View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8214_high_2 (Length: 831)

Name: NF8214_high_2
Description: NF8214
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8214_high_2
NF8214_high_2
[»] chr3 (79 HSPs)
chr3 (18-819)||(45271908-45272708)
chr3 (106-314)||(35492904-35493108)
chr3 (106-315)||(46576341-46576546)
chr3 (107-315)||(8456149-8456353)
chr3 (107-315)||(40133448-40133652)
chr3 (107-315)||(45529754-45529957)
chr3 (106-314)||(49258262-49258466)
chr3 (106-315)||(30807152-30807357)
chr3 (107-315)||(25289714-25289917)
chr3 (107-314)||(34492575-34492778)
chr3 (109-315)||(53424176-53424377)
chr3 (107-315)||(15566499-15566701)
chr3 (106-314)||(21362936-21363140)
chr3 (112-313)||(25379760-25379957)
chr3 (114-315)||(26174114-26174311)
chr3 (107-315)||(30257618-30257822)
chr3 (107-315)||(48977382-48977586)
chr3 (107-314)||(18176887-18177090)
chr3 (112-314)||(52821636-52821833)
chr3 (128-315)||(53233910-53234092)
chr3 (130-315)||(10190741-10190922)
chr3 (135-314)||(39041852-39042027)
chr3 (130-315)||(10083818-10083999)
chr3 (106-315)||(40940818-40941023)
chr3 (106-314)||(32151418-32151621)
chr3 (107-314)||(31537838-31538041)
chr3 (108-315)||(52455648-52455851)
chr3 (120-266)||(26108299-26108445)
chr3 (105-314)||(29915262-29915474)
chr3 (105-314)||(29964415-29964627)
chr3 (107-282)||(7470244-7470418)
chr3 (107-314)||(7485531-7485728)
chr3 (153-315)||(8097278-8097436)
chr3 (106-314)||(4462626-4462829)
chr3 (110-315)||(25344057-25344257)
chr3 (107-283)||(51532783-51532959)
chr3 (107-276)||(19857047-19857214)
chr3 (137-314)||(33398468-33398641)
chr3 (174-315)||(2511296-2511433)
chr3 (136-315)||(8958034-8958210)
chr3 (128-283)||(49167071-49167229)
chr3 (142-314)||(1692863-1693030)
chr3 (110-289)||(53288734-53288912)
chr3 (107-283)||(4252423-4252599)
chr3 (161-314)||(24407309-24407458)
chr3 (207-315)||(24165714-24165817)
chr3 (112-315)||(11390601-11390800)
chr3 (176-279)||(1242036-1242139)
chr3 (193-288)||(17579157-17579253)
chr3 (209-314)||(54475777-54475878)
chr3 (107-216)||(55287797-55287906)
chr3 (106-283)||(55371321-55371489)
chr3 (129-240)||(14343358-14343469)
chr3 (106-283)||(26158811-26158981)
chr3 (107-283)||(50582986-50583161)
chr3 (242-315)||(53848433-53848502)
chr3 (221-313)||(48104985-48105073)
chr3 (185-315)||(1178244-1178368)
chr3 (107-199)||(9842915-9843006)
chr3 (107-234)||(38732960-38733087)
chr3 (117-283)||(34844380-34844547)
chr3 (248-314)||(4048085-4048147)
chr3 (107-215)||(25017510-25017617)
chr3 (222-315)||(33698705-33698794)
chr3 (174-314)||(48972714-48972847)
chr3 (108-201)||(51390948-51391041)
chr3 (111-314)||(6041670-6041871)
chr3 (249-314)||(50731237-50731298)
chr3 (249-314)||(50781556-50781617)
chr3 (128-199)||(9853631-9853702)
chr3 (245-283)||(33793584-33793622)
chr3 (111-160)||(36660768-36660817)
chr3 (262-315)||(3747730-3747779)
chr3 (224-288)||(7195918-7195982)
chr3 (174-261)||(8455950-8456037)
chr3 (108-160)||(16140292-16140344)
chr3 (222-275)||(6127562-6127615)
chr3 (244-314)||(25017620-25017685)
chr3 (250-283)||(51390160-51390193)
[»] chr7 (73 HSPs)
chr7 (102-315)||(40542909-40543118)
chr7 (107-315)||(7175861-7176065)
chr7 (111-315)||(22119890-22120090)
chr7 (107-314)||(7275275-7275478)
chr7 (107-315)||(2751269-2751473)
chr7 (107-315)||(21217832-21218036)
chr7 (110-315)||(21835152-21835353)
chr7 (106-314)||(17196950-17197154)
chr7 (108-315)||(2103054-2103255)
chr7 (106-314)||(18044104-18044308)
chr7 (104-288)||(10091183-10091367)
chr7 (107-315)||(11997847-11998051)
chr7 (128-315)||(22703505-22703688)
chr7 (106-314)||(27009356-27009561)
chr7 (107-315)||(2344297-2344501)
chr7 (110-315)||(28089817-28090021)
chr7 (107-315)||(42913512-42913716)
chr7 (107-288)||(17212051-17212232)
chr7 (106-315)||(27312149-27312354)
chr7 (111-315)||(23012507-23012707)
chr7 (151-315)||(654704-654863)
chr7 (105-288)||(39145674-39145857)
chr7 (149-315)||(16374034-16374196)
chr7 (107-313)||(32849589-32849791)
chr7 (108-288)||(19421230-19421410)
chr7 (107-315)||(31197589-31197792)
chr7 (149-315)||(29861711-29861872)
chr7 (118-314)||(28950877-28951072)
chr7 (131-315)||(31273936-31274115)
chr7 (181-315)||(23092168-23092298)
chr7 (107-315)||(43785298-43785502)
chr7 (111-260)||(13332475-13332622)
chr7 (110-283)||(9718014-9718187)
chr7 (107-313)||(22638290-22638488)
chr7 (107-314)||(31712902-31713098)
chr7 (192-314)||(3851840-3851958)
chr7 (108-237)||(7799905-7800034)
chr7 (110-281)||(9683827-9683998)
chr7 (108-315)||(23330738-23330941)
chr7 (111-314)||(27704004-27704202)
chr7 (174-314)||(41907514-41907649)
chr7 (107-283)||(28646967-28647143)
chr7 (141-314)||(36772303-36772471)
chr7 (112-237)||(42814867-42814992)
chr7 (108-315)||(21574101-21574305)
chr7 (188-283)||(21373789-21373884)
chr7 (123-206)||(22299863-22299946)
chr7 (107-314)||(25333417-25333603)
chr7 (128-264)||(14199713-14199848)
chr7 (137-281)||(22643371-22643515)
chr7 (106-314)||(22696317-22696522)
chr7 (107-171)||(23854394-23854458)
chr7 (107-186)||(21370595-21370674)
chr7 (110-266)||(8435741-8435895)
chr7 (183-314)||(33137825-33137951)
chr7 (107-206)||(40332097-40332196)
chr7 (111-169)||(28003838-28003896)
chr7 (210-306)||(8943409-8943502)
chr7 (110-221)||(12211625-12211735)
chr7 (106-314)||(38864446-38864650)
chr7 (167-283)||(1766171-1766286)
chr7 (181-240)||(6491679-6491738)
chr7 (111-157)||(577681-577727)
chr7 (223-314)||(25102809-25102895)
chr7 (186-283)||(35476418-35476515)
chr7 (229-279)||(40332193-40332243)
chr7 (183-283)||(11909981-11910081)
chr7 (188-283)||(23636592-23636687)
chr7 (107-190)||(22264622-22264705)
chr7 (111-160)||(3951140-3951190)
chr7 (107-157)||(33137949-33137998)
chr7 (111-203)||(3950895-3950988)
chr7 (244-281)||(41443318-41443355)
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (105-315)||(4718641-4718847)
chr8 (107-315)||(34237654-34237858)
chr8 (107-315)||(3734622-3734826)
chr8 (107-315)||(39349254-39349458)
chr8 (106-315)||(20305905-20306110)
chr8 (106-315)||(21092538-21092743)
chr8 (106-313)||(28193471-28193674)
chr8 (107-315)||(2618184-2618388)
chr8 (106-314)||(42643118-42643322)
chr8 (120-314)||(21603241-21603431)
chr8 (108-315)||(19471608-19471812)
chr8 (108-315)||(19542532-19542736)
chr8 (108-315)||(19589960-19590164)
chr8 (110-313)||(15259407-15259606)
chr8 (107-315)||(32879277-32879481)
chr8 (108-315)||(42328004-42328206)
chr8 (132-315)||(8765525-8765704)
chr8 (130-315)||(14632975-14633156)
chr8 (107-268)||(18532105-18532266)
chr8 (112-314)||(264400-264597)
chr8 (112-314)||(651324-651521)
chr8 (112-314)||(837059-837256)
chr8 (117-315)||(4698722-4698916)
chr8 (110-288)||(27746357-27746535)
chr8 (132-314)||(20469940-20470117)
chr8 (107-288)||(7557973-7558146)
chr8 (128-315)||(34610686-34610869)
chr8 (107-288)||(28088284-28088465)
chr8 (109-288)||(28964033-28964211)
chr8 (174-314)||(6953008-6953143)
chr8 (107-288)||(2166695-2166875)
chr8 (107-283)||(24018380-24018557)
chr8 (174-314)||(10292120-10292255)
chr8 (110-272)||(21667551-21667713)
chr8 (174-314)||(25248414-25248547)
chr8 (107-288)||(26168871-26169051)
chr8 (222-315)||(2639410-2639499)
chr8 (108-314)||(18128512-18128714)
chr8 (174-269)||(24999299-24999394)
chr8 (110-275)||(36848785-36848949)
chr8 (110-281)||(34639237-34639406)
chr8 (128-272)||(9047316-9047460)
chr8 (106-283)||(3403529-3403706)
chr8 (111-283)||(28908823-28908997)
chr8 (110-283)||(34694602-34694776)
chr8 (174-288)||(1219414-1219528)
chr8 (110-226)||(8042655-8042764)
chr8 (110-216)||(8387539-8387644)
chr8 (115-205)||(41070767-41070857)
chr8 (137-283)||(12312874-12313019)
chr8 (187-283)||(13749133-13749230)
chr8 (110-205)||(3794792-3794887)
chr8 (111-281)||(22200589-22200758)
chr8 (224-275)||(43817784-43817835)
chr8 (135-275)||(20505587-20505718)
chr8 (246-287)||(8387482-8387523)
[»] chr6 (38 HSPs)
chr6 (106-315)||(34147339-34147544)
chr6 (106-315)||(34159955-34160160)
chr6 (107-315)||(15360097-15360301)
chr6 (107-314)||(654146-654349)
chr6 (107-313)||(9238969-9239171)
chr6 (113-314)||(11448871-11449068)
chr6 (106-315)||(3222635-3222838)
chr6 (109-315)||(21982320-21982521)
chr6 (107-314)||(5360071-5360274)
chr6 (105-315)||(21148510-21148715)
chr6 (107-315)||(17081053-17081257)
chr6 (110-315)||(1344934-1345133)
chr6 (105-314)||(28672059-28672264)
chr6 (110-315)||(9843935-9844136)
chr6 (106-315)||(11007158-11007363)
chr6 (153-290)||(12390465-12390602)
chr6 (107-241)||(12591631-12591765)
chr6 (115-314)||(9690638-9690833)
chr6 (106-283)||(33499467-33499645)
chr6 (106-314)||(9208245-9208449)
chr6 (104-315)||(14212883-14213080)
chr6 (128-314)||(11840916-11841097)
chr6 (107-216)||(13753234-13753343)
chr6 (106-196)||(22576060-22576150)
chr6 (129-283)||(17149483-17149637)
chr6 (130-274)||(28968078-28968222)
chr6 (128-315)||(17706318-17706489)
chr6 (107-271)||(31039014-31039177)
chr6 (112-283)||(10377714-10377886)
chr6 (107-288)||(33718491-33718661)
chr6 (212-314)||(15730495-15730593)
chr6 (131-283)||(6383901-6384053)
chr6 (109-214)||(8479308-8479412)
chr6 (222-314)||(14504082-14504170)
chr6 (248-283)||(32596211-32596246)
chr6 (183-283)||(17225737-17225836)
chr6 (224-315)||(21903618-21903706)
chr6 (245-288)||(27866225-27866268)
[»] chr1 (73 HSPs)
chr1 (107-315)||(4621236-4621440)
chr1 (106-314)||(24674386-24674590)
chr1 (106-314)||(24122016-24122220)
chr1 (107-315)||(15059401-15059605)
chr1 (106-315)||(7766726-7766931)
chr1 (106-276)||(8077640-8077810)
chr1 (106-315)||(27454863-27455070)
chr1 (107-283)||(46607804-46607980)
chr1 (107-314)||(7197247-7197449)
chr1 (107-283)||(30677170-30677346)
chr1 (128-313)||(17935784-17935965)
chr1 (123-315)||(7578419-7578607)
chr1 (107-313)||(34778336-34778535)
chr1 (131-314)||(45859043-45859222)
chr1 (107-284)||(168195-168372)
chr1 (132-314)||(9500355-9500533)
chr1 (107-283)||(32729539-32729714)
chr1 (106-281)||(7946837-7947011)
chr1 (107-310)||(1378892-1379090)
chr1 (106-315)||(23734109-23734315)
chr1 (106-315)||(23741301-23741507)
chr1 (107-271)||(23232300-23232468)
chr1 (128-313)||(37351454-37351643)
chr1 (106-288)||(18646846-18647028)
chr1 (107-275)||(29057373-29057540)
chr1 (137-314)||(36155888-36156061)
chr1 (105-309)||(21726721-21726921)
chr1 (130-275)||(33905545-33905690)
chr1 (128-288)||(8779758-8779918)
chr1 (113-281)||(32930749-32930917)
chr1 (111-288)||(2272342-2272519)
chr1 (106-275)||(18533759-18533928)
chr1 (112-216)||(46113496-46113600)
chr1 (183-315)||(8254751-8254879)
chr1 (105-283)||(2537696-2537863)
chr1 (107-203)||(20487297-20487393)
chr1 (108-314)||(1486415-1486617)
chr1 (107-199)||(14258538-14258630)
chr1 (186-314)||(45331621-45331746)
chr1 (208-290)||(12876956-12877038)
chr1 (106-314)||(40802069-40802271)
chr1 (109-283)||(16899507-16899673)
chr1 (218-315)||(22909976-22910069)
chr1 (106-284)||(1138572-1138749)
chr1 (131-283)||(19480552-19480706)
chr1 (219-314)||(26513148-26513238)
chr1 (117-283)||(37046994-37047162)
chr1 (218-315)||(48699863-48699957)
chr1 (112-306)||(40145889-40146079)
chr1 (107-271)||(25237028-25237192)
chr1 (106-274)||(25496528-25496692)
chr1 (228-281)||(50202661-50202714)
chr1 (109-185)||(1818730-1818806)
chr1 (108-204)||(24216973-24217069)
chr1 (107-158)||(47091684-47091735)
chr1 (131-283)||(39714677-39714829)
chr1 (110-314)||(52135127-52135323)
chr1 (106-314)||(809215-809419)
chr1 (112-283)||(1095031-1095193)
chr1 (128-223)||(19034474-19034568)
chr1 (111-201)||(1378743-1378833)
chr1 (130-275)||(16539625-16539769)
chr1 (240-314)||(35138115-35138185)
chr1 (107-159)||(6776139-6776190)
chr1 (108-272)||(9926184-9926350)
chr1 (201-314)||(26820275-26820384)
chr1 (246-314)||(23041655-23041719)
chr1 (232-283)||(27159205-27159255)
chr1 (131-206)||(39964530-39964605)
chr1 (264-315)||(14603947-14603994)
chr1 (186-283)||(20999190-20999287)
chr1 (260-314)||(5315478-5315528)
chr1 (221-274)||(17447382-17447434)
[»] scaffold0576 (1 HSPs)
scaffold0576 (107-315)||(5081-5285)
[»] chr4 (72 HSPs)
chr4 (107-315)||(40058851-40059055)
chr4 (107-313)||(52983613-52983815)
chr4 (107-315)||(34844757-34844961)
chr4 (107-315)||(27528794-27528998)
chr4 (107-315)||(32986191-32986395)
chr4 (107-315)||(46714386-46714591)
chr4 (106-314)||(33696279-33696483)
chr4 (107-283)||(54127369-54127545)
chr4 (107-315)||(5609201-5609405)
chr4 (107-314)||(25852208-25852412)
chr4 (106-315)||(19660531-19660736)
chr4 (110-314)||(20566346-20566547)
chr4 (106-315)||(36131509-36131714)
chr4 (111-315)||(45787703-45787902)
chr4 (131-312)||(20077986-20078163)
chr4 (106-315)||(44343506-44343712)
chr4 (107-265)||(35674786-35674944)
chr4 (107-260)||(33992620-33992773)
chr4 (117-314)||(35229172-35229365)
chr4 (107-274)||(22625097-22625273)
chr4 (112-279)||(32942369-32942536)
chr4 (174-314)||(34723860-34723996)
chr4 (111-314)||(51535611-51535818)
chr4 (108-290)||(13873315-13873497)
chr4 (128-314)||(49287873-49288054)
chr4 (107-270)||(1985830-1985993)
chr4 (111-288)||(34835527-34835704)
chr4 (110-283)||(13584281-13584454)
chr4 (174-315)||(32990496-32990633)
chr4 (130-283)||(7391992-7392143)
chr4 (110-281)||(13550205-13550376)
chr4 (113-281)||(55961783-55961939)
chr4 (137-314)||(12500059-12500231)
chr4 (107-274)||(13771518-13771686)
chr4 (106-315)||(18875516-18875720)
chr4 (156-315)||(21387486-21387639)
chr4 (174-288)||(9517663-9517777)
chr4 (191-315)||(27574396-27574516)
chr4 (131-288)||(20527056-20527212)
chr4 (120-240)||(2351020-2351140)
chr4 (191-283)||(53787084-53787177)
chr4 (111-221)||(43719154-43719264)
chr4 (192-275)||(22488063-22488146)
chr4 (185-272)||(25969540-25969625)
chr4 (104-223)||(41621684-41621802)
chr4 (186-260)||(29875825-29875899)
chr4 (117-315)||(4911926-4912124)
chr4 (185-314)||(51595094-51595219)
chr4 (234-314)||(9978509-9978585)
chr4 (107-164)||(34722164-34722221)
chr4 (130-315)||(30879165-30879345)
chr4 (247-314)||(23639758-23639821)
chr4 (247-314)||(23645416-23645479)
chr4 (188-280)||(13716480-13716572)
chr4 (248-314)||(52494623-52494685)
chr4 (112-283)||(9646243-9646414)
chr4 (217-288)||(4585735-4585804)
chr4 (236-283)||(13017836-13017883)
chr4 (234-288)||(4064981-4065035)
chr4 (111-160)||(42245744-42245793)
chr4 (181-314)||(12824468-12824597)
chr4 (243-315)||(43719086-43719154)
chr4 (117-208)||(51250495-51250589)
chr4 (222-283)||(8158372-8158433)
chr4 (249-315)||(23131435-23131497)
chr4 (244-314)||(55158343-55158409)
chr4 (231-287)||(10143779-10143834)
chr4 (185-267)||(10125892-10125973)
chr4 (225-275)||(40252401-40252451)
chr4 (225-283)||(42508408-42508466)
chr4 (231-281)||(51961978-51962028)
chr4 (192-233)||(39288938-39288978)
[»] chr5 (73 HSPs)
chr5 (110-315)||(8484660-8484861)
chr5 (106-315)||(15641105-15641309)
chr5 (106-315)||(27498730-27498935)
chr5 (106-315)||(32059439-32059644)
chr5 (106-314)||(11926501-11926706)
chr5 (101-315)||(33709502-33709709)
chr5 (107-315)||(38684202-38684405)
chr5 (107-315)||(30485822-30486026)
chr5 (107-314)||(34310136-34310339)
chr5 (130-315)||(19456210-19456389)
chr5 (105-315)||(4603769-4603975)
chr5 (107-315)||(7085625-7085829)
chr5 (132-315)||(18207226-18207405)
chr5 (107-314)||(23270522-23270725)
chr5 (107-315)||(31287945-31288149)
chr5 (115-315)||(10869564-10869760)
chr5 (107-265)||(25586926-25587085)
chr5 (111-281)||(15971151-15971321)
chr5 (104-306)||(13038463-13038660)
chr5 (104-306)||(13108458-13108655)
chr5 (128-315)||(37495062-37495252)
chr5 (106-309)||(11464913-11465111)
chr5 (109-314)||(19145412-19145612)
chr5 (110-314)||(27487554-27487755)
chr5 (107-315)||(22392695-22392886)
chr5 (117-314)||(6014280-6014473)
chr5 (110-314)||(25750613-25750811)
chr5 (108-306)||(36954813-36955007)
chr5 (107-266)||(15931053-15931211)
chr5 (107-288)||(34049816-34049986)
chr5 (182-315)||(35425082-35425211)
chr5 (110-315)||(38630978-38631161)
chr5 (106-288)||(42193478-42193658)
chr5 (107-315)||(12317154-12317353)
chr5 (130-315)||(12398447-12398628)
chr5 (106-315)||(21236361-21236566)
chr5 (192-314)||(9659311-9659429)
chr5 (111-283)||(26009291-26009463)
chr5 (106-224)||(1827616-1827734)
chr5 (110-288)||(10399770-10399949)
chr5 (107-314)||(5049131-5049333)
chr5 (218-315)||(41351103-41351195)
chr5 (196-314)||(13659245-13659359)
chr5 (232-314)||(22693054-22693132)
chr5 (107-283)||(15485318-15485495)
chr5 (130-313)||(17015420-17015593)
chr5 (106-314)||(28614486-28614687)
chr5 (130-221)||(7151346-7151437)
chr5 (185-283)||(31206314-31206413)
chr5 (167-283)||(10813878-10813994)
chr5 (105-283)||(33025472-33025650)
chr5 (135-314)||(36895447-36895622)
chr5 (107-164)||(3715055-3715112)
chr5 (112-283)||(2499205-2499376)
chr5 (110-283)||(930513-930685)
chr5 (107-203)||(37397707-37397803)
chr5 (182-289)||(41568890-41568996)
chr5 (107-197)||(5067295-5067385)
chr5 (117-207)||(21589297-21589390)
chr5 (110-216)||(22253239-22253345)
chr5 (174-283)||(24158193-24158302)
chr5 (131-283)||(16247028-16247180)
chr5 (244-288)||(5067392-5067436)
chr5 (259-315)||(10631288-10631340)
chr5 (111-162)||(42006791-42006842)
chr5 (106-160)||(16616112-16616166)
chr5 (249-315)||(33737878-33737939)
chr5 (108-205)||(40330628-40330725)
chr5 (250-290)||(42953652-42953692)
chr5 (193-235)||(3639851-3639894)
chr5 (222-285)||(39459405-39459468)
chr5 (189-265)||(10076811-10076888)
chr5 (106-159)||(21042676-21042729)
[»] chr2 (70 HSPs)
chr2 (107-315)||(33827572-33827776)
chr2 (107-315)||(44946052-44946256)
chr2 (106-314)||(11941210-11941414)
chr2 (107-315)||(15037953-15038157)
chr2 (105-314)||(30466830-30467035)
chr2 (106-288)||(24195997-24196177)
chr2 (111-288)||(44976175-44976353)
chr2 (144-315)||(35171831-35171998)
chr2 (111-288)||(17324764-17324940)
chr2 (128-290)||(10582012-10582172)
chr2 (106-315)||(41313985-41314189)
chr2 (130-307)||(36242319-36242492)
chr2 (107-314)||(25293160-25293356)
chr2 (110-267)||(4567480-4567637)
chr2 (107-314)||(36390569-36390769)
chr2 (130-315)||(43374329-43374505)
chr2 (123-254)||(27290598-27290729)
chr2 (109-315)||(19054021-19054224)
chr2 (129-315)||(34516413-34516589)
chr2 (112-314)||(41329842-41330039)
chr2 (130-283)||(5394034-5394187)
chr2 (108-315)||(8192351-8192553)
chr2 (112-315)||(8258896-8259095)
chr2 (186-315)||(28668946-28669071)
chr2 (107-314)||(27269344-27269553)
chr2 (159-315)||(2140485-2140634)
chr2 (183-315)||(3943810-3943938)
chr2 (130-314)||(13266507-13266686)
chr2 (130-288)||(1191530-1191688)
chr2 (130-288)||(45271401-45271559)
chr2 (107-216)||(32845085-32845194)
chr2 (102-212)||(18976524-18976633)
chr2 (128-271)||(19849848-19849991)
chr2 (108-283)||(14946774-14946948)
chr2 (122-262)||(23787056-23787196)
chr2 (107-289)||(5608055-5608237)
chr2 (108-241)||(40997419-40997552)
chr2 (191-314)||(714125-714244)
chr2 (106-314)||(6714295-6714485)
chr2 (132-314)||(29361573-29361745)
chr2 (111-225)||(918782-918898)
chr2 (104-198)||(4852549-4852643)
chr2 (233-314)||(44929846-44929923)
chr2 (107-315)||(28194137-28194337)
chr2 (206-288)||(4769259-4769341)
chr2 (240-315)||(18692087-18692158)
chr2 (117-286)||(19605870-19606038)
chr2 (213-283)||(44610139-44610209)
chr2 (115-251)||(4618744-4618880)
chr2 (110-283)||(18708472-18708647)
chr2 (220-314)||(31778138-31778228)
chr2 (174-281)||(19174824-19174930)
chr2 (130-285)||(29698164-29698318)
chr2 (236-315)||(14486948-14487023)
chr2 (244-315)||(18976454-18976521)
chr2 (117-283)||(26176225-26176389)
chr2 (188-285)||(35943758-35943856)
chr2 (224-307)||(45132398-45132477)
chr2 (224-314)||(9400961-9401047)
chr2 (201-266)||(19517030-19517095)
chr2 (246-315)||(39957891-39957956)
chr2 (129-263)||(1845701-1845838)
chr2 (174-282)||(19525428-19525532)
chr2 (231-288)||(32845194-32845251)
chr2 (106-146)||(20297556-20297596)
chr2 (131-237)||(13747578-13747684)
chr2 (106-197)||(31536201-31536291)
chr2 (107-205)||(10324891-10324987)
chr2 (106-160)||(32526235-32526289)
chr2 (244-281)||(4852660-4852697)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (107-315)||(40319-40522)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (107-314)||(7309-7512)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (107-283)||(97393-97569)
[»] scaffold0366 (2 HSPs)
scaffold0366 (111-315)||(9299-9498)
scaffold0366 (111-283)||(12028-12199)
[»] scaffold0623 (1 HSPs)
scaffold0623 (111-314)||(1057-1255)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (132-315)||(161828-162007)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (108-315)||(52870-53073)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (106-288)||(41666-41848)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (111-315)||(10694-10892)
[»] scaffold0328 (2 HSPs)
scaffold0328 (107-305)||(14985-15178)
scaffold0328 (174-314)||(13047-13180)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (152-315)||(39131-39290)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (107-314)||(66756-66951)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (118-267)||(1-150)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (137-314)||(20246-20418)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (182-315)||(32357-32485)
[»] scaffold1175 (1 HSPs)
scaffold1175 (201-283)||(2453-2535)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (106-205)||(8512-8611)
scaffold0199 (248-314)||(8451-8513)
[»] scaffold0460 (1 HSPs)
scaffold0460 (107-203)||(8286-8382)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (107-222)||(27770-27885)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (112-314)||(29143-29340)
[»] scaffold0240 (2 HSPs)
scaffold0240 (104-164)||(12900-12960)
scaffold0240 (218-259)||(2381-2422)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (107-203)||(26650-26746)
[»] scaffold0330 (1 HSPs)
scaffold0330 (218-259)||(18363-18404)
[»] scaffold1712 (1 HSPs)
scaffold1712 (236-269)||(648-681)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 707; Significance: 0; HSPs: 79)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 707; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 45272708 - 45271908
Alignment:
Q  18 caaacgaggtaattaaatcgttttcagttcatttgattgatttccctaccctataatctttatgtttagttataagcgtgaggcaatgtaacccatttgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45272708 caaacgaggtaattaaatcgttttcagttcatttgattgatttccctaccctataatctatatgtttagttataagcatgaggcaatgtaacccatttgg 45272609  T
Q  118 ggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacg 217  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45272608 ggttggcctagtcgttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcagtttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacg 45272509  T
Q  218 gagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttcnn 317  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||      
T  45272508 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgact----cttggatcggataccgagttttcaa 45272413  T
Q  318 nnnnnnn---tgtgaggcaatgtgatgcataagtaaaagacatttcaccttataaaccagttttgtatgattgagttagacgcaattctaaatattcaaa 414  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45272412 aaaaaaaaagtgtgaggcaatgtgatgcataagtaaaagacatttcaccttataaaccagttttgtatgattgagttagacgcaattctaaatattcaaa 45272313  T
Q  415 acaataatatacattatcaagattttgatctcaattagtctctattatttgattattcaggttgttgaaatcgaaacagctcctaagaaaaaaggacatc 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45272312 acaataatatacattatcaagattttgatctcaattagtctctattatttgattattcaggttgttgaaatcgaaacagctcctaagaaaaaaggacatc 45272213  T
Q  515 ataagagaaggaaattggtggcgatgaagaagaatctactcaacgttaagaatctgcagaagaatagcatgaacaaaatgatggcctgcgctggcaatga 614  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45272212 ataagagaaggaaattggtggcgatgaagaagaatctactcaacgttaagaatctgcagaagaatagcatgaacaaaatgatggcctgcgctggcaatga 45272113  T
Q  615 tagaagaaaacttcttgcggatcattgattaatacattagttcctgctagaacgaatgttgaagacacattaattatataataacttagaaataagtgtt 714  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45272112 tagaagaaaacttcttgcggatcattgattaatacattagttgctgctagaacgaatgttgaagacacattaattatataataacttagaaataagtgtt 45272013  T
Q  715 tctttgtttgggaatttctaggcatttttgggttcaatttcttctgaatccacatatactggtagctaaatgtatgtaatactatttgatcatatttaga 814  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45272012 tctttgtttgggaatttctaggcattttttggttcaatttcttctgaatccacatatactggtagctaaatgtatgtaatactatttgatcatatttaga 45271913  T
Q  815 ataat 819  Q
    |||||    
T  45271912 ataat 45271908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 106 - 314
Target Start/End: Original strand, 35492904 - 35493108
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35492904 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 35493003  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||| | |||    
T  35493004 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggattgaata 35493099  T
Q  306 ccgagtttt 314  Q
    |||||||||    
T  35493100 ccgagtttt 35493108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 106 - 315
Target Start/End: Original strand, 46576341 - 46576546
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  46576341 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggc 46576440  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    ||||||||||||||||    
T  46576441 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtcggattggtccccttggattagtcg----attcttggatcggata 46576536  T
Q  306 ccgagttttc 315  Q
    ||||||||||    
T  46576537 ccgagttttc 46576546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8456353 - 8456149
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8456353 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 8456254  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    ||||||| |||||||||    
T  8456253 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcagtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttgaatcggatac 8456158  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  8456157 cgagttttc 8456149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 40133652 - 40133448
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  40133652 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggattttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggct 40133553  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    |||||||||||||||||    
T  40133552 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcg----attcttggatcggatac 40133457  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  40133456 cgagttttc 40133448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 45529957 - 45529754
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  45529957 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcgatgggct 45529858  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||| ||||||||||    
T  45529857 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attctt-gatcggatac 45529763  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  45529762 cgagttttc 45529754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 106 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 49258466 - 49258262
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  49258466 taacccatttggggtttgcctagtggttggcttgggatcttgcagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggc 49258367  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||    
T  49258366 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggata 49258271  T
Q  306 ccgagtttt 314  Q
    |||||||||    
T  49258270 ccgagtttt 49258262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 106 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30807357 - 30807152
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30807357 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 30807258  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaac-gggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggat 304  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |    |||||||||||||||    
T  30807257 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcggtaggattggt-ccctcggattagtcg----attcttggatcggat 30807163  T
Q  305 accgagttttc 315  Q
    |||||||||||    
T  30807162 accgagttttc 30807152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 25289917 - 25289714
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25289917 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggct 25289818  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    |||||||||||||||||    
T  25289817 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcgaattagtcg----attcttggatcggatac 25289723  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  25289722 cgagttttc 25289714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 107 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 34492778 - 34492575
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  34492778 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgttcgattccctctgctgccaatttcgttgggct 34492679  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    ||||||||||| |||||    
T  34492678 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtccattcagattagttg----attcttggatctgatac 34492583  T
Q  307 cgagtttt 314  Q
    ||||||||    
T  34492582 cgagtttt 34492575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 109 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 53424377 - 53424176
Alignment:
Q  109 cccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaa 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  53424377 cccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaa 53424278  T
Q  209 gtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccg 308  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||    
T  53424277 gtccatacagagtttgctatggctttaaacggg-cccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggataccg 53424183  T
Q  309 agttttc 315  Q
    |||||||    
T  53424182 agttttc 53424176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15566701 - 15566499
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15566701 aacccatttggg-ttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggct 15566603  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    |||||||||||||||||    
T  15566602 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggg-cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcg----attcttggatcggatac 15566508  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  15566507 cgagttttc 15566499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 106 - 314
Target Start/End: Original strand, 21362936 - 21363140
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  21362936 taacccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtaggc 21363035  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||  ||||||||||||||||    
T  21363036 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggttccctcggatta----atcgattcttggatcggata 21363131  T
Q  306 ccgagtttt 314  Q
    |||||||||    
T  21363132 ccgagtttt 21363140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 112 - 313
Target Start/End: Original strand, 25379760 - 25379957
Alignment:
Q  112 atttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtc 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25379760 atttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttctagtgccaatttcggagggctaagtc 25379859  T
Q  212 catacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagt 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||| ||||    
T  25379860 catacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagcgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggatactgagt 25379955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 114 - 315
Target Start/End: Original strand, 26174114 - 26174311
Alignment:
Q  114 ttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcca 213  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26174114 ttggagttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggttaagtcca 26174213  T
Q  214 tacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttt 313  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||    
T  26174214 tacagagcttgctctggctttaaatagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggataccgagttt 26174309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Original strand, 30257618 - 30257822
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||| ||    
T  30257618 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatggact 30257717  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  30257718 aagtccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtggcattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggatac 30257813  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    ||| |||||    
T  30257814 cgaattttc 30257822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Original strand, 48977382 - 48977586
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  48977382 aacccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtgggtt 48977481  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     | ||||||||||||||    
T  48977482 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----gtccttggatcggatac 48977577  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  48977578 cgagttttc 48977586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 107 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18177090 - 18176887
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| || |||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  18177090 aacccatttggggttggcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcttccagaggtatcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggact 18176991  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  18176990 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggattagtcg----attcttggatcggatac 18176895  T
Q  307 cgagtttt 314  Q
     |||||||    
T  18176894 agagtttt 18176887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 112 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 52821833 - 52821636
Alignment:
Q  112 atttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtc 211  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52821833 atttggtgttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgagctaagtc 52821734  T
Q  212 catacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagt 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  52821733 catacagagcttgctctggctttaaacggg-gccccgtaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggataccgagt 52821639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 128 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 53234092 - 53233910
Alignment:
Q  128 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53234092 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctc 53233993  T
Q  228 tggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||| |||||||||||||||||||    
T  53233992 tggctctaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attctt-gatcggataccgagttttc 53233910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 130 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10190922 - 10190741
Alignment:
Q  130 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10190922 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagggctcaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 10190823  T
Q  230 gctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10190822 gctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggataccgagttttc 10190741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 135 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 39042027 - 39041852
Alignment:
Q  135 gcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggcttt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  39042027 gcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatgcagagcttgctctggcttt 39041928  T
Q  235 aaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||    
T  39041927 aaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtccactcggattagtcg----attcttggatcggataccgagtttt 39041852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 130 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10083999 - 10083818
Alignment:
Q  130 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10083999 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagggctcaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 10083900  T
Q  230 gctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10083899 gctttaaacggggcccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggataccgagttttc 10083818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 315
Target Start/End: Original strand, 40940818 - 40941023
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  40940818 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggac 40940917  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||     | |||||||| ||| ||||    
T  40940918 taagtccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccccacaagtgggtggtaggattggtcccctcgaatta----ctcaattcttgaatcagata 40941013  T
Q  306 ccgagttttc 315  Q
    ||||||||||    
T  40941014 ccgagttttc 40941023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 314
Target Start/End: Original strand, 32151418 - 32151621
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  32151418 taacccatttggg-ttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtttcaaattcgattctctctagtgccaatttcggtgggc 32151516  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |    ||||||||||||||||    
T  32151517 taagctcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagtcg----attcttggatcggata 32151612  T
Q  306 ccgagtttt 314  Q
    |||||||||    
T  32151613 ccgagtttt 32151621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 107 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 31538041 - 31537838
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31538041 aacccatttggggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgtttgattccctctggtgccaattttggtgggct 31537942  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||||     
T  31537941 aagtctatacagagcttactctggctttaaacggagcccctgcaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagtc----aattcttggatcggatat 31537846  T
Q  307 cgagtttt 314  Q
    ||||||||    
T  31537845 cgagtttt 31537838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 108 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 52455851 - 52455648
Alignment:
Q  108 acccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggcta 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  52455851 acccatttggggttggcctagtggttggctagggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggcta 52455752  T
Q  208 agtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatacc 307  Q
    |||| | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||    
T  52455751 agtctacacagagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaagtgactggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggattggatacc 52455656  T
Q  308 gagttttc 315  Q
    ||||||||    
T  52455655 gagttttc 52455648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 120 - 266
Target Start/End: Original strand, 26108299 - 26108445
Alignment:
Q  120 ttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacgga 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26108299 ttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaga 26108398  T
Q  220 gcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggatt 266  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  26108399 gcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggctgtgggatt 26108445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29915474 - 29915262
Alignment:
Q  105 gtaacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtggg 204  Q
    ||||||||||| |||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||| ||||||||||    
T  29915474 gtaacccatttagggttgacctaatggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcttctggtgccattttcggtggg 29915375  T
Q  205 ctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt----aattcttggatc 300  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||    ||||||||||||    
T  29915374 ctaagtacatacagagcttgccctggctttaaacggg-cccccgcaagtgggcggtgggattgatcccatcgaattagtcgattcttgaattcttggatc 29915276  T
Q  301 ggataccgagtttt 314  Q
    |||||  |||||||    
T  29915275 ggatattgagtttt 29915262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29964627 - 29964415
Alignment:
Q  105 gtaacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtggg 204  Q
    ||||||||||| |||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||| ||||||||||    
T  29964627 gtaacccatttagggttgacctaatggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcttctggtgccattttcggtggg 29964528  T
Q  205 ctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt----aattcttggatc 300  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||    ||||||||||||    
T  29964527 ctaagtacatacagagcttgccctggctttaaacggg-cccccgcaagtgggcggtgggattgatcccatcgaattagtcgattcttgaattcttggatc 29964429  T
Q  301 ggataccgagtttt 314  Q
    |||||  |||||||    
T  29964428 ggatattgagtttt 29964415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 107 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7470418 - 7470244
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  7470418 aacccatttggggtttgcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctaatgccaatttcggtgggct 7470319  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattag 282  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7470318 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggg-gccctgcaagtgggcagtgggattggtcccctcagattag 7470244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 107 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 7485728 - 7485531
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7485728 aacccatttggggttggcatagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggct 7485629  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||| |||    |||||| ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  7485628 aagttcat----agcttgatctggctttaaacagg-cccctgcaagtggccggtgggattggt-ccctcggattagtcg----attcttggatcggatac 7485539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 153 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8097436 - 8097278
Alignment:
Q  153 tgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaag 252  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8097436 tgctcctccagaggcctcaggttcgattccctcttgtgctaatttcgatgggctaagtccatacagagcatgctctggctttaaacggggcccccgcaag 8097337  T
Q  253 tgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8097336 tgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggataccgagttttc 8097278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 314
Target Start/End: Original strand, 4462626 - 4462829
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || || | ||||||  |||||| ||||||||  ||||||||| |||||    
T  4462626 taactcatttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctacttcaaaagtctcatgttcgattccctctggcaccaatttcgatgggc 4462725  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    || |||||||||| |||||    
T  4462726 taagttcatacagagcttactctagctttaaacggg-gccccgcaagtggacggtgggattgatccactcggattag----tttattcttggattggata 4462820  T
Q  306 ccgagtttt 314  Q
    |||||||||    
T  4462821 ccgagtttt 4462829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 110 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 25344257 - 25344057
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  || ||| |||| ||||| ||||||  |||| |||||    
T  25344257 ccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggtttgattccctttggtgtcaatttttgtggtctaag 25344158  T
Q  210 tccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccga 309  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||| |    |||||| ||||| |||||||    
T  25344157 tccatacagagtttgctctggctttaaacggggcccccgctagtgggcgatgggattggt-tcctcggattagtcg----attcttagatcgaataccga 25344063  T
Q  310 gttttc 315  Q
    ||||||    
T  25344062 gttttc 25344057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 283
Target Start/End: Original strand, 51532783 - 51532959
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||| |||  | ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| | ||||  ||||||||||||||||||    
T  51532783 aacccatttggggttgacctattagttggtttgagattttggagtttgcttctccaaaggtctcatgttcgattctctctaatgccaatttcggtgggct 51532882  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  51532883 aagtccatacagagcttgctctaactttaaatgggacccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcagattagt 51532959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 107 - 276
Target Start/End: Original strand, 19857047 - 19857214
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  19857047 aacccatttggg-ttggcctggtggttggcttgg-atcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgattccctttggtgtcaatttcggtgggct 19857144  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcg 276  Q
    |||| ||    |||||||||||  ||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19857145 aagttcagttagagcttgctctaactttaaatggggtctccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcg 19857214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 137 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33398641 - 33398468
Alignment:
Q  137 ttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaa 236  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | |  |||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33398641 ttgggatcttgtagtttgctcttctaaagatctcaagttcgattccctctagtgccaattttggtgggttatgtccatacagagcttgctctagctttaa 33398542  T
Q  237 acgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    |||||||||||||||||||| ||||    
T  33398541 acggggcccccgcaagtgggcggtgggattggttccctcgaattagtcg----attcttggatcggataccgaatttt 33398468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 174 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2511433 - 2511296
Alignment:
Q  174 ttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccc 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2511433 ttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctcgctctgactttaaacgggacctccgcaagtgggcggtgggattggtctcc 2511334  T
Q  274 tcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    ||| |||||| |    ||||||| |||||||||| |||||||    
T  2511333 tcgaattagtag----attcttgaatcggataccaagttttc 2511296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8958210 - 8958034
Alignment:
Q  136 cttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggcttt- 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || | |||| |  ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||     
T  8958210 cttgggatcttggagtctgctccttcaaaggtcttatgttcgatttcctctggtgtcaattttggtgggctaagtccatacaaagcttgctctagcttta 8958111  T
Q  235 aaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8958110 aaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctctgatta----atcgattcttggatcagataccgagttttc 8958034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 128 - 283
Target Start/End: Original strand, 49167071 - 49167229
Alignment:
Q  128 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagc---ttg 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  | |||  |||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||   |||    
T  49167071 gtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccaaagatatcaggttcgattctctctggtgtcaatttcggtggactaagtccatacatagcgttttg 49167170  T
Q  225 ctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | ||||||    
T  49167171 ctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggtggtggggttggttcccttgaattagt 49167229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 314
Target Start/End: Original strand, 1692863 - 1693030
Alignment:
Q  142 atcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacggg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| || | | ||| |||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||| || ||    
T  1692863 atcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccatttagtgtcaatttcggtggactaagtctatacagaacttgctctggctttagacagg 1692962  T
Q  242 acccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
     |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |    ||||||| |||||||||||||||||    
T  1692963 -cccccgcaagtgggcggtgggatttgccccctcagattagtcg----attcttgaatcggataccgagtttt 1693030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 53288912 - 53288734
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    |||||| | |||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| | ||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53288912 ccattttgcgttggccaagtggttggtttgggatattagagtttgctcctccaaaggtctcaggctcgattccctctggtgccaatttcggtggactaag 53288813  T
Q  210 tccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatta 289  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||  || ||||| |||| ||||||||| |||||| |||||    
T  53288812 tccatacaaagcttgctttggctttaaacggg-gccccgcaaacggacggtgagattagtcccctcgaattagtcgatta 53288734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4252599 - 4252423
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||   | ||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||  |     
T  4252599 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaagtttgattccctctggtgccaatttcagtgatc- 4252501  T
Q  207 aagtccatacggagc-ttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    ||||||||||  ||| || |||||| ||  |||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4252500 aagtccatacaaagctttactctggtttagaacggcccccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggattagt 4252423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 314
Target Start/End: Original strand, 24407309 - 24407458
Alignment:
Q  161 cagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggt 260  Q
    |||| ||||||  |||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||  |||| ||  |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  24407309 cagaggtctcagattcgattctctctggtgctaatttcggtgggttaagtatatacagaatttgctctgactttaaacggggccatcgcaagtgggcggt 24407408  T
Q  261 gggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||    
T  24407409 gggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggataccgagtttt 24407458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 207 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24165817 - 24165714
Alignment:
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  24165817 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccc-gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcg----attcttggatcggatac 24165723  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  24165722 cgagttttc 24165714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 112 - 315
Target Start/End: Original strand, 11390601 - 11390800
Alignment:
Q  112 atttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtc 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |  | |||  || |||  ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11390601 atttggggttggcctagtggttggtttgagatcttggagttttctcctccaaagatttcaggtttgatttcctctggtgtcaattttggtgggctaagtc 11390700  T
Q  212 catacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagt 311  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||| || |||||| ||    ||| ||||  ||||||||||||||| |    ||||||||||||||||| ||||    
T  11390701 catacagagcttgctctgtctttaaatgggtcctccgcaaatgattcgtgagattattcccctcggattagtcg----attcttggatcggatactgagt 11390796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 176 - 279
Target Start/End: Original strand, 1242036 - 1242139
Alignment:
Q  176 cgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagc-ttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccct 274  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1242036 cgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtccatacagagctttgctctggctttaaacggg-gtcccgcaagtgggcggtggaattggtcccct 1242134  T
Q  275 cggat 279  Q
     ||||    
T  1242135 tggat 1242139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 193 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17579253 - 17579157
Alignment:
Q  193 aatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggaccc-ccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  17579253 aattttggtgggctaagtccatacagagcttgctttagctttaaacgggaccctccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcagattagtcgatt 17579157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 209 - 314
Target Start/End: Original strand, 54475777 - 54475878
Alignment:
Q  209 gtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccg 308  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    ||||||||||| |||||||    
T  54475777 gtccatacagagcttgctttggctttaaacggggccaccgcaagtgggcggtgggattggtccccttggattagtcg----attcttggatcagataccg 54475872  T
Q  309 agtttt 314  Q
    ||||||    
T  54475873 agtttt 54475878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 216
Target Start/End: Original strand, 55287797 - 55287906
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||  |||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  55287797 aacccatttggggttggcatagtggttggcttggaatcttagagtttgctccttcagaggtttcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggct 55287896  T
Q  207 aagtccatac 216  Q
    | ||||||||    
T  55287897 aggtccatac 55287906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 55371489 - 55371321
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||| |||   | ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||| || |    
T  55371489 taacctatttgaggttggcctagtggttggcttgcgattttggagtatgcttctctcaaggtctcatgttcgattccctttggtgccaatttcggcggac 55371390  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
     |||| ||||        |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55371389 -aagttcata--------gctctggcttaaaacggggccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 55371321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14343469 - 14343358
Alignment:
Q  129 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctct 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||  |||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  14343469 tggttggtttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcagattcgatttcatctgacgccaatttcaatgggctaagtccatacagaacttgctct 14343370  T
Q  229 ggctttaaacgg 240  Q
    | ||||||||||    
T  14343369 gcctttaaacgg 14343358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 283
Target Start/End: Original strand, 26158811 - 26158981
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    |||| ||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||| ||||||||   | ||||||  ||  || |||| |||||||||||||||||||     
T  26158811 taactcatttggggttggcctatgtgttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttcattccctttggtgccaatttcggtggg- 26158909  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    ||||||||||| |      |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26158910 taagtccatacag------ctctggcttagaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagt 26158981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 283
Target Start/End: Original strand, 50582986 - 50583161
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   | || |||  ||||||  |||||| ||||||||||| |||| |    
T  50582986 aacccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctcttaaggtttcaggttcgatttcctctgttgccaatttcgttggg-t 50583084  T
Q  207 aagtccatacggagc-ttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    ||||||||||  | | ||| | || |||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  50583085 aagtccatacaaaactttgatttgactttaaa-tggagccccgtaagtgagcggtgggattggtcctctcgaattagt 50583161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 242 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 53848502 - 53848433
Alignment:
Q  242 acccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  53848502 acccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggataccgagttttc 53848433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 313
Target Start/End: Original strand, 48104985 - 48105073
Alignment:
Q  221 cttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttt 313  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||    
T  48104985 cttgctctggctttaaacagggcccccacaagtgggcggtgagattggtcccttcggattagtcg----attcttggatcggataccgagttt 48105073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 315
Target Start/End: Original strand, 1178244 - 1178368
Alignment:
Q  185 ctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagc-ttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||| |||  |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1178244 ctggtgccaatttcggtgggc-aagtccatacagaactttgctctggctttaaatggg-gccccacacgtgggcggtgggattggt-ccctcggattagt 1178340  T
Q  284 tgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
     |    | ||||||||||||||||||||||||    
T  1178341 cg----aatcttggatcggataccgagttttc 1178368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 199
Target Start/End: Original strand, 9842915 - 9843006
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcg 199  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||| |||||| ||||||||    
T  9842915 aacccatttggggttggtctagtggttggtttgggatcttggagttttctcctccagaggtctcga-ttcgattcccactggtgtcaatttcg 9843006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 234
Target Start/End: Original strand, 38732960 - 38733087
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||| |||||| ||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||  | |||| | ||||| || |||||||||||||||    
T  38732960 aacccatttgaggttgggctaatggttgacttggaatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggtccgattctctctgttgtcaatttcggtgggct 38733059  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggcttt 234  Q
     ||| ||||| ||| |||||||| ||||    
T  38733060 gagttcatacagaggttgctctgacttt 38733087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 283
Target Start/End: Original strand, 34844380 - 34844547
Alignment:
Q  117 gggttggcctggtg--gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccat 214  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| || |||||||| ||||||||   | ||||||  |||||| |||||  | |||||||||||||| ||| || |||    
T  34844380 gggttgccctggtgttgttggcttgagaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctccagagccaatttcggtggacta-gtacat 34844478  T
Q  215 acggagctt-gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    || |||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34844479 acagagctttgctatggctttaaatggg-cccccgcaagtggatggtgggattggacccctcggattagt 34844547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 248 - 314
Target Start/End: Original strand, 4048085 - 4048147
Alignment:
Q  248 gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  4048085 gcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagttg----attcttggatcggataccgagtttt 4048147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 215
Target Start/End: Original strand, 25017510 - 25017617
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| |  |||||| || ||| ||| |||||||||||||||    
T  25017510 aacccatttggggttggcccagatgttggcttgg-atcttggagtttgctcctccaaagatcttaggttcgattccatctagtgtcaatttcggtgggct 25017608  T
Q  207 aagtccata 215  Q
    |||||||||    
T  25017609 aagtccata 25017617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 33698794 - 33698705
Alignment:
Q  222 ttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| |    ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33698794 ttgctctggctttaaacggggctcccgcaaatgggtggtgggattggtcccctcaaattagtcg----attctcggatcggatgccgagttttc 33698705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 48972847 - 48972714
Alignment:
Q  174 ttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccc 273  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||  |||   |||||||| ||||  ||||||||      
T  48972847 ttcgattccctctggtgccaatttcgatgggttaagttcatatagagtttgctctgactttaaacggatccc---caagtggggggtgaaattggtccat 48972751  T
Q  274 tcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    ||| |||||| |    ||||||| |||||||||||||||||    
T  48972750 tcgaattagtcg----attcttgaatcggataccgagtttt 48972714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 51391041 - 51390948
Alignment:
Q  108 acccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggt 201  Q
    ||||||||| || || ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||   |  |||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  51391041 acccatttgaggctgtcctagtggttggcttgagatcttagagtttgctcctctcaagatctcaatttcaattccctcttgtgccaatttcggt 51390948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6041871 - 6041670
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 210  Q
    |||||||||||| |||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||   | |  |||  ||||||  || || ||||||||||||||||  |||||    
T  6041871 catttggggttgccctaatggttgacttgaaatcttggagtttgctcctctcaaggagtcatgttcgattgcccctagtgccaatttcggtggattaagt 6041772  T
Q  211 ccatacggagct-tgctctggctttaaacg-ggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccg 308  Q
    |||||| ||| | ||||||| |||||||||  | ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||  ||||||| |     |||||||||| |||||||    
T  6041771 ccatacagagttatgctctgactttaaacgaagcccccctcaaatgggcggtgagattgttccccttagattagtcg----gttcttggatcagataccg 6041676  T
Q  309 agtttt 314  Q
    ||||||    
T  6041675 agtttt 6041670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 50731298 - 50731237
Alignment:
Q  249 caagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    || ||||||||||||||||||||||    
T  50731298 caagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcg----atccttggatcggataccgagtttt 50731237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 314
Target Start/End: Original strand, 50781556 - 50781617
Alignment:
Q  249 caagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    || ||||||||||||||||||||||    
T  50781556 caagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcg----atccttggatcggataccgagtttt 50781617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 199
Target Start/End: Original strand, 9853631 - 9853702
Alignment:
Q  128 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcg 199  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| | |||||||||||||    
T  9853631 gtggttagtttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattcccaccggtgccaatttcg 9853702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 283
Target Start/End: Original strand, 33793584 - 33793622
Alignment:
Q  245 cccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33793584 cccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagt 33793622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 160
Target Start/End: Original strand, 36660768 - 36660817
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctc 160  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  36660768 catttggggttgacctagtggttggtttaggatcttggagtttgctcctc 36660817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 315
Target Start/End: Original strand, 3747730 - 3747779
Alignment:
Q  262 ggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||    
T  3747730 ggattggtcccctcggattagtcgatt----cttggatcggataccgagttttc 3747779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 288
Target Start/End: Original strand, 7195918 - 7195982
Alignment:
Q  224 gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  7195918 gctctgactttaaatgggccccccacatgtgggcagtgggattggtcccctcagattagtcgatt 7195982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8456037 - 8455950
Alignment:
Q  174 ttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggaccccc-gcaagtgggcggtg 261  Q
    |||||| | |||| || ||||||| | ||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  8456037 ttcgattctctctagtaccaattttgatgggc-aagtccatacataacttgctctggctttaaatgggaccccctgcaagtgggcggtg 8455950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 160
Target Start/End: Original strand, 16140292 - 16140344
Alignment:
Q  108 acccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctc 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||| |||||||||    
T  16140292 acccatttggggttggcctagtgattagtttgggatcttggagcttgctcctc 16140344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 275
Target Start/End: Original strand, 6127562 - 6127615
Alignment:
Q  222 ttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctc 275  Q
    ||||||||| ||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  6127562 ttgctctggttttaaacaggctccccgcaaatggacggtgggattggtcccctc 6127615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 314
Target Start/End: Original strand, 25017620 - 25017685
Alignment:
Q  244 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |    |||||||||||| ||||||||||||    
T  25017620 ccccgcaagtgggcggtgggattggt-tccttggattagtcg----attcttggatcgaataccgagtttt 25017685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 51390193 - 51390160
Alignment:
Q  250 aagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51390193 aagtgggcggtgagattggtcccctcggattagt 51390160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 73)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 102 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 40543118 - 40542909
Alignment:
Q  102 aatgtaacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggt 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  40543118 aatgcaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggt 40543019  T
Q  202 gggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcg 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||    
T  40543018 gggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcg 40542923  T
Q  302 gataccgagttttc 315  Q
    ||||||||||||||    
T  40542922 gataccgagttttc 40542909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7176065 - 7175861
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7176065 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 7175966  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  7175965 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacaggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggatac 7175870  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
     ||||||||    
T  7175869 tgagttttc 7175861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 111 - 315
Target Start/End: Original strand, 22119890 - 22120090
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22119890 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 22119989  T
Q  211 ccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgag 310  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||    
T  22119990 ccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggataccgag 22120085  T
Q  311 ttttc 315  Q
    |||||    
T  22120086 ttttc 22120090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 107 - 314
Target Start/End: Original strand, 7275275 - 7275478
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7275275 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 7275374  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  7275375 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggatac 7275470  T
Q  307 cgagtttt 314  Q
    ||||||||    
T  7275471 cgagtttt 7275478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Original strand, 2751269 - 2751473
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2751269 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 2751368  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  2751369 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggatac 2751464  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  2751465 cgagttttc 2751473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21218036 - 21217832
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21218036 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggct 21217937  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  21217936 aagtccatacagagcttgctctagctttaaacgggccccccacaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagttg----attcttggatcggatac 21217841  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  21217840 cgagttttc 21217832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 110 - 315
Target Start/End: Original strand, 21835152 - 21835353
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21835152 ccatttagggttgacctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 21835251  T
Q  210 tccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccga 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||| |||    
T  21835252 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggatatcga 21835347  T
Q  310 gttttc 315  Q
    ||||||    
T  21835348 gttttc 21835353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 106 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17197154 - 17196950
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  17197154 taacccatttggggtcggcctagtggttggtttgcgatcttggagtttgctcctccataggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgagc 17197055  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    ||||||||||||||||    
T  17197054 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcg----attcttggatcggata 17196959  T
Q  306 ccgagtttt 314  Q
    |||||||||    
T  17196958 ccgagtttt 17196950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 108 - 315
Target Start/End: Original strand, 2103054 - 2103255
Alignment:
Q  108 acccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggcta 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  2103054 acccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggcta 2103153  T
Q  208 agtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatacc 307  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||     |||||||||||    
T  2103154 agtccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcat-----gatcggatacc 2103247  T
Q  308 gagttttc 315  Q
    ||||||||    
T  2103248 gagttttc 2103255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 106 - 314
Target Start/End: Original strand, 18044104 - 18044308
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18044104 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcccaggttcgattccctcttgtgccaatttcggtgggc 18044203  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |    ||||||||||||||||    
T  18044204 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggtggtggaattggtcccctcagattagtcg----attcttggatcggata 18044299  T
Q  306 ccgagtttt 314  Q
    |||||||||    
T  18044300 ccgagtttt 18044308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 104 - 288
Target Start/End: Original strand, 10091183 - 10091367
Alignment:
Q  104 tgtaacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgg 203  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10091183 tgtaacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgg 10091282  T
Q  204 gctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10091283 gctaagtccatacagagcttgctctggctttaaatggggtccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 10091367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Original strand, 11997847 - 11998051
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11997847 aacccatttgtggttgggctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggttggct 11997946  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    |||||||||||||||||    
T  11997947 aagtccatacatagcttgctctggctttaaactgggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcg----attcttggatcggatac 11998042  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  11998043 cgagttttc 11998051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 128 - 315
Target Start/End: Original strand, 22703505 - 22703688
Alignment:
Q  128 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22703505 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacaaagcttgctc 22703604  T
Q  228 tggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||| ||||||||||| |||||||    
T  22703605 tggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attctttgatcggatacccagttttc 22703688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 106 - 314
Target Start/End: Original strand, 27009356 - 27009561
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27009356 taacccatttggggttggcctagtggttggcttcggatcttggagtttgctcatccagaggtctcaggttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 27009455  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgc-aagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggat 304  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |    |||||||||| ||||    
T  27009456 taagtccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccctgcaaagtggacggtgggattggtcccctcaaattagtcg----attcttggattggat 27009551  T
Q  305 accgagtttt 314  Q
    ||||||||||    
T  27009552 accgagtttt 27009561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Original strand, 2344297 - 2344501
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  |||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  2344297 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaagctctcagattcgattccttctggtgccaattttggtgggct 2344396  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |     | ||||||||||||||    
T  2344397 aagtccatacagagctttttttggctttaaacgggacccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcg----gtccttggatcggatac 2344492  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  2344493 cgagttttc 2344501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 110 - 315
Target Start/End: Original strand, 28089817 - 28090021
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28089817 ccatttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgataccctctggtgtcaatttcggtgggctaag 28089916  T
Q  210 tccatac----ggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    |||||||     |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||    
T  28089917 tccatacaaagtgagcttgctctggctttaaatggg-cccccgcaagtgggcgatgagattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggata 28090011  T
Q  306 ccgagttttc 315  Q
    ||||||||||    
T  28090012 ccgagttttc 28090021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 42913716 - 42913512
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||  | | |||||||||||||| |||| |    
T  42913716 aacccattttcggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgatttcatatggtgccaatttcgatgggat 42913617  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||    
T  42913616 aagtccatacggaacttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagttg----attcttagatcggatac 42913521  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  42913520 cgagttttc 42913512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Original strand, 17212051 - 17212232
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  17212051 aacccatttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattctctctggtgccaatttcggtgggct 17212150  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17212151 aagtccatacagagattgctctggcttaaaacgggacccctgcaagtgagtggtgggattggtcccctcggattagtcgatt 17212232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 106 - 315
Target Start/End: Original strand, 27312149 - 27312354
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||| |||||| |||||||||||| || ||    
T  27312149 taacctatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtttcaggttcgattccctctagtgccaatttcgatgtgc 27312248  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
     |||||||||| |||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    ||||||||||||||||    
T  27312249 caagtccatacagagctacctctgactttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcg----attcttggatcggata 27312344  T
Q  306 ccgagttttc 315  Q
    ||||||||||    
T  27312345 ccgagttttc 27312354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 111 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23012707 - 23012507
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 210  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23012707 catttagggttggcccagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtcttaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagt 23012608  T
Q  211 ccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgag 310  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||    ||||||||||||||    
T  23012607 ccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcgtattagtcaattcatt----gatcggataccgag 23012512  T
Q  311 ttttc 315  Q
    |||||    
T  23012511 ttttc 23012507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 151 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 654863 - 654704
Alignment:
Q  151 tttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgca 250  Q
    |||||||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  654863 tttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggg-cccccgca 654765  T
Q  251 agtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||    
T  654764 agtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----gttcttggatcggataccgagttttc 654704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 39145857 - 39145674
Alignment:
Q  105 gtaacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtggg 204  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  39145857 gtaacccatttgaggttgacctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagatgtcttcggttcgattccctgtggtgccaatttcggtggg 39145758  T
Q  205 ctaagtccat-acggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  39145757 ctaagtcaataacagagcttgctctggctttaaacggg-cccctgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgatt 39145674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 149 - 315
Target Start/End: Original strand, 16374034 - 16374196
Alignment:
Q  149 agtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccg 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16374034 agtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacagaatttgctatggctttaaacgggacccccg 16374133  T
Q  249 caagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16374134 caaatggacggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggataccgagttttc 16374196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 107 - 313
Target Start/End: Original strand, 32849589 - 32849791
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||   || ||| |||||| ||  |||||| ||||||||    
T  32849589 aacccatttggggttagcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcgggtttgattccctctagtctcaattttggtgggct 32849688  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    |||||||||||||||||    
T  32849689 aagtccacactgagcttgctctggctttaaatgggactcccataagtgggcagtgggattggtcccctcagattagtcg----attcttggatcggatac 32849784  T
Q  307 cgagttt 313  Q
    |||||||    
T  32849785 cgagttt 32849791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 108 - 288
Target Start/End: Original strand, 19421230 - 19421410
Alignment:
Q  108 acccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggcta 207  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||  | ||||||| |||||||| |||||||    
T  19421230 acccatttggggttgacttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgatttcttctggtgtcaatttcgatgggcta 19421329  T
Q  208 agtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19421330 agtccatacagagcttgctctgactttaaatggggcgcccacaagtgggcggtgggattggtctcctcggattagtcgatt 19421410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Original strand, 31197589 - 31197792
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||| |  | || || ||||||||||||  |    
T  31197589 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcatccagatgtctcaggtttgattcattatg-tgtcaatttcggtggatt 31197687  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |    ||||||||||||||||     
T  31197688 aagtccatacagatcttgctcttgctttaaacggggcccccgcaagtggtcggtgggattggtcccctcagattagtcg----attcttggatcggatat 31197783  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  31197784 cgagttttc 31197792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 149 - 315
Target Start/End: Original strand, 29861711 - 29861872
Alignment:
Q  149 agtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccg 248  Q
    |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29861711 agtttgctcctc-agaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagaacttgctctggctttaaacggggcccccg 29861809  T
Q  249 caagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    |||||| |||||||||||||||||||    
T  29861810 caagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagtcg----attcttagatcggataccgagttttc 29861872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 314
Target Start/End: Original strand, 28950877 - 28951072
Alignment:
Q  118 ggttggcctggtggttggcttgggatcttggagt---ttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccat 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||   |||||||| |||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28950877 ggttggcctagtggttggcttggggtcttggagtagtttgctccttcagaggtctcaggttcgactccctctggtgccaatttcggtgggctaagttcat 28950976  T
Q  215 acggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||      ||||||||||||||||||||||||||    
T  28950977 atagagcttgctctggctttaaacgggtccctcgcaagtcggcggtgggattggtcccctcgaactag----acaattcttggatcggataccgagtttt 28951072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 131 - 315
Target Start/End: Original strand, 31273936 - 31274115
Alignment:
Q  131 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctgg 230  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31273936 gttgacttgggatcttggagtttgctcctccagagctctcaagttcgattccctctggagctaatttcggcgggctaagtccatacagagcttgctctgg 31274035  T
Q  231 ctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31274036 ctttaaacggg-gctccgcaagtgggcagtgagattggtcccctcgaattagtcg----attcttggaccggataccgagttttc 31274115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 181 - 315
Target Start/End: Original strand, 23092168 - 23092298
Alignment:
Q  181 ccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23092168 ccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatggacggtgggattggtcccctcggatt 23092267  T
Q  281 agttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    ||| |    |||| |||||||||||||||||||||    
T  23092268 agtcg----attcatggatcggataccgagttttc 23092298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 43785502 - 43785298
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| |||||| ||| || |||| |||||| |||| ||    
T  43785502 aacccatttggggttgacctaatggttggcttgggatctttgagattgctcctccaaaggtctcaagttcgattcccacttgtgctaatttcagtggact 43785403  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||     |||||||||||||    
T  43785402 aagtccatacagagcttactctggttttaaacggggcctccgcaagtggacggtgagattggtccccttggattagtcgattt----ttggatcggatac 43785307  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||| ||||    
T  43785306 cgagctttc 43785298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 111 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13332622 - 13332475
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13332622 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctcctgaggtctcaggtacgattccctctggagccaatttcggtgggctaagt 13332523  T
Q  211 ccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggt 260  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||    
T  13332522 ccatacagagcttactctggctttaaacagg--ccccgcaagtggccggt 13332475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 110 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9718187 - 9718014
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  9718187 ccatttgaggttggcctagtggttggcctgagatattggagtttgctcctccaaaagtctcaagttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaag 9718088  T
Q  210 tccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  9718087 tccatagagagcttgctctggctttaaacggggccctcacaaatgagcggtggaattggtctcctcgaattagt 9718014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 313
Target Start/End: Original strand, 22638290 - 22638488
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||| |||||||||| | || | ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  22638290 aacccatttggggttggtctagtggttgacttgagatcttagagtttgctctttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggtt 22638389  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||| ||    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |    |||||||||||||||||    
T  22638390 aagttca----gagcttgctctggctttaaacggggcctccgcaagtgggcggtgggattgatctcctcgaattagtcg----attcttggatcggatac 22638481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 31713098 - 31712902
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   | |||  ||||||||||||||        | |    
T  31713098 aacccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctcgagaggtctcaggattgatttcctctggtgccaata-------gat 31713006  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  31713005 aagtccatacaacgcttactctggctttaagcgggaccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggatac 31712910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 314
Target Start/End: Original strand, 3851840 - 3851958
Alignment:
Q  192 caatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaat 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    ||    
T  3851840 caatttcggtgggctaagtccatatagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcg----at 3851935  T
Q  292 tcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  3851936 tcttggatcggataccgagtttt 3851958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7800034 - 7799905
Alignment:
Q  108 acccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggcta 207  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7800034 acccatttggggttgacctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggtta 7799935  T
Q  208 agtccatacggagcttgctctggctttaaa 237  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  7799934 agtccatagagagcttgctatggctttaaa 7799905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 110 - 281
Target Start/End: Original strand, 9683827 - 9683998
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||      || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9683827 ccatttgcggttggcctagtggttgacttgagatctgggagtttgctcctctagaggtctcaggcctaattccctctagtgccaatttcggtgggctaag 9683926  T
Q  210 tccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatta 281  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9683927 tccataccgagcttactctggctttaaacggggtccccacaagtgggcggtaggataggtcccctcggatta 9683998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 108 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23330941 - 23330738
Alignment:
Q  108 acccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggcta 207  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||   | ||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  23330941 acccatttggggttagcctagtggttggcttgggattttagagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgactccctccggtgccaatttcggtgggc-a 23330843  T
Q  208 agtccatacggagctt-gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  |||||    | ||| ||||||||||||||    
T  23330842 agtccatacagagctttgctctggcttaaaacgggacctccgcaagtgggcggtaagattggtcccctcaaattag----tcaatccttggatcggatac 23330747  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  23330746 cgagttttc 23330738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 314
Target Start/End: Original strand, 27704004 - 27704202
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 210  Q
    ||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27704004 catttggagttggtccagtggttggcttgagatcttgaagtttgctcctacagaggtctcaggttcgatttcctttggtgccaatttcggtgggctaagt 27704103  T
Q  211 ccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgag 310  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| |    ||||||| ||| |||||||||    
T  27704104 ccatagagagcttgctttggctttaaa-tggacccccgcaagtgggtggtgtgattgatcccctcagattagtcg----attcttgaatcagataccgag 27704198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 174 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41907649 - 41907514
Alignment:
Q  174 ttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccc 273  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41907649 ttcgattctctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagaggttgctctggctttaaacgtggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccc 41907550  T
Q  274 tcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
     | ||||||| |    |||||||||||||||||||||||||    
T  41907549 -cagattagtcg----attcttggatcggataccgagtttt 41907514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 283
Target Start/End: Original strand, 28646967 - 28647143
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||| |||   | ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  28646967 aacctatttggggttggcctagtgattgacttgggatcttggagtgtgcttctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc- 28647065  T
Q  207 aagtccatacggag-cttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    ||||| |||| |||  ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  28647066 aagtcaatacagagttttgctctggcttataacggggcccccacaagtgggcggtgggattggttccctcgaattagt 28647143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 141 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 36772471 - 36772303
Alignment:
Q  141 gatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||  || |||  || ||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36772471 gatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggtttgatttccccta-tgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacgg 36772373  T
Q  241 gacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    | ||||||  |||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |    |||||| ||||||||||||||||||    
T  36772372 ggcccccgggagtgggcggtggaattagtcctctcggattagtcg----attctttgatcggataccgagtttt 36772303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 237
Target Start/End: Original strand, 42814867 - 42814992
Alignment:
Q  112 atttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtc 211  Q
    |||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42814867 atttggagttggcttagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctcttgaagtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtc 42814966  T
Q  212 catacggagcttgctctggctttaaa 237  Q
    |||||  ||||||||||| |||||||    
T  42814967 catacaaagcttgctctgactttaaa 42814992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21574305 - 21574101
Alignment:
Q  108 acccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgat-cccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||   | ||| ||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||     
T  21574305 acccatttggggttggcctagtggttggtttgggattttggagtgtgctcctctcaaggtcacaggttcgattcccctttggtgccaacttcggtgggc- 21574207  T
Q  207 aagtccatacggagctt-gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    |||||||||| |||||| || | |||||  |||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |     | |||||||||||||    
T  21574206 aagtccatacagagctttgcccaggcttagaacggggcccccacaagtaggcggtgagattggtcccctcggattagtcg----gtccttggatcggata 21574111  T
Q  306 ccgagttttc 315  Q
    ||||||||||    
T  21574110 ccgagttttc 21574101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 283
Target Start/End: Original strand, 21373789 - 21373884
Alignment:
Q  188 gtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||    
T  21373789 gtgccaatttcggtgggctaagtctatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgagattggtcctcacggattagt 21373884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 206
Target Start/End: Original strand, 22299863 - 22299946
Alignment:
Q  123 gcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22299863 gcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 22299946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 314
Target Start/End: Original strand, 25333417 - 25333603
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||  ||||||||| |||| |    
T  25333417 aacccatttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgataccctctggcaccaatttcgttgggtt 25333516  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    ||                ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||| ||    
T  25333517 aa----------------ctctgactttaaacaggccccccgcaagtgggcagtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcgga-ac 25333595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 128 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14199848 - 14199713
Alignment:
Q  128 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctc 227  Q
    |||||||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  14199848 gtggttgatttggaatcttggagtttcctcctccagaggtctcaggttcgattccctctaatgccaattttggtgggctaagtctatatagagcttgctc 14199749  T
Q  228 tggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtggga 264  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  14199748 tgcctttaaacggg-gccccgcaagtgggtggtggga 14199713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 137 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 22643515 - 22643371
Alignment:
Q  137 ttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaa 236  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | ||| |||| |  ||||||  |||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22643515 ttgggatcttgaagtttactccactagaggtcttatgttcgatttcctctgatgtcaatttcggtaggctaagtccatacagagcttgctctgactttaa 22643416  T
Q  237 acgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatta 281  Q
    ||||  ||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  22643415 acggagccctcgcaagtggccggtgtgattagtcccctcggatta 22643371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 314
Target Start/End: Original strand, 22696317 - 22696522
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||   | ||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  22696317 taactcattaggggttggcctagtggttgatttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtggg- 22696415  T
Q  206 taagtccatacggagc-ttgctctggctttaaacgggacccc--cgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcgg 302  Q
      | ||||||| |||| ||||||||||||  |||| | ||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |     | ||||||||||    
T  22696416 -gactccatacagagctttgctctggcttagaacgaggcccccgcgcaagtaggcggcgggattggtcctctcggattagtcg----gtccttggatcgg 22696510  T
Q  303 ataccgagtttt 314  Q
    ||||||||||||    
T  22696511 ataccgagtttt 22696522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 171
Target Start/End: Original strand, 23854394 - 23854458
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctca 171  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23854394 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctca 23854458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 186
Target Start/End: Original strand, 21370595 - 21370674
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctct 186  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||| ||||||    
T  21370595 aacccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttactccttcagatgtctcaggttcgattccctct 21370674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8435895 - 8435741
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    |  ||| |  ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  8435895 ccatttggggttggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctttgaagatcttaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggc-aag 8435797  T
Q  210 tccatacggagc-ttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggatt 266  Q
    |||||||  ||| ||| | |||||||||   || ||||||||||||||| ||||||||    
T  8435796 tccatacaaagctttgttttggctttaa--tgggcccccgcaagtgggcagtgggatt 8435741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33137951 - 33137825
Alignment:
Q  183 ctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattag 282  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  33137951 ctctggtgtcaattttagtgggctaagtccatacagagctcgctctagctttaaatggg-gccctgcaagtgggcggtgaaattggtcccctcgaattag 33137853  T
Q  283 ttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    | |    |||||| ||||||||| ||||||||    
T  33137852 tcg----attcttagatcggatatcgagtttt 33137825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 206
Target Start/End: Original strand, 40332097 - 40332196
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | ||||||  ||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  40332097 aacccatttggagttggtctagtggttggcttgaaatcttggagtttgctcctctaaaggtctcaggttcgatttcctctggtgtcaatttcgatgggct 40332196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 169
Target Start/End: Original strand, 28003838 - 28003896
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtct 169  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28003838 catttggggttgatctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtct 28003896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 210 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8943502 - 8943409
Alignment:
Q  210 tccatacggagcttgctctggctttaaacgggaccccc-gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |    |||||||||||||||||    
T  8943502 tccatacagagcttggtctggttttaaacgggcccccccgcaagtgggcggtgtgattggtccccttgaattagtcg----attcttggatcggatac 8943409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12211735 - 12211625
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |  |||||  || |||  |||||||||||||||||| ||| | |||    
T  12211735 ccatttggggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtgtgctcctctcaagatctcaggtttgatttcctctggtgccaatttcgatggac-aag 12211637  T
Q  210 tccatacggagc 221  Q
    ||||||| ||||    
T  12211636 tccatacagagc 12211625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 38864650 - 38864446
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| ||||||| |  |||||| ||||||  || ||| || | | |||||||||||||||| |    
T  38864650 taactcatttggggttgacctagtggttgacttgagatctttgagtttgtttttccagaagtctcacgtttgattccttttagtgccaatttcggtggac 38864551  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
     ||||  |    |||||||||||| |||||||||| | ||| |||| ||| |||||  |||||||| |||| |||||    | |||||||||||||||||    
T  38864550 caagtgtaccgcgagcttgctctgactttaaacggaatccctgcaaatggacggtgatattggtcctctcgaattag----tcaattcttggatcggata 38864455  T
Q  306 ccgagtttt 314  Q
     ||| ||||    
T  38864454 tcgaatttt 38864446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1766286 - 1766171
Alignment:
Q  167 tctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagc-ttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggat 265  Q
    |||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||| || | ||||  ||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||||    
T  1766286 tctcaagttcgattcccttttgtgtcaatttcggtggg-taagtccatacagaactttgccttggcttagaacggg-gccccacaagtgggcggttggat 1766189  T
Q  266 tggtcccctcggattagt 283  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1766188 tggtcccctcggattagt 1766171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 240
Target Start/End: Original strand, 6491679 - 6491738
Alignment:
Q  181 ccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgg 240  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6491679 ccctctggtgtcaatttcgatgggctaaattcatacagagcttgctttggctttaaacgg 6491738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 157
Target Start/End: Original strand, 577681 - 577727
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctc 157  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  577681 catttggggttggcctagtggtttgcttgggatcttagagtttgctc 577727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 25102895 - 25102809
Alignment:
Q  223 tgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||| |    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  25102895 tgctctggctttaaacagggcccccgcaagt-gacggtgggattggttccttcggattagtcg----attcttggatcagataccgattttt 25102809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 283
Target Start/End: Original strand, 35476418 - 35476515
Alignment:
Q  186 tggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagctt-gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  35476418 tggtgccaattttggtggg-taagttcatacagagctttgctctggcttagaacgggacccctgcaaatgaccggtggaattggtctccttggattagt 35476515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 279
Target Start/End: Original strand, 40332193 - 40332243
Alignment:
Q  229 ggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggat 279  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40332193 ggctttagacggggcctccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggat 40332243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11910081 - 11909981
Alignment:
Q  183 ctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagctt-gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatta 281  Q
    |||||||| |||||| ||||| | ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  11910081 ctctggtgtcaattttggtggtc-aagtccatacgaagctttgttctagctttaaacgaggcccctacaagtggacggtgggattggtcctctcgaatta 11909983  T
Q  282 gt 283  Q
    ||    
T  11909982 gt 11909981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23636687 - 23636592
Alignment:
Q  188 gtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagctt-gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||||||||| ||| ||| | ||||| | |||||||||||| |  |||||||||||    
T  23636687 gtgccaatttcggtgggtta-gtccatatagagctttgctctggctttaaatggggccctcacaagtagacggtgggattggacttctcggattagt 23636592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22264705 - 22264622
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtg 190  Q
    |||||||||||||||||||    |||||| |||| |||||||||||||||||||   | ||||||  |||||| ||||||||||    
T  22264705 aacccatttggggttggccgaagggttggtttggaatcttggagtttgctcctctcaaggtctcagattcgattccctctggtg 22264622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3951190 - 3951140
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggctt-gggatcttggagtttgctcctc 160  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3951190 catttggggttggtctagtggttggcttggggatcttggagtgtgctcctc 3951140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 33137998 - 33137949
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctc 157  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||    
T  33137998 aacccatttggggttggcctagt-gttggcttgggaatttggagtttgctc 33137949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3950988 - 3950895
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttg-ggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgg 203  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||  ||||||||   ||||||||  |||||| |||| |||||| ||||| |||||    
T  3950988 catttggggttggtctagtggttggcttgagaatcttggagcgtgctcctctcaatgtctcatgttcgattccctttggtgctaattttggtgg 3950895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 281
Target Start/End: Original strand, 41443318 - 41443355
Alignment:
Q  244 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatta 281  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41443318 ccccgcaagtgggcagtgggattggtcccctcagatta 41443355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 158; Significance: 1e-83; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 105 - 315
Target Start/End: Original strand, 4718641 - 4718847
Alignment:
Q  105 gtaacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtggg 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4718641 gtaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggg 4718740  T
Q  205 ctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggat 304  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||    
T  4718741 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggat 4718836  T
Q  305 accgagttttc 315  Q
    |||||||||||    
T  4718837 accgagttttc 4718847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 34237858 - 34237654
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34237858 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 34237759  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  34237758 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggatac 34237663  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  34237662 cgagttttc 34237654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3734826 - 3734622
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3734826 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 3734727  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  3734726 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcagtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggatac 3734631  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  3734630 cgagttttc 3734622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Original strand, 39349254 - 39349458
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39349254 aacccatttggggttggcccagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 39349353  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  39349354 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcg----attcttggatcggatac 39349449  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    | |||||||    
T  39349450 caagttttc 39349458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 106 - 315
Target Start/End: Original strand, 20305905 - 20306110
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  20305905 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtctcagtttcgattccttctggtgccaatttcgatgggc 20306004  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    || |||||||||||||    
T  20306005 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcg----atccttggatcggata 20306100  T
Q  306 ccgagttttc 315  Q
    ||||||||||    
T  20306101 ccgagttttc 20306110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 106 - 315
Target Start/End: Original strand, 21092538 - 21092743
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  21092538 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtctcagtttcgattccttctggtgccaatttcgatgggc 21092637  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    || |||||||||||||    
T  21092638 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcg----atccttggatcggata 21092733  T
Q  306 ccgagttttc 315  Q
    ||||||||||    
T  21092734 ccgagttttc 21092743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 106 - 313
Target Start/End: Original strand, 28193471 - 28193674
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  28193471 taacctatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggt 28193570  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||    
T  28193571 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccctacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggata 28193666  T
Q  306 ccgagttt 313  Q
    ||||||||    
T  28193667 ccgagttt 28193674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Original strand, 2618184 - 2618388
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2618184 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttgggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggct 2618283  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||| |    
T  2618284 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggattc 2618379  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  2618380 cgagttttc 2618388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 106 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 42643322 - 42643118
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  42643322 taacccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctagtgccaatttcggtgggc 42643223  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||    
T  42643222 taagtccatacagagcttgctctgtcttgaaacgggggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgcattagttg----attcttggatcggata 42643127  T
Q  306 ccgagtttt 314  Q
    |||||||||    
T  42643126 ccgagtttt 42643118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 314
Target Start/End: Original strand, 21603241 - 21603431
Alignment:
Q  120 ttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacgga 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  21603241 ttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtgggctaagcccatacaga 21603340  T
Q  220 gcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||    
T  21603341 gcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggataccgagtttt 21603431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 108 - 315
Target Start/End: Original strand, 19471608 - 19471812
Alignment:
Q  108 acccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggcta 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19471608 acccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagcta 19471707  T
Q  208 agtccatacggagcttgctctggctttaaac-gggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    || ||||||||||||||    
T  19471708 agtccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcgaattagtcg----atacttggatcggatac 19471803  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  19471804 cgagttttc 19471812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 108 - 315
Target Start/End: Original strand, 19542532 - 19542736
Alignment:
Q  108 acccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggcta 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19542532 acccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagcta 19542631  T
Q  208 agtccatacggagcttgctctggctttaaac-gggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    || ||||||||||||||    
T  19542632 agtccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcgaattagtcg----atacttggatcggatac 19542727  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  19542728 cgagttttc 19542736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 108 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19590164 - 19589960
Alignment:
Q  108 acccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggcta 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19590164 acccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagcta 19590065  T
Q  208 agtccatacggagcttgctctggctttaaac-gggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    || ||||||||||||||    
T  19590064 agtccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcgaattagtcg----atacttggatcggatac 19589969  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  19589968 cgagttttc 19589960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 110 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15259606 - 15259407
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15259606 ccatttggggttggtctagtggttggtttgggatcttggattttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 15259507  T
Q  210 tccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccga 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |    ||||||||||||||| ||||    
T  15259506 tccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgtaattggtcccctcgaattagtcg----attcttggatcggatgccga 15259411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Original strand, 32879277 - 32879481
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32879277 aacccatttggggttggtctagtggttgacttgggatcttcgagtttggtcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 32879376  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||| ||||||    
T  32879377 aagttcatacagagcttgctctgacattaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggattggatac 32879472  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  32879473 cgagttttc 32879481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 108 - 315
Target Start/End: Original strand, 42328004 - 42328206
Alignment:
Q  108 acccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggcta 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  42328004 acccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagttt-ctcctccagaggtgtcaggtttgattccctctgttgccaatttcggtgggcta 42328102  T
Q  208 agtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatacc 307  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |    ||||||||||||||||||    
T  42328103 agtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccacaagtggacgatgggattggtcccctcgaattagtcg----attcttggatcggatacc 42328198  T
Q  308 gagttttc 315  Q
    ||||||||    
T  42328199 gagttttc 42328206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 132 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8765704 - 8765525
Alignment:
Q  132 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggc 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8765704 ttggcttgagatcttggagtttgctcccccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgatgggctaagtccatacagagcttgctctggc 8765605  T
Q  232 tttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8765604 tttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggataccgagttttc 8765525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 130 - 315
Target Start/End: Original strand, 14632975 - 14633156
Alignment:
Q  130 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14632975 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtctatacagagcttgctctg 14633074  T
Q  230 gctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    ||||| |||||  |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    |||||||||||||||||| |||||||    
T  14633075 gctttgaacggagcgtccacaagtgggcggtgggattggtccccttggattagtcg----attcttggatcggataccaagttttc 14633156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 107 - 268
Target Start/End: Original strand, 18532105 - 18532266
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| | || |||||||||||||||    
T  18532105 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctcagatgtcaatttcggtgggct 18532204  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattgg 268  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  18532205 aagtccatacagaacttgctctggatttaaacggggcccctgcaagtgggcggtgagattgg 18532266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 112 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 264597 - 264400
Alignment:
Q  112 atttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtc 211  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  264597 atttggcgttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtc 264498  T
Q  212 catacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagt 311  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |    |||||||||||||||||||| |    
T  264497 tatacatagcttgctctggctttaaacggg-cccccacaaatgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcg----attcttggatcggataccgaat 264403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 112 - 314
Target Start/End: Original strand, 651324 - 651521
Alignment:
Q  112 atttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtc 211  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  651324 atttggcgttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtc 651423  T
Q  212 catacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagt 311  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |    |||||||||||||||||||| |    
T  651424 tatacatagcttgctctggctttaaacggg-cccccacaaatgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcg----attcttggatcggataccgaat 651518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 112 - 314
Target Start/End: Original strand, 837059 - 837256
Alignment:
Q  112 atttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtc 211  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  837059 atttggcgttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtc 837158  T
Q  212 catacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagt 311  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |    |||||||||||||||||||| |    
T  837159 tatacatagcttgctctggctttaaacggg-cccccacaaatgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcg----attcttggatcggataccgaat 837253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 117 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4698916 - 4698722
Alignment:
Q  117 gggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatac 216  Q
    |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  4698916 gggttggcccagcggttggtttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatga 4698817  T
Q  217 ggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
     || ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||||| |||||||||||||||    
T  4698816 agaacttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcatggattggataccgagttttc 4698722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 110 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27746535 - 27746357
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27746535 ccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaag 27746436  T
Q  210 tccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagt-gggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  27746435 tccatacagagcttgctctggctttaaaaggg-gccccacaagtggggcgatggaattagtcccctcggattagtcgatt 27746357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 132 - 314
Target Start/End: Original strand, 20469940 - 20470117
Alignment:
Q  132 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| | |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20469940 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagagccaatttagatgggctaagtccatacagagcttgctctggc 20470039  T
Q  232 tttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||     |||||||||||||||||||||    
T  20470040 tttaaacagagcccccgcaagtgggcggtgggattggttcc-tcggattagtcgattt----ttggatcggataccgagtttt 20470117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 7558146 - 7557973
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  7558146 aacccatttggggttggcctagtagttagcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcagattcgatttcctctggtgccaattttggtgggct 7558047  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    ||||||       ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7558046 aagtcc-------gcttgttctggctttaaac-ggacccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgatt 7557973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 128 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 34610869 - 34610686
Alignment:
Q  128 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctc 227  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  34610869 gtggttggcttaggattttggagtttgttcatccagatgtctgaggttcgattccctctgatgccaatttcggtggtctaagtctatacagagcttgctc 34610770  T
Q  228 tggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  34610769 tggctttaaacgagcccctcgcaagtgggcggtagaattggtcccctcgaattagtcg----attcttggatcggataccgagttttc 34610686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Original strand, 28088284 - 28088465
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||| |||| ||||| ||||||||||||| |    
T  28088284 aacccatctggggttggcttagtggttgacttgggatcttggagtttgttcatccagaggtctcagattcgattccctttggtgtcaatttcggtgggtt 28088383  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  28088384 aagtccatacagagcttgctctgactttaaatggggcctccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcagaatagtcgatt 28088465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 109 - 288
Target Start/End: Original strand, 28964033 - 28964211
Alignment:
Q  109 cccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaa 208  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||||||||||||   | || |||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28964033 cccatttggggttggtctagtggttggtttgagatcttagagtttgctcctcttaaggtttcatgttcgattccatctggtgccaatttcggtgggctaa 28964132  T
Q  209 gtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28964133 gtccatacggagctatgtctggctttaaacggggcccccgcaagtgggc-gtgggattggtcccctcgaattagtcgatt 28964211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 174 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6953143 - 6953008
Alignment:
Q  174 ttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccc 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  6953143 ttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagttggcggtgggattggt-ccc 6953045  T
Q  274 tcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    |||||||||| |    |||||||||||| ||||||||||||    
T  6953044 tcggattagtcg----attcttggatcgaataccgagtttt 6953008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Original strand, 2166695 - 2166875
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtg--gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtggg 204  Q
    |||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||  ||||||||||| || ||    
T  2166695 aacccatttggggttggcccagtgcagttggtttgggatcttggagtttgcttctccaaaggtctcaggttcgattccctc--gtgccaatttcagtagg 2166792  T
Q  205 ctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2166793 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaataaga-ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgatt 2166875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 283
Target Start/End: Original strand, 24018380 - 24018557
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||| |||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |  ||||||  |||||  || ||||||| |||||||    
T  24018380 aacctatttggggttgatctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctgaggttcgatttcctctaatgtcaatttcagtgggct 24018479  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggac-ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  24018480 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggcctccccacaagtgggcggtgagattggtccccttgaattagt 24018557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 174 - 314
Target Start/End: Original strand, 10292120 - 10292255
Alignment:
Q  174 ttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccc 273  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  10292120 ttcgattccctctgatgccaatttcagtgggctgagtccat-cagagattgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtccct 10292218  T
Q  274 tcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    ||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||    
T  10292219 tcggattagttg----attcttggatcgaataccgagtttt 10292255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 272
Target Start/End: Original strand, 21667551 - 21667713
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  | |||  ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21667551 ccatttgaggttggtctagtggttggcttggaatcttggaggttgctcctccaaagatttcaggttcgatttcctttggtgctaatttcggtgggctaag 21667650  T
Q  210 tccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtccc 272  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21667651 tccatacagagcttgctctgcctttaaacggagcatccgcaagtgggcggtggaattggtccc 21667713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 174 - 314
Target Start/End: Original strand, 25248414 - 25248547
Alignment:
Q  174 ttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccc 273  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25248414 ttcgattccctctggtgtcaatttcggtaggctaagtc-atacagagtttgctctggctttaaacggg-ccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccc 25248511  T
Q  274 tcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    |||||||||| ||||     || ||||||||||||||||||    
T  25248512 tcggattagtcgatt-----tttgatcggataccgagtttt 25248547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 26169051 - 26168871
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||  || ||| ||  ||| |||||||||||||||||     
T  26169051 aacccatttagggttggcctagtggtttgcttgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggtttgattcctcctgatgccaatttcggtgggc- 26168953  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||| | | ||| |||||||||| | || |||||||||||||||| |||| ||||    
T  26168952 aagttcatacagagcttgttctggctttaaatgagcccctcgcaagtgggggatgagattggtcccctcggagtagtcgatt 26168871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 222 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2639499 - 2639410
Alignment:
Q  222 ttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2639499 ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggataccgagttttc 2639410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 314
Target Start/End: Original strand, 18128512 - 18128714
Alignment:
Q  108 acccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggcta 207  Q
    ||||||||||| |||||    |||||| |||||||||||| ||| |||||||    | |||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  18128512 acccatttgggattggctcattggttgacttgggatcttgaagtgtgctcctttcaaggtcttagattcgattctctctggtgccaatttcggtgggcga 18128611  T
Q  208 agtccatacggagctt-gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    | ||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |     ||||||||||| ||||    
T  18128612 a-tccataaagagctttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcctctcagattagtcg----gttcttggatcgaatac 18128706  T
Q  307 cgagtttt 314  Q
    ||||||||    
T  18128707 cgagtttt 18128714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 174 - 269
Target Start/End: Original strand, 24999299 - 24999394
Alignment:
Q  174 ttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggt 269  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24999299 ttcgattccctctgatgccaattttgatgggctaagttcatatagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt 24999394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 36848949 - 36848785
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||| | ||||||||||||||||   | || | |  ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36848949 ccatttggggttggcatagtggttgacttgggtttttggagtttgctcctctcaaggttttagattccatttcctctggtgccaatttcggtgggctaag 36848850  T
Q  210 tccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctc 275  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| | |  | || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  36848849 tccatacggagtttgctcgggctttaaatgag-gcaccacaagtgggcggtgggattagtcccctc 36848785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 34639406 - 34639237
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34639406 ccatttggggttagtctagtggttggcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggctcgat-ccctctggtgccaatttcggtggg-taag 34639309  T
Q  210 tccatacggagc-ttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatta 281  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  |||||| || | |||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||    
T  34639308 tccatacagagctttgctctggcttagaacggg-cctctgcaagtggacggtaggattggtcccttcgaatta 34639237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 128 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9047460 - 9047316
Alignment:
Q  128 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctc 227  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | || | || || ||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| |||    
T  9047460 gtggttggtttgagatcttggagtttgctcctccaaaggttttaagtttgattccctctaatgccaattttggtggactaagtccatacaaagcttactc 9047361  T
Q  228 tggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtccc 272  Q
    || |||||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||||||    
T  9047360 tgactttaaacggaacccccgcatgtggacagtggaattggtccc 9047316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3403706 - 3403529
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| ||   | |||| |  |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  3403706 taacccatttgaggttggccttggggttggcctgagatcttggagtttgctcatctcaaggtcttatgttcgattccatctggtgccaatttcggtgggc 3403607  T
Q  206 taagtccatacggagc-ttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
     ||||||||||  | | ||| | |||||||||| ||| ||| || |||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3403606 -aagtccatacaaaactttgttttggctttaaatggggccctcgtaagtgggcggtgaggttggtcccctcgaattagt 3403529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 283
Target Start/End: Original strand, 28908823 - 28908997
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctcc--agatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaa 208  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| |||| || ||||||||||||||||   || ||| |||  ||| || |||||||||| ||||| | |||||| ||    
T  28908823 catttggagttggtctagtggttggtttggaattttggagtttgctcctctcaaggtgtttcaggttcaattccctctggtgtcaattacagtgggc-aa 28908921  T
Q  209 gtccatacggagctt-gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||    
T  28908922 gtccatacagagctttgttctggctttaaacggggctcccgcaagtgggcgatgtgattgatcccctcagattagt 28908997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34694776 - 34694602
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||   | |||| |  |||||| || |||||||||||||||||||||| ||     
T  34694776 ccatttggggttggtctagtggttgacttgtgatcttggagtttgctcctctcaaggtcttaggttcgattccatctggtgccaatttcggtgggc-aaa 34694678  T
Q  210 tccatacggagc-ttgctctggctttaaacggga-cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    | |||||  ||| |||||| |||||  ||||| | ||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  34694677 ttcatacaaagctttgctccggcttagaacggaatccccctctagtggacggtgggattggtcccctcagattagt 34694602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 288
Target Start/End: Original strand, 1219414 - 1219528
Alignment:
Q  174 ttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccc 273  Q
    |||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||     
T  1219414 ttcgattccctctgatatcaatttcagtgggctaagtccatacagaatttgttctggctttaaacggggcccccataagtgggcggtaggatcggtccct 1219513  T
Q  274 tcggattagttgatt 288  Q
    |||||||||| ||||    
T  1219514 tcggattagtcgatt 1219528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 226
Target Start/End: Original strand, 8042655 - 8042764
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||       |||||||||||| ||||||||| |    
T  8042655 ccatttggggttgacctagtgcttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtctcaggttcga-------tggtgccaattttggtgggctatg 8042747  T
Q  210 tccatacggagcttgct 226  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  8042748 tccatacagagtttgct 8042764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8387644 - 8387539
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctc-cagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaa 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| ||| |||  ||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8387644 ccatttggggttggcctagtggttgtcttgagatcttagagtttgcttctctcag-ggtctcaagttcgatttcctctggtgccaattttggtgggc-aa 8387547  T
Q  209 gtccatac 216  Q
    ||||||||    
T  8387546 gtccatac 8387539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 205
Target Start/End: Original strand, 41070767 - 41070857
Alignment:
Q  115 tggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||   | ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  41070767 tggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtgtgctactctcaaggtctcaagttcgattccctttggtgtcaatttcggtgggc 41070857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 283
Target Start/End: Original strand, 12312874 - 12313019
Alignment:
Q  137 ttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagctt-gctctggcttta 235  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |  |||||| ||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||| ||| ||  ||||| | | ||||||||    
T  12312874 ttgggatcttggagtttgctcttctcaaaatctcaagttcgatttcctctggtgccaattttgatgggc-aaggccacacaaagctttgatttggcttta 12312972  T
Q  236 aacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12312973 aatggg-cccccacaagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagt 12313019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 283
Target Start/End: Original strand, 13749133 - 13749230
Alignment:
Q  187 ggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagctt-gctctggctttaaacgggacccc-cgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  13749133 ggtgccaattttggtgggc-aagttcatacaaagctttgctctggcttagaacggggccccccgcaagtgggcagtggaattggtcccctcggattagt 13749230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 205
Target Start/End: Original strand, 3794792 - 3794887
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||   | ||||||  |||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  3794792 ccatttgtggttgacctaatggttggcttaggatcttgaagtttgctcctctcaaggtctcatgttcggttccctctggtgccaatttcggcgggc 3794887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 22200758 - 22200589
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 210  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||   | ||||||  |||||| |||||| ||||||||||| | |||  ||||    
T  22200758 catttgaggttggcctg-tggttggtttgggatcttggagtttacttctctcaaagtctcaggttcgattccctctagtgccaatttc-gagggaaaagt 22200661  T
Q  211 ccatacggagc-ttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatta 281  Q
     ||||| |||| ||||||||||||  |||||  |||| |||||| | | || |||||||| |||||| ||||    
T  22200660 tcatacagagctttgctctggcttagaacggagcccctgcaagtagacagtaggattggtaccctcgaatta 22200589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 43817835 - 43817784
Alignment:
Q  224 gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctc 275  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43817835 gctctagctttaaacaggacccccgcaagtgggcggtggaattggtctcctc 43817784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 275
Target Start/End: Original strand, 20505587 - 20505718
Alignment:
Q  135 gcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagctt-gctctggctt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||        |||| ||||||  | ||||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||| | | ||||||    
T  20505587 gcttgggatcttggagtttgctcctc--------tcaaattcgatttcttctggtgccaatttcagcgggc-aagtccatacaaagctttgttttggctt 20505677  T
Q  234 taaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctc 275  Q
    ||||  || | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20505678 taaatagggcacc-gcaagtgggcggtgggattggtcccctc 20505718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8387523 - 8387482
Alignment:
Q  246 ccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgat 287  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8387523 ccgcaagtggacggtgggattgatctcctcggattagttgat 8387482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 157; Significance: 5e-83; HSPs: 38)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 106 - 315
Target Start/End: Original strand, 34147339 - 34147544
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34147339 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccagaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 34147438  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||    
T  34147439 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggata 34147534  T
Q  306 ccgagttttc 315  Q
    ||||||||||    
T  34147535 ccgagttttc 34147544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 106 - 315
Target Start/End: Original strand, 34159955 - 34160160
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34159955 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccagaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 34160054  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||    
T  34160055 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggata 34160150  T
Q  306 ccgagttttc 315  Q
    ||||||||||    
T  34160151 ccgagttttc 34160160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15360301 - 15360097
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15360301 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 15360202  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  15360201 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggatac 15360106  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  15360105 cgagttttc 15360097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 107 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 654349 - 654146
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  654349 aacccatttgggtttggcctagtggctgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 654250  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||    
T  654249 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatta----ttggatcggatac 654154  T
Q  307 cgagtttt 314  Q
    ||||||||    
T  654153 cgagtttt 654146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 107 - 313
Target Start/End: Original strand, 9238969 - 9239171
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  9238969 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggtt 9239068  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  9239069 aagtccatatagagcttgctttggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggatac 9239164  T
Q  307 cgagttt 313  Q
    |||||||    
T  9239165 cgagttt 9239171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 113 - 314
Target Start/End: Original strand, 11448871 - 11449068
Alignment:
Q  113 tttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11448871 tttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 11448970  T
Q  213 atacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtt 312  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||| |||||||| ||||||    
T  11448971 atacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttgaatcggatatcgagtt 11449066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 106 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3222838 - 3222635
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3222838 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttgcagtttgctcctc-agaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 3222740  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||    
T  3222739 taagtccatacagagcttgctctgtctttaaacggg-gccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggata 3222645  T
Q  306 ccgagttttc 315  Q
    ||||||||||    
T  3222644 ccgagttttc 3222635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 109 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21982521 - 21982320
Alignment:
Q  109 cccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaa 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  |||||| |||  ||||||||||||| |||||||||    
T  21982521 cccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttgaagtttgctcctccagaggtctgaggttcgattcccgatggtgccaatttcagtgggctaa 21982422  T
Q  209 gtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccg 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    |||||||||||||||||||    
T  21982421 gtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggattagtcg----attcttggatcggataccg 21982327  T
Q  309 agttttc 315  Q
    |||||||    
T  21982326 agttttc 21982320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 107 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 5360274 - 5360071
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||  |||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  5360274 aacccatttggagttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgcttctcaagaggtctcaggttcgattccctctaatgccaatttcggtgggct 5360175  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    |||||| ||||||||||    
T  5360174 aagtccatacagagcttgctctgactttaaacggaacccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcg----attcttagatcggatac 5360079  T
Q  307 cgagtttt 314  Q
    ||||||||    
T  5360078 cgagtttt 5360071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 105 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21148715 - 21148510
Alignment:
Q  105 gtaacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtggg 204  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  21148715 gtaacccatttggagttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctttttcagaggtctcaagttcgattccctctagtgccaatttcgatggg 21148616  T
Q  205 ctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggat 304  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||| |||||||    
T  21148615 ctaagtccatacagagcttgctctgactttaaacggg-gccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttgaatcggat 21148521  T
Q  305 accgagttttc 315  Q
    |||||||||||    
T  21148520 accgagttttc 21148510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17081257 - 17081053
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||| |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  17081257 aacccatttgaggttagtctagtggttggcttaggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaagtttgattccctctggtgtcaatttcggtgggct 17081158  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||     ||||||||||| ||||    
T  17081157 aagtccatacagagcttgctctgactttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaataagttg----tttcttggatcgaatac 17081062  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  17081061 cgagttttc 17081053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 110 - 315
Target Start/End: Original strand, 1344934 - 1345133
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1344934 ccatttggggttgacctagtggttgg--tgggatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaag 1345031  T
Q  210 tccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccga 309  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |    ||||||||||||||||||||    
T  1345032 tccatacaaagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtggacggtgggattggtccccttggattagtcg----attcttggatcggataccga 1345127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 105 - 314
Target Start/End: Original strand, 28672059 - 28672264
Alignment:
Q  105 gtaacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtggg 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |  |||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  28672059 gtaacccatttggggttggcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcctctagaggtcttaggttcgattccctctggtgtcaattttggtggg 28672158  T
Q  205 ctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggat 304  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| |||    
T  28672159 ctaagtccatacagagcttgttttggctttaaacgggcccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcagat 28672254  T
Q  305 accgagtttt 314  Q
    ||||||||||    
T  28672255 accgagtttt 28672264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 315
Target Start/End: Original strand, 9843935 - 9844136
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||   ||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  9843935 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgacttcctctggtgtcaattttggtgggttaag 9844034  T
Q  210 tccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccga 309  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    |||||||||||||||| |||    
T  9844035 tccatacagagcttgttctggctttaaacggggccccctcaagtgggcggtgagattggtcccttcggattagtcg----attcttggatcggatatcga 9844130  T
Q  310 gttttc 315  Q
    ||||||    
T  9844131 gttttc 9844136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 106 - 315
Target Start/End: Original strand, 11007158 - 11007363
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| | ||||| |  ||||||||||||||    
T  11007158 taacccatttggggttgatctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattcactctgctctcaatttcggtgggc 11007257  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    |||||| |||||||||    
T  11007258 taagtccatacaaagcttgctctagctttaagcggggcccccgcaagtgggcggtgggattggccccctcggattagtcg----attctttgatcggata 11007353  T
Q  306 ccgagttttc 315  Q
    || |||||||    
T  11007354 cctagttttc 11007363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 153 - 290
Target Start/End: Original strand, 12390465 - 12390602
Alignment:
Q  153 tgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaag 252  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  12390465 tgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaag 12390564  T
Q  253 tgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12390565 tgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattaa 12390602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 107 - 241
Target Start/End: Original strand, 12591631 - 12591765
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  12591631 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctcgtgccaatttcagtgggct 12591730  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacggg 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12591731 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggg 12591765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 115 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9690833 - 9690638
Alignment:
Q  115 tggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccat 214  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||| |  ||||||  | ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9690833 tggggttgacctagtggttggtttgagattttggagtttgctcttccagaggtcttaggttcgatttcttctagtgtcaatttcggtgggctaagtccat 9690734  T
Q  215 acggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||    
T  9690733 acagagcttgctctggctttaaacggggccctcacaagtggacggtgggattggtcctctcggattagtcg----attcttggatcggataccgagtttt 9690638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 283
Target Start/End: Original strand, 33499467 - 33499645
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttc-gatcccctctggtgccaatttcggtggg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  33499467 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcagattccctctggtgtcaatttcggtggg 33499566  T
Q  205 ctaagtccatacggagc-ttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    || |||||||||  | | ||||| |||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33499567 ct-agtccatacaaatctttgctttggctttaaatgggccctccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 33499645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 106 - 314
Target Start/End: Original strand, 9208245 - 9208449
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||   | ||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9208245 taacccatttggggttgttctagtggttggattgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcgattccccctggtgccaatttcggtgggc 9208344  T
Q  206 taagtccatacggag-cttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggat 304  Q
     |||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |    |||||||||||  ||    
T  9208345 -aagtccatacagagccttgctttggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtctcctcagaatagtcg----attcttggatcaaat 9208439  T
Q  305 accgagtttt 314  Q
    ||||||||||    
T  9208440 accgagtttt 9208449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 315
Target Start/End: Original strand, 14212883 - 14213080
Alignment:
Q  104 tgtaacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgg 203  Q
    |||||| |||||||| ||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  14212883 tgtaactcatttgggattgacctaatggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgg 14212982  T
Q  204 gctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcgga 303  Q
    ||||||||||||  ||          ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    ||||||||||||||    
T  14212983 gctaagtccatataga----------gctttaaacgggggccccgcaagtgggtggtgggattggtccactcggattagtcg----attcttggatcgga 14213068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 128 - 314
Target Start/End: Original strand, 11840916 - 11841097
Alignment:
Q  128 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctc 227  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||     
T  11840916 gtggttggcttgggatattagaatttgctcctccagaggtctcaggctcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacaaagcttgctt 11841015  T
Q  228 tggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    ||| ||||||||||  ||||  |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||    |||||||||||||||||||||    
T  11841016 tggttttaaacggg-gccccataagtggacggtgggattagtcccctcgaattagtcgatta----ttggatcggataccgagtttt 11841097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 216
Target Start/End: Original strand, 13753234 - 13753343
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  13753234 aacccatttggggttggcctagtggttggctttggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattctctctggtgccaatttcggtgggct 13753333  T
Q  207 aagtccatac 216  Q
    || |||||||    
T  13753334 aaatccatac 13753343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 196
Target Start/End: Original strand, 22576060 - 22576150
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatt 196  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  22576060 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatt 22576150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17149637 - 17149483
Alignment:
Q  129 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagc-ttgctc 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||   | ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||     
T  17149637 tggttggtttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggttggc-aagtccatacagagccttgctt 17149539  T
Q  228 tggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17149538 tggctttaaatggggcccccgcaagtgaacggtgggattggtcccctcgaattagt 17149483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 130 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28968222 - 28968078
Alignment:
Q  130 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| | |||| | | ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||    
T  28968222 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcagattcgattctctctagcgtcaatttcggtgggttaagtccatacagaacttactctg 28968123  T
Q  230 gctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccct 274  Q
     ||||||||||  |||  | || | ||||||||||||||||||||    
T  28968122 cctttaaacggtgcccatgtaaataggcggtgggattggtcccct 28968078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 128 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17706489 - 17706318
Alignment:
Q  128 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctc 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||| ||||             ||||||    
T  17706489 gtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcaagttcgattccttctggtgtcaatttcggtggactaa------------tttgctc 17706402  T
Q  228 tggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||    | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17706401 tggctttaaactgggccctcgcaagtggacggtgtgattggtttcctcggataag----tcaattcttggatcggataccgaattttc 17706318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 271
Target Start/End: Original strand, 31039014 - 31039177
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||| ||  || |||||||| | ||||||||||||||||| ||| |  |||||| || ||| |||||| ||  |||||||| ||||||    
T  31039014 aacccatttggggttgacccagtagttggctttgaatcttggagtttgctccaccaaagatctcaagtttgattccctctagtatcaatttcgatgggct 31039113  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcc 271  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| | ||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31039114 aagtccatacagagtttgctatggctatgaa-tggacccccacaagtgggcggtgtgattggtcc 31039177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 283
Target Start/End: Original strand, 10377714 - 10377886
Alignment:
Q  112 atttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtc 211  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||| ||||| |    | ||||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  10377714 atttggggttggcccagttgttggcttgagatcttggagtgtgctcatgtcaaggtctcaggttcaattccctatggtgccaatttcggtgggc-aagtc 10377812  T
Q  212 catacggagctt-gctctggctttaaacgggacccccg-caagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||||  ||||| |||||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10377813 catacatagctttgctctgacttaaaacggggccccccacaagtgggcggtggcattggtcccctcggagtagt 10377886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 33718661 - 33718491
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  |||||  |||||| | ||||||||| ||||| ||||  ||    
T  33718661 aacccatttagggttggtctagtggttggtttgggatcttggagtttacttctccagagatctcaggttcgattctctctggtgcaaattttggtgaact 33718562  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    |||| ||||| |||           |||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  33718561 aagtacatacagag-----------tttaaacggggcctctgcaagtggacggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 33718491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15730593 - 15730495
Alignment:
Q  212 catacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagt 311  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    |||||| ||||||||| |||||    
T  15730593 catacagagcttgttctggctttaaacgtggcccccacacgtgggcggtgggattggtcacctcggattagtcg----attctttgatcggatatcgagt 15730498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6384053 - 6383901
Alignment:
Q  131 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagc-ttgctctg 229  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||   | ||||||  ||| || ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| ||||| ||    
T  6384053 gttggcttgggaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcaat-ccctcgggtgccaatttcagtgggct-agtccataaagagctttgctttg 6383956  T
Q  230 gctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtggga-ttggtcccctcggattagt 283  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||    
T  6383955 gctttaaatgggacccccacaagtggacagtgggatttggacccctcagattagt 6383901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 214
Target Start/End: Original strand, 8479308 - 8479412
Alignment:
Q  109 cccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaa 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||   |  | |||  ||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  8479308 cccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtgtgctcctcttaagatttcaggttcgatttcctctggtgtcaatttcggtgggc-aa 8479406  T
Q  209 gtccat 214  Q
    ||||||    
T  8479407 gtccat 8479412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14504170 - 14504082
Alignment:
Q  222 ttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |    || |||| |||||||||||||||||    
T  14504170 ttgctctggttttaaatggggtccccgcaagtgggcggtgggattgatcctctcgaattagtcg----atccttgtatcggataccgagtttt 14504082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 283
Target Start/End: Original strand, 32596211 - 32596246
Alignment:
Q  248 gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32596211 gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 32596246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Original strand, 17225737 - 17225836
Alignment:
Q  183 ctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagctt-gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatta 281  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||| | ||  |||||| |||| |||| ||||||||||||||| || |||| |||||    
T  17225737 ctctggtgccaatttcggcgggc-aagtccatacagagctttgctctcgtttagaacggggcccc-gcaaatgggcggtgggattgatctcctcagatta 17225834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21903706 - 21903618
Alignment:
Q  224 gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggt-cccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |    ||||||||||||||| | ||||||||    
T  21903706 gctctggctttaaatggggcaccagcaagtgggcggtgggaatggtccccctcagattagtcg----attcttggatcggatgcagagttttc 21903618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27866268 - 27866225
Alignment:
Q  245 cccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  27866268 cccgcaagtgggcggtgggattagtcccctcgaattagtcgatt 27866225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 73)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4621440 - 4621236
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4621440 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 4621341  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  4621340 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggatac 4621245  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  4621244 cgagttttc 4621236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 106 - 314
Target Start/End: Original strand, 24674386 - 24674590
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24674386 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 24674485  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    ||||||||||||||||    
T  24674486 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgtattagtcg----attcttggatcggata 24674581  T
Q  306 ccgagtttt 314  Q
    |||| ||||    
T  24674582 ccgaatttt 24674590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 106 - 314
Target Start/End: Original strand, 24122016 - 24122220
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24122016 taactcatttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggggtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 24122115  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||    
T  24122116 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggata 24122211  T
Q  306 ccgagtttt 314  Q
    |||||||||    
T  24122212 ccgagtttt 24122220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15059605 - 15059401
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15059605 aacccatttggggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggct 15059506  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |    |||||||||||||||||    
T  15059505 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagtcg----attcttggatcggatac 15059410  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  15059409 cgagttttc 15059401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 106 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7766931 - 7766726
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7766931 taacccattcggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggc 7766832  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||| ||||||||    
T  7766831 taagtccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttgaatcggata 7766736  T
Q  306 ccgagttttc 315  Q
     |||||||||    
T  7766735 tcgagttttc 7766726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 106 - 276
Target Start/End: Original strand, 8077640 - 8077810
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  8077640 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggc 8077739  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcg 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8077740 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcg 8077810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 106 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27455070 - 27454863
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||| ||    
T  27455070 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattcactctgatgccaatttcggtgagc 27454971  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacggg--acccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcgga 303  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||    
T  27454970 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggccccccccgcatgtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcgga 27454875  T
Q  304 taccgagttttc 315  Q
    |||| |||||||    
T  27454874 tacctagttttc 27454863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 107 - 283
Target Start/End: Original strand, 46607804 - 46607980
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46607804 aacccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 46607903  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46607904 aagtccatacagagcttgctctgactttaaaaggcccccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagt 46607980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 107 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 7197449 - 7197247
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  7197449 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtggg-t 7197351  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    |||| ||||||||||||    
T  7197350 aagtcaatacagaccttgctctggctttaaacgaggcccctgcaagtgggcggtgagattggtcccctcggattagtcg----attcatggatcggatac 7197255  T
Q  307 cgagtttt 314  Q
    ||||||||    
T  7197254 cgagtttt 7197247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 107 - 283
Target Start/End: Original strand, 30677170 - 30677346
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30677170 aacccatttggggttgacctagtggttggtttgggatctaggagtttgctcctccaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggct 30677269  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30677270 aagtccatacagagcttgctttggctttaaatgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagt 30677346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 128 - 313
Target Start/End: Original strand, 17935784 - 17935965
Alignment:
Q  128 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctc 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17935784 gtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagtttgctc 17935883  T
Q  228 tggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttt 313  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||    
T  17935884 tggctttaaacggggcccccgcaagtgggcgatgggattggtccactcggattagtcg----attcttggatcggataccgagttt 17935965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 123 - 315
Target Start/End: Original strand, 7578419 - 7578607
Alignment:
Q  123 gcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagct 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  7578419 gcctagtggttggcttgggatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaagct 7578518  T
Q  223 tgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  7578519 tgctctgactttaaacggggccctcgcaagtgggtggtgggattggttccctcggattagttgattt----ttggatcggataccgagttttc 7578607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 107 - 313
Target Start/End: Original strand, 34778336 - 34778535
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||||||||| ||||||| |||||| |    
T  34778336 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtaccaattttggtgggtt 34778435  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
       ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |    |||||||||||||||||    
T  34778436 ---tccatacagagtttgctttggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtccccttggattagtcg----attcttggatcggatac 34778528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 131 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 45859222 - 45859043
Alignment:
Q  131 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctgg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |    
T  45859222 gttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacatcgcttgctcttg 45859123  T
Q  231 ctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||    
T  45859122 ctttaaacagggcccccgcaagtgggtggtaggattggtcccctcggattagttgatta----ttggatcggataccgaatttt 45859043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 107 - 284
Target Start/End: Original strand, 168195 - 168372
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | || | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  168195 aacccatttggagttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctctttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 168294  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtt 284  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  168295 aagttcatacagagcttgttctgactttaaacgggactcccgctagtggccggtgggattggtcccctcggattagtt 168372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 132 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9500533 - 9500355
Alignment:
Q  132 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9500533 ttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 9500434  T
Q  232 tttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |    |||||||||||||||| ||||||||    
T  9500433 tttaaacggagcccccacaagtgggcggtgagattggtctcttcggattagtcg----attcttggatcggatatcgagtttt 9500355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 107 - 283
Target Start/End: Original strand, 32729539 - 32729714
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  32729539 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctctcaaagtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtgggc- 32729637  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  32729638 aagtccatacagagcttgctctggctttaaatggggtccccgcaagtgggcggtgggattgatccccttggattagt 32729714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 106 - 281
Target Start/End: Original strand, 7946837 - 7947011
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7946837 taacccatttggggtcgacctagtggttggcttgagatcttgaagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 7946936  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatta 281  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  7946937 taagtctatacagagcttgctctcgctttaaatggg-gccccgcaagtgggtggtgagattggtcccctcagatta 7947011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 107 - 310
Target Start/End: Original strand, 1378892 - 1379090
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  1378892 aacccatttaaggttggcttagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtctcatgttcgatttcctctggtgtcaatttcggtgggct 1378991  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |    |||||| ||||||||||    
T  1378992 aagtccatacagaacttgctctggctttaaacggg-cccccgcaagtggacggtgagattggtcccctcagattagtcg----attcttagatcggatac 1379086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 106 - 315
Target Start/End: Original strand, 23734109 - 23734315
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23734109 taacccatttggggttggtttagtagttggcttgggatcttagaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggc 23734208  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaac-gggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggat 304  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |    ||||||| |||||||    
T  23734209 taagtccatacagagtttgctatgcctttaaacggggccccccgcaagtgggcggtgaaattggtcccctcagattagtcg----attcttgaatcggat 23734304  T
Q  305 accgagttttc 315  Q
    ||| |||||||    
T  23734305 accaagttttc 23734315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 106 - 315
Target Start/End: Original strand, 23741301 - 23741507
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23741301 taacccatttggggttggtttagtagttggcttgggatcttagaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggc 23741400  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaac-gggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggat 304  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |    ||||||| |||||||    
T  23741401 taagtccatacagagtttgctatgcctttaaacggggccccccgcaagtgggcggtgaaattggtcccctcagattagtcg----attcttgaatcggat 23741496  T
Q  305 accgagttttc 315  Q
    ||| |||||||    
T  23741497 accaagttttc 23741507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 107 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 23232468 - 23232300
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || |||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  23232468 aacccatttgggattggcctagtggttgacttgggatcttgaagtttgctcttccagaggtttcaggttcgattccctctggcgccaatttcggtgggct 23232369  T
Q  207 aagtccatacggagctt----gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcc 271  Q
    |||||||||| ||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23232368 aagtccatacagagcttgcaagctctggctttaaatgggacccccgcaagtgggtggtgggattggtcc 23232300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 128 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 37351643 - 37351454
Alignment:
Q  128 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgct- 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  37351643 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaatgtctcaggttcgattccttctgatgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctc 37351544  T
Q  227 --------ctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttt 313  Q
            ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     | |||||||||||||||||||||    
T  37351543 tggaagctctggctttaaacggg-cccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----gtccttggatcggataccgagttt 37351454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 106 - 288
Target Start/End: Original strand, 18646846 - 18647028
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18646846 taacctatttggggttgacctagtggttggcttgtgatctttgagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggc 18646945  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    |||||| ||||  || |||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||    
T  18646946 taagtctatacaaagtttgctctggctttaaacggagcccctgtaagtgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgatt 18647028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29057540 - 29057373
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||| |||||||||||| | ||      
T  29057540 aacccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctgctccaaaggtctcaggttcgattccctcttgtgccaatttcgat-ggta 29057442  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctc 275  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  29057441 aagtctatacagagcttgctctggctttcaacgggacccccgcaaatgggcgatgtgattggtcccctc 29057373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 137 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 36156061 - 36155888
Alignment:
Q  137 ttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| | | |||||    
T  36156061 ttgggatcttggagtttgctcctccagaggtgtcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggccaagtccatgcagagcttgctttagttttaa 36155962  T
Q  237 acgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||| |    |||||||||||||||||||||||||    
T  36155961 acagggcccccgcaggtgggcggtgggattggtcccttcaaattagtcg----attcttggatcggataccgagtttt 36155888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 309
Target Start/End: Original strand, 21726721 - 21726921
Alignment:
Q  105 gtaacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtggg 204  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  21726721 gtaacccatttgaggttgacctagtggttgatttgggttcttgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatggg 21726820  T
Q  205 ctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggat 304  Q
     ||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    ||  |||||||||||||||    
T  21726821 ttaagtccatatagagcttgttctagctttaaacgggtcccccacaagtgggcggtggggttgatcccctcagatta----atcgattcttggatcggat 21726916  T
Q  305 accga 309  Q
    |||||    
T  21726917 accga 21726921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33905690 - 33905545
Alignment:
Q  130 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  33905690 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtatcaatttcggtgggttaagtccatacagagtttgttctg 33905591  T
Q  230 gctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctc 275  Q
    |||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  33905590 gctttaaacggggcctccgtaagtggacggtgggattgatcccctc 33905545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 128 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 8779918 - 8779758
Alignment:
Q  128 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctc 227  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||  | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  8779918 gtggttgatttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcagcttcgatttcttctagtgtcaatttcggtgggctaagtccatacacagcttactc 8779819  T
Q  228 tggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8779818 tagctttaaacggggcccccacaagtaggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatt 8779758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 113 - 281
Target Start/End: Original strand, 32930749 - 32930917
Alignment:
Q  113 tttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 212  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  32930749 tttggggttgacctagtggttggtttggaatcttggagtttactccttcagaggtctcaagttcgatttcctctggtgcccattttggtgggctaagtcc 32930848  T
Q  213 atacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatta 281  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||    
T  32930849 atgcagagcttgctctggctttaaacggggtccctgcaagtggatggtgggattgatcccctcagatta 32930917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 111 - 288
Target Start/End: Original strand, 2272342 - 2272519
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||  || ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2272342 catttggggttggcctagtggttgacttgggatcttagagtttgctcctacagaggtctcaggtttgattccctctgatgccaatttcgctgggctaagt 2272441  T
Q  211 ccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
     |||||  || |||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||    
T  2272442 tcatacaaagtttgctctgactttaaacggggcccctacaagggggcggtaggattgatcccatcggattagtcgatt 2272519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18533928 - 18533759
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| || |||  || ||| | |||| |||||||||||| ||| |    
T  18533928 taacccatttggggttgacatagtggttgacttgagatcttagagtttgctcctccagaggtatcagatttgattctctctagtgccaatttcgatggac 18533829  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctc 275  Q
    ||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  18533828 taagtccatatagagcttgttctgactttaaacggggcccctgcaagtgggccgtgggattggtcccctc 18533759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46113600 - 46113496
Alignment:
Q  112 atttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtc 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46113600 atttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtaccaatttcggtgggctaagtc 46113501  T
Q  212 catac 216  Q
    |||||    
T  46113500 catac 46113496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 183 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8254879 - 8254751
Alignment:
Q  183 ctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattag 282  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  8254879 ctctggtgtcaatttcggtgggctaagttcatacagaacttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatccccttgaattag 8254780  T
Q  283 ttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    | |    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8254779 tcg----attcttgaatcggataccgagttttc 8254751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 283
Target Start/End: Original strand, 2537696 - 2537863
Alignment:
Q  105 gtaacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtggg 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||      ||||||||   | ||||||  || ||| || | |||||||||||||||||||    
T  2537696 gtaacccatttggggttggcctagtggttggattgggatctt------tgctcctctcaaggtctcaggtttgattccatttggtgccaatttcggtggg 2537789  T
Q  205 ctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    ||| |||||     |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2537790 ctatgtcca-----agcttgctttggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggagggattggtcccctcggattagt 2537863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 20487393 - 20487297
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgg 203  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20487393 aacccatttggggttggtttagtggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgg 20487297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 314
Target Start/End: Original strand, 1486415 - 1486617
Alignment:
Q  108 acccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggcta 207  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||   | ||||||  |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||    
T  1486415 acccatttggggttgacctagtggttggcttgggatcttggagt--gctactctcaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatggg-ta 1486511  T
Q  208 agtccatacggagctt-gctctggctttaaacgggacccc--cgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggat 304  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||  |||||| ||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |     | ||||||||||||    
T  1486512 agtccatacagagctttgctctgacttagaacggggcccccccgcaagtggacggtgggatcggtcccctccgattagtcg----gtccttggatcggat 1486607  T
Q  305 accgagtttt 314  Q
    ||||||||||    
T  1486608 accgagtttt 1486617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14258630 - 14258538
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcg 199  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||| |||||||||    
T  14258630 aacccatttgggcttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgttcctccagatgtctctggttcgattccctctggtaccaatttcg 14258538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 186 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 45331746 - 45331621
Alignment:
Q  186 tggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggac-ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtt 284  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||       
T  45331746 tggtggcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctttggctttaaacggggctccccgcaagtggacggtgggattaatcccctcagatta--- 45331650  T
Q  285 gattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
     ||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  45331649 -atcgattcttgaatcggataccgagtttt 45331621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 208 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12877038 - 12876956
Alignment:
Q  208 agtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaa 290  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12877038 agtccatacagagcttgctctagctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattaatggattaa 12876956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 40802271 - 40802069
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||   | ||||||  || ||| | |  |||||||||||| | || ||    
T  40802271 taacccatttggggttggctttgtggttggcttgagatattggagtttgctcatctcaaggtctcatgtttgattctccatggtgccaattttgatgagc 40802172  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
     |||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||| || | |||||| |    ||||||| |||| |||    
T  40802171 -aagtccatacagagcttgctctgactttaaacggg-tccccgcaagtgggtggtgagattggtcctctagaattagtcg----attcttgaatcgaata 40802078  T
Q  306 ccgagtttt 314  Q
    |||||||||    
T  40802077 ccgagtttt 40802069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 283
Target Start/End: Original strand, 16899507 - 16899673
Alignment:
Q  109 cccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaa 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||| |||| |||        |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |     
T  16899507 cccatttggggttggcctagtggttgacttgtaatcttggagtgtgctgctc--------tcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggcca- 16899597  T
Q  209 gtccatacggagctt-gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    ||||||||  ||||| ||||||| ||  |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16899598 gtccatacaaagctttgctctggtttagaacggggcccctgcaagtggacggtgagattggtcccctcggattagt 16899673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 218 - 315
Target Start/End: Original strand, 22909976 - 22910069
Alignment:
Q  218 gagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    || ||| |||||||||||||||||||    
T  22909976 gagcttgctctgactttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggatttgtcccctcggattagtcg----atacttcgatcggataccgagttttc 22910069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 284
Target Start/End: Original strand, 1138572 - 1138749
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||   | |||| |  |||||  | |||| |||||||||||||||| |    
T  1138572 taacccatttggggttgacctagtggttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtcttaggttcgaatctctctagtgccaatttcggtggac 1138671  T
Q  206 taagtccatacggagc-ttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtt 284  Q
     |||||||||| |||| |||||||| |||  ||| || |||  |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  1138672 -aagtccatacagagctttgctctgacttagaacagggcccttgcaagtgggcagtggaattggt-ccctcggattagtt 1138749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 283
Target Start/End: Original strand, 19480552 - 19480706
Alignment:
Q  131 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagct-tgctctg 229  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||   | ||||||  |||||| |||   |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  19480552 gttgacttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcacattcgattccccgcggtgccaattttagtgggctaagtccatatagagctatgctctg 19480651  T
Q  230 gctttaaacggg-acccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  19480652 gctttaaatgggtacccccgcacgtggacggtgggattggatccctcgggttagt 19480706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26513238 - 26513148
Alignment:
Q  219 agcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    |||||||||||| ||||||||||||    
T  26513238 agcttgctctgactttaaacggg-cccccacaagtgggcggtgggaatggtcccctcggattagtcg----attcttggatcgaataccgagtttt 26513148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 283
Target Start/End: Original strand, 37046994 - 37047162
Alignment:
Q  117 gggttggcctggtggt--tggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccat 214  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||   | ||||||  || ||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| ||||||    
T  37046994 gggttggtctggtggtgttggcttgggaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttgattccccctggtacaaattttggtgggcta-gtccat 37047092  T
Q  215 acggagctt-gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    || |||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37047093 acagagctttgctctagctttaaatggggcccccacaagtggacggtgggattggacccctaggattagt 37047162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 315
Target Start/End: Original strand, 48699863 - 48699957
Alignment:
Q  218 gagcttgctctgg-ctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |    |||||||||||||||| |||||||||    
T  48699863 gagcttgctctgggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattgttcccttcggattagtcg----attcttggatcggatatcgagttttc 48699957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40146079 - 40145889
Alignment:
Q  112 atttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtc 211  Q
    |||||| |||| ||| |||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||     |||  ||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  40146079 atttggagttgacctagtggttgatttgtgatcttgaagtttgctccttcag-----tcaggttcgatttcctctagtgccaatttatgtgggctaagtc 40145985  T
Q  212 catacggagcttgctctggctttaaacgggaccc-----ccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||     || |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  40145984 catacagagcttgctctgactttaaatgggcccccacaaccacaagtgggtggtgagtttggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggatac 40145889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 25237192 - 25237028
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    ||||||||| | ||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||| |||   | ||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  25237192 aacccatttagagttggcctaatggttagtttgggatcttggagtttgcttctctcaaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggc- 25237094  T
Q  207 aagtccatacggag-cttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcc 271  Q
    |||||||||| |||  |||||||| |||  || ||  || |||||||||| |||||| ||||||||    
T  25237093 aagtccatacagagttttgctctgacttagaatggtgcctccgcaagtggacggtggaattggtcc 25237028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25496692 - 25496528
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||   | ||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||    
T  25496692 taacctatttggcgttggcctagtgattggcttgggatcttggagattgctcctcttaaggtctcaagttcgattccctctagtgcctatttcggtgagc 25496593  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccct 274  Q
     |||| ||||  ||||||   ||||||| ||| |||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25496592 -aagttcatattgagctt--actggcttaaaatggg-gctccgcaagtggacggtgggattgatcccct 25496528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 228 - 281
Target Start/End: Original strand, 50202661 - 50202714
Alignment:
Q  228 tggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatta 281  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50202661 tggctttaaacgggaccctcgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggatta 50202714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Original strand, 1818730 - 1818806
Alignment:
Q  109 cccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctc 185  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||  |||||| |||||    
T  1818730 cccatttggggttggcctggtagttggcttaggatcttggagtttgctcttccagaggtttcaggttcgattccctc 1818806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 204
Target Start/End: Original strand, 24216973 - 24217069
Alignment:
Q  108 acccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtggg 204  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||   | ||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  24216973 acccatttggggttgacctagtggttgacttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattacctttggtgccaatttcggtggg 24217069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 158
Target Start/End: Original strand, 47091684 - 47091735
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcc 158  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47091684 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcc 47091735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 39714829 - 39714677
Alignment:
Q  131 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcc-cctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagctt-gctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||| || ||| | |||| |||||| |||||||||||||| |||||   ||||||| |||||    
T  39714829 gttggcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaagtttgattctcctc-ggtgccgatttcggtgggcta-gtccaaggggagctttgctct 39714732  T
Q  229 ggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    || |||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||| | ||||||||||||    
T  39714731 ggatttaaatgggccccccacaagtggatggtgggattggactcctcggattagt 39714677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 314
Target Start/End: Original strand, 52135127 - 52135323
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||   ||||||||  ||||||   |||| ||||||||| |||||||| ||     
T  52135127 ccatttggggttggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcatctcaatgtctcaggttcgattatctctagtgccaattccggtgggc-aaa 52135225  T
Q  210 tccatacggagc-ttgctctggc-tttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatacc 307  Q
    ||||     ||| |||||||||| |||||| ||  || | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |     ||||||||||||||||     
T  52135226 tcca-----agctttgctctggcttttaaatggagccactgcaagtggacggtgggattggtcccctcatattagtcg----gttcttggatcggatact 52135316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 314
Target Start/End: Original strand, 809215 - 809419
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||   | ||||||  || |||  || || ||| ||||||||||||||    
T  809215 taacccatctagggttggcctcgtggttggtttgggatcttggagtttactcctcttaaggtctcaggtttgattacccctagtgtcaatttcggtgggc 809314  T
Q  206 taagtccatacggag-cttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggat 304  Q
     ||||||||||  || |||| ||||||||| || ||| |    |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| |    |||||||||| ||||    
T  809315 -aagtccatacaaagccttgatctggctttgaatggggcatttgcaaatgggcggtgggattggttccttcggagtagtcg----attcttggattggat 809409  T
Q  305 accgagtttt 314  Q
    || |||||||    
T  809410 actgagtttt 809419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1095193 - 1095031
Alignment:
Q  112 atttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtc 211  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | || |||        |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||     
T  1095193 atttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtgttcttctc--------tcaagttcgatttcttctggtgccaatttcggtgggc-aagta 1095103  T
Q  212 catacggagctt----gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    ||||| ||||||    ||||||||||  ||||||  |||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  1095102 catacagagctttgcagctctggcttagaacggg-gccccgcaagtg---ggtgggattggttccctcggattagt 1095031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19034568 - 19034474
Alignment:
Q  128 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagctt 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | || |||  ||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19034568 gtggttggtttgggatcttggagtttgttcctcaaaaggtttcaggttcgattatctctggtgccaatttcggtgggc-aagtccatacagagctt 19034474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 201
Target Start/End: Original strand, 1378743 - 1378833
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggt 201  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||   |||||||| ||||||||||    
T  1378743 catttggggttggtctagtggttgacttggaatcttggagtttactcctccaaaggtctcatgttcgattttctctggtgtcaatttcggt 1378833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 275
Target Start/End: Original strand, 16539625 - 16539769
Alignment:
Q  130 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagctt-gctct 228  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||    | ||||||  || ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| || ||    
T  16539625 ggttggtttgggatcttggagtgagctccttgcaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgggc-aagtccatacagagctttgcgct 16539723  T
Q  229 ggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctc 275  Q
    |||||  |||||| |||  | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16539724 ggcttagaacggggccct-gtaagtgggtggtgggattggtcccctc 16539769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 314
Target Start/End: Original strand, 35138115 - 35138185
Alignment:
Q  240 ggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |     | ||||||||||||||||||||||    
T  35138115 ggacccccgcaagtgggcggtgggattgattccctcggattagtcg----gtccttggatcggataccgagtttt 35138185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 159
Target Start/End: Original strand, 6776139 - 6776190
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcct 159  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6776139 aacccatttggg-ttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcct 6776190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9926350 - 9926184
Alignment:
Q  108 acccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctcc--agatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    |||||||||| | ||| || || |||| |||||||||||||||| ||||||||   || | |||||  |||||| || ||||||| |||||| |||||||    
T  9926350 acccatttggagctggtctagtagttgacttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctctcagattcgattccttctggtgtcaattttggtgggc 9926251  T
Q  206 taagtccatacggagctt-gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtccc 272  Q
     || |||||||  || || ||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9926250 aaa-tccatacaaagttttgctctggcttagaacggagcccccgcaactgggcggtgggattgatccc 9926184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 314
Target Start/End: Original strand, 26820275 - 26820384
Alignment:
Q  201 tgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatc 300  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||| || | |||||||||| |    ||||||||||     
T  26820275 tgggttaagtccatacagaacttgctctgcctttaaatgggacccctgcaagtggatggtggaattgatcgcttcggattagtcg----attcttggatt 26820370  T
Q  301 ggataccgagtttt 314  Q
    | ||||||||||||    
T  26820371 gaataccgagtttt 26820384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 314
Target Start/End: Original strand, 23041655 - 23041719
Alignment:
Q  246 ccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |    |||||||||||||||||||||||||    
T  23041655 ccgcaagtggacagtgggattggtcccctcgaattagtcg----attcttggatcggataccgagtttt 23041719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 283
Target Start/End: Original strand, 27159205 - 27159255
Alignment:
Q  232 tttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27159205 tttaaacggg-cccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcagattagt 27159255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 206
Target Start/End: Original strand, 39964530 - 39964605
Alignment:
Q  131 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||   | ||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39964530 gttggcttgcgaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggct 39964605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 315
Target Start/End: Original strand, 14603947 - 14603994
Alignment:
Q  264 attggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||    
T  14603947 attggtcccctcggattagtcgatt----cttggatcggataccgagttttc 14603994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20999287 - 20999190
Alignment:
Q  186 tggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttg-ctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||||   | | ||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20999287 tggtaccaatttcggtgggcta-gtccatacagagctttacgctggctttaaataaggctccctcaagtggacggtggtattggacccctcggattagt 20999190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 314
Target Start/End: Original strand, 5315478 - 5315528
Alignment:
Q  260 tgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||    ||||||||||||||||||||||    
T  5315478 tgggattggtcccctcggataagtcgatt----cttggatcggataccgagtttt 5315528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 274
Target Start/End: Original strand, 17447382 - 17447434
Alignment:
Q  221 cttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccct 274  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  17447382 cttgctctggatttaaatgg-acccccgcaagtgggaggtgggatttgtcccct 17447434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0576 (Bit Score: 152; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0576
Description:

Target: scaffold0576; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5285 - 5081
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5285 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 5186  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  5185 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggatac 5090  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  5089 cgagttttc 5081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 152; Significance: 5e-80; HSPs: 72)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 40059055 - 40058851
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  40059055 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggct 40058956  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  40058955 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggatac 40058860  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  40058859 cgagttttc 40058851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 107 - 313
Target Start/End: Original strand, 52983613 - 52983815
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  52983613 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggct 52983712  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  52983713 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggatac 52983808  T
Q  307 cgagttt 313  Q
    |||||||    
T  52983809 cgagttt 52983815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 34844961 - 34844757
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  34844961 aacccatttggggttggcctagtggtttgcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggct 34844862  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  34844861 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggatac 34844766  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  34844765 cgagttttc 34844757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27528998 - 27528794
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27528998 aacccatctggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 27528899  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  27528898 aagtccatacagagcttgctctggctttatacggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggatac 27528803  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  27528802 cgagttttc 27528794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Original strand, 32986191 - 32986395
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  32986191 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgccaatttcggtgggct 32986290  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    |||||||||||||||||    
T  32986291 aagtccatacagagcttgctctgactttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggaatagtcg----attcttggatcggatac 32986386  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  32986387 cgagttttc 32986395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Original strand, 46714386 - 46714591
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatc-ccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  46714386 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttccctttggtgccaatttcggtgggc 46714485  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||    
T  46714486 taagtccatacagagcttgcccttgctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtc----aattcttgaatcggata 46714581  T
Q  306 ccgagttttc 315  Q
    ||||||||||    
T  46714582 ccgagttttc 46714591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 106 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33696483 - 33696279
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  33696483 taacccatttagggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgccaatttcggtgggc 33696384  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||     |||||||||||||||||    
T  33696383 taagtccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcctctcggattagtc----aattcttggatcggata 33696288  T
Q  306 ccgagtttt 314  Q
     ||||||||    
T  33696287 tcgagtttt 33696279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 107 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 54127545 - 54127369
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  54127545 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcaattccctcttgtgccaatttcggtgggct 54127446  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54127445 aagtctatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 54127369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5609405 - 5609201
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5609405 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcattcagtggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggct 5609306  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  5609305 aagtccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattgatcccctcggattagtcg----attcttggatcggatac 5609210  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  5609209 cgagttttc 5609201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 107 - 314
Target Start/End: Original strand, 25852208 - 25852412
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25852208 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 25852307  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggcttt-aaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |     |||||||| ||||||    
T  25852308 aagtccatacagagcttgctctggctttaaaacgggaccctcgcaagtgggcaatgggattggtcccctcggattagtcg----gttcttggaccggata 25852403  T
Q  306 ccgagtttt 314  Q
    |||||||||    
T  25852404 ccgagtttt 25852412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 106 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19660736 - 19660531
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| | ||||| ||| ||||||||||||     
T  19660736 taacccatttggagttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattctctctgatgcaaatttcggtggga 19660637  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    ||||||||||||||||    
T  19660636 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcg----attcttggatcggata 19660541  T
Q  306 ccgagttttc 315  Q
    ||||||||||    
T  19660540 ccgagttttc 19660531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 110 - 314
Target Start/End: Original strand, 20566346 - 20566547
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtc-tcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaa 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20566346 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtgatcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggcaaa 20566445  T
Q  209 gtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccg 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    |||||||||||||||| ||    
T  20566446 gtccatacagagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcgctgggattggtcccctcagattagtcg----attcttggatcggatatcg 20566541  T
Q  309 agtttt 314  Q
    ||||||    
T  20566542 agtttt 20566547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 36131714 - 36131509
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  36131714 taacccatttggggttggcatagtggtttgcttgggattttggagttcgttcctccagatgtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtggcc 36131615  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    || |||| ||||    
T  36131614 taagtccatacagagcttgctatgactttaaacgggacccccgtaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatta----ttagatcagata 36131519  T
Q  306 ccgagttttc 315  Q
    ||||||||||    
T  36131518 ccgagttttc 36131509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 111 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 45787902 - 45787703
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  45787902 catttggggttggcctagtggttggcttggaatcttgga-tttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctgatgccaatttcagtgggctaagt 45787804  T
Q  211 ccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgag 310  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |    |||||||||||||||||||||    
T  45787803 ccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcg----attcttggatcggataccgag 45787708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 131 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20078163 - 20077986
Alignment:
Q  131 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctgg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20078163 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattcccactggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctgg 20078064  T
Q  231 ctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtt 312  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||    
T  20078063 ctttaaacggggcccccgtaagtgggcggtgggattagttccctcggattagtcg----attcttggatcggataccgagtt 20077986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 106 - 315
Target Start/End: Original strand, 44343506 - 44343712
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggtt-ggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtggg 204  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  44343506 taacctatttggggttgggctagtggtttggcttgggatcttggagtttgctcccccaaaggactcaagttcgattccctctggtgctaattttggtggg 44343605  T
Q  205 ctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggat 304  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    ||||||| |||||||    
T  44343606 ctaagtccatacagagcttgctctgactttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcg----attcttgaatcggat 44343701  T
Q  305 accgagttttc 315  Q
    |||||||||||    
T  44343702 accgagttttc 44343712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 107 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 35674944 - 35674786
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  35674944 aacccatttggggttggccaagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccaaaggtcacaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggct 35674845  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggat 265  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  35674844 aagtccatacagagcttgctctgcctttaaacggggcccccgcaagtgggcggttggat 35674786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 107 - 260
Target Start/End: Original strand, 33992620 - 33992773
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  33992620 aacccatttagggttgacctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggct 33992719  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggt 260  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33992720 aagtccatacatagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggt 33992773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 117 - 314
Target Start/End: Original strand, 35229172 - 35229365
Alignment:
Q  117 gggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatac 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35229172 gggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttct-atgccaatttcggtgggctaagtccatac 35229270  T
Q  217 ggagcttgctctggctttaaacggg-acccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
      ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |    |||||||||||||||||||| ||||    
T  35229271 atagcttgctctgactttaaacgggtccccccacaagtgagcggtgggattggtcccctcgaattagtcg----attcttggatcggataccgaatttt 35229365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22625273 - 22625097
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22625273 aacccatttgaggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttactcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggct 22625174  T
Q  207 aagtccatacggagctt---------gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccct 274  Q
    |||||||||| ||||||         |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22625173 aagtccatacagagcttgctcagccagctctgcctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccct 22625097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 112 - 279
Target Start/End: Original strand, 32942369 - 32942536
Alignment:
Q  112 atttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtc 211  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || | |  |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32942369 atttggggttggtctagtggttggcttgagatcttggagtttactcctccagaggtttaaggttcgattctctctgatgccaatttcggtgggctaagtc 32942468  T
Q  212 catacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggat 279  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32942469 catacagagcttactctggctttaaacggcccccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggat 32942536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 174 - 314
Target Start/End: Original strand, 34723860 - 34723996
Alignment:
Q  174 ttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccc 273  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  34723860 ttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcctc 34723959  T
Q  274 tcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    |||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||    
T  34723960 tcggattagtcg----attcttggatcggataccgagtttt 34723996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 111 - 314
Target Start/End: Original strand, 51535611 - 51535818
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc----t 206  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||    |    
T  51535611 catttagggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccacaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaatt 51535710  T
Q  207 aagtccatacggagctt---gctctggctttaaacgggaccccc-gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcgg 302  Q
    |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    |||||| ||||||    
T  51535711 aagtccatacagagcttgcagctctggctttaaacggggcccccagcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcg----attcttagatcgg 51535806  T
Q  303 ataccgagtttt 314  Q
    ||||||| ||||    
T  51535807 ataccgaatttt 51535818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13873497 - 13873315
Alignment:
Q  108 acccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggcta 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13873497 acccatttggggttggcctagtggtttgcttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtaggcta 13873398  T
Q  208 agtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaa 290  Q
    ||| ||||| ||| ||||||| |||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||||| ||||||    
T  13873397 agttcatacagagtttgctctagcttcaaacagggcccccgcaagtgggtggtggaattgatcctctgggattagtcgattaa 13873315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 128 - 314
Target Start/End: Original strand, 49287873 - 49288054
Alignment:
Q  128 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctc 227  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||     
T  49287873 gtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaaatttgcta 49287972  T
Q  228 tggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||| |||||||    
T  49287973 tggctttaaacggg-ctcccgcaagtgggcgctgagattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcagatactgagtttt 49288054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Original strand, 1985830 - 1985993
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  1985830 aacccatttgggattggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgcgaatttcgatgggct 1985929  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtc 270  Q
    |||||||||| |||    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1985930 aagtccatacagagtaaactctggctttaaacggagcccccacaagtgggcggtggaattggtc 1985993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 111 - 288
Target Start/End: Original strand, 34835527 - 34835704
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 210  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34835527 catttggggttggtctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctcttaaggtctcatgttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagt 34835626  T
Q  211 ccatacggagcttgctctggctttaaa-cgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34835627 ccatacggagctatgtctggctttaaatagggccccccgcaagtgggc-gtgagattggtcccctcggattagtcgatt 34835704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 110 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13584454 - 13584281
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13584454 ccatttgaggttggcctagtggttggcctgagatattggagtttgctcctccaaaagtctcaagttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaag 13584355  T
Q  210 tccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  13584354 tccatagagagcttgctctggctttaaacggggccctcacaaatgagcggtggaattggtctcctcgaattagt 13584281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 174 - 315
Target Start/End: Original strand, 32990496 - 32990633
Alignment:
Q  174 ttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccc 273  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32990496 ttcgattccctttagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccc 32990595  T
Q  274 tcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    ||||| |||| |    |||||||||||| |||| ||||||||    
T  32990596 tcggactagtcg----attcttggatcgaatactgagttttc 32990633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7392143 - 7391992
Alignment:
Q  130 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  7392143 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggt-ggttaagtccatacagagtttgctctg 7392045  T
Q  230 gctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7392044 gctttaaatgggaccccc-atagtgggcggtgggattgttcccctcggattagt 7391992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 110 - 281
Target Start/End: Original strand, 13550205 - 13550376
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||      || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13550205 ccatttgcggttggcctagtggttgacttgagatctgggagtttgctcctctagaggtctcaggcctaattccctctagtgccaatttcggtgggctaag 13550304  T
Q  210 tccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatta 281  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  13550305 tccataccgagcttactctggctttaaacggggtccccacaagtgggcggtaggataggtcccctcggatta 13550376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 113 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 55961939 - 55961783
Alignment:
Q  113 tttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 212  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||            |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55961939 tttgggattggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctt-----------cctctggtgccaatttcggtgggctaagtcc 55961851  T
Q  213 atacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatta 281  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  55961850 atacagagcttgctctgactttaaacggg-gccccacaagtgggcggtgggattggttccttcggatta 55961783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12500231 - 12500059
Alignment:
Q  137 ttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||  || ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12500231 ttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcaatgggctaagtccatacatagcttgctctggctttaa 12500132  T
Q  237 acgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||| | | ||||||||||    | |||||||||| |||||||||||||||    
T  12500131 acgggacccccgcaagtgggcggtaaaattgat-ctctcggattag----tcaattcttggaccggataccgagtttt 12500059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13771686 - 13771518
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||   | ||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||||||||    
T  13771686 aacccatttggggttggtctgatggttggcttgggatcttgaagtttgctcatctcaaggtctcaaattcgattccctctgatgtcaatctcggtgggct 13771587  T
Q  207 aagtccatacggagct-tgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccct 274  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||  | || ||||||||||||    
T  13771586 aagtccatacgaagctatgctctggctttaaacggggctcccgcaagtggatgatgagattggtcccct 13771518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18875720 - 18875516
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||| ||||| | | |||||||| ||||||| || ||||||| | || || |  |||||  |||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  18875720 taacccatttgtggttgacatagtggttggtttgggattttagagtttgtttcttcaaagatctcaggttcgattccctctgatgtcaatttcggtgggc 18875621  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||     |||| ||||||| ||||    
T  18875620 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggg-cccccacaagtgggtagtgggattgatcccctcggattagtc----aatttttggatcagata 18875526  T
Q  306 ccgagttttc 315  Q
    ||||||||||    
T  18875525 ccgagttttc 18875516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21387639 - 21387486
Alignment:
Q  156 tcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgg 255  Q
    |||||||||  |||||  |||||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21387639 tcctccagagatctcaggttcgattccctatagtgtcaattttggtgggctaagtctatacagagcttgctctggctttaaacgggatccccgcaagtgg 21387540  T
Q  256 gcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||| |||||||    
T  21387539 gcggtggg--tggtcccctcggattagtcgatta----ttggatcggataccaagttttc 21387486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 174 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9517777 - 9517663
Alignment:
Q  174 ttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccc 273  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  9517777 ttcgattctctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaggtgggtggtgagattggtcccc 9517678  T
Q  274 tcggattagttgatt 288  Q
    |||||||||| ||||    
T  9517677 tcggattagtcgatt 9517663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 191 - 315
Target Start/End: Original strand, 27574396 - 27574516
Alignment:
Q  191 ccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaa 290  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    || ||    
T  27574396 ccaatttcggtaggctaaattcatacagagcttgctctggctttaaaaggggcccccgcaagtgggcggtgagtttggtcccctcggatta----atcaa 27574491  T
Q  291 ttcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  27574492 ttcttggatcggatactgagttttc 27574516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20527212 - 20527056
Alignment:
Q  131 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctgg 230  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | | |    
T  20527212 gttggtttgagattttggagtttgttcctccagaggtctcaagtttgattccctctggcgccaatttcggtgggctaagtccatatagagcttgatttcg 20527113  T
Q  231 ctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
     ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20527112 gtttaaacagg-gccccgtaagtgggcggtaggattggtctcctcggattagtcgatt 20527056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 240
Target Start/End: Original strand, 2351020 - 2351140
Alignment:
Q  120 ttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacgga 219  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  |    
T  2351020 ttggcctagtggttggcttggaatcttgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtcgactaaatccatacata 2351119  T
Q  220 gcttgctctggctttaaacgg 240  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  2351120 gcttgttccggctttaaacgg 2351140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 191 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 53787177 - 53787084
Alignment:
Q  191 ccaatttcggtgggctaagtccatacggagct-tgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  53787177 ccaatttcggtgggctaagtccatgcggagctatgctctggctttaaacggagcccccgcaaatgggcggtgggattagtcccctcagattagt 53787084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 43719264 - 43719154
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 210  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||  |||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  43719264 catttggggttggtctagtggttggtttgagatcttggagtttgctcctccagaggtttcaggttcgattctctctagtgctaatttcggtgggctaagt 43719165  T
Q  211 ccatacggagc 221  Q
    |||||| ||||    
T  43719164 ccatacagagc 43719154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22488146 - 22488063
Alignment:
Q  192 caatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctc 275  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22488146 caatttcggtggactaagtccatatagagcttgttctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattgatcccctc 22488063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25969625 - 25969540
Alignment:
Q  185 ctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtccc 272  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25969625 ctggtgccaatttcggtggcc-aagtccatacagaacttgctctggctttaaacggg-cccccgtaagtgagcggtgggattggtccc 25969540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41621802 - 41621684
Alignment:
Q  104 tgtaacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||   | ||||||  || |||  |||||||||||||||| |||||    
T  41621802 tgtaacccatttggggttggcctaatggttggcttgagatcttggagtttgctcctctcaaggtctcatgtttgatttcctctggtgccaattttggtgg 41621703  T
Q  204 gctaagtccatacggagctt 223  Q
    || || ||||||| ||||||    
T  41621702 gc-aaatccatacagagctt 41621684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 186 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29875899 - 29875825
Alignment:
Q  186 tggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  29875899 tggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgttctgactttaaatggaacccccgcaagttggcggt 29875825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 315
Target Start/End: Original strand, 4911926 - 4912124
Alignment:
Q  117 gggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatac 216  Q
    |||||||| | ||||||| |||  ||||||||||||||||  |  ||| || |||  |||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||| |||||||     
T  4911926 gggttggcttagtggttgacttaagatcttggagtttgcttttttagaagtttcaggttcgattccctctggtgttaattttggtggcctatgtccatat 4912025  T
Q  217 gga----gcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtt 312  Q
     ||    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||| |    ||||||||||| |||||||||||    
T  4912026 agagcttgcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggtggtgtgattgatccccccgaattagtcg----attcttggatcagataccgagtt 4912121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 314
Target Start/End: Original strand, 51595094 - 51595219
Alignment:
Q  185 ctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtt 284  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |||  || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| || | ||||||||       
T  51595094 ctggtgccaatttcgatggactaaatcaatagagaacttgctctgactttaaacgggatccccgcaagtggacggtggaattgatctcttcggatta--- 51595190  T
Q  285 gattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  51595191 -atcgattcttggatcggataccgagtttt 51595219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 234 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9978585 - 9978509
Alignment:
Q  234 taaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||    
T  9978585 taaatgggtcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggattagttg----attcttagatcggataccgagtttt 9978509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 164
Target Start/End: Original strand, 34722164 - 34722221
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaga 164  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34722164 aacctatttggggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaga 34722221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30879345 - 30879165
Alignment:
Q  130 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctg 229  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||   || | |  || ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||  || ||||||||    
T  30879345 ggttggtttgggatcttgtagtttgctccttcatgggttttaggtttgattccctctggtgccaatttcgatgggttaaatccatacaaagtttgctctg 30879246  T
Q  230 gctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||||| |||   || |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    ||  ||||||||||| |||||||| |||||    
T  30879245 gctttaaa-gggggtcctgcaagtggacggtgggattggttccctcagatta----atcgattcttggatcagataccgaattttc 30879165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 314
Target Start/End: Original strand, 23639758 - 23639821
Alignment:
Q  247 cgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||    
T  23639758 cgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggataccgagtttt 23639821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 314
Target Start/End: Original strand, 23645416 - 23645479
Alignment:
Q  247 cgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||    
T  23645416 cgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggataccgagtttt 23645479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13716572 - 13716480
Alignment:
Q  188 gtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagctt-gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 280  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  13716572 gtgccaatttcagtgggc-aagtccatacggaactttgctatgtctttaaacagggccctcgcaagtgggcggtgggattggtcctcttggatt 13716480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 314
Target Start/End: Original strand, 52494623 - 52494685
Alignment:
Q  248 gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    |||||||||||||||||||||||||    
T  52494623 gcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcg----attcttggatcggataccgagtttt 52494685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9646414 - 9646243
Alignment:
Q  112 atttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtc 211  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||| |||||||    | ||||||  || ||| | ||||| || |||||||  ||||| ||||     
T  9646414 atttggggttggtctagtggttggtttgggatctttgagtgtgctcctgtcaaggtctcatgtttgattctctctgatgacaatttcaatgggc-aagtt 9646316  T
Q  212 catacggagctt-gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    ||||| | |||| ||||||||||  ||| || || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  9646315 catacagtgctttgctctggcttagaaccgggccaccgcaagtgggcagtgggattgatcccctcggattagt 9646243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4585804 - 4585735
Alignment:
Q  217 ggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||    
T  4585804 ggagcttgctttggctttaaacggg-cccccgcaagtgggcggt-ggattggtcctttcggattagtcgatt 4585735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 283
Target Start/End: Original strand, 13017836 - 13017883
Alignment:
Q  236 aacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  13017836 aacgggacccccgcaagtgggcagtgggattggtccactcggattagt 13017883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 288
Target Start/End: Original strand, 4064981 - 4065035
Alignment:
Q  234 taaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4064981 taaacggagcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatt 4065035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 160
Target Start/End: Original strand, 42245744 - 42245793
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctc 160  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  42245744 catttggggttggcctagtggttgacttgggatcttagagtttgctcctc 42245793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 314
Target Start/End: Original strand, 12824468 - 12824597
Alignment:
Q  181 ccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatt 280  Q
    |||||| ||| |||||| | |||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| | ||| |||    
T  12824468 ccctcttgtgtcaattttgatgggctaagttcatatagagtttgctctagctttaaatggagctcctgcaagtggacggtgggattggtctcatcgaatt 12824567  T
Q  281 agttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    ||| |    ||||||||||||||||| |||||||    
T  12824568 agtcg----attcttggatcggatacggagtttt 12824597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 243 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 43719154 - 43719086
Alignment:
Q  243 cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    |||||||||||||||||||| |||||    
T  43719154 cccccgaaagtgggcggtgggattggtcatctcggattagtcg----attcttggatcggataccgaattttc 43719086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 51250589 - 51250495
Alignment:
Q  117 gggttggcctggtggt--tggcttgggatcttggagtttgctcctccagatg-tctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaa 208  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| ||  | | |||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  51250589 gggttggcctggtggtattggcttgggatctgggagtgtgctccgcctcaagatctcaagttcgattccctccggtgccaatttgggtgggctaa 51250495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 283
Target Start/End: Original strand, 8158372 - 8158433
Alignment:
Q  222 ttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||    
T  8158372 ttgctctgactttaaacgagagccccgcaagtggacggtgggattggttccctaagattagt 8158433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23131497 - 23131435
Alignment:
Q  249 caagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    |||||| |||||||||||||||||||    
T  23131497 caagtgggcggtaggattggtcccctcgaattagtcg----attcttcgatcggataccgagttttc 23131435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 55158409 - 55158343
Alignment:
Q  244 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    ||| |||||||||| ||||||||||    
T  55158409 ccccgcaaatgggtggtgggattggtcccctcggattagtcg----atttttggatcggaaaccgagtttt 55158343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 287
Target Start/End: Original strand, 10143779 - 10143834
Alignment:
Q  231 ctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgat 287  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10143779 ctttaaacgggtcccc-gcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattaattgat 10143834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 267
Target Start/End: Original strand, 10125892 - 10125973
Alignment:
Q  185 ctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagc-ttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattg 267  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||    
T  10125892 ctggtgccaatttcagtgggc-aaggccatacagagctttgctctagctttaaacggg-gccctgcaagtgggcagtgggattg 10125973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 275
Target Start/End: Original strand, 40252401 - 40252451
Alignment:
Q  225 ctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctc 275  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  40252401 ctctggctttaaatgggtcacccgcaagtgggcggtgagattggtctcctc 40252451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 42508466 - 42508408
Alignment:
Q  225 ctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  42508466 ctctgactttaaatgggccccccacaagtgggcggttgaattggtcccctcgaattagt 42508408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 281
Target Start/End: Original strand, 51961978 - 51962028
Alignment:
Q  231 ctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatta 281  Q
    ||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  51961978 ctttaaacatgacctccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaatta 51962028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Original strand, 39288938 - 39288978
Alignment:
Q  192 caatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctt 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  39288938 caatttcggtgggc-aagtccatacagagcttgctctggctt 39288978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 73)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 110 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8484861 - 8484660
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8484861 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctaag 8484762  T
Q  210 tccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccga 309  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||    
T  8484761 ttcatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggataccga 8484666  T
Q  310 gttttc 315  Q
    ||||||    
T  8484665 gttttc 8484660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 106 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15641309 - 15641105
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  15641309 taacccatttggggttagcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggc 15641210  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||| |||||||||    
T  15641209 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attctt-gatcggata 15641115  T
Q  306 ccgagttttc 315  Q
    ||||||||||    
T  15641114 ccgagttttc 15641105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 106 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27498935 - 27498730
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27498935 taacccatttggggttgacctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc 27498836  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||    
T  27498835 taagtccatacatagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggata 27498740  T
Q  306 ccgagttttc 315  Q
    ||||||||||    
T  27498739 ccgagttttc 27498730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 106 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 32059644 - 32059439
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32059644 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtgggc 32059545  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     | |||||||||||||    
T  32059544 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----gtccttggatcggata 32059449  T
Q  306 ccgagttttc 315  Q
    ||||||||||    
T  32059448 ccgagttttc 32059439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 106 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11926706 - 11926501
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11926706 taacccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttagattccctctggtgccaatttcggtgggc 11926607  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaac-gggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggat 304  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||    
T  11926606 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggat 11926511  T
Q  305 accgagtttt 314  Q
    ||||||||||    
T  11926510 accgagtttt 11926501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 101 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 33709709 - 33709502
Alignment:
Q  101 caatgtaacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcgg 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33709709 caatttaacccatttggg-ttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcgg 33709611  T
Q  201 tgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatc 300  Q
    |||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||    
T  33709610 tgggctaagtccatacagag--agctctggctttaaacgggacccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatc 33709517  T
Q  301 ggataccgagttttc 315  Q
    |||||||| ||||||    
T  33709516 ggataccgtgttttc 33709502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Original strand, 38684202 - 38684405
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38684202 aacccacttggggttggcccagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 38684301  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  38684302 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggg-cccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggatac 38684396  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    ||| |||||    
T  38684397 cgatttttc 38684405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Original strand, 30485822 - 30486026
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  30485822 aacccatttggggttggcccagcggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattcactctggtgtcaatttcggtgggct 30485921  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  30485922 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacgatgcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtc----aattcttggatcggatac 30486017  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  30486018 cgagttttc 30486026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 107 - 314
Target Start/End: Original strand, 34310136 - 34310339
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34310136 aacccatttggggttggcctagtggtcggcttggaatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggct 34310235  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||    ||  |||||||||||||||||    
T  34310236 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccccataagtggacggtgggattggtcccctcgaatta----atcgattcttggatcggatac 34310331  T
Q  307 cgagtttt 314  Q
    ||||||||    
T  34310332 cgagtttt 34310339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 130 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19456389 - 19456210
Alignment:
Q  130 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19456389 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatccc-tctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctg 19456291  T
Q  230 gctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19456290 gctttaaacggg-gccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggataccgagttttc 19456210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 105 - 315
Target Start/End: Original strand, 4603769 - 4603975
Alignment:
Q  105 gtaacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtggg 204  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  4603769 gtaatccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaagatctcaagttcgattccttctggtgccaatttcgatggg 4603868  T
Q  205 ctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggat 304  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     | ||||||||||||    
T  4603869 ctaagtccatacagagctcgctctggctttaaacggggcccctgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcg----gtccttggatcggat 4603964  T
Q  305 accgagttttc 315  Q
    |||||||||||    
T  4603965 accgagttttc 4603975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7085829 - 7085625
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   |||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  7085829 aacccatttggggctggcttagtggttggcttgggatcttggagttttctcctccagaggtctccggttcgattccctctagtgtcaatttcggtgggct 7085730  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||| |||||||||    
T  7085729 aagtccatacagagcttgctctgactttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttgaatcggatac 7085634  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  7085633 cgagttttc 7085625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 132 - 315
Target Start/End: Original strand, 18207226 - 18207405
Alignment:
Q  132 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggc 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18207226 ttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctccggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgttctggc 18207325  T
Q  232 tttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18207326 tttaaacgaggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggataccgagttttc 18207405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 107 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23270725 - 23270522
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||  |||| | ||||||||||||||||||    
T  23270725 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcatccaaaggtctcaagttcgatttcctccgatgccaatttcggtgggct 23270626  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||    
T  23270625 aagtccatacagagcttgctttggctttaaacggagcccccgcaaatggacggtgggattggtcccctcggattagttg----attcttggattggatac 23270530  T
Q  307 cgagtttt 314  Q
    | ||||||    
T  23270529 caagtttt 23270522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31288149 - 31287945
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||| |    
T  31288149 aacccattttgggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcatgttcgattccctttggtgccaatttcggtgggtt 31288050  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    ||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |     |||||||| |||||||    
T  31288049 aagtccatacaaagcttgctttgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtctcctcgaattagtcg----gttcttggaccggatac 31287954  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  31287953 cgagttttc 31287945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 115 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10869760 - 10869564
Alignment:
Q  115 tggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccat 214  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  10869760 tggggttggcatggtggttgacttgcgatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccatctggttccaatttcggtgggctaagtccac 10869661  T
Q  215 acggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||||| ||||||    
T  10869660 actgagcttgctctggctttaaatggggcctccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----gttcttggatcggataccaagtttt 10869565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 107 - 265
Target Start/End: Original strand, 25586926 - 25587085
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25586926 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggct 25587025  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacggga-cccccgcaagtgggcggtgggat 265  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  25587026 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacaggaccccccccaagtgggcggtcggat 25587085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 111 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 15971321 - 15971151
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 210  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||||| || |||||||||||||||||||    
T  15971321 catttagggttggcttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctgatgtcaatttcggtgggctaagt 15971222  T
Q  211 ccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatta 281  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15971221 ccatacatagcttgctctgactttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgagattgatcccctcggatta 15971151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 104 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13038660 - 13038463
Alignment:
Q  104 tgtaacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  13038660 tgtaacccatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgg 13038561  T
Q  204 gctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcgga 303  Q
    ||||||| ||||| ||||  | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    ||||||||||||||    
T  13038560 gctaagttcatacagagcaag-tatggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagtcg----attcttggatcgga 13038466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 104 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13108655 - 13108458
Alignment:
Q  104 tgtaacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  13108655 tgtaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgg 13108556  T
Q  204 gctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcgga 303  Q
    ||||||| ||||| ||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    ||||||||||||||    
T  13108555 gctaagttcatacagagcaag-tctgcctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagtcg----attcttggatcgga 13108461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 128 - 315
Target Start/End: Original strand, 37495062 - 37495252
Alignment:
Q  128 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctc 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37495062 gtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtccatacagagcttgctc 37495161  T
Q  228 tggctttaaacgggacc-------cccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    ||||||||||||   ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  37495162 tggctttaaacgcccccccccccgcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggataccgagttttc 37495252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 106 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 11465111 - 11464913
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  11465111 taacccatttcgggttggcctagtgattggcttgaaatcttggagtttgctcctccaaatgtctcaggttcgatttcctctggtgccaattttggtgggc 11465012  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |    ||||||||||||||||    
T  11465011 taagttcatacagagcttactctggctttaaacggg-gccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcgaattagtcg----attcttggatcggata 11464917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 109 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19145612 - 19145412
Alignment:
Q  109 cccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaa 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||   | |||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19145612 cccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtatgctcctctcaaggtctccggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc-aa 19145514  T
Q  209 gtccatacggagctt-gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatacc 307  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  19145513 gtccatacagagctttgctctggctttaaatggt-cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttg----gttcttggatcggatacc 19145419  T
Q  308 gagtttt 314  Q
    |||||||    
T  19145418 gagtttt 19145412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 110 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27487755 - 27487554
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||  || |||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  27487755 ccatttggggttggcctagtggttgatttgggattttggagtttgctcttccagaggtctcaggtttgatcccatttggtgccaatttcggtggactaag 27487656  T
Q  210 tccatacggagcttgctctggctttaaac-gggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccg 308  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||| |    
T  27487655 tccatacagagcttgctctagctttaaacgggggcccttgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggatacag 27487560  T
Q  309 agtttt 314  Q
    ||||||    
T  27487559 agtttt 27487554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Original strand, 22392695 - 22392886
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||   ||||||||||||||||||    
T  22392695 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctc---tgccaatttcggtgggct 22392791  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    ||||          ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |    ||| |||||||||||||    
T  22392792 aagt----------cttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcagattagtcg----atttttggatcggatac 22392877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 117 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6014473 - 6014280
Alignment:
Q  117 gggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatac 216  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6014473 gggttggcctagtgattggcttgggatcttggagtttgcttctccagagatctcaggttcgattacttctggtgccaatttcggtgggttaagtccatac 6014374  T
Q  217 ggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |    |||||||||||||||| ||||||||    
T  6014373 agagcttgctctggctttaaacggggtccacgcaagtgggcggtgagattagtcccctcgaattagtcg----attcttggatcggatatcgagtttt 6014280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 110 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 25750811 - 25750613
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcg--atcccctctggtgccaatttcggtgggcta 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |  || || ||||||||||||||||||||| ||    
T  25750811 ccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttggatattccttctggtgccaatttcggtgggtta 25750712  T
Q  208 agtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatacc 307  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| || ||||||| |    ||||||||||||||||||    
T  25750711 agtccatatagagcttgctctggctt--aacgggacccc--caagtggggggtgagattggtcccttcagattagtcg----attcttggatcggatacc 25750620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 306
Target Start/End: Original strand, 36954813 - 36955007
Alignment:
Q  108 acccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggcta 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||||||| | |||||||| | ||||    
T  36954813 acccatttggggttggcctagtggttgccttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggttctaatttcggcgtgcta 36954912  T
Q  208 agtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||| |    |||||||||||||||||    
T  36954913 agtccatacagagtttgctttggctttaaatgggccccccgcaagtggactgtgggattagtcccctcatattagtcg----attcttggatcggatac 36955007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 107 - 266
Target Start/End: Original strand, 15931053 - 15931211
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15931053 aacccatttggggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgcttcttcacaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggt-ggct 15931151  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggatt 266  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||    
T  15931152 aagtccatacagagcctgctctggctttaaacagggctctcgcaagtgggcggtgggatt 15931211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 107 - 288
Target Start/End: Original strand, 34049816 - 34049986
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| || ||| |           |||||||    
T  34049816 aacccatttggggttgggctagtagttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttctag-----------gtgggct 34049904  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34049905 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggtcggtaggattggtcccctcggattagttgatt 34049986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 182 - 315
Target Start/End: Original strand, 35425082 - 35425211
Alignment:
Q  182 cctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatta 281  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35425082 cctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagctcgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcctctcggatta 35425181  T
Q  282 gttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    || |    |||||||||||||||||||| |||||    
T  35425182 gtcg----attcttggatcggataccgaattttc 35425211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 38631161 - 38630978
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38631161 ccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatttcgatgggctaag 38631062  T
Q  210 tccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccga 309  Q
    ||||||| ||||                   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||  ||||||||||||||||||||    
T  38631061 tccatacagagc------------------aggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatta----atcgattcttggatcggataccga 38630984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 288
Target Start/End: Original strand, 42193478 - 42193658
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||  ||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  42193478 taacccatttattgttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgcttccccagaggtctcaggttcgatttcctctgatgccaatttcggtgggc 42193577  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    |||||| |||| ||| ||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  42193578 taagtctatacagagtttgctttggctttaaatgg--accccgcaagtgggcggtggggttggtcctctcggattagtcgatt 42193658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12317353 - 12317154
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||   || |||  | ||||||| ||||||||||||| |    
T  12317353 aacccatttggggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctcttgaggtctcgggtttgatttcatctggtgtcaatttcggtgggtt 12317254  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||    |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||     ||||||| ||||||||||    
T  12317253 aagtcca----gagcttgctctgactttaagcgggccccccgcaagtgggtggtgggattgatccc-tcggattagtc----aattcttagatcggatac 12317163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12398628 - 12398447
Alignment:
Q  130 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  12398628 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctatggtgtcaatttcggtggcctaagttcatacagagcttgctctg 12398529  T
Q  230 gctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||| |||  |||||| |     ||||||||| |||||||||||||||    
T  12398528 gctttaaatggggcccccgcaaatggacggtgagattgatcctctcaaattagtcg----gttcttggattggataccgagttttc 12398447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21236566 - 21236361
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    |||||||||| |||||||| | || ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||    |||||| | |||| ||| |||||||  |||||    
T  21236566 taacccatttagggttggcttagtagttcgcttaggatcttggagttttctccttcagaggtcttcggttcgattctctctagtgtcaatttcaatgggc 21236467  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    ||||||| ||||||||    
T  21236466 taagtccatacagagttttctctgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattagtcccctcagattagtcg----attcttgaatcggata 21236371  T
Q  306 ccgagttttc 315  Q
    ||||||||||    
T  21236370 ccgagttttc 21236361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9659429 - 9659311
Alignment:
Q  192 caatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaat 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    ||    
T  9659429 caatttcggtgggctaagtccatacacagcttgctctggctttaaatgggccccccgcaagtggacggtgggattggtcccttcggattagttg----at 9659334  T
Q  292 tcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  9659333 tcttggatgggataccgagtttt 9659311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 111 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26009463 - 26009291
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 210  Q
    |||||||| || |||| |||||||| |||||||||  |||||| |||||| | | || ||   |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  26009463 catttgggttttgcctagtggttggtttgggatctcagagtttactcctcgaaaggtttccggttcgattccctttggtgccaatttcagtgggctaagt 26009364  T
Q  211 ccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  26009363 ccatgcagagcttactctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtagtgggattagtcccctcggattagt 26009291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1827734 - 1827616
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| | ||||||||||||||     
T  1827734 taacccatttggggttgacctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgataccaatttcggtgggt 1827635  T
Q  206 taagtccatacggagcttg 224  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  1827634 taagtccatacagagcttg 1827616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 288
Target Start/End: Original strand, 10399770 - 10399949
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    |||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||| || || |  | |||  || ||| | |||||| |||||||||| |||||||||    
T  10399770 ccatttggtgttggtctagtggttgactttggatcttggagtttgcttcttcaaagatttcaggtttgattctctctggcgccaatttcgatgggctaag 10399869  T
Q  210 tccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtc-ccctcggattagttgatt 288  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  10399870 tccatacggagcatgctctgactttaaacggggcccccgtaagtggacggtgggattggtcaccctcgaattagtcgatt 10399949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 314
Target Start/End: Original strand, 5049131 - 5049333
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||| | |  || |||  |||| |||||| ||||||||  || | | ||||||  ||| || ||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  5049131 aacccatttggggttgacttaatgattgatttggaatcttgaagtttgcttttctaaaggtctcagattcaattccctctggtaccaatttcgatggtct 5049230  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||| |    |||||||||||| ||||    
T  5049231 aagttcatacagagcttgctctggctttaaacggg-cccccgcaaatggacggtgggattggtcccatcgaattagtcg----attcttggatcgaatac 5049325  T
Q  307 cgagtttt 314  Q
    | ||||||    
T  5049326 caagtttt 5049333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 218 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 41351195 - 41351103
Alignment:
Q  218 gagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  41351195 gagcttgctctggctttaaacggggctcc-gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggataccgagttttc 41351103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 196 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13659359 - 13659245
Alignment:
Q  196 ttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattctt 295  Q
    |||| |||| ||||||||||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||  ||||||    
T  13659359 ttcgatgggttaagtccatagagaacttgctttgactttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggatta----atcgattctt 13659264  T
Q  296 ggatcggataccgagtttt 314  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  13659263 ggatcggataccgaatttt 13659245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 232 - 314
Target Start/End: Original strand, 22693054 - 22693132
Alignment:
Q  232 tttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||    
T  22693054 tttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggataccgagtttt 22693132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15485495 - 15485318
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtgg-ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||||||   | ||||||  |||||| ||| |||   ||||||||||||||     
T  15485495 aacccatttggggttggcctagcgggttggcttgggaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccc-ctgacaccaatttcggtgggt 15485397  T
Q  206 taagtccatacggagct-tgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||||||||||  | || || |||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15485396 taagtccatacaaaactatgttctggctttaaatggggtccccgcaagtggatggtgggattggacccctcggattagt 15485318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17015593 - 17015420
Alignment:
Q  130 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctg 229  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||| | |||| ||||||  || ||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||     |||||| ||    
T  17015593 ggttggcttgagatcttgaagtttcctctttcagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcattgggataagtccata-----cttgctttg 17015499  T
Q  230 gctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttt 313  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17015498 gctttaaac-ggatccccgcaagtaagcggtaggaatggtaccctcggatta----attaattcttgaatcggataccgagttt 17015420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28614687 - 28614486
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctg-gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtggg 204  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  |||||  ||||||  |||||| || ||||| ||||| |    
T  28614687 taacccatttggggttgg--tgagtggttggcttgagatcttagagtttgttcctccaaagatctcaggttcgattacctctgatgtcaatt-cggtgag 28614591  T
Q  205 ctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggat 304  Q
     |||||||||||  |||||| |||| |||||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||     |||||||||||    
T  28614590 ataagtccatacaaagcttgttctgactttaaacgggatccc-gcagatggacggtgggattgatcccctcgaattagtcgattt----ttggatcggat 28614496  T
Q  305 accgagtttt 314  Q
    ||||||||||    
T  28614495 accgagtttt 28614486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 130 - 221
Target Start/End: Original strand, 7151346 - 7151437
Alignment:
Q  130 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |  |||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7151346 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctcaagaggtcttaggttcgactccctctggcgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagc 7151437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 283
Target Start/End: Original strand, 31206314 - 31206413
Alignment:
Q  185 ctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagct-tgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  31206314 ctggtgccaatttcattggcctaagtccatacagagctatgctcttgctttaaatgggacccccacaagtggacggtgggattggactcctcggattagt 31206413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10813994 - 10813878
Alignment:
Q  167 tctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagc-ttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggat 265  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| || ||||||||    
T  10813994 tctcaagtttgatcccctctggtgtcaatttttttgggctaagtccatacggagctttgctctggctttaaacagg-gccccacaagtaggtggtgggat 10813896  T
Q  266 tggtcccctcggattagt 283  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  10813895 ttgtccccttggattagt 10813878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 283
Target Start/End: Original strand, 33025472 - 33025650
Alignment:
Q  105 gtaacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtggg 204  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||   |  |||||| || ||| |||  || |||| |||||| |||     
T  33025472 gtaacccatttggggttggcctcgcggttggcttgggatcttggagtgtgctcctctcaagatctcaactttgattccccttgatgccgatttcgatgga 33025571  T
Q  205 ctaagtccatacggagct-tgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
     |||||||||||  |||| |||||||||||||||  || ||||| ||||||| ||  ||||| || | ||||||||||||    
T  33025572 ttaagtccatacaaagctatgctctggctttaaatagg-cccccacaagtggacgacgggatgggacgcctcggattagt 33025650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 314
Target Start/End: Original strand, 36895447 - 36895622
Alignment:
Q  135 gcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagc-ttgctctggctt 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   | || |||  |||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  36895447 gcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtttcatgttcgattccctctggtaccaatttcggtggtc-aagtccatacaaagctttgctctggctt 36895545  T
Q  234 taaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
      ||||   || |||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |     ||||||||||||||||||||||||    
T  36895546 agaacgtagccgccgcaagtgggcggggggattgttctcctcgaattagtcg----gttcttggatcggataccgagtttt 36895622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 3715112 - 3715055
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaga 164  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3715112 aaccaatttggggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccaga 3715055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2499376 - 2499205
Alignment:
Q  112 atttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtc 211  Q
    ||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||    | ||||||  |||||| | | ||| || |||||||| ||||| |||||    
T  2499376 atttggggttggcttagtggctgacttgggatcttggaatttgctcctttcaaagtctcaggttcgattctccctgttgtcaatttcgatgggc-aagtc 2499278  T
Q  212 catacggagc-ttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    ||||  |||| || ||||||||||||| |||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2499277 catatagagccttactctggctttaaatgggacccttgaaagtggacggtgagattggtcccctcggaatagt 2499205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 930685 - 930513
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctc-tggtgccaatttcggtgggctaa 208  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||||||||   | ||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||    
T  930685 ccatttggggttggcccagtggttggcttgagattttagagtttgctcctctcaaagtctcaggttcgattcccacttggtgccaatttcggtggac-aa 930587  T
Q  209 gtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
     | |||||  ||||||||| |||||  |||  | ||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  930586 attcatacatagcttgctccggcttagaacaag-ccctcgcaagtggacagtgtgattggtcccctcggattagt 930513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 203
Target Start/End: Original strand, 37397707 - 37397803
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgg 203  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |  || ||| ||| |||||| |||||| |||||    
T  37397707 aacctatttggggttggtctagtggttggcttgtgatcttggagtttgctcctccaaaggtctaaggtttgattccccctggtgtcaattttggtgg 37397803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 41568996 - 41568890
Alignment:
Q  182 cctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatta 281  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||  ||| | || ||||||| || ||||| |||| |||| |||||||||||||||||  |||||    
T  41568996 cctcttgtgtcaatttcggtggactaagtccatacagaatttgttttgtctttaaatggaacccc-gcaaatgggtggtgggattggtcccctaagatta 41568898  T
Q  282 gttgatta 289  Q
    ||||||||    
T  41568897 gttgatta 41568890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 197
Target Start/End: Original strand, 5067295 - 5067385
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaattt 197  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  ||||||   |||||||| ||||||    
T  5067295 aacccatttggagttggtctagtggttgacttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattttctctggtgtcaattt 5067385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 207
Target Start/End: Original strand, 21589297 - 21589390
Alignment:
Q  117 gggttggcctggtggt--tggcttgggatcttggagtttgctcctcca-gatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggcta 207  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| || ||||| |||| ||||  |||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21589297 gggttggcctggtggtattggcttgggacctgggagtctgctactcctcgatgtctcaggttcgattccctctggtgccaatttaggtgggcta 21589390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22253345 - 22253239
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||   |  |||||  |||||    |||| |||||||||||| |||||||||    
T  22253345 ccatttggggttggtctagtggttggcttgggatctttgactttgctcctctctagatctcaggttcgactttctctagtgccaatttcgatgggctaag 22253246  T
Q  210 tccatac 216  Q
    |||||||    
T  22253245 tccatac 22253239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24158302 - 24158193
Alignment:
Q  174 ttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttg-ctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtccc 272  Q
    |||||| || ||||||| |||||||| |||| |||||||||||  |||||  |||||||||  |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||    
T  24158302 ttcgattccttctggtgtcaatttcgatggg-taagtccatacatagctttactctggcttagaacggggcctctgcaagtgggcggtgagattggtccc 24158204  T
Q  273 ctcggattagt 283  Q
    ||| |||||||    
T  24158203 ctcagattagt 24158193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16247180 - 16247028
Alignment:
Q  131 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagctt-gctctg 229  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||    | ||||||  ||| |||||| | ||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||| ||| ||    
T  16247180 gttggcttgggaccttgcagtgtgctcctatcaaggtctcaggttcaatcccccccggtgccaatcttggtgggcta-gtccatacagaactttgctttg 16247082  T
Q  230 gctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    | |||||| |||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16247081 ggtttaaatgggctccccacaagtggacggtgggattggacccctcggattagt 16247028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 288
Target Start/End: Original strand, 5067392 - 5067436
Alignment:
Q  244 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  5067392 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctctgattagtcgatt 5067436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10631340 - 10631288
Alignment:
Q  259 gtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||    
T  10631340 gtgggattggtcccctcggattagtcgatt----cttggatcggataccgagttttc 10631288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 162
Target Start/End: Original strand, 42006791 - 42006842
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctcca 162  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  42006791 catttggggttgggctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcatcca 42006842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 160
Target Start/End: Original strand, 16616112 - 16616166
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctc 160  Q
    ||||||||||| | ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616112 taacccatttgagattggcttagtagttggcttgggatcttggagtttgctcctc 16616166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 315
Target Start/End: Original strand, 33737878 - 33737939
Alignment:
Q  249 caagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  33737878 caagtgggcggtgagattggtcccctcgg-ttagttg----attcttgaatcggataccgagttttc 33737939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 205
Target Start/End: Original strand, 40330628 - 40330725
Alignment:
Q  108 acccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   | ||||||| ||| || | || |||||| ||||||| |||||    
T  40330628 acccatttgaggttggcttagtggttagcttgagatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaagttcaattctctatggtgctaatttcgttgggc 40330725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 290
Target Start/End: Original strand, 42953652 - 42953692
Alignment:
Q  250 aagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaa 290  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42953652 aagtgggcggttggattggtcccctcggattagtcgattaa 42953692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 235
Target Start/End: Original strand, 3639851 - 3639894
Alignment:
Q  193 aatttcggtgggctaagtccatacggagct-tgctctggcttta 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3639851 aatttcggtggactaagtccatacggagctatgctctggcttta 3639894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 285
Target Start/End: Original strand, 39459405 - 39459468
Alignment:
Q  222 ttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttg 285  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  39459405 ttgctctggcttaaaacggagccccctcaagtggacggtgagattaatcccctcggattagttg 39459468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10076888 - 10076811
Alignment:
Q  189 tgccaatttcggtgggctaagtccatacggagct-tgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggat 265  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  10076888 tgccagttttggtgggataagtccatacagagctatgctctaactttaaatgggtcccccacaagtggacggtgggat 10076811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21042729 - 21042676
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcct 159  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21042729 taactcatttggggttggtttagtgattggtttgggatcttggagtttgctcct 21042676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 148; Significance: 1e-77; HSPs: 70)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 33827776 - 33827572
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  33827776 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagattgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgttgggct 33827677  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    |||||||||||||||||    
T  33827676 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccctgcaagtgggcggtgggattggtccccttggattagtcg----attcttggatcggatac 33827581  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  33827580 cgagttttc 33827572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 44946256 - 44946052
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  44946256 aacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 44946157  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  44946156 aagtccatacagaacttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggatac 44946061  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  44946060 cgagttttc 44946052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 106 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11941414 - 11941210
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| || |||| |||||||||||| ||||||     
T  11941414 taacccatttggggttggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctatggtgccaattttggtgggt 11941315  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||    
T  11941314 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggata 11941219  T
Q  306 ccgagtttt 314  Q
    |||||||||    
T  11941218 ccgagtttt 11941210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Original strand, 15037953 - 15038157
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15037953 aacccatttggggttggcctagtggttgactcgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggct 15038052  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    |||||||||||||||||    
T  15038053 aagtccatacagagcttgctttggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcg----attcttggatcggatac 15038148  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  15038149 cgagttttc 15038157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 105 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 30467035 - 30466830
Alignment:
Q  105 gtaacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtggg 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  30467035 gtaacccatttggggttggcctagtggttggtttgggatattggagtttgttcctctagaggtctcaggttcgattctctctgctgccaatttcggtggg 30466936  T
Q  205 ctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggat 304  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    |||||||||||||||    
T  30466935 ctaagtccatacagagcttgctctggctttaaaccgggcccccgcaagtgggcagtgggattggtcccttcggattagtcg----attcttggatcggat 30466840  T
Q  305 accgagtttt 314  Q
    ||||||||||    
T  30466839 accgagtttt 30466830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 288
Target Start/End: Original strand, 24195997 - 24196177
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24195997 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggattttggggttcgctcctccagaggtttcaggttcgattccctctggtgcaaatttcggtgggc 24196096  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24196097 taagtccatacagaacttgctctggctttaaacggg--ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatt 24196177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 111 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 44976353 - 44976175
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44976353 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggggtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaagt 44976254  T
Q  211 ccatacggagcttgctctggctttaaacgggac-ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  44976253 ccatacagagtttgctctggctttaaacggggctccccgcaagtgggcggtgggattgatcccttcggattagtcgatt 44976175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 144 - 315
Target Start/End: Original strand, 35171831 - 35171998
Alignment:
Q  144 cttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggac 243  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  35171831 cttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggcaccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggc 35171930  T
Q  244 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35171931 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttgaatcggataccgagttttc 35171998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 111 - 288
Target Start/End: Original strand, 17324764 - 17324940
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324764 catttggggttggcctagtggttggtttggtatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 17324863  T
Q  211 ccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||    
T  17324864 ccatacagagcttgctctggctttaaatggg-cccccacaagtgggcggtgggattagtcccctcaaattagtcgatt 17324940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 128 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10582172 - 10582012
Alignment:
Q  128 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10582172 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctc 10582073  T
Q  228 tggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaa 290  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10582072 tagctttaaacggg-ccctcgcaagtgggc-gtgggattggtcccctcgaattagtcgattaa 10582012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 106 - 315
Target Start/End: Original strand, 41313985 - 41314189
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  41313985 taacccatttggggttgccgtagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggc 41314084  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    ||  |||||| |||||||||    
T  41314085 taagtctatacagagcttgctctgactttaaacggga-tcccgcaagtggacggtgggattggtcccctcagatta----atcgattcttcgatcggata 41314179  T
Q  306 ccgagttttc 315  Q
    || |||||||    
T  41314180 ccaagttttc 41314189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 130 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 36242492 - 36242319
Alignment:
Q  130 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctg 229  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  36242492 ggttggcttgggatcttgaaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccagccagagcttgctctg 36242393  T
Q  230 gctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatacc 307  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||  ||||||||||||||||||    
T  36242392 gctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatta----atcgattcttggatcggatacc 36242319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 107 - 314
Target Start/End: Original strand, 25293160 - 25293356
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25293160 aacccatttgaggttggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctcgagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 25293259  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaac-gggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    |||| ||||        ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||    
T  25293260 aagttcata--------gctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggata 25293347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 110 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4567637 - 4567480
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaag 209  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  4567637 ccatttggggttggcctagtagttggcttgggatcttgaagtttgctccttcagaagtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggctaaa 4567538  T
Q  210 tccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattg 267  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4567537 tccatacagagcttgttctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattg 4567480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 107 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 36390769 - 36390569
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  36390769 aacccatttggggttggcctagtggttggtttgggatct--gagtttgcttctccaaaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtggact 36390672  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    || |||| |||||||||    
T  36390671 aagtccatacaaagcttgctctgactttaaatgggacccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggatcagtcg----atacttgaatcggatac 36390577  T
Q  307 cgagtttt 314  Q
    ||||||||    
T  36390576 cgagtttt 36390569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 130 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 43374505 - 43374329
Alignment:
Q  130 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  43374505 ggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtttatacaaagcttgctctg 43374406  T
Q  230 gctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||||      |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  43374405 gctttaa-----gcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccttcggattagtcg----attcttggatcggataccgagttttc 43374329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 254
Target Start/End: Original strand, 27290598 - 27290729
Alignment:
Q  123 gcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagct 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27290598 gcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattcccttcggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagct 27290697  T
Q  223 tgctctggctttaaacgggacccccgcaagtg 254  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27290698 tgctctggctttaaacgggccccccgcaagtg 27290729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 109 - 315
Target Start/End: Original strand, 19054021 - 19054224
Alignment:
Q  109 cccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaa 208  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||  || ||| || |||||||  || |||||||||||||    
T  19054021 cccatttggggtgggcctagtgattggcttgagatcttggagtctgctcctccaaaggtctcaggtttgattccttctggtgttaacttcggtgggctaa 19054120  T
Q  209 gtccatacggagcttgctctggctttaaacggga-cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatacc 307  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    ||||||||||| ||||||    
T  19054121 gtccatacagagcttgctttggctttaaatggaaccccccgcaagtgggcggtgggattggtccgctcggattagtcg----attcttggatcagatacc 19054216  T
Q  308 gagttttc 315  Q
    ||||||||    
T  19054217 gagttttc 19054224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 129 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 34516589 - 34516413
Alignment:
Q  129 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||| |     ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34516589 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtttcaggttcgattc-----ggtggtaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctct 34516495  T
Q  229 ggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
     |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| |||||||    
T  34516494 cgctttaaacggg-cccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggataccaagttttc 34516413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 112 - 314
Target Start/End: Original strand, 41329842 - 41330039
Alignment:
Q  112 atttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtc 211  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41329842 atttggggttggcctagtggttagtttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtttcagattcgattccctctggtgccaattttggcgggctaagtc 41329941  T
Q  212 catacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagt 311  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |     |||||||| ||||||||||||    
T  41329942 cata-agagcttgctctggctttaaatggggcccccacaagtgggcggtgagattggtcccctcagattagtcg----gttcttggaccggataccgagt 41330036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 283
Target Start/End: Original strand, 5394034 - 5394187
Alignment:
Q  130 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctg 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  5394034 ggttggcttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaagtccatacagagtttgctctg 5394133  T
Q  230 gctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
     ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5394134 actttaaatggggccgccgcaagtgggcggtgggattggtccgttcggattagt 5394187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 108 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8192553 - 8192351
Alignment:
Q  108 acccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggcta 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  8192553 acccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatgtcggtgggc-a 8192455  T
Q  208 agtccatacggagc-ttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |     | ||||||||||||||    
T  8192454 agtccatatagagctttgctctggcttagaac-ggcccctcgcaagtgggcggtgggattgggcccctcggattagtcg----gtccttggatcggatac 8192360  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  8192359 cgagttttc 8192351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 112 - 315
Target Start/End: Original strand, 8258896 - 8259095
Alignment:
Q  112 atttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtc 211  Q
    ||||||||||| | |  ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||  |||||||| |||||| ||||||    
T  8258896 atttggggttgacataatggttagtttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgattccctctgacgccaattttggtgggttaagtc 8258995  T
Q  212 catacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagt 311  Q
    ||||| || |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| |    ||||||||||||||||| ||||    
T  8258996 catacagatcttgttctggctttaatcggggcccccgcaagtaggcggtgggattagttccttcggattagtcg----attcttggatcggatactgagt 8259091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 186 - 315
Target Start/End: Original strand, 28668946 - 28669071
Alignment:
Q  186 tggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttg 285  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28668946 tggtgccaatttcggtggactaagtccatacagagcttgctttggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg 28669045  T
Q  286 attaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||     ||||||||||||||||||||||    
T  28669046 attt----ttggatcggataccgagttttc 28669071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27269553 - 27269344
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgcc------aatttcgg 200  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || | |  || ||| |||||||||| |      ||||||||    
T  27269553 aacccatttggggttggcatagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctctaaaggttttaggtttgattccctctggtgtcggtgtcaatttcgg 27269454  T
Q  201 tgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatc 300  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    ||||||||||     
T  27269453 tgggctaagtccatatagaacttgctctggctttaaacagccctcccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcg----attcttggata 27269358  T
Q  301 ggataccgagtttt 314  Q
    ||||||||||||||    
T  27269357 ggataccgagtttt 27269344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 159 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2140634 - 2140485
Alignment:
Q  159 tccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggaccccc-gcaagtgggc 257  Q
    |||||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  2140634 tccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgg----agtccatacagagcttgctctggctttaaatgggcccccccgcaagtgggc 2140539  T
Q  258 ggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  2140538 ggtgggattggtcccctcggattagtcgatta----ttggatcggataccgagttttc 2140485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 183 - 315
Target Start/End: Original strand, 3943810 - 3943938
Alignment:
Q  183 ctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattag 282  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3943810 ctctggtgccaatttcggttggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggtggtgggattggtccccttggattag 3943909  T
Q  283 ttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    | | |||    |||||||||||||| |||||||    
T  3943910 tcggtta----ttggatcggataccaagttttc 3943938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 314
Target Start/End: Original strand, 13266507 - 13266686
Alignment:
Q  130 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctg 229  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||  ||| ||||||  |||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13266507 ggttggcttgagatcttggaatttgctcctttagaggtctcatgttcgattcactctggtgccaattccggtggactaagtccatacagagcttgctctg 13266606  T
Q  230 gctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||  |||||| |    |||||||||||||||| ||||||||    
T  13266607 gctttaaacggg-gccccgcaagtgggtaatgggattggtcccctcaaattagtcg----attcttggatcggatatcgagtttt 13266686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 288
Target Start/End: Original strand, 1191530 - 1191688
Alignment:
Q  130 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctg 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  1191530 ggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgtttccctctagtaccaatttcggtgggctaagtccatacagagtttgctctg 1191629  T
Q  230 gctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    |||||||||||   ||||| |||||  |||||| |||| |||||||| |||||| ||||    
T  1191630 gctttaaacggtgtccccgaaagtgaacggtggaattgttcccctcgaattagtcgatt 1191688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 288
Target Start/End: Original strand, 45271401 - 45271559
Alignment:
Q  130 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctg 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45271401 ggttggcttgggatcttagagtttgcttctccagaggtttcatgttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagagcttgctctg 45271500  T
Q  230 gctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    ||||||||||   |||| ||||||| |||| | ||||| |||||||  |||||| ||||    
T  45271501 gctttaaacgaagcccctgcaagtgagcggagagattgatcccctcaaattagtcgatt 45271559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 216
Target Start/End: Original strand, 32845085 - 32845194
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32845085 aacccatttggggttggcctagtagttagcttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtttcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 32845184  T
Q  207 aagtccatac 216  Q
    ||||||||||    
T  32845185 aagtccatac 32845194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18976633 - 18976524
Alignment:
Q  102 aatgtaacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggt 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||    
T  18976633 aatgcaacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgttcgattccctct-gagccaatttcggt 18976535  T
Q  202 gggctaagtcc 212  Q
    || ||||||||    
T  18976534 ggactaagtcc 18976524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 271
Target Start/End: Original strand, 19849848 - 19849991
Alignment:
Q  128 gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctc 227  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| || |||||| || | | ||| |||||| | ||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  19849848 gtggttggtttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtcttaagttcgattccttttagtgtcaattttgatggactaagtctatacagagcttgctc 19849947  T
Q  228 tggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcc 271  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19849948 tggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcc 19849991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 283
Target Start/End: Original strand, 14946774 - 14946948
Alignment:
Q  108 acccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggcta 207  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||   | || | |  ||||||   |||||||| ||||||| ||||||||    
T  14946774 acccatttggagttggcctagtggttgacttgagatcttgaagtttgctcctctcaaggttttaggttcgattttctctggtgtcaatttcagtgggcta 14946873  T
Q  208 agtccatacggagct-tgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14946874 agtccatacggagctatgctctagctttaaac-ggaccccc-caagtaggcagtgggattggtcccctcagattagt 14946948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23787196 - 23787056
Alignment:
Q  122 ggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagc 221  Q
    ||||| |||||||| |||  || ||||| |||||| || || | ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  23787196 ggcctagtggttggtttgaaattttggaatttgcttctacaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctaaatccatacagagt 23787097  T
Q  222 ttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgg 262  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23787096 ttgctctgactttaaatgggacctccgcaagtgggcggtgg 23787056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5608237 - 5608055
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    ||||||||| ||||||| || |  |||||||||  |||||||| ||||||||| |||| ||||||  |||||| | |||||||| |||||| ||||||||    
T  5608237 aacccatttcgggttggtctagcagttggcttgaaatcttggaatttgctccttcagaggtctcatattcgattctctctggtgtcaattttggtgggct 5608138  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatta 289  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||  | ||| ||| ||| ||| ||||||| |||| || ||| ||| |||||    
T  5608137 aagtccatatagagcttgctctgactttaaacggagctcccacaaatggtcggcgggattgatcccttcagatgagtcgatta 5608055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40997552 - 40997419
Alignment:
Q  108 acccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggcta 207  Q
    ||||||||| ||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||| || ||| || || |||||||||||| | ||    
T  40997552 acccatttgaggtgggtctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcatgttcaattccccctagtaccaatttcggtgagata 40997453  T
Q  208 agtccatacggagcttgctctggctttaaacggg 241  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  40997452 agtcaatacagagcttgctctgactttaaacggg 40997419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 714244 - 714125
Alignment:
Q  191 ccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |    |    
T  714244 ccaatttcggtgggctaagtccatagagagtttgctctgactttaaacggagcccccgcaaatgggcggtgggtttcgtcccctcagattagtcg----a 714149  T
Q  291 ttcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||    
T  714148 ttcttagattggataccgagtttt 714125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6714485 - 6714295
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| || ||| |    |||||||||||||    
T  6714485 taacccatttgggattggcctaatggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccatctagcattaatttcggtgggc 6714386  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    |||||              |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| |    |||||||||| |||||    
T  6714385 taagt--------------ctctcgctttaaacgggactcccgcaagtggacggtgagattggtcccctcaaattagtcg----attcttggattggata 6714304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 314
Target Start/End: Original strand, 29361573 - 29361745
Alignment:
Q  132 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggc 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||  | ||||  |||||| || |||||||||||| |||||||||    ||||||||  ||||    
T  29361573 ttggattgggatcttggagtttgctcctccaaagatctcaggt-cgatttcctctgatgtcaatttcggtggactaagtcca----gagcttgccgtggc 29361667  T
Q  232 tttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    ||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  29361668 tttaaacgg-agccccgcaagtgggcagtgggattgatctcctcggatta----attgattcctggatcggatatcgagtttt 29361745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 918898 - 918782
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatt---tcgatcccctctggtgccaatttcggtgggcta 207  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| | || ||||||| |   ||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  918898 catttggggttgacctagtggttggcttgggattttgaagtttgctcct-ctgaggtctcaagttcgtcgattccctcttgtgccaatttcgttgggcta 918800  T
Q  208 agtccatacggagcttgc 225  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  918799 agtccatacagagcttgc 918782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 198
Target Start/End: Original strand, 4852549 - 4852643
Alignment:
Q  104 tgtaacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttc 198  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||    
T  4852549 tgtaactcatttggggttgacctagtggttgacttggaatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttc 4852643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44929923 - 44929846
Alignment:
Q  233 ttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |    |||||||||||||||||||||||||    
T  44929923 ttaaacgggacccccgcaagtggacggtgggattggtccccttgaattagtcg----attcttggatcggataccgagtttt 44929846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28194337 - 28194137
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggtt-ggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||| ||||||||   | |||| |  |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28194337 aacccatttggggttggcgtagtgatttggcttgggatcttggagtgtgctcctcttaaggtcttaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggc 28194238  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
     |||||||||| ||    ||    ||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||| |     | |||||||||||||    
T  28194237 -aagtccatacaga----gcaaaagcttagaacggggcccccgcaagtaggcggtgggattggtctcgtcagattagtcg----gtccttggatcggata 28194147  T
Q  306 ccgagttttc 315  Q
    ||||||||||    
T  28194146 ccgagttttc 28194137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 206 - 288
Target Start/End: Original strand, 4769259 - 4769341
Alignment:
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| | |||||||||||  |||||| ||||    
T  4769259 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacgggggccccgcaagtggacggtgaggttggtcccctcaaattagtcgatt 4769341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 240 - 315
Target Start/End: Original strand, 18692087 - 18692158
Alignment:
Q  240 ggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18692087 ggacccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcgtattagtcg----attcttggatcggataccgagttttc 18692158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19606038 - 19605870
Alignment:
Q  117 gggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatac 216  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||   | ||||||  |||||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19606038 gggttgccctagtggttggcttgggatcttggagtgcgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctaatgctaatttcggtgggc-aagtccatac 19605940  T
Q  217 ggag-cttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttga 286  Q
     ||| ||||||||  |||  || |||   ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19605939 agagtcttgctctcacttagaaaggg-ggcccacaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagttga 19605870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 283
Target Start/End: Original strand, 44610139 - 44610209
Alignment:
Q  213 atacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44610139 atacagagcttgctctagctttaaatggggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggattagt 44610209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4618880 - 4618744
Alignment:
Q  115 tggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccat 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||   | || |||  ||||||  || |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4618880 tggggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtatgctcctctcaaggtttcaggttcgatttcccctggtgccaatttcggcgggc-aagtccat 4618782  T
Q  215 acggagc-ttgctctggctttaaacgggacccccgcaa 251  Q
    ||  | | |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4618781 acaaaactttgctctggctttaaatgggtcccccgcaa 4618744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 283
Target Start/End: Original strand, 18708472 - 18708647
Alignment:
Q  110 ccatttggggttggcctg--gtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggcta 207  Q
    ||||||||||||| || |  |||||||  ||||||||||||||| || |||||   | ||||||  |||||  ||||||| | |||||||| |||||| |    
T  18708472 ccatttggggttgcccagtagtggttgaattgggatcttggagtgtgttcctctcaaggtctcaggttcgactccctctgataccaatttcagtgggc-a 18708570  T
Q  208 agtccatacggagctt-gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
     || ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18708571 tgttcatacagagctttgctctgacttaaaacgggacccccgcaaatggacggtgggattgatcccctcagattagt 18708647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 220 - 314
Target Start/End: Original strand, 31778138 - 31778228
Alignment:
Q  220 gcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||    | | ||||||||||||||||||||||||    
T  31778138 gcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgagattggtcctctcagattag----tcagttcttggatcggataccgagtttt 31778228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 281
Target Start/End: Original strand, 19174824 - 19174930
Alignment:
Q  174 ttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagctt-gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtccc 272  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||  ||||| | ||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  19174824 ttcgattccttctggtgccaatttcggtggg-taggtccatacagagctttgctctggcttagaacgg-agccccgtaaatgggcggtgggattgatccc 19174921  T
Q  273 ctcggatta 281  Q
    |||||||||    
T  19174922 ctcggatta 19174930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 285
Target Start/End: Original strand, 29698164 - 29698318
Alignment:
Q  130 ggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagc-ttgctct 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||   | ||||||| ||  ||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| || ||||    
T  29698164 ggttggcttgggatcttggaatttgctcctctcaaggtctcaagttttatttcctctggtgtcaatttcggtgggc-aagttcatacagagctttactct 29698262  T
Q  229 ggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttg 285  Q
    | ||| |||| ||| |||||||| |||||| || |||||||||||||| || |||||    
T  29698263 gacttaaaacagga-ccccgcaaatgggcgatgagattggtcccctcgaataagttg 29698318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 315
Target Start/End: Original strand, 14486948 - 14487023
Alignment:
Q  236 aacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     | |||||||||||||||||||||||    
T  14486948 aacggggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----gtccttggatcggataccgagttttc 14487023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18976521 - 18976454
Alignment:
Q  244 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    |||||||||||||||||||| |||||    
T  18976521 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcg----attcttggatcggataccgaattttc 18976454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26176389 - 26176225
Alignment:
Q  117 gggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatac 216  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||   | ||||||  |||||| | | ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  26176389 gggttggcctggtg-ttgacttgggaccttggggtgtgctcctctcaaggtctcagattcgattctccctggtgccaattttggtggccta-gtccatac 26176292  T
Q  217 ggagctt-gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
     || ||| ||| ||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||    
T  26176291 agacctttgctttggatttaaatggg-cccccgcaagtggacggtgggattggacccttcagattagt 26176225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 285
Target Start/End: Original strand, 35943758 - 35943856
Alignment:
Q  188 gtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagct-tgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttg 285  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| | ||| || | ||||||||||  |  |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35943758 gtgccaattttggtaggctaagtccatacagtgctatgatttggctttaaattgagcccctgcaagtggacggtgggattggacccctcggattagttg 35943856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 307
Target Start/End: Original strand, 45132398 - 45132477
Alignment:
Q  224 gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatacc 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||    ||  ||||||||||||||||||    
T  45132398 gctctggctttaaacggggcccccacaagtgggcagtaggattggtcctctcggatta----atcgattcttggatcggatacc 45132477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9401047 - 9400961
Alignment:
Q  224 gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||  |||  ||||||| |    ||||||||||||||||| |||||||    
T  9401047 gctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcagtgggattggtttccttagattagtcg----attcttggatcggatactgagtttt 9400961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 201 - 266
Target Start/End: Original strand, 19517030 - 19517095
Alignment:
Q  201 tgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggatt 266  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  || || |||||||| ||||||||    
T  19517030 tgggctaagtccatacagagcttgctttggctttaaacggggtcctcgtaagtgggcagtgggatt 19517095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 315
Target Start/End: Original strand, 39957891 - 39957956
Alignment:
Q  246 ccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    |||||||||| |||||||||||||||    
T  39957891 ccgcaagtgggcgatgggattggttccctcggattagtcg----attcttggattggataccgagttttc 39957956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1845838 - 1845701
Alignment:
Q  129 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc---taagtccatacggagcttgc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||  |||||| |  |||| || |||||||| | |||   |||||||||||  | |||||    
T  1845838 tggttggcttgggatcttggagtttgctcctctaaaaatttcagattcgattcattctgatgtcaatttcgataggctaataagtccatacaaaacttgc 1845739  T
Q  226 tctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtggg 263  Q
    | ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||    
T  1845738 tttggctttaaacgaagcccctgcaagtgggcggtggg 1845701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19525532 - 19525428
Alignment:
Q  174 ttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccc 273  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   |||     |||||||||| | | |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19525532 ttcgattccctctggtgccaattttggtgggc-aagtccatacaatgctaa---tggctttaaatgaggcccccgcaagtgggtggtgagattggtcccc 19525437  T
Q  274 tcggattag 282  Q
    | |||||||    
T  19525436 ttggattag 19525428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 288
Target Start/End: Original strand, 32845194 - 32845251
Alignment:
Q  231 ctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  32845194 ctttaaacagggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccttcgaattagtcgatt 32845251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 146
Target Start/End: Original strand, 20297556 - 20297596
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatctt 146  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20297556 taacccatttggggttggcccagtggttggcttgggatctt 20297596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13747684 - 13747578
Alignment:
Q  131 gttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagc-ttgctctg 229  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||  | ||||||  || ||  ||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||    
T  13747684 gttggcttgggaccttggagtatgctcctcccaaggtctcaggtttgaatccccccggtgccgatttcggtgggct-agtccatacagtgctttgctctg 13747586  T
Q  230 gctttaaa 237  Q
    ||||||||    
T  13747585 gctttaaa 13747578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 31536201 - 31536291
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaattt 197  Q
    ||||||||||||| || | || | ||||||||||||||||||||||  | |||||   | ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31536201 taacccatttgggattagtctagcggttggcttgggatcttggagtgcgttcctcttaaagtctcaagttcgat-ccctctggtgccaattt 31536291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 205
Target Start/End: Original strand, 10324891 - 10324987
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||| |||||| || |||| ||||||||  |||||| ||||||  ||  |||||||||||||    
T  10324891 aacccatttggggttggcatagtggttggtttgggatattgaagtttg-tcgtcca-atgtctcaggttcgattccctcttatgttaatttcggtgggc 10324987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 32526289 - 32526235
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctc 160  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  32526289 taacccatttggagttggcttagtggttgatttgggatcttgaagtttgctcctc 32526235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 281
Target Start/End: Original strand, 4852660 - 4852697
Alignment:
Q  244 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatta 281  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  4852660 ccccgcaagtggacggtggaattggtcccctcggatta 4852697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 107 - 315
Target Start/End: Original strand, 40319 - 40522
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40319 aacccatttggggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 40418  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  40419 aagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggattagtcg----attcttggatcggatac 40513  T
Q  307 cgagttttc 315  Q
    |||||||||    
T  40514 cgagttttc 40522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 135; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 107 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 7512 - 7309
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7512 aacctatttggggttggcctagtagttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctccggtgccaatttcggtgggct 7413  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  7412 aagtccatacagagctttctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcggatac 7317  T
Q  307 cgagtttt 314  Q
    | ||||||    
T  7316 caagtttt 7309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 107 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 97569 - 97393
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  97569 aacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttgtagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 97470  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  97469 aagtccatacagagcttgctctgactttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcctctcgtattagt 97393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0366 (Bit Score: 132; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0366
Description:

Target: scaffold0366; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 111 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9498 - 9299
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9498 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagt 9399  T
Q  211 ccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgag 310  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |    |||||| ||||||||||||||    
T  9398 ccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcg----attctt-gatcggataccgag 9304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0366; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 111 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12199 - 12028
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12199 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaagt 12100  T
Q  211 ccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12099 ccatacagagcttgctctggctttaaatggg-gccccacaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagt 12028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0623 (Bit Score: 131; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0623
Description:

Target: scaffold0623; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 111 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1255 - 1057
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1255 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagt 1156  T
Q  211 ccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgag 310  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |    |||||| ||||||||||||||    
T  1155 ccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcg----attctt-gatcggataccgag 1061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 132 - 315
Target Start/End: Original strand, 161828 - 162007
Alignment:
Q  132 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  161828 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 161927  T
Q  232 tttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  161928 ttttaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcagataccgagttttc 162007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 123; Significance: 9e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 108 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 53073 - 52870
Alignment:
Q  108 acccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggcta 207  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  53073 acccatttgggattggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggcttcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggcaa 52974  T
Q  208 agtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatacc 307  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |    ||||||| ||||||||||    
T  52973 aatccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaggtgggcggtaggattggtcctctcggattagtcg----attcttgaatcggatacc 52878  T
Q  308 gagttttc 315  Q
    ||||||||    
T  52877 gagttttc 52870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 106 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 41848 - 41666
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| || ||||||||| || ||    
T  41848 taacccatttggggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctcttgttccaatttcgttgtgc 41749  T
Q  206 taagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgatt 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41748 taagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccctgcaagtgggcaatgggattggtcccctcggattagtcgatt 41666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 111 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10892 - 10694
Alignment:
Q  111 catttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagt 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10892 catttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaagt 10793  T
Q  211 ccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgag 310  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     |||||||| |||||||||||||    
T  10792 ccatacagagcttgctctggctttaaatggggcccca-caagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtc----aattcttg-atcggataccgag 10699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 107 - 305
Target Start/End: Original strand, 14985 - 15178
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||| |||||||||||| |    
T  14985 aacccatttggggttggcctagtggttggcctgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgctaatttcggtgggtt 15084  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggata 305  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  15085 aagtccatccagagcttgctctggctttaaatgggccccccgcaagtgggcgg-gggattggtctcctcggattagtc----aattcttggatcggata 15178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 174 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13180 - 13047
Alignment:
Q  174 ttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccc 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13180 ttcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacagagcttgcta---ctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattgatcccc 13084  T
Q  274 tcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    || |||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  13083 tcagattagttg----attcttggatcggataccgagtttt 13047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 152 - 315
Target Start/End: Original strand, 39131 - 39290
Alignment:
Q  152 ttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaa 251  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  39131 ttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctatgtccatacagaacttgttctggctttaaacggggcccccgcaa 39230  T
Q  252 gtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39231 gtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----attcttggatcagataccgagttttc 39290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 107 - 314
Target Start/End: Original strand, 66756 - 66951
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  66756 aacccatttgggattggtctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcacgttcgattccttctggtgccaattttggtgggct 66855  T
Q  207 aagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggatac 306  Q
    |||||        |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     | ||||||||||||||    
T  66856 aagtc--------gcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg----gtccttggatcggatac 66943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 150 - 1
Alignment:
Q  118 ggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacg 217  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||  || |||||||| ||||||||||||||||     
T  150 ggttggcctagtggttggcttgtgatcttggagtttgctcgtccagaggtctcaggttcgattccctcttatgtcaatttcgatgggctaagtccataca 51  T
Q  218 gagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattg 267  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  50 gagtttgctctagctttaaacggggcccccacatgtgggcggtgggattg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 314
Target Start/End: Original strand, 20246 - 20418
Alignment:
Q  137 ttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||  || ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20246 ttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcaatgggctaagtccatacatagcttgctctggctttaa 20345  T
Q  237 acgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||| | | ||||||||||    | |||||||||| |||||||||||||||    
T  20346 acgggacccccgcaagtgggcggtaaaattgat-ctctcggattag----tcaattcttggaccggataccgagtttt 20418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 182 - 315
Target Start/End: Original strand, 32357 - 32485
Alignment:
Q  182 cctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggatta 281  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32357 cctctggagccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaatgtggcccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggatta 32456  T
Q  282 gttgattaattcttggatcggataccgagttttc 315  Q
    || |    |||||| |||||||||||||||||||    
T  32457 gtcg----attctt-gatcggataccgagttttc 32485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1175 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1175
Description:

Target: scaffold1175; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 201 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2535 - 2453
Alignment:
Q  201 tgggctaagtccatacggagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2535 tgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagt 2453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 72; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8611 - 8512
Alignment:
Q  106 taacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  8611 taacccatttggggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattatctctggtgccaatttcggtgggc 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8513 - 8451
Alignment:
Q  248 gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgagtttt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    |||||| ||||||||||||||||||    
T  8513 gcaagtgggcggtgggattggtccgctcggattagtcg----attcttagatcggataccgagtttt 8451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0460 (Bit Score: 69; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0460
Description:

Target: scaffold0460; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8382 - 8286
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgg 203  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8382 aacccatttggggttggtttagtggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgg 8286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 222
Target Start/End: Original strand, 27770 - 27885
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggct 206  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||   | |||||   |||||| |||| ||||||||||||  |||||||    
T  27770 aacccatttggggttggtctagtggttggtttgggattttggagtttgctcctctcaaggtctcgggttcgattccctgtggtgccaatttgagtgggct 27869  T
Q  207 aagtccatacggagct 222  Q
    ||||||||||| ||||    
T  27870 aagtccatacgaagct 27885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 51; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 112 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29340 - 29143
Alignment:
Q  112 atttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtc 211  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || |||||   | |||| |  |||||| ||| ||| ||||| ||||||| || ||||||    
T  29340 atttgggattggcctagtggttggcttggaatcttgaagtgtgttcctctcaaggtcttaggttcgattcccgctgatgccattttcggtcgg-taagtc 29242  T
Q  212 catacggagctt-gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgattaattcttggatcggataccgag 310  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||| || |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||    | | | ||||||||||||||||||    
T  29241 catacagagctttgctctggcttaaaatgg-acccccgcaaatggacagtgggattggtcccctcagattag----tcagtccttggatcggataccgag 29147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12960 - 12900
Alignment:
Q  104 tgtaacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaga 164  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12960 tgtaacctatttgggattggcctagtggttgacttgggatcttggagttcgctcctccaga 12900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 259
Target Start/End: Original strand, 2381 - 2422
Alignment:
Q  218 gagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcgg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2381 gagcttgctctggctttaaacgggaccctcacaagtgggcgg 2422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26746 - 26650
Alignment:
Q  107 aacccatttggggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaatttcgatcccctctggtgccaatttcggtgg 203  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||  || ||| | ||||  |||||||||||||||    
T  26746 aacccatttggggttggcctactggttggcttaggatcttggagtttgcttttcaagaggtctcatgtttgattctctcttatgccaatttcggtgg 26650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 259
Target Start/End: Original strand, 18363 - 18404
Alignment:
Q  218 gagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcgg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18363 gagcttgctctggctttaaacgggaccctcacaagtgggcgg 18404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1712 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1712
Description:

Target: scaffold1712; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 681 - 648
Alignment:
Q  236 aacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  681 aacgggacccccgcaagtgggcggagggattggt 648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University