View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8260A_low_68 (Length: 383)

Name: NF8260A_low_68
Description: NF8260A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8260A_low_68
NF8260A_low_68
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (5-234)||(44241349-44241579)
chr1 (12-234)||(29001730-29001953)
chr1 (5-234)||(9869097-9869327)
chr1 (5-234)||(31072310-31072540)
chr1 (5-234)||(1174597-1174828)
chr1 (12-236)||(4599527-4599753)
chr1 (12-234)||(6238654-6238877)
chr1 (12-234)||(39053338-39053561)
chr1 (12-234)||(39059710-39059933)
chr1 (12-234)||(42091895-42092118)
chr1 (12-234)||(45015780-45016003)
chr1 (12-234)||(26621468-26621692)
chr1 (12-234)||(41305514-41305738)
chr1 (12-234)||(44916329-44916560)
chr1 (12-234)||(41297515-41297739)
chr1 (17-234)||(11913262-11913479)
chr1 (12-203)||(27240161-27240354)
chr1 (12-234)||(43686626-43686851)
chr1 (12-234)||(32797735-32797945)
chr1 (12-234)||(41299188-41299412)
chr1 (13-234)||(1115982-1116206)
chr1 (12-145)||(23764521-23764655)
chr1 (12-170)||(5445028-5445186)
chr1 (12-229)||(28413678-28413897)
chr1 (155-234)||(23762336-23762415)
chr1 (13-229)||(39806057-39806274)
chr1 (12-212)||(38672788-38672991)
chr1 (12-229)||(2824824-2825042)
chr1 (99-225)||(47646755-47646883)
chr1 (12-228)||(23251342-23251568)
chr1 (122-229)||(5357752-5357861)
chr1 (122-229)||(45620149-45620258)
chr1 (186-230)||(9316137-9316181)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (5-234)||(37026040-37026270)
chr7 (12-234)||(26601911-26602134)
chr7 (12-234)||(15914637-15914860)
chr7 (12-234)||(39432907-39433129)
chr7 (12-234)||(15949158-15949381)
chr7 (12-234)||(3924093-3924316)
chr7 (12-234)||(36875544-36875767)
chr7 (12-234)||(5049912-5050135)
chr7 (12-234)||(14287714-14287937)
chr7 (13-234)||(14298900-14299122)
chr7 (12-234)||(6795437-6795660)
chr7 (12-234)||(23612388-23612611)
chr7 (12-234)||(9642916-9643141)
chr7 (12-234)||(1948633-1948857)
chr7 (12-234)||(6020864-6021088)
chr7 (12-234)||(8185392-8185616)
chr7 (12-234)||(8192952-8193176)
chr7 (5-231)||(45433577-45433805)
chr7 (12-234)||(48353480-48353704)
chr7 (12-234)||(2446645-2446868)
chr7 (30-234)||(21642535-21642740)
chr7 (12-234)||(19089806-19090030)
chr7 (12-234)||(48347096-48347320)
chr7 (13-234)||(33850643-33850865)
chr7 (12-234)||(5056307-5056531)
chr7 (12-234)||(1378946-1379169)
chr7 (12-234)||(8142446-8142669)
chr7 (232-377)||(42422112-42422257)
chr7 (12-229)||(10831130-10831349)
chr7 (12-229)||(11024922-11025141)
chr7 (160-234)||(13774130-13774204)
chr7 (12-229)||(21901193-21901413)
chr7 (11-63)||(1942043-1942095)
chr7 (168-229)||(27954243-27954303)
chr7 (186-229)||(28442628-28442671)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (11-234)||(2643-2867)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (12-234)||(13671817-13672040)
chr6 (5-234)||(27670086-27670316)
chr6 (12-234)||(31547894-31548117)
chr6 (12-234)||(32328493-32328716)
chr6 (12-234)||(1428423-1428646)
chr6 (12-234)||(34711557-34711780)
chr6 (12-234)||(9864760-9864984)
chr6 (12-234)||(4186684-4186907)
chr6 (12-234)||(11058150-11058373)
chr6 (15-234)||(21262574-21262795)
chr6 (12-234)||(4020235-4020459)
chr6 (12-234)||(4026661-4026885)
chr6 (12-234)||(34655249-34655473)
chr6 (12-234)||(34648798-34649022)
chr6 (12-234)||(4738323-4738547)
chr6 (22-234)||(7069702-7069916)
chr6 (5-167)||(29906882-29907045)
chr6 (5-167)||(30117335-30117498)
chr6 (12-139)||(7062578-7062707)
chr6 (91-234)||(1167480-1167630)
chr6 (36-229)||(10081567-10081762)
chr6 (172-234)||(7062516-7062578)
chr6 (93-229)||(9846601-9846738)
chr6 (197-234)||(29907044-29907081)
chr6 (197-234)||(30117299-30117336)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (12-234)||(22359963-22360186)
chr5 (13-234)||(4973563-4973785)
chr5 (12-234)||(22313829-22314052)
chr5 (13-234)||(5876218-5876440)
chr5 (12-234)||(34357288-34357511)
chr5 (12-234)||(34359079-34359302)
chr5 (12-234)||(2957857-2958081)
chr5 (12-234)||(2966326-2966550)
chr5 (12-234)||(29980458-29980681)
chr5 (12-234)||(30041244-30041467)
chr5 (12-234)||(40958617-40958840)
chr5 (12-234)||(25894649-25894873)
chr5 (5-234)||(2438793-2439022)
chr5 (12-232)||(42150817-42151039)
chr5 (12-234)||(12505765-12505996)
chr5 (12-234)||(29414669-29414892)
chr5 (12-229)||(33794091-33794309)
chr5 (12-229)||(9843348-9843566)
chr5 (12-229)||(2156125-2156341)
chr5 (123-225)||(19853484-19853588)
chr5 (122-229)||(12918955-12919064)
chr5 (122-229)||(30580195-30580304)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (12-234)||(21341882-21342105)
chr2 (15-234)||(2021448-2021668)
chr2 (12-234)||(21331994-21332217)
chr2 (12-234)||(42931372-42931595)
chr2 (12-234)||(16856487-16856709)
chr2 (12-234)||(12950795-12951018)
chr2 (12-234)||(16817330-16817552)
chr2 (12-234)||(36782184-36782408)
chr2 (12-234)||(34834812-34835035)
chr2 (12-234)||(34841256-34841479)
chr2 (12-234)||(29484925-29485149)
chr2 (12-234)||(45011981-45012205)
chr2 (11-234)||(2164026-2164250)
chr2 (12-234)||(15852548-15852772)
chr2 (12-234)||(43267857-43268081)
chr2 (12-234)||(2157611-2157834)
chr2 (12-234)||(13901957-13902180)
chr2 (12-234)||(21067958-21068181)
chr2 (85-234)||(45700644-45700793)
chr2 (5-229)||(41455598-41455823)
chr2 (70-234)||(11909950-11910116)
chr2 (70-229)||(17784443-17784604)
chr2 (87-225)||(13162892-13163032)
chr2 (70-229)||(17789096-17789257)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (5-234)||(16405334-16405568)
chr4 (12-234)||(55462772-55462995)
chr4 (12-234)||(16838359-16838581)
chr4 (12-234)||(27590304-27590527)
chr4 (11-234)||(41372984-41373209)
chr4 (12-233)||(37368315-37368538)
chr4 (12-234)||(13594105-13594330)
chr4 (12-234)||(7780406-7780629)
chr4 (12-234)||(8103880-8104104)
chr4 (12-234)||(30238259-30238482)
chr4 (12-234)||(17456853-17457077)
chr4 (17-234)||(36754791-36755017)
chr4 (5-234)||(30211536-30211758)
chr4 (87-234)||(5660549-5660696)
chr4 (5-211)||(13003809-13004017)
chr4 (12-229)||(2947844-2948062)
chr4 (12-108)||(48914898-48914996)
chr4 (12-44)||(5660743-5660775)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (12-234)||(12768743-12768966)
chr8 (12-234)||(11358193-11358417)
chr8 (12-234)||(7311348-7311571)
chr8 (12-234)||(8013320-8013543)
chr8 (12-234)||(36005482-36005705)
chr8 (11-234)||(36075965-36076189)
chr8 (12-234)||(36425730-36425954)
chr8 (12-234)||(6464576-6464799)
chr8 (18-234)||(15012393-15012610)
chr8 (12-234)||(36021799-36022023)
chr8 (12-234)||(41242116-41242339)
chr8 (12-234)||(1238212-1238436)
chr8 (12-234)||(16710668-16710892)
chr8 (5-234)||(31017391-31017608)
chr8 (91-234)||(26250591-26250734)
chr8 (42-234)||(45068416-45068609)
chr8 (12-229)||(7933931-7934150)
chr8 (12-65)||(14393733-14393786)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (12-234)||(4311486-4311709)
chr3 (5-234)||(10941304-10941534)
chr3 (12-234)||(32746369-32746592)
chr3 (12-234)||(6036265-6036488)
chr3 (12-234)||(24179072-24179296)
chr3 (11-234)||(9570548-9570774)
chr3 (12-234)||(27501967-27502191)
chr3 (12-234)||(13014985-13015208)
chr3 (11-234)||(9577050-9577276)
chr3 (12-234)||(43995068-43995300)
chr3 (12-234)||(25893229-25893458)
chr3 (12-234)||(43931581-43931799)
chr3 (11-234)||(23068462-23068686)
chr3 (5-224)||(20651135-20651362)
chr3 (12-138)||(41353860-41353987)
chr3 (5-162)||(41354142-41354300)
chr3 (11-229)||(4590792-4591012)
chr3 (11-78)||(3577095-3577162)
chr3 (5-229)||(20952759-20952993)
chr3 (5-229)||(2785700-2785922)
chr3 (122-229)||(4644354-4644463)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (5-234)||(49683-49912)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (5-234)||(15163-15393)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (12-234)||(5005-5228)
[»] scaffold0936 (1 HSPs)
scaffold0936 (12-234)||(3264-3486)
[»] scaffold0510 (2 HSPs)
scaffold0510 (12-234)||(8881-9105)
scaffold0510 (12-234)||(2560-2784)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (93-234)||(12014-12155)
scaffold0513 (12-76)||(11949-12014)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (12-118)||(99913-100020)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (5-211)||(24268-24476)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 44241349 - 44241579
Alignment:
Q  5 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataa 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  44241349 tatcacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgatgaagttgagattaataa 44241448  T
Q  104 ggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44241449 ggcgtgaaacttgttaggattagagttcattgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 44241548  T
Q  204 cctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44241549 cctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 44241579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 29001730 - 29001953
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  29001730 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtaa 29001829  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29001830 aacttgttaggattagagttccttggtcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 29001929  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||    
T  29001930 aacactattcatgtccaaataata 29001953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 9869097 - 9869327
Alignment:
Q  5 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataa 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9869097 tatcataaaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggtagtttgttttaatgactaagttgcaaatgataaaattgagattaataa 9869196  T
Q  104 ggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 203  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9869197 ggtgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatc 9869296  T
Q  204 cctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  9869297 cctcgacaacatctttcgtgtccaaacaata 9869327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 31072310 - 31072540
Alignment:
Q  5 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataa 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  31072310 tatcacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagctaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataa 31072409  T
Q  104 ggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 203  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31072410 ggcatgaaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggactctagcttttctttgatattatcatgtatc 31072509  T
Q  204 cctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31072510 cctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 31072540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 1174597 - 1174828
Alignment:
Q  5 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaata 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| |||||    
T  1174597 tatcatggaccgttcgacaccaaatatcattctaagttgaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaata 1174696  T
Q  103 aggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtat 202  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1174697 gggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgagcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtat 1174796  T
Q  203 ccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1174797 ccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 1174828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 4599527 - 4599753
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  4599527 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 4599626  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4599627 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 4599726  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaatact 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4599727 caacaccattcgtgtccaaacaatact 4599753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 6238654 - 6238877
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  6238654 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 6238753  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6238754 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 6238853  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6238854 aacaccattcgtgtccaaacaata 6238877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 39053561 - 39053338
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  39053561 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtga 39053462  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39053461 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 39053362  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  39053361 aacactattcgtgtccaaacaata 39053338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 39059933 - 39059710
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  39059933 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtga 39059834  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39059833 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 39059734  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  39059733 aacactattcgtgtccaaacaata 39059710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 42091895 - 42092118
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  42091895 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 42091994  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42091995 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 42092094  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  42092095 aacaccattcgtgtccaaacaata 42092118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 45015780 - 45016003
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  45015780 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 45015879  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45015880 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 45015979  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  45015980 aacaccattcgtgtccaaacaata 45016003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 26621468 - 26621692
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| || | || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  26621468 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaatttcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 26621567  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26621568 aaacttgttaggattagggttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 26621667  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26621668 caacaccattcgtgtccaaacaata 26621692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41305738 - 41305514
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  41305738 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtttaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 41305639  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41305638 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 41305539  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  41305538 caacaccattcatgtccaaacaata 41305514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 44916329 - 44916560
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagtt---------gcaatgataaagttgagattaata 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||         | ||||||||||||||||||||||    
T  44916329 gaccattcgacaccaaatatcattctaaattaaaagatagtttgttgtttgttttaaaaactaagttaactatgttgaaatgataaagttgagattaata 44916428  T
Q  103 aggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtat 202  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44916429 aggcgtgaaacttgttaggattagaattccttaaccaaacgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtat 44916528  T
Q  203 ccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44916529 ccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 44916560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 41297515 - 41297739
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  41297515 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 41297614  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  41297615 aaacttgttaggattagagttccttgatcgatcctcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcga 41297714  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41297715 caacaccattcgtgtccaaacaata 41297739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11913479 - 11913262
Alignment:
Q  17 ttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||| ||   ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11913479 ttcgacaccaaatatcattctaagtttaaaagatagattgtttgtttgtttaaa---ctaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcgtgaaac 11913383  T
Q  114 ttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11913382 ttgttaggattagagttccttgaccaagcatcacatgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaac 11913283  T
Q  214 accattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11913282 accattcgtgtccaaacaata 11913262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 27240354 - 27240161
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  27240354 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaataaggcgtg 27240255  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 203  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27240254 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 27240161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 43686626 - 43686851
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | |||||    
T  43686626 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataatctgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgt 43686725  T
Q  109 gaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 208  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  43686726 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtctcatttaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcg 43686825  T
Q  209 acaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  43686826 acaacaccattcgtgtccaaacaata 43686851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 32797735 - 32797945
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||            || ||||| ||||| ||    
T  32797735 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaa-gataatttgttgtttgttttagaaactaagttgcaa------------gagtaatagggcgtaaa 32797821  T
Q  112 a-cttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32797822 aacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 32797921  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  32797922 aacacaattcgtgtccaaacaata 32797945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41299412 - 41299188
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  41299412 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttatttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 41299313  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  41299312 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacatataacctaatgaccattcatggattcaagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 41299213  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||| | |||||||||||    
T  41299212 caacaccattcttttccaaacaata 41299188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1116206 - 1115982
Alignment:
Q  13 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||   |||| ||||||| |||||||| |||||    
T  1116206 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagctaatttgttgtttgttt-agtaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggtgtgaa 1116108  T
Q  112 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 211  Q
    |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  1116107 acttcttatgattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgactatacatggattctaccttttctttgatattatcatgtatccctcgaca 1116008  T
Q  212 ac---accattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||   |||||| ||||||||||||||    
T  1116007 acactaccatttgtgtccaaacaata 1115982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23764655 - 23764521
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23764655 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 23764556  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtc 145  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23764555 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtc 23764521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 5445186 - 5445028
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||| ||||    
T  5445186 gaccgttcgacaccaactatcattctaagttaaa-gataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggtgtga 5445088  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatg 170  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  5445087 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcctcacacataacctaatgaccatacatg 5445028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28413897 - 28413678
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  28413897 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-a 28413799  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 208  Q
    ||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||     ||||||||||||||| ||||    
T  28413798 aaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcattttaccaatattatcacgtatcgctca 28413699  T
Q  209 acaacaccattcgtgtccaaa 229  Q
    |||| |  |||||||||||||    
T  28413698 acaagattattcgtgtccaaa 28413678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 155 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23762415 - 23762336
Alignment:
Q  155 ctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23762415 ctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 23762336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 39806057 - 39806274
Alignment:
Q  13 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |  ||| |||||| ||||||||||| ||    
T  39806057 accgtttgacaccaaatatcattttaagttaaa-gataatttgttgttcgttttagaaactaagttgcaagagtaaaaattgagagtaataaggcgt-aa 39806154  T
Q  112 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    |   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||| ||| |||    |||||||||||||||| |||||    
T  39806155 aaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattccagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaa 39806254  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaa 229  Q
    ||| |  |||||||||||||    
T  39806255 caagattattcgtgtccaaa 39806274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38672991 - 38672788
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaag-ttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||     
T  38672991 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtttgaaagataatttgttgttcgttttagaaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgt- 38672893  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 207  Q
    |||    || | |||||||||||||||| |||||||| || ||| || || ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||    
T  38672892 aaaaacattggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctgataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctc 38672793  T
Q  208 aacaa 212  Q
    |||||    
T  38672792 aacaa 38672788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2825042 - 2824824
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||   || |  |||||||||| ||||||||||| ||    
T  2825042 gaccattcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatatgttgtttgttttagtaaccaagtataaaagtgaaagttgagagtaataaggcgt-aa 2824944  T
Q  112 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    |   ||| | |||||||||||||||| | |||||| || ||| ||||| ||  |||| ||| |||||||| |||     ||||||||||||||| |||||    
T  2824943 aaacgttggaattagagttccttgattatgcgtcaaacataacctaataatcacatatatgaattctagcgttttacccatattatcacgtatcgctcaa 2824844  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaa 229  Q
    ||| |  |||| ||||||||    
T  2824843 caagattattcatgtccaaa 2824824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Original strand, 47646755 - 47646883
Alignment:
Q  99 aataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacat--ggattctagcttttctttgatattatc 196  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||  |||||  ||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||  | |||||||||    
T  47646755 aataaggcgtaaaacttgttatgattagagttcgttgaccaagaatcacatataacctaatgatcacatatacggattctagcttttaatcgatattatc 47646854  T
Q  197 acgtatccctcaacaacaccattcgtgtc 225  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  47646855 acgtatccctcgacaacatcattcatgtc 47646883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 23251342 - 23251568
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttt-----taa--taactaagttgcaatgataaa-gttgagattaata 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||||||     |||  ||||||| | ||||  ||||| ||||||| |||||    
T  23251342 gaccgttcgacaccaaatatcattcgaagttaaaagagtagttgtttgtttgtttgtaactaagttaactaattcgcaagaataaaagttgagagtaata 23251441  T
Q  103 aggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatc--atacatggattctagcttttctttgatattatcacgt 200  Q
    |||||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| |||  ||| |||||||||||| |||    |||||||||||||    
T  23251442 aggcgtaaaaac-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcgcatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgt 23251540  T
Q  201 atccctcaacaacaccattcgtgtccaa 228  Q
    ||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  23251541 atcgctcaacaagattattcgtgtccaa 23251568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5357861 - 5357752
Alignment:
Q  122 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||     ||||||||||||||| |||||||| |  |||    
T  5357861 attagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcattttcccaatattatcacgtatcgctcaacaagattatt 5357762  T
Q  220 cgtgtccaaa 229  Q
    ||||||||||    
T  5357761 cgtgtccaaa 5357752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 45620258 - 45620149
Alignment:
Q  122 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 219  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||| |  |||    
T  45620258 attagagttccttgattaagcttcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcgacaagattatt 45620159  T
Q  220 cgtgtccaaa 229  Q
    ||||||||||    
T  45620158 cgtgtccaaa 45620149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 230
Target Start/End: Original strand, 9316137 - 9316181
Alignment:
Q  186 ttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaac 230  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  9316137 ttgatattatcacatattgctcaacaacatcattcgtgtccaaac 9316181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 37026040 - 37026270
Alignment:
Q  5 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataa 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  37026040 tatcacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgactaactaagttgtaaatgataaagttgagattaataa 37026139  T
Q  104 ggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37026140 ggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacattgattctagtttttctttgatattatcacgtatc 37026239  T
Q  204 cctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37026240 cctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 37026270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 26601911 - 26602134
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  26601911 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 26602010  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26602011 aacttgttaggattagaattccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaacatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 26602110  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  26602111 aacactattcgtgtccaaacaata 26602134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 15914637 - 15914860
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15914637 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 15914736  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15914737 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgac 15914836  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  15914837 aacactattcgtgtccaaacaata 15914860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 39432907 - 39433129
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39432907 gaccgttcgacaacaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagtgcaaatgataaagttgagattaataaggtgtgaa 39433006  T
Q  112 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39433007 acttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgaca 39433106  T
Q  212 acaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  39433107 acgccattcgtgtccaaacaata 39433129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 15949158 - 15949381
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15949158 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 15949257  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15949258 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcatataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgac 15949357  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  15949358 aacactattcgtgtccaaacaata 15949381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3924316 - 3924093
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  3924316 gaccgttcgataccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 3924217  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3924216 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 3924117  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  3924116 aacaccattcgtgtccaaacaata 3924093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 36875544 - 36875767
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  36875544 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 36875643  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36875644 aacttgttaggattggagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatatatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 36875743  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36875744 aacaccattcgtgtccaaacaata 36875767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5050135 - 5049912
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  5050135 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 5050036  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5050035 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 5049936  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5049935 aacaccattcgtgtccaaacaata 5049912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 14287714 - 14287937
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  14287714 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 14287813  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14287814 atcttgttaggattagagttccttgatcgaacgtcgcacgtaccctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 14287913  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14287914 aacaccattcgtgtccaaacaata 14287937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 14298900 - 14299122
Alignment:
Q  13 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  14298900 accgtttgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaa 14298999  T
Q  112 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14299000 acttgttaggattagagttccttgatcgaacgtcgcacgtaccctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgaca 14299099  T
Q  212 acaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14299100 acaccattcgtgtccaaacaata 14299122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 6795437 - 6795660
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  6795437 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 6795536  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6795537 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 6795636  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6795637 aacaccattcgtgtccaaacaata 6795660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 23612388 - 23612611
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  23612388 gaccgttcgacacgaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattacaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 23612487  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23612488 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 23612587  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  23612588 aacactattcgtgtccaaacaata 23612611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9643141 - 9642916
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | |||||    
T  9643141 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaaagataatatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgt 9643042  T
Q  109 gaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 208  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9643041 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcg 9642942  T
Q  209 acaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9642941 acaacaccattcgtgtccaaacaata 9642916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1948857 - 1948633
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1948857 gaccgttcaacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagataaagttgagattaatagggcgtg 1948758  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  1948757 aaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagattttctttgagattatcacgtatccctcga 1948658  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  1948657 caacactattcgtgtccaaacaata 1948633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6021088 - 6020864
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  6021088 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 6020989  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6020988 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcga 6020889  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  6020888 caacactattcgtgtccaaacaata 6020864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8185616 - 8185392
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  8185616 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 8185517  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8185516 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 8185417  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  8185416 caacactattcgtgtccaaacaata 8185392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8193176 - 8192952
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  8193176 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 8193077  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8193076 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 8192977  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  8192976 caacactattcgtgtccaaacaata 8192952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 45433577 - 45433805
Alignment:
Q  5 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataa 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||| ||||||| ||||||    
T  45433577 tatcacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagtttcaagagtaaaagttgagagtaataa 45433676  T
Q  104 ggcgtgaaa-cttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtat 202  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  45433677 ggcgtaaaaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcatgtat 45433776  T
Q  203 ccctcaacaacaccattcgtgtccaaaca 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45433777 ccctcgacaacaccattcgtgtccaaaca 45433805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 48353704 - 48353480
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  48353704 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 48353605  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48353604 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 48353505  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  48353504 caacactattcgtgtccaaacaata 48353480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 2446645 - 2446868
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  2446645 gaccattcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 2446744  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2446745 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 2446844  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  2446845 aacaccattcgtgtccaaacaata 2446868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 234
Target Start/End: Original strand, 21642535 - 21642740
Alignment:
Q  30 atcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagag 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21642535 atcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagag 21642634  T
Q  129 ttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaa 228  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21642635 ttccttgatcaagcatcacacataacctaatgaacaaacatggattctagcttttcattgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaa 21642734  T
Q  229 acaata 234  Q
    ||||||    
T  21642735 acaata 21642740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 19089806 - 19090030
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  19089806 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 19089905  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19089906 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctaacttttctttgatattatcacgtatccctcga 19090005  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  19090006 caacactattcgtgtccaaacaata 19090030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 48347320 - 48347096
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||| ||    
T  48347320 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcatg 48347221  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48347220 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 48347121  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  48347120 caacactattcgtgtccaaacaata 48347096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33850865 - 33850643
Alignment:
Q  13 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| || |||||||| ||    
T  33850865 accgtttgacaccaaatatcattctaagttaaaagtcaatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaatagtaaaagttgagagtagtaaggcgttaa 33850766  T
Q  112 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  33850765 acttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgactatacatgtattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgaca 33850666  T
Q  212 acaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33850665 acaccattcgtgtccaaacaata 33850643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5056531 - 5056307
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  5056531 gaccgttcgacaccaattatcatttcaagtaaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 5056432  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5056431 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 5056332  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5056331 caacaccattcgtgtccaaacaata 5056307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 1378946 - 1379169
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  1378946 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 1379045  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1379046 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgac 1379145  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1379146 aacaccattcgtgtccaaacaata 1379169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8142669 - 8142446
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | || ||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  8142669 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattacaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 8142570  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8142569 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgac 8142470  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8142469 aacaccattcgtgtccaaacaata 8142446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 232 - 377
Target Start/End: Original strand, 42422112 - 42422257
Alignment:
Q  232 atactataacttttaagattgacatttactttgtagaccaccaaggagtgataagcgttgtgttttatatataaacttcctctctattgtttaaaagctc 331  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42422112 atactataacttttaagattgccatttgctttgtaggccactaagaagtgataagcgctgcattttatatataaacttcctctctattgtttaaaagctc 42422211  T
Q  332 ccgatgttggactattttcaaagcagcacaagagctacatgctctc 377  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  42422212 ccgatgttggaatattttcacaacagcacaagagctacatgctctc 42422257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10831349 - 10831130
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  10831349 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-a 10831251  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 208  Q
    ||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||  |||    |||||||||||||||| ||||    
T  10831250 aaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagagttttaccgatattatcacgtatcgctca 10831151  T
Q  209 acaacaccattcgtgtccaaa 229  Q
    |||| |  |||| ||||||||    
T  10831150 acaagattattcatgtccaaa 10831130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11025141 - 11024922
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  11025141 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-a 11025043  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 208  Q
    ||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||  |||    |||||||||||||||| ||||    
T  11025042 aaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagagttttaccgatattatcacgtatcgctca 11024943  T
Q  209 acaacaccattcgtgtccaaa 229  Q
    |||| |  |||| ||||||||    
T  11024942 acaagattattcatgtccaaa 11024922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13774204 - 13774130
Alignment:
Q  160 gatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  13774204 gatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaata 13774130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21901413 - 21901193
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| || | || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  21901413 gaccgttcgacaccatatatcattctaagttgaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaatttcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgt- 21901315  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 207  Q
    |||   ||||| || ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||    
T  21901314 aaaaacgttagaatcagagttccttgattaagcgtcaaacataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctc 21901215  T
Q  208 aacaacaccattcgtgtccaaa 229  Q
    ||||| |  |||||||||||||    
T  21901214 aacaagattattcgtgtccaaa 21901193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Original strand, 1942043 - 1942095
Alignment:
Q  11 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgt 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1942043 agaccgttcgacaccaaatatcattataagttaaacgataatttgttgtttgt 1942095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 229
Target Start/End: Original strand, 27954243 - 27954303
Alignment:
Q  168 atggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 229  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27954243 atggattctagctttactc-gatattatcacatattcctcaacaacatcattcgtgtccaaa 27954303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 229
Target Start/End: Original strand, 28442628 - 28442671
Alignment:
Q  186 ttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 229  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28442628 ttgatattatcacatatcgctcaacaacatcattcgtgtccaaa 28442671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Original strand, 2643 - 2867
Alignment:
Q  11 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2643 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagctgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtg 2742  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2743 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattatagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 2842  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  2843 caacaccattcgtatccaaacaata 2867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13672040 - 13671817
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13672040 gaccgttcgacaccaaatatcattataagttaaacgataatttgttgtttatttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataatgcgtga 13671941  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13671940 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 13671841  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||    
T  13671840 aacactattagtgtccaaacaata 13671817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 27670086 - 27670316
Alignment:
Q  5 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataa 103  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27670086 tatcatggatcgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataa 27670185  T
Q  104 ggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 203  Q
     | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27670186 agtgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagtgtcacacgtaacctaataatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatc 27670285  T
Q  204 cctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  27670286 cctcgacaacatcattcgtgtccaaacaata 27670316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 31547894 - 31548117
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  31547894 gaccgttcgacaccaaatatcattcttagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtga 31547993  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31547994 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 31548093  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  31548094 aacactattcgtgtccaaacaata 31548117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 32328716 - 32328493
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  32328716 gaccgttcgacaccagatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 32328617  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32328616 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacatataacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 32328517  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  32328516 aacaccattcgtgtccaaacaata 32328493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1428646 - 1428423
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1428646 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaataaggcgtaa 1428547  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1428546 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 1428447  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1428446 aacaccattcgtgtccaaacaata 1428423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34711780 - 34711557
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34711780 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34711681  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34711680 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34711581  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34711580 aacaccattcgtgtccaaacaata 34711557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9864984 - 9864760
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  9864984 gaccgttcgacaccaaataccattctaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 9864885  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864884 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacttaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 9864785  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||| || ||||||||||||||||||    
T  9864784 caatactattcgtgtccaaacaata 9864760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 4186684 - 4186907
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||      
T  4186684 gaccgttcgacaccaaatataattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtag 4186783  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  4186784 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctaacttttctttgatattatcatgtatccctcgac 4186883  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  4186884 aacaccattcgtgtccaaacaata 4186907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11058373 - 11058150
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  11058373 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 11058274  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11058273 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 11058174  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  11058173 aacaccattcgtgtccaaacaata 11058150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21262795 - 21262574
Alignment:
Q  15 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||| |||    
T  21262795 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaa 21262696  T
Q  113 cttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaa 212  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21262695 cttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagtttttctttgatattatcacgtatccctcgacaa 21262596  T
Q  213 caccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21262595 caccattcgtgtccaaacaata 21262574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4020459 - 4020235
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  4020459 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 4020360  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4020359 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 4020260  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  4020259 caacactattcgtgtccaaacaata 4020235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4026885 - 4026661
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  4026885 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 4026786  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4026785 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 4026686  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  4026685 caacactattcgtgtccaaacaata 4026661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 34655249 - 34655473
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  34655249 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 34655348  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34655349 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 34655448  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  34655449 caacactattcgtgtccaaacaata 34655473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 34648798 - 34649022
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  34648798 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtatctcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 34648897  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34648898 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 34648997  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  34648998 caacactattcgtgtccaaacaata 34649022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4738547 - 4738323
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  4738547 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 4738448  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  4738447 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 4738348  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||    
T  4738347 caacactattcgagtccaaacaata 4738323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7069916 - 7069702
Alignment:
Q  22 caccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 119  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7069916 caccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtta 7069817  T
Q  120 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 219  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  7069816 ggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactatt 7069717  T
Q  220 cgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||||||||||||    
T  7069716 cgtgtccaaacaata 7069702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Original strand, 29906882 - 29907045
Alignment:
Q  5 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataa 103  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  29906882 tatcacagaccgttcgacactaaatatcattctaagttaaaatataatttgttgtttgttttagtaactaaattgctaataataaaattgagattaataa 29906981  T
Q  104 ggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatac 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29906982 ggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatac 29907045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30117498 - 30117335
Alignment:
Q  5 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataa 103  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  30117498 tatcacagaccgttcgacactaaatatcattctaagttaaaatataatttgttgtttgttttagtaactaaattgctaataataaaattgagattaataa 30117399  T
Q  104 ggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatac 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  30117398 ggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaaggaccatac 30117335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 7062707 - 7062578
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  7062707 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 7062608  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatca 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7062607 aaacttgttaggattagagttccttgatca 7062578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1167630 - 1167480
Alignment:
Q  91 ttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttt-------t 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||||| |||       |    
T  1167630 ttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagaattctttgatcaagcgtcacacataacctgatgatcatatacggattctagttttttttttat 1167531  T
Q  184 ctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  1167530 tttttatattatcatgtatccctcaacaatatcgttcgtgtccaaataata 1167480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10081762 - 10081567
Alignment:
Q  36 ctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagtt-gagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttcctt 134  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||| || |||| ||||||||||| |||   ||| | |||||||||||||    
T  10081762 ctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagaaactaagttgcaagagtaaaatttgagagtaataaggcgtaaaaac-gttggaattagagttcctt 10081664  T
Q  135 gatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 229  Q
    ||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    ||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  10081663 gattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacatatcgctcaacaagattattcgtgtccaaa 10081567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7062578 - 7062516
Alignment:
Q  172 attctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7062578 attctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 7062516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 229
Target Start/End: Original strand, 9846601 - 9846738
Alignment:
Q  93 gagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacat--ggattctagcttttctttgat 190  Q
    |||||||||||||||| |||   ||| | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| || || |||| | ||  |||||||||| |||  | |||    
T  9846601 gagattaataaggcgtaaaagc-gttggaattagagttcgttgattaagcgtcaaacataacctgataatcacatatacggattctagcattttatcgat 9846699  T
Q  191 attatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 229  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  9846700 attatcacgtatcgctcgacaacatcattcgtgttcaaa 9846738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 234
Target Start/End: Original strand, 29907044 - 29907081
Alignment:
Q  197 acgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29907044 acgtgtccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 29907081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30117336 - 30117299
Alignment:
Q  197 acgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30117336 acgtgtccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 30117299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 22359963 - 22360186
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22359963 gaccgttcgacaccaaatattattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 22360062  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22360063 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 22360162  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  22360163 aacactattcgtgtccaaacaata 22360186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 4973563 - 4973785
Alignment:
Q  13 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4973563 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaaatgataaaattgagattaataaggggtgaa 4973662  T
Q  112 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 211  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  4973663 acttgttaggatcagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacataatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgaca 4973762  T
Q  212 acaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  4973763 acatcattcgtgtccaaacaata 4973785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 22313829 - 22314052
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22313829 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttatttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 22313928  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22313929 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccgtacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 22314028  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  22314029 aacactattcgtgtccaaacaata 22314052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 5876218 - 5876440
Alignment:
Q  13 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaa 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5876218 accgttcaacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaa 5876317  T
Q  112 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5876318 acttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcacgtatccctcgaca 5876417  T
Q  212 acaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  5876418 acactattcgtgtccaaacaata 5876440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34357511 - 34357288
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34357511 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34357412  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34357411 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34357312  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34357311 aacaccattcgtgtccaaacaata 34357288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34359302 - 34359079
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34359302 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34359203  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34359202 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34359103  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34359102 aacaccattcgtgtccaaacaata 34359079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 2957857 - 2958081
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  2957857 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 2957956  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2957957 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 2958056  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  2958057 caacactattcgtgtccaaacaata 2958081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 2966326 - 2966550
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  2966326 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 2966425  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2966426 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 2966525  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  2966526 caacactattcgtgtccaaacaata 2966550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 29980458 - 29980681
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  29980458 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 29980557  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29980558 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 29980657  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29980658 aacaccattcgtgtccaaacaata 29980681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30041467 - 30041244
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  30041467 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 30041368  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30041367 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 30041268  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  30041267 aacaccattcgtgtccaaacaata 30041244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40958840 - 40958617
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  40958840 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttatttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 40958741  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  40958740 cacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtattcctcgac 40958641  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  40958640 aacactattcgtgtccaaacaata 40958617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25894873 - 25894649
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  25894873 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 25894774  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25894773 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatcgattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 25894674  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  25894673 caacactattcgtgtccaaacaata 25894649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 2438793 - 2439022
Alignment:
Q  5 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataa 103  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||    
T  2438793 tatcacagaccgtccgataccaaaaatcattataagttaaaagaaaatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaagtgagattaataa 2438892  T
Q  104 ggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2438893 ggcgtgaaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatga-catgcatggattctagcttttctttgatattatcatgtatc 2438991  T
Q  204 cctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  2438992 cctcgacaacatcatttgtgtccaaacaata 2439022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 232
Target Start/End: Original strand, 42150817 - 42151039
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  42150817 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 42150916  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42150917 aaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagtttttctttgatattatcacgtatccctcga 42151016  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaa 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  42151017 caacactattcgtgtccaaacaa 42151039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12505996 - 12505765
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttt------taa--taactaagttgc-aatgataaagttgagattaata 102  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| |||      |||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12505996 gacctttcgacaccaaataccattttaagttaaaagatagtttgttgtttatttagaaactaagttaactatgttgcgaataataaagttgagattaata 12505897  T
Q  103 aggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtat 202  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12505896 aggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagagtcccacgtaacctaatgattatacatggattctagcttctctttgatattatcacgtat 12505797  T
Q  203 ccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12505796 ccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaata 12505765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29414892 - 29414669
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  || |   ||    ||||| |||| ||||| ||||| |    
T  29414892 gaccgttcaacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaagcaaatataaaattgaaagtcgagagtaatagggcgtaa 29414793  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    ||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29414792 aacttattaggattagaatttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 29414693  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||    
T  29414692 aacatcattcatgttcaaacaata 29414669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Original strand, 33794091 - 33794309
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  33794091 gaccgtttgacaccaaatatcattctaagttaaa-gataatttgttgtatgttttagaaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgt-a 33794188  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 208  Q
    ||  |||| | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||    
T  33794189 aaaatgttggaattagagttctttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttactgatattatcacgtatcgctca 33794288  T
Q  209 acaacaccattcgtgtccaaa 229  Q
    |||| |  |||||| ||||||    
T  33794289 acaagattattcgtatccaaa 33794309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Original strand, 9843348 - 9843566
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| || |   || |  |||||||||| ||||| ||||| ||    
T  9843348 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaaccaaatataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgt-aa 9843446  T
Q  112 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    |    || | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||    
T  9843447 aaacattggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaa 9843546  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaa 229  Q
    ||| |  |||||||||||||    
T  9843547 caagattattcgtgtccaaa 9843566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2156341 - 2156125
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||||| |||| ||||   || |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  2156341 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtttaaaagataatttgtt---tgttttagtaaccaagtgtaaaagtgaaagttgagagtaataaggcgtaa 2156245  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 208  Q
    ||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||  |||    |||||||||||||||| ||||    
T  2156244 aaac-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagtgttttaccgatattatcacgtatcgctca 2156146  T
Q  209 acaacaccattcgtgtccaaa 229  Q
    |||| |  |||||||||||||    
T  2156145 acaagattattcgtgtccaaa 2156125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19853588 - 19853484
Alignment:
Q  123 ttagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattc 220  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19853588 ttagagttcgttgattaagcgtcaaacataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcactcaacaacatcattc 19853489  T
Q  221 gtgtc 225  Q
     ||||    
T  19853488 atgtc 19853484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12919064 - 12918955
Alignment:
Q  122 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 219  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || ||| ||||| | ||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  12919064 attagagttccttggttaagcgtcaaacataacctaataaccacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagactatt 12918965  T
Q  220 cgtgtccaaa 229  Q
    ||||||||||    
T  12918964 cgtgtccaaa 12918955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30580304 - 30580195
Alignment:
Q  122 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 219  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||  | ||||||||||||||||  || || ||| ||||    
T  30580304 attagagttcgttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttatcgatattatcacgtatcggtcgacgacatcatt 30580205  T
Q  220 cgtgtccaaa 229  Q
    ||||||||||    
T  30580204 cgtgtccaaa 30580195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21342105 - 21341882
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21342105 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttaatgactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 21342006  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21342005 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 21341906  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  21341905 aacaccattcatgtccaaacaata 21341882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2021668 - 2021448
Alignment:
Q  15 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  2021668 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggtgtaaaac 2021569  T
Q  114 ttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2021568 ttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaac 2021469  T
Q  214 accattcgtgtccaaacaata 234  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  2021468 actattcgtgtccaaacaata 2021448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21332217 - 21331994
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21332217 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagatagttggttgtttgttttaatgactaaatttcaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 21332118  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21332117 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 21332018  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  21332017 aacaccattcatgtccaaacaata 21331994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 42931595 - 42931372
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  42931595 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaacagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 42931496  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42931495 aacttgttaggattagagttccttgatcaaatgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 42931396  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  42931395 aacactattcgtgtccaaacaata 42931372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16856709 - 16856487
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16856709 gaccgttcgacagcaaatatcattcaaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 16856611  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16856610 nacttgttaggattagagtttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgac 16856511  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16856510 aacaccattcgtgtccaaacaata 16856487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 12950795 - 12951018
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  12950795 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaataaggcgtaa 12950894  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12950895 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 12950994  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12950995 aacaccattcgtgtccaaacaata 12951018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16817552 - 16817330
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16817552 gaccgttcgacagcaaatatcattcaaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 16817454  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16817453 cacttgttaggattagagtttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgac 16817354  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16817353 aacaccattcgtgtccaaacaata 16817330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36782408 - 36782184
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  36782408 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 36782309  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36782308 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 36782209  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  36782208 caacaccattcgtgtccaaacaata 36782184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34835035 - 34834812
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34835035 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34834936  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34834935 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34834836  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34834835 aacaccattcgtgtccaaacaata 34834812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34841479 - 34841256
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34841479 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34841380  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34841379 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34841280  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34841279 aacaccattcgtgtccaaacaata 34841256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 29484925 - 29485149
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  29484925 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 29485024  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29485025 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 29485124  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  29485125 caacactattcgtgtccaaacaata 29485149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 45011981 - 45012205
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  45011981 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 45012080  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45012081 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 45012180  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  45012181 caacactattcgtgtccaaacaata 45012205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Original strand, 2164026 - 2164250
Alignment:
Q  11 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| |||||     
T  2164026 agaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgta 2164125  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2164126 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgattatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 2164225  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2164226 caacaccattcgtgtccaaacaata 2164250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 15852548 - 15852772
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  15852548 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 15852647  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15852648 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacttaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 15852747  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  15852748 caacactattcgtgtccaaacaata 15852772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 43267857 - 43268081
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  43267857 gaccgttcgacaccaattatcatttcaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 43267956  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43267957 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 43268056  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  43268057 caacaccattcgtgtccaaacaata 43268081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 2157611 - 2157834
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  2157611 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 2157710  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2157711 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctatcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 2157810  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  2157811 aacaccattcgtgtccaaacaata 2157834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13902180 - 13901957
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  13902180 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 13902081  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13902080 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgac 13901981  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13901980 aacaccattcgtgtccaaacaata 13901957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21068181 - 21067958
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| || |||    
T  21068181 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgtattagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggtgtg 21068082  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21068081 aaactt-ttaggattagagttccttgagcaggcatcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 21067983  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21067982 caacaccattcgtgtccaaacaata 21067958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 85 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45700793 - 45700644
Alignment:
Q  85 ataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttc 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45700793 ataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagaattagagttccttgatcaaacgtcacacataacctaatgatcatacctggattctagcttttc 45700694  T
Q  185 tttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  45700693 tttgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaata 45700644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Original strand, 41455598 - 41455823
Alignment:
Q  5 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataag 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||   || |  |||||||||| |||||||    
T  41455598 tatcacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagtgcaaaagtaaaagttgagagtaataag 41455697  T
Q  105 gcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtat 202  Q
    |||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||| | | |||    |||||||||||||||    
T  41455698 gcgt-aaaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattccaccgttttaccgatattatcacgtat 41455796  T
Q  203 ccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 229  Q
    | |||||||| |  |||||||||||||    
T  41455797 cactcaacaagattattcgtgtccaaa 41455823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11910116 - 11909950
Alignment:
Q  70 aactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatga--tcatac 167  Q
    |||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |||||   ||||     
T  11910116 aactaatttgcaagaataaaagtgagattaataaggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcatcccatataatccaatgaccacatat 11910017  T
Q  168 atggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    | ||||||||||||||  |  |||||||||||||||  || |||| |  ||||||||||||| ||||    
T  11910016 acggattctagcttttaatctatattatcacgtatcagtcgacaatattattcgtgtccaaataata 11909950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17784604 - 17784443
Alignment:
Q  70 aactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--ta 166  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  ||    
T  17784604 aactaatttgcaaagataaaagttgagagtaataaggcgtaaaagc-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacata 17784506  T
Q  167 catggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 229  Q
     ||| |||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  17784505 tatgaattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcgacaacatcattcgtgtccaaa 17784443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 225
Target Start/End: Original strand, 13162892 - 13163032
Alignment:
Q  87 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttc 184  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||  || ||  |||  |||||||  |||| |  |||||||||||||     
T  13162892 aaagttgagagtaataaggcgtaaaacttgttaggattagagttcattgaccaagaatcgcatataacataatgatcacatatacagattctagctttta 13162991  T
Q  185 tttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtc 225  Q
     |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  13162992 atcaatattatcacgtatccctcgacaacatcattcatgtc 13163032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17789257 - 17789096
Alignment:
Q  70 aactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--ta 166  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||  |||| ||||  ||    
T  17789257 aactaatttgcaaagataaaagttgagagtaataaggcgtaaaagc-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacataataatcacata 17789159  T
Q  167 catggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 229  Q
     |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||    
T  17789158 tatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcgacaacatcattcctgtccaaa 17789096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 16405334 - 16405568
Alignment:
Q  5 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataa 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16405334 tatcacagaccgttcgacaccaaatatcgttctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataa 16405433  T
Q  104 ggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttg----atattatcacg 199  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| | |    
T  16405434 ggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatatatattataatg 16405533  T
Q  200 tatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16405534 tatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 16405568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 55462995 - 55462772
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  55462995 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 55462896  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  55462895 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 55462796  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  55462795 aacactattcgtgtccaaacaata 55462772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16838581 - 16838359
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  16838581 gaccgttagacaccaaatatcattctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggcgtga 16838483  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16838482 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctatcttttctttgatattatcatgtatccctcgac 16838383  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16838382 aacaccattcgtgtccaaacaata 16838359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 27590304 - 27590527
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  27590304 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtga 27590403  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27590404 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 27590503  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  27590504 aacactattcgtgtccaaacaata 27590527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Original strand, 41372984 - 41373209
Alignment:
Q  11 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgt 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  41372984 agaccgttcgacaccaattatcattctaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgt 41373083  T
Q  109 gaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 208  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41373084 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcg 41373183  T
Q  209 acaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  41373184 acaacatcattcgtgtccaaacaata 41373209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37368538 - 37368315
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  37368538 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 37368439  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37368438 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 37368339  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaat 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  37368338 caacactattcgtgtccaaacaat 37368315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 13594105 - 13594330
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | |||||    
T  13594105 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaaagataatatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgt 13594204  T
Q  109 gaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 208  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13594205 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcg 13594304  T
Q  209 acaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13594305 acaacaccattcgtgtccaaacaata 13594330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 7780406 - 7780629
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaa-gttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||     
T  7780406 gaccgttcgacactaaatatcattctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaacgaaattgcaaatgataaaagttgagagtaatagggcgta 7780504  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7780505 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 7780604  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  7780605 caacatcattcgtgtccaaacaata 7780629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 8103880 - 8104104
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  8103880 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 8103979  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8103980 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 8104079  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  8104080 caacactattcgtgtccaaacaata 8104104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 30238259 - 30238482
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  30238259 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 30238358  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  30238359 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatgtattctagcttttctttgatattatcatttatccctcgac 30238458  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  30238459 aacactattcgtgtccaaacaata 30238482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 17456853 - 17457077
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  || ||| |||||||||||| ||||||    
T  17456853 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgacaaaattgagattaatagggcgtg 17456952  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17456953 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 17457052  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| |||| |||||||||||||    
T  17457053 caacactattcatgtccaaacaata 17457077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36755017 - 36754791
Alignment:
Q  17 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagtt---------gcaatgataaagttgagattaataaggcg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||         | |||||||||||||||||||||||||||    
T  36755017 ttcgacaccaaatatcattctaaattaaaagatagtttgttgtttgttttagtaactaagttaactatattgaaatgataaagttgagattaataaggcg 36754918  T
Q  108 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 207  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36754917 tgaaacttattaggattgaagttccttaatcaagcgtcacacattacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctc 36754818  T
Q  208 aacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  36754817 gacaacaccattcgtgtccaaacaata 36754791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30211758 - 30211536
Alignment:
Q  5 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataa 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||        |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  30211758 tatcacagaccgttcgacaccaaatat--------gttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataa 30211667  T
Q  104 ggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 203  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30211666 ggcatgaaacttgttatgattagagttccttaatcaagcgtcacacataacttaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcacgtatc 30211567  T
Q  204 cctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30211566 cctcgacaacaccattcgtgtccaaaaaata 30211536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 87 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5660696 - 5660549
Alignment:
Q  87 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  5660696 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcatcacatgtaacctaatgatcatatacggattctaacttttctt 5660597  T
Q  187 tgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||    
T  5660596 tgatataatcacgtatccctcgacaatatcattcgtgtccaaataata 5660549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13004017 - 13003809
Alignment:
Q  5 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataa 103  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |  |||||||||| ||||||    
T  13004017 tatcacagactgttcgacaccaaatatcattataagttaaaagacaatttgttgtttgttttagtaacaaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataa 13003918  T
Q  104 ggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgta 201  Q
    ||||| |||   ||| | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    ||||||||||||||    
T  13003917 ggcgt-aaaaacgttggaattagagttctttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgta 13003819  T
Q  202 tccctcaaca 211  Q
    || |||||||    
T  13003818 tcactcaaca 13003809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Original strand, 2947844 - 2948062
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| || |   || |  |||||||||| ||||| ||||| ||    
T  2947844 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaaccaaatataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgt-aa 2947942  T
Q  112 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    |    || | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||    
T  2947943 aaacattggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaa 2948042  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaa 229  Q
    ||| |  |||||||||||||    
T  2948043 caagattattcgtgtccaaa 2948062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 108
Target Start/End: Original strand, 48914898 - 48914996
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||| || |||||| |||||||||||| |||||    
T  48914898 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgt 48914996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 5660775 - 5660743
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaa 44  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5660775 gaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaa 5660743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 12768743 - 12768966
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12768743 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaatgataattcgttgtttgttttaataactaaattgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtga 12768842  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  12768843 aacttgttaggattagagttctttgatcaagcttcacacgtaacctaatgattatacatggattctagattttctttgatattatcatgtatccctcgac 12768942  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  12768943 aagaccattcgtgtccaaacaata 12768966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11358417 - 11358193
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  11358417 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 11358318  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11358317 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 11358218  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  11358217 caacactattcgtgtccaaacaata 11358193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 7311348 - 7311571
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  7311348 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 7311447  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7311448 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 7311547  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7311548 aacaccattcgtgtccaaacaata 7311571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8013543 - 8013320
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  8013543 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 8013444  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8013443 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 8013344  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8013343 aacaccattcgtgtccaaacaata 8013320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36005705 - 36005482
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  36005705 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 36005606  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36005605 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 36005506  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36005505 aacaccattcgtgtccaaacaata 36005482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Original strand, 36075965 - 36076189
Alignment:
Q  11 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  36075965 agaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacaatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 36076064  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36076065 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 36076164  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  36076165 caacaccattcgtgtccaaacaata 36076189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36425954 - 36425730
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  36425954 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 36425855  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36425854 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 36425755  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  36425754 caacactattcgtgtccaaacaata 36425730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6464799 - 6464576
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  6464799 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 6464700  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6464699 aactcgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 6464600  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6464599 aacaccattcgtgtccaaacaata 6464576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 15012393 - 15012610
Alignment:
Q  18 tcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||| ||||||| ||||| || ||||||||||    
T  15012393 tcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagttactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaatagggtgtgaaacttg 15012492  T
Q  117 ttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacc 216  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15012493 ttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacggaacctaatgactatacatggattctatcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacacc 15012592  T
Q  217 attcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15012593 attcgtgtccaaacaata 15012610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36022023 - 36021799
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  36022023 gaccgttcgacaccaattatcatttcaagtaaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 36021924  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36021923 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 36021824  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  36021823 caacaccattcgtgtccaaacaata 36021799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41242339 - 41242116
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  41242339 gaccgtttgacaccaaatatcttttcaagttaaatgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 41242240  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41242239 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 41242140  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  41242139 aacaccattcgtgtccaaacaata 41242116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 1238212 - 1238436
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttg-caatgataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| |||  || |  |||||||||| |||||  ||||     
T  1238212 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaaaataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgaaaaagtaaaagttgagagtaatagagcgta 1238311  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1238312 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacaaataacctgatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 1238411  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  1238412 caacactattcgtgtccaaacaata 1238436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16710892 - 16710668
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| | |||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||  |||| ||| |     
T  16710892 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagcaatagggcata 16710793  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16710792 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 16710693  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16710692 caacaccattcgtgtccaaacaata 16710668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 31017391 - 31017608
Alignment:
Q  5 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataag 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||              || |||||||    
T  31017391 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaacaaagttgc--------------gaataataag 31017476  T
Q  105 gcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcata--catggattctagcttttctttgatattatcacgtat 202  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31017477 gcgtgaaactagttaggattagagttctttaatcaagcgtcacatgtaacctaatgaccatatacatggattctaatttttctttgatattatcacgtat 31017576  T
Q  203 ccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31017577 ccctcgacaacaccattcgtgtccaaaaaata 31017608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 91 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26250734 - 26250591
Alignment:
Q  91 ttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgat 190  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||    
T  26250734 ttgagattaataaggcgtgaaatttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaatctaataaccatacatggtttatagcttttctttgat 26250635  T
Q  191 attatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  26250634 attatcacgtatccctcgacaatatcattcgtgtccaaacaata 26250591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45068609 - 45068416
Alignment:
Q  42 taaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaa 140  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||| || |||||    
T  45068609 taaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaaacgtaaaatttgttaggattagagttctttaatcaa 45068510  T
Q  141 gcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  45068509 gcgtcgcacgtaacctaatgaccatacatggattctagtttttctttgatattatcatgtaaccctcgataacaccattcgtgtccgaacaata 45068416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7934150 - 7933931
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaag-ttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||||| |||| || |   || |  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  7934150 gaccgttcgacaccaaatatcattctaaggttaaacgatagttgatggtttgttttagtaaccaaatataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgtaa 7934051  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 208  Q
    ||    || | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||||    
T  7934050 aaaca-ttggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctca 7933952  T
Q  209 acaacaccattcgtgtccaaa 229  Q
    |||| |  |||||||||||||    
T  7933951 acaagattattcgtgtccaaa 7933931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 65
Target Start/End: Original strand, 14393733 - 14393786
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttt 65  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||| |||||||||||    
T  14393733 gaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaaaggttgattggttgtttgttt 14393786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4311709 - 4311486
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  4311709 gaccgttcaacaccaaatatcattctaagttaaatgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 4311610  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4311609 aacttgttaggattagagttccttgatcaatcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 4311510  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  4311509 aacactattcgtgtccaaacaata 4311486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10941534 - 10941304
Alignment:
Q  5 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataa 103  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  10941534 tatcacagaccgtttgacacctaatataattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataa 10941435  T
Q  104 ggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10941434 ggcgtgaaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatatatggattctaacttttctttgatattatcacgtatc 10941335  T
Q  204 cctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10941334 cctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 10941304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 32746369 - 32746592
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  32746369 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 32746468  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32746469 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 32746568  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  32746569 aacactattcgtgtccaaacaata 32746592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 6036265 - 6036488
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6036265 gaccgtttgacaccaaatataattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgaaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 6036364  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6036365 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcactcgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 6036464  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  6036465 aacactattcgtgtccaaacaata 6036488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 24179072 - 24179296
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  24179072 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 24179171  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24179172 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 24179271  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  24179272 caacactattcgtgtccaaacaata 24179296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9570774 - 9570548
Alignment:
Q  11 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgca-atgataaagttgagattaataaggcg 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  9570774 agaccgttcgacaccaattatcattctaagtttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcagatgataaaattgagattaatagggcg 9570675  T
Q  108 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 207  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9570674 taaaacttgttaggattagaattccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 9570575  T
Q  208 aacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9570574 aacaataccattcgtgtccaaacaata 9570548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27502191 - 27501967
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  27502191 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 27502092  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27502091 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 27501992  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  27501991 caacactattcgtgtccaaacaata 27501967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 13014985 - 13015208
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | ||||| |    
T  13014985 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgtaa 13015084  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13015085 aacttgttaggattagagtttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 13015184  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  13015185 aacactattcgtgtccaaacaata 13015208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9577276 - 9577050
Alignment:
Q  11 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgca-atgataaagttgagattaataaggcg 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  9577276 agaccgttcgacaccaattattattctaagtttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcagatgataaaattgagattaatagggcg 9577177  T
Q  108 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 207  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9577176 taaaacttgttaggattagaattccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 9577077  T
Q  208 aacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9577076 aacaataccattcgtgtccaaacaata 9577050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 43995068 - 43995300
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc---------aatgataaagttgagattaata 102  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||          ||||||||||||||||||||||    
T  43995068 gaccattcgacatcaaatatcattctaagttaaaagatagtttgttgtttgttttagaaactaagttgactatgttgaaatgataaagttgagattaata 43995167  T
Q  103 aggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttc-tttgatattatcacgta 201  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43995168 aggcgtgaaacttgtcaggattagagttccttaaccaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttcttttgatattattacgta 43995267  T
Q  202 tccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43995268 tccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 43995300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 25893229 - 25893458
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  25893229 gaccgttcgacaccaaataccattctaagttaaaaagttaattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 25893328  T
Q  110 aaacttgttagtattagagtt-----ccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatcc 204  Q
    ||||||||||| |||||||||     |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25893329 aaacttgttaggattagagttaaattccttgatcaagcgtcacacgtaacttaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatcc 25893428  T
Q  205 ctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25893429 ctcaacaatactattcgtgtccaaacaata 25893458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 43931581 - 43931799
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  43931581 gaccgtccgacaccaaataccattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcggataataaaattgagattaataaggcgtga 43931680  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcac--acgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||     
T  43931681 aacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacatacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttc-------ttatcacgtatccctcg 43931773  T
Q  209 acaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  43931774 acaacaccattcgtgttcaaacaata 43931799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Original strand, 23068462 - 23068686
Alignment:
Q  11 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcg 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||| ||||||| ||||    
T  23068462 agaccgttcgtcaccaaatatcattctaagttaaaaagataatctgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgaaattaatagggcg 23068561  T
Q  108 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 207  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23068562 -gaaacttgttaggattagagttctttgatcgagcatcgcacgtaacctaatgatcatacatggattcta-cttttctttgatattatcacgtatccctc 23068659  T
Q  208 aacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  23068660 gacaacaccattcgtgtccaaacaata 23068686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20651362 - 20651135
Alignment:
Q  5 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaat------aactaagttgcaatgataaa-gttgaga 96  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| ||       |||||| ||||||  ||||| |||||||    
T  20651362 tatcatggactgttcgacaccaaatatcattttaagttaaaagattggttgtttgtttgtttaaactatgtgaactaatttgcaagaataaaagttgaga 20651263  T
Q  97 ttaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatc 196  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20651262 ttaataaggcgtgaaactcgttaggattagagttccttgatcaagcatcacacgtaatttaatgatcatatacggattctaccttttctttgatattatc 20651163  T
Q  197 acgtatccctcaacaacaccattcgtgt 224  Q
    ||||||||||  |||| | |||||||||    
T  20651162 acgtatcccttgacaatatcattcgtgt 20651135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 138
Target Start/End: Original strand, 41353860 - 41353987
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  41353860 gaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataggacgtaa 41353959  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatc 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  41353960 aacttgttaggattagagttccttgatc 41353987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41354300 - 41354142
Alignment:
Q  5 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaata 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| |||||    
T  41354300 tatcatggaccgttcgacaccaaatatcattctaagttgaaa-ataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaata 41354202  T
Q  103 aggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat 162  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41354201 gggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgagcaagcgtcacacgtaacctaatgat 41354142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 4590792 - 4591012
Alignment:
Q  11 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| || |   || | ||||||||||| ||||| |||||     
T  4590792 agaccgttcgacaccaattatcattccaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaaccaaatataaaagttaaagttgagagtaatagggcgt- 4590890  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 207  Q
    |||   ||| | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||    
T  4590891 aaaaacgttggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctc 4590990  T
Q  208 aacaacaccattcgtgtccaaa 229  Q
    ||||| |  |||||||||||||    
T  4590991 aacaagattattcgtgtccaaa 4591012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 3577162 - 3577095
Alignment:
Q  11 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagtt 78  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3577162 agaccgttcgacaccaaatattattctaagttaaatgataatttgttgtttgtttgaataactaagtt 3577095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20952993 - 20952759
Alignment:
Q  5 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacga-taatttgttgtttgttt-----taa--taactaagttgcaatgat-aaagttgag 95  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||     |||  ||||||| ||||||  || |||||||||    
T  20952993 tatcacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagagtaattgtttgtttctttgcaactaagttaactaatttgcaagaataaaagttgag 20952894  T
Q  96 attaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatatt 193  Q
    | ||||||||||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||    ||||||    
T  20952893 agtaataaggcgt-aaaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcgcatatatggattctagcgctttaccgatatt 20952795  T
Q  194 atcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 229  Q
    |||||||||| |||||||| |  |||| ||||||||    
T  20952794 atcacgtatcgctcaacaagattattcatgtccaaa 20952759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Original strand, 2785700 - 2785922
Alignment:
Q  5 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgat-aatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataa 103  Q
    |||||| |||||||||||| | | |||||||  ||||||||  || |||||||||||||||| ||  |||||  | | | |||||||||||||   |||     
T  2785700 tatcatggaccgttcgacatcgattatcatttcaagttaaaacattaatttgttgtttgtttaaa--actaaaatacgaagataaagttgaga---atat 2785794  T
Q  104 ggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca----tacatggattctagcttttctttgatattatcacg 199  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||  ||| |  |||| ||    |||||  ||||||||||||  | ||||||||||||    
T  2785795 ggcgtaaaacatgttaggattagagtttcttgaccaagcatcacatataaccatatgaccacatatacat--attctagcttttaatcgatattatcacg 2785892  T
Q  200 tatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 229  Q
    |||||||| |||| | |||| |||||||||    
T  2785893 tatccctcgacaaaatcatttgtgtccaaa 2785922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4644463 - 4644354
Alignment:
Q  122 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 219  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || |||  |||| ||||  || |||||||||||| |||    ||||||||||||||||  ||||||| || |||    
T  4644463 attagagttccttggttaagcgtcaaacataacataataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgttcaacaagactatt 4644364  T
Q  220 cgtgtccaaa 229  Q
    ||||||||||    
T  4644363 cgtgtccaaa 4644354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 49683 - 49912
Alignment:
Q  5 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataa 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  49683 tatcacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatag 49781  T
Q  104 ggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 203  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49782 ggcgtaaaacttgttaggattagagttccttcatcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacacggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 49881  T
Q  204 cctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  49882 cctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 49912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 15163 - 15393
Alignment:
Q  5 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataa 103  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||| |||||||||||||    
T  15163 tatcacagacctttcgacacaaaatatcattctaacttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaatagtaaaattgagattaataa 15262  T
Q  104 ggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15263 ggcgtgaaacttgttaggattagagttccttattccagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatc 15362  T
Q  204 cctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15363 cctcgacaacaccgttcgtgtccaaacaata 15393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5228 - 5005
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  5228 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 5129  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5128 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 5029  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5028 aacaccattcgtgtccaaacaata 5005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0936 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0936
Description:

Target: scaffold0936; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3486 - 3264
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  3486 gaccattcgacactaaatatcattctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggcgtga 3388  T
Q  111 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3387 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcttcacacttaacctaattaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 3288  T
Q  211 aacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  3287 aacatcattcgtgtccaaacaata 3264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9105 - 8881
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  9105 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 9006  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9005 aaacttgttaggattagagttccttgatcgatcctcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcga 8906  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  8905 caacaccattcgtgtccaaacaata 8881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2784 - 2560
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  2784 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttatttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 2685  T
Q  110 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2684 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacatataacctaatgaccattcatggattcaagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 2585  T
Q  210 caacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  2584 caacaccattcatgtccaaacaata 2560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Original strand, 12014 - 12155
Alignment:
Q  93 gagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatat 192  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12014 gagagtaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcataaatggattctagcttttctttgatat 12113  T
Q  193 tatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12114 tatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 12155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 76
Target Start/End: Original strand, 11949 - 12014
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaag 76  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  11949 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaag 12014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 118
Target Start/End: Original strand, 99913 - 100020
Alignment:
Q  12 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  99913 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtga 100012  T
Q  111 aacttgtt 118  Q
    ||||||||    
T  100013 aacttgtt 100020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 24476 - 24268
Alignment:
Q  5 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataa 103  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |  |||||||||| ||||||    
T  24476 tatcacagactgttcgacaccaaatatcattataagttaaaagacaatttgttgtttgttttagtaacaaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataa 24377  T
Q  104 ggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgta 201  Q
    ||||| |||   ||| | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    ||||||||||||||    
T  24376 ggcgt-aaaaacgttggaattagagttctttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgta 24278  T
Q  202 tccctcaaca 211  Q
    || |||||||    
T  24277 tcactcaaca 24268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University