View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8250_low_4 (Length: 622)

Name: NF8250_low_4
Description: NF8250
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8250_low_4
NF8250_low_4
[»] chr6 (77 HSPs)
chr6 (14-608)||(27272441-27273029)
chr6 (266-608)||(22934741-22935083)
chr6 (266-608)||(23857186-23857528)
chr6 (266-608)||(24863710-24864052)
chr6 (266-608)||(15424178-15424520)
chr6 (266-608)||(26918373-26918715)
chr6 (266-608)||(26988994-26989336)
chr6 (266-608)||(24304479-24304821)
chr6 (266-602)||(27000066-27000402)
chr6 (266-605)||(16749847-16750186)
chr6 (266-608)||(13298812-13299154)
chr6 (275-608)||(29549477-29549810)
chr6 (276-608)||(4757767-4758099)
chr6 (278-608)||(3696086-3696416)
chr6 (266-608)||(29573006-29573348)
chr6 (278-608)||(34463207-34463537)
chr6 (276-608)||(27044390-27044723)
chr6 (276-608)||(4525289-4525621)
chr6 (284-608)||(4545636-4545960)
chr6 (284-608)||(4723995-4724319)
chr6 (276-608)||(4773009-4773341)
chr6 (276-608)||(26116271-26116603)
chr6 (276-609)||(27359852-27360185)
chr6 (276-609)||(27450195-27450528)
chr6 (278-608)||(16674144-16674474)
chr6 (275-609)||(26777475-26777809)
chr6 (266-608)||(30557877-30558219)
chr6 (284-608)||(28207465-28207789)
chr6 (276-608)||(29501418-29501750)
chr6 (266-608)||(16943888-16944230)
chr6 (276-608)||(27007730-27008062)
chr6 (276-608)||(27485132-27485464)
chr6 (14-244)||(27629925-27630155)
chr6 (273-608)||(27290231-27290566)
chr6 (276-608)||(17025280-17025612)
chr6 (272-608)||(14143146-14143482)
chr6 (272-608)||(26787943-26788279)
chr6 (272-608)||(27196316-27196652)
chr6 (272-608)||(27252588-27252924)
chr6 (276-603)||(20160704-20161031)
chr6 (276-603)||(22171800-22172127)
chr6 (272-608)||(22456795-22457131)
chr6 (275-603)||(13521939-13522267)
chr6 (275-594)||(33374131-33374450)
chr6 (275-594)||(8892186-8892504)
chr6 (275-594)||(8903421-8903739)
chr6 (272-502)||(22477240-22477470)
chr6 (272-594)||(28162656-28162978)
chr6 (59-212)||(20160499-20160652)
chr6 (59-212)||(22172179-22172332)
chr6 (89-207)||(28162485-28162603)
chr6 (275-578)||(27629591-27629894)
chr6 (482-608)||(17092301-17092427)
chr6 (6-195)||(4525031-4525220)
chr6 (6-195)||(29549220-29549409)
chr6 (89-207)||(13522323-13522441)
chr6 (89-207)||(33374506-33374624)
chr6 (6-207)||(24304871-24305072)
chr6 (89-207)||(8892560-8892678)
chr6 (6-212)||(26918122-26918328)
chr6 (6-207)||(15424570-15424771)
chr6 (119-212)||(22935125-22935218)
chr6 (119-212)||(23857570-23857663)
chr6 (6-178)||(4757503-4757675)
chr6 (68-212)||(22477521-22477665)
chr6 (6-178)||(27360292-27360464)
chr6 (6-178)||(27450635-27450807)
chr6 (89-207)||(8903795-8903913)
chr6 (6-212)||(26999815-27000021)
chr6 (6-207)||(13299204-13299405)
chr6 (6-207)||(26988743-26988944)
chr6 (6-178)||(4546066-4546238)
chr6 (6-178)||(4724425-4724597)
chr6 (6-178)||(4772739-4772911)
chr6 (6-178)||(28207184-28207356)
chr6 (6-177)||(29572755-29572926)
chr6 (125-165)||(16673988-16674028)
[»] chr2 (69 HSPs)
chr2 (266-608)||(27434351-27434693)
chr2 (266-608)||(23128473-23128815)
chr2 (266-608)||(28882206-28882548)
chr2 (266-608)||(20837910-20838252)
chr2 (266-608)||(12655534-12655876)
chr2 (266-608)||(11635093-11635435)
chr2 (266-608)||(11641282-11641624)
chr2 (266-608)||(21677089-21677431)
chr2 (266-608)||(34861672-34862014)
chr2 (266-608)||(37685816-37686158)
chr2 (266-608)||(37701081-37701423)
chr2 (266-608)||(32049790-32050132)
chr2 (266-576)||(34286346-34286656)
chr2 (266-576)||(34291406-34291716)
chr2 (266-608)||(37925485-37925827)
chr2 (266-523)||(34279441-34279698)
chr2 (266-608)||(22925935-22926277)
chr2 (268-608)||(13936451-13936791)
chr2 (266-608)||(31876273-31876615)
chr2 (276-608)||(37375163-37375495)
chr2 (266-608)||(16829245-16829587)
chr2 (266-608)||(16891894-16892236)
chr2 (278-608)||(40233515-40233845)
chr2 (275-608)||(39890075-39890408)
chr2 (284-608)||(260660-260984)
chr2 (266-608)||(19416406-19416748)
chr2 (278-608)||(12716509-12716839)
chr2 (278-608)||(27777226-27777556)
chr2 (278-608)||(27816984-27817314)
chr2 (278-608)||(39051729-39052059)
chr2 (267-606)||(21703073-21703412)
chr2 (278-605)||(27803711-27804038)
chr2 (278-608)||(12586814-12587144)
chr2 (272-599)||(27118686-27119013)
chr2 (272-603)||(19456333-19456664)
chr2 (272-594)||(31891249-31891571)
chr2 (278-594)||(9349903-9350219)
chr2 (272-608)||(34303210-34303546)
chr2 (275-594)||(3784655-3784974)
chr2 (275-594)||(16163600-16163919)
chr2 (275-594)||(34157012-34157330)
chr2 (278-576)||(27392973-27393271)
chr2 (11-207)||(21703460-21703656)
chr2 (89-207)||(31891624-31891742)
chr2 (89-207)||(3784481-3784599)
chr2 (89-207)||(34156838-34156956)
chr2 (89-206)||(34303600-34303717)
chr2 (11-207)||(19456717-19456913)
chr2 (89-207)||(16163426-16163544)
chr2 (6-212)||(21677476-21677682)
chr2 (89-207)||(27118515-27118633)
chr2 (6-195)||(37374902-37375091)
chr2 (6-178)||(12716933-12717105)
chr2 (8-212)||(27434738-27434942)
chr2 (8-207)||(23128865-23129064)
chr2 (6-212)||(13936838-13937044)
chr2 (6-212)||(37925234-37925440)
chr2 (125-212)||(11635483-11635570)
chr2 (125-212)||(11641672-11641759)
chr2 (6-177)||(31876022-31876193)
chr2 (6-177)||(34861421-34861592)
chr2 (6-177)||(37686238-37686409)
chr2 (6-177)||(37701503-37701674)
chr2 (6-165)||(40233240-40233399)
chr2 (6-212)||(32049539-32049745)
chr2 (6-212)||(34279190-34279396)
chr2 (6-207)||(28881955-28882156)
chr2 (125-165)||(39052169-39052209)
chr2 (6-178)||(39889803-39889975)
[»] chr7 (59 HSPs)
chr7 (266-608)||(10916672-10917014)
chr7 (266-607)||(16503185-16503526)
chr7 (266-607)||(16518221-16518562)
chr7 (266-608)||(2154570-2154912)
chr7 (266-608)||(11424580-11424922)
chr7 (266-610)||(5127989-5128333)
chr7 (266-608)||(5147144-5147486)
chr7 (266-608)||(4144927-4145269)
chr7 (266-608)||(26319673-26320015)
chr7 (266-608)||(9618648-9618990)
chr7 (266-608)||(16736264-16736606)
chr7 (266-608)||(16751318-16751660)
chr7 (266-608)||(17523529-17523871)
chr7 (266-608)||(17529344-17529686)
chr7 (266-608)||(26274898-26275240)
chr7 (266-608)||(26669718-26670060)
chr7 (266-608)||(45387340-45387682)
chr7 (266-608)||(26435254-26435596)
chr7 (278-608)||(26537674-26538004)
chr7 (276-608)||(31564194-31564526)
chr7 (284-608)||(11441587-11441911)
chr7 (278-608)||(3445315-3445645)
chr7 (266-608)||(24592345-24592687)
chr7 (276-608)||(31124927-31125259)
chr7 (267-606)||(16041321-16041660)
chr7 (272-608)||(26484697-26485033)
chr7 (272-594)||(2108823-2109145)
chr7 (272-600)||(16449810-16450138)
chr7 (272-608)||(39210827-39211163)
chr7 (275-608)||(2775365-2775698)
chr7 (275-594)||(31088282-31088601)
chr7 (272-573)||(18540802-18541103)
chr7 (275-594)||(45733466-45733785)
chr7 (404-608)||(4200682-4200886)
chr7 (275-558)||(5159525-5159808)
chr7 (399-608)||(26682804-26683013)
chr7 (11-201)||(16041077-16041267)
chr7 (11-199)||(16450199-16450387)
chr7 (8-212)||(16503571-16503775)
chr7 (8-212)||(16518607-16518811)
chr7 (6-212)||(5127738-5127944)
chr7 (89-207)||(31088657-31088775)
chr7 (89-207)||(45733292-45733410)
chr7 (6-195)||(5159268-5159457)
chr7 (6-212)||(45387089-45387295)
chr7 (6-195)||(4145331-4145520)
chr7 (278-379)||(26485756-26485857)
chr7 (6-178)||(31564624-31564796)
chr7 (6-177)||(9618397-9618568)
chr7 (6-165)||(3445040-3445199)
chr7 (125-212)||(5147531-5147618)
chr7 (6-177)||(24592767-24592938)
chr7 (6-177)||(26275320-26275491)
chr7 (6-177)||(26320095-26320266)
chr7 (125-212)||(26435122-26435209)
chr7 (6-165)||(26538111-26538270)
chr7 (6-212)||(2154319-2154525)
chr7 (125-207)||(11424972-11425054)
chr7 (125-165)||(26485982-26486022)
[»] chr5 (82 HSPs)
chr5 (266-608)||(24687972-24688314)
chr5 (266-608)||(30934638-30934980)
chr5 (266-608)||(11549359-11549701)
chr5 (266-608)||(23717803-23718145)
chr5 (266-608)||(33777492-33777834)
chr5 (267-608)||(24970024-24970365)
chr5 (266-608)||(23752265-23752607)
chr5 (266-608)||(22998929-22999271)
chr5 (266-608)||(9548358-9548700)
chr5 (266-608)||(15658575-15658917)
chr5 (266-608)||(8665290-8665632)
chr5 (266-608)||(30152023-30152365)
chr5 (266-608)||(9317456-9317798)
chr5 (266-608)||(12132160-12132502)
chr5 (266-608)||(15758672-15759014)
chr5 (266-608)||(2511056-2511398)
chr5 (266-608)||(26480397-26480739)
chr5 (266-608)||(6874310-6874652)
chr5 (266-608)||(30168474-30168816)
chr5 (276-608)||(28649250-28649582)
chr5 (266-608)||(5637915-5638257)
chr5 (276-600)||(18500553-18500877)
chr5 (266-608)||(18375227-18375569)
chr5 (275-608)||(34616532-34616865)
chr5 (284-608)||(31431463-31431787)
chr5 (276-608)||(37671298-37671630)
chr5 (276-608)||(37754995-37755327)
chr5 (276-608)||(37770802-37771134)
chr5 (278-608)||(31826222-31826552)
chr5 (266-573)||(41674714-41675021)
chr5 (266-608)||(33516361-33516703)
chr5 (278-608)||(43078269-43078599)
chr5 (275-609)||(28959600-28959934)
chr5 (266-608)||(29966881-29967223)
chr5 (266-608)||(30029420-30029762)
chr5 (275-609)||(32599286-32599620)
chr5 (267-608)||(23892212-23892553)
chr5 (276-608)||(3789556-3789888)
chr5 (276-608)||(37358458-37358790)
chr5 (267-606)||(22888476-22888815)
chr5 (278-608)||(24681457-24681787)
chr5 (278-608)||(24723984-24724314)
chr5 (272-608)||(29888897-29889233)
chr5 (278-608)||(40473364-40473694)
chr5 (276-608)||(13324644-13324976)
chr5 (267-606)||(25199035-25199374)
chr5 (275-594)||(11325808-11326127)
chr5 (275-603)||(33877261-33877589)
chr5 (275-594)||(13184477-13184796)
chr5 (275-594)||(13440323-13440642)
chr5 (275-557)||(33292539-33292821)
chr5 (8-197)||(25198788-25198977)
chr5 (68-243)||(22888289-22888464)
chr5 (8-207)||(23891962-23892161)
chr5 (89-207)||(11325634-11325752)
chr5 (89-207)||(13184852-13184970)
chr5 (89-207)||(13440698-13440816)
chr5 (89-207)||(33877087-33877205)
chr5 (6-212)||(31431182-31431388)
chr5 (70-195)||(33292346-33292471)
chr5 (6-207)||(33777241-33777442)
chr5 (6-178)||(24681191-24681363)
chr5 (6-178)||(24723718-24723890)
chr5 (6-165)||(8665724-8665883)
chr5 (6-177)||(15759094-15759265)
chr5 (6-212)||(3789280-3789486)
chr5 (6-212)||(41674463-41674669)
chr5 (6-207)||(23718195-23718396)
chr5 (6-207)||(23752657-23752858)
chr5 (119-212)||(24969891-24969984)
chr5 (6-178)||(13325080-13325252)
chr5 (6-178)||(37358891-37359063)
chr5 (6-177)||(5637664-5637835)
chr5 (6-177)||(9317205-9317376)
chr5 (125-212)||(9548745-9548832)
chr5 (6-177)||(12131909-12132080)
chr5 (6-201)||(24688370-24688565)
chr5 (6-177)||(26480146-26480317)
chr5 (6-177)||(31826656-31826827)
chr5 (6-165)||(40473801-40473960)
chr5 (125-178)||(28649099-28649152)
chr5 (6-178)||(37671728-37671900)
[»] scaffold0089 (5 HSPs)
scaffold0089 (266-608)||(39987-40329)
scaffold0089 (266-608)||(46903-47245)
scaffold0089 (267-608)||(29760-30101)
scaffold0089 (8-207)||(29510-29709)
scaffold0089 (8-212)||(40374-40578)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (266-608)||(17014011-17014353)
chr4 (266-608)||(14665029-14665371)
chr4 (266-608)||(24592232-24592574)
chr4 (266-608)||(14763222-14763564)
chr4 (266-608)||(5005884-5006226)
chr4 (266-608)||(27163235-27163577)
chr4 (266-608)||(6569864-6570206)
chr4 (276-608)||(18800531-18800863)
chr4 (266-608)||(40105556-40105898)
chr4 (266-608)||(14098552-14098894)
chr4 (276-608)||(36344433-36344765)
chr4 (276-608)||(54833408-54833740)
chr4 (266-608)||(31126436-31126778)
chr4 (278-608)||(30753777-30754107)
chr4 (278-608)||(33673716-33674046)
chr4 (278-608)||(39850661-39850991)
chr4 (266-608)||(21969712-21970054)
chr4 (272-603)||(15284851-15285182)
chr4 (267-606)||(1900269-1900608)
chr4 (272-606)||(15227887-15228221)
chr4 (275-594)||(24460537-24460856)
chr4 (272-573)||(14235478-14235779)
chr4 (275-573)||(24112682-24112980)
chr4 (275-573)||(34188913-34189211)
chr4 (278-576)||(15391288-15391586)
chr4 (11-208)||(15227638-15227835)
chr4 (11-243)||(1900025-1900257)
chr4 (6-207)||(14664778-14664979)
chr4 (70-195)||(24112489-24112614)
chr4 (70-195)||(34189279-34189404)
chr4 (11-207)||(15285235-15285431)
chr4 (6-178)||(18800961-18801133)
chr4 (6-178)||(19373021-19373193)
chr4 (89-207)||(24460912-24461030)
chr4 (6-165)||(39850383-39850542)
chr4 (6-212)||(17013760-17013966)
chr4 (6-195)||(14763626-14763815)
chr4 (6-207)||(24592621-24592822)
chr4 (6-195)||(36344834-36345023)
chr4 (125-165)||(33674162-33674202)
chr4 (125-212)||(5005749-5005836)
chr4 (125-212)||(6569732-6569819)
chr4 (6-212)||(54833150-54833356)
chr4 (9-177)||(40105978-40106146)
[»] chr3 (92 HSPs)
chr3 (266-608)||(8301226-8301568)
chr3 (267-608)||(15892665-15893006)
chr3 (266-608)||(4796612-4796954)
chr3 (266-608)||(8295929-8296271)
chr3 (266-608)||(15741053-15741395)
chr3 (266-608)||(18051219-18051561)
chr3 (266-608)||(18330626-18330968)
chr3 (266-608)||(29148714-29149056)
chr3 (266-608)||(6192273-6192615)
chr3 (266-608)||(35880723-35881065)
chr3 (266-608)||(4721588-4721930)
chr3 (275-608)||(22387537-22387870)
chr3 (266-608)||(18277011-18277353)
chr3 (266-608)||(18292312-18292654)
chr3 (266-608)||(18307613-18307955)
chr3 (266-608)||(4416876-4417218)
chr3 (266-608)||(28115913-28116255)
chr3 (266-608)||(7073169-7073511)
chr3 (266-608)||(31964432-31964774)
chr3 (266-608)||(50134030-50134372)
chr3 (266-608)||(10396090-10396432)
chr3 (266-608)||(5609281-5609623)
chr3 (266-608)||(47023410-47023752)
chr3 (266-608)||(28339259-28339601)
chr3 (266-608)||(7996519-7996861)
chr3 (266-608)||(10643027-10643369)
chr3 (266-608)||(21674650-21674992)
chr3 (278-608)||(36997036-36997366)
chr3 (275-608)||(4346646-4346979)
chr3 (275-608)||(28021241-28021574)
chr3 (266-594)||(5713184-5713512)
chr3 (266-594)||(5724094-5724422)
chr3 (266-594)||(5757055-5757383)
chr3 (266-594)||(5767946-5768274)
chr3 (276-608)||(6542421-6542753)
chr3 (266-608)||(17984915-17985257)
chr3 (284-608)||(8211713-8212037)
chr3 (277-608)||(5466953-5467284)
chr3 (278-608)||(48465896-48466226)
chr3 (275-608)||(22870815-22871148)
chr3 (275-608)||(22885874-22886207)
chr3 (276-608)||(5596316-5596648)
chr3 (276-608)||(18242706-18243038)
chr3 (266-608)||(18225148-18225490)
chr3 (284-608)||(51781998-51782322)
chr3 (266-608)||(5013669-5014011)
chr3 (278-608)||(11110308-11110638)
chr3 (266-608)||(24328116-24328458)
chr3 (278-608)||(20576806-20577136)
chr3 (284-608)||(51797087-51797412)
chr3 (278-608)||(29664929-29665259)
chr3 (272-606)||(18530351-18530685)
chr3 (272-608)||(32292715-32293051)
chr3 (275-608)||(31034076-31034409)
chr3 (272-603)||(16626470-16626801)
chr3 (275-599)||(5652353-5652677)
chr3 (275-594)||(17993757-17994076)
chr3 (275-573)||(4625910-4626208)
chr3 (275-573)||(32439120-32439418)
chr3 (276-573)||(20066010-20066307)
chr3 (275-486)||(4893176-4893387)
chr3 (6-195)||(8211447-8211636)
chr3 (89-207)||(17994132-17994250)
chr3 (6-212)||(22871220-22871426)
chr3 (6-212)||(22886279-22886485)
chr3 (89-206)||(4625736-4625853)
chr3 (70-195)||(32438927-32439052)
chr3 (11-207)||(16626854-16627049)
chr3 (70-195)||(4892983-4893108)
chr3 (6-195)||(5466691-5466880)
chr3 (6-207)||(18050968-18051169)
chr3 (6-207)||(35880472-35880673)
chr3 (6-212)||(4721337-4721543)
chr3 (6-212)||(4796999-4797205)
chr3 (89-207)||(5652179-5652297)
chr3 (6-212)||(7996268-7996474)
chr3 (6-212)||(10642776-10642982)
chr3 (6-212)||(28116303-28116509)
chr3 (6-207)||(15741433-15741634)
chr3 (6-195)||(18277415-18277604)
chr3 (6-195)||(18292716-18292905)
chr3 (6-195)||(18308017-18308206)
chr3 (6-195)||(22387938-22388127)
chr3 (6-178)||(6542854-6543026)
chr3 (8-212)||(15893052-15893256)
chr3 (11-207)||(18530108-18530304)
chr3 (6-165)||(21674399-21674558)
chr3 (125-212)||(29665331-29665418)
chr3 (6-165)||(48465621-48465780)
chr3 (6-212)||(7072918-7073124)
chr3 (125-165)||(51781836-51781876)
chr3 (125-165)||(51796925-51796965)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (266-608)||(2137136-2137478)
chr8 (266-608)||(19688094-19688436)
chr8 (266-608)||(27608782-27609124)
chr8 (266-608)||(16277550-16277892)
chr8 (267-608)||(16283446-16283787)
chr8 (266-608)||(14557620-14557962)
chr8 (266-608)||(19674437-19674779)
chr8 (266-608)||(31489627-31489969)
chr8 (266-608)||(19208237-19208579)
chr8 (266-608)||(28361832-28362174)
chr8 (266-608)||(31354520-31354862)
chr8 (276-608)||(19286468-19286800)
chr8 (276-608)||(12092601-12092933)
chr8 (276-608)||(29829328-29829660)
chr8 (266-608)||(33258719-33259061)
chr8 (276-608)||(3329384-3329716)
chr8 (275-608)||(18710591-18710924)
chr8 (434-608)||(189258-189432)
chr8 (275-608)||(9354627-9354961)
chr8 (272-566)||(44563103-44563396)
chr8 (275-599)||(19658926-19659249)
chr8 (275-573)||(33244670-33244968)
chr8 (278-576)||(22080787-22081085)
chr8 (89-207)||(44562932-44563050)
chr8 (6-207)||(18710331-18710532)
chr8 (8-212)||(16283196-16283400)
chr8 (89-207)||(9354453-9354571)
chr8 (89-207)||(19659305-19659423)
chr8 (278-342)||(19518280-19518344)
chr8 (6-207)||(16277299-16277500)
chr8 (6-207)||(2137528-2137729)
chr8 (6-207)||(14557372-14557573)
chr8 (6-177)||(19208659-19208830)
chr8 (6-212)||(19286210-19286416)
chr8 (125-178)||(19518441-19518494)
chr8 (6-178)||(29829058-29829230)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (266-607)||(27288-27629)
scaffold0143 (6-207)||(27037-27238)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (266-608)||(47-390)
scaffold0029 (6-212)||(435-641)
[»] scaffold0350 (2 HSPs)
scaffold0350 (266-608)||(7157-7499)
scaffold0350 (6-177)||(7579-7750)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (266-608)||(8984-9326)
scaffold0159 (266-608)||(20011-20353)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (266-608)||(10962665-10963007)
chr1 (266-608)||(41793226-41793568)
chr1 (266-608)||(28584976-28585318)
chr1 (266-608)||(51638213-51638555)
chr1 (267-606)||(16207951-16208290)
chr1 (272-573)||(28151863-28152164)
chr1 (267-608)||(20340253-20340594)
chr1 (272-555)||(20461082-20461365)
chr1 (11-207)||(20460857-20461053)
chr1 (89-207)||(20340642-20340760)
chr1 (6-212)||(41793613-41793819)
chr1 (6-178)||(51637962-51638134)
chr1 (6-177)||(10962414-10962585)
chr1 (11-108)||(16208434-16208531)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (266-608)||(30449-30790)
scaffold0124 (272-606)||(20390-20723)
scaffold0124 (11-207)||(20162-20358)
scaffold0124 (6-207)||(30198-30399)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (266-608)||(14848-15190)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (275-608)||(9571-9904)
scaffold0336 (6-195)||(7977-8166)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (266-608)||(26119-26462)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (284-608)||(7963-8287)
scaffold0038 (6-178)||(7682-7854)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (276-600)||(6015-6344)
scaffold0415 (340-606)||(1838-2103)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (272-572)||(46756-47072)
[»] scaffold0260 (2 HSPs)
scaffold0260 (267-608)||(2576-2917)
scaffold0260 (89-207)||(2965-3083)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (272-549)||(5-282)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (278-576)||(21569-21867)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (416-576)||(568-728)
[»] scaffold2173 (2 HSPs)
scaffold2173 (182-244)||(1-63)
scaffold2173 (275-578)||(94-397)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 77)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 27273029 - 27272441
Alignment:
Q  14 cacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27273029 cacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctggagcaggtcagactacagctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccat 27272930  T
Q  114 actcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgt 213  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27272929 actcctatgtaccgtattctcaacatccattctacccgccattttactattagtatcctttgccatcaggaccacctcaagtacctgtgaatgctattgt 27272830  T
Q  214 gcagcagaagccacagcaaccaccagttcagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgct 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||                     ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27272829 gcagcagaagccacaacaaccaccagttcagcaacaacaacaacag------aatcagcaagtcagacctactttccctccgataccgatgttatatgct 27272736  T
Q  314 gagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaat 413  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27272735 gagttgcttccgactctactccagagagggcattgtacaaccagacagggtaagcccccacctgatccgtcgcctcccaggttcaggtccgacctcaaat 27272636  T
Q  414 gtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttga 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  27272635 gtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcatcgatcaagggaagctgacctttga 27272536  T
Q  514 gaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27272535 gaataatgttccgcatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggtagctcctagacttgatgtcc 27272441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 22935083 - 22934741
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22935083 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggca 22934984  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22934983 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 22934884  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22934883 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 22934784  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22934783 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 22934741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 23857528 - 23857186
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23857528 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggca 23857429  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23857428 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 23857329  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23857328 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 23857229  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23857228 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 23857186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 24863710 - 24864052
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24863710 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 24863809  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24863810 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 24863909  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24863910 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 24864009  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24864010 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24864052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 15424520 - 15424178
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15424520 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaactagacagggca 15424421  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424420 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 15424321  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15424320 gaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 15424221  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15424220 aatatgatcaaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15424178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 26918373 - 26918715
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918373 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 26918472  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26918473 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcttt 26918572  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  26918573 gaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 26918672  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26918673 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 26918715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 26988994 - 26989336
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26988994 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggca 26989093  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26989094 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 26989193  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26989194 gaagtatatcgtaaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 26989293  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26989294 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 26989336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 24304821 - 24304479
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24304821 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 24304722  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24304721 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgattt 24304622  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24304621 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 24304522  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24304521 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24304479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 266 - 602
Target Start/End: Original strand, 27000066 - 27000402
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27000066 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 27000165  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27000166 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 27000265  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  27000266 gaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 27000365  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttg 602  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  27000366 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctacacttg 27000402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 266 - 605
Target Start/End: Original strand, 16749847 - 16750186
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16749847 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggca 16749946  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16749947 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 16750046  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  16750047 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 16750146  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatg 605  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16750147 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatg 16750186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 13299154 - 13298812
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13299154 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 13299055  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||    
T  13299054 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgacgtcgagggatgctacacttt 13298955  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13298954 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 13298855  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13298854 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 13298812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 275 - 608
Target Start/End: Original strand, 29549477 - 29549810
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  29549477 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 29549576  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  29549577 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 29549676  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  29549677 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatc 29549776  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  29549777 gaagtgtgtgaggaagctcctggacttgatgtcc 29549810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Original strand, 4757767 - 4758099
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4757767 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 4757866  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  4757867 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatc 4757966  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4757967 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 4758066  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4758067 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4758099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 278 - 608
Target Start/End: Original strand, 3696086 - 3696416
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  3696086 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctg 3696185  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3696186 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 3696285  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3696286 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 3696385  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
       ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  3696386 atgtgtgatgaagctcctagacttgatgtcc 3696416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 29573006 - 29573348
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||| |    
T  29573006 aatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggta 29573105  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29573106 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 29573205  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  29573206 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 29573305  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  29573306 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 29573348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 278 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 34463537 - 34463207
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||||| || |||||||||||||    
T  34463537 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacaaggaaagcccccacctg 34463438  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  34463437 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 34463338  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34463337 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 34463238  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34463237 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 34463207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Original strand, 27044390 - 27044723
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27044390 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacc 27044489  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggt-gctatgctttgaagtacat 474  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  27044490 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtggttatgctttgaagtatat 27044589  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27044590 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 27044689  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27044690 gaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27044723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Original strand, 4525289 - 4525621
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  4525289 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgcacaactagacagggcaagccaccacc 4525388  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  4525389 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcccaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatt 4525488  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4525489 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 4525588  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4525589 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4525621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 284 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 4545960 - 4545636
Alignment:
Q  284 actttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgt 383  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  4545960 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 4545861  T
Q  384 tgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 483  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  4545860 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 4545761  T
Q  484 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 583  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  4545760 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 4545661  T
Q  584 gaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  4545660 gaggaagctcctagacttgatgtcc 4545636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 284 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 4724319 - 4723995
Alignment:
Q  284 actttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgt 383  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4724319 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 4724220  T
Q  384 tgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 483  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  4724219 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 4724120  T
Q  484 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 583  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  4724119 actcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 4724020  T
Q  584 gaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  4724019 gaggaagctcctagacttgatgtcc 4723995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Original strand, 4773009 - 4773341
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||    
T  4773009 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 4773108  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  4773109 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 4773208  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4773209 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 4773308  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4773309 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4773341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 26116603 - 26116271
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  26116603 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccgactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 26116504  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  26116503 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 26116404  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26116403 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 26116304  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26116303 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 26116271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 276 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 27360185 - 27359852
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27360185 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 27360086  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  27360085 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatc 27359986  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27359985 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 27359886  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcca 609  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27359885 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcca 27359852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 276 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 27450528 - 27450195
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27450528 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 27450429  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  27450428 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatc 27450329  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27450328 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 27450229  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcca 609  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27450228 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcca 27450195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 278 - 608
Target Start/End: Original strand, 16674144 - 16674474
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||||    
T  16674144 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 16674243  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16674244 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 16674343  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16674344 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 16674443  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16674444 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 16674474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 275 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 26777809 - 26777475
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26777809 gctagaccaaccttccctcctataccgatgttgtatgccgaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 26777710  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  26777709 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 26777610  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26777609 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 26777510  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcca 609  Q
    ||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  26777509 gaagtgtgtgaggaaaatcctagacttgatgtcca 26777475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 30558219 - 30557877
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30558219 aatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggca 30558120  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30558119 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 30558020  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  30558019 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 30557920  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  30557919 aatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 30557877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 284 - 608
Target Start/End: Original strand, 28207465 - 28207789
Alignment:
Q  284 actttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgt 383  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28207465 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 28207564  T
Q  384 tgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 483  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  28207565 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 28207664  T
Q  484 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 583  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  28207665 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 28207764  T
Q  584 gaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  28207765 gaggaagctcctagacttgatgtcc 28207789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Original strand, 29501418 - 29501750
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29501418 ctagaccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacc 29501517  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  29501518 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 29501617  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29501618 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 29501717  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29501718 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 29501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 16944230 - 16943888
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  16944230 aatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggta 16944131  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16944130 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 16944031  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||     
T  16944030 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtg 16943931  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  16943930 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 16943888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Original strand, 27007730 - 27008062
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||    
T  27007730 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 27007829  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  27007830 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 27007929  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27007930 gtgaagaagctcattgaccagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 27008029  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  27008030 aagtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtcc 27008062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Original strand, 27485132 - 27485464
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27485132 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacc 27485231  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  27485232 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 27485331  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27485332 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 27485431  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27485432 aagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 27485464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27630155 - 27629925
Alignment:
Q  14 cacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27630155 cacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctcgggagcaggtcagtctacggctactgtcgcccctgttaatgttgctcagctacctccaccat 27630056  T
Q  114 actcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgt 213  Q
    || ||| | |||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27630055 acccctgtacaccatattctcagcatccattcttcccaccgttttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgt 27629956  T
Q  214 gcagcagaagccacagcaaccaccagttcag 244  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27629955 gcaacagaagccacaacaaccaccagttcag 27629925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 273 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 27290566 - 27290231
Alignment:
Q  273 aagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagccccc 372  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||    
T  27290566 aagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctcc 27290467  T
Q  373 acctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtac 472  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||    
T  27290466 acctgatccgttacctcccaagttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaagtac 27290367  T
Q  473 atcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatga 572  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  27290366 attgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcaacaatcttcttccgaatcatgctactgtaaatatga 27290267  T
Q  573 tcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    | || | || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27290266 ttgaggtatatgaggaagctcctagacttgatgtcc 27290231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Original strand, 17025280 - 17025612
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||    
T  17025280 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 17025379  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
     || || || ||||| |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  17025380 ggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 17025479  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17025480 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 17025579  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17025580 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 17025612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 272 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 14143482 - 14143146
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| ||  ||| ||||||||| ||||| |    
T  14143482 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 14143383  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  14143382 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 14143283  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 571  Q
    ||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  14143282 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 14143183  T
Q  572 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    || || | || ||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  14143182 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 14143146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 272 - 608
Target Start/End: Original strand, 26787943 - 26788279
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| ||  ||| ||||||||| ||||| |    
T  26787943 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 26788042  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  26788043 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 26788142  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 571  Q
    ||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  26788143 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 26788242  T
Q  572 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    || || | || ||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  26788243 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 26788279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 272 - 608
Target Start/End: Original strand, 27196316 - 27196652
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| ||  ||| ||||||||| ||||| |    
T  27196316 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 27196415  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  27196416 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 27196515  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 571  Q
    ||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  27196516 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 27196615  T
Q  572 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    || || | || ||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  27196616 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 27196652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 272 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 27252924 - 27252588
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| ||  ||| ||||||||| ||||| |    
T  27252924 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctc 27252825  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  27252824 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 27252725  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 571  Q
    ||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  27252724 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 27252625  T
Q  572 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    || || | || ||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  27252624 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 27252588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 276 - 603
Target Start/End: Original strand, 20160704 - 20161031
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  20160704 ctagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacagagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacc 20160803  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || || ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  20160804 tgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatatt 20160903  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    |||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||| | ||| || |||||||    
T  20160904 gtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcg 20161003  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttga 603  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  20161004 aagtgtgtgaggaagctcctagacttga 20161031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 276 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 22172127 - 22171800
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  22172127 ctagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacagagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacc 22172028  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || || ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  22172027 tgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatatt 22171928  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    |||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||| | ||| || |||||||    
T  22171927 gtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcg 22171828  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttga 603  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  22171827 aagtgtgtgaggaagctcctagacttga 22171800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 272 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 22457131 - 22456795
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  | | |||| || |||||||||||||||||||| |    
T  22457131 caagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccgactctacttctcataaggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 22457032  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  22457031 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttcttacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagta 22456932  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 571  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||  ||    
T  22456931 cattgtgaagaagctcatagaccaaggaaagttaacttttgagaataatttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacgtg 22456832  T
Q  572 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    || || | || ||||| |||||| |||||||||||||    
T  22456831 attgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 22456795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 275 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 13522267 - 13521939
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  13522267 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 13522168  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||    
T  13522167 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacat 13522068  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
     ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||||     
T  13522067 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 13521968  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcctagacttga 603  Q
    || | || ||||| ||||||  |||||||    
T  13521967 gaggtatatgaggaagctcccggacttga 13521939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 275 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 33374450 - 33374131
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  33374450 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 33374351  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  33374350 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 33374251  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||||     
T  33374250 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 33374151  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcc 594  Q
    || | || ||||| ||||||    
T  33374150 gaggtatatgaggaagctcc 33374131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 275 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 8892504 - 8892186
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  8892504 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 8892405  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  8892404 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 8892305  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  8892304 tgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 8892206  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcc 594  Q
    |||| || ||||| ||||||    
T  8892205 gaagtatatgaggaagctcc 8892186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 275 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 8903739 - 8903421
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  8903739 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 8903640  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  8903639 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 8903540  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  8903539 tgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 8903441  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcc 594  Q
    |||| || ||||| ||||||    
T  8903440 gaagtatatgaggaagctcc 8903421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 272 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 22477470 - 22477240
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  | | |||| || |||||||||||||||||||| |    
T  22477470 caagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccgactctacttctcatatggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 22477371  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  22477370 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctaacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagta 22477271  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaag 502  Q
    ||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  22477270 cattgtgaagaagctcatagaccaaggaaag 22477240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 272 - 594
Target Start/End: Original strand, 28162656 - 28162978
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  28162656 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 28162755  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    ||| |||||| | |||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  || ||||| || |||| |||    
T  28162756 cacttgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcggaggatgctacgcgttgaggta 28162855  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 571  Q
    ||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||    
T  28162856 cattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatg 28162955  T
Q  572 atcgaagaatgtgaggcagctcc 594  Q
    || || | || ||||| ||||||    
T  28162956 attgaggtatatgaggaagctcc 28162978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 212
Target Start/End: Original strand, 20160499 - 20160652
Alignment:
Q  59 ggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccatttt 158  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||   | |||||  |||||||||||||| ||||  || |||||||    
T  20160499 ggtcaatccatggctactgttgcccctgttaatgctactcaattacctccaccatacctgtttgcacattactctcaacatcctttctatccaccatttt 20160598  T
Q  159 accatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 212  Q
    ||||||| |||||| | ||| | || | ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20160599 accatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattg 20160652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22172332 - 22172179
Alignment:
Q  59 ggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccatttt 158  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||   | |||||  |||||||||||||| ||||  || |||||||    
T  22172332 ggtcaatccatggctactgttgcccctgttaatgctactcaattacctccaccatacctgtttgcacattactctcaacatcctttctatccaccatttt 22172233  T
Q  159 accatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 212  Q
    ||||||| |||||| | ||| | || | ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22172232 accatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattg 22172179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Original strand, 28162485 - 28162603
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  28162485 aatgctgctcagctacctccatcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggacaac 28162584  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  28162585 ctcaggtacccgttaatgc 28162603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 27629894 - 27629591
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| | ||| || |    
T  27629894 gctaggcctacttttcctccaatcccgatgttgtatgctgatttacttccaacattacttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaggcctccgc 27629795  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    | ||||| || || || |||||  |  | || ||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| || || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  27629794 cagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgacgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 27629695  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
     ||  | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| ||||| || |||||| | ||||| || ||||| |||||     
T  27629694 tgtccagaggcttattgaccaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataaccctcttccagaccatgctgcagtaaacatgatt 27629595  T
Q  575 gaag 578  Q
    ||||    
T  27629594 gaag 27629591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 482 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 17092427 - 17092301
Alignment:
Q  482 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 581  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| || ||||  || | ||    
T  17092427 aagctcattgaccagggaaagttgacttttgagaataatacccctcatgtcctcgataatccccttccaaaccacgctgctgtgaacatgactgaggtat 17092328  T
Q  582 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||| |||| | | |||||||||||    
T  17092327 gtgaggaagctaccaaacttgatgtcc 17092301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Original strand, 4525031 - 4525220
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  4525031 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcc 4525130  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggt 195  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||    
T  4525131 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtatcctttgccaccaggccaacctcaggt 4525220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Original strand, 29549220 - 29549409
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  29549220 atggacatcacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 29549319  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggt 195  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | |||||||||    
T  29549320 tccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggt 29549409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13522441 - 13522323
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  13522441 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 13522342  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  13522341 ctcaggtacccgttaatgc 13522323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33374624 - 33374506
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  33374624 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 33374525  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  33374524 ctcaggtacccgttaatgc 33374506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24305072 - 24304871
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || |||||||||||||| ||| | |||||||| ||  | ||    
T  24305072 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgtcgctcctatcaatgctgcccaaatgcc 24304973  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  24304972 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 24304873  T
Q  206 gc 207  Q
    ||    
T  24304872 gc 24304871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8892678 - 8892560
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||| |||||||||| || | ||    
T  8892678 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtattctttgccatcgggtcaac 8892579  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  8892578 ctcaggtacccgttaatgc 8892560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Original strand, 26918122 - 26918328
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  26918122 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 26918221  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  26918222 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 26918321  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  26918322 gcaattg 26918328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15424771 - 15424570
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| || ||  | ||    
T  15424771 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 15424672  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  15424671 tccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 15424572  T
Q  206 gc 207  Q
    ||    
T  15424571 gc 15424570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22935218 - 22935125
Alignment:
Q  119 tatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 212  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||| | || | ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22935218 tatgcgccgtattctcaacatcccttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgcaattg 22935125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23857663 - 23857570
Alignment:
Q  119 tatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 212  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||| | || | ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23857663 tatgcgccgtattctcaacatcccttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgcaattg 23857570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Original strand, 4757503 - 4757675
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  |||| ||||| || |||||||||||||| ||| | ||||| |||||  | ||    
T  4757503 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagccggagccggtcaatcaatggctactgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 4757602  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcca 178  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  4757603 tccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcca 4757675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22477665 - 22477521
Alignment:
Q  68 atggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaat 167  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||| ||  ||||||   | ||| | ||||| | ||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||| | |    
T  22477665 atggctactgttgccccaattaatgctgcccaattacctctgtcgtacccgtatgcgcagtactctcagcatcccttctttccaccattctatcattagt 22477566  T
Q  168 atcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 212  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22477565 atcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattg 22477521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27360464 - 27360292
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  27360464 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 27360365  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcca 178  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  27360364 tccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcca 27360292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27450807 - 27450635
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  27450807 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 27450708  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcca 178  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  27450707 tccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcca 27450635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8903913 - 8903795
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||||| ||||  ||||| || ||||| || ||||| ||| |||||||||| || | ||    
T  8903913 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatctcttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtcaac 8903814  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  8903813 ctcaggtacccgttaatgc 8903795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Original strand, 26999815 - 27000021
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| || ||  | ||    
T  26999815 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 26999914  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  26999915 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 27000014  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  27000015 gcaattg 27000021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13299405 - 13299204
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| || ||  | ||    
T  13299405 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagctggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 13299306  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  13299305 tccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 13299206  T
Q  206 gc 207  Q
    ||    
T  13299205 gc 13299204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Original strand, 26988743 - 26988944
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| || ||  | ||    
T  26988743 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 26988842  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  26988843 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 26988942  T
Q  206 gc 207  Q
    ||    
T  26988943 gc 26988944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 4546238 - 4546066
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  4546238 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctgcagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 4546139  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcca 178  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  4546138 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcca 4546066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 4724597 - 4724425
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  4724597 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctgcagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 4724498  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcca 178  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  4724497 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcca 4724425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Original strand, 4772739 - 4772911
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  |||| ||||| ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  4772739 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagccggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 4772838  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcca 178  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  4772839 tccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcca 4772911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Original strand, 28207184 - 28207356
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  28207184 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctgcagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 28207283  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcca 178  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  28207284 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcca 28207356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 29572755 - 29572926
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  29572755 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 29572854  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcc 177  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  29572855 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 29572926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Original strand, 16673988 - 16674028
Alignment:
Q  125 ccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatca 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  16673988 ccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatca 16674028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 307; Significance: 1e-172; HSPs: 69)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 27434693 - 27434351
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27434693 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccggctttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 27434594  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27434593 agcccccacctgatccgttgcctcccaagttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 27434494  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27434493 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 27434394  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27434393 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27434351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 23128815 - 23128473
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128815 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 23128716  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128715 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 23128616  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23128615 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 23128516  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23128515 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 23128473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 28882206 - 28882548
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882206 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 28882305  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882306 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 28882405  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28882406 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 28882505  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28882506 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 28882548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 20837910 - 20838252
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20837910 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggca 20838009  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20838010 agcccccacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgaccttaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 20838109  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20838110 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 20838209  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20838210 aatttgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 20838252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 12655534 - 12655876
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655534 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 12655633  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12655634 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcttt 12655733  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  12655734 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgta 12655833  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12655834 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 12655876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 11635435 - 11635093
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11635435 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 11635336  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11635335 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgcttt 11635236  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  11635235 gaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtg 11635136  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||    
T  11635135 aatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 11635093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 11641624 - 11641282
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11641624 aatcagcaagctagacctactttccctccgatacagatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 11641525  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11641524 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgcttt 11641425  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  11641424 gaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtg 11641325  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||    
T  11641324 aatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 11641282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 21677431 - 21677089
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21677431 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 21677332  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21677331 agcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 21677232  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  21677231 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 21677132  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||    
T  21677131 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 21677089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 34861672 - 34862014
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  34861672 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 34861771  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34861772 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 34861871  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  34861872 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 34861971  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| ||||| |||||||    
T  34861972 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagactagatgtcc 34862014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 37686158 - 37685816
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  37686158 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 37686059  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37686058 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 37685959  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||||||     
T  37685958 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtg 37685859  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  37685858 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 37685816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 37701423 - 37701081
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  37701423 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 37701324  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37701323 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 37701224  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||||||     
T  37701223 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtg 37701124  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  37701123 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 37701081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 32049790 - 32050132
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  32049790 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 32049889  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    | |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32049890 aacccccaccggacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 32049989  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||     
T  32049990 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 32050089  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||| ||||  ||||||| || |||||||||||||||||    
T  32050090 aatatgattgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 32050132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 266 - 576
Target Start/End: Original strand, 34286346 - 34286656
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  34286346 aatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggta 34286445  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  34286446 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgcttt 34286545  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  34286546 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtg 34286645  T
Q  566 aatatgatcga 576  Q
    |||||||||||    
T  34286646 aatatgatcga 34286656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 266 - 576
Target Start/End: Original strand, 34291406 - 34291716
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  34291406 aatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggta 34291505  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  34291506 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgcttt 34291605  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  34291606 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtg 34291705  T
Q  566 aatatgatcga 576  Q
    |||||||||||    
T  34291706 aatatgatcga 34291716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 37925485 - 37925827
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  37925485 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 37925584  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37925585 agcccccacccgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgacttccatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 37925684  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  37925685 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtg 37925784  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  37925785 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 37925827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 266 - 523
Target Start/End: Original strand, 34279441 - 34279698
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  34279441 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggta 34279540  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34279541 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 34279640  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtc 523  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279641 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtc 34279698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 22926277 - 22925935
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22926277 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 22926178  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22926177 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 22926078  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||     
T  22926077 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcacgctgctgtg 22925978  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  22925977 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 22925935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 268 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 13936791 - 13936451
Alignment:
Q  268 tcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaag 367  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || |||||||||    
T  13936791 tcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaag 13936692  T
Q  368 cccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttga 467  Q
    || ||||| || || || ||||| |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13936691 cctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttga 13936592  T
Q  468 agtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaa 567  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  13936591 agtacatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaa 13936492  T
Q  568 tatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13936491 tatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 13936451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 31876273 - 31876615
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  31876273 aatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggta 31876372  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31876373 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 31876472  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  31876473 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 31876572  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  31876573 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 31876615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Original strand, 37375163 - 37375495
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||    
T  37375163 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 37375262  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  37375263 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37375362  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37375363 gtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37375462  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  37375463 aagtgtgtggggaagctcctagacttgatgtcc 37375495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 16829587 - 16829245
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16829587 aatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggca 16829488  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16829487 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 16829388  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  16829387 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 16829288  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  16829287 aatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 16829245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 16891894 - 16892236
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16891894 aatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggca 16891993  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16891994 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 16892093  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  16892094 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 16892193  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  16892194 aatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 16892236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 278 - 608
Target Start/End: Original strand, 40233515 - 40233845
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||||    
T  40233515 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 40233614  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  40233615 atccgttgcctccaaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgt 40233714  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  40233715 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaaaatgatcgaa 40233814  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40233815 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 40233845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 275 - 608
Target Start/End: Original strand, 39890075 - 39890408
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39890075 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 39890174  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  39890175 ctgatccgttgcctccaaggttcagggctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctctgaagtatat 39890274  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39890275 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 39890374  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39890375 gaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 39890408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 284 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 260984 - 260660
Alignment:
Q  284 actttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgt 383  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  260984 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatctgt 260885  T
Q  384 tgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 483  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  260884 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 260785  T
Q  484 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 583  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||     
T  260784 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcaacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgc 260685  T
Q  584 gaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||| || |||||||||||||||||    
T  260684 gaggaagttcctagacttgatgtcc 260660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 19416748 - 19416406
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  19416748 aatcagcaagccaggccaactttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggta 19416649  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19416648 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 19416549  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||     
T  19416548 gaaatatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 19416449  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  19416448 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 19416406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 278 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 12716839 - 12716509
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| |    
T  12716839 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 12716740  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    | || || ||||| |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12716739 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 12716640  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12716639 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 12716540  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12716539 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 12716509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 278 - 608
Target Start/End: Original strand, 27777226 - 27777556
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| |    
T  27777226 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 27777325  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    | || || ||||| |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27777326 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 27777425  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27777426 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 27777525  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27777526 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27777556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 278 - 608
Target Start/End: Original strand, 27816984 - 27817314
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| |    
T  27816984 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 27817083  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    | || || ||||| |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27817084 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 27817183  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27817184 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 27817283  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27817284 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27817314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 278 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 39052059 - 39051729
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| |    
T  39052059 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 39051960  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    | || || ||||| |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  39051959 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 39051860  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39051859 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 39051760  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39051759 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 39051729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 267 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 21703412 - 21703073
Alignment:
Q  267 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 366  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||||||||||| |||    
T  21703412 atcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacaggacaa 21703313  T
Q  367 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 466  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||    
T  21703312 gcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcaaaggatgctacgctttg 21703213  T
Q  467 aagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 566  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  21703212 aagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaa 21703113  T
Q  567 atatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgt 606  Q
    | ||||| || | || ||||| |||||| ||||| |||||    
T  21703112 acatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgt 21703073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 278 - 605
Target Start/End: Original strand, 27803711 - 27804038
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| |    
T  27803711 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 27803810  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    | || || ||||| |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27803811 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 27803910  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27803911 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 27804010  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatg 605  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||    
T  27804011 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatg 27804038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 278 - 608
Target Start/End: Original strand, 12586814 - 12587144
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| |    
T  12586814 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagtcgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 12586913  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    | || || ||||| |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  12586914 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgt 12587013  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12587014 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 12587113  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12587114 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 12587144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 272 - 599
Target Start/End: Original strand, 27118686 - 27119013
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  27118686 caagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 27118785  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||| |||    
T  27118786 cacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggta 27118885  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 571  Q
    ||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || | |||||| |||    
T  27118886 cattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtaaacatg 27118985  T
Q  572 atcgaagaatgtgaggcagctcctagac 599  Q
    || || | || ||||| |||||| ||||    
T  27118986 attgaggtatatgaggaagctcccagac 27119013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 272 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 19456664 - 19456333
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  19456664 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcatagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 19456565  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||    
T  19456564 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagaatgctacgctttgaagta 19456465  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 571  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || |||    
T  19456464 cattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatg 19456365  T
Q  572 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttga 603  Q
    || || | |||||||| |||||| ||||||||    
T  19456364 attgaggtatgtgaggaagctcccagacttga 19456333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 272 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 31891571 - 31891249
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  31891571 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 31891472  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  31891471 cacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcgttgaggta 31891372  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 571  Q
    ||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||| ||||||| ||||| || ||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||    
T  31891371 cattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttaagaataacgtccctcacgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatg 31891272  T
Q  572 atcgaagaatgtgaggcagctcc 594  Q
    || || | || ||||| ||||||    
T  31891271 attgaggtatatgaggaagctcc 31891249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 278 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 9350219 - 9349903
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || || |||||||| ||||| |    
T  9350219 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcaaggcaagcctccaccgg 9350120  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    | || || ||||| |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  9350119 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 9350020  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||     
T  9350019 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgag 9349920  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcc 594  Q
    | || ||||| ||||||    
T  9349919 gtatatgaggaagctcc 9349903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 272 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 34303546 - 34303210
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  34303546 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 34303447  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||    
T  34303446 cacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggta 34303347  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 571  Q
    ||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||| |||| |||    
T  34303346 cattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaaacatgctgctataaacatg 34303247  T
Q  572 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    || || | || ||||| |||||| |||||||||||||    
T  34303246 attgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 34303210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 275 - 594
Target Start/End: Original strand, 3784655 - 3784974
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  3784655 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 3784754  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  3784755 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 3784854  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  3784855 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 3784954  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcc 594  Q
    || | || ||||| ||||||    
T  3784955 gaggtatatgaggaagctcc 3784974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 275 - 594
Target Start/End: Original strand, 16163600 - 16163919
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  16163600 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 16163699  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| || ||||| || |||| ||||||    
T  16163700 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatggcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 16163799  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  16163800 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 16163899  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcc 594  Q
    || | || ||||| ||||||    
T  16163900 gaggtatatgaggaagctcc 16163919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 275 - 594
Target Start/End: Original strand, 34157012 - 34157330
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  34157012 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 34157111  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  34157112 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 34157211  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  34157212 tgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 34157310  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcc 594  Q
    || | || ||||| ||||||    
T  34157311 gaggtatatgaggaagctcc 34157330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 278 - 576
Target Start/End: Original strand, 27392973 - 27393271
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||| || |  | |||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||     
T  27392973 agacctacctttcctccgataccaatgatgtatgccgagctgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcagggcaagcctccaccta 27393072  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    | ||||||||||||||||||   || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| ||    
T  27393073 acccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgt 27393172  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcga 576  Q
     || |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || | ||| || ||||||||    
T  27393173 aaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgatcga 27393271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21703656 - 21703460
Alignment:
Q  11 catcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccac 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||  |  |||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||  || |||||||      
T  21703656 catcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcctagttacctccgt 21703557  T
Q  111 catactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    | ||| | ||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||    
T  21703556 cgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 21703460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31891742 - 31891624
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  31891742 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggacaac 31891643  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  31891642 ctcaggtacccgttaatgc 31891624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Original strand, 3784481 - 3784599
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  3784481 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 3784580  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  3784581 ctcaggtacccgttaatgc 3784599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Original strand, 34156838 - 34156956
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  34156838 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 34156937  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  34156938 ctcaggtacccgttaatgc 34156956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 34303717 - 34303600
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  34303717 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 34303618  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatg 206  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  34303617 ctcaggtacccgttaatg 34303600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19456913 - 19456717
Alignment:
Q  11 catcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccac 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||  |  |||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||      
T  19456913 catcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagctggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgt 19456814  T
Q  111 catactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    | ||| | ||||| |  |||| ||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||| | ||||| || | ||||||||| ||||| |||||    
T  19456813 cgtacccatatgcgcaatactttcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaggtgcccgttaatgc 19456717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Original strand, 16163426 - 16163544
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||| |||||||||| || | ||    
T  16163426 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtcaac 16163525  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  16163526 ctcaggtacccgttaatgc 16163544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21677682 - 21677476
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  21677682 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 21677583  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    ||| |||||| | |||   ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| || ||||| |||    
T  21677582 tccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 21677483  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  21677482 gcgattg 21677476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Original strand, 27118515 - 27118633
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| |  |||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  27118515 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgcatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 27118614  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  27118615 ctcaggtacccgttaatgc 27118633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Original strand, 37374902 - 37375091
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | || ||  ||||  | ||    
T  37374902 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaacgcaactcaaatgcc 37375001  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggt 195  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || | |||||||||    
T  37375002 tccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccgccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggt 37375091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12717105 - 12716933
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  12717105 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcc 12717006  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcca 178  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  12717005 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgcca 12716933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27434942 - 27434738
Alignment:
Q  8 ggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctc 107  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  |||| ||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| ||  | ||||    
T  27434942 ggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctc 27434843  T
Q  108 caccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    |  | ||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||| | || | |||||| |||||||| |||||    
T  27434842 cgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 27434743  T
Q  208 tattg 212  Q
     ||||    
T  27434742 aattg 27434738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23129064 - 23128865
Alignment:
Q  8 ggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctc 107  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| || ||  | ||||    
T  23129064 ggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctc 23128965  T
Q  108 caccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    |  ||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||||    
T  23128964 cgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 23128865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13937044 - 13936838
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  13937044 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 13936945  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| | || | |||||| || ||||| |||    
T  13936944 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 13936845  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  13936844 gcaattg 13936838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Original strand, 37925234 - 37925440
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  37925234 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 37925333  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | |||||| || ||||| |||    
T  37925334 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 37925433  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  37925434 gcgattg 37925440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11635570 - 11635483
Alignment:
Q  125 ccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 212  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| ||||| ||||    
T  11635570 ccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattg 11635483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11641759 - 11641672
Alignment:
Q  125 ccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 212  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| ||||| ||||    
T  11641759 ccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattg 11641672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 31876022 - 31876193
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  31876022 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 31876121  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcc 177  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  31876122 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 31876193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 34861421 - 34861592
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  34861421 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 34861520  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcc 177  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  34861521 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 34861592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37686409 - 37686238
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  37686409 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 37686310  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcc 177  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  37686309 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 37686238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37701674 - 37701503
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  37701674 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 37701575  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcc 177  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  37701574 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 37701503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 40233240 - 40233399
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || |||||||| || || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  40233240 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 40233339  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatca 165  Q
    |||  ||||| | |||   ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  40233340 tccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatca 40233399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Original strand, 32049539 - 32049745
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||  | ||||| |||||  | ||    
T  32049539 atggacaccacaagaaaaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 32049638  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    ||| |||||| | |||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| || ||||| |||    
T  32049639 tccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 32049738  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  32049739 gcaattg 32049745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Original strand, 34279190 - 34279396
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  34279190 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 34279289  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| | || | |||||| || ||||| |||    
T  34279290 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 34279389  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  34279390 gcaattg 34279396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Original strand, 28881955 - 28882156
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||  | || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| || ||  | ||    
T  28881955 atggacaccacaagaagaaagaaacggaaatagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 28882054  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  28882055 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 28882154  T
Q  206 gc 207  Q
    ||    
T  28882155 gc 28882156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 39052209 - 39052169
Alignment:
Q  125 ccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatca 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  39052209 ccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatca 39052169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Original strand, 39889803 - 39889975
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||| ||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  39889803 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 39889902  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcca 178  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  39889903 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcca 39889975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 59)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 10917014 - 10916672
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10917014 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 10916915  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10916914 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 10916815  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10916814 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 10916715  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10916714 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 10916672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 266 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 16503526 - 16503185
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16503526 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 16503427  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16503426 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgtttt 16503327  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16503326 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 16503227  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtc 607  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16503226 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtc 16503185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 266 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 16518562 - 16518221
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16518562 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 16518463  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16518462 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgtttt 16518363  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16518362 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 16518263  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtc 607  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16518262 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtc 16518221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 2154570 - 2154912
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154570 aatcagcaagctagacatactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 2154669  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  2154670 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgcttt 2154769  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2154770 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 2154869  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2154870 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 2154912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 11424922 - 11424580
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11424922 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgcacaaccagacagggca 11424823  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11424822 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 11424723  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  11424722 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 11424623  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11424622 aatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtcc 11424580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 266 - 610
Target Start/End: Original strand, 5127989 - 5128333
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5127989 aatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggta 5128088  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5128089 agcccccacctaatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgcttt 5128188  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  5128189 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtg 5128288  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtccat 610  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5128289 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccat 5128333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 5147486 - 5147144
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  5147486 aatcaacaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggta 5147387  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5147386 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 5147287  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  5147286 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 5147187  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||    
T  5147186 aatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 5147144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 4145269 - 4144927
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  4145269 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 4145170  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4145169 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 4145070  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  4145069 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 4144970  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  4144969 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 4144927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 26320015 - 26319673
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  26320015 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 26319916  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26319915 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 26319816  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||     
T  26319815 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtg 26319716  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  26319715 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26319673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 9618648 - 9618990
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9618648 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 9618747  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9618748 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 9618847  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  9618848 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 9618947  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  9618948 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 9618990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 16736606 - 16736264
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16736606 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggca 16736507  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16736506 agcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 16736407  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||     
T  16736406 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtg 16736307  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16736306 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 16736264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 16751660 - 16751318
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16751660 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggca 16751561  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16751560 agcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 16751461  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||     
T  16751460 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtg 16751361  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16751360 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 16751318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 17523529 - 17523871
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17523529 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggca 17523628  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17523629 agcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 17523728  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||     
T  17523729 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtg 17523828  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17523829 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 17523871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 17529686 - 17529344
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17529686 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggca 17529587  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17529586 agcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 17529487  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||     
T  17529486 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtg 17529387  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17529386 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 17529344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 26275240 - 26274898
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  26275240 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 26275141  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26275140 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgcttt 26275041  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  26275040 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 26274941  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  26274940 aatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26274898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 26670060 - 26669718
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  26670060 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 26669961  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26669960 agcccccacctgatccgttgcccccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 26669861  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  26669860 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 26669761  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  26669760 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26669718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 45387340 - 45387682
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  45387340 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 45387439  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45387440 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 45387539  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  45387540 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 45387639  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| || ||||||||||    
T  45387640 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtcc 45387682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 26435254 - 26435596
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  26435254 aatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggta 26435353  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26435354 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 26435453  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  26435454 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 26435553  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26435554 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 26435596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 278 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 26538004 - 26537674
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||    
T  26538004 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtgcgactagacagggcaagccaccacctg 26537905  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26537904 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 26537805  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26537804 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 26537705  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26537704 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 26537674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 31564526 - 31564194
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31564526 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 31564427  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  31564426 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 31564327  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31564326 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 31564227  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31564226 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 31564194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 284 - 608
Target Start/End: Original strand, 11441587 - 11441911
Alignment:
Q  284 actttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgt 383  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11441587 acttttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 11441686  T
Q  384 tgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 483  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  11441687 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 11441786  T
Q  484 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 583  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11441787 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgt 11441886  T
Q  584 gaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  11441887 gaggaagctcctagacttgatgtcc 11441911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 278 - 608
Target Start/End: Original strand, 3445315 - 3445645
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3445315 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 3445414  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  3445415 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgt 3445514  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3445515 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaa 3445614  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3445615 gtatgtgaggaaactcctagacttgatgtcc 3445645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 24592687 - 24592345
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  24592687 aatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggta 24592588  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24592587 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 24592488  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||     
T  24592487 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtg 24592388  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24592387 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24592345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Original strand, 31124927 - 31125259
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31124927 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacc 31125026  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  31125027 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 31125126  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31125127 gtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 31125226  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31125227 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 31125259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 267 - 606
Target Start/End: Original strand, 16041321 - 16041660
Alignment:
Q  267 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 366  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||    
T  16041321 atcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaa 16041420  T
Q  367 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 466  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  16041421 gcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctaaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtagaaggatgctacgctttg 16041520  T
Q  467 aagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 566  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  16041521 aagtacattgtgaaaaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtga 16041620  T
Q  567 atatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgt 606  Q
    | ||||| || | ||  |||| |||||| ||||| |||||    
T  16041621 acatgattgaggtatacgaggaagctcccagactcgatgt 16041660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 272 - 608
Target Start/End: Original strand, 26484697 - 26485033
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |    
T  26484697 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 26484796  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  26484797 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 26484896  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 571  Q
    ||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  26484897 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 26484996  T
Q  572 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    || || | || ||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  26484997 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 26485033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 272 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 2109145 - 2108823
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |    
T  2109145 caagctagacctacctttcctctgataccaatgatatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 2109046  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  2109045 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 2108946  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 571  Q
    ||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  2108945 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 2108846  T
Q  572 atcgaagaatgtgaggcagctcc 594  Q
    || || | || ||||| ||||||    
T  2108845 attgaggtatatgaggaagctcc 2108823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 272 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 16450138 - 16449810
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  16450138 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 16450039  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  16450038 cacctgatcctttgcctcccaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagta 16449939  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 571  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||    
T  16449938 cattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 16449839  T
Q  572 atcgaagaatgtgaggcagctcctagact 600  Q
    || || | || ||||| |||||| |||||    
T  16449838 attgaggtatatgaggaagctcccagact 16449810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 272 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 39211163 - 39210827
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| || |||| ||||||||| ||||  |    
T  39211163 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcttc 39211064  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  39211063 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctttgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 39210964  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 571  Q
    ||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  39210963 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 39210864  T
Q  572 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    || || | || ||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  39210863 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 39210827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 275 - 608
Target Start/End: Original strand, 2775365 - 2775698
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||| ||| |||||| |||| |  |||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  2775365 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagtagctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccac 2775464  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||    
T  2775465 ctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacat 2775564  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
     ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||||     
T  2775565 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 2775664  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    || | || ||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  2775665 gaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 2775698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 275 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 31088601 - 31088282
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  31088601 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 31088502  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  31088501 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 31088402  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  31088401 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 31088302  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcc 594  Q
    || | || ||||| ||||||    
T  31088301 gaggtatatgaggaagctcc 31088282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 272 - 573
Target Start/End: Original strand, 18540802 - 18541103
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |    
T  18540802 caagctagacctacttttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 18540901  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    |||| || || || ||||| |||||| | || || || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  18540902 caccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagta 18541001  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 571  Q
    |||||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  18541002 catcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatg 18541101  T
Q  572 at 573  Q
    ||    
T  18541102 at 18541103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 275 - 594
Target Start/End: Original strand, 45733466 - 45733785
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| || ||    ||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  45733466 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcttaactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 45733565  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  45733566 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 45733665  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  45733666 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 45733765  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcc 594  Q
    || | || ||||| ||||||    
T  45733766 gaggtatatgaggaagctcc 45733785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 404 - 608
Target Start/End: Original strand, 4200682 - 4200886
Alignment:
Q  404 gacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| | |||||||||     
T  4200682 gacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagt 4200781  T
Q  504 tgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttga 603  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  |||||||    
T  4200782 tgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgataaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 4200881  T
Q  604 tgtcc 608  Q
     ||||    
T  4200882 cgtcc 4200886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 275 - 558
Target Start/End: Original strand, 5159525 - 5159808
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||    
T  5159525 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 5159624  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    | || || || ||||| |||||| | || || || || ||||| ||||||||||||||  | || ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||    
T  5159625 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttaaggggtgctatgctctaaagtacat 5159724  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgc 558  Q
    ||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  5159725 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatgatgc 5159808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 399 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 26683013 - 26682804
Alignment:
Q  399 ggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaagg 498  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||  | ||||| ||||| || |||||    
T  26683013 ggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattttaaaaaaactcatagaccaagg 26682914  T
Q  499 aaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctaga 598  Q
    |||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||    
T  26682913 aaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccgga 26682814  T
Q  599 cttgatgtcc 608  Q
    ||||| ||||    
T  26682813 cttgacgtcc 26682804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 201
Target Start/End: Original strand, 16041077 - 16041267
Alignment:
Q  11 catcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccac 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||  |  |||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||      
T  16041077 catcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgt 16041176  T
Q  111 catactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgt 201  Q
    | ||| | ||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |||| || | |||||||||||||||    
T  16041177 cgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgtcatcgggtcaacctcaggtacccgt 16041267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16450387 - 16450199
Alignment:
Q  11 catcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccac 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| | || || ||||||||  |  |||| ||||| || || |||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||      
T  16450387 catcataagaagaaagaaacaaaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatagctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgt 16450288  T
Q  111 catactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtaccc 199  Q
    | ||| | || || | ||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  16450287 cgtacccgtacgcgcagtactctcagcatcccttctttccaccattttatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtaccc 16450199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16503775 - 16503571
Alignment:
Q  8 ggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctc 107  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  |||| ||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| ||  | ||||    
T  16503775 ggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctc 16503676  T
Q  108 caccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    |  ||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||| | || | ||||||||||||||| |||||    
T  16503675 cgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 16503576  T
Q  208 tattg 212  Q
     ||||    
T  16503575 aattg 16503571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16518811 - 16518607
Alignment:
Q  8 ggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctc 107  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  |||| ||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| ||  | ||||    
T  16518811 ggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctc 16518712  T
Q  108 caccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    |  ||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||| | || | ||||||||||||||| |||||    
T  16518711 cgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 16518612  T
Q  208 tattg 212  Q
     ||||    
T  16518611 aattg 16518607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Original strand, 5127738 - 5127944
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  5127738 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 5127837  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  5127838 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtatcctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 5127937  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  5127938 gcaattg 5127944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31088775 - 31088657
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  31088775 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 31088676  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  31088675 ctcaggtacccgttaatgc 31088657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Original strand, 45733292 - 45733410
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  45733292 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 45733391  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  45733392 ctcaggtacccgttaatgc 45733410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Original strand, 5159268 - 5159457
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| || || || || |   ||  || ||||||||||| || ||| | |||||||||||| | ||    
T  5159268 atggacatcacaagaagaaagatacggaggtgggaatgatagccgctggaactaatccatccatggctactgttgctcctatcaatgctgctcagtttcc 5159367  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggt 195  Q
     ||  | ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | |||||||||    
T  5159368 cccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggt 5159457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Original strand, 45387089 - 45387295
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  45387089 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 45387188  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| || ||||| |||    
T  45387189 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 45387288  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  45387289 gcaattg 45387295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4145520 - 4145331
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  4145520 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 4145421  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggt 195  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | |||||||||    
T  4145420 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggt 4145331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26485857 - 26485756
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||||    
T  26485857 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 26485758  T
Q  378 at 379  Q
    ||    
T  26485757 at 26485756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31564796 - 31564624
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  31564796 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 31564697  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcca 178  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  31564696 tccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcca 31564624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 9618397 - 9618568
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  9618397 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 9618496  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcc 177  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  9618497 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 9618568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 3445040 - 3445199
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  3445040 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 3445139  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatca 165  Q
    |||  ||||| | ||    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  3445140 tccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatca 3445199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5147618 - 5147531
Alignment:
Q  125 ccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| ||||| ||||    
T  5147618 ccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattg 5147531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24592938 - 24592767
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  24592938 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 24592839  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcc 177  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  24592838 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 24592767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26275491 - 26275320
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  26275491 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 26275392  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcc 177  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  26275391 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 26275320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26320266 - 26320095
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  26320266 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 26320167  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcc 177  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  26320166 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 26320095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 212
Target Start/End: Original strand, 26435122 - 26435209
Alignment:
Q  125 ccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| ||||| ||||    
T  26435122 ccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattg 26435209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26538270 - 26538111
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||  || |||| ||||| || || ||||| || || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  26538270 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctggagccggtcaatcaatagctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 26538171  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatca 165  Q
    |||  ||||| | |||   ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  26538170 tccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatca 26538111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Original strand, 2154319 - 2154525
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| || ||  | ||    
T  2154319 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 2154418  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| ||| |||| |||    
T  2154419 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtatccgttaat 2154518  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  2154519 gcaattg 2154525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11425054 - 11424972
Alignment:
Q  125 ccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||||    
T  11425054 ccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 11424972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26486022 - 26485982
Alignment:
Q  125 ccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatca 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  26486022 ccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatca 26485982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 82)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 24688314 - 24687972
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24688314 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatattgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 24688215  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24688214 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 24688115  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24688114 gaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 24688015  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24688014 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24687972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 30934638 - 30934980
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30934638 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggca 30934737  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30934738 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 30934837  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30934838 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 30934937  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30934938 tatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 30934980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 11549359 - 11549701
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549359 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 11549458  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549459 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 11549558  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11549559 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 11549658  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11549659 aatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 11549701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 23718145 - 23717803
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23718145 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 23718046  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23718045 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 23717946  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23717945 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 23717846  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23717845 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 23717803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 33777492 - 33777834
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33777492 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 33777591  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33777592 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcttt 33777691  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||     
T  33777692 gaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtg 33777791  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33777792 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 33777834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 267 - 608
Target Start/End: Original strand, 24970024 - 24970365
Alignment:
Q  267 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 366  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24970024 atcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 24970123  T
Q  367 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 466  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24970124 gcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 24970223  T
Q  467 aagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 566  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24970224 aagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagcggacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaa 24970323  T
Q  567 atatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24970324 atatgatcaaagtacgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24970365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 23752607 - 23752265
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752607 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 23752508  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752507 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 23752408  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  23752407 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 23752308  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23752307 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 23752265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 22999271 - 22998929
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22999271 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggca 22999172  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999171 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 22999072  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22999071 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaaccatgccgctgta 22998972  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22998971 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 22998929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 9548700 - 9548358
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9548700 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggta 9548601  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9548600 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 9548501  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  9548500 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 9548401  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9548400 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 9548358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 15658917 - 15658575
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15658917 aatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggta 15658818  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15658817 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 15658718  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  15658717 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 15658618  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15658617 aatatgatcgaaatgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15658575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 8665632 - 8665290
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8665632 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 8665533  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8665532 agcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 8665433  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  8665432 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtg 8665333  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||    
T  8665332 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 8665290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 30152023 - 30152365
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  30152023 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 30152122  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30152123 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 30152222  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  30152223 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 30152322  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30152323 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 30152365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 9317456 - 9317798
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9317456 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 9317555  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9317556 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 9317655  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  9317656 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 9317755  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  9317756 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 9317798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 12132160 - 12132502
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  12132160 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 12132259  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12132260 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 12132359  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  12132360 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 12132459  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  12132460 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 12132502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 15759014 - 15758672
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15759014 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 15758915  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15758914 agcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 15758815  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||     
T  15758814 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 15758715  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15758714 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15758672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 2511056 - 2511398
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2511056 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 2511155  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2511156 agcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 2511255  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||     
T  2511256 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 2511355  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2511356 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 2511398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 26480397 - 26480739
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26480397 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 26480496  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26480497 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 26480596  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  26480597 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 26480696  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  26480697 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26480739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 6874310 - 6874652
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6874310 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagctgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 6874409  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6874410 agcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 6874509  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  6874510 gaagtatatcgtgaagaagcttatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 6874609  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6874610 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 6874652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 30168474 - 30168816
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  30168474 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggca 30168573  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30168574 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 30168673  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||     
T  30168674 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctcacttttgagaataatgtcccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 30168773  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||    
T  30168774 aatatgatcgaagtatgtgaagaaactcctagacttgatgtcc 30168816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Original strand, 28649250 - 28649582
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  28649250 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 28649349  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  28649350 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 28649449  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28649450 gtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 28649549  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28649550 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 28649582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 5637915 - 5638257
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  5637915 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 5638014  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5638015 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 5638114  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||     
T  5638115 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgaaaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtg 5638214  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  5638215 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 5638257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 276 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 18500877 - 18500553
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  18500877 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18500778  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  18500777 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 18500678  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18500677 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 18500578  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagact 600  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||    
T  18500577 aagtgtgtgaggaagctcctagact 18500553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 18375569 - 18375227
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  18375569 aatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 18375470  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18375469 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 18375370  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  18375369 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 18375270  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18375269 aatatgattgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18375227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 275 - 608
Target Start/End: Original strand, 34616532 - 34616865
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  34616532 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccac 34616631  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  34616632 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 34616731  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34616732 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 34616831  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||  ||||||| || |||||||||||||||||    
T  34616832 gaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 34616865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 284 - 608
Target Start/End: Original strand, 31431463 - 31431787
Alignment:
Q  284 actttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgt 383  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31431463 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgt 31431562  T
Q  384 tgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 483  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  31431563 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 31431662  T
Q  484 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 583  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  31431663 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 31431762  T
Q  584 gaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  31431763 gaggaagctcctagacttgatgtcc 31431787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 37671630 - 37671298
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||||||||| |||||    
T  37671630 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggcaagccaccacc 37671531  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  37671530 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37671431  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37671430 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37671331  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37671330 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 37671298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Original strand, 37754995 - 37755327
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  37754995 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacaaggcaagccaccacc 37755094  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  37755095 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37755194  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37755195 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37755294  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37755295 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 37755327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 37771134 - 37770802
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  37771134 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 37771035  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  37771034 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37770935  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37770934 atgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37770835  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  37770834 aagtgtgtgaggaagcttctagacttgatgtcc 37770802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 278 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 31826552 - 31826222
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31826552 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 31826453  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  31826452 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgt 31826353  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31826352 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 31826253  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  31826252 gtatgtgaggaaactcctagacttgatgtcc 31826222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 266 - 573
Target Start/End: Original strand, 41674714 - 41675021
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  41674714 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggta 41674813  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |    
T  41674814 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggccatgatgttgaggggtgctatgctct 41674913  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
     ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||     
T  41674914 aaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagctgacttttgagaataatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtg 41675013  T
Q  566 aatatgat 573  Q
    ||||||||    
T  41675014 aatatgat 41675021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 33516361 - 33516703
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33516361 aatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggca 33516460  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33516461 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 33516560  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  33516561 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 33516660  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  33516661 aatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 33516703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 278 - 608
Target Start/End: Original strand, 43078269 - 43078599
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  43078269 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggtaagcccccacctg 43078368  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  43078369 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 43078468  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43078469 gaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 43078568  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43078569 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 43078599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 275 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 28959934 - 28959600
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28959934 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 28959835  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  28959834 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 28959735  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  28959734 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 28959635  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcca 609  Q
    ||||  |||||||   |||||||||||||||||||    
T  28959634 gaagtgtgtgaggagactcctagacttgatgtcca 28959600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 29967223 - 29966881
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  29967223 aatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggta 29967124  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29967123 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 29967024  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  29967023 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 29966924  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  29966923 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 29966881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 30029420 - 30029762
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  30029420 aatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggta 30029519  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30029520 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 30029619  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  30029620 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 30029719  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  30029720 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 30029762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 275 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 32599620 - 32599286
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| ||||||||||    
T  32599620 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccac 32599521  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  32599520 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcattaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 32599421  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  32599420 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgctgtgaatatgatc 32599321  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcca 609  Q
    ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  32599320 gaagtgtgtgaggaagcccctagacttgatgtcca 32599286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 267 - 608
Target Start/End: Original strand, 23892212 - 23892553
Alignment:
Q  267 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 366  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||    
T  23892212 atcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatcatgtatgccgagttgcttccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaa 23892311  T
Q  367 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 466  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||| ||    
T  23892312 gcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaagatgctatgctctg 23892411  T
Q  467 aagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 566  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |    
T  23892412 aagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtga 23892511  T
Q  567 atatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |  |||| || | || ||||| |||||| |||||||||||||    
T  23892512 acgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 23892553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Original strand, 3789556 - 3789888
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||    
T  3789556 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 3789655  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  3789656 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 3789755  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3789756 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 3789855  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3789856 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 3789888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 37358790 - 37358458
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  37358790 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacc 37358691  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  37358690 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatt 37358591  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37358590 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatattccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37358491  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37358490 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 37358458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 267 - 606
Target Start/End: Original strand, 22888476 - 22888815
Alignment:
Q  267 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 366  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || | |  |||||||| || |||||||||||||||||    
T  22888476 atcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctatttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaa 22888575  T
Q  367 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 466  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  22888576 gcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttg 22888675  T
Q  467 aagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 566  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  22888676 aagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaa 22888775  T
Q  567 atatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgt 606  Q
    | ||||| || | || ||||| |||||||||||| |||||    
T  22888776 acatgattgaggtatatgaggaagctcctagactcgatgt 22888815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 278 - 608
Target Start/End: Original strand, 24681457 - 24681787
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| |    
T  24681457 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 24681556  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    | || || ||||| |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24681557 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 24681656  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24681657 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 24681756  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24681757 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24681787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 278 - 608
Target Start/End: Original strand, 24723984 - 24724314
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| |    
T  24723984 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 24724083  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    | || || ||||| |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24724084 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 24724183  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24724184 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 24724283  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24724284 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24724314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 272 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 29889233 - 29888897
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||| | || || ||| |||| |  |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  29889233 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgctgagctactcccaactctacttctcagagggcactgcaccaccagacagggcaagcctc 29889134  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29889133 cacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcatatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaagta 29889034  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 571  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||    
T  29889033 catcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 29888934  T
Q  572 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    || || |  | ||||| |||||| |||||||||||||    
T  29888933 attgaggtgtatgaggaagctcccagacttgatgtcc 29888897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 278 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 40473694 - 40473364
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| |    
T  40473694 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 40473595  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    | || || ||||| |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  40473594 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 40473495  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40473494 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 40473395  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40473394 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 40473364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 13324976 - 13324644
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||    
T  13324976 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 13324877  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
     || || || ||||| |||||| | || || ||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  13324876 ggaccctttacctccaaggttccgctctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 13324777  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13324776 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 13324677  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13324676 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 13324644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 267 - 606
Target Start/End: Original strand, 25199035 - 25199374
Alignment:
Q  267 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 366  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||    
T  25199035 atcaacaagctagacctaccttttctccgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaa 25199134  T
Q  367 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 466  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||     
T  25199135 gcctccacctgatccgttacctcccaggttccgttctgatctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcttta 25199234  T
Q  467 aagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 566  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  25199235 aagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaa 25199334  T
Q  567 atatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgt 606  Q
    | ||||| || | || ||||  ||| || |||||||||||    
T  25199335 acatgattgaggtatatgagaaagcccccagacttgatgt 25199374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 275 - 594
Target Start/End: Original strand, 11325808 - 11326127
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  11325808 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 11325907  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  11325908 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacat 11326007  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
     ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |  |||||||| |||||     
T  11326008 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgttgctgtaaacatgatt 11326107  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcc 594  Q
    || | || ||||| ||||||    
T  11326108 gaggtatatgaggaagctcc 11326127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 275 - 603
Target Start/End: Original strand, 33877261 - 33877589
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  33877261 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 33877360  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||    
T  33877361 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacat 33877460  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
     ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||||     
T  33877461 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 33877560  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcctagacttga 603  Q
    || | || ||||| ||||||  |||||||    
T  33877561 gaggtatatgaggaagctcccggacttga 33877589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 275 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 13184796 - 13184477
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  13184796 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 13184697  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  13184696 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 13184597  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  13184596 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 13184497  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcc 594  Q
    || | || ||||| ||||||    
T  13184496 gaggtatatgaggaagctcc 13184477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 275 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 13440642 - 13440323
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||| | || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  13440642 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctaaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 13440543  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  13440542 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 13440443  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||     
T  13440442 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtaaacatgatt 13440343  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcc 594  Q
    || | || ||||| ||||||    
T  13440342 gaggtatatgaggaagctcc 13440323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 275 - 557
Target Start/End: Original strand, 33292539 - 33292821
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||    
T  33292539 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 33292638  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    | || || || ||||| |||||| | || || || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  33292639 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 33292738  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatg 557  Q
    ||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  33292739 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatg 33292821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 197
Target Start/End: Original strand, 25198788 - 25198977
Alignment:
Q  8 ggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctc 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||| |  |||| ||||| || ||||||||||| || ||| |||||||| | ||  | ||||    
T  25198788 ggacatcataagaagaaggaaacagaagtagggatggtatccgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgcttcccaattgcctc 25198887  T
Q  108 caccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtac 197  Q
    |  | ||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||    
T  25198888 cgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtac 25198977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 243
Target Start/End: Original strand, 22888289 - 22888464
Alignment:
Q  68 atggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaat 167  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||  | ||| | ||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |    
T  22888289 atggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagt 22888388  T
Q  168 atcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagcaaccaccagttca 243  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||| |||| |||||  | || ||||| | || ||| || |||||||||||    
T  22888389 atcctttgccatcgggtcaacctcaggtaaccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttca 22888464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 207
Target Start/End: Original strand, 23891962 - 23892161
Alignment:
Q  8 ggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctc 107  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||  |  |||| | ||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| ||  | ||||    
T  23891962 ggacatcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagccgatcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctc 23892061  T
Q  108 caccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    |  | ||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||    
T  23892062 cgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaacattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtcaatgc 23892161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Original strand, 11325634 - 11325752
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||  |||| ||    
T  11325634 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccattgggacaac 11325733  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  11325734 ctcaggtacccgttaatgc 11325752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13184970 - 13184852
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  13184970 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 13184871  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  13184870 ctcaggtacccgttaatgc 13184852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13440816 - 13440698
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  13440816 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 13440717  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  13440716 ctcaggtacccgttaatgc 13440698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Original strand, 33877087 - 33877205
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  33877087 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 33877186  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  33877187 ctcaggtacccgttaatgc 33877205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Original strand, 31431182 - 31431388
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||  || |||| ||||| ||| |||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  31431182 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatctgtggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 31431281  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  31431282 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 31431381  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  31431382 gcaattg 31431388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 195
Target Start/End: Original strand, 33292346 - 33292471
Alignment:
Q  70 ggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatat 169  Q
    ||||||||| || ||| | |||||||||||| | || ||  | ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||     
T  33292346 ggctactgttgctcctatcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtac 33292445  T
Q  170 cctttgccatcaggaccacctcaggt 195  Q
    ||||||||| | || | |||||||||    
T  33292446 cctttgccaccgggccaacctcaggt 33292471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Original strand, 33777241 - 33777442
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  33777241 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagctggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 33777340  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  33777341 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 33777440  T
Q  206 gc 207  Q
    ||    
T  33777441 gc 33777442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Original strand, 24681191 - 24681363
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  24681191 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcc 24681290  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcca 178  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  24681291 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgcca 24681363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Original strand, 24723718 - 24723890
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  24723718 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcc 24723817  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcca 178  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  24723818 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgcca 24723890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 8665883 - 8665724
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  8665883 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 8665784  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatca 165  Q
    ||| |||||| | |||   ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  8665783 tccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatca 8665724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15759265 - 15759094
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||||||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  15759265 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtgtcagctggagcaggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 15759166  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcc 177  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  15759165 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 15759094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Original strand, 3789280 - 3789486
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || |||||||| || || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  3789280 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 3789379  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | |||   ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || |  |||||||| ||||| |||    
T  3789380 tccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaggtgcccgtcaat 3789479  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  3789480 gcaattg 3789486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Original strand, 41674463 - 41674669
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||| | || ||  | ||    
T  41674463 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatacagcccaaatgcc 41674562  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||  |||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| | || |||||||| |||||||| |||    
T  41674563 tccgtcatacccatatgtgccgtatgctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtccacctcaagtacccgtcaat 41674662  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  41674663 gcaattg 41674669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23718396 - 23718195
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| || ||  | ||    
T  23718396 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 23718297  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  23718296 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 23718197  T
Q  206 gc 207  Q
    ||    
T  23718196 gc 23718195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23752858 - 23752657
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| || ||  | ||    
T  23752858 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 23752759  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  23752758 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 23752659  T
Q  206 gc 207  Q
    ||    
T  23752658 gc 23752657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 212
Target Start/End: Original strand, 24969891 - 24969984
Alignment:
Q  119 tatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 212  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||| | || | ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24969891 tatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattg 24969984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13325252 - 13325080
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || |||||||| || || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  13325252 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagctggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 13325153  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcca 178  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  13325152 tccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcca 13325080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 37359063 - 37358891
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  37359063 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 37358964  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcca 178  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  37358963 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcca 37358891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 5637664 - 5637835
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  5637664 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 5637763  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcc 177  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  5637764 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 5637835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 9317205 - 9317376
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  9317205 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 9317304  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcc 177  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  9317305 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 9317376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9548832 - 9548745
Alignment:
Q  125 ccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 212  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| ||||| ||||    
T  9548832 ccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattg 9548745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 12131909 - 12132080
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  12131909 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 12132008  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcc 177  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  12132009 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 12132080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24688565 - 24688370
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| || ||  | ||    
T  24688565 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 24688466  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgt 201  Q
    |||  ||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||| ||||| | || | |||||| ||||||||    
T  24688465 tccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgt 24688370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 26480146 - 26480317
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  26480146 atggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 26480245  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcc 177  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  26480246 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 26480317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 31826827 - 31826656
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  31826827 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 31826728  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcc 177  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  31826727 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 31826656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 40473960 - 40473801
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| |||||| | ||||| |||||  | ||    
T  40473960 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgcccctatcaatgcagctcaaatgcc 40473861  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatca 165  Q
    |||  ||||| |  |    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  40473860 tccgtcatacccacacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatca 40473801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 178
Target Start/End: Original strand, 28649099 - 28649152
Alignment:
Q  125 ccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcca 178  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  28649099 ccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgcca 28649152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 37671900 - 37671728
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  |||| ||||| ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  37671900 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagccggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 37671801  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcca 178  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  37671800 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcca 37671728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 5)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 40329 - 39987
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40329 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 40230  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40229 agcccccacctgatccgttgccccccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 40130  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40129 gaagtatatcgtgaaggagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 40030  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40029 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 39987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 47245 - 46903
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47245 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggca 47146  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47145 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcttt 47046  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  47045 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 46946  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46945 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 46903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 267 - 608
Target Start/End: Original strand, 29760 - 30101
Alignment:
Q  267 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 366  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29760 atcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 29859  T
Q  367 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 466  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29860 gcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccaccaaggcgccctgggtcacgatgtcgaggggtgctatgctttg 29959  T
Q  467 aagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 566  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29960 aagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtaa 30059  T
Q  567 atatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30060 atatgatcgaagtatgtgaggaagctcttagacttgatgtcc 30101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 207
Target Start/End: Original strand, 29510 - 29709
Alignment:
Q  8 ggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctc 107  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  |||| ||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| ||  | ||||    
T  29510 ggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctc 29609  T
Q  108 caccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    || | ||| | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||| | || | |||||| |||||||| |||||    
T  29610 catcgtacccgtatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 29709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40578 - 40374
Alignment:
Q  8 ggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctc 107  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| || ||  | ||||    
T  40578 ggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctc 40479  T
Q  108 caccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    | || ||| | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| || ||||| || ||||||||| | || | ||||||||||||||| |||||    
T  40478 cgccgtacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttctgccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtaaatgc 40379  T
Q  208 tattg 212  Q
     ||||    
T  40378 aattg 40374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 17014011 - 17014353
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17014011 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccaaagagggcattgtacaaccagacagggca 17014110  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17014111 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcttt 17014210  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17014211 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 17014310  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17014311 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 17014353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 14665029 - 14665371
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14665029 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggca 14665128  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665129 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 14665228  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14665229 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatatcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 14665328  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14665329 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 14665371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 24592574 - 24592232
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592574 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 24592475  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24592474 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcttt 24592375  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24592374 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttcccaatcatgccgctgta 24592275  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24592274 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24592232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 14763564 - 14763222
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14763564 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggca 14763465  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14763464 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 14763365  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  14763364 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtg 14763265  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14763264 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 14763222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 5005884 - 5006226
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5005884 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaaggca 5005983  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5005984 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 5006083  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||     
T  5006084 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagttgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttctgaatcatgccgctgtg 5006183  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5006184 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 5006226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 27163577 - 27163235
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  27163577 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 27163478  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27163477 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 27163378  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    ||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||     
T  27163377 gaaatatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 27163278  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27163277 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27163235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 6569864 - 6570206
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6569864 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggta 6569963  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6569964 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 6570063  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  6570064 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtg 6570163  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6570164 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 6570206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 18800863 - 18800531
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  18800863 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18800764  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  18800763 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 18800664  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18800663 gtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 18800564  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18800563 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18800531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 40105898 - 40105556
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  40105898 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgaacttcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggca 40105799  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40105798 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 40105699  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  40105698 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 40105599  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  40105598 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 40105556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 14098552 - 14098894
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14098552 aatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggca 14098651  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14098652 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggactgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 14098751  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  14098752 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 14098851  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  14098852 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 14098894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 36344765 - 36344433
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||    
T  36344765 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 36344666  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  36344665 tgatccgttgcctccgaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 36344566  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36344565 gtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 36344466  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36344465 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 36344433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Original strand, 54833408 - 54833740
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  54833408 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacc 54833507  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  54833508 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 54833607  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54833608 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 54833707  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54833708 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 54833740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 31126778 - 31126436
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  31126778 aatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggta 31126679  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31126678 agcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 31126579  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  31126578 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 31126479  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||| |  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  31126478 aatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 31126436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 278 - 608
Target Start/End: Original strand, 30753777 - 30754107
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30753777 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 30753876  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30753877 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 30753976  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30753977 gaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 30754076  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30754077 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 30754107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 278 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 33674046 - 33673716
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| |    
T  33674046 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 33673947  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33673946 acccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 33673847  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33673846 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 33673747  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |  ||||||| || |||||||||||||||||    
T  33673746 gtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 33673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 278 - 608
Target Start/End: Original strand, 39850661 - 39850991
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| |    
T  39850661 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 39850760  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    | || || ||||| |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  39850761 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 39850860  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39850861 gaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaacccccttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 39850960  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39850961 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 39850991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 21969712 - 21970054
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || || || ||||    
T  21969712 aatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacgactaggcaaggca 21969811  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21969812 agcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 21969911  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||     
T  21969912 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 21970011  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||| |||   ||||||| || |||||||||||||||||    
T  21970012 aatatgattgaaatgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 21970054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 272 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 15285182 - 15284851
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||   ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  15285182 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatttcgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 15285083  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  15285082 cacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 15284983  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 571  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||| || |||    
T  15284982 cattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgttgctgtgaacatg 15284883  T
Q  572 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttga 603  Q
    || || | |||||||| |||||| ||||||||    
T  15284882 attgaggtatgtgaggaagctcccagacttga 15284851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 267 - 606
Target Start/End: Original strand, 1900269 - 1900608
Alignment:
Q  267 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 366  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||||||||| || ||    
T  1900269 atcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacatggtaa 1900368  T
Q  367 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 466  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||||  | || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||  |||||    
T  1900369 gcctccacctgatccgttgcttctcaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacactttg 1900468  T
Q  467 aagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 566  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  1900469 aagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaataatgtcccttatgtccttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaa 1900568  T
Q  567 atatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgt 606  Q
    | ||||| || | || ||||| |||||| ||||| |||||    
T  1900569 acatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgt 1900608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 272 - 606
Target Start/End: Original strand, 15227887 - 15228221
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  15227887 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgtacaaccagacagggtaagcctc 15227986  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  15227987 cacctgatccattgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcacgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 15228086  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 571  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||    
T  15228087 cattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacctttgagaataacgtccgtcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 15228186  T
Q  572 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgt 606  Q
    || |  | || ||||  |||||| |||||||||||    
T  15228187 attggggtatatgagatagctcccagacttgatgt 15228221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 275 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 24460856 - 24460537
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  24460856 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 24460757  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  24460756 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 24460657  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  24460656 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 24460557  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcc 594  Q
    |||| || ||||| ||||||    
T  24460556 gaagtatatgaggaagctcc 24460537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 272 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 14235779 - 14235478
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| | || | || |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  14235779 caagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagctgctcccgactctgcttcttaaagggcactgtacaaccagacagggcaagcctc 14235680  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    ||||| | || |||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||     
T  14235679 cacctaaccctttgcctcccaggttccatttcgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgagggatgttacgctttgaagtt 14235580  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 571  Q
    ||| || || |||||||| || || |||||| | ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||    
T  14235579 cattgtaaagaagctcatagaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcacgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 14235480  T
Q  572 at 573  Q
    ||    
T  14235479 at 14235478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 275 - 573
Target Start/End: Original strand, 24112682 - 24112980
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||    
T  24112682 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 24112781  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    | || || || ||||| |||||| | || || || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  24112782 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 24112881  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgat 573  Q
    ||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||    
T  24112882 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 24112980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 275 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 34189211 - 34188913
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||    
T  34189211 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 34189112  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    | || || || ||||| |||||| | || || || || ||||| ||||||||||| ||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  34189111 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggtgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 34189012  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgat 573  Q
    ||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||    
T  34189011 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 34188913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 278 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 15391586 - 15391288
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||| || |  | |||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||     
T  15391586 agacctacctttcctccgataccaatgctgtacgccgagttgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcaggggaagcctccaccta 15391487  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    | |||||||||||||||||| | || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| ||    
T  15391486 acccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgt 15391387  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcga 576  Q
     || |||||||||||  | |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||  ||||| || ||||| || ||||||||    
T  15391386 aaagaagctcattgactagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtgaacatgatcga 15391288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 208
Target Start/End: Original strand, 15227638 - 15227835
Alignment:
Q  11 catcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccac 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||  |  |||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||      
T  15227638 catcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagctggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgt 15227737  T
Q  111 catactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgct 208  Q
    | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||    
T  15227738 cgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgct 15227835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 243
Target Start/End: Original strand, 1900025 - 1900257
Alignment:
Q  11 catcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccac 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||  |  |||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||      
T  1900025 catcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgt 1900124  T
Q  111 catactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctat 210  Q
    | ||| | ||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  |    
T  1900125 cgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgt 1900224  T
Q  211 tgtgcagcagaagccacagcaaccaccagttca 243  Q
     || ||||| | || ||| || |||||||||||    
T  1900225 cgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttca 1900257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Original strand, 14664778 - 14664979
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | |||||||| ||  | ||    
T  14664778 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagctggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgctgcccaaatgcc 14664877  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  14664878 tccgtcatacccatatgcaccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 14664977  T
Q  206 gc 207  Q
    ||    
T  14664978 gc 14664979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 195
Target Start/End: Original strand, 24112489 - 24112614
Alignment:
Q  70 ggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatat 169  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||| | || ||  | ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||     
T  24112489 ggctactgttgctcctgtcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtac 24112588  T
Q  170 cctttgccatcaggaccacctcaggt 195  Q
    ||||||||| | || | |||||||||    
T  24112589 cctttgccaccgggccaacctcaggt 24112614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 34189404 - 34189279
Alignment:
Q  70 ggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatat 169  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||| | || ||  | ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||     
T  34189404 ggctactgtcgctcctatcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtac 34189305  T
Q  170 cctttgccatcaggaccacctcaggt 195  Q
    ||||||||| | || | |||||||||    
T  34189304 cctttgccaccgggccaacctcaggt 34189279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15285431 - 15285235
Alignment:
Q  11 catcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccac 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||  | ||||||||  |  |||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||     
T  15285431 catcataagaagaaagaaacagaagtatggatggtatctgccggagctggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccat 15285332  T
Q  111 catactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
      ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||| | ||||| || | ||||||||| ||||| |||||    
T  15285331 tgtacccatatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaggtgcccgttaatgc 15285235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18801133 - 18800961
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||  || |||| |||||  ||||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  18801133 atggacaccacaagaagaaagaaacagaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaagctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcc 18801034  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcca 178  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  18801033 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgcca 18800961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Original strand, 19373021 - 19373193
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  19373021 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 19373120  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcca 178  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  19373121 tccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcca 19373193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24461030 - 24460912
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||| |||||||||| || | ||    
T  24461030 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtcaac 24460931  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  24460930 ctcaggtacccgttaatgc 24460912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 39850383 - 39850542
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  39850383 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcc 39850482  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatca 165  Q
    |||  ||||| | ||    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  39850483 tccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatca 39850542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Original strand, 17013760 - 17013966
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| || ||  | ||    
T  17013760 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagccggagctggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 17013859  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  17013860 tccttcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 17013959  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  17013960 gcaattg 17013966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14763815 - 14763626
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||| ||||| || ||| | |||||  ||||  | ||    
T  14763815 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggccactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 14763716  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggt 195  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | |||||||||    
T  14763715 tccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggt 14763626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24592822 - 24592621
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||  | || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  24592822 atggacaccacaagaagaaagaaacggaaatagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 24592723  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  24592722 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 24592623  T
Q  206 gc 207  Q
    ||    
T  24592622 gc 24592621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 36345023 - 36344834
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||| ||||| || ||| | |||||  ||||  | ||    
T  36345023 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggccactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 36344924  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggt 195  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||||||| | || | |||||||||    
T  36344923 tccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcctaccgttttatcatcagtatcctttgccaccgggccaacctcaggt 36344834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 33674202 - 33674162
Alignment:
Q  125 ccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatca 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33674202 ccgtactctcagcatccgttcttcccaccattttaccatca 33674162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 212
Target Start/End: Original strand, 5005749 - 5005836
Alignment:
Q  125 ccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 212  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| ||||| ||||    
T  5005749 ccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattg 5005836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 212
Target Start/End: Original strand, 6569732 - 6569819
Alignment:
Q  125 ccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 212  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| ||||| ||||    
T  6569732 ccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattg 6569819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Original strand, 54833150 - 54833356
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  |||| ||||| || ||||| ||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  54833150 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 54833249  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| | || | ||||||||| || || |||    
T  54833250 tccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttaccaccgggccaacctcaggttcctgtcaat 54833349  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  54833350 gccattg 54833356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 40106146 - 40105978
Alignment:
Q  9 gacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctcc 108  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | |||||    
T  40106146 gacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctcc 40106047  T
Q  109 accatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcc 177  Q
      ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  40106046 gtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 40105978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 92)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 8301568 - 8301226
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8301568 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 8301469  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8301468 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtagaggggtgctatgcttt 8301369  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8301368 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 8301269  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8301268 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 8301226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 267 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 15893006 - 15892665
Alignment:
Q  267 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 366  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15893006 atcaacaagctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 15892907  T
Q  367 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 466  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892906 gcccccacctgatcctttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 15892807  T
Q  467 aagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 566  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15892806 aagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaa 15892707  T
Q  567 atatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15892706 atatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15892665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 4796954 - 4796612
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796954 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 4796855  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796854 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 4796755  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  4796754 gaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 4796655  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4796654 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4796612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 8295929 - 8296271
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8295929 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccacagagggcattgtacaaccagacagggca 8296028  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8296029 agcccctacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 8296128  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8296129 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 8296228  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8296229 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 8296271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 15741395 - 15741053
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15741395 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 15741296  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15741295 agcccccacctgattcgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgagggatgctatgcttt 15741196  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15741195 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 15741096  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15741095 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15741053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 18051219 - 18051561
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18051219 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggca 18051318  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051319 agcccccacctgatccgctgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttctatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 18051418  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  18051419 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 18051518  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    || ||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18051519 aacatgattgaagtatgtgagaaagctcctagacttgatgtcc 18051561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 18330626 - 18330968
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18330626 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgaccttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 18330725  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18330726 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcttt 18330825  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  18330826 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 18330925  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18330926 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18330968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 29149056 - 29148714
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29149056 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggca 29148957  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29148956 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 29148857  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29148856 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 29148757  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29148756 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 29148714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 6192273 - 6192615
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192273 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 6192372  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192373 agcccccacctgatctgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 6192472  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6192473 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 6192572  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6192573 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 6192615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 35880723 - 35881065
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35880723 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccaaacagggca 35880822  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35880823 agcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 35880922  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  35880923 gaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 35881022  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  35881023 aatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtcc 35881065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 4721588 - 4721930
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4721588 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 4721687  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  4721688 agcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacacttt 4721787  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||     
T  4721788 gaagtatatcgtgaaaaatctcattgatcaaggaaagctgactttttagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtg 4721887  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4721888 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagactcgatgtcc 4721930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 275 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 22387870 - 22387537
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22387870 gctagaccgacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 22387771  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22387770 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 22387671  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22387670 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 22387571  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22387570 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 22387537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 18277353 - 18277011
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18277353 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggca 18277254  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18277253 agcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 18277154  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  18277153 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtg 18277054  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18277053 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18277011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 18292654 - 18292312
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18292654 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggca 18292555  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18292554 agcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 18292455  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  18292454 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtg 18292355  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18292354 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18292312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 18307955 - 18307613
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18307955 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggca 18307856  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18307855 agcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 18307756  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  18307755 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtg 18307656  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18307655 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18307613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 4416876 - 4417218
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4416876 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 4416975  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4416976 aacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 4417075  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  4417076 gaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 4417175  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4417176 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4417218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 28116255 - 28115913
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28116255 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 28116156  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28116155 agcccccacttgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 28116056  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  28116055 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacatttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 28115956  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||    
T  28115955 aatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 28115913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 7073169 - 7073511
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |    
T  7073169 aatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacaaggta 7073268  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7073269 agcccccgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 7073368  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  7073369 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 7073468  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    || ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7073469 aacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 7073511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 31964774 - 31964432
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31964774 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 31964675  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31964674 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 31964575  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  31964574 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 31964475  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31964474 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 31964432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 50134372 - 50134030
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50134372 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 50134273  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  50134272 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 50134173  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  50134172 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 50134073  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50134072 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 50134030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 10396090 - 10396432
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |    
T  10396090 aatcagcaagctagacctactttccctccgatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacaactagacagggta 10396189  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10396190 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 10396289  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  10396290 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacctttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 10396389  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10396390 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 10396432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 5609623 - 5609281
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5609623 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 5609524  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  5609523 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaagggtgttatgcttt 5609424  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||     
T  5609423 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 5609324  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5609323 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 5609281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 47023410 - 47023752
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  47023410 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 47023509  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47023510 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 47023609  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||     
T  47023610 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtg 47023709  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  47023710 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 47023752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 28339259 - 28339601
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28339259 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 28339358  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28339359 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 28339458  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||     
T  28339459 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 28339558  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  28339559 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 28339601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 7996519 - 7996861
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  7996519 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 7996618  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7996619 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 7996718  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    ||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||     
T  7996719 gaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 7996818  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| || ||||||||||    
T  7996819 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtcc 7996861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 10643027 - 10643369
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  10643027 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 10643126  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10643127 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 10643226  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    ||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||     
T  10643227 gaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 10643326  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| || ||||||||||    
T  10643327 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtcc 10643369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 21674650 - 21674992
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  21674650 aatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccaaagagggcattgtacgactagacagggca 21674749  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21674750 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 21674849  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  21674850 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgctccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtg 21674949  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21674950 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 21674992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 278 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 36997366 - 36997036
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  36997366 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 36997267  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  36997266 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgt 36997167  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36997166 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccatatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 36997067  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  36997066 gtatgtgaggaaactcctagacttgatgtcc 36997036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 275 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 4346979 - 4346646
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| ||||||||||    
T  4346979 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccac 4346880  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4346879 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 4346780  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4346779 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 4346680  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4346679 gaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4346646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 275 - 608
Target Start/End: Original strand, 28021241 - 28021574
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28021241 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactatactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 28021340  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  28021341 ctgatccattacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggttatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 28021440  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28021441 cgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccccacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 28021540  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28021541 gaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 28021574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 266 - 594
Target Start/End: Original strand, 5713184 - 5713512
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  5713184 aatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggta 5713283  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5713284 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 5713383  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  5713384 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgta 5713483  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcc 594  Q
    || ||||| || | || ||||| ||||||    
T  5713484 aacatgattgaggtatatgaggaagctcc 5713512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 266 - 594
Target Start/End: Original strand, 5724094 - 5724422
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  5724094 aatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggta 5724193  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5724194 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 5724293  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  5724294 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgta 5724393  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcc 594  Q
    || ||||| || | || ||||| ||||||    
T  5724394 aacatgattgaggtatatgaggaagctcc 5724422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 266 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 5757383 - 5757055
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  5757383 aatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggta 5757284  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5757283 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 5757184  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  5757183 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgta 5757084  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcc 594  Q
    || ||||| || | || ||||| ||||||    
T  5757083 aacatgattgaggtatatgaggaagctcc 5757055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 266 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 5768274 - 5767946
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  5768274 aatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggta 5768175  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5768174 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 5768075  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  5768074 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgta 5767975  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcc 594  Q
    || ||||| || | || ||||| ||||||    
T  5767974 aacatgattgaggtatatgaggaagctcc 5767946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 6542753 - 6542421
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  6542753 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacaactagacagggcaagccaccacc 6542654  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  6542653 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 6542554  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6542553 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 6542454  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  6542453 aagtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtcc 6542421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 17985257 - 17984915
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17985257 aatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggca 17985158  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||| | |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  17985157 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgagggatgttatgcttt 17985058  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||     
T  17985057 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 17984958  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17984957 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctagacttgatgtcc 17984915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 284 - 608
Target Start/End: Original strand, 8211713 - 8212037
Alignment:
Q  284 actttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgt 383  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  8211713 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgt 8211812  T
Q  384 tgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 483  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  8211813 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 8211912  T
Q  484 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 583  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  8211913 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 8212012  T
Q  584 gaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  8212013 gaggaagctcctagacttgatgtcc 8212037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 277 - 608
Target Start/End: Original strand, 5466953 - 5467284
Alignment:
Q  277 tagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacct 376  Q
    |||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5466953 tagaccaacttttcctcttatacctatgttgtatgcagaactccttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacct 5467052  T
Q  377 gatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcg 476  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5467053 gatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcg 5467152  T
Q  477 tgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcga 576  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5467153 tgaagaagctcattgatcaagggaaactgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcga 5467252  T
Q  577 agaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5467253 agtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 5467284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 278 - 608
Target Start/End: Original strand, 48465896 - 48466226
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||||    
T  48465896 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccaaagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 48465995  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  48465996 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 48466095  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48466096 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 48466195  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48466196 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 48466226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 275 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 22871148 - 22870815
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  22871148 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 22871049  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22871048 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 22870949  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22870948 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 22870849  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||  ||||||| || |||||||||||||||||    
T  22870848 gaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 22870815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 275 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 22886207 - 22885874
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  22886207 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 22886108  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22886107 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 22886008  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22886007 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 22885908  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||  ||||||| || |||||||||||||||||    
T  22885907 gaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 22885874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 5596648 - 5596316
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5596648 ctagaccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacc 5596549  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  5596548 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 5596449  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5596448 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 5596349  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5596348 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 5596316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Original strand, 18242706 - 18243038
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18242706 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacc 18242805  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  18242806 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 18242905  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18242906 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 18243005  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18243006 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18243038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 18225148 - 18225490
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  18225148 aatcaacaagctaggcctaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggta 18225247  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18225248 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 18225347  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||     
T  18225348 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtg 18225447  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  18225448 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctaggcttgatgtcc 18225490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 284 - 608
Target Start/End: Original strand, 51781998 - 51782322
Alignment:
Q  284 actttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgt 383  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||  | ||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  51781998 acttttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttctaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 51782097  T
Q  384 tgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 483  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  51782098 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 51782197  T
Q  484 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 583  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  51782198 gctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 51782297  T
Q  584 gaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  51782298 gaggaagctcctagacttgatgtcc 51782322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 5013669 - 5014011
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||  | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  5013669 aatcagcaagccaggccaacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggta 5013768  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5013769 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 5013868  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||     
T  5013869 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 5013968  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  5013969 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 5014011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 278 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 11110638 - 11110308
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| ||||| |||||||    
T  11110638 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcctccacctg 11110539  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11110538 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 11110439  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  11110438 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaa 11110339  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11110338 gtgtgtgaggaagctccaagacttgatgtcc 11110308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 24328116 - 24328458
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  24328116 aatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggta 24328215  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24328216 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 24328315  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    ||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||     
T  24328316 gaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 24328415  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  24328416 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 24328458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 278 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 20577136 - 20576806
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| |    
T  20577136 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 20577037  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    | || || ||||| |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20577036 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 20576937  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20576936 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 20576837  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20576836 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 20576806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 284 - 608
Target Start/End: Original strand, 51797087 - 51797412
Alignment:
Q  284 actttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgt 383  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||  | ||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  51797087 acttttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttctaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 51797186  T
Q  384 tgcctccca-ggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaa 482  Q
    |||||| || |||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  51797187 tgcctcacaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaaga 51797286  T
Q  483 agctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatg 582  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  51797287 agctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtg 51797386  T
Q  583 tgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  51797387 tgaggaagctcctagacttgatgtcc 51797412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 278 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 29665259 - 29664929
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| |    
T  29665259 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 29665160  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    | || || ||||| |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29665159 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 29665060  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 577  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29665059 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaa 29664960  T
Q  578 gaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29664959 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 29664929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 272 - 606
Target Start/End: Original strand, 18530351 - 18530685
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  18530351 caagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgctgagttactcctgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 18530450  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  18530451 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 18530550  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 571  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||    
T  18530551 cattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcgtgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatg 18530650  T
Q  572 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgt 606  Q
    || || | || ||||| |||||| |||||| ||||    
T  18530651 attgaggtatatgagggagctcccagacttaatgt 18530685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 272 - 608
Target Start/End: Original strand, 32292715 - 32293051
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| || |||| ||||||||| ||| | |    
T  32292715 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagtctc 32292814  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  32292815 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 32292914  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 571  Q
    ||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  32292915 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 32293014  T
Q  572 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    || || | || ||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  32293015 attgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 32293051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 275 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 31034409 - 31034076
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  31034409 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccac 31034310  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  31034309 ctgatccgttacctcctaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacat 31034210  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
     ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||||     
T  31034209 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 31034110  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    || | || ||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  31034109 gaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 31034076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 272 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 16626801 - 16626470
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||  ||||| || || ||| |||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  16626801 caagctagacctacctttcctccgataccaatgatatatgtcgagttactccctactctacttcttagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 16626702  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  16626701 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 16626602  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 571  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||  | ||||| || |||    
T  16626601 cattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtccttgacaatcctcttccgaatcacactgctgtgaacatg 16626502  T
Q  572 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttga 603  Q
    || || | || ||||| |||||| ||||||||    
T  16626501 attgaggtatatgaggaagctcccagacttga 16626470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 275 - 599
Target Start/End: Original strand, 5652353 - 5652677
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||  | |||||| || ||||||||||||||||||||  |||    
T  5652353 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagccttcac 5652452  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    |||| |||| |||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  5652453 ctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 5652552  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||     
T  5652553 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacatgatt 5652652  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcctagac 599  Q
    || | |||||||| |||||| ||||    
T  5652653 gaggtatgtgaggaagctcccagac 5652677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 275 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 17994076 - 17993757
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  17994076 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 17993977  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  17993976 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 17993877  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  17993876 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 17993777  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcc 594  Q
    || | || ||||| ||||||    
T  17993776 gaggtatatgaggaagctcc 17993757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 275 - 573
Target Start/End: Original strand, 4625910 - 4626208
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  4625910 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 4626009  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  4626010 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 4626109  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgat 573  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  4626110 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgat 4626208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 275 - 573
Target Start/End: Original strand, 32439120 - 32439418
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||    
T  32439120 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 32439219  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    | || || || ||||| |||||| | || || || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  32439220 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 32439319  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgat 573  Q
    ||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||    
T  32439320 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 32439418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 276 - 573
Target Start/End: Original strand, 20066010 - 20066307
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||    
T  20066010 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 20066109  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
     |  || || ||||| |||||| | || || || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  20066110 gggccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatc 20066209  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgat 573  Q
    || || ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||    
T  20066210 gtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatatgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 20066307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 486
Target Start/End: Original strand, 4893176 - 4893387
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || || || || |||||||| || ||||    
T  4893176 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaaacctccac 4893275  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    | || || || ||||| ||||||   || || || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  4893276 cggaccctttacctccaaggttccactctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 4893375  T
Q  475 cgtgaaaaagct 486  Q
    ||| || |||||    
T  4893376 cgtcaagaagct 4893387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Original strand, 8211447 - 8211636
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  8211447 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 8211546  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggt 195  Q
    |||  ||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | |||||||||    
T  8211547 tccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggt 8211636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17994250 - 17994132
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  17994250 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 17994151  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  17994150 ctcaggtacccgttaatgc 17994132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22871426 - 22871220
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||| | ||    
T  22871426 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcagatgcc 22871327  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| |||| |  ||||| || ||||| |||    
T  22871326 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccaggccagcctcaagtgcccgtcaat 22871227  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  22871226 gcaattg 22871220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22886485 - 22886279
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||| | ||    
T  22886485 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcagatgcc 22886386  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| |||| |  ||||| || ||||| |||    
T  22886385 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccaggccagcctcaagtgcccgtcaat 22886286  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  22886285 gcaattg 22886279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Original strand, 4625736 - 4625853
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  4625736 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 4625835  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatg 206  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  4625836 ctcaggtacccgttaatg 4625853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 195
Target Start/End: Original strand, 32438927 - 32439052
Alignment:
Q  70 ggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatat 169  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||| | || ||  | ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||     
T  32438927 ggctactgttgctcctgtcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtac 32439026  T
Q  170 cctttgccatcaggaccacctcaggt 195  Q
    ||||||||| | || | |||||||||    
T  32439027 cctttgccaccgggccaacctcaggt 32439052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16627049 - 16626854
Alignment:
Q  11 catcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccac 110  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || || ||||||||  |  |||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||      
T  16627049 catcataagaagaag-aaacagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgt 16626951  T
Q  111 catactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    | ||| | |||||||  |||||||| ||||| ||||| || || || || ||||| |||||| | ||||| || | ||||| ||||||||| |||||    
T  16626950 cgtacccgtatgcacaatactctcagcatcccttctttccaccgttctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctccggtacccgttaatgc 16626854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 195
Target Start/End: Original strand, 4892983 - 4893108
Alignment:
Q  70 ggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatat 169  Q
    ||||||||| || ||| | |||||||||||| | || ||  | ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||     
T  4892983 ggctactgttgctcctatcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtac 4893082  T
Q  170 cctttgccatcaggaccacctcaggt 195  Q
    ||||||||| | || | |||||||||    
T  4893083 cctttgccaccgggccaacctcaggt 4893108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Original strand, 5466691 - 5466880
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  |||| ||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  5466691 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagccggagccggtcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcc 5466790  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggt 195  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | || | |||||||||    
T  5466791 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccattttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggt 5466880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Original strand, 18050968 - 18051169
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| || ||  | ||    
T  18050968 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 18051067  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  18051068 tccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 18051167  T
Q  206 gc 207  Q
    ||    
T  18051168 gc 18051169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Original strand, 35880472 - 35880673
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  35880472 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 35880571  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  35880572 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 35880671  T
Q  206 gc 207  Q
    ||    
T  35880672 gc 35880673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Original strand, 4721337 - 4721543
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  4721337 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 4721436  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  4721437 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcttttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 4721536  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  4721537 gcaattg 4721543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4797205 - 4796999
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| || ||  | ||    
T  4797205 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 4797106  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  4797105 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 4797006  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  4797005 gcaattg 4796999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Original strand, 5652179 - 5652297
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||| ||||| ||| || | ||    
T  5652179 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcgtttgcaatcgggtcaac 5652278  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  5652279 ctcaggtacccgttaatgc 5652297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Original strand, 7996268 - 7996474
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||  | ||||| |||||  | ||    
T  7996268 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 7996367  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    ||| |||||| | |||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| || ||||| |||    
T  7996368 tccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 7996467  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  7996468 gcaattg 7996474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Original strand, 10642776 - 10642982
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||  | ||||| |||||  | ||    
T  10642776 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcc 10642875  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    ||| |||||| | |||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| || ||||| |||    
T  10642876 tccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 10642975  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  10642976 gcaattg 10642982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28116509 - 28116303
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || |||||||| || || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  28116509 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 28116410  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  28116409 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaat 28116310  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  28116309 gcaattg 28116303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15741634 - 15741433
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| || ||  | ||    
T  15741634 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 15741535  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  15741534 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 15741435  T
Q  206 gc 207  Q
    ||    
T  15741434 gc 15741433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18277604 - 18277415
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||| ||||| || ||| | |||||  ||||  | ||    
T  18277604 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggccactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 18277505  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggt 195  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | |||||||||    
T  18277504 tccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggt 18277415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18292905 - 18292716
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||| ||||| || ||| | |||||  ||||  | ||    
T  18292905 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggccactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 18292806  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggt 195  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | |||||||||    
T  18292805 tccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggt 18292716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18308206 - 18308017
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||| ||||| || ||| | |||||  ||||  | ||    
T  18308206 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggccactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcc 18308107  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggt 195  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | |||||||||    
T  18308106 tccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggt 18308017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22388127 - 22387938
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| || || || || |   ||  || ||||||||||| || ||| | |||||||||||| | ||    
T  22388127 atggacatcacaagaagaaagatacggaggtgggaatgatagccgctggaactaatccatccatggctactgttgctcctatcaatgctgctcagtttcc 22388028  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggt 195  Q
     ||  | ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| || ||||||||| | || | |||||||||    
T  22388027 cccgtcctacccttatgcaccatactctcagcatccgttcttcccatcgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggt 22387938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 6543026 - 6542854
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  6543026 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcc 6542927  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcca 178  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  6542926 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcca 6542854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15893256 - 15893052
Alignment:
Q  8 ggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctc 107  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | |||||||| ||  | ||||    
T  15893256 ggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgctgcccaaatgcctc 15893157  T
Q  108 caccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    |  | ||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||| | || | |||||| |||||||| |||||    
T  15893156 cgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgcccttctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 15893057  T
Q  208 tattg 212  Q
     ||||    
T  15893056 aattg 15893052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 207
Target Start/End: Original strand, 18530108 - 18530304
Alignment:
Q  11 catcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccac 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||  |  || |  |||| || |||||||||||  ||||| |||||||||| ||| ||||||||     
T  18530108 catcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggaactagtcaatccatggctactgttacccctattaatgctgcccagttacctccat 18530207  T
Q  111 catactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||| | ||||| || | |||||| || ||||| |||||    
T  18530208 cgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaagtgcccgttaatgc 18530304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 21674399 - 21674558
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| |||||  | |||||||| || || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  21674399 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaacccatggctaccgtggctcctatcaatgcagctcaaatgcc 21674498  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatca 165  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21674499 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatccgttctttccgccattttaccatca 21674558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29665418 - 29665331
Alignment:
Q  125 ccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  29665418 ccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattg 29665331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 48465621 - 48465780
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||  || |||| ||||| || || ||||| || || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  48465621 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctggagccggtcaatcaatagctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 48465720  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatca 165  Q
    |||  ||||| | |||   ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  48465721 tccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatca 48465780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Original strand, 7072918 - 7073124
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || ||||  |||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  7072918 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccagtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 7073017  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| | || | |||||| || ||||| |||    
T  7073018 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 7073117  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  7073118 gcaattg 7073124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Original strand, 51781836 - 51781876
Alignment:
Q  125 ccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatca 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  51781836 ccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatca 51781876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Original strand, 51796925 - 51796965
Alignment:
Q  125 ccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatca 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  51796925 ccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatca 51796965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 2137478 - 2137136
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2137478 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 2137379  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2137378 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 2137279  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2137278 gaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtctcgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 2137179  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2137178 aatatgatcgaagcatgtgagaaagctcctagacttgatgtcc 2137136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 19688094 - 19688436
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688094 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 19688193  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688194 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 19688293  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19688294 gaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 19688393  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  19688394 aatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 19688436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 27609124 - 27608782
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27609124 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 27609025  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27609024 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgagggatgctatgcttt 27608925  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  27608924 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 27608825  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27608824 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27608782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 16277550 - 16277892
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277550 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 16277649  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16277650 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcttt 16277749  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  16277750 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgta 16277849  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16277850 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 16277892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 267 - 608
Target Start/End: Original strand, 16283446 - 16283787
Alignment:
Q  267 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 366  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16283446 atcaacaagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccttagagggcattgtacaaccagacagggcaa 16283545  T
Q  367 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16283546 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcaccctgggtcatgatgtcgaagggtgctatgctttg 16283645  T
Q  467 aagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 566  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16283646 aagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtga 16283745  T
Q  567 atatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    | ||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16283746 acatgattgaagtatgtgaggaagctcctagacttgttgtcc 16283787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 14557620 - 14557962
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557620 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 14557719  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557720 agccctcgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 14557819  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14557820 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 14557919  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14557920 aatgtgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 14557962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 19674437 - 19674779
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19674437 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 19674536  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19674537 aacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgagaggtgttatgcttt 19674636  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  19674637 gaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 19674736  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19674737 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 19674779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 31489969 - 31489627
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31489969 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 31489870  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31489869 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 31489770  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  31489769 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 31489670  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  31489669 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 31489627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 19208579 - 19208237
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19208579 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 19208480  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19208479 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 19208380  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  19208379 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 19208280  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  19208279 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 19208237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 28362174 - 28361832
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  28362174 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 28362075  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28362074 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 28361975  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  28361974 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 28361875  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  28361874 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 28361832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 31354520 - 31354862
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31354520 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgccgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 31354619  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31354620 agcctccacctgatcctttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 31354719  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  31354720 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 31354819  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  31354820 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcccagacttgatgtcc 31354862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Original strand, 19286468 - 19286800
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19286468 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacc 19286567  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  19286568 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 19286667  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19286668 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 19286767  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19286768 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 19286800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 12092933 - 12092601
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12092933 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 12092834  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  12092833 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 12092734  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12092733 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 12092634  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12092633 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 12092601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Original strand, 29829328 - 29829660
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  29829328 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttccaactttactccagagagggcattgtaccaccagacagggtaagcccccacc 29829427  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| |||||| | || || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  29829428 tgatccgttgcctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 29829527  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29829528 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 29829627  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29829628 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 29829660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 33258719 - 33259061
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  33258719 aatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggta 33258818  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33258819 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 33258918  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||     
T  33258919 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgttgtg 33259018  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  33259019 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 33259061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 276 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 3329716 - 3329384
Alignment:
Q  276 ctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacc 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||||||    
T  3329716 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 3329617  T
Q  376 tgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  3329616 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 3329517  T
Q  476 gtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcg 575  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  3329516 gtgaagaagctcgttgatcaagggaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcg 3329417  T
Q  576 aagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3329416 aagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 3329384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 275 - 608
Target Start/End: Original strand, 18710591 - 18710924
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  18710591 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagccctcac 18710690  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  18710691 ctgatccgctgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcagggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatat 18710790  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||||     
T  18710791 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 18710890  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    || | || ||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  18710891 gaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 18710924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 434 - 608
Target Start/End: Original strand, 189258 - 189432
Alignment:
Q  434 ctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcc 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  189258 ctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcc 189357  T
Q  534 tcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  189358 tcgacaatcctcttccaaatcatgcctctgttaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 189432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 275 - 608
Target Start/End: Original strand, 9354627 - 9354961
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||  | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  9354627 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 9354726  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    ||||||| | |||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  9354727 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgacgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 9354826  T
Q  475 cgt-gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgat 573  Q
     ||  ||||| ||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9354827 tgtaaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 9354926  T
Q  574 cgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||  ||||||| || |||||||||||||||||    
T  9354927 cgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 9354961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 272 - 566
Target Start/End: Original strand, 44563103 - 44563396
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |  | |||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  44563103 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 44563202  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    |||||||||| | |||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||    
T  44563203 cacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggta 44563302  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 566  Q
    ||| || ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  44563303 cattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaa 44563396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 275 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 19659249 - 19658926
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||| |  | |||||  || |||||||||||||||||||| ||||    
T  19659249 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaaccagacagggcaagcctccac 19659150  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    |||| |||| |||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  19659149 ctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 19659050  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  19659049 tgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 19658951  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcctagac 599  Q
    || | || ||||| |||||| ||||    
T  19658950 gaggtatatgaggaagctcccagac 19658926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 275 - 573
Target Start/End: Original strand, 33244670 - 33244968
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||| ||| || || |||||| |||| |  | |||||  || |||||||||||||||||||| ||||    
T  33244670 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgttgaattactcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaaccagacagggcaagcctccac 33244769  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    |||| |||| |||||| | |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  33244770 ctgacccgtcgcctcctaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgcgctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 33244869  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgat 573  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| |||||    
T  33244870 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaaccacgctgctgtaaacatgat 33244968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 278 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 22081085 - 22080787
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||| |||| || ||| |||| |||||||| || |  | |||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||     
T  22081085 agacctacctttcctccgataccaatgctgtacgccgagctgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcagggaaagcctccaccta 22080986  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    | |||||||||||||||||| | || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| ||    
T  22080985 acccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgt 22080886  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcga 576  Q
     || ||||||||||| || |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||    
T  22080885 aaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcga 22080787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Original strand, 44562932 - 44563050
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  44562932 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggacaac 44563031  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  44563032 ctcaggtacccgttaatgc 44563050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Original strand, 18710331 - 18710532
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||  || |||| ||||| || |||||||| || || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  18710331 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 18710430  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | ||||||||| ||||| |||    
T  18710431 tccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcccgtcaat 18710530  T
Q  206 gc 207  Q
    ||    
T  18710531 gc 18710532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Original strand, 16283196 - 16283400
Alignment:
Q  8 ggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctc 107  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  |||| ||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||| ||  | ||||    
T  16283196 ggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctc 16283295  T
Q  108 caccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    |  | ||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||| | |||||||||||| |||| | ||||||||||||| | |||||    
T  16283296 cgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcattagtatcctttgccaccaggtcaacctcaggtacccattaatgc 16283395  T
Q  208 tattg 212  Q
     ||||    
T  16283396 aattg 16283400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Original strand, 9354453 - 9354571
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  9354453 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 9354552  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  9354553 ctcaggtacccgttaatgc 9354571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19659423 - 19659305
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  19659423 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 19659324  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  19659323 ctcaggtacccgttaatgc 19659305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19518344 - 19518280
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagg 342  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19518344 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagg 19518280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Original strand, 16277299 - 16277500
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| || ||  | ||    
T  16277299 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 16277398  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  16277399 tccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 16277498  T
Q  206 gc 207  Q
    ||    
T  16277499 gc 16277500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2137729 - 2137528
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| || ||  | ||    
T  2137729 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 2137630  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  2137629 tccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgtcattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 2137530  T
Q  206 gc 207  Q
    ||    
T  2137529 gc 2137528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Original strand, 14557372 - 14557573
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || |||||||||||||| ||| | ||||| || ||  | ||    
T  14557372 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgtcgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 14557471  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| ||||| || |||    
T  14557472 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacctgttaat 14557571  T
Q  206 gc 207  Q
    ||    
T  14557572 gc 14557573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19208830 - 19208659
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  19208830 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 19208731  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcc 177  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  19208730 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 19208659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Original strand, 19286210 - 19286416
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  |  |||| ||||| || ||||| ||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  19286210 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 19286309  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| | || | ||||||||| || || |||    
T  19286310 tccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttaccaccgggccaacctcaggttcctgtcaat 19286409  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  19286410 gccattg 19286416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19518494 - 19518441
Alignment:
Q  125 ccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcca 178  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  19518494 ccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctttgcca 19518441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Original strand, 29829058 - 29829230
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || |||||||| || || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  29829058 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 29829157  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcca 178  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  29829158 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcca 29829230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 266 - 607
Target Start/End: Original strand, 27288 - 27629
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27288 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 27387  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27388 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 27487  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27488 gaagtatatcgtgaagaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 27587  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtc 607  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27588 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtc 27629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Original strand, 27037 - 27238
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| || ||  | ||    
T  27037 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 27136  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  27137 tccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctaccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 27236  T
Q  206 gc 207  Q
    ||    
T  27237 gc 27238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 390 - 47
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctg-agttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  390 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctttagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggc 291  T
Q  365 aagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctt 464  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  290 aagcccccaccggatccgttgcctcccaagttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgcgttgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctt 191  T
Q  465 tgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgt 564  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  190 tgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgt 91  T
Q  565 aaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  90 aaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 47  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 641 - 435
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  641 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcaactggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 542  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  541 tccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 442  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  441 gcaattg 435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 7499 - 7157
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  7499 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 7400  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7399 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 7300  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||     
T  7299 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtg 7200  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  7199 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 7157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7750 - 7579
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  7750 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 7651  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcc 177  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  7650 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 7579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 9326 - 8984
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9326 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 9227  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9226 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 9127  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  9126 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtg 9027  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  9026 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 8984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 20011 - 20353
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20011 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 20110  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20111 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 20210  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  20211 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtg 20310  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20311 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 20353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 10962665 - 10963007
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  10962665 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttgctccagagagggcattgtacaactagacagggta 10962764  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10962765 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 10962864  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  10962865 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 10962964  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||   ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  10962965 aatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 10963007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 41793568 - 41793226
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41793568 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggca 41793469  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41793468 agcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 41793369  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  41793368 gaagtatatcgtgaagaagctcgtcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 41793269  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41793268 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 41793226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 28584976 - 28585318
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  28584976 aatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 28585075  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28585076 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 28585175  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  28585176 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtg 28585275  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  28585276 aatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 28585318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 51638213 - 51638555
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |    
T  51638213 aatcagcaagctaggcctactttcccttcgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggta 51638312  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51638313 agcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 51638412  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||     
T  51638413 gaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 51638512  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51638513 aatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 51638555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 267 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 16208290 - 16207951
Alignment:
Q  267 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 366  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||    
T  16208290 atcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtataccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggaaa 16208191  T
Q  367 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 466  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  16208190 acctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttg 16208091  T
Q  467 aagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 566  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  16208090 aagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaa 16207991  T
Q  567 atatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgt 606  Q
    | ||||| || | || ||||  |||||| |||||||||||    
T  16207990 acatgattgaggtatatgagaaagctcccagacttgatgt 16207951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 272 - 573
Target Start/End: Original strand, 28151863 - 28152164
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |    
T  28151863 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctc 28151962  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  28151963 cacctgatctgttacctcccaggctccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaata 28152062  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 571  Q
    ||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||    
T  28152063 cattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatg 28152162  T
Q  572 at 573  Q
    ||    
T  28152163 at 28152164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 267 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 20340594 - 20340253
Alignment:
Q  267 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 366  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  20340594 atcagcaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaa 20340495  T
Q  367 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 466  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  20340494 gcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttg 20340395  T
Q  467 aagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 566  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  20340394 aagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtga 20340295  T
Q  567 atatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    | ||||| || | || ||||| |||||| |||||||| ||||    
T  20340294 acatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtcc 20340253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 272 - 555
Target Start/End: Original strand, 20461082 - 20461365
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  20461082 caagctagacctacctttcctccgatactaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 20461181  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  20461182 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagta 20461281  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatca 555  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||||||  |||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20461282 cattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgaaaatatcgtccctcatgtcctcgataatcctcttccgaatca 20461365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 207
Target Start/End: Original strand, 20460857 - 20461053
Alignment:
Q  11 catcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccac 110  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| || || ||||||||  |  |||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||| |    
T  20460857 catcataagaagaaagaaatagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactattgcccctattaatgctgcccagttacctccgc 20460956  T
Q  111 catactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    | ||| | ||||| |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| | ||||| || | ||||||||||||||| |||||    
T  20460957 cgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcaatatcctctaccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 20461053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20340760 - 20340642
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | || || |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  20340760 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtacgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 20340661  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  20340660 ctcaggtacccgtcaatgc 20340642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41793819 - 41793613
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||  || |||| ||||| || |||||||| || || ||| | ||||| || ||  | ||    
T  41793819 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtatcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 41793720  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| || ||||| |||    
T  41793719 tccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 41793620  T
Q  206 gctattg 212  Q
    || ||||    
T  41793619 gcaattg 41793613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Original strand, 51637962 - 51638134
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  51637962 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 51638061  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcca 178  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  51638062 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcca 51638134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 10962414 - 10962585
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  10962414 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 10962513  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcc 177  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  10962514 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcc 10962585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16208531 - 16208434
Alignment:
Q  11 catcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctcc 108  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |  ||||||||  |  |||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  16208531 catcataagaagaaagaaacagaagtagagatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctcc 16208434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Original strand, 30449 - 30790
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30449 aatcagcaagctagacctactttcc-tcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggca 30547  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30548 agccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttt 30647  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30648 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgta 30747  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30748 aatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 30790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 272 - 606
Target Start/End: Original strand, 20390 - 20723
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  20390 caagctagacctacctttcccccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 20489  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  20490 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagta 20589  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatg 571  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||    
T  20590 cattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatg 20688  T
Q  572 atcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgt 606  Q
    || || | || ||| | |||||| ||||| |||||    
T  20689 attgaggtatatgaagaagctcccagactcgatgt 20723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 207
Target Start/End: Original strand, 20162 - 20358
Alignment:
Q  11 catcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacctccac 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||  |  |||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||      
T  20162 catcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgt 20261  T
Q  111 catactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    | ||| | ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||  |||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||    
T  20262 cgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccatcattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 20358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Original strand, 30198 - 30399
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||  | || ||||| ||  || |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| || ||  | ||    
T  30198 atggacaccacaagaagaaagaaacggaaatagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcc 30297  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaat 205  Q
    |||  ||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| |||    
T  30298 tccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaat 30397  T
Q  206 gc 207  Q
    ||    
T  30398 gc 30399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 15190 - 14848
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15190 aatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggta 15091  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15090 agcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgcttt 14991  T
Q  466 gaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgta 565  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  14990 gaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtg 14891  T
Q  566 aatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14890 aatgtgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 14848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 275 - 608
Target Start/End: Original strand, 9571 - 9904
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9571 gctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagcccccac 9670  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  9671 ctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 9770  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9771 tgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 9870  T
Q  575 gaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9871 gaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 9904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Original strand, 7977 - 8166
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||  || |||| ||||| ||| |||||||||| || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  7977 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatctgtggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 8076  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggt 195  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||    
T  8077 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtatcctttgccaccaggccaacctcaggt 8166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 266 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 26462 - 26119
Alignment:
Q  266 aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggca 365  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  26462 aatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggta 26363  T
Q  366 agcccccacctgatccgttgcctccca-ggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctt 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26362 agcccccacctgatccgttgcctccaaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctt 26263  T
Q  465 tgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgt 564  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26262 tgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgt 26163  T
Q  565 aaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
     ||||||||||||   ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  26162 gaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 284 - 608
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8287
Alignment:
Q  284 actttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgt 383  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7963 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 8062  T
Q  384 tgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 483  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  8063 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 8162  T
Q  484 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 583  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  8163 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 8262  T
Q  584 gaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  8263 gaggaagctcctagacttgatgtcc 8287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Original strand, 7682 - 7854
Alignment:
Q  6 atggacatcacaagaagaaggaaacagaggttggaatggtatcctctagagcaggtcagtctatggctactgtcgcccctgttaatgctgctcagctacc 105  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||  | ||    
T  7682 atggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctgcagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 7781  T
Q  106 tccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgcca 178  Q
    |||  ||||| | |||   ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  7782 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgcca 7854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 276 - 600
Target Start/End: Original strand, 6015 - 6344
Alignment:
Q  276 ctagaccta-ctttccctccgataccgatgttg-tatgctgagttgcttccgacttt-actccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagccccc 372  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  6015 ctagacctaacttttcctcctataccgatgtttatatgctgagttgcttccaacttttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccacc 6114  T
Q  373 acctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttc-catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt-gaagt 470  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6115 acctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatttttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttttgaagt 6214  T
Q  471 acatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatat 570  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  6215 atatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatat 6314  T
Q  571 gatcgaagaatgtgaggcagctcctagact 600  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  6315 gatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 6344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 340 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1838
Alignment:
Q  340 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggt 439  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  2103 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 2004  T
Q  440 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgata 539  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  2003 catgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgaca 1905  T
Q  540 atccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgt 606  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||| | |||||| ||||| |||||    
T  1904 atcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccagactcgatgt 1838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 165; Significance: 6e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 272 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 47072 - 46756
Alignment:
Q  272 caagctagacctacttt-ccctccgatacc-gatgttgtatgctgagttgcttccgac---tttactccatagaggg-cattgtacaacc-agacagggc 364  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  47072 caagctagacctacttttccctccgatacccgatgttgtatgctgagttgcttccccccgatttactccatagagggacattgtacaacctagacagggc 46973  T
Q  365 aa--gcccccacctgatccgttgcctcccaggttca-ggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtc--atg-atgtcgaggggtgc- 457  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||     
T  46972 aaacgcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcgaatggatgtcgaggggtgcg 46873  T
Q  458 tatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa-gctgactttt-gagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatca 555  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  46872 tatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaaagcggactttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatca 46773  T
Q  556 tgccgctgtaaatatga 572  Q
    ||| |||||||||||||    
T  46772 tgctgctgtaaatatga 46756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 267 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 2917 - 2576
Alignment:
Q  267 atcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaa 366  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  2917 atcagcaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaa 2818  T
Q  367 gcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttg 466  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  2817 gcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttg 2718  T
Q  467 aagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 566  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  2717 aagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtga 2618  T
Q  567 atatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 608  Q
    | ||||| || | || ||||| |||||| |||||||| ||||    
T  2617 acatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtcc 2576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3083 - 2965
Alignment:
Q  89 aatgctgctcagctacctccaccatactcctatgcaccgtactctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccac 188  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| | || || |  |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||    
T  3083 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtacgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 2984  T
Q  189 ctcaggtacccgtgaatgc 207  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  2983 ctcaggtacccgtcaatgc 2965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 118; Significance: 7e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 272 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 282 - 5
Alignment:
Q  272 caagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccc 371  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| ||  |||||||||| |||||||| |    
T  282 caagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgctcaaccagacatggcaagcctc 183  T
Q  372 cacctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagta 471  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  182 cacctgatccgttgccttccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 83  T
Q  472 catcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttcc 549  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  82 cattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaaccttcgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 278 - 576
Target Start/End: Original strand, 21569 - 21867
Alignment:
Q  278 agacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctg 377  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||| |||| |||||||| || |  | ||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||     
T  21569 agacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctgctcccgactttgcttctcaaaggacactgcacaaccaggcagggcaagcctccaccta 21668  T
Q  378 atccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgt 477  Q
    | | |||||||||||||||| | || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  21669 acctgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggggctctgggccaagatgttgaaggatgttacgctttgaagtagattgt 21768  T
Q  478 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcga 576  Q
     || ||||||||||| || |||||| | |||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||    
T  21769 aaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttaagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcga 21867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 61; Significance: 7e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 416 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 728 - 568
Alignment:
Q  416 gatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgaga 515  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  728 gatttccatcaagatgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgaga 629  T
Q  516 ataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcga 576  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||    
T  628 ataatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcga 568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 182 - 244
Target Start/End: Original strand, 1 - 63
Alignment:
Q  182 ggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagcaaccaccagttcag 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1 ggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcaacagaagccacaacaaccaccagttcag 63  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 578
Target Start/End: Original strand, 94 - 397
Alignment:
Q  275 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 374  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |    
T  94 gctaggcctacttttcctccaatcccgatgttgtatgctgatttacttccaacattacttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgc 193  T
Q  375 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtcagacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacat 474  Q
    | ||||| || || || |||||  |  | || ||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| || || ||| |||| |||||||| ||||| ||    
T  194 cagatccattaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgacgttgagaggtgttatgctttaaagtatat 293  T
Q  475 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 574  Q
     ||  | | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| ||||| || |||||| | ||||| || ||||| |||||     
T  294 tgtccagaggcttattgaccaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataaccctcttccagaccatgctgcagtaaacatgatt 393  T
Q  575 gaag 578  Q
    ||||    
T  394 gaag 397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University