View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8237_low_8 (Length: 262)

Name: NF8237_low_8
Description: NF8237
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8237_low_8
NF8237_low_8
[»] chr3 (33 HSPs)
chr3 (14-245)||(19565140-19565373)
chr3 (14-245)||(5135583-5135815)
chr3 (14-245)||(34083758-34083988)
chr3 (14-245)||(45336169-45336401)
chr3 (14-245)||(40081379-40081609)
chr3 (17-243)||(19390447-19390672)
chr3 (14-245)||(27935473-27935703)
chr3 (14-241)||(45183280-45183508)
chr3 (24-245)||(6269074-6269294)
chr3 (24-245)||(22968092-22968312)
chr3 (24-245)||(39772089-39772309)
chr3 (14-241)||(33041252-33041479)
chr3 (14-241)||(6503209-6503437)
chr3 (14-245)||(6930533-6930766)
chr3 (14-245)||(29564794-29565023)
chr3 (24-244)||(38282708-38282933)
chr3 (152-243)||(35514559-35514651)
chr3 (14-207)||(8257160-8257355)
chr3 (104-241)||(11017952-11018078)
chr3 (14-115)||(35937650-35937749)
chr3 (12-114)||(19814764-19814865)
chr3 (58-167)||(40368607-40368715)
chr3 (27-147)||(5177271-5177391)
chr3 (27-241)||(27912305-27912518)
chr3 (39-112)||(7468738-7468810)
chr3 (181-245)||(38415611-38415675)
chr3 (101-207)||(218889-218996)
chr3 (57-120)||(48559591-48559653)
chr3 (101-175)||(10353045-10353119)
chr3 (14-64)||(11017909-11017959)
chr3 (143-212)||(30122565-30122635)
chr3 (185-222)||(26267852-26267889)
chr3 (38-118)||(38415472-38415551)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (14-202)||(192245-192434)
chr5 (14-245)||(13818276-13818506)
chr5 (14-245)||(1776014-1776244)
chr5 (17-245)||(39434995-39435222)
chr5 (14-245)||(16155296-16155524)
chr5 (17-245)||(36293262-36293489)
chr5 (14-241)||(31680666-31680894)
chr5 (14-245)||(36291667-36291898)
chr5 (14-241)||(33430620-33430848)
chr5 (14-241)||(31501358-31501586)
chr5 (24-245)||(26282966-26283186)
chr5 (14-179)||(38269049-38269214)
chr5 (14-165)||(15959585-15959736)
chr5 (14-241)||(12278496-12278728)
chr5 (99-245)||(43069173-43069320)
chr5 (14-171)||(10034276-10034431)
chr5 (14-171)||(39657169-39657324)
chr5 (14-179)||(17332259-17332424)
chr5 (14-171)||(16333539-16333694)
chr5 (104-241)||(37254940-37255066)
chr5 (194-245)||(28801601-28801652)
chr5 (26-117)||(30297604-30297693)
chr5 (192-245)||(10034226-10034279)
chr5 (192-245)||(16333691-16333744)
chr5 (192-245)||(39657321-39657374)
chr5 (28-88)||(37255058-37255118)
chr5 (14-85)||(23034262-23034333)
chr5 (14-88)||(23034428-23034502)
chr5 (30-154)||(35338255-35338378)
chr5 (14-69)||(43069329-43069384)
chr5 (14-168)||(20363056-20363209)
chr5 (14-123)||(20368463-20368571)
chr5 (29-118)||(27750660-27750747)
chr5 (17-148)||(35911373-35911505)
chr5 (14-81)||(18266250-18266317)
chr5 (181-244)||(22761050-22761113)
chr5 (14-245)||(31271707-31271934)
chr5 (14-64)||(24792894-24792944)
chr5 (33-119)||(11779220-11779303)
chr5 (101-206)||(8788601-8788712)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (14-245)||(10352523-10352756)
chr4 (14-245)||(29995622-29995856)
chr4 (15-245)||(1818012-1818244)
chr4 (17-245)||(40529314-40529541)
chr4 (14-245)||(17510871-17511101)
chr4 (14-245)||(36381985-36382214)
chr4 (14-241)||(43143224-43143452)
chr4 (14-241)||(3292536-3292764)
chr4 (14-245)||(25931007-25931237)
chr4 (14-245)||(48989623-48989856)
chr4 (24-245)||(34406932-34407152)
chr4 (24-245)||(43356203-43356423)
chr4 (24-245)||(47501072-47501292)
chr4 (14-241)||(50204717-50204945)
chr4 (14-241)||(6689875-6690103)
chr4 (14-237)||(28876954-28877178)
chr4 (14-241)||(35546252-35546480)
chr4 (24-245)||(13012487-13012707)
chr4 (24-245)||(26438927-26439147)
chr4 (14-245)||(48130273-48130505)
chr4 (56-245)||(26448347-26448537)
chr4 (14-239)||(33136084-33136313)
chr4 (28-241)||(30216397-30216610)
chr4 (24-245)||(20129609-20129832)
chr4 (14-245)||(30077275-30077503)
chr4 (24-245)||(30110270-30110480)
chr4 (14-241)||(42333414-42333644)
chr4 (14-245)||(6235819-6236037)
chr4 (60-241)||(44156948-44157128)
chr4 (104-241)||(13394947-13395087)
chr4 (14-206)||(29094481-29094675)
chr4 (14-88)||(13394881-13394955)
chr4 (14-245)||(31853522-31853754)
chr4 (24-168)||(29134280-29134422)
chr4 (99-243)||(39994182-39994326)
chr4 (69-207)||(49062638-49062779)
chr4 (27-148)||(13502270-13502391)
chr4 (57-170)||(18990499-18990612)
chr4 (14-119)||(4038344-4038448)
chr4 (69-120)||(16877620-16877670)
chr4 (30-96)||(9415344-9415410)
chr4 (101-179)||(20635670-20635748)
chr4 (27-88)||(54933462-54933523)
chr4 (33-118)||(56225728-56225812)
chr4 (101-206)||(31854005-31854111)
chr4 (101-207)||(21831590-21831697)
chr4 (109-179)||(2321574-2321644)
chr4 (14-96)||(5290886-5290968)
chr4 (14-118)||(26571666-26571770)
chr4 (101-202)||(41998219-41998320)
chr4 (62-118)||(2941209-2941264)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (14-247)||(41971897-41972131)
chr1 (17-245)||(33490001-33490230)
chr1 (14-244)||(42310579-42310808)
chr1 (14-245)||(3829278-3829509)
chr1 (14-245)||(32981695-32981924)
chr1 (14-171)||(7433794-7433949)
chr1 (14-241)||(17445611-17445821)
chr1 (14-135)||(23313401-23313522)
chr1 (104-241)||(35907851-35907989)
chr1 (14-101)||(11957989-11958076)
chr1 (15-93)||(28463396-28463474)
chr1 (14-88)||(35907981-35908055)
chr1 (64-154)||(5715507-5715596)
chr1 (58-120)||(18716430-18716491)
chr1 (192-245)||(7433744-7433797)
chr1 (59-170)||(24663185-24663296)
chr1 (56-119)||(9901673-9901735)
chr1 (58-148)||(7350314-7350403)
chr1 (58-122)||(43894384-43894448)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (14-245)||(9877515-9877747)
chr8 (14-245)||(3648432-3648662)
chr8 (14-245)||(42231232-42231464)
chr8 (15-245)||(36408835-36409074)
chr8 (14-241)||(16787665-16787893)
chr8 (24-245)||(39914813-39915033)
chr8 (14-245)||(15838583-15838814)
chr8 (14-241)||(4404307-4404535)
chr8 (24-206)||(40470191-40470373)
chr8 (14-245)||(2728833-2729068)
chr8 (14-245)||(23402403-23402635)
chr8 (14-191)||(378774-378951)
chr8 (13-171)||(29728019-29728175)
chr8 (80-245)||(34136531-34136697)
chr8 (14-170)||(32540104-32540259)
chr8 (80-245)||(3435560-3435730)
chr8 (14-116)||(34136441-34136543)
chr8 (58-245)||(40401190-40401377)
chr8 (14-84)||(7278480-7278550)
chr8 (14-134)||(9175542-9175661)
chr8 (192-245)||(29728172-29728225)
chr8 (22-119)||(32750345-32750439)
chr8 (30-84)||(15863282-15863336)
chr8 (29-94)||(19034-19099)
chr8 (27-111)||(29351793-29351876)
chr8 (69-124)||(33639058-33639112)
chr8 (14-94)||(3672248-3672327)
chr8 (58-115)||(35852622-35852679)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (14-245)||(31581259-31581489)
chr2 (14-245)||(4554832-4555064)
chr2 (17-245)||(17444682-17444909)
chr2 (17-245)||(44084244-44084475)
chr2 (14-245)||(8058972-8059205)
chr2 (14-241)||(12756477-12756705)
chr2 (14-241)||(45418882-45419110)
chr2 (24-245)||(6403452-6403672)
chr2 (24-245)||(41251282-41251502)
chr2 (14-245)||(7072174-7072403)
chr2 (14-240)||(2286096-2286317)
chr2 (14-242)||(26238241-26238468)
chr2 (26-242)||(26162354-26162571)
chr2 (14-171)||(35963064-35963219)
chr2 (61-239)||(8147653-8147832)
chr2 (14-167)||(18981967-18982118)
chr2 (14-245)||(37621701-37621932)
chr2 (78-245)||(45121530-45121697)
chr2 (14-116)||(2957784-2957886)
chr2 (14-168)||(21556470-21556623)
chr2 (14-116)||(42442411-42442513)
chr2 (152-243)||(771296-771388)
chr2 (80-171)||(42442334-42442423)
chr2 (80-171)||(2957874-2957963)
chr2 (28-88)||(32126841-32126901)
chr2 (14-119)||(26591466-26591570)
chr2 (192-245)||(32126956-32127009)
chr2 (27-94)||(15441837-15441904)
chr2 (101-179)||(18364729-18364807)
chr2 (192-245)||(2957960-2958013)
chr2 (192-245)||(35963014-35963067)
chr2 (192-245)||(42442284-42442337)
chr2 (28-94)||(816711-816777)
chr2 (104-165)||(32126893-32126952)
chr2 (30-118)||(25391404-25391491)
chr2 (196-245)||(18981913-18981962)
chr2 (102-152)||(15511958-15512008)
chr2 (99-176)||(18365139-18365217)
chr2 (58-126)||(2042761-2042828)
chr2 (143-179)||(15441622-15441658)
chr2 (14-94)||(17373478-17373558)
chr2 (28-88)||(18829310-18829370)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (14-241)||(7003024-7003252)
chr7 (14-241)||(7048895-7049123)
chr7 (14-245)||(8394424-8394654)
chr7 (15-245)||(36658476-36658705)
chr7 (14-245)||(33685859-33686090)
chr7 (14-241)||(43184108-43184336)
chr7 (14-245)||(36631115-36631345)
chr7 (24-245)||(14776755-14776975)
chr7 (14-241)||(8867371-8867599)
chr7 (14-241)||(26625045-26625272)
chr7 (14-171)||(5555836-5555991)
chr7 (14-171)||(3113760-3113915)
chr7 (14-245)||(40919661-40919875)
chr7 (104-241)||(34388786-34388924)
chr7 (14-168)||(20605998-20606152)
chr7 (14-166)||(11020669-11020825)
chr7 (61-207)||(8725268-8725413)
chr7 (14-88)||(34388720-34388794)
chr7 (14-157)||(20611791-20611934)
chr7 (14-118)||(49010158-49010261)
chr7 (14-109)||(20609351-20609445)
chr7 (14-95)||(13072500-13072581)
chr7 (57-170)||(33386972-33387083)
chr7 (125-241)||(37001908-37002013)
chr7 (185-245)||(10868268-10868328)
chr7 (192-245)||(3113912-3113965)
chr7 (192-245)||(5555786-5555839)
chr7 (14-119)||(23581433-23581537)
chr7 (69-168)||(44832327-44832426)
chr7 (31-118)||(32199111-32199197)
chr7 (28-114)||(23582396-23582481)
chr7 (57-241)||(6184009-6184195)
chr7 (14-70)||(38638022-38638078)
chr7 (185-222)||(22929216-22929253)
chr7 (56-117)||(25709004-25709064)
chr7 (143-207)||(44832653-44832718)
chr7 (101-145)||(21359832-21359876)
chr7 (58-118)||(45709938-45709997)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (14-243)||(33228975-33229206)
chr6 (14-245)||(29743578-29743812)
chr6 (24-245)||(398916-399136)
chr6 (14-241)||(28997029-28997257)
chr6 (14-171)||(34948421-34948576)
chr6 (14-170)||(13838171-13838325)
chr6 (43-175)||(18339459-18339592)
chr6 (14-108)||(10231735-10231828)
chr6 (14-138)||(12850020-12850143)
chr6 (27-147)||(22814736-22814855)
chr6 (16-94)||(9491313-9491391)
chr6 (17-119)||(12098413-12098514)
chr6 (196-245)||(13838120-13838169)
chr6 (30-155)||(21556416-21556540)
chr6 (192-245)||(34948573-34948626)
chr6 (104-179)||(23217379-23217453)
chr6 (56-209)||(11796829-11796981)
chr6 (31-114)||(28931437-28931519)
chr6 (14-88)||(31373323-31373397)
chr6 (101-167)||(34638846-34638912)
chr6 (102-155)||(29341449-29341502)
chr6 (56-88)||(4335204-4335236)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (24-245)||(480105-480325)
[»] scaffold2142 (1 HSPs)
scaffold2142 (63-245)||(821-1002)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (16-239)||(17610-17832)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (14-245)||(53220-53434)
[»] scaffold0495 (1 HSPs)
scaffold0495 (14-108)||(8455-8548)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (152-243)||(31777-31870)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (17-88)||(18013-18084)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (14-64)||(35277-35327)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (185-223)||(11042-11080)
[»] scaffold0152 (1 HSPs)
scaffold0152 (185-223)||(37438-37476)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (58-120)||(2139-2200)
[»] scaffold0055 (6 HSPs)
scaffold0055 (182-223)||(19103-19144)
scaffold0055 (182-223)||(34033-34074)
scaffold0055 (182-223)||(36202-36243)
scaffold0055 (182-223)||(43863-43904)
scaffold0055 (182-223)||(56589-56630)
scaffold0055 (182-223)||(75250-75291)
[»] scaffold0052 (5 HSPs)
scaffold0052 (182-223)||(2985-3026)
scaffold0052 (182-223)||(17521-17562)
scaffold0052 (182-223)||(41001-41042)
scaffold0052 (182-223)||(54193-54234)
scaffold0052 (182-223)||(61990-62031)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 33)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 19565140 - 19565373
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaatt-gtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcata 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19565140 aagaaccttcacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatacaaattaattataagttagtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcata 19565239  T
Q  113 attaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgt 211  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  19565240 attaatttatccctggtcgaagaaatttaattttttgtgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatgt 19565339  T
Q  212 aggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19565340 aggtcacatttttagactacacgtatattatagg 19565373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5135815 - 5135583
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  5135815 aagaaccttcacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgaaggaataaaaattcataa 5135716  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  5135715 ttaatttatccctagtcgaagaaatttaattttttgtgtaaagctattttttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaatttcaacatgta 5135616  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5135615 cgtcacatttttagactacgcgtatattatagg 5135583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 34083758 - 34083988
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34083758 aagaaccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatataaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataa 34083857  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34083858 ttaatttctccctagtcgaagaaatttaa--ttttgtgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaattcaacttgta 34083955  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34083956 ggtcacatttttagactacacgtatattatagg 34083988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 45336401 - 45336169
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaatt-gtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcata 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45336401 aagaacctttacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatacaaattaattataagttagtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcata 45336302  T
Q  113 attaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgt 211  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  45336301 attaatttatccctggtcgaagaaatttaattttttgtgt-aagctatattttaacgtgctaaaaatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaattcaacctgt 45336203  T
Q  212 aggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45336202 agatcacatttttagactacacgtatattatagg 45336169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 40081379 - 40081609
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  40081379 aagaaccttcacaatgaaattttataatttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataa 40081478  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  40081479 ttaatttatccctggtcgaagaaatttaa--ttttgtgtaaagctacattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatgta 40081576  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  40081577 ggtcacatttttagactacaagtatactatagg 40081609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19390672 - 19390447
Alignment:
Q  17 aaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataatta 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19390672 aaccttcacaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatta 19390573  T
Q  117 atttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggt 215  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19390572 atttatcgctggtcgaagaaatttaa--ttttgtgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtaagaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatgtaggt 19390475  T
Q  216 cacatttttagactacgcgtatattata 243  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||    
T  19390474 cgcatttttagactacacgtatattata 19390447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27935703 - 27935473
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  27935703 aagaatcttcacaatgaaattttgtagtttttaaacg-gatacaaattaattacaaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaaatcataa 27935605  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  27935604 ttaatttatccctggtcgaagaaatttaattttttgtgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtg-aaaaattcaacctgta 27935506  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  27935505 ggtcacatttttagaccagacgtatattatagg 27935473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 45183508 - 45183280
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  45183508 aagaaccttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattttttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataa 45183409  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| || || |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  45183408 ttaatttatctctagtcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacgtgctaatcatgtatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgta 45183309  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45183308 ggtcacatttttagactacacgtatatta 45183280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 245
Target Start/End: Original strand, 6269074 - 6269294
Alignment:
Q  24 acaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttc 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6269074 acaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatc 6269173  T
Q  124 cctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacattt 222  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  6269174 cctggtcgaagaaatttaa--ttttatgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtaagaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatttaggtcacatgt 6269271  T
Q  223 ttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  6269272 ttagactacacgtatattatagg 6269294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 245
Target Start/End: Original strand, 22968092 - 22968312
Alignment:
Q  24 acaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttc 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22968092 acaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatc 22968191  T
Q  124 cctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacattt 222  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  22968192 cctggtcgaagaaatttaa--ttttatgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtaagaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatttaggtcacatgt 22968289  T
Q  223 ttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  22968290 ttagactacacgtatattatagg 22968312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39772309 - 39772089
Alignment:
Q  24 acaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttc 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39772309 acaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatc 39772210  T
Q  124 cctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacattt 222  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  39772209 cctggtcgaagaaatttaa--ttttatgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtaagaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatttaggtcacatgt 39772112  T
Q  223 ttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  39772111 ttagactacacgtatattatagg 39772089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33041479 - 33041252
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||| |||||||||||    
T  33041479 aagaaccttcacagtgaaattttgtagtctttaaatgagatacaaattaattataaattgttta-gaaattcataattatgaggaaatgaaaattcataa 33041381  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  33041380 ttaatttatctctggtcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacgtgttaatcatgtatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgta 33041281  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33041280 ggtcacatttttagactacacgtatatta 33041252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Original strand, 6503209 - 6503437
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||    
T  6503209 aagaaccttcacagtgaaatttcgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagagaatgaaaattcataa 6503308  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| || || |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||  |||||||||||||| ||||    
T  6503309 ttaatttatctctagtcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacgtgctaatcatgtatgataaaaataatgaaaaaattcaacatgta 6503408  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6503409 ggtcacatttttagaatacacgtatatta 6503437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 6930533 - 6930766
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  6930533 aagaaccttcacaaggaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaagttcataattatgagggaatgaaaattcataa 6930632  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaa-aaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgt 211  Q
    ||||||| || || |||||| ||| |||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||||| |||    
T  6930633 ttaatttatctctagtcgaagaaattttttttttttatgtaaagctatattttaacgtgctaatcatgtatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgt 6930732  T
Q  212 aggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6930733 aagtcacatttttagactacacgtatattatagg 6930766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 29564794 - 29565023
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||||||||||||    
T  29564794 aagaaccttcacaatgaaattttatagtttttaaatgaga--caaattaattataaattgtttaagaaattcataatcatgag--aataaaaattcataa 29564889  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatgg---aaaaaatcgtgaaaaaattcaactt 209  Q
    ||||| |  || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||   |||||||| ||| |||||| ||| |    
T  29564890 ttaatgt--ccttagtcgaaaaaatctaattttttgtgtaaaactgtattttaacgtcctaaacatgcctggaaaaaaaaatcatgagaaaatttaacct 29564987  T
Q  210 gtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
     ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  29564988 ctaggttacttttttcgactacgcttatattatagg 29565023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 38282933 - 38282708
Alignment:
Q  24 acaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttc 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  38282933 acaatgaaatcttgtagtttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattat-gggaaataaaaattcataattaatttgtc 38282835  T
Q  124 cctggtcgaaa-aaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaa----atcgtgaaaaaattcaacttgtaggtca 217  Q
    ||| |||||||    |||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    ||    |||||||||||  | || ||||    
T  38282834 ccttgtcgaaatttttttttttttttttgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtattgaaaaaaaatatatgaaaaaaattcaaactctatgtca 38282735  T
Q  218 catttttagactacgcgtatattatag 244  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  38282734 catttttatactacgcgtatattatag 38282708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 35514651 - 35514559
Alignment:
Q  152 taaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattata 243  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  35514651 taaagctatattttaacgtgataaacatgtatgaaaaaattagtgaaaaaattcaacatgtaggtcacatttttaaactacacgtatattata 35514559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8257355 - 8257160
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| || |   ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||    
T  8257355 aagaaccttcacaatgaaattttaaagtttttaaacgaaagaaaaattaattataaattgcttaagaaattcataattat-gaggaataaaaattgataa 8257257  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaa---ttttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaac 207  Q
    ||| ||| || || || | |||||| |||   |||||| |||||| | ||||||||||||  ||||||| | || |||||||  ||||||||||||||    
T  8257256 ttattttgtctctagtag-aaaaatctaatttttttttttgtaaagccatattttaacgtcttaaacatgtctgaaaaaaattatgaaaaaattcaac 8257160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 241
Target Start/End: Original strand, 11017952 - 11018078
Alignment:
Q  104 aaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacattatggaaaaaatcgtgaaaaaatt 203  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   || ||| |        ||||||||||    
T  11017952 aaattaataattaatttatctctggtcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacgtgcta---atcatgta--------tgaaaaaatt 11018040  T
Q  204 caacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11018041 caacatgtaggtcacatttttagactacatgtatatta 11018078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 35937749 - 35937650
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||    
T  35937749 aagaaccttcaccatgaagttttggagtttttaaaagagatacaaattaattatgaattgtttaagaaactcataataat--gggaataaaaattcataa 35937652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 114
Target Start/End: Original strand, 19814764 - 19814865
Alignment:
Q  12 agaagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcat 111  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| | ||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||    
T  19814764 agaagaaccttcaccatgaaattttgaagtttttaaacgagatacgaatcaattatgaattttttaagaaatacataattat-gggcaataaaaattcat 19814862  T
Q  112 aat 114  Q
    |||    
T  19814863 aat 19814865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 40368715 - 40368607
Alignment:
Q  58 aattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaac 157  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| ||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||| | |    
T  40368715 aattatttatgaattgtttaagaaattcataattatggaa-aataaaaattcataattagttcgtccctagtcggaaaaatctaattttttgtgtagagc 40368617  T
Q  158 tatattttaa 167  Q
     |||||||||    
T  40368616 aatattttaa 40368607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5177391 - 5177271
Alignment:
Q  27 atgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccct 126  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |    |||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  ||||||||| | ||||  ||||||    
T  5177391 atgaaattttaaagtttttaaatgatagatgaattaagtataaattgtttaacaaattcaaaattatgggggaacgaaaattcatgaataatccttccct 5177292  T
Q  127 ggtcgaaaaaatttaattttt 147  Q
     ||| ||||| ||||||||||    
T  5177291 tgtcaaaaaattttaattttt 5177271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27912518 - 27912305
Alignment:
Q  27 atgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccct 126  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||  |   || |||||||||||||||| |||||||    
T  27912518 atgaaattttggagtttttaaacgagggacaaattaattatgaattgtttatgaaattcataaatataag---atgaaaattcataattaatctttccct 27912422  T
Q  127 ggtcgaaaaaatttaattt--tttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacattatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacattttt 224  Q
     |||| |||| | ||||||  ||| || ||| |  ||||||||| | |||||| |      ||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| |    
T  27912421 tgtcggaaaattctaattttatttttggaaagccgtattttaacatcctaaacgtgcctacaaaaatcgtgaaaaacttcaacctctaggtcacttttct 27912322  T
Q  225 agactacgcgtatatta 241  Q
    ||||| || ||||||||    
T  27912321 agacttcgtgtatatta 27912305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 7468810 - 7468738
Alignment:
Q  39 agtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcata 112  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  7468810 agtttttaaatgaaaaacgaattaattatgaattgttaaagaaattcataatta-ggaggaataaaaattcata 7468738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 245
Target Start/End: Original strand, 38415611 - 38415675
Alignment:
Q  181 atggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  38415611 atggaaaaaattatgaaaaatttcaacttttaggttatttttttggactacgcgtatattatagg 38415675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 218996 - 218889
Alignment:
Q  101 taaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaa 199  Q
    |||||||||||||| ||||  ||| | || |||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||| |||||||| | || ||||||   ||||||    
T  218996 taaaaattcataatcaattcgtccttagttgaaaaaatttaaatttttgtgtaaagtcatgttttaacgtactaaacatgtttgaaaaaaactatgaaaa 218897  T
Q  200 aattcaac 207  Q
    ||||||||    
T  218896 aattcaac 218889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 120
Target Start/End: Original strand, 48559591 - 48559653
Alignment:
Q  57 aaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaattt 120  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||||    
T  48559591 aaattaattatgaattgtttaaaaaattcataattat-gaggaatgaaaatttataattaattt 48559653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 175
Target Start/End: Original strand, 10353045 - 10353119
Alignment:
Q  101 taaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaa 175  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | || ||||||  ||||||| |||||||||  || |||||||||| ||||    
T  10353045 taaaaattcataattaatttgtccttagttgaaaaatgttaatttattgtgtaaagttaaattttaacgttctaa 10353119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 64
Target Start/End: Original strand, 11017909 - 11017959
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaat 64  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  11017909 aagaaccttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaat 11017959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30122635 - 30122565
Alignment:
Q  143 ttttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacatt-atggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30122635 ttttttgtgcaaagccatattttaacgtcctaatcatgcatggaaaaaatcatgaaaaaattcaacatgta 30122565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Original strand, 26267852 - 26267889
Alignment:
Q  185 aaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacattt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  26267852 aaaaaatcgtgaaaaaattcaacctctaggtcacattt 26267889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 118
Target Start/End: Original strand, 38415472 - 38415551
Alignment:
Q  38 tagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaat 118  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||  ||||||||||| ||||||||    
T  38415472 tagtttttaaactagagacaaattaattataaattatttaacaaattcatgattat-ggaaaataaaaattcgtaattaat 38415551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 192434 - 192245
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  192434 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgggggaataaaaattcataa 192335  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaat 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  192334 ttaatttttccctggtcaaaaaaattttatttttagtgtaaaactatattttaacgtgctaaacatgtatggaaaaaatcgtgaaaaaat 192245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13818506 - 13818276
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13818506 aagaaccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaattataaactgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataa 13818407  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  13818406 ttaatttatccctggtcgaagaaatttaa--ttttgtgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaattcaaactgta 13818309  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13818308 ggtcacatttttagactacacgtatattatagg 13818276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 1776014 - 1776244
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1776014 aagaaccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacagattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataa 1776113  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  1776114 ttaatttatccctagtcgaagaaatttaa--ttttgtgtatagctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatgta 1776211  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1776212 ggtcacatttttagactacacgtatattatagg 1776244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39435222 - 39434995
Alignment:
Q  17 aaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataatta 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  39435222 aaccttcacaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatta 39435123  T
Q  117 atttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggt 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  39435122 atttatccctggtcgaagaaatttaa--ttttgtgcaaagctatattttaacgtgctaaacatgtaagaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatgtaggt 39435025  T
Q  216 cacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39435024 cacatttttagactacacgtatattatagg 39434995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16155524 - 16155296
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16155524 aagaaccttcacaataatattttataatttttaaacgaga--caaattaattataaattggttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataa 16155427  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16155426 ttaatttatccctggtcgaagaaatttaa--ttttgtgtaaaactatattttaacgtgttaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaattcaacttgta 16155329  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16155328 ggtcacatttttagactacacgtatattatagg 16155296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 245
Target Start/End: Original strand, 36293262 - 36293489
Alignment:
Q  17 aaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataatta 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  36293262 aaccttcacaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaattataaattatttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatta 36293361  T
Q  117 atttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggt 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  36293362 atttatccctggtcgaagaaatttaa--ttttgtgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtaagaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatttaggt 36293459  T
Q  216 cacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36293460 cacatttttagactacacgtatattatagg 36293489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31680894 - 31680666
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  31680894 aagaaccttcgcagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataa 31680795  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| || || |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  31680794 ttaatttatctctagtcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacgtgctaatcatgtatggaaaaaataatgaaaaaattcaacatgta 31680695  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31680694 ggtcacatttttagactacacgtatatta 31680666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36291898 - 36291667
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaatt-gtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcata 112  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  36291898 aagaaccttcacaataaaattttatagtttttaaacgagatacaaattaattataagttagtttaagaa-ttcataattatgagggaataaaaatttata 36291800  T
Q  113 attaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgt 211  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  36291799 attaatttatccctggtcgaagaaatttaattttttgtgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtat-gaaaaaatagtgaaaaaattcaacatgt 36291701  T
Q  212 aggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36291700 agatcacatttttagactacacgtatattatagg 36291667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33430848 - 33430620
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  33430848 aagaaccttcgcagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataa 33430749  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| || || |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  33430748 ttaatttatctctagtcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacgtgctaatcatgtatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgta 33430649  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33430648 ggtcacatttttagactacacgtatatta 33430620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Original strand, 31501358 - 31501586
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31501358 aagaaccatcacaatgaaattatgtagtctttaaacaagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataa 31501457  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  31501458 ttaatttatccctggtcgaagaaatttaatattttatgtaaagctataatttaatgtgctaaacatgcatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgta 31501557  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31501558 ggtcacatttttagactacacgtatatta 31501586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 245
Target Start/End: Original strand, 26282966 - 26283186
Alignment:
Q  24 acaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttc 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26282966 acaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattacgagggaataaaaattcataattaatttatc 26283065  T
Q  124 cctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacattt 222  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  26283066 cctggtcgaagaaatttaa--ttttatgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtaagaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatttaggtcacatgt 26283163  T
Q  223 ttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  26283164 ttagactacacgtatattatagg 26283186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 179
Target Start/End: Original strand, 38269049 - 38269214
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  38269049 aagaaccttcacaatgaaattttgtagtttttatacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattat-ggggaataaaaattcataa 38269147  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattt-tttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat 179  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38269148 ttaatttgtccctggtcgaaaaaatttaatttatttatgtaaagctatattttaacgtgctaaacat 38269214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 165
Target Start/End: Original strand, 15959585 - 15959736
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15959585 aagaaccttcacaatgaaattttgtagtttttaaacgagctgcaaattaattataaattgattaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataa 15959684  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatatttt 165  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15959685 ttaatttatccctggtcgaagaaatttaattttttgtgtaaagctgtatttt 15959736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Original strand, 12278496 - 12278728
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  12278496 aagaaccttcacagtgaaattttgtaatctttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataa 12278595  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaa---tttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatg-gaaaaaatcgtgaaaaaattcaact 208  Q
    ||||||| || ||||||||| |||   |||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||  ||||||||||||||     
T  12278596 ttaatttatctctggtcgaagaaattttttttttttttatgtaaagctatattttaacgtgctaatcctgtatgaaaaaaaataatgaaaaaattcaaca 12278695  T
Q  209 tgtaggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12278696 tgtaggtcacatttttagactacacgtatatta 12278728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43069320 - 43069173
Alignment:
Q  99 aataaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaa 197  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  43069320 aatacaaattcataattaatttatccctggtcgaagaaatttaattttttgtgtaaaactataatttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaa 43069221  T
Q  198 aaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43069220 aaaattcaacctgtaggtcacatttttagactacacgtatattatagg 43069173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 10034431 - 10034276
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  10034431 aagaaccttcacaatgaaattttataatttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaatattcataa 10034332  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtg 171  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10034331 ttaatttatccctggtcgaagaaatttaa--ttttgtgtaaagctatattttaacgtg 10034276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 39657169 - 39657324
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39657169 aagaaccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaataaattcataattatgagggaataaaaattcataa 39657268  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtg 171  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39657269 ttaatttatccatggtcgaagaaatttaa--ttttgtgtaaagctatattttaacgtg 39657324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 179
Target Start/End: Original strand, 17332259 - 17332424
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||    
T  17332259 aagaaccttcacaatgaaattttgtagtctttaaacaagatacaaattaattataaattgcttaagaaattcataattatgagggaatgaaaaatcataa 17332358  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat 179  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17332359 ttaatttatctctggtcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaatgtgctaaacat 17332424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 16333539 - 16333694
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16333539 aagaaccttcccaatgaaattttgtaatttttaaacaagatacaaattaattataaattttttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataa 16333638  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtg 171  Q
    ||||||| || ||||| ||| ||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||    
T  16333639 ttaatttatctctggttgaagaaatttaa--ttttgtataaagctatattttaacgtg 16333694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 37255066 - 37254940
Alignment:
Q  104 aaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacattatggaaaaaatcgtgaaaaaatt 203  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   || ||| |        ||||||||||    
T  37255066 aaattcataattaatttatctctgatcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacgtgcta---atcatgta--------tgaaaaaatt 37254978  T
Q  204 caacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37254977 caacatgtaggtcacatttttagactacgcgtatatta 37254940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28801652 - 28801601
Alignment:
Q  194 tgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28801652 tgaaaaaattcaacctgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 28801601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 117
Target Start/End: Original strand, 30297604 - 30297693
Alignment:
Q  26 aatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaa 117  Q
    |||||| ||||  |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30297604 aatgaattttttcagtttttaaacgagagacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattat-ggggaat-aaaattcataattaa 30297693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10034279 - 10034226
Alignment:
Q  192 cgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10034279 cgtgaaaaaattcaacctgtaggtcacatttttagactacacgtatattatagg 10034226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 245
Target Start/End: Original strand, 16333691 - 16333744
Alignment:
Q  192 cgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16333691 cgtgaaaaaattcaacctgtaggtcacatttttagactacacgtatattatagg 16333744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 245
Target Start/End: Original strand, 39657321 - 39657374
Alignment:
Q  192 cgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39657321 cgtgaaaagattcaacttgtaggtcacatttttagactacacgtatattatagg 39657374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 37255118 - 37255058
Alignment:
Q  28 tgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcata 88  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37255118 tgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattatttaagaaattcata 37255058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 23034333 - 23034262
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattc 85  Q
    ||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23034333 aagaaccttcaaaattaaattttatagtttttaaataagagacaaattaattataaattgtttaagaaattc 23034262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 23034502 - 23034428
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcata 88  Q
    |||||| || ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23034502 aagaactttcacaattaaattttatagttttaaaacgagagacaaattaattataaattgtttaagaaattcata 23034428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 35338378 - 35338255
Alignment:
Q  30 aaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggt 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||| ||||  |||   ||    
T  35338378 aaattttggggtttttaaatgagatacgaattaattatgaattttttaaaaaattcataattat-ggaaaataaaaattcataataaattcgtcctcagt 35338280  T
Q  130 cgaaaaaatttaattttttgtgtaa 154  Q
     |||||| | |||||||||||||||    
T  35338279 tgaaaaagtctaattttttgtgtaa 35338255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 43069384 - 43069329
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataa 69  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  43069384 aagaaccttcaaaatgaaattttgtagtttttaaacgagatacaaattaattataa 43069329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20363209 - 20363056
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||| || |  |||||| ||||| |||| |  |||||||||||| |||| ||||||  |||| ||||||    
T  20363209 aagaacattcacaatgaaattttggagtttttaaacgataaacaaatttattatgaattatccaagaaattcataattat-ggggaacgaaaactcataa 20363111  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaac 168  Q
    ||||| |||| || |||| |||| |  ||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  20363110 ttaatctttctcttgtcggaaaattccaattttttgtggaaagccgtattttaac 20363056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 20368571 - 20368463
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |  |||||| ||||| |||| |  |||||||||||| |||| ||||||  |||| ||||||    
T  20368571 aagaaccttcacaatgaaattttggagtttttaaacgataaacaaatttattatgaattatccaagaaattcataattat-ggggaacgaaaactcataa 20368473  T
Q  114 ttaatttttc 123  Q
    ||||| ||||    
T  20368472 ttaatctttc 20368463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 27750747 - 27750660
Alignment:
Q  29 gaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaat 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||   ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  27750747 gaaattttgtagtttttaaacgagcgacaaattaat-attaattgtt-aagaaattcataattatggggaacaaaaaattcataattaat 27750660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 148
Target Start/End: Original strand, 35911373 - 35911505
Alignment:
Q  17 aaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatggggga-ataaaaattcataatt 115  Q
    |||||| || |||||||||| || |||| ||| ||||    |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||    
T  35911373 aaccttcaccatgaaattttatatttttcaaacgagagatgaattaactatgaattgtttaagaaattcataattatggggaacgaaaaaattcataatt 35911472  T
Q  116 aatttttccctggtcgaaaaaatttaatttttt 148  Q
    |||| || ||| ||| ||||| | |||||||||    
T  35911473 aattattaccttgtcaaaaaattctaatttttt 35911505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Original strand, 18266250 - 18266317
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaa 81  Q
    ||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||    
T  18266250 aagaaccttcaccatggaattttgaagtttttaaatgagagacaaactaattatgaattgtttaagaa 18266317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22761113 - 22761050
Alignment:
Q  181 atggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatag 244  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22761113 atggaaaaaattatgaaaaatttcaacctctaggtaacttttttagactacgcgtatattatag 22761050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31271934 - 31271707
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| | ||| || ||||  |||||| ||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |   | ||||||||||||    
T  31271934 aagaaccttcagaataaagtttttcagttttgaaacgagagacaaattaattataaatggtttaagaaattcataattatgag---aaaaaaattcataa 31271838  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaa-aaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaa--acattatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttg 210  Q
    ||||| | ||||| || |||| | |||||   ||||||||||| |  |||||||||||  |||  ||    || |||||| | ||||| |||||||| |     
T  31271837 ttaatctgtccctagttgaaatatattta---ttttgtgtaaagccgtattttaacgttataagcacgccttgaaaaaaaccatgaaataattcaacctc 31271741  T
Q  211 taggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  31271740 taggtcac-tttttggactacgtgtatattatagg 31271707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 24792944 - 24792894
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaat 64  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  24792944 aagaaccttcaccatgaaattttggagtttttaaacgagatgcaaattaat 24792894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 119
Target Start/End: Original strand, 11779220 - 11779303
Alignment:
Q  33 ttttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatt 119  Q
    ||||| |||||||||| |||   |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||   | ||| ||||||||||||||    
T  11779220 ttttggagtttttaaacgagcgacaaattaattatgaattgtttaaaaaattcataattatggg---aaaaatattcataattaatt 11779303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 206
Target Start/End: Original strand, 8788601 - 8788712
Alignment:
Q  101 taaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaa-----tttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgt 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||      |||  |||||||||||||   || ||||||||| |||||||| ||||||||||||  |    
T  8788601 taaaaattcataattaatttttcctcggttgaaaaatctttttttttttttttgtgtaaagtcatgttttaacgtcctaaacatgtatggaaaaaattat 8788700  T
Q  195 gaaaaaattcaa 206  Q
    ||||||||||||    
T  8788701 gaaaaaattcaa 8788712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 10352523 - 10352756
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaatt-gtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcata 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10352523 aagaaccttcacaatgaaattttgtactttttaaacgagatacaaattaattataagttagtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcata 10352622  T
Q  113 attaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgt 211  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  10352623 attaatttatcccttgtcgaagaaatttaattttttgtgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaattcaacttgt 10352722  T
Q  212 aggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10352723 aggtcacatttttagactacacgtatattatagg 10352756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 29995622 - 29995856
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaatt-gtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcata 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  29995622 aagaaccttcacaatgaaattttgtagtttttaaacgagatacaaattaattataagttagtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcata 29995721  T
Q  113 attaatttttccctggtcgaaaaaatttaa-ttttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttg 210  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  29995722 attaatttatccctggtcgaagaaatttaatttttttgtgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaattcaacctg 29995821  T
Q  211 taggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29995822 taggtcacatttttagactacacatatattatagg 29995856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1818244 - 1818012
Alignment:
Q  15 agaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaatt-gtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1818244 agaaccttcacaatgaaattttgtagttttcaaacgagatacaaattaattataagttagtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataa 1818145  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  1818144 ttaatttatccctagtcgaagaaatttaattttttgtgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaattcaacctgta 1818045  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1818044 ggtcacatttttagactacatgtatattatagg 1818012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40529541 - 40529314
Alignment:
Q  17 aaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataatta 116  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40529541 aaccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacaagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatta 40529442  T
Q  117 atttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggt 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  40529441 atttatccctggtcgaagaaatttaa--ttttgtgtaaagttatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaattcaatctgtaggt 40529344  T
Q  216 cacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40529343 cacatttttagactacacgtatattatagg 40529314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 17510871 - 17511101
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17510871 aagaaccttcacaatgaaattttataatttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataa 17510970  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  17510971 ttaatttatccctggttgaagaaatttaa--ttttgtgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaattcaacctgta 17511068  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  17511069 ggtcacatttttagactatatgtatattatagg 17511101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 36381985 - 36382214
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  36381985 aagaaccttcacaataaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataa 36382084  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36382085 ttaatttatccctagtcgaagaaatttaa--ttttgtgtaaaactatattttaacgtgttaaaaatgtat-gaaaaaatagtgaaaaaattcaacttgta 36382181  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  36382182 ggtcacatttttagactacacatatattatagg 36382214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Original strand, 43143224 - 43143452
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  43143224 aagaaccttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataa 43143323  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  43143324 ttaatttatctctggtcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacgtgctaatcatgtatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgta 43143423  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43143424 ggtcacatttttagactacacgtatatta 43143452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Original strand, 3292536 - 3292764
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  3292536 aagaaccttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataa 3292635  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| || || |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  3292636 ttaatttatctctagtcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacgtgctaatcatgtatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgta 3292735  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3292736 ggtcacatttttagactacacgtatatta 3292764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25931237 - 25931007
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  25931237 aagaaccttcacagttaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataa 25931138  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  25931137 ttaatttatctctggtcgaagaaatttaa--ttttgtgtaaagccatattttaacgtgctaaacatatatgaaaataatagtgaaaaaattcaacatgta 25931040  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25931039 tgtcacatttttagactacacgtatattatagg 25931007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 48989856 - 48989623
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  48989856 aagaaccttcacagtgaaattttttagtttttaaacgagatacaaattaatcataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaaatcataa 48989757  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatg-gaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgt 211  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  48989756 ttaatttatccctggtcgaagaaatttaattttttgtgtaaagctatattttaacgtgctatacatgtatgaaaaaaaatagtgaaaaaattcaacctgt 48989657  T
Q  212 aggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  48989656 aggtctcatttttagaccagacgtatattatagg 48989623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 245
Target Start/End: Original strand, 34406932 - 34407152
Alignment:
Q  24 acaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttc 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34406932 acaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatc 34407031  T
Q  124 cctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacattt 222  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  34407032 cctggtcgaagaaatttaa--ttttatgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtaagaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatttaggtcacatgt 34407129  T
Q  223 ttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  34407130 ttagactacacgtatattatagg 34407152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43356423 - 43356203
Alignment:
Q  24 acaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttc 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43356423 acaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatc 43356324  T
Q  124 cctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacattt 222  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  43356323 cctggtcgaagaaatttaa--ttttatgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtaagaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatttaggtcacatgt 43356226  T
Q  223 ttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  43356225 ttagactacacgtatattatagg 43356203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 47501292 - 47501072
Alignment:
Q  24 acaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttc 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47501292 acaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatc 47501193  T
Q  124 cctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacattt 222  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  47501192 cctggtcgaagaaatttaa--ttttatgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtaagaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatttaggtcacatgt 47501095  T
Q  223 ttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  47501094 ttagactacacgtatattatagg 47501072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Original strand, 50204717 - 50204945
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaat-aaaaattcata 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  50204717 aagaaccttcacaatgaaattttgtagtctttaaacgagatataaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaaattcata 50204816  T
Q  113 attaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgt 211  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||| |||    
T  50204817 attaatttatccctggtcgaagaaatttaattttttatgtaaagctacattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaataatg-aaaaattcaacatgt 50204915  T
Q  212 aggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  50204916 agatcacatttttagactacacgtatatta 50204945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Original strand, 6689875 - 6690103
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  6689875 aagaaccttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagattcaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataa 6689974  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| || || |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||  |||||||||| ||| ||||    
T  6689975 ttaatttatctctagtcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacatgctaatcatgtatgaaaaaaataatgaaaaaatttaacatgta 6690074  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6690075 ggtcacatttttagactacacgtatatta 6690103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 28876954 - 28877178
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  28876954 aagaaccttcacaatgaaattttgtagtctttaaacgagatagaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgaggaaataaaaattcataa 28877053  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||| ||| ||||    
T  28877054 ttaatttatccctgatcgaagaaatttaatttcttatgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaataatgaaaaaatttaacatgta 28877153  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtat 237  Q
    |||| |||||||||||||| |||||    
T  28877154 ggtcgcatttttagactacacgtat 28877178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35546480 - 35546252
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  35546480 aagaaccttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattatttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataa 35546381  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| || || |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  35546380 ttaatttatctctagtcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacgtgctaatcatgtatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgta 35546281  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35546280 ggtcacatttttagactatacgtatatta 35546252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13012707 - 13012487
Alignment:
Q  24 acaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttc 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13012707 acaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaattataaattatttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatc 13012608  T
Q  124 cctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacattt 222  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  13012607 cctggtcgaagaaatttaa--ttttatgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtaagaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatttaggtcacatgt 13012510  T
Q  223 ttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  13012509 ttagactacacgtatattatagg 13012487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 245
Target Start/End: Original strand, 26438927 - 26439147
Alignment:
Q  24 acaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttc 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26438927 acaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatc 26439026  T
Q  124 cctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacattt 222  Q
     ||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  26439027 tctggtcgaagaaatttaa--ttttatgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtaagaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatttaggtcacatgt 26439124  T
Q  223 ttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  26439125 ttagactacacgtatattatagg 26439147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 48130505 - 48130273
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  48130505 aagaaccttcacaataaaatattgtagtttttaaacgacatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgaaggaataaaaattcataa 48130406  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtg--aaaaaattcaacttg 210  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| |||  |||||||||||||||    
T  48130405 ttattttatccct-gtcgaagaaatttaattttttgtgtaaagctatattttaacgtattaaacatgtat-gaaaaaatagtgaaaaaaaattcaacttg 48130308  T
Q  211 taggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48130307 taggtcacattttaagactacgcgtatattatagg 48130273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 56 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26448537 - 26448347
Alignment:
Q  56 caaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaa 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26448537 caaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaaatcataattaatttatccctggtcgaagaaatttaaatttttgtgtaaa 26448438  T
Q  156 actatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  26448437 gctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatgtaggtcacacttttagactagacgtatattatagg 26448347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 33136084 - 33136313
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||    
T  33136084 aagaaccttcacaatgaaatttcgtagtttttaaacaagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattacgagggagtaaaaattcataa 33136183  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatg---gaaaaaatcgtgaaaaaattcaactt 209  Q
    ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||  |||||||||||||| |    
T  33136184 ttaatttatccttgatcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaaaaataatgaaaaaattcaacat 33136283  T
Q  210 gtaggtcacatttttagactacgcgtatat 239  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33136284 gtaggtcacatttttagactacacgtatat 33136313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 241
Target Start/End: Original strand, 30216397 - 30216610
Alignment:
Q  28 tgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctg 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||    
T  30216397 tgaaattttgtagtctttaaatgagatacaagttaattataaattgttta-gaaattcataattatgagggaatgaaaattcataattaatttatctctg 30216495  T
Q  128 gtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttag 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30216496 gtcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacgtgttaatcatgtatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgtaggtcacatttttag 30216595  T
Q  227 actacgcgtatatta 241  Q
    ||||| |||||||||    
T  30216596 actacacgtatatta 30216610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20129832 - 20129609
Alignment:
Q  24 acaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttc 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20129832 acaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatc 20129733  T
Q  124 cctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat----tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcaca 219  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||     |   ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  20129732 cctggtcgaagaaatttaa--ttttatgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtaaaaaaaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatttaggtcaca 20129635  T
Q  220 tttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    | |||||||||| |||||||||||||    
T  20129634 tgtttagactacacgtatattatagg 20129609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 30077275 - 30077503
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaatt-gtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcata 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30077275 aagaaccttcacaatgaaattttgtagtttttaaacgagatacaaattaattataagttagtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcata 30077374  T
Q  113 attaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatg-gaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttg 210  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||| |||||||     ||| ||    
T  30077375 attaatttatccctggtcgaagaaatttaa-tttttgtttaaagctatattttaacatgctaaacatgtatgaaaaaaaatagtgaaaa-----aacatg 30077468  T
Q  211 taggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  30077469 taggtcacattttttgactacacgtatattatagg 30077503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30110480 - 30110270
Alignment:
Q  24 acaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  30110480 acaatgaaattttgtagtttttaaacgagatacaaattagttataaagtgtttaagaaatttataattatgagggaataaaaactcataattaatttatc 30110381  T
Q  124 cctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacattt 222  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||           ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30110380 cctggtcgaagaaatttaat-ttttgtgcaaagctatattttaacgtgctaaatatgtatg-----------gaaaaaattcaacttgtaggtcacattt 30110293  T
Q  223 ttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30110292 ttagactacgcgtatattatagg 30110270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Original strand, 42333414 - 42333644
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgttt-aagaaattcatatttatgggggaataaaaattcata 112  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||    
T  42333414 aagaaccttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattgttttaagaaattcataattatgaggggatgaaaattcata 42333513  T
Q  113 attaatttttccctggtcgaaaaaatttaa-ttttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttg 210  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    ||||||||||||| |     
T  42333514 attaatttatctctggtcgaagaaatttaatttttttatgtaaaactatattttaacgtgctaatcatgtatgaaaaaaaaaaggaaaaaattcaacatc 42333613  T
Q  211 taggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  42333614 taggtcacatttttagactacatgtatatta 42333644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6236037 - 6235819
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  6236037 aagaaccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgaaggaataaaaattcataa 6235938  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacattatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtag 213  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||||   ||| |        |||||||||||||| |||||    
T  6235937 ttaatttatccctggtcgaagaaatttaa--ttttgtgtaaagctattttttaatgtgctaaac---atgta--------tgaaaaaattcaacatgtag 6235851  T
Q  214 gtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  6235850 gtcacatttttagaccacacgtatattatagg 6235819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 44157128 - 44156948
Alignment:
Q  60 ttaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaatt-ttttgtgtaaaact 158  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||  ||||||||    
T  44157128 ttaattattaattatttaagaaattcataattatgagagaataaaaattcataattaatttatccctggttgaagaaatttaatttttttacgtaaaact 44157029  T
Q  159 atattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    ||||||   |||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  44157028 atattt---cgtgctaaacatgtatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacacgtaggtcacatttttagactgcacgtatatta 44156948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 241
Target Start/End: Original strand, 13394947 - 13395087
Alignment:
Q  104 aaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatg--gaaaaaatcgtgaaaaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||   |||||||  |||||||    
T  13394947 aaattcataattaatttatccctggtcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacgtgctaaagatgtatgaaaaaaaaataatgaaaaa 13395046  T
Q  201 attcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13395047 attcaatatgtaggtcacatttttagactacacgtatatta 13395087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 29094675 - 29094481
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  29094675 aagaaccttcaccatgaaattttgaagtttttaaacgagatacgaattaattatgaattgtttaagaaattcataattat-ggggaatacaaattcataa 29094577  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaa--atttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaa 206  Q
    | ||||| ||||| |||||||||  || |||||||||||||||| | || | ||||| | ||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  29094576 taaatttgtccctagtcgaaaaaatatataattttttgtgtaaagccatgtcttaacatcctaaagatgcctggaaaaaatcatgaaaaaattcaa 29094481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Original strand, 13394881 - 13394955
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcata 88  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13394881 aagaaccttcacaatgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcata 13394955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31853754 - 31853522
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| || || ||| |||| ||| |||||  || || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  31853754 aagaaccttcaccataaaaatttggagtgtttaaccgaaatacaaattaattatgaattgtttaagaaattcatacttat-ggggaataaaaattcataa 31853656  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaat-cgtgaaaaaattcaacttgt 211  Q
    | ||| | ||| |  | | |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||| | ||||| || | ||||||||||   |||||||||||||  | |    
T  31853655 taaatctgtccataattggaaaaatataattttttgtgtaaaaccatgatttaacatcctaaagatgtctggaaaaaatatatgaaaaaattcaatcttt 31853556  T
Q  212 aggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    || |||| ||||| ||| | | ||||||||||||    
T  31853555 agatcacttttttggaccaagagtatattatagg 31853522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 168
Target Start/End: Original strand, 29134280 - 29134422
Alignment:
Q  24 acaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttc 123  Q
    ||||||||||||||  |||| |||| | ||   ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||    
T  29134280 acaatgaaattttgctgtttataaacgtgacaaaaattaattttaaattgattaagaaattcatagttataggg-aataaaaattcgtaattaatctgtc 29134378  T
Q  124 cctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaac 168  Q
      | |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29134379 a-tagtcgtaaaaatctaattttttgtgtaaaacaatattttaac 29134422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 39994326 - 39994182
Alignment:
Q  99 aataaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaa 197  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || |||||||||| |   |||||| | |||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||    
T  39994326 aataaaaattcataat-aatttgtctctagtcgaaaaaaatcttttttttttttaaaaccatattttaacgtcctaaacatgtttggaaaaaatcatgaa 39994228  T
Q  198 aaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattata 243  Q
    |||||| ||| | ||| |||| |||||| ||||||  |||||||||    
T  39994227 aaaatttaacctctagatcacttttttaaactacgaatatattata 39994182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 207
Target Start/End: Original strand, 49062638 - 49062779
Alignment:
Q  69 aattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaac 168  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |  ||  ||||||||||||||||  ||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  49062638 aattgtttaagaaattcataattaagaga-aaggaaaattcataattaatcattctcttgtcgaaaaattttaattttttgtgaaaaatcatattttaac 49062736  T
Q  169 gtgctaaaca----ttatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaac 207  Q
    || |||||||     |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  49062737 gtcctaaacaatatgtatgcaaaaaatcatgaaaaaattcaac 49062779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 148
Target Start/End: Original strand, 13502270 - 13502391
Alignment:
Q  27 atgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaa-attcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccc 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||  ||  || |||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  13502270 atgaaattttggagtttttaaatgagagacggattaattatgaattgtttaagaacttttttaattat-ggggaataaaaattaatatttaatttgtccc 13502368  T
Q  126 tggtcgaaaaaatttaatttttt 148  Q
    | ||||||||||| || ||||||    
T  13502369 tagtcgaaaaaatctattttttt 13502391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 170
Target Start/End: Original strand, 18990499 - 18990612
Alignment:
Q  57 aaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggtcg-aaaaaatttaattttttgtgtaaa 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | | | | |||| |||||| |  |||||||||||||     
T  18990499 aaattaattataaattgcttaagaaattcatatttat-ggagaataaaaattaataattaatatgtgcttagtcgaaaaaaaatctattttttgtgtaat 18990597  T
Q  156 actatattttaacgt 170  Q
      |||||||||||||    
T  18990598 gttatattttaacgt 18990612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 119
Target Start/End: Original strand, 4038344 - 4038448
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    |||||| || || ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  4038344 aagaactttcaccatgaaattttggaggttttaaacgagatataaattagttatgaattgcttaagaaattcataattat-ggggaataaaaactcataa 4038442  T
Q  114 ttaatt 119  Q
    | ||||    
T  4038443 taaatt 4038448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 120
Target Start/End: Original strand, 16877620 - 16877670
Alignment:
Q  69 aattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaattt 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16877620 aattgtttaagaaattcataattatgggg-aataaaaattcataattaattt 16877670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 9415410 - 9415344
Alignment:
Q  30 aaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatggg 96  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  9415410 aaattttggggtttttaaacgagatacaaatttattatgaattgtttaagaaattcataattatggg 9415344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20635748 - 20635670
Alignment:
Q  101 taaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat 179  Q
    |||||||||||||||||||  || || ||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  20635748 taaaaattcataattaattcgtctcttgtcgaaaagttctaattttttgtgtaaaacaatattttaaagtcctaaacat 20635670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 54933523 - 54933462
Alignment:
Q  27 atgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcata 88  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54933523 atgaaattttggagtttttaaatgataaacgaattaattataaattgttttagaaattcata 54933462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 56225812 - 56225728
Alignment:
Q  33 ttttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaat 118  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  56225812 ttttatagtttttaaatgagagacaatttaattatggattgttaaagaaattcataattat-ggggaataaaaagtcaaaattaat 56225728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 206
Target Start/End: Original strand, 31854005 - 31854111
Alignment:
Q  101 taaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||  ||| | || |||||| | || |||||||||||||   |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||    
T  31854005 taaaatttcataattaattcgtccttagttgaaaaattctacttttttgtgtaaagtgatattttaacgttctaaacatgcatggaaaaaatcaagaaaa 31854104  T
Q  200 aattcaa 206  Q
    |||||||    
T  31854105 aattcaa 31854111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 207
Target Start/End: Original strand, 21831590 - 21831697
Alignment:
Q  101 taaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | || |||| |  |||||| |||| |||  ||||||||||| |  |||||||  ||| |||||||| ||||||    
T  21831590 taaaaattcataattaatttgtcccttgacgcaaaattccaattttatgtgaaaagttatattttaacatcttaaacatgcatgtaaaaaatcatgaaaa 21831689  T
Q  200 aattcaac 207  Q
    ||||||||    
T  21831690 aattcaac 21831697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 179
Target Start/End: Original strand, 2321574 - 2321644
Alignment:
Q  109 cataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat 179  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||| | ||||||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||    
T  2321574 cataattaattattcccttgttgaaaaattataattttttatggaaagccatattttaacgtactaaacat 2321644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 5290968 - 5290886
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatggg 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |  |||||| ||||| |||  |  |||||||||||| |||||||    
T  5290968 aagaaccttcacaatgaaattttggagtttttaaacgataaacaaatttattatgaataatccaagaaattcataattatggg 5290886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 26571770 - 26571666
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattg-tttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcata 112  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||| || | ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||  || ||| ||||||||||    
T  26571770 aagaaccttcatgatgaaatgttggagtttttaaatgaaatacgaattaattagaaattgttttaaaaaattaatagttat-tggaaatgaaaattcata 26571672  T
Q  113 attaat 118  Q
    ||||||    
T  26571671 attaat 26571666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 202
Target Start/End: Original strand, 41998219 - 41998320
Alignment:
Q  101 taaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacattatggaaaaaatcgtgaaaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||| ||||  |  || |||||||||||  ||||||| || | ||||||  |||||||    
T  41998219 taaaaattcataattaattcattccttgtcgaaaaaatctaattttatgtgggatgctttattttaacgtcttaaacatgattgcaaaaattatgaaaaa 41998318  T
Q  201 at 202  Q
    ||    
T  41998319 at 41998320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 118
Target Start/End: Original strand, 2941209 - 2941264
Alignment:
Q  62 aattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaat 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  2941209 aattataaattatttaagaaattcttaattat-ggggaatgaaaatacataattaat 2941264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 41971897 - 41972131
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  41971897 aagaaccttcacaatgaaattttgtagtttttaaacgaggtataaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataa 41971996  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41971997 ttactttatcccttgtcgaagaaatttaattttttgtgtaaagctatattttaacatgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaattcaacctgta 41972096  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattataggtg 247  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41972097 ggtcacatttttagactacgcctatattataggtg 41972131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33490230 - 33490001
Alignment:
Q  17 aaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataatta 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  33490230 aaccttcacaatgaaattttgtagtttttaaacgagatacgaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattaataatta 33490131  T
Q  117 atttttccctggtcgaaaaaatttaatt-ttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacattatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggt 215  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  33490130 atttatccctagtcgaagaaatttaatttttttgtgtaaagctatattttaacgtgctaacttgtatgtaaaaaatagtgaaaaaattcaacatgtaggt 33490031  T
Q  216 cacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33490030 cacatttttagactatgcgtatattatagg 33490001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 244
Target Start/End: Original strand, 42310579 - 42310808
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  42310579 aagaaccttcacaatgaaattttgtaatttttaaactagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgatggaataaaaattcataa 42310678  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  42310679 ttaatttatccctggtcgaagaaatttaa--ttttgagtaaagctatattttaacgtgctaaatatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatgta 42310776  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatag 244  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42310777 gggcacatttttagactacacgtatattatag 42310808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3829509 - 3829278
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  3829509 aagaaccttcacaatgaaattt-gtagtttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaaatcataa 3829411  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  | |    
T  3829410 ttaatttatccctggtcgaagaaatttaattttttgtgtaaagctatattttaatgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaattcaacccgga 3829311  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
     ||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  3829310 agtctcatttttagaccagacgtatattatagg 3829278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 32981695 - 32981924
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    
T  32981695 aagaaccttcacaataaaattttataatttttcaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagagaataaaaatttataa 32981794  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  32981795 ttaatttatccctggtcgaagaaatttaa--ttttgagtaaagttatattttaacgtgctaaacatgtat-gaaaaaatagtgaaaaaattcaacatgta 32981891  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32981892 ggtcacatttttagactacatgtatattatagg 32981924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 7433949 - 7433794
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  7433949 aagaaccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaattataaattgttaaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataa 7433850  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtg 171  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||    
T  7433849 ttaatttatccctggtcgaagaaatttaa--tattgtgtaaagctatattttaacgtg 7433794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17445821 - 17445611
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  17445821 aagaaccttcataatgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgaaggaataaaaattcataa 17445722  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| |||||||||                   |||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||| ||||    
T  17445721 ttaatttatccctggtc------------------atgtaaagctatattttagcgtgctaaacatgtatgaaaaaaataatgtaaaaattcaacatgta 17445640  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17445639 ggtcaaatttttagactacacgtatatta 17445611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 23313522 - 23313401
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  23313522 aagaaccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaataaattcataattataagggaataaaaattcataa 23313423  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaa 135  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  23313422 ttaatttatccctggtcgaaaa 23313401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35907989 - 35907851
Alignment:
Q  104 aaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaat 202  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||   |||||||||    
T  35907989 aaattcataattaatttatctctgatcgaagaaatttaattttttatgtaaaactatattttaacgtgctaatcatgtatgaaaaaaagaatgaaaaaat 35907890  T
Q  203 tcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35907889 tcaacatgtaggtcacatttttagactacacgtatatta 35907851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 101
Target Start/End: Original strand, 11957989 - 11958076
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaat 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  11957989 aagaaccttcacaatgaaattttgtagtttttaaacgagatacaaattaattataaattatttaagaaattcataattatgagggaat 11958076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 28463474 - 28463396
Alignment:
Q  15 agaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttat 93  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28463474 agaaccttcacaatgaaattttgtagtttttaaacgaaatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattat 28463396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 35908055 - 35907981
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcata 88  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35908055 aagaaccttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcata 35907981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 154
Target Start/End: Original strand, 5715507 - 5715596
Alignment:
Q  64 ttataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaa 154  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| | ||| |||||||||    
T  5715507 ttatgaattgtttaagaaattcataattatggag-aataaaaattcataataaatttgtccctagtcggaaaaatctcattgtttgtgtaa 5715596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 120
Target Start/End: Original strand, 18716430 - 18716491
Alignment:
Q  58 aattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaattt 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18716430 aattaattatgaattgtttaagaaattcataatt-ttggggaatgaaaattcataattaattt 18716491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7433797 - 7433744
Alignment:
Q  192 cgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7433797 cgtgaaaaaattcaacctgtaagtcacatttttagactacatgtatattatagg 7433744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 170
Target Start/End: Original strand, 24663185 - 24663296
Alignment:
Q  59 attaattataaattgtttaagaaa-ttcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaac 157  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||  || || || | |||||| |||||| |  |||||| |    
T  24663185 attaattatgaattgtttaagaaaattcataattatggagga-taaaaatttataattaattcgtctctagttggaaaaatataatttatcatgtaaagc 24663283  T
Q  158 tatattttaacgt 170  Q
    |||||||||||||    
T  24663284 tatattttaacgt 24663296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 119
Target Start/End: Original strand, 9901673 - 9901735
Alignment:
Q  56 caaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatt 119  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||    
T  9901673 caaattaattatgaattatttaagaaattcataattat-ggcgattaaaaattcataattaatt 9901735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 148
Target Start/End: Original strand, 7350314 - 7350403
Alignment:
Q  58 aattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaatttttt 148  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||  |||| | |||| |||| | |||||||||    
T  7350314 aattaattatgaattgtttaataaaatcataattatggga-aacaaaaattcataattaatcattccttagtcggaaaattctaatttttt 7350403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 58 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 43894448 - 43894384
Alignment:
Q  58 aattaattataaattgttt-aagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaattttt 122  Q
    |||||||||| |||| ||| || ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  43894448 aattaattatgaatttttttaacaaattcataattatggag-aataaaaattcataattaattttt 43894384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9877747 - 9877515
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9877747 aagaaccttcacaatgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattatgaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataa 9877648  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  9877647 ttaatttatccctggtcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgta 9877548  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  9877547 ggtcacgtttttagactacacgtatattatagg 9877515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 3648432 - 3648662
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3648432 aagaaccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagataaaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataa 3648531  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |||    
T  3648532 ttaatttatccctggtcgaagaaatttaa--ttttgtgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaattcaacccgta 3648629  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3648630 ggtcacatttttagactacacgtatattatagg 3648662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42231464 - 42231232
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  42231464 aagaaccttcacgatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataa 42231365  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  42231364 ttaatttatccctgtttgaagaaatttaattttttgtgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaagtcaacttgta 42231265  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||||||| || |  |||||||||||||    
T  42231264 ggtcacatttttataccagacgtatattatagg 42231232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36409074 - 36408835
Alignment:
Q  15 agaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaatt--------gtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaa 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||        |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  36409074 agaaccttcacaatgaaattttgtagtttttaaacgagatacaaattaattataagttataagttagtttaagaaattcataattatgagggaataaaaa 36408975  T
Q  107 ttcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattca 205  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  36408974 ttcataattaatttatccctagtcgaagaaatttaattttttgtgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaattca 36408875  T
Q  206 acttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36408874 acctgtaggtcacatttttagactacacgtatattatagg 36408835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Original strand, 16787665 - 16787893
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  16787665 aagaactttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataa 16787764  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  16787765 ttaatttatctctggtcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacgtgctaatcatgtatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgta 16787864  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16787865 ggtcacatttttagactacacgtatatta 16787893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39915033 - 39914813
Alignment:
Q  24 acaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttc 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39915033 acaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatc 39914934  T
Q  124 cctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacattt 222  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  39914933 cctggtcgaagaaatttaa--ttttatgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtaagaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatttaggtcacatgt 39914836  T
Q  223 ttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  39914835 ttagactacgcgtatattatagg 39914813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15838814 - 15838583
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  15838814 aagaaccttcacaataaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatacaaattcataa 15838715  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatg-gaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgt 211  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  15838714 ttaatttatccctagtcgaagaaatttaa--ttttgtgcaaagctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaaatagtgaaaaaattcaacctgt 15838617  T
Q  212 aggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15838616 aggtcacatttttagactacacgtatattatagg 15838583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4404535 - 4404307
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  4404535 aagaacctttacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataa 4404436  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| || | |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  4404435 ttaatttatctgtggtcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacgtgctaatcatgtacgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgta 4404336  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4404335 ggtcacatttttagactacacgtatatta 4404307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 206
Target Start/End: Original strand, 40470191 - 40470373
Alignment:
Q  24 acaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  40470191 acaatgaaattttgtagtttttaaatgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataa-taatttatc 40470289  T
Q  124 cctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaa 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40470290 cctggtcgaagaaatttaattttttgtgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaattcaa 40470373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 2728833 - 2729068
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||    
T  2728833 aagaaccttcacagtgaaattttatagtttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgatggaacaaaaaatcataa 2728932  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaa---ttttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaactt 209  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  2728933 ttaatttatccctggtcgaagaaatttaatttttttttgtgtaaagctatattttaacatgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaattcaacct 2729032  T
Q  210 gtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  2729033 gtaggtctcatttttagaccagacgtatattatagg 2729068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23402635 - 23402403
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  23402635 aagaaccttcatagtgaaattttgtagtctttaaacaagatacaaattaattataagttgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataa 23402536  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaa-ttttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgt 211  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||||| |||    
T  23402535 -taatttatctctggtcgaagaaatttaatttttttatgtaaaactatattttaacgtgctaatcatgtatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgt 23402437  T
Q  212 aggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23402436 aggtcacatttttagactacacgtatattatagg 23402403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 378951 - 378774
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  378951 aagaaacttcacaataaaattttgtagtttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagg-aataaaaattcataa 378853  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaat 191  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  378852 ttaatttgtccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaagctatattttaacatgctaaacatgtatggaaaaaat 378774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 171
Target Start/End: Original strand, 29728019 - 29728175
Alignment:
Q  13 gaagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcata 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  29728019 gaagaaccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcata 29728118  T
Q  113 attaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtg 171  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29728119 attaattgatccctggtcgaagaaatttaa--ttttgtgtaaagctatattttaacgtg 29728175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 80 - 245
Target Start/End: Original strand, 34136531 - 34136697
Alignment:
Q  80 aaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat 179  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  34136531 aaattcataattatgagggaatgaaaattcataattaatttatctctggtcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacgtgctaatcat 34136630  T
Q  180 -tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
     |||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34136631 gtatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgtaggtcacatttttagactacacgtatattatagg 34136697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Original strand, 32540104 - 32540259
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  32540104 aagaaccttcaaaatgaaattttataatttttaaatgagagacgaattaattataaattttttaagaaatttataattat-ggggaataaaaattcataa 32540202  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgt 170  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||    
T  32540203 ttaatttgtccctagtcaaaaaaatctatttttttgtgtaaagtcatattttaacgt 32540259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3435730 - 3435560
Alignment:
Q  80 aaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaat----ttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaa 175  Q
    |||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |    ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3435730 aaattcctaattatgaaggaataaaaattcataattaatttatccctggtcgaagatttatttttttttttttgtgtaaagctatattttaatgtgctaa 3435631  T
Q  176 acat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||| |||| |||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3435630 acatgtatgaaaaatatagtgaaaaaattcaacctgttggtcacatttttagactatgcgtatattatagg 3435560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 116
Target Start/End: Original strand, 34136441 - 34136543
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  34136441 aagaaccttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataa 34136540  T
Q  114 tta 116  Q
    |||    
T  34136541 tta 34136543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 245
Target Start/End: Original strand, 40401190 - 40401377
Alignment:
Q  58 aattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaac 157  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||| || ||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||| |||| | || ||||||||    
T  40401190 aattaattataaattattttagaaattcataattacaggg-aacaaaaattcataattaatctatcccaagtcggaaaaatctaatatattatgtaaaac 40401288  T
Q  158 tatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
     |||||||||| |  ||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||| | ||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  40401289 catattttaacatcttaaacatgtatggaaaaaattatgaaaaaatttaacctctacatcacttttttggactacgcatatattatagg 40401377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 7278550 - 7278480
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaatt 84  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7278550 aagaaccttcacaatgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaatt 7278480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 9175661 - 9175542
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    |||| |||| || ||||| ||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||    
T  9175661 aagatccttcactatgaagttttgcagtttttaaacgagagacaaattaattataagttatttaagaaattcataattat-gagaaataaaaattcataa 9175563  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaa 134  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  9175562 ttaatttgtccttggtcgaaa 9175542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 245
Target Start/End: Original strand, 29728172 - 29728225
Alignment:
Q  192 cgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29728172 cgtgaaaaaattcaacctgtaggtcacatttttagactacacgtatattatagg 29728225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 32750439 - 32750345
Alignment:
Q  22 taacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatt 119  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||  || |||||||||||||||| ||||    
T  32750439 taaccatgaaattttggagtttttaaacgagatacgaattaattatgaattgtttatgaaattcata---atatggaaataaaaattcataataaatt 32750345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 84
Target Start/End: Original strand, 15863282 - 15863336
Alignment:
Q  30 aaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaatt 84  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15863282 aaattttggagtttttaaacgagatacgaattaattatgaattgtttaagaaatt 15863336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 19099 - 19034
Alignment:
Q  29 gaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatg 94  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19099 gaaattttgaagtttttaaaccagggacaaattaattattaattgtttaagaaattcataattatg 19034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 29351876 - 29351793
Alignment:
Q  27 atgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcat 111  Q
    |||| |||||| ||||||||   ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  29351876 atgagattttggagtttttactcgagatacaaattaataatgaattttttaagaaattcataattat-ggagaataaaaattcat 29351793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 33639112 - 33639058
Alignment:
Q  69 aattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttcc 124  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33639112 aattgtttaagaaatttataattatggga-aataaaaattcataattaattcttcc 33639058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Original strand, 3672248 - 3672327
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatg-caaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatg 94  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  3672248 aagaaccttcaccatgaaatttgg-agtttttaaatga-atgacgaattaattatgaattgtttaaggaattcataattatg 3672327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 58 - 115
Target Start/End: Original strand, 35852622 - 35852679
Alignment:
Q  58 aattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataatt 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||  | | || ||||||||||||||    
T  35852622 aattaattatgaattgtttaagaaattcataattaacgtgaaacaaaaattcataatt 35852679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 31581259 - 31581489
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31581259 aagaaccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataa 31581358  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  31581359 ttaatttatccctagtcgaagaaatttaa--ttttgtgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatgta 31581456  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31581457 ggtcacatttctagactacacgtatattatagg 31581489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 4554832 - 4555064
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||    
T  4554832 aagaacattcacaatgaaattttgtagtttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcttaattacgagggaataaaaattcataa 4554931  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  4554932 ttaatttatccatggtcgaagaaatttaattttttgtgtaaagctattttttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaatttaacatgta 4555031  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4555032 ggtcacatttttatactacgcgtatattatagg 4555064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 245
Target Start/End: Original strand, 17444682 - 17444909
Alignment:
Q  17 aaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataatta 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17444682 aaccttcacaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataatta 17444781  T
Q  117 atttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggt 215  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17444782 atttatccctgttcgaagaaatttaa--ttttgtgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtaagaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatgtaggt 17444879  T
Q  216 cacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17444880 cacatttttagactacacgtatattatagg 17444909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 245
Target Start/End: Original strand, 44084244 - 44084475
Alignment:
Q  17 aaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataatta 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44084244 aaccttcacaatgaaattttgtagtttttaaacgagatacaaattaattataaattatttaagaaattcataattatgagggaataaaaaatcataatta 44084343  T
Q  117 atttttccctggtcgaaaaaatttaa--ttttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtag 213  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  44084344 atttatccctggtcgaagaaatttaattttttttgtgtaaagctatactttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagcgaaaaaattcaacctgtag 44084443  T
Q  214 gtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  44084444 gtcacatttttagaccagacgtatattatagg 44084475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 8058972 - 8059205
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  8058972 aagaaccttcccaatgaaatttcgtagtctttaaacaagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcatat 8059071  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatg-gaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgt 211  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||| |||    
T  8059072 ttaatttatccctggtagaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacgtgttaaacatgtatgaaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgt 8059171  T
Q  212 aggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8059172 aggtcacatttttagactacacgtatattatagg 8059205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Original strand, 12756477 - 12756705
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  12756477 aagaaccttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataa 12756576  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| || || |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  12756577 ttaatttatctctagtcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaatgtgctaatcatgtatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgta 12756676  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12756677 ggtcacatttttagactacacgtatatta 12756705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 45419110 - 45418882
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  45419110 aagaaccttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataa 45419011  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  45419010 ttaatttatctctagtcgaagaaatttagttttttatgtaaagctatattttaacgtgctaatcatgtatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgta 45418911  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45418910 ggtcacatttttagactacacgtatatta 45418882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 245
Target Start/End: Original strand, 6403452 - 6403672
Alignment:
Q  24 acaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttc 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6403452 acaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatc 6403551  T
Q  124 cctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacattt 222  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  6403552 cctggtcgaagaaatttaa--ttttatgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtaagaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatttaggtcacatgt 6403649  T
Q  223 ttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  6403650 ttagactacacgtatattatagg 6403672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 245
Target Start/End: Original strand, 41251282 - 41251502
Alignment:
Q  24 acaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttc 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41251282 acaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatc 41251381  T
Q  124 cctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacattt 222  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  41251382 cctggtcgaagaaatttaa--ttttatgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtaagaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatttaggtcacatgt 41251479  T
Q  223 ttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  41251480 ttagactacacgtatattatagg 41251502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 7072174 - 7072403
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  7072174 aagaaccttcccaatgaaattttgtagttattaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattacgagggaataaaaattcataa 7072273  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatg-gaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgt 211  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  7072274 ttaatttatccctggtcgaagaaatttaa--ttttgtgtaaagctatattttaacgtgct-aacatgtatgaaaaaaaatagtg-aaaaattcaacatgt 7072369  T
Q  212 aggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7072370 aggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 7072403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2286317 - 2286096
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||    
T  2286317 aagaaccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaacttaattataaattgtttaagaaattcataattatgaggggat-aaaattcataa 2286219  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | ||| ||||||||||||||||||||    
T  2286218 ttaatttatccctagtcgaagaaatttaa--ttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacatgtatg---acaatagtgaaaaaattcaacttgta 2286124  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatatt 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2286123 ggtcacatttttagactacacgtatatt 2286096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26238468 - 26238241
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  26238468 aagaaccttcacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatacaaattaattataaattgtttataaaattcataattacgaggggataaaaattcataa 26238369  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
     |||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  26238368 -taatttatcccttttcgaagaaatttaa-tttttgtgtaaagatataatttaacgtgctaaacatgtatgaaaaagatagtgaaaaaattcaatttgta 26238271  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26238270 ggtcacatttttagactacgcgtatattat 26238241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 242
Target Start/End: Original strand, 26162354 - 26162571
Alignment:
Q  26 aatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26162354 aatgaaattttgtagtttttaaacgagatacaaattagttataaattgtttaaaaaattcataattatgagggaataaaaatt-ataattaatttatccc 26162452  T
Q  126 tggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtg-aaaaaattcaacttgtaggtcacatttt 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26162453 tggtcgaagaaatttaattttttgtgtaaagctatattttaatgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaaattcaacatgtaggtctcatttt 26162552  T
Q  224 tagactacgcgtatattat 242  Q
    ||||| |  ||||||||||    
T  26162553 tagaccagacgtatattat 26162571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 35963219 - 35963064
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  35963219 aagaaccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaataaattcataattatgagggaataaaaattcataa 35963120  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtg 171  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  35963119 ttaatttatccctggtcgaagaaatttaa--tattgtgtaaaactatattttaacgtg 35963064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8147832 - 8147653
Alignment:
Q  61 taattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||    
T  8147832 taattataaattgtttaagaaattcataattatgaggaaatgaaaattcataattaatttatctctggtcgaagaaatttaattttttatataaagctat 8147733  T
Q  161 attttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatat 239  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8147732 attttaatgtgctaatcatgtatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgtaggtcacatttttagactacacgtatat 8147653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18982118 - 18981967
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18982118 aagaaccttcacgatgaaattttgtaatttttaaacgagataaaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataa 18982019  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaa 167  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  18982018 ttaatttatctctggtcgaagaaatttaa--ttttgtgtaaagctatattttaa 18981967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 37621701 - 37621932
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  37621701 aagaaccttcacaatgaaattttgaagtttttaaacgagatacgaattaattatgaattatttaagaaattcataattat-ggggaataaaaattcataa 37621799  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacatt-atggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    |||||   ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||  || |||||||| |||||||||||||    ||    
T  37621800 ttaatccgtccctagtcggaaaaatctgattttttgtgtaaaactatgttttaacatcctaaagattcctgaaaaaaatcatgaaaaaattcaataacta 37621899  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    | |||| ||||| ||| || |||||||||||||    
T  37621900 gatcacttttttggaccacacgtatattatagg 37621932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 78 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 45121697 - 45121530
Alignment:
Q  78 agaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaac 177  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |  || || |||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  45121697 agaaattcataataatgggggaataaaaattcataattaatttggcattgctcaaaaaaaattaattttttttataaagctatattttaacgtgctaaac 45121598  T
Q  178 at-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    || |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45121597 atgtatg-aaaaaatagtgaaaaaattcaacttgtaagtcacatttttagactacgcatatattatagg 45121530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 116
Target Start/End: Original strand, 2957784 - 2957886
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  2957784 aagaacctacacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataaatatgagggaataaaaattcataa 2957883  T
Q  114 tta 116  Q
    |||    
T  2957884 tta 2957886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21556623 - 21556470
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||    
T  21556623 aagaaccttcaccatgaaattttggagtttttaaacgagatacaaattaattatgaattgtttaagaaattcataattat-gtgaaataaaaattcataa 21556525  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaac 168  Q
    | | ||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | || |||||||    
T  21556524 taatttcgtccctagtcggaaaaatctaattttttgtgtaaagccatgttttaac 21556470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 42442513 - 42442411
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    |||||| || ||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  42442513 aagaacattcacaatgaaattttataatttttaaacgagatataaattaactataaattgtttaagaaattcataaatatgagggaataaaaattcataa 42442414  T
Q  114 tta 116  Q
    |||    
T  42442413 tta 42442411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 771388 - 771296
Alignment:
Q  152 taaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattata 243  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  771388 taaagctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaataatagtgaaaaaattcaacctgtaagacacatttttagactacacgtatattata 771296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 42442423 - 42442334
Alignment:
Q  80 aaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtg 171  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  42442423 aaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatccctggttgaagaaatttaa--ttttgtgtaaagctataatttaacgtg 42442334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 171
Target Start/End: Original strand, 2957874 - 2957963
Alignment:
Q  80 aaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtg 171  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2957874 aaattcataattatgaggaaataaaaattcataattaatttatccctggttgaagaaatttaa--ttttgtgtaaagctataatttaacgtg 2957963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 88
Target Start/End: Original strand, 32126841 - 32126901
Alignment:
Q  28 tgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcata 88  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32126841 tgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcata 32126901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 26591570 - 26591466
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| || | ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||    
T  26591570 aagaaccttcaccaagaaattttagagtttttaaacgagatacaaattaattatgaattgtttaagaaattcatagctat-gagaaataaaaattcataa 26591472  T
Q  114 ttaatt 119  Q
    | ||||    
T  26591471 taaatt 26591466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 245
Target Start/End: Original strand, 32126956 - 32127009
Alignment:
Q  192 cgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32126956 cgtgaaaaaattcaacctgtaggtcacatttttagactacacgtatattatagg 32127009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 94
Target Start/End: Original strand, 15441837 - 15441904
Alignment:
Q  27 atgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatg 94  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  15441837 atgaaattttggattttttaaatgagacacaaattaattatgaattgtttaagaaattcataattatg 15441904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18364807 - 18364729
Alignment:
Q  101 taaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat 179  Q
    |||||||||||||||||||| || || || |||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  18364807 taaaaattcataattaatttgtcactagttgaaaaattctaaatttttgtgtaaaaccatattttaacgttctaaacat 18364729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 245
Target Start/End: Original strand, 2957960 - 2958013
Alignment:
Q  192 cgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2957960 cgtgaaaaaattcaacctgtagatcacatttttagactacacgtatattatagg 2958013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35963067 - 35963014
Alignment:
Q  192 cgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35963067 cgtgaaaaaattcaacctgtaagtcacatttttagactacacgtatattatagg 35963014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42442337 - 42442284
Alignment:
Q  192 cgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42442337 cgtgaaaaaattcaacatgtagatcacatttttagactacacgtatattatagg 42442284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 94
Target Start/End: Original strand, 816711 - 816777
Alignment:
Q  28 tgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatg 94  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  816711 tgaaattttggagtttttaaaggagagacaaattaattatgaattgtttaaaaaattcataattatg 816777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 165
Target Start/End: Original strand, 32126893 - 32126952
Alignment:
Q  104 aaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatatttt 165  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32126893 aaattcataattaatttatccatggtcgaagaaatttaa--ttttgtgtaaaactatatttt 32126952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 25391491 - 25391404
Alignment:
Q  30 aaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaat 118  Q
    |||||||| |||||||||| ||||   || |||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25391491 aaattttggagtttttaaaggagaaataagttaattatgaattgtttaaaaaatttataattatggag-aataaaaattcataattaat 25391404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18981962 - 18981913
Alignment:
Q  196 aaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  18981962 aaaaaattcaacctgtaggtcacatttttagactacacatatattttagg 18981913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 15512008 - 15511958
Alignment:
Q  102 aaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgt 152  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15512008 aaaaattcataataaatttgtcactattcgaaaaaatttaattttttgtgt 15511958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 176
Target Start/End: Original strand, 18365139 - 18365217
Alignment:
Q  99 aataaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaatttt-ttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaa 176  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| || |||||    
T  18365139 aataaacattcataattaatttgtccttagtagaaaagatttaattttgttgtgtaaagttatattttaatgttctaaa 18365217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 126
Target Start/End: Original strand, 2042761 - 2042828
Alignment:
Q  58 aattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccct 126  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| | | |||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  2042761 aattaattatgaattgtttaaaaaatttacaattatggga-aatgaaaattcataattaatttgtccct 2042828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15441658 - 15441622
Alignment:
Q  143 ttttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat 179  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15441658 ttttttgtgtaaagctatattttaacgtcctaaacat 15441622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Original strand, 17373478 - 17373558
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatg 94  Q
    |||||| || || ||||||||||| ||||| |||||| ||| | |||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||    
T  17373478 aagaacattcaccatgaaattttggagtttctaaatgtgatacgaattaattacgaattttttaggaaattcataattatg 17373558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 18829370 - 18829310
Alignment:
Q  28 tgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcata 88  Q
    |||||||| | ||||||||||  | || | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18829370 tgaaatttagaagtttttaaacaatatacgaattaattatgaattgtttaagaaattcata 18829310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7003252 - 7003024
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  7003252 aagaaccttcacaatgaaattttgtagtctttaaacgatatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgtgggaataaaaattcataa 7003153  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  7003152 ttaatttatccctggtcgaagaaatttaattttttatgtaaaactatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgta 7003053  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||    
T  7003052 ggtcacttttttagactacacatatatta 7003024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7049123 - 7048895
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  7049123 aagaaccttcacaatgaaattttgtagtctttaaacgatatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgtgggaataaaaattcataa 7049024  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  7049023 ttaatttatccctggtcgaagaaatttaattttttatgtaaaactatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgta 7048924  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||    
T  7048923 ggtcacttttttagactacacatatatta 7048895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8394654 - 8394424
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  8394654 aagaaccttcacgatgaaattttgtaatttttaaatgagatataaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataa 8394555  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  8394554 ttaatttatccctagtcgaagaaatttaa--ttttgtgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtatggaaaaaataatgaaaaaattcaacctgta 8394457  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  8394456 ggtcacatttttagactacacatatattatagg 8394424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36658705 - 36658476
Alignment:
Q  15 agaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataat 114  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  36658705 agaaccttcacaataaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataat 36658606  T
Q  115 taatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacattatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtagg 214  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||| |||||     
T  36658605 taatttatccctgttcgaagaaatttatttttttatgtaaagctatattttaacgtgctaaaca-tatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgtaga 36658507  T
Q  215 tcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36658506 tcacatttttagactacacgtatattatagg 36658476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33686090 - 33685859
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||    
T  33686090 aagaatcttcacaataaaattttgtagtttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaggtcataa 33685991  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  33685990 ttaatttatccctagtcgaagaaatttaattttttgtgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaa-tcaacctgta 33685892  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  33685891 ggtcacatttttagaccagacgtatattatagg 33685859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Original strand, 43184108 - 43184336
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  43184108 aagaaccttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataa 43184207  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| || || |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  43184208 ttaatttatctctagtcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacgtgctaatcatgtatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgta 43184307  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43184308 ggtcacatttttagactacacgtatatta 43184336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36631345 - 36631115
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  36631345 aagaactttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaatttaattatcaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataa 36631246  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  36631245 ttaatttatccctagtcgaagaaatttaa--ttttgtgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaattcaacctgta 36631148  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  36631147 ggtcacatttctagactacacgtattttatagg 36631115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 245
Target Start/End: Original strand, 14776755 - 14776975
Alignment:
Q  24 acaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttc 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14776755 acaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatc 14776854  T
Q  124 cctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacattt 222  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  14776855 cctggtcgaagaaatttaa--ttttatgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtaagaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatttaggtcacatgt 14776952  T
Q  223 ttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  14776953 ttagactacacgtatattatagg 14776975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Original strand, 8867371 - 8867599
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  8867371 aagaaccttcacagtgaaattttgtagtctttaaacaagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgaaggaatgaaaattcataa 8867470  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  8867471 ttaatttatctctggtcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgta 8867570  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  8867571 ggtcacatttttagagtacatgtatatta 8867599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26625272 - 26625045
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||| ||||  |||||    
T  26625272 aagaaccttcacagtgaaattttgtagtctttaaatgagatacaaattaattataaattgttt-agagattcataattatgaggaaatgaaaaaacataa 26625174  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||  |||||||||||||| | ||    
T  26625173 ttaatttatctctggtcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacgtgttaatcatgtatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatata 26625074  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26625073 ggtcacatttttagactacacgtatatta 26625045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 5555991 - 5555836
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5555991 aagaaccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataa 5555892  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtg 171  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||    
T  5555891 ttaatttatccctggtcgaagaaatttaa--tattgtgtaaagctatattttaacgtg 5555836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 3113760 - 3113915
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3113760 aagaaccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataa 3113859  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtg 171  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||    
T  3113860 ttaatttatctctggtcgaagaaatttaa--tattgtgtaaagctatattttaacgtg 3113915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 40919661 - 40919875
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  40919661 aagaaccttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataa 40919760  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    | ||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||                  |||| ||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  40919761 tcaatttatctctggtcgaagaaatttaattttttatgta------------------ctaatcatgtatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgta 40919842  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40919843 ggtcacatttttagactacacgtatattatagg 40919875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 241
Target Start/End: Original strand, 34388786 - 34388924
Alignment:
Q  104 aaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaat 202  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||   |||||||||    
T  34388786 aaattcataattaatttatctctgatcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacgtgctaatcatgtatgaaaaaaagaatgaaaaaat 34388885  T
Q  203 tcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34388886 tcaacatgtaggtcacatttttagactacatgtatatta 34388924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20606152 - 20605998
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| |    
T  20606152 aagaaccttcaccatgaaattttgaagtttttaaatgagatacaaattaattatgaattgtttaagaaattcataattat-gggtaataaaatttcatga 20606054  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaa-ttttttgtgtaaaactatattttaac 168  Q
    | ||| | ||||| |||| |||||| ||| |||| |||||||||| || |||||||    
T  20606053 taaatctgtccctagtcggaaaaatctaacttttgtgtgtaaaaccatgttttaac 20605998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Original strand, 11020669 - 11020825
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |  |||||||||||||||    
T  11020669 aagaaccttcacaacgaaattttggagtttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaatttataattacgagataataaaaattcataa 11020768  T
Q  114 ttaatttttccc-tggtc---gaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatatttta 166  Q
    ||||||| |||| |  ||   ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11020769 ttaatttatccctttatccctgaagaaatttaattttttgtgtaaagttatatttta 11020825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 207
Target Start/End: Original strand, 8725268 - 8725413
Alignment:
Q  61 taattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactat 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||    
T  8725268 taattataaattgtttaagaaatttataattatggga-aataaaaattcataattaatctttcattagtcgaaaaaatctatttttttgcgtaaatctat 8725366  T
Q  161 attttaacgtgctaaacattatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaac 207  Q
    ||||| |||| ||||||||  |||| |||||| | ||| ||||||||    
T  8725367 attttgacgtcctaaacatgttggataaaatcattaaataattcaac 8725413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Original strand, 34388720 - 34388794
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcata 88  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34388720 aagaaccttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcata 34388794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 20611934 - 20611791
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| || ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| | |    
T  20611934 aagaaccttcaccatgcaattttgaagattttaaatgagatacaaattaattatgaatagtttaagaaattcataattat-gggtaataaaaattcgtga 20611836  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaa-ttttttgtgtaaaac 157  Q
    | ||| | ||||| |||  |||||| ||| |||| ||||||||||    
T  20611835 taaatctgtccctagtcagaaaaatctaacttttgtgtgtaaaac 20611791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 49010261 - 49010158
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||    
T  49010261 aagaatcttcacaatgaagttttgcaatttttaaacgagagacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattat-ggaaaataaaaaatcataa 49010163  T
Q  114 ttaat 118  Q
    |||||    
T  49010162 ttaat 49010158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 20609445 - 20609351
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattc 109  Q
    ||||||||| || ||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  20609445 aagaaccttcaccatgcaattttgaagattttaaatgagatacaaattaattatgaatagtttaagaaattcataattat-gggtaataaaaattc 20609351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 95
Target Start/End: Original strand, 13072500 - 13072581
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgg 95  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13072500 aagaaccttcaccatgaaattttggagattttaaacgagatactaattaattatgaattgtttaagaaattcataattatgg 13072581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33387083 - 33386972
Alignment:
Q  57 aaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaa 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||   | ||| |||| |||||||||||| ||||||||||     
T  33387083 aaattaattatgaattgtttaagaaattcataattat-gaggagtaaaaattcataattaatccgt-cctagtcggaaaaatttaattatttgtgtaaag 33386986  T
Q  157 ctatattttaacgt 170  Q
      ||||||||||||    
T  33386985 gcatattttaacgt 33386972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 241
Target Start/End: Original strand, 37001908 - 37002013
Alignment:
Q  125 ctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacattatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacattttt 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    | |       |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37001908 ctggtcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacgtgctaatcat----gta-------tgaaaaaattcaacatgtaggtcacattttt 37001996  T
Q  225 agactacgcgtatatta 241  Q
    ||||||| |||||||||    
T  37001997 agactacacgtatatta 37002013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 245
Target Start/End: Original strand, 10868268 - 10868328
Alignment:
Q  185 aaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10868268 aaaaaatagtgaaaaaaattaatttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 10868328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 245
Target Start/End: Original strand, 3113912 - 3113965
Alignment:
Q  192 cgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3113912 cgtgaaaaaattcaacctgtaagtcacatttttagactacacgtatattatagg 3113965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5555839 - 5555786
Alignment:
Q  192 cgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5555839 cgtgaaaaaattcaacctgtaagtcacatttttagactacacgtatattatagg 5555786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 23581537 - 23581433
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    |||||| || || ||||||||||| |||| ||||| ||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||    
T  23581537 aagaactttcaccatgaaattttggagttgttaaacgagatactaattaattatgaattgttaaagaaattcttaattat-ggggaataaaaaatcataa 23581439  T
Q  114 ttaatt 119  Q
    | ||||    
T  23581438 taaatt 23581433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44832426 - 44832327
Alignment:
Q  69 aattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttt-tgtgtaaaactatattttaa 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| || | |||||| || ||||| |||||||| | || ||||||    
T  44832426 aattgtttaagaaattcatatttat-ggggaataaaaattcataataaattcgtccctagttggaaaaatctattttttgtgtgtaaagccatgttttaa 44832328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 32199197 - 32199111
Alignment:
Q  31 aattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaat 118  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  32199197 aattttatagtttttaaacgagagacaaattaattaaaaattgtttatgaaattcttaatta-ggaggaatgaaaattcataattaat 32199111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 23582481 - 23582396
Alignment:
Q  28 tgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataat 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | || || |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  23582481 tgaaatttggtagtttttaaatgagatatgaattaattatgactttttaaagaaattcatagttat-ggggaataaaaattcctaat 23582396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6184195 - 6184009
Alignment:
Q  57 aaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaatttttt--gtgtaa 154  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||  |  || ||||||||||||||| || || ||| ||||||||| | |||||||||  ||| ||    
T  6184195 aaattaactatgaattgtttaagtaattaataattattaga-aacaaaaattcataattatttatttccttgtcgaaaaattctaatttttttcgtggaa 6184097  T
Q  155 aactatattttaacgtgctaaacatt-atggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    |||| || ||||| ||  |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||  ||| |||||| |||||||||||    
T  6184096 aactgtagtttaatgtcataaacatgcatgcaaaaaatcttgaaaaaattcaacatctaagtcagttttctagacttcgcgtatatta 6184009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 70
Target Start/End: Original strand, 38638022 - 38638078
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaa 70  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  38638022 aagaaccttcacagtgaatttttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaa 38638078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Original strand, 22929216 - 22929253
Alignment:
Q  185 aaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacattt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22929216 aaaaaatcgtgaaaaaattcaacctctaggtcacattt 22929253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 25709064 - 25709004
Alignment:
Q  56 caaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaa 117  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||    
T  25709064 caaattaattataaatatttgaagaaattcataattat-gggaaacaaaaattcataattaa 25709004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 143 - 207
Target Start/End: Original strand, 44832653 - 44832718
Alignment:
Q  143 ttttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaac 207  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  44832653 ttttttgtgtaaaatcatattttaacgtcctaaatatgcatgaaaaaaatcatgaaaaaattcaac 44832718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 145
Target Start/End: Original strand, 21359832 - 21359876
Alignment:
Q  101 taaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattt 145  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||    
T  21359832 taaaaattcataattaatatgtccctcgtcgaaaaactttaattt 21359876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 45709997 - 45709938
Alignment:
Q  58 aattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaat 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | || | ||||| ||||||||||||||||    
T  45709997 aattaattataaattgtttaagtaattcttaataat-gaggaatgaaaattcataattaat 45709938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 33228975 - 33229206
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaatt-gtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcata 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  33228975 aagaaccttcacaatgaaattttgtagtttttaaacgagatacaaattaattataaattagtttaagaaattcataattatgagggaatacaaattcata 33229074  T
Q  113 attaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgt 211  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| | |    
T  33229075 attaatttatccctggtcgaagaaatttaattttttgtgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaattcaacctat 33229174  T
Q  212 aggtcacatttttagactacgcgtatattata 243  Q
    || ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  33229175 agttcacatttttagactacacatatattata 33229206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29743812 - 29743578
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaatt-gtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcata 112  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  29743812 aagaacattcacaatgaaattttgtagtttttaaacgagatacaaattaattataagttagtttaagaaattcataattatgagtgaataaaaattcata 29743713  T
Q  113 attaatttttccctggtcgaaaaaatttaatt-ttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttg 210  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  29743712 attaatttatccctagtcgaagaaatttaatttttttgtgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtatgaaaaaaatagtgaaaaaattcaacctg 29743613  T
Q  211 taggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29743612 taggtcacatttttagactacacatatattatagg 29743578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 399136 - 398916
Alignment:
Q  24 acaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttc 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  399136 acaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatc 399037  T
Q  124 cctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacattt 222  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  399036 cctggtcgaagaaatttaa--ttttatgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtaagaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatttaggtcacatgt 398939  T
Q  223 ttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  398938 ttagactacacgtatattatagg 398916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28997257 - 28997029
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  28997257 aagaaccttcgcagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataa 28997158  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    ||||||| || || |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  || |||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  28997157 ttaatttatctctagtcgaagaaatttaattttttatgtaaagctatattttaacgtgctaattatgtatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgta 28997058  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatatta 241  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28997057 ggtcacatttttagaatacacgtatatta 28997029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 34948421 - 34948576
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  34948421 aagaaccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattacgagggaataaaaattcataa 34948520  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtg 171  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||    
T  34948521 ttaatttatccctggtcgaagaaatttaa--tattgtgtaaagttatattttaacgtg 34948576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13838325 - 13838171
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13838325 aagaaccttcacaatgaaattttgtaatttttaaacgatatacaaattaattataaattgtttaataaattcataattatgagggaataaaaattcataa 13838226  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgt 170  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13838225 ttaatttatccatggtcgaagaaatttaa--ttttgtgtaaagctatattttaacgt 13838171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18339592 - 18339459
Alignment:
Q  43 tttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaa 142  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  18339592 tttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataattaatttatctctggtcgaagaaatttaa 18339493  T
Q  143 tt-ttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaa 175  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18339492 tttttttatgtaaagctatattttaacgtgctaa 18339459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 10231828 - 10231735
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaatt 108  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10231828 aagaaccttcaccatgaaattttgaagattttaaatgagatacgaattaattattaattgtttaagaaattcataattat-ggggaataaaaatt 10231735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 138
Target Start/End: Original strand, 12850020 - 12850143
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| || ||||||||||  |||||||||||| |    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||| ||||    
T  12850020 aagaacctttaccatgaaattttagagtttttaaatgcgggataaattaattatgaattgtttaagaaattcataattat-ggggaacgaaaatttataa 12850118  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaat 138  Q
    ||||||  ||||| || ||||||||    
T  12850119 ttaattcgtcccttgttgaaaaaat 12850143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 147
Target Start/End: Original strand, 22814736 - 22814855
Alignment:
Q  27 atgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccct 126  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |  | |||||||||| |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| ||||||  |||| |    
T  22814736 atgaaattttcaagtttttaaatgatagacgaattaattatgaattgtttaagaaattcaaaatta-cggggaataaaaattcattattaatcattcctt 22814834  T
Q  127 ggtcgaaaaaatttaattttt 147  Q
     ||| ||||||| ||||||||    
T  22814835 agtcaaaaaaatctaattttt 22814855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 9491391 - 9491313
Alignment:
Q  16 gaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatg 94  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  9491391 gaaccttaactatgaaattttgaagtttttaaatcagaaatgaattaattatgaattgtttaagaagttcataattatg 9491313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 12098514 - 12098413
Alignment:
Q  17 aaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataatta 116  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||| |   |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||  |||||| |||||||    
T  12098514 aacctttaccatgaaattttaaagtttttaaatgcgggacaaattaattatgaattatttaagaaattcataattat-ggggaacgaaaatttataatta 12098416  T
Q  117 att 119  Q
    |||    
T  12098415 att 12098413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13838169 - 13838120
Alignment:
Q  196 aaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13838169 aaaagattcaacttgtaggtcatatttttagactacacgtatattatagg 13838120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 155
Target Start/End: Original strand, 21556416 - 21556540
Alignment:
Q  30 aaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggt 129  Q
    |||||||| |||| || ||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||||||||||||   |||   ||    
T  21556416 aaattttggagttatttaacaagatacaaattaattatgaattttttaagaaattgatactta-cgggaaataaaaattcataattaatccgtccagagt 21556514  T
Q  130 cgaaaaaatttaattttttgtgtaaa 155  Q
    || |||||| ||||||||||||||||    
T  21556515 cggaaaaatctaattttttgtgtaaa 21556540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 245
Target Start/End: Original strand, 34948573 - 34948626
Alignment:
Q  192 cgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34948573 cgtgaaaaaattcaatctgtaagtcacatttttagactacacgtatattatagg 34948626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23217453 - 23217379
Alignment:
Q  104 aaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat 179  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||    
T  23217453 aaattcataattaatctgtcccttgtcgaaaaa-tataattttttgtgtaaagccatattttaatgtcctaaacat 23217379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11796981 - 11796829
Alignment:
Q  56 caaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaa 155  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | |||||  || ||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||| | ||| || ||||||    
T  11796981 caaattaattatgaattatttaagaaatttataatgatggg--aacaaaaatttataattgattcgtcccttgtcgaaaaaattgattttattttgtaaa 11796884  T
Q  156 actatattttaacgtgctaaacattat-ggaaaaaatcgtgaaaaaattcaactt 209  Q
       |||||||||| | ||||| ||| | | |||||||| |||| ||||| |||||    
T  11796883 gaaatattttaaccttctaaatattctagcaaaaaatcatgaataaattaaactt 11796829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 28931519 - 28931437
Alignment:
Q  31 aattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataat 114  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  28931519 aattttgaagtttttaaacaagataaaaattaattatgaattatttacgaaattcataattat-gggaaataaaaattaataat 28931437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Original strand, 31373323 - 31373397
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcata 88  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||     |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31373323 aagaaccttcacaacaaaattttgaagtttttaaacgagtgatgaattaattatgaattgtttaagaaattcata 31373397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 34638912 - 34638846
Alignment:
Q  101 taaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaa 167  Q
    |||||||| |||||||| || | |||  |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  34638912 taaaaatttataattaacttgtacctattcgaaaaattctaattttttgtgtaaaaccatattttaa 34638846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 29341502 - 29341449
Alignment:
Q  102 aaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaa 155  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||| |||||||||    
T  29341502 aaaaattcataattaatttgtccctactcggaaaaatataatttgttgtgtaaa 29341449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 88
Target Start/End: Original strand, 4335204 - 4335236
Alignment:
Q  56 caaattaattataaattgtttaagaaattcata 88  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4335204 caaattaattatgaattgtttaagaaattcata 4335236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 245
Target Start/End: Original strand, 480105 - 480325
Alignment:
Q  24 acaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttc 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  480105 acaatgaaattttgtaaattttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatc 480204  T
Q  124 cctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacattt 222  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  480205 cctggtcgaagaaatttaa--ttttatgtaaagctatattttaacgtgctaaacatgtaagaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatttaggtcacatgt 480302  T
Q  223 ttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  480303 ttagactacacgtatattatagg 480325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2142 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold2142
Description:

Target: scaffold2142; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 63 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1002 - 821
Alignment:
Q  63 attataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatat 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||    
T  1002 attataaattgtttaagaaattcataattatgagggaataaaaattcataattaatttatccctggtcgaagaaatttaa--ttttatgtaaagctatat 905  T
Q  163 tttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  904 tttaacgtgctaaacatgtaagaaaaaaatagtgaaaaaattcaacatttaggtcacatgtttagactacacgtatattatagg 821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17832 - 17610
Alignment:
Q  16 gaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataatt 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  17832 gaaccttcacaatgaaattttgctgtttttaaa-gagagacaaattacttataaattgttaaagaaattcatacttatgggg-aataaaaattcataatt 17735  T
Q  116 aatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtagg 214  Q
    ||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17734 aatttgtccctagtaaaaaaaatctaattttttgtgtaaagctatattttaatatcctaaacatgtctggaaaaaatcatgaaaaaattcaatttgtagg 17635  T
Q  215 tcacatttttagactacgcgtatat 239  Q
    || | ||||| ||||||||||||||    
T  17634 tcccttttttggactacgcgtatat 17610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 53434 - 53220
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataa 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  53434 aagaaccttcacagtgaaattttgtagtctttaaacgagatacaaattaattataaattgtttaagaaattcataattatgagggaatgaaaattcataa 53335  T
Q  114 ttaatttttccctggtcgaaaaaatttaattttttgtgtaaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgta 212  Q
    | ||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||                  |||| ||| |||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  53334 tcaatttatctctggtcgaagaaatttaattttttatgta------------------ctaatcatgtatgaaaaaaataatgaaaaaattcaacatgta 53253  T
Q  213 ggtcacatttttagactacgcgtatattatagg 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53252 ggtcacatttttagactacacgtatattatagg 53220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0495 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0495
Description:

Target: scaffold0495; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 8548 - 8455
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaatt 108  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8548 aagaaccttcaccatgaaattttgaagattttaaatgagatacgaattaattattaattgtttaagaaattcataattat-ggggaataaaaatt 8455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31870 - 31777
Alignment:
Q  152 taaaactatattttaacgtgctaaacat-tatggaaaaaatc-gtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttttagactacgcgtatattata 243  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31870 taaagctatattttaacatgctaaacatgtatgaaaaaaattagtgaaaaaattcaacctgtaggtcacatttttagactacccgtatattata 31777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 18084 - 18013
Alignment:
Q  17 aaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaattataaattgtttaagaaattcata 88  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18084 aaccttcacaatgaaattttgtaaattttaaacgatatacaaattaattataaattgtttaagacattcata 18013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 35327 - 35277
Alignment:
Q  14 aagaaccttaacaatgaaattttgtagtttttaaatgagatgcaaattaat 64  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  35327 aagaaccttcaccatgaaattttggagtttttaaacgagatgcaaattaat 35277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 223
Target Start/End: Original strand, 11042 - 11080
Alignment:
Q  185 aaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11042 aaaaaatcgtgaaaaaattcaacttctaggtcacttttt 11080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0152 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0152
Description:

Target: scaffold0152; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 223
Target Start/End: Original strand, 37438 - 37476
Alignment:
Q  185 aaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  37438 aaaaaatcgtgaaaaaattcaacttctaggtcacttttt 37476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 120
Target Start/End: Original strand, 2139 - 2200
Alignment:
Q  58 aattaattataaattgtttaagaaattcatatttatgggggaataaaaattcataattaattt 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  ||||| |||||||||||| ||||    
T  2139 aattaattatgaattgtttaagaaattcataattat-gaagaatacaaattcataatttattt 2200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 6)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 223
Target Start/End: Original strand, 19103 - 19144
Alignment:
Q  182 tggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  19103 tggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacctctaggtcacttttt 19144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34074 - 34033
Alignment:
Q  182 tggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  34074 tggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacctctaggtcacttttt 34033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36243 - 36202
Alignment:
Q  182 tggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  36243 tggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacctctaggtcacttttt 36202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 43904 - 43863
Alignment:
Q  182 tggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  43904 tggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacctctaggtcacttttt 43863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 56630 - 56589
Alignment:
Q  182 tggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  56630 tggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacctctaggtcacttttt 56589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 75291 - 75250
Alignment:
Q  182 tggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  75291 tggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacctctaggtcacttttt 75250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 5)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 223
Target Start/End: Original strand, 2985 - 3026
Alignment:
Q  182 tggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  2985 tggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacctctaggtcacttttt 3026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 223
Target Start/End: Original strand, 17521 - 17562
Alignment:
Q  182 tggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  17521 tggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacctctaggtcacttttt 17562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 223
Target Start/End: Original strand, 41001 - 41042
Alignment:
Q  182 tggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  41001 tggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacctctaggtcacttttt 41042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 54234 - 54193
Alignment:
Q  182 tggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  54234 tggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacctctaggtcacttttt 54193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 223
Target Start/End: Original strand, 61990 - 62031
Alignment:
Q  182 tggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacttgtaggtcacatttt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  61990 tggaaaaaatcgtgaaaaaattcaacctctaggtcacttttt 62031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University