View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8251_low_3 (Length: 803)

Name: NF8251_low_3
Description: NF8251
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8251_low_3
NF8251_low_3
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (471-786)||(27622913-27623228)
chr6 (477-786)||(27283574-27283883)
chr6 (471-783)||(13517401-13517720)
chr6 (538-781)||(33369703-33369954)
chr6 (477-783)||(30551193-30551506)
chr6 (538-781)||(29556231-29556482)
chr6 (538-783)||(4539032-4539285)
chr6 (538-756)||(27200897-27201123)
chr6 (538-756)||(27248110-27248336)
chr6 (538-783)||(29579707-29579960)
chr6 (538-786)||(28214138-28214394)
chr6 (538-781)||(26792491-26792742)
chr6 (538-781)||(29508096-29508347)
chr6 (540-783)||(34457761-34458012)
chr6 (553-783)||(27064174-27064412)
chr6 (538-788)||(26109674-26109933)
chr6 (538-781)||(27014399-27014650)
chr6 (553-781)||(14138689-14138925)
chr6 (477-781)||(27209574-27209886)
chr6 (477-781)||(27239342-27239654)
chr6 (477-783)||(27491811-27492125)
chr6 (538-783)||(27355356-27355609)
chr6 (538-781)||(26927427-26927679)
chr6 (553-756)||(4764462-4764673)
chr6 (477-783)||(4531967-4532280)
chr6 (538-783)||(26665910-26666163)
chr6 (538-783)||(26771881-26772134)
chr6 (538-781)||(16756496-16756748)
chr6 (538-762)||(28167188-28167420)
chr6 (538-783)||(4779584-4779837)
chr6 (538-756)||(8898950-8899176)
chr6 (538-783)||(16937279-16937532)
chr6 (538-783)||(16680832-16681085)
chr6 (471-781)||(24298967-24299285)
chr6 (477-782)||(22928067-22928380)
chr6 (538-754)||(15405803-15406028)
chr6 (538-754)||(15417590-15417815)
chr6 (538-762)||(24870402-24870635)
chr6 (477-776)||(27031701-27032008)
chr6 (477-781)||(13292157-13292470)
chr6 (477-776)||(27025822-27026129)
chr6 (477-723)||(20131253-20131500)
chr6 (477-723)||(22201370-22201617)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (12-289)||(15775710-15775987)
chr8 (471-657)||(15775288-15775474)
chr8 (538-783)||(29836023-29836276)
chr8 (540-783)||(28355223-28355474)
chr8 (533-783)||(33265420-33265678)
chr8 (538-762)||(18716177-18716409)
chr8 (477-786)||(12085937-12086253)
chr8 (540-783)||(31483142-31483393)
chr8 (477-745)||(31361267-31361542)
chr8 (476-762)||(22074135-22074429)
chr8 (538-783)||(44567680-44567934)
chr8 (540-783)||(19201654-19201906)
chr8 (538-783)||(19681156-19681409)
chr8 (477-762)||(18797404-18797697)
chr8 (477-781)||(15774250-15774562)
chr8 (477-776)||(21341394-21341702)
chr8 (477-776)||(14569836-14570143)
chr8 (538-781)||(2130552-2130804)
chr8 (471-782)||(19694791-19695110)
chr8 (538-776)||(22139595-22139842)
chr8 (538-783)||(9361304-9361556)
chr8 (477-781)||(33249039-33249351)
chr8 (477-782)||(16260613-16260926)
chr8 (538-782)||(19654610-19654863)
chr8 (477-781)||(27602137-27602449)
chr8 (538-754)||(19910451-19910676)
chr8 (135-284)||(15775884-15776032)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (12-289)||(24813123-24813400)
chr4 (471-657)||(24813636-24813822)
chr4 (477-783)||(54840097-54840410)
chr4 (477-783)||(31119756-31120069)
chr4 (477-783)||(21976410-21976723)
chr4 (540-783)||(20331743-20331994)
chr4 (538-783)||(27156632-27156885)
chr4 (538-781)||(6576544-6576796)
chr4 (477-781)||(14752762-14753073)
chr4 (477-783)||(40098879-40099192)
chr4 (477-762)||(5701256-5701548)
chr4 (538-762)||(39857342-39857574)
chr4 (476-762)||(15379482-15379776)
chr4 (538-781)||(36323643-36323894)
chr4 (538-781)||(36337852-36338103)
chr4 (538-756)||(18793949-18794175)
chr4 (538-777)||(5012593-5012841)
chr4 (478-782)||(15234526-15234838)
chr4 (539-782)||(1906975-1907227)
chr4 (471-762)||(15275865-15276164)
chr4 (477-782)||(24585616-24585929)
chr4 (538-781)||(24119349-24119601)
chr4 (538-783)||(33667107-33667360)
chr4 (538-782)||(34182263-34182515)
chr4 (538-783)||(14105250-14105503)
chr4 (538-783)||(30760470-30760723)
chr4 (477-657)||(24814547-24814726)
chr4 (538-781)||(17019737-17019989)
chr4 (616-762)||(14671717-14671871)
chr4 (135-284)||(24813078-24813226)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (12-289)||(13178078-13178355)
chr5 (471-657)||(13178638-13178824)
chr5 (477-783)||(15752004-15752317)
chr5 (477-783)||(30036128-30036441)
chr5 (477-783)||(33523086-33523399)
chr5 (538-783)||(6880995-6881248)
chr5 (471-783)||(33881808-33882127)
chr5 (538-783)||(31819627-31819880)
chr5 (538-781)||(9543934-9544185)
chr5 (540-783)||(40466757-40467008)
chr5 (477-783)||(37351810-37352123)
chr5 (477-783)||(18493914-18494227)
chr5 (478-774)||(22895118-22895422)
chr5 (538-783)||(28953001-28953254)
chr5 (477-783)||(43084956-43085262)
chr5 (538-781)||(2517749-2518000)
chr5 (538-783)||(9324165-9324419)
chr5 (538-783)||(26487075-26487329)
chr5 (538-756)||(37745555-37745781)
chr5 (538-783)||(32589481-32589734)
chr5 (536-783)||(12138864-12139119)
chr5 (538-781)||(15651967-15652218)
chr5 (538-776)||(18121639-18121886)
chr5 (477-783)||(30158722-30159035)
chr5 (538-783)||(3796235-3796488)
chr5 (538-783)||(37761676-37761929)
chr5 (540-783)||(11330336-11330587)
chr5 (478-776)||(25206998-25207304)
chr5 (478-776)||(25271154-25271460)
chr5 (538-781)||(31438141-31438392)
chr5 (471-781)||(24730653-24730970)
chr5 (477-762)||(8658639-8658931)
chr5 (538-783)||(34623201-34623454)
chr5 (538-783)||(5644502-5644755)
chr5 (471-783)||(13317966-13318285)
chr5 (538-783)||(28655947-28656200)
chr5 (471-783)||(30175170-30175489)
chr5 (538-781)||(37664710-37664961)
chr5 (538-783)||(13435875-13436128)
chr5 (538-783)||(18368736-18368989)
chr5 (477-781)||(23726921-23727233)
chr5 (477-782)||(23898578-23898892)
chr5 (538-762)||(41681408-41681638)
chr5 (477-776)||(11556043-11556350)
chr5 (538-776)||(23632659-23632906)
chr5 (477-776)||(22992286-22992593)
chr5 (477-781)||(33784166-33784478)
chr5 (477-748)||(13179962-13180241)
chr5 (538-781)||(33299220-33299472)
chr5 (477-781)||(24976528-24976840)
chr5 (538-781)||(24608929-24609181)
chr5 (538-781)||(30941314-30941566)
chr5 (135-284)||(13178033-13178181)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (12-289)||(3790872-3791149)
chr2 (471-657)||(3790473-3790659)
chr2 (477-783)||(13929845-13930158)
chr2 (477-783)||(19409718-19410031)
chr2 (477-783)||(37932072-37932385)
chr2 (538-783)||(3789138-3789391)
chr2 (477-783)||(16822572-16822885)
chr2 (477-783)||(16898595-16898908)
chr2 (477-783)||(32056447-32056760)
chr2 (477-783)||(37679132-37679445)
chr2 (477-783)||(37694397-37694710)
chr2 (471-782)||(27397031-27397350)
chr2 (540-783)||(253948-254199)
chr2 (540-783)||(21670469-21670720)
chr2 (542-771)||(34297856-34298093)
chr2 (478-782)||(21696423-21696735)
chr2 (540-783)||(9343283-9343534)
chr2 (540-783)||(16168173-16168424)
chr2 (540-783)||(27810398-27810649)
chr2 (540-783)||(39045178-39045430)
chr2 (477-783)||(39896764-39897077)
chr2 (538-783)||(12593509-12593762)
chr2 (471-783)||(22921372-22921691)
chr2 (538-762)||(37384371-37384603)
chr2 (471-762)||(31882987-31883285)
chr2 (540-783)||(37945161-37945412)
chr2 (538-783)||(34161536-34161789)
chr2 (471-781)||(12709852-12710169)
chr2 (538-776)||(34268216-34268463)
chr2 (538-783)||(11628479-11628732)
chr2 (538-783)||(34868329-34868582)
chr2 (538-762)||(27123216-27123448)
chr2 (540-783)||(27782918-27783169)
chr2 (471-762)||(19449639-19449939)
chr2 (538-756)||(40240245-40240471)
chr2 (538-781)||(23117471-23117723)
chr2 (533-762)||(27427761-27428000)
chr2 (482-781)||(28888929-28889236)
chr2 (538-781)||(31868102-31868354)
chr2 (672-781)||(20844590-20844699)
chr2 (538-781)||(12662165-12662418)
chr2 (135-199)||(3791130-3791194)
chr2 (471-578)||(20844802-20844908)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (471-781)||(3451926-3452244)
chr7 (472-783)||(26268209-26268527)
chr7 (488-786)||(26508848-26509154)
chr7 (135-289)||(3452501-3452655)
chr7 (477-783)||(26678233-26678546)
chr7 (477-783)||(26663041-26663354)
chr7 (540-783)||(16744711-16744962)
chr7 (538-783)||(31083812-31084066)
chr7 (477-781)||(2779919-2780230)
chr7 (471-756)||(31130616-31130909)
chr7 (538-783)||(26441938-26442191)
chr7 (477-783)||(31557533-31557847)
chr7 (538-783)||(26313052-26313306)
chr7 (538-783)||(26596349-26596603)
chr7 (538-783)||(4206069-4206322)
chr7 (538-783)||(45393913-45394166)
chr7 (540-783)||(4138436-4138687)
chr7 (538-781)||(22148563-22148814)
chr7 (538-783)||(11447582-11447835)
chr7 (478-782)||(16443134-16443446)
chr7 (538-783)||(26519501-26519754)
chr7 (482-762)||(16048027-16048315)
chr7 (138-289)||(26267899-26268050)
chr7 (538-762)||(39206353-39206585)
chr7 (538-762)||(45737995-45738227)
chr7 (477-781)||(11417931-11418243)
chr7 (538-781)||(5154758-5155010)
chr7 (540-783)||(24585726-24585978)
chr7 (538-748)||(5140526-5140744)
chr7 (590-781)||(22152790-22152989)
chr7 (590-781)||(22208705-22208904)
chr7 (477-762)||(10848299-10848592)
chr7 (471-781)||(5165059-5165377)
chr7 (477-781)||(2161247-2161558)
chr7 (538-782)||(16511637-16511890)
chr7 (471-781)||(10910072-10910390)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (477-783)||(24334835-24335148)
chr3 (471-783)||(18231851-18232170)
chr3 (477-783)||(28109250-28109564)
chr3 (477-783)||(10649730-10650042)
chr3 (477-783)||(17978238-17978551)
chr3 (538-781)||(11103731-11103982)
chr3 (477-783)||(5020370-5020683)
chr3 (538-783)||(6536090-6536343)
chr3 (471-783)||(28345830-28346149)
chr3 (540-783)||(5589705-5589956)
chr3 (540-783)||(5717714-5717965)
chr3 (540-783)||(5728624-5728875)
chr3 (540-783)||(5763493-5763744)
chr3 (538-781)||(31029613-31029864)
chr3 (539-781)||(4340047-4340297)
chr3 (540-783)||(29658316-29658567)
chr3 (538-781)||(32445791-32446042)
chr3 (477-776)||(16617776-16618084)
chr3 (477-781)||(18285666-18285977)
chr3 (477-781)||(18300967-18301278)
chr3 (477-762)||(22041087-22041381)
chr3 (538-781)||(4630420-4630671)
chr3 (477-783)||(32297290-32297603)
chr3 (538-783)||(22864211-22864464)
chr3 (538-783)||(22879270-22879523)
chr3 (540-783)||(47030114-47030366)
chr3 (538-781)||(4423557-4423808)
chr3 (538-783)||(17970227-17970481)
chr3 (477-783)||(18249377-18249690)
chr3 (538-783)||(5602660-5602913)
chr3 (538-783)||(20570203-20570456)
chr3 (471-756)||(31957737-31958029)
chr3 (553-781)||(5473628-5473864)
chr3 (538-783)||(16404139-16404392)
chr3 (538-783)||(10402811-10403064)
chr3 (538-762)||(48472590-48472822)
chr3 (477-782)||(15367903-15368217)
chr3 (477-782)||(19701055-19701368)
chr3 (538-756)||(21681406-21681632)
chr3 (538-783)||(51788681-51788934)
chr3 (538-762)||(20072693-20072925)
chr3 (538-783)||(28027930-28028183)
chr3 (477-781)||(29142063-29142375)
chr3 (477-781)||(35887399-35887711)
chr3 (477-781)||(4728265-4728577)
chr3 (477-781)||(5658773-5659085)
chr3 (477-781)||(6208534-6208846)
chr3 (538-783)||(8218284-8218537)
chr3 (477-781)||(18057907-18058219)
chr3 (477-781)||(4789940-4790252)
chr3 (477-782)||(16422845-16423158)
chr3 (477-776)||(8282769-8283076)
chr3 (538-657)||(16599406-16599525)
chr3 (477-782)||(15886026-15886339)
chr3 (477-657)||(7080022-7080201)
chr3 (477-776)||(18337268-18337575)
chr3 (538-781)||(22380949-22381201)
chr3 (477-782)||(4690313-4690626)
chr3 (477-754)||(15734425-15734710)
chr3 (680-781)||(7079867-7079968)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (482-783)||(51644921-51645229)
chr1 (538-783)||(10951791-10952044)
chr1 (540-781)||(10969344-10969593)
chr1 (538-783)||(3647846-3648099)
chr1 (538-783)||(28591780-28592033)
chr1 (477-776)||(16201276-16201583)
chr1 (538-781)||(41786640-41786891)
chr1 (538-762)||(28156425-28156657)
chr1 (482-776)||(20333667-20333969)
chr1 (477-781)||(14692162-14692474)
chr1 (477-781)||(14694844-14695156)
chr1 (477-781)||(14697528-14697840)
chr1 (477-771)||(14700209-14700511)
chr1 (482-782)||(20467484-20467792)
chr1 (618-782)||(21891136-21891308)
chr1 (573-646)||(13769558-13769631)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (538-786)||(14636-14892)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (487-782)||(27992-28293)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (538-783)||(2354-2607)
scaffold0322 (477-762)||(12769-13062)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (477-762)||(8187-8479)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (477-781)||(12715-13026)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (538-783)||(10615-10869)
scaffold0143 (477-781)||(33971-34283)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (538-783)||(2483-2736)
scaffold0159 (706-783)||(18505-18582)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (471-762)||(25809-26108)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (478-785)||(467-782)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (538-783)||(16273-16526)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (471-781)||(24213-24531)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (538-781)||(3921-4173)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (538-776)||(8966-9214)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (669-781)||(40067-40181)
scaffold0099 (538-581)||(39922-39965)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (715-781)||(6741-6807)
[»] scaffold0685 (1 HSPs)
scaffold0685 (477-581)||(1309-1412)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (538-581)||(13281-13324)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 471 - 786
Target Start/End: Original strand, 27622913 - 27623228
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27622913 ctgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 27623012  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaagtc 670  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27623013 gaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatc 27623112  T
Q  671 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgg 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623113 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccagaaccatggctgagggtagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgg 27623212  T
Q  771 ggataacgccgttatg 786  Q
    ||||||||||||||||    
T  27623213 ggataacgccgttatg 27623228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 477 - 786
Target Start/End: Original strand, 27283574 - 27283883
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  27283574 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 27283672  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacac-gacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaagtcctctt 675  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||| |  || | | |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27283673 catgactgttggcagtttgtagacacagttttgaagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatcctctt 27283772  T
Q  676 tggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggata 775  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27283773 tggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggtagatagctaatcaacttactggggatagaattctggaagacccgactggggata 27283872  T
Q  776 acgccgttatg 786  Q
    |||||||||||    
T  27283873 acgccgttatg 27283883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 471 - 783
Target Start/End: Original strand, 13517401 - 13517720
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13517401 ctgatattgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 13517499  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 662  Q
    | |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  13517500 gtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 13517599  T
Q  663 tagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13517600 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 13517699  T
Q  763 ccgactggggataacgccgtt 783  Q
    | ||||||||| || ||||||    
T  13517700 ctgactggggaaaatgccgtt 13517720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Original strand, 33369703 - 33369954
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33369703 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 33369802  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  33369803 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggt 33369902  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  33369903 atgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 33369954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Original strand, 30551193 - 30551506
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  30551193 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 30551291  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  30551292 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagatatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 30551391  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30551392 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 30551491  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| |||||||||    
T  30551492 ggggaaaacgccgtt 30551506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 29556482 - 29556231
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29556482 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 29556383  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  29556382 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctttttgaagatgacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagataggc 29556283  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  29556282 atgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 29556231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Original strand, 4539032 - 4539285
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4539032 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 4539131  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4539132 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagct 4539231  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |  ||||   ||||||||||| ||||||    
T  4539232 atgcaacttgctggggatagaatctcgagagactttactggggataatgccgtt 4539285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 538 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 27201123 - 27200897
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27201123 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 27201024  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    ||||||||||||||| ||||        | || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27201023 gcacgtagtggctcgagctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagct 27200924  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttg 756  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  27200923 atgcaacttgctggggatagaatcttg 27200897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 538 - 756
Target Start/End: Original strand, 27248110 - 27248336
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27248110 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 27248209  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    ||||||||||||||| ||||        | || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27248210 gcacgtagtggctcgagctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagct 27248309  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttg 756  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  27248310 atgcaacttgctggggatagaatcttg 27248336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 29579960 - 29579707
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29579960 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 29579861  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||| ||||||| |        || | ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  29579860 gcacgtagtggcccgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 29579761  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
       ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  29579760 gtgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggagaatgccgtt 29579707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 538 - 786
Target Start/End: Complemental strand, 28214394 - 28214138
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28214394 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 28214295  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28214294 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagct 28214195  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatg 786  Q
    |  |||||||||||  || |||||| ||||| |   |||||||| ||||||||||||    
T  28214194 atacaacttgctggaaattgaatctcggaaggctttactggggaaaacgccgttatg 28214138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 26792742 - 26792491
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26792742 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 26792643  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |    
T  26792642 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagacgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggt 26792543  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||    
T  26792542 atgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccg 26792491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 29508347 - 29508096
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  29508347 gtaatatgcataattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggagaagacaagacatcagagtattgg 29508248  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  29508247 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggt 29508148  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    |   ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||    
T  29508147 atgtaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataacgccg 29508096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 540 - 783
Target Start/End: Original strand, 34457761 - 34458012
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34457761 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 34457860  T
Q  640 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 731  Q
    || ||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  34457861 acatagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 34457960  T
Q  732 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  34457961 gcaacttgctggagatagagtcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 34458012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 553 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 27064412 - 27064174
Alignment:
Q  553 atgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcg 652  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27064412 atgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcg 27064313  T
Q  653 tgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggg 744  Q
    ||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |  ||  | |||||||||     
T  27064312 tgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccatggctgagggcaggcaagtatgcgacttgctgga 27064213  T
Q  745 gatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27064212 gatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgtt 27064174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 538 - 788
Target Start/End: Original strand, 26109674 - 26109933
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26109674 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacgagacatcagagtattgg 26109773  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaagtcctctttggagataacgccg-ttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    ||||||||||||||||||||        | || | ||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26109774 gcacgtagtggctcgtgctatgttacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagc 26109873  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgat 788  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| |  ||||   ||||||||||| |||||| ||||    
T  26109874 tatgcaacttgctggggatagaatctcgagagactttactggggataatgccgttgtgat 26109933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 27014650 - 27014399
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27014650 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 27014551  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |    
T  27014550 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggt 27014451  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    |  | ||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  27014450 atgcgactcgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 27014399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 553 - 781
Target Start/End: Original strand, 14138689 - 14138925
Alignment:
Q  553 atgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcg 652  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14138689 atgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcg 14138788  T
Q  653 tgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggg 744  Q
    ||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||    
T  14138789 tgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggg 14138888  T
Q  745 gatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  14138889 gatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 14138925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 27209886 - 27209574
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||    
T  27209886 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtaatg 27209788  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--catag------aa 667  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||       ||    
T  27209787 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagatagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctagattacatattccagtaa 27209688  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  27209687 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctac 27209588  T
Q  768 tggggataacgccg 781  Q
    |||| |||| ||||    
T  27209587 tgggaataatgccg 27209574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Original strand, 27239342 - 27239654
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||    
T  27239342 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtaatg 27239440  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--catag------aa 667  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||       ||    
T  27239441 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagatagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctagattacatattccagtaa 27239540  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  27239541 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctac 27239640  T
Q  768 tggggataacgccg 781  Q
    |||| |||| ||||    
T  27239641 tgggaataatgccg 27239654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 27492125 - 27491811
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  27492125 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 27492027  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||        | || | |||     
T  27492026 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtagctcgtgctatattacaccttcttggaaa 27491927  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||    
T  27491926 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggaccatggctgagggcaggtaggtaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagacctcac 27491827  T
Q  768 tggggataacgccgtt 783  Q
     ||||| |||||||||    
T  27491826 cggggaaaacgccgtt 27491811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Original strand, 27355356 - 27355609
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27355356 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 27355455  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| ||| |    
T  27355456 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggt 27355555  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  |||||  || ||||| |||||||||    
T  27355556 atgcaacttgctggggatagaatcttgagagacctcaccggggaaaacgccgtt 27355609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 26927679 - 26927427
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  26927679 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 26927580  T
Q  637 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||    
T  26927579 ggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtatcggaaccaaggctgaggatagatagc 26927480  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  26927479 taatcaactcgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 26927427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 553 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 4764673 - 4764462
Alignment:
Q  553 atgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcg 652  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4764673 atgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcg 4764574  T
Q  653 tgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggg 744  Q
    ||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||    
T  4764573 tgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggg 4764474  T
Q  745 gatagaatcttg 756  Q
    ||||||||||||    
T  4764473 gatagaatcttg 4764462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 4532280 - 4531967
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  4532280 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 4532182  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |        || | |||     
T  4532181 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgagctatattacacattcttggaaa 4532082  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||    
T  4532081 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggctggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttact 4531982  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    |||||||| ||||||    
T  4531981 ggggataatgccgtt 4531967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Original strand, 26665910 - 26666163
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26665910 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 26666009  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||  |  || |    
T  26666010 gcacgtagtggctcgtgctatatgacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggtgggcaggt 26666109  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  26666110 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 26666163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Original strand, 26771881 - 26772134
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26771881 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 26771980  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||  |  || |    
T  26771981 gcacgtagtggctcgtgctatatgacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggtgggcaggt 26772080  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  26772081 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 26772134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 16756748 - 16756496
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  16756748 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 16756649  T
Q  637 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |        ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16756648 ggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagc 16756549  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  16756548 tatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 16756496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 538 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 28167420 - 28167188
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28167420 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 28167321  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | |||||    
T  28167320 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagct 28167221  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28167220 atgcaacttgctggggatagagtcttgggagac 28167188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 4779837 - 4779584
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  4779837 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagaattttgg 4779738  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||  || |    
T  4779737 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggcaggcaggt 4779638  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  4779637 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 4779584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 538 - 756
Target Start/End: Original strand, 8898950 - 8899176
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8898950 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 8899049  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgct-------acatcatagaag-tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||       ||||  | | || |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  8899050 gcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 8899149  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttg 756  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||    
T  8899150 atgtaacttgctggggatagagtcttg 8899176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Original strand, 16937279 - 16937532
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16937279 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 16937378  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| || | |        ||  | |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  16937379 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggagattctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 16937478  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |    |||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| |||||||||    
T  16937479 atgtgacttgctggggatagagtcttgagagactccactggggaaaacgccgtt 16937532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 16681085 - 16680832
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16681085 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 16680986  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgct-------acatcatagaag-tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||| ||||||||||||||       ||||  | | || |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  16680985 gcacatagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 16680886  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  16680885 atgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 16680832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 471 - 781
Target Start/End: Original strand, 24298967 - 24299285
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24298967 ctgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 24299065  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata----- 664  Q
    | |||||||||  ||||    |||||||||||   | ||| | || |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| || | |         
T  24299066 gtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattc 24299165  T
Q  665 ---gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaaga 761  Q
       ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24299166 ttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaga 24299265  T
Q  762 cccgactggggataacgccg 781  Q
    | | |||||| |||| ||||    
T  24299266 ctctactgggaataatgccg 24299285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 477 - 782
Target Start/End: Original strand, 22928067 - 22928380
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||    
T  22928067 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtgatg 22928165  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||    ||||||||||| | | | | | || |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || | |        |||    
T  22928166 catgactgttggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaa 22928265  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  22928266 atcctctttggagataacatcgttgggagatgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 22928365  T
Q  768 tggggataacgccgt 782  Q
    | ||||||| |||||    
T  22928366 tagggataatgccgt 22928380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 538 - 754
Target Start/End: Original strand, 15405803 - 15406028
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  15405803 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 15405902  T
Q  637 ggcacgtagtggctcgtgctacatcataga--------agtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    ||||||||||||||||||||| || | | |        | |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15405903 ggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagc 15406002  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatct 754  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||    
T  15406003 tatgcaacttgctggggatagaatct 15406028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 538 - 754
Target Start/End: Original strand, 15417590 - 15417815
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  15417590 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 15417689  T
Q  637 ggcacgtagtggctcgtgctacatcataga--------agtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    ||||||||||||||||||||| || | | |        | |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15417690 ggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagc 15417789  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatct 754  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||    
T  15417790 tatgcaacttgctggggatagaatct 15417815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 538 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 24870635 - 24870402
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||    ||||||||||| | | | | | || |||||||||| | ||||||||    
T  24870635 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgctggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattg 24870536  T
Q  637 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    |||||||| |||||||||||| || | |        ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24870535 ggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagc 24870436  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24870435 tatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 24870402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 477 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 27032008 - 27031701
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  27032008 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatg 27031910  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||    ||||||||||| | | | | | || |||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| || | |        |||    
T  27031909 catgactgttggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagcattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcttggaa 27031810  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||    
T  27031809 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggataggatctcggaagactctac 27031710  T
Q  768 tggggataa 776  Q
    |||| ||||    
T  27031709 tgggaataa 27031701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Original strand, 13292157 - 13292470
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  13292157 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatg 13292255  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||    ||||||||||| | ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  13292256 catgactgttggcgatttgtagacacaatttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaa 13292355  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatag-ctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 766  Q
     |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  13292356 atcctctttggagatgacgtcgttgggggacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagtctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactcta 13292455  T
Q  767 ctggggataacgccg 781  Q
    ||||| |||| ||||    
T  13292456 ctgggaataatgccg 13292470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 477 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 27026129 - 27025822
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  27026129 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatg 27026031  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcataga--------a 667  Q
    |||||  ||||    ||||||||||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | | |        |    
T  27026030 catgactgttggcgatttgtagacaaagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaa 27025931  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  27025930 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagttatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctac 27025831  T
Q  768 tggggataa 776  Q
    |||| ||||    
T  27025830 tgggaataa 27025822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 477 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 20131500 - 20131253
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || ||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  20131500 ttgacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatggatgcttgaaatg 20131402  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 668  Q
    |||||||||||  | |||||| | ||   ||| |     |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |        |||     
T  20131401 catgatggttggcaatttgta-agacagtttctc-----agacaagacatcggagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcctggaaa 20131308  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcag 723  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20131307 tcctctttggagatatcgtcgttgggagacgtatcgaaaccatggctgagggcag 20131253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 477 - 723
Target Start/End: Original strand, 22201370 - 22201617
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || ||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  22201370 ttgacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatggatgcttgaaatg 22201468  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 668  Q
    |||||||||||  | |||||| | ||   ||| |     |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |        |||     
T  22201469 catgatggttggcaatttgta-agacagtttctc-----agacaagacatcggagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcctggaaa 22201562  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcag 723  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22201563 tcctctttggagatatcgtcgttgggagacgtatcgaaaccatggctgagggcag 22201617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 12 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15775987 - 15775710
Alignment:
Q  12 gatggacatcactggggatttgtaatgggattagaattgacttgacgtcgtcctgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggata 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15775987 gatggaaatcactggggatttgtaatgggattagaattgacttgacgtcgtcctgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggata 15775888  T
Q  112 acagaggtagaagtaagttgactgggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15775887 acagaggtagaagtaagttgactgggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatt 15775788  T
Q  212 tgaaactgacttgacgtcatcttagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15775787 tgaaactgacttgacgtcatcttagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 15775710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 471 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 15775474 - 15775288
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15775474 ctgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgatt 15775375  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 657  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15775374 gaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 15775288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 29836276 - 29836023
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29836276 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 29836177  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  29836176 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggt 29836077  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29836076 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgtt 29836023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 540 - 783
Target Start/End: Original strand, 28355223 - 28355474
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355223 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 28355322  T
Q  640 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 731  Q
    |||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  28355323 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 28355422  T
Q  732 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  28355423 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 28355474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 533 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 33265678 - 33265420
Alignment:
Q  533 gacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagt 632  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33265678 gacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagt 33265579  T
Q  633 attgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcaga 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  33265578 attgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggaaatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcagg 33265479  T
Q  725 tagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||| |||||||||    
T  33265478 taggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggaaaacgccgtt 33265420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 538 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 18716409 - 18716177
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18716409 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 18716310  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18716309 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagct 18716210  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18716209 atgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 18716177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 477 - 786
Target Start/End: Original strand, 12085937 - 12086253
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    ||||| ||| |||||| | ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  12085937 ttgatgttggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 12086035  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  12086036 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 12086135  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  || |||||| ||||| |   |||    
T  12086136 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatacaacttgctggaaattgaatctcggaaggctttact 12086235  T
Q  769 ggggataacgccgttatg 786  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  12086236 ggggaaaacgccgttatg 12086253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 540 - 783
Target Start/End: Original strand, 31483142 - 31483393
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483142 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtcggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 31483241  T
Q  640 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 731  Q
    |||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  31483242 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 31483341  T
Q  732 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  31483342 gcaatttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 31483393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 477 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 31361542 - 31361267
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  31361542 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 31361444  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 668  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  31361443 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaaa 31361344  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 745  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  31361343 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 31361267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 476 - 762
Target Start/End: Original strand, 22074135 - 22074429
Alignment:
Q  476 attgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaat 575  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||| || | |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  22074135 attgacattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatagtttt-attaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaat 22074233  T
Q  576 gcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------ga 666  Q
    ||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |        ||    
T  22074234 gcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggaatattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttgga 22074333  T
Q  667 agtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22074334 aatcctctttggatataacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 22074429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 44567934 - 44567680
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44567934 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagaatattgg 44567835  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca---------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    |||||||| |||||| |||| |         || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  44567834 gcacgtagcggctcgcgctatattacacatttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgaggacaggtagc 44567735  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    ||  |||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  44567734 tatgcaacttgctggaaatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 44567680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 540 - 783
Target Start/End: Original strand, 19201654 - 19201906
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19201654 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaagcacaacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 19201753  T
Q  640 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 731  Q
    |||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| || ||||    
T  19201754 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacagctgagggcaggtaactaa 19201853  T
Q  732 tcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
     |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  19201854 acaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 19201906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 19681409 - 19681156
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  19681409 gtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 19681310  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || |    
T  19681309 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggt 19681210  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  19681209 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 19681156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 477 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 18797697 - 18797404
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  18797697 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 18797599  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  18797598 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaa 18797499  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  18797498 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctaaggatagaatcttgggagac 18797404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 15774562 - 15774250
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  15774562 ttgacattggaaatgcgacatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 15774464  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||  || | ||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |        |||    
T  15774463 catgactgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctggaa 15774364  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  15774363 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 15774264  T
Q  768 tggggataacgccg 781  Q
    |||| |||| ||||    
T  15774263 tgggaataatgccg 15774250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 477 - 776
Target Start/End: Original strand, 21341394 - 21341702
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  21341394 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 21341492  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  21341493 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaa 21341592  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccga 766  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||| | |    
T  21341593 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgcttgaggatagaatctcggaagactcta 21341692  T
Q  767 ctggggataa 776  Q
    ||||| ||||    
T  21341693 ctgggaataa 21341702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 477 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 14570143 - 14569836
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  14570143 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 14570045  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 667  Q
    |||||| ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |        || | |||    
T  14570044 catgattgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacacagtggctcgtgctatactacacattcttggaa 14569945  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  14569944 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaactcgctggggatagaatctcggaagactctac 14569845  T
Q  768 tggggataa 776  Q
    |||| ||||    
T  14569844 tgggaataa 14569836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Original strand, 2130552 - 2130804
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||    ||||||||||| | | | | | || |||||||||| | ||||||||    
T  2130552 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgctggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattg 2130651  T
Q  637 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |        ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2130652 ggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagc 2130751  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  2130752 tatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 2130804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 471 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 19695110 - 19694791
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  19695110 ctgatattgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 19695012  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata----- 664  Q
    | |||||||||  ||||    |||||||||||   | | | | || |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| || || | |         
T  19695011 gtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgttatattacacattc 19694912  T
Q  665 ---gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaaga 761  Q
       ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19694911 ctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaga 19694812  T
Q  762 cccgactggggataacgccgt 782  Q
    | | |||||| |||| |||||    
T  19694811 ctctactgggaataatgccgt 19694791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 538 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 22139842 - 22139595
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 636  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   | | | | || |||||||||| | ||||||||    
T  22139842 gtaatatgcatgattatgcgtgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattg 22139743  T
Q  637 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |        ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||    
T  22139742 ggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagc 22139643  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 776  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  22139642 tatacaacttgctggggacagaatctcggaagactctactggggataa 22139595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 9361556 - 9361304
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9361556 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 9361457  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || |  || |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| | ||| |    
T  9361456 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggggacgtatcgg-accatagctgagggccggtaggt 9361358  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |   |||| |||||||||||| |||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  9361357 atgtaactggctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 9361304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 33249351 - 33249039
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  33249351 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 33249253  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  33249252 catgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacaaacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaa 33249153  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  33249152 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttggaagactctac 33249053  T
Q  768 tggggataacgccg 781  Q
    |||| |||| ||||    
T  33249052 tgggaataatgccg 33249039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 477 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 16260926 - 16260613
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||  |||  |||| ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||    
T  16260926 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacggtttc-atcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgttatg 16260828  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   | | | | || |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || | |        |||    
T  16260827 catgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaa 16260728  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | | ||    
T  16260727 atcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctac 16260628  T
Q  768 tggggataacgccgt 782  Q
    |||| |||| |||||    
T  16260627 tgggaataatgccgt 16260613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 538 - 782
Target Start/End: Original strand, 19654610 - 19654863
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||| |||| ||||||||   | | | | || |||||||||| | ||||||||    
T  19654610 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttgacagttggtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattg 19654709  T
Q  637 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    |||||||| |||||||||||| || | |        ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||    
T  19654710 ggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagc 19654809  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 782  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||| |||| |||||    
T  19654810 tatgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctactgggaataatgccgt 19654863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Original strand, 27602137 - 27602449
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  27602137 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 27602235  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||    ||||||||| |   ||| | | || |||||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||| || | |        |||    
T  27602236 catgactgttggcgatttgtagacgcagtttcgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcggtggctcgtgctatattacacattcttggaa 27602335  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||||||||| |||| | ||    
T  27602336 atcctctttggagctgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctaaggatagaatcttgggagactctac 27602435  T
Q  768 tggggataacgccg 781  Q
    |||| |||| ||||    
T  27602436 tgggaataatgccg 27602449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 538 - 754
Target Start/End: Original strand, 19910451 - 19910676
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   | | | | || |||||||||| | ||||||||    
T  19910451 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattg 19910550  T
Q  637 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    |||||  |||||||||||||| || | |        ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19910551 ggcacacagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagc 19910650  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatct 754  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||    
T  19910651 tatgcaacttgctgaggatagaatct 19910676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15776032 - 15775884
Alignment:
Q  135 gggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggaga-ttgaaataagaatttgaaactgacttgacgtcatct 233  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || ||| |||  ||  ||  || |||||||||||| ||     
T  15776032 gggacaaactgttcttggattgaactagccacttatccaaacatggatggaaatcactggggatttgtaatggga--ttagaattgacttgacgtcgtcc 15775935  T
Q  234 tagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacag 284  Q
    |  |||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  15775934 tgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggataacag 15775884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 289
Target Start/End: Original strand, 24813123 - 24813400
Alignment:
Q  12 gatggacatcactggggatttgtaatgggattagaattgacttgacgtcgtcctgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggata 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24813123 gatggaaatcactggggatttgtaatgggattagaattgacttgacgtcgtcctgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggata 24813222  T
Q  112 acagaggtagaagtaagttgactgggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24813223 acagaggtagaagtaagttgactgggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatt 24813322  T
Q  212 tgaaactgacttgacgtcatcttagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24813323 tgaaactgacttgacgtcatcttagtttgaaaggtggaaagtggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 24813400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 471 - 657
Target Start/End: Original strand, 24813636 - 24813822
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24813636 ctgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgatt 24813735  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 657  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24813736 gaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcatggggaagacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 24813822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 54840410 - 54840097
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  54840410 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 54840312  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  54840311 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattggattattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 54840212  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54840211 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacccgact 54840112  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| |||||||||    
T  54840111 ggggaaaacgccgtt 54840097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Original strand, 31119756 - 31120069
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  31119756 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 31119854  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  31119855 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 31119954  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31119955 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 31120054  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| |||||||||    
T  31120055 ggggaaaacgccgtt 31120069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 21976723 - 21976410
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  21976723 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 21976625  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  21976624 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagatatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 21976525  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21976524 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 21976425  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| |||||||||    
T  21976424 ggggaaaacgccgtt 21976410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 540 - 783
Target Start/End: Original strand, 20331743 - 20331994
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20331743 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 20331842  T
Q  640 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 731  Q
    |||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  20331843 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 20331942  T
Q  732 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  20331943 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 20331994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Original strand, 27156632 - 27156885
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27156632 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggagaagacaagacattagagtattgg 27156731  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  27156732 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagat 27156831  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  27156832 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 27156885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 6576796 - 6576544
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6576796 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcatggggaagacaagacattagagtattgg 6576697  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctc-tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||      
T  6576696 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctcttttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaag 6576597  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||    
T  6576596 tatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactccactggggataatgccg 6576544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Original strand, 14752762 - 14753073
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  14752762 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 14752860  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  14752861 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 14752960  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  14752961 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 14753060  T
Q  769 ggggataacgccg 781  Q
    ||| |||| ||||    
T  14753061 gggaataatgccg 14753073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Original strand, 40098879 - 40099192
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    ||||||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  40098879 ttgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 40098977  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  40098978 catgactgttggtattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 40099077  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||    
T  40099078 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccact 40099177  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| |||||||||    
T  40099178 ggggaaaacgccgtt 40099192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 477 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 5701548 - 5701256
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  5701548 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5701450  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  5701449 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5701350  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5701349 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 5701256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 538 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 39857574 - 39857342
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39857574 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 39857475  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| || ||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  39857474 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaattcttctgtggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggt 39857375  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39857374 atgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 39857342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 476 - 762
Target Start/End: Original strand, 15379482 - 15379776
Alignment:
Q  476 attgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaat 575  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||| || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||    
T  15379482 attgacattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatagtttt-attaaatgtatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaacgcttgtaat 15379580  T
Q  576 gcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------ga 666  Q
    ||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |        ||    
T  15379581 gcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggaatattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttgga 15379680  T
Q  667 agtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15379681 aatcctctttggatataacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 15379776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Original strand, 36323643 - 36323894
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36323643 gtaatgtgcatgattatgcatgcatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagaatattgg 36323742  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||      
T  36323743 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggc 36323842  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  36323843 atgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 36323894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Original strand, 36337852 - 36338103
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36337852 gtaatgtgcatgattatgcatgcatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagaatattgg 36337951  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||      
T  36337952 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggc 36338051  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  36338052 atgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 36338103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 538 - 756
Target Start/End: Original strand, 18793949 - 18794175
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18793949 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 18794048  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  18794049 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 18794148  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttg 756  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||    
T  18794149 atgtaacttgctggggatagagtcttg 18794175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 538 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 5012841 - 5012593
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5012841 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcgtgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtgttgg 5012742  T
Q  638 g-cacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    | ||||||||||||||||||| || | |        ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||     
T  5012741 ggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacggctgagggcaggtagg 5012642  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataac 777  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5012641 tatgcaacttgctggggatagaatcttgagagacccgactggggataac 5012593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 478 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 15234838 - 15234526
Alignment:
Q  478 tgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgc 577  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| | ||  |  |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  15234838 tgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgggcacatggtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15234740  T
Q  578 atgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 668  Q
    ||||| || |  || ||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  15234739 atgattgtgggcagcttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 15234640  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||    
T  15234639 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctgct 15234540  T
Q  769 ggggataacgccgt 782  Q
    |||||||| |||||    
T  15234539 ggggataatgccgt 15234526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 539 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 1907227 - 1906975
Alignment:
Q  539 taatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgg 637  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||    
T  1907227 taatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggtagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgg 1907128  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| || | |        ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  1907127 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagct 1907028  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 782  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||| |||||    
T  1907027 atgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctactggggataatgccgt 1906975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 471 - 762
Target Start/End: Original strand, 15275865 - 15276164
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||| || | |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15275865 ctgaaattgacattggaaatgcaacatgtataggtggtataatagtttt-attaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 15275963  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata----- 664  Q
    | |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |         
T  15275964 gtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattc 15276063  T
Q  665 ---gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaaga 761  Q
       ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15276064 ttggaaatcctctttggagataacgttgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgacttgctggggacagaatctcggaaga 15276163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 477 - 782
Target Start/End: Original strand, 24585616 - 24585929
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  24585616 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 24585714  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  24585715 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 24585814  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  24585815 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 24585914  T
Q  768 tggggataacgccgt 782  Q
    |||| |||| |||||    
T  24585915 tgggaataatgccgt 24585929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 24119601 - 24119349
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24119601 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 24119502  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctacatcata---------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    |||||||||||||||||||| || | |          || |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||   |||     
T  24119501 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaaaatcctctttggagatgacatcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccagtaga 24119402  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  24119401 tatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 24119349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Original strand, 33667107 - 33667360
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  33667107 gtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 33667206  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || |    
T  33667207 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggt 33667306  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  33667307 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 33667360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 538 - 782
Target Start/End: Original strand, 34182263 - 34182515
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34182263 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcaattcgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 34182362  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||| ||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | |||||    
T  34182363 gcacatagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtagct 34182462  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 782  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| |||| |||||    
T  34182463 atgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctactgggaataatgccgt 34182515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 14105503 - 14105250
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  || |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14105503 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtgggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 14105404  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| || | |        ||  |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||  | ||| |    
T  14105403 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggtcggtaggt 14105304  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| |||||||||    
T  14105303 atgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccactggggaaaacgccgtt 14105250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 30760723 - 30760470
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  30760723 gtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 30760624  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || |    
T  30760623 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctttttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggt 30760524  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  30760523 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 30760470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 477 - 657
Target Start/End: Original strand, 24814547 - 24814726
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  24814547 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 24814645  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 657  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24814646 catgactgttggcattttgtaggcacgactttacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 24814726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 17019989 - 17019737
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   | ||| | || |||||||||| | |||| |||    
T  17019989 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttg 17019890  T
Q  637 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    |||||| |||||||||||||| || | |        ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  17019889 ggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagt 17019790  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  17019789 tatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 17019737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 616 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 14671871 - 14671717
Alignment:
Q  616 agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaa 707  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || | |        ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  14671871 agacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaa 14671772  T
Q  708 ccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14671771 ccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 14671717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 24813078 - 24813226
Alignment:
Q  135 gggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggaga-ttgaaataagaatttgaaactgacttgacgtcatct 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || ||| |||  ||  ||  || |||||||||||| ||     
T  24813078 gggacaagctgttcttggattgaactagccacttatccaaacatggatggaaatcactggggatttgtaatggga--ttagaattgacttgacgtcgtcc 24813175  T
Q  234 tagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacag 284  Q
    |  |||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  24813176 tgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggataacag 24813226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 12 - 289
Target Start/End: Original strand, 13178078 - 13178355
Alignment:
Q  12 gatggacatcactggggatttgtaatgggattagaattgacttgacgtcgtcctgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggata 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13178078 gatggaaatcactggggatttgtaatgggattagaattgacttgacgtcgtcctgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggata 13178177  T
Q  112 acagaggtagaagtaagttgactgggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13178178 acagaggtagaagtaagttgactgggacaagctgttcttgaactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatt 13178277  T
Q  212 tgaaactgacttgacgtcatcttagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13178278 tgaaactgacttgacatcatcttagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 13178355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 471 - 657
Target Start/End: Original strand, 13178638 - 13178824
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13178638 ctgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgatt 13178737  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 657  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13178738 gaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 13178824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Original strand, 15752004 - 15752317
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  15752004 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 15752102  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  15752103 catgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 15752202  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752203 tcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgact 15752302  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| |||||||||    
T  15752303 ggggaaaacgccgtt 15752317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 30036441 - 30036128
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  30036441 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 30036343  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  30036342 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 30036243  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30036242 tcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgact 30036143  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| |||||||||    
T  30036142 ggggaaaacgccgtt 30036128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 33523399 - 33523086
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  33523399 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 33523301  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  33523300 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 33523201  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33523200 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 33523101  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| |||||||||    
T  33523100 ggggaaaacgccgtt 33523086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 6881248 - 6880995
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6881248 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 6881149  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  6881148 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggt 6881049  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||    
T  6881048 atgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataacgccgtt 6880995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 471 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 33882127 - 33881808
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  33882127 ctgatattgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 33882029  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 662  Q
    | |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  33882028 gtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 33881929  T
Q  663 tagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33881928 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 33881829  T
Q  763 ccgactggggataacgccgtt 783  Q
    | ||||||||| || ||||||    
T  33881828 ctgactggggaaaatgccgtt 33881808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Original strand, 31819627 - 31819880
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31819627 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 31819726  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||| ||||||||| ||||| || | |        ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  31819727 gcacatagtggctcatgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggt 31819826  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31819827 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgtt 31819880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Original strand, 9543934 - 9544185
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9543934 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 9544033  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9544034 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggt 9544133  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    |  ||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  9544134 atgcaactcgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 9544185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 540 - 783
Target Start/End: Original strand, 40466757 - 40467008
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40466757 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 40466856  T
Q  640 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 731  Q
    |||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  40466857 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 40466956  T
Q  732 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  40466957 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 40467008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Original strand, 37351810 - 37352123
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||   || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  37351810 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgttataacagttcc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 37351908  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  37351909 catgactgttggcatttggtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 37352008  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||   |||    
T  37352009 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgagagactttact 37352108  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    |||||||| ||||||    
T  37352109 ggggataatgccgtt 37352123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Original strand, 18493914 - 18494227
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| | ||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  18493914 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 18494012  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     ||||   || | |||     
T  18494013 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 18494112  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||     
T  18494113 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggccagtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctacc 18494212  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| |||||||||    
T  18494213 ggggaaaacgccgtt 18494227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 478 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 22895422 - 22895118
Alignment:
Q  478 tgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgc 577  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  22895422 tgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgcaatgc 22895324  T
Q  578 atgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 668  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  22895323 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagtcattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 22895224  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  22895223 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 22895124  T
Q  769 ggggat 774  Q
    ||||||    
T  22895123 ggggat 22895118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Original strand, 28953001 - 28953254
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28953001 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattggagtattgg 28953100  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctacat--cata------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||       || |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28953101 gcacgtagtggctcgtgctatattacatattcttgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagct 28953200  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  || ||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||| |||||||||    
T  28953201 atgcatcttgctggggacagaatctcggaagactttactggggaaaacgccgtt 28953254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 43085262 - 43084956
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  43085262 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 43085164  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca-tcatagaagtcctctt 675  Q
    |||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || | ||| ||||||     
T  43085163 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattcttggaaatcctctc 43085064  T
Q  676 tggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggata 775  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| | || ||||| |    
T  43085063 tggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaa 43084964  T
Q  776 acgccgtt 783  Q
    ||||||||    
T  43084963 acgccgtt 43084956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 2518000 - 2517749
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2518000 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 2517901  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || |    
T  2517900 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtaccggagccacggctgagggcaggcaggt 2517801  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||    
T  2517800 atgcaacttgctggagatagaatcttgaaagactttactggggataatgccg 2517749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 9324419 - 9324165
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9324419 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 9324320  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  9324319 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaact 9324220  T
Q  730 aatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  9324219 aaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 9324165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 26487329 - 26487075
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26487329 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 26487230  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  26487229 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaact 26487130  T
Q  730 aatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  26487129 aaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 26487075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 538 - 756
Target Start/End: Original strand, 37745555 - 37745781
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  37745555 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaaaacaagacatcagagtattgg 37745654  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    ||||||||||||||||||||        | || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  37745655 gcacgtagtggctcgtgctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagct 37745754  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttg 756  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  37745755 atgcaactcgctggggatagaatcttg 37745781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Original strand, 32589481 - 32589734
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  32589481 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgatcgttggcagtttgtaggcacgacttcgcgggaaagacaagacattggagtattgg 32589580  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  32589581 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagat 32589680  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  32589681 atacaacttgctggagatagaatcttgggagacctgactggggagaacgccgtt 32589734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 536 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 12139119 - 12138864
Alignment:
Q  536 atgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtatt 635  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12139119 atgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtatt 12139020  T
Q  636 gggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatag 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||    
T  12139019 gggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcag 12138920  T
Q  728 ctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
     ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  12138919 gtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 12138864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Original strand, 15651967 - 15652218
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15651967 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 15652066  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| | | |||||||||||||  || ||||| |||||||||||| |||||    
T  15652067 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgatgtcgttgggagacgtgtcgaaaccaaggctgagggcaggtagct 15652166  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    |  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  15652167 atgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 15652218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 538 - 776
Target Start/End: Original strand, 18121639 - 18121886
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagaca-ttagagtattg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18121639 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcaccgggaagacaagacatttagagtattg 18121738  T
Q  637 ggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||        | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||    
T  18121739 ggcacgtagtggctcgtgctatatcacgcattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaaggctgagggcaggtagc 18121838  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 776  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| ||||    
T  18121839 tatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataa 18121886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 30159035 - 30158722
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  30159035 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 30158937  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  30158936 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggagaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 30158837  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||  || ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  30158836 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgaggataggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacttgact 30158737  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| || ||||||    
T  30158736 ggggaaaatgccgtt 30158722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 3796488 - 3796235
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3796488 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagcattgg 3796389  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || |    
T  3796388 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggt 3796289  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  3796288 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 3796235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 37761929 - 37761676
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  37761929 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagatatcagaatattgg 37761830  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  37761829 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagct 37761730  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
       ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  37761729 gtgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 37761676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 540 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 11330587 - 11330336
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11330587 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 11330488  T
Q  640 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 731  Q
    |||||| ||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||     
T  11330487 acgtagcggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtat 11330388  T
Q  732 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
      ||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||| || ||||||    
T  11330387 gtaacttgctggggatagagtcttgagagacctgactggggaaaatgccgtt 11330336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 478 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 25207304 - 25206998
Alignment:
Q  478 tgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgc 577  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  25207304 tgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-atcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 25207206  T
Q  578 atgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||   ||||| | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        || | | |     
T  25207205 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctgggaa 25207106  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  25207105 tcctctttggagataacgtcgtcgggagacgtatcagaaccagggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 25207006  T
Q  769 ggggataa 776  Q
    | ||||||    
T  25207005 gaggataa 25206998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 478 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 25271460 - 25271154
Alignment:
Q  478 tgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgc 577  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  25271460 tgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-atcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 25271362  T
Q  578 atgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||   ||||| | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        || | | |     
T  25271361 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctgggaa 25271262  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  25271261 tcctctttggagataacgtcgtcgggagacgtatcagaaccagggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 25271162  T
Q  769 ggggataa 776  Q
    | ||||||    
T  25271161 gaggataa 25271154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 31438392 - 31438141
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31438392 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 31438293  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  |    
T  31438292 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaagt 31438193  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||    
T  31438192 atgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccg 31438141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 471 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 24730970 - 24730653
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    |||| |||| ||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24730970 ctgatattgttattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 24730872  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 662  Q
    | |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |        ||     
T  24730871 gtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggcccgtgctatattacacattct 24730772  T
Q  663 tagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    | ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  24730771 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatagaatcttgagagac 24730672  T
Q  763 ccgactggggataacgccg 781  Q
       ||||||||||| ||||    
T  24730671 tttactggggataatgccg 24730653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 477 - 762
Target Start/End: Original strand, 8658639 - 8658931
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  8658639 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 8658737  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  8658738 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 8658837  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  8658838 tcctctttggagatgacgtcgctgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggaaatagaatctcggaagac 8658931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 34623454 - 34623201
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34623454 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 34623355  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| ||| |    
T  34623354 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgggggcaggtaggt 34623255  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  34623254 atgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 34623201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 5644755 - 5644502
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5644755 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 5644656  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  5644655 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagat 5644556  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||  || |||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  5644555 atgcaacttgctgtagacagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 5644502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 471 - 783
Target Start/End: Original strand, 13317966 - 13318285
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    |||| |||| ||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13317966 ctgatattgttattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 13318064  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 662  Q
    | |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  13318065 gtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 13318164  T
Q  663 tagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13318165 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 13318264  T
Q  763 ccgactggggataacgccgtt 783  Q
       |||||||| |||||||||    
T  13318265 tttactggggaaaacgccgtt 13318285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 28656200 - 28655947
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28656200 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 28656101  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    ||||||||||||||||||     ||||   || | ||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||  || |||||||||||| ||| |    
T  28656100 gcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcttctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagtcaaggctgagggcaggtaggt 28656001  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  || |||||||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  28656000 atgcaccttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 28655947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 471 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 30175489 - 30175170
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    |||| |||||||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || ||| || |||||||  |||||||||||||| ||    
T  30175489 ctgatattgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtattacgcatgattgtgcatgtatgaatgctt 30175391  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 662  Q
    | |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  30175390 gtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 30175291  T
Q  663 tagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    | ||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || |    
T  30175290 tggaaatcttctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggc 30175191  T
Q  763 ccgactggggataacgccgtt 783  Q
     | |||||||| |||||||||    
T  30175190 tccactggggaaaacgccgtt 30175170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Original strand, 37664710 - 37664961
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37664710 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacgttagagtattgg 37664809  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||  |  || |    
T  37664810 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccaaggctgagggtgggcaggt 37664909  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||| |||||   |||||||| |||||||    
T  37664910 atgcaacttgctggagatagaatcttgaaagactttactggggaaaacgccg 37664961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Original strand, 13435875 - 13436128
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13435875 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 13435974  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||| | || ||| |||||||||| | ||| |    
T  13435975 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcattgggagacgtatcagagccaaggctgagggctggtaggt 13436074  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  13436075 atgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 13436128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Original strand, 18368736 - 18368989
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18368736 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 18368835  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| || | |        ||  | |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  18368836 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggagattctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 18368935  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |   |||||||||||||||||  ||||  |||| | |||||||| |||||||||    
T  18368936 atgtaacttgctggggatagagccttgagagactccactggggaaaacgccgtt 18368989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 23727233 - 23726921
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  23727233 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 23727135  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  || |  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  23727134 catgactgtcggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 23727035  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  23727034 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 23726935  T
Q  768 tggggataacgccg 781  Q
    |||| |||| ||||    
T  23726934 tgggaataatgccg 23726921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 477 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 23898892 - 23898578
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  |||| ||| || | || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  23898892 ttgacattgaaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-atcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtacgaatgcttgtaatg 23898794  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
     ||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | |        |||    
T  23898793 tatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaa 23898694  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccga 766  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||| | |    
T  23898693 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgcttggggatagaatctcggaagactcta 23898594  T
Q  767 ctggggataacgccgt 782  Q
    |||||||||| |||||    
T  23898593 ctggggataatgccgt 23898578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 538 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 41681638 - 41681408
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||     || ||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41681638 gtaatatgcgtgattatgcatgtatgaatgt----aacgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagtcattagagtattgg 41681543  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctacat----cat------agaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatag 727  Q
    |||||||||||||||||||| ||    |||      | || |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||     
T  41681542 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatgactgagggcaggtaa 41681443  T
Q  728 ctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41681442 ctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 41681408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 477 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 11556350 - 11556043
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  11556350 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 11556252  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaa 667  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |        | |||    
T  11556251 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacgcattcctggaa 11556152  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| | ||    
T  11556151 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctac 11556052  T
Q  768 tggggataa 776  Q
    |||| ||||    
T  11556051 tgggaataa 11556043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 538 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 23632906 - 23632659
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   | ||| | || |||||||||| | |||| |||    
T  23632906 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttg 23632807  T
Q  637 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    ||||||  ||||||||||||| || | |        ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23632806 ggcacgcggtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagc 23632707  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 776  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  23632706 tatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataa 23632659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 477 - 776
Target Start/End: Original strand, 22992286 - 22992593
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  22992286 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatg 22992384  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  22992385 catgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 22992484  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  22992485 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 22992584  T
Q  768 tggggataa 776  Q
    |||| ||||    
T  22992585 tgggaataa 22992593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 33784478 - 33784166
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  33784478 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 33784380  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaa 667  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |        | |||    
T  33784379 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacgcattcctggaa 33784280  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||   | ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  33784279 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaagttgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 33784180  T
Q  768 tggggataacgccg 781  Q
    |||| |||| ||||    
T  33784179 tgggaataatgccg 33784166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 477 - 748
Target Start/End: Original strand, 13179962 - 13180241
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  13179962 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 13180060  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||  | |||||||||||   ||| | | || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  13180061 catgactgttggcattttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaa 13180160  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggata 748  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||    
T  13180161 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggata 13180241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 33299472 - 33299220
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  33299472 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 33299373  T
Q  637 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |        ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  ||| |||||| | ||||    
T  33299372 ggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggcggagggccggtagc 33299273  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    ||  |||||||||||||||||||| | || |||| | |||||| |||| ||||    
T  33299272 tatgcaacttgctggggatagaatatcgggagactctactgggaataatgccg 33299220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 24976840 - 24976528
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  24976840 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 24976742  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttca-cgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------ga 666  Q
    |||||  ||||    ||||||||||| | |||  | | || |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| || | |        ||    
T  24976741 catgactgttggcgatttgtagacac-agttctgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctgga 24976643  T
Q  667 agtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 766  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  24976642 aatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactcta 24976543  T
Q  767 ctggggataacgccg 781  Q
    ||||| |||| ||||    
T  24976542 ctgggaataatgccg 24976528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 24609181 - 24608929
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||    |||||||||||   | | | | || |||||||||| | ||||||||    
T  24609181 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattg 24609082  T
Q  637 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    |||||||| |||||||||||| || | |        ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  24609081 ggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagt 24608982  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  24608981 tatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 24608929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 30941566 - 30941314
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   | | ||| || |||||||||| | ||||||||    
T  30941566 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcggagacagacaagacactggagtattg 30941467  T
Q  637 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    |||||  |||||||||||||| || | |        ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  30941466 ggcacacagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagc 30941367  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  30941366 tatgcaacttgctgaggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 30941314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 13178033 - 13178181
Alignment:
Q  135 gggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggaga-ttgaaataagaatttgaaactgacttgacgtcatct 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || ||| |||  ||  ||  || |||||||||||| ||     
T  13178033 gggacaagctgttcttggattgaactagccacttatccaaacatggatggaaatcactggggatttgtaatggga--ttagaattgacttgacgtcgtcc 13178130  T
Q  234 tagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacag 284  Q
    |  |||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  13178131 tgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggataacag 13178181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 12 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3791149 - 3790872
Alignment:
Q  12 gatggacatcactggggatttgtaatgggattagaattgacttgacgtcgtcctgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcacaggata 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3791149 gatggaaatcactggggatttgtaatgggattagaattgacttgacgtcgtcctgatttgaaaggtagcaattggccaaactgcaccggctcataggata 3791050  T
Q  112 acagaggtagaagtaagttgactgggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3791049 acagaggtagaagtaagttgactgggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatt 3790950  T
Q  212 tgaaactgacttgacgtcatcttagtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3790949 tgaaactgacttgacgtcatcttagtttgaaaggtggaacctggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 3790872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 471 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 3790659 - 3790473
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3790659 ctgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgatt 3790560  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 657  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3790559 gaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 3790473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Original strand, 13929845 - 13930158
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  13929845 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 13929943  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  13929944 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 13930043  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  13930044 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggagatagaatcttgggagacctgact 13930143  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| |||||||||    
T  13930144 ggggagaacgccgtt 13930158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Original strand, 19409718 - 19410031
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  19409718 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 19409816  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  19409817 catgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 19409916  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19409917 tcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagaccccact 19410016  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| |||||||||    
T  19410017 ggggaaaacgccgtt 19410031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 37932385 - 37932072
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| ||   || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  37932385 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 37932287  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  37932286 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 37932187  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37932186 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgact 37932087  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| |||||||||    
T  37932086 ggggaaaacgccgtt 37932072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 3789391 - 3789138
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3789391 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 3789292  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  3789291 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtagct 3789192  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3789191 atgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgtt 3789138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Original strand, 16822572 - 16822885
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  16822572 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 16822670  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  16822671 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16822770  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16822771 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 16822870  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| |||||||||    
T  16822871 ggggaaaacgccgtt 16822885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 16898908 - 16898595
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  16898908 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 16898810  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  16898809 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16898710  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16898709 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 16898610  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| |||||||||    
T  16898609 ggggaaaacgccgtt 16898595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 32056760 - 32056447
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  32056760 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 32056662  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  32056661 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 32056562  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32056561 tcctctttggagatgacgtcgttgggagatgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 32056462  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| |||||||||    
T  32056461 ggggaaaacgccgtt 32056447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Original strand, 37679132 - 37679445
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  37679132 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 37679230  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 668  Q
    |||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||      
T  37679231 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 37679330  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37679331 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 37679430  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| || ||||||    
T  37679431 ggggaaaatgccgtt 37679445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Original strand, 37694397 - 37694710
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  37694397 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 37694495  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 668  Q
    |||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||      
T  37694496 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 37694595  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37694596 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 37694695  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| || ||||||    
T  37694696 ggggaaaatgccgtt 37694710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 471 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 27397350 - 27397031
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  27397350 ctgaaattgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagtttt-attaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 27397252  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata----- 664  Q
    | |||||||||  ||||  |||||||||||||   |||   | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |         
T  27397251 gtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgtagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattc 27397152  T
Q  665 ---gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaaga 761  Q
       ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27397151 ttggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaga 27397052  T
Q  762 cccgactggggataacgccgt 782  Q
    | |  |||||||||| |||||    
T  27397051 ctccgctggggataatgccgt 27397031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 540 - 783
Target Start/End: Original strand, 253948 - 254199
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  253948 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 254047  T
Q  640 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 731  Q
    |||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  254048 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 254147  T
Q  732 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  254148 acaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 254199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 540 - 783
Target Start/End: Original strand, 21670469 - 21670720
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 639  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21670469 aatatgcatgcttatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 21670568  T
Q  640 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 731  Q
    |||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  21670569 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 21670668  T
Q  732 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  21670669 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaacgccgtt 21670720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 542 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 34298093 - 34297856
Alignment:
Q  542 tatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcac 641  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34298093 tatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcac 34297994  T
Q  642 gtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatc 733  Q
    |||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |    
T  34297993 gtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgc 34297894  T
Q  734 aacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 771  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  34297893 aacttgctggggatagaatctcggaagactctactggg 34297856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 478 - 782
Target Start/End: Original strand, 21696423 - 21696735
Alignment:
Q  478 tgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgc 577  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  21696423 tgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 21696521  T
Q  578 atgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaag 668  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | |||     
T  21696522 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcaatattacacattcctggaaa 21696621  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | | |||    
T  21696622 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctact 21696721  T
Q  769 ggggataacgccgt 782  Q
    |||||||| |||||    
T  21696722 ggggataatgccgt 21696735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 540 - 783
Target Start/End: Original strand, 9343283 - 9343534
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9343283 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 9343382  T
Q  640 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 731  Q
    |||||||| ||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  9343383 acgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 9343482  T
Q  732 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  9343483 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 9343534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 540 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 16168424 - 16168173
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16168424 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 16168325  T
Q  640 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 731  Q
    |||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  16168324 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 16168225  T
Q  732 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  16168224 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 16168173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 540 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 27810649 - 27810398
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 639  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27810649 aataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 27810550  T
Q  640 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 731  Q
    |||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  27810549 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 27810450  T
Q  732 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  27810449 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 27810398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 540 - 783
Target Start/End: Original strand, 39045178 - 39045430
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045178 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 39045277  T
Q  640 acgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 731  Q
    ||||||||||||||||     ||||   || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  39045278 acgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 39045377  T
Q  732 tcaac-ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  39045378 gcaactttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 39045430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 39897077 - 39896764
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||    
T  39897077 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatg 39896979  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  39896978 catgactgttggcattttgtaggcgcgacttcacggggaagacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 39896879  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  39896878 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttggaagactttact 39896779  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| |||||||||    
T  39896778 ggggaaaacgccgtt 39896764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 12593762 - 12593509
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||  || |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12593762 gtaatacgcatgattatgcatgtatgaatgcctgtaatgcatgactgttgacagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 12593663  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgct-------acatcatagaag-tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||       ||||  | | || |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  12593662 gcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 12593563  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  12593562 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 12593509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 471 - 783
Target Start/End: Original strand, 22921372 - 22921691
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22921372 ctgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttt-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 22921470  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 662  Q
    | |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  22921471 gtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 22921570  T
Q  663 tagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || |    
T  22921571 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggc 22921670  T
Q  763 ccgactggggataacgccgtt 783  Q
     | |||||||| |||||||||    
T  22921671 tccactggggaaaacgccgtt 22921691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 538 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 37384603 - 37384371
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37384603 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 37384504  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| || ||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  37384503 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaattcttctgtggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggt 37384404  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37384403 atgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 37384371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 471 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 31883285 - 31882987
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31883285 ctgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 31883187  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 662  Q
    | |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  31883186 gtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 31883087  T
Q  663 tagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31883086 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 31882987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 540 - 783
Target Start/End: Original strand, 37945161 - 37945412
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||   |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945161 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgctggtaatgcatgactattggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 37945260  T
Q  640 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 731  Q
    |||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  37945261 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagatgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 37945360  T
Q  732 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  37945361 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 37945412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 34161789 - 34161536
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161789 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 34161690  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    ||||||||||||||||||     ||||   || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||| | ||| |    
T  34161689 gcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagagccaaggctgagggctggtaggt 34161590  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  34161589 atgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 34161536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 471 - 781
Target Start/End: Original strand, 12709852 - 12710169
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    |||| |||| ||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  12709852 ctgatattgttattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 12709950  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 662  Q
    | |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |        ||     
T  12709951 gtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggcccgtgctatattacacattct 12710050  T
Q  663 tagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    | ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  12710051 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatagaatcttgagagac 12710150  T
Q  763 ccgactggggataacgccg 781  Q
       ||||||||||| ||||    
T  12710151 tttactggggataatgccg 12710169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 538 - 776
Target Start/End: Original strand, 34268216 - 34268463
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  34268216 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 34268315  T
Q  637 ggcacgtagtggctcgtgcta-------cat-catagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    |||||||||||||||||||||       ||| | | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34268316 ggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagc 34268415  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 776  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  34268416 tatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggggataa 34268463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Original strand, 11628479 - 11628732
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11628479 gtaatatgtatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattggagtattgg 11628578  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  11628579 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtaggt 11628678  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  11628679 atgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 11628732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 34868582 - 34868329
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  34868582 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagacacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 34868483  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || |    
T  34868482 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggt 34868383  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  34868382 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 34868329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 538 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 27123448 - 27123216
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27123448 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 27123349  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | |||||    
T  27123348 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagct 27123249  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27123248 atgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 27123216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 540 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 27783169 - 27782918
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27783169 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 27783070  T
Q  640 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 731  Q
    |||||||||||||||||| |        || | ||| |||||| ||||||| | | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||     
T  27783069 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgatgtcgttggtagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtat 27782970  T
Q  732 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
      |||||||||||||||||||||||  |||| | |||||| | |||||||||    
T  27782969 gtaacttgctggggatagaatcttgagagactccactgggaaaaacgccgtt 27782918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 471 - 762
Target Start/End: Original strand, 19449639 - 19449939
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||  ||||||| ||||||| |||| |||| |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  19449639 ctgaaattgacattgaaaatgcaatatacatggatgatataacagtttt-atcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 19449737  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca------- 662  Q
    | || ||||||  ||||  ||||||||||||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||           
T  19449738 gtaacgcatgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctatatcacacattc 19449837  T
Q  663 -tagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaag 760  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19449838 ttagaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaag 19449937  T
Q  761 ac 762  Q
    ||    
T  19449938 ac 19449939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 538 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 40240471 - 40240245
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40240471 gtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacgttagagtattgg 40240372  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgct-------acatcatagaag-tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||       ||||  | | || |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  40240371 gcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 40240272  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttg 756  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||    
T  40240271 atgtaacttgctggggatagagtcttg 40240245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 23117723 - 23117471
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga-tggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtatt 635  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||  | |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||    
T  23117723 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgtttgcga-tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt 23117625  T
Q  636 gggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatag 727  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |        ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  23117624 gggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggaggcgtatcggaaccatggctgagggcaggtag 23117525  T
Q  728 ctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  23117524 ctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 23117471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 533 - 762
Target Start/End: Original strand, 27427761 - 27428000
Alignment:
Q  533 gacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagag 631  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   | | | | || |||||||||| | |||    
T  27427761 gacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggag 27427860  T
Q  632 tattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcag 723  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || | |        ||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27427861 tattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcag 27427960  T
Q  724 atagctaat-caacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
     ||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27427961 gtagcttatgcaacttgctggggacagaatctcggaagac 27428000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 482 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 28889236 - 28888929
Alignment:
Q  482 attgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 581  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  28889236 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggtgtgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgttatgcatga 28889138  T
Q  582 tggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcct 672  Q
      ||||    |||||||||||   ||| | | || ||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||| || | |        ||| ||||    
T  28889137 ctgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagatgttggagtattgggcatgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcct 28889038  T
Q  673 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggg 772  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||     
T  28889037 ctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactggga 28888938  T
Q  773 ataacgccg 781  Q
    |||| ||||    
T  28888937 ataatgccg 28888929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Original strand, 31868102 - 31868354
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  31868102 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 31868201  T
Q  637 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |        ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | |||     
T  31868202 ggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagg 31868301  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    ||   |||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  31868302 tatgaaacttgatggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 31868354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 672 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 20844699 - 20844590
Alignment:
Q  672 tctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 771  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  20844699 tctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggg 20844600  T
Q  772 gataacgccg 781  Q
     |||| ||||    
T  20844599 aataatgccg 20844590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 12662418 - 12662165
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||| ||||   | ||| | || |||||||||| | |||| |||    
T  12662418 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtaaacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttg 12662319  T
Q  637 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    |||||| |||||||||||||| || | |        ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||     
T  12662318 ggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagg 12662219  T
Q  729 taatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    ||  |||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  12662218 tatgcaacttgcttgaggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 12662165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3791194 - 3791130
Alignment:
Q  135 gggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagatt 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||    
T  3791194 gggacaagctgttcttggattgaactagccacttatccaaacatggatggaaatcactggggatt 3791130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 20844908 - 20844802
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||  || | ||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  20844908 ctgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgcataggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 20844810  T
Q  571 gaaatgca 578  Q
    | ||||||    
T  20844809 gtaatgca 20844802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 471 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 3452244 - 3451926
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3452244 ctgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgatt 3452145  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 662  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  3452144 gaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacggggaagccaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 3452045  T
Q  663 tagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    | ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3452044 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtaccggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 3451945  T
Q  763 ccgactggggataacgccg 781  Q
     | |||||| |||| ||||    
T  3451944 tctactgggaataatgccg 3451926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 472 - 783
Target Start/End: Original strand, 26268209 - 26268527
Alignment:
Q  472 tgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattg 571  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26268209 tgacatttgtattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattg 26268308  T
Q  572 aaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcat 663  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || |    
T  26268309 aaatgcatgatggttgacagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctt 26268408  T
Q  664 agaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 763  Q
     ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  26268409 ggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgg-acctaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagact 26268507  T
Q  764 cgactggggataacgccgtt 783  Q
      |||||||| |||||||||    
T  26268508 ttactggggaaaacgccgtt 26268527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 488 - 786
Target Start/End: Original strand, 26508848 - 26509154
Alignment:
Q  488 aatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttg 587  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    
T  26508848 aatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatggttgtaatgcatgactgttg 26508946  T
Q  588 atagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttgg 678  Q
      |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |        ||| ||||||||||    
T  26508947 gcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctggaaatcctctttgg 26509046  T
Q  679 agataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacg 778  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509047 agataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaacttgctgggggtagaatcttggaagacccgactggggataacg 26509146  T
Q  779 ccgttatg 786  Q
    ||||||||    
T  26509147 ccgttatg 26509154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 135 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3452655 - 3452501
Alignment:
Q  135 gggacaagctgttcttggactgaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatttgaaactgacttgacgtcatctt 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3452655 gggacaagctgttcttggattgaactagccacttatccaaacatggatggaaatcactggggattgaaataagaatttgaaactgacttgacgtcatctt 3452556  T
Q  235 agtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3452555 agtttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 3452501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Original strand, 26678233 - 26678546
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  26678233 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 26678331  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  26678332 catgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26678431  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26678432 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 26678531  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| || ||||||    
T  26678532 ggggaaaatgccgtt 26678546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Original strand, 26663041 - 26663354
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  26663041 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 26663139  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  26663140 catgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26663239  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26663240 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 26663339  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| || ||||||    
T  26663340 ggggaaaatgccgtt 26663354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 540 - 783
Target Start/End: Original strand, 16744711 - 16744962
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744711 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 16744810  T
Q  640 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 731  Q
    |||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  16744811 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgacggaaccatagctgagggcaggtagatat 16744910  T
Q  732 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  16744911 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 16744962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Original strand, 31083812 - 31084066
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31083812 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 31083911  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  31083912 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagct 31084011  T
Q  730 aatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  31084012 aaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 31084066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 2780230 - 2779919
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  2780230 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 2780132  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  2780131 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 2780032  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  2780031 tcctctttgaagatgacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 2779932  T
Q  769 ggggataacgccg 781  Q
    ||| |||| ||||    
T  2779931 gggaataatgccg 2779919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 471 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 31130909 - 31130616
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    |||| |||| ||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31130909 ctgatattgttattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 31130811  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 662  Q
    | |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  31130810 gtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 31130711  T
Q  663 tagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaacc-atggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 756  Q
    | ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31130710 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccaatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttg 31130616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 26442191 - 26441938
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26442191 gtaatacgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 26442092  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  26442091 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 26441992  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||    
T  26441991 atgcaacttgctggggatagaatcttgagagaccccaccggggaaaacgccgtt 26441938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Original strand, 31557533 - 31557847
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||    
T  31557533 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatg 31557631  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||        | || | |||     
T  31557632 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtagctcgtgctatattacaccttcttggaaa 31557731  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   ||    
T  31557732 tcctctttggagatggcgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtaaacaacttgcttggggatagaatcttggaagactttac 31557831  T
Q  768 tggggataacgccgtt 783  Q
    |||||| |||||||||    
T  31557832 tggggaaaacgccgtt 31557847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Original strand, 26313052 - 26313306
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313052 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcaagacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 26313151  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  26313152 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaact 26313251  T
Q  730 aatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  26313252 aaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 26313306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 26596603 - 26596349
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26596603 gtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 26596504  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaacc-atggctgagggcagatagc 728  Q
    |||||||||||||| ||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| |||     
T  26596503 gcacgtagtggctcatgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaatagctgagggcaggtaga 26596404  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  26596403 tatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 26596349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 4206322 - 4206069
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4206322 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtgttgg 4206223  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  4206222 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgccggaaccatggccgagggcaggtaggt 4206123  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  4206122 atgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 4206069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 45394166 - 45393913
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  45394166 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagaatattgg 45394067  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||| ||||| |        || | | | |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  45394066 gcacgtagtggctcatgctatattacacattcttgggaatcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagct 45393967  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  45393966 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 45393913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 540 - 783
Target Start/End: Original strand, 4138436 - 4138687
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4138436 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 4138535  T
Q  640 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 731  Q
    |||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||  || ||     
T  4138536 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggcaggtat 4138635  T
Q  732 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
     ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  4138636 gcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 4138687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 22148814 - 22148563
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22148814 gtaatgtgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 22148715  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||      
T  22148714 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccctggctgagggcaggtaggc 22148615  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  22148614 atgcaactggctggggataggatctcggaagactctactgggaataatgccg 22148563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 11447835 - 11447582
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  11447835 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 11447736  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || |    
T  11447735 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggt 11447636  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  11447635 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 11447582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 478 - 782
Target Start/End: Original strand, 16443134 - 16443446
Alignment:
Q  478 tgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgc 577  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| | |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  16443134 tgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataa-aagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16443232  T
Q  578 atgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 668  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| || | |        |||     
T  16443233 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcatgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 16443332  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||    
T  16443333 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggagccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctgct 16443432  T
Q  769 ggggataacgccgt 782  Q
    |||||||| |||||    
T  16443433 ggggataatgccgt 16443446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 26519754 - 26519501
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  26519754 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 26519655  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || |    
T  26519654 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggt 26519555  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  26519554 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 26519501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 482 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 16048315 - 16048027
Alignment:
Q  482 attgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 581  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||| | || ||| |||||||||| || |||||||||||| | | |||||||||    
T  16048315 attggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-atcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatacatgtatgaatgctcgtaatgcatga 16048217  T
Q  582 tggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcct 672  Q
      ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||| ||||    
T  16048216 ctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcct 16048117  T
Q  673 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16048116 ctttggagataaagtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 16048027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 138 - 289
Target Start/End: Original strand, 26267899 - 26268050
Alignment:
Q  138 acaagctgttcttggact-gaactagccacttatccgaacatgtatgggaatcactggagattgaaataagaatttgaaactgacttgacgtcatcttag 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| | |    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26267899 acaagctgttcttggacttgaactagccacttgaccgaaca-gaaacatattcactggggattgaaataagaatttgaaactgacttgacgtcatcttag 26267997  T
Q  237 tttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaacaggggtg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26267998 tttgaaaggtggaaactggccaaactgcactggctcacaaggtaataggggtg 26268050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 538 - 762
Target Start/End: Original strand, 39206353 - 39206585
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39206353 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 39206452  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | |||||    
T  39206453 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagct 39206552  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39206553 atgcaacttgctgaggatagaatcttgggagac 39206585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 538 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 45738227 - 45737995
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45738227 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 45738128  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | |||||    
T  45738127 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagct 45738028  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  45738027 atgcaatttgctggggatagaatcttgggagac 45737995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Original strand, 11417931 - 11418243
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  11417931 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 11418029  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaa 667  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |        | |||    
T  11418030 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacgcattcctggaa 11418129  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  11418130 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctac 11418229  T
Q  768 tggggataacgccg 781  Q
    |||| |||| ||||    
T  11418230 tgggaataatgccg 11418243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 5155010 - 5154758
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  5155010 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 5154911  T
Q  637 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |        ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5154910 ggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagc 5154811  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  5154810 tatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 5154758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 540 - 783
Target Start/End: Original strand, 24585726 - 24585978
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagaca-ttagagtattggg 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||  ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24585726 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacggggaagacaagacatttagagtattggg 24585825  T
Q  639 cacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagcta 730  Q
    ||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||| ||    
T  24585826 cacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgaaggcaggtagata 24585925  T
Q  731 atcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
      ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  24585926 tgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 24585978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 538 - 748
Target Start/End: Original strand, 5140526 - 5140744
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5140526 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 5140625  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgct-------acatcatagaag-tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||       ||||  | | || |||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  5140626 gcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcattgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 5140725  T
Q  730 aatcaacttgctggggata 748  Q
    |   |||||||||||||||    
T  5140726 atgtaacttgctggggata 5140744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 590 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 22152989 - 22152790
Alignment:
Q  590 agtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggaga 681  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||    
T  22152989 agtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggaga 22152890  T
Q  682 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  22152889 tgacgtcgttgggagacgtatcggaaccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactctactgggaataatgccg 22152790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 590 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 22208904 - 22208705
Alignment:
Q  590 agtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggaga 681  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||    
T  22208904 agtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggaga 22208805  T
Q  682 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  22208804 tgacgtcgttgggagacgtatcggaaccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactctactgggaataatgccg 22208705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 477 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 10848592 - 10848299
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| || |    
T  10848592 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-atcagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacg 10848494  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |        |||    
T  10848493 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctatatcacacattcttggaa 10848394  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||  | |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10848393 atcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatggctgagggcgggttgctacgcgacttgctggggacagaatctcggaagac 10848299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 471 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 5165377 - 5165059
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5165377 ctgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 5165279  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata----- 664  Q
    | |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |         
T  5165278 gtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattc 5165179  T
Q  665 ---gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaaga 761  Q
       ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  5165178 ctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggaga 5165079  T
Q  762 cccgactggggataacgccg 781  Q
    | | ||| ||||||| ||||    
T  5165078 ctctactagggataatgccg 5165059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 2161558 - 2161247
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  2161558 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 2161460  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||| ||||  || | ||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  2161459 catgattgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 2161360  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  2161359 atcctctttggagacgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcag-tagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 2161261  T
Q  768 tggggataacgccg 781  Q
    |||| |||| ||||    
T  2161260 tgggaataatgccg 2161247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 538 - 782
Target Start/End: Original strand, 16511637 - 16511890
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   | | | | || |||||||||| | ||||||||    
T  16511637 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattg 16511736  T
Q  637 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    |||||||| || ||||||||| || | |        ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  16511737 ggcacgtaatgactcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagt 16511836  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 782  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| |||||    
T  16511837 tatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccgt 16511890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 471 - 781
Target Start/End: Original strand, 10910072 - 10910390
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  10910072 ctgatattgacattggaaatgcaatatgtatgaatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 10910170  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttca-cgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata---- 664  Q
    | |||||| ||  ||||    ||||||||||| | |||| | | || |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || | |        
T  10910171 gtaatgcacgactgttggcgatttgtagacac-agttcagcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacatt 10910269  T
Q  665 ----gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaag 760  Q
        ||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| || ||    
T  10910270 cctggaaatcctctttggagatgacgttgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgaggatagaatctcgggag 10910369  T
Q  761 acccgactggggataacgccg 781  Q
    || | |||||| |||| ||||    
T  10910370 actctactgggaataatgccg 10910390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 24335148 - 24334835
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  24335148 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 24335050  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  24335049 catgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 24334950  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24334949 tcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagaccccact 24334850  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| |||||||||    
T  24334849 ggggaaaacgccgtt 24334835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 471 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 18232170 - 18231851
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18232170 ctgacgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 18232072  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 662  Q
    | |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  18232071 gtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 18231972  T
Q  663 tagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18231971 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagac 18231872  T
Q  763 ccgactggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| ||||| |||||||||    
T  18231871 ccgaccggggaaaacgccgtt 18231851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Original strand, 28109250 - 28109564
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||| | ||||||||||||||| |||  |||    
T  28109250 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtgatg 28109348  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 668  Q
    |||||  |||   ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  28109349 catgactgttagcagtttgtaggcacgacttcaccgggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28109448  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc-gac 767  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  28109449 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggagatagaatcttggaaaaccctgac 28109548  T
Q  768 tggggataacgccgtt 783  Q
    |||||| |||||||||    
T  28109549 tggggaaaacgccgtt 28109564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 10650042 - 10649730
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  10650042 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 10649944  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  10649943 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 10649844  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  10649843 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttggaaga-cttact 10649745  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| |||||||||    
T  10649744 ggggaaaacgccgtt 10649730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Original strand, 17978238 - 17978551
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  17978238 ttgacattggaactgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 17978336  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  17978337 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaaaacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 17978436  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17978437 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 17978536  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| |||||||||    
T  17978537 ggggaaaacgccgtt 17978551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Original strand, 11103731 - 11103982
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11103731 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacggggaagacaagacattagagtattgg 11103830  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  11103831 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggt 11103930  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  11103931 atgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 11103982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 5020683 - 5020370
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  5020683 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5020585  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 668  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  5020584 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaaa 5020485  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||    
T  5020484 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttact 5020385  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| |||||||||    
T  5020384 ggggaaaacgccgtt 5020370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Original strand, 6536090 - 6536343
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  6536090 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagaatattgg 6536189  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6536190 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagct 6536289  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  6536290 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 6536343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 471 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 28346149 - 28345830
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  28346149 ctgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttt-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 28346051  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catca 662  Q
    | |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||     
T  28346050 gtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacaccttct 28345951  T
Q  663 tagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || |    
T  28345950 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggc 28345851  T
Q  763 ccgactggggataacgccgtt 783  Q
     | |||||||| |||||||||    
T  28345850 tccactggggaaaacgccgtt 28345830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 540 - 783
Target Start/End: Original strand, 5589705 - 5589956
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5589705 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 5589804  T
Q  640 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 731  Q
    |||||||| ||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  5589805 acgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtaggtat 5589904  T
Q  732 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  5589905 gcaacttgctagagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 5589956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 540 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 5717965 - 5717714
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5717965 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacggggaaggcaagacattagagtattgggc 5717866  T
Q  640 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 731  Q
    |||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  5717865 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 5717766  T
Q  732 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  5717765 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 5717714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 540 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 5728875 - 5728624
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5728875 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacggggaaggcaagacattagagtattgggc 5728776  T
Q  640 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 731  Q
    |||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  5728775 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 5728676  T
Q  732 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  5728675 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 5728624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 540 - 783
Target Start/End: Original strand, 5763493 - 5763744
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5763493 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacggggaaggcaagacattagagtattgggc 5763592  T
Q  640 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 731  Q
    |||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  5763593 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 5763692  T
Q  732 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  5763693 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 5763744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Original strand, 31029613 - 31029864
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31029613 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggtacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 31029712  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  31029713 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggctgagggcaggtagct 31029812  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  31029813 atgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 31029864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 539 - 781
Target Start/End: Original strand, 4340047 - 4340297
Alignment:
Q  539 taatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattggg 638  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4340047 taatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattggg 4340146  T
Q  639 cacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagcta 730  Q
    ||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||    
T  4340147 cacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggta 4340246  T
Q  731 atcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||    
T  4340247 tgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctactggggataatgccg 4340297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 540 - 783
Target Start/End: Original strand, 29658316 - 29658567
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658316 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcgcgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 29658415  T
Q  640 acgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 731  Q
    ||||||||||||||||     ||||   || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  29658416 acgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgttggaaccatagctgagggcaggtagatat 29658515  T
Q  732 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  29658516 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 29658567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 32446042 - 32445791
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32446042 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 32445943  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    ||||||||||||||||||     ||||   || | ||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  32445942 gcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcctctttggtgatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagct 32445843  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  32445842 atgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 32445791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 477 - 776
Target Start/End: Original strand, 16617776 - 16618084
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16617776 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagtttt-atcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgaaatg 16617874  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaa 667  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||        | |||    
T  16617875 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctcgtgctatatcacacattcttggaa 16617974  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 766  Q
     ||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |      
T  16617975 atcctctttggagatatcgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactccg 16618074  T
Q  767 ctggggataa 776  Q
    ||||||||||    
T  16618075 ctggggataa 16618084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Original strand, 18285666 - 18285977
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||    
T  18285666 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatg 18285764  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  18285765 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 18285864  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  18285865 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 18285964  T
Q  769 ggggataacgccg 781  Q
    ||| |||| ||||    
T  18285965 gggaataatgccg 18285977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Original strand, 18300967 - 18301278
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||    
T  18300967 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatg 18301065  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  18301066 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 18301165  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  18301166 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 18301265  T
Q  769 ggggataacgccg 781  Q
    ||| |||| ||||    
T  18301266 gggaataatgccg 18301278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 477 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 22041381 - 22041087
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22041381 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagtttt-atcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgaaatg 22041283  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaa 667  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||        | |||    
T  22041282 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctcgtgctatatcacacattcttggaa 22041183  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
     ||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22041182 atcctctttggagatatcgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 22041087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 4630671 - 4630420
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4630671 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 4630572  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    ||||||||||||||||||     ||||   || | ||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||    
T  4630571 gcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcctctttggtgatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcatgtagct 4630472  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  4630471 atgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 4630420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 32297603 - 32297290
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  32297603 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 32297505  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 668  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||      
T  32297504 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 32297405  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32297404 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgcaactcgctggagatagaatcttggaagacctgact 32297305  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| || ||||||    
T  32297304 ggggaaaatgccgtt 32297290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Original strand, 22864211 - 22864464
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  22864211 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcatggggaagacaagacgtcagagtattgg 22864310  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22864311 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggt 22864410  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||    
T  22864411 atgcaacttgctggggatagaatcttgggagactttactggggaaaacgccgtt 22864464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Original strand, 22879270 - 22879523
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  22879270 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcatggggaagacaagacgtcagagtattgg 22879369  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22879370 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggt 22879469  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||    
T  22879470 atgcaacttgctggggatagaatcttgggagactttactggggaaaacgccgtt 22879523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 540 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 47030366 - 47030114
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  47030366 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagaatattgggc 47030267  T
Q  640 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 731  Q
    |||||||||||||||||| |        || | ||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  47030266 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcaggtagctat 47030167  T
Q  732 tcaac-ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
     |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  47030166 gcaactttgctggagatagaatcttggaagactccactggggaaaacgccgtt 47030114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 4423808 - 4423557
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4423808 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttataggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 4423709  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |    
T  4423708 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggt 4423609  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||    
T  4423608 atgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccg 4423557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Original strand, 17970227 - 17970481
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970227 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcactttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 17970326  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| || ||    
T  17970327 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacatattggaaccatggctgagggcaggtaact 17970426  T
Q  730 aatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  17970427 aaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 17970481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 477 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 18249690 - 18249377
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  18249690 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 18249592  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  18249591 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 18249492  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| | ||     
T  18249491 tcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccacc 18249392  T
Q  769 ggggataacgccgtt 783  Q
    ||||| |||||||||    
T  18249391 ggggaaaacgccgtt 18249377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Original strand, 5602660 - 5602913
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5602660 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 5602759  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  5602760 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagat 5602859  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  5602860 atgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 5602913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Original strand, 20570203 - 20570456
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20570203 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggggagacaagacattagagtattgg 20570302  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| | | ||| |    
T  20570303 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgaggaccggtaggt 20570402  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |   |||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||| |||||||||    
T  20570403 atgtaacttgctggggatagaatcttgagagactccactggggaaaacgccgtt 20570456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 471 - 756
Target Start/End: Original strand, 31957737 - 31958029
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31957737 ctgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttt-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 31957835  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 662  Q
    | |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  31957836 gtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 31957935  T
Q  663 tagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 756  Q
    | ||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  31957936 tggaaatcctctttggagatgacgttgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttg 31958029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 553 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 5473864 - 5473628
Alignment:
Q  553 atgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcg 652  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5473864 atgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcg 5473765  T
Q  653 tgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggg 744  Q
    ||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||    
T  5473764 tgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggg 5473665  T
Q  745 gatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  5473664 gatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 5473628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Original strand, 16404139 - 16404392
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16404139 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 16404238  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| ||| |    
T  16404239 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggt 16404338  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  |||||  || ||||| |||||||||    
T  16404339 atgcaacttgctggggatagaatcttgagagacctcaccggggaaaacgccgtt 16404392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 10403064 - 10402811
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10403064 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 10402965  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgct-------acatcatagaag-tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||       ||||  | | || |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||| | ||| |    
T  10402964 gcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgggggccggtaggt 10402865  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||  |||||| || ||||| |||||||||    
T  10402864 atgtaacttgctggggatagagtcttgagagaccccaccggggaaaacgccgtt 10402811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 538 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 48472822 - 48472590
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48472822 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 48472723  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | |||||    
T  48472722 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagct 48472623  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48472622 atgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 48472590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 477 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 15368217 - 15367903
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  15368217 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-atcagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 15368119  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |        |||    
T  15368118 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcccagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctacatcacacattcttggaa 15368019  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 766  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |      
T  15368018 atcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatggttgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctg 15367919  T
Q  767 ctggggataacgccgt 782  Q
    |||||||||| |||||    
T  15367918 ctggggataatgccgt 15367903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 477 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 19701368 - 19701055
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  |||| ||| || | | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  19701368 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-atcaaatgcatgggcttgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 19701270  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
     ||||  ||||  |||||||||||||   ||| |   || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  19701269 tatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcatagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaa 19701170  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  19701169 atcttctttggagataacgccattgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatacaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 19701070  T
Q  768 tggggataacgccgt 782  Q
    ||||||||| |||||    
T  19701069 tggggataatgccgt 19701055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 538 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 21681632 - 21681406
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21681632 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 21681533  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| || | |        ||  |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  21681532 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 21681433  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttg 756  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||    
T  21681432 atgtaacttgctggggatagagtcttg 21681406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 51788934 - 51788681
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  51788934 gtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 51788835  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || |    
T  51788834 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggt 51788735  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  51788734 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 51788681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 538 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 20072925 - 20072693
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20072925 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacatcacggggaagacaagacatcagagtattgg 20072826  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | |||||    
T  20072825 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagct 20072726  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20072725 atgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 20072693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 28028183 - 28027930
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28028183 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacggggaagacaagacattagagtaatgg 28028084  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    ||| ||||||||||||||||||        || | ||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||| |    
T  28028083 gcaagtagtggctcgtgctacattacacattcttggaaatcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtaggt 28027984  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||| |||||||||    
T  28027983 atgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggaaaacgccgtt 28027930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Original strand, 29142063 - 29142375
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| ||| |||||||| ||| ||| ||||||| |||  || | |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  29142063 ttgacattggaaacgcaacatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 29142161  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  29142162 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaa 29142261  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  29142262 atcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 29142361  T
Q  768 tggggataacgccg 781  Q
    |||| |||| ||||    
T  29142362 tgggaataatgccg 29142375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 35887711 - 35887399
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  35887711 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 35887613  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcataga--------a 667  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||   ||| | | || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || | | |        |    
T  35887612 catgactgttgacagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaa 35887513  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| | ||    
T  35887512 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctac 35887413  T
Q  768 tggggataacgccg 781  Q
    |||| |||| ||||    
T  35887412 tgggaataatgccg 35887399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 4728577 - 4728265
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  4728577 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatg 4728479  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  4728478 catgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 4728379  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  4728378 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctac 4728279  T
Q  768 tggggataacgccg 781  Q
    |||| |||| ||||    
T  4728278 tgggaataatgccg 4728265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 5659085 - 5658773
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  5659085 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5658987  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||  || | ||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  5658986 catgactgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacaccttcctggaa 5658887  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  5658886 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 5658787  T
Q  768 tggggataacgccg 781  Q
    |||| |||| ||||    
T  5658786 tgggaataatgccg 5658773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 6208846 - 6208534
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  6208846 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatg 6208748  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  6208747 catgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 6208648  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  6208647 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctac 6208548  T
Q  768 tggggataacgccg 781  Q
    |||| |||| ||||    
T  6208547 tgggaataatgccg 6208534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 8218537 - 8218284
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  8218537 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaacgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaaggcgttagagtattgg 8218438  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||| ||||||||||||| |        || | ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  8218437 gcacgtggtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 8218338  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |   |||||||||| |||||| |||||  |||| | |||||||| |||||||||    
T  8218337 atgtaacttgctggagatagagtcttgagagactccactggggaaaacgccgtt 8218284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 18058219 - 18057907
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  18058219 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 18058121  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  18058120 catgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 18058021  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  18058020 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 18057921  T
Q  768 tggggataacgccg 781  Q
    |||| |||| ||||    
T  18057920 tgggaataatgccg 18057907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Original strand, 4789940 - 4790252
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  4789940 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 4790038  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | |        |||    
T  4790039 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaa 4790138  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||||||||| |||| | ||    
T  4790139 atcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctaaggatagaatcttgggagactctac 4790238  T
Q  768 tggggataacgccg 781  Q
    |||| |||| ||||    
T  4790239 tgggaataatgccg 4790252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 477 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 16423158 - 16422845
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    ||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  16423158 ttgatatcggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attatatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 16423060  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||   ||||||||||||   | | | | || ||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||| || | |        |||    
T  16423059 catgactgttggcggtttgtagacacagttccgcagagacagacaaggcactggagtattgggtacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaa 16422960  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||    
T  16422959 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgcaggggatagaatctcggaagactctac 16422860  T
Q  768 tggggataacgccgt 782  Q
    ||||||||| |||||    
T  16422859 tggggataatgccgt 16422845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 477 - 776
Target Start/End: Original strand, 8282769 - 8283076
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  8282769 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 8282867  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   | | | | || |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| || | |        |||    
T  8282868 catgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaa 8282967  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  8282968 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 8283067  T
Q  768 tggggataa 776  Q
    |||| ||||    
T  8283068 tgggtataa 8283076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 538 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 16599525 - 16599406
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16599525 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 16599426  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgcta 657  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16599425 gcacgtagtggctcgtgcta 16599406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 477 - 782
Target Start/End: Original strand, 15886026 - 15886339
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  15886026 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 15886124  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||    ||||||||||    | | | | || |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || | |        |||    
T  15886125 catgactgttggcgatttgtagacatagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaa 15886224  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  15886225 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatctcggaagactctac 15886324  T
Q  768 tggggataacgccgt 782  Q
    |||| |||| |||||    
T  15886325 tgggaataatgccgt 15886339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 477 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 7080201 - 7080022
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  7080201 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 7080103  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 657  Q
    |||||  ||||  | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7080102 catgaccgttggcaattcgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 7080022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 477 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 18337575 - 18337268
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| || ||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||    
T  18337575 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatacaacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatg 18337477  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||    ||||||||||    ||| | | || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||        |||    
T  18337476 catgactgttggcgatttgtagacatagtttcgcagagacagacaggacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattatactttcctggaa 18337377  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  18337376 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccctggctgagggcaggtagctacgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctac 18337277  T
Q  768 tggggataa 776  Q
    |||| ||||    
T  18337276 tgggaataa 18337268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Original strand, 22380949 - 22381201
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||  ||||    ||||||||||    ||| | | || ||||| |||||| ||||||||    
T  22380949 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacatagtttcgcagagacagacaggacattggagtattg 22381048  T
Q  637 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||        ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22381049 ggcacgtagtggctcgtgctatattatactttcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagc 22381148  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  22381149 tatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 22381201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 477 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 4690626 - 4690313
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  4690626 ttgatattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 4690528  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||    |||||||||||   | | | | || |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| || | |        |||    
T  4690527 catgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 4690428  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  4690427 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 4690328  T
Q  768 tggggataacgccgt 782  Q
    |||| |||| |||||    
T  4690327 tgggaataatgccgt 4690313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 477 - 754
Target Start/End: Original strand, 15734425 - 15734710
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| |||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||  ||| ||||    
T  15734425 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcataggcacataatatgcatgactatgcatgtatgaattcttgtaatg 15734523  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||    |||||||||||   |||   | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  15734524 catgactgttggcgatttgtagacacagtttcgtagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 15734623  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatct 754  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15734624 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggttgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 15734710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 680 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 7079968 - 7079867
Alignment:
Q  680 gataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgc 779  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||    
T  7079968 gataacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgc 7079869  T
Q  780 cg 781  Q
    ||    
T  7079868 cg 7079867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 482 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 51645229 - 51644921
Alignment:
Q  482 attgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 581  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  51645229 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 51645131  T
Q  582 tggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctc 673  Q
      ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||    
T  51645130 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctc 51645031  T
Q  674 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 773  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||    
T  51645030 tttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactgggga 51644931  T
Q  774 taacgccgtt 783  Q
     |||||||||    
T  51644930 aaacgccgtt 51644921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 10952044 - 10951791
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10952044 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacggggaagacaagacattagagtattgg 10951945  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||    
T  10951944 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacggctgagggcaggtagct 10951845  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  10951844 aaacaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 10951791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 540 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 10969593 - 10969344
Alignment:
Q  540 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 639  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10969593 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 10969494  T
Q  640 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 731  Q
    |||||||| ||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  10969493 acgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtat 10969394  T
Q  732 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
     | ||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||    
T  10969393 gccacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccg 10969344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 3648099 - 3647846
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3648099 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 3648000  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgct-------acatcatagaag-tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||       ||||  | | || |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  3647999 gcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggt 3647900  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  3647899 atgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 3647846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 28592033 - 28591780
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28592033 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagaatattgg 28591934  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  28591933 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggctggtaggt 28591834  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |   |||||||| |||||||| |||||  |||| | |||||||| |||||||||    
T  28591833 atgtaacttgctagggatagagtcttgagagactccactggggaaaacgccgtt 28591780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 477 - 776
Target Start/End: Original strand, 16201276 - 16201583
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  16201276 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-atcaaatgtatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 16201374  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |        |||    
T  16201375 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcatgctatattacacattcctggaa 16201474  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||    
T  16201475 atcctctttggagataacaccgttgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctgggggtagaatctcggaagactctac 16201574  T
Q  768 tggggataa 776  Q
    |||||||||    
T  16201575 tggggataa 16201583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Original strand, 41786640 - 41786891
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41786640 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacgtcagagtattgg 41786739  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |    
T  41786740 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggctgagggcaggcaggt 41786839  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||    
T  41786840 atgcaacttgctggagatagaatcttgaaagactttactggggataatgccg 41786891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 538 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 28156657 - 28156425
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28156657 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 28156558  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | |||||    
T  28156557 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagct 28156458  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28156457 atgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 28156425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 482 - 776
Target Start/End: Original strand, 20333667 - 20333969
Alignment:
Q  482 attgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 581  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20333667 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 20333765  T
Q  582 tggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcct 672  Q
      ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||| ||||    
T  20333766 ctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 20333865  T
Q  673 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggg 772  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||    
T  20333866 ctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctgggg 20333965  T
Q  773 ataa 776  Q
    ||||    
T  20333966 ataa 20333969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Original strand, 14692162 - 14692474
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  14692162 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 14692260  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    ||||   ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  14692261 catggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 14692360  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  14692361 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 14692460  T
Q  768 tggggataacgccg 781  Q
    |||| |||| ||||    
T  14692461 tgggaataatgccg 14692474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Original strand, 14694844 - 14695156
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  14694844 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 14694942  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    ||||   ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  14694943 catggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 14695042  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  14695043 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 14695142  T
Q  768 tggggataacgccg 781  Q
    |||| |||| ||||    
T  14695143 tgggaataatgccg 14695156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Original strand, 14697528 - 14697840
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  14697528 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 14697626  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    ||||   ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  14697627 catggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 14697726  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  14697727 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 14697826  T
Q  768 tggggataacgccg 781  Q
    |||| |||| ||||    
T  14697827 tgggaataatgccg 14697840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 477 - 771
Target Start/End: Original strand, 14700209 - 14700511
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  14700209 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 14700307  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    ||||   ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  14700308 catggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 14700407  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  14700408 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 14700507  T
Q  768 tggg 771  Q
    ||||    
T  14700508 tggg 14700511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 482 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 20467792 - 20467484
Alignment:
Q  482 attgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 581  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20467792 attggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 20467694  T
Q  582 tggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcct 672  Q
      ||||  || ||||||||||   |||   | || ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || | |        ||| ||||    
T  20467693 ctgttggcagcttgtagacaccgtttcgtagagacagacaaggcattggagtattggccacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcct 20467594  T
Q  673 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggg 772  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||    
T  20467593 ctttggagataacgtcgttgggagacatatcggaaccatggctgagggtaggtagctatgtaacttgctggggatagaatctcggaagactctgctgggg 20467494  T
Q  773 ataacgccgt 782  Q
    |||| |||||    
T  20467493 ataatgccgt 20467484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 618 - 782
Target Start/End: Original strand, 21891136 - 21891308
Alignment:
Q  618 acaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaacc 709  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || | |        ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  21891136 acaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaacc 21891235  T
Q  710 atggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 782  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| |||||    
T  21891236 atggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccgt 21891308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 573 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 13769631 - 13769558
Alignment:
Q  573 aatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagt 646  Q
    |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13769631 aatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaatacattagagtattgggcacgtagt 13769558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 538 - 786
Target Start/End: Complemental strand, 14892 - 14636
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14892 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 14793  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14792 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagct 14693  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatg 786  Q
    |  |||||||||||  || |||||| ||||| |   |||||||| ||||||||||||    
T  14692 atacaacttgctggaaattgaatctcggaaggctttactggggaaaacgccgttatg 14636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 487 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 28293 - 27992
Alignment:
Q  487 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  28293 aaatgcaacatgtatggatggtataacagtttt-attaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 28195  T
Q  587 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta-----cat-catagaagtcctctttgga 679  Q
    |  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     ||| | | ||| |||||||||||    
T  28194 ggcagtttgtagacacagtttcgctgagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgttatatcacacattcttggaaatcctctttgga 28095  T
Q  680 gataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgc 779  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||    
T  28094 gataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatataacttgctggggatagaatctcggaagactccgctggggataatgc 27995  T
Q  780 cgt 782  Q
    |||    
T  27994 cgt 27992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 2607 - 2354
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2607 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagcattgg 2508  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||| |    
T  2507 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgttgttgggagacgtgtcggaaccaaagctgagggcaggtagat 2408  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  2407 atacaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 2354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 477 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 13062 - 12769
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| || ||||||| |||| |||| |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  13062 ttgacattggaaatgcaatatgcatgggtgatataacagtttt-atcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 12964  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
     ||||  ||||  |||| ||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |        |||    
T  12963 tatgactgttggcagttagtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacatccctggaa 12864  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||   |||||| || ||||||||||| |||||||    
T  12863 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggccgagggcaggtagctatgaaacttgttgcggatagaatctcggaagac 12769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 477 - 762
Target Start/End: Original strand, 8187 - 8479
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  8187 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 8285  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  8286 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 8385  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 762  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8386 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 108; Significance: 8e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 13026 - 12715
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  13026 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 12928  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaag 668  Q
    |||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  12927 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 12828  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| | |||    
T  12827 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctact 12728  T
Q  769 ggggataacgccg 781  Q
    ||| |||| ||||    
T  12727 gggaataatgccg 12715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 10869 - 10615
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10869 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaagcacgacttcacagggaagacaagacattagaatattgg 10770  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca---------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    |||||||||||||||||||| |         || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  10769 gcacgtagtggctcgtgctatattacacatttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgaggacaggtagc 10670  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    ||  |||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  10669 tatgcaacttgctggaaatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 10615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 477 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 34283 - 33971
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  34283 ttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 34185  T
Q  577 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 667  Q
    |||||  ||||    |||||||||||   | ||| | || |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| || | |        |||    
T  34184 catgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaa 34085  T
Q  668 gtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 767  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||| | ||    
T  34084 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgaggatagaatctcgggagactctac 33985  T
Q  768 tggggataacgccg 781  Q
    |||| |||| ||||    
T  33984 tgggaataatgccg 33971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 105; Significance: 5e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Original strand, 2483 - 2736
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2483 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 2582  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  2583 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagat 2682  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  2683 atgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 2736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 706 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 18582 - 18505
Alignment:
Q  706 aaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  18582 aaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 18505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 471 - 762
Target Start/End: Original strand, 25809 - 26108
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    |||| ||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||| | |||| |||| |||||| | ||  || |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  25809 ctgaaattgacattggaaatgaaagatgtatgggtggtataatagtttt-atcaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 25907  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata----- 664  Q
    | |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || | |||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||| |         
T  25908 gtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacacacaaaacattggactattgggcacgtagtggctcatgctatatcacacattc 26007  T
Q  665 ---gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaaga 761  Q
       ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26008 ttggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaagcaacttgctggggaaagaatctcggaaga 26107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 478 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 782 - 467
Alignment:
Q  478 tgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgc 577  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| | ||  |  |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  782 tgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgggcactttgtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 684  T
Q  578 atgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaag 668  Q
    ||||| || |  || ||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || | |        |||     
T  683 atgattgtgggcagcttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtgtctcgtgctatattacacattcccggaaa 584  T
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 768  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| |  ||    
T  583 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcagaaccatggttgagggcaggtagctatgcaacctgctggggatagaatctcggaagactctgct 484  T
Q  769 ggggataacgccgttat 785  Q
    |||||||| ||||||||    
T  483 ggggataatgccgttat 467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 538 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 16526 - 16273
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 637  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16526 gtaatatgcatgattgtgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaaaacatcagagtattgg 16427  T
Q  638 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 729  Q
    ||||||||||||||||| || |        || | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  16426 gcacgtagtggctcgtgttatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 16327  T
Q  730 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 783  Q
    |   |||| |||||||||||| |||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  16326 atgtaactggctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 16273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 471 - 781
Target Start/End: Original strand, 24213 - 24531
Alignment:
Q  471 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 570  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||| || | ||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24213 ctgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcatgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 24311  T
Q  571 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata----- 664  Q
    | |||||| ||  | ||    ||||||||| |   | | ||| || |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || | |         
T  24312 gtaatgcacgactgctggcgatttgtagacgcagttccgcggagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattc 24411  T
Q  665 ---gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaaga 761  Q
       ||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24412 ctggaaattctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaga 24511  T
Q  762 cccgactggggataacgccg 781  Q
    | | |||||| |||| ||||    
T  24512 ctctactgggaataatgccg 24531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 538 - 781
Target Start/End: Original strand, 3921 - 4173
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  3921 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 4020  T
Q  637 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    |||||| |||||||||||||| || | |        ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  4021 ggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcttggacatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctaagggcaggtagc 4120  T
Q  729 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  4121 tatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 4173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 68; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 538 - 776
Target Start/End: Original strand, 8966 - 9214
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 636  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  8966 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 9065  T
Q  637 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaagtcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 728  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |        ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  9066 ggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggacatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagc 9165  T
Q  729 taatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 776  Q
     |  |||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  9166 catgcaacttgcttgaggatagaatctcggaagactctactgggaataa 9214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 669 - 781
Target Start/End: Original strand, 40067 - 40181
Alignment:
Q  669 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctga-gggcagatagctaat-caacttgctggggatagaatcttggaagacccga 766  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  40067 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgaggggcaggtagttaatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactcta 40166  T
Q  767 ctggggataacgccg 781  Q
    ||||| |||| ||||    
T  40167 ctgggaataatgccg 40181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 538 - 581
Target Start/End: Original strand, 39922 - 39965
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 581  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39922 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 39965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 715 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 6807 - 6741
Alignment:
Q  715 tgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 781  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  6807 tgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 6741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0685 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0685
Description:

Target: scaffold0685; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 477 - 581
Target Start/End: Original strand, 1309 - 1412
Alignment:
Q  477 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 576  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  1309 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 1407  T
Q  577 catga 581  Q
    |||||    
T  1408 catga 1412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 538 - 581
Target Start/End: Original strand, 13281 - 13324
Alignment:
Q  538 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 581  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13281 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 13324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University