||||||  || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1211 cctcctctcatcattcagcctctgtttacccttgtcagcaggagcactgtatggcttcggacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcacc 1112  T
Q  611 ttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  1111 ttgtaatgagctttcgtatcctcttcatagatcctacagctgcttaccaaatcagagaagtttcttattttcgaataaccaatagccctcttgat 1017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 447; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 705
Target Start/End: Original strand, 7648 - 8342
Alignment:
Q  11 agatggacatcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7648 agatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtaattaccgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 7747  T
Q  111 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7748 ctcctttcgtatcagatacaaccagacccaacttatatgcacagtcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 7847  T
Q  211 attattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggc 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    |  ||| | | |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  7848 actattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcactagtagtctgcatgccagtcaacgcgaacactttaccacctgtcctaaccttcttaggc 7947  T
Q  311 tgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacc 410  Q
    || ||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7948 tgagtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcaagtgtagcaaacaatatccccacgcttacattcagctaaagtgtgtcctttctgaccacacc 8047  T
Q  411 tgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttggg 510  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  8048 tgaagcacttcttctcatctctatcacaagcattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaattatctcagtaggagcatctctcctcttggg 8147  T
Q  511 cctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcacc 610  Q
    |||| ||||||||||||  || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8148 cctcctctcatcattcagcctctgtttacccttgtcagcaggagcactgtatggcttcggacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcacc 8247  T
Q  611 ttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  8248 ttgtaatgagctttcgtatcctcttcatagatcctacagctgcttaccaaatcagagaagtttcttattttcgaataaccaatagccctcttgat 8342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 442; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 705
Target Start/End: Original strand, 34250 - 34935
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  34250 tcaaagtctttaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaaatagctactgaacccttagctggaatttcaacaaccatttccactttca 34349  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  34350 tatcagatacaaccggacccaacttatatacatattcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcagttaaaggagtactattaaa 34449  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34450 gaaacaagtacctctaataagtcggtcctcattaactgtttgcgtaccagtcaaggcaaacacctttccacctgtcctaaccttcttcggctgcgtacac 34549  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34550 tacgaactaatatgaccttcctcattgcagttataacaaacaacgtccccacgcttacaatcaactaatgtgtgtcctttctaaccacacctgaagcact 34649  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34650 tcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaaacaaacaatgtcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctc 34749  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  34750 atcatttaacctttgcttacccttgtcagcaggagcactatacagcttcggacgactctgctgtcccttgcctctgcgttcactcatcaccttgtaatga 34849  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||    
T  34850 gcttttgtgtcctcctcataaatcctgcagctacttaccaaatcagagaagtttcttattttctaataaccaatggcactcttgat 34935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 429; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 1206 - 518
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1206 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacatcttagaaaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 1107  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1106 tatcagatacagccagacccaacttatatgcacaatcaatagcaataaaacaatgagtagcactagtgtctataatagcaattaagggagtactattaaa 1007  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||   || ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1006 gaaacaagtacctttgataagtctgtcctcattagttgtttgcgtaccggtcaaagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttctttggctgcgtacac 907  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  906 tgcgaactgatatgtccttcctcgttgcagttataacaaacaatgtccccacgcttacaatcagctagtgtgtgtcccttctgaccacacctgaagcact 807  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  806 tcttctcatctctatcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaatcaatgtccgtaggagcatctctcctcttgggcctcctctc 707  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  706 atcatttaacctctgcttccccttgtcggcaggagcactatacggcttcggacgactttgctgtcccttgcctctatgttcactcatcaccttgtaatga 607  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||| ||||| || ||| ||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  606 gctttggtatcttcctcagaaatcctgcagctacttaccaaatcagagaagtttcttattttctgataaccaatggctctcttgatgtc 518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 429; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Original strand, 36852 - 37540
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36852 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttattgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 36951  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36952 tatcagatacaaccagacccaacttgtatgcacaatcaacatcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 37051  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||   || ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  37052 gaaacaagtacctatgataagtctgtcttcattagttgtttgcgtaccggtcaaagaaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggctgcgtacac 37151  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37152 tgtgaactgatatgaccttcctcattgcagttatagcaaacaatatccccacacttacaatcagctagtgtgtgtcccttctgaccacacctgaagcact 37251  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  37252 tcttctcatctttatcacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgaagcaaaaaatatcagtaggagtgtctctcctcttgggcctcctctc 37351  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37352 atcattcaatctctgcttacccttgtcggcaagagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttacctctacgttcactcatcaccttgtaatga 37451  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||  ||| |||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  37452 gctttcgtatcttcttcatagatcctacagctgcttaacagctcataaaagtttctaattttctgatatccaatagctctcttgatgtc 37540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 429; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 1274 - 586
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1274 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacatcttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 1175  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1174 tatcagatacaatcagacccaacttatgcgcacaatcaacaacaatgaaataatgagtagcaccagtagctataatagcaattaaaggagtactattaaa 1075  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  1074 gaaacaagtacctctgataagtctgtcctcattagttgtttgcgtaccggtcaaagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggttgcgtacac 975  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  974 tgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttataataaacaatgtccccacgcttacaatcagctagagtgtatcctttctgaccacacctgaagcact 875  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  874 tcttctcatctctatcacaaacgttactcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaacaatctcggtaggagcatctctcctcttgggcctcctctc 775  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||| || || | |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  774 atcatttaacctcttcttacccttgtcagcaggagcattatacggcttcggacgactctgttgtcccttacctctgcgttcactcatcaccttgtaatga 675  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||||  | ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||||| || |||||||||||    
T  674 gctttgttgtcctcctcataaatcctgcagctacttaccaaatcagagaaatttctttttttctgataaccaatggctctcttgatgtc 586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 424; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 78 - 705
Target Start/End: Original strand, 70079 - 70706
Alignment:
Q  78 ctgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagt 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70079 ctgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccattcatatcagatataactagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagt 70178  T
Q  178 agcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagca 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  70179 agcaccagtatctataatagcaattaaaggaatactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagtcaaagca 70278  T
Q  278 aacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttac 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  70279 aacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactaatatgtccttcctcattacagttgtagcaaacaatatccccacgcttgc 70378  T
Q  378 aatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaaca 477  Q
    ||||| | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  70379 aatcagccaatgtgtgtcctttctgtccacatctgaaacacttcttctcatctcggtcacacacattactcttgtggcctttctcaccacacttaaagca 70478  T
Q  478 aacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactc 577  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  70479 aataatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcagcctctgtttacctttgtcagcaggagcactatacggtttcggacgactc 70578  T
Q  578 tgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttctta 677  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  70579 tgttgtcccttacctctgcgctcactcatcactttataatgagctttggtatcctcttcatagattctacagctgcttaccaattcagaaaaatttctta 70678  T
Q  678 tcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  70679 tcttctgataaccaatagccctcttgat 70706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 60643 - 60857
Alignment:
Q  11 agatggacatcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60643 agatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 60742  T
Q  111 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 210  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  60743 ctccattcatatcagatataactagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggaat 60842  T
Q  211 attattaaagaaaca 225  Q
    | |||||||||||||    
T  60843 actattaaagaaaca 60857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 611 - 705
Target Start/End: Original strand, 433 - 527
Alignment:
Q  611 ttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||| || || |||||||| || | ||||| |||||| |  ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  433 ttgtaatgtgctttggtatccacttcatagattctgcaactgctcactagttcagtaaagttacagatcttctgatatccaattgcccgcttgat 527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 65 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 4650 - 4010
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4650 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccattcatatcagatataacccgacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 4551  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||    
T  4550 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagaaattaaatgagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcaccgtctgcgt 4451  T
Q  265 acgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatg 364  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||     
T  4450 accagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactaatatgtccttcctcattacagttgtagcaaacaata 4351  T
Q  365 tccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcac 464  Q
    ||||||||||| |||||| | || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| ||||    
T  4350 tccccacgcttgcaatcagccaatgtgtgtcctttctgaccacacctaaagcacttcttctcatctcgatcacacacattacttttgtagtctttctcac 4251  T
Q  465 cacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacgg 564  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4250 cacacttgaagcaaataatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcaacctctgtttacctttgtcagcaggagcactatacgg 4151  T
Q  565 cttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattca 664  Q
     |||  ||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4150 tttcggacgactctactgtcccttacctctgcgctcactcatcactttataatgagcttttgtatcctcttcatagatcctacaactacttaccaattca 4051  T
Q  665 gaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4050 gaaaagttccttatcttttgataaccaatagcccttttgat 4010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 402; Significance: 0; HSPs: 58)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 705
Target Start/End: Original strand, 23274108 - 23274793
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23274108 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttca 23274207  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23274208 tatcagatacaaccagacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccggtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 23274307  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |    | |||| ||| ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||    
T  23274308 gaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcataccagtcagagcaaacactttaccaccagtcctaaccttcttcggttgtgtgcac 23274407  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| ||||||| || ||||| ||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  23274408 tgtgaactgatatggccctcctcattgcagttatagcaaactatgtctccccgcttacaatcagctaatgtgtgtcccttctgtccacacctgaagcact 23274507  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||||     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23274508 tcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgttgcaaacaatttcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctc 23274607  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23274608 atcatttaacctctgcttacccttgtcagcaggagcactatactgcttcggacgactctgttgtcccttgcccctacgttcactcatcaccttgtaatga 23274707  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23274708 gccttcgtatcctcttcatagatcctacagctgcttaccaactcagaaaagtttcttattttctgataaccaatagccctcttgat 23274793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 19716945 - 19716260
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19716945 tcaaagtctctaccaaacatagacaatggacatctcaagcaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 19716846  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
     |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19716845 aatcagatacaactaaacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 19716746  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    |  ||||||| |||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| || |||    
T  19716745 gaaacaagtacctttgataagtcggtcctcactagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggctgtgtgcac 19716646  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||| ||||||| || || | |||| |||| || |||||||  || | |||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19716645 tgcgaactgatatggccctctttgttgcagttataacaaacaacatcactacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaaacact 19716546  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||||     |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19716545 tcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaacgatctcagcaggagcatctctcctattgggcctcctctc 19716446  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||| || ||||||| || || ||   ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19716445 atcattcaatctctgctttcccttgtcaacaagggcactgtatggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatga 19716346  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  19716345 gctttagtgtcttcctcatatatcctgcagctgcttaccaactcagagaaatttctaatcttctgatagccaatggctctcttgat 19716260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 21 - 708
Target Start/End: Original strand, 20848105 - 20848789
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20848105 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 20848204  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20848205 atcagatacatccaaacccaacttatatgcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaag 20848304  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||  | |||  |||||| ||||  | |||||    
T  20848305 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacact 20848404  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| |||||||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  20848405 gtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcactt 20848504  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||  ||||||||||||||||||||   || | |||    
T  20848505 cctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagc-aacaatctcaacaggagcatctctcctcttgg--atcctatca 20848601  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||  ||   | ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||   |||| ||||||||||||| || || | ||||||||| | ||| |||||||    
T  20848602 tcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgag 20848701  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||| || || ||||||||||| || || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20848702 ctttggtgtcttcttcataaattctgcacctgttaaccaactcagaaaagattctgatctgttgatatccaatagctctcttgatgtc 20848789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 21 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 23097945 - 23097261
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23097945 caaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatctctcctttcat 23097846  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
     |||| ||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23097845 gtcagttacaaccagacccaacttaaatgcacattctaaagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaag 23097746  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    || ||||||||||| ||||| | |||||||||    |  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| || ||||    
T  23097745 aatcaagtacctcttataagcctgtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttcccaccagttctaatcttctttggctgagtgcact 23097646  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| |||| || || ||||| |   | || || |||||||  || || | ||| || | | | || |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23097645 gtgaactgatgtggccctcctcatcacaattataacaaacaacatcacccctcttgcagttagccaatgtgtgtcctttctgaccacacttgaagcactt 23097546  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    ||||| ||||  |  |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23097545 cttctgatctttggtacaaacattacttttgtggcctttctcgccacacttaaagcaaactatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctctca 23097446  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    ||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||     ||||||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23097445 tcattcagtcgttgctttcccttgtcagcaggggcactgtacggcttagggagactctgatgtgctttacctctccgctcactcatcaccttgtaatgag 23097346  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||| ||| || || || || || || || ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23097345 cttttgaatcttcctcgtagattctgcagctacttacaaactcagaaaaagttctgatcttctgatagccaaaggccctcttgat 23097261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 163 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 19721365 - 19720823
Alignment:
Q  163 aatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgc 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    |  |||    
T  19721365 aatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctttgataagtcggtcctcactagtagtctgc 19721266  T
Q  263 gtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaa 362  Q
    |||| |||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| || |||| |||| ||||||| || || | |||| |||| || |||||||    
T  19721265 gtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggctgtgtgcactgcgaactgatatggccctctttgttgcagttataacaaacaa 19721166  T
Q  363 tgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttc 462  Q
      || | |||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||| ||    
T  19721165 catcactacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctc 19721066  T
Q  463 accacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatac 562  Q
     ||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||| || ||||||| ||     
T  19721065 gccacacttgtaacaaacgatctcagcaggagcatctctcctattgggcctcctctcatcattcaatctctgctttcccttgtcaacaagggcactgtat 19720966  T
Q  563 ggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaatt 662  Q
    || ||   ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  19720965 ggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttagtgtcttcctcatatatcctgcagctgcttaccaact 19720866  T
Q  663 cagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  19720865 cagagaaatttctaatcttctgatagccaatggctctcttgat 19720823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 20 - 669
Target Start/End: Original strand, 12576868 - 12577517
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | | |||| || |  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12576868 tcaaaatctctaccaaacatagaaattggacacctcaagcaaaccagagaagtagtcattgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 12576967  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||| |||| || |||||  ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  12576968 tatcagacacaatcaaacccagtttataggcacattctaaagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggaatactattaaa 12577067  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||  | |  || |||| |||||||||||| || || |||||    ||||||||||| ||||| || |||    
T  12577068 gaaacaagtacctctgatgaggcggtcctcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcac 12577167  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  | | |||| ||||| || || ||  | || ||||| ||||  || || ||||| |||||  |||   |||| || ||| | ||||| ||||| ||||    
T  12577168 tgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacatctgaaacact 12577267  T
Q  420 tcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttct 518  Q
    ||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || || || || |||| ||||||||| ||| |  | |||||| |||    
T  12577268 tcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtgacctttctcgccacacttaaagcacactatctcagcaggagcatccctcttactcggcctcctct 12577366  T
Q  519 catcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatg 618  Q
    ||||||| | ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  12577367 catcattaagtctctgcttacccttgtcagccggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcactttataatg 12577466  T
Q  619 agcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaa 669  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||||||    
T  12577467 agctttggtgtcctcctcgtagatcctacagcgactcaccaaatcagaaaa 12577517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 311
Target Start/End: Original strand, 23113238 - 23113528
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  23113238 tcaaaatctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacgagagaagtagttactgaacccttagttggagtttcaacaaccatttctccactca 23113337  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||   || | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23113338 tacttgacataaccagacccaatttatatgcacaatcaacaacaatgaaacaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaa 23113437  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggct 311  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||  || || | |||||| ||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||    
T  23113438 gaaacaagtacctttgataagt-cgtcctcaataactgcctgtgttccagtcaatgcaaacacctttccacctgtctgagccttcttaggct 23113528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 300 - 698
Target Start/End: Original strand, 28350670 - 28351068
Alignment:
Q  300 ccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtccttt 399  Q
    |||||||||||| | | |||| |||| ||| ||||||||| ||||   | ||| |||||||||| || |||||||| || ||| |||  || || |||||    
T  28350670 ccttcttaggcttcttgcactgcgaactgagatgaccttcttcgtcacaattgaagcaaacaatatcaccacgcttgcattcagctatcgtatgcccttt 28350769  T
Q  400 ccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatct 499  Q
    |   ||||| | ||||||||| |||||||| |  |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| |||| |||||    
T  28350770 cttcccacatcggaagcactttttctcatcaccattgcaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggaacatct 28350869  T
Q  500 ctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgct 599  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||  || |||||| |||| |||||||| ||||||  |||||  || || ||||||   || ||||    
T  28350870 ctcctcttaggtctcctctcatcattcaatctttgctcccctttgtcaacaggagcactatagggcttcggacgaccttgctgacccttgttcctccgct 28350969  T
Q  600 cactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccc 698  Q
    || |  | ||||| || |||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  28350970 cattactaaccttatagtgagctatcgtatccacttcataaatcctacagctgcttaccaattcagaaaattgtctgatcttctgatagccaatggccc 28351068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22733689 - 22733485
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||    
T  22733689 caaacatagacaagggacatcttatacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagttggagtttcgacaaccatttctccattcatatcagacatgac 22733590  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||||||||   |||||||||| |||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||   |||||||||||    
T  22733589 aagacccaacttagtagcacaatcaaaagcaataaatcaacgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtattatcaatataacaagtacct 22733490  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  22733489 ctgat 22733485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Original strand, 23074391 - 23074595
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| | | |    
T  23074391 caaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgataaccatctctccattcatatcagacatagc 23074490  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| ||   |||||||||||    
T  23074491 aagacccaacttaatagcacaatcaaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaatgtgtattatcaatataacaagtacct 23074590  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  23074591 ctgat 23074595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 354 - 698
Target Start/End: Original strand, 21901386 - 21901730
Alignment:
Q  354 agcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtg 453  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||| |||  || || ||||||   ||||| | ||||||||| |||||||| |  |  |||||||||||||||||    
T  21901386 agcaaacaatatcaccacgcttgcattcagctatcgtatgccctttcttcccacatcggaagcactttttctcatcaccattgcaaacattactcttgtg 21901485  T
Q  454 gcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggg 553  Q
    ||| || |||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| || || || |||||||||||     
T  21901486 gcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagtaggaacatctcttctcttaggtctcctctcatcattcaatctctgtttccctttgtcagcagga 21901585  T
Q  554 gcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgc 653  Q
    ||||| || ||||||  | |||  || || || |||   ||   ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  21901586 gcactgtagggcttcggatgaccttgatggcctttgttcctcttctcactcataaccttataatgagatttcgtatcctcctcataaattctacagctgc 21901685  T
Q  654 ttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccc 698  Q
    | |||||||||||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||    
T  21901686 tcaccaattcagaaaattgtctgatcttttggtaaccaatggccc 21901730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 24817768 - 24817577
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24817768 tcaaaatctctaccaaacatagataaaggacatcttagacacactagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattca 24817669  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagta 211  Q
    |||  || |     |||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  24817668 tattcgacattgtaagacccaacttagaagcacaatcaagagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatatcaactaaaggagta 24817577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23105643 - 23105461
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||    
T  23105643 caaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattcatatcagacatgac 23105544  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattat 215  Q
     ||||||||||||   |||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||    
T  23105543 aagacccaacttagtagcacaatcataagaaataaaacaatgcgtagcaccagtaacaataatagcaactaaaggtgtattat 23105461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 45673929 - 45673706
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    ||||||||||||||| ||||| || | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  45673929 accaaacatagacaaaagacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 45673830  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  45673829 acaagacccaaagcagaatcacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagctccattatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 45673730  T
Q  231 ctctgataagtccgtcctcattca 254  Q
    ||||||| | ||  ||||||||||    
T  45673729 ctctgatcaatcgatcctcattca 45673706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 9338108 - 9338314
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  9338108 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 9338207  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  9338208 acaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 9338307  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  9338308 ctctgat 9338314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 9486742 - 9486948
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  9486742 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 9486841  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  9486842 acaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 9486941  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  9486942 ctctgat 9486948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11351628 - 11351422
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  11351628 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacata 11351529  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||  || | |||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||   | |||||||    
T  11351528 tctagacccaaagtagaagcacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaatgagtattattaatatagcaagtac 11351429  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  11351428 ctctgat 11351422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 16983766 - 16983972
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  16983766 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 16983865  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  16983866 acaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 16983965  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  16983966 ctctgat 16983972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 17001526 - 17001732
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  17001526 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagataaa 17001625  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  17001626 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 17001725  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  17001726 ctctgat 17001732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21323183 - 21322977
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| | |    
T  21323183 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccaatcatatcagacata 21323084  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||  || | |||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||   |||| ||||    
T  21323083 acaagacccaaagtagaagcacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattatcaatataacatgtac 21322984  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  21322983 ctctgat 21322977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22742849 - 22742677
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||  || | |||||||| | |||||    
T  22742849 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacataacaagacccaaagtagaagcacaatcgaaagcaa 22742750  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | |||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||   |||| |||||||||||    
T  22742749 taaaacaatgcgtagcaccagtaccaataatagcaactaaaggagtattatcaatataacatgtacctctgat 22742677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Original strand, 23064973 - 23065145
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  23064973 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgataaccatctctccattcatatcagacatagcaagacccaacttaatagcacaatcaaaagcaa 23065072  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  23065073 taaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaatgtgtattatcaatataacaagtacctctgat 23065145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24705399 - 24705151
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  | || || | ||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| | |    
T  24705399 accaaacatagacaaagggcatctcaaacatacgagagaagtagttaccaaacccttagctggagtttcgacaaccatctctgcattcatatcagacaaa 24705300  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||  || |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||    
T  24705299 tcaagacccaaagtagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatatcaactaaaggagtattattaatataacaagtac 24705200  T
Q  231 ctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaa 279  Q
    ||||||| |  |  ||||||||| |||  || |||| ||||||||||||    
T  24705199 ctctgatcaagcgatcctcattctctgtctgagtaccagtcaaagcaaa 24705151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22323259 - 22323053
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  22323259 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 22323160  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  22323159 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 22323060  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  22323059 ctctgat 22323053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 24712560 - 24712766
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  24712560 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 24712659  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  24712660 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 24712759  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  24712760 ctctgat 24712766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44383487 - 44383281
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  44383487 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 44383388  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  44383387 tcaagacccaaaacagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 44383288  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  44383287 ctctgat 44383281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23029378 - 23029191
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  |||| || | ||| || ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||| | |    
T  23029378 accaaacatagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggattttcgacaaccatcactccattcatatcagacaaa 23029279  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaa 218  Q
    || ||||||||   | | |||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23029278 acaagacccaaagcagaagcacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaagggagtattattaa 23029191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 234
Target Start/End: Original strand, 27220542 - 27220745
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  27220542 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 27220641  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  27220642 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 27220741  T
Q  231 ctct 234  Q
    ||||    
T  27220742 ctct 27220745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 218
Target Start/End: Original strand, 27373795 - 27373982
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  27373795 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 27373894  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaa 218  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27373895 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaa 27373982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 10871376 - 10871582
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  10871376 accaaacatagacaaacgacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagccggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 10871475  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  10871476 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 10871575  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  10871576 ctctgat 10871582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 24678013 - 24678219
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  |||| || | ||| || ||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  24678013 accaaacatagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctgaagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacata 24678112  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||  || | |||||||| | |||||| ||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |   | |||||||    
T  24678113 tctagacccaaagtagaagcacaatcgaaagcaataaaacaatgcctagcaccagtatcattaatagcaactaaaggagtattattcatatagcaagtac 24678212  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  24678213 ctctgat 24678219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24657575 - 24657369
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  |||| || | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  24657575 accaaacatagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 24657476  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||| ||||  || |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||   | |||||||    
T  24657475 tcaagatccaaagtagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcagctgtatcaataatagcaactaatggagtattattaatatagcaagtac 24657376  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  24657375 ctctgat 24657369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24874667 - 24874461
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  24874667 accaaacatagacaaaggacatttgaaacatacgagagaagtagtcaccgaaaccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 24874568  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||   | |||||||    
T  24874567 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgcgtagcaccagtatcaataatagaaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 24874468  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  24874467 ctctgat 24874461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Original strand, 24264930 - 24265102
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||  |||||||||| | | | ||||||||   | |  ||||||| | |||||    
T  24264930 agagaagtagtcaccgaacccttagccggagtttcgacaaccatctatccactcatatcagacaaatcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaa 24265029  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  24265030 taaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 24265102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21142958 - 21142771
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  21142958 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcatcgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 21142859  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaa 218  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21142858 tcaagacccaaaacagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgcgtagcaccaatatcaataatagcaactaaaggagtattattaa 21142771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30208788 - 30208631
Alignment:
Q  80 gaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtag 179  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||   || | ||| |||||||| ||  |  |||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  30208788 gaaccctttgccggggtttcgacaaccatttcccctttcatagacgacataacaagacccaatttcgaaacacaatcagcagcaataaaacaatgtgtag 30208689  T
Q  180 caccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||| ||||    
T  30208688 caccagtatctataatagtaattaagggagtactattaatgaaacatgtacctttgat 30208631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Original strand, 23204874 - 23205046
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||   | |  ||||||  | |||||    
T  23204874 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtatcgacaaccatctctccattcatatcagacacatcaagacccaaagcagaaacacaatggaaagcaa 23204973  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
      |  ||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  23204974 aaatgcaatgcgtagcactagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 23205046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 22462993 - 22462931
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||    
T  22462993 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatc 22462931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 72
Target Start/End: Original strand, 23279291 - 23279343
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagt 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  23279291 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagt 23279343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 237
Target Start/End: Original strand, 19817492 - 19817579
Alignment:
Q  150 cacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    |||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||| || ||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  19817492 cacaatccgcagcaataaagcaatgtgtagcaccagtatctgtagtagtaattaagggagtactattaatgaaacatgtacctctgat 19817579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 23116571 - 23116440
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| || | |||||||||  || |||| |||| | | |||||   || ||| |||    
T  23116571 acaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatctctgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgc 23116472  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggctt 567  Q
    || || || ||||||||||||||||| |||||    
T  23116471 ttgcccttatcagcaggggcactataaggctt 23116440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 24817352 - 24817221
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||||| || |||| || |  | |||||| |||||||||||||||| ||     
T  24817352 acaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagtatagcaaacaatctcagtagtagtatctttctttctaggcctcctctcatcattcaatctttgt 24817253  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggctt 567  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  24817252 ttacccttatcagcaggagcactataaggctt 24817221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 497
Target Start/End: Original strand, 23205245 - 23205306
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcat 497  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||    
T  23205245 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgaaggagcat 23205306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 497
Target Start/End: Original strand, 23676849 - 23676910
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcat 497  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||    
T  23676849 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgaaggagcat 23676910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 170 - 237
Target Start/End: Original strand, 23676583 - 23676650
Alignment:
Q  170 caatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  23676583 caatgcgtagcactagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 23676650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 11351223 - 11351161
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||    
T  11351223 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgcaggagcatc 11351161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 608 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 22742306 - 22742209
Alignment:
Q  608 accttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || || ||   ||  |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22742306 accttgtaatgagccttggtatcctcttcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcggagaaaactcggatcttctggtaaccaattgccctcttgat 22742209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 24817179 - 24817094
Alignment:
Q  609 ccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaata 694  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||| |||||||||||  |  ||||||||||| ||||||    
T  24817179 ccttgtaatgagctttagtatcttcctcatagattctgcaactgctcaccagttcagaaaagtaacggatcttctgatacccaata 24817094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 645
Target Start/End: Original strand, 10871887 - 10871987
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcc 644  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||    
T  10871887 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcttcgtagatcc 10871986  T
Q  645 t 645  Q
    |    
T  10871987 t 10871987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22739431 - 22739363
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataa 239  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |  |||||  ||||||||||||    
T  22739431 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctctgataa 22739363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 645
Target Start/End: Original strand, 24265407 - 24265507
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcc 644  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||    
T  24265407 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcc 24265506  T
Q  645 t 645  Q
    |    
T  24265507 t 24265507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 645
Target Start/End: Original strand, 9338616 - 9338719
Alignment:
Q  542 ttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaa 641  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  9338616 ttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcataga 9338715  T
Q  642 tcct 645  Q
    ||||    
T  9338716 tcct 9338719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 645
Target Start/End: Original strand, 9487250 - 9487353
Alignment:
Q  542 ttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaa 641  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  9487250 ttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcataga 9487349  T
Q  642 tcct 645  Q
    ||||    
T  9487350 tcct 9487353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 44382979 - 44382876
Alignment:
Q  542 ttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaa 641  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  44382979 ttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcataga 44382880  T
Q  642 tcct 645  Q
    ||||    
T  44382879 tcct 44382876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 24657170 - 24657128
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaa 478  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24657170 acaaacagtactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaa 24657128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 24704994 - 24704932
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||| |||| ||||    
T  24704994 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagataatctcagcaggaacatc 24704932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 240
Target Start/End: Original strand, 22280771 - 22280840
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataag 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |  |||||  |||||||||||||    
T  22280771 aatgactagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctctgataag 22280840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 41606269 - 41606209
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcaga 126  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  41606269 agagaagtagtcaccgaacccttagccggagtttcgac-accatctctccattcatatcaga 41606209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 394; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 43810 - 43125
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  43810 tcaaagtatctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactaaacccttagctggagtttcaacaaccatttttccattca 43711  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43710 tatcagacataaccagacccaacttatatgcacaatcaacaacaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 43611  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||    
T  43610 gaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcactgtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgtccgaaccttcttgggcttcttgcac 43511  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||  | |||||||| || || |   | || ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  43510 tgcgagctaatatgaccctcttcatcacaattatagcaaacaacatccccacgcttacaatcagctaaagtgtgtcctttctgtccacacctaaagcact 43411  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  43410 tcttctcatctcgatcacacacattactcttgtggcccttttcacgacacttgaaacagacaatctcattaggagcatctctcctcttaggcctcctctc 43311  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    ||||||||  || || ||||| |||| || ||| ||||||||| | ||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43310 atcattcagcctctgtttacctttgttagaaggagcactatacagttttggacgactctgttgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaatga 43211  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
      ||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43210 catttggtatcctcttaatatatcctacagctgcttaccaaatctgagaaattccttatcttttgataaccaatagccctcttgat 43125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 107
Target Start/End: Original strand, 25129 - 25216
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaacca 107  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||| | |||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25129 tcaaaatctctaccatacatagacaacggacaactcaaacaaaccaaagaagtagttatcgaacccttagctcgagtttcgacaacca 25216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 391; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 705
Target Start/End: Original strand, 19985121 - 19985815
Alignment:
Q  11 agatggacatcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19985121 agatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 19985220  T
Q  111 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 210  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19985221 ctccattcatatcagatataaccaaacccaacttatatgcacaatcaacaacaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 19985320  T
Q  211 attattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggc 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19985321 actattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtccttattcacagtctgcgtactagtcaatgcaaataccttgccacctgtccgaaccttcttaggc 19985420  T
Q  311 tgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacc 410  Q
    | | | ||||  ||  | ||||| || || || |   | || ||||||||||  ||||||| ||| |||||| |||| ||||||| |||| | ||||| |    
T  19985421 ttcttgcactgtgagctaatatgcccctcttcatcacaattatagcaaacaacatccccactcttgcaatcagctaatgtgtgtcatttctgtccacatc 19985520  T
Q  411 tgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttggg 510  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  19985521 tgaaatacttcttctcatcacggtcacatacattactcttgtggcttttttcgccacacttgaaacaaacaatctcagtaggagcatctctcctcttagg 19985620  T
Q  511 cctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcacc 610  Q
    |||| |||||||| |||  || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||    
T  19985621 cctcctctcatcaatcatcctctgtttacccttgtccgcaggggcactatacggcttcggacgactctgctatcccttgccactgcgctcactcatcacc 19985720  T
Q  611 ttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  19985721 ttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcctacaactgcttaccaaatcagaaaaatttattatcttttgataaccaatggcccgcttgat 19985815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 705
Target Start/End: Original strand, 21928369 - 21929063
Alignment:
Q  11 agatggacatcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21928369 agatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacgcacagctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 21928468  T
Q  111 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 210  Q
    | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21928469 cgccattcatatcagatataaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 21928568  T
Q  211 attattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggc 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  21928569 actattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcttcattcacagtttgcttactagtcaaagcaaacaccttgccacctgtccgaaccttcttgggc 21928668  T
Q  311 tgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacc 410  Q
    | | | || |  ||  | ||||| || || || |   | || |||||||| |  || |||||||| |||||| | ||||||||||||||| | ||||| |    
T  21928669 ttcttgcattgtgagctaatatgcccctcttcatcacaattatagcaaacgacatcaccacgcttgcaatcacccaaagtgtgtcctttctgtccacatc 21928768  T
Q  411 tgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttggg 510  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  21928769 tgaaacacttcttctcatctcggtcacttacattactctcgtggcccttttcgccacacttgaaacaaagaatctcagtaggagcatctctcctcctagg 21928868  T
Q  511 cctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcacc 610  Q
    |||| ||||||||||||  || || || || ||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21928869 cctcctctcatcattcagcctctgttttcctttgtcagcaggagcactatacggtttaggacgactctgttgtcccttacctctacgctcactcatcacc 21928968  T
Q  611 ttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21928969 ttgtaatgagctttggtatcctcttcatagattctacagctgcttaccaattcagaaaaatttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 21929063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 681
Target Start/End: Original strand, 22373819 - 22374480
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22373819 tcaaagtctctatcaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccattca 22373918  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22373919 tatcagatataactagacccaacttatatgcacaatcaacatcaatgaaactatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 22374018  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| | | |||    
T  22374019 gaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaacagtttgggtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgttagagccttcttaggcttcctgcac 22374118  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||  | ||||||||||| || |   | || ||||||||||| || |||||||| |||||| |||| ||||||||||||   |||||||| || ||||    
T  22374119 tgcgagctaatatgaccttcttcatcacaattatagcaaacaatatcaccacgcttgcaatcagctaatgtgtgtcctttctttccacacctaaaacact 22374218  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  22374219 tcttttcatcacggtcacatacattactcttgtggtctttttcaccacacttgaaacagacaatctcagtaggagaatctctcctcctaggcctcctctc 22374318  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
     ||||| | ||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22374319 ctcattaagtctttgtttacctttgacagcaggggcactatacggtttcggacgactctactgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttataatga 22374418  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatctt 681  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||    
T  22374419 gcttttgtatcctcctgatagatcctacagctactcaccaaatcagaaaaattccttatctt 22374480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 22028111 - 22027423
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22028111 tcaaaatctctaccaaacatagacaatggacaccttaaacaaacaagagaagtagttactaaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 22028012  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22028011 tataagataaaaccaaacccaacttatatgcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 22027912  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    |  |||||||  ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| || |||    
T  22027911 gaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattagtagtctgcgtaccggtcaatgcaaacacttttccaccggttctaaccttcttcggctgtgtgcac 22027812  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| ||||||| || || || ||| |||| |||||||||| ||| || | |||||||||| |||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  22027811 tgagaactgatatggccctcttcattgtagttatagcaaacaacgtctcccctcttacaatcagctaatgtgtgacccttctgaccacacctgaagcact 22027712  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22027711 tcttctcatctttggtacaaacattactcttgtggcctttatcgccacacttgtaacaaactatctcagcaggagcatctctcctattgggcctcctctc 22027612  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||    
T  22027611 atcattcaatctttgctttcccttgtcagcaggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtcccttaccacttcgctcactcatcaccttataatga 22027512  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
     ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| ||  |||| ||||  ||||| || || || |||||||||||    
T  22027511 tcttttgtgtcctcctcatagatcctgcaacgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttgataccctatggctctcttgatgtc 22027423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 31414362 - 31413678
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31414362 caaagtctctaccaaacatagacaatggacatctcaagcaaactagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 31414263  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31414262 atcagatacatccaaacccaacttataagcacattcattagcaatgaaacaatgagtagcaccaatatctataatagcaattaaaggagtactattaaag 31414163  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||| ||| |||||| |||||||| || ||||| || ||| ||||||| | ||| |||||||    
T  31414162 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcattagtagtctgcataccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctagccttcttcgactgagtacact 31414063  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  31414062 gtgaactgatatgaccttcttcgttgcagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacattcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctaaaacactt 31413963  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | |||||||||   ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31413962 cctctcatctctaccacaagcattgctcttatggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatttcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctca 31413863  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||   ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||  ||||||||||    
T  31413862 tcattcattctctgctttcccttgtcagcaggggcgctgtaaggtttaggacgactctgctgtcccttaccccttcgctcactcatcattttgtaatgag 31413763  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||| || || || ||||| ||||| || ||| ||||||| | ||| ||  || | ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  31413762 ctttggtgtcttcctcatatatcctgcagctgtttaccaacttagagaaaattttaatcttctgatacccaatagctcttttgat 31413678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 21 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 29301256 - 29300569
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29301256 caaagtctctaccaaacatagacaacggacaactcagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 29301157  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29301156 atcagatacaagcagacccaacttatatgcacattctaaagcaatgaaacaatgcgtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaag 29301057  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  |||||||  ||||| | |||||| || |||||  ||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  29301056 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcatttgtagtctgcgtacccgtcaatgaaaacactttcccaccgatcctagccttcttcggctgagtacact 29300957  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| ||||||||||||| || ||| |||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| || |||||||||| || |||||    
T  29300956 gagaactgatatgaccttcttcattgcagttatagtagacaatgtccccacgcttacattcagctagtgtgtgtcctctctgaccacacctaaaacactt 29300857  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | | |||||||   ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||||| ||||||||||||| | |||    
T  29300856 cctttcatctctaccacaagcattgctcttgtggcctctttcaccacacttaaaacaaacaatttcagcgggaacatctcccctcttgggcctcctatca 29300757  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||||||   | ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||   ||||||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||    
T  29300756 tcattcatcttctgcttccctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgactctaatgtcccttacccctcctctcactcattaccttgtaatgag 29300657  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||   ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  29300656 cttttgtgtcctcctcatatatcctgcagctgcttactaactcagagaaaactctaatcttctgatacccaatagctcttttgatgtc 29300569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 21 - 650
Target Start/End: Original strand, 22053814 - 22054443
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22053814 caaagtctctaccaaacatagatgtaggacacctcagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 22053913  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22053914 atcagatacaatcagacccaacttatatgcactttctaaagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaag 22054013  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||    |  ||||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||| || ||||    
T  22054014 aaacaagtacctctgataagacggtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccaccagttctatccttcttcggctgtgtgcact 22054113  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      | | ||||||| || || |||||| |||| || || ||||  || |||||||| |||||  |||||  ||| || ||| ||||||| |||||||||||    
T  22054114 gtgtactgatatggccctcttcgttgcagttataacatacaacatcaccacgcttgcaatccgctaaaaggtgacccttctgaccacatctgaagcactt 22054213  T
Q  421 cttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||| || |||||||||||| || |||||| ||||    
T  22054214 cttctcatccttggt-acaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacaaactatctcagcagaagcatctctcctattcggcctcctctc 22054312  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||   |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22054313 atcattaagtctctgcttacccttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgccgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatga 22054412  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaac 650  Q
    ||||| || ||||| ||| | ||||| ||||    
T  22054413 gctttggtgtcctcctcacagatcctgcaac 22054443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 21 - 708
Target Start/End: Original strand, 28983862 - 28984549
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28983862 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 28983961  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28983962 atcagatatatccaaacccaacttataagcacattcaatagcaataaaacagtgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaag 28984061  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  || |||| ||||| |||||||||||| |||||  | |||  |||||| ||||  | |||||    
T  28984062 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgtgtaccagtcagagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacact 28984161  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| |||||||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  28984162 gtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcactt 28984261  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28984262 cctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcaactggagcatctctcctcttgggcctcctatca 28984361  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||  ||  || ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||   |||| ||||||||||||| || || | ||||||||| | |||||||||||    
T  28984362 tcacccatcctctgctttcccttgtccgcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttgtaatgag 28984461  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||  ||| ||||  ||||| ||||| || || ||||||||    
T  28984462 ctttggtgtcttcttcataaatcctacacctgttaaccaactcagaaaagactctgatctgttgatatccaatggctcttttgatgtc 28984549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 26 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 16269049 - 16268367
Alignment:
Q  26 tctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcag 125  Q
    ||||||||||||||||| |   |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16269049 tctctaccaaacatagatataggacaccccagacaagcaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcatatcag 16268950  T
Q  126 atacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaaca 225  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16268949 atacatccaaacccaacttataggcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaagaaaca 16268850  T
Q  226 agtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaa 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||  | |||||  |||    
T  16268849 agtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccaccagttctagccttcttcggctcaggacactgtgaa 16268750  T
Q  326 ttgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttct 425  Q
     |||||||||| ||  | ||| | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||   | || || ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16268749 ctgatatgaccctctccattgcaattgtagcagacaatatccccacgcttgcattcagctaggctatgacccttctgaccacacctgaagcacttcctct 16268650  T
Q  426 catctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcatt 525  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||| | |||||| |    
T  16268649 catctttaccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcttcttaggcctcctgtcatcact 16268550  T
Q  526 caatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttt 625  Q
    ||   | ||||| || ||||||||| | ||||| || |||||   |||| ||||||||||||| || || | ||||||||| |  ||||||||||||||     
T  16268549 catcttctgctttcctttgtcagcaagagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatattgtaatgagctttg 16268450  T
Q  626 gtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    || || ||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||| |||  ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16268449 gtgtcttcttcataaattctacaactattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagcccttttgatgtc 16268367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 20 - 698
Target Start/End: Original strand, 20391036 - 20391714
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  20391036 tcaaaatctctaccaaacatagacaacagacaactcaaacaaacgagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccactaa 20391135  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||   || | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  20391136 tacttgacataaccagacccaacttatattcacaattaacagcaatgaatcaatgtgtagcaccagtatcaataatagaaattaaaggagtactattaaa 20391235  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| | | |||    
T  20391236 gaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaactgtctgcgtaccagtcaatgcaaacacctttccacctgtctgagccttcttaggcttcctgcac 20391335  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||| | | ||||||||| ||||   | ||| |||||||||| || |||||||| || ||  ||| ||| || ||||||   ||||| | ||||||||    
T  20391336 tgcgaactaagatgaccttcttcgtcacaattgaagcaaacaatatcaccacgcttgcattccgctatagtatgccctttcttcccacatcggaagcact 20391435  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    | |||||||| |  |   ||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||| ||||| || ||| ||||    
T  20391436 ttttctcatcaccattggaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagaaggaacatctctactcttaggtctcctctc 20391535  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| || ||||||  |||||  || || || |||   || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  20391536 atcattcaatctttgtttccctttgtcagcaggagcactgtagggcttcggacgaccttgctgacctttgttcctccgctcactcataaccttataatga 20391635  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccc 698  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  20391636 gctttggtatcctcttcataaattctacagctgctcaccaattcagaaaattgcctgatcttttgatacccaatggccc 20391714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 252
Target Start/End: Original strand, 28989081 - 28989312
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28989081 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtatcaacaaccatttctcctttcat 28989180  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28989181 atcagatatatccaaacccaacttataagcacattcaatagcaataaaacagtgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaag 28989280  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcatt 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28989281 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcatt 28989312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Original strand, 27357487 - 27357665
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27357487 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccccagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 27357586  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagca 199  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27357587 atcagatacatccaaacccaacttataggcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagca 27357665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 272 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 6607048 - 6606651
Alignment:
Q  272 aaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccac 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||| ||| ||||| || |   | ||| |||||||||| |||||||    
T  6607048 aaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgtgtacactgtgaactgagatgtccttcttcatcacaattgaagcaaacaatatccccac 6606949  T
Q  372 gcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacactt 471  Q
    |||| || ||| |||  || || || |||   ||||| | ||||||||||||||| || |  |  |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6606948 gcttgcattcagctatcgtatgccccttctttccacatcggaagcacttcttctcctcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctcaccacactt 6606849  T
Q  472 gaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaa 571  Q
    | | |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| ||||  ||  |||||  |||  |||| || ||||||  |    
T  6606848 gtagcaaacaatctcagtaggaacatctcttctcttaggtctcctctcatcattcaatctttgctctcctctgtcaataggaacactgtagggcttcgga 6606749  T
Q  572 cgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaa 669  Q
    || |  || || ||||||   || ||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  6606748 cgtccttgctgacccttgttcctccgctcactcctaaccttataatgagccttcgtatcctcctcataaattctacaactactcaccaattcagaaaa 6606651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 279
Target Start/End: Original strand, 21253908 - 21254154
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||    
T  21253908 caaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattcatatcagacatgac 21254007  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||||||||   |||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||   | |||||||||    
T  21254008 aagacccaacttagtagcacaatcataagcaataaaataatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtattatcaatatagcaagtacct 21254107  T
Q  233 ctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaa 279  Q
    ||||| |  |  ||||||||| |||  || |||| ||||||||||||    
T  21254108 ctgatcaagcgatcctcattctctgtctgtgtaccagtcaaagcaaa 21254154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21391679 - 21391475
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||    
T  21391679 caaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtggtcaccgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccattcatatcagacatgac 21391580  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||||||||   |||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||   | |||||||||    
T  21391579 aagacccaacttagtagcacaatcataagaaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtattatcaatatagcaagtacct 21391480  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  21391479 ctgat 21391475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21781005 - 21780801
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||    
T  21781005 caaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtggtcaccgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccattcatatcagacatgac 21780906  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||||||||   |||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||   | |||||||||    
T  21780905 aagacccaacttagtagcacaatcataagaaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtattatcaatatagcaagtacct 21780806  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  21780805 ctgat 21780801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22421710 - 22421506
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||| ||  |||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  || | | |    
T  22421710 caaacatagataaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatttgacatagc 22421611  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     |||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||| ||| |||  |||||||||||    
T  22421610 aagacccaacttagaagcacaatcaatagcaataaaacaatgtgtagcaccagtatcaataatagcagctaaaggtgtactatcaaaataacaagtacct 22421511  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  22421510 ctgat 22421506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 19980928 - 19981134
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  19980928 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacata 19981027  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||  || | |||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||   |||| ||||    
T  19981028 acaagacccaaagtagaagcacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattatcaatataacatgtac 19981127  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  19981128 ctctgat 19981134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21786173 - 21785999
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||    
T  21786173 caaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtggtcaccgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccattcatatcagacatgac 21786074  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaagg 207  Q
     ||||||||||||   |||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21786073 aagacccaacttagtagcacaatcataagaaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaagg 21785999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22375284 - 22375071
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| ||  |||||||||| || |||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  22375284 tcaaaatctctaccaaacatagacaaaggacatcttaaacacacg-gagaagtagtcaccgaacccttagttggagtttcgacgaccatctctccattca 22375186  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||  || | | | |||||||||||| | |||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22375185 tattcgacatagcaagacccaacttagaagcacaatcaatatcaataaaacaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatcaaa 22375086  T
Q  220 gaaacaagtacctct 234  Q
    | |||| ||||||||    
T  22375085 gtaacatgtacctct 22375071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17671842 - 17671636
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  17671842 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 17671743  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  17671742 acaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 17671643  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  17671642 ctctgat 17671636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 22523507 - 22523683
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||| ||   ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  || | |    
T  22523507 accaaacatagaaaaagaacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatttgacata 22523606  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaagg 207  Q
     | |||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22523607 gcaagacccaacttagaagcacaatcaatagcaataaaacaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaactaaagg 22523683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 279
Target Start/End: Original strand, 22990006 - 22990254
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  || | |    
T  22990006 accaaacatagacaagggacatcttaaacatacaagagaagtagtcaccgaacccttcgctggagtttcgacaaccatctctccattcatatttgacata 22990105  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | |||||||||||  | |||||||||| |||||| ||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |||||| ||| | | |||  |||| ||||    
T  22990106 gcaagacccaactttgaagcacaatcaatagcaataaaacaatgtttagcactagtatcaataatagcaactaaaggtgtactgtcaaaataacatgtac 22990205  T
Q  231 ctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaa 279  Q
    ||||||| |  |  ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||    
T  22990206 ctctgatcaaacgatcctcattctctgtctgcgtaccagtcaaagcaaa 22990254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 19115361 - 19115567
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  19115361 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcactgaacccttagctggagttttgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 19115460  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  19115461 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 19115560  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  19115561 ctctgat 19115567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20016083 - 20015877
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  20016083 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 20015984  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  20015983 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 20015884  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  20015883 ctctgat 20015877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21164358 - 21164152
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  |||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  21164358 accaaacatagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 21164259  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||   | | |||||||  | |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||   |||| ||||    
T  21164258 acaagacccaaagaagaagcacaattgaaagcaataaaacaatgcgtagcatcagtatcaataatagcaactaaaggagtatgatcaatataacatgtac 21164159  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  21164158 ctctgat 21164152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22245846 - 22245584
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||  ||||  |||  || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||    
T  22245846 tcaaaatctcgaccaaacatagacaaaggacatattaagcacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctatccattca 22245747  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||  || | | | |||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | |||  ||||||  ||||||||| ||| ||| |||    
T  22245746 tattcgacatagcaagacccaacttagaagcacaatcaatagcaataaaacaatgtgtagcactaatatgaataatataaattaaaggtgtactatcaaa 22245647  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacac 282  Q
      |||| |||||||| || |  |  ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22245646 ataacatgtacctctaatcaaacgatcctcattctctgtttgcgtaccagtcaaagcaaacac 22245584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22246264 - 22246002
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||  ||||  |||  || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||    
T  22246264 tcaaaatctcgaccaaacatagacaaaggacatattaagcacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctatccattca 22246165  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||  || | | | |||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | |||  ||||||  ||||||||| ||| ||| |||    
T  22246164 tattcgacatagcaagacccaacttagaagcacaatcaatagcaataaaacaatgtgtagcactaatatgaataatataaattaaaggtgtactatcaaa 22246065  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacac 282  Q
      |||| |||||||| || |  |  ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22246064 ataacatgtacctctaatcaaacgatcctcattctctgtttgcgtaccagtcaaagcaaacac 22246002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 32603106 - 32603312
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  |||| |  | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  32603106 accaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 32603205  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  32603206 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 32603305  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  32603306 ctctgat 32603312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22126779 - 22126531
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  22126779 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtaatcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 22126680  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  22126679 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 22126580  T
Q  231 ctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaa 279  Q
    ||||||| |  |  ||||||||| |||  || |||| ||||||||||||    
T  22126579 ctctgatcaaacgatcctcattctctgtctgagtaccagtcaaagcaaa 22126531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 18859538 - 18859744
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  18859538 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 18859637  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  18859638 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 18859737  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  18859738 ctctgat 18859744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 22031064 - 22031270
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  |||| |  | ||| || ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  22031064 accaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagttggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 22031163  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||    
T  22031164 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatataacaagtac 22031263  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  22031264 ctctgat 22031270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22117995 - 22117789
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  22117995 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 22117896  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||| ||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  22117895 tcaagacccaaagcagaaacacgatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 22117796  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  22117795 ctctgat 22117789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 22042788 - 22042994
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  |||| |  | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| | |    
T  22042788 accaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccaatcatatcagaaaaa 22042887  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||||| || ||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  22042888 tcaagacccaaagcagaaacacaatcaaaagaaataaagcaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 22042987  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  22042988 ctctgat 22042994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30310964 - 30310758
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  |||| |  | ||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  30310964 accaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtctcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 30310865  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  30310864 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 30310765  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  30310764 ctctgat 30310758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 15536344 - 15536550
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||| ||||||||  |||||| || ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  15536344 accaaatatagacaaaggacaacgtaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 15536443  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  || |||| | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||   | |||||||    
T  15536444 tcaagacccaaggcagaaacataatcgaaagcaataaagcaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaacggagtatcattaatatagcaagtac 15536543  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  15536544 ctctgat 15536550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22129437 - 22129231
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  |||| |  | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| | |    
T  22129437 accaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctgtccattcatatcagacaaa 22129338  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||   | |||||||    
T  22129337 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgtgtaacaccagtatcaataatagcaactaaagcagtattattaatctagcaagtac 22129238  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  22129237 ctctgat 22129231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19481843 - 19481686
Alignment:
Q  80 gaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtag 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |   | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||| ||||    
T  19481843 gaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccgttcatatcagacaactcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgcgtag 19481744  T
Q  180 caccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  19481743 caccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 19481686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 609 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 21970793 - 21970694
Alignment:
Q  609 ccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21970793 ccttataatgggctttggtatcatcctcataaatcctacagctactcaccaactcagaaaagtttctaatcttctgataaccaatggctctcttgatgtc 21970694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 609 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 22004323 - 22004225
Alignment:
Q  609 ccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgt 707  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22004323 ccttataatgagctttggtatcatcttcataaatcctacagctactcaccaacttagaaaagtttataatcttctgataaccaatggctctcttgatgt 22004225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 436 - 645
Target Start/End: Original strand, 22043193 - 22043402
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||  || |||| |||| | | |||||   || ||| ||     
T  22043193 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagttggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 22043292  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    || || ||||||| |||||||||||| |||||     ||||||| || ||||||    | |||||| |||  |||||||||||||| || |||||||| |    
T  22043293 ttgcccttgtcagtaggggcactataaggcttagggtgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcct 22043392  T
Q  636 cataaatcct 645  Q
    ||||||||||    
T  22043393 cataaatcct 22043402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 436 - 693
Target Start/End: Original strand, 22523876 - 22524133
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||| |||||||| |||||||||| || |||||  |  | || ||||| |||  |||||||||| || || | |||| | |||||||||| | ||| ||     
T  22523876 acaagcattactcctgtggcctttctcgccacaagtatagcacacaatctcaacaggagcatctttcttcctaggccgcctctcatcattaactctttgt 22523975  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||   ||||||||| || || |||||| | |||||| |||  | |||||||||||| || |||||||| |    
T  22523976 tttcccttatcagcaggggcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgccttttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcct 22524075  T
Q  636 cataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaat 693  Q
     ||||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  22524076 tataaatcctgcaactgctcaccagctcggaaaagttacggatcttctggtaaccaat 22524133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 30310559 - 30310497
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  30310559 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatc 30310497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 567
Target Start/End: Original strand, 32603511 - 32603642
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || | |||||||||  || |||| || | | | |||||   || ||| |||    
T  32603511 acaaacattactcttgtggcctttcccaccacagttgaaacaaacaatttccgaaggagcatccttcttcttaggtcgcctatcatcgaccattctctgc 32603610  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggctt 567  Q
    || || || ||||||||||||||||| |||||    
T  32603611 ttgcccttatcagcaggggcactataaggctt 32603642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 536 - 705
Target Start/End: Original strand, 21671981 - 21672150
Alignment:
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || |||||   ||||||||| || |||||| |  | |||||| |||  | |||||||||||  || | |||||| |    
T  21671981 ttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggcatcctcct 21672080  T
Q  636 cataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||| |||||||| ||||  |||||||||  ||  |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21672081 cataaatcctgcaactgctcaccagctcagaaaagactcggatcttctggtaaccaattgccctcttgat 21672150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 545 - 648
Target Start/End: Original strand, 18860049 - 18860152
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcc 644  Q
    ||||| |||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  18860049 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 18860148  T
Q  645 taca 648  Q
    ||||    
T  18860149 taca 18860152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 22126268 - 22126168
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcc 644  Q
    ||||| |||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  22126268 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 22126169  T
Q  645 t 645  Q
    |    
T  22126168 t 22126168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 693
Target Start/End: Original strand, 22990520 - 22990668
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcc 644  Q
    |||||||| ||||| || |||||   |||||| || || || |||||| | |||||| |||  | |||||||||||| || ||||| || ||||||||||    
T  22990520 tcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacctttgcctttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcttcctcataaatcc 22990619  T
Q  645 tacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaat 693  Q
    | |||||||| ||||  |||||||| || |  |||||||| ||||||||    
T  22990620 tgcaactgctcaccagctcagaaaaattacggatcttctggtaaccaat 22990668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 567
Target Start/End: Original strand, 15536749 - 15536880
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| ||| || | |||||||||  || |||| |||| | | |||||   || ||| |||    
T  15536749 acaaacattactcttgtggccttcttcgccacaattaaaacaaataatctccgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgc 15536848  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggctt 567  Q
    || || || || |||||||||||||| |||||    
T  15536849 ttgcccttatcggcaggggcactataaggctt 15536880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 233
Target Start/End: Original strand, 19870773 - 19870856
Alignment:
Q  150 cacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctc 233  Q
    ||||||||| || ||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||   ||| || | ||||||||||||||    
T  19870773 cacaatcaagagaaataaaagaatgcgtagctccaatatctataatagcaattaaagggaaattgttgatgaaacaagtacctc 19870856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 610 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 22421134 - 22421039
Alignment:
Q  610 cttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||   |  |||||||| |  |||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  22421134 cttgtaatgagccttagtatcctcctcataaatcctgcaactgctcacctggttggaaaagttacggatcttctggtaaccaattgcccgcttgat 22421039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 21391276 - 21391214
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||| |||| |||||||||    
T  21391276 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagaaaaacaaacaatctcagcaggagcatc 21391214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 21780602 - 21780540
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||| |||| |||||||||    
T  21780602 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagaaaaacaaacaatctcagcaggagcatc 21780540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 609 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 21982196 - 21982098
Alignment:
Q  609 ccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgt 707  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || || ||||| | | |||||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  21982196 ccttataatgggctttggtatcatcctcataaatccttcagctactcaccaaattaaaaaagtttataatcttctgataaccaatggctttcttgatgt 21982098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 609 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 21998682 - 21998584
Alignment:
Q  609 ccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgt 707  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || || ||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  21998682 ccttataatgggctttggtatcatcctcataaattcttcagctactcaccaactcaaaaaagtttataatcttctgataaccaatggctttcttgatgt 21998584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 611 - 672
Target Start/End: Original strand, 3274646 - 3274707
Alignment:
Q  611 ttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtt 672  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||| |||| ||||||||||||    
T  3274646 ttgtaatgagctcttgtatcctcctcatagattctgcagctgctcaccagttcagaaaagtt 3274707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20650035 - 20649990
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  20650035 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 20649990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Original strand, 5718 - 6405
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5718 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacatcttagacaaacaagagaagtagttactgaacccatagctggagtttcaacaaccatttcttctttca 5817  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  5818 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacattaaatagcaatgaaacaatgagtagcactagtatctataataacaattaaaggagtactattaaa 5917  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||  |    | |||||||  ||| | ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  5918 gaaacaagtacctctgataagcctgtcctcgctagtggtttgcgtatcagttagagcaaacactttaccaccggtcctaaccttcttcggttgtgtacac 6017  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| | ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6018 tgtgaactaatatgtccttcctcgttgcagttataacaaacaatgtccccacgcttgcaatcagctagtgtgtgtcctttctgaccacatctgaagcact 6117  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6118 tcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaacaatgtcagtaagagcatctctcctcttgggcctcctctc 6217  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||| || || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  6218 atcatttaacct-tgcttacccttgtcagtaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctgcgttcactcatcaccttgtaatga 6316  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  6317 gctttcgtgtcctcctcataaatcctacagctgcttcccaattcaaagaagttccttattttctgatagccaatggctctcttgatgtc 6405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41452 - 41282
Alignment:
Q  67 agaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatg 166  Q
    ||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||||||   || | ||| |||||||| ||  |  |||||||| |||||||     
T  41452 agaagtagtcaccgaacccttagccgaagtttcgacaaccatttccccattcatagatgacataacaagacccaatttcgaaacacaatcagcagcaata 41353  T
Q  167 aaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||    
T  41352 aaacaatgtgtagcaccagtatctataatagtaattaagggagtactattaatgtaacatgtacctctgat 41282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 71)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 23563738 - 23563050
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23563738 tcaaagtctctaccaaacatagacaacgtacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 23563639  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  23563638 tatcagatatatccatacccaacttatatgcacattcaatagcaattaaacattgagtagcaccagtttctataatatcaattaaaggagtactattaaa 23563539  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23563538 gaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattagttgtttgcgtaccggtcaaagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggctgcgtacac 23563439  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||| | |||||||||||||| ||| |||| || |||||| |||| |||| |||||| ||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23563438 tgcgaactaatatgaccttcctcattgcagttataacaaacattgtctccacccttacagtcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcact 23563339  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23563338 tcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaacaatgtcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctc 23563239  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    || ||| || || |||||| | || |||||||| |||||||||||||||  || |||||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23563238 attatttaacctctgcttatccttttcagcaggagcactatacggcttcggacaactcttctgtcccttacctctacgttcactcatcatcttgtaatga 23563139  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| | | | || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23563138 gctttagtgtcctcctcataaatcctgcagctacttaccaaattaaagaaatttctaatcttctgataaccaatggctctcttgatgtc 23563050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 23078474 - 23077790
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23078474 caaagtctctaccaaacatagacaatggacatctcaagcaaactagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcccttcat 23078375  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23078374 atcagatacatccaaacccaacttataagcacattcaattgcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaag 23078275  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  23078274 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcattagtagtctgcgtactagtcaatgcaaacactttcccaccggtcctagccttcttcggctgagtacact 23078175  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  23078174 atgaactgatatgaccttcttcgttgcagttgtagcaaacaatgtctccacgcttacattcagctagggtgtgtcctttctgaccacacctgaaacattt 23078075  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | |||||||||   ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  23078074 cctctcatctctaccacaagcattgcttttgtggcctttttcaccacacttgaaacatacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatca 23077975  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||||||   | ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||   ||||||||| |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||    
T  23077974 tcattcatcttctgcttccctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgactctgctgtcccttacccctcctctcactcattaccttgtaatgag 23077875  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  23077874 ctttggtgtcttcctcatatatcctgcagctgcttaccaactcagagaaaattctaatcttctgatacccaatagctcttttgat 23077790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 56 - 708
Target Start/End: Original strand, 20345116 - 20345768
Alignment:
Q  56 agacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaat 155  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |    
T  20345116 agacaaacaagagaagtggttattgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcatatcagatacatccaaacccaacttataggcacatt 20345215  T
Q  156 caacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcac 255  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       
T  20345216 caatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggt 20345315  T
Q  256 tgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtag 355  Q
     |  ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||| ||||  | |||||  ||| | |||||||||||| | ||| ||||||||    
T  20345316 agtctgcgtaccagttaaagcaaataccttcccaccagttctagccttcttcggctcaggacactgtgaactaatatgaccttccccattgcagttgtag 20345415  T
Q  356 caaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggc 455  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||||| | |||| || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||    ||||||||||||||||||||     
T  20345416 cagacaatgtccccacgcttgcattcaactagactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctttaccacaaacattactcttgtggg 20345515  T
Q  456 ctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggc 555  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||   | ||||| || ||||||||||| ||    
T  20345516 ctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagc 20345615  T
Q  556 actatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgctt 655  Q
    |||||| |||||   |||| |||  |||||||| || || | ||||||||| | ||||||||||||||| || || || |||||||| || || ||  |     
T  20345616 actataaggcttaggacgattctactgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcctcataaattctgcacctatta 20345715  T
Q  656 accaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||| |||||||||  ||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  20345716 accaactcagaaaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 20345768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 56 - 708
Target Start/End: Original strand, 22505513 - 22506165
Alignment:
Q  56 agacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaat 155  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||| |    
T  22505513 agacaaacaagagaagtagttattgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcatattagatacatccaaacccaacttataagcacatt 22505612  T
Q  156 caacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcac 255  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||       
T  22505613 caatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctttgataagtcggtcctcattggt 22505712  T
Q  256 tgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtag 355  Q
     |  ||||||| |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || |  | |||||  ||| |||| ||||| ||  | ||| ||||||||    
T  22505713 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacaccttgcccccagttctaaccttcttcggttcaggacactgtgaactgatgtgaccctctccattgcagttgtag 22505812  T
Q  356 caaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggc 455  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| ||||  | |||||  || |||||||||||||||||||| |||| |||    |||||||||| ||||||||||    
T  22505813 cagacaatgtccccacgcttacattcagctaagctatgtcccatctgaccacacctgaagcacttcctctcgtctttaccacaaacattgctcttgtggc 22505912  T
Q  456 ctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggc 555  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||   | ||||| || ||||||||||| ||    
T  22505913 ctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctttgtcagcaggagc 22506012  T
Q  556 actatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgctt 655  Q
    ||| || |||||   |||| |||| |||||||| || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || || ||||||||||| || || ||| |     
T  22506013 actgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttataatgagctttggtgtcttcttcataaattctgcacctgtta 22506112  T
Q  656 accaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||| ||||| |||  ||| || | |||||| |||||||| || ||||||||    
T  22506113 accaactcagagaagactctgatttgctgatatccaatagctcttttgatgtc 22506165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 21 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 14884560 - 14883873
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14884560 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 14884461  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||| ||| | | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14884460 atcagacacatctaaacccaacttatatgcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaag 14884361  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| ||||||||||||||| || |||||  | |||  |||| | ||||  | |||||    
T  14884360 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacactttcccaccaattctagtcttcctcggctcaggacact 14884261  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| | |||||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||| | ||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  14884260 gtgaactaatatgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagccaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcactt 14884161  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | | |||||||   |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  14884160 cctatcatctctcccacagacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagctggagcatctctcctcttgggcctcctatca 14884061  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||  ||  || ||||| || ||||||| ||| ||||| || |||||   |||| ||||||||||||| || || | ||||||||| | ||| |||||||    
T  14884060 tcacccatcctctgctttcctttgtcagtaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgag 14883961  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||| || || |||||||| || || || ||  | ||||| ||||| |||  ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14883960 ctttggtgtcttcttcatagattctgcacctattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagcccttttgatgtc 14883873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 21983747 - 21983074
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  21983747 tcaaaatctctaccaaacataaacaatggacaactcaaacaaacgagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccactca 21983648  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||   || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21983647 tacttgacataaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgtgtagcaccagtatcaataatagtaattaaaggagtactattaaa 21983548  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| |  | |||||||||||| | | |||    
T  21983547 gaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaactgtctgcgtaacagtcaatgcaaacacctttccacctgcctgagccttcttaggcttcctgcac 21983448  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||| | | ||||||||| ||||   | ||| |||||||||| || |||||||| || ||  |||  || || ||||||   ||||| | ||||||||    
T  21983447 tgcgaactaagatgaccttcttcgtcacaattgaagcaaacaatatcaccacgcttgcattccgctatcgtatgccctttcttcccacatcggaagcact 21983348  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    | |||||||| |  |  | |||||||||||||||||| || ||||||||| |  | |||||||| |||| |||| ||||||| ||||| || ||| ||||    
T  21983347 ttttctcatcaccattgcgaacattactcttgtggcccttctcaccacacctatagcaaacaatctcagcaggaacatctcttctcttaggtctcctctc 21983248  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||| || ||||||  |||||  || || || |||   || ||||||||||| | ||| ||||||    
T  21983247 atcattcaatctttgcttccctttgtcagcaggaacactgtagggcttcggacgaccttgctgacctttgttcctccgctcactcataaacttataatga 21983148  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaat 693  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  21983147 gctttcgtatcctcctcataaattctacagctgctcacaaattcagaaaattttctgatcttttgataaccaat 21983074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 708
Target Start/End: Original strand, 25850871 - 25851558
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25850871 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacctttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 25850970  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25850971 atcagatacatccaaacccaacttataggcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaatgagtactattaaag 25851070  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||    |  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||| ||||  | |||||    
T  25851071 aaacaagtacctctgataagacggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaaagcaaataccttcccaccagttctagccttcttcggctcaggacact 25851170  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| | |||||||| ||  | ||| |||||||||| |||||||| ||||||||  | ||| ||| | |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  25851171 gtgaactaatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaatgtctccacgcttgtattcagctagactgtgacccttctgaccacacctgaagcactt 25851270  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | | ||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  25851271 cctatcatctttaccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaagagcatctctcctcttgggcctcctatca 25851370  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||  ||   | ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||   |||| |||| |||||||| || || | ||||||||| | |||||||||||    
T  25851371 tcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgag 25851470  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||| || || ||||||||||| || || ||  | ||||| ||||| ||   ||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  25851471 ctttggtgtcttcttcataaattctgcacctattaaccaactcagagaaaactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 25851558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 20 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 21561595 - 21560917
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  21561595 tcaaaatctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacgagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccactca 21561496  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||   || | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21561495 tacttgacataaccatacctaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaattaaagaagtactattaaa 21561396  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaa-ccttcttaggctgcgtaca 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||| | | ||    
T  21561395 gaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaactgtttgcataccagtcaatgcaaacacctttccacctg-cctaagccttcttatgcttcctgca 21561297  T
Q  319 ctacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcac 418  Q
    || |||| | | ||||||||| ||||   | ||| |||||||||| || |||| ||| || |   |||  || || ||||||   ||||| | |||||||    
T  21561296 ctgcgaactaagatgaccttcttcgtcacaattgaagcaaacaatatcaccacacttgcatttcgctatcgtatgccctttcttcccacatcggaagcac 21561197  T
Q  419 ttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttct 518  Q
    || |||||| | |  |  | |||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||| ||||| || ||| |||    
T  21561196 tttttctcaacaccattgctaacattactcttgtggcccttcttaccacacttgaagcaaacaatctcagcaggaacatctcttctcttaggtctcctct 21561097  T
Q  519 catcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatg 618  Q
    ||||||||||||| || || || ||||||||||  ||||| || ||||||  |||||  || || || |||   || | ||||||||| ||||| ||| |    
T  21561096 catcattcaatctttgtttccctttgtcagcagtagcactgtagggcttcggacgaccttgctgacctttgttcctcctctcactcataaccttataacg 21560997  T
Q  619 agcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccc 698  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| |  || ||||| ||||||||||| ||||    
T  21560996 ggctttcgtatcctcctcataaattctacagctgctcaccaatttagaaaattacctgatcttttgataaccaatggccc 21560917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 17266904 - 17266216
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | | |||| || |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17266904 tcaaaatctctaccaaacatagaaattggacacctcaagcaaacaagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 17266805  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    | | ||| |||| || ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17266804 tgttagacacaaacaaacccaacctatatgcactttctaaagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 17266705  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||| |||| || | |||||||||  | |  |  |||| |||||||||||| || || |||||    ||||||||||| ||||| || |||    
T  17266704 gaaacaagtacctttgatgagacggtcctcattagcagtctaggtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcac 17266605  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  | | |||| ||||| || || ||  | || ||||| ||||  || || ||||| |||||  |||   |||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  17266604 tgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcact 17266505  T
Q  420 tcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttct 518  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||| ||||||||| ||| |  | |||||| |||    
T  17266504 tcttctcatcctcggt-acaaacgttactcttgtgacctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggcctcctct 17266406  T
Q  519 catcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatg 618  Q
    ||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17266405 catcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgactctgatgccctttacctcttcgctcactcatcaccttataatg 17266306  T
Q  619 agcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||| |  |||||||| ||||| ||  |||| ||||  || || || |||||||||||||||||    
T  17266305 agctttggtgtcctcctcgtagatcctacagcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 17266216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 430 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 21870438 - 21870163
Alignment:
Q  430 tcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaat 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  21870438 tcggtcacaaacattactcttgtggtctttctcaccacacttgaagcaaattatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctcccatcattcaat 21870339  T
Q  530 ctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtat 629  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21870338 ttctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtat 21870239  T
Q  630 cctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21870238 cctcttcatatatcctgcagctacttaccaattcagaaaagttccttatcttttgatagccaatagccctcttgat 21870163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 430 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 21874718 - 21874443
Alignment:
Q  430 tcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaat 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  21874718 tcggtcacaaacattactcttgtggtctttctcaccacacttgaagcaaattatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctcccatcattcaat 21874619  T
Q  530 ctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtat 629  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21874618 ttctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtat 21874519  T
Q  630 cctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21874518 cctcttcatatatcctgcagctacttaccaattcagaaaagttccttatcttttgatagccaatagccctcttgat 21874443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 497
Target Start/End: Original strand, 20824257 - 20824728
Alignment:
Q  26 tctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcag 125  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20824257 tctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacacaccagagaagtagttactgaacccttggctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcag 20824356  T
Q  126 atacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaaca 225  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20824357 atataatcagacccaacttatatgcacactctaaagcaatgaaacaatgtgtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaagaaaca 20824456  T
Q  226 agtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaa 325  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||    |  ||||||| |||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  20824457 agtacctctgataagtcgatcctcattggtagtctgcgtaccagtcaaagcaaatacttttcctccagtcctgaccttcttaggttgcgtgcactgcgaa 20824556  T
Q  326 ttgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttct 425  Q
     | || |||||||| ||     ||||  | |||||||| || |||||||| || || || ||    || |||||| |||| || ||||| || |||||||    
T  20824557 ctaatgtgaccttcatcaccacagttaaaacaaacaatatctccacgcttgcagtccaccaacacatgacctttctgaccgcatctgaaacatttcttct 20824656  T
Q  426 catctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcat 497  Q
    ||||| |    ||| |||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||| ||||  ||||||||    
T  20824657 catcttgagtgcaagcattactcttgtggcccttcacaccacatttgtaacaaacaacatcaacaggagcat 20824728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 28892512 - 28892280
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28892512 tcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacaccagagaagtagttactgaacccttggctggagtttcaacaaccatttctcctttca 28892413  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  28892412 tatcagatacaatcagacccaacttatatgcacattctaaagcaatgaaacaatgcgtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtaccattaaa 28892313  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcatt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28892312 gaaacaagtacctctgataagtcgatcctcatt 28892280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 252
Target Start/End: Original strand, 20778711 - 20778943
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20778711 tcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacacacaagagaagtagtcactgaacccttggctggagtttcaacaaccatttctcctttca 20778810  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20778811 tatcagatacaattaggcccaacttatatgcacattctaaagcaatgaaacaatgtgtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 20778910  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcatt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20778911 gaaacaagtacctctgataagtcgatcctcatt 20778943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 242
Target Start/End: Original strand, 22464748 - 22464970
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22464748 tcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacacacaagagaagtagttactgaacccttggctggagtttcaacaaccatttcccctttca 22464847  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22464848 tatcagatacaattaggcccaacttatatgcacattctaaagcaatgaaacaatgcgtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 22464947  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22464948 gaaacaagtacctctgataagtc 22464970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21631924 - 21631637
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||  || | ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21631924 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttccccattcatattcgacataacaagacccaacttagaagcacaatcaacagcaa 21631825  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgt 264  Q
    | |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||| || |  | ||||||||||||||  || ||    
T  21631824 taaaacaatgcgtagcaccagtattaataatagcaattaaaggagtactatcaaagtaacatgtacctctaatcaaccggtcctcattcactgtctgtgt 21631725  T
Q  265 acgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttg 352  Q
    || ||||||||||||||| || ||||  |||  | |||||||||||| | | |||| ||||   ||||||||||| || ||| |||||    
T  21631724 accagtcaaagcaaacactttcccactagtctgagccttcttaggcttcttgcactgcgaaccaatatgaccttcttcattgcagttg 21631637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Original strand, 25429250 - 25429454
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | | |||    
T  25429250 caaacatagacaagggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcaaacataac 25429349  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||||||||   ||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||   |||||||||||    
T  25429350 aagacccaacttagtagcaaaatcaaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtattatcaatataacaagtacct 25429449  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  25429450 ctgat 25429454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 272 - 698
Target Start/End: Original strand, 43122517 - 43122943
Alignment:
Q  272 aaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccac 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||| ||| ||||| ||||   | ||| |||||||||| || ||||    
T  43122517 aaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgtgtacactgtgaactgagatgtccttcttcgtcacaattgaagcaaacaatatcaccac 43122616  T
Q  372 gcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacactt 471  Q
    |||| || ||| |||  |  || || |||   ||||| | ||||||||||||||| || |  |  || |||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  43122617 gcttgcattcagctatcgcatgccccttctttccacatcggaagcacttcttctcctcaccattgcagacattactcttgtggcccctctcgccacactt 43122716  T
Q  472 gaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaa 571  Q
    | | |||||||| || | | || ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||  || |||||| || | ||||| || ||||||       
T  43122717 gtagcaaacaatctctgcatgaacatctctcctcttaggtctcctctcatcattcaatctttgctctcctttgtcaacatgagcactgtagggcttcggc 43122816  T
Q  572 cgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagt 671  Q
    |||   ||||| ||||||   || |||||| || | ||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  43122817 cgatcttgttgacccttgttcctccgctcattcctaaccttatagtgagctttcgtatcctcctcgtaaatcctacagctgctcaccaattcagaaaaat 43122916  T
Q  672 ttcttatcttctgataaccaatagccc 698  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||    
T  43122917 ttcttatcttttggtacccaatggccc 43122943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 412 - 681
Target Start/End: Original strand, 23669822 - 23670091
Alignment:
Q  412 gaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggc 511  Q
    ||||||||||||||| || |  |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |  ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||     
T  23669822 gaagcacttcttctcctcaccattgcaaacattactcttgtggcctttctcaccacactggtaggaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttaggt 23669921  T
Q  512 ctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcacct 611  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||  || |||||| |||| ||||| || ||||||   ||||  ||||| ||||||   || |||||| || |  |||    
T  23669922 ctcctctcatcattcaatctttgctctcctttgtcaacaggagcactgtagggcttcggtcgaccttgttgacccttgttcctccgctcattcctagcct 23670021  T
Q  612 tgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatctt 681  Q
    | || |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23670022 tatagtgagctttcgtatcctcctcgtaaatcctacagctgctcaccaattcagaaaaatttcttatctt 23670091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 21882601 - 21882807
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  |||| || | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  21882601 accaaacatagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacata 21882700  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||  || | |||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  21882701 gcaagacccaaagtagaagcacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataataccaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 21882800  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  21882801 ctctgat 21882807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 16359329 - 16359535
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  16359329 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 16359428  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  16359429 acaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 16359528  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  16359529 ctctgat 16359535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29473632 - 29473426
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  29473632 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattcatatcagacaaa 29473533  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  29473532 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 29473433  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  29473432 ctctgat 29473426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 34569321 - 34569527
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  34569321 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 34569420  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  34569421 acaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 34569520  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  34569521 ctctgat 34569527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 40711607 - 40711813
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  40711607 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 40711706  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  40711707 acaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaagatagcaagtac 40711806  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  40711807 ctctgat 40711813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26736284 - 26736080
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||  || | | |    
T  26736284 caaacatagacaaaggacatcttaaacatacaagagaagtagtcaccaaacccttagttggagtttcgacaaccatctctccattcatatttgacatagc 26736185  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||||| || | |||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||||    
T  26736184 aagacccaacatagaagcacaatcaatagaaataaaacaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtactatcaaaataacaagtacct 26736085  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  26736084 ctgat 26736080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14997298 - 14997092
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  14997298 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagccggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 14997199  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  14997198 tcaagacccaaagcagaaacacaatcaaaagcaataaaacaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 14997099  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  14997098 ctctgat 14997092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 18781941 - 18782147
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  |||| |  | ||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  18781941 accaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcacggaacccttagctggagtttcaacaaccatctctccattcatatcagacaaa 18782040  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  18782041 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 18782140  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  18782141 ctctgat 18782147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22330446 - 22330240
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  22330446 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 22330347  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  22330346 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 22330247  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  22330246 ctctgat 22330240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 27521233 - 27521439
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  27521233 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 27521332  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  27521333 ccaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 27521432  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  27521433 ctctgat 27521439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37289021 - 37288849
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | | ||||||||   | |  ||||||| | |||||    
T  37289021 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagaaaaatcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaa 37288922  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  37288921 taaaacaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 37288849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Original strand, 41773703 - 41773875
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | | ||||||||   | |  ||||||| | |||||    
T  41773703 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaatcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaa 41773802  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  41773803 taaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 41773875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 207
Target Start/End: Original strand, 23474011 - 23474198
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||  | | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  23474011 tcaaaatctcgaccaaacatagacaaaggacatctttaatacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattca 23474110  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaagg 207  Q
    |||  |  | | |||||||||||||| | | |||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  23474111 tattcgtcatagccagacccaacttagaagtacaatcaatagcaataaaacaatgtgtagcaccggtatcaataatagcaactaaagg 23474198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 19772787 - 19772993
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  19772787 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagccggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 19772886  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  19772887 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 19772986  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  19772987 ctctgat 19772993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 27613183 - 27613389
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  27613183 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagccggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 27613282  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  27613283 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 27613382  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  27613383 ctctgat 27613389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27682959 - 27682753
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | | |    
T  27682959 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcaaacaaa 27682860  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  27682859 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 27682760  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  27682759 ctctgat 27682753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 22350746 - 22350952
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  22350746 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagataagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 22350845  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||  || |  ||||||| | |||||| || ||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  22350846 tcaagacccaaagtagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgcgtagcactagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 22350945  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  22350946 ctctgat 22350952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27666049 - 27665843
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  27666049 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagtcggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 27665950  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  27665949 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 27665850  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  27665849 ctctgat 27665843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Original strand, 23460832 - 23461004
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| | | | ||||||||  || | |||||||| | |||||    
T  23460832 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctcttcattcatatcagacaaatcaagacccaaagtagaagcacaatcgaaagcaa 23460931  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | |||  ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  23460932 taaaaacatgggtagcaccaatatcaataatagcaactaaaggagtattattaatacagcaagtacctctgat 23461004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 218
Target Start/End: Original strand, 20803424 - 20803611
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| | |    
T  20803424 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccaaacccttagctggagtttcgacaaccatctttccattcatatcagacaaa 20803523  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaa 218  Q
     | ||||||||  || |  ||||||| | |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20803524 gcgagacccaaagtagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcactagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaa 20803611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Original strand, 22137529 - 22137701
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | | ||||||||   | |  ||||||| | |||||    
T  22137529 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaatcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaa 22137628  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | || ||||| ||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  22137629 taaagcaatgcgtatcaccattatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 22137701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 436 - 705
Target Start/End: Original strand, 23474426 - 23474695
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||  || | |||||||| |||| |  | | ||| || |  |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  23474426 acaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaatctcagcaacaacttctttctttctgggcctcctctcatcattcaatctttgc 23474525  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    ||||| || |||||||| ||| | || |||||   |||||| || || ||||||||| | | |||| |||  |||||||||||||| || ||||| || |    
T  23474526 ttacccttatcagcaggagcaatgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcct 23474625  T
Q  636 cataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||  || || || ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  23474626 catgtattctgcagctgctcaccaactcagaaaagttacggatcttctggtaaccaattgcccgcttgat 23474695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 237
Target Start/End: Original strand, 23525952 - 23526084
Alignment:
Q  105 ccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaa 204  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | | | ||||||||| || | |||||||| | |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  23525952 ccatctctccattcatatcagacatatcaagacccaacgtagaagcacaatcgaaagcaataaaacaatgtgttgcaccagtatcaataatagcaactaa 23526051  T
Q  205 aggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  23526052 aggagtattattaatatagcaagtacctctgat 23526084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 16258214 - 16258095
Alignment:
Q  412 gaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggc 511  Q
    ||||||||||||||| || |  |  |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||     
T  16258214 gaagcacttcttctcctcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggatcatctctcctcttaggt 16258115  T
Q  512 ctcttctcatcattcaatct 531  Q
    ||| |||||||| |||||||    
T  16258114 ctcctctcatcagtcaatct 16258095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 22591933 - 22591814
Alignment:
Q  412 gaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggc 511  Q
    ||||||||||||||| || |  |  |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||     
T  22591933 gaagcacttcttctcctcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggatcatctctcctcttaggt 22591834  T
Q  512 ctcttctcatcattcaatct 531  Q
    ||| |||||||| |||||||    
T  22591833 ctcctctcatcagtcaatct 22591814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 412 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 22595488 - 22595369
Alignment:
Q  412 gaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggc 511  Q
    ||||||||||||||| || |  |  |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||     
T  22595488 gaagcacttcttctcctcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggatcatctctcctcttaggt 22595389  T
Q  512 ctcttctcatcattcaatct 531  Q
    ||| |||||||| |||||||    
T  22595388 ctcctctcatcagtcaatct 22595369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 287
Target Start/End: Original strand, 21409995 - 21410217
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    |||||| |||| || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||   || | ||| |||||||| ||  |  |||||||| ||||||    
T  21409995 agagaactagtcaccgaagccttagccggggtttcgacaaccatttccccattaatagatgacataacaagacccaatttcgaaacacaatcagcagcaa 21410094  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgt 264  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||| || |  ||||||||| |||  |  ||    
T  21410095 taaaacaatatgtagcaccagtatctatgatagtaattaagggagtactattaatgaaacatgtacctctgatcagacgatcctcattctctgtctaagt 21410194  T
Q  265 acgagtcaaagcaaacaccttgc 287  Q
    || ||  ||||||||||||||||    
T  21410195 accagctaaagcaaacaccttgc 21410217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21332440 - 21332339
Alignment:
Q  136 acccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctg 235  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||  |||| |||||||||    
T  21332440 acccaacttagaagcacaatcaatagcaataaaacaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtactatcaaaataacatgtacctctg 21332341  T
Q  236 at 237  Q
    ||    
T  21332340 at 21332339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 21336853 - 21336762
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatat 122  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||| ||  |||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  21336853 accaaacatagacaaaagacatcttaaacacacacgagaagtagtcaccaaacccttaactggagtttcgacaaccatctctccattcatat 21336762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21342939 - 21342878
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcaga 126  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  21342939 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcaga 21342878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Original strand, 18782346 - 18782408
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || | |||||||||    
T  18782346 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatc 18782408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 708
Target Start/End: Original strand, 22465126 - 22465436
Alignment:
Q  398 ttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcat 497  Q
    ||| |||| || ||||| || |||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||| ||  ||||||| ||| |||||| || ||||  ||||||||    
T  22465126 ttctgaccgcatctgaaacatttcttctcatcttggatgcaagcattactcttgtggcccttcacaccacatttgtaacaaataacatcaacaggagcat 22465225  T
Q  498 ctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacg 597  Q
     ||||| ||| |||  | |||||||||||||||| |  || || |||| || ||| ||||| || ||||||   |||||    || |||||    ||       
T  22465226 ttctccccttaggctgcctctcatcattcaatctttatttgcctttgttagtaggagcactgtagggcttcgggcgactactctgacccttattcctttt 22465325  T
Q  598 ctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagcc 697  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||  || ||  || | ||||||||||| ||||| ||     
T  22465326 ctcgctcatcaccttataatgagcctttgtatcctcctcataaattctacagctactcaccaattatgagaaaattatgatcttctgatatccaatggct 22465425  T
Q  698 ctcttgatgtc 708  Q
    |||||||||||    
T  22465426 ctcttgatgtc 22465436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 612 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 21331967 - 21331874
Alignment:
Q  612 tgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| || |  |||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  21331967 tgtaatgagccttagtatcctcctcataaatcctgcaactgctcaccagctcagaaaaattacggatcttctggtaaccaattgcccgcttgat 21331874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 545 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 22329935 - 22329835
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcc 644  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  22329935 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 22329836  T
Q  645 t 645  Q
    |    
T  22329835 t 22329835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 687
Target Start/End: Original strand, 20770518 - 20770603
Alignment:
Q  602 ctcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgata 687  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || ||  |||| |||||||||||    
T  20770518 ctcatcaccttatagtgagcctttgtatcctcctcataaattctacagctcctcaccaattccgagaaaattctgatcttctgata 20770603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 687
Target Start/End: Original strand, 20779293 - 20779378
Alignment:
Q  602 ctcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgata 687  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| || ||  |||| |||||||||||    
T  20779293 ctcatcaccttatagtgagcctttgtatcctcctcataaattctacagctgctcaacaattccgagaaaattctgatcttctgata 20779378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 598 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 28891934 - 28891845
Alignment:
Q  598 ctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgata 687  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || || |  || |||||||| || ||  |||| |||||||||||    
T  28891934 ctcactcatcaccttgtaatgagccttcgtatcctcctcataaattctgcagcaactcaccaattctgagaaaattctgatcttctgata 28891845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 14996787 - 14996687
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcc 644  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  14996787 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactacctcgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 14996688  T
Q  645 t 645  Q
    |    
T  14996687 t 14996687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 645
Target Start/End: Original strand, 19773298 - 19773398
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcc 644  Q
    ||||| |||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  19773298 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 19773397  T
Q  645 t 645  Q
    |    
T  19773398 t 19773398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 639
Target Start/End: Original strand, 23461203 - 23461406
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| || | |||||||||  || |||| |||| | | |||||   || ||| |      
T  23461203 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaatagacaatttccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctat 23461302  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtccctt-gcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctct 634  Q
    || || || ||||||||||||||||| |||||    |||||||| || ||||| | || | |||||| |||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  23461303 tttcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtct-tccgctcattcacaaccttgtaatgagctttggtgtcctct 23461401  T
Q  635 tcata 639  Q
    |||||    
T  23461402 tcata 23461406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 27682448 - 27682348
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcc 644  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||    
T  27682448 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcc 27682349  T
Q  645 t 645  Q
    |    
T  27682348 t 27682348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 645
Target Start/End: Original strand, 16359837 - 16359940
Alignment:
Q  542 ttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaa 641  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  16359837 ttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcataga 16359936  T
Q  642 tcct 645  Q
    ||||    
T  16359937 tcct 16359940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 642
Target Start/End: Original strand, 21410373 - 21410572
Alignment:
Q  443 ttactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgt 542  Q
    |||||||| || ||||| || |||||   |||||| ||||  |||||||||| ||||||| |  |||||||| ||| ||||||||  ||||||||||| |    
T  21410373 ttactcttatgacctttctctccacatcggaaacacacaacttcagtaggagtatctctctttctgggcctcctcttatcattcaccctatgcttaccct 21410472  T
Q  543 tgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaat 642  Q
    | ||||| || ||||| || || ||   |||||| |||||   ||| || || |||||| |||| | ||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  21410473 tatcagctggagcactgtaaggtttaccacgactttgttggtgcttacccctccgctcattcataatcttataatgagctttggtgtcatcttcataaat 21410572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 610 - 669
Target Start/End: Original strand, 25429826 - 25429885
Alignment:
Q  610 cttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaa 669  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  25429826 cttgtaatgagccttggtatcctcctcataaatcctgcaactgctcaccagctcagaaaa 25429885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 645
Target Start/End: Original strand, 27521741 - 27521844
Alignment:
Q  542 ttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaa 641  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || || ||||||||||| |    
T  27521741 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtgtcctcttcataga 27521840  T
Q  642 tcct 645  Q
    ||||    
T  27521841 tcct 27521844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 545 - 636
Target Start/End: Original strand, 27613694 - 27613785
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttc 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||  | |  ||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  27613694 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttc 27613785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 645
Target Start/End: Original strand, 34569829 - 34569932
Alignment:
Q  542 ttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaa 641  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  34569829 ttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcataga 34569928  T
Q  642 tcct 645  Q
    ||||    
T  34569929 tcct 34569932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Original strand, 23526283 - 23526345
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||||||    
T  23526283 acaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatc 23526345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 437 - 498
Target Start/End: Original strand, 20803830 - 20803891
Alignment:
Q  437 caaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| || | |||||||||    
T  20803830 caaacatttctcttgtggcctttctcaccataattgaaacagacaatctccgcaggagcatc 20803891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 608 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 21631381 - 21631296
Alignment:
Q  608 accttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaat 693  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||| |||| |||| || |  ||||||||||| |||||    
T  21631381 accttgtaatgagctttcgtatcttcctcatagattctgcaactgctcaccagttcataaaatttacggatcttctgatatccaat 21631296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 23508633 - 23508678
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  23508633 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 23508678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 24584159 - 24584204
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  24584159 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 24584204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 386; Significance: 0; HSPs: 55)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 705
Target Start/End: Original strand, 19455771 - 19456456
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19455771 tcaaagtctctaccaaacatagacaacgaacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcacctttca 19455870  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19455871 tatcagatacaaccagacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 19455970  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||| |    | |||||||| ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  19455971 gaaacaagtacctctgataagaaaatcctcaatagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggtcctaaccttctttggttgagtacac 19456070  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  19456071 tacgaactaatatgaccttcctcgttgcagttatagcaaacaatgtctccacgcttacaatcatctagtgtgtgtcctttctgacaccacctgaagcact 19456170  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19456171 tcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaacaatctcagtaggagtatctctcctcttgggcctcctctc 19456270  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    ||||||||  || || || || ||||||||||| |||||||| || ||   |||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||||||    
T  19456271 atcattcagcctttgttttcctttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttacctctgcgttcactcaccagcttgtaatga 19456370  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||    
T  19456371 gccttagtatcctcttcatatatcctgcagctgcttactaactctgagaaatttcttatcttttgatagccaatacctctcttgat 19456456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 75 - 705
Target Start/End: Original strand, 19465971 - 19466601
Alignment:
Q  75 ttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  19465971 ttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatg 19466070  T
Q  175 agtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaa 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |    | |||||||| ||||| |    
T  19466071 agtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagaaaatcctcaatagtggtttgcgtaccagtcaga 19466170  T
Q  275 gcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgct 374  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  19466171 gcaaacactttaccaccggtcctaaccttctttggttgagtacactacgaactaatatgaccttcctcgttgcagttatagcaaacaatgtctccacgct 19466270  T
Q  375 tacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaa 474  Q
    |||||||| |||  |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19466271 tacaatcatctagtgtgtgtcctttctgacaccacctgaagcacttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaa 19466370  T
Q  475 acaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacga 574  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || || || || ||||||||||| |||||||| || ||   ||||    
T  19466371 gcaaacaatctcagtaggagtatctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctttgttttcctttgtcagcaggagcactatatggtttaggacga 19466470  T
Q  575 ctctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttc 674  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||| || || || || ||||    
T  19466471 ctctgttgtcccttacctctgcgttcactcaccagcttgtaatgagccttagtatcctcttcatatatcctgcagctgcttactaactctgagaaatttc 19466570  T
Q  675 ttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||||||||    
T  19466571 ttatcttttgatagccaatacctctcttgat 19466601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Original strand, 19437750 - 19438438
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19437750 tcaaagtctctaacaaacataaacaacggacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcccttca 19437849  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19437850 tatcagatacaactagactcaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 19437949  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| | |    | |||||||| ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || |||    
T  19437950 gaaacaagtacctctgataagtcgatccttactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacaccttaccactagtcctaaccttcttcggctgtgtgcac 19438049  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||| ||||||| |  || |||||| |||| || || ||||  || |||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19438050 tgcgaactgatatggcgctcttcgttgcagttataacatacaacatcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaaacact 19438149  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    | |||||||||     |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19438150 tattctcatctttagtacaaacattactcaagtggcctttctcaccacacttgtaacgaacgatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctctc 19438249  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| ||||| |  |||||||  |||||||||| |    
T  19438250 atcatttaacctctgcttacccttgtcagcaggagcactatatggcttcggacgactctgctgtcccttacctctcctttcactcactaccttgtaataa 19438349  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  19438350 gccttcgtatcctcttcatagatcctacagctgcttaccaactcagaaaagtttctgatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 19438438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 698
Target Start/End: Original strand, 25770592 - 25771270
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25770592 tcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagtgattgaaccctttgctggagattcaacaaccatttctccattca 25770691  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25770692 tatcagacataaccagacccaacttataagcacaatcaacaacaatgaaacaatgaatagcaccaatatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 25770791  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||| | | | |||    
T  25770792 gaaacaagtacctctgataagtcggtccttattaacagtttgcttactagtcaaaggaaacaccttgccacctgtcagagccttcttaggtttcctgcac 25770891  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||  | ||||||||||| || |   | |||||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||   ||||| |  || ||||    
T  25770892 tgagagctaatatgaccttcttcatcacaattgtagcacacaatatcaccacgcttgcaatcagataatgtgtgtcctttcgtcccacatcgaaaacact 25770991  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25770992 tcttctcatcacggtcacataaattattcttgtggcctttttcaccacacttgaaacagacaatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctc 25771091  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    ||||||||  || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||    
T  25771092 atcattcagcctctgtttacctttgtcagcaggagcactatacggttacggacgactctgttgtcccttacctctgcgctcactcatcactctataatga 25771191  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccc 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||    
T  25771192 gcttttgtatcctcttcataaatcctacagctgcttaccaactcagaaaaattccttatcttttggtagccaatagccc 25771270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 14377446 - 14376761
Alignment:
Q  23 aagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14377446 aagtctctaccaaacatagacaacagacaccttagacaaacaagagaagtagctactaaaccctttgctggagtttcaacaaccatttctcctttcatat 14377347  T
Q  123 cagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaa 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14377346 cagatacaaccaaacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtaacaccagtgtctataatagcaattaaaggattactattaaagaa 14377247  T
Q  223 acaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactac 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |    |  ||||||| |||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| | |    
T  14377246 acaagtacctctgataagtcggtcctcactagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacacttttccaccggttctaaccttcttcggctgtgtacattgc 14377147  T
Q  323 gaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttct 422  Q
    ||| |||| || || || || ||| |||| || |||||||  || ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14377146 gaactgatgtggccctcttcattgcagttataacaaacaacatcaccacgcttacaattagctaaagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttct 14377047  T
Q  423 tctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatc 522  Q
    ||||||||     |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  14377046 tctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcaccgcacttgtagcaaacaacatcaacaggagcatctctcctattgggtctcctctcatc 14376947  T
Q  523 attcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagct 622  Q
    |||||| || || || || ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||    
T  14376946 attcaacctctgttttcccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgctccttcgatcactcatcaccttgtaatgagct 14376847  T
Q  623 tttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    || || ||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  14376846 ttcgtgtcctcctcatagatcctgcagctactaaccaattcagagaagtttctgatcttctgatacccaatgtctctcttgatgtc 14376761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 698
Target Start/End: Original strand, 21474348 - 21475010
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  21474348 tcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacatgagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttttctattca 21474447  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21474448 tatcagacataaccagacccaacttatatgcacaatcaacaacaatcaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 21474547  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| | | | |||    
T  21474548 gaaacaaatacctctgataagtcggtcctcattagaagtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcagagccttcttaggtttcctgcac 21474647  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| | |||||||| || || |   | |||||||| ||||| || |||||||| || ||| | || ||||||||||||   ||||| | ||| ||||    
T  21474648 tgagaactaatatgaccctcttcatcacaattgtagcacacaatatcaccacgcttgcactcagccaatgtgtgtcctttcttcccacatcggaaacact 21474747  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  21474748 tcttctcatcacggtcacatacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatctcagtaggagcatctctcctcctaggcctcctctc 21474847  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    ||||||||   | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||                ||||||||||||||||| ||||||    
T  21474848 atcattcagcatctgcttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctg----------------cgctcactcatcaccttataatga 21474931  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccc 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |  || ||||||||||    
T  21474932 gcttttgtatcctcttcataaatcctacagctgcttaccaattcagaaaaattccttatcttttagtagccaatagccc 21475010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 58 - 708
Target Start/End: Original strand, 18797476 - 18798126
Alignment:
Q  58 acaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatca 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||     
T  18797476 acaaacaagagaagtagtcactgaacccttagctagagtttcaacaaccatctctcctttcatgtcagatacaatcaaacccaacttatatgcacattct 18797575  T
Q  158 acagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactg 257  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    |    
T  18797576 aaagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtag 18797675  T
Q  258 attgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagca 357  Q
      ||||||| |||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||||  ||| ||||||| ||||| || ||| |||| |||||    
T  18797676 tctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctaaccttctttggttgagtgcactgtgaactgatatggccttcatcattgcagttatagca 18797775  T
Q  358 aacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcct 457  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| || |||| |||||||      |||||||||||||||||||||    
T  18797776 aacaacgtcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcccttctgaccacacctgaaacatttctgctcatctttagtgcaaacattactcttgtggcct 18797875  T
Q  458 ttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcac 557  Q
    || || ||||||||  |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  18797876 ttctcgccacacttataacaaacaatatccacaggagcatccctcctcttgggcctcctctcatcattcaatctttgctttcccttgtcagcaggagcac 18797975  T
Q  558 tatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttac 657  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || || || |||||    
T  18797976 tatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctgcggtcactcatcaccttgtaatgagcttctgtgtcctcttcatagattctgcagctacttac 18798075  T
Q  658 caattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18798076 caactcagagaagtttctgatcttctggtatccaatagccctcttgatgtc 18798126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 24515956 - 24515337
Alignment:
Q  11 agatggacatcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  24515956 agatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttaatgaacacttaactggagtttcaacaaccattt 24515857  T
Q  111 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24515856 cccctttcatatcagatacaaccagacccaacttataagcacattcaataacaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagt 24515757  T
Q  211 attattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggc 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    | |||||||| ||||| || |||||| || ||||| ||||||||| || | ||     
T  24515756 actattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagaaaacacgttaccaccggtcctaaccgtcctcggt 24515657  T
Q  311 tgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacc 410  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||| |||| || |||||||  || || | ||| |||||| |||  ||||||| |||| |||||||||    
T  24515656 tgcgtacactgcgaactgatgtgaccttcctcattgcagttataacaaacaacatctcccctcttccaatcagctagtgtgtgtcttttctgaccacacc 24515557  T
Q  411 tgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttggg 510  Q
    |||| |||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24515556 tgaaacacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttataacaaacaatatcaacaggagcatctctcctcttggg 24515457  T
Q  511 cctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcacc 610  Q
    |||| ||||||||||||  || || || || ||||||||||| |||||||| || ||   |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24515456 cctcctctcatcattcagcctctgttttcccttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttgcctctgcggtcactcatcacc 24515357  T
Q  611 ttgtaatgagcttttgtatc 630  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  24515356 ttgtaatgagctttcgtatc 24515337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 21 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 10466380 - 10465696
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10466380 caaagtccctaccaaacatagataacagacaccttaaacagacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 10466281  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10466280 atcagatacatccaaacccaacttataggcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaacagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaag 10466181  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  |||||||   ||||  ||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  10466180 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccgatcaatacaaacactttccctccggtcctgaccttcttcggctgagtacact 10466081  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| | ||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||| |||||||||| || || ||    
T  10466080 gtgaactaatatgaccttcttcattgcagttatagcagacaatgtccccacgcttacattcagctagggtgtgtcccttctgaccacacctaaaacattt 10465981  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | |||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  10465980 cctctcatctctaccacaagcattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcaggaacatctctcctcttgggcctcctatca 10465881  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    ||||||| | | ||||| || ||||||||| | ||| | || |||||   ||||||||| |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||    
T  10465880 tcattcattttctgctttcccttgtcagcaagagcattgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacccctcctctcactcatcaccttgtaatgag 10465781  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||   ||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10465780 cttttgtgtcttcctcatatatcctgcagctgctcaccaactcagagaaaactctaatcttctgataccctatagccctcttgat 10465696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 20 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 19486827 - 19486149
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  19486827 tcaaaatctctaccaaacatagacaacagacaactcaaacaaacaagagaagtagttactaaacccttagctggagtttcaacaaccatttctctactca 19486728  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||   || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19486727 tacttgacatgaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgtgtagcaccagtatcaataataacaattaaaggagtactattaaa 19486628  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| |  | |||||||||||| | | |||    
T  19486627 gaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaaatgtttgcgtaccagtcaatgcaaacaactttccacctgcctgagccttcttaggcttcctgcac 19486528  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||| | | ||||||||| ||||   | ||| |||||||||| || ||| |||| || ||  |||  || || ||||||   ||||| | ||||||||    
T  19486527 tgcgaactaagatgaccttcttcgtcacaattgaagcaaacaatatcaccatgcttgcattccgctatcgtatgccctttcttcccacatcggaagcact 19486428  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||| |  |  |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||||    
T  19486427 tcttctcatcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagtaggaacatctcttctcttaggtctcctctc 19486328  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||  || || || |||   || ||||||||||| ||||||||||||    
T  19486327 atcattcaatctttgcttccctttgtcagcaggagcactgtagggcttcgaacgaccttgctggcctttgttcctccgctcactcataaccttgtaatga 19486228  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccc 698  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||    
T  19486227 gctttggtatcctcttcgtagattctacaactgctcaccaattcagaaaattgcctaatcttctgataaccaatggccc 19486149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 21 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 21567523 - 21566839
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21567523 caaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatctctcctttcat 21567424  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
     |||| ||||| || |||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  21567423 gtcagttacaatcaaacccaactaatatgcacattctaaagcaatgaaacaatgagtagtaccagtgtctataatagcaattgaataagtactattaaag 21567324  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| |||    |  ||||||| ||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| ||||| || ||||    
T  21567323 aaacaagtacctctgataagcatgtccttattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccaccggttctaatcttctttggctgagtgcact 21567224  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| |||| || || ||||  |   | || || |||||||  || || | ||| || | | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21567223 gggaactgatgtggccctccttatcacaattataacaaacaacatcacccctcttgcagttagccaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcactt 21567124  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    ||||||||||     |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  21567123 cttctcatctttagtacaaacattacttttgtggcctttctcgccacacttaaagcaaactatttcagcaggagcatctctcctcttgggccttctctca 21567024  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    ||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||    
T  21567023 tcattcagtcgttgctttcccttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttactcctccgctcactcatcaccttgtaatgag 21566924  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||| ||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21566923 cttttgaatcttcctcatagattctacagctgcttaccaactcagaaaaagtcctgatcttctgatagccaatggccctcttgat 21566839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 56 - 708
Target Start/End: Original strand, 24367184 - 24367836
Alignment:
Q  56 agacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaat 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||| |    
T  24367184 agacaaacaagagaagtggttactgaatccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcatatcagatatatccggacccaactgatatgcacatt 24367283  T
Q  156 caacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcac 255  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       
T  24367284 caatagcaataaaacaatgagtagcaccagtattaataatagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattagg 24367383  T
Q  256 tgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtag 355  Q
     |  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||   ||||| || |  |  ||||  ||| | |||||||||||  | ||| | |||||     
T  24367384 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttcccaccagttctagttttcttcggttcagggcactgtgaactaatatgaccttctccattgcaattgtaa 24367483  T
Q  356 caaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggc 455  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||    
T  24367484 cagacaatgtccccccgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattactcttgtggc 24367583  T
Q  456 ctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggc 555  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||   | ||||| || ||||||||||| ||    
T  24367584 ctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacatgagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagc 24367683  T
Q  556 actatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgctt 655  Q
    ||| || |||||   |||| |||| |||||||| || || | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||| ||| || ||||| ||| |     
T  24367684 actgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttgatagattctacacctgtta 24367783  T
Q  656 accaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||| ||| | |||  ||| |||| |||||| ||||| || |||||||||||    
T  24367784 accaactcatagaagactctgatctgctgatatccaatggctctcttgatgtc 24367836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 34643119 - 34642430
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| || |||||||||||||| |   |||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34643119 tcaaaatccctaccaaacatagatataggacatctcaaacaaacaagagaagtagtcactgaacccttagccggagtttcaacgaccatttctcctttca 34643020  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||| |||| || |||||  ||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  34643019 tatcagacacaatcaaacccagtttataagcacactctaaagcaatgaaacaatgtgtagcaccagtgtctataatagcgattaaagggatactattaaa 34642920  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||| | | |||||||| || ||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||    
T  34642919 gaaacaagtacctctgataagtctatcttcattcgcggtttgcgtaccagccaaggcaaacactttcccaccggtcctaaccttcttcggttgagtgcac 34642820  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||   ||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  34642819 tgagaactgatatgaccctccccattgcagttgtagcatacaatatcaccacgtttacaatcagctaacacgtgacccttctgtccacacctgaagcact 34642720  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctctt-gggcctcttct 518  Q
    |||||||||||  |  |||||||||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| || || | |||||  ||||| | ||| ||| ||| | |    
T  34642719 tcttctcatctttggtacaaacattacttttgtggcccttctcgccacacttaaagcaaactatctccgcaggagtgtctcttcccttggggtctccttt 34642620  T
Q  519 catcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatg 618  Q
    ||||||||| ||  ||||| || ||  ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  34642619 catcattcagtcgttgctttcccttaccagcaggagcactatacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccctccgttcactcatcaccttgtaatg 34642520  T
Q  619 agcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||  ||| ||| |||||||| || || || || |||| ||| |||||||   |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34642519 agcccttgaatcttcttcatagattctgcagctacttatcaactcagaaagagttctgatcttttgatagccaatggccctcttgatgtc 34642430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Original strand, 15462084 - 15462772
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15462084 tcaaaatctctaccaaacatagataacggacaccttagacacaccagagaagtagttactgaacccttggctggagtttcaacaaccatttctcctttca 15462183  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15462184 tatcagatacaatcagacccaacttatatgcacattctaaagcaatgaaacaatgtgtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 15462283  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||    |  ||||||| |||||| ||||| || || || || || || ||||||||||| ||||| |||    
T  15462284 gaaacaagtacctctgataagtcgatcctcattggtagtctgcgtaccagtcaaggcaaatacttttcctccagttctgaccttcttaggttgcgtgcac 15462383  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||| | || || || |||||     |||| || || || || || || ||||| || ||| | ||    || |||||| |||| || ||||| || |    
T  15462384 tgcgaactaatgtggccctcctcaccacagttataacacacgatatctccccgcttgcactcagccaacacatgacctttctgaccgcatctgaaacatt 15462483  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||||| |   || ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| ||||  |||||  |||||||   | |||  | ||||    
T  15462484 tcttctcatctctggtgcagacattactcttgtggcctttcgcaccacacttgtaacacacaacatcaacaggagtctctctccctctaggctgcctctc 15462583  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||||||||| || || || |||| |||||| ||||| || ||||||   |||||    || |||||    ||   ||||||||||||||||||||||    
T  15462584 atcattcaatctctgtttgcctttgttagcaggagcactgtagggcttcgggcgactactctgacccttattcctcttctcactcatcaccttgtaatga 15462683  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || || ||  | || ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  15462684 gctttcgtatcctcctcataaatcctacagctactcaccaactccgagaaaatcctgatcttctgatatccaatggctctcttgatgtc 15462772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23085358 - 23085096
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23085358 tcaaaatctctaccaaacatagataaaggacatcttaaacacactagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattca 23085259  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||   || | |   |||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| || |||||||||| ||| |||    
T  23085258 tacttgacatagtaagacccaacttagaagcataatcaacaacaataaaacaatgtgtagcaccagtttcaataatagaaactaaaggagtactatcaaa 23085159  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacac 282  Q
      |||| |||||||| || | || |||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  23085158 ataacatgtacctctaatcaatcggtcctcattctctgtctgcatactagtcaaagcaaacac 23085096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 412 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 8720846 - 8720553
Alignment:
Q  412 gaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggc 511  Q
    ||||||||||||||| || |  |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||  |||| ||||||||||||| |||    
T  8720846 gaagcacttcttctcctcaccattgcaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcatcaggatcatctctcctcttaggc 8720747  T
Q  512 ctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcacct 611  Q
    ||| ||||||||||||||||| | |  || ||||   |||| ||||| || || |||  |||||  ||||| ||||||   || |||||  || | | ||    
T  8720746 ctcctctcatcattcaatctaggttcccctttgtttacaggagcactgtagggtttcggacgaccttgttgacccttgttcctccgctcgttcctaatct 8720647  T
Q  612 tgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8720646 tgtagtgagctttggtatcctcctcatatatcctacagctactcaccaactcggaaaagttccttatcttctgataaccaatagcccttttgat 8720553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18405464 - 18405260
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| || | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | |    
T  18405464 caaacatagacaagggacatctcaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacatagc 18405365  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||  |||||| ||| ||| |||  |||||||||||    
T  18405364 aagacccaacttagtagcacaatcaaaagcaataaaacaatgcatagcaccagtatcaataatagcagctaaaggtgtactatcaaaataacaagtacct 18405265  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  18405264 ctgat 18405260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20010977 - 20010821
Alignment:
Q  30 taccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatac 129  Q
    ||||||| ||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20010977 taccaaaaatagacaacggacaccttaaacacacaagagaagtagttactgaacccttggctggagtttcaacaaccatttcccctttcatattagatac 20010878  T
Q  130 aaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagt 186  Q
     |  || ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20010877 gattaggcccaacttataagcacattctaaagcaatgaaacaatgcgtagcaccagt 20010821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Original strand, 23081184 - 23081388
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||  || | | |    
T  23081184 caaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattaatatttgacatagc 23081283  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     | |||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||  |||| ||||||    
T  23081284 aaaacccaacttagaagcacaatcaatagcaataaaacaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtactatcaaaataacatgtacct 23081383  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  23081384 ctgat 23081388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 30678557 - 30678297
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||   |||  | ||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||    
T  30678557 tcaaagtctcgaccaaacatcgacaacgaacacttcagacacactagagaagtagtaaccaaacccttagctggagtttcgacaaccatttccccatcca 30678458  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||   || | ||| |||||||||||| | |||||||||  |||||| |||||| | ||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30678457 tacatgacataacaagacccaacttagaagcacaatcagtagcaataaaacaacgcgtagcacaaatatcaataatagcaattaaagaagtactattaaa 30678358  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaac 280  Q
    |||||| ||||||||||| |  |  ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  30678357 gaaacatgtacctctgatcaaccgatcctcattcactgtttgtgtaccagtcaaagcaaac 30678297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 71 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5836710 - 5836544
Alignment:
Q  71 gtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaac 170  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | | ||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||    
T  5836710 gtagttaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaatcaagacccaaagtataagcacaatcaaaagcaataaaac 5836611  T
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  5836610 aatgcgtagcaccaatatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 5836544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18182900 - 18182686
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  18182900 tcaaaatctcgaccaagcatagacaaatgacatcttaaacaaacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgactaccatctctccattca 18182801  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||  || | | | |||||||||||| | |||||||||| |||||| |   |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  18182800 tatttgacatagcaagacccaacttagaagcacaatcaatagcaataaggaaatgtgtagcaccaatatcaataatagcaattaaaggagtactatcaaa 18182701  T
Q  220 gaaacaagtacctct 234  Q
    | |||| ||||||||    
T  18182700 gtaacatgtacctct 18182686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 412 - 705
Target Start/End: Original strand, 16813780 - 16814073
Alignment:
Q  412 gaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggc 511  Q
    ||||||||||||||| || |  |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||     
T  16813780 gaagcacttcttctcctcaccattgcaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggatcatctctcctcttaggt 16813879  T
Q  512 ctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcacct 611  Q
    ||| |||||||||||||||| || |  || ||||   |||| ||||| || || |||  |||||  ||||| ||||||   || |||||| || | | ||    
T  16813880 ctcctctcatcattcaatctctgttcccctttgtttacaggagcactgtagggtttcggacgaccttgttgacccttgttcctccgctcattcctaatct 16813979  T
Q  612 tgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    | || |||||||| |||||||| ||||| ||| |  | || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16813980 tatagtgagctttggtatcctcctcatatatcatgtagctactcaccaactcggaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 16814073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29589961 - 29589755
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  29589961 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 29589862  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  29589861 acaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 29589762  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  29589761 ctctgat 29589755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Original strand, 22436662 - 22436834
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||  || | |||||||| | |||||    
T  22436662 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacataacaagacccaaagtagaagcacaatcgaaagcaa 22436761  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||   |||| |||||||||||    
T  22436762 taaaacaatgcgtagcactagtatcaataatagcaactaaaggagtattatcaatataacatgtacctctgat 22436834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2872324 - 2872118
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  2872324 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 2872225  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  2872224 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 2872125  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  2872124 ctctgat 2872118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 16574649 - 16574855
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  16574649 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 16574748  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  16574749 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 16574848  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  16574849 ctctgat 16574855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16620731 - 16620525
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  16620731 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 16620632  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  16620631 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 16620532  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  16620531 ctctgat 16620525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16925162 - 16924956
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||| ||  |||| || | ||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  16925162 accaaacatagaaaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgatcccttagctggagtttcgacgaccatctctccattcatatcagacaaa 16925063  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||  || |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||    
T  16925062 tcaagacccaaagtagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatataacaagtac 16924963  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  16924962 ctctgat 16924956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27559491 - 27559285
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  |||| || | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  27559491 accaaacatagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 27559392  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||||   |||||||||    
T  27559391 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccattatcaataatagcaacaaatggagtattattaatataacaagtac 27559292  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  27559291 ctctgat 27559285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24293304 - 24293098
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  24293304 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 24293205  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| ||||  || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  24293204 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaaccgtgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 24293105  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  24293104 ctctgat 24293098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 215
Target Start/End: Original strand, 19867446 - 19867630
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| ||| | |    
T  19867446 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctcttcattcatataagacata 19867545  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattat 215  Q
    || || |||||  || | |||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  19867546 acaaggcccaaggtagaagcacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagaaactaaaggagtattat 19867630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28260719 - 28260513
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |      
T  28260719 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaac 28260620  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||   | |||||||    
T  28260619 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggggtattattaatatagcaagtac 28260520  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  28260519 ctctgat 28260513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 28285197 - 28285403
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |      
T  28285197 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaac 28285296  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||   | |||||||    
T  28285297 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggggtattattaatatagcaagtac 28285396  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  28285397 ctctgat 28285403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28339468 - 28339262
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |      
T  28339468 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaac 28339369  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||   | |||||||    
T  28339368 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggggtattattaatatagcaagtac 28339269  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  28339268 ctctgat 28339262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 464 - 705
Target Start/End: Original strand, 19881588 - 19881829
Alignment:
Q  464 ccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacg 563  Q
    |||||||| || ||||| || |||| |||||  ||||| | |||||| ||  |||||||||||| ||  ||||| || ||  |||||||||| || ||||    
T  19881588 ccacacttaaagcaaactatctcagcaggagtgtctcttcccttgggtcttctctcatcattcagtcgttgctttcccttaccagcaggggcgctgtacg 19881687  T
Q  564 gcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattc 663  Q
    ||||   |||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| || || || || |||| ||| ||    
T  19881688 gcttaggacgactttgttgttccttgcccctccgttcactcatcaccttgtaatgagcctttgaatcttcttcatagattctgcagctacttatcaactc 19881787  T
Q  664 agaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
     ||||   |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19881788 ggaaagagttctgatcttctgataaccaatggccctcttgat 19881829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Original strand, 28312423 - 28312595
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |   | ||||||||   | |  ||||||  | |||||    
T  28312423 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaactcaagacccaaagcagaaacacaattgaaagcaa 28312522  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  28312523 taaagcaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 28312595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 234
Target Start/End: Original strand, 27190229 - 27190398
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| || |   | ||||||||   | |  ||||||| | |||||    
T  27190229 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctccccattcatatctgacaactcaagacccaaaccagaaacacaatcgaaagcaa 27190328  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctct 234  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||||||    
T  27190329 taaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctct 27190398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27259011 - 27258842
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| || |   | ||||||||   | |  ||||||| | |||||    
T  27259011 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctccccattcatatctgacaactcaagacccaaaccagaaacacaatcgaaagcaa 27258912  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctct 234  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||||||    
T  27258911 taaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctct 27258842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 436 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 30678141 - 30677872
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | |||||||  |||| ||||| |||| || |  | |||||| ||||||||||||  || |||    
T  30678141 acaaacattactcttgtggctcttctcaccacacttgtagcaaacaacctcagcaggagtatctttctttctaggcctcctctcatcattcaccctttgc 30678042  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    ||||  || |||||||| ||  | || |||||   |||| |||| || | ||| || || ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |    
T  30678041 ttacatttatcagcaggagcgttgtaaggctttggacgattctgctgactcttacccctccgctcactcataaccttgtaattagctttggtatcttcct 30677942  T
Q  636 cataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |  |  ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  30677941 catagatcctgcaactgctcactaattcagaaaattgacggatcttctgatatccaatggcccgcttgat 30677872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 25115311 - 25115517
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| | |    
T  25115311 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaatcatctctccattcatatcagacaaa 25115410  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | |||||| |   | |  ||||||| | |||||| || ||||| |||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  25115411 tcaagacccgaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgcgtagtaccaatatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 25115510  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  25115511 ctctgat 25115517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 436 - 705
Target Start/End: Original strand, 23081587 - 23081856
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||||||| |||  |||||||||| || || | |||| | |||||||||| | ||| |||    
T  23081587 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtataacaaacaatctcaacaggagcatctttcttcctaggccgcctctcatcattaactctttgc 23081686  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    || || || |||||||  ||||| || |||||   ||||||||| || || ||| || | |||||| |||  | |||||||||||| || |||||||| |    
T  23081687 tttcctttatcagcagcagcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgactttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcct 23081786  T
Q  636 cataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||||||| || |||||||| || |  ||||||||| | |  |||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  23081787 cataaattctgcaactgctcactagctcagaaaaggtacgaatcttctggtaaccaattgcccgcttgat 23081856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 20010645 - 20010346
Alignment:
Q  410 ctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaa-acaatatcagtaggagcatctctcctcttg 508  Q
    ||||| || |||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||| |||| ||||  |||||||| ||||| |||     
T  20010645 ctgaaacatttcttctcatcttgggtgcaagcattactcttgtggcccttcacaccacatttgtaacaatacaacatcaacaggagcatttctcccctta 20010546  T
Q  509 ggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatca 608  Q
    |||  | |||||||||||||||| || || || |||| || ||| ||||| || ||||||   |||||    || |||||    ||   ||| |||||||    
T  20010545 ggctgcctctcatcattcaatctttgtttgcctttgttagtaggagcactgtagggcttcgggcgactactctgacccttattccttttctcgctcatca 20010446  T
Q  609 ccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || ||  |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  20010445 ccttataatgagcctttgtatcctcctcataaattctacagctactcaccaattctgagaaaattctgatcttctgatatccaatggctctcttgatgtc 20010346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 436 - 705
Target Start/End: Original strand, 18660083 - 18660352
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| || |||||   | |||||||||  |||||||||   ||| |||||||||| | | |||||||||| |  || |||    
T  18660083 acaagcattactcttgtgacatttctctccacatcggtaacaaacaacttcagtaggattctctttcctcttgggtcccctctcatcattaaccctctgc 18660182  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    | ||| || |||||||| ||||| || |||||   |||||| || || | ||| ||| | | ||||||||   |||||||||||||||| |||||||| |    
T  18660183 tcacccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgactcttacctttcctctcactcacagccttgtaatgagctttcgtatcctcct 18660282  T
Q  636 cataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||| || || |||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||| ||| |||||  ||||||||||    
T  18660283 catagattctgcaactgctcaccagttcagaaaagttacggatcttctaatatccaatgaccctcttgat 18660352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 545 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 5836239 - 5836139
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcc 644  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  | |||||| |||    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5836239 tcagcaggggcactatacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccttccgctcattcacagtcttgtagtgagctttggtatcctcttcgtaaatcc 5836140  T
Q  645 t 645  Q
    |    
T  5836139 t 5836139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 442 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 25958864 - 25958636
Alignment:
Q  442 attactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccg 541  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||| || ||| ||||  ||     
T  25958864 attactcctgtggcctttcttaccacacctgtagcaaacaatctcagtaggagcatctctactcttaggtctcctctcatcatccagtctttgctcccct 25958765  T
Q  542 ttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaa 641  Q
    | |||| || | |||||||| |||||   |||||| || || || || |||||   |||  |||  | |||||| |||||| | |||||||| |||||||    
T  25958764 tcgtcaacaagagcactataaggctttggacgactttgctgcccttttcctctcttctctttcactatcttgtagtgagctctagtatcctcctcataaa 25958665  T
Q  642 tcctacaactgcttaccaattcagaaaag 670  Q
    |||| |||||||| ||||  |||||||||    
T  25958664 tcctgcaactgctcaccagctcagaaaag 25958636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22829769 - 22829702
Alignment:
Q  170 caatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  22829769 caatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 22829702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Original strand, 21764976 - 21765038
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||    
T  21764976 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgcaggagcatc 21765038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 23084769 - 23084680
Alignment:
Q  609 ccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccc 698  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| || |  ||||||| ||| ||||| ||||    
T  23084769 ccttgtaatgagctttagtatcttcctcatagattctacaactgctcaccagttcagaaaaattacggatcttctaatacccaatggccc 23084680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 2871813 - 2871713
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcc 644  Q
    |||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||||  | | |||| |||  | |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  2871813 tcagcaggggcactgtacagcttaggacgactctgttgtcccttgcccttcctctcattcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcc 2871714  T
Q  645 t 645  Q
    |    
T  2871713 t 2871713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 610 - 652
Target Start/End: Original strand, 22437207 - 22437249
Alignment:
Q  610 cttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactg 652  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22437207 cttgtaatgagccttggtatcctcttcataaatcctgcaactg 22437249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 545 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 22829397 - 22829351
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcc 591  Q
    |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  22829397 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgcc 22829351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 27559086 - 27559044
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaa 478  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27559086 acaaacagtactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaa 27559044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16379755 - 16379710
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  16379755 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 16379710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16647351 - 16647306
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  16647351 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 16647306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 367; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 705
Target Start/End: Original strand, 1625 - 2317
Alignment:
Q  11 agatggacatcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1625 agatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacagtggaaaactcaaacaaagaaaagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaagaaccattt 1724  T
Q  111 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 210  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1725 ctccattcatatcagacataaccagacccaacttatatgcacaatcaacaacaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 1824  T
Q  211 attattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggc 310  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  1825 actattaaagaaacaagtacctttgataagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgtccgaaacttcttgggc 1924  T
Q  311 tgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacc 410  Q
    | | | |||| |||  | ||||| || || || |   | || ||||| ||||  | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||    
T  1925 ttcttgcactgcgagctaatatgtccctcttcatcacaattatagcatacaacat-cccacgcttacaatcagctaaagtatgtcctttctgtccacacc 2023  T
Q  411 tgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttggg 510  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  2024 taaagcacttcttctcatctcggtcacacacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaataatttcagtaggagcatctcacctcttagg 2123  T
Q  511 cctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcacc 610  Q
    |||| ||||||||||||  || || ||||| ||||||||||  |||||| |||| |||  ||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||||||     
T  2124 cctcctctcatcattcagcctctgtttacctttgtcagcagaagcacta-acggtttcggacgactctactatcccttacctctgcgctcactcatcact 2222  T
Q  611 ttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2223 ttataatgagcttttgtatcctcttcatagattctacagctgcttactaattcagaaaaatttcttatcttctgataaccaatagcccgcttgat 2317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 98974 - 98286
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  98974 tcaaagtctctaccaaacatagacaacgaacaccttagacacacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcccttca 98875  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  98874 tattagatacaaccagacccaacttataagcacattcaatagtaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 98775  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    | ||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||    
T  98774 gaaacaagtacctttgataagtcggtcctcactagtggtttgtgtaccagtcagagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggctgtgtgcac 98675  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||| ||||||| || || |||||| |||| || || ||||  || |||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  98674 tgcgaactgatatggccctcttcgttgcagttataacatacaacatcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaaacact 98575  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||||     |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  98574 tcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaacgatctcagcaggagcatctctccacttgggcctcctctc 98475  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||| || || |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||    
T  98474 atcatttaacctctgcttacccttgtcagcatgagcactatatggcttcggacgactctgttgtcccttacctctcctttcactcattaccttgtaatga 98375  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    || || |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  98374 gccttcgtatcctcttcattgatcctacagctgcttaccaactcagaaaagtttctgatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 98286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 698
Target Start/End: Original strand, 175892 - 176578
Alignment:
Q  11 agatggacatcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 110  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  175892 agatcgacttcaaaatctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttagtgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 175991  T
Q  111 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 210  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  175992 ctccattcatatcagatataaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 176091  T
Q  211 attattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggc 310  Q
    | || |||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||    
T  176092 acta-taaagaaataagtacctctgataagtcggtctttattaacagtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcagagccttctaaagc 176190  T
Q  311 tgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacc 410  Q
    | | | |||| |||  | ||||||||||| || |   | || ||||||||||  || |||||||| |||||| |||| ||||||||||||   |||||||    
T  176191 ttcctgcactgcgagctaatatgaccttcttcatcacaattatagcaaacaacatcaccacgcttgcaatcagctaatgtgtgtcctttctttccacacc 176290  T
Q  411 tgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttggg 510  Q
    | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| | ||    
T  176291 taaaacacttcttctcatcacggtcacatacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacagacaatctctgtaggagcatctctcctcctagg 176390  T
Q  511 cctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcacc 610  Q
    |||| |||||||||||| ||| || ||| | ||||  ||||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  176391 cctcctctcatcattcagtctctgtttaactttgttggcaggagcactatacggtttcggacgactctgctgtcccttacctctacgctcactcatcacc 176490  T
Q  611 ttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccc 698  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||| ||||||| |||||||| || || ||||| ||||    
T  176491 ttataatgagcttttgtatcctcttcatagatcctacagctactcaccaaatcataaaagttccttatcttttggtagccaatggccc 176578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 666
Target Start/End: Original strand, 29440 - 30086
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29440 tcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagtgaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccattca 29539  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29540 tatcagacataaccagacccaacttatatgcacaatcaactgcaatgaaacaatgagtagcactagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 29639  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | | |||    
T  29640 gaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaacagtttgcgtaccagtcagagcaaacaccttgccacctgtcagagccttcttaggcttcctgcac 29739  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||  | ||||||||||| || |   | |||||||||||||  || |||||||| || ||| |||  ||||||||||||   ||||||| ||| ||||    
T  29740 tgcgagctaatatgaccttcttcatcacaattgtagcaaacaacatcaccacgcttgcactcagctattgtgtgtcctttcgtcccacaccggaaacact 29839  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  29840 tcttctcatcatggttacaaacattactcttgtggcccttttcaccacacttgaaatagactatctcaataggagcatctctcctcctaggcctcctctc 29939  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29940 atcattcagtctctgcttacctttgtcagcaggagcactagacggtttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttataatga 30039  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcaga 666  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||    
T  30040 gcctttgtatcctcttcatagattctacaactactcaccaaatcaga 30086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 2343 - 1655
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  2343 tcaaagtctctaccaaacatagacaacgaacatcttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatatcccctttca 2244  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  2243 tatcagatacaaccagacccaacttataagaacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggaatactattaaa 2144  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||    | |||| |    | |||||||| ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  2143 gaaacaagtacctctgataagcatcttctcactagtgggttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggtcctaaccttcttcggttgtgtacac 2044  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2043 tgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttatagcaaacaacgtctccccgcttacaatcagctaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcact 1944  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1943 tcttctcatctttatcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatttcagcaggagcatctatcctcttgggcctcctctc 1844  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    ||||||||  || || || || ||||||||||| |||||||| || ||   | ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1843 atcattcagcctctgttttcctttgtcagcaggagcactatatggtttaggatgactctgctgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaatga 1744  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| | |  || || ||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  1743 gctttagtatcttcttcatatatcatgctgctactcaccaaatcagagaaaattcttatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 1655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 693
Target Start/End: Original strand, 70285 - 70958
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  70285 tcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacaaactagagaagtagttactgaacccttggctagagtttcaacaacaatttctcctttca 70384  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  70385 tatcagatacaatcagacccaacttatatgcacattctaaagcaaagaaacaatgagtaacaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 70484  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||    |  ||||||| ||||||| |||| || || || || || || ||||||||||| ||||| |||    
T  70485 gaaacaagtacctctgataagtcgatcctcattggtagtctgcgtaccagtcaaaacaaatacttttcctccagttctgaccttcttaggttgcgtgcac 70584  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| | || || || ||||| ||  |||| || |||||||| || |||||||| || ||| | ||    || |||||  |||| || ||||| ||||    
T  70585 tgtgaactaatgtggccctcctcattacagttataacaaacaatatctccacgcttgcattcagccaacacatgacctttatgaccgcatctgaaacact 70684  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||||  |   || ||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| | | |||| | ||||    
T  70685 tcttctcatctttggtgcagacattacccttgtggcctttcgcaccacacttgtaacaaacaacatcaacaggagcatctctccccctaggccgcctctc 70784  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||||||||| || || || |||||||||||  || | || ||||||   |||||    || |||||    ||   ||| ||||||||||| || |||    
T  70785 atcattcaatctttgttttcctttgtcagcaggaacaatgtagggcttcgggcgactactctgacccttattcctcttctcgctcatcaccttatagtga 70884  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaat 693  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  70885 gcctttgtatcctcctcataaatcatacagctactcaccaattcagagaaatttctgatcttctgatacccaat 70958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 322 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 11995 - 11609
Alignment:
Q  322 cgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttc 421  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |  |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11995 cgaactgatatgaccttcttcgttccaaatgtaacaaacaatgtcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttc 11896  T
Q  422 ttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcat 521  Q
    |||||||||     |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11895 ttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaacgatctcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcat 11796  T
Q  522 cattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagc 621  Q
    |||| | ||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||   ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  11795 cattaagtctctgctttcctttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttctctcactcatcaccttataatgagc 11696  T
Q  622 ttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
     || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||  || | ||||| ||||| || || || |||||||||||    
T  11695 cttagtgtcctcttcatatatcctgcagctgcttaccaaatcagagaaaattttaatcttttgataccctatggctctcttgatgtc 11609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 340; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 459
Target Start/End: Original strand, 12640 - 13079
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12640 tcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaacttaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 12739  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12740 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 12839  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12840 gaaacaagtacccctgataagttggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttaacgcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 12939  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||| ||||||||||||| || ||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12940 tgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccccacgcttacaatcagctaaagtgtgtcctttctgaccacacctaaagcact 13039  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggccttt 459  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13040 tcttctcgtcacggtcacatacattactcttgtggccttt 13079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Original strand, 8527 - 9215
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8527 tcaaaatctctaccaaacatagacaatggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttta 8626  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8627 tatcagatacaaccaaacccaacttatatgcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 8726  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |    |  ||||||| |||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  8727 gaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtagtatgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggtactaaccttcttcggttgagtgcac 8826  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8827 tgcgaactgatatggccttcttcgttgcagttgtagcaaacaatgtcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaaacact 8926  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||||     ||||||||||||||||||||| || || ||||||||  |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  8927 tcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggccattctcgccacacttataacaaacaatctcatcaggagcatctctcctcttgggtcttctctc 9026  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    ||||||||   | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||  || || |||||||||||||  ||||||    
T  9027 atcattcagcttctgcttccctttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgctccttcgatcactcatcacctaataatga 9126  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    | ||| || ||||| ||||| ||  | || || |||||||||||||| |||||| | |||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  9127 gatttcgtgtcctcctcatagattatgcagctacttaccaattcagagaagtttttgatcttctggtacccaatggctctcttgatgtc 9215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 693
Target Start/End: Original strand, 20727 - 21400
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20727 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttca 20826  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20827 tatcagatacgaccagacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 20926  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||| |    | |||||||| ||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  20927 gaaacaagtacctctgataagtagatcctcaatagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggttctaaccttcttcggttgtgtacac 21026  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| ||||| | || ||||| ||| |||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  21027 tgtgaactgatacggccctcctcattgcagttatagcaaattatgtctccccgcttacaatcaactaatgtgtgtcccttctgtccacacctgaagcact 21126  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||| ||     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21127 tcttctcacctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcagaagcatctctcctcttgggcctcctctc 21226  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    ||||||||  || || || || ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21227 atcattcagcctctgttttcctttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgactctactgtcccttgcctttacgctcactcatcaccttgtaatga 21326  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaat 693  Q
    |||||  |||| || ||||| || || || || || ||||| || || || ||||||||||||||||| |||||    
T  21327 gctttcctatcttcctcatatattctgcagctactcaccaactcggagaaatttcttatcttctgatagccaat 21400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 20 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 878 - 193
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  878 tcaaagtctctactaaacatagacaacggacattttaaacacacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 779  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||     | ||||| |||||||||||| || | |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  778 tatcagatatttttatacccatcttatatgcacattctatagcaattaaacattgtgtagcaccagtttctataatagcaattaaaggagtactattaaa 679  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    |  || |||| |||||| |||||||| || ||| | || ||||||||||| ||||| || |||    
T  678 gaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattagtagtctgtgtaccagtcaatgcaaacactttcccatcggttctaaccttcttcggctgtgtgcac 579  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| ||||||| || || || ||| |||| ||||||||||  || |||||||| |||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  578 tgtgaactgatatggccctcttcattgcagttatagcaaacaacatcaccacgcttgcaatcagctaggctgtgtcctttctgaccacacctgaaacact 479  T
Q  420 tcttctcatc-tcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttct 518  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||    ||||| ||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  478 tcttctcatccttggt-acaaacatcactcttgtggcctttcctgccacatttgtaacaaacgatctcagcaggagcatctctcctattgggcctcctct 380  T
Q  519 catcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatg 618  Q
    ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  379 catcattcaatatctgctttcccttgtcagcaggggcactgtacggcttagggtgactctgttgtcccttacctcttcgttcactcatcaccttataatg 280  T
Q  619 agcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  279 agctttggtgtcctcctcgtagatcctacaactactcaccaaatcagagaagattcttatcttctgatagccaatggctctcttgat 193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 39723 - 39038
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39723 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 39624  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39623 atcagatacatccaaacccaacttatatgcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaag 39524  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |    | |||||||| ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| |  || |||||||    
T  39523 aaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggtcctaaccttcttcgattgtgtacact 39424  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
     |||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||  || || |||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39423 gcgaactgatacgaccttcctcattgcagttatagcaaacaacatctccccgcttacaattagctaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcactt 39324  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39323 cttctcatctttatcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctctca 39224  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||||||  || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||   | ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39223 tcattcagcctctgctttcccttgtcagcaggagcactatatggtttaggaagactctgctgtcccttacctcttcgttcactcatcaccttgtaatgag 39124  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| ||||||||  |||| |||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  39123 ctttagtatcttcctcatatatcctgcagctactcaccaactcagaaaa--ttctaatcttctggtacccaatggctctcttgatgtc 39038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 44818 - 44656
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44818 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagttggagtttcaacaaccatttcccctttca 44719  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcac 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  44718 tatcagatacaaccagacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcac 44656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Original strand, 4839 - 5083
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||| ||||||  ||||  ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  || | |    
T  4839 accaaacaaagacaaaggacatgttaaacacacaagagaagtagttactaaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatttgacata 4938  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || | |||||||||| | |||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  || ||| |||  |||| ||||    
T  4939 acaaaacccaacttagaagcacaatcaatagaaataaaacaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtatactatcaaaataacatgtac 5038  T
Q  231 ctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaag 275  Q
    |||| || | ||  ||||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  5039 ctctaattaatcgatcctcattctctgtctgcgtaccagtcaaag 5083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Original strand, 14382 - 14554
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| | | | ||||||||   | |  | ||||| | |||||    
T  14382 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcataccagacaaatcaagacccaaagcagaaacgcaatcgaaagcaa 14481  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | || ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  14482 taaagcaatgcgtagcaccaatatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 14554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 567
Target Start/End: Original strand, 14753 - 14884
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || | |||||||||  || |||| |||| | | |||||   || ||| ||     
T  14753 acaaacattactcttgtggccattctcgccacacttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcatatcatcgaccattctctgt 14852  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggctt 567  Q
    || || || ||||||||||||||||| |||||    
T  14853 ttgcccttatcagcaggggcactataaggctt 14884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 705
Target Start/End: Original strand, 5244 - 5513
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||  || | |||||||| |||| |  | ||||| || |  | |||||| |||||||||| | ||| ||     
T  5244 acaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaatctcagcaacaacatctttctttctaggcctcatctcatcattaactctttgt 5343  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    || || || |||||||| ||||  || |||||   |||||| || || ||||||||| | | |||| |||  |||||||||||||| || ||||| || |    
T  5344 ttgcccttatcagcaggagcaccgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcct 5443  T
Q  636 cataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||| || || ||| |||| ||||| ||||||||||| |  |||||||  |||||||| |||| ||||||    
T  5444 catatattctgcaattgctcaccaactcagaaaagttacggatcttctagtaaccaattgcccgcttgat 5513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 180648 - 180563
Alignment:
Q  602 ctcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgata 687  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || || || || |||| ||| || ||  |||| |||||||||||    
T  180648 ctcatcaccttgtaatgagccttcgtatcctcctcataaattctgcagctactcaccatttctgagaaaattctgatcttctgata 180563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 1663 - 990
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1663 tcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtaattactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccattca 1564  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1563 tatcagacataatcagacccaacttatatgcacaattaacaacaatgaaacaatgtgtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 1464  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | | |||    
T  1463 gaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattagtagttttcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcagagccttcttaggcttcctgcac 1364  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||  | |||||||| || || |   | |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| | || ||||||||||||   ||||| | ||| ||||    
T  1363 tgagagctaatatgaccctcttcatcacaattgtagcacacaatatcaccacgcttacactcagccaatgtgtgtcctttcttcccacatcggaaacact 1264  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  1263 tcttctcatcacggtcacatacattacccttgtggcctttttcaccacatttaaaacagacaatcttagtaggagcatctctcctcctaggcctcctctc 1164  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1163 atcattcagtctctgcttacccttgtcaacaggagcactatacggtttcggacgactctgctgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttataatga 1064  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaat 693  Q
    |||||||| ||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||    
T  1063 gcttttgtgtcctcctcatatattctgcagctactcaccaaatcagagaaattccttatcttttggtaaccaat 990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 28676 - 28003
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28676 tcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtaattactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccattca 28577  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28576 tatcagacataatcagacccaacttatatgcacaattaacaacaatgaaacaatgtgtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 28477  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | | |||    
T  28476 gaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattagtagttttcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcagagccttcttaggcttcctgcac 28377  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||  | |||||||| || || |   | |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| | || ||||||||||||   ||||| | ||| ||||    
T  28376 tgagagctaatatgaccctcttcatcacaattgtagcacacaatatcaccacgcttacactcagccaatgtgtgtcctttcttcccacatcggaaacact 28277  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  28276 tcttctcatcacggtcacatacattacccttgtggcctttttcaccacatttaaaacagacaatcttagtaggagcatctctcctcctaggcctcctctc 28177  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28176 atcattcagtctctgcttacccttgtcaacaggagcactatacggtttcggacgactctgctgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttataatga 28077  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaat 693  Q
    |||||||| ||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||    
T  28076 gcttttgtgtcctcctcatatattctgcagctactcaccaaatcagagaaattccttatcttttggtaaccaat 28003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 3)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 10163 - 9477
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10163 tcaaagtctctactaaacatagacaacggacatcttagacaaactagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttca 10064  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10063 tatcagatacaaccagacccaacttataagcaaattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 9964  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||| |    | |||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||     
T  9963 gaaacaagtacctttgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggttgcgtacat 9864  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| | ||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||  || || ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9863 tgtgaacttatatggccctcctcattgcagttatagcaaacaacatctccccgcttacaatcaactagggtgtgtcctttctgaccacacctgaagcact 9764  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    ||||||||||    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  9763 tcttctcatccttatcacagacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatatcagcaggagcatctctcctgtttggcctcctctc 9664  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    ||||||||  || ||||| || || |||||| | |||||||| || ||   | ||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||| ||    
T  9663 atcattcatcctttgctttcccttatcagcaagagcactatatggtttaggatgactctgctgtcctttacctcttcgttcactcatcaccttgtaaaga 9564  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    || || |||||||| ||||  ||||| || || || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  9563 gccttagtatcctcctcat--atcctgcagctactcaccaactcagagaagattcttatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 9477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24323 - 24119
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| || | ||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  || | | |    
T  24323 caaacatagacaaaggacatctcaaacgcacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatttgacatagc 24224  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||| ||||||   |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||||    
T  24223 aagacctaacttagtagcacaatcaatagcaataaaacaatgcgtagcactagtatcaataatagcaactaaaggtgtactatcaaaataacaagtacct 24124  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  24123 ctgat 24119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 614 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 23742 - 23686
Alignment:
Q  614 taatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaag 670  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  23742 taatgagccttggtatcctcctcataaatcctgcaactgcttaccagctcagaaaag 23686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 22 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 5598 - 4912
Alignment:
Q  22 aaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcata 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5598 aaagtctctaccaaacatagacaacagacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcata 5499  T
Q  122 tcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaaga 221  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5498 ttagatacaaccagacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagcgtctataatagcaattaaaggagtactattaaaga 5399  T
Q  222 aacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacacta 321  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |    | |||||||| ||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||||| || |  ||||||||    
T  5398 aacaagtacctctgataagtcgatcctcagtagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggttctaaccttcttcggttatgtacacta 5299  T
Q  322 cgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttc 421  Q
     ||| ||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||  || |  |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5298 tgaactgatatggccctcctcattgcagttatagcaaacaacatctctccgcttacaatcagctaaagtgtgtcccttctgaccacacctgaagcacttc 5199  T
Q  422 ttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcat 521  Q
    ||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| | |||| | ||||||    
T  5198 ttctcatccttatcacagacattactcttgtggcctttttcgccacacttgtagcaaacaatctcagcaggagcatctctcctcctaggccacctctcat 5099  T
Q  522 cattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagc 621  Q
     |||||  || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||   ||||||||  | ||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5098 tattcagcctttgctttcccttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctactttcctttacctcttcgttcactcatcaccttgtaatgagc 4999  T
Q  622 ttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||| || || || ||||| ||| | || || || ||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  4998 tttagtgtcttcctcatatatcatgcagctactcaccaattcagagaaaattctaatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 4912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 11 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 8862 - 8165
Alignment:
Q  11 agatggacatcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8862 agatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 8763  T
Q  111 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  8762 ctcctttcatatcagatacaaccagacctaacttataagcacattcgatagcaatgaaacattgagtagcactagtgtctataatagcaattaaaggatt 8663  T
Q  211 attattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggc 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    |  ||||||| |||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||     
T  8662 actattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggt 8563  T
Q  311 tgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacc 410  Q
    ||  | |||| |||| ||||||| || |  || ||| |||| || ||||||| ||| |||||||| |||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  8562 tgattgcactgcgaactgatatggccctattcattgcagttataacaaacaacgtcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcccttctgaccacacc 8463  T
Q  411 tgaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgg 509  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| || || ||||||||  ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  8462 tgaaacacttcttctcatccttagt-acaaacattactcttgtggccattctcgccacacttataacaaacaatatcaacatgagcatctctcctcttgg 8364  T
Q  510 gcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcac 609  Q
    | ||| ||||||||||||  || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  8363 gtctcctctcatcattcagcctctgctttcccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcccctgcggtcactcatcac 8264  T
Q  610 cttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||||||||||||||  | ||||| ||||| || || || |  |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  8263 cttgtaatgagctttcatgtcctcctcatagattctgcagcaacttaccaattcagagaagtttttgatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 8165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 11 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 19076 - 18379
Alignment:
Q  11 agatggacatcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19076 agatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 18977  T
Q  111 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18976 ctcctttcatatcagatacaaccagacctaacttataagcacattcgatagcaatgaaacattgagtagcactagtgtctataatagcaattaaaggatt 18877  T
Q  211 attattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggc 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    |  ||||||| |||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||     
T  18876 actattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggt 18777  T
Q  311 tgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacc 410  Q
    ||  | |||| |||| ||||||| || |  || ||| |||| || ||||||| ||| |||||||| |||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  18776 tgattgcactgcgaactgatatggccctattcattgcagttataacaaacaacgtcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcccttctgaccacacc 18677  T
Q  411 tgaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgg 509  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| || || ||||||||  ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  18676 tgaaacacttcttctcatccttagt-acaaacattactcttgtggccattctcgccacacttataacaaacaatatcaacatgagcatctctcctcttgg 18578  T
Q  510 gcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcac 609  Q
    | ||| ||||||||||||  || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  18577 gtctcctctcatcattcagcctctgctttcccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcccctgcggtcactcatcac 18478  T
Q  610 cttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||||||||||||||  | ||||| ||||| || || || |  |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  18477 cttgtaatgagctttcatgtcctcctcatagattctgcagcaacttaccaattcagagaagtttttgatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 18379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 2)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 22 - 687
Target Start/End: Original strand, 6953 - 7618
Alignment:
Q  22 aaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcata 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6953 aaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcata 7052  T
Q  122 tcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaaga 221  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7053 tcagaaacaaccaaacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaaga 7152  T
Q  222 aacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacacta 321  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |    | |||||| | ||| | ||||||||| || ||||| ||||||| |||||| |||| | | || |     
T  7153 aacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtgccagttagagcaaacactttaccaccggtcctaatcttcttgggcttcttgcattg 7252  T
Q  322 cgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttc 421  Q
    |||  | ||||| || || || |   |||| || |||||||  || |||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7253 cgagctaatatgcccctcttcatcatagttataacaaacaacatcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttc 7352  T
Q  422 ttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcat 521  Q
    |||||||||     |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7353 ttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctattgggcctcctctcat 7452  T
Q  522 cattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagc 621  Q
    ||||||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||  || || |||||||||||||||||||||||    
T  7453 cattcaacctctgcttacccttgtcaacaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgctccttcgatcactcatcaccttgtaatgagc 7552  T
Q  622 ttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgata 687  Q
    ||| || ||||| ||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  7553 tttcgtgtcctcctcatagattctgcagctacttaccaattcagagaagttcctgatcttctgata 7618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 653 - 708
Target Start/End: Original strand, 3 - 58
Alignment:
Q  653 cttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  3 cttaccaattcagagaagttcctgatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 58  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 307; Significance: 1e-172; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 11 - 705
Target Start/End: Original strand, 5506 - 6200
Alignment:
Q  11 agatggacatcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5506 agattgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaagtcaaacaaataagagaagtagttactaaacccttagctggagtttcaacaaccattt 5605  T
Q  111 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 210  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5606 ctccattcatatcagacataaccagacccaacttatatgcataaacaacaacaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 5705  T
Q  211 attattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggc 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | | |||||||||| ||||||| || | ||||||||||||     
T  5706 actattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcactgtttgcgtaccaattagagcaaacaccatgccaccggttcgaaccttcttaggt 5805  T
Q  311 tgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacc 410  Q
    | | | ||||||||  | || || || || || |   | || || |||||||  ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| | ||||| |    
T  5806 ttcttgcactacgagctaatgtgtccctcttcatcacaattataacaaacaacatccccacgcttgcaatcagctaatgtgtgtcctttctgtccacatc 5905  T
Q  411 tgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttggg 510  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | ||| |||| |||||||||||| | ||    
T  5906 tgaaacacttcttcttatctcaatcacacacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaaatagacagtctcattaggggcatctctcctcctagg 6005  T
Q  511 cctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcacc 610  Q
    |||| ||||||||||||   | || || || ||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||     
T  6006 cctcctctcatcattcagcatctgttttcctttgtcagcaggagcactatacggtttcggacgactctgctgacccttacctctgcgctcactcatcact 6105  T
Q  611 ttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||| || || || || |||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  6106 ttataatgagctttcgtatcctcttcatatattctaaagctgcttaccaaatccgagaaattccttatcttttgataaccaatggcccgcttgat 6200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 297; Significance: 1e-166; HSPs: 3)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 233 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 62950 - 62478
Alignment:
Q  233 ctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatat 332  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  62950 ctgataagtcggtcctcattcactgtttgcgtaccagtcaaagcaaacactttgccacctgtcctaactttcttaggctgcgtacactgcgaactgatat 62851  T
Q  333 gaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcg 432  Q
    ||||||  || ||  |||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  62850 gaccttattcattacagttgtagaaaacaacatccccacgcttacaatcagctaaagtgtgtactttctgaccacacctaaagcacttcttctcatcatg 62751  T
Q  433 gtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatcta 532  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  62750 gtcacatacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaattaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcaatctc 62651  T
Q  533 tgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcct 632  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  62650 tgcttacccttgtcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgctgccccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcct 62551  T
Q  633 cttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  62550 cttcatatatcctgcagctacttaccaactcagagaaattccttatcttttgatagccaatagccctcttgat 62478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 20 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 65689 - 65211
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| |||||||||||||| || |   |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65689 tcaaaatctctaccaaacatggatataggacaccttaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 65590  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  65589 tatcagatacaatcaaacccaacttatatgcacattctaaagcaaggaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggtgtactattaaa 65490  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    |  ||||||| |||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || |||    
T  65489 gaaacaagtacctctgataagcctgtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaatgcatacacttttccaccggtcctaaccttctttggctgggtgcac 65390  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| |||| || |||||||| |   | || || |||||||  || || | |||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  65389 tgtgaactgatgtggccttcctcatcacaattataacaaacaacatctcctctcttacaattagccaacgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcact 65290  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    | |||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  |||| |||||||||    
T  65289 ttttctcatctttggtacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaacaacctcagcaggagcatc 65211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 519 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 65214 - 65028
Alignment:
Q  519 catcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatg 618  Q
    ||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||| ||    || | |||||||||||||||||||||    
T  65214 catcattcagtctctgcttgcccttatcagcaggggcactatatggcttcgggcgactctgttgtccattattccttctctcactcatcaccttgtaatg 65115  T
Q  619 agcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||||||    
T  65114 agcttttgtatcctcttcataaattctgcagctactcaccaactcagagaaatttctgattttctgataaccaatggctctcttgat 65028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 292; Significance: 1e-163; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 21 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 30716 - 30077
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  30716 caaagtctctaccaaacatagacaacggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattacccctttcat 30617  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  30616 atcagatacaaccaaacccaacttatatgcacattcaatatcaatgaaacaatgagtagcaccaatatctataatagcaattaaaggagtacttttaaag 30517  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||   ||  ||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  30516 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcatttgttgtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggtcctagccttcttcggctgagtacact 30417  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
     |||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||   |||||||||||  ||||||||| || || ||    
T  30416 tcgaactgatatgaccttcttctttgcagttgtagcatacaatgtccccattcttacattcagctagtttgtgtcctttcttaccacacctaaaacattt 30317  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | ||| |||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  30316 cctcttatctctaccacaagcattgctcttgtggcctttttcaccacacttataacaaacaatctcagcaggagcatctttcctcttgggcctcctgtca 30217  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||||||   | || || || ||||||||||| ||||| || || ||   |||| |||||| |||||| || || | ||||||||| | || ||||||||    
T  30216 tcattcatcttctgtttccctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgttatcccttacccctcctctcactcattatctagtaatgag 30117  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaa 660  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  30116 cttttgtgtcctcctcatatatcctgcagctgcttaccaa 30077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2062 (Bit Score: 287; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold2062
Description:

Target: scaffold2062; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 163 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 1125 - 575
Alignment:
Q  163 aatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgc 262  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |   || ||||    
T  1125 aatgaaacaatgagtaacactagtgtctataatagcaattaaaggcgtattattaaagaaacaagtacctctgataagtctgtccttactagttgtttgc 1026  T
Q  263 gtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattga-----tatgaccttcctcgttgaagttgtagca 357  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||| |||| |||     | ||||||||||||||| |||| |||||    
T  1025 gtaccagtcaaagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggttgtgtacactgcgaactgaactgatgtgaccttcctcgttgcagttatagca 926  T
Q  358 aacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcct 457  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  925 aacaatgtcaccacgcttacaatcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacatgaagcacttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcct 826  T
Q  458 ttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcac 557  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| | ||    
T  825 ttttcaccacacttgaagcaaacaatatccataggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcagtcgctgcttacccttgtcagcaggagtac 726  T
Q  558 tatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttac 657  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  725 tatatggcttcggacgactctgttgtcccttacctctacattcactcatcaccttgtaatgagatttcgtgtcctcctcataaatcctacagctggttac 626  T
Q  658 caattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||| ||| ||||| |||||  ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  625 caatttagagaagttccttattctctgatagccaatggctctcttgatgtc 575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 21 - 694
Target Start/End: Original strand, 10891 - 11564
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    ||||||| |||||||||||||| |   |||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10891 caaagtccctaccaaacatagatataggacaccccaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagttggagtttcaacaagtatttctcctttcat 10990  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||  || | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10991 atcagatacaatcaaacccaacttatatgcactttctaaaaaaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaag 11090  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |  ||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  11091 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaatagtctgcgtaccagtcaacgcaaacaccttccctccggtcctagccttcttcggctgagtacact 11190  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||  |||||||||| || || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  | |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11191 gtgagctgatatgaccctcttcattgcagttgtagcagacaatgtccccacgcttacattcagctagtgcgtgtcccttctgaccacacctgaagcactt 11290  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | |||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| | |||    
T  11291 cctctcatctctaccacaagcattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggactcctatca 11390  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    ||||||||  | ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||   |||| |||| || ||||| || || | ||||||||| | |||||||||||    
T  11391 tcattcaaaatctgctttcctttgtcagcaggagcactataaggcttaggacgaatctgctgacccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgag 11490  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaata 694  Q
    |||| || || || ||||||||||| || ||| ||||||| ||||| |||  ||| |||| |||||| ||||||    
T  11491 ctttggtgtcttcctcataaatcctgcagctgtttaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaata 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Original strand, 22035 - 22723
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22035 tcaaaatctctaccaaacatagacaatggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacacttagctaaagtttcaacaaccatttctcctttca 22134  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22135 tatcagatacaaccaaacccaacatatatgcacattcaatagcaatgaaacaatgagtaacaccagtatctataataccaattaaaggagtactattaaa 22234  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    |  || |||| |||||| ||||||||  | ||| | || ||||||||||| ||||| || |||    
T  22235 gaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattagtagtctgagtaccagtcaatgcaaacactataccaacggttctaaccttcttcggctgtgtgcac 22334  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| ||||||| || || || ||| |||| ||||||||||  || |||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  22335 tgagaactgatatggccctcttcattgcagttatagcaaacaacatcaccacgcttgcaatcaactagggtgtgtcctttctgaccacacttgaagcatt 22434  T
Q  420 tcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttct 518  Q
    ||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  22435 tcttctcatccttagt-aaaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaacgatctcaacaggagcatctctcctattgggcctcctct 22533  T
Q  519 catcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatg 618  Q
    ||||||||| ||| || || || ||||| ||||||||||| || || ||   | ||||||  |||||||| || || ||| ||||||||||| | |||||    
T  22534 catcattcagtctttgatttcctttgtcggcaggggcactgtatggtttaggaagactctactgtcccttaccccttcgcccactcatcaccatataatg 22633  T
Q  619 agcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  22634 agcttttgtgtcctcctcatagattctgcagctacttaccaaatcagagaaaattcttatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 22723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 22 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 164790 - 164107
Alignment:
Q  22 aaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcata 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  164790 aaagtccctaccaaacatagacaatagacaccttagataaacaagagaagtagttattgaaccatttgctggagtttcaacaaccatttcccctttctta 164691  T
Q  122 tcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaaga 221  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  164690 tcagatataaccagacccaacttataagcacattcaatggcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaaga 164591  T
Q  222 aacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacacta 321  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |    |  | |||||  ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| ||| | |     
T  164590 aacaagtacctctgataagtcggtcctcactagtagtctacgtaccggtcaatgcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggctgagtataatg 164491  T
Q  322 cgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttc 421  Q
    |||| ||||||| ||||| || ||| |||| || |||||||  |  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  164490 cgaactgatatggccttcttcattgcagttataacaaacaacattaccacgcttgcaatcaactaaagtgtgtcctttctgaccacacctgaaacacttc 164391  T
Q  422 ttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcat 521  Q
    ||||||||      |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || |||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  164390 ttctcatccttagaacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaacgatctcagcaggagcgtctctcctattgggcctcctctcat 164291  T
Q  522 cattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagc 621  Q
    ||||||| || || || || ||||||||||||||||| || |  ||   ||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  164290 cattcaacctctgttttcccttgtcagcaggggcactgtatgatttaggacgactctgctgtcctttacctcttcgttcactcatcaccttgtaatgagc 164191  T
Q  622 ttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||| || | ||| ||||| ||||| || || || ||||| || || ||  |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  164190 tttcgtgttctcctcatatatcctgcagctactcaccaactcggagaaaattctgatcttctgatacccaatggctctcttgat 164107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 65 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30920 - 30770
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||   | | |||||||||| |||||    
T  30920 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaaacaagacccaaagcagaagcacaatcaaaagcaa 30821  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattat 215  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  30820 taaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattat 30770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 47360 - 47155
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| | |      
T  47360 caaacatagacaaaagacaccttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacc-ttagatggagtttcgacaaccatctctccattcatattagacataga 47262  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| || |||||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  47261 aagacccaacttagtagcacaatcaatagcaataaaacaatgtgtagcaccagaatcaataatagtaactaaaggtgtactattaaaataacaagtacct 47162  T
Q  233 ctgataa 239  Q
    |||||||    
T  47161 ctgataa 47155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 145
Target Start/End: Original strand, 152007 - 152119
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||    
T  152007 caaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattcatatcagacatgac 152106  T
Q  133 cagacccaactta 145  Q
     ||||||||||||    
T  152107 aagacccaactta 152119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 30549 - 30487
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||||||    
T  30549 acaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatc 30487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 22 - 708
Target Start/End: Original strand, 53962 - 54648
Alignment:
Q  22 aaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcata 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  53962 aaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacacaagagaagtagttaatgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctacattcata 54061  T
Q  122 tcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaaga 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54062 tcagatacaaccagacacaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtaacaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaaga 54161  T
Q  222 aacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacacta 321  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |    | |||||||| ||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||| || || || || |||      
T  54162 aacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtgaaagcaaacactttaccactggtcctaacctttttcggttgtgtgcaccg 54261  T
Q  322 cgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttc 421  Q
     ||  |||||||||| || || ||| |||| || |||||||  || |||||||| |||| | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  54262 tgagctgatatgaccctcttcattgcagttataacaaacaacatcaccacgcttgcaataagctagagtgtgtcccttctgaccacacctgaaacacttc 54361  T
Q  422 ttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcat 521  Q
    |||||||||     |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || |||| | |||||| ||  || ||||||||| ||||||    
T  54362 ttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaacgatctcagcaagagcatttcatctattgggcctcctctcat 54461  T
Q  522 cattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagc 621  Q
    ||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||  || || |||||||||||||| ||||||||    
T  54462 cattcaacctctgcttccctttgtcagcaggagcactatacggctttggacgactctgatgtcctttgctccttcgatcactcatcaccttataatgagc 54561  T
Q  622 ttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||  | ||||| ||||| || || || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  54562 tttcatgtcctcctcatagattctgcagctacttaccaattcagagaagtttctgatcttctgatacccaatggctcttttgatgtc 54648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 21 - 705
Target Start/End: Original strand, 251536 - 252217
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  251536 caaagtctctaccaaacatagacaatggacatctcaagcaaactagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 251635  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  251636 atcagatacatccaaacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcactagtatctataatagcaattaaagaagtactattaaag 251735  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||    |  ||||||| |||| | |||||||| |  ||||| |||||| |||||   ||||| |||||||    
T  251736 aaacaagtacctctgataagccggtcctcattagtagtctgcgtaccagtccatgcaaacacttccccaccggtcctagccttc---ggctgagtacact 251832  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||| || || ||    
T  251833 gtgaactgatatgaccttcttcgttgcagttttagcaaacaatgtctccacgcttacattcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctaaaacattt 251932  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | |||||||||   ||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  251933 cctctcatctctaccacaagcatagcttttgtggcctttttcaccacacttgaaacacacaatctcaacaagagcatctctcctcttgggcctcctatca 252032  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||||||   |||| || ||  || ||||||| ||||| || || ||   |||| | ||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||    
T  252033 tcattcatcttatgttttcctgtggcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattatgttgtcccttacccctcctctcactcatcaccttgtaatgag 252132  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| | |||||| || |||||    
T  252133 ctttggtgtcttcctcatatatcctgcagctgcttaccaattcagagaaaattctaatcttctgatacctaatagctcttttgat 252217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 230093 - 230026
Alignment:
Q  170 caatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  230093 caatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 230026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 229827 - 229765
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||    
T  229827 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaaacaatctccgcaggagcatc 229765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 20 - 448
Target Start/End: Original strand, 11873 - 12301
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11873 tcaaagtatctaccaaacatagacaacggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccattca 11972  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11973 tatcagacataaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcgccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 12072  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12073 gaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcacagtttgcgtaccagtcaacgcaaataccttgccacctgtccgaaccttcttaggctgcgtacac 12172  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| | ||||| ||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||    
T  12173 tgtgaactaatatgtccttcttcattacagttgtagcaaacaatatccccacacttgcaatcagccaatgtgtgtcctttctgtccacatctgaaacact 12272  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactc 448  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12273 tcttctcatctcggtcacatacattactc 12301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 485 - 584
Target Start/End: Original strand, 12322 - 12421
Alignment:
Q  485 tcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtc 584  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||  || || ||| | ||||||||||| ||||||||||  |||  ||||||||| ||||    
T  12322 tcagtaggagcatctctcctctaaggcctcctctcatcattcagcctctgtttatctttgtcagcaggagcactatacgatttcggacgactctgctgtc 12421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 21 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 514743 - 514068
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  514743 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccccagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 514644  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  514643 atcagatacatccaaacccaacttataagcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaag 514544  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || |  | |||||    
T  514543 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacaccttgcccccagttctaaccttcttcggttcaggacact 514444  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| |||||||||| ||  | ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  514443 gtgaactgatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaatgtccccacacttacattcagttaagctgtgtcccttctgaccacacctgaagcactt 514344  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | |||| |||    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  514343 cctctcgtctttaccacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatca 514244  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||||||   | | ||| || ||||||||||| ||||| || |||||   |||| |||| |||||||| || || | ||||||||| | |||||||||||    
T  514243 tcattcatcttcttctttcctttgtcagcaggagcactttaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgag 514144  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagc 696  Q
    |||| || || ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||  ||| |||| |||||| ||||||||    
T  514143 ctttggtgtcttcttcataaattctacacctgtttaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagc 514068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 211
Target Start/End: Original strand, 441572 - 441757
Alignment:
Q  26 tctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcag 125  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |    
T  441572 tctctaccaaacatagataaaggacatcttagacacactagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattcatatttg 441671  T
Q  126 atacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagta 211  Q
    | | |   |||||||| ||| | |||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  441672 acatagtaagacccaatttagaagcacaatcaagagcaataaaacaatccgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagta 441757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 279
Target Start/End: Original strand, 495939 - 496192
Alignment:
Q  26 tctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcag 125  Q
    |||| |||||||||||||||   ||| |||| | | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  |    
T  495939 tctcgaccaaacatagacaaagaacatcttaaaaacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatttg 496038  T
Q  126 atacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaaca 225  Q
    | | | | |||||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||  || ||| |||  ||||    
T  496039 acatagcaagacccaacttcgaagcacaatcaatagcaataaaacaatgtgtagcactagtatcaataatagcaactaaaggtctactatcaaaataaca 496138  T
Q  226 agtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaa 279  Q
     ||||||||||| |  |  ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||    
T  496139 tgtacctctgatcaaacgatcctcattctctgtctgcgtaccagtcaaagcaaa 496192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 609 - 693
Target Start/End: Original strand, 442154 - 442238
Alignment:
Q  609 ccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaat 693  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||| |||||||||||| |  ||||| ||||| |||||    
T  442154 ccttgtaatgagctttagtatcttcctcatagattctacagctgctcaccagttcagaaaagttacgaatcttatgatacccaat 442238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 277; Significance: 1e-154; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 552
Target Start/End: Original strand, 325620 - 326151
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  325620 tcaaagtctctaccaaacatagacaacagacatcttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttca 325719  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  325720 tatcagatacaaccagacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtaatattaaa 325819  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |    | |||||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || |||    
T  325820 gaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcaaagcaaacactttaccaccggttctaaccttctttggttgtgtgcac 325919  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| ||||||| || || || ||| |||| || |||||||  || || |||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  325920 tgtgaactgatatggccctcttcattgcagttataacaaacaacatctccccgcttacaattagctaatgtgtgtcctttctgaccacacttgaagcact 326019  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  326020 tcttctcatctttatcacagacattactcttgtggtctttctcgccacacttgtagcaaacaatctcagcaggagcatctctcctatt-ggcctcctctc 326118  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcagg 552  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| ||||||    
T  326119 atcattcagcctctgcttacccttgttagcagg 326151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 20 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 200859 - 200338
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  200859 tcaaaatctctaccaaacatagacaacagacaaatcaaacaaacgagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccactca 200760  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||   || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  200759 tacttgacataaccagacccaacttatatgcacaatcaacaacaatgaaacaatgtgtagcactagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaa 200660  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |  ||||||| |||         |||||| ||||||| |  |||| ||||||||| | | |||    
T  200659 gaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaaccgtctgcgtaccagt---------cacctttccacctgcctgaaccctcttaggcttcttgcac 200569  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||| | | ||||||||| ||||   | ||| |||||||||| || |||||||| || ||  |||  || || ||||||   ||||| | ||||||||    
T  200568 tgcgaactaagatgaccttcttcgtcacaattgaagcaaacaatatcaccacgcttgcattccgctatcgtatgccctttcttcccacatcggaagcact 200469  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||| |  |  |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| ||| ||||| | ||||| ||||| || ||| ||||    
T  200468 tcttctcatcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctcattaggaacttctcttctcttaggtctcctctc 200369  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagca 550  Q
    |||||||||||| | ||| || |||||||||    
T  200368 atcattcaatctttacttccctttgtcagca 200338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 371 - 708
Target Start/End: Original strand, 319507 - 319844
Alignment:
Q  371 cgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacact 470  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  319507 cgcttacaattagctaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttatcacagacattactcttgtggcctttctcgccacact 319606  T
Q  471 tgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttcta 570  Q
    || | ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||      
T  319607 tgtagcaaacaatcccagcaggagcatctctcctattgggcctcctctcatcattcagcctctgcttatccttgtcagcaggagcactatacggcttcgg 319706  T
Q  571 acgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaag 670  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || |||||||||||||| |||    
T  319707 acgactctgctgtcctttgccccttcgatcacttatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataaattctgcagctacttaccaattcagagaag 319806  T
Q  671 tttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||  ||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  319807 ttctttatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 319844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 272; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 21 - 708
Target Start/End: Original strand, 375 - 1062
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  375 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccccagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacgaccatttcccctttcat 474  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  475 atcagatacatccaaacccaacttataagcacattcaatagcaataaaacaatgactagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaag 574  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || |  | |||||    
T  575 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacaccttgcccccagttctaaccttcttcggttcaggacact 674  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| | |||||||| ||  | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  675 gtgaacttatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaatgtccccacgcttacattcagctaaattgtgacccttctgaccgcacctgaagcactt 774  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | ||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  775 cctctcatctttaccacaaacattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatca 874  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    ||| ||||  | | ||| || ||||||||||| ||||| || |||||   |||| |||| |||||||| || || | ||||||||| | |||||||||||    
T  875 tcaatcaacttctactttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgag 974  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||| || || ||||||||||| || || ||| | ||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||   |||||| || ||||||||    
T  975 ctttggtgtcttcttcataaattctgcatctgttaaccaactcagagaagattctgatctgctgatactgaatagctcttttgatgtc 1062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 3)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 229 - 705
Target Start/End: Original strand, 5562 - 6035
Alignment:
Q  229 acctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattg 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  5562 acctctgataagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagtcaacgcaaacactttgccacctgtcctaaccttcttaggttgcgtacactgcgaactg 5661  T
Q  329 atatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcat 428  Q
    ||||||||||| || ||  | |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5662 atatgaccttcttcattacaattgtagcaaacaacatccccacgcttacaatcagctaaagtgtgtcctttctgaccacacctaaagcacttcttctcat 5761  T
Q  429 ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaa 528  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  5762 ctcgatcacacacgttactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaattatctcagtaggagcatctctcctcttaagcctcctctcatcattcaa 5861  T
Q  529 tctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgta 628  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||   ||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  5862 tctctgcttacccttgtcagcaggg---ctatacggcttcggacgactatgttgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaataagctttcgta 5958  T
Q  629 tcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5959 tcctcttcatatatcctgcagctacttaccaattcagagaaattccttatcttttgatagccaatagccctcttgat 6035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Original strand, 2775 - 2998
Alignment:
Q  11 agatggacatcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 110  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2775 agatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 2874  T
Q  111 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2875 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaagcaacaacaatgaaacaatgagtagccccagtatctataatagcaattaaaggagt 2974  T
Q  211 attattaaagaaacaagtacctct 234  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  2975 actattaaagaaacaagtacctct 2998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 186 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 11968 - 11484
Alignment:
Q  186 tatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacacctt 285  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  11968 tatcaataatagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcactggtagtttgcgtaccagtcaaagcaaacacctt 11869  T
Q  286 gccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaact 385  Q
     ||||| || |||  |||||| || |  | |||||  | | | |||||||||||  | ||| ||||||| || ||||||||||||||||| |  ||| ||    
T  11868 cccaccagttctagtcttcttcggttcaggacactgtgtactaatatgaccttctccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgctttcagct 11769  T
Q  386 aaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatat 485  Q
    ||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||   |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| | || ||||| |    
T  11768 aaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacatacattactcttgtggcctttcttaccacacttgtatcatacaatct 11669  T
Q  486 cagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcc 585  Q
    ||   || |||||||||||||||||| || | ||||||  ||   | ||||| || ||||||||| | ||| | || |||||   |||| ||||||||||    
T  11668 catctggtgcatctctcctcttgggcttcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaagagcaatgtaaggcttaggacgattctgttgtcc 11569  T
Q  586 cttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaag 670  Q
    ||| || || | ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||    
T  11568 cttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaatcctacacctgttaaccaactccgaaaag 11484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 21 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 5535 - 4998
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5535 caaaatctctaccaaacataaacaatggacacctcaagcaaactagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcttttcat 5436  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5435 atcagatacatccatacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaatgagtactattaaag 5336  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  5335 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcatttgtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggtcctagccttcttcggctgagtacact 5236  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  5235 atgaactgatatgaccttcttcgttgcagttgtagcagacaatgtctccacgcttacattcagctagggtgtgtcctttctgaccacacctgaaacattt 5136  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | |||||| ||   ||||| ||||  | ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  5135 cctctcatttctaccacaagcattgtttttgtggcctttttcatcactcttttaacaaacaatttcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatca 5036  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcact 558  Q
    |||||||  || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  5035 tcattcatcctctgcttccctttgtcagcaggagcact 4998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 172 - 705
Target Start/End: Original strand, 51716 - 52249
Alignment:
Q  172 atgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtc 271  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||| ||||    
T  51716 atgagtagcacgagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaagaaataagtacctctgataagtcagtcctcattcacaatctgcgtaccagtc 51815  T
Q  272 aaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccac 371  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||| | |||| |||||| || |   |||| ||| ||||||  || |||     
T  51816 aaagtaaacaccttgccacctgtccgaaccttctttggctgcgtacactgtgaactaatattaccttcttcatcacagttatagaaaacaacatcaccat 51915  T
Q  372 gcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacactt 471  Q
    |||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51916 gcttgcaataagctaaagtgtgtcctttcttaccacacctaaagcacttcttctcatctcgatcacatacattactcttgtggcctttctcaccacactt 52015  T
Q  472 gaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaa 571  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||  || || ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||  |    
T  52016 gaaacagataatctcagtaggagcatctctcctcctaggcctcctctcatcattcagcctctgtttacctttgtcagcaggagcactatacagtttcgga 52115  T
Q  572 cgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagt 671  Q
    || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  52116 cggctctgctgtcccttacctctgcgctcactcatcactttataatgagcctttgtatcctcttcataaatcctacagctgcttaccaattcagaaatat 52215  T
Q  672 ttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  52216 tccttatcttttgataaccaatagcccgcttgat 52249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 666
Target Start/End: Original strand, 263139 - 263785
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |   |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  263139 tcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 263238  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  263239 tatcagatacaatcaaacccaacttatatgcactttctaaagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 263338  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    |  ||||||| ||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||| | ||| || |||    
T  263339 gaaacaagtacctctaataagcctgtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccactagttctaaccttcttcgactgtgtgcac 263438  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  | | ||||||| || || |||||  |||| || || ||||  || |||  ||| |||||  |||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  263439 tgtgtactgatatggccctcttcgttacagttataacatacaacatcaccatccttgcaatccgctaaaaggtgacccttctgaccacacctgaagcact 263538  T
Q  420 tcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttct 518  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||   ||||||| |||    
T  263539 tcttctcatccttggt-acaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacaaactatctcagcaggagcatctctcctaacgggcctcctct 263637  T
Q  519 catcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatg 618  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  263638 catcattcagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactgtacggcttaagacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatg 263737  T
Q  619 agcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcaga 666  Q
    | |||| || ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||    
T  263738 aactttggtgtcctcctcatagatcctgcaacgacttaccaaatcaga 263785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 267; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 231 - 705
Target Start/End: Original strand, 16761 - 17235
Alignment:
Q  231 ctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgat 330  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||| ||| || ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||    
T  16761 ctctgataagtcggtcctcattcacagtttgcataccagacaacgaaaataccttgccacctgtcctaaccttcttagtctgcgtacactgcgaactaat 16860  T
Q  331 atgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatct 430  Q
    ||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16861 atgtccttcctcattacagttgtagcaaacaatatccccacgcttgcaatcagccaatgtgtgtcctttctgaccacacctaaagcacttcttctcatct 16960  T
Q  431 cggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatc 530  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |     
T  16961 cgatcacacacattactcttgtggcctttctctccacacttgaaacaaataatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcagtt 17060  T
Q  531 tatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatc 630  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  17061 tctgcttacccttgtcggcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcctttgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatt 17160  T
Q  631 ctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  17161 ctcttcatatattctacatctgcttaccaattcagaaaaattccttatctattgatagccaatagccctcttgat 17235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 20 - 666
Target Start/End: Original strand, 203294 - 203940
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |   |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  203294 tcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 203393  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  203394 tatcagatacaatcaaacccaacttataagcactttctaaagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 203493  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    |  ||||||| ||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||| | ||| || |||    
T  203494 gaaacaagtacctctaataagcctgtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccactagttctaaccttcttcgactgtgtgcac 203593  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  | | ||||||| || || |||||  |||| || || ||||  || |||  ||| |||||  |||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  203594 tgtgtactgatatggccctcttcgttacagttataacatacaacatcaccatccttgcaatccgctaaaaggtgacccttctgaccacacctgaagcact 203693  T
Q  420 tcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttct 518  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||  |||||||||||||||   ||||||| |||    
T  203694 tcttctcatccttggt-acaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacaaactatctcaccaggagcatctctcctaacgggcctcctct 203792  T
Q  519 catcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatg 618  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  203793 catcattcagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatg 203892  T
Q  619 agcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcaga 666  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||    
T  203893 agctttggtgtcctcctcatagatcctgcaacgacttaccaaatcaga 203940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Original strand, 424266 - 424438
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | | |||| |||   | |  |||||||    ||||    
T  424266 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaatcaagactcaaagcagaaacacaatcgtaggcaa 424365  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  424366 taaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagaaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 424438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 545 - 639
Target Start/End: Original strand, 424746 - 424840
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcata 639  Q
    |||||||||||| | ||||||||   |||||| || |||||||||||  | |||||| ||| || |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  424746 tcagcaggggcattgtacggcttaggacgactatgctgtcccttgcccttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcctcctcata 424840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 20 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 1245 - 764
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1245 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 1146  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1145 tatcatatacaaccagacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 1046  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||| |    | |||| ||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||| | || |||||||||    
T  1045 gaaacaagtacctctgataattcgatcctcactagtggtttgcataccagtcaaagcaaacactttaccaccggttctaaccttcctcggttgcgtacac 946  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| |||||||||| || || ||| |||| || |||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  945 tgtgaactgatatgaccctcttcattgcagttataacaaacaatatcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcact 846  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctct 501  Q
    |||||||||||     ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  845 tcttctcatctttagtacaaacattactcttatggcctttcttgccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctct 764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 542 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 3920 - 3754
Alignment:
Q  542 ttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaa 641  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||  || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  3920 ttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgctccttcgatcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataga 3821  T
Q  642 tcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    | || || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  3820 ttctgcagctacttaccaattcagagaagttcctgatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 3754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 99 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 9333 - 8724
Alignment:
Q  99 caacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagc 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9333 caacaaccatttcccctttcatatcagatacaacctgacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagc 9234  T
Q  199 aattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtccta 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    | |||||||| ||||| ||||||||| || ||||| ||||||    
T  9233 aattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacacattaccaccggtccta 9134  T
Q  299 accttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctt 398  Q
    |||||||| |  || ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||  || || |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  9133 accttcttcgtttgtgtacactgcgaattgatttgaccttcctcattgcagttatagcaaacaacatctccccgcttacaattagctaatgtgtgtcctt 9034  T
Q  399 tccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||| | || || ||||||    
T  9033 tctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttatcacagacattactcttgtggcttttctcaccacacttgtagcaaacaatcttagcagaagcatc 8934  T
Q  499 tctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgc 598  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || || | || |||||| | ||| || ||||| ||     
T  8933 tctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgctttcccttgtctgcaggagcactatatggtttatgacaactctgctatcctttacctcttcgt 8834  T
Q  599 tcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccc 698  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||  |||| | ||||||||| ||||| || |    
T  8833 tcactcataaccttgtcatgagctttagtatcttcctcatatatcctgcagctactcaccaactcagagaaaattctaaccttctgatacccaatggctc 8734  T
Q  699 tcttgatgtc 708  Q
    ||||||||||    
T  8733 tcttgatgtc 8724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 21 - 660
Target Start/End: Original strand, 39972 - 40611
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39972 caaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacagacaagagaagtagttactaaacccttggctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 40071  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40072 atcagatacaatcaaccccaacttatatgcactttctaaagcaataaaacaatgagtagcacctgtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaag 40171  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||    |  ||||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||    
T  40172 aaacaagtacctctaataagacggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggctgtgtgcact 40271  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      | | ||||||| || || |||||| |||| || || ||||  || | |||||| |||||  ||||  |||| || |||  ||||||||||||||||||    
T  40272 gagtactgatatggccctcttcgttgcagttataacatacaacatcacaacgcttgcaatccgctaacatgtgacccttctaaccacacctgaagcactt 40371  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    ||| ||||||  |  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| || || |||| ||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  40372 cttatcatctttggtacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttataacagactatctcagcaggagcatctctcctattcggcctcctctca 40471  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  40472 tcattcagtctttgctttcccttgtcagcaggggcactgtacggtttaggacgactctgttgtcccatacctcttcgctcactcatcaccttataatgag 40571  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaa 660  Q
    ||||||| ||||||| ||| || || ||||  ||||||||    
T  40572 cttttgtgtcctctttatagattctgcaacgacttaccaa 40611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17726 - 17523
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |  |     
T  17726 caaacatagacaag-gacatcttaaacacacaagagaagtagtcagcgagcccttagctggagtttcgacaaccatttctccattcatatcaggcatgat 17628  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||||||||   |||||||||  || |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  17627 aagacccaacttagtagcacaatcataagaaatgaaacaatgcgtagcacctgtatcaataatagcaactaaaggtgtattattaatataacaagtacct 17528  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  17527 ctgat 17523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 21 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 5239 - 4621
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5239 caaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaagagacaagagaagtagttactgaacccttggctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 5140  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5139 atcagatacaatcaaacccaacttatatgcactttctaaagcaatgaaacaatgtgtagcaccagtgtctataatatcaattaaaggagtagtattaaag 5040  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||    |  |||||   ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||| | ||||| |||||||    
T  5039 aaacaagtacctctgataagacggtcctcattagtagtctgcgtcatagtcaaagcaaacacttttccaccggttctaaccttcctcggctgtgtacact 4940  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      | | ||||||| || ||||||||| |||| || || ||||  || |||||||| |||||| ||||  |||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  4939 gagtactgatatggccctcctcgttgcagttataacatacaacatcaccacgcttgcaatcagctaacatgtgacccttctgtccacacctgaagcactt 4840  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    ||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  |||| || || |||| ||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  4839 cttctcatctttggtacaaacattactcttgtggcctttctggccacacttataacagactatctcagcaggagcatctctcctatttggcctcctctca 4740  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||||  ||||||||| ||||| ||   ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4739 tcattcagtctttgctttcccttgtcaaaaggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgag 4640  T
Q  621 cttttgtatcctcttcata 639  Q
     |||||| ||||| |||||    
T  4639 gttttgtgtcctcctcata 4621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 21 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 17874 - 17215
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| |||||||||||||||| |||  |||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17874 caaaatctctaccaaacatagtcaactgactccttaaacagacaagagaagtagttactgaacccttggctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 17775  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||  || | |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17774 atcagatacaatcaaacccaacttatatgcactttctaaagcaatgaaacaataagtagcaccaatgtctataatagcaattaaaggagtactattaaag 17675  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||    |  ||||||| ||||||||||||||  || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  17674 aaacaagtacctctgataagacgatcctcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacattttcccaccagttctaaccttcttcggctgtgtacact 17575  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      | | ||||||| || || |||||| | ||||| || ||||  || |||||| |  ||||  |||| ||||| || ||  || ||||||| ||||||||    
T  17574 gagtactgatatggccctcttcgttgcaattgtaacatacaacatcaccacgcatgtaatccgctaatgtgtgacccttttgatcacacctaaagcactt 17475  T
Q  421 cttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  17474 cttctcatccttggt-acaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttataacaaactatctcagcaggagcatctctcctattcggcctcctctc 17376  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||||| ||| || || || ||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17375 atcattcagtctttgttttcccttgtcagcaggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatga 17276  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatct 680  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||   ||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  17275 gcttttgtgtcctcctcatagatcctgcaacgatttaccaaatcagagaagattctaatct 17215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 20 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 10177 - 9538
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |   |||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10177 tcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgtacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 10078  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10077 tatcagatacaatcaaacccaacttatatgcactttctaaagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 9978  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||| ||    |||||    |  ||||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||| | || |||    
T  9977 gaaacaagtacctctgataag-cctatatcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccaccagttctaaccttcttcggcagtgtgcac 9879  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  | | ||||||| |  || |||||| |||| || || ||||  || |||||||| |||||  |||||  ||| || |||  |||||||||||||||||    
T  9878 tgtgtactgatatggcactcttcgttgcagttataacatacaacatcaccacgcttgcaatccgctaaaaggtgacccttctaaccacacctgaagcact 9779  T
Q  420 tcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttct 518  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||   ||||||| |||    
T  9778 tcttctcatccttggt-acaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacaaactatctcagcaggagcatctctcctaacgggcctcctct 9680  T
Q  519 catcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatg 618  Q
    ||||||| | |||  ||||||| || |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9679 catcattaagtctcagcttacccttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatg 9580  T
Q  619 agcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaa 660  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  9579 agctttggtgtcctcctcatagatcctgcaacgacttaccaa 9538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 56 - 708
Target Start/End: Original strand, 41684 - 42336
Alignment:
Q  56 agacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaat 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |    
T  41684 agacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcatatcagatatatccaaacccaacttataagcacatt 41783  T
Q  156 caacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcac 255  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       
T  41784 caatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattagg 41883  T
Q  256 tgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtag 355  Q
     |  ||||||| |||||||||||||||||| || ||  | |||  |||||| ||||  | |||||  ||| |||||||||||||| | ||| |||||||     
T  41884 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttcccccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaa 41983  T
Q  356 caaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggc 455  Q
    || ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||    
T  41984 cagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattactcttgtggc 42083  T
Q  456 ctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggc 555  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||   | ||||| || ||||||||||| ||    
T  42084 ctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagc 42183  T
Q  556 actatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgctt 655  Q
    ||| || |||||   |||| ||||||||||||| || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || || |||||||| || || || ||  |     
T  42184 actgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcatagattctgcacctatta 42283  T
Q  656 accaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||| ||||| |||  | | |||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  42284 accaactcagagaagactttgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 42336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 20 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 936 - 251
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| || |||||||||||||| |   |||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  936 tcaaaatccctaccaaacatagatagaggacacctcaaacaaacaagggaagtagtcactgaacccttagctgaagtttcaacaaccatctctcctttca 837  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  836 tatcagatacaatcaaacccaacttatatgcacattctaaagcaatgaaacaatgtgtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 737  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||    |  ||||||| |||||| |||||||| || ||||| || |||| |||||| ||||| || |||    
T  736 gaaacaagtacctctgataagcttgtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaacgcaaacactttcccaccggttctaatcttctttggctgagtgcac 637  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| |||| || || ||||| |   | || || |||||||  ||    | ||| || | | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  636 tgtgaactgatgtggccctcctcatcacaattataacaaacaacatcattcctcttgcagttagccaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcact 537  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
    |||||||||||  |  |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  536 tcttctcatctttggtacaaacattacttttgtggcctttctcgccacacttaaagcaaactatctcagtaggagcatctctcctcttgggtcttctctc 437  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    ||||||||  |  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  436 atcattcagccgttgctttcccttgtcagcagggggactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccctccgctcactcatcaccttgtaatga 337  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||||||| ||| || || || || || || ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  336 gcttttgaatcttcctcgtagattctgcagctgcttaccaactcagaaaaagttctgatcttctgatagccaatggccctcttgat 251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 10710 - 10916
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||| |||| || | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| | |    
T  10710 accaaacatagacaatggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatattagacata 10809  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||||||   |||||||||| | |||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||    
T  10810 gcaagacccaacttagtagcacaatcaataacaataaaacaatgcgtagcaccaatatcaataatagcaactaaaggtgtactatcaaaataacaagtac 10909  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  10910 ctctgat 10916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 62 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 6606 - 6002
Alignment:
Q  62 acaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacag 161  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||  || | ||    
T  6606 acaagagaagtagtcactgaacccttagccggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaatcaaacccaacttataagcactttctaaag 6507  T
Q  162 caatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattg 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    |  ||    
T  6506 caatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattatagaaacaagtacctctgataagacggtcctcattagtagtctg 6407  T
Q  262 cgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaaca 361  Q
     |||| |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || || ||||  | | |||| || || |  |||||  | || ||||| |||    
T  6406 tgtaccagtcaaagcaaatacctttccaccagttctaaccttcttctgttgtgtgcactgagtactgatgtggccctattcgttacaattatagcataca 6307  T
Q  362 atgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttt 460  Q
    || || ||||||||||||||| |||    ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||     
T  6306 atatcgccacgcttacaatcagctagcacgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtggcctttc 6208  T
Q  461 tcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactat 560  Q
    || |||||||| |||||||| || ||   ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  6207 tcgccacacttaaaacaaactatctcgacaggagcatctctcctattcggcctcctctcatcattcagtctttgcttacccttgtcagcaggggcactgt 6108  T
Q  561 acggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaa 660  Q
    |||||||   |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||   ||||||||    
T  6107 acggcttaggacgactctgttgtcccttacctcttcgttcactcatcactttataatgagctttggtgtcctcctcataaatcctgcaatgacttaccaa 6008  T
Q  661 ttcaga 666  Q
     |||||    
T  6007 atcaga 6002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 53814 - 53126
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53814 tcaaagtctctaccaaacatagacaatggacatctcaagcaaacaagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 53715  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    | ||||||||||  | ||| |||||||||||||  || | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53714 tttcagatacaattaaacctaacttatatgcactttctatagcattgaaacaatgagtagcaccagtttctataatagcaattaaaggagtactattaaa 53615  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||    |  ||||||| |||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||  || ||     
T  53614 gaaacaagtacctctgataagttggtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaatactttcccaccggttctaaccttcttcggctatgtgcat 53515  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    |  ||| ||||||| || || || ||  |||| || || || | ||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||| || |    
T  53514 tgtgaactgatatggccctcttcattacagttataacataccacgtcaccacgcttgcaatcaactaggatgtgtcctttttgaccacacctgaatcatt 53415  T
Q  420 tcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttct 518  Q
    ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||  ||| | ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  53414 tcttctcatccttagt-acaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaacgatcccagcaagagcatctctcctattgggcctcctct 53316  T
Q  519 catcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatg 618  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||   ||||   || ||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  53315 catcattcaatctctgctttcccttgtcagcaggggcactgtatggtttaggacgaacttgatgtcccttatctcttcgctcactcatcaccttataatg 53216  T
Q  619 agcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||| || || || || ||||| ||||| || || || ||||| || || ||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  53215 agccttggtgtcttcctcatatatcctgcagctactcaccaaatccgagaagattctaatcttttgatacccaatggctctcttgatgtc 53126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 67498 - 66817
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67498 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccccaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 67399  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||||||||  || |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  67398 atcggatacaatcaaacccaacttatatgcactttctaaggcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaag 67299  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||    |  ||| ||| |||||| |||||||| || ||||| || |||||| |||| ||||   |||| |    
T  67298 aaacaagtacctctgatgagtcggtcctcattggtagtctgcataccagtcaatgcaaacacttttccaccagttctaaccctcttcggctcactacatt 67199  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
     |||| | |||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||   ||||||| ||  ||||||||||||| || ||    
T  67198 gcgaactaatatgaccttctccattgcagttgtagcagacaatgtccccaagcttacattcagctaggttgtgtcccttttgaccacacctgaaacattt 67099  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctca 520  Q
    | |||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  67098 cctctcatgtctaccacaaacattgctcttgtggcctttttcaccacacttataacaaacaatctcggaaggagcatctctcctcttgggtctcctatca 66999  T
Q  521 tcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgag 620  Q
    |||||||   | | ||| || |||||| |||| ||||| || |||||   |||| |||| ||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||    
T  66998 tcattcatcatctactttcctttgtcaacaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttgcccctcctctcactcattatcttgtaatgag 66899  T
Q  621 cttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctctt 702  Q
    |||| || || || ||||||||||| || ||| ||||||| ||||| ||   ||| |||| |||||| |||||||| |||||    
T  66898 ctttggtgtcttcctcataaatcctgcagctgtttaccaaatcagagaacactctgatctgctgatacccaatagctctctt 66817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 7)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 314 - 708
Target Start/End: Original strand, 153699 - 154093
Alignment:
Q  314 gtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctga 413  Q
    ||||||| |||| | || ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  153699 gtacactgcgaactaatgtgaccttcctcattgcagttatagcaaacaatgtctccacgcttacaatcagctaatgtgtgtcctttctgaccacacctga 153798  T
Q  414 agcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcct 513  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  153799 agcacttcttctcatctctatcacagacattactcttatggcttttttcaccacacttgaagcaaacaatctcagtgggagcatctctcctcttgggcct 153898  T
Q  514 cttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttg 613  Q
    | |||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||||  | |||| ||||||||||    
T  153899 cctctcatcattcagtcgctgcttacccttgtcagcaggagcactatatggcttcggacgactctgctgtcccttacctctttgttcacccatcaccttg 153998  T
Q  614 taatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  153999 taatgagctttcgtctcctcctcataaatcctacagctgcttaccaactcagagaagtttctaatcttctgataaccaatggctctcttgatgtc 154093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 306
Target Start/End: Original strand, 151480 - 151766
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  151480 tcaatgtctctaccaaacatagacaacggacatcttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 151579  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  151580 tataagatacaaccaaacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcactagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 151679  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttctt 306  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | ||||||| |    | |||||||| ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  151680 gaaacaaatacctctaataagcctgtcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggtcctaaccttctt 151766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23924 - 23707
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||   ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  23924 tcaaaatctcgaccaaacatagacaaagaacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattca 23825  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||  || | | | |||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||    
T  23824 tatttgacatagcaagacccaacttagaagcacaatcaatagcaataaaacaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtactatcaaa 23725  T
Q  220 gaaacaagtacctctgat 237  Q
      |||| |||||||||||    
T  23724 ataacatgtacctctgat 23707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 73841 - 73792
Alignment:
Q  167 aaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  73841 aaacaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 73792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 78222 - 78173
Alignment:
Q  167 aaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  78222 aaacaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 78173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 175760 - 175708
Alignment:
Q  164 atgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  175760 atgaaagaatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 175708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 182054 - 182099
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  182054 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 182099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 368 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 4496 - 4160
Alignment:
Q  368 ccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccac 467  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  4496 ccacgcttacaatcagctaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcatttcttctcatctctatcacaaacattactcttttggcctttctcgccac 4397  T
Q  468 acttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggctt 567  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  4396 acttgaagcaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcatttaaactctgcttacccttgtcagcaggagcagtgtacggctt 4297  T
Q  568 ctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaa 667  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  4296 cggacgactctgttgtcccttgcctctacgttcactcatcaccttgtaatgag-tttcgtatcctcctcataaatcctacagctgcttaccaaatcagag 4198  T
Q  668 aagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  4197 aagtttcttattttctgataaccaatggctctcttgat 4160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17446 - 17240
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||| ||  |||| || | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  17446 accaaacatagataaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 17347  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||  || |  ||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||    
T  17346 tcaagacccaaagtagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatataacaagtac 17247  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  17246 ctctgat 17240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 195217 - 195034
Alignment:
Q  32 ccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaa 131  Q
    ||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||| | ||    
T  195217 ccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaactatctctccaatcatatcagacataa 195118  T
Q  132 ccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattat 215  Q
    | ||||||||  || | |||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  195117 caagacccaaagtagaagcacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattat 195034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 24220 - 24433
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| |||||||||||||| |||||  ||||  | || || || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  24220 caaaatctctaccaaacatcgacaaaggacacttcaggcatactagagaagtagtcactgaacccttagccggggtttcgacaaccatttctccattcat 24319  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    ||  || | ||| ||| |||| ||  |  ||||||||||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |    
T  24320 atatgacataacaagatccaatttcgaaacacaatcaacaacaataaaacaatgtgtagccctagtatctataatagtaattaagggagtactattaatg 24419  T
Q  221 aaacaagtacctct 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  24420 aaacatgtacctct 24433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 191 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 1707 - 1193
Alignment:
Q  191 ataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccac 290  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| |||||| |||||||| || || |    
T  1707 ataatagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttccctc 1608  T
Q  291 ctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagt 390  Q
    | ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||    
T  1607 cggtcctgaccttcttcggctgagtacactgcgaactgatatgaccttcttcattgcagttgtagcaaacaatgtccccacacttacattcagctagggt 1508  T
Q  391 gtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagta 490  Q
    |||||| |||  ||||||||| || || ||| || ||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |    
T  1507 gtgtcccttctaaccacacctaaaacatttcctcacatctctaccacaagcattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagca 1408  T
Q  491 ggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgc 590  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | | || || || ||||||||||| ||||| || |||||   ||||||||| |||||||| |    
T  1407 ggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcattttctgttttcccttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttac 1308  T
Q  591 ctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataacc 690  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||| ||    
T  1307 ctctcctctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcttcctcatatatcctacagctgcttaccaactcagagaagactctgatcttctgataccc 1208  T
Q  691 aatagccctcttgat 705  Q
     ||||| || |||||    
T  1207 tatagctcttttgat 1193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 254 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 441 - 71
Alignment:
Q  254 actgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgt 353  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | |||| | |||||||||||||| ||| |||| |    
T  441 actgtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccaccggtcctaaccttcttcggttgcgtacattgcgaactaatatgaccttcctcattgcagttat 342  T
Q  354 agcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtg 453  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  341 aacaaacaatgtccccacgcttacaatcagctagtgtgtgtcttttctgaccacacatgaagcacttcttctcatctctatcacagacattactcttgtg 242  T
Q  454 gcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggg 553  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || || |||||||| |||||||||||     
T  241 gcctttctcgccacacttgaagcaaacaatatcagtaggagcctctctgctcttgggcctcctctcatcatttaacctctgcttacccttgtcagcagga 142  T
Q  554 gcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttt 624  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  141 gcattttacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctgcgttcactcatcaccttgtaatgagcttt 71  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 483
Target Start/End: Original strand, 29848 - 30310
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29848 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccccagacaaacaagagaagtggttcttgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 29947  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29948 atcagatacatccaaacccaacttatatgcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaag 30047  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| | |||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||  | |||||    
T  30048 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccaatcaatgcaaacacctttccaccatttctaaccttcttcggctcaggacact 30147  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
     |||| |||||||||| ||  | ||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||   |||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  30148 gcgaactgatatgaccctctccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttacattcagctaggttgtgtcttttctgaccacacctgaatcactt 30247  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaat 483  Q
    | |||||||||   ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  30248 cctctcatctctaccacaaacgttgcttttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaat 30310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 533 - 708
Target Start/End: Original strand, 30336 - 30511
Alignment:
Q  533 tgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcct 632  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||   ||||||||| ||||||||||| || | |||||||||   ||||||||||||||| || || |    
T  30336 tgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttgcccctcctctcactcattgtcttgtaatgagctttggtgtctt 30435  T
Q  633 cttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||| ||||| |||  ||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  30436 cttcataaattctgcaactgttaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctctattgatgtc 30511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 210; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 127 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 2132 - 1555
Alignment:
Q  127 tacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaa 226  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2132 tacaatcaaacccaacttatatgcacactctaaagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaagaaacaa 2033  T
Q  227 gtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaat 326  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  | |  ||||||| ||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| ||||| || ||||  |||     
T  2032 gtacctctgataagcctgtcctcaatagcagtctgcgtactagtcaaagcaaacactttcccaccggttctaatcttctttggctgagtgcactgggaac 1933  T
Q  327 tgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctc 426  Q
    |||| || || ||||| |   | || || |||||||  || || | ||| || | | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1932 tgatgtggccctcctcatcacaattataacaaacaacatcacccctcttgcagttagccaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctc 1833  T
Q  427 atctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattc 526  Q
    ||||  |  |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||  | ||||  || |||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1832 atctttggtacaaacattacttttgtggcctttctcgccacacttatagcaaattatttcagcagtagcatctctcctcttgggccttctctcatcattc 1733  T
Q  527 aatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttg 626  Q
    | ||  ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1732 agtcgttgctttcccttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttttcccttacccctccgctcactcatcaccttgtaatgagcttttg 1633  T
Q  627 tatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttga 704  Q
     ||| || ||||| || || || ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1632 aatcttcctcatagattctgcagctgcttaccaactcagaaaaagttctgatcttctgatagccaatggccctcttga 1555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 205; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 425 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 5888 - 5608
Alignment:
Q  425 tcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcat 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5888 tcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgtaataaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcat 5789  T
Q  525 tcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttt 624  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5788 tcagtctctgcttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggatgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttt 5689  T
Q  625 tgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5688 cgtatcttcttcatagatcctacagctgcttaccaaatcagagaagtttattattttctgataaccaatagccctcttgat 5608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 246 - 14
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  246 tcaaagtctctaccaaacatagacaacgtacatcttatacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 147  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  146 tatcagatataaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcacccgtatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 47  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcatt 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46 gaaacaagtacctctgataagtcggtcctcatt 14  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 20 - 320
Target Start/End: Original strand, 496 - 796
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  496 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagatggagtttcaacaaccatttcccctttca 595  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  596 tatcagatacaaccagacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 695  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| | |    | |||||||| ||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||| || || ||||||    
T  696 gaaacaagtacctctgataagtcgatccttactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccgatcctaaccttcttcggttgtgtacac 795  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  796 t 796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 401 - 708
Target Start/End: Original strand, 798 - 1105
Alignment:
Q  401 cgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctc 500  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||    
T  798 cgaccacacctgaagtacttcttctcatctttatcacagacattactcttgtggcctttctagccacacttgtagcaaacaatctcagcaggagcatctc 897  T
Q  501 tcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctc 600  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||   |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  898 tcctcttaggcctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttacctctgcgctc 997  T
Q  601 actcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctc 700  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  998 actcatcaccttgtaatgagccttattatcctcctcatatattctgcagctactcaccaactcagagaaaattctaatcttctgatacccaatggctctc 1097  T
Q  701 ttgatgtc 708  Q
    ||||||||    
T  1098 ttgatgtc 1105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20919 - 20682
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20919 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttca 20820  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||    
T  20819 tatcagatacaaccagacccaatttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataataacatttaaaggagtactatgaaa 20720  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactg 257  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  20719 gaaacaagtagctttgataagtcggtcctcattcactg 20682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12739 - 12502
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12739 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagttggagtttcaacaaccatttctcctttca 12640  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||    
T  12639 tatttgatacaaccagatccaatttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataataacatttaaaggagtactatgaaa 12540  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactg 257  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  12539 gaaacaagtagctttgataagtcggtcctcattcactg 12502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 317 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 12506 - 12120
Alignment:
Q  317 cactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagc 416  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||| ||||    
T  12506 cactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttataacaaacaatgtccccacgcttacaatcatctaatgtgtgtcctttctgagcacacctaaagc 12407  T
Q  417 acttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctctt 516  Q
    ||||||||||||||     | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |  ||    ||    |||||||||||||||||||  |    
T  12406 acttcttctcatctttacgaaaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgaagcaatctctact--taccctcatctctcctcttgggcctact 12309  T
Q  517 ctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaa 616  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12308 ctcatcattcagtctctgcttacccttgtcagcaggagcactgtacggcttcggacgactatgctatcccttgcctctacgatcactcatcaccttgtaa 12209  T
Q  617 tgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  12208 tgatctttcgtatcctcctcataaatcctacagctgcttaccaaatcagtgaagtttcttattttctgataaccaatggctctcttgat 12120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 317 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 20686 - 20300
Alignment:
Q  317 cactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagc 416  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||| ||||    
T  20686 cactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttataacaaacaatgtccccacgcttacaatcatctaatgtgtgtcctttctgagcacacctaaagc 20587  T
Q  417 acttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctctt 516  Q
    ||||||||||||||     | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |  ||    ||    |||||||||||||||||||  |    
T  20586 acttcttctcatctttacgaaaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgaagcaatctctact--taccctcatctctcctcttgggcctact 20489  T
Q  517 ctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaa 616  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20488 ctcatcattcagtctctgcttacccttgtcagcaggagcactgtacggcttcggacgactatgctatcccttgcctctacgatcactcatcaccttgtaa 20389  T
Q  617 tgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  20388 tgatctttcgtatcctcctcataaatcctacagctgcttaccaaatcagtgaagtttcttattttctgataaccaatggctctcttgat 20300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 417 - 705
Target Start/End: Original strand, 115934 - 116222
Alignment:
Q  417 acttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctctt 516  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  115934 acttcttctcatctctatcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacatgaaacaaacaatatcagtaggagcatccctcctcttaggcctcct 116033  T
Q  517 ctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaa 616  Q
    ||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116034 ctcatcattcagtctcttcttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaa 116133  T
Q  617 tgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||||||||   ||| |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  116134 tgagctttcaaatcttcttcacagatcctacagctgcttaccaaatcagagaaatttcttattttctgataaccaatagccctcttgat 116222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 224
Target Start/End: Original strand, 110523 - 110727
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  110523 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagccggagttttaacaaccatttctcctttca 110622  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  110623 tatcagacacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacaacaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataacagcaattaaaggagtactattaaa 110722  T
Q  220 gaaac 224  Q
    |||||    
T  110723 gaaac 110727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 483
Target Start/End: Original strand, 11723 - 12173
Alignment:
Q  21 caaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11723 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttcccctttcat 11822  T
Q  121 atcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaag 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11823 atcagatacatccaaacccaacttatatgcacattcaatagcaataaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaag 11922  T
Q  221 aaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacact 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |  || |||| |||||||||||||||||| |||||  | |||  |||||| ||||  | |||||    
T  11923 aaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgtgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacact 12022  T
Q  321 acgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcactt 420  Q
      ||| |            | | ||| ||||||| || | ||||||||||||||| || ||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  12023 gtgaact------------cccattgcagttgtaacagataatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcactt 12110  T
Q  421 cttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaat 483  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  12111 cctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaat 12173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 240
Target Start/End: Original strand, 1033 - 1253
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1033 tcaaagtctctaccaaacatagacaacagacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttaactggagtttcaacaacaatttcccctttca 1132  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1133 tatcagatacaaccagacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaa 1232  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataag 240  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1233 gaaacaagtacctctgataag 1253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 259 - 708
Target Start/End: Original strand, 5205 - 5654
Alignment:
Q  259 ttgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaa 358  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| || |||    
T  5205 ttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggtcctaaccttcttcggttgagtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttataacaa 5304  T
Q  359 acaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctt 458  Q
    |||| ||| || |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| |||||||||    
T  5305 acaacgtctccccgcttacaattagctaatgtgtgtcctttctaaccacacctgaagcacttcttctcatctttatcacagacattactcctgtggcctt 5404  T
Q  459 tttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcact 558  Q
    | || || |||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || || || || || |||||||| |||||    
T  5405 tctcgccgcacttgtagcaaacaatctcagcaggagcatctctcctcgtgggcctcctctcatcattcaacctctgttttcccttatcagcaggagcact 5504  T
Q  559 atacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttacc 658  Q
    ||| || ||   ||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||    
T  5505 atatggtttaggacgactctgttgtcctttacctcttcgttcactcatcaccttgtaatgagctttagtatcttcttcatatatcctgcagctactcacc 5604  T
Q  659 aattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    || ||||| ||  |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  5605 aactcagagaaaattcttatcttctgatacccaatggttctcttgatgtc 5654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 186 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 1832 - 1310
Alignment:
Q  186 tatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacacctt 285  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |  ||||||| |||||| |||||||| ||    
T  1832 tatcaataatagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacacttt 1733  T
Q  286 gccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaact 385  Q
    ||| || || ||||||||||| || |  | |||||  ||| |||||||||| ||  | ||| |||||||||| | ||||||||||||||| || ||| ||    
T  1732 gcccccagttctaaccttcttcggttcgggacactgtgaactgatatgaccctctccattgcagttgtagcagataatgtccccacgcttgcattcagct 1633  T
Q  386 aaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatat 485  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  1632 aaactgtgtcccttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctttaccacaaacattactcttgtgtcctttctcaccacacttgtaacaaacaatct 1533  T
Q  486 cagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcc 585  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||   | ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| |||||    
T  1532 cagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcactcatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttatgacgattctgctgtcc 1433  T
Q  586 cttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctga 685  Q
    ||| || || | ||||||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||  |||||||| ||||    
T  1432 cttacccctcctctcactcattatgttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattctacacctgttaaccaactcagagaagactcttatctgctga 1333  T
Q  686 taaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    || |||||||| || ||||||||    
T  1332 tacccaatagctcttttgatgtc 1310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 182; Significance: 5e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 58 - 567
Target Start/End: Original strand, 115513 - 116022
Alignment:
Q  58 acaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatca 157  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |  ||||||||||| ||     
T  115513 acaaacaagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcaacgaccatttctcctttcatatcagatacaatcaaacctagtttatatgcacactct 115612  T
Q  158 acagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactg 257  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||    |    
T  115613 aaagcaatgaaacaatgtgtagcaccagtatctataatagcaattaaagggatactattaaagaaacaagtacctctgataagtctatcttcatttgtgg 115712  T
Q  258 attgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagca 357  Q
     |||| ||| || ||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||  ||| |||||||||| ||| | ||| | || |||||    
T  115713 tttgcataccagccaaggcaaacactttcccaccggtcctaaccttcttcggttgagtgcactgagaactgatatgaccctccccattgcaattatagca 115812  T
Q  358 aacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcct 457  Q
     || || || |||||||| |||||| ||||   ||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||||||||    
T  115813 tactatatcaccacgcttgcaatcagctaacacgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattacttttgtggcct 115912  T
Q  458 ttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcac 557  Q
    || || |||||||| || ||||| || |||| |||||  ||||| | |||||||||  |||||||||||| ||  ||||| || ||  |||||||||| |    
T  115913 ttctcgccacacttaaagcaaactatttcagcaggagtgtctcttcccttgggccttctctcatcattcagtcgttgctttcccttaccagcaggggcgc 116012  T
Q  558 tatacggctt 567  Q
    | ||||||||    
T  116013 tgtacggctt 116022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 94285 - 93996
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94285 tcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacaccagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 94186  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  94185 tatcagatacaagcagacccaacttatatgcacattctaaagcaatgaaacaatgcgtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 94086  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttagg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||    |  ||||||| |||||||||||| || || || || ||||| |||||||||||    
T  94085 gaaacaagtacctctgataagtcgatcctcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaatacttttcctccagtcctgaccttcttagg 93996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 93703 - 93618
Alignment:
Q  602 ctcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgata 687  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || || || || |||||||| || ||  |||| |||||||||||    
T  93703 ctcatcaccttgtaatgagccttcgtatcctcctcataaattctgcagctactcaccaattctgagaaaattctgatcttctgata 93618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 179; Significance: 3e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 20 - 493
Target Start/End: Original strand, 11743 - 12214
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  11743 tcaaaatctctaccaaacatagacaaaggacaactcaaacaaacaagagaagtagttattgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccactca 11842  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    || | ||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11843 tacctga--caatcagacccaacttatatgcacaatcaatagcaatgaaacaatgtgtagcaccatggtctataatagcaattaaaggagtactattaaa 11940  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||| | ||  ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| | | |||    
T  11941 gaaacaagtatctctaataagtcggtcctcattaattgtctgcgtaccagtcaatgcaaacacctttccacctgtctgagccttcttaggcttcctgcac 12040  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||| | | ||||||||| ||||   | ||| |||||||||| || |||||||| || ||  |||  || || ||||||   ||||| |  |||||||    
T  12041 tgcgaactaagatgaccttcttcgtcacaattgaagcaaacaatatcaccacgcttgcattccgctatcgtatgccctttcttcccacatcgaaagcact 12140  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtagga 493  Q
    | |||||||| |  |  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  12141 ttttctcatcaccattgcaagcattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagtagga 12214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 4480 - 3999
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  4480 tcaaagtctctaccaaacatagacaaaggacaactcaaacaaacaaaagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccactca 4381  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||   || | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4380 tacttgacataagtagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactattaaa 4281  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |     ||||  ||||| | ||||||||| |||| ||||  | |||||||||||| | |  |     
T  4280 gaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaaccgtccatgtaccggtcaatgaaaacacctttccacttgtctgagccttcttaggcttcctggat 4181  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | |||  | | ||||||||| || |   | ||| | || |||||||| ||| | || || ||| |||  ||||||| ||||   ||||||  ||| |||     
T  4180 tgcgagctaagatgaccttcttcatcacaattgaaacagacaatgtctccatgtttgcactcagctattgtgtgtcttttcttcccacacaggaaacaca 4081  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctct 501  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4080 tcttctcatcacggtcacatacattactcttgtttcccttttcaccaaacttgaaacagacaatctcagtaggagcatctct 3999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 496 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 775 - 574
Alignment:
Q  496 atctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctcta 595  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  775 atctctcctcttaggcctcctctcatcattcagtctctatttacctttgtcagcaggagcactgtacggtttcggacgactctgctgtcccttacctcta 676  T
Q  596 cgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatag 695  Q
    | ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||| || |||||||| || || |||||||    
T  675 cactcactcatcaccttat-gtgagcttttgtatcctcttcataaatcctacagctgctcactaattaagaaaaattccttatcttttggtagccaatag 577  T
Q  696 ccc 698  Q
    |||    
T  576 ccc 574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 177; Significance: 5e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 384 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 569 - 245
Alignment:
Q  384 ctaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaat 483  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  569 ctaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctgtatcacaaacactacttttgtggcctttctcgccacacttgaaacaaacaat 470  T
Q  484 atcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgt 583  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| || |||    
T  469 atctataggagcatctctcctcttgggccttctctcatcatttaacctctgcttacccttgtcagaaggagcactatacggcttcggacgactgtgctgt 370  T
Q  584 cccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttct 683  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||    
T  369 cccttacctctacgtttactcatcaccttgtaatgagctttcctgtcctcctcataaatcctgcaactgcttaccaaatcagagaagtttttaatcttct 270  T
Q  684 gataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    |||||||||| || |||||||||||    
T  269 gataaccaatggctctcttgatgtc 245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 20 - 252
Target Start/End: Original strand, 15036 - 15268
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15036 tcaaaatctctacgaaacatagacaatggacaccttagacaaactagagaagtagttgctgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 15135  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  15136 tatcaaatacaatcaaacccaacttatatgcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtactataaaa 15235  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcatt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15236 gaaacaagtacctctgataagtcgatcctcatt 15268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 327 - 708
Target Start/End: Original strand, 15292 - 15673
Alignment:
Q  327 tgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctc 426  Q
    ||||||| || || || ||| |||| || |||||||  || |||||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15292 tgatatggccctcttcattgcagttataacaaacaacatcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcatttctgaccacacctgaagcacttcttctc 15391  T
Q  427 atc-tcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcatt 525  Q
     || |  || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | || | ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15392 gtccttagt-acaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttatagcagaaaatctcagcaggagcatctctcctattgggcctcctctcatcatt 15490  T
Q  526 caatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttt 625  Q
     || || ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||   | || ||||||||||||||||||||||||||     
T  15491 taacctctgctttcgcttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcctttgctcattcgatcactcatcaccttgtaatgagctttc 15590  T
Q  626 gtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    || ||||| ||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  15591 gtttcctcctcatagattctgcagctacttaccaattcagagaaatttctgatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 15673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 282
Target Start/End: Original strand, 6032 - 6288
Alignment:
Q  26 tctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcag 125  Q
    |||| ||||||||| |||||  |||| |||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  |    
T  6032 tctcgaccaaacattgacaaaggacatcttaaacacacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaatcatctctcctttcatattcg 6131  T
Q  126 atacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaaca 225  Q
    | | |   |||||||||||| | ||||||| || |||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  6132 acatagtaagacccaacttagaagcacaataaatagcattaaaacaatgcgtagcatcagtatcaataatagcaattaaaggagtactatcaaagtaaca 6231  T
Q  226 agtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacac 282  Q
     |||||||| || |  |  ||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  6232 tgtacctctaatcaaacgatcctcattctctgtttgcgtaccagtcaaaccaaacac 6288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 170; Significance: 7e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 464 - 705
Target Start/End: Original strand, 3222 - 3463
Alignment:
Q  464 ccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacg 563  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3222 ccacacttgaagcaaataatctcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacg 3321  T
Q  564 gcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattc 663  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||||    
T  3322 gcttcggacgactctgttgtcccttgcctctgcgctcactcatcaccttataatgagctttcgtatcctcttcatatatcctgcaggtacttaccaattc 3421  T
Q  664 agaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3422 agaaaagttccttatcttttgataaccaatagccctcttgat 3463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 4274 - 3736
Alignment:
Q  26 tctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcag 125  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   |    
T  4274 tctctaccaaacatagacaattgacatcttaaacaaacaagataagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctccactcatacttg 4175  T
Q  126 atacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaaca 225  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  4174 acataaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaaagtgtagcaccagtgtcaataatagcaatta---gagtactattaaagaaaca 4078  T
Q  226 agtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaa 325  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| || |  || ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| | | || | |||     
T  4077 agtacctcttataagtcggtcctcattaaccgtctgtgtaccggtcaatgcaaacacctttccacctgtctgagccttcttaggcttcatgcattgcgag 3978  T
Q  326 ttgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttct 425  Q
    || | ||||||||| |  |   | ||| || ||||||| || |||||||| || ||| |||  |  || || |||   ||||| | ||||||||||||||    
T  3977 ttaagatgaccttctttatcacaattgaagtaaacaatatcaccacgcttgcattcagctatcgcatgccccttctttccacatcggaagcacttcttct 3878  T
Q  426 catctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcatt 525  Q
    | || |  |  || |||||||||||||||||  | || ||||||||| | |||||||| |||  || | ||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  3877 cctcaccattgcagacattactcttgtggcccctctcgccacacttgtagcaaacaatctcaacagaaacatctctcctcttaggtctcctctcatcatt 3778  T
Q  526 caatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggctt 567  Q
    |||||| || || || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  3777 caatctttgtttccccttgtcagcaggagcactatagggctt 3736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8125 - 7972
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | | ||||||||   | |  | ||||||| |||||    
T  8125 agagaagtagtcaccgaacgtttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaatcaagacccaaagcagaaacccaatcaaaagcaa 8026  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaa 218  Q
    | || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  8025 taaagcaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaa 7972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 7754 - 7704
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatc 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||    
T  7754 acaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatc 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 166; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 25 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9613 - 9396
Alignment:
Q  25 gtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatca 124  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  9613 gtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaactatttcccgtttcatatca 9514  T
Q  125 gatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9513 gatacaaccagacccaacttataagtacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtgtctataatagcaattaaaggagtactattaatgaaac 9414  T
Q  225 aagtacctctgataagtc 242  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9413 aagtacctctgataagtc 9396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 49277 - 49086
Alignment:
Q  11 agatggacatcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccattt 110  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  49277 agatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacagacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagcttgattttcaacaaccattt 49178  T
Q  111 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaatt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49177 ctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacatcaatgaaacaatgagtagcactagtatctataatagcaatt 49086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 155; Significance: 7e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 259 - 708
Target Start/End: Original strand, 2783 - 3226
Alignment:
Q  259 ttgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaa 358  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || | |||||  ||| ||||||| || ||||| ||| |||| ||||||    
T  2783 ttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggttctaaccttcttcggttgtgcacactgtgaactgatatggccctcctcattgcagttatagcaa 2882  T
Q  359 acaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctt 458  Q
    || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  2883 actatgtctccccgcttacaatcagctaatgtgtgtcccttctgtccacacctgaagaacttcttctcatctttatcacaaacattactcttgtggcctt 2982  T
Q  459 tttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcact 558  Q
    | | |||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  2983 tcttaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcaacctctgttttcctttgtcagcaggagcact 3082  T
Q  559 atacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttacc 658  Q
    |||||| ||   | ||||||| ||||  || |||||      || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||    
T  3083 atacggtttaggatgactctgctgtcatttacctct------acacatcaccttgtaatgagctttagtatcttcttcatatatcctgcagctactcacc 3176  T
Q  659 aattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    || ||||| ||  |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  3177 aaatcagagaaaattcttatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 3226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2165 (Bit Score: 143; Significance: 9e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold2165
Description:

Target: scaffold2165; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 194 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 1020 - 518
Alignment:
Q  194 atagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctg 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    || ||||||| |||||| |||||||||||||| |  |    
T  1020 atagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagttggtcctcattggtagactgcgtaccagtcaatgcaaacaccttgcccctag 921  T
Q  294 tcctaaccttcttaggctgcgtacactacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtg 393  Q
    | ||||||||||| || |  | ||||| |||| | |||||||| ||  | ||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  920 ttctaaccttcttcggttcaggacactgcgaactaatatgaccctctccatttcagttatagcagacaatgtccccacgcttacattcagctaaactgtg 821  T
Q  394 tcctttccgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtagga 493  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||| |||| |||    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||| ||||    
T  820 tcccttttgaccacacctgaagcacttcctctcgtctttaccacaaacattgctcttgtggcctttctcaccaaacttgtaacaaacaatctcagaagga 721  T
Q  494 gcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctc 593  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||||   | ||||| || ||||||  ||| ||||| || |||||   |||| |||| |||||||| || |    
T  720 gcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctttgtcaataggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccc 621  T
Q  594 tacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaat 693  Q
    | | || |||||| | |||||||| | |||| || || ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||  ||| |||| |||||| |||||    
T  620 tcctctaactcattatcttgtaataaactttggtgtcttcttcataaattctacacctgttaaccaactcagagaagactctaatctgctgatacccaat 521  T
Q  694 agc 696  Q
    |||    
T  520 agc 518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 137; Significance: 4e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 58 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 187 - 3
Alignment:
Q  58 acaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatca 157  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||     
T  187 acaaacaagagaagtagttactaaacccttagttggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaatcaaactcaacttatatgcactttct 88  T
Q  158 acagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtc 242  Q
    | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  87 aaagcaatgaaacaatgaatagcactagtatctataatagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtc 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 118 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19262 - 19023
Alignment:
Q  118 catatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatta 217  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  19262 cataacagatacaaccaaacccaacttataagcacattcaatagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagtaattaaaggagtactatta 19163  T
Q  218 aagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtac 317  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||| |    | |||||||| ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||    
T  19162 aagaaacaagcacctctgataagcctgtcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggtcctaaccttcttcggttgtgtac 19063  T
Q  318 actacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagca 357  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  19062 actgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttatagca 19023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 446 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 33337 - 33078
Alignment:
Q  446 ctcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgt 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || || || || ||||    
T  33337 ctcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatttcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcatcctctgttttcctttgt 33238  T
Q  546 cagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcct 645  Q
    ||||||| ||||| || || ||   ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  33237 cagcaggagcactgtatggtttaggacgactctgctgtcccttaccccttcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatatcct 33138  T
Q  646 acaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
     || ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  33137 gcagctgcttaccaactcagagaaaattctaatcttttgatacccaatagctcttttgat 33078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 110; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 327 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 24007 - 23626
Alignment:
Q  327 tgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcacttcttctc 426  Q
    |||||||||||||| | ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  24007 tgatatgaccttccccattgcaattgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatc 23908  T
Q  427 atctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattc 526  Q
    |||||   |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |    
T  23907 atctcttccacatacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtatcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcaccc 23808  T
Q  527 aatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttg 626  Q
    |   | ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||   |||||||||||||||||| || || | ||||||||| | ||| ||||||| ||| |    
T  23807 atcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagttttgg 23708  T
Q  627 tatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    | || |||||||| || || || ||  | ||||| ||||| |||  ||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  23707 tgtcttcttcatagattctgcacctattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 23626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1845 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1845
Description:

Target: scaffold1845; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 410 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 1305 - 1007
Alignment:
Q  410 ctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgg 509  Q
    |||||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  1305 ctgaagcacttcctctcatctctaccacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgg 1206  T
Q  510 gcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcac 609  Q
    | ||| | ||||||||||   | ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||   |||| |||  |||||||| || || | ||||||||| |     
T  1205 gtctcctatcatcattcatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattcttctgtccctttcccctcctctcactcattat 1106  T
Q  610 cttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| |||  ||| |||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  1105 cttgtaatgagctttggtgtcttcttcgtaaatcctgcaactgtttaccaactcagagaagaatctgatctgctgatacccaatagctctcttaatgtc 1007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 103; Significance: 7e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Original strand, 5001 - 5263
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  5001 tcaaagtctcgaccaaacatcgacaaaggacaccttagacacactagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacgaccatatctccattca 5100  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||   | | ||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  5101 tatttaacataacaagacccaacttagaagcacaatcaacaccaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaattaaaagagtactatcaaa 5200  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacac 282  Q
    | |||| |||||||| || |  | ||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  5201 gtaacatgtacctctaatcaaccggtccttattcaatgtctgcgtaccagtcaaagcaaacac 5263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 608 - 705
Target Start/End: Original strand, 5589 - 5686
Alignment:
Q  608 accttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||| |||||||||||  |  ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  5589 accttgtaatgagctttcgtatcttcctcatagattctgcaactgctcaccagttcagaaaagtcacggatcttctgatatccaatggcccacttgat 5686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 103; Significance: 7e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Original strand, 17791 - 18005
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  17791 tcaaagtctcgaccaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccaaacccttagctggagtttcgacaaccatttccccattca 17890  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||  || | |   |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  17891 tattcgacatagtaagacccaacttagacgcacaatcaacagcaataaaacaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtactatcaaa 17990  T
Q  220 gaaacaagtacctct 234  Q
    | |||| ||||||||    
T  17991 gtaacatgtacctct 18005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 111265 - 111081
Alignment:
Q  53 cttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcac 152  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||  || | | | ||||||||||||   ||||    
T  111265 cttaaacacacaagagaagtagtcaacaaacccttagctggagtttcgacaaccatcactccattcatatttgacatagcaagacccaacttagtagcac 111166  T
Q  153 aatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||  |||| |||||||||||    
T  111165 aatcaatagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtactattaaaataacatgtacctctgat 111081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 436 - 705
Target Start/End: Original strand, 18174 - 18443
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||  || | |||||||| |||| || ||||||| || |  | |||||| |||||||||| | ||| |||    
T  18174 acaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaatctcagcagtagcatctttctttcttggcctcctctcatcattaactctttgc 18273  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    ||||| || |||||||| ||| | || |||||   |||||| |  || || || ||| | | |||| |||   |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18274 ttacccttatcagcaggagcattgtaaggctttggacgacttttctgacctttacctttcctctcattcacagccttgtaatgagctttggtatcttctt 18373  T
Q  636 cataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||||||| || ||||| || ||||  ||| ||||||| |  |||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  18374 cataaattctgcaactactcaccagctcaaaaaagttacggatcttctggtaaccaattgcccgcttgat 18443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 705
Target Start/End: Original strand, 6786 - 7471
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6786 tcaaaatctcgaccaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccaaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattca 6885  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||  || | | | |||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||  || | |    
T  6886 tattcgacatagcaagacccaacttagaagcacaatcaatagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataataacagttaaaggagtacgatcaca 6985  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
      |||| ||||||||||| |  |  ||||||||| |||  || |||| |||||||||||| ||  | |||   |||    |||||||||||| | ||||     
T  6986 ataacatgtacctctgatcaaacgatcctcattctctgtctgagtaccagtcaaagcaaaaactctcccagtagtctgtgccttcttaggcttcttacat 7085  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | ||||   |||||||||||||| ||| | ||| | || ||||  ||  || ||||||| ||| | |  || || ||||||  |||||| |  |||||||    
T  7086 tgcgaaccaatatgaccttcctcattgcaattgaaacacacaacatcatcatgcttacactcagcaagtgtatgccctttcttaccacaacgaaagcact 7185  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
      ||| | || |    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||  |  | |||||||| |||  |||||||||| || |  | |||||| ||||    
T  7186 gtttcacgtccctaggacaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtatagcaaacaatctcaacaggagcatctttctttctaggcctcctctc 7285  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||    ||||| || || | ||||||| | |||||| |||  ||||||||||||    
T  7286 atcattcattctttgcttacccttatcagcaggagcactgtaaggctttggtcgactttgctgactcttgcctttccgctcattcacaaccttgtaatga 7385  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| || |  |||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7386 gccttagtatcttcctcatatatcctgcaactgctcaccagctcagaaaaattacggatcttctggtaaccaattgcccgcttgat 7471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 705
Target Start/End: Original strand, 13916 - 14601
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13916 tcaaaatctcgaccaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccaaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattca 14015  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||  || | | | |||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||  || | |    
T  14016 tattcgacatagcaagacccaacttagaagcacaatcaatagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataataacagttaaaggagtacgatcaca 14115  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacac 319  Q
      |||| ||||||||||| |  |  ||||||||| |||  || |||| |||||||||||| ||  | |||   |||    |||||||||||| | ||||     
T  14116 ataacatgtacctctgatcaaacgatcctcattctctgtctgagtaccagtcaaagcaaaaactctcccagtagtctgtgccttcttaggcttcttacat 14215  T
Q  320 tacgaattgatatgaccttcctcgttgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcaactaaagtgtgtcctttccgaccacacctgaagcact 419  Q
    | ||||   |||||||||||||| ||| | ||| | || ||||  ||  || ||||||| ||| | |  || || ||||||  |||||| |  |||||||    
T  14216 tgcgaaccaatatgaccttcctcattgcaattgaaacacacaacatcatcatgcttacactcagcaagtgtatgccctttcttaccacaacgaaagcact 14315  T
Q  420 tcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctc 519  Q
      ||| | || |    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||  |  | |||||||| |||  |||||||||| || |  | |||||| ||||    
T  14316 gtttcacgtccctaggacaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtatagcaaacaatctcaacaggagcatctttctttctaggcctcctctc 14415  T
Q  520 atcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatga 619  Q
    |||||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||    ||||| || || | ||||||| | |||||| |||  ||||||||||||    
T  14416 atcattcattctttgcttacccttatcagcaggagcactgtaaggctttggtcgactttgctgactcttgcctttccgctcattcacaaccttgtaatga 14515  T
Q  620 gcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| || |  |||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  14516 gccttagtatcttcctcatatatcctgcaactgctcaccagctcagaaaaattacggatcttctggtaaccaattgcccgcttgat 14601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 58 - 202
Target Start/End: Original strand, 21802 - 21946
Alignment:
Q  58 acaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatca 157  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||| ||     
T  21802 acaaacaagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcaacgaccatttctcctttcatatcagatataatcaaacccaatttatatgcacactct 21901  T
Q  158 acagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaatt 202  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21902 aaagcaatgaaacaatgagtagctccagtgtctataatagcaatt 21946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 98; Significance: 7e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Original strand, 26025 - 26158
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26025 tcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacaaactagagaagtagttactgaacccttggctggagtttcaacaaccatttctcctttca 26124  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcaca 153  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  26125 tatcagatacaatcaggcccaacttatatgcaca 26158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13864 - 13608
Alignment:
Q  26 tctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcag 125  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||  || |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  |    
T  13864 tctcgaccaaacatagacaatggacatcttaatcacacaagagaagtagtcaccgaactcttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatattcg 13765  T
Q  126 atacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaaca 225  Q
    | | | | |||||||||||| | |||||||||| ||||||  ||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  13764 acatagcaagacccaacttagaagcacaatcaatagcaatagaacaatgtgtagcatcaatatcaataatagcaattaaaggagtactatcaaagtaaca 13665  T
Q  226 agtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacac 282  Q
     ||||||||||| |  |  ||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  13664 tgtacctctgatcaaacgatcctcattctctgtttgtgtaccagtcaaagcaaacac 13608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 436 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 13449 - 13213
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||  || | |||||||| ||||||  | ||||| || |  | |||||| |||||||||||||||| |||    
T  13449 acaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaatctcagtaacaacatctttctttctaggcctcctctcatcattcaatctttgc 13350  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    ||||| || |||||||| |||||  | | |||   || ||| || || ||||||||| | | |||| |||  |||| |||| |||| || ||||| || |    
T  13349 ttacccttatcagcaggagcactgcaagactttggacaactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaacctcgtaacgagccttagtatcttcct 13250  T
Q  636 cataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtt 672  Q
    |||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13249 catatattctacaactgctcaccagctcagaaaagtt 13213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 611 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 9922 - 9828
Alignment:
Q  611 ttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  9922 ttgtaatgtgctttggtatcctcttcatagattctgcaactgctcactaattcagtaaagttacggatcttctgatatccaattgcccgcttgat 9828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 33 - 282
Target Start/End: Original strand, 8336 - 8585
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| || | ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||    
T  8336 caaacatagacaaaggacatctcaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttaactggagtttcgacaaccatttctccattcatatcagacatgac 8435  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||||||||   |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||||    
T  8436 aagacccaacttagtagcacaatcataagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacct 8535  T
Q  233 ctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacac 282  Q
    ||||| |  |  ||||| ||| |||  || |||| |||||||||||||||    
T  8536 ctgatcaagcaatcctcgttctctgtctgtgtaccagtcaaagcaaacac 8585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 14657 - 14398
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||| | | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  14657 tcaaaatctcgaccaaacatagacaaaggacatcttaaatacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattca 14558  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||  || | | | ||||||||||||   |||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| |||    
T  14557 tattcgacatagcaagacccaacttaggagcacaatcaatagaaataaaacaatgtgtagcaccagtatcaataaaagctattaaaggagtaatatcaaa 14458  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaa 279  Q
    | |||| ||||||||||| |  |  ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||    
T  14457 gtaacatgtacctctgatcaaacgatcctcattctctgtctgcgtaccagtcaaagcaaa 14398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23689 - 23430
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23689 tcaaaatctctaccaaacatagataaatgacatcttaaacacacaagagaagtagtcgccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattca 23590  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    ||| ||| | | | |||||||||||| | |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  23589 tattagacatagcaagacccaacttagaagcactatcaagagcaataaaacaatgcgtagcactattatcaataatagcaactaaaggagtactatcaaa 23490  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaa 279  Q
      |||| ||||||||||| | ||  |||||||||  ||  | ||||| ||||||||||||    
T  23489 ataacacgtacctctgattaatcgatcctcattctgtgccttcgtaccagtcaaagcaaa 23430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9742 - 9551
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9742 tcaaaatctctaccaaacatagataaaggacatcttagacacactagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattca 9643  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagta 211  Q
    |||  || |     |||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  9642 tattcgacattgtaagacccaacttagaagcacaatcaagagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatatcaactaaaggagta 9551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 9326 - 9195
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||  |  | |||||||| ||||||| || |||| || |  | |||||| |||||||||||||||| ||     
T  9326 acaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagtatagcaaacaatctcagtagtagtatctttctttctaggcctcctctcatcattcaatctttgt 9227  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggctt 567  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  9226 ttacccttatcagcaggagcactataaggctt 9195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 9153 - 9068
Alignment:
Q  609 ccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaata 694  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||| |||||||||||  |  ||||||||||| ||||||    
T  9153 ccttgtaatgagctttagtatcttcctcatagattctgcaactgctcaccagttcagaaaagtaacggatcttctgatacccaata 9068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 36422 - 36628
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  |||| || | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  36422 accaaacatagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 36521  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||  || |  ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||    
T  36522 tcaagacccaaagtagaaacacaatcgaaagcaatgaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatataacaagtac 36621  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  36622 ctctgat 36628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 567
Target Start/End: Original strand, 36827 - 36958
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || | |||||||||  || |||| |||| | | |||||   || ||| ||     
T  36827 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacgatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 36926  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggctt 567  Q
    || || || ||||||||||||||||| |||||    
T  36927 ttgcccttatcagcaggggcactatagggctt 36958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Original strand, 1132 - 1257
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1132 tcaaagtctctaccaaacatagacaacagacatcttagacaaacaagagaagta--------acccttagctggagtttcaacaaccatttatcctttca 1223  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcaca 153  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1224 tatcggatacaaccagacccaacttatatgcaca 1257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 756 - 552
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||    
T  756 caaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagtgaagtagtcacagaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattcatatcagacatgac 657  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     |||||||| |||   |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||   |||||||||||    
T  656 aagacccaatttagtagcacaatcataagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtattatcaatataacaagtacct 557  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  556 ctgat 552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 610 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 179 - 130
Alignment:
Q  610 cttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttacca 659  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  179 cttgtaatgagccttagtatcctcatcataaatcctgcaactgctcacca 130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Original strand, 4360 - 4564
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| | | |    
T  4360 caaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagatggagtttcgacaaccatctctccattcatattagacatagc 4459  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||||    
T  4460 aagacccaacttagtagcacaatcaatagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtactatcaaaataacaagtacct 4559  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  4560 ctgat 4564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 91 - 237
Target Start/End: Original strand, 1 - 147
Alignment:
Q  91 tggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatct 190  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| | | | ||||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  1 tggagtttcgacaaccatctctccattcatattagacatagcaagacccaacttagtagcacaatcaatagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatca 100  T
Q  191 ataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||    
T  101 ataatagcaactaaaggtgtactatcaaaataacaagtacctctgat 147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2641 - 2437
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||    
T  2641 caaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatgtctccattcatatcagacataac 2542  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||||||||   ||||| |||  |||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||   | |||||||||    
T  2541 aagacccaacttagtagcacattcataagcaataaaagaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtattattaatatagcaagtacct 2442  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  2441 ctgat 2437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 282
Target Start/End: Original strand, 26265 - 26527
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26265 tcaaagtctcgaccaaacatagataaaggacatcttagacacactagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattca 26364  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||  || | |   |||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  26365 tattcgacatagtaagacccaacttagaagcacaatcaacaacaataaaacattgcgtagcaccaatatcaataatagcaactaaaagagtactatcaaa 26464  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacac 282  Q
      ||||  ||||||| || | ||  ||||||||| |||  ||||||| ||| |||||||||||    
T  26465 ataacatttacctctaatcaatcgatcctcattctctgtctgcgtaccagtaaaagcaaacac 26527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37200 - 36994
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  37200 accaaacatagacaaaggacatatcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagataaa 37101  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||   |||| ||||    
T  37100 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtatgatcaatataacatgtac 37001  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  37000 ctctgat 36994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 608 - 705
Target Start/End: Original strand, 26853 - 26950
Alignment:
Q  608 accttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || ||||| || || |||||||| |||| ||||||||| || |  ||||| | ||| ||||| |||||||||||    
T  26853 accttgtaatgagctttcgtatattcctcatagattctgcaactgctcaccagttcagaaaatttacgaatctttttatatccaatggccctcttgat 26950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11258 - 11054
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||    
T  11258 caaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattcatatcagacatgac 11159  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||||||||   |||||||||  |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| || |||||| ||||||| ||   | |||||||||    
T  11158 aagacccaacttagtagcacaatcataagcaataaaacaatgtgtagcactagtatcaataatagaaactaaaggtgtattatcaatatagcaagtacct 11059  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  11058 ctgat 11054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15362 - 15111
Alignment:
Q  28 tctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagat 127  Q
    ||||||||||||||| ||  || | |||| ||| || | ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||     
T  15362 tctaccaaacatagataaaggatatcttaaacacactaaagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattcatatttgac 15263  T
Q  128 acaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaag 227  Q
    | |   |||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| |||  |||| |    
T  15262 atagtaagacccaacttagaagcacaatcaagagcaataaaacaatgcgtagcaccagtattaataatagcaactaaaggagtactatcaaaataacatg 15163  T
Q  228 tacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaa 279  Q
    ||||||| || | ||  ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||    
T  15162 tacctctaatcaatcgatcctcattctctgtctgcgtaccagtcaaagcaaa 15111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 58005 - 57746
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||    
T  58005 tcaaaatctcgaccaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctttccattca 57906  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||  || | | | ||||| |||||| | |||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||    
T  57905 tattcgacatagcaagacctaacttagaagcacaatcaataacaataaaacaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtactatcaaa 57806  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaa 279  Q
      |||| ||||||||||| |  |   |||||||| |||  ||||||| ||||||||||||    
T  57805 ataacatgtacctctgatcaaacgagcctcattctctgtctgcgtaccagtcaaagcaaa 57746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 436 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 57589 - 57320
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||| |||||||||| |||||||| || |||||  |  |  ||||||| |||  |||||||||| || |  | |||||| |||||||||||| ||| |||    
T  57589 acaagcattactcttatggcctttctcgccacaagtatagtaaacaatctcaacaggagcatctttctttctaggcctcctctcatcattcattctttgc 57490  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || |||||   |||||| || || || |||||| | |||||| |||  |||||||||||||| || ||||| || |    
T  57489 ttacccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacctttgcctttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcct 57390  T
Q  636 cataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  57389 catatattctacaactgctcaccagctcagaaaagttacggatcttctggtaaccaattgcccgcttgat 57320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 279
Target Start/End: Original strand, 15335 - 15582
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| |||| ||||| | |||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15335 tcaaaatctcgaccaatcgtagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagttggagtttcgacaaccatctctcctttca 15434  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaa 219  Q
    |||  ||            ||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  15435 tatttga------------caacttagaagcacaatcaatagcaataaaacaatgcgtagcaccaatatcaataatagcaattaaaggagtactatcaaa 15522  T
Q  220 gaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaa 279  Q
    | |||| ||||||||||| | ||  ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  15523 gtaacatgtacctctgatcaatcgatcctcattctctgtttgcgtaccagtcaaagcaaa 15582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 693
Target Start/End: Original strand, 15739 - 15996
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||  || | |||||||| |||| |  | ||||| || |  |||||| | |||||||||| | ||| ||     
T  15739 acaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaatctcagcaacaacatctttcttgctgggccgcctctcatcattaactctttgt 15838  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    || || || |||||||| ||||| || |||||   |||||| ||  |   ||||||| | | |||| |||  |||||||||||||| || |||||||| |    
T  15839 ttgcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgcggaaacttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcct 15938  T
Q  636 cataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaat 693  Q
    |||| || || |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||| ||||||||    
T  15939 catagattctgcaactgctcaccaactcagaaaaattacggatcttctggtaaccaat 15996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 216805 - 216552
Alignment:
Q  26 tctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcag 125  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||| || | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  |    
T  216805 tctcgaccaatcatagacaaaggacatctgaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttctacaaccatctctccattcatattcg 216706  T
Q  126 atacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaaca 225  Q
    | | | | ||||| |||||  | | |||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||    
T  216705 acatagcaagacctaactttgaagtacaatcaataacaataaaacaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaattaaagtagtactatcaaagtaaca 216606  T
Q  226 agtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaa 279  Q
     ||||||||||| | |   ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||    
T  216605 tgtacctctgatcaattgatcctcattctctgtctgcgtaccagtcaaagcaaa 216552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 436 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 216395 - 216126
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||  || | |||||||| |||| |  | ||||| || |  | |||||| | | |||||||||||| |||    
T  216395 acaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaatctcagcaacatcatctttctttctaggcctccttttatcattcaatctttgc 216296  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || |||||   |||||| || || ||||||||| | | |||| |||  |||||||||||||| || |||||||  |    
T  216295 ttacccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatccttct 216196  T
Q  636 cataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||| ||  | |||||||| | ||  ||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  216195 catatattatgcaactgctcagcagctcagaaaagttacggatcttctggtaaccaattgcccacttgat 216126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 81; Significance: 9e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Original strand, 1915 - 2119
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| | |      
T  1915 caaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatattagacataga 2014  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||||||||   |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||  ||||||||| |    
T  2015 aagacccaacttagtagcacaatcaaaagcaataaaaaaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtactatcaaaataacaagtactt 2114  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  2115 ctgat 2119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 693
Target Start/End: Original strand, 2427 - 2575
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcc 644  Q
    |||||| ||||||| || |||||   |||||||||||| |||||| |  | |||||| |||  | |||||||||||  || |||||||| || |||||||    
T  2427 tcagcaagggcactgtaaggcttaggacgactctgttgacccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcgtaaatcc 2526  T
Q  645 tacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaat 693  Q
    | |||||||| ||||  |||||||||  ||  |||||||| ||||||||    
T  2527 tgcaactgctcaccagctcagaaaagactcggatcttctggtaaccaat 2575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 81; Significance: 9e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 55848 - 55644
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| ||||  || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| | |      
T  55848 caaacatagacaaaggacatcttaatcacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatattagacatagt 55749  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||||||||   |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||||    
T  55748 aagacccaacttagtagcacaatcaatagcaataaaaaaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtactatcaaaataacaagtacct 55649  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  55648 ctgat 55644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 670
Target Start/End: Original strand, 48059 - 48293
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |  | || ||||| |||  |||||||||| || |  | || | | ||||||||  || ||| ||     
T  48059 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgt 48158  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || |||||   ||||||||| || || ||| || | |||||| |||  | |||||||||||  || |||||||| |    
T  48159 ttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcct 48258  T
Q  636 cataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaag 670  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  48259 cataaattctgcaactgctcaccaactcagaaaag 48293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10538 - 10332
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| | |    
T  10538 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagttaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcataccagacata 10439  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
       ||||||||  || | |||||||| | |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||    
T  10438 tgtagacccaaagtagaagcacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtggcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatataacaagtac 10339  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  10338 ctctgat 10332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 10133 - 10071
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  10133 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgtaggagcatc 10071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29308 - 29102
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||| ||  |||| || | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  29308 accaaacatagataaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagataaa 29209  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||  || |  ||||||| | |||||| || ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||    
T  29208 tcaagacccaaagtagaaacacaatcgaaagcaataaatcaatgcgtagcaccattatcaataatagcaactaaaggagtattattaatataacaagtac 29109  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  29108 ctctgat 29102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 237
Target Start/End: Original strand, 1959 - 2129
Alignment:
Q  67 agaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatg 166  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||  || | ||  ||||||||||||   ||||||||| || ||||     
T  1959 agaagtagtcaccgaacccttagctggggtttcgacaaccatttccccattcatatatgacataataagacccaacttagtagcacaatcagcaacaata 2058  T
Q  167 aaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  2059 aaacaatgcgtagcaccagtatctataatagtaattaaaggagtactattaatgaaacatgtacctctgat 2129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 22171 - 22377
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  22171 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 22270  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  22271 acaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 22370  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  22371 ctctgat 22377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 78; Significance: 6e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 436 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 16584 - 16351
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||  |||| ||||| |||| || |  | |||||| ||||||||||||  || |||    
T  16584 acaagcattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaacctcagcaggagtatctttctttctaggcctcctctcatcattcaccctttgc 16485  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||   ||||||||| || | ||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |    
T  16484 ttacctttatcagcaggagcactataaggctttggacgactctgctgactcttacccctccgctcactcataaccttgtaatgagctttggtatcttcct 16385  T
Q  636 cataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaa 669  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16384 catagatcctgcaacttctcaccaattcagaaaa 16351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 180 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16840 - 16738
Alignment:
Q  180 caccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctcattcactgattgcgtacgagtcaaagcaaa 279  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16840 caccagtatcaataatagcaattaaaggagtacaattaaagaaacatgtacctctgatcaaccggtcctcattcactgtttgcgtaccagtcaaagcaaa 16741  T
Q  280 cac 282  Q
    |||    
T  16740 cac 16738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21576 - 21413
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||  ||||  | ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||    
T  21576 tcaaagtctcgaccaaacatcgagaacggacacttcagacacactagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttccccatcca 21477  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcacc 183  Q
    ||   || | ||| || ||||||||| | |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||    
T  21476 tacatgacataacaaggcccaacttagaagcacaatcagtagcaataaaacaatgcgtagcacc 21413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 237
Target Start/End: Original strand, 14873 - 15041
Alignment:
Q  69 aagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaa 168  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||||   |||||||||  |||||| ||    
T  14873 aagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattcatatcagacatgacaagacccaacttagtagcacaatcataagcaataaa 14972  T
Q  169 acaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||   | ||||||||||||||    
T  14973 acaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtattatcaatatagcaagtacctctgat 15041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 545 - 659
Target Start/End: Original strand, 15349 - 15463
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcc 644  Q
    ||||||||||||||||| |||||    ||||||||||| |||||  || | |||||| |||  | |||||||||||  || |||||||| ||||| ||||    
T  15349 tcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgttgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcatagatcc 15448  T
Q  645 tacaactgcttacca 659  Q
    | |||||||| ||||    
T  15449 tgcaactgctcacca 15463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Original strand, 13997 - 14193
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    |||||||| | | |||| ||||||||   ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  13997 tcaaagtcacgatcaaaaatagacaaagaacatcttaaacatacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattca 14096  T
Q  120 tatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||| | | | ||||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| ||||    
T  14097 tatcagacatagcaagacccaacttagtagcacaatcaaaagcaataaaacaatgcgtagcaccactatcaataatagcaactaaaggtgtactatt 14193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Original strand, 11291 - 11394
Alignment:
Q  134 agacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctc 233  Q
    ||||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||  ||||||||||||    
T  11291 agacccaacttagtagcacaatcaaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtactatcaaaataacaagtacctc 11390  T
Q  234 tgat 237  Q
    ||||    
T  11391 tgat 11394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 25242 - 25287
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25242 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaattaaaggagtactatt 25287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Original strand, 8149 - 8353
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | |    
T  8149 caaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacatatc 8248  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     || ||| ||| |   |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||| ||| | |  |||||||||||    
T  8249 aagtcccgactaagtagcacaatcaaaagcaataaaacaatgtgtagcactagtatcaataatagcaactaaaggcgtactatcacaataacaagtacct 8348  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  8349 ctgat 8353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 7)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Original strand, 54563 - 54767
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||| ||  |||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |  |     
T  54563 caaacatagaaaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattcatattagacatgaa 54662  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||||||||   |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||   | |||||||||    
T  54663 aagacccaacttagtagcacaatcataagcaataaaacaatgcgtagcaccaatatcaataatagcaactaaaggtgtattatcaatatagcaagtacct 54762  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  54763 ctgat 54767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 236
Target Start/End: Original strand, 31807 - 32012
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | | |    
T  31807 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagttaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcaaacaaa 31906  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
    || ||||||||   | | |||||||| | |||||| ||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  31907 acaagacccaaagcagaagcacaatcgaaagcaataaaataatgcgtaacaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 32006  T
Q  231 ctctga 236  Q
    ||||||    
T  32007 ctctga 32012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 236
Target Start/End: Original strand, 37307 - 37478
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | | ||| ||||||||   | | |||||||| | |||||    
T  37307 agagaagtagtaacagaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcaaacaaaacaagacccaaagcagaagcacaatcgaaagcaa 37406  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctga 236  Q
    | ||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||||||||    
T  37407 taaaataatgcgtaacaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctga 37478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10584 - 10412
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | | ||||||||   | |  ||||||| | || ||    
T  10584 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaatcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagtaa 10485  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | || ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||   | ||||||||||||||    
T  10484 taaagcaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtgttattaatatagcaagtacctctgat 10412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13239 - 13067
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | | ||||||||   | |  ||||||| | |   |    
T  13239 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaatcaagacccaaagcagaaacacaatcgatattta 13140  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | || ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||   | ||||||||||||||    
T  13139 taaatcaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagttttattaatatagcaagtacctctgat 13067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 10214 - 10152
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  10214 acaaacattactcttgtggcctttcccgccatagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatc 10152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 12869 - 12807
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  12869 acaaacattactcttgtggcctttcccgccatagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatc 12807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Original strand, 7194 - 7366
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||   | |  ||||||| | |||||    
T  7194 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaaacaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaa 7293  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  7294 taaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 7366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 76; Significance: 9e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40856 - 40681
Alignment:
Q  62 acaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacag 161  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||   |||||||||| ||    
T  40856 acaagagaagtagtcaccgaacccttagttggagtttcgacaaccatctctccattcatattagacataacaagacccaacttagtagcacaatcaaaag 40757  T
Q  162 caatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||| |||  | ||||||||||||||    
T  40756 caataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatggcaactaaaggtgtactatcaaaatagcaagtacctctgat 40681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Original strand, 8876 - 9077
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||    
T  8876 caaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcactgaacccttggctggagtttcgacaaccatttctccattcatatcagacatgac 8975  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||||||||   ||||||| |  ||||||   | |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||   | |||||||||    
T  8976 aagacccaacttagtagcacaataataagcaat---aaaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtattatcaatatagcaagtacct 9072  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  9073 ctgat 9077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 474 - 639
Target Start/End: Original strand, 2198 - 2363
Alignment:
Q  474 aacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacg 573  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||   |||    
T  2198 aacaaactatctcagcaggagcatctctcctattccgcctcctctcatcattcaacctttgctttcctttgtcagtaggggcactgtacggtttaggacg 2297  T
Q  574 actctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcata 639  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  2298 actctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtgtcctcctcata 2363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 234
Target Start/End: Original strand, 104153 - 104354
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  || | |||    
T  104153 caaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagttacctaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatttgacataac 104252  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
      ||||||| ||| | |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||| || |||||| ||| ||| |||  |||| ||||||    
T  104253 aggacccaaattagaagcacaatcaatagcaataaaacaatgcgtagcaccattatcaataatagaaactaaaggtgtactatcaaaataacatgtacct 104352  T
Q  233 ct 234  Q
    ||    
T  104353 ct 104354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 705
Target Start/End: Original strand, 104561 - 104824
Alignment:
Q  442 attactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccg 541  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |  | |||||||| |||  |||||||||| || |  | |||| | |||||||| ||| ||| || || ||     
T  104561 attactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcaaacaatctcaacaggagcatctttctttctaggccgcctctcatcaatcattctctgttttccc 104660  T
Q  542 ttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaa 641  Q
    || |||||||| |||||||| |||||   ||||||||| || || ||| || | |||||| |||  | |||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  104661 ttatcagcaggagcactataaggctttggacgactctgctgacctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttagtatcctcctcataaa 104760  T
Q  642 tcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||||||  | |  |||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  104761 tcctgcaactgctcaccagctcagaaaaagtacggatcttctggtaaccaattgcccgcttgat 104824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25090 - 24910
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||| ||  |||| |||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||    
T  25090 caaacatagataaaggacatcttaaacacacaagagatgtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctccattcatatcagacatgac 24991  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtatt 213  Q
     |||||  |||||   |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  24990 aagacctgacttagtagcacaatcataagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggcgtatt 24910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1192 - 1147
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  1192 aatgagtagcaccagtatctataattgcaatcaaaggagtactatt 1147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8117 - 7913
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||| ||| | | |    
T  8117 caaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagttttcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattaatattagacatagc 8018  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||| ||||   |||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||||    
T  8017 aagacccaccttagtagcacaatcaatagcaataaagcaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtactatcaaaataacaagtacct 7918  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  7917 ctgat 7913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Original strand, 17861 - 18065
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  17861 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 17960  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | |||| |||   | |  ||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||    
T  17961 tcaagactcaaagcagaaacacaatcataggcaataaagcaatgagtagcaccagtatcaataatagcaattaaaggagtattattaatatagcaagtac 18060  T
Q  231 ctctg 235  Q
    |||||    
T  18061 ctctg 18065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 11393 - 11599
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  11393 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 11492  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | |||| |||   | |  ||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  11493 tcaagactcaaagcagaaacacaatcataggcaataaagcaatgagtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 11592  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  11593 ctctgat 11599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 237
Target Start/End: Original strand, 55058 - 55134
Alignment:
Q  161 gcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  55058 gcaataaagcaatgagtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 55134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 53651 - 53719
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttc 99  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  53651 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 53719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 215
Target Start/End: Original strand, 1 - 148
Alignment:
Q  68 gaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatga 167  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||  || | ||| |||| | |||||| |    
T  1 gaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacataacaagacccaaagtagaagcataatcgaaagcaataa 100  T
Q  168 aacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattat 215  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  101 aacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattat 148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Original strand, 369 - 431
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||| ||||    
T  369 acaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacaaacaatctcagcaggaacatc 431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 608 - 666
Target Start/End: Original strand, 541 - 599
Alignment:
Q  608 accttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcaga 666  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  541 accttgtaatgagccttagtgtcctcctcataaatcctgcaactgctcaccaactcaga 599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 71; Significance: 9e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 10292 - 10498
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  10292 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 10391  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  10392 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaagcaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 10491  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  10492 ctctgat 10498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 71; Significance: 9e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 8182 - 8388
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  |||||   | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |      
T  8182 accaaacatagacaacggacaatgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaat 8281  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||| ||   | || ||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  8282 tcaagacctaaagcagatacacaatcgaaagcaataaagcaatgagtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 8381  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  8382 ctctgat 8388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 71; Significance: 9e-32; HSPs: 4)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 3348 - 3554
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  3348 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcatcgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 3447  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  3448 tcaagacccaaggcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 3547  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  3548 ctctgat 3554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Original strand, 17118 - 17290
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | | ||||||||   | |  ||||||| | |||||    
T  17118 agagaagtagtcatcgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaatcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaa 17217  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  17218 taaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagaaactaaaggagttttattaatataacaagtacctctgat 17290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 567
Target Start/End: Original strand, 17489 - 17620
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||  || |||| |||| | | |||||   || ||||||     
T  17489 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctatgt 17588  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggctt 567  Q
    || || || ||||||||||||||||| |||||    
T  17589 ttgcccttatcagcaggggcactatagggctt 17620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 545 - 639
Target Start/End: Original strand, 3859 - 3953
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcata 639  Q
    ||||| |||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  3859 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcata 3953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 461 - 669
Target Start/End: Original strand, 7911 - 8119
Alignment:
Q  461 tcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactat 560  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| || ||||| || ||| |||||||||||||||| ||||  || |||||| |||| ||||| |    
T  7911 tcaccacacttgtaacaaacaatctcagtaggaacatcccttctcttaggtctcctctcatcattcaatctctgctctcctttgtcaacaggagcactgt 8010  T
Q  561 acggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaa 660  Q
    | ||||||  |||||  || || ||||||   || ||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  8011 agggcttcggacgaccttgctgacccttgttcctccgctcactcctaaccttataatgagccttcgtatcctcctcataaattctacaactactcaccaa 8110  T
Q  661 ttcagaaaa 669  Q
    |||||||||    
T  8111 ttcagaaaa 8119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 536
Target Start/End: Original strand, 1244 - 1368
Alignment:
Q  412 gaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggc 511  Q
    ||||||||||||||| || |  |  |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||     
T  1244 gaagcacttcttctcctcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagtaggaacatcccttctcttaggt 1343  T
Q  512 ctcttctcatcattcaatctatgct 536  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||    
T  1344 ctcctctcatcattcaatctctgct 1368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35095 - 34911
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  35095 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagacgtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacata 34996  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattat 215  Q
    || ||||||||  || | |||||||| | | |||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  34995 acaagacccaaagtagaagcacaatcgaaaacaataaaacaatgcttagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattat 34911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Original strand, 41558 - 41762
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||  |||||||   | | | |    
T  41558 caaacatagacaaaggacatcttaaacacacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagttttgacaaccatctctctattcatattttacatagc 41657  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||  |||| ||||||    
T  41658 aagacccaacttagtagcacaatcaatagcaataaaacaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtactatcaaaataacatgtacct 41757  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  41758 ctgat 41762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Original strand, 75278 - 75482
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||  |||||||   | | | |    
T  75278 caaacatagacaaaggacatcttaaacacacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagttttgacaaccatctctctattcatattttacatagc 75377  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||  |||| ||||||    
T  75378 aagacccaacttagtagcacaatcaatagcaataaaacaatgtgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtactatcaaaataacatgtacct 75477  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  75478 ctgat 75482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 218
Target Start/End: Original strand, 942 - 1093
Alignment:
Q  67 agaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatg 166  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||   | |  ||||||||| ||||||     
T  942 agaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaaacaagacccaaaaaagaaacacaatcaaaagcaata 1041  T
Q  167 aaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaa 218  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  1042 aaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggtgtactattaa 1093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3561 - 3450
Alignment:
Q  20 tcaaagtctctaccaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttca 119  Q
    ||||| || |||||||||||||| |   |||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3561 tcaaaatccctaccaaacatagatataggacatctcaaacaaacaagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcaacgaccatttctcctttca 3462  T
Q  120 tatcagatacaa 131  Q
    ||||||||||||    
T  3461 tatcagatacaa 3450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 66; Significance: 8e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 237
Target Start/End: Original strand, 3524 - 3681
Alignment:
Q  80 gaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtag 179  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| | | | ||||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  3524 gaacccttagctagagtttcgacaaccatctctccattcatattagacatagcaagacccaacttagtagcacaatcaatagcaataaaacaatgcgtag 3623  T
Q  180 caccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||    
T  3624 caccagtatcaatgatagcaactaaaggtgtactatcaaaataacaagtacctctgat 3681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Original strand, 18576 - 18780
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |   |    
T  18576 caaacatagacaaaggacatcttaaacacacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccgttcatatcagacaactc 18675  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacct 232  Q
     ||||||||   | |  ||||||| | |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||| ||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||||    
T  18676 aagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaaacaatgcgtagcactagtatcaataatatcaactaaaggtgtactatcaaaataacaagtacct 18775  T
Q  233 ctgat 237  Q
    |||||    
T  18776 ctgat 18780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13470 - 13298
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| | | | ||||||||   | |  ||||||| | |||||    
T  13470 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctcttcattcatatcagacaaatcaagacccaaaccagaaacacaatcgaaagcaa 13371  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  13370 taaagcaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 13298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Original strand, 41079 - 41285
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  41079 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaa 41178  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  || |||| | |||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||    
T  41179 tcaagacccaaagcagaaacataatccaaagcaataaagcaatgcgtagccccagtgtcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtac 41278  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  41279 ctctgat 41285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 13099 - 13037
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  13099 acaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatc 13037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1412 - 1206
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  1412 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagaaaaa 1313  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||  || |  || | || | |||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |    
T  1312 tcaagacccaaagtagaaacaaagtcgaaagcaataaagcaatacgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatataacaagttc 1213  T
Q  231 ctctgat 237  Q
    |||||||    
T  1212 ctctgat 1206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 596 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 850 - 748
Alignment:
Q  596 cgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatag 695  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  850 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtatcatcctcataaatcctacagctactcaccaactcagaaaagtttctaatcttctgataaccaatgg 751  T
Q  696 ccc 698  Q
    |||    
T  750 ccc 748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 207
Target Start/End: Original strand, 4509 - 4683
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaac 132  Q
    |||||||||||||  |||  |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| | | |    
T  4509 caaacatagacaaaggacttcttaaacacacaagggaagtagtcaccgaaccctcagctggagtttcgacaaccatctctccattcatattagacatagc 4608  T
Q  133 cagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaagg 207  Q
     ||||||||||||   |||||||||| | |||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  4609 aagacccaacttagtagcacaatcaataacaataaaacaatgcgtagcaccaatatcaataatagcaactaaagg 4683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 63; Significance: 5e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 596 - 698
Target Start/End: Original strand, 25949 - 26051
Alignment:
Q  596 cgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatag 695  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  25949 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtatcatcctcataaatcctacagctactcaccaactcagaaaagtttctaatcttctgataaccaatgg 26048  T
Q  696 ccc 698  Q
    |||    
T  26049 ccc 26051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 61; Significance: 8e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1115 - 943
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | | | ||||||||   | |  ||||||| | |||||    
T  1115 agagaagtagtcaccgaacccttagctagagtttcgacaaccatctctccattcatgtcagacaaatcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaa 1016  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  1015 taaagcaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 436 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 744 - 613
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||  ||| ||||  |||||||| ||| |||| |||| | | |||||   || ||| ||     
T  744 acaaacattactcttgtggtctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccctcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 645  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggctt 567  Q
    || || || ||||||||||||||||| |||||    
T  644 ttgcccttatcagcaggggcactataaggctt 613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 61; Significance: 8e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 237
Target Start/End: Original strand, 21566 - 21734
Alignment:
Q  69 aagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaa 168  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| | ||| ||||||||  || | |||||||| | |||||| ||    
T  21566 aagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcaaatcagacataacaagacccaaagtagaagcacaatcgaaagcaataaa 21665  T
Q  169 acaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | |||| ||||||||  |||| |||||||||| ||| |||||||||||||   |||| |||||||||||    
T  21666 ataatgcgtagcaccgatatcaataatagcaactaagggagtattattaatataacatgtacctctgat 21734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 237
Target Start/End: Original strand, 36990 - 37158
Alignment:
Q  69 aagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaa 168  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| | ||| ||||||||  || | |||||||| | |||||| ||    
T  36990 aagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcaaatcagacataacaagacccaaagtagaagcacaatcgaaagcaataaa 37089  T
Q  169 acaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    | |||| ||||||||  |||| |||||||||| ||| |||||||||||||   |||| |||||||||||    
T  37090 ataatgcgtagcaccgatatcaataatagcaactaagggagtattattaatataacatgtacctctgat 37158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 234
Target Start/End: Original strand, 65 - 268
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagataca 130  Q
    |||||||||||| ||  |||| || | ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  65 accaaacatagataaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccaaacccttagctgaagtttcgacgaccatctctccattcatatcagacaaa 164  T
Q  131 accagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtac 230  Q
     | ||||||||   | |  ||||||| | |||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||    
T  165 tcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaaaaaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatataacaagtac 264  T
Q  231 ctct 234  Q
    ||||    
T  265 ctct 268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1914 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1914
Description:

Target: scaffold1914; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 404 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 1237 - 996
Alignment:
Q  404 ccacacctgaagcacttcttctcatc-tcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctc 502  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || || || || |||| || |||| |  ||    
T  1237 ccacatctgaaacacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtgacctttctcgccacacttaaagcatactatctcagcagaagcacccttc 1139  T
Q  503 ctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcac 602  Q
     |  | |||||| |||||||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||| ||||| |||||||    
T  1138 ttactcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttatcagccggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcac 1039  T
Q  603 tcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcct 645  Q
    || ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  1038 tcttcaccttataatgagctttggtgtcctcctcatagatcct 996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 542 - 708
Target Start/End: Original strand, 1 - 167
Alignment:
Q  542 ttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaa 641  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||  |||||  || || ||||||   || |||||| || | ||||| || |||||| | ||||||||||||||||    
T  1 ttgtcaacaggagcactatagggcttcggacgaccttgctgacccttgttcctccgctcattcctaaccttatagtgagctctcgtatcctcttcataaa 100  T
Q  642 tcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||    
T  101 tcctactgctgcttaccaattcagaaaaatttctaatcttctgataacctatggctctcttgatgtc 167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11698 - 11533
Alignment:
Q  69 aagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaa 168  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||| | | | ||||||||   | |  ||||||| | |||||| ||    
T  11698 aagtagtcaccgaacccttagctggagtttaaaaaaccatatctccattcatatcagacaaatcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaataaa 11599  T
Q  169 acaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctct 234  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  11598 gcaatgcgtagcaccagtatcaataatagaaactaaaggagtattattaatataacaagtacctct 11533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 11331 - 11269
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||    
T  11331 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgtaggagcatc 11269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 15016 - 14954
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||    
T  15016 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgtaggagcatc 14954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 826 - 674
Alignment:
Q  65 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaa 164  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | | ||||||||   | |  ||||||| | |||||    
T  826 agagaagtagttacctaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaatcaagacccaaagcagaaacacaatcgaaagcaa 727  T
Q  165 tgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatta 217  Q
    | || ||||| |||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||    
T  726 taaagcaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaacttaatgagtattatta 674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 436 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 455 - 240
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||  || |||| |||| | | |||||   || ||| ||     
T  455 acaaacattgctcttgtggcctttctcgccacaattgaaacaaacaatctccgtaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctttgt 356  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    || || || |||||||||||| |||| |||||    |||||||| || ||||||    | |||||| |||  |||||||||||||| || ||||||||||    
T  355 ttgcccttatcagcaggggcaatataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctctt 256  T
Q  636 cataaatcctacaact 651  Q
    |||| || ||||||||    
T  255 catagattctacaact 240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 151 - 282
Target Start/End: Original strand, 11072 - 11203
Alignment:
Q  151 acaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtccgtcctca 250  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||| || |  |  ||||||    
T  11072 acaatcaatagcaataaaacaatgagtagtaccagtatcaataataacaattaaatgagtactatcaaagtaacatgtacctctaatcaaacgatcctca 11171  T
Q  251 ttcactgattgcgtacgagtcaaagcaaacac 282  Q
    ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11172 ttctctgtttgcgtaccagtcaaagcaaacac 11203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 545 - 705
Target Start/End: Original strand, 11466 - 11626
Alignment:
Q  545 tcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcc 644  Q
    ||||||||||||||||| |||||   |||||| || || ||||||||| | | |||| |||  |||||||||||||| || ||||| || ||||| || |    
T  11466 tcagcaggggcactataaggcttgggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcctcatatattc 11565  T
Q  645 tacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    | |||||||| ||||  ||||||||||| |  |||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  11566 tgcaactgctcaccagctcagaaaagttacggatcttctggtaaccaattgcccgcttgat 11626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15894 - 15753
Alignment:
Q  96 tttcaacaaccatttctcctttcatatcagatacaaccagacccaacttatatgcacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataat 195  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | | ||||||||  || |  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15894 tttcgacaaccatctctccattcatatcagacaaatcaagacccaaagtagaaacacaatcgaaagcaattaaacaatgcgtagcaccagtatcaataat 15795  T
Q  196 agcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
     |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  15794 tgcaactaaaggagtattattaatataacaagtacctctgat 15753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 596 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 30843 - 30741
Alignment:
Q  596 cgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatag 695  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||| |    
T  30843 cgctcacacataaccttgtaatgagctttggtatcctcttcgtagattctacaactgctcaccaattcagaaaattgcctaatcctctgataaccaatgg 30744  T
Q  696 ccc 698  Q
    |||    
T  30743 ccc 30741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 413 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 31011 - 30895
Alignment:
Q  413 aagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcc 512  Q
    ||||||||||||||||| |  |  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||| ||||| |  |    
T  31011 aagcacttcttctcatcaccattgcaagcattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggaacatctcttctcttagttc 30912  T
Q  513 tcttctcatcattcaat 529  Q
    || ||||||||||||||    
T  30911 tcctctcatcattcaat 30895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 436 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 1397 - 1128
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| || || ||   | |||||||||  |||||||||   ||| |||||||||| | | ||||||||||||  || |||    
T  1397 acaaccattactcttgtgacctttctctcctcatcggtaacaaacaacttcagtaggattctctttcctcttgggtcccctctcatcattcaccctctgc 1298  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    | ||| || |||||||| | ||| || |||||   |||| ||||||| | ||| ||| | | ||||||||   |||||| ||||||||| |||||||| |    
T  1297 tcacccttatcagcaggagtactgtaaggctttggacgattctgttgactcttacctttcctctcactcacagccttgtgatgagctttcgtatcctcct 1198  T
Q  636 cataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||| || || |||||||| |||| || ||||||||| |  ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  1197 catagattctgcaactgctcaccagtttagaaaagttaccgatcttctgatatccaacggccctcttgat 1128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 126
Target Start/End: Original strand, 3527 - 3620
Alignment:
Q  33 caaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatatcaga 126  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  3527 caaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaaatagttaccgaaaccttagctgcagtttcgacaaccatctctccattcatatcaga 3620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1274 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1274
Description:

Target: scaffold1274; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 509 - 705
Target Start/End: Original strand, 20 - 215
Alignment:
Q  509 ggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatca 608  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||   |||||| || ||  |||||||| | | |||| |||  |    
T  20 ggcctcctctcatcattcaatctttgcttacccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctg-accttgcctttcctctcattcacaa 118  T
Q  609 ccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||||| ||||  ||||||||||| |  || ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  119 ccttgtaatgagctttggtatcttcctcatagattttgcaactgctcaccagctcagaaaagttacggattttctggtaaccaattgcccgcttgat 215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 237
Target Start/End: Original strand, 48719 - 48795
Alignment:
Q  161 gcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  48719 gcaataaagcaatgagtagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 48795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 237
Target Start/End: Original strand, 2907 - 2994
Alignment:
Q  150 cacaatcaacagcaatgaaacaatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    ||||||| | |||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  2907 cacaatcgaaagcaaaaaaacaatgcgtagcaccagtatcaataatagcaactaatggagtattattaatataacaagtacctctgat 2994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 571 - 702
Target Start/End: Original strand, 17703 - 17834
Alignment:
Q  571 acgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaag 670  Q
    ||||||||| |||||||| || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||    
T  17703 acgactctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttataatgagctttggtgtcttcttcataaattctgcaactgtttaccaactcagagaag 17802  T
Q  671 tttcttatcttctgataaccaatagccctctt 702  Q
      ||| |||| |||||| |||||||| |||||    
T  17803 actctgatctgctgatacccaatagctctctt 17834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 440 - 524
Target Start/End: Original strand, 36161 - 36245
Alignment:
Q  440 acattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcat 524  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||| | |||||| |||||||| ||||| || ||| |||||||||    
T  36161 acattactcttgtggcctttctcaccacacctgtagcaaacaatcttagtaggggcatctcttctcttaggtctcctctcatcat 36245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 242
Target Start/End: Original strand, 1364 - 1415
Alignment:
Q  191 ataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtc 242  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1364 ataatagctattaaaggagtactattcaagaaacaagtacctctgataagtc 1415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 410 - 663
Target Start/End: Original strand, 1583 - 1836
Alignment:
Q  410 ctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgg 509  Q
    ||||| || |||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||| |    
T  1583 ctgaaacatttcttctcatcttgggtgcaagcattactcttgtggcccttaacaccacatttgtaacaaacaacatcaacaggagcatttctccccttag 1682  T
Q  510 gcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcac 609  Q
    ||  | |||||||||||||||| || || || |||| || ||| | ||| || ||||||   |||||    || |||||    ||   ||| ||||||||    
T  1683 gctgcctctcatcattcaatctttgtttgcctttgttagtaggagaactgtagggcttcgggcgactactctgacccttattccttttctcgctcatcac 1782  T
Q  610 cttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattc 663  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  1783 cttataatgagcctttgtatcctcctcataaattctacagctactcaccaattc 1836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 122
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12678
Alignment:
Q  31 accaaacatagacaatagacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcctttcatat 122  Q
    |||||||||||||||  ||||  | | ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  12587 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctccattcatat 12678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 533 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 13932 - 13757
Alignment:
Q  533 tgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcct 632  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||   |||| |||| |||||||| || || | ||||||||| | ||| ||||||||||| || || |    
T  13932 tgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttttaatgagctttggtgtctt 13833  T
Q  633 cttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |||  ||| |||| |||||| | |||||| |||||||||||    
T  13832 cttcatagattctacacctgttaaccaactcagagaagactctgatctgctgatatctaatagctctcttgatgtc 13757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Original strand, 208 - 270
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  208 acaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatc 270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1600 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1600
Description:

Target: scaffold1600; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 509 - 705
Target Start/End: Original strand, 468 - 664
Alignment:
Q  509 ggcctcttctcatcattcaatctatgcttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatca 608  Q
    |||||| |||||||||||| ||| || ||||| || |||||||| || || || |||||    ||||| || || ||||| ||| | | ||||||||       
T  468 ggcctcctctcatcattcactctttgtttacccttatcagcaggagcgctgtaaggctttgggcgactttgctgacccttacctttcctctcactcacag 567  T
Q  609 ccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 705  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||||||  |||| |||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  568 ccttgtaatgagctttagtatcctcctcatagactctgcaactgcacaccagttcagaaaagttacggatcttttgatatccaatggccatcttgat 664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 436 - 567
Target Start/End: Original strand, 117 - 248
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||  || |||| |||| | | |||||   || ||| ||     
T  117 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 216  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggctt 567  Q
    || || || ||||||||||||||||| |||||    
T  217 tttcccttatcagcaggggcactatagggctt 248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 139585 - 139391
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  ||| ||||  |||| ||| ||| |||| |||| | | |||||   || ||| ||     
T  139585 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcaagtaatctcagctggagtatccctcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 139486  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatc 630  Q
    || || || ||||||||||||||||| |||||    |||||||| || ||||||    | |||||| |||  |||||||||||||| ||||||||    
T  139485 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagcctttgtatc 139391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 474
Target Start/End: Original strand, 179 - 217
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaa 474  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  179 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaa 217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 2635 - 2680
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2635 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtattatt 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 608 - 669
Target Start/End: Original strand, 2252 - 2313
Alignment:
Q  608 accttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaa 669  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||||||    
T  2252 accttgtaatgagctttcgtatcctcctcatagattctgcaactactcaccaattcagaaaa 2313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13571 - 13502
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataag 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |  |||||  |||||||||||||    
T  13571 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactattgataaaacacatacctctgataag 13502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 861 - 816
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  861 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5045 - 5000
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5045 aatgagtagcaccagtatcgataattgcaatcaaaggagtattatt 5000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 218
Target Start/End: Original strand, 171188 - 171229
Alignment:
Q  177 tagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaa 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  171188 tagcaccagtatcaataatagcaactaaaggagtattattaa 171229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 478
Target Start/End: Original strand, 171447 - 171489
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaa 478  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  171447 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgtaacaa 171489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0947 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0947
Description:

Target: scaffold0947; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 653 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 1307 - 1252
Alignment:
Q  653 cttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgatgtc 708  Q
    ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1307 cttaccaacccagagaagtttctaatcttctgataaccaatggctctcttgatgtc 1252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 497
Target Start/End: Original strand, 445 - 504
Alignment:
Q  438 aaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcat 497  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||| ||||||||    
T  445 aaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcat 504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0789 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0789
Description:

Target: scaffold0789; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 237
Target Start/End: Original strand, 1 - 68
Alignment:
Q  170 caatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgat 237  Q
    ||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  1 caatgcgtagcaccactatcaattatagcacttaaaggagtattattaatatagcaagtacctctgat 68  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 639
Target Start/End: Original strand, 5327 - 5530
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgc 535  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| || | |||||||||  || |||| |||| | | |||||   || ||| ||     
T  5327 acaaacattactcttatggcccttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 5426  T
Q  536 ttaccgttgtcagcaggggcactatacggcttctaacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctctt 635  Q
    || || || |||||| |||||||||| |||||    |||||||| || ||||||    | |||||| |||  |||||||||||||| || |||||||| |    
T  5427 ttgcccttatcagcaagggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcat 5526  T
Q  636 cata 639  Q
    ||||    
T  5527 cata 5530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 436 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 14007 - 13945
Alignment:
Q  436 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatc 498  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || | |||||||||    
T  14007 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgcaggagcatc 13945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 628 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 16306 - 16232
Alignment:
Q  628 atcctcttcataaatcctacaactgcttaccaattcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctctt 702  Q
    |||||| || |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||    
T  16306 atcctcctcgtaaatcctgcaactgctcaccagctcagaaaagtttcgaatcttctggtaaccaattgctctctt 16232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0848 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0848
Description:

Target: scaffold0848; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 443 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 4967 - 4874
Alignment:
Q  443 ttactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcttctcatcattcaatctatgct 536  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| || ||||||| || |||| |||||  |||  | ||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  4967 ttactcttgtgacccttctcaccacacctgtaacaaactatttcagcaggagtctcttccttcttgggcctcctctcgtcattcaacctatgct 4874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5544 - 5499
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  5544 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 5499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 26460 - 26505
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  26460 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 26505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 35149 - 35194
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  35149 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 35194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 24027 - 24072
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  24027 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 24072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 610 - 659
Target Start/End: Original strand, 2732 - 2781
Alignment:
Q  610 cttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacaactgcttacca 659  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  2732 cttgtaatgagtctttgtatcctcctcataaatcctgcaactgctcacca 2781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 8221 - 8266
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  8221 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 8266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 90566 - 90611
Alignment:
Q  171 aatgagtagcaccagtatctataatagcaattaaaggagtattatt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  90566 aatgagtagcaccagtatcaataattgcaatcaaaggagtactatt 90611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University