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Alignment Overview

Query: NF8260A_low_375 (Length: 233)

Name: NF8260A_low_375
Description: NF8260A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8260A_low_375
NF8260A_low_375
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (21-220)||(46272-46472)
[»] chr8 (48 HSPs)
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chr8 (21-220)||(30473915-30474115)
chr8 (21-220)||(44832217-44832417)
chr8 (21-220)||(6299051-6299251)
chr8 (21-220)||(10477935-10478135)
chr8 (21-220)||(32110892-32111092)
chr8 (21-220)||(995846-996046)
chr8 (21-220)||(18175379-18175579)
chr8 (21-220)||(39257441-39257641)
chr8 (21-220)||(40026798-40026998)
chr8 (21-220)||(11725188-11725388)
chr8 (21-220)||(28274245-28274445)
chr8 (21-207)||(35122353-35122540)
chr8 (22-215)||(18210656-18210850)
chr8 (21-214)||(28582859-28583053)
chr8 (21-220)||(18841902-18842102)
chr8 (23-220)||(44836907-44837105)
chr8 (21-220)||(18568863-18569063)
chr8 (21-220)||(24408874-24409074)
chr8 (39-220)||(19240661-19240843)
chr8 (39-220)||(19313845-19314027)
chr8 (29-220)||(19412829-19413022)
chr8 (21-220)||(11142459-11142665)
chr8 (42-220)||(24004779-24004958)
chr8 (21-183)||(39997726-39997889)
chr8 (101-220)||(23353688-23353808)
chr8 (22-220)||(25875322-25875530)
chr8 (158-220)||(18481929-18481991)
chr8 (172-220)||(39997660-39997708)
chr8 (172-215)||(6299290-6299333)
chr8 (172-215)||(10477853-10477896)
chr8 (172-215)||(11142381-11142424)
chr8 (172-215)||(11725106-11725149)
chr8 (172-215)||(18175297-18175340)
chr8 (172-215)||(18997616-18997659)
chr8 (172-215)||(19240580-19240623)
chr8 (172-215)||(19313764-19313807)
chr8 (172-215)||(19412752-19412795)
chr8 (172-215)||(23353846-23353889)
chr8 (172-215)||(24408795-24408838)
chr8 (172-215)||(30474153-30474196)
chr8 (172-215)||(32111131-32111174)
chr8 (172-215)||(35122585-35122628)
chr8 (172-215)||(39997580-39997623)
chr8 (172-215)||(44832457-44832500)
chr8 (172-215)||(44836824-44836867)
chr8 (172-214)||(18210893-18210935)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (21-220)||(21804603-21804803)
chr7 (21-220)||(38163370-38163570)
chr7 (21-220)||(42242185-42242385)
chr7 (21-215)||(3840672-3840867)
chr7 (21-220)||(27138559-27138759)
chr7 (21-220)||(33916978-33917178)
chr7 (21-220)||(31373454-31373654)
chr7 (21-220)||(17178268-17178469)
chr7 (21-220)||(21341821-21342021)
chr7 (21-220)||(21669979-21670179)
chr7 (21-220)||(24924077-24924277)
chr7 (21-220)||(16376576-16376776)
chr7 (21-220)||(21656626-21656826)
chr7 (21-220)||(43933575-43933775)
chr7 (22-220)||(15109697-15109896)
chr7 (21-220)||(40968889-40969089)
chr7 (21-220)||(13786168-13786368)
chr7 (21-220)||(27903448-27903648)
chr7 (22-220)||(21753524-21753723)
chr7 (21-183)||(39030283-39030446)
chr7 (170-220)||(31096698-31096748)
chr7 (172-215)||(15109930-15109973)
chr7 (172-215)||(3840912-3840955)
chr7 (172-215)||(16376812-16376855)
chr7 (172-215)||(17178508-17178551)
chr7 (172-215)||(21341737-21341780)
chr7 (172-215)||(21656547-21656590)
chr7 (172-215)||(21669895-21669938)
chr7 (172-215)||(21804842-21804885)
chr7 (172-215)||(27138798-27138841)
chr7 (172-215)||(31373370-31373413)
chr7 (172-215)||(33917217-33917260)
chr7 (172-215)||(42242424-42242467)
chr7 (174-215)||(43933815-43933856)
chr7 (172-212)||(24924001-24924041)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (21-220)||(12597296-12597496)
chr6 (21-220)||(19997663-19997863)
chr6 (21-220)||(33645940-33646140)
chr6 (21-220)||(28099628-28099828)
chr6 (21-220)||(2266766-2266974)
chr6 (21-220)||(10584759-10584959)
chr6 (21-220)||(17202430-17202630)
chr6 (21-214)||(13533771-13533965)
chr6 (21-220)||(2005426-2005626)
chr6 (21-215)||(15044725-15044920)
chr6 (21-220)||(3592891-3593091)
chr6 (57-220)||(17594814-17594979)
chr6 (94-220)||(8539598-8539725)
chr6 (94-220)||(25448747-25448874)
chr6 (21-115)||(1405594-1405688)
chr6 (26-129)||(33035523-33035626)
chr6 (172-215)||(2266684-2266727)
chr6 (172-215)||(10584996-10585039)
chr6 (172-215)||(12597535-12597578)
chr6 (172-215)||(15044639-15044682)
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chr6 (172-215)||(17594733-17594776)
chr6 (172-215)||(19997580-19997623)
chr6 (172-215)||(28099868-28099911)
chr6 (172-215)||(33645858-33645901)
[»] chr5 (39 HSPs)
chr5 (21-220)||(10729473-10729673)
chr5 (21-220)||(20874686-20874886)
chr5 (21-220)||(34107369-34107569)
chr5 (21-220)||(34110650-34110850)
chr5 (21-220)||(38246896-38247096)
chr5 (21-220)||(16526337-16526537)
chr5 (26-220)||(17373200-17373395)
chr5 (25-220)||(33570342-33570538)
chr5 (21-220)||(2398973-2399171)
chr5 (37-220)||(14141154-14141338)
chr5 (29-220)||(27647928-27648120)
chr5 (21-220)||(1395987-1396187)
chr5 (21-220)||(5479194-5479394)
chr5 (21-220)||(20655080-20655280)
chr5 (26-220)||(29275622-29275817)
chr5 (21-220)||(33375760-33375962)
chr5 (32-220)||(6940545-6940734)
chr5 (21-220)||(24223195-24223395)
chr5 (21-220)||(25099267-25099467)
chr5 (21-220)||(25158357-25158557)
chr5 (45-220)||(1394541-1394717)
chr5 (21-140)||(40177120-40177239)
chr5 (53-215)||(17913744-17913907)
chr5 (172-215)||(1395907-1395950)
chr5 (172-215)||(2399210-2399253)
chr5 (172-215)||(5479115-5479158)
chr5 (172-215)||(6940768-6940811)
chr5 (172-215)||(10729712-10729755)
chr5 (172-215)||(14141377-14141420)
chr5 (172-215)||(16526577-16526620)
chr5 (172-215)||(17373434-17373477)
chr5 (172-215)||(20874604-20874647)
chr5 (172-215)||(24223434-24223477)
chr5 (172-215)||(27647845-27647888)
chr5 (172-215)||(33570578-33570621)
chr5 (172-215)||(34107608-34107651)
chr5 (172-215)||(34110566-34110609)
chr5 (172-215)||(38247135-38247178)
chr5 (172-215)||(40177033-40177076)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (21-220)||(16917919-16918119)
chr4 (21-220)||(52434622-52434822)
chr4 (21-220)||(30824953-30825153)
chr4 (21-220)||(53143293-53143493)
chr4 (21-220)||(12090490-12090691)
chr4 (21-220)||(37651664-37651864)
chr4 (21-220)||(31966000-31966200)
chr4 (21-214)||(16904983-16905177)
chr4 (21-220)||(46256032-46256232)
chr4 (21-220)||(33139502-33139702)
chr4 (21-220)||(44376110-44376310)
chr4 (21-220)||(45977021-45977221)
chr4 (21-214)||(35760585-35760779)
chr4 (21-220)||(31628518-31628718)
chr4 (21-220)||(41387124-41387324)
chr4 (39-220)||(45782478-45782660)
chr4 (21-220)||(37590835-37591035)
chr4 (21-220)||(48118565-48118762)
chr4 (21-220)||(52098221-52098422)
chr4 (21-220)||(39058388-39058588)
chr4 (21-220)||(47142831-47143031)
chr4 (23-220)||(54624955-54625146)
chr4 (52-215)||(50229768-50229933)
chr4 (30-84)||(50229712-50229766)
chr4 (172-215)||(12090730-12090773)
chr4 (172-215)||(16905218-16905261)
chr4 (172-215)||(16918158-16918201)
chr4 (172-215)||(30825192-30825235)
chr4 (172-215)||(31966239-31966282)
chr4 (97-144)||(34684603-34684650)
chr4 (172-215)||(39058622-39058665)
chr4 (172-215)||(45977264-45977307)
chr4 (172-215)||(47143070-47143113)
chr4 (172-215)||(48118802-48118845)
chr4 (172-215)||(52098460-52098503)
chr4 (172-215)||(52434540-52434583)
chr4 (172-215)||(53143534-53143577)
chr4 (172-215)||(54624879-54624922)
chr4 (175-215)||(50229979-50230019)
[»] chr3 (39 HSPs)
chr3 (21-220)||(3898420-3898620)
chr3 (21-220)||(12264198-12264398)
chr3 (21-220)||(38653958-38654158)
chr3 (21-220)||(43363642-43363842)
chr3 (21-220)||(49672560-49672760)
chr3 (21-220)||(1941751-1941951)
chr3 (21-220)||(21098302-21098502)
chr3 (21-220)||(34121353-34121553)
chr3 (21-220)||(49506380-49506580)
chr3 (26-220)||(54073025-54073220)
chr3 (21-220)||(4584465-4584665)
chr3 (21-220)||(20671247-20671447)
chr3 (21-220)||(26948796-26948996)
chr3 (21-220)||(36076485-36076685)
chr3 (23-220)||(31488409-31488607)
chr3 (21-220)||(39146438-39146638)
chr3 (21-220)||(45557915-45558115)
chr3 (32-220)||(24119205-24119394)
chr3 (21-220)||(49478206-49478406)
chr3 (21-220)||(55041614-55041820)
chr3 (21-173)||(40014684-40014837)
chr3 (22-144)||(26051334-26051457)
chr3 (147-220)||(26052236-26052309)
chr3 (21-92)||(6460199-6460269)
chr3 (172-215)||(1941990-1942033)
chr3 (172-215)||(3898338-3898381)
chr3 (172-215)||(12264115-12264158)
chr3 (172-215)||(20671166-20671209)
chr3 (172-215)||(21098219-21098262)
chr3 (172-215)||(26052349-26052392)
chr3 (172-215)||(26948689-26948732)
chr3 (172-215)||(31488329-31488372)
chr3 (172-215)||(34121271-34121314)
chr3 (172-215)||(38654198-38654241)
chr3 (172-215)||(43363881-43363924)
chr3 (172-215)||(49478124-49478167)
chr3 (172-215)||(49672478-49672521)
chr3 (172-215)||(55041858-55041901)
chr3 (174-215)||(36076723-36076764)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (21-220)||(41663235-41663435)
chr2 (21-220)||(41664508-41664708)
chr2 (21-220)||(6120550-6120750)
chr2 (21-220)||(18351549-18351749)
chr2 (21-220)||(44902080-44902279)
chr2 (21-215)||(20544828-20545023)
chr2 (21-220)||(19596394-19596594)
chr2 (21-220)||(31424007-31424207)
chr2 (21-220)||(42441958-42442162)
chr2 (21-220)||(8700259-8700459)
chr2 (21-220)||(36279485-36279685)
chr2 (23-220)||(26231292-26231490)
chr2 (20-220)||(999261-999462)
chr2 (23-215)||(34007742-34007935)
chr2 (21-220)||(42055197-42055395)
chr2 (31-205)||(16214837-16215012)
chr2 (21-150)||(27944827-27944956)
chr2 (21-144)||(692233-692356)
chr2 (172-215)||(19596634-19596677)
chr2 (172-215)||(6120467-6120510)
chr2 (172-215)||(16214741-16214784)
chr2 (172-215)||(18351467-18351510)
chr2 (172-215)||(26231527-26231570)
chr2 (172-215)||(31423924-31423967)
chr2 (172-215)||(34007980-34008023)
chr2 (172-215)||(41663152-41663195)
chr2 (172-215)||(42441876-42441919)
[»] chr1 (35 HSPs)
chr1 (21-220)||(4266379-4266579)
chr1 (21-220)||(34888717-34888917)
chr1 (21-220)||(38913778-38913978)
chr1 (21-220)||(50151058-50151258)
chr1 (21-220)||(2951397-2951597)
chr1 (21-201)||(1231813-1231994)
chr1 (23-220)||(7333942-7334140)
chr1 (21-220)||(9216029-9216229)
chr1 (21-220)||(23482738-23482938)
chr1 (21-220)||(35614065-35614265)
chr1 (21-220)||(18706540-18706739)
chr1 (21-220)||(38444629-38444829)
chr1 (30-220)||(39727978-39728169)
chr1 (29-207)||(35614827-35615005)
chr1 (21-215)||(52687145-52687339)
chr1 (21-150)||(50326070-50326199)
chr1 (21-220)||(18855264-18855463)
chr1 (21-145)||(31018231-31018355)
chr1 (33-207)||(19764593-19764768)
chr1 (81-220)||(19768462-19768602)
chr1 (85-220)||(2590333-2590468)
chr1 (23-107)||(5061335-5061419)
chr1 (21-84)||(29942153-29942216)
chr1 (172-215)||(1231725-1231768)
chr1 (172-215)||(2951636-2951679)
chr1 (172-215)||(4266297-4266340)
chr1 (172-215)||(18706773-18706816)
chr1 (172-215)||(19764814-19764857)
chr1 (172-215)||(19768382-19768425)
chr1 (172-215)||(23482972-23483015)
chr1 (172-215)||(35613984-35614027)
chr1 (172-215)||(35614734-35614777)
chr1 (172-215)||(38914017-38914060)
chr1 (172-215)||(52036310-52036353)
chr1 (175-215)||(7333863-7333903)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (21-220)||(149081-149281)
scaffold0022 (172-215)||(149318-149361)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (24-220)||(19345-19542)
[»] scaffold0836 (1 HSPs)
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[»] scaffold0515 (1 HSPs)
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[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (21-142)||(6102-6223)


Alignment Details
Target: scaffold0031 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 46472 - 46272
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  46472 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 46373  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46372 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 46273  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  46272 g 46272  T

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Target: chr8 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 48)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15961330 - 15961130
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15961330 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 15961231  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15961230 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 15961131  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  15961130 g 15961130  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18997898 - 18997698
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18997898 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 18997799  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18997798 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 18997699  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  18997698 g 18997698  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 30473915 - 30474115
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  30473915 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 30474014  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30474015 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 30474114  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  30474115 g 30474115  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 44832217 - 44832417
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  44832217 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 44832316  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44832317 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 44832416  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  44832417 g 44832417  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 6299051 - 6299251
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6299051 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 6299150  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6299151 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcctttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 6299250  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  6299251 g 6299251  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10478135 - 10477935
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10478135 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcacaaatatatgcagatgttggaattcgaa 10478036  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10478035 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 10477936  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  10477935 g 10477935  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 32110892 - 32111092
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  32110892 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggttccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 32110991  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32110992 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 32111091  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  32111092 g 32111092  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 995846 - 996046
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  995846 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcatatgttggaattcgaa 995945  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  995946 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaacttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 996045  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  996046 g 996046  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18175579 - 18175379
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18175579 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 18175480  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18175479 cctcagacaccacacttattcaccaaaaaaatattaattattatcaaacgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 18175380  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  18175379 g 18175379  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39257641 - 39257441
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39257641 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaatttgaa 39257542  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  39257541 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 39257442  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  39257441 g 39257441  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40026998 - 40026798
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40026998 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagataatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaatttgaa 40026899  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  40026898 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 40026799  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  40026798 g 40026798  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11725388 - 11725188
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11725388 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtctcaaatatatgcagatgttggaattcgaa 11725289  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  11725288 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 11725189  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  11725188 g 11725188  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 28274245 - 28274445
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  28274245 tcatatacattgtagatgtagcagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatacgcagatgttggaattcgaa 28274344  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  28274345 cctcatacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 28274444  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  28274445 g 28274445  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Original strand, 35122353 - 35122540
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  35122353 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtccaaaatatatgcagatgttggaattcgaa 35122452  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaat 207  Q
     |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35122453 tctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttattaaaattatatgtcaat 35122540  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Original strand, 18210656 - 18210850
Alignment:
Q  22 catatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaac 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18210656 catatacattgtagatatagtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtctcaaatatatgcagatgttggaatttgaac 18210755  T
Q  122 ctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18210756 ctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttatttccttcttttgttaaagttatatgtcaatgttatatt 18210850  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28583053 - 28582859
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  28583053 tcatatacattgtagatgtagtagataaaaacaaatctcaatgtatatcaaagagaatgaaatatgtggtctcaaatatatgcagatgttggaattcgaa 28582954  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatat 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28582953 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatat 28582859  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18842102 - 18841902
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18842102 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtccaaaatatatgcagatgttggaattcgaa 18842003  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
     |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  18842002 tctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtatgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 18841903  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  18841902 g 18841902  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44837105 - 44836907
Alignment:
Q  23 atatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacc 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44837105 atatacattgtagatgtagtagacaaaaataaatctcaatacatatcaaagagaataaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaattcgaacc 44837006  T
Q  123 tcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||    
T  44837005 tcagacaccacgcttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatctcaatgttaaattattgg 44836907  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18569063 - 18568863
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18569063 tcatatacattgtagatgttgtagacaaaaacatatctcaatgcatatcaaagagaataaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 18568964  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattca-ccaaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  18568963 cctcaaacaccacacttattcatcttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 18568864  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  18568863 g 18568863  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24409074 - 24408874
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24409074 tcatatacattgtagatgtagtagataaaaacaaatcttaatgcatatcaaagataatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 24408975  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  24408974 catcatacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 24408875  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  24408874 g 24408874  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19240843 - 19240661
Alignment:
Q  39 tagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgctta 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19240843 tagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacactta 19240744  T
Q  139 ttcac-caaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19240743 ttcacgttaaaaatattaatttttatcaatggtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 19240661  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19314027 - 19313845
Alignment:
Q  39 tagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgctta 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19314027 tagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacactta 19313928  T
Q  139 ttcac-caaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19313927 ttcacgttaaaaatattaatttttatcaatggtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 19313845  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19413022 - 19412829
Alignment:
Q  29 attgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagac 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19413022 attgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagac 19412923  T
Q  129 accacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattc-ttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    |||||  |||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19412922 accacagttattcaccttaaaaatattaatttttatccatcgtgtgttacttcattctttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 19412829  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11142665 - 11142459
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11142665 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgctcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 11142566  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatatta------ttttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattata 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  11142565 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcagtgttata 11142466  T
Q  214 ttcttgg 220  Q
    || ||||    
T  11142465 ttattgg 11142459  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 220
Target Start/End: Original strand, 24004779 - 24004958
Alignment:
Q  42 tagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgcttattc 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24004779 tagacaaaatcaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttgaaattcgaacctcagacaccacacttattc 24004878  T
Q  142 acc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24004879 accttaaaaatattaatttttatcaatcatgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 24004958  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 39997889 - 39997726
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  39997889 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgtatatcaaagagaatgaaatatgtggttccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 39997790  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcatt 183  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39997789 cctcagacaccacacttattcacctttaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcatt 39997726  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 101 - 220
Target Start/End: Original strand, 23353688 - 23353808
Alignment:
Q  101 tgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgcttattcacca-aaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattat 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23353688 tgcagatgttggaattcgaacctcagacaccccacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatggtgtgttacttcattcttttgttaaaattat 23353787  T
Q  200 atgtcaatattatattcttgg 220  Q
    |||||||| ||||||| ||||    
T  23353788 atgtcaatgttatattattgg 23353808  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 25875322 - 25875530
Alignment:
Q  22 catatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaac 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||      |||||||||| ||||||| ||||    
T  25875322 catatacatcgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatattaaagagaataaaacatgtgctccc-----tatgcagatgctggaattcgaac 25875416  T
Q  122 ctcagacacc--------------acgcttattcacca-aaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaa 206  Q
    ||||||||                || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25875417 ctcagacatattaaagagaataaaacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaa 25875516  T
Q  207 tattatattcttgg 220  Q
    | ||||||| ||||    
T  25875517 tgttatattattgg 25875530  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 220
Target Start/End: Original strand, 18481929 - 18481991
Alignment:
Q  158 ttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18481929 ttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 18481991  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39997708 - 39997660
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  39997708 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgtcaatgttatattattgg 39997660  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 6299290 - 6299333
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  6299290 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 6299333  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10477896 - 10477853
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  10477896 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 10477853  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11142424 - 11142381
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  11142424 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 11142381  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11725149 - 11725106
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  11725149 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 11725106  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18175340 - 18175297
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  18175340 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 18175297  T

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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18997659 - 18997616
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  18997659 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 18997616  T

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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19240623 - 19240580
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  19240623 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 19240580  T

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Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19313807 - 19313764
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  19313807 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 19313764  T

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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19412795 - 19412752
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  19412795 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 19412752  T

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Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 23353846 - 23353889
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  23353846 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 23353889  T

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Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24408838 - 24408795
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  24408838 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 24408795  T

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Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 30474153 - 30474196
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  30474153 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 30474196  T

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Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 32111131 - 32111174
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  32111131 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 32111174  T

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Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 35122585 - 35122628
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  35122585 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 35122628  T

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Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39997623 - 39997580
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  39997623 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 39997580  T

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Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 44832457 - 44832500
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  44832457 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 44832500  T

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Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 44836867 - 44836824
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  44836867 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 44836824  T

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Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 214
Target Start/End: Original strand, 18210893 - 18210935
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatat 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  18210893 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatat 18210935  T

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Target: chr7 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 21804603 - 21804803
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21804603 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 21804702  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21804703 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 21804802  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  21804803 g 21804803  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 38163370 - 38163570
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  38163370 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 38163469  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38163470 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 38163569  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  38163570 g 38163570  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 42242185 - 42242385
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  42242185 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 42242284  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42242285 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 42242384  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  42242385 g 42242385  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 3840672 - 3840867
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3840672 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 3840771  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3840772 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 3840867  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 27138559 - 27138759
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  27138559 tcatatacattctagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 27138658  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27138659 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 27138758  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  27138759 g 27138759  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 33916978 - 33917178
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  33916978 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 33917077  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33917078 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttatttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 33917177  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  33917178 g 33917178  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31373654 - 31373454
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  31373654 tcatatacattgtagatataatagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttgaaattcgaa 31373555  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31373554 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtattacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 31373455  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  31373454 g 31373454  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 17178268 - 17178469
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17178268 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaattcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 17178367  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc--aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattctt 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17178368 cctcagacaccacacttattcaccaaaaaaaatattaatttttatcaatcgggtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattatt 17178467  T
Q  219 gg 220  Q
    ||    
T  17178468 gg 17178469  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21342021 - 21341821
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21342021 tcatatacattgtagatataatagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtagtctcaaatatatgcagatgttggaattcgaa 21341922  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21341921 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 21341822  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  21341821 g 21341821  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21670179 - 21669979
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21670179 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 21670080  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  21670079 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 21669980  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  21669979 g 21669979  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24924277 - 24924077
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24924277 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgtagatgttggaatttgaa 24924178  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  24924177 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaaattttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 24924078  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  24924077 g 24924077  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 16376576 - 16376776
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16376576 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 16376675  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16376676 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 16376775  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  16376776 g 16376776  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21656826 - 21656626
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21656826 tcatatacactgtagatgaagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 21656727  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  21656726 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 21656627  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  21656626 g 21656626  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 43933575 - 43933775
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  43933575 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaaaaaatctcaatgcatataaaagagaataaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 43933674  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  43933675 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 43933774  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  43933775 g 43933775  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 15109697 - 15109896
Alignment:
Q  22 catatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaac 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15109697 catatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaac 15109796  T
Q  122 ctcagacaccacgcttattca-ccaaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    |||||||||||| |||||||| |  |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15109797 ctcagacaccacacttattcatcttaaaagtattaatttttatcaattgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 15109896  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40969089 - 40968889
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  40969089 tcatatacattgtagatgtagtagacacaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 40968990  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  40968989 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 40968890  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  40968889 g 40968889  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13786368 - 13786168
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13786368 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 13786269  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  13786268 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgcgtcttacttcatttttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 13786169  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  13786168 g 13786168  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 27903448 - 27903648
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  27903448 tcatatatattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 27903547  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  27903548 cctcatacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttaccaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattctatgtcaatgttatattattg 27903647  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  27903648 g 27903648  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 21753524 - 21753723
Alignment:
Q  22 catatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaac 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  21753524 catatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtctcaaatatatgcagatgttaaaattcgaac 21753623  T
Q  122 ctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    || ||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21753624 cttagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 21753723  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 183
Target Start/End: Original strand, 39030283 - 39030446
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  39030283 tcatatatattgtagatgtagtagacaaaaacaaatttcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 39030382  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcatt 183  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  39030383 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcatt 39030446  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31096748 - 31096698
Alignment:
Q  170 tgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31096748 tgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 31096698  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 15109930 - 15109973
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15109930 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatattatatt 15109973  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 3840912 - 3840955
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  3840912 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 3840955  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 16376812 - 16376855
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16376812 tgttacttcattattttgtaaaaattatatgtcaatgttatatt 16376855  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 17178508 - 17178551
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  17178508 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 17178551  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21341780 - 21341737
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  21341780 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 21341737  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21656590 - 21656547
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  21656590 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 21656547  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21669938 - 21669895
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  21669938 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 21669895  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 21804842 - 21804885
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  21804842 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 21804885  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 27138798 - 27138841
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  27138798 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 27138841  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31373413 - 31373370
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  31373413 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 31373370  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 33917217 - 33917260
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  33917217 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 33917260  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 42242424 - 42242467
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  42242424 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 42242467  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 215
Target Start/End: Original strand, 43933815 - 43933856
Alignment:
Q  174 ttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  43933815 ttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 43933856  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24924041 - 24924001
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattat 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  24924041 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttat 24924001  T

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Target: chr6 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 12597296 - 12597496
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12597296 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 12597395  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12597396 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 12597495  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  12597496 g 12597496  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19997863 - 19997663
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19997863 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 19997764  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19997763 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 19997664  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  19997663 g 19997663  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33646140 - 33645940
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  33646140 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggttccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 33646041  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33646040 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 33645941  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  33645940 g 33645940  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 28099628 - 28099828
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  28099628 tcatatacattgtagatataatagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgctgatgttggaattcgaa 28099727  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28099728 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 28099827  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  28099828 g 28099828  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2266974 - 2266766
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  2266974 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 2266875  T
Q  121 cctcagacac--------cacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatatta 211  Q
    ||||||||||        |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2266874 cctcagacaccacgacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatatta 2266775  T
Q  212 tattcttgg 220  Q
    |||| ||||    
T  2266774 tattattgg 2266766  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 10584759 - 10584959
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10584759 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatcttaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 10584858  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  10584859 cctcagacactacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 10584958  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  10584959 g 10584959  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17202630 - 17202430
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17202630 tcatatacattgtagatgtagtagacaaatacaaatcacaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 17202531  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  17202530 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 17202431  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  17202430 g 17202430  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13533965 - 13533771
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13533965 tcatatacattgtagatgtagtagataaaaacaaatctcaatgtatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 13533866  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatat 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13533865 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatat 13533771  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2005626 - 2005426
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  2005626 tcatatacattgtagatgcagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcttaaatatatgcagatgttggaattcgaa 2005527  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  2005526 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 2005427  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  2005426 g 2005426  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15044920 - 15044725
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15044920 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaataaatttcaatgcatatcaaagagaataaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 15044821  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15044820 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgttttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatatt 15044725  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3593091 - 3592891
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  3593091 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatccaagagaatgaaatatgtgatcccaaatatattcagatgttggaattcgaa 3592992  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  3592991 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatgaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatctcaatgttatattattg 3592892  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  3592891 g 3592891  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 57 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17594979 - 17594814
Alignment:
Q  57 ctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatatt- 154  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||     
T  17594979 ctcaatgcatatcaaagaaaatgaaatatgtggtcccaaatatatggagatgttgaaattcaaacttcagacaccacacttattcaccttaaaaatatta 17594880  T
Q  155 attttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  17594879 aatttttatcaatcgtatgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 17594814  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 94 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8539725 - 8539598
Alignment:
Q  94 aaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgcttattcacca-aaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgtta 192  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8539725 aaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgtta 8539626  T
Q  193 aaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  8539625 aaattatatgtcaatgttatattattgg 8539598  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 94 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25448874 - 25448747
Alignment:
Q  94 aaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaa-atattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgtta 192  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25448874 aaatatatgtagatgttggaattcgaaactcagacaccacgcttattcaccaaaaatatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcatttttttgtta 25448775  T
Q  193 aaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25448774 aaattatatgtcaatattatattattgg 25448747  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 115
Target Start/End: Original strand, 1405594 - 1405688
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaat 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1405594 tcatatacattgtagatgtagtagataaaaacaaatctcaatgtatattaaagagaatgaaatatgtgatcccaaatatatgcagatgttggaat 1405688  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 33035626 - 33035523
Alignment:
Q  26 tacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctca 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  33035626 tacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatgtcaaagagaataaaacatgtggtctcaaatatatgcagatgctggaattcgaatctca 33035527  T
Q  126 gaca 129  Q
    ||||    
T  33035526 gaca 33035523  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2266727 - 2266684
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  2266727 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 2266684  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 10584996 - 10585039
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  10584996 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 10585039  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 12597535 - 12597578
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  12597535 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 12597578  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15044682 - 15044639
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  15044682 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 15044639  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17202391 - 17202348
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  17202391 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 17202348  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17594776 - 17594733
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  17594776 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 17594733  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19997623 - 19997580
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  19997623 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 19997580  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 28099868 - 28099911
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  28099868 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 28099911  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33645901 - 33645858
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  33645901 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 33645858  T

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Target: chr5 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 39)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 10729473 - 10729673
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10729473 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatccaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 10729572  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10729573 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 10729672  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  10729673 g 10729673  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20874886 - 20874686
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20874886 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 20874787  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20874786 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 20874687  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  20874686 g 20874686  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 34107369 - 34107569
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34107369 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 34107468  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34107469 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 34107568  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  34107569 g 34107569  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34110850 - 34110650
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34110850 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 34110751  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34110750 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 34110651  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  34110650 g 34110650  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 38246896 - 38247096
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  38246896 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 38246995  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38246996 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 38247095  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  38247096 g 38247096  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 16526337 - 16526537
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16526337 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 16526436  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16526437 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcgttcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 16526536  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  16526537 g 16526537  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Original strand, 17373200 - 17373395
Alignment:
Q  26 tacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17373200 tacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctca 17373299  T
Q  126 gacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17373300 gacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 17373395  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 220
Target Start/End: Original strand, 33570342 - 33570538
Alignment:
Q  25 atacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctc 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33570342 atacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcataccaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctc 33570441  T
Q  125 agacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33570442 agacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 33570538  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 2398973 - 2399171
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  2398973 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 2399072  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2399073 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatc--gtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 2399170  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 37 - 220
Target Start/End: Original strand, 14141154 - 14141338
Alignment:
Q  37 tatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgct 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14141154 tatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccacgct 14141253  T
Q  137 tattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14141254 tattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgccaatattatattattgg 14141338  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 29 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27648120 - 27647928
Alignment:
Q  29 attgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagac 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27648120 attgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatacagatgttggaattcgaacctcagac 27648021  T
Q  129 accacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27648020 accacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattgttgg 27647928  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1396187 - 1395987
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  1396187 tcatatacattgcagatgtagcagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatctgcagatgttggaattcgaa 1396088  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  1396087 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcagtcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 1395988  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  1395987 g 1395987  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5479394 - 5479194
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  5479394 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtgatcccaaatatatgtagatgttggaattcgaa 5479295  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  5479294 cctcagacactacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 5479195  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  5479194 g 5479194  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 20655080 - 20655280
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20655080 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 20655179  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  20655180 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 20655279  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  20655280 g 20655280  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29275817 - 29275622
Alignment:
Q  26 tacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctca 125  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29275817 tacattgtagatgtaatagacaaaaacaaatttcaatgcatatcaaagagaatgaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctca 29275718  T
Q  126 gacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29275717 gacaccacacttattcaccttaaaaatattaacttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 29275622  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33375962 - 33375760
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggt--cctaaatatatgcagatgttggaatttg 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |    
T  33375962 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtgtcccaaatatatgcagatgttggaattcg 33375863  T
Q  119 aacctcagacaccacgcttattcacca-aaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattct 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  33375862 aacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattat 33375763  T
Q  218 tgg 220  Q
    |||    
T  33375762 tgg 33375760  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 220
Target Start/End: Original strand, 6940545 - 6940734
Alignment:
Q  32 gtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacacc 131  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6940545 gtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcatacacc 6940644  T
Q  132 acgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  6940645 acacttattcacctgaaaaatattaatttttatcaatcgtatgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaacgttatattattgg 6940734  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 24223195 - 24223395
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24223195 tcatatacatcgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatgaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 24223294  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||    
T  24223295 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattactctttaccaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaagtatatgtcaatgtgatattattg 24223394  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  24223395 g 24223395  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 25099267 - 25099467
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  25099267 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctgaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcacaaatatatgcagatgttggaattcgaa 25099366  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  25099367 cctcaggcaccacacttattcgccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 25099466  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  25099467 g 25099467  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 25158357 - 25158557
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  25158357 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctgaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcacaaatatatgcagatgttggaattcgaa 25158456  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  25158457 cctcaggcaccacacttattcgccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 25158556  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  25158557 g 25158557  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 220
Target Start/End: Original strand, 1394541 - 1394717
Alignment:
Q  45 acaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgcttattcacc 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  1394541 acaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcaaacaccacacttgttcacc 1394640  T
Q  145 -aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  1394641 ttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaatttatatgtcaatgttatattattgg 1394717  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 40177239 - 40177120
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  40177239 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatataaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 40177140  T
Q  121 cctcagacaccacgcttatt 140  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40177139 cctcagacaccacgcttatt 40177120  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 53 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17913907 - 17913744
Alignment:
Q  53 aaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaat 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||    
T  17913907 aaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgtagatgttggaattcgaacctcaaataccacacttattcaccttaaaaat 17913808  T
Q  152 attattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17913807 attaatctttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatatt 17913744  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1395950 - 1395907
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  1395950 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 1395907  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 2399210 - 2399253
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  2399210 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 2399253  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5479158 - 5479115
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  5479158 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 5479115  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 6940768 - 6940811
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  6940768 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 6940811  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 10729712 - 10729755
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  10729712 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 10729755  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 14141377 - 14141420
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  14141377 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 14141420  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 16526577 - 16526620
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  16526577 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 16526620  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 17373434 - 17373477
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  17373434 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 17373477  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20874647 - 20874604
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  20874647 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 20874604  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 24223434 - 24223477
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  24223434 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 24223477  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27647888 - 27647845
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  27647888 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 27647845  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 33570578 - 33570621
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  33570578 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 33570621  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 34107608 - 34107651
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  34107608 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 34107651  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 34110609 - 34110566
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  34110609 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 34110566  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 38247135 - 38247178
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  38247135 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 38247178  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40177076 - 40177033
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  40177076 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 40177033  T

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Target: chr4 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 16917919 - 16918119
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16917919 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 16918018  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16918019 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 16918118  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  16918119 g 16918119  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 52434822 - 52434622
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  52434822 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 52434723  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52434722 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 52434623  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  52434622 g 52434622  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 30824953 - 30825153
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  30824953 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggttccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 30825052  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30825053 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 30825152  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  30825153 g 30825153  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 53143293 - 53143493
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  53143293 tcatatacattgtagatataatagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 53143392  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53143393 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 53143492  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  53143493 g 53143493  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 12090490 - 12090691
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  12090490 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgtagatgttggaattcgaa 12090589  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattc-accaaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttca-ttcttttgttaaaattatatgtcaatattatattctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12090590 cctcagacaccacgcttattcaaccaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcatttcttttgttaaaattatatgtcaatattatattatt 12090689  T
Q  219 gg 220  Q
    ||    
T  12090690 gg 12090691  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37651864 - 37651664
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  37651864 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatgaaagagaatgaaatatgtggtctcaaatatatgcagatgttggaattcgaa 37651765  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37651764 cctcaaacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 37651665  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  37651664 g 37651664  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 31966000 - 31966200
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  31966000 tcatatacattgtagatttattatacataaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 31966099  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31966100 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 31966199  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  31966200 g 31966200  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 16904983 - 16905177
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16904983 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 16905082  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatat 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16905083 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatat 16905177  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 46256232 - 46256032
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  46256232 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattggaa 46256133  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  46256132 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtatcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 46256033  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  46256032 g 46256032  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 33139502 - 33139702
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  33139502 tcatatacattgtagatttagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaattaaatatgttgtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 33139601  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||  |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  33139602 cctcagacaccacatttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtattacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 33139701  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  33139702 g 33139702  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 44376110 - 44376310
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  44376110 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcacaaatatatgcagatgttggaattcgaa 44376209  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  44376210 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 44376309  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  44376310 g 44376310  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 45977021 - 45977221
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45977021 tcatatacatcgtagatgtagtagataaaaataaatatcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaattcgaa 45977120  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  45977121 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 45977220  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  45977221 g 45977221  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35760779 - 35760585
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  35760779 tcatatacattgtagatatagtagataaaaataaatctcaatgtatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 35760680  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatat 214  Q
    ||||| |||||||  |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35760679 cctcaaacaccacaattattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatat 35760585  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 31628518 - 31628718
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  31628518 tcatatacattgtagatgttgtagacaaaaacatatctcaatgcatatcaaagagaattaaatatgtggtctcaaatatatgcagatgttggaattcgaa 31628617  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattca-ccaaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  31628618 cctcatacaccacacttattcatcttaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 31628717  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  31628718 g 31628718  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 41387324 - 41387124
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||    
T  41387324 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgctgaaattcgaa 41387225  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  41387224 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcgatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 41387125  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  41387124 g 41387124  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 220
Target Start/End: Original strand, 45782478 - 45782660
Alignment:
Q  39 tagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgctta 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45782478 tagtagacaaaaataaatctcaatatatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgaagatgttggaatttgaacctcagacaccacactta 45782577  T
Q  139 ttcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  45782578 ttcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 45782660  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 37590835 - 37591035
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  37590835 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaatcaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttgaaattcgaa 37590934  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  37590935 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcatgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 37591034  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  37591035 g 37591035  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 48118565 - 48118762
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  48118565 tcatatacattgtagat---gtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 48118661  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  48118662 cctcaaacaccacacgtattcaccttaaaaatattaatttttaccaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 48118761  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 52098221 - 52098422
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  52098221 tcatatacactgtaaatatagtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcaaa 52098320  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatatt-attttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattctt 218  Q
    | |||||||| || ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  52098321 cttcagacacaacacttattcaccttaaaaatattaaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattatt 52098420  T
Q  219 gg 220  Q
    ||    
T  52098421 gg 52098422  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 39058388 - 39058588
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||    
T  39058388 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaattttaatatatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatcaagatgttggaattcgaa 39058487  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  39058488 cctcagataccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcatgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 39058587  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  39058588 g 39058588  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 47142831 - 47143031
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  47142831 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgacatatgtggtctcaaatatatgcagatgttagaattcgaa 47142930  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||    
T  47142931 cctcagacaccatgcttattcaccttaaaaatattaatttttatcgattgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatctcaatgttaaattattg 47143030  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  47143031 g 47143031  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 54625146 - 54624955
Alignment:
Q  23 atatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacc 122  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54625146 atatacattgtagacgtagtagacaaaaacaaatcttaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacc 54625047  T
Q  123 tcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  54625046 tcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatca------tgttacttcattc-tttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 54624955  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 215
Target Start/End: Original strand, 50229768 - 50229933
Alignment:
Q  52 caaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaa 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  |||||    
T  50229768 caaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaacatgtggtccaaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagacaccatacttattcaccttaaaaa 50229867  T
Q  151 tatt-attttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50229868 tattaattttttatcaatagtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatatt 50229933  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 84
Target Start/End: Original strand, 50229712 - 50229766
Alignment:
Q  30 ttgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaata 84  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50229712 ttgtagatgtagtagacaaaaaaaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaata 50229766  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 12090730 - 12090773
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  12090730 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 12090773  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 16905218 - 16905261
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  16905218 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 16905261  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 16918158 - 16918201
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  16918158 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 16918201  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 30825192 - 30825235
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  30825192 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 30825235  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 31966239 - 31966282
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  31966239 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 31966282  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 144
Target Start/End: Original strand, 34684603 - 34684650
Alignment:
Q  97 tatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgcttattcacc 144  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  34684603 tatatgcagaggttggaattcgaacctcagacaccccacttattcacc 34684650  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 39058622 - 39058665
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  39058622 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 39058665  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 45977264 - 45977307
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  45977264 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 45977307  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 47143070 - 47143113
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  47143070 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 47143113  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 48118802 - 48118845
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  48118802 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 48118845  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 52098460 - 52098503
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  52098460 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 52098503  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 52434583 - 52434540
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  52434583 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 52434540  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 53143534 - 53143577
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  53143534 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 53143577  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 54624922 - 54624879
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  54624922 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 54624879  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 215
Target Start/End: Original strand, 50229979 - 50230019
Alignment:
Q  175 tacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  50229979 tacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 50230019  T

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Target: chr3 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3898620 - 3898420
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3898620 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatattaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaatttgaa 3898521  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3898520 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 3898421  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  3898420 g 3898420  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12264398 - 12264198
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12264398 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 12264299  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12264298 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 12264199  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  12264198 g 12264198  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 38653958 - 38654158
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  38653958 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 38654057  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38654058 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 38654157  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  38654158 g 38654158  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 43363642 - 43363842
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  43363642 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 43363741  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43363742 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 43363841  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  43363842 g 43363842  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 49672760 - 49672560
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  49672760 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 49672661  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49672660 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 49672561  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  49672560 g 49672560  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 1941751 - 1941951
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  1941751 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 1941850  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1941851 cctcagacatcacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 1941950  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  1941951 g 1941951  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21098502 - 21098302
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21098502 tcatatacattgtagatataatagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 21098403  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21098402 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 21098303  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  21098302 g 21098302  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34121553 - 34121353
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34121553 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatacgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 34121454  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34121453 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 34121354  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  34121353 g 34121353  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 49506380 - 49506580
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  49506380 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 49506479  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49506480 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtggtacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 49506579  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  49506580 g 49506580  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 54073220 - 54073025
Alignment:
Q  26 tacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54073220 tacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctca 54073121  T
Q  126 gacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54073120 gacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 54073025  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 4584465 - 4584665
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4584465 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaatttgaa 4584564  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  4584565 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 4584664  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  4584665 g 4584665  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20671447 - 20671247
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20671447 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 20671348  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  20671347 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 20671248  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  20671247 g 20671247  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26948996 - 26948796
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26948996 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 26948897  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  26948896 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaacttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 26948797  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  26948796 g 26948796  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 36076485 - 36076685
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36076485 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatattaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 36076584  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    | ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  36076585 cttcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 36076684  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  36076685 g 36076685  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31488607 - 31488409
Alignment:
Q  23 atatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacc 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31488607 atatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgttgtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacc 31488508  T
Q  123 tcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  31488507 tcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttactttattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 31488409  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39146638 - 39146438
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  39146638 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaataaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 39146539  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  39146538 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 39146439  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  39146438 g 39146438  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 45557915 - 45558115
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||    
T  45557915 tcatatatattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaagtatatgcagatgttgaaattcgaa 45558014  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45558015 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtattacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 45558114  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  45558115 g 45558115  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 32 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24119394 - 24119205
Alignment:
Q  32 gtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacacc 131  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24119394 gtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatattaaagataatgaaatatatggtcccaaatatatgcagatgttggaattcaaacctcagacacc 24119295  T
Q  132 acgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24119294 acacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 24119205  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 49478406 - 49478206
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  49478406 tcatttacattgtagacgtagtagataaaaacaaatctcaatacatatcaaagataatgaaatatgtggtcccaaatatatgcaaatgttggaattcgaa 49478307  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  49478306 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttattaaaattatatgtcaatgttatattattg 49478207  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  49478206 g 49478206  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 55041614 - 55041820
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  55041614 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggttccaaatatatgcagatgtttgaattcgaa 55041713  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatatta------ttttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattata 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55041714 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatttttatcaatcgtgtgttacttcactcttttgttaaaattatatgtcaatgttata 55041813  T
Q  214 ttcttgg 220  Q
    || ||||    
T  55041814 ttattgg 55041820  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 40014684 - 40014837
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  40014684 tcatatacattgtagatataataaacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 40014783  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtg 173  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40014784 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtg 40014837  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Original strand, 26051334 - 26051457
Alignment:
Q  22 catatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggt-cctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||| |||    
T  26051334 catatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtccccaaatatatgctgaggttggaattcgaa 26051433  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26051434 cctcagacaccacgcttattcacc 26051457  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 220
Target Start/End: Original strand, 26052236 - 26052309
Alignment:
Q  147 aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  26052236 aaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 26052309  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 6460199 - 6460269
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcc 92  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6460199 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatacatatcaaa-agaataaaatatgtggtcc 6460269  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 1941990 - 1942033
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  1941990 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 1942033  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3898381 - 3898338
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  3898381 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 3898338  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12264158 - 12264115
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  12264158 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 12264115  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20671209 - 20671166
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  20671209 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 20671166  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21098262 - 21098219
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  21098262 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 21098219  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 26052349 - 26052392
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  26052349 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 26052392  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26948732 - 26948689
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  26948732 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 26948689  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31488372 - 31488329
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  31488372 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 31488329  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 34121314 - 34121271
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  34121314 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 34121271  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 38654198 - 38654241
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  38654198 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 38654241  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 43363881 - 43363924
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  43363881 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 43363924  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 49478167 - 49478124
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  49478167 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 49478124  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 49672521 - 49672478
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  49672521 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 49672478  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 55041858 - 55041901
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  55041858 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 55041901  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 215
Target Start/End: Original strand, 36076723 - 36076764
Alignment:
Q  174 ttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  36076723 ttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 36076764  T

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Target: chr2 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 41663435 - 41663235
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  41663435 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 41663336  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41663335 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 41663236  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  41663235 g 41663235  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 41664708 - 41664508
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  41664708 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 41664609  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41664608 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 41664509  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  41664508 g 41664508  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6120750 - 6120550
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6120750 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 6120651  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  6120650 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaactatatgtcaatattatattattg 6120551  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  6120550 g 6120550  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18351749 - 18351549
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18351749 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 18351650  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18351649 cctcaaacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 18351550  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  18351549 g 18351549  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44902279 - 44902080
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  44902279 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 44902180  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44902179 cctcagacaccacgcttattcacaaaaaaaatataatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattgg 44902080  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20545023 - 20544828
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  20545023 tcatatacattgtagatatggtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttagaattcgaa 20544924  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20544923 cctaaaacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtggtacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 20544828  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 19596394 - 19596594
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19596394 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatattaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 19596493  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  19596494 cctcagacaccacgcttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttaaattattg 19596593  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  19596594 g 19596594  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31424207 - 31424007
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  31424207 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgtagatgttggaattcgaa 31424108  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  31424107 cctcatacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaattgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 31424008  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  31424007 g 31424007  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42442162 - 42441958
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttgg------aa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      ||    
T  42442162 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 42442063  T
Q  115 tttgaacctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattata 213  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42442062 ttcgaacctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatc--gtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattata 42441965  T
Q  214 ttcttgg 220  Q
    || ||||    
T  42441964 ttattgg 42441958  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8700459 - 8700259
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  8700459 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatttcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 8700360  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||| |||||||  || ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  8700359 cctcatacaccacattttttcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 8700260  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  8700259 g 8700259  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 36279485 - 36279685
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36279485 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatatcaatgtatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 36279584  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
     |||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  36279585 tctcagataccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 36279684  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  36279685 g 36279685  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 23 - 220
Target Start/End: Original strand, 26231292 - 26231490
Alignment:
Q  23 atatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacc 122  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26231292 atatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatttcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtctcaaatatattcagatgttggaattcgaacc 26231391  T
Q  123 tcagacaccacgcttattca-ccaaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  26231392 tcagacaccacacttattcatcttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 26231490  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 999261 - 999462
Alignment:
Q  20 ctcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttga 119  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  999261 ctcatatactttgtagatgtagtagataaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgtagatgttggaattcga 999360  T
Q  120 acctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattctt 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  999361 acctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattatt 999460  T
Q  219 gg 220  Q
    ||    
T  999461 gg 999462  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 215
Target Start/End: Original strand, 34007742 - 34007935
Alignment:
Q  23 atatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacc 122  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  34007742 atatccattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtagtcccaaatatatgccgatgttggaattcgaacc 34007841  T
Q  123 tcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34007842 tcagacaccacacttatccaccttaaaaatattaatttttataaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatatt 34007935  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42055395 - 42055197
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  42055395 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaataggtgatcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 42055296  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||| |||    
T  42055295 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaagat--tatgtcaatgttatattattg 42055198  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16215012 - 16214837
Alignment:
Q  31 tgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacac 130  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||    
T  16215012 tgtagatgtagtagacaaaaataaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtccaaaatatatgcaaatgtaggaattcgaacctctaacac 16214913  T
Q  131 cacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtca 205  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16214912 cacacttattcaccttaaaaatattaatttttattaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtca 16214837  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 150
Target Start/End: Original strand, 27944827 - 27944956
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  27944827 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 27944926  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaa 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27944927 cctcagacaccacgcttattcacaaaaaaa 27944956  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 144
Target Start/End: Original strand, 692233 - 692356
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  692233 tcatatacattgtaaatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatatggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 692332  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  692333 cctcagacaccacacttattcacc 692356  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 19596634 - 19596677
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19596634 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgttaatgttatatt 19596677  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6120510 - 6120467
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  6120510 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 6120467  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16214784 - 16214741
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  16214784 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 16214741  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18351510 - 18351467
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  18351510 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 18351467  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 26231527 - 26231570
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  26231527 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 26231570  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31423967 - 31423924
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  31423967 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 31423924  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 34007980 - 34008023
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  34007980 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 34008023  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41663195 - 41663152
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  41663195 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 41663152  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42441919 - 42441876
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  42441919 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 42441876  T

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Target: chr1 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 35)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4266579 - 4266379
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  4266579 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 4266480  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4266479 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 4266380  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  4266379 g 4266379  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 34888717 - 34888917
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34888717 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 34888816  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34888817 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 34888916  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  34888917 g 34888917  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 38913778 - 38913978
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  38913778 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 38913877  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38913878 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 38913977  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  38913978 g 38913978  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 50151258 - 50151058
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  50151258 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 50151159  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50151158 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 50151059  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  50151058 g 50151058  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 2951397 - 2951597
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  2951397 tcatatacattgtaaatataataaacaaaaaaaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 2951496  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2951497 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattattg 2951596  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  2951597 g 2951597  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1231994 - 1231813
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  1231994 tcatatacattgtaaatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 1231895  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaa-aaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1231894 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatat 1231813  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7334140 - 7333942
Alignment:
Q  23 atatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacc 122  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  7334140 atatagatggtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcaaacc 7334041  T
Q  123 tcagacaccacgcttattcacca-aaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  7334040 tcagacaccacacttattcaccataaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 7333942  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9216229 - 9216029
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9216229 tcatatacattgtagatatagtagataaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 9216130  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  9216129 cctcagacaccacacttatttaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 9216030  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  9216029 g 9216029  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 23482738 - 23482938
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23482738 tcatatacattgtagatgtagtagacaaatacaaatctcaatgcatatcaaagagcatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 23482837  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  23482838 cctcatacaccacacttattcacctgaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaacgttatattattg 23482937  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  23482938 g 23482938  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 35614265 - 35614065
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  35614265 tcatatacattgtaaatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 35614166  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    | | ||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  35614165 cttaagacaccacacttattcacctgaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgtcatattattg 35614066  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  35614065 g 35614065  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 18706540 - 18706739
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18706540 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatcttaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcc-aaatatatgcagatgttggaattcgaa 18706638  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  18706639 cctcatacaccacacttattcacctgaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgtaacttcattcttttgttaaaattatatgtcaacgttatattattg 18706738  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38444829 - 38444629
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  38444829 tcatatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttgaaattcgaa 38444730  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    | ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  38444729 cttcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaataatgtgttacttcattcttttgataaaattatatgtcaatgttatattattg 38444630  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  38444629 g 38444629  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39728169 - 39727978
Alignment:
Q  30 ttgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagaca 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39728169 ttgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagaca 39728070  T
Q  130 ccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  39728069 ccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 39727978  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35615005 - 35614827
Alignment:
Q  29 attgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagac 128  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35615005 attgtaaatgtagtagacaaaaacaaatcttaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtctcaaatatatgcagatgttggaattcgaacctcagac 35614906  T
Q  129 accacgcttattcaccaaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaat 207  Q
    ||||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35614905 accacacttatttaccttaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaat 35614827  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 52687145 - 52687339
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  52687145 tcatatacattgtagatgtagtatacaaaaacaaatctcaatgcctatgaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaatccgaa 52687244  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  52687245 cctca-acaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcatttttttattaaaattatatgtcaatgttatatt 52687339  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 50326199 - 50326070
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  50326199 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 50326100  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaa 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50326099 cctcagacaccacgcttattcaccaaaaaa 50326070  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 18855264 - 18855463
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||    
T  18855264 tcatatacattgtagatgcagtagacaaat-caaatctcaatgcatatcaaagagaataaaacatgtggtcccaaatatatgtagatgttgaaattcgaa 18855362  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  18855363 cctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcatgtattacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattg 18855462  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 145
Target Start/End: Original strand, 31018231 - 31018355
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  31018231 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 31018330  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacca 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  31018331 cctcagacaccacgcttattcacca 31018355  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 33 - 207
Target Start/End: Original strand, 19764593 - 19764768
Alignment:
Q  33 tagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacacca 132  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  19764593 tagatgtagtatacaaaaacaaatctcaatgcatattaaaaagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcaaatgtttgaattcgaacctcagacacca 19764692  T
Q  133 cgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaat 207  Q
    | ||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19764693 cacttattcaccttaaaaatattaatttttatgaatcgtgtgttacttcattattttgttaaaattacatgtcaat 19764768  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 81 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19768602 - 19768462
Alignment:
Q  81 aatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgcttattcacca-aaaaatattattttttatcaatcgtgtgttactt 179  Q
    |||||||||| | ||||| ||| |||||||| | || |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19768602 aatatgtggttccaaatacatgtagatgttgaatttcgaacctcagacaccacacttattcatcttaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttactt 19768503  T
Q  180 cattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19768502 cattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 19768462  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 85 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2590468 - 2590333
Alignment:
Q  85 tgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacctcagacaccacgcttattcacca-aaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcatt 183  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2590468 tgtggttccaaatatatgcagatgttcgaattc-aacctcagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcatt 2590370  T
Q  184 cttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2590369 cttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 2590333  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 5061419 - 5061335
Alignment:
Q  23 atatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagat 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5061419 atatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagat 5061335  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 29942216 - 29942153
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaata 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29942216 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaata 29942153  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1231768 - 1231725
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  1231768 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 1231725  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 2951636 - 2951679
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  2951636 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 2951679  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4266340 - 4266297
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  4266340 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 4266297  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 18706773 - 18706816
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  18706773 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 18706816  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 19764814 - 19764857
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  19764814 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 19764857  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19768425 - 19768382
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  19768425 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 19768382  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 23482972 - 23483015
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  23482972 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 23483015  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35614027 - 35613984
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  35614027 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaattttatatt 35613984  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35614777 - 35614734
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  35614777 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 35614734  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 38914017 - 38914060
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  38914017 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 38914060  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 52036310 - 52036353
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  52036310 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 52036353  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7333903 - 7333863
Alignment:
Q  175 tacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  7333903 tacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 7333863  T

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Target: scaffold0022 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 149081 - 149281
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  149081 tcatataaattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaa 149180  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttg 219  Q
    | ||| |||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  149181 catcaaacacaacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaacgttatattattg 149280  T
Q  220 g 220  Q
    |    
T  149281 g 149281  T

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Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 215
Target Start/End: Original strand, 149318 - 149361
Alignment:
Q  172 tgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  149318 tgttacttcattcttttgtaaaaattatatgttaatgttatatt 149361  T

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Target: scaffold0173 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19542 - 19345
Alignment:
Q  24 tatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaacct 123  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19542 tatacattgtagatgtagtagacaaaaacaaatctcaatgcatattaaagataattaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaacct 19443  T
Q  124 cagacaccacgcttattcacc-aaaaaatattattttttatcaatcgtgtgttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatattatattcttgg 220  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19442 cagacaccacacttattcaccttaaaaatattaatttttatcaatcgtgtcttacttcattcttttgttaaaattatatgtcaatgttatattattgg 19345  T

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Target: scaffold0836 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0836
Description:

Target: scaffold0836; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 142
Target Start/End: Original strand, 5310 - 5430
Alignment:
Q  22 catatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaac 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5310 catatacattgtagatataatagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcccaaatatatgcagatgttggaattcgaac 5409  T
Q  122 ctcagacaccacgcttattca 142  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5410 ctcagacaccacgcttattca 5430  T

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Target: scaffold0515 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 142
Target Start/End: Original strand, 6092 - 6213
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6092 tcatatacattgtagatgttgtagacaaaaacatatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtctcaaatatatgcagatgttggaattcgaa 6191  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattca 142  Q
    ||||| ||||||| ||||||||    
T  6192 cctcaaacaccacacttattca 6213  T

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Target: scaffold0306 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 142
Target Start/End: Original strand, 6102 - 6223
Alignment:
Q  21 tcatatacattgtagatatagtagacaaaaacaaatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtcctaaatatatgcagatgttggaatttgaa 120  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6102 tcatatacattgtagatgttgtagacaaaaacatatctcaatgcatatcaaagagaatgaaatatgtggtctcaaatatatgcagatgttggaattcgaa 6201  T
Q  121 cctcagacaccacgcttattca 142  Q
    ||||| ||||||| ||||||||    
T  6202 cctcaaacaccacacttattca 6223  T

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