View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8253_low_13 (Length: 387)

Name: NF8253_low_13
Description: NF8253
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8253_low_13
NF8253_low_13
[»] chr5 (42 HSPs)
chr5 (1-359)||(32269611-32269969)
chr5 (12-358)||(35310384-35310730)
chr5 (12-359)||(15291851-15292197)
chr5 (18-357)||(13166741-13167080)
chr5 (18-355)||(27336634-27336969)
chr5 (58-357)||(33691926-33692224)
chr5 (145-359)||(37873596-37873810)
chr5 (12-349)||(26212407-26212745)
chr5 (26-292)||(43129536-43129801)
chr5 (61-340)||(14423639-14423912)
chr5 (18-357)||(34335274-34335613)
chr5 (189-355)||(42921637-42921802)
chr5 (166-359)||(25663011-25663204)
chr5 (58-287)||(35455963-35456192)
chr5 (219-358)||(22188687-22188826)
chr5 (194-357)||(38875576-38875738)
chr5 (210-359)||(430537-430686)
chr5 (23-256)||(3114000-3114232)
chr5 (18-215)||(433371-433568)
chr5 (110-337)||(8100509-8100736)
chr5 (88-291)||(43115359-43115561)
chr5 (286-359)||(2566194-2566267)
chr5 (212-315)||(14723269-14723372)
chr5 (18-173)||(38446287-38446442)
chr5 (169-267)||(32230489-32230587)
chr5 (298-357)||(23023532-23023591)
chr5 (86-241)||(8858969-8859124)
chr5 (228-329)||(41343479-41343581)
chr5 (261-345)||(27294387-27294471)
chr5 (145-329)||(7716146-7716328)
chr5 (12-125)||(9841151-9841265)
chr5 (264-359)||(15809984-15810077)
chr5 (230-359)||(15832997-15833123)
chr5 (298-355)||(24113514-24113571)
chr5 (166-242)||(9829333-9829407)
chr5 (77-125)||(27355606-27355654)
chr5 (296-359)||(15506724-15506787)
chr5 (190-244)||(13307406-13307460)
chr5 (194-256)||(16017212-16017274)
chr5 (236-354)||(23423920-23424038)
chr5 (190-243)||(26577403-26577456)
chr5 (296-336)||(16017131-16017171)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (12-352)||(4412891-4413231)
chr2 (12-359)||(41867733-41868080)
chr2 (13-359)||(19161609-19161955)
chr2 (18-359)||(17344573-17344914)
chr2 (12-352)||(9685240-9685580)
chr2 (12-354)||(18744779-18745121)
chr2 (22-354)||(28224940-28225272)
chr2 (20-355)||(23484771-23485104)
chr2 (18-357)||(27502299-27502637)
chr2 (12-337)||(20142565-20142875)
chr2 (18-354)||(3825666-3826003)
chr2 (13-355)||(5532360-5532700)
chr2 (85-359)||(44686351-44686628)
chr2 (237-354)||(13413291-13413408)
chr2 (26-357)||(16351678-16352014)
chr2 (186-336)||(34814818-34814967)
chr2 (57-347)||(2888463-2888749)
chr2 (204-359)||(2886632-2886786)
chr2 (78-357)||(7760737-7761015)
chr2 (77-353)||(33612437-33612711)
chr2 (186-357)||(13147096-13147270)
chr2 (35-193)||(9674945-9675103)
chr2 (139-357)||(32029039-32029256)
chr2 (70-355)||(29808014-29808296)
chr2 (58-125)||(10579650-10579717)
chr2 (22-125)||(13146969-13147072)
chr2 (195-355)||(11921218-11921372)
chr2 (163-238)||(1296026-1296101)
chr2 (180-250)||(3968402-3968472)
chr2 (304-358)||(20142871-20142924)
chr2 (284-354)||(44684955-44685025)
chr2 (56-243)||(44720374-44720559)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (12-352)||(19277235-19277575)
chr7 (20-359)||(4501194-4501532)
chr7 (12-359)||(982884-983231)
chr7 (12-359)||(45613667-45614014)
chr7 (58-359)||(21326709-21327010)
chr7 (41-359)||(27521406-27521722)
chr7 (12-359)||(24527524-24527872)
chr7 (19-358)||(43856810-43857149)
chr7 (86-357)||(22197924-22198194)
chr7 (86-357)||(22239627-22239897)
chr7 (18-359)||(28517118-28517459)
chr7 (20-359)||(5825208-5825545)
chr7 (82-355)||(32584539-32584813)
chr7 (12-256)||(3676677-3676922)
chr7 (214-359)||(48539116-48539261)
chr7 (169-359)||(30216040-30216230)
chr7 (131-352)||(25186880-25187096)
chr7 (96-357)||(34772719-34772977)
chr7 (67-355)||(10905057-10905332)
chr7 (179-357)||(42295176-42295354)
chr7 (185-359)||(40726478-40726652)
chr7 (232-359)||(5972261-5972388)
chr7 (217-354)||(6634993-6635130)
chr7 (252-357)||(41117835-41117940)
chr7 (153-311)||(9281098-9281255)
chr7 (153-311)||(9292069-9292226)
chr7 (167-311)||(2904348-2904492)
chr7 (199-355)||(23792951-23793107)
chr7 (199-290)||(47679129-47679220)
chr7 (278-352)||(44525927-44526001)
chr7 (172-357)||(36558853-36559037)
chr7 (271-359)||(23037480-23037568)
chr7 (180-255)||(7637505-7637579)
chr7 (319-359)||(27027762-27027802)
chr7 (208-315)||(10032192-10032299)
chr7 (74-125)||(47679294-47679345)
chr7 (264-354)||(5714980-5715069)
chr7 (12-114)||(38596635-38596737)
chr7 (318-355)||(45974730-45974767)
chr7 (28-281)||(38839337-38839592)
chr7 (298-354)||(43333941-43333997)
chr7 (309-357)||(45003019-45003067)
chr7 (234-292)||(45424755-45424813)
chr7 (194-226)||(34067869-34067901)
[»] chr3 (39 HSPs)
chr3 (2-359)||(53785644-53786003)
chr3 (12-340)||(52741336-52741665)
chr3 (18-353)||(44198708-44199043)
chr3 (20-359)||(39583062-39583401)
chr3 (12-359)||(49017902-49018245)
chr3 (12-357)||(13582447-13582793)
chr3 (38-354)||(37132851-37133166)
chr3 (153-359)||(26772693-26772899)
chr3 (81-357)||(38145993-38146269)
chr3 (188-359)||(32546730-32546901)
chr3 (56-354)||(54508254-54508551)
chr3 (18-355)||(7900797-7901128)
chr3 (131-357)||(3443256-3443482)
chr3 (18-353)||(37992274-37992608)
chr3 (190-359)||(26856765-26856934)
chr3 (56-359)||(5338581-5338885)
chr3 (138-357)||(38978750-38978969)
chr3 (57-357)||(7501881-7502180)
chr3 (192-359)||(38670885-38671052)
chr3 (192-347)||(51234563-51234718)
chr3 (199-355)||(52411903-52412059)
chr3 (85-357)||(25324966-25325241)
chr3 (146-357)||(46940729-46940943)
chr3 (169-358)||(4472998-4473186)
chr3 (270-349)||(44781-44860)
chr3 (195-355)||(21552603-21552766)
chr3 (23-117)||(29861974-29862068)
chr3 (282-359)||(4763888-4763964)
chr3 (147-354)||(43123085-43123292)
chr3 (247-357)||(25094632-25094742)
chr3 (35-250)||(35484540-35484755)
chr3 (319-357)||(4669795-4669833)
chr3 (292-353)||(3643092-3643153)
chr3 (87-183)||(35236317-35236413)
chr3 (238-357)||(42206004-42206124)
chr3 (286-357)||(7257655-7257726)
chr3 (295-357)||(46320025-46320087)
chr3 (236-293)||(3376790-3376847)
chr3 (193-250)||(13772493-13772550)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (12-355)||(24124967-24125310)
chr8 (22-315)||(500207-500499)
chr8 (61-359)||(38815229-38815517)
chr8 (18-359)||(39434602-39434943)
chr8 (18-336)||(35739818-35740135)
chr8 (19-355)||(25021646-25021982)
chr8 (56-358)||(3187906-3188207)
chr8 (169-358)||(6592512-6592700)
chr8 (58-250)||(10189587-10189779)
chr8 (169-358)||(6618221-6618409)
chr8 (217-359)||(37514156-37514298)
chr8 (195-356)||(28196130-28196291)
chr8 (163-355)||(4699810-4699999)
chr8 (67-354)||(8115752-8116038)
chr8 (22-225)||(37517163-37517366)
chr8 (163-358)||(4073470-4073666)
chr8 (245-359)||(22589395-22589508)
chr8 (69-357)||(8540260-8540550)
chr8 (179-283)||(8882339-8882442)
chr8 (264-359)||(3821159-3821254)
chr8 (25-256)||(42921965-42922196)
chr8 (252-359)||(18804548-18804654)
chr8 (230-356)||(43823927-43824053)
chr8 (57-293)||(8619815-8620045)
chr8 (186-359)||(121722-121893)
chr8 (272-357)||(9259377-9259462)
chr8 (264-325)||(40223480-40223541)
chr8 (69-118)||(40839727-40839776)
chr8 (228-359)||(3863249-3863383)
chr8 (319-359)||(8882279-8882319)
chr8 (309-357)||(24451057-24451105)
chr8 (186-347)||(39671170-39671332)
chr8 (186-347)||(36004069-36004230)
chr8 (195-321)||(6120938-6121064)
chr8 (264-357)||(3825572-3825665)
chr8 (272-359)||(5329687-5329774)
chr8 (58-218)||(11611120-11611275)
chr8 (309-359)||(42659162-42659212)
chr8 (15-108)||(39671015-39671108)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (18-357)||(34644503-34644842)
chr1 (12-334)||(29169619-29169940)
chr1 (12-350)||(28040952-28041290)
chr1 (27-359)||(45659487-45659818)
chr1 (57-359)||(4861859-4862161)
chr1 (12-276)||(19035465-19035729)
chr1 (84-359)||(22346830-22347103)
chr1 (38-354)||(20259649-20259964)
chr1 (87-357)||(2764416-2764686)
chr1 (56-359)||(2898637-2898929)
chr1 (194-348)||(21472949-21473103)
chr1 (131-359)||(31737267-31737494)
chr1 (202-359)||(24177526-24177683)
chr1 (199-358)||(38731545-38731704)
chr1 (21-340)||(37932052-37932370)
chr1 (28-359)||(50161258-50161596)
chr1 (57-322)||(42919832-42920096)
chr1 (28-256)||(25375674-25375902)
chr1 (230-357)||(7213187-7213314)
chr1 (230-356)||(18616196-18616322)
chr1 (185-355)||(50314622-50314791)
chr1 (230-358)||(47459618-47459746)
chr1 (145-293)||(16500035-16500183)
chr1 (297-344)||(868513-868560)
chr1 (180-237)||(35387653-35387710)
chr1 (12-160)||(38731714-38731862)
chr1 (154-248)||(37200028-37200122)
chr1 (319-359)||(30688492-30688532)
chr1 (186-274)||(36486906-36486994)
chr1 (296-355)||(11128363-11128422)
chr1 (18-49)||(22347122-22347153)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (26-359)||(33185-33519)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (41-359)||(959516-959833)
chr6 (20-359)||(4206429-4206768)
chr6 (18-359)||(34304431-34304772)
chr6 (18-329)||(45500-45819)
chr6 (28-357)||(33220552-33220881)
chr6 (18-357)||(357548-357886)
chr6 (81-359)||(17249199-17249477)
chr6 (20-355)||(29337916-29338247)
chr6 (1-210)||(32115773-32115984)
chr6 (12-241)||(12401384-12401613)
chr6 (67-326)||(34415404-34415663)
chr6 (185-359)||(4165920-4166094)
chr6 (79-359)||(34554169-34554448)
chr6 (195-356)||(28625869-28626030)
chr6 (79-357)||(24016274-24016551)
chr6 (57-257)||(28543412-28543612)
chr6 (103-355)||(28008903-28009155)
chr6 (278-357)||(32115655-32115734)
chr6 (153-249)||(34168913-34169009)
chr6 (305-359)||(3137365-3137419)
chr6 (169-353)||(3714858-3715042)
chr6 (191-357)||(13398186-13398352)
chr6 (186-289)||(6225077-6225180)
chr6 (210-359)||(26225602-26225751)
chr6 (279-355)||(7200627-7200703)
chr6 (20-124)||(20693434-20693537)
[»] scaffold1768 (1 HSPs)
scaffold1768 (12-359)||(9-356)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (85-349)||(6279-6542)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (18-357)||(50000756-50001096)
chr4 (21-359)||(25504230-25504566)
chr4 (12-352)||(30940564-30940897)
chr4 (58-358)||(53619522-53619822)
chr4 (60-359)||(26521424-26521722)
chr4 (19-358)||(56461939-56462277)
chr4 (15-290)||(12918200-12918475)
chr4 (12-359)||(53170447-53170783)
chr4 (28-357)||(55933303-55933630)
chr4 (153-357)||(600658-600862)
chr4 (24-355)||(132324-132657)
chr4 (167-359)||(34107674-34107868)
chr4 (18-293)||(31847088-31847363)
chr4 (12-275)||(12053432-12053693)
chr4 (264-359)||(16955395-16955490)
chr4 (213-357)||(3329933-3330077)
chr4 (72-220)||(1041386-1041533)
chr4 (202-311)||(50483211-50483320)
chr4 (12-267)||(16957569-16957818)
chr4 (232-359)||(38535614-38535741)
chr4 (152-344)||(45386026-45386218)
chr4 (18-125)||(3330119-3330226)
chr4 (209-355)||(7536593-7536739)
chr4 (170-359)||(23255648-23255828)
chr4 (265-357)||(4419200-4419292)
chr4 (179-343)||(46440881-46441045)
chr4 (131-331)||(50462890-50463090)
chr4 (92-357)||(46391220-46391482)
chr4 (166-357)||(48656889-48657085)
chr4 (195-352)||(6865828-6865984)
chr4 (57-312)||(53098403-53098643)
chr4 (18-120)||(25706683-25706785)
chr4 (15-100)||(6865641-6865726)
chr4 (186-354)||(28739845-28740014)
chr4 (239-355)||(54190903-54191019)
chr4 (272-358)||(42455692-42455778)
chr4 (279-359)||(39001332-39001412)
chr4 (230-316)||(747812-747898)
chr4 (299-357)||(18981651-18981708)
chr4 (75-125)||(54927625-54927675)
chr4 (32-124)||(9815706-9815797)
chr4 (209-293)||(11562899-11562983)
chr4 (230-316)||(712636-712722)
chr4 (58-108)||(18534586-18534636)
chr4 (189-315)||(43849350-43849476)
chr4 (286-359)||(45661626-45661699)
chr4 (278-359)||(50464387-50464468)
chr4 (277-355)||(34213559-34213636)
chr4 (53-207)||(38535452-38535606)
chr4 (296-357)||(23242837-23242898)
chr4 (296-352)||(32312820-32312876)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (134-359)||(103041-103265)
[»] scaffold0470 (1 HSPs)
scaffold0470 (169-358)||(7539-7727)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (24-281)||(47376-47633)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (157-358)||(49351-49548)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (57-322)||(18235-18499)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (16-99)||(19916-19999)
scaffold0186 (156-290)||(10364-10502)
[»] scaffold0493 (1 HSPs)
scaffold0493 (78-280)||(8407-8609)
[»] scaffold0119 (1 HSPs)
scaffold0119 (145-237)||(16191-16283)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 42)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 32269611 - 32269969
Alignment:
Q  1 ggcgcatgtgattcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32269611 ggcgcatgtgattcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaaatctgcagatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgt 32269710  T
Q  101 agacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacat 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  32269711 agacttgactggggtttcaccacttctggaattaggtgtcgggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagctgcatcaaccaaagtggtcaaacat 32269810  T
Q  201 gagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32269811 gagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgatttcctagcactagaggttgttgaccttctgcatgaagttc 32269910  T
Q  301 aaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32269911 aaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 32269969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 35310730 - 35310384
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35310730 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacacttaggcttgcggatgttatgatgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtggacttgattg 35310631  T
Q  112 gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtg 211  Q
    |||||||||||||| | |  ||||| ||| || |||||| |||||||||  |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||    
T  35310630 gggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggggcttttacggtaggacagacaaccctaaaagatgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcatg 35310531  T
Q  212 ttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||  || || ||| |||||| |||| |||||||||||  ||| |||| |||  ||    
T  35310530 ttctgacaatcaacatgcttttataccatctgcttttgacactttcggcttcctggcatcagaggctgttaaccttctacatagagtccaaagggttttg 35310431  T
Q  312 catagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgag 358  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35310430 catatcaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgag 35310384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 15291851 - 15292197
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  15291851 ttcccaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcgaatgttatggtgtacggctgggtaggaggaaaacatgtttgtgtagacttgaatg 15291950  T
Q  112 gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtg 211  Q
     ||||||||||||| | | |||| ||||| ||||||||  |||| ||||  ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||  |||    
T  15291951 aggtttcaccacttgttggattaagtgtcgggccttttgcggtatgacagacaaccctaaaagtggcgtcaaacaaagtggccaaacatgagaaaacgtg 15292050  T
Q  212 ttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatg 311  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| | |||||   ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  15292051 ttctgacaatcaacatgtttttatacaatttgttttttacacttttagttttctagcactagaggttattgatcttctaca-aaagttcaaaaggtcatg 15292149  T
Q  312 catagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15292150 catagcaatgtcacatctcctaggtccatgaatgttgtgtttatgagg 15292197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Original strand, 13166741 - 13167080
Alignment:
Q  18 actgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggttt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |   ||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  13166741 actgacccactagatagaagatcgacacttaagcatgcggatgttatggtctacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtggacttgactggg-ttt 13166839  T
Q  118 caccacttctagaatt-aggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctg 216  Q
    |||||||| | || || | | || ||| |||||| ||| |||||  |||||||||||  || ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  13166840 caccacttgtggattttatgggttagggcttttacggtgggacagacaaccctaaaatctgcgtcaagcaaagtggctaaacatgagaaagcgtgttctg 13166939  T
Q  217 acaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatag 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||| |||||  ||||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||||||    
T  13166940 acaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggcttcctagcatcagagactgttgaccttctacatagagtccaaagggttatgcatag 13167039  T
Q  317 cgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13167040 caatggtatgtctcctaggtccatgaatgttgggtttacga 13167080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27336969 - 27336634
Alignment:
Q  18 actgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggttt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27336969 actgacccactagatagaagatcgacacttaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtggacttgactggggttt 27336870  T
Q  118 caccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctga 217  Q
    |||||||| | |  ||||| ||  || ||||||   |||||||  || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27336869 caccacttgtgggtttaggggtgggggcttttacaataggacagacagccctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaatcgtgttctga 27336770  T
Q  218 caatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagc 317  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||  |  || |||||| ||||||  |||||||||||||||  ||   ||| ||| ||| |||||    
T  27336769 caatcaacatacttttataccatttgcttttgacacttgtggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacat--agagaaaatggttatgtatagc 27336672  T
Q  318 gatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
     |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27336671 aatgttatgtctcctaagtccatgaatgttgtttttac 27336634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 357
Target Start/End: Original strand, 33691926 - 33692224
Alignment:
Q  58 atgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtagg 157  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| | |  ||||| ||| || |||||| ||||||    
T  33691926 atgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtggacttgactgaggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggggcttttacggtagg 33692025  T
Q  158 acatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttc 257  Q
    ||| |||  |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  33692026 acaggcaggcctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgacaaaacgtgttatgacaatcaacatgcttttgtaccatttgcttttgacactttc 33692125  T
Q  258 gattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    |  ||  ||||| |||||  ||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||| | |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  33692126 ggcttcttagcatcagagactgttgaccttctacatagtgtccaaagggt-atgcataacaatgttatgtctcataggttcatgaatgttctgtttacga 33692224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 145 - 359
Target Start/End: Original strand, 37873596 - 37873810
Alignment:
Q  145 cttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgc 244  Q
    |||||| |||||||||  || | |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  37873596 cttttacggtaggacagacagctctaaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgc 37873695  T
Q  245 ttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaat 344  Q
    |||||| ||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | | |||||||| || ||||||| ||||||    
T  37873696 ttttgacacttttggcttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgcagaacaatgtcatgacttctaggtctatgaat 37873795  T
Q  345 gttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||||||| ||||    
T  37873796 gttgtgtttaagagg 37873810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 349
Target Start/End: Original strand, 26212407 - 26212745
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaaca-tgcatgtgtagacttgatt 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||| | |||||||||||| |||| |    
T  26212407 ttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcatgcagatgtgatggtgtacgggtggctaggtggaaaaaaatgcatgtgtagatttgact 26212506  T
Q  111 ggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgt 210  Q
    ||||||||| ||||| |   |||||||||  | |||||||| || |||   |||   |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  26212507 ggggtttcatcacttgtgagattaggtgttggaccttttatcgttggaatggcagttctaaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgt 26212606  T
Q  211 gttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcat 310  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |  |||||  |||  |||||||||||| | || |||||||||||  ||||||||| |||||    
T  26212607 attctgacgatcaacatgcttttataccatttgttttttaccctttcagtttcttagcaccagaggctattaaccttctacatagagttcaaaatgtcat 26212706  T
Q  311 gcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgt 349  Q
    | || || || | |||||||||| |||||||||||||||    
T  26212707 gtatggcaatattatgtctcctaagtccatgaatgttgt 26212745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 43129801 - 43129536
Alignment:
Q  26 actagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccactt 125  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  43129801 actagatagaagatcgacacttaggcatgcagatgttatgatgtacggatggataggaggaaaa-atgcatgtgtgaaattgactggggtttcaccactt 43129703  T
Q  126 ctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaac 225  Q
     | | |||||| ||| |  |||||| ||| |||||| ||  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43129702 gttggattaggggtcggaacttttacggttggacattcagtcctaaaagatgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaac 43129603  T
Q  226 acgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctaca 292  Q
    | | |||| |||||||||||||||| | ||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  43129602 atgtttttctaccatttgcttttgacattttcggtttcctaacaccagatgtttttgaccttctaca 43129536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14423912 - 14423639
Alignment:
Q  61 ttatgttgtacggatgggt-aggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggac 159  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | ||||| |  |||||||    
T  14423912 ttatggtgtacggatggtttaggtggaaaatatgcttgtgaagacttgattggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggacctttaaccgtaggac 14423813  T
Q  160 atgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcga 259  Q
    | ||||||||||||  || ||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  14423812 aggcaaccctaaaaaatgcgtcaagcaaagtgaccgaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttc-- 14423715  T
Q  260 ttttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccat 340  Q
      | |||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||   ||||| || |||| | |||||||||||| |||||||||    
T  14423714 --tcctagcatcagaggctgttgaccttctacatagagtt---aaggtaattcataacaatgtcatgtctcttaggtccat 14423639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 34335613 - 34335274
Alignment:
Q  18 actgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggttt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||   |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| || || | |||||||     
T  34335613 actgacccactagatagaagatcgacacttaggcttgcatatgttatggtgtacaaatgagtaggaggaaaacatgcatgtgtggaattcactggggttc 34335514  T
Q  118 caccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctga 217  Q
     | ||||| ||| |||| | ||||   ||||||  |||||| |  ||||||||||||   |||||| ||||  || |||||||||||||| |||| ||||    
T  34335513 tatcacttgtaggattaagggtcaaagcttttactgtaggatagacaaccctaaaagccatgtcaagcaaaagggccaaacatgagaaagcgtgtcctga 34335414  T
Q  218 caatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagc 317  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||  | |||||| || |    
T  34335413 caatcaacatgcttttataccatttgtttttgacactttcgactttctgacaccagaggctgttgaccttctacatagagttcaacggatcatgcgtaac 34335314  T
Q  318 gatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
     || |||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  34335313 aatctcatgtctcctagacccataaatattgtgtttacga 34335274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 189 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 42921802 - 42921637
Alignment:
Q  189 gtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttc 288  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  42921802 gtggtcaaacacgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttatgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttggccttc 42921703  T
Q  289 tacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  42921702 tacatagagttcagaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaagtccat-aatattgtgtttac 42921637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 359
Target Start/End: Original strand, 25663011 - 25663204
Alignment:
Q  166 ccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttct 265  Q
    ||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   || ||    
T  25663011 ccctaaaagctgcatcaaacaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgataatcaacatgtttttataccatttgcttttgacactttcagcttcct 25663110  T
Q  266 agcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||  ||| |||| ||| ||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25663111 agcatcagaagttgttgatcttctacatagagtccaaagggttatgcatatcaatgttatgtcccctaggtccatgaatgttgagtttacgagg 25663204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35456192 - 35455963
Alignment:
Q  58 atgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtagg 157  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  |||||||  |||||  ||| |||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  35456192 atgttatggtgtacagatgggtaggaggtaaatatgcatgtgtggacttgaccggggttttgccactcgtaggattaggggtccggccttttacggtagg 35456093  T
Q  158 acatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttc 257  Q
      | | | ||| ||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||     
T  35456092 gtaggtagcccaaaaagttgtgttaagtaaaatggtcaaacatgagaaagcgtgttctaacaatcaacatgcttttataccttttgcttttgacaatttt 35455993  T
Q  258 gattttctagcaccagaggttgttgacctt 287  Q
    |  || ||||||||||||| ||||||||||    
T  35455992 ggcttcctagcaccagaggatgttgacctt 35455963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 219 - 358
Target Start/End: Original strand, 22188687 - 22188826
Alignment:
Q  219 aatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcg 318  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |     
T  22188687 aatcaacatgattttatactatttgtttttgacactttcgattttttagcaccagaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcataaca 22188786  T
Q  319 atgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgag 358  Q
    || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22188787 atatcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgag 22188826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 194 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 38875738 - 38875576
Alignment:
Q  194 caaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacat 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||| ||||||   || ||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  38875738 caaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacatgtttttgtaccatttgtttttgacactttcagcttcctagcaccagaggctgctgaccttctacgt 38875639  T
Q  294 gaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
      |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  38875638 agagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcttgtctcctaggtcaatg-atgttgtgtttacga 38875576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 430686 - 430537
Alignment:
Q  210 tgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtca 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||  ||||| ||||||  |||||||||||||||  | | |||| ||| |    
T  430686 tgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttttgtcttcatagcatcagaggcagttgaccttctacatagattccaaagggtta 430587  T
Q  310 tgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  430586 tgcatagtaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 430537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 256
Target Start/End: Original strand, 3114000 - 3114232
Alignment:
Q  23 cccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcacca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||  ||| |||||||||||   |  ||||||||    
T  3114000 cccactagatagaagatcaacacttagtcatgcagatgttatggtgtacaaatgggtaagaggaaa-cactcatttgtagacttgaccagtatttcacca 3114098  T
Q  123 cttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatc 222  Q
    ||  | | |||||| ||| || |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  3114099 ctcatgggattaggggtcggggcttttacggtaggacaggcagccctaaaagttgcatcaaacaaagtggccaaacatgagaaagcatgttctgacagtc 3114198  T
Q  223 aacacgcttttataccatttgcttttgatacttt 256  Q
    |||| | |||||||||||||| |||||| |||||    
T  3114199 aacatgtttttataccatttgtttttgacacttt 3114232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 433568 - 433371
Alignment:
Q  18 actgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggttt 117  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||    
T  433568 actggcccactaaatagaagatccacacttaggcatgcggatgttatggtgtacagatgggttggaggaaaatatgcatgtgtggacttgaccggggttt 433469  T
Q  118 caccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttct 215  Q
    |||||| | | |  ||| | ||  || |||||| ||||||| |  ||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  433468 caccacctgtgggtttaagggtaggggcttttacggtaggatagacaaccttaaaagctgtgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttct 433371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 8100736 - 8100509
Alignment:
Q  110 tggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtg 209  Q
    |||||||||||||||| | | |||| | ||| || |||| || |||||||||||| ||||||| | ||  ||||  ||| |||||||||||||||||  |    
T  8100736 tggggtttcaccacttgtgggattaagagtcgggactttaatagtaggacatgcatccctaaacgctgcatcaagtaaaatggtcaaacatgagaaaacg 8100637  T
Q  210 tgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtca 309  Q
    |||| |||||||  ||| |||||||||||||||| || ||| |||||| | || ||  ||| |||||||||||||||||||| |  |||| |||   |||    
T  8100636 tgttgtgacaatttacatgcttttataccatttgtttgtgacactttcaacttccttccactagaggttgttgaccttctacgtagagtttaaagattca 8100537  T
Q  310 tgcatagcgatgtcatgtctcctaggtc 337  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||    
T  8100536 tgcatatcaatgtcatgtcttctaggtc 8100509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 88 - 291
Target Start/End: Original strand, 43115359 - 43115561
Alignment:
Q  88 aacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaa 187  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||  | | |||||  ||| || |||||| ||||||| |  || |||||||||||| || ||| ||    
T  43115359 aacatgcatgtatggatttgatcggggtttcaccactcatgggattagaggtcggggcttttacggtaggatagacagccctaaaagttgcgtaaat-aa 43115457  T
Q  188 agtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgacctt 287  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||  || ||  || |||||||| |||||||||||    
T  43115458 agcggtcaaatatgagaaagcgtgttttgacaatcaacatgctttcatagcatttgcttttgacacttctgacttcgtaacaccagagattgttgacctt 43115557  T
Q  288 ctac 291  Q
    ||||    
T  43115558 ctac 43115561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 286 - 359
Target Start/End: Original strand, 2566194 - 2566267
Alignment:
Q  286 ttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  2566194 ttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctagatccatcaatgttgtgtttacgagg 2566267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 315
Target Start/End: Original strand, 14723269 - 14723372
Alignment:
Q  212 ttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| | ||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  14723269 ttctgacaatcaacatgcttttatatcatttgttttttacacttttggttttttagcatcagaggttgttgaccttatacttaaagttcaaaatgtcatg 14723368  T
Q  312 cata 315  Q
    ||||    
T  14723369 cata 14723372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 38446442 - 38446287
Alignment:
Q  18 actgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggttt 117  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||  |||   |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  38446442 actgaccctctagatagaatatcgacacttaggcatgcaaatgttatggtgtacggatgggttggagtaaaacatgcatgtgtggacttgactgaggttt 38446343  T
Q  118 caccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaa 173  Q
    |||||||| | |  ||||| ||  || |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  38446342 caccacttgtgggtttaggagttggggcttttacggtatgacatgcatccctaaaa 38446287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 267
Target Start/End: Original strand, 32230489 - 32230587
Alignment:
Q  169 taaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctag 267  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| | ||||||||    
T  32230489 taaaagttgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaaatgtgttctgacaatcaacaagcttttataccatctgcgttcgacacttttggttttctag 32230587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 298 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 23023591 - 23023532
Alignment:
Q  298 ttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23023591 ttcaaaaggtcatgcatatcaatgtcatgtctcctaggtcgatgaatgttgtgtttacga 23023532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8859124 - 8858969
Alignment:
Q  86 aaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatc 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||   ||||||   ||   |||||| ||| ||||| |||||||  |||  || ||||| |    
T  8859124 aaaacatgcatgtgtggacttgactgaggtttcattacttctgagattagggaccatagcttttacggtgggacaagcaacccacaaaactgcgtcaagc 8859025  T
Q  186 aaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  8859024 aaagtagtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttatatcatt 8858969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 329
Target Start/End: Original strand, 41343479 - 41343581
Alignment:
Q  228 gcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatga-agttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatg 326  Q
    |||||||||||||||| ||| || |  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| | ||||||||| | || |||||    
T  41343479 gcttttataccatttgttttcgacatattcggttttctagcaccagaggttgttggccttctacataatagttcaaaggatcatgcataacaatatcatg 41343578  T
Q  327 tct 329  Q
    |||    
T  41343579 tct 41343581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27294471 - 27294387
Alignment:
Q  261 tttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatg 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| | ||| | |  | |||||| |||||||||||||||    
T  27294471 tttctagcaccagaggttgttgaccttctacatatagttcaaatggtcacgtataacaacattatgtcttctaggtccatgaatg 27294387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 7716328 - 7716146
Alignment:
Q  145 cttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgc 244  Q
    |||||||||| | |||| ||||| | || || ||||||| |||||||||||||||  |||    || || ||||| |||| | | || ||||||||||||    
T  7716328 cttttatggtggaacatacaaccgtcaatgtcgtgtcaagcaaagtggtcaaacaaaagac---gtattatgacattcaatatgtttctataccatttgc 7716232  T
Q  245 -ttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtct 329  Q
     |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||| | | ||||||| | || ||||||||    
T  7716231 gttttgacacttttggttttctagcaccagaggttgttggtcttttacataaagttcaaaggattatgcataacaatatcatgtct 7716146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 125
Target Start/End: Original strand, 9841151 - 9841265
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacgg-atgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgatt 110  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||   || |||||||||| ||| ||| |||||||| || ||||||||| |||||| |||||| |    
T  9841151 ttcctgacttacctactagatagaagatcgacacttaggcctgcggatgttatggtgtgcgggatgggtagaagaaaaacatgcgtgtgtaaacttgagt 9841250  T
Q  111 ggggtttcaccactt 125  Q
     ||||||||||||||    
T  9841251 agggtttcaccactt 9841265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 264 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15810077 - 15809984
Alignment:
Q  264 ctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaa-ggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    ||||||| |||||||||||||||   | ||  ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  15810077 ctagcacgagaggttgttgacct---atatagagttcaaaatggtcatgtatagcaatgtcatgtctcctaggcccatgaatgtcgtgttcacgagg 15809984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15833123 - 15832997
Alignment:
Q  230 ttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtct 329  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||   |||| ||  |||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||    
T  15833123 ttttattccatttacgtttgacacttttgacttcctagcaccagatgttgttga---tctatatagagttcaaatggtcatgtataacaatgtcacgtct 15833027  T
Q  330 cctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    ||||| | ||||||||| ||||| ||||||    
T  15833026 cctagattcatgaatgtcgtgttcacgagg 15832997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 298 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24113571 - 24113514
Alignment:
Q  298 ttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
    |||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24113571 ttcaaatgatcatgcataacaatgtcatgtcttctaggtccatgaatgttgtttttac 24113514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 242
Target Start/End: Original strand, 9829333 - 9829407
Alignment:
Q  166 ccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccattt 242  Q
    |||||||||||| || || |||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9829333 ccctaaaagttgcgt-aagcaaagtgg-ctaacatgataaaatgtgttttgacaatcaacatgcttttataccattt 9829407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 125
Target Start/End: Original strand, 27355606 - 27355654
Alignment:
Q  77 ggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccactt 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  27355606 ggtaggaggaaaacatggatgtgttgaattgaatggggtttcaccactt 27355654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 359
Target Start/End: Original strand, 15506724 - 15506787
Alignment:
Q  296 agttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||    
T  15506724 agtttaaaaggttatgtatagcaatgtcatgtctcctagacctacgaatgttgtgtttacgagg 15506787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13307460 - 13307406
Alignment:
Q  190 tggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgc 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| | ||||||||| |||||    
T  13307460 tggtcaaacatgagaaagtgtattcttactatcaacatgtttttataccttttgc 13307406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16017274 - 16017212
Alignment:
Q  194 caaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatacttt 256  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  16017274 caaatatgagaaagtgtgttctaataatcaacatgatttaatactatttgcgtttgatacttt 16017212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 354
Target Start/End: Original strand, 23423920 - 23424038
Alignment:
Q  236 accatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctagg 335  Q
    ||||||||||||||| |||||| | || ||| || || | ||||||||||||||||||  | |||||| | |||| ||| || ||||||||| |||||      
T  23423920 accatttgcttttgacactttcaacttcctaacatcaaatgttgttgaccttctacatagatttcaaaggatcattcattgcaatgtcatgtatcctact 23424019  T
Q  336 tccatgaatgttgtgttta 354  Q
    || || ||| |||||||||    
T  23424020 tctatcaatattgtgttta 23424038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 243
Target Start/End: Original strand, 26577403 - 26577456
Alignment:
Q  190 tggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttg 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||| |||||    
T  26577403 tggtcaaacataagaaagtgtgttccgactatcaacatgtttttatacaatttg 26577456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16017171 - 16017131
Alignment:
Q  296 agttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggt 336  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  16017171 agttcaaaaggtcatgcatagcaatgttgtgtctcctaggt 16017131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 352
Target Start/End: Original strand, 4412891 - 4413231
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  4412891 ttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactg 4412990  T
Q  112 gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtg 211  Q
    |||||||||||||| | | |||| ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  4412991 gggtttcaccacttgtgggattaagtgtcagaccttttaccgtaggacaggcaaccctaaaagctgtgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtg 4413090  T
Q  212 ttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  4413091 ttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagagattgttgaccttctacatagggttcaaaaggtcatg 4413190  T
Q  312 catagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtt 352  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4413191 catagcaaagtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtt 4413231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 41867733 - 41868080
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  41867733 ttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacagatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactg 41867832  T
Q  112 gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtg 211  Q
     | |||||| |||| | | |||||||||| | |||||||| |||||||| ||| || |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  41867833 agatttcacgacttgtgggattaggtgtcggaccttttatcgtaggacaggcagccttaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcatg 41867932  T
Q  212 ttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41867933 ttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcgggttcctagcaccagaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatg 41868032  T
Q  312 catagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41868033 cataacaatgtcatgtctcccaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 41868080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Original strand, 19161609 - 19161955
Alignment:
Q  13 tcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattgg 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  19161609 tcctaactgacccattagatagaagatcaacactcaggcatgcggatgttatgatgtaaggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgaatag 19161708  T
Q  113 ggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgt 212  Q
    ||||||||||||| |   ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || |||||  ||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  19161709 ggtttcaccacttgtgagattagatgtcaggccttttatggtaggacatacatccctaaaatctgcgtcaagaaaagtgggcaaacatgaaaaagcgtgt 19161808  T
Q  213 tctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgc 312  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||| || | ||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  19161809 tctgacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgacactttcggttttgtaacactagaggctgcttaccttttacatagagttcaaaaggtcatgc 19161908  T
Q  313 atagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||    
T  19161909 atatcaatgtcatgtctcctaggtcaatgaatagtgtgttttcgagg 19161955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17344914 - 17344573
Alignment:
Q  18 actgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggttt 117  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17344914 actgacccgctagaaagaagatcaacactcaggcatgcggatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgactggggttt 17344815  T
Q  118 caccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctga 217  Q
    ||| |||| | | |||||||||||| |||||||  |||||| |  ||  ||| |||| || |||||  || |||| |||||| ||||||  ||||| | |    
T  17344814 cacaacttgtgggattaggtgtcagaccttttaccgtaggaaagccagtccttaaagctgcgtcaagtaaggtggccaaacacgagaaaacgtgttttca 17344715  T
Q  218 caatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagc 317  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  17344714 caatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcagtttcctagcaccataggctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcataac 17344615  T
Q  318 gatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17344614 aatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 17344573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 352
Target Start/End: Original strand, 9685240 - 9685580
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||   |  ||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  9685240 ttcctgactgacccactagatagaaggtcaacactcaggcctgcaaacattatggtgtgcatatgggtaggtggaaaacatgattgtgtagacttgactg 9685339  T
Q  112 gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtg 211  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||  |||||| | ||| ||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||    
T  9685340 gggtttcaccacttgtgggattaggtgtcagaccttttaccgtaggataggcagccctaaaatccgcgtcaagcaaagtggccaaacatgaaaaagcgtg 9685439  T
Q  212 ttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  9685440 ttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttttgattttctagcactagaggctgtggaccttctatatagagttcaaaaggtcatg 9685539  T
Q  312 catagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtt 352  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9685540 gatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtt 9685580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 354
Target Start/End: Original strand, 18744779 - 18745121
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||   || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18744779 ttcctgactgacccgctagaaagaatatcaacactcaggcctgcgggtgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgactg 18744878  T
Q  112 gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtg 211  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||  |||  ||| | | |||| ||||  | |||||   | |||| |||||| ||||||| |||    
T  18744879 gggtttcaccacttgtgggattaggtgtcaggccatttaccgtaacacaggaagcccttaaagcagcgtcaagttaggtggccaaacacgagaaagcgtg 18744978  T
Q  212 ttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatg 311  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||| |||||    
T  18744979 ttctgacaatcaacatacttttataccatttgcttttgacattttcgattttctagcaccataggctgttggccttctacatagagttcaaaagatcatg 18745078  T
Q  312 catagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttta 354  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18745079 catagcaatgtcatatttcctaggtctatgaatgttgtgttta 18745121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 28225272 - 28224940
Alignment:
Q  22 acccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcacc 121  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||   |  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  28225272 acccactagatagaatatcgacacttaggcctacggatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtggacttgaatggggtttcact 28225173  T
Q  122 acttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaat 221  Q
    |||| | |  ||||| || ||| |||||| |||||||||  ||||  |||||| || ||||| |||||||  |||| ||||||||| || ||||||||||    
T  28225172 acttgtgggcttaggagttagggcttttacggtaggacaaacaactttaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaatatgagaaagcgtattctgacaat 28225073  T
Q  222 caacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatg 321  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||||  ||| |||| | | ||||||  | ||     
T  28225072 caacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggcttcctagcttcagaggttgttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcatgacaata 28224973  T
Q  322 tcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttta 354  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28224972 ttatgtctcctaggtcaatgaatgttgtgttta 28224940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Original strand, 23484771 - 23485104
Alignment:
Q  20 tgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttca 119  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||   |||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23484771 tgacctactatatagaagatcaacactcaagcatgcatatgttatgatgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttca 23484870  T
Q  120 ccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgaca 219  Q
    |||||| | | |||| ||||| ||||||| | ||| |||||   | ||||||||| |  ||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||    
T  23484871 ccacttgtgggattaagtgtcgggcctttaacggtgggacaactagccctaaaagctacgtcaaacaaagtggccaaatatgagaaagcatgttctgaca 23484970  T
Q  220 atcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcga 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||  ||| ||||||||||| |    |||| |  |||||  |||||||||| ||||||||| | |    
T  23484971 atcaacatgcttttataccatttgtttttgacac-ttctgtttcctagcaccaga-gacaatgacttcttacatagagttcaaaagatcatgcataacaa 23485068  T
Q  320 tgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
    ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23485069 tgctatgtctcctaggtccatgaacgttgtgtttac 23485104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27502637 - 27502299
Alignment:
Q  18 actgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggttt 117  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||   || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  27502637 actgacccactagatgcaagatcgacacttaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtggacctgaatggggttt 27502538  T
Q  118 caccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctga 217  Q
    |||||||| | |  ||||| |||||  |||||| | |||||||   ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  27502537 caccacttgtgggtttaggggtcagagcttttacgataggaca-ataaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaaacgtgttccga 27502439  T
Q  218 caatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagc 317  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||   |||||| |||||||| || |||||| || |   ||||||||||||||||  | | |||| ||| |||||||||    
T  27502438 caaacaacatgcttttatacaattgctttttgacactttcgacttcctagcatcatatactgttgaccttctacatagaatccaaagggttatgcatagc 27502339  T
Q  318 gatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
     || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27502338 aatatcatgtctcctagatctatgaatgttgtgtttacga 27502299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 337
Target Start/End: Original strand, 20142565 - 20142875
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||  ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20142565 ttcctgactgacccagtagatagaagatcaacactcaaacctgcagacattatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgattg 20142664  T
Q  112 gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtg 211  Q
    ||| |||||||||| | | ||||||||||   |||||||  |||||||| ||| | ||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||             
T  20142665 gggcttcaccacttgtgggattaggtgtcgtaccttttaccgtaggacaggcagctctaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatga--------- 20142755  T
Q  212 ttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatg 311  Q
          ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||     
T  20142756 ------caatcaacatgcttttataccattttcttttgacacttttggttttctagcatcaaaggttgttgaccttatacatagagttcaaaaggtcata 20142849  T
Q  312 catagcgatgtcatgtctcctaggtc 337  Q
    |||| | |||||||||||||||||||    
T  20142850 cataacaatgtcatgtctcctaggtc 20142875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 3826003 - 3825666
Alignment:
Q  18 actgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggttt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | |    ||||||||||| | |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  3826003 actgacccactagatagaagatcgacctttatgcttgtggatgttaaggtgtacaaatgagtaggagaaaaacatgcatgtgtggacttgattgaggttt 3825904  T
Q  118 caccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgtt-ctg 216  Q
    |||| ||| | | |||||| |||||| |||||| |||| ||||   | ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||    
T  3825903 caccccttgtgggattaggggtcaggacttttacggtatgacagagagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgaaaaagttttttcctg 3825804  T
Q  217 acaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatag 316  Q
    |||||| ||| | ||||||  |||||||||  || |||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| ||||  ||||||||   ||||||||||    
T  3825803 acaatctacatgtttttatttcatttgcttcagacactttcaatttcctagcatcaaaggttgttgaccttcaacatcgagttcaaagaatcatgcatag 3825704  T
Q  317 cgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttta 354  Q
    | ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  3825703 caatgtcatgtcttctaggaccataaatgttgtgttta 3825666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5532700 - 5532360
Alignment:
Q  13 tcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattgg 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||   |  | ||  ||||||||  |||| |||  |||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||    
T  5532700 tcctgactgacccactagatagaagatcgacatcgaagtctgcagatgttatagtgtatggactggtaggagaaaaacatgcatgtgtgaacttaaccgg 5532601  T
Q  113 ggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgt 212  Q
     |||||||||||  ||| |||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  5532600 agtttcaccactcataggattaggggtcggggattttacggtaggacatgcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaaacgtgt 5532501  T
Q  213 tctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgc 312  Q
    | |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| |  || ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||    
T  5532500 tgtgacaatcaacatgcttttatactatttacttttgacactttag-cttcctagcaccataggttgttgagcttctacatagagttcaaagggtcatgc 5532402  T
Q  313 atagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
    | | | ||| |||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  5532401 acaacaatgccatgactcctaagttcatgaatg-tgtgtttac 5532360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 44686628 - 44686351
Alignment:
Q  85 gaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaat 184  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |  ||||| ||| || |||||| | |||||||  ||  |||||||| || |||||     
T  44686628 gaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggggcttttacgataggacagacagtcctaaaagctg-gtcaag 44686530  T
Q  185 caaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaa----cacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgt 280  Q
    ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||   || |||||||| |||||||  || |||||| ||||| ||||    
T  44686529 caatgtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaatcaacatgcttttatattgttcgcttttgacactttcggcttcctagcatcagagtttgt 44686430  T
Q  281 tgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||||||||||  | | |||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44686429 tgaccttctacatagattccaaagggttatgcatagcaatgttatgtctcctaggtccgtgaatgttgtgtttacgagg 44686351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 237 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 13413408 - 13413291
Alignment:
Q  237 ccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggt 336  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  13413408 ccatttgtttttgacactttcggttttcaagcagcagaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaggt 13413309  T
Q  337 ccatgaatgttgtgttta 354  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13413308 ccatgaatgttgtgttta 13413291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 357
Target Start/End: Original strand, 16351678 - 16352014
Alignment:
Q  26 actagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccactt 125  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||  |||||||| | |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||  | | |||||||| ||    
T  16351678 actatatagaagatcaacacttagatctgtaaatgttatggtatacgaatgggttggaagacaacatgcatgtgtagacttgacagag-tttcaccattt 16351776  T
Q  126 ctagaattaggtgtcaggccttttatggtagg---acatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatc 222  Q
     | |||||| ||||| |    |||| | ||||   |||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16351777 gtggaattatgtgtcggagtatttacgataggtagacagacaatcctaaaagttgtgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaaatgtgttctcacaatc 16351876  T
Q  223 aacacgcttttataccatttgcttttgatact---ttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcga 319  Q
    ||||   |||||||   ||||||||||| | |   || |  | | || || |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | | |    
T  16351877 aacataattttatattgtttgcttttgacattttgtttggctctttatcatcagaggttgttgaccttctacatagagttcaaatggtcatgcacaacaa 16351976  T
Q  320 tgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||    
T  16351977 tgtcatgtctcttaggtacatgaatattatgtttacga 16352014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 186 - 336
Target Start/End: Original strand, 34814818 - 34814967
Alignment:
Q  186 aaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgacc 285  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||  || ||| ||||||||  ||||||||    
T  34814818 aaagtgatcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaatatgcttttataccatttgctttcgacactttcg-gttcctaacaccagagactgttgacc 34814916  T
Q  286 ttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggt 336  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||| | |||| ||||||| |||||    
T  34814917 ttctacatagagttcaaatggtcatgcataacaatgttatgtctcttaggt 34814967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2888749 - 2888463
Alignment:
Q  57 gatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtag 156  Q
    ||||||||| | |||  ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | |||  |||| |||||| ||| |||||| ||| |     |||||||||    
T  2888749 gatgttatggtatacatatgggtaagaggtaaacatgcatgtgtggacttaactggaatttcgccacttataggattaggggtcgga----ttatggtag 2888654  T
Q  157 gacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatacttt 256  Q
      ||  ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||| | || ||| |||||    
T  2888653 tgcaaacaaccctaaaagttgcgtctagcaaagtggacaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgtttttataccattcgtttatgacacttt 2888554  T
Q  257 cgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgtt 347  Q
     |  || ||| ||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| | | ||||||| |||| ||  ||||| ||||||    
T  2888553 tggcttcctaacacaagaggttgttgaccttctacacaaggttcaaaatgtcatgcacaacaatgtcatatctcttaaatccataaatgtt 2888463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 204 - 359
Target Start/End: Original strand, 2886632 - 2886786
Alignment:
Q  204 aaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaa 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||| | |||| |||||| |||||| ||| |||||  ||||||||    
T  2886632 aaagtgtgttctgacaatcaacatgtttttatatcatttgtttttgatattttcggtttccaagcatcagaggctgttgatcttttacatagagttcaaa 2886731  T
Q  304 aggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    ||  |||||||||| || |||| |||| | ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  2886732 agagcatgcatagcaatatcatatctcgt-ggtccataaatgttgtgtttatgagg 2886786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 357
Target Start/End: Original strand, 7760737 - 7761015
Alignment:
Q  78 gtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttg 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||||||||||| | | |||| |   || | |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |    
T  7760737 gtaggaggaaaacatacatgtgtgaacttgactagggtttcaccacttgtgggattatgaaccaagacttttatggtgggacaagcaaccctcaaagtcg 7760836  T
Q  178 tgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggt 277  Q
     |||||  ||||||| ||| |||||||||  ||| ||| ||||||| ||   |||  ||| |||||| || || || || | ||||||| ||||||||||    
T  7760837 cgtcaagtaaagtggccaatcatgagaaaacgtgatctaacaatca-catattttcttacgatttgcattagacacctttggttttctatcaccagaggt 7760935  T
Q  278 tgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| | |||||| |||| |||| ||||||| || || || ||||| |||| ||||||    
T  7760936 tgttgaccttctacatagagttcaaaggatcatgcgtagcaatgtgatgtctcataagttcaagaatgatgtgcttacga 7761015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 353
Target Start/End: Original strand, 33612437 - 33612711
Alignment:
Q  77 ggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagtt 176  Q
    ||||| |||||| ||||||| | ||||||||| || ||||||||| ||| | | | || | |||  | || |||||||||||||||||||||||||||      
T  33612437 ggtagaaggaaagcatgcatatatagacttgactgaggtttcaccgcttgtgggagtaagggtctaggctattatggtaggacatgcaaccctaaaagcc 33612536  T
Q  177 gtgt-caatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagag 275  Q
      || ||| |||| |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||| ||||| |  || ||| |||| |||    
T  33612537 acgtgcaagcaaaatggt-aaacatgagaaaacgtgttttgacaatcaacatgattttatacaatttgtatttgacacttttggcttcctaacaccggag 33612635  T
Q  276 gttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttt 353  Q
    ||||||||| |||||||   |||||| | ||||   |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33612636 gttgttgacattctaca--gagttcagagggtcgctcatagcaatgtcttgtcccctaggtccatgaatgttgtgttt 33612711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 186 - 357
Target Start/End: Original strand, 13147096 - 13147270
Alignment:
Q  186 aaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgc---ttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttg 282  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||      |||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||| |||||||| ||||||    
T  13147096 aaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcagcatatactttttataccatttgattttgacacttttggttttctaacaccagagattgttg 13147195  T
Q  283 accttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    ||||||| |||  ||| |||| |||| |||| | | ||||| ||||| ||| || ||||||| |||| |||||||    
T  13147196 accttcttcatatagtacaaagggtcgtgcacaacaatgtcttgtcttctaagttcatgaatattgtatttacga 13147270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9675103 - 9674945
Alignment:
Q  35 aagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaatta 134  Q
    |||||| ||||| ||| |||  ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  | | ||||    
T  9675103 aagatcgacacttagacatgcagatgttatgatgtacgaatgagtaggaggaaaacatgcatgtatgaacttgattggggtttcaccactcatgggatta 9675004  T
Q  135 ggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggt 193  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||   | ||||||||  || ||||| |||||||||    
T  9675003 gggatcagaccttttatggtaggacaaatagccctaaaatatgcgtcaaacaaagtggt 9674945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 357
Target Start/End: Original strand, 32029039 - 32029256
Alignment:
Q  139 tcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttatacc 238  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||  | || |||| |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |    
T  32029039 tcagggcttttacgataggacatgcaaccctaaaaattgatt-aagcaaattggttaaatatgagaatgtgtgttcagacaatcaacatgctttcatatc 32029137  T
Q  239 atttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtcc 338  Q
    ||||| |||||| ||||||   || | | |  |||||| ||||||||||||||||  ||||||||  ||||| |||| | |||||||||||  ||||  |    
T  32029138 atttgtttttgacactttcagcttcccaacttcagaggctgttgaccttctacatagagttcaaagagtcatccataacaatgtcatgtcttataggatc 32029237  T
Q  339 atgaatgttgtgtttacga 357  Q
    |||||| | ||||||||||    
T  32029238 atgaatatcgtgtttacga 32029256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 29808296 - 29808014
Alignment:
Q  70 acggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccct 169  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||| | | ||||||  | ||   |||||| |||||| |  ||||  |    
T  29808296 acggatgagtacgaggaaaacatgcatttgtgaatttgattggggtttcaccacttattggattagggttgaga--ttttattgtaggatagtcaacttt 29808199  T
Q  170 aaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagca 269  Q
    ||||||||  ||||  |||||   ||||||||||| || ||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||| | | | |  |||| ||||||    
T  29808198 aaaagttgcctcaagtaaagtcaccaaacatgagacagcgtgttataacaatcaacatg-ttttataccatttgcttttcacattatttatttcctagca 29808100  T
Q  270 ccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
     | ||||||||||||||| |||||  |||| ||  ||||||||| | | |  |||||  |||||||||||||||||| || |||||    
T  29808099 tcggaggttgttgaccttttacatagagtttaagtggtcatgcacaacaacatcatgaatcctaggtccatgaatgtcgtatttac 29808014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 125
Target Start/End: Original strand, 10579650 - 10579717
Alignment:
Q  58 atgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccactt 125  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  10579650 atgttatggtgtacgagtgggtaggaggaaaacatgcatttgtggacttgactggggtttcaccactt 10579717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Original strand, 13146969 - 13147072
Alignment:
Q  22 acccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcacc 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||  |||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| | ||||||  |||||| || |||||||||    
T  13146969 acccactagatagaagatcgacatttaggcatgtagatgttatggtgtacgcatgggtaggaagaaaacacggatgtgtgaacttgactgtggtttcacc 13147068  T
Q  122 actt 125  Q
    ||||    
T  13147069 actt 13147072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 355
Target Start/End: Original strand, 11921218 - 11921372
Alignment:
Q  195 aaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatg 294  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||| | | || ||  ||||||||||||||||     
T  11921218 aaacattagaaaacgtgttctgacaatcaacatatttttataccgtttgttttttatactttcaattttctggtatcatagactgttgaccttctacata 11921317  T
Q  295 aagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
     |||||||| |||      || | || | || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11921318 gagttcaaagggt------tatcaattttatatcttctaggtccatgaatgttgtgtttac 11921372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 238
Target Start/End: Original strand, 1296026 - 1296101
Alignment:
Q  163 caaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttatacc 238  Q
    |||| ||||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||| | |||||||||    
T  1296026 caacgctaaaagctgcgtcaaacaaaatggccaaacatgagaaaatatgttctgacaataaacatgtttttatacc 1296101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 250
Target Start/End: Original strand, 3968402 - 3968472
Alignment:
Q  180 tcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttga 250  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||| | |||||||||| |||||| |||||    
T  3968402 tcaagcaaagtggtcaaatatgagaaaacatgttttgacaatcaatatgcttttatacaatttgcgtttga 3968472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 358
Target Start/End: Original strand, 20142871 - 20142924
Alignment:
Q  304 aggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgag 358  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  20142871 aggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaggt-catggatgttgtgttgacgag 20142924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 354
Target Start/End: Original strand, 44684955 - 44685025
Alignment:
Q  284 ccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttta 354  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||| | || | ||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  44684955 ccttctacatagagttcaaagggtcatgcataacaatattatgtcttataagtccatgaatgttgtgttta 44685025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 44720559 - 44720374
Alignment:
Q  56 ggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggta 155  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||| ||||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||  || | | |||||| |||||   ||||| | ||    
T  44720559 ggatgttttgatgtacgaatggataggatgaaaatatg--tgtgtaaaattgattgaggtttcaccgtttgtgggattaggggtcagcaattttacgtta 44720462  T
Q  156 ggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttg 243  Q
    | ||||||||| |||||||  | |||||  ||  ||| ||||||||| |||  ||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  44720461 gaacatgcaacgctaaaagccgcgtcaagtaagatggccaaacatgaaaaaacgtgttatgacaatcaacatgtttttataccgtttg 44720374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 19277575 - 19277235
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  19277575 ttcctgactgacgcactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtctacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactg 19277476  T
Q  112 gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtg 211  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| |||| ||||||   |||||||| |||  |||||||| || ||||| |||||| | |||||||||||||| |||    
T  19277475 gggtttcaccacttgtcggattaggtttcagaccttttgccgtaggacaggcagtcctaaaagctgcgtcaagcaaagtagccaaacatgagaaagcgtg 19277376  T
Q  212 ttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19277375 ttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatg 19277276  T
Q  312 catagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtt 352  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19277275 catagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtt 19277235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4501532 - 4501194
Alignment:
Q  20 tgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttca 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4501532 tgacccactagatagaagataaacactcaggccagcggatgttatggtgtacggataggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgactggggtttca 4501433  T
Q  120 ccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgaca 219  Q
    |||||| | | |||||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  4501432 ccacttgtgggattaggtgtcgggccttttaccgtaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaaacaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgaca 4501333  T
Q  220 atcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcga 319  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  4501332 atcaacatgcttttatataatttgcttttgacacttt-ggttttctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaagttcatgcatagcaa 4501234  T
Q  320 tgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4501233 tgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgagg 4501194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 983231 - 982884
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |     
T  983231 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcatccggaagttatgatgtacgaatgagtaggtgaaaaacatgcttgtgtagacttgacta 983132  T
Q  112 gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtg 211  Q
    |||||| ||||||| | | |||||||||  | |||||||| |||||||| ||| || |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  |||    
T  983131 gggtttaaccacttgtgggattaggtgtgggaccttttattgtaggacaggcagccataaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaatcgtg 983032  T
Q  212 ttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  983031 ttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgatactttcggttttctagcaccagaggttgttggccttctacatagagttcaaaaggtcatg 982932  T
Q  312 catagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  982931 catatcaatgtcatgtcttctatgtccatgaatgttgtgttcacgagg 982884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 45613667 - 45614014
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||   || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45613667 ttcctgactgacccgctagaaagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatgatgtacgaatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgactg 45613766  T
Q  112 gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtg 211  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||   ||||||||  ||||||||||||||| |||||  || |||  |||||| | |||||||||    
T  45613767 gggtttcaccacttgtaggattaggtgtcgggcctttttccgtaggacagacaaccctaaaagttgcgtcaagtaaggtgaccaaacacgggaaagtgtg 45613866  T
Q  212 ttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatg 311  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||||| |||||    
T  45613867 ttctgacaatcaacatgtttttataccatttgattttgacactttcggtttccaagcaccagaggctgttagccttctacatagagttcaaaagttcatg 45613966  T
Q  312 catagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45613967 cataacaatgtcaaatctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 45614014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 58 - 359
Target Start/End: Original strand, 21326709 - 21327010
Alignment:
Q  58 atgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtagg 157  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||| | | |||||||||| | |||||||  |||||    
T  21326709 atgttatggtgtacagatgggtaggtggaaaacatacttgtgtagatttgattggagtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtagg 21326808  T
Q  158 acatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttc 257  Q
    |||  || |||||||||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21326809 acaaacagccctaaaagccgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttc 21326908  T
Q  258 gattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21326909 gatttcctagcaccagaggctgttgaccttttacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttcacga 21327008  T
Q  358 gg 359  Q
    ||    
T  21327009 gg 21327010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 41 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27521722 - 27521406
Alignment:
Q  41 aacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtc 140  Q
    ||||||||| | || |||||||||  | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || | |||||||| || | | ||||||||||    
T  27521722 aacactcaggtctgcggatgttattgtctacggatgggtaggagaaaaacat--atgtgtagacttgactgagatttcaccatttgtgggattaggtgtc 27521625  T
Q  141 aggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccat 240  Q
     ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  27521624 gggccttttacggtaggacatgcacccttaaaagttgcgttaaacaaagtggtcaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcatttatacaat 27521525  T
Q  241 ttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccat 340  Q
    || ||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||    
T  27521524 ttacttttgacacttttggtttcctagcatcagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaagtctat 27521425  T
Q  341 gaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27521424 gaatgttgtgtttacgagg 27521406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24527872 - 24527524
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatggg-taggaggaaaacatgcatgtgtagacttgatt 110  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| | || | |||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  24527872 ttcctaactggcccactaggtcgaagatcaacactcaggtctgcgaatgtcatggtgtacggatgggataggtggaaaacatgtttgtgtagacttgact 24527773  T
Q  111 ggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgt 210  Q
     |||| ||| || || | | |||||||||| | |||||||  |||||||| ||| |||||||||  |||||||  |||||||  ||||||||||||  ||    
T  24527772 agggtctcatcatttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaggcagccctaaaagcagtgtcaagtaaagtgggaaaacatgagaaaacgt 24527673  T
Q  211 gttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcat 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24527672 gttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcagtttcctagcacgagaggcggttgaccttctacatagagttcaaaaggtcat 24527573  T
Q  311 gcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  24527572 gcatagcaatgtcatttctccttggtccatgaatgttgtattcacgagg 24527524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 43857149 - 43856810
Alignment:
Q  19 ctgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   ||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||  ||||||||    
T  43857149 ctgacccactagatagaagatcaacacttaggcctgcagatgttatggtgtacggatgggtaggagaaaaacatacatgcgtggacttgacgggggtttc 43857050  T
Q  119 accacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgac 218  Q
    ||||||| | | |||||| ||| || ||||||  ||||||||  ||||  |||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||    
T  43857049 accacttgtgggattaggggtcggggcttttacagtaggacagacaacattaaaagatgcgtcaatcaaagtggctagacatgagaaagcgtgttttgac 43856950  T
Q  219 aatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcg 318  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||| | ||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | |     
T  43856949 aatcaacatgcgtttatacaatttgcttttgacatttttggtttcctaacaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgcacaaca 43856850  T
Q  319 atgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgag 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43856849 atgtcatgactcctaggtccatgaatgttatgtttacgag 43856810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 86 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22198194 - 22197924
Alignment:
Q  86 aaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatc 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||  | ||||| |    
T  22198194 aaaacatgcatgtgtagatttgattggggtttcgccacttgtgcgattaggtgtcgggccttttatggtaggacgcgcagccctaaaagcggcgtcaagc 22198095  T
Q  186 aaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgacc 285  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  22198094 aaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttccaacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgtcactttcggtttcctagcatcagaggttgttgacc 22197995  T
Q  286 ttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22197994 ttctacatagagttcaaaaggttatg-atagcaacgtcatgtctcctaggtcaatgaatgttgtgtttacga 22197924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 86 - 357
Target Start/End: Original strand, 22239627 - 22239897
Alignment:
Q  86 aaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatc 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||  | ||||| |    
T  22239627 aaaacatgcatgtgtagatttgattggggtttcgccacttgtgcgattaggtgtcgggccttttatggtaggacgcgcagccctaaaagcggcgtcaagc 22239726  T
Q  186 aaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgacc 285  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  22239727 aaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttccaacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgtcactttcggtttcctagcatcagaggttgttgacc 22239826  T
Q  286 ttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22239827 ttctacatagagttcaaaaggttatg-atagcaacgtcatgtctcctaggtcaatgaatgttgtgtttacga 22239897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 359
Target Start/End: Original strand, 28517118 - 28517459
Alignment:
Q  18 actgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggttt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||   |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  28517118 actgacccactagatagaagatcgacacttaggcctgcaaatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgtatgtgtggacttgactggggttt 28517217  T
Q  118 caccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctga 217  Q
    |||||||| | |  ||||| ||  || ||||||  ||||||||  |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  ||    
T  28517218 caccacttgtgggtttaggggtgggggcttttacagtaggacagacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgtttaga 28517317  T
Q  218 caatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagc 317  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||| |||||   |||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||||| |    
T  28517318 caatcaacatgtttttataccatttgcttttgacacttttgacttcctagcatcagagacagttgaccttctacatagagtccaaagggttatgcataac 28517417  T
Q  318 gatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28517418 aatgttatgtctcctaagtccatgaatgttgtgtttacgagg 28517459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5825545 - 5825208
Alignment:
Q  20 tgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||   || |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5825545 tgacccactagatagaagatcgacacataggcctgcggatgttatggtgtacgaatgggttggaggaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttca 5825446  T
Q  120 ccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgaca 219  Q
    |||||| | |  ||||| |||  | |||||| || |||||| | | ||||||||| ||  |||| |||||||  ||||||||| || | ||||| |||||    
T  5825445 ccacttgtgggtttaggggtcgaggcttttacggcaggacaggaagccctaaaagctgcatcaagcaaagtg--caaacatgacaatgcgtgttatgaca 5825348  T
Q  220 atcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcga 319  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||| ||||||||| |    
T  5825347 atcaacatgtttttataccatttacttttgacactttcggcatcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagtcgaaagggttatgcatagcaa 5825248  T
Q  320 tgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5825247 tgttatgtctcctaggtctatggatgttgtgtttacgagg 5825208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 82 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 32584813 - 32584539
Alignment:
Q  82 gaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtc 181  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| | | |||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  32584813 gaggaaaacatgcatgtgtggacttgactcgggtttcacctcttgtgggattaggggtcggggattttacggtaggacatgcaaccctaaaaattgcatc 32584714  T
Q  182 aatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgtt 281  Q
    || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  32584713 aaacaaagtggtcaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaagatgcttttacaccatttgcttttgacactttatgtttcctagcaccagaggttgtt 32584614  T
Q  282 gaccttctacatgaagtt-caaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
    ||||||||| ||  |||| |||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  32584613 gaccttctagatagagttccaaaagatcatgcatatcaatgttatgtctcatagatcgatgaatgttgtgtttac 32584539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3676922 - 3676677
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  3676922 ttcctgactgacccaatagatagaaaatcaacactcaggcttgtagatgttatggtgtagggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactg 3676823  T
Q  112 gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatg-caaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgt 210  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| | |||||||  |||||||| | || ||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  3676822 gggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggtccttttaccgtaggacaggccagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatcagaaagcgt 3676723  T
Q  211 gttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatacttt 256  Q
    ||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3676722 gttcttactatcaatatgcttttataccatttgcttttgacacttt 3676677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 214 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 48539261 - 48539116
Alignment:
Q  214 ctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgca 313  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||  ||| ||||||||||||||    
T  48539261 ctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggttttctagcaccagaggctgttgatcgtctacatagagtccaaaaggtcatgca 48539162  T
Q  314 tagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48539161 tagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 48539116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 169 - 359
Target Start/End: Original strand, 30216040 - 30216230
Alignment:
Q  169 taaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagc 268  Q
    |||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  30216040 taaaagctgcgtcaagcaaaatggtcaaatatgagaaagcgtgttttgacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagc 30216139  T
Q  269 accagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    | ||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30216140 atcagagtttgttgatcttccacataaagttcaaatggtcatgcatagcaatgtcatatctcctaggtctatgaatgttgtgttcacgagg 30216230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 131 - 352
Target Start/End: Original strand, 25186880 - 25187096
Alignment:
Q  131 attaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgct 230  Q
    |||||||||| | |||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||| | |    
T  25186880 attaggtgtcggaccttttaccgtaggacataaaaccctaaaagttgtgtcaagtaaagtggtctaacatgagaaagcgtgttccgataatcaacatgtt 25186979  T
Q  231 tttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctc 330  Q
    ||| ||||||||||||||||     ||| ||| | | ||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25186980 tttctaccatttgcttttga-----tcggtttccgaacactagaggttgttgaccttctatatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctc 25187074  T
Q  331 ctaggtccatgaatgttgtgtt 352  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  25187075 ctagatccatgaatgttgtgtt 25187096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 34772977 - 34772719
Alignment:
Q  96 tgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtca 195  Q
    |||||||||||||||| ||||| | || || | | |||| ||||  ||| ||||| |||| || | ||| | |||||||||||  |||||||||| | ||    
T  34772977 tgtgtagacttgattgaggttttatcatttgtgggattatgtgttgggctttttacggtatgataggcagctctaaaagttgt--caatcaaagtagcca 34772880  T
Q  196 aacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatga 295  Q
    || |||||||||||||||| |||||| || | | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||||||||| |    
T  34772879 aatatgagaaagtgtgttcggacaattaatatgtttttataccatttgcttttgaaactttcaatttcttag-attagaggttgttgaccttctacataa 34772781  T
Q  296 agttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    | ||||||| |||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34772780 acttcaaaaagtcatgcatatcaatgtcatgttttctaggtccatgaatattgtgtttacga 34772719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 10905332 - 10905057
Alignment:
Q  67 tgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg-gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaa 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| || || ||||||||||| | | |||| | || ||| ||||||||                 
T  10905332 tgtacggatggataggaggaaaacatgcatgtgtgaacttgactgaggttttcaccacttgttggattaagagttaggacttttatg------------- 10905246  T
Q  166 ccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttct 265  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||    
T  10905245 ccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaatatgagaaaaagtgttctgacactcaacatgc-tttataccatttgcttttgacacttttggttgcct 10905147  T
Q  266 agcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||  | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10905146 agcaccagagtatgttgaccttctacatagagttcaaagagccatgcataacaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgtcgtgtttac 10905057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 179 - 357
Target Start/End: Original strand, 42295176 - 42295354
Alignment:
Q  179 gtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggtt 278  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| |||||| ||||    
T  42295176 gtcaagcaaaatggccaaacataagaaagcttcttctgacaatcaacatgtttttataccatttgttttttatactttcggtttcctaacaccaggggtt 42295275  T
Q  279 gttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    |||||||||||||||   ||||||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42295276 gttgaccttctacatagcgttcaaaatatcatgcataacattgtcatgtctcctaggtccatgaatcttgtgtttacga 42295354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 185 - 359
Target Start/End: Original strand, 40726478 - 40726652
Alignment:
Q  185 caaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgac 284  Q
    |||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||  ||  ||||| ||||||||||||||    
T  40726478 caaagtggccaaacataataaaatgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgtttttgacactttcggcttcatagcatcagaggttgttgac 40726577  T
Q  285 cttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||||||  ||| |||| ||| ||||||| | |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40726578 cttctacatagagtccaaagggttatgcataacaatgctatgtctcctagatccatgaatgttgtgtttatgagg 40726652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 232 - 359
Target Start/End: Original strand, 5972261 - 5972388
Alignment:
Q  232 ttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcc 331  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||    
T  5972261 ttataccatttgtttttgacattttcatttttctagtatcagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaatgtcatgcatagtaatgtcatttctcc 5972360  T
Q  332 taggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
     || || |||||||||||||||||||||    
T  5972361 cagatctatgaatgttgtgtttacgagg 5972388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 217 - 354
Target Start/End: Original strand, 6634993 - 6635130
Alignment:
Q  217 acaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatag 316  Q
    ||||||||||   ||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || || |||   || ||||||     
T  6634993 acaatcaacatatttttatatcatttgcttttgacagtttcgattttttagcatcagaggttgttgaccttctacgtaaaattaaaataatcttgcataa 6635092  T
Q  317 cgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttta 354  Q
    | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6635093 caatgtcatgtctcctagatccataaatgttgtgttta 6635130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 252 - 357
Target Start/End: Original strand, 41117835 - 41117940
Alignment:
Q  252 actttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgt 351  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41117835 actttcggtttcctaacaccagatgttgttaaccttctacatagagtttaaaagatcatgcatagcaatgtcatgtttcctaggtccatgaatgttgtgt 41117934  T
Q  352 ttacga 357  Q
    | ||||    
T  41117935 tcacga 41117940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Original strand, 9281098 - 9281255
Alignment:
Q  153 gtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgata 252  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||  |||| |||| | | |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  ||||| |    
T  9281098 gtaggacagacaaccctaaaagctgcatcaagcaaactag-caaacatgagaaagcgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttggatttgaca 9281196  T
Q  253 ctttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatg 311  Q
     |||    || ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  9281197 ttttttgcttcctagcaccagatgttgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatg 9281255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Original strand, 9292069 - 9292226
Alignment:
Q  153 gtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgata 252  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||  |||| |||| | | |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  ||||| |    
T  9292069 gtaggacagacaaccctaaaagctgcatcaagcaaactag-caaacatgagaaagcgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttggatttgaca 9292167  T
Q  253 ctttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatg 311  Q
     |||    || ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  9292168 ttttttgcttcctagcaccagatgttgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatg 9292226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2904492 - 2904348
Alignment:
Q  167 cctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttcta 266  Q
    ||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||| |||||| || ||| |  || |  || |||    
T  2904492 cctaaaagttacgtcaagcaaaatagtcaaacatgagaaagcatgttccgacaatcaacatgattttatatcatttgtttgtgacatgtttggcttccta 2904393  T
Q  267 gcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatg 311  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  2904392 gcactagaggttgttgaccttctacgtaaagtttaaagggtcatg 2904348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 23793107 - 23792951
Alignment:
Q  199 atgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagt 298  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||| |||| |||| || ||   ||||| ||||| | |||  |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||    
T  23793107 atgagaaaatatgttttgacaatcaacatgcttctatatcaattatgtttgacacttttgttttcttagcaccacaggttgttgaccttctaaatacagt 23793008  T
Q  299 tcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
    ||||| | |||| |||||  |||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  23793007 tcaaaggatcatacatagtaatgtaatgtctcctaggtctataaatcttgtgtttac 23792951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 47679220 - 47679129
Alignment:
Q  199 atgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttcta 290  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||| ||||| | ||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  47679220 atgagaaagtgtgttctcacaatcaatatacttttatactatttgcgtttgacattttcggtttcctagcatcacaggttgttgaccttcta 47679129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 44526001 - 44525927
Alignment:
Q  278 tgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtt 352  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44526001 tgttgaccttctacatggagttcaaaagaatatgcataacaatgtcatgtctcctatatccatgaatgttgtgtt 44525927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 357
Target Start/End: Original strand, 36558853 - 36559037
Alignment:
Q  172 aagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcacc 271  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||| || |||||  || ||   |||||||||| | |||||||  |||||| ||||| | ||| | ||||||||||||    
T  36558853 aagttgtgttaattaaagtgatcaaagataagaaaacgtatttcaacaatcaacatgtttttatataatttgcatttgacatttttggttttctagcacc 36558952  T
Q  272 agaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    | | || |||||| |||| |||  |||| ||| |||||||||||   || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  36558953 aaaagtcgttgactttctccatagagtt-aaatggtcatgcatataaatatcatgtcttataggtccatgaatgttgtgtttacga 36559037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23037568 - 23037480
Alignment:
Q  271 cagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    ||||||||||||||| ||||| |   ||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23037568 cagaggttgttgaccatctacgtagggttcaaagggttatgcatagcaatgtcatttctcttaggtctatgaattttgtgtttacgagg 23037480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 255
Target Start/End: Original strand, 7637505 - 7637579
Alignment:
Q  180 tcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactt 255  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7637505 tcaagcaaagtggtcaa-catgagaaagtgtgctctgacgatcaataagcttttataccatttgcgtttgacactt 7637579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 319 - 359
Target Start/End: Original strand, 27027762 - 27027802
Alignment:
Q  319 atgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27027762 atgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttcacgagg 27027802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 315
Target Start/End: Original strand, 10032192 - 10032299
Alignment:
Q  208 tgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggt 307  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||| ||||   ||  |||||  ||| |||||| |||||||||||  |||||||| | |    
T  10032192 tgtgttctgacaatcaatatgtttttatactatttgcttttgatattttcagcttcttagcattagatgttgttaaccttctacatagagttcaaaggat 10032291  T
Q  308 catgcata 315  Q
    ||||||||    
T  10032292 catgcata 10032299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 47679345 - 47679294
Alignment:
Q  74 atgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccactt 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  47679345 atgggtaggaggaaaacatacatgtctagacttgactagggtttcaccactt 47679294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 5715069 - 5714980
Alignment:
Q  264 ctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttta 354  Q
    ||||||||||||  |||| || ||  ||||| |||||||| |||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5715069 ctagcaccagagactgttcacttttaacatggagttcaaa-ggtcatacataacaatgttatgtctcctaggtccataaatgttgtgttta 5714980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 38596737 - 38596635
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    ||||| || ||||||||| ||| |||||| ||||| |   |||||||||||||| |||||||||| |||| || |||| |||||||| | ||||||| ||    
T  38596737 ttcctgaccgacccactaaataaaagatcgacacttaagcatgtggatgttatggtgtacggatgtgtagaagaaaaatatgcatgtatggacttgactg 38596638  T
Q  112 ggg 114  Q
    |||    
T  38596637 ggg 38596635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 318 - 355
Target Start/End: Original strand, 45974730 - 45974767
Alignment:
Q  318 gatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45974730 gatgtcatgtctcctaggttcatgaatgttgtgtttac 45974767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 38839592 - 38839337
Alignment:
Q  28 tagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttct 127  Q
    ||||||||||||| ||  | ||| || | ||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || | ||||| || || |    
T  38839592 tagatagaagatcgacggttagacatatagatgttatggtgtacggatgtgtaagag-aaaacatgcatgtgtggacttgactgagatttcatca-ttgt 38839495  T
Q  128 agaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacac 227  Q
     | ||| || |||  | |||||| || || |||  |||| |||||||||| || ||  ||| | ||||||||||||||||  |||| || |||||||||     
T  38839494 gggatttggggtcgtgtcttttacggaagaacagacaactctaaaagttgcgtaaaataaaatcgtcaaacatgagaaagcatgttatgtcaatcaacat 38839395  T
Q  228 gc----ttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgtt 281  Q
    ||    |||||||  |||||||||||| ||||| || || ||| ||| ||||||||||    
T  38839394 gcatgtttttatataatttgcttttgacacttttgacttcctaacacgagaggttgtt 38839337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 354
Target Start/End: Original strand, 43333941 - 43333997
Alignment:
Q  298 ttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttta 354  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  43333941 ttcaaaaggtcatgcatatcaatgacatgtctcctagatctatgaatgttgagttta 43333997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 357
Target Start/End: Original strand, 45003019 - 45003067
Alignment:
Q  309 atgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  45003019 atgcatagcaatgttatgtctcataggaccatgaatgttgtgtttacga 45003067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 292
Target Start/End: Original strand, 45424755 - 45424813
Alignment:
Q  234 ataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctaca 292  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |   |||||||||||||    
T  45424755 ataccatttgcttttgaaactttcgacttcctagcaccagatgcccttgaccttctaca 45424813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 226
Target Start/End: Original strand, 34067869 - 34067901
Alignment:
Q  194 caaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaaca 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34067869 caaacatgagaaagtgtgttttgacaatcaaca 34067901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 53786003 - 53785644
Alignment:
Q  2 gcgcatgtga--ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtg 99  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53786003 gcgcatgtgaacttcctaactgacccgctagaaataagatcaacactcaggcatgcggatgttttggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtg 53785904  T
Q  100 tagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaaca 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  | | |||||||||| |||||||||  |||||| | ||| |||| ||||  | |||||  || |||| ||||||    
T  53785903 tagacttgactggggtttcaccactagtgggattaggtgtcgggccttttaccgtaggataggcagcccttaaagccgcgtcaagtaaggtggccaaaca 53785804  T
Q  200 tgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagtt 299  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  53785803 cgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagtt 53785704  T
Q  300 caaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53785703 caaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttatgtttacgagg 53785644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Original strand, 52741336 - 52741665
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  52741336 ttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcagacttgcagatgttgtggtatacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactg 52741435  T
Q  112 gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaa-gttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgt 210  Q
     ||||||||||||| | | ||||| |||  | |||||||| |||||||| ||| |||||||| | || ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||    
T  52741436 aggtttcaccacttgtgggattagatgtaggaccttttattgtaggacaggcagccctaaaaagctgagtcaaacaaattgaccaaacatgagaaagcgt 52741535  T
Q  211 gttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcat 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  52741536 gttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttttggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcat 52741635  T
Q  311 gcatagcgatgtcatgtctcctaggtccat 340  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  52741636 gcatagcaatgtcatgtctcctagatccat 52741665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 44199043 - 44198708
Alignment:
Q  18 actgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggttt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||| ||||||||    
T  44199043 actgacccactagatagaagatcaacactcaggcttgtggacattatggtgtatggatgagtaggtggaaaacatgttagtgtagacttgactggggttt 44198944  T
Q  118 caccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctga 217  Q
    |||||||| | | |||||||||| | |||||||  ||||| || ||| | |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  44198943 caccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggtcaggcagctctaaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctga 44198844  T
Q  218 caatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagc 317  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || |||| |||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  44198843 gaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcttaacacccgaggctgttgaccttctacatagagttcagaaggttatgcatagc 44198744  T
Q  318 gatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttt 353  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44198743 aatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttt 44198708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 39583062 - 39583401
Alignment:
Q  20 tgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttca 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  ||||| |    
T  39583062 tgacccactagatagaagatcgacacttaggcatgcggatgttatagtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgcgtggacttgacttaggtttta 39583161  T
Q  120 ccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgaca 219  Q
    |||||| | | |||| | ||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  39583162 ccacttgtgggattaagggtcgggccatttatggtaggataggcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgaca 39583261  T
Q  220 atcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcga 319  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| || ||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||| |    
T  39583262 atcaacatgcttttatatcatttgttttcgacactttcggtttcctagcatcataggttgttgaccttctgcatagagttcaaagggtcatgcatagcaa 39583361  T
Q  320 tgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  39583362 tgtcatgtctcctaggttcatgaatgtcgtgtttacgagg 39583401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 49018245 - 49017902
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||  ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  49018245 ttcctgactgacccactagatagaagattaacactcaggcatgcagatgttatggtgtacggattggtacgaggaaaacatgcatgtgtaaacttgactg 49018146  T
Q  112 gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtg 211  Q
    | |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  || || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  49018145 gagtttcaccacttgtggaattaggtgtcgagccttttacggtaggacaagcaaccctgaaagttacgtaaaacaaagtgaccaaacatgagaaagtgtg 49018046  T
Q  212 ttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatg 311  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||||  |||| | ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  49018045 ttctaacaatcaacatgtttttataccattttttttttacactttcggtttcctagcacccgaggttgttgatcttctacgtaaagttcaaaaggtcatg 49017946  T
Q  312 catagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    ||||   |||||||||    |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  49017945 catataaatgtcatgt----taggtcaatgaatgttgtgtttatgagg 49017902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 13582793 - 13582447
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgt--tgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgat 109  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |   |  ||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13582793 ttcctgactgatccattagatagaagatcaacactctggcttacggatgctatatggtgtatggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgac 13582694  T
Q  110 tggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtg 209  Q
     | ||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13582693 cgaggtttcaacacttgtgggattaggtgtcaggccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaatcaaagtgatcaaacataagaaagtg 13582594  T
Q  210 tgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtca 309  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||||    ||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  13582593 tgttctgacaatcaacgtgtttttataccatttg-tttttacacttttgatttcctagcaccaacaattgttgaccttctacagagagttcaaaaggtca 13582495  T
Q  310 tgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13582494 tgcataacaatgtcatgtctcctaggaccatgaatgttgtgtttacga 13582447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 38 - 354
Target Start/End: Original strand, 37132851 - 37133166
Alignment:
Q  38 atcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggt 137  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| | | | |||| ||    
T  37132851 atcaacactaagacatgtggatattatggtgtacggatgtgtagaaa-aaaacatgcatgtgtagacatgattgaggttttaccacctgtgggattaagt 37132949  T
Q  138 gtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttatac 237  Q
    ||||| |||||||| | || |||  || ||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  37132950 gtcagaccttttatcggagaacagacagccctaaaagctacgtcaagcaaagtggttaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttatac 37133049  T
Q  238 catttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtc 337  Q
    |||||| |||| | ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  37133050 catttgttttttacactttcggtttcttagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttctaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaagtt 37133149  T
Q  338 catgaatgttgtgttta 354  Q
     ||||||||||||||||    
T  37133150 aatgaatgttgtgttta 37133166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26772899 - 26772693
Alignment:
Q  153 gtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgata 252  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  26772899 gtaggacatgcatccctaaaagttgtgtcaagcaaagtggccaaacatcagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgaca 26772800  T
Q  253 ctttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtt 352  Q
    |||| |  || |||||| ||||||  |||||||||||| ||  ||| |||| | | ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772799 cttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctatatagagtacaaaggattatgcataacaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtt 26772700  T
Q  353 tacgagg 359  Q
    |||||||    
T  26772699 tacgagg 26772693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 81 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 38146269 - 38145993
Alignment:
Q  81 ggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgt 180  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||| |||| | | |||||| ||| |  |||| | ||||||||||||| |||||||||  |  |    
T  38146269 ggaggaaaatatgcatgtgaggacttgcatggggtttcacgacttgtgggattaggggtcggagctttgagggtaggacatgcagccctaaaagcggcat 38146170  T
Q  181 caatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgt 280  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |  ||||| |||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  38146169 caatcaaagtggtcaaacgcgagacaacgtgttttgacaatcaacatgtttttataccatttacatttgacacttttgacttcctagcaccagaggttgt 38146070  T
Q  281 tgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    | || |||||| |  |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38146069 ttacattctacttagagttcaaagggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaggtccatgaacgttgtgtttacga 38145993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 188 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32546901 - 32546730
Alignment:
Q  188 agtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgacctt 287  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  32546901 agtggccaaacatgagaaagcgtgttcggacaatcaacatacttttataccatttgcttttgacactttcagtttcctagcaccaaaggctgttgacctt 32546802  T
Q  288 ctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32546801 ctacatagagttcaaaaagtcatgcatagtaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttcacgagg 32546730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 56 - 354
Target Start/End: Original strand, 54508254 - 54508551
Alignment:
Q  56 ggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggta 155  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  |||||   ||    
T  54508254 ggatgttatggtgtacggatgggtagaag-aaaacatgcatgtgtgtacttgattggggtttcaccacttgttggattaggtgtcaggatttttacaata 54508352  T
Q  156 ggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgt-gttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatact 254  Q
     |||| ||| || |||| |||| ||||| |||| |||  ||||||||||||   | ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||| | |    
T  54508353 agacaagcagccataaa-gttgcgtcaaacaaaatggctaaacatgagaaaaacttgttctgacaattaacatgtttttatatcatttgcttttgacatt 54508451  T
Q  255 ttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttta 354  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||| | |||||| || | || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54508452 tttgattttctagcaccagaggttgttgaccttctgcataaggtacaaaggatcatgcgtaacaatatcatatctgctaggtccatgaatgttgtgttta 54508551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 7901128 - 7900797
Alignment:
Q  18 actgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggttt 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||      |||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7901128 actgactcactagatagaagatcaacacccgtatatgt------tatggtgtatagatgtgtaggaggaaaacatgcatgtgtggacttgactggggttt 7901035  T
Q  118 caccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctga 217  Q
    |||||||| | | |||||| ||  || |||||| ||||||||    | ||||||||  || ||||| |||| | | | |||||||||||| || ||||||    
T  7901034 caccacttgtgggattaggggttgggtcttttacggtaggacggatatccctaaaaactgcgtcaagcaaaatagccgaacatgagaaagcgttttctga 7900935  T
Q  218 caatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagc 317  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  || | | || ||||||    
T  7900934 caatcaacatgcttttataccatttgtttttgacactttcggcttcctagcatcagaggttgttgaccttctacatagagtttgaaggattatacatagc 7900835  T
Q  318 gatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
     |||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||    
T  7900834 aatgttatgtttcctaggtccatcaatattttgtttac 7900797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 131 - 357
Target Start/End: Original strand, 3443256 - 3443482
Alignment:
Q  131 attaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgct 230  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||   |  ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||    
T  3443256 attaggtgtcaggacttttacgataggacagagagtcctaaaagttgcgtcaagcaaaatggccaaacatgaaaaagtgtattctaacaatcaacatgct 3443355  T
Q  231 tttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctc 330  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||  ||||| ||||||    
T  3443356 tttataccattttctgttgacactttcagtttcctagcactagaggttgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgcgtaggaatgtcttgtctc 3443455  T
Q  331 ctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    |||  || |||||||||||||||||||    
T  3443456 ctaaatctatgaatgttgtgtttacga 3443482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 37992608 - 37992274
Alignment:
Q  18 actgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggttt 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||| || | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||    
T  37992608 actgacccacttgatagaagatggacacttaggtctgtagatgttatgatgtacggatgggtaggaggaaaacatgtgtgtgtggacttgatcggggttt 37992509  T
Q  118 caccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctga 217  Q
    || ||||  |   |||||  |||  |  ||||| ||||||||||  | ||||  |||||||||||| |||||||  |||||||||| |||  ||||||||    
T  37992508 catcactcatgagattagaggtcgagatttttacggtaggacatatagccctgcaagttgtgtcaaacaaagtgaccaaacatgaggaagcatgttctga 37992409  T
Q  218 caatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagc 317  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||  ||| |  ||  |||||| |||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||||| ||     
T  37992408 caatcaacatgattttatatcatttacttttgatggttttggcttcatagcactagaggttgttgaccttctacaaagagttc-aagggtcatgcacagt 37992310  T
Q  318 gatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttt 353  Q
     |||||||| ||| || || ||||||||||||||||    
T  37992309 aatgtcatgactcgtacgtgcatgaatgttgtgttt 37992274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 190 - 359
Target Start/End: Original strand, 26856765 - 26856934
Alignment:
Q  190 tggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttct 289  Q
    |||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  26856765 tggtcaaatatgataaagcgtgttgtgacaatcaacatgcttttataccatctgcttttgacgctttcgatttcctagcactagagactgttgaccttct 26856864  T
Q  290 acatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  26856865 acatagagttcaaagggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtttatgaatgttgtgcttgcgagg 26856934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5338885 - 5338581
Alignment:
Q  56 ggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtc-aggccttttatggt 154  Q
    |||||||| | |||| | |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| | | ||||||  |  ||  |||||| |||    
T  5338885 ggatgttacggtgtatgaatgggtagaagaaaaacatgcatctgtggacttgatttgggttacaccacttgtgggattagggatttagagcttttacggt 5338786  T
Q  155 aggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttc---tgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgat 251  Q
    ||||||   | |||||| ||||| ||||| |||| | | |||||||||||||||| |||    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  5338785 aggacagaaagccctaagagttgcgtcaaacaaaattgccaaacatgagaaagtgcgttgcgttgacagtcaacatgcttttatacaatttgcttttgac 5338686  T
Q  252 actttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgt 351  Q
    |||||||  || ||||||| |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||   |||||||||||    
T  5338685 actttcggcttcctagcactagagattgttgacattctacatagagttcaaaaggtcatgcgtagcaatgtcttgtctcataggtc---gaatgttgtgt 5338589  T
Q  352 ttacgagg 359  Q
    ||||||||    
T  5338588 ttacgagg 5338581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 357
Target Start/End: Original strand, 38978750 - 38978969
Alignment:
Q  138 gtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttatac 237  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||| ||||  || || |||||||||| | | ||||||||    
T  38978750 gtcagaccttttacggtaggaaatacaaccctaaaagttgtgtcaagcaaattggttagacatgtgaaaacgtattttgacaatcaatatgtttttatac 38978849  T
Q  238 catttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtc 337  Q
     ||||| |||||| ||||| | ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||     
T  38978850 tatttgtttttgacacttttggtttcctagcacctgaggccgttgaccttctacatatagttcaaaaggtgatgcataacaatgtcatgtctcataggtt 38978949  T
Q  338 catgaatgttgtgtttacga 357  Q
     || ||||||||||||||||    
T  38978950 tatcaatgttgtgtttacga 38978969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 357
Target Start/End: Original strand, 7501881 - 7502180
Alignment:
Q  57 gatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtag 156  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||  | |   |||| ||| ||| | ||| | |||    
T  7501881 gatgttatggtatacggattggtagaaggaaaacatgcatgtgtagacttaaccagggtttcaccactcgtgggtctaggggtcgggc-tgttacgatag 7501979  T
Q  157 gacatgcaaccctaaaagttgt-gtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgctttt-ataccatttgcttttgatact 254  Q
    |||| || ||| |||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| | |    
T  7501980 gacaagctaccgtaaaagtttttgtcaagtaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttcgaacaatcaacatgttttttataccattttcttttgacatt 7502079  T
Q  255 ttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttta 354  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| ||||||||| | | |||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||    
T  7502080 tttggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctaca--gagtttaaagggtcatgcacaacaatgtcatgactcatagatccatgaatattatgttta 7502177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 359
Target Start/End: Original strand, 38670885 - 38671052
Alignment:
Q  192 gtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctac 291  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| |  ||||||||| ||||||  | |||||||||||    
T  38670885 gtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgtttttgacacttttggctttctagcatcagaggcggatgaccttctac 38670984  T
Q  292 atgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    ||  |||  |||  || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38670985 atagagtctaaagagttatgcatagcaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtgtacgagg 38671052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 192 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 51234718 - 51234563
Alignment:
Q  192 gtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctac 291  Q
    ||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51234718 gtcaaacatgaaaaagcatgttatgacaaccaacatgcttttataccatttatttttgacactttcgactttctagcatcagaggttgttgaccttctac 51234619  T
Q  292 atgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgtt 347  Q
    ||  |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| | |||| ||||||    
T  51234618 atagagttcaaaaggttatgcataacaatgttatgtctcctaagcccattaatgtt 51234563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 199 - 355
Target Start/End: Original strand, 52411903 - 52412059
Alignment:
Q  199 atgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagt 298  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||   |||||| ||| ||| || |||||||||||||||  |||    
T  52411903 atgagagagcgtgttctgacaatcaacatgcttttattccatttgcttttgacactttcagctttctaacactagatgtcgttgaccttctacatagagt 52412002  T
Q  299 tcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||    
T  52412003 tcaaagggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagacccataaatattgtgtttac 52412059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25325241 - 25324966
Alignment:
Q  85 gaaaacatgcatgtgtagacttgattgggg-tttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaa 183  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||| ||| || | || ||  |||||| ||  ||||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||    
T  25325241 gaaaacatgcatgtatagatttaattgggggttttactatttatatgattaggggttgggccttttatggtaggacatgtagttctaaaagttgcgtcaa 25325142  T
Q  184 tcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacac--gcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgtt 281  Q
     |||||||   |||||| | |||  || || || |||||||||   | ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  25325141 gcaaagtgacaaaacattataaaacgtattttggcaatcaacatatgtttttataccatttgctttcaacactttcgatttcctagcaccatagattgtt 25325042  T
Q  282 gaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    ||||||||||||  |||||||| | ||||||||||| |||||| || |||||  ||||||||| ||||| ||||||    
T  25325041 gaccttctacatagagttcaaatgatcatgcatagcaatgtcaagtttcctaaatccatgaatattgtgcttacga 25324966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 357
Target Start/End: Original strand, 46940729 - 46940943
Alignment:
Q  146 ttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgct 245  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  46940729 ttttatggtaggacagacaactctaaaagatgcgtcaagcaaagtggccaaacattagaaaacatgttccgacaatcaacatgcttttataccatttgtt 46940828  T
Q  246 tttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgac---cttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatga 342  Q
    ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||  | |||||   |||||||||  |||||||| | |||||||   | |||||||| ||| ||||| |||||    
T  46940829 tttgacacttttgacgtcctagcaccatagactattgaccagcttctacatagagttcaaaggatcatgcacgacaatgtcatgactcataggttcatga 46940928  T
Q  343 atgttgtgtttacga 357  Q
    |||||||||||||||    
T  46940929 atgttgtgtttacga 46940943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 169 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4473186 - 4472998
Alignment:
Q  169 taaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagc 268  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||   |||||||| |||| ||||||| || ||||| | | |||||||| ||||| |||||| |||||||  || |||||    
T  4473186 taaaaattgcgtcaagcaaagtgtcaaaacatgaaaaagcgtgttctaaccatcaatatgtttttatactatttgtttttgacactttcggcttcctagc 4473087  T
Q  269 accagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgag 358  Q
    ||||||  || || ||||||||||| |||||||||   ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4473086 accagaa-ttcttaaccttctacataaagttcaaagaatcatgcatagcaatttcatgtctcctaggtctatgaatattgtgtttacgag 4472998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 270 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 44860 - 44781
Alignment:
Q  270 ccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgt 349  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44860 ccagaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtttcctaggtccatgaatgttgt 44781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21552766 - 21552603
Alignment:
Q  195 aaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatg 294  Q
    ||||||| |||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| | ||||  ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||     
T  21552766 aaacatgggaaaatgtattatgacaatcaacatgcttt-ataccatttatttttgacattttcagtttcctagcatcagagactgttgaccttctacata 21552668  T
Q  295 aagttcaaaaggtcatgcatag--cg--atgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
     |||||||||||||||||||||  ||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21552667 gagttcaaaaggtcatgcatagtacgtaatatcatatctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 21552603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 29862068 - 29861974
Alignment:
Q  23 cccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggttt 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  29862068 cccactagatagaagatcgacacttaggcatgcagatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtgaacttgactggggttt 29861974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 282 - 359
Target Start/End: Original strand, 4763888 - 4763964
Alignment:
Q  282 gaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4763888 gaccttctacatagagttcaaaaggttatgcatagcaatgtcatgtctcct-ggtccatgaatgttgtgtttacgagg 4763964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 43123292 - 43123085
Alignment:
Q  147 tttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgctt 246  Q
    |||| ||| |||||||||||| | ||||| |  |||| |||||||   |||||||| ||||  ||||||||||||||||| | | |||||| |||| |      
T  43123292 tttacggtgggacatgcaaccatcaaagtcgcatcaagcaaagtgtctaaacatgataaaggatgttctgacaatcaacatgttgttatactatttacga 43123193  T
Q  247 ttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgt 346  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||  || | ||||||  |||||| || ||| |    
T  43123192 ttgacacttttgattttctagcaccatagtttgttgactttctacaaaaagttcaaagggtcgtgcatagaaatattatgtcttataggtcaataaatat 43123093  T
Q  347 tgtgttta 354  Q
    ||||||||    
T  43123092 tgtgttta 43123085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 357
Target Start/End: Original strand, 25094632 - 25094742
Alignment:
Q  247 ttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgt 346  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| | | | ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||| || |||  || ||||||||||||    
T  25094632 ttgacacttttgactttctagcaccaaaagatattgaccttctacatatagttcaaatggtcatgcatagcaatgtaatatcttttaagtccatgaatgt 25094731  T
Q  347 tgtgtttacga 357  Q
    |||||| ||||    
T  25094732 tgtgttcacga 25094742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 250
Target Start/End: Original strand, 35484540 - 35484755
Alignment:
Q  35 aagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaatta 134  Q
    |||||| ||||| | ||||||| |||||||||  |||  || ||| |||| |||| || | ||||||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||    
T  35484540 aagatcgacacttaaatatgtgaatgttatgtcatacaaattggtgggagaaaaatatacgtgtgtagacttgactggggtttcacaacttgtgaaatta 35484639  T
Q  135 ggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgctttta 234  Q
     |  |   | |||||| |||||||||  ||||  |||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||| | ||||     
T  35484640 aggattgagacttttacggtaggacaaacaactttaaaaactatgtcaagtaaagtggtcaaacatgagaaaatatgttccaacaatcaacatgtttttg 35484739  T
Q  235 taccatttgcttttga 250  Q
    ||| |||||| |||||    
T  35484740 tactatttgcatttga 35484755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 357
Target Start/End: Original strand, 4669795 - 4669833
Alignment:
Q  319 atgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4669795 atgtcatgtctccttggtccatgaatgttgtgtttacga 4669833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 292 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 3643153 - 3643092
Alignment:
Q  292 atgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttt 353  Q
    |||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  3643153 atgaagttcaaaggatcatgcataacaatgtcatgttttttaggtccatgaatgttgtgttt 3643092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 35236413 - 35236317
Alignment:
Q  87 aaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaa 183  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | | | ||||||  ||  |||||||||||||||| | | | | |||||||||| |||||    
T  35236413 aaacatgcatgtgtggacttgattgaggtttcaccacctgtgggattagggatcgagccttttatggtaggataggtagctctaaaagttgcgtcaa 35236317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 42206124 - 42206004
Alignment:
Q  238 catttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgtt-gaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggt 336  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| || ||||  || ||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||  |||| |||| |||||| |    
T  42206124 catttgcatttgacacttttgactttctagcatcaaaggtaatttgacattctacatagagtttaaatggtcatgcatagaaatgtaatgtatcctagat 42206025  T
Q  337 ccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    |||| || |||||||||||||    
T  42206024 ccataaacgttgtgtttacga 42206004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 286 - 357
Target Start/End: Original strand, 7257655 - 7257726
Alignment:
Q  286 ttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    ||||||||  |||||||| ||  || |||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  7257655 ttctacatatagttcaaagggctatccatagcaatatcatgtattctaggtccatgaatgttgtgtttacga 7257726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 357
Target Start/End: Original strand, 46320025 - 46320087
Alignment:
Q  295 aagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    ||||||||| |||||  || | |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  46320025 aagttcaaagggtcacacacaacgatgtcatgacttctaggtccatgaatgtcgtgtttacga 46320087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 293
Target Start/End: Original strand, 3376790 - 3376847
Alignment:
Q  236 accatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacat 293  Q
    |||||||||||||||   ||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3376790 accatttgcttttgacttttttggtttcctagcactagaggttgttgaccttctacat 3376847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13772550 - 13772493
Alignment:
Q  193 tcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttga 250  Q
    ||||||||||||||  ||||||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  13772550 tcaaacatgagaaaacgtgttccatcaatcaacacacttttataccatttgcgtttga 13772493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24125310 - 24124967
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||   |||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  24125310 ttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcatatgttatggtctactgacgggtaggaagaaaacatgcatgtgtagacttgactg 24125211  T
Q  112 gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtg 211  Q
    |||||||||||||| | | |||| | |||  |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||| |||| ||| |||||||||||||| |||    
T  24125210 gggtttcaccacttgtgggattatgcgtcgtgccttttacggtgggacaagcagccctaaaagctgcatcaagcaaaatggccaaacatgagaaagcgtg 24125111  T
Q  212 ttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatg 311  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24125110 ctctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacaattttgatttcctagcaccagaggttgttggccttctacataaagttcaaaaggtcatg 24125011  T
Q  312 catagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24125010 catagcaatgtcatgtctcataggtccatgaatgttgtgtttac 24124967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 500499 - 500207
Alignment:
Q  22 acccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcacc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  500499 acccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatgttgtatggatgggtagaaggaaaacatgcatgtgtagacttgagtgaggtttcacc 500400  T
Q  122 acttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaat 221  Q
    |||| | | |||||||||| ||||||||| ||||||||   || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  500399 acttgtgggattaggtgtcgggccttttacggtaggaccgacagccctaaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaaacgtgttctgacaat 500300  T
Q  222 caacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcata 315  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||| |||| |  ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  500299 caacatgcttttataccatttacttttgacattttcggtttcctagtatgagagg-tgttggccttctacatagagttcaaaaggtcatgcata 500207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 61 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 38815517 - 38815229
Alignment:
Q  61 ttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggaca 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||| ||||||||| | | |||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  38815517 ttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgt----------ggggtatcaccacttgtgggattaggggtcggggcttttatggtaggaca 38815428  T
Q  161 tgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgat 260  Q
      || |||||||||    | ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||       
T  38815427 gacagccctaaaagccacgccaaacaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttccgc 38815328  T
Q  261 tttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38815327 ttcctagcaccagagggtgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 38815229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 39434943 - 39434602
Alignment:
Q  18 actgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggttt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  39434943 actgacccactagatagaagatcgacacttaggtctgtcgatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtgtacttgactggggttt 39434844  T
Q  118 caccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctga 217  Q
    |||||||| | |  ||||| ||   | ||||||  |||||||| | | | |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  39434843 caccacttgtgggtttaggggtggaggcttttacagtaggacaggaagctctaaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctga 39434744  T
Q  218 caatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagc 317  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || || |||||| ||||||   |||| |||||||||  ||| |||| ||| ||||||| |    
T  39434743 caatcaacatgcttttataccatttgtttttgacacttttgacttcctagcatcagaggcatttgatcttctacatagagtccaaagggttatgcatatc 39434644  T
Q  318 gatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
     |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39434643 aatgtaatgtctcttagatccatgaatgttgtgtttacgagg 39434602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 336
Target Start/End: Original strand, 35739818 - 35740135
Alignment:
Q  18 actgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggttt 117  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||| ||  |||  ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35739818 actgacccatttggtagaagatcaacacttaggcatgcagatgttatggtgtatgaatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtggacttgactggggttt 35739917  T
Q  118 caccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctga 217  Q
    |||||||  | | |||| | ||| ||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  35739918 caccactagtgggattaag-gtcgggccttttacggtaggacagacatccctaaaagttgtgttaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgggttctga 35740016  T
Q  218 caatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagc 317  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| |||||||| ||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |    
T  35740017 caatcaacatgtttttatacaattagcttttgacactttcagtttcctagcaccagagattgttgaccttctacatagagttcaaaaagtcatgcataac 35740116  T
Q  318 gatgtcatgtctcctaggt 336  Q
     |||||||||| |||||||    
T  35740117 aatgtcatgtcccctaggt 35740135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 355
Target Start/End: Original strand, 25021646 - 25021982
Alignment:
Q  19 ctgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||   ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||    
T  25021646 ctgacccactagatagaagatcgtcacttaggcctgcagatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtggacttgaccggagtttc 25021745  T
Q  119 accacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgac 218  Q
    ||||||| | | |||||| |||     |||||  ||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  25021746 accacttgtgggattaggggtcgatgtttttacagtatgacatacagccctaaaagttgtgtcaagcaaagtggtgaaatatgagaaagtgtgttctcac 25021845  T
Q  219 aatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcg 318  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||| | ||| |  || |||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||| | |     
T  25021846 aatcaacatgtttttataccattttcttttgacatttttggcttcctagcaccagaggttgttgaccatccacacaaagttcaaagggtcatgcacaaca 25021945  T
Q  319 atgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25021946 atgtcatatctcctaggtccaggaatgttgtgtttac 25021982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 56 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 3188207 - 3187906
Alignment:
Q  56 ggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggta 155  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||| | |  ||||| ||| || |||||| ||||    
T  3188207 ggatgttatggtgtacggatggattggaggaaaacatgcatgtgtggccttgtgtggggtttcaccacttgtgggtttagg-gtcggggcttttacggta 3188109  T
Q  156 ggacatgcaacc-ctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatact 254  Q
    ||||| | | || ||||||||||  |||| ||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3188108 ggacaggaagcctctaaaagttgcatcaagcaaagtggcaaaacatgaggaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgaaact 3188009  T
Q  255 ttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttta 354  Q
    ||||  || |||||| ||||||||||| |||||||||||  || ||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3188008 ttcggcttcctagcatcagaggttgttaaccttctacatagag-tcaaagggttatgcatagcaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttta 3187910  T
Q  355 cgag 358  Q
    ||||    
T  3187909 cgag 3187906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 169 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 6592700 - 6592512
Alignment:
Q  169 taaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagc 268  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||||    
T  6592700 taaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctcacaatcaacatgattttaaaccatttgcttttgacactttcagtttcctagc 6592601  T
Q  269 accagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgag 358  Q
     |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6592600 tccagaggttgttgaccttctgcatagagttcaaaaggtcatgcata-taatgtcatgtctcataggttcatgaatgttgtgtttacgag 6592512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 58 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10189779 - 10189587
Alignment:
Q  58 atgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtagg 157  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||| |   |||||| || | | |||||||||||||    
T  10189779 atgttatgttttacggattggtaggaggaaaacatgtatgtgtggacttgattgggatttcaccgcttgtgagattaggggttaaggcttttatggtagg 10189680  T
Q  158 acatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttga 250  Q
    |||| ||  ||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||    
T  10189679 acatacattcctaaaagttgcgccaattaaagtagtcaaacaagagaaagcatgttctgacaatcaacatgtttttatatcatttgcatttga 10189587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 169 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 6618409 - 6618221
Alignment:
Q  169 taaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagc 268  Q
    ||||||||| |||||  | ||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||||    
T  6618409 taaaagttgcgtcaaatagagtagttaaacatgagaaagcgtgttctcacaatcaacatgattttaaaccatttgcttttgacactttcagtttcctagc 6618310  T
Q  269 accagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgag 358  Q
     |||||| ||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6618309 tccagagattgttgaccttttgcatagcgttcaaaaggtcatgcata-taatgtcatgtctcataggtccatgaatgttatgtttacgag 6618221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 217 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 37514298 - 37514156
Alignment:
Q  217 acaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatag 316  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  37514298 acaatcaacatgcgtttatactatttgcttttgacactttcaatttcctagcgccagaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatat 37514199  T
Q  317 cgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    | |||| | ||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  37514198 caatgttacgtctcttaggtccatgaatgttgtattcacgagg 37514156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28196291 - 28196130
Alignment:
Q  195 aaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatg 294  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| | |||||||||||||| |||||| ||||| |  || ||||||||| |||||||||||| ||||| |     
T  28196291 aaacatgagaaagtgtgttatgataataaacatgtttttataccatttgtttttgacacttttgtcttcctagcaccataggttgttgaccatctacgta 28196192  T
Q  295 aagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacg 356  Q
     |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  28196191 gagttcaaaggatcatgcacaacaatgtcatgtctcctagatccacggatgttgtgtttacg 28196130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 4699999 - 4699810
Alignment:
Q  163 caaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattt 262  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| || | ||||||| ||||| |||| | ||||| |||||||| | || | ||||| |  ||    
T  4699999 caaccctcaaagttgtgtcaagcaaagtggccaaacatgataa-gcgtgttctcacaattaacatgtttttacaccatttg-tgttaacacttttggctt 4699902  T
Q  263 tctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
      |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4699901 catagcaccagaggctgttgaccttctatataaagttcaaa-ggtcatgaatagcaatattatgtcacctaggtccatgaatgttgtgtttac 4699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 8116038 - 8115752
Alignment:
Q  67 tgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaac 166  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||| |  ||||||||||||| ||| ||||   |||| |  ||||  ||||| ||| |||      
T  8116038 tgtacgaatgggtaagagaaaaacatgcatttgtgaacttgactaaggtttcaccacttgtaggattaatggtcatgattttttcggtagaacaagcagt 8115939  T
Q  167 cctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttcta 266  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||   |||||| | |||||| |  |||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||    
T  8115938 cctaaaagttatgtcaatcagagtggtcaaacgtaagaaatcttgttctaataatcaatatacttttataccatttgcatttgacacttttggtttttta 8115839  T
Q  267 gcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttta 354  Q
      |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||| |   | ||||||||||||| ||||||    
T  8115838 a-atgagaggttgttgaccttctacataaagttcaaaggatcatgcattgcaatgtcatgtttataaagtccatgaatgttatgttta 8115752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37517366 - 37517163
Alignment:
Q  22 acccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcacc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    ||   |||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  37517366 acccactagatagaagatcaacactcatgcctgcaaatgtgatggtgtacggatgggtaggtggaaaatatgtttgtgtagacttgactggggtttcgcc 37517267  T
Q  122 acttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaat 221  Q
    |||| | | |||||| ||  | |||||||  ||||||||  || | ||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  37517266 acttgttggattaggcgtaggaccttttaccgtaggacagacagctctaaaagctgcatcaagcaaagtggccaaacatgagaaagggtgttccgacaat 37517167  T
Q  222 caac 225  Q
    ||||    
T  37517166 caac 37517163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4073666 - 4073470
Alignment:
Q  163 caaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatacttt--cgat 260  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| |  ||||||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||  | ||    
T  4073666 caaccctaaaagttgcatcaaacaaagtggtcaaacaagagaaaacgtgttttaccaatcaacatgattttatacaatttgcatttgacacttttgccat 4073567  T
Q  261 tttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgag 358  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |  ||||   |||||||||||| ||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  4073566 ttt-tagtaccagaggttgttgaccttctacagagaaatcaatgagtcatgcatagcaatgtcatgtttccaagatccgtgaatgttgtgtttacgag 4073470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 245 - 359
Target Start/End: Original strand, 22589395 - 22589508
Alignment:
Q  245 ttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaat 344  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  22589395 ttttgacactttcggtttcctagcaccagaggctgttgacttt-tacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcataggtctatgaat 22589493  T
Q  345 gttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||||| ||||||    
T  22589494 gttgtgttcacgagg 22589508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 357
Target Start/End: Original strand, 8540260 - 8540550
Alignment:
Q  69 tacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccc 168  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||| || ||||| ||||  |||||| || || | | |||||  ||| || ||||||||||| ||||  ||| |     
T  8540260 tacggatgggtagaaagaaaacatgtatgcgtggactttattgatgtttcatcatttgttggattagaggtc-ggacttttatggtaagacaaacaatct 8540358  T
Q  169 taaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagc 268  Q
    ||||||||| ||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||  ||| ||| ||||| |||||| | |||||| |    
T  8540359 taaaagttgcgtcaaacaaaatagtcaaacattagaaaatgtgttctaacaatcgacatgtttttatgtcatctgcatttgacactttcaactttctaac 8540458  T
Q  269 accagaggttgttgaccttctac---atgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    | |||||||||||||| ||||||   || ||||||||| |||||||| || | ||||||||| | |||  | ||| ||||||||||||||||    
T  8540459 atcagaggttgttgactttctacataataaagttcaaagggtcatgcttaacaatgtcatgttttctattttcataaatgttgtgtttacga 8540550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 179 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8882442 - 8882339
Alignment:
Q  179 gtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggtt 278  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  8882442 gtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaatatgcttttaaaccatttgtttttga-actttcagttttctagcaccagaggtt 8882344  T
Q  279 gttga 283  Q
    |||||    
T  8882343 gttga 8882339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 264 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3821254 - 3821159
Alignment:
Q  264 ctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  3821254 ctagaaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaagggtaatgcatagcaatgtcatgtctcctaggttcataaatgttatgtttacgagg 3821159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 256
Target Start/End: Original strand, 42921965 - 42922196
Alignment:
Q  25 cactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccact 124  Q
    ||||| |||||||||  ||||| |  ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||| |||||| ||      
T  42921965 cactatatagaagattgacacttacgtatgtagatgttatggtgtacagatgggtaggaggaaaacaaacatgtgtggacttgactggagtttcatcaaa 42922064  T
Q  125 tctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaa 224  Q
      |   ||||   |||||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||    
T  42922065 cgtgagattaatggtcagagcttttatggtaagacatgcagccataaaagttgcgtcaaacaaaatggtcaaatttgagaaaacgtgttttgacaatcaa 42922164  T
Q  225 cacgcttttataccatttgcttttgatacttt 256  Q
     | ||||||| | ||||||| ||||| |||||    
T  42922165 aatgcttttaaatcatttgcctttgacacttt 42922196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 252 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18804654 - 18804548
Alignment:
Q  252 actttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgt 351  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| || || |||| |||    
T  18804654 acttttgatttcctagcaccagaggctgttgaccttctacatagatttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgactcctaggttca-gagtgttttgt 18804556  T
Q  352 ttacgagg 359  Q
    ||||||||    
T  18804555 ttacgagg 18804548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 230 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43824053 - 43823927
Alignment:
Q  230 ttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtct 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |  || || |||  ||||| | ||||||||  ||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  43824053 ttttataccatttgcttttgacacttttggcttccttgcattagaggctattgacctttcacatagagttcaaatggtcatgcatagcaatgtcatgtct 43823954  T
Q  330 cctaggtccatgaatgttgtgtttacg 356  Q
    || || ||||| |||||||||||||||    
T  43823953 ccgagatccattaatgttgtgtttacg 43823927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 8620045 - 8619815
Alignment:
Q  57 gatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtag 156  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||      |||||  |||||| |||||||||||||||| | | |||||   ||  | |||||| | |||    
T  8620045 gatgttatggtgtacgaatgggtaagaggaaaa------tgtgtgaacttgactggggtttcaccacttgtgggattagagatcgtgacttttacgatag 8619952  T
Q  157 gacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatacttt 256  Q
     |||  || |||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||| |||| | | |||    
T  8619951 aacagacagccctaaaagttgcgtcaagtaaaatggtcaaacatgaaaaagcgtattttgacaatcaacgtgcttttataccatttgtttttaacatttt 8619852  T
Q  257 cgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacat 293  Q
     |  |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8619851 tggctttctaacaccagaggttgttgactttcgacat 8619815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 359
Target Start/End: Original strand, 121722 - 121893
Alignment:
Q  186 aaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgacc 285  Q
    ||||| |||||| |||| ||| |||||||  ||| |||||| |||| |||   |||||||||||| |||||  | || |||||  ||||| ||||||||     
T  121722 aaagttgtcaaatatgataaaatgtgttcgcacagtcaacatgcttatatt--atttgcttttgaaacttttaacttcctagcctcagagattgttgaca 121819  T
Q  286 ttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||||  ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  121820 ttctacacaaagtttaaaagatcatgcatatcaatgtcatgtcatctaagtccatggatgttgtgtttacgagg 121893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 272 - 357
Target Start/End: Original strand, 9259377 - 9259462
Alignment:
Q  272 agaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |   ||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9259377 agaggttgttgaccttctacatagagttcacagactcatgcatagcaatgtcatatatcctaagtccatgaatgttgtatttacga 9259462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 264 - 325
Target Start/End: Original strand, 40223480 - 40223541
Alignment:
Q  264 ctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcat 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  40223480 ctagcaccggaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcat 40223541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 69 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 40839776 - 40839727
Alignment:
Q  69 tacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttc 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40839776 tacgggtgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggagtttc 40839727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3863383 - 3863249
Alignment:
Q  228 gcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgt 327  Q
    |||||||| |||||||| | ||| ||||| |  || |||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||  |||||||| ||||||| |    
T  3863383 gcttttattccatttgcatgtgacacttttggcttcctaggaccagaggttattgaccttctacatagagttcaaagggtagtgcatagcaatgtcatct 3863284  T
Q  328 ctcctaggtccatgaa---tgttgtgtttacgagg 359  Q
     ||||| ||| |||||   ||||||||||||||||    
T  3863283 ttcctaagtctatgaatattgttgtgtttacgagg 3863249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 319 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8882319 - 8882279
Alignment:
Q  319 atgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8882319 atgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 8882279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 309 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24451105 - 24451057
Alignment:
Q  309 atgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24451105 atgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttcacga 24451057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 347
Target Start/End: Original strand, 39671170 - 39671332
Alignment:
Q  186 aaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttg-atactttcgattttctagcaccagaggttgttgac 284  Q
    ||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||  ||||  | | |||||  || |||||||||||||||||| ||    
T  39671170 aaagtggccaaaccagagaaagcgtgttttgacaattaacatgtttttatacaatttatttttttacattttcggcttcctagcaccagaggttgttaac 39671269  T
Q  285 cttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgtt 347  Q
    ||| ||| |  |||| ||| ||||||| |||   |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39671270 cttttacgtagagttaaaagggtcatgaataaaaatgtcatgtctcctagatccatgaatgtt 39671332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 36004230 - 36004069
Alignment:
Q  186 aaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgacc 285  Q
    |||||||  ||| |||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | ||| || || ||| ||||||||||||||||||    
T  36004230 aaagtggctaaatatgacaaagtgcgttatgacaatcaacatgtttttataccatttacatttgacatttttgacttcctatcaccagaggttgttgacc 36004131  T
Q  286 ttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgtt 347  Q
     |||| |   ||||  || ||||||| ||| | |  | ||||||| ||||||||||||||||    
T  36004130 atctaaaaagagtttcaagggtcatggataacaacattatgtctcataggtccatgaatgtt 36004069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6121064 - 6120938
Alignment:
Q  195 aaacatgagaaagtgtgt--tctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctaca 292  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||| ||| ||  ||||| ||||| | |||||||| |||| |||| ||||| || |||||    
T  6121064 aaacatgagaaagtgtgtattctcacaatcaacatgtttttatagcatgtg--tttgacacttttggttttctagtaccaaaggtcgttgatctcctaca 6120967  T
Q  293 tgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatg 321  Q
       ||||||||||||||||| || |||||    
T  6120966 aagagttcaaaaggtcatgcgtatcgatg 6120938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 264 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3825665 - 3825572
Alignment:
Q  264 ctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||   | ||||||  || ||||||||| | ||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  3825665 ctagaaccataggttgttgaccttctacacagaattcaaagagtaatgcatagcaacgtcatgtttcatagatccatgaatattgtgtttacga 3825572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 272 - 359
Target Start/End: Original strand, 5329687 - 5329774
Alignment:
Q  272 agaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||| | | | || |||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  5329687 agagattgttgaccttctgcattgagttcaaagggtcatggacaacaatatcatgtctcctatgtctatcaatgttgtgtttatgagg 5329774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 58 - 218
Target Start/End: Original strand, 11611120 - 11611275
Alignment:
Q  58 atgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtagg 157  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||  | | ||||    | ||| |||||| | || |    
T  11611120 atgttatggtgtatgaatgggtagg-ggaaaacatgcatgtgtggacttcacaggggtttcaccactcgtgggatta----tgagggcttttacgataag 11611214  T
Q  158 acatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgac 218  Q
    | |  || ||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  11611215 atagacatccctaaaagttgtgtcaaataaagtggccaaatatgagaaagcatgttctgac 11611275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 42659212 - 42659162
Alignment:
Q  309 atgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    ||||||||| || | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42659212 atgcatagcaatattatgtcttctaggttcatgaatgttgtgtttacgagg 42659162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 108
Target Start/End: Original strand, 39671015 - 39671108
Alignment:
Q  15 ctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttga 108  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||| | || | || |||||||| | |||   |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  39671015 ctaactgacccactagatattagatcgacatttaggtctgcggatgttacggtgtctagatgggtaggagaaaaatatgcatgtgtggacttga 39671108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 34644842 - 34644503
Alignment:
Q  18 actgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggttt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  34644842 actgacccactagatagaagatcgacacttaggtatgcggatgttatggtgtatggatgggctggaggaaaacatgcatgtgtggacttgactggggttt 34644743  T
Q  118 caccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctga 217  Q
    |||||||| | |  ||||| ||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  34644742 caccacttgtgggtttaggggtcggggcttttacggtaggacaagcaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctga 34644643  T
Q  218 caatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagc 317  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||||| |    
T  34644642 caacctacatgcttttataccatttgtttttgacactttcggcttcctagcatcagaggttgttgaccttctacatagagtccaaagggttatgcatatc 34644543  T
Q  318 gatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34644542 aatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 34644503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 334
Target Start/End: Original strand, 29169619 - 29169940
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29169619 ttcctgactgacccgctagaaagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggataggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgactg 29169718  T
Q  112 gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtg 211  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||  ||||||||  || |||| |||||||||||||  || |||| |||||| ||||||  |||    
T  29169719 gggtttcaccactt-tgggattaggtgtcgggccttttaccgtaggacagacagcccttaaagttgtgtcaagtaaggtggccaaacacgagaaaacgtg 29169817  T
Q  212 ttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatg 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29169818 ttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttaaccttctacatagagttcaaaaggtcatg 29169917  T
Q  312 catagcgatgtcatgtctcctag 334  Q
    || ||| ||||||||||||||||    
T  29169918 cacagcaatgtcatgtctcctag 29169940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 28040952 - 28041290
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  28040952 ttcctgactaacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcagatgttatggtgtacagatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactg 28041051  T
Q  112 gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtg 211  Q
    ||||||||| |||| | | |||||||||| | |||||||  |||||| | ||| | ||||||   | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28041052 gggtttcactacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggataggcagctctaaaatccgcgtcaaacaaagtggccaaacatgagaaagtgtg 28041151  T
Q  212 ttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatg 311  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28041152 ttctgacaatcaacaggtttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggcggttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatg 28041251  T
Q  312 catagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtg 350  Q
    |||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  28041252 catagcaatgtcatgtcctctaagtccatgaatgttgtg 28041290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 359
Target Start/End: Original strand, 45659487 - 45659818
Alignment:
Q  27 ctagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttc 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||   |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||     
T  45659487 ctagaaagaagatcaacactcaggcatgcacatgttatagtgtacagatgggtaggaggaaaacatgcatgcgtagacttgactggggtttcaccacttg 45659586  T
Q  127 tagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccct-aaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaac 225  Q
    | | ||||||| || |||||||||  |||||||||||| |||| ||||| || |||||  || |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  45659587 tgggattaggtatcgggccttttaccgtaggacatgcagcccttaaaagctgcgtcaagtaaggtggccaaacacgagaaagcgtgttctgacaatcaac 45659686  T
Q  226 acgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcat 325  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  45659687 atgcttttataccatttgcttttgacactttcgatttcctatcaccagaggctgttgaccttct--atagagttcaaaagatcatgcatagcaatgtcat 45659784  T
Q  326 gtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  45659785 gtctcctaggtcaataaatgtcgtgtttacgagg 45659818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 57 - 359
Target Start/End: Original strand, 4861859 - 4862161
Alignment:
Q  57 gatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtag 156  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| | | |||||| |||  | | ||||||||||    
T  4861859 gatgttatggtgtacggatgggtaggagaaaaacatgcatgtgtggatttgactggtgtttcaccacttgttggattaggggtcttgacatttatggtag 4861958  T
Q  157 gacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatacttt 256  Q
    ||||  || || ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4861959 gacagacagccttaaaagttgcgtcaagtaaaatggtcaaacatgagaaagcgtcttctgacaagcaacatacttttatacaatttgcttttgacacttt 4862058  T
Q  257 cgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacg 356  Q
    |||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  4862059 cgatttcctaacaccaaaagttgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgcataacaatgtcacgtcccttagatccatgaatgttgtgattacg 4862158  T
Q  357 agg 359  Q
    |||    
T  4862159 agg 4862161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19035729 - 19035465
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  19035729 ttcctgaccgacccactagataaaagatcaacactcaggtatgtggacgttttggtgtacggatgggtaggtggaacacatgcttgtgtagacttgactg 19035630  T
Q  112 gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtg 211  Q
    || |||||||| || | | |||||||||| | |||||||  ||||| || ||| ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  19035629 ggatttcaccagttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtagggcaggcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtg 19035530  T
Q  212 ttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagagg 276  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||||    
T  19035529 ttctgacaatcaacatgcttttataccatttacttttgacacttacggtttcctagcaccagagg 19035465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 84 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22347103 - 22346830
Alignment:
Q  84 ggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaa 183  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| | || |||| | || | | |||||  ||||||||  ||||| |||||||| ||||||    
T  22347103 ggaaaacatgcttctgtagacttgattggtgtttcaccacttgtgga-ttagatttcggactttttaccgtaggacaaacaacc-taaaagttatgtcaa 22347006  T
Q  184 tcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttga 283  Q
     |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||||||||    
T  22347005 gcaaagtggccaaatatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcgtttataccttttgcttttgacactttcggtttcctagtagcagaggttgttga 22346906  T
Q  284 ccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  22346905 ccttctacacagagttcaaaaggtcatgcatagaaatgtcatgtctcctaggtttatgaatgttgtgttcacgagg 22346830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 354
Target Start/End: Original strand, 20259649 - 20259964
Alignment:
Q  38 atcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggt 137  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| ||| | | |||||||    
T  20259649 atcaacaccgagacatgtggatgttatggtgtacagatgggtagg-gaaaaacatgcatgtgtagacatgactagggttttaccgcttgtgggattaggt 20259747  T
Q  138 gtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttatac 237  Q
    ||||| |||||||  | |  ||| | | ||||||||| |  ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20259748 gtcagaccttttaccggaaaacaggtagccctaaaagctacgtcaagcaaagtggttaaaaatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttatac 20259847  T
Q  238 catttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtc 337  Q
    |||||  | |||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||     
T  20259848 catttattgttgacactttcggtttcttagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagtaatgtcatgtctcataagtt 20259947  T
Q  338 catgaatgttgtgttta 354  Q
     || |||||||||||||    
T  20259948 aataaatgttgtgttta 20259964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 87 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 2764686 - 2764416
Alignment:
Q  87 aaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatca 186  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |  ||||| ||  |  |||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||  ||    
T  2764686 aaacatgcatgtgtgaacttgattgaggtttcaccacttgtgggtttaggggttggtgcttttatggtaggataggcagtcctaaaagttgtgtcagaca 2764587  T
Q  187 aagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgacct 286  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  2764586 aagtggtcaaacatgagaaaacgtgttccgacaatcaacatgcttttatgccattttcttttgacactttcagcttcctagcatcagaggttgttgacct 2764487  T
Q  287 tctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    ||||||| |||| |||| ||| ||||| | | |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2764486 tctacataaagtccaaagggttatgcaaatcaatgttatgtctcttaggtccataaatgttgtgtttacga 2764416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 56 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 2898929 - 2898637
Alignment:
Q  56 ggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggta 155  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||      || ||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||||| |||||||||         
T  2898929 ggatgtcatggtgtacggatgggtatgaggaaaac------gtttagacttgatttgggtttcaccacttgtgtgattaggtgtcgggcctttta----- 2898841  T
Q  156 ggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtg----tgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgat 251  Q
       |||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  2898840 ---catgcaaccctaaaagatgcatcaagcaaagtggccaaacatgagaaagtgagcgtgttctgacaatcaata-gtttttataccatttgcttttgat 2898745  T
Q  252 actttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgt 351  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| | || ||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  2898744 actttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaagatcatgcataacaatatcatgtctcatacgatcatgaatgttgtgt 2898645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 194 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21473103 - 21472949
Alignment:
Q  194 caaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacat 293  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21473103 caaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgacacttgcagtttcctagcaccagaggctgttgaccttctacat 21473004  T
Q  294 gaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttg 348  Q
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21473003 agagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttg 21472949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 131 - 359
Target Start/End: Original strand, 31737267 - 31737494
Alignment:
Q  131 attaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgct 230  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| || |  |  |||||||||  | ||||| |||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||| |||    
T  31737267 attaggtgtcagaccttttacggtaagataaacggccctaaaagcggcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaaacatattctgacaatcaacatgct 31737366  T
Q  231 tttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctc 330  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||    
T  31737367 tttataccatttgtttttgacactttcgattttctagcattagaggctattgacattctacatagagttcaaaaggtcatgcatatcaatgttatgtttc 31737466  T
Q  331 ctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  31737467 ctagatccatgaat-tagtgtttacgagg 31737494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 202 - 359
Target Start/End: Original strand, 24177526 - 24177683
Alignment:
Q  202 agaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttca 301  Q
    ||||||||||| | |||||||||||   |||||||||||||| |||||| | ||||| ||| |||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||    
T  24177526 agaaagtgtgtaccgacaatcaacatatttttataccatttgtttttgacagtttcggtttcctagcatcagaggctgtttaccttctacatagagttca 24177625  T
Q  302 aaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24177626 aaaagtcatgcatagcaatgtcatatctcctaggtccatgaatgttgtgttcacgagg 24177683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 199 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 38731704 - 38731545
Alignment:
Q  199 atgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagt 298  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||| |  ||  ||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  38731704 atgagaaagcgtgttctgacaatcaacatacttttatacaatttgcttttgaaacttttggcttcttagcaccagaggttgttaaccttctacatagagt 38731605  T
Q  299 tcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgag 358  Q
    ||||| ||||||||| |   |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38731604 tcaaagggtcatgcacaataatgtcatgactcctaggtccatgaatattgtgtttacgag 38731545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 340
Target Start/End: Original strand, 37932052 - 37932370
Alignment:
Q  21 gacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcac 120  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||| ||   || |||||||||| |||||  ||||  |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  37932052 gacccattagatagaaaatcgacacttaggcctgcggatgttatgatgtacatatggacaggaggaaaacatgcatgcgtggacttgattgaggtttcac 37932151  T
Q  121 cacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaa 220  Q
    ||||| | | |||||| | || | ||||||  ||| ||||  || |||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  37932152 cacttgtgggattaggggccaaggcttttacagtaagacagacagccctaaaagttgtgtcaagcaaaatggtcaaatacgagaaag-gtgttctgacaa 37932250  T
Q  221 tcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgat 320  Q
    |||||  | ||||| |  |||   |||| | |||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||| |||   || |||||||  ||    
T  37932251 tcaacgtgtttttacattattatttttttacactttcggcttcctagcaccagaggatgttgacattctatattgagtttaaacattcgtgcatagtaat 37932350  T
Q  321 gtcatgtctcctaggtccat 340  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  37932351 gtcatgtctcataggtccat 37932370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Original strand, 50161258 - 50161596
Alignment:
Q  28 tagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttct 127  Q
    ||||||||||||||||||   | | |||  |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |  |   ||||||||||  |    
T  50161258 tagatagaagatcaacacatgggtctgtatatgttatggtgtacggttgggtaagagaaaaacatgcatgtgtggacttaaccgatatttcaccactcgt 50161357  T
Q  128 agaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacac 227  Q
     |||||||| |    | |||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  50161358 ggaattaggggctgagacttttacggtaggacagacaaccctaaaagttgcgtcaagcaaagtggacaaacatgagaaagcgtgttctcacaatcaacat 50161457  T
Q  228 gcttttataccatttgctttt---gatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtca 324  Q
    ||||||||| |||||  ||||    ||||||| |  |  ||||||||| |||||| |||| ||||||||  |||||||| | ||||||| ||| ||| ||    
T  50161458 gcttttatatcatttttttttttatatacttttggctccctagcaccaaaggttgatgacattctacatagagttcaaaggatcatgcagagcaatg-ca 50161556  T
Q  325 tgt-----ctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||     | | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50161557 tgttacgacacataggtccatgaatgttgtgtttaagagg 50161596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 57 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 42920096 - 42919832
Alignment:
Q  57 gatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtag 156  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||| | |||||| |||  | | |||| | ||| |  |||||||| |||    
T  42920096 gatgttaaggtgtacagatgggtaggaggaaaacatatttgtgtgggcttgattgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgatag 42919997  T
Q  157 gacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatacttt 256  Q
    ||||  |||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||  ||||||| |||||||||| | ||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  42919996 gacaaacaaccctaaaagttgcatcaaacaaagcggccaaacatgagaaac-gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgcttttgacacttt 42919898  T
Q  257 cgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgt 322  Q
     ||||| | ||||  |||| ||||| |||||||||||  |||| ||| ||||||||| ||| ||||    
T  42919897 tgatttccaagcagtagagattgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 42919832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 256
Target Start/End: Original strand, 25375674 - 25375902
Alignment:
Q  28 tagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttct 127  Q
    ||||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | || || ||||   ||||||||| |||  |    
T  25375674 tagatagaagattgacacttaggtctgcagatgttatggtatacggatgggtagaaggaaaacatgcaagcgtggatttgaccagggtttcactactcgt 25375773  T
Q  128 agaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacac 227  Q
     | |||||| |||||  |||||| |||||||||  |||| | |||||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||   |||||| || |||||||     
T  25375774 cggattaggggtcagagcttttacggtaggacagacaactccaaaagttgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgacaaaacatgttcttaccatcaacat 25375873  T
Q  228 gcttttataccatttgcttttgatacttt 256  Q
    | |||||||||||||||| |||| |||||    
T  25375874 gtttttataccatttgctattgacacttt 25375902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 230 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 7213314 - 7213187
Alignment:
Q  230 ttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtct 329  Q
    ||||||| |||||  |||||| ||||||| ||| ||||||  ||||  |||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  7213314 ttttatatcatttatttttgacactttcggtttcctagcattagagactgttgagcttctgcataaagttcaaaatgtcatgcataataatgtcatgtct 7213215  T
Q  330 cctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||    
T  7213214 tctaggtccatgaatgttgtgttcacga 7213187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 230 - 356
Target Start/End: Original strand, 18616196 - 18616322
Alignment:
Q  230 ttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtct 329  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||||||| || | |||| |    
T  18616196 ttttataccatttgtttttaacactttcgactttctagcacccgaggctgttgacattctacatataattcaaagggtcatgcatagcaatattatgtat 18616295  T
Q  330 cctaggtccatgaatgttgtgtttacg 356  Q
    | ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  18616296 cttaggtccataaatattgtatttacg 18616322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 355
Target Start/End: Original strand, 50314622 - 50314791
Alignment:
Q  185 caaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgac 284  Q
    |||||||||||||||||| |||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||  |||| ||| ||| ||| |||||||||    
T  50314622 caaagtggtcaaacatgacaaaacttgttctcacaatcaacatgcttttataccatttacttttgacattttttatttcctaacacaagatgttgttgac 50314721  T
Q  285 cttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
     ||||||||  |||||||| ||| || |  | | |||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||    
T  50314722 tttctacatagagttcaaagggttatacgcaacaatgtcatgactccta-gtccatgaataatgtgtttac 50314791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 230 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 47459746 - 47459618
Alignment:
Q  230 ttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtct 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| | ||||||  |||||||||||||||  ||| |||| |   ||||||||| |||| ||||||    
T  47459746 ttttataccatttgcttttgatacttttggcttcctagtatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggaatatgcatagcaatgttatgtct 47459647  T
Q  330 cctaggtccatgaatgttgtgtttacgag 358  Q
    |||| ||| || |||||||||||||||||    
T  47459646 cctaagtctataaatgttgtgtttacgag 47459618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16500183 - 16500035
Alignment:
Q  145 cttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgc 244  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||||   ||||||| |||| || |||||   |||||| ||||| |||| || ||||||| ||||||    
T  16500183 cttttacggtaggacagacaatcctaaaagttgcgtcacgtaaagtggccaaatataagaaaacatgttctaacaattaacatgcctttatactatttgc 16500084  T
Q  245 ttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacat 293  Q
    |||||| ||||| || || ||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  16500083 ttttgacacttttgacttcctagcattagaggctgttgaccttctacat 16500035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 344
Target Start/End: Original strand, 868513 - 868560
Alignment:
Q  297 gttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaat 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  868513 gttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaagtccatgaat 868560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 237
Target Start/End: Original strand, 35387653 - 35387710
Alignment:
Q  180 tcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttatac 237  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  35387653 tcaagcaaagtggccaaacatgaaaaagtgtgttctgacgatcaacaagcttttatac 35387710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 38731862 - 38731714
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | | | | |  ||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||| |     
T  38731862 ttccttactgacccactagatagaagatcgatagttaaacttgcagatattatggtgtgcggatgggtaggaggaaaatatgcaaatgtggatttgacta 38731763  T
Q  112 gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggaca 160  Q
    |||||||||||||  | || ||||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  38731762 gggtttcaccactcgttgatttaggggtcgggtcttttatggtatgaca 38731714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37200122 - 37200028
Alignment:
Q  154 taggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgctttt 248  Q
    ||||||||||| || ||||||||  |||||  ||||||||||||||| ||||||  ||| || |||||||| | | |||||||||||||| ||||    
T  37200122 taggacatgcagccataaaagttacgtcaagtaaagtggtcaaacataagaaagcatgtgctaacaatcaatatgtttttataccatttgttttt 37200028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 30688532 - 30688492
Alignment:
Q  319 atgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30688532 atgtcatgactcctgggtccatgaatgttgtgtttacgagg 30688492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36486994 - 36486906
Alignment:
Q  186 aaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccaga 274  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |   |||||||  |||||||||||| ||||| | |||| || |||||||    
T  36486994 aaagtggtcaaatatgagaaagcgtgttttgacaatcaatatctttttatataatttgcttttgacacttttggttttttatcaccaga 36486906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 11128363 - 11128422
Alignment:
Q  296 agttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  11128363 agtttaaaaggtcatgcatatcaatgttatgtctcctaggtctataaatgatgtgtttac 11128422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 22347153 - 22347122
Alignment:
Q  18 actgacccactagatagaagatcaacactcag 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22347153 actgacccactagatagaagatcaacactcag 22347122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33519 - 33185
Alignment:
Q  26 actagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacat--gcatgtgtagacttgattggggtttcaccac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  33519 actagatagaagatcaacactcaggcatgcggatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatatgcatgtgcaaacttgattggggtttcaccac 33420  T
Q  124 ttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatca 223  Q
    || | | |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||| || |  |||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33419 ttatgggattaggtgtcgggccttttacggtaggacaggcaaccttaaa-gtggcatcaagcaaagtggctaaacatgagaaagcgtgttctgacaatca 33321  T
Q  224 acacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtc 323  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||| | ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |     
T  33320 acatgtttttataccatttacttttgacattttcggtttcctaacaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatttt 33221  T
Q  324 atgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  33220 atgtctcctaggtccatgaacgtcgtgtttacgagg 33185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 41 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 959833 - 959516
Alignment:
Q  41 aacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtc 140  Q
    |||||||||  ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | | ||||||||||    
T  959833 aacactcaggcatgcggatgttacagtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtggacttgattgaagtttcaccacttatgggattaggtgtc 959734  T
Q  141 aggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccat 240  Q
     ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  959733 gggccttttacggtaggacaaacaaccctaaaagttgtgtcaagcaaagtggctaaccatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgtctttataccat 959634  T
Q  241 ttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccat 340  Q
    ||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  959633 ttgtttttgacattttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacgt-aagttcaaaaggtcatgcatagcaatgttgtgtctcctaggtccat 959535  T
Q  341 gaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||||||||||||||||    
T  959534 gaatgttgtgtttacgagg 959516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 4206429 - 4206768
Alignment:
Q  20 tgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttca 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4206429 tgacccactagataaaagatcaacactcaagcctgcggatgttatggtgtacaaatgggttggaggaaaacatgcatgtgtagacttgactggggtttca 4206528  T
Q  120 ccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgaca 219  Q
    |||||| | | ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  4206529 ccacttgtgggattaggcatcagaccttttacggtaggacatgcagccttaaaagtggcgtcaagcaaagtggctaaacatgagaaagcgtgttctgaca 4206628  T
Q  220 atcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcga 319  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | |    
T  4206629 atgaacatgcttttatatcatttgcttttgacactttcgggttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatgacaa 4206728  T
Q  320 tgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  4206729 tgtcatgtcacctaggtcaatgaatatagtgtttacgagg 4206768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34304772 - 34304431
Alignment:
Q  18 actgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggttt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   || |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34304772 actgacccactagatagaagatcgacacttaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggctggaggaaaacatgcatgtgtggacttgattggggttt 34304673  T
Q  118 caccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctga 217  Q
    |||||||| | |  ||||| ||| || |||||| ||| |||||   | ||||||||| || ||||| |||| |   |||||||||||||| |||||||||    
T  34304672 caccacttgtgggtttaggagtcggggcttttacggttggacagctagccctaaaagctgcgtcaagcaaaataaccaaacatgagaaagcgtgttctga 34304573  T
Q  218 caatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagc 317  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  || |||||| |||| | ||||||||||||||||  ||| ||||  || |||||||||    
T  34304572 caatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttgggcttcctagcatcagatgatgttgaccttctacatagagtccaaagagttatgcatagc 34304473  T
Q  318 gatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
     || ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34304472 aatatcatgtctcataggtctatgaatgttgtatttacgagg 34304431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 329
Target Start/End: Original strand, 45500 - 45819
Alignment:
Q  18 actgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttga----ttg-- 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    |||      
T  45500 actgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcagatgtgatggtgtacggatgggtagatggaaaacatgcttgtgtagacttgacagcttgac 45599  T
Q  112 --gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtg 209  Q
      | |||||||||||| | | |||||||||| | |||||||  |||||||| ||| | ||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||  |    
T  45600 aggtgtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaggcagctctaaaagctgcatcaagcaaagtgatcaaacatgagaaaacg 45699  T
Q  210 tgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtca 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  45700 tgttctgacaatcaacatgcttttattccatttgtttttgacactttcggtttcttagcaccagaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtca 45799  T
Q  310 tgcatagcgatgtcatgtct 329  Q
    |||||||| |||| ||||||    
T  45800 tgcatagcaatgttatgtct 45819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 357
Target Start/End: Original strand, 33220552 - 33220881
Alignment:
Q  28 tagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttct 127  Q
    ||||||||||||  ||||||||   ||  ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||| |    
T  33220552 tagatagaagattgacactcaggcctgcagatgttatgatgtacggatgagttggaggaaaacatgcatgtgtgaatttgactggggtttcaccacttgt 33220651  T
Q  128 agaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacac 227  Q
     |  ||||| ||| || |||||| |||||||||  || | ||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||     
T  33220652 gggtttaggggtcggggcttttacggtaggacagacagctctaaaagctgcatcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgtgttgacaatcaacat 33220751  T
Q  228 gcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||||||| ||||  |||    
T  33220752 gcttttataccatttgcttttgacactttcggcttcctagcatccgaggttgttgaccttctacatatagtccaaagggttatgcatagcaatgttgtgt 33220851  T
Q  328 ctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  33220852 cttctaggtccatgaatgttgcgtttacga 33220881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Original strand, 357548 - 357886
Alignment:
Q  18 actgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggttt 117  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  357548 actgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgcagatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggagttt 357647  T
Q  118 caccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctga 217  Q
    |||||||| | |  ||||| ||| |  |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  357648 caccacttgtgggtttaggggtcggtgcttttacggtaggacaggcagccctaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctga 357747  T
Q  218 caatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagc 317  Q
    |||| |||| ||||||||| | |||| |||| | ||||| | ||| ||| ||  |||||||| |||||||||||||  ||| |||| | | | |||||||    
T  357748 caatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttttg-tttcctaacattagaggttgatgaccttctacatagagtccaaatgattaagcatagc 357846  T
Q  318 gatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
     |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  357847 aatgttatctctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 81 - 359
Target Start/End: Original strand, 17249199 - 17249477
Alignment:
Q  81 ggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgt 180  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| || | |  || || ||  |  |||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  17249199 ggaggaaaatatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccatttgtgggtttcggagtgggcgcttttacggtaggacaaacaaccctaaaagttgcgt 17249298  T
Q  181 caatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgt 280  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  || |||||| ||||||  ||    
T  17249299 caaacaaagtggccaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagt 17249398  T
Q  281 tgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||||||||||  ||| |||| | | ||| ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17249399 tgaccttctacatagagtccaaaggattatgtatagcaatgttatgtctcctaagttcatgaatgttgtgtttacgagg 17249477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Original strand, 29337916 - 29338247
Alignment:
Q  20 tgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttca 119  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||   ||  ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |    
T  29337916 tgacccactagatagaagttcgacacttaggcctgcagatgttatggtgtgcagatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtggacttgatcgaggtttta 29338015  T
Q  120 ccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgaca 219  Q
    |||||      |||||  ||| || |||||| |||||||||  ||| | |||||| |||||||| |||||  | |||||||||||||  ||||||| |||    
T  29338016 ccactcg----attagtggtcggggcttttacggtaggacaaacaatcataaaagatgtgtcaagcaaagctgccaaacatgagaaaacgtgttctaaca 29338111  T
Q  220 atcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcga 319  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||  || || |||||||||||| | |||||||||||||||   ||||||| ||||||||| | | |    
T  29338112 atcaacatgctcttataccatttgcttttgacacttctgacttcctagcaccagagatcgttgaccttctacatatggttcaaagggtcatgcacatcaa 29338211  T
Q  320 tgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29338212 tgtcatgactcctaggtccatgaatgttgtgtttac 29338247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 32115984 - 32115773
Alignment:
Q  1 ggcgcatgtga--ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgt 98  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  32115984 ggcgcatgtgaacttcctgactgacctactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacagatgagtaggaggaaaacatgcatgt 32115885  T
Q  99 gtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaac 198  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||| | | |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  32115884 gtagacttgaccggggtttcatcacttatgggattaggtgtcgggcattttacgttaggacatgcagccttaaaagttgcgtcaaacaaagtggccaaac 32115785  T
Q  199 atgagaaagtgt 210  Q
    ||||||||||||    
T  32115784 atgagaaagtgt 32115773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12401613 - 12401384
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| |  | ||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12401613 ttcctgactgacctactagatagcagatcaagacttaagtctgcaaatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 12401514  T
Q  112 gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtg 211  Q
    |||||||||||||| | | |||| |  ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || |||    
T  12401513 gggtttcaccacttatgggattatggttcagggcttttatggtaggacaagcagcactaaaagttgcgtcaaacaaagtggccaaacataagatagcgtg 12401414  T
Q  212 ttctgacaatcaacacgcttttataccatt 241  Q
    || ||  |||||||| |||| |||||||||    
T  12401413 ttttgctaatcaacatgcttatataccatt 12401384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 34415663 - 34415404
Alignment:
Q  67 tgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaac 166  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||   | | |||||| |||||| |||||| ||||||| | ||| |    
T  34415663 tgtatggatgggtaggaggaaaacatacatttgtgaacttgattggggtttcaccacacgttggattaggggtcaggacttttacggtaggataggcatc 34415564  T
Q  167 cctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttcta 266  Q
    | || ||| || ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||| |||    
T  34415563 cttacaagctgcgtcaagcaaaatggcgaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacatgcttttatgccatttgtttttgacactttaggtttccta 34415464  T
Q  267 gcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatg 326  Q
     ||||| | |  |||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34415463 acaccaaatgcagttgaccttctatatagagttcaaatggtcatgcatagcaatgtcatg 34415404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 185 - 359
Target Start/End: Original strand, 4165920 - 4166094
Alignment:
Q  185 caaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgac 284  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  4165920 caaagtggctaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatatcatttgcttttgacactttcgggttcctagcaccagaggttgttgac 4166019  T
Q  285 cttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||    
T  4166020 cttctacatagagtttaaaaggtcatgcatgacaatgtcatgtcacctaggtcaataaatatagtgtttacgagg 4166094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 359
Target Start/End: Original strand, 34554169 - 34554448
Alignment:
Q  79 taggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgt 178  Q
    ||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| || | | ||||||  ||||| ||||||  ||||| ||  |||| ||||||||||     
T  34554169 taggaggaaaacaagcatatgtggatttgattggggtttcaccaattgtgggattagggatcagggcttttaaagtaggtcagacaacactaaaagttgc 34554268  T
Q  179 gtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggtt 278  Q
    ||||| ||||  |  |||||||||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||||||||| ||||||| || ||||  || ||||||||||| | |    
T  34554269 gtcaagcaaaacgaccaaacatgagaaagcgtgttctgataatcaagatgtttttataccatttacttttgacacattcggcttcctagcaccagatgct 34554368  T
Q  279 gttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
     ||||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||    
T  34554369 attgactttctacatagagtttaaaaggtcatgtatagcaatatcatgtctcgtaagt-catgaattttgtgtttacgagg 34554448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28626030 - 28625869
Alignment:
Q  195 aaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaaca-cgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacat 293  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28626030 aaacacgagaaaacgtgttctgacaatcaacattttttttataccatttgttttttacactttcaatttcctagcaccagaggttgttgagcttctacat 28625931  T
Q  294 gaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacg 356  Q
     ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  28625930 aaagttcaaaaggtcatgcataac-atgtcatatctcataggtctatgaatgttgtgtttacg 28625869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24016551 - 24016274
Alignment:
Q  79 taggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||  || ||||| |||||| | | |||||| ||| || ||||| ||| | ||||  ||||| |||||||||     
T  24016551 taggaggaaaacatgcatgtgtgaatttgaccggagtttccccacttgtgggattaggagtcggggctttt-tgggaagacagacaaccgtaaaagttgc 24016453  T
Q  179 gtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggtt 278  Q
     ||||  ||| | ||||||||||||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| |||    
T  24016452 atcaagtaaaatagtcaaacatgagaaagcttgttctcacaatcaacatgtttttataccatttgctattgatagttttggtttcctagcaccagatgtt 24016353  T
Q  279 gttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    |||||  || |||||  |||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||| || ||| ||| || |||||||||    
T  24016352 gttgattttttacatagagttcaaagggtcatgcacaagaatgtcatgtctcctaagtacataaatattatgtttacga 24016274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28543612 - 28543412
Alignment:
Q  57 gatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtag 156  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||| | | |||||  |||||| |||||| ||||     
T  28543612 gatgttatgatgtacagatggataggaggaaaacatgcatgtgtggatttgactgaggtttcaccacttgtgggattagaggtcaggacttttacggtaa 28543513  T
Q  157 gacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatacttt 256  Q
    |||| ||| || ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||| |||||  | ||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  28543512 gacaggcagccttaaaagtcgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaatcgtgttttgaaaatcactatgctcttatactatttgattttgacacttt 28543413  T
Q  257 c 257  Q
    |    
T  28543412 c 28543412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 103 - 355
Target Start/End: Original strand, 28008903 - 28009155
Alignment:
Q  103 acttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatga 202  Q
    |||||| ||| |||||||||||  | | |||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||    
T  28008903 acttgactggagtttcaccactcgtgggattaggggtcggggcttttacggtaggacatgcaaccctaaaagctacgtcaagcaaagcggtcaaacatga 28009002  T
Q  203 gaaagtgtgttctgacaatc---aacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagtt 299  Q
    |||||  |||||| ||||||   || | | ||||||||||||||||||||| ||||| |  |   || ||||| | ||||||||||||||  ||  ||||    
T  28009003 gaaagcttgttctaacaatcaagaatatggttttataccatttgcttttgacacttttggct---taacaccaaaagttgttgaccttctgtatatagtt 28009099  T
Q  300 caaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
    |||| |||||| || | | |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  28009100 caaagggtcatacacaacaatgtcatgactcctaggtccatgaacgttgtctttac 28009155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 278 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 32115734 - 32115655
Alignment:
Q  278 tgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32115734 tgttgaccttctacaaagagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 32115655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34169009 - 34168913
Alignment:
Q  153 gtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttg 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34169009 gtaggacatgcaaccctaaaatttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcatgtttggacaagcaacatgcttttataccatttgcttttg 34168913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 305 - 359
Target Start/End: Original strand, 3137365 - 3137419
Alignment:
Q  305 ggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3137365 ggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 3137419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 3715042 - 3714858
Alignment:
Q  169 taaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagc 268  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  ||||||| ||||| |||| | ||||||| ||| || |||||| ||||| || ||  ||||    
T  3715042 taaaagttgtgtcaaacaaaatggttaaacatgagaaaacgtgttctcacaattaacatgtttttatatcatctgtttttgacacttttgacttcttagc 3714943  T
Q  269 accagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttt 353  Q
    |||| ||  | |||| |||||||||  |||| |||   ||||||| | | |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  3714942 accaaagactcttgatcttctacatagagtttaaagaatcatgcacaacaatgtcatgtctcataaatccatgaatgttgtgttt 3714858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 357
Target Start/End: Original strand, 13398186 - 13398352
Alignment:
Q  191 ggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttcta 290  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||   |||||||| |||| ||||||||| ||| || || ||| || |||| ||||||||| |||||    
T  13398186 ggtcaaatatgaaaaagcatgttccgacaatcaacatatttttatactatttacttttgatatttttgacttcctaacatcagaagttgttgacattcta 13398285  T
Q  291 catgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    |||  |||||||||| | ||||||| | |||||| | || |||| | ||| ||||||||||||||||    
T  13398286 catagagttcaaaagatgatgcataacaatgtcacgacttctagatgcataaatgttgtgtttacga 13398352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6225180 - 6225077
Alignment:
Q  186 aaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgacc 285  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||| |||  ||||||  ||||| ||||| |  |||||| ||||||| | | ||||||    
T  6225180 aaagtggtcaaacatgagaaattttgttgtgacaatcaacatgcttatatgtcatttgtgtttgacacttttgcctttctatcaccagatgctcttgacc 6225081  T
Q  286 ttct 289  Q
    ||||    
T  6225080 ttct 6225077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Original strand, 26225602 - 26225751
Alignment:
Q  210 tgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtca 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||||| | ||| |  |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||  |||||||| | |||    
T  26225602 tgttctgacaatcaacatgcttttttaccagttatgtttgacatttttggctttctagcactagatgttgttggccttcaacatagagttcaaaggctca 26225701  T
Q  310 tgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||| ||  |  | |||||| ||||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  26225702 tgcagagaaacattatgtcttctaggtcgatggattttgtgtttatgagg 26225751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 355
Target Start/End: Original strand, 7200627 - 7200703
Alignment:
Q  279 gttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||  |||||||||||| |  | ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  7200627 gttgaccttttacataaatttcaaagagtcatgcatagcaacattatgtctcctagatcaatgaatgttgtatttac 7200703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 124
Target Start/End: Original strand, 20693434 - 20693537
Alignment:
Q  20 tgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttca 119  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||| ||   ||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||  |||||||  ||||||||    
T  20693434 tgaccaactagataaaagatccacacttaggcctgcagatattatggtgtacagatgggtaggaggaaaacatgc-tatgtgaacttgatcagggtttca 20693532  T
Q  120 ccact 124  Q
    |||||    
T  20693533 ccact 20693537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1768 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold1768
Description:

Target: scaffold1768; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Original strand, 9 - 356
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  9 ttcctgactgacccactagatagatgatcaacacgcaggcccgcggatgttatgatgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtatagacttgactg 108  T
Q  112 gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtg 211  Q
    |||||||||||||| | | |||| ||||| |||||||||  |||||||| ||| ||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||| |||| |    
T  109 gggtttcaccacttgtgggattaagtgtcgggccttttactgtaggacaggcagccctaaaaactgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagacagtggg 208  T
Q  212 ttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatg 311  Q
    || |||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||     
T  209 ttatgaccatcaacatgcttttataccatttgtgtttgacacttttggttttctagtaccaaaggttgttgaccttctgcataaagttcaaaaagtcata 308  T
Q  312 catagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  309 catagcaatgtcatgtctcctagatcgatgaacgttgtgtttacgagg 356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6542 - 6279
Alignment:
Q  85 gaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaat 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||| ||| | |||||||  ||||||||  || |||||||||||| |||||     
T  6542 gaaaacatgcttgtgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattagg-gtcggaccttttaccgtaggacagacagccctaaaagttgcgtcaag 6444  T
Q  185 caaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgac 284  Q
     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  6443 taaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttctataccatttgcttttgacactttcagtttcctagcaccagaggctgttgac 6344  T
Q  285 cttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgt 349  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6343 cttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgt 6279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Original strand, 50000756 - 50001096
Alignment:
Q  18 actgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggttt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  50000756 actgacccactagatagaagatcgacacttaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtggacttgactggggttt 50000855  T
Q  118 caccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctga 217  Q
    |||||||| | |  | ||| ||  || |||||| |||||||||  || | ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50000856 caccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtaggacagacagctctaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctga 50000955  T
Q  218 caatcaacacgctttta-taccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatag 316  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||  |||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||||||    
T  50000956 caatcaacatgcttttaatacaatttgcttttgacacttttggctttctagcatcagaggcagttgaccttctacatatagtccaaagggttatgcatag 50001055  T
Q  317 cgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  50001056 caatgttatgtctcctagatccataaatgttgtgtttacga 50001096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25504566 - 25504230
Alignment:
Q  21 gacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcac 120  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  25504566 gacccactagatagaagtttaacactcagacatgcggatgttatggtgtacggatgggtaggagaaaaacatgcatgtatagacttgactgaggtttcac 25504467  T
Q  121 cacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaa 220  Q
    ||||| | | |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||  |||| |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  25504466 cacttgtgggattaggcgtcaggccttttacggtatgacaggcaaccct-aaagttgcatcaagcaaa-tggtcaaacatgagaaaacgtgttctaacaa 25504369  T
Q  221 tcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgat 320  Q
    || ||| | ||||||||| ||||||||||| | ||| | ||| ||||||| ||||  |||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||||  ||    
T  25504368 tcgacatgtttttataccgtttgcttttgacatttttggtttcctagcactagagactgttgaccttttaaatagagtttaaaaggtcatgcatagtaat 25504269  T
Q  321 gtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25504268 gtcatgtctcataggtccatgaatattgtgtttatgagg 25504230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 352
Target Start/End: Original strand, 30940564 - 30940897
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||   |  | |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  30940564 ttcctgactgacccactagatagaagatcaacactaaggcctacgaatgttatggtgtacgaatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactg 30940663  T
Q  112 gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtg 211  Q
     |||||| |||||| | | |||| ||||||  |||||||   |||||||  ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  30940664 aggtttcgccacttgtgggattaagtgtcaaaccttttaccataggacagacaaccctaaaagttgcgtcaagtaaagtggtcaaacatgagaaagcgtg 30940763  T
Q  212 ttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatg 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||      ||||||||  ||||||||||||||||    
T  30940764 ttctgacaatcaacatgcttttatacca-ttgcttttgacactttcgatttcctagcacctgaggctg------ttctacatagagttcaaaaggtcatg 30940856  T
Q  312 catagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtt 352  Q
    |||| | ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  30940857 cataacaatgtcatatatcctaggtctatgaatgttgtgtt 30940897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 58 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 53619822 - 53619522
Alignment:
Q  58 atgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtagg 157  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |  ||||  ||  || ||||||  |||||    
T  53619822 atgttatggtgtacggatgagttggaggaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttagaggtgggggcttttacagtagg 53619723  T
Q  158 acatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttc 257  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||     
T  53619722 acaggcaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacactttt 53619623  T
Q  258 gattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    || || |||||| ||||||  |||||||||||||||  |||  ||| ||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53619622 gacttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtctaaagggttatgcataacaatgttatgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttacga 53619523  T
Q  358 g 358  Q
    |    
T  53619522 g 53619522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 60 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26521722 - 26521424
Alignment:
Q  60 gttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggac 159  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26521722 gttatggtgtacagacgggtaggaggaaaacatgcatgtatggacttgactggagtttcatcacttgtgggattaggggtcagaccttttatggtaggac 26521623  T
Q  160 atgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcga 259  Q
    |  ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||  ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  | ||||| |     
T  26521622 aaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagtggctaaacatgaaaaaacgtgttatgacaatcaacatgcttttatatcatatgctttcaacacttttgg 26521523  T
Q  260 ttttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26521522 tttcctagcaccagaggctgttgaccttctacatacagttcaaagggtcatgcgtagcaatgtcatgtatcctaggcccatg-atgttgtgtttacgagg 26521424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 358
Target Start/End: Original strand, 56461939 - 56462277
Alignment:
Q  19 ctgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttc 118  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |   ||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  56461939 ctgatccactagatagaagatcgacacttaagcatgcgaatgttatggtgtacggatgagtaggtggaaaacatgcatgtgtggacttgactgaggtttc 56462038  T
Q  119 accacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgac 218  Q
    |||| || | | |||||| |||  | |||||| ||| | | |  | ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  56462039 accatttgttggattaggggtcgagacttttacggttgtatagaccaccctaaaagttgcgtcaaacaaagtgg-caaacatgataaagcgtgttctgac 56462137  T
Q  219 aatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcg 318  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||  |     
T  56462138 aatcaacatgtttttataccatttgttttagacacttttggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaggatcatgcatgaca 56462237  T
Q  319 atgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgag 358  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  56462238 atgtcatgtctcctaagtccataaatgttgtgtttacgag 56462277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 290
Target Start/End: Original strand, 12918200 - 12918475
Alignment:
Q  15 ctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattgggg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  | |||| ||| |    
T  12918200 ctaactgacccactagatagaagatcgacacttaggcctgtggatgtcatggtgtatggatgggtaagaggaaaacatgcatgtgtgtagttgactggag 12918299  T
Q  115 tttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttc 214  Q
    ||||| ||||| | | |||| |  || || |||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  12918300 tttcatcacttgtgggattaagattcggggcttttacggtaggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagtggtcaaacataagaaatcgtgttc 12918399  T
Q  215 tgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttcta 290  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12918400 tgacaatcaacacacttttatactatttacttttgacactttcgacttcctagcatcagagattgttgaccttcta 12918475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 53170783 - 53170447
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||  || |||||| |      ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  53170783 ttcctgactgacctactagatagaagatcaacacttaggcatgcagacgttatggt------atgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttgactg 53170690  T
Q  112 gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtg 211  Q
    |||||||||||||  | | |||||||||| | |||||||  ||| |||| ||| |||||||||| |||| |   ||||| | |||||||||||||| |||    
T  53170689 gggtttcaccactcgtgggattaggtgtcggaccttttacagtatgacaggcagccctaaaagtcgtgttaggtaaagtagccaaacatgagaaagcgtg 53170590  T
Q  212 ttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatg 311  Q
    |||||||| |||||| ||||       |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  53170589 ttctgacagtcaacatgcttg------atttgcttttgacactttcggtttgctagcaccagaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatg 53170496  T
Q  312 catagcgatgtcatgtctcc--taggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  53170495 catagcaatgtcatgtctcctataggt-catgaatgttgtgttcacgagg 53170447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 357
Target Start/End: Original strand, 55933303 - 55933630
Alignment:
Q  28 tagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttct 127  Q
    ||||||||||||| ||||| || |  |  ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||| |  | || |  ||||||||||| ||| |    
T  55933303 tagatagaagatcgacacttaggtccgcagatgttatggtctacggatgggttggaggaaaacatgaatgtctgaatttaaccggggtttcaccccttgt 55933402  T
Q  128 agaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacac 227  Q
     |  ||| | |||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||     
T  55933403 gggtttaagggtcagggcttttacggtaggacagtcagccctaaaagttgcgtcaaacaaagtggccaaacatgagaaagtttgttctaacaatcaacat 55933502  T
Q  228 gcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |  ||||||||||||||||||||  ||| |||| ||| || |||| | || | ||||    
T  55933503 gcttttataccatttgcttttgacactttcgacttcctagcatc--aggttgttgaccttctacatagagtccaaagggttatacataacaatattatgt 55933600  T
Q  328 ctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55933601 ctcctaggtccgtgaatgttgtgtttacga 55933630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 153 - 357
Target Start/End: Original strand, 600658 - 600862
Alignment:
Q  153 gtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgata 252  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  600658 gtaggacagacaaccctaaaagttatgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaaacgtgttctaacaattaacatgcttttataccatttgcttttgtca 600757  T
Q  253 ctttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtt 352  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  600758 ctttcggtttcctaacaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgtataactatgtcatgtctcctaggtccattaatgctgtgtt 600857  T
Q  353 tacga 357  Q
    |||||    
T  600858 tacga 600862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 132657 - 132324
Alignment:
Q  24 ccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccac 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |  |||  ||||||||| ||||| |||  |||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  132657 ccactagatagaagatcgacacttcggcatgcagatgttatggtgtacagatacgtaggaggaaaatatgcatgtgtgaacttgactggggtttcaccac 132558  T
Q  124 ttctagaattaggtgtcaggccttttatggt--aggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaat 221  Q
    || | | |||||| ||| || |||||| |||  |||||| ||| ||||||||| || ||||| |||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||    
T  132557 ttgttggattaggggtcgggacttttacggtgtaggacaggcagccctaaaagctgcgtcaagcaaaatggcaaaacatgagaaatcgtgttctgacaat 132458  T
Q  222 caacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatg 321  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||| ||| |||  | ||||| |||||||| |||||||   |||| ||| ||||| ||||| | |||    
T  132457 caacatgcttttataccatttgttttttacactttcggtttcctaatatcagagattgttgacattctacacagagtttaaagggtcaagcataacaatg 132358  T
Q  322 tcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
    ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||    
T  132357 tcatgtcttttaggttcatgattgttgtgtttac 132324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 167 - 359
Target Start/End: Original strand, 34107674 - 34107868
Alignment:
Q  167 cctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaa--gtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttc 264  Q
    ||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  34107674 cctaaaaattgcgtcaaacgaagtggccaaacatgagaaaacgtgtgttcagataatcaacatgtttttataccatttgtttttgacactttcgatttcc 34107773  T
Q  265 tagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  34107774 tagcaccagaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaagtcatgcataacaatgttatgtctcctagatccatgaatgttgtgttcacgagg 34107868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 31847363 - 31847088
Alignment:
Q  18 actgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggttt 117  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||| ||   ||  ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  31847363 actgacccactagataaaagattgacacttaggcctgcagatattatggtgtacagatggattggaggaaaacatgcatgtgtggacttgactagggttt 31847264  T
Q  118 caccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctga 217  Q
    |||||||| | |  ||||| ||  || ||||||  |||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  31847263 caccacttgtgggtttaggggtgggggcttttacagtaggacaggcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaaccatgttctga 31847164  T
Q  218 caatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacat 293  Q
    || |||||| | |||| |||||||||||||||| ||||| |  || |||||| |||| |  |||||||||||||||    
T  31847163 cagtcaacatgtttttttaccatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaagcggttgaccttctacat 31847088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12053693 - 12053432
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||  | | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  12053693 ttcctgactgatccactagatagaagatcgagactttggtctgcagatgttatgttgtacagatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtggacattattg 12053594  T
Q  112 gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtg 211  Q
    ||||||||||| |  | | ||| || |||  | ||||||  ||||||||  || | ||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||  |||    
T  12053593 gggtttcaccattagttggattgggggtc--gacttttacagtaggacaaacagctctaaaagctgcgtcaaacaaagttgtcaaacatgagaaatcgtg 12053496  T
Q  212 ttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagag 275  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||    
T  12053495 ttctaacaatcaaaacgtttttatatcatttgctttcgactctttcaatttcctagcaccagag 12053432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 264 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16955490 - 16955395
Alignment:
Q  264 ctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16955490 ctagcaccagaggttgctgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggcccatgaatgttgtgtttacgagg 16955395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 213 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3330077 - 3329933
Alignment:
Q  213 tctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |  || |||||| ||||||  |||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||    
T  3330077 tctgacaatcaacatgcttttatactatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaagggttatgc 3329978  T
Q  313 atagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3329977 atagcaatgttatgtctcctaggtccatgaatgctgtgtttacga 3329933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1041533 - 1041386
Alignment:
Q  72 ggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggcctttt-atggtaggacatgcaacccta 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || |   |||||||||||| | | |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  1041533 ggatgggtaggaggaaaacatgcatatgtggac--gacttaagtttcaccacttatgggattaggtgtcagacctttttatggtaggacaagcaactcta 1041436  T
Q  171 aaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaa 220  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1041435 aaagttgtgtcaaacatagtggtcaaacataagaaagtgtgttctgacaa 1041386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 202 - 311
Target Start/End: Original strand, 50483211 - 50483320
Alignment:
Q  202 agaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttca 301  Q
    |||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  50483211 agaaagcgtcttctgacaatcaacatgattttataccatttgctttcgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttca 50483310  T
Q  302 aaaggtcatg 311  Q
    ||||||||||    
T  50483311 aaaggtcatg 50483320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16957818 - 16957569
Alignment:
Q  12 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattg 111  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  |    
T  16957818 ttcctgactgacccgctagataaaagatcaacacttaggcctgcagatgttatggtgtacggatgggtaggtgtaaaacatgcatgtgtggacttgacgg 16957719  T
Q  112 gggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtg 211  Q
    |      ||||||| | | |||||| ||| ||||| |||  |||||| | |||  ||||||||||| ||  | |||| ||  ||||||||||||||||||    
T  16957718 g------accacttgttggattaggggtcgggcctcttacagtaggataggcagtcctaaaagttgcgtagagcaaaatgaccaaacatgagaaagtgtg 16957625  T
Q  212 ttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctag 267  Q
     ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  16957624 ctctgataatcaacatgcttatataccatttgcttttgacactttcagttttctag 16957569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 232 - 359
Target Start/End: Original strand, 38535614 - 38535741
Alignment:
Q  232 ttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcc 331  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||  |||||||||||| |||||||||||      
T  38535614 ttataccatttgcatttgacacttttgacttcctagcaccagaggttgttcaccctctacatagagttcaaagagtcatgcatagcaatgtcatgtctta 38535713  T
Q  332 taggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  38535714 taggtccatggatgttgtgtttacgagg 38535741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 344
Target Start/End: Original strand, 45386026 - 45386218
Alignment:
Q  152 ggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     ||||||||||||| | |||||     
T  45386026 ggtaggacatgcaaccctaaaagctaagtcaaggaaagtggtcaaacataagaaagcgtgttctgacaatcaatttctttttataccatttacatttgaa 45386125  T
Q  252 actttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaat 344  Q
    ||||| |  |||||||||| ||||||  || ||||||||| | || |||||| ||||||||||| | ||||  |||||| || ||||||||||    
T  45386126 acttttggctttctagcacaagaggtcattaaccttctacctaaaattcaaagggtcatgcataacaatgttgtgtctcttaagtccatgaat 45386218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 3330226 - 3330119
Alignment:
Q  18 actgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggttt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3330226 actgacccactagatagaagatcaacacttaggcatgcagatgttatggtgtacggatggattggaggaaaacgtgcatgtgtggacttgactggggttt 3330127  T
Q  118 caccactt 125  Q
    ||||||||    
T  3330126 caccactt 3330119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 209 - 355
Target Start/End: Original strand, 7536593 - 7536739
Alignment:
Q  209 gtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtc 308  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||    
T  7536593 gtgttttgacaatcaacatgtttttatacaatttgtttttgacaatttcagtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaatgatc 7536692  T
Q  309 atgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
     |||||||| || | ||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  7536693 gtgcatagcaattttatgtctcgtagatccatgaatgttatgtttac 7536739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23255828 - 23255648
Alignment:
Q  170 aaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagca 269  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||         || ||  |||||    
T  23255828 aaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaattaacatgcttttataccatttgttttt---------gacttcttagca 23255738  T
Q  270 ccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
     || |||  |||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23255737 tcataggcagttgaccttctacatagagtccaaagggttatgcataacaatgttatgtctcctaagtccatgaatattgtgtttacgagg 23255648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 4419292 - 4419200
Alignment:
Q  265 tagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4419292 tagcatcagaggttgttgaccttctacatagagttcaaagggttatgcataacaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 4419200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 179 - 343
Target Start/End: Original strand, 46440881 - 46441045
Alignment:
Q  179 gtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggtt 278  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||  || |||||| |||| | |    
T  46440881 gtcaaacaaagtggtcaaacataaaaaagtgtgttctaacaattaacacgtttttatatcatttgcttttgacactttcggcttcctagcatcagaagct 46440980  T
Q  279 gttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaa 343  Q
    | |||||||||||||  ||| |||| |||  |||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||    
T  46440981 gctgaccttctacatagagtccaaagggttgtgcatagcaatgctatgtctcataggttcatgaa 46441045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 331
Target Start/End: Original strand, 50462890 - 50463090
Alignment:
Q  131 attaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgct 230  Q
    |||||||||| |  ||| || |||||||||  || || ||||||||| ||||| |||  ||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  50462890 attaggtgtcggtacttctacggtaggacagacagccttaaaagttgcgtcaagcaagatgaccaaacatgagaaagtgtcttccgacaatcaacatgct 50462989  T
Q  231 tttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctc 330  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||  |||||||||||||| |  |||| ||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  50462990 ttcataccatttgcttttgacacttttgatttccttacaccagagactgttgaccttctacgtagagtttaaagggccatgcataacaatgccatgtctc 50463089  T
Q  331 c 331  Q
    |    
T  50463090 c 50463090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 357
Target Start/End: Original strand, 46391220 - 46391482
Alignment:
Q  92 tgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtg 191  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| |  |||||| ||||||| |||    |||||||| |  ||| | ||||| |    
T  46391220 tgcatgtgtgaatttgattggggtttcaccacttgtaggattagaggtcggatcttttacggtaggatatgttgacctaaaagctacgtcgaacaaagcg 46391319  T
Q  192 gtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctac 291  Q
    || ||||| ||||||   |||||| |||  ||||| | |||||||||||| |||| | | | ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  46391320 gttaaacacgagaaaacatgttctcacagccaacatgtttttataccatt-gcttgtaacattttcgatttcctatcagtagaggttgttgaccttctac 46391418  T
Q  292 atgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    || ||||||||||| ||||||  | | |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  46391419 ataaagttcaaaagatcatgc--aacaatgtcatgtctcctaaatccatgaatgttgtatttacga 46391482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 357
Target Start/End: Original strand, 48656889 - 48657085
Alignment:
Q  166 ccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttct 265  Q
    |||||||||||   ||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||||||| ||  |    
T  48656889 ccctaaaagtttcatcaagtaaaatggacaaacatgagaaagtgtgttatgtcaatcaaaatgtttttataccatttgtttttgacactttcgacttctt 48656988  T
Q  266 agc-accagaggttgttga----ccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    ||| |  ||||||||||||    ||||||||||  ||| |||| | | ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  48656989 agcgattagaggttgttgaccttccttctacatagagtccaaatgattatgcatagcaatgttatgtctcataggtctatgaatgttgtgtttacga 48657085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 352
Target Start/End: Original strand, 6865828 - 6865984
Alignment:
Q  195 aaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttc-tagcaccagaggttgttgaccttctacat 293  Q
    ||||| ||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||    
T  6865828 aaacacgagaaaacgtgttctgactatcaacatgcttttatatcatttgcttttgacacttt-gagcttcatagcactagatgttgttaaccttttacat 6865926  T
Q  294 gaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtt 352  Q
      |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  6865927 agagttcaaagggtaatgcatagcaatgtcatgtctcctagat-catgaatgttctgtt 6865984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 53098643 - 53098403
Alignment:
Q  57 gatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgat-tggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggta 155  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||| || ||  | |||||| ||| ||  ||||| ||||    
T  53098643 gatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcaaatgtggacttgatcgggggtttcactac-tcatggattaggggtc-ggatttttacggta 53098546  T
Q  156 ggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactt 255  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||              ||||||||||||||| | ||||  ||| ||| ||||||| | ||    
T  53098545 ggacatgcaatcctaaaagttgagttaaacaaagtggtcaaa--------------ttctgacaatcaacatgtttttgaaccgtttccttttgacattt 53098460  T
Q  256 tcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgc 312  Q
    | | ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  53098459 ttggtttcctagcatcagaggttgttaaccttctacatagagttcaaatggtcatgc 53098403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 25706785 - 25706683
Alignment:
Q  18 actgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggttt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |    |  | |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25706785 actgacccactagatagaagatcgacacttaagcctacgtatgttatggtgtacagatgggtaggagaaaaacatgcatgtgtggacttgatttgggttt 25706686  T
Q  118 cac 120  Q
    |||    
T  25706685 cac 25706683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Original strand, 6865641 - 6865726
Alignment:
Q  15 ctaactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgt 100  Q
    |||||||| | | ||||||||||||  ||||| || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6865641 ctaactgatctattagatagaagattgacacttaggtatgcggatgttatgatgtacgtatgggtaggaggaaaacatgcatgtgt 6865726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 28740014 - 28739845
Alignment:
Q  186 aaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgc-ttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgac 284  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||| ||||| | |||| |  |||||||||||||   ||||| |||||||| || ||| ||||| | |||||||||    
T  28740014 aaagtggccaaacacgagaaattgtgttgtgacagttaacatgtgttttataccatttatgtttgacactttcgacttcctaacaccacaagttgttgac 28739915  T
Q  285 cttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttta 354  Q
    ||| |||||  |||||||   |  ||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28739914 cttttacatagagttcaacgtgcaatgcataacaatgttatgtctcctaggtccataaatgttgtgttta 28739845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 239 - 355
Target Start/End: Original strand, 54190903 - 54191019
Alignment:
Q  239 atttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtcc 338  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||||||| | |||||||| ||| || ||||    
T  54190903 atttgcttttgacacttttgactttctagtatcagaggttgttgaccttccacatagagttcaaagggccatgcataacaatgtcatgactcttaagtcc 54191002  T
Q  339 atgaatgttgtgtttac 355  Q
    || ||| |||| |||||    
T  54191003 ataaatattgtatttac 54191019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 358
Target Start/End: Original strand, 42455692 - 42455778
Alignment:
Q  272 agaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgag 358  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||| | ||||| ||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42455692 agaggttgttaaccttctacatagagttcaaatgatcatggataacaatgtcatgttttctaggtccatgaatgttgtttttacgag 42455778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 39001412 - 39001332
Alignment:
Q  279 gttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||||||||||||  ||| |||| | | ||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39001412 gttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcataacaatgttgtgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 39001332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 230 - 316
Target Start/End: Original strand, 747812 - 747898
Alignment:
Q  230 ttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatag 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | |||  ||  | |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  747812 ttttataccatttgcttttgatatttctggtttcttaatatcagaggttgttgaccttctacatagagtttaaaaggtcatgcatag 747898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 299 - 357
Target Start/End: Original strand, 18981651 - 18981708
Alignment:
Q  299 tcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18981651 tcaaagggtcatgcatagtaatgtcatgtctc-taggtccatgaatgttgtgtttacga 18981708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 54927675 - 54927625
Alignment:
Q  75 tgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccactt 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  54927675 tgggtaggagggaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttccccactt 54927625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 124
Target Start/End: Original strand, 9815706 - 9815797
Alignment:
Q  32 tagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccact 124  Q
    ||||||||||||| | |||| ||  |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  9815706 tagaagatcaacatttagatctgcagatgctatggtgtacagataggtaggaggaaaacaagcatgtgta-acttgatcggggtttcgccact 9815797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 209 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11562983 - 11562899
Alignment:
Q  209 gtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacat 293  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||| || | ||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||||||||    
T  11562983 gtgttcggacaatcaacatgcttttatatcatttactttagacattttcggttttctaacactcgaggttgttgatcttctacat 11562899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 316
Target Start/End: Original strand, 712636 - 712722
Alignment:
Q  230 ttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatag 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | |||  ||  | |||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  712636 ttttataccatttgcttttgatatttctggtttcttaatatcagaggttgttgtccttctacatagagtttaaaaggtcatgcatag 712722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18534636 - 18534586
Alignment:
Q  58 atgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttga 108  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  18534636 atgttatggtatacggatgggtagaaggaaaacatgcatgtgtggacttga 18534586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 315
Target Start/End: Original strand, 43849350 - 43849476
Alignment:
Q  189 gtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttc 288  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||| || || ||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||| |  || |||| |||| ||||||| || ||||    
T  43849350 gtggccaaacacgagaaagcgtgttcagataaccaacatgcttttatactatttgtgtttgacacttttggcttcctagaaccaaaggttgtggatcttc 43849449  T
Q  289 tacatgaagttcaaaaggtcatgcata 315  Q
    ||||   |||||||| |||||||||||    
T  43849450 tacaaagagttcaaatggtcatgcata 43849476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 286 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 45661699 - 45661626
Alignment:
Q  286 ttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| || | | |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45661699 ttctacataaagttcaaagggtcatacacaacaatgtcataactcgtaggtccatgaatattgtgtttacgagg 45661626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 359
Target Start/End: Original strand, 50464387 - 50464468
Alignment:
Q  278 tgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    |||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||    
T  50464387 tgttgaccttctacgtagagtttaaagggtcatgcataacaatgtcatgtctcccaaatatatgaatgttgtgtttacgagg 50464468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 34213636 - 34213559
Alignment:
Q  277 ttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttac 355  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||| |||||||| || | ||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34213636 ttgttgaccttctagatagagttcaaagggtcatgcctaacaatgtg-tctctcctagttccatgaatgttgtgtttac 34213559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 207
Target Start/End: Original strand, 38535452 - 38535606
Alignment:
Q  53 tgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatg 152  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||  || | |||||||| | ||||||||| |||| | | ||| |  ||  || ||||||      
T  38535452 tgtggatgttattgtggacggatgggtaggaggaaaatatgtgtgagcagacttgactagggtttcactacttgtgggatttgaggttggggcttttaat 38535551  T
Q  153 gtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaag 207  Q
    |||| |||  || | |||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||    
T  38535552 gtagaacagacagctctaaaagttgtgtctaacaaagtggtcaaatataagaaag 38535606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 23242898 - 23242837
Alignment:
Q  296 agttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacga 357  Q
    |||| ||| ||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23242898 agtttaaagggtcatgcataacaatgtcatttctcttaggtccataaatattgtgtttacga 23242837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 352
Target Start/End: Original strand, 32312820 - 32312876
Alignment:
Q  296 agttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtt 352  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  ||||| |||| || ||||||||||||||    
T  32312820 agttcaaaaggtcatgcataacaatgtagtgtcttctagatctatgaatgttgtgtt 32312876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 103265 - 103041
Alignment:
Q  134 aggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgctttt 233  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||| ||| |||| |||| || |||||  ||  ||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  103265 aggtgtcgggccttttaccgtaggacaggcagccctcaaagctgcgtcaagtaagatggccaaacacgagaaagcgtgt-ctgacaatcaacatgctttt 103167  T
Q  234 ataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctccta 333  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  103166 ataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggctgttgaccttctacatcgagctcaaaaggtcatgcataacaatgtcgtgtctccta 103067  T
Q  334 ggtccatgaatgttgtgtttacgagg 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  103066 ggtccatgaatgttgtgtttacgagg 103041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0470 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0470
Description:

Target: scaffold0470; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 169 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 7727 - 7539
Alignment:
Q  169 taaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagc 268  Q
    ||||||||| |||||  | ||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||||    
T  7727 taaaagttgcgtcaaatagagtagttaaacatgagaaagcgtgttctcacaatcaacatgattttaaaccatttgcttttgacactttcagtttcctagc 7628  T
Q  269 accagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgag 358  Q
     |||||| ||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7627 tccagagattgttgaccttttgcatagcgttcaaaaggtcatgcata-taatgtcatgtctcataggtccatgaatgttatgtttacgag 7539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 281
Target Start/End: Original strand, 47376 - 47633
Alignment:
Q  24 ccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccac 123  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||  |||   |||||||| |||||  ||| ||| ||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  47376 ccactaaatagaagatcaacacttagggatgcaaatgttatggtgtacaaatgagtatgagaaaaaaatgcaagtgtggacttgattggggtttcaccac 47475  T
Q  124 ttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatca 223  Q
    || | | ||||||  |   | |||||| |||||||||   || ||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  47476 ttgtgggattagggattgagacttttacggtaggacaaataaacctaaaagttgcgtcaagtaaaatggccaaacatgagaaaatgtgttctgacagtta 47575  T
Q  224 acacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggttgtt 281  Q
    |||   ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| ||| ||||||    
T  47576 acatatttttataccatttgcttttaacactttcgatttcctaacactagaagttgtt 47633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 157 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 49548 - 49351
Alignment:
Q  157 gacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatacttt 256  Q
    |||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49548 gacaagcagccctaaaagttgcatcaaacaaagtggtcaaatgtgagaaatcgtgttctgacaatcaacgtgcttttataccatttgcttttgacacttt 49449  T
Q  257 cgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacg 356  Q
    ||| ||  || ||||| ||||||  |    || ||||  |||||||| | ||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  49448 cgacttcttaacaccaaaggttgagg----tcaacatagagttcaaaggatcatgcataacaatgtcatgtctcttatgtccatgaatgtagtatttacg 49353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 57 - 322
Target Start/End: Original strand, 18235 - 18499
Alignment:
Q  57 gatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtag 156  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||| | |||||| |||  | | |||| | ||| |  |||||||| |||    
T  18235 gatgttaaggtgtacagatgggtaggaggaaaacatatttgtgtgggcttgattgagatttcactactcgtgggattacgggtcggagcttttatgatag 18334  T
Q  157 gacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatacttt 256  Q
    ||||  |||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||  ||||||| |||||||||| | ||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  18335 gacaaacaaccctaaaagttgcatcaaacaaagcggccaaacatgagaaac-gtgttctcacaatcaacatgtttttatgtcatctgcttttgacacttt 18433  T
Q  257 cgattttctagcaccagaggttgttgaccttctacatgaagttcaaaaggtcatgcatagcgatgt 322  Q
     ||||| | ||||  |||| ||||| |||||||||||  |||| ||| ||||||||| ||| ||||    
T  18434 tgatttccaagcagtagagattgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 18499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19999 - 19916
Alignment:
Q  16 taactgacccactagatagaagatcaacactcagatatgtggatgttatgttgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19999 taactgacccactagatagaagatgaacacttagacctgtagatgttatggtgtacggataggtaggaggaaaacatgcatgtg 19916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10502 - 10364
Alignment:
Q  156 ggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaa----cacgcttttataccatttgcttttgat 251  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||||     
T  10502 ggacaagcagccctaaaagttgcgtcaagtaaaatggccaaacatgataatgcgtgttctgacaatcaatcaacatgcttttataccatttgcttttgac 10403  T
Q  252 actttcgattttctagcaccagaggttgttgaccttcta 290  Q
    ||||  |  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10402 acttgtggcttcctagcaccagaggttgttgaccttcta 10364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0493 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0493
Description:

Target: scaffold0493; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 280
Target Start/End: Original strand, 8407 - 8609
Alignment:
Q  78 gtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggggtttcaccacttctagaattaggtgtcaggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttg 177  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||| || ||||||||| |||||| ||| |||  | | | || |||| |  || ||||| |||||| | |||| ||    
T  8407 gtaggagggaaacatgcatgtttggactggactggggtttccccacttgtaggattgagagacggggctttcactgtgggacaagcaaccttcaaagctg 8506  T
Q  178 tgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgattttctagcaccagaggt 277  Q
      |||| |||  ||||  |||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| | ||||| | ||| ||||||| ||||||    
T  8507 cttcaaacaatttggttgaacatgagaaaacatgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgcgtttaacacttttggtttcctagcactagaggt 8606  T
Q  278 tgt 280  Q
    |||    
T  8607 tgt 8609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16283 - 16191
Alignment:
Q  145 cttttatggtaggacatgcaaccctaaaagttgtgtcaatcaaagtggtcaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacacgcttttatac 237  Q
    ||||||| ||||||||  |||| ||||||| || ||||| |||| ||| |||||||||||||   |||||||||||| |||| | ||||||||    
T  16283 cttttatagtaggacagacaacgctaaaagctgcgtcaaacaaaatggccaaacatgagaaaacatgttctgacaataaacatgtttttatac 16191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University