View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8209_low_5 (Length: 438)

Name: NF8209_low_5
Description: NF8209
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8209_low_5
NF8209_low_5
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (60-422)||(20774166-20774528)
chr5 (57-422)||(22462356-22462721)
chr5 (60-422)||(28894541-28894903)
chr5 (60-422)||(28916012-28916374)
chr5 (60-422)||(28923367-28923729)
chr5 (60-422)||(20821860-20822222)
chr5 (60-422)||(22235519-22235881)
chr5 (63-421)||(21890359-21890717)
chr5 (60-421)||(17268934-17269294)
chr5 (60-403)||(21563591-21563934)
chr5 (60-421)||(24716126-24716487)
chr5 (60-421)||(24619895-24620256)
chr5 (60-421)||(22503086-22503447)
chr5 (60-421)||(25848482-25848843)
chr5 (60-421)||(24749154-24749515)
chr5 (60-421)||(14886591-14886952)
chr5 (62-422)||(21831360-21831720)
chr5 (60-422)||(20342689-20343051)
chr5 (57-421)||(24797997-24798361)
chr5 (60-422)||(23079688-23080050)
chr5 (60-361)||(22381606-22381907)
chr5 (60-376)||(19770385-19770701)
chr5 (60-376)||(27668135-27668451)
chr5 (65-379)||(25423619-25423933)
chr5 (60-421)||(23471654-23472015)
chr5 (60-376)||(14999384-14999700)
chr5 (60-376)||(34566919-34567235)
chr5 (60-376)||(37291141-37291457)
chr5 (57-379)||(20467739-20468060)
chr5 (60-376)||(16356927-16357243)
chr5 (60-388)||(22332520-22332848)
chr5 (60-376)||(22348848-22349164)
chr5 (60-376)||(27610779-27611095)
chr5 (60-376)||(27685045-27685361)
chr5 (60-376)||(40709205-40709521)
chr5 (60-261)||(21339046-21339247)
chr5 (184-421)||(37542981-37543218)
chr5 (60-376)||(41771267-41771583)
chr5 (60-376)||(27518832-27519148)
chr5 (60-376)||(29475718-29476034)
chr5 (60-376)||(22135093-22135409)
chr5 (60-388)||(23574167-23574490)
chr5 (60-286)||(21497772-21497997)
chr5 (64-255)||(21496569-21496760)
chr5 (148-388)||(26738360-26738600)
chr5 (63-261)||(18776198-18776396)
chr5 (60-208)||(23516966-23517114)
chr5 (140-406)||(21407643-21407909)
chr5 (60-189)||(20799185-20799314)
chr5 (60-172)||(23440650-23440762)
chr5 (363-422)||(21680377-21680436)
chr5 (60-189)||(37545328-37545457)
chr5 (60-127)||(922-989)
chr5 (324-388)||(23440899-23440963)
chr5 (60-115)||(26738611-26738666)
chr5 (186-388)||(20799999-20800201)
chr5 (325-376)||(21338942-21338993)
chr5 (324-379)||(23517215-23517270)
chr5 (345-379)||(21936830-21936864)
chr5 (345-379)||(24581902-24581936)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (57-422)||(654-1019)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (57-422)||(20856250-20856615)
chr1 (60-422)||(20835377-20835739)
chr1 (60-422)||(22432605-22432967)
chr1 (60-422)||(19662626-19662992)
chr1 (60-422)||(20939552-20939914)
chr1 (60-421)||(19854821-19855174)
chr1 (60-421)||(31539487-31539848)
chr1 (60-421)||(24099093-24099454)
chr1 (60-421)||(37677588-37677949)
chr1 (60-421)||(20294920-20295281)
chr1 (60-388)||(21749449-21749777)
chr1 (56-388)||(50619767-50620099)
chr1 (60-376)||(16350134-16350450)
chr1 (60-388)||(22361767-22362095)
chr1 (60-376)||(51333028-51333344)
chr1 (60-376)||(21837458-21837774)
chr1 (60-376)||(33390564-33390880)
chr1 (60-376)||(21830811-21831127)
chr1 (60-376)||(17044550-17044866)
chr1 (60-286)||(16369805-16370031)
chr1 (60-208)||(19106875-19107023)
chr1 (123-379)||(20139401-20139657)
chr1 (56-388)||(19760389-19760721)
chr1 (321-421)||(21951678-21951778)
chr1 (129-388)||(20250379-20250638)
chr1 (60-172)||(16078391-16078503)
chr1 (60-172)||(41354208-41354320)
chr1 (60-133)||(41308333-41308406)
chr1 (345-379)||(20830924-20830958)
chr1 (324-376)||(16078191-16078243)
chr1 (324-376)||(20937686-20937738)
chr1 (324-376)||(41353197-41353249)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (57-422)||(95422-95787)
scaffold0029 (64-422)||(113087-113445)
scaffold0029 (60-376)||(109277-109593)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (60-421)||(27900879-27901240)
chr4 (60-421)||(15002782-15003143)
chr4 (60-421)||(15246417-15246778)
chr4 (60-421)||(1648695-1649056)
chr4 (62-422)||(15078130-15078490)
chr4 (60-422)||(8706411-8706773)
chr4 (60-392)||(15358537-15358869)
chr4 (60-420)||(15319644-15320004)
chr4 (60-421)||(3264212-3264573)
chr4 (60-422)||(33223416-33223778)
chr4 (60-421)||(11206649-11207010)
chr4 (60-421)||(29452955-29453316)
chr4 (56-422)||(14691391-14691757)
chr4 (60-421)||(20891475-20891836)
chr4 (62-421)||(44661284-44661643)
chr4 (60-422)||(15414443-15414805)
chr4 (56-421)||(14850524-14850889)
chr4 (63-376)||(16251648-16251961)
chr4 (60-376)||(8052826-8053142)
chr4 (60-376)||(8386905-8387221)
chr4 (60-376)||(12477093-12477409)
chr4 (60-376)||(14681060-14681376)
chr4 (60-376)||(27711829-27712145)
chr4 (60-376)||(29038607-29038923)
chr4 (56-384)||(1639620-1639948)
chr4 (60-388)||(7090925-7091253)
chr4 (60-376)||(12524169-12524485)
chr4 (60-388)||(15147076-15147403)
chr4 (60-376)||(40473533-40473849)
chr4 (60-376)||(18297698-18298014)
chr4 (60-376)||(19777996-19778312)
chr4 (60-376)||(23956240-23956556)
chr4 (60-376)||(14303181-14303497)
chr4 (60-393)||(16354631-16354964)
chr4 (63-376)||(18226649-18226962)
chr4 (67-384)||(14159970-14160287)
chr4 (129-205)||(18549694-18549770)
chr4 (345-379)||(15292618-15292652)
chr4 (62-100)||(16146409-16146447)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (63-421)||(67897-68255)
scaffold0034 (60-422)||(4373-4735)
scaffold0034 (60-421)||(13322-13683)
[»] chr6 (56 HSPs)
chr6 (60-422)||(15459693-15460055)
chr6 (60-422)||(34645148-34645510)
chr6 (60-422)||(21563694-21564056)
chr6 (60-422)||(21569553-21569915)
chr6 (60-421)||(25768548-25768909)
chr6 (60-422)||(19453777-19454139)
chr6 (64-422)||(21471962-21472320)
chr6 (60-421)||(8762496-8762857)
chr6 (60-422)||(14381029-14381391)
chr6 (60-421)||(5296769-5297130)
chr6 (62-399)||(17415845-17416182)
chr6 (60-422)||(27560179-27560541)
chr6 (60-421)||(22796195-22796556)
chr6 (60-421)||(18795047-18795408)
chr6 (60-412)||(28282385-28282737)
chr6 (63-422)||(19879658-19880017)
chr6 (60-422)||(10468411-10468773)
chr6 (60-421)||(24364769-24365130)
chr6 (60-376)||(1542692-1543008)
chr6 (60-388)||(18407538-18407866)
chr6 (60-376)||(24312776-24313092)
chr6 (60-393)||(5838810-5839143)
chr6 (56-388)||(15896447-15896779)
chr6 (60-388)||(19865044-19865372)
chr6 (60-391)||(28262790-28263121)
chr6 (60-391)||(28341539-28341870)
chr6 (60-376)||(16626325-16626641)
chr6 (60-376)||(29591528-29591844)
chr6 (123-376)||(20636909-20637162)
chr6 (60-376)||(2874411-2874727)
chr6 (60-388)||(22762051-22762379)
chr6 (64-391)||(28291965-28292292)
chr6 (67-388)||(27391769-27392090)
chr6 (60-388)||(25112909-25113237)
chr6 (67-388)||(27331029-27331350)
chr6 (60-388)||(22078286-22078614)
chr6 (57-376)||(25609469-25609788)
chr6 (60-388)||(16927236-16927564)
chr6 (60-388)||(23078826-23079154)
chr6 (60-376)||(27187793-27188109)
chr6 (60-376)||(27261131-27261447)
chr6 (60-379)||(22434226-22434545)
chr6 (63-328)||(11280161-11280426)
chr6 (57-196)||(17032737-17032876)
chr6 (123-421)||(18197291-18197589)
chr6 (60-143)||(1641129-1641212)
chr6 (60-203)||(16963148-16963291)
chr6 (354-422)||(19435653-19435721)
chr6 (147-379)||(22442711-22442943)
chr6 (60-207)||(27559765-27559912)
chr6 (123-208)||(21836973-21837058)
chr6 (345-379)||(1648419-1648453)
chr6 (156-286)||(18966984-18967114)
chr6 (348-379)||(23996893-23996924)
chr6 (345-379)||(16381978-16382012)
chr6 (363-413)||(19488843-19488893)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (60-421)||(6708-7069)
[»] chr3 (70 HSPs)
chr3 (60-422)||(10419690-10420052)
chr3 (60-421)||(13322298-13322659)
chr3 (60-422)||(14086795-14087157)
chr3 (60-422)||(13971765-13972127)
chr3 (60-422)||(17492752-17493114)
chr3 (60-422)||(18133991-18134353)
chr3 (60-413)||(12360196-12360549)
chr3 (60-421)||(16827849-16828209)
chr3 (60-421)||(16836156-16836517)
chr3 (60-422)||(13942146-13942508)
chr3 (63-421)||(14574054-14574406)
chr3 (60-412)||(8758737-8759089)
chr3 (60-412)||(41177644-41177996)
chr3 (60-421)||(11303419-11303780)
chr3 (60-421)||(28754440-28754801)
chr3 (60-421)||(47124066-47124427)
chr3 (60-412)||(4678560-4678912)
chr3 (60-422)||(44777369-44777731)
chr3 (60-364)||(15952671-15952975)
chr3 (60-421)||(10384091-10384451)
chr3 (60-413)||(16380582-16380935)
chr3 (60-421)||(16338158-16338519)
chr3 (60-375)||(15227771-15228086)
chr3 (60-421)||(9522831-9523192)
chr3 (60-403)||(16329324-16329668)
chr3 (60-393)||(12498360-12498693)
chr3 (60-393)||(16491866-16492199)
chr3 (60-376)||(10005712-10006028)
chr3 (60-388)||(17489962-17490290)
chr3 (60-391)||(6600848-6601179)
chr3 (273-422)||(11960814-11960963)
chr3 (60-376)||(5424632-5424948)
chr3 (60-376)||(10906322-10906638)
chr3 (60-376)||(13252802-13253118)
chr3 (60-376)||(16635885-16636201)
chr3 (60-376)||(43163209-43163525)
chr3 (60-391)||(53384705-53385036)
chr3 (60-376)||(48425559-48425875)
chr3 (61-208)||(14126464-14126611)
chr3 (60-376)||(15347947-15348263)
chr3 (60-376)||(20061756-20062072)
chr3 (57-388)||(16371522-16371853)
chr3 (60-242)||(12850104-12850286)
chr3 (63-376)||(16411984-16412297)
chr3 (57-388)||(14876188-14876520)
chr3 (60-376)||(15589094-15589410)
chr3 (63-391)||(16756272-16756600)
chr3 (57-355)||(15061865-15062163)
chr3 (62-376)||(15339383-15339697)
chr3 (63-376)||(26792101-26792414)
chr3 (60-376)||(15402212-15402528)
chr3 (60-376)||(16806628-16806944)
chr3 (63-388)||(15209006-15209331)
chr3 (63-376)||(15724636-15724949)
chr3 (60-286)||(16692272-16692502)
chr3 (64-388)||(15248263-15248587)
chr3 (60-208)||(11564551-11564699)
chr3 (72-261)||(15015573-15015762)
chr3 (57-115)||(11960986-11961044)
chr3 (21-57)||(14685174-14685210)
chr3 (366-422)||(31694831-31694887)
chr3 (366-422)||(31939331-31939387)
chr3 (60-99)||(26008961-26009000)
chr3 (345-379)||(8274098-8274132)
chr3 (345-379)||(13967039-13967073)
chr3 (345-379)||(30138213-30138247)
chr3 (345-379)||(30147764-30147798)
chr3 (345-422)||(16742359-16742436)
chr3 (21-57)||(10790579-10790615)
chr3 (69-233)||(18748796-18748960)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (121-421)||(468-768)
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (60-422)||(20975511-20975873)
chr8 (60-421)||(1266797-1267158)
chr8 (60-413)||(21840976-21841329)
chr8 (60-421)||(31416335-31416696)
chr8 (63-421)||(23655489-23655847)
chr8 (62-422)||(22061293-22061653)
chr8 (60-422)||(20388658-20389020)
chr8 (60-422)||(22371499-22371861)
chr8 (60-421)||(19851970-19852331)
chr8 (60-421)||(19858006-19858367)
chr8 (60-421)||(803534-803895)
chr8 (60-421)||(6679670-6680031)
chr8 (60-412)||(31570712-31571064)
chr8 (60-421)||(16271085-16271446)
chr8 (60-421)||(22051422-22051783)
chr8 (60-421)||(6604217-6604578)
chr8 (60-421)||(27355107-27355468)
chr8 (60-422)||(29303286-29303648)
chr8 (57-421)||(14565698-14566062)
chr8 (60-421)||(12305317-12305678)
chr8 (56-421)||(20395986-20396351)
chr8 (56-421)||(22377315-22377680)
chr8 (56-421)||(22383490-22383855)
chr8 (58-378)||(23949476-23949796)
chr8 (60-376)||(19113249-19113565)
chr8 (60-379)||(16407949-16408267)
chr8 (60-378)||(21393769-21394087)
chr8 (60-378)||(21788263-21788581)
chr8 (60-393)||(21251500-21251833)
chr8 (60-376)||(32600703-32601019)
chr8 (60-421)||(20009780-20010122)
chr8 (62-388)||(21921630-21921955)
chr8 (60-376)||(17673929-17674245)
chr8 (60-376)||(18857136-18857452)
chr8 (60-388)||(21166432-21166759)
chr8 (64-388)||(22040422-22040746)
chr8 (64-376)||(30313050-30313362)
chr8 (60-388)||(23650600-23650928)
chr8 (60-388)||(19978526-19978854)
chr8 (60-208)||(22046932-22047080)
chr8 (64-205)||(15533943-15534084)
chr8 (63-376)||(22164098-22164411)
chr8 (64-376)||(22120080-22120392)
chr8 (60-376)||(22132947-22133263)
chr8 (57-379)||(22987757-22988074)
chr8 (60-167)||(20017865-20017972)
chr8 (60-172)||(19484980-19485092)
chr8 (342-421)||(22248278-22248357)
chr8 (129-205)||(19863684-19863760)
chr8 (129-205)||(19868321-19868397)
chr8 (345-378)||(21850241-21850274)
chr8 (324-388)||(21043268-21043332)
chr8 (90-205)||(22129017-22129132)
chr8 (345-379)||(16876998-16877032)
chr8 (25-57)||(1733390-1733422)
chr8 (324-376)||(19483970-19484022)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (60-422)||(33097-33459)
scaffold0076 (222-422)||(56320-56520)
scaffold0076 (345-379)||(41067-41101)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (60-422)||(49934-50296)
scaffold0028 (60-376)||(43678-43994)
scaffold0028 (60-376)||(8998-9314)
scaffold0028 (60-208)||(15460-15608)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (60-422)||(6658-7020)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (60-422)||(51600-51962)
scaffold0067 (60-422)||(60634-60996)
scaffold0067 (60-422)||(67022-67384)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (60-422)||(118092-118454)
scaffold0004 (60-410)||(323228-323578)
scaffold0004 (60-422)||(202888-203250)
scaffold0004 (60-261)||(386343-386544)
scaffold0004 (57-286)||(112542-112771)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (60-422)||(27365036-27365398)
chr2 (60-422)||(19652009-19652371)
chr2 (60-421)||(24641866-24642227)
chr2 (213-421)||(27210130-27210338)
chr2 (60-422)||(23276900-23277262)
chr2 (60-422)||(24948713-24949075)
chr2 (60-412)||(12574477-12574829)
chr2 (60-421)||(1063875-1064236)
chr2 (60-421)||(20828383-20828744)
chr2 (60-421)||(20833109-20833470)
chr2 (60-408)||(21125130-21125476)
chr2 (60-412)||(27787865-27788217)
chr2 (60-421)||(31830782-31831143)
chr2 (60-292)||(23294082-23294314)
chr2 (108-422)||(23110907-23111221)
chr2 (60-421)||(11357832-11358193)
chr2 (60-388)||(24675613-24675941)
chr2 (63-376)||(27371396-27371709)
chr2 (60-376)||(9610260-9610576)
chr2 (60-388)||(21325257-21325585)
chr2 (60-376)||(27218140-27218456)
chr2 (60-376)||(16923013-16923329)
chr2 (60-376)||(16982276-16982592)
chr2 (60-376)||(17063841-17064157)
chr2 (60-376)||(17067499-17067815)
chr2 (60-376)||(22324859-22325175)
chr2 (60-376)||(24707485-24707801)
chr2 (123-388)||(23107721-23107986)
chr2 (63-376)||(24262497-24262810)
chr2 (60-376)||(10868974-10869290)
chr2 (60-376)||(16925484-16925800)
chr2 (60-376)||(16999124-16999440)
chr2 (60-388)||(22756456-22756784)
chr2 (60-286)||(23064201-23064427)
chr2 (63-376)||(21145044-21145357)
chr2 (60-373)||(41608391-41608704)
chr2 (60-376)||(24876752-24877068)
chr2 (316-422)||(23294315-23294421)
chr2 (60-208)||(24710157-24710305)
chr2 (60-208)||(44385740-44385888)
chr2 (62-208)||(20442684-20442830)
chr2 (60-208)||(23189131-23189279)
chr2 (69-422)||(45529644-45529997)
chr2 (60-259)||(30211037-30211236)
chr2 (200-421)||(24819644-24819865)
chr2 (56-189)||(24825472-24825605)
chr2 (222-388)||(21890709-21890875)
chr2 (345-376)||(22276687-22276718)
chr2 (317-376)||(24710415-24710474)
chr2 (321-376)||(44385572-44385627)
chr2 (345-378)||(12640234-12640267)
chr2 (81-234)||(25128792-25128945)
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (62-422)||(14285780-14286140)
chr7 (63-422)||(13666023-13666382)
chr7 (60-422)||(6413994-6414356)
chr7 (60-421)||(13021840-13022201)
chr7 (60-421)||(19147694-19148055)
chr7 (60-421)||(20747093-20747454)
chr7 (60-421)||(15102008-15102369)
chr7 (57-421)||(11305668-11306032)
chr7 (60-412)||(18053367-18053719)
chr7 (60-422)||(14130356-14130718)
chr7 (60-422)||(23505274-23505636)
chr7 (60-422)||(14434174-14434536)
chr7 (60-421)||(14263649-14264010)
chr7 (60-421)||(49152784-49153145)
chr7 (63-421)||(16071699-16072057)
chr7 (192-422)||(19613290-19613520)
chr7 (60-421)||(16949876-16950237)
chr7 (60-422)||(11387832-11388194)
chr7 (57-422)||(15340911-15341276)
chr7 (60-422)||(12206204-12206566)
chr7 (56-379)||(15625030-15625353)
chr7 (60-421)||(8211533-8211894)
chr7 (58-421)||(812-1175)
chr7 (60-421)||(12456185-12456546)
chr7 (60-421)||(13968073-13968434)
chr7 (58-412)||(11771677-11772031)
chr7 (60-421)||(26118010-26118371)
chr7 (60-376)||(12687983-12688299)
chr7 (237-422)||(12457300-12457485)
chr7 (60-376)||(9596539-9596855)
chr7 (60-376)||(18551230-18551546)
chr7 (60-376)||(8199110-8199426)
chr7 (60-376)||(44790823-44791139)
chr7 (60-387)||(14040178-14040504)
chr7 (60-387)||(14350208-14350534)
chr7 (60-376)||(11236685-11237001)
chr7 (60-376)||(8708087-8708403)
chr7 (60-376)||(10871477-10871793)
chr7 (60-376)||(11552574-11552890)
chr7 (60-376)||(13686546-13686862)
chr7 (60-376)||(14332879-14333195)
chr7 (60-376)||(15160529-15160845)
chr7 (56-388)||(15154117-15154449)
chr7 (60-376)||(18178224-18178540)
chr7 (64-376)||(16788-17100)
chr7 (69-403)||(21662452-21662786)
chr7 (60-233)||(14955102-14955275)
chr7 (93-376)||(23203085-23203368)
chr7 (93-376)||(23509212-23509495)
chr7 (247-379)||(321506-321638)
chr7 (69-233)||(4440419-4440583)
chr7 (60-118)||(23199451-23199509)
chr7 (345-379)||(27107243-27107277)
chr7 (60-96)||(12457262-12457298)
chr7 (21-53)||(14325743-14325775)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (60-422)||(19644-20006)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (60-421)||(27749-28110)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (60-422)||(41443-41803)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (60-422)||(21091-21453)
scaffold0235 (136-422)||(10877-11163)
[»] scaffold0298 (5 HSPs)
scaffold0298 (60-421)||(20507-20868)
scaffold0298 (60-338)||(12865-13143)
scaffold0298 (60-338)||(16635-16913)
scaffold0298 (334-422)||(11477-11565)
scaffold0298 (334-422)||(15247-15335)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (60-413)||(40262-40615)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (67-422)||(25285-25640)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (60-422)||(48627-48989)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (60-422)||(46819-47181)
scaffold0010 (60-421)||(41754-42115)
scaffold0010 (60-421)||(2445-2806)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (60-421)||(10317-10678)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (60-421)||(27048-27409)
scaffold0192 (60-238)||(26666-26844)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (62-421)||(17958-18317)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (62-421)||(3277-3636)
scaffold0035 (129-205)||(12833-12909)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (67-422)||(195124-195479)
scaffold0011 (57-421)||(149091-149455)
scaffold0011 (58-410)||(25965-26317)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (60-422)||(4872-5234)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (153-421)||(5830-6098)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (60-420)||(5757-6117)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (63-422)||(100972-101331)
scaffold0020 (62-388)||(180725-181051)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (60-422)||(944-1306)
scaffold0120 (60-376)||(6547-6863)
scaffold0120 (324-376)||(12846-12898)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (60-403)||(114704-115052)
scaffold0001 (60-261)||(90513-90714)
scaffold0001 (56-379)||(390663-390986)
scaffold0001 (121-261)||(89835-89975)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (60-418)||(6660-7019)
scaffold0149 (60-418)||(11091-11450)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (60-422)||(44029-44391)
scaffold0114 (60-422)||(45041-45403)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (63-421)||(47651-48009)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (60-422)||(6456-6818)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (136-421)||(2188-2473)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (60-421)||(51284-51645)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (81-422)||(81252-81593)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (57-413)||(12215-12570)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (162-422)||(13719-13979)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (60-422)||(11293-11655)
[»] scaffold0053 (3 HSPs)
scaffold0053 (203-421)||(57268-57486)
scaffold0053 (57-421)||(48455-48819)
scaffold0053 (60-118)||(57541-57599)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (60-421)||(1393-1754)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (60-421)||(4954-5315)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (60-421)||(393-754)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (60-421)||(5274-5635)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (60-421)||(570-931)
scaffold0139 (60-187)||(28043-28170)
scaffold0139 (60-187)||(34296-34423)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (57-422)||(260829-261194)
scaffold0005 (60-376)||(278296-278612)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (136-422)||(7660-7946)
scaffold0222 (60-422)||(2775-3137)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (60-402)||(31934-32276)
scaffold0106 (60-393)||(14563-14896)
scaffold0106 (60-208)||(17965-18113)
scaffold0106 (140-376)||(18321-18557)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (64-403)||(28207-28546)
scaffold0064 (64-403)||(40198-40537)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (60-421)||(2318-2679)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (60-421)||(3315-3676)
scaffold0403 (60-393)||(6896-7229)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (60-383)||(2336-2657)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (63-421)||(249140-249498)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (60-413)||(43307-43660)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (62-422)||(19375-19735)
scaffold0090 (62-422)||(23537-23897)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (60-338)||(11412-11690)
scaffold0124 (60-241)||(5-186)
scaffold0124 (334-422)||(12996-13084)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (200-422)||(528-750)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (60-422)||(24492-24853)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (60-421)||(16134-16495)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (213-422)||(5-210)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (172-421)||(14618-14867)
scaffold0261 (172-421)||(22797-23046)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (60-421)||(17883-18233)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (60-422)||(32739-33101)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (60-421)||(26785-27146)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (201-373)||(49437-49609)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (123-422)||(12081-12380)
scaffold0483 (60-143)||(9782-9865)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (56-421)||(1428-1793)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (60-388)||(19126-19454)
scaffold0081 (60-261)||(50017-50218)
scaffold0081 (123-388)||(34613-34878)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (56-403)||(25158-25505)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (62-421)||(218838-219197)
scaffold0012 (56-388)||(229563-229895)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (60-421)||(4555-4916)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (61-393)||(19451-19783)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (60-388)||(32207-32534)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (60-393)||(6573-6906)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (56-421)||(3660-4025)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (60-379)||(1991-2310)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (60-399)||(15859-16198)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (238-421)||(20096-20279)
scaffold0104 (238-421)||(22916-23099)
scaffold0104 (60-241)||(1052-1233)
scaffold0104 (141-241)||(12582-12682)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (58-375)||(3872-4189)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (58-375)||(9118-9435)
scaffold0109 (58-376)||(33039-33357)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (56-412)||(9490-9846)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (60-376)||(160-476)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (60-388)||(14884-15212)
scaffold0044 (60-376)||(1144-1460)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (197-413)||(28718-28934)
scaffold0026 (60-202)||(37726-37868)
scaffold0026 (170-388)||(29578-29797)
[»] scaffold0600 (2 HSPs)
scaffold0600 (60-234)||(4399-4573)
scaffold0600 (341-422)||(4581-4662)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (123-388)||(39465-39730)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (60-388)||(277-605)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (60-388)||(63485-63813)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (60-399)||(14522-14861)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (64-388)||(3911-4232)
scaffold0023 (60-237)||(130672-130849)
scaffold0023 (60-259)||(28963-29161)
scaffold0023 (69-195)||(59287-59413)
scaffold0023 (324-388)||(28826-28890)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (60-421)||(15401-15762)
scaffold0040 (63-376)||(112953-113266)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (60-388)||(3268-3596)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (60-260)||(13011-13211)
scaffold0293 (324-376)||(13256-13308)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (60-388)||(220-548)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (60-376)||(7921-8237)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (60-388)||(4553-4881)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (60-376)||(7463-7779)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (60-388)||(16179-16507)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (60-286)||(18761-18987)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (60-393)||(25498-25831)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (270-422)||(482-633)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (60-236)||(622-798)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (76-388)||(2914-3226)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (333-421)||(7566-7654)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (60-376)||(7890-8206)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (60-376)||(22391-22707)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (136-388)||(8541-8793)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (64-376)||(65933-66245)
scaffold0042 (60-388)||(39274-39601)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (60-234)||(68199-68373)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (90-387)||(4425-4722)
scaffold0270 (90-387)||(11555-11852)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (60-376)||(938-1254)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (57-388)||(1197-1528)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (56-379)||(116368-116691)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (60-379)||(196941-197260)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (60-388)||(6538-6866)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (60-376)||(8314-8630)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (60-379)||(5745-6064)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (60-261)||(80075-80276)
scaffold0022 (56-88)||(126953-126985)
[»] scaffold0379 (2 HSPs)
scaffold0379 (200-388)||(7345-7533)
scaffold0379 (56-172)||(12647-12763)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (345-421)||(20862-20938)
scaffold0077 (345-379)||(27729-27763)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (60-207)||(844-991)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (216-422)||(10228-10434)
scaffold0130 (60-154)||(10428-10522)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (60-376)||(7797-8110)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (69-403)||(5031-5364)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (60-286)||(9867-10093)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (63-187)||(4953-5077)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (136-388)||(24098-24350)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (62-388)||(1791-2117)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (60-199)||(1523-1662)
scaffold0413 (324-388)||(1681-1745)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (322-421)||(17467-17566)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (363-422)||(34015-34074)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (200-421)||(11618-11839)
scaffold0018 (200-421)||(17810-18031)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (139-422)||(85938-86213)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (345-386)||(880-921)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (224-295)||(17524-17595)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (147-234)||(71830-71917)
scaffold0021 (81-234)||(33021-33174)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (345-379)||(3338-3372)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (345-379)||(3967-4001)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (345-379)||(24203-24237)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (345-395)||(3391-3441)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (345-379)||(44347-44381)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (69-234)||(182-347)
[»] scaffold1701 (1 HSPs)
scaffold1701 (21-53)||(28-60)
[»] scaffold1001 (1 HSPs)
scaffold1001 (60-100)||(195-235)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 20774166 - 20774528
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20774166 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaaccttg 20774265  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20774266 ggtctctgtctgacactatactcgacggaaccccatgcaatttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 20774365  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20774366 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgtcctctcgaagtattaggtaaacttgacacaaaatccatagaa 20774465  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20774466 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgt 20774528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 57 - 422
Target Start/End: Original strand, 22462356 - 22462721
Alignment:
Q  57 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22462356 ctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacc 22462455  T
Q  157 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22462456 ttgggtctctatctgacactatacttgacggaactccatgcaacttaacaatattctaaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 22462555  T
Q  257 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 356  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22462556 aatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 22462655  T
Q  357 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22462656 gaaatgatatcccatttccactctggtacctccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 22462721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28894903 - 28894541
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28894903 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacacatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttg 28894804  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28894803 ggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatttccgccaactgagctactggataactgatattaat 28894704  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28894703 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccatatcgaatcatgtcctctcggagtattaggcaaacttgtcacaaaatccatagaa 28894604  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28894603 atactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgt 28894541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28916374 - 28916012
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28916374 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttg 28916275  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28916274 ggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatttccgccaactgagctactggataactgatattaat 28916175  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28916174 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccatatcgaatcatgtcctctcggagtattaggcaaacttgtcacaaaatccatagaa 28916075  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28916074 atactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgt 28916012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28923729 - 28923367
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28923729 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttg 28923630  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28923629 ggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatttccgccaactgagctactggataactgatattaat 28923530  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28923529 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccatatcgaatcatgtcctctcggagtattaggcaaacttgtcacaaaatccatagaa 28923430  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28923429 atactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgt 28923367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 20821860 - 20822222
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20821860 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaacctcg 20821959  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20821960 ggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatttccgccaactgagctactggataacttatattaat 20822059  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20822060 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcaactacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacgaaatccatagaa 20822159  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20822160 atactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaatcccgcaggcctctgatgt 20822222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 22235881 - 22235519
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| ||||| ||||| |||||||    
T  22235881 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccttg 22235782  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||    
T  22235781 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactaagctaccgaataactaatattaat 22235682  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22235681 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaaccaatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 22235582  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  22235581 atgctatctcacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctacaggcttctgatgt 22235519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 63 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 21890717 - 21890359
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| || |    
T  21890717 gactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggat 21890618  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 262  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||     
T  21890617 ctctatccgacacaatactcgatggaactccatggaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgatcgg 21890518  T
Q  263 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 362  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||| |  || |||||||| || | ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21890517 aataaagtgtgtcgacttcgtcaacctatagacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattttgtaaactcgtcacaaaatccatggaaatg 21890418  T
Q  363 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
     | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  21890417 ttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaacccttcaggcttctgatg 21890359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 17269294 - 17268934
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | | ||||||| |||||||   | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  17269294 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaatt-agtctcaatttcgaacccagagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 17269196  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17269195 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 17269096  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  17269095 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 17268996  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  17268995 atgctatcccatttccactctggtacatccaacggtgtcaacaatcctgcaggtttctgatg 17268934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 60 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 21563934 - 21563591
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21563934 tccgactgaccatatgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21563835  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||    
T  21563834 gatctctatccgacacaatgctcgatggaacaccatgcagcttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattaat 21563735  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || | ||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  21563734 cggaataaaatgcgccgacttcgtcaatctatcaacaactacccaaatggcatcgtgccctcttggagtattcggtaaacttgtcacaaaatccatggat 21563635  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21563634 atgctatcccatttccactccggcacatccaatggtgtcaacaa 21563591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 24716487 - 24716126
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||| |    
T  24716487 tccgactgaccatctgtctgaggatgctaagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcg 24716388  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
      |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24716387 aatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccatattatgaatgtaaatctctgccaactctgctaccggataactaatatttat 24716288  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | |||||| || ||||||||||||||||  || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||    
T  24716287 tggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttgctaaactcgtcacgaaatccatagaa 24716188  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  24716187 ataatgtcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatg 24716126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 24620256 - 24619895
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||| |    
T  24620256 tccgactgaccatctgtctgaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcg 24620157  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
      |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24620156 aatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccatattatgaatgtaaatctctgccaactctgctaccggataactaatatttat 24620057  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | |||||| || ||||||||||||||||  || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||    
T  24620056 tggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttgctaaactcgtcacgaaatccatagaa 24619957  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  24619956 ataatgtcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatg 24619895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 22503086 - 22503447
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  22503086 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 22503185  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22503186 gatccctatccgacacaatgctcgatggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattaat 22503285  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22503286 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctttcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 22503385  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  22503386 atactgtcccacttccactccgatacatccaacggtgacaacaaccctgcaggcttctgatg 22503447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 25848482 - 25848843
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || |||||| |  |||| || || ||||| ||||| |    
T  25848482 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaattcttccagaacctagaagtgaacctcg 25848581  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  25848582 gatctctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctactggataactgatattgat 25848681  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| ||||| ||||||||| |||||| ||| || |||||||| || |  |||||| | |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  25848682 aggaataaagtgtgccgacttcatcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgctctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 25848781  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  25848782 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 25848843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 24749515 - 24749154
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||| |    
T  24749515 tccgactgaccatctgtctaaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcg 24749416  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
      |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24749415 aatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccatattatgaatgtaaatctctgccaactctgctaccggataactaatatttat 24749316  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | |||||| || ||||||||||||||||  || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||    
T  24749315 tggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttgctaaactcgtcacgaaatccatagaa 24749216  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  24749215 ataatgtcccatttccactccagtacatccaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatg 24749154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 14886952 - 14886591
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  14886952 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 14886853  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14886852 gatctctatctgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattaat 14886753  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || | |||||| ||  ||| ||| || |||||||| || ||||||||||| ||     
T  14886752 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcatcatgtcctttcgaagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatggag 14886653  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14886652 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 14886591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 62 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21831720 - 21831360
Alignment:
Q  62 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 161  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| |     
T  21831720 cgactgaccatgtgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttcga 21831621  T
Q  162 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 261  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||| |  |||| |||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| || |    
T  21831620 tctctatctgacacaatgctcgacagaacacggtgcagcttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattgattg 21831521  T
Q  262 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 361  Q
     ||| |||||||||||||||| ||| || || || || ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  | ||    
T  21831520 gaataaagtgcgccgacttcgacaatctatcaacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaatcttgttacaaaatccatgcatat 21831421  T
Q  362 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||| ||||||||    
T  21831420 gctatctcattttcactccggcacatctaacggtgtcaacaacccagtaggcttctgatgt 21831360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 20342689 - 20343051
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  20342689 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 20342788  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  20342789 gatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattgat 20342888  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| ||||||||| |||||| ||| || || ||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  20342889 aggaatgaagtgtgccgacttcctcaaccggtcgacaacgacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 20342988  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20342989 atactgtcccacttccactccggtacgtccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 20343051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 57 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 24798361 - 24797997
Alignment:
Q  57 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 156  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||    
T  24798361 ctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcagtttcgaccccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 24798262  T
Q  157 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 256  Q
    | || || ||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24798261 tcggatccctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatatt 24798162  T
Q  257 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 356  Q
    ||| | |||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || | |||||| ||  ||| ||| || |||||||| || |||||||||||     
T  24798161 aataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcatcatgtcctttcgaagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatg 24798062  T
Q  357 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24798061 gagatactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 24797997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 23080050 - 23079688
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  23080050 tccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcaaacccaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 23079951  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
      || ||||| || || ||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23079950 aatccctatccgatacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatgctatgaacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattaat 23079851  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
       |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23079850 atgaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 23079751  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||  | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23079750 atattgtccgacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 23079688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 361
Target Start/End: Original strand, 22381606 - 22381907
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  22381606 tccgactgaccatctgcctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 22381705  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| || ||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22381706 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatgttttgaacataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 22381805  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22381806 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctatcaaccagaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 22381905  T
Q  360 at 361  Q
    ||    
T  22381906 at 22381907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 19770385 - 19770701
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19770385 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 19770484  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  19770485 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 19770584  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  19770585 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtatttggcaaacttgtcacaaaatccatggat 19770684  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  19770685 atactatcccatttcca 19770701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27668451 - 27668135
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27668451 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27668352  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27668351 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 27668252  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27668251 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 27668152  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  27668151 atactatcccatttcca 27668135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 379
Target Start/End: Original strand, 25423619 - 25423933
Alignment:
Q  65 ctgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtct 164  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  25423619 ctgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaccttggatct 25423718  T
Q  165 ctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaa 264  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||| || ||||| ||||| ||||  || ||| |||| |||||||||| ||    
T  25423719 ctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatatctcgaatataaatctctgccaattgagaaacaggaaaactaatattaatcggaa 25423818  T
Q  265 tgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgct 364  Q
      || || ||| |||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  25423819 gaaaatgagccaacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatact 25423918  T
Q  365 atcccatttccactc 379  Q
    |||||||||||||||    
T  25423919 atcccatttccactc 25423933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 23471654 - 23472015
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||  |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  23471654 tccgactgaccatctgtctacggatgatacgcctaactaaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 23471753  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||  ||||| | ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  23471754 gatctctatctgatacaatgcttgaaggaaaaccatgtagcttcacaatattgcgaatgtaaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatattaat 23471853  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| || || |||||||||||||| || || || |  || || ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  23471854 cggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaattacacaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 23471953  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  |||||||    
T  23471954 atgctatcccatttccactatggtatatctaaaggtgttatcaaccctgcaggtttctgatg 23472015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 14999700 - 14999384
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||  |||| || |||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14999700 tccgactgaccatatgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14999601  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  14999600 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 14999501  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  14999500 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 14999401  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  14999400 atactatcccatttcca 14999384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 34566919 - 34567235
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  34566919 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 34567018  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  34567019 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 34567118  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  34567119 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 34567218  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  34567219 atactatcccatttcca 34567235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 37291457 - 37291141
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  37291457 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 37291358  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  37291357 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 37291258  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||     
T  37291257 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtgtttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 37291158  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  37291157 atactatcccatttcca 37291141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 57 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 20468060 - 20467739
Alignment:
Q  57 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 156  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  20468060 ctttcagactggccatctgtctgcggataatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacc 20467961  T
Q  157 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 256  Q
    | || ||||||||||| || || || ||| |||| ||||| | |||||||||||   | ||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  20467960 tcggatctctatctgatacaatgcttgacagaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaatctccgtcaactgagatacaggacaactgatatt 20467861  T
Q  257 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 356  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| |||  | |||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  20467860 aatcggaatgaa-tgagccgacttcgtcaatctatccacaatcacccaaatagtgtcattcccttttggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatg 20467762  T
Q  357 gaaatgctatcccatttccactc 379  Q
    || || |||||||||||||||||    
T  20467761 gatatactatcccatttccactc 20467739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 16356927 - 16357243
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16356927 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16357026  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16357027 gatccctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16357126  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16357127 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 16357226  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  16357227 atactatcccatttcca 16357243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22332848 - 22332520
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22332848 tccgactgaccatctttctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22332749  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || |||||||||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  22332748 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctccgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 22332649  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22332648 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22332549  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22332548 atactatcccacttccattccggcacatc 22332520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 22348848 - 22349164
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22348848 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctctgcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22348947  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  22348948 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 22349047  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || ||||||||||||||||| || || | |||||  || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22349048 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaataaccctaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 22349147  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  22349148 atactatcccatttcca 22349164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 27610779 - 27611095
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27610779 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacaccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27610878  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27610879 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27610978  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || || ||||| |||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27610979 aggtagaaaatgagctgactttgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27611078  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  27611079 atactatcccatttcca 27611095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27685361 - 27685045
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27685361 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27685262  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27685261 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 27685162  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27685161 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 27685062  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  27685061 atactatcccatttcca 27685045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 40709205 - 40709521
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  40709205 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 40709304  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  | || ||||||||    
T  40709305 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttaacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaagctaatattaat 40709404  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  40709405 cggtagaaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 40709504  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  40709505 atactatcccatttcca 40709521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21339247 - 21339046
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || || ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  21339247 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 21339148  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  21339147 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcgaatataaatctccgccaactgagacacaggaaaactgatattaat 21339048  T
Q  260 cg 261  Q
    ||    
T  21339047 cg 21339046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 184 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 37543218 - 37542981
Alignment:
Q  184 acggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgt 283  Q
    ||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||    
T  37543218 acggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgactttgt 37543119  T
Q  284 caacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggt 383  Q
    ||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| |||    
T  37543118 caaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagataatgtcccacttccactctggt 37543019  T
Q  384 acatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  37543018 acatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 37542981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 41771267 - 41771583
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  41771267 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctgaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 41771366  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||| ||||    
T  41771367 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatactaat 41771466  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  41771467 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 41771566  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  41771567 atactatcccatttcca 41771583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 27518832 - 27519148
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27518832 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgtcgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27518931  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27518932 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27519031  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27519032 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27519131  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  27519132 atactatcccatttcca 27519148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 29476034 - 29475718
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || |||||| |  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  29476034 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttcgaaccccaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 29475935  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | || ||| || ||||| ||||| || || || ||  |||| ||||||||    
T  29475934 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttaatataaatctctgccaattgggcaacagggaaactaatattaat 29475835  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  29475834 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 29475735  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  29475734 atactatcccatttcca 29475718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 22135093 - 22135409
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22135093 tccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22135192  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  22135193 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 22135292  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || ||||| |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22135293 cggtagaaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 22135392  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  22135393 atactatcccatttcca 22135409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Original strand, 23574167 - 23574490
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  23574167 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 23574266  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||  ||  ||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  23574267 gatcaataaatgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttccttaatatagatctctgccaactgggcaaccggaaaactaatattaat 23574366  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||     || || |  |||||  | |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  23574367 cggtagaaaatgagccgacttcgtca-----tcaacaatcacccaatttgtgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 23574461  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  23574462 atactatcccatttccactctggcacatc 23574490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21497997 - 21497772
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| ||| || |||||||||  |||||||| ||||    
T  21497997 tccggctgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaaattttccaaaatccagaagtaaatcttg 21497898  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  21497897 gatctctatctgacacaatgctcga-agaacaccatgcaacttcacaatatcatgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 21497799  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 286  Q
    || ||  || || ||||||||||||||    
T  21497798 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaa 21497772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 255
Target Start/End: Original strand, 21496569 - 21496760
Alignment:
Q  64 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 163  Q
    ||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||  | || || |||||||   ||| ||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  21496569 actgaccatctatttgcgaatgataagccgaactcaaccttaacttagaacccagggcattttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatc 21496668  T
Q  164 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 255  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  21496669 tctatccgacacaatacttgatggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatataaatatccgccaactgagctaccggaaaactaatat 21496760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26738600 - 26738360
Alignment:
Q  148 aagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggata 247  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||| ||||  || ||| |    
T  26738600 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcgaatgtaaatttccgccaattgagaaacaggaaa 26738501  T
Q  248 actgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcaca 347  Q
    | ||||||||||   || ||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||    
T  26738500 attgatattaattagaaggaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcaca 26738401  T
Q  348 aaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26738400 aaatccatggatatgctatcacatttccactctggtacatc 26738360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 261
Target Start/End: Original strand, 18776198 - 18776396
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  18776198 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaggcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggat 18776297  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 261  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||| ||| | ||  || || ||||||||||| || || || ||| |||| ||||||||||    
T  18776298 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcataatctccttgatttaaatctccgccaattgggcaacaggaaaactaatattaatcg 18776396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 208
Target Start/End: Original strand, 23516966 - 23517114
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||    
T  23516966 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaaccctcttgcaaactctttcaaaatctagaagtaaatcttg 23517065  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 208  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  |||||||    
T  23517066 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatctcacaat 23517114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 406
Target Start/End: Original strand, 21407643 - 21407909
Alignment:
Q  140 aaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagct 239  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |   | || || |||||||||||||||| |    
T  21407643 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgtagcttcacaatctcacggatataaatctccgccaactgagat 21407742  T
Q  240 actggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaac 339  Q
    || ||| ||||||| ||||||| ||| || || ||||||||||| |   | || || |  ||||| |||| || ||| ||  | |||||||| || ||||    
T  21407743 acaggaaaactgatgttaatcggaataaaatgggccgacttcgttagtgtatccacaattacccaaatcgcataatgtccttttggagtattcggaaaac 21407842  T
Q  340 ttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacc 406  Q
    | |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||||||||    
T  21407843 tcgtcacaaaatccatggatatattatcccacttccactctggaatatctaaaggtgtcaacaaacc 21407909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 189
Target Start/End: Original strand, 20799185 - 20799314
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| |||| || |||||||| || ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  20799185 tccgactgaccatctgtccgcggataataagccaaactcaatctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaacttttccaaaatctaaaagtaaatcttg 20799284  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaa 189  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  20799285 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 20799314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 172
Target Start/End: Original strand, 23440650 - 23440762
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  23440650 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttg 23440749  T
Q  160 ggtctctatctga 172  Q
    | |||||||||||    
T  23440750 gatctctatctga 23440762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21680436 - 21680377
Alignment:
Q  363 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  21680436 ctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggtttctgatgt 21680377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 37545457 - 37545328
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | || |||||| || |||| || || ||||| ||||| |    
T  37545457 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaaattttccagaacctagaagtgaacctcg 37545358  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaa 189  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||    
T  37545357 gatctctatccgacacaatgctagacggaa 37545328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 989 - 922
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttg 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||    
T  989 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttg 922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 388
Target Start/End: Original strand, 23440899 - 23440963
Alignment:
Q  324 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  23440899 ggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 23440963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 26738666 - 26738611
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacc 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  26738666 tccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttagaacc 26738611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 388
Target Start/End: Original strand, 20799999 - 20800201
Alignment:
Q  186 ggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtca 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| | || ||||||||||  |  || || |||||||| ||||    
T  20799999 ggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaacctaatattaatcggtagaaaatgagccgactttgtca 20800098  T
Q  286 acctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtac 385  Q
    | || || |  | |||||| || |  |||| ||| || |||||||| |||||||  |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||    
T  20800099 atctatcaataataacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggtaaacgcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcac 20800198  T
Q  386 atc 388  Q
    |||    
T  20800199 atc 20800201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21338993 - 21338942
Alignment:
Q  325 gagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 376  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21338993 gagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttcca 21338942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 379
Target Start/End: Original strand, 23517215 - 23517270
Alignment:
Q  324 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 379  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  23517215 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactc 23517270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 21936864 - 21936830
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21936864 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 21936830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Original strand, 24581902 - 24581936
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24581902 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 24581936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 57 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 1019 - 654
Alignment:
Q  57 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 156  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||     
T  1019 ctttccgaatgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttcaagtaaact 920  T
Q  157 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 256  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  919 ttgggtctctatttgacactatactcgacggaaccccatgcaatttcacaatattctgaatgtagatctccgctaactgagctactggataactgatatt 820  T
Q  257 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 356  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  819 aatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 720  T
Q  357 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  719 gaaatgttatcccatttccactctggtacttccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 57 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20856615 - 20856250
Alignment:
Q  57 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 156  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20856615 ctttccgactgaccatatgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacc 20856516  T
Q  157 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20856515 ttgggtctctatctgacactatacttgacggaacaccatgcaacttaacaatattctaaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 20856416  T
Q  257 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 356  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20856415 aatcagaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 20856316  T
Q  357 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20856315 gaaatgatatcccatttccactctggtacctccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 20856250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20835739 - 20835377
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||| | ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  20835739 tccgattgaccgtctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtcagctcttccagaatctagaagtgaacctcg 20835640  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20835639 gatccctatccgacacaattctcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 20835540  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| || |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20835539 cggaataaaatgcgtcgactttgtcaacatgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 20835440  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20835439 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 20835377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 22432967 - 22432605
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || ||  |||| ||||| |    
T  22432967 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctataagtgaacctcg 22432868  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22432867 gatccctatccgacacaatactcgaaggaacttcatgcagcttcacaattttctgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 22432768  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22432767 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaattatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 22432668  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22432667 atgctatcccatttccactctggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 22432605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19662992 - 19662626
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||||||  |||||||||| || || ||||| |    
T  19662992 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcg 19662893  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19662892 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 19662793  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||    
T  19662792 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccacatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccataaaa 19662693  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggt----acatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||| ||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  19662692 atgctataccacttccactccggccggcacatccaacggtgtcaacaactctgcaggcttctgatgt 19662626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20939914 - 20939552
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    |||| ||  ||||||| || ||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  20939914 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcggcctcaacttctaacccaaaacgtcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 20939815  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  20939814 gatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcattatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccgaataattgatattaat 20939715  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20939714 cgaaataaagtgcgtcgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagcgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 20939615  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||   |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20939614 ataaaatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 20939552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 19854821 - 19855174
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  19854821 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 19854920  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  19854921 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcaccatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgat 19855020  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||||||||||||        |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19855021 cggaataaagtgcgccgactt--------tgtcaaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 19855112  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  19855113 atgctatcccacttccactctggcacatccaacggtgtcaacaaccccgcaggcttctgatg 19855174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 31539848 - 31539487
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  31539848 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacttcattttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 31539749  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31539748 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 31539649  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||     
T  31539648 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggcaaactcgtcacaaaatccatagag 31539549  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31539548 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 31539487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 24099454 - 24099093
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||  ||||||| |||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  24099454 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 24099355  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || || || | ||||||||| || ||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  24099354 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaatgttatgaacataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattgat 24099255  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | |||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24099254 tggaatgaaatgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatagcatcatgccctctcgtagtgttcggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 24099155  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24099154 atactgtcccatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 24099093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 37677588 - 37677949
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  37677588 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 37677687  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37677688 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattaat 37677787  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||     
T  37677788 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactagttacaaaatccatagag 37677887  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  37677888 atactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 37677949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 20294920 - 20295281
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || |||| |||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  20294920 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtagactcttccagaacctagaagtgaacctcg 20295019  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  20295020 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctaccgagtaactgatattaat 20295119  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || | |||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||     
T  20295120 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaataacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagag 20295219  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20295220 ataatgtcccacttccagtccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20295281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Original strand, 21749449 - 21749777
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21749449 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21749548  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  21749549 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 21749648  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  21749649 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggat 21749748  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  21749749 atactatcccatttccactctggcacatc 21749777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 56 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 50620099 - 50619767
Alignment:
Q  56 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||     
T  50620099 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaat 50620000  T
Q  156 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 255  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    ||| || ||||| ||||||||||  ||  || |||||||||    
T  50619999 cttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatttcacaatatcacaaatataaatctctgccaactgagaaacaagaaaactgatat 50619900  T
Q  256 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 355  Q
    ||||||  ||||| || ||| |||||||||| || || || |  ||||| ||||  ||||  || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  50619899 taatcgggatgaaatgagccaacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcatttcctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 50619800  T
Q  356 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
     || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  50619799 ggatatactatcccatttccactctggtacatc 50619767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16350450 - 16350134
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16350450 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16350351  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  | || ||||||||    
T  16350350 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaagctaatattaat 16350251  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  16350250 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 16350151  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  16350150 atactatcccatttcca 16350134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22362095 - 22361767
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||  |||| || || |  ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22362095 tccgactgaccatatgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagatcttaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22361996  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||| |   || ||| |||| ||||||||    
T  22361995 ggtctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatataaatctccgccaactaataaacaggaaaactaatattaat 22361896  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  || | |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22361895 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcgttccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22361796  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  22361795 atactatcccatttccactctggcacatc 22361767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 51333344 - 51333028
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  51333344 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 51333245  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  51333244 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 51333145  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  51333144 cggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 51333045  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  51333044 atactatcccatttcca 51333028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 21837458 - 21837774
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21837458 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21837557  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  21837558 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 21837657  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  21837658 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctgggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21837757  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  21837758 atactatcccatttcca 21837774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 33390880 - 33390564
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  33390880 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 33390781  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  33390780 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 33390681  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||     
T  33390680 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctaggagtattcgacaaactcgtcacaaaatccatggat 33390581  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  33390580 atactatcccatttcca 33390564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 21830811 - 21831127
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21830811 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21830910  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| ||||| || || || ||  |||| ||||||||    
T  21830911 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaattgggcaacagggaaactaatattaat 21831010  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    |   |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  21831011 ctgtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggaaaactcgtcacaaaatccatggat 21831110  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  21831111 atactatcccatttcca 21831127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 17044866 - 17044550
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  17044866 tccgactgaccatctgtctgcagatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttg 17044767  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| ||||| || || || ||| |||| ||||||||    
T  17044766 gatctctgtctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaattgggcaacaggaaaactaatattaat 17044667  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || ||| |||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | ||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  17044666 cggtagaaaatgagccaacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccctctctgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 17044567  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  17044566 atactatcccatttcca 17044550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 286
Target Start/End: Original strand, 16369805 - 16370031
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||  | || ||  | ||||| ||||   |||||||||| |||||||| || |    
T  16369805 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttatagcctaaagcctcttgcaaacccttccaaaatctagaagtaaatctcg 16369904  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   |||| || ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  16369905 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactgagctataggaaaactgatattaat 16370004  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 286  Q
    || |||||| || ||||||||||||||    
T  16370005 cggaatgaaatgagccgacttcgtcaa 16370031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 208
Target Start/End: Original strand, 19106875 - 19107023
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||  |||    
T  19106875 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatattg 19106974  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 208  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19106975 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 19107023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 379
Target Start/End: Original strand, 20139401 - 20139657
Alignment:
Q  123 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 222  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| |    
T  20139401 tcttgtaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcccaaatgtaaa 20139500  T
Q  223 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 322  Q
    | || |||||| |||  || ||  |||| |||||||||| ||  || || || ||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| ||    
T  20139501 tttctgccaaccgagaaacagggaaactaatattaatcggaagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgtgtcattccctct 20139600  T
Q  323 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 379  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  20139601 aggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactc 20139657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 19760721 - 19760389
Alignment:
Q  56 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||  | ||||| |||||  || ||||||| || ||||||    
T  19760721 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacttcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactcttctaaaatctagaggtaaac 19760622  T
Q  156 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 255  Q
    || || | |||||| || || ||  |||| ||||| ||||| | |||||||||||     ||||| |||||||| |||| || |||  || |||||||||    
T  19760621 ctcggatttctatccgatacaatgttcgatggaacaccatgtagcttcacaatatcgcagatgtaaatctccgctaactaagatacatgaaaactgatat 19760522  T
Q  256 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 355  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||| || || || |  ||||| || |  ||||  ||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  19760521 taatcgaaattaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatagcgtcatttcctttcggagtactcggcaaacttgtcacaaaatccat 19760422  T
Q  356 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
     || || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  19760421 ggatatactatctcatttccactctggcacatc 19760389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 321 - 421
Target Start/End: Original strand, 21951678 - 21951778
Alignment:
Q  321 ctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgat 420  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21951678 ctcggagtgttcggcaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgat 21951777  T
Q  421 g 421  Q
    |    
T  21951778 g 21951778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 388
Target Start/End: Original strand, 20250379 - 20250638
Alignment:
Q  129 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccg 228  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||| | ||||||||||   |||| || ||||| |    
T  20250379 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatttctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgccaattcacaatatcacgaatataaatctctg 20250478  T
Q  229 ccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagt 328  Q
    |||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  | || |||  | |||||    
T  20250479 ccaactgagaaacaggaaaactgatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtaattccctttaggagt 20250578  T
Q  329 attaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| || |||||    
T  20250579 attcggaaaactcgtcacaaaatccatgtatatactatcccatttccactctggcacatc 20250638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16078503 - 16078391
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  16078503 tccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaagccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 16078404  T
Q  160 ggtctctatctga 172  Q
    | |||||||||||    
T  16078403 gatctctatctga 16078391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 41354320 - 41354208
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  41354320 tccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 41354221  T
Q  160 ggtctctatctga 172  Q
    | |||||||||||    
T  41354220 gatctctatctga 41354208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Original strand, 41308333 - 41308406
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaact 133  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| |||||    
T  41308333 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaact 41308406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 20830958 - 20830924
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20830958 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 20830924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16078243 - 16078191
Alignment:
Q  324 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 376  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  16078243 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 16078191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 376
Target Start/End: Original strand, 20937686 - 20937738
Alignment:
Q  324 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 376  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  20937686 ggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 20937738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 41353249 - 41353197
Alignment:
Q  324 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 376  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  41353249 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 41353197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 57 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 95787 - 95422
Alignment:
Q  57 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  95787 ctttccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaacc 95688  T
Q  157 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  95687 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatattctggatgtagatttccgccaactgagctactgggtaacttatatt 95588  T
Q  257 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 356  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  95587 aatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcaacaacaacccatatagaatcgtgtcctctcggggtattgggtaaacttgtcacgaaatccata 95488  T
Q  357 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  95487 gaaatactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgt 95422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 64 - 422
Target Start/End: Original strand, 113087 - 113445
Alignment:
Q  64 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 163  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| || || ||||| |  ||    
T  113087 actgaccatctttctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcgaatc 113186  T
Q  164 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 263  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||| || ||||| |||||||| || || | | |||||||||| || | |    
T  113187 tctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcagcttcacaatgtcccgaatataaatctctgccaactgcgccaccgtaaaactgatatttattgga 113286  T
Q  264 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 363  Q
    || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||||| |    
T  113287 ataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgactacaacccatattgaatcatgtcctctcggagtgtttggtagactcgtcacgaaatccatagaaatac 113386  T
Q  364 tatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  113387 tatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 113445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 109593 - 109277
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  109593 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 109494  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  109493 gttctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 109394  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||     
T  109393 aggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaattccatcgat 109294  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  109293 atactatcccatttcca 109277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 27900879 - 27901240
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |    
T  27900879 tccgactgaccatctgtctacggatgataagctgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccccg 27900978  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27900979 ggtctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcatcttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaactgagctactggataactgatattaat 27901078  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27901079 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 27901178  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27901179 atgctgtcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatg 27901240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 15003143 - 15002782
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  15003143 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 15003044  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||    
T  15003043 ggtctctttccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaaccgagctaccggataactaacattgat 15002944  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  15002943 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 15002844  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||| | ||||| |||| ||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  15002843 atgatctcccacttccgctctggcacatctaacggtgtcaacaacactgcaggcttctgatg 15002782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 15246417 - 15246778
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  15246417 tccgactgaccatctgtctggggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 15246516  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
      |||||||| || || |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  15246517 aatctctatccgatacaatactcgacgaaactccatgtaacttcacaatattgtgaatataaatctctgccaactgagctattggataactaatattgat 15246616  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  15246617 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagaa 15246716  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15246717 atgctatcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 15246778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 1649056 - 1648695
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  || ||||||| ||||| ||||| |    
T  1649056 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttctaaaatctggaagtgaacctcg 1648957  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| | |||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  1648956 gatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgaagcttcacaatatgatgaatataaatctcagccaactgagctaccgaataactaatattaat 1648857  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | |||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1648856 aggaatgaaatgtgccgacttagtcaacctatcgaccacaacccatatagaattatgccctctcggagtattaggtaaactcgttacaaaatccatagaa 1648757  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1648756 atgctgtcccatttccactccagtatatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatg 1648695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 62 - 422
Target Start/End: Original strand, 15078130 - 15078490
Alignment:
Q  62 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 161  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||     
T  15078130 cgactgaccatttgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtaaacctcgga 15078229  T
Q  162 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 261  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  15078230 tctctatccgacacaatactcgatggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctccaccaactaagctaccggaaaactaatattgatcg 15078329  T
Q  262 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 361  Q
     ||| || |||||||||||| ||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||    
T  15078330 gaataaaatgcgccgacttcatcaacctttcaacaacaacccaaatggtatcatgccctctcggagtattcgataaactcgtcacaaaatccatggaaat 15078429  T
Q  362 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    | | ||||| |||||||| || ||||| || |||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  15078430 gttgtcccacttccactctggcacatctaatggtgtcattaaccctgcaggcttctgatgt 15078490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 8706411 - 8706773
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || |||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8706411 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaactcaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8706510  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||    
T  8706511 gatctctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcagcttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattgat 8706610  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||| || | ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  8706611 tggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcaacaaccacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatggat 8706710  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  8706711 atgctatctcatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaacccagcaggcttctgatgt 8706773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 60 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15358869 - 15358537
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| | |||  ||| |||||||||||| ||||| |    
T  15358869 tccgactgaccatctctctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcagactcttcccaaatcttgaagtgaacctcg 15358770  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15358769 gatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 15358670  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||    
T  15358669 tggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcagaaaatccatagaa 15358570  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaac 392  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15358569 atactgtcccatttccactccggcacatccaac 15358537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 60 - 420
Target Start/End: Original strand, 15319644 - 15320004
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  | |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  15319644 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 15319743  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  15319744 gatctctatctgacacaatgctcgatgggacaccatgcaacttcacaatattatgaatataaatttccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 15319843  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  || || ||| |||| ||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||     
T  15319844 cgggataaaatgccccgagttcgtcaacctatcaacaacaacccaaatggtatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggag 15319943  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgat 420  Q
    ||| | ||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15319944 atgttgtcccacttccactctcgcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgat 15320004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 3264573 - 3264212
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  3264573 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 3264474  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3264473 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 3264374  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  3264373 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 3264274  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3264273 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 3264212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 33223416 - 33223778
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||| ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  33223416 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 33223515  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||  | ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  33223516 gatctctatccgacacaatactcgacgggacaccatgtagcttcacaatgctatgaacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattgat 33223615  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||| ||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  33223616 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaatccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 33223715  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  33223716 atactgtcccacttccattccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 33223778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 11207010 - 11206649
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  || | || || ||||| |||||      
T  11207010 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttcaagaacctagaagtgaacctca 11206911  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11206910 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtatatctctgctaactgcgctaccggataactgatattaat 11206811  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  11206810 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaatcggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 11206711  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11206710 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 11206649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 29453316 - 29452955
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  29453316 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 29453217  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  29453216 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatgttaat 29453117  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  29453116 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 29453017  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  29453016 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 29452955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 56 - 422
Target Start/End: Original strand, 14691391 - 14691757
Alignment:
Q  56 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  14691391 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 14691490  T
Q  156 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 255  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  14691491 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcgggaatgtaaatctccaccaactgaggtacaggaaaactgatat 14691590  T
Q  256 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 355  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| |  ||||| ||||  |||| |||  ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  14691591 tactcgaaatgaaatgagccgacttcgtcaatccatctacaatcacccaaatcgcgtcattccctttcgaagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 14691690  T
Q  356 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  14691691 ggatatgctatcccatttccactctggtacatctaacggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatgt 14691757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 20891475 - 20891836
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  |||| ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  20891475 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 20891574  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||| |||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||| | ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  20891575 gatctttatccgacacaatacttgacggtacaccgtgcaacttcacaatactatgaacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattgat 20891674  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||     
T  20891675 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtagactcgtcacgaaatccatagag 20891774  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||    
T  20891775 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcatcaaccctgtaggcttctgatg 20891836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 62 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 44661643 - 44661284
Alignment:
Q  62 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 161  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| ||     
T  44661643 cgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcgga 44661544  T
Q  162 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 261  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||| || |    
T  44661543 tctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataattgatattgatag 44661444  T
Q  262 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 361  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  44661443 gaatgaagtgtgccgactttgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagat 44661344  T
Q  362 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  44661343 actatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccccgcaggcttctgatg 44661284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 15414805 - 15414443
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||    
T  15414805 tccgactggctatctgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagatgtaaatcttg 15414706  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||| ||||| |||||||  || || | | |||| ||||||||    
T  15414705 gatctctatccgacacaatacttgacggaacaccatgcagcttcacaatatcacgaatgtaaatctctgccaactatgccaccgaaaaactaatattaat 15414606  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||| || |||||||| || || || || || | |||||| | ||||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||     
T  15414605 cggaataaagtgtgctgacttcgttaatctatcaacaaccagccatatggcatcatgccctctcgaagtattcagtaaacttgttacaaagtccatggat 15414506  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||| ||| || |||||| ||||||||    
T  15414505 atgctatcccatttccactctggcacatctaatggtttcagcaacccagcaggcttctgatgt 15414443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 56 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 14850889 - 14850524
Alignment:
Q  56 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  14850889 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 14850790  T
Q  156 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 255  Q
    ||  | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||| ||  ||||||||||||  || ||| |||| ||||    
T  14850789 ctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatcgcgaatgtaaattcccgccaactgagaaacaggaaaactcatat 14850690  T
Q  256 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 355  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||  |||| |||  || ||||||| || |||||  ||||||||| |||    
T  14850689 taatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatctacaatcacccaaatcgcgtcattccctttctgagtattcggaaaactcatcacaaaatacat 14850590  T
Q  356 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
     || ||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  14850589 ggatatgttatcccatttccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 14850524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16251961 - 16251648
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  16251961 gactgaccatctgtctgcgaatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 16251862  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 262  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||     
T  16251861 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcgg 16251762  T
Q  263 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 362  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||     
T  16251761 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccccctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgaatata 16251662  T
Q  363 ctatcccatttcca 376  Q
    ||||||||||||||    
T  16251661 ctatcccatttcca 16251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8053142 - 8052826
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8053142 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8053043  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| || ||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  8053042 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgctaactgggcaacagggaaactaatattaat 8052943  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || || ||||||||||||||||| || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8052942 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctgtcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 8052843  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  8052842 atactatcccatttcca 8052826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 8386905 - 8387221
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8386905 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8387004  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  8387005 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 8387104  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8387105 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 8387204  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  8387205 atactatcccatttcca 8387221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 12477093 - 12477409
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  12477093 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 12477192  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  12477193 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 12477292  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  12477293 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 12477392  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  12477393 atactatcccatttcca 12477409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 14681060 - 14681376
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14681060 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14681159  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| || || || ||||| ||||  ||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  14681160 gatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctccgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 14681259  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  14681260 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 14681359  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||| ||||||    
T  14681360 atactatcccttttcca 14681376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 27711829 - 27712145
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27711829 tccgactgaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27711928  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27711929 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27712028  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27712029 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgtgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27712128  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  27712129 atactatcccatttcca 27712145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 29038923 - 29038607
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  29038923 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 29038824  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  29038823 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 29038724  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  29038723 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 29038624  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  29038623 atactatcccatttcca 29038607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 56 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1639948 - 1639620
Alignment:
Q  56 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 155  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| |  |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||     
T  1639948 tctttccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccaaactccacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaat 1639849  T
Q  156 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattct-gaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgata 254  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||| | || || ||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  1639848 cttggatctctatctgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaat-ttctcggatataaatctctgtcaactgagctacgggaaaactgata 1639750  T
Q  255 ttaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatcca 354  Q
    ||||||| ||  || || |||| ||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  1639749 ttaatcggaagaaaatgagccgtcttcgtcaatctatcgacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatcca 1639650  T
Q  355 tagaaatgctatcccatttccactccggta 384  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  1639649 tggatatgctatcccacttccactctggta 1639620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Original strand, 7090925 - 7091253
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| || ||||||| ||||||||  |||    
T  7090925 tccgactgactatctgtctgcggatgatatgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttctaaaatctagaagtaaattttg 7091024  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattct-gaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaa 258  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||  || ||| |||| |||||||    
T  7091025 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat-ttctcgaatatagatctctgccaactgagaaacaggaaaactaatattaa 7091123  T
Q  259 tcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccataga 358  Q
    ||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||  ||||  |||| |||  | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||    
T  7091124 tcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcaccctaatcgcgtcattccctttaggagtattcgacaaacttgtcacaaaatccatgga 7091223  T
Q  359 aatgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
     || ||||||||||||||||| || |||||    
T  7091224 tatactatcccatttccactctggcacatc 7091253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 12524169 - 12524485
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| || |    
T  12524169 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcg 12524268  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| || ||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  12524269 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgctaactgggcaacaggaaaactaatattaat 12524368  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  12524369 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 12524468  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  12524469 atactatcccatttcca 12524485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15147403 - 15147076
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  ||||||||||  ||||||| ||||    
T  15147403 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgtcgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtaaatcttg 15147304  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||||||||  ||||||  || |  ||| |||||||||||||    
T  15147303 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttccttaatatagatctctaccaactaggcaataggaaaactgatattaat 15147204  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||     
T  15147203 cg-tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaactatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcgacaaactcgtcacaaaatccatggat 15147105  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  15147104 atactatcccatttccactctggcacatc 15147076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 40473533 - 40473849
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| ||  |||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  40473533 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 40473632  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||  |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  40473633 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctttgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 40473732  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  40473733 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 40473832  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  40473833 atactatcccatttcca 40473849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 18297698 - 18298014
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  18297698 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccgaaatctagaagtaaatcttg 18297797  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  18297798 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 18297897  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||     
T  18297898 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaattcatggat 18297997  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  18297998 atactatcccatttcca 18298014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 19778312 - 19777996
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19778312 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 19778213  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||   | || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  19778212 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttggtataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 19778113  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  19778112 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 19778013  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  19778012 atactatcccatttcca 19777996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 23956240 - 23956556
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23956240 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaacttaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 23956339  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  23956340 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 23956439  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  23956440 aggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 23956539  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  23956540 atactatcccatttcca 23956556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 14303497 - 14303181
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14303497 tccgactaaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14303398  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  14303397 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 14303298  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  14303297 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 14303198  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  14303197 atactatcccatttcca 14303181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16354964 - 16354631
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  16354964 tccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 16354865  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | | ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  | ||| || ||||  |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  16354864 gatatctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgaaacttcacaatctctttaatataaatctttgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 16354765  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  |||| ||| |   ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16354764 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcattccctccatgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16354665  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 393  Q
    || |||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  16354664 atactatcccatttccattctggcacatctaacg 16354631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18226962 - 18226649
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  18226962 gactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcctccaaaatctagaagtaaatcttggat 18226863  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 262  Q
    ||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||  || || ||| |||||||||||||||     
T  18226862 ctcgatctgatacaatgctcgaaggcacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactaggcaacaggaaaactgatattaatcgg 18226763  T
Q  263 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 362  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  18226762 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatata 18226663  T
Q  363 ctatcccatttcca 376  Q
    ||||||||||||||    
T  18226662 ctatcccatttcca 18226649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 384
Target Start/End: Original strand, 14159970 - 14160287
Alignment:
Q  67 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 166  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14159970 gaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttgggtctct 14160069  T
Q  167 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 266  Q
     ||| | || ||  | || ||||| |||||||||||||||||||   |||| || || || ||||||||||  || ||| |||| |||||||| | || |    
T  14160070 gtctaatacaatgtttgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatttctgccaactgagacacaggaaaactaatattaattggaagg 14160169  T
Q  267 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 366  Q
    || || |||||||| ||||  || |  || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||| | |||||||||||||| || |||||||    
T  14160170 aaatgagccgacttagtcagtctatagacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtattcggcaaaatcgtcacaaaatccatggatatgctat 14160269  T
Q  367 cccatttccactccggta 384  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  14160270 cccatttccactctggta 14160287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18549770 - 18549694
Alignment:
Q  129 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 205  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18549770 aaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcac 18549694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15292652 - 15292618
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15292652 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 15292618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 100
Target Start/End: Original strand, 16146409 - 16146447
Alignment:
Q  62 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaa 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16146409 cgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaa 16146447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 63 - 421
Target Start/End: Original strand, 67897 - 68255
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  67897 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacctcgggt 67996  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 262  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  67997 ctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaactgagctactggataactgatattaatcgg 68096  T
Q  263 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  68097 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaagtccatagaaatg 68196  T
Q  363 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  68197 ttgtcccatttccactccagtacatccaacggtgtcaacaaccctgtaggcctctgatg 68255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4735 - 4373
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||| |||||  |||| ||||| |    
T  4735 tccgactgaccatctgtctgaggacgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctaaaagtgaacctcg 4636  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  4635 gatccctatccgacataatactcgacggtacaccatgtagctttacaatattatgaatataaatctccgccaactgagccaccggataactaatattaat 4536  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  4535 cggaataaagtgcgccgactttgtcaacttgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 4436  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  4435 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttttgatgt 4373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 13683 - 13322
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||      
T  13683 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctct 13584  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |  ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13583 gattcctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgactataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 13484  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13483 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcaacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaacttgttacaaaatccatagaa 13384  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  13383 atattgtcccacttccactccggcacatctaacggcgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 13322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 56)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 15459693 - 15460055
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15459693 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacttcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaaccttg 15459792  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15459793 ggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacgatattatgaatgtaaatctctgccagctgagctactggataacttatattaat 15459892  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15459893 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcaacaacaacccatatagaatcgtgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 15459992  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15459993 atgctatcccatttccactccggtatatccaacggtgtcaacaatcctgcaggcttctgatgt 15460055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 34645510 - 34645148
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34645510 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttg 34645411  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | || || ||||| ||||| || || || ||| |||||||||| ||    
T  34645410 gatccctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccggatataaatctctgccaattgcgccaccggaaaactgatatttat 34645311  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34645310 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgactacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 34645211  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34645210 atactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatgt 34645148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21564056 - 21563694
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  21564056 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 21563957  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
      ||||||||  |||| ||||||||| | || ||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  21563956 aatctctatcctacacaatactcgaccgtacaccatgaagcttaacaatattatgaatatatatctccgccaactgagctacctgataactgatattgat 21563857  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21563856 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 21563757  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  21563756 atgttatcccatttccactccggcacatccaacgatgtcaacaaccctgcaagcttctgatgt 21563694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21569915 - 21569553
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  21569915 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 21569816  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
      ||||||||  |||| ||||||||| | || ||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  21569815 aatctctatcctacacaatactcgaccgtacaccatgaagcttaacaatattatgaatatatatctccgccaactgagctaccagataactgatattgat 21569716  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21569715 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 21569616  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  21569615 atgttatcccatttccactccggcacatccaacgatgtcaacaaccctgcaagcttctgatgt 21569553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 25768548 - 25768909
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| |    
T  25768548 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttggaaactcttccaaaatcttgaattaaacctcg 25768647  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  25768648 gatctctatcggacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaatattataaatgtaaatctccgccaactgagctactggaaaactaatattgat 25768747  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| | || || |||||||| || | |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  25768748 cgaaataaaatgcgccgacttcgtcaacgtatcgacgacaacccaaatggcatcatgtcccctcgaagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 25768847  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  25768848 atactgtcccacttccactctggcacatctaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 25768909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 19453777 - 19454139
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| || || ||||| |    
T  19453777 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcg 19453876  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19453877 gatccctatccgacataatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 19453976  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19453977 cggaataaagtgcgctgactttgtcaacctgtcaaccacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 19454076  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  19454077 atgatatcccaattccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagacttctgatgt 19454139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 64 - 422
Target Start/End: Original strand, 21471962 - 21472320
Alignment:
Q  64 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 163  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  21471962 actgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatc 21472061  T
Q  164 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 263  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||      
T  21472062 tctatccgacacaatactcgatggaactccatgaaacttcacaataatatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgatcggg 21472161  T
Q  264 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 363  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||| ||| |||||| ||| || || |    
T  21472162 ataaaatgcgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaactcgtcgcaaaattcatggagatac 21472261  T
Q  364 tatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21472262 tgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 21472320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 8762857 - 8762496
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  8762857 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaacctcg 8762758  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  8762757 gatctctatccgacacaatactcgacggtacgccatgtagcttcacaatatcatgaatatagatctccgccaactgagctaccggataattgatatcaat 8762658  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  8762657 cagaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccaaatggcatcatgccctctctgagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatataa 8762558  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    |||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  8762557 atgtcgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 8762496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 14381391 - 14381029
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  14381391 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagctgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 14381292  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||  ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  14381291 gatctctattcgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctcccccaactgagctaccaggtaactaatattaat 14381192  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14381191 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 14381092  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14381091 atgctatctcacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaatcctgcaggcctctgatgt 14381029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 5297130 - 5296769
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  5297130 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaacccaacctcaatttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 5297031  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||| |||| |||||    
T  5297030 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatgttttgaatataaatctcagccaactgagctacccgataattgatgttaat 5296931  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||  || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5296930 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactagtcacaaaatccatagaa 5296831  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5296830 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 5296769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 62 - 399
Target Start/End: Original strand, 17415845 - 17416182
Alignment:
Q  62 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 161  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| ||     
T  17415845 cgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacttaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcgga 17415944  T
Q  162 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 261  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  17415945 tccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaattg 17416044  T
Q  262 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 361  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || | |||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||    
T  17416045 gaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgactactacccaaatggcatcatgtcctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagaaat 17416144  T
Q  362 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 399  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17416145 gttatcccacttccactccggcacatccaacggtgtca 17416182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 27560541 - 27560179
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  27560541 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 27560442  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  27560441 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttgat 27560342  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27560341 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccaccacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 27560242  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27560241 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggcgtcaacaatcctgcaggcttctgatgt 27560179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 22796556 - 22796195
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  22796556 tccgactgaccatatgtttgcgaatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 22796457  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  22796456 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggataactaataatgat 22796357  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||| | |||||| |||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |     
T  22796356 cggaataaagtgtgtcgactttgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatgtat 22796257  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||| | | ||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  22796256 atgttgttccacttccactttggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 22796195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 18795047 - 18795408
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||   ||||||| ||||||||  ||||||| ||||   |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  18795047 tccgattgaccatccgtatgaggatgataagccaaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaacgcttccataatctagaagtgaacctcg 18795146  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |   | || || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  18795147 gatctctatctgacacagtactcgacggaacaccatgcatcttcacaatgtcacggatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactgatatttat 18795246  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18795247 cggaataaagtgcgctgacttcgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaaattgtcacaaaatccatagaa 18795346  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  18795347 atgttgtcccacttccactctggaacatctaatggtatcaacaaccctgcaggcttctgatg 18795408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 60 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 28282737 - 28282385
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  28282737 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 28282638  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  28282637 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 28282538  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28282537 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 28282438  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28282437 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 28282385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 63 - 422
Target Start/End: Original strand, 19879658 - 19880017
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| || || ||||| || |    
T  19879658 gactgtccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcggat 19879757  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 262  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |   || || |||||||||||||| || |  ||| |||||||||| ||||     
T  19879758 ctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccagatataaatctccgccaactgcgccatcggaaaactgatatttatcgg 19879857  T
Q  263 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 362  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  19879858 aataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatattgaatcatatcccctcggagtgtttggtagactcgtcacgaaatccatagaaatg 19879957  T
Q  363 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19879958 ctatcccatttccactctggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 19880017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10468773 - 10468411
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| ||||||||  ||||||| || || || ||||| |    
T  10468773 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccaaaacctagaggtgaacctcg 10468674  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||||| || |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  10468673 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatattatggacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattgat 10468574  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||     
T  10468573 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaattgcttcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacgaaatctatagag 10468474  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10468473 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 10468411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 24364769 - 24365130
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  24364769 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 24364868  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||| | |||||| ||||||| ||    
T  24364869 gatctctattcgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctgccggataattgatattgat 24364968  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  24364969 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagat 24365068  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24365069 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 24365130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 1543008 - 1542692
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  1543008 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 1542909  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  1542908 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 1542809  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || ||||||||||||||||| || || | |||||| || | ||  | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  1542808 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcatatttccctctgggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 1542709  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  1542708 atactatcccatttcca 1542692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 18407866 - 18407538
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  18407866 tccgactgaccctctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagacgtaaaccttg 18407767  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||| |||  || ||| |||||||||||||    
T  18407766 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaaatctctgccaacagagaaacaggaaaactgatattaat 18407667  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||  || || | |||||||||||| || || || |  ||| | ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18407666 cggaagaaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcaccaaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 18407567  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  18407566 atactatcccatttccactctggcacatc 18407538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24313092 - 24312776
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  24313092 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 24312993  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||    
T  24312992 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactgatattaat 24312893  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  24312892 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 24312793  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  24312792 atactatcccatttcca 24312776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 60 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 5839143 - 5838810
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  5839143 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 5839044  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||| |||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || |||||  |||||||||  || ||| |||| ||||| ||    
T  5839043 gatctctaactgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttccttgatataaatctctaccaactgagaaacaggaaaactaatatttat 5838944  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||||||||| || | |||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  5838943 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactagtcacaaaatccatggat 5838844  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 393  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5838843 atactatcccatttccattccggcacatctaacg 5838810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 56 - 388
Target Start/End: Original strand, 15896447 - 15896779
Alignment:
Q  56 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 155  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |   | ||||| |||||  |||||||| | |||||| ||    
T  15896447 tctttccgactgattatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacttcaacttagaacctacagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtatac 15896546  T
Q  156 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 255  Q
    ||    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | |||||||||||   | ||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  15896547 ctcacatctctatctgatacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatat 15896646  T
Q  256 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 355  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||| || || |  ||||| ||     ||| |||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15896647 taatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaatcacccaaataacgccattccctttcggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccat 15896746  T
Q  356 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
     || || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  15896747 ggatatactatcccatttccactttggtacatc 15896779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Original strand, 19865044 - 19865372
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  19865044 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 19865143  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || ||  || |||||||||||||    
T  19865144 gatctctatctgatacaatgctcgtaggaacaccatgaaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacacgaaaactgatattaat 19865243  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  19865244 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 19865343  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  19865344 atactatcccatttccactctggcacatc 19865372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 60 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28263121 - 28262790
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  28263121 tccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 28263022  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  28263021 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcaaaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 28262922  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  | ||| || || ||||| ||||| || || || | |||||| || | |||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  28262921 aggtaggaaatgagctgactttgtcaatctatcaactataacccaaattgcatcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 28262822  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 391  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28262821 atactatcccatttccattccggcacatccaa 28262790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 60 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28341870 - 28341539
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  28341870 tccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 28341771  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  28341770 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcaaaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 28341671  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  | ||| || || ||||| ||||| || || || | |||||| || | |||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  28341670 aggtaggaaatgagctgactttgtcaatctatcaactataacccaaattgcatcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 28341571  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 391  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28341570 atactatcccatttccattccggcacatccaa 28341539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16626641 - 16626325
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16626641 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcatctttgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16626542  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  16626541 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 16626442  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16626441 aggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctcagagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16626342  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  16626341 atactatcccatttcca 16626325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 29591844 - 29591528
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| | |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  29591844 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcactctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 29591745  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  29591744 gatctctatctgacacaatgctcgaagggacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 29591645  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  | ||| || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  29591644 cggtaggaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 29591545  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  29591544 atactatcccatttcca 29591528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 123 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 20637162 - 20636909
Alignment:
Q  123 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 222  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||    
T  20637162 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataga 20637063  T
Q  223 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 322  Q
    |||| ||||||||||  || |||||||| |||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  |    
T  20637062 tctctgccaactgagaaacaggataactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattcccttt 20636963  T
Q  323 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 376  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  20636962 aggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 20636909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2874727 - 2874411
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  2874727 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 2874628  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||  || || ||||| |||||||  || || ||  |||| ||||||||    
T  2874627 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaagttcacaatctccttgatataaatctctgccaactaggcaacagggaaactaatattaat 2874528  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  2874527 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 2874428  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  2874427 atactatcccatttcca 2874411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22762379 - 22762051
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||| | |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22762379 tccgactaaccatcagtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctctggcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22762280  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  22762279 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 22762180  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    |  ||  || || |||||||| ||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22762179 cataagaaaatgagccgacttagtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22762080  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  22762079 atactatcccatttccactctggcacatc 22762051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28292292 - 28291965
Alignment:
Q  64 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 163  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  28292292 actgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 28292193  T
Q  164 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 263  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||| |      
T  28292192 tctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggt 28292093  T
Q  264 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 363  Q
    | ||| || || ||||| ||||| || || || | |||||| || | |||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  28292092 aggaaatgagctgactttgtcaatctatcaactataacccaaattgcatcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatac 28291993  T
Q  364 tatcccatttccactccggtacatccaa 391  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28291992 tatcccatttccattccggcacatccaa 28291965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 27392090 - 27391769
Alignment:
Q  67 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 166  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || |||| |||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  27392090 gaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 27391991  T
Q  167 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 266  Q
    |||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| | ||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||      
T  27391990 atctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgtcaactgagaaacaggaaaacttatattaatcggaaga 27391891  T
Q  267 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 366  Q
    || || |||||||||||||| || || || |  ||||| |||   |||| |||    |||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  27391890 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcacgtcattcccttaaggagtatttggcaagcttgtcacaaaatccatggatatgctat 27391791  T
Q  367 cccatttccactccggtacatc 388  Q
    |||||||| |||| || |||||    
T  27391790 cccatttctactctggcacatc 27391769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Original strand, 25112909 - 25113237
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  25112909 tccgactgaccatctgtctgtggatgataggccgaacttaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 25113008  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  25113009 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 25113108  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||     
T  25113109 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacgaaatccatcgat 25113208  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||    
T  25113209 atactatcccatttccattctggtacatc 25113237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 27331350 - 27331029
Alignment:
Q  67 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 166  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || |||| |||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  27331350 gaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 27331251  T
Q  167 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 266  Q
    |||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| | ||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||      
T  27331250 atctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgtcaactgagaaacaggaaaacttatattaatcggaaga 27331151  T
Q  267 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 366  Q
    || || |||||||||||||| || || || |  ||||| |||   |||| |||    |||||||  || || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  27331150 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcacgtcattcccttaaggagtatagggcaagcttgtcacaaaatccatggatatgctat 27331051  T
Q  367 cccatttccactccggtacatc 388  Q
    |||||||| |||| || |||||    
T  27331050 cccatttctactctggcacatc 27331029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22078614 - 22078286
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || || || ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22078614 tccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagagcctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22078515  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||   |||| |||||||| | ||||||||  || ||| ||||||||||||     
T  22078514 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatatctcgaatatagatctctgtcaactgagaaacaggaaaactgatattaac 22078415  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||  || ||||||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  || | |||  | |||||||| || |||||  ||||||||||||  ||     
T  22078414 cggaagaaaatgcgccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcgttccctttaggagtattcggcaaactcatcacaaaatccacggat 22078315  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || |||||||| |||||||| || |||||    
T  22078314 atactatcccacttccactctggcacatc 22078286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 25609788 - 25609469
Alignment:
Q  57 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  25609788 ctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 25609689  T
Q  157 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 256  Q
    |||| ||||||||||| || ||  |||| ||||| |||||||||||||| || |  | ||  || ||||| ||||| ||||  || ||| |||||||| |    
T  25609688 ttggatctctatctgatacaatggtcgaaggaacaccatgcaacttcacgatctctttaacataaatctctgccaattgagaaacaggaaaactgatact 25609589  T
Q  257 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 356  Q
    |||||  |  || || || ||||||||||| ||||| || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||| | || ||||| ||||| ||||||||     
T  25609588 aatcgccagaaaatgtgctgacttcgtcaatctgtcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtaatcggcaaactcgtcacgaaatccatg 25609489  T
Q  357 gaaatgctatcccatttcca 376  Q
    || || ||||||||||||||    
T  25609488 gatatactatcccatttcca 25609469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16927564 - 16927236
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || | ||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| || |    
T  16927564 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcg 16927465  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    ||||||||| ||| || || ||||| ||||  ||||||||||||||||| |  | ||| || | ||| |||||||  || || ||| ||||||| |||||    
T  16927464 ggtctctatttgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctctttaatataaacctctgccaactatgcaacaggaaaactgatgttaat 16927365  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || || ||||||||||| ||||| || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16927364 cggtagaaaatgtgctgacttcgtcaatctgtcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16927265  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  16927264 atactatcccatttccactctggcacatc 16927236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Original strand, 23078826 - 23079154
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||    |||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||    
T  23078826 tccgactgaccatctctctgcggacgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagactcttgtaaactcttcaaaaatctagaagtaaatcttg 23078925  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   |||| || || |||||||||||||  ||  || |||||||||||||    
T  23078926 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatctcgaatataaatttccgccaactgagacacatgaaaactgatattaat 23079025  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || |||||| || ||| |||||||||| || ||||| |  ||||| ||||  |||| | |  | ||||||||    ||||| |||||||||||||| ||     
T  23079026 cggaatgaaatgagccaacttcgtcaatctatctacaatcacccaaatcgcgtcattcactttaggagtattctaaaaactcgtcacaaaatccatggat 23079125  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23079126 atactatctcatttccactctggtacatc 23079154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 27187793 - 27188109
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27187793 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27187892  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27187893 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27187992  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || || || |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27187993 aggtagaaaatgagctgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggtgtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27188092  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  27188093 atactatcccatttcca 27188109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27261447 - 27261131
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27261447 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27261348  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27261347 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27261248  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || || || |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27261247 aggtagaaaatgagctgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggtgtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27261148  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  27261147 atactatcccatttcca 27261131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 379
Target Start/End: Original strand, 22434226 - 22434545
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||  |||||||| ||||    
T  22434226 tccgactaatcatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatccagaagtaaatcttg 22434325  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || | |  ||| || ||||| | |||||| || || ||| |||||||||||||    
T  22434326 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatttccataatataaatctctgtcaactgggcaacaggaaaactgatattaat 22434425  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    |   |  || || ||||||||||||||  | || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22434426 cagtagaaaatgagccgacttcgtcaatatatcgacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22434525  T
Q  360 atgctatcccatttccactc 379  Q
    || |||||||||||||||||    
T  22434526 atactatcccatttccactc 22434545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11280426 - 11280161
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| || || ||||| || |    
T  11280426 gactggccatcggtctgaggatggtaagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcggat 11280327  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 262  Q
    |||||||||| || |||||||| | ||  ||||||||||||||||| | | | || || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||| ||||     
T  11280326 ctctatctgatacaatactcgatgtaataccatgcaacttcacaatttcccggatataaatctctgccaactgtgccaccggaaaactgatatttatcgg 11280227  T
Q  263 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagt 328  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| |  || || |||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  11280226 aataaagtgcgccaacttcgtcaatccatcgactacaaccaatattgaatcatgtcccctcggagt 11280161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 196
Target Start/End: Original strand, 17032737 - 17032876
Alignment:
Q  57 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  17032737 ctttccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 17032836  T
Q  157 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatg 196  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||    
T  17032837 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 17032876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 18197589 - 18197291
Alignment:
Q  123 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 222  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   | ||||| |    
T  18197589 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgatggaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaa 18197490  T
Q  223 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 322  Q
    |||| || ||||||| |||   | ||||||| ||||||| |||||| ||  | |||||||||||  | || || |  ||||| || |  || | |||  |    
T  18197489 tctctgctaactgagatacaaaaaaactgatgttaatcggaatgaaatgatctgacttcgtcaatttatccacaatcacccaaatagcgtcgttcccttt 18197390  T
Q  323 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  18197389 aggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgcatatgctatcccatttccactctggtatatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 18197291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Original strand, 1641129 - 1641212
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaat 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||    
T  1641129 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaat 1641212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16963291 - 16963148
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || | ||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| || |    
T  16963291 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcg 16963192  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttc 203  Q
    ||||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  16963191 ggtctctatctgatataatgctcgaaggaacaccatgcaacttc 16963148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 354 - 422
Target Start/End: Original strand, 19435653 - 19435721
Alignment:
Q  354 atagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19435653 atagaaatactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 19435721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 379
Target Start/End: Original strand, 22442711 - 22442943
Alignment:
Q  147 gaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggat 246  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || | |  ||| || ||||| | |||||| || || |||     
T  22442711 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatttccataatataaatctctgtcaactgggcaacaggaa 22442810  T
Q  247 aactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac 346  Q
    ||||||||||||||   |  || || ||||||||||||||  | || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||    
T  22442811 aactgatattaatcagtagaaaatgagccgacttcgtcaatatatcgacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcac 22442910  T
Q  347 aaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 379  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  22442911 aaaatccatggatatactatcccatttccactc 22442943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27559912 - 27559765
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  27559912 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 27559813  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaa 207  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||    
T  27559812 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 27559765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21837058 - 21836973
Alignment:
Q  123 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 208  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21837058 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21836973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1648453 - 1648419
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1648453 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 1648419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18967114 - 18966984
Alignment:
Q  156 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 255  Q
    ||||| |||||||||||||  ||  |||||  ||| ||||| | |||||||||||   | ||||| |||||||||||||||| |||  || ||||||| |    
T  18967114 cttggatctctatctgacataatgatcgacaaaacaccatgtaccttcacaatatcgcggatgtaaatctccgccaactgagatacaagaaaactgatgt 18967015  T
Q  256 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 286  Q
    |||||| |||||| || |||||| |||||||    
T  18967014 taatcggaatgaaatgagccgacgtcgtcaa 18966984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 379
Target Start/End: Original strand, 23996893 - 23996924
Alignment:
Q  348 aaatccatagaaatgctatcccatttccactc 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23996893 aaatccatagaaatgctatcccatttccactc 23996924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16382012 - 16381978
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16382012 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 16381978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 19488893 - 19488843
Alignment:
Q  363 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 413  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  19488893 ctatcccatttccactccggcacatctaatggtgtcaacaacccagcaggc 19488843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 6708 - 7069
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||    
T  6708 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtgaactcttccaaaatctagaagtgaaccttg 6807  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6808 ggtctctatcggacactatactcgaggggataccatgcaacttcacaatgttatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 6907  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6908 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatggaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 7007  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||    
T  7008 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaactttcctgcaggcctctgatg 7069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 70)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10420052 - 10419690
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10420052 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaaccttg 10419953  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10419952 ggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacgatattatgaatgtaaatctccgccagctgagctactggataacttatattaat 10419853  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10419852 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcaacaacaacccatatagaatcgtgtcctctcggggtattgggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 10419753  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  10419752 atgctatcccatttccactccggtatatccaacggtgtcaacaatcccgcaggcttctgatgt 10419690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 13322659 - 13322298
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||  | |||||||| |||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||      
T  13322659 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccttaacctcgaacccaaaacatcttgcaaactcttccagaatctagaagtaaacctca 13322560  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13322559 gatccctatctgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctctgccaactgagctaccggataactgatattaat 13322460  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13322459 cgaaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaactcgtcacaaaatccatagag 13322360  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  13322359 atgctgtcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcagacctccgatg 13322298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 14086795 - 14087157
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  14086795 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 14086894  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  14086895 gatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 14086994  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14086995 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 14087094  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  14087095 atactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggtttctgatgt 14087157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 13972127 - 13971765
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  13972127 tccgactgaccatctgtctggggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 13972028  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | || || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  13972027 gatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccggatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 13971928  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13971927 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 13971828  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13971827 atactatcccatttccactccggtatatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 13971765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 17492752 - 17493114
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  17492752 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaagttcgaccccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 17492851  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| || || | || | ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17492852 gatctctatccgaaacaacacacaacggaacaccatgcaacttcacaatgttatgaatgtagatctccgccaactgagctaccggataattgatattaat 17492951  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| || ||||||||||||||||| || || || | ||||||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  17492952 tggaataaaatgcgccgacttcgtcaatctatcgacaataacccatatggcatcatgccctcttggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 17493051  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17493052 atgctatcccacttcaactctggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 17493114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18134353 - 18133991
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || ||||||||    || || |||||  |||| |||||  |||| ||||| |    
T  18134353 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaaagtgtcctgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcg 18134254  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18134253 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtaaccttacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 18134154  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  18134153 cggaataaagtgcgccgaattcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccattgaa 18134054  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  18134053 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctaatgt 18133991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 60 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 12360549 - 12360196
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||| ||  |||| ||||| || || ||||| |    
T  12360549 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaatctcttccataatctagatgtgaacctcg 12360450  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| | ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||    
T  12360449 gatccctatccgacacaatactctacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatgtaaatctccgccaactgagctatcggatatttgatattaat 12360350  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12360349 cggaataaagtgcgccaactttgtcaacctgtcgaccacaacccatatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 12360250  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 413  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12360249 atgttatcccacttccactccggcacatccaactgtgtcaacaaccctgcaggc 12360196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16828209 - 16827849
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| ||| |  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  16828209 tccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaattcttccaaaatctagaagtgaacctcg 16828110  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  16828109 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgat 16828010  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||| || | ||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  16828009 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcca-cacaacccaaatggcatcatgccctctcagagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 16827911  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16827910 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 16827849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16836517 - 16836156
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| ||||| || || ||||| |    
T  16836517 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcg 16836418  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16836417 gatctctatccgatgcaatactcgacggaactccatgaagcttcacaacattatgaatgtaaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 16836318  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16836317 aggaatgaagtgcgccgactttgtcaacttgtcgaccacaacccaaatagaatcatgtcctcttggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 16836218  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16836217 atgctatcccatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 16836156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 13942146 - 13942508
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  13942146 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 13942245  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| | | | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  13942246 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcaccacactatgtatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 13942345  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13942346 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 13942445  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  13942446 atgctatcccatttccactccggtacatccaatgatgtcaacaatcctgcaggtttctgatgt 13942508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 63 - 421
Target Start/End: Original strand, 14574054 - 14574406
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||    |    
T  14574054 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctgaaat 14574153  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 262  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||         
T  14574154 ctctatctgacacaatactcgacgaaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactg--atta----g 14574247  T
Q  263 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 362  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14574248 aataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatg 14574347  T
Q  363 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14574348 ctatcccacttccactctggcacatctaacgatgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 14574406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 60 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 8759089 - 8758737
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  8759089 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 8758990  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  8758989 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 8758890  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8758889 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 8758790  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8758789 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 8758737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 60 - 412
Target Start/End: Original strand, 41177644 - 41177996
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  41177644 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 41177743  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  41177744 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 41177843  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41177844 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 41177943  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41177944 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 41177996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 11303780 - 11303419
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  | || || |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  11303780 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaggcgtcctgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 11303681  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  11303680 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccagataactaatattgat 11303581  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  11303580 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacgacgacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagaa 11303481  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||    
T  11303480 atgttgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctacaagcttctgatg 11303419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 28754440 - 28754801
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||||||||| |    
T  28754440 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtaaacctcg 28754539  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28754540 gatctctatctgacacaatactagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaat 28754639  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||     
T  28754640 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggggtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagag 28754739  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  28754740 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 28754801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 47124066 - 47124427
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  47124066 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 47124165  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |  ||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  47124166 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgcgctaccgggtaactgatattaat 47124265  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || |  ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  47124266 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatagcgtcatgcctcctcggagtgttcggtaaacttgtcacaaaatccatagag 47124365  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  47124366 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 47124427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 60 - 412
Target Start/End: Original strand, 4678560 - 4678912
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  4678560 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 4678659  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| || | | | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  4678660 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagctttaccacactatgtatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 4678759  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  4678760 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccaccacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 4678859  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4678860 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 4678912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 44777369 - 44777731
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || || |||||  |||| ||||||||  |||| || || ||||||||||| |    
T  44777369 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtaaacctcg 44777468  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||||| | | || || || || || |||||||||||||| |||||| |||| || ||    
T  44777469 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgtagcttcacaacactatgtatataaatttcagccaactgagctaccggataattgatgttgat 44777568  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  44777569 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccaccacccaaatcgaatcatgtcccttcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 44777668  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  44777669 atgctatcccatttccactctggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcgggcttctgatgt 44777731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 60 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15952975 - 15952671
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  15952975 tccgactgaccatatgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 15952876  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||    
T  15952875 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataagcaatattgat 15952776  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||| |||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||    
T  15952775 cggaataaagtgtgccgacttcgtcagcctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatggaa 15952676  T
Q  360 atgct 364  Q
    |||||    
T  15952675 atgct 15952671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 10384091 - 10384451
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||| | |||| || || ||||| ||||| |    
T  10384091 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgcaaacatttccagaacctagaagtgaacctcg 10384190  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  10384191 gatctctatccgacacaatacta-acggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattgat 10384289  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  10384290 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 10384389  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10384390 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 10384451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 60 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16380935 - 16380582
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || || ||| | |    
T  16380935 tccgactgaccatctgtctgagaatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacatcg 16380836  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16380835 gatccctatccgacacaatacttgaaggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 16380736  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| || || |||||||| | ||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16380735 aggaataaaatgtgccgactttgacaatctatcaaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaagcttgtcacgaaatccatagaa 16380636  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 413  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16380635 atgctatcccatttccactctggtacatccaacggcgtcaacaatcctgcaggc 16380582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16338519 - 16338158
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||| | ||||| |    
T  16338519 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaactgaacctcg 16338420  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| |||||||||| | ||||  || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16338419 gatccctatccgacacaatacttgacggtacaccgtgcagcttcacaatactatgaacataaatctctgccaactgtgctaccgggtaactgatattaat 16338320  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||     
T  16338319 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcgtcatgccctcttggagtgttcggtaaactcgtcacgaaatccatagag 16338220  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  16338219 atattgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtgaacaaccctgcaggcttctgatg 16338158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 60 - 375
Target Start/End: Original strand, 15227771 - 15228086
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||    
T  15227771 tccgactgaccaattgtttgcggatgataagctgaactccacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagatgtaaatcttg 15227870  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||    |||||| ||||| |||||||| || ||  || |||| ||||||||    
T  15227871 gatctctatccgatacaatactcgatggaacaccatgcagcttcgcaatatcacaaatgtaaatctctgccaactgtgccaccagaaaactaatattaat 15227970  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||| || ||||||||||| || || || || |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  15227971 cggaataaagtgtgctgacttcgtcaatctatcaacaactacccatatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaacttgttacaaagtccatggat 15228070  T
Q  360 atgctatcccatttcc 375  Q
    ||||||||||||||||    
T  15228071 atgctatcccatttcc 15228086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 9522831 - 9523192
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  9522831 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 9522930  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||| ||  |  ||| |||||||||||||    
T  9522931 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactaagaaataggaaaactgatattaat 9523030  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  9523031 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaattacccaaatcgggtcattccctttaggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggat 9523130  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||| || ||| |||||  |||||||    
T  9523131 atactatcccatttccactctggcacatctaatggtatcatcataccagcaggtttctgatg 9523192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 16329668 - 16329324
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | |||||||||||  |||| || || ||| | ||||| |    
T  16329668 tccgactaaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaactcttccagaacctagaaatgaacctcg 16329569  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||| | ||||  || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  16329568 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatactatgaacataaatctctgccaactgtgctaccgggtaactgatattgat 16329469  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| || ||||||||||||| ||  || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||     
T  16329468 aggaatgaagtgtgctgacttcgtcaaccggttgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgtttggtagactcgtcacgaaatccatagag 16329369  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatcc-aacggtgtcaacaa 403  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16329368 atactgtcccacttccactccggtacatcctaacggtgtcaacaa 16329324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 393
Target Start/End: Original strand, 12498360 - 12498693
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  12498360 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 12498459  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  12498460 gatctctatttgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 12498559  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || ||||||||| |||| || || || | |||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  12498560 cggtagaaaatgagccgacttcatcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcattccctctaggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatagat 12498659  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 393  Q
    || |||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  12498660 atactatcccatttccattctggcacatctaacg 12498693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16492199 - 16491866
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||    
T  16492199 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacaccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccataatctagaagtaaatcttg 16492100  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  16492099 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 16492000  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||  || ||| | |||||||||||||| ||     
T  16491999 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtatgcggaaaaatcgtcacaaaatccatggat 16491900  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 393  Q
    ||  |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  16491899 atattatcccatttccactctggcacatctaacg 16491866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 10005712 - 10006028
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  10005712 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgtaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 10005811  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  10005812 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 10005911  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  10005912 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 10006011  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  10006012 atactatcccatttcca 10006028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Original strand, 17489962 - 17490290
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  17489962 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 17490061  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  17490062 gatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatatagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 17490161  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || |  |  ||||| || |  |||| |||  |  ||||||| || ||||| | |||||||||||| ||     
T  17490162 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaataatcacccaaattgcgtcattccctttaagagtattcggcaaactcgacacaaaatccatggat 17490261  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  17490262 atgctatctcatttccactctggcacatc 17490290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 60 - 391
Target Start/End: Original strand, 6600848 - 6601179
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  6600848 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 6600947  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  6600948 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 6601047  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  | ||| || || ||||||||||| || || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  6601048 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcgctccctctcggagtattcggaaaacttgtcacaaaatccatcgat 6601147  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 391  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6601148 atactatcccatttccattccggcacatccaa 6601179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 273 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 11960963 - 11960814
Alignment:
Q  273 gccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatt 372  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  11960963 gccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtgtttggaaaactcgtcacaaaatccatagaaatactgtctcatt 11960864  T
Q  373 tccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11960863 tccactccggtacatccaacggtgtcaacaatcctgcaggcttctgatgt 11960814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 5424948 - 5424632
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  5424948 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 5424849  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  5424848 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaactttacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 5424749  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  5424748 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatcgat 5424649  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  5424648 atactatcccatttcca 5424632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 10906322 - 10906638
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  10906322 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 10906421  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  10906422 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 10906521  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  10906522 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 10906621  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  10906622 atactatcccatttcca 10906638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 13252802 - 13253118
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  13252802 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 13252901  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| || |||||    
T  13252902 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatgttaat 13253001  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  13253002 cggtagaaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 13253101  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  13253102 atactatcccatttcca 13253118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 16635885 - 16636201
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16635885 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16635984  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16635985 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16636084  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16636085 aggcaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 16636184  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  16636185 atactatcccatttcca 16636201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 43163209 - 43163525
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  43163209 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 43163308  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  43163309 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 43163408  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  43163409 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 43163508  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  43163509 atactatcccatttcca 43163525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 53385036 - 53384705
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  53385036 tccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 53384937  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatat-tctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaa 258  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||| ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||    
T  53384936 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctctg-atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaa 53384838  T
Q  259 tcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccataga 358  Q
    | |  | ||| || || ||||| ||||| || || || | |||||| || | |||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  53384837 taggtaggaaatgagctgactttgtcaatctatcaactataacccaaattgcatcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcga 53384738  T
Q  359 aatgctatcccatttccactccggtacatccaa 391  Q
     || |||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  53384737 tatactatcccatttccattccgacacatccaa 53384705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 48425559 - 48425875
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  48425559 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 48425658  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  48425659 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 48425758  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  | ||| || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  48425759 aggtaggaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctttaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 48425858  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  48425859 atactatcccatttcca 48425875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14126611 - 14126464
Alignment:
Q  61 ccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgg 160  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  14126611 ccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgaaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 14126512  T
Q  161 gtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 208  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14126511 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14126464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15348263 - 15347947
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15348263 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15348164  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  15348163 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 15348064  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  15348063 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 15347964  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  15347963 atactatcccatttcca 15347947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 20062072 - 20061756
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  20062072 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 20061973  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  20061972 gatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 20061873  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  20061872 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 20061773  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  20061772 atactatcccatttcca 20061756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 388
Target Start/End: Original strand, 16371522 - 16371853
Alignment:
Q  57 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 156  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  16371522 ctttccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 16371621  T
Q  157 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 256  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | || ||| || || || | |||||| || ||  || |||| |||||    
T  16371622 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatttccttaatataaatatctggcaactgggcaacatgaaaactaatatt 16371721  T
Q  257 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 356  Q
    |||||  |  || || || ||||||||||| || || || |  ||||| |||   |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||     
T  16371722 aatcggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcacgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatg 16371821  T
Q  357 gaaatgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  16371822 gatatactatcccatttccactctggcacatc 16371853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12850286 - 12850104
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||  |||| |||||| ||||  | |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||      
T  12850286 tccgactgaccatctgtctacggattataagccgaactcaacctcaactttgaatccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctca 12850187  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctact 242  Q
    | |||||||| ||||| || || || || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12850186 gatctctatccgacacaatgcttgatgggacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctact 12850104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16412297 - 16411984
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    ||||||||||| || || || |||||  ||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  16412297 gactgaccatctgtttgtggttgatactccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 16412198  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 262  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||||     
T  16412197 ctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaatcgg 16412098  T
Q  263 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 362  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  16412097 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggaaaactcgtcacaaaatccatggatata 16411998  T
Q  363 ctatcccatttcca 376  Q
    ||||||||||||||    
T  16411997 ctatcccatttcca 16411984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 14876520 - 14876188
Alignment:
Q  57 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 156  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  14876520 ctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 14876421  T
Q  157 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataact-gatat 255  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  ||||||| | ||  || || ||||| ||| |||| || || ||| ||||  ||||    
T  14876420 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgatataaatctctgcctactgggcaacaggaaaactaaatat 14876321  T
Q  256 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 355  Q
    ||||||  |  || || |||| ||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || ||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  14876320 taatcggtagaaaatgagccggcttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcattccctctaggagtattctgcaaactcgtcacaaaatccat 14876221  T
Q  356 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
     || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  14876220 ggatatactatcccatttccactctggcacatc 14876188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15589410 - 15589094
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15589410 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15589311  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  15589310 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 15589211  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  15589210 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 15589111  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  15589110 atactatcccatttcca 15589094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 63 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16756600 - 16756272
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  16756600 gactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 16756501  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 262  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||| |     
T  16756500 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaatagg 16756401  T
Q  263 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 362  Q
     |  || || || ||||||||||| || || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  16756400 tagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatata 16756301  T
Q  363 ctatcccatttccactccggtacatccaa 391  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  16756300 ctatcccatttccattccagcacatccaa 16756272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 355
Target Start/End: Original strand, 15061865 - 15062163
Alignment:
Q  57 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| |    
T  15061865 ctttccgactgaccatctgtctgcgtatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactattccaaaatctagaagtaaatc 15061964  T
Q  157 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 256  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | || ||| || || || ||||| || || || ||| |||| |||||    
T  15061965 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatttccttaatataaatatctgccaattgggcaacaggaaaactaatatt 15062064  T
Q  257 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 355  Q
    |||||  |  || || || ||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  15062065 aatcggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 15062163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 376
Target Start/End: Original strand, 15339383 - 15339697
Alignment:
Q  62 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 161  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| |||  |  ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||     
T  15339383 cgactgaccatctgtctgtcgatgatacgccgaactcaatctcagctacgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 15339482  T
Q  162 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 261  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || |   |||| ||||||||||    
T  15339483 tctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagtgaaactaatattaatcg 15339582  T
Q  262 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 361  Q
      |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  15339583 gtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatat 15339682  T
Q  362 gctatcccatttcca 376  Q
     ||||||||||||||    
T  15339683 actatcccatttcca 15339697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26792414 - 26792101
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  26792414 gactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 26792315  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 262  Q
    ||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| ||||| || || || ||  |||| |||||||| |     
T  26792314 ctctatctgacacaatgctggaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaaatgggcaacggggaaactaatattaattgg 26792215  T
Q  263 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 362  Q
     || || || ||| |||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  26792214 tataaaatgagccaacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatcgatata 26792115  T
Q  363 ctatcccatttcca 376  Q
    ||||||||||||||    
T  26792114 ctatcccatttcca 26792101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15402528 - 15402212
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||| |||||||||||| |||  || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15402528 tccgactgaccagctgtctatggatgatacgccgaactcaatctcagcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15402429  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  || | ||||||||    
T  15402428 gatctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaagtaatattaat 15402329  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || | ||| |||||||||||||| ||     
T  15402328 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcatactcgtcacaaaatccatggat 15402229  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  15402228 atactatcccatttcca 15402212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16806944 - 16806628
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | |||||  ||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  16806944 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcctcttgctaacttttccaaaacctagaagtaaatcttg 16806845  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  16806844 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 16806745  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||| | || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||     
T  16806744 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacctaaattgtgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaagtccatggat 16806645  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  16806644 atactatcccatttcca 16806628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 388
Target Start/End: Original strand, 15209006 - 15209331
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||| || ||||| |  || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||| ||    |    
T  15209006 gactgaccatctgtctgcggatgatacgccgagctcaacctcaacttagaacctacaacctcttgcaaaatcttccaaaatctagaagtaaatctcatat 15209105  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 262  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||   || || || || || ||||||| ||  || ||| |||||||||||||||     
T  15209106 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaataacgtggatataaatttctgccaactaagacacaggaaaactgatattaatcgg 15209205  T
Q  263 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 362  Q
    |||||| |  |||||||| ||||| || || || |  | ||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||    
T  15209206 aatgaaataagccgactttgtcaatctatcaacaatcatccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatg 15209305  T
Q  363 ctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15209306 ctatcccatttccactctggtacatc 15209331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15724949 - 15724636
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |    
T  15724949 gactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctacaagtaaatcttggat 15724850  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 262  Q
    ||||||||||||| || |  || ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||| ||||||     
T  15724849 ctctatctgacacaatgcctgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaataataatcgg 15724750  T
Q  263 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 362  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  15724749 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatata 15724650  T
Q  363 ctatcccatttcca 376  Q
    ||||||||||||||    
T  15724649 ctatcccatttcca 15724636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 286
Target Start/End: Original strand, 16692272 - 16692502
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatct----tgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 155  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  | |||    || |||||| |||||||||| ||||||||     
T  16692272 tccgactgaccatccgtctgtggatgataagctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctctagcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaat 16692371  T
Q  156 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 255  Q
    ||| | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| | ||  || || ||||||||||| || || || ||| |||| ||||    
T  16692372 cttagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttgatataaatctccgccaattgggcaacaggaaaactaatat 16692471  T
Q  256 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 286  Q
    ||||||  | ||| || ||||||||||||||    
T  16692472 taatcggtaggaaatgagccgacttcgtcaa 16692502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 388
Target Start/End: Original strand, 15248263 - 15248587
Alignment:
Q  64 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 163  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||    ||    
T  15248263 actgaccatctgtctgctgatgatacgccgagctcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatctcatatc 15248362  T
Q  164 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 263  Q
    ||||||||| || || ||| | ||||| |||||||||||||||||||   | || || || |||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| |    
T  15248363 tctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcggatataaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatattaatcgga 15248462  T
Q  264 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 363  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || || || |  ||||| ||||  | || |||  | |||||||  || ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  15248463 atgaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgttattccctttaggagtatacggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgc 15248562  T
Q  364 tatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    | ||||||||||||||  |||||||    
T  15248563 tgtcccatttccactctagtacatc 15248587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11564699 - 11564551
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||  ||||| |||||||||| |||| ||| ||||    
T  11564699 tccgactaaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaatttcaacttcgaacccaaagcctcttgctaacttttccaaaatctagaagaaaatcttg 11564600  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 208  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  11564599 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 11564551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15015762 - 15015573
Alignment:
Q  72 tccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctg 171  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||| | || || |||||  ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  15015762 tccgactgcggatgatatgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttcctaaatctagaagtaaatcttggatctctatctg 15015663  T
Q  172 acactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 261  Q
    | || |||||||||||||| ||||| | | ||| ||| |   |||| || || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  15015662 atacaatactcgacggaacaccatgtagcctcaaaatctcacgaatataaatttccgccaactgagatacaggaaaactgatattaatcg 15015573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 11961044 - 11960986
Alignment:
Q  57 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacc 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  11961044 ctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacc 11960986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 14685210 - 14685174
Alignment:
Q  21 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagcggtc 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14685210 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagcggtc 14685174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31694887 - 31694831
Alignment:
Q  366 tcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  31694887 tcccacttccactccggcacatttaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 31694831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 422
Target Start/End: Original strand, 31939331 - 31939387
Alignment:
Q  366 tcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  31939331 tcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgaaggcttctgatgt 31939387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 26009000 - 26008961
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactca 99  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26009000 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactca 26008961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 8274132 - 8274098
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8274132 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 8274098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13967073 - 13967039
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13967073 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 13967039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Original strand, 30138213 - 30138247
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30138213 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 30138247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Original strand, 30147764 - 30147798
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30147764 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 30147798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 16742436 - 16742359
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  |||||||  || ||||||||  || |||||||||    
T  16742436 acaaaatccatagaaatgctattccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacctgacggtctctgatgt 16742359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 57
Target Start/End: Original strand, 10790579 - 10790615
Alignment:
Q  21 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagcggtc 57  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10790579 ttgatagctgtacacaccataggggcttccagcggtc 10790615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 233
Target Start/End: Original strand, 18748796 - 18748960
Alignment:
Q  69 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 168  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |  |||||  || |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||| || ||   ||    
T  18748796 ccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcctgat 18748895  T
Q  169 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaac 233  Q
    ||||||| ||||| || ||||   |||||||| | ||||| | || |||||||||||| ||||||    
T  18748896 ctgacacaatactagaaggaatatcatgcaacctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaac 18748960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 121 - 421
Target Start/End: Original strand, 468 - 768
Alignment:
Q  121 catcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgta 220  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  468 catcttgtaaactctttcaaaatcttgaagtaaacctcgggtctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcatcttcacaatattatgaatgta 567  T
Q  221 gatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgcccc 320  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  568 aatctctgccaactgagctactggataactgatattaatcggaatgaagtgcgccgatttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccct 667  T
Q  321 ctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgat 420  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  668 cttggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgttgtcccatttccactccggtacatccaacggcgtcaacaatcctgcaggcctctgat 767  T
Q  421 g 421  Q
    |    
T  768 g 768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20975873 - 20975511
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||| || |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  20975873 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcatgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 20975774  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20975773 gatctccatctgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctatcggataactgatattaat 20975674  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  20975673 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtatgtggtaaattcgtcacaaaatccatagaa 20975574  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  20975573 atgctatcccatttccactccggcacatccaacggtgtcaacaacactgcaggcttctgatgt 20975511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 1266797 - 1267158
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| || ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  1266797 tccgaccgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcatcttgcaagctcttccataatctagaagtgaacctcg 1266896  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| || |||||||| || ||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1266897 gatctctatccgacacaatgctcgacggtacaccatgcagcttaacaatgttatgaatgtaaatctccgccaactgtgctacaggataactgatattaat 1266996  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1266997 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcgtgtcctctaagagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 1267096  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1267097 atgctatcccatttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 1267158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 60 - 413
Target Start/End: Original strand, 21840976 - 21841329
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||  || ||| |||||| ||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  21840976 tccgactgaccatttgtttgcagatgatgagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttttaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 21841075  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  21841076 gatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgctaactgagctactggaaaactaatattgat 21841175  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||    
T  21841176 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgaccaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggaa 21841275  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 413  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21841276 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggc 21841329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 31416696 - 31416335
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  31416696 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 31416597  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || | ||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31416596 gatccctatccgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaatgttataaacataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 31416497  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31416496 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgctcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 31416397  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31416396 atgctatcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 31416335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 63 - 421
Target Start/End: Original strand, 23655489 - 23655847
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |  ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| || |    
T  23655489 gactgaccatctgtctgcggatgataacccgaactcaacctcaactccgaacccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggat 23655588  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 262  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |    
T  23655589 ctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgcaacttcacaatattgtgaatataaatctccgccaactaagctaccggataactaatattaatcaa 23655688  T
Q  263 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 362  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  23655689 aatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaactacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatggaaatg 23655788  T
Q  363 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||| |||||||    
T  23655789 ttgtcccacttccactccggcacatctaacggtgttaataaccctgcaggcttctgatg 23655847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 62 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 22061653 - 22061293
Alignment:
Q  62 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 161  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || | |||  |||| || || ||||| ||||||||     
T  22061653 cgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcagactcttccagaacctagaagtgaaccttgga 22061554  T
Q  162 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 261  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |    
T  22061553 tccctatccgacacaatactcgacggaactccatgtagtttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggatacttgatgttaatag 22061454  T
Q  262 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 361  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| || ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22061453 gaatgaagtgcgccgactttctcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcgtgtcctctcgtagtgtttggtaaactcatcacaaaatccatagaaat 22061354  T
Q  362 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  22061353 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaataaccctgcaggcttctgatgt 22061293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 20388658 - 20389020
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| | ||||  |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  20388658 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttacaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 20388757  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||    
T  20388758 gatctctatctgatacaattatcgacggaacaccatgcaactttacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccactggaaaactaatattgat 20388857  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||     
T  20388858 tggaataaagtgtgccgacttcgtcaatctatcaacaactacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaacttgtcacacaatccatggat 20388957  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  20388958 atgctatcccatttccactccggcacatctaatggtgtcaacaacccagcaggcttctgatgt 20389020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 22371499 - 22371861
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| |    
T  22371499 tccgactcaccatctgtttgcggattataagccgaacccaacctcaactttgaacccaacgcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtaaacctcg 22371598  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||  ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  22371599 gatctctattcgacacaatactcgatggaagcccatgaaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgtcaaatgagctaccggaaaactaatattgat 22371698  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  22371699 cggaataaaatgcgccgacttcgtcaacctatcaacaactacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 22371798  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22371799 atgttgtcccacttccactcaggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 22371861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 19851970 - 19852331
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||  ||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  19851970 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 19852069  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||    
T  19852070 gatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcccaatattatgaatgtaaatttctgccaactgtgctaccggaaaactaatattgat 19852169  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    |||||| || ||  ||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||| |||||||||| |||    
T  19852170 cgaaataaaatgtaccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggcaaactcgtctcaaaatccatggaa 19852269  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  19852270 atgctgtcccacttccactctggcacatcgaacggtgtcaacaaccctgcatgcttctgatg 19852331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 19858006 - 19858367
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||  ||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  19858006 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 19858105  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||    
T  19858106 gatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcccaatattatgaatgtaaatttctgccaactgtgctaccggaaaactaatattgat 19858205  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    |||||| || ||  ||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||| |||||||||| |||    
T  19858206 cgaaataaaatgtaccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggcaaactcgtctcaaaatccatggaa 19858305  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  19858306 atgctgtcccacttccactctggcacatcgaacggtgtcaacaaccctgcatgcttctgatg 19858367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 803895 - 803534
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  803895 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccaaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 803796  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  803795 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactatgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 803696  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||     
T  803695 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccgtagag 803596  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  803595 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 803534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 6679670 - 6680031
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  6679670 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 6679769  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6679770 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 6679869  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  6679870 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 6679969  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  6679970 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcatgcttctgatg 6680031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 60 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 31571064 - 31570712
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  31571064 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 31570965  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| | |||||| || || ||    
T  31570964 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccgaataactaatgttgat 31570865  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31570864 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 31570765  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31570764 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 31570712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16271446 - 16271085
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  16271446 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccataacctagaagtgaacctcg 16271347  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| | |||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16271346 gatccctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcaccacattgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctaccgggtaactgatattaat 16271247  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  16271246 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 16271147  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  16271146 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccttgcaggcttctgatg 16271085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 22051422 - 22051783
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  22051422 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttggaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 22051521  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  22051522 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatttagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttgat 22051621  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| || || |||||||| |||||||| ||  |||||||||| || |||||||| |  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22051622 aggaataaaatgtgccgactttgtcaacctatcacccacaacccaaatagaatcatgtcttctcggagtgtttagtaaacttgtcacaaaatccatagaa 22051721  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  22051722 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggcgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 22051783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 6604217 - 6604578
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  6604217 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 6604316  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  6604317 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattgat 6604416  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  6604417 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 6604516  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  6604517 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcatgcttctgatg 6604578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 27355107 - 27355468
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  27355107 tccgactgaccatccgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 27355206  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||    
T  27355207 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccacactatgaatgtaaatctctgccaactgttctaccggataactgatattgat 27355306  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| | |||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||||||     
T  27355307 gggaatgaagtgtgtcgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaattcgtcacaaaatccatagag 27355406  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  27355407 atactgtcccacttccactccagtacatctaacggtgtcaaaaaccctgcaggcttctgatg 27355468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 29303648 - 29303286
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  29303648 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 29303549  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| || | ||  || ||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  29303548 gatccctatccgacacaatactcgaaggaaccccatgtagcttcacaatgttataaacataaatctctgccaattgtgctaccgaataactgatattaat 29303449  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||||||| |||| ||| || |||||| | ||||| |||||||||||     
T  29303448 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcgaagtgtttggtaaattcgtcacgaaatccatagag 29303349  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  29303348 atactatcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 29303286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 57 - 421
Target Start/End: Original strand, 14565698 - 14566062
Alignment:
Q  57 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 156  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||    
T  14565698 ctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 14565797  T
Q  157 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 256  Q
    | || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14565798 tcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatatt 14565897  T
Q  257 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 356  Q
    ||| | |||||| || ||||||||||||||||  || || || ||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  14565898 aataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaactacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccata 14565997  T
Q  357 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14565998 gagatactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 14566062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 12305317 - 12305678
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    || ||||||||  |||| ||  | ||||| ||||| |    
T  12305317 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgtgtcctgtaaactcttccagaacatagaagtgaacctcg 12305416  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12305417 gatccctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattaat 12305516  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || ||||| || || |  |||| ||| |||||||| || |||||  | ||||| |||||||||||     
T  12305517 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaactcaaatagtgtcataccctctcggagtgttcggtaaggtcgtcacgaaatccatagag 12305616  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12305617 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 12305678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 56 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 20396351 - 20395986
Alignment:
Q  56 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||   ||  || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  20396351 tctttccgactgaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaaccacagcttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 20396252  T
Q  156 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 255  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||| | | || ||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  20396251 cttggatctctatctgacacaatgctcggcaggacaccatgcaacttcacaatctggcgaatgtaaatctccgccaactgagatagaggaaaactgatat 20396152  T
Q  256 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 355  Q
    ||| || |||||| || || |||||||| || || || || |  ||||| || |   ||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  20396151 taaccggaatgaaatgagctgacttcgttaatctatccacaatcacccaaatagcggcatgccctcttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 20396052  T
Q  356 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
     || || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||||    
T  20396051 ggatatactatcccattttcactctggcacatctaacggtgtcaacaacccagcaggtttctgatg 20395986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 56 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 22377680 - 22377315
Alignment:
Q  56 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  22377680 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 22377581  T
Q  156 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 255  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   ||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  22377580 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcacgaatgtaaatttccgccaactgagatacaggaaaactgatat 22377481  T
Q  256 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 355  Q
    |||||  |||  | || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | | ||||||  | ||||| |||||||||| |||    
T  22377480 taatcagaatagaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttagaagtattcagcaaactcgtcacaaaattcat 22377381  T
Q  356 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
     || ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  22377380 ggatatgctatcccattcccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 22377315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 56 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 22383855 - 22383490
Alignment:
Q  56 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  22383855 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 22383756  T
Q  156 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 255  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   ||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  22383755 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcacgaatgtaaatttccgccaactgagatacaggaaaactgatat 22383656  T
Q  256 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 355  Q
    |||||  |||  | || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | | ||||||  | ||||| |||||||||| |||    
T  22383655 taatcagaatagaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttagaagtattcagcaaactcgtcacaaaattcat 22383556  T
Q  356 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
     || ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  22383555 ggatatgctatcccattcccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 22383490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 58 - 378
Target Start/End: Original strand, 23949476 - 23949796
Alignment:
Q  58 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 157  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || || | ||| | |||  |||||||||| |||||||||||    
T  23949476 tttccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaacctattgcatactcttccaaaatctagaagtaaacct 23949575  T
Q  158 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 257  Q
     || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | ||||||| |||   | ||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||    
T  23949576 cggatctctatctgatacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacagtatcgcggatgtaaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatgtta 23949675  T
Q  258 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 357  Q
    |||| |||||| || ||| |||||||||| || ||||| |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  23949676 atcggaatgaaatgagccaacttcgtcaatctatctacaatcacccaaatagcgtcattccctcttggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatgg 23949775  T
Q  358 aaatgctatcccatttccact 378  Q
    | ||  |||||||||||||||    
T  23949776 atatattatcccatttccact 23949796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 19113249 - 19113565
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19113249 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 19113348  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  | || ||||||||    
T  19113349 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaagctaatattaat 19113448  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  19113449 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 19113548  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  19113549 atactatcccatttcca 19113565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 60 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16408267 - 16407949
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  16408267 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctataagtaaatcttg 16408168  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||| |||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||| ||    
T  16408167 ggtctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttc-caatctccttaatataaatctctgccaactgggccacaggaaaactaatatttat 16408069  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || |  | |||||| || |  | || ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16408068 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaattataacccaaattgcgtaattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16407969  T
Q  360 atgctatcccatttccactc 379  Q
    || |||||||||||||||||    
T  16407968 atactatcccatttccactc 16407949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 60 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21394087 - 21393769
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21394087 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctggaagtaaatcttg 21393988  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||  ||||  || ||| || | ||||||||    
T  21393987 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatataaatctctgccagttgagaaacaggaaaattaatattaat 21393888  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  21393887 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21393788  T
Q  360 atgctatcccatttccact 378  Q
    || ||||||||||||||||    
T  21393787 atactatcccatttccact 21393769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 60 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21788581 - 21788263
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21788581 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctggaagtaaatcttg 21788482  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||  ||||  || ||| || | ||||||||    
T  21788481 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatataaatctctgccagttgagaaacaggaaaattaatattaat 21788382  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  21788381 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21788282  T
Q  360 atgctatcccatttccact 378  Q
    || ||||||||||||||||    
T  21788281 atactatcccatttccact 21788263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 393
Target Start/End: Original strand, 21251500 - 21251833
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| |||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21251500 tccgactgactatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21251599  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||| ||||  || ||| |||| ||||||||    
T  21251600 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacaaatgtaaatctccgccaattgagaaacaggaaaactaatattaat 21251699  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  21251700 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21251799  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 393  Q
    || | |||||||||||| || || ||||| ||||    
T  21251800 atacgatcccatttccaatctggcacatctaacg 21251833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 32600703 - 32601019
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  32600703 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttg 32600802  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  32600803 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 32600902  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  32600903 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 32601002  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||| ||||||||    
T  32601003 atactatctcatttcca 32601019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 20010122 - 20009780
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||   | || |||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||      
T  20010122 tccgaatgaccatctgcctgcggatgataagccgaactcacccttaactttgaacccaaggcatcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctga 20010023  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
      | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |                
T  20010022 aatttctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgggctaccggaaa------------ 20009935  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
           || |||| ||| ||||||||||  || || |||||||| || | ||||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||    
T  20009934 -------aaatgcgtcgaattcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcattccctcttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggaa 20009842  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20009841 atgttgtcccacttccactctggcacatctaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20009780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 21921955 - 21921630
Alignment:
Q  62 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 161  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||     
T  21921955 cgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 21921856  T
Q  162 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 261  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||  || ||| |||||||||||||||    
T  21921855 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctcttccaattgagaaacaggaaaactgatattaatcg 21921756  T
Q  262 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 361  Q
     ||  || || |||||||||| ||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||   | ||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  21921755 gaagaaaatgagccgacttcgacaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccgtttaggagt-ttcggcaaactcgtcacaaaatccatggatat 21921657  T
Q  362 gctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
      |||||||||||||||| || |||||    
T  21921656 attatcccatttccactctggcacatc 21921630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 17674245 - 17673929
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  17674245 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 17674146  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||   | || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  17674145 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttggtataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 17674046  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  17674045 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 17673946  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  17673945 atactatcccatttcca 17673929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 18857136 - 18857452
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  18857136 tccgactgaccatctgtctgcgggtgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 18857235  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| || |||||    
T  18857236 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatgttaat 18857335  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  18857336 aggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggat 18857435  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  18857436 atactatcccatttcca 18857452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 21166759 - 21166432
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21166759 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21166660  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | || ||| || ||||| || ||||  || || ||| |||||||||||||    
T  21166659 gatctctatctgata-aatgctcgaaggaacaccatgcaactttacaatctccttaatataaatctctgctaactaggcaacaggaaaactgatattaat 21166561  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  21166560 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21166461  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    ||  ||||||| |||||||| || |||||    
T  21166460 atattatcccacttccactctggcacatc 21166432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 388
Target Start/End: Original strand, 22040422 - 22040746
Alignment:
Q  64 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 163  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||| ||    
T  22040422 actgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatgttggatc 22040521  T
Q  164 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 263  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||| ||| || || ||| |||| ||||||||||      
T  22040522 tctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccagctgggcaacaggaaaactaatattaatcggt 22040621  T
Q  264 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 363  Q
    |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  22040622 agaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatac 22040721  T
Q  364 tatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||    
T  22040722 tatcccatttccattccggcacatc 22040746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 30313362 - 30313050
Alignment:
Q  64 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 163  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  30313362 actgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 30313263  T
Q  164 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 263  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || |||||| ||||||| || || ||| |||| ||||||||||      
T  30313262 tctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctccaccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggt 30313163  T
Q  264 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 363  Q
    |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  30313162 agaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatac 30313063  T
Q  364 tatcccatttcca 376  Q
    |||||||||||||    
T  30313062 tatcccatttcca 30313050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Original strand, 23650600 - 23650928
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23650600 tccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 23650699  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||| ||||  ||  || || | ||||||||    
T  23650700 gatctctatctgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaaatgagaaacaagaaaaataatattaat 23650799  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    |  ||  || || ||||| |||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||   ||     
T  23650800 cagaagaaaatgagccgaattcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatcctgggat 23650899  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  23650900 atactatcccatttccactctggcacatc 23650928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Original strand, 19978526 - 19978854
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||  | || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  19978526 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgtcgagctcaatctcaacttagaacccaaagcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 19978625  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||| ||  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  || || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||    
T  19978626 gatctctatttgttacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttcattgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaat 19978725  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || ||    ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||| ||     
T  19978726 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacagtcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcatcacaaaatccatggat 19978825  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  19978826 atactatcccatttccactctggcacatc 19978854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 208
Target Start/End: Original strand, 22046932 - 22047080
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  22046932 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 22047031  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 208  Q
    | ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  22047032 gatctctatctgatatgatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaat 22047080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 205
Target Start/End: Original strand, 15533943 - 15534084
Alignment:
Q  64 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 163  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15533943 actgaccatctttctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 15534042  T
Q  164 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 205  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  15534043 tctatctgatacaatactcgaaggaacaccatgtaacctcac 15534084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22164411 - 22164098
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    ||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  22164411 gactgaccatatgtctgcggatgacacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 22164312  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 262  Q
    |||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||  | || || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||     
T  22164311 ctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatcttacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcgg 22164212  T
Q  263 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 362  Q
     | ||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  22164211 taggaattgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggatata 22164112  T
Q  363 ctatcccatttcca 376  Q
    ||||||||||||||    
T  22164111 ctatcccatttcca 22164098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22120392 - 22120080
Alignment:
Q  64 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 163  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  22120392 actgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatc 22120293  T
Q  164 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 263  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  | || ||||||||||      
T  22120292 tctatctgacacaatgctcgaaggaataccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaagctaatattaatcggt 22120193  T
Q  264 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 363  Q
    |  || || |||||||| ||||| || || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  22120192 agaaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatac 22120093  T
Q  364 tatcccatttcca 376  Q
    | |||||||||||    
T  22120092 tgtcccatttcca 22120080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22133263 - 22132947
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22133263 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22133164  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||  | || || | ||  || || |||||   |||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  22133163 gatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatcttacgatctccttgatataaatctctttcaactgggcaacaggaaaactaatattaat 22133064  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  | ||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||| ||     
T  22133063 cggtaggaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgtgtcgttccctctaggagtattcggaaaactcatcacaaaatccatggat 22132964  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  22132963 atactatcccatttcca 22132947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 379
Target Start/End: Original strand, 22987757 - 22988074
Alignment:
Q  57 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 156  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| || ||||| ||  | ||||  |||||  ||||||||||     |||| |    
T  22987757 ctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacgcaacctcaacttagaacctaaagcctcttacaaactcttccaaaatct-----taaatc 22987851  T
Q  157 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 256  Q
    | |  ||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || || |||||||||||||  || ||| ||||||||||    
T  22987852 tcgaatctctatctcatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcgaatataaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatatt 22987951  T
Q  257 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 356  Q
    |||||  || || ||  ||||||| ||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||     
T  22987952 aatcggtataaaatgatccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatg 22988051  T
Q  357 gaaatgctatcccatttccactc 379  Q
    || ||| ||||||||||| ||||    
T  22988052 gatatgttatcccatttctactc 22988074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20017972 - 20017865
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  20017972 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 20017873  T
Q  160 ggtctcta 167  Q
    | ||||||    
T  20017872 gatctcta 20017865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 19485092 - 19484980
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19485092 tccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 19484993  T
Q  160 ggtctctatctga 172  Q
    | |||||||||||    
T  19484992 gatctctatctga 19484980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 22248357 - 22248278
Alignment:
Q  342 gtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||||||  |||||||    
T  22248357 gtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggtacatctaaaggtgttatcaaccctgcaggtttctgatg 22248278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 205
Target Start/End: Original strand, 19863684 - 19863760
Alignment:
Q  129 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 205  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19863684 aaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcac 19863760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 205
Target Start/End: Original strand, 19868321 - 19868397
Alignment:
Q  129 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 205  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19868321 aaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcac 19868397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21850274 - 21850241
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccact 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850274 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccact 21850241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 388
Target Start/End: Original strand, 21043268 - 21043332
Alignment:
Q  324 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  21043268 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 21043332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22129132 - 22129017
Alignment:
Q  90 gccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaa 189  Q
    |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  22129132 gccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaa 22129033  T
Q  190 ccccatgcaacttcac 205  Q
      ||||||||| ||||    
T  22129032 taccatgcaacctcac 22129017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16877032 - 16876998
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16877032 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 16876998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 57
Target Start/End: Original strand, 1733390 - 1733422
Alignment:
Q  25 tagccgtacacaccatatgggcttccagcggtc 57  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1733390 tagctgtacacaccatatgggcttccagcggtc 1733422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 19484022 - 19483970
Alignment:
Q  324 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 376  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  19484022 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 19483970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 33459 - 33097
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  33459 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 33360  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  33359 gatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 33260  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33259 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 33160  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  33159 atactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggtttctgatgt 33097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 222 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 56520 - 56320
Alignment:
Q  222 atctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccc 321  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| |    
T  56520 atctccgccaactgtgctaccggataactaatattaataggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcataccctc 56421  T
Q  322 tcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||| ||| || |||||||||| | | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  56420 tcgaagtgtttggtaaacttggctccaaatccatagaaatgctatctcacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 56321  T
Q  422 t 422  Q
    |    
T  56320 t 56320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Original strand, 41067 - 41101
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41067 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 41101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 50296 - 49934
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  50296 tccgactgaccatccgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttggaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 50197  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  50196 gatctctatttgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 50097  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50096 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattatgtaaacttgtcacaaaatccatagaa 49997  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  49996 atactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 49934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 43678 - 43994
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  43678 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 43777  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  43778 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 43877  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || ||||||||||||||||| || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  43878 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctgggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 43977  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  43978 atactatcccatttcca 43994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 8998 - 9314
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8998 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 9097  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || |  ||  |||| ||||||||    
T  9098 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaatagggaaactaatattaat 9197  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || ||||| |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  9198 cggtagaaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 9297  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  9298 atactatcccatttcca 9314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 208
Target Start/End: Original strand, 15460 - 15608
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || || |||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15460 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgatcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15559  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 208  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15560 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 15608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 7020 - 6658
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||   |||| || ||||||||  | ||||| |||||  | || ||||| ||||| ||||| |    
T  7020 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacgcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactctttcagaatctagaagtgaacctcg 6921  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6920 gatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatgtagatttccgccaactgagctaccggataactgatattaat 6821  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6820 cagaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 6721  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6720 atgctatcccacttccactccggtacatccagcggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 6658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 51962 - 51600
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  51962 tccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 51863  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  51862 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattctgaatatatatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 51763  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  51762 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 51663  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  51662 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 51600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 60996 - 60634
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  60996 tccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 60897  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  60896 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattctgaatatatatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 60797  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  60796 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 60697  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  60696 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 60634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 67384 - 67022
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  67384 tccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 67285  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  67284 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattctgaatatatatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 67185  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  67184 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 67085  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  67084 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 67022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 118092 - 118454
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  118092 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 118191  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  118192 gatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgcgctaccggataactgatattaat 118291  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  118292 cggaataaagtgcgccgacttcatcaacatgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 118391  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||   |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  118392 ataaaatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 118454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 60 - 410
Target Start/End: Original strand, 323228 - 323578
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||   |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  323228 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccaaactcagcctcaacttcgaacccaaggcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 323327  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  323328 gatccctatccgacaaaatactcgacggtacaccatgcaacttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 323427  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  323428 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacttgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 323527  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgca 410  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  323528 atgttatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgca 323578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 203250 - 202888
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  203250 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctacaagtaaatcttg 203151  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||   |||| || || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||    
T  203150 gatctctatttgacacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaatatcacgaatataaatttctgccaactgagccactggaaaactaatattgat 203051  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  203050 tggaataaagtgtgccgacttcgtcaatctatcaacaaccacccaaatggtatcatgccctctcggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatggat 202951  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||||    
T  202950 atgctatcctatttccactccggcacatctaacgatgtcaacaacccagcaggcttctgatgt 202888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 261
Target Start/End: Original strand, 386343 - 386544
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  386343 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 386442  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  386443 gatctctatccgacacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatgtaattctccgctaactgagctaccggaaaactaatattgat 386542  T
Q  260 cg 261  Q
    ||    
T  386543 cg 386544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 286
Target Start/End: Original strand, 112542 - 112771
Alignment:
Q  57 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 156  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  112542 cttttcgactgaccatctgtctacggatgatacgccgaactcaacttcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacc 112641  T
Q  157 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 256  Q
    |  | ||||||||||| || || || | |||||| ||||| | |||||||||||  || ||||| || ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  112642 tcagatctctatctgatacaatgcttggcggaacaccatgtagcttcacaatatcgtggatgtaaatatccgccaactgagatataggaaaactgatatt 112741  T
Q  257 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 286  Q
    ||||| |||||| || ||| ||||||||||    
T  112742 aatcggaatgaaatgagcccacttcgtcaa 112771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 27365398 - 27365036
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  27365398 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 27365299  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | || || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  27365298 gatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccggatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 27365199  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27365198 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 27365099  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27365098 atactatcccatttccactccggtatatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 27365036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19652371 - 19652009
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  19652371 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 19652272  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||  |||| ||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19652271 gatccttatccgacacaatactcgacggtactccatataacttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 19652172  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  19652171 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtctacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtatacttgtcactaaatccatagaa 19652072  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19652071 atactgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatgt 19652009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 24641866 - 24642227
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  24641866 tccgactaaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaagtcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 24641965  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    |  ||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24641966 gacctctatccgacataatactcgacggtacaccatgtaacttcacaatattgtgaatatgaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 24642065  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24642066 tggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 24642165  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  24642166 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgccaacaaccctgcaggcttctgatg 24642227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 213 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 27210338 - 27210130
Alignment:
Q  213 tgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaat 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27210338 tgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatagaat 27210239  T
Q  313 catgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27210238 catgccccctcggagtattaggtaaacttatcacaaaatccatataaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaatcctgcagg 27210139  T
Q  413 cctctgatg 421  Q
    |||||||||    
T  27210138 cctctgatg 27210130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 23276900 - 23277262
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || || ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  23276900 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccttaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 23276999  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
      || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23277000 aatcactatccgacacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgcgctaccggataactgatattaat 23277099  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| || |||||| | ||||||||||||||||||    
T  23277100 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctcttggagtgttcggtaaaatcgtcacaaaatccatagaa 23277199  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23277200 atgctatcccacttccattccggcacatctaacagtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 23277262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 24948713 - 24949075
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||  | ||| ||||  ||||||| |||||  |||| |||||  |||| ||||| |    
T  24948713 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacatcgaaaccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcg 24948812  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || |||||||| || ||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24948813 gatccctatctgatacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 24948912  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24948913 cggaataaagtgcgccaacttcatcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 24949012  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    || |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  24949013 atcctatcccatttcaactccggcacatccaacgatatcaacaaccctgcaggcttctgatgt 24949075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 60 - 412
Target Start/End: Original strand, 12574477 - 12574829
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  12574477 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 12574576  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  12574577 gatctctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 12574676  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12574677 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccactacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 12574776  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12574777 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 12574829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 1063875 - 1064236
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  1063875 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaatttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 1063974  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  1063975 gatctctatccgacacaatactagacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattgat 1064074  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  1064075 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 1064174  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1064175 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 1064236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 20828383 - 20828744
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  20828383 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 20828482  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20828483 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 20828582  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  20828583 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcgaagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 20828682  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20828683 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20828744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 20833109 - 20833470
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  20833109 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 20833208  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20833209 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 20833308  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  20833309 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcgaagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 20833408  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20833409 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20833470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 60 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 21125476 - 21125130
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  21125476 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 21125377  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  21125376 gatctctatctgacacaatactcgatggaaccccatgtaacttcacgat--tatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 21125279  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||| || | | |||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  21125278 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgaaaacaacccaaatggcaccatgtcctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 21125179  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctg 408  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  21125178 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctg 21125130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 60 - 412
Target Start/End: Original strand, 27787865 - 27788217
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  27787865 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 27787964  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  27787965 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 27788064  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27788065 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacgacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 27788164  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27788165 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 27788217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 31830782 - 31831143
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  31830782 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 31830881  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |  ||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  31830882 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgcgctaccgggtaactgatattaat 31830981  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||     
T  31830982 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatggag 31831081  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31831082 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 31831143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 292
Target Start/End: Original strand, 23294082 - 23294314
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  23294082 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaagctcttccagaatctagaagtgaacctcg 23294181  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23294182 gatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgattttaat 23294281  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtc 292  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23294282 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtc 23294314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 108 - 422
Target Start/End: Original strand, 23110907 - 23111221
Alignment:
Q  108 tttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaa 207  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23110907 tttgaacccaatgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacacaatgcaacttcacaa 23111006  T
Q  208 tattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatat 307  Q
    |||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||  || || |||||  |||||||||| || || || || ||||| ||    
T  23111007 tatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattaatcgggataaaatgcgctaacttcgtcaatctatcgacaactacccaaat 23111106  T
Q  308 cgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacct 407  Q
     | ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||     
T  23111107 agcatcatgccctcttggagtattgggtaaacttgttacaaaatccatggatatgttatcccatttccactctggcacatctaatggtgtcaacaaccca 23111206  T
Q  408 gcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||| ||||||||    
T  23111207 gcaggcttctgatgt 23111221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 11358193 - 11357832
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  11358193 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 11358094  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |  || || | | |  |||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  11358093 gatccctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagttttaccacactgcgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataattgatattaat 11357994  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  11357993 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 11357894  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  11357893 atactatcccacttccactccggtacatctaacggtgccaacaaccctgcaggcttctgatg 11357832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Original strand, 24675613 - 24675941
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  24675613 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 24675712  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||| ||| || || |||||  |||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||  || || ||| |||||||||||||    
T  24675713 gatctctatatgatacaatgctcgaaagaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactaggcaacaggaaaactgatattaat 24675812  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  24675813 cggtagaaaatgggccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 24675912  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||    
T  24675913 atgctattccatttccactctggcacatc 24675941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 376
Target Start/End: Original strand, 27371396 - 27371709
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  27371396 gactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 27371495  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 262  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| |||||||| |     
T  27371496 ctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaatagg 27371595  T
Q  263 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 362  Q
     |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  27371596 tagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatata 27371695  T
Q  363 ctatcccatttcca 376  Q
    ||||||||||||||    
T  27371696 ctatcccatttcca 27371709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 9610260 - 9610576
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  9610260 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 9610359  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  9610360 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 9610459  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  9610460 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 9610559  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  9610560 atactatcccatttcca 9610576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 21325585 - 21325257
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21325585 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccggactcaatctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21325486  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  21325485 gatctctatctgatataatgctcgacagaacaccatgcaacttcacaatttccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 21325386  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| ||||| || |  ||||| |||   ||||  || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||     
T  21325385 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctgtcaacaatcacccaaatctcgtcatatcctctaggagtattcggaaaactcgtcacgaaatccatggat 21325286  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  21325285 atactatcccatttccactctggcacatc 21325257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 27218140 - 27218456
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27218140 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27218239  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27218240 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27218339  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27218340 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27218439  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  27218440 atactatcccatttcca 27218456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 16923013 - 16923329
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16923013 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16923112  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16923113 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16923212  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16923213 aggtagaaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16923312  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  16923313 atactatcccatttcca 16923329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 16982276 - 16982592
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16982276 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16982375  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16982376 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16982475  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16982476 aggtagaaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16982575  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  16982576 atactatcccatttcca 16982592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 17063841 - 17064157
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  17063841 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 17063940  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  17063941 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 17064040  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  17064041 aggtagaaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 17064140  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  17064141 atactatcccatttcca 17064157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 17067499 - 17067815
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  17067499 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 17067598  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  17067599 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 17067698  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  17067699 aggtagaaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 17067798  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  17067799 atactatcccatttcca 17067815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22325175 - 22324859
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22325175 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22325076  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || |  ||  |||| ||||||||    
T  22325075 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaatagggaaactaatattaat 22324976  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22324975 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22324876  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  22324875 atactatcccatttcca 22324859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24707801 - 24707485
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  ||||||||||  ||||||| ||||    
T  24707801 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtaaatcttg 24707702  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  24707701 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatttccttaatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 24707602  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| ||||| || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  24707601 cgctagaaaatgagccgacttcgtcaatctgtcaacgattacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 24707502  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  24707501 atactatcccatttcca 24707485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 23107986 - 23107721
Alignment:
Q  123 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 222  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||    
T  23107986 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaga 23107887  T
Q  223 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 322  Q
    |||| ||||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  ||||  ||  |    
T  23107886 tctcggccaactgaggaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcatttccttt 23107787  T
Q  323 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  23107786 aggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 23107721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 376
Target Start/End: Original strand, 24262497 - 24262810
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  24262497 gactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 24262596  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 262  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||||     
T  24262597 ctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaatcgg 24262696  T
Q  263 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 362  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  24262697 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatata 24262796  T
Q  363 ctatcccatttcca 376  Q
    ||||||||||||||    
T  24262797 ctatcccatttcca 24262810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 10868974 - 10869290
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  10868974 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 10869073  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  10869074 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 10869173  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| ||||  ||   ||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||     
T  10869174 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaatcgcgtcgctccctctcggagtactcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 10869273  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  10869274 atactatcccatttcca 10869290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 16925484 - 16925800
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16925484 tccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16925583  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16925584 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16925683  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |      
T  16925684 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgtt 16925783  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  16925784 atactatcccatttcca 16925800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 16999124 - 16999440
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16999124 tccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16999223  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16999224 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16999323  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |      
T  16999324 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgtt 16999423  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  16999424 atactatcccatttcca 16999440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22756784 - 22756456
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| || ||||| ||||    
T  22756784 tccgactgaccatctgtctgtgtatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgaaaactcttccaaaatctagaggtaaatcttg 22756685  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||    
T  22756684 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaat 22756585  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||| ||||| || || |  |  |||||  |||  |||| ||| || |||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||     
T  22756584 cggtagaaaatgagccgactttgtcaatctatcaaaaatcacccaagtcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcgcaaaatccatggat 22756485  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  22756484 atactatcccatttccactctggcacatc 22756456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 286
Target Start/End: Original strand, 23064201 - 23064427
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23064201 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaacttg 23064300  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||   |||| || ||||| ||||| ||||  || ||| |||| ||||||||    
T  23064301 gatctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcactatatctcgaatataaatctctgccaattgagaaacaggaaaactaatattaat 23064400  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 286  Q
    || ||  || || ||||||||||||||    
T  23064401 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaa 23064427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21145357 - 21145044
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  21145357 gactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 21145258  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 262  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||| || || |||||||  || || ||  |||| ||||| ||||     
T  21145257 ctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatttctgccaacttggcaacagggaaactaatattgatcgg 21145158  T
Q  263 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 362  Q
     |  || || ||||| |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||     
T  21145157 tagaaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacgaaatccatcgatata 21145058  T
Q  363 ctatcccatttcca 376  Q
    ||||||||||||||    
T  21145057 ctatcccatttcca 21145044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41608704 - 41608391
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  41608704 tccgactgaccatctgtctacggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 41608605  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||   ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  41608604 gatctctgtctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatccccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 41608505  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  41608504 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 41608405  T
Q  360 atgctatcccattt 373  Q
    || |||||||||||    
T  41608404 atactatcccattt 41608391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24877068 - 24876752
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||| | |||||||| ||||    
T  24877068 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatgtagaagtaaatcttg 24876969  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  24876968 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 24876869  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  | ||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||     
T  24876868 cggtaggaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaacaacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacgaaatccatcgat 24876769  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  24876768 atactatcccatttcca 24876752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 316 - 422
Target Start/End: Original strand, 23294315 - 23294421
Alignment:
Q  316 gccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcct 415  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  23294315 gccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccactttcactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggctt 23294414  T
Q  416 ctgatgt 422  Q
    |||||||    
T  23294415 ctgatgt 23294421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 208
Target Start/End: Original strand, 24710157 - 24710305
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  24710157 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 24710256  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 208  Q
    | |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||    
T  24710257 gatctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 24710305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 44385888 - 44385740
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  44385888 tccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 44385789  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 208  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  44385788 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 44385740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20442830 - 20442684
Alignment:
Q  62 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 161  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||     
T  20442830 cgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 20442731  T
Q  162 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 208  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  20442730 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacatcacaat 20442684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 208
Target Start/End: Original strand, 23189131 - 23189279
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23189131 tccgactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 23189230  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 208  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  23189231 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaat 23189279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 422
Target Start/End: Original strand, 45529644 - 45529997
Alignment:
Q  69 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 168  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||| | || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||    
T  45529644 ccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctat 45529743  T
Q  169 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaa 268  Q
    |||| || |||||||| | ||| ||||| | ||||||||| |   | || || |||||   ||||||||  || ||| ||||||| |||||   ||| ||    
T  45529744 ctgatacaatactcgatgcaacaccatgtagcttcacaatctctcggatataaatctctatcaactgagacacaggaaaactgatgttaattagaataaa 45529843  T
Q  269 gtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcc 368  Q
     || |||||||||||||  || || || |  ||||| |||| |||||| ||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  45529844 atgagccgacttcgtcagtctatccacaattacccaaatcgcatcatgtccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggacatactatcc 45529943  T
Q  369 catttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    || ||||||||  | ||||| || ||||||||||| || |||||  ||||||||    
T  45529944 cacttccactctagaacatctaaaggtgtcaacaacccagcaggtttctgatgt 45529997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 30211236 - 30211037
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||| || ||||||||| | || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  30211236 tccgtctgtccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 30211137  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| |   | || || |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  30211136 gatccctatctgatacaatactcgatggaacaccatgtagcttcacaatctcacggatataaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatgttaat 30211037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 24819865 - 24819644
Alignment:
Q  200 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 299  Q
    |||||||||||   | ||||| ||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||  | |  || |      
T  24819865 cttcacaatatcgcggatgtaaatctccgcccactgagatataggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgagttcgtcaatatatgaacaatc 24819766  T
Q  300 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 399  Q
    ||||  || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  24819765 accccaatagtgtcattcccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggcacatctaaaggtgtca 24819666  T
Q  400 acaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
     ||| ||||||||  |||||||    
T  24819665 tcaaccctgcaggtttctgatg 24819644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24825605 - 24825472
Alignment:
Q  56 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 155  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  24825605 tctttccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 24825506  T
Q  156 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaa 189  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  24825505 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 24825472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 21890875 - 21890709
Alignment:
Q  222 atctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccc 321  Q
    ||||| ||||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| |||| ||||| |||      
T  21890875 atctctgccaactgagaaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcatcattccctt 21890776  T
Q  322 tcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    | ||| |||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||| || |||||    
T  21890775 taggattattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccttttccactctggcacatc 21890709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 376
Target Start/End: Original strand, 22276687 - 22276718
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22276687 acaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 22276718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 376
Target Start/End: Original strand, 24710415 - 24710474
Alignment:
Q  317 ccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 376  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  24710415 ccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 24710474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 44385627 - 44385572
Alignment:
Q  321 ctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 376  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  44385627 ctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 44385572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12640267 - 12640234
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccact 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12640267 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccact 12640234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 234
Target Start/End: Original strand, 25128792 - 25128945
Alignment:
Q  81 ggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatac 180  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| || |  |||||  ||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||| || || | ||||||||| ||||    
T  25128792 ggatgataagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatac 25128891  T
Q  181 tcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 234  Q
    | || ||||  ||||||||| | ||||| |  | |||||||||| | |||||||    
T  25128892 tagaaggaataccatgcaacctaacaatctgttcaatgtagatcccagccaact 25128945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 62 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 14286140 - 14285780
Alignment:
Q  62 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 161  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| || ||  ||| |||||| || || ||||| ||     
T  14286140 cgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaaagcatcttgcaagctcttccgaaatctagatgtgaacctcgga 14286041  T
Q  162 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 261  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  14286040 tctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatgtagatctccgctaactgtgctaccggataactgatgttaatcg 14285941  T
Q  262 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 361  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14285940 gaatgaagtgcgtcgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgttacaaaatccatagaaat 14285841  T
Q  362 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
     || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14285840 actgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 14285780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 63 - 422
Target Start/End: Original strand, 13666023 - 13666382
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  13666023 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaagctcttccagaatctagaagtgaacctcggat 13666122  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 262  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||  || ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  13666123 ccctatccgacacaatactcgacgatacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccaccaactgagctaccggataactgatattgatcgg 13666222  T
Q  263 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 362  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13666223 aataaagtgcgccgactttgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagaaatg 13666322  T
Q  363 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13666323 ctatcccacttccactccggcacatccatcggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 13666382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 6413994 - 6414356
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||      
T  6413994 tccgactgaccttctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctca 6414093  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  6414094 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctctgctaactgagctatcggataactgatattgat 6414193  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6414194 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 6414293  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6414294 atactatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 6414356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 13021840 - 13022201
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||| |||| || || || || ||||| |    
T  13021840 tccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaacttttccagaacctagaggtgaacctcg 13021939  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || |||||||| || ||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13021940 gatccctatctgatacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatgctatgaacataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 13022039  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | |||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  13022040 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcatcatgccccctcggagtgtttggttaactcgtcacgaaatccatagaa 13022139  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  13022140 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 13022201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 19147694 - 19148055
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||  |||  || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||      
T  19147694 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctca 19147793  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  19147794 gatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 19147893  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||| ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  19147894 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcataccctctaggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 19147993  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  19147994 atgctatcccacttccattctggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 19148055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 20747093 - 20747454
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||  |||  || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||      
T  20747093 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctca 20747192  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  20747193 gatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 20747292  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||| ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  20747293 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcataccctcttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 20747392  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20747393 atgctatcccacttccattctggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20747454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 15102369 - 15102008
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  15102369 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 15102270  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| ||| |||| || |  ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15102269 gatctctatccgacacaatattcgatggtaaaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgat 15102170  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || | ||||||||  |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15102169 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaatctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccgtctcgaagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 15102070  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15102069 atgttgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 15102008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 57 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 11306032 - 11305668
Alignment:
Q  57 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 156  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||||||||| ||||| ||||    
T  11306032 ctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccaaaatctagaagtgaacc 11305933  T
Q  157 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 256  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11305932 tcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatatt 11305833  T
Q  257 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 356  Q
    ||| | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  11305832 aataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccata 11305733  T
Q  357 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11305732 gagatactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 11305668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 60 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 18053719 - 18053367
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  18053719 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 18053620  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  18053619 gatccctatctgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 18053520  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||    
T  18053519 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaattcgtcacaaaatccatagaa 18053420  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18053419 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 18053367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 14130356 - 14130718
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  14130356 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 14130455  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  14130456 gatccctatccgacacaatacttgaaggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttgat 14130555  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14130556 aggaataaaatgtgccgactttgtcaacctatcaaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 14130655  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14130656 atgctatcccatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 14130718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 23505636 - 23505274
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  23505636 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 23505537  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||| | |||||| | | | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  23505536 gatccctatccgacacaatacacgaaggaactccatgtagcttcaccacactatgtatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 23505437  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  23505436 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 23505337  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||    
T  23505336 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggcgtcaacaatcctgcaggtttctgatgt 23505274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 14434174 - 14434536
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  14434174 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 14434273  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  14434274 gatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttgat 14434373  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14434374 aggaataaaatgtgccgactttgtcaacctatcaaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 14434473  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14434474 atgctatcccatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 14434536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 14264010 - 14263649
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  14264010 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 14263911  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  14263910 gatttctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 14263811  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || | ||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||| ||| |||    
T  14263810 cggaataaagtgtgccgacttcgttaacctatcgacaacaacgcaaatggcatcatgccctctcggagtattcgataaactcgtcacaaaattcatggaa 14263711  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |  |||||| |||||||    
T  14263710 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccacgcaggcttctgatg 14263649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 49152784 - 49153145
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  49152784 tccgactgaccatccgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 49152883  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  49152884 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaat 49152983  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||     
T  49152984 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagag 49153083  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  49153084 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 49153145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 63 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16072057 - 16071699
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||| | ||||| || |    
T  16072057 gactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaactgaacctcggat 16071958  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 262  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||     
T  16071957 ctctatccgacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgatcgg 16071858  T
Q  263 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 362  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||  |||| || | |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16071857 aagaaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctttgagtgttcgataaactcgtcacaaaatccatggaaatg 16071758  T
Q  363 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
     | ||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16071757 ttgtcccacttccactctagcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 16071699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 192 - 422
Target Start/End: Original strand, 19613290 - 19613520
Alignment:
Q  192 ccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgt 291  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| || | | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || |    
T  19613290 ccatgcaacttcacaatgtcccgaatataaatctccgccaactgagccaccgaaaaactgatatttatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctat 19613389  T
Q  292 ctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaa 391  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19613390 caaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaa 19613489  T
Q  392 cggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19613490 tggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 19613520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16950237 - 16949876
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  16950237 tccgactgaccatctgtctgaggatgataatccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 16950138  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
      |||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| | ||||||||| || ||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16950137 aatctctatccgacacaatactcgacagtactccatgtagcttcacaatgttatgaacataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 16950038  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| ||||||||  | |||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  16950037 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgctcggtagactcgtcacgaaatccatagaa 16949938  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  16949937 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgttaacaaccctgcaggcttctgatg 16949876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 11388194 - 11387832
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  11388194 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 11388095  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||     | ||||| |||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| ||    
T  11388094 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatggcacggatgtaaatctccgccagctgaggtaccggaaaactgatatttat 11387995  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||| || || | |||||| || | |||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||    
T  11387994 cggaataaagtgcgctgacttcgtcaacctatccacaaaaacccaaatagcatcatgccctatcggagtattcggtaaactcgtcataaaatccgtagaa 11387895  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11387894 atgttgtcccacttccactctggcacatctaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 11387832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 57 - 422
Target Start/End: Original strand, 15340911 - 15341276
Alignment:
Q  57 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || || ||||    
T  15340911 ctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcatcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagatgtgaacc 15341010  T
Q  157 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 256  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| | ||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  15341011 tcggatccctatccgacacaatactagaaggaactctatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgtt 15341110  T
Q  257 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 356  Q
     || | ||| ||||| ||| |||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||||||||||    
T  15341111 gataggaataaagtgtgccaactttgtcaacctatcgactacaacccatatagaatcatgtcctctcggggtgtttggtaaactcgtcataaaatccata 15341210  T
Q  357 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15341211 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 15341276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12206566 - 12206204
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||    
T  12206566 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctcgatgtaaatcttg 12206467  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| ||||||||    
T  12206466 gatctctatccaacacaatactcgacggaacaccatgcagcttcacaatatcacgaatgtaaatctctgccaactgtgccactggaaaactaatattaat 12206367  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| ||||| || |||||| |||| || || || || | ||||||   ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  12206366 tggaataaagtgtgctgacttcttcaatctatcaacaaccatccatatgacatcatgccctctcagagtatttggtaaacttgttacaaagtccatggat 12206267  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  12206266 atgctatcccatttccattctggaacatctaatggtgtcaacaacccagcaggcttctgatgt 12206204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 56 - 379
Target Start/End: Original strand, 15625030 - 15625353
Alignment:
Q  56 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| || |||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  15625030 tctttccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 15625129  T
Q  156 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 255  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||    
T  15625130 cttggatctctatctgacacaatgctcggcggaacaccatgtagcttcacaatatcgcgaatgtagatctccgccaactgagacacaggaaaactgatat 15625229  T
Q  256 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 355  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || || |||| |||  | |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15625230 taatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaatcacccaaatagagtcattcccttttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccat 15625329  T
Q  356 agaaatgctatcccatttccactc 379  Q
     || ||  ||||||||||||||||    
T  15625330 ggatatagtatcccatttccactc 15625353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 8211894 - 8211533
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | |||||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  8211894 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 8211795  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||    
T  8211794 gatctctatctgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaattgcgctaccggataactgatattgat 8211695  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| || |  |||||||| |||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||     
T  8211694 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtagactcgtcacaaaatccatagag 8211595  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  8211594 atactgtctcacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccatgcaggcttctgatg 8211533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 58 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 1175 - 812
Alignment:
Q  58 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 157  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| |||||    
T  1175 tttccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacct 1076  T
Q  158 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 257  Q
    ||  || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||  || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||     
T  1075 tgtatccctatccgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaatgttatgaacataaatctccgccaactgtgctaccagataactgatattg 976  T
Q  258 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 357  Q
    |||| |||||| || || ||||||||||||||||| || |  ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||    
T  975 atcggaatgaaatgtgctgacttcgtcaacctgtcgacaatgacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaacttggcacgaaatccatag 876  T
Q  358 aaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  875 aaatattgtcccacttccactccggcacatctaacgatgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 12456185 - 12456546
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||| || || |||||  ||||||||||| |  |||| || || ||||| ||||| |    
T  12456185 tccgactgaccatctgtctggggatgataagccgagctcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgtaaattcttccagaacctagaagtgaacctcg 12456284  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || || || | |||||||||  | | ||  || |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  12456285 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaatgctataaacataaatctctaccaactgtgctaccggataactgatattgat 12456384  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12456385 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcgtagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 12456484  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  12456485 atattgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccatgcaggcttctgatg 12456546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 13968434 - 13968073
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  13968434 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 13968335  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  13968334 gatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataacttatattaat 13968235  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  13968234 aggaataaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagag 13968135  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  13968134 atactgtcccacttccagtccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 13968073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 11772031 - 11771677
Alignment:
Q  58 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 157  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11772031 tttccgactaaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcctccaaaatctagaagtaaacct 11771932  T
Q  158 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 257  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||   | ||||| || |||||||||||||  ||  || ||||||||||     
T  11771931 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatatcgcggatgtaaatttccgccaactgagacacaagaaaactgatattt 11771832  T
Q  258 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 357  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  11771831 atcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 11771732  T
Q  358 aaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 412  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  11771731 atatgctatcccatttccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcagg 11771677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 26118371 - 26118010
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || |||||||   |||| || || ||||| ||||| |    
T  26118371 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacgcttccagaacctagaagtgaacctcg 26118272  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || || || || ||||| ||||| |||||| ||||||| ||    
T  26118271 gatctctatccgacacaatactcgccggaacaccatgaagtttcactacactgtgaatataaatttctgctaactgcgctaccggataattgatattgat 26118172  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  26118171 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 26118072  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  26118071 atactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccccgcaggcttctgatg 26118010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 12687983 - 12688299
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  12687983 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 12688082  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| || || || ||||| ||||  ||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  12688083 gatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctccgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 12688182  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  12688183 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccccctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 12688282  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  12688283 atactatcccatttcca 12688299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 237 - 422
Target Start/End: Original strand, 12457300 - 12457485
Alignment:
Q  237 gctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggta 336  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||| | || | ||||||||| |||||||| ||  |||    
T  12457300 gctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtctacaacaacctaaatagcatcatgccctctcggagtgttccgta 12457399  T
Q  337 aacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12457400 aactcgtcacgaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 12457485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 9596539 - 9596855
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  9596539 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 9596638  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| || || ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  9596639 gatctctatctgatacaatgctcgaagggacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 9596738  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | ||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||     
T  9596739 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccctctaggagtattcggcaaacttgtcacaaagtccatggat 9596838  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  9596839 atactatcccatttcca 9596855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18551546 - 18551230
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  18551546 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 18551447  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  18551446 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 18551347  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  18551346 aggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 18551247  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  18551246 atactatcccatttcca 18551230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 8199110 - 8199426
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8199110 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8199209  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  8199210 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 8199309  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8199310 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 8199409  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  8199410 atactatcccatttcca 8199426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 44791139 - 44790823
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  44791139 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 44791040  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  44791039 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 44790940  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  44790939 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 44790840  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  44790839 atactatcccatttcca 44790823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 387
Target Start/End: Original strand, 14040178 - 14040504
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| |   | ||||| ||| || |||||||| | |||||||| ||||    
T  14040178 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttg 14040277  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  14040278 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatatagatttctgccaactgaaacacaggaaaactgatattaat 14040377  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||| |||| || ||||| ||||||| |||||| ||     
T  14040378 cggaataaagtgagccgacttcgtcaatctatc-acaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggaatattcggcaaactcgtcacaacatccatggat 14040476  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacat 387  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||    
T  14040477 atactatcccatttccactctggtacat 14040504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 387
Target Start/End: Original strand, 14350208 - 14350534
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| |   | ||||| ||| || |||||||| | |||||||| ||||    
T  14350208 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttg 14350307  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  14350308 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatatagatttctgccaactgaaacacaggaaaactgatattaat 14350407  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||| |||| || ||||| ||||||| |||||| ||     
T  14350408 cggaataaagtgagccgacttcgtcaatctatc-acaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggaatattcggcaaactcgtcacaacatccatggat 14350506  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacat 387  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||    
T  14350507 atactatcccatttccactctggtacat 14350534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11237001 - 11236685
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  11237001 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 11236902  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  11236901 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 11236802  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||     
T  11236801 cggcagaaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattttgcaaactcgtcacaaaatccatggat 11236702  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  11236701 atactatcccatttcca 11236685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 8708087 - 8708403
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8708087 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8708186  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  8708187 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 8708286  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || |  ||||| |||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8708287 aggtagaaaatgagttgactttgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 8708386  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  8708387 atactatcccatttcca 8708403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 10871477 - 10871793
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  10871477 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 10871576  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  10871577 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 10871676  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  10871677 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 10871776  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  10871777 atactatcccatttcca 10871793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11552890 - 11552574
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||    
T  11552890 tccgactgtccatctatctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaaggaaatcttg 11552791  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  11552790 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 11552691  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  11552690 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccattgat 11552591  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  11552590 atactatcccatttcca 11552574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 13686546 - 13686862
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  13686546 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 13686645  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || |||||  ||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  13686646 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctaccaactgggcaacggggaaactaatattaat 13686745  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  13686746 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 13686845  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  13686846 atactatcccatttcca 13686862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 14332879 - 14333195
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14332879 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14332978  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||  | ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  14332979 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgataaaaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 14333078  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  14333079 aggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaagagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 14333178  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  14333179 atactatcccatttcca 14333195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15160845 - 15160529
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15160845 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15160746  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  15160745 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 15160646  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||     
T  15160645 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcaaaaaatccatggat 15160546  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  15160545 atactatcccatttcca 15160529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15154449 - 15154117
Alignment:
Q  56 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | |  || |||||| |||||||||| ||||| ||     
T  15154449 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctgctgcaaacttttccaaaatctagaagtgaat 15154350  T
Q  156 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 255  Q
    ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| || ||||||    
T  15154349 cttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttcacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaattgatat 15154250  T
Q  256 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 355  Q
    |||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||| |||| |||  | |||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  15154249 taatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaattacccaaatcgagtcattccctttaggagtattcggcaaactcgttaaaaaatccat 15154150  T
Q  356 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
     || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  15154149 ggatatactatcccatttccactctggcacatc 15154117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 18178224 - 18178540
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  18178224 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctaaaagtaaatcttg 18178323  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || ||  |||| ||||| ||||| | ||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  18178324 gatctctatctgatacaatgttcgaaggaacaccatgtagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 18178423  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  18178424 aggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatagat 18178523  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  18178524 atactatcccatttcca 18178540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 17100 - 16788
Alignment:
Q  64 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 163  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  17100 actgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 17001  T
Q  164 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 263  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | | ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||      
T  17000 tctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggt 16901  T
Q  264 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 363  Q
    |  || || |||||||||| ||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  16900 agaaaatgagccgacttcgacaatctatcaacgatgacccaaattgtgtcgttccctctaggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggatatac 16801  T
Q  364 tatcccatttcca 376  Q
    |||||||||||||    
T  16800 tatcccatttcca 16788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 403
Target Start/End: Original strand, 21662452 - 21662786
Alignment:
Q  69 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 168  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||| || ||||||||| | || |  |||||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||    
T  21662452 ccatctgtctgcggatgatacgcctaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctacaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctat 21662551  T
Q  169 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaa 268  Q
    || | || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |   | || || ||||   ||||||||| ||| ||| || |||| ||||||| ||| ||    
T  21662552 ctaatacaatactcgatggaacaccatgtaacttcacaatctcacggatataaatcttttccaactgagatacaggaaaattgatgttaatcggaataaa 21662651  T
Q  269 gtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcc 368  Q
     || |||||||||||||  || || || |  ||||| |||| |||||| ||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  21662652 atgagccgacttcgtcagtctatccacaattacccaaatcgcatcatgtccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcc 21662751  T
Q  369 catttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 403  Q
    ||  ||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  21662752 cacgtccactctggaacatctaaaggtgtcaacaa 21662786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 14955102 - 14955275
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | | ||| |||||| |  |||  || |||||||| ||||    
T  14955102 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctgttgcaaacttttgaaaatcctagaagtaaatcttg 14955201  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaac 233  Q
    | ||||||||  | || || ||||| ||||  ||||||||| ||||||| | || |||||| ||||||||||||    
T  14955202 gatctctatccaatacaatgctcgaaggaataccatgcaacgtcacaatctccttaatgtaaatctccgccaac 14955275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 23203368 - 23203085
Alignment:
Q  93 gaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccc 192  Q
    ||||||||| |||| || || |||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |    
T  23203368 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23203269  T
Q  193 catgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtc 292  Q
    |||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| ||||| |  || || ||  |||| |||||||| |  |  || || || ||||||||||| || ||    
T  23203268 catgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaatttggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatc 23203169  T
Q  293 taccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 376  Q
     || | |||||| || |  || | ||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  23203168 aacaataacccaaattgcgtcgttccctctcgtagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 23203085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 23509495 - 23509212
Alignment:
Q  93 gaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccc 192  Q
    ||||||||| |||| || || |||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |    
T  23509495 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23509396  T
Q  193 catgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtc 292  Q
    |||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| ||||| |  || || ||  |||| |||||||| |  |  || || || ||||||||||| || ||    
T  23509395 catgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaatttggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatc 23509296  T
Q  293 taccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 376  Q
     || | |||||| || |  || | ||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  23509295 aacaataacccaaattgcgtcgttccctctcgtagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 23509212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 321638 - 321506
Alignment:
Q  247 aactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac 346  Q
    |||| |||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || |||||||||||    
T  321638 aactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaacttgtcac 321539  T
Q  347 aaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 379  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  321538 aaaatccatggatatactatcccatttccactc 321506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 233
Target Start/End: Original strand, 4440419 - 4440583
Alignment:
Q  69 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 168  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||| || |  |||||  || |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||| || || | ||    
T  4440419 ccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 4440518  T
Q  169 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaac 233  Q
    ||||||| ||||| || ||||  ||||||||| ||||||| | || |||||||||||| ||||||    
T  4440519 ctgacacaatactagaaggaataccatgcaacctcacaatctgctcaatgtagatctcagccaac 4440583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 23199509 - 23199451
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaa 118  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||    
T  23199509 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaa 23199451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27107277 - 27107243
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27107277 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 27107243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 96
Target Start/End: Original strand, 12457262 - 12457298
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaac 96  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12457262 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaac 12457298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 14325775 - 14325743
Alignment:
Q  21 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagc 53  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14325775 ttgatagccgtacacaccgtatgggcttccagc 14325743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 19644 - 20006
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  19644 tccgactgaccatctgtctgaggatcataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 19743  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19744 gatccctatcagacacaatactcgacggaactccatgtagcttcacaatgttctgaatataaatctccgccaactgagctacgagataactgatattaat 19843  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19844 aggaatgaagtgcgccgactttgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctttcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 19943  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19944 atgctatcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 20006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 27749 - 28110
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  27749 tccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 27848  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27849 gatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaactgagctaacggataactgatattaat 27948  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || | |||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27949 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgtcctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 28048  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  28049 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccgtgcaggcttctgatg 28110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 41443 - 41803
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||  |    
T  41443 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaac--aacctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccccg 41540  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||  ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41541 gatctctattcgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 41640  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  41641 cggaataaagtgcgccgacttcatcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 41740  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  41741 atgctatcccacttccactccggcatatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 41803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21453 - 21091
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  21453 tccgactgaccgtctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaacctcg 21354  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21353 gatctctatccgacacaatacttgacagcacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 21254  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21253 cgaaataaagtgcgccaactttgtcaatttgtcgaccacaacccatatcgcatcatgccctctcggagtgttaggtagactcgtcacaaaatccatagaa 21154  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21153 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatgt 21091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 136 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 11163 - 10877
Alignment:
Q  136 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 235  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  11163 tccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacagcacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactg 11064  T
Q  236 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  11063 agctaccggataactgatattaatcgaaataaagtgcgccaactttgtcaatttgtcgaccacaacccatatcgcatcatgccctctcggagtgttaggt 10964  T
Q  336 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10963 agactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatgt 10877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 5)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 20507 - 20868
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  20507 tccgactaaacatctgtctgcggatgataaaccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 20606  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20607 gatcgctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattgtgaatataaatctccacaaactgagctaccgggtaactgatattaat 20706  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||    
T  20707 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcaacaacaacccaaatggaatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcataaaatccatagaa 20806  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||    
T  20807 atgttgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcatcaaccctgtaggcttctgatg 20868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 60 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13143 - 12865
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||| |    
T  13143 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcg 13044  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13043 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattattaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 12944  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaa 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| | |||||||    
T  12943 cgaaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctaggagtgtaaggtaaa 12865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 60 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16913 - 16635
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||| |    
T  16913 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcg 16814  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16813 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattattaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 16714  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaa 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| | |||||||    
T  16713 cgaaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctaggagtgtaaggtaaa 16635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 334 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 11565 - 11477
Alignment:
Q  334 gtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11565 gtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 11477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 334 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 15335 - 15247
Alignment:
Q  334 gtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15335 gtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 15247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 60 - 413
Target Start/End: Original strand, 40262 - 40615
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  40262 tccgactgaccatctctttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 40361  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  40362 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgat 40461  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  40462 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 40561  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 413  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40562 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggc 40615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 67 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 25640 - 25285
Alignment:
Q  67 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 166  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| || ||  |||| ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  25640 gaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaatctcttccataatctagaagtgaacctcggatctct 25541  T
Q  167 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 266  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||     
T  25540 atccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcataaaattatgaatgtagatctccgccaactgagctaccggataactgataataattggaata 25441  T
Q  267 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 366  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  25440 aagtgcgctgacttcgtcaacctgtcaaccacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgtttt 25341  T
Q  367 cccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||    
T  25340 cccacttccactccggcacatccaacggtgtcaaaaaccctgcagacttctgatgt 25285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 48989 - 48627
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  48989 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 48890  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  48889 gattcctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagctttacaatattatgaatataaatctcagccaactgagctaccagataactgatgttaat 48790  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  48789 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaacttgtcactaaatccatagaa 48690  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  48689 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccatgcaggcttctgatgt 48627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 47181 - 46819
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||| || || ||||| |||||||    
T  47181 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaaccttg 47082  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||    
T  47081 gatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgcagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactaagctatcggataattgatattaat 46982  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  46981 cggaataaaatgcgccgacttcgtcaacctgttgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 46882  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  46881 atgttatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaacccttcaggcttctgatgt 46819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 42115 - 41754
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  42115 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 42016  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42015 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 41916  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  41915 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 41816  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  41815 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 41754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 2445 - 2806
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||||| | |||  |||||||||| || |||||||| |    
T  2445 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttacaacctaaagcctcttgcacactcttccaaaatctagaggtaaacctcg 2544  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| ||  | ||||| ||||| ||||| | ||||| |||||   |||| || || | |||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  2545 gatctctatctgatacattgctcgaaggaacaccatgtagcttcataatatcgcgaatataaattttcgccaactgagacacaggaaaactgatattaat 2644  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || |||||| || |||||||||||||| || || || |  | ||| || |   ||| |||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||  ||     
T  2645 cggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcagccaaattgcgccattccctttaggagtattcgacaaactcgtcacaaaatccacggat 2744  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  2745 atgctatcccatttccattctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 2806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 10317 - 10678
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  10317 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgaaaactcttccaaaatcttgaagtgaaccttg 10416  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  10417 gatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctcctccaactgagctaccggaaaactaatattgat 10516  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||   ||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||    
T  10517 tggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatgacatcatgccctctcggactattcggtaaactcgtcacaaaatccatgaaa 10616  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10617 atgctatcccacttccactctggcatatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 10678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 27048 - 27409
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  27048 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaaccttg 27147  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  27148 gatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatcttctccaactgagctaccggaaaactaatattgat 27247  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  27248 cggaataaaatgcgctgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 27347  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27348 atgctatcccacttccactctggcacatctaacagtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 27409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 60 - 238
Target Start/End: Original strand, 26666 - 26844
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  26666 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaaccttg 26765  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagc 238  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||    
T  26766 gatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatcttctccaactgagc 26844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 62 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 18317 - 17958
Alignment:
Q  62 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 161  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||     
T  18317 cgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaaccttgga 18218  T
Q  162 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 261  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18217 tctctatacgacacaatactcgacggaactccatgaaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctactggataactaatattgatcg 18118  T
Q  262 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 361  Q
     ||| ||||| |||||||| |||||| |||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||    
T  18117 gaataaagtgtgccgactttgtcaacttgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacgaaatccatggaaat 18018  T
Q  362 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||| ||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18017 gctgtcccactttcactctgccacatctaacggtgtcaacaatcctgcaggcttctgatg 17958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 62 - 421
Target Start/End: Original strand, 3277 - 3636
Alignment:
Q  62 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 161  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||| ||| | |||  |||||||||| ||||| |||||  |     
T  3277 cgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcattttgcagactcttccaaaatctagaagtgaacctcaga 3376  T
Q  162 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 261  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  3377 tcactatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgttatgaatgtagatctccgccaactgagctaccggataactgatattaattg 3476  T
Q  262 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 361  Q
     ||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3477 gaataaaatgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcagagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaat 3576  T
Q  362 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  3577 gctgtcccacttccattccgccacatccaacggtgtcaacaaccctgcagtcttctgatg 3636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12909 - 12833
Alignment:
Q  129 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 205  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  12909 aaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatacacgaaggaacaccatgcaacttcac 12833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 67 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 195479 - 195124
Alignment:
Q  67 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 166  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  195479 gaccatctgtctgaggatggtaagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatgttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctct 195380  T
Q  167 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 266  Q
    ||| ||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| || | ||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||     
T  195379 atccgacacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaatgttatgaatataaacctctgctaactgagctaccggataaatgatattaatcggaata 195280  T
Q  267 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 366  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  195279 aagtgcgccgactttgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcagagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctat 195180  T
Q  367 cccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  195179 ccaacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgtaggcttctgatgt 195124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 57 - 421
Target Start/End: Original strand, 149091 - 149455
Alignment:
Q  57 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 156  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||  ||||||| | |||  |||||||||| ||||| ||||    
T  149091 ctttccgactgaccatctttctgaggatgataagccgaactcaactccaacttcgaacccaatgcatcttgcagactcttccaaaatctagaagtgaacc 149190  T
Q  157 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 256  Q
    | || || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| | ||||| ||| || | ||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  149191 tcggatccctatccgacataatactcgacggtacaccatgtagcttcaaaatgttatcaatataaatctcctccaactgagctaccggataactgatatt 149290  T
Q  257 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 356  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  149291 aatcggaatgaaatgtgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatggaatcatgccctctcggagtgttcagtaaactcgtcacaaaatccata 149390  T
Q  357 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  149391 gaaatgctgtcccaattacactccagcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 149455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 58 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 26317 - 25965
Alignment:
Q  58 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  26317 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacct 26218  T
Q  158 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 257  Q
     || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||   | ||||| || ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  26217 cggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatatcgcggatgtaaatttccgccaactgggatacaggaaaactgatatta 26118  T
Q  258 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 357  Q
    |||| ||| || || |||||||||||||| || || |  |  ||||| ||||  |||| |||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  26117 atcggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaataatcacccaaatcgcgtcattccctttcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 26018  T
Q  358 aaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgca 410  Q
    | ||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  26017 atatgctatgccatttccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgca 25965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5234 - 4872
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||||| || |||||  |||| || || ||||| |||||      
T  5234 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacatcctgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctca 5135  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
      || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5134 aatccctatccgacacaatactcgaaagaactccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 5035  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5034 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaatccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 4935  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4934 atgttatcccatttccactccgatacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 4872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 153 - 421
Target Start/End: Original strand, 5830 - 6098
Alignment:
Q  153 aaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactga 252  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  5830 aaccttggatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaatattatgaatgtaaatctcagccaactgagctacaggataactaa 5929  T
Q  253 tattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatc 352  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  5930 tgttaataggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatc 6029  T
Q  353 catagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6030 catagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcttctgatg 6098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 60 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 6117 - 5757
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| |||||      
T  6117 tccgactgaccatctatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcatccagaacctagaagtgaacctca 6018  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6017 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattatgaatataaatcttagccaactgagctaccggataactgatgttaat 5918  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| | |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5917 aggaatgaagtgtgtcgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 5818  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  5817 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgtaggcttctgat 5757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 63 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 101331 - 100972
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| || |    
T  101331 gactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggat 101232  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 262  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  || |||| ||||| ||||     
T  101231 ccctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccagaaaactaatatttatcgg 101132  T
Q  263 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 362  Q
     || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||     
T  101131 gataaaatgtgccgacttcgtcaacctatctaccacgacccaaatggcatcatgccctcttggagtgtttggcaaactcgtcacaaaatccatagaaata 101032  T
Q  363 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  101031 ttgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 100972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 388
Target Start/End: Original strand, 180725 - 181051
Alignment:
Q  62 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 161  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||     
T  180725 cgactgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactgttccaaaatctagaagtaaatcttgga 180824  T
Q  162 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 261  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || |  ||| |||||||||||||||    
T  180825 tctctatccgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaagaggaaaactgatattaatcg 180924  T
Q  262 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 361  Q
      |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  180925 gtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatat 181024  T
Q  362 gctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
     ||||||||||||||||| || |||||    
T  181025 actatcccatttccactctggcacatc 181051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 1306 - 944
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  1306 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccacaacttcgaacccaaagcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcg 1207  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || || || ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1206 gatccctgtccgacacgatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttataaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 1107  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1106 cggaatatagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 1007  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1006 attaggtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 6547 - 6863
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||| ||  | || || |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6547 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcatgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaccttg 6646  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  6647 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 6746  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||||||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||     
T  6747 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccatatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgttacaaaatccatggat 6846  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  6847 atactatcccatttcca 6863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 376
Target Start/End: Original strand, 12846 - 12898
Alignment:
Q  324 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 376  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  12846 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 12898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 60 - 403
Target Start/End: Original strand, 114704 - 115052
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  114704 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcg 114803  T
Q  160 ggtct-----ctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgata 254  Q
    | ||      |||||  |||| ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  114804 gatcggatccctatccaacacaatactcgacggtacaccatgcagctttacaatattatgactgtaaatctccgccaactgagctaccggataactgata 114903  T
Q  255 ttaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatcca 354  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  114904 ttaatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctgtcaaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatcca 115003  T
Q  355 tagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 403  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  115004 tagaaatgctattccacttccactccagcacatccaacggtgtcaacaa 115052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 60 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 90714 - 90513
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||   ||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  90714 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcacacccaagccatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 90615  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  90614 gatctctatccgatacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctctgccaactgagctactagataactaatattgat 90515  T
Q  260 cg 261  Q
    ||    
T  90514 cg 90513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 56 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 390986 - 390663
Alignment:
Q  56 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||     
T  390986 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaat 390887  T
Q  156 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 255  Q
    ||||| ||| ||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  |  ||| |||||||||    
T  390886 cttggatctttatctgatacaatgctcgatggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctcagccaactgagaaataggaaaactgatat 390787  T
Q  256 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 355  Q
    |||||| ||| || || | | |||||||||| || || || || ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  390786 taatcggaataaaatgagtcaacttcgtcaatctatcaacaaccacccaaatcgcgtcatcccctttaggagtattcagcaaactcgtcacaaaatccat 390687  T
Q  356 agaaatgctatcccatttccactc 379  Q
     || || |||||||||||||||||    
T  390686 ggatatactatcccatttccactc 390663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 121 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 89975 - 89835
Alignment:
Q  121 catcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgta 220  Q
    ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  89975 catcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgatacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatata 89876  T
Q  221 gatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 261  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  89875 aatctctgccaactgagctactagataactaatattgatcg 89835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 60 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 7019 - 6660
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||      
T  7019 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctca 6920  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||    
T  6919 gatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaacattgat 6820  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac-aaaatccataga 358  Q
    |  ||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  6819 cagaataaagtgcgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaaatccatgga 6720  T
Q  359 aatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctg 418  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  6719 aatgctgtcccacttccactccggcacatctaatggtgtcaacaaccttgcaggcttctg 6660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 60 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11091
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||      
T  11450 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctca 11351  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||    
T  11350 gatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaacattgat 11251  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac-aaaatccataga 358  Q
    |  ||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  11250 cagaataaagtgcgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaaatccatgga 11151  T
Q  359 aatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctg 418  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  11150 aatgctgtcccacttccactccggcacatctaatggtgtcaacaaccttgcaggcttctg 11091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 44029 - 44391
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  44029 tccgactgaccatgtatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 44128  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  44129 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactcatgttaat 44228  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  ||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  44229 agggatgaagtgttccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgttacaaaatccatagaa 44328  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  44329 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 44391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 45041 - 45403
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  45041 tccgactgaccatgtatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 45140  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  45141 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactcatgttaat 45240  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  ||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  45241 agggatgaagtgttccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgttacaaaatccatagaa 45340  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  45341 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 45403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 63 - 421
Target Start/End: Original strand, 47651 - 48009
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  47651 gactgaccatttgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcgggt 47750  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 262  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||     
T  47751 ctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctcccccaactgagctaccggataactaatattgatcgg 47850  T
Q  263 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 362  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| || | |||| | || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47851 aataaagtgtgccgacttagtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcagggcctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatg 47950  T
Q  363 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
     | ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||||||    
T  47951 ttgtcccacttccactctggcacatctaacggggtcaacaaccctgtaggcttctgatg 48009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 6818 - 6456
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  | |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||      
T  6818 tccgactgaccatttgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctca 6719  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  6718 gatctctatccgacacaatgttcgatggaaccccatgtaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 6619  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||     
T  6618 cgggataaaatgcgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggtatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggag 6519  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||| ||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  6518 atgctgtcccacttccactctggaaaatctaacggtgtcaacaatcctgcaggcttctcatgt 6456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 136 - 421
Target Start/End: Original strand, 2188 - 2473
Alignment:
Q  136 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 235  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2188 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatttgaaacaatactcgacgggactccatgcaacttcacaatattatgaatgtagatctccgccaactg 2287  T
Q  236 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||    
T  2288 agctaccggataactgatattaatcggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggt 2387  T
Q  336 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||  ||||| |||||||    
T  2388 aaacttgtcacaaaatccatagaaatactgtcccacttccactccggcacatcaaacggtgtcaaaaacccaacaggcttctgatg 2473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 51645 - 51284
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||  |||| |||||      
T  51645 tccgactaaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtgaacctca 51546  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  51545 gatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 51446  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||| | ||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  51445 cggaataaagtgtgacgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccttctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 51346  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  51345 atgctgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 51284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 81 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 81593 - 81252
Alignment:
Q  81 ggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatac 180  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || || ||  |||||||||| || || ||||| || || ||||| ||||| ||||    
T  81593 ggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaagctcttccaaaatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatac 81494  T
Q  181 tcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgactt 280  Q
    ||||||| || ||||| | ||||| |||||| ||||| || ||||  | |||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  81493 tcgacggtacaccatgtagcttcaaaatattatgaatataaatctaagtcaactgagctaccggataactgatgttaataggaatgaagtgtgccgactt 81394  T
Q  281 cgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactcc 380  Q
     |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81393 tgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcgtagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactcc 81294  T
Q  381 ggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  81293 ggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 81252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 57 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 12570 - 12215
Alignment:
Q  57 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||||||||| || || ||||    
T  12570 ctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccaaaatctagatgtgaacc 12471  T
Q  157 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 256  Q
    | || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  12470 tcggatccctatccgacacaatactcgacggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataattgatgtt 12371  T
Q  257 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 356  Q
     ||   ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||| | ||||| |||||||||    
T  12370 gataccaatgaagtgcgtcgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaaatcgtcacgaaatccata 12271  T
Q  357 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12270 gaaatgctatcccatttccactctggtacatccaacgg-gtcaacaaccctgcaggc 12215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 162 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 13979 - 13719
Alignment:
Q  162 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 261  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13979 tctctatccgacataatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatgttaatcg 13880  T
Q  262 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 361  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13879 gaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaat 13780  T
Q  362 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  13779 gctatcccacttccactctggtacatccaacggtgtcaacaaccttgcaggcttctgatgt 13719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Original strand, 11293 - 11655
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  11293 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactgaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctcgaagtgaacctcg 11392  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11393 gatctccatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatgttttgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 11492  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | |||||||||  ||||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  11493 aggaatgaagtgtaccgactttgtcaacctatcgaccacaaaccatatagaatcaaaccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 11592  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11593 atgttatcccatttccactccgatacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 11655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 203 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 57486 - 57268
Alignment:
Q  203 cacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacc 302  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  57486 cacaatattatgaatgtaaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaataggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacc 57387  T
Q  303 catatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaaca 402  Q
    || || |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57386 caaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaaca 57287  T
Q  403 aacctgcaggcctctgatg 421  Q
    | ||||||||| |||||||    
T  57286 accctgcaggcttctgatg 57268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 57 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 48819 - 48455
Alignment:
Q  57 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 156  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || ||||||||  ||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  48819 ctttccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaacatcttgaagtgaacc 48720  T
Q  157 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 256  Q
    | || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||    
T  48719 tcggatctttatccgacacaatactcgacggaaccccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctatcggaaaactaatatt 48620  T
Q  257 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 356  Q
     |||| ||  ||||  ||||||||||||||||| || || |||| ||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||     
T  48619 gatcggaagaaagtttgccgacttcgtcaacctatcgacaacaatccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatcaatg 48520  T
Q  357 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    |||||| | ||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  48519 gaaatgttgtcccacttccactctggcatatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 48455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 57599 - 57541
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaa 118  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||    
T  57599 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaa 57541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 1754 - 1393
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||| |||||  ||||||| || ||||| ||||| |    
T  1754 tccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacttcaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaacctcgaagtgaacctcg 1655  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||  ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||    
T  1654 gatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgcaacttaaaaatatgatgaatataaatctccgccaactaagctaccggaaaactaatattgat 1555  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| || || ||| ||||||||||||| || ||  ||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||    
T  1554 cggaataaaatgtgcctacttcgtcaacctatcgacagcaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcataaaatccatggaa 1455  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1454 atgctatcccacttccactctggcacatctaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 1393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 4954 - 5315
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || |||||| |   |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| |    
T  4954 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccgaggaatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtaaacctcg 5053  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
      |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| ||    
T  5054 aatctctatccgacacgatgctcgatggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctatcggaaaactaatattgat 5153  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||     
T  5154 cggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggag 5253  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||| | ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5254 atgttgtcccacttccactatggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 5315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 393 - 754
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  393 tccgactgaccatctgtttgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 492  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  493 gatctctatccgacacaatactcgatggtacatcatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 592  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||| | ||||||||||||||| || || | | |||| || | ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  593 cggaataaagtgtgtcgacttcgtcaacctatcgacaaaatcccaaatggcatcatgccctctcagagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 692  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||| | ||||| |||||||  || | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  693 atgttgtcccacttccactttggcaaatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 5274 - 5635
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  5274 tccgactgaccatctgtctgcagatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcg 5373  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
      |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5374 aatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaatgttatgaatataaatctccgctaactgagctaccggataactgatattaat 5473  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||| | |||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  5474 aggaatgaagtgtgccaacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcgtattattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 5573  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||| | ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5574 atgttgtcccacttccagtctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 5635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 931 - 570
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  931 tccgactgaccatctgtttgcggacgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 832  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||  || |||| ||||| ||    
T  831 gatctctatccgacacaatactcgatgaaacaccatgtaacttcataatattatgaatataaatctcagccaattgagctaccagaaaactaatattgat 732  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||    
T  731 cggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcagtaaactcgtcacaaaatccatggaa 632  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  631 atgctatcccactttcactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 187
Target Start/End: Original strand, 28043 - 28170
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| || || |||||  | ||||| |||||  ||||||||||  |||| ||||| |    
T  28043 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtgaacctcg 28142  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacgg 187  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  28143 gatctctatctgacacaatacttgacgg 28170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 187
Target Start/End: Original strand, 34296 - 34423
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| || || |||||  | ||||| |||||  ||||||||||  |||| ||||| |    
T  34296 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtgaacctcg 34395  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacgg 187  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  34396 gatctctatctgacacaatacttgacgg 34423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 57 - 422
Target Start/End: Original strand, 260829 - 261194
Alignment:
Q  57 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || || ||||    
T  260829 ctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacc 260928  T
Q  157 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 256  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||    
T  260929 tcggatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaattgagctatcggataactgatgtt 261028  T
Q  257 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 356  Q
     || | ||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||| |||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  261029 gataggaataaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcagagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccata 261128  T
Q  357 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  261129 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggcgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 261194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 278612 - 278296
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||| |||||  ||||||| || |||||||| ||||    
T  278612 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaatttagaaccgaaggcctcttgcaaactcttccaaaacctagaagtaaatcttg 278513  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| ||| || | || || ||| |||||||||||||    
T  278512 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgcctacagggcgacaggaaaactgatattaat 278413  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||     || || |||||||||||||| || || || |  | ||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  278412 cggtggaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcatccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 278313  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  278312 atactatcccatttcca 278296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 136 - 422
Target Start/End: Original strand, 7660 - 7946
Alignment:
Q  136 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 235  Q
    |||| ||||| ||||| ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||| | | |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||    
T  7660 tccagaatctagaagtgaacatcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccacgtagcttcacaatattatgaatataaatctccaccaactg 7759  T
Q  236 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 335  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||    
T  7760 agctaccagataactgatattaatcggaataaagtgcgccgacttcatcaacttgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgtttggt 7859  T
Q  336 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7860 aaactcgtcacaaaatccagagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 7946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3137 - 2775
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| |||||  |||| ||||| |    
T  3137 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcatgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcg 3038  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||| || || ||||  || |||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  3037 gatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcactatgttatgaacataaatctccgccaactatgctaccagataactgatattaat 2938  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||| | ||| ||||| || ||||| || | || ||| |||||||||| |||||||    
T  2937 aggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgataacaacctatatagcatcgtgccctcttggagtgtttgctatactcgtcacaaaattcatagaa 2838  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  2837 atactatcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttcttatgt 2775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 60 - 402
Target Start/End: Original strand, 31934 - 32276
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||   ||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  31934 tccgactgacaatctgtttgcggatgataagctgaactcaaccccaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 32033  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  32034 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaattgagctaccggataactgatattgat 32133  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| ||| || ||||||| || ||||| || |  |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  32134 tggaataaagagcaccgactttgttaacctatcaaaaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 32233  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaaca 402  Q
    ||| | ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32234 atgttgtcccacttccactcctgcacatccaacggtgtcaaca 32276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 393
Target Start/End: Original strand, 14563 - 14896
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||||  |||| || ||| | ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14563 tccgactgagcatctgtttgcggctgatacgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14662  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  14663 gatctctatctgacacaatgctcgaatgaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 14762  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||  || || ||||||||||||||||| || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||     
T  14763 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtattaggcaaactcttcacaaaatccatggat 14862  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 393  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  14863 atactatcccatttccactctggcacatctaacg 14896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 208
Target Start/End: Original strand, 17965 - 18113
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  17965 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 18064  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 208  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| || || ||| |||||||    
T  18065 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccgtgtaacctcacaat 18113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18557 - 18321
Alignment:
Q  140 aaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagct 239  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| || || || || ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||      
T  18557 aaatctagaagtaaatcttggatctctatatgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaaatttccgccaactgagaa 18458  T
Q  240 actggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaac 339  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||   ||| |||  | |||||||| | |||||    
T  18457 acaggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcggcattccctttaggagtattcgttaaac 18358  T
Q  340 ttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 376  Q
    | |||||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  18357 tcgtcacaaaatacatggatatactatcccatttcca 18321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 64 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 28546 - 28207
Alignment:
Q  64 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 163  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||| | ||||| ||| || | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  28546 actgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagtttttcaaaatctagaagtaaatcttggatc 28447  T
Q  164 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 263  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| |    
T  28446 tctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattaatcgga 28347  T
Q  264 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 363  Q
    || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  28346 ataaaatgcgccgacttcgtcaatctatcaacaactacccaaatggtatcatgtccccttggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatggatatgc 28247  T
Q  364 tatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 403  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  28246 tatcccatttccactctggcacatctaatggtgtcaacaa 28207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 64 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 40537 - 40198
Alignment:
Q  64 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 163  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||| | ||||| ||| || | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  40537 actgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagtttttcaaaatctagaagtaaatcttggatc 40438  T
Q  164 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 263  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| |    
T  40437 tctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattaatcgga 40338  T
Q  264 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 363  Q
    || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  40337 ataaaatgcgccgacttcgtcaatctatcaacaactacccaaatggtatcatgtccccttggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatggatatgc 40238  T
Q  364 tatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 403  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  40237 tatcccatttccactctggcacatctaatggtgtcaacaa 40198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 2318 - 2679
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||| |    
T  2318 tccgactgaccatctgtctacggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcgtgaagtgaacctcg 2417  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | | |||||| ||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||| ||    
T  2418 gatgtctatccgacacaatactcgatggaagtccatgtaacttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaactgagctaccggataactattattgat 2517  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || ||||| || | ||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  2518 cggaataaagtgtgttgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcgtgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 2617  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||| | ||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  2618 atgttgtcccacttctactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 2679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 3315 - 3676
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  3315 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagacgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 3414  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||    
T  3415 gatctctatccgacacaatacttgacggaacaccatgtaacttcttaatattatgaatataaatctccgccaactgagctatcggataactaatattgat 3514  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| || | |||| |||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  3515 cggaataaagtgcgcggactttgtcaacctatcgacaaccacccaaatggcatcacgccctctgggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 3614  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  3615 atgttgtcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctacaggcttctgatg 3676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 60 - 393
Target Start/End: Original strand, 6896 - 7229
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  6896 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 6995  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  6996 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 7095  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||     
T  7096 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattagacaaactcgtcacaaaatccatggat 7195  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 393  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  7196 atactatcccatttccactctggcacatctaacg 7229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 60 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 2657 - 2336
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||   |||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  2657 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggaatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaaccttg 2558  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| | || |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  2557 gatctctatccgatacaatactcgacggtacaccatgtaacttcacaatattgtgactataaatctccgcc--ctgagctaccggataattgatattaat 2460  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2459 tggaataaagtgtgccgacttcgttaacctatcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 2360  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggt 383  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||    
T  2359 atgccgtcccacttccactccggt 2336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 63 - 421
Target Start/End: Original strand, 249140 - 249498
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || |||||||| || |    
T  249140 gactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtaaacctcggat 249239  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 262  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||  | ||||  || |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |     
T  249240 ccctatctgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaatgctatgaacataaatctctaccaactgtgctaccggataactgatattaattgg 249339  T
Q  263 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 362  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  249340 aatgaaatgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaattgcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaaata 249439  T
Q  363 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  249440 ctgtcccacttcgactccggtacatccaacggtgtcaacaaccatgcaggcttctgatg 249498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 60 - 413
Target Start/End: Original strand, 43307 - 43660
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  || || |||||  ||||||| |||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  43307 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaaattcagcttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 43406  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || |||||||| || ||||||||||| || || || | |||||||||  | ||||  || ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  43407 gatccctatctgatacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaatgctatgaacataaatctctgccaactgtgctaccagataactgatattaat 43506  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||   ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43507 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatgacatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 43606  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 413  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43607 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccatgcaggc 43660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 62 - 422
Target Start/End: Original strand, 19375 - 19735
Alignment:
Q  62 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 161  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||   ||||||| |||||  || | ||||| ||||| |||   ||     
T  19375 cgactgatcatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaactcttctagaatctagaagtgaactgcgga 19474  T
Q  162 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 261  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||| | | | || || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  19475 tctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcactctcacaatgtcccggatataaatctccgccaactgagctaccggaaaacttatattgatcg 19574  T
Q  262 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 361  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19575 gaataaagtgcgctgacttcgtcaacctatccaccacaacccaaatagcatcatgccctctcggagtattgggtaaactcgtcacaaaatccatagaaat 19674  T
Q  362 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    | | ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19675 gttgtcccacttccattctggcacatctaaaggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 19735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 62 - 422
Target Start/End: Original strand, 23537 - 23897
Alignment:
Q  62 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 161  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||   ||||||| |||||  || | ||||| ||||| |||   ||     
T  23537 cgactgatcatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaactcttctagaatctagaagtgaactgcgga 23636  T
Q  162 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 261  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||| | | | || || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  23637 tctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcactctcacaatgtcccggatataaatctccgccaactgagctaccggaaaacttatattgatcg 23736  T
Q  262 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 361  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23737 gaataaagtgcgctgacttcgtcaacctatccaccacaacccaaatagcatcatgccctctcggagtattgggtaaactcgtcacaaaatccatagaaat 23836  T
Q  362 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    | | ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23837 gttgtcccacttccattctggcacatctaaaggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 23897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 60 - 338
Target Start/End: Original strand, 11412 - 11690
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||| |    
T  11412 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcg 11511  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11512 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattattaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 11611  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaa 338  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| | |||||||    
T  11612 cgaaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctaggagtgtaaggtaaa 11690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 186 - 5
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||||||  |||||||||| || || ||||| |    
T  186 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcg 87  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctac 241  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||    
T  86 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattattaatataaatctccgccaactgagctac 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 334 - 422
Target Start/End: Original strand, 12996 - 13084
Alignment:
Q  334 gtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12996 gtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 13084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 200 - 422
Target Start/End: Original strand, 528 - 750
Alignment:
Q  200 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 299  Q
    |||||||||||| |  || || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  528 cttcacaatattatcgatataaatctccgccaactgagctaccagataactgatattaatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaacttgtcgaccaca 627  T
Q  300 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 399  Q
    |||||||| | ||||||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  628 acccatatagtatcatgccctctcgaagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgttatcccacttccacttcggcacatccaacggtgaca 727  T
Q  400 acaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  728 acaaccctgcaggcttctgatgt 750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 24853 - 24492
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||  |||| || || |||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  24853 tccgactgaccatctgtttacggatgataagccgaactcaacctcaacttagatcccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 24754  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| |   |||| || ||||||||||| ||||| ||   | |||| ||||| ||    
T  24753 gatctcaatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcaactacacaatttcacgaatataaatctccgccaaatgagccaccataaaactaatattgat 24654  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||| || |||| |||||||||||| || ||||| || ||||| || | ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |    
T  24653 tggaataaattgcgtcgacttcgtcaatctatctacaaccacccaaatggtatcatgccctcttggagtattcggtaaacttgttacaaaatccat-gga 24555  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  24554 atactatcccatttccacttcggcacatctaacggtgtcaacaacccagcaggcttctgatgt 24492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16495 - 16134
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  16495 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 16396  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||  ||||| |||||| ||||||| ||    
T  16395 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactacgctaccggataattgatattgat 16296  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| || |  | |||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  16295 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgttatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 16196  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16195 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 16134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 213 - 422
Target Start/End: Original strand, 5 - 210
Alignment:
Q  213 tgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaat 312  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  5 tgaatataaatctcagccaactgagc----ggataactgatgttaataggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaat 100  T
Q  313 catgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 412  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  101 catgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctacagg 200  T
Q  413 cctctgatgt 422  Q
    | ||||||||    
T  201 cttctgatgt 210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 172 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 14867 - 14618
Alignment:
Q  172 acactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtg 271  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||| || ||    
T  14867 acacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccggcaactgagctaccggataactaagattgatcggaataaattg 14768  T
Q  272 cgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccat 371  Q
     |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||     
T  14767 tgccgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtagactcgtcacaaaatccatagaaatgttgtcccac 14668  T
Q  372 ttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  14667 ttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagtcttctgatg 14618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 172 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 23046 - 22797
Alignment:
Q  172 acactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtg 271  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||| || ||    
T  23046 acacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccggcaactgagctaccggataactaagattgatcggaataaattg 22947  T
Q  272 cgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccat 371  Q
     |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||     
T  22946 tgccgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtagactcgtcacaaaatccatagaaatgttgtcccac 22847  T
Q  372 ttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| | |||||||    
T  22846 ttccactccggcacatccaacggtgtcaacaacccagcagtcttctgatg 22797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 17883 - 18233
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| |||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| || || |    
T  17883 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaatctcg 17982  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||  |||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  17983 gatctctatcccacacaatactcgatagaactccatgcaactttacaatattatgaatataaacctccgccgactgagctactggataactaatattgat 18082  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||           |||||||| || | ||||||| | | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  18083 cggaataaagtgtgccgacttcgtca-----------acaacccaaatggcatcatgctctcacggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 18171  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||||||    
T  18172 atgatgtcccacttccactctggcacatctaacggagtcaacaaccctgaaggcttctgatg 18233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 60 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 33101 - 32739
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  33101 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaatcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 33002  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| |||   ||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||||  || |||||  ||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  33001 gatccctatccgacgaaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatgctatgaacataaatctctaccaactgtgctaccgggtaactgacattaat 32902  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| |   ||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  32901 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgatagcaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaacttgtcacgaaatccatagaa 32802  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32801 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 32739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 26785 - 27146
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| |||||      
T  26785 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctca 26884  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||  || || |||| |||||||||| | ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  26885 gatccctatccgacacaatacttgacgatacaccgtgcagcttcacaatactatgaacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattgat 26984  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| |  |  |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||     
T  26985 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaacagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacgaaatccatagag 27084  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    || || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27085 atactgtcccacttccactacggtacatcaaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 27146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 201 - 373
Target Start/End: Original strand, 49437 - 49609
Alignment:
Q  201 ttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaa 300  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  49437 ttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggttaactgatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacttgtcgaccacaa 49536  T
Q  301 cccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccattt 373  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49537 cccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgccacaaaatccatagaaatgctatcccattt 49609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 123 - 422
Target Start/End: Original strand, 12081 - 12380
Alignment:
Q  123 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 222  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   ||||||| |    
T  12081 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcgggaatgtaaa 12180  T
Q  223 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 322  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| |  ||||| ||||  |||| |||  |    
T  12181 tctccaccaactgaggtacaggaaaactgatattactcgaaatgaaatgagccgacttcgtcaatccatctacaatcacccaaatcgcgtcattcccttt 12280  T
Q  323 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    || |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  12281 cgaagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggtacatctaacggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatgt 12380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 9865 - 9782
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaat 143  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  9865 tccgactgaccatatgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaat 9782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 56 - 421
Target Start/End: Original strand, 1428 - 1793
Alignment:
Q  56 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 155  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  1428 tcttttcgactaaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaacttcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 1527  T
Q  156 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 255  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||| || || | ||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |    
T  1528 cttggatctctatctgacacaatgttcgatggaacaccttgtagcttcacaatctcgtgaatgtaaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatgt 1627  T
Q  256 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 355  Q
    |||||  |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  ||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  1628 taatcagaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaatcacccaaatagcgtcatgtcctcttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 1727  T
Q  356 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
      | || |||||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||||    
T  1728 gtatatactatcccatttccattctagcacatctaacggtgtcaacaacccagcaggtttctgatg 1793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Original strand, 19126 - 19454
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  19126 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 19225  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||    
T  19226 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaat 19325  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  19326 cggcagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 19425  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  19426 atactatctcatttccactctggcacatc 19454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 261
Target Start/End: Original strand, 50017 - 50218
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  50017 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 50116  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  50117 gatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaatatcaagaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 50216  T
Q  260 cg 261  Q
    ||    
T  50217 cg 50218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 388
Target Start/End: Original strand, 34613 - 34878
Alignment:
Q  123 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 222  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || |    
T  34613 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaa 34712  T
Q  223 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 322  Q
    |||| |||||||| || || ||| |||||||||||||||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| ||    
T  34713 tctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaatcggcagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctct 34812  T
Q  323 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  34813 aggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatctcatttccactctggcacatc 34878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 56 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 25505 - 25158
Alignment:
Q  56 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 155  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  25505 tctttcagactgaccatctgtctccggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 25406  T
Q  156 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 255  Q
    | |||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||| |   ||||||| ||||| |||||||||| |||  || ||||||| |    
T  25405 catggaactctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaatctcacgaatgtaaatctctgccaactgagatacaagaaaactgatgt 25306  T
Q  256 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 355  Q
    |||| | |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  25305 taattggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaatcacccaaatagcgtcatgccctcttggagtattcggcaaactcgtgacaaaatccat 25206  T
Q  356 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 403  Q
     || |  |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  25205 ggatacactatcccatttccactacggcacatctaacggtgtcaacaa 25158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 219197 - 218838
Alignment:
Q  62 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 161  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||     
T  219197 cgactgaccatctgtctgcggatgataccccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttgga 219098  T
Q  162 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 261  Q
    ||||||| ||| || || ||||| ||||| |||||  ||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  219097 tctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgtcacttcacaatatcgcgaatgtaaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatattaatcg 218998  T
Q  262 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 361  Q
     ||| || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| |  || || |||||||||||||| || ||    
T  218997 gaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcgacaagctcgtcacaaaatccatggatat 218898  T
Q  362 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  218897 gctatcccatttccactctggtatatctaatggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 218838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 388
Target Start/End: Original strand, 229563 - 229895
Alignment:
Q  56 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 155  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||  | || || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||| |||  |||||||     
T  229563 tctttccgactgaccatttgtctgcgaatgatacgccgaactcaaccttaacttagaacctaaatcctcttgcaaacttttccaaactctataagtaaat 229662  T
Q  156 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 255  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||    
T  229663 cttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatat 229762  T
Q  256 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 355  Q
    |||||| ||| || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  229763 taatcggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 229862  T
Q  356 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
     || || ||||| || |||||||| || |||||    
T  229863 ggatatactatcacaattccactctggcacatc 229895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 4555 - 4916
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  4555 tccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 4654  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||   ||||||| || |||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  4655 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcataatatcgcgaatgtaaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatattaat 4754  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  |  ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  4755 cggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttatgagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggat 4854  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||  || ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  4855 atgctatcccatttccactctagaacatataaaggtgtcatcaaacctgcaggtttctgatg 4916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 19783 - 19451
Alignment:
Q  61 ccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgg 160  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||  |||||| |||| ||||| |||||||| |||||    
T  19783 ccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaacttttccataatctagaagtaaatcttgg 19684  T
Q  161 gtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatc 260  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||    
T  19683 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaatc 19584  T
Q  261 gaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaa 360  Q
    | ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  | || |||  | |||||||| |  | ||| |||||||||||||| || |    
T  19583 ggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgttattccctttaggagtatttgtcatactcgtcacaaaatccatggata 19484  T
Q  361 tgctatcccatttccactccggtacatccaacg 393  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19483 tactatcccatttccactctggaacatctaacg 19451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 32534 - 32207
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  32534 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 32435  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||| ||| || || |||||  |||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  32434 gatctctatttgatac-attctcgaaagaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatgtaaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatattaat 32336  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || |||||| || | |||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  32335 cggaatgaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 32236  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32235 atgctatcccatttccactctggtacatc 32207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 393
Target Start/End: Original strand, 6573 - 6906
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||| | ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  6573 tccgactgactatctatttgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 6672  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  6673 gatctctatctgacacaatggtcgaaggaacaccatgcaacttcagaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 6772  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||  || |  |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  6773 cggaagaaaataagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 6872  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 393  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  6873 atactatcccatttccactcaggcacatctaacg 6906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 56 - 421
Target Start/End: Original strand, 3660 - 4025
Alignment:
Q  56 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 155  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  3660 tctttccgactgaccatttgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 3759  T
Q  156 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 255  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   | || || ||||||||||||||||  || ||| |||||||||    
T  3760 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcggatataaatctccgccaactgagacacaggaaaactgatat 3859  T
Q  256 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 355  Q
    |||||| |||||| || ||||||||   ||| || ||||| |  ||| | ||||  |||| |||  ||||||| || |  ||||| ||||||||||||||    
T  3860 taatcggaatgaaatgagccgacttgtgcaatctatctacaatcacctaaatcgcgtcattccctttcggagtgttcgaaaaactcgtcacaaaatccat 3959  T
Q  356 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
     || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||  ||||||||  |||||||    
T  3960 ggatatactatcccatttccactctggcacatctaaaggtgtcatcagccctgcaggtttctgatg 4025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 60 - 379
Target Start/End: Original strand, 1991 - 2310
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  1991 tccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 2090  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | |||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| ||||||||||||     
T  2091 ggtctctatctgatacaatgctcgacggaacacgatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaag 2190  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||  || || | |||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| |  ||||| || ||||||||||| ||     
T  2191 cggaagaaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcgacaaactcgttacaaaatccatggat 2290  T
Q  360 atgctatcccatttccactc 379  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2291 atgctatcccatttccactc 2310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 60 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16198 - 15859
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||  | | ||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  16198 tccgactgaccatttgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctattgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 16099  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||| || |||||||||| ||  |  ||| |||||||||||||    
T  16098 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatcgcgaatgtaaatttccgccaacttagacataggaaaactgatattaat 15999  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| || || | |||||||||||| || || || |  ||||| ||||  ||||  ||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  15998 cggaataaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcatttcctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 15899  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 399  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  15898 atgctatcccatttccactctggtacatctaaaggtgtca 15859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 238 - 421
Target Start/End: Original strand, 20096 - 20279
Alignment:
Q  238 ctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaa 337  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| ||   ||||||||| |||||||| || |||||    
T  20096 ctaccggataactgatattaataggaatgaagtgtgccgatttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatgtcatcatgccctctcggagtgttcggtaa 20195  T
Q  338 acttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20196 acttgtcacgaaatccatagaaatactgtcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 238 - 421
Target Start/End: Original strand, 22916 - 23099
Alignment:
Q  238 ctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaa 337  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| ||   ||||||||| |||||||| || |||||    
T  22916 ctaccggataactgatattaataggaatgaagtgtgccgatttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatgtcatcatgccctctcggagtgttcggtaa 23015  T
Q  338 acttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  23016 acttgtcacgaaatccatagaaatactgtcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 23099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 241
Target Start/End: Original strand, 1052 - 1233
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||  ||||| ||||| |||||      
T  1052 tccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttcctgaatctagaagtgaacctca 1151  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctac 241  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| || | ||| || |||||||||||||| |||||    
T  1152 gatctctatccgacacaatactcgacggtaccccatgtagcttcacaatgttatcaatataaatctccgccaactgtgctac 1233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 241
Target Start/End: Original strand, 12582 - 12682
Alignment:
Q  141 aatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagcta 240  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  12582 aatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtaccccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgtgcta 12681  T
Q  241 c 241  Q
    |    
T  12682 c 12682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4189 - 3872
Alignment:
Q  58 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  4189 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 4090  T
Q  158 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 257  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||    
T  4089 tggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatatta 3990  T
Q  258 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 357  Q
    ||||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  3989 atcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcattccctgtaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 3890  T
Q  358 aaatgctatcccatttcc 375  Q
    | || |||||||||||||    
T  3889 atatactatcccatttcc 3872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 375
Target Start/End: Original strand, 9118 - 9435
Alignment:
Q  58 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  9118 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 9217  T
Q  158 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 257  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||    
T  9218 tggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatatta 9317  T
Q  258 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 357  Q
    ||||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  9318 atcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcattccctgtaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 9417  T
Q  358 aaatgctatcccatttcc 375  Q
    | || |||||||||||||    
T  9418 atatactatcccatttcc 9435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 33357 - 33039
Alignment:
Q  58 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 157  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  33357 tttccggctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 33258  T
Q  158 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 257  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || ||  || |||| ||||||    
T  33257 tggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaagaaaactaatatta 33158  T
Q  258 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 357  Q
    ||||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  33157 atcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcattccctgtaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 33058  T
Q  358 aaatgctatcccatttcca 376  Q
    | || ||||||||||||||    
T  33057 atatactatcccatttcca 33039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 56 - 412
Target Start/End: Original strand, 9490 - 9846
Alignment:
Q  56 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 155  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||  | || || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  9490 tctttccgactgacaatctgtctgcggatgatatgccgaacttaacctaaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 9589  T
Q  156 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 255  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||  |||| ||||| | |||||||||||   ||||||| || ||| |||||||||  || ||| |||||||||    
T  9590 cttggatctctatctgatacaatgctcgaatgaacaccatgtagcttcacaatatcgcgaatgtaaatttcctccaactgagacacaggaaaactgatat 9689  T
Q  256 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 355  Q
    |||||| |||||| || || || ||||| || || || || |  ||||| |||  ||||| |||  ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  9690 taatcggaatgaaatgagctgatttcgttaatctatcaacaattacccaaatcacatcattccctttcgtagtattcggaaaactcgtcacaaaatccat 9789  T
Q  356 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 412  Q
     || || |||||| |||||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  9790 ggatatactatcctatttccactctggcacatctaacggtgtcatcaaccctgcagg 9846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 476 - 160
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||  || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  476 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaacctcagcttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 377  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||  |||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |  ||| |||| ||||||||    
T  376 gatctctatcacacacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaataggaaaactaatattaat 277  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  276 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 177  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  176 atactatcccatttcca 160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Original strand, 14884 - 15212
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14884 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14983  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||  || || ||| |||| ||||||||    
T  14984 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaaccccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactaggcaacaggaaaactaatattaat 15083  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  | ||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  15084 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattagccaaattgcatcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 15183  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||    
T  15184 atactatcccatttccattctggtacatc 15212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 1144 - 1460
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  1144 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaattcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 1243  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  1244 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 1343  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || | |||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  1344 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcgttccctctagaagtatttggcaaacttgtcacaaaatccatggat 1443  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  1444 atactatcccatttcca 1460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 197 - 413
Target Start/End: Original strand, 28718 - 28934
Alignment:
Q  197 caacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctacc 296  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||| |  ||     
T  28718 caacttcacaatattatgaatgtaaatctccaccaactgagctaccggaaaactaatattgatcggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatagaca 28817  T
Q  297 acaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtg 396  Q
    |||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| || ||||| ||| |||    
T  28818 acaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatgttgtcccacttccactctggcacatctaacagtg 28917  T
Q  397 tcaacaaacctgcaggc 413  Q
    | ||||| |||||||||    
T  28918 ttaacaaccctgcaggc 28934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 202
Target Start/End: Original strand, 37726 - 37868
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  37726 tccgactgaccatctgtttgcggatgataggctgaactgaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 37825  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaactt 202  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||    
T  37826 gatctctatccgacacaatgctcgatggaaccccatacaactt 37868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 388
Target Start/End: Original strand, 29578 - 29797
Alignment:
Q  170 tgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaag 269  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||  ||     
T  29578 tgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaa 29677  T
Q  270 tgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac-aaaatccatagaaatgctatcc 368  Q
    || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| |||  | ||||||| | | ||||| ||||| ||||||||| || || ||||||    
T  29678 tgagccgacttcgtcaatctttcaacaatcacccaaattgcgtcattccctttaggagtatcatgcaaactcgtcacaaaaatccatggatatactatcc 29777  T
Q  369 catttccactccggtacatc 388  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  29778 catttccactctggcacatc 29797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 234
Target Start/End: Original strand, 4399 - 4573
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  4399 tccgactgaccatctctctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 4498  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 234  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  4499 gatctctttccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaact 4573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 341 - 422
Target Start/End: Original strand, 4581 - 4662
Alignment:
Q  341 tgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4581 tgtcacaaaatccatggatatgctataccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 4662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 123 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 39730 - 39465
Alignment:
Q  123 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 222  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |    
T  39730 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgatggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaaa 39631  T
Q  223 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 322  Q
    |||| ||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  |    
T  39630 tctctgccaactgagaaacaggaaaactgatactaatcgaaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattcccttt 39531  T
Q  323 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  39530 aggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatctcatttccactctggcacatc 39465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 605 - 277
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||  |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  605 tccgactgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctctttcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 506  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  505 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 406  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || ||||||||| |||| || || || |  ||||| ||||  |||| | | || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||     
T  405 cggtagaaaatgagccgacttcatcaatctatcaactatcacccaaatcgcgtcattctctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaactccatggat 306  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || || |||||||||||||| || |||||    
T  305 atactgtcccatttccactctggcacatc 277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 63813 - 63485
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||   | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  63813 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccagagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 63714  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||| | ||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  63713 gatctttttctgatataatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctttatataaatctctgccaactgagcaacaggaaaactgatattaat 63614  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||| ||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||  |     
T  63613 cggtagaaaatgagccgacgtcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgcat 63514  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  63513 atactatcccatttccactctggcacatc 63485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14861 - 14522
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  14861 tccgactgaccatctgtccgcgggtgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaatcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaacctcg 14762  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| |  ||  | |||||||| ||||| | |||||||||||   | ||||| ||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  14761 gatctctatctgataaaatgtttgacggaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaatctctgccaactgagatacaggaaaactgatgttaat 14662  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || |||||| || ||||||||||| || || ||||| |  ||||| || |  |||| |||  |||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||     
T  14661 cggaatgaaatgagccgacttcgttaatctatctacaatcacccaaatagcgtcattcccattcggagtattcggcaaactcgtcacaaattccatggat 14562  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 399  Q
    || ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  14561 atactatctcatttccactctggcacatctaaaggtgtca 14522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 4232 - 3911
Alignment:
Q  64 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 163  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  ||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  4232 actgaccatctgtgtgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctataagtaaatcttggatc 4133  T
Q  164 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 263  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||||||| |    
T  4132 tctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttcgcgaatgtaaatctccgccaactaagacacgggaaaactgatattaatcgga 4033  T
Q  264 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 363  Q
    || || |  || ||||||||||| || |   | |||| ||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  4032 ataaactaagctgacttcgtcaatctat---caacaatccaaatcgtgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgc 3936  T
Q  364 tatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    |||||||||||||||| || |||||    
T  3935 tatcccatttccactctggaacatc 3911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Original strand, 130672 - 130849
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  130672 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 130771  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgag 237  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  130772 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgag 130849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29161 - 28963
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||    
T  29161 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaag-aaatcttg 29063  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||| | ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| || ||||| || || ||| |||||||||||||    
T  29062 gatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgctaactgggcaacaggaaaactgatattaat 28963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 195
Target Start/End: Original strand, 59287 - 59413
Alignment:
Q  69 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 168  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||| | || || |||||   ||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  59287 ccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactctcccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 59386  T
Q  169 ctgacactatactcgacggaaccccat 195  Q
    |||| || ||||| |||||||| ||||    
T  59387 ctgatacaatacttgacggaacaccat 59413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 28890 - 28826
Alignment:
Q  324 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  28890 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 28826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 421
Target Start/End: Original strand, 15401 - 15762
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  15401 tccgactgaccatctgtctgaggatgatatgtcgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 15500  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||   | || || |||||||| |||||||  || ||| |||  || |||||    
T  15501 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaactttacaatatcacggatataaatctccgcgaactgagacacaggagaaccaatgttaat 15600  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||| || || ||||||||| |||| |  || || |  ||||| ||||  |||| ||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  15601 cggaataaaatgagccgacttcatcaatccatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctctcgtagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggat 15700  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  15701 atgctatcccatttccactatggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 15762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 113266 - 112953
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||| |||| ||||| |    
T  113266 gactgaccatctgtctgcggatgacacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggat 113167  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 262  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |   |||| || || ||  |||||||||  || ||| |||| |||||||| |     
T  113166 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctggaatataaatttcttccaactgagaaacaggaaaactaatattaattgg 113067  T
Q  263 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 362  Q
    || ||| || |||||||||||||| || || || || ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||    
T  113066 aaggaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaaccacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatg 112967  T
Q  363 ctatcccatttcca 376  Q
    ||||||||||||||    
T  112966 ctatcccatttcca 112953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 3596 - 3268
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||    
T  3596 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgtaaacttttccaaaatctttatgtaaatcttg 3497  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| | || ||| || ||||| |||||||| |  ||  || |||||||||||||    
T  3496 gatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttaatatatatctctgccaactgggtaacaagaaaactgatattaat 3397  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||| ||||| || || || |  ||||| |||   |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  3396 cggtagaaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatcccgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 3297  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  3296 atactatctcatttccactctggcacatc 3268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 260
Target Start/End: Original strand, 13011 - 13211
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  13011 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 13110  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  13111 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 13210  T
Q  260 c 260  Q
    |    
T  13211 c 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 376
Target Start/End: Original strand, 13256 - 13308
Alignment:
Q  324 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 376  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  13256 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 13308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Original strand, 220 - 548
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||    ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  220 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaggctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 319  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||    |||| || ||||| ||||||||||  || |||  ||||||||||||    
T  320 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaataccacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaagactgatattaat 419  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    |  ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |      
T  420 cagaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaattcatgggt 519  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  520 atactatcccatttccactctggcacatc 548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 7921 - 8237
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  7921 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8020  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||| |||||||||||| | ||  || || ||||| || ||| | || ||  || |||| ||||||||    
T  8021 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatacaacttcacaatctccttgatataaatctctgctaacagggcaacaagaaaactaatattaat 8120  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || ||||||||| ||||||| || || |||||||| || |  || | ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  8121 cggtagaaaatgagccgacttcatcaacctatcaacaacaacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggaaaacttgtcacaaaatccattgat 8220  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  8221 atactatcccatttcca 8237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 4881 - 4553
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  ||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  4881 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatcccaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 4782  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| |  || ||  |||| ||||||||    
T  4781 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggaaacagggaaactaatattaat 4682  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || || ||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || || || |||||||||||||| ||     
T  4681 cggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaagctcgtcacaaaatccatggat 4582  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  4581 atactatcccatttccactctggcacatc 4553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 7463 - 7779
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  7463 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 7562  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| ||||| || || || ||  |||| ||||||||    
T  7563 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaattgggcaacagggaaactaatattaat 7662  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    |   |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  7663 ctgtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggaaaactcgtcacaaaatccatggat 7762  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  7763 atactatcccatttcca 7779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Original strand, 16179 - 16507
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||    
T  16179 tccgactgaccatctgtctgaggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtatatcttg 16278  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||| |||  | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  16279 gatctctatatgatgcaattctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 16378  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    |  ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||     
T  16379 cagaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcatcattcccattaggagtatttggaaaactcgtcacaaaatcgatggat 16478  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  16479 atactatcgcatttccactctggcacatc 16507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18987 - 18761
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||| || ||||  ||  | ||||  |||||  |||||||||| |||||||||||      
T  18987 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacgcaacctcaacttagaacttaaagcctctttcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctca 18888  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||| || ||||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  18887 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatcgcgaatgtaaatttccgccaactgagatacaagaaaactgatattaat 18788  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 286  Q
    || |||||| || ||||||||||||||    
T  18787 cggaatgaaatgagccgacttcgtcaa 18761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 393
Target Start/End: Original strand, 25498 - 25831
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  25498 tccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 25597  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | | ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  | ||| || ||||  |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  25598 gatatctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgaaacttcacaatctctttaatataaatctttgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 25697  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  |||| ||| |   ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  25698 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcattccctccatgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 25797  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 393  Q
    || |||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  25798 atactatcccatttccattctggcacatctaacg 25831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 270 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 633 - 482
Alignment:
Q  270 tgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatccc 369  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||||  || |  |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  633 tgcgctgacttcgtcaacctatcgacaacaaccctaatggtgtcatgccctctcggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggaaatgctatccc 534  T
Q  370 atttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  533 acttccactcaggtacatctaacggtgtcaac-aacctgcatgcttctgatgt 482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Original strand, 622 - 798
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  622 tccgtctgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcg 721  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactga 236  Q
    | ||||||||   ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  722 gatctctatccaccacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaatattgtgaatataaatctccgccaactga 798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 388
Target Start/End: Original strand, 2914 - 3226
Alignment:
Q  76 tctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacac 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  2914 tctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 3013  T
Q  176 tatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgcc 275  Q
     || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||| ||||  ||  || || | |||||||||| ||  || || |||    
T  3014 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaattgagaaacaagaaaattaatattaatcggaagaaaatgagcc 3113  T
Q  276 gacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcc 375  Q
    || |||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  3114 gaattcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcc 3213  T
Q  376 actccggtacatc 388  Q
    |||| || |||||    
T  3214 actctggcacatc 3226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 333 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 7654 - 7566
Alignment:
Q  333 ggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  7654 ggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccagtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 7566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 7890 - 8206
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||| ||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  7890 tccgcctgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 7989  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    |  |||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  7990 gacctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 8089  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || ||||| |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8090 cggtagaaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 8189  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  8190 atactatcccatttcca 8206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 22391 - 22707
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  22391 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 22490  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  22491 gatctctatctgatacaatgctcgaagaaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 22590  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || |  || ||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22591 cggtagaaaataagcagacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgtcccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22690  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  22691 atactatcccatttcca 22707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 8793 - 8541
Alignment:
Q  136 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 235  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || |||||  |||||||    
T  8793 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctaccaactg 8694  T
Q  236 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 335  Q
    ||  || ||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| || || || |  ||| | ||||  |||| |||  | |||||||| ||     
T  8693 agaaacaggaaaactgatattaatcggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcaccaaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggc 8594  T
Q  336 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8593 aaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggtacatc 8541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 376
Target Start/End: Original strand, 65933 - 66245
Alignment:
Q  64 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 163  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  65933 actgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 66032  T
Q  164 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 263  Q
     |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| ||||  |||||||||      
T  66033 cctatctgatacaatactcgaaggaacaccatgtaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactattattaatcggt 66132  T
Q  264 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 363  Q
    |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | |||   |||  | |||||||| || || || |||||||||||||| || || |    
T  66133 agaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgctccctttaggagtattcggcaagctcgtcacaaaatccatggatatac 66232  T
Q  364 tatcccatttcca 376  Q
    |||||||||||||    
T  66233 tatcccatttcca 66245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 39601 - 39274
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||||||  | ||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  39601 tccgactgac-atctgtctgtggatgatacgccgaactcaatcttaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttcgaaaatctagaagtaaatcttg 39503  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||  |||| | || ||| || |||||  | ||||| || |  ||| |||||||||||||    
T  39502 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaactttgcaatctccttaatataaatctctactaactgggcaataggaaaactgatattaat 39403  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||     
T  39402 tggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcagcaaactcgtcacaaaatccatggat 39303  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  39302 atactatcccatttccactctggcacatc 39274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 68373 - 68199
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||||||||||  | || || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||      
T  68373 tccgactgaccatctatttgtgggtgataagccgaagtcaatctcaactttgaacccaagttctcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctca 68274  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 234  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  68273 gatctctatccgacacaatactcgatggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaact 68199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 387
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4722
Alignment:
Q  90 gccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaa 189  Q
    |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  4425 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 4524  T
Q  190 ccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacct 289  Q
    | ||||| |||||||||||||   ||||||| || ||||| ||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||    
T  4525 caccatgtaacttcacaatatctcgaatgtaaatttccgctaactgagatacaagaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatct 4624  T
Q  290 gtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacat 387  Q
     |  || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  4625 ataaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctattctatttccactctggtacat 4722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 387
Target Start/End: Original strand, 11555 - 11852
Alignment:
Q  90 gccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaa 189  Q
    |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  11555 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 11654  T
Q  190 ccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacct 289  Q
    | ||||| |||||||||||||   ||||||| || ||||| ||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||    
T  11655 caccatgtaacttcacaatatctcgaatgtaaatttccgctaactgagatacaagaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatct 11754  T
Q  290 gtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacat 387  Q
     |  || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  11755 ataaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctattctatttccactctggtacat 11852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 938 - 1254
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  938 tccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 1037  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||   ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  1038 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatccccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 1137  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || |  ||||| || |  ||   ||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  1138 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaatcacccaaattgtgtcgctccatctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 1237  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  1238 atactatcccatttcca 1254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 388
Target Start/End: Original strand, 1197 - 1528
Alignment:
Q  57 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 156  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||| |||||||| |||| || ||||| ||  | || || |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  1197 ctttcggactgaccatatgtctgaggatgatacgccaaactcaatctcaacttagaacctaaagcctcctgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 1296  T
Q  157 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 256  Q
    || | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |   |||| || ||||| ||||||||||  || | | |||||||| |    
T  1297 ttagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttgacgaatatatatctctgccaactgagacacagaaaaactgatact 1396  T
Q  257 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 356  Q
    ||||| ||  || || |||||||| ||||| || || || |  ||||| |||| ||||| |||  | |||||||| || ||| | ||||||||||||||     
T  1397 aatcggaagaaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcatcattccctttaggagtattcggcaaagtcgtcacaaaatccatg 1496  T
Q  357 gaaatgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  1497 gatatactatcccatttccactctggcacatc 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 116691 - 116368
Alignment:
Q  56 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 155  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  116691 tcttttcgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 116592  T
Q  156 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 255  Q
    || || ||||||||||| || || ||||||| ||| ||||| | |||||||||||   | ||||| |||||||||||||| | ||  ||  || || | |    
T  116591 ctcggatctctatctgatacaatgctcgacgaaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaatctccgccaactgggatagaggtaaattgttgt 116492  T
Q  256 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 355  Q
    ||||   |||||| || | |||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  116491 taatatgaatgaaatgagtcgacttcgtcaatctctccacaatcacccaaatagcgtcattcccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 116392  T
Q  356 agaaatgctatcccatttccactc 379  Q
     || || |||||||||||||||||    
T  116391 ggatatactatcccatttccactc 116368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 197260 - 196941
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  197260 tccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 197161  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||| ||| || || ||||| ||||| |||| |||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  197160 gatctctatttgatacaatgctcgaaggaacgccatacaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 197061  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || || ||||||||||| || || || |  | ||| ||||  |||| ||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||     
T  197060 cggtagaaaatgtgctgacttcgtcaatctatcaacaatcatccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggctaactcgtcacaaaatccatggat 196961  T
Q  360 atgctatcccatttccactc 379  Q
    ||  ||||||||||| ||||    
T  196960 atattatcccatttcgactc 196941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 388
Target Start/End: Original strand, 6538 - 6866
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| |||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||| ||| |||||||| ||||    
T  6538 tccgactaaccatctgtctacggatgatacgccgaacacaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaattctagaagtaaatcttg 6637  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||  || || || |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  6638 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctaaaaataaatatctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 6737  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||| | |  ||||| |||||||||||||| ||     
T  6738 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctataggagtaatcgacaaactcgtcacaaaatccatggat 6837  T
Q  360 atgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  6838 atactatcccatttccactctggcacatc 6866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Original strand, 8314 - 8630
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  8314 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacatcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaaactagaagtaaatcttg 8413  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| ||| |||||||   ||  || || ||||| |||||||| || |  ||| |||| ||||||||    
T  8414 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgtaacctcacaatcaccttgatataaatctctgccaactgggcaataggaaaactaatattaat 8513  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |   |||| || | ||| | ||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8514 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattgcccaaattgcatcgttccctctctgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 8613  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||||||||||||    
T  8614 atactatcccatttcca 8630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 379
Target Start/End: Original strand, 5745 - 6064
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||| || ||| |||| | ||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  5745 tccgactaacaatctgtctacagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 5844  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||  ||||||| ||  || ||| |||||||||||||    
T  5845 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatattacgaatataaatctatgccaacttagaaacaggaaaactgatattaat 5944  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    || ||  || ||  ||||||||||||| ||  | |  |  ||||| || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| |      
T  5945 cggaagaaaatgaaccgacttcgtcaatctacccataatcacccaaattgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgggt 6044  T
Q  360 atgctatcccatttccactc 379  Q
    || |||||||||||||||||    
T  6045 atactatcccatttccactc 6064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 80276 - 80075
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||  |||||  ||||||||||| ||||||| ||||    
T  80276 tccgaatgaccatctgtccgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctctttcaaactcttccaaaatctttaagtaaatcttg 80177  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||| | ||||| ||||||||||||||||| |  | ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  80176 gatctctatctgatacaatgctctaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 80077  T
Q  260 cg 261  Q
    ||    
T  80076 cg 80075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 126985 - 126953
Alignment:
Q  56 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgata 88  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  126985 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgata 126953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 7533 - 7345
Alignment:
Q  200 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 299  Q
    |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||| || || |      
T  7533 cttcacaatatcgcgaatgtaaatctccgccaactgagacacgggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagtcgacttcgtcaacctatcaacaatc 7434  T
Q  300 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    ||||| || |  |||| |||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  7433 acccaaatagcgtcattccctttgggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 7345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 12763 - 12647
Alignment:
Q  56 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 155  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  12763 tctttccgactgaccatctatctgcggatgatacgctgaactgaacatcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 12664  T
Q  156 cttgggtctctatctga 172  Q
    ||  | |||||||||||    
T  12663 ctcagatctctatctga 12647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 345 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 20938 - 20862
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20938 acaaaatccatagaaatgctgtcccatttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27763 - 27729
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27763 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 27729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 991 - 844
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  991 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 892  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaa 207  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||    
T  891 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaa 844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10434 - 10228
Alignment:
Q  216 atgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcat 315  Q
    ||||| ||||| ||||| || || || ||| |||| ||||||||   ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||| | | |||||    
T  10434 atgtaaatctctgccaattgtgccaccggaaaactaatattaattagaataaagtgtgctgacttcgtcaatctatcaaccaccacccatgtggcatcat 10335  T
Q  316 gccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcct 415  Q
    |||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || |||||| |    
T  10334 gccctctcgaggtatttggtaaacttgttacaaagtccatggatatgctatcccatttccattctggcacatctaatggtgtcaacaacccagcaggctt 10235  T
Q  416 ctgatgt 422  Q
    |||||||    
T  10234 ctgatgt 10228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 10522 - 10428
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaa 154  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||| || ||||||| || |||||    
T  10522 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagctgaactcaatctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttcgaaaatctagatgtaaa 10428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8110 - 7797
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||   |||  |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8110 tccgactgaccatttttctttggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaa-cttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8012  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| |||||||||   || ||| |||| ||||||||    
T  8011 gatctctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaactga--aacaggaaaactaatattaat 7914  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 359  Q
    |  ||  || || | |||||||||||| || || || |  ||||| ||||  || | |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  7913 cagaagaaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtctttccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 7814  T
Q  360 atgctatcccatttcca 376  Q
    || ||||| ||||||||    
T  7813 atactatctcatttcca 7797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 5364 - 5031
Alignment:
Q  69 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 168  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||  |||  || ||||||||| | || || ||||   |||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  5364 ccatcggtctgcggatgatacgtcgaactcaaactcagcttagaacccaacgcctcctgcaaacccttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 5265  T
Q  169 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaa 268  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |    ||| || |||||||||| ||||| |||  || |||| || ||||||  ||| ||    
T  5264 ctgatacaatactcgacggaacaccatgtagcttcacaatctcacaaatataaatctccgccacctgagatacaagaaaactaatgttaatcagaataaa 5165  T
Q  269 gtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcc 368  Q
     || ||||| |||||||  || || |  |  ||||| |||| |||||| || ||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  5164 atgagccgaattcgtcagtctatccataattacccaaatcgcatcatgtcctctttgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat-gatatactatcc 5066  T
Q  369 catttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 403  Q
    || |||||||| || | ||| || |||||||||||    
T  5065 cacttccactctggaatatctaaaggtgtcaacaa 5031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 286
Target Start/End: Original strand, 9867 - 10093
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||  ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  9867 tccgactgatcatctgtttgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacgtaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 9966  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 259  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || |||||  |||||| ||  || ||| |||||||||||||    
T  9967 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctcccaactcagaaacaggaaaactgatattaat 10066  T
Q  260 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 286  Q
    || ||  || || | ||||||||||||    
T  10067 cggaagaaaatgagtcgacttcgtcaa 10093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5077 - 4953
Alignment:
Q  63 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 162  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  5077 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacttaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggat 4978  T
Q  163 ctctatctgacactatactcgacgg 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||    
T  4977 ctctatccgacacaatactcgacgg 4953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 388
Target Start/End: Original strand, 24098 - 24350
Alignment:
Q  136 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 235  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||  | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || |||| |||||||||    
T  24098 tccaaaatctagaagttaatcttggatctctatccgatccaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatcttcgccaactg 24197  T
Q  236 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 335  Q
     || || ||| |||||||||||||||  | ||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | | |||||| |      
T  24198 ggcaacaggaaaactgatattaatcggtaggaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctatagaagtattcgac 24297  T
Q  336 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    |||||  ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  24298 aaactcatcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 24350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 388
Target Start/End: Original strand, 1791 - 2117
Alignment:
Q  62 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 161  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| | |||||||| |||||||| |||||     
T  1791 cgacagaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttacaaaatctagaagtaaatcttgga 1890  T
Q  162 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 261  Q
    ||| ||||||| || ||  | || ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||| ||||  |  ||| |||| |||||||||     
T  1891 tctatatctgatacaatgtttgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaattgagaaataggaaaactaatattaatct 1990  T
Q  262 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 361  Q
     ||  || || ||||||| ||||||  || | || |  ||||| ||||  |||| |||  |  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  1991 gaagaaaatgagccgactacgtcaatatgccaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaagagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatat 2090  T
Q  362 gctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
     ||||||||||||||||| || |||||    
T  2091 actatcccatttccactctggcacatc 2117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 199
Target Start/End: Original strand, 1523 - 1662
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 159  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||      
T  1523 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactaaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaactaa 1622  T
Q  160 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaa 199  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||    
T  1623 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 1662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 388
Target Start/End: Original strand, 1681 - 1745
Alignment:
Q  324 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 388  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| || |||||    
T  1681 ggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccacttccactctggcacatc 1745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 322 - 421
Target Start/End: Original strand, 17467 - 17566
Alignment:
Q  322 tcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  17467 tcggagtgttcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggaacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 17566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 422
Target Start/End: Original strand, 34015 - 34074
Alignment:
Q  363 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  34015 ctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggattctgatgt 34074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 11839 - 11618
Alignment:
Q  200 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 299  Q
    |||||||||||   | ||||| ||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||  | |  || |      
T  11839 cttcacaatatcgcggatgtaaatctccgcccactgagatataggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgagttcgtcaatatatgaacaatc 11740  T
Q  300 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 399  Q
    ||||  || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  11739 accccaatagtgtcattcccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatattctatcccatttccactctggcacatctaaaggtgtca 11640  T
Q  400 acaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
     ||| ||||||||  |||||||    
T  11639 tcaaccctgcaggtttctgatg 11618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 18031 - 17810
Alignment:
Q  200 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 299  Q
    |||||||||||   | ||||| ||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||  | |  || |      
T  18031 cttcacaatatcgcggatgtaaatctccgcccactgagatataggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgagttcgtcaatatatgaacaatc 17932  T
Q  300 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 399  Q
    ||||  || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  17931 accccaatagtgtcattcccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatattctatcccatttccactctggcacatctaaaggtgtca 17832  T
Q  400 acaaacctgcaggcctctgatg 421  Q
     ||| ||||||||  |||||||    
T  17831 tcaaccctgcaggtttctgatg 17810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 86213 - 85938
Alignment:
Q  139 aaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagc 238  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||| ||  ||||        |||| || ||||||||||||||||     
T  86213 aaaatctagaagtaaatcttgggtctctatttgatacaatactcgacggaacaccatgtaatctcac--------gaatataaatctccgccaactgaga 86122  T
Q  239 tactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaa 338  Q
    ||  ||| || |||| ||||| | ||| || || ||||||||| |||  || || || |  ||||| |||| || ||| ||  | |||||||| ||  ||    
T  86121 tagaggaaaattgatgttaattggaataaaatgggccgacttcatcagtctatccacaattacccaaatcgcattatgtccttttggagtattcggacaa 86022  T
Q  339 cttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 422  Q
    || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||  || ||||| || ||||||||||| || |||||  ||||||||    
T  86021 ctcgtcacaaaatccatggatatattatcccacttccactttggaacatctaaaggtgtcaacaacccagcaggtttctgatgt 85938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 921 - 880
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtaca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  921 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggtaca 880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17595 - 17524
Alignment:
Q  224 ctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctac 295  Q
    ||||||||||| || ||  ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || |||||    
T  17595 ctccgccaactaagatataggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatctac 17524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 234
Target Start/End: Original strand, 71830 - 71917
Alignment:
Q  147 gaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 234  Q
    |||||||||||| | || | ||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||| | || |||||||||||| |||||||    
T  71830 gaagtaaaccttagatcccgatccgacacaatactagacggaataccatgcaacctcacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 71917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33174 - 33021
Alignment:
Q  81 ggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatac 180  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| || |  |||||  || |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||| || || | ||||||||| ||||    
T  33174 ggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatac 33075  T
Q  181 tcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 234  Q
    | || ||||  ||||||||  ||||||| | || |||||||||||| |||||||    
T  33074 tagaaggaataccatgcaatctcacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 33021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3372 - 3338
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3372 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 3338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Original strand, 3967 - 4001
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3967 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 4001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Original strand, 24203 - 24237
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24203 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 24237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 3441 - 3391
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 395  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  3441 acaaagtccatagaaatgctatcccacttccactccggcacaaacaacggt 3391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 379
Target Start/End: Original strand, 44347 - 44381
Alignment:
Q  345 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44347 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 44381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 234
Target Start/End: Original strand, 182 - 347
Alignment:
Q  69 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatctt-gaagtaaaccttgggtctcta 167  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||| || |  |||||   | |||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||| || || | |    
T  182 ccatcggtctggcgatgataagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagtagcttgcaaactt-tccaaaaacttagaactaaacctcggatcccga 280  T
Q  168 tctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 234  Q
    |||||||| | ||| || ||||  ||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  281 tctgacacaagactagaaggaataccatgcaacctcacaatatgctcaatgtagatctcagccaact 347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1701 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1701
Description:

Target: scaffold1701; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 53
Target Start/End: Original strand, 28 - 60
Alignment:
Q  21 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagc 53  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28 ttgatagccgtacacaccgtatgggcttccagc 60  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1001 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1001
Description:

Target: scaffold1001; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 100
Target Start/End: Original strand, 195 - 235
Alignment:
Q  60 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaa 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  195 tccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaa 235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University