View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8257_low_4 (Length: 561)

Name: NF8257_low_4
Description: NF8257
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8257_low_4
NF8257_low_4
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (1-546)||(26179326-26179871)
chr7 (17-546)||(26088025-26088554)
chr7 (17-546)||(26111813-26112342)
chr7 (9-546)||(19102914-19103451)
chr7 (4-540)||(26242646-26243185)
chr7 (1-540)||(26251094-26251636)
chr7 (9-540)||(26297694-26298228)
chr7 (9-532)||(26302059-26302589)
chr7 (9-546)||(26191508-26192045)
chr7 (9-543)||(26128813-26129347)
chr7 (1-321)||(26278167-26278484)
chr7 (9-546)||(26204137-26204665)
chr7 (9-546)||(26223775-26224302)
chr7 (9-376)||(26155601-26155968)
chr7 (9-185)||(26186853-26187028)
chr7 (221-546)||(26186485-26186810)
chr7 (18-172)||(26260489-26260643)
chr7 (412-543)||(26155449-26155580)
chr7 (42-165)||(26227596-26227719)
chr7 (42-165)||(26208035-26208158)
chr7 (221-362)||(26260299-26260440)
chr7 (429-536)||(26227249-26227356)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (42-539)||(44903500-44904000)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 450; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 26179871 - 26179326
Alignment:
Q  1 caaacaccggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26179871 caaacaccggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatc 26179772  T
Q  101 taatatcagaagttgtgatgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcttca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26179771 taatatcagaagttgtgatgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcttca 26179672  T
Q  201 tctttatcannnnnnnnnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggc 300  Q
    |||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26179671 tctttatcatatttttttataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgcggaaacctaacaaggc 26179572  T
Q  301 taccaaaacttacatacaatacagactcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctcttttccaagttcctctatgtgtccccttttggc 400  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26179571 taccaaaacttacatataatacagactcattttgctttgagttaagccaatttagccattcttcctcttttccaagttcctctatgtgtccccttttggc 26179472  T
Q  401 cnnnnnnncaccatccttgttggtccaagctgaaactggtcctacactccaagttttgatccccatggtagtgttaataagtttttcataatcactttct 500  Q
    |       ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  26179471 ctttttttcaccatccttgttagtccaagctgaaactggtcctacactccaagttttgatccccattgtagtgttacttaatttttcataatcactttca 26179372  T
Q  501 aattcatgaaaactattgtatagtgttccataacttcttttctctg 546  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26179371 agttcatgaaaactattgtatagtgttccataacttcttttctctg 26179326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 17 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 26088554 - 26088025
Alignment:
Q  17 gatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgt 116  Q
    ||||||||||||||| |  ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  26088554 gatcattggcaaaccagcattcaagctttcaagaatcgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcaggatgatccaatatcagaagttgt 26088455  T
Q  117 gatgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatcannnnnnn 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||   | | ||   |||||  | |||           
T  26088454 ggtgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatcctttcctcaaaatcttgaaggaaagtgttttcactctcatccctctcatatttcc 26088355  T
Q  217 nnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaacttacata 316  Q
      | ||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||| |  || |||||  || || ||||||||||||||    
T  26088354 ttacaacccagataaaattatgacctgaattttcgagaccgtgtgcaatttctacaatctgagcattatcaagcctaattagacttccaaaacttacata 26088255  T
Q  317 caatacagactcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctcttttccaagttcctctatgtgtccccttttggccnnnnnnncaccatcc 416  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||       || ||| |    
T  26088254 caatacggactcattttcctttgagttaagccaatttagccactcttcctcttttccaagctcctctatgtgtcccctattggcctttttttcatcattc 26088155  T
Q  417 ttgttggtccaagctgaaactggtcctacactccaagttttgatccccatggtagtgttaataagtttttcataatcactttctaattcatgaaaactat 516  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |   ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  26088154 ttgttggtccaagctgaaactggccctacactccaagatttgatccccattgtagtgcttccaagtttttcataatcactttccagttcatgaaaactat 26088055  T
Q  517 tgtatagtgttccataacttcttttctctg 546  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26088054 tgtatagtgttccataactaattttctctg 26088025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 17 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 26112342 - 26111813
Alignment:
Q  17 gatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgt 116  Q
    ||||||||||||||| |  ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  26112342 gatcattggcaaaccagcattcaagctttcaagaatcgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcaggatgatccaatatcagaagttgt 26112243  T
Q  117 gatgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatcannnnnnn 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||   | | ||   |||||  | |||           
T  26112242 ggtgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatcctttcctcaaaatcttgaaggaaagtgttttcactctcatccctctcatatttcc 26112143  T
Q  217 nnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaacttacata 316  Q
      | ||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||| |  || |||||  || || ||||||||||||||    
T  26112142 ttacaacccagataaaattatgacctgaattttcgagaccgtgtgcaatttctacaatctgagcattatcaagcctaattagacttccaaaacttacata 26112043  T
Q  317 caatacagactcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctcttttccaagttcctctatgtgtccccttttggccnnnnnnncaccatcc 416  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||       || ||| |    
T  26112042 caatacggactcattttcctttgagttaagccaatttagccactcttcctcttttccaagctcctctatgtgtcccctattggcctttttttcatcattc 26111943  T
Q  417 ttgttggtccaagctgaaactggtcctacactccaagttttgatccccatggtagtgttaataagtttttcataatcactttctaattcatgaaaactat 516  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |   ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  26111942 ttgttggtccaagctgaaactggccctacactccaagatttgatccccattgtagtgcttccaagtttttcataatcactttccagttcatgaaaactat 26111843  T
Q  517 tgtatagtgttccataacttcttttctctg 546  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26111842 tgtatagtgttccataactaattttctctg 26111813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 546
Target Start/End: Original strand, 19102914 - 19103451
Alignment:
Q  9 ggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatca 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19102914 ggccatgtgatcattggcaaacccgaattcaagctttcgagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatccaatatca 19103013  T
Q  109 gaagttgtgatgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatc 208  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||  | | ||   |||||| | ||    
T  19103014 gaagttgcggtgcccaattccatatgatatatccctttttgctttctttcatccttgcctcaaaatcttgtagaaaactgttttcactctcatctctctc 19103113  T
Q  209 annnnnnnnnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaa 308  Q
    |         | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||| |||| |||    || ||||   || || ||||||    
T  19103114 atttttccttacaacccagataaaattatgacctgaattttcaagaccgtgtgcgatttctacaatctgatcattttcaagcctagttagacttccaaaa 19103213  T
Q  309 cttacatacaatacagactcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctcttttccaagttcctctatgtgtccccttttggccnnnnnnn 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||  |||||           
T  19103214 cttacatacaatacagactcattttgctttgagttaagccaatttagccactcttcctcttttccgatctcctctacgtgccccctactggccttttttt 19103313  T
Q  409 caccatccttgttggtccaagctgaaactggtcctacactccaagttttgatccccatggtagtgttaataagtttttcataatcactttctaattcatg 508  Q
    || |||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| |||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  19103314 catcatccttgttagccctagctgaaactggtcctacacaccaagatttgatccccaatgtagtcttaccaagttttacataatcactttccagttcatg 19103413  T
Q  509 aaaactattgtatagtgttccataacttcttttctctg 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19103414 aaaactattgtatagtgttccataacttcttttctctg 19103451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 4 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 26243185 - 26242646
Alignment:
Q  4 acaccggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaa 103  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||    
T  26243185 acactggccacgtaatcattggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcttgttgctgggtgatccaa 26243086  T
Q  104 tatcagaagttgtgatgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcttcatct 203  Q
    |||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  26243085 tatcagaagttgcggtgcccagtcccatatgatatagcccttgttgctttctttcatcctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcctcaact 26242986  T
Q  204 ttatcannnnnnnnnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggctac 303  Q
    ||||||         ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |    
T  26242985 ttatcatctttttttataacccagataaaattatgacctgaattttcaagcccgtgagcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctagtctggctgc 26242886  T
Q  304 caaaacttacatacaatacagactcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctcttttccaa---gttcctctatgtgtccccttttggc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||  || |||||| |    || |||  |||||||||| || ||    
T  26242885 caaaacttacatacaatacagactcattttgcttcaggttaagccaatttagcaattctgtctgttttcctatgcttttctccgtgtgtcccctattcgc 26242786  T
Q  401 cnnnnnnncaccatccttgttggtccaagctgaaactggtcctacactccaagttttgatccccatggtagtgttaataagtttttcataatcactttct 500  Q
    |        | |||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| || || ||||| ||| |||| || ||||||||||||||     
T  26242785 ctttcttttatcatccttgttagcccaggctgaaactggtccgacactccatgatttgattccgattgtagttttactaagattctcataatcactttca 26242686  T
Q  501 aattcatgaaaactattgtatagtgttccataacttcttt 540  Q
    | |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||    
T  26242685 agttcatgaaaactgttgtatagtgacccatagcttcttt 26242646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 26251636 - 26251094
Alignment:
Q  1 caaacaccggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || |  ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26251636 caaacactggccacgtgatcattggcaaaccagcatttaagctttcaagagttgagttccaaccacaatgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatc 26251537  T
Q  101 taatatcagaagttgtgatgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcttca 200  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||    
T  26251536 caatatcagaagttgtggtgcccaattccagatgatatagcccttgttgctttctttcatcctttcctcaaatttttgcaaaaaaccttctccatcctca 26251437  T
Q  201 tctttatcannnnnnnnnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggc 300  Q
    |||||||||         ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  26251436 tctttatcatctttttttataacccagataaaattatgacctgaattttcaagcccatgtgcaatttctacaagctgagcatgaggaagcctagtaaggc 26251337  T
Q  301 taccaaaacttacatacaatacagactcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctcttttcc-aag--ttcctctatgtgtcccctttt 397  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||  || |||||| |||  || ||| ||||||||||| ||    
T  26251336 tgccaaaacttacatacaatactgactcattttgcttcgagttaagccaattaagcaattctgtctgttttcctaagcttttctccatgtgtcccctatt 26251237  T
Q  398 ggccnnnnnnncaccatccttgttggtccaagctgaaactggtcctacactccaagttttgatccccatggtagtgttaataagtttttcataatcactt 497  Q
     |||       || |||||||||| | ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||| || || ||| | |||  ||| || || |||||| ||    
T  26251236 cgcctttctttcatcatccttgttagcccaggcagaaactggtccgacactccatgatttgattccaattgtacttttacaaagcttctcgtaatcattt 26251137  T
Q  498 tctaattcatgaaaactattgtatagtgttccataacttcttt 540  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||    
T  26251136 tcaagttcatgaaaactgttgtatagtgacccatagcttcttt 26251094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 26298228 - 26297694
Alignment:
Q  9 ggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatca 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  ||||  ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  26298228 ggccatgtgatcattggcaaaccagcattcaagctttcgagagttgagttccaaccacaatgagtcacaattcctcctgttgcagggtggtccaatatca 26298129  T
Q  109 gaagttgtgatgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatc 208  Q
    ||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  26298128 gaagttgcggtgcccagtcccatatgatatagcccttgctgctttctttaatcctttcctcaaattcttgcagaaaaccttctccatcctcatctgtatc 26298029  T
Q  209 annnnnnnnnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaa 308  Q
    |         ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||| ||||||    
T  26298028 atccctttttataacccagataaaattatgacctgaattttcaagcccatgaacaatttctacaagctgagcataaggaagcctagtaaagctgccaaaa 26297929  T
Q  309 cttacatacaatacagactcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctcttttcc-aag--ttcctctatgtgtccccttttggccnnnn 405  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||   | |||||| |||  || ||| ||||||||||| || |||        
T  26297928 cttacatacaatacagattcattttccttcgaattaagccaatttagcaattctgtatgttttcctaagcttttctcaatgtgtcccctattagcctttc 26297829  T
Q  406 nnncaccatccttgttggtccaagctgaaactggtcctacactccaagttttgatccccatggtagtgttaataagtttttcataatcactttctaattc 505  Q
       || |||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| |  ||||| || || ||||| |||| |||||| |||||||||||||| | |||    
T  26297828 tttcatcatccttgttagcccaggctgaaactggtccgacactccatgacttgattccgattgtagttttaaaaagtttctcataatcactttcaagttc 26297729  T
Q  506 atgaaaactattgtatagtgttccataacttcttt 540  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||    
T  26297728 atgaaaactgttgtatagtgacccatagcttcttt 26297694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 26302589 - 26302059
Alignment:
Q  9 ggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatca 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  ||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  26302589 ggccatgtgatcattggcaaaccagcattcaagctttcgagaattgagttccaacaacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatccaatatta 26302490  T
Q  109 gaagttgtgatgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatc 208  Q
    |||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||    
T  26302489 gaagctgcggtgcccaattccatatgatatagccttttttgctttctttcatcctttcctcaaatacttgcaggaaaccttcttcatcctcatttctatc 26302390  T
Q  209 annnnnnnnnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaa 308  Q
    |         |  ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||    
T  26302389 atattttcgtacgacccaaataaaactatgacctgaattttcaagcccgtgtgcaatttctacaagctgagcatgaggatgccaaacaaggctgccaaaa 26302290  T
Q  309 cttacatacaatacagactcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctcttttcc-aagttcctct------atgtgtccccttttggcc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||   |||||||| |||||| |||        ||||||||| |  | |    
T  26302289 cttacatacaatacagactcattttgctttgagttaagccaatttaccaattctgtttcttttccaaagttcttctccgcgcgcgtgtcccctatgagtc 26302190  T
Q  402 nnnnnnncaccatccttgttggtccaagctgaaactggtcctacactccaagttttgatccccatggtagtgttaataagtttttcataatcactttcta 501  Q
           || | | |||||| | |||| | ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| || || | | |||||||  ||||||||||||| |    
T  26302189 ttgctttcatccttcttgttagcccaaacagaaactggtcctacattccaagatttgattcccattgttgtttgactaagtttcacataatcactttcaa 26302090  T
Q  502 attcatgaaaactattgtatagtgttccata 532  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26302089 gttcatgaaaactattgtatagtgttccata 26302059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 26192045 - 26191508
Alignment:
Q  9 ggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatca 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||     
T  26192045 ggccacgcgatcattggcaaaccagcattcaagctttcaagaatcgagttccaaccacagtgagtcacaattccacctgttgcagggtgatccaatatct 26191946  T
Q  109 gaagttgtgatgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatc 208  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||  | | ||   |||||  ||||    
T  26191945 gaagctgtggtgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttccctcaaaatcttgtaggaaactgttttcactctcatccatatc 26191846  T
Q  209 annnnnnnnnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaa 308  Q
    |         | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  | ||||   |  || |||||     
T  26191845 atttttccttacaacccagataaaattatgacctgaattttcaagcccatgtgcaatttctacaagctgagcatgagttagcctagttaaacttccaaag 26191746  T
Q  309 cttacatacaatacagactcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctcttttccaagttcctctatgtgtccccttttggccnnnnnnn 408  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||   ||||||||||| ||| | |   ||           
T  26191745 cttacataaagtacagactcattttgctttgagttaagccaatttagccactctgccacttttccattctcctctatgtgccccttatcacccttctttt 26191646  T
Q  409 caccatccttgttggtccaagctgaaactggtcctacactccaagttttgatccccatggtagtgttaataagtttttcataatcactttctaattcatg 508  Q
    || ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  26191645 catcatcctttttagcccaagctgaaactggtcctacactccaagatttgatcccccttgtagtattacaaagtttctcatattcactttctagttcatg 26191546  T
Q  509 aaaactattgtatagtgttccataacttcttttctctg 546  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  26191545 aaaactattgtatagtgtgccatagcttttttcctctg 26191508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 26129347 - 26128813
Alignment:
Q  9 ggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatca 108  Q
    ||||| || |||||||||||||| |  || |  ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |    
T  26129347 ggccatgtaatcattggcaaaccagcatttaagctttcgagagttgagttccaaccacaatgagtcacaattcctcctatggcagggtgatccaatataa 26129248  T
Q  109 gaagttgtgatgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatc 208  Q
    | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||   | | ||   |||||  | ||    
T  26129247 ggagctgtggtgcccaattccatatgatatagcccttttttctttctttcatcctttcctcaaaatcttgaaggaaattgttttcactctcatcgctctc 26129148  T
Q  209 annnnnnnnnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaa 308  Q
              | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||| |  || ||||   || || ||||||    
T  26129147 ctttttccttacaacccatataaaattatgacctgaattttcgagaccgtgtgcaatttctacaatctgagcattatcaagcctagttagacttccaaaa 26129048  T
Q  309 cttacatacaatacagactcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctcttttccaagttcctctatgtgtccccttttggccnnnnnnn 408  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||           
T  26129047 cttacatacagtacggactcattttgctttgagttaagccaatttaaccagtctgcctcttttccaagctcctctatgtgtcccctattccccttgtttt 26128948  T
Q  409 caccatccttgttggtccaagctgaaactggtcctacactccaagttttgatccccatggtagtgttaataagtttttcataatcactttctaattcatg 508  Q
    || |||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||||| | ||||||    
T  26128947 catcatccttgttagcccatgatgaaactggtcctacactccaagatttgatccccaaggtagtgttacaaatgttttcataatcactttccagttcatg 26128848  T
Q  509 aaaactattgtatagtgttccataacttcttttct 543  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26128847 aaaactattgcatagtgttccataacttcttttct 26128813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26278484 - 26278167
Alignment:
Q  1 caaacaccggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||    
T  26278484 caaacactggccacgtgatcattggcaaaccagcatttacgctttcaagagttgagttccaaccacaatgagtcacaatccctccgattgcagggtattc 26278385  T
Q  101 taatatcagaagttgtgatgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcttca 200  Q
     |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26278384 caatatcagcagttgtggtgcccaatcccatatgatgtagcccttgttgctttctttcatccttttctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcctca 26278285  T
Q  201 tctttatcannnnnnnnnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggc 300  Q
    ||||||| |         ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  26278284 tctttatta---ttttttataacccagataaaattatgacctgaattttcaagcccgtgtgcaatttctacaagctgagcatgaggaagcctaataaggc 26278188  T
Q  301 taccaaaacttacatacaata 321  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  26278187 tgccaaagcttacatacaata 26278167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 26204665 - 26204137
Alignment:
Q  9 ggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatca 108  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26204665 ggccatgttatcattggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatca 26204566  T
Q  109 gaagttgtgatgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatc 208  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||| ||||||||| || | |||||||||||    
T  26204565 gaagctgtggggcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttttctcaaaatctatcagaaaaccttcttcaccatcatctttatc 26204466  T
Q  209 annnnnnnnnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaa 308  Q
              | |||||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||  ||| |||  |||||| || ||||  |||||| ||||||    
T  26204465 cttttctctaacaacccaaatgaaattatgaccagaattttcaagaccatgagctatttcagcaatctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaa 26204366  T
Q  309 cttacatacaatacagactcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctcttttccaa-gttcctctatgtgtccccttttggccnnnnnn 407  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||||||| | ||||||  |||||||||| |||| | |  ||||  |||||               
T  26204365 cttacatacaacacagactcgttttccttagaattaagccaatttaccaattcttgatcttttccaatgttcttttccgtgtatccttt----------a 26204276  T
Q  408 ncaccatccttgttggtccaagctgaaactggtcctacactccaagttttgatccccatggtagtgttaataagtttttcataatcactttctaattcat 507  Q
     || | || |||||  |||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||| |||  |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  26204275 tcatcgtctttgttaatccatgctgaaaccggtcctatactccaagatttgatccctattgtagttttaccaagtttctcataatcactttctagttcat 26204176  T
Q  508 gaaaactattgtatagtgttccataacttcttttctctg 546  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26204175 gaaaactattgtatagtgttccaaagcttcttttctctg 26204137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 26224302 - 26223775
Alignment:
Q  9 ggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatca 108  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26224302 ggccatgttatcattggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatca 26224203  T
Q  109 gaagttgtgatgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatc 208  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||| ||||||||| || | |||||||||||    
T  26224202 gaagctgtggggcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttttctcaaa-tctatcagaaaaccttcttcaccatcatctttatc 26224104  T
Q  209 annnnnnnnnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaa 308  Q
              | |||||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||  ||| |||  |||||| || ||||  |||||| ||||||    
T  26224103 cttttctctaacaacccaaatgaaattatgaccagaattttcaagaccatgagctatttcagcaatctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaa 26224004  T
Q  309 cttacatacaatacagactcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctcttttccaa-gttcctctatgtgtccccttttggccnnnnnn 407  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||||||| | ||||||  |||||||||| |||| | | |||||  |||||               
T  26224003 cttacatacaacacagactcgttttccttagaattaagccaatttaccaattcttgatcttttccaatgttcttttctgtgtatccttt----------a 26223914  T
Q  408 ncaccatccttgttggtccaagctgaaactggtcctacactccaagttttgatccccatggtagtgttaataagtttttcataatcactttctaattcat 507  Q
     || | || |||||  |||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||| |||  |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  26223913 tcatcgtctttgttaatccatgctgaaaccggtcctatactccaagatttgatccctattgtagttttaccaagtttctcataatcactttctagttcat 26223814  T
Q  508 gaaaactattgtatagtgttccataacttcttttctctg 546  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26223813 gaaaactattgtatagtgttccaaagcttcttttctctg 26223775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26155968 - 26155601
Alignment:
Q  9 ggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatca 108  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26155968 ggccatgtaatcattggcaaaccagaattcaagctttcgagagttgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatccaatatca 26155869  T
Q  109 gaagttgtgatgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatc 208  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||   | | ||   |||||  | ||    
T  26155868 gaagctgtggtgcccaattccatatgatatatccctttttgctttctttcatcctttcctcaaaatcttgaaggaaagtgttttcactctcatcgctctc 26155769  T
Q  209 annnnnnnnnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaa 308  Q
              | ||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||| |  || ||||   || || ||||||    
T  26155768 ctttttccttacaacccagataaaattatgacctgaattttcgagaccgtgtgcaatttctacaatctgagcattatcaagcctagttagacttccaaaa 26155669  T
Q  309 cttacatacaatacagactcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctcttttccaag 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  26155668 cttacatacaatacggactcattttgctttgtgttaagccaatttaaccactcggcctcttttccaag 26155601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26187028 - 26186853
Alignment:
Q  9 ggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatca 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26187028 ggccatgtgatcattggcaaacccgagttcacgctttccagaattgagttccaacaacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatccaatatca 26186929  T
Q  109 gaagttgtgatgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaa 185  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||    
T  26186928 gaagctgtggtgcccaattccatatgatatatccctttttgctttctttcattcttt-ctcaaaatcttgtaggaaa 26186853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 221 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 26186810 - 26186485
Alignment:
Q  221 aacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaacttacatacaat 320  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |  || ||||   |  || |||||||||| ||||| |    
T  26186810 aacccagataaaattatgatctgaattttcaagaccgtgtgcaatttctacaatctgagcattatcaagcctagttacacttccaaaacttaaatacagt 26186711  T
Q  321 acagactcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctcttttccaagttcctctatgtgtccccttttggccnnnnnnncaccatccttgt 420  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||| ||||| ||||||||||| ||  ||       || |||||||||    
T  26186710 acggactcaatttgctttgagttaagccaatttagccactcttcctcttctgcaagctcctccatgtgtcccctattacccttcttttcatcatccttgt 26186611  T
Q  421 tggtccaagctgaaactggtcctacactccaagttttgatccccatggtagtgttaataagtttttcataatcactttctaattcatgaaaactattgta 520  Q
    | | | | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  26186610 tagccaatgatgaaactggtcctacactccatgatttgatccccaagatagtgttactaagttttttataatcactctccagttcatgaaaactattgta 26186511  T
Q  521 tagtgttccataacttcttttctctg 546  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||    
T  26186510 tagtgttccgtaactttttttctctg 26186485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 26260643 - 26260489
Alignment:
Q  18 atcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgtg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||    
T  26260643 atcattggcaaacccgagttcaagctttcaagaattgagttccatccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatccaatataaggagctgtg 26260544  T
Q  118 atgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaa 172  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26260543 gtgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatcctttgctcaaa 26260489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 412 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 26155580 - 26155449
Alignment:
Q  412 catccttgttggtccaagctgaaactggtcctacactccaagttttgatccccatggtagtgttaataagtttttcataatcactttctaattcatgaaa 511  Q
    |||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  26155580 catccttgttagcccatgatgaaactggtcctacactccaagttttgatccccatggtagtgttactaagtttttcataatcactttccagttcatgaaa 26155481  T
Q  512 actattgtatagtgttccataacttcttttct 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26155480 actattgtatagtgttccataacttcttttct 26155449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26227719 - 26227596
Alignment:
Q  42 ctttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgtgatgcccaattccatatgatatagc 141  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  26227719 ctttcaagaattgagttccaaccacaatgagtcactacccctgctgttgcagggtgacctaatatgagaagttgtggtgcccaattccatatgatatatc 26227620  T
Q  142 cctttttgctttctttcaaccttt 165  Q
    |||||||| ||||||||| |||||    
T  26227619 cctttttgttttctttcatccttt 26227596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26208158 - 26208035
Alignment:
Q  42 ctttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgtgatgcccaattccatatgatatagc 141  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  26208158 ctttcaagaattgaattccaaccacaatgagtcactatccctcctgttgcagggtggcctaatatgagaagctgtggtgcccaattccatatgatatatc 26208059  T
Q  142 cctttttgctttctttcaaccttt 165  Q
    |||||||| ||||||||| |||||    
T  26208058 cctttttgttttctttcatccttt 26208035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26260440 - 26260299
Alignment:
Q  221 aacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaacttacatacaat 320  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||| |||| |||||||| || || ||||   | ||| |||||||||||||||||     
T  26260440 aacccaaatgaaattatgacctgaattttcaagtccatgagctatttcaacaacctgagcataagaaagcctagtcaagcttccaaaacttacatacaac 26260341  T
Q  321 acagactcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattct 362  Q
    ||||| |||||  | || |||||||||||||||||| |||||    
T  26260340 acagaatcattagggttagagttaagccaatttaacaattct 26260299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 26227356 - 26227249
Alignment:
Q  429 gctgaaactggtcctacactccaagttttgatccccatggtagtgttaataagtttttcataatcactttctaattcatgaaaactattgtatagtgttc 528  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  | ||   ||| || |||||||||| ||| | ||| ||||| |||||| |||  ||||    
T  26227356 gctgaaactggtcctacactccatgctttgatccccattgtgctcttgtaaagattctcataatcaccttcaagttcgtgaaagctattgcataaagttc 26227257  T
Q  529 cataactt 536  Q
    ||||||||    
T  26227256 cataactt 26227249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 42 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 44904000 - 44903500
Alignment:
Q  42 ctttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgtgatgcccaattccatatgatatagc 141  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  44904000 ctttcaagagttgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatgagaagctgcggtgcccaattccatatgatatagc 44903901  T
Q  142 cctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatcannnnnnnnnataacccagataaaattttgacc 241  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  | |  || ||| |||||         | ||||||||||||||| |||||    
T  44903900 ccttgttgctttctttcaccctttcctcaaaatcttgcaggaaaccttcctcgttctcgtctctatcatttttccttacaacccagataaaattatgacc 44903801  T
Q  242 tgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaacttacatacaatacagactcattttgcttcgag 341  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  || | ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  44903800 tgacttttcaagcccatgtgcaatttctacaagctgagcatgaaaaagcttagtaaggcttccaaaacttacatacaacacagactcattttgctttgag 44903701  T
Q  342 ttaagccaatttaaccattcttcctcttttccaa-gttc--ctctatgtgtccccttttggccnnnnnnncaccatccttgttggtccaagctgaaactg 438  Q
    ||||||||||||| | |||||  ||||||| ||| ||||  ||| | ||||||||| ||| ||       || || ||||||| | ||||| ||||||||    
T  44903700 ttaagccaatttagcaattctctctctttttcaacgttcttctccacgtgtcccctattgcccttccgttcatcacccttgttagcccaagttgaaactg 44903601  T
Q  439 gtcctacactccaagttttgatccccatggtagtgttaataagtttttcataatcactttctaattcatgaaaactattgtatagtgttccataacttct 538  Q
    |||||||||||||||  || |||||||| ||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  44903600 gtcctacactccaagacttaatccccattgtagttttactaactttctcataatcactttcaagttcatgaaaactattgcatattgtcccataacttct 44903501  T
Q  539 t 539  Q
    |    
T  44903500 t 44903500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University