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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF8214_low_5 (Length: 570)
Name: NF8214_low_5
Description: NF8214
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF8214_low_5 |
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Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 492; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 492; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 555
Target Start/End: Original strand, 8925533 - 8926072
Alignment:
| Q |
16 |
atgaactggatgacatgcggacaattacaaagacttatctctttagttaagttggactacataggtggaaaaaatatttaatatgattaatgaattgcat |
115 |
Q |
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| T |
8925533 |
atgaactggatgacatgcggacaactacaaagacttatctctttagttaagtcggactacataggtggaaaaaatatttaatatgattaatgtattgcat |
8925632 |
T |
|
| Q |
116 |
gatatattttataataaaaaacattatttgtttctttataattgttt--atgaacaacaacaattttatattttgaaatgataaaaatcacataaaataa |
213 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
8925633 |
gatatattttataataaaaaacattatttgtttctttataattgtttttatggacaacaacaattttatattttgaaatgataaaaatcacataaaataa |
8925732 |
T |
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| Q |
214 |
attaatataagcaaaactaaatccagtcatttataggcatcaaatatatgtaagaattattttattttatactaagtcaattcatttgcatttgttttat |
313 |
Q |
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| T |
8925733 |
attaatataagcaaaacaaaatccagtcatttataggcatcaaatatatgtaagaattattttattttatactaaatcaattcatttgcatttgttttat |
8925832 |
T |
|
| Q |
314 |
gttttgtattactatattagtctattaatttgtaagaattatcctcttgatgcatatatacacattagaatttgtgacaataatacaatacttttgttaa |
413 |
Q |
| |
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| T |
8925833 |
gttttgtattactatattagtctattaatttgtaagaattatcctcttgatgcatatatacacattagaatttgtgacaataatacaatacttttgttaa |
8925932 |
T |
|
| Q |
414 |
ttaaataaatagtttttccattcttaaccattccttcaagttggatgcctataaatacattacattgcaccttaagaatcgcactcctcacagcatatac |
513 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
8925933 |
ttaaataaatagtttttccattcttaaccattccttcaagttggatgcctataaatacattacattgcaccttaagaatcgcactcctcacagcatata- |
8926031 |
T |
|
| Q |
514 |
tctctcattcatatatagctgaatattgaagtgagagaaaag |
555 |
Q |
| |
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|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
8926032 |
-ctctcattcacatatagctgaatattgaagtgagagaaaag |
8926072 |
T |
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